Date: 2019-12-25 23:29:27 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 523 361
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | ||
|---|---|---|---|---|---|
| CV:mclust | 2 | 1.000 | 0.983 | 0.986 | ** |
| ATC:mclust | 2 | 1.000 | 0.994 | 0.997 | ** |
| ATC:skmeans | 2 | 0.959 | 0.961 | 0.983 | ** |
| ATC:kmeans | 2 | 0.936 | 0.933 | 0.972 | * |
| MAD:kmeans | 2 | 0.907 | 0.930 | 0.970 | * |
| SD:skmeans | 2 | 0.897 | 0.931 | 0.970 | |
| MAD:skmeans | 2 | 0.866 | 0.927 | 0.968 | |
| SD:kmeans | 2 | 0.865 | 0.930 | 0.969 | |
| CV:skmeans | 2 | 0.806 | 0.896 | 0.955 | |
| SD:mclust | 2 | 0.771 | 0.861 | 0.934 | |
| CV:kmeans | 2 | 0.767 | 0.895 | 0.950 | |
| SD:NMF | 3 | 0.688 | 0.811 | 0.920 | |
| MAD:NMF | 3 | 0.668 | 0.807 | 0.915 | |
| SD:pam | 4 | 0.555 | 0.760 | 0.877 | |
| ATC:pam | 4 | 0.543 | 0.714 | 0.855 | |
| MAD:pam | 4 | 0.523 | 0.762 | 0.871 | |
| MAD:mclust | 3 | 0.503 | 0.807 | 0.872 | |
| CV:NMF | 2 | 0.480 | 0.811 | 0.899 | |
| ATC:NMF | 4 | 0.357 | 0.598 | 0.747 | |
| SD:hclust | 4 | 0.331 | 0.679 | 0.777 | |
| MAD:hclust | 4 | 0.327 | 0.678 | 0.781 | |
| ATC:hclust | 2 | 0.215 | 0.729 | 0.837 | |
| CV:hclust | 3 | 0.205 | 0.614 | 0.794 | |
| CV:pam | 3 | 0.172 | 0.593 | 0.725 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 0.741 0.880 0.944 0.401 0.611 0.611
#> CV:NMF 2 0.480 0.811 0.899 0.449 0.559 0.559
#> MAD:NMF 2 0.763 0.891 0.951 0.392 0.608 0.608
#> ATC:NMF 2 0.501 0.787 0.899 0.371 0.663 0.663
#> SD:skmeans 2 0.897 0.931 0.970 0.501 0.499 0.499
#> CV:skmeans 2 0.806 0.896 0.955 0.499 0.501 0.501
#> MAD:skmeans 2 0.866 0.927 0.968 0.501 0.499 0.499
#> ATC:skmeans 2 0.959 0.961 0.983 0.500 0.500 0.500
#> SD:mclust 2 0.771 0.861 0.934 0.349 0.611 0.611
#> CV:mclust 2 1.000 0.983 0.986 0.244 0.761 0.761
#> MAD:mclust 2 0.768 0.785 0.921 0.330 0.651 0.651
#> ATC:mclust 2 1.000 0.994 0.997 0.236 0.761 0.761
#> SD:kmeans 2 0.865 0.930 0.969 0.493 0.503 0.503
#> CV:kmeans 2 0.767 0.895 0.950 0.485 0.509 0.509
#> MAD:kmeans 2 0.907 0.930 0.970 0.497 0.502 0.502
#> ATC:kmeans 2 0.936 0.933 0.972 0.495 0.502 0.502
#> SD:pam 2 0.293 0.570 0.782 0.364 0.569 0.569
#> CV:pam 2 0.291 0.721 0.845 0.370 0.667 0.667
#> MAD:pam 2 0.245 0.652 0.812 0.385 0.528 0.528
#> ATC:pam 2 0.343 0.703 0.841 0.420 0.500 0.500
#> SD:hclust 2 0.187 0.624 0.771 0.386 0.509 0.509
#> CV:hclust 2 0.523 0.769 0.906 0.177 0.885 0.885
#> MAD:hclust 2 0.179 0.596 0.758 0.387 0.591 0.591
#> ATC:hclust 2 0.215 0.729 0.837 0.414 0.513 0.513
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.688 0.811 0.920 0.426 0.731 0.590
#> CV:NMF 3 0.227 0.459 0.708 0.402 0.697 0.501
#> MAD:NMF 3 0.668 0.807 0.915 0.474 0.724 0.580
#> ATC:NMF 3 0.221 0.344 0.643 0.582 0.710 0.585
#> SD:skmeans 3 0.791 0.870 0.938 0.225 0.887 0.776
#> CV:skmeans 3 0.682 0.823 0.899 0.236 0.873 0.753
#> MAD:skmeans 3 0.771 0.865 0.933 0.227 0.877 0.758
#> ATC:skmeans 3 0.780 0.837 0.916 0.229 0.871 0.745
#> SD:mclust 3 0.538 0.869 0.878 0.293 0.933 0.895
#> CV:mclust 3 0.369 0.688 0.800 1.185 0.651 0.541
#> MAD:mclust 3 0.503 0.807 0.872 0.427 0.904 0.854
#> ATC:mclust 3 0.485 0.825 0.876 0.897 0.823 0.767
#> SD:kmeans 3 0.598 0.817 0.886 0.225 0.772 0.597
#> CV:kmeans 3 0.767 0.847 0.935 0.219 0.825 0.681
#> MAD:kmeans 3 0.536 0.711 0.824 0.220 0.763 0.584
#> ATC:kmeans 3 0.582 0.765 0.870 0.216 0.762 0.586
#> SD:pam 3 0.318 0.628 0.776 0.458 0.570 0.449
#> CV:pam 3 0.172 0.593 0.725 0.501 0.739 0.625
#> MAD:pam 3 0.336 0.597 0.794 0.428 0.657 0.480
#> ATC:pam 3 0.354 0.491 0.777 0.339 0.590 0.400
#> SD:hclust 3 0.252 0.593 0.762 0.382 0.534 0.394
#> CV:hclust 3 0.205 0.614 0.794 1.133 0.762 0.736
#> MAD:hclust 3 0.243 0.572 0.769 0.396 0.608 0.482
#> ATC:hclust 3 0.266 0.357 0.667 0.307 0.577 0.400
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.627 0.739 0.866 0.249 0.798 0.560
#> CV:NMF 4 0.301 0.357 0.623 0.156 0.785 0.498
#> MAD:NMF 4 0.627 0.732 0.859 0.239 0.795 0.556
#> ATC:NMF 4 0.357 0.598 0.747 0.187 0.711 0.435
#> SD:skmeans 4 0.707 0.795 0.882 0.172 0.874 0.689
#> CV:skmeans 4 0.584 0.652 0.816 0.141 0.893 0.739
#> MAD:skmeans 4 0.686 0.730 0.854 0.166 0.873 0.685
#> ATC:skmeans 4 0.605 0.669 0.822 0.144 0.913 0.779
#> SD:mclust 4 0.359 0.647 0.708 0.392 0.698 0.502
#> CV:mclust 4 0.267 0.591 0.679 0.175 0.809 0.615
#> MAD:mclust 4 0.333 0.685 0.738 0.335 0.724 0.524
#> ATC:mclust 4 0.325 0.605 0.675 0.388 0.676 0.481
#> SD:kmeans 4 0.670 0.823 0.898 0.138 0.776 0.515
#> CV:kmeans 4 0.534 0.676 0.804 0.172 0.804 0.561
#> MAD:kmeans 4 0.678 0.805 0.893 0.133 0.768 0.503
#> ATC:kmeans 4 0.828 0.846 0.917 0.150 0.758 0.489
#> SD:pam 4 0.555 0.760 0.877 0.234 0.734 0.548
#> CV:pam 4 0.238 0.315 0.624 0.195 0.841 0.688
#> MAD:pam 4 0.523 0.762 0.871 0.191 0.839 0.663
#> ATC:pam 4 0.543 0.714 0.855 0.210 0.688 0.425
#> SD:hclust 4 0.331 0.679 0.777 0.193 0.746 0.558
#> CV:hclust 4 0.130 0.507 0.682 0.253 0.797 0.716
#> MAD:hclust 4 0.327 0.678 0.781 0.189 0.761 0.568
#> ATC:hclust 4 0.321 0.643 0.759 0.145 0.653 0.406
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.571 0.558 0.774 0.0701 0.912 0.723
#> CV:NMF 5 0.381 0.436 0.634 0.0779 0.827 0.484
#> MAD:NMF 5 0.572 0.556 0.770 0.0691 0.887 0.655
#> ATC:NMF 5 0.399 0.429 0.637 0.1083 0.865 0.578
#> SD:skmeans 5 0.705 0.709 0.841 0.0668 0.932 0.773
#> CV:skmeans 5 0.558 0.530 0.735 0.0847 0.897 0.691
#> MAD:skmeans 5 0.694 0.691 0.826 0.0682 0.936 0.782
#> ATC:skmeans 5 0.640 0.627 0.812 0.0643 0.945 0.832
#> SD:mclust 5 0.364 0.633 0.702 0.0859 0.911 0.745
#> CV:mclust 5 0.287 0.451 0.635 0.0970 0.811 0.567
#> MAD:mclust 5 0.333 0.639 0.711 0.0748 0.898 0.711
#> ATC:mclust 5 0.387 0.636 0.752 0.1297 0.933 0.813
#> SD:kmeans 5 0.696 0.650 0.834 0.0763 0.964 0.884
#> CV:kmeans 5 0.536 0.552 0.726 0.0781 0.943 0.815
#> MAD:kmeans 5 0.684 0.672 0.828 0.0791 0.944 0.824
#> ATC:kmeans 5 0.694 0.706 0.832 0.0851 0.879 0.626
#> SD:pam 5 0.636 0.789 0.897 0.0502 0.954 0.871
#> CV:pam 5 0.306 0.384 0.607 0.1013 0.763 0.485
#> MAD:pam 5 0.596 0.792 0.877 0.0598 0.966 0.903
#> ATC:pam 5 0.563 0.669 0.804 0.0523 0.949 0.850
#> SD:hclust 5 0.384 0.587 0.760 0.0661 0.967 0.904
#> CV:hclust 5 0.144 0.564 0.707 0.1239 0.870 0.774
#> MAD:hclust 5 0.399 0.641 0.763 0.0713 0.961 0.888
#> ATC:hclust 5 0.345 0.635 0.764 0.0653 0.968 0.910
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.556 0.481 0.687 0.0392 0.929 0.749
#> CV:NMF 6 0.445 0.340 0.580 0.0465 0.938 0.730
#> MAD:NMF 6 0.556 0.505 0.688 0.0396 0.947 0.805
#> ATC:NMF 6 0.460 0.363 0.570 0.0485 0.858 0.466
#> SD:skmeans 6 0.716 0.682 0.830 0.0413 0.947 0.791
#> CV:skmeans 6 0.572 0.453 0.681 0.0407 0.937 0.769
#> MAD:skmeans 6 0.709 0.674 0.819 0.0413 0.952 0.807
#> ATC:skmeans 6 0.652 0.569 0.773 0.0406 0.940 0.792
#> SD:mclust 6 0.413 0.334 0.618 0.0911 0.831 0.544
#> CV:mclust 6 0.346 0.468 0.631 0.0621 0.874 0.634
#> MAD:mclust 6 0.412 0.495 0.597 0.1014 0.837 0.512
#> ATC:mclust 6 0.562 0.725 0.802 0.0632 0.900 0.695
#> SD:kmeans 6 0.670 0.601 0.763 0.0595 0.895 0.654
#> CV:kmeans 6 0.518 0.414 0.661 0.0470 0.857 0.549
#> MAD:kmeans 6 0.646 0.582 0.765 0.0578 0.902 0.664
#> ATC:kmeans 6 0.700 0.672 0.811 0.0567 0.914 0.680
#> SD:pam 6 0.594 0.577 0.766 0.1333 0.868 0.602
#> CV:pam 6 0.347 0.373 0.597 0.0528 0.837 0.551
#> MAD:pam 6 0.595 0.504 0.749 0.1233 0.857 0.574
#> ATC:pam 6 0.567 0.585 0.724 0.0810 0.836 0.524
#> SD:hclust 6 0.420 0.513 0.748 0.0434 0.986 0.957
#> CV:hclust 6 0.191 0.494 0.682 0.0835 0.962 0.921
#> MAD:hclust 6 0.416 0.609 0.741 0.0406 0.985 0.955
#> ATC:hclust 6 0.428 0.474 0.734 0.0741 0.930 0.803
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 52, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 104, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 157, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 210, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 262, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 52, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 104, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 157, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 210, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 262, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 52)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 104)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 157)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 210)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 262)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.187 0.624 0.771 0.3857 0.509 0.509
#> 3 3 0.252 0.593 0.762 0.3820 0.534 0.394
#> 4 4 0.331 0.679 0.777 0.1934 0.746 0.558
#> 5 5 0.384 0.587 0.760 0.0661 0.967 0.904
#> 6 6 0.420 0.513 0.748 0.0434 0.986 0.957
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.6801 0.7420 0.820 0.180
#> SRR772342 1 0.7453 0.7162 0.788 0.212
#> SRR772343 1 0.9963 -0.0418 0.536 0.464
#> SRR772344 2 0.8443 0.7491 0.272 0.728
#> SRR772345 2 0.8443 0.7491 0.272 0.728
#> SRR772346 2 1.0000 0.1865 0.500 0.500
#> SRR772347 1 1.0000 -0.1912 0.500 0.500
#> SRR772348 2 0.7815 0.7476 0.232 0.768
#> SRR772349 2 0.7815 0.7476 0.232 0.768
#> SRR772350 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.7602 0.7436 0.220 0.780
#> SRR772352 2 0.8327 0.7516 0.264 0.736
#> SRR772353 2 0.9552 0.6350 0.376 0.624
#> SRR772354 2 0.9552 0.6350 0.376 0.624
#> SRR772355 2 0.8081 0.7507 0.248 0.752
#> SRR772356 2 0.8081 0.7507 0.248 0.752
#> SRR772357 1 0.8267 0.6523 0.740 0.260
#> SRR772358 1 0.7745 0.6974 0.772 0.228
#> SRR772359 1 0.9866 0.1272 0.568 0.432
#> SRR772360 2 0.9996 0.2932 0.488 0.512
#> SRR772361 1 0.0376 0.7141 0.996 0.004
#> SRR772362 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772364 2 0.9996 0.2502 0.488 0.512
#> SRR772365 2 0.9977 0.3204 0.472 0.528
#> SRR772366 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772367 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.8207 0.7501 0.256 0.744
#> SRR772369 2 0.9491 0.6499 0.368 0.632
#> SRR772370 2 0.9393 0.6715 0.356 0.644
#> SRR772371 2 0.9944 0.3557 0.456 0.544
#> SRR772372 2 0.9944 0.3557 0.456 0.544
#> SRR772373 2 0.8661 0.7409 0.288 0.712
#> SRR772374 2 0.8555 0.7445 0.280 0.720
#> SRR772375 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.8267 0.7514 0.260 0.740
#> SRR772377 1 0.9323 0.4292 0.652 0.348
#> SRR772378 2 0.9996 0.2766 0.488 0.512
#> SRR772379 2 0.9833 0.5143 0.424 0.576
#> SRR772380 2 0.9970 0.3612 0.468 0.532
#> SRR772381 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.7219 0.7261 0.800 0.200
#> SRR772383 1 0.7376 0.7180 0.792 0.208
#> SRR772384 1 0.9323 0.4292 0.652 0.348
#> SRR772385 2 0.8955 0.6949 0.312 0.688
#> SRR772386 2 0.8955 0.7263 0.312 0.688
#> SRR772387 2 0.8861 0.7325 0.304 0.696
#> SRR772388 1 0.4298 0.7535 0.912 0.088
#> SRR772389 1 0.4431 0.7547 0.908 0.092
#> SRR772390 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772391 1 0.5519 0.7568 0.872 0.128
#> SRR772392 1 0.5519 0.7568 0.872 0.128
#> SRR772393 2 0.9358 0.6475 0.352 0.648
#> SRR772394 2 0.9393 0.6401 0.356 0.644
#> SRR772395 2 0.8081 0.7503 0.248 0.752
#> SRR772396 1 0.4690 0.7562 0.900 0.100
#> SRR772397 1 0.4562 0.7556 0.904 0.096
#> SRR772398 1 0.9044 0.5224 0.680 0.320
#> SRR772399 1 0.9044 0.5224 0.680 0.320
#> SRR772400 1 0.4815 0.7567 0.896 0.104
#> SRR772401 1 0.4431 0.7547 0.908 0.092
#> SRR772402 2 0.2043 0.6526 0.032 0.968
#> SRR772403 2 0.2043 0.6526 0.032 0.968
#> SRR772404 2 0.8144 0.7498 0.252 0.748
#> SRR772405 1 0.9044 0.4964 0.680 0.320
#> SRR772406 2 0.8909 0.7273 0.308 0.692
#> SRR772407 2 0.8763 0.7386 0.296 0.704
#> SRR772408 2 0.0938 0.6433 0.012 0.988
#> SRR772409 2 0.0672 0.6401 0.008 0.992
#> SRR772410 2 0.9732 0.5640 0.404 0.596
#> SRR772411 2 0.9732 0.5640 0.404 0.596
#> SRR772412 1 0.6148 0.7534 0.848 0.152
#> SRR772413 1 0.6148 0.7534 0.848 0.152
#> SRR772414 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.9129 0.7077 0.328 0.672
#> SRR772416 2 0.9087 0.7135 0.324 0.676
#> SRR772417 1 1.0000 -0.2044 0.504 0.496
#> SRR772418 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772419 2 0.4022 0.6810 0.080 0.920
#> SRR772420 2 0.4161 0.6828 0.084 0.916
#> SRR772421 2 0.9491 0.6523 0.368 0.632
#> SRR772422 2 0.9491 0.6523 0.368 0.632
#> SRR772423 2 0.1633 0.6495 0.024 0.976
#> SRR772424 2 0.0938 0.6428 0.012 0.988
#> SRR772425 2 0.8661 0.7412 0.288 0.712
#> SRR772426 2 0.8207 0.7519 0.256 0.744
#> SRR772427 2 0.8207 0.7519 0.256 0.744
#> SRR772428 1 0.4431 0.7547 0.908 0.092
#> SRR772429 1 0.4690 0.7563 0.900 0.100
#> SRR772430 2 0.9460 0.6641 0.364 0.636
#> SRR772431 2 0.2043 0.6522 0.032 0.968
#> SRR772432 2 0.2043 0.6522 0.032 0.968
#> SRR772433 1 0.4161 0.7524 0.916 0.084
#> SRR772434 1 0.4161 0.7524 0.916 0.084
#> SRR772435 1 1.0000 -0.2493 0.500 0.500
#> SRR772436 1 0.9983 -0.1305 0.524 0.476
#> SRR772437 1 0.0376 0.7141 0.996 0.004
#> SRR772438 1 0.6247 0.7490 0.844 0.156
#> SRR772439 1 0.5842 0.7539 0.860 0.140
#> SRR772440 2 0.9580 0.6235 0.380 0.620
#> SRR772441 2 0.9170 0.7041 0.332 0.668
#> SRR772442 2 0.2423 0.6560 0.040 0.960
#> SRR772443 2 0.2778 0.6588 0.048 0.952
#> SRR772444 1 0.6343 0.7506 0.840 0.160
#> SRR772445 1 0.6531 0.7474 0.832 0.168
#> SRR772446 1 0.6973 0.7360 0.812 0.188
#> SRR772447 1 0.7219 0.7258 0.800 0.200
#> SRR772448 2 0.9044 0.7180 0.320 0.680
#> SRR772449 2 0.8813 0.7362 0.300 0.700
#> SRR772450 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.5946 0.7552 0.856 0.144
#> SRR772453 1 0.6438 0.7481 0.836 0.164
#> SRR772454 1 0.9209 0.4877 0.664 0.336
#> SRR772455 2 1.0000 0.2097 0.500 0.500
#> SRR772456 2 0.0672 0.6401 0.008 0.992
#> SRR772457 2 0.0672 0.6401 0.008 0.992
#> SRR772458 1 0.6801 0.7408 0.820 0.180
#> SRR772459 1 0.6973 0.7364 0.812 0.188
#> SRR772460 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.8144 0.7506 0.252 0.748
#> SRR772463 2 0.8144 0.7506 0.252 0.748
#> SRR772464 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.9460 0.6566 0.364 0.636
#> SRR772466 2 0.9491 0.6500 0.368 0.632
#> SRR772467 2 0.2603 0.6633 0.044 0.956
#> SRR772468 2 0.2603 0.6633 0.044 0.956
#> SRR772469 1 0.8207 0.6593 0.744 0.256
#> SRR772470 1 0.8081 0.6721 0.752 0.248
#> SRR772471 1 0.9000 0.5422 0.684 0.316
#> SRR772472 1 0.8955 0.5506 0.688 0.312
#> SRR772473 2 0.2778 0.6619 0.048 0.952
#> SRR772474 2 0.2603 0.6594 0.044 0.956
#> SRR772475 2 0.9000 0.6928 0.316 0.684
#> SRR772476 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.5737 0.7564 0.864 0.136
#> SRR772479 1 0.5737 0.7564 0.864 0.136
#> SRR772480 2 0.6531 0.7033 0.168 0.832
#> SRR772481 2 0.6801 0.7036 0.180 0.820
#> SRR772482 1 0.6973 0.7358 0.812 0.188
#> SRR772483 1 0.6973 0.7358 0.812 0.188
#> SRR772484 2 0.8955 0.7278 0.312 0.688
#> SRR772485 2 0.8955 0.7278 0.312 0.688
#> SRR772486 1 0.7139 0.7235 0.804 0.196
#> SRR772487 1 0.7139 0.7235 0.804 0.196
#> SRR772488 2 0.9427 0.6666 0.360 0.640
#> SRR772489 2 0.9427 0.6666 0.360 0.640
#> SRR772490 1 0.7139 0.7318 0.804 0.196
#> SRR772491 1 0.6148 0.7541 0.848 0.152
#> SRR772492 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.8763 0.7385 0.296 0.704
#> SRR772497 2 0.8713 0.7408 0.292 0.708
#> SRR772498 2 0.8813 0.6994 0.300 0.700
#> SRR772499 2 0.8813 0.6994 0.300 0.700
#> SRR772500 2 0.7815 0.7475 0.232 0.768
#> SRR772501 2 0.7883 0.7487 0.236 0.764
#> SRR772502 1 0.9970 -0.0560 0.532 0.468
#> SRR772503 1 0.9954 -0.0102 0.540 0.460
#> SRR772504 2 0.8555 0.7445 0.280 0.720
#> SRR772505 2 0.8499 0.7467 0.276 0.724
#> SRR772506 2 0.3114 0.6696 0.056 0.944
#> SRR772507 2 0.3114 0.6696 0.056 0.944
#> SRR772508 2 0.7883 0.7482 0.236 0.764
#> SRR772509 1 0.9358 0.4164 0.648 0.352
#> SRR772510 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772511 1 1.0000 -0.2044 0.504 0.496
#> SRR772512 1 0.1414 0.7212 0.980 0.020
#> SRR772513 2 0.8386 0.7496 0.268 0.732
#> SRR772514 2 0.8386 0.7496 0.268 0.732
#> SRR772515 2 0.8713 0.7408 0.292 0.708
#> SRR772516 2 0.8661 0.7407 0.288 0.712
#> SRR772517 2 0.8608 0.7445 0.284 0.716
#> SRR772518 2 0.8861 0.7336 0.304 0.696
#> SRR772519 2 0.8386 0.7485 0.268 0.732
#> SRR772520 2 0.8443 0.7482 0.272 0.728
#> SRR772521 2 0.9970 0.3528 0.468 0.532
#> SRR772522 2 0.9970 0.3528 0.468 0.532
#> SRR772523 2 0.8499 0.7477 0.276 0.724
#> SRR772524 2 0.8499 0.7474 0.276 0.724
#> SRR772525 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.2778 0.6655 0.048 0.952
#> SRR772527 2 0.2778 0.6655 0.048 0.952
#> SRR772528 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772529 1 0.7674 0.7025 0.776 0.224
#> SRR772530 1 0.7219 0.7273 0.800 0.200
#> SRR772531 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.8555 0.7450 0.280 0.720
#> SRR772533 2 0.8555 0.7450 0.280 0.720
#> SRR772534 1 0.9996 -0.1629 0.512 0.488
#> SRR772535 2 0.7745 0.7460 0.228 0.772
#> SRR772536 2 0.8608 0.7435 0.284 0.716
#> SRR772537 2 0.0938 0.6432 0.012 0.988
#> SRR772538 2 0.1184 0.6461 0.016 0.984
#> SRR772539 1 0.7139 0.7305 0.804 0.196
#> SRR772540 1 0.7299 0.7233 0.796 0.204
#> SRR772541 2 0.8713 0.7410 0.292 0.708
#> SRR772542 1 0.7815 0.6837 0.768 0.232
#> SRR772543 1 0.6973 0.7305 0.812 0.188
#> SRR772544 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.6801 0.7413 0.820 0.180
#> SRR772546 1 0.6801 0.7413 0.820 0.180
#> SRR772547 1 0.9881 0.1225 0.564 0.436
#> SRR772548 1 0.9775 0.2259 0.588 0.412
#> SRR772549 1 0.6048 0.7544 0.852 0.148
#> SRR772550 1 0.5737 0.7566 0.864 0.136
#> SRR772551 2 0.9460 0.6392 0.364 0.636
#> SRR772552 2 0.9323 0.6639 0.348 0.652
#> SRR772553 2 0.9170 0.6783 0.332 0.668
#> SRR772554 2 0.8661 0.7407 0.288 0.712
#> SRR772555 2 0.8661 0.7407 0.288 0.712
#> SRR772556 1 0.6148 0.7537 0.848 0.152
#> SRR772557 1 0.6048 0.7546 0.852 0.148
#> SRR772558 1 0.8661 0.6041 0.712 0.288
#> SRR772559 1 0.8207 0.6591 0.744 0.256
#> SRR772560 2 0.9491 0.6316 0.368 0.632
#> SRR772561 1 0.1414 0.7212 0.980 0.020
#> SRR772562 2 0.8499 0.7467 0.276 0.724
#> SRR772563 2 0.8499 0.7467 0.276 0.724
#> SRR772564 1 0.4298 0.7537 0.912 0.088
#> SRR772565 1 0.4298 0.7537 0.912 0.088
#> SRR772566 1 0.3431 0.7445 0.936 0.064
#> SRR772567 1 0.3431 0.7445 0.936 0.064
#> SRR772568 2 0.8713 0.7406 0.292 0.708
#> SRR772569 2 0.8661 0.7424 0.288 0.712
#> SRR772570 1 0.8661 0.6040 0.712 0.288
#> SRR772571 1 0.9358 0.4456 0.648 0.352
#> SRR772572 1 0.9998 -0.1799 0.508 0.492
#> SRR772573 1 1.0000 -0.2204 0.500 0.500
#> SRR772574 1 0.8555 0.6197 0.720 0.280
#> SRR772575 1 0.8861 0.5719 0.696 0.304
#> SRR772576 2 0.9209 0.6989 0.336 0.664
#> SRR772577 2 0.9460 0.6616 0.364 0.636
#> SRR772578 2 0.1184 0.6464 0.016 0.984
#> SRR772579 2 0.1184 0.6464 0.016 0.984
#> SRR772580 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.9248 0.6426 0.340 0.660
#> SRR772582 2 0.9248 0.6508 0.340 0.660
#> SRR772583 2 0.9087 0.7145 0.324 0.676
#> SRR772584 2 0.9427 0.6632 0.360 0.640
#> SRR772585 2 0.8499 0.7487 0.276 0.724
#> SRR772586 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772587 1 0.9954 -0.0074 0.540 0.460
#> SRR772588 2 0.8267 0.7506 0.260 0.740
#> SRR772589 2 0.8267 0.7506 0.260 0.740
#> SRR772590 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.3584 0.7462 0.932 0.068
#> SRR772592 1 0.3431 0.7445 0.936 0.064
#> SRR772593 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772594 2 0.1414 0.6485 0.020 0.980
#> SRR772595 2 0.1414 0.6485 0.020 0.980
#> SRR772596 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772597 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.4161 0.7524 0.916 0.084
#> SRR772599 1 0.4022 0.7508 0.920 0.080
#> SRR772600 2 0.2043 0.6499 0.032 0.968
#> SRR772601 2 0.1414 0.6465 0.020 0.980
#> SRR772602 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.2778 0.6602 0.048 0.952
#> SRR772604 2 0.1633 0.6496 0.024 0.976
#> SRR772605 2 0.8861 0.7318 0.304 0.696
#> SRR772606 1 0.4298 0.7538 0.912 0.088
#> SRR772607 1 0.4298 0.7538 0.912 0.088
#> SRR772608 2 0.8813 0.7373 0.300 0.700
#> SRR772609 2 0.8813 0.7373 0.300 0.700
#> SRR772610 2 0.8327 0.7501 0.264 0.736
#> SRR772611 2 0.8327 0.7501 0.264 0.736
#> SRR772612 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.4939 0.7576 0.892 0.108
#> SRR772615 1 0.4815 0.7572 0.896 0.104
#> SRR772616 1 0.9954 -0.0074 0.540 0.460
#> SRR772617 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.9710 0.5837 0.400 0.600
#> SRR772622 2 0.9393 0.6697 0.356 0.644
#> SRR772623 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772625 2 0.8955 0.6949 0.312 0.688
#> SRR772626 2 0.8955 0.6886 0.312 0.688
#> SRR772627 2 0.8813 0.6988 0.300 0.700
#> SRR772628 1 0.7674 0.7020 0.776 0.224
#> SRR772629 1 0.8386 0.6388 0.732 0.268
#> SRR772630 1 0.9983 -0.1051 0.524 0.476
#> SRR772631 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772632 2 0.6343 0.7188 0.160 0.840
#> SRR772633 2 0.6343 0.7188 0.160 0.840
#> SRR772634 1 0.9998 -0.2049 0.508 0.492
#> SRR772635 2 0.9996 0.2917 0.488 0.512
#> SRR772636 2 0.8955 0.6949 0.312 0.688
#> SRR772637 1 0.5519 0.7567 0.872 0.128
#> SRR772638 1 0.5294 0.7570 0.880 0.120
#> SRR772639 2 0.8661 0.7412 0.288 0.712
#> SRR772640 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.9491 0.6559 0.368 0.632
#> SRR772643 2 0.9209 0.6991 0.336 0.664
#> SRR772644 1 0.8661 0.6042 0.712 0.288
#> SRR772645 1 0.8499 0.6260 0.724 0.276
#> SRR772646 2 0.8555 0.7449 0.280 0.720
#> SRR772647 2 0.8555 0.7449 0.280 0.720
#> SRR772648 2 0.9248 0.6919 0.340 0.660
#> SRR772649 2 0.9170 0.7029 0.332 0.668
#> SRR772650 1 0.9909 0.0702 0.556 0.444
#> SRR772651 1 0.9909 0.0702 0.556 0.444
#> SRR772652 1 0.7056 0.7337 0.808 0.192
#> SRR772653 1 0.7056 0.7337 0.808 0.192
#> SRR772654 2 0.9795 0.5409 0.416 0.584
#> SRR772655 2 0.9833 0.5180 0.424 0.576
#> SRR772656 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0376 0.7141 0.996 0.004
#> SRR772658 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.8499 0.7481 0.276 0.724
#> SRR772661 1 0.7745 0.6461 0.772 0.228
#> SRR772662 2 1.0000 0.2261 0.500 0.500
#> SRR772663 1 0.9988 -0.1348 0.520 0.480
#> SRR772664 2 0.8763 0.7381 0.296 0.704
#> SRR772665 2 0.8763 0.7383 0.296 0.704
#> SRR772666 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.5842 0.7101 0.140 0.860
#> SRR772668 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.6332 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.9909 0.4489 0.444 0.556
#> SRR772671 2 0.9896 0.4672 0.440 0.560
#> SRR772672 2 0.8267 0.7508 0.260 0.740
#> SRR772673 2 0.8267 0.7508 0.260 0.740
#> SRR772674 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.9087 0.4850 0.676 0.324
#> SRR772676 2 0.9881 0.4724 0.436 0.564
#> SRR772677 2 0.9881 0.4739 0.436 0.564
#> SRR772678 1 0.9323 0.4292 0.652 0.348
#> SRR772679 1 1.0000 -0.2158 0.504 0.496
#> SRR772680 1 0.9977 -0.0905 0.528 0.472
#> SRR772681 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.8386 0.7492 0.268 0.732
#> SRR772683 2 0.8386 0.7493 0.268 0.732
#> SRR772685 2 0.9000 0.7243 0.316 0.684
#> SRR772686 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0376 0.6368 0.004 0.996
#> SRR772689 2 0.0376 0.6368 0.004 0.996
#> SRR772690 1 0.0000 0.7114 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.8955 0.6949 0.312 0.688
#> SRR772692 1 0.9996 -0.1896 0.512 0.488
#> SRR772693 2 0.9881 0.4784 0.436 0.564
#> SRR772694 2 0.8861 0.7328 0.304 0.696
#> SRR772695 2 0.9552 0.6331 0.376 0.624
#> SRR772696 2 0.9358 0.6773 0.352 0.648
#> SRR772697 2 0.9358 0.6773 0.352 0.648
#> SRR772698 1 0.0672 0.7173 0.992 0.008
#> SRR772699 1 0.6623 0.7461 0.828 0.172
#> SRR772700 1 0.6623 0.7460 0.828 0.172
#> SRR772701 1 0.7815 0.6921 0.768 0.232
#> SRR772702 1 0.7950 0.6811 0.760 0.240
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.5650 0.4554 0.688 0.000 0.312
#> SRR772342 1 0.5397 0.4954 0.720 0.000 0.280
#> SRR772343 1 0.5096 0.6463 0.836 0.080 0.084
#> SRR772344 1 0.5948 0.4521 0.640 0.360 0.000
#> SRR772345 1 0.5926 0.4590 0.644 0.356 0.000
#> SRR772346 1 0.5020 0.6384 0.836 0.108 0.056
#> SRR772347 1 0.5263 0.6362 0.824 0.116 0.060
#> SRR772348 1 0.6180 0.3218 0.584 0.416 0.000
#> SRR772349 1 0.6180 0.3218 0.584 0.416 0.000
#> SRR772350 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772351 1 0.6140 0.3344 0.596 0.404 0.000
#> SRR772352 1 0.5882 0.4570 0.652 0.348 0.000
#> SRR772353 1 0.5455 0.6149 0.788 0.184 0.028
#> SRR772354 1 0.5455 0.6149 0.788 0.184 0.028
#> SRR772355 1 0.6126 0.3716 0.600 0.400 0.000
#> SRR772356 1 0.6126 0.3716 0.600 0.400 0.000
#> SRR772357 1 0.5378 0.5440 0.756 0.008 0.236
#> SRR772358 1 0.5480 0.5145 0.732 0.004 0.264
#> SRR772359 1 0.4768 0.6411 0.848 0.052 0.100
#> SRR772360 1 0.5656 0.6431 0.804 0.128 0.068
#> SRR772361 3 0.3038 0.9166 0.104 0.000 0.896
#> SRR772362 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772363 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772364 1 0.5497 0.6336 0.812 0.124 0.064
#> SRR772365 1 0.5276 0.6335 0.820 0.128 0.052
#> SRR772366 3 0.3192 0.9133 0.112 0.000 0.888
#> SRR772367 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772368 1 0.5882 0.4409 0.652 0.348 0.000
#> SRR772369 1 0.5551 0.6028 0.768 0.212 0.020
#> SRR772370 1 0.5860 0.5965 0.748 0.228 0.024
#> SRR772371 1 0.5659 0.6245 0.796 0.152 0.052
#> SRR772372 1 0.5719 0.6232 0.792 0.156 0.052
#> SRR772373 1 0.5560 0.5177 0.700 0.300 0.000
#> SRR772374 1 0.5621 0.5104 0.692 0.308 0.000
#> SRR772375 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772376 1 0.6062 0.4103 0.616 0.384 0.000
#> SRR772377 1 0.6487 0.5003 0.700 0.032 0.268
#> SRR772378 1 0.4035 0.6445 0.880 0.080 0.040
#> SRR772379 1 0.4139 0.6332 0.860 0.124 0.016
#> SRR772380 1 0.3933 0.6424 0.880 0.092 0.028
#> SRR772381 3 0.0892 0.9437 0.020 0.000 0.980
#> SRR772382 1 0.5497 0.4688 0.708 0.000 0.292
#> SRR772383 1 0.5397 0.4804 0.720 0.000 0.280
#> SRR772384 1 0.6487 0.5003 0.700 0.032 0.268
#> SRR772385 1 0.5560 0.4744 0.700 0.300 0.000
#> SRR772386 1 0.5864 0.5409 0.704 0.288 0.008
#> SRR772387 1 0.5928 0.5313 0.696 0.296 0.008
#> SRR772388 1 0.6180 0.2774 0.584 0.000 0.416
#> SRR772389 1 0.6168 0.2877 0.588 0.000 0.412
#> SRR772390 3 0.3192 0.9133 0.112 0.000 0.888
#> SRR772391 1 0.5968 0.3732 0.636 0.000 0.364
#> SRR772392 1 0.5968 0.3732 0.636 0.000 0.364
#> SRR772393 1 0.6053 0.5646 0.720 0.260 0.020
#> SRR772394 1 0.5977 0.5709 0.728 0.252 0.020
#> SRR772395 1 0.5968 0.4306 0.636 0.364 0.000
#> SRR772396 1 0.6111 0.3091 0.604 0.000 0.396
#> SRR772397 1 0.6111 0.3080 0.604 0.000 0.396
#> SRR772398 1 0.4351 0.6006 0.828 0.004 0.168
#> SRR772399 1 0.4351 0.6006 0.828 0.004 0.168
#> SRR772400 1 0.6126 0.2996 0.600 0.000 0.400
#> SRR772401 1 0.6168 0.2742 0.588 0.000 0.412
#> SRR772402 2 0.4399 0.7995 0.188 0.812 0.000
#> SRR772403 2 0.4346 0.8048 0.184 0.816 0.000
#> SRR772404 1 0.5835 0.4537 0.660 0.340 0.000
#> SRR772405 1 0.6482 0.4602 0.680 0.024 0.296
#> SRR772406 1 0.5397 0.5415 0.720 0.280 0.000
#> SRR772407 1 0.5497 0.5293 0.708 0.292 0.000
#> SRR772408 2 0.3116 0.8567 0.108 0.892 0.000
#> SRR772409 2 0.3038 0.8577 0.104 0.896 0.000
#> SRR772410 1 0.5412 0.6240 0.796 0.172 0.032
#> SRR772411 1 0.5412 0.6240 0.796 0.172 0.032
#> SRR772412 1 0.5882 0.3923 0.652 0.000 0.348
#> SRR772413 1 0.5882 0.3923 0.652 0.000 0.348
#> SRR772414 3 0.0592 0.9415 0.012 0.000 0.988
#> SRR772415 1 0.5502 0.5726 0.744 0.248 0.008
#> SRR772416 1 0.5775 0.5666 0.728 0.260 0.012
#> SRR772417 1 0.3456 0.6439 0.904 0.060 0.036
#> SRR772418 3 0.3192 0.9133 0.112 0.000 0.888
#> SRR772419 2 0.5178 0.6918 0.256 0.744 0.000
#> SRR772420 2 0.5216 0.6838 0.260 0.740 0.000
#> SRR772421 1 0.5816 0.5990 0.752 0.224 0.024
#> SRR772422 1 0.5816 0.5990 0.752 0.224 0.024
#> SRR772423 2 0.3619 0.8309 0.136 0.864 0.000
#> SRR772424 2 0.3030 0.8443 0.092 0.904 0.004
#> SRR772425 1 0.5706 0.5056 0.680 0.320 0.000
#> SRR772426 1 0.6079 0.3915 0.612 0.388 0.000
#> SRR772427 1 0.6079 0.3915 0.612 0.388 0.000
#> SRR772428 1 0.6168 0.2758 0.588 0.000 0.412
#> SRR772429 1 0.6140 0.2947 0.596 0.000 0.404
#> SRR772430 1 0.5536 0.6060 0.776 0.200 0.024
#> SRR772431 2 0.4452 0.7969 0.192 0.808 0.000
#> SRR772432 2 0.4452 0.7969 0.192 0.808 0.000
#> SRR772433 1 0.6204 0.2459 0.576 0.000 0.424
#> SRR772434 1 0.6204 0.2459 0.576 0.000 0.424
#> SRR772435 1 0.6349 0.6399 0.768 0.140 0.092
#> SRR772436 1 0.6181 0.6427 0.780 0.116 0.104
#> SRR772437 3 0.2356 0.9332 0.072 0.000 0.928
#> SRR772438 1 0.5810 0.4181 0.664 0.000 0.336
#> SRR772439 1 0.5968 0.3733 0.636 0.000 0.364
#> SRR772440 1 0.5503 0.6082 0.772 0.208 0.020
#> SRR772441 1 0.5737 0.5720 0.732 0.256 0.012
#> SRR772442 2 0.4555 0.7847 0.200 0.800 0.000
#> SRR772443 2 0.4555 0.7794 0.200 0.800 0.000
#> SRR772444 1 0.5810 0.3940 0.664 0.000 0.336
#> SRR772445 1 0.5760 0.4047 0.672 0.000 0.328
#> SRR772446 1 0.5591 0.4550 0.696 0.000 0.304
#> SRR772447 1 0.5497 0.4722 0.708 0.000 0.292
#> SRR772448 1 0.5327 0.5541 0.728 0.272 0.000
#> SRR772449 1 0.5560 0.5283 0.700 0.300 0.000
#> SRR772450 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772451 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772452 1 0.5905 0.4011 0.648 0.000 0.352
#> SRR772453 1 0.5760 0.4364 0.672 0.000 0.328
#> SRR772454 1 0.6542 0.6074 0.736 0.060 0.204
#> SRR772455 1 0.4058 0.6460 0.880 0.076 0.044
#> SRR772456 2 0.3116 0.8570 0.108 0.892 0.000
#> SRR772457 2 0.3038 0.8579 0.104 0.896 0.000
#> SRR772458 1 0.5591 0.4544 0.696 0.000 0.304
#> SRR772459 1 0.5529 0.4659 0.704 0.000 0.296
#> SRR772460 2 0.1411 0.8326 0.036 0.964 0.000
#> SRR772461 2 0.1411 0.8326 0.036 0.964 0.000
#> SRR772462 1 0.5859 0.4579 0.656 0.344 0.000
#> SRR772463 1 0.5859 0.4579 0.656 0.344 0.000
#> SRR772464 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772465 1 0.5219 0.6090 0.788 0.196 0.016
#> SRR772466 1 0.5167 0.6100 0.792 0.192 0.016
#> SRR772467 2 0.4178 0.8120 0.172 0.828 0.000
#> SRR772468 2 0.4178 0.8120 0.172 0.828 0.000
#> SRR772469 1 0.5378 0.5420 0.756 0.008 0.236
#> SRR772470 1 0.5285 0.5315 0.752 0.004 0.244
#> SRR772471 1 0.4700 0.5879 0.812 0.008 0.180
#> SRR772472 1 0.4521 0.5870 0.816 0.004 0.180
#> SRR772473 2 0.4931 0.7448 0.232 0.768 0.000
#> SRR772474 2 0.4931 0.7528 0.232 0.768 0.000
#> SRR772475 1 0.5529 0.4829 0.704 0.296 0.000
#> SRR772476 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772477 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772478 1 0.5926 0.3826 0.644 0.000 0.356
#> SRR772479 1 0.5926 0.3826 0.644 0.000 0.356
#> SRR772480 2 0.6244 0.2843 0.440 0.560 0.000
#> SRR772481 2 0.6291 0.1995 0.468 0.532 0.000
#> SRR772482 1 0.6075 0.4562 0.676 0.008 0.316
#> SRR772483 1 0.6075 0.4562 0.676 0.008 0.316
#> SRR772484 1 0.5580 0.5601 0.736 0.256 0.008
#> SRR772485 1 0.5580 0.5601 0.736 0.256 0.008
#> SRR772486 1 0.5785 0.4699 0.696 0.004 0.300
#> SRR772487 1 0.5785 0.4699 0.696 0.004 0.300
#> SRR772488 1 0.5318 0.6013 0.780 0.204 0.016
#> SRR772489 1 0.5318 0.6013 0.780 0.204 0.016
#> SRR772490 1 0.5560 0.4621 0.700 0.000 0.300
#> SRR772491 1 0.6081 0.3971 0.652 0.004 0.344
#> SRR772492 2 0.0237 0.8109 0.004 0.996 0.000
#> SRR772493 2 0.0237 0.8109 0.004 0.996 0.000
#> SRR772494 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772495 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772496 1 0.5722 0.5329 0.704 0.292 0.004
#> SRR772497 1 0.5497 0.5285 0.708 0.292 0.000
#> SRR772498 1 0.6473 0.4765 0.652 0.332 0.016
#> SRR772499 1 0.6473 0.4765 0.652 0.332 0.016
#> SRR772500 1 0.6126 0.3520 0.600 0.400 0.000
#> SRR772501 1 0.6079 0.3763 0.612 0.388 0.000
#> SRR772502 1 0.3993 0.6430 0.884 0.052 0.064
#> SRR772503 1 0.3875 0.6423 0.888 0.044 0.068
#> SRR772504 1 0.5760 0.4867 0.672 0.328 0.000
#> SRR772505 1 0.5859 0.4689 0.656 0.344 0.000
#> SRR772506 2 0.4504 0.7822 0.196 0.804 0.000
#> SRR772507 2 0.4504 0.7822 0.196 0.804 0.000
#> SRR772508 1 0.6045 0.3859 0.620 0.380 0.000
#> SRR772509 1 0.6597 0.5032 0.696 0.036 0.268
#> SRR772510 3 0.0592 0.9415 0.012 0.000 0.988
#> SRR772511 1 0.3456 0.6439 0.904 0.060 0.036
#> SRR772512 3 0.4178 0.8473 0.172 0.000 0.828
#> SRR772513 1 0.5560 0.5135 0.700 0.300 0.000
#> SRR772514 1 0.5560 0.5135 0.700 0.300 0.000
#> SRR772515 1 0.5650 0.5127 0.688 0.312 0.000
#> SRR772516 1 0.5678 0.5047 0.684 0.316 0.000
#> SRR772517 1 0.5465 0.5261 0.712 0.288 0.000
#> SRR772518 1 0.5728 0.5480 0.720 0.272 0.008
#> SRR772519 1 0.5760 0.4875 0.672 0.328 0.000
#> SRR772520 1 0.5678 0.4987 0.684 0.316 0.000
#> SRR772521 1 0.4174 0.6414 0.872 0.092 0.036
#> SRR772522 1 0.4174 0.6414 0.872 0.092 0.036
#> SRR772523 1 0.5760 0.4875 0.672 0.328 0.000
#> SRR772524 1 0.5785 0.4848 0.668 0.332 0.000
#> SRR772525 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772526 2 0.4346 0.7984 0.184 0.816 0.000
#> SRR772527 2 0.4346 0.7984 0.184 0.816 0.000
#> SRR772528 3 0.3192 0.9133 0.112 0.000 0.888
#> SRR772529 1 0.5254 0.4979 0.736 0.000 0.264
#> SRR772530 1 0.5465 0.4825 0.712 0.000 0.288
#> SRR772531 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772532 1 0.5859 0.4736 0.656 0.344 0.000
#> SRR772533 1 0.5859 0.4736 0.656 0.344 0.000
#> SRR772534 1 0.3583 0.6440 0.900 0.056 0.044
#> SRR772535 1 0.6111 0.3527 0.604 0.396 0.000
#> SRR772536 1 0.5760 0.4933 0.672 0.328 0.000
#> SRR772537 2 0.2711 0.8585 0.088 0.912 0.000
#> SRR772538 2 0.3192 0.8583 0.112 0.888 0.000
#> SRR772539 1 0.5529 0.4715 0.704 0.000 0.296
#> SRR772540 1 0.5465 0.4821 0.712 0.000 0.288
#> SRR772541 1 0.5254 0.5484 0.736 0.264 0.000
#> SRR772542 1 0.5517 0.5079 0.728 0.004 0.268
#> SRR772543 1 0.5650 0.4521 0.688 0.000 0.312
#> SRR772544 3 0.1031 0.9437 0.024 0.000 0.976
#> SRR772545 1 0.5650 0.4495 0.688 0.000 0.312
#> SRR772546 1 0.5650 0.4495 0.688 0.000 0.312
#> SRR772547 1 0.4092 0.6386 0.876 0.036 0.088
#> SRR772548 1 0.4371 0.6352 0.860 0.032 0.108
#> SRR772549 1 0.5859 0.4042 0.656 0.000 0.344
#> SRR772550 1 0.5926 0.3851 0.644 0.000 0.356
#> SRR772551 1 0.4504 0.6023 0.804 0.196 0.000
#> SRR772552 1 0.4887 0.5869 0.772 0.228 0.000
#> SRR772553 1 0.5797 0.5071 0.712 0.280 0.008
#> SRR772554 1 0.5733 0.4988 0.676 0.324 0.000
#> SRR772555 1 0.5733 0.4988 0.676 0.324 0.000
#> SRR772556 1 0.5882 0.3959 0.652 0.000 0.348
#> SRR772557 1 0.5882 0.3949 0.652 0.000 0.348
#> SRR772558 1 0.5012 0.5667 0.788 0.008 0.204
#> SRR772559 1 0.5378 0.5414 0.756 0.008 0.236
#> SRR772560 1 0.5939 0.5914 0.748 0.224 0.028
#> SRR772561 3 0.4178 0.8473 0.172 0.000 0.828
#> SRR772562 1 0.5678 0.5007 0.684 0.316 0.000
#> SRR772563 1 0.5678 0.5007 0.684 0.316 0.000
#> SRR772564 1 0.6192 0.2567 0.580 0.000 0.420
#> SRR772565 1 0.6192 0.2567 0.580 0.000 0.420
#> SRR772566 1 0.6260 0.2001 0.552 0.000 0.448
#> SRR772567 1 0.6252 0.2123 0.556 0.000 0.444
#> SRR772568 1 0.5529 0.5239 0.704 0.296 0.000
#> SRR772569 1 0.5560 0.5186 0.700 0.300 0.000
#> SRR772570 1 0.4784 0.5698 0.796 0.004 0.200
#> SRR772571 1 0.4741 0.6198 0.828 0.020 0.152
#> SRR772572 1 0.3888 0.6447 0.888 0.064 0.048
#> SRR772573 1 0.4058 0.6435 0.880 0.076 0.044
#> SRR772574 1 0.5156 0.5527 0.776 0.008 0.216
#> SRR772575 1 0.5585 0.5801 0.772 0.024 0.204
#> SRR772576 1 0.5244 0.5759 0.756 0.240 0.004
#> SRR772577 1 0.5687 0.5948 0.756 0.224 0.020
#> SRR772578 2 0.3879 0.8409 0.152 0.848 0.000
#> SRR772579 2 0.3816 0.8430 0.148 0.852 0.000
#> SRR772580 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772581 1 0.5797 0.5216 0.712 0.280 0.008
#> SRR772582 1 0.5896 0.5062 0.700 0.292 0.008
#> SRR772583 1 0.5201 0.5766 0.760 0.236 0.004
#> SRR772584 1 0.4963 0.6024 0.792 0.200 0.008
#> SRR772585 1 0.5529 0.5184 0.704 0.296 0.000
#> SRR772586 3 0.3340 0.9044 0.120 0.000 0.880
#> SRR772587 1 0.3237 0.6404 0.912 0.032 0.056
#> SRR772588 1 0.5859 0.4623 0.656 0.344 0.000
#> SRR772589 1 0.5859 0.4623 0.656 0.344 0.000
#> SRR772590 3 0.2537 0.9307 0.080 0.000 0.920
#> SRR772591 1 0.6252 0.2102 0.556 0.000 0.444
#> SRR772592 1 0.6260 0.2001 0.552 0.000 0.448
#> SRR772593 3 0.3267 0.9099 0.116 0.000 0.884
#> SRR772594 2 0.3412 0.8541 0.124 0.876 0.000
#> SRR772595 2 0.3412 0.8541 0.124 0.876 0.000
#> SRR772596 3 0.3116 0.9154 0.108 0.000 0.892
#> SRR772597 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772598 1 0.6215 0.2412 0.572 0.000 0.428
#> SRR772599 1 0.6225 0.2330 0.568 0.000 0.432
#> SRR772600 2 0.4291 0.8040 0.180 0.820 0.000
#> SRR772601 2 0.4062 0.8150 0.164 0.836 0.000
#> SRR772602 3 0.1163 0.9433 0.028 0.000 0.972
#> SRR772603 2 0.5016 0.7488 0.240 0.760 0.000
#> SRR772604 2 0.4399 0.8013 0.188 0.812 0.000
#> SRR772605 1 0.5216 0.5534 0.740 0.260 0.000
#> SRR772606 1 0.6192 0.2568 0.580 0.000 0.420
#> SRR772607 1 0.6192 0.2568 0.580 0.000 0.420
#> SRR772608 1 0.5728 0.5478 0.720 0.272 0.008
#> SRR772609 1 0.5728 0.5478 0.720 0.272 0.008
#> SRR772610 1 0.5810 0.4714 0.664 0.336 0.000
#> SRR772611 1 0.5810 0.4714 0.664 0.336 0.000
#> SRR772612 2 0.1399 0.8262 0.028 0.968 0.004
#> SRR772613 2 0.1399 0.8262 0.028 0.968 0.004
#> SRR772614 1 0.6095 0.3181 0.608 0.000 0.392
#> SRR772615 1 0.6126 0.3033 0.600 0.000 0.400
#> SRR772616 1 0.3356 0.6405 0.908 0.036 0.056
#> SRR772617 2 0.2878 0.8411 0.096 0.904 0.000
#> SRR772618 2 0.2878 0.8411 0.096 0.904 0.000
#> SRR772619 2 0.0237 0.8109 0.004 0.996 0.000
#> SRR772620 2 0.0237 0.8109 0.004 0.996 0.000
#> SRR772621 1 0.5728 0.6167 0.772 0.196 0.032
#> SRR772622 1 0.5687 0.5980 0.756 0.224 0.020
#> SRR772623 3 0.0424 0.9396 0.008 0.000 0.992
#> SRR772624 3 0.3192 0.9133 0.112 0.000 0.888
#> SRR772625 1 0.5560 0.4744 0.700 0.300 0.000
#> SRR772626 1 0.6341 0.5060 0.672 0.312 0.016
#> SRR772627 1 0.6497 0.4703 0.648 0.336 0.016
#> SRR772628 1 0.5797 0.5024 0.712 0.008 0.280
#> SRR772629 1 0.5158 0.5475 0.764 0.004 0.232
#> SRR772630 1 0.4288 0.6457 0.872 0.068 0.060
#> SRR772631 3 0.3192 0.9133 0.112 0.000 0.888
#> SRR772632 2 0.6244 0.1962 0.440 0.560 0.000
#> SRR772633 2 0.6215 0.2395 0.428 0.572 0.000
#> SRR772634 1 0.5481 0.6451 0.816 0.108 0.076
#> SRR772635 1 0.5403 0.6429 0.816 0.124 0.060
#> SRR772636 1 0.5560 0.4744 0.700 0.300 0.000
#> SRR772637 1 0.5988 0.3710 0.632 0.000 0.368
#> SRR772638 1 0.6026 0.3564 0.624 0.000 0.376
#> SRR772639 1 0.5678 0.5082 0.684 0.316 0.000
#> SRR772640 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772641 2 0.2796 0.8581 0.092 0.908 0.000
#> SRR772642 1 0.5597 0.6004 0.764 0.216 0.020
#> SRR772643 1 0.5201 0.5813 0.760 0.236 0.004
#> SRR772644 1 0.5220 0.5698 0.780 0.012 0.208
#> SRR772645 1 0.5156 0.5618 0.776 0.008 0.216
#> SRR772646 1 0.5760 0.4906 0.672 0.328 0.000
#> SRR772647 1 0.5760 0.4906 0.672 0.328 0.000
#> SRR772648 1 0.5502 0.5778 0.744 0.248 0.008
#> SRR772649 1 0.5580 0.5707 0.736 0.256 0.008
#> SRR772650 1 0.4628 0.6424 0.856 0.056 0.088
#> SRR772651 1 0.4628 0.6424 0.856 0.056 0.088
#> SRR772652 1 0.5815 0.4664 0.692 0.004 0.304
#> SRR772653 1 0.5815 0.4664 0.692 0.004 0.304
#> SRR772654 1 0.5852 0.6261 0.776 0.180 0.044
#> SRR772655 1 0.5688 0.6300 0.788 0.168 0.044
#> SRR772656 3 0.0892 0.9437 0.020 0.000 0.980
#> SRR772657 3 0.2959 0.9190 0.100 0.000 0.900
#> SRR772658 2 0.0829 0.8123 0.012 0.984 0.004
#> SRR772659 2 0.0829 0.8123 0.012 0.984 0.004
#> SRR772660 1 0.5706 0.4904 0.680 0.320 0.000
#> SRR772661 1 0.6950 -0.0794 0.508 0.016 0.476
#> SRR772662 1 0.6091 0.6451 0.784 0.124 0.092
#> SRR772663 1 0.6184 0.6449 0.780 0.112 0.108
#> SRR772664 1 0.5873 0.5238 0.684 0.312 0.004
#> SRR772665 1 0.5902 0.5186 0.680 0.316 0.004
#> SRR772666 3 0.0892 0.9436 0.020 0.000 0.980
#> SRR772667 2 0.6298 0.3591 0.388 0.608 0.004
#> SRR772668 2 0.0424 0.7994 0.000 0.992 0.008
#> SRR772669 2 0.0424 0.7994 0.000 0.992 0.008
#> SRR772670 1 0.4779 0.6379 0.840 0.124 0.036
#> SRR772671 1 0.4848 0.6365 0.836 0.128 0.036
#> SRR772672 1 0.5706 0.4888 0.680 0.320 0.000
#> SRR772673 1 0.5706 0.4888 0.680 0.320 0.000
#> SRR772674 3 0.0892 0.9437 0.020 0.000 0.980
#> SRR772675 1 0.6451 0.4655 0.684 0.024 0.292
#> SRR772676 1 0.4662 0.6354 0.844 0.124 0.032
#> SRR772677 1 0.4848 0.6355 0.836 0.128 0.036
#> SRR772678 1 0.6487 0.5003 0.700 0.032 0.268
#> SRR772679 1 0.4902 0.6461 0.844 0.092 0.064
#> SRR772680 1 0.4838 0.6457 0.848 0.076 0.076
#> SRR772681 3 0.0892 0.9437 0.020 0.000 0.980
#> SRR772682 1 0.5785 0.4786 0.668 0.332 0.000
#> SRR772683 1 0.5733 0.4886 0.676 0.324 0.000
#> SRR772685 1 0.5831 0.5457 0.708 0.284 0.008
#> SRR772686 3 0.0592 0.9415 0.012 0.000 0.988
#> SRR772687 3 0.0592 0.9413 0.012 0.000 0.988
#> SRR772688 2 0.2959 0.8585 0.100 0.900 0.000
#> SRR772689 2 0.2959 0.8585 0.100 0.900 0.000
#> SRR772690 3 0.1031 0.9438 0.024 0.000 0.976
#> SRR772691 1 0.5560 0.4744 0.700 0.300 0.000
#> SRR772692 1 0.5710 0.6445 0.804 0.116 0.080
#> SRR772693 1 0.5407 0.6326 0.804 0.156 0.040
#> SRR772694 1 0.5465 0.5434 0.712 0.288 0.000
#> SRR772695 1 0.4915 0.6129 0.804 0.184 0.012
#> SRR772696 1 0.5843 0.5806 0.732 0.252 0.016
#> SRR772697 1 0.5843 0.5806 0.732 0.252 0.016
#> SRR772698 3 0.3192 0.9133 0.112 0.000 0.888
#> SRR772699 1 0.5733 0.4333 0.676 0.000 0.324
#> SRR772700 1 0.5733 0.4304 0.676 0.000 0.324
#> SRR772701 1 0.5138 0.5163 0.748 0.000 0.252
#> SRR772702 1 0.5325 0.5214 0.748 0.004 0.248
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.344 0.8537 0.840 0.152 0.004 0.004
#> SRR772342 1 0.401 0.8272 0.788 0.204 0.004 0.004
#> SRR772343 2 0.537 0.1654 0.440 0.548 0.000 0.012
#> SRR772344 2 0.274 0.6867 0.012 0.892 0.000 0.096
#> SRR772345 2 0.268 0.6892 0.012 0.896 0.000 0.092
#> SRR772346 2 0.617 0.1687 0.420 0.528 0.000 0.052
#> SRR772347 2 0.624 0.1496 0.424 0.520 0.000 0.056
#> SRR772348 2 0.344 0.6104 0.004 0.840 0.004 0.152
#> SRR772349 2 0.344 0.6104 0.004 0.840 0.004 0.152
#> SRR772350 3 0.249 0.8267 0.048 0.000 0.916 0.036
#> SRR772351 2 0.305 0.6309 0.004 0.860 0.000 0.136
#> SRR772352 2 0.302 0.6993 0.024 0.884 0.000 0.092
#> SRR772353 2 0.415 0.7103 0.180 0.800 0.004 0.016
#> SRR772354 2 0.415 0.7103 0.180 0.800 0.004 0.016
#> SRR772355 2 0.366 0.6458 0.020 0.836 0.000 0.144
#> SRR772356 2 0.371 0.6420 0.020 0.832 0.000 0.148
#> SRR772357 1 0.478 0.7712 0.732 0.248 0.004 0.016
#> SRR772358 1 0.430 0.8091 0.768 0.220 0.004 0.008
#> SRR772359 2 0.559 -0.0562 0.480 0.504 0.008 0.008
#> SRR772360 2 0.515 0.5323 0.320 0.664 0.008 0.008
#> SRR772361 3 0.431 0.8181 0.132 0.008 0.820 0.040
#> SRR772362 4 0.416 0.8374 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772363 4 0.416 0.8374 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772364 2 0.636 0.1065 0.436 0.508 0.004 0.052
#> SRR772365 2 0.634 0.1683 0.420 0.524 0.004 0.052
#> SRR772366 3 0.529 0.6406 0.440 0.004 0.552 0.004
#> SRR772367 3 0.316 0.8482 0.108 0.000 0.872 0.020
#> SRR772368 2 0.400 0.6750 0.044 0.844 0.008 0.104
#> SRR772369 2 0.296 0.7418 0.116 0.876 0.004 0.004
#> SRR772370 2 0.334 0.7421 0.124 0.860 0.004 0.012
#> SRR772371 2 0.644 0.2266 0.404 0.532 0.004 0.060
#> SRR772372 2 0.650 0.2270 0.404 0.528 0.004 0.064
#> SRR772373 2 0.210 0.7189 0.020 0.936 0.004 0.040
#> SRR772374 2 0.236 0.7170 0.020 0.924 0.004 0.052
#> SRR772375 3 0.316 0.8482 0.108 0.000 0.872 0.020
#> SRR772376 2 0.310 0.6675 0.012 0.868 0.000 0.120
#> SRR772377 2 0.823 0.1781 0.316 0.480 0.164 0.040
#> SRR772378 2 0.524 0.4219 0.356 0.628 0.000 0.016
#> SRR772379 2 0.447 0.6672 0.212 0.768 0.004 0.016
#> SRR772380 2 0.497 0.5562 0.292 0.692 0.004 0.012
#> SRR772381 3 0.240 0.8281 0.048 0.000 0.920 0.032
#> SRR772382 1 0.377 0.8473 0.820 0.168 0.004 0.008
#> SRR772383 1 0.403 0.8388 0.804 0.180 0.004 0.012
#> SRR772384 2 0.825 0.1640 0.320 0.476 0.164 0.040
#> SRR772385 2 0.595 0.5769 0.092 0.720 0.016 0.172
#> SRR772386 2 0.267 0.7321 0.048 0.908 0.000 0.044
#> SRR772387 2 0.250 0.7279 0.040 0.916 0.000 0.044
#> SRR772388 1 0.236 0.7956 0.920 0.056 0.024 0.000
#> SRR772389 1 0.244 0.8006 0.916 0.060 0.024 0.000
#> SRR772390 3 0.529 0.6406 0.440 0.004 0.552 0.004
#> SRR772391 1 0.261 0.8364 0.896 0.096 0.008 0.000
#> SRR772392 1 0.261 0.8364 0.896 0.096 0.008 0.000
#> SRR772393 2 0.599 0.6351 0.216 0.688 0.004 0.092
#> SRR772394 2 0.596 0.6385 0.220 0.688 0.004 0.088
#> SRR772395 2 0.261 0.6748 0.008 0.896 0.000 0.096
#> SRR772396 1 0.247 0.8219 0.908 0.080 0.012 0.000
#> SRR772397 1 0.225 0.8149 0.920 0.068 0.012 0.000
#> SRR772398 1 0.549 0.5008 0.604 0.376 0.004 0.016
#> SRR772399 1 0.549 0.5008 0.604 0.376 0.004 0.016
#> SRR772400 1 0.293 0.8179 0.896 0.076 0.024 0.004
#> SRR772401 1 0.281 0.8040 0.904 0.064 0.028 0.004
#> SRR772402 4 0.496 0.7273 0.004 0.380 0.000 0.616
#> SRR772403 4 0.498 0.7263 0.004 0.384 0.000 0.612
#> SRR772404 2 0.373 0.6850 0.040 0.860 0.008 0.092
#> SRR772405 2 0.829 0.0957 0.332 0.456 0.176 0.036
#> SRR772406 2 0.223 0.7294 0.036 0.928 0.000 0.036
#> SRR772407 2 0.231 0.7280 0.032 0.924 0.000 0.044
#> SRR772408 4 0.436 0.8291 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR772409 4 0.436 0.8308 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR772410 2 0.462 0.6810 0.204 0.764 0.000 0.032
#> SRR772411 2 0.462 0.6810 0.204 0.764 0.000 0.032
#> SRR772412 1 0.247 0.8387 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR772413 1 0.247 0.8387 0.900 0.096 0.000 0.004
#> SRR772414 3 0.305 0.8484 0.108 0.000 0.876 0.016
#> SRR772415 2 0.297 0.7426 0.096 0.884 0.000 0.020
#> SRR772416 2 0.302 0.7424 0.092 0.884 0.000 0.024
#> SRR772417 2 0.536 0.3876 0.360 0.620 0.000 0.020
#> SRR772418 3 0.529 0.6406 0.440 0.004 0.552 0.004
#> SRR772419 4 0.500 0.5493 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR772420 4 0.500 0.5378 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR772421 2 0.317 0.7411 0.112 0.872 0.004 0.012
#> SRR772422 2 0.317 0.7411 0.112 0.872 0.004 0.012
#> SRR772423 4 0.461 0.7890 0.004 0.304 0.000 0.692
#> SRR772424 4 0.412 0.8127 0.004 0.236 0.000 0.760
#> SRR772425 2 0.202 0.7114 0.012 0.932 0.000 0.056
#> SRR772426 2 0.277 0.6527 0.004 0.880 0.000 0.116
#> SRR772427 2 0.277 0.6527 0.004 0.880 0.000 0.116
#> SRR772428 1 0.216 0.7919 0.932 0.048 0.016 0.004
#> SRR772429 1 0.233 0.8017 0.924 0.056 0.016 0.004
#> SRR772430 2 0.365 0.7242 0.136 0.844 0.008 0.012
#> SRR772431 4 0.508 0.7289 0.008 0.376 0.000 0.616
#> SRR772432 4 0.508 0.7289 0.008 0.376 0.000 0.616
#> SRR772433 1 0.249 0.7860 0.920 0.048 0.028 0.004
#> SRR772434 1 0.249 0.7860 0.920 0.048 0.028 0.004
#> SRR772435 2 0.515 0.5180 0.348 0.640 0.004 0.008
#> SRR772436 2 0.540 0.4168 0.384 0.600 0.004 0.012
#> SRR772437 3 0.349 0.8291 0.092 0.004 0.868 0.036
#> SRR772438 1 0.363 0.8396 0.848 0.128 0.020 0.004
#> SRR772439 1 0.328 0.8324 0.872 0.104 0.020 0.004
#> SRR772440 2 0.368 0.7375 0.132 0.844 0.004 0.020
#> SRR772441 2 0.284 0.7423 0.088 0.892 0.000 0.020
#> SRR772442 4 0.510 0.7095 0.008 0.380 0.000 0.612
#> SRR772443 4 0.510 0.7086 0.008 0.380 0.000 0.612
#> SRR772444 1 0.311 0.8393 0.880 0.100 0.004 0.016
#> SRR772445 1 0.329 0.8431 0.868 0.112 0.004 0.016
#> SRR772446 1 0.353 0.8509 0.836 0.152 0.000 0.012
#> SRR772447 1 0.372 0.8425 0.820 0.168 0.000 0.012
#> SRR772448 2 0.313 0.7409 0.076 0.884 0.000 0.040
#> SRR772449 2 0.284 0.7319 0.048 0.900 0.000 0.052
#> SRR772450 4 0.422 0.8364 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR772451 4 0.422 0.8364 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR772452 1 0.310 0.8452 0.868 0.120 0.012 0.000
#> SRR772453 1 0.367 0.8443 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR772454 1 0.530 0.4901 0.612 0.372 0.000 0.016
#> SRR772455 2 0.531 0.3691 0.376 0.608 0.000 0.016
#> SRR772456 4 0.436 0.8294 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR772457 4 0.433 0.8314 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR772458 1 0.345 0.8515 0.836 0.156 0.000 0.008
#> SRR772459 1 0.354 0.8505 0.828 0.164 0.000 0.008
#> SRR772460 4 0.331 0.8011 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772461 4 0.331 0.8011 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772462 2 0.179 0.6900 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772463 2 0.179 0.6900 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772464 3 0.304 0.8468 0.100 0.000 0.880 0.020
#> SRR772465 2 0.376 0.7373 0.116 0.848 0.004 0.032
#> SRR772466 2 0.361 0.7376 0.112 0.856 0.004 0.028
#> SRR772467 4 0.479 0.7478 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR772468 4 0.479 0.7478 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR772469 1 0.451 0.7537 0.724 0.268 0.000 0.008
#> SRR772470 1 0.463 0.7666 0.728 0.260 0.004 0.008
#> SRR772471 1 0.511 0.6399 0.656 0.328 0.000 0.016
#> SRR772472 1 0.503 0.6625 0.672 0.312 0.000 0.016
#> SRR772473 4 0.523 0.6367 0.008 0.428 0.000 0.564
#> SRR772474 4 0.524 0.6331 0.008 0.436 0.000 0.556
#> SRR772475 2 0.597 0.5784 0.096 0.720 0.016 0.168
#> SRR772476 4 0.419 0.8368 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR772477 4 0.416 0.8374 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772478 1 0.234 0.8416 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.234 0.8416 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.665 -0.0514 0.080 0.548 0.004 0.368
#> SRR772481 2 0.685 0.0401 0.100 0.548 0.004 0.348
#> SRR772482 1 0.412 0.8344 0.796 0.188 0.012 0.004
#> SRR772483 1 0.412 0.8344 0.796 0.188 0.012 0.004
#> SRR772484 2 0.210 0.7329 0.060 0.928 0.000 0.012
#> SRR772485 2 0.210 0.7329 0.060 0.928 0.000 0.012
#> SRR772486 1 0.411 0.8300 0.804 0.176 0.016 0.004
#> SRR772487 1 0.411 0.8300 0.804 0.176 0.016 0.004
#> SRR772488 2 0.357 0.7332 0.132 0.848 0.004 0.016
#> SRR772489 2 0.357 0.7332 0.132 0.848 0.004 0.016
#> SRR772490 1 0.387 0.8518 0.820 0.164 0.008 0.008
#> SRR772491 1 0.304 0.8461 0.876 0.112 0.004 0.008
#> SRR772492 4 0.289 0.7550 0.004 0.124 0.000 0.872
#> SRR772493 4 0.289 0.7550 0.004 0.124 0.000 0.872
#> SRR772494 4 0.416 0.8374 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772495 4 0.416 0.8374 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772496 2 0.241 0.7315 0.040 0.920 0.000 0.040
#> SRR772497 2 0.222 0.7277 0.032 0.928 0.000 0.040
#> SRR772498 2 0.647 0.5834 0.196 0.656 0.004 0.144
#> SRR772499 2 0.647 0.5834 0.196 0.656 0.004 0.144
#> SRR772500 2 0.294 0.6335 0.004 0.868 0.000 0.128
#> SRR772501 2 0.277 0.6478 0.004 0.880 0.000 0.116
#> SRR772502 2 0.552 0.2225 0.412 0.568 0.000 0.020
#> SRR772503 2 0.544 0.1929 0.420 0.564 0.000 0.016
#> SRR772504 2 0.197 0.7037 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772505 2 0.227 0.6943 0.008 0.916 0.000 0.076
#> SRR772506 4 0.487 0.7055 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR772507 4 0.487 0.7055 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR772508 2 0.357 0.6496 0.024 0.856 0.004 0.116
#> SRR772509 2 0.822 0.1891 0.312 0.484 0.164 0.040
#> SRR772510 3 0.280 0.8484 0.100 0.000 0.888 0.012
#> SRR772511 2 0.536 0.3876 0.360 0.620 0.000 0.020
#> SRR772512 3 0.566 0.7551 0.196 0.028 0.732 0.044
#> SRR772513 2 0.115 0.7178 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR772514 2 0.115 0.7178 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR772515 2 0.226 0.7190 0.020 0.924 0.000 0.056
#> SRR772516 2 0.226 0.7158 0.020 0.924 0.000 0.056
#> SRR772517 2 0.130 0.7208 0.016 0.964 0.000 0.020
#> SRR772518 2 0.234 0.7338 0.060 0.920 0.000 0.020
#> SRR772519 2 0.197 0.7039 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772520 2 0.172 0.7083 0.008 0.944 0.000 0.048
#> SRR772521 2 0.501 0.5376 0.292 0.688 0.000 0.020
#> SRR772522 2 0.501 0.5376 0.292 0.688 0.000 0.020
#> SRR772523 2 0.197 0.7038 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772524 2 0.225 0.7032 0.012 0.920 0.000 0.068
#> SRR772525 3 0.316 0.8482 0.108 0.000 0.872 0.020
#> SRR772526 4 0.483 0.7284 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR772527 4 0.483 0.7284 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR772528 3 0.529 0.6406 0.440 0.004 0.552 0.004
#> SRR772529 1 0.432 0.8307 0.784 0.196 0.004 0.016
#> SRR772530 1 0.418 0.8363 0.792 0.192 0.008 0.008
#> SRR772531 3 0.316 0.8482 0.108 0.000 0.872 0.020
#> SRR772532 2 0.247 0.6952 0.012 0.908 0.000 0.080
#> SRR772533 2 0.247 0.6952 0.012 0.908 0.000 0.080
#> SRR772534 2 0.538 0.2873 0.396 0.588 0.000 0.016
#> SRR772535 2 0.332 0.6361 0.012 0.852 0.000 0.136
#> SRR772536 2 0.230 0.7114 0.016 0.920 0.000 0.064
#> SRR772537 4 0.407 0.8376 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772538 4 0.433 0.8337 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR772539 1 0.368 0.8495 0.828 0.160 0.004 0.008
#> SRR772540 1 0.377 0.8456 0.820 0.168 0.004 0.008
#> SRR772541 2 0.324 0.7271 0.064 0.888 0.008 0.040
#> SRR772542 1 0.465 0.7830 0.748 0.232 0.016 0.004
#> SRR772543 1 0.428 0.8335 0.800 0.172 0.024 0.004
#> SRR772544 3 0.301 0.8420 0.080 0.000 0.888 0.032
#> SRR772545 1 0.312 0.8494 0.844 0.156 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.312 0.8494 0.844 0.156 0.000 0.000
#> SRR772547 1 0.561 0.1388 0.492 0.488 0.000 0.020
#> SRR772548 1 0.559 0.2551 0.524 0.456 0.000 0.020
#> SRR772549 1 0.309 0.8478 0.864 0.128 0.008 0.000
#> SRR772550 1 0.298 0.8434 0.880 0.108 0.008 0.004
#> SRR772551 2 0.487 0.7037 0.180 0.764 0.000 0.056
#> SRR772552 2 0.514 0.7029 0.172 0.752 0.000 0.076
#> SRR772553 2 0.607 0.5865 0.108 0.720 0.020 0.152
#> SRR772554 2 0.230 0.7107 0.016 0.920 0.000 0.064
#> SRR772555 2 0.230 0.7107 0.016 0.920 0.000 0.064
#> SRR772556 1 0.298 0.8422 0.880 0.108 0.008 0.004
#> SRR772557 1 0.298 0.8424 0.880 0.108 0.008 0.004
#> SRR772558 1 0.486 0.7215 0.700 0.284 0.000 0.016
#> SRR772559 1 0.445 0.7617 0.732 0.260 0.000 0.008
#> SRR772560 2 0.547 0.6871 0.200 0.732 0.008 0.060
#> SRR772561 3 0.566 0.7551 0.196 0.028 0.732 0.044
#> SRR772562 2 0.172 0.7086 0.008 0.944 0.000 0.048
#> SRR772563 2 0.172 0.7086 0.008 0.944 0.000 0.048
#> SRR772564 1 0.228 0.7919 0.924 0.052 0.024 0.000
#> SRR772565 1 0.228 0.7919 0.924 0.052 0.024 0.000
#> SRR772566 1 0.241 0.7648 0.920 0.040 0.040 0.000
#> SRR772567 1 0.232 0.7679 0.924 0.040 0.036 0.000
#> SRR772568 2 0.230 0.7225 0.028 0.924 0.000 0.048
#> SRR772569 2 0.220 0.7197 0.024 0.928 0.000 0.048
#> SRR772570 1 0.474 0.6665 0.668 0.328 0.000 0.004
#> SRR772571 1 0.510 0.5203 0.612 0.380 0.000 0.008
#> SRR772572 2 0.527 0.3778 0.364 0.620 0.000 0.016
#> SRR772573 2 0.542 0.4114 0.352 0.624 0.000 0.024
#> SRR772574 1 0.506 0.7257 0.692 0.288 0.004 0.016
#> SRR772575 1 0.538 0.5981 0.632 0.348 0.004 0.016
#> SRR772576 2 0.260 0.7409 0.068 0.908 0.000 0.024
#> SRR772577 2 0.334 0.7416 0.120 0.860 0.000 0.020
#> SRR772578 4 0.478 0.8077 0.004 0.336 0.000 0.660
#> SRR772579 4 0.476 0.8098 0.004 0.332 0.000 0.664
#> SRR772580 3 0.316 0.8482 0.108 0.000 0.872 0.020
#> SRR772581 2 0.631 0.6122 0.188 0.672 0.004 0.136
#> SRR772582 2 0.624 0.6143 0.176 0.680 0.004 0.140
#> SRR772583 2 0.326 0.7412 0.096 0.876 0.004 0.024
#> SRR772584 2 0.384 0.7322 0.144 0.832 0.004 0.020
#> SRR772585 2 0.295 0.7208 0.048 0.900 0.004 0.048
#> SRR772586 3 0.530 0.6316 0.448 0.004 0.544 0.004
#> SRR772587 2 0.576 0.0171 0.456 0.520 0.004 0.020
#> SRR772588 2 0.179 0.6908 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772589 2 0.179 0.6908 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772590 3 0.391 0.8287 0.120 0.004 0.840 0.036
#> SRR772591 1 0.232 0.7679 0.924 0.040 0.036 0.000
#> SRR772592 1 0.241 0.7648 0.920 0.040 0.040 0.000
#> SRR772593 3 0.530 0.6334 0.444 0.004 0.548 0.004
#> SRR772594 4 0.438 0.8306 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR772595 4 0.438 0.8306 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR772596 3 0.528 0.6459 0.436 0.004 0.556 0.004
#> SRR772597 3 0.316 0.8482 0.108 0.000 0.872 0.020
#> SRR772598 1 0.258 0.7834 0.916 0.048 0.032 0.004
#> SRR772599 1 0.250 0.7790 0.920 0.044 0.032 0.004
#> SRR772600 4 0.506 0.7342 0.008 0.368 0.000 0.624
#> SRR772601 4 0.485 0.7507 0.004 0.352 0.000 0.644
#> SRR772602 3 0.301 0.8416 0.080 0.000 0.888 0.032
#> SRR772603 4 0.535 0.6314 0.012 0.432 0.000 0.556
#> SRR772604 4 0.498 0.7180 0.004 0.384 0.000 0.612
#> SRR772605 2 0.391 0.7270 0.088 0.852 0.008 0.052
#> SRR772606 1 0.257 0.7914 0.916 0.052 0.028 0.004
#> SRR772607 1 0.257 0.7914 0.916 0.052 0.028 0.004
#> SRR772608 2 0.247 0.7332 0.052 0.920 0.004 0.024
#> SRR772609 2 0.255 0.7344 0.056 0.916 0.004 0.024
#> SRR772610 2 0.212 0.7012 0.008 0.924 0.000 0.068
#> SRR772611 2 0.212 0.7012 0.008 0.924 0.000 0.068
#> SRR772612 4 0.317 0.7879 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR772613 4 0.327 0.7928 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR772614 1 0.259 0.8236 0.904 0.080 0.016 0.000
#> SRR772615 1 0.271 0.8202 0.900 0.080 0.020 0.000
#> SRR772616 2 0.585 0.0326 0.452 0.520 0.004 0.024
#> SRR772617 4 0.419 0.8049 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR772618 4 0.419 0.8049 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR772619 4 0.289 0.7550 0.004 0.124 0.000 0.872
#> SRR772620 4 0.289 0.7550 0.004 0.124 0.000 0.872
#> SRR772621 2 0.411 0.7207 0.176 0.804 0.004 0.016
#> SRR772622 2 0.374 0.7384 0.128 0.844 0.004 0.024
#> SRR772623 3 0.249 0.8267 0.048 0.000 0.916 0.036
#> SRR772624 3 0.529 0.6406 0.440 0.004 0.552 0.004
#> SRR772625 2 0.595 0.5769 0.092 0.720 0.016 0.172
#> SRR772626 2 0.640 0.6016 0.204 0.660 0.004 0.132
#> SRR772627 2 0.648 0.5779 0.192 0.656 0.004 0.148
#> SRR772628 1 0.428 0.8081 0.764 0.224 0.012 0.000
#> SRR772629 1 0.472 0.7505 0.716 0.272 0.008 0.004
#> SRR772630 2 0.558 0.2745 0.400 0.576 0.000 0.024
#> SRR772631 3 0.529 0.6406 0.440 0.004 0.552 0.004
#> SRR772632 2 0.465 0.2114 0.004 0.684 0.000 0.312
#> SRR772633 2 0.472 0.1726 0.004 0.672 0.000 0.324
#> SRR772634 2 0.517 0.5224 0.324 0.660 0.008 0.008
#> SRR772635 2 0.480 0.5954 0.284 0.704 0.008 0.004
#> SRR772636 2 0.595 0.5769 0.092 0.720 0.016 0.172
#> SRR772637 1 0.280 0.8356 0.888 0.100 0.012 0.000
#> SRR772638 1 0.268 0.8315 0.896 0.092 0.012 0.000
#> SRR772639 2 0.194 0.7121 0.012 0.936 0.000 0.052
#> SRR772640 4 0.416 0.8374 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772641 4 0.416 0.8374 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772642 2 0.316 0.7435 0.124 0.864 0.000 0.012
#> SRR772643 2 0.264 0.7434 0.076 0.904 0.000 0.020
#> SRR772644 1 0.513 0.6977 0.680 0.300 0.004 0.016
#> SRR772645 1 0.472 0.7019 0.692 0.300 0.000 0.008
#> SRR772646 2 0.197 0.7069 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772647 2 0.210 0.7088 0.012 0.928 0.000 0.060
#> SRR772648 2 0.286 0.7413 0.072 0.900 0.004 0.024
#> SRR772649 2 0.271 0.7400 0.064 0.908 0.004 0.024
#> SRR772650 2 0.551 0.2183 0.424 0.560 0.004 0.012
#> SRR772651 2 0.551 0.2183 0.424 0.560 0.004 0.012
#> SRR772652 1 0.368 0.8427 0.820 0.172 0.004 0.004
#> SRR772653 1 0.372 0.8397 0.816 0.176 0.004 0.004
#> SRR772654 2 0.426 0.6923 0.200 0.784 0.008 0.008
#> SRR772655 2 0.437 0.6807 0.212 0.772 0.008 0.008
#> SRR772656 3 0.231 0.8254 0.044 0.000 0.924 0.032
#> SRR772657 3 0.426 0.8208 0.128 0.008 0.824 0.040
#> SRR772658 4 0.329 0.7629 0.004 0.140 0.004 0.852
#> SRR772659 4 0.329 0.7629 0.004 0.140 0.004 0.852
#> SRR772660 2 0.365 0.7108 0.056 0.868 0.008 0.068
#> SRR772661 1 0.871 -0.0104 0.372 0.288 0.304 0.036
#> SRR772662 2 0.515 0.4640 0.348 0.640 0.004 0.008
#> SRR772663 2 0.553 0.3630 0.388 0.592 0.004 0.016
#> SRR772664 2 0.307 0.7286 0.044 0.888 0.000 0.068
#> SRR772665 2 0.330 0.7256 0.048 0.876 0.000 0.076
#> SRR772666 3 0.321 0.8493 0.104 0.000 0.872 0.024
#> SRR772667 2 0.593 -0.1002 0.016 0.592 0.020 0.372
#> SRR772668 4 0.349 0.6991 0.016 0.092 0.020 0.872
#> SRR772669 4 0.349 0.6991 0.016 0.092 0.020 0.872
#> SRR772670 2 0.506 0.6010 0.272 0.704 0.004 0.020
#> SRR772671 2 0.495 0.6051 0.272 0.708 0.004 0.016
#> SRR772672 2 0.229 0.7098 0.012 0.924 0.004 0.060
#> SRR772673 2 0.241 0.7124 0.016 0.920 0.004 0.060
#> SRR772674 3 0.240 0.8281 0.048 0.000 0.920 0.032
#> SRR772675 2 0.827 0.1252 0.324 0.464 0.176 0.036
#> SRR772676 2 0.482 0.6226 0.240 0.736 0.004 0.020
#> SRR772677 2 0.485 0.6179 0.244 0.732 0.004 0.020
#> SRR772678 2 0.825 0.1640 0.320 0.476 0.164 0.040
#> SRR772679 2 0.521 0.4344 0.364 0.624 0.004 0.008
#> SRR772680 2 0.544 0.3298 0.396 0.588 0.004 0.012
#> SRR772681 3 0.240 0.8281 0.048 0.000 0.920 0.032
#> SRR772682 2 0.225 0.7024 0.012 0.920 0.000 0.068
#> SRR772683 2 0.202 0.7115 0.012 0.932 0.000 0.056
#> SRR772685 2 0.302 0.7363 0.056 0.896 0.004 0.044
#> SRR772686 3 0.280 0.8485 0.100 0.000 0.888 0.012
#> SRR772687 3 0.506 0.7787 0.284 0.000 0.692 0.024
#> SRR772688 4 0.416 0.8388 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772689 4 0.416 0.8388 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772690 3 0.297 0.8488 0.096 0.000 0.884 0.020
#> SRR772691 2 0.595 0.5769 0.092 0.720 0.016 0.172
#> SRR772692 2 0.525 0.5025 0.340 0.644 0.008 0.008
#> SRR772693 2 0.451 0.6564 0.244 0.744 0.004 0.008
#> SRR772694 2 0.373 0.7383 0.076 0.860 0.004 0.060
#> SRR772695 2 0.389 0.7337 0.148 0.828 0.004 0.020
#> SRR772696 2 0.353 0.7422 0.100 0.864 0.004 0.032
#> SRR772697 2 0.346 0.7420 0.096 0.868 0.004 0.032
#> SRR772698 3 0.529 0.6406 0.440 0.004 0.552 0.004
#> SRR772699 1 0.368 0.8482 0.828 0.160 0.008 0.004
#> SRR772700 1 0.390 0.8490 0.824 0.156 0.012 0.008
#> SRR772701 1 0.451 0.7878 0.744 0.244 0.004 0.008
#> SRR772702 1 0.453 0.7959 0.752 0.232 0.004 0.012
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.298 0.76808 0.868 0.096 0.004 0.000 0.032
#> SRR772342 1 0.380 0.74239 0.808 0.144 0.004 0.000 0.044
#> SRR772343 2 0.556 -0.00304 0.456 0.476 0.000 0.000 0.068
#> SRR772344 2 0.218 0.69234 0.008 0.908 0.000 0.080 0.004
#> SRR772345 2 0.212 0.69468 0.008 0.912 0.000 0.076 0.004
#> SRR772346 1 0.669 0.09186 0.428 0.428 0.000 0.028 0.116
#> SRR772347 1 0.682 0.10585 0.428 0.420 0.000 0.036 0.116
#> SRR772348 2 0.349 0.62084 0.000 0.816 0.000 0.152 0.032
#> SRR772349 2 0.349 0.62084 0.000 0.816 0.000 0.152 0.032
#> SRR772350 3 0.346 0.62885 0.000 0.000 0.828 0.044 0.128
#> SRR772351 2 0.244 0.64845 0.000 0.876 0.000 0.120 0.004
#> SRR772352 2 0.267 0.70243 0.012 0.892 0.000 0.076 0.020
#> SRR772353 2 0.449 0.63025 0.196 0.744 0.000 0.004 0.056
#> SRR772354 2 0.449 0.63025 0.196 0.744 0.000 0.004 0.056
#> SRR772355 2 0.316 0.66419 0.012 0.848 0.000 0.128 0.012
#> SRR772356 2 0.321 0.66105 0.012 0.844 0.000 0.132 0.012
#> SRR772357 1 0.429 0.70802 0.764 0.180 0.004 0.000 0.052
#> SRR772358 1 0.414 0.72781 0.780 0.164 0.004 0.000 0.052
#> SRR772359 1 0.551 0.11689 0.480 0.456 0.000 0.000 0.064
#> SRR772360 2 0.519 0.47319 0.320 0.624 0.000 0.004 0.052
#> SRR772361 3 0.500 0.54768 0.028 0.004 0.624 0.004 0.340
#> SRR772362 4 0.331 0.77927 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772363 4 0.331 0.77927 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772364 1 0.704 0.16227 0.436 0.384 0.000 0.040 0.140
#> SRR772365 1 0.705 0.10792 0.416 0.404 0.000 0.040 0.140
#> SRR772366 3 0.659 0.17064 0.340 0.000 0.440 0.000 0.220
#> SRR772367 3 0.212 0.65149 0.036 0.000 0.924 0.008 0.032
#> SRR772368 2 0.442 0.65723 0.040 0.800 0.000 0.088 0.072
#> SRR772369 2 0.355 0.69547 0.116 0.832 0.000 0.004 0.048
#> SRR772370 2 0.378 0.69783 0.128 0.820 0.000 0.012 0.040
#> SRR772371 2 0.726 -0.08501 0.396 0.400 0.000 0.048 0.156
#> SRR772372 1 0.729 0.07091 0.396 0.396 0.000 0.048 0.160
#> SRR772373 2 0.150 0.71461 0.016 0.952 0.000 0.024 0.008
#> SRR772374 2 0.185 0.71583 0.020 0.936 0.000 0.036 0.008
#> SRR772375 3 0.212 0.65149 0.036 0.000 0.924 0.008 0.032
#> SRR772376 2 0.252 0.67602 0.004 0.884 0.000 0.104 0.008
#> SRR772377 2 0.780 -0.57343 0.188 0.396 0.084 0.000 0.332
#> SRR772378 2 0.561 0.31607 0.360 0.556 0.000 0.000 0.084
#> SRR772379 2 0.459 0.59253 0.220 0.720 0.000 0.000 0.060
#> SRR772380 2 0.507 0.48948 0.300 0.640 0.000 0.000 0.060
#> SRR772381 3 0.349 0.62349 0.004 0.000 0.784 0.004 0.208
#> SRR772382 1 0.308 0.76017 0.852 0.116 0.000 0.000 0.032
#> SRR772383 1 0.331 0.75274 0.836 0.128 0.000 0.000 0.036
#> SRR772384 2 0.782 -0.58595 0.192 0.392 0.084 0.000 0.332
#> SRR772385 2 0.651 0.33439 0.036 0.596 0.000 0.160 0.208
#> SRR772386 2 0.208 0.72086 0.040 0.924 0.000 0.032 0.004
#> SRR772387 2 0.191 0.71882 0.032 0.932 0.000 0.032 0.004
#> SRR772388 1 0.199 0.71076 0.932 0.020 0.032 0.000 0.016
#> SRR772389 1 0.208 0.71573 0.928 0.024 0.032 0.000 0.016
#> SRR772390 3 0.659 0.17064 0.340 0.000 0.440 0.000 0.220
#> SRR772391 1 0.200 0.75080 0.928 0.048 0.012 0.000 0.012
#> SRR772392 1 0.200 0.75080 0.928 0.048 0.012 0.000 0.012
#> SRR772393 2 0.674 0.45264 0.204 0.600 0.000 0.084 0.112
#> SRR772394 2 0.678 0.44471 0.212 0.592 0.000 0.080 0.116
#> SRR772395 2 0.279 0.67741 0.004 0.880 0.000 0.088 0.028
#> SRR772396 1 0.225 0.73926 0.920 0.040 0.020 0.000 0.020
#> SRR772397 1 0.189 0.73218 0.936 0.032 0.016 0.000 0.016
#> SRR772398 1 0.554 0.48626 0.612 0.300 0.004 0.000 0.084
#> SRR772399 1 0.554 0.48626 0.612 0.300 0.004 0.000 0.084
#> SRR772400 1 0.199 0.73140 0.932 0.032 0.016 0.000 0.020
#> SRR772401 1 0.201 0.71997 0.932 0.024 0.020 0.000 0.024
#> SRR772402 4 0.554 0.65376 0.004 0.324 0.000 0.596 0.076
#> SRR772403 4 0.560 0.65408 0.004 0.328 0.000 0.588 0.080
#> SRR772404 2 0.414 0.66476 0.032 0.816 0.000 0.084 0.068
#> SRR772405 2 0.797 -0.62618 0.208 0.380 0.096 0.000 0.316
#> SRR772406 2 0.182 0.71711 0.020 0.940 0.000 0.020 0.020
#> SRR772407 2 0.191 0.71765 0.020 0.936 0.000 0.024 0.020
#> SRR772408 4 0.356 0.77179 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR772409 4 0.356 0.77317 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR772410 2 0.438 0.61569 0.192 0.756 0.000 0.008 0.044
#> SRR772411 2 0.455 0.61531 0.192 0.748 0.000 0.012 0.048
#> SRR772412 1 0.197 0.75168 0.924 0.052 0.000 0.000 0.024
#> SRR772413 1 0.197 0.75168 0.924 0.052 0.000 0.000 0.024
#> SRR772414 3 0.176 0.65523 0.036 0.000 0.940 0.008 0.016
#> SRR772415 2 0.331 0.71467 0.108 0.852 0.000 0.020 0.020
#> SRR772416 2 0.315 0.71919 0.096 0.864 0.000 0.024 0.016
#> SRR772417 2 0.558 0.28308 0.368 0.552 0.000 0.000 0.080
#> SRR772418 3 0.660 0.17076 0.336 0.000 0.440 0.000 0.224
#> SRR772419 4 0.429 0.48842 0.000 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR772420 4 0.430 0.47887 0.000 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR772421 2 0.298 0.70861 0.096 0.868 0.000 0.004 0.032
#> SRR772422 2 0.298 0.70861 0.096 0.868 0.000 0.004 0.032
#> SRR772423 4 0.489 0.69277 0.004 0.232 0.000 0.700 0.064
#> SRR772424 4 0.426 0.72940 0.004 0.184 0.000 0.764 0.048
#> SRR772425 2 0.161 0.71238 0.004 0.944 0.000 0.040 0.012
#> SRR772426 2 0.218 0.66542 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR772427 2 0.218 0.66542 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR772428 1 0.170 0.70958 0.944 0.012 0.016 0.000 0.028
#> SRR772429 1 0.170 0.71672 0.944 0.016 0.012 0.000 0.028
#> SRR772430 2 0.447 0.64598 0.132 0.772 0.000 0.008 0.088
#> SRR772431 4 0.569 0.64697 0.008 0.320 0.000 0.592 0.080
#> SRR772432 4 0.569 0.64697 0.008 0.320 0.000 0.592 0.080
#> SRR772433 1 0.180 0.70300 0.940 0.012 0.020 0.000 0.028
#> SRR772434 1 0.180 0.70300 0.940 0.012 0.020 0.000 0.028
#> SRR772435 2 0.535 0.44578 0.332 0.604 0.000 0.004 0.060
#> SRR772436 2 0.560 0.35168 0.376 0.552 0.000 0.004 0.068
#> SRR772437 3 0.432 0.59383 0.016 0.004 0.720 0.004 0.256
#> SRR772438 1 0.366 0.72828 0.836 0.056 0.012 0.000 0.096
#> SRR772439 1 0.317 0.72264 0.868 0.036 0.016 0.000 0.080
#> SRR772440 2 0.378 0.69706 0.120 0.824 0.000 0.016 0.040
#> SRR772441 2 0.316 0.71721 0.084 0.868 0.000 0.020 0.028
#> SRR772442 4 0.557 0.64213 0.008 0.344 0.000 0.584 0.064
#> SRR772443 4 0.550 0.64444 0.008 0.340 0.000 0.592 0.060
#> SRR772444 1 0.235 0.75477 0.908 0.060 0.004 0.000 0.028
#> SRR772445 1 0.265 0.75885 0.892 0.068 0.004 0.000 0.036
#> SRR772446 1 0.306 0.76416 0.864 0.096 0.004 0.000 0.036
#> SRR772447 1 0.306 0.75950 0.856 0.108 0.000 0.000 0.036
#> SRR772448 2 0.301 0.72347 0.068 0.880 0.000 0.028 0.024
#> SRR772449 2 0.269 0.72252 0.036 0.900 0.000 0.040 0.024
#> SRR772450 4 0.340 0.77867 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR772451 4 0.340 0.77867 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR772452 1 0.283 0.75923 0.888 0.068 0.020 0.000 0.024
#> SRR772453 1 0.346 0.75731 0.844 0.112 0.020 0.000 0.024
#> SRR772454 1 0.500 0.42922 0.636 0.312 0.000 0.000 0.052
#> SRR772455 2 0.563 0.24519 0.392 0.536 0.000 0.004 0.068
#> SRR772456 4 0.353 0.77231 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR772457 4 0.351 0.77426 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR772458 1 0.297 0.76421 0.864 0.108 0.004 0.000 0.024
#> SRR772459 1 0.289 0.76370 0.864 0.116 0.004 0.000 0.016
#> SRR772460 4 0.246 0.71992 0.000 0.112 0.000 0.880 0.008
#> SRR772461 4 0.246 0.71992 0.000 0.112 0.000 0.880 0.008
#> SRR772462 2 0.210 0.70000 0.004 0.916 0.000 0.068 0.012
#> SRR772463 2 0.210 0.70000 0.004 0.916 0.000 0.068 0.012
#> SRR772464 3 0.187 0.65503 0.032 0.000 0.936 0.008 0.024
#> SRR772465 2 0.388 0.69040 0.108 0.820 0.000 0.012 0.060
#> SRR772466 2 0.372 0.69175 0.104 0.828 0.000 0.008 0.060
#> SRR772467 4 0.403 0.69798 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR772468 4 0.403 0.69798 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR772469 1 0.452 0.67800 0.732 0.216 0.004 0.000 0.048
#> SRR772470 1 0.442 0.69081 0.744 0.204 0.004 0.000 0.048
#> SRR772471 1 0.488 0.59525 0.676 0.264 0.000 0.000 0.060
#> SRR772472 1 0.479 0.62203 0.696 0.240 0.000 0.000 0.064
#> SRR772473 4 0.558 0.58996 0.008 0.392 0.000 0.544 0.056
#> SRR772474 4 0.588 0.58384 0.008 0.388 0.000 0.524 0.080
#> SRR772475 2 0.655 0.33197 0.040 0.596 0.000 0.156 0.208
#> SRR772476 4 0.337 0.77884 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR772477 4 0.331 0.77927 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772478 1 0.201 0.75575 0.924 0.056 0.004 0.000 0.016
#> SRR772479 1 0.201 0.75575 0.924 0.056 0.004 0.000 0.016
#> SRR772480 2 0.705 -0.06278 0.084 0.500 0.000 0.328 0.088
#> SRR772481 2 0.718 0.01357 0.100 0.508 0.000 0.300 0.092
#> SRR772482 1 0.343 0.74574 0.832 0.136 0.008 0.000 0.024
#> SRR772483 1 0.343 0.74574 0.832 0.136 0.008 0.000 0.024
#> SRR772484 2 0.271 0.71244 0.064 0.892 0.000 0.008 0.036
#> SRR772485 2 0.271 0.71244 0.064 0.892 0.000 0.008 0.036
#> SRR772486 1 0.414 0.71722 0.804 0.100 0.012 0.000 0.084
#> SRR772487 1 0.414 0.71722 0.804 0.100 0.012 0.000 0.084
#> SRR772488 2 0.390 0.68492 0.124 0.812 0.000 0.008 0.056
#> SRR772489 2 0.390 0.68492 0.124 0.812 0.000 0.008 0.056
#> SRR772490 1 0.340 0.76506 0.844 0.112 0.008 0.000 0.036
#> SRR772491 1 0.252 0.76414 0.900 0.068 0.008 0.000 0.024
#> SRR772492 4 0.250 0.67206 0.004 0.064 0.000 0.900 0.032
#> SRR772493 4 0.250 0.67206 0.004 0.064 0.000 0.900 0.032
#> SRR772494 4 0.331 0.77927 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772495 4 0.331 0.77927 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772496 2 0.207 0.72184 0.032 0.928 0.000 0.028 0.012
#> SRR772497 2 0.187 0.72043 0.028 0.936 0.000 0.028 0.008
#> SRR772498 2 0.726 0.38608 0.184 0.556 0.000 0.132 0.128
#> SRR772499 2 0.726 0.38608 0.184 0.556 0.000 0.132 0.128
#> SRR772500 2 0.218 0.65319 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR772501 2 0.202 0.66537 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR772502 2 0.599 0.13085 0.400 0.504 0.000 0.008 0.088
#> SRR772503 2 0.590 0.08345 0.412 0.496 0.000 0.004 0.088
#> SRR772504 2 0.144 0.70603 0.004 0.948 0.000 0.044 0.004
#> SRR772505 2 0.173 0.69800 0.004 0.932 0.000 0.060 0.004
#> SRR772506 4 0.414 0.64780 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR772507 4 0.414 0.64780 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR772508 2 0.401 0.63555 0.020 0.816 0.000 0.108 0.056
#> SRR772509 2 0.779 -0.56383 0.188 0.400 0.084 0.000 0.328
#> SRR772510 3 0.173 0.65865 0.036 0.000 0.940 0.004 0.020
#> SRR772511 2 0.558 0.28308 0.368 0.552 0.000 0.000 0.080
#> SRR772512 3 0.608 0.43836 0.068 0.016 0.520 0.004 0.392
#> SRR772513 2 0.215 0.71419 0.012 0.924 0.000 0.032 0.032
#> SRR772514 2 0.207 0.71469 0.012 0.928 0.000 0.032 0.028
#> SRR772515 2 0.189 0.71547 0.020 0.932 0.000 0.044 0.004
#> SRR772516 2 0.189 0.71289 0.020 0.932 0.000 0.044 0.004
#> SRR772517 2 0.181 0.71738 0.024 0.940 0.000 0.016 0.020
#> SRR772518 2 0.255 0.71727 0.068 0.900 0.000 0.016 0.016
#> SRR772519 2 0.164 0.71037 0.008 0.940 0.000 0.048 0.004
#> SRR772520 2 0.149 0.71159 0.008 0.948 0.000 0.040 0.004
#> SRR772521 2 0.558 0.45278 0.284 0.624 0.000 0.008 0.084
#> SRR772522 2 0.563 0.45107 0.284 0.620 0.000 0.008 0.088
#> SRR772523 2 0.137 0.70824 0.004 0.952 0.000 0.040 0.004
#> SRR772524 2 0.164 0.70793 0.008 0.940 0.000 0.048 0.004
#> SRR772525 3 0.212 0.65149 0.036 0.000 0.924 0.008 0.032
#> SRR772526 4 0.409 0.67240 0.000 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR772527 4 0.409 0.67240 0.000 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR772528 3 0.659 0.17064 0.340 0.000 0.440 0.000 0.220
#> SRR772529 1 0.373 0.75088 0.816 0.132 0.004 0.000 0.048
#> SRR772530 1 0.362 0.76049 0.828 0.124 0.008 0.000 0.040
#> SRR772531 3 0.212 0.65149 0.036 0.000 0.924 0.008 0.032
#> SRR772532 2 0.192 0.70162 0.008 0.924 0.000 0.064 0.004
#> SRR772533 2 0.192 0.70162 0.008 0.924 0.000 0.064 0.004
#> SRR772534 2 0.565 0.14558 0.404 0.516 0.000 0.000 0.080
#> SRR772535 2 0.277 0.65384 0.004 0.864 0.000 0.124 0.008
#> SRR772536 2 0.193 0.71582 0.016 0.928 0.000 0.052 0.004
#> SRR772537 4 0.318 0.77440 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR772538 4 0.353 0.77600 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR772539 1 0.301 0.76320 0.864 0.104 0.004 0.000 0.028
#> SRR772540 1 0.311 0.76120 0.856 0.112 0.004 0.000 0.028
#> SRR772541 2 0.399 0.68237 0.060 0.824 0.000 0.028 0.088
#> SRR772542 1 0.467 0.68355 0.752 0.156 0.008 0.000 0.084
#> SRR772543 1 0.425 0.72443 0.800 0.096 0.016 0.000 0.088
#> SRR772544 3 0.335 0.64644 0.020 0.000 0.828 0.004 0.148
#> SRR772545 1 0.279 0.75763 0.872 0.100 0.000 0.000 0.028
#> SRR772546 1 0.279 0.75763 0.872 0.100 0.000 0.000 0.028
#> SRR772547 1 0.583 0.28194 0.496 0.408 0.000 0.000 0.096
#> SRR772548 1 0.571 0.35295 0.528 0.384 0.000 0.000 0.088
#> SRR772549 1 0.285 0.76366 0.884 0.076 0.012 0.000 0.028
#> SRR772550 1 0.241 0.75859 0.908 0.060 0.012 0.000 0.020
#> SRR772551 2 0.547 0.60132 0.176 0.704 0.000 0.036 0.084
#> SRR772552 2 0.554 0.61931 0.164 0.708 0.000 0.056 0.072
#> SRR772553 2 0.663 0.32281 0.052 0.596 0.000 0.140 0.212
#> SRR772554 2 0.193 0.71024 0.016 0.928 0.000 0.052 0.004
#> SRR772555 2 0.193 0.71024 0.016 0.928 0.000 0.052 0.004
#> SRR772556 1 0.233 0.75589 0.908 0.064 0.004 0.000 0.024
#> SRR772557 1 0.224 0.75483 0.912 0.064 0.004 0.000 0.020
#> SRR772558 1 0.459 0.66749 0.724 0.212 0.000 0.000 0.064
#> SRR772559 1 0.458 0.68568 0.740 0.200 0.008 0.000 0.052
#> SRR772560 2 0.584 0.56426 0.212 0.664 0.000 0.044 0.080
#> SRR772561 3 0.608 0.43836 0.068 0.016 0.520 0.004 0.392
#> SRR772562 2 0.153 0.71058 0.004 0.948 0.000 0.036 0.012
#> SRR772563 2 0.153 0.71058 0.004 0.948 0.000 0.036 0.012
#> SRR772564 1 0.162 0.71246 0.948 0.016 0.020 0.000 0.016
#> SRR772565 1 0.162 0.71246 0.948 0.016 0.020 0.000 0.016
#> SRR772566 1 0.223 0.68268 0.920 0.012 0.036 0.000 0.032
#> SRR772567 1 0.207 0.68797 0.928 0.012 0.032 0.000 0.028
#> SRR772568 2 0.173 0.71596 0.020 0.940 0.000 0.036 0.004
#> SRR772569 2 0.163 0.71387 0.016 0.944 0.000 0.036 0.004
#> SRR772570 1 0.467 0.60648 0.684 0.272 0.000 0.000 0.044
#> SRR772571 1 0.523 0.51503 0.624 0.316 0.004 0.000 0.056
#> SRR772572 2 0.558 0.32040 0.352 0.572 0.000 0.004 0.072
#> SRR772573 2 0.561 0.35914 0.344 0.584 0.000 0.012 0.060
#> SRR772574 1 0.450 0.67203 0.728 0.216 0.000 0.000 0.056
#> SRR772575 1 0.497 0.56299 0.660 0.280 0.000 0.000 0.060
#> SRR772576 2 0.266 0.71868 0.052 0.896 0.000 0.008 0.044
#> SRR772577 2 0.357 0.70279 0.108 0.836 0.000 0.008 0.048
#> SRR772578 4 0.440 0.74960 0.000 0.308 0.000 0.672 0.020
#> SRR772579 4 0.438 0.75126 0.000 0.304 0.000 0.676 0.020
#> SRR772580 3 0.204 0.65213 0.036 0.000 0.928 0.008 0.028
#> SRR772581 2 0.681 0.47242 0.188 0.600 0.000 0.116 0.096
#> SRR772582 2 0.676 0.49048 0.176 0.608 0.000 0.120 0.096
#> SRR772583 2 0.400 0.70280 0.092 0.820 0.000 0.020 0.068
#> SRR772584 2 0.434 0.67250 0.148 0.780 0.000 0.012 0.060
#> SRR772585 2 0.367 0.69951 0.048 0.848 0.000 0.040 0.064
#> SRR772586 3 0.663 0.15942 0.340 0.000 0.432 0.000 0.228
#> SRR772587 1 0.593 0.17215 0.464 0.432 0.000 0.000 0.104
#> SRR772588 2 0.188 0.69994 0.000 0.924 0.000 0.064 0.012
#> SRR772589 2 0.188 0.69994 0.000 0.924 0.000 0.064 0.012
#> SRR772590 3 0.475 0.57608 0.024 0.004 0.668 0.004 0.300
#> SRR772591 1 0.215 0.68608 0.924 0.012 0.032 0.000 0.032
#> SRR772592 1 0.223 0.68268 0.920 0.012 0.036 0.000 0.032
#> SRR772593 3 0.662 0.16646 0.336 0.000 0.436 0.000 0.228
#> SRR772594 4 0.377 0.77204 0.000 0.268 0.000 0.728 0.004
#> SRR772595 4 0.377 0.77204 0.000 0.268 0.000 0.728 0.004
#> SRR772596 3 0.655 0.18444 0.336 0.000 0.452 0.000 0.212
#> SRR772597 3 0.212 0.65149 0.036 0.000 0.924 0.008 0.032
#> SRR772598 1 0.189 0.69999 0.936 0.012 0.024 0.000 0.028
#> SRR772599 1 0.198 0.69530 0.932 0.012 0.024 0.000 0.032
#> SRR772600 4 0.572 0.65147 0.008 0.316 0.000 0.592 0.084
#> SRR772601 4 0.547 0.66865 0.004 0.296 0.000 0.620 0.080
#> SRR772602 3 0.372 0.64060 0.024 0.000 0.796 0.004 0.176
#> SRR772603 4 0.616 0.56911 0.012 0.392 0.000 0.500 0.096
#> SRR772604 4 0.582 0.63897 0.004 0.336 0.000 0.564 0.096
#> SRR772605 2 0.449 0.67021 0.084 0.792 0.000 0.032 0.092
#> SRR772606 1 0.217 0.71219 0.924 0.020 0.020 0.000 0.036
#> SRR772607 1 0.217 0.71219 0.924 0.020 0.020 0.000 0.036
#> SRR772608 2 0.297 0.71714 0.048 0.884 0.000 0.020 0.048
#> SRR772609 2 0.305 0.71707 0.052 0.880 0.000 0.020 0.048
#> SRR772610 2 0.196 0.71072 0.008 0.928 0.000 0.052 0.012
#> SRR772611 2 0.196 0.71072 0.008 0.928 0.000 0.052 0.012
#> SRR772612 4 0.301 0.70296 0.000 0.104 0.000 0.860 0.036
#> SRR772613 4 0.306 0.70443 0.000 0.108 0.000 0.856 0.036
#> SRR772614 1 0.247 0.74394 0.908 0.052 0.024 0.000 0.016
#> SRR772615 1 0.266 0.74025 0.900 0.052 0.024 0.000 0.024
#> SRR772616 1 0.607 0.15958 0.460 0.432 0.000 0.004 0.104
#> SRR772617 4 0.447 0.71212 0.000 0.204 0.000 0.736 0.060
#> SRR772618 4 0.447 0.71212 0.000 0.204 0.000 0.736 0.060
#> SRR772619 4 0.250 0.67206 0.004 0.064 0.000 0.900 0.032
#> SRR772620 4 0.250 0.67206 0.004 0.064 0.000 0.900 0.032
#> SRR772621 2 0.408 0.66628 0.160 0.788 0.000 0.008 0.044
#> SRR772622 2 0.381 0.69571 0.116 0.824 0.000 0.016 0.044
#> SRR772623 3 0.346 0.62885 0.000 0.000 0.828 0.044 0.128
#> SRR772624 3 0.659 0.17064 0.340 0.000 0.440 0.000 0.220
#> SRR772625 2 0.651 0.33439 0.036 0.596 0.000 0.160 0.208
#> SRR772626 2 0.720 0.40039 0.192 0.560 0.000 0.120 0.128
#> SRR772627 2 0.727 0.38394 0.180 0.556 0.000 0.136 0.128
#> SRR772628 1 0.414 0.72221 0.780 0.176 0.016 0.000 0.028
#> SRR772629 1 0.412 0.68024 0.752 0.212 0.000 0.000 0.036
#> SRR772630 2 0.571 0.14397 0.412 0.512 0.000 0.004 0.072
#> SRR772631 3 0.659 0.17064 0.340 0.000 0.440 0.000 0.220
#> SRR772632 2 0.384 0.28057 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR772633 2 0.389 0.24677 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR772634 2 0.544 0.46457 0.316 0.616 0.004 0.004 0.060
#> SRR772635 2 0.519 0.52893 0.276 0.660 0.004 0.004 0.056
#> SRR772636 2 0.651 0.33439 0.036 0.596 0.000 0.160 0.208
#> SRR772637 1 0.250 0.75176 0.904 0.060 0.024 0.000 0.012
#> SRR772638 1 0.247 0.74903 0.908 0.052 0.024 0.000 0.016
#> SRR772639 2 0.153 0.71200 0.004 0.948 0.000 0.036 0.012
#> SRR772640 4 0.331 0.77927 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772641 4 0.331 0.77927 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772642 2 0.345 0.69922 0.120 0.836 0.000 0.004 0.040
#> SRR772643 2 0.299 0.71766 0.068 0.880 0.000 0.016 0.036
#> SRR772644 1 0.480 0.65193 0.708 0.228 0.004 0.000 0.060
#> SRR772645 1 0.448 0.65067 0.720 0.232 0.000 0.000 0.048
#> SRR772646 2 0.136 0.70770 0.004 0.948 0.000 0.048 0.000
#> SRR772647 2 0.148 0.70903 0.008 0.944 0.000 0.048 0.000
#> SRR772648 2 0.287 0.71944 0.060 0.888 0.000 0.020 0.032
#> SRR772649 2 0.272 0.72079 0.056 0.896 0.000 0.020 0.028
#> SRR772650 2 0.554 0.11649 0.432 0.500 0.000 0.000 0.068
#> SRR772651 2 0.554 0.11649 0.432 0.500 0.000 0.000 0.068
#> SRR772652 1 0.306 0.74405 0.848 0.128 0.000 0.000 0.024
#> SRR772653 1 0.311 0.74006 0.844 0.132 0.000 0.000 0.024
#> SRR772654 2 0.451 0.62351 0.200 0.744 0.000 0.008 0.048
#> SRR772655 2 0.464 0.61393 0.208 0.732 0.000 0.008 0.052
#> SRR772656 3 0.337 0.61914 0.000 0.000 0.784 0.004 0.212
#> SRR772657 3 0.492 0.55210 0.024 0.004 0.628 0.004 0.340
#> SRR772658 4 0.327 0.67285 0.004 0.080 0.000 0.856 0.060
#> SRR772659 4 0.327 0.67285 0.004 0.080 0.000 0.856 0.060
#> SRR772660 2 0.402 0.68701 0.056 0.828 0.000 0.052 0.064
#> SRR772661 5 0.850 0.00000 0.220 0.224 0.220 0.000 0.336
#> SRR772662 2 0.529 0.38802 0.356 0.584 0.000 0.000 0.060
#> SRR772663 2 0.560 0.23974 0.400 0.524 0.000 0.000 0.076
#> SRR772664 2 0.296 0.71911 0.036 0.884 0.000 0.060 0.020
#> SRR772665 2 0.316 0.71747 0.040 0.872 0.000 0.068 0.020
#> SRR772666 3 0.262 0.65861 0.036 0.000 0.888 0.000 0.076
#> SRR772667 2 0.604 -0.00933 0.004 0.548 0.000 0.328 0.120
#> SRR772668 4 0.407 0.57911 0.008 0.048 0.000 0.792 0.152
#> SRR772669 4 0.403 0.58179 0.008 0.048 0.000 0.796 0.148
#> SRR772670 2 0.521 0.52265 0.276 0.652 0.000 0.004 0.068
#> SRR772671 2 0.514 0.51795 0.280 0.648 0.000 0.000 0.072
#> SRR772672 2 0.217 0.71338 0.012 0.920 0.000 0.052 0.016
#> SRR772673 2 0.228 0.71474 0.016 0.916 0.000 0.052 0.016
#> SRR772674 3 0.349 0.62349 0.004 0.000 0.784 0.004 0.208
#> SRR772675 2 0.794 -0.60274 0.200 0.388 0.096 0.000 0.316
#> SRR772676 2 0.506 0.54523 0.232 0.692 0.000 0.008 0.068
#> SRR772677 2 0.520 0.53362 0.236 0.680 0.000 0.008 0.076
#> SRR772678 2 0.782 -0.58595 0.192 0.392 0.084 0.000 0.332
#> SRR772679 2 0.533 0.36136 0.372 0.568 0.000 0.000 0.060
#> SRR772680 2 0.545 0.24506 0.404 0.532 0.000 0.000 0.064
#> SRR772681 3 0.349 0.62349 0.004 0.000 0.784 0.004 0.208
#> SRR772682 2 0.164 0.71036 0.004 0.940 0.000 0.048 0.008
#> SRR772683 2 0.137 0.71395 0.004 0.952 0.000 0.040 0.004
#> SRR772685 2 0.275 0.72488 0.048 0.896 0.000 0.036 0.020
#> SRR772686 3 0.192 0.65944 0.032 0.000 0.928 0.000 0.040
#> SRR772687 3 0.585 0.40098 0.224 0.000 0.628 0.008 0.140
#> SRR772688 4 0.331 0.78098 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772689 4 0.331 0.78098 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772690 3 0.313 0.65591 0.032 0.000 0.848 0.000 0.120
#> SRR772691 2 0.651 0.33439 0.036 0.596 0.000 0.160 0.208
#> SRR772692 2 0.552 0.44014 0.336 0.596 0.004 0.004 0.060
#> SRR772693 2 0.485 0.58864 0.236 0.700 0.000 0.004 0.060
#> SRR772694 2 0.378 0.72400 0.068 0.840 0.000 0.060 0.032
#> SRR772695 2 0.436 0.67100 0.156 0.776 0.000 0.012 0.056
#> SRR772696 2 0.333 0.71507 0.084 0.860 0.000 0.020 0.036
#> SRR772697 2 0.327 0.71531 0.080 0.864 0.000 0.020 0.036
#> SRR772698 3 0.659 0.17064 0.340 0.000 0.440 0.000 0.220
#> SRR772699 1 0.321 0.76187 0.856 0.108 0.012 0.000 0.024
#> SRR772700 1 0.324 0.76260 0.856 0.104 0.012 0.000 0.028
#> SRR772701 1 0.384 0.71297 0.780 0.188 0.000 0.000 0.032
#> SRR772702 1 0.369 0.71667 0.792 0.180 0.000 0.000 0.028
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.2774 0.7195 0.872 0.076 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR772342 1 0.3492 0.6672 0.816 0.112 0.000 0.000 0.008 0.064
#> SRR772343 1 0.5360 -0.3244 0.456 0.436 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772344 2 0.2122 0.6402 0.008 0.900 0.000 0.084 0.000 0.008
#> SRR772345 2 0.2068 0.6418 0.008 0.904 0.000 0.080 0.000 0.008
#> SRR772346 1 0.6337 -0.5854 0.384 0.352 0.000 0.012 0.000 0.252
#> SRR772347 1 0.6484 -0.6140 0.380 0.344 0.000 0.020 0.000 0.256
#> SRR772348 2 0.3351 0.5773 0.000 0.800 0.000 0.160 0.000 0.040
#> SRR772349 2 0.3283 0.5806 0.000 0.804 0.000 0.160 0.000 0.036
#> SRR772350 3 0.5151 0.6580 0.000 0.000 0.648 0.008 0.152 0.192
#> SRR772351 2 0.2431 0.6064 0.000 0.860 0.000 0.132 0.000 0.008
#> SRR772352 2 0.2532 0.6413 0.012 0.884 0.000 0.080 0.000 0.024
#> SRR772353 2 0.4541 0.4608 0.196 0.704 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR772354 2 0.4541 0.4608 0.196 0.704 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR772355 2 0.2975 0.6224 0.012 0.840 0.000 0.132 0.000 0.016
#> SRR772356 2 0.3016 0.6202 0.012 0.836 0.000 0.136 0.000 0.016
#> SRR772357 1 0.3820 0.6108 0.780 0.144 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR772358 1 0.3718 0.6452 0.796 0.128 0.000 0.000 0.008 0.068
#> SRR772359 1 0.5310 -0.3087 0.480 0.428 0.000 0.000 0.004 0.088
#> SRR772360 2 0.5141 0.1072 0.320 0.592 0.000 0.004 0.004 0.080
#> SRR772361 3 0.3581 0.6401 0.004 0.004 0.780 0.000 0.188 0.024
#> SRR772362 4 0.2697 0.7570 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.2697 0.7570 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR772364 1 0.6674 -0.8230 0.352 0.280 0.000 0.016 0.008 0.344
#> SRR772365 6 0.6695 0.7889 0.332 0.304 0.000 0.016 0.008 0.340
#> SRR772366 5 0.4705 0.8894 0.260 0.000 0.088 0.000 0.652 0.000
#> SRR772367 3 0.4268 0.7193 0.036 0.000 0.692 0.000 0.264 0.008
#> SRR772368 2 0.4683 0.5665 0.036 0.756 0.000 0.092 0.012 0.104
#> SRR772369 2 0.3393 0.5878 0.108 0.820 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR772370 2 0.3620 0.5960 0.120 0.808 0.000 0.012 0.000 0.060
#> SRR772371 6 0.6954 0.8956 0.292 0.296 0.000 0.036 0.008 0.368
#> SRR772372 6 0.6949 0.8939 0.292 0.292 0.000 0.036 0.008 0.372
#> SRR772373 2 0.1710 0.6552 0.016 0.936 0.000 0.028 0.000 0.020
#> SRR772374 2 0.1838 0.6549 0.020 0.928 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR772375 3 0.4268 0.7193 0.036 0.000 0.692 0.000 0.264 0.008
#> SRR772376 2 0.2501 0.6274 0.004 0.872 0.000 0.108 0.000 0.016
#> SRR772377 2 0.7758 -0.2058 0.128 0.356 0.024 0.000 0.316 0.176
#> SRR772378 2 0.5478 -0.1487 0.352 0.512 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR772379 2 0.4494 0.3883 0.216 0.692 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR772380 2 0.4996 0.1559 0.296 0.604 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR772381 3 0.0692 0.7589 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR772382 1 0.3075 0.7033 0.852 0.092 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR772383 1 0.3174 0.6885 0.840 0.108 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR772384 2 0.7781 -0.2141 0.132 0.352 0.024 0.000 0.316 0.176
#> SRR772385 2 0.6872 0.2442 0.024 0.536 0.000 0.172 0.068 0.200
#> SRR772386 2 0.2051 0.6539 0.040 0.916 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR772387 2 0.1906 0.6536 0.032 0.924 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR772388 1 0.1542 0.6933 0.936 0.008 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR772389 1 0.1477 0.6941 0.940 0.008 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR772390 5 0.4705 0.8894 0.260 0.000 0.088 0.000 0.652 0.000
#> SRR772391 1 0.1511 0.7186 0.944 0.032 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR772392 1 0.1511 0.7186 0.944 0.032 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR772393 2 0.6633 -0.1778 0.116 0.516 0.000 0.080 0.008 0.280
#> SRR772394 2 0.6700 -0.2293 0.128 0.504 0.000 0.076 0.008 0.284
#> SRR772395 2 0.2931 0.6232 0.004 0.860 0.000 0.088 0.004 0.044
#> SRR772396 1 0.1930 0.7113 0.924 0.028 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR772397 1 0.1922 0.7105 0.924 0.024 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR772398 1 0.5452 0.1063 0.592 0.256 0.000 0.000 0.008 0.144
#> SRR772399 1 0.5452 0.1063 0.592 0.256 0.000 0.000 0.008 0.144
#> SRR772400 1 0.2183 0.7024 0.912 0.020 0.000 0.000 0.040 0.028
#> SRR772401 1 0.2137 0.6927 0.912 0.012 0.000 0.000 0.048 0.028
#> SRR772402 4 0.5914 0.5860 0.004 0.232 0.000 0.580 0.024 0.160
#> SRR772403 4 0.5963 0.5860 0.004 0.236 0.000 0.572 0.024 0.164
#> SRR772404 2 0.4449 0.5758 0.028 0.772 0.000 0.088 0.012 0.100
#> SRR772405 2 0.7877 -0.2317 0.144 0.344 0.032 0.000 0.324 0.156
#> SRR772406 2 0.1944 0.6537 0.016 0.924 0.000 0.024 0.000 0.036
#> SRR772407 2 0.1950 0.6554 0.016 0.924 0.000 0.028 0.000 0.032
#> SRR772408 4 0.2996 0.7439 0.000 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.2996 0.7454 0.000 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR772410 2 0.4179 0.4505 0.188 0.744 0.000 0.012 0.000 0.056
#> SRR772411 2 0.4267 0.4489 0.188 0.740 0.000 0.016 0.000 0.056
#> SRR772412 1 0.2001 0.7206 0.920 0.044 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772413 1 0.2001 0.7206 0.920 0.044 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772414 3 0.3884 0.7339 0.036 0.000 0.724 0.000 0.240 0.000
#> SRR772415 2 0.3164 0.6303 0.104 0.844 0.000 0.020 0.000 0.032
#> SRR772416 2 0.3173 0.6362 0.092 0.848 0.000 0.024 0.000 0.036
#> SRR772417 2 0.5457 -0.2072 0.356 0.512 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR772418 5 0.4663 0.8814 0.252 0.000 0.088 0.000 0.660 0.000
#> SRR772419 4 0.3966 0.4332 0.000 0.444 0.000 0.552 0.000 0.004
#> SRR772420 4 0.3971 0.4238 0.000 0.448 0.000 0.548 0.000 0.004
#> SRR772421 2 0.2813 0.6210 0.092 0.864 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR772422 2 0.2813 0.6210 0.092 0.864 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR772423 4 0.5120 0.6442 0.004 0.168 0.000 0.680 0.016 0.132
#> SRR772424 4 0.3943 0.6956 0.004 0.116 0.000 0.788 0.008 0.084
#> SRR772425 2 0.1693 0.6505 0.004 0.932 0.000 0.044 0.000 0.020
#> SRR772426 2 0.2118 0.6254 0.000 0.888 0.000 0.104 0.000 0.008
#> SRR772427 2 0.2118 0.6254 0.000 0.888 0.000 0.104 0.000 0.008
#> SRR772428 1 0.1536 0.6920 0.940 0.004 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR772429 1 0.1577 0.6977 0.940 0.008 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR772430 2 0.4842 0.5203 0.128 0.720 0.000 0.008 0.016 0.128
#> SRR772431 4 0.6088 0.5768 0.012 0.232 0.000 0.580 0.028 0.148
#> SRR772432 4 0.6088 0.5768 0.012 0.232 0.000 0.580 0.028 0.148
#> SRR772433 1 0.1738 0.6871 0.928 0.004 0.000 0.000 0.052 0.016
#> SRR772434 1 0.1738 0.6871 0.928 0.004 0.000 0.000 0.052 0.016
#> SRR772435 2 0.5215 0.1370 0.332 0.568 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR772436 2 0.5359 -0.0425 0.376 0.520 0.000 0.004 0.000 0.100
#> SRR772437 3 0.1945 0.7336 0.004 0.004 0.920 0.000 0.056 0.016
#> SRR772438 1 0.4116 0.6095 0.776 0.036 0.000 0.000 0.048 0.140
#> SRR772439 1 0.3778 0.6190 0.796 0.020 0.000 0.000 0.048 0.136
#> SRR772440 2 0.3791 0.5863 0.112 0.800 0.000 0.016 0.000 0.072
#> SRR772441 2 0.3103 0.6325 0.076 0.856 0.000 0.024 0.000 0.044
#> SRR772442 4 0.5936 0.5692 0.008 0.276 0.000 0.568 0.024 0.124
#> SRR772443 4 0.5847 0.5690 0.008 0.272 0.000 0.576 0.020 0.124
#> SRR772444 1 0.2164 0.7210 0.912 0.044 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR772445 1 0.2450 0.7214 0.896 0.048 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR772446 1 0.2527 0.7140 0.884 0.064 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR772447 1 0.2488 0.7067 0.880 0.076 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772448 2 0.2878 0.6484 0.064 0.872 0.000 0.032 0.000 0.032
#> SRR772449 2 0.2563 0.6539 0.036 0.892 0.000 0.044 0.000 0.028
#> SRR772450 4 0.2793 0.7548 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.2793 0.7548 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.2271 0.7166 0.908 0.036 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR772453 1 0.2924 0.7066 0.864 0.084 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR772454 1 0.4645 0.1667 0.648 0.276 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772455 2 0.5603 -0.2265 0.384 0.484 0.000 0.004 0.000 0.128
#> SRR772456 4 0.3052 0.7476 0.000 0.216 0.000 0.780 0.000 0.004
#> SRR772457 4 0.3052 0.7475 0.000 0.216 0.000 0.780 0.000 0.004
#> SRR772458 1 0.2721 0.7146 0.868 0.088 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR772459 1 0.2679 0.7100 0.868 0.096 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR772460 4 0.1625 0.6990 0.000 0.060 0.000 0.928 0.000 0.012
#> SRR772461 4 0.1625 0.6990 0.000 0.060 0.000 0.928 0.000 0.012
#> SRR772462 2 0.2069 0.6444 0.004 0.908 0.000 0.068 0.000 0.020
#> SRR772463 2 0.2069 0.6444 0.004 0.908 0.000 0.068 0.000 0.020
#> SRR772464 3 0.4003 0.7339 0.032 0.000 0.716 0.000 0.248 0.004
#> SRR772465 2 0.3556 0.5894 0.104 0.816 0.000 0.012 0.000 0.068
#> SRR772466 2 0.3411 0.5900 0.100 0.824 0.000 0.008 0.000 0.068
#> SRR772467 4 0.3636 0.6579 0.000 0.320 0.000 0.676 0.000 0.004
#> SRR772468 4 0.3636 0.6579 0.000 0.320 0.000 0.676 0.000 0.004
#> SRR772469 1 0.4207 0.5541 0.744 0.176 0.000 0.000 0.008 0.072
#> SRR772470 1 0.4256 0.5809 0.748 0.164 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR772471 1 0.4549 0.3809 0.680 0.232 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772472 1 0.4396 0.4406 0.704 0.208 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772473 4 0.6085 0.4984 0.008 0.320 0.000 0.524 0.024 0.124
#> SRR772474 4 0.6525 0.4861 0.012 0.324 0.000 0.472 0.028 0.164
#> SRR772475 2 0.6914 0.2422 0.028 0.536 0.000 0.168 0.068 0.200
#> SRR772476 4 0.2762 0.7555 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.2697 0.7570 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1555 0.7218 0.940 0.040 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR772479 1 0.1555 0.7218 0.940 0.040 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR772480 2 0.7204 -0.1778 0.044 0.424 0.000 0.288 0.028 0.216
#> SRR772481 2 0.7257 -0.1604 0.056 0.444 0.000 0.264 0.028 0.208
#> SRR772482 1 0.3694 0.6692 0.808 0.120 0.000 0.000 0.024 0.048
#> SRR772483 1 0.3694 0.6692 0.808 0.120 0.000 0.000 0.024 0.048
#> SRR772484 2 0.2884 0.6350 0.064 0.864 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR772485 2 0.2884 0.6350 0.064 0.864 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR772486 1 0.4672 0.5317 0.728 0.060 0.000 0.000 0.044 0.168
#> SRR772487 1 0.4672 0.5317 0.728 0.060 0.000 0.000 0.044 0.168
#> SRR772488 2 0.3976 0.5777 0.128 0.776 0.000 0.008 0.000 0.088
#> SRR772489 2 0.3976 0.5777 0.128 0.776 0.000 0.008 0.000 0.088
#> SRR772490 1 0.3211 0.7170 0.848 0.076 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR772491 1 0.2291 0.7236 0.904 0.044 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR772492 4 0.2295 0.6518 0.004 0.024 0.000 0.908 0.016 0.048
#> SRR772493 4 0.2295 0.6518 0.004 0.024 0.000 0.908 0.016 0.048
#> SRR772494 4 0.2697 0.7570 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.2697 0.7570 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.2115 0.6558 0.032 0.916 0.000 0.032 0.000 0.020
#> SRR772497 2 0.1950 0.6560 0.028 0.924 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR772498 2 0.6902 -0.2164 0.092 0.464 0.000 0.124 0.008 0.312
#> SRR772499 2 0.6902 -0.2164 0.092 0.464 0.000 0.124 0.008 0.312
#> SRR772500 2 0.2146 0.6161 0.000 0.880 0.000 0.116 0.000 0.004
#> SRR772501 2 0.2006 0.6245 0.000 0.892 0.000 0.104 0.000 0.004
#> SRR772502 2 0.5685 -0.3371 0.396 0.472 0.000 0.008 0.000 0.124
#> SRR772503 2 0.5598 -0.3538 0.408 0.464 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR772504 2 0.1477 0.6452 0.004 0.940 0.000 0.048 0.000 0.008
#> SRR772505 2 0.1728 0.6431 0.004 0.924 0.000 0.064 0.000 0.008
#> SRR772506 4 0.3756 0.6128 0.000 0.352 0.000 0.644 0.000 0.004
#> SRR772507 4 0.3756 0.6128 0.000 0.352 0.000 0.644 0.000 0.004
#> SRR772508 2 0.4294 0.5632 0.016 0.776 0.000 0.112 0.012 0.084
#> SRR772509 2 0.7756 -0.2017 0.128 0.360 0.024 0.000 0.312 0.176
#> SRR772510 3 0.3727 0.7460 0.036 0.000 0.748 0.000 0.216 0.000
#> SRR772511 2 0.5487 -0.2111 0.356 0.508 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR772512 3 0.4995 0.5116 0.016 0.016 0.668 0.000 0.252 0.048
#> SRR772513 2 0.2341 0.6499 0.012 0.900 0.000 0.032 0.000 0.056
#> SRR772514 2 0.2213 0.6513 0.012 0.908 0.000 0.032 0.000 0.048
#> SRR772515 2 0.1873 0.6518 0.020 0.924 0.000 0.048 0.000 0.008
#> SRR772516 2 0.1873 0.6497 0.020 0.924 0.000 0.048 0.000 0.008
#> SRR772517 2 0.2103 0.6516 0.024 0.916 0.000 0.020 0.000 0.040
#> SRR772518 2 0.2918 0.6411 0.064 0.868 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR772519 2 0.1655 0.6503 0.008 0.932 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR772520 2 0.1410 0.6516 0.008 0.944 0.000 0.044 0.000 0.004
#> SRR772521 2 0.5305 0.0713 0.268 0.604 0.000 0.008 0.000 0.120
#> SRR772522 2 0.5375 0.0517 0.268 0.596 0.000 0.008 0.000 0.128
#> SRR772523 2 0.1410 0.6472 0.004 0.944 0.000 0.044 0.000 0.008
#> SRR772524 2 0.1655 0.6493 0.008 0.932 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR772525 3 0.4268 0.7193 0.036 0.000 0.692 0.000 0.264 0.008
#> SRR772526 4 0.3699 0.6362 0.000 0.336 0.000 0.660 0.000 0.004
#> SRR772527 4 0.3699 0.6362 0.000 0.336 0.000 0.660 0.000 0.004
#> SRR772528 5 0.4705 0.8894 0.260 0.000 0.088 0.000 0.652 0.000
#> SRR772529 1 0.3279 0.6816 0.828 0.108 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR772530 1 0.3249 0.7011 0.836 0.096 0.000 0.000 0.008 0.060
#> SRR772531 3 0.4268 0.7193 0.036 0.000 0.692 0.000 0.264 0.008
#> SRR772532 2 0.1900 0.6442 0.008 0.916 0.000 0.068 0.000 0.008
#> SRR772533 2 0.1900 0.6442 0.008 0.916 0.000 0.068 0.000 0.008
#> SRR772534 2 0.5638 -0.3364 0.384 0.464 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR772535 2 0.2714 0.6080 0.004 0.848 0.000 0.136 0.000 0.012
#> SRR772536 2 0.1914 0.6534 0.016 0.920 0.000 0.056 0.000 0.008
#> SRR772537 4 0.3003 0.7537 0.000 0.172 0.000 0.812 0.000 0.016
#> SRR772538 4 0.3348 0.7471 0.000 0.216 0.000 0.768 0.000 0.016
#> SRR772539 1 0.2493 0.7102 0.884 0.076 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR772540 1 0.2617 0.7061 0.876 0.080 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR772541 2 0.4393 0.5813 0.052 0.772 0.000 0.028 0.016 0.132
#> SRR772542 1 0.5268 0.4455 0.680 0.120 0.000 0.000 0.044 0.156
#> SRR772543 1 0.4658 0.5764 0.740 0.068 0.000 0.000 0.052 0.140
#> SRR772544 3 0.2311 0.7712 0.016 0.000 0.880 0.000 0.104 0.000
#> SRR772545 1 0.2309 0.7111 0.888 0.084 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772546 1 0.2309 0.7111 0.888 0.084 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772547 1 0.5686 -0.3113 0.472 0.364 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR772548 1 0.5565 -0.2386 0.508 0.340 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR772549 1 0.2295 0.7208 0.904 0.052 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR772550 1 0.1861 0.7200 0.928 0.036 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772551 2 0.5349 0.3156 0.136 0.660 0.000 0.032 0.000 0.172
#> SRR772552 2 0.5429 0.3738 0.128 0.668 0.000 0.052 0.000 0.152
#> SRR772553 2 0.7021 0.2352 0.036 0.536 0.000 0.152 0.076 0.200
#> SRR772554 2 0.1914 0.6478 0.016 0.920 0.000 0.056 0.000 0.008
#> SRR772555 2 0.1914 0.6478 0.016 0.920 0.000 0.056 0.000 0.008
#> SRR772556 1 0.2466 0.7205 0.896 0.052 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR772557 1 0.2386 0.7207 0.900 0.052 0.000 0.000 0.024 0.024
#> SRR772558 1 0.4159 0.5299 0.736 0.176 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772559 1 0.4154 0.5524 0.748 0.176 0.000 0.000 0.008 0.068
#> SRR772560 2 0.5985 0.3175 0.204 0.612 0.000 0.048 0.008 0.128
#> SRR772561 3 0.4995 0.5116 0.016 0.016 0.668 0.000 0.252 0.048
#> SRR772562 2 0.1552 0.6516 0.004 0.940 0.000 0.036 0.000 0.020
#> SRR772563 2 0.1552 0.6516 0.004 0.940 0.000 0.036 0.000 0.020
#> SRR772564 1 0.1873 0.6921 0.924 0.008 0.000 0.000 0.048 0.020
#> SRR772565 1 0.1873 0.6921 0.924 0.008 0.000 0.000 0.048 0.020
#> SRR772566 1 0.2002 0.6717 0.908 0.004 0.000 0.000 0.076 0.012
#> SRR772567 1 0.1888 0.6758 0.916 0.004 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR772568 2 0.1737 0.6529 0.020 0.932 0.000 0.040 0.000 0.008
#> SRR772569 2 0.1649 0.6516 0.016 0.936 0.000 0.040 0.000 0.008
#> SRR772570 1 0.4542 0.4046 0.684 0.240 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR772571 1 0.4943 0.2305 0.632 0.272 0.000 0.000 0.004 0.092
#> SRR772572 2 0.5288 -0.1490 0.344 0.552 0.000 0.004 0.000 0.100
#> SRR772573 2 0.5296 -0.1005 0.336 0.568 0.000 0.012 0.000 0.084
#> SRR772574 1 0.4275 0.5293 0.728 0.192 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR772575 1 0.4728 0.3186 0.660 0.256 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR772576 2 0.2860 0.6403 0.052 0.868 0.000 0.012 0.000 0.068
#> SRR772577 2 0.3566 0.6065 0.104 0.812 0.000 0.008 0.000 0.076
#> SRR772578 4 0.4066 0.7154 0.000 0.272 0.000 0.692 0.000 0.036
#> SRR772579 4 0.4045 0.7178 0.000 0.268 0.000 0.696 0.000 0.036
#> SRR772580 3 0.4246 0.7207 0.036 0.000 0.696 0.000 0.260 0.008
#> SRR772581 2 0.6728 -0.0275 0.148 0.548 0.000 0.108 0.008 0.188
#> SRR772582 2 0.6662 0.0948 0.136 0.568 0.000 0.112 0.012 0.172
#> SRR772583 2 0.3946 0.6018 0.100 0.792 0.000 0.020 0.000 0.088
#> SRR772584 2 0.4347 0.5370 0.152 0.744 0.000 0.012 0.000 0.092
#> SRR772585 2 0.4065 0.6132 0.044 0.804 0.000 0.044 0.012 0.096
#> SRR772586 5 0.4613 0.8839 0.260 0.000 0.080 0.000 0.660 0.000
#> SRR772587 1 0.5771 -0.3485 0.444 0.380 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR772588 2 0.1867 0.6449 0.000 0.916 0.000 0.064 0.000 0.020
#> SRR772589 2 0.1867 0.6449 0.000 0.916 0.000 0.064 0.000 0.020
#> SRR772590 3 0.2908 0.6959 0.004 0.004 0.848 0.000 0.124 0.020
#> SRR772591 1 0.1946 0.6742 0.912 0.004 0.000 0.000 0.072 0.012
#> SRR772592 1 0.2002 0.6717 0.908 0.004 0.000 0.000 0.076 0.012
#> SRR772593 5 0.4617 0.8797 0.252 0.000 0.084 0.000 0.664 0.000
#> SRR772594 4 0.3694 0.7444 0.000 0.232 0.000 0.740 0.000 0.028
#> SRR772595 4 0.3694 0.7444 0.000 0.232 0.000 0.740 0.000 0.028
#> SRR772596 5 0.4814 0.8777 0.256 0.000 0.100 0.000 0.644 0.000
#> SRR772597 3 0.4268 0.7193 0.036 0.000 0.692 0.000 0.264 0.008
#> SRR772598 1 0.1969 0.6843 0.920 0.004 0.004 0.000 0.052 0.020
#> SRR772599 1 0.2033 0.6804 0.916 0.004 0.004 0.000 0.056 0.020
#> SRR772600 4 0.6180 0.5736 0.008 0.240 0.000 0.556 0.028 0.168
#> SRR772601 4 0.5851 0.6013 0.004 0.220 0.000 0.592 0.024 0.160
#> SRR772602 3 0.2006 0.7687 0.016 0.000 0.904 0.000 0.080 0.000
#> SRR772603 4 0.6685 0.4673 0.012 0.320 0.000 0.444 0.028 0.196
#> SRR772604 4 0.6303 0.5553 0.004 0.264 0.000 0.516 0.028 0.188
#> SRR772605 2 0.4797 0.5604 0.076 0.744 0.000 0.032 0.016 0.132
#> SRR772606 1 0.2085 0.6897 0.912 0.008 0.000 0.000 0.056 0.024
#> SRR772607 1 0.2164 0.6882 0.908 0.008 0.000 0.000 0.056 0.028
#> SRR772608 2 0.3031 0.6411 0.048 0.860 0.000 0.020 0.000 0.072
#> SRR772609 2 0.3095 0.6396 0.052 0.856 0.000 0.020 0.000 0.072
#> SRR772610 2 0.2002 0.6520 0.008 0.916 0.000 0.056 0.000 0.020
#> SRR772611 2 0.2002 0.6520 0.008 0.916 0.000 0.056 0.000 0.020
#> SRR772612 4 0.2631 0.6703 0.000 0.044 0.000 0.880 0.008 0.068
#> SRR772613 4 0.2742 0.6654 0.000 0.044 0.000 0.872 0.008 0.076
#> SRR772614 1 0.1864 0.7137 0.924 0.032 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR772615 1 0.2240 0.7085 0.908 0.032 0.000 0.000 0.044 0.016
#> SRR772616 1 0.5904 -0.3690 0.432 0.388 0.000 0.004 0.000 0.176
#> SRR772617 4 0.4556 0.6668 0.000 0.132 0.000 0.736 0.020 0.112
#> SRR772618 4 0.4594 0.6686 0.000 0.136 0.000 0.732 0.020 0.112
#> SRR772619 4 0.2295 0.6518 0.004 0.024 0.000 0.908 0.016 0.048
#> SRR772620 4 0.2295 0.6518 0.004 0.024 0.000 0.908 0.016 0.048
#> SRR772621 2 0.3935 0.5363 0.152 0.776 0.000 0.012 0.000 0.060
#> SRR772622 2 0.3504 0.5960 0.112 0.820 0.000 0.016 0.000 0.052
#> SRR772623 3 0.5151 0.6580 0.000 0.000 0.648 0.008 0.152 0.192
#> SRR772624 5 0.4705 0.8894 0.260 0.000 0.088 0.000 0.652 0.000
#> SRR772625 2 0.6872 0.2442 0.024 0.536 0.000 0.172 0.068 0.200
#> SRR772626 2 0.6881 -0.2235 0.100 0.468 0.000 0.112 0.008 0.312
#> SRR772627 2 0.6923 -0.2292 0.088 0.460 0.000 0.132 0.008 0.312
#> SRR772628 1 0.4018 0.6366 0.780 0.140 0.000 0.000 0.024 0.056
#> SRR772629 1 0.3960 0.5623 0.760 0.180 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR772630 2 0.5591 -0.3204 0.400 0.472 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR772631 5 0.4705 0.8894 0.260 0.000 0.088 0.000 0.652 0.000
#> SRR772632 2 0.3464 0.3530 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR772633 2 0.3515 0.3249 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR772634 2 0.5334 0.1124 0.304 0.584 0.000 0.004 0.004 0.104
#> SRR772635 2 0.5040 0.2581 0.264 0.636 0.000 0.004 0.004 0.092
#> SRR772636 2 0.6872 0.2442 0.024 0.536 0.000 0.172 0.068 0.200
#> SRR772637 1 0.1950 0.7144 0.924 0.032 0.000 0.000 0.028 0.016
#> SRR772638 1 0.1882 0.7121 0.928 0.024 0.000 0.000 0.028 0.020
#> SRR772639 2 0.1624 0.6502 0.004 0.936 0.000 0.040 0.000 0.020
#> SRR772640 4 0.2697 0.7570 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.2697 0.7570 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR772642 2 0.3426 0.5985 0.116 0.816 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR772643 2 0.2895 0.6370 0.064 0.868 0.000 0.016 0.000 0.052
#> SRR772644 1 0.4324 0.5079 0.724 0.192 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR772645 1 0.4091 0.5011 0.732 0.200 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR772646 2 0.1429 0.6475 0.004 0.940 0.000 0.052 0.000 0.004
#> SRR772647 2 0.1655 0.6499 0.008 0.932 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR772648 2 0.2594 0.6437 0.056 0.888 0.000 0.020 0.000 0.036
#> SRR772649 2 0.2459 0.6463 0.052 0.896 0.000 0.020 0.000 0.032
#> SRR772650 2 0.5327 -0.2606 0.436 0.460 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR772651 2 0.5327 -0.2606 0.436 0.460 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR772652 1 0.3351 0.6896 0.832 0.104 0.000 0.000 0.016 0.048
#> SRR772653 1 0.3396 0.6840 0.828 0.108 0.000 0.000 0.016 0.048
#> SRR772654 2 0.4409 0.4507 0.184 0.732 0.000 0.008 0.004 0.072
#> SRR772655 2 0.4520 0.4368 0.192 0.720 0.000 0.008 0.004 0.076
#> SRR772656 3 0.0458 0.7554 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772657 3 0.3502 0.6437 0.004 0.004 0.784 0.000 0.188 0.020
#> SRR772658 4 0.2932 0.6375 0.004 0.028 0.000 0.868 0.020 0.080
#> SRR772659 4 0.2932 0.6375 0.004 0.028 0.000 0.868 0.020 0.080
#> SRR772660 2 0.4328 0.5966 0.052 0.788 0.000 0.056 0.012 0.092
#> SRR772661 5 0.7441 0.3133 0.156 0.192 0.028 0.000 0.484 0.140
#> SRR772662 2 0.5195 -0.0433 0.360 0.540 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR772663 2 0.5376 -0.2225 0.408 0.480 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR772664 2 0.2737 0.6526 0.036 0.880 0.000 0.060 0.000 0.024
#> SRR772665 2 0.2924 0.6504 0.040 0.868 0.000 0.068 0.000 0.024
#> SRR772666 3 0.3630 0.7507 0.032 0.000 0.756 0.000 0.212 0.000
#> SRR772667 2 0.6530 0.0649 0.004 0.512 0.000 0.292 0.076 0.116
#> SRR772668 4 0.4610 0.4893 0.004 0.008 0.000 0.724 0.112 0.152
#> SRR772669 4 0.4481 0.4982 0.004 0.008 0.000 0.736 0.100 0.152
#> SRR772670 2 0.5163 0.2245 0.276 0.608 0.000 0.004 0.000 0.112
#> SRR772671 2 0.4986 0.2378 0.284 0.612 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR772672 2 0.2266 0.6528 0.012 0.908 0.000 0.052 0.004 0.024
#> SRR772673 2 0.2359 0.6531 0.016 0.904 0.000 0.052 0.004 0.024
#> SRR772674 3 0.0692 0.7589 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR772675 2 0.7836 -0.2160 0.136 0.352 0.032 0.000 0.324 0.156
#> SRR772676 2 0.4718 0.3141 0.220 0.684 0.000 0.008 0.000 0.088
#> SRR772677 2 0.4875 0.2850 0.224 0.668 0.000 0.008 0.000 0.100
#> SRR772678 2 0.7781 -0.2141 0.132 0.352 0.024 0.000 0.316 0.176
#> SRR772679 2 0.5228 -0.0644 0.376 0.524 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR772680 2 0.5309 -0.1810 0.408 0.488 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR772681 3 0.0692 0.7589 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR772682 2 0.1542 0.6522 0.004 0.936 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR772683 2 0.1296 0.6528 0.004 0.948 0.000 0.044 0.000 0.004
#> SRR772685 2 0.2699 0.6570 0.048 0.884 0.000 0.040 0.000 0.028
#> SRR772686 3 0.3682 0.7534 0.032 0.000 0.764 0.000 0.200 0.004
#> SRR772687 5 0.5888 0.3454 0.176 0.000 0.316 0.000 0.500 0.008
#> SRR772688 4 0.2664 0.7578 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR772689 4 0.2664 0.7578 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.3345 0.7560 0.028 0.000 0.788 0.000 0.184 0.000
#> SRR772691 2 0.6872 0.2442 0.024 0.536 0.000 0.172 0.068 0.200
#> SRR772692 2 0.5387 0.0137 0.332 0.560 0.000 0.004 0.004 0.100
#> SRR772693 2 0.4818 0.3562 0.232 0.664 0.000 0.004 0.000 0.100
#> SRR772694 2 0.3545 0.6480 0.044 0.832 0.000 0.060 0.000 0.064
#> SRR772695 2 0.4353 0.5320 0.148 0.748 0.000 0.016 0.000 0.088
#> SRR772696 2 0.3141 0.6312 0.084 0.852 0.000 0.024 0.000 0.040
#> SRR772697 2 0.3089 0.6318 0.080 0.856 0.000 0.024 0.000 0.040
#> SRR772698 5 0.4705 0.8894 0.260 0.000 0.088 0.000 0.652 0.000
#> SRR772699 1 0.3324 0.7067 0.840 0.088 0.000 0.000 0.024 0.048
#> SRR772700 1 0.3402 0.7058 0.836 0.088 0.000 0.000 0.028 0.048
#> SRR772701 1 0.3792 0.6122 0.780 0.160 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR772702 1 0.3658 0.6218 0.792 0.152 0.000 0.000 0.008 0.048
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.865 0.930 0.969 0.4930 0.503 0.503
#> 3 3 0.598 0.817 0.886 0.2252 0.772 0.597
#> 4 4 0.670 0.823 0.898 0.1380 0.776 0.515
#> 5 5 0.696 0.650 0.834 0.0763 0.964 0.884
#> 6 6 0.670 0.601 0.763 0.0595 0.895 0.654
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.6887 0.7924 0.816 0.184
#> SRR772344 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.3733 0.9070 0.928 0.072
#> SRR772347 1 0.5178 0.8675 0.884 0.116
#> SRR772348 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772353 2 0.9795 0.2470 0.416 0.584
#> SRR772354 2 0.5294 0.8560 0.120 0.880
#> SRR772355 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772357 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772358 1 0.1414 0.9411 0.980 0.020
#> SRR772359 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772360 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772361 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.2423 0.9273 0.960 0.040
#> SRR772365 1 0.8267 0.6810 0.740 0.260
#> SRR772366 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.0672 0.9735 0.008 0.992
#> SRR772370 2 0.0938 0.9701 0.012 0.988
#> SRR772371 1 0.9815 0.3337 0.580 0.420
#> SRR772372 1 1.0000 0.0832 0.504 0.496
#> SRR772373 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.3431 0.9120 0.936 0.064
#> SRR772378 2 0.5629 0.8396 0.132 0.868
#> SRR772379 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772380 2 0.7139 0.7482 0.196 0.804
#> SRR772381 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772384 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772385 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772386 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772393 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772394 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772395 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772402 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.0938 0.9701 0.012 0.988
#> SRR772411 2 0.1184 0.9665 0.016 0.984
#> SRR772412 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772417 1 0.9815 0.3332 0.580 0.420
#> SRR772418 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.0672 0.9735 0.008 0.992
#> SRR772422 2 0.0376 0.9768 0.004 0.996
#> SRR772423 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772430 1 0.9815 0.3163 0.580 0.420
#> SRR772431 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.2948 0.9184 0.948 0.052
#> SRR772436 1 0.1184 0.9430 0.984 0.016
#> SRR772437 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772440 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0376 0.9500 0.996 0.004
#> SRR772448 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772449 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0938 0.9456 0.988 0.012
#> SRR772454 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772455 1 0.7299 0.7673 0.796 0.204
#> SRR772456 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.0376 0.9768 0.004 0.996
#> SRR772466 2 0.0376 0.9768 0.004 0.996
#> SRR772467 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.7219 0.7719 0.800 0.200
#> SRR772470 1 0.5294 0.8635 0.880 0.120
#> SRR772471 1 0.7139 0.7772 0.804 0.196
#> SRR772472 1 0.5294 0.8636 0.880 0.120
#> SRR772473 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772480 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772481 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772482 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772484 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772485 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772486 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.5059 0.8641 0.112 0.888
#> SRR772489 2 0.0376 0.9768 0.004 0.996
#> SRR772490 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772498 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772499 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.7453 0.7556 0.788 0.212
#> SRR772503 1 0.4562 0.8861 0.904 0.096
#> SRR772504 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.4939 0.8718 0.892 0.108
#> SRR772510 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772512 1 0.8713 0.6058 0.708 0.292
#> SRR772513 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.7376 0.7292 0.208 0.792
#> SRR772522 2 0.7950 0.6737 0.240 0.760
#> SRR772523 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.7376 0.7613 0.792 0.208
#> SRR772535 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772541 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772547 1 0.8813 0.6113 0.700 0.300
#> SRR772548 1 0.6438 0.8167 0.836 0.164
#> SRR772549 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772551 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772552 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772553 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772554 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.4562 0.8859 0.904 0.096
#> SRR772559 1 0.5946 0.8386 0.856 0.144
#> SRR772560 2 0.9248 0.4608 0.340 0.660
#> SRR772561 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.1843 0.9362 0.972 0.028
#> SRR772571 1 0.2778 0.9230 0.952 0.048
#> SRR772572 1 0.9795 0.3443 0.584 0.416
#> SRR772573 2 0.9775 0.2592 0.412 0.588
#> SRR772574 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0672 0.9479 0.992 0.008
#> SRR772576 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772577 2 0.2236 0.9472 0.036 0.964
#> SRR772578 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.2236 0.9475 0.036 0.964
#> SRR772582 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772583 2 0.0672 0.9736 0.008 0.992
#> SRR772584 2 0.0672 0.9735 0.008 0.992
#> SRR772585 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.4022 0.8994 0.920 0.080
#> SRR772588 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772600 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.0376 0.9769 0.004 0.996
#> SRR772606 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.8207 0.6890 0.744 0.256
#> SRR772617 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.0938 0.9703 0.012 0.988
#> SRR772622 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772623 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772627 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772628 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772630 1 1.0000 0.0637 0.500 0.500
#> SRR772631 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.0376 0.9500 0.996 0.004
#> SRR772635 1 0.4939 0.8750 0.892 0.108
#> SRR772636 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.2043 0.9511 0.032 0.968
#> SRR772643 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772644 1 0.3584 0.9088 0.932 0.068
#> SRR772645 1 0.3879 0.9026 0.924 0.076
#> SRR772646 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772650 1 0.6343 0.8212 0.840 0.160
#> SRR772651 1 0.2603 0.9258 0.956 0.044
#> SRR772652 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772654 2 0.6887 0.7691 0.184 0.816
#> SRR772655 2 0.8207 0.6450 0.256 0.744
#> SRR772656 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.0376 0.9500 0.996 0.004
#> SRR772662 1 0.3114 0.9189 0.944 0.056
#> SRR772663 1 0.5178 0.8696 0.884 0.116
#> SRR772664 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.6973 0.7603 0.188 0.812
#> SRR772671 2 0.5294 0.8540 0.120 0.880
#> SRR772672 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772676 2 0.8713 0.5718 0.292 0.708
#> SRR772677 2 0.7139 0.7482 0.196 0.804
#> SRR772678 1 0.0938 0.9459 0.988 0.012
#> SRR772679 1 0.7528 0.7487 0.784 0.216
#> SRR772680 1 0.4298 0.8930 0.912 0.088
#> SRR772681 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772692 1 0.7745 0.7363 0.772 0.228
#> SRR772693 2 0.3431 0.9197 0.064 0.936
#> SRR772694 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772696 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772697 2 0.0000 0.9800 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.9520 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772342 1 0.3879 0.8227 0.848 0.000 0.152
#> SRR772343 1 0.0237 0.8223 0.996 0.000 0.004
#> SRR772344 2 0.0237 0.8763 0.004 0.996 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 1 0.0237 0.8223 0.996 0.000 0.004
#> SRR772347 1 0.0237 0.8223 0.996 0.000 0.004
#> SRR772348 2 0.3619 0.8826 0.136 0.864 0.000
#> SRR772349 2 0.2448 0.8857 0.076 0.924 0.000
#> SRR772350 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772351 2 0.3340 0.8851 0.120 0.880 0.000
#> SRR772352 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772353 1 0.0424 0.8172 0.992 0.008 0.000
#> SRR772354 1 0.0747 0.8140 0.984 0.016 0.000
#> SRR772355 2 0.3879 0.8795 0.152 0.848 0.000
#> SRR772356 2 0.2796 0.8863 0.092 0.908 0.000
#> SRR772357 1 0.2625 0.8329 0.916 0.000 0.084
#> SRR772358 1 0.2165 0.8323 0.936 0.000 0.064
#> SRR772359 1 0.0000 0.8207 1.000 0.000 0.000
#> SRR772360 1 0.0237 0.8192 0.996 0.004 0.000
#> SRR772361 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772362 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.1163 0.8250 0.972 0.000 0.028
#> SRR772365 1 0.0424 0.8186 0.992 0.000 0.008
#> SRR772366 3 0.0592 0.9832 0.012 0.000 0.988
#> SRR772367 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772368 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772369 1 0.2356 0.7752 0.928 0.072 0.000
#> SRR772370 1 0.0747 0.8139 0.984 0.016 0.000
#> SRR772371 1 0.4521 0.6638 0.816 0.180 0.004
#> SRR772372 1 0.4228 0.6988 0.844 0.148 0.008
#> SRR772373 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772374 2 0.4121 0.8747 0.168 0.832 0.000
#> SRR772375 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772376 2 0.2625 0.8857 0.084 0.916 0.000
#> SRR772377 3 0.2550 0.9437 0.040 0.024 0.936
#> SRR772378 1 0.0424 0.8172 0.992 0.008 0.000
#> SRR772379 1 0.5678 0.4003 0.684 0.316 0.000
#> SRR772380 1 0.3340 0.7357 0.880 0.120 0.000
#> SRR772381 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772382 1 0.3116 0.8315 0.892 0.000 0.108
#> SRR772383 1 0.3686 0.8264 0.860 0.000 0.140
#> SRR772384 3 0.2165 0.9402 0.064 0.000 0.936
#> SRR772385 2 0.2261 0.8849 0.068 0.932 0.000
#> SRR772386 2 0.4346 0.8664 0.184 0.816 0.000
#> SRR772387 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772388 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772389 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772390 3 0.0592 0.9832 0.012 0.000 0.988
#> SRR772391 1 0.4002 0.8195 0.840 0.000 0.160
#> SRR772392 1 0.3816 0.8240 0.852 0.000 0.148
#> SRR772393 2 0.5728 0.7867 0.272 0.720 0.008
#> SRR772394 2 0.6379 0.6347 0.368 0.624 0.008
#> SRR772395 2 0.3116 0.8861 0.108 0.892 0.000
#> SRR772396 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772397 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772398 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772399 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772400 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772401 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772402 2 0.1170 0.8774 0.016 0.976 0.008
#> SRR772403 2 0.1170 0.8774 0.016 0.976 0.008
#> SRR772404 2 0.3879 0.8790 0.152 0.848 0.000
#> SRR772405 3 0.1964 0.9463 0.056 0.000 0.944
#> SRR772406 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772407 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 1 0.5621 0.4225 0.692 0.308 0.000
#> SRR772411 1 0.5363 0.4997 0.724 0.276 0.000
#> SRR772412 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772413 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772414 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772415 1 0.6286 -0.1978 0.536 0.464 0.000
#> SRR772416 2 0.5810 0.6875 0.336 0.664 0.000
#> SRR772417 1 0.0424 0.8185 0.992 0.008 0.000
#> SRR772418 3 0.0592 0.9832 0.012 0.000 0.988
#> SRR772419 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 1 0.5327 0.4726 0.728 0.272 0.000
#> SRR772422 2 0.5948 0.6583 0.360 0.640 0.000
#> SRR772423 2 0.1015 0.8762 0.012 0.980 0.008
#> SRR772424 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772425 2 0.4002 0.8776 0.160 0.840 0.000
#> SRR772426 2 0.0592 0.8779 0.012 0.988 0.000
#> SRR772427 2 0.0592 0.8779 0.012 0.988 0.000
#> SRR772428 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772429 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772430 1 0.0661 0.8192 0.988 0.008 0.004
#> SRR772431 2 0.1453 0.8768 0.024 0.968 0.008
#> SRR772432 2 0.1453 0.8768 0.024 0.968 0.008
#> SRR772433 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772434 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772435 1 0.0424 0.8172 0.992 0.008 0.000
#> SRR772436 1 0.0848 0.8207 0.984 0.008 0.008
#> SRR772437 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772438 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772439 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772440 2 0.6286 0.4177 0.464 0.536 0.000
#> SRR772441 2 0.5431 0.7726 0.284 0.716 0.000
#> SRR772442 2 0.1170 0.8774 0.016 0.976 0.008
#> SRR772443 2 0.1711 0.8805 0.032 0.960 0.008
#> SRR772444 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772445 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772446 1 0.3340 0.8300 0.880 0.000 0.120
#> SRR772447 1 0.1411 0.8296 0.964 0.000 0.036
#> SRR772448 2 0.5926 0.6659 0.356 0.644 0.000
#> SRR772449 2 0.4178 0.8725 0.172 0.828 0.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.3941 0.8212 0.844 0.000 0.156
#> SRR772453 1 0.3816 0.8238 0.852 0.000 0.148
#> SRR772454 1 0.0747 0.8251 0.984 0.000 0.016
#> SRR772455 1 0.0237 0.8192 0.996 0.004 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772459 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772460 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772461 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772462 2 0.3267 0.8855 0.116 0.884 0.000
#> SRR772463 2 0.3686 0.8824 0.140 0.860 0.000
#> SRR772464 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772465 2 0.6299 0.3508 0.476 0.524 0.000
#> SRR772466 1 0.4346 0.6594 0.816 0.184 0.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.2066 0.8322 0.940 0.000 0.060
#> SRR772470 1 0.2165 0.8323 0.936 0.000 0.064
#> SRR772471 1 0.2066 0.8321 0.940 0.000 0.060
#> SRR772472 1 0.1860 0.8314 0.948 0.000 0.052
#> SRR772473 2 0.2680 0.8848 0.068 0.924 0.008
#> SRR772474 2 0.1315 0.8785 0.020 0.972 0.008
#> SRR772475 2 0.3752 0.8807 0.144 0.856 0.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.4002 0.8195 0.840 0.000 0.160
#> SRR772479 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772480 2 0.5728 0.7890 0.272 0.720 0.008
#> SRR772481 2 0.6297 0.6739 0.352 0.640 0.008
#> SRR772482 1 0.3879 0.8228 0.848 0.000 0.152
#> SRR772483 1 0.3340 0.8300 0.880 0.000 0.120
#> SRR772484 2 0.5678 0.7289 0.316 0.684 0.000
#> SRR772485 2 0.5591 0.7457 0.304 0.696 0.000
#> SRR772486 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772487 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772488 1 0.5785 0.3103 0.668 0.332 0.000
#> SRR772489 1 0.6062 0.1276 0.616 0.384 0.000
#> SRR772490 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772491 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772492 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772493 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772494 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772497 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772498 2 0.4291 0.8803 0.152 0.840 0.008
#> SRR772499 2 0.3965 0.8835 0.132 0.860 0.008
#> SRR772500 2 0.0892 0.8798 0.020 0.980 0.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 1 0.1289 0.8062 0.968 0.032 0.000
#> SRR772503 1 0.0000 0.8207 1.000 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.3192 0.8858 0.112 0.888 0.000
#> SRR772505 2 0.2711 0.8864 0.088 0.912 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.0424 0.8776 0.008 0.992 0.000
#> SRR772509 1 0.9433 0.0622 0.476 0.192 0.332
#> SRR772510 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772511 1 0.4796 0.6105 0.780 0.220 0.000
#> SRR772512 3 0.4602 0.8041 0.108 0.040 0.852
#> SRR772513 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772514 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772515 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772516 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772517 2 0.4399 0.8639 0.188 0.812 0.000
#> SRR772518 2 0.5431 0.7724 0.284 0.716 0.000
#> SRR772519 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772520 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772521 1 0.3551 0.7231 0.868 0.132 0.000
#> SRR772522 1 0.2796 0.7619 0.908 0.092 0.000
#> SRR772523 2 0.1031 0.8804 0.024 0.976 0.000
#> SRR772524 2 0.3116 0.8860 0.108 0.892 0.000
#> SRR772525 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772526 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0592 0.9832 0.012 0.000 0.988
#> SRR772529 1 0.3412 0.8294 0.876 0.000 0.124
#> SRR772530 1 0.2537 0.8326 0.920 0.000 0.080
#> SRR772531 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772532 2 0.3482 0.8841 0.128 0.872 0.000
#> SRR772533 2 0.3412 0.8844 0.124 0.876 0.000
#> SRR772534 1 0.0000 0.8207 1.000 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.3941 0.8787 0.156 0.844 0.000
#> SRR772536 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772537 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772538 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772539 1 0.3816 0.8243 0.852 0.000 0.148
#> SRR772540 1 0.3267 0.8303 0.884 0.000 0.116
#> SRR772541 2 0.5178 0.8058 0.256 0.744 0.000
#> SRR772542 1 0.3941 0.8209 0.844 0.000 0.156
#> SRR772543 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772544 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772545 1 0.3816 0.8240 0.852 0.000 0.148
#> SRR772546 1 0.3879 0.8227 0.848 0.000 0.152
#> SRR772547 1 0.2400 0.7868 0.932 0.064 0.004
#> SRR772548 1 0.3192 0.8309 0.888 0.000 0.112
#> SRR772549 1 0.3816 0.8241 0.852 0.000 0.148
#> SRR772550 1 0.3816 0.8241 0.852 0.000 0.148
#> SRR772551 1 0.6192 0.0246 0.580 0.420 0.000
#> SRR772552 2 0.6215 0.4852 0.428 0.572 0.000
#> SRR772553 2 0.3816 0.8797 0.148 0.852 0.000
#> SRR772554 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772555 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772556 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772557 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772558 1 0.0000 0.8207 1.000 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.1529 0.8301 0.960 0.000 0.040
#> SRR772560 1 0.4291 0.6681 0.820 0.180 0.000
#> SRR772561 3 0.0592 0.9810 0.012 0.000 0.988
#> SRR772562 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772563 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772564 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772565 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772566 1 0.4178 0.8113 0.828 0.000 0.172
#> SRR772567 1 0.4178 0.8112 0.828 0.000 0.172
#> SRR772568 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772569 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772570 1 0.3038 0.8316 0.896 0.000 0.104
#> SRR772571 1 0.0424 0.8236 0.992 0.000 0.008
#> SRR772572 1 0.2165 0.7849 0.936 0.064 0.000
#> SRR772573 1 0.5363 0.4968 0.724 0.276 0.000
#> SRR772574 1 0.1411 0.8297 0.964 0.000 0.036
#> SRR772575 1 0.0000 0.8207 1.000 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.6079 0.6041 0.388 0.612 0.000
#> SRR772577 2 0.6309 0.3341 0.496 0.504 0.000
#> SRR772578 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772579 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772580 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772581 1 0.3112 0.7558 0.900 0.096 0.004
#> SRR772582 2 0.6299 0.3775 0.476 0.524 0.000
#> SRR772583 1 0.1643 0.7990 0.956 0.044 0.000
#> SRR772584 1 0.5529 0.4112 0.704 0.296 0.000
#> SRR772585 2 0.4399 0.8649 0.188 0.812 0.000
#> SRR772586 3 0.1289 0.9674 0.032 0.000 0.968
#> SRR772587 1 0.2448 0.8326 0.924 0.000 0.076
#> SRR772588 2 0.0237 0.8762 0.004 0.996 0.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772591 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772592 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772593 3 0.0592 0.9832 0.012 0.000 0.988
#> SRR772594 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772595 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772596 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772597 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772598 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772599 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772600 2 0.1711 0.8770 0.032 0.960 0.008
#> SRR772601 2 0.1015 0.8762 0.012 0.980 0.008
#> SRR772602 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772603 2 0.5335 0.8205 0.232 0.760 0.008
#> SRR772604 2 0.1315 0.8784 0.020 0.972 0.008
#> SRR772605 2 0.6307 0.3132 0.488 0.512 0.000
#> SRR772606 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772607 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772608 2 0.5882 0.6790 0.348 0.652 0.000
#> SRR772609 2 0.6291 0.4165 0.468 0.532 0.000
#> SRR772610 2 0.4002 0.8776 0.160 0.840 0.000
#> SRR772611 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772612 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772613 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772614 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772615 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772616 1 0.0661 0.8233 0.988 0.004 0.008
#> SRR772617 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772618 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772619 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772620 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772621 1 0.5968 0.2014 0.636 0.364 0.000
#> SRR772622 1 0.5706 0.3441 0.680 0.320 0.000
#> SRR772623 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772624 3 0.1289 0.9674 0.032 0.000 0.968
#> SRR772625 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772626 2 0.4589 0.8741 0.172 0.820 0.008
#> SRR772627 2 0.3295 0.8863 0.096 0.896 0.008
#> SRR772628 1 0.3482 0.8286 0.872 0.000 0.128
#> SRR772629 1 0.3619 0.8271 0.864 0.000 0.136
#> SRR772630 1 0.2261 0.7826 0.932 0.068 0.000
#> SRR772631 3 0.0592 0.9832 0.012 0.000 0.988
#> SRR772632 2 0.0237 0.8763 0.004 0.996 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 1 0.0237 0.8221 0.996 0.000 0.004
#> SRR772635 1 0.0424 0.8172 0.992 0.008 0.000
#> SRR772636 2 0.2261 0.8849 0.068 0.932 0.000
#> SRR772637 1 0.3941 0.8212 0.844 0.000 0.156
#> SRR772638 1 0.4002 0.8193 0.840 0.000 0.160
#> SRR772639 2 0.3816 0.8807 0.148 0.852 0.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.5882 0.2613 0.652 0.348 0.000
#> SRR772643 2 0.5016 0.8199 0.240 0.760 0.000
#> SRR772644 1 0.1643 0.8307 0.956 0.000 0.044
#> SRR772645 1 0.1529 0.8301 0.960 0.000 0.040
#> SRR772646 2 0.3752 0.8815 0.144 0.856 0.000
#> SRR772647 2 0.3879 0.8797 0.152 0.848 0.000
#> SRR772648 2 0.5431 0.7720 0.284 0.716 0.000
#> SRR772649 2 0.4555 0.8555 0.200 0.800 0.000
#> SRR772650 1 0.0000 0.8207 1.000 0.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0424 0.8236 0.992 0.000 0.008
#> SRR772652 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772653 1 0.4002 0.8194 0.840 0.000 0.160
#> SRR772654 1 0.0592 0.8158 0.988 0.012 0.000
#> SRR772655 1 0.0592 0.8157 0.988 0.012 0.000
#> SRR772656 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772657 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772658 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772659 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772660 2 0.4178 0.8732 0.172 0.828 0.000
#> SRR772661 3 0.1964 0.9484 0.056 0.000 0.944
#> SRR772662 1 0.0000 0.8207 1.000 0.000 0.000
#> SRR772663 1 0.0237 0.8192 0.996 0.004 0.000
#> SRR772664 2 0.3879 0.8790 0.152 0.848 0.000
#> SRR772665 2 0.3879 0.8790 0.152 0.848 0.000
#> SRR772666 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772667 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772668 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772669 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772670 1 0.2625 0.7694 0.916 0.084 0.000
#> SRR772671 1 0.0424 0.8172 0.992 0.008 0.000
#> SRR772672 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772673 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772674 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772675 3 0.2261 0.9413 0.068 0.000 0.932
#> SRR772676 1 0.5621 0.4130 0.692 0.308 0.000
#> SRR772677 1 0.5016 0.5635 0.760 0.240 0.000
#> SRR772678 3 0.2682 0.9261 0.076 0.004 0.920
#> SRR772679 1 0.0424 0.8172 0.992 0.008 0.000
#> SRR772680 1 0.0000 0.8207 1.000 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772682 2 0.4002 0.8773 0.160 0.840 0.000
#> SRR772683 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772685 2 0.5810 0.6982 0.336 0.664 0.000
#> SRR772686 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772687 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772688 2 0.0000 0.8749 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0424 0.8719 0.000 0.992 0.008
#> SRR772690 3 0.0424 0.9848 0.008 0.000 0.992
#> SRR772691 2 0.2356 0.8851 0.072 0.928 0.000
#> SRR772692 1 0.0237 0.8192 0.996 0.004 0.000
#> SRR772693 1 0.5760 0.3206 0.672 0.328 0.000
#> SRR772694 2 0.4062 0.8762 0.164 0.836 0.000
#> SRR772695 1 0.6026 0.1565 0.624 0.376 0.000
#> SRR772696 2 0.4654 0.8500 0.208 0.792 0.000
#> SRR772697 2 0.4121 0.8744 0.168 0.832 0.000
#> SRR772698 3 0.0592 0.9832 0.012 0.000 0.988
#> SRR772699 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
#> SRR772700 1 0.3752 0.8250 0.856 0.000 0.144
#> SRR772701 1 0.4002 0.8194 0.840 0.000 0.160
#> SRR772702 1 0.4062 0.8174 0.836 0.000 0.164
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.3219 0.7930 0.836 0.164 0.000 0.000
#> SRR772344 2 0.3444 0.6449 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772345 2 0.2408 0.7742 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772346 1 0.1398 0.9058 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR772347 1 0.1978 0.8828 0.928 0.068 0.004 0.000
#> SRR772348 2 0.1867 0.8128 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772349 2 0.2704 0.7480 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772350 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772351 2 0.0188 0.8547 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772352 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772353 2 0.4164 0.6598 0.264 0.736 0.000 0.000
#> SRR772354 2 0.3610 0.7340 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772356 2 0.2469 0.7671 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772357 1 0.0188 0.9275 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772359 1 0.2408 0.8519 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR772360 1 0.4585 0.4800 0.668 0.332 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772362 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772363 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772364 1 0.1082 0.9164 0.972 0.020 0.004 0.004
#> SRR772365 1 0.3870 0.7842 0.820 0.164 0.008 0.008
#> SRR772366 3 0.3280 0.9210 0.016 0.000 0.860 0.124
#> SRR772367 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772368 2 0.0188 0.8546 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772369 2 0.2814 0.7922 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR772370 2 0.2868 0.7878 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR772371 1 0.5592 0.3943 0.608 0.368 0.008 0.016
#> SRR772372 1 0.5646 0.3494 0.592 0.384 0.008 0.016
#> SRR772373 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772376 2 0.2973 0.7166 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772377 3 0.4606 0.8768 0.008 0.060 0.808 0.124
#> SRR772378 2 0.4830 0.3934 0.392 0.608 0.000 0.000
#> SRR772379 2 0.2281 0.8209 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR772380 2 0.4522 0.5536 0.320 0.680 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772384 3 0.4768 0.8927 0.032 0.036 0.808 0.124
#> SRR772385 2 0.4500 0.5612 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR772386 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.3280 0.9210 0.016 0.000 0.860 0.124
#> SRR772391 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.2140 0.8319 0.008 0.932 0.008 0.052
#> SRR772394 2 0.2546 0.8368 0.028 0.920 0.008 0.044
#> SRR772395 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772402 4 0.4647 0.7695 0.000 0.288 0.008 0.704
#> SRR772403 4 0.4673 0.7645 0.000 0.292 0.008 0.700
#> SRR772404 2 0.2589 0.7549 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR772405 3 0.4581 0.8987 0.028 0.032 0.816 0.124
#> SRR772406 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772408 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772409 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772410 2 0.2345 0.8162 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR772411 2 0.2814 0.7910 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR772412 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772415 2 0.1940 0.8341 0.076 0.924 0.000 0.000
#> SRR772416 2 0.0336 0.8567 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772417 1 0.4888 0.2947 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR772418 3 0.3280 0.9210 0.016 0.000 0.860 0.124
#> SRR772419 4 0.4776 0.6759 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR772420 4 0.4382 0.8064 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR772421 2 0.2408 0.8155 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR772422 2 0.1302 0.8491 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR772423 4 0.4391 0.8102 0.000 0.252 0.008 0.740
#> SRR772424 4 0.3196 0.8823 0.000 0.136 0.008 0.856
#> SRR772425 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772426 2 0.4967 -0.2593 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR772427 4 0.4998 0.4416 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR772428 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772430 2 0.4989 0.1778 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR772431 4 0.4792 0.7336 0.000 0.312 0.008 0.680
#> SRR772432 4 0.4792 0.7336 0.000 0.312 0.008 0.680
#> SRR772433 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772435 1 0.3873 0.6937 0.772 0.228 0.000 0.000
#> SRR772436 1 0.2408 0.8515 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772440 2 0.1474 0.8469 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR772441 2 0.0592 0.8560 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR772442 4 0.4990 0.6692 0.000 0.352 0.008 0.640
#> SRR772443 2 0.5220 -0.0132 0.000 0.568 0.008 0.424
#> SRR772444 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0188 0.9275 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.1211 0.8507 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR772449 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772450 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772451 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772452 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0469 0.9239 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772455 1 0.3444 0.7739 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR772456 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772457 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772458 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772460 4 0.2868 0.8892 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR772461 4 0.2868 0.8892 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR772462 2 0.0336 0.8528 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772463 2 0.0188 0.8545 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772464 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772465 2 0.1211 0.8502 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR772466 2 0.2530 0.8108 0.112 0.888 0.000 0.000
#> SRR772467 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772468 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772469 1 0.3024 0.8085 0.852 0.148 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.1211 0.9065 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.3123 0.8000 0.844 0.156 0.000 0.000
#> SRR772472 1 0.1637 0.8910 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR772473 2 0.4391 0.5654 0.000 0.740 0.008 0.252
#> SRR772474 2 0.5281 -0.1849 0.000 0.528 0.008 0.464
#> SRR772475 2 0.4304 0.6189 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR772476 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772477 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772478 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.3072 0.8186 0.024 0.892 0.008 0.076
#> SRR772481 2 0.3127 0.8210 0.032 0.892 0.008 0.068
#> SRR772482 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772484 2 0.1118 0.8518 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR772485 2 0.1022 0.8531 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR772486 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772488 2 0.3486 0.7471 0.188 0.812 0.000 0.000
#> SRR772489 2 0.2408 0.8181 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR772490 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772492 4 0.2868 0.8892 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR772493 4 0.2868 0.8892 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR772494 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772495 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772496 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772498 2 0.1545 0.8368 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR772499 2 0.1722 0.8329 0.000 0.944 0.008 0.048
#> SRR772500 2 0.1118 0.8354 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772501 2 0.2281 0.7793 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772502 1 0.4977 0.1387 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR772503 1 0.2216 0.8647 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772505 2 0.0336 0.8526 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772506 4 0.3907 0.8762 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR772507 4 0.3975 0.8698 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR772508 2 0.4605 0.2797 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR772509 2 0.5618 0.6813 0.020 0.756 0.100 0.124
#> SRR772510 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772511 2 0.3032 0.7956 0.124 0.868 0.000 0.008
#> SRR772512 3 0.4122 0.6374 0.004 0.236 0.760 0.000
#> SRR772513 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772517 2 0.0336 0.8564 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772518 2 0.0921 0.8542 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772521 2 0.3649 0.7212 0.204 0.796 0.000 0.000
#> SRR772522 2 0.3569 0.7313 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR772523 2 0.2408 0.7669 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772524 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772525 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772526 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772527 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772528 3 0.3280 0.9210 0.016 0.000 0.860 0.124
#> SRR772529 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772534 1 0.2469 0.8508 0.892 0.108 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772537 4 0.3052 0.8887 0.000 0.136 0.004 0.860
#> SRR772538 4 0.3052 0.8887 0.000 0.136 0.004 0.860
#> SRR772539 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0188 0.9275 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.0707 0.8563 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772544 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772547 1 0.4353 0.6968 0.756 0.232 0.000 0.012
#> SRR772548 1 0.2408 0.8523 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.3032 0.7992 0.124 0.868 0.000 0.008
#> SRR772552 2 0.1389 0.8478 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR772553 2 0.3024 0.7828 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772554 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0707 0.9199 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0707 0.9195 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772560 2 0.4776 0.4205 0.376 0.624 0.000 0.000
#> SRR772561 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772570 1 0.0592 0.9214 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0921 0.9156 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR772572 1 0.4855 0.3348 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR772573 2 0.4941 0.2338 0.436 0.564 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.0336 0.9255 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0592 0.9220 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.1211 0.8512 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR772577 2 0.2216 0.8279 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772578 4 0.3208 0.8929 0.000 0.148 0.004 0.848
#> SRR772579 4 0.3024 0.8929 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR772580 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772581 2 0.4464 0.6921 0.224 0.760 0.004 0.012
#> SRR772582 2 0.1953 0.8483 0.044 0.940 0.004 0.012
#> SRR772583 2 0.3688 0.7208 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR772584 2 0.2760 0.8004 0.128 0.872 0.000 0.000
#> SRR772585 2 0.0188 0.8563 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772586 3 0.4046 0.9035 0.048 0.000 0.828 0.124
#> SRR772587 1 0.0921 0.9148 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR772588 2 0.3942 0.5391 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR772589 2 0.4972 -0.2606 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772590 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772593 3 0.3392 0.9196 0.020 0.000 0.856 0.124
#> SRR772594 4 0.3196 0.8880 0.000 0.136 0.008 0.856
#> SRR772595 4 0.3105 0.8899 0.000 0.140 0.004 0.856
#> SRR772596 3 0.3280 0.9210 0.016 0.000 0.860 0.124
#> SRR772597 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772600 4 0.5172 0.5598 0.000 0.404 0.008 0.588
#> SRR772601 4 0.4647 0.7688 0.000 0.288 0.008 0.704
#> SRR772602 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772603 2 0.3972 0.7445 0.016 0.824 0.008 0.152
#> SRR772604 4 0.5055 0.6411 0.000 0.368 0.008 0.624
#> SRR772605 2 0.1867 0.8357 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR772606 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.1118 0.8520 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR772609 2 0.1474 0.8459 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772612 4 0.3032 0.8807 0.000 0.124 0.008 0.868
#> SRR772613 4 0.3032 0.8807 0.000 0.124 0.008 0.868
#> SRR772614 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.3400 0.7749 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR772617 4 0.3032 0.8807 0.000 0.124 0.008 0.868
#> SRR772618 4 0.3032 0.8807 0.000 0.124 0.008 0.868
#> SRR772619 4 0.2868 0.8892 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR772620 4 0.2868 0.8892 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR772621 2 0.2281 0.8215 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR772622 2 0.2469 0.8131 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR772623 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772624 3 0.3962 0.9064 0.044 0.000 0.832 0.124
#> SRR772625 4 0.4356 0.8122 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR772626 2 0.1722 0.8320 0.000 0.944 0.008 0.048
#> SRR772627 2 0.2976 0.7760 0.000 0.872 0.008 0.120
#> SRR772628 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772630 1 0.4961 0.1776 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR772631 3 0.3497 0.9181 0.024 0.000 0.852 0.124
#> SRR772632 2 0.4454 0.3822 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR772633 4 0.4888 0.5986 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR772634 1 0.2530 0.8477 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR772635 2 0.4985 0.1666 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR772636 2 0.4564 0.5383 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR772637 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772640 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772641 4 0.3610 0.8978 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772642 2 0.2345 0.8187 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR772643 2 0.0188 0.8566 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772644 1 0.0336 0.9255 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0188 0.9275 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0188 0.8545 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772647 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772648 2 0.0817 0.8548 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR772649 2 0.0188 0.8564 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772650 1 0.3726 0.7374 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR772651 1 0.1118 0.9100 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772654 2 0.3528 0.7407 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR772655 2 0.3356 0.7567 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR772656 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772657 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772658 4 0.2888 0.8818 0.000 0.124 0.004 0.872
#> SRR772659 4 0.2888 0.8818 0.000 0.124 0.004 0.872
#> SRR772660 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772661 3 0.4676 0.8962 0.032 0.032 0.812 0.124
#> SRR772662 1 0.3311 0.7839 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR772663 1 0.3400 0.7654 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.0469 0.8509 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772665 2 0.2345 0.7746 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772666 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772667 4 0.2760 0.8851 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR772668 4 0.2888 0.8818 0.000 0.124 0.004 0.872
#> SRR772669 4 0.2888 0.8818 0.000 0.124 0.004 0.872
#> SRR772670 2 0.3649 0.7241 0.204 0.796 0.000 0.000
#> SRR772671 2 0.4477 0.5745 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR772672 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772674 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772675 3 0.4481 0.8993 0.024 0.032 0.820 0.124
#> SRR772676 2 0.3444 0.7394 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR772677 2 0.3219 0.7664 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR772678 3 0.5277 0.8576 0.024 0.072 0.780 0.124
#> SRR772679 1 0.4843 0.3117 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR772680 1 0.2647 0.8432 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772685 2 0.1022 0.8531 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR772686 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772687 3 0.1059 0.9451 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR772688 4 0.3528 0.8976 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR772689 4 0.3074 0.8937 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR772690 3 0.0336 0.9494 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772691 2 0.4522 0.5579 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR772692 2 0.4933 0.2846 0.432 0.568 0.000 0.000
#> SRR772693 2 0.2647 0.8086 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR772694 2 0.0188 0.8556 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772695 2 0.2081 0.8295 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR772696 2 0.0336 0.8567 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772697 2 0.0000 0.8560 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772698 3 0.3280 0.9210 0.016 0.000 0.860 0.124
#> SRR772699 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.9294 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.0290 0.87538 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772342 1 0.0865 0.87273 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR772343 1 0.5680 0.47555 0.628 0.160 0.000 0.000 0.212
#> SRR772344 2 0.3766 0.35802 0.000 0.728 0.000 0.268 0.004
#> SRR772345 2 0.3395 0.44188 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR772346 1 0.5279 0.59287 0.652 0.076 0.000 0.004 0.268
#> SRR772347 1 0.5713 0.53769 0.620 0.100 0.000 0.008 0.272
#> SRR772348 2 0.3146 0.66108 0.000 0.856 0.000 0.092 0.052
#> SRR772349 2 0.3810 0.56319 0.000 0.792 0.000 0.168 0.040
#> SRR772350 3 0.4608 0.87260 0.008 0.000 0.644 0.012 0.336
#> SRR772351 2 0.1195 0.71973 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR772352 2 0.0451 0.72153 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR772353 2 0.4964 0.45315 0.096 0.700 0.000 0.000 0.204
#> SRR772354 2 0.4199 0.57442 0.056 0.764 0.000 0.000 0.180
#> SRR772355 2 0.0807 0.72124 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR772356 2 0.2536 0.63965 0.000 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR772357 1 0.1282 0.86835 0.952 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR772358 1 0.1956 0.85311 0.916 0.008 0.000 0.000 0.076
#> SRR772359 1 0.5184 0.57854 0.688 0.176 0.000 0.000 0.136
#> SRR772360 1 0.6356 -0.08318 0.468 0.364 0.000 0.000 0.168
#> SRR772361 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772362 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772363 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772364 1 0.5223 0.53666 0.628 0.048 0.000 0.008 0.316
#> SRR772365 5 0.6538 0.01157 0.396 0.152 0.000 0.008 0.444
#> SRR772366 3 0.0290 0.79597 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772367 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772368 2 0.1952 0.71127 0.000 0.912 0.000 0.004 0.084
#> SRR772369 2 0.2448 0.68360 0.020 0.892 0.000 0.000 0.088
#> SRR772370 2 0.2540 0.67539 0.024 0.888 0.000 0.000 0.088
#> SRR772371 5 0.7104 0.43309 0.252 0.356 0.004 0.008 0.380
#> SRR772372 5 0.7065 0.44822 0.240 0.348 0.004 0.008 0.400
#> SRR772373 2 0.1493 0.71761 0.000 0.948 0.000 0.028 0.024
#> SRR772374 2 0.1211 0.72241 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR772375 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772376 2 0.3521 0.47573 0.000 0.764 0.000 0.232 0.004
#> SRR772377 3 0.1560 0.77021 0.004 0.020 0.948 0.000 0.028
#> SRR772378 2 0.6108 0.09899 0.188 0.564 0.000 0.000 0.248
#> SRR772379 2 0.3970 0.55899 0.024 0.752 0.000 0.000 0.224
#> SRR772380 2 0.5909 0.17383 0.164 0.592 0.000 0.000 0.244
#> SRR772381 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772382 1 0.0771 0.87382 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR772383 1 0.0609 0.87419 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772384 3 0.1651 0.76919 0.008 0.012 0.944 0.000 0.036
#> SRR772385 2 0.7278 -0.15400 0.000 0.364 0.300 0.316 0.020
#> SRR772386 2 0.0771 0.72182 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772387 2 0.0693 0.72245 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR772388 1 0.0290 0.87353 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772389 1 0.0290 0.87353 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772390 3 0.0290 0.79597 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0451 0.87409 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772392 1 0.0771 0.87484 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR772393 2 0.4602 0.14966 0.000 0.640 0.004 0.016 0.340
#> SRR772394 2 0.4633 0.12898 0.000 0.632 0.004 0.016 0.348
#> SRR772395 2 0.2291 0.70653 0.000 0.908 0.000 0.036 0.056
#> SRR772396 1 0.0162 0.87397 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772397 1 0.0451 0.87274 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772398 1 0.2966 0.82135 0.848 0.016 0.000 0.000 0.136
#> SRR772399 1 0.2358 0.84805 0.888 0.008 0.000 0.000 0.104
#> SRR772400 1 0.0955 0.86858 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR772401 1 0.0955 0.86858 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR772402 4 0.6409 0.29657 0.000 0.180 0.000 0.468 0.352
#> SRR772403 4 0.6416 0.28826 0.000 0.180 0.000 0.464 0.356
#> SRR772404 2 0.3413 0.62511 0.000 0.832 0.000 0.124 0.044
#> SRR772405 3 0.1483 0.77482 0.008 0.012 0.952 0.000 0.028
#> SRR772406 2 0.0794 0.72106 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772407 2 0.0703 0.72110 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772408 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772409 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772410 2 0.3283 0.62013 0.028 0.832 0.000 0.000 0.140
#> SRR772411 2 0.3452 0.60049 0.032 0.820 0.000 0.000 0.148
#> SRR772412 1 0.0566 0.87265 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR772413 1 0.0566 0.87265 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR772414 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772415 2 0.1956 0.71291 0.008 0.916 0.000 0.000 0.076
#> SRR772416 2 0.2124 0.70559 0.004 0.900 0.000 0.000 0.096
#> SRR772417 2 0.6610 -0.28321 0.340 0.436 0.000 0.000 0.224
#> SRR772418 3 0.0290 0.79597 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772419 4 0.3635 0.54398 0.000 0.248 0.000 0.748 0.004
#> SRR772420 4 0.3003 0.64436 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR772421 2 0.1956 0.69647 0.008 0.916 0.000 0.000 0.076
#> SRR772422 2 0.1041 0.71733 0.004 0.964 0.000 0.000 0.032
#> SRR772423 4 0.6132 0.39884 0.000 0.140 0.000 0.508 0.352
#> SRR772424 4 0.4938 0.60847 0.000 0.048 0.000 0.640 0.312
#> SRR772425 2 0.0865 0.71882 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR772426 4 0.4659 -0.03253 0.000 0.492 0.000 0.496 0.012
#> SRR772427 4 0.4641 0.05500 0.000 0.456 0.000 0.532 0.012
#> SRR772428 1 0.1041 0.86836 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772429 1 0.1041 0.86836 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772430 2 0.6420 -0.11850 0.324 0.484 0.000 0.000 0.192
#> SRR772431 4 0.6386 0.28337 0.000 0.172 0.000 0.460 0.368
#> SRR772432 4 0.6386 0.28337 0.000 0.172 0.000 0.460 0.368
#> SRR772433 1 0.1041 0.86836 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772434 1 0.1041 0.86836 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772435 1 0.6087 0.18294 0.552 0.288 0.000 0.000 0.160
#> SRR772436 1 0.5162 0.58865 0.692 0.148 0.000 0.000 0.160
#> SRR772437 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772438 1 0.1644 0.85578 0.940 0.000 0.004 0.008 0.048
#> SRR772439 1 0.1492 0.85993 0.948 0.000 0.004 0.008 0.040
#> SRR772440 2 0.0880 0.72342 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772441 2 0.1043 0.71868 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772442 4 0.6598 0.15837 0.000 0.216 0.000 0.428 0.356
#> SRR772443 5 0.6744 0.29398 0.000 0.332 0.000 0.268 0.400
#> SRR772444 1 0.0451 0.87274 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772445 1 0.0566 0.87265 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR772446 1 0.0162 0.87416 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772447 1 0.0798 0.87310 0.976 0.008 0.000 0.000 0.016
#> SRR772448 2 0.1928 0.69882 0.004 0.920 0.000 0.004 0.072
#> SRR772449 2 0.0963 0.71685 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772450 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772451 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772452 1 0.0162 0.87416 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772453 1 0.0703 0.87336 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772454 1 0.3467 0.78318 0.832 0.036 0.004 0.000 0.128
#> SRR772455 1 0.6225 0.24973 0.548 0.228 0.000 0.000 0.224
#> SRR772456 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772457 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772458 1 0.0404 0.87439 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772459 1 0.0162 0.87397 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772460 4 0.0771 0.79256 0.000 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR772461 4 0.0771 0.79256 0.000 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR772462 2 0.2291 0.70660 0.000 0.908 0.000 0.036 0.056
#> SRR772463 2 0.2209 0.70854 0.000 0.912 0.000 0.032 0.056
#> SRR772464 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772465 2 0.2761 0.64826 0.024 0.872 0.000 0.000 0.104
#> SRR772466 2 0.2707 0.65055 0.024 0.876 0.000 0.000 0.100
#> SRR772467 4 0.1043 0.79416 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR772468 4 0.1121 0.79186 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772469 1 0.4266 0.70068 0.776 0.120 0.000 0.000 0.104
#> SRR772470 1 0.2735 0.83082 0.880 0.036 0.000 0.000 0.084
#> SRR772471 1 0.4351 0.68084 0.768 0.132 0.000 0.000 0.100
#> SRR772472 1 0.2903 0.82120 0.872 0.048 0.000 0.000 0.080
#> SRR772473 2 0.6299 -0.41434 0.000 0.464 0.000 0.156 0.380
#> SRR772474 2 0.6718 -0.47218 0.000 0.384 0.000 0.248 0.368
#> SRR772475 2 0.6793 0.02611 0.000 0.500 0.316 0.160 0.024
#> SRR772476 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772477 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772478 1 0.0451 0.87409 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772479 1 0.0451 0.87409 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772480 5 0.4892 0.30920 0.004 0.488 0.000 0.016 0.492
#> SRR772481 5 0.4815 0.29045 0.008 0.480 0.000 0.008 0.504
#> SRR772482 1 0.1851 0.86284 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772483 1 0.1831 0.86336 0.920 0.004 0.000 0.000 0.076
#> SRR772484 2 0.2353 0.70962 0.004 0.908 0.000 0.028 0.060
#> SRR772485 2 0.2264 0.71152 0.004 0.912 0.000 0.024 0.060
#> SRR772486 1 0.2408 0.84428 0.892 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR772487 1 0.3004 0.82864 0.860 0.004 0.008 0.008 0.120
#> SRR772488 2 0.3110 0.65020 0.080 0.860 0.000 0.000 0.060
#> SRR772489 2 0.1830 0.71351 0.008 0.924 0.000 0.000 0.068
#> SRR772490 1 0.0000 0.87420 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0290 0.87353 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772492 4 0.1310 0.78713 0.000 0.020 0.000 0.956 0.024
#> SRR772493 4 0.1310 0.78713 0.000 0.020 0.000 0.956 0.024
#> SRR772494 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772495 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772496 2 0.0798 0.72413 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR772497 2 0.0771 0.72403 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772498 2 0.4442 0.24287 0.000 0.676 0.004 0.016 0.304
#> SRR772499 2 0.4512 0.23856 0.000 0.676 0.004 0.020 0.300
#> SRR772500 2 0.2574 0.64299 0.000 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR772501 2 0.3530 0.49677 0.000 0.784 0.000 0.204 0.012
#> SRR772502 2 0.6216 -0.13255 0.284 0.536 0.000 0.000 0.180
#> SRR772503 1 0.5233 0.59027 0.680 0.128 0.000 0.000 0.192
#> SRR772504 2 0.1082 0.71786 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR772505 2 0.1168 0.71696 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR772506 4 0.2690 0.68683 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR772507 4 0.2773 0.67698 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR772508 2 0.5002 0.24784 0.000 0.636 0.000 0.312 0.052
#> SRR772509 2 0.5882 0.05062 0.008 0.524 0.388 0.000 0.080
#> SRR772510 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772511 2 0.4104 0.50437 0.032 0.748 0.000 0.000 0.220
#> SRR772512 3 0.6640 0.56292 0.004 0.212 0.472 0.000 0.312
#> SRR772513 2 0.2171 0.71051 0.000 0.912 0.000 0.024 0.064
#> SRR772514 2 0.2036 0.71184 0.000 0.920 0.000 0.024 0.056
#> SRR772515 2 0.1012 0.72104 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR772516 2 0.1195 0.71899 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR772517 2 0.1872 0.71402 0.000 0.928 0.000 0.020 0.052
#> SRR772518 2 0.1638 0.71396 0.004 0.932 0.000 0.000 0.064
#> SRR772519 2 0.1668 0.71689 0.000 0.940 0.000 0.028 0.032
#> SRR772520 2 0.1082 0.71745 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR772521 2 0.4133 0.51540 0.052 0.768 0.000 0.000 0.180
#> SRR772522 2 0.3958 0.52851 0.040 0.776 0.000 0.000 0.184
#> SRR772523 2 0.2006 0.68978 0.000 0.916 0.000 0.072 0.012
#> SRR772524 2 0.0955 0.71750 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR772525 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772526 4 0.1121 0.79186 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772527 4 0.1121 0.79186 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772528 3 0.0290 0.79597 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0771 0.87446 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR772530 1 0.0955 0.87183 0.968 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR772531 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772532 2 0.0955 0.71750 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR772533 2 0.0955 0.71750 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR772534 1 0.5295 0.56947 0.664 0.112 0.000 0.000 0.224
#> SRR772535 2 0.0566 0.72179 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR772536 2 0.0579 0.72189 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772537 4 0.2448 0.77118 0.000 0.020 0.000 0.892 0.088
#> SRR772538 4 0.3151 0.74929 0.000 0.020 0.000 0.836 0.144
#> SRR772539 1 0.0609 0.87433 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772540 1 0.1205 0.86879 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR772541 2 0.2020 0.70500 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR772542 1 0.2692 0.84240 0.884 0.008 0.004 0.008 0.096
#> SRR772543 1 0.1894 0.85675 0.920 0.000 0.000 0.008 0.072
#> SRR772544 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772545 1 0.0771 0.87450 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR772546 1 0.0771 0.87450 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR772547 1 0.6150 0.35154 0.576 0.176 0.000 0.004 0.244
#> SRR772548 1 0.4164 0.71200 0.784 0.096 0.000 0.000 0.120
#> SRR772549 1 0.0290 0.87453 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772550 1 0.0290 0.87453 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772551 2 0.4478 0.41496 0.020 0.700 0.000 0.008 0.272
#> SRR772552 2 0.3716 0.56681 0.020 0.800 0.000 0.008 0.172
#> SRR772553 2 0.5775 0.18234 0.000 0.596 0.324 0.048 0.032
#> SRR772554 2 0.1082 0.71879 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR772555 2 0.0992 0.72001 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR772556 1 0.0771 0.87475 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR772557 1 0.0671 0.87390 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR772558 1 0.2727 0.82525 0.868 0.016 0.000 0.000 0.116
#> SRR772559 1 0.2390 0.84178 0.896 0.020 0.000 0.000 0.084
#> SRR772560 2 0.5773 0.22009 0.168 0.616 0.000 0.000 0.216
#> SRR772561 3 0.4283 0.87328 0.008 0.000 0.644 0.000 0.348
#> SRR772562 2 0.1981 0.71163 0.000 0.924 0.000 0.028 0.048
#> SRR772563 2 0.1907 0.71269 0.000 0.928 0.000 0.028 0.044
#> SRR772564 1 0.1041 0.86836 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772565 1 0.1041 0.86836 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772566 1 0.0451 0.87274 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772567 1 0.0613 0.87202 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR772568 2 0.0898 0.72146 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR772569 2 0.0955 0.71750 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR772570 1 0.1877 0.85664 0.924 0.012 0.000 0.000 0.064
#> SRR772571 1 0.3106 0.80936 0.844 0.024 0.000 0.000 0.132
#> SRR772572 2 0.6315 -0.26904 0.396 0.448 0.000 0.000 0.156
#> SRR772573 2 0.5841 0.00319 0.256 0.596 0.000 0.000 0.148
#> SRR772574 1 0.1894 0.85751 0.920 0.008 0.000 0.000 0.072
#> SRR772575 1 0.3764 0.75813 0.800 0.044 0.000 0.000 0.156
#> SRR772576 2 0.1956 0.71563 0.008 0.916 0.000 0.000 0.076
#> SRR772577 2 0.3164 0.67601 0.044 0.852 0.000 0.000 0.104
#> SRR772578 4 0.1300 0.79465 0.000 0.028 0.000 0.956 0.016
#> SRR772579 4 0.1195 0.79460 0.000 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR772580 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772581 2 0.5232 -0.00988 0.036 0.580 0.000 0.008 0.376
#> SRR772582 2 0.4557 0.24928 0.012 0.656 0.000 0.008 0.324
#> SRR772583 2 0.4558 0.50682 0.064 0.728 0.000 0.000 0.208
#> SRR772584 2 0.3656 0.61285 0.020 0.784 0.000 0.000 0.196
#> SRR772585 2 0.1965 0.70620 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR772586 3 0.1012 0.78317 0.020 0.000 0.968 0.000 0.012
#> SRR772587 1 0.3386 0.79606 0.832 0.040 0.000 0.000 0.128
#> SRR772588 2 0.4666 0.31136 0.000 0.676 0.000 0.284 0.040
#> SRR772589 2 0.5114 -0.07917 0.000 0.488 0.000 0.476 0.036
#> SRR772590 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772591 1 0.0451 0.87274 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772592 1 0.0451 0.87274 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772593 3 0.0451 0.79384 0.008 0.004 0.988 0.000 0.000
#> SRR772594 4 0.3745 0.71963 0.000 0.024 0.000 0.780 0.196
#> SRR772595 4 0.3317 0.75621 0.000 0.044 0.000 0.840 0.116
#> SRR772596 3 0.0451 0.79726 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR772597 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772598 1 0.0955 0.86858 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR772599 1 0.0955 0.86858 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR772600 5 0.6748 -0.04218 0.000 0.260 0.000 0.368 0.372
#> SRR772601 4 0.6374 0.30264 0.000 0.172 0.000 0.468 0.360
#> SRR772602 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772603 5 0.5508 0.32110 0.000 0.460 0.000 0.064 0.476
#> SRR772604 4 0.6672 0.03200 0.000 0.232 0.000 0.392 0.376
#> SRR772605 2 0.3639 0.60469 0.024 0.792 0.000 0.000 0.184
#> SRR772606 1 0.0955 0.86858 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR772607 1 0.0955 0.86858 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR772608 2 0.1478 0.71591 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR772609 2 0.2136 0.71026 0.008 0.904 0.000 0.000 0.088
#> SRR772610 2 0.1830 0.71352 0.000 0.932 0.000 0.028 0.040
#> SRR772611 2 0.1981 0.71278 0.000 0.924 0.000 0.028 0.048
#> SRR772612 4 0.4400 0.63934 0.000 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR772613 4 0.4419 0.63597 0.000 0.020 0.000 0.668 0.312
#> SRR772614 1 0.0451 0.87274 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772615 1 0.0451 0.87274 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772616 1 0.5799 0.44368 0.612 0.168 0.000 0.000 0.220
#> SRR772617 4 0.4400 0.63960 0.000 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR772618 4 0.4360 0.64639 0.000 0.020 0.000 0.680 0.300
#> SRR772619 4 0.1399 0.78595 0.000 0.020 0.000 0.952 0.028
#> SRR772620 4 0.1399 0.78595 0.000 0.020 0.000 0.952 0.028
#> SRR772621 2 0.1408 0.71448 0.008 0.948 0.000 0.000 0.044
#> SRR772622 2 0.2077 0.69368 0.008 0.908 0.000 0.000 0.084
#> SRR772623 3 0.4608 0.87260 0.008 0.000 0.644 0.012 0.336
#> SRR772624 3 0.0898 0.78565 0.020 0.000 0.972 0.000 0.008
#> SRR772625 4 0.3264 0.67014 0.000 0.164 0.000 0.820 0.016
#> SRR772626 2 0.4462 0.22948 0.000 0.672 0.004 0.016 0.308
#> SRR772627 2 0.5489 -0.12972 0.000 0.576 0.004 0.064 0.356
#> SRR772628 1 0.1502 0.86474 0.940 0.004 0.000 0.000 0.056
#> SRR772629 1 0.0880 0.87284 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772630 2 0.6465 -0.21381 0.308 0.484 0.000 0.000 0.208
#> SRR772631 3 0.0404 0.79405 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772632 4 0.4440 0.06416 0.000 0.468 0.000 0.528 0.004
#> SRR772633 4 0.3906 0.47194 0.000 0.292 0.000 0.704 0.004
#> SRR772634 1 0.5761 0.46227 0.620 0.184 0.000 0.000 0.196
#> SRR772635 2 0.6109 -0.04041 0.272 0.556 0.000 0.000 0.172
#> SRR772636 2 0.7284 -0.16859 0.000 0.348 0.296 0.336 0.020
#> SRR772637 1 0.0000 0.87420 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0290 0.87453 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772639 2 0.1310 0.72384 0.000 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR772640 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772641 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772642 2 0.1764 0.71290 0.008 0.928 0.000 0.000 0.064
#> SRR772643 2 0.1041 0.72307 0.004 0.964 0.000 0.000 0.032
#> SRR772644 1 0.2660 0.82240 0.864 0.008 0.000 0.000 0.128
#> SRR772645 1 0.2193 0.84555 0.900 0.008 0.000 0.000 0.092
#> SRR772646 2 0.1386 0.71606 0.000 0.952 0.000 0.032 0.016
#> SRR772647 2 0.1300 0.71701 0.000 0.956 0.000 0.028 0.016
#> SRR772648 2 0.0703 0.71858 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772649 2 0.0794 0.71798 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772650 1 0.6350 0.17356 0.524 0.240 0.000 0.000 0.236
#> SRR772651 1 0.4021 0.74162 0.780 0.052 0.000 0.000 0.168
#> SRR772652 1 0.1282 0.87249 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR772653 1 0.1430 0.87159 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR772654 2 0.3710 0.57945 0.048 0.808 0.000 0.000 0.144
#> SRR772655 2 0.3551 0.59950 0.044 0.820 0.000 0.000 0.136
#> SRR772656 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772657 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772658 4 0.3319 0.74159 0.000 0.020 0.000 0.820 0.160
#> SRR772659 4 0.3690 0.71909 0.000 0.020 0.000 0.780 0.200
#> SRR772660 2 0.1851 0.71019 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR772661 3 0.1560 0.77021 0.004 0.020 0.948 0.000 0.028
#> SRR772662 1 0.5984 0.37258 0.588 0.208 0.000 0.000 0.204
#> SRR772663 1 0.5931 0.38456 0.596 0.204 0.000 0.000 0.200
#> SRR772664 2 0.1168 0.71906 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR772665 2 0.2462 0.65324 0.000 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR772666 3 0.4387 0.87475 0.008 0.000 0.652 0.004 0.336
#> SRR772667 4 0.2915 0.76414 0.000 0.024 0.000 0.860 0.116
#> SRR772668 4 0.3789 0.71232 0.000 0.020 0.000 0.768 0.212
#> SRR772669 4 0.3586 0.72615 0.000 0.020 0.000 0.792 0.188
#> SRR772670 2 0.4434 0.51029 0.056 0.736 0.000 0.000 0.208
#> SRR772671 2 0.5365 0.35966 0.116 0.656 0.000 0.000 0.228
#> SRR772672 2 0.1943 0.71339 0.000 0.924 0.000 0.020 0.056
#> SRR772673 2 0.1740 0.71530 0.000 0.932 0.000 0.012 0.056
#> SRR772674 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772675 3 0.1393 0.77713 0.008 0.012 0.956 0.000 0.024
#> SRR772676 2 0.3485 0.59853 0.048 0.828 0.000 0.000 0.124
#> SRR772677 2 0.3229 0.61426 0.032 0.840 0.000 0.000 0.128
#> SRR772678 3 0.2234 0.73844 0.004 0.036 0.916 0.000 0.044
#> SRR772679 1 0.6561 -0.20877 0.424 0.372 0.000 0.000 0.204
#> SRR772680 1 0.5547 0.51713 0.644 0.148 0.000 0.000 0.208
#> SRR772681 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772682 2 0.0798 0.72183 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR772683 2 0.1211 0.71912 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR772685 2 0.0865 0.71946 0.004 0.972 0.000 0.000 0.024
#> SRR772686 3 0.4574 0.87463 0.008 0.000 0.652 0.012 0.328
#> SRR772687 3 0.4646 0.86130 0.024 0.000 0.696 0.012 0.268
#> SRR772688 4 0.0963 0.79613 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772689 4 0.0609 0.79308 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772690 3 0.4252 0.87472 0.008 0.000 0.652 0.000 0.340
#> SRR772691 2 0.7290 -0.16211 0.000 0.352 0.312 0.316 0.020
#> SRR772692 2 0.6036 0.04628 0.208 0.580 0.000 0.000 0.212
#> SRR772693 2 0.2482 0.68285 0.024 0.892 0.000 0.000 0.084
#> SRR772694 2 0.1851 0.69914 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR772695 2 0.3642 0.57606 0.008 0.760 0.000 0.000 0.232
#> SRR772696 2 0.1638 0.70484 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR772697 2 0.0963 0.71655 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772698 3 0.0290 0.79597 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0963 0.87289 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772700 1 0.1197 0.87266 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR772701 1 0.0609 0.87384 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772702 1 0.0404 0.87439 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.0790 0.850940 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772342 1 0.2051 0.831350 0.896 0.000 0.004 0.000 0.004 0.096
#> SRR772343 6 0.5157 0.400596 0.336 0.068 0.004 0.000 0.008 0.584
#> SRR772344 2 0.2772 0.633654 0.000 0.816 0.000 0.180 0.000 0.004
#> SRR772345 2 0.2664 0.632926 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR772346 6 0.4521 0.381365 0.292 0.016 0.000 0.000 0.032 0.660
#> SRR772347 6 0.4532 0.407489 0.276 0.024 0.000 0.000 0.028 0.672
#> SRR772348 2 0.3490 0.724725 0.000 0.828 0.000 0.068 0.020 0.084
#> SRR772349 2 0.3544 0.703394 0.000 0.820 0.000 0.100 0.016 0.064
#> SRR772350 3 0.4096 0.731767 0.000 0.000 0.508 0.000 0.484 0.008
#> SRR772351 2 0.0405 0.777957 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR772352 2 0.0891 0.774396 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR772353 6 0.4795 0.135549 0.024 0.456 0.000 0.000 0.016 0.504
#> SRR772354 2 0.4579 -0.023027 0.016 0.492 0.000 0.000 0.012 0.480
#> SRR772355 2 0.0508 0.776138 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR772356 2 0.2070 0.730409 0.000 0.896 0.000 0.092 0.000 0.012
#> SRR772357 1 0.3052 0.729516 0.780 0.000 0.000 0.000 0.004 0.216
#> SRR772358 1 0.3560 0.675964 0.732 0.000 0.004 0.000 0.008 0.256
#> SRR772359 6 0.5937 0.292802 0.408 0.128 0.004 0.000 0.012 0.448
#> SRR772360 6 0.6313 0.576780 0.248 0.248 0.004 0.000 0.016 0.484
#> SRR772361 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772362 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772364 6 0.5638 0.165208 0.368 0.012 0.000 0.000 0.112 0.508
#> SRR772365 6 0.5504 0.339156 0.144 0.052 0.000 0.000 0.144 0.660
#> SRR772366 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772367 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772368 2 0.2968 0.721761 0.000 0.816 0.000 0.000 0.016 0.168
#> SRR772369 2 0.3592 0.568388 0.000 0.740 0.000 0.000 0.020 0.240
#> SRR772370 2 0.3617 0.562269 0.000 0.736 0.000 0.000 0.020 0.244
#> SRR772371 6 0.5851 0.350534 0.088 0.136 0.000 0.000 0.140 0.636
#> SRR772372 6 0.5656 0.297863 0.072 0.124 0.000 0.000 0.152 0.652
#> SRR772373 2 0.0692 0.774636 0.000 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR772374 2 0.0767 0.776776 0.000 0.976 0.000 0.004 0.008 0.012
#> SRR772375 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772376 2 0.2597 0.658565 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR772377 3 0.1616 0.597479 0.000 0.012 0.940 0.000 0.020 0.028
#> SRR772378 6 0.5018 0.478234 0.068 0.308 0.000 0.000 0.012 0.612
#> SRR772379 6 0.4234 0.168663 0.000 0.440 0.000 0.000 0.016 0.544
#> SRR772380 6 0.4892 0.426753 0.048 0.348 0.000 0.000 0.012 0.592
#> SRR772381 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772382 1 0.1327 0.841911 0.936 0.000 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772383 1 0.1531 0.839461 0.928 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR772384 3 0.2001 0.581366 0.000 0.016 0.920 0.000 0.020 0.044
#> SRR772385 3 0.7020 -0.086481 0.000 0.328 0.360 0.264 0.012 0.036
#> SRR772386 2 0.1480 0.768263 0.000 0.940 0.000 0.000 0.020 0.040
#> SRR772387 2 0.0993 0.774168 0.000 0.964 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR772388 1 0.0725 0.849028 0.976 0.000 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR772389 1 0.0725 0.849028 0.976 0.000 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR772390 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0858 0.848239 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR772392 1 0.1219 0.848103 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR772393 6 0.5592 0.268742 0.000 0.368 0.000 0.000 0.148 0.484
#> SRR772394 6 0.5564 0.299560 0.000 0.328 0.000 0.000 0.156 0.516
#> SRR772395 2 0.2062 0.756271 0.000 0.900 0.000 0.004 0.008 0.088
#> SRR772396 1 0.0260 0.846402 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772397 1 0.0146 0.846932 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772398 1 0.4607 0.576506 0.656 0.008 0.004 0.000 0.040 0.292
#> SRR772399 1 0.4314 0.674759 0.716 0.012 0.004 0.000 0.036 0.232
#> SRR772400 1 0.1003 0.839605 0.964 0.000 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772401 1 0.1003 0.839605 0.964 0.000 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772402 5 0.7144 0.710736 0.000 0.092 0.000 0.288 0.396 0.224
#> SRR772403 5 0.7218 0.707952 0.000 0.112 0.000 0.292 0.396 0.200
#> SRR772404 2 0.3317 0.717717 0.000 0.836 0.000 0.080 0.012 0.072
#> SRR772405 3 0.1787 0.591851 0.000 0.016 0.932 0.000 0.020 0.032
#> SRR772406 2 0.1124 0.772991 0.000 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR772407 2 0.1219 0.772425 0.000 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR772408 4 0.0547 0.762598 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.0547 0.762598 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772410 2 0.4407 0.163268 0.004 0.592 0.000 0.000 0.024 0.380
#> SRR772411 2 0.4405 0.168061 0.008 0.604 0.000 0.000 0.020 0.368
#> SRR772412 1 0.0520 0.847366 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR772413 1 0.0405 0.846571 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR772414 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772415 2 0.3460 0.675204 0.000 0.760 0.000 0.000 0.020 0.220
#> SRR772416 2 0.3665 0.640098 0.000 0.728 0.000 0.000 0.020 0.252
#> SRR772417 6 0.5753 0.588865 0.148 0.260 0.000 0.000 0.020 0.572
#> SRR772418 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772419 4 0.3244 0.442481 0.000 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR772420 4 0.3050 0.493670 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR772421 2 0.2907 0.693187 0.000 0.828 0.000 0.000 0.020 0.152
#> SRR772422 2 0.1895 0.757726 0.000 0.912 0.000 0.000 0.016 0.072
#> SRR772423 5 0.7050 0.663472 0.000 0.084 0.000 0.316 0.396 0.204
#> SRR772424 4 0.6170 -0.363539 0.000 0.024 0.000 0.432 0.392 0.152
#> SRR772425 2 0.0291 0.776328 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772426 2 0.4192 0.200437 0.000 0.572 0.000 0.412 0.000 0.016
#> SRR772427 2 0.4218 0.161322 0.000 0.556 0.000 0.428 0.000 0.016
#> SRR772428 1 0.1088 0.839651 0.960 0.000 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR772429 1 0.1088 0.839651 0.960 0.000 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR772430 6 0.5897 0.464010 0.132 0.312 0.008 0.000 0.012 0.536
#> SRR772431 5 0.7106 0.714656 0.000 0.084 0.000 0.268 0.400 0.248
#> SRR772432 5 0.7131 0.718307 0.000 0.088 0.000 0.264 0.400 0.248
#> SRR772433 1 0.1088 0.839651 0.960 0.000 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR772434 1 0.1088 0.839651 0.960 0.000 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR772435 6 0.5760 0.415240 0.360 0.156 0.000 0.000 0.004 0.480
#> SRR772436 1 0.5153 -0.145739 0.464 0.084 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR772437 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772438 1 0.2361 0.791421 0.884 0.000 0.000 0.000 0.028 0.088
#> SRR772439 1 0.1950 0.814692 0.912 0.000 0.000 0.000 0.024 0.064
#> SRR772440 2 0.2398 0.738071 0.000 0.876 0.000 0.000 0.020 0.104
#> SRR772441 2 0.2060 0.751341 0.000 0.900 0.000 0.000 0.016 0.084
#> SRR772442 5 0.7400 0.731645 0.000 0.164 0.000 0.248 0.396 0.192
#> SRR772443 5 0.7367 0.712913 0.000 0.184 0.000 0.160 0.400 0.256
#> SRR772444 1 0.0291 0.847111 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772445 1 0.0146 0.846932 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772446 1 0.1152 0.847917 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR772447 1 0.2595 0.783269 0.836 0.000 0.000 0.000 0.004 0.160
#> SRR772448 2 0.2536 0.725597 0.000 0.864 0.000 0.000 0.020 0.116
#> SRR772449 2 0.1967 0.750366 0.000 0.904 0.000 0.000 0.012 0.084
#> SRR772450 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.1049 0.848527 0.960 0.000 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR772453 1 0.2101 0.822532 0.892 0.000 0.004 0.000 0.004 0.100
#> SRR772454 1 0.3881 0.339752 0.600 0.004 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR772455 6 0.5163 0.513861 0.276 0.112 0.004 0.000 0.000 0.608
#> SRR772456 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0692 0.850594 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR772459 1 0.0291 0.848350 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772460 4 0.0260 0.761181 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0260 0.761181 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772462 2 0.2169 0.756781 0.000 0.900 0.000 0.012 0.008 0.080
#> SRR772463 2 0.2214 0.753458 0.000 0.892 0.000 0.004 0.012 0.092
#> SRR772464 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772465 2 0.3695 0.463571 0.000 0.712 0.000 0.000 0.016 0.272
#> SRR772466 2 0.3606 0.509731 0.000 0.728 0.000 0.000 0.016 0.256
#> SRR772467 4 0.0937 0.748634 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR772468 4 0.1007 0.745346 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.4884 0.403926 0.592 0.064 0.000 0.000 0.004 0.340
#> SRR772470 1 0.4204 0.610293 0.688 0.036 0.000 0.000 0.004 0.272
#> SRR772471 1 0.5150 0.372328 0.584 0.072 0.000 0.000 0.012 0.332
#> SRR772472 1 0.4127 0.587907 0.672 0.016 0.004 0.000 0.004 0.304
#> SRR772473 5 0.7247 0.638741 0.000 0.284 0.000 0.116 0.396 0.204
#> SRR772474 5 0.7409 0.697750 0.000 0.228 0.000 0.168 0.400 0.204
#> SRR772475 2 0.6332 0.137149 0.000 0.468 0.388 0.088 0.020 0.036
#> SRR772476 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0935 0.848649 0.964 0.000 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR772479 1 0.0777 0.848533 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR772480 6 0.5829 -0.426246 0.000 0.144 0.000 0.008 0.404 0.444
#> SRR772481 6 0.6063 -0.382964 0.000 0.172 0.000 0.012 0.388 0.428
#> SRR772482 1 0.3245 0.767831 0.796 0.000 0.004 0.000 0.016 0.184
#> SRR772483 1 0.3485 0.746736 0.772 0.000 0.004 0.000 0.020 0.204
#> SRR772484 2 0.2501 0.746224 0.000 0.872 0.000 0.004 0.016 0.108
#> SRR772485 2 0.2636 0.744682 0.000 0.860 0.000 0.004 0.016 0.120
#> SRR772486 1 0.4112 0.660244 0.724 0.000 0.004 0.000 0.048 0.224
#> SRR772487 1 0.4464 0.592407 0.676 0.000 0.004 0.000 0.056 0.264
#> SRR772488 2 0.3897 0.685469 0.028 0.764 0.000 0.000 0.020 0.188
#> SRR772489 2 0.3594 0.687278 0.008 0.768 0.000 0.000 0.020 0.204
#> SRR772490 1 0.0865 0.851226 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772491 1 0.0291 0.848433 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772492 4 0.0508 0.750359 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR772493 4 0.0508 0.750359 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR772494 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.0993 0.778509 0.000 0.964 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR772497 2 0.1225 0.778523 0.000 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR772498 2 0.5503 -0.000803 0.000 0.484 0.000 0.000 0.132 0.384
#> SRR772499 2 0.5749 0.000545 0.000 0.480 0.000 0.008 0.136 0.376
#> SRR772500 2 0.1812 0.740251 0.000 0.912 0.000 0.080 0.000 0.008
#> SRR772501 2 0.2703 0.644685 0.000 0.824 0.000 0.172 0.000 0.004
#> SRR772502 6 0.6109 0.544406 0.148 0.324 0.000 0.000 0.028 0.500
#> SRR772503 6 0.5637 0.309763 0.384 0.072 0.004 0.000 0.024 0.516
#> SRR772504 2 0.0436 0.775325 0.000 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR772505 2 0.0405 0.774524 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR772506 4 0.2491 0.601672 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000
#> SRR772507 4 0.2597 0.585340 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR772508 2 0.4367 0.627942 0.000 0.744 0.000 0.144 0.012 0.100
#> SRR772509 3 0.5672 -0.046522 0.000 0.380 0.504 0.000 0.020 0.096
#> SRR772510 3 0.3868 0.732145 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR772511 6 0.4493 0.312966 0.004 0.424 0.000 0.000 0.024 0.548
#> SRR772512 5 0.6498 -0.451385 0.000 0.236 0.344 0.000 0.396 0.024
#> SRR772513 2 0.2636 0.738962 0.000 0.860 0.000 0.004 0.016 0.120
#> SRR772514 2 0.2163 0.753241 0.000 0.892 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR772515 2 0.0653 0.775379 0.000 0.980 0.000 0.004 0.012 0.004
#> SRR772516 2 0.0551 0.775581 0.000 0.984 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR772517 2 0.2203 0.757426 0.000 0.896 0.000 0.004 0.016 0.084
#> SRR772518 2 0.2581 0.743223 0.000 0.856 0.000 0.000 0.016 0.128
#> SRR772519 2 0.0748 0.775446 0.000 0.976 0.000 0.004 0.004 0.016
#> SRR772520 2 0.0291 0.775782 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR772521 2 0.4801 -0.197594 0.016 0.488 0.000 0.000 0.024 0.472
#> SRR772522 2 0.4700 -0.179710 0.008 0.492 0.000 0.000 0.028 0.472
#> SRR772523 2 0.0436 0.775997 0.000 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR772524 2 0.0291 0.775782 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR772525 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772526 4 0.1204 0.733899 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR772527 4 0.1204 0.733899 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772529 1 0.1444 0.842924 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR772530 1 0.2302 0.810144 0.872 0.000 0.000 0.000 0.008 0.120
#> SRR772531 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772532 2 0.0291 0.774748 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR772533 2 0.0291 0.774748 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR772534 6 0.4618 0.376522 0.320 0.036 0.000 0.000 0.012 0.632
#> SRR772535 2 0.0363 0.776325 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772536 2 0.0717 0.774863 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR772537 4 0.3190 0.601576 0.000 0.000 0.000 0.820 0.136 0.044
#> SRR772538 4 0.3806 0.508873 0.000 0.000 0.000 0.752 0.200 0.048
#> SRR772539 1 0.1531 0.842351 0.928 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR772540 1 0.2809 0.778038 0.824 0.000 0.004 0.000 0.004 0.168
#> SRR772541 2 0.3915 0.577627 0.000 0.692 0.004 0.000 0.016 0.288
#> SRR772542 1 0.4240 0.654983 0.716 0.004 0.004 0.000 0.044 0.232
#> SRR772543 1 0.2957 0.783261 0.844 0.000 0.004 0.000 0.032 0.120
#> SRR772544 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772545 1 0.1700 0.835155 0.916 0.000 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR772546 1 0.1700 0.835168 0.916 0.000 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR772547 6 0.4907 0.435326 0.292 0.052 0.000 0.000 0.020 0.636
#> SRR772548 1 0.4706 0.530542 0.640 0.036 0.004 0.000 0.012 0.308
#> SRR772549 1 0.1082 0.847092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR772550 1 0.1082 0.847092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR772551 6 0.4711 0.422183 0.000 0.328 0.000 0.000 0.064 0.608
#> SRR772552 2 0.4649 -0.163417 0.000 0.492 0.000 0.000 0.040 0.468
#> SRR772553 2 0.5288 0.230880 0.000 0.512 0.420 0.004 0.024 0.040
#> SRR772554 2 0.0551 0.775079 0.000 0.984 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR772555 2 0.0551 0.775079 0.000 0.984 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR772556 1 0.0777 0.850501 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR772557 1 0.0603 0.849590 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR772558 1 0.4261 0.399451 0.584 0.008 0.004 0.000 0.004 0.400
#> SRR772559 1 0.3928 0.609291 0.684 0.008 0.004 0.000 0.004 0.300
#> SRR772560 6 0.5053 0.374735 0.056 0.368 0.000 0.000 0.012 0.564
#> SRR772561 3 0.4097 0.731179 0.000 0.000 0.500 0.000 0.492 0.008
#> SRR772562 2 0.1845 0.760986 0.000 0.916 0.000 0.004 0.008 0.072
#> SRR772563 2 0.1787 0.762448 0.000 0.920 0.000 0.004 0.008 0.068
#> SRR772564 1 0.1088 0.839651 0.960 0.000 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR772565 1 0.1088 0.839651 0.960 0.000 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR772566 1 0.0363 0.846713 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772567 1 0.0363 0.846713 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772568 2 0.0665 0.775131 0.000 0.980 0.000 0.004 0.008 0.008
#> SRR772569 2 0.0551 0.775079 0.000 0.984 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR772570 1 0.3871 0.631004 0.696 0.004 0.004 0.000 0.008 0.288
#> SRR772571 1 0.4606 0.376583 0.572 0.020 0.004 0.000 0.008 0.396
#> SRR772572 6 0.6223 0.571632 0.220 0.296 0.000 0.000 0.016 0.468
#> SRR772573 2 0.5899 -0.315845 0.148 0.476 0.000 0.000 0.012 0.364
#> SRR772574 1 0.3421 0.684078 0.736 0.000 0.000 0.000 0.008 0.256
#> SRR772575 1 0.4199 0.200377 0.544 0.008 0.000 0.000 0.004 0.444
#> SRR772576 2 0.2692 0.737718 0.000 0.840 0.000 0.000 0.012 0.148
#> SRR772577 2 0.3902 0.648439 0.012 0.732 0.004 0.000 0.012 0.240
#> SRR772578 4 0.0665 0.758164 0.000 0.008 0.000 0.980 0.008 0.004
#> SRR772579 4 0.0779 0.758336 0.000 0.008 0.000 0.976 0.008 0.008
#> SRR772580 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772581 6 0.5127 0.368801 0.004 0.260 0.000 0.000 0.116 0.620
#> SRR772582 6 0.5208 0.379917 0.000 0.336 0.000 0.000 0.108 0.556
#> SRR772583 6 0.4381 0.124708 0.004 0.456 0.000 0.000 0.016 0.524
#> SRR772584 2 0.4224 0.240299 0.000 0.552 0.000 0.000 0.016 0.432
#> SRR772585 2 0.3348 0.683357 0.000 0.768 0.000 0.000 0.016 0.216
#> SRR772586 3 0.0146 0.623453 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772587 1 0.4525 0.250685 0.528 0.012 0.004 0.000 0.008 0.448
#> SRR772588 2 0.3637 0.645627 0.000 0.788 0.000 0.164 0.008 0.040
#> SRR772589 2 0.4359 0.443867 0.000 0.664 0.000 0.296 0.008 0.032
#> SRR772590 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772591 1 0.0363 0.846713 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772592 1 0.0363 0.846713 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772593 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772594 4 0.4340 0.438228 0.000 0.000 0.000 0.712 0.200 0.088
#> SRR772595 4 0.4700 0.480693 0.000 0.048 0.000 0.728 0.164 0.060
#> SRR772596 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772597 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772598 1 0.1003 0.839605 0.964 0.000 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772599 1 0.1003 0.839605 0.964 0.000 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772600 5 0.7343 0.747153 0.000 0.136 0.000 0.228 0.400 0.236
#> SRR772601 5 0.7073 0.702725 0.000 0.080 0.000 0.292 0.396 0.232
#> SRR772602 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772603 5 0.6677 0.571077 0.000 0.180 0.000 0.052 0.404 0.364
#> SRR772604 5 0.7188 0.732828 0.000 0.096 0.000 0.260 0.396 0.248
#> SRR772605 2 0.4264 -0.000741 0.000 0.492 0.000 0.000 0.016 0.492
#> SRR772606 1 0.1088 0.840476 0.960 0.000 0.000 0.000 0.016 0.024
#> SRR772607 1 0.1003 0.839605 0.964 0.000 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772608 2 0.2613 0.743217 0.000 0.848 0.000 0.000 0.012 0.140
#> SRR772609 2 0.3171 0.695609 0.000 0.784 0.000 0.000 0.012 0.204
#> SRR772610 2 0.2056 0.758835 0.000 0.904 0.000 0.004 0.012 0.080
#> SRR772611 2 0.1901 0.761153 0.000 0.912 0.000 0.004 0.008 0.076
#> SRR772612 4 0.5564 -0.236096 0.000 0.000 0.000 0.472 0.388 0.140
#> SRR772613 4 0.5568 -0.246827 0.000 0.000 0.000 0.468 0.392 0.140
#> SRR772614 1 0.0291 0.847798 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772615 1 0.0363 0.846713 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772616 6 0.5076 0.409810 0.324 0.068 0.000 0.000 0.012 0.596
#> SRR772617 4 0.5690 -0.292874 0.000 0.000 0.000 0.452 0.388 0.160
#> SRR772618 4 0.5686 -0.281743 0.000 0.000 0.000 0.456 0.384 0.160
#> SRR772619 4 0.0508 0.750359 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR772620 4 0.0508 0.750359 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR772621 2 0.2538 0.725216 0.000 0.860 0.000 0.000 0.016 0.124
#> SRR772622 2 0.3156 0.663410 0.000 0.800 0.000 0.000 0.020 0.180
#> SRR772623 3 0.4096 0.731767 0.000 0.000 0.508 0.000 0.484 0.008
#> SRR772624 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772625 4 0.3181 0.610908 0.000 0.144 0.000 0.824 0.012 0.020
#> SRR772626 2 0.5568 -0.040476 0.000 0.468 0.000 0.000 0.140 0.392
#> SRR772627 6 0.6572 -0.085651 0.000 0.336 0.000 0.032 0.224 0.408
#> SRR772628 1 0.2462 0.795028 0.860 0.000 0.004 0.000 0.004 0.132
#> SRR772629 1 0.1327 0.844231 0.936 0.000 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772630 6 0.5788 0.564945 0.136 0.292 0.000 0.000 0.020 0.552
#> SRR772631 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772632 4 0.3866 0.077010 0.000 0.484 0.000 0.516 0.000 0.000
#> SRR772633 4 0.3563 0.329728 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR772634 6 0.5996 0.394324 0.352 0.116 0.004 0.000 0.024 0.504
#> SRR772635 6 0.5840 0.418703 0.104 0.404 0.000 0.000 0.024 0.468
#> SRR772636 3 0.6960 -0.124293 0.000 0.316 0.324 0.320 0.012 0.028
#> SRR772637 1 0.0972 0.848145 0.964 0.000 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR772638 1 0.1196 0.847015 0.952 0.000 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR772639 2 0.0717 0.776805 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR772640 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772642 2 0.2981 0.710570 0.000 0.820 0.000 0.000 0.020 0.160
#> SRR772643 2 0.1926 0.770535 0.000 0.912 0.000 0.000 0.020 0.068
#> SRR772644 1 0.4063 0.372995 0.572 0.000 0.004 0.000 0.004 0.420
#> SRR772645 1 0.4145 0.504839 0.628 0.004 0.004 0.000 0.008 0.356
#> SRR772646 2 0.0820 0.774231 0.000 0.972 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR772647 2 0.0622 0.774947 0.000 0.980 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR772648 2 0.1391 0.769100 0.000 0.944 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR772649 2 0.1657 0.763957 0.000 0.928 0.000 0.000 0.016 0.056
#> SRR772650 6 0.5371 0.507034 0.292 0.128 0.000 0.000 0.004 0.576
#> SRR772651 6 0.4356 -0.071516 0.480 0.004 0.004 0.000 0.008 0.504
#> SRR772652 1 0.2121 0.834815 0.892 0.000 0.000 0.000 0.012 0.096
#> SRR772653 1 0.2266 0.828255 0.880 0.000 0.000 0.000 0.012 0.108
#> SRR772654 2 0.4323 0.205449 0.004 0.600 0.000 0.000 0.020 0.376
#> SRR772655 2 0.4266 0.271750 0.004 0.620 0.000 0.000 0.020 0.356
#> SRR772656 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772657 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772658 4 0.4487 0.355886 0.000 0.000 0.000 0.668 0.264 0.068
#> SRR772659 4 0.4766 0.220497 0.000 0.000 0.000 0.612 0.316 0.072
#> SRR772660 2 0.3103 0.699640 0.000 0.784 0.000 0.000 0.008 0.208
#> SRR772661 3 0.1346 0.600690 0.000 0.008 0.952 0.000 0.016 0.024
#> SRR772662 6 0.5474 0.506808 0.284 0.128 0.004 0.000 0.004 0.580
#> SRR772663 6 0.5420 0.402565 0.344 0.100 0.004 0.000 0.004 0.548
#> SRR772664 2 0.0665 0.778446 0.000 0.980 0.000 0.008 0.008 0.004
#> SRR772665 2 0.1942 0.761535 0.000 0.916 0.000 0.064 0.012 0.008
#> SRR772666 3 0.3868 0.732145 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR772667 4 0.4035 0.512845 0.000 0.004 0.000 0.740 0.204 0.052
#> SRR772668 4 0.4729 0.287152 0.000 0.000 0.000 0.636 0.284 0.080
#> SRR772669 4 0.4597 0.325192 0.000 0.000 0.000 0.652 0.276 0.072
#> SRR772670 6 0.4385 0.200861 0.012 0.440 0.000 0.000 0.008 0.540
#> SRR772671 6 0.4579 0.340470 0.028 0.380 0.000 0.000 0.008 0.584
#> SRR772672 2 0.1812 0.760211 0.000 0.912 0.000 0.000 0.008 0.080
#> SRR772673 2 0.1970 0.759125 0.000 0.900 0.000 0.000 0.008 0.092
#> SRR772674 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772675 3 0.1693 0.594868 0.000 0.012 0.936 0.000 0.020 0.032
#> SRR772676 2 0.4027 0.356670 0.008 0.672 0.000 0.000 0.012 0.308
#> SRR772677 2 0.4090 0.309917 0.004 0.652 0.000 0.000 0.016 0.328
#> SRR772678 3 0.2172 0.573549 0.000 0.024 0.912 0.000 0.020 0.044
#> SRR772679 6 0.5833 0.574685 0.208 0.220 0.004 0.000 0.008 0.560
#> SRR772680 6 0.5079 0.379148 0.344 0.068 0.004 0.000 0.004 0.580
#> SRR772681 3 0.3998 0.732096 0.000 0.000 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR772682 2 0.0862 0.778851 0.000 0.972 0.000 0.004 0.008 0.016
#> SRR772683 2 0.0405 0.776770 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR772685 2 0.1461 0.768804 0.000 0.940 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR772686 3 0.3997 0.732197 0.000 0.000 0.508 0.000 0.488 0.004
#> SRR772687 3 0.4195 0.697255 0.016 0.000 0.648 0.000 0.328 0.008
#> SRR772688 4 0.0458 0.764507 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772689 4 0.0603 0.763730 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004 0.000
#> SRR772690 3 0.3868 0.732145 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR772691 3 0.7005 -0.082195 0.000 0.328 0.368 0.256 0.012 0.036
#> SRR772692 6 0.5680 0.444408 0.076 0.384 0.004 0.000 0.024 0.512
#> SRR772693 2 0.3843 0.588057 0.008 0.740 0.004 0.000 0.016 0.232
#> SRR772694 2 0.2981 0.695807 0.000 0.820 0.000 0.000 0.020 0.160
#> SRR772695 6 0.3998 0.000106 0.000 0.492 0.000 0.000 0.004 0.504
#> SRR772696 2 0.2214 0.741071 0.000 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR772697 2 0.1967 0.750524 0.000 0.904 0.000 0.000 0.012 0.084
#> SRR772698 3 0.0000 0.625820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772699 1 0.1826 0.841065 0.924 0.000 0.004 0.000 0.020 0.052
#> SRR772700 1 0.2623 0.812190 0.852 0.000 0.000 0.000 0.016 0.132
#> SRR772701 1 0.2191 0.811347 0.876 0.000 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR772702 1 0.0858 0.850383 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.897 0.931 0.970 0.5005 0.499 0.499
#> 3 3 0.791 0.870 0.938 0.2245 0.887 0.776
#> 4 4 0.707 0.795 0.882 0.1723 0.874 0.689
#> 5 5 0.705 0.709 0.841 0.0668 0.932 0.773
#> 6 6 0.716 0.682 0.830 0.0413 0.947 0.791
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0672 0.9566 0.992 0.008
#> SRR772344 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772347 1 0.0376 0.9595 0.996 0.004
#> SRR772348 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772353 1 0.6801 0.7836 0.820 0.180
#> SRR772354 1 0.9833 0.2805 0.576 0.424
#> SRR772355 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772357 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772359 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772360 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772361 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772365 1 0.0938 0.9538 0.988 0.012
#> SRR772366 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.5408 0.8557 0.124 0.876
#> SRR772370 2 0.5408 0.8528 0.124 0.876
#> SRR772371 1 0.8386 0.6561 0.732 0.268
#> SRR772372 1 0.7883 0.7071 0.764 0.236
#> SRR772373 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.1843 0.9409 0.972 0.028
#> SRR772378 1 0.9358 0.4901 0.648 0.352
#> SRR772379 2 0.0376 0.9725 0.004 0.996
#> SRR772380 1 0.8327 0.6637 0.736 0.264
#> SRR772381 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772384 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772385 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772386 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772393 2 0.0938 0.9666 0.012 0.988
#> SRR772394 2 0.3584 0.9154 0.068 0.932
#> SRR772395 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772402 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.3879 0.9059 0.076 0.924
#> SRR772411 2 0.5178 0.8606 0.116 0.884
#> SRR772412 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0376 0.9725 0.004 0.996
#> SRR772416 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772417 1 0.7453 0.7410 0.788 0.212
#> SRR772418 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.7602 0.7231 0.220 0.780
#> SRR772422 2 0.2603 0.9390 0.044 0.956
#> SRR772423 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772430 1 0.4022 0.8927 0.920 0.080
#> SRR772431 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772436 1 0.0376 0.9595 0.996 0.004
#> SRR772437 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772440 2 0.0672 0.9698 0.008 0.992
#> SRR772441 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772448 2 0.2603 0.9389 0.044 0.956
#> SRR772449 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772466 2 0.1843 0.9530 0.028 0.972
#> SRR772467 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.3733 0.9019 0.928 0.072
#> SRR772470 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772471 1 0.2236 0.9341 0.964 0.036
#> SRR772472 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772473 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772480 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772481 2 0.0672 0.9696 0.008 0.992
#> SRR772482 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772484 2 0.1184 0.9633 0.016 0.984
#> SRR772485 2 0.1184 0.9633 0.016 0.984
#> SRR772486 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.7815 0.7047 0.232 0.768
#> SRR772489 2 0.5629 0.8443 0.132 0.868
#> SRR772490 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772498 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772499 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.6247 0.8122 0.844 0.156
#> SRR772503 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772504 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.4022 0.8933 0.920 0.080
#> SRR772510 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.3733 0.9107 0.072 0.928
#> SRR772512 1 0.9460 0.4324 0.636 0.364
#> SRR772513 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.9998 -0.0213 0.492 0.508
#> SRR772522 1 0.9933 0.2192 0.548 0.452
#> SRR772523 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.3733 0.9015 0.928 0.072
#> SRR772535 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772541 2 0.0938 0.9665 0.012 0.988
#> SRR772542 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772547 1 0.6712 0.7880 0.824 0.176
#> SRR772548 1 0.0938 0.9536 0.988 0.012
#> SRR772549 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772551 2 0.3431 0.9192 0.064 0.936
#> SRR772552 2 0.0376 0.9725 0.004 0.996
#> SRR772553 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772554 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772560 1 0.8713 0.6148 0.708 0.292
#> SRR772561 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772572 1 0.8386 0.6563 0.732 0.268
#> SRR772573 1 0.9896 0.2593 0.560 0.440
#> SRR772574 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772576 2 0.0938 0.9665 0.012 0.988
#> SRR772577 2 0.6973 0.7699 0.188 0.812
#> SRR772578 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.7883 0.6914 0.236 0.764
#> SRR772582 2 0.0376 0.9725 0.004 0.996
#> SRR772583 2 0.8016 0.6726 0.244 0.756
#> SRR772584 2 0.6801 0.7812 0.180 0.820
#> SRR772585 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772588 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772600 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.1843 0.9528 0.028 0.972
#> SRR772606 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0938 0.9665 0.012 0.988
#> SRR772610 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.6048 0.8221 0.852 0.148
#> SRR772617 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.6712 0.7871 0.176 0.824
#> SRR772622 2 0.3274 0.9238 0.060 0.940
#> SRR772623 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772627 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772628 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772630 1 0.8909 0.5836 0.692 0.308
#> SRR772631 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772635 1 0.0376 0.9595 0.996 0.004
#> SRR772636 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.8207 0.6619 0.256 0.744
#> SRR772643 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772644 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0376 0.9724 0.004 0.996
#> SRR772649 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772650 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772654 1 0.8661 0.6137 0.712 0.288
#> SRR772655 1 0.8207 0.6681 0.744 0.256
#> SRR772656 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772662 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772663 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772664 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772670 1 0.9775 0.3417 0.588 0.412
#> SRR772671 1 0.9608 0.4064 0.616 0.384
#> SRR772672 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772676 2 0.9661 0.3281 0.392 0.608
#> SRR772677 2 0.8763 0.5676 0.296 0.704
#> SRR772678 1 0.0672 0.9567 0.992 0.008
#> SRR772679 1 0.0672 0.9566 0.992 0.008
#> SRR772680 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772681 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0376 0.9724 0.004 0.996
#> SRR772686 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772692 1 0.1414 0.9468 0.980 0.020
#> SRR772693 2 0.9358 0.4629 0.352 0.648
#> SRR772694 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.1414 0.9603 0.020 0.980
#> SRR772696 2 0.0376 0.9725 0.004 0.996
#> SRR772697 2 0.0000 0.9752 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.9623 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.0237 0.9128 0.996 0.000 0.004
#> SRR772342 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0237 0.9119 0.996 0.004 0.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 1 0.0747 0.9086 0.984 0.000 0.016
#> SRR772347 1 0.0747 0.9114 0.984 0.000 0.016
#> SRR772348 2 0.0592 0.9398 0.000 0.988 0.012
#> SRR772349 2 0.0237 0.9418 0.000 0.996 0.004
#> SRR772350 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772351 2 0.0592 0.9399 0.000 0.988 0.012
#> SRR772352 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772353 1 0.0592 0.9077 0.988 0.012 0.000
#> SRR772354 1 0.3879 0.7554 0.848 0.152 0.000
#> SRR772355 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772356 2 0.0237 0.9417 0.000 0.996 0.004
#> SRR772357 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772359 3 0.6260 0.2027 0.448 0.000 0.552
#> SRR772360 3 0.5529 0.5849 0.296 0.000 0.704
#> SRR772361 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772362 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.1163 0.9069 0.972 0.000 0.028
#> SRR772365 1 0.3349 0.8587 0.888 0.004 0.108
#> SRR772366 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772367 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772368 2 0.0592 0.9398 0.000 0.988 0.012
#> SRR772369 2 0.5024 0.7292 0.220 0.776 0.004
#> SRR772370 2 0.6475 0.5966 0.280 0.692 0.028
#> SRR772371 1 0.8765 0.4723 0.588 0.212 0.200
#> SRR772372 1 0.8765 0.4572 0.580 0.168 0.252
#> SRR772373 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772376 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772377 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772378 1 0.1774 0.8909 0.960 0.024 0.016
#> SRR772379 2 0.5318 0.7436 0.204 0.780 0.016
#> SRR772380 1 0.4589 0.7399 0.820 0.172 0.008
#> SRR772381 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772382 1 0.0747 0.9115 0.984 0.000 0.016
#> SRR772383 1 0.0424 0.9126 0.992 0.000 0.008
#> SRR772384 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772385 2 0.1753 0.9132 0.000 0.952 0.048
#> SRR772386 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772391 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.4002 0.8146 0.000 0.840 0.160
#> SRR772394 2 0.4931 0.7169 0.000 0.768 0.232
#> SRR772395 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772396 1 0.1031 0.9096 0.976 0.000 0.024
#> SRR772397 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772398 3 0.1860 0.9187 0.052 0.000 0.948
#> SRR772399 3 0.4002 0.7928 0.160 0.000 0.840
#> SRR772400 1 0.4235 0.7838 0.824 0.000 0.176
#> SRR772401 1 0.2959 0.8611 0.900 0.000 0.100
#> SRR772402 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772403 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772404 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772405 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772406 2 0.0237 0.9417 0.000 0.996 0.004
#> SRR772407 2 0.0237 0.9417 0.000 0.996 0.004
#> SRR772408 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 2 0.5623 0.6015 0.280 0.716 0.004
#> SRR772411 2 0.6286 0.0874 0.464 0.536 0.000
#> SRR772412 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772413 1 0.1031 0.9096 0.976 0.000 0.024
#> SRR772414 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772415 2 0.3879 0.8200 0.152 0.848 0.000
#> SRR772416 2 0.0747 0.9362 0.016 0.984 0.000
#> SRR772417 1 0.2625 0.8467 0.916 0.084 0.000
#> SRR772418 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772419 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 2 0.6753 0.3624 0.016 0.596 0.388
#> SRR772422 2 0.2590 0.8898 0.004 0.924 0.072
#> SRR772423 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772424 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772425 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772428 1 0.1289 0.9067 0.968 0.000 0.032
#> SRR772429 1 0.1031 0.9097 0.976 0.000 0.024
#> SRR772430 1 0.1453 0.8944 0.968 0.024 0.008
#> SRR772431 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772432 2 0.1170 0.9362 0.008 0.976 0.016
#> SRR772433 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772434 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772435 1 0.0237 0.9128 0.996 0.000 0.004
#> SRR772436 1 0.0424 0.9126 0.992 0.000 0.008
#> SRR772437 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772438 1 0.2165 0.8889 0.936 0.000 0.064
#> SRR772439 1 0.2261 0.8866 0.932 0.000 0.068
#> SRR772440 2 0.0892 0.9330 0.020 0.980 0.000
#> SRR772441 2 0.0475 0.9412 0.004 0.992 0.004
#> SRR772442 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772443 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772444 1 0.0592 0.9122 0.988 0.000 0.012
#> SRR772445 1 0.0424 0.9126 0.992 0.000 0.008
#> SRR772446 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.2878 0.8761 0.000 0.904 0.096
#> SRR772449 2 0.0424 0.9410 0.000 0.992 0.008
#> SRR772450 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0592 0.9122 0.988 0.000 0.012
#> SRR772459 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772460 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772464 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772465 2 0.1529 0.9170 0.040 0.960 0.000
#> SRR772466 2 0.4654 0.7363 0.208 0.792 0.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.0237 0.9120 0.996 0.004 0.000
#> SRR772470 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.0424 0.9103 0.992 0.008 0.000
#> SRR772472 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772473 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772474 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772475 3 0.6140 0.2930 0.000 0.404 0.596
#> SRR772476 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.1491 0.9322 0.016 0.968 0.016
#> SRR772481 2 0.3445 0.8776 0.088 0.896 0.016
#> SRR772482 1 0.6045 0.4323 0.620 0.000 0.380
#> SRR772483 1 0.6062 0.4235 0.616 0.000 0.384
#> SRR772484 2 0.3482 0.8418 0.128 0.872 0.000
#> SRR772485 2 0.3412 0.8459 0.124 0.876 0.000
#> SRR772486 1 0.5968 0.4760 0.636 0.000 0.364
#> SRR772487 1 0.6291 0.1876 0.532 0.000 0.468
#> SRR772488 2 0.5497 0.6272 0.292 0.708 0.000
#> SRR772489 2 0.5291 0.6687 0.268 0.732 0.000
#> SRR772490 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772491 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772492 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772498 2 0.2959 0.8771 0.000 0.900 0.100
#> SRR772499 2 0.2448 0.8984 0.000 0.924 0.076
#> SRR772500 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 1 0.8821 0.3594 0.552 0.144 0.304
#> SRR772503 1 0.2959 0.8623 0.900 0.000 0.100
#> SRR772504 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772509 3 0.0829 0.9469 0.012 0.004 0.984
#> SRR772510 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772511 2 0.5551 0.7076 0.224 0.760 0.016
#> SRR772512 3 0.0829 0.9376 0.004 0.012 0.984
#> SRR772513 2 0.0237 0.9413 0.004 0.996 0.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772518 2 0.1643 0.9175 0.044 0.956 0.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772521 1 0.6704 0.4190 0.608 0.376 0.016
#> SRR772522 1 0.9602 0.1428 0.404 0.396 0.200
#> SRR772523 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772525 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772526 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772529 1 0.0592 0.9122 0.988 0.000 0.012
#> SRR772530 1 0.1031 0.9096 0.976 0.000 0.024
#> SRR772531 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772532 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772534 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.0592 0.9399 0.000 0.988 0.012
#> SRR772536 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772537 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772538 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772539 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.3377 0.8772 0.092 0.896 0.012
#> SRR772542 1 0.5968 0.4760 0.636 0.000 0.364
#> SRR772543 1 0.3879 0.8117 0.848 0.000 0.152
#> SRR772544 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772545 1 0.0237 0.9128 0.996 0.000 0.004
#> SRR772546 1 0.0237 0.9128 0.996 0.000 0.004
#> SRR772547 1 0.3686 0.7864 0.860 0.140 0.000
#> SRR772548 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.4539 0.8091 0.148 0.836 0.016
#> SRR772552 2 0.3359 0.8735 0.084 0.900 0.016
#> SRR772553 3 0.3192 0.8298 0.000 0.112 0.888
#> SRR772554 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772556 1 0.0424 0.9126 0.992 0.000 0.008
#> SRR772557 1 0.0424 0.9126 0.992 0.000 0.008
#> SRR772558 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772560 1 0.4963 0.7059 0.792 0.200 0.008
#> SRR772561 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772562 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772564 1 0.5926 0.4940 0.644 0.000 0.356
#> SRR772565 1 0.3267 0.8482 0.884 0.000 0.116
#> SRR772566 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772567 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772568 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772570 1 0.0237 0.9128 0.996 0.000 0.004
#> SRR772571 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772572 1 0.4399 0.7280 0.812 0.188 0.000
#> SRR772573 1 0.6095 0.3952 0.608 0.392 0.000
#> SRR772574 1 0.0237 0.9128 0.996 0.000 0.004
#> SRR772575 1 0.0747 0.9115 0.984 0.000 0.016
#> SRR772576 2 0.2486 0.9018 0.060 0.932 0.008
#> SRR772577 2 0.5268 0.7411 0.212 0.776 0.012
#> SRR772578 2 0.0424 0.9409 0.000 0.992 0.008
#> SRR772579 2 0.0424 0.9409 0.000 0.992 0.008
#> SRR772580 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772581 2 0.6948 0.0675 0.472 0.512 0.016
#> SRR772582 2 0.2703 0.8995 0.056 0.928 0.016
#> SRR772583 1 0.5595 0.6498 0.756 0.228 0.016
#> SRR772584 2 0.6879 0.3036 0.428 0.556 0.016
#> SRR772585 2 0.1182 0.9358 0.012 0.976 0.012
#> SRR772586 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772587 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772588 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772591 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772592 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772593 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772594 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772595 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772596 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772597 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772598 1 0.3340 0.8433 0.880 0.000 0.120
#> SRR772599 1 0.2448 0.8803 0.924 0.000 0.076
#> SRR772600 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772601 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772602 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772603 2 0.3272 0.8847 0.080 0.904 0.016
#> SRR772604 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772605 2 0.4453 0.8093 0.152 0.836 0.012
#> SRR772606 1 0.1753 0.8985 0.952 0.000 0.048
#> SRR772607 1 0.1289 0.9067 0.968 0.000 0.032
#> SRR772608 2 0.3340 0.8506 0.120 0.880 0.000
#> SRR772609 2 0.4555 0.7625 0.200 0.800 0.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772612 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772613 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772614 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772615 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772616 1 0.0592 0.9085 0.988 0.012 0.000
#> SRR772617 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772618 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772619 2 0.0424 0.9409 0.000 0.992 0.008
#> SRR772620 2 0.0424 0.9409 0.000 0.992 0.008
#> SRR772621 2 0.5470 0.7613 0.168 0.796 0.036
#> SRR772622 2 0.4452 0.7722 0.192 0.808 0.000
#> SRR772623 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772624 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772625 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772626 2 0.3192 0.8663 0.000 0.888 0.112
#> SRR772627 2 0.1529 0.9258 0.000 0.960 0.040
#> SRR772628 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772629 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772630 1 0.4178 0.7486 0.828 0.172 0.000
#> SRR772631 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772632 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 3 0.5785 0.4791 0.332 0.000 0.668
#> SRR772635 3 0.3619 0.8294 0.136 0.000 0.864
#> SRR772636 2 0.1529 0.9191 0.000 0.960 0.040
#> SRR772637 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0424 0.9409 0.000 0.992 0.008
#> SRR772640 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 2 0.7676 0.5791 0.112 0.672 0.216
#> SRR772643 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772644 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772648 2 0.0424 0.9395 0.008 0.992 0.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772650 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.3116 0.8539 0.892 0.000 0.108
#> SRR772653 1 0.1964 0.8949 0.944 0.000 0.056
#> SRR772654 1 0.4995 0.7651 0.824 0.144 0.032
#> SRR772655 1 0.8609 0.4165 0.596 0.160 0.244
#> SRR772656 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772657 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772658 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772659 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772660 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772661 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772662 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772663 1 0.0237 0.9111 0.996 0.000 0.004
#> SRR772664 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772666 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772667 2 0.0592 0.9398 0.000 0.988 0.012
#> SRR772668 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772669 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772670 1 0.4452 0.7224 0.808 0.192 0.000
#> SRR772671 1 0.1267 0.8986 0.972 0.024 0.004
#> SRR772672 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772674 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772675 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772676 2 0.6798 0.2775 0.400 0.584 0.016
#> SRR772677 2 0.6482 0.5379 0.296 0.680 0.024
#> SRR772678 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772679 1 0.0661 0.9081 0.988 0.008 0.004
#> SRR772680 1 0.0000 0.9127 1.000 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772682 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772685 2 0.0892 0.9330 0.020 0.980 0.000
#> SRR772686 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772687 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772688 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.9425 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772691 2 0.4291 0.7758 0.000 0.820 0.180
#> SRR772692 3 0.6205 0.4623 0.336 0.008 0.656
#> SRR772693 2 0.7708 0.1815 0.048 0.528 0.424
#> SRR772694 2 0.0747 0.9386 0.000 0.984 0.016
#> SRR772695 2 0.5992 0.6581 0.268 0.716 0.016
#> SRR772696 2 0.0747 0.9392 0.000 0.984 0.016
#> SRR772697 2 0.0592 0.9399 0.000 0.988 0.012
#> SRR772698 3 0.0747 0.9515 0.016 0.000 0.984
#> SRR772699 1 0.3619 0.8272 0.864 0.000 0.136
#> SRR772700 1 0.3619 0.8277 0.864 0.000 0.136
#> SRR772701 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
#> SRR772702 1 0.1163 0.9084 0.972 0.000 0.028
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772343 1 0.2164 0.88665 0.924 0.004 0.004 0.068
#> SRR772344 2 0.1211 0.84254 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772345 2 0.1022 0.84608 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772346 1 0.3486 0.77292 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR772347 1 0.2868 0.83495 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR772348 4 0.4817 0.55775 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR772349 2 0.4477 0.45100 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR772350 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.4948 -0.07287 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR772352 2 0.3024 0.76519 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772353 1 0.4237 0.78989 0.808 0.040 0.000 0.152
#> SRR772354 1 0.6576 0.51601 0.628 0.220 0.000 0.152
#> SRR772355 2 0.2216 0.79788 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772356 2 0.1716 0.82244 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772357 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772359 3 0.4998 0.07007 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR772360 3 0.4500 0.54731 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR772361 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772363 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772364 1 0.5000 -0.00791 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR772365 4 0.4947 0.64510 0.212 0.012 0.024 0.752
#> SRR772366 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772368 4 0.4304 0.64130 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR772369 2 0.4444 0.77116 0.072 0.808 0.000 0.120
#> SRR772370 2 0.4197 0.78115 0.036 0.808 0.000 0.156
#> SRR772371 4 0.6434 0.73431 0.144 0.128 0.028 0.700
#> SRR772372 4 0.5071 0.81098 0.056 0.116 0.032 0.796
#> SRR772373 2 0.1867 0.84157 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772374 2 0.1557 0.84482 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772375 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772377 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772378 1 0.4769 0.64234 0.684 0.008 0.000 0.308
#> SRR772379 4 0.5092 0.71114 0.096 0.140 0.000 0.764
#> SRR772380 1 0.5200 0.73166 0.744 0.072 0.000 0.184
#> SRR772381 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772384 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772385 2 0.1677 0.83962 0.000 0.948 0.040 0.012
#> SRR772386 2 0.1940 0.83399 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772387 2 0.1792 0.83415 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772388 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772392 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772393 4 0.4375 0.84262 0.000 0.180 0.032 0.788
#> SRR772394 4 0.4636 0.84362 0.000 0.188 0.040 0.772
#> SRR772395 2 0.2973 0.79068 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772396 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 3 0.1118 0.91692 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772399 3 0.2530 0.83195 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR772400 1 0.2216 0.86182 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR772401 1 0.0921 0.90589 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR772402 4 0.3444 0.85106 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR772403 4 0.3610 0.85128 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772404 2 0.3311 0.77732 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR772405 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.3801 0.62478 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR772407 2 0.4907 -0.10310 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR772408 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772409 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772410 2 0.6542 0.44663 0.252 0.620 0.000 0.128
#> SRR772411 2 0.6878 0.10546 0.424 0.472 0.000 0.104
#> SRR772412 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.4423 0.75112 0.036 0.788 0.000 0.176
#> SRR772416 2 0.3266 0.77602 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR772417 1 0.4057 0.80540 0.816 0.032 0.000 0.152
#> SRR772418 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772420 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772421 2 0.6618 0.56364 0.036 0.660 0.236 0.068
#> SRR772422 2 0.3367 0.81028 0.012 0.876 0.020 0.092
#> SRR772423 4 0.3688 0.85101 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR772424 4 0.3764 0.85049 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR772425 2 0.0921 0.84595 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772426 2 0.1118 0.84701 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772427 2 0.1118 0.84701 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772428 1 0.0188 0.91558 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772430 1 0.4049 0.76097 0.780 0.008 0.000 0.212
#> SRR772431 4 0.2704 0.82779 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR772432 4 0.2408 0.81435 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR772433 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772435 1 0.0469 0.91392 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772436 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0336 0.91457 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772439 1 0.0469 0.91322 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772440 2 0.3498 0.79995 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR772441 2 0.3907 0.67499 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR772442 4 0.3266 0.84966 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR772443 4 0.2760 0.83563 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR772444 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772447 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772448 4 0.5992 0.57141 0.008 0.376 0.032 0.584
#> SRR772449 2 0.4746 0.31109 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR772450 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772451 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772452 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772453 1 0.0336 0.91528 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772454 1 0.0336 0.91517 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772455 1 0.0817 0.91106 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772456 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772457 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772458 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772461 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772462 2 0.2921 0.79297 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR772463 2 0.2973 0.79068 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772464 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.3390 0.81228 0.016 0.852 0.000 0.132
#> SRR772466 2 0.4197 0.78073 0.036 0.808 0.000 0.156
#> SRR772467 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772468 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772469 1 0.1792 0.89117 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR772470 1 0.0336 0.91570 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772471 1 0.1978 0.88734 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR772472 1 0.0707 0.91228 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772473 4 0.3356 0.84777 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR772474 4 0.3356 0.85152 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR772475 2 0.4720 0.47464 0.000 0.672 0.324 0.004
#> SRR772476 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772477 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772478 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772479 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 4 0.3157 0.84323 0.004 0.144 0.000 0.852
#> SRR772481 4 0.2300 0.80367 0.016 0.064 0.000 0.920
#> SRR772482 1 0.4382 0.59765 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR772483 1 0.4406 0.59360 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR772484 2 0.4713 0.74127 0.052 0.776 0.000 0.172
#> SRR772485 2 0.4789 0.73725 0.056 0.772 0.000 0.172
#> SRR772486 1 0.4500 0.56747 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR772487 1 0.4989 0.15242 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR772488 2 0.5670 0.65998 0.152 0.720 0.000 0.128
#> SRR772489 2 0.5452 0.69150 0.108 0.736 0.000 0.156
#> SRR772490 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0336 0.84838 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772493 2 0.0336 0.84838 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772494 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772495 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772496 2 0.2011 0.83250 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR772497 2 0.1940 0.83253 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772498 4 0.4319 0.84369 0.000 0.228 0.012 0.760
#> SRR772499 4 0.4284 0.84475 0.000 0.224 0.012 0.764
#> SRR772500 2 0.0707 0.84948 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772501 2 0.0707 0.84897 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772502 1 0.7909 0.42276 0.564 0.068 0.260 0.108
#> SRR772503 1 0.2882 0.86737 0.892 0.000 0.024 0.084
#> SRR772504 2 0.1940 0.82966 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772505 2 0.1118 0.84426 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772506 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772507 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772508 2 0.3486 0.76300 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR772509 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772510 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772511 4 0.3813 0.84152 0.024 0.148 0.000 0.828
#> SRR772512 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772513 2 0.3172 0.77862 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR772514 2 0.3024 0.78710 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772515 2 0.1940 0.82999 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772516 2 0.1940 0.82999 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772517 2 0.3266 0.78354 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR772518 2 0.4123 0.74095 0.008 0.772 0.000 0.220
#> SRR772519 2 0.1940 0.84032 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772520 2 0.1389 0.84739 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772521 1 0.7581 -0.02273 0.440 0.200 0.000 0.360
#> SRR772522 4 0.9458 0.34222 0.288 0.172 0.148 0.392
#> SRR772523 2 0.1118 0.84750 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772524 2 0.1118 0.84535 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772525 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772527 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772528 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0921 0.84734 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772533 2 0.0817 0.84620 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772534 1 0.2081 0.88060 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR772535 2 0.4804 0.16967 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR772536 2 0.1022 0.84597 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772537 4 0.4164 0.82815 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772538 4 0.4193 0.82516 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR772539 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772540 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772541 4 0.4957 0.58121 0.016 0.300 0.000 0.684
#> SRR772542 1 0.4406 0.59802 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR772543 1 0.1867 0.87795 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR772544 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772547 1 0.4711 0.76836 0.784 0.064 0.000 0.152
#> SRR772548 1 0.1940 0.88855 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR772549 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772550 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772551 4 0.3497 0.83412 0.024 0.124 0.000 0.852
#> SRR772552 4 0.3726 0.84914 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR772553 3 0.2714 0.80493 0.000 0.112 0.884 0.004
#> SRR772554 2 0.1940 0.82999 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772555 2 0.1940 0.82999 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772556 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0592 0.91340 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772559 1 0.0817 0.91096 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772560 1 0.5963 0.64104 0.688 0.116 0.000 0.196
#> SRR772561 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.2589 0.81189 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR772563 2 0.2216 0.82577 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772564 1 0.4643 0.50842 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR772565 1 0.1302 0.89738 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR772566 1 0.0188 0.91546 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0817 0.84692 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772569 2 0.0817 0.84818 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772570 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0336 0.91517 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772572 1 0.5280 0.73394 0.748 0.096 0.000 0.156
#> SRR772573 1 0.6567 0.41447 0.588 0.308 0.000 0.104
#> SRR772574 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.5630 0.47192 0.032 0.608 0.000 0.360
#> SRR772577 4 0.6606 0.55085 0.152 0.224 0.000 0.624
#> SRR772578 4 0.4843 0.65211 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR772579 4 0.4804 0.67284 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR772580 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772581 4 0.3828 0.80020 0.068 0.084 0.000 0.848
#> SRR772582 4 0.3123 0.83997 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR772583 1 0.6008 0.21056 0.496 0.040 0.000 0.464
#> SRR772584 4 0.5573 0.50881 0.272 0.052 0.000 0.676
#> SRR772585 4 0.4888 0.31729 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR772586 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.1716 0.89350 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR772588 2 0.1211 0.84548 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772589 2 0.1022 0.84741 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772590 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772593 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772594 4 0.4134 0.83201 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR772595 4 0.4164 0.82930 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772596 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.1211 0.89907 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR772599 1 0.0817 0.90768 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR772600 4 0.3024 0.84398 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR772601 4 0.2973 0.83859 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR772602 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772603 4 0.2271 0.80196 0.008 0.076 0.000 0.916
#> SRR772604 4 0.3123 0.84561 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR772605 4 0.4898 0.64857 0.024 0.260 0.000 0.716
#> SRR772606 1 0.0469 0.91303 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772607 1 0.0188 0.91549 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772608 2 0.4669 0.74065 0.036 0.764 0.000 0.200
#> SRR772609 2 0.5363 0.69755 0.064 0.720 0.000 0.216
#> SRR772610 2 0.2530 0.81276 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR772611 2 0.2760 0.80154 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR772612 4 0.3907 0.84478 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR772613 4 0.3975 0.84403 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR772614 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.91619 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.2408 0.87238 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR772617 4 0.3801 0.84967 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR772618 4 0.3801 0.84967 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR772619 2 0.4994 -0.38034 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR772620 2 0.4989 -0.35476 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR772621 2 0.4735 0.74796 0.108 0.804 0.008 0.080
#> SRR772622 2 0.4843 0.73068 0.112 0.784 0.000 0.104
#> SRR772623 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772624 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772626 4 0.4194 0.84363 0.000 0.228 0.008 0.764
#> SRR772627 4 0.3873 0.84252 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR772628 1 0.0376 0.91502 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR772629 1 0.0376 0.91516 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR772630 1 0.5122 0.73541 0.756 0.080 0.000 0.164
#> SRR772631 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0336 0.84951 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772633 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772634 3 0.4624 0.45990 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR772635 3 0.4595 0.72525 0.184 0.000 0.776 0.040
#> SRR772636 2 0.1452 0.84253 0.000 0.956 0.036 0.008
#> SRR772637 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772638 1 0.0188 0.91585 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772639 2 0.4955 -0.07515 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR772640 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772641 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772642 2 0.6308 0.65552 0.068 0.720 0.152 0.060
#> SRR772643 2 0.1389 0.84627 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772644 1 0.0469 0.91440 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772645 1 0.0469 0.91440 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772646 2 0.0469 0.85089 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772647 2 0.0707 0.85104 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772648 2 0.2334 0.82354 0.004 0.908 0.000 0.088
#> SRR772649 2 0.2081 0.82685 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772650 1 0.1302 0.90224 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR772651 1 0.0707 0.91182 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772652 1 0.2408 0.84660 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR772653 1 0.1211 0.89843 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR772654 1 0.6757 0.20527 0.524 0.376 0.000 0.100
#> SRR772655 2 0.8225 0.21423 0.376 0.456 0.072 0.096
#> SRR772656 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772658 4 0.4250 0.82384 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR772659 4 0.4008 0.84203 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR772660 2 0.3764 0.73274 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR772661 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772662 1 0.0817 0.91029 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772663 1 0.0921 0.90842 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772664 2 0.0817 0.85040 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772665 2 0.0592 0.85098 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772666 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772667 4 0.4605 0.64117 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR772668 4 0.3975 0.84361 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR772669 4 0.3975 0.84277 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR772670 1 0.5994 0.64894 0.692 0.152 0.000 0.156
#> SRR772671 1 0.3757 0.81112 0.828 0.020 0.000 0.152
#> SRR772672 2 0.2814 0.79923 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772673 2 0.2973 0.79342 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772674 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772675 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772676 2 0.7260 0.23536 0.352 0.532 0.020 0.096
#> SRR772677 2 0.7355 0.37059 0.232 0.596 0.024 0.148
#> SRR772678 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772679 1 0.2149 0.87598 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR772680 1 0.1867 0.88475 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR772681 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0336 0.84943 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772683 2 0.0707 0.84924 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772685 2 0.2101 0.83758 0.012 0.928 0.000 0.060
#> SRR772686 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772687 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772689 2 0.0188 0.84924 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772690 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.2412 0.81000 0.000 0.908 0.084 0.008
#> SRR772692 3 0.6028 0.35296 0.364 0.000 0.584 0.052
#> SRR772693 2 0.7857 0.41835 0.096 0.572 0.256 0.076
#> SRR772694 4 0.3444 0.85295 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR772695 4 0.3015 0.72815 0.092 0.024 0.000 0.884
#> SRR772696 4 0.4661 0.69494 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR772697 4 0.4830 0.58256 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR772698 3 0.0000 0.95083 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.1940 0.87505 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR772700 1 0.1557 0.88936 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR772701 1 0.0188 0.91546 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772702 1 0.0188 0.91546 0.996 0.000 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.0290 0.8799 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772342 1 0.1357 0.8737 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR772343 1 0.4342 0.7244 0.740 0.004 0.008 0.020 0.228
#> SRR772344 2 0.0771 0.7903 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR772345 2 0.0898 0.7886 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR772346 1 0.4481 0.6597 0.720 0.000 0.000 0.232 0.048
#> SRR772347 1 0.3914 0.7485 0.788 0.000 0.000 0.164 0.048
#> SRR772348 4 0.6647 0.1921 0.000 0.384 0.000 0.392 0.224
#> SRR772349 2 0.5635 0.3735 0.000 0.636 0.000 0.168 0.196
#> SRR772350 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772351 2 0.5167 0.2707 0.000 0.552 0.000 0.404 0.044
#> SRR772352 2 0.4981 0.6455 0.000 0.708 0.000 0.172 0.120
#> SRR772353 5 0.2930 0.6481 0.164 0.004 0.000 0.000 0.832
#> SRR772354 5 0.3601 0.6761 0.128 0.052 0.000 0.000 0.820
#> SRR772355 2 0.1478 0.7681 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR772356 2 0.0703 0.7838 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR772357 1 0.1282 0.8730 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR772358 1 0.1357 0.8728 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR772359 1 0.5168 0.0478 0.508 0.000 0.452 0.000 0.040
#> SRR772360 3 0.4808 0.3270 0.400 0.000 0.576 0.000 0.024
#> SRR772361 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772364 4 0.5167 0.2579 0.404 0.000 0.000 0.552 0.044
#> SRR772365 4 0.3670 0.6686 0.100 0.000 0.008 0.832 0.060
#> SRR772366 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772367 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772368 5 0.6348 0.3632 0.000 0.196 0.000 0.292 0.512
#> SRR772369 2 0.6397 0.5060 0.060 0.612 0.000 0.092 0.236
#> SRR772370 2 0.6136 0.4937 0.024 0.592 0.000 0.100 0.284
#> SRR772371 4 0.4025 0.6759 0.104 0.056 0.004 0.820 0.016
#> SRR772372 4 0.2744 0.7782 0.024 0.072 0.004 0.892 0.008
#> SRR772373 2 0.2233 0.7624 0.000 0.904 0.000 0.016 0.080
#> SRR772374 2 0.3420 0.7304 0.000 0.840 0.000 0.084 0.076
#> SRR772375 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772377 3 0.0703 0.9344 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772378 5 0.4573 0.6135 0.164 0.000 0.000 0.092 0.744
#> SRR772379 5 0.4205 0.5792 0.008 0.028 0.000 0.208 0.756
#> SRR772380 5 0.5057 0.5534 0.240 0.004 0.000 0.072 0.684
#> SRR772381 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0290 0.8791 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772383 1 0.0290 0.8791 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772384 3 0.0703 0.9344 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772385 2 0.1310 0.7795 0.000 0.956 0.020 0.000 0.024
#> SRR772386 2 0.2773 0.7499 0.000 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR772387 2 0.3269 0.7324 0.000 0.848 0.000 0.096 0.056
#> SRR772388 1 0.1041 0.8763 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR772389 1 0.1124 0.8750 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR772390 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772391 1 0.1282 0.8730 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR772392 1 0.1892 0.8603 0.916 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR772393 4 0.2692 0.7864 0.000 0.092 0.008 0.884 0.016
#> SRR772394 4 0.3121 0.8081 0.004 0.152 0.004 0.836 0.004
#> SRR772395 2 0.4225 0.2638 0.000 0.632 0.000 0.004 0.364
#> SRR772396 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772397 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 3 0.3264 0.7504 0.164 0.000 0.820 0.000 0.016
#> SRR772399 3 0.3910 0.5920 0.272 0.000 0.720 0.000 0.008
#> SRR772400 1 0.1041 0.8698 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR772401 1 0.0451 0.8784 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR772402 4 0.2707 0.8053 0.000 0.132 0.000 0.860 0.008
#> SRR772403 4 0.2629 0.8066 0.000 0.136 0.000 0.860 0.004
#> SRR772404 2 0.4356 0.3041 0.000 0.648 0.000 0.012 0.340
#> SRR772405 3 0.0703 0.9344 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772406 2 0.3319 0.6889 0.000 0.820 0.000 0.160 0.020
#> SRR772407 2 0.4161 0.1507 0.000 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772410 2 0.7172 -0.0724 0.184 0.416 0.000 0.032 0.368
#> SRR772411 2 0.7608 -0.1913 0.268 0.348 0.000 0.044 0.340
#> SRR772412 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772415 5 0.3586 0.6440 0.000 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR772416 5 0.3766 0.6540 0.000 0.268 0.000 0.004 0.728
#> SRR772417 1 0.5703 0.5932 0.628 0.000 0.000 0.184 0.188
#> SRR772418 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772419 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772421 2 0.7392 0.4929 0.024 0.588 0.108 0.120 0.160
#> SRR772422 2 0.4183 0.6892 0.000 0.780 0.000 0.136 0.084
#> SRR772423 4 0.2605 0.8071 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR772424 4 0.3074 0.7984 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR772425 2 0.0290 0.7906 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772426 2 0.2221 0.7691 0.000 0.912 0.000 0.036 0.052
#> SRR772427 2 0.2221 0.7691 0.000 0.912 0.000 0.036 0.052
#> SRR772428 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772429 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772430 5 0.3690 0.6269 0.200 0.000 0.000 0.020 0.780
#> SRR772431 4 0.3141 0.7348 0.000 0.040 0.000 0.852 0.108
#> SRR772432 4 0.3085 0.7250 0.000 0.032 0.000 0.852 0.116
#> SRR772433 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772434 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772435 1 0.3999 0.4513 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR772436 1 0.3424 0.6526 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR772437 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0324 0.8790 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR772439 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772440 2 0.6095 0.4775 0.004 0.588 0.000 0.184 0.224
#> SRR772441 2 0.4887 0.5962 0.000 0.660 0.000 0.288 0.052
#> SRR772442 4 0.2813 0.7998 0.000 0.108 0.000 0.868 0.024
#> SRR772443 4 0.2962 0.7840 0.000 0.084 0.000 0.868 0.048
#> SRR772444 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.1430 0.8708 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR772447 1 0.1502 0.8702 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR772448 4 0.5477 0.2473 0.008 0.380 0.016 0.572 0.024
#> SRR772449 2 0.4935 0.5063 0.000 0.616 0.000 0.344 0.040
#> SRR772450 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.1430 0.8708 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR772453 1 0.1704 0.8660 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR772454 1 0.2848 0.8016 0.840 0.000 0.000 0.004 0.156
#> SRR772455 1 0.3582 0.7512 0.768 0.000 0.000 0.008 0.224
#> SRR772456 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772462 2 0.4150 0.2146 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR772463 2 0.4264 0.2273 0.000 0.620 0.000 0.004 0.376
#> SRR772464 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772465 2 0.5949 0.5424 0.012 0.620 0.000 0.132 0.236
#> SRR772466 2 0.6116 0.5278 0.020 0.612 0.000 0.128 0.240
#> SRR772467 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.3362 0.8236 0.844 0.000 0.000 0.080 0.076
#> SRR772470 1 0.2036 0.8658 0.920 0.000 0.000 0.024 0.056
#> SRR772471 1 0.3443 0.7921 0.816 0.008 0.000 0.012 0.164
#> SRR772472 1 0.1952 0.8604 0.912 0.000 0.000 0.004 0.084
#> SRR772473 4 0.2189 0.7905 0.000 0.084 0.000 0.904 0.012
#> SRR772474 4 0.2707 0.8071 0.000 0.132 0.000 0.860 0.008
#> SRR772475 2 0.4086 0.5485 0.000 0.736 0.240 0.000 0.024
#> SRR772476 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1357 0.8719 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR772479 1 0.1205 0.8739 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR772480 4 0.2124 0.7705 0.000 0.056 0.000 0.916 0.028
#> SRR772481 4 0.2522 0.7152 0.000 0.012 0.000 0.880 0.108
#> SRR772482 1 0.3086 0.7457 0.816 0.000 0.180 0.000 0.004
#> SRR772483 1 0.2462 0.8112 0.880 0.000 0.112 0.000 0.008
#> SRR772484 5 0.4659 0.5556 0.020 0.332 0.000 0.004 0.644
#> SRR772485 5 0.4607 0.5772 0.020 0.320 0.000 0.004 0.656
#> SRR772486 1 0.4015 0.6299 0.724 0.000 0.264 0.008 0.004
#> SRR772487 1 0.4375 0.4380 0.628 0.000 0.364 0.004 0.004
#> SRR772488 5 0.4578 0.6192 0.040 0.244 0.000 0.004 0.712
#> SRR772489 5 0.4125 0.6511 0.024 0.224 0.000 0.004 0.748
#> SRR772490 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.2304 0.7488 0.000 0.892 0.000 0.008 0.100
#> SRR772497 2 0.1831 0.7507 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR772498 4 0.3387 0.7950 0.000 0.196 0.004 0.796 0.004
#> SRR772499 4 0.3474 0.7962 0.000 0.192 0.008 0.796 0.004
#> SRR772500 2 0.1300 0.7844 0.000 0.956 0.000 0.016 0.028
#> SRR772501 2 0.0898 0.7877 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR772502 1 0.7751 0.3355 0.508 0.004 0.136 0.192 0.160
#> SRR772503 1 0.4019 0.7593 0.808 0.004 0.004 0.120 0.064
#> SRR772504 2 0.3506 0.7177 0.000 0.824 0.000 0.132 0.044
#> SRR772505 2 0.0510 0.7900 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772508 2 0.4555 -0.1484 0.000 0.520 0.000 0.008 0.472
#> SRR772509 3 0.0703 0.9344 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772510 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772511 4 0.3551 0.7246 0.012 0.056 0.000 0.844 0.088
#> SRR772512 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772513 5 0.4084 0.5953 0.000 0.328 0.000 0.004 0.668
#> SRR772514 5 0.4321 0.4809 0.000 0.396 0.000 0.004 0.600
#> SRR772515 2 0.3875 0.7036 0.000 0.804 0.000 0.124 0.072
#> SRR772516 2 0.3641 0.7122 0.000 0.820 0.000 0.120 0.060
#> SRR772517 2 0.4744 -0.0771 0.000 0.508 0.000 0.016 0.476
#> SRR772518 5 0.4166 0.5412 0.000 0.348 0.000 0.004 0.648
#> SRR772519 2 0.2853 0.7538 0.000 0.876 0.000 0.052 0.072
#> SRR772520 2 0.1741 0.7781 0.000 0.936 0.000 0.024 0.040
#> SRR772521 4 0.7609 0.1393 0.288 0.040 0.020 0.476 0.176
#> SRR772522 4 0.7708 0.2070 0.220 0.020 0.072 0.520 0.168
#> SRR772523 2 0.2067 0.7773 0.000 0.920 0.000 0.048 0.032
#> SRR772524 2 0.2450 0.7626 0.000 0.900 0.000 0.052 0.048
#> SRR772525 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772529 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0798 0.7890 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR772533 2 0.0865 0.7893 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR772534 1 0.4104 0.7783 0.788 0.000 0.000 0.124 0.088
#> SRR772535 2 0.4326 0.5423 0.000 0.708 0.000 0.264 0.028
#> SRR772536 2 0.1668 0.7837 0.000 0.940 0.000 0.028 0.032
#> SRR772537 4 0.3684 0.7290 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR772538 4 0.3636 0.7361 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR772539 1 0.1357 0.8719 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR772540 1 0.1205 0.8765 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR772541 5 0.4503 0.6495 0.000 0.120 0.000 0.124 0.756
#> SRR772542 1 0.3734 0.6688 0.752 0.000 0.240 0.004 0.004
#> SRR772543 1 0.1041 0.8701 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR772544 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0703 0.8799 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772546 1 0.0703 0.8799 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772547 1 0.5767 0.6662 0.688 0.040 0.000 0.144 0.128
#> SRR772548 1 0.3670 0.8073 0.820 0.000 0.000 0.068 0.112
#> SRR772549 1 0.1430 0.8708 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR772550 1 0.1430 0.8708 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR772551 4 0.2491 0.7772 0.000 0.068 0.000 0.896 0.036
#> SRR772552 4 0.3229 0.7979 0.000 0.128 0.000 0.840 0.032
#> SRR772553 3 0.3284 0.7383 0.000 0.148 0.828 0.000 0.024
#> SRR772554 2 0.3705 0.7100 0.000 0.816 0.000 0.120 0.064
#> SRR772555 2 0.4057 0.6964 0.000 0.792 0.000 0.120 0.088
#> SRR772556 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.2136 0.8573 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR772559 1 0.2448 0.8544 0.892 0.000 0.000 0.020 0.088
#> SRR772560 5 0.4928 0.6364 0.192 0.072 0.000 0.012 0.724
#> SRR772561 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772562 2 0.3715 0.5028 0.000 0.736 0.000 0.004 0.260
#> SRR772563 2 0.3242 0.5939 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR772564 1 0.3550 0.6680 0.760 0.000 0.236 0.000 0.004
#> SRR772565 1 0.0566 0.8777 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR772566 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0671 0.7899 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR772569 2 0.1216 0.7875 0.000 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR772570 1 0.1357 0.8725 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR772571 1 0.1952 0.8617 0.912 0.000 0.000 0.004 0.084
#> SRR772572 1 0.6498 0.4471 0.564 0.044 0.000 0.096 0.296
#> SRR772573 1 0.7783 0.0795 0.440 0.240 0.000 0.084 0.236
#> SRR772574 1 0.0703 0.8792 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772575 1 0.0609 0.8797 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772576 5 0.5993 0.5527 0.000 0.248 0.000 0.172 0.580
#> SRR772577 5 0.7555 0.5462 0.108 0.160 0.000 0.228 0.504
#> SRR772578 2 0.4300 -0.1658 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR772579 2 0.4219 0.0631 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR772580 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772581 4 0.1314 0.7280 0.012 0.012 0.000 0.960 0.016
#> SRR772582 4 0.1117 0.7352 0.000 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR772583 5 0.4465 0.6342 0.148 0.004 0.000 0.084 0.764
#> SRR772584 5 0.4599 0.6072 0.040 0.028 0.000 0.172 0.760
#> SRR772585 5 0.4832 0.6550 0.000 0.176 0.000 0.104 0.720
#> SRR772586 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772587 1 0.3704 0.8084 0.820 0.000 0.000 0.092 0.088
#> SRR772588 2 0.0609 0.7876 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772589 2 0.0609 0.7867 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772590 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772593 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772594 4 0.3366 0.7752 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR772595 4 0.3480 0.7617 0.000 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR772596 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772597 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772599 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772600 4 0.2773 0.8007 0.000 0.112 0.000 0.868 0.020
#> SRR772601 4 0.2777 0.8025 0.000 0.120 0.000 0.864 0.016
#> SRR772602 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772603 4 0.2660 0.7023 0.000 0.008 0.000 0.864 0.128
#> SRR772604 4 0.2777 0.8025 0.000 0.120 0.000 0.864 0.016
#> SRR772605 5 0.4610 0.6376 0.004 0.112 0.000 0.128 0.756
#> SRR772606 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772607 1 0.0162 0.8794 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772608 5 0.5234 0.5037 0.004 0.332 0.000 0.052 0.612
#> SRR772609 5 0.5202 0.6342 0.016 0.260 0.000 0.052 0.672
#> SRR772610 2 0.3480 0.5277 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR772611 2 0.4283 -0.0599 0.000 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR772612 4 0.3074 0.7984 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR772613 4 0.3074 0.7984 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4801 0.7291 0.728 0.000 0.000 0.148 0.124
#> SRR772617 4 0.3010 0.8053 0.000 0.172 0.000 0.824 0.004
#> SRR772618 4 0.3048 0.8043 0.000 0.176 0.000 0.820 0.004
#> SRR772619 2 0.3837 0.3841 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR772620 2 0.3730 0.4345 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR772621 2 0.6055 0.5888 0.040 0.668 0.004 0.120 0.168
#> SRR772622 2 0.6194 0.5681 0.048 0.648 0.000 0.132 0.172
#> SRR772623 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772624 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772625 2 0.0162 0.7898 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772626 4 0.3243 0.8023 0.000 0.180 0.004 0.812 0.004
#> SRR772627 4 0.3048 0.8041 0.000 0.176 0.000 0.820 0.004
#> SRR772628 1 0.0162 0.8800 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772629 1 0.0290 0.8793 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772630 1 0.6197 0.5297 0.596 0.012 0.000 0.172 0.220
#> SRR772631 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772632 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772634 3 0.4440 0.0747 0.468 0.000 0.528 0.000 0.004
#> SRR772635 3 0.6831 0.4366 0.260 0.000 0.564 0.100 0.076
#> SRR772636 2 0.1211 0.7813 0.000 0.960 0.016 0.000 0.024
#> SRR772637 1 0.1430 0.8708 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR772638 1 0.1430 0.8708 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR772639 2 0.4430 0.3437 0.000 0.628 0.000 0.360 0.012
#> SRR772640 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772642 2 0.6577 0.3324 0.052 0.600 0.132 0.000 0.216
#> SRR772643 2 0.2416 0.7364 0.000 0.888 0.000 0.012 0.100
#> SRR772644 1 0.2248 0.8563 0.900 0.000 0.000 0.012 0.088
#> SRR772645 1 0.2179 0.8528 0.896 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR772646 2 0.0162 0.7902 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772647 2 0.0703 0.7890 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772648 2 0.5177 0.6105 0.000 0.688 0.000 0.132 0.180
#> SRR772649 2 0.5201 0.6064 0.000 0.684 0.000 0.128 0.188
#> SRR772650 1 0.4757 0.4297 0.596 0.000 0.000 0.024 0.380
#> SRR772651 1 0.3521 0.7194 0.764 0.000 0.000 0.004 0.232
#> SRR772652 1 0.1638 0.8491 0.932 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR772653 1 0.0865 0.8720 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR772654 1 0.8370 -0.0924 0.372 0.284 0.004 0.148 0.192
#> SRR772655 2 0.8769 0.1029 0.244 0.388 0.028 0.148 0.192
#> SRR772656 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.3752 0.7117 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR772659 4 0.3177 0.7909 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR772660 5 0.4885 0.4536 0.000 0.400 0.000 0.028 0.572
#> SRR772661 3 0.0703 0.9344 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772662 1 0.4135 0.5195 0.656 0.000 0.000 0.004 0.340
#> SRR772663 1 0.4375 0.3388 0.576 0.000 0.000 0.004 0.420
#> SRR772664 2 0.2464 0.7529 0.000 0.888 0.000 0.016 0.096
#> SRR772665 2 0.2304 0.7539 0.000 0.892 0.000 0.008 0.100
#> SRR772666 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.6726 0.1623 0.000 0.360 0.000 0.388 0.252
#> SRR772668 4 0.3143 0.7936 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR772669 4 0.3210 0.7887 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR772670 5 0.2928 0.6573 0.092 0.032 0.000 0.004 0.872
#> SRR772671 5 0.3578 0.6206 0.204 0.004 0.000 0.008 0.784
#> SRR772672 2 0.4066 0.3593 0.000 0.672 0.000 0.004 0.324
#> SRR772673 2 0.4350 0.1122 0.000 0.588 0.000 0.004 0.408
#> SRR772674 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.0703 0.9344 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772676 2 0.8624 0.0907 0.268 0.380 0.020 0.132 0.200
#> SRR772677 2 0.8614 0.1857 0.164 0.416 0.024 0.164 0.232
#> SRR772678 3 0.0703 0.9344 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772679 5 0.4430 0.3471 0.360 0.000 0.000 0.012 0.628
#> SRR772680 5 0.4443 -0.0314 0.472 0.000 0.000 0.004 0.524
#> SRR772681 3 0.0162 0.9401 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772683 2 0.0404 0.7895 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772685 2 0.3018 0.7523 0.004 0.872 0.000 0.056 0.068
#> SRR772686 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.0963 0.9173 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.7903 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0162 0.7895 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772690 3 0.0290 0.9401 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772691 2 0.2036 0.7580 0.000 0.920 0.056 0.000 0.024
#> SRR772692 1 0.6814 0.1807 0.488 0.000 0.368 0.068 0.076
#> SRR772693 2 0.7479 0.3938 0.120 0.584 0.156 0.112 0.028
#> SRR772694 4 0.3521 0.7943 0.000 0.140 0.000 0.820 0.040
#> SRR772695 5 0.4633 0.3493 0.008 0.008 0.000 0.372 0.612
#> SRR772696 4 0.4552 0.4737 0.000 0.352 0.004 0.632 0.012
#> SRR772697 4 0.4841 0.1990 0.000 0.416 0.000 0.560 0.024
#> SRR772698 3 0.0609 0.9360 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772699 1 0.1282 0.8640 0.952 0.000 0.044 0.000 0.004
#> SRR772700 1 0.1251 0.8679 0.956 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR772701 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.8799 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.0520 0.86871 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR772342 1 0.1713 0.86218 0.928 0.000 0.000 0.000 0.028 0.044
#> SRR772343 1 0.5391 0.55778 0.588 0.016 0.000 0.004 0.080 0.312
#> SRR772344 4 0.0935 0.77421 0.000 0.004 0.000 0.964 0.032 0.000
#> SRR772345 4 0.0713 0.77519 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR772346 1 0.5631 0.40486 0.548 0.328 0.000 0.000 0.104 0.020
#> SRR772347 1 0.5284 0.55793 0.632 0.236 0.000 0.000 0.116 0.016
#> SRR772348 4 0.5873 -0.04667 0.000 0.352 0.000 0.444 0.000 0.204
#> SRR772349 4 0.4603 0.52983 0.000 0.148 0.000 0.696 0.000 0.156
#> SRR772350 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772351 4 0.5660 0.21481 0.000 0.300 0.000 0.516 0.184 0.000
#> SRR772352 4 0.4982 0.21346 0.000 0.084 0.000 0.576 0.340 0.000
#> SRR772353 6 0.1408 0.68171 0.036 0.000 0.000 0.000 0.020 0.944
#> SRR772354 6 0.1503 0.68610 0.032 0.000 0.000 0.008 0.016 0.944
#> SRR772355 4 0.1349 0.75699 0.000 0.056 0.000 0.940 0.004 0.000
#> SRR772356 4 0.0865 0.77104 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR772357 1 0.2066 0.85580 0.908 0.000 0.000 0.000 0.052 0.040
#> SRR772358 1 0.1984 0.85797 0.912 0.000 0.000 0.000 0.056 0.032
#> SRR772359 1 0.5324 0.03114 0.468 0.000 0.428 0.000 0.104 0.000
#> SRR772360 3 0.4938 0.29220 0.356 0.000 0.568 0.000 0.076 0.000
#> SRR772361 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 2 0.5144 0.25201 0.404 0.532 0.000 0.000 0.036 0.028
#> SRR772365 2 0.3383 0.71788 0.080 0.844 0.004 0.000 0.040 0.032
#> SRR772366 3 0.3317 0.82172 0.000 0.012 0.804 0.000 0.168 0.016
#> SRR772367 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772368 6 0.4787 0.51552 0.000 0.236 0.000 0.108 0.000 0.656
#> SRR772369 5 0.5660 0.54579 0.028 0.024 0.000 0.356 0.552 0.040
#> SRR772370 5 0.4672 0.61496 0.004 0.008 0.000 0.280 0.660 0.048
#> SRR772371 2 0.3756 0.65615 0.068 0.816 0.000 0.008 0.092 0.016
#> SRR772372 2 0.2507 0.73736 0.012 0.892 0.000 0.008 0.072 0.016
#> SRR772373 4 0.2179 0.74215 0.000 0.000 0.000 0.900 0.064 0.036
#> SRR772374 4 0.3163 0.58459 0.000 0.000 0.000 0.764 0.232 0.004
#> SRR772375 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772376 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772377 3 0.3550 0.81421 0.000 0.012 0.788 0.000 0.176 0.024
#> SRR772378 6 0.3531 0.63523 0.040 0.072 0.000 0.000 0.056 0.832
#> SRR772379 6 0.2983 0.66343 0.004 0.092 0.000 0.012 0.032 0.860
#> SRR772380 6 0.5011 0.55505 0.100 0.096 0.000 0.004 0.072 0.728
#> SRR772381 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0260 0.86761 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772383 1 0.0458 0.86789 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772384 3 0.3550 0.81421 0.000 0.012 0.788 0.000 0.176 0.024
#> SRR772385 4 0.3930 0.59124 0.000 0.012 0.012 0.772 0.180 0.024
#> SRR772386 4 0.3624 0.62967 0.000 0.060 0.000 0.784 0.156 0.000
#> SRR772387 4 0.3271 0.57624 0.000 0.008 0.000 0.760 0.232 0.000
#> SRR772388 1 0.1408 0.86348 0.944 0.000 0.000 0.000 0.036 0.020
#> SRR772389 1 0.1564 0.86165 0.936 0.000 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR772390 3 0.3317 0.82172 0.000 0.012 0.804 0.000 0.168 0.016
#> SRR772391 1 0.2197 0.85286 0.900 0.000 0.000 0.000 0.044 0.056
#> SRR772392 1 0.2672 0.84301 0.868 0.000 0.000 0.000 0.052 0.080
#> SRR772393 2 0.3056 0.78685 0.000 0.856 0.008 0.048 0.084 0.004
#> SRR772394 2 0.2575 0.81268 0.000 0.872 0.000 0.100 0.024 0.004
#> SRR772395 4 0.3782 0.25474 0.000 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR772396 1 0.0653 0.86938 0.980 0.004 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR772397 1 0.0508 0.86864 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR772398 3 0.3834 0.66679 0.140 0.004 0.780 0.000 0.076 0.000
#> SRR772399 3 0.4223 0.54420 0.232 0.004 0.712 0.000 0.052 0.000
#> SRR772400 1 0.1268 0.85717 0.952 0.000 0.036 0.000 0.004 0.008
#> SRR772401 1 0.0922 0.86170 0.968 0.000 0.024 0.000 0.004 0.004
#> SRR772402 2 0.0865 0.80509 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR772403 2 0.1267 0.81259 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR772404 4 0.3756 0.39106 0.000 0.004 0.000 0.644 0.000 0.352
#> SRR772405 3 0.3550 0.81421 0.000 0.012 0.788 0.000 0.176 0.024
#> SRR772406 4 0.3633 0.64755 0.000 0.136 0.000 0.796 0.064 0.004
#> SRR772407 4 0.4192 0.17052 0.000 0.412 0.000 0.572 0.016 0.000
#> SRR772408 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772410 5 0.6887 0.43826 0.052 0.024 0.000 0.256 0.504 0.164
#> SRR772411 5 0.6838 0.46059 0.084 0.028 0.000 0.196 0.556 0.136
#> SRR772412 1 0.0291 0.86708 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772413 1 0.0291 0.86708 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772414 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772415 6 0.2673 0.68026 0.004 0.000 0.000 0.132 0.012 0.852
#> SRR772416 6 0.2572 0.68041 0.000 0.000 0.000 0.136 0.012 0.852
#> SRR772417 5 0.6805 0.30195 0.264 0.168 0.000 0.004 0.488 0.076
#> SRR772418 3 0.3317 0.82172 0.000 0.012 0.804 0.000 0.168 0.016
#> SRR772419 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772420 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772421 5 0.5773 0.55872 0.016 0.008 0.084 0.312 0.572 0.008
#> SRR772422 4 0.4274 0.36514 0.000 0.012 0.004 0.640 0.336 0.008
#> SRR772423 2 0.1327 0.81532 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR772424 2 0.2527 0.79908 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR772425 4 0.0405 0.78065 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR772426 4 0.1806 0.73706 0.000 0.000 0.000 0.908 0.088 0.004
#> SRR772427 4 0.1806 0.73706 0.000 0.000 0.000 0.908 0.088 0.004
#> SRR772428 1 0.0551 0.86723 0.984 0.000 0.008 0.000 0.004 0.004
#> SRR772429 1 0.0405 0.86794 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR772430 6 0.0858 0.68405 0.028 0.000 0.000 0.000 0.004 0.968
#> SRR772431 2 0.1769 0.78625 0.000 0.924 0.000 0.012 0.004 0.060
#> SRR772432 2 0.1888 0.78411 0.000 0.916 0.000 0.012 0.004 0.068
#> SRR772433 1 0.0436 0.86614 0.988 0.000 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR772434 1 0.0291 0.86646 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772435 1 0.4066 0.34124 0.596 0.000 0.000 0.000 0.012 0.392
#> SRR772436 1 0.3835 0.50914 0.668 0.000 0.000 0.000 0.012 0.320
#> SRR772437 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0881 0.86408 0.972 0.000 0.008 0.000 0.012 0.008
#> SRR772439 1 0.1262 0.85981 0.956 0.000 0.020 0.000 0.016 0.008
#> SRR772440 4 0.6669 -0.16731 0.000 0.072 0.000 0.432 0.356 0.140
#> SRR772441 4 0.5286 0.40748 0.000 0.144 0.000 0.624 0.224 0.008
#> SRR772442 2 0.2554 0.81025 0.000 0.876 0.000 0.076 0.048 0.000
#> SRR772443 2 0.1616 0.81122 0.000 0.932 0.000 0.048 0.000 0.020
#> SRR772444 1 0.0000 0.86699 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.86699 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.2451 0.84691 0.884 0.000 0.000 0.000 0.056 0.060
#> SRR772447 1 0.2451 0.84676 0.884 0.000 0.000 0.000 0.060 0.056
#> SRR772448 2 0.6296 0.14422 0.004 0.472 0.008 0.328 0.180 0.008
#> SRR772449 4 0.5894 0.15593 0.000 0.264 0.000 0.504 0.228 0.004
#> SRR772450 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.2340 0.85120 0.896 0.004 0.000 0.000 0.056 0.044
#> SRR772453 1 0.2830 0.83879 0.864 0.004 0.000 0.000 0.064 0.068
#> SRR772454 1 0.3516 0.77497 0.788 0.000 0.000 0.000 0.048 0.164
#> SRR772455 1 0.5211 0.59104 0.608 0.012 0.000 0.000 0.092 0.288
#> SRR772456 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0260 0.86836 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772459 1 0.0405 0.86812 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR772460 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772462 4 0.3797 0.22823 0.000 0.000 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR772463 4 0.3817 0.19123 0.000 0.000 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR772464 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772465 5 0.3560 0.64660 0.004 0.000 0.000 0.256 0.732 0.008
#> SRR772466 5 0.4015 0.65080 0.016 0.004 0.000 0.244 0.724 0.012
#> SRR772467 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772468 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.4873 0.72613 0.720 0.148 0.000 0.000 0.084 0.048
#> SRR772470 1 0.3025 0.83745 0.856 0.012 0.000 0.000 0.080 0.052
#> SRR772471 1 0.4418 0.73728 0.728 0.012 0.000 0.000 0.076 0.184
#> SRR772472 1 0.3424 0.82053 0.824 0.008 0.000 0.000 0.076 0.092
#> SRR772473 2 0.2258 0.80055 0.000 0.896 0.000 0.044 0.060 0.000
#> SRR772474 2 0.1411 0.81309 0.000 0.936 0.000 0.060 0.004 0.000
#> SRR772475 4 0.5735 0.35523 0.000 0.012 0.152 0.632 0.180 0.024
#> SRR772476 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.2263 0.85052 0.896 0.000 0.000 0.000 0.048 0.056
#> SRR772479 1 0.1865 0.85781 0.920 0.000 0.000 0.000 0.040 0.040
#> SRR772480 2 0.0777 0.79878 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR772481 2 0.1413 0.78494 0.004 0.948 0.000 0.004 0.008 0.036
#> SRR772482 1 0.2826 0.80146 0.856 0.000 0.112 0.000 0.024 0.008
#> SRR772483 1 0.2734 0.80838 0.864 0.000 0.104 0.000 0.024 0.008
#> SRR772484 6 0.3678 0.60935 0.008 0.000 0.000 0.228 0.016 0.748
#> SRR772485 6 0.3510 0.63368 0.008 0.000 0.000 0.204 0.016 0.772
#> SRR772486 1 0.4192 0.66089 0.740 0.004 0.200 0.000 0.048 0.008
#> SRR772487 1 0.5033 0.54939 0.668 0.012 0.244 0.000 0.060 0.016
#> SRR772488 6 0.5480 0.51075 0.020 0.000 0.000 0.176 0.176 0.628
#> SRR772489 6 0.4445 0.61581 0.008 0.000 0.000 0.164 0.100 0.728
#> SRR772490 1 0.0405 0.86746 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004 0.000
#> SRR772491 1 0.0508 0.86874 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR772492 4 0.0363 0.77897 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0363 0.77897 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 4 0.3254 0.66404 0.000 0.000 0.000 0.816 0.136 0.048
#> SRR772497 4 0.1867 0.74576 0.000 0.000 0.000 0.916 0.020 0.064
#> SRR772498 2 0.3425 0.78638 0.000 0.800 0.000 0.164 0.028 0.008
#> SRR772499 2 0.3425 0.78638 0.000 0.800 0.000 0.164 0.028 0.008
#> SRR772500 4 0.0937 0.76974 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR772501 4 0.0865 0.77132 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR772502 5 0.5668 0.51447 0.120 0.076 0.152 0.000 0.652 0.000
#> SRR772503 1 0.6139 0.23450 0.524 0.136 0.040 0.000 0.300 0.000
#> SRR772504 4 0.3320 0.59299 0.000 0.016 0.000 0.772 0.212 0.000
#> SRR772505 4 0.0891 0.77614 0.000 0.008 0.000 0.968 0.024 0.000
#> SRR772506 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772507 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772508 6 0.4057 0.24897 0.000 0.008 0.000 0.436 0.000 0.556
#> SRR772509 3 0.3550 0.81421 0.000 0.012 0.788 0.000 0.176 0.024
#> SRR772510 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.4621 0.51787 0.004 0.676 0.000 0.032 0.268 0.020
#> SRR772512 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772513 6 0.2762 0.65202 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR772514 6 0.3076 0.61450 0.000 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR772515 4 0.3528 0.48040 0.000 0.004 0.000 0.700 0.296 0.000
#> SRR772516 4 0.3383 0.52811 0.000 0.004 0.000 0.728 0.268 0.000
#> SRR772517 6 0.4617 0.17379 0.000 0.008 0.000 0.444 0.024 0.524
#> SRR772518 6 0.3632 0.61522 0.004 0.008 0.000 0.228 0.008 0.752
#> SRR772519 4 0.2653 0.68647 0.000 0.000 0.000 0.844 0.144 0.012
#> SRR772520 4 0.1714 0.74217 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR772521 5 0.5560 0.55212 0.068 0.112 0.100 0.016 0.700 0.004
#> SRR772522 5 0.5667 0.51635 0.040 0.152 0.148 0.008 0.652 0.000
#> SRR772523 4 0.2066 0.75198 0.000 0.052 0.000 0.908 0.040 0.000
#> SRR772524 4 0.2669 0.67896 0.000 0.008 0.000 0.836 0.156 0.000
#> SRR772525 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.3317 0.82172 0.000 0.012 0.804 0.000 0.168 0.016
#> SRR772529 1 0.0000 0.86699 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0603 0.86907 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016 0.000
#> SRR772531 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772532 4 0.0547 0.77781 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR772533 4 0.0508 0.77944 0.000 0.004 0.000 0.984 0.012 0.000
#> SRR772534 1 0.6162 0.56417 0.588 0.172 0.000 0.000 0.168 0.072
#> SRR772535 4 0.4228 0.55117 0.000 0.212 0.000 0.716 0.072 0.000
#> SRR772536 4 0.2048 0.72127 0.000 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR772537 2 0.3448 0.69142 0.000 0.716 0.000 0.280 0.004 0.000
#> SRR772538 2 0.3448 0.69297 0.000 0.716 0.000 0.280 0.004 0.000
#> SRR772539 1 0.2442 0.84787 0.884 0.000 0.000 0.000 0.048 0.068
#> SRR772540 1 0.2001 0.86180 0.912 0.000 0.000 0.000 0.040 0.048
#> SRR772541 6 0.1401 0.69074 0.004 0.028 0.000 0.020 0.000 0.948
#> SRR772542 1 0.3486 0.71961 0.788 0.000 0.180 0.000 0.024 0.008
#> SRR772543 1 0.1426 0.85681 0.948 0.000 0.028 0.000 0.016 0.008
#> SRR772544 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.1088 0.86729 0.960 0.000 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR772546 1 0.1168 0.86731 0.956 0.000 0.000 0.000 0.028 0.016
#> SRR772547 1 0.6747 0.50018 0.540 0.212 0.000 0.008 0.116 0.124
#> SRR772548 1 0.5140 0.71380 0.700 0.152 0.000 0.000 0.068 0.080
#> SRR772549 1 0.2390 0.84845 0.888 0.000 0.000 0.000 0.056 0.056
#> SRR772550 1 0.2451 0.84699 0.884 0.000 0.000 0.000 0.056 0.060
#> SRR772551 2 0.2220 0.77982 0.000 0.908 0.000 0.020 0.052 0.020
#> SRR772552 2 0.4542 0.78209 0.000 0.748 0.000 0.128 0.088 0.036
#> SRR772553 3 0.5885 0.57076 0.000 0.012 0.612 0.172 0.180 0.024
#> SRR772554 4 0.3426 0.50976 0.000 0.004 0.000 0.720 0.276 0.000
#> SRR772555 4 0.3684 0.40147 0.000 0.004 0.000 0.664 0.332 0.000
#> SRR772556 1 0.0146 0.86737 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772557 1 0.0146 0.86737 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772558 1 0.3646 0.80894 0.808 0.012 0.000 0.000 0.068 0.112
#> SRR772559 1 0.3950 0.80816 0.804 0.052 0.000 0.000 0.068 0.076
#> SRR772560 6 0.2910 0.67927 0.048 0.004 0.000 0.044 0.028 0.876
#> SRR772561 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772562 4 0.3409 0.50895 0.000 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR772563 4 0.3217 0.60267 0.000 0.000 0.000 0.768 0.008 0.224
#> SRR772564 1 0.3121 0.71871 0.796 0.000 0.192 0.000 0.008 0.004
#> SRR772565 1 0.1296 0.85354 0.948 0.000 0.044 0.000 0.004 0.004
#> SRR772566 1 0.0260 0.86617 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0146 0.86665 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772568 4 0.1196 0.76949 0.000 0.008 0.000 0.952 0.040 0.000
#> SRR772569 4 0.1411 0.76264 0.000 0.004 0.000 0.936 0.060 0.000
#> SRR772570 1 0.2631 0.84810 0.880 0.008 0.000 0.000 0.068 0.044
#> SRR772571 1 0.2852 0.83749 0.856 0.000 0.000 0.000 0.064 0.080
#> SRR772572 5 0.6950 0.30413 0.288 0.072 0.000 0.024 0.492 0.124
#> SRR772573 5 0.6082 0.53151 0.180 0.000 0.000 0.156 0.596 0.068
#> SRR772574 1 0.1408 0.86576 0.944 0.000 0.000 0.000 0.036 0.020
#> SRR772575 1 0.0458 0.86870 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772576 6 0.6305 0.44030 0.000 0.112 0.000 0.188 0.120 0.580
#> SRR772577 6 0.6259 0.53569 0.088 0.216 0.000 0.108 0.004 0.584
#> SRR772578 4 0.4189 0.01727 0.000 0.436 0.000 0.552 0.008 0.004
#> SRR772579 4 0.4127 0.14776 0.000 0.400 0.000 0.588 0.008 0.004
#> SRR772580 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772581 2 0.1364 0.76043 0.004 0.944 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR772582 2 0.0951 0.78199 0.000 0.968 0.000 0.008 0.020 0.004
#> SRR772583 6 0.3039 0.66577 0.076 0.028 0.000 0.004 0.028 0.864
#> SRR772584 6 0.2220 0.68258 0.012 0.060 0.000 0.004 0.016 0.908
#> SRR772585 6 0.2058 0.68953 0.000 0.036 0.000 0.056 0.000 0.908
#> SRR772586 3 0.3317 0.82172 0.000 0.012 0.804 0.000 0.168 0.016
#> SRR772587 1 0.5540 0.67157 0.664 0.124 0.000 0.000 0.144 0.068
#> SRR772588 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772589 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.86699 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0146 0.86665 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772593 3 0.3317 0.82172 0.000 0.012 0.804 0.000 0.168 0.016
#> SRR772594 2 0.3329 0.74316 0.000 0.756 0.000 0.236 0.004 0.004
#> SRR772595 2 0.3499 0.71365 0.000 0.728 0.000 0.264 0.004 0.004
#> SRR772596 3 0.3219 0.82277 0.000 0.008 0.808 0.000 0.168 0.016
#> SRR772597 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0837 0.86333 0.972 0.000 0.020 0.000 0.004 0.004
#> SRR772599 1 0.0551 0.86517 0.984 0.000 0.008 0.000 0.004 0.004
#> SRR772600 2 0.0937 0.80677 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR772601 2 0.1082 0.80753 0.000 0.956 0.000 0.040 0.000 0.004
#> SRR772602 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.1493 0.78098 0.000 0.936 0.000 0.004 0.004 0.056
#> SRR772604 2 0.0865 0.80509 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR772605 6 0.1332 0.68991 0.000 0.012 0.000 0.028 0.008 0.952
#> SRR772606 1 0.0881 0.86346 0.972 0.000 0.012 0.000 0.008 0.008
#> SRR772607 1 0.0779 0.86437 0.976 0.000 0.008 0.000 0.008 0.008
#> SRR772608 6 0.4919 0.55468 0.004 0.008 0.000 0.216 0.096 0.676
#> SRR772609 6 0.4075 0.65544 0.012 0.012 0.000 0.156 0.044 0.776
#> SRR772610 4 0.3126 0.57778 0.000 0.000 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR772611 4 0.3866 -0.02596 0.000 0.000 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR772612 2 0.2562 0.79678 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR772613 2 0.2597 0.79437 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR772614 1 0.0146 0.86665 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0146 0.86665 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.6507 0.53488 0.560 0.148 0.000 0.000 0.168 0.124
#> SRR772617 2 0.2300 0.80947 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR772618 2 0.2300 0.80952 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR772619 4 0.2996 0.57392 0.000 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR772620 4 0.2793 0.61106 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR772621 5 0.4628 0.36116 0.012 0.008 0.004 0.424 0.548 0.004
#> SRR772622 5 0.4594 0.36074 0.024 0.008 0.000 0.424 0.544 0.000
#> SRR772623 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772624 3 0.3317 0.82172 0.000 0.012 0.804 0.000 0.168 0.016
#> SRR772625 4 0.0717 0.77573 0.000 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR772626 2 0.3275 0.79743 0.000 0.820 0.000 0.140 0.032 0.008
#> SRR772627 2 0.2925 0.80011 0.000 0.832 0.000 0.148 0.016 0.004
#> SRR772628 1 0.1121 0.86792 0.964 0.008 0.008 0.000 0.016 0.004
#> SRR772629 1 0.1268 0.85832 0.952 0.004 0.008 0.000 0.036 0.000
#> SRR772630 5 0.5923 0.36962 0.284 0.044 0.000 0.020 0.588 0.064
#> SRR772631 3 0.3352 0.81988 0.000 0.012 0.800 0.000 0.172 0.016
#> SRR772632 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772633 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772634 1 0.4911 0.15873 0.516 0.008 0.440 0.000 0.028 0.008
#> SRR772635 3 0.6213 -0.10033 0.188 0.016 0.412 0.000 0.384 0.000
#> SRR772636 4 0.3930 0.59124 0.000 0.012 0.012 0.772 0.180 0.024
#> SRR772637 1 0.2389 0.84841 0.888 0.000 0.000 0.000 0.060 0.052
#> SRR772638 1 0.2571 0.84416 0.876 0.000 0.000 0.000 0.060 0.064
#> SRR772639 4 0.4028 0.45126 0.000 0.308 0.000 0.668 0.024 0.000
#> SRR772640 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 4 0.7074 0.22119 0.052 0.004 0.128 0.532 0.052 0.232
#> SRR772643 4 0.2214 0.73619 0.000 0.012 0.000 0.892 0.004 0.092
#> SRR772644 1 0.3582 0.81674 0.820 0.020 0.000 0.000 0.064 0.096
#> SRR772645 1 0.3453 0.81813 0.824 0.012 0.000 0.000 0.064 0.100
#> SRR772646 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772647 4 0.0458 0.77930 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR772648 5 0.3923 0.48727 0.000 0.008 0.000 0.372 0.620 0.000
#> SRR772649 5 0.3911 0.49493 0.000 0.008 0.000 0.368 0.624 0.000
#> SRR772650 6 0.5806 -0.08063 0.424 0.044 0.000 0.000 0.068 0.464
#> SRR772651 1 0.4181 0.67814 0.700 0.000 0.000 0.000 0.052 0.248
#> SRR772652 1 0.2513 0.77384 0.852 0.000 0.140 0.000 0.008 0.000
#> SRR772653 1 0.1970 0.81959 0.900 0.000 0.092 0.000 0.008 0.000
#> SRR772654 5 0.4985 0.61661 0.148 0.008 0.024 0.108 0.712 0.000
#> SRR772655 5 0.5327 0.62771 0.072 0.008 0.096 0.120 0.704 0.000
#> SRR772656 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772658 2 0.3515 0.62306 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR772659 2 0.2730 0.78360 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR772660 6 0.3586 0.53824 0.000 0.004 0.000 0.280 0.004 0.712
#> SRR772661 3 0.3550 0.81421 0.000 0.012 0.788 0.000 0.176 0.024
#> SRR772662 1 0.4751 0.20552 0.500 0.000 0.000 0.000 0.048 0.452
#> SRR772663 6 0.4841 -0.06198 0.436 0.000 0.000 0.000 0.056 0.508
#> SRR772664 4 0.3198 0.49898 0.000 0.000 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR772665 4 0.2697 0.62361 0.000 0.000 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR772666 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.6012 -0.16640 0.000 0.364 0.000 0.396 0.000 0.240
#> SRR772668 2 0.2631 0.79149 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR772669 2 0.2793 0.77633 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR772670 6 0.2594 0.67196 0.028 0.000 0.000 0.016 0.072 0.884
#> SRR772671 6 0.2365 0.65566 0.072 0.000 0.000 0.000 0.040 0.888
#> SRR772672 4 0.3547 0.43548 0.000 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR772673 4 0.3823 0.16427 0.000 0.000 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR772674 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.3550 0.81421 0.000 0.012 0.788 0.000 0.176 0.024
#> SRR772676 5 0.5086 0.64880 0.040 0.008 0.072 0.160 0.716 0.004
#> SRR772677 5 0.5288 0.63537 0.016 0.024 0.100 0.156 0.700 0.004
#> SRR772678 3 0.3550 0.81421 0.000 0.012 0.788 0.000 0.176 0.024
#> SRR772679 6 0.3247 0.57592 0.156 0.000 0.000 0.000 0.036 0.808
#> SRR772680 6 0.4313 0.39193 0.284 0.000 0.000 0.000 0.048 0.668
#> SRR772681 3 0.0146 0.86432 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772682 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772683 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772685 4 0.3106 0.68105 0.004 0.012 0.000 0.832 0.140 0.012
#> SRR772686 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.2378 0.74062 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000
#> SRR772688 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772689 4 0.0000 0.78219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0260 0.86425 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772691 4 0.4257 0.57030 0.000 0.012 0.028 0.756 0.180 0.024
#> SRR772692 3 0.7459 -0.10187 0.320 0.072 0.332 0.000 0.260 0.016
#> SRR772693 4 0.7916 -0.00918 0.084 0.088 0.148 0.496 0.168 0.016
#> SRR772694 2 0.3164 0.81026 0.000 0.844 0.000 0.104 0.020 0.032
#> SRR772695 6 0.4329 0.51165 0.012 0.300 0.000 0.000 0.024 0.664
#> SRR772696 2 0.5277 0.38126 0.000 0.556 0.000 0.340 0.100 0.004
#> SRR772697 2 0.6003 0.06377 0.000 0.424 0.000 0.372 0.200 0.004
#> SRR772698 3 0.3317 0.82172 0.000 0.012 0.804 0.000 0.168 0.016
#> SRR772699 1 0.1908 0.85599 0.924 0.000 0.044 0.000 0.020 0.012
#> SRR772700 1 0.1536 0.86292 0.944 0.000 0.024 0.000 0.020 0.012
#> SRR772701 1 0.0520 0.86806 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR772702 1 0.0777 0.86413 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.293 0.570 0.782 0.3645 0.569 0.569
#> 3 3 0.318 0.628 0.776 0.4581 0.570 0.449
#> 4 4 0.555 0.760 0.877 0.2342 0.734 0.548
#> 5 5 0.636 0.789 0.897 0.0502 0.954 0.871
#> 6 6 0.594 0.577 0.766 0.1333 0.868 0.602
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772342 1 0.9993 0.3657 0.516 0.484
#> SRR772343 2 0.9661 0.1961 0.392 0.608
#> SRR772344 2 0.0376 0.7723 0.004 0.996
#> SRR772345 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772346 2 0.9661 0.1977 0.392 0.608
#> SRR772347 2 0.9944 -0.1126 0.456 0.544
#> SRR772348 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.2778 0.7686 0.048 0.952
#> SRR772352 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772353 2 0.9286 0.3663 0.344 0.656
#> SRR772354 2 0.9000 0.4436 0.316 0.684
#> SRR772355 2 0.1414 0.7746 0.020 0.980
#> SRR772356 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772357 1 0.9896 0.5030 0.560 0.440
#> SRR772358 1 0.9963 0.4376 0.536 0.464
#> SRR772359 2 0.9988 -0.2271 0.480 0.520
#> SRR772360 2 0.9944 -0.1116 0.456 0.544
#> SRR772361 1 0.3431 0.5872 0.936 0.064
#> SRR772362 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772364 2 0.9954 -0.1347 0.460 0.540
#> SRR772365 2 0.9248 0.3789 0.340 0.660
#> SRR772366 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0672 0.7733 0.008 0.992
#> SRR772369 2 0.8443 0.5428 0.272 0.728
#> SRR772370 2 0.8144 0.5769 0.252 0.748
#> SRR772371 2 0.9286 0.3733 0.344 0.656
#> SRR772372 2 0.8661 0.5108 0.288 0.712
#> SRR772373 2 0.2778 0.7677 0.048 0.952
#> SRR772374 2 0.3114 0.7650 0.056 0.944
#> SRR772375 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772377 2 0.9933 0.0358 0.452 0.548
#> SRR772378 2 0.8813 0.4814 0.300 0.700
#> SRR772379 2 0.6973 0.6680 0.188 0.812
#> SRR772380 2 0.8443 0.5424 0.272 0.728
#> SRR772381 1 0.0938 0.5988 0.988 0.012
#> SRR772382 1 0.9944 0.4622 0.544 0.456
#> SRR772383 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772384 2 1.0000 -0.1986 0.500 0.500
#> SRR772385 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772386 2 0.5629 0.7248 0.132 0.868
#> SRR772387 2 0.5059 0.7380 0.112 0.888
#> SRR772388 1 0.7883 0.6225 0.764 0.236
#> SRR772389 1 0.8661 0.6207 0.712 0.288
#> SRR772390 1 0.0672 0.5988 0.992 0.008
#> SRR772391 1 0.9896 0.5029 0.560 0.440
#> SRR772392 1 0.9944 0.4621 0.544 0.456
#> SRR772393 2 0.6623 0.6866 0.172 0.828
#> SRR772394 2 0.7219 0.6558 0.200 0.800
#> SRR772395 2 0.0672 0.7733 0.008 0.992
#> SRR772396 1 0.9323 0.6051 0.652 0.348
#> SRR772397 1 0.9358 0.6027 0.648 0.352
#> SRR772398 1 0.9996 0.3543 0.512 0.488
#> SRR772399 1 0.9996 0.3557 0.512 0.488
#> SRR772400 1 0.9129 0.6133 0.672 0.328
#> SRR772401 1 0.8763 0.6201 0.704 0.296
#> SRR772402 2 0.0672 0.7734 0.008 0.992
#> SRR772403 2 0.0376 0.7723 0.004 0.996
#> SRR772404 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772405 1 1.0000 0.1893 0.500 0.500
#> SRR772406 2 0.3274 0.7643 0.060 0.940
#> SRR772407 2 0.7528 0.6317 0.216 0.784
#> SRR772408 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.6247 0.7031 0.156 0.844
#> SRR772411 2 0.6343 0.7000 0.160 0.840
#> SRR772412 1 0.9866 0.5180 0.568 0.432
#> SRR772413 1 0.9815 0.5366 0.580 0.420
#> SRR772414 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.5294 0.7352 0.120 0.880
#> SRR772416 2 0.5059 0.7385 0.112 0.888
#> SRR772417 2 0.9209 0.3929 0.336 0.664
#> SRR772418 1 0.1184 0.6032 0.984 0.016
#> SRR772419 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.8608 0.5212 0.284 0.716
#> SRR772422 2 0.7950 0.6043 0.240 0.760
#> SRR772423 2 0.0376 0.7723 0.004 0.996
#> SRR772424 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772427 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772428 1 0.9608 0.5775 0.616 0.384
#> SRR772429 1 0.9963 0.4375 0.536 0.464
#> SRR772430 2 0.8763 0.4804 0.296 0.704
#> SRR772431 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772432 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772433 1 0.9000 0.6161 0.684 0.316
#> SRR772434 1 0.8555 0.6216 0.720 0.280
#> SRR772435 2 0.9922 -0.0754 0.448 0.552
#> SRR772436 2 0.9866 0.0104 0.432 0.568
#> SRR772437 1 0.6048 0.5821 0.852 0.148
#> SRR772438 1 0.8861 0.6183 0.696 0.304
#> SRR772439 1 0.9286 0.6066 0.656 0.344
#> SRR772440 2 0.6973 0.6684 0.188 0.812
#> SRR772441 2 0.5059 0.7390 0.112 0.888
#> SRR772442 2 0.0938 0.7741 0.012 0.988
#> SRR772443 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772444 1 0.9866 0.5180 0.568 0.432
#> SRR772445 1 0.9896 0.5025 0.560 0.440
#> SRR772446 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772447 1 0.9909 0.4939 0.556 0.444
#> SRR772448 2 0.5519 0.7277 0.128 0.872
#> SRR772449 2 0.5059 0.7379 0.112 0.888
#> SRR772450 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.9286 0.6065 0.656 0.344
#> SRR772453 1 0.9896 0.4927 0.560 0.440
#> SRR772454 2 1.0000 -0.2981 0.496 0.504
#> SRR772455 2 0.9248 0.3773 0.340 0.660
#> SRR772456 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772459 1 0.9754 0.5524 0.592 0.408
#> SRR772460 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0376 0.7722 0.004 0.996
#> SRR772463 2 0.0376 0.7722 0.004 0.996
#> SRR772464 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.5946 0.7154 0.144 0.856
#> SRR772466 2 0.8144 0.5724 0.252 0.748
#> SRR772467 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772469 2 0.9922 -0.0565 0.448 0.552
#> SRR772470 1 0.9944 0.4635 0.544 0.456
#> SRR772471 2 0.9963 -0.1405 0.464 0.536
#> SRR772472 2 0.9963 -0.1502 0.464 0.536
#> SRR772473 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772474 2 0.1414 0.7745 0.020 0.980
#> SRR772475 2 0.0938 0.7736 0.012 0.988
#> SRR772476 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.9248 0.6087 0.660 0.340
#> SRR772479 1 0.9732 0.5569 0.596 0.404
#> SRR772480 2 0.4690 0.7480 0.100 0.900
#> SRR772481 2 0.7674 0.6204 0.224 0.776
#> SRR772482 2 1.0000 -0.2974 0.496 0.504
#> SRR772483 2 1.0000 -0.2990 0.496 0.504
#> SRR772484 2 0.2423 0.7713 0.040 0.960
#> SRR772485 2 0.2603 0.7698 0.044 0.956
#> SRR772486 1 0.9522 0.5854 0.628 0.372
#> SRR772487 1 1.0000 0.3174 0.504 0.496
#> SRR772488 2 0.9393 0.3222 0.356 0.644
#> SRR772489 2 0.9129 0.4137 0.328 0.672
#> SRR772490 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772491 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772492 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772497 2 0.2236 0.7723 0.036 0.964
#> SRR772498 2 0.6247 0.7015 0.156 0.844
#> SRR772499 2 0.5178 0.7343 0.116 0.884
#> SRR772500 2 0.0938 0.7741 0.012 0.988
#> SRR772501 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772502 2 0.9358 0.3446 0.352 0.648
#> SRR772503 2 0.9993 -0.2454 0.484 0.516
#> SRR772504 2 0.0938 0.7742 0.012 0.988
#> SRR772505 2 0.0672 0.7734 0.008 0.992
#> SRR772506 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772509 2 0.9522 0.3209 0.372 0.628
#> SRR772510 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.7950 0.5970 0.240 0.760
#> SRR772512 2 0.9983 -0.1055 0.476 0.524
#> SRR772513 2 0.1633 0.7740 0.024 0.976
#> SRR772514 2 0.0672 0.7736 0.008 0.992
#> SRR772515 2 0.3274 0.7640 0.060 0.940
#> SRR772516 2 0.2043 0.7727 0.032 0.968
#> SRR772517 2 0.4562 0.7477 0.096 0.904
#> SRR772518 2 0.4431 0.7490 0.092 0.908
#> SRR772519 2 0.1414 0.7748 0.020 0.980
#> SRR772520 2 0.0938 0.7745 0.012 0.988
#> SRR772521 2 0.8861 0.4756 0.304 0.696
#> SRR772522 2 0.9323 0.3593 0.348 0.652
#> SRR772523 2 0.0938 0.7741 0.012 0.988
#> SRR772524 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772525 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.9896 0.5026 0.560 0.440
#> SRR772530 1 0.9922 0.4835 0.552 0.448
#> SRR772531 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0376 0.7722 0.004 0.996
#> SRR772533 2 0.0938 0.7741 0.012 0.988
#> SRR772534 2 0.9815 0.0726 0.420 0.580
#> SRR772535 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772536 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772537 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772539 2 1.0000 -0.2975 0.496 0.504
#> SRR772540 2 0.9988 -0.2290 0.480 0.520
#> SRR772541 2 0.4562 0.7481 0.096 0.904
#> SRR772542 1 0.9795 0.5421 0.584 0.416
#> SRR772543 1 0.9129 0.6132 0.672 0.328
#> SRR772544 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.9983 0.3982 0.524 0.476
#> SRR772546 1 0.9922 0.4840 0.552 0.448
#> SRR772547 2 0.9427 0.3201 0.360 0.640
#> SRR772548 2 0.9970 -0.1601 0.468 0.532
#> SRR772549 1 0.9248 0.6072 0.660 0.340
#> SRR772550 1 0.9754 0.5352 0.592 0.408
#> SRR772551 2 0.6973 0.6728 0.188 0.812
#> SRR772552 2 0.4298 0.7526 0.088 0.912
#> SRR772553 2 0.2236 0.7703 0.036 0.964
#> SRR772554 2 0.1414 0.7745 0.020 0.980
#> SRR772555 2 0.1414 0.7748 0.020 0.980
#> SRR772556 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772557 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772558 2 0.9850 0.0359 0.428 0.572
#> SRR772559 2 0.9954 -0.1295 0.460 0.540
#> SRR772560 2 0.8207 0.5712 0.256 0.744
#> SRR772561 1 0.9087 0.4972 0.676 0.324
#> SRR772562 2 0.1633 0.7740 0.024 0.976
#> SRR772563 2 0.0938 0.7744 0.012 0.988
#> SRR772564 1 0.9732 0.5548 0.596 0.404
#> SRR772565 1 0.9044 0.6160 0.680 0.320
#> SRR772566 1 0.2043 0.6082 0.968 0.032
#> SRR772567 1 0.2778 0.6112 0.952 0.048
#> SRR772568 2 0.4161 0.7533 0.084 0.916
#> SRR772569 2 0.5294 0.7325 0.120 0.880
#> SRR772570 1 0.9983 0.3994 0.524 0.476
#> SRR772571 2 0.9993 -0.2458 0.484 0.516
#> SRR772572 2 0.9286 0.3751 0.344 0.656
#> SRR772573 2 0.8813 0.4874 0.300 0.700
#> SRR772574 1 0.9954 0.4505 0.540 0.460
#> SRR772575 1 0.9988 0.3855 0.520 0.480
#> SRR772576 2 0.6148 0.7084 0.152 0.848
#> SRR772577 2 0.6343 0.6999 0.160 0.840
#> SRR772578 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.7602 0.6312 0.220 0.780
#> SRR772582 2 0.7674 0.6226 0.224 0.776
#> SRR772583 2 0.7815 0.6086 0.232 0.768
#> SRR772584 2 0.7745 0.6161 0.228 0.772
#> SRR772585 2 0.2043 0.7724 0.032 0.968
#> SRR772586 1 0.3431 0.6101 0.936 0.064
#> SRR772587 1 0.9881 0.4976 0.564 0.436
#> SRR772588 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.1414 0.5978 0.980 0.020
#> SRR772591 1 0.5629 0.6184 0.868 0.132
#> SRR772592 1 0.4690 0.6162 0.900 0.100
#> SRR772593 1 0.2603 0.6087 0.956 0.044
#> SRR772594 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0376 0.7723 0.004 0.996
#> SRR772596 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.9522 0.5865 0.628 0.372
#> SRR772599 1 0.9087 0.6149 0.676 0.324
#> SRR772600 2 0.1633 0.7740 0.024 0.976
#> SRR772601 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772602 1 0.0376 0.5990 0.996 0.004
#> SRR772603 2 0.1633 0.7740 0.024 0.976
#> SRR772604 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772605 2 0.4431 0.7500 0.092 0.908
#> SRR772606 1 0.9460 0.5936 0.636 0.364
#> SRR772607 1 0.9661 0.5697 0.608 0.392
#> SRR772608 2 0.3733 0.7604 0.072 0.928
#> SRR772609 2 0.4815 0.7447 0.104 0.896
#> SRR772610 2 0.0376 0.7723 0.004 0.996
#> SRR772611 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772612 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.9732 0.5571 0.596 0.404
#> SRR772615 1 0.8016 0.6228 0.756 0.244
#> SRR772616 2 0.9732 0.1652 0.404 0.596
#> SRR772617 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.9323 0.3602 0.348 0.652
#> SRR772622 2 0.8763 0.4900 0.296 0.704
#> SRR772623 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.2423 0.6099 0.960 0.040
#> SRR772625 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.4939 0.7406 0.108 0.892
#> SRR772627 2 0.5059 0.7371 0.112 0.888
#> SRR772628 1 0.9833 0.5308 0.576 0.424
#> SRR772629 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772630 2 0.8608 0.5150 0.284 0.716
#> SRR772631 1 0.0376 0.5989 0.996 0.004
#> SRR772632 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772634 2 0.9933 -0.0970 0.452 0.548
#> SRR772635 2 0.9963 -0.1516 0.464 0.536
#> SRR772636 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.8955 0.6168 0.688 0.312
#> SRR772638 1 0.9608 0.5323 0.616 0.384
#> SRR772639 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772640 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.7602 0.6278 0.220 0.780
#> SRR772643 2 0.8267 0.5621 0.260 0.740
#> SRR772644 2 0.9866 0.0139 0.432 0.568
#> SRR772645 2 0.9954 -0.1298 0.460 0.540
#> SRR772646 2 0.0672 0.7733 0.008 0.992
#> SRR772647 2 0.1184 0.7745 0.016 0.984
#> SRR772648 2 0.7219 0.6600 0.200 0.800
#> SRR772649 2 0.6247 0.7024 0.156 0.844
#> SRR772650 2 0.9608 0.2288 0.384 0.616
#> SRR772651 2 0.9933 -0.0956 0.452 0.548
#> SRR772652 1 0.9977 0.4126 0.528 0.472
#> SRR772653 1 0.9933 0.4734 0.548 0.452
#> SRR772654 2 0.9393 0.3343 0.356 0.644
#> SRR772655 2 0.9815 0.0742 0.420 0.580
#> SRR772656 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.4562 0.5835 0.904 0.096
#> SRR772658 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.1633 0.7746 0.024 0.976
#> SRR772661 1 0.9944 0.3474 0.544 0.456
#> SRR772662 2 0.9286 0.3648 0.344 0.656
#> SRR772663 2 0.9427 0.3143 0.360 0.640
#> SRR772664 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.8386 0.5476 0.268 0.732
#> SRR772671 2 0.8555 0.5233 0.280 0.720
#> SRR772672 2 0.2043 0.7724 0.032 0.968
#> SRR772673 2 0.1633 0.7742 0.024 0.976
#> SRR772674 1 0.0938 0.5983 0.988 0.012
#> SRR772675 2 1.0000 -0.1810 0.496 0.504
#> SRR772676 2 0.8909 0.4702 0.308 0.692
#> SRR772677 2 0.7815 0.6161 0.232 0.768
#> SRR772678 2 0.9996 -0.1451 0.488 0.512
#> SRR772679 2 0.9608 0.2274 0.384 0.616
#> SRR772680 2 0.9850 0.0348 0.428 0.572
#> SRR772681 1 0.3114 0.5900 0.944 0.056
#> SRR772682 2 0.1633 0.7742 0.024 0.976
#> SRR772683 2 0.0938 0.7745 0.012 0.988
#> SRR772685 2 0.5519 0.7266 0.128 0.872
#> SRR772686 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.5990 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.7708 0.000 1.000
#> SRR772692 2 0.9710 0.1668 0.400 0.600
#> SRR772693 2 0.9000 0.4511 0.316 0.684
#> SRR772694 2 0.5519 0.7270 0.128 0.872
#> SRR772695 2 0.6623 0.6860 0.172 0.828
#> SRR772696 2 0.5737 0.7233 0.136 0.864
#> SRR772697 2 0.5294 0.7343 0.120 0.880
#> SRR772698 1 0.1184 0.5998 0.984 0.016
#> SRR772699 1 0.9833 0.5308 0.576 0.424
#> SRR772700 1 0.9922 0.4839 0.552 0.448
#> SRR772701 1 0.9881 0.5109 0.564 0.436
#> SRR772702 1 0.9866 0.5180 0.568 0.432
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.5864 0.52178 0.704 0.008 0.288
#> SRR772342 1 0.5327 0.54720 0.728 0.000 0.272
#> SRR772343 1 0.2492 0.70605 0.936 0.016 0.048
#> SRR772344 2 0.6291 0.00537 0.468 0.532 0.000
#> SRR772345 2 0.5905 0.42061 0.352 0.648 0.000
#> SRR772346 1 0.2599 0.70817 0.932 0.016 0.052
#> SRR772347 1 0.4629 0.63167 0.808 0.004 0.188
#> SRR772348 1 0.6286 0.21112 0.536 0.464 0.000
#> SRR772349 2 0.6309 -0.13644 0.500 0.500 0.000
#> SRR772350 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772351 1 0.4887 0.63938 0.772 0.228 0.000
#> SRR772352 1 0.5178 0.61194 0.744 0.256 0.000
#> SRR772353 1 0.2063 0.72101 0.948 0.044 0.008
#> SRR772354 1 0.1878 0.72124 0.952 0.044 0.004
#> SRR772355 1 0.5098 0.61249 0.752 0.248 0.000
#> SRR772356 1 0.6095 0.39512 0.608 0.392 0.000
#> SRR772357 1 0.5953 0.53505 0.708 0.012 0.280
#> SRR772358 1 0.5244 0.58101 0.756 0.004 0.240
#> SRR772359 1 0.3349 0.68084 0.888 0.004 0.108
#> SRR772360 1 0.3272 0.69347 0.904 0.016 0.080
#> SRR772361 3 0.4346 0.65242 0.184 0.000 0.816
#> SRR772362 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772363 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772364 1 0.3845 0.67390 0.872 0.012 0.116
#> SRR772365 1 0.2443 0.71672 0.940 0.028 0.032
#> SRR772366 3 0.1964 0.83119 0.056 0.000 0.944
#> SRR772367 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 1 0.5650 0.52830 0.688 0.312 0.000
#> SRR772369 1 0.2496 0.72266 0.928 0.068 0.004
#> SRR772370 1 0.2537 0.71921 0.920 0.080 0.000
#> SRR772371 1 0.5988 0.67221 0.776 0.056 0.168
#> SRR772372 1 0.3899 0.72008 0.888 0.056 0.056
#> SRR772373 1 0.4842 0.64037 0.776 0.224 0.000
#> SRR772374 1 0.4796 0.64059 0.780 0.220 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 1 0.6302 0.18701 0.520 0.480 0.000
#> SRR772377 1 0.5581 0.63287 0.792 0.040 0.168
#> SRR772378 1 0.2793 0.71924 0.928 0.044 0.028
#> SRR772379 1 0.3375 0.71809 0.892 0.100 0.008
#> SRR772380 1 0.3791 0.72068 0.892 0.060 0.048
#> SRR772381 3 0.0592 0.84766 0.012 0.000 0.988
#> SRR772382 1 0.5292 0.58936 0.764 0.008 0.228
#> SRR772383 1 0.5864 0.52195 0.704 0.008 0.288
#> SRR772384 1 0.4994 0.63231 0.816 0.024 0.160
#> SRR772385 2 0.6225 0.15079 0.432 0.568 0.000
#> SRR772386 1 0.3816 0.69397 0.852 0.148 0.000
#> SRR772387 1 0.4121 0.68087 0.832 0.168 0.000
#> SRR772388 1 0.6682 0.01037 0.504 0.008 0.488
#> SRR772389 1 0.6625 0.19282 0.552 0.008 0.440
#> SRR772390 3 0.0424 0.85232 0.008 0.000 0.992
#> SRR772391 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772392 1 0.5618 0.55709 0.732 0.008 0.260
#> SRR772393 1 0.3267 0.70862 0.884 0.116 0.000
#> SRR772394 1 0.3030 0.71855 0.904 0.092 0.004
#> SRR772395 1 0.5926 0.47643 0.644 0.356 0.000
#> SRR772396 1 0.6434 0.35661 0.612 0.008 0.380
#> SRR772397 1 0.6416 0.36552 0.616 0.008 0.376
#> SRR772398 1 0.4399 0.63103 0.812 0.000 0.188
#> SRR772399 1 0.4453 0.66411 0.836 0.012 0.152
#> SRR772400 1 0.6513 0.30845 0.592 0.008 0.400
#> SRR772401 1 0.6608 0.21817 0.560 0.008 0.432
#> SRR772402 1 0.5810 0.52341 0.664 0.336 0.000
#> SRR772403 1 0.6111 0.40952 0.604 0.396 0.000
#> SRR772404 1 0.6168 0.33109 0.588 0.412 0.000
#> SRR772405 1 0.5412 0.62945 0.796 0.032 0.172
#> SRR772406 1 0.4555 0.65752 0.800 0.200 0.000
#> SRR772407 1 0.3272 0.71627 0.892 0.104 0.004
#> SRR772408 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772409 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772410 1 0.4047 0.69858 0.848 0.148 0.004
#> SRR772411 1 0.3965 0.70688 0.860 0.132 0.008
#> SRR772412 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772413 1 0.5988 0.49921 0.688 0.008 0.304
#> SRR772414 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.3941 0.68989 0.844 0.156 0.000
#> SRR772416 1 0.4110 0.69369 0.844 0.152 0.004
#> SRR772417 1 0.2926 0.71488 0.924 0.036 0.040
#> SRR772418 3 0.2400 0.82862 0.064 0.004 0.932
#> SRR772419 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772420 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772421 1 0.3886 0.72298 0.880 0.096 0.024
#> SRR772422 1 0.3454 0.71594 0.888 0.104 0.008
#> SRR772423 2 0.5733 0.42581 0.324 0.676 0.000
#> SRR772424 2 0.5882 0.34658 0.348 0.652 0.000
#> SRR772425 1 0.6215 0.30364 0.572 0.428 0.000
#> SRR772426 1 0.6192 0.33960 0.580 0.420 0.000
#> SRR772427 1 0.6302 0.14474 0.520 0.480 0.000
#> SRR772428 1 0.6252 0.43236 0.648 0.008 0.344
#> SRR772429 1 0.5247 0.59432 0.768 0.008 0.224
#> SRR772430 1 0.2682 0.72523 0.920 0.076 0.004
#> SRR772431 1 0.5465 0.58017 0.712 0.288 0.000
#> SRR772432 1 0.5216 0.60439 0.740 0.260 0.000
#> SRR772433 1 0.6617 0.22485 0.556 0.008 0.436
#> SRR772434 1 0.6664 0.12674 0.528 0.008 0.464
#> SRR772435 1 0.2636 0.70241 0.932 0.020 0.048
#> SRR772436 1 0.2063 0.70215 0.948 0.008 0.044
#> SRR772437 3 0.5363 0.54984 0.276 0.000 0.724
#> SRR772438 1 0.6587 0.24319 0.568 0.008 0.424
#> SRR772439 1 0.6451 0.34839 0.608 0.008 0.384
#> SRR772440 1 0.3500 0.71034 0.880 0.116 0.004
#> SRR772441 1 0.4235 0.67617 0.824 0.176 0.000
#> SRR772442 1 0.6008 0.47089 0.628 0.372 0.000
#> SRR772443 1 0.5098 0.61620 0.752 0.248 0.000
#> SRR772444 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772445 1 0.5692 0.54719 0.724 0.008 0.268
#> SRR772446 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772447 1 0.5864 0.52141 0.704 0.008 0.288
#> SRR772448 1 0.3851 0.70199 0.860 0.136 0.004
#> SRR772449 1 0.4409 0.68080 0.824 0.172 0.004
#> SRR772450 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772451 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772452 1 0.6467 0.33749 0.604 0.008 0.388
#> SRR772453 1 0.5650 0.49512 0.688 0.000 0.312
#> SRR772454 1 0.3845 0.67385 0.872 0.012 0.116
#> SRR772455 1 0.1832 0.70476 0.956 0.008 0.036
#> SRR772456 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772457 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772458 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772459 1 0.6129 0.46770 0.668 0.008 0.324
#> SRR772460 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772461 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772462 1 0.6307 0.12150 0.512 0.488 0.000
#> SRR772463 1 0.5905 0.47370 0.648 0.352 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.5060 0.70396 0.816 0.156 0.028
#> SRR772466 1 0.4270 0.71946 0.860 0.116 0.024
#> SRR772467 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772468 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772469 1 0.5659 0.58012 0.740 0.012 0.248
#> SRR772470 1 0.5553 0.55386 0.724 0.004 0.272
#> SRR772471 1 0.5318 0.62358 0.780 0.016 0.204
#> SRR772472 1 0.5450 0.60082 0.760 0.012 0.228
#> SRR772473 1 0.5098 0.61144 0.752 0.248 0.000
#> SRR772474 1 0.5465 0.58860 0.712 0.288 0.000
#> SRR772475 1 0.6215 0.30830 0.572 0.428 0.000
#> SRR772476 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772477 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772478 1 0.6467 0.33831 0.604 0.008 0.388
#> SRR772479 1 0.6155 0.46077 0.664 0.008 0.328
#> SRR772480 1 0.4351 0.68501 0.828 0.168 0.004
#> SRR772481 1 0.3933 0.72520 0.880 0.092 0.028
#> SRR772482 1 0.3816 0.65801 0.852 0.000 0.148
#> SRR772483 1 0.3845 0.67411 0.872 0.012 0.116
#> SRR772484 1 0.4931 0.62837 0.768 0.232 0.000
#> SRR772485 1 0.4974 0.62724 0.764 0.236 0.000
#> SRR772486 1 0.5926 0.41650 0.644 0.000 0.356
#> SRR772487 1 0.4409 0.64712 0.824 0.004 0.172
#> SRR772488 1 0.4269 0.72220 0.872 0.076 0.052
#> SRR772489 1 0.2651 0.72255 0.928 0.060 0.012
#> SRR772490 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772491 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772492 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772493 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772494 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772495 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772496 1 0.5098 0.62001 0.752 0.248 0.000
#> SRR772497 1 0.5098 0.61544 0.752 0.248 0.000
#> SRR772498 1 0.3752 0.70067 0.856 0.144 0.000
#> SRR772499 1 0.4452 0.67698 0.808 0.192 0.000
#> SRR772500 2 0.6299 -0.05407 0.476 0.524 0.000
#> SRR772501 2 0.5327 0.56809 0.272 0.728 0.000
#> SRR772502 1 0.3590 0.70339 0.896 0.028 0.076
#> SRR772503 1 0.4555 0.61976 0.800 0.000 0.200
#> SRR772504 1 0.5431 0.58730 0.716 0.284 0.000
#> SRR772505 1 0.5810 0.52073 0.664 0.336 0.000
#> SRR772506 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772507 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772508 2 0.6126 0.27822 0.400 0.600 0.000
#> SRR772509 1 0.3791 0.70668 0.892 0.048 0.060
#> SRR772510 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 1 0.3370 0.72547 0.904 0.072 0.024
#> SRR772512 1 0.5443 0.56004 0.736 0.004 0.260
#> SRR772513 1 0.5138 0.61011 0.748 0.252 0.000
#> SRR772514 1 0.6168 0.33310 0.588 0.412 0.000
#> SRR772515 1 0.4702 0.64692 0.788 0.212 0.000
#> SRR772516 1 0.4887 0.63314 0.772 0.228 0.000
#> SRR772517 1 0.4555 0.66307 0.800 0.200 0.000
#> SRR772518 1 0.4235 0.67583 0.824 0.176 0.000
#> SRR772519 1 0.5591 0.54036 0.696 0.304 0.000
#> SRR772520 1 0.6008 0.42818 0.628 0.372 0.000
#> SRR772521 1 0.3797 0.71741 0.892 0.052 0.056
#> SRR772522 1 0.3213 0.72246 0.912 0.060 0.028
#> SRR772523 1 0.5760 0.53416 0.672 0.328 0.000
#> SRR772524 1 0.5254 0.60182 0.736 0.264 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772527 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772528 3 0.0592 0.85080 0.012 0.000 0.988
#> SRR772529 1 0.5797 0.53237 0.712 0.008 0.280
#> SRR772530 1 0.5580 0.56002 0.736 0.008 0.256
#> SRR772531 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 1 0.6192 0.35748 0.580 0.420 0.000
#> SRR772533 1 0.5591 0.56501 0.696 0.304 0.000
#> SRR772534 1 0.3112 0.68605 0.900 0.004 0.096
#> SRR772535 1 0.5327 0.59761 0.728 0.272 0.000
#> SRR772536 1 0.5327 0.59905 0.728 0.272 0.000
#> SRR772537 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772538 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772539 1 0.5502 0.56494 0.744 0.008 0.248
#> SRR772540 1 0.4931 0.60754 0.784 0.004 0.212
#> SRR772541 1 0.4834 0.66079 0.792 0.204 0.004
#> SRR772542 1 0.5621 0.50481 0.692 0.000 0.308
#> SRR772543 1 0.6513 0.30874 0.592 0.008 0.400
#> SRR772544 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.4755 0.62891 0.808 0.008 0.184
#> SRR772546 1 0.5763 0.53787 0.716 0.008 0.276
#> SRR772547 1 0.4915 0.68218 0.832 0.036 0.132
#> SRR772548 1 0.5578 0.59097 0.748 0.012 0.240
#> SRR772549 1 0.6498 0.31837 0.596 0.008 0.396
#> SRR772550 1 0.6318 0.40325 0.636 0.008 0.356
#> SRR772551 1 0.4446 0.72067 0.856 0.112 0.032
#> SRR772552 1 0.4555 0.65880 0.800 0.200 0.000
#> SRR772553 1 0.5291 0.59644 0.732 0.268 0.000
#> SRR772554 1 0.5327 0.60206 0.728 0.272 0.000
#> SRR772555 1 0.5678 0.54593 0.684 0.316 0.000
#> SRR772556 1 0.5864 0.52178 0.704 0.008 0.288
#> SRR772557 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772558 1 0.5167 0.63582 0.792 0.016 0.192
#> SRR772559 1 0.5201 0.58774 0.760 0.004 0.236
#> SRR772560 1 0.3377 0.72318 0.896 0.092 0.012
#> SRR772561 3 0.6513 0.11312 0.476 0.004 0.520
#> SRR772562 1 0.5327 0.58447 0.728 0.272 0.000
#> SRR772563 1 0.6140 0.35434 0.596 0.404 0.000
#> SRR772564 1 0.6172 0.49952 0.680 0.012 0.308
#> SRR772565 1 0.6527 0.29831 0.588 0.008 0.404
#> SRR772566 3 0.5656 0.63862 0.264 0.008 0.728
#> SRR772567 3 0.6180 0.51811 0.332 0.008 0.660
#> SRR772568 1 0.4555 0.65803 0.800 0.200 0.000
#> SRR772569 1 0.4555 0.66351 0.800 0.200 0.000
#> SRR772570 1 0.5292 0.60147 0.764 0.008 0.228
#> SRR772571 1 0.4663 0.66158 0.828 0.016 0.156
#> SRR772572 1 0.5105 0.69279 0.828 0.048 0.124
#> SRR772573 1 0.5253 0.71164 0.828 0.076 0.096
#> SRR772574 1 0.5461 0.57212 0.748 0.008 0.244
#> SRR772575 1 0.4963 0.61381 0.792 0.008 0.200
#> SRR772576 1 0.3551 0.70187 0.868 0.132 0.000
#> SRR772577 1 0.3482 0.70427 0.872 0.128 0.000
#> SRR772578 2 0.1860 0.85443 0.052 0.948 0.000
#> SRR772579 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.4289 0.72750 0.868 0.092 0.040
#> SRR772582 1 0.3193 0.71568 0.896 0.100 0.004
#> SRR772583 1 0.3213 0.72202 0.900 0.092 0.008
#> SRR772584 1 0.2711 0.72007 0.912 0.088 0.000
#> SRR772585 1 0.4974 0.62709 0.764 0.236 0.000
#> SRR772586 3 0.6318 0.47338 0.356 0.008 0.636
#> SRR772587 1 0.6082 0.53127 0.692 0.012 0.296
#> SRR772588 2 0.3412 0.79211 0.124 0.876 0.000
#> SRR772589 2 0.3619 0.77152 0.136 0.864 0.000
#> SRR772590 3 0.1643 0.82152 0.044 0.000 0.956
#> SRR772591 3 0.6527 0.34667 0.404 0.008 0.588
#> SRR772592 3 0.6451 0.40619 0.384 0.008 0.608
#> SRR772593 3 0.5656 0.59173 0.284 0.004 0.712
#> SRR772594 2 0.1964 0.85243 0.056 0.944 0.000
#> SRR772595 2 0.4062 0.73600 0.164 0.836 0.000
#> SRR772596 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 1 0.6180 0.45525 0.660 0.008 0.332
#> SRR772599 1 0.6527 0.29944 0.588 0.008 0.404
#> SRR772600 1 0.5216 0.61076 0.740 0.260 0.000
#> SRR772601 1 0.6026 0.46037 0.624 0.376 0.000
#> SRR772602 3 0.0237 0.85206 0.004 0.000 0.996
#> SRR772603 1 0.4974 0.62576 0.764 0.236 0.000
#> SRR772604 1 0.5431 0.58964 0.716 0.284 0.000
#> SRR772605 1 0.4452 0.66774 0.808 0.192 0.000
#> SRR772606 1 0.6339 0.39676 0.632 0.008 0.360
#> SRR772607 1 0.6205 0.44673 0.656 0.008 0.336
#> SRR772608 1 0.4605 0.65410 0.796 0.204 0.000
#> SRR772609 1 0.4452 0.66437 0.808 0.192 0.000
#> SRR772610 1 0.6008 0.41787 0.628 0.372 0.000
#> SRR772611 1 0.5465 0.57058 0.712 0.288 0.000
#> SRR772612 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772613 2 0.1643 0.85744 0.044 0.956 0.000
#> SRR772614 1 0.6102 0.47498 0.672 0.008 0.320
#> SRR772615 1 0.6680 0.02697 0.508 0.008 0.484
#> SRR772616 1 0.5253 0.64204 0.792 0.020 0.188
#> SRR772617 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772618 2 0.0592 0.88422 0.012 0.988 0.000
#> SRR772619 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772620 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772621 1 0.2982 0.72257 0.920 0.056 0.024
#> SRR772622 1 0.2846 0.72070 0.924 0.056 0.020
#> SRR772623 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772624 3 0.5928 0.57735 0.296 0.008 0.696
#> SRR772625 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772626 1 0.3879 0.69169 0.848 0.152 0.000
#> SRR772627 1 0.4682 0.68219 0.804 0.192 0.004
#> SRR772628 1 0.5785 0.51074 0.696 0.004 0.300
#> SRR772629 1 0.5896 0.51611 0.700 0.008 0.292
#> SRR772630 1 0.3484 0.71662 0.904 0.048 0.048
#> SRR772631 3 0.4291 0.73927 0.180 0.000 0.820
#> SRR772632 2 0.4974 0.64903 0.236 0.764 0.000
#> SRR772633 2 0.0592 0.88476 0.012 0.988 0.000
#> SRR772634 1 0.3031 0.69915 0.912 0.012 0.076
#> SRR772635 1 0.3030 0.68805 0.904 0.004 0.092
#> SRR772636 2 0.3482 0.79153 0.128 0.872 0.000
#> SRR772637 1 0.6565 0.26550 0.576 0.008 0.416
#> SRR772638 1 0.6467 0.30886 0.604 0.008 0.388
#> SRR772639 1 0.5254 0.59568 0.736 0.264 0.000
#> SRR772640 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772641 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772642 1 0.2448 0.72114 0.924 0.076 0.000
#> SRR772643 1 0.2448 0.72041 0.924 0.076 0.000
#> SRR772644 1 0.4413 0.64756 0.832 0.008 0.160
#> SRR772645 1 0.5536 0.59270 0.752 0.012 0.236
#> SRR772646 1 0.6045 0.42258 0.620 0.380 0.000
#> SRR772647 1 0.5058 0.61551 0.756 0.244 0.000
#> SRR772648 1 0.4345 0.70582 0.848 0.136 0.016
#> SRR772649 1 0.3551 0.70177 0.868 0.132 0.000
#> SRR772650 1 0.1905 0.71204 0.956 0.016 0.028
#> SRR772651 1 0.4453 0.66377 0.836 0.012 0.152
#> SRR772652 1 0.4700 0.63104 0.812 0.008 0.180
#> SRR772653 1 0.5420 0.57797 0.752 0.008 0.240
#> SRR772654 1 0.2550 0.71897 0.936 0.040 0.024
#> SRR772655 1 0.3587 0.69731 0.892 0.020 0.088
#> SRR772656 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772657 3 0.4796 0.61196 0.220 0.000 0.780
#> SRR772658 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772659 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772660 1 0.5291 0.59183 0.732 0.268 0.000
#> SRR772661 1 0.5619 0.55215 0.744 0.012 0.244
#> SRR772662 1 0.1163 0.71622 0.972 0.028 0.000
#> SRR772663 1 0.2383 0.70590 0.940 0.016 0.044
#> SRR772664 1 0.6225 0.29842 0.568 0.432 0.000
#> SRR772665 1 0.6235 0.28683 0.564 0.436 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772668 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772669 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772670 1 0.2998 0.72432 0.916 0.068 0.016
#> SRR772671 1 0.2165 0.72341 0.936 0.064 0.000
#> SRR772672 1 0.5327 0.59249 0.728 0.272 0.000
#> SRR772673 1 0.5016 0.62061 0.760 0.240 0.000
#> SRR772674 3 0.1163 0.83455 0.028 0.000 0.972
#> SRR772675 1 0.5466 0.63856 0.800 0.040 0.160
#> SRR772676 1 0.4174 0.72521 0.872 0.092 0.036
#> SRR772677 1 0.3995 0.71426 0.868 0.116 0.016
#> SRR772678 1 0.5454 0.64412 0.804 0.044 0.152
#> SRR772679 1 0.2152 0.70819 0.948 0.016 0.036
#> SRR772680 1 0.4602 0.66372 0.832 0.016 0.152
#> SRR772681 3 0.4062 0.68973 0.164 0.000 0.836
#> SRR772682 1 0.6045 0.40757 0.620 0.380 0.000
#> SRR772683 1 0.5859 0.47499 0.656 0.344 0.000
#> SRR772685 1 0.3752 0.69550 0.856 0.144 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772688 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772689 2 0.0424 0.88739 0.008 0.992 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.85408 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 1 0.6305 0.14011 0.516 0.484 0.000
#> SRR772692 1 0.2187 0.71564 0.948 0.028 0.024
#> SRR772693 1 0.3045 0.72366 0.916 0.064 0.020
#> SRR772694 1 0.4002 0.68685 0.840 0.160 0.000
#> SRR772695 1 0.3267 0.70961 0.884 0.116 0.000
#> SRR772696 1 0.4291 0.69665 0.840 0.152 0.008
#> SRR772697 1 0.4531 0.68516 0.824 0.168 0.008
#> SRR772698 3 0.1753 0.83643 0.048 0.000 0.952
#> SRR772699 1 0.5722 0.52275 0.704 0.004 0.292
#> SRR772700 1 0.5618 0.55651 0.732 0.008 0.260
#> SRR772701 1 0.5397 0.53998 0.720 0.000 0.280
#> SRR772702 1 0.5928 0.51057 0.696 0.008 0.296
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.2281 0.8009 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.2149 0.7976 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR772343 2 0.4304 0.6088 0.284 0.716 0.000 0.000
#> SRR772344 2 0.4830 0.3977 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR772345 2 0.4999 0.0690 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR772346 2 0.4605 0.5046 0.336 0.664 0.000 0.000
#> SRR772347 1 0.4948 0.2974 0.560 0.440 0.000 0.000
#> SRR772348 2 0.3945 0.7280 0.004 0.780 0.000 0.216
#> SRR772349 2 0.4500 0.5808 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR772350 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0817 0.8442 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772352 2 0.1022 0.8448 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772353 2 0.2081 0.8261 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR772354 2 0.1867 0.8343 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.0592 0.8432 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772356 2 0.3311 0.7769 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR772357 1 0.3444 0.7655 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.4304 0.6311 0.716 0.284 0.000 0.000
#> SRR772359 2 0.4564 0.5321 0.328 0.672 0.000 0.000
#> SRR772360 2 0.4040 0.6736 0.248 0.752 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772363 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772364 2 0.4948 0.2248 0.440 0.560 0.000 0.000
#> SRR772365 2 0.3400 0.7619 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR772366 3 0.3428 0.8233 0.144 0.000 0.844 0.012
#> SRR772367 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.1389 0.8403 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772369 2 0.1302 0.8387 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR772370 2 0.0921 0.8421 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR772371 2 0.4605 0.4784 0.336 0.664 0.000 0.000
#> SRR772372 2 0.4356 0.5834 0.292 0.708 0.000 0.000
#> SRR772373 2 0.0336 0.8427 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772374 2 0.0000 0.8404 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.4543 0.5672 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR772377 2 0.4007 0.7944 0.128 0.836 0.024 0.012
#> SRR772378 2 0.3024 0.7880 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR772379 2 0.2197 0.8326 0.080 0.916 0.000 0.004
#> SRR772380 2 0.3219 0.7704 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.3873 0.7223 0.772 0.228 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.1302 0.8085 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR772384 2 0.4124 0.7736 0.164 0.812 0.012 0.012
#> SRR772385 2 0.5237 0.4894 0.016 0.628 0.000 0.356
#> SRR772386 2 0.0592 0.8429 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0188 0.8414 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772388 1 0.0779 0.8027 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR772389 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.1059 0.9218 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR772391 1 0.0707 0.8054 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.1792 0.8076 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.0707 0.8436 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772394 2 0.1940 0.8353 0.076 0.924 0.000 0.000
#> SRR772395 2 0.2647 0.8140 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772396 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.4977 0.2189 0.540 0.460 0.000 0.000
#> SRR772399 2 0.4877 0.3161 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772402 2 0.2408 0.8252 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772403 2 0.3837 0.7127 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR772404 2 0.2921 0.8012 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR772405 2 0.4507 0.7360 0.200 0.776 0.012 0.012
#> SRR772406 2 0.0000 0.8404 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772407 2 0.1118 0.8410 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR772408 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772409 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772410 2 0.1661 0.8431 0.052 0.944 0.000 0.004
#> SRR772411 2 0.1302 0.8436 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR772412 1 0.2216 0.7975 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0524 0.8437 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR772416 2 0.0895 0.8461 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR772417 2 0.4134 0.6478 0.260 0.740 0.000 0.000
#> SRR772418 3 0.4026 0.8309 0.092 0.048 0.848 0.012
#> SRR772419 4 0.1389 0.9036 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR772420 4 0.1389 0.9035 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR772421 2 0.2081 0.8300 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR772422 2 0.1474 0.8387 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR772423 2 0.4998 0.0891 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR772424 4 0.4981 0.0577 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR772425 2 0.3486 0.7576 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR772426 2 0.4134 0.6653 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR772427 2 0.4406 0.5884 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR772428 1 0.0921 0.8066 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR772429 1 0.1302 0.8086 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR772430 2 0.2973 0.7906 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR772431 2 0.1978 0.8385 0.004 0.928 0.000 0.068
#> SRR772432 2 0.1489 0.8436 0.004 0.952 0.000 0.044
#> SRR772433 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772435 2 0.4072 0.6628 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR772436 2 0.4008 0.6737 0.244 0.756 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0336 0.9265 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR772438 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772439 1 0.1109 0.8059 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR772440 2 0.0592 0.8448 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR772441 2 0.0188 0.8405 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772442 2 0.3649 0.7490 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR772443 2 0.1022 0.8428 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772444 1 0.0707 0.8049 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.3074 0.7811 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.0592 0.8451 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR772449 2 0.0336 0.8431 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772450 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772451 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772452 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.1792 0.8050 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR772454 2 0.4981 0.1316 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR772455 2 0.4193 0.6353 0.268 0.732 0.000 0.000
#> SRR772456 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772457 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772458 1 0.1867 0.8063 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0707 0.8051 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772460 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772461 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772462 2 0.3764 0.7251 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR772463 2 0.2647 0.8127 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772464 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.1557 0.8385 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR772466 2 0.2266 0.8291 0.084 0.912 0.000 0.004
#> SRR772467 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772468 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772469 1 0.3764 0.7213 0.784 0.216 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.2408 0.7995 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.4543 0.5812 0.676 0.324 0.000 0.000
#> SRR772472 1 0.4679 0.5306 0.648 0.352 0.000 0.000
#> SRR772473 2 0.0817 0.8434 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772474 2 0.2345 0.8265 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772475 2 0.4253 0.7353 0.016 0.776 0.000 0.208
#> SRR772476 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772477 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772478 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.1302 0.8455 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR772481 2 0.2401 0.8248 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR772482 1 0.4996 0.1073 0.516 0.484 0.000 0.000
#> SRR772483 1 0.4989 0.1298 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR772484 2 0.0469 0.8417 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772485 2 0.0592 0.8409 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772486 1 0.1302 0.8092 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR772487 1 0.4730 0.4807 0.636 0.364 0.000 0.000
#> SRR772488 2 0.2921 0.7961 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR772489 2 0.2281 0.8186 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR772490 1 0.2868 0.7907 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772492 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772493 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772494 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772495 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772496 2 0.1109 0.8457 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR772497 2 0.0804 0.8436 0.008 0.980 0.000 0.012
#> SRR772498 2 0.1042 0.8473 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772499 2 0.2522 0.8363 0.016 0.908 0.000 0.076
#> SRR772500 2 0.4661 0.5004 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR772501 4 0.4817 0.3449 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR772502 2 0.4746 0.3960 0.368 0.632 0.000 0.000
#> SRR772503 1 0.4866 0.3962 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.2345 0.8278 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772505 2 0.3444 0.7560 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772506 4 0.0707 0.9220 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR772507 4 0.0921 0.9172 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772508 2 0.4661 0.4948 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR772509 2 0.2510 0.8364 0.064 0.916 0.008 0.012
#> SRR772510 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.2149 0.8271 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR772512 2 0.6240 0.5094 0.076 0.604 0.320 0.000
#> SRR772513 2 0.1022 0.8428 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772514 2 0.2868 0.8020 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR772515 2 0.0927 0.8459 0.008 0.976 0.000 0.016
#> SRR772516 2 0.0895 0.8440 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR772517 2 0.1109 0.8469 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR772518 2 0.0188 0.8414 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772519 2 0.1118 0.8434 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772520 2 0.3074 0.7930 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR772521 2 0.3751 0.7363 0.196 0.800 0.000 0.004
#> SRR772522 2 0.2589 0.8103 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR772523 2 0.3311 0.7760 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR772524 2 0.1302 0.8427 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772525 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772527 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772528 3 0.2255 0.8935 0.068 0.000 0.920 0.012
#> SRR772529 1 0.3837 0.7292 0.776 0.224 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.3311 0.7720 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.4103 0.6743 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR772533 2 0.3074 0.7913 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR772534 2 0.4961 0.1720 0.448 0.552 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.1743 0.8421 0.004 0.940 0.000 0.056
#> SRR772536 2 0.1940 0.8366 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772537 4 0.0707 0.9215 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR772538 4 0.0592 0.9237 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR772539 1 0.2345 0.8028 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.3610 0.7576 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.2915 0.8306 0.080 0.892 0.000 0.028
#> SRR772542 1 0.2868 0.7888 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772544 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.4888 0.3575 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.4193 0.6672 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR772547 2 0.5112 0.1532 0.436 0.560 0.000 0.004
#> SRR772548 1 0.4888 0.3928 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0817 0.8056 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.3311 0.7513 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR772552 2 0.1970 0.8402 0.060 0.932 0.000 0.008
#> SRR772553 2 0.1888 0.8415 0.016 0.940 0.000 0.044
#> SRR772554 2 0.1557 0.8418 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772555 2 0.2408 0.8254 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772556 1 0.2530 0.7890 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.1389 0.8072 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.4907 0.3723 0.580 0.420 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.3764 0.7414 0.784 0.216 0.000 0.000
#> SRR772560 2 0.3123 0.7759 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR772561 3 0.5344 0.4787 0.032 0.300 0.668 0.000
#> SRR772562 2 0.1118 0.8406 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772563 2 0.2814 0.8077 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772564 1 0.3448 0.7577 0.828 0.168 0.004 0.000
#> SRR772565 1 0.1824 0.8072 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR772566 1 0.1888 0.7774 0.940 0.016 0.044 0.000
#> SRR772567 1 0.2142 0.7672 0.928 0.016 0.056 0.000
#> SRR772568 2 0.0188 0.8405 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772569 2 0.1824 0.8402 0.004 0.936 0.000 0.060
#> SRR772570 1 0.4855 0.4139 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR772571 2 0.4250 0.6235 0.276 0.724 0.000 0.000
#> SRR772572 2 0.4790 0.3620 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR772573 2 0.4697 0.4276 0.356 0.644 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.3942 0.7217 0.764 0.236 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.4713 0.5054 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.0707 0.8427 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772577 2 0.0817 0.8441 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR772578 4 0.2281 0.8527 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR772579 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772580 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.2973 0.7920 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR772582 2 0.0921 0.8428 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR772583 2 0.2197 0.8316 0.080 0.916 0.000 0.004
#> SRR772584 2 0.0592 0.8436 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR772585 2 0.0895 0.8437 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR772586 1 0.6733 0.2441 0.548 0.068 0.372 0.012
#> SRR772587 1 0.3764 0.7325 0.784 0.216 0.000 0.000
#> SRR772588 4 0.4222 0.6366 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR772589 4 0.4250 0.6285 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR772590 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0779 0.8016 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR772593 3 0.6886 0.1838 0.420 0.072 0.496 0.012
#> SRR772594 4 0.2281 0.8527 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR772595 4 0.3569 0.7278 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR772596 3 0.1174 0.9208 0.020 0.000 0.968 0.012
#> SRR772597 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0707 0.8049 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772600 2 0.1557 0.8404 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772601 2 0.3219 0.7875 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR772602 3 0.0188 0.9316 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772603 2 0.0779 0.8432 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR772604 2 0.1978 0.8389 0.004 0.928 0.000 0.068
#> SRR772605 2 0.1820 0.8456 0.036 0.944 0.000 0.020
#> SRR772606 1 0.1302 0.8103 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0707 0.8049 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0937 0.8463 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR772609 2 0.0804 0.8456 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR772610 2 0.2081 0.8291 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772611 2 0.1302 0.8426 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772612 4 0.0707 0.9214 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR772613 4 0.1940 0.8759 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR772614 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0592 0.8036 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4996 0.1634 0.516 0.484 0.000 0.000
#> SRR772617 4 0.1792 0.8877 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR772618 4 0.1637 0.8949 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR772619 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772620 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772621 2 0.2469 0.8154 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR772622 2 0.2281 0.8154 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR772623 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.5584 0.1885 0.580 0.008 0.400 0.012
#> SRR772625 4 0.0657 0.9230 0.004 0.012 0.000 0.984
#> SRR772626 2 0.0000 0.8404 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772627 2 0.2737 0.8207 0.008 0.888 0.000 0.104
#> SRR772628 1 0.1022 0.8077 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772629 1 0.1389 0.8101 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR772630 2 0.4304 0.5963 0.284 0.716 0.000 0.000
#> SRR772631 3 0.5573 0.1934 0.476 0.004 0.508 0.012
#> SRR772632 4 0.4406 0.5741 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR772633 4 0.1118 0.9122 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR772634 2 0.4431 0.5699 0.304 0.696 0.000 0.000
#> SRR772635 2 0.4679 0.4626 0.352 0.648 0.000 0.000
#> SRR772636 4 0.4214 0.6969 0.016 0.204 0.000 0.780
#> SRR772637 1 0.1022 0.8076 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.1716 0.8029 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.1211 0.8420 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772640 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772641 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772642 2 0.0707 0.8416 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772643 2 0.1389 0.8371 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR772644 1 0.4925 0.3393 0.572 0.428 0.000 0.000
#> SRR772645 1 0.4855 0.4325 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.3444 0.7563 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772647 2 0.0336 0.8404 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772648 2 0.1389 0.8419 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR772649 2 0.0707 0.8421 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772650 2 0.3074 0.7848 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR772651 2 0.4790 0.3741 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.4998 0.0757 0.512 0.488 0.000 0.000
#> SRR772653 1 0.3907 0.7106 0.768 0.232 0.000 0.000
#> SRR772654 2 0.3123 0.7798 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR772655 2 0.4477 0.5585 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772658 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772659 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772660 2 0.0817 0.8426 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772661 2 0.5969 0.3963 0.360 0.600 0.028 0.012
#> SRR772662 2 0.2589 0.8078 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR772663 2 0.4134 0.6454 0.260 0.740 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.4008 0.6873 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR772665 2 0.4103 0.6712 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR772666 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772667 4 0.1940 0.8800 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR772668 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772669 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772670 2 0.2469 0.8143 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR772671 2 0.3528 0.7412 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR772672 2 0.1389 0.8419 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772673 2 0.0817 0.8414 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772674 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772675 2 0.3680 0.8067 0.120 0.852 0.016 0.012
#> SRR772676 2 0.2081 0.8305 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR772677 2 0.1716 0.8357 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR772678 2 0.4124 0.7712 0.164 0.812 0.012 0.012
#> SRR772679 2 0.3219 0.7704 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR772680 2 0.4830 0.3262 0.392 0.608 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0188 0.9313 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772682 2 0.2921 0.7962 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR772683 2 0.1867 0.8343 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772685 2 0.0592 0.8419 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772687 3 0.2546 0.8703 0.092 0.000 0.900 0.008
#> SRR772688 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772689 4 0.0469 0.9255 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772690 3 0.0000 0.9338 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.4831 0.6423 0.016 0.704 0.000 0.280
#> SRR772692 2 0.2973 0.7897 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR772693 2 0.2011 0.8322 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR772694 2 0.0524 0.8439 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR772695 2 0.0336 0.8422 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772696 2 0.1004 0.8450 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR772697 2 0.0469 0.8442 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772698 3 0.3122 0.8673 0.084 0.016 0.888 0.012
#> SRR772699 1 0.3219 0.7759 0.836 0.164 0.000 0.000
#> SRR772700 1 0.3764 0.7333 0.784 0.216 0.000 0.000
#> SRR772701 1 0.3074 0.7818 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0817 0.8066 0.976 0.024 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.2020 0.80610 0.900 0.100 0.000 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.1608 0.81107 0.928 0.072 0.000 0.000 0.000
#> SRR772343 2 0.3508 0.66919 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR772344 2 0.4114 0.44246 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR772345 2 0.4300 0.14029 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR772346 2 0.4045 0.47258 0.356 0.644 0.000 0.000 0.000
#> SRR772347 1 0.4249 0.29854 0.568 0.432 0.000 0.000 0.000
#> SRR772348 2 0.3300 0.74742 0.004 0.792 0.000 0.204 0.000
#> SRR772349 2 0.3796 0.61385 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR772350 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0609 0.85574 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR772352 2 0.0794 0.85739 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR772353 2 0.1608 0.84103 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR772354 2 0.1478 0.84762 0.064 0.936 0.000 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.0404 0.85592 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772356 2 0.2732 0.79356 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR772357 1 0.2929 0.76612 0.820 0.180 0.000 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.3707 0.62823 0.716 0.284 0.000 0.000 0.000
#> SRR772359 2 0.3730 0.61743 0.288 0.712 0.000 0.000 0.000
#> SRR772360 2 0.3210 0.72916 0.212 0.788 0.000 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 2 0.4210 0.33979 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000
#> SRR772365 2 0.3003 0.76108 0.188 0.812 0.000 0.000 0.000
#> SRR772366 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772368 2 0.1197 0.85294 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR772369 2 0.1043 0.85199 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR772370 2 0.0703 0.85485 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR772371 2 0.3983 0.47844 0.340 0.660 0.000 0.000 0.000
#> SRR772372 2 0.3752 0.59027 0.292 0.708 0.000 0.000 0.000
#> SRR772373 2 0.0404 0.85458 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.85166 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772376 2 0.3876 0.58959 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR772377 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772378 2 0.2424 0.80933 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR772379 2 0.1638 0.84834 0.064 0.932 0.000 0.004 0.000
#> SRR772380 2 0.2377 0.81034 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.3210 0.73738 0.788 0.212 0.000 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0794 0.82213 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR772384 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772385 5 0.0510 0.96826 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR772386 2 0.0162 0.85317 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0162 0.85279 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772388 1 0.0162 0.81593 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772389 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772390 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772391 1 0.0162 0.81837 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.1410 0.81779 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.0290 0.85445 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772394 2 0.1671 0.84598 0.076 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR772395 2 0.2074 0.83261 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.4278 0.22395 0.548 0.452 0.000 0.000 0.000
#> SRR772399 2 0.4161 0.37939 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0324 0.81807 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR772401 1 0.0162 0.81599 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772402 2 0.2020 0.83695 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR772403 2 0.3210 0.73295 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR772404 2 0.2516 0.81097 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR772405 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.85166 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772407 2 0.0703 0.85476 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR772408 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 2 0.1704 0.84584 0.068 0.928 0.000 0.004 0.000
#> SRR772411 2 0.1410 0.85011 0.060 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR772412 1 0.1478 0.81473 0.936 0.064 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0566 0.85569 0.012 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR772416 2 0.0671 0.85663 0.016 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR772417 2 0.3305 0.70909 0.224 0.776 0.000 0.000 0.000
#> SRR772418 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772419 4 0.1197 0.88626 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR772420 4 0.1270 0.88281 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR772421 2 0.1732 0.84138 0.080 0.920 0.000 0.000 0.000
#> SRR772422 2 0.1197 0.85144 0.048 0.952 0.000 0.000 0.000
#> SRR772423 2 0.4304 0.10058 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR772424 4 0.4294 0.03675 0.000 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR772425 2 0.2813 0.78589 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR772426 2 0.3586 0.66169 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR772427 2 0.3857 0.57045 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR772428 1 0.0290 0.81910 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR772429 1 0.1121 0.81966 0.956 0.044 0.000 0.000 0.000
#> SRR772430 2 0.3067 0.79676 0.140 0.844 0.000 0.004 0.012
#> SRR772431 2 0.1608 0.84742 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR772432 2 0.1197 0.85454 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR772433 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0290 0.81495 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772435 2 0.3508 0.67387 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR772436 2 0.3452 0.68405 0.244 0.756 0.000 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0162 0.81599 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772439 1 0.0671 0.81927 0.980 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR772440 2 0.0290 0.85519 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.85166 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772442 2 0.3003 0.76843 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR772443 2 0.0794 0.85548 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.2561 0.78666 0.856 0.144 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.0566 0.85683 0.012 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR772449 2 0.0451 0.85592 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR772450 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.1341 0.81695 0.944 0.056 0.000 0.000 0.000
#> SRR772454 2 0.4300 0.12317 0.476 0.524 0.000 0.000 0.000
#> SRR772455 2 0.3424 0.69170 0.240 0.760 0.000 0.000 0.000
#> SRR772456 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.1197 0.82137 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0162 0.81822 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772460 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.3109 0.74983 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772463 2 0.2179 0.82764 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772465 2 0.1043 0.85362 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR772466 2 0.1478 0.84552 0.064 0.936 0.000 0.000 0.000
#> SRR772467 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.3177 0.72486 0.792 0.208 0.000 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.2230 0.80164 0.884 0.116 0.000 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.3876 0.58941 0.684 0.316 0.000 0.000 0.000
#> SRR772472 1 0.4015 0.53223 0.652 0.348 0.000 0.000 0.000
#> SRR772473 2 0.0510 0.85502 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772474 2 0.2020 0.83640 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR772475 5 0.0510 0.96826 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR772476 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.0963 0.85790 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR772481 2 0.1704 0.84587 0.068 0.928 0.000 0.004 0.000
#> SRR772482 2 0.4307 -0.00159 0.496 0.504 0.000 0.000 0.000
#> SRR772483 2 0.4451 0.03635 0.492 0.504 0.000 0.000 0.004
#> SRR772484 2 0.0404 0.85346 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772485 2 0.0510 0.85383 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772486 1 0.1205 0.82114 0.956 0.040 0.000 0.000 0.004
#> SRR772487 1 0.4757 0.41536 0.596 0.380 0.000 0.000 0.024
#> SRR772488 2 0.2127 0.82714 0.108 0.892 0.000 0.000 0.000
#> SRR772489 2 0.1792 0.83335 0.084 0.916 0.000 0.000 0.000
#> SRR772490 1 0.2424 0.79547 0.868 0.132 0.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772492 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.0671 0.85751 0.004 0.980 0.000 0.016 0.000
#> SRR772497 2 0.0324 0.85435 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR772498 2 0.0798 0.85873 0.008 0.976 0.000 0.016 0.000
#> SRR772499 2 0.2110 0.84660 0.016 0.912 0.000 0.072 0.000
#> SRR772500 2 0.3913 0.55163 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR772501 4 0.4192 0.28609 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR772502 2 0.4114 0.38519 0.376 0.624 0.000 0.000 0.000
#> SRR772503 1 0.4138 0.42957 0.616 0.384 0.000 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.1851 0.84311 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR772505 2 0.2891 0.77223 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772506 4 0.0609 0.90666 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772507 4 0.0880 0.89862 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772508 2 0.3966 0.52261 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR772509 5 0.0404 0.97310 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR772510 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.1851 0.83587 0.088 0.912 0.000 0.000 0.000
#> SRR772512 2 0.6819 0.32498 0.060 0.512 0.336 0.000 0.092
#> SRR772513 2 0.0794 0.85552 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR772514 2 0.2230 0.82421 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR772515 2 0.0865 0.85628 0.004 0.972 0.000 0.024 0.000
#> SRR772516 2 0.0510 0.85568 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772517 2 0.0955 0.85731 0.004 0.968 0.000 0.028 0.000
#> SRR772518 2 0.0290 0.85389 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772519 2 0.1043 0.85486 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR772520 2 0.2471 0.81322 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR772521 2 0.3123 0.75724 0.184 0.812 0.000 0.004 0.000
#> SRR772522 2 0.2179 0.82185 0.112 0.888 0.000 0.000 0.000
#> SRR772523 2 0.2773 0.79120 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR772524 2 0.0963 0.85564 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772529 1 0.3210 0.73960 0.788 0.212 0.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.2605 0.78617 0.852 0.148 0.000 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772532 2 0.3452 0.69680 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR772533 2 0.2605 0.80333 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR772534 2 0.4242 0.26536 0.428 0.572 0.000 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.1430 0.85405 0.004 0.944 0.000 0.052 0.000
#> SRR772536 2 0.1608 0.84790 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR772537 4 0.0510 0.90811 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772538 4 0.0162 0.91480 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772539 1 0.1851 0.81352 0.912 0.088 0.000 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.3242 0.73867 0.784 0.216 0.000 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.2291 0.85046 0.056 0.908 0.000 0.036 0.000
#> SRR772542 1 0.2873 0.79483 0.860 0.120 0.000 0.000 0.020
#> SRR772543 1 0.0324 0.81763 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR772544 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.4171 0.38002 0.604 0.396 0.000 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.3480 0.68743 0.752 0.248 0.000 0.000 0.000
#> SRR772547 2 0.4350 0.26317 0.408 0.588 0.000 0.004 0.000
#> SRR772548 1 0.4201 0.38753 0.592 0.408 0.000 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0162 0.81822 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.2966 0.74078 0.184 0.816 0.000 0.000 0.000
#> SRR772552 2 0.1282 0.85516 0.044 0.952 0.000 0.004 0.000
#> SRR772553 5 0.0609 0.96279 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR772554 2 0.1410 0.85153 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR772555 2 0.2020 0.83670 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR772556 1 0.1671 0.80935 0.924 0.076 0.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0609 0.82047 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.4227 0.36277 0.580 0.420 0.000 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.3177 0.74544 0.792 0.208 0.000 0.000 0.000
#> SRR772560 2 0.2424 0.80398 0.132 0.868 0.000 0.000 0.000
#> SRR772561 3 0.3412 0.66590 0.028 0.152 0.820 0.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0963 0.85422 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR772563 2 0.2329 0.82213 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR772564 1 0.3053 0.75248 0.828 0.164 0.000 0.000 0.008
#> SRR772565 1 0.1408 0.81839 0.948 0.044 0.000 0.000 0.008
#> SRR772566 1 0.0955 0.80235 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR772567 1 0.1082 0.80057 0.964 0.000 0.028 0.000 0.008
#> SRR772568 2 0.0000 0.85166 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772569 2 0.1270 0.85210 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR772570 1 0.4182 0.40228 0.600 0.400 0.000 0.000 0.000
#> SRR772571 2 0.3636 0.63838 0.272 0.728 0.000 0.000 0.000
#> SRR772572 2 0.4138 0.36418 0.384 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR772573 2 0.3999 0.46484 0.344 0.656 0.000 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.3274 0.73180 0.780 0.220 0.000 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.4060 0.48394 0.640 0.360 0.000 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.0703 0.85467 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR772577 2 0.0794 0.85600 0.028 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR772578 4 0.1965 0.83573 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR772579 4 0.0162 0.91488 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772581 2 0.2377 0.81367 0.128 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR772582 2 0.0703 0.85598 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR772583 2 0.1704 0.84721 0.068 0.928 0.000 0.004 0.000
#> SRR772584 2 0.0566 0.85511 0.012 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR772585 2 0.0771 0.85525 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR772586 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772587 1 0.3177 0.73464 0.792 0.208 0.000 0.000 0.000
#> SRR772588 4 0.3774 0.56662 0.000 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR772589 4 0.3730 0.57579 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0162 0.81574 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772592 1 0.0162 0.81498 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR772593 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772594 4 0.2074 0.82240 0.000 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR772595 4 0.3109 0.68703 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR772596 5 0.0880 0.95975 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR772597 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772600 2 0.1197 0.85381 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR772601 2 0.2732 0.79495 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR772602 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0579 0.85600 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR772604 2 0.1571 0.85224 0.004 0.936 0.000 0.060 0.000
#> SRR772605 2 0.1310 0.85801 0.024 0.956 0.000 0.020 0.000
#> SRR772606 1 0.0963 0.82299 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0162 0.81790 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0912 0.85789 0.012 0.972 0.000 0.016 0.000
#> SRR772609 2 0.0404 0.85346 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772610 2 0.1608 0.84525 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR772611 2 0.0794 0.85618 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR772612 4 0.0290 0.91296 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772613 4 0.1671 0.85619 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.81646 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0162 0.81803 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4304 0.14489 0.516 0.484 0.000 0.000 0.000
#> SRR772617 4 0.1478 0.87261 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR772618 4 0.1341 0.88027 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR772619 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 2 0.1965 0.83096 0.096 0.904 0.000 0.000 0.000
#> SRR772622 2 0.1544 0.84002 0.068 0.932 0.000 0.000 0.000
#> SRR772623 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772624 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772625 4 0.1341 0.86910 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR772626 2 0.0162 0.85304 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR772627 2 0.2411 0.82727 0.008 0.884 0.000 0.108 0.000
#> SRR772628 1 0.0609 0.82105 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR772629 1 0.1121 0.82254 0.956 0.044 0.000 0.000 0.000
#> SRR772630 2 0.3480 0.66378 0.248 0.752 0.000 0.000 0.000
#> SRR772631 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772632 4 0.3837 0.53704 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR772633 4 0.0963 0.89772 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772634 2 0.3707 0.61854 0.284 0.716 0.000 0.000 0.000
#> SRR772635 2 0.4015 0.48400 0.348 0.652 0.000 0.000 0.000
#> SRR772636 5 0.2193 0.88028 0.000 0.008 0.000 0.092 0.900
#> SRR772637 1 0.0703 0.82121 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.1197 0.81678 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0963 0.85475 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR772640 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 2 0.0609 0.85425 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR772643 2 0.0880 0.85289 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR772644 1 0.4235 0.33470 0.576 0.424 0.000 0.000 0.000
#> SRR772645 1 0.4182 0.41884 0.600 0.400 0.000 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.2852 0.77733 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.85166 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772648 2 0.1043 0.85474 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR772649 2 0.0510 0.85455 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR772650 2 0.2605 0.79508 0.148 0.852 0.000 0.000 0.000
#> SRR772651 2 0.4088 0.42266 0.368 0.632 0.000 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.4306 0.02097 0.508 0.492 0.000 0.000 0.000
#> SRR772653 1 0.3210 0.72562 0.788 0.212 0.000 0.000 0.000
#> SRR772654 2 0.2516 0.79993 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR772655 2 0.3774 0.59818 0.296 0.704 0.000 0.000 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772660 2 0.0609 0.85537 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR772661 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772662 2 0.2074 0.82334 0.104 0.896 0.000 0.000 0.000
#> SRR772663 2 0.3336 0.70333 0.228 0.772 0.000 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.3366 0.71032 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR772665 2 0.3452 0.69437 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.1792 0.85246 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR772668 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772669 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772670 2 0.1965 0.83024 0.096 0.904 0.000 0.000 0.000
#> SRR772671 2 0.2813 0.77197 0.168 0.832 0.000 0.000 0.000
#> SRR772672 2 0.1121 0.85367 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR772673 2 0.0703 0.85406 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR772674 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772675 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772676 2 0.1478 0.84957 0.064 0.936 0.000 0.000 0.000
#> SRR772677 2 0.1270 0.85094 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR772678 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772679 2 0.2516 0.80188 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR772680 2 0.4101 0.40957 0.372 0.628 0.000 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772682 2 0.2561 0.80207 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR772683 2 0.1478 0.84889 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR772685 2 0.0510 0.85419 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.4867 0.64773 0.104 0.000 0.716 0.000 0.180
#> SRR772688 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 4 0.0000 0.91657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.97634 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772691 5 0.0510 0.96826 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR772692 2 0.2561 0.79756 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR772693 2 0.1608 0.84598 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR772694 2 0.0162 0.85254 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772695 2 0.0404 0.85404 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772696 2 0.0771 0.85703 0.020 0.976 0.000 0.004 0.000
#> SRR772697 2 0.0566 0.85659 0.012 0.984 0.000 0.004 0.000
#> SRR772698 5 0.0000 0.98516 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772699 1 0.2891 0.76959 0.824 0.176 0.000 0.000 0.000
#> SRR772700 1 0.3177 0.73871 0.792 0.208 0.000 0.000 0.000
#> SRR772701 1 0.2561 0.79049 0.856 0.144 0.000 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0290 0.81928 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.3611 0.805505 0.796 0.096 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772342 1 0.3356 0.814839 0.808 0.052 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR772343 6 0.5080 0.263406 0.112 0.288 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR772344 2 0.5171 0.108059 0.000 0.560 0.000 0.104 0.000 0.336
#> SRR772345 2 0.5607 0.092290 0.000 0.532 0.000 0.184 0.000 0.284
#> SRR772346 2 0.5926 0.149263 0.276 0.464 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR772347 1 0.5873 0.206988 0.452 0.340 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR772348 6 0.2887 0.525441 0.000 0.120 0.000 0.036 0.000 0.844
#> SRR772349 6 0.4941 0.429091 0.000 0.236 0.000 0.124 0.000 0.640
#> SRR772350 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772351 2 0.3899 0.198663 0.000 0.628 0.000 0.008 0.000 0.364
#> SRR772352 2 0.3161 0.485529 0.000 0.776 0.000 0.008 0.000 0.216
#> SRR772353 2 0.3769 0.324363 0.004 0.640 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR772354 6 0.4057 0.131386 0.008 0.436 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR772355 2 0.3023 0.502018 0.000 0.784 0.000 0.004 0.000 0.212
#> SRR772356 6 0.5151 0.147966 0.000 0.444 0.000 0.084 0.000 0.472
#> SRR772357 1 0.4526 0.727841 0.704 0.132 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR772358 1 0.5860 0.421367 0.484 0.268 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR772359 2 0.4012 0.466615 0.176 0.748 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772360 2 0.3017 0.523525 0.108 0.840 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772361 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 2 0.4493 0.349472 0.312 0.636 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772365 2 0.3958 0.509879 0.128 0.764 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772366 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772368 6 0.2668 0.530619 0.000 0.168 0.000 0.000 0.004 0.828
#> SRR772369 2 0.2902 0.503253 0.004 0.800 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR772370 2 0.3512 0.434407 0.008 0.720 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR772371 2 0.5081 0.345304 0.256 0.616 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR772372 2 0.4503 0.433151 0.192 0.700 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772373 2 0.2340 0.554176 0.000 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR772374 2 0.2697 0.515434 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR772375 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772376 6 0.5803 0.157781 0.000 0.404 0.000 0.180 0.000 0.416
#> SRR772377 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772378 6 0.4506 0.282097 0.044 0.348 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR772379 6 0.3614 0.473800 0.028 0.220 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR772380 6 0.4635 0.263503 0.056 0.336 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR772381 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.4156 0.731034 0.732 0.188 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772383 1 0.1845 0.845808 0.920 0.028 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772384 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772385 5 0.0405 0.979909 0.000 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR772386 2 0.3351 0.415335 0.000 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR772387 2 0.1814 0.561604 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR772388 1 0.0603 0.837554 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR772389 1 0.1152 0.842604 0.952 0.004 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772390 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0777 0.841591 0.972 0.004 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772392 1 0.1549 0.839052 0.936 0.044 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772393 2 0.2631 0.524102 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR772394 2 0.2771 0.569023 0.032 0.852 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR772395 6 0.2581 0.529357 0.000 0.128 0.000 0.016 0.000 0.856
#> SRR772396 1 0.0820 0.842405 0.972 0.012 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772397 1 0.0363 0.838154 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772398 2 0.4852 -0.091034 0.452 0.492 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR772399 2 0.4344 0.346620 0.304 0.652 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772400 1 0.1341 0.843670 0.948 0.024 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772401 1 0.0725 0.840543 0.976 0.012 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772402 2 0.4653 0.225103 0.000 0.588 0.000 0.052 0.000 0.360
#> SRR772403 2 0.3667 0.484791 0.000 0.788 0.000 0.080 0.000 0.132
#> SRR772404 6 0.3102 0.535090 0.000 0.156 0.000 0.028 0.000 0.816
#> SRR772405 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.2996 0.483363 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR772407 2 0.2697 0.527089 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR772408 4 0.0937 0.876927 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772409 4 0.0713 0.881744 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772410 6 0.4097 0.013406 0.008 0.492 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR772411 2 0.4196 0.367934 0.028 0.640 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR772412 1 0.1265 0.835413 0.948 0.044 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772413 1 0.0146 0.834603 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772414 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772415 6 0.3198 0.482978 0.000 0.260 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR772416 6 0.2491 0.529587 0.000 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR772417 2 0.5268 0.223158 0.116 0.552 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR772418 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772419 4 0.4118 0.596814 0.000 0.028 0.000 0.660 0.000 0.312
#> SRR772420 4 0.3791 0.704249 0.000 0.032 0.000 0.732 0.000 0.236
#> SRR772421 2 0.1480 0.567066 0.020 0.940 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772422 2 0.1196 0.567413 0.008 0.952 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772423 6 0.5270 0.371625 0.000 0.180 0.000 0.216 0.000 0.604
#> SRR772424 4 0.6060 -0.174772 0.000 0.264 0.000 0.392 0.000 0.344
#> SRR772425 2 0.4823 0.106639 0.000 0.552 0.000 0.060 0.000 0.388
#> SRR772426 2 0.5394 0.172100 0.000 0.568 0.000 0.156 0.000 0.276
#> SRR772427 2 0.5373 0.114303 0.000 0.552 0.000 0.136 0.000 0.312
#> SRR772428 1 0.0520 0.837405 0.984 0.008 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772429 1 0.1720 0.845603 0.928 0.040 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772430 6 0.4468 0.398113 0.048 0.288 0.000 0.000 0.004 0.660
#> SRR772431 6 0.4238 0.167943 0.000 0.444 0.000 0.016 0.000 0.540
#> SRR772432 2 0.4010 0.162811 0.000 0.584 0.000 0.008 0.000 0.408
#> SRR772433 1 0.0000 0.834552 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.834552 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772435 2 0.2972 0.535083 0.128 0.836 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772436 2 0.3608 0.506654 0.148 0.788 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772437 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0858 0.842095 0.968 0.004 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772439 1 0.1092 0.842079 0.960 0.020 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772440 2 0.2664 0.540835 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR772441 2 0.2416 0.542266 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR772442 6 0.4769 0.409233 0.000 0.264 0.000 0.092 0.000 0.644
#> SRR772443 2 0.3961 0.053388 0.000 0.556 0.000 0.004 0.000 0.440
#> SRR772444 1 0.0622 0.841228 0.980 0.012 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772445 1 0.3455 0.788147 0.800 0.144 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR772446 1 0.0891 0.841976 0.968 0.008 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772447 1 0.1908 0.838629 0.900 0.004 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR772448 2 0.1806 0.563667 0.004 0.908 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772449 2 0.1075 0.562034 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR772450 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.1204 0.839854 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR772453 1 0.3168 0.800981 0.804 0.024 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR772454 2 0.5019 0.138125 0.428 0.500 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR772455 6 0.5230 0.191704 0.108 0.344 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR772456 4 0.0547 0.884528 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772457 4 0.0260 0.886540 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772458 1 0.2997 0.833534 0.844 0.060 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR772459 1 0.0725 0.841049 0.976 0.012 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772460 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772462 6 0.2784 0.528665 0.000 0.124 0.000 0.028 0.000 0.848
#> SRR772463 6 0.3202 0.507992 0.000 0.176 0.000 0.024 0.000 0.800
#> SRR772464 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772465 6 0.4026 0.329088 0.012 0.376 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR772466 2 0.4366 0.163429 0.024 0.548 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR772467 4 0.1267 0.867272 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772468 4 0.0790 0.880640 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772469 1 0.4616 0.625625 0.648 0.072 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR772470 1 0.4535 0.747297 0.704 0.148 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR772471 1 0.5439 0.262065 0.472 0.120 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR772472 1 0.5741 0.263969 0.456 0.172 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR772473 2 0.3076 0.470641 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR772474 2 0.3421 0.418685 0.000 0.736 0.000 0.008 0.000 0.256
#> SRR772475 5 0.0405 0.979909 0.000 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR772476 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0260 0.837434 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772479 1 0.0000 0.834552 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.4467 0.067898 0.028 0.508 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR772481 6 0.4472 0.041087 0.028 0.476 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR772482 2 0.4783 0.034071 0.428 0.520 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772483 2 0.5190 0.272357 0.324 0.576 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR772484 6 0.3838 0.150665 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR772485 2 0.3810 0.156695 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR772486 1 0.2740 0.836840 0.864 0.076 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR772487 1 0.5646 0.340552 0.496 0.388 0.000 0.000 0.016 0.100
#> SRR772488 2 0.4788 0.222470 0.056 0.548 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR772489 2 0.3993 0.430893 0.024 0.676 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR772490 1 0.3645 0.790396 0.784 0.152 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772491 1 0.1563 0.842832 0.932 0.012 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR772492 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 6 0.3989 0.108099 0.000 0.468 0.000 0.004 0.000 0.528
#> SRR772497 6 0.3672 0.385165 0.000 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR772498 2 0.1364 0.561608 0.004 0.944 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR772499 2 0.1844 0.562657 0.004 0.924 0.000 0.024 0.000 0.048
#> SRR772500 6 0.5155 0.362401 0.000 0.280 0.000 0.124 0.000 0.596
#> SRR772501 2 0.6000 -0.096010 0.000 0.400 0.000 0.236 0.000 0.364
#> SRR772502 2 0.5270 0.290438 0.268 0.588 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR772503 1 0.5767 0.378538 0.484 0.324 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR772504 6 0.4310 0.206694 0.000 0.440 0.000 0.020 0.000 0.540
#> SRR772505 2 0.4002 0.270455 0.000 0.660 0.000 0.020 0.000 0.320
#> SRR772506 4 0.3265 0.716407 0.000 0.004 0.000 0.748 0.000 0.248
#> SRR772507 4 0.3271 0.729482 0.000 0.008 0.000 0.760 0.000 0.232
#> SRR772508 6 0.3575 0.516888 0.000 0.128 0.000 0.076 0.000 0.796
#> SRR772509 5 0.0146 0.985439 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR772510 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.4028 0.360586 0.024 0.668 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR772512 2 0.4643 0.329866 0.008 0.652 0.300 0.000 0.028 0.012
#> SRR772513 6 0.2442 0.534845 0.000 0.144 0.000 0.004 0.000 0.852
#> SRR772514 6 0.2350 0.530415 0.000 0.100 0.000 0.020 0.000 0.880
#> SRR772515 2 0.3578 0.227434 0.000 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR772516 2 0.3409 0.312265 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR772517 2 0.3868 -0.018251 0.000 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR772518 2 0.3765 0.228251 0.000 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR772519 6 0.3351 0.455617 0.000 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712
#> SRR772520 6 0.4135 0.410707 0.000 0.300 0.000 0.032 0.000 0.668
#> SRR772521 2 0.3787 0.501674 0.100 0.780 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR772522 2 0.1176 0.564963 0.020 0.956 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772523 2 0.4429 0.053785 0.000 0.548 0.000 0.028 0.000 0.424
#> SRR772524 2 0.4246 0.039653 0.000 0.532 0.000 0.016 0.000 0.452
#> SRR772525 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0146 0.886607 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772527 4 0.0363 0.885697 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772528 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.4659 0.648973 0.656 0.260 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR772530 1 0.4414 0.747293 0.712 0.180 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772531 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772532 2 0.4950 0.132812 0.000 0.576 0.000 0.080 0.000 0.344
#> SRR772533 2 0.3175 0.481689 0.000 0.808 0.000 0.028 0.000 0.164
#> SRR772534 2 0.5984 0.125491 0.276 0.444 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR772535 2 0.4130 0.345169 0.004 0.672 0.000 0.024 0.000 0.300
#> SRR772536 2 0.3109 0.434277 0.000 0.772 0.000 0.004 0.000 0.224
#> SRR772537 4 0.2221 0.843002 0.000 0.072 0.000 0.896 0.000 0.032
#> SRR772538 4 0.2432 0.837561 0.000 0.024 0.000 0.876 0.000 0.100
#> SRR772539 1 0.3570 0.799896 0.792 0.064 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR772540 1 0.4969 0.683458 0.648 0.156 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR772541 6 0.2001 0.525414 0.004 0.092 0.000 0.004 0.000 0.900
#> SRR772542 1 0.4940 0.748936 0.688 0.172 0.000 0.000 0.016 0.124
#> SRR772543 1 0.1700 0.844193 0.928 0.024 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR772544 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.4319 0.331064 0.576 0.400 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772546 1 0.3933 0.664055 0.716 0.248 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772547 6 0.4974 0.300394 0.144 0.212 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR772548 6 0.5865 -0.065122 0.380 0.196 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR772549 1 0.1757 0.839838 0.916 0.008 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772550 1 0.1610 0.839343 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR772551 2 0.5288 0.050486 0.100 0.476 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR772552 6 0.4261 0.211447 0.020 0.408 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR772553 5 0.0508 0.972549 0.000 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR772554 2 0.4258 -0.053481 0.000 0.516 0.000 0.016 0.000 0.468
#> SRR772555 2 0.4355 0.077622 0.000 0.556 0.000 0.024 0.000 0.420
#> SRR772556 1 0.1584 0.827612 0.928 0.064 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772557 1 0.0914 0.839600 0.968 0.016 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772558 6 0.5736 0.136634 0.320 0.188 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR772559 1 0.5173 0.422830 0.520 0.092 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR772560 6 0.4552 0.336956 0.064 0.288 0.000 0.000 0.000 0.648
#> SRR772561 3 0.2994 0.666177 0.004 0.208 0.788 0.000 0.000 0.000
#> SRR772562 6 0.3647 0.327699 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR772563 6 0.2932 0.524570 0.000 0.164 0.000 0.016 0.000 0.820
#> SRR772564 1 0.2909 0.769811 0.828 0.156 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR772565 1 0.1218 0.839470 0.956 0.028 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR772566 1 0.0405 0.834063 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR772567 1 0.0653 0.831019 0.980 0.000 0.012 0.000 0.004 0.004
#> SRR772568 2 0.3578 0.367234 0.000 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR772569 2 0.3373 0.455949 0.000 0.744 0.000 0.008 0.000 0.248
#> SRR772570 1 0.5930 0.341682 0.460 0.248 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR772571 2 0.5482 0.247018 0.160 0.548 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR772572 6 0.6019 0.044869 0.244 0.356 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR772573 6 0.5817 0.138239 0.204 0.320 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR772574 1 0.3834 0.704748 0.732 0.232 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772575 1 0.5063 0.390581 0.544 0.372 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR772576 2 0.2178 0.551052 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR772577 2 0.2593 0.540924 0.008 0.844 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR772578 4 0.2664 0.792426 0.000 0.136 0.000 0.848 0.000 0.016
#> SRR772579 4 0.0713 0.878660 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772581 2 0.4797 0.265767 0.064 0.580 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR772582 2 0.2473 0.555015 0.008 0.856 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR772583 2 0.4039 0.310715 0.016 0.632 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR772584 6 0.3797 0.267069 0.000 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR772585 6 0.3747 0.308042 0.000 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR772586 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.4707 0.641784 0.656 0.092 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR772588 6 0.5046 0.370249 0.000 0.144 0.000 0.224 0.000 0.632
#> SRR772589 6 0.5150 0.342806 0.000 0.136 0.000 0.256 0.000 0.608
#> SRR772590 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0146 0.834603 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772592 1 0.0508 0.836143 0.984 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR772593 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772594 4 0.3857 0.735921 0.000 0.152 0.000 0.768 0.000 0.080
#> SRR772595 4 0.4764 0.524237 0.000 0.292 0.000 0.628 0.000 0.080
#> SRR772596 5 0.0790 0.962543 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0972 0.842105 0.964 0.008 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772599 1 0.0291 0.836695 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772600 6 0.3710 0.440961 0.000 0.292 0.000 0.012 0.000 0.696
#> SRR772601 6 0.4284 0.470413 0.000 0.256 0.000 0.056 0.000 0.688
#> SRR772602 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.3774 0.172455 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR772604 6 0.4045 0.451455 0.004 0.268 0.000 0.028 0.000 0.700
#> SRR772605 6 0.3898 0.346563 0.012 0.336 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR772606 1 0.1867 0.845919 0.916 0.020 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772607 1 0.0405 0.838688 0.988 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772608 6 0.3659 0.330044 0.000 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR772609 6 0.2664 0.524876 0.000 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR772610 6 0.2743 0.530509 0.000 0.164 0.000 0.008 0.000 0.828
#> SRR772611 6 0.2871 0.522577 0.000 0.192 0.000 0.004 0.000 0.804
#> SRR772612 4 0.1225 0.872750 0.000 0.036 0.000 0.952 0.000 0.012
#> SRR772613 4 0.3651 0.751773 0.000 0.048 0.000 0.772 0.000 0.180
#> SRR772614 1 0.2331 0.839772 0.888 0.032 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772615 1 0.0622 0.839200 0.980 0.008 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772616 6 0.5473 0.241374 0.240 0.192 0.000 0.000 0.000 0.568
#> SRR772617 4 0.3542 0.764947 0.000 0.052 0.000 0.788 0.000 0.160
#> SRR772618 4 0.4414 0.613388 0.000 0.064 0.000 0.676 0.000 0.260
#> SRR772619 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772620 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772621 2 0.3163 0.547277 0.040 0.820 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR772622 2 0.2039 0.567432 0.020 0.904 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772623 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772624 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772625 4 0.1327 0.846882 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR772626 2 0.1501 0.564895 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772627 2 0.1700 0.557518 0.000 0.928 0.000 0.024 0.000 0.048
#> SRR772628 1 0.2812 0.835255 0.856 0.048 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR772629 1 0.3072 0.831729 0.840 0.076 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR772630 6 0.5408 0.101984 0.116 0.408 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR772631 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772632 4 0.5157 0.251872 0.000 0.360 0.000 0.544 0.000 0.096
#> SRR772633 4 0.3717 0.764374 0.000 0.072 0.000 0.780 0.000 0.148
#> SRR772634 2 0.3248 0.506982 0.164 0.804 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772635 2 0.3766 0.443110 0.212 0.748 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772636 5 0.2221 0.890212 0.000 0.000 0.000 0.072 0.896 0.032
#> SRR772637 1 0.2163 0.835729 0.892 0.016 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR772638 1 0.1858 0.834538 0.912 0.012 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772639 2 0.3314 0.458194 0.000 0.740 0.000 0.004 0.000 0.256
#> SRR772640 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 2 0.2730 0.536599 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR772643 2 0.3499 0.374211 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR772644 6 0.5948 0.065947 0.328 0.232 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR772645 6 0.5799 -0.015183 0.368 0.184 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR772646 2 0.2837 0.536506 0.000 0.856 0.000 0.056 0.000 0.088
#> SRR772647 2 0.3428 0.419980 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR772648 2 0.1082 0.563216 0.004 0.956 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772649 2 0.0713 0.559717 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772650 2 0.5025 0.203492 0.084 0.560 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR772651 2 0.5787 0.205811 0.252 0.504 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR772652 2 0.4469 -0.037010 0.468 0.504 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772653 1 0.3345 0.731497 0.776 0.204 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772654 2 0.2685 0.555373 0.072 0.868 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR772655 2 0.3663 0.492229 0.148 0.784 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR772656 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772659 4 0.0000 0.886647 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772660 6 0.3647 0.372620 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR772661 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772662 2 0.4196 0.330006 0.028 0.640 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR772663 2 0.5438 0.252543 0.148 0.548 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR772664 6 0.5217 0.213935 0.000 0.392 0.000 0.096 0.000 0.512
#> SRR772665 2 0.5012 0.262437 0.000 0.600 0.000 0.100 0.000 0.300
#> SRR772666 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772667 6 0.4537 -0.046290 0.000 0.036 0.000 0.412 0.000 0.552
#> SRR772668 4 0.0291 0.885936 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR772669 4 0.0146 0.886535 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772670 6 0.3952 0.370693 0.020 0.308 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR772671 6 0.4631 0.324058 0.060 0.320 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR772672 6 0.2743 0.520768 0.000 0.164 0.000 0.008 0.000 0.828
#> SRR772673 6 0.2340 0.529751 0.000 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR772674 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772675 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772676 2 0.1225 0.565031 0.012 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772677 2 0.0603 0.563832 0.004 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772678 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772679 2 0.4947 0.003217 0.064 0.480 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR772680 6 0.5465 0.288496 0.220 0.208 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR772681 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772682 2 0.4462 0.343183 0.000 0.660 0.000 0.060 0.000 0.280
#> SRR772683 6 0.4086 0.216072 0.000 0.464 0.000 0.008 0.000 0.528
#> SRR772685 2 0.1219 0.563680 0.004 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR772686 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.4459 0.649094 0.132 0.000 0.712 0.000 0.156 0.000
#> SRR772688 4 0.1501 0.858961 0.000 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772689 4 0.0260 0.886431 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772690 3 0.0000 0.976435 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772691 5 0.0405 0.979909 0.000 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR772692 2 0.1934 0.563887 0.040 0.916 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772693 2 0.2784 0.568615 0.028 0.848 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR772694 6 0.3782 0.237241 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR772695 2 0.3986 0.000242 0.004 0.532 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR772696 2 0.0547 0.559540 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772697 2 0.0632 0.558931 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772698 5 0.0000 0.989277 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.4671 0.720599 0.688 0.160 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR772700 1 0.5102 0.646844 0.624 0.228 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR772701 1 0.3417 0.799250 0.796 0.160 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772702 1 0.1863 0.842815 0.920 0.044 0.000 0.000 0.000 0.036
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.771 0.861 0.934 0.3491 0.611 0.611
#> 3 3 0.538 0.869 0.878 0.2930 0.933 0.895
#> 4 4 0.359 0.647 0.708 0.3919 0.698 0.502
#> 5 5 0.364 0.633 0.702 0.0859 0.911 0.745
#> 6 6 0.413 0.334 0.618 0.0911 0.831 0.544
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772342 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772343 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772347 1 0.9686 0.59885 0.604 0.396
#> SRR772348 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0672 0.96111 0.008 0.992
#> SRR772350 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.3114 0.90474 0.056 0.944
#> SRR772352 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772353 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772354 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772355 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772357 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772358 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772359 2 0.2423 0.92482 0.040 0.960
#> SRR772360 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772361 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772365 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772366 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0672 0.96130 0.008 0.992
#> SRR772369 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772370 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772371 1 0.9552 0.63339 0.624 0.376
#> SRR772372 1 0.9661 0.60527 0.608 0.392
#> SRR772373 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0376 0.96490 0.004 0.996
#> SRR772377 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772378 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772379 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772380 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772381 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772382 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772383 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772384 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772385 1 0.0376 0.79707 0.996 0.004
#> SRR772386 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772388 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772389 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772391 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772392 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772393 2 0.9998 -0.32461 0.492 0.508
#> SRR772394 1 0.9988 0.40203 0.520 0.480
#> SRR772395 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772396 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772397 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772398 1 0.9460 0.65289 0.636 0.364
#> SRR772399 1 0.9970 0.43613 0.532 0.468
#> SRR772400 2 0.3114 0.90538 0.056 0.944
#> SRR772401 2 0.0376 0.96488 0.004 0.996
#> SRR772402 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772403 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772404 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772411 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772412 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772413 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772417 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772418 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.0672 0.96112 0.008 0.992
#> SRR772422 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772423 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772424 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772425 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772428 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772429 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772430 2 0.0938 0.95748 0.012 0.988
#> SRR772431 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772432 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772433 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772434 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772435 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772436 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772437 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772438 2 0.9988 -0.28330 0.480 0.520
#> SRR772439 2 0.9896 -0.13100 0.440 0.560
#> SRR772440 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772442 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772443 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772444 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772445 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772446 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772447 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772448 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772449 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772452 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772453 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772454 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772455 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772458 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772459 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0672 0.96103 0.008 0.992
#> SRR772462 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772466 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772469 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772470 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772471 2 0.0672 0.96119 0.008 0.992
#> SRR772472 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772473 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772474 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772475 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772478 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772479 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772480 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772481 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772482 2 0.0376 0.96490 0.004 0.996
#> SRR772483 2 0.0672 0.96135 0.008 0.992
#> SRR772484 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772485 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772486 2 0.9998 -0.32302 0.492 0.508
#> SRR772487 1 1.0000 0.35114 0.504 0.496
#> SRR772488 2 0.0376 0.96494 0.004 0.996
#> SRR772489 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772490 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772491 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772492 2 0.9815 -0.04559 0.420 0.580
#> SRR772493 2 0.9922 -0.16475 0.448 0.552
#> SRR772494 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772498 1 0.9970 0.43327 0.532 0.468
#> SRR772499 1 0.9909 0.49503 0.556 0.444
#> SRR772500 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772502 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772503 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772504 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772510 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772512 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772513 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.5408 0.80812 0.124 0.876
#> SRR772522 2 0.3274 0.89998 0.060 0.940
#> SRR772523 2 0.5408 0.80630 0.124 0.876
#> SRR772524 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.1184 0.95281 0.016 0.984
#> SRR772527 2 0.0938 0.95714 0.012 0.988
#> SRR772528 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772529 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772530 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772534 2 0.4562 0.84939 0.096 0.904
#> SRR772535 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772537 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772538 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772539 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772540 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772541 2 0.0672 0.96129 0.008 0.992
#> SRR772542 2 0.8813 0.41687 0.300 0.700
#> SRR772543 2 0.5737 0.78315 0.136 0.864
#> SRR772544 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772545 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772546 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772547 2 0.0376 0.96493 0.004 0.996
#> SRR772548 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772549 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772550 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772551 2 0.7602 0.61917 0.220 0.780
#> SRR772552 2 0.1843 0.93844 0.028 0.972
#> SRR772553 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772554 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772556 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772557 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772558 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772559 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772560 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772561 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772564 2 0.9427 0.21618 0.360 0.640
#> SRR772565 2 0.7056 0.67954 0.192 0.808
#> SRR772566 2 0.0376 0.96490 0.004 0.996
#> SRR772567 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0376 0.96496 0.004 0.996
#> SRR772570 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772571 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772572 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772573 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772574 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772575 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772576 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772577 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772578 2 0.9710 0.04694 0.400 0.600
#> SRR772579 2 0.9775 -0.00388 0.412 0.588
#> SRR772580 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772581 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772582 1 0.9460 0.65315 0.636 0.364
#> SRR772583 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772584 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772585 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772587 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772588 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772591 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772592 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772594 1 0.9933 0.47857 0.548 0.452
#> SRR772595 2 0.9815 -0.04526 0.420 0.580
#> SRR772596 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772598 2 0.0938 0.95709 0.012 0.988
#> SRR772599 2 0.0376 0.96491 0.004 0.996
#> SRR772600 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772601 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772602 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772603 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772604 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772605 2 0.0376 0.96467 0.004 0.996
#> SRR772606 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772607 2 0.0376 0.96493 0.004 0.996
#> SRR772608 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772612 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772613 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772614 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772615 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772616 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772617 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772618 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772619 1 0.9850 0.53483 0.572 0.428
#> SRR772620 1 0.9933 0.47923 0.548 0.452
#> SRR772621 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772622 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772623 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772625 1 0.2603 0.78707 0.956 0.044
#> SRR772626 1 0.9993 0.39039 0.516 0.484
#> SRR772627 1 0.9866 0.52448 0.568 0.432
#> SRR772628 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772629 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772630 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772631 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.1184 0.95258 0.016 0.984
#> SRR772633 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772634 2 0.0672 0.96117 0.008 0.992
#> SRR772635 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772636 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772637 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772638 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772643 2 0.2043 0.93455 0.032 0.968
#> SRR772644 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772645 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772646 2 0.0672 0.96115 0.008 0.992
#> SRR772647 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772650 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772651 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772652 2 0.1184 0.95260 0.016 0.984
#> SRR772653 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772654 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772655 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772656 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772658 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772659 1 0.9393 0.66481 0.644 0.356
#> SRR772660 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772662 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772663 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772664 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.9983 -0.26701 0.476 0.524
#> SRR772668 1 0.9286 0.67170 0.656 0.344
#> SRR772669 1 0.9358 0.66722 0.648 0.352
#> SRR772670 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772671 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772672 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772676 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772677 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772678 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772679 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772680 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772681 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0376 0.96495 0.004 0.996
#> SRR772690 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772691 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772692 2 0.0376 0.96495 0.004 0.996
#> SRR772693 2 0.0376 0.96496 0.004 0.996
#> SRR772694 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772696 2 0.0938 0.95687 0.012 0.988
#> SRR772697 2 0.1184 0.95242 0.016 0.984
#> SRR772698 1 0.0000 0.79794 1.000 0.000
#> SRR772699 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772700 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772701 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
#> SRR772702 2 0.0000 0.96841 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.2165 0.89722 0.936 0.064 0.000
#> SRR772342 1 0.1411 0.90419 0.964 0.036 0.000
#> SRR772343 1 0.2356 0.89048 0.928 0.072 0.000
#> SRR772344 1 0.3038 0.88865 0.896 0.104 0.000
#> SRR772345 1 0.2711 0.89947 0.912 0.088 0.000
#> SRR772346 2 0.6264 0.80316 0.244 0.724 0.032
#> SRR772347 2 0.6621 0.76450 0.284 0.684 0.032
#> SRR772348 1 0.2165 0.89938 0.936 0.064 0.000
#> SRR772349 1 0.2400 0.90750 0.932 0.064 0.004
#> SRR772350 3 0.2301 0.93015 0.004 0.060 0.936
#> SRR772351 1 0.3784 0.86399 0.864 0.132 0.004
#> SRR772352 1 0.2711 0.90226 0.912 0.088 0.000
#> SRR772353 1 0.1860 0.90360 0.948 0.052 0.000
#> SRR772354 1 0.2261 0.89420 0.932 0.068 0.000
#> SRR772355 1 0.2448 0.90141 0.924 0.076 0.000
#> SRR772356 1 0.3340 0.89331 0.880 0.120 0.000
#> SRR772357 1 0.1964 0.89990 0.944 0.056 0.000
#> SRR772358 1 0.1529 0.90269 0.960 0.040 0.000
#> SRR772359 1 0.2774 0.90371 0.920 0.072 0.008
#> SRR772360 1 0.3038 0.89219 0.896 0.104 0.000
#> SRR772361 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 1 0.4504 0.80861 0.804 0.196 0.000
#> SRR772363 1 0.4555 0.80426 0.800 0.200 0.000
#> SRR772364 2 0.6012 0.81941 0.220 0.748 0.032
#> SRR772365 2 0.6183 0.80885 0.236 0.732 0.032
#> SRR772366 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772367 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 1 0.2711 0.88174 0.912 0.088 0.000
#> SRR772369 1 0.2165 0.90527 0.936 0.064 0.000
#> SRR772370 1 0.1964 0.90461 0.944 0.056 0.000
#> SRR772371 2 0.7085 0.66700 0.356 0.612 0.032
#> SRR772372 2 0.7001 0.66998 0.340 0.628 0.032
#> SRR772373 1 0.2625 0.89071 0.916 0.084 0.000
#> SRR772374 1 0.2356 0.89467 0.928 0.072 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 1 0.2625 0.89719 0.916 0.084 0.000
#> SRR772377 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772378 1 0.2537 0.90013 0.920 0.080 0.000
#> SRR772379 1 0.1643 0.90108 0.956 0.044 0.000
#> SRR772380 1 0.2711 0.89930 0.912 0.088 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 1 0.1411 0.90338 0.964 0.036 0.000
#> SRR772383 1 0.1289 0.90377 0.968 0.032 0.000
#> SRR772384 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772385 3 0.1163 0.97387 0.000 0.028 0.972
#> SRR772386 1 0.2448 0.90363 0.924 0.076 0.000
#> SRR772387 1 0.3267 0.89546 0.884 0.116 0.000
#> SRR772388 1 0.2448 0.89328 0.924 0.076 0.000
#> SRR772389 1 0.2796 0.88884 0.908 0.092 0.000
#> SRR772390 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772391 1 0.2711 0.89740 0.912 0.088 0.000
#> SRR772392 1 0.2448 0.90246 0.924 0.076 0.000
#> SRR772393 1 0.7389 -0.06594 0.504 0.464 0.032
#> SRR772394 1 0.7346 0.04662 0.536 0.432 0.032
#> SRR772395 1 0.2796 0.88058 0.908 0.092 0.000
#> SRR772396 1 0.2356 0.89425 0.928 0.072 0.000
#> SRR772397 1 0.2448 0.89298 0.924 0.076 0.000
#> SRR772398 1 0.4591 0.86448 0.848 0.120 0.032
#> SRR772399 1 0.4591 0.86459 0.848 0.120 0.032
#> SRR772400 1 0.3038 0.87887 0.896 0.104 0.000
#> SRR772401 1 0.3038 0.87887 0.896 0.104 0.000
#> SRR772402 2 0.4591 0.85276 0.120 0.848 0.032
#> SRR772403 2 0.4295 0.85554 0.104 0.864 0.032
#> SRR772404 1 0.2878 0.87889 0.904 0.096 0.000
#> SRR772405 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772406 1 0.2165 0.90355 0.936 0.064 0.000
#> SRR772407 1 0.2066 0.90542 0.940 0.060 0.000
#> SRR772408 1 0.4062 0.85875 0.836 0.164 0.000
#> SRR772409 1 0.4121 0.85479 0.832 0.168 0.000
#> SRR772410 1 0.1163 0.90407 0.972 0.028 0.000
#> SRR772411 1 0.2261 0.90946 0.932 0.068 0.000
#> SRR772412 1 0.2261 0.89631 0.932 0.068 0.000
#> SRR772413 1 0.2066 0.89820 0.940 0.060 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.2066 0.89339 0.940 0.060 0.000
#> SRR772416 1 0.2356 0.89138 0.928 0.072 0.000
#> SRR772417 1 0.2165 0.89789 0.936 0.064 0.000
#> SRR772418 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772419 1 0.3267 0.87479 0.884 0.116 0.000
#> SRR772420 1 0.3340 0.87120 0.880 0.120 0.000
#> SRR772421 1 0.3607 0.89048 0.880 0.112 0.008
#> SRR772422 1 0.3116 0.89755 0.892 0.108 0.000
#> SRR772423 2 0.4519 0.85432 0.116 0.852 0.032
#> SRR772424 2 0.4137 0.84859 0.096 0.872 0.032
#> SRR772425 1 0.2261 0.89584 0.932 0.068 0.000
#> SRR772426 1 0.3038 0.88263 0.896 0.104 0.000
#> SRR772427 1 0.3192 0.87990 0.888 0.112 0.000
#> SRR772428 1 0.2711 0.88835 0.912 0.088 0.000
#> SRR772429 1 0.2448 0.89418 0.924 0.076 0.000
#> SRR772430 1 0.2711 0.88291 0.912 0.088 0.000
#> SRR772431 2 0.4446 0.84476 0.112 0.856 0.032
#> SRR772432 2 0.4591 0.85029 0.120 0.848 0.032
#> SRR772433 1 0.2878 0.88266 0.904 0.096 0.000
#> SRR772434 1 0.2959 0.88103 0.900 0.100 0.000
#> SRR772435 1 0.1411 0.90245 0.964 0.036 0.000
#> SRR772436 1 0.1529 0.90333 0.960 0.040 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772438 1 0.6714 0.45137 0.672 0.296 0.032
#> SRR772439 1 0.6183 0.59885 0.732 0.236 0.032
#> SRR772440 1 0.2165 0.90558 0.936 0.064 0.000
#> SRR772441 1 0.2625 0.90224 0.916 0.084 0.000
#> SRR772442 2 0.4371 0.85631 0.108 0.860 0.032
#> SRR772443 2 0.4591 0.85298 0.120 0.848 0.032
#> SRR772444 1 0.2356 0.89458 0.928 0.072 0.000
#> SRR772445 1 0.2356 0.89435 0.928 0.072 0.000
#> SRR772446 1 0.2959 0.88823 0.900 0.100 0.000
#> SRR772447 1 0.2878 0.88667 0.904 0.096 0.000
#> SRR772448 1 0.3192 0.89497 0.888 0.112 0.000
#> SRR772449 1 0.3267 0.89291 0.884 0.116 0.000
#> SRR772450 1 0.4504 0.81395 0.804 0.196 0.000
#> SRR772451 1 0.4346 0.82207 0.816 0.184 0.000
#> SRR772452 1 0.2796 0.89315 0.908 0.092 0.000
#> SRR772453 1 0.2537 0.89904 0.920 0.080 0.000
#> SRR772454 1 0.2066 0.90450 0.940 0.060 0.000
#> SRR772455 1 0.1031 0.90475 0.976 0.024 0.000
#> SRR772456 1 0.4121 0.84573 0.832 0.168 0.000
#> SRR772457 1 0.3686 0.87101 0.860 0.140 0.000
#> SRR772458 1 0.1289 0.90317 0.968 0.032 0.000
#> SRR772459 1 0.1860 0.90043 0.948 0.052 0.000
#> SRR772460 1 0.4702 0.78979 0.788 0.212 0.000
#> SRR772461 1 0.4750 0.78459 0.784 0.216 0.000
#> SRR772462 1 0.2711 0.88436 0.912 0.088 0.000
#> SRR772463 1 0.2796 0.88058 0.908 0.092 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.1753 0.90714 0.952 0.048 0.000
#> SRR772466 1 0.2448 0.90786 0.924 0.076 0.000
#> SRR772467 1 0.3879 0.85102 0.848 0.152 0.000
#> SRR772468 1 0.4178 0.83540 0.828 0.172 0.000
#> SRR772469 1 0.2448 0.89326 0.924 0.076 0.000
#> SRR772470 1 0.1964 0.89990 0.944 0.056 0.000
#> SRR772471 1 0.1031 0.90381 0.976 0.024 0.000
#> SRR772472 1 0.1031 0.90614 0.976 0.024 0.000
#> SRR772473 2 0.4931 0.84890 0.140 0.828 0.032
#> SRR772474 2 0.4446 0.85058 0.112 0.856 0.032
#> SRR772475 3 0.1163 0.97387 0.000 0.028 0.972
#> SRR772476 1 0.4452 0.81247 0.808 0.192 0.000
#> SRR772477 1 0.4504 0.80866 0.804 0.196 0.000
#> SRR772478 1 0.2261 0.89971 0.932 0.068 0.000
#> SRR772479 1 0.2165 0.90278 0.936 0.064 0.000
#> SRR772480 2 0.4799 0.85831 0.132 0.836 0.032
#> SRR772481 2 0.4865 0.85940 0.136 0.832 0.032
#> SRR772482 1 0.2959 0.88103 0.900 0.100 0.000
#> SRR772483 1 0.2796 0.88603 0.908 0.092 0.000
#> SRR772484 1 0.2711 0.88243 0.912 0.088 0.000
#> SRR772485 1 0.2448 0.89069 0.924 0.076 0.000
#> SRR772486 1 0.7001 0.37585 0.628 0.340 0.032
#> SRR772487 1 0.6828 0.46409 0.656 0.312 0.032
#> SRR772488 1 0.2537 0.89537 0.920 0.080 0.000
#> SRR772489 1 0.2261 0.89938 0.932 0.068 0.000
#> SRR772490 1 0.2066 0.89873 0.940 0.060 0.000
#> SRR772491 1 0.1643 0.90226 0.956 0.044 0.000
#> SRR772492 1 0.6934 0.46593 0.624 0.348 0.028
#> SRR772493 1 0.7141 0.38875 0.600 0.368 0.032
#> SRR772494 1 0.4504 0.82077 0.804 0.196 0.000
#> SRR772495 1 0.4555 0.80927 0.800 0.200 0.000
#> SRR772496 1 0.2537 0.89195 0.920 0.080 0.000
#> SRR772497 1 0.2165 0.89764 0.936 0.064 0.000
#> SRR772498 1 0.7065 0.40122 0.616 0.352 0.032
#> SRR772499 1 0.7123 0.37092 0.604 0.364 0.032
#> SRR772500 1 0.3038 0.88285 0.896 0.104 0.000
#> SRR772501 1 0.2878 0.88768 0.904 0.096 0.000
#> SRR772502 1 0.2860 0.90308 0.912 0.084 0.004
#> SRR772503 1 0.2356 0.90275 0.928 0.072 0.000
#> SRR772504 1 0.3116 0.89562 0.892 0.108 0.000
#> SRR772505 1 0.2796 0.89885 0.908 0.092 0.000
#> SRR772506 1 0.3551 0.86415 0.868 0.132 0.000
#> SRR772507 1 0.3619 0.86189 0.864 0.136 0.000
#> SRR772508 1 0.2796 0.88058 0.908 0.092 0.000
#> SRR772509 3 0.0892 0.97980 0.000 0.020 0.980
#> SRR772510 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 1 0.1031 0.90649 0.976 0.024 0.000
#> SRR772512 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772513 1 0.2625 0.88311 0.916 0.084 0.000
#> SRR772514 1 0.2711 0.88288 0.912 0.088 0.000
#> SRR772515 1 0.2711 0.89719 0.912 0.088 0.000
#> SRR772516 1 0.2448 0.89805 0.924 0.076 0.000
#> SRR772517 1 0.2261 0.90235 0.932 0.068 0.000
#> SRR772518 1 0.2165 0.89304 0.936 0.064 0.000
#> SRR772519 1 0.2711 0.88878 0.912 0.088 0.000
#> SRR772520 1 0.2878 0.89916 0.904 0.096 0.000
#> SRR772521 1 0.4755 0.79204 0.808 0.184 0.008
#> SRR772522 1 0.3752 0.88884 0.884 0.096 0.020
#> SRR772523 1 0.5443 0.70210 0.736 0.260 0.004
#> SRR772524 1 0.3752 0.86204 0.856 0.144 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 1 0.4178 0.83631 0.828 0.172 0.000
#> SRR772527 1 0.4121 0.83909 0.832 0.168 0.000
#> SRR772528 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772529 1 0.2066 0.89804 0.940 0.060 0.000
#> SRR772530 1 0.1753 0.90176 0.952 0.048 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 1 0.2625 0.89946 0.916 0.084 0.000
#> SRR772533 1 0.2711 0.89789 0.912 0.088 0.000
#> SRR772534 1 0.3412 0.86956 0.876 0.124 0.000
#> SRR772535 1 0.2496 0.90379 0.928 0.068 0.004
#> SRR772536 1 0.2537 0.89995 0.920 0.080 0.000
#> SRR772537 2 0.4295 0.85151 0.104 0.864 0.032
#> SRR772538 2 0.4731 0.84716 0.128 0.840 0.032
#> SRR772539 1 0.1753 0.90010 0.952 0.048 0.000
#> SRR772540 1 0.1529 0.90464 0.960 0.040 0.000
#> SRR772541 1 0.2711 0.88437 0.912 0.088 0.000
#> SRR772542 1 0.4602 0.84051 0.832 0.152 0.016
#> SRR772543 1 0.3826 0.86005 0.868 0.124 0.008
#> SRR772544 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.1643 0.90724 0.956 0.044 0.000
#> SRR772546 1 0.1860 0.90434 0.948 0.052 0.000
#> SRR772547 1 0.1643 0.90559 0.956 0.044 0.000
#> SRR772548 1 0.1289 0.90502 0.968 0.032 0.000
#> SRR772549 1 0.2878 0.89477 0.904 0.096 0.000
#> SRR772550 1 0.2711 0.89734 0.912 0.088 0.000
#> SRR772551 1 0.4731 0.82993 0.840 0.128 0.032
#> SRR772552 1 0.2096 0.90896 0.944 0.052 0.004
#> SRR772553 3 0.1163 0.97387 0.000 0.028 0.972
#> SRR772554 1 0.2356 0.89950 0.928 0.072 0.000
#> SRR772555 1 0.2448 0.89991 0.924 0.076 0.000
#> SRR772556 1 0.2165 0.89662 0.936 0.064 0.000
#> SRR772557 1 0.1964 0.89939 0.944 0.056 0.000
#> SRR772558 1 0.2537 0.90247 0.920 0.080 0.000
#> SRR772559 1 0.2796 0.89453 0.908 0.092 0.000
#> SRR772560 1 0.2625 0.88511 0.916 0.084 0.000
#> SRR772561 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772562 1 0.2625 0.88653 0.916 0.084 0.000
#> SRR772563 1 0.2878 0.88317 0.904 0.096 0.000
#> SRR772564 1 0.3910 0.87048 0.876 0.104 0.020
#> SRR772565 1 0.3375 0.87868 0.892 0.100 0.008
#> SRR772566 1 0.2959 0.88103 0.900 0.100 0.000
#> SRR772567 1 0.2448 0.89405 0.924 0.076 0.000
#> SRR772568 1 0.2796 0.90208 0.908 0.092 0.000
#> SRR772569 1 0.3192 0.89709 0.888 0.112 0.000
#> SRR772570 1 0.1289 0.90363 0.968 0.032 0.000
#> SRR772571 1 0.1289 0.90273 0.968 0.032 0.000
#> SRR772572 1 0.1411 0.90580 0.964 0.036 0.000
#> SRR772573 1 0.1411 0.90624 0.964 0.036 0.000
#> SRR772574 1 0.1964 0.89928 0.944 0.056 0.000
#> SRR772575 1 0.1643 0.90182 0.956 0.044 0.000
#> SRR772576 1 0.2165 0.90515 0.936 0.064 0.000
#> SRR772577 1 0.2066 0.90491 0.940 0.060 0.000
#> SRR772578 1 0.6224 0.69093 0.728 0.240 0.032
#> SRR772579 1 0.6475 0.64141 0.692 0.280 0.028
#> SRR772580 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 2 0.6056 0.82634 0.224 0.744 0.032
#> SRR772582 2 0.6978 0.70957 0.336 0.632 0.032
#> SRR772583 1 0.2537 0.89544 0.920 0.080 0.000
#> SRR772584 1 0.1964 0.90646 0.944 0.056 0.000
#> SRR772585 1 0.2625 0.88515 0.916 0.084 0.000
#> SRR772586 3 0.0592 0.98407 0.000 0.012 0.988
#> SRR772587 1 0.2165 0.89683 0.936 0.064 0.000
#> SRR772588 1 0.2537 0.90100 0.920 0.080 0.000
#> SRR772589 1 0.2878 0.88119 0.904 0.096 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 1 0.2066 0.89933 0.940 0.060 0.000
#> SRR772592 1 0.1411 0.90338 0.964 0.036 0.000
#> SRR772593 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772594 2 0.6800 0.68743 0.308 0.660 0.032
#> SRR772595 1 0.7353 -0.00902 0.532 0.436 0.032
#> SRR772596 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772597 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 1 0.3038 0.87887 0.896 0.104 0.000
#> SRR772599 1 0.2878 0.88368 0.904 0.096 0.000
#> SRR772600 2 0.4591 0.85547 0.120 0.848 0.032
#> SRR772601 2 0.4519 0.85288 0.116 0.852 0.032
#> SRR772602 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772603 2 0.4591 0.84140 0.120 0.848 0.032
#> SRR772604 2 0.4446 0.84654 0.112 0.856 0.032
#> SRR772605 1 0.2625 0.88401 0.916 0.084 0.000
#> SRR772606 1 0.2165 0.89905 0.936 0.064 0.000
#> SRR772607 1 0.1529 0.90341 0.960 0.040 0.000
#> SRR772608 1 0.2711 0.89162 0.912 0.088 0.000
#> SRR772609 1 0.2625 0.89376 0.916 0.084 0.000
#> SRR772610 1 0.2066 0.89918 0.940 0.060 0.000
#> SRR772611 1 0.2537 0.88669 0.920 0.080 0.000
#> SRR772612 2 0.4056 0.84878 0.092 0.876 0.032
#> SRR772613 2 0.4137 0.84859 0.096 0.872 0.032
#> SRR772614 1 0.1643 0.90173 0.956 0.044 0.000
#> SRR772615 1 0.2261 0.89715 0.932 0.068 0.000
#> SRR772616 1 0.2625 0.89523 0.916 0.084 0.000
#> SRR772617 2 0.4056 0.84668 0.092 0.876 0.032
#> SRR772618 2 0.4217 0.85435 0.100 0.868 0.032
#> SRR772619 2 0.6341 0.70148 0.252 0.716 0.032
#> SRR772620 2 0.6556 0.67809 0.276 0.692 0.032
#> SRR772621 1 0.2878 0.90057 0.904 0.096 0.000
#> SRR772622 1 0.2066 0.90563 0.940 0.060 0.000
#> SRR772623 3 0.2680 0.91693 0.008 0.068 0.924
#> SRR772624 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772625 3 0.5096 0.76251 0.084 0.080 0.836
#> SRR772626 1 0.7377 -0.02361 0.516 0.452 0.032
#> SRR772627 2 0.7366 0.32482 0.444 0.524 0.032
#> SRR772628 1 0.1411 0.90338 0.964 0.036 0.000
#> SRR772629 1 0.1529 0.90566 0.960 0.040 0.000
#> SRR772630 1 0.1860 0.90637 0.948 0.052 0.000
#> SRR772631 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772632 1 0.3619 0.86491 0.864 0.136 0.000
#> SRR772633 1 0.3551 0.86777 0.868 0.132 0.000
#> SRR772634 1 0.3267 0.88388 0.884 0.116 0.000
#> SRR772635 1 0.3129 0.89957 0.904 0.088 0.008
#> SRR772636 3 0.1163 0.97387 0.000 0.028 0.972
#> SRR772637 1 0.1753 0.90164 0.952 0.048 0.000
#> SRR772638 1 0.2261 0.89402 0.932 0.068 0.000
#> SRR772639 1 0.2537 0.90784 0.920 0.080 0.000
#> SRR772640 1 0.4555 0.80437 0.800 0.200 0.000
#> SRR772641 1 0.4399 0.81795 0.812 0.188 0.000
#> SRR772642 1 0.2356 0.90685 0.928 0.072 0.000
#> SRR772643 1 0.2625 0.90548 0.916 0.084 0.000
#> SRR772644 1 0.2165 0.90490 0.936 0.064 0.000
#> SRR772645 1 0.1643 0.90200 0.956 0.044 0.000
#> SRR772646 1 0.3038 0.88510 0.896 0.104 0.000
#> SRR772647 1 0.3038 0.88440 0.896 0.104 0.000
#> SRR772648 1 0.2448 0.90183 0.924 0.076 0.000
#> SRR772649 1 0.2878 0.90051 0.904 0.096 0.000
#> SRR772650 1 0.1860 0.90151 0.948 0.052 0.000
#> SRR772651 1 0.0892 0.90353 0.980 0.020 0.000
#> SRR772652 1 0.3295 0.88159 0.896 0.096 0.008
#> SRR772653 1 0.2959 0.88153 0.900 0.100 0.000
#> SRR772654 1 0.2625 0.90220 0.916 0.084 0.000
#> SRR772655 1 0.2537 0.90252 0.920 0.080 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772658 2 0.3889 0.84660 0.084 0.884 0.032
#> SRR772659 2 0.3973 0.84259 0.088 0.880 0.032
#> SRR772660 1 0.2711 0.88209 0.912 0.088 0.000
#> SRR772661 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772662 1 0.1163 0.90595 0.972 0.028 0.000
#> SRR772663 1 0.1289 0.90289 0.968 0.032 0.000
#> SRR772664 1 0.2356 0.89484 0.928 0.072 0.000
#> SRR772665 1 0.2537 0.89504 0.920 0.080 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 1 0.4295 0.85866 0.864 0.104 0.032
#> SRR772668 2 0.4930 0.76367 0.120 0.836 0.044
#> SRR772669 2 0.4931 0.78699 0.140 0.828 0.032
#> SRR772670 1 0.2066 0.89645 0.940 0.060 0.000
#> SRR772671 1 0.2261 0.89420 0.932 0.068 0.000
#> SRR772672 1 0.2711 0.88316 0.912 0.088 0.000
#> SRR772673 1 0.2537 0.88485 0.920 0.080 0.000
#> SRR772674 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772675 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772676 1 0.2356 0.90411 0.928 0.072 0.000
#> SRR772677 1 0.2537 0.90396 0.920 0.080 0.000
#> SRR772678 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772679 1 0.2537 0.88525 0.920 0.080 0.000
#> SRR772680 1 0.2537 0.88742 0.920 0.080 0.000
#> SRR772681 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772682 1 0.3038 0.88103 0.896 0.104 0.000
#> SRR772683 1 0.2711 0.88880 0.912 0.088 0.000
#> SRR772685 1 0.2796 0.90149 0.908 0.092 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772688 1 0.3619 0.86173 0.864 0.136 0.000
#> SRR772689 1 0.3879 0.85185 0.848 0.152 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.98691 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 3 0.1163 0.97387 0.000 0.028 0.972
#> SRR772692 1 0.2625 0.89369 0.916 0.084 0.000
#> SRR772693 1 0.3192 0.89330 0.888 0.112 0.000
#> SRR772694 1 0.1529 0.90634 0.960 0.040 0.000
#> SRR772695 1 0.2165 0.89827 0.936 0.064 0.000
#> SRR772696 1 0.3500 0.89247 0.880 0.116 0.004
#> SRR772697 1 0.3573 0.88988 0.876 0.120 0.004
#> SRR772698 3 0.0424 0.98646 0.000 0.008 0.992
#> SRR772699 1 0.2959 0.88103 0.900 0.100 0.000
#> SRR772700 1 0.2796 0.88626 0.908 0.092 0.000
#> SRR772701 1 0.1753 0.90144 0.952 0.048 0.000
#> SRR772702 1 0.2261 0.89606 0.932 0.068 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.2125 7.48e-01 0.920 0.076 0.000 0.004
#> SRR772342 1 0.3047 7.47e-01 0.872 0.116 0.000 0.012
#> SRR772343 1 0.4776 6.50e-01 0.732 0.244 0.000 0.024
#> SRR772344 2 0.5105 7.26e-01 0.276 0.696 0.000 0.028
#> SRR772345 2 0.4804 7.28e-01 0.276 0.708 0.000 0.016
#> SRR772346 4 0.5144 7.77e-01 0.216 0.052 0.000 0.732
#> SRR772347 4 0.5788 7.47e-01 0.228 0.084 0.000 0.688
#> SRR772348 1 0.5459 1.41e-01 0.552 0.432 0.000 0.016
#> SRR772349 1 0.5277 -1.23e-01 0.532 0.460 0.000 0.008
#> SRR772350 3 0.2402 8.84e-01 0.000 0.012 0.912 0.076
#> SRR772351 2 0.6209 4.62e-01 0.456 0.492 0.000 0.052
#> SRR772352 2 0.5440 6.61e-01 0.384 0.596 0.000 0.020
#> SRR772353 1 0.4855 3.93e-01 0.644 0.352 0.000 0.004
#> SRR772354 1 0.5143 3.99e-01 0.628 0.360 0.000 0.012
#> SRR772355 2 0.5220 6.96e-01 0.352 0.632 0.000 0.016
#> SRR772356 2 0.5203 7.09e-01 0.348 0.636 0.000 0.016
#> SRR772357 1 0.2921 7.32e-01 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.3751 6.76e-01 0.800 0.196 0.000 0.004
#> SRR772359 1 0.5399 -4.40e-01 0.520 0.468 0.000 0.012
#> SRR772360 1 0.5388 -4.31e-01 0.532 0.456 0.000 0.012
#> SRR772361 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.5226 6.51e-01 0.128 0.756 0.000 0.116
#> SRR772363 2 0.5228 6.47e-01 0.124 0.756 0.000 0.120
#> SRR772364 4 0.4755 7.96e-01 0.200 0.040 0.000 0.760
#> SRR772365 4 0.4793 7.98e-01 0.204 0.040 0.000 0.756
#> SRR772366 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772367 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.6165 2.77e-01 0.448 0.508 0.004 0.040
#> SRR772369 2 0.5294 4.88e-01 0.484 0.508 0.000 0.008
#> SRR772370 2 0.5203 6.30e-01 0.416 0.576 0.000 0.008
#> SRR772371 4 0.6353 7.22e-01 0.208 0.140 0.000 0.652
#> SRR772372 4 0.6366 7.03e-01 0.240 0.120 0.000 0.640
#> SRR772373 2 0.4222 7.29e-01 0.272 0.728 0.000 0.000
#> SRR772374 2 0.4431 7.29e-01 0.304 0.696 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.4720 7.31e-01 0.264 0.720 0.000 0.016
#> SRR772377 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772378 1 0.3427 7.44e-01 0.860 0.112 0.000 0.028
#> SRR772379 1 0.4095 7.02e-01 0.792 0.192 0.000 0.016
#> SRR772380 1 0.3108 7.42e-01 0.872 0.112 0.000 0.016
#> SRR772381 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.2973 7.39e-01 0.884 0.096 0.000 0.020
#> SRR772383 1 0.3048 7.33e-01 0.876 0.108 0.000 0.016
#> SRR772384 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772385 3 0.3215 9.46e-01 0.000 0.092 0.876 0.032
#> SRR772386 2 0.5290 6.54e-01 0.404 0.584 0.000 0.012
#> SRR772387 2 0.5417 6.35e-01 0.412 0.572 0.000 0.016
#> SRR772388 1 0.2796 7.44e-01 0.892 0.092 0.000 0.016
#> SRR772389 1 0.2943 7.43e-01 0.892 0.076 0.000 0.032
#> SRR772390 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772391 1 0.3080 7.41e-01 0.880 0.096 0.000 0.024
#> SRR772392 1 0.2928 7.43e-01 0.880 0.108 0.000 0.012
#> SRR772393 4 0.7458 4.94e-01 0.288 0.212 0.000 0.500
#> SRR772394 4 0.7572 4.41e-01 0.288 0.232 0.000 0.480
#> SRR772395 2 0.5272 6.61e-01 0.288 0.680 0.000 0.032
#> SRR772396 1 0.1356 7.30e-01 0.960 0.032 0.000 0.008
#> SRR772397 1 0.1209 7.18e-01 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR772398 1 0.6264 -1.98e-01 0.560 0.376 0.000 0.064
#> SRR772399 1 0.5884 -1.02e-01 0.592 0.364 0.000 0.044
#> SRR772400 1 0.3542 6.93e-01 0.852 0.120 0.000 0.028
#> SRR772401 1 0.2775 7.00e-01 0.896 0.084 0.000 0.020
#> SRR772402 4 0.3907 8.10e-01 0.120 0.044 0.000 0.836
#> SRR772403 4 0.3903 8.11e-01 0.080 0.076 0.000 0.844
#> SRR772404 2 0.5686 5.96e-01 0.332 0.632 0.004 0.032
#> SRR772405 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772406 2 0.5487 6.45e-01 0.400 0.580 0.000 0.020
#> SRR772407 2 0.5345 6.14e-01 0.428 0.560 0.000 0.012
#> SRR772408 2 0.5279 7.05e-01 0.192 0.736 0.000 0.072
#> SRR772409 2 0.5307 7.04e-01 0.188 0.736 0.000 0.076
#> SRR772410 1 0.4655 5.27e-01 0.684 0.312 0.000 0.004
#> SRR772411 1 0.3978 6.90e-01 0.796 0.192 0.000 0.012
#> SRR772412 1 0.1022 7.24e-01 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.1209 7.19e-01 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR772414 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772415 1 0.5217 3.42e-01 0.608 0.380 0.000 0.012
#> SRR772416 1 0.5355 4.24e-01 0.620 0.360 0.000 0.020
#> SRR772417 1 0.3335 7.38e-01 0.856 0.128 0.000 0.016
#> SRR772418 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772419 2 0.5417 6.97e-01 0.180 0.732 0.000 0.088
#> SRR772420 2 0.4949 7.05e-01 0.180 0.760 0.000 0.060
#> SRR772421 2 0.5508 5.45e-01 0.476 0.508 0.000 0.016
#> SRR772422 2 0.5576 5.83e-01 0.444 0.536 0.000 0.020
#> SRR772423 4 0.3978 8.12e-01 0.108 0.056 0.000 0.836
#> SRR772424 4 0.4022 8.07e-01 0.068 0.096 0.000 0.836
#> SRR772425 2 0.4539 7.29e-01 0.272 0.720 0.000 0.008
#> SRR772426 2 0.4072 7.30e-01 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR772427 2 0.4343 7.31e-01 0.264 0.732 0.000 0.004
#> SRR772428 1 0.2635 7.11e-01 0.904 0.076 0.000 0.020
#> SRR772429 1 0.2363 7.23e-01 0.920 0.056 0.000 0.024
#> SRR772430 1 0.5789 4.62e-01 0.624 0.336 0.004 0.036
#> SRR772431 4 0.3862 8.00e-01 0.152 0.024 0.000 0.824
#> SRR772432 4 0.3813 7.99e-01 0.148 0.024 0.000 0.828
#> SRR772433 1 0.2021 7.01e-01 0.936 0.040 0.000 0.024
#> SRR772434 1 0.1724 7.22e-01 0.948 0.032 0.000 0.020
#> SRR772435 1 0.2918 7.40e-01 0.876 0.116 0.000 0.008
#> SRR772436 1 0.2053 7.46e-01 0.924 0.072 0.000 0.004
#> SRR772437 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.6243 2.03e-05 0.548 0.060 0.000 0.392
#> SRR772439 1 0.6041 2.70e-01 0.608 0.060 0.000 0.332
#> SRR772440 2 0.5607 4.21e-01 0.488 0.492 0.000 0.020
#> SRR772441 2 0.5378 5.88e-01 0.448 0.540 0.000 0.012
#> SRR772442 4 0.4114 8.14e-01 0.112 0.060 0.000 0.828
#> SRR772443 4 0.4153 8.10e-01 0.132 0.048 0.000 0.820
#> SRR772444 1 0.1356 7.20e-01 0.960 0.032 0.000 0.008
#> SRR772445 1 0.1488 7.16e-01 0.956 0.032 0.000 0.012
#> SRR772446 1 0.2984 7.43e-01 0.888 0.084 0.000 0.028
#> SRR772447 1 0.2984 7.43e-01 0.888 0.084 0.000 0.028
#> SRR772448 2 0.5696 4.99e-01 0.484 0.492 0.000 0.024
#> SRR772449 2 0.5511 5.25e-01 0.484 0.500 0.000 0.016
#> SRR772450 2 0.5116 6.55e-01 0.128 0.764 0.000 0.108
#> SRR772451 2 0.5110 6.59e-01 0.132 0.764 0.000 0.104
#> SRR772452 1 0.3205 7.42e-01 0.872 0.104 0.000 0.024
#> SRR772453 1 0.2741 7.43e-01 0.892 0.096 0.000 0.012
#> SRR772454 1 0.2799 7.47e-01 0.884 0.108 0.000 0.008
#> SRR772455 1 0.3494 7.19e-01 0.824 0.172 0.000 0.004
#> SRR772456 2 0.5352 6.84e-01 0.168 0.740 0.000 0.092
#> SRR772457 2 0.4630 7.15e-01 0.196 0.768 0.000 0.036
#> SRR772458 1 0.2473 7.26e-01 0.908 0.080 0.000 0.012
#> SRR772459 1 0.2402 7.38e-01 0.912 0.076 0.000 0.012
#> SRR772460 2 0.5476 6.34e-01 0.120 0.736 0.000 0.144
#> SRR772461 2 0.5690 6.13e-01 0.116 0.716 0.000 0.168
#> SRR772462 2 0.5306 5.82e-01 0.348 0.632 0.000 0.020
#> SRR772463 2 0.5527 5.57e-01 0.356 0.616 0.000 0.028
#> SRR772464 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772465 1 0.5127 3.33e-01 0.632 0.356 0.000 0.012
#> SRR772466 1 0.5186 3.51e-01 0.640 0.344 0.000 0.016
#> SRR772467 2 0.5077 6.85e-01 0.160 0.760 0.000 0.080
#> SRR772468 2 0.4872 6.77e-01 0.148 0.776 0.000 0.076
#> SRR772469 1 0.3048 7.43e-01 0.876 0.108 0.000 0.016
#> SRR772470 1 0.2867 7.43e-01 0.884 0.104 0.000 0.012
#> SRR772471 1 0.5093 4.57e-01 0.640 0.348 0.000 0.012
#> SRR772472 1 0.4155 6.29e-01 0.756 0.240 0.000 0.004
#> SRR772473 4 0.4203 8.09e-01 0.068 0.108 0.000 0.824
#> SRR772474 4 0.4094 8.12e-01 0.116 0.056 0.000 0.828
#> SRR772475 3 0.3215 9.46e-01 0.000 0.092 0.876 0.032
#> SRR772476 2 0.5116 6.55e-01 0.128 0.764 0.000 0.108
#> SRR772477 2 0.5222 6.54e-01 0.132 0.756 0.000 0.112
#> SRR772478 1 0.4576 6.05e-01 0.728 0.260 0.000 0.012
#> SRR772479 1 0.3300 7.28e-01 0.848 0.144 0.000 0.008
#> SRR772480 4 0.3934 8.11e-01 0.116 0.048 0.000 0.836
#> SRR772481 4 0.4130 8.14e-01 0.108 0.064 0.000 0.828
#> SRR772482 1 0.4775 4.74e-01 0.740 0.232 0.000 0.028
#> SRR772483 1 0.4485 5.97e-01 0.772 0.200 0.000 0.028
#> SRR772484 2 0.5643 3.80e-01 0.428 0.548 0.000 0.024
#> SRR772485 2 0.5597 2.73e-01 0.464 0.516 0.000 0.020
#> SRR772486 1 0.6451 -1.26e-01 0.524 0.072 0.000 0.404
#> SRR772487 1 0.7068 -9.70e-02 0.492 0.128 0.000 0.380
#> SRR772488 2 0.5147 3.54e-01 0.460 0.536 0.000 0.004
#> SRR772489 2 0.5163 3.41e-01 0.480 0.516 0.000 0.004
#> SRR772490 1 0.1902 7.33e-01 0.932 0.064 0.000 0.004
#> SRR772491 1 0.2021 7.28e-01 0.932 0.056 0.000 0.012
#> SRR772492 2 0.6483 2.80e-01 0.096 0.592 0.000 0.312
#> SRR772493 2 0.6468 1.74e-01 0.084 0.568 0.000 0.348
#> SRR772494 2 0.5171 6.45e-01 0.128 0.760 0.000 0.112
#> SRR772495 2 0.5167 6.51e-01 0.132 0.760 0.000 0.108
#> SRR772496 2 0.4790 5.78e-01 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR772497 2 0.5028 5.45e-01 0.400 0.596 0.000 0.004
#> SRR772498 4 0.7845 2.24e-01 0.304 0.292 0.000 0.404
#> SRR772499 4 0.8129 2.02e-01 0.304 0.292 0.008 0.396
#> SRR772500 2 0.4295 7.29e-01 0.240 0.752 0.000 0.008
#> SRR772501 2 0.4188 7.28e-01 0.244 0.752 0.000 0.004
#> SRR772502 1 0.5564 -3.16e-01 0.544 0.436 0.000 0.020
#> SRR772503 1 0.4327 5.80e-01 0.768 0.216 0.000 0.016
#> SRR772504 2 0.5271 7.09e-01 0.320 0.656 0.000 0.024
#> SRR772505 2 0.5069 7.11e-01 0.320 0.664 0.000 0.016
#> SRR772506 2 0.5291 6.97e-01 0.180 0.740 0.000 0.080
#> SRR772507 2 0.5355 6.96e-01 0.180 0.736 0.000 0.084
#> SRR772508 2 0.5511 5.91e-01 0.332 0.636 0.000 0.032
#> SRR772509 3 0.3015 9.49e-01 0.000 0.092 0.884 0.024
#> SRR772510 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772511 1 0.4855 2.57e-01 0.644 0.352 0.000 0.004
#> SRR772512 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772513 1 0.5744 1.36e-01 0.536 0.436 0.000 0.028
#> SRR772514 1 0.5708 2.37e-01 0.556 0.416 0.000 0.028
#> SRR772515 2 0.5407 7.20e-01 0.296 0.668 0.000 0.036
#> SRR772516 2 0.5062 7.17e-01 0.300 0.680 0.000 0.020
#> SRR772517 2 0.4916 5.95e-01 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR772518 2 0.5404 3.36e-01 0.476 0.512 0.000 0.012
#> SRR772519 2 0.4585 6.85e-01 0.332 0.668 0.000 0.000
#> SRR772520 2 0.4769 7.23e-01 0.308 0.684 0.000 0.008
#> SRR772521 1 0.7371 -1.11e-01 0.472 0.360 0.000 0.168
#> SRR772522 2 0.6801 4.23e-01 0.448 0.456 0.000 0.096
#> SRR772523 2 0.7106 5.55e-01 0.324 0.528 0.000 0.148
#> SRR772524 2 0.5632 7.03e-01 0.340 0.624 0.000 0.036
#> SRR772525 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.4985 6.80e-01 0.152 0.768 0.000 0.080
#> SRR772527 2 0.5174 6.74e-01 0.152 0.756 0.000 0.092
#> SRR772528 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772529 1 0.1661 7.33e-01 0.944 0.052 0.000 0.004
#> SRR772530 1 0.2271 7.33e-01 0.916 0.076 0.000 0.008
#> SRR772531 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.5137 7.21e-01 0.296 0.680 0.000 0.024
#> SRR772533 2 0.5161 7.20e-01 0.300 0.676 0.000 0.024
#> SRR772534 1 0.4727 6.87e-01 0.792 0.100 0.000 0.108
#> SRR772535 2 0.5417 6.17e-01 0.412 0.572 0.000 0.016
#> SRR772536 2 0.5057 6.99e-01 0.340 0.648 0.000 0.012
#> SRR772537 4 0.3833 8.06e-01 0.072 0.080 0.000 0.848
#> SRR772538 4 0.3996 8.01e-01 0.060 0.104 0.000 0.836
#> SRR772539 1 0.4010 7.12e-01 0.816 0.156 0.000 0.028
#> SRR772540 1 0.3160 7.43e-01 0.872 0.108 0.000 0.020
#> SRR772541 1 0.5406 5.88e-01 0.692 0.268 0.004 0.036
#> SRR772542 1 0.5174 5.65e-01 0.760 0.116 0.000 0.124
#> SRR772543 1 0.4100 6.17e-01 0.824 0.048 0.000 0.128
#> SRR772544 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.3636 7.13e-01 0.820 0.172 0.000 0.008
#> SRR772546 1 0.3725 6.94e-01 0.812 0.180 0.000 0.008
#> SRR772547 1 0.3962 7.32e-01 0.820 0.152 0.000 0.028
#> SRR772548 1 0.3554 7.39e-01 0.844 0.136 0.000 0.020
#> SRR772549 1 0.3099 7.43e-01 0.876 0.104 0.000 0.020
#> SRR772550 1 0.2987 7.42e-01 0.880 0.104 0.000 0.016
#> SRR772551 1 0.6790 3.86e-01 0.604 0.228 0.000 0.168
#> SRR772552 1 0.4910 5.58e-01 0.704 0.276 0.000 0.020
#> SRR772553 3 0.3215 9.46e-01 0.000 0.092 0.876 0.032
#> SRR772554 2 0.5062 7.19e-01 0.300 0.680 0.000 0.020
#> SRR772555 2 0.5038 7.20e-01 0.296 0.684 0.000 0.020
#> SRR772556 1 0.1576 7.27e-01 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR772557 1 0.1576 7.27e-01 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR772558 1 0.3088 7.41e-01 0.864 0.128 0.000 0.008
#> SRR772559 1 0.3367 7.43e-01 0.864 0.108 0.000 0.028
#> SRR772560 1 0.4840 6.41e-01 0.732 0.240 0.000 0.028
#> SRR772561 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.4222 7.12e-01 0.272 0.728 0.000 0.000
#> SRR772563 2 0.4072 7.14e-01 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR772564 1 0.4436 6.30e-01 0.800 0.148 0.000 0.052
#> SRR772565 1 0.3900 6.84e-01 0.844 0.084 0.000 0.072
#> SRR772566 1 0.2335 7.13e-01 0.920 0.060 0.000 0.020
#> SRR772567 1 0.2271 7.21e-01 0.916 0.076 0.000 0.008
#> SRR772568 2 0.5159 6.88e-01 0.364 0.624 0.000 0.012
#> SRR772569 2 0.5110 6.95e-01 0.352 0.636 0.000 0.012
#> SRR772570 1 0.3448 7.24e-01 0.828 0.168 0.000 0.004
#> SRR772571 1 0.4214 6.96e-01 0.780 0.204 0.000 0.016
#> SRR772572 1 0.3625 7.23e-01 0.828 0.160 0.000 0.012
#> SRR772573 1 0.4088 6.67e-01 0.764 0.232 0.000 0.004
#> SRR772574 1 0.1938 7.42e-01 0.936 0.052 0.000 0.012
#> SRR772575 1 0.2124 7.44e-01 0.924 0.068 0.000 0.008
#> SRR772576 2 0.5399 5.19e-01 0.468 0.520 0.000 0.012
#> SRR772577 1 0.5673 -2.74e-01 0.528 0.448 0.000 0.024
#> SRR772578 4 0.7873 4.32e-02 0.292 0.320 0.000 0.388
#> SRR772579 4 0.7877 4.70e-02 0.300 0.312 0.000 0.388
#> SRR772580 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772581 4 0.5006 8.08e-01 0.124 0.104 0.000 0.772
#> SRR772582 4 0.5751 7.65e-01 0.124 0.164 0.000 0.712
#> SRR772583 1 0.3224 7.41e-01 0.864 0.120 0.000 0.016
#> SRR772584 1 0.4284 6.54e-01 0.764 0.224 0.000 0.012
#> SRR772585 1 0.5599 4.29e-01 0.616 0.352 0.000 0.032
#> SRR772586 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772587 1 0.2610 7.46e-01 0.900 0.088 0.000 0.012
#> SRR772588 2 0.4382 7.21e-01 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR772589 2 0.4164 7.09e-01 0.264 0.736 0.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.2522 7.26e-01 0.908 0.076 0.000 0.016
#> SRR772592 1 0.2706 7.34e-01 0.900 0.080 0.000 0.020
#> SRR772593 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772594 4 0.6587 6.02e-01 0.112 0.292 0.000 0.596
#> SRR772595 2 0.7342 -1.83e-01 0.156 0.432 0.000 0.412
#> SRR772596 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772597 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.2984 6.92e-01 0.888 0.084 0.000 0.028
#> SRR772599 1 0.2466 7.00e-01 0.916 0.056 0.000 0.028
#> SRR772600 4 0.3934 8.12e-01 0.116 0.048 0.000 0.836
#> SRR772601 4 0.3760 8.05e-01 0.136 0.028 0.000 0.836
#> SRR772602 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772603 4 0.3757 7.98e-01 0.152 0.020 0.000 0.828
#> SRR772604 4 0.3876 8.10e-01 0.124 0.040 0.000 0.836
#> SRR772605 1 0.5594 5.64e-01 0.672 0.284 0.004 0.040
#> SRR772606 1 0.2222 7.30e-01 0.924 0.060 0.000 0.016
#> SRR772607 1 0.2546 7.18e-01 0.912 0.060 0.000 0.028
#> SRR772608 1 0.3763 7.30e-01 0.832 0.144 0.000 0.024
#> SRR772609 1 0.3266 7.42e-01 0.868 0.108 0.000 0.024
#> SRR772610 1 0.5402 -9.68e-02 0.516 0.472 0.000 0.012
#> SRR772611 2 0.5508 4.16e-01 0.408 0.572 0.000 0.020
#> SRR772612 4 0.3464 7.93e-01 0.056 0.076 0.000 0.868
#> SRR772613 4 0.3601 7.98e-01 0.056 0.084 0.000 0.860
#> SRR772614 1 0.1807 7.20e-01 0.940 0.052 0.000 0.008
#> SRR772615 1 0.2376 7.15e-01 0.916 0.068 0.000 0.016
#> SRR772616 1 0.3497 7.45e-01 0.860 0.104 0.000 0.036
#> SRR772617 4 0.3617 8.03e-01 0.064 0.076 0.000 0.860
#> SRR772618 4 0.3834 8.10e-01 0.076 0.076 0.000 0.848
#> SRR772619 4 0.5538 5.98e-01 0.036 0.320 0.000 0.644
#> SRR772620 4 0.5913 5.29e-01 0.048 0.352 0.000 0.600
#> SRR772621 2 0.5229 6.42e-01 0.428 0.564 0.000 0.008
#> SRR772622 1 0.5483 -2.86e-01 0.536 0.448 0.000 0.016
#> SRR772623 3 0.2593 8.76e-01 0.000 0.016 0.904 0.080
#> SRR772624 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772625 3 0.3770 9.30e-01 0.004 0.104 0.852 0.040
#> SRR772626 4 0.7536 4.65e-01 0.284 0.228 0.000 0.488
#> SRR772627 4 0.7322 5.39e-01 0.244 0.224 0.000 0.532
#> SRR772628 1 0.2300 7.29e-01 0.920 0.064 0.000 0.016
#> SRR772629 1 0.2670 7.37e-01 0.904 0.072 0.000 0.024
#> SRR772630 1 0.3647 7.29e-01 0.832 0.152 0.000 0.016
#> SRR772631 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772632 2 0.4764 7.23e-01 0.220 0.748 0.000 0.032
#> SRR772633 2 0.4853 7.24e-01 0.220 0.744 0.000 0.036
#> SRR772634 1 0.5482 -7.81e-02 0.608 0.368 0.000 0.024
#> SRR772635 2 0.5607 5.03e-01 0.488 0.492 0.000 0.020
#> SRR772636 3 0.3215 9.46e-01 0.000 0.092 0.876 0.032
#> SRR772637 1 0.3962 7.20e-01 0.820 0.152 0.000 0.028
#> SRR772638 1 0.4104 7.03e-01 0.808 0.164 0.000 0.028
#> SRR772639 2 0.5337 6.05e-01 0.424 0.564 0.000 0.012
#> SRR772640 2 0.5222 6.54e-01 0.132 0.756 0.000 0.112
#> SRR772641 2 0.5222 6.55e-01 0.132 0.756 0.000 0.112
#> SRR772642 2 0.5378 5.96e-01 0.448 0.540 0.000 0.012
#> SRR772643 2 0.5298 6.88e-01 0.372 0.612 0.000 0.016
#> SRR772644 1 0.4079 7.08e-01 0.800 0.180 0.000 0.020
#> SRR772645 1 0.4012 7.05e-01 0.800 0.184 0.000 0.016
#> SRR772646 2 0.4673 7.32e-01 0.292 0.700 0.000 0.008
#> SRR772647 2 0.4103 7.29e-01 0.256 0.744 0.000 0.000
#> SRR772648 2 0.5510 6.58e-01 0.376 0.600 0.000 0.024
#> SRR772649 2 0.5571 6.43e-01 0.396 0.580 0.000 0.024
#> SRR772650 1 0.2918 7.41e-01 0.876 0.116 0.000 0.008
#> SRR772651 1 0.3852 7.13e-01 0.808 0.180 0.000 0.012
#> SRR772652 1 0.5062 2.31e-01 0.680 0.300 0.000 0.020
#> SRR772653 1 0.4767 3.99e-01 0.724 0.256 0.000 0.020
#> SRR772654 2 0.5452 6.05e-01 0.428 0.556 0.000 0.016
#> SRR772655 2 0.5387 6.53e-01 0.400 0.584 0.000 0.016
#> SRR772656 3 0.0188 9.53e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772657 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772658 4 0.3547 8.00e-01 0.064 0.072 0.000 0.864
#> SRR772659 4 0.3464 7.96e-01 0.056 0.076 0.000 0.868
#> SRR772660 2 0.5821 3.26e-01 0.432 0.536 0.000 0.032
#> SRR772661 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772662 1 0.3324 7.40e-01 0.852 0.136 0.000 0.012
#> SRR772663 1 0.3577 7.25e-01 0.832 0.156 0.000 0.012
#> SRR772664 2 0.5099 6.22e-01 0.380 0.612 0.000 0.008
#> SRR772665 2 0.5007 6.50e-01 0.356 0.636 0.000 0.008
#> SRR772666 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772667 1 0.6660 -1.49e-01 0.464 0.452 0.000 0.084
#> SRR772668 4 0.3781 7.35e-01 0.028 0.124 0.004 0.844
#> SRR772669 4 0.3934 7.59e-01 0.048 0.116 0.000 0.836
#> SRR772670 1 0.4877 5.31e-01 0.664 0.328 0.000 0.008
#> SRR772671 1 0.3937 7.00e-01 0.800 0.188 0.000 0.012
#> SRR772672 2 0.5414 5.36e-01 0.376 0.604 0.000 0.020
#> SRR772673 2 0.5695 2.03e-01 0.476 0.500 0.000 0.024
#> SRR772674 3 0.0188 9.53e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772675 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772676 2 0.5691 4.75e-01 0.468 0.508 0.000 0.024
#> SRR772677 2 0.5607 4.65e-01 0.484 0.496 0.000 0.020
#> SRR772678 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772679 1 0.4964 6.25e-01 0.716 0.256 0.000 0.028
#> SRR772680 1 0.4446 6.93e-01 0.776 0.196 0.000 0.028
#> SRR772681 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.4040 7.24e-01 0.248 0.752 0.000 0.000
#> SRR772683 2 0.4072 7.17e-01 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR772685 2 0.5427 6.31e-01 0.416 0.568 0.000 0.016
#> SRR772686 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772687 3 0.2796 9.50e-01 0.000 0.092 0.892 0.016
#> SRR772688 2 0.5512 6.88e-01 0.172 0.728 0.000 0.100
#> SRR772689 2 0.5535 6.92e-01 0.192 0.720 0.000 0.088
#> SRR772690 3 0.0000 9.53e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772691 3 0.3215 9.46e-01 0.000 0.092 0.876 0.032
#> SRR772692 1 0.5526 -2.93e-01 0.564 0.416 0.000 0.020
#> SRR772693 2 0.5600 5.44e-01 0.468 0.512 0.000 0.020
#> SRR772694 1 0.4741 3.96e-01 0.668 0.328 0.000 0.004
#> SRR772695 1 0.3450 7.21e-01 0.836 0.156 0.000 0.008
#> SRR772696 2 0.5695 5.06e-01 0.476 0.500 0.000 0.024
#> SRR772697 2 0.5685 5.41e-01 0.460 0.516 0.000 0.024
#> SRR772698 3 0.2909 9.50e-01 0.000 0.092 0.888 0.020
#> SRR772699 1 0.2670 7.19e-01 0.904 0.072 0.000 0.024
#> SRR772700 1 0.2546 7.19e-01 0.912 0.060 0.000 0.028
#> SRR772701 1 0.2796 7.34e-01 0.892 0.092 0.000 0.016
#> SRR772702 1 0.2542 7.24e-01 0.904 0.084 0.000 0.012
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.3613 0.7266 0.812 0.160 0.012 0.016 0.000
#> SRR772342 1 0.3381 0.7279 0.808 0.176 0.016 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.4834 0.6355 0.716 0.224 0.016 0.044 0.000
#> SRR772344 2 0.4065 0.6789 0.120 0.808 0.056 0.016 0.000
#> SRR772345 2 0.3356 0.6854 0.120 0.844 0.024 0.012 0.000
#> SRR772346 4 0.5436 0.7403 0.212 0.108 0.008 0.672 0.000
#> SRR772347 4 0.6164 0.6703 0.244 0.140 0.016 0.600 0.000
#> SRR772348 1 0.6323 0.1171 0.492 0.404 0.036 0.068 0.000
#> SRR772349 1 0.6074 0.1360 0.500 0.416 0.040 0.044 0.000
#> SRR772350 3 0.5562 0.8292 0.000 0.004 0.548 0.064 0.384
#> SRR772351 2 0.6090 0.4180 0.304 0.588 0.076 0.032 0.000
#> SRR772352 2 0.4741 0.6080 0.204 0.724 0.068 0.004 0.000
#> SRR772353 1 0.5283 0.4873 0.636 0.308 0.032 0.024 0.000
#> SRR772354 1 0.5051 0.4902 0.640 0.316 0.032 0.012 0.000
#> SRR772355 2 0.4834 0.6686 0.160 0.748 0.072 0.020 0.000
#> SRR772356 2 0.4972 0.6649 0.176 0.736 0.060 0.028 0.000
#> SRR772357 1 0.3048 0.7160 0.820 0.176 0.004 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.3975 0.6923 0.744 0.240 0.008 0.008 0.000
#> SRR772359 2 0.4805 0.5815 0.252 0.700 0.032 0.016 0.000
#> SRR772360 2 0.5090 0.5824 0.212 0.712 0.040 0.036 0.000
#> SRR772361 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772362 2 0.5924 0.5997 0.076 0.648 0.232 0.044 0.000
#> SRR772363 2 0.5920 0.5913 0.072 0.644 0.240 0.044 0.000
#> SRR772364 4 0.5506 0.7312 0.236 0.100 0.008 0.656 0.000
#> SRR772365 4 0.5488 0.7499 0.180 0.136 0.008 0.676 0.000
#> SRR772366 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772367 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772368 2 0.6727 0.2086 0.400 0.460 0.040 0.100 0.000
#> SRR772369 2 0.4208 0.5987 0.248 0.728 0.020 0.004 0.000
#> SRR772370 2 0.4321 0.5973 0.252 0.720 0.024 0.004 0.000
#> SRR772371 4 0.6062 0.6654 0.148 0.248 0.008 0.596 0.000
#> SRR772372 4 0.6326 0.6371 0.168 0.248 0.012 0.572 0.000
#> SRR772373 2 0.4421 0.6446 0.220 0.740 0.024 0.016 0.000
#> SRR772374 2 0.3482 0.6767 0.168 0.812 0.012 0.008 0.000
#> SRR772375 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772376 2 0.4716 0.6797 0.140 0.768 0.036 0.056 0.000
#> SRR772377 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772378 1 0.2796 0.7175 0.868 0.116 0.008 0.008 0.000
#> SRR772379 1 0.4226 0.6849 0.768 0.188 0.012 0.032 0.000
#> SRR772380 1 0.3031 0.7195 0.852 0.128 0.004 0.016 0.000
#> SRR772381 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772382 1 0.4932 0.6863 0.708 0.232 0.032 0.028 0.000
#> SRR772383 1 0.4905 0.6737 0.692 0.256 0.036 0.016 0.000
#> SRR772384 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772385 5 0.0451 0.9822 0.000 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR772386 2 0.3795 0.6652 0.144 0.808 0.044 0.004 0.000
#> SRR772387 2 0.3880 0.6588 0.116 0.820 0.048 0.016 0.000
#> SRR772388 1 0.2352 0.7160 0.896 0.092 0.008 0.004 0.000
#> SRR772389 1 0.2633 0.7115 0.896 0.068 0.012 0.024 0.000
#> SRR772390 5 0.0404 0.9762 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772391 1 0.2178 0.6944 0.920 0.048 0.008 0.024 0.000
#> SRR772392 1 0.2694 0.7204 0.876 0.108 0.008 0.008 0.000
#> SRR772393 4 0.6717 0.4442 0.128 0.356 0.028 0.488 0.000
#> SRR772394 4 0.6567 0.3949 0.120 0.404 0.020 0.456 0.000
#> SRR772395 2 0.5836 0.5856 0.220 0.656 0.032 0.092 0.000
#> SRR772396 1 0.4745 0.7031 0.744 0.180 0.060 0.016 0.000
#> SRR772397 1 0.4607 0.6939 0.752 0.184 0.044 0.020 0.000
#> SRR772398 2 0.6356 0.4313 0.292 0.592 0.048 0.060 0.008
#> SRR772399 2 0.6221 0.4158 0.308 0.580 0.052 0.060 0.000
#> SRR772400 1 0.6471 0.3959 0.508 0.376 0.064 0.052 0.000
#> SRR772401 1 0.5903 0.4866 0.576 0.340 0.048 0.036 0.000
#> SRR772402 4 0.3201 0.8079 0.096 0.052 0.000 0.852 0.000
#> SRR772403 4 0.3234 0.8121 0.084 0.064 0.000 0.852 0.000
#> SRR772404 2 0.6286 0.5473 0.240 0.616 0.048 0.096 0.000
#> SRR772405 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772406 2 0.4743 0.6491 0.184 0.740 0.064 0.012 0.000
#> SRR772407 2 0.4533 0.6602 0.148 0.772 0.060 0.020 0.000
#> SRR772408 2 0.5310 0.6490 0.104 0.724 0.140 0.032 0.000
#> SRR772409 2 0.5328 0.6454 0.096 0.724 0.144 0.036 0.000
#> SRR772410 1 0.5357 0.3506 0.580 0.372 0.028 0.020 0.000
#> SRR772411 1 0.4420 0.6231 0.712 0.260 0.016 0.012 0.000
#> SRR772412 1 0.4923 0.6981 0.720 0.212 0.044 0.024 0.000
#> SRR772413 1 0.4744 0.7031 0.744 0.184 0.052 0.020 0.000
#> SRR772414 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772415 1 0.5382 0.4319 0.612 0.332 0.032 0.024 0.000
#> SRR772416 1 0.5663 0.4046 0.600 0.328 0.036 0.036 0.000
#> SRR772417 1 0.3554 0.7087 0.776 0.216 0.004 0.004 0.000
#> SRR772418 5 0.0404 0.9762 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772419 2 0.5320 0.6547 0.112 0.732 0.112 0.044 0.000
#> SRR772420 2 0.5327 0.6536 0.132 0.728 0.100 0.040 0.000
#> SRR772421 2 0.4611 0.6373 0.160 0.764 0.052 0.024 0.000
#> SRR772422 2 0.4532 0.6424 0.152 0.772 0.052 0.024 0.000
#> SRR772423 4 0.3181 0.8126 0.072 0.072 0.000 0.856 0.000
#> SRR772424 4 0.3516 0.8103 0.052 0.108 0.004 0.836 0.000
#> SRR772425 2 0.3828 0.6700 0.184 0.788 0.020 0.008 0.000
#> SRR772426 2 0.3497 0.6816 0.140 0.828 0.020 0.012 0.000
#> SRR772427 2 0.3451 0.6853 0.128 0.836 0.024 0.012 0.000
#> SRR772428 1 0.6125 0.5536 0.588 0.304 0.068 0.040 0.000
#> SRR772429 1 0.5377 0.6438 0.664 0.260 0.052 0.024 0.000
#> SRR772430 1 0.5946 0.4788 0.620 0.264 0.024 0.092 0.000
#> SRR772431 4 0.3400 0.7992 0.116 0.040 0.004 0.840 0.000
#> SRR772432 4 0.3496 0.7998 0.124 0.040 0.004 0.832 0.000
#> SRR772433 1 0.5024 0.6763 0.732 0.180 0.056 0.032 0.000
#> SRR772434 1 0.4704 0.6974 0.744 0.192 0.032 0.032 0.000
#> SRR772435 1 0.4110 0.6974 0.736 0.244 0.008 0.012 0.000
#> SRR772436 1 0.4153 0.7101 0.740 0.236 0.016 0.008 0.000
#> SRR772437 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772438 1 0.6910 0.1938 0.524 0.168 0.036 0.272 0.000
#> SRR772439 1 0.6981 0.3148 0.532 0.200 0.040 0.228 0.000
#> SRR772440 2 0.4717 0.4767 0.308 0.660 0.028 0.004 0.000
#> SRR772441 2 0.4524 0.5814 0.236 0.720 0.040 0.004 0.000
#> SRR772442 4 0.3590 0.8153 0.080 0.092 0.000 0.828 0.000
#> SRR772443 4 0.3612 0.8110 0.100 0.064 0.004 0.832 0.000
#> SRR772444 1 0.4843 0.6955 0.736 0.188 0.056 0.020 0.000
#> SRR772445 1 0.4702 0.7029 0.752 0.172 0.056 0.020 0.000
#> SRR772446 1 0.1883 0.6996 0.932 0.048 0.008 0.012 0.000
#> SRR772447 1 0.1956 0.7008 0.928 0.052 0.008 0.012 0.000
#> SRR772448 2 0.5074 0.6074 0.180 0.724 0.076 0.020 0.000
#> SRR772449 2 0.4844 0.6364 0.152 0.752 0.072 0.024 0.000
#> SRR772450 2 0.5829 0.6063 0.080 0.660 0.220 0.040 0.000
#> SRR772451 2 0.5938 0.5994 0.076 0.652 0.224 0.048 0.000
#> SRR772452 1 0.1843 0.7017 0.932 0.052 0.008 0.008 0.000
#> SRR772453 1 0.1717 0.7023 0.936 0.052 0.008 0.004 0.000
#> SRR772454 1 0.3239 0.7303 0.828 0.156 0.012 0.004 0.000
#> SRR772455 1 0.3167 0.7174 0.836 0.148 0.008 0.008 0.000
#> SRR772456 2 0.5699 0.6255 0.088 0.692 0.172 0.048 0.000
#> SRR772457 2 0.5189 0.6505 0.108 0.724 0.148 0.020 0.000
#> SRR772458 1 0.4548 0.6996 0.756 0.180 0.048 0.016 0.000
#> SRR772459 1 0.4981 0.6948 0.724 0.200 0.048 0.028 0.000
#> SRR772460 2 0.6262 0.5793 0.068 0.628 0.228 0.076 0.000
#> SRR772461 2 0.6448 0.5543 0.064 0.616 0.220 0.100 0.000
#> SRR772462 2 0.6179 0.4485 0.328 0.568 0.052 0.052 0.000
#> SRR772463 2 0.6562 0.4016 0.332 0.536 0.052 0.080 0.000
#> SRR772464 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772465 1 0.5335 0.1257 0.508 0.452 0.024 0.016 0.000
#> SRR772466 1 0.5041 0.2060 0.544 0.428 0.020 0.008 0.000
#> SRR772467 2 0.6069 0.6075 0.096 0.644 0.216 0.044 0.000
#> SRR772468 2 0.6114 0.6024 0.092 0.640 0.220 0.048 0.000
#> SRR772469 1 0.2929 0.7230 0.856 0.128 0.004 0.012 0.000
#> SRR772470 1 0.2833 0.7234 0.864 0.120 0.004 0.012 0.000
#> SRR772471 1 0.4583 0.5820 0.696 0.272 0.012 0.020 0.000
#> SRR772472 1 0.3211 0.7012 0.824 0.164 0.008 0.004 0.000
#> SRR772473 4 0.3521 0.8053 0.040 0.140 0.000 0.820 0.000
#> SRR772474 4 0.3622 0.8155 0.096 0.068 0.004 0.832 0.000
#> SRR772475 5 0.0451 0.9822 0.000 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR772476 2 0.5919 0.6081 0.076 0.660 0.212 0.052 0.000
#> SRR772477 2 0.5790 0.6051 0.072 0.664 0.220 0.044 0.000
#> SRR772478 1 0.2929 0.6797 0.856 0.128 0.012 0.004 0.000
#> SRR772479 1 0.1857 0.6975 0.928 0.060 0.008 0.004 0.000
#> SRR772480 4 0.3359 0.8071 0.108 0.052 0.000 0.840 0.000
#> SRR772481 4 0.3569 0.8111 0.104 0.068 0.000 0.828 0.000
#> SRR772482 2 0.6099 0.1242 0.392 0.520 0.040 0.048 0.000
#> SRR772483 2 0.5970 0.0127 0.440 0.484 0.036 0.040 0.000
#> SRR772484 2 0.6631 0.3106 0.376 0.496 0.060 0.068 0.000
#> SRR772485 2 0.6564 0.2365 0.400 0.480 0.060 0.060 0.000
#> SRR772486 1 0.7406 0.0247 0.412 0.244 0.036 0.308 0.000
#> SRR772487 1 0.7500 -0.0262 0.376 0.288 0.036 0.300 0.000
#> SRR772488 2 0.5843 0.2698 0.420 0.508 0.052 0.020 0.000
#> SRR772489 2 0.5711 0.2629 0.428 0.508 0.048 0.016 0.000
#> SRR772490 1 0.5493 0.6619 0.672 0.240 0.048 0.040 0.000
#> SRR772491 1 0.4561 0.6924 0.764 0.164 0.052 0.020 0.000
#> SRR772492 2 0.6728 0.5067 0.064 0.596 0.196 0.144 0.000
#> SRR772493 2 0.6801 0.4854 0.060 0.584 0.200 0.156 0.000
#> SRR772494 2 0.5754 0.6114 0.084 0.668 0.212 0.036 0.000
#> SRR772495 2 0.5789 0.6094 0.076 0.668 0.212 0.044 0.000
#> SRR772496 2 0.5183 0.5316 0.308 0.640 0.036 0.016 0.000
#> SRR772497 2 0.5388 0.4963 0.324 0.616 0.044 0.016 0.000
#> SRR772498 2 0.6226 -0.1674 0.076 0.480 0.024 0.420 0.000
#> SRR772499 2 0.6264 -0.1360 0.080 0.484 0.024 0.412 0.000
#> SRR772500 2 0.3691 0.6734 0.164 0.804 0.028 0.004 0.000
#> SRR772501 2 0.3699 0.6836 0.128 0.824 0.036 0.012 0.000
#> SRR772502 2 0.5254 0.5614 0.236 0.688 0.032 0.044 0.000
#> SRR772503 2 0.5645 -0.1632 0.464 0.476 0.012 0.048 0.000
#> SRR772504 2 0.3807 0.6689 0.116 0.820 0.056 0.008 0.000
#> SRR772505 2 0.3575 0.6762 0.120 0.824 0.056 0.000 0.000
#> SRR772506 2 0.5521 0.6403 0.100 0.712 0.144 0.044 0.000
#> SRR772507 2 0.5521 0.6441 0.100 0.712 0.144 0.044 0.000
#> SRR772508 2 0.6415 0.4339 0.316 0.552 0.032 0.100 0.000
#> SRR772509 5 0.0162 0.9875 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR772510 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772511 2 0.5399 0.0865 0.440 0.516 0.028 0.016 0.000
#> SRR772512 3 0.4278 0.9779 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR772513 1 0.6778 0.1831 0.496 0.360 0.056 0.088 0.000
#> SRR772514 1 0.6717 0.2337 0.508 0.352 0.056 0.084 0.000
#> SRR772515 2 0.4824 0.6682 0.160 0.752 0.060 0.028 0.000
#> SRR772516 2 0.3941 0.6814 0.132 0.812 0.036 0.020 0.000
#> SRR772517 2 0.5483 0.4637 0.344 0.596 0.040 0.020 0.000
#> SRR772518 1 0.5847 -0.0793 0.480 0.452 0.036 0.032 0.000
#> SRR772519 2 0.5048 0.5759 0.268 0.676 0.040 0.016 0.000
#> SRR772520 2 0.4652 0.6210 0.260 0.700 0.032 0.008 0.000
#> SRR772521 2 0.6347 -0.0251 0.388 0.484 0.012 0.116 0.000
#> SRR772522 2 0.5656 0.3451 0.316 0.592 0.004 0.088 0.000
#> SRR772523 2 0.6498 0.4887 0.260 0.592 0.076 0.072 0.000
#> SRR772524 2 0.4676 0.6524 0.156 0.760 0.064 0.020 0.000
#> SRR772525 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772526 2 0.6252 0.6053 0.108 0.636 0.204 0.052 0.000
#> SRR772527 2 0.6200 0.6026 0.104 0.636 0.212 0.048 0.000
#> SRR772528 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772529 1 0.4339 0.7081 0.756 0.196 0.040 0.008 0.000
#> SRR772530 1 0.4923 0.6935 0.720 0.212 0.044 0.024 0.000
#> SRR772531 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772532 2 0.4247 0.6813 0.136 0.792 0.056 0.016 0.000
#> SRR772533 2 0.4560 0.6798 0.160 0.764 0.060 0.016 0.000
#> SRR772534 1 0.5317 0.6722 0.708 0.172 0.020 0.100 0.000
#> SRR772535 2 0.5414 0.5155 0.276 0.648 0.060 0.016 0.000
#> SRR772536 2 0.4254 0.6750 0.156 0.776 0.064 0.004 0.000
#> SRR772537 4 0.4229 0.8060 0.052 0.124 0.024 0.800 0.000
#> SRR772538 4 0.4347 0.7982 0.044 0.132 0.032 0.792 0.000
#> SRR772539 1 0.2340 0.7028 0.908 0.068 0.012 0.012 0.000
#> SRR772540 1 0.3521 0.7291 0.808 0.172 0.012 0.008 0.000
#> SRR772541 1 0.6042 0.5278 0.648 0.212 0.044 0.096 0.000
#> SRR772542 1 0.6605 0.4120 0.544 0.308 0.040 0.108 0.000
#> SRR772543 1 0.5866 0.5802 0.676 0.180 0.048 0.096 0.000
#> SRR772544 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772545 1 0.4518 0.5987 0.660 0.320 0.016 0.004 0.000
#> SRR772546 1 0.4564 0.6483 0.696 0.272 0.024 0.008 0.000
#> SRR772547 1 0.3558 0.7249 0.816 0.156 0.008 0.020 0.000
#> SRR772548 1 0.3320 0.7266 0.828 0.152 0.008 0.012 0.000
#> SRR772549 1 0.2069 0.6996 0.924 0.052 0.012 0.012 0.000
#> SRR772550 1 0.2011 0.6929 0.928 0.044 0.008 0.020 0.000
#> SRR772551 1 0.6148 0.5370 0.600 0.260 0.020 0.120 0.000
#> SRR772552 1 0.5755 0.4424 0.556 0.372 0.052 0.020 0.000
#> SRR772553 5 0.0451 0.9822 0.000 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR772554 2 0.3510 0.6795 0.128 0.832 0.032 0.008 0.000
#> SRR772555 2 0.4036 0.6802 0.108 0.816 0.052 0.024 0.000
#> SRR772556 1 0.4902 0.6875 0.712 0.224 0.048 0.016 0.000
#> SRR772557 1 0.4753 0.6995 0.736 0.196 0.052 0.016 0.000
#> SRR772558 1 0.1990 0.7077 0.920 0.068 0.008 0.004 0.000
#> SRR772559 1 0.2199 0.7039 0.916 0.060 0.008 0.016 0.000
#> SRR772560 1 0.5145 0.6263 0.724 0.164 0.020 0.092 0.000
#> SRR772561 3 0.4278 0.9779 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR772562 2 0.4737 0.6344 0.216 0.728 0.028 0.028 0.000
#> SRR772563 2 0.5076 0.6247 0.220 0.708 0.036 0.036 0.000
#> SRR772564 1 0.6371 0.2268 0.488 0.404 0.036 0.072 0.000
#> SRR772565 1 0.5852 0.5413 0.648 0.240 0.040 0.072 0.000
#> SRR772566 1 0.5974 0.5751 0.608 0.292 0.052 0.048 0.000
#> SRR772567 1 0.5931 0.5091 0.584 0.328 0.044 0.044 0.000
#> SRR772568 2 0.3516 0.6770 0.152 0.820 0.020 0.008 0.000
#> SRR772569 2 0.3247 0.6793 0.136 0.840 0.016 0.008 0.000
#> SRR772570 1 0.3990 0.6158 0.688 0.308 0.004 0.000 0.000
#> SRR772571 1 0.3509 0.7087 0.792 0.196 0.004 0.008 0.000
#> SRR772572 1 0.4142 0.6739 0.752 0.220 0.012 0.016 0.000
#> SRR772573 1 0.4443 0.6035 0.680 0.300 0.008 0.012 0.000
#> SRR772574 1 0.4002 0.7232 0.780 0.184 0.028 0.008 0.000
#> SRR772575 1 0.4358 0.7076 0.736 0.228 0.028 0.008 0.000
#> SRR772576 2 0.5072 0.4792 0.300 0.652 0.032 0.016 0.000
#> SRR772577 2 0.5486 0.0991 0.440 0.512 0.024 0.024 0.000
#> SRR772578 2 0.6554 -0.0364 0.076 0.504 0.048 0.372 0.000
#> SRR772579 2 0.6464 -0.0350 0.068 0.508 0.048 0.376 0.000
#> SRR772580 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772581 4 0.4733 0.7964 0.084 0.152 0.012 0.752 0.000
#> SRR772582 4 0.5934 0.6759 0.128 0.240 0.012 0.620 0.000
#> SRR772583 1 0.3387 0.7192 0.836 0.132 0.008 0.024 0.000
#> SRR772584 1 0.4786 0.5999 0.696 0.260 0.024 0.020 0.000
#> SRR772585 1 0.6601 0.2519 0.524 0.340 0.044 0.092 0.000
#> SRR772586 5 0.0162 0.9868 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772587 1 0.3829 0.7241 0.776 0.196 0.028 0.000 0.000
#> SRR772588 2 0.4682 0.6134 0.248 0.708 0.032 0.012 0.000
#> SRR772589 2 0.5088 0.5892 0.256 0.684 0.028 0.032 0.000
#> SRR772590 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772591 1 0.4986 0.6897 0.720 0.208 0.036 0.036 0.000
#> SRR772592 1 0.4528 0.7058 0.748 0.200 0.028 0.024 0.000
#> SRR772593 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772594 4 0.5975 0.5626 0.068 0.320 0.028 0.584 0.000
#> SRR772595 2 0.6434 -0.1737 0.088 0.452 0.028 0.432 0.000
#> SRR772596 5 0.0404 0.9764 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772597 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772598 1 0.6010 0.5055 0.584 0.320 0.060 0.036 0.000
#> SRR772599 1 0.5683 0.6369 0.660 0.236 0.072 0.032 0.000
#> SRR772600 4 0.3226 0.8127 0.088 0.060 0.000 0.852 0.000
#> SRR772601 4 0.3270 0.8070 0.100 0.044 0.004 0.852 0.000
#> SRR772602 3 0.4278 0.9779 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR772603 4 0.3218 0.7912 0.128 0.024 0.004 0.844 0.000
#> SRR772604 4 0.3037 0.8036 0.100 0.040 0.000 0.860 0.000
#> SRR772605 1 0.6465 0.3891 0.572 0.288 0.044 0.096 0.000
#> SRR772606 1 0.5247 0.6825 0.712 0.196 0.048 0.044 0.000
#> SRR772607 1 0.5312 0.6779 0.712 0.188 0.056 0.044 0.000
#> SRR772608 1 0.4461 0.6767 0.756 0.192 0.024 0.028 0.000
#> SRR772609 1 0.3780 0.7051 0.812 0.148 0.020 0.020 0.000
#> SRR772610 1 0.5901 0.0717 0.492 0.436 0.040 0.032 0.000
#> SRR772611 2 0.6154 0.3780 0.360 0.544 0.048 0.048 0.000
#> SRR772612 4 0.3684 0.8069 0.052 0.076 0.028 0.844 0.000
#> SRR772613 4 0.3514 0.8045 0.048 0.088 0.016 0.848 0.000
#> SRR772614 1 0.5052 0.6852 0.732 0.176 0.060 0.032 0.000
#> SRR772615 1 0.5828 0.5722 0.608 0.304 0.052 0.036 0.000
#> SRR772616 1 0.3387 0.7224 0.836 0.132 0.008 0.024 0.000
#> SRR772617 4 0.3727 0.8126 0.060 0.096 0.012 0.832 0.000
#> SRR772618 4 0.3568 0.8107 0.064 0.080 0.012 0.844 0.000
#> SRR772619 4 0.7058 0.4521 0.032 0.296 0.188 0.484 0.000
#> SRR772620 4 0.7189 0.3713 0.036 0.332 0.184 0.448 0.000
#> SRR772621 2 0.4042 0.6326 0.196 0.772 0.020 0.012 0.000
#> SRR772622 2 0.5189 0.4286 0.332 0.620 0.036 0.012 0.000
#> SRR772623 3 0.5606 0.8203 0.000 0.004 0.548 0.068 0.380
#> SRR772624 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772625 5 0.0889 0.9623 0.004 0.012 0.004 0.004 0.976
#> SRR772626 4 0.6472 0.4131 0.096 0.384 0.028 0.492 0.000
#> SRR772627 4 0.6217 0.4784 0.080 0.380 0.024 0.516 0.000
#> SRR772628 1 0.5396 0.6841 0.684 0.228 0.056 0.032 0.000
#> SRR772629 1 0.4986 0.6587 0.700 0.240 0.028 0.032 0.000
#> SRR772630 1 0.3855 0.7015 0.748 0.240 0.004 0.008 0.000
#> SRR772631 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772632 2 0.4521 0.6765 0.108 0.788 0.072 0.032 0.000
#> SRR772633 2 0.4763 0.6729 0.116 0.768 0.088 0.028 0.000
#> SRR772634 2 0.5891 0.5059 0.252 0.640 0.052 0.056 0.000
#> SRR772635 2 0.5248 0.6088 0.188 0.716 0.044 0.052 0.000
#> SRR772636 5 0.0451 0.9822 0.000 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR772637 1 0.2270 0.7051 0.908 0.072 0.016 0.004 0.000
#> SRR772638 1 0.2199 0.6952 0.916 0.060 0.016 0.008 0.000
#> SRR772639 2 0.5663 0.5035 0.332 0.592 0.060 0.016 0.000
#> SRR772640 2 0.5974 0.5908 0.076 0.640 0.240 0.044 0.000
#> SRR772641 2 0.6102 0.5896 0.076 0.632 0.240 0.052 0.000
#> SRR772642 2 0.4803 0.6370 0.204 0.732 0.032 0.032 0.000
#> SRR772643 2 0.4276 0.6740 0.164 0.780 0.020 0.036 0.000
#> SRR772644 1 0.3210 0.7139 0.832 0.152 0.008 0.008 0.000
#> SRR772645 1 0.3320 0.7074 0.828 0.152 0.012 0.008 0.000
#> SRR772646 2 0.3737 0.6826 0.144 0.816 0.020 0.020 0.000
#> SRR772647 2 0.3583 0.6794 0.168 0.808 0.016 0.008 0.000
#> SRR772648 2 0.4616 0.6441 0.152 0.768 0.052 0.028 0.000
#> SRR772649 2 0.4378 0.6544 0.120 0.792 0.064 0.024 0.000
#> SRR772650 1 0.3643 0.7018 0.776 0.212 0.008 0.004 0.000
#> SRR772651 1 0.4296 0.6655 0.720 0.256 0.012 0.012 0.000
#> SRR772652 2 0.5994 0.1109 0.404 0.516 0.044 0.036 0.000
#> SRR772653 2 0.5901 -0.0189 0.436 0.492 0.040 0.032 0.000
#> SRR772654 2 0.4847 0.6210 0.200 0.732 0.032 0.036 0.000
#> SRR772655 2 0.4855 0.6268 0.192 0.736 0.032 0.040 0.000
#> SRR772656 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772657 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772658 4 0.3800 0.7980 0.052 0.084 0.028 0.836 0.000
#> SRR772659 4 0.3716 0.7911 0.048 0.072 0.036 0.844 0.000
#> SRR772660 2 0.6741 0.3138 0.356 0.500 0.048 0.096 0.000
#> SRR772661 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772662 1 0.4533 0.6984 0.704 0.260 0.004 0.032 0.000
#> SRR772663 1 0.3280 0.7219 0.812 0.176 0.000 0.012 0.000
#> SRR772664 2 0.5197 0.5567 0.296 0.648 0.040 0.016 0.000
#> SRR772665 2 0.5207 0.5705 0.268 0.668 0.044 0.020 0.000
#> SRR772666 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772667 1 0.7120 0.0925 0.448 0.356 0.040 0.156 0.000
#> SRR772668 4 0.3991 0.7262 0.028 0.064 0.052 0.840 0.016
#> SRR772669 4 0.3343 0.7411 0.040 0.068 0.028 0.864 0.000
#> SRR772670 1 0.5299 0.4386 0.612 0.336 0.016 0.036 0.000
#> SRR772671 1 0.3607 0.7032 0.820 0.144 0.008 0.028 0.000
#> SRR772672 2 0.6077 0.4616 0.320 0.580 0.040 0.060 0.000
#> SRR772673 1 0.6255 -0.0383 0.476 0.428 0.040 0.056 0.000
#> SRR772674 3 0.4304 0.9332 0.000 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR772675 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772676 2 0.4820 0.5775 0.232 0.708 0.052 0.008 0.000
#> SRR772677 2 0.4768 0.5751 0.244 0.704 0.044 0.008 0.000
#> SRR772678 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772679 1 0.5462 0.5587 0.668 0.244 0.024 0.064 0.000
#> SRR772680 1 0.4803 0.6933 0.752 0.160 0.024 0.064 0.000
#> SRR772681 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772682 2 0.4301 0.6539 0.204 0.756 0.020 0.020 0.000
#> SRR772683 2 0.4323 0.6474 0.196 0.760 0.020 0.024 0.000
#> SRR772685 2 0.3798 0.6651 0.120 0.816 0.060 0.004 0.000
#> SRR772686 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772687 5 0.0162 0.9868 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772688 2 0.5796 0.6344 0.100 0.692 0.152 0.056 0.000
#> SRR772689 2 0.5464 0.6406 0.088 0.720 0.140 0.052 0.000
#> SRR772690 3 0.4283 0.9823 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR772691 5 0.0451 0.9822 0.000 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR772692 2 0.5374 0.5498 0.232 0.684 0.044 0.040 0.000
#> SRR772693 2 0.5003 0.6286 0.184 0.732 0.048 0.036 0.000
#> SRR772694 1 0.5423 0.4505 0.592 0.352 0.040 0.016 0.000
#> SRR772695 1 0.3935 0.6845 0.760 0.220 0.012 0.008 0.000
#> SRR772696 2 0.4872 0.6285 0.164 0.744 0.072 0.020 0.000
#> SRR772697 2 0.5017 0.6293 0.156 0.744 0.060 0.040 0.000
#> SRR772698 5 0.0000 0.9903 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR772699 1 0.5770 0.5829 0.612 0.304 0.040 0.044 0.000
#> SRR772700 1 0.5743 0.6192 0.624 0.288 0.056 0.032 0.000
#> SRR772701 1 0.5571 0.5677 0.608 0.324 0.040 0.028 0.000
#> SRR772702 1 0.5855 0.5946 0.620 0.284 0.060 0.036 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.4467 3.28e-01 0.692 0.236 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR772342 1 0.4149 3.73e-01 0.728 0.212 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR772343 1 0.5164 5.05e-01 0.716 0.152 0.032 0.028 0.000 0.072
#> SRR772344 2 0.3424 5.50e-01 0.036 0.844 0.084 0.024 0.000 0.012
#> SRR772345 2 0.4146 5.50e-01 0.032 0.800 0.100 0.020 0.000 0.048
#> SRR772346 4 0.6315 3.53e-01 0.160 0.144 0.000 0.584 0.000 0.112
#> SRR772347 4 0.6579 1.02e-01 0.144 0.208 0.000 0.540 0.000 0.108
#> SRR772348 1 0.6938 3.75e-01 0.528 0.228 0.040 0.052 0.000 0.152
#> SRR772349 1 0.6755 3.65e-01 0.548 0.248 0.048 0.052 0.000 0.104
#> SRR772350 3 0.6799 1.44e-01 0.000 0.000 0.364 0.044 0.248 0.344
#> SRR772351 2 0.5432 4.07e-01 0.216 0.668 0.048 0.024 0.000 0.044
#> SRR772352 2 0.3294 5.17e-01 0.088 0.848 0.008 0.020 0.000 0.036
#> SRR772353 1 0.5223 4.64e-01 0.700 0.140 0.020 0.020 0.000 0.120
#> SRR772354 1 0.5451 4.30e-01 0.668 0.128 0.016 0.020 0.000 0.168
#> SRR772355 2 0.3461 5.47e-01 0.048 0.852 0.036 0.024 0.000 0.040
#> SRR772356 2 0.4428 5.41e-01 0.072 0.788 0.076 0.032 0.000 0.032
#> SRR772357 1 0.2886 4.98e-01 0.836 0.144 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR772358 1 0.4141 4.75e-01 0.712 0.248 0.004 0.004 0.000 0.032
#> SRR772359 2 0.4191 5.05e-01 0.148 0.768 0.036 0.000 0.000 0.048
#> SRR772360 2 0.3241 5.14e-01 0.108 0.836 0.012 0.000 0.000 0.044
#> SRR772361 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772362 3 0.4338 3.73e-03 0.016 0.420 0.560 0.004 0.000 0.000
#> SRR772363 3 0.4402 9.69e-03 0.020 0.412 0.564 0.004 0.000 0.000
#> SRR772364 4 0.6395 3.48e-01 0.192 0.108 0.000 0.568 0.000 0.132
#> SRR772365 4 0.6740 3.71e-02 0.092 0.228 0.000 0.504 0.000 0.176
#> SRR772366 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772367 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772368 1 0.7487 2.61e-01 0.420 0.240 0.016 0.104 0.000 0.220
#> SRR772369 2 0.4441 5.20e-01 0.172 0.744 0.024 0.004 0.000 0.056
#> SRR772370 2 0.4244 5.29e-01 0.172 0.752 0.024 0.000 0.000 0.052
#> SRR772371 4 0.6903 -2.56e-01 0.064 0.308 0.004 0.436 0.000 0.188
#> SRR772372 4 0.6782 -2.61e-01 0.068 0.300 0.000 0.448 0.000 0.184
#> SRR772373 2 0.6554 4.55e-01 0.132 0.592 0.132 0.016 0.000 0.128
#> SRR772374 2 0.5359 5.43e-01 0.088 0.712 0.084 0.016 0.000 0.100
#> SRR772375 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772376 2 0.6198 3.45e-01 0.056 0.564 0.288 0.020 0.000 0.072
#> SRR772377 5 0.0146 9.93e-01 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772378 1 0.2638 4.82e-01 0.888 0.044 0.000 0.036 0.000 0.032
#> SRR772379 1 0.4184 4.97e-01 0.780 0.136 0.008 0.028 0.000 0.048
#> SRR772380 1 0.2732 4.96e-01 0.884 0.060 0.004 0.024 0.000 0.028
#> SRR772381 3 0.6083 1.66e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.296 0.308
#> SRR772382 1 0.5568 9.54e-02 0.492 0.380 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR772383 1 0.5448 1.23e-01 0.472 0.420 0.000 0.004 0.000 0.104
#> SRR772384 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772385 5 0.0508 9.88e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR772386 2 0.3078 5.55e-01 0.068 0.864 0.032 0.004 0.000 0.032
#> SRR772387 2 0.2825 5.45e-01 0.032 0.884 0.036 0.008 0.000 0.040
#> SRR772388 1 0.2777 4.55e-01 0.884 0.040 0.012 0.012 0.000 0.052
#> SRR772389 1 0.3343 4.38e-01 0.852 0.040 0.016 0.020 0.000 0.072
#> SRR772390 5 0.0260 9.90e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772391 1 0.3189 4.06e-01 0.844 0.008 0.016 0.020 0.000 0.112
#> SRR772392 1 0.3060 4.58e-01 0.864 0.060 0.008 0.012 0.000 0.056
#> SRR772393 2 0.6380 -3.85e-01 0.052 0.420 0.000 0.404 0.000 0.124
#> SRR772394 2 0.6264 -2.91e-01 0.048 0.472 0.000 0.360 0.000 0.120
#> SRR772395 2 0.8168 2.47e-01 0.200 0.404 0.156 0.068 0.000 0.172
#> SRR772396 1 0.5483 1.38e-01 0.560 0.296 0.000 0.004 0.000 0.140
#> SRR772397 1 0.5362 1.32e-01 0.524 0.356 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR772398 2 0.5049 3.13e-01 0.168 0.692 0.000 0.020 0.004 0.116
#> SRR772399 2 0.5030 3.00e-01 0.176 0.688 0.000 0.016 0.004 0.116
#> SRR772400 2 0.5388 -8.22e-03 0.372 0.520 0.000 0.004 0.000 0.104
#> SRR772401 2 0.5475 -1.14e-01 0.416 0.460 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR772402 4 0.3100 7.39e-01 0.124 0.024 0.008 0.840 0.000 0.004
#> SRR772403 4 0.3331 7.52e-01 0.088 0.056 0.012 0.840 0.000 0.004
#> SRR772404 2 0.8051 1.10e-01 0.252 0.380 0.064 0.096 0.000 0.208
#> SRR772405 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.3570 5.42e-01 0.084 0.836 0.020 0.016 0.000 0.044
#> SRR772407 2 0.3398 5.27e-01 0.060 0.848 0.008 0.028 0.000 0.056
#> SRR772408 2 0.5249 1.28e-01 0.028 0.488 0.452 0.020 0.000 0.012
#> SRR772409 2 0.5140 1.58e-01 0.032 0.508 0.436 0.016 0.000 0.008
#> SRR772410 1 0.5949 4.40e-01 0.604 0.252 0.028 0.028 0.000 0.088
#> SRR772411 1 0.4999 4.88e-01 0.704 0.196 0.020 0.024 0.000 0.056
#> SRR772412 1 0.5249 1.31e-01 0.528 0.368 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR772413 1 0.5354 1.46e-01 0.552 0.316 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR772414 3 0.6082 1.71e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.292 0.312
#> SRR772415 1 0.5649 4.54e-01 0.656 0.164 0.024 0.020 0.000 0.136
#> SRR772416 1 0.5995 4.38e-01 0.628 0.172 0.028 0.028 0.000 0.144
#> SRR772417 1 0.4804 4.01e-01 0.660 0.276 0.004 0.024 0.000 0.036
#> SRR772418 5 0.0146 9.93e-01 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772419 2 0.6554 2.02e-01 0.084 0.464 0.372 0.016 0.000 0.064
#> SRR772420 2 0.6901 1.96e-01 0.116 0.428 0.368 0.016 0.000 0.072
#> SRR772421 2 0.2189 5.28e-01 0.060 0.904 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772422 2 0.2251 5.29e-01 0.052 0.904 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR772423 4 0.3206 7.49e-01 0.108 0.048 0.008 0.836 0.000 0.000
#> SRR772424 4 0.3467 7.42e-01 0.036 0.064 0.064 0.836 0.000 0.000
#> SRR772425 2 0.5915 4.80e-01 0.104 0.652 0.168 0.028 0.000 0.048
#> SRR772426 2 0.5561 4.47e-01 0.052 0.660 0.212 0.020 0.000 0.056
#> SRR772427 2 0.5422 4.98e-01 0.056 0.688 0.176 0.020 0.000 0.060
#> SRR772428 2 0.5534 -1.54e-01 0.424 0.444 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR772429 1 0.5438 1.08e-01 0.496 0.380 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR772430 1 0.6374 3.87e-01 0.600 0.100 0.016 0.096 0.000 0.188
#> SRR772431 4 0.2865 7.21e-01 0.140 0.012 0.000 0.840 0.000 0.008
#> SRR772432 4 0.3016 7.23e-01 0.136 0.016 0.000 0.836 0.000 0.012
#> SRR772433 1 0.5625 1.87e-02 0.504 0.332 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR772434 1 0.5409 1.41e-01 0.524 0.348 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR772435 1 0.4573 2.73e-01 0.584 0.372 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772436 1 0.4823 2.59e-01 0.584 0.348 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR772437 3 0.6082 1.71e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.292 0.312
#> SRR772438 6 0.7729 0.00e+00 0.256 0.252 0.000 0.228 0.000 0.264
#> SRR772439 2 0.7677 -9.18e-01 0.248 0.284 0.000 0.192 0.000 0.276
#> SRR772440 2 0.4307 4.32e-01 0.240 0.712 0.008 0.008 0.000 0.032
#> SRR772441 2 0.2894 5.22e-01 0.108 0.852 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR772442 4 0.3381 7.51e-01 0.092 0.056 0.012 0.836 0.000 0.004
#> SRR772443 4 0.3167 7.39e-01 0.120 0.032 0.000 0.836 0.000 0.012
#> SRR772444 1 0.5481 1.20e-01 0.520 0.340 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR772445 1 0.5428 1.94e-01 0.568 0.308 0.000 0.008 0.000 0.116
#> SRR772446 1 0.3291 3.95e-01 0.836 0.016 0.016 0.012 0.000 0.120
#> SRR772447 1 0.3157 4.01e-01 0.848 0.016 0.016 0.012 0.000 0.108
#> SRR772448 2 0.3084 5.02e-01 0.064 0.856 0.004 0.008 0.000 0.068
#> SRR772449 2 0.2906 5.21e-01 0.040 0.876 0.004 0.028 0.000 0.052
#> SRR772450 3 0.4622 -2.99e-02 0.020 0.432 0.536 0.012 0.000 0.000
#> SRR772451 3 0.4688 -2.45e-02 0.024 0.428 0.536 0.012 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.3103 4.02e-01 0.848 0.016 0.016 0.008 0.000 0.112
#> SRR772453 1 0.3202 4.14e-01 0.848 0.016 0.016 0.016 0.000 0.104
#> SRR772454 1 0.4620 3.72e-01 0.696 0.220 0.000 0.012 0.000 0.072
#> SRR772455 1 0.2940 5.06e-01 0.848 0.112 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR772456 3 0.5367 -6.10e-02 0.048 0.428 0.500 0.012 0.000 0.012
#> SRR772457 3 0.5629 -1.01e-01 0.044 0.440 0.476 0.020 0.000 0.020
#> SRR772458 1 0.5607 1.47e-01 0.544 0.312 0.000 0.008 0.000 0.136
#> SRR772459 1 0.5320 1.69e-01 0.532 0.352 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR772460 3 0.4812 2.71e-02 0.012 0.396 0.564 0.016 0.000 0.012
#> SRR772461 3 0.5087 2.17e-02 0.012 0.392 0.552 0.032 0.000 0.012
#> SRR772462 1 0.7542 1.96e-01 0.416 0.264 0.076 0.032 0.000 0.212
#> SRR772463 1 0.7685 1.87e-01 0.404 0.256 0.072 0.044 0.000 0.224
#> SRR772464 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772465 2 0.5909 -1.31e-01 0.440 0.440 0.008 0.020 0.000 0.092
#> SRR772466 1 0.5711 3.34e-01 0.520 0.356 0.004 0.012 0.000 0.108
#> SRR772467 3 0.5176 -4.41e-02 0.056 0.412 0.520 0.008 0.000 0.004
#> SRR772468 3 0.5165 -2.57e-02 0.056 0.404 0.528 0.008 0.000 0.004
#> SRR772469 1 0.3150 4.88e-01 0.860 0.076 0.012 0.016 0.000 0.036
#> SRR772470 1 0.3443 4.87e-01 0.836 0.096 0.008 0.016 0.000 0.044
#> SRR772471 1 0.5586 4.34e-01 0.648 0.172 0.036 0.004 0.000 0.140
#> SRR772472 1 0.3642 4.94e-01 0.824 0.092 0.008 0.016 0.000 0.060
#> SRR772473 4 0.3225 7.03e-01 0.032 0.132 0.004 0.828 0.000 0.004
#> SRR772474 4 0.3372 7.49e-01 0.112 0.040 0.008 0.832 0.000 0.008
#> SRR772475 5 0.0508 9.88e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR772476 3 0.4617 -2.30e-02 0.020 0.428 0.540 0.012 0.000 0.000
#> SRR772477 3 0.4496 1.13e-02 0.020 0.408 0.564 0.008 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.4165 4.41e-01 0.788 0.056 0.024 0.012 0.000 0.120
#> SRR772479 1 0.3051 4.30e-01 0.860 0.020 0.016 0.012 0.000 0.092
#> SRR772480 4 0.3024 7.37e-01 0.120 0.028 0.004 0.844 0.000 0.004
#> SRR772481 4 0.3315 7.35e-01 0.104 0.056 0.004 0.832 0.000 0.004
#> SRR772482 2 0.5000 2.67e-01 0.260 0.652 0.008 0.008 0.000 0.072
#> SRR772483 2 0.5251 2.11e-01 0.336 0.576 0.004 0.008 0.000 0.076
#> SRR772484 1 0.7367 2.79e-01 0.464 0.216 0.048 0.052 0.000 0.220
#> SRR772485 1 0.7082 3.12e-01 0.496 0.200 0.040 0.044 0.000 0.220
#> SRR772486 2 0.7639 -8.30e-01 0.192 0.320 0.000 0.228 0.000 0.260
#> SRR772487 2 0.7542 -7.27e-01 0.184 0.364 0.000 0.220 0.000 0.232
#> SRR772488 1 0.6998 2.53e-01 0.468 0.264 0.056 0.016 0.000 0.196
#> SRR772489 1 0.6966 2.27e-01 0.444 0.300 0.040 0.020 0.000 0.196
#> SRR772490 1 0.5662 5.88e-02 0.460 0.384 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR772491 1 0.5829 5.79e-02 0.512 0.312 0.000 0.008 0.000 0.168
#> SRR772492 3 0.5414 2.26e-02 0.012 0.364 0.544 0.076 0.000 0.004
#> SRR772493 3 0.5210 2.49e-02 0.008 0.372 0.544 0.076 0.000 0.000
#> SRR772494 3 0.4631 -4.67e-02 0.020 0.440 0.528 0.012 0.000 0.000
#> SRR772495 3 0.4617 -2.78e-02 0.020 0.428 0.540 0.012 0.000 0.000
#> SRR772496 1 0.7299 1.36e-02 0.372 0.368 0.068 0.024 0.000 0.168
#> SRR772497 1 0.7128 7.79e-02 0.400 0.356 0.052 0.024 0.000 0.168
#> SRR772498 2 0.6350 -1.50e-01 0.012 0.492 0.032 0.340 0.000 0.124
#> SRR772499 2 0.6503 -1.63e-01 0.020 0.484 0.032 0.340 0.000 0.124
#> SRR772500 2 0.5990 4.17e-01 0.064 0.624 0.212 0.016 0.000 0.084
#> SRR772501 2 0.5506 4.80e-01 0.056 0.680 0.180 0.020 0.000 0.064
#> SRR772502 2 0.3579 5.03e-01 0.112 0.824 0.008 0.020 0.000 0.036
#> SRR772503 2 0.4975 1.78e-01 0.316 0.616 0.004 0.012 0.000 0.052
#> SRR772504 2 0.2159 5.39e-01 0.024 0.916 0.004 0.016 0.000 0.040
#> SRR772505 2 0.2708 5.54e-01 0.032 0.892 0.040 0.016 0.000 0.020
#> SRR772506 2 0.6108 1.30e-01 0.072 0.444 0.432 0.012 0.000 0.040
#> SRR772507 2 0.5970 1.12e-01 0.064 0.448 0.440 0.012 0.000 0.036
#> SRR772508 1 0.8109 7.60e-02 0.332 0.300 0.060 0.100 0.000 0.208
#> SRR772509 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772510 3 0.6082 1.71e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.292 0.312
#> SRR772511 2 0.4824 3.43e-01 0.288 0.652 0.008 0.020 0.000 0.032
#> SRR772512 3 0.6091 1.68e-01 0.000 0.000 0.388 0.000 0.292 0.320
#> SRR772513 1 0.7180 3.32e-01 0.496 0.156 0.028 0.084 0.000 0.236
#> SRR772514 1 0.7265 3.51e-01 0.512 0.128 0.068 0.064 0.000 0.228
#> SRR772515 2 0.3310 5.53e-01 0.080 0.852 0.020 0.016 0.000 0.032
#> SRR772516 2 0.3230 5.62e-01 0.052 0.864 0.024 0.024 0.000 0.036
#> SRR772517 2 0.6188 2.89e-01 0.316 0.544 0.072 0.020 0.000 0.048
#> SRR772518 1 0.6840 6.89e-02 0.420 0.392 0.080 0.020 0.000 0.088
#> SRR772519 2 0.7535 1.06e-01 0.296 0.400 0.092 0.024 0.000 0.188
#> SRR772520 2 0.7191 3.05e-01 0.240 0.496 0.116 0.024 0.000 0.124
#> SRR772521 2 0.6015 1.54e-01 0.204 0.616 0.008 0.108 0.000 0.064
#> SRR772522 2 0.4868 4.16e-01 0.104 0.736 0.004 0.104 0.000 0.052
#> SRR772523 2 0.5482 4.40e-01 0.176 0.688 0.052 0.036 0.000 0.048
#> SRR772524 2 0.3689 5.39e-01 0.064 0.836 0.020 0.036 0.000 0.044
#> SRR772525 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772526 3 0.5332 -1.93e-02 0.064 0.392 0.528 0.004 0.000 0.012
#> SRR772527 3 0.5284 -1.55e-02 0.060 0.392 0.532 0.004 0.000 0.012
#> SRR772528 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.5065 2.20e-01 0.568 0.340 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR772530 1 0.5362 1.62e-01 0.524 0.356 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR772531 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772532 2 0.4161 5.46e-01 0.052 0.800 0.096 0.032 0.000 0.020
#> SRR772533 2 0.4379 5.46e-01 0.068 0.788 0.088 0.028 0.000 0.028
#> SRR772534 1 0.6718 8.58e-06 0.520 0.260 0.008 0.096 0.000 0.116
#> SRR772535 2 0.5232 4.82e-01 0.152 0.716 0.048 0.040 0.000 0.044
#> SRR772536 2 0.3508 5.53e-01 0.060 0.848 0.028 0.036 0.000 0.028
#> SRR772537 4 0.4020 7.20e-01 0.024 0.096 0.080 0.796 0.000 0.004
#> SRR772538 4 0.4188 6.93e-01 0.016 0.096 0.108 0.776 0.000 0.004
#> SRR772539 1 0.3086 4.57e-01 0.856 0.040 0.008 0.008 0.000 0.088
#> SRR772540 1 0.4320 3.91e-01 0.704 0.240 0.000 0.008 0.000 0.048
#> SRR772541 1 0.6160 3.98e-01 0.620 0.084 0.012 0.108 0.000 0.176
#> SRR772542 2 0.7052 -5.28e-01 0.312 0.392 0.000 0.080 0.000 0.216
#> SRR772543 1 0.6926 -4.30e-01 0.388 0.316 0.000 0.060 0.000 0.236
#> SRR772544 3 0.6082 1.71e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.292 0.312
#> SRR772545 1 0.4482 3.65e-01 0.628 0.324 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR772546 1 0.4573 4.17e-01 0.672 0.272 0.004 0.008 0.000 0.044
#> SRR772547 1 0.3855 4.97e-01 0.800 0.128 0.004 0.024 0.000 0.044
#> SRR772548 1 0.4121 4.77e-01 0.768 0.128 0.000 0.012 0.000 0.092
#> SRR772549 1 0.3310 3.91e-01 0.832 0.008 0.012 0.024 0.000 0.124
#> SRR772550 1 0.3358 3.91e-01 0.832 0.008 0.016 0.024 0.000 0.120
#> SRR772551 1 0.6452 -2.59e-03 0.484 0.328 0.004 0.136 0.000 0.048
#> SRR772552 2 0.5621 -1.51e-01 0.452 0.464 0.012 0.040 0.000 0.032
#> SRR772553 5 0.0508 9.88e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR772554 2 0.3070 5.59e-01 0.044 0.872 0.044 0.016 0.000 0.024
#> SRR772555 2 0.2799 5.56e-01 0.036 0.888 0.032 0.016 0.000 0.028
#> SRR772556 1 0.5160 2.14e-01 0.564 0.332 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR772557 1 0.5232 2.04e-01 0.564 0.320 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR772558 1 0.3274 4.46e-01 0.856 0.036 0.016 0.020 0.000 0.072
#> SRR772559 1 0.3742 4.13e-01 0.824 0.028 0.016 0.036 0.000 0.096
#> SRR772560 1 0.5561 4.48e-01 0.692 0.060 0.024 0.084 0.000 0.140
#> SRR772561 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772562 2 0.7421 3.44e-01 0.192 0.492 0.152 0.032 0.000 0.132
#> SRR772563 2 0.7725 3.04e-01 0.188 0.444 0.172 0.032 0.000 0.164
#> SRR772564 2 0.6170 -2.25e-01 0.340 0.480 0.000 0.028 0.000 0.152
#> SRR772565 1 0.6676 -3.79e-01 0.404 0.332 0.000 0.040 0.000 0.224
#> SRR772566 2 0.5788 -1.82e-01 0.432 0.432 0.012 0.000 0.000 0.124
#> SRR772567 2 0.5788 -8.89e-02 0.400 0.468 0.008 0.004 0.000 0.120
#> SRR772568 2 0.4590 5.58e-01 0.076 0.768 0.096 0.012 0.000 0.048
#> SRR772569 2 0.4950 5.50e-01 0.064 0.744 0.104 0.016 0.000 0.072
#> SRR772570 1 0.4411 4.46e-01 0.672 0.276 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR772571 1 0.3868 5.05e-01 0.780 0.152 0.004 0.004 0.000 0.060
#> SRR772572 1 0.4128 5.08e-01 0.764 0.172 0.004 0.024 0.000 0.036
#> SRR772573 1 0.5260 4.45e-01 0.628 0.272 0.004 0.020 0.000 0.076
#> SRR772574 1 0.4822 2.90e-01 0.628 0.296 0.000 0.004 0.000 0.072
#> SRR772575 1 0.4871 2.36e-01 0.580 0.348 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR772576 2 0.3724 4.82e-01 0.188 0.772 0.000 0.012 0.000 0.028
#> SRR772577 2 0.4951 2.45e-01 0.348 0.596 0.008 0.012 0.000 0.036
#> SRR772578 2 0.7001 -1.06e-01 0.024 0.464 0.084 0.324 0.000 0.104
#> SRR772579 2 0.7399 -1.18e-01 0.020 0.408 0.136 0.324 0.000 0.112
#> SRR772580 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772581 4 0.4876 4.76e-01 0.044 0.220 0.000 0.688 0.000 0.048
#> SRR772582 4 0.5941 1.65e-04 0.076 0.328 0.000 0.536 0.000 0.060
#> SRR772583 1 0.3097 4.96e-01 0.856 0.080 0.000 0.036 0.000 0.028
#> SRR772584 1 0.4809 4.95e-01 0.724 0.176 0.012 0.028 0.000 0.060
#> SRR772585 1 0.6721 3.75e-01 0.552 0.132 0.016 0.088 0.000 0.212
#> SRR772586 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.4601 3.48e-01 0.688 0.232 0.000 0.008 0.000 0.072
#> SRR772588 1 0.7716 -5.40e-03 0.368 0.332 0.128 0.032 0.000 0.140
#> SRR772589 1 0.7926 -1.50e-03 0.340 0.324 0.160 0.036 0.000 0.140
#> SRR772590 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772591 1 0.5613 1.29e-01 0.492 0.388 0.004 0.004 0.000 0.112
#> SRR772592 1 0.5504 1.64e-01 0.536 0.348 0.004 0.004 0.000 0.108
#> SRR772593 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772594 4 0.6105 4.15e-01 0.016 0.224 0.204 0.548 0.000 0.008
#> SRR772595 4 0.7170 2.33e-01 0.024 0.320 0.196 0.412 0.000 0.048
#> SRR772596 5 0.0260 9.90e-01 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772597 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772598 2 0.5724 -2.44e-01 0.412 0.424 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR772599 1 0.5648 6.17e-02 0.472 0.372 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR772600 4 0.3262 7.47e-01 0.112 0.040 0.004 0.836 0.000 0.008
#> SRR772601 4 0.2794 7.27e-01 0.144 0.012 0.004 0.840 0.000 0.000
#> SRR772602 3 0.6091 1.68e-01 0.000 0.000 0.388 0.000 0.292 0.320
#> SRR772603 4 0.2957 7.23e-01 0.140 0.016 0.000 0.836 0.000 0.008
#> SRR772604 4 0.3019 7.35e-01 0.124 0.020 0.004 0.844 0.000 0.008
#> SRR772605 1 0.6248 3.92e-01 0.600 0.092 0.008 0.104 0.000 0.196
#> SRR772606 1 0.6060 2.76e-02 0.484 0.328 0.000 0.016 0.000 0.172
#> SRR772607 1 0.5984 -3.99e-02 0.468 0.340 0.000 0.008 0.000 0.184
#> SRR772608 1 0.3997 4.88e-01 0.800 0.092 0.004 0.028 0.000 0.076
#> SRR772609 1 0.3423 4.87e-01 0.836 0.080 0.000 0.028 0.000 0.056
#> SRR772610 1 0.6616 3.62e-01 0.548 0.200 0.036 0.028 0.000 0.188
#> SRR772611 1 0.7398 1.99e-01 0.436 0.260 0.080 0.024 0.000 0.200
#> SRR772612 4 0.3292 7.40e-01 0.024 0.056 0.076 0.844 0.000 0.000
#> SRR772613 4 0.3504 7.39e-01 0.032 0.060 0.076 0.832 0.000 0.000
#> SRR772614 1 0.5704 9.56e-02 0.508 0.332 0.000 0.004 0.000 0.156
#> SRR772615 2 0.5573 -1.56e-01 0.416 0.460 0.000 0.004 0.000 0.120
#> SRR772616 1 0.3510 4.87e-01 0.832 0.096 0.004 0.028 0.000 0.040
#> SRR772617 4 0.3475 7.44e-01 0.040 0.056 0.068 0.836 0.000 0.000
#> SRR772618 4 0.3481 7.47e-01 0.052 0.044 0.068 0.836 0.000 0.000
#> SRR772619 3 0.5987 -2.56e-01 0.012 0.140 0.472 0.372 0.000 0.004
#> SRR772620 3 0.5962 -2.30e-01 0.008 0.152 0.476 0.360 0.000 0.004
#> SRR772621 2 0.3196 5.43e-01 0.108 0.840 0.016 0.000 0.000 0.036
#> SRR772622 2 0.3867 4.44e-01 0.216 0.744 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR772623 3 0.6905 1.40e-01 0.000 0.000 0.364 0.056 0.236 0.344
#> SRR772624 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772625 5 0.0912 9.77e-01 0.000 0.008 0.012 0.004 0.972 0.004
#> SRR772626 2 0.6427 -3.07e-01 0.024 0.440 0.016 0.388 0.000 0.132
#> SRR772627 2 0.6426 -3.15e-01 0.024 0.424 0.020 0.412 0.000 0.120
#> SRR772628 1 0.5743 6.57e-02 0.464 0.396 0.000 0.008 0.000 0.132
#> SRR772629 1 0.6025 -6.13e-02 0.436 0.380 0.004 0.004 0.000 0.176
#> SRR772630 1 0.5001 3.67e-01 0.636 0.296 0.008 0.024 0.000 0.036
#> SRR772631 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.6014 2.92e-01 0.044 0.552 0.324 0.020 0.000 0.060
#> SRR772633 2 0.5865 2.08e-01 0.048 0.504 0.388 0.008 0.000 0.052
#> SRR772634 2 0.3670 4.85e-01 0.116 0.812 0.008 0.008 0.000 0.056
#> SRR772635 2 0.3393 5.18e-01 0.084 0.844 0.012 0.016 0.000 0.044
#> SRR772636 5 0.0508 9.88e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR772637 1 0.3104 4.47e-01 0.860 0.036 0.016 0.008 0.000 0.080
#> SRR772638 1 0.3196 4.19e-01 0.848 0.016 0.020 0.012 0.000 0.104
#> SRR772639 2 0.6334 4.07e-01 0.244 0.584 0.092 0.036 0.000 0.044
#> SRR772640 3 0.4338 4.25e-03 0.016 0.420 0.560 0.004 0.000 0.000
#> SRR772641 3 0.4421 -8.08e-03 0.020 0.424 0.552 0.004 0.000 0.000
#> SRR772642 2 0.5305 5.39e-01 0.132 0.704 0.084 0.008 0.000 0.072
#> SRR772643 2 0.5351 5.47e-01 0.096 0.708 0.108 0.012 0.000 0.076
#> SRR772644 1 0.2739 5.01e-01 0.872 0.084 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR772645 1 0.2635 4.99e-01 0.884 0.068 0.004 0.008 0.000 0.036
#> SRR772646 2 0.6093 4.54e-01 0.064 0.616 0.216 0.020 0.000 0.084
#> SRR772647 2 0.5975 4.85e-01 0.080 0.640 0.180 0.016 0.000 0.084
#> SRR772648 2 0.2281 5.32e-01 0.028 0.908 0.004 0.012 0.000 0.048
#> SRR772649 2 0.2051 5.30e-01 0.020 0.920 0.004 0.012 0.000 0.044
#> SRR772650 1 0.3810 4.63e-01 0.752 0.208 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR772651 1 0.4393 3.89e-01 0.640 0.316 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772652 2 0.4613 2.64e-01 0.260 0.660 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772653 2 0.4845 1.98e-01 0.280 0.628 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR772654 2 0.3493 5.37e-01 0.112 0.828 0.016 0.008 0.000 0.036
#> SRR772655 2 0.3339 5.46e-01 0.088 0.848 0.020 0.016 0.000 0.028
#> SRR772656 3 0.6083 1.66e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.296 0.308
#> SRR772657 3 0.6087 1.70e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.292 0.316
#> SRR772658 4 0.3525 7.31e-01 0.020 0.060 0.096 0.824 0.000 0.000
#> SRR772659 4 0.3423 7.31e-01 0.024 0.048 0.096 0.832 0.000 0.000
#> SRR772660 1 0.7776 1.91e-01 0.392 0.276 0.056 0.068 0.000 0.208
#> SRR772661 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772662 1 0.4667 2.88e-01 0.576 0.380 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR772663 1 0.2833 4.86e-01 0.836 0.148 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR772664 2 0.7588 8.94e-02 0.316 0.400 0.092 0.036 0.000 0.156
#> SRR772665 2 0.7638 8.21e-02 0.316 0.384 0.108 0.028 0.000 0.164
#> SRR772666 3 0.6082 1.71e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.292 0.312
#> SRR772667 1 0.7787 2.61e-01 0.476 0.180 0.084 0.156 0.000 0.104
#> SRR772668 4 0.3902 6.84e-01 0.024 0.016 0.112 0.816 0.016 0.016
#> SRR772669 4 0.2997 7.02e-01 0.036 0.024 0.048 0.876 0.000 0.016
#> SRR772670 1 0.5609 4.57e-01 0.644 0.184 0.028 0.008 0.000 0.136
#> SRR772671 1 0.3218 4.98e-01 0.860 0.060 0.016 0.016 0.000 0.048
#> SRR772672 1 0.7547 1.28e-01 0.392 0.308 0.084 0.028 0.000 0.188
#> SRR772673 1 0.7011 3.23e-01 0.516 0.220 0.060 0.032 0.000 0.172
#> SRR772674 3 0.6081 9.13e-02 0.000 0.000 0.384 0.000 0.340 0.276
#> SRR772675 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772676 2 0.2884 5.10e-01 0.092 0.864 0.004 0.008 0.000 0.032
#> SRR772677 2 0.2658 5.24e-01 0.080 0.876 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR772678 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772679 1 0.5062 4.96e-01 0.712 0.164 0.012 0.036 0.000 0.076
#> SRR772680 1 0.4890 4.91e-01 0.728 0.160 0.012 0.044 0.000 0.056
#> SRR772681 3 0.6082 1.71e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.292 0.312
#> SRR772682 2 0.6897 4.27e-01 0.132 0.560 0.180 0.032 0.000 0.096
#> SRR772683 2 0.7021 4.09e-01 0.140 0.552 0.168 0.036 0.000 0.104
#> SRR772685 2 0.1755 5.40e-01 0.032 0.932 0.008 0.000 0.000 0.028
#> SRR772686 3 0.6082 1.71e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.292 0.312
#> SRR772687 5 0.0146 9.93e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772688 3 0.5601 -1.20e-01 0.048 0.452 0.460 0.004 0.000 0.036
#> SRR772689 3 0.5808 -1.29e-01 0.060 0.444 0.456 0.012 0.000 0.028
#> SRR772690 3 0.6082 1.71e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.292 0.312
#> SRR772691 5 0.0508 9.88e-01 0.000 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR772692 2 0.3394 5.02e-01 0.108 0.832 0.008 0.008 0.000 0.044
#> SRR772693 2 0.4353 5.43e-01 0.108 0.780 0.056 0.008 0.000 0.048
#> SRR772694 1 0.5597 3.55e-01 0.544 0.368 0.016 0.028 0.000 0.044
#> SRR772695 1 0.3911 4.97e-01 0.780 0.164 0.004 0.020 0.000 0.032
#> SRR772696 2 0.3458 4.94e-01 0.056 0.836 0.004 0.020 0.000 0.084
#> SRR772697 2 0.3488 5.10e-01 0.048 0.844 0.012 0.028 0.000 0.068
#> SRR772698 5 0.0000 9.95e-01 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772699 2 0.5261 -1.64e-01 0.444 0.460 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR772700 1 0.5257 1.09e-01 0.472 0.432 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR772701 2 0.5209 -1.07e-01 0.416 0.492 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR772702 2 0.5454 -9.49e-02 0.392 0.484 0.000 0.000 0.000 0.124
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.741 0.880 0.944 0.4008 0.611 0.611
#> 3 3 0.688 0.811 0.920 0.4263 0.731 0.590
#> 4 4 0.627 0.739 0.866 0.2491 0.798 0.560
#> 5 5 0.571 0.558 0.774 0.0701 0.912 0.723
#> 6 6 0.556 0.481 0.687 0.0392 0.929 0.749
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772347 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772348 1 0.6973 0.78168 0.812 0.188
#> SRR772349 2 0.7950 0.70265 0.240 0.760
#> SRR772350 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772351 1 0.8443 0.65635 0.728 0.272
#> SRR772352 2 0.9977 0.11640 0.472 0.528
#> SRR772353 1 0.3733 0.90392 0.928 0.072
#> SRR772354 1 0.1843 0.93499 0.972 0.028
#> SRR772355 1 0.9044 0.56120 0.680 0.320
#> SRR772356 2 0.5737 0.83679 0.136 0.864
#> SRR772357 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0672 0.94399 0.992 0.008
#> SRR772359 1 0.1633 0.93674 0.976 0.024
#> SRR772360 1 0.0672 0.94399 0.992 0.008
#> SRR772361 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772365 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772366 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772368 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772369 1 0.3431 0.91132 0.936 0.064
#> SRR772370 1 0.3431 0.91118 0.936 0.064
#> SRR772371 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772372 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772373 2 0.1184 0.91730 0.016 0.984
#> SRR772374 2 0.4022 0.88408 0.080 0.920
#> SRR772375 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.3114 0.90805 0.944 0.056
#> SRR772378 1 0.0938 0.94241 0.988 0.012
#> SRR772379 1 0.1184 0.94073 0.984 0.016
#> SRR772380 1 0.1843 0.93473 0.972 0.028
#> SRR772381 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0376 0.94523 0.996 0.004
#> SRR772383 1 0.1843 0.93445 0.972 0.028
#> SRR772384 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772385 1 0.9993 -0.05939 0.516 0.484
#> SRR772386 1 0.8861 0.54159 0.696 0.304
#> SRR772387 2 0.6247 0.82233 0.156 0.844
#> SRR772388 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0376 0.94525 0.996 0.004
#> SRR772392 1 0.0672 0.94389 0.992 0.008
#> SRR772393 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772394 1 0.0376 0.94528 0.996 0.004
#> SRR772395 2 0.7950 0.71514 0.240 0.760
#> SRR772396 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772402 1 0.4815 0.87772 0.896 0.104
#> SRR772403 1 0.7883 0.71324 0.764 0.236
#> SRR772404 1 0.0376 0.94523 0.996 0.004
#> SRR772405 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772406 1 0.6623 0.80370 0.828 0.172
#> SRR772407 1 0.1414 0.93914 0.980 0.020
#> SRR772408 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772410 1 0.4431 0.88730 0.908 0.092
#> SRR772411 1 0.6801 0.79126 0.820 0.180
#> SRR772412 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772415 1 0.2603 0.92507 0.956 0.044
#> SRR772416 1 0.1414 0.93904 0.980 0.020
#> SRR772417 1 0.3733 0.90416 0.928 0.072
#> SRR772418 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772421 1 0.0938 0.94261 0.988 0.012
#> SRR772422 1 0.5408 0.84877 0.876 0.124
#> SRR772423 1 0.6048 0.83272 0.852 0.148
#> SRR772424 1 0.9323 0.50197 0.652 0.348
#> SRR772425 2 0.1843 0.91320 0.028 0.972
#> SRR772426 2 0.3584 0.89075 0.068 0.932
#> SRR772427 2 0.2423 0.90672 0.040 0.960
#> SRR772428 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772430 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772431 1 0.4161 0.89470 0.916 0.084
#> SRR772432 1 0.3114 0.91787 0.944 0.056
#> SRR772433 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772436 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772437 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772440 1 0.1633 0.93719 0.976 0.024
#> SRR772441 1 0.2043 0.93243 0.968 0.032
#> SRR772442 1 0.9248 0.51441 0.660 0.340
#> SRR772443 1 0.4431 0.88757 0.908 0.092
#> SRR772444 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0672 0.94389 0.992 0.008
#> SRR772447 1 0.1414 0.93876 0.980 0.020
#> SRR772448 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772449 1 0.4161 0.89428 0.916 0.084
#> SRR772450 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0376 0.94525 0.996 0.004
#> SRR772454 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0376 0.94523 0.996 0.004
#> SRR772460 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.4022 0.88417 0.080 0.920
#> SRR772463 2 0.6887 0.78836 0.184 0.816
#> SRR772464 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772465 1 0.9044 0.55792 0.680 0.320
#> SRR772466 1 0.8661 0.61954 0.712 0.288
#> SRR772467 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772470 1 0.2043 0.93227 0.968 0.032
#> SRR772471 1 0.0938 0.94252 0.988 0.012
#> SRR772472 1 0.1414 0.93876 0.980 0.020
#> SRR772473 1 0.6887 0.78616 0.816 0.184
#> SRR772474 1 0.9087 0.55146 0.676 0.324
#> SRR772475 1 0.9977 -0.00538 0.528 0.472
#> SRR772476 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772480 1 0.3114 0.91635 0.944 0.056
#> SRR772481 1 0.1414 0.93871 0.980 0.020
#> SRR772482 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772484 2 0.9129 0.57181 0.328 0.672
#> SRR772485 2 0.9209 0.54052 0.336 0.664
#> SRR772486 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.9635 0.40993 0.388 0.612
#> SRR772489 1 0.9922 0.18062 0.552 0.448
#> SRR772490 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772496 1 0.8327 0.66264 0.736 0.264
#> SRR772497 1 0.6148 0.82798 0.848 0.152
#> SRR772498 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772499 1 0.0938 0.94217 0.988 0.012
#> SRR772500 2 0.0938 0.91814 0.012 0.988
#> SRR772501 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.1184 0.94086 0.984 0.016
#> SRR772503 1 0.0376 0.94523 0.996 0.004
#> SRR772504 2 0.2043 0.91112 0.032 0.968
#> SRR772505 2 0.1184 0.91724 0.016 0.984
#> SRR772506 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772508 1 0.9635 0.31307 0.612 0.388
#> SRR772509 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772510 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772511 1 0.3879 0.90176 0.924 0.076
#> SRR772512 2 0.9815 0.37547 0.420 0.580
#> SRR772513 1 0.2043 0.93381 0.968 0.032
#> SRR772514 2 0.9775 0.31639 0.412 0.588
#> SRR772515 2 0.0672 0.91915 0.008 0.992
#> SRR772516 2 0.1184 0.91734 0.016 0.984
#> SRR772517 1 0.9170 0.52568 0.668 0.332
#> SRR772518 1 0.1184 0.94105 0.984 0.016
#> SRR772519 2 0.0938 0.91831 0.012 0.988
#> SRR772520 2 0.0376 0.91963 0.004 0.996
#> SRR772521 1 0.6531 0.80639 0.832 0.168
#> SRR772522 1 0.4161 0.89428 0.916 0.084
#> SRR772523 2 0.1843 0.91203 0.028 0.972
#> SRR772524 2 0.3114 0.89946 0.056 0.944
#> SRR772525 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0672 0.91910 0.008 0.992
#> SRR772533 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.2236 0.92982 0.964 0.036
#> SRR772535 1 0.7602 0.73744 0.780 0.220
#> SRR772536 2 0.9209 0.52825 0.336 0.664
#> SRR772537 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772541 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0376 0.94525 0.996 0.004
#> SRR772546 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772547 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772548 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772551 1 0.1414 0.93876 0.980 0.020
#> SRR772552 1 0.2948 0.91975 0.948 0.052
#> SRR772553 1 0.6048 0.80785 0.852 0.148
#> SRR772554 2 0.0376 0.91963 0.004 0.996
#> SRR772555 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772560 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772561 1 0.6887 0.75620 0.816 0.184
#> SRR772562 2 0.6048 0.82910 0.148 0.852
#> SRR772563 2 0.1843 0.91297 0.028 0.972
#> SRR772564 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.7883 0.72362 0.236 0.764
#> SRR772569 2 0.0672 0.91893 0.008 0.992
#> SRR772570 1 0.0376 0.94523 0.996 0.004
#> SRR772571 1 0.0938 0.94252 0.988 0.012
#> SRR772572 1 0.3879 0.90125 0.924 0.076
#> SRR772573 1 0.4562 0.88459 0.904 0.096
#> SRR772574 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772576 1 0.3431 0.91141 0.936 0.064
#> SRR772577 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772578 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.1184 0.91617 0.016 0.984
#> SRR772580 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772581 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772582 1 0.1414 0.93871 0.980 0.020
#> SRR772583 1 0.2948 0.91930 0.948 0.052
#> SRR772584 1 0.1184 0.94073 0.984 0.016
#> SRR772585 1 0.0938 0.94269 0.988 0.012
#> SRR772586 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.0672 0.94401 0.992 0.008
#> SRR772588 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.5294 0.85082 0.120 0.880
#> SRR772595 2 0.1184 0.91717 0.016 0.984
#> SRR772596 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772600 1 0.4022 0.89934 0.920 0.080
#> SRR772601 1 0.0938 0.94241 0.988 0.012
#> SRR772602 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772603 1 0.3431 0.91057 0.936 0.064
#> SRR772604 1 0.1633 0.93684 0.976 0.024
#> SRR772605 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772606 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772608 1 0.6343 0.81755 0.840 0.160
#> SRR772609 1 0.4562 0.88344 0.904 0.096
#> SRR772610 1 0.9732 0.32390 0.596 0.404
#> SRR772611 1 0.9608 0.37202 0.616 0.384
#> SRR772612 2 0.7602 0.73086 0.220 0.780
#> SRR772613 1 0.9815 0.30231 0.580 0.420
#> SRR772614 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.3431 0.91030 0.936 0.064
#> SRR772617 2 0.3114 0.89692 0.056 0.944
#> SRR772618 2 0.4022 0.88350 0.080 0.920
#> SRR772619 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772621 1 0.5629 0.84467 0.868 0.132
#> SRR772622 1 0.2043 0.93244 0.968 0.032
#> SRR772623 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.6343 0.81705 0.160 0.840
#> SRR772626 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772627 1 0.0376 0.94507 0.996 0.004
#> SRR772628 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.1414 0.93893 0.980 0.020
#> SRR772630 1 0.5178 0.86526 0.884 0.116
#> SRR772631 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772635 1 0.0938 0.94239 0.988 0.012
#> SRR772636 2 0.7219 0.77544 0.200 0.800
#> SRR772637 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.8207 0.68327 0.256 0.744
#> SRR772640 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772642 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772643 1 0.6973 0.75241 0.812 0.188
#> SRR772644 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772646 2 0.1414 0.91581 0.020 0.980
#> SRR772647 2 0.4939 0.86314 0.108 0.892
#> SRR772648 2 0.7528 0.74034 0.216 0.784
#> SRR772649 1 0.9552 0.43206 0.624 0.376
#> SRR772650 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772654 1 0.3274 0.91414 0.940 0.060
#> SRR772655 1 0.7528 0.74431 0.784 0.216
#> SRR772656 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772660 1 0.0376 0.94523 0.996 0.004
#> SRR772661 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772662 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772663 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772664 2 0.3431 0.89332 0.064 0.936
#> SRR772665 2 0.6712 0.79044 0.176 0.824
#> SRR772666 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772667 1 0.4022 0.89947 0.920 0.080
#> SRR772668 1 0.0376 0.94521 0.996 0.004
#> SRR772669 1 0.2778 0.92217 0.952 0.048
#> SRR772670 1 0.0938 0.94268 0.988 0.012
#> SRR772671 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772672 1 0.6048 0.83335 0.852 0.148
#> SRR772673 1 0.2778 0.92216 0.952 0.048
#> SRR772674 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772676 1 0.9775 0.32839 0.588 0.412
#> SRR772677 1 0.6438 0.81059 0.836 0.164
#> SRR772678 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772679 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772680 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772681 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.5178 0.85555 0.116 0.884
#> SRR772683 2 0.6887 0.78197 0.184 0.816
#> SRR772685 1 0.8207 0.66120 0.744 0.256
#> SRR772686 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.92007 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.9850 0.35234 0.428 0.572
#> SRR772692 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772693 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772694 1 0.3879 0.90236 0.924 0.076
#> SRR772695 1 0.1184 0.94063 0.984 0.016
#> SRR772696 1 0.1633 0.93747 0.976 0.024
#> SRR772697 1 0.1633 0.93726 0.976 0.024
#> SRR772698 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.94639 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0747 0.9155 0.984 0.000 0.016
#> SRR772344 2 0.0592 0.8372 0.012 0.988 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 1 0.0237 0.9200 0.996 0.000 0.004
#> SRR772347 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772348 1 0.3120 0.8650 0.908 0.080 0.012
#> SRR772349 1 0.6126 0.2849 0.600 0.400 0.000
#> SRR772350 3 0.0592 0.9034 0.012 0.000 0.988
#> SRR772351 1 0.3941 0.7936 0.844 0.156 0.000
#> SRR772352 1 0.6215 0.1914 0.572 0.428 0.000
#> SRR772353 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772354 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.6587 0.3424 0.424 0.568 0.008
#> SRR772356 2 0.5058 0.6990 0.244 0.756 0.000
#> SRR772357 1 0.0424 0.9187 0.992 0.000 0.008
#> SRR772358 1 0.2448 0.8753 0.924 0.000 0.076
#> SRR772359 1 0.1289 0.9069 0.968 0.000 0.032
#> SRR772360 1 0.0237 0.9198 0.996 0.000 0.004
#> SRR772361 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.0747 0.9149 0.984 0.000 0.016
#> SRR772365 1 0.2625 0.8695 0.916 0.000 0.084
#> SRR772366 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 3 0.5733 0.5166 0.324 0.000 0.676
#> SRR772369 1 0.0892 0.9120 0.980 0.020 0.000
#> SRR772370 1 0.0237 0.9197 0.996 0.004 0.000
#> SRR772371 1 0.5291 0.6290 0.732 0.000 0.268
#> SRR772372 1 0.5216 0.6439 0.740 0.000 0.260
#> SRR772373 2 0.5621 0.6258 0.308 0.692 0.000
#> SRR772374 2 0.4796 0.7244 0.220 0.780 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772377 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772378 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772379 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772380 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772384 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772385 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772386 1 0.6505 -0.0377 0.528 0.468 0.004
#> SRR772387 2 0.2959 0.8055 0.100 0.900 0.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772393 3 0.5178 0.6184 0.256 0.000 0.744
#> SRR772394 3 0.6565 0.3084 0.416 0.008 0.576
#> SRR772395 2 0.5835 0.5736 0.340 0.660 0.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.3752 0.8134 0.856 0.000 0.144
#> SRR772399 1 0.2550 0.8858 0.932 0.012 0.056
#> SRR772400 1 0.5138 0.6622 0.748 0.000 0.252
#> SRR772401 1 0.3192 0.8480 0.888 0.000 0.112
#> SRR772402 1 0.0237 0.9198 0.996 0.004 0.000
#> SRR772403 1 0.3551 0.8143 0.868 0.132 0.000
#> SRR772404 3 0.7389 0.0965 0.464 0.032 0.504
#> SRR772405 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772406 1 0.2945 0.8605 0.908 0.088 0.004
#> SRR772407 1 0.2680 0.8763 0.924 0.068 0.008
#> SRR772408 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 1 0.0237 0.9197 0.996 0.004 0.000
#> SRR772411 1 0.1031 0.9099 0.976 0.024 0.000
#> SRR772412 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772416 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772417 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772418 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 1 0.3695 0.8314 0.880 0.108 0.012
#> SRR772422 1 0.6819 -0.1011 0.512 0.476 0.012
#> SRR772423 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772424 1 0.3500 0.8357 0.880 0.116 0.004
#> SRR772425 2 0.3116 0.8019 0.108 0.892 0.000
#> SRR772426 2 0.4235 0.7515 0.176 0.824 0.000
#> SRR772427 2 0.3551 0.7834 0.132 0.868 0.000
#> SRR772428 1 0.1031 0.9117 0.976 0.000 0.024
#> SRR772429 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772430 1 0.5058 0.6766 0.756 0.000 0.244
#> SRR772431 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772432 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772433 1 0.0424 0.9186 0.992 0.000 0.008
#> SRR772434 1 0.0592 0.9170 0.988 0.000 0.012
#> SRR772435 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772436 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772438 1 0.2537 0.8726 0.920 0.000 0.080
#> SRR772439 1 0.1411 0.9036 0.964 0.000 0.036
#> SRR772440 1 0.0592 0.9162 0.988 0.012 0.000
#> SRR772441 1 0.0592 0.9162 0.988 0.012 0.000
#> SRR772442 1 0.1289 0.9059 0.968 0.032 0.000
#> SRR772443 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772448 1 0.3038 0.8516 0.896 0.000 0.104
#> SRR772449 1 0.6685 0.6012 0.708 0.244 0.048
#> SRR772450 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.6008 0.5070 0.372 0.628 0.000
#> SRR772463 2 0.6192 0.3966 0.420 0.580 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772466 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772467 2 0.0237 0.8377 0.004 0.996 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.0592 0.9169 0.988 0.000 0.012
#> SRR772472 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772473 1 0.3116 0.8409 0.892 0.108 0.000
#> SRR772474 1 0.1163 0.9077 0.972 0.028 0.000
#> SRR772475 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0237 0.9199 0.996 0.000 0.004
#> SRR772479 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772480 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772481 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772482 3 0.5835 0.4783 0.340 0.000 0.660
#> SRR772483 3 0.6095 0.3546 0.392 0.000 0.608
#> SRR772484 1 0.6235 0.1092 0.564 0.436 0.000
#> SRR772485 1 0.5859 0.4118 0.656 0.344 0.000
#> SRR772486 1 0.5905 0.4521 0.648 0.000 0.352
#> SRR772487 3 0.6180 0.3107 0.416 0.000 0.584
#> SRR772488 1 0.5835 0.4232 0.660 0.340 0.000
#> SRR772489 1 0.3340 0.8244 0.880 0.120 0.000
#> SRR772490 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 1 0.4399 0.7397 0.812 0.188 0.000
#> SRR772497 1 0.3619 0.8099 0.864 0.136 0.000
#> SRR772498 3 0.0424 0.9069 0.008 0.000 0.992
#> SRR772499 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.2356 0.8175 0.072 0.928 0.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 1 0.1878 0.8977 0.952 0.004 0.044
#> SRR772503 1 0.0424 0.9187 0.992 0.000 0.008
#> SRR772504 2 0.1643 0.8300 0.044 0.956 0.000
#> SRR772505 2 0.0747 0.8366 0.016 0.984 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.7174 0.2575 0.460 0.516 0.024
#> SRR772509 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772510 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 1 0.0983 0.9137 0.980 0.016 0.004
#> SRR772512 3 0.1289 0.8861 0.000 0.032 0.968
#> SRR772513 1 0.1585 0.9045 0.964 0.028 0.008
#> SRR772514 1 0.4605 0.7205 0.796 0.204 0.000
#> SRR772515 2 0.5058 0.7048 0.244 0.756 0.000
#> SRR772516 2 0.3752 0.7807 0.144 0.856 0.000
#> SRR772517 1 0.2066 0.8832 0.940 0.060 0.000
#> SRR772518 1 0.1411 0.9017 0.964 0.036 0.000
#> SRR772519 2 0.5178 0.6932 0.256 0.744 0.000
#> SRR772520 2 0.3686 0.7836 0.140 0.860 0.000
#> SRR772521 1 0.2959 0.8499 0.900 0.100 0.000
#> SRR772522 1 0.1267 0.9088 0.972 0.024 0.004
#> SRR772523 2 0.6274 0.2429 0.456 0.544 0.000
#> SRR772524 2 0.6215 0.3574 0.428 0.572 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 2 0.2165 0.8211 0.064 0.936 0.000
#> SRR772533 2 0.2711 0.8115 0.088 0.912 0.000
#> SRR772534 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772535 1 0.3038 0.8474 0.896 0.104 0.000
#> SRR772536 2 0.6140 0.4186 0.404 0.596 0.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772539 1 0.0237 0.9200 0.996 0.000 0.004
#> SRR772540 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772541 1 0.5216 0.6499 0.740 0.000 0.260
#> SRR772542 1 0.5621 0.5707 0.692 0.000 0.308
#> SRR772543 1 0.1529 0.9008 0.960 0.000 0.040
#> SRR772544 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772547 1 0.0424 0.9187 0.992 0.000 0.008
#> SRR772548 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0424 0.9185 0.992 0.000 0.008
#> SRR772550 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772551 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772552 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772553 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772554 2 0.2165 0.8227 0.064 0.936 0.000
#> SRR772555 2 0.1289 0.8332 0.032 0.968 0.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772560 1 0.1163 0.9090 0.972 0.000 0.028
#> SRR772561 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772562 1 0.6305 -0.0839 0.516 0.484 0.000
#> SRR772563 2 0.4887 0.7202 0.228 0.772 0.000
#> SRR772564 1 0.5327 0.6303 0.728 0.000 0.272
#> SRR772565 1 0.1529 0.9021 0.960 0.000 0.040
#> SRR772566 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772568 2 0.4931 0.7144 0.232 0.768 0.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772570 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772572 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772573 1 0.0237 0.9197 0.996 0.004 0.000
#> SRR772574 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772576 1 0.0237 0.9198 0.996 0.004 0.000
#> SRR772577 1 0.0237 0.9200 0.996 0.000 0.004
#> SRR772578 2 0.1163 0.8241 0.000 0.972 0.028
#> SRR772579 2 0.4346 0.6821 0.000 0.816 0.184
#> SRR772580 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.0237 0.9198 0.996 0.000 0.004
#> SRR772582 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772583 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772584 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772585 1 0.0424 0.9189 0.992 0.000 0.008
#> SRR772586 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772587 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772588 2 0.0424 0.8377 0.008 0.992 0.000
#> SRR772589 2 0.1964 0.8256 0.056 0.944 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772593 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772594 2 0.2845 0.8096 0.068 0.920 0.012
#> SRR772595 2 0.1031 0.8257 0.000 0.976 0.024
#> SRR772596 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 1 0.4399 0.7660 0.812 0.000 0.188
#> SRR772599 1 0.1964 0.8928 0.944 0.000 0.056
#> SRR772600 1 0.0424 0.9183 0.992 0.008 0.000
#> SRR772601 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772602 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772603 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772604 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772605 1 0.5835 0.4905 0.660 0.000 0.340
#> SRR772606 1 0.1753 0.8986 0.952 0.000 0.048
#> SRR772607 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772608 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772609 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772610 1 0.4654 0.7027 0.792 0.208 0.000
#> SRR772611 1 0.6062 0.2988 0.616 0.384 0.000
#> SRR772612 1 0.6215 0.2181 0.572 0.428 0.000
#> SRR772613 1 0.6155 0.4789 0.664 0.328 0.008
#> SRR772614 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772617 1 0.6309 -0.0666 0.504 0.496 0.000
#> SRR772618 1 0.5706 0.5126 0.680 0.320 0.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 1 0.3482 0.8165 0.872 0.128 0.000
#> SRR772622 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772623 3 0.1031 0.8922 0.024 0.000 0.976
#> SRR772624 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772625 3 0.4452 0.7099 0.000 0.192 0.808
#> SRR772626 3 0.3816 0.7548 0.148 0.000 0.852
#> SRR772627 3 0.0661 0.9053 0.008 0.004 0.988
#> SRR772628 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772630 1 0.0237 0.9197 0.996 0.004 0.000
#> SRR772631 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 1 0.2537 0.8770 0.920 0.000 0.080
#> SRR772635 1 0.2902 0.8772 0.920 0.016 0.064
#> SRR772636 3 0.1411 0.8833 0.000 0.036 0.964
#> SRR772637 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772639 1 0.5988 0.3573 0.632 0.368 0.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.4723 0.7871 0.824 0.016 0.160
#> SRR772643 2 0.9714 0.3387 0.324 0.440 0.236
#> SRR772644 1 0.1964 0.8911 0.944 0.000 0.056
#> SRR772645 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0237 0.8380 0.004 0.996 0.000
#> SRR772647 2 0.4842 0.7184 0.224 0.776 0.000
#> SRR772648 2 0.6192 0.3554 0.420 0.580 0.000
#> SRR772649 2 0.6180 0.3642 0.416 0.584 0.000
#> SRR772650 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0237 0.9199 0.996 0.000 0.004
#> SRR772653 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772654 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772655 1 0.3038 0.8456 0.896 0.104 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 2 0.1289 0.8301 0.032 0.968 0.000
#> SRR772660 1 0.6513 0.0724 0.520 0.004 0.476
#> SRR772661 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772662 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772663 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.5363 0.6639 0.276 0.724 0.000
#> SRR772665 2 0.6126 0.4148 0.400 0.600 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 1 0.3434 0.8626 0.904 0.064 0.032
#> SRR772668 3 0.0661 0.9063 0.004 0.008 0.988
#> SRR772669 1 0.5236 0.7566 0.804 0.028 0.168
#> SRR772670 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772671 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772672 1 0.6380 0.6246 0.732 0.224 0.044
#> SRR772673 1 0.0237 0.9200 0.996 0.000 0.004
#> SRR772674 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772675 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772676 1 0.4931 0.6768 0.768 0.232 0.000
#> SRR772677 1 0.0892 0.9129 0.980 0.020 0.000
#> SRR772678 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772679 1 0.0237 0.9200 0.996 0.000 0.004
#> SRR772680 1 0.0237 0.9200 0.996 0.000 0.004
#> SRR772681 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772682 2 0.5733 0.5935 0.324 0.676 0.000
#> SRR772683 2 0.4654 0.7334 0.208 0.792 0.000
#> SRR772685 2 0.6140 0.4360 0.404 0.596 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.8382 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772692 1 0.1163 0.9096 0.972 0.000 0.028
#> SRR772693 3 0.6813 0.0976 0.468 0.012 0.520
#> SRR772694 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772695 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772696 1 0.6570 0.5249 0.668 0.024 0.308
#> SRR772697 3 0.9471 0.2693 0.308 0.208 0.484
#> SRR772698 3 0.0000 0.9133 0.000 0.000 1.000
#> SRR772699 1 0.4121 0.7936 0.832 0.000 0.168
#> SRR772700 1 0.1964 0.8937 0.944 0.000 0.056
#> SRR772701 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.9210 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.1302 0.8494 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR772342 1 0.2011 0.8351 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR772343 1 0.0188 0.8483 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772344 2 0.1940 0.8544 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772345 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772346 4 0.1474 0.7979 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR772347 4 0.2216 0.8004 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR772348 1 0.2542 0.8189 0.904 0.084 0.000 0.012
#> SRR772349 1 0.4175 0.6972 0.776 0.212 0.000 0.012
#> SRR772350 3 0.2530 0.8187 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR772351 4 0.6873 0.5692 0.160 0.252 0.000 0.588
#> SRR772352 2 0.6958 0.4345 0.184 0.584 0.000 0.232
#> SRR772353 1 0.0336 0.8485 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772354 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.6027 0.6290 0.164 0.700 0.004 0.132
#> SRR772356 2 0.5006 0.7391 0.104 0.772 0.000 0.124
#> SRR772357 1 0.1022 0.8497 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772358 1 0.1637 0.8453 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR772359 1 0.1211 0.8488 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772360 1 0.7090 0.0982 0.508 0.024 0.068 0.400
#> SRR772361 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0188 0.8755 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772363 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 4 0.2999 0.7903 0.132 0.000 0.004 0.864
#> SRR772365 4 0.2342 0.8006 0.080 0.000 0.008 0.912
#> SRR772366 3 0.0188 0.9106 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772368 1 0.3528 0.6990 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR772369 1 0.3077 0.8216 0.892 0.036 0.004 0.068
#> SRR772370 1 0.1929 0.8487 0.940 0.024 0.000 0.036
#> SRR772371 4 0.2329 0.7632 0.012 0.000 0.072 0.916
#> SRR772372 4 0.1302 0.7645 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR772373 2 0.3583 0.7321 0.180 0.816 0.000 0.004
#> SRR772374 2 0.3428 0.7706 0.144 0.844 0.000 0.012
#> SRR772375 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0469 0.8745 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772377 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772378 1 0.1474 0.8456 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR772379 1 0.0921 0.8502 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772380 1 0.1302 0.8485 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR772381 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772382 4 0.4761 0.4572 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR772383 1 0.4040 0.6864 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR772384 3 0.0188 0.9105 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772385 3 0.0336 0.9076 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772386 2 0.6656 0.5083 0.100 0.616 0.008 0.276
#> SRR772387 2 0.1488 0.8658 0.012 0.956 0.000 0.032
#> SRR772388 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772389 1 0.1118 0.8489 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772390 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772392 1 0.0707 0.8495 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772393 3 0.5112 0.2426 0.004 0.000 0.560 0.436
#> SRR772394 4 0.6235 0.2242 0.040 0.008 0.408 0.544
#> SRR772395 2 0.4941 0.2842 0.436 0.564 0.000 0.000
#> SRR772396 1 0.3710 0.7630 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR772397 1 0.1940 0.8386 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR772398 4 0.3439 0.7755 0.048 0.000 0.084 0.868
#> SRR772399 4 0.2669 0.7822 0.032 0.004 0.052 0.912
#> SRR772400 1 0.6362 0.4648 0.616 0.000 0.288 0.096
#> SRR772401 1 0.6890 0.3867 0.580 0.000 0.152 0.268
#> SRR772402 4 0.0469 0.7824 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR772403 4 0.0921 0.7765 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772404 1 0.2483 0.8228 0.916 0.032 0.052 0.000
#> SRR772405 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772406 4 0.4898 0.7647 0.116 0.104 0.000 0.780
#> SRR772407 4 0.3419 0.7959 0.056 0.056 0.008 0.880
#> SRR772408 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772410 1 0.0921 0.8506 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772411 1 0.2965 0.8188 0.892 0.072 0.000 0.036
#> SRR772412 1 0.3942 0.6772 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR772413 1 0.3024 0.7849 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR772414 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772415 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772416 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772417 1 0.4699 0.5590 0.676 0.004 0.000 0.320
#> SRR772418 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772421 4 0.5972 0.7231 0.112 0.148 0.016 0.724
#> SRR772422 4 0.7717 0.1547 0.080 0.408 0.048 0.464
#> SRR772423 4 0.0707 0.7859 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR772424 4 0.2413 0.7831 0.020 0.064 0.000 0.916
#> SRR772425 2 0.1520 0.8678 0.020 0.956 0.000 0.024
#> SRR772426 2 0.2589 0.8110 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR772427 2 0.2473 0.8294 0.080 0.908 0.000 0.012
#> SRR772428 1 0.5250 0.6832 0.744 0.000 0.080 0.176
#> SRR772429 1 0.2198 0.8380 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR772430 1 0.0336 0.8473 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772431 4 0.2973 0.7821 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR772432 4 0.3311 0.7656 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR772433 1 0.5174 0.3787 0.620 0.000 0.012 0.368
#> SRR772434 1 0.2021 0.8474 0.936 0.000 0.024 0.040
#> SRR772435 1 0.3688 0.7229 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR772436 4 0.4972 0.2691 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR772437 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772438 4 0.3176 0.7973 0.084 0.000 0.036 0.880
#> SRR772439 4 0.2363 0.7979 0.056 0.000 0.024 0.920
#> SRR772440 1 0.6263 0.3701 0.576 0.068 0.000 0.356
#> SRR772441 1 0.6316 -0.0455 0.476 0.048 0.004 0.472
#> SRR772442 4 0.2844 0.7972 0.052 0.048 0.000 0.900
#> SRR772443 4 0.2921 0.7860 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR772444 1 0.4382 0.5896 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR772445 1 0.4605 0.5204 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR772446 1 0.0336 0.8485 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772447 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772448 4 0.2908 0.7956 0.064 0.000 0.040 0.896
#> SRR772449 4 0.7359 0.4709 0.116 0.292 0.024 0.568
#> SRR772450 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0188 0.8483 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772453 1 0.0336 0.8485 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772454 1 0.3837 0.6981 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR772455 1 0.1211 0.8491 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772456 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0188 0.8758 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772458 1 0.4898 0.3401 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR772459 1 0.2011 0.8398 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR772460 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0188 0.8758 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772462 1 0.3873 0.6668 0.772 0.228 0.000 0.000
#> SRR772463 1 0.3688 0.6781 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772465 1 0.4513 0.7652 0.804 0.076 0.000 0.120
#> SRR772466 1 0.1820 0.8443 0.944 0.036 0.000 0.020
#> SRR772467 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.2408 0.8249 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR772470 1 0.1118 0.8491 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772471 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772472 1 0.0469 0.8494 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772473 4 0.2741 0.7660 0.012 0.096 0.000 0.892
#> SRR772474 4 0.3312 0.7986 0.072 0.052 0.000 0.876
#> SRR772475 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772476 2 0.0707 0.8724 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772477 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 4 0.1302 0.7983 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR772481 4 0.2011 0.7990 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR772482 3 0.6262 0.1961 0.400 0.000 0.540 0.060
#> SRR772483 1 0.6262 0.2914 0.540 0.000 0.400 0.060
#> SRR772484 1 0.1867 0.8220 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR772485 1 0.0592 0.8478 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772486 4 0.4453 0.5989 0.012 0.000 0.244 0.744
#> SRR772487 3 0.5378 0.1868 0.012 0.000 0.540 0.448
#> SRR772488 1 0.3032 0.7820 0.868 0.124 0.000 0.008
#> SRR772489 1 0.3757 0.7513 0.828 0.152 0.000 0.020
#> SRR772490 4 0.4877 0.3084 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR772491 1 0.3764 0.7351 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR772492 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0188 0.8755 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772495 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 1 0.1452 0.8451 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR772497 1 0.1798 0.8388 0.944 0.040 0.000 0.016
#> SRR772498 3 0.1118 0.8905 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR772499 3 0.1576 0.8809 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR772500 2 0.1004 0.8707 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR772501 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772502 4 0.4468 0.6710 0.232 0.000 0.016 0.752
#> SRR772503 4 0.1743 0.7999 0.056 0.000 0.004 0.940
#> SRR772504 2 0.1716 0.8553 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772505 2 0.1302 0.8667 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772506 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772508 1 0.2081 0.8111 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR772509 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772510 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772511 4 0.5711 0.6783 0.244 0.020 0.036 0.700
#> SRR772512 3 0.0336 0.9079 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR772513 1 0.0188 0.8480 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772514 1 0.0921 0.8440 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR772515 2 0.3550 0.8154 0.044 0.860 0.000 0.096
#> SRR772516 2 0.1854 0.8614 0.012 0.940 0.000 0.048
#> SRR772517 1 0.3554 0.7693 0.844 0.136 0.000 0.020
#> SRR772518 1 0.0336 0.8477 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772519 1 0.5292 0.0930 0.512 0.480 0.000 0.008
#> SRR772520 2 0.2081 0.8341 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR772521 4 0.2111 0.7901 0.024 0.044 0.000 0.932
#> SRR772522 4 0.1362 0.7870 0.020 0.012 0.004 0.964
#> SRR772523 2 0.3479 0.7763 0.012 0.840 0.000 0.148
#> SRR772524 2 0.3946 0.7581 0.020 0.812 0.000 0.168
#> SRR772525 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.4134 0.6782 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR772530 1 0.4941 0.3016 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR772531 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0707 0.8731 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772533 2 0.2021 0.8604 0.012 0.932 0.000 0.056
#> SRR772534 4 0.3688 0.7199 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR772535 4 0.7349 0.2857 0.364 0.164 0.000 0.472
#> SRR772536 2 0.4775 0.7603 0.076 0.784 0.000 0.140
#> SRR772537 2 0.4790 0.4549 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR772538 2 0.3649 0.7225 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR772539 1 0.0592 0.8494 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772540 1 0.1637 0.8407 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR772541 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772542 4 0.4606 0.5721 0.012 0.000 0.264 0.724
#> SRR772543 4 0.6698 0.4282 0.340 0.000 0.104 0.556
#> SRR772544 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772546 1 0.0592 0.8491 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772547 1 0.2714 0.8207 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR772548 1 0.1716 0.8457 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR772549 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772550 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772551 4 0.4222 0.6599 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR772552 1 0.2714 0.8221 0.884 0.004 0.000 0.112
#> SRR772553 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772554 2 0.1388 0.8688 0.012 0.960 0.000 0.028
#> SRR772555 2 0.1004 0.8715 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR772556 1 0.4431 0.5854 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR772557 1 0.3873 0.7042 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR772558 1 0.0707 0.8494 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772559 1 0.1211 0.8493 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772560 1 0.0188 0.8479 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772561 3 0.0188 0.9109 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772562 1 0.4699 0.5123 0.676 0.320 0.000 0.004
#> SRR772563 2 0.4454 0.5538 0.308 0.692 0.000 0.000
#> SRR772564 3 0.6745 -0.0701 0.092 0.000 0.480 0.428
#> SRR772565 4 0.3687 0.7796 0.064 0.000 0.080 0.856
#> SRR772566 1 0.3161 0.8029 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR772567 1 0.1867 0.8425 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR772568 2 0.3858 0.8009 0.056 0.844 0.000 0.100
#> SRR772569 2 0.0188 0.8759 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772570 1 0.0188 0.8483 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772571 1 0.0817 0.8492 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772572 1 0.1489 0.8465 0.952 0.004 0.000 0.044
#> SRR772573 1 0.2222 0.8417 0.924 0.016 0.000 0.060
#> SRR772574 1 0.2868 0.8071 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR772575 1 0.3726 0.7474 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR772576 1 0.6060 0.0326 0.516 0.044 0.000 0.440
#> SRR772577 4 0.5562 0.2159 0.460 0.004 0.012 0.524
#> SRR772578 2 0.4491 0.7595 0.000 0.800 0.060 0.140
#> SRR772579 3 0.6817 0.1400 0.000 0.408 0.492 0.100
#> SRR772580 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772581 4 0.1022 0.7915 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR772582 4 0.1557 0.7975 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR772583 1 0.0921 0.8508 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772584 1 0.0707 0.8505 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772585 1 0.0336 0.8472 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772586 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.4319 0.7050 0.760 0.000 0.012 0.228
#> SRR772588 2 0.0817 0.8704 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR772589 2 0.2868 0.7860 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.1792 0.8443 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR772592 1 0.4907 0.3298 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR772593 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.5558 0.2409 0.000 0.548 0.020 0.432
#> SRR772595 2 0.6621 0.5455 0.000 0.628 0.184 0.188
#> SRR772596 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772598 4 0.7814 0.3775 0.280 0.000 0.304 0.416
#> SRR772599 1 0.3900 0.7896 0.844 0.000 0.084 0.072
#> SRR772600 4 0.2307 0.7986 0.048 0.016 0.008 0.928
#> SRR772601 4 0.1389 0.7972 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR772602 3 0.0336 0.9083 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772603 4 0.4040 0.6946 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR772604 4 0.0921 0.7902 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR772605 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772606 4 0.6447 0.0969 0.448 0.000 0.068 0.484
#> SRR772607 4 0.4933 0.5768 0.296 0.000 0.016 0.688
#> SRR772608 1 0.0188 0.8478 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772609 1 0.0592 0.8505 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772610 1 0.0376 0.8478 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772611 1 0.0657 0.8465 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR772612 4 0.1940 0.7565 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR772613 4 0.1389 0.7722 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR772614 1 0.4804 0.4491 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR772615 1 0.2408 0.8292 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR772616 1 0.2408 0.8271 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR772617 4 0.3311 0.7041 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772618 4 0.3123 0.7054 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR772619 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0707 0.8724 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772621 1 0.6901 0.1609 0.488 0.404 0.000 0.108
#> SRR772622 1 0.5271 0.5193 0.656 0.024 0.000 0.320
#> SRR772623 3 0.4103 0.6369 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR772624 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772625 3 0.2345 0.8224 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR772626 3 0.4356 0.5838 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR772627 3 0.5004 0.4091 0.000 0.004 0.604 0.392
#> SRR772628 1 0.4866 0.4063 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR772629 4 0.3074 0.7717 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR772630 1 0.4978 0.5616 0.664 0.012 0.000 0.324
#> SRR772631 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0188 0.8759 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772634 1 0.6813 0.1939 0.516 0.000 0.104 0.380
#> SRR772635 4 0.6959 0.4737 0.328 0.044 0.048 0.580
#> SRR772636 3 0.0592 0.9012 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.5705 0.6273 0.204 0.704 0.000 0.092
#> SRR772640 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 1 0.4782 0.7448 0.804 0.032 0.132 0.032
#> SRR772643 2 0.8172 0.1720 0.380 0.440 0.140 0.040
#> SRR772644 1 0.0817 0.8494 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772645 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772646 2 0.0188 0.8758 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772647 2 0.2814 0.8002 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR772648 2 0.4775 0.6623 0.028 0.740 0.000 0.232
#> SRR772649 2 0.4781 0.5082 0.004 0.660 0.000 0.336
#> SRR772650 1 0.0707 0.8494 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772651 1 0.0707 0.8499 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772652 4 0.4996 0.1386 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR772653 4 0.4123 0.7350 0.220 0.000 0.008 0.772
#> SRR772654 1 0.5558 0.2676 0.548 0.020 0.000 0.432
#> SRR772655 4 0.6197 0.4346 0.072 0.324 0.000 0.604
#> SRR772656 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.2530 0.8348 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR772659 4 0.4776 0.3680 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR772660 1 0.1520 0.8438 0.956 0.024 0.020 0.000
#> SRR772661 3 0.0336 0.9076 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772662 1 0.3123 0.7786 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR772663 1 0.1118 0.8498 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772664 1 0.5155 0.1392 0.528 0.468 0.000 0.004
#> SRR772665 1 0.5659 0.3985 0.600 0.368 0.000 0.032
#> SRR772666 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772667 1 0.0657 0.8476 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR772668 3 0.4961 0.2608 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR772669 4 0.3568 0.7721 0.052 0.008 0.068 0.872
#> SRR772670 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772671 1 0.0336 0.8485 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772672 1 0.0804 0.8501 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR772673 1 0.0469 0.8486 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772674 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772675 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772676 4 0.6426 0.5741 0.108 0.272 0.000 0.620
#> SRR772677 4 0.5483 0.7426 0.128 0.136 0.000 0.736
#> SRR772678 3 0.0188 0.9105 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772679 1 0.0000 0.8470 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772680 1 0.0817 0.8503 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772681 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.4422 0.6170 0.256 0.736 0.000 0.008
#> SRR772683 2 0.5040 0.4049 0.364 0.628 0.000 0.008
#> SRR772685 2 0.6696 0.4929 0.124 0.616 0.004 0.256
#> SRR772686 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772687 3 0.2081 0.8290 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR772688 2 0.0188 0.8759 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.8764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772691 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772692 4 0.2908 0.7968 0.064 0.000 0.040 0.896
#> SRR772693 3 0.7811 0.1677 0.344 0.020 0.484 0.152
#> SRR772694 1 0.2737 0.8248 0.888 0.008 0.000 0.104
#> SRR772695 1 0.1940 0.8408 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR772696 4 0.3764 0.6688 0.000 0.012 0.172 0.816
#> SRR772697 4 0.6338 0.4025 0.000 0.084 0.316 0.600
#> SRR772698 3 0.0000 0.9132 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.4037 0.7582 0.824 0.000 0.136 0.040
#> SRR772700 1 0.7113 0.3273 0.552 0.000 0.172 0.276
#> SRR772701 1 0.2704 0.8117 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR772702 1 0.4804 0.3961 0.616 0.000 0.000 0.384
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.1638 0.67530 0.932 0.064 0.000 0.000 0.004
#> SRR772342 1 0.1893 0.67563 0.928 0.024 0.000 0.000 0.048
#> SRR772343 1 0.3067 0.64700 0.844 0.012 0.004 0.000 0.140
#> SRR772344 4 0.2522 0.82364 0.004 0.076 0.000 0.896 0.024
#> SRR772345 4 0.0324 0.85910 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772346 2 0.3670 0.61330 0.020 0.796 0.004 0.000 0.180
#> SRR772347 2 0.2797 0.60610 0.060 0.880 0.000 0.000 0.060
#> SRR772348 1 0.6285 -0.31409 0.452 0.004 0.004 0.112 0.428
#> SRR772349 1 0.6776 -0.10382 0.444 0.008 0.000 0.344 0.204
#> SRR772350 3 0.3575 0.75217 0.000 0.120 0.824 0.000 0.056
#> SRR772351 2 0.6765 0.37362 0.088 0.520 0.000 0.332 0.060
#> SRR772352 4 0.7128 0.25194 0.036 0.232 0.000 0.496 0.236
#> SRR772353 1 0.0404 0.67294 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772354 1 0.0880 0.67171 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772355 4 0.6611 0.60082 0.104 0.148 0.032 0.660 0.056
#> SRR772356 4 0.5409 0.65703 0.060 0.184 0.000 0.708 0.048
#> SRR772357 1 0.1300 0.67890 0.956 0.016 0.000 0.000 0.028
#> SRR772358 1 0.4649 0.50205 0.716 0.064 0.000 0.000 0.220
#> SRR772359 1 0.3113 0.67277 0.872 0.048 0.000 0.012 0.068
#> SRR772360 1 0.6882 0.35030 0.624 0.092 0.120 0.012 0.152
#> SRR772361 3 0.0963 0.85161 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772362 4 0.0162 0.85876 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772363 4 0.0162 0.85876 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772364 2 0.4717 0.56792 0.124 0.768 0.024 0.000 0.084
#> SRR772365 2 0.3204 0.61920 0.032 0.872 0.032 0.000 0.064
#> SRR772366 3 0.3582 0.73428 0.008 0.000 0.768 0.000 0.224
#> SRR772367 3 0.0000 0.85449 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772368 1 0.5013 0.33308 0.680 0.000 0.240 0.000 0.080
#> SRR772369 1 0.6297 0.31331 0.616 0.060 0.000 0.080 0.244
#> SRR772370 1 0.4604 0.53912 0.764 0.040 0.000 0.164 0.032
#> SRR772371 2 0.2833 0.57329 0.004 0.852 0.004 0.000 0.140
#> SRR772372 2 0.2660 0.59488 0.000 0.864 0.008 0.000 0.128
#> SRR772373 4 0.3766 0.56953 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR772374 4 0.2488 0.78223 0.124 0.004 0.000 0.872 0.000
#> SRR772375 3 0.0162 0.85475 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772376 4 0.0703 0.85824 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR772377 3 0.1671 0.84842 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772378 1 0.1408 0.67523 0.948 0.008 0.000 0.000 0.044
#> SRR772379 1 0.3700 0.53668 0.752 0.008 0.000 0.000 0.240
#> SRR772380 1 0.3789 0.56019 0.760 0.016 0.000 0.000 0.224
#> SRR772381 3 0.1197 0.84948 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772382 2 0.5068 0.05558 0.388 0.572 0.000 0.000 0.040
#> SRR772383 1 0.4329 0.46137 0.716 0.252 0.000 0.000 0.032
#> SRR772384 3 0.1792 0.84784 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772385 3 0.2233 0.84004 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104
#> SRR772386 4 0.6510 0.59243 0.076 0.144 0.004 0.644 0.132
#> SRR772387 4 0.2086 0.84508 0.016 0.028 0.000 0.928 0.028
#> SRR772388 1 0.3013 0.62484 0.832 0.008 0.000 0.000 0.160
#> SRR772389 1 0.2900 0.66068 0.864 0.028 0.000 0.000 0.108
#> SRR772390 3 0.1671 0.84842 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772391 1 0.0955 0.67747 0.968 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR772392 1 0.1952 0.66186 0.912 0.004 0.000 0.000 0.084
#> SRR772393 2 0.5503 0.43682 0.004 0.632 0.272 0.000 0.092
#> SRR772394 2 0.5335 0.53671 0.012 0.704 0.184 0.004 0.096
#> SRR772395 1 0.4846 0.23268 0.612 0.004 0.000 0.360 0.024
#> SRR772396 1 0.5809 0.37922 0.640 0.188 0.008 0.000 0.164
#> SRR772397 1 0.3338 0.66093 0.852 0.076 0.004 0.000 0.068
#> SRR772398 2 0.3062 0.59637 0.004 0.868 0.080 0.000 0.048
#> SRR772399 2 0.4307 0.59471 0.008 0.800 0.104 0.008 0.080
#> SRR772400 5 0.8083 0.57747 0.236 0.148 0.188 0.000 0.428
#> SRR772401 5 0.7972 0.53545 0.212 0.248 0.112 0.000 0.428
#> SRR772402 2 0.2392 0.61274 0.004 0.888 0.000 0.004 0.104
#> SRR772403 2 0.3412 0.61293 0.000 0.820 0.000 0.028 0.152
#> SRR772404 1 0.3947 0.62392 0.828 0.004 0.096 0.020 0.052
#> SRR772405 3 0.2179 0.84137 0.004 0.000 0.896 0.000 0.100
#> SRR772406 2 0.5910 0.57824 0.068 0.704 0.008 0.128 0.092
#> SRR772407 2 0.6671 0.56257 0.028 0.624 0.040 0.092 0.216
#> SRR772408 4 0.0451 0.85837 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772409 4 0.0290 0.85865 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772410 1 0.5713 0.06371 0.560 0.044 0.000 0.024 0.372
#> SRR772411 1 0.7033 -0.17470 0.492 0.084 0.000 0.084 0.340
#> SRR772412 1 0.3276 0.62620 0.836 0.032 0.000 0.000 0.132
#> SRR772413 1 0.2554 0.66754 0.892 0.036 0.000 0.000 0.072
#> SRR772414 3 0.1357 0.84776 0.000 0.004 0.948 0.000 0.048
#> SRR772415 1 0.0609 0.67542 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772416 1 0.1357 0.67317 0.948 0.004 0.000 0.000 0.048
#> SRR772417 2 0.6558 -0.24206 0.232 0.468 0.000 0.000 0.300
#> SRR772418 3 0.2127 0.83976 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772419 4 0.0162 0.85876 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772420 4 0.0290 0.85865 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772421 2 0.9186 0.27560 0.136 0.384 0.096 0.252 0.132
#> SRR772422 4 0.9204 -0.06278 0.056 0.232 0.164 0.356 0.192
#> SRR772423 2 0.2179 0.61022 0.004 0.896 0.000 0.000 0.100
#> SRR772424 2 0.3936 0.61596 0.004 0.800 0.000 0.052 0.144
#> SRR772425 4 0.2362 0.84253 0.024 0.028 0.000 0.916 0.032
#> SRR772426 4 0.1638 0.83323 0.064 0.004 0.000 0.932 0.000
#> SRR772427 4 0.1697 0.83592 0.060 0.008 0.000 0.932 0.000
#> SRR772428 1 0.6443 0.32940 0.636 0.176 0.084 0.000 0.104
#> SRR772429 1 0.4252 0.61489 0.784 0.064 0.008 0.000 0.144
#> SRR772430 1 0.2125 0.67258 0.920 0.004 0.024 0.000 0.052
#> SRR772431 2 0.6679 0.31475 0.244 0.476 0.000 0.004 0.276
#> SRR772432 2 0.6547 0.36325 0.208 0.500 0.004 0.000 0.288
#> SRR772433 1 0.5841 0.35700 0.640 0.236 0.020 0.000 0.104
#> SRR772434 1 0.4258 0.62705 0.788 0.076 0.008 0.000 0.128
#> SRR772435 1 0.3831 0.61279 0.812 0.044 0.008 0.000 0.136
#> SRR772436 1 0.5729 0.30001 0.616 0.236 0.000 0.000 0.148
#> SRR772437 3 0.1892 0.83488 0.000 0.004 0.916 0.000 0.080
#> SRR772438 2 0.5150 0.40439 0.028 0.652 0.024 0.000 0.296
#> SRR772439 2 0.2472 0.60593 0.020 0.908 0.020 0.000 0.052
#> SRR772440 1 0.5885 0.37815 0.652 0.204 0.000 0.024 0.120
#> SRR772441 1 0.7133 0.09711 0.524 0.260 0.004 0.044 0.168
#> SRR772442 2 0.6233 0.55307 0.048 0.612 0.000 0.084 0.256
#> SRR772443 2 0.4702 0.55948 0.128 0.748 0.000 0.004 0.120
#> SRR772444 1 0.4054 0.52404 0.760 0.204 0.000 0.000 0.036
#> SRR772445 1 0.4068 0.59768 0.792 0.144 0.004 0.000 0.060
#> SRR772446 1 0.1270 0.67009 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772447 1 0.1478 0.66757 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772448 2 0.4595 0.60005 0.036 0.792 0.068 0.004 0.100
#> SRR772449 2 0.7682 0.32228 0.036 0.448 0.024 0.320 0.172
#> SRR772450 4 0.0162 0.85876 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772451 4 0.0162 0.85882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772452 1 0.3242 0.57735 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR772453 1 0.3074 0.59089 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR772454 1 0.3336 0.63507 0.844 0.060 0.000 0.000 0.096
#> SRR772455 1 0.3789 0.57630 0.768 0.020 0.000 0.000 0.212
#> SRR772456 4 0.0162 0.85882 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772457 4 0.0703 0.85649 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR772458 2 0.5218 0.05089 0.336 0.604 0.000 0.000 0.060
#> SRR772459 1 0.6311 -0.15541 0.504 0.176 0.000 0.000 0.320
#> SRR772460 4 0.0162 0.85911 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772461 4 0.0290 0.85904 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772462 1 0.4086 0.39791 0.704 0.000 0.000 0.284 0.012
#> SRR772463 1 0.3266 0.54411 0.796 0.000 0.000 0.200 0.004
#> SRR772464 3 0.0703 0.85329 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772465 1 0.7420 -0.03610 0.484 0.228 0.000 0.228 0.060
#> SRR772466 1 0.6296 0.38303 0.644 0.056 0.000 0.160 0.140
#> SRR772467 4 0.0324 0.85885 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772468 4 0.0162 0.85883 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772469 1 0.6153 -0.27930 0.484 0.136 0.000 0.000 0.380
#> SRR772470 1 0.4419 0.38434 0.668 0.020 0.000 0.000 0.312
#> SRR772471 1 0.3508 0.52402 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR772472 1 0.3790 0.49982 0.724 0.004 0.000 0.000 0.272
#> SRR772473 2 0.5077 0.59570 0.012 0.724 0.000 0.108 0.156
#> SRR772474 2 0.5749 0.58494 0.080 0.692 0.000 0.060 0.168
#> SRR772475 3 0.2690 0.81467 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR772476 4 0.1430 0.84715 0.000 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR772477 4 0.0290 0.85827 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772478 1 0.1121 0.67426 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772479 1 0.0703 0.67310 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772480 2 0.2740 0.61578 0.028 0.876 0.000 0.000 0.096
#> SRR772481 2 0.3362 0.60869 0.076 0.844 0.000 0.000 0.080
#> SRR772482 3 0.7977 -0.37516 0.260 0.092 0.396 0.000 0.252
#> SRR772483 5 0.7453 0.53762 0.240 0.048 0.264 0.000 0.448
#> SRR772484 1 0.2928 0.64188 0.872 0.000 0.000 0.064 0.064
#> SRR772485 1 0.1943 0.66796 0.924 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR772486 2 0.6227 0.33091 0.004 0.556 0.168 0.000 0.272
#> SRR772487 2 0.6385 0.30190 0.000 0.504 0.296 0.000 0.200
#> SRR772488 1 0.2388 0.65785 0.900 0.000 0.000 0.072 0.028
#> SRR772489 1 0.3178 0.64522 0.860 0.004 0.000 0.048 0.088
#> SRR772490 2 0.5836 -0.14879 0.448 0.468 0.004 0.000 0.080
#> SRR772491 1 0.5810 0.16585 0.580 0.296 0.000 0.000 0.124
#> SRR772492 4 0.0324 0.85885 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772493 4 0.0324 0.85885 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772494 4 0.0290 0.85827 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.85887 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 1 0.5909 0.33980 0.636 0.012 0.000 0.160 0.192
#> SRR772497 1 0.4356 0.56381 0.748 0.004 0.000 0.044 0.204
#> SRR772498 3 0.6572 0.16719 0.000 0.328 0.452 0.000 0.220
#> SRR772499 3 0.6388 0.38155 0.000 0.240 0.516 0.000 0.244
#> SRR772500 4 0.0613 0.85928 0.004 0.008 0.000 0.984 0.004
#> SRR772501 4 0.0000 0.85887 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 2 0.4839 0.52173 0.124 0.756 0.020 0.000 0.100
#> SRR772503 2 0.3442 0.60178 0.060 0.836 0.000 0.000 0.104
#> SRR772504 4 0.2949 0.81946 0.000 0.068 0.004 0.876 0.052
#> SRR772505 4 0.2549 0.83416 0.004 0.044 0.004 0.904 0.044
#> SRR772506 4 0.0000 0.85887 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 4 0.0000 0.85887 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 1 0.2228 0.66908 0.912 0.000 0.000 0.040 0.048
#> SRR772509 3 0.1671 0.84842 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772510 3 0.1121 0.85021 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772511 2 0.5606 0.48488 0.132 0.712 0.028 0.008 0.120
#> SRR772512 3 0.1638 0.84189 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064
#> SRR772513 1 0.1043 0.67079 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772514 1 0.1485 0.67633 0.948 0.000 0.000 0.020 0.032
#> SRR772515 4 0.4455 0.75528 0.040 0.128 0.000 0.788 0.044
#> SRR772516 4 0.2575 0.83354 0.036 0.044 0.000 0.904 0.016
#> SRR772517 1 0.3635 0.61841 0.824 0.008 0.000 0.036 0.132
#> SRR772518 1 0.2520 0.65670 0.888 0.012 0.000 0.004 0.096
#> SRR772519 4 0.4236 0.41733 0.328 0.004 0.000 0.664 0.004
#> SRR772520 4 0.1341 0.83905 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR772521 2 0.2036 0.61167 0.008 0.928 0.000 0.028 0.036
#> SRR772522 2 0.2692 0.61567 0.004 0.884 0.008 0.008 0.096
#> SRR772523 4 0.3700 0.78601 0.020 0.080 0.000 0.840 0.060
#> SRR772524 4 0.2758 0.82107 0.024 0.076 0.000 0.888 0.012
#> SRR772525 3 0.0000 0.85449 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0000 0.85887 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 4 0.0000 0.85887 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.2416 0.83724 0.012 0.000 0.888 0.000 0.100
#> SRR772529 1 0.5297 0.13151 0.580 0.360 0.000 0.000 0.060
#> SRR772530 2 0.5670 -0.04967 0.388 0.528 0.000 0.000 0.084
#> SRR772531 3 0.0703 0.85440 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772532 4 0.0960 0.85695 0.004 0.016 0.000 0.972 0.008
#> SRR772533 4 0.3184 0.81425 0.012 0.068 0.000 0.868 0.052
#> SRR772534 2 0.3085 0.56143 0.116 0.852 0.000 0.000 0.032
#> SRR772535 2 0.7190 0.35510 0.116 0.560 0.000 0.196 0.128
#> SRR772536 4 0.5481 0.58944 0.008 0.212 0.000 0.668 0.112
#> SRR772537 2 0.5685 0.20304 0.000 0.520 0.000 0.396 0.084
#> SRR772538 4 0.4473 0.48828 0.000 0.324 0.000 0.656 0.020
#> SRR772539 1 0.1282 0.67203 0.952 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR772540 1 0.3455 0.63325 0.844 0.024 0.020 0.000 0.112
#> SRR772541 1 0.1041 0.67621 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772542 2 0.5735 0.45181 0.008 0.648 0.152 0.000 0.192
#> SRR772543 5 0.6906 0.12770 0.068 0.412 0.080 0.000 0.440
#> SRR772544 3 0.1544 0.84203 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772545 1 0.1608 0.67700 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR772546 1 0.0865 0.67556 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR772547 1 0.5837 -0.36174 0.460 0.080 0.004 0.000 0.456
#> SRR772548 5 0.5975 0.42981 0.424 0.084 0.008 0.000 0.484
#> SRR772549 1 0.3039 0.60228 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR772550 1 0.2891 0.60613 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR772551 2 0.5073 0.47781 0.100 0.688 0.000 0.000 0.212
#> SRR772552 5 0.7083 0.57167 0.336 0.268 0.000 0.012 0.384
#> SRR772553 3 0.1792 0.84695 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772554 4 0.1026 0.85641 0.004 0.024 0.000 0.968 0.004
#> SRR772555 4 0.1041 0.85561 0.000 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR772556 1 0.3845 0.61529 0.812 0.060 0.004 0.000 0.124
#> SRR772557 1 0.4057 0.60365 0.792 0.120 0.000 0.000 0.088
#> SRR772558 1 0.2280 0.64879 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR772559 1 0.4642 0.38069 0.660 0.032 0.000 0.000 0.308
#> SRR772560 1 0.2179 0.66069 0.896 0.004 0.000 0.000 0.100
#> SRR772561 3 0.1478 0.84294 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772562 1 0.4677 0.48330 0.732 0.004 0.000 0.196 0.068
#> SRR772563 4 0.4825 0.22829 0.408 0.000 0.000 0.568 0.024
#> SRR772564 3 0.6446 0.16873 0.032 0.356 0.520 0.000 0.092
#> SRR772565 2 0.6534 0.48780 0.056 0.608 0.212 0.000 0.124
#> SRR772566 1 0.5819 0.31381 0.620 0.144 0.004 0.000 0.232
#> SRR772567 1 0.5125 0.48100 0.696 0.148 0.000 0.000 0.156
#> SRR772568 4 0.3498 0.78069 0.024 0.132 0.000 0.832 0.012
#> SRR772569 4 0.0566 0.85836 0.004 0.000 0.000 0.984 0.012
#> SRR772570 1 0.3635 0.53178 0.748 0.004 0.000 0.000 0.248
#> SRR772571 1 0.1124 0.67795 0.960 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR772572 5 0.6108 0.32246 0.444 0.096 0.000 0.008 0.452
#> SRR772573 1 0.7201 -0.24397 0.476 0.144 0.000 0.056 0.324
#> SRR772574 1 0.4767 0.46220 0.720 0.192 0.000 0.000 0.088
#> SRR772575 1 0.4552 0.38438 0.696 0.264 0.000 0.000 0.040
#> SRR772576 1 0.5126 0.52944 0.736 0.048 0.004 0.040 0.172
#> SRR772577 1 0.6001 0.34057 0.632 0.048 0.068 0.000 0.252
#> SRR772578 4 0.5369 0.60440 0.000 0.232 0.036 0.684 0.048
#> SRR772579 4 0.7572 0.32122 0.000 0.208 0.172 0.508 0.112
#> SRR772580 3 0.0162 0.85456 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772581 2 0.1571 0.60598 0.004 0.936 0.000 0.000 0.060
#> SRR772582 2 0.2909 0.61653 0.012 0.848 0.000 0.000 0.140
#> SRR772583 1 0.2969 0.65245 0.852 0.020 0.000 0.000 0.128
#> SRR772584 1 0.2077 0.67515 0.908 0.008 0.000 0.000 0.084
#> SRR772585 1 0.1764 0.67355 0.928 0.008 0.000 0.000 0.064
#> SRR772586 3 0.3305 0.74980 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR772587 5 0.7050 0.42889 0.304 0.336 0.008 0.000 0.352
#> SRR772588 4 0.1357 0.84358 0.048 0.000 0.000 0.948 0.004
#> SRR772589 4 0.3565 0.71245 0.176 0.000 0.000 0.800 0.024
#> SRR772590 3 0.0880 0.85218 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772591 1 0.3569 0.64255 0.828 0.068 0.000 0.000 0.104
#> SRR772592 2 0.6202 -0.04800 0.228 0.552 0.000 0.000 0.220
#> SRR772593 3 0.2605 0.81670 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772594 2 0.6860 0.33526 0.000 0.460 0.016 0.188 0.336
#> SRR772595 4 0.7480 0.16547 0.000 0.284 0.064 0.464 0.188
#> SRR772596 3 0.1341 0.85161 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772597 3 0.0609 0.85380 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772598 1 0.8142 -0.30416 0.364 0.280 0.248 0.000 0.108
#> SRR772599 1 0.7025 0.04003 0.560 0.124 0.084 0.000 0.232
#> SRR772600 2 0.4735 0.56695 0.032 0.668 0.000 0.004 0.296
#> SRR772601 2 0.3766 0.58812 0.004 0.728 0.000 0.000 0.268
#> SRR772602 3 0.2825 0.80189 0.000 0.016 0.860 0.000 0.124
#> SRR772603 2 0.5996 0.25490 0.316 0.548 0.000 0.000 0.136
#> SRR772604 2 0.4197 0.59365 0.028 0.728 0.000 0.000 0.244
#> SRR772605 1 0.2130 0.67506 0.908 0.000 0.012 0.000 0.080
#> SRR772606 2 0.7514 -0.27364 0.188 0.452 0.064 0.000 0.296
#> SRR772607 2 0.6143 0.01428 0.136 0.544 0.004 0.000 0.316
#> SRR772608 1 0.1082 0.67830 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR772609 1 0.0955 0.67612 0.968 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR772610 1 0.2364 0.67598 0.908 0.008 0.000 0.020 0.064
#> SRR772611 1 0.3105 0.64311 0.864 0.004 0.000 0.088 0.044
#> SRR772612 2 0.3012 0.60822 0.000 0.860 0.000 0.036 0.104
#> SRR772613 2 0.3182 0.60952 0.000 0.844 0.000 0.032 0.124
#> SRR772614 1 0.5499 -0.00762 0.532 0.400 0.000 0.000 0.068
#> SRR772615 1 0.6015 0.16374 0.584 0.144 0.004 0.000 0.268
#> SRR772616 5 0.6947 0.55922 0.368 0.216 0.012 0.000 0.404
#> SRR772617 2 0.6305 0.51807 0.020 0.600 0.000 0.204 0.176
#> SRR772618 2 0.6384 0.53651 0.036 0.600 0.000 0.124 0.240
#> SRR772619 4 0.0290 0.85911 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772620 4 0.1502 0.84710 0.000 0.004 0.000 0.940 0.056
#> SRR772621 1 0.7362 0.10605 0.504 0.084 0.004 0.292 0.116
#> SRR772622 1 0.5576 0.48731 0.704 0.164 0.000 0.048 0.084
#> SRR772623 3 0.4946 0.63633 0.000 0.168 0.712 0.000 0.120
#> SRR772624 3 0.2439 0.83188 0.004 0.000 0.876 0.000 0.120
#> SRR772625 3 0.5927 0.37868 0.000 0.000 0.540 0.340 0.120
#> SRR772626 2 0.6288 0.23788 0.000 0.472 0.372 0.000 0.156
#> SRR772627 2 0.5806 0.35498 0.000 0.568 0.332 0.004 0.096
#> SRR772628 2 0.6174 -0.05941 0.236 0.556 0.000 0.000 0.208
#> SRR772629 2 0.3269 0.57966 0.096 0.848 0.000 0.000 0.056
#> SRR772630 2 0.6756 -0.12259 0.188 0.500 0.000 0.016 0.296
#> SRR772631 3 0.1792 0.84702 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772632 4 0.0162 0.85883 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772633 4 0.0324 0.85885 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772634 2 0.7881 -0.37329 0.148 0.372 0.116 0.000 0.364
#> SRR772635 2 0.8599 0.03212 0.296 0.412 0.048 0.132 0.112
#> SRR772636 3 0.3590 0.78468 0.000 0.000 0.828 0.092 0.080
#> SRR772637 1 0.3452 0.53433 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR772638 1 0.3074 0.59001 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR772639 4 0.5293 0.66340 0.120 0.136 0.000 0.720 0.024
#> SRR772640 4 0.0000 0.85887 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0324 0.85885 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772642 1 0.5551 0.45602 0.732 0.020 0.136 0.036 0.076
#> SRR772643 1 0.8205 -0.11667 0.392 0.028 0.196 0.324 0.060
#> SRR772644 1 0.2011 0.66534 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088
#> SRR772645 1 0.1908 0.66003 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR772646 4 0.0510 0.85834 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772647 4 0.1638 0.83349 0.064 0.004 0.000 0.932 0.000
#> SRR772648 4 0.3239 0.75926 0.004 0.156 0.000 0.828 0.012
#> SRR772649 4 0.4270 0.63493 0.004 0.248 0.004 0.728 0.016
#> SRR772650 1 0.2017 0.66361 0.912 0.008 0.000 0.000 0.080
#> SRR772651 1 0.2248 0.65989 0.900 0.012 0.000 0.000 0.088
#> SRR772652 1 0.5770 0.00328 0.516 0.408 0.008 0.000 0.068
#> SRR772653 2 0.5933 0.25028 0.308 0.584 0.012 0.000 0.096
#> SRR772654 2 0.7559 0.02636 0.220 0.504 0.000 0.104 0.172
#> SRR772655 2 0.5495 0.24368 0.024 0.552 0.000 0.396 0.028
#> SRR772656 3 0.1792 0.83528 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772657 3 0.0880 0.85251 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772658 4 0.4123 0.75224 0.000 0.104 0.000 0.788 0.108
#> SRR772659 2 0.4963 0.42695 0.000 0.608 0.000 0.352 0.040
#> SRR772660 1 0.3863 0.52797 0.740 0.000 0.000 0.012 0.248
#> SRR772661 3 0.2280 0.83351 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772662 1 0.3008 0.65322 0.868 0.036 0.004 0.000 0.092
#> SRR772663 1 0.1205 0.67721 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR772664 4 0.6462 0.28838 0.168 0.020 0.000 0.572 0.240
#> SRR772665 4 0.7322 -0.06891 0.256 0.036 0.000 0.448 0.260
#> SRR772666 3 0.0794 0.85262 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772667 1 0.3047 0.64322 0.832 0.004 0.000 0.004 0.160
#> SRR772668 3 0.6118 0.33997 0.000 0.288 0.548 0.000 0.164
#> SRR772669 2 0.5029 0.58158 0.040 0.752 0.056 0.004 0.148
#> SRR772670 1 0.1478 0.66721 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772671 1 0.2574 0.65281 0.876 0.012 0.000 0.000 0.112
#> SRR772672 1 0.1830 0.67945 0.932 0.000 0.000 0.028 0.040
#> SRR772673 1 0.1082 0.67751 0.964 0.008 0.000 0.000 0.028
#> SRR772674 3 0.2284 0.82770 0.004 0.004 0.896 0.000 0.096
#> SRR772675 3 0.1671 0.84842 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772676 2 0.6181 0.34161 0.064 0.516 0.000 0.388 0.032
#> SRR772677 2 0.7318 0.43567 0.152 0.552 0.004 0.200 0.092
#> SRR772678 3 0.1908 0.84464 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772679 1 0.2127 0.65428 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772680 1 0.1914 0.67319 0.928 0.008 0.008 0.000 0.056
#> SRR772681 3 0.1270 0.84828 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772682 4 0.3883 0.68654 0.184 0.000 0.000 0.780 0.036
#> SRR772683 4 0.4446 0.65161 0.192 0.008 0.000 0.752 0.048
#> SRR772685 4 0.8233 0.36907 0.136 0.108 0.052 0.512 0.192
#> SRR772686 3 0.1121 0.84949 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772687 3 0.4946 0.53294 0.052 0.000 0.648 0.000 0.300
#> SRR772688 4 0.0613 0.85953 0.004 0.004 0.000 0.984 0.008
#> SRR772689 4 0.0451 0.85909 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR772690 3 0.1121 0.84964 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772691 3 0.2077 0.84571 0.000 0.000 0.908 0.008 0.084
#> SRR772692 2 0.4437 0.60460 0.048 0.800 0.088 0.000 0.064
#> SRR772693 3 0.8831 -0.19877 0.240 0.168 0.424 0.076 0.092
#> SRR772694 1 0.6214 0.27851 0.620 0.172 0.000 0.024 0.184
#> SRR772695 1 0.4886 0.49488 0.712 0.100 0.000 0.000 0.188
#> SRR772696 2 0.6074 0.51638 0.004 0.640 0.204 0.020 0.132
#> SRR772697 2 0.6825 0.49084 0.000 0.596 0.196 0.108 0.100
#> SRR772698 3 0.1671 0.84842 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772699 1 0.7253 -0.30821 0.472 0.060 0.144 0.000 0.324
#> SRR772700 1 0.7995 -0.34307 0.436 0.256 0.148 0.000 0.160
#> SRR772701 1 0.3410 0.64495 0.840 0.092 0.000 0.000 0.068
#> SRR772702 1 0.5083 -0.03050 0.532 0.432 0.000 0.000 0.036
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.2890 0.6833 0.860 0.012 0.000 0.000 0.032 0.096
#> SRR772342 1 0.3647 0.6865 0.812 0.016 0.000 0.000 0.104 0.068
#> SRR772343 1 0.5893 0.5459 0.652 0.024 0.112 0.000 0.048 0.164
#> SRR772344 4 0.3733 0.7516 0.000 0.060 0.000 0.820 0.064 0.056
#> SRR772345 4 0.0405 0.8067 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR772346 2 0.6176 0.1788 0.020 0.456 0.000 0.000 0.352 0.172
#> SRR772347 2 0.5474 0.4713 0.060 0.668 0.000 0.000 0.140 0.132
#> SRR772348 6 0.7403 0.3248 0.284 0.008 0.164 0.076 0.020 0.448
#> SRR772349 4 0.7468 -0.2526 0.320 0.020 0.012 0.332 0.036 0.280
#> SRR772350 3 0.4989 0.4464 0.000 0.052 0.532 0.000 0.408 0.008
#> SRR772351 4 0.8653 -0.3532 0.072 0.192 0.004 0.292 0.192 0.248
#> SRR772352 6 0.7416 0.0233 0.032 0.100 0.000 0.348 0.120 0.400
#> SRR772353 1 0.0603 0.6674 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR772354 1 0.0870 0.6696 0.972 0.000 0.004 0.000 0.012 0.012
#> SRR772355 4 0.7792 0.2055 0.088 0.072 0.004 0.476 0.180 0.180
#> SRR772356 4 0.5596 0.6277 0.052 0.068 0.000 0.708 0.092 0.080
#> SRR772357 1 0.3042 0.6763 0.856 0.008 0.004 0.000 0.044 0.088
#> SRR772358 1 0.5438 0.5362 0.608 0.032 0.032 0.000 0.024 0.304
#> SRR772359 1 0.5801 0.6141 0.672 0.020 0.004 0.048 0.124 0.132
#> SRR772360 1 0.6088 0.4521 0.612 0.088 0.024 0.020 0.240 0.016
#> SRR772361 3 0.3531 0.6632 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR772362 4 0.0146 0.8054 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0291 0.8060 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772364 2 0.5585 0.4408 0.104 0.640 0.004 0.000 0.212 0.040
#> SRR772365 2 0.5172 0.4070 0.028 0.636 0.004 0.000 0.276 0.056
#> SRR772366 3 0.2165 0.6508 0.000 0.000 0.884 0.000 0.008 0.108
#> SRR772367 3 0.2969 0.7030 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR772368 1 0.5518 0.2715 0.564 0.000 0.332 0.000 0.032 0.072
#> SRR772369 1 0.7396 0.1015 0.428 0.048 0.012 0.092 0.064 0.356
#> SRR772370 1 0.6551 0.4062 0.560 0.020 0.000 0.196 0.048 0.176
#> SRR772371 2 0.6166 0.2298 0.000 0.484 0.016 0.000 0.212 0.288
#> SRR772372 2 0.5911 0.3231 0.000 0.532 0.016 0.000 0.168 0.284
#> SRR772373 4 0.3875 0.5233 0.280 0.000 0.000 0.700 0.016 0.004
#> SRR772374 4 0.2624 0.7101 0.148 0.004 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR772375 3 0.3151 0.6970 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR772376 4 0.4302 0.7021 0.000 0.024 0.132 0.780 0.032 0.032
#> SRR772377 3 0.0622 0.7068 0.000 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR772378 1 0.1401 0.6740 0.948 0.004 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR772379 1 0.4534 0.5787 0.668 0.020 0.012 0.000 0.012 0.288
#> SRR772380 1 0.4834 0.5920 0.680 0.020 0.020 0.000 0.028 0.252
#> SRR772381 3 0.3337 0.6947 0.000 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR772382 1 0.7458 -0.1652 0.388 0.224 0.000 0.000 0.172 0.216
#> SRR772383 1 0.6030 0.5107 0.608 0.116 0.000 0.000 0.088 0.188
#> SRR772384 3 0.0820 0.7045 0.000 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR772385 3 0.1682 0.6837 0.000 0.000 0.928 0.000 0.020 0.052
#> SRR772386 4 0.5591 0.6490 0.052 0.128 0.000 0.700 0.072 0.048
#> SRR772387 4 0.1408 0.8045 0.008 0.024 0.000 0.952 0.008 0.008
#> SRR772388 1 0.4278 0.6554 0.740 0.004 0.008 0.000 0.060 0.188
#> SRR772389 1 0.5062 0.5989 0.660 0.036 0.000 0.000 0.060 0.244
#> SRR772390 3 0.0291 0.7104 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR772391 1 0.1644 0.6752 0.920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR772392 1 0.2128 0.6756 0.908 0.004 0.000 0.000 0.056 0.032
#> SRR772393 2 0.7341 -0.0294 0.000 0.408 0.144 0.004 0.288 0.156
#> SRR772394 2 0.5805 0.4055 0.008 0.660 0.132 0.000 0.108 0.092
#> SRR772395 1 0.5453 0.3181 0.608 0.020 0.016 0.308 0.008 0.040
#> SRR772396 1 0.6792 0.3327 0.520 0.104 0.004 0.000 0.220 0.152
#> SRR772397 1 0.5326 0.6115 0.684 0.044 0.004 0.000 0.112 0.156
#> SRR772398 2 0.6914 -0.0164 0.004 0.400 0.068 0.000 0.360 0.168
#> SRR772399 2 0.6745 0.3248 0.008 0.548 0.124 0.000 0.132 0.188
#> SRR772400 6 0.7925 0.2566 0.144 0.072 0.252 0.000 0.108 0.424
#> SRR772401 6 0.7738 0.3618 0.148 0.084 0.140 0.000 0.136 0.492
#> SRR772402 2 0.2077 0.5166 0.004 0.916 0.000 0.004 0.032 0.044
#> SRR772403 2 0.2745 0.5175 0.004 0.880 0.000 0.024 0.072 0.020
#> SRR772404 1 0.4644 0.6148 0.764 0.000 0.120 0.040 0.024 0.052
#> SRR772405 3 0.1245 0.6972 0.000 0.000 0.952 0.000 0.016 0.032
#> SRR772406 2 0.8195 0.1269 0.068 0.388 0.000 0.208 0.204 0.132
#> SRR772407 2 0.6666 0.3896 0.036 0.612 0.024 0.100 0.180 0.048
#> SRR772408 4 0.0405 0.8064 0.000 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR772409 4 0.0870 0.8066 0.000 0.004 0.000 0.972 0.012 0.012
#> SRR772410 6 0.6339 -0.0512 0.400 0.052 0.012 0.036 0.024 0.476
#> SRR772411 6 0.7063 0.0535 0.384 0.108 0.008 0.064 0.020 0.416
#> SRR772412 1 0.2765 0.6627 0.848 0.004 0.000 0.000 0.132 0.016
#> SRR772413 1 0.2772 0.6822 0.876 0.016 0.000 0.000 0.060 0.048
#> SRR772414 3 0.3565 0.6768 0.000 0.000 0.692 0.000 0.304 0.004
#> SRR772415 1 0.1370 0.6789 0.948 0.000 0.004 0.000 0.012 0.036
#> SRR772416 1 0.1931 0.6815 0.916 0.004 0.004 0.000 0.008 0.068
#> SRR772417 6 0.6882 0.2333 0.184 0.340 0.012 0.000 0.044 0.420
#> SRR772418 3 0.0790 0.7038 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772419 4 0.0436 0.8075 0.000 0.004 0.000 0.988 0.004 0.004
#> SRR772420 4 0.1173 0.8081 0.000 0.008 0.000 0.960 0.016 0.016
#> SRR772421 5 0.8346 0.1272 0.212 0.136 0.012 0.288 0.316 0.036
#> SRR772422 4 0.8198 -0.0138 0.096 0.136 0.044 0.424 0.264 0.036
#> SRR772423 2 0.2673 0.5191 0.000 0.880 0.000 0.012 0.044 0.064
#> SRR772424 2 0.3756 0.5180 0.004 0.824 0.000 0.060 0.060 0.052
#> SRR772425 4 0.4015 0.7555 0.024 0.072 0.012 0.816 0.008 0.068
#> SRR772426 4 0.1637 0.7904 0.056 0.004 0.000 0.932 0.004 0.004
#> SRR772427 4 0.1699 0.7881 0.060 0.004 0.000 0.928 0.004 0.004
#> SRR772428 1 0.6796 0.4572 0.600 0.080 0.124 0.000 0.076 0.120
#> SRR772429 1 0.5627 0.6064 0.692 0.096 0.048 0.000 0.036 0.128
#> SRR772430 1 0.2220 0.6700 0.908 0.000 0.044 0.000 0.012 0.036
#> SRR772431 2 0.5747 0.3890 0.172 0.636 0.000 0.000 0.128 0.064
#> SRR772432 2 0.5379 0.4420 0.108 0.676 0.000 0.000 0.156 0.060
#> SRR772433 1 0.5517 0.5323 0.664 0.076 0.012 0.000 0.200 0.048
#> SRR772434 1 0.5532 0.6064 0.668 0.052 0.004 0.000 0.148 0.128
#> SRR772435 1 0.4405 0.6000 0.724 0.028 0.000 0.000 0.208 0.040
#> SRR772436 1 0.4687 0.5824 0.732 0.064 0.000 0.000 0.156 0.048
#> SRR772437 3 0.3769 0.6359 0.000 0.004 0.640 0.000 0.356 0.000
#> SRR772438 6 0.6864 0.0709 0.004 0.296 0.052 0.000 0.216 0.432
#> SRR772439 2 0.6124 0.3481 0.008 0.564 0.024 0.000 0.204 0.200
#> SRR772440 1 0.7337 0.3145 0.524 0.156 0.000 0.056 0.168 0.096
#> SRR772441 1 0.7762 0.1787 0.472 0.180 0.000 0.084 0.176 0.088
#> SRR772442 2 0.5585 0.4745 0.016 0.684 0.000 0.124 0.120 0.056
#> SRR772443 2 0.4862 0.4902 0.096 0.744 0.000 0.016 0.108 0.036
#> SRR772444 1 0.5517 0.5600 0.664 0.064 0.000 0.000 0.120 0.152
#> SRR772445 1 0.4298 0.6636 0.776 0.048 0.000 0.000 0.092 0.084
#> SRR772446 1 0.3156 0.6579 0.800 0.000 0.000 0.000 0.020 0.180
#> SRR772447 1 0.2466 0.6791 0.872 0.008 0.000 0.000 0.008 0.112
#> SRR772448 5 0.7627 0.0736 0.020 0.324 0.040 0.024 0.364 0.228
#> SRR772449 5 0.8358 0.0655 0.028 0.152 0.012 0.244 0.288 0.276
#> SRR772450 4 0.0146 0.8054 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0146 0.8059 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772452 1 0.4289 0.5289 0.612 0.000 0.000 0.000 0.028 0.360
#> SRR772453 1 0.3802 0.5766 0.676 0.000 0.000 0.000 0.012 0.312
#> SRR772454 1 0.4798 0.5590 0.720 0.148 0.000 0.000 0.100 0.032
#> SRR772455 1 0.4905 0.5808 0.672 0.012 0.008 0.000 0.064 0.244
#> SRR772456 4 0.0508 0.8082 0.000 0.004 0.000 0.984 0.012 0.000
#> SRR772457 4 0.1464 0.8000 0.000 0.004 0.000 0.944 0.016 0.036
#> SRR772458 2 0.6470 -0.1163 0.336 0.464 0.000 0.000 0.052 0.148
#> SRR772459 6 0.6136 -0.1175 0.416 0.092 0.000 0.000 0.052 0.440
#> SRR772460 4 0.0405 0.8065 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR772461 4 0.0914 0.8066 0.000 0.000 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR772462 1 0.4071 0.5016 0.716 0.000 0.000 0.248 0.016 0.020
#> SRR772463 1 0.3862 0.4942 0.712 0.000 0.004 0.268 0.004 0.012
#> SRR772464 3 0.3221 0.6940 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR772465 1 0.8235 -0.0586 0.396 0.180 0.000 0.208 0.080 0.136
#> SRR772466 1 0.7475 0.1992 0.468 0.104 0.000 0.152 0.036 0.240
#> SRR772467 4 0.0551 0.8069 0.000 0.004 0.004 0.984 0.008 0.000
#> SRR772468 4 0.0806 0.8069 0.000 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR772469 6 0.6046 -0.0320 0.400 0.064 0.024 0.000 0.028 0.484
#> SRR772470 1 0.4629 0.4169 0.560 0.020 0.008 0.000 0.004 0.408
#> SRR772471 1 0.4008 0.5774 0.672 0.000 0.016 0.000 0.004 0.308
#> SRR772472 1 0.4100 0.4999 0.612 0.004 0.004 0.000 0.004 0.376
#> SRR772473 2 0.4984 0.4919 0.016 0.724 0.000 0.108 0.128 0.024
#> SRR772474 2 0.5497 0.4839 0.052 0.712 0.000 0.056 0.112 0.068
#> SRR772475 3 0.2214 0.6560 0.000 0.000 0.892 0.004 0.012 0.092
#> SRR772476 4 0.1957 0.7924 0.000 0.008 0.000 0.920 0.024 0.048
#> SRR772477 4 0.0146 0.8054 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1477 0.6784 0.940 0.000 0.008 0.000 0.004 0.048
#> SRR772479 1 0.1461 0.6781 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR772480 2 0.4228 0.5230 0.020 0.776 0.000 0.004 0.100 0.100
#> SRR772481 2 0.5279 0.4604 0.112 0.692 0.000 0.000 0.128 0.068
#> SRR772482 3 0.8535 -0.4050 0.244 0.064 0.264 0.000 0.236 0.192
#> SRR772483 6 0.7626 0.2708 0.156 0.044 0.280 0.000 0.092 0.428
#> SRR772484 1 0.1851 0.6707 0.928 0.000 0.000 0.036 0.012 0.024
#> SRR772485 1 0.1269 0.6716 0.956 0.000 0.000 0.012 0.020 0.012
#> SRR772486 6 0.7114 -0.0261 0.000 0.248 0.208 0.000 0.108 0.436
#> SRR772487 3 0.7713 -0.3888 0.000 0.224 0.288 0.000 0.248 0.240
#> SRR772488 1 0.2432 0.6664 0.888 0.000 0.000 0.080 0.008 0.024
#> SRR772489 1 0.2457 0.6734 0.904 0.032 0.000 0.036 0.012 0.016
#> SRR772490 1 0.7607 -0.2671 0.324 0.200 0.004 0.000 0.316 0.156
#> SRR772491 1 0.7208 0.0537 0.416 0.208 0.000 0.000 0.116 0.260
#> SRR772492 4 0.0291 0.8063 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772493 4 0.0146 0.8054 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0405 0.8064 0.000 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR772495 4 0.0520 0.8073 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR772496 1 0.7603 0.0993 0.416 0.056 0.024 0.200 0.016 0.288
#> SRR772497 1 0.6793 0.4056 0.532 0.036 0.032 0.088 0.020 0.292
#> SRR772498 3 0.7506 -0.2979 0.000 0.216 0.380 0.000 0.204 0.200
#> SRR772499 3 0.6973 -0.0650 0.000 0.144 0.480 0.000 0.144 0.232
#> SRR772500 4 0.1223 0.8067 0.004 0.016 0.000 0.960 0.012 0.008
#> SRR772501 4 0.0405 0.8070 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR772502 5 0.7526 -0.0550 0.088 0.308 0.000 0.012 0.320 0.272
#> SRR772503 2 0.7239 0.0521 0.096 0.368 0.000 0.000 0.248 0.288
#> SRR772504 4 0.2065 0.7926 0.000 0.052 0.000 0.912 0.032 0.004
#> SRR772505 4 0.3927 0.7471 0.004 0.068 0.000 0.812 0.052 0.064
#> SRR772506 4 0.0405 0.8067 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR772507 4 0.0603 0.8075 0.000 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR772508 1 0.2814 0.6687 0.888 0.000 0.020 0.028 0.032 0.032
#> SRR772509 3 0.0777 0.7096 0.004 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000
#> SRR772510 3 0.3547 0.6624 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR772511 2 0.6675 0.3994 0.104 0.608 0.048 0.016 0.044 0.180
#> SRR772512 3 0.3852 0.6060 0.000 0.000 0.612 0.004 0.384 0.000
#> SRR772513 1 0.2007 0.6831 0.924 0.008 0.012 0.000 0.016 0.040
#> SRR772514 1 0.2569 0.6832 0.892 0.000 0.004 0.048 0.012 0.044
#> SRR772515 4 0.5703 0.6385 0.044 0.136 0.000 0.688 0.052 0.080
#> SRR772516 4 0.3795 0.7553 0.056 0.028 0.000 0.832 0.048 0.036
#> SRR772517 1 0.4582 0.6316 0.780 0.048 0.000 0.084 0.052 0.036
#> SRR772518 1 0.2407 0.6770 0.908 0.008 0.004 0.012 0.032 0.036
#> SRR772519 4 0.4329 0.4453 0.300 0.012 0.000 0.664 0.000 0.024
#> SRR772520 4 0.2787 0.7698 0.072 0.016 0.000 0.880 0.012 0.020
#> SRR772521 2 0.4916 0.4702 0.000 0.704 0.000 0.028 0.108 0.160
#> SRR772522 2 0.4730 0.4888 0.000 0.688 0.000 0.008 0.208 0.096
#> SRR772523 4 0.4584 0.6747 0.028 0.148 0.000 0.756 0.044 0.024
#> SRR772524 4 0.2949 0.7703 0.020 0.036 0.000 0.876 0.056 0.012
#> SRR772525 3 0.3101 0.7006 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR772526 4 0.0405 0.8067 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR772527 4 0.0777 0.8070 0.000 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR772528 3 0.1370 0.6983 0.004 0.000 0.948 0.000 0.012 0.036
#> SRR772529 1 0.7065 0.1560 0.464 0.144 0.000 0.000 0.156 0.236
#> SRR772530 2 0.6757 -0.1204 0.332 0.456 0.008 0.000 0.060 0.144
#> SRR772531 3 0.3405 0.6909 0.000 0.000 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR772532 4 0.2198 0.7972 0.000 0.032 0.000 0.912 0.024 0.032
#> SRR772533 4 0.4308 0.7355 0.008 0.056 0.000 0.784 0.048 0.104
#> SRR772534 2 0.6453 0.2858 0.168 0.564 0.000 0.000 0.108 0.160
#> SRR772535 6 0.8521 0.0687 0.088 0.224 0.000 0.156 0.200 0.332
#> SRR772536 4 0.6652 0.2866 0.020 0.116 0.004 0.496 0.040 0.324
#> SRR772537 2 0.6780 0.2311 0.000 0.460 0.000 0.312 0.104 0.124
#> SRR772538 2 0.5285 0.1217 0.000 0.484 0.000 0.444 0.024 0.048
#> SRR772539 1 0.0806 0.6708 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR772540 1 0.2411 0.6820 0.900 0.032 0.000 0.000 0.044 0.024
#> SRR772541 1 0.1908 0.6742 0.924 0.000 0.020 0.000 0.012 0.044
#> SRR772542 6 0.7380 -0.0793 0.000 0.300 0.200 0.000 0.136 0.364
#> SRR772543 6 0.7069 0.2282 0.028 0.188 0.152 0.000 0.100 0.532
#> SRR772544 3 0.3684 0.6584 0.000 0.000 0.664 0.000 0.332 0.004
#> SRR772545 1 0.3823 0.6754 0.780 0.004 0.004 0.000 0.052 0.160
#> SRR772546 1 0.2996 0.6864 0.856 0.004 0.004 0.000 0.048 0.088
#> SRR772547 6 0.8046 0.3583 0.256 0.072 0.148 0.000 0.120 0.404
#> SRR772548 6 0.7604 0.3320 0.300 0.080 0.164 0.000 0.044 0.412
#> SRR772549 1 0.4023 0.6314 0.724 0.000 0.016 0.000 0.020 0.240
#> SRR772550 1 0.3512 0.6192 0.720 0.000 0.000 0.000 0.008 0.272
#> SRR772551 2 0.7013 0.2321 0.092 0.440 0.020 0.000 0.100 0.348
#> SRR772552 6 0.7016 0.3885 0.124 0.152 0.020 0.028 0.092 0.584
#> SRR772553 3 0.0972 0.7022 0.000 0.000 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR772554 4 0.1636 0.7989 0.000 0.036 0.000 0.936 0.004 0.024
#> SRR772555 4 0.1321 0.8036 0.000 0.020 0.000 0.952 0.004 0.024
#> SRR772556 1 0.3438 0.6532 0.812 0.020 0.000 0.000 0.144 0.024
#> SRR772557 1 0.4235 0.6423 0.756 0.032 0.000 0.000 0.168 0.044
#> SRR772558 1 0.3571 0.6454 0.760 0.000 0.004 0.000 0.020 0.216
#> SRR772559 1 0.4996 0.3535 0.516 0.012 0.008 0.000 0.028 0.436
#> SRR772560 1 0.3043 0.6769 0.836 0.000 0.008 0.000 0.024 0.132
#> SRR772561 3 0.4010 0.5672 0.000 0.008 0.584 0.000 0.408 0.000
#> SRR772562 1 0.5516 0.4289 0.656 0.028 0.000 0.228 0.040 0.048
#> SRR772563 4 0.4847 0.3508 0.364 0.004 0.000 0.588 0.028 0.016
#> SRR772564 5 0.6962 0.2229 0.036 0.136 0.344 0.000 0.444 0.040
#> SRR772565 5 0.7177 0.2854 0.032 0.268 0.168 0.000 0.472 0.060
#> SRR772566 1 0.6555 0.3449 0.532 0.064 0.024 0.000 0.088 0.292
#> SRR772567 1 0.5968 0.5220 0.600 0.108 0.004 0.000 0.056 0.232
#> SRR772568 4 0.3843 0.7474 0.016 0.088 0.000 0.820 0.028 0.048
#> SRR772569 4 0.0748 0.8090 0.004 0.000 0.000 0.976 0.016 0.004
#> SRR772570 1 0.5327 0.5206 0.604 0.016 0.028 0.000 0.036 0.316
#> SRR772571 1 0.2787 0.6873 0.872 0.012 0.000 0.000 0.044 0.072
#> SRR772572 6 0.7330 0.3897 0.264 0.124 0.060 0.000 0.068 0.484
#> SRR772573 6 0.7232 0.2411 0.328 0.104 0.004 0.060 0.048 0.456
#> SRR772574 1 0.6167 0.4505 0.592 0.128 0.004 0.000 0.068 0.208
#> SRR772575 1 0.6224 0.3727 0.596 0.152 0.000 0.000 0.112 0.140
#> SRR772576 1 0.5602 0.5286 0.692 0.096 0.000 0.076 0.116 0.020
#> SRR772577 1 0.4889 0.5081 0.684 0.072 0.008 0.000 0.224 0.012
#> SRR772578 4 0.6495 0.4457 0.000 0.180 0.028 0.600 0.084 0.108
#> SRR772579 4 0.8526 -0.1411 0.000 0.132 0.160 0.372 0.172 0.164
#> SRR772580 3 0.3101 0.7010 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR772581 2 0.2801 0.4983 0.000 0.860 0.000 0.000 0.068 0.072
#> SRR772582 2 0.4558 0.4573 0.016 0.724 0.000 0.000 0.172 0.088
#> SRR772583 1 0.5418 0.5887 0.648 0.048 0.004 0.000 0.068 0.232
#> SRR772584 1 0.2933 0.6733 0.864 0.012 0.004 0.000 0.088 0.032
#> SRR772585 1 0.2514 0.6736 0.896 0.008 0.008 0.000 0.044 0.044
#> SRR772586 3 0.2257 0.6463 0.000 0.000 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR772587 2 0.7620 0.0321 0.220 0.436 0.048 0.000 0.072 0.224
#> SRR772588 4 0.1204 0.7921 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR772589 4 0.3543 0.5520 0.272 0.000 0.000 0.720 0.004 0.004
#> SRR772590 3 0.3482 0.6710 0.000 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR772591 1 0.5218 0.5843 0.660 0.032 0.000 0.000 0.092 0.216
#> SRR772592 6 0.7289 0.3332 0.256 0.300 0.008 0.000 0.072 0.364
#> SRR772593 3 0.1075 0.6969 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR772594 2 0.7999 0.2529 0.000 0.380 0.076 0.108 0.132 0.304
#> SRR772595 2 0.8538 0.1360 0.000 0.312 0.108 0.268 0.124 0.188
#> SRR772596 3 0.0858 0.7126 0.000 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR772597 3 0.3221 0.6952 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR772598 5 0.7933 0.0892 0.304 0.120 0.168 0.000 0.364 0.044
#> SRR772599 1 0.8320 -0.1443 0.364 0.080 0.124 0.000 0.220 0.212
#> SRR772600 2 0.4515 0.4889 0.016 0.752 0.000 0.008 0.120 0.104
#> SRR772601 2 0.4183 0.4925 0.004 0.752 0.000 0.000 0.128 0.116
#> SRR772602 3 0.4379 0.5586 0.000 0.028 0.576 0.000 0.396 0.000
#> SRR772603 2 0.5449 0.2606 0.256 0.624 0.000 0.000 0.076 0.044
#> SRR772604 2 0.4478 0.4901 0.008 0.724 0.000 0.000 0.168 0.100
#> SRR772605 1 0.3721 0.6515 0.808 0.000 0.108 0.000 0.020 0.064
#> SRR772606 6 0.7618 0.1519 0.112 0.200 0.016 0.000 0.316 0.356
#> SRR772607 6 0.7270 0.2418 0.076 0.220 0.024 0.000 0.212 0.468
#> SRR772608 1 0.2561 0.6836 0.880 0.004 0.000 0.008 0.016 0.092
#> SRR772609 1 0.2449 0.6825 0.888 0.012 0.000 0.000 0.020 0.080
#> SRR772610 1 0.4003 0.6657 0.800 0.008 0.000 0.088 0.020 0.084
#> SRR772611 1 0.3522 0.6201 0.812 0.004 0.004 0.144 0.008 0.028
#> SRR772612 2 0.4853 0.4964 0.000 0.704 0.000 0.020 0.120 0.156
#> SRR772613 2 0.3565 0.5057 0.004 0.820 0.000 0.008 0.076 0.092
#> SRR772614 1 0.7451 -0.0961 0.396 0.144 0.004 0.000 0.268 0.188
#> SRR772615 1 0.6185 0.1849 0.456 0.084 0.004 0.000 0.052 0.404
#> SRR772616 6 0.7130 0.4428 0.212 0.144 0.092 0.000 0.032 0.520
#> SRR772617 2 0.4018 0.4607 0.008 0.772 0.000 0.168 0.040 0.012
#> SRR772618 2 0.4747 0.4842 0.028 0.764 0.000 0.040 0.088 0.080
#> SRR772619 4 0.0984 0.8078 0.000 0.012 0.000 0.968 0.008 0.012
#> SRR772620 4 0.2553 0.7835 0.000 0.012 0.000 0.888 0.044 0.056
#> SRR772621 1 0.7052 0.0168 0.388 0.020 0.000 0.376 0.164 0.052
#> SRR772622 1 0.6906 0.4347 0.576 0.092 0.000 0.072 0.180 0.080
#> SRR772623 5 0.5184 -0.2552 0.000 0.076 0.420 0.000 0.500 0.004
#> SRR772624 3 0.1219 0.6946 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR772625 3 0.4224 0.3885 0.000 0.000 0.736 0.204 0.020 0.040
#> SRR772626 5 0.7463 0.2897 0.000 0.228 0.240 0.000 0.376 0.156
#> SRR772627 2 0.7420 -0.2033 0.000 0.356 0.268 0.000 0.248 0.128
#> SRR772628 6 0.7383 0.2867 0.136 0.204 0.004 0.000 0.236 0.420
#> SRR772629 2 0.7054 0.0763 0.124 0.440 0.000 0.000 0.152 0.284
#> SRR772630 6 0.7681 0.1109 0.100 0.316 0.028 0.020 0.108 0.428
#> SRR772631 3 0.0806 0.7073 0.000 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR772632 4 0.0622 0.8075 0.000 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR772633 4 0.0260 0.8056 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772634 6 0.7631 0.1203 0.036 0.164 0.208 0.000 0.132 0.460
#> SRR772635 5 0.8560 0.1487 0.188 0.172 0.020 0.124 0.408 0.088
#> SRR772636 3 0.2517 0.6034 0.000 0.000 0.876 0.100 0.016 0.008
#> SRR772637 1 0.4682 0.5704 0.664 0.012 0.020 0.000 0.020 0.284
#> SRR772638 1 0.4022 0.6240 0.708 0.000 0.000 0.000 0.040 0.252
#> SRR772639 4 0.6647 0.3509 0.136 0.256 0.004 0.536 0.012 0.056
#> SRR772640 4 0.0405 0.8067 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR772641 4 0.0508 0.8065 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004 0.000
#> SRR772642 1 0.7320 0.4046 0.580 0.036 0.104 0.048 0.092 0.140
#> SRR772643 4 0.7265 -0.0105 0.380 0.036 0.068 0.424 0.072 0.020
#> SRR772644 1 0.3595 0.6755 0.820 0.004 0.064 0.000 0.012 0.100
#> SRR772645 1 0.3806 0.6610 0.780 0.004 0.032 0.000 0.012 0.172
#> SRR772646 4 0.1293 0.8061 0.004 0.004 0.000 0.956 0.016 0.020
#> SRR772647 4 0.1913 0.7869 0.060 0.004 0.000 0.920 0.012 0.004
#> SRR772648 4 0.4315 0.7158 0.004 0.072 0.000 0.784 0.080 0.060
#> SRR772649 4 0.4548 0.6716 0.000 0.064 0.000 0.752 0.128 0.056
#> SRR772650 1 0.1699 0.6750 0.936 0.016 0.000 0.000 0.032 0.016
#> SRR772651 1 0.1401 0.6711 0.948 0.004 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR772652 1 0.6089 0.2793 0.548 0.268 0.004 0.000 0.152 0.028
#> SRR772653 1 0.7340 -0.1761 0.372 0.260 0.008 0.000 0.280 0.080
#> SRR772654 6 0.8159 0.1111 0.084 0.236 0.000 0.084 0.228 0.368
#> SRR772655 2 0.7152 0.1655 0.024 0.432 0.000 0.340 0.084 0.120
#> SRR772656 3 0.3690 0.6710 0.000 0.000 0.684 0.000 0.308 0.008
#> SRR772657 3 0.3409 0.6796 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR772658 4 0.5387 0.4150 0.000 0.312 0.000 0.592 0.048 0.048
#> SRR772659 2 0.4492 0.3924 0.000 0.684 0.000 0.260 0.040 0.016
#> SRR772660 1 0.5786 0.4312 0.592 0.000 0.176 0.008 0.012 0.212
#> SRR772661 3 0.1333 0.6924 0.000 0.000 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR772662 1 0.3278 0.6795 0.824 0.020 0.000 0.000 0.136 0.020
#> SRR772663 1 0.1788 0.6799 0.928 0.004 0.000 0.000 0.040 0.028
#> SRR772664 4 0.5737 0.2650 0.064 0.028 0.004 0.520 0.004 0.380
#> SRR772665 4 0.7528 -0.0307 0.152 0.040 0.024 0.400 0.032 0.352
#> SRR772666 3 0.3409 0.6793 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR772667 1 0.5246 0.5961 0.720 0.028 0.032 0.004 0.076 0.140
#> SRR772668 5 0.6347 0.2374 0.000 0.224 0.264 0.004 0.488 0.020
#> SRR772669 2 0.7409 0.0429 0.056 0.364 0.016 0.004 0.308 0.252
#> SRR772670 1 0.2956 0.6769 0.856 0.000 0.016 0.000 0.028 0.100
#> SRR772671 1 0.3454 0.6647 0.804 0.008 0.004 0.000 0.024 0.160
#> SRR772672 1 0.3161 0.6786 0.860 0.004 0.008 0.064 0.008 0.056
#> SRR772673 1 0.2159 0.6856 0.916 0.016 0.000 0.004 0.024 0.040
#> SRR772674 3 0.3784 0.6670 0.000 0.000 0.680 0.000 0.308 0.012
#> SRR772675 3 0.0458 0.7112 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772676 4 0.8044 -0.1588 0.104 0.280 0.000 0.396 0.128 0.092
#> SRR772677 2 0.8007 0.2141 0.176 0.408 0.000 0.188 0.184 0.044
#> SRR772678 3 0.0717 0.7059 0.000 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR772679 1 0.2647 0.6724 0.896 0.032 0.016 0.000 0.032 0.024
#> SRR772680 1 0.2893 0.6725 0.880 0.008 0.032 0.000 0.044 0.036
#> SRR772681 3 0.3699 0.6554 0.000 0.004 0.660 0.000 0.336 0.000
#> SRR772682 4 0.5898 0.4371 0.248 0.020 0.004 0.616 0.032 0.080
#> SRR772683 4 0.5124 0.6506 0.120 0.016 0.048 0.740 0.012 0.064
#> SRR772685 4 0.7280 0.1214 0.148 0.080 0.004 0.452 0.296 0.020
#> SRR772686 3 0.3619 0.6700 0.000 0.000 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR772687 3 0.3631 0.5715 0.012 0.000 0.792 0.000 0.036 0.160
#> SRR772688 4 0.1015 0.8072 0.004 0.012 0.000 0.968 0.012 0.004
#> SRR772689 4 0.0603 0.8067 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004 0.000
#> SRR772690 3 0.3446 0.6753 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR772691 3 0.1003 0.7021 0.000 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR772692 2 0.7278 0.0938 0.024 0.460 0.076 0.000 0.252 0.188
#> SRR772693 5 0.9402 0.1957 0.176 0.116 0.240 0.068 0.288 0.112
#> SRR772694 1 0.7622 0.0548 0.464 0.144 0.028 0.016 0.088 0.260
#> SRR772695 1 0.5805 0.5251 0.648 0.072 0.008 0.004 0.072 0.196
#> SRR772696 5 0.6656 0.3436 0.008 0.224 0.112 0.020 0.572 0.064
#> SRR772697 5 0.7971 0.1584 0.000 0.260 0.064 0.152 0.408 0.116
#> SRR772698 3 0.0508 0.7096 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR772699 1 0.7728 -0.1570 0.364 0.036 0.128 0.000 0.132 0.340
#> SRR772700 1 0.8625 -0.2914 0.320 0.120 0.132 0.000 0.228 0.200
#> SRR772701 1 0.3749 0.6707 0.804 0.028 0.000 0.000 0.124 0.044
#> SRR772702 1 0.6668 0.1846 0.484 0.292 0.004 0.000 0.060 0.160
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.523 0.769 0.906 0.1772 0.885 0.885
#> 3 3 0.205 0.614 0.794 1.1332 0.762 0.736
#> 4 4 0.130 0.507 0.682 0.2526 0.797 0.716
#> 5 5 0.144 0.564 0.707 0.1239 0.870 0.774
#> 6 6 0.191 0.494 0.682 0.0835 0.962 0.921
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 2 0.4815 0.8357 0.104 0.896
#> SRR772342 2 0.6887 0.7213 0.184 0.816
#> SRR772343 2 0.2043 0.8834 0.032 0.968
#> SRR772344 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772346 2 0.0376 0.8874 0.004 0.996
#> SRR772347 2 0.0938 0.8877 0.012 0.988
#> SRR772348 2 0.0672 0.8876 0.008 0.992
#> SRR772349 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.5741 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0672 0.8878 0.008 0.992
#> SRR772353 2 0.1414 0.8857 0.020 0.980
#> SRR772354 2 0.1414 0.8863 0.020 0.980
#> SRR772355 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772356 2 0.0672 0.8878 0.008 0.992
#> SRR772357 2 0.2423 0.8799 0.040 0.960
#> SRR772358 2 0.6048 0.7808 0.148 0.852
#> SRR772359 2 0.4562 0.8420 0.096 0.904
#> SRR772360 2 0.2236 0.8816 0.036 0.964
#> SRR772361 2 0.9833 -0.2632 0.424 0.576
#> SRR772362 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772364 2 0.0376 0.8875 0.004 0.996
#> SRR772365 2 0.4431 0.8305 0.092 0.908
#> SRR772366 1 0.9491 0.7515 0.632 0.368
#> SRR772367 1 0.9522 0.7544 0.628 0.372
#> SRR772368 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.1414 0.8864 0.020 0.980
#> SRR772370 2 0.0672 0.8879 0.008 0.992
#> SRR772371 2 0.5842 0.7926 0.140 0.860
#> SRR772372 2 0.3733 0.8615 0.072 0.928
#> SRR772373 2 0.0672 0.8872 0.008 0.992
#> SRR772374 2 0.0376 0.8868 0.004 0.996
#> SRR772375 1 0.9248 0.7516 0.660 0.340
#> SRR772376 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772377 2 0.7528 0.6257 0.216 0.784
#> SRR772378 2 0.2423 0.8808 0.040 0.960
#> SRR772379 2 0.2236 0.8817 0.036 0.964
#> SRR772380 2 0.1633 0.8857 0.024 0.976
#> SRR772381 2 0.9850 -0.2786 0.428 0.572
#> SRR772382 2 0.5294 0.8183 0.120 0.880
#> SRR772383 2 0.4690 0.8411 0.100 0.900
#> SRR772384 2 0.7602 0.6182 0.220 0.780
#> SRR772385 2 0.6531 0.7267 0.168 0.832
#> SRR772386 2 0.0376 0.8877 0.004 0.996
#> SRR772387 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772388 2 0.9775 -0.1618 0.412 0.588
#> SRR772389 2 0.9866 -0.2635 0.432 0.568
#> SRR772390 1 0.9977 0.6260 0.528 0.472
#> SRR772391 2 0.5629 0.8027 0.132 0.868
#> SRR772392 2 0.4431 0.8453 0.092 0.908
#> SRR772393 2 0.0376 0.8868 0.004 0.996
#> SRR772394 2 0.0938 0.8872 0.012 0.988
#> SRR772395 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772396 2 0.5294 0.8152 0.120 0.880
#> SRR772397 2 0.8608 0.4565 0.284 0.716
#> SRR772398 2 0.6438 0.7548 0.164 0.836
#> SRR772399 2 0.6148 0.7748 0.152 0.848
#> SRR772400 2 0.7815 0.6130 0.232 0.768
#> SRR772401 2 0.7674 0.6350 0.224 0.776
#> SRR772402 2 0.0376 0.8874 0.004 0.996
#> SRR772403 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0376 0.8876 0.004 0.996
#> SRR772405 2 0.7602 0.6193 0.220 0.780
#> SRR772406 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0376 0.8875 0.004 0.996
#> SRR772408 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.2948 0.8747 0.052 0.948
#> SRR772411 2 0.2948 0.8744 0.052 0.948
#> SRR772412 2 0.4562 0.8431 0.096 0.904
#> SRR772413 2 0.4939 0.8307 0.108 0.892
#> SRR772414 1 0.9795 0.7236 0.584 0.416
#> SRR772415 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772416 2 0.1184 0.8870 0.016 0.984
#> SRR772417 2 0.2236 0.8808 0.036 0.964
#> SRR772418 1 0.9993 0.5868 0.516 0.484
#> SRR772419 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.0672 0.8874 0.008 0.992
#> SRR772422 2 0.0938 0.8877 0.012 0.988
#> SRR772423 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0938 0.8874 0.012 0.988
#> SRR772426 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772428 2 0.6438 0.7549 0.164 0.836
#> SRR772429 2 0.5178 0.8220 0.116 0.884
#> SRR772430 2 0.0938 0.8869 0.012 0.988
#> SRR772431 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772433 2 0.6801 0.7200 0.180 0.820
#> SRR772434 2 0.7815 0.6172 0.232 0.768
#> SRR772435 2 0.1843 0.8839 0.028 0.972
#> SRR772436 2 0.3114 0.8726 0.056 0.944
#> SRR772437 2 0.9833 -0.2632 0.424 0.576
#> SRR772438 2 0.6531 0.7482 0.168 0.832
#> SRR772439 2 0.9427 0.1471 0.360 0.640
#> SRR772440 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772441 2 0.1184 0.8871 0.016 0.984
#> SRR772442 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772444 2 0.4690 0.8401 0.100 0.900
#> SRR772445 2 0.3431 0.8683 0.064 0.936
#> SRR772446 2 0.4562 0.8427 0.096 0.904
#> SRR772447 2 0.3584 0.8634 0.068 0.932
#> SRR772448 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772449 2 0.0672 0.8871 0.008 0.992
#> SRR772450 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772452 2 0.8081 0.5729 0.248 0.752
#> SRR772453 2 0.6438 0.7550 0.164 0.836
#> SRR772454 2 0.1843 0.8831 0.028 0.972
#> SRR772455 2 0.3584 0.8646 0.068 0.932
#> SRR772456 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772458 2 0.5737 0.7981 0.136 0.864
#> SRR772459 2 0.7528 0.6562 0.216 0.784
#> SRR772460 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.9710 0.7386 0.600 0.400
#> SRR772465 2 0.1843 0.8849 0.028 0.972
#> SRR772466 2 0.0672 0.8875 0.008 0.992
#> SRR772467 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772469 2 0.6148 0.7737 0.152 0.848
#> SRR772470 2 0.5294 0.8180 0.120 0.880
#> SRR772471 2 0.4022 0.8558 0.080 0.920
#> SRR772472 2 0.4022 0.8553 0.080 0.920
#> SRR772473 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.6247 0.7487 0.156 0.844
#> SRR772476 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772478 2 0.5408 0.8113 0.124 0.876
#> SRR772479 2 0.5408 0.8118 0.124 0.876
#> SRR772480 2 0.1414 0.8845 0.020 0.980
#> SRR772481 2 0.0376 0.8874 0.004 0.996
#> SRR772482 2 0.3879 0.8593 0.076 0.924
#> SRR772483 2 0.4298 0.8501 0.088 0.912
#> SRR772484 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772485 2 0.0376 0.8876 0.004 0.996
#> SRR772486 2 0.8499 0.4854 0.276 0.724
#> SRR772487 2 0.7883 0.5971 0.236 0.764
#> SRR772488 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772489 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772490 2 0.5629 0.8040 0.132 0.868
#> SRR772491 2 0.4939 0.8316 0.108 0.892
#> SRR772492 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0938 0.8876 0.012 0.988
#> SRR772497 2 0.0672 0.8871 0.008 0.992
#> SRR772498 2 0.1414 0.8863 0.020 0.980
#> SRR772499 2 0.0938 0.8874 0.012 0.988
#> SRR772500 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772502 2 0.3114 0.8718 0.056 0.944
#> SRR772503 2 0.2778 0.8755 0.048 0.952
#> SRR772504 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772509 2 0.6887 0.6958 0.184 0.816
#> SRR772510 1 1.0000 0.5464 0.504 0.496
#> SRR772511 2 0.0672 0.8869 0.008 0.992
#> SRR772512 2 0.9833 -0.2632 0.424 0.576
#> SRR772513 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772518 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.3584 0.8642 0.068 0.932
#> SRR772522 2 0.4431 0.8485 0.092 0.908
#> SRR772523 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0376 0.8876 0.004 0.996
#> SRR772525 1 0.5059 0.6371 0.888 0.112
#> SRR772526 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.9954 0.6428 0.540 0.460
#> SRR772529 2 0.3274 0.8699 0.060 0.940
#> SRR772530 2 0.5519 0.8035 0.128 0.872
#> SRR772531 1 0.6531 0.6638 0.832 0.168
#> SRR772532 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772534 2 0.2423 0.8786 0.040 0.960
#> SRR772535 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772536 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772539 2 0.3114 0.8729 0.056 0.944
#> SRR772540 2 0.2948 0.8749 0.052 0.948
#> SRR772541 2 0.0672 0.8869 0.008 0.992
#> SRR772542 2 0.5737 0.7947 0.136 0.864
#> SRR772543 2 0.6343 0.7599 0.160 0.840
#> SRR772544 2 0.9866 -0.3014 0.432 0.568
#> SRR772545 2 0.5294 0.8173 0.120 0.880
#> SRR772546 2 0.4431 0.8469 0.092 0.908
#> SRR772547 2 0.4298 0.8509 0.088 0.912
#> SRR772548 2 0.5059 0.8269 0.112 0.888
#> SRR772549 2 0.7528 0.6577 0.216 0.784
#> SRR772550 2 0.8386 0.5180 0.268 0.732
#> SRR772551 2 0.0938 0.8876 0.012 0.988
#> SRR772552 2 0.0938 0.8873 0.012 0.988
#> SRR772553 2 0.6438 0.7341 0.164 0.836
#> SRR772554 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772556 2 0.3733 0.8607 0.072 0.928
#> SRR772557 2 0.4690 0.8393 0.100 0.900
#> SRR772558 2 0.2603 0.8768 0.044 0.956
#> SRR772559 2 0.6343 0.7609 0.160 0.840
#> SRR772560 2 0.1633 0.8860 0.024 0.976
#> SRR772561 2 0.9833 -0.2632 0.424 0.576
#> SRR772562 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772564 2 0.7528 0.6524 0.216 0.784
#> SRR772565 2 0.7453 0.6622 0.212 0.788
#> SRR772566 2 0.9896 -0.3006 0.440 0.560
#> SRR772567 2 0.9491 0.1005 0.368 0.632
#> SRR772568 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772570 2 0.5946 0.7848 0.144 0.856
#> SRR772571 2 0.4815 0.8356 0.104 0.896
#> SRR772572 2 0.5946 0.7904 0.144 0.856
#> SRR772573 2 0.4939 0.8314 0.108 0.892
#> SRR772574 2 0.5842 0.7934 0.140 0.860
#> SRR772575 2 0.2603 0.8774 0.044 0.956
#> SRR772576 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772577 2 0.1184 0.8869 0.016 0.984
#> SRR772578 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772580 1 0.9286 0.7529 0.656 0.344
#> SRR772581 2 0.3431 0.8663 0.064 0.936
#> SRR772582 2 0.1414 0.8863 0.020 0.980
#> SRR772583 2 0.2948 0.8740 0.052 0.948
#> SRR772584 2 0.1843 0.8843 0.028 0.972
#> SRR772585 2 0.0672 0.8872 0.008 0.992
#> SRR772586 1 0.9983 0.6159 0.524 0.476
#> SRR772587 2 0.6531 0.7472 0.168 0.832
#> SRR772588 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772590 2 0.9833 -0.2632 0.424 0.576
#> SRR772591 2 0.9661 -0.0396 0.392 0.608
#> SRR772592 2 0.9552 0.0401 0.376 0.624
#> SRR772593 2 0.9998 -0.5280 0.492 0.508
#> SRR772594 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.9775 0.7284 0.588 0.412
#> SRR772597 1 0.9393 0.7555 0.644 0.356
#> SRR772598 2 0.4690 0.8358 0.100 0.900
#> SRR772599 2 0.6973 0.7115 0.188 0.812
#> SRR772600 2 0.0376 0.8874 0.004 0.996
#> SRR772601 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772602 2 0.9815 -0.2498 0.420 0.580
#> SRR772603 2 0.0672 0.8871 0.008 0.992
#> SRR772604 2 0.0376 0.8871 0.004 0.996
#> SRR772605 2 0.1184 0.8866 0.016 0.984
#> SRR772606 2 0.6973 0.7094 0.188 0.812
#> SRR772607 2 0.6887 0.7201 0.184 0.816
#> SRR772608 2 0.0376 0.8874 0.004 0.996
#> SRR772609 2 0.0938 0.8877 0.012 0.988
#> SRR772610 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0672 0.8874 0.008 0.992
#> SRR772612 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772614 2 0.7674 0.6334 0.224 0.776
#> SRR772615 2 0.9044 0.3329 0.320 0.680
#> SRR772616 2 0.3274 0.8684 0.060 0.940
#> SRR772617 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.1414 0.8864 0.020 0.980
#> SRR772622 2 0.0938 0.8874 0.012 0.988
#> SRR772623 1 0.2236 0.5921 0.964 0.036
#> SRR772624 1 0.9795 0.7231 0.584 0.416
#> SRR772625 2 0.5737 0.7806 0.136 0.864
#> SRR772626 2 0.2043 0.8827 0.032 0.968
#> SRR772627 2 0.0376 0.8872 0.004 0.996
#> SRR772628 2 0.6623 0.7424 0.172 0.828
#> SRR772629 2 0.5059 0.8275 0.112 0.888
#> SRR772630 2 0.2603 0.8781 0.044 0.956
#> SRR772631 2 0.9977 -0.4571 0.472 0.528
#> SRR772632 2 0.0376 0.8868 0.004 0.996
#> SRR772633 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772634 2 0.2423 0.8802 0.040 0.960
#> SRR772635 2 0.2423 0.8793 0.040 0.960
#> SRR772636 2 0.5629 0.7850 0.132 0.868
#> SRR772637 2 0.8016 0.5813 0.244 0.756
#> SRR772638 2 0.7815 0.6197 0.232 0.768
#> SRR772639 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.2043 0.8834 0.032 0.968
#> SRR772643 2 0.0376 0.8868 0.004 0.996
#> SRR772644 2 0.3733 0.8608 0.072 0.928
#> SRR772645 2 0.5842 0.7899 0.140 0.860
#> SRR772646 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.1414 0.8862 0.020 0.980
#> SRR772649 2 0.0938 0.8876 0.012 0.988
#> SRR772650 2 0.3584 0.8646 0.068 0.932
#> SRR772651 2 0.2236 0.8817 0.036 0.964
#> SRR772652 2 0.4431 0.8471 0.092 0.908
#> SRR772653 2 0.4298 0.8514 0.088 0.912
#> SRR772654 2 0.1633 0.8855 0.024 0.976
#> SRR772655 2 0.1414 0.8859 0.020 0.980
#> SRR772656 2 0.8499 0.4110 0.276 0.724
#> SRR772657 2 0.9833 -0.2632 0.424 0.576
#> SRR772658 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.1184 0.8869 0.016 0.984
#> SRR772661 2 0.9522 0.0169 0.372 0.628
#> SRR772662 2 0.2778 0.8761 0.048 0.952
#> SRR772663 2 0.1633 0.8856 0.024 0.976
#> SRR772664 2 0.0672 0.8876 0.008 0.992
#> SRR772665 2 0.1184 0.8864 0.016 0.984
#> SRR772666 2 0.9988 -0.4936 0.480 0.520
#> SRR772667 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.2043 0.8840 0.032 0.968
#> SRR772671 2 0.2236 0.8817 0.036 0.964
#> SRR772672 2 0.0376 0.8874 0.004 0.996
#> SRR772673 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772674 2 0.9970 -0.4487 0.468 0.532
#> SRR772675 2 0.7139 0.6702 0.196 0.804
#> SRR772676 2 0.5178 0.8239 0.116 0.884
#> SRR772677 2 0.5294 0.8190 0.120 0.880
#> SRR772678 2 0.7950 0.5617 0.240 0.760
#> SRR772679 2 0.2236 0.8815 0.036 0.964
#> SRR772680 2 0.2778 0.8776 0.048 0.952
#> SRR772681 2 0.9896 -0.3322 0.440 0.560
#> SRR772682 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.9522 0.7527 0.628 0.372
#> SRR772687 1 0.1184 0.5836 0.984 0.016
#> SRR772688 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.9732 0.7368 0.596 0.404
#> SRR772691 2 0.5842 0.7743 0.140 0.860
#> SRR772692 2 0.1843 0.8821 0.028 0.972
#> SRR772693 2 0.1184 0.8874 0.016 0.984
#> SRR772694 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0672 0.8872 0.008 0.992
#> SRR772696 2 0.0672 0.8874 0.008 0.992
#> SRR772697 2 0.0000 0.8872 0.000 1.000
#> SRR772698 1 1.0000 0.5523 0.504 0.496
#> SRR772699 2 0.3431 0.8679 0.064 0.936
#> SRR772700 2 0.2236 0.8813 0.036 0.964
#> SRR772701 2 0.5059 0.8278 0.112 0.888
#> SRR772702 2 0.4298 0.8513 0.088 0.912
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 2 0.6095 0.35252 0.000 0.608 0.392
#> SRR772342 3 0.6819 0.23507 0.012 0.476 0.512
#> SRR772343 2 0.5109 0.71647 0.008 0.780 0.212
#> SRR772344 2 0.0592 0.79189 0.000 0.988 0.012
#> SRR772345 2 0.0592 0.79033 0.000 0.988 0.012
#> SRR772346 2 0.3918 0.76957 0.004 0.856 0.140
#> SRR772347 2 0.4351 0.75308 0.004 0.828 0.168
#> SRR772348 2 0.2356 0.79784 0.000 0.928 0.072
#> SRR772349 2 0.2096 0.79888 0.004 0.944 0.052
#> SRR772350 1 0.1643 0.95214 0.956 0.000 0.044
#> SRR772351 2 0.1860 0.79042 0.000 0.948 0.052
#> SRR772352 2 0.3193 0.78909 0.004 0.896 0.100
#> SRR772353 2 0.4235 0.73635 0.000 0.824 0.176
#> SRR772354 2 0.3686 0.76200 0.000 0.860 0.140
#> SRR772355 2 0.2096 0.79421 0.004 0.944 0.052
#> SRR772356 2 0.2400 0.79250 0.004 0.932 0.064
#> SRR772357 2 0.4974 0.68401 0.000 0.764 0.236
#> SRR772358 2 0.6664 -0.03836 0.008 0.528 0.464
#> SRR772359 2 0.5835 0.48322 0.000 0.660 0.340
#> SRR772360 2 0.3816 0.77016 0.000 0.852 0.148
#> SRR772361 3 0.8561 0.66867 0.156 0.244 0.600
#> SRR772362 2 0.0424 0.78646 0.000 0.992 0.008
#> SRR772363 2 0.0424 0.78646 0.000 0.992 0.008
#> SRR772364 2 0.3539 0.77357 0.012 0.888 0.100
#> SRR772365 2 0.6585 0.55500 0.044 0.712 0.244
#> SRR772366 3 0.7187 0.36544 0.232 0.076 0.692
#> SRR772367 3 0.7226 0.36148 0.236 0.076 0.688
#> SRR772368 2 0.0829 0.78376 0.004 0.984 0.012
#> SRR772369 2 0.3482 0.77465 0.000 0.872 0.128
#> SRR772370 2 0.3038 0.79021 0.000 0.896 0.104
#> SRR772371 2 0.6672 0.00247 0.008 0.520 0.472
#> SRR772372 2 0.5404 0.64026 0.004 0.740 0.256
#> SRR772373 2 0.2625 0.79410 0.000 0.916 0.084
#> SRR772374 2 0.1753 0.79687 0.000 0.952 0.048
#> SRR772375 3 0.6964 0.26877 0.264 0.052 0.684
#> SRR772376 2 0.1643 0.79720 0.000 0.956 0.044
#> SRR772377 2 0.8068 -0.23867 0.064 0.480 0.456
#> SRR772378 2 0.4974 0.69131 0.000 0.764 0.236
#> SRR772379 2 0.3607 0.78629 0.008 0.880 0.112
#> SRR772380 2 0.4796 0.70429 0.000 0.780 0.220
#> SRR772381 3 0.8286 0.67138 0.140 0.236 0.624
#> SRR772382 2 0.6675 0.28888 0.012 0.584 0.404
#> SRR772383 2 0.6247 0.42260 0.004 0.620 0.376
#> SRR772384 3 0.7581 0.29817 0.040 0.464 0.496
#> SRR772385 2 0.7430 0.04246 0.036 0.540 0.424
#> SRR772386 2 0.3038 0.79038 0.000 0.896 0.104
#> SRR772387 2 0.1289 0.79440 0.000 0.968 0.032
#> SRR772388 3 0.5696 0.59406 0.056 0.148 0.796
#> SRR772389 3 0.6181 0.60043 0.072 0.156 0.772
#> SRR772390 3 0.6788 0.53719 0.136 0.120 0.744
#> SRR772391 2 0.6633 0.15894 0.008 0.548 0.444
#> SRR772392 2 0.6026 0.40745 0.000 0.624 0.376
#> SRR772393 2 0.3349 0.78792 0.004 0.888 0.108
#> SRR772394 2 0.3532 0.78553 0.008 0.884 0.108
#> SRR772395 2 0.1163 0.79478 0.000 0.972 0.028
#> SRR772396 2 0.7036 0.08373 0.020 0.536 0.444
#> SRR772397 3 0.7140 0.62213 0.040 0.328 0.632
#> SRR772398 2 0.6948 -0.07098 0.016 0.512 0.472
#> SRR772399 2 0.6948 -0.04018 0.016 0.512 0.472
#> SRR772400 3 0.6386 0.46301 0.004 0.412 0.584
#> SRR772401 3 0.6416 0.51914 0.008 0.376 0.616
#> SRR772402 2 0.2301 0.76500 0.004 0.936 0.060
#> SRR772403 2 0.1765 0.76971 0.004 0.956 0.040
#> SRR772404 2 0.2261 0.79866 0.000 0.932 0.068
#> SRR772405 3 0.7748 0.33166 0.048 0.452 0.500
#> SRR772406 2 0.2682 0.79140 0.004 0.920 0.076
#> SRR772407 2 0.2096 0.79911 0.004 0.944 0.052
#> SRR772408 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772409 2 0.0424 0.78896 0.000 0.992 0.008
#> SRR772410 2 0.4842 0.68128 0.000 0.776 0.224
#> SRR772411 2 0.5115 0.67771 0.004 0.768 0.228
#> SRR772412 2 0.6026 0.42957 0.000 0.624 0.376
#> SRR772413 2 0.6140 0.31418 0.000 0.596 0.404
#> SRR772414 3 0.7244 0.42715 0.208 0.092 0.700
#> SRR772415 2 0.2066 0.79450 0.000 0.940 0.060
#> SRR772416 2 0.3116 0.78467 0.000 0.892 0.108
#> SRR772417 2 0.4291 0.73839 0.000 0.820 0.180
#> SRR772418 3 0.6530 0.54572 0.120 0.120 0.760
#> SRR772419 2 0.0747 0.79157 0.000 0.984 0.016
#> SRR772420 2 0.0592 0.79176 0.000 0.988 0.012
#> SRR772421 2 0.1643 0.79570 0.000 0.956 0.044
#> SRR772422 2 0.2590 0.79597 0.004 0.924 0.072
#> SRR772423 2 0.1989 0.76990 0.004 0.948 0.048
#> SRR772424 2 0.1647 0.77034 0.004 0.960 0.036
#> SRR772425 2 0.2356 0.79442 0.000 0.928 0.072
#> SRR772426 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772427 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772428 2 0.6664 0.01647 0.008 0.528 0.464
#> SRR772429 2 0.6617 0.31912 0.012 0.600 0.388
#> SRR772430 2 0.3941 0.76471 0.000 0.844 0.156
#> SRR772431 2 0.1950 0.77049 0.008 0.952 0.040
#> SRR772432 2 0.1647 0.77034 0.004 0.960 0.036
#> SRR772433 3 0.6520 0.21490 0.004 0.488 0.508
#> SRR772434 3 0.6379 0.54346 0.008 0.368 0.624
#> SRR772435 2 0.4409 0.75051 0.004 0.824 0.172
#> SRR772436 2 0.5775 0.64730 0.012 0.728 0.260
#> SRR772437 3 0.8561 0.66867 0.156 0.244 0.600
#> SRR772438 2 0.7186 -0.10371 0.024 0.500 0.476
#> SRR772439 3 0.6678 0.65805 0.060 0.216 0.724
#> SRR772440 2 0.2356 0.79563 0.000 0.928 0.072
#> SRR772441 2 0.2496 0.79847 0.004 0.928 0.068
#> SRR772442 2 0.1399 0.79085 0.004 0.968 0.028
#> SRR772443 2 0.3030 0.78713 0.004 0.904 0.092
#> SRR772444 2 0.6298 0.37998 0.004 0.608 0.388
#> SRR772445 2 0.5835 0.51572 0.000 0.660 0.340
#> SRR772446 2 0.6513 0.32202 0.008 0.592 0.400
#> SRR772447 2 0.5327 0.61756 0.000 0.728 0.272
#> SRR772448 2 0.2200 0.79027 0.004 0.940 0.056
#> SRR772449 2 0.2711 0.79568 0.000 0.912 0.088
#> SRR772450 2 0.0592 0.78778 0.000 0.988 0.012
#> SRR772451 2 0.0592 0.78778 0.000 0.988 0.012
#> SRR772452 3 0.6758 0.57612 0.020 0.360 0.620
#> SRR772453 3 0.6521 0.18765 0.004 0.492 0.504
#> SRR772454 2 0.4887 0.68960 0.000 0.772 0.228
#> SRR772455 2 0.5873 0.56893 0.004 0.684 0.312
#> SRR772456 2 0.0424 0.78646 0.000 0.992 0.008
#> SRR772457 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772458 2 0.6771 0.11446 0.012 0.548 0.440
#> SRR772459 3 0.7372 0.35086 0.032 0.448 0.520
#> SRR772460 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772461 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772462 2 0.0892 0.79446 0.000 0.980 0.020
#> SRR772463 2 0.1031 0.79263 0.000 0.976 0.024
#> SRR772464 3 0.7413 0.42909 0.224 0.092 0.684
#> SRR772465 2 0.4629 0.73500 0.004 0.808 0.188
#> SRR772466 2 0.2878 0.79323 0.000 0.904 0.096
#> SRR772467 2 0.0592 0.79036 0.000 0.988 0.012
#> SRR772468 2 0.0592 0.79036 0.000 0.988 0.012
#> SRR772469 2 0.6944 -0.05141 0.016 0.516 0.468
#> SRR772470 2 0.6527 0.28173 0.008 0.588 0.404
#> SRR772471 2 0.5760 0.53724 0.000 0.672 0.328
#> SRR772472 2 0.5882 0.48360 0.000 0.652 0.348
#> SRR772473 2 0.2301 0.77952 0.004 0.936 0.060
#> SRR772474 2 0.2384 0.78705 0.008 0.936 0.056
#> SRR772475 2 0.7207 0.22936 0.032 0.584 0.384
#> SRR772476 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772477 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772478 2 0.6432 0.19876 0.004 0.568 0.428
#> SRR772479 2 0.6516 -0.01494 0.004 0.516 0.480
#> SRR772480 2 0.4645 0.72515 0.008 0.816 0.176
#> SRR772481 2 0.3272 0.77209 0.004 0.892 0.104
#> SRR772482 2 0.6102 0.52822 0.008 0.672 0.320
#> SRR772483 2 0.6529 0.40792 0.012 0.620 0.368
#> SRR772484 2 0.1289 0.79484 0.000 0.968 0.032
#> SRR772485 2 0.1753 0.79565 0.000 0.952 0.048
#> SRR772486 3 0.7492 0.60563 0.052 0.340 0.608
#> SRR772487 3 0.6985 0.53874 0.024 0.384 0.592
#> SRR772488 2 0.1765 0.78112 0.004 0.956 0.040
#> SRR772489 2 0.2384 0.79045 0.008 0.936 0.056
#> SRR772490 2 0.6518 -0.05655 0.004 0.512 0.484
#> SRR772491 2 0.6565 0.24605 0.008 0.576 0.416
#> SRR772492 2 0.1267 0.77869 0.004 0.972 0.024
#> SRR772493 2 0.1267 0.77869 0.004 0.972 0.024
#> SRR772494 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772495 2 0.0747 0.78654 0.000 0.984 0.016
#> SRR772496 2 0.2537 0.79496 0.000 0.920 0.080
#> SRR772497 2 0.2711 0.78769 0.000 0.912 0.088
#> SRR772498 2 0.3816 0.76972 0.000 0.852 0.148
#> SRR772499 2 0.2590 0.79660 0.004 0.924 0.072
#> SRR772500 2 0.1163 0.79410 0.000 0.972 0.028
#> SRR772501 2 0.1411 0.79440 0.000 0.964 0.036
#> SRR772502 2 0.5178 0.65935 0.000 0.744 0.256
#> SRR772503 2 0.5397 0.62983 0.000 0.720 0.280
#> SRR772504 2 0.1129 0.79319 0.004 0.976 0.020
#> SRR772505 2 0.0747 0.79248 0.000 0.984 0.016
#> SRR772506 2 0.0424 0.79083 0.000 0.992 0.008
#> SRR772507 2 0.0892 0.79325 0.000 0.980 0.020
#> SRR772508 2 0.0892 0.79218 0.000 0.980 0.020
#> SRR772509 2 0.7561 -0.07593 0.040 0.516 0.444
#> SRR772510 3 0.8392 0.60937 0.200 0.176 0.624
#> SRR772511 2 0.3644 0.78194 0.004 0.872 0.124
#> SRR772512 3 0.8561 0.66867 0.156 0.244 0.600
#> SRR772513 2 0.2356 0.79927 0.000 0.928 0.072
#> SRR772514 2 0.1643 0.79620 0.000 0.956 0.044
#> SRR772515 2 0.1289 0.79713 0.000 0.968 0.032
#> SRR772516 2 0.1753 0.79852 0.000 0.952 0.048
#> SRR772517 2 0.1267 0.79522 0.004 0.972 0.024
#> SRR772518 2 0.2165 0.79318 0.000 0.936 0.064
#> SRR772519 2 0.0892 0.78948 0.000 0.980 0.020
#> SRR772520 2 0.1411 0.79696 0.000 0.964 0.036
#> SRR772521 2 0.5591 0.58077 0.000 0.696 0.304
#> SRR772522 2 0.6229 0.49466 0.008 0.652 0.340
#> SRR772523 2 0.2066 0.79828 0.000 0.940 0.060
#> SRR772524 2 0.1753 0.79820 0.000 0.952 0.048
#> SRR772525 3 0.6309 -0.44901 0.500 0.000 0.500
#> SRR772526 2 0.0592 0.78778 0.000 0.988 0.012
#> SRR772527 2 0.0592 0.78778 0.000 0.988 0.012
#> SRR772528 3 0.6968 0.52237 0.148 0.120 0.732
#> SRR772529 2 0.5502 0.68044 0.008 0.744 0.248
#> SRR772530 2 0.6811 0.21427 0.016 0.580 0.404
#> SRR772531 3 0.6225 -0.33668 0.432 0.000 0.568
#> SRR772532 2 0.1031 0.79330 0.000 0.976 0.024
#> SRR772533 2 0.0592 0.79050 0.000 0.988 0.012
#> SRR772534 2 0.4605 0.72488 0.000 0.796 0.204
#> SRR772535 2 0.2496 0.79765 0.004 0.928 0.068
#> SRR772536 2 0.1765 0.79679 0.004 0.956 0.040
#> SRR772537 2 0.1525 0.78392 0.004 0.964 0.032
#> SRR772538 2 0.1525 0.77871 0.004 0.964 0.032
#> SRR772539 2 0.5480 0.64710 0.004 0.732 0.264
#> SRR772540 2 0.5109 0.70431 0.008 0.780 0.212
#> SRR772541 2 0.1267 0.79572 0.004 0.972 0.024
#> SRR772542 2 0.6617 0.16932 0.008 0.556 0.436
#> SRR772543 2 0.6308 -0.11992 0.000 0.508 0.492
#> SRR772544 3 0.8372 0.66119 0.152 0.228 0.620
#> SRR772545 2 0.6869 0.18397 0.016 0.560 0.424
#> SRR772546 2 0.6126 0.45284 0.004 0.644 0.352
#> SRR772547 2 0.6398 0.38917 0.008 0.620 0.372
#> SRR772548 2 0.7104 0.34098 0.032 0.608 0.360
#> SRR772549 3 0.6869 0.42082 0.016 0.424 0.560
#> SRR772550 3 0.6543 0.60161 0.016 0.344 0.640
#> SRR772551 2 0.4351 0.74679 0.004 0.828 0.168
#> SRR772552 2 0.3267 0.78090 0.000 0.884 0.116
#> SRR772553 2 0.7400 0.12010 0.036 0.552 0.412
#> SRR772554 2 0.1411 0.79448 0.000 0.964 0.036
#> SRR772555 2 0.1289 0.79540 0.000 0.968 0.032
#> SRR772556 2 0.5810 0.50240 0.000 0.664 0.336
#> SRR772557 2 0.6527 0.31159 0.008 0.588 0.404
#> SRR772558 2 0.5497 0.60592 0.000 0.708 0.292
#> SRR772559 3 0.6516 0.19229 0.004 0.480 0.516
#> SRR772560 2 0.4645 0.74638 0.008 0.816 0.176
#> SRR772561 3 0.8561 0.66867 0.156 0.244 0.600
#> SRR772562 2 0.1860 0.79431 0.000 0.948 0.052
#> SRR772563 2 0.2400 0.79897 0.004 0.932 0.064
#> SRR772564 3 0.6811 0.46573 0.016 0.404 0.580
#> SRR772565 3 0.6910 0.47504 0.020 0.396 0.584
#> SRR772566 3 0.6463 0.60079 0.080 0.164 0.756
#> SRR772567 3 0.5728 0.64856 0.032 0.196 0.772
#> SRR772568 2 0.1878 0.79775 0.004 0.952 0.044
#> SRR772569 2 0.1529 0.79474 0.000 0.960 0.040
#> SRR772570 2 0.6680 -0.09330 0.008 0.508 0.484
#> SRR772571 2 0.6373 0.31852 0.004 0.588 0.408
#> SRR772572 2 0.6869 0.19200 0.016 0.560 0.424
#> SRR772573 2 0.6244 0.20699 0.000 0.560 0.440
#> SRR772574 2 0.6252 0.14886 0.000 0.556 0.444
#> SRR772575 2 0.4291 0.73982 0.000 0.820 0.180
#> SRR772576 2 0.1765 0.79562 0.004 0.956 0.040
#> SRR772577 2 0.3896 0.76235 0.008 0.864 0.128
#> SRR772578 2 0.2301 0.79560 0.004 0.936 0.060
#> SRR772579 2 0.1647 0.79558 0.004 0.960 0.036
#> SRR772580 3 0.7022 0.28808 0.260 0.056 0.684
#> SRR772581 2 0.5835 0.49876 0.000 0.660 0.340
#> SRR772582 2 0.3784 0.77324 0.004 0.864 0.132
#> SRR772583 2 0.5919 0.63951 0.012 0.712 0.276
#> SRR772584 2 0.4235 0.75206 0.000 0.824 0.176
#> SRR772585 2 0.2400 0.79890 0.004 0.932 0.064
#> SRR772586 3 0.7221 0.56172 0.148 0.136 0.716
#> SRR772587 3 0.6518 0.19819 0.004 0.484 0.512
#> SRR772588 2 0.0424 0.78885 0.000 0.992 0.008
#> SRR772589 2 0.0747 0.78951 0.000 0.984 0.016
#> SRR772590 3 0.8561 0.66867 0.156 0.244 0.600
#> SRR772591 3 0.6662 0.63309 0.072 0.192 0.736
#> SRR772592 3 0.6685 0.66845 0.048 0.244 0.708
#> SRR772593 3 0.7016 0.59868 0.116 0.156 0.728
#> SRR772594 2 0.1399 0.79287 0.004 0.968 0.028
#> SRR772595 2 0.0747 0.79018 0.000 0.984 0.016
#> SRR772596 3 0.7085 0.47092 0.188 0.096 0.716
#> SRR772597 3 0.6875 0.28618 0.244 0.056 0.700
#> SRR772598 2 0.6275 0.46275 0.008 0.644 0.348
#> SRR772599 3 0.6641 0.35767 0.008 0.448 0.544
#> SRR772600 2 0.2301 0.76500 0.004 0.936 0.060
#> SRR772601 2 0.1765 0.77235 0.004 0.956 0.040
#> SRR772602 3 0.8494 0.66610 0.156 0.236 0.608
#> SRR772603 2 0.2680 0.77361 0.008 0.924 0.068
#> SRR772604 2 0.2486 0.77326 0.008 0.932 0.060
#> SRR772605 2 0.3644 0.77552 0.004 0.872 0.124
#> SRR772606 3 0.6763 0.37790 0.012 0.436 0.552
#> SRR772607 3 0.6659 0.28268 0.008 0.460 0.532
#> SRR772608 2 0.2261 0.79235 0.000 0.932 0.068
#> SRR772609 2 0.2945 0.79524 0.004 0.908 0.088
#> SRR772610 2 0.1031 0.78867 0.000 0.976 0.024
#> SRR772611 2 0.2165 0.79909 0.000 0.936 0.064
#> SRR772612 2 0.2496 0.76934 0.004 0.928 0.068
#> SRR772613 2 0.1647 0.77034 0.004 0.960 0.036
#> SRR772614 3 0.6565 0.46811 0.008 0.416 0.576
#> SRR772615 3 0.6633 0.68037 0.040 0.260 0.700
#> SRR772616 2 0.5864 0.59826 0.008 0.704 0.288
#> SRR772617 2 0.1989 0.76785 0.004 0.948 0.048
#> SRR772618 2 0.1878 0.77317 0.004 0.952 0.044
#> SRR772619 2 0.1267 0.77869 0.004 0.972 0.024
#> SRR772620 2 0.1267 0.77869 0.004 0.972 0.024
#> SRR772621 2 0.3116 0.78650 0.000 0.892 0.108
#> SRR772622 2 0.2959 0.78704 0.000 0.900 0.100
#> SRR772623 1 0.2804 0.95036 0.924 0.016 0.060
#> SRR772624 3 0.6962 0.45639 0.184 0.092 0.724
#> SRR772625 2 0.6814 0.31129 0.020 0.608 0.372
#> SRR772626 2 0.5201 0.69186 0.004 0.760 0.236
#> SRR772627 2 0.1399 0.79613 0.004 0.968 0.028
#> SRR772628 3 0.6520 0.18272 0.004 0.488 0.508
#> SRR772629 2 0.6204 0.27415 0.000 0.576 0.424
#> SRR772630 2 0.5201 0.69314 0.004 0.760 0.236
#> SRR772631 3 0.7097 0.61912 0.108 0.172 0.720
#> SRR772632 2 0.1860 0.79312 0.000 0.948 0.052
#> SRR772633 2 0.0592 0.79176 0.000 0.988 0.012
#> SRR772634 2 0.5138 0.66290 0.000 0.748 0.252
#> SRR772635 2 0.3941 0.75197 0.000 0.844 0.156
#> SRR772636 2 0.6796 0.32497 0.020 0.612 0.368
#> SRR772637 3 0.6427 0.59420 0.012 0.348 0.640
#> SRR772638 3 0.6686 0.54724 0.016 0.372 0.612
#> SRR772639 2 0.1878 0.79795 0.004 0.952 0.044
#> SRR772640 2 0.0592 0.78778 0.000 0.988 0.012
#> SRR772641 2 0.0892 0.79113 0.000 0.980 0.020
#> SRR772642 2 0.4605 0.71753 0.000 0.796 0.204
#> SRR772643 2 0.1765 0.79830 0.004 0.956 0.040
#> SRR772644 2 0.6129 0.52911 0.008 0.668 0.324
#> SRR772645 2 0.6505 -0.00026 0.004 0.528 0.468
#> SRR772646 2 0.0892 0.79253 0.000 0.980 0.020
#> SRR772647 2 0.1643 0.79766 0.000 0.956 0.044
#> SRR772648 2 0.3983 0.76879 0.004 0.852 0.144
#> SRR772649 2 0.2066 0.79806 0.000 0.940 0.060
#> SRR772650 2 0.4796 0.69313 0.000 0.780 0.220
#> SRR772651 2 0.5465 0.62269 0.000 0.712 0.288
#> SRR772652 2 0.6264 0.38895 0.004 0.616 0.380
#> SRR772653 2 0.6467 0.38127 0.008 0.604 0.388
#> SRR772654 2 0.4750 0.72643 0.000 0.784 0.216
#> SRR772655 2 0.4452 0.74120 0.000 0.808 0.192
#> SRR772656 2 0.8914 -0.00588 0.164 0.556 0.280
#> SRR772657 3 0.8561 0.66867 0.156 0.244 0.600
#> SRR772658 2 0.1647 0.77034 0.004 0.960 0.036
#> SRR772659 2 0.1647 0.77034 0.004 0.960 0.036
#> SRR772660 2 0.3412 0.78012 0.000 0.876 0.124
#> SRR772661 3 0.7758 0.67780 0.084 0.280 0.636
#> SRR772662 2 0.4842 0.70302 0.000 0.776 0.224
#> SRR772663 2 0.3715 0.78216 0.004 0.868 0.128
#> SRR772664 2 0.2878 0.78698 0.000 0.904 0.096
#> SRR772665 2 0.3038 0.78216 0.000 0.896 0.104
#> SRR772666 3 0.8218 0.61356 0.176 0.184 0.640
#> SRR772667 2 0.1129 0.78042 0.004 0.976 0.020
#> SRR772668 2 0.1647 0.77034 0.004 0.960 0.036
#> SRR772669 2 0.1647 0.77034 0.004 0.960 0.036
#> SRR772670 2 0.4682 0.73145 0.004 0.804 0.192
#> SRR772671 2 0.4555 0.73344 0.000 0.800 0.200
#> SRR772672 2 0.2590 0.79802 0.004 0.924 0.072
#> SRR772673 2 0.1765 0.79739 0.004 0.956 0.040
#> SRR772674 3 0.8353 0.63656 0.180 0.192 0.628
#> SRR772675 2 0.7748 -0.14582 0.048 0.500 0.452
#> SRR772676 2 0.6735 0.21509 0.012 0.564 0.424
#> SRR772677 2 0.6228 0.40390 0.004 0.624 0.372
#> SRR772678 3 0.7715 0.41614 0.048 0.428 0.524
#> SRR772679 2 0.3816 0.75685 0.000 0.852 0.148
#> SRR772680 2 0.5363 0.63692 0.000 0.724 0.276
#> SRR772681 3 0.8349 0.65687 0.156 0.220 0.624
#> SRR772682 2 0.0747 0.79219 0.000 0.984 0.016
#> SRR772683 2 0.1643 0.79668 0.000 0.956 0.044
#> SRR772685 2 0.0892 0.79253 0.000 0.980 0.020
#> SRR772686 3 0.7344 0.37068 0.240 0.080 0.680
#> SRR772687 1 0.3412 0.94306 0.876 0.000 0.124
#> SRR772688 2 0.1647 0.77034 0.004 0.960 0.036
#> SRR772689 2 0.1647 0.77586 0.004 0.960 0.036
#> SRR772690 3 0.7136 0.42039 0.212 0.084 0.704
#> SRR772691 2 0.6935 0.30042 0.024 0.604 0.372
#> SRR772692 2 0.5269 0.72595 0.016 0.784 0.200
#> SRR772693 2 0.3715 0.77835 0.004 0.868 0.128
#> SRR772694 2 0.2066 0.79878 0.000 0.940 0.060
#> SRR772695 2 0.3454 0.79173 0.008 0.888 0.104
#> SRR772696 2 0.2066 0.79650 0.000 0.940 0.060
#> SRR772697 2 0.1163 0.79695 0.000 0.972 0.028
#> SRR772698 3 0.6460 0.55507 0.112 0.124 0.764
#> SRR772699 2 0.5678 0.56932 0.000 0.684 0.316
#> SRR772700 2 0.4796 0.70289 0.000 0.780 0.220
#> SRR772701 2 0.6189 0.42726 0.004 0.632 0.364
#> SRR772702 2 0.6189 0.43683 0.004 0.632 0.364
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 2 0.6784 -0.30155 0.464 0.468 0.028 0.040
#> SRR772342 1 0.7422 0.49847 0.548 0.332 0.076 0.044
#> SRR772343 2 0.5536 0.55353 0.280 0.680 0.008 0.032
#> SRR772344 2 0.1388 0.77279 0.028 0.960 0.000 0.012
#> SRR772345 2 0.1059 0.77056 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR772346 2 0.4499 0.70320 0.160 0.792 0.000 0.048
#> SRR772347 2 0.5185 0.68243 0.172 0.760 0.008 0.060
#> SRR772348 2 0.3051 0.78030 0.088 0.884 0.000 0.028
#> SRR772349 2 0.2660 0.77524 0.056 0.908 0.000 0.036
#> SRR772350 3 0.4761 0.22201 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR772351 2 0.2759 0.75482 0.044 0.904 0.000 0.052
#> SRR772352 2 0.4072 0.75157 0.120 0.828 0.000 0.052
#> SRR772353 2 0.4895 0.63462 0.232 0.740 0.008 0.020
#> SRR772354 2 0.4005 0.70823 0.176 0.808 0.008 0.008
#> SRR772355 2 0.2589 0.77498 0.044 0.912 0.000 0.044
#> SRR772356 2 0.2197 0.77394 0.048 0.928 0.000 0.024
#> SRR772357 2 0.5454 0.49225 0.304 0.664 0.004 0.028
#> SRR772358 1 0.7066 0.48953 0.528 0.384 0.044 0.044
#> SRR772359 2 0.5960 0.05728 0.420 0.548 0.016 0.016
#> SRR772360 2 0.4054 0.71582 0.188 0.796 0.000 0.016
#> SRR772361 1 0.7268 0.14547 0.532 0.152 0.312 0.004
#> SRR772362 2 0.1151 0.76345 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR772363 2 0.1042 0.76449 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772364 2 0.5121 0.62984 0.096 0.772 0.004 0.128
#> SRR772365 2 0.7786 -0.03222 0.216 0.556 0.028 0.200
#> SRR772366 1 0.7216 -0.53228 0.504 0.036 0.400 0.060
#> SRR772367 3 0.6784 0.58161 0.460 0.040 0.472 0.028
#> SRR772368 2 0.1854 0.75379 0.012 0.940 0.000 0.048
#> SRR772369 2 0.4225 0.71587 0.184 0.792 0.000 0.024
#> SRR772370 2 0.3662 0.74743 0.148 0.836 0.004 0.012
#> SRR772371 1 0.7313 0.47553 0.544 0.344 0.036 0.076
#> SRR772372 2 0.6517 0.34163 0.316 0.612 0.032 0.040
#> SRR772373 2 0.2861 0.77548 0.096 0.888 0.000 0.016
#> SRR772374 2 0.1576 0.77973 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR772375 3 0.6522 0.61929 0.424 0.028 0.520 0.028
#> SRR772376 2 0.2021 0.78181 0.056 0.932 0.000 0.012
#> SRR772377 1 0.7797 0.41947 0.480 0.360 0.136 0.024
#> SRR772378 2 0.5847 0.47865 0.304 0.648 0.008 0.040
#> SRR772379 2 0.4244 0.74065 0.168 0.800 0.000 0.032
#> SRR772380 2 0.5565 0.49758 0.308 0.656 0.004 0.032
#> SRR772381 1 0.7416 0.08446 0.532 0.140 0.316 0.012
#> SRR772382 1 0.7212 0.39048 0.468 0.440 0.048 0.044
#> SRR772383 2 0.6696 -0.15251 0.436 0.500 0.036 0.028
#> SRR772384 1 0.7672 0.43035 0.508 0.340 0.128 0.024
#> SRR772385 1 0.7284 0.40887 0.480 0.412 0.088 0.020
#> SRR772386 2 0.3519 0.75864 0.128 0.852 0.004 0.016
#> SRR772387 2 0.1389 0.77760 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR772388 1 0.7405 -0.01256 0.636 0.084 0.192 0.088
#> SRR772389 1 0.6606 -0.09617 0.684 0.068 0.196 0.052
#> SRR772390 1 0.6910 -0.36270 0.572 0.056 0.340 0.032
#> SRR772391 1 0.7509 0.46089 0.500 0.384 0.044 0.072
#> SRR772392 2 0.6299 -0.23442 0.468 0.488 0.020 0.024
#> SRR772393 2 0.3907 0.75300 0.120 0.836 0.000 0.044
#> SRR772394 2 0.3842 0.75358 0.128 0.836 0.000 0.036
#> SRR772395 2 0.1489 0.77723 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR772396 1 0.7240 0.44369 0.496 0.408 0.040 0.056
#> SRR772397 1 0.7750 0.34468 0.612 0.180 0.128 0.080
#> SRR772398 1 0.7022 0.50309 0.548 0.360 0.064 0.028
#> SRR772399 1 0.6793 0.50163 0.552 0.372 0.048 0.028
#> SRR772400 1 0.6780 0.51141 0.620 0.284 0.064 0.032
#> SRR772401 1 0.6519 0.50079 0.672 0.228 0.052 0.048
#> SRR772402 2 0.3447 0.67034 0.020 0.852 0.000 0.128
#> SRR772403 2 0.2730 0.69565 0.016 0.896 0.000 0.088
#> SRR772404 2 0.2871 0.78320 0.072 0.896 0.000 0.032
#> SRR772405 1 0.7522 0.43942 0.536 0.320 0.120 0.024
#> SRR772406 2 0.3286 0.76328 0.080 0.876 0.000 0.044
#> SRR772407 2 0.2773 0.78106 0.072 0.900 0.000 0.028
#> SRR772408 2 0.1042 0.76456 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772409 2 0.1297 0.76936 0.020 0.964 0.000 0.016
#> SRR772410 2 0.4746 0.50494 0.304 0.688 0.000 0.008
#> SRR772411 2 0.4980 0.49582 0.304 0.680 0.000 0.016
#> SRR772412 2 0.6350 -0.10690 0.440 0.512 0.032 0.016
#> SRR772413 1 0.6459 0.32204 0.492 0.456 0.020 0.032
#> SRR772414 3 0.6735 0.52974 0.444 0.060 0.484 0.012
#> SRR772415 2 0.2731 0.77309 0.092 0.896 0.004 0.008
#> SRR772416 2 0.4033 0.73945 0.148 0.824 0.008 0.020
#> SRR772417 2 0.5112 0.61554 0.252 0.716 0.004 0.028
#> SRR772418 1 0.6735 -0.31685 0.580 0.056 0.340 0.024
#> SRR772419 2 0.1820 0.77643 0.036 0.944 0.000 0.020
#> SRR772420 2 0.1256 0.77256 0.028 0.964 0.000 0.008
#> SRR772421 2 0.2610 0.77839 0.088 0.900 0.000 0.012
#> SRR772422 2 0.3172 0.77163 0.112 0.872 0.004 0.012
#> SRR772423 2 0.3616 0.69275 0.036 0.852 0.000 0.112
#> SRR772424 2 0.2676 0.70420 0.012 0.896 0.000 0.092
#> SRR772425 2 0.2520 0.77530 0.088 0.904 0.004 0.004
#> SRR772426 2 0.1042 0.76456 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772427 2 0.1042 0.76456 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772428 1 0.6877 0.49022 0.548 0.372 0.048 0.032
#> SRR772429 1 0.6769 0.36828 0.476 0.456 0.024 0.044
#> SRR772430 2 0.5087 0.68934 0.176 0.760 0.004 0.060
#> SRR772431 2 0.2610 0.71492 0.012 0.900 0.000 0.088
#> SRR772432 2 0.2861 0.70461 0.016 0.888 0.000 0.096
#> SRR772433 1 0.7045 0.49269 0.556 0.348 0.068 0.028
#> SRR772434 1 0.7072 0.49234 0.632 0.240 0.080 0.048
#> SRR772435 2 0.4792 0.65965 0.220 0.752 0.008 0.020
#> SRR772436 2 0.6487 0.31928 0.344 0.588 0.016 0.052
#> SRR772437 1 0.7268 0.14547 0.532 0.152 0.312 0.004
#> SRR772438 1 0.8543 0.24462 0.440 0.364 0.100 0.096
#> SRR772439 1 0.7682 0.01205 0.620 0.092 0.180 0.108
#> SRR772440 2 0.2908 0.77122 0.064 0.896 0.000 0.040
#> SRR772441 2 0.3307 0.77274 0.104 0.868 0.000 0.028
#> SRR772442 2 0.2722 0.75745 0.032 0.904 0.000 0.064
#> SRR772443 2 0.4480 0.72539 0.096 0.816 0.004 0.084
#> SRR772444 1 0.6109 0.29830 0.504 0.460 0.016 0.020
#> SRR772445 2 0.5662 -0.00994 0.456 0.524 0.004 0.016
#> SRR772446 1 0.6210 0.26557 0.488 0.472 0.020 0.020
#> SRR772447 2 0.5099 0.30638 0.380 0.612 0.000 0.008
#> SRR772448 2 0.2943 0.75801 0.032 0.892 0.000 0.076
#> SRR772449 2 0.3372 0.77173 0.096 0.868 0.000 0.036
#> SRR772450 2 0.1411 0.76832 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR772451 2 0.1411 0.76832 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR772452 1 0.6538 0.47388 0.672 0.216 0.084 0.028
#> SRR772453 1 0.6612 0.51667 0.588 0.340 0.044 0.028
#> SRR772454 2 0.5369 0.48888 0.324 0.652 0.004 0.020
#> SRR772455 2 0.6305 0.20635 0.372 0.576 0.020 0.032
#> SRR772456 2 0.1059 0.76634 0.012 0.972 0.000 0.016
#> SRR772457 2 0.1297 0.76704 0.016 0.964 0.000 0.020
#> SRR772458 1 0.6765 0.49233 0.532 0.396 0.048 0.024
#> SRR772459 1 0.7041 0.50577 0.596 0.292 0.084 0.028
#> SRR772460 2 0.1174 0.76513 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR772461 2 0.1174 0.76513 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR772462 2 0.1677 0.77875 0.040 0.948 0.000 0.012
#> SRR772463 2 0.1004 0.77513 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR772464 1 0.6587 -0.56879 0.480 0.044 0.460 0.016
#> SRR772465 2 0.5390 0.63458 0.228 0.724 0.016 0.032
#> SRR772466 2 0.3032 0.76536 0.124 0.868 0.000 0.008
#> SRR772467 2 0.1297 0.76849 0.020 0.964 0.000 0.016
#> SRR772468 2 0.1406 0.77058 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR772469 1 0.6573 0.50192 0.564 0.372 0.032 0.032
#> SRR772470 1 0.6335 0.40229 0.524 0.428 0.016 0.032
#> SRR772471 2 0.6334 0.01072 0.416 0.536 0.024 0.024
#> SRR772472 2 0.6202 -0.16827 0.464 0.496 0.016 0.024
#> SRR772473 2 0.3383 0.72433 0.052 0.872 0.000 0.076
#> SRR772474 2 0.3383 0.75356 0.052 0.872 0.000 0.076
#> SRR772475 2 0.7254 -0.33845 0.440 0.456 0.084 0.020
#> SRR772476 2 0.1174 0.76513 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR772477 2 0.1042 0.76456 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772478 1 0.6422 0.47967 0.532 0.416 0.028 0.024
#> SRR772479 1 0.6517 0.51130 0.580 0.356 0.028 0.036
#> SRR772480 2 0.6456 0.46894 0.152 0.684 0.016 0.148
#> SRR772481 2 0.4940 0.63022 0.096 0.776 0.000 0.128
#> SRR772482 2 0.5970 0.19418 0.388 0.576 0.012 0.024
#> SRR772483 2 0.6263 -0.15481 0.460 0.496 0.012 0.032
#> SRR772484 2 0.1722 0.77808 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR772485 2 0.2342 0.77721 0.080 0.912 0.000 0.008
#> SRR772486 1 0.7592 0.44079 0.612 0.204 0.124 0.060
#> SRR772487 1 0.7171 0.45543 0.624 0.236 0.100 0.040
#> SRR772488 2 0.2871 0.73428 0.032 0.896 0.000 0.072
#> SRR772489 2 0.3542 0.74755 0.060 0.864 0.000 0.076
#> SRR772490 1 0.7011 0.50080 0.548 0.364 0.048 0.040
#> SRR772491 1 0.6335 0.41887 0.524 0.428 0.016 0.032
#> SRR772492 2 0.1970 0.74552 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772493 2 0.1970 0.74552 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772494 2 0.1042 0.76456 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772495 2 0.1174 0.76513 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR772496 2 0.3325 0.77135 0.112 0.864 0.000 0.024
#> SRR772497 2 0.3392 0.75969 0.124 0.856 0.000 0.020
#> SRR772498 2 0.4546 0.71025 0.188 0.780 0.004 0.028
#> SRR772499 2 0.3325 0.77677 0.112 0.864 0.000 0.024
#> SRR772500 2 0.1576 0.77769 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR772501 2 0.1256 0.77734 0.028 0.964 0.000 0.008
#> SRR772502 2 0.5349 0.41462 0.336 0.640 0.000 0.024
#> SRR772503 2 0.5891 0.35985 0.348 0.612 0.008 0.032
#> SRR772504 2 0.1820 0.77491 0.036 0.944 0.000 0.020
#> SRR772505 2 0.1305 0.77439 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR772506 2 0.1004 0.77172 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR772507 2 0.1356 0.77450 0.032 0.960 0.000 0.008
#> SRR772508 2 0.1411 0.77265 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR772509 1 0.7436 0.41884 0.492 0.388 0.096 0.024
#> SRR772510 1 0.7404 -0.20687 0.508 0.096 0.372 0.024
#> SRR772511 2 0.4050 0.73550 0.168 0.808 0.000 0.024
#> SRR772512 1 0.7304 0.14837 0.528 0.156 0.312 0.004
#> SRR772513 2 0.3160 0.77430 0.108 0.872 0.000 0.020
#> SRR772514 2 0.1722 0.78054 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR772515 2 0.2222 0.78380 0.060 0.924 0.000 0.016
#> SRR772516 2 0.2197 0.78212 0.048 0.928 0.000 0.024
#> SRR772517 2 0.2032 0.77480 0.028 0.936 0.000 0.036
#> SRR772518 2 0.2876 0.77734 0.092 0.892 0.008 0.008
#> SRR772519 2 0.0937 0.76943 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR772520 2 0.1798 0.78109 0.040 0.944 0.000 0.016
#> SRR772521 2 0.6648 0.16315 0.364 0.560 0.012 0.064
#> SRR772522 2 0.6250 -0.08150 0.444 0.512 0.012 0.032
#> SRR772523 2 0.2334 0.78025 0.088 0.908 0.000 0.004
#> SRR772524 2 0.1938 0.78224 0.052 0.936 0.000 0.012
#> SRR772525 3 0.6352 0.50998 0.260 0.000 0.632 0.108
#> SRR772526 2 0.1182 0.76766 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR772527 2 0.1182 0.76766 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR772528 1 0.6896 -0.38595 0.564 0.048 0.352 0.036
#> SRR772529 2 0.5968 0.39711 0.328 0.624 0.008 0.040
#> SRR772530 2 0.7371 -0.40220 0.440 0.456 0.068 0.036
#> SRR772531 3 0.6141 0.54152 0.300 0.000 0.624 0.076
#> SRR772532 2 0.1452 0.77634 0.036 0.956 0.000 0.008
#> SRR772533 2 0.1059 0.77005 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR772534 2 0.5337 0.52212 0.300 0.672 0.004 0.024
#> SRR772535 2 0.3611 0.76084 0.080 0.860 0.000 0.060
#> SRR772536 2 0.2002 0.78138 0.044 0.936 0.000 0.020
#> SRR772537 2 0.2363 0.75017 0.024 0.920 0.000 0.056
#> SRR772538 2 0.2048 0.73527 0.008 0.928 0.000 0.064
#> SRR772539 2 0.6374 0.26160 0.356 0.580 0.008 0.056
#> SRR772540 2 0.5770 0.53316 0.280 0.672 0.016 0.032
#> SRR772541 2 0.2224 0.77664 0.032 0.928 0.000 0.040
#> SRR772542 1 0.7213 0.45751 0.516 0.388 0.044 0.052
#> SRR772543 1 0.7001 0.49708 0.568 0.340 0.040 0.052
#> SRR772544 1 0.7496 0.08792 0.516 0.144 0.328 0.012
#> SRR772545 1 0.6158 0.44033 0.536 0.424 0.016 0.024
#> SRR772546 2 0.6194 -0.16031 0.452 0.508 0.016 0.024
#> SRR772547 1 0.6289 0.27223 0.484 0.472 0.016 0.028
#> SRR772548 2 0.7322 -0.32772 0.436 0.460 0.028 0.076
#> SRR772549 1 0.7147 0.49667 0.612 0.268 0.056 0.064
#> SRR772550 1 0.7278 0.44417 0.636 0.204 0.104 0.056
#> SRR772551 2 0.5644 0.57006 0.248 0.696 0.008 0.048
#> SRR772552 2 0.4579 0.68358 0.200 0.768 0.000 0.032
#> SRR772553 1 0.7299 0.38919 0.460 0.432 0.088 0.020
#> SRR772554 2 0.1639 0.77914 0.036 0.952 0.004 0.008
#> SRR772555 2 0.1545 0.77815 0.040 0.952 0.000 0.008
#> SRR772556 2 0.5990 -0.16001 0.476 0.492 0.008 0.024
#> SRR772557 1 0.6561 0.38354 0.512 0.428 0.016 0.044
#> SRR772558 2 0.5723 0.25966 0.388 0.580 0.000 0.032
#> SRR772559 1 0.7023 0.51449 0.576 0.328 0.056 0.040
#> SRR772560 2 0.5385 0.64825 0.216 0.728 0.008 0.048
#> SRR772561 1 0.7304 0.14837 0.528 0.156 0.312 0.004
#> SRR772562 2 0.1824 0.77775 0.060 0.936 0.000 0.004
#> SRR772563 2 0.2142 0.78304 0.056 0.928 0.000 0.016
#> SRR772564 1 0.6472 0.49994 0.664 0.244 0.056 0.036
#> SRR772565 1 0.6187 0.50352 0.684 0.236 0.044 0.036
#> SRR772566 1 0.7065 -0.10196 0.636 0.072 0.236 0.056
#> SRR772567 1 0.6529 0.12030 0.692 0.096 0.176 0.036
#> SRR772568 2 0.1610 0.78141 0.032 0.952 0.000 0.016
#> SRR772569 2 0.1302 0.77696 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR772570 1 0.6613 0.47949 0.548 0.388 0.036 0.028
#> SRR772571 1 0.6719 0.30215 0.472 0.460 0.016 0.052
#> SRR772572 1 0.6505 0.44570 0.528 0.416 0.032 0.024
#> SRR772573 1 0.6072 0.49002 0.576 0.384 0.020 0.020
#> SRR772574 1 0.6482 0.48022 0.540 0.404 0.024 0.032
#> SRR772575 2 0.4610 0.64306 0.236 0.744 0.000 0.020
#> SRR772576 2 0.2032 0.77351 0.036 0.936 0.000 0.028
#> SRR772577 2 0.5015 0.69602 0.120 0.780 0.004 0.096
#> SRR772578 2 0.3245 0.77043 0.064 0.880 0.000 0.056
#> SRR772579 2 0.2197 0.77431 0.048 0.928 0.000 0.024
#> SRR772580 3 0.6686 0.61839 0.424 0.032 0.512 0.032
#> SRR772581 2 0.6505 -0.11430 0.424 0.520 0.020 0.036
#> SRR772582 2 0.4375 0.70714 0.180 0.788 0.000 0.032
#> SRR772583 2 0.6040 0.40474 0.324 0.620 0.004 0.052
#> SRR772584 2 0.4975 0.66821 0.208 0.752 0.008 0.032
#> SRR772585 2 0.3731 0.76776 0.072 0.860 0.004 0.064
#> SRR772586 1 0.6944 -0.33452 0.580 0.056 0.328 0.036
#> SRR772587 1 0.7025 0.51680 0.568 0.336 0.064 0.032
#> SRR772588 2 0.1182 0.76735 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR772589 2 0.1520 0.77081 0.024 0.956 0.000 0.020
#> SRR772590 1 0.7268 0.14547 0.532 0.152 0.312 0.004
#> SRR772591 1 0.7108 -0.02052 0.636 0.096 0.224 0.044
#> SRR772592 1 0.7220 0.19080 0.644 0.128 0.180 0.048
#> SRR772593 1 0.7043 -0.18472 0.588 0.080 0.304 0.028
#> SRR772594 2 0.1520 0.77282 0.024 0.956 0.000 0.020
#> SRR772595 2 0.1174 0.77356 0.020 0.968 0.000 0.012
#> SRR772596 1 0.7198 -0.44741 0.524 0.048 0.380 0.048
#> SRR772597 3 0.6590 0.61154 0.420 0.036 0.520 0.024
#> SRR772598 2 0.7205 -0.17933 0.404 0.500 0.032 0.064
#> SRR772599 1 0.7304 0.49219 0.572 0.312 0.064 0.052
#> SRR772600 2 0.3501 0.66117 0.020 0.848 0.000 0.132
#> SRR772601 2 0.2861 0.69325 0.016 0.888 0.000 0.096
#> SRR772602 1 0.7312 0.13707 0.520 0.152 0.324 0.004
#> SRR772603 2 0.3674 0.68735 0.036 0.848 0.000 0.116
#> SRR772604 2 0.3598 0.68301 0.028 0.848 0.000 0.124
#> SRR772605 2 0.4745 0.71126 0.168 0.784 0.008 0.040
#> SRR772606 1 0.7584 0.44709 0.560 0.304 0.076 0.060
#> SRR772607 1 0.6819 0.52248 0.600 0.308 0.064 0.028
#> SRR772608 2 0.2611 0.77087 0.096 0.896 0.000 0.008
#> SRR772609 2 0.3335 0.76626 0.128 0.856 0.000 0.016
#> SRR772610 2 0.1888 0.75841 0.016 0.940 0.000 0.044
#> SRR772611 2 0.3051 0.78291 0.088 0.884 0.000 0.028
#> SRR772612 2 0.3731 0.68576 0.036 0.844 0.000 0.120
#> SRR772613 2 0.2611 0.69635 0.008 0.896 0.000 0.096
#> SRR772614 1 0.7346 0.48331 0.576 0.300 0.080 0.044
#> SRR772615 1 0.6662 0.32562 0.688 0.136 0.140 0.036
#> SRR772616 2 0.6309 0.09011 0.408 0.540 0.008 0.044
#> SRR772617 2 0.2924 0.69726 0.016 0.884 0.000 0.100
#> SRR772618 2 0.2987 0.71697 0.016 0.880 0.000 0.104
#> SRR772619 2 0.1970 0.74552 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772620 2 0.1807 0.74781 0.008 0.940 0.000 0.052
#> SRR772621 2 0.3523 0.75367 0.136 0.848 0.008 0.008
#> SRR772622 2 0.3501 0.75639 0.132 0.848 0.000 0.020
#> SRR772623 3 0.5592 0.19257 0.008 0.016 0.608 0.368
#> SRR772624 1 0.6843 -0.45636 0.540 0.040 0.384 0.036
#> SRR772625 2 0.6898 -0.25656 0.432 0.484 0.072 0.012
#> SRR772626 2 0.6192 0.53884 0.248 0.664 0.008 0.080
#> SRR772627 2 0.2313 0.77387 0.044 0.924 0.000 0.032
#> SRR772628 1 0.7279 0.50157 0.576 0.308 0.048 0.068
#> SRR772629 1 0.6829 0.42202 0.504 0.424 0.028 0.044
#> SRR772630 2 0.5853 0.44430 0.316 0.636 0.004 0.044
#> SRR772631 1 0.7242 -0.11351 0.576 0.096 0.300 0.028
#> SRR772632 2 0.1716 0.77571 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR772633 2 0.1042 0.77195 0.020 0.972 0.000 0.008
#> SRR772634 2 0.5787 0.39126 0.344 0.620 0.008 0.028
#> SRR772635 2 0.4240 0.68695 0.200 0.784 0.004 0.012
#> SRR772636 2 0.6898 -0.25082 0.432 0.484 0.072 0.012
#> SRR772637 1 0.6758 0.43993 0.668 0.192 0.108 0.032
#> SRR772638 1 0.7115 0.48510 0.620 0.252 0.088 0.040
#> SRR772639 2 0.1975 0.78213 0.048 0.936 0.000 0.016
#> SRR772640 2 0.1297 0.76929 0.020 0.964 0.000 0.016
#> SRR772641 2 0.1510 0.77106 0.028 0.956 0.000 0.016
#> SRR772642 2 0.5449 0.53486 0.288 0.676 0.004 0.032
#> SRR772643 2 0.2402 0.78279 0.076 0.912 0.000 0.012
#> SRR772644 2 0.6243 0.05058 0.412 0.540 0.008 0.040
#> SRR772645 1 0.7027 0.46652 0.516 0.400 0.044 0.040
#> SRR772646 2 0.1256 0.77444 0.028 0.964 0.000 0.008
#> SRR772647 2 0.1677 0.78000 0.040 0.948 0.000 0.012
#> SRR772648 2 0.3991 0.72249 0.172 0.808 0.000 0.020
#> SRR772649 2 0.1902 0.78122 0.064 0.932 0.000 0.004
#> SRR772650 2 0.5003 0.50497 0.308 0.676 0.000 0.016
#> SRR772651 2 0.6007 0.27648 0.372 0.584 0.004 0.040
#> SRR772652 1 0.6550 0.29783 0.484 0.460 0.024 0.032
#> SRR772653 1 0.6790 0.27228 0.476 0.456 0.036 0.032
#> SRR772654 2 0.5047 0.60331 0.256 0.716 0.004 0.024
#> SRR772655 2 0.4756 0.65304 0.232 0.744 0.004 0.020
#> SRR772656 4 0.9589 0.00000 0.128 0.308 0.228 0.336
#> SRR772657 1 0.7268 0.14547 0.532 0.152 0.312 0.004
#> SRR772658 2 0.2676 0.70238 0.012 0.896 0.000 0.092
#> SRR772659 2 0.2676 0.70238 0.012 0.896 0.000 0.092
#> SRR772660 2 0.3428 0.74742 0.144 0.844 0.000 0.012
#> SRR772661 1 0.7893 0.30549 0.544 0.180 0.244 0.032
#> SRR772662 2 0.5303 0.53104 0.288 0.684 0.008 0.020
#> SRR772663 2 0.4532 0.73428 0.156 0.792 0.000 0.052
#> SRR772664 2 0.3142 0.75907 0.132 0.860 0.000 0.008
#> SRR772665 2 0.3157 0.75208 0.144 0.852 0.000 0.004
#> SRR772666 1 0.7221 -0.18790 0.488 0.112 0.392 0.008
#> SRR772667 2 0.2179 0.74381 0.012 0.924 0.000 0.064
#> SRR772668 2 0.2546 0.70722 0.008 0.900 0.000 0.092
#> SRR772669 2 0.2546 0.70722 0.008 0.900 0.000 0.092
#> SRR772670 2 0.5484 0.54541 0.272 0.688 0.008 0.032
#> SRR772671 2 0.5401 0.59379 0.260 0.700 0.008 0.032
#> SRR772672 2 0.2635 0.78182 0.076 0.904 0.000 0.020
#> SRR772673 2 0.2115 0.78179 0.036 0.936 0.004 0.024
#> SRR772674 1 0.7398 -0.08779 0.536 0.104 0.336 0.024
#> SRR772675 1 0.7533 0.42185 0.500 0.368 0.108 0.024
#> SRR772676 1 0.6990 0.44279 0.504 0.412 0.024 0.060
#> SRR772677 2 0.6202 -0.20379 0.464 0.496 0.016 0.024
#> SRR772678 1 0.7718 0.41983 0.524 0.308 0.144 0.024
#> SRR772679 2 0.3992 0.70653 0.188 0.800 0.004 0.008
#> SRR772680 2 0.6296 0.38573 0.324 0.616 0.024 0.036
#> SRR772681 1 0.7163 0.02499 0.528 0.132 0.336 0.004
#> SRR772682 2 0.1356 0.77684 0.032 0.960 0.000 0.008
#> SRR772683 2 0.1767 0.78116 0.044 0.944 0.000 0.012
#> SRR772685 2 0.1510 0.77447 0.028 0.956 0.000 0.016
#> SRR772686 3 0.6639 0.56460 0.436 0.048 0.500 0.016
#> SRR772687 3 0.6052 0.25837 0.064 0.000 0.616 0.320
#> SRR772688 2 0.2610 0.70777 0.012 0.900 0.000 0.088
#> SRR772689 2 0.2101 0.73542 0.012 0.928 0.000 0.060
#> SRR772690 3 0.6441 0.53844 0.464 0.048 0.480 0.008
#> SRR772691 2 0.6955 -0.27747 0.436 0.476 0.076 0.012
#> SRR772692 2 0.5291 0.61469 0.264 0.700 0.004 0.032
#> SRR772693 2 0.3836 0.73566 0.168 0.816 0.000 0.016
#> SRR772694 2 0.2521 0.78297 0.064 0.912 0.000 0.024
#> SRR772695 2 0.4057 0.74764 0.160 0.812 0.000 0.028
#> SRR772696 2 0.2216 0.77654 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772697 2 0.1863 0.78167 0.040 0.944 0.004 0.012
#> SRR772698 1 0.6843 -0.29951 0.584 0.060 0.328 0.028
#> SRR772699 2 0.5712 0.22444 0.404 0.572 0.012 0.012
#> SRR772700 2 0.5560 0.46659 0.324 0.644 0.004 0.028
#> SRR772701 2 0.6766 -0.22044 0.448 0.484 0.044 0.024
#> SRR772702 2 0.6382 -0.18897 0.464 0.488 0.020 0.028
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.6536 0.6081 0.496 0.384 0.052 0.000 0.068
#> SRR772342 1 0.7246 0.5588 0.540 0.244 0.136 0.004 0.076
#> SRR772343 2 0.5228 0.3185 0.364 0.592 0.012 0.000 0.032
#> SRR772344 2 0.1041 0.7728 0.032 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR772345 2 0.1106 0.7753 0.024 0.964 0.000 0.000 0.012
#> SRR772346 2 0.5099 0.6104 0.204 0.720 0.012 0.012 0.052
#> SRR772347 2 0.5331 0.5857 0.228 0.692 0.008 0.016 0.056
#> SRR772348 2 0.3031 0.7733 0.120 0.856 0.000 0.004 0.020
#> SRR772349 2 0.2448 0.7788 0.088 0.892 0.000 0.000 0.020
#> SRR772350 4 0.2179 0.8371 0.000 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR772351 2 0.2983 0.7586 0.096 0.864 0.000 0.000 0.040
#> SRR772352 2 0.4117 0.7349 0.160 0.788 0.004 0.004 0.044
#> SRR772353 2 0.4848 0.5119 0.272 0.684 0.016 0.000 0.028
#> SRR772354 2 0.3786 0.6645 0.204 0.776 0.004 0.000 0.016
#> SRR772355 2 0.2608 0.7793 0.088 0.888 0.000 0.004 0.020
#> SRR772356 2 0.2570 0.7820 0.084 0.888 0.000 0.000 0.028
#> SRR772357 2 0.5557 0.2298 0.356 0.584 0.012 0.004 0.044
#> SRR772358 1 0.7218 0.6221 0.504 0.320 0.100 0.008 0.068
#> SRR772359 2 0.6008 -0.3579 0.436 0.484 0.052 0.000 0.028
#> SRR772360 2 0.4124 0.6531 0.232 0.744 0.008 0.000 0.016
#> SRR772361 3 0.6693 0.6041 0.400 0.096 0.472 0.020 0.012
#> SRR772362 2 0.1117 0.7697 0.020 0.964 0.000 0.000 0.016
#> SRR772363 2 0.1012 0.7701 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR772364 2 0.5624 0.5492 0.176 0.696 0.028 0.004 0.096
#> SRR772365 2 0.8000 -0.0747 0.264 0.476 0.064 0.032 0.164
#> SRR772366 3 0.6985 0.6115 0.264 0.024 0.564 0.116 0.032
#> SRR772367 3 0.5621 0.6201 0.224 0.020 0.680 0.064 0.012
#> SRR772368 2 0.1774 0.7657 0.052 0.932 0.000 0.000 0.016
#> SRR772369 2 0.3977 0.6756 0.204 0.764 0.000 0.000 0.032
#> SRR772370 2 0.3631 0.7126 0.180 0.800 0.004 0.004 0.012
#> SRR772371 1 0.6755 0.6100 0.580 0.252 0.056 0.004 0.108
#> SRR772372 2 0.6042 -0.0818 0.380 0.532 0.060 0.000 0.028
#> SRR772373 2 0.2731 0.7723 0.104 0.876 0.000 0.004 0.016
#> SRR772374 2 0.1571 0.7780 0.060 0.936 0.000 0.000 0.004
#> SRR772375 3 0.5502 0.5710 0.184 0.016 0.700 0.092 0.008
#> SRR772376 2 0.2276 0.7784 0.076 0.908 0.004 0.004 0.008
#> SRR772377 1 0.7424 0.5198 0.444 0.312 0.208 0.020 0.016
#> SRR772378 2 0.5394 0.2258 0.364 0.580 0.008 0.000 0.048
#> SRR772379 2 0.3663 0.7198 0.208 0.776 0.000 0.000 0.016
#> SRR772380 2 0.5228 0.2807 0.364 0.592 0.012 0.000 0.032
#> SRR772381 3 0.6623 0.6256 0.392 0.092 0.484 0.024 0.008
#> SRR772382 1 0.6675 0.6487 0.512 0.360 0.076 0.004 0.048
#> SRR772383 1 0.6814 0.5384 0.460 0.408 0.060 0.004 0.068
#> SRR772384 1 0.7240 0.4822 0.448 0.296 0.232 0.012 0.012
#> SRR772385 1 0.6985 0.5654 0.436 0.372 0.172 0.008 0.012
#> SRR772386 2 0.3567 0.7402 0.144 0.820 0.004 0.000 0.032
#> SRR772387 2 0.1697 0.7760 0.060 0.932 0.000 0.000 0.008
#> SRR772388 1 0.8244 -0.4886 0.404 0.052 0.340 0.052 0.152
#> SRR772389 1 0.7736 -0.5211 0.440 0.044 0.360 0.040 0.116
#> SRR772390 3 0.6423 0.6802 0.324 0.040 0.572 0.032 0.032
#> SRR772391 1 0.6803 0.6569 0.536 0.308 0.080 0.000 0.076
#> SRR772392 1 0.6001 0.6241 0.536 0.380 0.052 0.000 0.032
#> SRR772393 2 0.3805 0.7329 0.156 0.808 0.008 0.004 0.024
#> SRR772394 2 0.3966 0.7183 0.176 0.784 0.004 0.000 0.036
#> SRR772395 2 0.1408 0.7769 0.044 0.948 0.000 0.000 0.008
#> SRR772396 1 0.7419 0.6502 0.476 0.340 0.096 0.012 0.076
#> SRR772397 1 0.7906 -0.2757 0.512 0.088 0.240 0.032 0.128
#> SRR772398 1 0.6913 0.6226 0.540 0.288 0.128 0.008 0.036
#> SRR772399 1 0.6849 0.6330 0.568 0.272 0.092 0.008 0.060
#> SRR772400 1 0.6968 0.4431 0.576 0.204 0.136 0.000 0.084
#> SRR772401 1 0.7217 0.3502 0.592 0.156 0.128 0.012 0.112
#> SRR772402 2 0.4146 0.6692 0.088 0.804 0.000 0.012 0.096
#> SRR772403 2 0.3051 0.7098 0.076 0.864 0.000 0.000 0.060
#> SRR772404 2 0.2575 0.7815 0.100 0.884 0.004 0.000 0.012
#> SRR772405 1 0.7301 0.4773 0.472 0.276 0.220 0.016 0.016
#> SRR772406 2 0.3606 0.7520 0.120 0.832 0.004 0.004 0.040
#> SRR772407 2 0.2669 0.7807 0.104 0.876 0.000 0.000 0.020
#> SRR772408 2 0.1012 0.7701 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR772409 2 0.0992 0.7726 0.024 0.968 0.000 0.000 0.008
#> SRR772410 2 0.4866 0.2869 0.352 0.620 0.012 0.000 0.016
#> SRR772411 2 0.5131 0.2621 0.352 0.608 0.016 0.000 0.024
#> SRR772412 1 0.6550 0.5089 0.468 0.428 0.052 0.012 0.040
#> SRR772413 1 0.6565 0.6272 0.512 0.376 0.068 0.012 0.032
#> SRR772414 3 0.5227 0.6282 0.200 0.032 0.720 0.036 0.012
#> SRR772415 2 0.2672 0.7611 0.116 0.872 0.004 0.000 0.008
#> SRR772416 2 0.3966 0.7008 0.176 0.784 0.004 0.000 0.036
#> SRR772417 2 0.4954 0.4233 0.336 0.628 0.008 0.000 0.028
#> SRR772418 3 0.6303 0.6744 0.332 0.036 0.572 0.024 0.036
#> SRR772419 2 0.1597 0.7799 0.048 0.940 0.000 0.000 0.012
#> SRR772420 2 0.1041 0.7731 0.032 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR772421 2 0.2573 0.7725 0.104 0.880 0.000 0.000 0.016
#> SRR772422 2 0.3218 0.7609 0.128 0.844 0.000 0.004 0.024
#> SRR772423 2 0.3827 0.7008 0.112 0.816 0.004 0.000 0.068
#> SRR772424 2 0.3159 0.7147 0.088 0.856 0.000 0.000 0.056
#> SRR772425 2 0.2249 0.7708 0.096 0.896 0.000 0.000 0.008
#> SRR772426 2 0.1012 0.7701 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR772427 2 0.1012 0.7701 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR772428 1 0.6882 0.6487 0.540 0.304 0.084 0.004 0.068
#> SRR772429 1 0.6932 0.6444 0.488 0.368 0.036 0.012 0.096
#> SRR772430 2 0.4983 0.5601 0.268 0.676 0.008 0.000 0.048
#> SRR772431 2 0.2719 0.7299 0.068 0.884 0.000 0.000 0.048
#> SRR772432 2 0.3033 0.7210 0.084 0.864 0.000 0.000 0.052
#> SRR772433 1 0.7018 0.5754 0.512 0.276 0.172 0.000 0.040
#> SRR772434 1 0.6770 0.2895 0.604 0.156 0.160 0.000 0.080
#> SRR772435 2 0.4982 0.5578 0.252 0.692 0.024 0.000 0.032
#> SRR772436 2 0.6559 -0.0232 0.364 0.520 0.036 0.008 0.072
#> SRR772437 3 0.6693 0.6041 0.400 0.096 0.472 0.020 0.012
#> SRR772438 1 0.8555 0.3190 0.392 0.240 0.184 0.012 0.172
#> SRR772439 1 0.8048 -0.5131 0.388 0.036 0.376 0.056 0.144
#> SRR772440 2 0.2984 0.7714 0.108 0.860 0.000 0.000 0.032
#> SRR772441 2 0.3152 0.7659 0.136 0.840 0.000 0.000 0.024
#> SRR772442 2 0.2903 0.7681 0.080 0.872 0.000 0.000 0.048
#> SRR772443 2 0.4109 0.7204 0.148 0.788 0.000 0.004 0.060
#> SRR772444 1 0.6638 0.6117 0.496 0.388 0.048 0.008 0.060
#> SRR772445 1 0.6128 0.4643 0.488 0.428 0.024 0.004 0.056
#> SRR772446 1 0.6202 0.6207 0.536 0.376 0.040 0.008 0.040
#> SRR772447 2 0.5248 -0.0271 0.416 0.548 0.024 0.004 0.008
#> SRR772448 2 0.3047 0.7611 0.084 0.868 0.000 0.004 0.044
#> SRR772449 2 0.3304 0.7652 0.128 0.840 0.004 0.000 0.028
#> SRR772450 2 0.1281 0.7722 0.032 0.956 0.000 0.000 0.012
#> SRR772451 2 0.1082 0.7713 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008
#> SRR772452 1 0.7440 0.0800 0.568 0.136 0.196 0.024 0.076
#> SRR772453 1 0.7285 0.5733 0.520 0.264 0.148 0.004 0.064
#> SRR772454 2 0.5321 0.2006 0.388 0.568 0.020 0.000 0.024
#> SRR772455 2 0.6177 -0.3153 0.440 0.476 0.040 0.004 0.040
#> SRR772456 2 0.0771 0.7706 0.020 0.976 0.000 0.000 0.004
#> SRR772457 2 0.1082 0.7714 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008
#> SRR772458 1 0.6578 0.6610 0.564 0.304 0.068 0.004 0.060
#> SRR772459 1 0.7361 0.4770 0.532 0.212 0.180 0.004 0.072
#> SRR772460 2 0.0898 0.7697 0.020 0.972 0.000 0.000 0.008
#> SRR772461 2 0.0898 0.7697 0.020 0.972 0.000 0.000 0.008
#> SRR772462 2 0.1502 0.7827 0.056 0.940 0.000 0.000 0.004
#> SRR772463 2 0.1082 0.7761 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008
#> SRR772464 3 0.5544 0.6590 0.252 0.024 0.664 0.056 0.004
#> SRR772465 2 0.5169 0.4815 0.300 0.648 0.024 0.000 0.028
#> SRR772466 2 0.3154 0.7471 0.148 0.836 0.004 0.000 0.012
#> SRR772467 2 0.1082 0.7733 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008
#> SRR772468 2 0.1041 0.7724 0.032 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR772469 1 0.6689 0.6131 0.584 0.268 0.080 0.008 0.060
#> SRR772470 1 0.6243 0.6666 0.560 0.340 0.044 0.004 0.052
#> SRR772471 1 0.6456 0.4363 0.448 0.448 0.060 0.004 0.040
#> SRR772472 1 0.6170 0.5607 0.508 0.400 0.052 0.000 0.040
#> SRR772473 2 0.3506 0.7247 0.104 0.832 0.000 0.000 0.064
#> SRR772474 2 0.4077 0.7310 0.120 0.808 0.004 0.008 0.060
#> SRR772475 1 0.6860 0.5349 0.424 0.408 0.148 0.008 0.012
#> SRR772476 2 0.0898 0.7697 0.020 0.972 0.000 0.000 0.008
#> SRR772477 2 0.1012 0.7701 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR772478 1 0.6109 0.6604 0.568 0.328 0.084 0.004 0.016
#> SRR772479 1 0.6680 0.6402 0.580 0.280 0.076 0.012 0.052
#> SRR772480 2 0.6205 0.3761 0.212 0.624 0.020 0.004 0.140
#> SRR772481 2 0.5770 0.5122 0.172 0.680 0.008 0.016 0.124
#> SRR772482 2 0.6307 -0.3079 0.428 0.484 0.044 0.012 0.032
#> SRR772483 1 0.6161 0.5052 0.496 0.424 0.044 0.012 0.024
#> SRR772484 2 0.1764 0.7770 0.064 0.928 0.000 0.000 0.008
#> SRR772485 2 0.2228 0.7669 0.092 0.900 0.004 0.000 0.004
#> SRR772486 1 0.7827 -0.0175 0.520 0.128 0.220 0.020 0.112
#> SRR772487 1 0.7348 0.2707 0.540 0.180 0.208 0.008 0.064
#> SRR772488 2 0.2712 0.7503 0.088 0.880 0.000 0.000 0.032
#> SRR772489 2 0.3339 0.7509 0.124 0.836 0.000 0.000 0.040
#> SRR772490 1 0.7162 0.6307 0.544 0.276 0.100 0.012 0.068
#> SRR772491 1 0.6543 0.6680 0.536 0.344 0.052 0.004 0.064
#> SRR772492 2 0.2139 0.7598 0.052 0.916 0.000 0.000 0.032
#> SRR772493 2 0.2139 0.7598 0.052 0.916 0.000 0.000 0.032
#> SRR772494 2 0.1012 0.7701 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR772495 2 0.0898 0.7697 0.020 0.972 0.000 0.000 0.008
#> SRR772496 2 0.3256 0.7538 0.148 0.832 0.000 0.004 0.016
#> SRR772497 2 0.3606 0.7308 0.164 0.808 0.004 0.000 0.024
#> SRR772498 2 0.4295 0.6269 0.248 0.724 0.004 0.000 0.024
#> SRR772499 2 0.3478 0.7628 0.136 0.828 0.004 0.000 0.032
#> SRR772500 2 0.1557 0.7753 0.052 0.940 0.000 0.000 0.008
#> SRR772501 2 0.1331 0.7782 0.040 0.952 0.000 0.000 0.008
#> SRR772502 2 0.5516 0.1429 0.376 0.572 0.028 0.004 0.020
#> SRR772503 2 0.5704 0.0220 0.396 0.544 0.020 0.004 0.036
#> SRR772504 2 0.1725 0.7789 0.044 0.936 0.000 0.000 0.020
#> SRR772505 2 0.1205 0.7742 0.040 0.956 0.000 0.000 0.004
#> SRR772506 2 0.0703 0.7714 0.024 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR772507 2 0.1043 0.7742 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR772508 2 0.1251 0.7765 0.036 0.956 0.000 0.000 0.008
#> SRR772509 1 0.7111 0.5517 0.448 0.344 0.184 0.012 0.012
#> SRR772510 3 0.6778 0.6896 0.352 0.060 0.520 0.056 0.012
#> SRR772511 2 0.4205 0.6779 0.208 0.756 0.008 0.000 0.028
#> SRR772512 3 0.6728 0.6007 0.396 0.100 0.472 0.020 0.012
#> SRR772513 2 0.3085 0.7696 0.116 0.852 0.000 0.000 0.032
#> SRR772514 2 0.1830 0.7816 0.068 0.924 0.000 0.000 0.008
#> SRR772515 2 0.2130 0.7839 0.080 0.908 0.000 0.000 0.012
#> SRR772516 2 0.2006 0.7848 0.072 0.916 0.000 0.000 0.012
#> SRR772517 2 0.1952 0.7799 0.084 0.912 0.000 0.000 0.004
#> SRR772518 2 0.2597 0.7651 0.120 0.872 0.004 0.000 0.004
#> SRR772519 2 0.0880 0.7759 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR772520 2 0.1934 0.7807 0.052 0.928 0.000 0.004 0.016
#> SRR772521 2 0.6820 -0.4040 0.412 0.452 0.044 0.004 0.088
#> SRR772522 1 0.5831 0.4939 0.508 0.428 0.024 0.004 0.036
#> SRR772523 2 0.2233 0.7735 0.104 0.892 0.000 0.000 0.004
#> SRR772524 2 0.1981 0.7787 0.064 0.920 0.000 0.000 0.016
#> SRR772525 3 0.5596 -0.2263 0.064 0.000 0.600 0.324 0.012
#> SRR772526 2 0.0865 0.7710 0.024 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR772527 2 0.0865 0.7710 0.024 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR772528 3 0.6985 0.6405 0.320 0.036 0.540 0.056 0.048
#> SRR772529 2 0.6069 0.0119 0.356 0.552 0.036 0.000 0.056
#> SRR772530 1 0.7176 0.6355 0.440 0.384 0.100 0.000 0.076
#> SRR772531 3 0.5537 -0.0337 0.084 0.000 0.648 0.256 0.012
#> SRR772532 2 0.1251 0.7764 0.036 0.956 0.000 0.000 0.008
#> SRR772533 2 0.1041 0.7750 0.032 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR772534 2 0.5304 0.2816 0.360 0.596 0.008 0.008 0.028
#> SRR772535 2 0.3567 0.7506 0.144 0.820 0.004 0.000 0.032
#> SRR772536 2 0.1809 0.7841 0.060 0.928 0.000 0.000 0.012
#> SRR772537 2 0.2396 0.7639 0.068 0.904 0.004 0.000 0.024
#> SRR772538 2 0.2171 0.7546 0.064 0.912 0.000 0.000 0.024
#> SRR772539 2 0.6156 -0.2089 0.412 0.496 0.016 0.004 0.072
#> SRR772540 2 0.5502 0.3334 0.324 0.612 0.028 0.000 0.036
#> SRR772541 2 0.2824 0.7793 0.096 0.872 0.000 0.000 0.032
#> SRR772542 1 0.7049 0.6397 0.536 0.288 0.100 0.004 0.072
#> SRR772543 1 0.7054 0.6002 0.564 0.260 0.092 0.012 0.072
#> SRR772544 3 0.6583 0.6376 0.380 0.088 0.500 0.020 0.012
#> SRR772545 1 0.6607 0.6604 0.548 0.332 0.060 0.012 0.048
#> SRR772546 1 0.6140 0.5503 0.492 0.420 0.044 0.000 0.044
#> SRR772547 1 0.6234 0.5991 0.520 0.392 0.040 0.008 0.040
#> SRR772548 1 0.7104 0.6341 0.496 0.352 0.052 0.016 0.084
#> SRR772549 1 0.7034 0.3910 0.576 0.192 0.132 0.000 0.100
#> SRR772550 1 0.7267 0.1408 0.548 0.148 0.200 0.000 0.104
#> SRR772551 2 0.5284 0.3324 0.332 0.616 0.016 0.000 0.036
#> SRR772552 2 0.4598 0.5869 0.264 0.700 0.008 0.000 0.028
#> SRR772553 1 0.6899 0.5688 0.440 0.384 0.156 0.008 0.012
#> SRR772554 2 0.1872 0.7815 0.052 0.928 0.000 0.000 0.020
#> SRR772555 2 0.1788 0.7821 0.056 0.932 0.004 0.000 0.008
#> SRR772556 1 0.5798 0.5531 0.536 0.400 0.032 0.004 0.028
#> SRR772557 1 0.6430 0.6601 0.548 0.344 0.048 0.008 0.052
#> SRR772558 2 0.5657 -0.1487 0.440 0.504 0.012 0.004 0.040
#> SRR772559 1 0.7369 0.5738 0.532 0.240 0.160 0.012 0.056
#> SRR772560 2 0.5248 0.5191 0.268 0.664 0.016 0.000 0.052
#> SRR772561 3 0.6728 0.6007 0.396 0.100 0.472 0.020 0.012
#> SRR772562 2 0.1956 0.7724 0.076 0.916 0.000 0.000 0.008
#> SRR772563 2 0.2332 0.7788 0.076 0.904 0.000 0.004 0.016
#> SRR772564 1 0.6641 0.3621 0.620 0.168 0.124 0.000 0.088
#> SRR772565 1 0.6392 0.3458 0.668 0.144 0.112 0.016 0.060
#> SRR772566 1 0.7640 -0.5300 0.416 0.040 0.396 0.040 0.108
#> SRR772567 1 0.7314 -0.4525 0.488 0.048 0.348 0.028 0.088
#> SRR772568 2 0.1809 0.7821 0.060 0.928 0.000 0.000 0.012
#> SRR772569 2 0.1492 0.7734 0.040 0.948 0.004 0.000 0.008
#> SRR772570 1 0.6775 0.6460 0.548 0.312 0.064 0.008 0.068
#> SRR772571 1 0.6726 0.6290 0.488 0.380 0.040 0.004 0.088
#> SRR772572 1 0.7240 0.6638 0.520 0.304 0.080 0.012 0.084
#> SRR772573 1 0.6430 0.6578 0.580 0.296 0.068 0.004 0.052
#> SRR772574 1 0.6403 0.6624 0.556 0.320 0.080 0.000 0.044
#> SRR772575 2 0.4387 0.5523 0.272 0.704 0.008 0.000 0.016
#> SRR772576 2 0.2104 0.7804 0.060 0.916 0.000 0.000 0.024
#> SRR772577 2 0.4548 0.6906 0.152 0.764 0.004 0.004 0.076
#> SRR772578 2 0.3400 0.7660 0.136 0.828 0.000 0.000 0.036
#> SRR772579 2 0.2293 0.7807 0.084 0.900 0.000 0.000 0.016
#> SRR772580 3 0.5456 0.5702 0.180 0.020 0.708 0.084 0.008
#> SRR772581 1 0.6478 0.4972 0.448 0.440 0.064 0.000 0.048
#> SRR772582 2 0.4184 0.6312 0.232 0.740 0.004 0.000 0.024
#> SRR772583 2 0.5911 0.1408 0.348 0.564 0.020 0.000 0.068
#> SRR772584 2 0.4786 0.5588 0.260 0.696 0.020 0.000 0.024
#> SRR772585 2 0.3779 0.7511 0.144 0.804 0.000 0.000 0.052
#> SRR772586 3 0.6548 0.6808 0.344 0.036 0.548 0.044 0.028
#> SRR772587 1 0.6781 0.5793 0.576 0.252 0.124 0.008 0.040
#> SRR772588 2 0.0865 0.7706 0.024 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR772589 2 0.1168 0.7733 0.032 0.960 0.000 0.000 0.008
#> SRR772590 3 0.6693 0.6041 0.400 0.096 0.472 0.020 0.012
#> SRR772591 3 0.7749 0.4917 0.396 0.060 0.404 0.028 0.112
#> SRR772592 1 0.7621 -0.3685 0.440 0.096 0.360 0.012 0.092
#> SRR772593 3 0.6655 0.6592 0.360 0.048 0.528 0.032 0.032
#> SRR772594 2 0.1544 0.7821 0.068 0.932 0.000 0.000 0.000
#> SRR772595 2 0.1043 0.7781 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR772596 3 0.6797 0.6663 0.304 0.024 0.552 0.096 0.024
#> SRR772597 3 0.5434 0.5564 0.168 0.024 0.720 0.076 0.012
#> SRR772598 1 0.7155 0.5522 0.424 0.404 0.080 0.000 0.092
#> SRR772599 1 0.7263 0.4842 0.548 0.232 0.124 0.004 0.092
#> SRR772600 2 0.4188 0.6576 0.080 0.800 0.000 0.012 0.108
#> SRR772601 2 0.3242 0.7030 0.072 0.852 0.000 0.000 0.076
#> SRR772602 3 0.6673 0.6112 0.384 0.096 0.488 0.020 0.012
#> SRR772603 2 0.4011 0.6818 0.100 0.812 0.004 0.004 0.080
#> SRR772604 2 0.4028 0.6814 0.104 0.808 0.000 0.008 0.080
#> SRR772605 2 0.4703 0.6163 0.244 0.712 0.008 0.004 0.032
#> SRR772606 1 0.7811 0.3867 0.516 0.200 0.152 0.012 0.120
#> SRR772607 1 0.7211 0.5618 0.544 0.244 0.132 0.004 0.076
#> SRR772608 2 0.2723 0.7532 0.124 0.864 0.000 0.000 0.012
#> SRR772609 2 0.3421 0.7344 0.164 0.816 0.004 0.000 0.016
#> SRR772610 2 0.1725 0.7710 0.044 0.936 0.000 0.000 0.020
#> SRR772611 2 0.3122 0.7733 0.120 0.852 0.004 0.000 0.024
#> SRR772612 2 0.4166 0.6774 0.116 0.792 0.004 0.000 0.088
#> SRR772613 2 0.3169 0.7079 0.084 0.856 0.000 0.000 0.060
#> SRR772614 1 0.8001 0.3077 0.468 0.208 0.220 0.012 0.092
#> SRR772615 1 0.7362 -0.3006 0.532 0.072 0.280 0.020 0.096
#> SRR772616 1 0.5954 0.4161 0.484 0.440 0.028 0.000 0.048
#> SRR772617 2 0.3457 0.7040 0.080 0.848 0.000 0.008 0.064
#> SRR772618 2 0.3269 0.7294 0.096 0.848 0.000 0.000 0.056
#> SRR772619 2 0.2139 0.7598 0.052 0.916 0.000 0.000 0.032
#> SRR772620 2 0.1661 0.7608 0.036 0.940 0.000 0.000 0.024
#> SRR772621 2 0.3722 0.7208 0.164 0.808 0.008 0.008 0.012
#> SRR772622 2 0.3728 0.7304 0.164 0.804 0.008 0.000 0.024
#> SRR772623 4 0.3280 0.8155 0.004 0.004 0.120 0.848 0.024
#> SRR772624 3 0.6763 0.6559 0.304 0.024 0.560 0.080 0.032
#> SRR772625 2 0.6521 -0.4921 0.424 0.436 0.128 0.004 0.008
#> SRR772626 2 0.5616 0.4165 0.292 0.624 0.008 0.004 0.072
#> SRR772627 2 0.2654 0.7775 0.084 0.884 0.000 0.000 0.032
#> SRR772628 1 0.7129 0.5611 0.560 0.236 0.108 0.004 0.092
#> SRR772629 1 0.6495 0.6694 0.536 0.340 0.056 0.000 0.068
#> SRR772630 2 0.5425 0.1518 0.376 0.572 0.016 0.000 0.036
#> SRR772631 3 0.6653 0.6330 0.360 0.064 0.524 0.020 0.032
#> SRR772632 2 0.1892 0.7680 0.080 0.916 0.000 0.000 0.004
#> SRR772633 2 0.1168 0.7756 0.032 0.960 0.000 0.000 0.008
#> SRR772634 2 0.5495 -0.0167 0.416 0.536 0.012 0.004 0.032
#> SRR772635 2 0.4145 0.6139 0.244 0.736 0.004 0.004 0.012
#> SRR772636 2 0.6491 -0.4902 0.428 0.436 0.124 0.004 0.008
#> SRR772637 1 0.7246 0.0409 0.576 0.116 0.220 0.024 0.064
#> SRR772638 1 0.7295 0.2727 0.572 0.168 0.168 0.012 0.080
#> SRR772639 2 0.1924 0.7832 0.064 0.924 0.004 0.000 0.008
#> SRR772640 2 0.1041 0.7724 0.032 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR772641 2 0.1364 0.7750 0.036 0.952 0.000 0.000 0.012
#> SRR772642 2 0.5224 0.3179 0.348 0.608 0.008 0.004 0.032
#> SRR772643 2 0.2511 0.7802 0.088 0.892 0.004 0.000 0.016
#> SRR772644 2 0.6192 -0.4094 0.456 0.456 0.024 0.004 0.060
#> SRR772645 1 0.7374 0.6296 0.484 0.312 0.132 0.004 0.068
#> SRR772646 2 0.1124 0.7755 0.036 0.960 0.000 0.000 0.004
#> SRR772647 2 0.1502 0.7821 0.056 0.940 0.000 0.000 0.004
#> SRR772648 2 0.4424 0.6585 0.212 0.744 0.012 0.000 0.032
#> SRR772649 2 0.2170 0.7748 0.088 0.904 0.004 0.000 0.004
#> SRR772650 2 0.5076 0.2515 0.364 0.600 0.024 0.000 0.012
#> SRR772651 2 0.5882 -0.1790 0.432 0.500 0.012 0.008 0.048
#> SRR772652 1 0.6169 0.6352 0.548 0.360 0.052 0.004 0.036
#> SRR772653 1 0.6327 0.6025 0.516 0.376 0.072 0.000 0.036
#> SRR772654 2 0.5217 0.4695 0.284 0.660 0.016 0.004 0.036
#> SRR772655 2 0.4874 0.5673 0.240 0.704 0.016 0.000 0.040
#> SRR772656 5 0.7484 0.0000 0.032 0.152 0.200 0.056 0.560
#> SRR772657 3 0.6693 0.6041 0.400 0.096 0.472 0.020 0.012
#> SRR772658 2 0.2790 0.7227 0.068 0.880 0.000 0.000 0.052
#> SRR772659 2 0.3043 0.7138 0.080 0.864 0.000 0.000 0.056
#> SRR772660 2 0.3754 0.6972 0.176 0.796 0.008 0.000 0.020
#> SRR772661 1 0.7401 -0.3105 0.420 0.136 0.392 0.020 0.032
#> SRR772662 2 0.5510 0.3423 0.308 0.624 0.032 0.000 0.036
#> SRR772663 2 0.4377 0.6974 0.192 0.756 0.008 0.000 0.044
#> SRR772664 2 0.2997 0.7389 0.148 0.840 0.000 0.000 0.012
#> SRR772665 2 0.3123 0.7272 0.160 0.828 0.000 0.000 0.012
#> SRR772666 3 0.6047 0.6822 0.328 0.072 0.576 0.020 0.004
#> SRR772667 2 0.2046 0.7585 0.068 0.916 0.000 0.000 0.016
#> SRR772668 2 0.2708 0.7302 0.072 0.884 0.000 0.000 0.044
#> SRR772669 2 0.2708 0.7302 0.072 0.884 0.000 0.000 0.044
#> SRR772670 2 0.5633 0.3195 0.316 0.612 0.016 0.004 0.052
#> SRR772671 2 0.5157 0.4393 0.324 0.628 0.012 0.000 0.036
#> SRR772672 2 0.2694 0.7715 0.108 0.876 0.008 0.000 0.008
#> SRR772673 2 0.2006 0.7846 0.072 0.916 0.000 0.000 0.012
#> SRR772674 3 0.6841 0.6597 0.392 0.068 0.480 0.048 0.012
#> SRR772675 1 0.7237 0.5413 0.464 0.320 0.184 0.016 0.016
#> SRR772676 1 0.7076 0.6623 0.532 0.316 0.052 0.024 0.076
#> SRR772677 1 0.6556 0.5438 0.480 0.412 0.056 0.008 0.044
#> SRR772678 1 0.7289 0.4199 0.440 0.272 0.264 0.012 0.012
#> SRR772679 2 0.4033 0.6515 0.208 0.764 0.008 0.000 0.020
#> SRR772680 2 0.5867 0.0430 0.372 0.552 0.036 0.000 0.040
#> SRR772681 3 0.6539 0.6451 0.380 0.084 0.504 0.020 0.012
#> SRR772682 2 0.1205 0.7804 0.040 0.956 0.000 0.000 0.004
#> SRR772683 2 0.1571 0.7809 0.060 0.936 0.000 0.000 0.004
#> SRR772685 2 0.1408 0.7785 0.044 0.948 0.000 0.000 0.008
#> SRR772686 3 0.5469 0.6322 0.208 0.024 0.700 0.056 0.012
#> SRR772687 4 0.4426 0.7610 0.028 0.000 0.188 0.760 0.024
#> SRR772688 2 0.2830 0.7299 0.080 0.876 0.000 0.000 0.044
#> SRR772689 2 0.2209 0.7529 0.056 0.912 0.000 0.000 0.032
#> SRR772690 3 0.5417 0.6481 0.228 0.024 0.692 0.044 0.012
#> SRR772691 1 0.6552 0.4995 0.428 0.428 0.132 0.004 0.008
#> SRR772692 2 0.5721 0.4434 0.296 0.624 0.008 0.016 0.056
#> SRR772693 2 0.3874 0.6919 0.200 0.776 0.008 0.000 0.016
#> SRR772694 2 0.2858 0.7808 0.088 0.880 0.004 0.004 0.024
#> SRR772695 2 0.3805 0.7181 0.184 0.784 0.000 0.000 0.032
#> SRR772696 2 0.2411 0.7680 0.108 0.884 0.000 0.000 0.008
#> SRR772697 2 0.1628 0.7828 0.056 0.936 0.000 0.000 0.008
#> SRR772698 3 0.6378 0.6725 0.336 0.044 0.564 0.024 0.032
#> SRR772699 2 0.6591 -0.2327 0.404 0.488 0.048 0.012 0.048
#> SRR772700 2 0.5139 0.2192 0.384 0.576 0.004 0.000 0.036
#> SRR772701 1 0.6333 0.5846 0.508 0.392 0.064 0.004 0.032
#> SRR772702 1 0.6460 0.5591 0.480 0.408 0.048 0.000 0.064
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.6893 0.443567 0.476 0.328 0.088 0.000 0.080 0.028
#> SRR772342 1 0.7531 0.091892 0.488 0.180 0.160 0.004 0.140 0.028
#> SRR772343 2 0.5459 0.235918 0.364 0.548 0.016 0.000 0.064 0.008
#> SRR772344 2 0.1010 0.762663 0.036 0.960 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772345 2 0.1088 0.765065 0.024 0.960 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772346 2 0.5252 0.545604 0.220 0.668 0.012 0.000 0.076 0.024
#> SRR772347 2 0.5672 0.511565 0.200 0.652 0.012 0.004 0.100 0.032
#> SRR772348 2 0.2937 0.767373 0.100 0.852 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR772349 2 0.2488 0.770411 0.076 0.880 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR772350 4 0.1471 0.765294 0.000 0.000 0.064 0.932 0.000 0.004
#> SRR772351 2 0.3352 0.743782 0.072 0.832 0.004 0.000 0.088 0.004
#> SRR772352 2 0.4083 0.718808 0.156 0.772 0.004 0.000 0.052 0.016
#> SRR772353 2 0.4767 0.481326 0.288 0.648 0.008 0.000 0.052 0.004
#> SRR772354 2 0.3669 0.660776 0.208 0.760 0.004 0.000 0.028 0.000
#> SRR772355 2 0.2918 0.768417 0.088 0.856 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR772356 2 0.2618 0.770764 0.076 0.872 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR772357 2 0.5437 0.210824 0.364 0.556 0.024 0.000 0.044 0.012
#> SRR772358 1 0.7305 0.297464 0.484 0.264 0.100 0.008 0.124 0.020
#> SRR772359 1 0.6041 0.437310 0.452 0.428 0.048 0.000 0.064 0.008
#> SRR772360 2 0.3986 0.637770 0.228 0.732 0.008 0.000 0.032 0.000
#> SRR772361 3 0.6087 0.491505 0.312 0.056 0.568 0.020 0.028 0.016
#> SRR772362 2 0.0909 0.759037 0.012 0.968 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772363 2 0.0820 0.759217 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772364 2 0.6103 0.401303 0.108 0.620 0.012 0.000 0.188 0.072
#> SRR772365 2 0.7875 -0.285959 0.116 0.432 0.032 0.024 0.288 0.108
#> SRR772366 3 0.6251 0.541229 0.156 0.004 0.616 0.140 0.076 0.008
#> SRR772367 3 0.4785 0.570241 0.136 0.008 0.740 0.076 0.040 0.000
#> SRR772368 2 0.1930 0.757632 0.036 0.916 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR772369 2 0.4197 0.662007 0.216 0.728 0.004 0.000 0.048 0.004
#> SRR772370 2 0.3669 0.688164 0.204 0.768 0.008 0.000 0.012 0.008
#> SRR772371 1 0.7021 0.234949 0.544 0.204 0.072 0.000 0.132 0.048
#> SRR772372 2 0.6302 -0.237605 0.376 0.468 0.052 0.000 0.100 0.004
#> SRR772373 2 0.2734 0.764905 0.104 0.864 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR772374 2 0.1584 0.767216 0.064 0.928 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772375 3 0.5025 0.507040 0.096 0.004 0.728 0.120 0.048 0.004
#> SRR772376 2 0.2203 0.768734 0.084 0.896 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR772377 1 0.7396 0.320997 0.400 0.276 0.256 0.016 0.032 0.020
#> SRR772378 2 0.5475 0.188389 0.364 0.552 0.012 0.000 0.052 0.020
#> SRR772379 2 0.3949 0.705507 0.208 0.748 0.000 0.004 0.036 0.004
#> SRR772380 2 0.5231 0.194797 0.392 0.548 0.012 0.008 0.032 0.008
#> SRR772381 3 0.6033 0.520198 0.304 0.048 0.580 0.020 0.024 0.024
#> SRR772382 1 0.6670 0.484380 0.504 0.312 0.104 0.000 0.056 0.024
#> SRR772383 1 0.6721 0.485047 0.460 0.372 0.072 0.004 0.072 0.020
#> SRR772384 1 0.7255 0.253949 0.392 0.256 0.292 0.008 0.036 0.016
#> SRR772385 1 0.7047 0.376583 0.396 0.336 0.216 0.004 0.032 0.016
#> SRR772386 2 0.3662 0.727206 0.156 0.792 0.004 0.000 0.044 0.004
#> SRR772387 2 0.1745 0.766730 0.068 0.920 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772388 3 0.8261 0.109994 0.260 0.032 0.344 0.036 0.260 0.068
#> SRR772389 3 0.7420 0.297904 0.264 0.004 0.416 0.040 0.240 0.036
#> SRR772390 3 0.5450 0.580427 0.220 0.012 0.672 0.036 0.044 0.016
#> SRR772391 1 0.6930 0.432141 0.516 0.260 0.100 0.000 0.100 0.024
#> SRR772392 1 0.6679 0.479942 0.492 0.328 0.076 0.000 0.084 0.020
#> SRR772393 2 0.3667 0.720143 0.164 0.788 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR772394 2 0.4344 0.686379 0.164 0.748 0.004 0.000 0.072 0.012
#> SRR772395 2 0.1462 0.767171 0.056 0.936 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772396 1 0.7577 0.394006 0.444 0.292 0.112 0.012 0.116 0.024
#> SRR772397 1 0.8176 -0.485196 0.356 0.036 0.232 0.016 0.268 0.092
#> SRR772398 1 0.6929 0.346086 0.508 0.220 0.188 0.004 0.072 0.008
#> SRR772399 1 0.7116 0.378405 0.504 0.232 0.132 0.000 0.112 0.020
#> SRR772400 1 0.7176 0.025053 0.512 0.152 0.188 0.004 0.132 0.012
#> SRR772401 1 0.7284 -0.124003 0.516 0.100 0.184 0.000 0.160 0.040
#> SRR772402 2 0.4355 0.622975 0.032 0.756 0.000 0.000 0.148 0.064
#> SRR772403 2 0.2892 0.702238 0.020 0.840 0.000 0.000 0.136 0.004
#> SRR772404 2 0.2795 0.770019 0.100 0.856 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR772405 1 0.7426 0.258555 0.408 0.240 0.280 0.016 0.032 0.024
#> SRR772406 2 0.3579 0.738766 0.120 0.816 0.004 0.000 0.048 0.012
#> SRR772407 2 0.2747 0.770568 0.096 0.860 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR772408 2 0.0820 0.759110 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772409 2 0.0862 0.761198 0.016 0.972 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR772410 2 0.5034 0.219820 0.356 0.580 0.024 0.000 0.040 0.000
#> SRR772411 2 0.5437 0.157356 0.356 0.560 0.024 0.000 0.052 0.008
#> SRR772412 1 0.6365 0.474377 0.464 0.392 0.072 0.000 0.056 0.016
#> SRR772413 1 0.6272 0.505312 0.520 0.336 0.084 0.000 0.036 0.024
#> SRR772414 3 0.4271 0.585312 0.116 0.012 0.792 0.040 0.032 0.008
#> SRR772415 2 0.2488 0.756229 0.124 0.864 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR772416 2 0.3870 0.687715 0.188 0.768 0.004 0.004 0.032 0.004
#> SRR772417 2 0.5181 0.356601 0.336 0.588 0.016 0.000 0.056 0.004
#> SRR772418 3 0.5495 0.574684 0.220 0.008 0.668 0.024 0.052 0.028
#> SRR772419 2 0.1500 0.770704 0.052 0.936 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772420 2 0.1049 0.762974 0.032 0.960 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772421 2 0.2662 0.760571 0.120 0.856 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR772422 2 0.3196 0.750939 0.136 0.824 0.000 0.004 0.036 0.000
#> SRR772423 2 0.3817 0.673091 0.052 0.784 0.000 0.000 0.152 0.012
#> SRR772424 2 0.3108 0.699149 0.044 0.828 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR772425 2 0.2358 0.761138 0.108 0.876 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772426 2 0.0820 0.759110 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772427 2 0.0820 0.759110 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772428 1 0.6891 0.395340 0.528 0.256 0.108 0.004 0.084 0.020
#> SRR772429 1 0.7631 0.330952 0.432 0.304 0.084 0.008 0.132 0.040
#> SRR772430 2 0.5302 0.513214 0.260 0.640 0.012 0.000 0.068 0.020
#> SRR772431 2 0.2547 0.718680 0.016 0.868 0.000 0.000 0.112 0.004
#> SRR772432 2 0.2858 0.708876 0.032 0.844 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR772433 1 0.7147 0.180512 0.484 0.204 0.216 0.000 0.076 0.020
#> SRR772434 1 0.6797 -0.160122 0.560 0.092 0.192 0.000 0.132 0.024
#> SRR772435 2 0.4975 0.535039 0.256 0.668 0.028 0.004 0.040 0.004
#> SRR772436 2 0.6589 -0.114882 0.356 0.488 0.032 0.008 0.088 0.028
#> SRR772437 3 0.6087 0.491505 0.312 0.056 0.568 0.020 0.028 0.016
#> SRR772438 5 0.8548 0.000000 0.288 0.160 0.152 0.004 0.312 0.084
#> SRR772439 3 0.8176 0.124377 0.260 0.016 0.336 0.024 0.252 0.112
#> SRR772440 2 0.3076 0.757588 0.112 0.840 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR772441 2 0.3455 0.757010 0.128 0.816 0.004 0.004 0.048 0.000
#> SRR772442 2 0.2910 0.757406 0.068 0.852 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR772443 2 0.4357 0.701181 0.124 0.760 0.000 0.004 0.096 0.016
#> SRR772444 1 0.6783 0.474860 0.484 0.324 0.052 0.000 0.112 0.028
#> SRR772445 1 0.6539 0.454177 0.452 0.392 0.044 0.000 0.084 0.028
#> SRR772446 1 0.6477 0.487694 0.520 0.336 0.048 0.016 0.064 0.016
#> SRR772447 2 0.5663 -0.126047 0.412 0.504 0.028 0.004 0.040 0.012
#> SRR772448 2 0.3165 0.750633 0.072 0.844 0.000 0.000 0.076 0.008
#> SRR772449 2 0.3328 0.755825 0.112 0.832 0.008 0.000 0.044 0.004
#> SRR772450 2 0.1168 0.761348 0.028 0.956 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772451 2 0.0993 0.760476 0.024 0.964 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772452 1 0.7563 -0.206507 0.480 0.096 0.252 0.008 0.120 0.044
#> SRR772453 1 0.7512 0.215975 0.492 0.192 0.192 0.008 0.076 0.040
#> SRR772454 2 0.5547 0.143670 0.384 0.532 0.028 0.000 0.044 0.012
#> SRR772455 1 0.6022 0.386424 0.452 0.428 0.040 0.000 0.072 0.008
#> SRR772456 2 0.0909 0.760006 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772457 2 0.1074 0.762114 0.028 0.960 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772458 1 0.6882 0.435675 0.540 0.252 0.076 0.004 0.096 0.032
#> SRR772459 1 0.7411 0.129911 0.492 0.172 0.196 0.004 0.112 0.024
#> SRR772460 2 0.0725 0.758512 0.012 0.976 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772461 2 0.0725 0.758512 0.012 0.976 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772462 2 0.1745 0.773253 0.056 0.924 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772463 2 0.1196 0.767013 0.040 0.952 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772464 3 0.4923 0.589427 0.172 0.012 0.720 0.072 0.020 0.004
#> SRR772465 2 0.5032 0.433537 0.312 0.620 0.028 0.000 0.036 0.004
#> SRR772466 2 0.3095 0.734612 0.144 0.828 0.012 0.000 0.016 0.000
#> SRR772467 2 0.0993 0.762219 0.024 0.964 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772468 2 0.0972 0.761529 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772469 1 0.6955 0.296995 0.552 0.200 0.120 0.004 0.100 0.024
#> SRR772470 1 0.6155 0.479092 0.568 0.288 0.060 0.000 0.064 0.020
#> SRR772471 1 0.6502 0.457270 0.444 0.400 0.064 0.000 0.076 0.016
#> SRR772472 1 0.6488 0.482981 0.488 0.356 0.056 0.004 0.084 0.012
#> SRR772473 2 0.3662 0.708242 0.060 0.808 0.000 0.008 0.120 0.004
#> SRR772474 2 0.4213 0.706402 0.100 0.772 0.000 0.000 0.104 0.024
#> SRR772475 1 0.6893 0.389704 0.392 0.368 0.188 0.000 0.036 0.016
#> SRR772476 2 0.0725 0.758512 0.012 0.976 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772477 2 0.0909 0.760093 0.012 0.968 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772478 1 0.6597 0.482999 0.532 0.276 0.120 0.004 0.056 0.012
#> SRR772479 1 0.7008 0.409438 0.544 0.220 0.112 0.004 0.088 0.032
#> SRR772480 2 0.6228 0.206730 0.140 0.548 0.000 0.004 0.264 0.044
#> SRR772481 2 0.6660 0.272554 0.116 0.564 0.004 0.008 0.204 0.104
#> SRR772482 1 0.6247 0.390942 0.448 0.432 0.044 0.004 0.044 0.028
#> SRR772483 1 0.6201 0.470632 0.504 0.372 0.044 0.008 0.060 0.012
#> SRR772484 2 0.1858 0.767913 0.076 0.912 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772485 2 0.2451 0.757945 0.108 0.876 0.004 0.000 0.008 0.004
#> SRR772486 1 0.7683 -0.337958 0.456 0.060 0.272 0.024 0.152 0.036
#> SRR772487 1 0.7696 -0.310314 0.456 0.096 0.256 0.004 0.136 0.052
#> SRR772488 2 0.2762 0.738729 0.048 0.860 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR772489 2 0.3477 0.738206 0.092 0.820 0.000 0.000 0.080 0.008
#> SRR772490 1 0.7273 0.395995 0.516 0.228 0.132 0.004 0.072 0.048
#> SRR772491 1 0.7059 0.458304 0.484 0.288 0.104 0.000 0.100 0.024
#> SRR772492 2 0.2030 0.749692 0.028 0.908 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR772493 2 0.2030 0.749692 0.028 0.908 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR772494 2 0.0820 0.759110 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772495 2 0.0725 0.758512 0.012 0.976 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772496 2 0.3601 0.738896 0.168 0.792 0.000 0.004 0.028 0.008
#> SRR772497 2 0.3512 0.712441 0.196 0.772 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR772498 2 0.4657 0.594690 0.256 0.684 0.012 0.000 0.036 0.012
#> SRR772499 2 0.3336 0.758745 0.132 0.824 0.004 0.000 0.032 0.008
#> SRR772500 2 0.1563 0.765337 0.056 0.932 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772501 2 0.1398 0.766674 0.052 0.940 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772502 2 0.5475 0.058224 0.388 0.532 0.036 0.000 0.036 0.008
#> SRR772503 2 0.5427 -0.089783 0.420 0.504 0.020 0.000 0.048 0.008
#> SRR772504 2 0.1616 0.768177 0.048 0.932 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772505 2 0.1434 0.764150 0.048 0.940 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772506 2 0.0865 0.760986 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772507 2 0.1333 0.764051 0.048 0.944 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772508 2 0.1408 0.766746 0.036 0.944 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772509 1 0.7196 0.352564 0.408 0.304 0.228 0.008 0.036 0.016
#> SRR772510 3 0.6269 0.556706 0.260 0.024 0.588 0.084 0.032 0.012
#> SRR772511 2 0.4136 0.655797 0.216 0.732 0.004 0.000 0.044 0.004
#> SRR772512 3 0.6124 0.487563 0.308 0.060 0.568 0.020 0.028 0.016
#> SRR772513 2 0.3465 0.755650 0.120 0.820 0.000 0.000 0.044 0.016
#> SRR772514 2 0.2112 0.772925 0.088 0.896 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772515 2 0.2094 0.774549 0.080 0.900 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772516 2 0.2176 0.775410 0.080 0.896 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR772517 2 0.2190 0.770344 0.060 0.900 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR772518 2 0.2951 0.756676 0.128 0.844 0.004 0.000 0.020 0.004
#> SRR772519 2 0.0972 0.765618 0.028 0.964 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772520 2 0.2034 0.772418 0.060 0.912 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR772521 2 0.6790 -0.459590 0.400 0.408 0.040 0.004 0.132 0.016
#> SRR772522 1 0.6006 0.455100 0.496 0.392 0.032 0.004 0.064 0.012
#> SRR772523 2 0.2445 0.765480 0.108 0.872 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772524 2 0.2019 0.765848 0.088 0.900 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772525 3 0.5370 -0.196668 0.016 0.000 0.568 0.348 0.060 0.008
#> SRR772526 2 0.0909 0.759600 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772527 2 0.0909 0.759600 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772528 3 0.6201 0.555540 0.208 0.012 0.632 0.048 0.064 0.036
#> SRR772529 2 0.6474 -0.147774 0.340 0.504 0.048 0.000 0.080 0.028
#> SRR772530 1 0.7565 0.364902 0.368 0.340 0.140 0.000 0.132 0.020
#> SRR772531 3 0.5239 0.016485 0.028 0.000 0.640 0.268 0.056 0.008
#> SRR772532 2 0.1442 0.765793 0.040 0.944 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR772533 2 0.1151 0.765213 0.032 0.956 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772534 2 0.5337 0.247895 0.348 0.568 0.012 0.000 0.064 0.008
#> SRR772535 2 0.3896 0.728830 0.132 0.784 0.004 0.000 0.076 0.004
#> SRR772536 2 0.1926 0.774738 0.068 0.912 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772537 2 0.2249 0.755694 0.032 0.900 0.004 0.000 0.064 0.000
#> SRR772538 2 0.1950 0.747673 0.024 0.912 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR772539 2 0.6351 -0.301236 0.412 0.452 0.028 0.004 0.080 0.024
#> SRR772540 2 0.5484 0.237111 0.336 0.572 0.040 0.000 0.048 0.004
#> SRR772541 2 0.2923 0.768338 0.100 0.848 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR772542 1 0.7332 0.319344 0.504 0.228 0.112 0.000 0.108 0.048
#> SRR772543 1 0.7398 0.164841 0.512 0.192 0.112 0.004 0.144 0.036
#> SRR772544 3 0.5906 0.518843 0.292 0.048 0.596 0.020 0.028 0.016
#> SRR772545 1 0.6960 0.481622 0.508 0.288 0.092 0.008 0.084 0.020
#> SRR772546 1 0.6584 0.485779 0.456 0.384 0.072 0.004 0.072 0.012
#> SRR772547 1 0.6654 0.465344 0.508 0.328 0.044 0.012 0.088 0.020
#> SRR772548 1 0.7493 0.306542 0.440 0.308 0.044 0.016 0.152 0.040
#> SRR772549 1 0.7573 -0.149845 0.500 0.144 0.168 0.008 0.148 0.032
#> SRR772550 1 0.7362 -0.324111 0.468 0.084 0.248 0.000 0.168 0.032
#> SRR772551 2 0.5623 0.210146 0.344 0.556 0.012 0.000 0.068 0.020
#> SRR772552 2 0.4591 0.561090 0.284 0.668 0.012 0.000 0.024 0.012
#> SRR772553 1 0.7051 0.378385 0.400 0.344 0.200 0.004 0.036 0.016
#> SRR772554 2 0.1867 0.771779 0.064 0.916 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772555 2 0.1807 0.772787 0.060 0.920 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772556 1 0.5935 0.483093 0.536 0.344 0.028 0.000 0.076 0.016
#> SRR772557 1 0.6739 0.476138 0.508 0.300 0.044 0.000 0.112 0.036
#> SRR772558 2 0.5763 -0.199045 0.444 0.468 0.016 0.008 0.048 0.016
#> SRR772559 1 0.7065 0.247649 0.524 0.188 0.188 0.000 0.056 0.044
#> SRR772560 2 0.5249 0.484899 0.276 0.632 0.012 0.000 0.064 0.016
#> SRR772561 3 0.6124 0.487563 0.308 0.060 0.568 0.020 0.028 0.016
#> SRR772562 2 0.2230 0.764454 0.084 0.892 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR772563 2 0.2262 0.768903 0.080 0.896 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR772564 1 0.6693 -0.080040 0.568 0.104 0.172 0.004 0.144 0.008
#> SRR772565 1 0.6663 -0.058249 0.596 0.092 0.140 0.004 0.144 0.024
#> SRR772566 3 0.7236 0.303870 0.288 0.004 0.440 0.024 0.196 0.048
#> SRR772567 3 0.7405 0.210431 0.360 0.032 0.404 0.016 0.144 0.044
#> SRR772568 2 0.1863 0.771690 0.060 0.920 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR772569 2 0.1578 0.762358 0.048 0.936 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR772570 1 0.7161 0.369414 0.492 0.260 0.096 0.008 0.132 0.012
#> SRR772571 1 0.6937 0.493045 0.472 0.332 0.060 0.000 0.096 0.040
#> SRR772572 1 0.7040 0.473406 0.496 0.272 0.084 0.004 0.128 0.016
#> SRR772573 1 0.6726 0.492117 0.532 0.268 0.108 0.000 0.064 0.028
#> SRR772574 1 0.6596 0.465569 0.532 0.272 0.096 0.000 0.088 0.012
#> SRR772575 2 0.4271 0.507594 0.304 0.664 0.012 0.000 0.020 0.000
#> SRR772576 2 0.2201 0.770554 0.052 0.900 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR772577 2 0.4755 0.671946 0.124 0.740 0.000 0.004 0.092 0.040
#> SRR772578 2 0.3495 0.753131 0.128 0.808 0.000 0.000 0.060 0.004
#> SRR772579 2 0.2488 0.770417 0.076 0.880 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR772580 3 0.4796 0.513471 0.092 0.008 0.748 0.100 0.052 0.000
#> SRR772581 1 0.6486 0.456683 0.440 0.396 0.092 0.000 0.064 0.008
#> SRR772582 2 0.4292 0.608042 0.244 0.708 0.004 0.000 0.036 0.008
#> SRR772583 2 0.6044 0.036446 0.356 0.520 0.016 0.000 0.072 0.036
#> SRR772584 2 0.4854 0.511896 0.264 0.660 0.012 0.000 0.060 0.004
#> SRR772585 2 0.3880 0.734273 0.120 0.780 0.000 0.000 0.096 0.004
#> SRR772586 3 0.5760 0.577421 0.236 0.012 0.640 0.048 0.052 0.012
#> SRR772587 1 0.6986 0.252444 0.520 0.192 0.164 0.000 0.112 0.012
#> SRR772588 2 0.0717 0.759269 0.016 0.976 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772589 2 0.0993 0.761955 0.024 0.964 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772590 3 0.6087 0.491505 0.312 0.056 0.568 0.020 0.028 0.016
#> SRR772591 3 0.7562 0.253611 0.264 0.036 0.436 0.004 0.192 0.068
#> SRR772592 3 0.7413 0.066006 0.332 0.056 0.416 0.012 0.160 0.024
#> SRR772593 3 0.5977 0.545233 0.260 0.016 0.616 0.032 0.048 0.028
#> SRR772594 2 0.2009 0.774142 0.068 0.908 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR772595 2 0.1391 0.769015 0.040 0.944 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772596 3 0.5896 0.579678 0.192 0.004 0.636 0.112 0.048 0.008
#> SRR772597 3 0.4939 0.496526 0.072 0.012 0.760 0.088 0.052 0.016
#> SRR772598 1 0.7548 0.314935 0.376 0.364 0.096 0.000 0.120 0.044
#> SRR772599 1 0.7759 -0.000895 0.480 0.176 0.156 0.012 0.144 0.032
#> SRR772600 2 0.4188 0.625558 0.024 0.764 0.000 0.000 0.152 0.060
#> SRR772601 2 0.3181 0.688963 0.020 0.824 0.000 0.000 0.144 0.012
#> SRR772602 3 0.6045 0.487137 0.300 0.056 0.580 0.020 0.028 0.016
#> SRR772603 2 0.4017 0.642802 0.056 0.764 0.000 0.000 0.168 0.012
#> SRR772604 2 0.4235 0.637786 0.064 0.756 0.000 0.000 0.160 0.020
#> SRR772605 2 0.4634 0.572814 0.260 0.672 0.004 0.000 0.060 0.004
#> SRR772606 1 0.7991 -0.480552 0.420 0.136 0.176 0.000 0.212 0.056
#> SRR772607 1 0.6972 0.137479 0.536 0.176 0.176 0.000 0.088 0.024
#> SRR772608 2 0.2790 0.744625 0.140 0.840 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772609 2 0.3529 0.720216 0.172 0.788 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR772610 2 0.1794 0.765893 0.036 0.924 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR772611 2 0.3196 0.756400 0.136 0.824 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR772612 2 0.4380 0.637189 0.068 0.748 0.004 0.000 0.164 0.016
#> SRR772613 2 0.3094 0.688659 0.036 0.824 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR772614 1 0.8232 -0.425024 0.348 0.144 0.260 0.000 0.192 0.056
#> SRR772615 1 0.7442 -0.374334 0.424 0.044 0.336 0.012 0.140 0.044
#> SRR772616 1 0.6156 0.424039 0.472 0.404 0.032 0.000 0.068 0.024
#> SRR772617 2 0.3043 0.695080 0.024 0.836 0.000 0.000 0.132 0.008
#> SRR772618 2 0.3265 0.713367 0.056 0.828 0.000 0.000 0.112 0.004
#> SRR772619 2 0.1950 0.749692 0.024 0.912 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR772620 2 0.1367 0.753019 0.012 0.944 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR772621 2 0.3836 0.715642 0.152 0.792 0.012 0.000 0.032 0.012
#> SRR772622 2 0.3900 0.705817 0.184 0.764 0.004 0.000 0.044 0.004
#> SRR772623 4 0.3196 0.725561 0.004 0.000 0.096 0.848 0.016 0.036
#> SRR772624 3 0.5992 0.567832 0.192 0.004 0.636 0.096 0.060 0.012
#> SRR772625 2 0.6652 -0.505645 0.388 0.400 0.168 0.000 0.036 0.008
#> SRR772626 2 0.5950 0.362223 0.276 0.592 0.016 0.004 0.080 0.032
#> SRR772627 2 0.2740 0.764134 0.076 0.864 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR772628 1 0.7363 0.117672 0.516 0.168 0.120 0.000 0.152 0.044
#> SRR772629 1 0.6751 0.485035 0.508 0.296 0.080 0.000 0.096 0.020
#> SRR772630 2 0.5378 0.062345 0.396 0.532 0.016 0.000 0.040 0.016
#> SRR772631 3 0.5949 0.520954 0.264 0.028 0.616 0.020 0.044 0.028
#> SRR772632 2 0.2060 0.758313 0.084 0.900 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772633 2 0.1225 0.765012 0.036 0.952 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772634 2 0.5477 -0.093257 0.432 0.492 0.016 0.000 0.044 0.016
#> SRR772635 2 0.4622 0.604005 0.232 0.704 0.020 0.004 0.036 0.004
#> SRR772636 2 0.6715 -0.504308 0.388 0.400 0.164 0.000 0.036 0.012
#> SRR772637 1 0.7459 -0.219067 0.480 0.076 0.272 0.008 0.116 0.048
#> SRR772638 1 0.7583 -0.208325 0.488 0.120 0.204 0.004 0.144 0.040
#> SRR772639 2 0.2069 0.774364 0.068 0.908 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR772640 2 0.1151 0.761497 0.032 0.956 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772641 2 0.1480 0.764365 0.040 0.940 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772642 2 0.5001 0.222576 0.384 0.560 0.004 0.000 0.040 0.012
#> SRR772643 2 0.2795 0.770784 0.100 0.864 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR772644 1 0.6340 0.448479 0.468 0.400 0.036 0.004 0.068 0.024
#> SRR772645 1 0.7851 0.285970 0.432 0.252 0.160 0.008 0.112 0.036
#> SRR772646 2 0.1196 0.764859 0.040 0.952 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772647 2 0.1625 0.772115 0.060 0.928 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772648 2 0.4497 0.638040 0.212 0.720 0.024 0.000 0.040 0.004
#> SRR772649 2 0.2499 0.765087 0.096 0.880 0.004 0.004 0.016 0.000
#> SRR772650 2 0.5156 0.240966 0.348 0.584 0.032 0.000 0.032 0.004
#> SRR772651 2 0.5820 -0.235296 0.436 0.464 0.012 0.000 0.056 0.032
#> SRR772652 1 0.6375 0.502649 0.528 0.320 0.072 0.000 0.056 0.024
#> SRR772653 1 0.6436 0.503186 0.508 0.336 0.088 0.000 0.040 0.028
#> SRR772654 2 0.4959 0.433830 0.304 0.632 0.020 0.000 0.036 0.008
#> SRR772655 2 0.4874 0.528132 0.268 0.660 0.020 0.000 0.048 0.004
#> SRR772656 6 0.5741 0.000000 0.016 0.096 0.164 0.032 0.016 0.676
#> SRR772657 3 0.6087 0.491505 0.312 0.056 0.568 0.020 0.028 0.016
#> SRR772658 2 0.2404 0.715954 0.016 0.872 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR772659 2 0.2662 0.708262 0.024 0.856 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR772660 2 0.3900 0.680046 0.184 0.764 0.004 0.000 0.044 0.004
#> SRR772661 3 0.7059 0.171704 0.324 0.104 0.480 0.016 0.048 0.028
#> SRR772662 2 0.5834 0.187227 0.324 0.564 0.020 0.000 0.060 0.032
#> SRR772663 2 0.4475 0.679042 0.180 0.736 0.008 0.000 0.064 0.012
#> SRR772664 2 0.3122 0.731774 0.160 0.816 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR772665 2 0.3403 0.718138 0.144 0.816 0.012 0.000 0.024 0.004
#> SRR772666 3 0.5301 0.556290 0.228 0.040 0.676 0.016 0.028 0.012
#> SRR772667 2 0.2046 0.750456 0.032 0.908 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR772668 2 0.2480 0.722874 0.024 0.872 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR772669 2 0.2480 0.722874 0.024 0.872 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR772670 2 0.5604 0.217483 0.356 0.560 0.016 0.008 0.040 0.020
#> SRR772671 2 0.5169 0.397822 0.332 0.592 0.016 0.000 0.056 0.004
#> SRR772672 2 0.2980 0.757641 0.116 0.848 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR772673 2 0.2344 0.774259 0.076 0.892 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR772674 3 0.6301 0.539517 0.296 0.028 0.568 0.056 0.036 0.016
#> SRR772675 1 0.7396 0.344351 0.416 0.284 0.228 0.016 0.032 0.024
#> SRR772676 1 0.7234 0.457996 0.488 0.288 0.072 0.004 0.100 0.048
#> SRR772677 1 0.6684 0.482048 0.452 0.384 0.080 0.004 0.060 0.020
#> SRR772678 1 0.7137 0.189556 0.384 0.236 0.328 0.008 0.028 0.016
#> SRR772679 2 0.4049 0.642498 0.208 0.740 0.008 0.000 0.044 0.000
#> SRR772680 2 0.5802 -0.097357 0.392 0.504 0.036 0.000 0.060 0.008
#> SRR772681 3 0.5805 0.528339 0.296 0.040 0.600 0.020 0.028 0.016
#> SRR772682 2 0.1391 0.770131 0.040 0.944 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772683 2 0.1787 0.771177 0.068 0.920 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR772685 2 0.1391 0.768295 0.040 0.944 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772686 3 0.4685 0.577946 0.128 0.012 0.760 0.064 0.028 0.008
#> SRR772687 4 0.4064 0.675818 0.016 0.000 0.152 0.780 0.040 0.012
#> SRR772688 2 0.2586 0.723125 0.032 0.868 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR772689 2 0.2145 0.744639 0.028 0.900 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR772690 3 0.4701 0.588360 0.140 0.012 0.756 0.052 0.032 0.008
#> SRR772691 2 0.6753 -0.518321 0.388 0.392 0.172 0.000 0.036 0.012
#> SRR772692 2 0.5862 0.372396 0.284 0.588 0.008 0.008 0.088 0.024
#> SRR772693 2 0.4262 0.659955 0.208 0.736 0.008 0.000 0.036 0.012
#> SRR772694 2 0.2717 0.770906 0.100 0.868 0.004 0.000 0.024 0.004
#> SRR772695 2 0.3819 0.690975 0.200 0.756 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR772696 2 0.2624 0.757514 0.124 0.856 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772697 2 0.1946 0.772402 0.072 0.912 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR772698 3 0.5635 0.570083 0.224 0.016 0.660 0.020 0.048 0.032
#> SRR772699 2 0.6508 -0.315042 0.408 0.444 0.052 0.000 0.064 0.032
#> SRR772700 2 0.5354 0.109538 0.400 0.532 0.012 0.004 0.040 0.012
#> SRR772701 1 0.6336 0.499630 0.512 0.336 0.092 0.004 0.048 0.008
#> SRR772702 1 0.6531 0.490150 0.480 0.360 0.064 0.000 0.076 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.767 0.895 0.950 0.4845 0.509 0.509
#> 3 3 0.767 0.847 0.935 0.2194 0.825 0.681
#> 4 4 0.534 0.676 0.804 0.1719 0.804 0.561
#> 5 5 0.536 0.552 0.726 0.0781 0.943 0.815
#> 6 6 0.518 0.414 0.661 0.0470 0.857 0.549
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0672 0.9249 0.992 0.008
#> SRR772342 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772343 1 0.5842 0.8532 0.860 0.140
#> SRR772344 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772346 2 0.5842 0.8298 0.140 0.860
#> SRR772347 2 0.6438 0.7945 0.164 0.836
#> SRR772348 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR772353 1 0.8207 0.7186 0.744 0.256
#> SRR772354 2 0.3114 0.9185 0.056 0.944
#> SRR772355 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772357 2 0.8763 0.5364 0.296 0.704
#> SRR772358 1 0.7674 0.7527 0.776 0.224
#> SRR772359 1 0.6801 0.8118 0.820 0.180
#> SRR772360 2 0.1843 0.9446 0.028 0.972
#> SRR772361 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772364 2 0.0938 0.9574 0.012 0.988
#> SRR772365 1 0.9983 0.1072 0.524 0.476
#> SRR772366 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.0672 0.9602 0.008 0.992
#> SRR772370 2 0.8207 0.6553 0.256 0.744
#> SRR772371 1 0.3114 0.9072 0.944 0.056
#> SRR772372 1 0.9522 0.5103 0.628 0.372
#> SRR772373 2 0.1414 0.9513 0.020 0.980
#> SRR772374 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.0376 0.9241 0.996 0.004
#> SRR772378 2 0.9552 0.3937 0.376 0.624
#> SRR772379 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772380 2 0.9286 0.4478 0.344 0.656
#> SRR772381 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.3584 0.9031 0.932 0.068
#> SRR772383 1 0.1414 0.9233 0.980 0.020
#> SRR772384 1 0.0376 0.9244 0.996 0.004
#> SRR772385 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772386 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.5519 0.8614 0.872 0.128
#> SRR772392 1 0.4431 0.8885 0.908 0.092
#> SRR772393 2 0.0938 0.9574 0.012 0.988
#> SRR772394 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772395 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.2948 0.9122 0.948 0.052
#> SRR772397 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772398 1 0.0938 0.9247 0.988 0.012
#> SRR772399 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772400 1 0.0938 0.9245 0.988 0.012
#> SRR772401 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772402 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772410 1 0.9954 0.2751 0.540 0.460
#> SRR772411 2 0.9996 -0.0887 0.488 0.512
#> SRR772412 1 0.2948 0.9123 0.948 0.052
#> SRR772413 1 0.1633 0.9220 0.976 0.024
#> SRR772414 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.4022 0.8957 0.080 0.920
#> SRR772417 1 0.9710 0.4389 0.600 0.400
#> SRR772418 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772422 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772423 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772429 1 0.2948 0.9092 0.948 0.052
#> SRR772430 2 0.1843 0.9453 0.028 0.972
#> SRR772431 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0672 0.9249 0.992 0.008
#> SRR772434 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772435 2 0.5294 0.8531 0.120 0.880
#> SRR772436 1 0.9686 0.3760 0.604 0.396
#> SRR772437 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772439 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772440 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR772444 1 0.3274 0.9082 0.940 0.060
#> SRR772445 1 0.1843 0.9211 0.972 0.028
#> SRR772446 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772447 1 0.7950 0.7397 0.760 0.240
#> SRR772448 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772449 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR772450 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772453 1 0.2778 0.9139 0.952 0.048
#> SRR772454 1 0.3879 0.8996 0.924 0.076
#> SRR772455 1 0.6148 0.8405 0.848 0.152
#> SRR772456 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.1184 0.9241 0.984 0.016
#> SRR772459 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772460 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.6148 0.8036 0.152 0.848
#> SRR772466 2 0.2043 0.9413 0.032 0.968
#> SRR772467 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.0938 0.9248 0.988 0.012
#> SRR772470 1 0.6343 0.8326 0.840 0.160
#> SRR772471 1 0.6343 0.8333 0.840 0.160
#> SRR772472 1 0.2423 0.9166 0.960 0.040
#> SRR772473 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.0938 0.9572 0.012 0.988
#> SRR772476 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.1414 0.9234 0.980 0.020
#> SRR772479 1 0.1414 0.9234 0.980 0.020
#> SRR772480 2 0.2236 0.9388 0.036 0.964
#> SRR772481 2 0.0672 0.9600 0.008 0.992
#> SRR772482 1 0.9754 0.4111 0.592 0.408
#> SRR772483 1 0.7745 0.7382 0.772 0.228
#> SRR772484 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772485 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772486 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772488 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772489 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772490 1 0.0938 0.9245 0.988 0.012
#> SRR772491 1 0.3274 0.9083 0.940 0.060
#> SRR772492 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.2778 0.9283 0.048 0.952
#> SRR772498 2 0.1633 0.9488 0.024 0.976
#> SRR772499 2 0.2603 0.9320 0.044 0.956
#> SRR772500 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.9933 0.2871 0.548 0.452
#> SRR772503 1 0.9170 0.5888 0.668 0.332
#> SRR772504 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772509 2 0.7745 0.7102 0.228 0.772
#> SRR772510 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.2778 0.9287 0.048 0.952
#> SRR772512 2 0.4022 0.8978 0.080 0.920
#> SRR772513 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772521 1 0.5842 0.8532 0.860 0.140
#> SRR772522 1 0.1414 0.9236 0.980 0.020
#> SRR772523 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.9775 0.3577 0.588 0.412
#> SRR772530 1 0.5737 0.8553 0.864 0.136
#> SRR772531 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.8955 0.6291 0.688 0.312
#> SRR772535 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.6973 0.8021 0.812 0.188
#> SRR772540 1 0.9922 0.3105 0.552 0.448
#> SRR772541 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772542 1 0.1843 0.9209 0.972 0.028
#> SRR772543 1 0.0938 0.9245 0.988 0.012
#> SRR772544 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.4161 0.8928 0.916 0.084
#> SRR772546 1 0.5519 0.8625 0.872 0.128
#> SRR772547 1 0.2603 0.9154 0.956 0.044
#> SRR772548 1 0.3431 0.9051 0.936 0.064
#> SRR772549 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772550 1 0.0938 0.9245 0.988 0.012
#> SRR772551 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772552 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772553 2 0.8861 0.5761 0.304 0.696
#> SRR772554 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.1633 0.9225 0.976 0.024
#> SRR772557 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772558 1 0.8555 0.6791 0.720 0.280
#> SRR772559 1 0.1184 0.9238 0.984 0.016
#> SRR772560 2 0.4562 0.8802 0.096 0.904
#> SRR772561 2 0.9209 0.5090 0.336 0.664
#> SRR772562 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.2423 0.9163 0.960 0.040
#> SRR772571 1 0.8763 0.6528 0.704 0.296
#> SRR772572 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772573 1 0.0938 0.9245 0.988 0.012
#> SRR772574 1 0.5294 0.8687 0.880 0.120
#> SRR772575 2 0.4939 0.8612 0.108 0.892
#> SRR772576 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772577 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772578 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772581 1 0.9044 0.6131 0.680 0.320
#> SRR772582 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR772583 2 0.7815 0.6992 0.232 0.768
#> SRR772584 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772585 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.3114 0.9097 0.944 0.056
#> SRR772588 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772592 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772593 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772599 1 0.0938 0.9249 0.988 0.012
#> SRR772600 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772606 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772607 1 0.0376 0.9246 0.996 0.004
#> SRR772608 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.1184 0.9244 0.984 0.016
#> SRR772615 1 0.0672 0.9248 0.992 0.008
#> SRR772616 1 0.5519 0.8634 0.872 0.128
#> SRR772617 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772622 2 0.2948 0.9247 0.052 0.948
#> SRR772623 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.1843 0.9454 0.028 0.972
#> SRR772627 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772628 1 0.0938 0.9245 0.988 0.012
#> SRR772629 1 0.2236 0.9184 0.964 0.036
#> SRR772630 1 0.4562 0.8863 0.904 0.096
#> SRR772631 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.4690 0.8811 0.900 0.100
#> SRR772635 2 0.1414 0.9506 0.020 0.980
#> SRR772636 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.9552 0.3975 0.376 0.624
#> SRR772643 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772644 1 0.5178 0.8722 0.884 0.116
#> SRR772645 1 0.6973 0.8026 0.812 0.188
#> SRR772646 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.3879 0.9012 0.076 0.924
#> SRR772649 2 0.1843 0.9456 0.028 0.972
#> SRR772650 2 0.9795 0.1973 0.416 0.584
#> SRR772651 1 0.5178 0.8715 0.884 0.116
#> SRR772652 1 0.5629 0.8601 0.868 0.132
#> SRR772653 1 0.0938 0.9245 0.988 0.012
#> SRR772654 2 0.9635 0.3580 0.388 0.612
#> SRR772655 2 0.6973 0.7609 0.188 0.812
#> SRR772656 1 0.5629 0.8472 0.868 0.132
#> SRR772657 1 0.0376 0.9241 0.996 0.004
#> SRR772658 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR772661 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772662 2 0.2423 0.9355 0.040 0.960
#> SRR772663 2 0.1414 0.9515 0.020 0.980
#> SRR772664 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772670 1 0.4690 0.8844 0.900 0.100
#> SRR772671 2 0.3274 0.9171 0.060 0.940
#> SRR772672 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.9815 0.2892 0.580 0.420
#> SRR772676 1 0.5737 0.8551 0.864 0.136
#> SRR772677 1 0.2043 0.9201 0.968 0.032
#> SRR772678 1 0.0672 0.9243 0.992 0.008
#> SRR772679 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR772680 1 0.8386 0.7013 0.732 0.268
#> SRR772681 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0672 0.9599 0.008 0.992
#> SRR772692 2 0.8763 0.5870 0.296 0.704
#> SRR772693 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772694 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772696 2 0.0376 0.9627 0.004 0.996
#> SRR772697 2 0.0000 0.9653 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.0000 0.9238 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.1184 0.9244 0.984 0.016
#> SRR772700 2 0.9686 0.3115 0.396 0.604
#> SRR772701 1 0.3114 0.9097 0.944 0.056
#> SRR772702 1 0.0672 0.9249 0.992 0.008
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0592 0.9088 0.988 0.000 0.012
#> SRR772343 1 0.2625 0.8576 0.916 0.084 0.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 2 0.6267 0.2288 0.452 0.548 0.000
#> SRR772347 1 0.5327 0.6105 0.728 0.272 0.000
#> SRR772348 2 0.0424 0.9231 0.008 0.992 0.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772350 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772352 2 0.1529 0.9029 0.040 0.960 0.000
#> SRR772353 1 0.1753 0.8899 0.952 0.048 0.000
#> SRR772354 1 0.6225 0.2588 0.568 0.432 0.000
#> SRR772355 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772357 1 0.4399 0.7399 0.812 0.188 0.000
#> SRR772358 1 0.2400 0.8762 0.932 0.064 0.004
#> SRR772359 1 0.1964 0.8839 0.944 0.056 0.000
#> SRR772360 2 0.5988 0.4402 0.368 0.632 0.000
#> SRR772361 3 0.0747 0.9261 0.016 0.000 0.984
#> SRR772362 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 2 0.5859 0.5048 0.344 0.656 0.000
#> SRR772365 1 0.4784 0.7103 0.796 0.200 0.004
#> SRR772366 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772369 2 0.4796 0.7240 0.220 0.780 0.000
#> SRR772370 1 0.0892 0.9070 0.980 0.020 0.000
#> SRR772371 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772372 1 0.1860 0.8876 0.948 0.052 0.000
#> SRR772373 2 0.3879 0.7963 0.152 0.848 0.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772377 3 0.4861 0.7694 0.180 0.012 0.808
#> SRR772378 1 0.0237 0.9114 0.996 0.004 0.000
#> SRR772379 2 0.4002 0.7892 0.160 0.840 0.000
#> SRR772380 1 0.0592 0.9106 0.988 0.012 0.000
#> SRR772381 3 0.1163 0.9193 0.028 0.000 0.972
#> SRR772382 1 0.0237 0.9114 0.996 0.004 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772384 3 0.6189 0.4423 0.364 0.004 0.632
#> SRR772385 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772386 2 0.5016 0.6974 0.240 0.760 0.000
#> SRR772387 2 0.0747 0.9186 0.016 0.984 0.000
#> SRR772388 1 0.3752 0.8064 0.856 0.000 0.144
#> SRR772389 1 0.4605 0.7342 0.796 0.000 0.204
#> SRR772390 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.1163 0.9035 0.972 0.028 0.000
#> SRR772393 2 0.2448 0.8739 0.076 0.924 0.000
#> SRR772394 2 0.1860 0.8946 0.052 0.948 0.000
#> SRR772395 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772396 1 0.0237 0.9114 0.996 0.004 0.000
#> SRR772397 1 0.1031 0.9050 0.976 0.000 0.024
#> SRR772398 1 0.4110 0.7939 0.844 0.004 0.152
#> SRR772399 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0892 0.9061 0.980 0.000 0.020
#> SRR772401 1 0.1163 0.9021 0.972 0.000 0.028
#> SRR772402 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772404 2 0.1163 0.9111 0.028 0.972 0.000
#> SRR772405 3 0.5431 0.6112 0.284 0.000 0.716
#> SRR772406 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 1 0.4654 0.7113 0.792 0.208 0.000
#> SRR772411 1 0.1031 0.9059 0.976 0.024 0.000
#> SRR772412 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0237 0.9105 0.996 0.000 0.004
#> SRR772414 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 2 0.0237 0.9249 0.004 0.996 0.000
#> SRR772416 1 0.5397 0.5992 0.720 0.280 0.000
#> SRR772417 1 0.1411 0.8982 0.964 0.036 0.000
#> SRR772418 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772422 2 0.1529 0.9038 0.040 0.960 0.000
#> SRR772423 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772425 2 0.3340 0.8302 0.120 0.880 0.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772430 2 0.6168 0.3484 0.412 0.588 0.000
#> SRR772431 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772433 1 0.0747 0.9084 0.984 0.000 0.016
#> SRR772434 1 0.0892 0.9063 0.980 0.000 0.020
#> SRR772435 1 0.4654 0.7059 0.792 0.208 0.000
#> SRR772436 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.3038 0.8589 0.104 0.000 0.896
#> SRR772438 1 0.0747 0.9082 0.984 0.000 0.016
#> SRR772439 1 0.1529 0.8960 0.960 0.000 0.040
#> SRR772440 2 0.2261 0.8800 0.068 0.932 0.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772443 2 0.4346 0.7638 0.184 0.816 0.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0592 0.9101 0.988 0.012 0.000
#> SRR772448 2 0.1163 0.9111 0.028 0.972 0.000
#> SRR772449 2 0.1753 0.8967 0.048 0.952 0.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0892 0.9062 0.980 0.000 0.020
#> SRR772453 1 0.0237 0.9114 0.996 0.004 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0424 0.9111 0.992 0.008 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0424 0.9104 0.992 0.000 0.008
#> SRR772459 1 0.0892 0.9066 0.980 0.000 0.020
#> SRR772460 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.4887 0.6848 0.772 0.228 0.000
#> SRR772466 2 0.5948 0.4640 0.360 0.640 0.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.0424 0.9099 0.992 0.000 0.008
#> SRR772470 1 0.1289 0.9014 0.968 0.032 0.000
#> SRR772471 1 0.1289 0.9011 0.968 0.032 0.000
#> SRR772472 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772473 2 0.1163 0.9109 0.028 0.972 0.000
#> SRR772474 2 0.0592 0.9208 0.012 0.988 0.000
#> SRR772475 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1015 0.9099 0.980 0.008 0.012
#> SRR772479 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772480 1 0.6267 0.1428 0.548 0.452 0.000
#> SRR772481 2 0.6307 0.0546 0.488 0.512 0.000
#> SRR772482 1 0.3482 0.8119 0.872 0.128 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772484 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772485 2 0.0592 0.9210 0.012 0.988 0.000
#> SRR772486 1 0.2066 0.8829 0.940 0.000 0.060
#> SRR772487 1 0.0424 0.9102 0.992 0.000 0.008
#> SRR772488 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772489 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772490 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0747 0.9092 0.984 0.016 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.1753 0.8984 0.048 0.952 0.000
#> SRR772497 2 0.5327 0.6508 0.272 0.728 0.000
#> SRR772498 2 0.5760 0.5441 0.328 0.672 0.000
#> SRR772499 2 0.4504 0.7517 0.196 0.804 0.000
#> SRR772500 2 0.0424 0.9229 0.008 0.992 0.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 1 0.3192 0.8308 0.888 0.112 0.000
#> SRR772503 1 0.1529 0.8959 0.960 0.040 0.000
#> SRR772504 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772509 2 0.6518 0.6927 0.080 0.752 0.168
#> SRR772510 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 2 0.6215 0.2942 0.428 0.572 0.000
#> SRR772512 2 0.4062 0.7718 0.000 0.836 0.164
#> SRR772513 2 0.0747 0.9189 0.016 0.984 0.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772518 2 0.0424 0.9228 0.008 0.992 0.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772521 1 0.0592 0.9105 0.988 0.012 0.000
#> SRR772522 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772523 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0424 0.9293 0.008 0.000 0.992
#> SRR772529 1 0.0592 0.9101 0.988 0.012 0.000
#> SRR772530 1 0.0475 0.9117 0.992 0.004 0.004
#> SRR772531 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772534 1 0.2066 0.8805 0.940 0.060 0.000
#> SRR772535 2 0.2537 0.8702 0.080 0.920 0.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772539 1 0.0237 0.9114 0.996 0.004 0.000
#> SRR772540 1 0.4291 0.7481 0.820 0.180 0.000
#> SRR772541 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772544 3 0.0592 0.9280 0.012 0.000 0.988
#> SRR772545 1 0.0892 0.9078 0.980 0.020 0.000
#> SRR772546 1 0.1964 0.8842 0.944 0.056 0.000
#> SRR772547 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772548 1 0.0747 0.9096 0.984 0.016 0.000
#> SRR772549 1 0.1529 0.8965 0.960 0.000 0.040
#> SRR772550 1 0.0892 0.9065 0.980 0.000 0.020
#> SRR772551 2 0.5905 0.4839 0.352 0.648 0.000
#> SRR772552 2 0.6140 0.3434 0.404 0.596 0.000
#> SRR772553 2 0.6722 0.6377 0.060 0.720 0.220
#> SRR772554 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0237 0.9109 0.996 0.000 0.004
#> SRR772558 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772560 1 0.2165 0.8760 0.936 0.064 0.000
#> SRR772561 3 0.6505 0.0870 0.004 0.468 0.528
#> SRR772562 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772563 2 0.1860 0.8935 0.052 0.948 0.000
#> SRR772564 1 0.2165 0.8804 0.936 0.000 0.064
#> SRR772565 1 0.0892 0.9062 0.980 0.000 0.020
#> SRR772566 1 0.6095 0.3802 0.608 0.000 0.392
#> SRR772567 1 0.4346 0.7584 0.816 0.000 0.184
#> SRR772568 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772570 1 0.0848 0.9107 0.984 0.008 0.008
#> SRR772571 1 0.0424 0.9114 0.992 0.008 0.000
#> SRR772572 1 0.0592 0.9088 0.988 0.000 0.012
#> SRR772573 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.0424 0.9115 0.992 0.008 0.000
#> SRR772575 1 0.4178 0.7616 0.828 0.172 0.000
#> SRR772576 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772577 2 0.1163 0.9107 0.028 0.972 0.000
#> SRR772578 2 0.0237 0.9249 0.004 0.996 0.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.0237 0.9115 0.996 0.004 0.000
#> SRR772582 2 0.6302 0.0934 0.480 0.520 0.000
#> SRR772583 1 0.5706 0.5271 0.680 0.320 0.000
#> SRR772584 2 0.4974 0.7000 0.236 0.764 0.000
#> SRR772585 2 0.0424 0.9228 0.008 0.992 0.000
#> SRR772586 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR772587 1 0.5363 0.6240 0.724 0.000 0.276
#> SRR772588 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0237 0.9306 0.004 0.000 0.996
#> SRR772591 1 0.5431 0.6104 0.716 0.000 0.284
#> SRR772592 1 0.5733 0.5360 0.676 0.000 0.324
#> SRR772593 3 0.0237 0.9305 0.004 0.000 0.996
#> SRR772594 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772596 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0424 0.9098 0.992 0.000 0.008
#> SRR772600 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772602 3 0.0424 0.9293 0.008 0.000 0.992
#> SRR772603 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772604 2 0.0237 0.9248 0.004 0.996 0.000
#> SRR772605 2 0.5905 0.4911 0.352 0.648 0.000
#> SRR772606 1 0.0592 0.9091 0.988 0.000 0.012
#> SRR772607 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.1411 0.9063 0.036 0.964 0.000
#> SRR772609 2 0.3038 0.8495 0.104 0.896 0.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772611 2 0.1643 0.9000 0.044 0.956 0.000
#> SRR772612 2 0.0424 0.9229 0.008 0.992 0.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772614 1 0.1753 0.8913 0.952 0.000 0.048
#> SRR772615 1 0.2165 0.8807 0.936 0.000 0.064
#> SRR772616 1 0.0237 0.9112 0.996 0.004 0.000
#> SRR772617 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 2 0.1753 0.8985 0.048 0.952 0.000
#> SRR772622 2 0.6225 0.2854 0.432 0.568 0.000
#> SRR772623 3 0.0237 0.9303 0.004 0.000 0.996
#> SRR772624 3 0.0424 0.9294 0.008 0.000 0.992
#> SRR772625 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772626 2 0.6267 0.2099 0.452 0.548 0.000
#> SRR772627 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772628 1 0.0424 0.9100 0.992 0.000 0.008
#> SRR772629 1 0.0237 0.9107 0.996 0.000 0.004
#> SRR772630 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772631 3 0.3038 0.8571 0.104 0.000 0.896
#> SRR772632 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 1 0.0424 0.9114 0.992 0.008 0.000
#> SRR772635 2 0.6008 0.4222 0.372 0.628 0.000
#> SRR772636 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772637 1 0.0892 0.9061 0.980 0.000 0.020
#> SRR772638 1 0.1753 0.8916 0.952 0.000 0.048
#> SRR772639 2 0.0237 0.9248 0.004 0.996 0.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.4399 0.7275 0.812 0.188 0.000
#> SRR772643 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772644 1 0.1163 0.9035 0.972 0.028 0.000
#> SRR772645 1 0.2448 0.8669 0.924 0.076 0.000
#> SRR772646 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772648 1 0.6309 -0.0257 0.504 0.496 0.000
#> SRR772649 2 0.5465 0.6226 0.288 0.712 0.000
#> SRR772650 1 0.4346 0.7434 0.816 0.184 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0747 0.9093 0.984 0.016 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772654 1 0.5098 0.6395 0.752 0.248 0.000
#> SRR772655 1 0.5178 0.6372 0.744 0.256 0.000
#> SRR772656 3 0.6511 0.7548 0.136 0.104 0.760
#> SRR772657 3 0.1964 0.9000 0.056 0.000 0.944
#> SRR772658 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772660 2 0.5363 0.6386 0.276 0.724 0.000
#> SRR772661 3 0.3482 0.8338 0.128 0.000 0.872
#> SRR772662 2 0.6215 0.2948 0.428 0.572 0.000
#> SRR772663 2 0.5733 0.5496 0.324 0.676 0.000
#> SRR772664 2 0.0592 0.9208 0.012 0.988 0.000
#> SRR772665 2 0.5098 0.6780 0.248 0.752 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772670 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772671 1 0.1860 0.8861 0.948 0.052 0.000
#> SRR772672 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772673 2 0.1964 0.8903 0.056 0.944 0.000
#> SRR772674 3 0.0424 0.9296 0.008 0.000 0.992
#> SRR772675 3 0.9241 0.2169 0.156 0.388 0.456
#> SRR772676 1 0.0592 0.9104 0.988 0.012 0.000
#> SRR772677 1 0.0424 0.9113 0.992 0.008 0.000
#> SRR772678 1 0.6804 0.0790 0.528 0.012 0.460
#> SRR772679 2 0.4346 0.7575 0.184 0.816 0.000
#> SRR772680 1 0.2537 0.8620 0.920 0.080 0.000
#> SRR772681 3 0.1163 0.9194 0.028 0.000 0.972
#> SRR772682 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772683 2 0.0237 0.9249 0.004 0.996 0.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.9312 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772692 1 0.6026 0.3825 0.624 0.376 0.000
#> SRR772693 2 0.0747 0.9188 0.016 0.984 0.000
#> SRR772694 2 0.0000 0.9268 0.000 1.000 0.000
#> SRR772695 2 0.2711 0.8648 0.088 0.912 0.000
#> SRR772696 2 0.1964 0.8906 0.056 0.944 0.000
#> SRR772697 2 0.0424 0.9233 0.008 0.992 0.000
#> SRR772698 3 0.0592 0.9275 0.012 0.000 0.988
#> SRR772699 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772700 1 0.1753 0.8892 0.952 0.048 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.4967 0.50263 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR772342 1 0.2773 0.78713 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR772343 4 0.5921 0.11460 0.448 0.036 0.000 0.516
#> SRR772344 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0188 0.87702 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772346 4 0.3587 0.63331 0.040 0.104 0.000 0.856
#> SRR772347 4 0.5323 0.58068 0.216 0.052 0.004 0.728
#> SRR772348 2 0.4679 0.46333 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR772349 2 0.1004 0.87422 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR772350 3 0.2522 0.88296 0.016 0.000 0.908 0.076
#> SRR772351 2 0.1474 0.87020 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772352 4 0.4977 0.19160 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR772353 4 0.5793 0.45310 0.324 0.048 0.000 0.628
#> SRR772354 4 0.6394 0.64681 0.120 0.244 0.000 0.636
#> SRR772355 2 0.3801 0.72306 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR772356 2 0.0707 0.87630 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772357 4 0.4057 0.54283 0.160 0.028 0.000 0.812
#> SRR772358 1 0.5500 0.12693 0.520 0.016 0.000 0.464
#> SRR772359 4 0.5669 0.12767 0.464 0.016 0.004 0.516
#> SRR772360 4 0.6123 0.56035 0.064 0.336 0.000 0.600
#> SRR772361 3 0.1624 0.89349 0.028 0.000 0.952 0.020
#> SRR772362 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 4 0.6366 0.64337 0.120 0.240 0.000 0.640
#> SRR772365 4 0.5971 0.31104 0.428 0.040 0.000 0.532
#> SRR772366 3 0.3439 0.88400 0.048 0.000 0.868 0.084
#> SRR772367 3 0.1042 0.89574 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR772368 2 0.1118 0.87487 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772369 4 0.6606 0.63379 0.152 0.224 0.000 0.624
#> SRR772370 4 0.3355 0.53117 0.160 0.004 0.000 0.836
#> SRR772371 1 0.3311 0.74835 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR772372 4 0.5147 -0.33226 0.460 0.004 0.000 0.536
#> SRR772373 2 0.4773 0.74760 0.092 0.788 0.000 0.120
#> SRR772374 2 0.1716 0.86370 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772375 3 0.1042 0.89574 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR772376 2 0.2589 0.83422 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR772377 3 0.5675 0.64058 0.048 0.004 0.676 0.272
#> SRR772378 4 0.3356 0.51049 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR772379 2 0.6407 0.08430 0.068 0.520 0.000 0.412
#> SRR772380 4 0.3791 0.49525 0.200 0.004 0.000 0.796
#> SRR772381 3 0.1929 0.89006 0.036 0.000 0.940 0.024
#> SRR772382 1 0.4431 0.71293 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR772383 1 0.2216 0.78502 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR772384 3 0.6990 0.36833 0.108 0.004 0.524 0.364
#> SRR772385 2 0.5388 0.08993 0.000 0.532 0.012 0.456
#> SRR772386 4 0.5184 0.55944 0.024 0.304 0.000 0.672
#> SRR772387 2 0.5132 0.13101 0.004 0.548 0.000 0.448
#> SRR772388 1 0.4070 0.73988 0.824 0.000 0.044 0.132
#> SRR772389 1 0.2408 0.72952 0.920 0.000 0.044 0.036
#> SRR772390 3 0.1724 0.89522 0.020 0.000 0.948 0.032
#> SRR772391 1 0.4134 0.73113 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR772392 1 0.4804 0.43417 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR772393 4 0.4746 0.39662 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR772394 4 0.5915 0.36487 0.040 0.400 0.000 0.560
#> SRR772395 2 0.2345 0.84429 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772396 1 0.3975 0.70501 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR772397 1 0.1635 0.77894 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR772398 1 0.4840 0.73012 0.732 0.000 0.028 0.240
#> SRR772399 1 0.3873 0.74759 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR772400 1 0.1004 0.76718 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR772401 1 0.3428 0.74947 0.844 0.000 0.012 0.144
#> SRR772402 2 0.1940 0.85976 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772403 2 0.0707 0.87157 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772404 2 0.4903 0.68932 0.028 0.724 0.000 0.248
#> SRR772405 3 0.6198 0.68392 0.152 0.000 0.672 0.176
#> SRR772406 2 0.4304 0.65217 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR772407 2 0.3219 0.79318 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR772408 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772410 4 0.7008 0.54641 0.276 0.160 0.000 0.564
#> SRR772411 4 0.5290 0.29286 0.404 0.012 0.000 0.584
#> SRR772412 1 0.4134 0.71756 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR772413 1 0.3123 0.76804 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR772414 3 0.1151 0.89587 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR772415 2 0.5016 0.29950 0.004 0.600 0.000 0.396
#> SRR772416 4 0.4740 0.62637 0.132 0.080 0.000 0.788
#> SRR772417 4 0.5386 0.37565 0.344 0.024 0.000 0.632
#> SRR772418 3 0.2578 0.89042 0.052 0.000 0.912 0.036
#> SRR772419 2 0.0469 0.87738 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772420 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772421 2 0.3801 0.72655 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR772422 4 0.5658 0.23410 0.016 0.452 0.004 0.528
#> SRR772423 2 0.2198 0.84787 0.008 0.920 0.000 0.072
#> SRR772424 2 0.1389 0.86706 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772425 4 0.5635 0.53759 0.028 0.340 0.004 0.628
#> SRR772426 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772428 1 0.4431 0.71385 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR772429 1 0.3311 0.76144 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR772430 4 0.4244 0.64667 0.032 0.168 0.000 0.800
#> SRR772431 2 0.0817 0.87055 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772432 2 0.0707 0.87157 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772433 1 0.4290 0.74920 0.772 0.000 0.016 0.212
#> SRR772434 1 0.0927 0.76481 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR772435 4 0.4875 0.59699 0.160 0.068 0.000 0.772
#> SRR772436 4 0.4543 0.28136 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR772437 3 0.3598 0.81959 0.028 0.000 0.848 0.124
#> SRR772438 1 0.4420 0.75082 0.748 0.000 0.012 0.240
#> SRR772439 1 0.0927 0.76528 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR772440 2 0.4164 0.68203 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR772441 2 0.3837 0.72553 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR772442 2 0.3837 0.73486 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR772443 4 0.5977 0.25443 0.040 0.432 0.000 0.528
#> SRR772444 1 0.4304 0.73811 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR772445 1 0.3172 0.78382 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR772446 1 0.2408 0.77699 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR772447 1 0.4608 0.61718 0.692 0.004 0.000 0.304
#> SRR772448 2 0.5282 0.62996 0.036 0.688 0.000 0.276
#> SRR772449 2 0.4978 0.55825 0.012 0.664 0.000 0.324
#> SRR772450 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0804 0.76935 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR772453 1 0.2654 0.77619 0.888 0.004 0.000 0.108
#> SRR772454 1 0.4989 0.17009 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR772455 4 0.4746 0.01147 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR772456 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.1792 0.78254 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR772459 1 0.0592 0.77273 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772460 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772462 2 0.0188 0.87670 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772463 2 0.0336 0.87696 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772464 3 0.0657 0.89633 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR772465 4 0.5003 0.60407 0.148 0.084 0.000 0.768
#> SRR772466 4 0.6572 0.64088 0.120 0.272 0.000 0.608
#> SRR772467 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.1545 0.77431 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR772470 1 0.2859 0.77931 0.880 0.008 0.000 0.112
#> SRR772471 1 0.4544 0.70893 0.760 0.016 0.004 0.220
#> SRR772472 1 0.2149 0.78033 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR772473 2 0.3108 0.83239 0.016 0.872 0.000 0.112
#> SRR772474 2 0.4417 0.77566 0.044 0.796 0.000 0.160
#> SRR772475 4 0.5594 0.19593 0.000 0.460 0.020 0.520
#> SRR772476 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.3340 0.75921 0.848 0.004 0.004 0.144
#> SRR772479 1 0.3219 0.75259 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR772480 4 0.6991 0.58395 0.232 0.188 0.000 0.580
#> SRR772481 4 0.7613 0.53297 0.240 0.288 0.000 0.472
#> SRR772482 4 0.5321 0.50678 0.296 0.032 0.000 0.672
#> SRR772483 4 0.4972 0.22031 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR772484 2 0.2081 0.85430 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772485 2 0.5566 0.63813 0.072 0.704 0.000 0.224
#> SRR772486 1 0.3495 0.74533 0.844 0.000 0.016 0.140
#> SRR772487 1 0.1302 0.77746 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR772488 2 0.1302 0.87154 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772489 2 0.1474 0.86946 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772490 1 0.4304 0.72299 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR772491 1 0.3837 0.71977 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR772492 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 4 0.5827 0.37004 0.036 0.396 0.000 0.568
#> SRR772497 4 0.6656 0.62772 0.160 0.220 0.000 0.620
#> SRR772498 4 0.4439 0.64881 0.048 0.140 0.004 0.808
#> SRR772499 4 0.6269 0.62040 0.096 0.272 0.000 0.632
#> SRR772500 2 0.2089 0.86080 0.020 0.932 0.000 0.048
#> SRR772501 2 0.1022 0.87622 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772502 4 0.4669 0.52959 0.200 0.036 0.000 0.764
#> SRR772503 4 0.3668 0.50033 0.188 0.004 0.000 0.808
#> SRR772504 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772505 2 0.0188 0.87623 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772506 2 0.0817 0.87481 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772507 2 0.0188 0.87702 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772508 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772509 4 0.7536 0.57162 0.032 0.216 0.160 0.592
#> SRR772510 3 0.0895 0.89658 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR772511 4 0.5798 0.63511 0.152 0.124 0.004 0.720
#> SRR772512 2 0.6320 0.59090 0.000 0.660 0.180 0.160
#> SRR772513 2 0.5201 0.32750 0.004 0.592 0.004 0.400
#> SRR772514 2 0.1474 0.86746 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772515 2 0.2973 0.80946 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772516 2 0.2216 0.84988 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772517 2 0.0336 0.87718 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772518 4 0.5000 0.11303 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR772519 2 0.1118 0.87368 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772520 2 0.2814 0.82446 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772521 4 0.5105 -0.18546 0.432 0.004 0.000 0.564
#> SRR772522 1 0.4961 0.44551 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR772523 2 0.3356 0.80269 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR772524 2 0.4164 0.67623 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR772525 3 0.2402 0.88397 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR772526 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.2739 0.88796 0.060 0.000 0.904 0.036
#> SRR772529 4 0.4331 0.39439 0.288 0.000 0.000 0.712
#> SRR772530 1 0.4605 0.67335 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR772531 3 0.2402 0.88397 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR772532 2 0.0336 0.87743 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772533 2 0.0707 0.87560 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772534 4 0.5228 0.41617 0.268 0.036 0.000 0.696
#> SRR772535 4 0.4897 0.53056 0.008 0.332 0.000 0.660
#> SRR772536 2 0.1716 0.86350 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772537 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772539 4 0.4134 0.36884 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR772540 4 0.6219 0.53169 0.264 0.096 0.000 0.640
#> SRR772541 2 0.3569 0.77516 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772542 1 0.4134 0.73397 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR772543 1 0.3123 0.76780 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR772544 3 0.1724 0.89220 0.032 0.000 0.948 0.020
#> SRR772545 1 0.4372 0.62220 0.728 0.000 0.004 0.268
#> SRR772546 1 0.5393 0.38785 0.608 0.008 0.008 0.376
#> SRR772547 1 0.5000 -0.02756 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR772548 1 0.4950 0.44939 0.620 0.004 0.000 0.376
#> SRR772549 1 0.1151 0.76276 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR772550 1 0.0779 0.77130 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR772551 4 0.4181 0.63793 0.052 0.128 0.000 0.820
#> SRR772552 4 0.5431 0.65407 0.064 0.224 0.000 0.712
#> SRR772553 4 0.7591 0.55234 0.048 0.156 0.188 0.608
#> SRR772554 2 0.0707 0.87631 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772555 2 0.4222 0.65189 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR772556 1 0.5132 0.49532 0.548 0.004 0.000 0.448
#> SRR772557 1 0.4511 0.71919 0.724 0.000 0.008 0.268
#> SRR772558 4 0.4730 0.09512 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR772559 1 0.3486 0.75379 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR772560 4 0.3088 0.54994 0.128 0.008 0.000 0.864
#> SRR772561 3 0.6720 0.36948 0.000 0.120 0.580 0.300
#> SRR772562 2 0.4313 0.65314 0.004 0.736 0.000 0.260
#> SRR772563 2 0.4716 0.73101 0.040 0.764 0.000 0.196
#> SRR772564 1 0.0927 0.76535 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR772565 1 0.1890 0.77774 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR772566 1 0.5204 0.68369 0.752 0.000 0.088 0.160
#> SRR772567 1 0.2500 0.72843 0.916 0.000 0.044 0.040
#> SRR772568 2 0.2973 0.82276 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772569 2 0.1389 0.86995 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772570 1 0.5024 0.42405 0.632 0.000 0.008 0.360
#> SRR772571 1 0.4356 0.59254 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR772572 1 0.3052 0.76150 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR772573 1 0.2530 0.78127 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR772574 1 0.2773 0.77557 0.880 0.004 0.000 0.116
#> SRR772575 4 0.3856 0.57493 0.136 0.032 0.000 0.832
#> SRR772576 2 0.3801 0.72141 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR772577 2 0.3616 0.81457 0.036 0.852 0.000 0.112
#> SRR772578 2 0.4790 0.41680 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR772579 2 0.0817 0.87607 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772580 3 0.1151 0.89535 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR772581 4 0.4961 -0.26065 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR772582 4 0.5417 0.65672 0.088 0.180 0.000 0.732
#> SRR772583 4 0.6639 0.52236 0.320 0.092 0.004 0.584
#> SRR772584 4 0.5549 0.62404 0.048 0.280 0.000 0.672
#> SRR772585 2 0.3982 0.74666 0.000 0.776 0.004 0.220
#> SRR772586 3 0.2586 0.89180 0.048 0.000 0.912 0.040
#> SRR772587 1 0.3245 0.75405 0.880 0.000 0.064 0.056
#> SRR772588 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772590 3 0.1182 0.89605 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR772591 1 0.4753 0.70594 0.788 0.000 0.084 0.128
#> SRR772592 1 0.4300 0.69257 0.820 0.000 0.088 0.092
#> SRR772593 3 0.2399 0.89071 0.048 0.000 0.920 0.032
#> SRR772594 2 0.0921 0.87537 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772595 2 0.0707 0.87658 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772596 3 0.2032 0.89473 0.028 0.000 0.936 0.036
#> SRR772597 3 0.1042 0.89574 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR772598 1 0.4972 0.50033 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR772599 1 0.2216 0.77612 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR772600 2 0.0921 0.87096 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772601 2 0.0921 0.86981 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772602 3 0.1411 0.89525 0.020 0.000 0.960 0.020
#> SRR772603 2 0.2589 0.84492 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR772604 2 0.1716 0.86682 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772605 4 0.4206 0.65264 0.048 0.136 0.000 0.816
#> SRR772606 1 0.3870 0.75610 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR772607 1 0.3610 0.75291 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR772608 2 0.5281 0.00827 0.008 0.528 0.000 0.464
#> SRR772609 2 0.6452 -0.08246 0.068 0.468 0.000 0.464
#> SRR772610 2 0.0188 0.87706 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772611 2 0.4262 0.68026 0.008 0.756 0.000 0.236
#> SRR772612 2 0.3219 0.74354 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR772613 2 0.0817 0.87055 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772614 1 0.2376 0.77507 0.916 0.000 0.016 0.068
#> SRR772615 1 0.1297 0.75912 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR772616 4 0.4800 0.11013 0.340 0.004 0.000 0.656
#> SRR772617 2 0.0592 0.87249 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772618 2 0.0921 0.86975 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772619 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772621 4 0.5500 0.20622 0.016 0.464 0.000 0.520
#> SRR772622 4 0.5208 0.65678 0.080 0.172 0.000 0.748
#> SRR772623 3 0.3198 0.87423 0.040 0.000 0.880 0.080
#> SRR772624 3 0.2965 0.88277 0.072 0.000 0.892 0.036
#> SRR772625 2 0.3402 0.78896 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR772626 4 0.6469 0.63790 0.164 0.192 0.000 0.644
#> SRR772627 2 0.2216 0.85652 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772628 1 0.1978 0.77775 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR772629 1 0.3764 0.74810 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR772630 1 0.4916 0.40591 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR772631 3 0.4418 0.77761 0.184 0.000 0.784 0.032
#> SRR772632 2 0.1637 0.86518 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772633 2 0.0336 0.87696 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772634 4 0.4776 0.16589 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR772635 4 0.6693 0.59693 0.116 0.304 0.000 0.580
#> SRR772636 2 0.1637 0.86512 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772637 1 0.0707 0.77207 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772638 1 0.0927 0.76395 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR772639 2 0.4372 0.64748 0.000 0.728 0.004 0.268
#> SRR772640 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 4 0.4171 0.60528 0.116 0.060 0.000 0.824
#> SRR772643 2 0.3837 0.72085 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR772644 4 0.5203 -0.12385 0.416 0.008 0.000 0.576
#> SRR772645 1 0.5224 0.55902 0.664 0.016 0.004 0.316
#> SRR772646 2 0.0336 0.87696 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772647 2 0.2760 0.82930 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR772648 4 0.6308 0.61763 0.208 0.136 0.000 0.656
#> SRR772649 4 0.6111 0.64786 0.080 0.256 0.004 0.660
#> SRR772650 4 0.5875 0.58849 0.224 0.092 0.000 0.684
#> SRR772651 4 0.4277 0.33568 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR772652 1 0.5022 0.70719 0.684 0.012 0.004 0.300
#> SRR772653 1 0.4643 0.67495 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR772654 4 0.5397 0.51484 0.220 0.064 0.000 0.716
#> SRR772655 4 0.4082 0.59662 0.108 0.052 0.004 0.836
#> SRR772656 3 0.5577 0.64015 0.040 0.012 0.704 0.244
#> SRR772657 3 0.2928 0.86420 0.024 0.004 0.896 0.076
#> SRR772658 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772659 2 0.0592 0.87249 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772660 4 0.5982 0.65305 0.112 0.204 0.000 0.684
#> SRR772661 3 0.4462 0.79582 0.164 0.000 0.792 0.044
#> SRR772662 4 0.6511 0.63114 0.188 0.172 0.000 0.640
#> SRR772663 4 0.5881 0.65352 0.084 0.240 0.000 0.676
#> SRR772664 4 0.5662 0.25422 0.016 0.456 0.004 0.524
#> SRR772665 4 0.5865 0.54986 0.048 0.340 0.000 0.612
#> SRR772666 3 0.0672 0.89632 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR772667 2 0.0921 0.86981 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772668 2 0.0817 0.87055 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772669 2 0.0817 0.87055 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772670 4 0.4454 0.34140 0.308 0.000 0.000 0.692
#> SRR772671 4 0.2921 0.54304 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR772672 2 0.4814 0.56192 0.008 0.676 0.000 0.316
#> SRR772673 2 0.4877 0.40863 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR772674 3 0.1724 0.89440 0.032 0.000 0.948 0.020
#> SRR772675 4 0.7417 0.13576 0.048 0.060 0.392 0.500
#> SRR772676 1 0.5139 0.61408 0.612 0.004 0.004 0.380
#> SRR772677 1 0.4098 0.72608 0.784 0.012 0.000 0.204
#> SRR772678 3 0.7957 0.09974 0.192 0.012 0.408 0.388
#> SRR772679 4 0.6286 0.45256 0.064 0.384 0.000 0.552
#> SRR772680 4 0.3486 0.47323 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR772681 3 0.1929 0.88978 0.036 0.000 0.940 0.024
#> SRR772682 2 0.1940 0.86076 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772683 2 0.4164 0.64823 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR772685 2 0.1389 0.87158 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772686 3 0.0779 0.89647 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR772687 3 0.3372 0.88119 0.036 0.000 0.868 0.096
#> SRR772688 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.87679 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0336 0.89580 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772691 2 0.4661 0.66776 0.000 0.728 0.016 0.256
#> SRR772692 4 0.4731 0.60285 0.160 0.060 0.000 0.780
#> SRR772693 4 0.5568 0.15726 0.012 0.468 0.004 0.516
#> SRR772694 2 0.2011 0.85541 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR772695 4 0.4594 0.59919 0.008 0.280 0.000 0.712
#> SRR772696 4 0.5536 0.43567 0.024 0.384 0.000 0.592
#> SRR772697 4 0.4925 0.31928 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR772698 3 0.2644 0.88708 0.060 0.000 0.908 0.032
#> SRR772699 1 0.4999 0.36984 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR772700 4 0.3801 0.46331 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR772701 1 0.4790 0.64629 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR772702 1 0.4008 0.75794 0.756 0.000 0.000 0.244
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 2 0.4927 -0.03605 0.296 0.652 0.000 0.000 0.052
#> SRR772342 1 0.4263 0.76534 0.760 0.180 0.000 0.000 0.060
#> SRR772343 2 0.6447 0.42824 0.212 0.560 0.000 0.012 0.216
#> SRR772344 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772345 4 0.1341 0.77493 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR772346 2 0.3399 0.49714 0.000 0.812 0.000 0.020 0.168
#> SRR772347 2 0.5283 0.48659 0.080 0.672 0.000 0.008 0.240
#> SRR772348 4 0.6654 0.12198 0.004 0.296 0.000 0.476 0.224
#> SRR772349 4 0.2291 0.77137 0.000 0.036 0.000 0.908 0.056
#> SRR772350 3 0.2806 0.75505 0.004 0.000 0.844 0.000 0.152
#> SRR772351 4 0.2914 0.76251 0.000 0.076 0.000 0.872 0.052
#> SRR772352 2 0.6786 0.06021 0.004 0.436 0.000 0.244 0.316
#> SRR772353 2 0.5887 0.50079 0.124 0.660 0.000 0.028 0.188
#> SRR772354 2 0.6569 0.31092 0.020 0.528 0.000 0.144 0.308
#> SRR772355 4 0.5763 0.51812 0.000 0.188 0.000 0.620 0.192
#> SRR772356 4 0.2077 0.76769 0.000 0.008 0.000 0.908 0.084
#> SRR772357 2 0.3282 0.51808 0.024 0.860 0.000 0.024 0.092
#> SRR772358 2 0.6532 0.21636 0.312 0.492 0.000 0.004 0.192
#> SRR772359 2 0.6820 0.35611 0.232 0.456 0.000 0.008 0.304
#> SRR772360 2 0.6540 0.24930 0.008 0.528 0.000 0.216 0.248
#> SRR772361 3 0.3551 0.77399 0.000 0.008 0.772 0.000 0.220
#> SRR772362 4 0.0162 0.77093 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772363 4 0.0162 0.77093 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772364 2 0.6318 0.41677 0.032 0.600 0.000 0.120 0.248
#> SRR772365 2 0.6155 0.38888 0.292 0.556 0.004 0.000 0.148
#> SRR772366 3 0.3656 0.76543 0.032 0.000 0.800 0.000 0.168
#> SRR772367 3 0.0794 0.79800 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772368 4 0.3184 0.75938 0.000 0.048 0.000 0.852 0.100
#> SRR772369 2 0.6354 0.35011 0.044 0.516 0.000 0.064 0.376
#> SRR772370 2 0.2707 0.52106 0.024 0.876 0.000 0.000 0.100
#> SRR772371 1 0.4927 0.62132 0.652 0.296 0.000 0.000 0.052
#> SRR772372 2 0.5446 -0.25052 0.360 0.576 0.000 0.004 0.060
#> SRR772373 4 0.6546 0.46857 0.052 0.112 0.000 0.592 0.244
#> SRR772374 4 0.4393 0.66941 0.000 0.076 0.000 0.756 0.168
#> SRR772375 3 0.1410 0.79194 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772376 4 0.5039 0.61689 0.000 0.116 0.000 0.700 0.184
#> SRR772377 3 0.6260 0.41141 0.016 0.080 0.476 0.004 0.424
#> SRR772378 2 0.3090 0.52708 0.040 0.856 0.000 0.000 0.104
#> SRR772379 2 0.6921 0.01806 0.008 0.420 0.000 0.324 0.248
#> SRR772380 2 0.2588 0.51638 0.060 0.892 0.000 0.000 0.048
#> SRR772381 3 0.3918 0.76672 0.008 0.008 0.752 0.000 0.232
#> SRR772382 1 0.5036 0.61604 0.560 0.404 0.000 0.000 0.036
#> SRR772383 1 0.3601 0.77419 0.820 0.128 0.000 0.000 0.052
#> SRR772384 5 0.7246 -0.19189 0.056 0.124 0.352 0.004 0.464
#> SRR772385 5 0.6528 0.46900 0.004 0.184 0.016 0.220 0.576
#> SRR772386 2 0.6194 0.24445 0.000 0.500 0.000 0.148 0.352
#> SRR772387 2 0.6948 -0.11213 0.004 0.356 0.000 0.336 0.304
#> SRR772388 1 0.4675 0.76364 0.780 0.108 0.040 0.000 0.072
#> SRR772389 1 0.2448 0.73785 0.892 0.000 0.020 0.000 0.088
#> SRR772390 3 0.3760 0.79520 0.028 0.000 0.784 0.000 0.188
#> SRR772391 1 0.4824 0.66033 0.596 0.376 0.000 0.000 0.028
#> SRR772392 1 0.6453 0.31203 0.468 0.368 0.000 0.004 0.160
#> SRR772393 2 0.6265 0.15462 0.000 0.540 0.000 0.220 0.240
#> SRR772394 2 0.6705 0.14503 0.004 0.468 0.000 0.244 0.284
#> SRR772395 4 0.4624 0.66718 0.000 0.112 0.000 0.744 0.144
#> SRR772396 1 0.5596 0.61679 0.596 0.304 0.000 0.000 0.100
#> SRR772397 1 0.2450 0.76933 0.896 0.028 0.000 0.000 0.076
#> SRR772398 1 0.5347 0.69797 0.648 0.288 0.012 0.004 0.048
#> SRR772399 1 0.4786 0.69896 0.652 0.308 0.000 0.000 0.040
#> SRR772400 1 0.2006 0.76079 0.916 0.012 0.000 0.000 0.072
#> SRR772401 1 0.3365 0.75687 0.836 0.120 0.000 0.000 0.044
#> SRR772402 4 0.3749 0.72832 0.000 0.080 0.000 0.816 0.104
#> SRR772403 4 0.1430 0.75727 0.000 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR772404 4 0.6882 0.20531 0.012 0.216 0.000 0.452 0.320
#> SRR772405 3 0.6977 0.46832 0.084 0.072 0.456 0.000 0.388
#> SRR772406 4 0.5934 0.47209 0.000 0.232 0.000 0.592 0.176
#> SRR772407 4 0.5711 0.52327 0.000 0.136 0.000 0.612 0.252
#> SRR772408 4 0.0162 0.77093 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772409 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 2 0.7511 0.41460 0.184 0.512 0.000 0.100 0.204
#> SRR772411 2 0.6302 0.39178 0.276 0.544 0.000 0.004 0.176
#> SRR772412 1 0.5355 0.70974 0.660 0.220 0.000 0.000 0.120
#> SRR772413 1 0.3489 0.76101 0.820 0.144 0.000 0.000 0.036
#> SRR772414 3 0.1043 0.79962 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772415 4 0.6628 -0.11334 0.000 0.372 0.000 0.408 0.220
#> SRR772416 2 0.4436 0.51148 0.028 0.736 0.000 0.012 0.224
#> SRR772417 2 0.5604 0.50565 0.116 0.680 0.000 0.020 0.184
#> SRR772418 3 0.3655 0.79157 0.036 0.000 0.804 0.000 0.160
#> SRR772419 4 0.1557 0.77379 0.000 0.008 0.000 0.940 0.052
#> SRR772420 4 0.0404 0.77061 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772421 4 0.5687 0.53058 0.000 0.164 0.000 0.628 0.208
#> SRR772422 2 0.7131 -0.01448 0.016 0.372 0.000 0.248 0.364
#> SRR772423 4 0.4126 0.67825 0.004 0.056 0.000 0.784 0.156
#> SRR772424 4 0.2540 0.74845 0.000 0.024 0.000 0.888 0.088
#> SRR772425 2 0.6519 0.21913 0.004 0.500 0.000 0.196 0.300
#> SRR772426 4 0.0794 0.77433 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR772427 4 0.0162 0.77093 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772428 1 0.5236 0.63111 0.568 0.380 0.000 0.000 0.052
#> SRR772429 1 0.4944 0.71514 0.700 0.208 0.000 0.000 0.092
#> SRR772430 2 0.4065 0.48633 0.000 0.772 0.000 0.048 0.180
#> SRR772431 4 0.1571 0.75481 0.000 0.004 0.000 0.936 0.060
#> SRR772432 4 0.1430 0.75666 0.000 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR772433 1 0.4518 0.74164 0.732 0.216 0.004 0.000 0.048
#> SRR772434 1 0.1205 0.76037 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR772435 2 0.4883 0.47592 0.052 0.684 0.000 0.004 0.260
#> SRR772436 2 0.3238 0.46077 0.136 0.836 0.000 0.000 0.028
#> SRR772437 3 0.4552 0.71393 0.000 0.040 0.696 0.000 0.264
#> SRR772438 1 0.4519 0.74126 0.720 0.228 0.000 0.000 0.052
#> SRR772439 1 0.1662 0.75558 0.936 0.004 0.004 0.000 0.056
#> SRR772440 4 0.6102 0.42637 0.000 0.264 0.000 0.560 0.176
#> SRR772441 4 0.6297 0.42345 0.004 0.204 0.000 0.556 0.236
#> SRR772442 4 0.5703 0.51121 0.000 0.244 0.000 0.616 0.140
#> SRR772443 2 0.6822 0.22662 0.020 0.504 0.000 0.192 0.284
#> SRR772444 1 0.5245 0.70229 0.640 0.280 0.000 0.000 0.080
#> SRR772445 1 0.4820 0.73003 0.696 0.236 0.000 0.000 0.068
#> SRR772446 1 0.3460 0.76120 0.828 0.128 0.000 0.000 0.044
#> SRR772447 1 0.6063 0.49945 0.540 0.316 0.000 0.000 0.144
#> SRR772448 4 0.6754 0.26831 0.008 0.236 0.000 0.480 0.276
#> SRR772449 4 0.6969 0.13798 0.016 0.312 0.000 0.452 0.220
#> SRR772450 4 0.0290 0.77169 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772451 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0703 0.75964 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772453 1 0.3825 0.75263 0.804 0.060 0.000 0.000 0.136
#> SRR772454 2 0.5740 0.23458 0.308 0.580 0.000 0.000 0.112
#> SRR772455 2 0.3885 0.30918 0.176 0.784 0.000 0.000 0.040
#> SRR772456 4 0.0404 0.77061 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772457 4 0.0162 0.77081 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772458 1 0.3669 0.77237 0.816 0.128 0.000 0.000 0.056
#> SRR772459 1 0.1444 0.76267 0.948 0.012 0.000 0.000 0.040
#> SRR772460 4 0.0162 0.77023 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772461 4 0.0162 0.77023 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772462 4 0.2416 0.76231 0.000 0.012 0.000 0.888 0.100
#> SRR772463 4 0.1877 0.77313 0.000 0.012 0.000 0.924 0.064
#> SRR772464 3 0.1121 0.80573 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772465 2 0.3658 0.51639 0.012 0.832 0.000 0.044 0.112
#> SRR772466 2 0.6511 0.30218 0.016 0.524 0.000 0.144 0.316
#> SRR772467 4 0.0609 0.77103 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772468 4 0.0510 0.77062 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772469 1 0.1943 0.76726 0.924 0.020 0.000 0.000 0.056
#> SRR772470 1 0.4924 0.74787 0.740 0.136 0.000 0.012 0.112
#> SRR772471 1 0.6300 0.51734 0.552 0.284 0.000 0.008 0.156
#> SRR772472 1 0.4152 0.75036 0.772 0.168 0.000 0.000 0.060
#> SRR772473 4 0.5352 0.60760 0.008 0.096 0.000 0.676 0.220
#> SRR772474 4 0.6143 0.55568 0.020 0.156 0.000 0.620 0.204
#> SRR772475 5 0.6774 0.45656 0.000 0.228 0.028 0.200 0.544
#> SRR772476 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0162 0.77093 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772478 1 0.5251 0.70412 0.680 0.184 0.000 0.000 0.136
#> SRR772479 1 0.5088 0.66918 0.668 0.252 0.000 0.000 0.080
#> SRR772480 2 0.7538 0.34158 0.148 0.476 0.000 0.092 0.284
#> SRR772481 2 0.7928 0.17912 0.112 0.440 0.000 0.212 0.236
#> SRR772482 2 0.6327 0.44629 0.116 0.584 0.000 0.028 0.272
#> SRR772483 2 0.6182 0.37988 0.324 0.520 0.000 0.000 0.156
#> SRR772484 4 0.3950 0.70837 0.000 0.068 0.000 0.796 0.136
#> SRR772485 4 0.6803 0.14110 0.020 0.164 0.000 0.476 0.340
#> SRR772486 1 0.3701 0.75240 0.824 0.112 0.004 0.000 0.060
#> SRR772487 1 0.1943 0.76632 0.924 0.020 0.000 0.000 0.056
#> SRR772488 4 0.3464 0.73580 0.000 0.068 0.000 0.836 0.096
#> SRR772489 4 0.4334 0.71504 0.000 0.092 0.000 0.768 0.140
#> SRR772490 2 0.5100 -0.45213 0.448 0.516 0.000 0.000 0.036
#> SRR772491 1 0.5676 0.63571 0.632 0.240 0.000 0.004 0.124
#> SRR772492 4 0.0703 0.76925 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR772493 4 0.0703 0.76925 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR772494 4 0.0162 0.77093 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772495 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.6416 0.17997 0.000 0.480 0.000 0.188 0.332
#> SRR772497 2 0.6406 0.34946 0.040 0.524 0.000 0.076 0.360
#> SRR772498 2 0.4552 0.45342 0.000 0.696 0.000 0.040 0.264
#> SRR772499 2 0.6798 0.30353 0.032 0.500 0.000 0.136 0.332
#> SRR772500 4 0.4524 0.67780 0.004 0.052 0.000 0.736 0.208
#> SRR772501 4 0.2628 0.76528 0.000 0.028 0.000 0.884 0.088
#> SRR772502 2 0.4220 0.52437 0.052 0.804 0.000 0.028 0.116
#> SRR772503 2 0.2983 0.50996 0.056 0.868 0.000 0.000 0.076
#> SRR772504 4 0.0609 0.77328 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772505 4 0.1251 0.77405 0.000 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR772506 4 0.1670 0.76997 0.000 0.012 0.000 0.936 0.052
#> SRR772507 4 0.0794 0.77469 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR772508 4 0.0404 0.77258 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772509 5 0.7034 0.43955 0.008 0.252 0.108 0.068 0.564
#> SRR772510 3 0.1121 0.80067 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772511 2 0.5769 0.42690 0.044 0.584 0.000 0.032 0.340
#> SRR772512 5 0.7538 0.44663 0.000 0.068 0.180 0.304 0.448
#> SRR772513 4 0.6897 -0.07803 0.004 0.280 0.000 0.396 0.320
#> SRR772514 4 0.3427 0.73705 0.000 0.056 0.000 0.836 0.108
#> SRR772515 4 0.5305 0.57623 0.000 0.152 0.000 0.676 0.172
#> SRR772516 4 0.4372 0.68736 0.000 0.072 0.000 0.756 0.172
#> SRR772517 4 0.1914 0.77711 0.000 0.016 0.000 0.924 0.060
#> SRR772518 2 0.6734 -0.06235 0.000 0.388 0.000 0.356 0.256
#> SRR772519 4 0.2824 0.75254 0.000 0.032 0.000 0.872 0.096
#> SRR772520 4 0.4922 0.63108 0.000 0.128 0.000 0.716 0.156
#> SRR772521 2 0.4425 0.19402 0.244 0.716 0.000 0.000 0.040
#> SRR772522 2 0.5263 -0.11197 0.368 0.576 0.000 0.000 0.056
#> SRR772523 4 0.5787 0.54147 0.000 0.180 0.000 0.616 0.204
#> SRR772524 4 0.6155 0.35259 0.000 0.276 0.000 0.548 0.176
#> SRR772525 3 0.2806 0.75505 0.004 0.000 0.844 0.000 0.152
#> SRR772526 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.3710 0.78991 0.024 0.000 0.784 0.000 0.192
#> SRR772529 2 0.4720 0.49799 0.124 0.736 0.000 0.000 0.140
#> SRR772530 1 0.5353 0.61581 0.576 0.360 0.000 0.000 0.064
#> SRR772531 3 0.2719 0.75878 0.004 0.000 0.852 0.000 0.144
#> SRR772532 4 0.1357 0.77531 0.000 0.004 0.000 0.948 0.048
#> SRR772533 4 0.3090 0.74085 0.000 0.040 0.000 0.856 0.104
#> SRR772534 2 0.4700 0.49301 0.112 0.768 0.000 0.020 0.100
#> SRR772535 2 0.5572 0.29658 0.000 0.644 0.000 0.192 0.164
#> SRR772536 4 0.3994 0.70767 0.000 0.068 0.000 0.792 0.140
#> SRR772537 4 0.0162 0.77023 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772538 4 0.0404 0.76990 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772539 2 0.3075 0.46671 0.092 0.860 0.000 0.000 0.048
#> SRR772540 2 0.5651 0.50528 0.084 0.676 0.000 0.032 0.208
#> SRR772541 4 0.5925 0.52069 0.000 0.216 0.000 0.596 0.188
#> SRR772542 1 0.4950 0.67028 0.612 0.348 0.000 0.000 0.040
#> SRR772543 1 0.5187 0.68762 0.656 0.260 0.000 0.000 0.084
#> SRR772544 3 0.3551 0.77449 0.000 0.008 0.772 0.000 0.220
#> SRR772545 1 0.5638 0.59394 0.636 0.172 0.000 0.000 0.192
#> SRR772546 1 0.6917 0.08194 0.384 0.324 0.000 0.004 0.288
#> SRR772547 2 0.5757 0.24023 0.336 0.560 0.000 0.000 0.104
#> SRR772548 1 0.6158 0.26091 0.452 0.416 0.000 0.000 0.132
#> SRR772549 1 0.1943 0.76607 0.924 0.020 0.000 0.000 0.056
#> SRR772550 1 0.1628 0.75936 0.936 0.008 0.000 0.000 0.056
#> SRR772551 2 0.3548 0.50870 0.008 0.836 0.000 0.044 0.112
#> SRR772552 2 0.4971 0.44739 0.000 0.708 0.000 0.116 0.176
#> SRR772553 5 0.6634 0.38269 0.008 0.272 0.100 0.040 0.580
#> SRR772554 4 0.2625 0.75273 0.000 0.016 0.000 0.876 0.108
#> SRR772555 4 0.6286 0.30930 0.000 0.204 0.000 0.532 0.264
#> SRR772556 2 0.5566 -0.15915 0.332 0.580 0.000 0.000 0.088
#> SRR772557 1 0.5491 0.63018 0.600 0.312 0.000 0.000 0.088
#> SRR772558 2 0.4263 0.36009 0.180 0.760 0.000 0.000 0.060
#> SRR772559 1 0.3829 0.74463 0.776 0.196 0.000 0.000 0.028
#> SRR772560 2 0.2046 0.51880 0.016 0.916 0.000 0.000 0.068
#> SRR772561 3 0.6670 0.13203 0.000 0.084 0.480 0.048 0.388
#> SRR772562 4 0.6383 0.27643 0.000 0.228 0.000 0.516 0.256
#> SRR772563 4 0.6679 0.32261 0.016 0.204 0.000 0.528 0.252
#> SRR772564 1 0.1682 0.76248 0.940 0.012 0.004 0.000 0.044
#> SRR772565 1 0.2214 0.76637 0.916 0.028 0.004 0.000 0.052
#> SRR772566 1 0.4747 0.71619 0.776 0.072 0.044 0.000 0.108
#> SRR772567 1 0.1830 0.75124 0.924 0.000 0.008 0.000 0.068
#> SRR772568 4 0.5159 0.62261 0.000 0.144 0.000 0.692 0.164
#> SRR772569 4 0.3551 0.72285 0.000 0.044 0.000 0.820 0.136
#> SRR772570 1 0.6518 0.32901 0.484 0.240 0.000 0.000 0.276
#> SRR772571 1 0.6183 0.44617 0.544 0.276 0.000 0.000 0.180
#> SRR772572 1 0.3555 0.76888 0.824 0.124 0.000 0.000 0.052
#> SRR772573 1 0.3214 0.77418 0.844 0.120 0.000 0.000 0.036
#> SRR772574 1 0.4788 0.73425 0.740 0.136 0.000 0.004 0.120
#> SRR772575 2 0.3463 0.52906 0.020 0.836 0.000 0.016 0.128
#> SRR772576 4 0.5728 0.51763 0.000 0.176 0.000 0.624 0.200
#> SRR772577 4 0.5648 0.60514 0.020 0.092 0.000 0.660 0.228
#> SRR772578 4 0.6289 0.16172 0.000 0.356 0.000 0.484 0.160
#> SRR772579 4 0.1444 0.77360 0.000 0.012 0.000 0.948 0.040
#> SRR772580 3 0.1544 0.78897 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772581 2 0.4424 0.18579 0.224 0.728 0.000 0.000 0.048
#> SRR772582 2 0.4456 0.50819 0.008 0.768 0.000 0.072 0.152
#> SRR772583 2 0.6968 0.38334 0.212 0.492 0.000 0.024 0.272
#> SRR772584 2 0.6358 0.37770 0.020 0.572 0.000 0.136 0.272
#> SRR772585 4 0.5877 0.51697 0.000 0.196 0.000 0.604 0.200
#> SRR772586 3 0.3327 0.78874 0.028 0.000 0.828 0.000 0.144
#> SRR772587 1 0.4086 0.76339 0.812 0.052 0.024 0.000 0.112
#> SRR772588 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772589 4 0.0510 0.77062 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772590 3 0.3461 0.77473 0.000 0.004 0.772 0.000 0.224
#> SRR772591 1 0.3527 0.75051 0.852 0.048 0.024 0.000 0.076
#> SRR772592 1 0.3506 0.73156 0.836 0.024 0.016 0.000 0.124
#> SRR772593 3 0.4180 0.78252 0.036 0.000 0.744 0.000 0.220
#> SRR772594 4 0.2879 0.76065 0.000 0.032 0.000 0.868 0.100
#> SRR772595 4 0.2104 0.77553 0.000 0.024 0.000 0.916 0.060
#> SRR772596 3 0.3060 0.79911 0.024 0.000 0.848 0.000 0.128
#> SRR772597 3 0.0609 0.80023 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772598 2 0.5086 -0.12323 0.304 0.636 0.000 0.000 0.060
#> SRR772599 1 0.3555 0.76343 0.824 0.124 0.000 0.000 0.052
#> SRR772600 4 0.2654 0.75443 0.000 0.032 0.000 0.884 0.084
#> SRR772601 4 0.2189 0.74986 0.000 0.012 0.000 0.904 0.084
#> SRR772602 3 0.3519 0.77641 0.000 0.008 0.776 0.000 0.216
#> SRR772603 4 0.4953 0.65679 0.000 0.124 0.000 0.712 0.164
#> SRR772604 4 0.5117 0.65026 0.004 0.096 0.000 0.696 0.204
#> SRR772605 2 0.3972 0.51264 0.008 0.788 0.000 0.032 0.172
#> SRR772606 1 0.4527 0.72520 0.700 0.260 0.000 0.000 0.040
#> SRR772607 1 0.4477 0.72614 0.708 0.252 0.000 0.000 0.040
#> SRR772608 2 0.6842 -0.01659 0.004 0.404 0.000 0.344 0.248
#> SRR772609 2 0.7460 0.08340 0.040 0.396 0.000 0.232 0.332
#> SRR772610 4 0.1270 0.77440 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR772611 4 0.6145 0.36679 0.008 0.148 0.000 0.580 0.264
#> SRR772612 4 0.4238 0.61150 0.000 0.164 0.000 0.768 0.068
#> SRR772613 4 0.1571 0.75481 0.000 0.004 0.000 0.936 0.060
#> SRR772614 1 0.3442 0.76274 0.836 0.060 0.000 0.000 0.104
#> SRR772615 1 0.1331 0.75726 0.952 0.008 0.000 0.000 0.040
#> SRR772616 2 0.3326 0.34174 0.152 0.824 0.000 0.000 0.024
#> SRR772617 4 0.1502 0.75743 0.000 0.004 0.000 0.940 0.056
#> SRR772618 4 0.2171 0.74569 0.000 0.024 0.000 0.912 0.064
#> SRR772619 4 0.0609 0.76963 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772620 4 0.0609 0.76820 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772621 2 0.6882 0.00288 0.004 0.408 0.000 0.296 0.292
#> SRR772622 2 0.5703 0.40359 0.040 0.588 0.000 0.032 0.340
#> SRR772623 3 0.3612 0.74069 0.028 0.000 0.800 0.000 0.172
#> SRR772624 3 0.4496 0.76804 0.092 0.000 0.752 0.000 0.156
#> SRR772625 4 0.5598 0.17253 0.000 0.076 0.000 0.524 0.400
#> SRR772626 2 0.6846 0.39124 0.088 0.532 0.000 0.072 0.308
#> SRR772627 4 0.3800 0.73961 0.000 0.080 0.000 0.812 0.108
#> SRR772628 1 0.3176 0.76981 0.856 0.064 0.000 0.000 0.080
#> SRR772629 1 0.4716 0.68911 0.656 0.308 0.000 0.000 0.036
#> SRR772630 2 0.5813 0.03088 0.328 0.560 0.000 0.000 0.112
#> SRR772631 3 0.6403 0.63010 0.112 0.024 0.544 0.000 0.320
#> SRR772632 4 0.3488 0.70959 0.000 0.024 0.000 0.808 0.168
#> SRR772633 4 0.1341 0.77322 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR772634 2 0.5459 0.33113 0.236 0.644 0.000 0.000 0.120
#> SRR772635 2 0.7079 0.22290 0.032 0.472 0.000 0.184 0.312
#> SRR772636 4 0.4873 0.50224 0.000 0.044 0.000 0.644 0.312
#> SRR772637 1 0.2046 0.76345 0.916 0.016 0.000 0.000 0.068
#> SRR772638 1 0.1310 0.76539 0.956 0.020 0.000 0.000 0.024
#> SRR772639 4 0.6431 0.20427 0.000 0.216 0.000 0.500 0.284
#> SRR772640 4 0.0000 0.77057 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0609 0.77256 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772642 2 0.3564 0.51917 0.024 0.820 0.000 0.008 0.148
#> SRR772643 4 0.5699 0.48349 0.000 0.156 0.000 0.624 0.220
#> SRR772644 2 0.4640 0.15153 0.256 0.696 0.000 0.000 0.048
#> SRR772645 1 0.6668 0.40429 0.500 0.268 0.000 0.008 0.224
#> SRR772646 4 0.1732 0.76575 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR772647 4 0.5027 0.61791 0.000 0.112 0.000 0.700 0.188
#> SRR772648 2 0.6470 0.40534 0.072 0.556 0.000 0.056 0.316
#> SRR772649 2 0.6373 0.32469 0.024 0.536 0.000 0.104 0.336
#> SRR772650 2 0.5849 0.49256 0.064 0.652 0.000 0.048 0.236
#> SRR772651 2 0.3695 0.36215 0.164 0.800 0.000 0.000 0.036
#> SRR772652 1 0.5733 0.62713 0.572 0.348 0.000 0.012 0.068
#> SRR772653 1 0.5118 0.59971 0.548 0.412 0.000 0.000 0.040
#> SRR772654 2 0.4347 0.50233 0.076 0.780 0.000 0.008 0.136
#> SRR772655 2 0.3482 0.49195 0.008 0.812 0.000 0.012 0.168
#> SRR772656 3 0.5960 0.46728 0.000 0.112 0.556 0.004 0.328
#> SRR772657 3 0.4354 0.73357 0.000 0.032 0.712 0.000 0.256
#> SRR772658 4 0.0510 0.76931 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772659 4 0.1430 0.75845 0.000 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR772660 2 0.6068 0.38834 0.028 0.556 0.000 0.068 0.348
#> SRR772661 3 0.6230 0.64852 0.084 0.028 0.552 0.000 0.336
#> SRR772662 2 0.6558 0.41551 0.096 0.548 0.000 0.044 0.312
#> SRR772663 2 0.6211 0.42746 0.040 0.592 0.000 0.080 0.288
#> SRR772664 2 0.6674 0.09047 0.000 0.428 0.000 0.248 0.324
#> SRR772665 2 0.6510 0.28389 0.012 0.548 0.000 0.204 0.236
#> SRR772666 3 0.2127 0.80589 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772667 4 0.1894 0.75211 0.000 0.008 0.000 0.920 0.072
#> SRR772668 4 0.1638 0.75519 0.000 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR772669 4 0.1638 0.75519 0.000 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR772670 2 0.3898 0.50764 0.116 0.804 0.000 0.000 0.080
#> SRR772671 2 0.2249 0.52162 0.008 0.896 0.000 0.000 0.096
#> SRR772672 4 0.6856 -0.04589 0.004 0.288 0.000 0.420 0.288
#> SRR772673 4 0.6779 0.00527 0.000 0.324 0.000 0.388 0.288
#> SRR772674 3 0.3196 0.78644 0.000 0.004 0.804 0.000 0.192
#> SRR772675 5 0.7039 0.33818 0.012 0.180 0.268 0.020 0.520
#> SRR772676 1 0.5586 0.45128 0.480 0.464 0.000 0.012 0.044
#> SRR772677 1 0.5838 0.62167 0.620 0.248 0.000 0.008 0.124
#> SRR772678 5 0.7528 -0.08146 0.076 0.144 0.300 0.004 0.476
#> SRR772679 2 0.6510 0.16451 0.000 0.488 0.000 0.252 0.260
#> SRR772680 2 0.2820 0.50979 0.056 0.884 0.000 0.004 0.056
#> SRR772681 3 0.4103 0.76478 0.012 0.012 0.748 0.000 0.228
#> SRR772682 4 0.3912 0.71069 0.000 0.088 0.000 0.804 0.108
#> SRR772683 4 0.5904 0.42543 0.000 0.232 0.000 0.596 0.172
#> SRR772685 4 0.3616 0.72472 0.000 0.032 0.000 0.804 0.164
#> SRR772686 3 0.1043 0.80249 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772687 3 0.3929 0.74217 0.028 0.000 0.764 0.000 0.208
#> SRR772688 4 0.0510 0.76931 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772689 4 0.0609 0.77045 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772690 3 0.1792 0.80738 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772691 5 0.6443 0.34104 0.000 0.096 0.028 0.368 0.508
#> SRR772692 2 0.4114 0.52019 0.060 0.776 0.000 0.000 0.164
#> SRR772693 5 0.6802 0.07944 0.000 0.328 0.000 0.300 0.372
#> SRR772694 4 0.4247 0.68786 0.000 0.092 0.000 0.776 0.132
#> SRR772695 2 0.5082 0.44131 0.000 0.664 0.000 0.076 0.260
#> SRR772696 2 0.6546 0.26982 0.012 0.488 0.000 0.148 0.352
#> SRR772697 2 0.6562 0.13543 0.000 0.464 0.000 0.228 0.308
#> SRR772698 3 0.4295 0.77819 0.028 0.004 0.732 0.000 0.236
#> SRR772699 2 0.4973 0.00911 0.320 0.632 0.000 0.000 0.048
#> SRR772700 2 0.2989 0.51704 0.060 0.868 0.000 0.000 0.072
#> SRR772701 2 0.5286 -0.46798 0.448 0.504 0.000 0.000 0.048
#> SRR772702 1 0.4983 0.72497 0.664 0.272 0.000 0.000 0.064
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 6 0.4389 0.4944 0.084 0.076 0.000 0.000 0.068 0.772
#> SRR772342 1 0.5198 0.5514 0.608 0.020 0.000 0.000 0.072 0.300
#> SRR772343 6 0.6711 0.4850 0.116 0.332 0.000 0.004 0.084 0.464
#> SRR772344 4 0.1007 0.7491 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR772345 4 0.2562 0.7154 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR772346 2 0.5964 -0.0864 0.008 0.456 0.000 0.016 0.108 0.412
#> SRR772347 2 0.6723 -0.3155 0.084 0.408 0.000 0.000 0.128 0.380
#> SRR772348 2 0.5086 0.3123 0.004 0.576 0.000 0.360 0.044 0.016
#> SRR772349 4 0.3791 0.6677 0.000 0.236 0.000 0.732 0.032 0.000
#> SRR772350 5 0.4400 0.8377 0.012 0.000 0.456 0.000 0.524 0.008
#> SRR772351 4 0.3892 0.7125 0.000 0.144 0.000 0.784 0.056 0.016
#> SRR772352 2 0.4840 0.5953 0.004 0.732 0.000 0.144 0.060 0.060
#> SRR772353 6 0.6195 0.4454 0.048 0.432 0.004 0.016 0.052 0.448
#> SRR772354 2 0.4332 0.5548 0.004 0.756 0.004 0.128 0.004 0.104
#> SRR772355 2 0.4535 -0.1878 0.000 0.488 0.000 0.480 0.032 0.000
#> SRR772356 4 0.3161 0.6812 0.000 0.216 0.000 0.776 0.008 0.000
#> SRR772357 6 0.5183 0.4525 0.004 0.396 0.000 0.020 0.040 0.540
#> SRR772358 6 0.7382 0.3862 0.168 0.252 0.008 0.008 0.108 0.456
#> SRR772359 2 0.7517 -0.3354 0.140 0.444 0.032 0.008 0.080 0.296
#> SRR772360 2 0.5235 0.5492 0.004 0.668 0.004 0.192 0.012 0.120
#> SRR772361 3 0.0520 0.3921 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772362 4 0.0363 0.7467 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0260 0.7467 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772364 2 0.6961 0.1381 0.004 0.460 0.000 0.108 0.132 0.296
#> SRR772365 6 0.7433 0.3512 0.164 0.344 0.000 0.004 0.144 0.344
#> SRR772366 5 0.5092 0.5917 0.040 0.004 0.460 0.000 0.484 0.012
#> SRR772367 3 0.3741 -0.3483 0.008 0.000 0.672 0.000 0.320 0.000
#> SRR772368 4 0.4141 0.7021 0.000 0.156 0.000 0.756 0.080 0.008
#> SRR772369 2 0.3955 0.5355 0.072 0.824 0.004 0.044 0.028 0.028
#> SRR772370 6 0.4901 0.3865 0.016 0.428 0.000 0.004 0.024 0.528
#> SRR772371 1 0.6655 0.1159 0.420 0.104 0.000 0.000 0.096 0.380
#> SRR772372 6 0.6507 0.4385 0.192 0.188 0.000 0.000 0.080 0.540
#> SRR772373 2 0.5725 -0.0596 0.036 0.480 0.000 0.428 0.044 0.012
#> SRR772374 4 0.3823 0.3622 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.3887 -0.4480 0.008 0.000 0.632 0.000 0.360 0.000
#> SRR772376 4 0.4353 0.2316 0.000 0.472 0.004 0.512 0.008 0.004
#> SRR772377 3 0.5516 0.3106 0.012 0.176 0.668 0.000 0.108 0.036
#> SRR772378 6 0.5432 0.5130 0.016 0.340 0.000 0.000 0.088 0.556
#> SRR772379 2 0.6836 0.4869 0.016 0.536 0.000 0.208 0.084 0.156
#> SRR772380 6 0.5144 0.5830 0.028 0.288 0.000 0.000 0.060 0.624
#> SRR772381 3 0.0881 0.3953 0.000 0.008 0.972 0.000 0.008 0.012
#> SRR772382 6 0.5960 -0.2744 0.436 0.060 0.000 0.000 0.064 0.440
#> SRR772383 1 0.6050 0.5550 0.572 0.060 0.004 0.000 0.092 0.272
#> SRR772384 3 0.6565 0.2835 0.048 0.172 0.604 0.000 0.108 0.068
#> SRR772385 2 0.6824 0.3444 0.000 0.516 0.276 0.116 0.064 0.028
#> SRR772386 2 0.4507 0.5663 0.012 0.776 0.000 0.084 0.052 0.076
#> SRR772387 2 0.3806 0.5114 0.000 0.736 0.004 0.240 0.008 0.012
#> SRR772388 1 0.4944 0.6143 0.644 0.000 0.000 0.000 0.132 0.224
#> SRR772389 1 0.2404 0.6407 0.884 0.000 0.000 0.000 0.080 0.036
#> SRR772390 3 0.4293 0.2475 0.028 0.008 0.728 0.000 0.220 0.016
#> SRR772391 6 0.5531 -0.1263 0.376 0.032 0.000 0.000 0.064 0.528
#> SRR772392 1 0.7427 -0.1823 0.324 0.264 0.012 0.000 0.076 0.324
#> SRR772393 2 0.5923 0.5195 0.004 0.636 0.000 0.104 0.092 0.164
#> SRR772394 2 0.5936 0.5391 0.008 0.644 0.000 0.152 0.100 0.096
#> SRR772395 4 0.4310 0.4153 0.000 0.396 0.000 0.580 0.024 0.000
#> SRR772396 6 0.6476 0.0622 0.368 0.116 0.000 0.000 0.068 0.448
#> SRR772397 1 0.3745 0.6556 0.816 0.052 0.000 0.000 0.044 0.088
#> SRR772398 1 0.5827 0.4321 0.532 0.028 0.008 0.000 0.080 0.352
#> SRR772399 6 0.5642 -0.3055 0.404 0.012 0.004 0.000 0.092 0.488
#> SRR772400 1 0.2933 0.6546 0.860 0.008 0.000 0.000 0.056 0.076
#> SRR772401 1 0.4191 0.6120 0.732 0.000 0.000 0.000 0.088 0.180
#> SRR772402 4 0.4648 0.6603 0.000 0.132 0.000 0.740 0.088 0.040
#> SRR772403 4 0.1913 0.7238 0.000 0.016 0.000 0.924 0.044 0.016
#> SRR772404 2 0.5205 0.3867 0.008 0.628 0.000 0.288 0.052 0.024
#> SRR772405 3 0.6044 0.3166 0.052 0.096 0.668 0.000 0.112 0.072
#> SRR772406 2 0.6085 0.1182 0.000 0.452 0.000 0.396 0.032 0.120
#> SRR772407 2 0.4533 -0.1616 0.000 0.504 0.000 0.468 0.024 0.004
#> SRR772408 4 0.0363 0.7467 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.0000 0.7466 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772410 2 0.7376 -0.1006 0.128 0.488 0.004 0.100 0.032 0.248
#> SRR772411 2 0.6913 -0.4487 0.200 0.428 0.000 0.004 0.060 0.308
#> SRR772412 1 0.6451 0.4486 0.556 0.172 0.004 0.000 0.068 0.200
#> SRR772413 1 0.4799 0.5895 0.676 0.024 0.000 0.000 0.056 0.244
#> SRR772414 3 0.3634 -0.2877 0.008 0.000 0.696 0.000 0.296 0.000
#> SRR772415 2 0.4045 0.3597 0.000 0.648 0.000 0.336 0.008 0.008
#> SRR772416 2 0.5571 0.0251 0.024 0.580 0.000 0.016 0.056 0.324
#> SRR772417 2 0.5901 -0.4058 0.048 0.468 0.000 0.008 0.052 0.424
#> SRR772418 3 0.4878 0.1184 0.044 0.008 0.656 0.000 0.276 0.016
#> SRR772419 4 0.3076 0.6783 0.000 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000
#> SRR772420 4 0.1588 0.7474 0.000 0.072 0.000 0.924 0.004 0.000
#> SRR772421 4 0.4338 0.1800 0.000 0.488 0.000 0.492 0.020 0.000
#> SRR772422 2 0.4386 0.5936 0.008 0.756 0.000 0.164 0.036 0.036
#> SRR772423 4 0.5113 0.5763 0.000 0.160 0.000 0.696 0.096 0.048
#> SRR772424 4 0.3591 0.6954 0.000 0.104 0.000 0.816 0.064 0.016
#> SRR772425 2 0.4256 0.5870 0.004 0.772 0.000 0.140 0.036 0.048
#> SRR772426 4 0.2416 0.7222 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000 0.000
#> SRR772427 4 0.0458 0.7468 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772428 6 0.5953 -0.0715 0.320 0.044 0.000 0.000 0.100 0.536
#> SRR772429 1 0.6729 0.2226 0.424 0.120 0.000 0.000 0.092 0.364
#> SRR772430 2 0.5606 0.1889 0.004 0.568 0.000 0.028 0.076 0.324
#> SRR772431 4 0.2316 0.7153 0.000 0.040 0.000 0.904 0.040 0.016
#> SRR772432 4 0.1944 0.7237 0.000 0.024 0.000 0.924 0.036 0.016
#> SRR772433 1 0.4943 0.5523 0.644 0.020 0.000 0.000 0.060 0.276
#> SRR772434 1 0.3128 0.6549 0.848 0.012 0.000 0.000 0.052 0.088
#> SRR772435 2 0.5540 0.1022 0.036 0.588 0.000 0.004 0.064 0.308
#> SRR772436 6 0.5147 0.5761 0.044 0.204 0.000 0.000 0.076 0.676
#> SRR772437 3 0.1049 0.3980 0.000 0.032 0.960 0.000 0.000 0.008
#> SRR772438 1 0.6095 0.4839 0.520 0.056 0.000 0.000 0.096 0.328
#> SRR772439 1 0.2672 0.6525 0.868 0.000 0.000 0.000 0.080 0.052
#> SRR772440 2 0.5958 0.0407 0.004 0.476 0.000 0.392 0.024 0.104
#> SRR772441 2 0.4636 -0.0463 0.000 0.532 0.000 0.432 0.032 0.004
#> SRR772442 4 0.6104 0.3634 0.000 0.316 0.000 0.524 0.112 0.048
#> SRR772443 2 0.6273 0.4678 0.008 0.612 0.000 0.120 0.132 0.128
#> SRR772444 1 0.6403 0.3317 0.444 0.076 0.000 0.004 0.080 0.396
#> SRR772445 1 0.6575 0.2989 0.440 0.096 0.004 0.000 0.080 0.380
#> SRR772446 1 0.5561 0.4858 0.584 0.044 0.000 0.000 0.068 0.304
#> SRR772447 6 0.6920 0.0285 0.352 0.200 0.000 0.000 0.068 0.380
#> SRR772448 2 0.5683 0.2727 0.008 0.576 0.000 0.296 0.104 0.016
#> SRR772449 2 0.5613 0.3392 0.008 0.592 0.000 0.300 0.064 0.036
#> SRR772450 4 0.0363 0.7467 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0260 0.7469 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.1901 0.6536 0.924 0.008 0.000 0.000 0.028 0.040
#> SRR772453 1 0.4945 0.6154 0.720 0.128 0.000 0.000 0.056 0.096
#> SRR772454 6 0.6386 0.5010 0.116 0.288 0.000 0.000 0.076 0.520
#> SRR772455 6 0.5207 0.5849 0.064 0.228 0.000 0.000 0.048 0.660
#> SRR772456 4 0.0405 0.7459 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR772457 4 0.0405 0.7467 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR772458 1 0.5185 0.5819 0.624 0.020 0.004 0.000 0.064 0.288
#> SRR772459 1 0.2614 0.6612 0.884 0.012 0.000 0.000 0.044 0.060
#> SRR772460 4 0.0436 0.7457 0.000 0.004 0.000 0.988 0.004 0.004
#> SRR772461 4 0.0291 0.7454 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR772462 4 0.3104 0.7112 0.000 0.204 0.000 0.788 0.004 0.004
#> SRR772463 4 0.3383 0.6378 0.000 0.268 0.000 0.728 0.004 0.000
#> SRR772464 3 0.3265 -0.1156 0.004 0.000 0.748 0.000 0.248 0.000
#> SRR772465 6 0.5656 0.2449 0.004 0.444 0.000 0.040 0.048 0.464
#> SRR772466 2 0.4471 0.5829 0.028 0.772 0.004 0.132 0.016 0.048
#> SRR772467 4 0.0891 0.7452 0.000 0.024 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR772468 4 0.0603 0.7464 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004 0.000
#> SRR772469 1 0.4220 0.6517 0.780 0.044 0.000 0.000 0.072 0.104
#> SRR772470 1 0.6928 0.4233 0.484 0.156 0.004 0.004 0.080 0.272
#> SRR772471 6 0.7112 -0.1520 0.356 0.196 0.000 0.000 0.092 0.356
#> SRR772472 1 0.5909 0.3635 0.512 0.040 0.000 0.000 0.092 0.356
#> SRR772473 4 0.5738 0.3798 0.004 0.348 0.000 0.528 0.104 0.016
#> SRR772474 4 0.6191 0.2333 0.020 0.400 0.000 0.456 0.108 0.016
#> SRR772475 2 0.7028 0.3522 0.000 0.484 0.280 0.148 0.060 0.028
#> SRR772476 4 0.0146 0.7462 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772477 4 0.0260 0.7467 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.6937 0.3878 0.464 0.116 0.008 0.000 0.104 0.308
#> SRR772479 1 0.6492 0.2797 0.452 0.072 0.004 0.000 0.096 0.376
#> SRR772480 2 0.7380 0.2214 0.136 0.500 0.000 0.032 0.148 0.184
#> SRR772481 2 0.7416 0.2961 0.088 0.520 0.000 0.084 0.116 0.192
#> SRR772482 2 0.6268 -0.1489 0.076 0.560 0.012 0.004 0.060 0.288
#> SRR772483 6 0.7175 0.3762 0.220 0.324 0.000 0.000 0.092 0.364
#> SRR772484 4 0.3804 0.3758 0.000 0.424 0.000 0.576 0.000 0.000
#> SRR772485 2 0.4772 0.3772 0.032 0.644 0.000 0.300 0.020 0.004
#> SRR772486 1 0.4012 0.6109 0.748 0.000 0.000 0.000 0.076 0.176
#> SRR772487 1 0.3133 0.6627 0.852 0.016 0.000 0.000 0.064 0.068
#> SRR772488 4 0.3819 0.5793 0.000 0.316 0.000 0.672 0.012 0.000
#> SRR772489 4 0.4446 0.4837 0.000 0.384 0.000 0.588 0.020 0.008
#> SRR772490 6 0.4892 0.3763 0.188 0.052 0.000 0.000 0.056 0.704
#> SRR772491 1 0.6668 0.1619 0.416 0.152 0.004 0.000 0.052 0.376
#> SRR772492 4 0.1262 0.7406 0.000 0.020 0.000 0.956 0.016 0.008
#> SRR772493 4 0.1262 0.7406 0.000 0.020 0.000 0.956 0.016 0.008
#> SRR772494 4 0.0260 0.7467 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0146 0.7467 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.3484 0.5752 0.008 0.844 0.004 0.080 0.040 0.024
#> SRR772497 2 0.3468 0.5213 0.048 0.856 0.004 0.028 0.032 0.032
#> SRR772498 2 0.4597 0.4505 0.000 0.724 0.004 0.036 0.040 0.196
#> SRR772499 2 0.4920 0.5493 0.020 0.756 0.004 0.096 0.064 0.060
#> SRR772500 4 0.4866 0.5082 0.008 0.364 0.000 0.588 0.028 0.012
#> SRR772501 4 0.3445 0.6563 0.000 0.260 0.000 0.732 0.000 0.008
#> SRR772502 6 0.5653 0.3939 0.012 0.432 0.004 0.020 0.048 0.484
#> SRR772503 6 0.4394 0.5845 0.008 0.276 0.000 0.000 0.040 0.676
#> SRR772504 4 0.1391 0.7495 0.000 0.040 0.000 0.944 0.016 0.000
#> SRR772505 4 0.2362 0.7362 0.000 0.136 0.000 0.860 0.004 0.000
#> SRR772506 4 0.2854 0.6851 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR772507 4 0.2416 0.7202 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000 0.000
#> SRR772508 4 0.1370 0.7493 0.000 0.036 0.000 0.948 0.012 0.004
#> SRR772509 2 0.6424 0.1223 0.000 0.484 0.368 0.032 0.080 0.036
#> SRR772510 3 0.3615 -0.2739 0.008 0.000 0.700 0.000 0.292 0.000
#> SRR772511 2 0.4464 0.4329 0.028 0.768 0.000 0.012 0.072 0.120
#> SRR772512 3 0.6040 -0.1521 0.000 0.356 0.452 0.184 0.004 0.004
#> SRR772513 2 0.4375 0.5071 0.004 0.724 0.004 0.220 0.036 0.012
#> SRR772514 4 0.3531 0.5673 0.000 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR772515 4 0.4091 0.2325 0.000 0.472 0.000 0.520 0.008 0.000
#> SRR772516 4 0.3717 0.4968 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR772517 4 0.3309 0.7158 0.000 0.192 0.000 0.788 0.016 0.004
#> SRR772518 2 0.4268 0.4965 0.000 0.700 0.000 0.256 0.016 0.028
#> SRR772519 4 0.3954 0.6064 0.000 0.292 0.000 0.688 0.012 0.008
#> SRR772520 4 0.4486 0.2610 0.000 0.452 0.000 0.524 0.012 0.012
#> SRR772521 6 0.5256 0.5611 0.080 0.180 0.000 0.000 0.060 0.680
#> SRR772522 6 0.6524 0.4478 0.200 0.140 0.004 0.000 0.096 0.560
#> SRR772523 4 0.4978 0.2450 0.000 0.448 0.000 0.496 0.048 0.008
#> SRR772524 2 0.5630 0.3550 0.000 0.568 0.000 0.320 0.056 0.056
#> SRR772525 5 0.4408 0.8304 0.012 0.000 0.468 0.000 0.512 0.008
#> SRR772526 4 0.0000 0.7466 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 4 0.0000 0.7466 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.5079 0.0442 0.044 0.012 0.628 0.000 0.300 0.016
#> SRR772529 6 0.5862 0.4885 0.052 0.336 0.000 0.000 0.076 0.536
#> SRR772530 1 0.6659 0.1522 0.456 0.108 0.004 0.004 0.068 0.360
#> SRR772531 5 0.4323 0.8212 0.008 0.000 0.476 0.000 0.508 0.008
#> SRR772532 4 0.2562 0.7122 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR772533 4 0.3547 0.5953 0.000 0.300 0.000 0.696 0.004 0.000
#> SRR772534 6 0.5338 0.5861 0.036 0.296 0.000 0.004 0.052 0.612
#> SRR772535 2 0.6074 0.4338 0.000 0.572 0.000 0.128 0.056 0.244
#> SRR772536 4 0.4079 0.4599 0.000 0.380 0.000 0.608 0.008 0.004
#> SRR772537 4 0.0405 0.7444 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR772538 4 0.0520 0.7455 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR772539 6 0.4201 0.5861 0.012 0.236 0.000 0.000 0.036 0.716
#> SRR772540 6 0.6357 0.4208 0.032 0.412 0.000 0.016 0.104 0.436
#> SRR772541 4 0.5864 0.3022 0.000 0.376 0.000 0.496 0.096 0.032
#> SRR772542 6 0.5797 -0.2185 0.376 0.044 0.000 0.000 0.072 0.508
#> SRR772543 1 0.6420 0.2100 0.432 0.076 0.000 0.000 0.096 0.396
#> SRR772544 3 0.0547 0.3809 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR772545 1 0.6944 0.3419 0.520 0.200 0.024 0.000 0.064 0.192
#> SRR772546 2 0.7877 -0.4533 0.292 0.308 0.032 0.000 0.096 0.272
#> SRR772547 6 0.6790 0.4111 0.232 0.196 0.000 0.000 0.084 0.488
#> SRR772548 6 0.6884 0.2216 0.284 0.188 0.000 0.000 0.080 0.448
#> SRR772549 1 0.3897 0.6471 0.796 0.020 0.000 0.000 0.084 0.100
#> SRR772550 1 0.2884 0.6592 0.864 0.008 0.000 0.000 0.064 0.064
#> SRR772551 2 0.5696 -0.0222 0.000 0.472 0.000 0.036 0.068 0.424
#> SRR772552 2 0.6142 0.2179 0.000 0.512 0.000 0.100 0.056 0.332
#> SRR772553 2 0.6320 0.1213 0.000 0.480 0.384 0.032 0.068 0.036
#> SRR772554 4 0.3595 0.6112 0.000 0.288 0.000 0.704 0.008 0.000
#> SRR772555 2 0.4231 0.2544 0.000 0.616 0.000 0.364 0.012 0.008
#> SRR772556 6 0.5634 0.4969 0.124 0.128 0.004 0.000 0.076 0.668
#> SRR772557 6 0.6574 0.1143 0.308 0.076 0.008 0.000 0.104 0.504
#> SRR772558 6 0.5114 0.5768 0.064 0.188 0.000 0.000 0.060 0.688
#> SRR772559 1 0.4136 0.5637 0.692 0.004 0.000 0.000 0.032 0.272
#> SRR772560 6 0.5395 0.3721 0.004 0.400 0.000 0.000 0.100 0.496
#> SRR772561 3 0.4353 0.2288 0.000 0.240 0.712 0.024 0.012 0.012
#> SRR772562 2 0.4121 0.2096 0.000 0.604 0.000 0.380 0.016 0.000
#> SRR772563 2 0.5210 0.2542 0.016 0.576 0.000 0.356 0.040 0.012
#> SRR772564 1 0.3976 0.6501 0.784 0.004 0.008 0.000 0.080 0.124
#> SRR772565 1 0.3469 0.6524 0.808 0.000 0.000 0.000 0.088 0.104
#> SRR772566 1 0.4085 0.6166 0.752 0.000 0.000 0.000 0.128 0.120
#> SRR772567 1 0.1845 0.6490 0.920 0.000 0.000 0.000 0.052 0.028
#> SRR772568 4 0.4942 0.1914 0.000 0.464 0.000 0.488 0.024 0.024
#> SRR772569 4 0.3714 0.5345 0.000 0.340 0.000 0.656 0.004 0.000
#> SRR772570 1 0.7467 0.1696 0.448 0.188 0.052 0.000 0.056 0.256
#> SRR772571 1 0.7082 0.2117 0.452 0.232 0.004 0.000 0.088 0.224
#> SRR772572 1 0.4813 0.6101 0.648 0.000 0.000 0.000 0.104 0.248
#> SRR772573 1 0.5058 0.5897 0.628 0.008 0.004 0.000 0.076 0.284
#> SRR772574 1 0.6211 0.4664 0.560 0.120 0.004 0.000 0.056 0.260
#> SRR772575 2 0.5134 -0.2773 0.004 0.504 0.000 0.012 0.044 0.436
#> SRR772576 4 0.4596 0.2184 0.000 0.460 0.000 0.508 0.028 0.004
#> SRR772577 4 0.5635 0.4223 0.020 0.348 0.000 0.548 0.076 0.008
#> SRR772578 2 0.6210 0.3860 0.000 0.496 0.000 0.304 0.028 0.172
#> SRR772579 4 0.2445 0.7442 0.000 0.108 0.000 0.872 0.020 0.000
#> SRR772580 3 0.3911 -0.4757 0.008 0.000 0.624 0.000 0.368 0.000
#> SRR772581 6 0.5251 0.5504 0.096 0.156 0.000 0.000 0.060 0.688
#> SRR772582 2 0.6157 -0.0226 0.008 0.512 0.000 0.036 0.104 0.340
#> SRR772583 2 0.6478 0.2740 0.172 0.592 0.004 0.008 0.092 0.132
#> SRR772584 2 0.5365 0.4986 0.008 0.692 0.000 0.080 0.064 0.156
#> SRR772585 4 0.6204 0.1288 0.000 0.404 0.000 0.432 0.128 0.036
#> SRR772586 3 0.5217 -0.2652 0.044 0.008 0.560 0.000 0.372 0.016
#> SRR772587 1 0.5407 0.6466 0.712 0.056 0.028 0.000 0.096 0.108
#> SRR772588 4 0.0937 0.7493 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR772589 4 0.1082 0.7503 0.000 0.040 0.000 0.956 0.004 0.000
#> SRR772590 3 0.0520 0.3923 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772591 1 0.3473 0.6298 0.808 0.000 0.000 0.000 0.096 0.096
#> SRR772592 1 0.3334 0.6366 0.820 0.004 0.000 0.000 0.124 0.052
#> SRR772593 3 0.4714 0.1867 0.040 0.008 0.680 0.000 0.256 0.016
#> SRR772594 4 0.4350 0.5975 0.000 0.292 0.000 0.660 0.048 0.000
#> SRR772595 4 0.3247 0.7204 0.000 0.156 0.000 0.808 0.036 0.000
#> SRR772596 3 0.4846 -0.0419 0.032 0.008 0.632 0.000 0.312 0.016
#> SRR772597 3 0.3758 -0.3576 0.008 0.000 0.668 0.000 0.324 0.000
#> SRR772598 6 0.4428 0.4610 0.084 0.060 0.000 0.000 0.088 0.768
#> SRR772599 1 0.5169 0.5836 0.656 0.024 0.000 0.000 0.096 0.224
#> SRR772600 4 0.3618 0.7069 0.000 0.084 0.000 0.816 0.084 0.016
#> SRR772601 4 0.2934 0.7081 0.000 0.044 0.000 0.864 0.076 0.016
#> SRR772602 3 0.0632 0.3785 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR772603 4 0.5795 0.4780 0.000 0.312 0.000 0.548 0.112 0.028
#> SRR772604 4 0.6073 0.3901 0.008 0.328 0.000 0.524 0.112 0.028
#> SRR772605 2 0.5442 -0.0362 0.000 0.548 0.000 0.008 0.108 0.336
#> SRR772606 1 0.5475 0.4656 0.564 0.044 0.000 0.000 0.052 0.340
#> SRR772607 1 0.4908 0.5065 0.596 0.004 0.000 0.000 0.068 0.332
#> SRR772608 2 0.4284 0.4553 0.004 0.664 0.004 0.304 0.000 0.024
#> SRR772609 2 0.5605 0.5651 0.036 0.688 0.000 0.144 0.092 0.040
#> SRR772610 4 0.2300 0.7304 0.000 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR772611 2 0.4234 0.2533 0.004 0.596 0.004 0.388 0.000 0.008
#> SRR772612 4 0.4823 0.5530 0.000 0.060 0.000 0.732 0.084 0.124
#> SRR772613 4 0.2380 0.7186 0.000 0.036 0.000 0.900 0.048 0.016
#> SRR772614 1 0.3844 0.6419 0.808 0.048 0.000 0.000 0.048 0.096
#> SRR772615 1 0.1498 0.6503 0.940 0.000 0.000 0.000 0.028 0.032
#> SRR772616 6 0.4383 0.5621 0.056 0.156 0.000 0.000 0.036 0.752
#> SRR772617 4 0.1932 0.7256 0.000 0.020 0.000 0.924 0.040 0.016
#> SRR772618 4 0.2923 0.6984 0.000 0.052 0.000 0.868 0.060 0.020
#> SRR772619 4 0.1173 0.7398 0.000 0.016 0.000 0.960 0.016 0.008
#> SRR772620 4 0.0767 0.7416 0.000 0.004 0.000 0.976 0.012 0.008
#> SRR772621 2 0.3897 0.5798 0.000 0.764 0.000 0.188 0.020 0.028
#> SRR772622 2 0.3488 0.4981 0.028 0.844 0.000 0.012 0.048 0.068
#> SRR772623 5 0.4982 0.8002 0.044 0.000 0.416 0.000 0.528 0.012
#> SRR772624 3 0.5844 -0.0212 0.144 0.008 0.580 0.000 0.252 0.016
#> SRR772625 2 0.6495 0.0596 0.000 0.412 0.168 0.388 0.020 0.012
#> SRR772626 2 0.5249 0.4882 0.056 0.732 0.000 0.040 0.088 0.084
#> SRR772627 4 0.4255 0.6765 0.000 0.228 0.000 0.712 0.056 0.004
#> SRR772628 1 0.5357 0.6185 0.676 0.064 0.000 0.000 0.092 0.168
#> SRR772629 6 0.5225 -0.3046 0.420 0.004 0.000 0.000 0.080 0.496
#> SRR772630 6 0.6303 0.4815 0.128 0.224 0.000 0.000 0.084 0.564
#> SRR772631 3 0.5728 0.2802 0.096 0.024 0.668 0.000 0.164 0.048
#> SRR772632 4 0.3782 0.5085 0.000 0.360 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR772633 4 0.2969 0.6802 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR772634 6 0.6602 0.4977 0.144 0.224 0.004 0.000 0.088 0.540
#> SRR772635 2 0.4814 0.5478 0.020 0.756 0.000 0.096 0.048 0.080
#> SRR772636 4 0.5716 0.3009 0.000 0.352 0.120 0.516 0.008 0.004
#> SRR772637 1 0.3575 0.6569 0.816 0.012 0.000 0.000 0.080 0.092
#> SRR772638 1 0.2814 0.6551 0.864 0.004 0.000 0.000 0.052 0.080
#> SRR772639 2 0.4480 0.3932 0.004 0.656 0.004 0.308 0.012 0.016
#> SRR772640 4 0.0146 0.7467 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0858 0.7485 0.000 0.028 0.000 0.968 0.004 0.000
#> SRR772642 2 0.5531 -0.1072 0.032 0.528 0.000 0.000 0.064 0.376
#> SRR772643 2 0.4111 -0.0295 0.000 0.536 0.000 0.456 0.004 0.004
#> SRR772644 6 0.6021 0.5449 0.108 0.200 0.004 0.004 0.064 0.620
#> SRR772645 1 0.7352 0.0494 0.380 0.272 0.000 0.008 0.084 0.256
#> SRR772646 4 0.3101 0.6512 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000
#> SRR772647 4 0.4863 0.2044 0.000 0.460 0.000 0.496 0.016 0.028
#> SRR772648 2 0.4590 0.4857 0.052 0.780 0.000 0.032 0.060 0.076
#> SRR772649 2 0.3430 0.5581 0.020 0.852 0.004 0.072 0.020 0.032
#> SRR772650 2 0.6052 -0.2346 0.036 0.532 0.000 0.028 0.056 0.348
#> SRR772651 6 0.5131 0.5801 0.052 0.220 0.004 0.000 0.048 0.676
#> SRR772652 6 0.6981 -0.2196 0.384 0.120 0.004 0.008 0.080 0.404
#> SRR772653 6 0.5838 0.1382 0.284 0.080 0.000 0.000 0.060 0.576
#> SRR772654 2 0.5436 -0.0448 0.056 0.492 0.000 0.004 0.020 0.428
#> SRR772655 2 0.4901 0.1452 0.008 0.588 0.000 0.004 0.044 0.356
#> SRR772656 3 0.3260 0.3478 0.000 0.076 0.848 0.000 0.036 0.040
#> SRR772657 3 0.0951 0.4012 0.000 0.020 0.968 0.000 0.004 0.008
#> SRR772658 4 0.0665 0.7449 0.000 0.008 0.000 0.980 0.008 0.004
#> SRR772659 4 0.1844 0.7266 0.000 0.016 0.000 0.928 0.040 0.016
#> SRR772660 2 0.4205 0.4838 0.024 0.800 0.000 0.032 0.056 0.088
#> SRR772661 3 0.5270 0.3222 0.068 0.024 0.716 0.000 0.136 0.056
#> SRR772662 2 0.5471 0.4146 0.068 0.704 0.000 0.024 0.080 0.124
#> SRR772663 2 0.5961 0.4098 0.032 0.656 0.000 0.068 0.080 0.164
#> SRR772664 2 0.3922 0.5650 0.008 0.764 0.020 0.196 0.004 0.008
#> SRR772665 2 0.5012 0.5660 0.004 0.676 0.004 0.200 0.004 0.112
#> SRR772666 3 0.2219 0.2226 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR772667 4 0.2519 0.7143 0.000 0.044 0.000 0.892 0.048 0.016
#> SRR772668 4 0.2100 0.7213 0.000 0.032 0.000 0.916 0.036 0.016
#> SRR772669 4 0.2100 0.7213 0.000 0.032 0.000 0.916 0.036 0.016
#> SRR772670 6 0.5526 0.5789 0.076 0.320 0.000 0.000 0.032 0.572
#> SRR772671 6 0.5117 0.4108 0.004 0.376 0.000 0.000 0.076 0.544
#> SRR772672 2 0.4370 0.4851 0.000 0.680 0.000 0.268 0.048 0.004
#> SRR772673 2 0.5800 0.4788 0.008 0.620 0.000 0.232 0.092 0.048
#> SRR772674 3 0.1524 0.3341 0.000 0.000 0.932 0.000 0.060 0.008
#> SRR772675 3 0.5881 0.1887 0.004 0.356 0.532 0.008 0.072 0.028
#> SRR772676 6 0.6846 0.1225 0.324 0.140 0.008 0.000 0.072 0.456
#> SRR772677 1 0.7309 0.2721 0.448 0.192 0.004 0.008 0.096 0.252
#> SRR772678 3 0.6972 0.2514 0.052 0.180 0.564 0.000 0.116 0.088
#> SRR772679 2 0.5111 0.5778 0.000 0.672 0.004 0.212 0.020 0.092
#> SRR772680 6 0.4886 0.5893 0.008 0.276 0.000 0.000 0.076 0.640
#> SRR772681 3 0.1026 0.3946 0.008 0.008 0.968 0.000 0.004 0.012
#> SRR772682 4 0.4064 0.4799 0.000 0.360 0.000 0.624 0.016 0.000
#> SRR772683 2 0.4214 -0.0475 0.000 0.528 0.000 0.460 0.004 0.008
#> SRR772685 4 0.3756 0.5446 0.000 0.352 0.000 0.644 0.000 0.004
#> SRR772686 3 0.3489 -0.2416 0.004 0.000 0.708 0.000 0.288 0.000
#> SRR772687 5 0.4727 0.7648 0.032 0.000 0.376 0.000 0.580 0.012
#> SRR772688 4 0.0767 0.7450 0.000 0.012 0.000 0.976 0.008 0.004
#> SRR772689 4 0.0964 0.7436 0.000 0.016 0.000 0.968 0.012 0.004
#> SRR772690 3 0.2762 0.0707 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR772691 2 0.7223 0.2969 0.000 0.408 0.292 0.228 0.052 0.020
#> SRR772692 2 0.6533 -0.1519 0.072 0.440 0.000 0.004 0.100 0.384
#> SRR772693 2 0.4587 0.5473 0.004 0.736 0.024 0.192 0.024 0.020
#> SRR772694 4 0.3965 0.4759 0.000 0.376 0.000 0.616 0.004 0.004
#> SRR772695 2 0.5622 0.4004 0.000 0.632 0.000 0.056 0.096 0.216
#> SRR772696 2 0.3164 0.5801 0.004 0.844 0.000 0.112 0.020 0.020
#> SRR772697 2 0.3827 0.5915 0.000 0.784 0.004 0.164 0.032 0.016
#> SRR772698 3 0.4838 0.2323 0.044 0.012 0.688 0.000 0.236 0.020
#> SRR772699 6 0.5358 0.4824 0.148 0.124 0.000 0.000 0.052 0.676
#> SRR772700 6 0.5296 0.5185 0.024 0.352 0.000 0.000 0.060 0.564
#> SRR772701 6 0.5679 0.3060 0.276 0.100 0.000 0.000 0.036 0.588
#> SRR772702 1 0.5658 0.4893 0.544 0.036 0.000 0.000 0.076 0.344
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.806 0.896 0.955 0.4993 0.501 0.501
#> 3 3 0.682 0.823 0.899 0.2359 0.873 0.753
#> 4 4 0.584 0.652 0.816 0.1408 0.893 0.739
#> 5 5 0.558 0.530 0.735 0.0847 0.897 0.691
#> 6 6 0.572 0.453 0.681 0.0407 0.937 0.769
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.3274 0.9120 0.940 0.060
#> SRR772344 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772346 2 0.8713 0.6060 0.292 0.708
#> SRR772347 2 0.9983 0.0799 0.476 0.524
#> SRR772348 2 0.0376 0.9556 0.004 0.996
#> SRR772349 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.2043 0.9375 0.032 0.968
#> SRR772353 1 0.4939 0.8706 0.892 0.108
#> SRR772354 2 0.9323 0.4529 0.348 0.652
#> SRR772355 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772357 1 0.9833 0.3113 0.576 0.424
#> SRR772358 1 0.4562 0.8817 0.904 0.096
#> SRR772359 1 0.2043 0.9311 0.968 0.032
#> SRR772360 2 0.7219 0.7468 0.200 0.800
#> SRR772361 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772364 2 0.4431 0.8837 0.092 0.908
#> SRR772365 1 0.9129 0.5146 0.672 0.328
#> SRR772366 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.4562 0.8825 0.096 0.904
#> SRR772370 1 0.8608 0.6133 0.716 0.284
#> SRR772371 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772372 1 0.7815 0.7191 0.768 0.232
#> SRR772373 2 0.3879 0.9009 0.076 0.924
#> SRR772374 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772378 1 0.5842 0.8306 0.860 0.140
#> SRR772379 2 0.0672 0.9536 0.008 0.992
#> SRR772380 1 0.5737 0.8386 0.864 0.136
#> SRR772381 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772384 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772385 2 0.2423 0.9316 0.040 0.960
#> SRR772386 2 0.3879 0.9013 0.076 0.924
#> SRR772387 2 0.0376 0.9556 0.004 0.996
#> SRR772388 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0938 0.9417 0.988 0.012
#> SRR772392 1 0.0672 0.9433 0.992 0.008
#> SRR772393 2 0.3431 0.9114 0.064 0.936
#> SRR772394 2 0.0672 0.9536 0.008 0.992
#> SRR772395 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.0376 0.9449 0.996 0.004
#> SRR772397 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772402 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0672 0.9534 0.008 0.992
#> SRR772405 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772410 1 0.7528 0.7422 0.784 0.216
#> SRR772411 1 0.5059 0.8675 0.888 0.112
#> SRR772412 1 0.1184 0.9397 0.984 0.016
#> SRR772413 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.8909 0.5649 0.308 0.692
#> SRR772417 1 0.5629 0.8471 0.868 0.132
#> SRR772418 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772422 2 0.1633 0.9433 0.024 0.976
#> SRR772423 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.2423 0.9304 0.040 0.960
#> SRR772426 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0938 0.9416 0.988 0.012
#> SRR772430 2 0.6712 0.7914 0.176 0.824
#> SRR772431 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772435 2 0.9993 0.0532 0.484 0.516
#> SRR772436 1 0.4161 0.8883 0.916 0.084
#> SRR772437 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772440 2 0.0938 0.9511 0.012 0.988
#> SRR772441 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0938 0.9512 0.012 0.988
#> SRR772444 1 0.0376 0.9449 0.996 0.004
#> SRR772445 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772447 1 0.3431 0.9088 0.936 0.064
#> SRR772448 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772449 2 0.0376 0.9557 0.004 0.996
#> SRR772450 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0376 0.9448 0.996 0.004
#> SRR772455 1 0.1633 0.9356 0.976 0.024
#> SRR772456 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772465 1 0.9866 0.2889 0.568 0.432
#> SRR772466 2 0.4562 0.8796 0.096 0.904
#> SRR772467 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772470 1 0.2603 0.9231 0.956 0.044
#> SRR772471 1 0.3733 0.9024 0.928 0.072
#> SRR772472 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772473 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0376 0.9556 0.004 0.996
#> SRR772475 2 0.2603 0.9287 0.044 0.956
#> SRR772476 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772480 2 0.5519 0.8495 0.128 0.872
#> SRR772481 2 0.4161 0.8915 0.084 0.916
#> SRR772482 1 0.5408 0.8561 0.876 0.124
#> SRR772483 1 0.1184 0.9393 0.984 0.016
#> SRR772484 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772485 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772486 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772489 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772490 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.1414 0.9378 0.980 0.020
#> SRR772492 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0672 0.9535 0.008 0.992
#> SRR772497 2 0.7219 0.7576 0.200 0.800
#> SRR772498 2 0.7299 0.7501 0.204 0.796
#> SRR772499 2 0.5178 0.8626 0.116 0.884
#> SRR772500 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.7815 0.7200 0.768 0.232
#> SRR772503 1 0.4939 0.8714 0.892 0.108
#> SRR772504 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772509 2 0.9850 0.2653 0.428 0.572
#> SRR772510 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.9686 0.3528 0.396 0.604
#> SRR772512 2 0.2043 0.9376 0.032 0.968
#> SRR772513 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772521 1 0.2423 0.9256 0.960 0.040
#> SRR772522 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772523 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.4431 0.8814 0.908 0.092
#> SRR772530 1 0.1414 0.9375 0.980 0.020
#> SRR772531 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.5519 0.8511 0.872 0.128
#> SRR772535 2 0.0376 0.9557 0.004 0.996
#> SRR772536 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0938 0.9418 0.988 0.012
#> SRR772540 1 0.7950 0.7078 0.760 0.240
#> SRR772541 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.1414 0.9378 0.980 0.020
#> SRR772546 1 0.3114 0.9149 0.944 0.056
#> SRR772547 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772548 1 0.0672 0.9434 0.992 0.008
#> SRR772549 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772551 2 0.2603 0.9277 0.044 0.956
#> SRR772552 2 0.1414 0.9456 0.020 0.980
#> SRR772553 1 0.9983 0.0742 0.524 0.476
#> SRR772554 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0672 0.9435 0.992 0.008
#> SRR772557 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.3274 0.9113 0.940 0.060
#> SRR772559 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772560 1 0.9996 0.0433 0.512 0.488
#> SRR772561 2 0.9881 0.2361 0.436 0.564
#> SRR772562 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0376 0.9557 0.004 0.996
#> SRR772564 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.0938 0.9417 0.988 0.012
#> SRR772571 1 0.5178 0.8627 0.884 0.116
#> SRR772572 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772573 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772574 1 0.1414 0.9375 0.980 0.020
#> SRR772575 1 0.9983 0.1351 0.524 0.476
#> SRR772576 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772577 2 0.0376 0.9556 0.004 0.996
#> SRR772578 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772581 1 0.4562 0.8833 0.904 0.096
#> SRR772582 2 0.3584 0.9059 0.068 0.932
#> SRR772583 2 0.9754 0.3326 0.408 0.592
#> SRR772584 2 0.1843 0.9397 0.028 0.972
#> SRR772585 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.0376 0.9449 0.996 0.004
#> SRR772588 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772600 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.2948 0.9220 0.052 0.948
#> SRR772606 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0376 0.9557 0.004 0.996
#> SRR772610 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.1414 0.9378 0.980 0.020
#> SRR772617 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.0376 0.9556 0.004 0.996
#> SRR772622 2 0.8499 0.6348 0.276 0.724
#> SRR772623 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.6247 0.8147 0.156 0.844
#> SRR772627 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772628 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772630 1 0.0376 0.9449 0.996 0.004
#> SRR772631 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0376 0.9556 0.004 0.996
#> SRR772633 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772635 2 0.7528 0.7150 0.216 0.784
#> SRR772636 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772642 1 0.9286 0.4810 0.656 0.344
#> SRR772643 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772644 1 0.1843 0.9331 0.972 0.028
#> SRR772645 1 0.3431 0.9095 0.936 0.064
#> SRR772646 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.7453 0.7406 0.212 0.788
#> SRR772649 2 0.5842 0.8355 0.140 0.860
#> SRR772650 1 0.8327 0.6686 0.736 0.264
#> SRR772651 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772652 1 0.2423 0.9258 0.960 0.040
#> SRR772653 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772654 1 0.9896 0.2028 0.560 0.440
#> SRR772655 2 0.9993 0.0670 0.484 0.516
#> SRR772656 1 0.4022 0.8950 0.920 0.080
#> SRR772657 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.4431 0.8848 0.092 0.908
#> SRR772661 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772662 2 0.6623 0.7959 0.172 0.828
#> SRR772663 2 0.5519 0.8493 0.128 0.872
#> SRR772664 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.1633 0.9430 0.024 0.976
#> SRR772666 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772670 1 0.0938 0.9419 0.988 0.012
#> SRR772671 1 0.9427 0.4563 0.640 0.360
#> SRR772672 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.5737 0.8334 0.864 0.136
#> SRR772676 1 0.2603 0.9233 0.956 0.044
#> SRR772677 1 0.0672 0.9434 0.992 0.008
#> SRR772678 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772679 2 0.1843 0.9397 0.028 0.972
#> SRR772680 1 0.5294 0.8594 0.880 0.120
#> SRR772681 1 0.0376 0.9448 0.996 0.004
#> SRR772682 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.1633 0.9433 0.024 0.976
#> SRR772692 1 0.9983 0.0742 0.524 0.476
#> SRR772693 2 0.1184 0.9488 0.016 0.984
#> SRR772694 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0376 0.9557 0.004 0.996
#> SRR772696 2 0.0672 0.9534 0.008 0.992
#> SRR772697 2 0.0000 0.9576 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.7299 0.7489 0.796 0.204
#> SRR772701 1 0.0376 0.9449 0.996 0.004
#> SRR772702 1 0.0000 0.9462 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.0000 0.843 1.000 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.1529 0.854 0.960 0.000 0.040
#> SRR772343 1 0.7186 0.539 0.624 0.040 0.336
#> SRR772344 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 2 0.8948 0.326 0.356 0.508 0.136
#> SRR772347 1 0.8395 0.383 0.568 0.328 0.104
#> SRR772348 2 0.1647 0.916 0.004 0.960 0.036
#> SRR772349 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772350 1 0.5859 0.598 0.656 0.000 0.344
#> SRR772351 2 0.1031 0.921 0.000 0.976 0.024
#> SRR772352 2 0.2982 0.897 0.024 0.920 0.056
#> SRR772353 1 0.2773 0.855 0.928 0.024 0.048
#> SRR772354 2 0.9074 0.213 0.328 0.516 0.156
#> SRR772355 2 0.0747 0.923 0.000 0.984 0.016
#> SRR772356 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772357 1 0.6965 0.546 0.696 0.244 0.060
#> SRR772358 1 0.7956 0.255 0.516 0.060 0.424
#> SRR772359 3 0.3482 0.850 0.128 0.000 0.872
#> SRR772360 2 0.6772 0.515 0.032 0.664 0.304
#> SRR772361 3 0.1529 0.913 0.040 0.000 0.960
#> SRR772362 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 2 0.5659 0.777 0.152 0.796 0.052
#> SRR772365 1 0.9086 0.449 0.552 0.220 0.228
#> SRR772366 3 0.3686 0.826 0.140 0.000 0.860
#> SRR772367 3 0.1753 0.913 0.048 0.000 0.952
#> SRR772368 2 0.1163 0.919 0.000 0.972 0.028
#> SRR772369 2 0.5137 0.807 0.104 0.832 0.064
#> SRR772370 1 0.5036 0.743 0.832 0.120 0.048
#> SRR772371 1 0.2261 0.851 0.932 0.000 0.068
#> SRR772372 1 0.2383 0.840 0.940 0.044 0.016
#> SRR772373 2 0.2902 0.885 0.064 0.920 0.016
#> SRR772374 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772375 3 0.1753 0.913 0.048 0.000 0.952
#> SRR772376 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772377 3 0.1411 0.912 0.036 0.000 0.964
#> SRR772378 1 0.2383 0.824 0.940 0.016 0.044
#> SRR772379 2 0.3554 0.882 0.064 0.900 0.036
#> SRR772380 1 0.2527 0.822 0.936 0.020 0.044
#> SRR772381 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772382 1 0.0747 0.848 0.984 0.000 0.016
#> SRR772383 1 0.2261 0.854 0.932 0.000 0.068
#> SRR772384 3 0.1411 0.912 0.036 0.000 0.964
#> SRR772385 3 0.5291 0.631 0.000 0.268 0.732
#> SRR772386 2 0.5138 0.699 0.252 0.748 0.000
#> SRR772387 2 0.0661 0.923 0.004 0.988 0.008
#> SRR772388 1 0.1964 0.854 0.944 0.000 0.056
#> SRR772389 1 0.3340 0.837 0.880 0.000 0.120
#> SRR772390 3 0.1529 0.913 0.040 0.000 0.960
#> SRR772391 1 0.0237 0.845 0.996 0.000 0.004
#> SRR772392 1 0.6062 0.492 0.616 0.000 0.384
#> SRR772393 2 0.5276 0.817 0.128 0.820 0.052
#> SRR772394 2 0.3253 0.892 0.052 0.912 0.036
#> SRR772395 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772396 1 0.2796 0.848 0.908 0.000 0.092
#> SRR772397 1 0.3267 0.841 0.884 0.000 0.116
#> SRR772398 1 0.4121 0.790 0.832 0.000 0.168
#> SRR772399 1 0.2261 0.852 0.932 0.000 0.068
#> SRR772400 1 0.4702 0.776 0.788 0.000 0.212
#> SRR772401 1 0.1643 0.854 0.956 0.000 0.044
#> SRR772402 2 0.1411 0.917 0.000 0.964 0.036
#> SRR772403 2 0.1163 0.919 0.000 0.972 0.028
#> SRR772404 2 0.2926 0.898 0.040 0.924 0.036
#> SRR772405 3 0.1411 0.912 0.036 0.000 0.964
#> SRR772406 2 0.2590 0.887 0.072 0.924 0.004
#> SRR772407 2 0.0424 0.925 0.000 0.992 0.008
#> SRR772408 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 1 0.6804 0.665 0.724 0.204 0.072
#> SRR772411 1 0.2846 0.855 0.924 0.020 0.056
#> SRR772412 1 0.4291 0.827 0.840 0.008 0.152
#> SRR772413 1 0.1163 0.851 0.972 0.000 0.028
#> SRR772414 3 0.1860 0.911 0.052 0.000 0.948
#> SRR772415 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772416 1 0.7311 0.285 0.580 0.384 0.036
#> SRR772417 1 0.3375 0.828 0.908 0.048 0.044
#> SRR772418 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772419 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772422 2 0.4346 0.767 0.000 0.816 0.184
#> SRR772423 2 0.1289 0.918 0.000 0.968 0.032
#> SRR772424 2 0.1289 0.918 0.000 0.968 0.032
#> SRR772425 2 0.3573 0.835 0.004 0.876 0.120
#> SRR772426 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772428 1 0.2537 0.853 0.920 0.000 0.080
#> SRR772429 1 0.3377 0.849 0.896 0.012 0.092
#> SRR772430 2 0.7214 0.542 0.324 0.632 0.044
#> SRR772431 2 0.1163 0.919 0.000 0.972 0.028
#> SRR772432 2 0.1163 0.919 0.000 0.972 0.028
#> SRR772433 1 0.1753 0.855 0.952 0.000 0.048
#> SRR772434 1 0.4062 0.816 0.836 0.000 0.164
#> SRR772435 1 0.7246 0.458 0.648 0.300 0.052
#> SRR772436 1 0.1751 0.828 0.960 0.012 0.028
#> SRR772437 3 0.1529 0.913 0.040 0.000 0.960
#> SRR772438 1 0.1643 0.855 0.956 0.000 0.044
#> SRR772439 1 0.3038 0.844 0.896 0.000 0.104
#> SRR772440 2 0.2625 0.880 0.084 0.916 0.000
#> SRR772441 2 0.1031 0.921 0.000 0.976 0.024
#> SRR772442 2 0.1411 0.917 0.000 0.964 0.036
#> SRR772443 2 0.5412 0.782 0.172 0.796 0.032
#> SRR772444 1 0.3340 0.833 0.880 0.000 0.120
#> SRR772445 1 0.1163 0.850 0.972 0.000 0.028
#> SRR772446 1 0.2711 0.847 0.912 0.000 0.088
#> SRR772447 1 0.2173 0.856 0.944 0.008 0.048
#> SRR772448 2 0.2443 0.907 0.032 0.940 0.028
#> SRR772449 2 0.3181 0.889 0.064 0.912 0.024
#> SRR772450 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.2878 0.845 0.904 0.000 0.096
#> SRR772453 1 0.2625 0.853 0.916 0.000 0.084
#> SRR772454 1 0.1964 0.854 0.944 0.000 0.056
#> SRR772455 1 0.0661 0.844 0.988 0.004 0.008
#> SRR772456 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.2356 0.852 0.928 0.000 0.072
#> SRR772459 1 0.4291 0.803 0.820 0.000 0.180
#> SRR772460 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772464 3 0.1753 0.913 0.048 0.000 0.952
#> SRR772465 1 0.6105 0.593 0.724 0.252 0.024
#> SRR772466 2 0.4921 0.813 0.072 0.844 0.084
#> SRR772467 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.3482 0.834 0.872 0.000 0.128
#> SRR772470 1 0.4121 0.840 0.868 0.024 0.108
#> SRR772471 1 0.6001 0.771 0.772 0.052 0.176
#> SRR772472 1 0.1529 0.854 0.960 0.000 0.040
#> SRR772473 2 0.2031 0.913 0.016 0.952 0.032
#> SRR772474 2 0.1832 0.914 0.008 0.956 0.036
#> SRR772475 3 0.4452 0.725 0.000 0.192 0.808
#> SRR772476 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.5988 0.541 0.632 0.000 0.368
#> SRR772479 1 0.2625 0.849 0.916 0.000 0.084
#> SRR772480 2 0.7847 0.412 0.344 0.588 0.068
#> SRR772481 2 0.7112 0.516 0.308 0.648 0.044
#> SRR772482 3 0.7188 0.568 0.280 0.056 0.664
#> SRR772483 1 0.6205 0.585 0.656 0.008 0.336
#> SRR772484 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772485 2 0.0424 0.924 0.008 0.992 0.000
#> SRR772486 1 0.1753 0.854 0.952 0.000 0.048
#> SRR772487 1 0.3619 0.831 0.864 0.000 0.136
#> SRR772488 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772489 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772490 1 0.0000 0.843 1.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.4531 0.809 0.824 0.008 0.168
#> SRR772492 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.2383 0.905 0.044 0.940 0.016
#> SRR772497 2 0.6394 0.738 0.116 0.768 0.116
#> SRR772498 2 0.8875 0.252 0.128 0.508 0.364
#> SRR772499 2 0.6345 0.413 0.004 0.596 0.400
#> SRR772500 2 0.0661 0.924 0.008 0.988 0.004
#> SRR772501 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 1 0.6590 0.706 0.756 0.112 0.132
#> SRR772503 1 0.1751 0.843 0.960 0.028 0.012
#> SRR772504 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772509 3 0.2356 0.848 0.000 0.072 0.928
#> SRR772510 3 0.1964 0.909 0.056 0.000 0.944
#> SRR772511 3 0.8179 0.354 0.084 0.352 0.564
#> SRR772512 3 0.5560 0.571 0.000 0.300 0.700
#> SRR772513 2 0.0237 0.925 0.004 0.996 0.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772517 2 0.0237 0.926 0.000 0.996 0.004
#> SRR772518 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772521 1 0.0237 0.845 0.996 0.000 0.004
#> SRR772522 1 0.1163 0.852 0.972 0.000 0.028
#> SRR772523 2 0.0983 0.923 0.004 0.980 0.016
#> SRR772524 2 0.0892 0.920 0.020 0.980 0.000
#> SRR772525 1 0.6280 0.323 0.540 0.000 0.460
#> SRR772526 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772529 1 0.5466 0.727 0.800 0.040 0.160
#> SRR772530 1 0.1399 0.852 0.968 0.004 0.028
#> SRR772531 3 0.5431 0.560 0.284 0.000 0.716
#> SRR772532 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772534 1 0.2564 0.840 0.936 0.036 0.028
#> SRR772535 2 0.4485 0.830 0.136 0.844 0.020
#> SRR772536 2 0.0424 0.925 0.000 0.992 0.008
#> SRR772537 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772539 1 0.0592 0.840 0.988 0.000 0.012
#> SRR772540 1 0.6239 0.706 0.768 0.160 0.072
#> SRR772541 2 0.1411 0.917 0.000 0.964 0.036
#> SRR772542 1 0.1031 0.850 0.976 0.000 0.024
#> SRR772543 1 0.1753 0.854 0.952 0.000 0.048
#> SRR772544 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772545 3 0.4605 0.735 0.204 0.000 0.796
#> SRR772546 3 0.4861 0.768 0.180 0.012 0.808
#> SRR772547 1 0.3192 0.843 0.888 0.000 0.112
#> SRR772548 1 0.5363 0.686 0.724 0.000 0.276
#> SRR772549 1 0.3482 0.833 0.872 0.000 0.128
#> SRR772550 1 0.2711 0.848 0.912 0.000 0.088
#> SRR772551 2 0.7150 0.493 0.348 0.616 0.036
#> SRR772552 2 0.6168 0.717 0.224 0.740 0.036
#> SRR772553 3 0.2066 0.859 0.000 0.060 0.940
#> SRR772554 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772556 1 0.3644 0.829 0.872 0.004 0.124
#> SRR772557 1 0.5216 0.717 0.740 0.000 0.260
#> SRR772558 1 0.0848 0.844 0.984 0.008 0.008
#> SRR772559 1 0.0892 0.849 0.980 0.000 0.020
#> SRR772560 1 0.5581 0.657 0.788 0.176 0.036
#> SRR772561 3 0.2537 0.842 0.000 0.080 0.920
#> SRR772562 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772563 2 0.1015 0.921 0.012 0.980 0.008
#> SRR772564 1 0.3619 0.834 0.864 0.000 0.136
#> SRR772565 1 0.3482 0.838 0.872 0.000 0.128
#> SRR772566 1 0.1860 0.854 0.948 0.000 0.052
#> SRR772567 1 0.3267 0.839 0.884 0.000 0.116
#> SRR772568 2 0.0592 0.923 0.012 0.988 0.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772570 3 0.3816 0.823 0.148 0.000 0.852
#> SRR772571 1 0.3850 0.848 0.884 0.028 0.088
#> SRR772572 1 0.1964 0.855 0.944 0.000 0.056
#> SRR772573 1 0.2066 0.854 0.940 0.000 0.060
#> SRR772574 1 0.3415 0.850 0.900 0.020 0.080
#> SRR772575 1 0.5470 0.679 0.796 0.168 0.036
#> SRR772576 2 0.0424 0.925 0.000 0.992 0.008
#> SRR772577 2 0.1525 0.919 0.004 0.964 0.032
#> SRR772578 2 0.2537 0.882 0.080 0.920 0.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772580 3 0.1753 0.913 0.048 0.000 0.952
#> SRR772581 1 0.0237 0.842 0.996 0.000 0.004
#> SRR772582 2 0.7044 0.491 0.348 0.620 0.032
#> SRR772583 2 0.9334 0.240 0.292 0.508 0.200
#> SRR772584 2 0.4136 0.840 0.116 0.864 0.020
#> SRR772585 2 0.1525 0.917 0.004 0.964 0.032
#> SRR772586 3 0.2711 0.883 0.088 0.000 0.912
#> SRR772587 1 0.4047 0.828 0.848 0.004 0.148
#> SRR772588 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772590 3 0.1529 0.913 0.040 0.000 0.960
#> SRR772591 1 0.1753 0.853 0.952 0.000 0.048
#> SRR772592 1 0.1753 0.853 0.952 0.000 0.048
#> SRR772593 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772594 2 0.0747 0.923 0.000 0.984 0.016
#> SRR772595 2 0.0424 0.925 0.000 0.992 0.008
#> SRR772596 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772597 3 0.2711 0.891 0.088 0.000 0.912
#> SRR772598 1 0.2959 0.828 0.900 0.000 0.100
#> SRR772599 1 0.4654 0.782 0.792 0.000 0.208
#> SRR772600 2 0.1289 0.918 0.000 0.968 0.032
#> SRR772601 2 0.1289 0.918 0.000 0.968 0.032
#> SRR772602 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772603 2 0.1289 0.918 0.000 0.968 0.032
#> SRR772604 2 0.1289 0.918 0.000 0.968 0.032
#> SRR772605 2 0.6168 0.724 0.224 0.740 0.036
#> SRR772606 1 0.1289 0.852 0.968 0.000 0.032
#> SRR772607 1 0.1163 0.851 0.972 0.000 0.028
#> SRR772608 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772609 2 0.3028 0.895 0.048 0.920 0.032
#> SRR772610 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772612 2 0.3973 0.865 0.088 0.880 0.032
#> SRR772613 2 0.1289 0.918 0.000 0.968 0.032
#> SRR772614 1 0.3752 0.829 0.856 0.000 0.144
#> SRR772615 1 0.3267 0.838 0.884 0.000 0.116
#> SRR772616 1 0.1647 0.846 0.960 0.004 0.036
#> SRR772617 2 0.1031 0.921 0.000 0.976 0.024
#> SRR772618 2 0.1525 0.917 0.004 0.964 0.032
#> SRR772619 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 2 0.0848 0.923 0.008 0.984 0.008
#> SRR772622 2 0.7694 0.461 0.316 0.616 0.068
#> SRR772623 1 0.6252 0.364 0.556 0.000 0.444
#> SRR772624 3 0.2537 0.889 0.080 0.000 0.920
#> SRR772625 2 0.5397 0.618 0.000 0.720 0.280
#> SRR772626 2 0.7850 0.465 0.316 0.608 0.076
#> SRR772627 2 0.1163 0.919 0.000 0.972 0.028
#> SRR772628 1 0.3192 0.840 0.888 0.000 0.112
#> SRR772629 1 0.1163 0.850 0.972 0.000 0.028
#> SRR772630 1 0.1163 0.853 0.972 0.000 0.028
#> SRR772631 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772632 2 0.0592 0.923 0.000 0.988 0.012
#> SRR772633 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 1 0.4504 0.782 0.804 0.000 0.196
#> SRR772635 2 0.6887 0.603 0.060 0.704 0.236
#> SRR772636 2 0.2959 0.860 0.000 0.900 0.100
#> SRR772637 1 0.3412 0.836 0.876 0.000 0.124
#> SRR772638 1 0.2959 0.844 0.900 0.000 0.100
#> SRR772639 2 0.0237 0.925 0.000 0.996 0.004
#> SRR772640 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.9503 0.134 0.476 0.208 0.316
#> SRR772643 2 0.0237 0.925 0.000 0.996 0.004
#> SRR772644 1 0.3112 0.843 0.900 0.004 0.096
#> SRR772645 1 0.6777 0.526 0.616 0.020 0.364
#> SRR772646 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772647 2 0.0592 0.923 0.012 0.988 0.000
#> SRR772648 2 0.6572 0.700 0.172 0.748 0.080
#> SRR772649 2 0.6617 0.225 0.008 0.556 0.436
#> SRR772650 1 0.6400 0.658 0.740 0.208 0.052
#> SRR772651 1 0.1411 0.851 0.964 0.000 0.036
#> SRR772652 1 0.4744 0.809 0.836 0.028 0.136
#> SRR772653 1 0.1964 0.853 0.944 0.000 0.056
#> SRR772654 1 0.6104 0.428 0.648 0.348 0.004
#> SRR772655 1 0.9444 0.128 0.440 0.380 0.180
#> SRR772656 3 0.1878 0.911 0.044 0.004 0.952
#> SRR772657 3 0.1411 0.912 0.036 0.000 0.964
#> SRR772658 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 2 0.1031 0.921 0.000 0.976 0.024
#> SRR772660 2 0.5656 0.799 0.068 0.804 0.128
#> SRR772661 3 0.1411 0.912 0.036 0.000 0.964
#> SRR772662 2 0.7742 0.527 0.288 0.632 0.080
#> SRR772663 2 0.7500 0.656 0.140 0.696 0.164
#> SRR772664 2 0.1753 0.902 0.000 0.952 0.048
#> SRR772665 2 0.2682 0.874 0.076 0.920 0.004
#> SRR772666 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772667 2 0.1163 0.919 0.000 0.972 0.028
#> SRR772668 2 0.1163 0.919 0.000 0.972 0.028
#> SRR772669 2 0.1163 0.919 0.000 0.972 0.028
#> SRR772670 1 0.0000 0.843 1.000 0.000 0.000
#> SRR772671 1 0.4092 0.766 0.876 0.088 0.036
#> SRR772672 2 0.1031 0.921 0.000 0.976 0.024
#> SRR772673 2 0.4677 0.830 0.132 0.840 0.028
#> SRR772674 3 0.1860 0.911 0.052 0.000 0.948
#> SRR772675 3 0.1711 0.885 0.008 0.032 0.960
#> SRR772676 1 0.3846 0.831 0.876 0.016 0.108
#> SRR772677 1 0.4887 0.759 0.772 0.000 0.228
#> SRR772678 3 0.1411 0.912 0.036 0.000 0.964
#> SRR772679 2 0.3356 0.887 0.036 0.908 0.056
#> SRR772680 1 0.2313 0.838 0.944 0.032 0.024
#> SRR772681 3 0.1643 0.914 0.044 0.000 0.956
#> SRR772682 2 0.0237 0.926 0.000 0.996 0.004
#> SRR772683 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772686 3 0.1753 0.913 0.048 0.000 0.952
#> SRR772687 1 0.6045 0.527 0.620 0.000 0.380
#> SRR772688 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.1753 0.913 0.048 0.000 0.952
#> SRR772691 3 0.5397 0.611 0.000 0.280 0.720
#> SRR772692 1 0.7170 0.350 0.612 0.352 0.036
#> SRR772693 2 0.3267 0.846 0.000 0.884 0.116
#> SRR772694 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772695 2 0.5111 0.814 0.144 0.820 0.036
#> SRR772696 2 0.1643 0.915 0.000 0.956 0.044
#> SRR772697 2 0.0000 0.926 0.000 1.000 0.000
#> SRR772698 3 0.1529 0.913 0.040 0.000 0.960
#> SRR772699 1 0.1643 0.849 0.956 0.000 0.044
#> SRR772700 1 0.3337 0.800 0.908 0.060 0.032
#> SRR772701 1 0.0424 0.846 0.992 0.000 0.008
#> SRR772702 1 0.2066 0.857 0.940 0.000 0.060
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 4 0.4999 -0.2179 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR772342 1 0.2654 0.7617 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR772343 1 0.6751 0.5462 0.680 0.040 0.168 0.112
#> SRR772344 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0188 0.8367 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772346 4 0.3070 0.5802 0.020 0.068 0.016 0.896
#> SRR772347 4 0.5778 0.4920 0.256 0.052 0.008 0.684
#> SRR772348 2 0.4422 0.7101 0.008 0.736 0.000 0.256
#> SRR772349 2 0.0188 0.8364 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772350 1 0.3942 0.6417 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR772351 2 0.3444 0.7741 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772352 2 0.5075 0.6818 0.012 0.708 0.012 0.268
#> SRR772353 1 0.4218 0.6677 0.796 0.008 0.012 0.184
#> SRR772354 2 0.8762 -0.2083 0.348 0.432 0.120 0.100
#> SRR772355 2 0.3975 0.7439 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR772356 2 0.1211 0.8371 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772357 4 0.6286 0.4066 0.228 0.040 0.048 0.684
#> SRR772358 1 0.6945 0.4108 0.600 0.028 0.296 0.076
#> SRR772359 3 0.4804 0.6475 0.276 0.000 0.708 0.016
#> SRR772360 2 0.6558 0.4733 0.044 0.676 0.216 0.064
#> SRR772361 3 0.1042 0.8649 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR772362 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772363 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772364 4 0.6460 0.3474 0.064 0.316 0.012 0.608
#> SRR772365 4 0.7199 0.3097 0.372 0.032 0.068 0.528
#> SRR772366 3 0.4955 0.2134 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR772367 3 0.2048 0.8627 0.064 0.000 0.928 0.008
#> SRR772368 2 0.4477 0.6623 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR772369 2 0.6486 0.5608 0.184 0.688 0.028 0.100
#> SRR772370 4 0.7886 0.3481 0.280 0.140 0.040 0.540
#> SRR772371 1 0.2760 0.7130 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR772372 1 0.5284 0.4051 0.556 0.004 0.004 0.436
#> SRR772373 2 0.2363 0.8036 0.056 0.920 0.000 0.024
#> SRR772374 2 0.0921 0.8366 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772375 3 0.2048 0.8626 0.064 0.000 0.928 0.008
#> SRR772376 2 0.0336 0.8378 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772377 3 0.0336 0.8542 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772378 4 0.2714 0.5252 0.112 0.000 0.004 0.884
#> SRR772379 2 0.6521 0.3486 0.076 0.512 0.000 0.412
#> SRR772380 4 0.5045 0.3217 0.304 0.004 0.012 0.680
#> SRR772381 3 0.1256 0.8666 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR772382 1 0.4053 0.6876 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR772383 1 0.2021 0.7651 0.932 0.000 0.012 0.056
#> SRR772384 3 0.0524 0.8556 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR772385 3 0.4158 0.5806 0.000 0.224 0.768 0.008
#> SRR772386 2 0.6429 0.3684 0.088 0.588 0.000 0.324
#> SRR772387 2 0.1471 0.8365 0.012 0.960 0.004 0.024
#> SRR772388 1 0.2976 0.7500 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR772389 1 0.0188 0.7568 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772390 3 0.0707 0.8643 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772391 1 0.4277 0.6376 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR772392 1 0.5371 0.5914 0.732 0.000 0.188 0.080
#> SRR772393 4 0.4632 0.3081 0.000 0.308 0.004 0.688
#> SRR772394 2 0.5992 0.3158 0.040 0.516 0.000 0.444
#> SRR772395 2 0.1940 0.8322 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772396 1 0.2831 0.7333 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR772397 1 0.0895 0.7618 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR772398 1 0.5820 0.6615 0.696 0.000 0.100 0.204
#> SRR772399 1 0.4348 0.7047 0.780 0.000 0.024 0.196
#> SRR772400 1 0.0817 0.7577 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR772401 1 0.3428 0.7360 0.844 0.000 0.012 0.144
#> SRR772402 2 0.4454 0.6395 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR772403 2 0.3726 0.7366 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR772404 2 0.6554 0.4433 0.084 0.540 0.000 0.376
#> SRR772405 3 0.0524 0.8556 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR772406 2 0.4222 0.6202 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR772407 2 0.3402 0.7940 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR772408 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772409 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772410 1 0.5868 0.5308 0.744 0.152 0.048 0.056
#> SRR772411 1 0.2408 0.7345 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR772412 1 0.2821 0.7657 0.900 0.004 0.020 0.076
#> SRR772413 1 0.2944 0.7412 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR772414 3 0.2675 0.8409 0.100 0.000 0.892 0.008
#> SRR772415 2 0.1637 0.8372 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772416 4 0.5792 0.5523 0.168 0.124 0.000 0.708
#> SRR772417 1 0.6177 0.1538 0.528 0.020 0.020 0.432
#> SRR772418 3 0.1716 0.8642 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR772419 2 0.0921 0.8362 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772420 2 0.0188 0.8367 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772421 2 0.2281 0.8292 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772422 2 0.5540 0.6608 0.008 0.744 0.156 0.092
#> SRR772423 2 0.4883 0.6816 0.016 0.696 0.000 0.288
#> SRR772424 2 0.4697 0.6136 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR772425 2 0.4728 0.7346 0.004 0.800 0.092 0.104
#> SRR772426 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772427 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772428 1 0.5386 0.6626 0.708 0.000 0.056 0.236
#> SRR772429 1 0.1930 0.7548 0.936 0.004 0.004 0.056
#> SRR772430 4 0.4199 0.5837 0.032 0.164 0.000 0.804
#> SRR772431 2 0.4040 0.7066 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR772432 2 0.3907 0.7177 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR772433 1 0.3907 0.7442 0.828 0.000 0.032 0.140
#> SRR772434 1 0.0817 0.7606 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR772435 4 0.7207 0.4794 0.252 0.140 0.016 0.592
#> SRR772436 4 0.4888 0.0843 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR772437 3 0.0524 0.8583 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR772438 1 0.3768 0.7256 0.808 0.000 0.008 0.184
#> SRR772439 1 0.0469 0.7589 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772440 2 0.3402 0.7386 0.004 0.832 0.000 0.164
#> SRR772441 2 0.3444 0.7820 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772442 2 0.4888 0.5202 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR772443 4 0.6005 0.2302 0.060 0.324 0.000 0.616
#> SRR772444 1 0.5309 0.7136 0.756 0.008 0.072 0.164
#> SRR772445 1 0.1978 0.7619 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR772446 1 0.0188 0.7573 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772447 1 0.2281 0.7384 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR772448 2 0.5990 0.5683 0.056 0.608 0.000 0.336
#> SRR772449 2 0.4882 0.6842 0.020 0.708 0.000 0.272
#> SRR772450 2 0.0921 0.8362 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772451 2 0.0188 0.8367 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772452 1 0.0336 0.7576 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772453 1 0.0937 0.7602 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR772454 1 0.3306 0.7025 0.840 0.000 0.004 0.156
#> SRR772455 4 0.5105 -0.0578 0.432 0.000 0.004 0.564
#> SRR772456 2 0.0336 0.8372 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772457 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.1109 0.7610 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR772459 1 0.1211 0.7621 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772462 2 0.0592 0.8380 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772463 2 0.0707 0.8387 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772464 3 0.1890 0.8655 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR772465 4 0.7482 0.3108 0.316 0.136 0.016 0.532
#> SRR772466 2 0.5592 0.5839 0.168 0.748 0.060 0.024
#> SRR772467 2 0.1022 0.8363 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772468 2 0.0469 0.8374 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772469 1 0.0336 0.7583 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772470 1 0.0469 0.7583 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772471 1 0.3120 0.7467 0.896 0.036 0.056 0.012
#> SRR772472 1 0.0592 0.7590 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772473 2 0.4973 0.6140 0.008 0.644 0.000 0.348
#> SRR772474 2 0.5343 0.6643 0.052 0.708 0.000 0.240
#> SRR772475 3 0.3810 0.6396 0.000 0.188 0.804 0.008
#> SRR772476 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772478 1 0.3831 0.6629 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR772479 1 0.0707 0.7584 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772480 1 0.8037 -0.3777 0.384 0.300 0.004 0.312
#> SRR772481 2 0.7731 -0.1098 0.228 0.396 0.000 0.376
#> SRR772482 3 0.7377 0.3682 0.316 0.012 0.536 0.136
#> SRR772483 1 0.6179 0.4410 0.672 0.000 0.188 0.140
#> SRR772484 2 0.0921 0.8362 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772485 2 0.2334 0.7902 0.088 0.908 0.004 0.000
#> SRR772486 1 0.3271 0.7394 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR772487 1 0.0592 0.7597 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772488 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772489 2 0.1389 0.8354 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR772490 1 0.4761 0.4958 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR772491 1 0.1690 0.7641 0.952 0.008 0.032 0.008
#> SRR772492 2 0.1211 0.8370 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772493 2 0.1022 0.8363 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772494 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772495 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.4720 0.7499 0.044 0.768 0.000 0.188
#> SRR772497 2 0.7537 0.4850 0.184 0.624 0.064 0.128
#> SRR772498 4 0.7526 0.3463 0.004 0.216 0.260 0.520
#> SRR772499 2 0.7891 0.0566 0.008 0.428 0.360 0.204
#> SRR772500 2 0.2500 0.8250 0.040 0.916 0.000 0.044
#> SRR772501 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772502 1 0.8072 0.0967 0.440 0.056 0.100 0.404
#> SRR772503 4 0.5433 -0.1050 0.448 0.008 0.004 0.540
#> SRR772504 2 0.1022 0.8363 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772505 2 0.0592 0.8378 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772506 2 0.0188 0.8367 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772507 2 0.0188 0.8367 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772508 2 0.1867 0.8333 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772509 3 0.1151 0.8402 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR772510 3 0.2675 0.8421 0.100 0.000 0.892 0.008
#> SRR772511 4 0.9558 0.1840 0.160 0.168 0.320 0.352
#> SRR772512 3 0.4820 0.4576 0.000 0.296 0.692 0.012
#> SRR772513 2 0.3006 0.8212 0.012 0.888 0.008 0.092
#> SRR772514 2 0.0188 0.8367 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772515 2 0.0188 0.8373 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772516 2 0.1302 0.8377 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772517 2 0.2281 0.8164 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772518 2 0.2973 0.8077 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772519 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772520 2 0.0592 0.8361 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772521 1 0.5276 0.3807 0.560 0.004 0.004 0.432
#> SRR772522 1 0.3718 0.7317 0.820 0.000 0.012 0.168
#> SRR772523 2 0.3688 0.7521 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR772524 2 0.3123 0.7900 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR772525 1 0.5250 0.2177 0.552 0.000 0.440 0.008
#> SRR772526 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.2408 0.8400 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR772529 4 0.7133 0.0693 0.392 0.008 0.104 0.496
#> SRR772530 1 0.3450 0.7471 0.836 0.000 0.008 0.156
#> SRR772531 3 0.5112 0.3848 0.384 0.000 0.608 0.008
#> SRR772532 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772534 1 0.6263 0.3512 0.528 0.020 0.024 0.428
#> SRR772535 4 0.4584 0.4448 0.004 0.300 0.000 0.696
#> SRR772536 2 0.0817 0.8377 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772537 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0921 0.8369 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772539 4 0.4730 0.1497 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR772540 1 0.7513 -0.0675 0.456 0.092 0.028 0.424
#> SRR772541 2 0.4830 0.5596 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR772542 1 0.4098 0.7008 0.784 0.000 0.012 0.204
#> SRR772543 1 0.2868 0.7163 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR772544 3 0.1151 0.8660 0.024 0.000 0.968 0.008
#> SRR772545 1 0.5000 -0.1075 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR772546 3 0.5532 0.2857 0.428 0.008 0.556 0.008
#> SRR772547 1 0.3893 0.6331 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR772548 1 0.4673 0.6891 0.792 0.000 0.132 0.076
#> SRR772549 1 0.0336 0.7573 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.7569 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772551 4 0.4436 0.5884 0.052 0.148 0.000 0.800
#> SRR772552 4 0.3853 0.5919 0.020 0.160 0.000 0.820
#> SRR772553 3 0.0927 0.8459 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR772554 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772555 2 0.1474 0.8353 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772556 1 0.6167 0.6036 0.648 0.000 0.096 0.256
#> SRR772557 1 0.5690 0.6623 0.716 0.000 0.168 0.116
#> SRR772558 4 0.4933 -0.0193 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR772559 1 0.3668 0.7091 0.808 0.000 0.004 0.188
#> SRR772560 4 0.2300 0.5515 0.064 0.016 0.000 0.920
#> SRR772561 3 0.0524 0.8538 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR772562 2 0.1398 0.8351 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR772563 2 0.1576 0.8201 0.048 0.948 0.000 0.004
#> SRR772564 1 0.1398 0.7626 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR772565 1 0.2660 0.7643 0.908 0.000 0.056 0.036
#> SRR772566 1 0.2928 0.7510 0.880 0.000 0.012 0.108
#> SRR772567 1 0.0000 0.7569 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772568 2 0.1557 0.8298 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772569 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772570 3 0.4720 0.5803 0.324 0.000 0.672 0.004
#> SRR772571 1 0.1721 0.7566 0.952 0.012 0.008 0.028
#> SRR772572 1 0.3105 0.7460 0.868 0.000 0.012 0.120
#> SRR772573 1 0.2101 0.7646 0.928 0.000 0.012 0.060
#> SRR772574 1 0.0000 0.7569 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772575 4 0.4646 0.4824 0.184 0.028 0.008 0.780
#> SRR772576 2 0.2408 0.8260 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772577 2 0.5471 0.6877 0.060 0.720 0.004 0.216
#> SRR772578 2 0.4713 0.4386 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR772579 2 0.2345 0.8274 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772580 3 0.2611 0.8443 0.096 0.000 0.896 0.008
#> SRR772581 1 0.5168 0.2516 0.504 0.000 0.004 0.492
#> SRR772582 4 0.3587 0.5887 0.040 0.104 0.000 0.856
#> SRR772583 1 0.8540 -0.2866 0.448 0.280 0.040 0.232
#> SRR772584 4 0.6071 0.2245 0.048 0.348 0.004 0.600
#> SRR772585 2 0.4699 0.6178 0.004 0.676 0.000 0.320
#> SRR772586 3 0.3610 0.7446 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR772587 1 0.1545 0.7537 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR772588 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772589 2 0.0188 0.8369 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772590 3 0.0524 0.8583 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR772591 1 0.2654 0.7502 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR772592 1 0.1978 0.7633 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR772593 3 0.1637 0.8654 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR772594 2 0.3024 0.7825 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772595 2 0.2647 0.8036 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772596 3 0.1716 0.8640 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR772597 3 0.2737 0.8373 0.104 0.000 0.888 0.008
#> SRR772598 4 0.6875 -0.0102 0.388 0.000 0.108 0.504
#> SRR772599 1 0.2124 0.7397 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR772600 2 0.4643 0.5932 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR772601 2 0.4746 0.5932 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR772602 3 0.1151 0.8660 0.024 0.000 0.968 0.008
#> SRR772603 2 0.4955 0.5916 0.008 0.648 0.000 0.344
#> SRR772604 2 0.5414 0.5552 0.020 0.604 0.000 0.376
#> SRR772605 4 0.1545 0.5698 0.008 0.040 0.000 0.952
#> SRR772606 1 0.3978 0.7135 0.796 0.000 0.012 0.192
#> SRR772607 1 0.4212 0.6928 0.772 0.000 0.012 0.216
#> SRR772608 2 0.0524 0.8373 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR772609 2 0.7059 0.3555 0.140 0.528 0.000 0.332
#> SRR772610 2 0.1118 0.8383 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772611 2 0.1398 0.8372 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR772612 2 0.4967 0.3322 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR772613 2 0.4164 0.6933 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR772614 1 0.1042 0.7609 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR772615 1 0.0188 0.7568 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772616 4 0.4978 0.0598 0.384 0.000 0.004 0.612
#> SRR772617 2 0.3400 0.7820 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR772618 2 0.4250 0.6822 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR772619 2 0.1211 0.8374 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772620 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772621 2 0.1637 0.8286 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772622 2 0.8323 -0.0628 0.192 0.468 0.036 0.304
#> SRR772623 1 0.4535 0.5689 0.704 0.000 0.292 0.004
#> SRR772624 3 0.3801 0.7192 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR772625 2 0.5442 0.4240 0.000 0.636 0.336 0.028
#> SRR772626 4 0.7681 0.3687 0.252 0.292 0.000 0.456
#> SRR772627 2 0.3764 0.7348 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR772628 1 0.0524 0.7585 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR772629 1 0.4018 0.6831 0.772 0.000 0.004 0.224
#> SRR772630 1 0.5062 0.5631 0.680 0.000 0.020 0.300
#> SRR772631 3 0.1389 0.8669 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR772632 2 0.0188 0.8364 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772633 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772634 1 0.6243 0.6191 0.668 0.000 0.160 0.172
#> SRR772635 2 0.7617 0.4446 0.132 0.616 0.188 0.064
#> SRR772636 2 0.3969 0.6931 0.000 0.804 0.180 0.016
#> SRR772637 1 0.0592 0.7615 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.7569 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.1004 0.8372 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR772640 2 0.0188 0.8367 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772641 2 0.1022 0.8363 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772642 4 0.8525 0.3982 0.088 0.168 0.216 0.528
#> SRR772643 2 0.1109 0.8374 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR772644 1 0.5599 0.5816 0.644 0.000 0.040 0.316
#> SRR772645 1 0.5309 0.6107 0.728 0.024 0.228 0.020
#> SRR772646 2 0.0000 0.8363 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772647 2 0.1474 0.8307 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772648 2 0.6753 0.3841 0.248 0.628 0.012 0.112
#> SRR772649 2 0.6826 0.3001 0.040 0.568 0.352 0.040
#> SRR772650 1 0.6263 0.2919 0.608 0.056 0.008 0.328
#> SRR772651 1 0.5112 0.4748 0.608 0.000 0.008 0.384
#> SRR772652 1 0.5100 0.7275 0.784 0.016 0.068 0.132
#> SRR772653 1 0.5182 0.6191 0.684 0.000 0.028 0.288
#> SRR772654 4 0.7882 0.3566 0.288 0.264 0.004 0.444
#> SRR772655 4 0.8341 0.4624 0.112 0.324 0.076 0.488
#> SRR772656 3 0.0927 0.8596 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR772657 3 0.0336 0.8558 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772658 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772659 2 0.3444 0.7774 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772660 4 0.7737 0.1583 0.164 0.356 0.012 0.468
#> SRR772661 3 0.0376 0.8567 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772662 4 0.7811 0.3739 0.320 0.268 0.000 0.412
#> SRR772663 4 0.8089 0.3437 0.076 0.292 0.100 0.532
#> SRR772664 2 0.1722 0.8155 0.000 0.944 0.048 0.008
#> SRR772665 2 0.3313 0.7698 0.028 0.880 0.008 0.084
#> SRR772666 3 0.1722 0.8670 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR772667 2 0.4382 0.6805 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR772668 2 0.4193 0.7084 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR772669 2 0.4193 0.7084 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR772670 1 0.5168 0.2328 0.504 0.000 0.004 0.492
#> SRR772671 4 0.1637 0.5465 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR772672 2 0.5497 0.6191 0.044 0.672 0.000 0.284
#> SRR772673 4 0.5295 -0.2811 0.008 0.488 0.000 0.504
#> SRR772674 3 0.1970 0.8649 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR772675 3 0.0524 0.8518 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR772676 1 0.5988 0.6473 0.696 0.032 0.040 0.232
#> SRR772677 1 0.3032 0.7281 0.868 0.008 0.124 0.000
#> SRR772678 3 0.0376 0.8567 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772679 2 0.5087 0.6968 0.024 0.736 0.012 0.228
#> SRR772680 4 0.5174 0.1158 0.368 0.000 0.012 0.620
#> SRR772681 3 0.1356 0.8671 0.032 0.000 0.960 0.008
#> SRR772682 2 0.1867 0.8272 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772683 2 0.1637 0.8364 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772685 2 0.0188 0.8372 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772686 3 0.1890 0.8656 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR772687 1 0.3873 0.6483 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR772688 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772689 2 0.1211 0.8386 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772690 3 0.1635 0.8673 0.044 0.000 0.948 0.008
#> SRR772691 3 0.4539 0.4996 0.000 0.272 0.720 0.008
#> SRR772692 4 0.4579 0.5235 0.200 0.032 0.000 0.768
#> SRR772693 2 0.5280 0.6760 0.028 0.772 0.152 0.048
#> SRR772694 2 0.0817 0.8361 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772695 4 0.3400 0.5697 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR772696 2 0.5560 0.6489 0.016 0.684 0.024 0.276
#> SRR772697 2 0.2216 0.8284 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772698 3 0.1474 0.8669 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR772699 1 0.4990 0.5305 0.640 0.000 0.008 0.352
#> SRR772700 4 0.5108 0.3402 0.308 0.020 0.000 0.672
#> SRR772701 1 0.4679 0.5343 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR772702 1 0.3308 0.7621 0.872 0.000 0.036 0.092
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 5 0.4249 0.485618 0.296 0.016 0.000 0.000 0.688
#> SRR772342 1 0.2707 0.711936 0.860 0.000 0.008 0.000 0.132
#> SRR772343 1 0.7817 0.241256 0.508 0.124 0.192 0.008 0.168
#> SRR772344 4 0.2648 0.699159 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR772345 4 0.2852 0.695679 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR772346 5 0.5341 0.350851 0.012 0.412 0.004 0.024 0.548
#> SRR772347 2 0.6973 -0.182504 0.184 0.500 0.008 0.016 0.292
#> SRR772348 4 0.4848 -0.210324 0.000 0.420 0.000 0.556 0.024
#> SRR772349 4 0.2818 0.697282 0.008 0.128 0.000 0.860 0.004
#> SRR772350 1 0.3612 0.564310 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR772351 4 0.4127 0.226173 0.000 0.312 0.000 0.680 0.008
#> SRR772352 4 0.6033 0.183017 0.004 0.256 0.008 0.608 0.124
#> SRR772353 1 0.6230 0.348808 0.596 0.120 0.024 0.000 0.260
#> SRR772354 4 0.9021 -0.202979 0.204 0.128 0.060 0.396 0.212
#> SRR772355 4 0.4622 -0.107152 0.000 0.440 0.000 0.548 0.012
#> SRR772356 4 0.1341 0.694455 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR772357 5 0.5302 0.646299 0.076 0.096 0.020 0.048 0.760
#> SRR772358 1 0.7856 0.272077 0.520 0.104 0.204 0.020 0.152
#> SRR772359 3 0.6738 0.473042 0.280 0.088 0.560 0.000 0.072
#> SRR772360 4 0.8408 0.128842 0.036 0.180 0.156 0.480 0.148
#> SRR772361 3 0.0510 0.849829 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0404 0.696279 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772363 4 0.0290 0.696310 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772364 2 0.6949 0.404747 0.036 0.560 0.008 0.164 0.232
#> SRR772365 2 0.7767 -0.226956 0.292 0.432 0.088 0.000 0.188
#> SRR772366 1 0.4688 0.175162 0.532 0.004 0.456 0.000 0.008
#> SRR772367 3 0.1341 0.847955 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR772368 2 0.4283 0.424738 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR772369 4 0.7683 0.099776 0.116 0.300 0.016 0.484 0.084
#> SRR772370 5 0.5389 0.611714 0.176 0.028 0.016 0.056 0.724
#> SRR772371 1 0.4134 0.612930 0.760 0.044 0.000 0.000 0.196
#> SRR772372 1 0.4648 0.191596 0.524 0.012 0.000 0.000 0.464
#> SRR772373 4 0.3690 0.681892 0.052 0.112 0.000 0.828 0.008
#> SRR772374 4 0.1851 0.675471 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR772375 3 0.1270 0.849571 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR772376 4 0.3039 0.688690 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR772377 3 0.2903 0.818612 0.000 0.048 0.872 0.000 0.080
#> SRR772378 5 0.5590 0.540782 0.076 0.308 0.008 0.000 0.608
#> SRR772379 2 0.6845 0.548709 0.032 0.516 0.000 0.296 0.156
#> SRR772380 5 0.4889 0.631472 0.136 0.144 0.000 0.000 0.720
#> SRR772381 3 0.0880 0.853349 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.4147 0.520570 0.676 0.008 0.000 0.000 0.316
#> SRR772383 1 0.1764 0.720187 0.928 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR772384 3 0.3133 0.816484 0.004 0.052 0.864 0.000 0.080
#> SRR772385 3 0.6166 0.544255 0.000 0.056 0.632 0.232 0.080
#> SRR772386 4 0.7339 -0.089850 0.052 0.320 0.004 0.472 0.152
#> SRR772387 4 0.1530 0.700568 0.008 0.028 0.004 0.952 0.008
#> SRR772388 1 0.2536 0.704872 0.868 0.000 0.004 0.000 0.128
#> SRR772389 1 0.0451 0.713019 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR772390 3 0.2444 0.849139 0.028 0.036 0.912 0.000 0.024
#> SRR772391 1 0.4517 0.375019 0.600 0.012 0.000 0.000 0.388
#> SRR772392 1 0.6052 0.496697 0.648 0.052 0.216 0.000 0.084
#> SRR772393 2 0.6033 0.398098 0.004 0.612 0.004 0.160 0.220
#> SRR772394 2 0.5883 0.591960 0.020 0.648 0.000 0.204 0.128
#> SRR772395 4 0.3003 0.576924 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR772396 1 0.4184 0.596171 0.740 0.024 0.004 0.000 0.232
#> SRR772397 1 0.2228 0.723098 0.920 0.020 0.016 0.000 0.044
#> SRR772398 1 0.5459 0.522431 0.644 0.000 0.120 0.000 0.236
#> SRR772399 1 0.4004 0.609252 0.748 0.004 0.016 0.000 0.232
#> SRR772400 1 0.1815 0.718276 0.940 0.016 0.024 0.000 0.020
#> SRR772401 1 0.3224 0.669365 0.824 0.000 0.016 0.000 0.160
#> SRR772402 2 0.4451 0.465181 0.000 0.644 0.000 0.340 0.016
#> SRR772403 2 0.4283 0.161450 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR772404 2 0.6070 0.572935 0.056 0.584 0.000 0.316 0.044
#> SRR772405 3 0.3257 0.816574 0.008 0.052 0.860 0.000 0.080
#> SRR772406 4 0.5379 0.387953 0.000 0.168 0.000 0.668 0.164
#> SRR772407 4 0.4604 0.008951 0.000 0.404 0.008 0.584 0.004
#> SRR772408 4 0.0162 0.699852 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772409 4 0.2230 0.696710 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR772410 1 0.6885 0.435715 0.636 0.100 0.020 0.136 0.108
#> SRR772411 1 0.4767 0.577199 0.720 0.088 0.000 0.000 0.192
#> SRR772412 1 0.3413 0.719388 0.864 0.008 0.040 0.016 0.072
#> SRR772413 1 0.2886 0.680990 0.844 0.008 0.000 0.000 0.148
#> SRR772414 3 0.1608 0.839146 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR772415 4 0.2674 0.639963 0.000 0.120 0.000 0.868 0.012
#> SRR772416 5 0.7446 0.434444 0.104 0.288 0.000 0.120 0.488
#> SRR772417 5 0.7332 0.290247 0.368 0.192 0.040 0.000 0.400
#> SRR772418 3 0.2925 0.845475 0.068 0.024 0.884 0.000 0.024
#> SRR772419 4 0.1410 0.693394 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR772420 4 0.2929 0.693907 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR772421 4 0.3586 0.502159 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR772422 4 0.5980 0.435700 0.004 0.172 0.148 0.656 0.020
#> SRR772423 4 0.4902 -0.282347 0.000 0.468 0.000 0.508 0.024
#> SRR772424 2 0.4846 0.513497 0.000 0.588 0.000 0.384 0.028
#> SRR772425 4 0.6380 0.330755 0.008 0.360 0.108 0.516 0.008
#> SRR772426 4 0.0404 0.696050 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772427 4 0.0290 0.696310 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772428 1 0.5075 0.492541 0.628 0.004 0.044 0.000 0.324
#> SRR772429 1 0.2992 0.705681 0.868 0.064 0.000 0.000 0.068
#> SRR772430 2 0.6128 -0.014159 0.008 0.496 0.008 0.076 0.412
#> SRR772431 2 0.4288 0.354583 0.000 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR772432 2 0.4242 0.282032 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR772433 1 0.4214 0.655133 0.764 0.012 0.028 0.000 0.196
#> SRR772434 1 0.0798 0.714549 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR772435 5 0.7021 0.542336 0.164 0.288 0.004 0.032 0.512
#> SRR772436 5 0.5082 0.584687 0.244 0.072 0.000 0.004 0.680
#> SRR772437 3 0.0290 0.847216 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.4065 0.637326 0.752 0.008 0.016 0.000 0.224
#> SRR772439 1 0.0451 0.713384 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772440 4 0.3955 0.613535 0.000 0.084 0.000 0.800 0.116
#> SRR772441 4 0.4883 0.157115 0.004 0.372 0.000 0.600 0.024
#> SRR772442 2 0.4511 0.546117 0.000 0.628 0.000 0.356 0.016
#> SRR772443 2 0.5698 0.469670 0.036 0.692 0.000 0.140 0.132
#> SRR772444 1 0.5437 0.617846 0.692 0.028 0.076 0.000 0.204
#> SRR772445 1 0.3011 0.700930 0.844 0.016 0.000 0.000 0.140
#> SRR772446 1 0.2616 0.712783 0.888 0.036 0.000 0.000 0.076
#> SRR772447 1 0.3958 0.645781 0.780 0.044 0.000 0.000 0.176
#> SRR772448 2 0.5465 0.517297 0.012 0.568 0.000 0.376 0.044
#> SRR772449 4 0.5906 0.060744 0.008 0.328 0.000 0.568 0.096
#> SRR772450 4 0.1043 0.698381 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR772451 4 0.2605 0.698787 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR772452 1 0.1082 0.712878 0.964 0.008 0.000 0.000 0.028
#> SRR772453 1 0.2153 0.717242 0.916 0.044 0.000 0.000 0.040
#> SRR772454 1 0.5254 0.532842 0.692 0.100 0.008 0.000 0.200
#> SRR772455 5 0.5621 0.450762 0.320 0.072 0.004 0.004 0.600
#> SRR772456 4 0.2929 0.694138 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR772457 4 0.2852 0.695597 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR772458 1 0.1942 0.720848 0.920 0.000 0.012 0.000 0.068
#> SRR772459 1 0.1393 0.719676 0.956 0.008 0.024 0.000 0.012
#> SRR772460 4 0.2230 0.696710 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR772461 4 0.2230 0.696710 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR772462 4 0.3534 0.652998 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR772463 4 0.3177 0.686365 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR772464 3 0.1043 0.852953 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR772465 5 0.7715 0.588442 0.176 0.096 0.028 0.148 0.552
#> SRR772466 4 0.6523 0.403989 0.144 0.172 0.004 0.628 0.052
#> SRR772467 4 0.1792 0.690154 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR772468 4 0.2929 0.692364 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR772469 1 0.1026 0.716759 0.968 0.004 0.004 0.000 0.024
#> SRR772470 1 0.1981 0.714104 0.924 0.048 0.000 0.000 0.028
#> SRR772471 1 0.4789 0.670248 0.780 0.076 0.040 0.004 0.100
#> SRR772472 1 0.2674 0.698967 0.856 0.004 0.000 0.000 0.140
#> SRR772473 2 0.5111 0.523919 0.012 0.588 0.000 0.376 0.024
#> SRR772474 2 0.5070 0.362471 0.024 0.568 0.000 0.400 0.008
#> SRR772475 3 0.5948 0.595160 0.000 0.056 0.664 0.200 0.080
#> SRR772476 4 0.2329 0.698150 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR772477 4 0.0290 0.696310 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772478 1 0.5315 0.609768 0.716 0.024 0.152 0.000 0.108
#> SRR772479 1 0.2669 0.701261 0.876 0.020 0.000 0.000 0.104
#> SRR772480 2 0.7129 0.197529 0.276 0.528 0.000 0.092 0.104
#> SRR772481 2 0.7593 0.409699 0.140 0.480 0.000 0.272 0.108
#> SRR772482 3 0.8944 0.050680 0.252 0.172 0.348 0.028 0.200
#> SRR772483 1 0.7152 0.294954 0.564 0.124 0.116 0.000 0.196
#> SRR772484 4 0.1121 0.697426 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772485 4 0.4151 0.672171 0.044 0.156 0.000 0.788 0.012
#> SRR772486 1 0.3081 0.668578 0.832 0.000 0.012 0.000 0.156
#> SRR772487 1 0.1059 0.717042 0.968 0.004 0.008 0.000 0.020
#> SRR772488 4 0.2848 0.698323 0.000 0.156 0.000 0.840 0.004
#> SRR772489 4 0.3774 0.606862 0.000 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR772490 5 0.4434 0.062516 0.460 0.004 0.000 0.000 0.536
#> SRR772491 1 0.3882 0.708010 0.836 0.044 0.060 0.000 0.060
#> SRR772492 4 0.2471 0.650666 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR772493 4 0.2280 0.662902 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR772494 4 0.0290 0.696310 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772495 4 0.2230 0.696710 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR772496 4 0.5512 0.281844 0.008 0.280 0.000 0.632 0.080
#> SRR772497 4 0.7592 0.095593 0.124 0.284 0.028 0.508 0.056
#> SRR772498 5 0.8465 0.050796 0.008 0.312 0.168 0.160 0.352
#> SRR772499 2 0.7911 0.296516 0.004 0.356 0.236 0.340 0.064
#> SRR772500 4 0.3604 0.677326 0.020 0.132 0.000 0.828 0.020
#> SRR772501 4 0.2773 0.698314 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR772502 5 0.7758 0.470599 0.276 0.032 0.092 0.092 0.508
#> SRR772503 5 0.4886 0.563646 0.256 0.032 0.012 0.004 0.696
#> SRR772504 4 0.2773 0.632905 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR772505 4 0.2852 0.697103 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR772506 4 0.2690 0.697385 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR772507 4 0.2773 0.695433 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR772508 4 0.3143 0.549923 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR772509 3 0.3538 0.807029 0.000 0.056 0.848 0.016 0.080
#> SRR772510 3 0.1732 0.834210 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.8499 0.000817 0.100 0.424 0.300 0.052 0.124
#> SRR772512 3 0.4721 0.396875 0.000 0.016 0.656 0.316 0.012
#> SRR772513 4 0.4398 0.535124 0.000 0.240 0.000 0.720 0.040
#> SRR772514 4 0.2773 0.698118 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR772515 4 0.3093 0.691690 0.000 0.168 0.000 0.824 0.008
#> SRR772516 4 0.2377 0.664276 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR772517 4 0.4182 0.386215 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR772518 4 0.4876 0.426682 0.000 0.220 0.000 0.700 0.080
#> SRR772519 4 0.0880 0.695591 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772520 4 0.2843 0.695656 0.000 0.144 0.000 0.848 0.008
#> SRR772521 5 0.5262 0.311846 0.376 0.032 0.012 0.000 0.580
#> SRR772522 1 0.4532 0.604864 0.716 0.016 0.020 0.000 0.248
#> SRR772523 2 0.4403 0.174545 0.000 0.560 0.000 0.436 0.004
#> SRR772524 4 0.4302 0.467590 0.000 0.248 0.000 0.720 0.032
#> SRR772525 1 0.4450 0.170942 0.508 0.000 0.488 0.000 0.004
#> SRR772526 4 0.2230 0.696710 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR772527 4 0.2329 0.696206 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR772528 3 0.3582 0.816491 0.108 0.024 0.840 0.000 0.028
#> SRR772529 5 0.7076 0.510056 0.280 0.092 0.060 0.016 0.552
#> SRR772530 1 0.3845 0.654763 0.760 0.004 0.012 0.000 0.224
#> SRR772531 3 0.4088 0.341935 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR772532 4 0.2424 0.698852 0.000 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR772533 4 0.2773 0.697829 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR772534 1 0.6493 -0.109507 0.456 0.080 0.028 0.004 0.432
#> SRR772535 5 0.6500 0.032561 0.000 0.236 0.000 0.276 0.488
#> SRR772536 4 0.2732 0.694944 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR772537 4 0.2329 0.695712 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR772538 4 0.1341 0.692419 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR772539 5 0.3795 0.617780 0.144 0.044 0.000 0.004 0.808
#> SRR772540 5 0.8047 0.401535 0.316 0.224 0.028 0.040 0.392
#> SRR772541 2 0.4437 0.569801 0.000 0.664 0.000 0.316 0.020
#> SRR772542 1 0.3884 0.557040 0.708 0.000 0.004 0.000 0.288
#> SRR772543 1 0.3919 0.629976 0.776 0.036 0.000 0.000 0.188
#> SRR772544 3 0.0880 0.853349 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.6128 0.345067 0.580 0.044 0.316 0.000 0.060
#> SRR772546 1 0.6837 0.135431 0.480 0.052 0.396 0.016 0.056
#> SRR772547 1 0.5713 0.370443 0.620 0.100 0.008 0.000 0.272
#> SRR772548 1 0.5826 0.546282 0.672 0.040 0.096 0.000 0.192
#> SRR772549 1 0.0771 0.714015 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR772550 1 0.0451 0.711071 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR772551 5 0.6100 0.456076 0.028 0.172 0.000 0.160 0.640
#> SRR772552 5 0.6328 0.254376 0.004 0.324 0.000 0.156 0.516
#> SRR772553 3 0.3367 0.811371 0.000 0.052 0.856 0.012 0.080
#> SRR772554 4 0.0510 0.696668 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772555 4 0.0794 0.694643 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR772556 1 0.6061 0.393282 0.572 0.016 0.080 0.004 0.328
#> SRR772557 1 0.5278 0.626216 0.696 0.008 0.116 0.000 0.180
#> SRR772558 5 0.4670 0.599560 0.200 0.076 0.000 0.000 0.724
#> SRR772559 1 0.3461 0.622228 0.772 0.004 0.000 0.000 0.224
#> SRR772560 5 0.4675 0.476701 0.016 0.360 0.000 0.004 0.620
#> SRR772561 3 0.0510 0.841433 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772562 4 0.3783 0.637839 0.000 0.252 0.000 0.740 0.008
#> SRR772563 4 0.3013 0.691704 0.008 0.160 0.000 0.832 0.000
#> SRR772564 1 0.1644 0.715584 0.940 0.004 0.048 0.000 0.008
#> SRR772565 1 0.2464 0.721857 0.904 0.004 0.048 0.000 0.044
#> SRR772566 1 0.2230 0.694941 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR772567 1 0.0566 0.712682 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR772568 4 0.1168 0.695738 0.000 0.032 0.000 0.960 0.008
#> SRR772569 4 0.2280 0.696347 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR772570 3 0.5798 0.461147 0.344 0.036 0.584 0.004 0.032
#> SRR772571 1 0.3395 0.699701 0.844 0.048 0.000 0.004 0.104
#> SRR772572 1 0.2124 0.706237 0.900 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR772573 1 0.1704 0.716239 0.928 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR772574 1 0.3165 0.701974 0.848 0.036 0.000 0.000 0.116
#> SRR772575 5 0.4862 0.641874 0.088 0.144 0.004 0.012 0.752
#> SRR772576 4 0.3885 0.477962 0.000 0.268 0.000 0.724 0.008
#> SRR772577 2 0.5397 0.094101 0.032 0.488 0.000 0.468 0.012
#> SRR772578 4 0.5861 0.247673 0.000 0.148 0.000 0.592 0.260
#> SRR772579 4 0.3750 0.525008 0.000 0.232 0.000 0.756 0.012
#> SRR772580 3 0.1671 0.836646 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR772581 5 0.4763 0.431703 0.336 0.032 0.000 0.000 0.632
#> SRR772582 5 0.5993 0.272538 0.008 0.376 0.000 0.092 0.524
#> SRR772583 1 0.8588 -0.245600 0.348 0.328 0.020 0.168 0.136
#> SRR772584 2 0.6880 0.452694 0.016 0.476 0.000 0.300 0.208
#> SRR772585 2 0.4269 0.536778 0.000 0.684 0.000 0.300 0.016
#> SRR772586 3 0.4130 0.720625 0.196 0.012 0.768 0.000 0.024
#> SRR772587 1 0.2363 0.713913 0.912 0.012 0.052 0.000 0.024
#> SRR772588 4 0.2732 0.699629 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR772589 4 0.3109 0.686312 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR772590 3 0.0290 0.847216 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.2193 0.703328 0.900 0.000 0.008 0.000 0.092
#> SRR772592 1 0.1410 0.716978 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR772593 3 0.3048 0.846382 0.060 0.036 0.880 0.000 0.024
#> SRR772594 4 0.4291 0.058032 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR772595 4 0.4249 0.203219 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR772596 3 0.2925 0.845475 0.068 0.024 0.884 0.000 0.024
#> SRR772597 3 0.1478 0.844446 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR772598 5 0.5869 0.434792 0.304 0.016 0.084 0.000 0.596
#> SRR772599 1 0.2338 0.714019 0.916 0.016 0.032 0.000 0.036
#> SRR772600 2 0.3612 0.537292 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR772601 2 0.4415 0.507968 0.000 0.604 0.000 0.388 0.008
#> SRR772602 3 0.0794 0.852856 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.4404 0.567084 0.000 0.712 0.000 0.252 0.036
#> SRR772604 2 0.4598 0.565193 0.008 0.664 0.000 0.312 0.016
#> SRR772605 2 0.5546 -0.167452 0.004 0.488 0.000 0.056 0.452
#> SRR772606 1 0.4332 0.605013 0.732 0.008 0.024 0.000 0.236
#> SRR772607 1 0.3910 0.574410 0.720 0.008 0.000 0.000 0.272
#> SRR772608 4 0.3648 0.686859 0.000 0.188 0.004 0.792 0.016
#> SRR772609 2 0.5757 0.569629 0.072 0.648 0.000 0.248 0.032
#> SRR772610 4 0.1671 0.694158 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR772611 4 0.2741 0.667381 0.000 0.132 0.004 0.860 0.004
#> SRR772612 2 0.6336 0.470527 0.000 0.488 0.000 0.340 0.172
#> SRR772613 2 0.4251 0.386873 0.000 0.624 0.000 0.372 0.004
#> SRR772614 1 0.1891 0.719348 0.936 0.016 0.016 0.000 0.032
#> SRR772615 1 0.0613 0.713247 0.984 0.008 0.004 0.000 0.004
#> SRR772616 5 0.4778 0.549369 0.244 0.036 0.008 0.004 0.708
#> SRR772617 4 0.4171 0.033789 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR772618 2 0.4225 0.395439 0.000 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR772619 4 0.2127 0.658382 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR772620 4 0.2891 0.691484 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR772621 4 0.2943 0.650123 0.000 0.052 0.008 0.880 0.060
#> SRR772622 4 0.8713 -0.159732 0.120 0.284 0.044 0.400 0.152
#> SRR772623 1 0.4283 0.460025 0.644 0.000 0.348 0.000 0.008
#> SRR772624 3 0.4857 0.602296 0.272 0.020 0.684 0.000 0.024
#> SRR772625 4 0.6191 0.236893 0.000 0.056 0.236 0.628 0.080
#> SRR772626 2 0.7987 0.356407 0.172 0.456 0.000 0.200 0.172
#> SRR772627 2 0.4533 0.198121 0.000 0.544 0.000 0.448 0.008
#> SRR772628 1 0.2344 0.713683 0.904 0.032 0.000 0.000 0.064
#> SRR772629 1 0.3910 0.554902 0.720 0.000 0.008 0.000 0.272
#> SRR772630 1 0.5859 0.413685 0.616 0.064 0.032 0.000 0.288
#> SRR772631 3 0.3542 0.838491 0.048 0.044 0.856 0.000 0.052
#> SRR772632 4 0.2488 0.696414 0.000 0.124 0.004 0.872 0.000
#> SRR772633 4 0.0162 0.698581 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772634 1 0.6499 0.417452 0.564 0.028 0.108 0.004 0.296
#> SRR772635 4 0.8990 -0.216553 0.132 0.244 0.100 0.416 0.108
#> SRR772636 4 0.4535 0.547369 0.000 0.044 0.096 0.792 0.068
#> SRR772637 1 0.1682 0.714663 0.940 0.012 0.004 0.000 0.044
#> SRR772638 1 0.0794 0.713467 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772639 4 0.3525 0.694656 0.000 0.184 0.008 0.800 0.008
#> SRR772640 4 0.2648 0.697868 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR772641 4 0.1270 0.697039 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR772642 5 0.6546 0.568782 0.068 0.052 0.124 0.076 0.680
#> SRR772643 4 0.1597 0.687380 0.000 0.048 0.000 0.940 0.012
#> SRR772644 5 0.5527 -0.059502 0.468 0.012 0.040 0.000 0.480
#> SRR772645 1 0.6614 0.488975 0.616 0.056 0.196 0.004 0.128
#> SRR772646 4 0.2424 0.696532 0.000 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR772647 4 0.0912 0.695027 0.000 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR772648 4 0.7809 0.089211 0.196 0.180 0.004 0.496 0.124
#> SRR772649 4 0.7808 0.155616 0.028 0.116 0.196 0.540 0.120
#> SRR772650 1 0.8127 -0.298964 0.360 0.208 0.028 0.048 0.356
#> SRR772651 5 0.5489 0.103054 0.448 0.020 0.028 0.000 0.504
#> SRR772652 1 0.4926 0.637418 0.724 0.000 0.108 0.004 0.164
#> SRR772653 1 0.4805 0.482504 0.648 0.000 0.040 0.000 0.312
#> SRR772654 5 0.6950 0.539223 0.172 0.072 0.000 0.180 0.576
#> SRR772655 5 0.7577 0.355807 0.080 0.064 0.056 0.256 0.544
#> SRR772656 3 0.0902 0.845694 0.008 0.004 0.976 0.004 0.008
#> SRR772657 3 0.0162 0.846008 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.0880 0.696749 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772659 4 0.4182 -0.068973 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR772660 2 0.6758 0.447899 0.092 0.648 0.020 0.124 0.116
#> SRR772661 3 0.3126 0.820470 0.008 0.048 0.868 0.000 0.076
#> SRR772662 2 0.6809 0.370423 0.176 0.604 0.000 0.108 0.112
#> SRR772663 2 0.7565 0.321262 0.044 0.564 0.076 0.100 0.216
#> SRR772664 4 0.3964 0.666656 0.000 0.176 0.016 0.788 0.020
#> SRR772665 4 0.5729 0.517733 0.028 0.164 0.000 0.680 0.128
#> SRR772666 3 0.1043 0.852953 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR772667 2 0.4494 0.450300 0.000 0.608 0.000 0.380 0.012
#> SRR772668 4 0.4452 -0.326056 0.000 0.496 0.000 0.500 0.004
#> SRR772669 4 0.4452 -0.326056 0.000 0.496 0.000 0.500 0.004
#> SRR772670 5 0.5645 0.501657 0.300 0.056 0.024 0.000 0.620
#> SRR772671 5 0.4479 0.580161 0.036 0.240 0.000 0.004 0.720
#> SRR772672 2 0.4541 0.417044 0.008 0.608 0.000 0.380 0.004
#> SRR772673 2 0.5789 0.592135 0.004 0.612 0.000 0.260 0.124
#> SRR772674 3 0.1121 0.852285 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.2974 0.816887 0.000 0.052 0.868 0.000 0.080
#> SRR772676 1 0.5834 0.508642 0.644 0.024 0.056 0.012 0.264
#> SRR772677 1 0.4593 0.672388 0.788 0.024 0.128 0.012 0.048
#> SRR772678 3 0.3062 0.818323 0.004 0.048 0.868 0.000 0.080
#> SRR772679 2 0.6636 0.247522 0.024 0.460 0.000 0.396 0.120
#> SRR772680 5 0.4386 0.610369 0.176 0.028 0.020 0.004 0.772
#> SRR772681 3 0.0880 0.853351 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR772682 4 0.3837 0.553099 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR772683 4 0.3098 0.607934 0.000 0.148 0.000 0.836 0.016
#> SRR772685 4 0.2966 0.691334 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR772686 3 0.1121 0.852056 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR772687 1 0.3109 0.632108 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR772688 4 0.1043 0.693708 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR772689 4 0.2074 0.662747 0.000 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR772690 3 0.1043 0.852953 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR772691 3 0.6261 0.521829 0.000 0.056 0.616 0.248 0.080
#> SRR772692 2 0.6281 -0.353035 0.116 0.456 0.000 0.008 0.420
#> SRR772693 4 0.6718 0.431466 0.008 0.252 0.080 0.592 0.068
#> SRR772694 4 0.0162 0.698581 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772695 2 0.6398 0.077461 0.008 0.460 0.000 0.132 0.400
#> SRR772696 2 0.5110 0.470570 0.000 0.660 0.028 0.288 0.024
#> SRR772697 4 0.3596 0.579333 0.000 0.212 0.000 0.776 0.012
#> SRR772698 3 0.2980 0.846779 0.056 0.036 0.884 0.000 0.024
#> SRR772699 1 0.4787 0.136559 0.528 0.012 0.004 0.000 0.456
#> SRR772700 5 0.5645 0.623419 0.176 0.156 0.000 0.008 0.660
#> SRR772701 1 0.4591 0.135913 0.516 0.004 0.004 0.000 0.476
#> SRR772702 1 0.3342 0.710540 0.836 0.008 0.020 0.000 0.136
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 6 0.4907 0.46216 0.228 0.012 0.000 0.000 0.092 0.668
#> SRR772342 1 0.3714 0.68941 0.800 0.004 0.016 0.000 0.036 0.144
#> SRR772343 1 0.8800 -0.19292 0.328 0.072 0.208 0.024 0.128 0.240
#> SRR772344 4 0.1563 0.67707 0.000 0.056 0.000 0.932 0.012 0.000
#> SRR772345 4 0.1802 0.67534 0.000 0.072 0.000 0.916 0.012 0.000
#> SRR772346 6 0.6517 0.26525 0.012 0.336 0.004 0.016 0.172 0.460
#> SRR772347 2 0.7417 -0.28751 0.104 0.364 0.000 0.008 0.200 0.324
#> SRR772348 2 0.5365 0.32465 0.004 0.532 0.000 0.384 0.068 0.012
#> SRR772349 4 0.1973 0.68144 0.008 0.028 0.000 0.924 0.036 0.004
#> SRR772350 1 0.3881 0.35566 0.600 0.000 0.396 0.000 0.000 0.004
#> SRR772351 4 0.4702 0.22307 0.000 0.408 0.000 0.552 0.032 0.008
#> SRR772352 4 0.6925 -0.04954 0.000 0.324 0.000 0.432 0.116 0.128
#> SRR772353 1 0.7566 0.00691 0.424 0.044 0.024 0.020 0.224 0.264
#> SRR772354 5 0.8764 0.28462 0.164 0.180 0.024 0.176 0.376 0.080
#> SRR772355 2 0.4551 0.31093 0.000 0.608 0.000 0.344 0.048 0.000
#> SRR772356 4 0.3883 0.65364 0.000 0.200 0.000 0.752 0.044 0.004
#> SRR772357 6 0.6344 0.43694 0.040 0.112 0.028 0.020 0.164 0.636
#> SRR772358 1 0.8530 -0.08284 0.392 0.088 0.144 0.012 0.212 0.152
#> SRR772359 3 0.7261 -0.10618 0.260 0.012 0.412 0.004 0.256 0.056
#> SRR772360 4 0.7642 -0.02389 0.028 0.032 0.088 0.512 0.172 0.168
#> SRR772361 3 0.0458 0.73639 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.2165 0.67091 0.000 0.108 0.000 0.884 0.008 0.000
#> SRR772363 4 0.2165 0.67186 0.000 0.108 0.000 0.884 0.008 0.000
#> SRR772364 2 0.7849 0.13492 0.024 0.392 0.000 0.188 0.164 0.232
#> SRR772365 2 0.8642 -0.34241 0.236 0.340 0.128 0.004 0.116 0.176
#> SRR772366 1 0.4471 0.08592 0.500 0.000 0.472 0.000 0.028 0.000
#> SRR772367 3 0.0790 0.73717 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR772368 2 0.3448 0.48091 0.000 0.716 0.000 0.280 0.004 0.000
#> SRR772369 4 0.7887 -0.11003 0.104 0.156 0.000 0.432 0.240 0.068
#> SRR772370 6 0.6837 0.44031 0.116 0.052 0.016 0.040 0.188 0.588
#> SRR772371 1 0.4972 0.51676 0.664 0.016 0.000 0.000 0.088 0.232
#> SRR772372 1 0.6403 0.08348 0.428 0.036 0.004 0.000 0.140 0.392
#> SRR772373 4 0.2527 0.67481 0.040 0.016 0.000 0.896 0.044 0.004
#> SRR772374 4 0.3239 0.65618 0.000 0.164 0.000 0.808 0.024 0.004
#> SRR772375 3 0.0790 0.73717 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR772376 4 0.2326 0.66436 0.000 0.092 0.000 0.888 0.012 0.008
#> SRR772377 3 0.3531 0.58962 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR772378 6 0.5868 0.39104 0.028 0.216 0.004 0.000 0.156 0.596
#> SRR772379 2 0.7145 0.31417 0.024 0.520 0.004 0.128 0.224 0.100
#> SRR772380 6 0.5792 0.43760 0.064 0.100 0.000 0.000 0.220 0.616
#> SRR772381 3 0.0632 0.73829 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.5068 0.52922 0.632 0.016 0.008 0.000 0.052 0.292
#> SRR772383 1 0.3156 0.69820 0.852 0.000 0.020 0.000 0.072 0.056
#> SRR772384 3 0.3547 0.58596 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR772385 3 0.6134 0.28750 0.000 0.040 0.504 0.124 0.332 0.000
#> SRR772386 2 0.7463 0.27652 0.016 0.388 0.004 0.344 0.104 0.144
#> SRR772387 4 0.3254 0.67238 0.004 0.104 0.000 0.836 0.052 0.004
#> SRR772388 1 0.3238 0.68609 0.832 0.000 0.012 0.000 0.036 0.120
#> SRR772389 1 0.0881 0.68599 0.972 0.000 0.012 0.000 0.008 0.008
#> SRR772390 3 0.3268 0.70577 0.044 0.000 0.812 0.000 0.144 0.000
#> SRR772391 1 0.5120 0.26087 0.524 0.004 0.004 0.000 0.060 0.408
#> SRR772392 1 0.6952 0.17064 0.492 0.020 0.288 0.000 0.108 0.092
#> SRR772393 2 0.6016 0.29894 0.004 0.616 0.000 0.068 0.128 0.184
#> SRR772394 2 0.7233 0.41676 0.000 0.436 0.000 0.228 0.188 0.148
#> SRR772395 4 0.4002 0.51738 0.000 0.320 0.000 0.660 0.020 0.000
#> SRR772396 1 0.5266 0.54842 0.668 0.020 0.004 0.004 0.096 0.208
#> SRR772397 1 0.3764 0.69573 0.832 0.024 0.032 0.000 0.064 0.048
#> SRR772398 1 0.5631 0.52116 0.612 0.004 0.108 0.000 0.028 0.248
#> SRR772399 1 0.4325 0.61793 0.732 0.008 0.024 0.000 0.024 0.212
#> SRR772400 1 0.2255 0.69320 0.908 0.000 0.024 0.000 0.044 0.024
#> SRR772401 1 0.3350 0.66707 0.812 0.004 0.012 0.000 0.016 0.156
#> SRR772402 2 0.5204 0.46615 0.000 0.548 0.000 0.376 0.060 0.016
#> SRR772403 4 0.4406 -0.21112 0.000 0.476 0.000 0.500 0.024 0.000
#> SRR772404 2 0.6497 0.55802 0.032 0.568 0.000 0.236 0.120 0.044
#> SRR772405 3 0.3499 0.59658 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR772406 4 0.6294 0.34333 0.000 0.204 0.000 0.568 0.076 0.152
#> SRR772407 2 0.4620 0.25057 0.000 0.580 0.004 0.384 0.028 0.004
#> SRR772408 4 0.2118 0.67333 0.000 0.104 0.000 0.888 0.008 0.000
#> SRR772409 4 0.0146 0.67862 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772410 1 0.6846 0.29673 0.552 0.168 0.012 0.008 0.184 0.076
#> SRR772411 1 0.6427 0.42249 0.560 0.064 0.000 0.008 0.228 0.140
#> SRR772412 1 0.3663 0.70028 0.836 0.016 0.032 0.000 0.060 0.056
#> SRR772413 1 0.3603 0.67102 0.804 0.000 0.016 0.000 0.040 0.140
#> SRR772414 3 0.1007 0.73097 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR772415 4 0.4410 0.59366 0.000 0.204 0.000 0.724 0.052 0.020
#> SRR772416 6 0.7351 0.31200 0.076 0.224 0.000 0.028 0.212 0.460
#> SRR772417 6 0.8317 0.16716 0.208 0.100 0.064 0.012 0.228 0.388
#> SRR772418 3 0.3901 0.68192 0.096 0.000 0.768 0.000 0.136 0.000
#> SRR772419 4 0.3250 0.66150 0.000 0.196 0.000 0.788 0.012 0.004
#> SRR772420 4 0.2404 0.66282 0.000 0.112 0.000 0.872 0.016 0.000
#> SRR772421 4 0.4715 0.38588 0.000 0.416 0.000 0.544 0.032 0.008
#> SRR772422 4 0.7201 0.25632 0.004 0.264 0.120 0.500 0.076 0.036
#> SRR772423 2 0.5656 0.47467 0.000 0.560 0.000 0.320 0.088 0.032
#> SRR772424 2 0.4668 0.51673 0.000 0.660 0.000 0.276 0.052 0.012
#> SRR772425 4 0.7123 0.00552 0.000 0.292 0.172 0.456 0.048 0.032
#> SRR772426 4 0.2118 0.67157 0.000 0.104 0.000 0.888 0.008 0.000
#> SRR772427 4 0.2165 0.67151 0.000 0.108 0.000 0.884 0.008 0.000
#> SRR772428 1 0.5848 0.45240 0.564 0.012 0.048 0.000 0.056 0.320
#> SRR772429 1 0.4881 0.62679 0.732 0.048 0.000 0.004 0.092 0.124
#> SRR772430 2 0.7194 -0.15604 0.016 0.440 0.016 0.056 0.132 0.340
#> SRR772431 2 0.4322 0.32364 0.000 0.528 0.000 0.452 0.020 0.000
#> SRR772432 2 0.3864 0.26344 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR772433 1 0.4082 0.65464 0.764 0.004 0.020 0.000 0.036 0.176
#> SRR772434 1 0.1483 0.69273 0.944 0.000 0.036 0.000 0.012 0.008
#> SRR772435 6 0.7937 0.21278 0.104 0.240 0.004 0.032 0.244 0.376
#> SRR772436 6 0.6145 0.48442 0.184 0.088 0.000 0.000 0.132 0.596
#> SRR772437 3 0.0603 0.73543 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR772438 1 0.4552 0.61783 0.696 0.004 0.012 0.000 0.048 0.240
#> SRR772439 1 0.1844 0.69289 0.932 0.004 0.012 0.000 0.024 0.028
#> SRR772440 4 0.5934 0.47713 0.004 0.188 0.000 0.624 0.068 0.116
#> SRR772441 2 0.5414 0.13358 0.000 0.524 0.000 0.372 0.096 0.008
#> SRR772442 2 0.3645 0.56086 0.000 0.784 0.000 0.176 0.020 0.020
#> SRR772443 2 0.5075 0.34598 0.000 0.704 0.000 0.048 0.136 0.112
#> SRR772444 1 0.5798 0.60770 0.644 0.004 0.084 0.000 0.092 0.176
#> SRR772445 1 0.4101 0.69246 0.796 0.028 0.008 0.000 0.072 0.096
#> SRR772446 1 0.3219 0.67966 0.840 0.008 0.000 0.000 0.076 0.076
#> SRR772447 1 0.4824 0.61329 0.720 0.032 0.000 0.000 0.124 0.124
#> SRR772448 2 0.5342 0.56871 0.012 0.656 0.000 0.216 0.100 0.016
#> SRR772449 2 0.6488 0.22597 0.016 0.456 0.000 0.384 0.096 0.048
#> SRR772450 4 0.2778 0.66833 0.000 0.168 0.000 0.824 0.008 0.000
#> SRR772451 4 0.1594 0.67897 0.000 0.052 0.000 0.932 0.016 0.000
#> SRR772452 1 0.1893 0.68919 0.928 0.008 0.004 0.000 0.036 0.024
#> SRR772453 1 0.3336 0.69172 0.840 0.024 0.000 0.000 0.084 0.052
#> SRR772454 1 0.7167 0.14788 0.476 0.076 0.020 0.000 0.188 0.240
#> SRR772455 6 0.6468 0.46082 0.212 0.056 0.024 0.000 0.128 0.580
#> SRR772456 4 0.2112 0.66872 0.000 0.088 0.000 0.896 0.016 0.000
#> SRR772457 4 0.1686 0.67684 0.000 0.064 0.000 0.924 0.012 0.000
#> SRR772458 1 0.3380 0.69802 0.840 0.004 0.016 0.000 0.060 0.080
#> SRR772459 1 0.1857 0.69388 0.928 0.000 0.028 0.000 0.032 0.012
#> SRR772460 4 0.0146 0.67862 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0146 0.67862 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772462 4 0.3178 0.61611 0.000 0.176 0.000 0.804 0.016 0.004
#> SRR772463 4 0.2624 0.66786 0.000 0.124 0.000 0.856 0.020 0.000
#> SRR772464 3 0.0713 0.73819 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR772465 6 0.8031 0.29821 0.116 0.164 0.020 0.060 0.160 0.480
#> SRR772466 4 0.6363 0.22336 0.084 0.040 0.008 0.592 0.244 0.032
#> SRR772467 4 0.3298 0.64415 0.000 0.236 0.000 0.756 0.008 0.000
#> SRR772468 4 0.2019 0.66999 0.000 0.088 0.000 0.900 0.012 0.000
#> SRR772469 1 0.2706 0.69034 0.876 0.008 0.004 0.000 0.084 0.028
#> SRR772470 1 0.3543 0.68465 0.816 0.008 0.004 0.000 0.120 0.052
#> SRR772471 1 0.5931 0.59550 0.668 0.032 0.036 0.012 0.164 0.088
#> SRR772472 1 0.3791 0.65888 0.788 0.004 0.000 0.000 0.092 0.116
#> SRR772473 2 0.4715 0.56314 0.004 0.700 0.000 0.216 0.064 0.016
#> SRR772474 2 0.6399 0.40286 0.008 0.428 0.000 0.404 0.124 0.036
#> SRR772475 3 0.5678 0.33704 0.000 0.012 0.524 0.124 0.340 0.000
#> SRR772476 4 0.0363 0.68062 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.2165 0.67190 0.000 0.108 0.000 0.884 0.008 0.000
#> SRR772478 1 0.5833 0.52156 0.640 0.004 0.112 0.000 0.172 0.072
#> SRR772479 1 0.3219 0.68736 0.840 0.000 0.008 0.000 0.076 0.076
#> SRR772480 2 0.7878 -0.16211 0.224 0.412 0.000 0.064 0.220 0.080
#> SRR772481 2 0.7684 0.11463 0.088 0.496 0.000 0.156 0.156 0.104
#> SRR772482 5 0.8138 0.17871 0.196 0.080 0.144 0.000 0.420 0.160
#> SRR772483 1 0.7356 0.02968 0.472 0.064 0.048 0.000 0.256 0.160
#> SRR772484 4 0.3037 0.67067 0.000 0.176 0.000 0.808 0.016 0.000
#> SRR772485 4 0.2903 0.67003 0.036 0.036 0.000 0.872 0.056 0.000
#> SRR772486 1 0.3287 0.65648 0.820 0.008 0.016 0.000 0.008 0.148
#> SRR772487 1 0.1893 0.69437 0.928 0.004 0.008 0.000 0.024 0.036
#> SRR772488 4 0.2573 0.67520 0.000 0.064 0.000 0.884 0.044 0.008
#> SRR772489 4 0.4005 0.56501 0.000 0.192 0.000 0.748 0.056 0.004
#> SRR772490 6 0.5166 0.09537 0.400 0.012 0.000 0.000 0.060 0.528
#> SRR772491 1 0.4268 0.69537 0.804 0.016 0.040 0.008 0.080 0.052
#> SRR772492 4 0.3615 0.59277 0.000 0.292 0.000 0.700 0.008 0.000
#> SRR772493 4 0.3490 0.61539 0.000 0.268 0.000 0.724 0.008 0.000
#> SRR772494 4 0.2118 0.67157 0.000 0.104 0.000 0.888 0.008 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.67786 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 4 0.7165 -0.16136 0.012 0.324 0.000 0.420 0.160 0.084
#> SRR772497 4 0.8151 -0.25622 0.088 0.260 0.020 0.400 0.188 0.044
#> SRR772498 2 0.8676 -0.30391 0.004 0.272 0.100 0.120 0.236 0.268
#> SRR772499 4 0.8474 -0.32116 0.004 0.196 0.148 0.352 0.228 0.072
#> SRR772500 4 0.4825 0.62060 0.020 0.160 0.000 0.728 0.076 0.016
#> SRR772501 4 0.1713 0.67950 0.000 0.044 0.000 0.928 0.028 0.000
#> SRR772502 6 0.7792 0.34076 0.216 0.108 0.056 0.008 0.136 0.476
#> SRR772503 6 0.5794 0.50004 0.176 0.056 0.008 0.008 0.092 0.660
#> SRR772504 4 0.3725 0.56808 0.000 0.316 0.000 0.676 0.008 0.000
#> SRR772505 4 0.2094 0.67189 0.000 0.080 0.000 0.900 0.020 0.000
#> SRR772506 4 0.1594 0.67715 0.000 0.052 0.000 0.932 0.016 0.000
#> SRR772507 4 0.1867 0.67579 0.000 0.064 0.000 0.916 0.020 0.000
#> SRR772508 4 0.3862 0.40835 0.000 0.388 0.000 0.608 0.004 0.000
#> SRR772509 3 0.3940 0.56797 0.000 0.004 0.652 0.008 0.336 0.000
#> SRR772510 3 0.1444 0.71017 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR772511 3 0.8902 -0.37323 0.044 0.264 0.300 0.044 0.188 0.160
#> SRR772512 3 0.4511 0.10805 0.000 0.000 0.620 0.332 0.048 0.000
#> SRR772513 4 0.6190 0.36441 0.000 0.252 0.000 0.544 0.160 0.044
#> SRR772514 4 0.1838 0.67908 0.000 0.068 0.000 0.916 0.016 0.000
#> SRR772515 4 0.2257 0.67010 0.000 0.048 0.000 0.904 0.040 0.008
#> SRR772516 4 0.3835 0.59307 0.000 0.300 0.000 0.684 0.016 0.000
#> SRR772517 4 0.3984 0.30825 0.000 0.336 0.000 0.648 0.016 0.000
#> SRR772518 4 0.6398 0.14501 0.000 0.376 0.000 0.452 0.100 0.072
#> SRR772519 4 0.3062 0.66294 0.000 0.144 0.000 0.824 0.032 0.000
#> SRR772520 4 0.1605 0.67785 0.000 0.012 0.000 0.940 0.032 0.016
#> SRR772521 6 0.5592 0.41644 0.292 0.028 0.012 0.000 0.068 0.600
#> SRR772522 1 0.6027 0.48152 0.584 0.016 0.044 0.000 0.084 0.272
#> SRR772523 4 0.5098 -0.17237 0.000 0.424 0.000 0.512 0.052 0.012
#> SRR772524 4 0.5216 0.42726 0.000 0.360 0.000 0.560 0.064 0.016
#> SRR772525 3 0.3944 0.06011 0.428 0.000 0.568 0.000 0.000 0.004
#> SRR772526 4 0.0000 0.67786 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 4 0.0146 0.67862 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.4237 0.63915 0.144 0.000 0.736 0.000 0.120 0.000
#> SRR772529 6 0.7554 0.37905 0.220 0.052 0.052 0.012 0.180 0.484
#> SRR772530 1 0.4447 0.60865 0.704 0.008 0.000 0.000 0.064 0.224
#> SRR772531 3 0.3390 0.38722 0.296 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000
#> SRR772532 4 0.0725 0.68030 0.000 0.012 0.000 0.976 0.012 0.000
#> SRR772533 4 0.1500 0.68442 0.000 0.052 0.000 0.936 0.012 0.000
#> SRR772534 6 0.7085 0.36665 0.284 0.048 0.068 0.008 0.080 0.512
#> SRR772535 6 0.6824 0.11739 0.000 0.340 0.000 0.128 0.100 0.432
#> SRR772536 4 0.1531 0.67648 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004 0.000
#> SRR772537 4 0.0146 0.67868 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772538 4 0.2473 0.66980 0.000 0.136 0.000 0.856 0.008 0.000
#> SRR772539 6 0.3930 0.51124 0.104 0.040 0.000 0.000 0.056 0.800
#> SRR772540 6 0.7438 0.22823 0.196 0.156 0.012 0.000 0.184 0.452
#> SRR772541 2 0.4888 0.57309 0.000 0.704 0.000 0.188 0.048 0.060
#> SRR772542 1 0.4297 0.56931 0.680 0.008 0.004 0.000 0.024 0.284
#> SRR772543 1 0.4995 0.53001 0.660 0.016 0.000 0.000 0.088 0.236
#> SRR772544 3 0.0632 0.73829 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.6184 0.16263 0.544 0.004 0.248 0.004 0.180 0.020
#> SRR772546 1 0.6812 -0.05352 0.436 0.012 0.296 0.000 0.224 0.032
#> SRR772547 1 0.7193 0.02069 0.456 0.068 0.020 0.000 0.196 0.260
#> SRR772548 1 0.6963 0.30175 0.504 0.016 0.072 0.000 0.184 0.224
#> SRR772549 1 0.2036 0.69101 0.912 0.000 0.008 0.000 0.064 0.016
#> SRR772550 1 0.1434 0.68989 0.948 0.000 0.008 0.000 0.020 0.024
#> SRR772551 6 0.6548 0.33720 0.012 0.156 0.000 0.080 0.180 0.572
#> SRR772552 6 0.6719 0.13334 0.008 0.368 0.000 0.036 0.184 0.404
#> SRR772553 3 0.3789 0.57737 0.000 0.000 0.660 0.008 0.332 0.000
#> SRR772554 4 0.2257 0.67275 0.000 0.116 0.000 0.876 0.008 0.000
#> SRR772555 4 0.3293 0.66078 0.000 0.140 0.000 0.812 0.048 0.000
#> SRR772556 1 0.6204 0.43484 0.532 0.008 0.052 0.000 0.092 0.316
#> SRR772557 1 0.5424 0.64483 0.680 0.000 0.084 0.000 0.100 0.136
#> SRR772558 6 0.6057 0.47576 0.128 0.088 0.000 0.000 0.176 0.608
#> SRR772559 1 0.3652 0.62742 0.760 0.008 0.000 0.000 0.020 0.212
#> SRR772560 6 0.5564 0.39001 0.012 0.260 0.000 0.004 0.128 0.596
#> SRR772561 3 0.0937 0.71616 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR772562 4 0.3699 0.58099 0.000 0.160 0.000 0.788 0.040 0.012
#> SRR772563 4 0.2961 0.66048 0.012 0.048 0.000 0.876 0.044 0.020
#> SRR772564 1 0.2724 0.69200 0.876 0.000 0.076 0.000 0.016 0.032
#> SRR772565 1 0.3176 0.70042 0.860 0.004 0.048 0.000 0.032 0.056
#> SRR772566 1 0.2760 0.68249 0.868 0.004 0.016 0.000 0.012 0.100
#> SRR772567 1 0.1760 0.69015 0.936 0.004 0.012 0.000 0.028 0.020
#> SRR772568 4 0.3058 0.67504 0.000 0.104 0.000 0.848 0.036 0.012
#> SRR772569 4 0.0458 0.67851 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR772570 3 0.5903 0.09660 0.360 0.008 0.512 0.000 0.100 0.020
#> SRR772571 1 0.4148 0.67354 0.796 0.024 0.004 0.008 0.104 0.064
#> SRR772572 1 0.2643 0.67693 0.856 0.000 0.008 0.000 0.008 0.128
#> SRR772573 1 0.2433 0.69266 0.888 0.004 0.004 0.000 0.020 0.084
#> SRR772574 1 0.3424 0.68624 0.828 0.012 0.000 0.000 0.080 0.080
#> SRR772575 6 0.5873 0.41325 0.044 0.136 0.000 0.000 0.224 0.596
#> SRR772576 4 0.5092 0.25878 0.000 0.448 0.000 0.492 0.044 0.016
#> SRR772577 4 0.5571 -0.28483 0.020 0.432 0.000 0.468 0.080 0.000
#> SRR772578 4 0.6697 0.17351 0.000 0.192 0.000 0.508 0.084 0.216
#> SRR772579 4 0.4419 0.36909 0.000 0.408 0.000 0.568 0.016 0.008
#> SRR772580 3 0.1204 0.72446 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR772581 6 0.5240 0.45737 0.256 0.028 0.000 0.000 0.080 0.636
#> SRR772582 6 0.6661 0.23357 0.008 0.284 0.000 0.044 0.180 0.484
#> SRR772583 1 0.8935 -0.48544 0.264 0.240 0.008 0.156 0.220 0.112
#> SRR772584 2 0.7705 0.14376 0.020 0.420 0.000 0.180 0.172 0.208
#> SRR772585 2 0.4930 0.52699 0.000 0.588 0.000 0.352 0.044 0.016
#> SRR772586 3 0.4121 0.55438 0.220 0.000 0.720 0.000 0.060 0.000
#> SRR772587 1 0.3590 0.68765 0.836 0.012 0.072 0.000 0.056 0.024
#> SRR772588 4 0.1686 0.67759 0.000 0.064 0.000 0.924 0.012 0.000
#> SRR772589 4 0.2070 0.67039 0.000 0.092 0.000 0.896 0.012 0.000
#> SRR772590 3 0.0458 0.73639 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.2816 0.68605 0.868 0.000 0.024 0.000 0.020 0.088
#> SRR772592 1 0.2159 0.68983 0.904 0.000 0.012 0.000 0.012 0.072
#> SRR772593 3 0.3718 0.69104 0.084 0.000 0.784 0.000 0.132 0.000
#> SRR772594 4 0.3916 0.25541 0.000 0.300 0.000 0.680 0.020 0.000
#> SRR772595 4 0.3652 0.18693 0.000 0.324 0.000 0.672 0.000 0.004
#> SRR772596 3 0.3655 0.68918 0.096 0.000 0.792 0.000 0.112 0.000
#> SRR772597 3 0.1297 0.72988 0.040 0.000 0.948 0.000 0.000 0.012
#> SRR772598 6 0.5821 0.42078 0.240 0.008 0.080 0.000 0.056 0.616
#> SRR772599 1 0.3569 0.67770 0.828 0.000 0.036 0.000 0.080 0.056
#> SRR772600 2 0.4134 0.51856 0.000 0.656 0.000 0.316 0.028 0.000
#> SRR772601 2 0.3281 0.55262 0.000 0.784 0.000 0.200 0.012 0.004
#> SRR772602 3 0.0547 0.73748 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.5123 0.55942 0.000 0.668 0.000 0.212 0.092 0.028
#> SRR772604 2 0.4174 0.54184 0.004 0.772 0.000 0.144 0.060 0.020
#> SRR772605 6 0.5983 0.16277 0.000 0.400 0.000 0.012 0.156 0.432
#> SRR772606 1 0.5150 0.55399 0.656 0.016 0.032 0.000 0.036 0.260
#> SRR772607 1 0.4655 0.56789 0.680 0.008 0.008 0.000 0.048 0.256
#> SRR772608 4 0.4274 0.60339 0.000 0.112 0.004 0.780 0.064 0.040
#> SRR772609 2 0.6455 0.50614 0.048 0.564 0.000 0.252 0.108 0.028
#> SRR772610 4 0.3190 0.65231 0.000 0.220 0.000 0.772 0.008 0.000
#> SRR772611 4 0.4779 0.59646 0.000 0.260 0.004 0.668 0.056 0.012
#> SRR772612 2 0.6565 0.43419 0.000 0.416 0.000 0.376 0.052 0.156
#> SRR772613 2 0.4322 0.34276 0.000 0.528 0.000 0.452 0.020 0.000
#> SRR772614 1 0.3047 0.69481 0.872 0.012 0.036 0.000 0.052 0.028
#> SRR772615 1 0.1268 0.68828 0.952 0.000 0.008 0.000 0.036 0.004
#> SRR772616 6 0.4713 0.50696 0.116 0.028 0.016 0.000 0.088 0.752
#> SRR772617 2 0.3756 0.23009 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR772618 2 0.4760 0.36165 0.000 0.520 0.000 0.436 0.040 0.004
#> SRR772619 4 0.3508 0.58915 0.000 0.292 0.000 0.704 0.004 0.000
#> SRR772620 4 0.1610 0.67591 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR772621 4 0.5654 0.53678 0.004 0.156 0.004 0.660 0.132 0.044
#> SRR772622 4 0.8600 -0.20870 0.084 0.196 0.016 0.356 0.244 0.104
#> SRR772623 1 0.4093 0.27528 0.552 0.000 0.440 0.000 0.004 0.004
#> SRR772624 3 0.4749 0.47043 0.260 0.000 0.648 0.000 0.092 0.000
#> SRR772625 4 0.6688 -0.06967 0.000 0.080 0.136 0.452 0.332 0.000
#> SRR772626 2 0.7876 0.22255 0.112 0.484 0.004 0.144 0.168 0.088
#> SRR772627 4 0.4969 -0.19742 0.000 0.436 0.000 0.508 0.048 0.008
#> SRR772628 1 0.3221 0.68937 0.844 0.008 0.004 0.000 0.092 0.052
#> SRR772629 1 0.4564 0.57374 0.684 0.008 0.020 0.000 0.024 0.264
#> SRR772630 1 0.6815 0.17557 0.480 0.036 0.060 0.000 0.088 0.336
#> SRR772631 3 0.4149 0.65333 0.064 0.000 0.720 0.000 0.216 0.000
#> SRR772632 4 0.0291 0.67806 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772633 4 0.2070 0.67261 0.000 0.100 0.000 0.892 0.008 0.000
#> SRR772634 1 0.7000 0.30125 0.488 0.016 0.064 0.000 0.216 0.216
#> SRR772635 2 0.8647 -0.17922 0.088 0.328 0.040 0.220 0.272 0.052
#> SRR772636 4 0.5742 0.30444 0.000 0.076 0.056 0.584 0.284 0.000
#> SRR772637 1 0.3110 0.68077 0.848 0.008 0.000 0.000 0.072 0.072
#> SRR772638 1 0.2002 0.69394 0.916 0.000 0.008 0.000 0.056 0.020
#> SRR772639 4 0.3632 0.66109 0.000 0.088 0.012 0.828 0.056 0.016
#> SRR772640 4 0.1625 0.67608 0.000 0.060 0.000 0.928 0.012 0.000
#> SRR772641 4 0.3023 0.65437 0.000 0.212 0.000 0.784 0.004 0.000
#> SRR772642 6 0.6858 0.27436 0.072 0.028 0.068 0.020 0.260 0.552
#> SRR772643 4 0.4135 0.63315 0.000 0.156 0.000 0.760 0.072 0.012
#> SRR772644 1 0.7207 0.02897 0.416 0.020 0.088 0.000 0.132 0.344
#> SRR772645 1 0.6344 0.52329 0.640 0.036 0.148 0.012 0.116 0.048
#> SRR772646 4 0.0363 0.67922 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772647 4 0.2894 0.67085 0.000 0.108 0.000 0.852 0.036 0.004
#> SRR772648 4 0.7664 0.04737 0.120 0.092 0.000 0.480 0.220 0.088
#> SRR772649 4 0.9090 -0.30832 0.040 0.176 0.148 0.304 0.252 0.080
#> SRR772650 6 0.8215 0.08886 0.228 0.164 0.028 0.004 0.272 0.304
#> SRR772651 6 0.6035 0.16687 0.368 0.016 0.012 0.000 0.112 0.492
#> SRR772652 1 0.5770 0.61998 0.676 0.028 0.104 0.004 0.040 0.148
#> SRR772653 1 0.5557 0.44623 0.584 0.012 0.052 0.000 0.032 0.320
#> SRR772654 6 0.7714 0.26537 0.160 0.052 0.008 0.132 0.148 0.500
#> SRR772655 6 0.7467 0.25306 0.060 0.060 0.024 0.156 0.156 0.544
#> SRR772656 3 0.1273 0.72747 0.012 0.004 0.960 0.004 0.008 0.012
#> SRR772657 3 0.0363 0.72421 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772658 4 0.2553 0.66957 0.000 0.144 0.000 0.848 0.008 0.000
#> SRR772659 2 0.4072 0.20928 0.000 0.544 0.000 0.448 0.008 0.000
#> SRR772660 2 0.7696 0.13931 0.048 0.476 0.020 0.096 0.264 0.096
#> SRR772661 3 0.3565 0.61093 0.004 0.000 0.692 0.000 0.304 0.000
#> SRR772662 2 0.6938 0.07765 0.128 0.552 0.000 0.032 0.192 0.096
#> SRR772663 2 0.8262 0.02024 0.020 0.432 0.072 0.100 0.228 0.148
#> SRR772664 4 0.3692 0.59666 0.000 0.040 0.008 0.816 0.116 0.020
#> SRR772665 4 0.5279 0.40531 0.020 0.036 0.000 0.708 0.128 0.108
#> SRR772666 3 0.0713 0.73819 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR772667 2 0.4556 0.44557 0.000 0.624 0.000 0.336 0.024 0.016
#> SRR772668 2 0.3942 0.33805 0.000 0.624 0.000 0.368 0.004 0.004
#> SRR772669 2 0.3942 0.33805 0.000 0.624 0.000 0.368 0.004 0.004
#> SRR772670 6 0.6299 0.43148 0.204 0.024 0.024 0.000 0.176 0.572
#> SRR772671 6 0.5760 0.43635 0.028 0.192 0.000 0.000 0.180 0.600
#> SRR772672 4 0.5076 -0.36809 0.004 0.460 0.000 0.472 0.064 0.000
#> SRR772673 2 0.6014 0.52501 0.000 0.612 0.000 0.180 0.120 0.088
#> SRR772674 3 0.0865 0.73567 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.3547 0.58596 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR772676 1 0.6777 0.41332 0.548 0.020 0.088 0.020 0.056 0.268
#> SRR772677 1 0.5701 0.55370 0.648 0.012 0.180 0.000 0.124 0.036
#> SRR772678 3 0.3499 0.59652 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR772679 4 0.7340 -0.35862 0.004 0.328 0.000 0.360 0.204 0.104
#> SRR772680 6 0.5104 0.49767 0.116 0.032 0.008 0.000 0.136 0.708
#> SRR772681 3 0.0632 0.73829 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR772682 4 0.3133 0.51096 0.000 0.212 0.000 0.780 0.008 0.000
#> SRR772683 4 0.4853 0.51722 0.000 0.248 0.000 0.668 0.064 0.020
#> SRR772685 4 0.1918 0.67522 0.000 0.088 0.000 0.904 0.008 0.000
#> SRR772686 3 0.0713 0.73819 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR772687 1 0.2933 0.60720 0.796 0.000 0.200 0.000 0.004 0.000
#> SRR772688 4 0.2531 0.67043 0.000 0.132 0.000 0.856 0.012 0.000
#> SRR772689 4 0.3245 0.61223 0.000 0.228 0.000 0.764 0.008 0.000
#> SRR772690 3 0.0713 0.73819 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000
#> SRR772691 3 0.6084 0.20129 0.000 0.016 0.472 0.172 0.340 0.000
#> SRR772692 2 0.7018 -0.36987 0.072 0.396 0.004 0.012 0.124 0.392
#> SRR772693 4 0.7009 0.12097 0.012 0.120 0.036 0.476 0.324 0.032
#> SRR772694 4 0.2760 0.67253 0.000 0.116 0.000 0.856 0.024 0.004
#> SRR772695 2 0.7079 -0.02017 0.000 0.396 0.000 0.088 0.204 0.312
#> SRR772696 2 0.6191 0.44656 0.004 0.524 0.024 0.328 0.108 0.012
#> SRR772697 4 0.5776 0.40911 0.004 0.344 0.000 0.544 0.060 0.048
#> SRR772698 3 0.3834 0.68562 0.084 0.000 0.772 0.000 0.144 0.000
#> SRR772699 6 0.5440 -0.11462 0.452 0.008 0.012 0.000 0.060 0.468
#> SRR772700 6 0.5980 0.46983 0.136 0.080 0.000 0.000 0.168 0.616
#> SRR772701 1 0.5860 0.22958 0.480 0.024 0.004 0.000 0.092 0.400
#> SRR772702 1 0.4228 0.67653 0.768 0.016 0.012 0.000 0.048 0.156
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.291 0.721 0.845 0.3700 0.667 0.667
#> 3 3 0.172 0.593 0.725 0.5011 0.739 0.625
#> 4 4 0.238 0.315 0.624 0.1948 0.841 0.688
#> 5 5 0.306 0.384 0.607 0.1013 0.763 0.485
#> 6 6 0.347 0.373 0.597 0.0528 0.837 0.551
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 2 0.9491 0.5704 0.368 0.632
#> SRR772342 1 0.9922 0.1779 0.552 0.448
#> SRR772343 2 0.7674 0.7820 0.224 0.776
#> SRR772344 2 0.2043 0.8419 0.032 0.968
#> SRR772345 2 0.4690 0.8404 0.100 0.900
#> SRR772346 2 0.7883 0.7758 0.236 0.764
#> SRR772347 2 0.8327 0.7351 0.264 0.736
#> SRR772348 2 0.1414 0.8331 0.020 0.980
#> SRR772349 2 0.1414 0.8368 0.020 0.980
#> SRR772350 1 0.0672 0.7788 0.992 0.008
#> SRR772351 2 0.1633 0.8320 0.024 0.976
#> SRR772352 2 0.6343 0.8304 0.160 0.840
#> SRR772353 2 0.7453 0.7921 0.212 0.788
#> SRR772354 2 0.5178 0.8457 0.116 0.884
#> SRR772355 2 0.4022 0.8472 0.080 0.920
#> SRR772356 2 0.4562 0.8404 0.096 0.904
#> SRR772357 2 0.5178 0.8089 0.116 0.884
#> SRR772358 2 0.8499 0.7156 0.276 0.724
#> SRR772359 1 0.9933 0.0563 0.548 0.452
#> SRR772360 2 0.7453 0.7830 0.212 0.788
#> SRR772361 1 0.1184 0.7805 0.984 0.016
#> SRR772362 2 0.0376 0.8287 0.004 0.996
#> SRR772363 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772364 2 0.3114 0.8444 0.056 0.944
#> SRR772365 2 0.4298 0.8484 0.088 0.912
#> SRR772366 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0672 0.7773 0.992 0.008
#> SRR772368 2 0.1414 0.8383 0.020 0.980
#> SRR772369 2 0.7815 0.7729 0.232 0.768
#> SRR772370 2 0.5629 0.7944 0.132 0.868
#> SRR772371 2 0.9286 0.6228 0.344 0.656
#> SRR772372 2 0.7745 0.7720 0.228 0.772
#> SRR772373 2 0.3733 0.8495 0.072 0.928
#> SRR772374 2 0.3114 0.8307 0.056 0.944
#> SRR772375 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.1633 0.8385 0.024 0.976
#> SRR772377 1 0.8861 0.6385 0.696 0.304
#> SRR772378 2 0.6801 0.8205 0.180 0.820
#> SRR772379 2 0.1633 0.8404 0.024 0.976
#> SRR772380 2 0.6438 0.8262 0.164 0.836
#> SRR772381 1 0.3431 0.7682 0.936 0.064
#> SRR772382 2 0.8267 0.7524 0.260 0.740
#> SRR772383 2 0.9866 0.3379 0.432 0.568
#> SRR772384 2 0.9896 0.1453 0.440 0.560
#> SRR772385 2 0.9998 0.1796 0.492 0.508
#> SRR772386 2 0.5059 0.8365 0.112 0.888
#> SRR772387 2 0.4298 0.8277 0.088 0.912
#> SRR772388 1 0.2778 0.7777 0.952 0.048
#> SRR772389 1 0.0376 0.7800 0.996 0.004
#> SRR772390 1 0.0672 0.7782 0.992 0.008
#> SRR772391 1 0.9998 -0.0869 0.508 0.492
#> SRR772392 2 0.9608 0.4866 0.384 0.616
#> SRR772393 2 0.5294 0.8405 0.120 0.880
#> SRR772394 2 0.4022 0.8504 0.080 0.920
#> SRR772395 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772396 2 0.9815 0.4060 0.420 0.580
#> SRR772397 2 0.9993 0.1943 0.484 0.516
#> SRR772398 1 0.7950 0.7060 0.760 0.240
#> SRR772399 2 0.8386 0.6431 0.268 0.732
#> SRR772400 1 0.9775 0.3915 0.588 0.412
#> SRR772401 2 0.9775 0.3597 0.412 0.588
#> SRR772402 2 0.3879 0.8473 0.076 0.924
#> SRR772403 2 0.4298 0.8436 0.088 0.912
#> SRR772404 2 0.4298 0.8455 0.088 0.912
#> SRR772405 1 0.9977 0.2797 0.528 0.472
#> SRR772406 2 0.1843 0.8368 0.028 0.972
#> SRR772407 2 0.4298 0.8496 0.088 0.912
#> SRR772408 2 0.0672 0.8282 0.008 0.992
#> SRR772409 2 0.0938 0.8345 0.012 0.988
#> SRR772410 2 0.5178 0.7930 0.116 0.884
#> SRR772411 2 0.5408 0.8355 0.124 0.876
#> SRR772412 2 0.9710 0.4789 0.400 0.600
#> SRR772413 1 0.9909 0.1576 0.556 0.444
#> SRR772414 1 0.2043 0.7780 0.968 0.032
#> SRR772415 2 0.1184 0.8315 0.016 0.984
#> SRR772416 2 0.6148 0.8313 0.152 0.848
#> SRR772417 2 0.7602 0.7805 0.220 0.780
#> SRR772418 1 0.0376 0.7781 0.996 0.004
#> SRR772419 2 0.1633 0.8368 0.024 0.976
#> SRR772420 2 0.4939 0.8383 0.108 0.892
#> SRR772421 2 0.4298 0.8423 0.088 0.912
#> SRR772422 2 0.6887 0.8135 0.184 0.816
#> SRR772423 2 0.4562 0.8405 0.096 0.904
#> SRR772424 2 0.1633 0.8403 0.024 0.976
#> SRR772425 2 0.6148 0.8311 0.152 0.848
#> SRR772426 2 0.0938 0.8290 0.012 0.988
#> SRR772427 2 0.0672 0.8282 0.008 0.992
#> SRR772428 2 0.9460 0.5139 0.364 0.636
#> SRR772429 2 0.9460 0.5682 0.364 0.636
#> SRR772430 2 0.5408 0.8443 0.124 0.876
#> SRR772431 2 0.4161 0.8430 0.084 0.916
#> SRR772432 2 0.4431 0.8439 0.092 0.908
#> SRR772433 1 0.8909 0.5660 0.692 0.308
#> SRR772434 1 0.8144 0.6702 0.748 0.252
#> SRR772435 2 0.7376 0.8034 0.208 0.792
#> SRR772436 2 0.5946 0.8313 0.144 0.856
#> SRR772437 1 0.4161 0.7695 0.916 0.084
#> SRR772438 2 0.9635 0.4060 0.388 0.612
#> SRR772439 1 0.9998 -0.0654 0.508 0.492
#> SRR772440 2 0.2236 0.8441 0.036 0.964
#> SRR772441 2 0.3584 0.8468 0.068 0.932
#> SRR772442 2 0.4022 0.8420 0.080 0.920
#> SRR772443 2 0.4431 0.8417 0.092 0.908
#> SRR772444 2 0.8763 0.5441 0.296 0.704
#> SRR772445 2 0.8144 0.7451 0.252 0.748
#> SRR772446 2 0.8955 0.6764 0.312 0.688
#> SRR772447 2 0.6623 0.8208 0.172 0.828
#> SRR772448 2 0.4690 0.8420 0.100 0.900
#> SRR772449 2 0.3114 0.8469 0.056 0.944
#> SRR772450 2 0.0376 0.8301 0.004 0.996
#> SRR772451 2 0.2603 0.8441 0.044 0.956
#> SRR772452 2 0.9970 0.2446 0.468 0.532
#> SRR772453 1 0.9732 0.3149 0.596 0.404
#> SRR772454 2 0.6438 0.8219 0.164 0.836
#> SRR772455 2 0.6887 0.8071 0.184 0.816
#> SRR772456 2 0.2423 0.8432 0.040 0.960
#> SRR772457 2 0.3431 0.8441 0.064 0.936
#> SRR772458 1 0.8608 0.6103 0.716 0.284
#> SRR772459 1 0.9996 -0.0706 0.512 0.488
#> SRR772460 2 0.0938 0.8321 0.012 0.988
#> SRR772461 2 0.0376 0.8308 0.004 0.996
#> SRR772462 2 0.4815 0.8405 0.104 0.896
#> SRR772463 2 0.3431 0.8443 0.064 0.936
#> SRR772464 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.7674 0.7058 0.224 0.776
#> SRR772466 2 0.6712 0.7693 0.176 0.824
#> SRR772467 2 0.3431 0.8441 0.064 0.936
#> SRR772468 2 0.3879 0.8421 0.076 0.924
#> SRR772469 2 0.7745 0.7396 0.228 0.772
#> SRR772470 2 0.7745 0.6959 0.228 0.772
#> SRR772471 2 0.9635 0.5081 0.388 0.612
#> SRR772472 2 0.8555 0.7158 0.280 0.720
#> SRR772473 2 0.6148 0.8315 0.152 0.848
#> SRR772474 2 0.3733 0.8483 0.072 0.928
#> SRR772475 2 0.9686 0.2724 0.396 0.604
#> SRR772476 2 0.0938 0.8337 0.012 0.988
#> SRR772477 2 0.0938 0.8296 0.012 0.988
#> SRR772478 2 0.9815 0.4213 0.420 0.580
#> SRR772479 1 0.9970 0.0599 0.532 0.468
#> SRR772480 2 0.5059 0.8423 0.112 0.888
#> SRR772481 2 0.1633 0.8332 0.024 0.976
#> SRR772482 2 0.9866 0.3909 0.432 0.568
#> SRR772483 2 0.9286 0.6204 0.344 0.656
#> SRR772484 2 0.0672 0.8336 0.008 0.992
#> SRR772485 2 0.5059 0.8386 0.112 0.888
#> SRR772486 1 0.5842 0.7466 0.860 0.140
#> SRR772487 2 0.9248 0.6127 0.340 0.660
#> SRR772488 2 0.0672 0.8330 0.008 0.992
#> SRR772489 2 0.5294 0.8399 0.120 0.880
#> SRR772490 1 0.9922 0.1418 0.552 0.448
#> SRR772491 2 0.9393 0.5709 0.356 0.644
#> SRR772492 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0672 0.8282 0.008 0.992
#> SRR772495 2 0.0672 0.8282 0.008 0.992
#> SRR772496 2 0.4562 0.8472 0.096 0.904
#> SRR772497 2 0.6343 0.8304 0.160 0.840
#> SRR772498 2 0.6048 0.8148 0.148 0.852
#> SRR772499 2 0.4939 0.8134 0.108 0.892
#> SRR772500 2 0.4022 0.8474 0.080 0.920
#> SRR772501 2 0.4161 0.8416 0.084 0.916
#> SRR772502 2 0.1184 0.8321 0.016 0.984
#> SRR772503 2 0.4298 0.8446 0.088 0.912
#> SRR772504 2 0.3584 0.8433 0.068 0.932
#> SRR772505 2 0.4690 0.8403 0.100 0.900
#> SRR772506 2 0.3879 0.8423 0.076 0.924
#> SRR772507 2 0.1414 0.8375 0.020 0.980
#> SRR772508 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR772509 2 0.9754 0.2289 0.408 0.592
#> SRR772510 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.6438 0.8227 0.164 0.836
#> SRR772512 2 0.8081 0.6687 0.248 0.752
#> SRR772513 2 0.6531 0.8259 0.168 0.832
#> SRR772514 2 0.3733 0.8449 0.072 0.928
#> SRR772515 2 0.2423 0.8448 0.040 0.960
#> SRR772516 2 0.5519 0.8377 0.128 0.872
#> SRR772517 2 0.3274 0.8443 0.060 0.940
#> SRR772518 2 0.2043 0.8318 0.032 0.968
#> SRR772519 2 0.2043 0.8329 0.032 0.968
#> SRR772520 2 0.1633 0.8353 0.024 0.976
#> SRR772521 2 0.5519 0.8375 0.128 0.872
#> SRR772522 2 0.7528 0.7876 0.216 0.784
#> SRR772523 2 0.5059 0.8377 0.112 0.888
#> SRR772524 2 0.3431 0.8453 0.064 0.936
#> SRR772525 1 0.0672 0.7788 0.992 0.008
#> SRR772526 2 0.0672 0.8324 0.008 0.992
#> SRR772527 2 0.1414 0.8328 0.020 0.980
#> SRR772528 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772529 2 0.9044 0.6436 0.320 0.680
#> SRR772530 2 0.9000 0.6542 0.316 0.684
#> SRR772531 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0938 0.8345 0.012 0.988
#> SRR772533 2 0.2043 0.8422 0.032 0.968
#> SRR772534 2 0.6887 0.8121 0.184 0.816
#> SRR772535 2 0.0938 0.8296 0.012 0.988
#> SRR772536 2 0.1843 0.8380 0.028 0.972
#> SRR772537 2 0.1843 0.8381 0.028 0.972
#> SRR772538 2 0.0376 0.8287 0.004 0.996
#> SRR772539 2 0.6887 0.8131 0.184 0.816
#> SRR772540 2 0.6712 0.8151 0.176 0.824
#> SRR772541 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772542 2 0.9988 0.1652 0.480 0.520
#> SRR772543 1 0.9970 0.0903 0.532 0.468
#> SRR772544 1 0.0938 0.7803 0.988 0.012
#> SRR772545 2 0.9983 0.2672 0.476 0.524
#> SRR772546 2 0.9522 0.4158 0.372 0.628
#> SRR772547 2 0.8081 0.7522 0.248 0.752
#> SRR772548 2 0.8763 0.6402 0.296 0.704
#> SRR772549 1 0.8016 0.6570 0.756 0.244
#> SRR772550 1 0.9635 0.3951 0.612 0.388
#> SRR772551 2 0.4298 0.8466 0.088 0.912
#> SRR772552 2 0.1843 0.8424 0.028 0.972
#> SRR772553 2 0.9954 0.2498 0.460 0.540
#> SRR772554 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.1843 0.8322 0.028 0.972
#> SRR772556 2 0.6887 0.8073 0.184 0.816
#> SRR772557 2 0.9954 0.0127 0.460 0.540
#> SRR772558 2 0.2423 0.8398 0.040 0.960
#> SRR772559 2 0.9323 0.6057 0.348 0.652
#> SRR772560 2 0.5178 0.8368 0.116 0.884
#> SRR772561 1 0.6712 0.7381 0.824 0.176
#> SRR772562 2 0.3584 0.8480 0.068 0.932
#> SRR772563 2 0.2778 0.8457 0.048 0.952
#> SRR772564 1 0.7376 0.6862 0.792 0.208
#> SRR772565 2 0.9977 0.2736 0.472 0.528
#> SRR772566 1 0.1414 0.7806 0.980 0.020
#> SRR772567 1 0.3431 0.7721 0.936 0.064
#> SRR772568 2 0.0672 0.8282 0.008 0.992
#> SRR772569 2 0.2236 0.8440 0.036 0.964
#> SRR772570 1 0.9580 0.5322 0.620 0.380
#> SRR772571 2 0.6531 0.8241 0.168 0.832
#> SRR772572 1 0.9686 0.4256 0.604 0.396
#> SRR772573 1 0.9552 0.4009 0.624 0.376
#> SRR772574 2 0.9710 0.4726 0.400 0.600
#> SRR772575 2 0.8443 0.7142 0.272 0.728
#> SRR772576 2 0.4562 0.8389 0.096 0.904
#> SRR772577 2 0.4562 0.8391 0.096 0.904
#> SRR772578 2 0.1633 0.8337 0.024 0.976
#> SRR772579 2 0.0376 0.8304 0.004 0.996
#> SRR772580 1 0.0672 0.7788 0.992 0.008
#> SRR772581 2 0.2236 0.8380 0.036 0.964
#> SRR772582 2 0.0938 0.8334 0.012 0.988
#> SRR772583 2 0.7453 0.7962 0.212 0.788
#> SRR772584 2 0.1184 0.8316 0.016 0.984
#> SRR772585 2 0.6048 0.8358 0.148 0.852
#> SRR772586 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.7139 0.7015 0.804 0.196
#> SRR772588 2 0.1184 0.8368 0.016 0.984
#> SRR772589 2 0.4562 0.8418 0.096 0.904
#> SRR772590 1 0.3114 0.7569 0.944 0.056
#> SRR772591 1 0.6048 0.7406 0.852 0.148
#> SRR772592 1 0.6048 0.7350 0.852 0.148
#> SRR772593 1 0.3584 0.7452 0.932 0.068
#> SRR772594 2 0.2423 0.8443 0.040 0.960
#> SRR772595 2 0.1414 0.8369 0.020 0.980
#> SRR772596 1 0.0938 0.7766 0.988 0.012
#> SRR772597 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.9970 0.3027 0.532 0.468
#> SRR772599 2 0.9996 0.1999 0.488 0.512
#> SRR772600 2 0.4815 0.8383 0.104 0.896
#> SRR772601 2 0.4161 0.8415 0.084 0.916
#> SRR772602 1 0.1414 0.7774 0.980 0.020
#> SRR772603 2 0.4562 0.8419 0.096 0.904
#> SRR772604 2 0.4690 0.8381 0.100 0.900
#> SRR772605 2 0.2236 0.8351 0.036 0.964
#> SRR772606 2 0.8763 0.7001 0.296 0.704
#> SRR772607 2 1.0000 0.2074 0.496 0.504
#> SRR772608 2 0.4022 0.8508 0.080 0.920
#> SRR772609 2 0.4815 0.8388 0.104 0.896
#> SRR772610 2 0.1414 0.8349 0.020 0.980
#> SRR772611 2 0.1414 0.8308 0.020 0.980
#> SRR772612 2 0.4298 0.8457 0.088 0.912
#> SRR772613 2 0.1184 0.8372 0.016 0.984
#> SRR772614 1 0.9248 0.5156 0.660 0.340
#> SRR772615 1 0.6712 0.7201 0.824 0.176
#> SRR772616 2 0.8661 0.6645 0.288 0.712
#> SRR772617 2 0.1414 0.8386 0.020 0.980
#> SRR772618 2 0.4298 0.8405 0.088 0.912
#> SRR772619 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.4690 0.8486 0.100 0.900
#> SRR772622 2 0.4562 0.8491 0.096 0.904
#> SRR772623 1 0.0938 0.7791 0.988 0.012
#> SRR772624 1 0.0376 0.7783 0.996 0.004
#> SRR772625 2 0.8713 0.5410 0.292 0.708
#> SRR772626 2 0.4815 0.8386 0.104 0.896
#> SRR772627 2 0.3879 0.8442 0.076 0.924
#> SRR772628 1 0.9775 0.3158 0.588 0.412
#> SRR772629 1 0.8713 0.5933 0.708 0.292
#> SRR772630 2 0.9754 0.4002 0.408 0.592
#> SRR772631 1 0.6712 0.7367 0.824 0.176
#> SRR772632 2 0.1843 0.8392 0.028 0.972
#> SRR772633 2 0.1633 0.8302 0.024 0.976
#> SRR772634 2 0.8443 0.7110 0.272 0.728
#> SRR772635 2 0.4562 0.8452 0.096 0.904
#> SRR772636 2 0.8555 0.5830 0.280 0.720
#> SRR772637 1 0.6148 0.7298 0.848 0.152
#> SRR772638 2 0.9977 0.1685 0.472 0.528
#> SRR772639 2 0.5946 0.8348 0.144 0.856
#> SRR772640 2 0.3114 0.8447 0.056 0.944
#> SRR772641 2 0.4022 0.8410 0.080 0.920
#> SRR772642 2 0.8499 0.7322 0.276 0.724
#> SRR772643 2 0.3274 0.8238 0.060 0.940
#> SRR772644 2 0.9286 0.5937 0.344 0.656
#> SRR772645 2 0.9087 0.6498 0.324 0.676
#> SRR772646 2 0.2043 0.8409 0.032 0.968
#> SRR772647 2 0.2043 0.8326 0.032 0.968
#> SRR772648 2 0.5294 0.8366 0.120 0.880
#> SRR772649 2 0.7674 0.7335 0.224 0.776
#> SRR772650 2 0.5408 0.8398 0.124 0.876
#> SRR772651 2 0.7528 0.7916 0.216 0.784
#> SRR772652 2 0.9491 0.5672 0.368 0.632
#> SRR772653 2 0.8386 0.7067 0.268 0.732
#> SRR772654 2 0.8081 0.7631 0.248 0.752
#> SRR772655 2 0.8713 0.7014 0.292 0.708
#> SRR772656 1 0.6148 0.7383 0.848 0.152
#> SRR772657 1 0.0376 0.7784 0.996 0.004
#> SRR772658 2 0.0376 0.8287 0.004 0.996
#> SRR772659 2 0.0672 0.8332 0.008 0.992
#> SRR772660 2 0.3879 0.8495 0.076 0.924
#> SRR772661 1 0.7056 0.7279 0.808 0.192
#> SRR772662 2 0.5178 0.8358 0.116 0.884
#> SRR772663 2 0.5629 0.8363 0.132 0.868
#> SRR772664 2 0.7299 0.7918 0.204 0.796
#> SRR772665 2 0.2603 0.8387 0.044 0.956
#> SRR772666 1 0.0672 0.7788 0.992 0.008
#> SRR772667 2 0.4298 0.8414 0.088 0.912
#> SRR772668 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.8289 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.7056 0.8120 0.192 0.808
#> SRR772671 2 0.6343 0.8258 0.160 0.840
#> SRR772672 2 0.2236 0.8371 0.036 0.964
#> SRR772673 2 0.4690 0.8410 0.100 0.900
#> SRR772674 1 0.0376 0.7801 0.996 0.004
#> SRR772675 2 0.9795 0.2202 0.416 0.584
#> SRR772676 2 0.7815 0.7769 0.232 0.768
#> SRR772677 2 0.9998 0.0344 0.492 0.508
#> SRR772678 1 0.9522 0.3552 0.628 0.372
#> SRR772679 2 0.4939 0.8422 0.108 0.892
#> SRR772680 2 0.9460 0.5582 0.364 0.636
#> SRR772681 1 0.7674 0.7057 0.776 0.224
#> SRR772682 2 0.1414 0.8369 0.020 0.980
#> SRR772683 2 0.2043 0.8290 0.032 0.968
#> SRR772685 2 0.4815 0.8386 0.104 0.896
#> SRR772686 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0672 0.8282 0.008 0.992
#> SRR772689 2 0.0672 0.8282 0.008 0.992
#> SRR772690 1 0.0000 0.7789 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.9661 0.2820 0.392 0.608
#> SRR772692 2 0.6148 0.8289 0.152 0.848
#> SRR772693 2 0.8144 0.7536 0.252 0.748
#> SRR772694 2 0.2423 0.8276 0.040 0.960
#> SRR772695 2 0.4161 0.8474 0.084 0.916
#> SRR772696 2 0.5178 0.8369 0.116 0.884
#> SRR772697 2 0.3879 0.8481 0.076 0.924
#> SRR772698 1 0.0938 0.7809 0.988 0.012
#> SRR772699 2 0.8207 0.7451 0.256 0.744
#> SRR772700 2 0.8763 0.7008 0.296 0.704
#> SRR772701 2 0.8909 0.6833 0.308 0.692
#> SRR772702 1 0.9580 0.3924 0.620 0.380
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.8038 0.5825 0.620 0.280 0.100
#> SRR772342 1 0.7281 0.5425 0.712 0.140 0.148
#> SRR772343 2 0.6819 0.3631 0.476 0.512 0.012
#> SRR772344 2 0.4235 0.7664 0.176 0.824 0.000
#> SRR772345 2 0.5325 0.7556 0.248 0.748 0.004
#> SRR772346 2 0.7401 0.5141 0.340 0.612 0.048
#> SRR772347 1 0.7030 0.1306 0.580 0.396 0.024
#> SRR772348 2 0.3845 0.7772 0.116 0.872 0.012
#> SRR772349 2 0.3551 0.7748 0.132 0.868 0.000
#> SRR772350 3 0.0747 0.7797 0.016 0.000 0.984
#> SRR772351 2 0.2200 0.7398 0.056 0.940 0.004
#> SRR772352 2 0.6646 0.7335 0.240 0.712 0.048
#> SRR772353 1 0.6793 -0.2414 0.536 0.452 0.012
#> SRR772354 2 0.6387 0.6193 0.300 0.680 0.020
#> SRR772355 2 0.4353 0.7810 0.156 0.836 0.008
#> SRR772356 2 0.5201 0.7552 0.236 0.760 0.004
#> SRR772357 2 0.6603 0.2470 0.332 0.648 0.020
#> SRR772358 2 0.8452 0.3435 0.340 0.556 0.104
#> SRR772359 1 0.6915 0.5685 0.736 0.140 0.124
#> SRR772360 1 0.6912 -0.0247 0.540 0.444 0.016
#> SRR772361 3 0.3482 0.7643 0.128 0.000 0.872
#> SRR772362 2 0.1964 0.7374 0.056 0.944 0.000
#> SRR772363 2 0.1964 0.7363 0.056 0.944 0.000
#> SRR772364 2 0.6143 0.6851 0.304 0.684 0.012
#> SRR772365 2 0.6507 0.7220 0.284 0.688 0.028
#> SRR772366 3 0.3038 0.7667 0.104 0.000 0.896
#> SRR772367 3 0.0237 0.7783 0.004 0.000 0.996
#> SRR772368 2 0.3983 0.7739 0.144 0.852 0.004
#> SRR772369 2 0.7786 0.6131 0.332 0.600 0.068
#> SRR772370 2 0.7482 0.5050 0.204 0.688 0.108
#> SRR772371 1 0.6443 0.5644 0.720 0.240 0.040
#> SRR772372 2 0.7607 0.3605 0.364 0.584 0.052
#> SRR772373 2 0.4834 0.7731 0.204 0.792 0.004
#> SRR772374 2 0.2955 0.7411 0.080 0.912 0.008
#> SRR772375 3 0.0592 0.7800 0.012 0.000 0.988
#> SRR772376 2 0.3412 0.7784 0.124 0.876 0.000
#> SRR772377 1 0.8100 -0.1837 0.512 0.068 0.420
#> SRR772378 2 0.6937 0.7055 0.272 0.680 0.048
#> SRR772379 2 0.4409 0.7808 0.172 0.824 0.004
#> SRR772380 2 0.6937 0.7041 0.272 0.680 0.048
#> SRR772381 3 0.3112 0.7769 0.096 0.004 0.900
#> SRR772382 2 0.7913 0.1734 0.452 0.492 0.056
#> SRR772383 1 0.9112 0.5250 0.540 0.272 0.188
#> SRR772384 1 0.9016 0.3256 0.556 0.192 0.252
#> SRR772385 1 0.8972 0.3955 0.564 0.200 0.236
#> SRR772386 2 0.5178 0.7647 0.256 0.744 0.000
#> SRR772387 2 0.4390 0.7410 0.148 0.840 0.012
#> SRR772388 3 0.6937 0.4664 0.404 0.020 0.576
#> SRR772389 3 0.4399 0.7374 0.188 0.000 0.812
#> SRR772390 3 0.6079 0.5385 0.388 0.000 0.612
#> SRR772391 1 0.5998 0.5478 0.788 0.128 0.084
#> SRR772392 1 0.9730 0.4229 0.420 0.352 0.228
#> SRR772393 2 0.4575 0.7618 0.160 0.828 0.012
#> SRR772394 2 0.5956 0.6961 0.324 0.672 0.004
#> SRR772395 2 0.2356 0.7485 0.072 0.928 0.000
#> SRR772396 1 0.7233 0.5503 0.672 0.264 0.064
#> SRR772397 1 0.9496 0.5422 0.492 0.276 0.232
#> SRR772398 3 0.9118 0.3687 0.352 0.152 0.496
#> SRR772399 1 0.8460 0.4565 0.472 0.440 0.088
#> SRR772400 1 0.7915 0.3801 0.644 0.108 0.248
#> SRR772401 2 0.9092 0.0444 0.296 0.532 0.172
#> SRR772402 2 0.5254 0.7635 0.264 0.736 0.000
#> SRR772403 2 0.5024 0.7687 0.220 0.776 0.004
#> SRR772404 2 0.4654 0.7829 0.208 0.792 0.000
#> SRR772405 1 0.8535 0.1102 0.556 0.112 0.332
#> SRR772406 2 0.3551 0.7389 0.132 0.868 0.000
#> SRR772407 2 0.4741 0.7631 0.152 0.828 0.020
#> SRR772408 2 0.1643 0.7429 0.044 0.956 0.000
#> SRR772409 2 0.2959 0.7732 0.100 0.900 0.000
#> SRR772410 2 0.6034 0.6572 0.152 0.780 0.068
#> SRR772411 2 0.5905 0.6693 0.352 0.648 0.000
#> SRR772412 1 0.7458 0.6203 0.676 0.236 0.088
#> SRR772413 1 0.8556 0.4917 0.596 0.148 0.256
#> SRR772414 3 0.2448 0.7546 0.076 0.000 0.924
#> SRR772415 2 0.3192 0.7679 0.112 0.888 0.000
#> SRR772416 2 0.6832 0.6545 0.376 0.604 0.020
#> SRR772417 1 0.7493 -0.1472 0.488 0.476 0.036
#> SRR772418 3 0.6192 0.5037 0.420 0.000 0.580
#> SRR772419 2 0.2945 0.7664 0.088 0.908 0.004
#> SRR772420 2 0.5588 0.7372 0.276 0.720 0.004
#> SRR772421 2 0.4233 0.7742 0.160 0.836 0.004
#> SRR772422 2 0.7104 0.5806 0.360 0.608 0.032
#> SRR772423 2 0.5690 0.7250 0.288 0.708 0.004
#> SRR772424 2 0.4629 0.7595 0.188 0.808 0.004
#> SRR772425 2 0.6229 0.7205 0.280 0.700 0.020
#> SRR772426 2 0.2301 0.7371 0.060 0.936 0.004
#> SRR772427 2 0.1878 0.7391 0.044 0.952 0.004
#> SRR772428 1 0.9192 0.5416 0.520 0.300 0.180
#> SRR772429 1 0.8836 0.2958 0.492 0.388 0.120
#> SRR772430 2 0.5239 0.7570 0.160 0.808 0.032
#> SRR772431 2 0.5363 0.7403 0.276 0.724 0.000
#> SRR772432 2 0.4931 0.7598 0.232 0.768 0.000
#> SRR772433 1 0.6191 0.4395 0.776 0.084 0.140
#> SRR772434 1 0.8363 -0.0505 0.504 0.084 0.412
#> SRR772435 2 0.8379 0.4291 0.352 0.552 0.096
#> SRR772436 2 0.6510 0.6299 0.364 0.624 0.012
#> SRR772437 3 0.4045 0.7603 0.104 0.024 0.872
#> SRR772438 2 0.9647 -0.1962 0.268 0.468 0.264
#> SRR772439 1 0.8784 0.5673 0.548 0.316 0.136
#> SRR772440 2 0.3686 0.7769 0.140 0.860 0.000
#> SRR772441 2 0.5443 0.7471 0.260 0.736 0.004
#> SRR772442 2 0.3983 0.7797 0.144 0.852 0.004
#> SRR772443 2 0.5397 0.7301 0.280 0.720 0.000
#> SRR772444 2 0.8080 0.2889 0.232 0.640 0.128
#> SRR772445 2 0.7395 0.3227 0.476 0.492 0.032
#> SRR772446 1 0.7824 0.3486 0.580 0.356 0.064
#> SRR772447 2 0.6617 0.6124 0.388 0.600 0.012
#> SRR772448 2 0.5450 0.7629 0.228 0.760 0.012
#> SRR772449 2 0.3686 0.7830 0.140 0.860 0.000
#> SRR772450 2 0.2261 0.7332 0.068 0.932 0.000
#> SRR772451 2 0.3551 0.7677 0.132 0.868 0.000
#> SRR772452 1 0.6286 0.5791 0.772 0.136 0.092
#> SRR772453 1 0.6309 0.4841 0.772 0.100 0.128
#> SRR772454 2 0.6879 0.5270 0.428 0.556 0.016
#> SRR772455 2 0.6857 0.6781 0.252 0.696 0.052
#> SRR772456 2 0.4842 0.7514 0.224 0.776 0.000
#> SRR772457 2 0.4555 0.7562 0.200 0.800 0.000
#> SRR772458 1 0.8068 0.3136 0.596 0.088 0.316
#> SRR772459 1 0.9857 0.5426 0.416 0.308 0.276
#> SRR772460 2 0.2261 0.7411 0.068 0.932 0.000
#> SRR772461 2 0.1964 0.7391 0.056 0.944 0.000
#> SRR772462 2 0.5722 0.7246 0.292 0.704 0.004
#> SRR772463 2 0.3551 0.7697 0.132 0.868 0.000
#> SRR772464 3 0.0424 0.7794 0.008 0.000 0.992
#> SRR772465 1 0.7054 0.4202 0.524 0.456 0.020
#> SRR772466 1 0.7188 -0.1297 0.488 0.488 0.024
#> SRR772467 2 0.4784 0.7649 0.200 0.796 0.004
#> SRR772468 2 0.3816 0.7695 0.148 0.852 0.000
#> SRR772469 2 0.8229 0.3635 0.256 0.620 0.124
#> SRR772470 1 0.7391 0.6028 0.636 0.308 0.056
#> SRR772471 1 0.7059 0.5877 0.716 0.192 0.092
#> SRR772472 1 0.7208 0.4308 0.644 0.308 0.048
#> SRR772473 2 0.6303 0.7469 0.248 0.720 0.032
#> SRR772474 2 0.4974 0.7781 0.236 0.764 0.000
#> SRR772475 1 0.9213 0.3752 0.536 0.236 0.228
#> SRR772476 2 0.2537 0.7459 0.080 0.920 0.000
#> SRR772477 2 0.2537 0.7364 0.080 0.920 0.000
#> SRR772478 1 0.8984 0.5289 0.496 0.368 0.136
#> SRR772479 1 0.5974 0.5981 0.784 0.148 0.068
#> SRR772480 2 0.6307 0.7020 0.328 0.660 0.012
#> SRR772481 2 0.3112 0.7709 0.096 0.900 0.004
#> SRR772482 1 0.7975 0.5508 0.656 0.204 0.140
#> SRR772483 2 0.8743 -0.1391 0.440 0.452 0.108
#> SRR772484 2 0.3551 0.7742 0.132 0.868 0.000
#> SRR772485 2 0.5760 0.7050 0.328 0.672 0.000
#> SRR772486 3 0.7453 0.5112 0.292 0.064 0.644
#> SRR772487 1 0.7676 0.2525 0.584 0.360 0.056
#> SRR772488 2 0.2537 0.7719 0.080 0.920 0.000
#> SRR772489 2 0.5480 0.7398 0.264 0.732 0.004
#> SRR772490 1 0.9376 0.5298 0.512 0.228 0.260
#> SRR772491 1 0.7146 0.4991 0.676 0.264 0.060
#> SRR772492 2 0.1753 0.7379 0.048 0.952 0.000
#> SRR772493 2 0.1529 0.7364 0.040 0.960 0.000
#> SRR772494 2 0.2066 0.7390 0.060 0.940 0.000
#> SRR772495 2 0.1643 0.7441 0.044 0.956 0.000
#> SRR772496 2 0.5036 0.7691 0.172 0.808 0.020
#> SRR772497 2 0.6481 0.7471 0.224 0.728 0.048
#> SRR772498 2 0.5874 0.6849 0.208 0.760 0.032
#> SRR772499 2 0.6355 0.6120 0.280 0.696 0.024
#> SRR772500 2 0.5291 0.7639 0.268 0.732 0.000
#> SRR772501 2 0.5517 0.7338 0.268 0.728 0.004
#> SRR772502 2 0.3377 0.7398 0.092 0.896 0.012
#> SRR772503 2 0.6062 0.7287 0.276 0.708 0.016
#> SRR772504 2 0.4110 0.7780 0.152 0.844 0.004
#> SRR772505 2 0.5178 0.7419 0.256 0.744 0.000
#> SRR772506 2 0.4931 0.7576 0.212 0.784 0.004
#> SRR772507 2 0.4291 0.7737 0.180 0.820 0.000
#> SRR772508 2 0.2682 0.7478 0.076 0.920 0.004
#> SRR772509 1 0.9181 0.3597 0.540 0.224 0.236
#> SRR772510 3 0.1860 0.7782 0.052 0.000 0.948
#> SRR772511 2 0.5926 0.6626 0.356 0.644 0.000
#> SRR772512 2 0.8550 0.2385 0.176 0.608 0.216
#> SRR772513 2 0.6180 0.7141 0.260 0.716 0.024
#> SRR772514 2 0.5115 0.7717 0.228 0.768 0.004
#> SRR772515 2 0.3551 0.7866 0.132 0.868 0.000
#> SRR772516 2 0.6051 0.7180 0.292 0.696 0.012
#> SRR772517 2 0.4504 0.7693 0.196 0.804 0.000
#> SRR772518 2 0.3377 0.7544 0.092 0.896 0.012
#> SRR772519 2 0.2772 0.7426 0.080 0.916 0.004
#> SRR772520 2 0.3192 0.7657 0.112 0.888 0.000
#> SRR772521 2 0.6180 0.6698 0.332 0.660 0.008
#> SRR772522 1 0.7578 0.0277 0.500 0.460 0.040
#> SRR772523 2 0.6008 0.6872 0.332 0.664 0.004
#> SRR772524 2 0.4172 0.7775 0.156 0.840 0.004
#> SRR772525 3 0.1031 0.7806 0.024 0.000 0.976
#> SRR772526 2 0.2537 0.7488 0.080 0.920 0.000
#> SRR772527 2 0.2066 0.7558 0.060 0.940 0.000
#> SRR772528 3 0.6307 0.3996 0.488 0.000 0.512
#> SRR772529 1 0.6357 0.4559 0.684 0.296 0.020
#> SRR772530 1 0.6211 0.5476 0.736 0.228 0.036
#> SRR772531 3 0.0424 0.7796 0.008 0.000 0.992
#> SRR772532 2 0.3879 0.7781 0.152 0.848 0.000
#> SRR772533 2 0.4654 0.7662 0.208 0.792 0.000
#> SRR772534 1 0.6664 -0.1285 0.528 0.464 0.008
#> SRR772535 2 0.3482 0.7682 0.128 0.872 0.000
#> SRR772536 2 0.3112 0.7571 0.096 0.900 0.004
#> SRR772537 2 0.4233 0.7721 0.160 0.836 0.004
#> SRR772538 2 0.2878 0.7682 0.096 0.904 0.000
#> SRR772539 2 0.6608 0.5397 0.432 0.560 0.008
#> SRR772540 1 0.6680 -0.2341 0.508 0.484 0.008
#> SRR772541 2 0.1964 0.7556 0.056 0.944 0.000
#> SRR772542 1 0.7814 0.6061 0.652 0.244 0.104
#> SRR772543 1 0.6634 0.5862 0.752 0.144 0.104
#> SRR772544 3 0.1163 0.7838 0.028 0.000 0.972
#> SRR772545 1 0.9684 0.5662 0.428 0.352 0.220
#> SRR772546 1 0.8331 0.4801 0.628 0.208 0.164
#> SRR772547 2 0.8645 0.3447 0.344 0.540 0.116
#> SRR772548 2 0.8935 -0.1504 0.352 0.512 0.136
#> SRR772549 1 0.7536 0.1887 0.632 0.064 0.304
#> SRR772550 1 0.8839 0.4881 0.572 0.172 0.256
#> SRR772551 2 0.5588 0.7265 0.276 0.720 0.004
#> SRR772552 2 0.3573 0.7722 0.120 0.876 0.004
#> SRR772553 1 0.9148 0.3956 0.544 0.220 0.236
#> SRR772554 2 0.2356 0.7670 0.072 0.928 0.000
#> SRR772555 2 0.3755 0.7682 0.120 0.872 0.008
#> SRR772556 2 0.8109 0.4423 0.256 0.628 0.116
#> SRR772557 1 0.8873 0.4236 0.576 0.224 0.200
#> SRR772558 2 0.4121 0.7298 0.168 0.832 0.000
#> SRR772559 1 0.4555 0.5933 0.800 0.200 0.000
#> SRR772560 2 0.5797 0.7386 0.280 0.712 0.008
#> SRR772561 3 0.5253 0.7206 0.096 0.076 0.828
#> SRR772562 2 0.4931 0.7735 0.232 0.768 0.000
#> SRR772563 2 0.5138 0.7532 0.252 0.748 0.000
#> SRR772564 1 0.8149 0.0676 0.520 0.072 0.408
#> SRR772565 1 0.9877 0.4196 0.388 0.352 0.260
#> SRR772566 3 0.4978 0.6836 0.216 0.004 0.780
#> SRR772567 3 0.6388 0.5916 0.284 0.024 0.692
#> SRR772568 2 0.2537 0.7447 0.080 0.920 0.000
#> SRR772569 2 0.4931 0.7706 0.232 0.768 0.000
#> SRR772570 1 0.8394 0.1531 0.576 0.108 0.316
#> SRR772571 2 0.6763 0.3795 0.436 0.552 0.012
#> SRR772572 1 0.9168 0.3975 0.528 0.184 0.288
#> SRR772573 1 0.7592 0.4072 0.680 0.112 0.208
#> SRR772574 1 0.6255 0.4619 0.776 0.112 0.112
#> SRR772575 1 0.7874 0.4951 0.568 0.368 0.064
#> SRR772576 2 0.5480 0.7431 0.264 0.732 0.004
#> SRR772577 2 0.5588 0.7269 0.276 0.720 0.004
#> SRR772578 2 0.2301 0.7479 0.060 0.936 0.004
#> SRR772579 2 0.1964 0.7495 0.056 0.944 0.000
#> SRR772580 3 0.1860 0.7687 0.052 0.000 0.948
#> SRR772581 2 0.4555 0.7610 0.200 0.800 0.000
#> SRR772582 2 0.4121 0.7746 0.168 0.832 0.000
#> SRR772583 2 0.7924 0.6074 0.304 0.612 0.084
#> SRR772584 2 0.2959 0.7751 0.100 0.900 0.000
#> SRR772585 2 0.5061 0.7502 0.208 0.784 0.008
#> SRR772586 3 0.4887 0.6920 0.228 0.000 0.772
#> SRR772587 3 0.7248 0.3416 0.436 0.028 0.536
#> SRR772588 2 0.4062 0.7640 0.164 0.836 0.000
#> SRR772589 2 0.5465 0.7271 0.288 0.712 0.000
#> SRR772590 3 0.2066 0.7808 0.060 0.000 0.940
#> SRR772591 3 0.7913 0.2090 0.452 0.056 0.492
#> SRR772592 3 0.5848 0.5524 0.268 0.012 0.720
#> SRR772593 3 0.6260 0.4697 0.448 0.000 0.552
#> SRR772594 2 0.4399 0.7767 0.188 0.812 0.000
#> SRR772595 2 0.3752 0.7757 0.144 0.856 0.000
#> SRR772596 3 0.5678 0.6189 0.316 0.000 0.684
#> SRR772597 3 0.1031 0.7816 0.024 0.000 0.976
#> SRR772598 1 0.7535 0.3856 0.692 0.132 0.176
#> SRR772599 1 0.7281 0.5156 0.712 0.140 0.148
#> SRR772600 2 0.5325 0.7528 0.248 0.748 0.004
#> SRR772601 2 0.5325 0.7387 0.248 0.748 0.004
#> SRR772602 3 0.0592 0.7798 0.012 0.000 0.988
#> SRR772603 2 0.5201 0.7567 0.236 0.760 0.004
#> SRR772604 2 0.5365 0.7566 0.252 0.744 0.004
#> SRR772605 2 0.3193 0.7434 0.100 0.896 0.004
#> SRR772606 1 0.8920 0.4443 0.468 0.408 0.124
#> SRR772607 1 0.7800 0.3529 0.668 0.128 0.204
#> SRR772608 2 0.4121 0.7881 0.168 0.832 0.000
#> SRR772609 2 0.5815 0.7126 0.304 0.692 0.004
#> SRR772610 2 0.3375 0.7511 0.100 0.892 0.008
#> SRR772611 2 0.2955 0.7463 0.080 0.912 0.008
#> SRR772612 2 0.5325 0.7650 0.248 0.748 0.004
#> SRR772613 2 0.4178 0.7565 0.172 0.828 0.000
#> SRR772614 1 0.9100 0.3145 0.516 0.160 0.324
#> SRR772615 3 0.7674 0.2042 0.472 0.044 0.484
#> SRR772616 2 0.8179 0.1100 0.352 0.564 0.084
#> SRR772617 2 0.3349 0.7616 0.108 0.888 0.004
#> SRR772618 2 0.5115 0.7531 0.228 0.768 0.004
#> SRR772619 2 0.2066 0.7309 0.060 0.940 0.000
#> SRR772620 2 0.2711 0.7460 0.088 0.912 0.000
#> SRR772621 2 0.5431 0.6763 0.284 0.716 0.000
#> SRR772622 2 0.5633 0.7384 0.208 0.768 0.024
#> SRR772623 3 0.2066 0.7774 0.060 0.000 0.940
#> SRR772624 3 0.6168 0.5126 0.412 0.000 0.588
#> SRR772625 1 0.8972 0.4893 0.460 0.412 0.128
#> SRR772626 2 0.5560 0.7149 0.300 0.700 0.000
#> SRR772627 2 0.4605 0.7828 0.204 0.796 0.000
#> SRR772628 1 0.9704 0.5032 0.456 0.280 0.264
#> SRR772629 1 0.7762 0.3995 0.668 0.120 0.212
#> SRR772630 1 0.7997 0.5707 0.600 0.316 0.084
#> SRR772631 1 0.7777 -0.0608 0.576 0.060 0.364
#> SRR772632 2 0.3941 0.7781 0.156 0.844 0.000
#> SRR772633 2 0.2301 0.7358 0.060 0.936 0.004
#> SRR772634 2 0.8865 -0.2765 0.404 0.476 0.120
#> SRR772635 2 0.5958 0.6973 0.300 0.692 0.008
#> SRR772636 1 0.8834 0.5003 0.464 0.420 0.116
#> SRR772637 1 0.7389 -0.0797 0.556 0.036 0.408
#> SRR772638 1 0.9653 0.5146 0.456 0.312 0.232
#> SRR772639 2 0.5708 0.7601 0.204 0.768 0.028
#> SRR772640 2 0.4346 0.7584 0.184 0.816 0.000
#> SRR772641 2 0.5070 0.7502 0.224 0.772 0.004
#> SRR772642 2 0.8362 0.4283 0.348 0.556 0.096
#> SRR772643 2 0.3091 0.7389 0.072 0.912 0.016
#> SRR772644 2 0.8363 -0.0114 0.412 0.504 0.084
#> SRR772645 2 0.8937 -0.1104 0.428 0.448 0.124
#> SRR772646 2 0.4605 0.7701 0.204 0.796 0.000
#> SRR772647 2 0.3213 0.7447 0.092 0.900 0.008
#> SRR772648 2 0.5690 0.7302 0.288 0.708 0.004
#> SRR772649 2 0.8843 0.1703 0.276 0.564 0.160
#> SRR772650 2 0.6849 0.6234 0.380 0.600 0.020
#> SRR772651 1 0.7397 -0.1187 0.484 0.484 0.032
#> SRR772652 1 0.7618 0.5978 0.628 0.304 0.068
#> SRR772653 1 0.8372 0.5978 0.564 0.336 0.100
#> SRR772654 2 0.7013 0.5752 0.324 0.640 0.036
#> SRR772655 1 0.7013 0.4855 0.640 0.324 0.036
#> SRR772656 3 0.7400 0.5296 0.264 0.072 0.664
#> SRR772657 3 0.3116 0.7672 0.108 0.000 0.892
#> SRR772658 2 0.1964 0.7350 0.056 0.944 0.000
#> SRR772659 2 0.2448 0.7440 0.076 0.924 0.000
#> SRR772660 2 0.5580 0.7599 0.256 0.736 0.008
#> SRR772661 1 0.7325 -0.1420 0.576 0.036 0.388
#> SRR772662 2 0.5480 0.7573 0.264 0.732 0.004
#> SRR772663 2 0.5881 0.7407 0.256 0.728 0.016
#> SRR772664 2 0.7222 0.5415 0.388 0.580 0.032
#> SRR772665 2 0.4209 0.7637 0.128 0.856 0.016
#> SRR772666 3 0.1753 0.7778 0.048 0.000 0.952
#> SRR772667 2 0.5201 0.7616 0.236 0.760 0.004
#> SRR772668 2 0.2448 0.7502 0.076 0.924 0.000
#> SRR772669 2 0.2448 0.7502 0.076 0.924 0.000
#> SRR772670 2 0.7490 0.5604 0.380 0.576 0.044
#> SRR772671 2 0.6018 0.6951 0.308 0.684 0.008
#> SRR772672 2 0.4531 0.7744 0.168 0.824 0.008
#> SRR772673 2 0.4605 0.7831 0.204 0.796 0.000
#> SRR772674 3 0.2096 0.7865 0.052 0.004 0.944
#> SRR772675 1 0.9021 0.3088 0.552 0.184 0.264
#> SRR772676 2 0.7284 0.4835 0.336 0.620 0.044
#> SRR772677 1 0.9642 0.3611 0.416 0.208 0.376
#> SRR772678 1 0.7274 0.1401 0.644 0.052 0.304
#> SRR772679 2 0.4808 0.7757 0.188 0.804 0.008
#> SRR772680 1 0.7064 0.5962 0.704 0.220 0.076
#> SRR772681 3 0.4689 0.7092 0.052 0.096 0.852
#> SRR772682 2 0.4235 0.7746 0.176 0.824 0.000
#> SRR772683 2 0.1989 0.7380 0.048 0.948 0.004
#> SRR772685 2 0.5722 0.7386 0.292 0.704 0.004
#> SRR772686 3 0.0592 0.7805 0.012 0.000 0.988
#> SRR772687 3 0.0892 0.7801 0.020 0.000 0.980
#> SRR772688 2 0.2400 0.7402 0.064 0.932 0.004
#> SRR772689 2 0.2625 0.7369 0.084 0.916 0.000
#> SRR772690 3 0.1031 0.7825 0.024 0.000 0.976
#> SRR772691 1 0.9325 0.3894 0.520 0.252 0.228
#> SRR772692 2 0.6033 0.6890 0.336 0.660 0.004
#> SRR772693 1 0.7044 0.3764 0.620 0.348 0.032
#> SRR772694 2 0.3112 0.7379 0.096 0.900 0.004
#> SRR772695 2 0.4974 0.7669 0.236 0.764 0.000
#> SRR772696 2 0.4912 0.7639 0.196 0.796 0.008
#> SRR772697 2 0.4602 0.7667 0.152 0.832 0.016
#> SRR772698 3 0.6460 0.4504 0.440 0.004 0.556
#> SRR772699 2 0.8895 -0.2519 0.392 0.484 0.124
#> SRR772700 1 0.8619 0.4221 0.480 0.420 0.100
#> SRR772701 1 0.7214 0.4220 0.632 0.324 0.044
#> SRR772702 1 0.6455 0.4702 0.764 0.108 0.128
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 4 0.8400 0.13830 0.316 0.228 0.028 0.428
#> SRR772342 4 0.8463 -0.20926 0.384 0.108 0.080 0.428
#> SRR772343 2 0.7571 0.07645 0.176 0.472 0.004 0.348
#> SRR772344 2 0.5126 0.21082 0.004 0.552 0.000 0.444
#> SRR772345 2 0.5921 0.13478 0.036 0.516 0.000 0.448
#> SRR772346 2 0.7459 0.13480 0.328 0.520 0.012 0.140
#> SRR772347 1 0.8197 -0.30885 0.336 0.324 0.008 0.332
#> SRR772348 2 0.4035 0.49192 0.020 0.804 0.000 0.176
#> SRR772349 2 0.4323 0.48645 0.028 0.788 0.000 0.184
#> SRR772350 3 0.0524 0.80821 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772351 2 0.3300 0.39184 0.008 0.848 0.000 0.144
#> SRR772352 2 0.6887 0.32898 0.096 0.560 0.008 0.336
#> SRR772353 2 0.7933 -0.10829 0.240 0.388 0.004 0.368
#> SRR772354 2 0.6154 0.41950 0.120 0.684 0.004 0.192
#> SRR772355 2 0.5328 0.46104 0.048 0.704 0.000 0.248
#> SRR772356 2 0.6327 0.19425 0.060 0.496 0.000 0.444
#> SRR772357 2 0.6919 0.16109 0.244 0.600 0.004 0.152
#> SRR772358 2 0.8375 0.08365 0.140 0.480 0.060 0.320
#> SRR772359 1 0.6574 0.50614 0.668 0.124 0.016 0.192
#> SRR772360 4 0.7868 0.17414 0.276 0.352 0.000 0.372
#> SRR772361 3 0.2926 0.78836 0.096 0.004 0.888 0.012
#> SRR772362 2 0.3024 0.39140 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772363 2 0.4830 0.09377 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR772364 4 0.6507 -0.11123 0.052 0.468 0.008 0.472
#> SRR772365 2 0.7333 0.22632 0.068 0.528 0.040 0.364
#> SRR772366 3 0.4328 0.65119 0.244 0.000 0.748 0.008
#> SRR772367 3 0.0188 0.80677 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772368 2 0.4283 0.45744 0.004 0.740 0.000 0.256
#> SRR772369 2 0.7424 0.20884 0.108 0.512 0.020 0.360
#> SRR772370 2 0.6980 0.27238 0.240 0.632 0.032 0.096
#> SRR772371 1 0.7439 0.25738 0.516 0.176 0.004 0.304
#> SRR772372 2 0.8375 -0.09547 0.256 0.428 0.024 0.292
#> SRR772373 2 0.4877 0.46863 0.044 0.752 0.000 0.204
#> SRR772374 2 0.1411 0.47759 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR772375 3 0.0188 0.80759 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772376 2 0.3552 0.49643 0.024 0.848 0.000 0.128
#> SRR772377 1 0.4323 0.40184 0.776 0.020 0.204 0.000
#> SRR772378 2 0.7207 0.33617 0.124 0.592 0.020 0.264
#> SRR772379 2 0.5305 0.38737 0.016 0.648 0.004 0.332
#> SRR772380 2 0.7069 0.36949 0.132 0.628 0.024 0.216
#> SRR772381 3 0.3712 0.75480 0.152 0.012 0.832 0.004
#> SRR772382 2 0.8275 -0.10257 0.328 0.400 0.016 0.256
#> SRR772383 4 0.9702 0.08164 0.304 0.216 0.152 0.328
#> SRR772384 1 0.4669 0.49509 0.796 0.100 0.104 0.000
#> SRR772385 1 0.5470 0.53563 0.780 0.096 0.080 0.044
#> SRR772386 2 0.5925 0.44600 0.100 0.700 0.004 0.196
#> SRR772387 2 0.3972 0.49162 0.080 0.840 0.000 0.080
#> SRR772388 1 0.7131 0.13651 0.520 0.004 0.352 0.124
#> SRR772389 3 0.6080 0.58866 0.236 0.000 0.664 0.100
#> SRR772390 1 0.5024 0.14388 0.632 0.000 0.360 0.008
#> SRR772391 1 0.6938 0.47054 0.568 0.076 0.020 0.336
#> SRR772392 4 0.9825 0.02345 0.248 0.288 0.164 0.300
#> SRR772393 2 0.4855 0.47832 0.076 0.788 0.004 0.132
#> SRR772394 4 0.6869 -0.07796 0.088 0.436 0.004 0.472
#> SRR772395 2 0.1970 0.47590 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772396 4 0.8449 -0.01690 0.380 0.192 0.036 0.392
#> SRR772397 1 0.9530 0.28342 0.388 0.192 0.148 0.272
#> SRR772398 1 0.8996 -0.02619 0.380 0.136 0.376 0.108
#> SRR772399 2 0.8139 -0.08880 0.360 0.456 0.036 0.148
#> SRR772400 1 0.7258 0.53174 0.664 0.100 0.112 0.124
#> SRR772401 2 0.8214 -0.10272 0.408 0.428 0.076 0.088
#> SRR772402 4 0.6079 0.12684 0.048 0.408 0.000 0.544
#> SRR772403 4 0.5620 0.10382 0.024 0.416 0.000 0.560
#> SRR772404 2 0.4820 0.49075 0.060 0.772 0.000 0.168
#> SRR772405 1 0.4259 0.47519 0.816 0.056 0.128 0.000
#> SRR772406 2 0.4839 0.38805 0.044 0.756 0.000 0.200
#> SRR772407 2 0.4635 0.48865 0.080 0.796 0.000 0.124
#> SRR772408 2 0.2011 0.46555 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR772409 2 0.4008 0.46176 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR772410 2 0.5085 0.40939 0.140 0.780 0.012 0.068
#> SRR772411 2 0.6824 0.28629 0.120 0.556 0.000 0.324
#> SRR772412 1 0.8545 0.08333 0.400 0.216 0.036 0.348
#> SRR772413 1 0.9430 0.31263 0.380 0.156 0.152 0.312
#> SRR772414 3 0.1284 0.80023 0.024 0.000 0.964 0.012
#> SRR772415 2 0.3249 0.48951 0.008 0.852 0.000 0.140
#> SRR772416 2 0.7343 0.16785 0.124 0.476 0.008 0.392
#> SRR772417 4 0.8135 0.13645 0.196 0.352 0.020 0.432
#> SRR772418 1 0.4697 0.25365 0.696 0.000 0.296 0.008
#> SRR772419 2 0.3831 0.45426 0.004 0.792 0.000 0.204
#> SRR772420 2 0.5526 0.31940 0.020 0.564 0.000 0.416
#> SRR772421 2 0.4740 0.47616 0.080 0.788 0.000 0.132
#> SRR772422 2 0.7584 0.18315 0.192 0.492 0.004 0.312
#> SRR772423 4 0.6042 0.03842 0.052 0.368 0.000 0.580
#> SRR772424 4 0.5024 0.19248 0.008 0.360 0.000 0.632
#> SRR772425 2 0.7145 0.27606 0.100 0.552 0.016 0.332
#> SRR772426 2 0.2053 0.47352 0.004 0.924 0.000 0.072
#> SRR772427 2 0.1109 0.46496 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR772428 1 0.7347 0.50530 0.612 0.248 0.072 0.068
#> SRR772429 4 0.8894 0.25384 0.264 0.296 0.052 0.388
#> SRR772430 2 0.4090 0.48699 0.076 0.844 0.008 0.072
#> SRR772431 4 0.5062 0.23696 0.020 0.300 0.000 0.680
#> SRR772432 4 0.5698 0.18685 0.036 0.356 0.000 0.608
#> SRR772433 1 0.6671 0.53961 0.644 0.044 0.052 0.260
#> SRR772434 1 0.7348 0.43598 0.628 0.048 0.200 0.124
#> SRR772435 2 0.8232 0.01648 0.156 0.420 0.036 0.388
#> SRR772436 2 0.7340 0.05090 0.156 0.436 0.000 0.408
#> SRR772437 3 0.3462 0.76036 0.116 0.020 0.860 0.004
#> SRR772438 2 0.9400 -0.11654 0.188 0.432 0.220 0.160
#> SRR772439 1 0.8786 0.18567 0.412 0.276 0.048 0.264
#> SRR772440 2 0.3617 0.49137 0.076 0.860 0.000 0.064
#> SRR772441 2 0.5847 0.31097 0.036 0.560 0.000 0.404
#> SRR772442 2 0.4881 0.46482 0.048 0.756 0.000 0.196
#> SRR772443 2 0.6457 0.25914 0.064 0.548 0.004 0.384
#> SRR772444 2 0.6979 0.18286 0.252 0.632 0.056 0.060
#> SRR772445 4 0.7762 0.15001 0.204 0.356 0.004 0.436
#> SRR772446 2 0.8449 -0.16325 0.300 0.364 0.020 0.316
#> SRR772447 2 0.7451 0.14639 0.172 0.508 0.004 0.316
#> SRR772448 2 0.5464 0.44242 0.064 0.708 0.000 0.228
#> SRR772449 2 0.4839 0.48100 0.044 0.756 0.000 0.200
#> SRR772450 2 0.4804 0.09328 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR772451 2 0.5383 0.03342 0.012 0.536 0.000 0.452
#> SRR772452 1 0.8638 0.11709 0.388 0.180 0.052 0.380
#> SRR772453 1 0.7513 0.46258 0.544 0.056 0.068 0.332
#> SRR772454 4 0.7251 -0.00134 0.144 0.416 0.000 0.440
#> SRR772455 2 0.6928 0.34136 0.156 0.664 0.036 0.144
#> SRR772456 4 0.4720 0.21298 0.004 0.324 0.000 0.672
#> SRR772457 4 0.5496 0.17485 0.024 0.372 0.000 0.604
#> SRR772458 4 0.8790 -0.33836 0.376 0.060 0.188 0.376
#> SRR772459 1 0.9644 0.03247 0.324 0.312 0.136 0.228
#> SRR772460 2 0.4564 0.15341 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR772461 2 0.4585 0.13992 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR772462 4 0.4978 0.16077 0.012 0.324 0.000 0.664
#> SRR772463 2 0.4706 0.43776 0.028 0.748 0.000 0.224
#> SRR772464 3 0.0336 0.80809 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772465 2 0.7082 -0.02906 0.368 0.500 0.000 0.132
#> SRR772466 2 0.7763 -0.03743 0.248 0.420 0.000 0.332
#> SRR772467 4 0.4916 0.09430 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR772468 2 0.5288 0.01733 0.008 0.520 0.000 0.472
#> SRR772469 2 0.8035 0.17180 0.192 0.576 0.068 0.164
#> SRR772470 1 0.7252 0.41411 0.580 0.212 0.008 0.200
#> SRR772471 1 0.7833 0.44204 0.556 0.188 0.032 0.224
#> SRR772472 4 0.7969 0.23695 0.256 0.236 0.016 0.492
#> SRR772473 2 0.6614 0.28976 0.076 0.544 0.004 0.376
#> SRR772474 2 0.5898 0.36837 0.048 0.604 0.000 0.348
#> SRR772475 1 0.5287 0.53083 0.760 0.156 0.076 0.008
#> SRR772476 2 0.5080 0.06061 0.004 0.576 0.000 0.420
#> SRR772477 2 0.4936 0.13438 0.008 0.652 0.000 0.340
#> SRR772478 1 0.7900 0.33540 0.540 0.268 0.036 0.156
#> SRR772479 1 0.8074 0.36670 0.524 0.124 0.056 0.296
#> SRR772480 2 0.6746 0.32707 0.116 0.568 0.000 0.316
#> SRR772481 2 0.3160 0.49121 0.020 0.872 0.000 0.108
#> SRR772482 1 0.6764 0.57905 0.688 0.132 0.048 0.132
#> SRR772483 2 0.8618 -0.13918 0.336 0.372 0.032 0.260
#> SRR772484 2 0.3725 0.48689 0.008 0.812 0.000 0.180
#> SRR772485 2 0.5902 0.25400 0.028 0.540 0.004 0.428
#> SRR772486 3 0.8616 0.17273 0.280 0.064 0.476 0.180
#> SRR772487 4 0.8537 0.24788 0.276 0.300 0.028 0.396
#> SRR772488 2 0.3351 0.49402 0.008 0.844 0.000 0.148
#> SRR772489 4 0.5901 -0.01976 0.036 0.432 0.000 0.532
#> SRR772490 4 0.9403 0.08931 0.232 0.212 0.136 0.420
#> SRR772491 4 0.8196 0.20312 0.276 0.228 0.024 0.472
#> SRR772492 2 0.4817 0.08945 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR772493 2 0.4855 0.08284 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR772494 2 0.3751 0.35915 0.004 0.800 0.000 0.196
#> SRR772495 2 0.3801 0.29965 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR772496 2 0.5118 0.48100 0.072 0.752 0.000 0.176
#> SRR772497 2 0.5716 0.46569 0.112 0.740 0.012 0.136
#> SRR772498 2 0.5354 0.42097 0.152 0.752 0.004 0.092
#> SRR772499 2 0.6172 0.38062 0.152 0.688 0.004 0.156
#> SRR772500 2 0.5587 0.39647 0.032 0.652 0.004 0.312
#> SRR772501 2 0.6020 0.28462 0.048 0.568 0.000 0.384
#> SRR772502 2 0.3239 0.47528 0.068 0.880 0.000 0.052
#> SRR772503 2 0.6699 0.33221 0.120 0.612 0.004 0.264
#> SRR772504 2 0.5386 0.22960 0.020 0.612 0.000 0.368
#> SRR772505 2 0.5865 0.35162 0.048 0.612 0.000 0.340
#> SRR772506 2 0.4877 0.33082 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR772507 2 0.4722 0.40861 0.008 0.692 0.000 0.300
#> SRR772508 2 0.4188 0.30018 0.004 0.752 0.000 0.244
#> SRR772509 1 0.5113 0.52065 0.776 0.136 0.080 0.008
#> SRR772510 3 0.0895 0.80779 0.020 0.004 0.976 0.000
#> SRR772511 2 0.7150 0.24886 0.132 0.532 0.004 0.332
#> SRR772512 2 0.7697 -0.01152 0.208 0.504 0.280 0.008
#> SRR772513 2 0.6833 0.39601 0.156 0.628 0.008 0.208
#> SRR772514 2 0.5756 0.34770 0.036 0.592 0.000 0.372
#> SRR772515 2 0.3958 0.49630 0.032 0.824 0.000 0.144
#> SRR772516 2 0.7013 0.22396 0.128 0.516 0.000 0.356
#> SRR772517 2 0.4889 0.33661 0.004 0.636 0.000 0.360
#> SRR772518 2 0.3463 0.49550 0.040 0.864 0.000 0.096
#> SRR772519 2 0.2174 0.48101 0.020 0.928 0.000 0.052
#> SRR772520 2 0.3030 0.49097 0.028 0.892 0.004 0.076
#> SRR772521 2 0.7572 0.16892 0.156 0.536 0.016 0.292
#> SRR772522 4 0.8065 0.18466 0.248 0.344 0.008 0.400
#> SRR772523 2 0.6233 0.22359 0.044 0.508 0.004 0.444
#> SRR772524 2 0.4874 0.47611 0.056 0.764 0.000 0.180
#> SRR772525 3 0.0707 0.80603 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772526 2 0.4008 0.28033 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR772527 2 0.3764 0.33467 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR772528 1 0.3933 0.37262 0.792 0.000 0.200 0.008
#> SRR772529 4 0.7906 0.24187 0.296 0.264 0.004 0.436
#> SRR772530 4 0.7418 0.26731 0.216 0.240 0.004 0.540
#> SRR772531 3 0.1661 0.79944 0.052 0.000 0.944 0.004
#> SRR772532 2 0.4123 0.45398 0.008 0.772 0.000 0.220
#> SRR772533 2 0.5085 0.33705 0.008 0.616 0.000 0.376
#> SRR772534 2 0.7843 -0.14206 0.264 0.372 0.000 0.364
#> SRR772535 2 0.4284 0.48782 0.020 0.780 0.000 0.200
#> SRR772536 2 0.2376 0.48690 0.016 0.916 0.000 0.068
#> SRR772537 2 0.5311 0.30470 0.024 0.648 0.000 0.328
#> SRR772538 2 0.4277 0.43455 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR772539 2 0.8025 -0.06918 0.188 0.420 0.016 0.376
#> SRR772540 4 0.7459 0.10281 0.160 0.352 0.004 0.484
#> SRR772541 2 0.4059 0.44741 0.012 0.788 0.000 0.200
#> SRR772542 1 0.8360 0.34710 0.476 0.144 0.056 0.324
#> SRR772543 1 0.8525 0.23273 0.424 0.120 0.076 0.380
#> SRR772544 3 0.1211 0.80736 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR772545 1 0.8119 0.42326 0.540 0.276 0.080 0.104
#> SRR772546 1 0.5723 0.57056 0.760 0.128 0.048 0.064
#> SRR772547 2 0.8582 -0.08773 0.228 0.400 0.036 0.336
#> SRR772548 2 0.7779 -0.04511 0.396 0.472 0.056 0.076
#> SRR772549 1 0.7542 0.50824 0.624 0.060 0.148 0.168
#> SRR772550 4 0.9040 -0.10324 0.304 0.104 0.160 0.432
#> SRR772551 2 0.6477 0.32432 0.100 0.600 0.000 0.300
#> SRR772552 2 0.3587 0.50150 0.040 0.856 0.000 0.104
#> SRR772553 1 0.5512 0.54217 0.760 0.140 0.080 0.020
#> SRR772554 2 0.3893 0.47767 0.008 0.796 0.000 0.196
#> SRR772555 2 0.4440 0.47607 0.060 0.804 0.000 0.136
#> SRR772556 2 0.7341 0.28954 0.196 0.624 0.040 0.140
#> SRR772557 1 0.6598 0.56576 0.700 0.160 0.076 0.064
#> SRR772558 2 0.4905 0.44746 0.096 0.788 0.004 0.112
#> SRR772559 4 0.7985 0.14327 0.320 0.272 0.004 0.404
#> SRR772560 2 0.6273 0.37611 0.108 0.644 0.000 0.248
#> SRR772561 3 0.4130 0.73284 0.108 0.064 0.828 0.000
#> SRR772562 2 0.5467 0.40047 0.024 0.648 0.004 0.324
#> SRR772563 2 0.5686 0.33211 0.028 0.616 0.004 0.352
#> SRR772564 1 0.9009 0.33944 0.416 0.072 0.284 0.228
#> SRR772565 2 0.9505 -0.16908 0.284 0.360 0.116 0.240
#> SRR772566 3 0.6468 0.52190 0.276 0.004 0.624 0.096
#> SRR772567 3 0.7796 0.35643 0.220 0.020 0.536 0.224
#> SRR772568 2 0.2089 0.48430 0.020 0.932 0.000 0.048
#> SRR772569 2 0.5137 0.41287 0.024 0.680 0.000 0.296
#> SRR772570 1 0.6246 0.52248 0.732 0.076 0.124 0.068
#> SRR772571 2 0.7083 0.18355 0.144 0.528 0.000 0.328
#> SRR772572 1 0.8933 0.49474 0.492 0.160 0.128 0.220
#> SRR772573 1 0.6159 0.55417 0.692 0.032 0.052 0.224
#> SRR772574 1 0.6152 0.52154 0.640 0.052 0.012 0.296
#> SRR772575 1 0.7730 0.24900 0.512 0.280 0.012 0.196
#> SRR772576 2 0.5769 0.34393 0.036 0.588 0.000 0.376
#> SRR772577 4 0.5970 0.16824 0.052 0.348 0.000 0.600
#> SRR772578 2 0.3652 0.45713 0.052 0.856 0.000 0.092
#> SRR772579 2 0.2473 0.47379 0.012 0.908 0.000 0.080
#> SRR772580 3 0.1151 0.80207 0.024 0.000 0.968 0.008
#> SRR772581 2 0.5471 0.43770 0.060 0.720 0.004 0.216
#> SRR772582 2 0.4855 0.44632 0.020 0.712 0.000 0.268
#> SRR772583 2 0.7927 0.26416 0.180 0.556 0.040 0.224
#> SRR772584 2 0.4348 0.48769 0.024 0.780 0.000 0.196
#> SRR772585 2 0.4824 0.47423 0.076 0.780 0.000 0.144
#> SRR772586 3 0.5273 0.27456 0.456 0.000 0.536 0.008
#> SRR772587 3 0.8374 0.13677 0.244 0.032 0.464 0.260
#> SRR772588 2 0.4431 0.38959 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR772589 4 0.5814 -0.08337 0.024 0.428 0.004 0.544
#> SRR772590 3 0.1867 0.79692 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR772591 3 0.8581 0.00790 0.308 0.032 0.400 0.260
#> SRR772592 3 0.6349 0.55586 0.164 0.008 0.680 0.148
#> SRR772593 1 0.4103 0.30243 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR772594 2 0.4136 0.48242 0.016 0.788 0.000 0.196
#> SRR772595 2 0.4973 0.30615 0.008 0.644 0.000 0.348
#> SRR772596 1 0.5290 -0.14648 0.516 0.000 0.476 0.008
#> SRR772597 3 0.0707 0.81040 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772598 1 0.7039 0.54785 0.680 0.112 0.088 0.120
#> SRR772599 1 0.7672 0.50552 0.596 0.148 0.048 0.208
#> SRR772600 4 0.6407 0.05466 0.068 0.412 0.000 0.520
#> SRR772601 4 0.5277 0.23465 0.028 0.304 0.000 0.668
#> SRR772602 3 0.0817 0.80918 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772603 2 0.6188 0.28147 0.056 0.548 0.000 0.396
#> SRR772604 2 0.6392 0.08502 0.064 0.484 0.000 0.452
#> SRR772605 2 0.3583 0.48836 0.040 0.864 0.004 0.092
#> SRR772606 1 0.8259 0.14768 0.436 0.372 0.040 0.152
#> SRR772607 1 0.5044 0.56187 0.808 0.060 0.060 0.072
#> SRR772608 2 0.4595 0.48738 0.040 0.776 0.000 0.184
#> SRR772609 2 0.6213 0.27541 0.048 0.556 0.004 0.392
#> SRR772610 2 0.4725 0.35637 0.012 0.728 0.004 0.256
#> SRR772611 2 0.3109 0.48431 0.016 0.880 0.004 0.100
#> SRR772612 4 0.5883 0.16175 0.040 0.388 0.000 0.572
#> SRR772613 4 0.4855 0.14663 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR772614 1 0.9431 0.39815 0.420 0.152 0.240 0.188
#> SRR772615 1 0.8736 0.12367 0.380 0.056 0.376 0.188
#> SRR772616 2 0.7841 -0.11338 0.424 0.428 0.032 0.116
#> SRR772617 2 0.5168 0.00155 0.004 0.504 0.000 0.492
#> SRR772618 4 0.5093 0.20804 0.012 0.348 0.000 0.640
#> SRR772619 2 0.4746 0.10144 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR772620 2 0.4961 0.03735 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR772621 2 0.6310 0.38492 0.152 0.660 0.000 0.188
#> SRR772622 2 0.4623 0.48524 0.088 0.816 0.012 0.084
#> SRR772623 3 0.2443 0.79948 0.060 0.000 0.916 0.024
#> SRR772624 1 0.4917 0.18986 0.656 0.000 0.336 0.008
#> SRR772625 1 0.5542 0.46773 0.644 0.328 0.016 0.012
#> SRR772626 2 0.6346 0.37186 0.084 0.628 0.004 0.284
#> SRR772627 2 0.5453 0.33104 0.020 0.592 0.000 0.388
#> SRR772628 1 0.9926 0.13755 0.284 0.256 0.192 0.268
#> SRR772629 1 0.6735 0.52973 0.664 0.032 0.096 0.208
#> SRR772630 1 0.8224 0.20555 0.436 0.200 0.024 0.340
#> SRR772631 1 0.3384 0.45765 0.860 0.024 0.116 0.000
#> SRR772632 2 0.3708 0.49703 0.020 0.832 0.000 0.148
#> SRR772633 2 0.1388 0.46752 0.012 0.960 0.000 0.028
#> SRR772634 2 0.8273 -0.06933 0.380 0.444 0.060 0.116
#> SRR772635 2 0.6426 0.31859 0.080 0.568 0.000 0.352
#> SRR772636 1 0.5302 0.43506 0.628 0.356 0.004 0.012
#> SRR772637 1 0.7385 0.35678 0.580 0.016 0.232 0.172
#> SRR772638 2 0.9728 -0.22423 0.276 0.308 0.140 0.276
#> SRR772639 2 0.6079 0.44474 0.120 0.692 0.004 0.184
#> SRR772640 4 0.5004 0.12905 0.004 0.392 0.000 0.604
#> SRR772641 4 0.5428 0.14298 0.020 0.380 0.000 0.600
#> SRR772642 2 0.8089 0.01850 0.240 0.464 0.016 0.280
#> SRR772643 2 0.3128 0.45221 0.032 0.888 0.004 0.076
#> SRR772644 2 0.8294 -0.13359 0.324 0.396 0.016 0.264
#> SRR772645 2 0.8564 -0.08727 0.228 0.412 0.036 0.324
#> SRR772646 2 0.4746 0.40166 0.008 0.688 0.000 0.304
#> SRR772647 2 0.2124 0.48420 0.028 0.932 0.000 0.040
#> SRR772648 2 0.6340 0.38723 0.096 0.620 0.000 0.284
#> SRR772649 2 0.8834 -0.05772 0.308 0.420 0.060 0.212
#> SRR772650 2 0.6900 0.09792 0.080 0.468 0.008 0.444
#> SRR772651 2 0.8028 -0.18665 0.356 0.364 0.004 0.276
#> SRR772652 1 0.7463 0.35386 0.532 0.248 0.004 0.216
#> SRR772653 1 0.8045 0.38955 0.536 0.280 0.056 0.128
#> SRR772654 2 0.6797 0.32447 0.240 0.600 0.000 0.160
#> SRR772655 1 0.7686 0.11544 0.492 0.244 0.004 0.260
#> SRR772656 3 0.7257 0.47135 0.248 0.052 0.616 0.084
#> SRR772657 3 0.2760 0.76512 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR772658 2 0.4830 0.09662 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR772659 2 0.4978 0.09449 0.004 0.612 0.000 0.384
#> SRR772660 2 0.6608 0.31766 0.064 0.572 0.012 0.352
#> SRR772661 1 0.3484 0.43237 0.844 0.008 0.144 0.004
#> SRR772662 2 0.5496 0.45207 0.108 0.732 0.000 0.160
#> SRR772663 2 0.6180 0.38932 0.080 0.624 0.000 0.296
#> SRR772664 2 0.7407 0.17584 0.224 0.516 0.000 0.260
#> SRR772665 2 0.3858 0.49872 0.036 0.844 0.004 0.116
#> SRR772666 3 0.1305 0.80692 0.036 0.000 0.960 0.004
#> SRR772667 4 0.5038 0.19440 0.012 0.336 0.000 0.652
#> SRR772668 2 0.4994 -0.00811 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR772669 2 0.4994 -0.00811 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR772670 2 0.7558 0.00740 0.168 0.456 0.004 0.372
#> SRR772671 2 0.6506 0.35643 0.132 0.628 0.000 0.240
#> SRR772672 2 0.5168 0.44051 0.040 0.712 0.000 0.248
#> SRR772673 2 0.5668 0.39865 0.048 0.652 0.000 0.300
#> SRR772674 3 0.2983 0.78896 0.108 0.004 0.880 0.008
#> SRR772675 1 0.4900 0.50570 0.788 0.092 0.116 0.004
#> SRR772676 2 0.7557 0.16899 0.280 0.556 0.024 0.140
#> SRR772677 4 0.9525 0.07361 0.144 0.188 0.292 0.376
#> SRR772678 1 0.4605 0.50763 0.824 0.052 0.096 0.028
#> SRR772679 2 0.5459 0.46477 0.072 0.732 0.004 0.192
#> SRR772680 1 0.7511 0.36972 0.504 0.116 0.020 0.360
#> SRR772681 3 0.3382 0.76253 0.040 0.080 0.876 0.004
#> SRR772682 2 0.4011 0.47855 0.008 0.784 0.000 0.208
#> SRR772683 2 0.2101 0.47375 0.012 0.928 0.000 0.060
#> SRR772685 2 0.5785 0.39160 0.064 0.664 0.000 0.272
#> SRR772686 3 0.0469 0.80821 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772687 3 0.3196 0.75684 0.136 0.000 0.856 0.008
#> SRR772688 2 0.4088 0.26491 0.004 0.764 0.000 0.232
#> SRR772689 2 0.4295 0.26673 0.008 0.752 0.000 0.240
#> SRR772690 3 0.0707 0.80821 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772691 1 0.5522 0.52775 0.748 0.160 0.080 0.012
#> SRR772692 2 0.7052 0.31538 0.152 0.596 0.008 0.244
#> SRR772693 4 0.8130 0.20710 0.356 0.268 0.008 0.368
#> SRR772694 2 0.3239 0.48083 0.052 0.880 0.000 0.068
#> SRR772695 2 0.5595 0.43209 0.056 0.700 0.004 0.240
#> SRR772696 2 0.4985 0.46490 0.080 0.768 0.000 0.152
#> SRR772697 2 0.5192 0.45526 0.076 0.760 0.004 0.160
#> SRR772698 1 0.5033 0.30915 0.708 0.004 0.268 0.020
#> SRR772699 2 0.8440 -0.00322 0.300 0.472 0.048 0.180
#> SRR772700 1 0.8360 -0.07932 0.416 0.348 0.028 0.208
#> SRR772701 1 0.8422 -0.10112 0.356 0.272 0.020 0.352
#> SRR772702 1 0.6387 0.50554 0.612 0.036 0.028 0.324
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.6706 4.80e-01 0.512 0.308 0.008 0.008 0.164
#> SRR772342 1 0.6009 4.67e-01 0.668 0.144 0.032 0.004 0.152
#> SRR772343 2 0.6778 3.09e-01 0.212 0.600 0.008 0.052 0.128
#> SRR772344 2 0.5538 7.83e-02 0.056 0.500 0.000 0.440 0.004
#> SRR772345 2 0.5900 1.99e-01 0.108 0.516 0.000 0.376 0.000
#> SRR772346 2 0.8254 1.60e-01 0.328 0.376 0.008 0.128 0.160
#> SRR772347 2 0.7489 -2.34e-01 0.380 0.384 0.000 0.056 0.180
#> SRR772348 2 0.5243 5.62e-01 0.088 0.672 0.000 0.236 0.004
#> SRR772349 2 0.5217 5.53e-01 0.088 0.676 0.000 0.232 0.004
#> SRR772350 3 0.2645 7.73e-01 0.096 0.000 0.884 0.012 0.008
#> SRR772351 4 0.4949 -2.16e-01 0.020 0.444 0.000 0.532 0.004
#> SRR772352 2 0.5617 4.98e-01 0.232 0.668 0.000 0.064 0.036
#> SRR772353 2 0.6704 1.51e-01 0.260 0.560 0.000 0.040 0.140
#> SRR772354 2 0.6476 5.62e-01 0.120 0.640 0.000 0.148 0.092
#> SRR772355 2 0.5224 5.14e-01 0.080 0.644 0.000 0.276 0.000
#> SRR772356 2 0.6322 1.61e-01 0.128 0.496 0.000 0.368 0.008
#> SRR772357 1 0.8439 2.51e-02 0.316 0.300 0.000 0.204 0.180
#> SRR772358 2 0.7095 1.26e-01 0.312 0.532 0.028 0.040 0.088
#> SRR772359 5 0.6347 9.89e-02 0.288 0.160 0.008 0.000 0.544
#> SRR772360 2 0.7213 -1.51e-01 0.240 0.496 0.000 0.044 0.220
#> SRR772361 3 0.1907 7.94e-01 0.028 0.000 0.928 0.000 0.044
#> SRR772362 4 0.4291 -1.48e-01 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR772363 4 0.1965 6.04e-01 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR772364 2 0.5831 3.60e-01 0.180 0.680 0.004 0.104 0.032
#> SRR772365 2 0.6333 4.08e-01 0.260 0.600 0.028 0.108 0.004
#> SRR772366 3 0.5882 4.50e-01 0.084 0.000 0.572 0.012 0.332
#> SRR772367 3 0.0000 8.02e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772368 4 0.5549 -1.96e-01 0.056 0.464 0.000 0.476 0.004
#> SRR772369 2 0.4530 5.08e-01 0.112 0.788 0.004 0.020 0.076
#> SRR772370 2 0.8428 2.89e-01 0.196 0.392 0.004 0.192 0.216
#> SRR772371 1 0.6652 2.95e-01 0.440 0.196 0.000 0.004 0.360
#> SRR772372 1 0.6964 5.07e-01 0.608 0.180 0.012 0.120 0.080
#> SRR772373 2 0.5050 5.73e-01 0.120 0.700 0.000 0.180 0.000
#> SRR772374 2 0.5283 4.53e-01 0.032 0.600 0.000 0.352 0.016
#> SRR772375 3 0.0162 8.02e-01 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772376 2 0.5136 5.41e-01 0.080 0.660 0.000 0.260 0.000
#> SRR772377 5 0.1831 5.46e-01 0.000 0.004 0.076 0.000 0.920
#> SRR772378 2 0.6964 4.72e-01 0.300 0.532 0.004 0.108 0.056
#> SRR772379 2 0.5125 4.44e-01 0.060 0.672 0.000 0.260 0.008
#> SRR772380 2 0.6218 5.73e-01 0.144 0.664 0.000 0.100 0.092
#> SRR772381 3 0.4087 7.22e-01 0.040 0.000 0.784 0.008 0.168
#> SRR772382 1 0.7522 4.22e-01 0.516 0.268 0.016 0.068 0.132
#> SRR772383 2 0.8455 -4.35e-01 0.324 0.364 0.124 0.016 0.172
#> SRR772384 5 0.0968 5.52e-01 0.004 0.012 0.012 0.000 0.972
#> SRR772385 5 0.1686 5.54e-01 0.012 0.036 0.004 0.004 0.944
#> SRR772386 2 0.6302 5.51e-01 0.192 0.552 0.000 0.252 0.004
#> SRR772387 2 0.6451 5.46e-01 0.104 0.608 0.000 0.232 0.056
#> SRR772388 5 0.6676 2.31e-01 0.364 0.004 0.200 0.000 0.432
#> SRR772389 3 0.6502 4.14e-01 0.316 0.008 0.508 0.000 0.168
#> SRR772390 5 0.4702 4.33e-01 0.072 0.000 0.192 0.004 0.732
#> SRR772391 1 0.5947 3.71e-01 0.624 0.092 0.008 0.012 0.264
#> SRR772392 1 0.8370 4.79e-01 0.464 0.260 0.108 0.048 0.120
#> SRR772393 2 0.6056 5.47e-01 0.136 0.604 0.000 0.248 0.012
#> SRR772394 2 0.6301 2.77e-01 0.284 0.572 0.000 0.124 0.020
#> SRR772395 2 0.5789 4.61e-01 0.088 0.552 0.000 0.356 0.004
#> SRR772396 1 0.7278 4.27e-01 0.448 0.284 0.004 0.024 0.240
#> SRR772397 1 0.7696 4.62e-01 0.540 0.184 0.080 0.024 0.172
#> SRR772398 3 0.8787 -8.12e-03 0.216 0.040 0.340 0.096 0.308
#> SRR772399 5 0.8688 -1.61e-01 0.252 0.272 0.012 0.144 0.320
#> SRR772400 5 0.6752 3.23e-01 0.316 0.068 0.048 0.016 0.552
#> SRR772401 5 0.9115 -2.60e-01 0.276 0.276 0.052 0.112 0.284
#> SRR772402 4 0.6599 1.72e-01 0.180 0.400 0.000 0.416 0.004
#> SRR772403 4 0.4682 5.88e-01 0.060 0.212 0.000 0.724 0.004
#> SRR772404 2 0.5205 5.79e-01 0.104 0.672 0.000 0.224 0.000
#> SRR772405 5 0.0865 5.50e-01 0.000 0.004 0.024 0.000 0.972
#> SRR772406 4 0.6576 -1.51e-01 0.080 0.360 0.000 0.512 0.048
#> SRR772407 2 0.6357 4.61e-01 0.116 0.476 0.000 0.396 0.012
#> SRR772408 2 0.4403 3.81e-01 0.004 0.560 0.000 0.436 0.000
#> SRR772409 2 0.4445 4.81e-01 0.024 0.700 0.000 0.272 0.004
#> SRR772410 2 0.7820 3.82e-01 0.156 0.420 0.000 0.316 0.108
#> SRR772411 2 0.5384 4.76e-01 0.288 0.632 0.000 0.076 0.004
#> SRR772412 1 0.7184 4.98e-01 0.524 0.240 0.024 0.016 0.196
#> SRR772413 1 0.7205 4.58e-01 0.556 0.180 0.096 0.000 0.168
#> SRR772414 3 0.0609 8.02e-01 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772415 2 0.4378 5.37e-01 0.036 0.716 0.000 0.248 0.000
#> SRR772416 2 0.4974 3.38e-01 0.316 0.640 0.000 0.004 0.040
#> SRR772417 1 0.6373 3.82e-01 0.560 0.340 0.020 0.032 0.048
#> SRR772418 5 0.4499 4.70e-01 0.096 0.000 0.136 0.004 0.764
#> SRR772419 4 0.4976 -2.73e-01 0.028 0.468 0.000 0.504 0.000
#> SRR772420 2 0.4386 5.45e-01 0.096 0.764 0.000 0.140 0.000
#> SRR772421 2 0.6630 5.12e-01 0.208 0.472 0.000 0.316 0.004
#> SRR772422 2 0.7406 2.95e-01 0.352 0.440 0.000 0.132 0.076
#> SRR772423 2 0.6653 -3.47e-04 0.192 0.484 0.000 0.316 0.008
#> SRR772424 4 0.4441 5.80e-01 0.044 0.236 0.000 0.720 0.000
#> SRR772425 2 0.6376 4.06e-01 0.320 0.568 0.016 0.076 0.020
#> SRR772426 2 0.4599 4.44e-01 0.020 0.624 0.000 0.356 0.000
#> SRR772427 2 0.4481 3.99e-01 0.008 0.576 0.000 0.416 0.000
#> SRR772428 5 0.7038 2.93e-01 0.176 0.160 0.008 0.068 0.588
#> SRR772429 1 0.7502 3.78e-01 0.464 0.352 0.024 0.052 0.108
#> SRR772430 2 0.6847 5.32e-01 0.188 0.528 0.004 0.260 0.020
#> SRR772431 4 0.4946 5.16e-01 0.052 0.300 0.000 0.648 0.000
#> SRR772432 4 0.4806 5.66e-01 0.060 0.252 0.000 0.688 0.000
#> SRR772433 5 0.6972 -3.94e-02 0.428 0.080 0.040 0.016 0.436
#> SRR772434 5 0.6208 3.83e-01 0.268 0.036 0.072 0.008 0.616
#> SRR772435 2 0.5812 3.17e-01 0.172 0.656 0.000 0.016 0.156
#> SRR772436 1 0.5242 8.66e-02 0.556 0.400 0.000 0.040 0.004
#> SRR772437 3 0.2795 7.75e-01 0.028 0.008 0.884 0.000 0.080
#> SRR772438 1 0.8802 3.90e-01 0.444 0.196 0.180 0.112 0.068
#> SRR772439 1 0.6959 3.99e-01 0.588 0.140 0.016 0.044 0.212
#> SRR772440 2 0.6163 5.21e-01 0.168 0.540 0.000 0.292 0.000
#> SRR772441 2 0.4910 5.13e-01 0.096 0.744 0.000 0.144 0.016
#> SRR772442 2 0.5832 4.66e-01 0.096 0.560 0.000 0.340 0.004
#> SRR772443 2 0.5116 5.15e-01 0.188 0.692 0.000 0.120 0.000
#> SRR772444 2 0.9014 1.65e-01 0.180 0.364 0.036 0.224 0.196
#> SRR772445 2 0.6318 -8.55e-02 0.432 0.468 0.000 0.044 0.056
#> SRR772446 1 0.6746 3.61e-01 0.472 0.368 0.004 0.016 0.140
#> SRR772447 2 0.6545 3.27e-02 0.400 0.476 0.000 0.088 0.036
#> SRR772448 2 0.6101 5.63e-01 0.188 0.612 0.000 0.188 0.012
#> SRR772449 2 0.5197 5.66e-01 0.116 0.680 0.000 0.204 0.000
#> SRR772450 4 0.1121 6.06e-01 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772451 4 0.3732 6.01e-01 0.032 0.176 0.000 0.792 0.000
#> SRR772452 1 0.6638 4.50e-01 0.560 0.208 0.016 0.004 0.212
#> SRR772453 1 0.6591 3.20e-01 0.576 0.112 0.024 0.012 0.276
#> SRR772454 1 0.5403 2.20e-01 0.556 0.396 0.000 0.032 0.016
#> SRR772455 1 0.7634 -2.54e-01 0.408 0.388 0.032 0.140 0.032
#> SRR772456 4 0.3949 5.51e-01 0.004 0.300 0.000 0.696 0.000
#> SRR772457 4 0.4042 5.84e-01 0.032 0.212 0.000 0.756 0.000
#> SRR772458 1 0.5427 4.45e-01 0.732 0.076 0.088 0.000 0.104
#> SRR772459 1 0.7929 4.47e-01 0.428 0.284 0.088 0.004 0.196
#> SRR772460 4 0.3398 4.71e-01 0.004 0.216 0.000 0.780 0.000
#> SRR772461 4 0.3266 5.10e-01 0.004 0.200 0.000 0.796 0.000
#> SRR772462 4 0.5652 3.49e-01 0.064 0.460 0.000 0.472 0.004
#> SRR772463 2 0.5386 4.34e-01 0.064 0.564 0.000 0.372 0.000
#> SRR772464 3 0.0162 8.03e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772465 5 0.8510 -2.09e-01 0.220 0.288 0.000 0.192 0.300
#> SRR772466 2 0.6443 1.81e-01 0.188 0.596 0.000 0.028 0.188
#> SRR772467 4 0.4503 5.73e-01 0.028 0.268 0.000 0.700 0.004
#> SRR772468 4 0.3757 5.85e-01 0.020 0.208 0.000 0.772 0.000
#> SRR772469 1 0.8619 3.92e-02 0.344 0.344 0.028 0.156 0.128
#> SRR772470 5 0.7506 -1.18e-01 0.360 0.196 0.000 0.052 0.392
#> SRR772471 1 0.7105 1.28e-01 0.408 0.148 0.000 0.040 0.404
#> SRR772472 1 0.5194 5.41e-01 0.672 0.252 0.000 0.008 0.068
#> SRR772473 2 0.6768 1.01e-01 0.148 0.440 0.000 0.392 0.020
#> SRR772474 2 0.5924 2.56e-01 0.096 0.524 0.000 0.376 0.004
#> SRR772475 5 0.2196 5.52e-01 0.000 0.056 0.004 0.024 0.916
#> SRR772476 4 0.2612 6.15e-01 0.008 0.124 0.000 0.868 0.000
#> SRR772477 4 0.2488 5.70e-01 0.004 0.124 0.000 0.872 0.000
#> SRR772478 5 0.7339 -8.16e-02 0.268 0.272 0.004 0.024 0.432
#> SRR772479 5 0.7677 -1.93e-01 0.256 0.324 0.052 0.000 0.368
#> SRR772480 2 0.6166 5.10e-01 0.228 0.620 0.000 0.124 0.028
#> SRR772481 2 0.5486 5.35e-01 0.096 0.640 0.000 0.260 0.004
#> SRR772482 5 0.5966 3.23e-01 0.216 0.128 0.000 0.020 0.636
#> SRR772483 1 0.7743 3.44e-01 0.380 0.340 0.000 0.068 0.212
#> SRR772484 2 0.4794 5.07e-01 0.032 0.656 0.000 0.308 0.004
#> SRR772485 2 0.3804 5.20e-01 0.132 0.812 0.000 0.052 0.004
#> SRR772486 1 0.7521 1.20e-01 0.444 0.048 0.308 0.004 0.196
#> SRR772487 1 0.6970 3.68e-01 0.432 0.416 0.016 0.020 0.116
#> SRR772488 2 0.4924 5.30e-01 0.060 0.668 0.000 0.272 0.000
#> SRR772489 2 0.6099 9.56e-02 0.116 0.552 0.000 0.324 0.008
#> SRR772490 1 0.5410 5.28e-01 0.720 0.152 0.080 0.000 0.048
#> SRR772491 1 0.6986 4.96e-01 0.468 0.356 0.028 0.004 0.144
#> SRR772492 4 0.1202 6.09e-01 0.004 0.032 0.000 0.960 0.004
#> SRR772493 4 0.1443 6.14e-01 0.004 0.044 0.000 0.948 0.004
#> SRR772494 4 0.4138 1.73e-01 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR772495 4 0.4362 2.24e-01 0.004 0.360 0.000 0.632 0.004
#> SRR772496 2 0.5630 5.76e-01 0.116 0.660 0.000 0.212 0.012
#> SRR772497 2 0.6750 5.75e-01 0.172 0.580 0.000 0.200 0.048
#> SRR772498 2 0.7671 4.99e-01 0.144 0.480 0.000 0.256 0.120
#> SRR772499 2 0.6976 5.30e-01 0.092 0.584 0.000 0.172 0.152
#> SRR772500 2 0.4319 5.71e-01 0.064 0.784 0.000 0.140 0.012
#> SRR772501 2 0.5423 4.62e-01 0.112 0.644 0.000 0.244 0.000
#> SRR772502 2 0.6471 4.73e-01 0.156 0.500 0.000 0.336 0.008
#> SRR772503 2 0.6344 3.95e-01 0.304 0.556 0.000 0.120 0.020
#> SRR772504 4 0.5205 3.59e-01 0.048 0.312 0.000 0.632 0.008
#> SRR772505 2 0.5124 5.58e-01 0.144 0.708 0.000 0.144 0.004
#> SRR772506 2 0.4087 4.74e-01 0.036 0.756 0.000 0.208 0.000
#> SRR772507 2 0.3844 5.43e-01 0.044 0.792 0.000 0.164 0.000
#> SRR772508 4 0.4958 7.79e-02 0.032 0.348 0.000 0.616 0.004
#> SRR772509 5 0.1404 5.56e-01 0.004 0.028 0.004 0.008 0.956
#> SRR772510 3 0.0609 8.02e-01 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.6322 4.16e-01 0.276 0.588 0.000 0.100 0.036
#> SRR772512 3 0.8315 -2.15e-01 0.012 0.324 0.364 0.100 0.200
#> SRR772513 2 0.6881 5.71e-01 0.172 0.592 0.000 0.152 0.084
#> SRR772514 2 0.5312 2.82e-01 0.056 0.628 0.000 0.308 0.008
#> SRR772515 2 0.4795 5.57e-01 0.072 0.704 0.000 0.224 0.000
#> SRR772516 2 0.6958 4.29e-01 0.236 0.520 0.000 0.212 0.032
#> SRR772517 2 0.4620 3.53e-01 0.028 0.652 0.000 0.320 0.000
#> SRR772518 2 0.6413 5.15e-01 0.096 0.560 0.000 0.308 0.036
#> SRR772519 2 0.4897 4.53e-01 0.028 0.616 0.000 0.352 0.004
#> SRR772520 2 0.5213 5.05e-01 0.056 0.628 0.000 0.312 0.004
#> SRR772521 1 0.6943 4.86e-05 0.452 0.376 0.004 0.144 0.024
#> SRR772522 1 0.6333 4.60e-01 0.588 0.284 0.000 0.052 0.076
#> SRR772523 2 0.3960 4.91e-01 0.140 0.800 0.000 0.056 0.004
#> SRR772524 2 0.6005 5.51e-01 0.144 0.604 0.000 0.244 0.008
#> SRR772525 3 0.1443 7.93e-01 0.044 0.000 0.948 0.004 0.004
#> SRR772526 4 0.4276 1.71e-01 0.004 0.380 0.000 0.616 0.000
#> SRR772527 4 0.4632 -8.90e-02 0.012 0.448 0.000 0.540 0.000
#> SRR772528 5 0.3089 5.38e-01 0.076 0.000 0.040 0.012 0.872
#> SRR772529 2 0.6771 -3.88e-01 0.372 0.424 0.000 0.008 0.196
#> SRR772530 1 0.5522 4.55e-01 0.564 0.376 0.004 0.004 0.052
#> SRR772531 3 0.3304 7.54e-01 0.052 0.000 0.852 0.004 0.092
#> SRR772532 2 0.4083 5.25e-01 0.028 0.744 0.000 0.228 0.000
#> SRR772533 2 0.3604 5.21e-01 0.056 0.836 0.000 0.100 0.008
#> SRR772534 1 0.7314 4.16e-01 0.504 0.280 0.000 0.084 0.132
#> SRR772535 2 0.5830 5.40e-01 0.124 0.604 0.000 0.268 0.004
#> SRR772536 2 0.4678 4.94e-01 0.028 0.668 0.000 0.300 0.004
#> SRR772537 2 0.5471 2.43e-01 0.040 0.576 0.000 0.368 0.016
#> SRR772538 2 0.4366 4.04e-01 0.016 0.664 0.000 0.320 0.000
#> SRR772539 2 0.6452 7.57e-03 0.384 0.508 0.004 0.040 0.064
#> SRR772540 2 0.6055 -2.66e-02 0.352 0.552 0.000 0.024 0.072
#> SRR772541 2 0.5051 2.55e-01 0.024 0.492 0.000 0.480 0.004
#> SRR772542 1 0.6734 4.36e-01 0.624 0.104 0.032 0.036 0.204
#> SRR772543 1 0.7916 3.40e-01 0.432 0.248 0.068 0.008 0.244
#> SRR772544 3 0.1469 7.98e-01 0.016 0.000 0.948 0.000 0.036
#> SRR772545 5 0.7120 2.03e-01 0.136 0.220 0.012 0.060 0.572
#> SRR772546 5 0.4883 4.98e-01 0.104 0.080 0.000 0.048 0.768
#> SRR772547 2 0.7075 -1.54e-01 0.384 0.432 0.004 0.028 0.152
#> SRR772548 5 0.8392 -1.52e-01 0.176 0.276 0.004 0.168 0.376
#> SRR772549 5 0.6617 2.91e-01 0.320 0.088 0.052 0.000 0.540
#> SRR772550 1 0.5561 4.53e-01 0.724 0.132 0.064 0.004 0.076
#> SRR772551 2 0.6574 2.63e-01 0.380 0.476 0.000 0.124 0.020
#> SRR772552 2 0.5611 5.57e-01 0.092 0.656 0.000 0.236 0.016
#> SRR772553 5 0.2290 5.52e-01 0.016 0.044 0.004 0.016 0.920
#> SRR772554 2 0.4354 5.27e-01 0.032 0.712 0.000 0.256 0.000
#> SRR772555 2 0.6426 5.28e-01 0.184 0.572 0.000 0.228 0.016
#> SRR772556 2 0.8209 2.67e-01 0.280 0.420 0.008 0.144 0.148
#> SRR772557 5 0.5805 4.87e-01 0.112 0.124 0.032 0.020 0.712
#> SRR772558 2 0.7477 4.72e-01 0.252 0.428 0.000 0.276 0.044
#> SRR772559 1 0.5138 5.34e-01 0.684 0.228 0.004 0.000 0.084
#> SRR772560 2 0.6068 4.53e-01 0.348 0.544 0.000 0.096 0.012
#> SRR772561 3 0.3143 7.69e-01 0.028 0.020 0.876 0.004 0.072
#> SRR772562 2 0.3281 5.74e-01 0.092 0.848 0.000 0.060 0.000
#> SRR772563 2 0.2879 5.39e-01 0.080 0.880 0.000 0.032 0.008
#> SRR772564 1 0.7416 3.02e-01 0.532 0.080 0.196 0.004 0.188
#> SRR772565 2 0.8210 -3.53e-01 0.364 0.368 0.068 0.028 0.172
#> SRR772566 3 0.7208 3.37e-01 0.308 0.016 0.464 0.012 0.200
#> SRR772567 3 0.7582 2.10e-01 0.360 0.084 0.412 0.000 0.144
#> SRR772568 2 0.4922 4.77e-01 0.028 0.636 0.000 0.328 0.008
#> SRR772569 2 0.4664 5.74e-01 0.096 0.748 0.000 0.152 0.004
#> SRR772570 5 0.5393 4.88e-01 0.140 0.048 0.068 0.008 0.736
#> SRR772571 2 0.7219 1.78e-01 0.320 0.484 0.000 0.128 0.068
#> SRR772572 1 0.7654 3.02e-01 0.496 0.132 0.060 0.024 0.288
#> SRR772573 1 0.6540 1.90e-01 0.516 0.064 0.040 0.008 0.372
#> SRR772574 5 0.6859 1.79e-01 0.240 0.220 0.004 0.016 0.520
#> SRR772575 5 0.8015 -1.34e-01 0.268 0.208 0.000 0.112 0.412
#> SRR772576 2 0.5550 5.41e-01 0.188 0.660 0.000 0.148 0.004
#> SRR772577 4 0.6140 3.53e-01 0.140 0.356 0.000 0.504 0.000
#> SRR772578 2 0.6398 3.91e-01 0.092 0.464 0.000 0.420 0.024
#> SRR772579 2 0.4954 4.02e-01 0.020 0.528 0.000 0.448 0.004
#> SRR772580 3 0.0324 8.02e-01 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772581 2 0.5814 5.47e-01 0.200 0.628 0.000 0.168 0.004
#> SRR772582 2 0.5231 5.72e-01 0.100 0.704 0.000 0.184 0.012
#> SRR772583 2 0.6670 4.70e-01 0.188 0.612 0.004 0.056 0.140
#> SRR772584 2 0.5537 5.63e-01 0.112 0.660 0.000 0.220 0.008
#> SRR772585 2 0.5941 5.58e-01 0.188 0.612 0.000 0.196 0.004
#> SRR772586 5 0.5957 1.01e-01 0.096 0.000 0.344 0.008 0.552
#> SRR772587 1 0.7069 1.48e-01 0.484 0.068 0.356 0.004 0.088
#> SRR772588 2 0.4201 4.94e-01 0.044 0.752 0.000 0.204 0.000
#> SRR772589 2 0.5492 -5.50e-02 0.068 0.588 0.000 0.340 0.004
#> SRR772590 3 0.1872 7.93e-01 0.020 0.000 0.928 0.000 0.052
#> SRR772591 1 0.7536 1.29e-01 0.464 0.092 0.324 0.004 0.116
#> SRR772592 3 0.5860 3.56e-01 0.416 0.032 0.520 0.008 0.024
#> SRR772593 5 0.2179 5.39e-01 0.004 0.000 0.100 0.000 0.896
#> SRR772594 2 0.4608 5.29e-01 0.036 0.700 0.000 0.260 0.004
#> SRR772595 4 0.5178 2.98e-01 0.032 0.448 0.000 0.516 0.004
#> SRR772596 5 0.5967 1.15e-01 0.088 0.000 0.344 0.012 0.556
#> SRR772597 3 0.0854 8.03e-01 0.008 0.000 0.976 0.004 0.012
#> SRR772598 5 0.6924 4.36e-01 0.136 0.112 0.080 0.032 0.640
#> SRR772599 5 0.6830 1.14e-02 0.304 0.204 0.008 0.004 0.480
#> SRR772600 4 0.6317 3.14e-01 0.144 0.356 0.000 0.496 0.004
#> SRR772601 4 0.5404 5.35e-01 0.080 0.260 0.000 0.652 0.008
#> SRR772602 3 0.0404 8.04e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772603 2 0.6033 3.87e-01 0.132 0.568 0.000 0.296 0.004
#> SRR772604 2 0.6368 7.71e-02 0.132 0.484 0.000 0.376 0.008
#> SRR772605 2 0.5887 5.16e-01 0.104 0.588 0.000 0.300 0.008
#> SRR772606 5 0.7886 -2.52e-01 0.320 0.276 0.000 0.068 0.336
#> SRR772607 5 0.4439 4.77e-01 0.204 0.040 0.004 0.004 0.748
#> SRR772608 2 0.4837 5.81e-01 0.092 0.728 0.000 0.176 0.004
#> SRR772609 2 0.4791 5.06e-01 0.160 0.736 0.000 0.100 0.004
#> SRR772610 4 0.4653 2.76e-01 0.016 0.324 0.000 0.652 0.008
#> SRR772611 2 0.5166 4.77e-01 0.044 0.604 0.000 0.348 0.004
#> SRR772612 4 0.5935 4.59e-01 0.092 0.352 0.000 0.548 0.008
#> SRR772613 4 0.3461 6.00e-01 0.004 0.224 0.000 0.772 0.000
#> SRR772614 1 0.8542 2.68e-01 0.404 0.132 0.188 0.020 0.256
#> SRR772615 1 0.7623 2.16e-01 0.480 0.068 0.236 0.004 0.212
#> SRR772616 1 0.8361 3.00e-01 0.376 0.240 0.008 0.112 0.264
#> SRR772617 4 0.3011 6.26e-01 0.016 0.140 0.000 0.844 0.000
#> SRR772618 4 0.4355 5.79e-01 0.044 0.224 0.000 0.732 0.000
#> SRR772619 4 0.0771 6.04e-01 0.000 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR772620 4 0.2179 6.22e-01 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR772621 2 0.7521 2.97e-01 0.340 0.412 0.000 0.192 0.056
#> SRR772622 2 0.6830 5.46e-01 0.208 0.524 0.004 0.248 0.016
#> SRR772623 3 0.3984 7.51e-01 0.112 0.004 0.812 0.004 0.068
#> SRR772624 5 0.4887 4.28e-01 0.084 0.000 0.180 0.008 0.728
#> SRR772625 5 0.4653 4.53e-01 0.004 0.132 0.000 0.112 0.752
#> SRR772626 2 0.5410 5.62e-01 0.168 0.692 0.000 0.128 0.012
#> SRR772627 2 0.5115 8.92e-02 0.036 0.484 0.000 0.480 0.000
#> SRR772628 1 0.5884 4.81e-01 0.716 0.104 0.100 0.016 0.064
#> SRR772629 1 0.7106 4.99e-02 0.456 0.068 0.068 0.012 0.396
#> SRR772630 1 0.7903 4.00e-01 0.484 0.208 0.020 0.068 0.220
#> SRR772631 5 0.0771 5.48e-01 0.020 0.000 0.004 0.000 0.976
#> SRR772632 2 0.5150 5.44e-01 0.076 0.652 0.000 0.272 0.000
#> SRR772633 2 0.4769 4.19e-01 0.016 0.588 0.000 0.392 0.004
#> SRR772634 5 0.8428 -2.56e-01 0.264 0.300 0.004 0.124 0.308
#> SRR772635 2 0.5836 5.09e-01 0.200 0.664 0.000 0.104 0.032
#> SRR772636 5 0.5108 4.23e-01 0.008 0.156 0.000 0.120 0.716
#> SRR772637 1 0.6752 3.73e-02 0.492 0.016 0.148 0.004 0.340
#> SRR772638 1 0.6891 4.40e-01 0.620 0.168 0.092 0.012 0.108
#> SRR772639 2 0.6678 5.85e-01 0.168 0.608 0.000 0.156 0.068
#> SRR772640 4 0.3779 5.96e-01 0.024 0.200 0.000 0.776 0.000
#> SRR772641 4 0.4398 5.85e-01 0.040 0.240 0.000 0.720 0.000
#> SRR772642 2 0.7549 1.83e-01 0.264 0.492 0.004 0.076 0.164
#> SRR772643 2 0.5837 3.58e-01 0.028 0.488 0.000 0.444 0.040
#> SRR772644 1 0.7522 4.05e-01 0.492 0.284 0.008 0.068 0.148
#> SRR772645 1 0.7778 3.01e-01 0.404 0.372 0.012 0.072 0.140
#> SRR772646 2 0.3647 5.46e-01 0.052 0.816 0.000 0.132 0.000
#> SRR772647 2 0.5217 4.79e-01 0.032 0.636 0.000 0.312 0.020
#> SRR772648 2 0.5319 5.32e-01 0.248 0.660 0.000 0.088 0.004
#> SRR772649 2 0.7850 -1.11e-01 0.152 0.384 0.004 0.092 0.368
#> SRR772650 2 0.5561 2.49e-01 0.320 0.612 0.000 0.036 0.032
#> SRR772651 1 0.8271 2.86e-01 0.348 0.292 0.000 0.132 0.228
#> SRR772652 5 0.7751 -2.16e-01 0.312 0.236 0.000 0.064 0.388
#> SRR772653 5 0.8336 -1.04e-01 0.332 0.120 0.028 0.120 0.400
#> SRR772654 2 0.7360 4.31e-01 0.264 0.512 0.000 0.116 0.108
#> SRR772655 5 0.7624 -2.10e-01 0.284 0.280 0.000 0.048 0.388
#> SRR772656 3 0.6873 4.92e-01 0.152 0.056 0.608 0.012 0.172
#> SRR772657 3 0.2654 7.77e-01 0.032 0.000 0.884 0.000 0.084
#> SRR772658 4 0.1357 6.02e-01 0.004 0.048 0.000 0.948 0.000
#> SRR772659 4 0.2605 6.11e-01 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR772660 2 0.5279 5.46e-01 0.184 0.704 0.000 0.096 0.016
#> SRR772661 5 0.0898 5.49e-01 0.008 0.000 0.020 0.000 0.972
#> SRR772662 2 0.6347 5.72e-01 0.200 0.576 0.000 0.212 0.012
#> SRR772663 2 0.5254 5.65e-01 0.200 0.692 0.000 0.100 0.008
#> SRR772664 2 0.6972 3.66e-01 0.172 0.576 0.000 0.076 0.176
#> SRR772665 2 0.5012 5.39e-01 0.032 0.696 0.000 0.244 0.028
#> SRR772666 3 0.0798 8.02e-01 0.016 0.000 0.976 0.000 0.008
#> SRR772667 4 0.4800 5.50e-01 0.052 0.272 0.000 0.676 0.000
#> SRR772668 4 0.2179 6.24e-01 0.000 0.100 0.000 0.896 0.004
#> SRR772669 4 0.2179 6.24e-01 0.000 0.100 0.000 0.896 0.004
#> SRR772670 2 0.6492 7.24e-02 0.388 0.496 0.000 0.064 0.052
#> SRR772671 2 0.6350 4.14e-01 0.368 0.500 0.000 0.120 0.012
#> SRR772672 2 0.4531 5.64e-01 0.068 0.776 0.000 0.136 0.020
#> SRR772673 2 0.6051 4.29e-01 0.088 0.576 0.000 0.316 0.020
#> SRR772674 3 0.4088 7.33e-01 0.064 0.004 0.792 0.000 0.140
#> SRR772675 5 0.1686 5.57e-01 0.000 0.028 0.020 0.008 0.944
#> SRR772676 2 0.8691 2.36e-01 0.232 0.392 0.020 0.176 0.180
#> SRR772677 1 0.7235 4.31e-01 0.472 0.252 0.248 0.008 0.020
#> SRR772678 5 0.1173 5.51e-01 0.020 0.012 0.004 0.000 0.964
#> SRR772679 2 0.5843 5.83e-01 0.136 0.656 0.000 0.188 0.020
#> SRR772680 1 0.7495 1.94e-01 0.376 0.212 0.004 0.036 0.372
#> SRR772681 3 0.2904 7.69e-01 0.024 0.052 0.892 0.004 0.028
#> SRR772682 2 0.4666 5.36e-01 0.056 0.704 0.000 0.240 0.000
#> SRR772683 2 0.4581 4.47e-01 0.012 0.624 0.000 0.360 0.004
#> SRR772685 2 0.5519 5.77e-01 0.184 0.664 0.000 0.148 0.004
#> SRR772686 3 0.0162 8.03e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772687 3 0.6037 5.65e-01 0.144 0.000 0.612 0.012 0.232
#> SRR772688 4 0.4618 1.93e-01 0.016 0.344 0.000 0.636 0.004
#> SRR772689 4 0.4009 3.06e-01 0.004 0.312 0.000 0.684 0.000
#> SRR772690 3 0.0290 8.03e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772691 5 0.2333 5.52e-01 0.012 0.052 0.004 0.016 0.916
#> SRR772692 2 0.6238 4.09e-01 0.380 0.496 0.000 0.116 0.008
#> SRR772693 2 0.7774 -2.72e-01 0.276 0.392 0.000 0.064 0.268
#> SRR772694 2 0.6316 4.74e-01 0.104 0.532 0.000 0.344 0.020
#> SRR772695 2 0.4820 5.78e-01 0.100 0.748 0.000 0.140 0.012
#> SRR772696 2 0.5997 5.67e-01 0.204 0.604 0.000 0.188 0.004
#> SRR772697 2 0.6968 5.01e-01 0.240 0.464 0.000 0.280 0.016
#> SRR772698 5 0.4166 4.96e-01 0.076 0.000 0.120 0.008 0.796
#> SRR772699 2 0.7845 -2.43e-01 0.264 0.372 0.000 0.068 0.296
#> SRR772700 2 0.7685 -2.09e-01 0.224 0.388 0.000 0.060 0.328
#> SRR772701 1 0.6757 5.24e-01 0.612 0.192 0.016 0.040 0.140
#> SRR772702 1 0.6895 1.57e-01 0.420 0.192 0.004 0.008 0.376
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.7264 0.44432 0.484 0.080 0.004 0.044 0.100 0.288
#> SRR772342 1 0.6171 0.28070 0.592 0.032 0.020 0.008 0.092 0.256
#> SRR772343 2 0.8052 0.09998 0.332 0.372 0.008 0.072 0.108 0.108
#> SRR772344 4 0.6117 -0.08771 0.072 0.400 0.000 0.460 0.000 0.068
#> SRR772345 2 0.6423 0.35553 0.112 0.468 0.000 0.352 0.000 0.068
#> SRR772346 2 0.7881 0.03147 0.256 0.392 0.000 0.032 0.152 0.168
#> SRR772347 1 0.8317 0.34562 0.336 0.240 0.000 0.056 0.160 0.208
#> SRR772348 2 0.4675 0.61546 0.096 0.748 0.000 0.064 0.000 0.092
#> SRR772349 2 0.4952 0.59817 0.112 0.732 0.000 0.076 0.004 0.076
#> SRR772350 3 0.4181 0.41294 0.012 0.000 0.600 0.004 0.000 0.384
#> SRR772351 2 0.3290 0.45558 0.016 0.776 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR772352 2 0.7295 0.39740 0.272 0.456 0.000 0.100 0.020 0.152
#> SRR772353 2 0.8391 -0.05531 0.260 0.328 0.000 0.080 0.124 0.208
#> SRR772354 2 0.6298 0.51349 0.216 0.604 0.000 0.036 0.092 0.052
#> SRR772355 2 0.5923 0.51667 0.096 0.580 0.000 0.264 0.000 0.060
#> SRR772356 4 0.6957 -0.13023 0.160 0.380 0.000 0.380 0.004 0.076
#> SRR772357 2 0.7540 -0.21660 0.344 0.372 0.000 0.028 0.164 0.092
#> SRR772358 1 0.8537 0.13569 0.348 0.304 0.048 0.064 0.064 0.172
#> SRR772359 5 0.6585 0.03692 0.356 0.076 0.008 0.016 0.488 0.056
#> SRR772360 1 0.8512 0.31096 0.304 0.256 0.000 0.084 0.216 0.140
#> SRR772361 3 0.0405 0.80470 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR772362 2 0.3183 0.43257 0.004 0.788 0.000 0.200 0.000 0.008
#> SRR772363 4 0.3767 0.62387 0.004 0.276 0.000 0.708 0.000 0.012
#> SRR772364 2 0.8027 0.20010 0.228 0.368 0.000 0.208 0.032 0.164
#> SRR772365 2 0.7526 0.15179 0.372 0.380 0.016 0.104 0.016 0.112
#> SRR772366 6 0.6176 0.25411 0.004 0.000 0.364 0.000 0.256 0.376
#> SRR772367 3 0.0972 0.80628 0.008 0.000 0.964 0.000 0.000 0.028
#> SRR772368 2 0.5609 0.12421 0.112 0.464 0.000 0.416 0.000 0.008
#> SRR772369 2 0.7472 0.46687 0.132 0.516 0.000 0.120 0.064 0.168
#> SRR772370 2 0.7234 0.20554 0.216 0.476 0.000 0.028 0.212 0.068
#> SRR772371 1 0.7458 0.28084 0.424 0.068 0.000 0.040 0.300 0.168
#> SRR772372 1 0.5666 0.47523 0.668 0.172 0.004 0.012 0.044 0.100
#> SRR772373 2 0.5381 0.59881 0.136 0.684 0.000 0.096 0.000 0.084
#> SRR772374 2 0.2162 0.56207 0.032 0.916 0.000 0.036 0.008 0.008
#> SRR772375 3 0.1049 0.80518 0.008 0.000 0.960 0.000 0.000 0.032
#> SRR772376 2 0.4183 0.60819 0.072 0.788 0.000 0.072 0.000 0.068
#> SRR772377 5 0.1493 0.47999 0.004 0.000 0.056 0.000 0.936 0.004
#> SRR772378 2 0.7121 0.35251 0.344 0.440 0.000 0.068 0.036 0.112
#> SRR772379 2 0.6407 0.45225 0.076 0.504 0.000 0.324 0.004 0.092
#> SRR772380 2 0.6999 0.54001 0.128 0.576 0.000 0.076 0.080 0.140
#> SRR772381 3 0.2892 0.67211 0.020 0.000 0.840 0.004 0.136 0.000
#> SRR772382 1 0.6531 0.48595 0.584 0.224 0.008 0.016 0.084 0.084
#> SRR772383 1 0.9114 0.37800 0.376 0.160 0.104 0.060 0.136 0.164
#> SRR772384 5 0.0436 0.49811 0.000 0.004 0.004 0.000 0.988 0.004
#> SRR772385 5 0.0653 0.50686 0.004 0.012 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR772386 2 0.5774 0.56808 0.192 0.632 0.000 0.088 0.000 0.088
#> SRR772387 2 0.4089 0.59742 0.100 0.804 0.000 0.024 0.044 0.028
#> SRR772388 6 0.7124 0.36926 0.228 0.000 0.092 0.000 0.272 0.408
#> SRR772389 3 0.6868 -0.44287 0.176 0.000 0.384 0.000 0.072 0.368
#> SRR772390 5 0.5337 0.06492 0.004 0.000 0.124 0.000 0.580 0.292
#> SRR772391 1 0.6040 0.25938 0.592 0.012 0.008 0.012 0.172 0.204
#> SRR772392 1 0.8316 0.37613 0.480 0.156 0.120 0.040 0.092 0.112
#> SRR772393 2 0.4601 0.58016 0.212 0.708 0.000 0.064 0.004 0.012
#> SRR772394 1 0.7945 -0.06139 0.308 0.288 0.000 0.196 0.016 0.192
#> SRR772395 2 0.3846 0.57325 0.100 0.800 0.000 0.080 0.000 0.020
#> SRR772396 1 0.7922 0.44797 0.472 0.100 0.008 0.072 0.192 0.156
#> SRR772397 1 0.7362 0.30445 0.520 0.108 0.028 0.012 0.124 0.208
#> SRR772398 3 0.8549 -0.35291 0.168 0.092 0.348 0.004 0.244 0.144
#> SRR772399 2 0.7858 -0.41709 0.284 0.300 0.012 0.004 0.276 0.124
#> SRR772400 5 0.7232 0.06751 0.236 0.044 0.036 0.000 0.452 0.232
#> SRR772401 2 0.8441 -0.22197 0.168 0.364 0.040 0.016 0.192 0.220
#> SRR772402 4 0.7037 0.07919 0.164 0.316 0.000 0.416 0.000 0.104
#> SRR772403 4 0.4712 0.64130 0.084 0.144 0.000 0.732 0.000 0.040
#> SRR772404 2 0.5312 0.61058 0.148 0.684 0.000 0.060 0.000 0.108
#> SRR772405 5 0.0551 0.49770 0.000 0.004 0.004 0.000 0.984 0.008
#> SRR772406 2 0.6623 0.28735 0.076 0.548 0.000 0.272 0.056 0.048
#> SRR772407 2 0.5899 0.50970 0.100 0.604 0.000 0.248 0.016 0.032
#> SRR772408 2 0.3181 0.53590 0.020 0.824 0.000 0.144 0.000 0.012
#> SRR772409 2 0.5260 0.55065 0.040 0.656 0.000 0.224 0.000 0.080
#> SRR772410 2 0.5664 0.41696 0.168 0.668 0.000 0.032 0.104 0.028
#> SRR772411 2 0.6975 0.38362 0.264 0.460 0.000 0.080 0.004 0.192
#> SRR772412 1 0.6911 0.47108 0.584 0.104 0.016 0.024 0.172 0.100
#> SRR772413 1 0.7002 0.29457 0.572 0.072 0.036 0.016 0.108 0.196
#> SRR772414 3 0.0000 0.80567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772415 2 0.3697 0.59900 0.100 0.816 0.000 0.044 0.000 0.040
#> SRR772416 2 0.7596 0.18335 0.340 0.360 0.000 0.080 0.032 0.188
#> SRR772417 1 0.6131 0.47036 0.652 0.168 0.024 0.028 0.028 0.100
#> SRR772418 5 0.5248 0.00402 0.008 0.000 0.088 0.000 0.568 0.336
#> SRR772419 2 0.5160 0.27264 0.052 0.560 0.000 0.368 0.000 0.020
#> SRR772420 2 0.6693 0.52969 0.168 0.516 0.000 0.220 0.000 0.096
#> SRR772421 2 0.5583 0.55900 0.196 0.632 0.000 0.136 0.000 0.036
#> SRR772422 1 0.7197 -0.12849 0.416 0.372 0.000 0.056 0.064 0.092
#> SRR772423 4 0.7459 0.07185 0.204 0.184 0.000 0.420 0.004 0.188
#> SRR772424 4 0.3243 0.66059 0.048 0.088 0.000 0.844 0.000 0.020
#> SRR772425 1 0.6462 -0.18101 0.464 0.396 0.012 0.068 0.012 0.048
#> SRR772426 2 0.2683 0.55574 0.052 0.880 0.000 0.056 0.000 0.012
#> SRR772427 2 0.1501 0.53694 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR772428 5 0.6737 0.27485 0.152 0.180 0.004 0.012 0.564 0.088
#> SRR772429 1 0.8228 0.46125 0.400 0.192 0.020 0.064 0.072 0.252
#> SRR772430 2 0.4603 0.56685 0.216 0.716 0.000 0.032 0.016 0.020
#> SRR772431 4 0.3392 0.60646 0.048 0.036 0.000 0.840 0.000 0.076
#> SRR772432 4 0.3296 0.65058 0.064 0.080 0.000 0.840 0.000 0.016
#> SRR772433 1 0.6779 0.05281 0.436 0.020 0.020 0.012 0.372 0.140
#> SRR772434 5 0.7008 -0.07472 0.232 0.012 0.056 0.000 0.456 0.244
#> SRR772435 2 0.8529 0.18387 0.220 0.352 0.000 0.112 0.148 0.168
#> SRR772436 1 0.5261 0.30192 0.640 0.240 0.000 0.024 0.000 0.096
#> SRR772437 3 0.1049 0.79230 0.008 0.000 0.960 0.000 0.032 0.000
#> SRR772438 1 0.7949 0.12506 0.428 0.180 0.188 0.004 0.036 0.164
#> SRR772439 1 0.6859 0.20468 0.528 0.096 0.012 0.000 0.148 0.216
#> SRR772440 2 0.4645 0.57801 0.164 0.732 0.000 0.052 0.000 0.052
#> SRR772441 2 0.7422 0.45722 0.148 0.448 0.000 0.260 0.020 0.124
#> SRR772442 2 0.5379 0.46469 0.084 0.584 0.000 0.312 0.000 0.020
#> SRR772443 2 0.7023 0.45627 0.156 0.484 0.000 0.180 0.000 0.180
#> SRR772444 2 0.7588 0.09679 0.156 0.516 0.040 0.024 0.188 0.076
#> SRR772445 1 0.7619 0.29663 0.420 0.252 0.000 0.076 0.040 0.212
#> SRR772446 1 0.7405 0.45040 0.404 0.236 0.000 0.008 0.104 0.248
#> SRR772447 1 0.7422 0.25294 0.344 0.336 0.000 0.052 0.028 0.240
#> SRR772448 2 0.6571 0.55065 0.180 0.564 0.000 0.160 0.008 0.088
#> SRR772449 2 0.5984 0.58821 0.164 0.620 0.000 0.120 0.000 0.096
#> SRR772450 4 0.2664 0.64923 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.4496 0.63859 0.044 0.212 0.000 0.716 0.000 0.028
#> SRR772452 1 0.6864 0.23272 0.452 0.080 0.000 0.004 0.148 0.316
#> SRR772453 1 0.6285 0.21444 0.588 0.020 0.012 0.016 0.156 0.208
#> SRR772454 1 0.4700 0.43984 0.724 0.180 0.000 0.020 0.008 0.068
#> SRR772455 2 0.6813 0.05958 0.376 0.444 0.032 0.016 0.016 0.116
#> SRR772456 4 0.2340 0.63017 0.004 0.044 0.000 0.896 0.000 0.056
#> SRR772457 4 0.2058 0.65299 0.024 0.048 0.000 0.916 0.000 0.012
#> SRR772458 1 0.5330 0.27799 0.696 0.012 0.036 0.008 0.068 0.180
#> SRR772459 1 0.7868 0.36853 0.484 0.164 0.080 0.004 0.124 0.144
#> SRR772460 2 0.3867 -0.28037 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.3857 0.38000 0.000 0.468 0.000 0.532 0.000 0.000
#> SRR772462 4 0.5120 0.52801 0.108 0.144 0.000 0.704 0.004 0.040
#> SRR772463 2 0.5085 0.49980 0.044 0.644 0.000 0.268 0.000 0.044
#> SRR772464 3 0.0891 0.80673 0.008 0.000 0.968 0.000 0.000 0.024
#> SRR772465 2 0.6996 -0.18610 0.288 0.408 0.000 0.012 0.252 0.040
#> SRR772466 2 0.8663 0.06946 0.196 0.336 0.000 0.132 0.176 0.160
#> SRR772467 4 0.4268 0.64482 0.044 0.172 0.000 0.752 0.000 0.032
#> SRR772468 4 0.3875 0.60130 0.016 0.260 0.000 0.716 0.000 0.008
#> SRR772469 2 0.7795 -0.18905 0.296 0.384 0.016 0.012 0.104 0.188
#> SRR772470 5 0.8008 -0.15318 0.304 0.160 0.000 0.036 0.340 0.160
#> SRR772471 1 0.7394 0.17515 0.420 0.072 0.000 0.048 0.336 0.124
#> SRR772472 1 0.4969 0.45560 0.716 0.076 0.000 0.016 0.024 0.168
#> SRR772473 4 0.6668 0.12810 0.224 0.332 0.000 0.412 0.008 0.024
#> SRR772474 2 0.6917 0.12072 0.152 0.388 0.000 0.380 0.004 0.076
#> SRR772475 5 0.1080 0.51019 0.004 0.032 0.000 0.000 0.960 0.004
#> SRR772476 4 0.3680 0.63205 0.004 0.232 0.000 0.744 0.000 0.020
#> SRR772477 4 0.4002 0.48929 0.000 0.404 0.000 0.588 0.000 0.008
#> SRR772478 5 0.7436 -0.16518 0.260 0.232 0.000 0.000 0.368 0.140
#> SRR772479 5 0.8652 -0.17379 0.228 0.104 0.048 0.036 0.336 0.248
#> SRR772480 2 0.7382 0.41164 0.244 0.456 0.000 0.144 0.016 0.140
#> SRR772481 2 0.4543 0.60465 0.088 0.760 0.000 0.072 0.000 0.080
#> SRR772482 5 0.5478 0.31696 0.292 0.072 0.000 0.008 0.604 0.024
#> SRR772483 1 0.7859 0.44310 0.396 0.232 0.000 0.028 0.196 0.148
#> SRR772484 2 0.4743 0.56645 0.044 0.712 0.000 0.192 0.000 0.052
#> SRR772485 2 0.7193 0.45384 0.160 0.484 0.000 0.152 0.008 0.196
#> SRR772486 1 0.7506 -0.32791 0.424 0.012 0.244 0.000 0.140 0.180
#> SRR772487 1 0.8182 0.46199 0.388 0.216 0.016 0.040 0.100 0.240
#> SRR772488 2 0.4416 0.60218 0.072 0.768 0.000 0.100 0.000 0.060
#> SRR772489 4 0.7283 -0.15462 0.140 0.328 0.000 0.400 0.008 0.124
#> SRR772490 1 0.5034 0.39482 0.732 0.044 0.060 0.004 0.016 0.144
#> SRR772491 1 0.7816 0.48421 0.496 0.120 0.016 0.068 0.096 0.204
#> SRR772492 4 0.2562 0.65120 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR772493 4 0.2416 0.65586 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000 0.000
#> SRR772494 2 0.4074 0.13680 0.016 0.656 0.000 0.324 0.000 0.004
#> SRR772495 2 0.3684 0.14562 0.000 0.664 0.000 0.332 0.000 0.004
#> SRR772496 2 0.5596 0.59772 0.152 0.668 0.000 0.120 0.008 0.052
#> SRR772497 2 0.5471 0.58178 0.184 0.684 0.000 0.056 0.044 0.032
#> SRR772498 2 0.5561 0.53477 0.132 0.692 0.000 0.040 0.104 0.032
#> SRR772499 2 0.6248 0.49345 0.124 0.636 0.000 0.040 0.140 0.060
#> SRR772500 2 0.6077 0.58307 0.088 0.636 0.000 0.140 0.012 0.124
#> SRR772501 2 0.6644 0.47790 0.108 0.508 0.000 0.264 0.000 0.120
#> SRR772502 2 0.4208 0.55205 0.132 0.784 0.000 0.036 0.016 0.032
#> SRR772503 2 0.7168 0.23877 0.260 0.456 0.004 0.076 0.008 0.196
#> SRR772504 4 0.5035 0.44568 0.056 0.332 0.000 0.596 0.000 0.016
#> SRR772505 2 0.6552 0.55680 0.188 0.548 0.000 0.156 0.000 0.108
#> SRR772506 2 0.6404 0.47040 0.072 0.504 0.000 0.308 0.000 0.116
#> SRR772507 2 0.5973 0.56596 0.072 0.608 0.000 0.196 0.000 0.124
#> SRR772508 2 0.4428 0.24441 0.032 0.624 0.000 0.340 0.000 0.004
#> SRR772509 5 0.0508 0.50423 0.004 0.012 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR772510 3 0.0260 0.80691 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772511 2 0.7772 0.29716 0.220 0.420 0.000 0.128 0.032 0.200
#> SRR772512 2 0.6257 0.04123 0.008 0.436 0.360 0.008 0.188 0.000
#> SRR772513 2 0.7202 0.51085 0.204 0.536 0.000 0.080 0.108 0.072
#> SRR772514 4 0.6423 -0.13882 0.104 0.380 0.000 0.460 0.012 0.044
#> SRR772515 2 0.4426 0.61142 0.080 0.768 0.000 0.092 0.000 0.060
#> SRR772516 2 0.7588 0.39213 0.256 0.388 0.000 0.248 0.024 0.084
#> SRR772517 2 0.5821 0.31524 0.036 0.456 0.000 0.428 0.000 0.080
#> SRR772518 2 0.5353 0.60898 0.136 0.708 0.000 0.084 0.024 0.048
#> SRR772519 2 0.2836 0.56782 0.052 0.872 0.000 0.060 0.000 0.016
#> SRR772520 2 0.2971 0.59125 0.076 0.864 0.000 0.032 0.000 0.028
#> SRR772521 1 0.6680 0.27639 0.468 0.316 0.000 0.048 0.008 0.160
#> SRR772522 1 0.5832 0.51816 0.680 0.132 0.000 0.044 0.064 0.080
#> SRR772523 2 0.7315 0.40978 0.192 0.428 0.000 0.200 0.000 0.180
#> SRR772524 2 0.5626 0.58758 0.192 0.644 0.000 0.096 0.000 0.068
#> SRR772525 3 0.2730 0.71967 0.012 0.000 0.836 0.000 0.000 0.152
#> SRR772526 2 0.3844 0.20105 0.004 0.676 0.000 0.312 0.000 0.008
#> SRR772527 2 0.3381 0.40487 0.008 0.772 0.000 0.212 0.000 0.008
#> SRR772528 5 0.4267 0.24163 0.012 0.000 0.028 0.000 0.688 0.272
#> SRR772529 1 0.8426 0.44492 0.360 0.148 0.000 0.100 0.152 0.240
#> SRR772530 1 0.6230 0.49145 0.632 0.100 0.000 0.072 0.032 0.164
#> SRR772531 3 0.4793 0.43063 0.008 0.000 0.668 0.000 0.084 0.240
#> SRR772532 2 0.4636 0.58398 0.016 0.716 0.000 0.176 0.000 0.092
#> SRR772533 2 0.6844 0.50513 0.108 0.508 0.000 0.236 0.004 0.144
#> SRR772534 1 0.6961 0.50700 0.564 0.184 0.000 0.052 0.112 0.088
#> SRR772535 2 0.5833 0.58122 0.128 0.640 0.000 0.136 0.000 0.096
#> SRR772536 2 0.2068 0.58152 0.048 0.916 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR772537 2 0.5719 0.40313 0.032 0.592 0.000 0.284 0.008 0.084
#> SRR772538 2 0.5740 0.46533 0.048 0.592 0.000 0.268 0.000 0.092
#> SRR772539 1 0.8464 0.19312 0.340 0.284 0.016 0.108 0.060 0.192
#> SRR772540 1 0.8156 0.22765 0.392 0.220 0.000 0.116 0.072 0.200
#> SRR772541 2 0.5059 0.28471 0.044 0.556 0.000 0.384 0.004 0.012
#> SRR772542 1 0.5550 0.34899 0.692 0.040 0.020 0.004 0.140 0.104
#> SRR772543 1 0.8695 0.26906 0.344 0.052 0.088 0.052 0.188 0.276
#> SRR772544 3 0.0146 0.80570 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772545 5 0.6609 0.18530 0.156 0.224 0.008 0.004 0.548 0.060
#> SRR772546 5 0.5006 0.46406 0.080 0.072 0.000 0.044 0.752 0.052
#> SRR772547 1 0.8066 0.31056 0.356 0.256 0.004 0.040 0.104 0.240
#> SRR772548 2 0.7253 -0.07041 0.196 0.392 0.000 0.020 0.332 0.060
#> SRR772549 6 0.7364 0.23700 0.180 0.020 0.044 0.016 0.320 0.420
#> SRR772550 1 0.5735 0.10818 0.520 0.008 0.020 0.016 0.044 0.392
#> SRR772551 1 0.6259 -0.16322 0.432 0.428 0.000 0.040 0.012 0.088
#> SRR772552 2 0.4498 0.61546 0.100 0.772 0.000 0.064 0.008 0.056
#> SRR772553 5 0.1225 0.51069 0.012 0.036 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR772554 2 0.5407 0.58380 0.060 0.664 0.000 0.188 0.000 0.088
#> SRR772555 2 0.5193 0.52245 0.172 0.696 0.000 0.040 0.008 0.084
#> SRR772556 2 0.7080 0.07782 0.292 0.456 0.008 0.000 0.132 0.112
#> SRR772557 5 0.5473 0.43647 0.068 0.064 0.020 0.008 0.712 0.128
#> SRR772558 2 0.6607 0.34599 0.232 0.548 0.000 0.028 0.040 0.152
#> SRR772559 1 0.5829 0.46524 0.632 0.132 0.004 0.004 0.040 0.188
#> SRR772560 2 0.5789 0.31071 0.416 0.484 0.000 0.040 0.008 0.052
#> SRR772561 3 0.1116 0.79281 0.004 0.008 0.960 0.000 0.028 0.000
#> SRR772562 2 0.6340 0.53900 0.140 0.584 0.000 0.136 0.000 0.140
#> SRR772563 2 0.6745 0.51529 0.120 0.540 0.000 0.164 0.004 0.172
#> SRR772564 1 0.7041 0.00829 0.508 0.008 0.104 0.004 0.152 0.224
#> SRR772565 1 0.8375 0.40917 0.372 0.248 0.052 0.016 0.112 0.200
#> SRR772566 6 0.6737 0.50814 0.092 0.000 0.268 0.004 0.132 0.504
#> SRR772567 6 0.7471 0.50026 0.200 0.008 0.308 0.016 0.068 0.400
#> SRR772568 2 0.3043 0.57624 0.048 0.872 0.000 0.044 0.012 0.024
#> SRR772569 2 0.5807 0.58144 0.120 0.644 0.000 0.132 0.000 0.104
#> SRR772570 5 0.5500 0.38757 0.084 0.012 0.072 0.004 0.700 0.128
#> SRR772571 1 0.7289 0.10938 0.412 0.364 0.000 0.064 0.056 0.104
#> SRR772572 1 0.7446 0.18953 0.492 0.072 0.044 0.004 0.196 0.192
#> SRR772573 1 0.6168 0.21989 0.552 0.008 0.028 0.004 0.284 0.124
#> SRR772574 5 0.7450 0.15301 0.236 0.036 0.000 0.100 0.472 0.156
#> SRR772575 5 0.8209 -0.18956 0.236 0.212 0.000 0.088 0.372 0.092
#> SRR772576 2 0.6969 0.49080 0.276 0.448 0.000 0.180 0.000 0.096
#> SRR772577 4 0.5265 0.47911 0.176 0.148 0.000 0.656 0.000 0.020
#> SRR772578 2 0.4597 0.54356 0.080 0.760 0.000 0.116 0.012 0.032
#> SRR772579 2 0.3759 0.51531 0.024 0.752 0.000 0.216 0.000 0.008
#> SRR772580 3 0.1124 0.80377 0.008 0.000 0.956 0.000 0.000 0.036
#> SRR772581 2 0.5943 0.46434 0.204 0.596 0.000 0.048 0.000 0.152
#> SRR772582 2 0.6515 0.55479 0.152 0.576 0.000 0.168 0.008 0.096
#> SRR772583 2 0.7661 0.40648 0.228 0.468 0.000 0.084 0.148 0.072
#> SRR772584 2 0.5851 0.59018 0.156 0.636 0.000 0.108 0.000 0.100
#> SRR772585 2 0.4343 0.55744 0.272 0.688 0.000 0.008 0.008 0.024
#> SRR772586 5 0.6037 -0.24364 0.008 0.000 0.192 0.000 0.452 0.348
#> SRR772587 1 0.5907 -0.19913 0.512 0.000 0.332 0.000 0.020 0.136
#> SRR772588 2 0.5711 0.52792 0.032 0.596 0.000 0.248 0.000 0.124
#> SRR772589 4 0.6783 0.12856 0.100 0.244 0.000 0.496 0.000 0.160
#> SRR772590 3 0.0405 0.80481 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000
#> SRR772591 6 0.7632 0.47569 0.240 0.012 0.272 0.024 0.056 0.396
#> SRR772592 6 0.6131 0.45979 0.192 0.004 0.328 0.000 0.008 0.468
#> SRR772593 5 0.2808 0.42536 0.008 0.000 0.048 0.000 0.868 0.076
#> SRR772594 2 0.4739 0.59840 0.056 0.736 0.000 0.152 0.004 0.052
#> SRR772595 4 0.5244 0.28020 0.032 0.436 0.000 0.496 0.000 0.036
#> SRR772596 5 0.6213 -0.27872 0.008 0.000 0.240 0.000 0.412 0.340
#> SRR772597 3 0.1398 0.79823 0.008 0.000 0.940 0.000 0.000 0.052
#> SRR772598 5 0.7005 0.35522 0.100 0.072 0.076 0.020 0.608 0.124
#> SRR772599 5 0.7556 -0.04688 0.260 0.088 0.000 0.020 0.388 0.244
#> SRR772600 4 0.6455 0.35076 0.204 0.228 0.000 0.516 0.000 0.052
#> SRR772601 4 0.3786 0.62856 0.068 0.052 0.000 0.816 0.000 0.064
#> SRR772602 3 0.1251 0.80591 0.012 0.000 0.956 0.000 0.008 0.024
#> SRR772603 2 0.7003 0.31374 0.192 0.400 0.000 0.336 0.004 0.068
#> SRR772604 4 0.6636 0.04704 0.196 0.312 0.000 0.444 0.000 0.048
#> SRR772605 2 0.5030 0.59374 0.132 0.720 0.000 0.088 0.004 0.056
#> SRR772606 1 0.7418 0.26422 0.320 0.252 0.000 0.000 0.308 0.120
#> SRR772607 5 0.5247 0.37653 0.168 0.032 0.000 0.000 0.672 0.128
#> SRR772608 2 0.5324 0.61173 0.100 0.700 0.000 0.116 0.004 0.080
#> SRR772609 2 0.7096 0.45944 0.172 0.472 0.000 0.184 0.000 0.172
#> SRR772610 4 0.5269 0.32252 0.044 0.416 0.000 0.516 0.004 0.020
#> SRR772611 2 0.4433 0.56596 0.076 0.756 0.000 0.132 0.000 0.036
#> SRR772612 4 0.6204 0.46433 0.112 0.216 0.000 0.580 0.000 0.092
#> SRR772613 4 0.2554 0.67394 0.004 0.092 0.000 0.876 0.000 0.028
#> SRR772614 1 0.8388 -0.09928 0.340 0.064 0.172 0.000 0.204 0.220
#> SRR772615 1 0.7899 -0.28791 0.368 0.032 0.204 0.000 0.124 0.272
#> SRR772616 1 0.7720 0.37643 0.368 0.292 0.004 0.012 0.200 0.124
#> SRR772617 4 0.3035 0.67539 0.016 0.148 0.000 0.828 0.000 0.008
#> SRR772618 4 0.3390 0.64717 0.056 0.072 0.000 0.840 0.000 0.032
#> SRR772619 4 0.2597 0.64820 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR772620 4 0.2260 0.66607 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR772621 2 0.6942 0.15325 0.360 0.452 0.000 0.056 0.052 0.080
#> SRR772622 2 0.5203 0.54023 0.184 0.696 0.004 0.016 0.020 0.080
#> SRR772623 3 0.5531 0.50994 0.056 0.000 0.652 0.004 0.080 0.208
#> SRR772624 5 0.5190 0.00310 0.004 0.000 0.088 0.000 0.556 0.352
#> SRR772625 5 0.3214 0.44507 0.004 0.200 0.000 0.004 0.788 0.004
#> SRR772626 2 0.6431 0.54421 0.112 0.564 0.000 0.132 0.000 0.192
#> SRR772627 4 0.5798 -0.04632 0.072 0.432 0.000 0.456 0.000 0.040
#> SRR772628 1 0.6453 0.28084 0.600 0.068 0.088 0.000 0.040 0.204
#> SRR772629 1 0.6729 0.10891 0.504 0.008 0.064 0.008 0.304 0.112
#> SRR772630 1 0.7622 0.40604 0.516 0.132 0.008 0.060 0.168 0.116
#> SRR772631 5 0.0790 0.48982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR772632 2 0.4041 0.60770 0.088 0.796 0.000 0.068 0.000 0.048
#> SRR772633 2 0.1901 0.54099 0.008 0.912 0.000 0.076 0.000 0.004
#> SRR772634 2 0.7588 -0.26799 0.204 0.340 0.000 0.012 0.328 0.116
#> SRR772635 2 0.7360 0.40594 0.260 0.472 0.000 0.112 0.032 0.124
#> SRR772636 5 0.3728 0.42435 0.004 0.228 0.000 0.012 0.748 0.008
#> SRR772637 1 0.7549 -0.27809 0.400 0.008 0.140 0.000 0.224 0.228
#> SRR772638 6 0.7008 0.09121 0.384 0.076 0.068 0.000 0.048 0.424
#> SRR772639 2 0.5959 0.53637 0.252 0.612 0.000 0.040 0.052 0.044
#> SRR772640 4 0.1657 0.65793 0.016 0.056 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.3499 0.66968 0.036 0.128 0.000 0.816 0.000 0.020
#> SRR772642 2 0.7981 0.10373 0.292 0.384 0.000 0.076 0.160 0.088
#> SRR772643 2 0.4310 0.50548 0.028 0.736 0.000 0.204 0.028 0.004
#> SRR772644 1 0.6233 0.46322 0.580 0.236 0.004 0.004 0.120 0.056
#> SRR772645 1 0.7274 0.40288 0.484 0.284 0.012 0.024 0.116 0.080
#> SRR772646 2 0.5504 0.57643 0.064 0.660 0.000 0.176 0.000 0.100
#> SRR772647 2 0.2189 0.57423 0.040 0.916 0.000 0.020 0.008 0.016
#> SRR772648 2 0.6608 0.45341 0.252 0.520 0.000 0.056 0.008 0.164
#> SRR772649 5 0.8038 -0.18381 0.180 0.284 0.000 0.064 0.372 0.100
#> SRR772650 1 0.7521 0.04068 0.412 0.304 0.000 0.100 0.028 0.156
#> SRR772651 1 0.8110 0.36707 0.360 0.268 0.000 0.048 0.184 0.140
#> SRR772652 1 0.7102 0.31861 0.428 0.212 0.000 0.012 0.288 0.060
#> SRR772653 5 0.7402 -0.06795 0.352 0.144 0.016 0.008 0.396 0.084
#> SRR772654 2 0.6277 0.38883 0.288 0.540 0.000 0.004 0.064 0.104
#> SRR772655 5 0.8075 -0.21471 0.284 0.164 0.000 0.052 0.364 0.136
#> SRR772656 3 0.6031 0.25359 0.164 0.036 0.644 0.004 0.124 0.028
#> SRR772657 3 0.1082 0.79289 0.004 0.000 0.956 0.000 0.040 0.000
#> SRR772658 4 0.2664 0.65012 0.000 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR772659 4 0.3954 0.59942 0.008 0.292 0.000 0.688 0.000 0.012
#> SRR772660 2 0.7296 0.45961 0.184 0.464 0.000 0.144 0.008 0.200
#> SRR772661 5 0.0458 0.49464 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772662 2 0.5175 0.56392 0.240 0.660 0.000 0.060 0.004 0.036
#> SRR772663 2 0.6230 0.50869 0.284 0.540 0.000 0.076 0.000 0.100
#> SRR772664 2 0.7666 0.28112 0.232 0.452 0.000 0.048 0.168 0.100
#> SRR772665 2 0.4119 0.60800 0.068 0.808 0.000 0.064 0.020 0.040
#> SRR772666 3 0.0000 0.80567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.3355 0.63864 0.076 0.072 0.000 0.836 0.000 0.016
#> SRR772668 4 0.1957 0.66402 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR772669 4 0.1957 0.66402 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR772670 1 0.7456 0.25205 0.420 0.300 0.000 0.064 0.040 0.176
#> SRR772671 2 0.5528 0.28788 0.452 0.468 0.000 0.028 0.008 0.044
#> SRR772672 2 0.5910 0.57807 0.064 0.652 0.000 0.144 0.016 0.124
#> SRR772673 2 0.6843 0.47516 0.120 0.516 0.000 0.260 0.016 0.088
#> SRR772674 3 0.3876 0.57129 0.068 0.000 0.772 0.000 0.156 0.004
#> SRR772675 5 0.0748 0.50691 0.004 0.016 0.004 0.000 0.976 0.000
#> SRR772676 2 0.6615 0.16339 0.336 0.480 0.008 0.020 0.136 0.020
#> SRR772677 1 0.6797 0.25409 0.564 0.080 0.228 0.036 0.004 0.088
#> SRR772678 5 0.0748 0.50025 0.004 0.004 0.000 0.000 0.976 0.016
#> SRR772679 2 0.5699 0.59695 0.168 0.660 0.000 0.108 0.012 0.052
#> SRR772680 1 0.7601 0.23128 0.412 0.060 0.000 0.076 0.320 0.132
#> SRR772681 3 0.2084 0.74330 0.016 0.044 0.916 0.000 0.024 0.000
#> SRR772682 2 0.4792 0.59441 0.064 0.728 0.000 0.148 0.000 0.060
#> SRR772683 2 0.2384 0.56138 0.040 0.900 0.000 0.044 0.000 0.016
#> SRR772685 2 0.5967 0.55349 0.224 0.600 0.000 0.092 0.000 0.084
#> SRR772686 3 0.0972 0.80628 0.008 0.000 0.964 0.000 0.000 0.028
#> SRR772687 6 0.6024 0.26976 0.008 0.000 0.268 0.004 0.204 0.516
#> SRR772688 2 0.3693 0.24141 0.004 0.708 0.000 0.280 0.000 0.008
#> SRR772689 2 0.3965 -0.01645 0.000 0.604 0.000 0.388 0.000 0.008
#> SRR772690 3 0.0972 0.80628 0.008 0.000 0.964 0.000 0.000 0.028
#> SRR772691 5 0.0935 0.51072 0.000 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR772692 2 0.6758 0.26709 0.304 0.452 0.000 0.052 0.004 0.188
#> SRR772693 1 0.8309 0.34269 0.344 0.184 0.000 0.092 0.276 0.104
#> SRR772694 2 0.4461 0.56671 0.096 0.784 0.000 0.052 0.036 0.032
#> SRR772695 2 0.5630 0.57737 0.100 0.680 0.000 0.076 0.012 0.132
#> SRR772696 2 0.4954 0.56062 0.268 0.652 0.000 0.048 0.000 0.032
#> SRR772697 2 0.5524 0.47715 0.288 0.608 0.000 0.056 0.008 0.040
#> SRR772698 5 0.4335 0.15743 0.008 0.000 0.024 0.000 0.644 0.324
#> SRR772699 2 0.7658 -0.36840 0.300 0.320 0.000 0.004 0.216 0.160
#> SRR772700 5 0.8309 -0.31597 0.240 0.264 0.000 0.056 0.304 0.136
#> SRR772701 1 0.6043 0.48698 0.664 0.104 0.008 0.016 0.100 0.108
#> SRR772702 1 0.7350 0.21660 0.456 0.032 0.004 0.064 0.284 0.160
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.983 0.986 0.2435 0.761 0.761
#> 3 3 0.369 0.688 0.800 1.1846 0.651 0.541
#> 4 4 0.267 0.591 0.679 0.1751 0.809 0.615
#> 5 5 0.287 0.451 0.635 0.0970 0.811 0.567
#> 6 6 0.346 0.468 0.631 0.0621 0.874 0.634
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772342 2 0.1414 0.987 0.020 0.980
#> SRR772343 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772344 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772345 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772346 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772347 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772348 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772349 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772350 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772351 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772352 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772353 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772354 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772355 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772356 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772357 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772358 2 0.1414 0.983 0.020 0.980
#> SRR772359 2 0.2043 0.973 0.032 0.968
#> SRR772360 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772361 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772362 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772363 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772364 2 0.0672 0.989 0.008 0.992
#> SRR772365 2 0.1184 0.987 0.016 0.984
#> SRR772366 1 0.0672 0.976 0.992 0.008
#> SRR772367 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772368 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772369 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772370 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772371 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772372 2 0.1184 0.989 0.016 0.984
#> SRR772373 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772374 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772375 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772376 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772377 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772378 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772379 2 0.1414 0.984 0.020 0.980
#> SRR772380 2 0.3274 0.952 0.060 0.940
#> SRR772381 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772382 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772383 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772384 1 0.1843 0.970 0.972 0.028
#> SRR772385 1 0.6973 0.798 0.812 0.188
#> SRR772386 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772387 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR772388 2 0.2423 0.971 0.040 0.960
#> SRR772389 2 0.1633 0.984 0.024 0.976
#> SRR772390 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772391 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772392 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772393 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772394 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR772395 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772396 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772397 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772398 2 0.2236 0.975 0.036 0.964
#> SRR772399 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772400 2 0.1414 0.986 0.020 0.980
#> SRR772401 2 0.1843 0.981 0.028 0.972
#> SRR772402 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772403 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772404 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772405 1 0.1843 0.970 0.972 0.028
#> SRR772406 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772407 2 0.0672 0.989 0.008 0.992
#> SRR772408 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772409 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772410 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772411 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772412 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772413 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772414 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772415 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772416 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772417 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772418 1 0.0938 0.975 0.988 0.012
#> SRR772419 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772420 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772421 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772422 2 0.1414 0.989 0.020 0.980
#> SRR772423 2 0.1184 0.989 0.016 0.984
#> SRR772424 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772425 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772426 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772427 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772428 2 0.1633 0.984 0.024 0.976
#> SRR772429 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772430 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772431 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772432 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772433 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772434 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772435 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772436 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772437 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772438 2 0.2043 0.978 0.032 0.968
#> SRR772439 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772440 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772441 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772442 2 0.0938 0.991 0.012 0.988
#> SRR772443 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772444 2 0.1414 0.987 0.020 0.980
#> SRR772445 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772446 2 0.1184 0.989 0.016 0.984
#> SRR772447 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772448 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772449 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772450 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772451 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772452 2 0.1633 0.984 0.024 0.976
#> SRR772453 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772454 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772455 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772456 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772457 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772458 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772459 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772460 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772461 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772462 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772463 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772464 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772465 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772466 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772467 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772468 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772469 2 0.1633 0.983 0.024 0.976
#> SRR772470 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772471 2 0.1184 0.987 0.016 0.984
#> SRR772472 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772473 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772474 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772475 1 0.4161 0.922 0.916 0.084
#> SRR772476 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772477 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772478 2 0.3114 0.955 0.056 0.944
#> SRR772479 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772480 2 0.1633 0.984 0.024 0.976
#> SRR772481 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772482 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772483 2 0.1414 0.986 0.020 0.980
#> SRR772484 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772485 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772486 2 0.2778 0.964 0.048 0.952
#> SRR772487 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772488 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772489 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772490 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772491 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772492 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772493 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772494 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772495 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772496 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772497 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772498 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772499 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772500 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772501 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772502 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772503 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772504 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772505 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772506 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772507 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772508 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772509 1 0.3274 0.947 0.940 0.060
#> SRR772510 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772511 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772512 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772513 2 0.1184 0.989 0.016 0.984
#> SRR772514 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772515 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772516 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772517 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772519 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772520 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772521 2 0.1414 0.987 0.020 0.980
#> SRR772522 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772523 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772524 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772525 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772526 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772527 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772528 1 0.1414 0.972 0.980 0.020
#> SRR772529 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772530 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772531 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772532 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772533 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772534 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772535 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772536 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772537 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772538 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772539 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772540 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772541 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772542 2 0.1414 0.987 0.020 0.980
#> SRR772543 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772544 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772545 2 0.3274 0.944 0.060 0.940
#> SRR772546 2 0.1843 0.977 0.028 0.972
#> SRR772547 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772548 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772549 2 0.3733 0.937 0.072 0.928
#> SRR772550 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772551 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772552 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772553 1 0.4022 0.930 0.920 0.080
#> SRR772554 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772555 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772556 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772557 2 0.2043 0.978 0.032 0.968
#> SRR772558 2 0.2043 0.978 0.032 0.968
#> SRR772559 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772560 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772561 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772562 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772563 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772564 2 0.2423 0.970 0.040 0.960
#> SRR772565 2 0.1843 0.981 0.028 0.972
#> SRR772566 2 0.1633 0.984 0.024 0.976
#> SRR772567 2 0.1414 0.986 0.020 0.980
#> SRR772568 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772569 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772570 2 0.5737 0.849 0.136 0.864
#> SRR772571 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772572 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772573 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772574 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772575 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772576 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772577 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772578 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772579 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772580 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772581 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772582 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772583 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772584 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772585 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772586 1 0.1184 0.974 0.984 0.016
#> SRR772587 2 0.1184 0.987 0.016 0.984
#> SRR772588 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772589 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772590 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772591 2 0.1843 0.981 0.028 0.972
#> SRR772592 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772593 1 0.1184 0.974 0.984 0.016
#> SRR772594 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772595 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772596 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772597 1 0.0672 0.975 0.992 0.008
#> SRR772598 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772599 2 0.2778 0.961 0.048 0.952
#> SRR772600 2 0.1414 0.986 0.020 0.980
#> SRR772601 2 0.1633 0.984 0.024 0.976
#> SRR772602 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772603 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772604 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772605 2 0.1184 0.990 0.016 0.984
#> SRR772606 2 0.1414 0.986 0.020 0.980
#> SRR772607 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772608 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772609 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772610 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772611 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772612 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772613 2 0.0938 0.987 0.012 0.988
#> SRR772614 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772615 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772616 2 0.1414 0.987 0.020 0.980
#> SRR772617 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772618 2 0.1414 0.987 0.020 0.980
#> SRR772619 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772620 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772621 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772622 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772623 1 0.3431 0.941 0.936 0.064
#> SRR772624 1 0.1184 0.974 0.984 0.016
#> SRR772625 1 0.7745 0.736 0.772 0.228
#> SRR772626 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772627 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772628 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772629 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772630 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772631 1 0.2043 0.965 0.968 0.032
#> SRR772632 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR772634 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772635 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772636 1 0.6148 0.847 0.848 0.152
#> SRR772637 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772638 2 0.2603 0.966 0.044 0.956
#> SRR772639 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772640 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772641 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772642 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772643 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772644 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772645 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772646 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772647 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772648 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772649 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772650 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772651 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772652 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772653 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772654 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772655 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772656 1 0.2043 0.965 0.968 0.032
#> SRR772657 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772658 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772659 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772660 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772661 1 0.1414 0.972 0.980 0.020
#> SRR772662 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772663 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772664 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772665 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772666 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772667 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772668 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772669 2 0.0938 0.989 0.012 0.988
#> SRR772670 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772671 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772672 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772673 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772674 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772675 1 0.1633 0.971 0.976 0.024
#> SRR772676 2 0.1414 0.987 0.020 0.980
#> SRR772677 2 0.1633 0.984 0.024 0.976
#> SRR772678 1 0.3114 0.947 0.944 0.056
#> SRR772679 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772680 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772681 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772682 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772683 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772685 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772686 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772687 1 0.0672 0.976 0.992 0.008
#> SRR772688 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772689 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772690 1 0.0376 0.976 0.996 0.004
#> SRR772691 1 0.4298 0.920 0.912 0.088
#> SRR772692 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772693 2 0.4298 0.915 0.088 0.912
#> SRR772694 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR772695 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772696 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772697 2 0.0376 0.990 0.004 0.996
#> SRR772698 1 0.1414 0.972 0.980 0.020
#> SRR772699 2 0.1184 0.988 0.016 0.984
#> SRR772700 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772701 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR772702 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.0747 0.78988 0.984 0.016 0.000
#> SRR772342 1 0.0592 0.79591 0.988 0.012 0.000
#> SRR772343 1 0.3816 0.71781 0.852 0.148 0.000
#> SRR772344 2 0.5138 0.80875 0.252 0.748 0.000
#> SRR772345 2 0.4062 0.81496 0.164 0.836 0.000
#> SRR772346 1 0.4399 0.68704 0.812 0.188 0.000
#> SRR772347 1 0.2878 0.77319 0.904 0.096 0.000
#> SRR772348 1 0.6260 -0.08897 0.552 0.448 0.000
#> SRR772349 2 0.5678 0.76122 0.316 0.684 0.000
#> SRR772350 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772351 1 0.6244 -0.10916 0.560 0.440 0.000
#> SRR772352 1 0.5810 0.35998 0.664 0.336 0.000
#> SRR772353 1 0.0892 0.79856 0.980 0.020 0.000
#> SRR772354 1 0.4654 0.64853 0.792 0.208 0.000
#> SRR772355 2 0.5650 0.75247 0.312 0.688 0.000
#> SRR772356 2 0.6404 0.71491 0.344 0.644 0.012
#> SRR772357 1 0.3192 0.76201 0.888 0.112 0.000
#> SRR772358 1 0.2590 0.78470 0.924 0.072 0.004
#> SRR772359 1 0.5772 0.64779 0.756 0.220 0.024
#> SRR772360 2 0.6062 0.65039 0.384 0.616 0.000
#> SRR772361 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 2 0.4062 0.81496 0.164 0.836 0.000
#> SRR772363 2 0.4121 0.81631 0.168 0.832 0.000
#> SRR772364 1 0.6126 0.13392 0.600 0.400 0.000
#> SRR772365 1 0.3267 0.75486 0.884 0.116 0.000
#> SRR772366 3 0.4634 0.92082 0.012 0.164 0.824
#> SRR772367 3 0.0237 0.93190 0.000 0.004 0.996
#> SRR772368 2 0.6095 0.62173 0.392 0.608 0.000
#> SRR772369 1 0.5497 0.51009 0.708 0.292 0.000
#> SRR772370 1 0.2625 0.77480 0.916 0.084 0.000
#> SRR772371 1 0.1031 0.79799 0.976 0.024 0.000
#> SRR772372 1 0.1163 0.79325 0.972 0.028 0.000
#> SRR772373 2 0.5905 0.70362 0.352 0.648 0.000
#> SRR772374 2 0.4121 0.81735 0.168 0.832 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 2 0.5785 0.73980 0.332 0.668 0.000
#> SRR772377 3 0.4473 0.92121 0.008 0.164 0.828
#> SRR772378 1 0.3551 0.72586 0.868 0.132 0.000
#> SRR772379 1 0.3412 0.72754 0.876 0.124 0.000
#> SRR772380 1 0.0475 0.79632 0.992 0.004 0.004
#> SRR772381 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 1 0.0747 0.79020 0.984 0.016 0.000
#> SRR772383 1 0.0747 0.79722 0.984 0.016 0.000
#> SRR772384 3 0.5008 0.91453 0.016 0.180 0.804
#> SRR772385 3 0.6905 0.77594 0.044 0.280 0.676
#> SRR772386 1 0.6235 -0.15256 0.564 0.436 0.000
#> SRR772387 2 0.5363 0.80038 0.276 0.724 0.000
#> SRR772388 1 0.0829 0.79356 0.984 0.012 0.004
#> SRR772389 1 0.0747 0.79722 0.984 0.016 0.000
#> SRR772390 3 0.4353 0.92160 0.008 0.156 0.836
#> SRR772391 1 0.0747 0.78988 0.984 0.016 0.000
#> SRR772392 1 0.3816 0.72302 0.852 0.148 0.000
#> SRR772393 1 0.3551 0.74244 0.868 0.132 0.000
#> SRR772394 1 0.6308 -0.31132 0.508 0.492 0.000
#> SRR772395 2 0.5497 0.78845 0.292 0.708 0.000
#> SRR772396 1 0.1163 0.79777 0.972 0.028 0.000
#> SRR772397 1 0.1031 0.79670 0.976 0.024 0.000
#> SRR772398 1 0.1751 0.78085 0.960 0.012 0.028
#> SRR772399 1 0.0424 0.79071 0.992 0.008 0.000
#> SRR772400 1 0.1411 0.79302 0.964 0.036 0.000
#> SRR772401 1 0.0892 0.78766 0.980 0.020 0.000
#> SRR772402 1 0.6308 -0.25660 0.508 0.492 0.000
#> SRR772403 2 0.6225 0.50847 0.432 0.568 0.000
#> SRR772404 2 0.6302 0.43040 0.480 0.520 0.000
#> SRR772405 3 0.4897 0.91852 0.016 0.172 0.812
#> SRR772406 2 0.5988 0.65997 0.368 0.632 0.000
#> SRR772407 2 0.5244 0.81385 0.240 0.756 0.004
#> SRR772408 2 0.4121 0.81610 0.168 0.832 0.000
#> SRR772409 2 0.4178 0.81754 0.172 0.828 0.000
#> SRR772410 1 0.4399 0.67223 0.812 0.188 0.000
#> SRR772411 1 0.1289 0.79681 0.968 0.032 0.000
#> SRR772412 1 0.0892 0.79820 0.980 0.020 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.79421 1.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.6307 -0.27270 0.512 0.488 0.000
#> SRR772416 1 0.4346 0.65768 0.816 0.184 0.000
#> SRR772417 1 0.1529 0.79442 0.960 0.040 0.000
#> SRR772418 3 0.4692 0.92028 0.012 0.168 0.820
#> SRR772419 2 0.4346 0.82267 0.184 0.816 0.000
#> SRR772420 2 0.4235 0.82115 0.176 0.824 0.000
#> SRR772421 2 0.5291 0.80657 0.268 0.732 0.000
#> SRR772422 1 0.6678 -0.29887 0.512 0.480 0.008
#> SRR772423 1 0.6192 0.04607 0.580 0.420 0.000
#> SRR772424 1 0.6309 -0.29343 0.500 0.500 0.000
#> SRR772425 1 0.6308 -0.31749 0.508 0.492 0.000
#> SRR772426 2 0.4002 0.81234 0.160 0.840 0.000
#> SRR772427 2 0.4121 0.81610 0.168 0.832 0.000
#> SRR772428 1 0.0237 0.79538 0.996 0.004 0.000
#> SRR772429 1 0.1163 0.79822 0.972 0.028 0.000
#> SRR772430 1 0.5529 0.41539 0.704 0.296 0.000
#> SRR772431 2 0.6309 0.32481 0.496 0.504 0.000
#> SRR772432 2 0.6180 0.56897 0.416 0.584 0.000
#> SRR772433 1 0.0592 0.78808 0.988 0.012 0.000
#> SRR772434 1 0.0892 0.79714 0.980 0.020 0.000
#> SRR772435 1 0.2165 0.78594 0.936 0.064 0.000
#> SRR772436 1 0.2878 0.76607 0.904 0.096 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772438 1 0.1170 0.79814 0.976 0.016 0.008
#> SRR772439 1 0.0592 0.79752 0.988 0.012 0.000
#> SRR772440 2 0.6309 0.41340 0.496 0.504 0.000
#> SRR772441 1 0.5785 0.38603 0.668 0.332 0.000
#> SRR772442 1 0.5363 0.49877 0.724 0.276 0.000
#> SRR772443 1 0.5760 0.37081 0.672 0.328 0.000
#> SRR772444 1 0.0747 0.79832 0.984 0.016 0.000
#> SRR772445 1 0.0424 0.79621 0.992 0.008 0.000
#> SRR772446 1 0.0592 0.79707 0.988 0.012 0.000
#> SRR772447 1 0.1643 0.79137 0.956 0.044 0.000
#> SRR772448 1 0.6291 -0.21865 0.532 0.468 0.000
#> SRR772449 1 0.5431 0.47967 0.716 0.284 0.000
#> SRR772450 2 0.4062 0.81533 0.164 0.836 0.000
#> SRR772451 2 0.5397 0.75946 0.280 0.720 0.000
#> SRR772452 1 0.0892 0.79714 0.980 0.020 0.000
#> SRR772453 1 0.0592 0.79707 0.988 0.012 0.000
#> SRR772454 1 0.1163 0.79802 0.972 0.028 0.000
#> SRR772455 1 0.0892 0.79174 0.980 0.020 0.000
#> SRR772456 2 0.4062 0.81496 0.164 0.836 0.000
#> SRR772457 2 0.4062 0.81496 0.164 0.836 0.000
#> SRR772458 1 0.0892 0.79763 0.980 0.020 0.000
#> SRR772459 1 0.1753 0.79103 0.952 0.048 0.000
#> SRR772460 2 0.4178 0.81716 0.172 0.828 0.000
#> SRR772461 2 0.4178 0.81716 0.172 0.828 0.000
#> SRR772462 2 0.4121 0.81772 0.168 0.832 0.000
#> SRR772463 2 0.4346 0.82315 0.184 0.816 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.4062 0.70573 0.836 0.164 0.000
#> SRR772466 1 0.6168 0.11123 0.588 0.412 0.000
#> SRR772467 2 0.4346 0.82199 0.184 0.816 0.000
#> SRR772468 2 0.4452 0.81917 0.192 0.808 0.000
#> SRR772469 1 0.1129 0.79755 0.976 0.020 0.004
#> SRR772470 1 0.1860 0.78703 0.948 0.052 0.000
#> SRR772471 1 0.2878 0.75567 0.904 0.096 0.000
#> SRR772472 1 0.0592 0.79707 0.988 0.012 0.000
#> SRR772473 2 0.6299 0.41223 0.476 0.524 0.000
#> SRR772474 1 0.6305 -0.28885 0.516 0.484 0.000
#> SRR772475 3 0.6420 0.81616 0.024 0.288 0.688
#> SRR772476 2 0.4235 0.81818 0.176 0.824 0.000
#> SRR772477 2 0.4121 0.81631 0.168 0.832 0.000
#> SRR772478 1 0.3045 0.77703 0.916 0.064 0.020
#> SRR772479 1 0.0747 0.79722 0.984 0.016 0.000
#> SRR772480 1 0.3752 0.73230 0.856 0.144 0.000
#> SRR772481 1 0.5431 0.52693 0.716 0.284 0.000
#> SRR772482 1 0.4887 0.64841 0.772 0.228 0.000
#> SRR772483 1 0.1163 0.79633 0.972 0.028 0.000
#> SRR772484 2 0.4654 0.82120 0.208 0.792 0.000
#> SRR772485 2 0.6302 0.39743 0.480 0.520 0.000
#> SRR772486 1 0.1182 0.78466 0.976 0.012 0.012
#> SRR772487 1 0.0747 0.79722 0.984 0.016 0.000
#> SRR772488 2 0.5397 0.79171 0.280 0.720 0.000
#> SRR772489 2 0.6309 0.32797 0.500 0.500 0.000
#> SRR772490 1 0.0747 0.78988 0.984 0.016 0.000
#> SRR772491 1 0.3482 0.72898 0.872 0.128 0.000
#> SRR772492 2 0.4178 0.81947 0.172 0.828 0.000
#> SRR772493 2 0.4178 0.82002 0.172 0.828 0.000
#> SRR772494 2 0.4062 0.81496 0.164 0.836 0.000
#> SRR772495 2 0.4002 0.81232 0.160 0.840 0.000
#> SRR772496 1 0.5016 0.61546 0.760 0.240 0.000
#> SRR772497 1 0.5497 0.51019 0.708 0.292 0.000
#> SRR772498 1 0.5016 0.59241 0.760 0.240 0.000
#> SRR772499 1 0.5882 0.36898 0.652 0.348 0.000
#> SRR772500 2 0.5529 0.78186 0.296 0.704 0.000
#> SRR772501 2 0.4931 0.80216 0.232 0.768 0.000
#> SRR772502 1 0.4121 0.69783 0.832 0.168 0.000
#> SRR772503 1 0.1529 0.79418 0.960 0.040 0.000
#> SRR772504 2 0.4452 0.82399 0.192 0.808 0.000
#> SRR772505 2 0.5327 0.78028 0.272 0.728 0.000
#> SRR772506 2 0.4121 0.81631 0.168 0.832 0.000
#> SRR772507 2 0.4121 0.81631 0.168 0.832 0.000
#> SRR772508 2 0.4399 0.82407 0.188 0.812 0.000
#> SRR772509 3 0.5774 0.88026 0.020 0.232 0.748
#> SRR772510 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 2 0.6308 0.35343 0.492 0.508 0.000
#> SRR772512 3 0.0237 0.93190 0.000 0.004 0.996
#> SRR772513 1 0.4291 0.68646 0.820 0.180 0.000
#> SRR772514 1 0.5982 0.41072 0.668 0.328 0.004
#> SRR772515 2 0.5178 0.81239 0.256 0.744 0.000
#> SRR772516 2 0.4605 0.82366 0.204 0.796 0.000
#> SRR772517 1 0.6299 -0.24660 0.524 0.476 0.000
#> SRR772518 1 0.6286 -0.21033 0.536 0.464 0.000
#> SRR772519 2 0.5431 0.75936 0.284 0.716 0.000
#> SRR772520 2 0.5905 0.70425 0.352 0.648 0.000
#> SRR772521 1 0.1031 0.79251 0.976 0.024 0.000
#> SRR772522 1 0.0424 0.79500 0.992 0.008 0.000
#> SRR772523 1 0.5760 0.34372 0.672 0.328 0.000
#> SRR772524 1 0.6045 0.14657 0.620 0.380 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 2 0.4121 0.81631 0.168 0.832 0.000
#> SRR772527 2 0.4062 0.81496 0.164 0.836 0.000
#> SRR772528 3 0.4840 0.91946 0.016 0.168 0.816
#> SRR772529 1 0.1964 0.78971 0.944 0.056 0.000
#> SRR772530 1 0.0592 0.79726 0.988 0.012 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 2 0.4887 0.82045 0.228 0.772 0.000
#> SRR772533 2 0.5650 0.76303 0.312 0.688 0.000
#> SRR772534 1 0.1529 0.79462 0.960 0.040 0.000
#> SRR772535 1 0.4555 0.65911 0.800 0.200 0.000
#> SRR772536 2 0.4291 0.82278 0.180 0.820 0.000
#> SRR772537 2 0.4452 0.82398 0.192 0.808 0.000
#> SRR772538 2 0.4346 0.82293 0.184 0.816 0.000
#> SRR772539 1 0.1163 0.79408 0.972 0.028 0.000
#> SRR772540 1 0.3267 0.74963 0.884 0.116 0.000
#> SRR772541 2 0.6286 0.44614 0.464 0.536 0.000
#> SRR772542 1 0.0747 0.78893 0.984 0.016 0.000
#> SRR772543 1 0.0747 0.79722 0.984 0.016 0.000
#> SRR772544 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.4902 0.71365 0.844 0.092 0.064
#> SRR772546 1 0.5455 0.67682 0.788 0.184 0.028
#> SRR772547 1 0.0892 0.79714 0.980 0.020 0.000
#> SRR772548 1 0.1860 0.79095 0.948 0.052 0.000
#> SRR772549 1 0.1877 0.78865 0.956 0.032 0.012
#> SRR772550 1 0.0747 0.79722 0.984 0.016 0.000
#> SRR772551 1 0.4235 0.69062 0.824 0.176 0.000
#> SRR772552 1 0.2448 0.78587 0.924 0.076 0.000
#> SRR772553 3 0.5687 0.88515 0.020 0.224 0.756
#> SRR772554 2 0.4291 0.82129 0.180 0.820 0.000
#> SRR772555 2 0.5058 0.80214 0.244 0.756 0.000
#> SRR772556 1 0.0892 0.79840 0.980 0.020 0.000
#> SRR772557 1 0.1636 0.79250 0.964 0.020 0.016
#> SRR772558 1 0.0424 0.79068 0.992 0.008 0.000
#> SRR772559 1 0.0592 0.78808 0.988 0.012 0.000
#> SRR772560 1 0.3941 0.69941 0.844 0.156 0.000
#> SRR772561 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772562 2 0.5058 0.81587 0.244 0.756 0.000
#> SRR772563 2 0.6095 0.66256 0.392 0.608 0.000
#> SRR772564 1 0.0983 0.79729 0.980 0.016 0.004
#> SRR772565 1 0.0592 0.79710 0.988 0.012 0.000
#> SRR772566 1 0.0592 0.78808 0.988 0.012 0.000
#> SRR772567 1 0.0892 0.79714 0.980 0.020 0.000
#> SRR772568 2 0.5785 0.72647 0.332 0.668 0.000
#> SRR772569 2 0.4178 0.81754 0.172 0.828 0.000
#> SRR772570 1 0.6834 0.59431 0.740 0.112 0.148
#> SRR772571 1 0.1529 0.79562 0.960 0.040 0.000
#> SRR772572 1 0.0237 0.79538 0.996 0.004 0.000
#> SRR772573 1 0.0237 0.79538 0.996 0.004 0.000
#> SRR772574 1 0.1643 0.79086 0.956 0.044 0.000
#> SRR772575 1 0.1411 0.79651 0.964 0.036 0.000
#> SRR772576 2 0.6095 0.63006 0.392 0.608 0.000
#> SRR772577 2 0.5835 0.72758 0.340 0.660 0.000
#> SRR772578 2 0.6286 0.46479 0.464 0.536 0.000
#> SRR772579 2 0.5859 0.71404 0.344 0.656 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.1031 0.79315 0.976 0.024 0.000
#> SRR772582 1 0.4654 0.63382 0.792 0.208 0.000
#> SRR772583 1 0.5497 0.50394 0.708 0.292 0.000
#> SRR772584 1 0.6215 0.00334 0.572 0.428 0.000
#> SRR772585 1 0.6235 -0.12272 0.564 0.436 0.000
#> SRR772586 3 0.4979 0.91792 0.020 0.168 0.812
#> SRR772587 1 0.1525 0.79724 0.964 0.032 0.004
#> SRR772588 2 0.4178 0.81975 0.172 0.828 0.000
#> SRR772589 2 0.4974 0.81487 0.236 0.764 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 1 0.0475 0.79500 0.992 0.004 0.004
#> SRR772592 1 0.0592 0.78808 0.988 0.012 0.000
#> SRR772593 3 0.4782 0.92017 0.016 0.164 0.820
#> SRR772594 2 0.6079 0.64416 0.388 0.612 0.000
#> SRR772595 2 0.5291 0.79337 0.268 0.732 0.000
#> SRR772596 3 0.4172 0.91996 0.004 0.156 0.840
#> SRR772597 3 0.0424 0.93033 0.008 0.000 0.992
#> SRR772598 1 0.0892 0.79154 0.980 0.020 0.000
#> SRR772599 1 0.1453 0.79559 0.968 0.024 0.008
#> SRR772600 2 0.6308 0.30926 0.492 0.508 0.000
#> SRR772601 1 0.6026 0.22749 0.624 0.376 0.000
#> SRR772602 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772603 2 0.6299 0.41426 0.476 0.524 0.000
#> SRR772604 1 0.6111 0.14586 0.604 0.396 0.000
#> SRR772605 1 0.5363 0.49258 0.724 0.276 0.000
#> SRR772606 1 0.0829 0.78690 0.984 0.012 0.004
#> SRR772607 1 0.0747 0.78893 0.984 0.016 0.000
#> SRR772608 2 0.5785 0.73795 0.332 0.668 0.000
#> SRR772609 1 0.6192 0.03484 0.580 0.420 0.000
#> SRR772610 2 0.6274 0.45543 0.456 0.544 0.000
#> SRR772611 2 0.4654 0.82313 0.208 0.792 0.000
#> SRR772612 1 0.6026 0.20089 0.624 0.376 0.000
#> SRR772613 2 0.6302 0.36211 0.480 0.520 0.000
#> SRR772614 1 0.1031 0.79859 0.976 0.024 0.000
#> SRR772615 1 0.1031 0.79741 0.976 0.024 0.000
#> SRR772616 1 0.0829 0.79328 0.984 0.012 0.004
#> SRR772617 2 0.6192 0.55660 0.420 0.580 0.000
#> SRR772618 1 0.6045 0.20080 0.620 0.380 0.000
#> SRR772619 2 0.4504 0.82340 0.196 0.804 0.000
#> SRR772620 2 0.5098 0.80690 0.248 0.752 0.000
#> SRR772621 2 0.6204 0.60012 0.424 0.576 0.000
#> SRR772622 1 0.6180 -0.03843 0.584 0.416 0.000
#> SRR772623 3 0.3234 0.87748 0.072 0.020 0.908
#> SRR772624 3 0.4840 0.91945 0.016 0.168 0.816
#> SRR772625 3 0.7065 0.74752 0.048 0.288 0.664
#> SRR772626 1 0.5397 0.49351 0.720 0.280 0.000
#> SRR772627 2 0.5733 0.74190 0.324 0.676 0.000
#> SRR772628 1 0.0892 0.79714 0.980 0.020 0.000
#> SRR772629 1 0.0747 0.79020 0.984 0.016 0.000
#> SRR772630 1 0.0592 0.79704 0.988 0.012 0.000
#> SRR772631 3 0.5223 0.91323 0.024 0.176 0.800
#> SRR772632 2 0.4346 0.82296 0.184 0.816 0.000
#> SRR772633 2 0.4178 0.81873 0.172 0.828 0.000
#> SRR772634 1 0.0592 0.79707 0.988 0.012 0.000
#> SRR772635 1 0.4750 0.64131 0.784 0.216 0.000
#> SRR772636 3 0.6512 0.79312 0.024 0.300 0.676
#> SRR772637 1 0.1031 0.79731 0.976 0.024 0.000
#> SRR772638 1 0.1315 0.79755 0.972 0.020 0.008
#> SRR772639 2 0.5785 0.75061 0.332 0.668 0.000
#> SRR772640 2 0.4121 0.81631 0.168 0.832 0.000
#> SRR772641 2 0.4178 0.81954 0.172 0.828 0.000
#> SRR772642 1 0.4702 0.62718 0.788 0.212 0.000
#> SRR772643 2 0.5443 0.80775 0.260 0.736 0.004
#> SRR772644 1 0.1031 0.79575 0.976 0.024 0.000
#> SRR772645 1 0.3482 0.73567 0.872 0.128 0.000
#> SRR772646 2 0.4654 0.82378 0.208 0.792 0.000
#> SRR772647 2 0.5591 0.73913 0.304 0.696 0.000
#> SRR772648 1 0.5859 0.33840 0.656 0.344 0.000
#> SRR772649 2 0.6079 0.64250 0.388 0.612 0.000
#> SRR772650 1 0.4121 0.70215 0.832 0.168 0.000
#> SRR772651 1 0.0747 0.78990 0.984 0.016 0.000
#> SRR772652 1 0.0747 0.79755 0.984 0.016 0.000
#> SRR772653 1 0.0592 0.78808 0.988 0.012 0.000
#> SRR772654 1 0.3941 0.71606 0.844 0.156 0.000
#> SRR772655 1 0.5968 0.24428 0.636 0.364 0.000
#> SRR772656 3 0.1453 0.92277 0.008 0.024 0.968
#> SRR772657 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772658 2 0.4555 0.82349 0.200 0.800 0.000
#> SRR772659 2 0.6095 0.61858 0.392 0.608 0.000
#> SRR772660 1 0.5926 0.33833 0.644 0.356 0.000
#> SRR772661 3 0.4840 0.91946 0.016 0.168 0.816
#> SRR772662 1 0.5397 0.50097 0.720 0.280 0.000
#> SRR772663 1 0.5254 0.56661 0.736 0.264 0.000
#> SRR772664 2 0.5517 0.79572 0.268 0.728 0.004
#> SRR772665 1 0.4887 0.62439 0.772 0.228 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 2 0.6168 0.57675 0.412 0.588 0.000
#> SRR772668 2 0.6291 0.39205 0.468 0.532 0.000
#> SRR772669 2 0.6291 0.39205 0.468 0.532 0.000
#> SRR772670 1 0.0424 0.79621 0.992 0.008 0.000
#> SRR772671 1 0.3340 0.74897 0.880 0.120 0.000
#> SRR772672 2 0.5835 0.72424 0.340 0.660 0.000
#> SRR772673 1 0.3879 0.70928 0.848 0.152 0.000
#> SRR772674 3 0.0424 0.93080 0.008 0.000 0.992
#> SRR772675 3 0.4749 0.91928 0.012 0.172 0.816
#> SRR772676 1 0.1647 0.79331 0.960 0.036 0.004
#> SRR772677 1 0.3267 0.74768 0.884 0.116 0.000
#> SRR772678 3 0.5595 0.88564 0.016 0.228 0.756
#> SRR772679 1 0.5706 0.43888 0.680 0.320 0.000
#> SRR772680 1 0.1163 0.79739 0.972 0.028 0.000
#> SRR772681 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772682 2 0.6168 0.62421 0.412 0.588 0.000
#> SRR772683 1 0.6154 0.10581 0.592 0.408 0.000
#> SRR772685 2 0.4121 0.81610 0.168 0.832 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.4634 0.92082 0.012 0.164 0.824
#> SRR772688 2 0.4291 0.82219 0.180 0.820 0.000
#> SRR772689 2 0.5098 0.80355 0.248 0.752 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.93230 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 3 0.5992 0.84701 0.016 0.268 0.716
#> SRR772692 1 0.4750 0.61235 0.784 0.216 0.000
#> SRR772693 1 0.9395 -0.22578 0.432 0.396 0.172
#> SRR772694 2 0.6075 0.73257 0.316 0.676 0.008
#> SRR772695 1 0.5397 0.47316 0.720 0.280 0.000
#> SRR772696 2 0.5810 0.73822 0.336 0.664 0.000
#> SRR772697 2 0.6302 0.41084 0.480 0.520 0.000
#> SRR772698 3 0.4840 0.91946 0.016 0.168 0.816
#> SRR772699 1 0.0237 0.79272 0.996 0.004 0.000
#> SRR772700 1 0.0424 0.79737 0.992 0.008 0.000
#> SRR772701 1 0.0592 0.78808 0.988 0.012 0.000
#> SRR772702 1 0.0424 0.79621 0.992 0.008 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.5631 0.6684 0.732 0.156 0.004 NA
#> SRR772342 1 0.5495 0.6631 0.728 0.176 0.000 NA
#> SRR772343 1 0.6856 0.4360 0.516 0.400 0.012 NA
#> SRR772344 2 0.3471 0.6963 0.060 0.868 0.000 NA
#> SRR772345 2 0.2486 0.6868 0.048 0.920 0.004 NA
#> SRR772346 1 0.6714 0.4802 0.540 0.360 0.000 NA
#> SRR772347 1 0.6770 0.6318 0.584 0.304 0.004 NA
#> SRR772348 2 0.6432 0.1257 0.372 0.552 0.000 NA
#> SRR772349 2 0.5240 0.6221 0.192 0.748 0.008 NA
#> SRR772350 3 0.4977 0.8414 0.000 0.000 0.540 NA
#> SRR772351 2 0.7518 0.3644 0.244 0.496 0.000 NA
#> SRR772352 2 0.6614 0.1930 0.360 0.548 0.000 NA
#> SRR772353 1 0.6027 0.6584 0.656 0.272 0.004 NA
#> SRR772354 1 0.5955 0.4854 0.552 0.412 0.004 NA
#> SRR772355 2 0.4136 0.7007 0.060 0.840 0.008 NA
#> SRR772356 2 0.4233 0.6941 0.120 0.828 0.008 NA
#> SRR772357 1 0.6928 0.5602 0.556 0.308 0.000 NA
#> SRR772358 1 0.7138 0.6478 0.576 0.308 0.024 NA
#> SRR772359 2 0.7825 -0.3654 0.424 0.436 0.100 NA
#> SRR772360 2 0.3366 0.6825 0.100 0.872 0.008 NA
#> SRR772361 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772362 2 0.2780 0.6867 0.024 0.912 0.016 NA
#> SRR772363 2 0.3094 0.6865 0.032 0.900 0.020 NA
#> SRR772364 2 0.7597 0.3959 0.220 0.528 0.008 NA
#> SRR772365 1 0.8387 0.3474 0.472 0.264 0.036 NA
#> SRR772366 3 0.0188 0.8226 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR772367 3 0.4992 0.8407 0.000 0.000 0.524 NA
#> SRR772368 2 0.6017 0.6009 0.104 0.692 0.004 NA
#> SRR772369 1 0.7062 0.2725 0.460 0.448 0.016 NA
#> SRR772370 1 0.6275 0.6104 0.620 0.304 0.004 NA
#> SRR772371 1 0.7082 0.6846 0.612 0.244 0.020 NA
#> SRR772372 1 0.6201 0.5477 0.664 0.212 0.000 NA
#> SRR772373 2 0.3765 0.6786 0.116 0.848 0.004 NA
#> SRR772374 2 0.3070 0.6855 0.068 0.896 0.016 NA
#> SRR772375 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772376 2 0.3587 0.6903 0.104 0.856 0.000 NA
#> SRR772377 3 0.0188 0.8239 0.000 0.000 0.996 NA
#> SRR772378 1 0.7598 0.1957 0.476 0.284 0.000 NA
#> SRR772379 1 0.6213 0.6652 0.680 0.228 0.016 NA
#> SRR772380 1 0.5554 0.6744 0.744 0.152 0.008 NA
#> SRR772381 3 0.4981 0.8413 0.000 0.000 0.536 NA
#> SRR772382 1 0.5222 0.6385 0.756 0.132 0.000 NA
#> SRR772383 1 0.5972 0.6767 0.680 0.244 0.008 NA
#> SRR772384 3 0.0376 0.8224 0.004 0.004 0.992 NA
#> SRR772385 3 0.2611 0.7566 0.008 0.096 0.896 NA
#> SRR772386 2 0.5788 0.5503 0.228 0.688 0.000 NA
#> SRR772387 2 0.2861 0.6946 0.096 0.888 0.000 NA
#> SRR772388 1 0.6071 0.6833 0.716 0.152 0.016 NA
#> SRR772389 1 0.6706 0.6919 0.668 0.208 0.036 NA
#> SRR772390 3 0.0524 0.8242 0.004 0.000 0.988 NA
#> SRR772391 1 0.5480 0.6231 0.736 0.140 0.000 NA
#> SRR772392 1 0.7532 0.4507 0.512 0.364 0.036 NA
#> SRR772393 1 0.6228 0.5367 0.572 0.364 0.000 NA
#> SRR772394 2 0.6146 0.5313 0.244 0.664 0.004 NA
#> SRR772395 2 0.3421 0.6954 0.088 0.868 0.000 NA
#> SRR772396 1 0.6736 0.6898 0.632 0.252 0.016 NA
#> SRR772397 1 0.6145 0.6900 0.692 0.212 0.016 NA
#> SRR772398 1 0.6855 0.5667 0.632 0.248 0.024 NA
#> SRR772399 1 0.5754 0.6879 0.716 0.184 0.004 NA
#> SRR772400 1 0.6957 0.6575 0.664 0.184 0.048 NA
#> SRR772401 1 0.5747 0.6704 0.740 0.148 0.016 NA
#> SRR772402 2 0.7576 0.4225 0.212 0.508 0.004 NA
#> SRR772403 2 0.7106 0.5002 0.164 0.576 0.004 NA
#> SRR772404 2 0.6513 0.5723 0.176 0.640 0.000 NA
#> SRR772405 3 0.0188 0.8226 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR772406 2 0.5661 0.5326 0.220 0.700 0.000 NA
#> SRR772407 2 0.2695 0.6982 0.056 0.912 0.008 NA
#> SRR772408 2 0.2623 0.6918 0.064 0.908 0.000 NA
#> SRR772409 2 0.2494 0.6898 0.036 0.916 0.000 NA
#> SRR772410 1 0.6168 0.5309 0.556 0.388 0.000 NA
#> SRR772411 1 0.6492 0.6824 0.668 0.212 0.016 NA
#> SRR772412 1 0.5657 0.6403 0.644 0.312 0.000 NA
#> SRR772413 1 0.5539 0.6894 0.712 0.224 0.004 NA
#> SRR772414 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772415 2 0.6207 0.3408 0.316 0.616 0.004 NA
#> SRR772416 1 0.6974 0.3394 0.488 0.396 0.000 NA
#> SRR772417 1 0.6682 0.4634 0.576 0.312 0.000 NA
#> SRR772418 3 0.0188 0.8226 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR772419 2 0.3240 0.6968 0.056 0.892 0.016 NA
#> SRR772420 2 0.2197 0.6977 0.048 0.928 0.000 NA
#> SRR772421 2 0.3051 0.6953 0.088 0.884 0.000 NA
#> SRR772422 2 0.6046 0.6324 0.156 0.724 0.024 NA
#> SRR772423 2 0.7632 0.3642 0.244 0.468 0.000 NA
#> SRR772424 2 0.7486 0.4157 0.228 0.500 0.000 NA
#> SRR772425 2 0.5186 0.6366 0.164 0.752 0.000 NA
#> SRR772426 2 0.2992 0.6798 0.084 0.892 0.008 NA
#> SRR772427 2 0.2224 0.6888 0.032 0.928 0.000 NA
#> SRR772428 1 0.5192 0.6861 0.760 0.160 0.004 NA
#> SRR772429 1 0.7284 0.6445 0.572 0.296 0.024 NA
#> SRR772430 2 0.7787 0.1353 0.372 0.384 0.000 NA
#> SRR772431 2 0.7576 0.4751 0.188 0.540 0.012 NA
#> SRR772432 2 0.6795 0.5312 0.140 0.612 0.004 NA
#> SRR772433 1 0.5863 0.6528 0.700 0.180 0.000 NA
#> SRR772434 1 0.6791 0.6636 0.668 0.192 0.036 NA
#> SRR772435 1 0.5453 0.6356 0.660 0.304 0.000 NA
#> SRR772436 1 0.7512 0.2688 0.496 0.268 0.000 NA
#> SRR772437 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772438 1 0.6099 0.6867 0.692 0.200 0.008 NA
#> SRR772439 1 0.6386 0.6987 0.660 0.228 0.008 NA
#> SRR772440 2 0.6465 0.5042 0.228 0.636 0.000 NA
#> SRR772441 2 0.6212 0.2056 0.380 0.560 0.000 NA
#> SRR772442 2 0.7786 0.2654 0.308 0.424 0.000 NA
#> SRR772443 2 0.7823 0.2660 0.280 0.412 0.000 NA
#> SRR772444 1 0.5199 0.7015 0.720 0.240 0.004 NA
#> SRR772445 1 0.6213 0.6683 0.656 0.260 0.008 NA
#> SRR772446 1 0.6189 0.6636 0.688 0.192 0.008 NA
#> SRR772447 1 0.6204 0.6740 0.692 0.192 0.012 NA
#> SRR772448 2 0.7587 0.3288 0.280 0.540 0.016 NA
#> SRR772449 2 0.7701 0.0410 0.384 0.424 0.004 NA
#> SRR772450 2 0.3189 0.6861 0.036 0.896 0.020 NA
#> SRR772451 2 0.3081 0.6936 0.064 0.888 0.000 NA
#> SRR772452 1 0.6383 0.6611 0.696 0.172 0.024 NA
#> SRR772453 1 0.5993 0.6863 0.684 0.224 0.004 NA
#> SRR772454 1 0.6911 0.5384 0.572 0.304 0.004 NA
#> SRR772455 1 0.6494 0.5340 0.632 0.232 0.000 NA
#> SRR772456 2 0.3007 0.6888 0.028 0.900 0.012 NA
#> SRR772457 2 0.1994 0.6889 0.004 0.936 0.008 NA
#> SRR772458 1 0.6250 0.6929 0.664 0.228 0.004 NA
#> SRR772459 1 0.6538 0.6850 0.672 0.216 0.028 NA
#> SRR772460 2 0.2060 0.6902 0.016 0.932 0.000 NA
#> SRR772461 2 0.1661 0.6890 0.004 0.944 0.000 NA
#> SRR772462 2 0.2923 0.6842 0.080 0.896 0.008 NA
#> SRR772463 2 0.2174 0.7042 0.052 0.928 0.000 NA
#> SRR772464 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772465 1 0.7120 0.3592 0.524 0.328 0.000 NA
#> SRR772466 2 0.6098 0.0823 0.384 0.572 0.008 NA
#> SRR772467 2 0.3025 0.7004 0.056 0.896 0.004 NA
#> SRR772468 2 0.3081 0.6986 0.064 0.888 0.000 NA
#> SRR772469 1 0.6541 0.6687 0.684 0.184 0.028 NA
#> SRR772470 1 0.6453 0.6678 0.676 0.208 0.020 NA
#> SRR772471 1 0.6132 0.6589 0.684 0.224 0.012 NA
#> SRR772472 1 0.6127 0.6783 0.696 0.180 0.008 NA
#> SRR772473 2 0.6576 0.5446 0.168 0.632 0.000 NA
#> SRR772474 2 0.7446 0.4845 0.208 0.552 0.008 NA
#> SRR772475 3 0.1545 0.8056 0.008 0.040 0.952 NA
#> SRR772476 2 0.2174 0.6905 0.020 0.928 0.000 NA
#> SRR772477 2 0.2883 0.6854 0.028 0.908 0.016 NA
#> SRR772478 1 0.7426 0.6352 0.624 0.216 0.080 NA
#> SRR772479 1 0.6168 0.6764 0.700 0.188 0.016 NA
#> SRR772480 1 0.7894 0.4750 0.528 0.248 0.024 NA
#> SRR772481 1 0.7685 0.1129 0.412 0.400 0.004 NA
#> SRR772482 1 0.7007 0.4841 0.508 0.408 0.028 NA
#> SRR772483 1 0.6366 0.6776 0.688 0.200 0.024 NA
#> SRR772484 2 0.3335 0.6624 0.120 0.860 0.000 NA
#> SRR772485 2 0.6033 0.4066 0.284 0.652 0.008 NA
#> SRR772486 1 0.6304 0.5699 0.680 0.188 0.008 NA
#> SRR772487 1 0.5997 0.6963 0.696 0.208 0.008 NA
#> SRR772488 2 0.3056 0.7050 0.072 0.892 0.004 NA
#> SRR772489 2 0.5620 0.6453 0.160 0.732 0.004 NA
#> SRR772490 1 0.6104 0.6093 0.680 0.180 0.000 NA
#> SRR772491 1 0.6006 0.6223 0.624 0.328 0.012 NA
#> SRR772492 2 0.4770 0.6498 0.048 0.780 0.004 NA
#> SRR772493 2 0.4370 0.6658 0.040 0.808 0.004 NA
#> SRR772494 2 0.2552 0.6870 0.020 0.920 0.012 NA
#> SRR772495 2 0.2731 0.6879 0.032 0.912 0.008 NA
#> SRR772496 1 0.6480 0.4661 0.544 0.392 0.008 NA
#> SRR772497 1 0.6293 0.3458 0.504 0.448 0.008 NA
#> SRR772498 2 0.6668 -0.2195 0.444 0.480 0.004 NA
#> SRR772499 2 0.6857 -0.2756 0.444 0.484 0.032 NA
#> SRR772500 2 0.4882 0.5879 0.208 0.756 0.008 NA
#> SRR772501 2 0.2489 0.6970 0.068 0.912 0.000 NA
#> SRR772502 1 0.6552 0.3317 0.484 0.440 0.000 NA
#> SRR772503 1 0.6524 0.5905 0.616 0.264 0.000 NA
#> SRR772504 2 0.3299 0.7028 0.044 0.888 0.012 NA
#> SRR772505 2 0.3088 0.7045 0.060 0.888 0.000 NA
#> SRR772506 2 0.2400 0.6890 0.032 0.928 0.012 NA
#> SRR772507 2 0.2441 0.6842 0.056 0.920 0.004 NA
#> SRR772508 2 0.3583 0.6896 0.040 0.864 0.004 NA
#> SRR772509 3 0.1042 0.8159 0.008 0.020 0.972 NA
#> SRR772510 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772511 2 0.5756 0.6286 0.176 0.728 0.012 NA
#> SRR772512 3 0.4977 0.8417 0.000 0.000 0.540 NA
#> SRR772513 1 0.6282 0.5303 0.572 0.368 0.004 NA
#> SRR772514 2 0.6298 -0.1574 0.440 0.508 0.004 NA
#> SRR772515 2 0.3182 0.6965 0.096 0.876 0.000 NA
#> SRR772516 2 0.2224 0.6961 0.040 0.928 0.000 NA
#> SRR772517 2 0.6713 0.4208 0.284 0.612 0.012 NA
#> SRR772518 2 0.5755 0.3063 0.332 0.624 0.000 NA
#> SRR772519 2 0.3271 0.6694 0.132 0.856 0.000 NA
#> SRR772520 2 0.4797 0.5393 0.260 0.720 0.000 NA
#> SRR772521 1 0.6482 0.4795 0.640 0.208 0.000 NA
#> SRR772522 1 0.6015 0.5588 0.652 0.268 0.000 NA
#> SRR772523 2 0.7006 0.5002 0.216 0.580 0.000 NA
#> SRR772524 2 0.6664 0.5071 0.232 0.616 0.000 NA
#> SRR772525 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772526 2 0.3076 0.6869 0.036 0.900 0.016 NA
#> SRR772527 2 0.3047 0.6879 0.040 0.900 0.012 NA
#> SRR772528 3 0.0188 0.8226 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR772529 1 0.6722 0.6165 0.604 0.276 0.004 NA
#> SRR772530 1 0.5576 0.6995 0.712 0.220 0.004 NA
#> SRR772531 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772532 2 0.3889 0.6824 0.112 0.844 0.004 NA
#> SRR772533 2 0.5340 0.5617 0.220 0.728 0.008 NA
#> SRR772534 1 0.6398 0.4788 0.576 0.344 0.000 NA
#> SRR772535 1 0.7079 0.4550 0.556 0.276 0.000 NA
#> SRR772536 2 0.2555 0.7002 0.040 0.920 0.008 NA
#> SRR772537 2 0.3453 0.6974 0.052 0.868 0.000 NA
#> SRR772538 2 0.3521 0.6852 0.052 0.864 0.000 NA
#> SRR772539 1 0.6134 0.6290 0.668 0.216 0.000 NA
#> SRR772540 1 0.6574 0.4838 0.548 0.364 0.000 NA
#> SRR772541 2 0.6818 0.4869 0.228 0.624 0.008 NA
#> SRR772542 1 0.6303 0.5392 0.660 0.192 0.000 NA
#> SRR772543 1 0.6475 0.6750 0.648 0.240 0.008 NA
#> SRR772544 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772545 1 0.8438 0.5950 0.544 0.196 0.168 NA
#> SRR772546 1 0.8391 0.5036 0.464 0.336 0.144 NA
#> SRR772547 1 0.6732 0.6815 0.660 0.204 0.024 NA
#> SRR772548 1 0.6640 0.6797 0.664 0.212 0.024 NA
#> SRR772549 1 0.6528 0.6592 0.684 0.176 0.024 NA
#> SRR772550 1 0.6114 0.6755 0.696 0.184 0.008 NA
#> SRR772551 1 0.7345 0.2948 0.508 0.308 0.000 NA
#> SRR772552 1 0.6550 0.6598 0.620 0.272 0.004 NA
#> SRR772553 3 0.1489 0.8051 0.004 0.044 0.952 NA
#> SRR772554 2 0.1811 0.6951 0.028 0.948 0.004 NA
#> SRR772555 2 0.3219 0.6776 0.112 0.868 0.000 NA
#> SRR772556 1 0.6065 0.6400 0.644 0.276 0.000 NA
#> SRR772557 1 0.5968 0.6943 0.688 0.240 0.016 NA
#> SRR772558 1 0.5613 0.6627 0.736 0.132 0.004 NA
#> SRR772559 1 0.5121 0.6503 0.764 0.120 0.000 NA
#> SRR772560 1 0.7676 0.1775 0.452 0.308 0.000 NA
#> SRR772561 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772562 2 0.3491 0.6856 0.104 0.864 0.004 NA
#> SRR772563 2 0.3941 0.6858 0.104 0.844 0.004 NA
#> SRR772564 1 0.6762 0.6740 0.628 0.256 0.016 NA
#> SRR772565 1 0.5934 0.6979 0.704 0.208 0.012 NA
#> SRR772566 1 0.5031 0.6793 0.768 0.140 0.000 NA
#> SRR772567 1 0.6472 0.6844 0.696 0.176 0.036 NA
#> SRR772568 2 0.3443 0.6819 0.136 0.848 0.000 NA
#> SRR772569 2 0.2443 0.6904 0.060 0.916 0.000 NA
#> SRR772570 1 0.9412 0.3989 0.356 0.292 0.252 NA
#> SRR772571 1 0.6305 0.6854 0.676 0.224 0.016 NA
#> SRR772572 1 0.5196 0.6817 0.764 0.160 0.008 NA
#> SRR772573 1 0.5508 0.6704 0.692 0.252 0.000 NA
#> SRR772574 1 0.6391 0.6681 0.692 0.184 0.024 NA
#> SRR772575 1 0.5254 0.6922 0.724 0.220 0.000 NA
#> SRR772576 2 0.5033 0.5579 0.220 0.740 0.004 NA
#> SRR772577 2 0.5496 0.6487 0.108 0.732 0.000 NA
#> SRR772578 2 0.6594 0.4498 0.228 0.624 0.000 NA
#> SRR772579 2 0.3787 0.6902 0.124 0.840 0.000 NA
#> SRR772580 3 0.4948 0.8418 0.000 0.000 0.560 NA
#> SRR772581 1 0.6202 0.5832 0.672 0.172 0.000 NA
#> SRR772582 1 0.7307 0.2294 0.496 0.360 0.004 NA
#> SRR772583 2 0.7723 -0.2723 0.428 0.436 0.032 NA
#> SRR772584 2 0.6996 0.4636 0.244 0.592 0.004 NA
#> SRR772585 2 0.6121 0.6075 0.156 0.680 0.000 NA
#> SRR772586 3 0.0524 0.8209 0.008 0.004 0.988 NA
#> SRR772587 1 0.6799 0.5777 0.588 0.312 0.012 NA
#> SRR772588 2 0.1697 0.6971 0.028 0.952 0.004 NA
#> SRR772589 2 0.3785 0.7007 0.084 0.856 0.004 NA
#> SRR772590 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772591 1 0.5643 0.6890 0.720 0.204 0.008 NA
#> SRR772592 1 0.5116 0.6584 0.764 0.128 0.000 NA
#> SRR772593 3 0.0188 0.8226 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR772594 2 0.5901 0.6408 0.148 0.712 0.004 NA
#> SRR772595 2 0.4610 0.6709 0.052 0.804 0.008 NA
#> SRR772596 3 0.0336 0.8247 0.000 0.000 0.992 NA
#> SRR772597 3 0.5648 0.8389 0.012 0.008 0.552 NA
#> SRR772598 1 0.5689 0.6668 0.712 0.184 0.000 NA
#> SRR772599 1 0.6323 0.6609 0.692 0.176 0.016 NA
#> SRR772600 2 0.7514 0.4385 0.208 0.520 0.004 NA
#> SRR772601 2 0.7806 0.2855 0.284 0.420 0.000 NA
#> SRR772602 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772603 2 0.6758 0.5468 0.192 0.628 0.004 NA
#> SRR772604 2 0.8357 0.2933 0.272 0.436 0.024 NA
#> SRR772605 2 0.7268 0.1866 0.372 0.476 0.000 NA
#> SRR772606 1 0.6250 0.6287 0.664 0.228 0.004 NA
#> SRR772607 1 0.5352 0.6799 0.740 0.168 0.000 NA
#> SRR772608 2 0.4749 0.6863 0.124 0.796 0.004 NA
#> SRR772609 2 0.7463 0.4170 0.224 0.504 0.000 NA
#> SRR772610 2 0.5912 0.4160 0.276 0.664 0.008 NA
#> SRR772611 2 0.3675 0.6859 0.104 0.860 0.016 NA
#> SRR772612 2 0.7906 0.1958 0.316 0.368 0.000 NA
#> SRR772613 2 0.7664 0.4560 0.200 0.528 0.012 NA
#> SRR772614 1 0.5972 0.6942 0.696 0.220 0.012 NA
#> SRR772615 1 0.6369 0.6813 0.700 0.184 0.036 NA
#> SRR772616 1 0.6134 0.6731 0.668 0.216 0.000 NA
#> SRR772617 2 0.7045 0.5599 0.176 0.616 0.012 NA
#> SRR772618 2 0.7910 0.1950 0.316 0.364 0.000 NA
#> SRR772619 2 0.3764 0.6816 0.040 0.844 0.000 NA
#> SRR772620 2 0.4881 0.6347 0.048 0.756 0.000 NA
#> SRR772621 2 0.3913 0.6703 0.148 0.824 0.000 NA
#> SRR772622 2 0.5612 0.5420 0.252 0.692 0.004 NA
#> SRR772623 3 0.6678 0.8074 0.060 0.016 0.564 NA
#> SRR772624 3 0.0188 0.8226 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR772625 3 0.3161 0.7246 0.012 0.124 0.864 NA
#> SRR772626 2 0.7730 0.2239 0.292 0.444 0.000 NA
#> SRR772627 2 0.4411 0.6839 0.080 0.812 0.000 NA
#> SRR772628 1 0.7183 0.6718 0.604 0.252 0.024 NA
#> SRR772629 1 0.5763 0.6439 0.700 0.204 0.000 NA
#> SRR772630 1 0.6437 0.5562 0.624 0.280 0.004 NA
#> SRR772631 3 0.0524 0.8197 0.004 0.008 0.988 NA
#> SRR772632 2 0.2317 0.6959 0.032 0.928 0.004 NA
#> SRR772633 2 0.2558 0.6926 0.036 0.920 0.008 NA
#> SRR772634 1 0.5911 0.6723 0.688 0.236 0.008 NA
#> SRR772635 1 0.6128 0.4548 0.536 0.420 0.004 NA
#> SRR772636 3 0.2124 0.7892 0.008 0.068 0.924 NA
#> SRR772637 1 0.6423 0.6931 0.680 0.192 0.016 NA
#> SRR772638 1 0.6801 0.6551 0.668 0.180 0.032 NA
#> SRR772639 2 0.3647 0.6948 0.108 0.852 0.000 NA
#> SRR772640 2 0.2383 0.6879 0.024 0.924 0.004 NA
#> SRR772641 2 0.3399 0.6773 0.092 0.872 0.004 NA
#> SRR772642 1 0.6152 0.3576 0.520 0.436 0.004 NA
#> SRR772643 2 0.4619 0.6438 0.144 0.804 0.016 NA
#> SRR772644 1 0.6269 0.6450 0.632 0.272 0.000 NA
#> SRR772645 1 0.6836 0.6418 0.620 0.276 0.028 NA
#> SRR772646 2 0.4037 0.6442 0.136 0.824 0.000 NA
#> SRR772647 2 0.4218 0.6343 0.184 0.796 0.008 NA
#> SRR772648 2 0.6188 0.4480 0.248 0.668 0.012 NA
#> SRR772649 2 0.5257 0.6186 0.172 0.764 0.032 NA
#> SRR772650 1 0.6795 0.4762 0.500 0.412 0.004 NA
#> SRR772651 1 0.5783 0.6670 0.692 0.220 0.000 NA
#> SRR772652 1 0.5790 0.6192 0.616 0.340 0.000 NA
#> SRR772653 1 0.5964 0.6300 0.684 0.208 0.000 NA
#> SRR772654 1 0.6684 0.5087 0.560 0.336 0.000 NA
#> SRR772655 2 0.6587 0.2486 0.324 0.576 0.000 NA
#> SRR772656 3 0.6200 0.8232 0.008 0.036 0.524 NA
#> SRR772657 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772658 2 0.4517 0.6637 0.028 0.792 0.008 NA
#> SRR772659 2 0.6797 0.5419 0.148 0.616 0.004 NA
#> SRR772660 2 0.6002 -0.1374 0.440 0.524 0.004 NA
#> SRR772661 3 0.0188 0.8226 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR772662 2 0.7520 0.1665 0.328 0.492 0.004 NA
#> SRR772663 2 0.6372 -0.2113 0.448 0.496 0.004 NA
#> SRR772664 2 0.4460 0.6579 0.148 0.808 0.012 NA
#> SRR772665 1 0.6145 0.3665 0.492 0.460 0.000 NA
#> SRR772666 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772667 2 0.7251 0.4986 0.168 0.572 0.008 NA
#> SRR772668 2 0.7760 0.4575 0.196 0.524 0.016 NA
#> SRR772669 2 0.7760 0.4575 0.196 0.524 0.016 NA
#> SRR772670 1 0.6264 0.6649 0.636 0.280 0.004 NA
#> SRR772671 1 0.7172 0.4380 0.532 0.304 0.000 NA
#> SRR772672 2 0.4740 0.6619 0.132 0.788 0.000 NA
#> SRR772673 1 0.7049 0.3908 0.484 0.392 0.000 NA
#> SRR772674 3 0.5097 0.8412 0.004 0.000 0.568 NA
#> SRR772675 3 0.0376 0.8224 0.004 0.004 0.992 NA
#> SRR772676 1 0.6661 0.5467 0.600 0.292 0.004 NA
#> SRR772677 1 0.7488 0.4708 0.528 0.352 0.044 NA
#> SRR772678 3 0.1042 0.8165 0.008 0.020 0.972 NA
#> SRR772679 2 0.6240 -0.3121 0.452 0.500 0.004 NA
#> SRR772680 1 0.6445 0.5861 0.600 0.304 0.000 NA
#> SRR772681 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772682 2 0.4724 0.6669 0.136 0.788 0.000 NA
#> SRR772683 2 0.5989 0.0237 0.400 0.556 0.000 NA
#> SRR772685 2 0.2845 0.6856 0.076 0.896 0.000 NA
#> SRR772686 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772687 3 0.0376 0.8233 0.004 0.000 0.992 NA
#> SRR772688 2 0.3143 0.6948 0.024 0.876 0.000 NA
#> SRR772689 2 0.5321 0.6339 0.064 0.740 0.004 NA
#> SRR772690 3 0.4994 0.8402 0.000 0.000 0.520 NA
#> SRR772691 3 0.1256 0.8107 0.008 0.028 0.964 NA
#> SRR772692 1 0.7832 0.0242 0.392 0.344 0.000 NA
#> SRR772693 2 0.8179 0.2397 0.236 0.520 0.204 NA
#> SRR772694 2 0.3257 0.6871 0.108 0.872 0.008 NA
#> SRR772695 1 0.7372 0.0235 0.420 0.420 0.000 NA
#> SRR772696 2 0.4161 0.6740 0.112 0.836 0.012 NA
#> SRR772697 2 0.4491 0.6630 0.140 0.800 0.000 NA
#> SRR772698 3 0.0188 0.8226 0.004 0.000 0.996 NA
#> SRR772699 1 0.5615 0.6849 0.728 0.176 0.004 NA
#> SRR772700 1 0.4998 0.6922 0.748 0.200 0.000 NA
#> SRR772701 1 0.5536 0.6730 0.724 0.180 0.000 NA
#> SRR772702 1 0.5742 0.6866 0.704 0.216 0.004 NA
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 4 0.6270 -0.11862 0.420 0.104 0.000 0.464 0.012
#> SRR772342 4 0.7019 0.03005 0.400 0.144 0.000 0.420 0.036
#> SRR772343 2 0.6979 -0.29552 0.224 0.392 0.000 0.372 0.012
#> SRR772344 2 0.4886 0.59871 0.040 0.764 0.000 0.116 0.080
#> SRR772345 2 0.2162 0.62179 0.012 0.916 0.000 0.008 0.064
#> SRR772346 4 0.6822 0.29649 0.268 0.236 0.000 0.484 0.012
#> SRR772347 1 0.7179 -0.04318 0.364 0.272 0.000 0.348 0.016
#> SRR772348 2 0.6993 0.28996 0.164 0.524 0.000 0.268 0.044
#> SRR772349 2 0.5779 0.55965 0.152 0.680 0.000 0.136 0.032
#> SRR772350 3 0.1571 0.90309 0.004 0.000 0.936 0.000 0.060
#> SRR772351 4 0.6855 0.16877 0.028 0.388 0.000 0.444 0.140
#> SRR772352 2 0.7375 0.18987 0.256 0.468 0.000 0.228 0.048
#> SRR772353 1 0.6891 0.31709 0.548 0.252 0.000 0.152 0.048
#> SRR772354 2 0.7082 -0.04666 0.364 0.428 0.000 0.180 0.028
#> SRR772355 2 0.3966 0.64010 0.024 0.820 0.000 0.108 0.048
#> SRR772356 2 0.5548 0.59642 0.064 0.728 0.008 0.136 0.064
#> SRR772357 4 0.6750 0.38875 0.224 0.264 0.000 0.500 0.012
#> SRR772358 1 0.7179 0.21840 0.496 0.296 0.004 0.164 0.040
#> SRR772359 2 0.8418 -0.07969 0.324 0.400 0.040 0.152 0.084
#> SRR772360 2 0.4368 0.61047 0.044 0.772 0.000 0.168 0.016
#> SRR772361 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772362 2 0.2349 0.61564 0.012 0.900 0.000 0.004 0.084
#> SRR772363 2 0.2935 0.61907 0.024 0.876 0.000 0.012 0.088
#> SRR772364 2 0.7487 -0.03513 0.136 0.424 0.000 0.360 0.080
#> SRR772365 4 0.7800 0.26688 0.224 0.184 0.004 0.484 0.104
#> SRR772366 5 0.4588 0.91476 0.016 0.000 0.380 0.000 0.604
#> SRR772367 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772368 2 0.5967 0.42677 0.012 0.608 0.000 0.260 0.120
#> SRR772369 2 0.7389 -0.03792 0.380 0.392 0.000 0.180 0.048
#> SRR772370 4 0.7370 0.18242 0.284 0.300 0.000 0.388 0.028
#> SRR772371 1 0.5908 0.48512 0.616 0.136 0.000 0.240 0.008
#> SRR772372 4 0.6515 0.39760 0.212 0.212 0.000 0.560 0.016
#> SRR772373 2 0.4171 0.62338 0.112 0.808 0.000 0.052 0.028
#> SRR772374 2 0.2581 0.63682 0.048 0.904 0.000 0.020 0.028
#> SRR772375 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772376 2 0.4112 0.63104 0.048 0.800 0.000 0.136 0.016
#> SRR772377 5 0.4470 0.89927 0.004 0.000 0.396 0.004 0.596
#> SRR772378 4 0.6398 0.44737 0.144 0.192 0.000 0.620 0.044
#> SRR772379 1 0.4928 0.53761 0.748 0.156 0.000 0.064 0.032
#> SRR772380 1 0.4256 0.50901 0.800 0.044 0.000 0.124 0.032
#> SRR772381 3 0.0865 0.93988 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR772382 4 0.6606 0.12341 0.344 0.136 0.000 0.500 0.020
#> SRR772383 1 0.5176 0.55303 0.716 0.172 0.000 0.096 0.016
#> SRR772384 5 0.4759 0.91308 0.012 0.008 0.380 0.000 0.600
#> SRR772385 5 0.6001 0.75298 0.004 0.092 0.364 0.004 0.536
#> SRR772386 2 0.6295 0.34312 0.104 0.588 0.000 0.276 0.032
#> SRR772387 2 0.3174 0.63932 0.036 0.868 0.000 0.080 0.016
#> SRR772388 1 0.4636 0.53703 0.780 0.068 0.000 0.116 0.036
#> SRR772389 1 0.6462 0.47755 0.600 0.148 0.000 0.216 0.036
#> SRR772390 5 0.4446 0.89981 0.008 0.000 0.400 0.000 0.592
#> SRR772391 4 0.6377 -0.04141 0.400 0.108 0.000 0.476 0.016
#> SRR772392 2 0.7165 -0.29000 0.236 0.396 0.000 0.348 0.020
#> SRR772393 2 0.7634 -0.26367 0.292 0.344 0.000 0.320 0.044
#> SRR772394 2 0.6339 0.37374 0.128 0.568 0.000 0.284 0.020
#> SRR772395 2 0.4012 0.63195 0.044 0.820 0.000 0.104 0.032
#> SRR772396 1 0.6774 0.32146 0.512 0.228 0.000 0.244 0.016
#> SRR772397 1 0.4833 0.57067 0.748 0.132 0.000 0.108 0.012
#> SRR772398 4 0.7592 0.29454 0.276 0.216 0.028 0.460 0.020
#> SRR772399 1 0.5477 0.47483 0.672 0.100 0.000 0.216 0.012
#> SRR772400 1 0.3331 0.53461 0.864 0.072 0.000 0.032 0.032
#> SRR772401 1 0.4506 0.49289 0.764 0.052 0.000 0.168 0.016
#> SRR772402 4 0.7123 0.11009 0.032 0.344 0.000 0.444 0.180
#> SRR772403 2 0.7008 0.02727 0.024 0.412 0.000 0.388 0.176
#> SRR772404 2 0.5955 0.43875 0.048 0.612 0.000 0.288 0.052
#> SRR772405 5 0.4576 0.91390 0.016 0.000 0.376 0.000 0.608
#> SRR772406 2 0.4830 0.42071 0.032 0.696 0.000 0.256 0.016
#> SRR772407 2 0.3343 0.64660 0.040 0.864 0.000 0.068 0.028
#> SRR772408 2 0.2184 0.63217 0.028 0.924 0.000 0.028 0.020
#> SRR772409 2 0.2672 0.62282 0.024 0.896 0.000 0.016 0.064
#> SRR772410 1 0.6193 0.35564 0.576 0.296 0.000 0.108 0.020
#> SRR772411 1 0.5043 0.55368 0.716 0.144 0.000 0.136 0.004
#> SRR772412 1 0.7412 -0.12075 0.396 0.288 0.000 0.284 0.032
#> SRR772413 1 0.7081 0.16871 0.480 0.192 0.000 0.296 0.032
#> SRR772414 3 0.0290 0.95228 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772415 2 0.6890 0.38009 0.168 0.568 0.000 0.208 0.056
#> SRR772416 2 0.7297 -0.23110 0.212 0.380 0.000 0.376 0.032
#> SRR772417 4 0.7215 0.41528 0.216 0.300 0.000 0.452 0.032
#> SRR772418 5 0.4588 0.91476 0.016 0.000 0.380 0.000 0.604
#> SRR772419 2 0.3520 0.64067 0.040 0.856 0.000 0.040 0.064
#> SRR772420 2 0.2845 0.63987 0.028 0.892 0.000 0.032 0.048
#> SRR772421 2 0.3239 0.63544 0.044 0.868 0.000 0.068 0.020
#> SRR772422 2 0.5780 0.53553 0.052 0.668 0.016 0.236 0.028
#> SRR772423 4 0.7213 0.18801 0.048 0.328 0.000 0.464 0.160
#> SRR772424 4 0.7465 0.11920 0.056 0.344 0.000 0.420 0.180
#> SRR772425 2 0.5705 0.50707 0.088 0.636 0.000 0.260 0.016
#> SRR772426 2 0.2822 0.62966 0.064 0.888 0.000 0.012 0.036
#> SRR772427 2 0.2374 0.62429 0.016 0.912 0.000 0.020 0.052
#> SRR772428 1 0.5298 0.50874 0.712 0.080 0.000 0.180 0.028
#> SRR772429 1 0.6959 0.18936 0.484 0.232 0.000 0.264 0.020
#> SRR772430 4 0.6757 0.30535 0.096 0.364 0.000 0.492 0.048
#> SRR772431 4 0.7334 0.02912 0.052 0.380 0.000 0.408 0.160
#> SRR772432 2 0.6660 0.16837 0.012 0.480 0.000 0.340 0.168
#> SRR772433 4 0.6442 -0.11185 0.436 0.104 0.000 0.440 0.020
#> SRR772434 1 0.3411 0.53570 0.860 0.072 0.000 0.032 0.036
#> SRR772435 1 0.7349 0.14856 0.472 0.264 0.000 0.216 0.048
#> SRR772436 4 0.5939 0.45165 0.140 0.208 0.000 0.636 0.016
#> SRR772437 3 0.0404 0.95080 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772438 1 0.7167 0.19416 0.472 0.188 0.004 0.308 0.028
#> SRR772439 1 0.6330 0.45083 0.600 0.136 0.000 0.236 0.028
#> SRR772440 2 0.6070 0.27481 0.076 0.560 0.000 0.340 0.024
#> SRR772441 2 0.7267 0.30053 0.216 0.508 0.000 0.220 0.056
#> SRR772442 4 0.7394 0.19445 0.076 0.328 0.000 0.460 0.136
#> SRR772443 4 0.7308 0.29498 0.080 0.244 0.000 0.520 0.156
#> SRR772444 1 0.6956 0.21252 0.508 0.208 0.000 0.256 0.028
#> SRR772445 1 0.7352 -0.01033 0.436 0.244 0.000 0.284 0.036
#> SRR772446 1 0.3043 0.55806 0.872 0.088 0.000 0.020 0.020
#> SRR772447 1 0.4886 0.56807 0.744 0.124 0.000 0.120 0.012
#> SRR772448 2 0.7352 0.00605 0.200 0.444 0.000 0.312 0.044
#> SRR772449 1 0.7942 -0.20615 0.312 0.312 0.000 0.304 0.072
#> SRR772450 2 0.2577 0.61648 0.016 0.892 0.000 0.008 0.084
#> SRR772451 2 0.3779 0.60175 0.040 0.836 0.000 0.032 0.092
#> SRR772452 1 0.3120 0.53059 0.876 0.064 0.000 0.032 0.028
#> SRR772453 1 0.5331 0.54580 0.720 0.152 0.000 0.096 0.032
#> SRR772454 4 0.7224 0.29920 0.292 0.288 0.000 0.400 0.020
#> SRR772455 4 0.6026 0.40507 0.200 0.196 0.000 0.600 0.004
#> SRR772456 2 0.3142 0.60963 0.004 0.864 0.000 0.056 0.076
#> SRR772457 2 0.2291 0.62266 0.008 0.908 0.000 0.012 0.072
#> SRR772458 1 0.5969 0.50472 0.644 0.160 0.000 0.176 0.020
#> SRR772459 1 0.5597 0.55396 0.704 0.152 0.004 0.112 0.028
#> SRR772460 2 0.2792 0.61826 0.016 0.884 0.000 0.016 0.084
#> SRR772461 2 0.2786 0.61880 0.012 0.884 0.000 0.020 0.084
#> SRR772462 2 0.2839 0.63922 0.048 0.892 0.000 0.036 0.024
#> SRR772463 2 0.3152 0.64338 0.032 0.868 0.000 0.084 0.016
#> SRR772464 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772465 4 0.6797 0.41632 0.152 0.340 0.000 0.484 0.024
#> SRR772466 2 0.6780 0.39585 0.200 0.576 0.000 0.176 0.048
#> SRR772467 2 0.3191 0.62792 0.016 0.868 0.000 0.040 0.076
#> SRR772468 2 0.3867 0.62636 0.048 0.836 0.000 0.044 0.072
#> SRR772469 1 0.3835 0.55343 0.836 0.076 0.000 0.056 0.032
#> SRR772470 1 0.4231 0.57306 0.784 0.148 0.000 0.060 0.008
#> SRR772471 1 0.3830 0.55027 0.824 0.116 0.000 0.040 0.020
#> SRR772472 1 0.3870 0.56127 0.820 0.080 0.000 0.092 0.008
#> SRR772473 2 0.7041 0.25563 0.072 0.516 0.000 0.304 0.108
#> SRR772474 2 0.7537 0.17830 0.140 0.464 0.000 0.304 0.092
#> SRR772475 5 0.5952 0.82746 0.012 0.060 0.372 0.008 0.548
#> SRR772476 2 0.3046 0.62083 0.020 0.876 0.000 0.028 0.076
#> SRR772477 2 0.2804 0.61438 0.016 0.880 0.000 0.012 0.092
#> SRR772478 1 0.5202 0.52454 0.760 0.128 0.028 0.036 0.048
#> SRR772479 1 0.4351 0.57465 0.784 0.104 0.000 0.104 0.008
#> SRR772480 1 0.7475 0.25981 0.448 0.140 0.000 0.332 0.080
#> SRR772481 4 0.7727 0.10659 0.264 0.280 0.000 0.396 0.060
#> SRR772482 2 0.7297 -0.13963 0.388 0.396 0.000 0.172 0.044
#> SRR772483 1 0.5402 0.53939 0.720 0.124 0.000 0.120 0.036
#> SRR772484 2 0.3926 0.62749 0.084 0.820 0.000 0.084 0.012
#> SRR772485 2 0.6361 0.44359 0.236 0.604 0.000 0.124 0.036
#> SRR772486 4 0.6928 0.21903 0.276 0.140 0.012 0.544 0.028
#> SRR772487 1 0.6858 0.37936 0.524 0.168 0.000 0.276 0.032
#> SRR772488 2 0.3640 0.64447 0.028 0.844 0.000 0.088 0.040
#> SRR772489 2 0.5185 0.55436 0.040 0.692 0.000 0.236 0.032
#> SRR772490 4 0.6333 0.15663 0.320 0.132 0.000 0.536 0.012
#> SRR772491 1 0.6986 0.09483 0.432 0.340 0.000 0.212 0.016
#> SRR772492 2 0.4514 0.57633 0.008 0.768 0.000 0.088 0.136
#> SRR772493 2 0.4583 0.57170 0.008 0.764 0.000 0.100 0.128
#> SRR772494 2 0.2550 0.61841 0.020 0.892 0.000 0.004 0.084
#> SRR772495 2 0.2237 0.61607 0.008 0.904 0.000 0.004 0.084
#> SRR772496 2 0.7339 0.04583 0.320 0.424 0.000 0.220 0.036
#> SRR772497 2 0.7182 0.20823 0.280 0.484 0.000 0.196 0.040
#> SRR772498 2 0.7525 0.06811 0.168 0.464 0.008 0.308 0.052
#> SRR772499 2 0.7056 0.30727 0.232 0.536 0.000 0.180 0.052
#> SRR772500 2 0.4753 0.57723 0.196 0.736 0.000 0.052 0.016
#> SRR772501 2 0.2765 0.63584 0.044 0.896 0.000 0.036 0.024
#> SRR772502 2 0.7181 -0.25818 0.184 0.396 0.000 0.388 0.032
#> SRR772503 4 0.6292 0.41142 0.208 0.260 0.000 0.532 0.000
#> SRR772504 2 0.3240 0.63722 0.024 0.868 0.000 0.036 0.072
#> SRR772505 2 0.3683 0.62937 0.048 0.848 0.000 0.056 0.048
#> SRR772506 2 0.2036 0.62775 0.024 0.920 0.000 0.000 0.056
#> SRR772507 2 0.2627 0.62903 0.044 0.900 0.000 0.012 0.044
#> SRR772508 2 0.3690 0.62823 0.008 0.832 0.000 0.092 0.068
#> SRR772509 5 0.5198 0.89924 0.020 0.020 0.372 0.000 0.588
#> SRR772510 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.5602 0.46902 0.096 0.636 0.000 0.260 0.008
#> SRR772512 3 0.1341 0.91059 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772513 1 0.7069 0.20087 0.476 0.308 0.000 0.184 0.032
#> SRR772514 2 0.7204 0.14161 0.332 0.452 0.000 0.176 0.040
#> SRR772515 2 0.3503 0.64137 0.060 0.848 0.000 0.080 0.012
#> SRR772516 2 0.2844 0.64409 0.016 0.888 0.000 0.064 0.032
#> SRR772517 2 0.7229 0.27247 0.192 0.512 0.000 0.240 0.056
#> SRR772518 2 0.6802 0.37975 0.188 0.568 0.000 0.200 0.044
#> SRR772519 2 0.4349 0.61433 0.108 0.800 0.000 0.056 0.036
#> SRR772520 2 0.5575 0.53017 0.132 0.704 0.000 0.128 0.036
#> SRR772521 4 0.6087 0.38741 0.176 0.164 0.000 0.636 0.024
#> SRR772522 4 0.7228 0.40456 0.236 0.240 0.000 0.484 0.040
#> SRR772523 2 0.7283 0.22006 0.120 0.504 0.000 0.288 0.088
#> SRR772524 2 0.6699 0.22023 0.088 0.528 0.000 0.328 0.056
#> SRR772525 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772526 2 0.2567 0.61799 0.012 0.892 0.004 0.004 0.088
#> SRR772527 2 0.2270 0.62078 0.020 0.904 0.000 0.000 0.076
#> SRR772528 5 0.4588 0.91476 0.016 0.000 0.380 0.000 0.604
#> SRR772529 4 0.6830 0.28894 0.284 0.208 0.000 0.492 0.016
#> SRR772530 1 0.6355 0.37461 0.584 0.184 0.000 0.216 0.016
#> SRR772531 3 0.0162 0.95266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772532 2 0.4589 0.61932 0.100 0.780 0.000 0.096 0.024
#> SRR772533 2 0.5616 0.55936 0.128 0.700 0.000 0.136 0.036
#> SRR772534 4 0.7277 0.39669 0.228 0.304 0.000 0.436 0.032
#> SRR772535 4 0.6630 0.33397 0.212 0.192 0.000 0.568 0.028
#> SRR772536 2 0.2228 0.64055 0.016 0.920 0.000 0.044 0.020
#> SRR772537 2 0.4062 0.62349 0.028 0.820 0.000 0.068 0.084
#> SRR772538 2 0.4185 0.60960 0.008 0.796 0.000 0.112 0.084
#> SRR772539 4 0.6251 0.27442 0.280 0.152 0.000 0.560 0.008
#> SRR772540 4 0.6972 0.27036 0.260 0.336 0.000 0.396 0.008
#> SRR772541 2 0.6549 0.36837 0.092 0.584 0.000 0.264 0.060
#> SRR772542 4 0.6483 0.31467 0.244 0.168 0.000 0.568 0.020
#> SRR772543 1 0.6651 0.29560 0.528 0.188 0.000 0.268 0.016
#> SRR772544 3 0.0404 0.95072 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772545 1 0.6829 0.45018 0.660 0.100 0.064 0.060 0.116
#> SRR772546 1 0.8413 0.10923 0.400 0.340 0.052 0.124 0.084
#> SRR772547 1 0.5457 0.55126 0.704 0.124 0.000 0.148 0.024
#> SRR772548 1 0.5271 0.56580 0.724 0.144 0.000 0.104 0.028
#> SRR772549 1 0.3294 0.51101 0.876 0.048 0.008 0.032 0.036
#> SRR772550 1 0.3810 0.55905 0.812 0.088 0.000 0.100 0.000
#> SRR772551 4 0.6309 0.46550 0.124 0.268 0.000 0.584 0.024
#> SRR772552 1 0.7355 0.07644 0.420 0.224 0.000 0.320 0.036
#> SRR772553 5 0.5595 0.87354 0.012 0.036 0.376 0.008 0.568
#> SRR772554 2 0.2607 0.63876 0.024 0.904 0.000 0.032 0.040
#> SRR772555 2 0.3390 0.63206 0.060 0.860 0.000 0.060 0.020
#> SRR772556 4 0.7424 0.29878 0.304 0.276 0.000 0.388 0.032
#> SRR772557 1 0.6314 0.45849 0.628 0.180 0.004 0.160 0.028
#> SRR772558 1 0.5360 0.47523 0.688 0.068 0.000 0.220 0.024
#> SRR772559 1 0.5713 0.39587 0.608 0.064 0.000 0.308 0.020
#> SRR772560 4 0.6518 0.47785 0.124 0.252 0.000 0.584 0.040
#> SRR772561 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772562 2 0.3791 0.63688 0.060 0.836 0.000 0.080 0.024
#> SRR772563 2 0.4679 0.61587 0.088 0.772 0.000 0.116 0.024
#> SRR772564 1 0.6859 0.26151 0.548 0.256 0.004 0.160 0.032
#> SRR772565 1 0.6875 0.22939 0.524 0.200 0.000 0.248 0.028
#> SRR772566 1 0.5729 0.40392 0.596 0.068 0.000 0.320 0.016
#> SRR772567 1 0.5704 0.54351 0.684 0.144 0.000 0.144 0.028
#> SRR772568 2 0.3937 0.62099 0.064 0.832 0.000 0.064 0.040
#> SRR772569 2 0.2597 0.63009 0.020 0.904 0.000 0.036 0.040
#> SRR772570 1 0.8963 0.17578 0.396 0.280 0.104 0.096 0.124
#> SRR772571 1 0.5998 0.45241 0.616 0.184 0.000 0.192 0.008
#> SRR772572 1 0.4581 0.55617 0.788 0.076 0.000 0.096 0.040
#> SRR772573 1 0.7453 -0.08949 0.396 0.220 0.004 0.348 0.032
#> SRR772574 1 0.3908 0.55884 0.824 0.088 0.000 0.072 0.016
#> SRR772575 1 0.7315 0.08809 0.432 0.216 0.000 0.316 0.036
#> SRR772576 2 0.5670 0.55415 0.144 0.704 0.000 0.096 0.056
#> SRR772577 2 0.5516 0.52967 0.032 0.676 0.000 0.228 0.064
#> SRR772578 2 0.5799 0.06598 0.040 0.524 0.000 0.408 0.028
#> SRR772579 2 0.4637 0.60050 0.056 0.784 0.000 0.108 0.052
#> SRR772580 3 0.1608 0.88890 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772581 4 0.6321 0.21651 0.312 0.160 0.000 0.524 0.004
#> SRR772582 4 0.7015 0.45806 0.156 0.308 0.000 0.496 0.040
#> SRR772583 2 0.7395 -0.09357 0.304 0.400 0.000 0.264 0.032
#> SRR772584 2 0.6471 0.28495 0.088 0.540 0.000 0.332 0.040
#> SRR772585 2 0.6297 0.45048 0.068 0.612 0.000 0.252 0.068
#> SRR772586 5 0.4939 0.91010 0.020 0.000 0.380 0.008 0.592
#> SRR772587 1 0.7170 -0.02366 0.388 0.280 0.000 0.316 0.016
#> SRR772588 2 0.2765 0.64370 0.024 0.896 0.000 0.036 0.044
#> SRR772589 2 0.4058 0.62594 0.020 0.816 0.000 0.092 0.072
#> SRR772590 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.6551 0.36082 0.568 0.136 0.000 0.264 0.032
#> SRR772592 1 0.5840 0.34463 0.540 0.056 0.000 0.384 0.020
#> SRR772593 5 0.4675 0.91316 0.020 0.000 0.380 0.000 0.600
#> SRR772594 2 0.5737 0.54124 0.084 0.676 0.000 0.200 0.040
#> SRR772595 2 0.4936 0.56193 0.008 0.728 0.000 0.168 0.096
#> SRR772596 5 0.4350 0.88924 0.004 0.000 0.408 0.000 0.588
#> SRR772597 3 0.2387 0.84486 0.004 0.008 0.908 0.012 0.068
#> SRR772598 1 0.6340 0.12235 0.460 0.112 0.000 0.416 0.012
#> SRR772599 1 0.3305 0.52351 0.868 0.056 0.000 0.032 0.044
#> SRR772600 4 0.7106 0.10205 0.032 0.348 0.000 0.444 0.176
#> SRR772601 4 0.7158 0.29089 0.064 0.220 0.000 0.536 0.180
#> SRR772602 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.7083 0.34285 0.116 0.552 0.000 0.240 0.092
#> SRR772604 4 0.8138 0.21410 0.176 0.256 0.000 0.412 0.156
#> SRR772605 4 0.6798 0.16873 0.108 0.396 0.000 0.456 0.040
#> SRR772606 4 0.6972 0.18855 0.344 0.180 0.004 0.456 0.016
#> SRR772607 1 0.5501 0.47129 0.660 0.104 0.000 0.228 0.008
#> SRR772608 2 0.4384 0.59149 0.032 0.764 0.000 0.184 0.020
#> SRR772609 2 0.7426 0.02971 0.092 0.432 0.000 0.364 0.112
#> SRR772610 2 0.6384 0.47978 0.168 0.628 0.000 0.156 0.048
#> SRR772611 2 0.3254 0.64071 0.052 0.868 0.000 0.060 0.020
#> SRR772612 4 0.6155 0.33292 0.028 0.188 0.000 0.632 0.152
#> SRR772613 4 0.7161 0.04020 0.032 0.384 0.000 0.404 0.180
#> SRR772614 1 0.6283 0.45939 0.604 0.188 0.000 0.188 0.020
#> SRR772615 1 0.5850 0.55403 0.680 0.140 0.000 0.140 0.040
#> SRR772616 4 0.6699 -0.04351 0.416 0.148 0.000 0.420 0.016
#> SRR772617 2 0.7144 0.27687 0.052 0.516 0.000 0.256 0.176
#> SRR772618 4 0.6737 0.32852 0.052 0.208 0.000 0.584 0.156
#> SRR772619 2 0.4704 0.58166 0.016 0.764 0.000 0.116 0.104
#> SRR772620 2 0.5701 0.51186 0.016 0.668 0.000 0.172 0.144
#> SRR772621 2 0.5342 0.56393 0.100 0.720 0.000 0.148 0.032
#> SRR772622 2 0.6220 0.45352 0.156 0.624 0.000 0.192 0.028
#> SRR772623 3 0.5200 0.62296 0.036 0.020 0.764 0.088 0.092
#> SRR772624 5 0.4588 0.91476 0.016 0.000 0.380 0.000 0.604
#> SRR772625 5 0.6814 0.56761 0.008 0.164 0.352 0.008 0.468
#> SRR772626 2 0.7106 -0.03167 0.112 0.428 0.000 0.400 0.060
#> SRR772627 2 0.5333 0.56945 0.044 0.716 0.000 0.176 0.064
#> SRR772628 1 0.7025 0.37210 0.524 0.204 0.000 0.232 0.040
#> SRR772629 4 0.6669 0.17959 0.332 0.188 0.000 0.472 0.008
#> SRR772630 4 0.7277 0.38605 0.252 0.236 0.000 0.472 0.040
#> SRR772631 5 0.4973 0.90770 0.028 0.004 0.376 0.000 0.592
#> SRR772632 2 0.2825 0.63617 0.020 0.896 0.004 0.032 0.048
#> SRR772633 2 0.2354 0.62172 0.012 0.904 0.000 0.008 0.076
#> SRR772634 1 0.5205 0.53399 0.736 0.140 0.000 0.084 0.040
#> SRR772635 2 0.7233 0.07294 0.308 0.468 0.000 0.180 0.044
#> SRR772636 5 0.6611 0.72142 0.016 0.100 0.372 0.012 0.500
#> SRR772637 1 0.4940 0.57200 0.744 0.120 0.000 0.120 0.016
#> SRR772638 1 0.3221 0.53443 0.872 0.056 0.000 0.028 0.044
#> SRR772639 2 0.4224 0.62474 0.044 0.796 0.000 0.136 0.024
#> SRR772640 2 0.2674 0.61913 0.020 0.888 0.000 0.008 0.084
#> SRR772641 2 0.3175 0.63109 0.064 0.872 0.000 0.020 0.044
#> SRR772642 2 0.7568 -0.05171 0.304 0.404 0.000 0.244 0.048
#> SRR772643 2 0.5260 0.61745 0.076 0.756 0.012 0.108 0.048
#> SRR772644 4 0.7209 0.25181 0.344 0.252 0.000 0.384 0.020
#> SRR772645 1 0.5575 0.45226 0.644 0.268 0.000 0.068 0.020
#> SRR772646 2 0.4419 0.62215 0.084 0.800 0.000 0.076 0.040
#> SRR772647 2 0.5166 0.55342 0.088 0.756 0.004 0.100 0.052
#> SRR772648 2 0.6356 0.35692 0.184 0.572 0.000 0.232 0.012
#> SRR772649 2 0.4919 0.58959 0.096 0.748 0.000 0.136 0.020
#> SRR772650 2 0.7079 -0.13222 0.256 0.428 0.000 0.300 0.016
#> SRR772651 4 0.6759 0.25790 0.296 0.204 0.000 0.488 0.012
#> SRR772652 1 0.7593 -0.23392 0.328 0.328 0.000 0.304 0.040
#> SRR772653 4 0.6488 0.18393 0.340 0.144 0.000 0.504 0.012
#> SRR772654 4 0.6947 0.36403 0.208 0.272 0.000 0.496 0.024
#> SRR772655 2 0.6277 -0.08410 0.104 0.444 0.000 0.440 0.012
#> SRR772656 3 0.1982 0.87313 0.000 0.028 0.932 0.012 0.028
#> SRR772657 3 0.0404 0.95080 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772658 2 0.4775 0.56897 0.016 0.756 0.000 0.092 0.136
#> SRR772659 2 0.7007 0.24029 0.040 0.508 0.000 0.288 0.164
#> SRR772660 2 0.6770 0.31390 0.216 0.560 0.000 0.188 0.036
#> SRR772661 5 0.4588 0.91476 0.016 0.000 0.380 0.000 0.604
#> SRR772662 2 0.6574 0.07808 0.148 0.472 0.000 0.368 0.012
#> SRR772663 2 0.7147 0.09325 0.200 0.464 0.000 0.304 0.032
#> SRR772664 2 0.4711 0.60435 0.072 0.772 0.000 0.124 0.032
#> SRR772665 2 0.7384 0.05609 0.320 0.440 0.000 0.192 0.048
#> SRR772666 3 0.0404 0.95080 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772667 2 0.6616 0.22380 0.012 0.508 0.000 0.304 0.176
#> SRR772668 4 0.7172 0.05859 0.032 0.368 0.000 0.416 0.184
#> SRR772669 4 0.7172 0.05859 0.032 0.368 0.000 0.416 0.184
#> SRR772670 1 0.7341 -0.18070 0.364 0.292 0.000 0.320 0.024
#> SRR772671 4 0.6692 0.44648 0.184 0.264 0.000 0.532 0.020
#> SRR772672 2 0.5404 0.55704 0.088 0.704 0.000 0.180 0.028
#> SRR772673 4 0.7715 0.21982 0.280 0.316 0.000 0.352 0.052
#> SRR772674 3 0.2295 0.85234 0.004 0.008 0.900 0.000 0.088
#> SRR772675 5 0.5077 0.91081 0.020 0.008 0.376 0.004 0.592
#> SRR772676 4 0.6772 0.42700 0.200 0.292 0.008 0.496 0.004
#> SRR772677 4 0.7660 0.29141 0.232 0.360 0.008 0.364 0.036
#> SRR772678 5 0.5167 0.89868 0.012 0.020 0.372 0.004 0.592
#> SRR772679 2 0.7164 0.11964 0.324 0.464 0.000 0.172 0.040
#> SRR772680 4 0.7467 0.34847 0.268 0.276 0.000 0.416 0.040
#> SRR772681 3 0.0324 0.94856 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR772682 2 0.5603 0.54331 0.060 0.688 0.000 0.200 0.052
#> SRR772683 2 0.7153 0.32318 0.216 0.516 0.000 0.220 0.048
#> SRR772685 2 0.3003 0.64162 0.040 0.880 0.000 0.064 0.016
#> SRR772686 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772687 5 0.4505 0.91122 0.012 0.000 0.384 0.000 0.604
#> SRR772688 2 0.3908 0.61856 0.016 0.824 0.000 0.072 0.088
#> SRR772689 2 0.5281 0.51492 0.008 0.700 0.000 0.152 0.140
#> SRR772690 3 0.0000 0.95357 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772691 5 0.5584 0.86824 0.012 0.036 0.372 0.008 0.572
#> SRR772692 4 0.6523 0.47732 0.120 0.248 0.000 0.588 0.044
#> SRR772693 2 0.8386 0.25267 0.140 0.520 0.084 0.128 0.128
#> SRR772694 2 0.4399 0.61467 0.108 0.796 0.000 0.064 0.032
#> SRR772695 4 0.7555 0.25663 0.176 0.360 0.000 0.400 0.064
#> SRR772696 2 0.4042 0.61631 0.044 0.792 0.000 0.156 0.008
#> SRR772697 2 0.4913 0.55954 0.056 0.720 0.000 0.208 0.016
#> SRR772698 5 0.4675 0.91317 0.020 0.000 0.380 0.000 0.600
#> SRR772699 1 0.5285 0.51186 0.732 0.100 0.000 0.128 0.040
#> SRR772700 1 0.6712 0.32635 0.532 0.168 0.000 0.276 0.024
#> SRR772701 4 0.6480 0.06287 0.392 0.144 0.000 0.456 0.008
#> SRR772702 1 0.4988 0.55792 0.752 0.124 0.000 0.092 0.032
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 6 0.6750 -0.02657 0.320 0.024 0.016 0.208 0.000 0.432
#> SRR772342 6 0.5338 0.43416 0.156 0.072 0.016 0.056 0.000 0.700
#> SRR772343 6 0.5498 0.40508 0.064 0.272 0.008 0.028 0.004 0.624
#> SRR772344 2 0.3452 0.62455 0.000 0.788 0.012 0.016 0.000 0.184
#> SRR772345 2 0.1736 0.63135 0.004 0.936 0.032 0.020 0.000 0.008
#> SRR772346 6 0.7783 0.27188 0.164 0.208 0.020 0.208 0.000 0.400
#> SRR772347 6 0.7271 0.37308 0.240 0.236 0.024 0.060 0.000 0.440
#> SRR772348 2 0.6955 -0.05795 0.092 0.440 0.020 0.092 0.000 0.356
#> SRR772349 2 0.6272 0.51592 0.112 0.628 0.028 0.056 0.004 0.172
#> SRR772350 3 0.3778 0.89172 0.000 0.000 0.696 0.016 0.288 0.000
#> SRR772351 6 0.6549 -0.07733 0.004 0.304 0.016 0.280 0.000 0.396
#> SRR772352 2 0.7226 -0.11924 0.132 0.384 0.020 0.088 0.000 0.376
#> SRR772353 1 0.7383 0.05130 0.380 0.180 0.016 0.088 0.000 0.336
#> SRR772354 2 0.7756 -0.14178 0.232 0.368 0.024 0.108 0.000 0.268
#> SRR772355 2 0.3657 0.62797 0.000 0.788 0.024 0.020 0.000 0.168
#> SRR772356 2 0.4828 0.51351 0.000 0.664 0.024 0.040 0.004 0.268
#> SRR772357 6 0.7159 0.41762 0.092 0.232 0.012 0.192 0.000 0.472
#> SRR772358 1 0.7587 -0.27541 0.320 0.272 0.012 0.080 0.004 0.312
#> SRR772359 2 0.8403 -0.29512 0.224 0.304 0.004 0.080 0.096 0.292
#> SRR772360 2 0.3786 0.60002 0.000 0.748 0.024 0.008 0.000 0.220
#> SRR772361 3 0.2793 0.95860 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772362 2 0.2701 0.60660 0.000 0.864 0.104 0.028 0.000 0.004
#> SRR772363 2 0.2987 0.60852 0.004 0.860 0.092 0.036 0.004 0.004
#> SRR772364 6 0.6569 0.15905 0.060 0.300 0.004 0.124 0.004 0.508
#> SRR772365 6 0.6780 0.13139 0.060 0.132 0.024 0.160 0.024 0.600
#> SRR772366 5 0.0260 0.93920 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR772367 3 0.2793 0.95860 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772368 2 0.5701 0.04818 0.000 0.496 0.008 0.132 0.000 0.364
#> SRR772369 2 0.7786 -0.17577 0.292 0.328 0.016 0.128 0.000 0.236
#> SRR772370 6 0.7666 0.39647 0.140 0.228 0.016 0.212 0.000 0.404
#> SRR772371 1 0.5859 0.21169 0.508 0.048 0.008 0.052 0.000 0.384
#> SRR772372 6 0.5436 0.34089 0.028 0.072 0.012 0.248 0.000 0.640
#> SRR772373 2 0.3724 0.65412 0.036 0.820 0.016 0.020 0.000 0.108
#> SRR772374 2 0.1686 0.64489 0.004 0.940 0.024 0.016 0.000 0.016
#> SRR772375 3 0.2793 0.95860 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772376 2 0.3989 0.61630 0.004 0.760 0.012 0.024 0.004 0.196
#> SRR772377 5 0.0622 0.93605 0.000 0.000 0.012 0.008 0.980 0.000
#> SRR772378 6 0.4185 0.38544 0.016 0.076 0.020 0.096 0.000 0.792
#> SRR772379 1 0.4487 0.61912 0.772 0.104 0.008 0.056 0.000 0.060
#> SRR772380 1 0.4278 0.61250 0.768 0.016 0.004 0.100 0.000 0.112
#> SRR772381 3 0.3023 0.94608 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR772382 6 0.6163 0.38649 0.116 0.056 0.016 0.204 0.000 0.608
#> SRR772383 1 0.5662 0.56534 0.632 0.136 0.012 0.020 0.000 0.200
#> SRR772384 5 0.0260 0.93934 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR772385 5 0.2730 0.81389 0.004 0.092 0.000 0.024 0.872 0.008
#> SRR772386 2 0.4933 0.28107 0.012 0.532 0.020 0.012 0.000 0.424
#> SRR772387 2 0.2561 0.65105 0.004 0.880 0.008 0.016 0.000 0.092
#> SRR772388 1 0.4673 0.61637 0.696 0.020 0.004 0.048 0.000 0.232
#> SRR772389 1 0.6427 0.26341 0.484 0.068 0.016 0.056 0.004 0.372
#> SRR772390 5 0.0547 0.93296 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772391 6 0.6642 0.20622 0.240 0.024 0.016 0.236 0.000 0.484
#> SRR772392 6 0.5815 0.37996 0.072 0.304 0.000 0.036 0.012 0.576
#> SRR772393 6 0.7263 0.33853 0.204 0.224 0.016 0.092 0.000 0.464
#> SRR772394 2 0.6251 0.09002 0.052 0.492 0.016 0.056 0.004 0.380
#> SRR772395 2 0.3667 0.63200 0.004 0.788 0.016 0.020 0.000 0.172
#> SRR772396 6 0.6620 0.18898 0.356 0.156 0.008 0.040 0.000 0.440
#> SRR772397 1 0.6278 0.47353 0.544 0.112 0.004 0.048 0.004 0.288
#> SRR772398 6 0.7083 0.44098 0.068 0.140 0.020 0.192 0.024 0.556
#> SRR772399 1 0.6140 0.56340 0.596 0.080 0.012 0.076 0.000 0.236
#> SRR772400 1 0.2666 0.63173 0.892 0.044 0.000 0.024 0.008 0.032
#> SRR772401 1 0.4777 0.60884 0.740 0.028 0.004 0.148 0.008 0.072
#> SRR772402 4 0.6611 0.66735 0.028 0.216 0.004 0.416 0.000 0.336
#> SRR772403 4 0.6596 0.53438 0.004 0.328 0.016 0.356 0.000 0.296
#> SRR772404 2 0.5219 0.15425 0.008 0.512 0.004 0.048 0.004 0.424
#> SRR772405 5 0.0291 0.94038 0.004 0.004 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR772406 2 0.5267 0.44955 0.008 0.672 0.016 0.164 0.000 0.140
#> SRR772407 2 0.2653 0.65228 0.004 0.888 0.024 0.024 0.000 0.060
#> SRR772408 2 0.2558 0.64072 0.012 0.896 0.028 0.012 0.000 0.052
#> SRR772409 2 0.2527 0.63428 0.004 0.896 0.044 0.016 0.000 0.040
#> SRR772410 1 0.6536 0.38280 0.532 0.268 0.008 0.072 0.000 0.120
#> SRR772411 1 0.5155 0.60355 0.684 0.100 0.004 0.028 0.000 0.184
#> SRR772412 6 0.6010 0.47245 0.144 0.216 0.008 0.036 0.000 0.596
#> SRR772413 6 0.5829 0.45892 0.212 0.112 0.008 0.044 0.000 0.624
#> SRR772414 3 0.3073 0.95729 0.000 0.000 0.788 0.008 0.204 0.000
#> SRR772415 2 0.7404 0.03352 0.144 0.440 0.028 0.080 0.004 0.304
#> SRR772416 6 0.6014 0.45345 0.120 0.192 0.016 0.048 0.000 0.624
#> SRR772417 6 0.4093 0.45177 0.028 0.152 0.012 0.028 0.000 0.780
#> SRR772418 5 0.0405 0.93925 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000
#> SRR772419 2 0.2198 0.63786 0.000 0.912 0.032 0.024 0.000 0.032
#> SRR772420 2 0.2007 0.64522 0.000 0.920 0.012 0.032 0.000 0.036
#> SRR772421 2 0.2852 0.64710 0.004 0.864 0.016 0.016 0.000 0.100
#> SRR772422 2 0.5136 0.48493 0.004 0.624 0.036 0.028 0.004 0.304
#> SRR772423 6 0.6497 -0.49148 0.020 0.228 0.004 0.316 0.000 0.432
#> SRR772424 6 0.6699 -0.60956 0.032 0.220 0.004 0.356 0.000 0.388
#> SRR772425 2 0.4766 0.43552 0.004 0.596 0.016 0.024 0.000 0.360
#> SRR772426 2 0.2322 0.63466 0.016 0.912 0.032 0.024 0.000 0.016
#> SRR772427 2 0.2182 0.63671 0.004 0.916 0.032 0.020 0.000 0.028
#> SRR772428 1 0.5672 0.59656 0.644 0.052 0.008 0.088 0.000 0.208
#> SRR772429 6 0.6675 0.39253 0.300 0.120 0.016 0.060 0.000 0.504
#> SRR772430 6 0.4504 0.41212 0.004 0.204 0.008 0.068 0.000 0.716
#> SRR772431 4 0.7112 0.61484 0.056 0.248 0.008 0.388 0.000 0.300
#> SRR772432 2 0.6370 -0.43135 0.000 0.392 0.012 0.288 0.000 0.308
#> SRR772433 6 0.6769 0.22851 0.252 0.072 0.016 0.136 0.000 0.524
#> SRR772434 1 0.3418 0.64318 0.852 0.056 0.008 0.028 0.004 0.052
#> SRR772435 6 0.7435 0.12530 0.288 0.192 0.016 0.096 0.000 0.408
#> SRR772436 6 0.5295 0.35802 0.012 0.084 0.020 0.224 0.000 0.660
#> SRR772437 3 0.2854 0.95764 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR772438 6 0.6744 0.29748 0.284 0.076 0.020 0.104 0.000 0.516
#> SRR772439 6 0.6410 -0.03130 0.388 0.060 0.012 0.080 0.000 0.460
#> SRR772440 2 0.5377 0.12543 0.000 0.484 0.012 0.076 0.000 0.428
#> SRR772441 2 0.7221 0.10234 0.124 0.428 0.016 0.108 0.000 0.324
#> SRR772442 6 0.5632 0.10923 0.020 0.164 0.008 0.176 0.000 0.632
#> SRR772443 6 0.6202 -0.56081 0.052 0.100 0.000 0.412 0.000 0.436
#> SRR772444 6 0.6348 0.32457 0.288 0.124 0.008 0.048 0.000 0.532
#> SRR772445 6 0.5953 0.48603 0.140 0.164 0.020 0.040 0.000 0.636
#> SRR772446 1 0.3291 0.64217 0.860 0.032 0.020 0.032 0.000 0.056
#> SRR772447 1 0.3962 0.65058 0.800 0.072 0.004 0.024 0.000 0.100
#> SRR772448 6 0.7427 0.23348 0.164 0.304 0.016 0.108 0.000 0.408
#> SRR772449 6 0.7053 0.31568 0.276 0.180 0.012 0.072 0.000 0.460
#> SRR772450 2 0.3070 0.60565 0.004 0.856 0.100 0.024 0.004 0.012
#> SRR772451 2 0.4574 0.56280 0.008 0.752 0.088 0.024 0.000 0.128
#> SRR772452 1 0.3176 0.61912 0.860 0.020 0.008 0.052 0.000 0.060
#> SRR772453 1 0.5264 0.60609 0.676 0.124 0.008 0.020 0.000 0.172
#> SRR772454 6 0.5862 0.43189 0.092 0.180 0.024 0.052 0.000 0.652
#> SRR772455 6 0.5284 0.41851 0.016 0.128 0.012 0.168 0.000 0.676
#> SRR772456 2 0.2984 0.63742 0.000 0.860 0.064 0.012 0.000 0.064
#> SRR772457 2 0.2056 0.62282 0.000 0.904 0.080 0.012 0.000 0.004
#> SRR772458 1 0.6536 0.27029 0.484 0.096 0.008 0.072 0.000 0.340
#> SRR772459 1 0.6462 0.29597 0.516 0.124 0.004 0.036 0.012 0.308
#> SRR772460 2 0.3492 0.61028 0.004 0.836 0.084 0.028 0.000 0.048
#> SRR772461 2 0.2937 0.62178 0.000 0.864 0.080 0.020 0.000 0.036
#> SRR772462 2 0.1293 0.64289 0.004 0.956 0.016 0.004 0.000 0.020
#> SRR772463 2 0.3097 0.65585 0.008 0.848 0.012 0.020 0.000 0.112
#> SRR772464 3 0.2793 0.95860 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772465 6 0.3956 0.44946 0.008 0.204 0.000 0.040 0.000 0.748
#> SRR772466 2 0.7138 0.26094 0.116 0.512 0.020 0.112 0.004 0.236
#> SRR772467 2 0.3151 0.63276 0.008 0.864 0.052 0.028 0.000 0.048
#> SRR772468 2 0.3913 0.61720 0.004 0.808 0.068 0.032 0.000 0.088
#> SRR772469 1 0.4003 0.64388 0.804 0.036 0.012 0.040 0.000 0.108
#> SRR772470 1 0.4927 0.60925 0.700 0.100 0.000 0.028 0.000 0.172
#> SRR772471 1 0.4490 0.62819 0.760 0.116 0.004 0.032 0.000 0.088
#> SRR772472 1 0.3627 0.65265 0.816 0.048 0.004 0.016 0.000 0.116
#> SRR772473 2 0.6723 -0.23274 0.024 0.388 0.008 0.196 0.004 0.380
#> SRR772474 6 0.7081 0.07218 0.112 0.300 0.004 0.144 0.000 0.440
#> SRR772475 5 0.2101 0.89296 0.000 0.052 0.000 0.028 0.912 0.008
#> SRR772476 2 0.3494 0.61749 0.004 0.836 0.076 0.024 0.000 0.060
#> SRR772477 2 0.2858 0.60880 0.008 0.864 0.096 0.028 0.000 0.004
#> SRR772478 1 0.5778 0.57523 0.692 0.120 0.008 0.036 0.100 0.044
#> SRR772479 1 0.5157 0.60058 0.684 0.068 0.004 0.044 0.000 0.200
#> SRR772480 1 0.7060 0.31837 0.456 0.068 0.012 0.192 0.000 0.272
#> SRR772481 6 0.8048 0.00223 0.228 0.172 0.032 0.172 0.004 0.392
#> SRR772482 2 0.7558 -0.13477 0.188 0.396 0.012 0.092 0.008 0.304
#> SRR772483 1 0.6542 0.43766 0.564 0.100 0.016 0.088 0.000 0.232
#> SRR772484 2 0.3165 0.65608 0.008 0.848 0.012 0.028 0.000 0.104
#> SRR772485 2 0.6827 0.43278 0.116 0.580 0.024 0.128 0.004 0.148
#> SRR772486 6 0.5727 0.31578 0.052 0.048 0.020 0.236 0.004 0.640
#> SRR772487 6 0.6658 0.10762 0.340 0.132 0.016 0.044 0.000 0.468
#> SRR772488 2 0.4052 0.61759 0.016 0.780 0.016 0.032 0.000 0.156
#> SRR772489 2 0.4946 0.42651 0.000 0.604 0.020 0.044 0.000 0.332
#> SRR772490 6 0.6519 0.35865 0.136 0.060 0.016 0.228 0.000 0.560
#> SRR772491 6 0.6479 0.38869 0.212 0.280 0.000 0.028 0.004 0.476
#> SRR772492 2 0.3763 0.62795 0.000 0.808 0.056 0.028 0.000 0.108
#> SRR772493 2 0.3975 0.62516 0.000 0.796 0.056 0.040 0.000 0.108
#> SRR772494 2 0.2808 0.61767 0.008 0.868 0.092 0.028 0.000 0.004
#> SRR772495 2 0.2912 0.60119 0.000 0.856 0.104 0.028 0.000 0.012
#> SRR772496 2 0.7746 -0.18410 0.196 0.352 0.020 0.104 0.004 0.324
#> SRR772497 2 0.7374 0.15260 0.144 0.460 0.016 0.112 0.004 0.264
#> SRR772498 6 0.6286 0.01186 0.048 0.424 0.016 0.072 0.000 0.440
#> SRR772499 2 0.7320 0.23553 0.112 0.492 0.024 0.108 0.008 0.256
#> SRR772500 2 0.4629 0.60174 0.104 0.764 0.012 0.072 0.000 0.048
#> SRR772501 2 0.2742 0.64088 0.008 0.880 0.020 0.016 0.000 0.076
#> SRR772502 6 0.5359 0.36205 0.020 0.332 0.016 0.044 0.000 0.588
#> SRR772503 6 0.5919 0.45344 0.028 0.184 0.008 0.176 0.000 0.604
#> SRR772504 2 0.2365 0.65319 0.000 0.896 0.024 0.012 0.000 0.068
#> SRR772505 2 0.3157 0.63644 0.004 0.832 0.012 0.016 0.000 0.136
#> SRR772506 2 0.1924 0.63089 0.004 0.928 0.028 0.028 0.000 0.012
#> SRR772507 2 0.1923 0.63563 0.008 0.928 0.036 0.020 0.000 0.008
#> SRR772508 2 0.2699 0.64239 0.000 0.856 0.008 0.012 0.000 0.124
#> SRR772509 5 0.1237 0.92810 0.000 0.020 0.000 0.020 0.956 0.004
#> SRR772510 3 0.3043 0.95739 0.000 0.000 0.792 0.008 0.200 0.000
#> SRR772511 2 0.5190 0.44508 0.028 0.612 0.012 0.024 0.004 0.320
#> SRR772512 3 0.3221 0.91847 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR772513 1 0.7277 0.20739 0.432 0.248 0.008 0.076 0.004 0.232
#> SRR772514 2 0.7626 -0.08754 0.304 0.364 0.024 0.088 0.000 0.220
#> SRR772515 2 0.3077 0.65013 0.012 0.836 0.008 0.008 0.000 0.136
#> SRR772516 2 0.2495 0.65388 0.000 0.892 0.032 0.016 0.000 0.060
#> SRR772517 2 0.7379 -0.09869 0.160 0.396 0.016 0.100 0.000 0.328
#> SRR772518 2 0.6631 0.38331 0.072 0.544 0.020 0.108 0.000 0.256
#> SRR772519 2 0.3738 0.62011 0.008 0.792 0.012 0.028 0.000 0.160
#> SRR772520 2 0.5051 0.54501 0.012 0.656 0.008 0.072 0.000 0.252
#> SRR772521 6 0.5035 0.35570 0.004 0.088 0.024 0.196 0.000 0.688
#> SRR772522 6 0.4538 0.46627 0.024 0.180 0.012 0.036 0.004 0.744
#> SRR772523 6 0.5684 0.21714 0.028 0.348 0.008 0.068 0.000 0.548
#> SRR772524 6 0.5226 0.10025 0.000 0.380 0.008 0.076 0.000 0.536
#> SRR772525 3 0.3171 0.95465 0.000 0.000 0.784 0.012 0.204 0.000
#> SRR772526 2 0.3123 0.59959 0.004 0.848 0.100 0.040 0.000 0.008
#> SRR772527 2 0.2939 0.62639 0.012 0.868 0.084 0.024 0.000 0.012
#> SRR772528 5 0.0260 0.93920 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR772529 6 0.7392 0.42040 0.140 0.176 0.016 0.200 0.000 0.468
#> SRR772530 6 0.5949 0.06177 0.368 0.080 0.012 0.028 0.000 0.512
#> SRR772531 3 0.3073 0.95605 0.000 0.000 0.788 0.008 0.204 0.000
#> SRR772532 2 0.4479 0.63234 0.048 0.776 0.024 0.024 0.004 0.124
#> SRR772533 2 0.5477 0.58249 0.060 0.700 0.020 0.100 0.000 0.120
#> SRR772534 6 0.4549 0.45993 0.024 0.188 0.016 0.036 0.000 0.736
#> SRR772535 6 0.7235 0.28502 0.164 0.096 0.016 0.264 0.000 0.460
#> SRR772536 2 0.1837 0.64867 0.000 0.932 0.020 0.012 0.004 0.032
#> SRR772537 2 0.3434 0.63724 0.004 0.840 0.056 0.024 0.000 0.076
#> SRR772538 2 0.4205 0.60308 0.000 0.760 0.036 0.040 0.000 0.164
#> SRR772539 6 0.6096 0.41303 0.104 0.076 0.008 0.200 0.000 0.612
#> SRR772540 6 0.6002 0.40273 0.064 0.276 0.020 0.052 0.000 0.588
#> SRR772541 6 0.6758 0.11808 0.056 0.392 0.020 0.108 0.000 0.424
#> SRR772542 6 0.5906 0.34847 0.056 0.064 0.020 0.244 0.000 0.616
#> SRR772543 6 0.6692 0.24865 0.336 0.100 0.012 0.076 0.000 0.476
#> SRR772544 3 0.2883 0.95641 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR772545 1 0.7373 0.46908 0.516 0.092 0.004 0.064 0.228 0.096
#> SRR772546 2 0.8668 -0.27405 0.200 0.308 0.008 0.104 0.108 0.272
#> SRR772547 1 0.5538 0.43591 0.592 0.048 0.012 0.036 0.000 0.312
#> SRR772548 1 0.5329 0.61351 0.688 0.120 0.004 0.048 0.000 0.140
#> SRR772549 1 0.2353 0.58528 0.904 0.008 0.008 0.064 0.008 0.008
#> SRR772550 1 0.3884 0.64625 0.808 0.040 0.004 0.044 0.000 0.104
#> SRR772551 6 0.6706 0.35166 0.064 0.132 0.020 0.248 0.000 0.536
#> SRR772552 1 0.6946 0.19971 0.432 0.144 0.012 0.068 0.000 0.344
#> SRR772553 5 0.1973 0.90763 0.004 0.036 0.000 0.028 0.924 0.008
#> SRR772554 2 0.1059 0.64147 0.000 0.964 0.016 0.004 0.000 0.016
#> SRR772555 2 0.2317 0.64595 0.004 0.892 0.008 0.008 0.000 0.088
#> SRR772556 6 0.4757 0.49257 0.064 0.172 0.012 0.024 0.000 0.728
#> SRR772557 6 0.6923 -0.09012 0.384 0.120 0.004 0.052 0.020 0.420
#> SRR772558 1 0.5044 0.59668 0.700 0.024 0.004 0.132 0.000 0.140
#> SRR772559 1 0.6292 0.50571 0.568 0.036 0.012 0.200 0.000 0.184
#> SRR772560 6 0.5552 0.39451 0.024 0.124 0.024 0.156 0.000 0.672
#> SRR772561 3 0.2793 0.95860 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772562 2 0.3254 0.65456 0.008 0.852 0.028 0.016 0.004 0.092
#> SRR772563 2 0.4860 0.58988 0.024 0.708 0.016 0.036 0.004 0.212
#> SRR772564 6 0.6737 0.39097 0.300 0.128 0.012 0.048 0.008 0.504
#> SRR772565 6 0.5872 0.43887 0.260 0.100 0.012 0.032 0.000 0.596
#> SRR772566 1 0.6406 0.46595 0.484 0.028 0.008 0.160 0.000 0.320
#> SRR772567 1 0.5293 0.49517 0.620 0.052 0.008 0.028 0.000 0.292
#> SRR772568 2 0.3062 0.60506 0.004 0.824 0.008 0.008 0.000 0.156
#> SRR772569 2 0.2222 0.63475 0.008 0.916 0.024 0.024 0.000 0.028
#> SRR772570 1 0.8873 -0.02193 0.256 0.200 0.028 0.044 0.236 0.236
#> SRR772571 1 0.6139 0.17342 0.472 0.108 0.000 0.044 0.000 0.376
#> SRR772572 1 0.4789 0.62558 0.712 0.032 0.012 0.040 0.000 0.204
#> SRR772573 6 0.5271 0.48991 0.124 0.128 0.012 0.036 0.000 0.700
#> SRR772574 1 0.4005 0.64668 0.804 0.060 0.004 0.044 0.000 0.088
#> SRR772575 6 0.6502 0.21728 0.320 0.088 0.012 0.072 0.000 0.508
#> SRR772576 2 0.6121 0.49704 0.072 0.636 0.024 0.100 0.000 0.168
#> SRR772577 2 0.5266 0.37953 0.004 0.596 0.016 0.068 0.000 0.316
#> SRR772578 2 0.5714 0.04594 0.000 0.484 0.000 0.176 0.000 0.340
#> SRR772579 2 0.3385 0.58332 0.004 0.792 0.004 0.016 0.000 0.184
#> SRR772580 3 0.3351 0.89493 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR772581 6 0.6750 0.33666 0.144 0.068 0.016 0.244 0.000 0.528
#> SRR772582 6 0.5837 0.38851 0.068 0.144 0.012 0.120 0.000 0.656
#> SRR772583 6 0.7388 0.30127 0.212 0.336 0.012 0.060 0.008 0.372
#> SRR772584 6 0.6197 0.23975 0.044 0.400 0.020 0.052 0.004 0.480
#> SRR772585 2 0.5476 0.19418 0.016 0.512 0.020 0.040 0.000 0.412
#> SRR772586 5 0.0622 0.93545 0.012 0.000 0.000 0.000 0.980 0.008
#> SRR772587 6 0.6588 0.41461 0.196 0.188 0.012 0.040 0.008 0.556
#> SRR772588 2 0.2745 0.64947 0.004 0.880 0.020 0.024 0.000 0.072
#> SRR772589 2 0.4513 0.57304 0.020 0.736 0.012 0.044 0.000 0.188
#> SRR772590 3 0.2793 0.95860 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772591 6 0.6351 0.29507 0.264 0.076 0.016 0.068 0.004 0.572
#> SRR772592 1 0.6611 0.38992 0.420 0.028 0.016 0.152 0.000 0.384
#> SRR772593 5 0.0405 0.93925 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988 0.000
#> SRR772594 2 0.6191 0.33729 0.052 0.564 0.020 0.076 0.000 0.288
#> SRR772595 2 0.5158 0.43938 0.008 0.648 0.020 0.064 0.000 0.260
#> SRR772596 5 0.0632 0.93171 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772597 3 0.4178 0.81104 0.004 0.004 0.660 0.016 0.316 0.000
#> SRR772598 6 0.7338 0.03519 0.328 0.088 0.008 0.212 0.000 0.364
#> SRR772599 1 0.3539 0.63273 0.844 0.028 0.008 0.060 0.004 0.056
#> SRR772600 4 0.6489 0.68602 0.020 0.228 0.004 0.436 0.000 0.312
#> SRR772601 4 0.5626 0.48648 0.028 0.072 0.000 0.460 0.000 0.440
#> SRR772602 3 0.2933 0.95821 0.000 0.000 0.796 0.004 0.200 0.000
#> SRR772603 2 0.6942 0.08643 0.072 0.468 0.016 0.112 0.004 0.328
#> SRR772604 4 0.7711 0.45132 0.220 0.132 0.016 0.380 0.000 0.252
#> SRR772605 6 0.4814 0.38516 0.016 0.252 0.008 0.048 0.000 0.676
#> SRR772606 6 0.6344 0.43414 0.104 0.104 0.008 0.192 0.000 0.592
#> SRR772607 1 0.6339 0.54043 0.556 0.064 0.004 0.132 0.000 0.244
#> SRR772608 2 0.4372 0.50259 0.004 0.680 0.012 0.024 0.000 0.280
#> SRR772609 6 0.6926 0.07449 0.052 0.264 0.016 0.168 0.004 0.496
#> SRR772610 2 0.6432 0.43288 0.076 0.596 0.012 0.124 0.004 0.188
#> SRR772611 2 0.2359 0.65579 0.004 0.904 0.024 0.016 0.000 0.052
#> SRR772612 4 0.5342 0.45706 0.004 0.084 0.004 0.528 0.000 0.380
#> SRR772613 6 0.6731 -0.56800 0.020 0.276 0.008 0.332 0.000 0.364
#> SRR772614 1 0.6243 0.08045 0.436 0.096 0.008 0.040 0.000 0.420
#> SRR772615 1 0.5900 0.45241 0.588 0.080 0.012 0.032 0.004 0.284
#> SRR772616 6 0.7407 0.29107 0.280 0.104 0.012 0.192 0.000 0.412
#> SRR772617 2 0.6832 -0.16664 0.024 0.432 0.020 0.216 0.000 0.308
#> SRR772618 4 0.5810 0.51059 0.016 0.104 0.004 0.488 0.000 0.388
#> SRR772619 2 0.3692 0.63423 0.000 0.816 0.064 0.028 0.000 0.092
#> SRR772620 2 0.5211 0.52910 0.000 0.676 0.052 0.076 0.000 0.196
#> SRR772621 2 0.4237 0.57742 0.008 0.700 0.016 0.012 0.000 0.264
#> SRR772622 2 0.5693 0.39878 0.052 0.568 0.024 0.024 0.000 0.332
#> SRR772623 3 0.6381 0.70970 0.028 0.008 0.552 0.048 0.304 0.060
#> SRR772624 5 0.0405 0.93825 0.008 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR772625 5 0.3427 0.68152 0.000 0.156 0.000 0.032 0.804 0.008
#> SRR772626 6 0.5658 0.34475 0.048 0.312 0.012 0.044 0.000 0.584
#> SRR772627 2 0.4258 0.51187 0.008 0.716 0.012 0.024 0.000 0.240
#> SRR772628 6 0.6599 0.19101 0.364 0.104 0.012 0.060 0.000 0.460
#> SRR772629 6 0.6811 0.45364 0.104 0.132 0.016 0.200 0.000 0.548
#> SRR772630 6 0.4248 0.42853 0.052 0.088 0.016 0.048 0.000 0.796
#> SRR772631 5 0.0862 0.93618 0.016 0.008 0.000 0.000 0.972 0.004
#> SRR772632 2 0.2168 0.63486 0.000 0.916 0.036 0.016 0.004 0.028
#> SRR772633 2 0.2812 0.63204 0.004 0.888 0.044 0.028 0.008 0.028
#> SRR772634 1 0.6619 0.49587 0.556 0.152 0.012 0.076 0.000 0.204
#> SRR772635 2 0.7893 -0.01194 0.180 0.404 0.028 0.136 0.004 0.248
#> SRR772636 5 0.2765 0.86517 0.004 0.064 0.004 0.028 0.884 0.016
#> SRR772637 1 0.5465 0.62983 0.668 0.068 0.008 0.060 0.000 0.196
#> SRR772638 1 0.2407 0.61586 0.904 0.012 0.008 0.040 0.000 0.036
#> SRR772639 2 0.3611 0.61938 0.004 0.780 0.008 0.020 0.000 0.188
#> SRR772640 2 0.2839 0.60584 0.000 0.860 0.100 0.032 0.000 0.008
#> SRR772641 2 0.1887 0.64270 0.008 0.932 0.024 0.020 0.000 0.016
#> SRR772642 2 0.7312 -0.08243 0.148 0.384 0.020 0.088 0.000 0.360
#> SRR772643 2 0.4797 0.63784 0.024 0.772 0.040 0.060 0.012 0.092
#> SRR772644 6 0.5666 0.49375 0.092 0.192 0.008 0.056 0.000 0.652
#> SRR772645 1 0.6337 0.45690 0.568 0.216 0.004 0.048 0.004 0.160
#> SRR772646 2 0.3697 0.64963 0.020 0.832 0.024 0.076 0.000 0.048
#> SRR772647 2 0.4421 0.56112 0.016 0.764 0.028 0.044 0.000 0.148
#> SRR772648 2 0.5758 0.21310 0.060 0.536 0.008 0.028 0.004 0.364
#> SRR772649 2 0.4698 0.62260 0.020 0.756 0.016 0.064 0.008 0.136
#> SRR772650 6 0.6146 0.31831 0.096 0.372 0.008 0.036 0.000 0.488
#> SRR772651 6 0.6625 0.45912 0.076 0.188 0.008 0.180 0.000 0.548
#> SRR772652 6 0.5679 0.44338 0.064 0.260 0.004 0.060 0.000 0.612
#> SRR772653 6 0.6630 0.42464 0.116 0.108 0.008 0.216 0.000 0.552
#> SRR772654 6 0.7182 0.40098 0.080 0.232 0.016 0.204 0.000 0.468
#> SRR772655 2 0.6438 0.00798 0.012 0.452 0.016 0.180 0.000 0.340
#> SRR772656 3 0.3652 0.92752 0.000 0.020 0.760 0.000 0.212 0.008
#> SRR772657 3 0.2823 0.95839 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR772658 2 0.3884 0.62623 0.000 0.804 0.064 0.036 0.000 0.096
#> SRR772659 2 0.7036 -0.39763 0.024 0.384 0.024 0.268 0.000 0.300
#> SRR772660 2 0.6501 0.24100 0.072 0.532 0.016 0.072 0.004 0.304
#> SRR772661 5 0.0405 0.94055 0.008 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR772662 6 0.5807 0.30693 0.072 0.372 0.004 0.036 0.000 0.516
#> SRR772663 6 0.6406 0.14178 0.072 0.424 0.020 0.052 0.000 0.432
#> SRR772664 2 0.4524 0.62689 0.016 0.764 0.028 0.044 0.004 0.144
#> SRR772665 2 0.7814 -0.07175 0.176 0.388 0.020 0.136 0.004 0.276
#> SRR772666 3 0.2883 0.95640 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR772667 2 0.6639 -0.41789 0.008 0.376 0.016 0.260 0.000 0.340
#> SRR772668 4 0.6764 0.67694 0.028 0.256 0.008 0.416 0.000 0.292
#> SRR772669 4 0.6764 0.67694 0.028 0.256 0.008 0.416 0.000 0.292
#> SRR772670 6 0.5770 0.48912 0.136 0.184 0.012 0.032 0.000 0.636
#> SRR772671 6 0.5326 0.46621 0.052 0.160 0.008 0.088 0.000 0.692
#> SRR772672 2 0.5491 0.44397 0.044 0.640 0.020 0.032 0.004 0.260
#> SRR772673 6 0.6779 0.35589 0.264 0.136 0.012 0.076 0.000 0.512
#> SRR772674 3 0.3565 0.87459 0.000 0.000 0.692 0.000 0.304 0.004
#> SRR772675 5 0.0837 0.93497 0.000 0.000 0.004 0.020 0.972 0.004
#> SRR772676 6 0.6197 0.45511 0.048 0.188 0.012 0.116 0.012 0.624
#> SRR772677 6 0.6066 0.36106 0.064 0.300 0.012 0.024 0.024 0.576
#> SRR772678 5 0.1282 0.92664 0.004 0.024 0.000 0.012 0.956 0.004
#> SRR772679 2 0.7429 0.09290 0.192 0.452 0.024 0.096 0.000 0.236
#> SRR772680 6 0.5401 0.48189 0.056 0.184 0.016 0.060 0.000 0.684
#> SRR772681 3 0.2823 0.95855 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR772682 2 0.4560 0.39477 0.000 0.592 0.008 0.028 0.000 0.372
#> SRR772683 2 0.7337 0.21651 0.124 0.464 0.028 0.112 0.000 0.272
#> SRR772685 2 0.1440 0.64572 0.004 0.948 0.012 0.004 0.000 0.032
#> SRR772686 3 0.2793 0.95860 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772687 5 0.0603 0.93173 0.000 0.000 0.016 0.004 0.980 0.000
#> SRR772688 2 0.3301 0.63924 0.000 0.844 0.064 0.024 0.000 0.068
#> SRR772689 2 0.4898 0.51636 0.000 0.696 0.032 0.076 0.000 0.196
#> SRR772690 3 0.2793 0.95860 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR772691 5 0.1749 0.91173 0.000 0.036 0.000 0.024 0.932 0.008
#> SRR772692 6 0.4410 0.42122 0.012 0.128 0.016 0.080 0.000 0.764
#> SRR772693 2 0.7811 0.11409 0.060 0.436 0.016 0.060 0.288 0.140
#> SRR772694 2 0.4421 0.59294 0.024 0.768 0.012 0.048 0.004 0.144
#> SRR772695 6 0.6318 0.41468 0.096 0.216 0.020 0.072 0.000 0.596
#> SRR772696 2 0.3679 0.60773 0.000 0.772 0.024 0.012 0.000 0.192
#> SRR772697 2 0.4274 0.49199 0.004 0.660 0.012 0.012 0.000 0.312
#> SRR772698 5 0.0508 0.93880 0.012 0.000 0.004 0.000 0.984 0.000
#> SRR772699 1 0.5283 0.60016 0.688 0.060 0.016 0.044 0.000 0.192
#> SRR772700 1 0.6862 0.32558 0.456 0.116 0.012 0.080 0.000 0.336
#> SRR772701 6 0.6858 0.42202 0.152 0.112 0.012 0.184 0.000 0.540
#> SRR772702 1 0.5406 0.59685 0.632 0.060 0.008 0.036 0.000 0.264
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.480 0.811 0.899 0.4490 0.559 0.559
#> 3 3 0.227 0.459 0.708 0.4018 0.697 0.501
#> 4 4 0.301 0.357 0.623 0.1561 0.785 0.498
#> 5 5 0.381 0.436 0.634 0.0779 0.827 0.484
#> 6 6 0.445 0.340 0.580 0.0465 0.938 0.730
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0672 0.90413 0.992 0.008
#> SRR772342 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.1633 0.90495 0.976 0.024
#> SRR772344 2 0.0376 0.86328 0.004 0.996
#> SRR772345 2 0.0672 0.86488 0.008 0.992
#> SRR772346 1 0.2043 0.90028 0.968 0.032
#> SRR772347 1 0.1414 0.90443 0.980 0.020
#> SRR772348 1 0.7815 0.72895 0.768 0.232
#> SRR772349 2 0.5737 0.83861 0.136 0.864
#> SRR772350 1 0.0938 0.90534 0.988 0.012
#> SRR772351 2 0.9044 0.57529 0.320 0.680
#> SRR772352 1 0.9393 0.52322 0.644 0.356
#> SRR772353 1 0.0672 0.90548 0.992 0.008
#> SRR772354 1 0.7219 0.77163 0.800 0.200
#> SRR772355 1 0.8763 0.61553 0.704 0.296
#> SRR772356 2 0.2423 0.86646 0.040 0.960
#> SRR772357 1 0.4298 0.86942 0.912 0.088
#> SRR772358 1 0.3114 0.89648 0.944 0.056
#> SRR772359 1 0.4431 0.87333 0.908 0.092
#> SRR772360 2 0.8661 0.64835 0.288 0.712
#> SRR772361 2 0.7219 0.78699 0.200 0.800
#> SRR772362 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.2043 0.90520 0.968 0.032
#> SRR772365 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772366 1 0.1633 0.90355 0.976 0.024
#> SRR772367 1 0.2236 0.90102 0.964 0.036
#> SRR772368 1 0.5946 0.84000 0.856 0.144
#> SRR772369 1 0.5737 0.83393 0.864 0.136
#> SRR772370 1 0.4431 0.86759 0.908 0.092
#> SRR772371 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772372 1 0.3879 0.87673 0.924 0.076
#> SRR772373 2 0.4690 0.85495 0.100 0.900
#> SRR772374 2 0.6801 0.80243 0.180 0.820
#> SRR772375 1 0.2236 0.90096 0.964 0.036
#> SRR772376 2 0.3114 0.86513 0.056 0.944
#> SRR772377 2 0.7883 0.75276 0.236 0.764
#> SRR772378 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772379 1 0.0938 0.90528 0.988 0.012
#> SRR772380 1 0.0672 0.90413 0.992 0.008
#> SRR772381 1 0.8144 0.69016 0.748 0.252
#> SRR772382 1 0.2236 0.89892 0.964 0.036
#> SRR772383 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772384 1 0.9686 0.33926 0.604 0.396
#> SRR772385 2 0.8207 0.72713 0.256 0.744
#> SRR772386 1 0.2423 0.89961 0.960 0.040
#> SRR772387 2 0.6343 0.82314 0.160 0.840
#> SRR772388 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772390 1 0.6247 0.81393 0.844 0.156
#> SRR772391 1 0.0376 0.90417 0.996 0.004
#> SRR772392 1 0.1184 0.90457 0.984 0.016
#> SRR772393 1 0.2948 0.89693 0.948 0.052
#> SRR772394 1 0.2778 0.89939 0.952 0.048
#> SRR772395 2 0.9850 0.37695 0.428 0.572
#> SRR772396 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772397 1 0.1633 0.90380 0.976 0.024
#> SRR772398 1 0.5059 0.85434 0.888 0.112
#> SRR772399 1 0.1184 0.90343 0.984 0.016
#> SRR772400 1 0.1184 0.90609 0.984 0.016
#> SRR772401 1 0.1843 0.90227 0.972 0.028
#> SRR772402 1 0.6531 0.79843 0.832 0.168
#> SRR772403 2 0.5629 0.83076 0.132 0.868
#> SRR772404 1 0.1633 0.90607 0.976 0.024
#> SRR772405 1 0.7219 0.76082 0.800 0.200
#> SRR772406 2 0.7815 0.75177 0.232 0.768
#> SRR772407 2 0.9552 0.51937 0.376 0.624
#> SRR772408 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0938 0.86219 0.012 0.988
#> SRR772410 1 0.6438 0.81797 0.836 0.164
#> SRR772411 1 0.0938 0.90528 0.988 0.012
#> SRR772412 1 0.0938 0.90585 0.988 0.012
#> SRR772413 1 0.1184 0.90629 0.984 0.016
#> SRR772414 1 0.4161 0.88022 0.916 0.084
#> SRR772415 1 0.9635 0.43765 0.612 0.388
#> SRR772416 1 0.1184 0.90514 0.984 0.016
#> SRR772417 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772418 1 0.3431 0.88986 0.936 0.064
#> SRR772419 2 0.2423 0.86448 0.040 0.960
#> SRR772420 2 0.2603 0.86668 0.044 0.956
#> SRR772421 2 0.5178 0.84522 0.116 0.884
#> SRR772422 1 0.9686 0.30555 0.604 0.396
#> SRR772423 1 0.9732 0.26365 0.596 0.404
#> SRR772424 1 0.5178 0.84231 0.884 0.116
#> SRR772425 1 0.8661 0.63997 0.712 0.288
#> SRR772426 2 0.0672 0.86551 0.008 0.992
#> SRR772427 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0672 0.90460 0.992 0.008
#> SRR772430 1 0.2043 0.90267 0.968 0.032
#> SRR772431 1 0.8499 0.61376 0.724 0.276
#> SRR772432 2 0.5294 0.84532 0.120 0.880
#> SRR772433 1 0.1184 0.90402 0.984 0.016
#> SRR772434 1 0.0938 0.90474 0.988 0.012
#> SRR772435 1 0.3114 0.89274 0.944 0.056
#> SRR772436 1 0.0376 0.90423 0.996 0.004
#> SRR772437 2 0.8081 0.72628 0.248 0.752
#> SRR772438 1 0.0376 0.90451 0.996 0.004
#> SRR772439 1 0.0938 0.90585 0.988 0.012
#> SRR772440 2 0.6973 0.78585 0.188 0.812
#> SRR772441 1 0.9944 0.02001 0.544 0.456
#> SRR772442 1 0.6887 0.78758 0.816 0.184
#> SRR772443 1 0.0672 0.90477 0.992 0.008
#> SRR772444 1 0.2236 0.89975 0.964 0.036
#> SRR772445 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0938 0.90545 0.988 0.012
#> SRR772447 1 0.0672 0.90477 0.992 0.008
#> SRR772448 1 0.2236 0.90351 0.964 0.036
#> SRR772449 1 0.2948 0.89843 0.948 0.052
#> SRR772450 2 0.0672 0.86443 0.008 0.992
#> SRR772451 2 0.0376 0.86215 0.004 0.996
#> SRR772452 1 0.0938 0.90474 0.988 0.012
#> SRR772453 1 0.0672 0.90513 0.992 0.008
#> SRR772454 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772455 1 0.2043 0.90080 0.968 0.032
#> SRR772456 2 0.0672 0.86457 0.008 0.992
#> SRR772457 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772459 1 0.1843 0.90480 0.972 0.028
#> SRR772460 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.8144 0.74796 0.252 0.748
#> SRR772463 2 0.1414 0.86549 0.020 0.980
#> SRR772464 1 0.4939 0.86135 0.892 0.108
#> SRR772465 1 0.8016 0.71286 0.756 0.244
#> SRR772466 2 0.9944 0.29935 0.456 0.544
#> SRR772467 2 0.5059 0.85241 0.112 0.888
#> SRR772468 2 0.1184 0.86563 0.016 0.984
#> SRR772469 1 0.0672 0.90460 0.992 0.008
#> SRR772470 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772471 1 0.1843 0.90476 0.972 0.028
#> SRR772472 1 0.1184 0.90514 0.984 0.016
#> SRR772473 1 0.2423 0.90450 0.960 0.040
#> SRR772474 1 0.8207 0.67841 0.744 0.256
#> SRR772475 2 0.5737 0.83224 0.136 0.864
#> SRR772476 2 0.0672 0.86216 0.008 0.992
#> SRR772477 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.1414 0.90426 0.980 0.020
#> SRR772479 1 0.0672 0.90477 0.992 0.008
#> SRR772480 1 0.1414 0.90616 0.980 0.020
#> SRR772481 1 0.7376 0.76548 0.792 0.208
#> SRR772482 1 0.1414 0.90416 0.980 0.020
#> SRR772483 1 0.1184 0.90481 0.984 0.016
#> SRR772484 2 0.1184 0.86619 0.016 0.984
#> SRR772485 2 0.7815 0.76425 0.232 0.768
#> SRR772486 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772488 2 0.2423 0.86476 0.040 0.960
#> SRR772489 2 0.6623 0.82186 0.172 0.828
#> SRR772490 1 0.0672 0.90413 0.992 0.008
#> SRR772491 1 0.1414 0.90599 0.980 0.020
#> SRR772492 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0672 0.86392 0.008 0.992
#> SRR772494 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772496 1 0.4815 0.86612 0.896 0.104
#> SRR772497 1 0.5408 0.85326 0.876 0.124
#> SRR772498 1 0.4562 0.87747 0.904 0.096
#> SRR772499 1 0.5178 0.85881 0.884 0.116
#> SRR772500 2 0.9754 0.48128 0.408 0.592
#> SRR772501 2 0.1184 0.86552 0.016 0.984
#> SRR772502 1 0.8267 0.68873 0.740 0.260
#> SRR772503 1 0.4022 0.87434 0.920 0.080
#> SRR772504 2 0.4298 0.85588 0.088 0.912
#> SRR772505 2 0.4161 0.85810 0.084 0.916
#> SRR772506 2 0.0376 0.86397 0.004 0.996
#> SRR772507 2 0.2603 0.86326 0.044 0.956
#> SRR772508 2 0.4690 0.85503 0.100 0.900
#> SRR772509 2 0.9710 0.44034 0.400 0.600
#> SRR772510 1 0.4298 0.87888 0.912 0.088
#> SRR772511 1 0.1843 0.90284 0.972 0.028
#> SRR772512 2 0.0672 0.86392 0.008 0.992
#> SRR772513 1 0.5946 0.82041 0.856 0.144
#> SRR772514 2 0.1843 0.86655 0.028 0.972
#> SRR772515 2 0.3733 0.86021 0.072 0.928
#> SRR772516 2 0.6623 0.81498 0.172 0.828
#> SRR772517 1 0.9732 0.32939 0.596 0.404
#> SRR772518 1 0.7602 0.75709 0.780 0.220
#> SRR772519 2 0.1184 0.86666 0.016 0.984
#> SRR772520 2 0.3879 0.85737 0.076 0.924
#> SRR772521 1 0.3879 0.87848 0.924 0.076
#> SRR772522 1 0.2236 0.90319 0.964 0.036
#> SRR772523 1 0.9635 0.36023 0.612 0.388
#> SRR772524 2 0.9795 0.36469 0.416 0.584
#> SRR772525 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772526 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0376 0.86416 0.004 0.996
#> SRR772528 1 0.4431 0.87370 0.908 0.092
#> SRR772529 1 0.3733 0.88653 0.928 0.072
#> SRR772530 1 0.2043 0.90382 0.968 0.032
#> SRR772531 1 0.1184 0.90479 0.984 0.016
#> SRR772532 2 0.1633 0.86725 0.024 0.976
#> SRR772533 2 0.6343 0.82575 0.160 0.840
#> SRR772534 1 0.3584 0.88664 0.932 0.068
#> SRR772535 1 0.6247 0.81515 0.844 0.156
#> SRR772536 2 0.2423 0.86802 0.040 0.960
#> SRR772537 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0938 0.86383 0.012 0.988
#> SRR772539 1 0.3733 0.87841 0.928 0.072
#> SRR772540 1 0.0938 0.90561 0.988 0.012
#> SRR772541 1 0.2423 0.89998 0.960 0.040
#> SRR772542 1 0.2043 0.90077 0.968 0.032
#> SRR772543 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772544 1 0.9522 0.44825 0.628 0.372
#> SRR772545 1 0.3431 0.89292 0.936 0.064
#> SRR772546 1 0.3114 0.89464 0.944 0.056
#> SRR772547 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772548 1 0.0672 0.90460 0.992 0.008
#> SRR772549 1 0.0938 0.90474 0.988 0.012
#> SRR772550 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772551 1 0.5519 0.83881 0.872 0.128
#> SRR772552 1 0.4022 0.87568 0.920 0.080
#> SRR772553 2 0.9087 0.62116 0.324 0.676
#> SRR772554 2 0.0672 0.86508 0.008 0.992
#> SRR772555 2 0.7883 0.76124 0.236 0.764
#> SRR772556 1 0.1414 0.90559 0.980 0.020
#> SRR772557 1 0.2423 0.90211 0.960 0.040
#> SRR772558 1 0.1633 0.90230 0.976 0.024
#> SRR772559 1 0.0672 0.90462 0.992 0.008
#> SRR772560 1 0.0938 0.90426 0.988 0.012
#> SRR772561 2 0.0938 0.86496 0.012 0.988
#> SRR772562 2 0.9850 0.39443 0.428 0.572
#> SRR772563 2 0.9775 0.45233 0.412 0.588
#> SRR772564 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772565 1 0.0938 0.90502 0.988 0.012
#> SRR772566 1 0.0672 0.90413 0.992 0.008
#> SRR772567 1 0.0938 0.90528 0.988 0.012
#> SRR772568 2 0.4690 0.85241 0.100 0.900
#> SRR772569 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.6048 0.82362 0.852 0.148
#> SRR772571 1 0.2236 0.90458 0.964 0.036
#> SRR772572 1 0.0376 0.90411 0.996 0.004
#> SRR772573 1 0.0672 0.90505 0.992 0.008
#> SRR772574 1 0.0938 0.90528 0.988 0.012
#> SRR772575 1 0.0376 0.90411 0.996 0.004
#> SRR772576 2 0.8713 0.67415 0.292 0.708
#> SRR772577 1 0.9815 0.30952 0.580 0.420
#> SRR772578 1 0.9732 0.28352 0.596 0.404
#> SRR772579 2 0.9129 0.62377 0.328 0.672
#> SRR772580 1 0.3733 0.88624 0.928 0.072
#> SRR772581 1 0.3114 0.88888 0.944 0.056
#> SRR772582 1 0.0938 0.90436 0.988 0.012
#> SRR772583 1 0.2236 0.90262 0.964 0.036
#> SRR772584 1 0.1633 0.90640 0.976 0.024
#> SRR772585 1 0.4562 0.87871 0.904 0.096
#> SRR772586 1 0.0938 0.90474 0.988 0.012
#> SRR772587 1 0.0938 0.90561 0.988 0.012
#> SRR772588 2 0.2423 0.86485 0.040 0.960
#> SRR772589 2 0.6887 0.80732 0.184 0.816
#> SRR772590 2 0.9896 0.25703 0.440 0.560
#> SRR772591 1 0.0938 0.90583 0.988 0.012
#> SRR772592 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.4161 0.87812 0.916 0.084
#> SRR772594 1 0.9996 -0.04006 0.512 0.488
#> SRR772595 2 0.9087 0.55383 0.324 0.676
#> SRR772596 1 0.3733 0.88512 0.928 0.072
#> SRR772597 1 0.2236 0.90309 0.964 0.036
#> SRR772598 1 0.0376 0.90435 0.996 0.004
#> SRR772599 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772600 1 0.7376 0.75350 0.792 0.208
#> SRR772601 1 0.3879 0.87667 0.924 0.076
#> SRR772602 1 0.9635 0.43254 0.612 0.388
#> SRR772603 1 0.4022 0.87496 0.920 0.080
#> SRR772604 1 0.1184 0.90556 0.984 0.016
#> SRR772605 1 0.1184 0.90637 0.984 0.016
#> SRR772606 1 0.0672 0.90535 0.992 0.008
#> SRR772607 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772608 2 0.7376 0.76173 0.208 0.792
#> SRR772609 1 0.2778 0.89929 0.952 0.048
#> SRR772610 2 0.6247 0.82269 0.156 0.844
#> SRR772611 2 0.9170 0.62622 0.332 0.668
#> SRR772612 2 0.9954 0.28258 0.460 0.540
#> SRR772613 1 0.9963 0.16399 0.536 0.464
#> SRR772614 1 0.1184 0.90463 0.984 0.016
#> SRR772615 1 0.1184 0.90579 0.984 0.016
#> SRR772616 1 0.0938 0.90417 0.988 0.012
#> SRR772617 2 0.4562 0.85492 0.096 0.904
#> SRR772618 1 0.7602 0.73232 0.780 0.220
#> SRR772619 2 0.0376 0.86215 0.004 0.996
#> SRR772620 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772621 1 1.0000 0.00871 0.504 0.496
#> SRR772622 1 0.3274 0.89103 0.940 0.060
#> SRR772623 1 0.0938 0.90570 0.988 0.012
#> SRR772624 1 0.1843 0.90277 0.972 0.028
#> SRR772625 2 0.4298 0.85361 0.088 0.912
#> SRR772626 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772627 2 0.9815 0.37709 0.420 0.580
#> SRR772628 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772629 1 0.4022 0.87388 0.920 0.080
#> SRR772630 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772631 1 0.3431 0.88922 0.936 0.064
#> SRR772632 2 0.0376 0.86328 0.004 0.996
#> SRR772633 2 0.0938 0.86496 0.012 0.988
#> SRR772634 1 0.1843 0.90672 0.972 0.028
#> SRR772635 1 0.2778 0.90086 0.952 0.048
#> SRR772636 2 0.1414 0.86603 0.020 0.980
#> SRR772637 1 0.0376 0.90412 0.996 0.004
#> SRR772638 1 0.0672 0.90460 0.992 0.008
#> SRR772639 2 0.3879 0.86230 0.076 0.924
#> SRR772640 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.2236 0.86416 0.036 0.964
#> SRR772642 1 0.4022 0.87904 0.920 0.080
#> SRR772643 2 0.5178 0.83765 0.116 0.884
#> SRR772644 1 0.0376 0.90493 0.996 0.004
#> SRR772645 1 0.2423 0.90022 0.960 0.040
#> SRR772646 2 0.3114 0.86498 0.056 0.944
#> SRR772647 2 0.2423 0.86534 0.040 0.960
#> SRR772648 1 0.3584 0.89357 0.932 0.068
#> SRR772649 1 0.7883 0.71372 0.764 0.236
#> SRR772650 1 0.0938 0.90534 0.988 0.012
#> SRR772651 1 0.2778 0.89594 0.952 0.048
#> SRR772652 1 0.2423 0.90503 0.960 0.040
#> SRR772653 1 0.2603 0.89627 0.956 0.044
#> SRR772654 1 0.5059 0.85381 0.888 0.112
#> SRR772655 1 0.8661 0.63092 0.712 0.288
#> SRR772656 1 0.6973 0.78434 0.812 0.188
#> SRR772657 2 0.5059 0.84565 0.112 0.888
#> SRR772658 2 0.0376 0.86345 0.004 0.996
#> SRR772659 2 0.7674 0.77020 0.224 0.776
#> SRR772660 1 0.1184 0.90457 0.984 0.016
#> SRR772661 1 0.4815 0.86374 0.896 0.104
#> SRR772662 1 0.0672 0.90469 0.992 0.008
#> SRR772663 1 0.1843 0.90478 0.972 0.028
#> SRR772664 2 0.6887 0.79146 0.184 0.816
#> SRR772665 1 0.6247 0.82750 0.844 0.156
#> SRR772666 1 0.7602 0.73951 0.780 0.220
#> SRR772667 1 0.5294 0.85015 0.880 0.120
#> SRR772668 1 0.9922 0.15090 0.552 0.448
#> SRR772669 1 0.9922 0.15090 0.552 0.448
#> SRR772670 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772671 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772672 1 0.4022 0.88475 0.920 0.080
#> SRR772673 1 0.0672 0.90413 0.992 0.008
#> SRR772674 1 0.3879 0.88365 0.924 0.076
#> SRR772675 2 0.7528 0.77410 0.216 0.784
#> SRR772676 1 0.9661 0.42247 0.608 0.392
#> SRR772677 1 0.8386 0.66585 0.732 0.268
#> SRR772678 1 0.5737 0.83510 0.864 0.136
#> SRR772679 1 0.7453 0.76185 0.788 0.212
#> SRR772680 1 0.0376 0.90453 0.996 0.004
#> SRR772681 2 0.9686 0.40420 0.396 0.604
#> SRR772682 2 0.7299 0.76486 0.204 0.796
#> SRR772683 1 0.9393 0.49968 0.644 0.356
#> SRR772685 2 0.9896 0.34257 0.440 0.560
#> SRR772686 1 0.7056 0.77810 0.808 0.192
#> SRR772687 1 0.1184 0.90457 0.984 0.016
#> SRR772688 2 0.0000 0.86316 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.2236 0.86793 0.036 0.964
#> SRR772690 1 0.7299 0.76320 0.796 0.204
#> SRR772691 2 0.6343 0.81693 0.160 0.840
#> SRR772692 1 0.0000 0.90361 1.000 0.000
#> SRR772693 2 0.7528 0.77325 0.216 0.784
#> SRR772694 2 0.1414 0.86671 0.020 0.980
#> SRR772695 1 0.1633 0.90468 0.976 0.024
#> SRR772696 1 0.4022 0.88317 0.920 0.080
#> SRR772697 1 0.9896 0.20823 0.560 0.440
#> SRR772698 1 0.2948 0.89483 0.948 0.052
#> SRR772699 1 0.0938 0.90605 0.988 0.012
#> SRR772700 1 0.2043 0.90132 0.968 0.032
#> SRR772701 1 0.3431 0.88463 0.936 0.064
#> SRR772702 1 0.0672 0.90413 0.992 0.008
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.3752 0.575384 0.856 0.000 0.144
#> SRR772342 1 0.5760 0.569252 0.672 0.000 0.328
#> SRR772343 3 0.6500 -0.156442 0.464 0.004 0.532
#> SRR772344 2 0.2537 0.809485 0.080 0.920 0.000
#> SRR772345 2 0.1015 0.815079 0.008 0.980 0.012
#> SRR772346 3 0.6608 0.225366 0.432 0.008 0.560
#> SRR772347 3 0.5873 0.328542 0.312 0.004 0.684
#> SRR772348 1 0.9142 0.392570 0.512 0.164 0.324
#> SRR772349 2 0.7984 0.610006 0.132 0.652 0.216
#> SRR772350 1 0.6308 0.283315 0.508 0.000 0.492
#> SRR772351 1 0.7037 0.253941 0.636 0.328 0.036
#> SRR772352 1 0.8042 0.438181 0.648 0.136 0.216
#> SRR772353 1 0.6302 0.355663 0.520 0.000 0.480
#> SRR772354 1 0.9428 0.169241 0.428 0.176 0.396
#> SRR772355 1 0.9544 0.099325 0.420 0.192 0.388
#> SRR772356 2 0.3375 0.805924 0.100 0.892 0.008
#> SRR772357 1 0.5506 0.473358 0.764 0.016 0.220
#> SRR772358 3 0.6373 0.009311 0.408 0.004 0.588
#> SRR772359 3 0.6201 0.471341 0.208 0.044 0.748
#> SRR772360 2 0.8362 0.291000 0.348 0.556 0.096
#> SRR772361 3 0.8432 0.364485 0.112 0.312 0.576
#> SRR772362 2 0.0424 0.810641 0.000 0.992 0.008
#> SRR772363 2 0.0237 0.811233 0.000 0.996 0.004
#> SRR772364 1 0.5803 0.584620 0.736 0.016 0.248
#> SRR772365 1 0.6274 0.350024 0.544 0.000 0.456
#> SRR772366 3 0.1765 0.559298 0.040 0.004 0.956
#> SRR772367 3 0.4411 0.535696 0.140 0.016 0.844
#> SRR772368 3 0.8794 -0.037462 0.440 0.112 0.448
#> SRR772369 3 0.8260 -0.164415 0.432 0.076 0.492
#> SRR772370 1 0.4748 0.527565 0.832 0.024 0.144
#> SRR772371 1 0.6204 0.432948 0.576 0.000 0.424
#> SRR772372 1 0.3528 0.564405 0.892 0.016 0.092
#> SRR772373 2 0.6463 0.738801 0.164 0.756 0.080
#> SRR772374 2 0.7380 0.630997 0.088 0.684 0.228
#> SRR772375 3 0.4413 0.542710 0.124 0.024 0.852
#> SRR772376 2 0.5710 0.763931 0.080 0.804 0.116
#> SRR772377 3 0.4700 0.508358 0.008 0.180 0.812
#> SRR772378 1 0.5397 0.540346 0.720 0.000 0.280
#> SRR772379 3 0.6339 0.145508 0.360 0.008 0.632
#> SRR772380 1 0.6126 0.414139 0.644 0.004 0.352
#> SRR772381 3 0.7107 0.499723 0.196 0.092 0.712
#> SRR772382 1 0.2550 0.564085 0.932 0.012 0.056
#> SRR772383 1 0.6509 0.338474 0.524 0.004 0.472
#> SRR772384 3 0.4136 0.532972 0.020 0.116 0.864
#> SRR772385 3 0.4342 0.532186 0.024 0.120 0.856
#> SRR772386 1 0.6313 0.541769 0.676 0.016 0.308
#> SRR772387 2 0.6622 0.697797 0.088 0.748 0.164
#> SRR772388 3 0.6291 -0.155152 0.468 0.000 0.532
#> SRR772389 1 0.6192 0.437266 0.580 0.000 0.420
#> SRR772390 3 0.2173 0.559675 0.008 0.048 0.944
#> SRR772391 1 0.3752 0.579446 0.856 0.000 0.144
#> SRR772392 3 0.5529 0.342034 0.296 0.000 0.704
#> SRR772393 1 0.7049 0.186511 0.528 0.020 0.452
#> SRR772394 1 0.7319 0.372377 0.548 0.032 0.420
#> SRR772395 1 0.9653 0.131626 0.424 0.364 0.212
#> SRR772396 1 0.6305 0.342304 0.516 0.000 0.484
#> SRR772397 3 0.6779 -0.121667 0.444 0.012 0.544
#> SRR772398 1 0.4137 0.538564 0.872 0.032 0.096
#> SRR772399 1 0.6735 0.291858 0.564 0.012 0.424
#> SRR772400 3 0.6483 0.051480 0.392 0.008 0.600
#> SRR772401 3 0.6641 0.062424 0.448 0.008 0.544
#> SRR772402 1 0.5981 0.576589 0.788 0.080 0.132
#> SRR772403 2 0.7610 0.381729 0.388 0.564 0.048
#> SRR772404 1 0.6654 0.332383 0.536 0.008 0.456
#> SRR772405 3 0.3045 0.551683 0.020 0.064 0.916
#> SRR772406 2 0.7624 0.513617 0.368 0.580 0.052
#> SRR772407 3 0.8347 0.179950 0.084 0.404 0.512
#> SRR772408 2 0.0475 0.811832 0.004 0.992 0.004
#> SRR772409 2 0.1753 0.813023 0.048 0.952 0.000
#> SRR772410 3 0.8479 0.213030 0.300 0.120 0.580
#> SRR772411 1 0.6386 0.459488 0.584 0.004 0.412
#> SRR772412 1 0.6267 0.390313 0.548 0.000 0.452
#> SRR772413 1 0.5497 0.565228 0.708 0.000 0.292
#> SRR772414 3 0.6056 0.467675 0.224 0.032 0.744
#> SRR772415 1 0.9608 0.304998 0.468 0.300 0.232
#> SRR772416 1 0.4883 0.586049 0.788 0.004 0.208
#> SRR772417 1 0.6129 0.530307 0.668 0.008 0.324
#> SRR772418 3 0.1620 0.557229 0.024 0.012 0.964
#> SRR772419 2 0.3879 0.755371 0.000 0.848 0.152
#> SRR772420 2 0.4836 0.786701 0.072 0.848 0.080
#> SRR772421 2 0.7129 0.673731 0.180 0.716 0.104
#> SRR772422 3 0.8869 0.323052 0.280 0.160 0.560
#> SRR772423 1 0.6191 0.579117 0.776 0.084 0.140
#> SRR772424 1 0.3832 0.585865 0.880 0.020 0.100
#> SRR772425 1 0.9183 0.275860 0.508 0.168 0.324
#> SRR772426 2 0.1529 0.809010 0.000 0.960 0.040
#> SRR772427 2 0.0424 0.812404 0.000 0.992 0.008
#> SRR772428 3 0.5706 0.329820 0.320 0.000 0.680
#> SRR772429 1 0.6460 0.356831 0.556 0.004 0.440
#> SRR772430 1 0.6468 0.122064 0.552 0.004 0.444
#> SRR772431 3 0.9289 -0.098906 0.396 0.160 0.444
#> SRR772432 2 0.8546 0.525166 0.284 0.584 0.132
#> SRR772433 1 0.6267 0.260655 0.548 0.000 0.452
#> SRR772434 3 0.4702 0.437225 0.212 0.000 0.788
#> SRR772435 1 0.6839 0.392068 0.624 0.024 0.352
#> SRR772436 1 0.3030 0.572539 0.904 0.004 0.092
#> SRR772437 3 0.7909 0.456640 0.112 0.240 0.648
#> SRR772438 3 0.6520 -0.195732 0.488 0.004 0.508
#> SRR772439 1 0.5465 0.559950 0.712 0.000 0.288
#> SRR772440 1 0.7268 -0.104968 0.524 0.448 0.028
#> SRR772441 1 0.9825 0.185243 0.424 0.268 0.308
#> SRR772442 1 0.6012 0.518228 0.788 0.088 0.124
#> SRR772443 1 0.4931 0.583528 0.768 0.000 0.232
#> SRR772444 1 0.5812 0.560459 0.724 0.012 0.264
#> SRR772445 1 0.5650 0.540315 0.688 0.000 0.312
#> SRR772446 3 0.5982 0.196352 0.328 0.004 0.668
#> SRR772447 1 0.6235 0.412937 0.564 0.000 0.436
#> SRR772448 1 0.6255 0.535600 0.684 0.016 0.300
#> SRR772449 1 0.6388 0.547753 0.692 0.024 0.284
#> SRR772450 2 0.0892 0.810492 0.000 0.980 0.020
#> SRR772451 2 0.1753 0.812355 0.048 0.952 0.000
#> SRR772452 3 0.6386 -0.077823 0.412 0.004 0.584
#> SRR772453 1 0.6432 0.447767 0.568 0.004 0.428
#> SRR772454 1 0.6045 0.469058 0.620 0.000 0.380
#> SRR772455 1 0.4293 0.554006 0.832 0.004 0.164
#> SRR772456 2 0.1919 0.815398 0.020 0.956 0.024
#> SRR772457 2 0.0475 0.812630 0.004 0.992 0.004
#> SRR772458 1 0.5859 0.532756 0.656 0.000 0.344
#> SRR772459 1 0.6189 0.499391 0.632 0.004 0.364
#> SRR772460 2 0.0237 0.811912 0.004 0.996 0.000
#> SRR772461 2 0.0475 0.811864 0.004 0.992 0.004
#> SRR772462 2 0.7661 0.179016 0.044 0.504 0.452
#> SRR772463 2 0.3973 0.806868 0.088 0.880 0.032
#> SRR772464 3 0.5069 0.541886 0.128 0.044 0.828
#> SRR772465 1 0.3141 0.539215 0.912 0.068 0.020
#> SRR772466 3 0.9713 0.097757 0.220 0.376 0.404
#> SRR772467 2 0.5481 0.766896 0.108 0.816 0.076
#> SRR772468 2 0.2096 0.813746 0.052 0.944 0.004
#> SRR772469 1 0.6286 0.336456 0.536 0.000 0.464
#> SRR772470 3 0.6295 -0.189949 0.472 0.000 0.528
#> SRR772471 3 0.6688 -0.029058 0.408 0.012 0.580
#> SRR772472 1 0.6155 0.523013 0.664 0.008 0.328
#> SRR772473 1 0.6973 0.461788 0.564 0.020 0.416
#> SRR772474 1 0.9268 0.290022 0.484 0.168 0.348
#> SRR772475 3 0.5517 0.403684 0.004 0.268 0.728
#> SRR772476 2 0.1289 0.812598 0.032 0.968 0.000
#> SRR772477 2 0.0424 0.812057 0.000 0.992 0.008
#> SRR772478 3 0.5115 0.398269 0.228 0.004 0.768
#> SRR772479 1 0.6062 0.483497 0.616 0.000 0.384
#> SRR772480 1 0.6102 0.524644 0.672 0.008 0.320
#> SRR772481 1 0.7202 0.525196 0.716 0.124 0.160
#> SRR772482 3 0.3983 0.540455 0.144 0.004 0.852
#> SRR772483 3 0.4931 0.455445 0.212 0.004 0.784
#> SRR772484 2 0.3337 0.811256 0.060 0.908 0.032
#> SRR772485 2 0.9089 0.344383 0.176 0.536 0.288
#> SRR772486 1 0.5497 0.513544 0.708 0.000 0.292
#> SRR772487 1 0.6215 0.448147 0.572 0.000 0.428
#> SRR772488 2 0.3272 0.812033 0.080 0.904 0.016
#> SRR772489 2 0.8772 0.238560 0.364 0.516 0.120
#> SRR772490 1 0.3500 0.578736 0.880 0.004 0.116
#> SRR772491 1 0.6295 0.379223 0.528 0.000 0.472
#> SRR772492 2 0.0237 0.811233 0.000 0.996 0.004
#> SRR772493 2 0.1163 0.812035 0.000 0.972 0.028
#> SRR772494 2 0.0237 0.811233 0.000 0.996 0.004
#> SRR772495 2 0.0237 0.811912 0.004 0.996 0.000
#> SRR772496 3 0.8774 -0.121584 0.412 0.112 0.476
#> SRR772497 3 0.5514 0.505557 0.156 0.044 0.800
#> SRR772498 3 0.6354 0.501868 0.196 0.056 0.748
#> SRR772499 3 0.4742 0.557979 0.104 0.048 0.848
#> SRR772500 3 0.8405 -0.071243 0.084 0.456 0.460
#> SRR772501 2 0.3043 0.811264 0.084 0.908 0.008
#> SRR772502 1 0.5166 0.526500 0.828 0.116 0.056
#> SRR772503 1 0.3112 0.552625 0.916 0.028 0.056
#> SRR772504 2 0.6208 0.725447 0.076 0.772 0.152
#> SRR772505 2 0.5202 0.783044 0.136 0.820 0.044
#> SRR772506 2 0.0892 0.812002 0.000 0.980 0.020
#> SRR772507 2 0.2743 0.815322 0.020 0.928 0.052
#> SRR772508 2 0.6783 0.701640 0.088 0.736 0.176
#> SRR772509 3 0.4811 0.516050 0.024 0.148 0.828
#> SRR772510 3 0.7012 0.351413 0.308 0.040 0.652
#> SRR772511 3 0.5502 0.438436 0.248 0.008 0.744
#> SRR772512 2 0.2959 0.784036 0.000 0.900 0.100
#> SRR772513 3 0.5951 0.441915 0.196 0.040 0.764
#> SRR772514 2 0.5442 0.758167 0.056 0.812 0.132
#> SRR772515 2 0.6161 0.650464 0.272 0.708 0.020
#> SRR772516 2 0.8838 0.387095 0.200 0.580 0.220
#> SRR772517 1 0.9868 0.151100 0.396 0.260 0.344
#> SRR772518 1 0.9243 0.228676 0.492 0.168 0.340
#> SRR772519 2 0.4677 0.785611 0.132 0.840 0.028
#> SRR772520 2 0.5881 0.715840 0.256 0.728 0.016
#> SRR772521 1 0.2492 0.557855 0.936 0.016 0.048
#> SRR772522 1 0.3670 0.588072 0.888 0.020 0.092
#> SRR772523 1 0.5093 0.556434 0.836 0.088 0.076
#> SRR772524 1 0.6195 0.405799 0.704 0.276 0.020
#> SRR772525 3 0.5621 0.320408 0.308 0.000 0.692
#> SRR772526 2 0.0661 0.811441 0.004 0.988 0.008
#> SRR772527 2 0.1182 0.813437 0.012 0.976 0.012
#> SRR772528 3 0.2434 0.555065 0.036 0.024 0.940
#> SRR772529 1 0.6769 0.324693 0.652 0.028 0.320
#> SRR772530 1 0.6387 0.546739 0.680 0.020 0.300
#> SRR772531 3 0.4172 0.523366 0.156 0.004 0.840
#> SRR772532 2 0.3472 0.813109 0.056 0.904 0.040
#> SRR772533 2 0.7807 0.624428 0.144 0.672 0.184
#> SRR772534 1 0.5894 0.553626 0.752 0.028 0.220
#> SRR772535 1 0.4902 0.518344 0.844 0.064 0.092
#> SRR772536 2 0.4289 0.796165 0.040 0.868 0.092
#> SRR772537 2 0.2772 0.808329 0.080 0.916 0.004
#> SRR772538 2 0.1647 0.813390 0.036 0.960 0.004
#> SRR772539 1 0.3845 0.566374 0.872 0.012 0.116
#> SRR772540 1 0.6386 0.446063 0.584 0.004 0.412
#> SRR772541 3 0.6510 0.224348 0.364 0.012 0.624
#> SRR772542 1 0.3715 0.592106 0.868 0.004 0.128
#> SRR772543 1 0.6154 0.446710 0.592 0.000 0.408
#> SRR772544 3 0.7721 0.489733 0.168 0.152 0.680
#> SRR772545 3 0.3995 0.534127 0.116 0.016 0.868
#> SRR772546 3 0.4418 0.551580 0.132 0.020 0.848
#> SRR772547 3 0.6489 -0.166488 0.456 0.004 0.540
#> SRR772548 3 0.6079 -0.028809 0.388 0.000 0.612
#> SRR772549 3 0.5158 0.396330 0.232 0.004 0.764
#> SRR772550 1 0.6192 0.455744 0.580 0.000 0.420
#> SRR772551 1 0.3009 0.553301 0.920 0.028 0.052
#> SRR772552 1 0.5708 0.525418 0.768 0.028 0.204
#> SRR772553 3 0.4128 0.537567 0.012 0.132 0.856
#> SRR772554 2 0.4094 0.806747 0.100 0.872 0.028
#> SRR772555 2 0.6835 0.709880 0.180 0.732 0.088
#> SRR772556 1 0.5958 0.577716 0.692 0.008 0.300
#> SRR772557 3 0.7287 0.037062 0.408 0.032 0.560
#> SRR772558 1 0.6228 0.382733 0.624 0.004 0.372
#> SRR772559 1 0.5285 0.581749 0.752 0.004 0.244
#> SRR772560 1 0.4978 0.569138 0.780 0.004 0.216
#> SRR772561 2 0.5070 0.681746 0.004 0.772 0.224
#> SRR772562 1 0.9963 0.165315 0.376 0.312 0.312
#> SRR772563 1 0.9189 0.313193 0.512 0.316 0.172
#> SRR772564 3 0.6225 -0.036259 0.432 0.000 0.568
#> SRR772565 1 0.5926 0.507394 0.644 0.000 0.356
#> SRR772566 1 0.5497 0.567696 0.708 0.000 0.292
#> SRR772567 1 0.6095 0.474858 0.608 0.000 0.392
#> SRR772568 2 0.5318 0.752031 0.204 0.780 0.016
#> SRR772569 2 0.0892 0.814609 0.020 0.980 0.000
#> SRR772570 3 0.3896 0.568271 0.060 0.052 0.888
#> SRR772571 1 0.6696 0.522599 0.632 0.020 0.348
#> SRR772572 1 0.6168 0.444454 0.588 0.000 0.412
#> SRR772573 1 0.5706 0.533663 0.680 0.000 0.320
#> SRR772574 1 0.6495 0.363976 0.536 0.004 0.460
#> SRR772575 1 0.5327 0.577830 0.728 0.000 0.272
#> SRR772576 2 0.9550 0.146658 0.204 0.456 0.340
#> SRR772577 1 0.9581 0.248928 0.476 0.288 0.236
#> SRR772578 1 0.6435 0.416996 0.756 0.168 0.076
#> SRR772579 2 0.9823 0.214813 0.260 0.420 0.320
#> SRR772580 3 0.5092 0.515779 0.176 0.020 0.804
#> SRR772581 1 0.1774 0.553121 0.960 0.016 0.024
#> SRR772582 1 0.4629 0.595508 0.808 0.004 0.188
#> SRR772583 3 0.6416 0.081968 0.376 0.008 0.616
#> SRR772584 1 0.6688 0.450021 0.580 0.012 0.408
#> SRR772585 3 0.7757 0.160851 0.408 0.052 0.540
#> SRR772586 3 0.2066 0.558327 0.060 0.000 0.940
#> SRR772587 1 0.6140 0.433472 0.596 0.000 0.404
#> SRR772588 2 0.3683 0.808209 0.044 0.896 0.060
#> SRR772589 2 0.8195 0.575728 0.232 0.632 0.136
#> SRR772590 3 0.7568 0.474694 0.108 0.212 0.680
#> SRR772591 1 0.6081 0.522920 0.652 0.004 0.344
#> SRR772592 1 0.5058 0.577271 0.756 0.000 0.244
#> SRR772593 3 0.1905 0.562511 0.028 0.016 0.956
#> SRR772594 2 0.9941 -0.203714 0.284 0.376 0.340
#> SRR772595 1 0.8395 0.166177 0.480 0.436 0.084
#> SRR772596 3 0.2050 0.562895 0.028 0.020 0.952
#> SRR772597 3 0.5772 0.501238 0.220 0.024 0.756
#> SRR772598 1 0.6286 0.033637 0.536 0.000 0.464
#> SRR772599 3 0.5397 0.336119 0.280 0.000 0.720
#> SRR772600 1 0.6091 0.575485 0.784 0.092 0.124
#> SRR772601 1 0.2550 0.554728 0.932 0.012 0.056
#> SRR772602 3 0.7680 0.477937 0.132 0.188 0.680
#> SRR772603 1 0.7566 0.371554 0.512 0.040 0.448
#> SRR772604 1 0.5884 0.554613 0.716 0.012 0.272
#> SRR772605 1 0.6633 0.247236 0.548 0.008 0.444
#> SRR772606 1 0.5845 0.508285 0.688 0.004 0.308
#> SRR772607 1 0.6225 0.312688 0.568 0.000 0.432
#> SRR772608 2 0.8325 0.320558 0.304 0.588 0.108
#> SRR772609 1 0.5956 0.560426 0.720 0.016 0.264
#> SRR772610 2 0.8288 0.299012 0.080 0.512 0.408
#> SRR772611 3 0.7583 -0.042166 0.040 0.468 0.492
#> SRR772612 1 0.5536 0.448071 0.804 0.144 0.052
#> SRR772613 1 0.8770 0.334813 0.572 0.272 0.156
#> SRR772614 3 0.6298 -0.000457 0.388 0.004 0.608
#> SRR772615 1 0.6045 0.484152 0.620 0.000 0.380
#> SRR772616 1 0.6168 0.262594 0.588 0.000 0.412
#> SRR772617 2 0.5573 0.768376 0.160 0.796 0.044
#> SRR772618 1 0.2903 0.538955 0.924 0.048 0.028
#> SRR772619 2 0.0829 0.812134 0.004 0.984 0.012
#> SRR772620 2 0.0424 0.812442 0.008 0.992 0.000
#> SRR772621 1 0.8618 0.247290 0.508 0.388 0.104
#> SRR772622 1 0.6962 0.546611 0.648 0.036 0.316
#> SRR772623 1 0.6509 0.299495 0.524 0.004 0.472
#> SRR772624 3 0.1453 0.557284 0.024 0.008 0.968
#> SRR772625 3 0.6204 0.009397 0.000 0.424 0.576
#> SRR772626 1 0.5926 0.523864 0.644 0.000 0.356
#> SRR772627 2 0.9463 0.169339 0.244 0.500 0.256
#> SRR772628 1 0.6235 0.417620 0.564 0.000 0.436
#> SRR772629 1 0.2550 0.560437 0.932 0.012 0.056
#> SRR772630 1 0.5926 0.503989 0.644 0.000 0.356
#> SRR772631 3 0.1919 0.560390 0.020 0.024 0.956
#> SRR772632 2 0.2063 0.816169 0.044 0.948 0.008
#> SRR772633 2 0.1753 0.805985 0.000 0.952 0.048
#> SRR772634 3 0.6379 0.096184 0.368 0.008 0.624
#> SRR772635 3 0.6753 0.049800 0.388 0.016 0.596
#> SRR772636 2 0.3192 0.776878 0.000 0.888 0.112
#> SRR772637 1 0.6252 0.391457 0.556 0.000 0.444
#> SRR772638 3 0.6260 -0.169044 0.448 0.000 0.552
#> SRR772639 2 0.7330 0.602332 0.092 0.692 0.216
#> SRR772640 2 0.0747 0.810058 0.000 0.984 0.016
#> SRR772641 2 0.2749 0.812475 0.012 0.924 0.064
#> SRR772642 1 0.7545 0.474456 0.652 0.076 0.272
#> SRR772643 2 0.6506 0.664108 0.044 0.720 0.236
#> SRR772644 1 0.6421 0.268382 0.572 0.004 0.424
#> SRR772645 3 0.6675 -0.021364 0.404 0.012 0.584
#> SRR772646 2 0.4859 0.791168 0.044 0.840 0.116
#> SRR772647 2 0.4521 0.761252 0.180 0.816 0.004
#> SRR772648 1 0.7567 0.487051 0.576 0.048 0.376
#> SRR772649 3 0.9028 0.272260 0.292 0.168 0.540
#> SRR772650 1 0.6299 0.334221 0.524 0.000 0.476
#> SRR772651 1 0.4514 0.567076 0.832 0.012 0.156
#> SRR772652 1 0.6798 0.425373 0.584 0.016 0.400
#> SRR772653 1 0.6369 0.406399 0.668 0.016 0.316
#> SRR772654 1 0.4930 0.527286 0.836 0.044 0.120
#> SRR772655 1 0.5519 0.481590 0.812 0.120 0.068
#> SRR772656 3 0.6157 0.536210 0.128 0.092 0.780
#> SRR772657 3 0.7208 0.297049 0.040 0.340 0.620
#> SRR772658 2 0.0829 0.811904 0.004 0.984 0.012
#> SRR772659 2 0.8609 0.539564 0.244 0.596 0.160
#> SRR772660 3 0.4702 0.481501 0.212 0.000 0.788
#> SRR772661 3 0.1636 0.558399 0.016 0.020 0.964
#> SRR772662 1 0.6280 0.357278 0.540 0.000 0.460
#> SRR772663 1 0.6944 0.364065 0.516 0.016 0.468
#> SRR772664 2 0.7824 0.319170 0.060 0.564 0.376
#> SRR772665 3 0.8280 -0.042277 0.404 0.080 0.516
#> SRR772666 3 0.6372 0.516675 0.176 0.068 0.756
#> SRR772667 3 0.7299 0.082744 0.412 0.032 0.556
#> SRR772668 1 0.9991 -0.026508 0.352 0.316 0.332
#> SRR772669 1 0.9991 -0.026508 0.352 0.316 0.332
#> SRR772670 1 0.6264 0.476336 0.616 0.004 0.380
#> SRR772671 1 0.4654 0.579304 0.792 0.000 0.208
#> SRR772672 3 0.5119 0.535016 0.160 0.028 0.812
#> SRR772673 1 0.6282 0.497832 0.612 0.004 0.384
#> SRR772674 3 0.4811 0.531473 0.148 0.024 0.828
#> SRR772675 3 0.4473 0.518498 0.008 0.164 0.828
#> SRR772676 1 0.5318 0.449128 0.780 0.204 0.016
#> SRR772677 1 0.8685 0.471584 0.596 0.192 0.212
#> SRR772678 3 0.2879 0.555746 0.024 0.052 0.924
#> SRR772679 3 0.9417 -0.081421 0.364 0.180 0.456
#> SRR772680 1 0.5588 0.538536 0.720 0.004 0.276
#> SRR772681 3 0.9063 0.398358 0.200 0.248 0.552
#> SRR772682 1 0.7112 0.004253 0.552 0.424 0.024
#> SRR772683 1 0.9840 0.135671 0.416 0.264 0.320
#> SRR772685 3 0.8054 0.262669 0.076 0.356 0.568
#> SRR772686 3 0.5944 0.538612 0.120 0.088 0.792
#> SRR772687 3 0.2537 0.553374 0.080 0.000 0.920
#> SRR772688 2 0.0592 0.810582 0.000 0.988 0.012
#> SRR772689 2 0.3045 0.811811 0.020 0.916 0.064
#> SRR772690 3 0.6254 0.532174 0.116 0.108 0.776
#> SRR772691 3 0.6255 0.285206 0.012 0.320 0.668
#> SRR772692 1 0.5678 0.533466 0.684 0.000 0.316
#> SRR772693 3 0.6407 0.422621 0.028 0.272 0.700
#> SRR772694 2 0.4591 0.789160 0.120 0.848 0.032
#> SRR772695 1 0.4915 0.598952 0.804 0.012 0.184
#> SRR772696 3 0.8158 0.118871 0.364 0.080 0.556
#> SRR772697 1 0.8554 0.362342 0.560 0.324 0.116
#> SRR772698 3 0.1491 0.561375 0.016 0.016 0.968
#> SRR772699 3 0.6680 -0.146418 0.484 0.008 0.508
#> SRR772700 1 0.6753 0.402711 0.596 0.016 0.388
#> SRR772701 1 0.3607 0.576153 0.880 0.008 0.112
#> SRR772702 1 0.5845 0.545522 0.688 0.004 0.308
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 4 0.6000 0.26010 0.356 0.000 0.052 0.592
#> SRR772342 1 0.6523 0.37010 0.628 0.000 0.136 0.236
#> SRR772343 1 0.5668 0.29058 0.636 0.004 0.328 0.032
#> SRR772344 2 0.1771 0.77171 0.012 0.948 0.004 0.036
#> SRR772345 2 0.1059 0.77556 0.016 0.972 0.012 0.000
#> SRR772346 4 0.6793 0.25974 0.132 0.000 0.288 0.580
#> SRR772347 1 0.6651 0.34993 0.596 0.004 0.300 0.100
#> SRR772348 4 0.9303 0.17993 0.316 0.124 0.168 0.392
#> SRR772349 2 0.8253 0.33664 0.248 0.528 0.056 0.168
#> SRR772350 1 0.4877 0.29646 0.664 0.000 0.328 0.008
#> SRR772351 4 0.7354 0.26865 0.160 0.244 0.016 0.580
#> SRR772352 4 0.8505 0.31083 0.208 0.096 0.160 0.536
#> SRR772353 1 0.7622 0.14721 0.504 0.004 0.232 0.260
#> SRR772354 4 0.9325 0.19962 0.324 0.104 0.204 0.368
#> SRR772355 1 0.8078 0.36032 0.564 0.180 0.196 0.060
#> SRR772356 2 0.3749 0.76231 0.056 0.872 0.032 0.040
#> SRR772357 4 0.6121 0.34365 0.164 0.004 0.140 0.692
#> SRR772358 1 0.8187 0.10491 0.412 0.012 0.276 0.300
#> SRR772359 3 0.7770 0.03527 0.336 0.004 0.448 0.212
#> SRR772360 2 0.7104 0.46366 0.272 0.612 0.060 0.056
#> SRR772361 3 0.5323 0.58236 0.172 0.076 0.748 0.004
#> SRR772362 2 0.1022 0.77116 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR772363 2 0.1109 0.77224 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR772364 1 0.6939 0.24396 0.620 0.028 0.088 0.264
#> SRR772365 1 0.5383 0.34222 0.672 0.000 0.292 0.036
#> SRR772366 3 0.4906 0.56179 0.140 0.000 0.776 0.084
#> SRR772367 3 0.4290 0.58694 0.212 0.000 0.772 0.016
#> SRR772368 1 0.7394 0.15909 0.532 0.080 0.352 0.036
#> SRR772369 1 0.8473 -0.06612 0.448 0.056 0.152 0.344
#> SRR772370 4 0.5279 0.36835 0.196 0.008 0.052 0.744
#> SRR772371 1 0.5440 0.39285 0.736 0.000 0.104 0.160
#> SRR772372 1 0.5550 0.00787 0.552 0.000 0.020 0.428
#> SRR772373 2 0.5812 0.67075 0.144 0.732 0.012 0.112
#> SRR772374 2 0.7969 0.50929 0.136 0.604 0.116 0.144
#> SRR772375 3 0.3681 0.60388 0.176 0.000 0.816 0.008
#> SRR772376 2 0.6115 0.67518 0.104 0.720 0.152 0.024
#> SRR772377 3 0.2901 0.60365 0.016 0.040 0.908 0.036
#> SRR772378 1 0.6678 0.37327 0.620 0.000 0.208 0.172
#> SRR772379 4 0.8111 0.15484 0.344 0.012 0.232 0.412
#> SRR772380 4 0.7330 0.24895 0.260 0.004 0.188 0.548
#> SRR772381 3 0.4400 0.55385 0.248 0.004 0.744 0.004
#> SRR772382 4 0.5039 0.21539 0.404 0.000 0.004 0.592
#> SRR772383 1 0.7926 0.09496 0.480 0.016 0.192 0.312
#> SRR772384 3 0.3337 0.58522 0.032 0.020 0.888 0.060
#> SRR772385 3 0.3932 0.56003 0.028 0.020 0.852 0.100
#> SRR772386 1 0.7009 0.39115 0.644 0.028 0.136 0.192
#> SRR772387 2 0.6915 0.57314 0.188 0.644 0.148 0.020
#> SRR772388 1 0.8017 -0.09901 0.376 0.004 0.272 0.348
#> SRR772389 1 0.4773 0.45548 0.788 0.000 0.120 0.092
#> SRR772390 3 0.2019 0.61278 0.032 0.004 0.940 0.024
#> SRR772391 4 0.6060 0.12681 0.440 0.000 0.044 0.516
#> SRR772392 3 0.5296 0.13314 0.496 0.000 0.496 0.008
#> SRR772393 4 0.6959 0.31900 0.176 0.008 0.200 0.616
#> SRR772394 1 0.6756 0.44391 0.692 0.064 0.152 0.092
#> SRR772395 1 0.9102 0.15828 0.428 0.220 0.264 0.088
#> SRR772396 1 0.7123 0.38904 0.580 0.004 0.236 0.180
#> SRR772397 1 0.6301 0.41839 0.636 0.000 0.260 0.104
#> SRR772398 4 0.6083 0.23710 0.372 0.004 0.044 0.580
#> SRR772399 4 0.7481 0.32600 0.208 0.024 0.180 0.588
#> SRR772400 1 0.7706 0.03714 0.464 0.004 0.204 0.328
#> SRR772401 4 0.7627 0.21327 0.256 0.000 0.272 0.472
#> SRR772402 1 0.7270 0.01774 0.524 0.104 0.016 0.356
#> SRR772403 2 0.8355 0.11975 0.232 0.448 0.028 0.292
#> SRR772404 1 0.5474 0.34935 0.672 0.004 0.292 0.032
#> SRR772405 3 0.3360 0.58300 0.036 0.004 0.876 0.084
#> SRR772406 2 0.7877 0.15269 0.120 0.432 0.032 0.416
#> SRR772407 3 0.7477 0.39135 0.156 0.272 0.556 0.016
#> SRR772408 2 0.0707 0.77151 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR772409 2 0.0937 0.77167 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR772410 1 0.9341 -0.11521 0.376 0.096 0.248 0.280
#> SRR772411 1 0.6991 0.12517 0.540 0.000 0.136 0.324
#> SRR772412 1 0.6426 0.41812 0.628 0.000 0.256 0.116
#> SRR772413 1 0.5555 0.43313 0.732 0.004 0.088 0.176
#> SRR772414 3 0.4836 0.46758 0.320 0.000 0.672 0.008
#> SRR772415 1 0.8830 0.05587 0.472 0.200 0.080 0.248
#> SRR772416 1 0.6009 0.19615 0.608 0.012 0.032 0.348
#> SRR772417 1 0.5438 0.43235 0.744 0.008 0.176 0.072
#> SRR772418 3 0.3691 0.58807 0.068 0.000 0.856 0.076
#> SRR772419 2 0.4353 0.66255 0.012 0.756 0.232 0.000
#> SRR772420 2 0.4217 0.71008 0.176 0.800 0.004 0.020
#> SRR772421 2 0.7312 0.59179 0.172 0.648 0.108 0.072
#> SRR772422 3 0.5553 0.19425 0.452 0.012 0.532 0.004
#> SRR772423 1 0.7417 0.13647 0.580 0.084 0.048 0.288
#> SRR772424 1 0.6025 0.15527 0.604 0.012 0.032 0.352
#> SRR772425 1 0.7439 0.25352 0.564 0.084 0.308 0.044
#> SRR772426 2 0.3194 0.77011 0.020 0.896 0.044 0.040
#> SRR772427 2 0.1209 0.77204 0.004 0.964 0.032 0.000
#> SRR772428 3 0.7454 0.04085 0.176 0.004 0.512 0.308
#> SRR772429 1 0.5066 0.44812 0.768 0.000 0.112 0.120
#> SRR772430 1 0.7623 0.04818 0.416 0.000 0.380 0.204
#> SRR772431 1 0.8774 0.01829 0.460 0.084 0.156 0.300
#> SRR772432 2 0.9352 0.13590 0.196 0.404 0.120 0.280
#> SRR772433 1 0.7494 0.17393 0.484 0.000 0.204 0.312
#> SRR772434 1 0.7618 0.20563 0.504 0.004 0.264 0.228
#> SRR772435 4 0.7286 0.31381 0.252 0.004 0.188 0.556
#> SRR772436 4 0.5550 0.15852 0.428 0.000 0.020 0.552
#> SRR772437 3 0.4688 0.60288 0.136 0.056 0.800 0.008
#> SRR772438 1 0.6683 0.43539 0.620 0.000 0.204 0.176
#> SRR772439 1 0.4685 0.40854 0.784 0.000 0.060 0.156
#> SRR772440 4 0.7749 0.03721 0.136 0.384 0.020 0.460
#> SRR772441 4 0.9118 0.22120 0.312 0.116 0.152 0.420
#> SRR772442 1 0.7309 0.23822 0.600 0.048 0.084 0.268
#> SRR772443 1 0.5257 0.34294 0.728 0.000 0.060 0.212
#> SRR772444 1 0.7202 0.07510 0.464 0.000 0.140 0.396
#> SRR772445 1 0.5290 0.43788 0.764 0.008 0.088 0.140
#> SRR772446 1 0.7824 -0.03500 0.424 0.004 0.216 0.356
#> SRR772447 1 0.5775 0.30817 0.696 0.000 0.092 0.212
#> SRR772448 4 0.7044 0.06616 0.440 0.008 0.092 0.460
#> SRR772449 4 0.7297 0.09208 0.428 0.020 0.088 0.464
#> SRR772450 2 0.1637 0.76788 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR772451 2 0.1585 0.77151 0.004 0.952 0.004 0.040
#> SRR772452 1 0.7476 -0.07533 0.432 0.004 0.152 0.412
#> SRR772453 1 0.6001 0.31009 0.688 0.000 0.128 0.184
#> SRR772454 1 0.5505 0.44042 0.716 0.004 0.220 0.060
#> SRR772455 1 0.6950 0.25711 0.572 0.000 0.156 0.272
#> SRR772456 2 0.1305 0.77328 0.036 0.960 0.004 0.000
#> SRR772457 2 0.0672 0.77280 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR772458 1 0.6405 0.36755 0.660 0.004 0.132 0.204
#> SRR772459 1 0.5493 0.39820 0.736 0.004 0.084 0.176
#> SRR772460 2 0.0804 0.77211 0.008 0.980 0.012 0.000
#> SRR772461 2 0.0707 0.77149 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR772462 2 0.7976 0.27242 0.144 0.488 0.336 0.032
#> SRR772463 2 0.3455 0.75949 0.044 0.880 0.012 0.064
#> SRR772464 3 0.3907 0.59922 0.180 0.004 0.808 0.008
#> SRR772465 4 0.6137 0.14555 0.448 0.048 0.000 0.504
#> SRR772466 1 0.9394 0.01666 0.412 0.272 0.152 0.164
#> SRR772467 2 0.4282 0.73590 0.140 0.820 0.024 0.016
#> SRR772468 2 0.2762 0.76762 0.028 0.912 0.012 0.048
#> SRR772469 1 0.5964 0.39786 0.684 0.000 0.108 0.208
#> SRR772470 1 0.6849 0.30450 0.612 0.004 0.156 0.228
#> SRR772471 4 0.8100 0.09380 0.368 0.012 0.224 0.396
#> SRR772472 1 0.7321 -0.07045 0.504 0.008 0.128 0.360
#> SRR772473 1 0.7736 0.34736 0.552 0.024 0.188 0.236
#> SRR772474 1 0.6855 0.42781 0.692 0.112 0.120 0.076
#> SRR772475 3 0.3495 0.58473 0.012 0.076 0.876 0.036
#> SRR772476 2 0.0712 0.77129 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR772477 2 0.1109 0.77215 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR772478 3 0.7870 -0.24057 0.276 0.000 0.364 0.360
#> SRR772479 1 0.6628 0.20191 0.636 0.008 0.116 0.240
#> SRR772480 1 0.6390 0.00451 0.516 0.012 0.040 0.432
#> SRR772481 4 0.7683 0.13485 0.416 0.108 0.028 0.448
#> SRR772482 3 0.5792 0.30376 0.416 0.000 0.552 0.032
#> SRR772483 1 0.7793 0.16705 0.468 0.004 0.272 0.256
#> SRR772484 2 0.2486 0.77495 0.048 0.920 0.028 0.004
#> SRR772485 2 0.9466 -0.17597 0.312 0.332 0.104 0.252
#> SRR772486 1 0.6784 0.31517 0.600 0.000 0.156 0.244
#> SRR772487 1 0.6835 0.30166 0.592 0.000 0.156 0.252
#> SRR772488 2 0.3176 0.76029 0.084 0.880 0.000 0.036
#> SRR772489 1 0.7721 0.12371 0.484 0.388 0.064 0.064
#> SRR772490 1 0.5808 0.03418 0.544 0.000 0.032 0.424
#> SRR772491 1 0.6720 0.44295 0.628 0.004 0.216 0.152
#> SRR772492 2 0.1118 0.77083 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR772493 2 0.1854 0.77297 0.012 0.940 0.048 0.000
#> SRR772494 2 0.1118 0.77135 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR772495 2 0.0469 0.77129 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR772496 1 0.7734 0.19007 0.576 0.060 0.104 0.260
#> SRR772497 3 0.8016 -0.08066 0.380 0.012 0.404 0.204
#> SRR772498 3 0.6472 0.51367 0.172 0.008 0.668 0.152
#> SRR772499 3 0.6712 0.49856 0.256 0.028 0.640 0.076
#> SRR772500 2 0.9137 0.14469 0.300 0.428 0.128 0.144
#> SRR772501 2 0.2246 0.77438 0.052 0.928 0.004 0.016
#> SRR772502 4 0.8311 0.08307 0.396 0.132 0.052 0.420
#> SRR772503 4 0.5810 0.22355 0.388 0.004 0.028 0.580
#> SRR772504 2 0.6650 0.51665 0.200 0.624 0.176 0.000
#> SRR772505 2 0.5349 0.71977 0.052 0.776 0.036 0.136
#> SRR772506 2 0.1004 0.77491 0.004 0.972 0.024 0.000
#> SRR772507 2 0.2585 0.77257 0.032 0.916 0.048 0.004
#> SRR772508 2 0.6377 0.61507 0.124 0.672 0.196 0.008
#> SRR772509 3 0.3595 0.57553 0.032 0.024 0.876 0.068
#> SRR772510 3 0.5250 0.42236 0.344 0.004 0.640 0.012
#> SRR772511 3 0.5244 0.29086 0.436 0.000 0.556 0.008
#> SRR772512 2 0.3688 0.69261 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR772513 4 0.8242 0.13686 0.272 0.012 0.352 0.364
#> SRR772514 2 0.8321 0.33234 0.132 0.548 0.092 0.228
#> SRR772515 2 0.4850 0.69571 0.168 0.776 0.004 0.052
#> SRR772516 2 0.8476 0.07425 0.300 0.416 0.256 0.028
#> SRR772517 4 0.9201 0.15815 0.336 0.112 0.164 0.388
#> SRR772518 4 0.8909 0.22924 0.176 0.080 0.316 0.428
#> SRR772519 2 0.4418 0.71367 0.008 0.784 0.016 0.192
#> SRR772520 2 0.5223 0.66426 0.040 0.736 0.008 0.216
#> SRR772521 1 0.5851 -0.05965 0.516 0.024 0.004 0.456
#> SRR772522 1 0.6441 0.10072 0.580 0.036 0.024 0.360
#> SRR772523 1 0.5569 0.19768 0.660 0.044 0.000 0.296
#> SRR772524 1 0.7999 -0.07694 0.380 0.352 0.004 0.264
#> SRR772525 3 0.5310 0.30457 0.412 0.000 0.576 0.012
#> SRR772526 2 0.0336 0.77193 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR772527 2 0.1004 0.77061 0.024 0.972 0.004 0.000
#> SRR772528 3 0.5677 0.45160 0.140 0.000 0.720 0.140
#> SRR772529 4 0.7248 0.35499 0.172 0.032 0.168 0.628
#> SRR772530 1 0.7154 0.13803 0.592 0.024 0.104 0.280
#> SRR772531 3 0.4134 0.54860 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR772532 2 0.4774 0.72570 0.096 0.812 0.020 0.072
#> SRR772533 2 0.8142 0.33984 0.240 0.540 0.052 0.168
#> SRR772534 1 0.6750 0.36014 0.656 0.016 0.164 0.164
#> SRR772535 4 0.6233 0.35849 0.196 0.040 0.060 0.704
#> SRR772536 2 0.4483 0.74360 0.104 0.828 0.032 0.036
#> SRR772537 2 0.2782 0.76681 0.024 0.904 0.004 0.068
#> SRR772538 2 0.0895 0.77223 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR772539 1 0.6149 -0.08594 0.476 0.000 0.048 0.476
#> SRR772540 1 0.4716 0.44114 0.764 0.000 0.196 0.040
#> SRR772541 1 0.6498 0.07890 0.536 0.008 0.400 0.056
#> SRR772542 1 0.5306 0.16850 0.632 0.000 0.020 0.348
#> SRR772543 1 0.4544 0.45812 0.788 0.000 0.164 0.048
#> SRR772544 3 0.4464 0.57158 0.224 0.012 0.760 0.004
#> SRR772545 3 0.8036 -0.02543 0.280 0.008 0.432 0.280
#> SRR772546 3 0.6423 0.41405 0.336 0.000 0.580 0.084
#> SRR772547 1 0.6788 0.39397 0.624 0.004 0.172 0.200
#> SRR772548 1 0.7660 0.22119 0.448 0.000 0.324 0.228
#> SRR772549 3 0.8080 -0.20821 0.336 0.004 0.336 0.324
#> SRR772550 1 0.6461 0.25286 0.640 0.000 0.144 0.216
#> SRR772551 4 0.5925 0.16022 0.444 0.004 0.028 0.524
#> SRR772552 4 0.5997 0.33950 0.240 0.004 0.080 0.676
#> SRR772553 3 0.2437 0.61275 0.024 0.024 0.928 0.024
#> SRR772554 2 0.4171 0.75124 0.096 0.840 0.012 0.052
#> SRR772555 2 0.7026 0.65027 0.132 0.680 0.096 0.092
#> SRR772556 1 0.7299 0.27426 0.512 0.000 0.176 0.312
#> SRR772557 1 0.7900 0.01755 0.372 0.000 0.308 0.320
#> SRR772558 4 0.6750 0.31719 0.200 0.004 0.168 0.628
#> SRR772559 1 0.6640 0.01306 0.508 0.004 0.072 0.416
#> SRR772560 1 0.6723 0.37861 0.616 0.000 0.188 0.196
#> SRR772561 3 0.5516 0.04056 0.012 0.428 0.556 0.004
#> SRR772562 1 0.8836 0.05789 0.444 0.308 0.080 0.168
#> SRR772563 1 0.7509 0.04871 0.512 0.360 0.028 0.100
#> SRR772564 1 0.5951 0.33053 0.636 0.000 0.300 0.064
#> SRR772565 1 0.4534 0.43443 0.800 0.000 0.068 0.132
#> SRR772566 1 0.5716 0.36646 0.700 0.000 0.088 0.212
#> SRR772567 1 0.4722 0.40399 0.792 0.004 0.060 0.144
#> SRR772568 2 0.4969 0.72433 0.084 0.788 0.008 0.120
#> SRR772569 2 0.1296 0.77417 0.028 0.964 0.004 0.004
#> SRR772570 3 0.6748 0.43368 0.240 0.012 0.632 0.116
#> SRR772571 1 0.5389 0.35306 0.740 0.008 0.060 0.192
#> SRR772572 1 0.6550 0.38641 0.636 0.000 0.180 0.184
#> SRR772573 1 0.4094 0.44904 0.828 0.000 0.116 0.056
#> SRR772574 1 0.7095 0.08734 0.540 0.004 0.128 0.328
#> SRR772575 1 0.7276 0.01073 0.448 0.000 0.148 0.404
#> SRR772576 2 0.9773 -0.16775 0.240 0.356 0.184 0.220
#> SRR772577 1 0.7961 0.32986 0.580 0.200 0.156 0.064
#> SRR772578 4 0.7327 0.24178 0.332 0.080 0.036 0.552
#> SRR772579 3 0.9550 0.08497 0.120 0.264 0.356 0.260
#> SRR772580 3 0.4655 0.48959 0.312 0.000 0.684 0.004
#> SRR772581 4 0.5138 0.22042 0.392 0.008 0.000 0.600
#> SRR772582 1 0.5773 0.21777 0.620 0.000 0.044 0.336
#> SRR772583 1 0.7754 0.11898 0.428 0.008 0.388 0.176
#> SRR772584 1 0.5070 0.45588 0.748 0.000 0.192 0.060
#> SRR772585 3 0.6384 0.12486 0.472 0.020 0.480 0.028
#> SRR772586 3 0.5177 0.53917 0.200 0.004 0.744 0.052
#> SRR772587 1 0.3443 0.45511 0.848 0.000 0.136 0.016
#> SRR772588 2 0.3978 0.73692 0.104 0.848 0.016 0.032
#> SRR772589 2 0.6178 0.50478 0.324 0.620 0.016 0.040
#> SRR772590 3 0.3979 0.61206 0.128 0.028 0.836 0.008
#> SRR772591 1 0.5918 0.42339 0.696 0.004 0.092 0.208
#> SRR772592 1 0.4100 0.38806 0.816 0.000 0.036 0.148
#> SRR772593 3 0.3550 0.60950 0.096 0.000 0.860 0.044
#> SRR772594 1 0.9034 0.11548 0.456 0.260 0.104 0.180
#> SRR772595 1 0.6737 0.15882 0.544 0.384 0.024 0.048
#> SRR772596 3 0.2813 0.61907 0.080 0.000 0.896 0.024
#> SRR772597 3 0.4188 0.61016 0.148 0.000 0.812 0.040
#> SRR772598 4 0.7694 0.14235 0.244 0.000 0.308 0.448
#> SRR772599 1 0.7806 0.12424 0.452 0.004 0.316 0.228
#> SRR772600 1 0.7416 0.16220 0.572 0.092 0.040 0.296
#> SRR772601 4 0.4917 0.27697 0.328 0.004 0.004 0.664
#> SRR772602 3 0.3909 0.61323 0.128 0.016 0.840 0.016
#> SRR772603 1 0.7955 0.22497 0.464 0.016 0.188 0.332
#> SRR772604 1 0.6554 -0.05706 0.472 0.012 0.048 0.468
#> SRR772605 1 0.6666 0.09182 0.508 0.000 0.404 0.088
#> SRR772606 1 0.7102 0.32666 0.548 0.000 0.164 0.288
#> SRR772607 4 0.7579 0.25493 0.228 0.004 0.256 0.512
#> SRR772608 2 0.6301 0.32287 0.376 0.568 0.008 0.048
#> SRR772609 1 0.4069 0.40319 0.840 0.024 0.020 0.116
#> SRR772610 4 0.9927 0.15993 0.200 0.248 0.252 0.300
#> SRR772611 3 0.8015 0.18253 0.208 0.356 0.424 0.012
#> SRR772612 4 0.6471 0.28982 0.272 0.080 0.012 0.636
#> SRR772613 1 0.8637 0.18686 0.496 0.268 0.088 0.148
#> SRR772614 1 0.5998 0.45315 0.680 0.000 0.212 0.108
#> SRR772615 1 0.5849 0.37490 0.700 0.008 0.072 0.220
#> SRR772616 1 0.7877 0.17376 0.388 0.000 0.304 0.308
#> SRR772617 2 0.6017 0.62470 0.200 0.692 0.004 0.104
#> SRR772618 4 0.5746 0.18641 0.424 0.016 0.008 0.552
#> SRR772619 2 0.1822 0.77374 0.008 0.944 0.044 0.004
#> SRR772620 2 0.0804 0.77167 0.012 0.980 0.008 0.000
#> SRR772621 1 0.8719 -0.04684 0.376 0.376 0.052 0.196
#> SRR772622 1 0.6524 0.43127 0.708 0.056 0.092 0.144
#> SRR772623 1 0.5769 0.34990 0.652 0.000 0.292 0.056
#> SRR772624 3 0.5883 0.41378 0.128 0.000 0.700 0.172
#> SRR772625 3 0.4997 0.45654 0.008 0.232 0.736 0.024
#> SRR772626 1 0.4659 0.43985 0.804 0.004 0.108 0.084
#> SRR772627 2 0.8910 -0.00433 0.336 0.400 0.196 0.068
#> SRR772628 1 0.5282 0.45044 0.760 0.004 0.136 0.100
#> SRR772629 4 0.5085 0.24946 0.376 0.000 0.008 0.616
#> SRR772630 1 0.5186 0.43141 0.752 0.000 0.164 0.084
#> SRR772631 3 0.3383 0.58650 0.052 0.000 0.872 0.076
#> SRR772632 2 0.1509 0.77498 0.020 0.960 0.012 0.008
#> SRR772633 2 0.2530 0.75459 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR772634 4 0.8442 0.15584 0.260 0.024 0.316 0.400
#> SRR772635 1 0.8002 -0.07729 0.432 0.024 0.156 0.388
#> SRR772636 2 0.4193 0.62953 0.000 0.732 0.268 0.000
#> SRR772637 1 0.5109 0.45899 0.744 0.000 0.196 0.060
#> SRR772638 1 0.7219 0.23994 0.552 0.004 0.160 0.284
#> SRR772639 2 0.7808 0.11436 0.200 0.464 0.328 0.008
#> SRR772640 2 0.1489 0.77238 0.004 0.952 0.044 0.000
#> SRR772641 2 0.2901 0.77456 0.036 0.908 0.040 0.016
#> SRR772642 4 0.7605 0.31462 0.264 0.020 0.164 0.552
#> SRR772643 2 0.7862 0.38517 0.028 0.516 0.304 0.152
#> SRR772644 3 0.7869 -0.11167 0.340 0.000 0.380 0.280
#> SRR772645 1 0.7815 0.09622 0.452 0.004 0.232 0.312
#> SRR772646 2 0.5867 0.68148 0.068 0.760 0.088 0.084
#> SRR772647 2 0.5189 0.66830 0.012 0.744 0.036 0.208
#> SRR772648 1 0.7269 0.24760 0.600 0.040 0.092 0.268
#> SRR772649 1 0.9685 0.06707 0.352 0.156 0.280 0.212
#> SRR772650 1 0.4808 0.42576 0.736 0.000 0.236 0.028
#> SRR772651 4 0.6560 0.08987 0.460 0.000 0.076 0.464
#> SRR772652 1 0.6631 0.41811 0.648 0.008 0.204 0.140
#> SRR772653 1 0.7469 0.11328 0.472 0.000 0.188 0.340
#> SRR772654 4 0.5555 0.37266 0.192 0.016 0.056 0.736
#> SRR772655 4 0.7354 0.26718 0.296 0.072 0.052 0.580
#> SRR772656 3 0.4331 0.60785 0.152 0.004 0.808 0.036
#> SRR772657 3 0.4586 0.60167 0.112 0.068 0.812 0.008
#> SRR772658 2 0.1545 0.77249 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR772659 2 0.8320 0.22705 0.276 0.460 0.028 0.236
#> SRR772660 3 0.6175 0.13380 0.464 0.004 0.492 0.040
#> SRR772661 3 0.3286 0.58715 0.044 0.000 0.876 0.080
#> SRR772662 1 0.5220 0.46366 0.752 0.000 0.156 0.092
#> SRR772663 1 0.7463 0.16369 0.504 0.000 0.272 0.224
#> SRR772664 2 0.7942 0.33263 0.144 0.532 0.284 0.040
#> SRR772665 1 0.8680 0.14654 0.480 0.072 0.268 0.180
#> SRR772666 3 0.4188 0.55751 0.244 0.000 0.752 0.004
#> SRR772667 1 0.6187 0.12144 0.564 0.008 0.388 0.040
#> SRR772668 1 0.9966 0.01040 0.284 0.248 0.252 0.216
#> SRR772669 1 0.9966 0.01040 0.284 0.248 0.252 0.216
#> SRR772670 1 0.6017 0.45830 0.692 0.004 0.200 0.104
#> SRR772671 1 0.6471 0.05043 0.512 0.000 0.072 0.416
#> SRR772672 3 0.6681 0.15468 0.460 0.020 0.476 0.044
#> SRR772673 4 0.7375 0.08978 0.404 0.004 0.140 0.452
#> SRR772674 3 0.4040 0.56172 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR772675 3 0.2513 0.60962 0.016 0.036 0.924 0.024
#> SRR772676 1 0.7994 -0.09124 0.400 0.224 0.008 0.368
#> SRR772677 1 0.6613 0.34788 0.680 0.204 0.056 0.060
#> SRR772678 3 0.3279 0.56972 0.032 0.000 0.872 0.096
#> SRR772679 1 0.9613 -0.13404 0.348 0.144 0.204 0.304
#> SRR772680 1 0.7506 0.21732 0.484 0.000 0.208 0.308
#> SRR772681 3 0.5350 0.53267 0.260 0.036 0.700 0.004
#> SRR772682 2 0.8120 0.19207 0.240 0.476 0.020 0.264
#> SRR772683 4 0.9242 0.27246 0.152 0.176 0.216 0.456
#> SRR772685 3 0.8079 0.20080 0.164 0.344 0.464 0.028
#> SRR772686 3 0.3808 0.59741 0.184 0.004 0.808 0.004
#> SRR772687 3 0.5767 0.50236 0.244 0.004 0.688 0.064
#> SRR772688 2 0.1004 0.77245 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR772689 2 0.4053 0.75338 0.108 0.844 0.028 0.020
#> SRR772690 3 0.3351 0.60956 0.148 0.000 0.844 0.008
#> SRR772691 3 0.4841 0.52190 0.016 0.148 0.792 0.044
#> SRR772692 1 0.5006 0.43253 0.772 0.000 0.124 0.104
#> SRR772693 3 0.6323 0.48399 0.052 0.196 0.700 0.052
#> SRR772694 2 0.5576 0.70616 0.024 0.752 0.064 0.160
#> SRR772695 1 0.6740 0.03719 0.516 0.016 0.056 0.412
#> SRR772696 1 0.7937 0.20634 0.496 0.080 0.356 0.068
#> SRR772697 1 0.7377 0.16324 0.532 0.344 0.024 0.100
#> SRR772698 3 0.3004 0.60859 0.060 0.000 0.892 0.048
#> SRR772699 4 0.7593 0.22232 0.288 0.000 0.236 0.476
#> SRR772700 4 0.7520 0.26879 0.260 0.008 0.196 0.536
#> SRR772701 4 0.6334 0.09505 0.456 0.000 0.060 0.484
#> SRR772702 1 0.7197 -0.02896 0.508 0.020 0.084 0.388
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 5 0.5969 0.398399 0.132 0.224 0.016 0.000 0.628
#> SRR772342 1 0.7302 0.410207 0.520 0.180 0.072 0.000 0.228
#> SRR772343 1 0.5742 0.536767 0.648 0.036 0.252 0.000 0.064
#> SRR772344 4 0.1518 0.782479 0.000 0.004 0.004 0.944 0.048
#> SRR772345 4 0.2140 0.785409 0.040 0.024 0.012 0.924 0.000
#> SRR772346 5 0.6400 0.453482 0.068 0.152 0.140 0.000 0.640
#> SRR772347 1 0.7958 0.312677 0.440 0.204 0.236 0.000 0.120
#> SRR772348 2 0.8199 0.449902 0.228 0.504 0.056 0.104 0.108
#> SRR772349 2 0.6831 -0.041562 0.112 0.440 0.008 0.416 0.024
#> SRR772350 1 0.5935 0.533670 0.632 0.040 0.268 0.004 0.056
#> SRR772351 5 0.4932 0.498375 0.048 0.024 0.008 0.172 0.748
#> SRR772352 2 0.7450 0.286025 0.080 0.496 0.048 0.044 0.332
#> SRR772353 2 0.7109 0.437347 0.252 0.544 0.104 0.000 0.100
#> SRR772354 2 0.6934 0.499969 0.108 0.640 0.028 0.120 0.104
#> SRR772355 1 0.8222 0.449922 0.488 0.076 0.236 0.148 0.052
#> SRR772356 4 0.4089 0.729140 0.044 0.008 0.016 0.816 0.116
#> SRR772357 5 0.5594 0.531658 0.068 0.124 0.092 0.000 0.716
#> SRR772358 2 0.6415 0.458216 0.232 0.600 0.132 0.000 0.036
#> SRR772359 2 0.6829 0.348784 0.164 0.532 0.276 0.004 0.024
#> SRR772360 4 0.8132 0.319857 0.232 0.056 0.068 0.500 0.144
#> SRR772361 3 0.3322 0.612071 0.104 0.000 0.848 0.044 0.004
#> SRR772362 4 0.0671 0.781123 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004
#> SRR772363 4 0.0290 0.779691 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR772364 5 0.7536 0.122962 0.372 0.140 0.068 0.004 0.416
#> SRR772365 1 0.6213 0.543795 0.644 0.056 0.216 0.004 0.080
#> SRR772366 3 0.4576 0.499116 0.040 0.268 0.692 0.000 0.000
#> SRR772367 3 0.2471 0.615297 0.136 0.000 0.864 0.000 0.000
#> SRR772368 1 0.7550 0.486966 0.544 0.072 0.260 0.068 0.056
#> SRR772369 2 0.7457 0.432424 0.200 0.572 0.064 0.036 0.128
#> SRR772370 5 0.4990 0.402253 0.036 0.288 0.012 0.000 0.664
#> SRR772371 1 0.7415 0.231846 0.448 0.356 0.072 0.004 0.120
#> SRR772372 5 0.5843 0.341667 0.304 0.032 0.048 0.004 0.612
#> SRR772373 4 0.6306 0.594195 0.052 0.224 0.004 0.632 0.088
#> SRR772374 4 0.7554 0.442249 0.136 0.200 0.052 0.564 0.048
#> SRR772375 3 0.1831 0.631611 0.076 0.004 0.920 0.000 0.000
#> SRR772376 4 0.5912 0.663730 0.184 0.036 0.092 0.680 0.008
#> SRR772377 3 0.3039 0.613725 0.004 0.124 0.856 0.012 0.004
#> SRR772378 1 0.7277 0.488086 0.512 0.060 0.220 0.000 0.208
#> SRR772379 2 0.3267 0.529570 0.064 0.868 0.044 0.000 0.024
#> SRR772380 2 0.3804 0.513964 0.040 0.832 0.028 0.000 0.100
#> SRR772381 3 0.3353 0.553471 0.196 0.000 0.796 0.000 0.008
#> SRR772382 5 0.5196 0.525869 0.208 0.100 0.004 0.000 0.688
#> SRR772383 2 0.6184 0.379818 0.332 0.564 0.060 0.000 0.044
#> SRR772384 3 0.3243 0.584141 0.004 0.180 0.812 0.000 0.004
#> SRR772385 3 0.3990 0.537279 0.000 0.244 0.740 0.012 0.004
#> SRR772386 1 0.7085 0.509069 0.612 0.072 0.088 0.036 0.192
#> SRR772387 4 0.6146 0.629470 0.140 0.032 0.120 0.684 0.024
#> SRR772388 2 0.6379 0.484242 0.204 0.624 0.120 0.000 0.052
#> SRR772389 1 0.7142 0.504053 0.580 0.204 0.100 0.008 0.108
#> SRR772390 3 0.2179 0.623693 0.004 0.100 0.896 0.000 0.000
#> SRR772391 5 0.6173 0.499747 0.232 0.096 0.044 0.000 0.628
#> SRR772392 1 0.5753 0.223812 0.512 0.036 0.428 0.004 0.020
#> SRR772393 2 0.7298 0.267900 0.088 0.492 0.096 0.004 0.320
#> SRR772394 1 0.6929 0.522605 0.632 0.096 0.124 0.020 0.128
#> SRR772395 1 0.8545 0.292703 0.408 0.028 0.208 0.252 0.104
#> SRR772396 1 0.8404 0.132109 0.340 0.280 0.172 0.000 0.208
#> SRR772397 1 0.7481 0.479442 0.528 0.196 0.184 0.004 0.088
#> SRR772398 5 0.3313 0.580754 0.120 0.020 0.008 0.004 0.848
#> SRR772399 2 0.6935 0.186845 0.096 0.496 0.052 0.004 0.352
#> SRR772400 2 0.6162 0.520724 0.204 0.644 0.100 0.000 0.052
#> SRR772401 2 0.6729 0.455153 0.096 0.600 0.096 0.000 0.208
#> SRR772402 5 0.7099 0.178187 0.388 0.128 0.004 0.040 0.440
#> SRR772403 5 0.8426 0.160850 0.216 0.108 0.012 0.320 0.344
#> SRR772404 1 0.6153 0.561366 0.664 0.068 0.184 0.004 0.080
#> SRR772405 3 0.3845 0.560516 0.012 0.224 0.760 0.000 0.004
#> SRR772406 5 0.6008 0.426467 0.048 0.012 0.040 0.264 0.636
#> SRR772407 3 0.7003 0.311978 0.264 0.008 0.524 0.180 0.024
#> SRR772408 4 0.0290 0.779691 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR772409 4 0.1200 0.784921 0.008 0.016 0.000 0.964 0.012
#> SRR772410 2 0.8082 0.475985 0.232 0.512 0.076 0.120 0.060
#> SRR772411 2 0.5815 0.367315 0.340 0.588 0.024 0.008 0.040
#> SRR772412 1 0.7888 0.474033 0.480 0.148 0.228 0.004 0.140
#> SRR772413 1 0.7178 0.488116 0.524 0.272 0.120 0.000 0.084
#> SRR772414 3 0.3870 0.472804 0.260 0.004 0.732 0.000 0.004
#> SRR772415 2 0.7920 0.338128 0.220 0.480 0.024 0.216 0.060
#> SRR772416 2 0.6948 0.121545 0.320 0.448 0.008 0.004 0.220
#> SRR772417 1 0.5886 0.555957 0.688 0.060 0.116 0.000 0.136
#> SRR772418 3 0.4194 0.533456 0.016 0.260 0.720 0.000 0.004
#> SRR772419 4 0.4082 0.707596 0.036 0.012 0.164 0.788 0.000
#> SRR772420 4 0.4615 0.728469 0.084 0.136 0.008 0.768 0.004
#> SRR772421 4 0.6489 0.619321 0.100 0.024 0.092 0.676 0.108
#> SRR772422 3 0.5907 0.180616 0.360 0.012 0.564 0.012 0.052
#> SRR772423 1 0.7375 -0.009661 0.436 0.116 0.008 0.060 0.380
#> SRR772424 1 0.6349 0.208556 0.552 0.084 0.016 0.012 0.336
#> SRR772425 1 0.7779 0.405260 0.480 0.036 0.316 0.080 0.088
#> SRR772426 4 0.1901 0.783719 0.000 0.040 0.024 0.932 0.004
#> SRR772427 4 0.0324 0.779913 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR772428 2 0.7467 0.359284 0.120 0.472 0.308 0.000 0.100
#> SRR772429 1 0.6069 0.502366 0.648 0.216 0.076 0.000 0.060
#> SRR772430 3 0.7241 -0.081649 0.304 0.028 0.432 0.000 0.236
#> SRR772431 2 0.8424 0.244221 0.364 0.368 0.056 0.064 0.148
#> SRR772432 5 0.9466 0.101040 0.232 0.124 0.088 0.276 0.280
#> SRR772433 1 0.8272 0.080885 0.348 0.188 0.152 0.000 0.312
#> SRR772434 2 0.6799 0.020935 0.372 0.444 0.168 0.000 0.016
#> SRR772435 2 0.6625 0.348542 0.076 0.556 0.068 0.000 0.300
#> SRR772436 5 0.5771 0.371870 0.316 0.112 0.000 0.000 0.572
#> SRR772437 3 0.2645 0.627552 0.068 0.000 0.888 0.044 0.000
#> SRR772438 1 0.7456 0.447640 0.496 0.252 0.172 0.000 0.080
#> SRR772439 1 0.6848 0.464833 0.560 0.216 0.032 0.004 0.188
#> SRR772440 5 0.7248 0.264452 0.100 0.088 0.000 0.344 0.468
#> SRR772441 2 0.7299 0.440884 0.148 0.572 0.016 0.072 0.192
#> SRR772442 1 0.7089 0.434854 0.572 0.020 0.112 0.052 0.244
#> SRR772443 1 0.6534 0.478833 0.608 0.120 0.044 0.004 0.224
#> SRR772444 2 0.7913 0.366711 0.164 0.496 0.112 0.012 0.216
#> SRR772445 1 0.6154 0.470984 0.652 0.204 0.048 0.004 0.092
#> SRR772446 2 0.4611 0.522730 0.140 0.764 0.084 0.000 0.012
#> SRR772447 2 0.6723 0.273193 0.308 0.548 0.052 0.004 0.088
#> SRR772448 2 0.6655 0.349238 0.308 0.500 0.012 0.000 0.180
#> SRR772449 2 0.5567 0.502492 0.192 0.692 0.016 0.008 0.092
#> SRR772450 4 0.0510 0.780754 0.000 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR772451 4 0.1430 0.776568 0.000 0.000 0.004 0.944 0.052
#> SRR772452 2 0.5065 0.504016 0.232 0.704 0.020 0.004 0.040
#> SRR772453 1 0.7479 -0.086573 0.408 0.372 0.040 0.008 0.172
#> SRR772454 1 0.5628 0.547602 0.704 0.116 0.136 0.000 0.044
#> SRR772455 1 0.6458 0.185797 0.464 0.012 0.128 0.000 0.396
#> SRR772456 4 0.2359 0.781570 0.060 0.016 0.004 0.912 0.008
#> SRR772457 4 0.0775 0.782076 0.004 0.008 0.004 0.980 0.004
#> SRR772458 1 0.7341 -0.064360 0.432 0.372 0.052 0.004 0.140
#> SRR772459 2 0.7074 -0.018787 0.368 0.476 0.052 0.008 0.096
#> SRR772460 4 0.0324 0.780671 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR772461 4 0.0324 0.780671 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR772462 4 0.7875 0.333316 0.136 0.100 0.284 0.468 0.012
#> SRR772463 4 0.3510 0.762212 0.012 0.100 0.004 0.848 0.036
#> SRR772464 3 0.1608 0.631137 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR772465 5 0.5440 0.509396 0.236 0.020 0.000 0.072 0.672
#> SRR772466 2 0.8957 0.226028 0.192 0.360 0.084 0.292 0.072
#> SRR772467 4 0.5120 0.708692 0.116 0.088 0.008 0.756 0.032
#> SRR772468 4 0.3132 0.778042 0.068 0.016 0.012 0.880 0.024
#> SRR772469 1 0.6112 0.382844 0.572 0.332 0.064 0.004 0.028
#> SRR772470 2 0.6394 -0.012014 0.440 0.448 0.084 0.000 0.028
#> SRR772471 2 0.3162 0.530063 0.064 0.876 0.040 0.004 0.016
#> SRR772472 2 0.5461 0.520777 0.136 0.708 0.012 0.008 0.136
#> SRR772473 1 0.7682 0.274445 0.480 0.276 0.104 0.004 0.136
#> SRR772474 1 0.6231 0.513491 0.684 0.168 0.060 0.040 0.048
#> SRR772475 3 0.3543 0.602920 0.000 0.128 0.828 0.040 0.004
#> SRR772476 4 0.1248 0.784121 0.016 0.008 0.004 0.964 0.008
#> SRR772477 4 0.0404 0.780402 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR772478 2 0.4636 0.517397 0.052 0.756 0.172 0.000 0.020
#> SRR772479 2 0.7341 0.250342 0.300 0.484 0.052 0.004 0.160
#> SRR772480 2 0.7010 0.231102 0.340 0.452 0.004 0.016 0.188
#> SRR772481 2 0.7966 0.193494 0.276 0.380 0.004 0.068 0.272
#> SRR772482 3 0.6802 -0.236272 0.412 0.152 0.416 0.000 0.020
#> SRR772483 2 0.6377 0.319752 0.248 0.580 0.152 0.000 0.020
#> SRR772484 4 0.1372 0.785260 0.016 0.024 0.004 0.956 0.000
#> SRR772485 2 0.6178 0.345410 0.060 0.580 0.016 0.324 0.020
#> SRR772486 1 0.6489 0.400477 0.536 0.016 0.148 0.000 0.300
#> SRR772487 1 0.6578 0.332192 0.596 0.232 0.056 0.000 0.116
#> SRR772488 4 0.4056 0.756236 0.044 0.080 0.000 0.824 0.052
#> SRR772489 1 0.6831 0.260852 0.584 0.064 0.008 0.248 0.096
#> SRR772490 5 0.6267 0.137781 0.400 0.064 0.036 0.000 0.500
#> SRR772491 1 0.7538 0.466590 0.540 0.176 0.176 0.008 0.100
#> SRR772492 4 0.0290 0.779691 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR772493 4 0.0693 0.782315 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR772494 4 0.0451 0.780307 0.000 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR772495 4 0.0324 0.780706 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR772496 2 0.7259 0.328098 0.340 0.500 0.024 0.064 0.072
#> SRR772497 2 0.7425 0.339819 0.184 0.468 0.304 0.016 0.028
#> SRR772498 3 0.7126 0.462525 0.128 0.124 0.604 0.012 0.132
#> SRR772499 3 0.7297 0.182612 0.272 0.188 0.496 0.036 0.008
#> SRR772500 4 0.6750 0.125852 0.116 0.408 0.032 0.444 0.000
#> SRR772501 4 0.1925 0.785545 0.036 0.012 0.004 0.936 0.012
#> SRR772502 5 0.8892 0.181938 0.284 0.192 0.028 0.156 0.340
#> SRR772503 5 0.3995 0.578322 0.108 0.064 0.008 0.004 0.816
#> SRR772504 4 0.6050 0.482798 0.284 0.004 0.112 0.592 0.008
#> SRR772505 4 0.5358 0.725520 0.064 0.044 0.032 0.760 0.100
#> SRR772506 4 0.0727 0.782513 0.000 0.004 0.012 0.980 0.004
#> SRR772507 4 0.3622 0.772937 0.064 0.024 0.048 0.856 0.008
#> SRR772508 4 0.6740 0.533820 0.248 0.028 0.100 0.596 0.028
#> SRR772509 3 0.3874 0.573796 0.004 0.196 0.780 0.016 0.004
#> SRR772510 3 0.4216 0.460360 0.260 0.008 0.720 0.000 0.012
#> SRR772511 3 0.5472 0.087429 0.436 0.044 0.512 0.000 0.008
#> SRR772512 4 0.3143 0.698667 0.000 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR772513 2 0.5222 0.520525 0.084 0.728 0.164 0.008 0.016
#> SRR772514 2 0.5316 -0.022670 0.020 0.508 0.004 0.456 0.012
#> SRR772515 4 0.6158 0.617395 0.192 0.068 0.012 0.668 0.060
#> SRR772516 4 0.7619 0.268142 0.224 0.020 0.224 0.492 0.040
#> SRR772517 2 0.5467 0.538319 0.124 0.744 0.024 0.068 0.040
#> SRR772518 2 0.8654 0.344076 0.080 0.416 0.260 0.056 0.188
#> SRR772519 4 0.3694 0.747745 0.008 0.052 0.004 0.836 0.100
#> SRR772520 4 0.5372 0.615936 0.028 0.056 0.000 0.680 0.236
#> SRR772521 1 0.5300 -0.121939 0.492 0.032 0.000 0.008 0.468
#> SRR772522 1 0.6581 0.305182 0.524 0.160 0.000 0.016 0.300
#> SRR772523 1 0.6671 0.219418 0.520 0.072 0.016 0.032 0.360
#> SRR772524 4 0.7910 -0.111893 0.304 0.060 0.008 0.400 0.228
#> SRR772525 3 0.4957 0.284394 0.336 0.016 0.632 0.004 0.012
#> SRR772526 4 0.0451 0.780942 0.000 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR772527 4 0.1493 0.784180 0.024 0.028 0.000 0.948 0.000
#> SRR772528 3 0.5050 0.288855 0.012 0.396 0.576 0.004 0.012
#> SRR772529 5 0.6224 0.471794 0.048 0.184 0.092 0.012 0.664
#> SRR772530 2 0.7933 0.331608 0.308 0.444 0.052 0.028 0.168
#> SRR772531 3 0.3757 0.534761 0.208 0.020 0.772 0.000 0.000
#> SRR772532 4 0.3712 0.740871 0.020 0.168 0.004 0.804 0.004
#> SRR772533 4 0.6046 0.385518 0.068 0.376 0.004 0.536 0.016
#> SRR772534 1 0.6712 0.524649 0.632 0.040 0.116 0.028 0.184
#> SRR772535 5 0.5878 0.350259 0.064 0.292 0.000 0.032 0.612
#> SRR772536 4 0.5213 0.735146 0.084 0.096 0.028 0.764 0.028
#> SRR772537 4 0.3510 0.762544 0.036 0.012 0.004 0.848 0.100
#> SRR772538 4 0.1314 0.785677 0.012 0.012 0.000 0.960 0.016
#> SRR772539 5 0.5793 0.492648 0.232 0.052 0.048 0.004 0.664
#> SRR772540 1 0.5730 0.554568 0.692 0.040 0.136 0.000 0.132
#> SRR772541 1 0.5947 0.375661 0.556 0.092 0.344 0.004 0.004
#> SRR772542 1 0.6131 0.276188 0.548 0.072 0.028 0.000 0.352
#> SRR772543 1 0.7349 0.523443 0.560 0.176 0.136 0.004 0.124
#> SRR772544 3 0.3280 0.580307 0.160 0.000 0.824 0.012 0.004
#> SRR772545 2 0.4464 0.414272 0.028 0.684 0.288 0.000 0.000
#> SRR772546 3 0.7030 0.267405 0.240 0.196 0.528 0.004 0.032
#> SRR772547 1 0.7210 0.197397 0.432 0.384 0.120 0.000 0.064
#> SRR772548 2 0.8144 0.190199 0.308 0.372 0.220 0.004 0.096
#> SRR772549 2 0.5237 0.508741 0.160 0.696 0.140 0.000 0.004
#> SRR772550 2 0.6759 0.328980 0.324 0.524 0.052 0.000 0.100
#> SRR772551 5 0.4970 0.543896 0.216 0.032 0.028 0.004 0.720
#> SRR772552 5 0.6542 0.015869 0.068 0.416 0.040 0.004 0.472
#> SRR772553 3 0.2568 0.626131 0.004 0.092 0.888 0.016 0.000
#> SRR772554 4 0.4492 0.734967 0.076 0.044 0.000 0.796 0.084
#> SRR772555 4 0.6370 0.636985 0.048 0.092 0.040 0.684 0.136
#> SRR772556 1 0.8278 0.303913 0.400 0.168 0.156 0.004 0.272
#> SRR772557 2 0.7821 0.385888 0.152 0.472 0.232 0.000 0.144
#> SRR772558 2 0.5062 0.425570 0.020 0.692 0.044 0.000 0.244
#> SRR772559 2 0.7058 0.124023 0.320 0.344 0.008 0.000 0.328
#> SRR772560 1 0.6790 0.518314 0.608 0.072 0.132 0.004 0.184
#> SRR772561 3 0.4047 0.410963 0.004 0.000 0.676 0.320 0.000
#> SRR772562 4 0.8411 -0.213689 0.308 0.284 0.028 0.320 0.060
#> SRR772563 1 0.7945 0.009179 0.388 0.180 0.004 0.340 0.088
#> SRR772564 1 0.6763 0.488348 0.524 0.204 0.252 0.000 0.020
#> SRR772565 1 0.7150 0.502843 0.552 0.248 0.092 0.004 0.104
#> SRR772566 1 0.7697 0.399474 0.464 0.240 0.068 0.004 0.224
#> SRR772567 1 0.6717 0.409682 0.552 0.284 0.048 0.000 0.116
#> SRR772568 4 0.4572 0.742131 0.088 0.056 0.000 0.792 0.064
#> SRR772569 4 0.2227 0.784958 0.028 0.032 0.012 0.924 0.004
#> SRR772570 3 0.6722 0.286942 0.108 0.320 0.536 0.012 0.024
#> SRR772571 2 0.7536 -0.068304 0.372 0.404 0.044 0.008 0.172
#> SRR772572 1 0.8296 0.142578 0.344 0.340 0.164 0.004 0.148
#> SRR772573 1 0.6434 0.546694 0.652 0.136 0.076 0.004 0.132
#> SRR772574 2 0.5848 0.448516 0.264 0.632 0.032 0.000 0.072
#> SRR772575 2 0.7730 0.221171 0.200 0.420 0.076 0.000 0.304
#> SRR772576 2 0.8647 0.274169 0.188 0.368 0.084 0.316 0.044
#> SRR772577 1 0.8714 0.405584 0.472 0.136 0.120 0.188 0.084
#> SRR772578 5 0.4068 0.586317 0.100 0.012 0.016 0.048 0.824
#> SRR772579 3 0.8863 -0.043059 0.108 0.036 0.336 0.272 0.248
#> SRR772580 3 0.4152 0.430385 0.296 0.012 0.692 0.000 0.000
#> SRR772581 5 0.5020 0.565973 0.180 0.104 0.000 0.004 0.712
#> SRR772582 1 0.7329 0.250946 0.436 0.204 0.040 0.000 0.320
#> SRR772583 3 0.7716 -0.018068 0.268 0.256 0.420 0.004 0.052
#> SRR772584 1 0.6546 0.553113 0.648 0.072 0.180 0.016 0.084
#> SRR772585 3 0.6684 -0.003141 0.416 0.068 0.468 0.012 0.036
#> SRR772586 3 0.5331 0.497753 0.092 0.224 0.676 0.000 0.008
#> SRR772587 1 0.6202 0.561360 0.672 0.124 0.132 0.004 0.068
#> SRR772588 4 0.3004 0.771657 0.020 0.108 0.000 0.864 0.008
#> SRR772589 4 0.6655 0.577546 0.152 0.172 0.004 0.616 0.056
#> SRR772590 3 0.1725 0.634840 0.044 0.000 0.936 0.020 0.000
#> SRR772591 1 0.7809 0.467736 0.480 0.268 0.116 0.008 0.128
#> SRR772592 1 0.7221 0.441833 0.516 0.172 0.048 0.004 0.260
#> SRR772593 3 0.2971 0.610863 0.008 0.156 0.836 0.000 0.000
#> SRR772594 1 0.7280 -0.072250 0.408 0.356 0.024 0.208 0.004
#> SRR772595 1 0.8180 0.227140 0.460 0.084 0.048 0.296 0.112
#> SRR772596 3 0.2189 0.631356 0.012 0.084 0.904 0.000 0.000
#> SRR772597 3 0.1638 0.638936 0.064 0.000 0.932 0.000 0.004
#> SRR772598 5 0.6058 0.449315 0.064 0.060 0.240 0.000 0.636
#> SRR772599 2 0.6264 0.371177 0.244 0.572 0.176 0.000 0.008
#> SRR772600 1 0.6929 0.287532 0.536 0.212 0.008 0.020 0.224
#> SRR772601 5 0.3689 0.568234 0.128 0.048 0.004 0.000 0.820
#> SRR772602 3 0.1596 0.639650 0.028 0.000 0.948 0.012 0.012
#> SRR772603 2 0.8244 0.160855 0.352 0.356 0.128 0.008 0.156
#> SRR772604 2 0.6426 0.366790 0.260 0.544 0.000 0.008 0.188
#> SRR772605 1 0.6576 0.323766 0.484 0.024 0.376 0.000 0.116
#> SRR772606 1 0.7914 0.402644 0.464 0.140 0.136 0.004 0.256
#> SRR772607 2 0.7834 0.212401 0.144 0.408 0.116 0.000 0.332
#> SRR772608 4 0.7637 0.233152 0.296 0.124 0.020 0.492 0.068
#> SRR772609 1 0.5847 0.446675 0.652 0.224 0.012 0.008 0.104
#> SRR772610 2 0.5589 0.428249 0.028 0.680 0.056 0.228 0.008
#> SRR772611 3 0.7878 0.080403 0.264 0.036 0.376 0.308 0.016
#> SRR772612 5 0.3216 0.573128 0.068 0.048 0.000 0.016 0.868
#> SRR772613 1 0.8285 0.286692 0.508 0.064 0.088 0.148 0.192
#> SRR772614 1 0.6398 0.541054 0.636 0.172 0.128 0.000 0.064
#> SRR772615 1 0.7278 0.252418 0.472 0.312 0.040 0.004 0.172
#> SRR772616 5 0.7815 -0.096507 0.292 0.060 0.308 0.000 0.340
#> SRR772617 4 0.6628 0.550924 0.196 0.160 0.000 0.596 0.048
#> SRR772618 5 0.4552 0.542537 0.240 0.040 0.000 0.004 0.716
#> SRR772619 4 0.0771 0.782705 0.004 0.000 0.020 0.976 0.000
#> SRR772620 4 0.1220 0.782059 0.020 0.008 0.004 0.964 0.004
#> SRR772621 4 0.8465 0.064369 0.172 0.220 0.020 0.436 0.152
#> SRR772622 1 0.8579 0.393600 0.476 0.216 0.080 0.124 0.104
#> SRR772623 1 0.6259 0.552624 0.632 0.056 0.216 0.000 0.096
#> SRR772624 3 0.4610 0.314400 0.016 0.388 0.596 0.000 0.000
#> SRR772625 3 0.4599 0.550570 0.000 0.088 0.752 0.156 0.004
#> SRR772626 1 0.6667 0.503675 0.600 0.164 0.056 0.000 0.180
#> SRR772627 1 0.8857 0.195120 0.412 0.132 0.140 0.256 0.060
#> SRR772628 1 0.6081 0.492675 0.636 0.228 0.096 0.000 0.040
#> SRR772629 5 0.3916 0.580441 0.072 0.096 0.012 0.000 0.820
#> SRR772630 1 0.6078 0.566377 0.680 0.060 0.140 0.004 0.116
#> SRR772631 3 0.3790 0.544985 0.004 0.248 0.744 0.000 0.004
#> SRR772632 4 0.2045 0.785343 0.032 0.012 0.004 0.932 0.020
#> SRR772633 4 0.2068 0.767147 0.000 0.004 0.092 0.904 0.000
#> SRR772634 2 0.4679 0.543567 0.072 0.788 0.096 0.004 0.040
#> SRR772635 2 0.4997 0.485421 0.256 0.688 0.004 0.008 0.044
#> SRR772636 4 0.3715 0.631335 0.000 0.000 0.260 0.736 0.004
#> SRR772637 1 0.7542 0.486193 0.524 0.164 0.144 0.000 0.168
#> SRR772638 2 0.6541 -0.000116 0.396 0.480 0.088 0.000 0.036
#> SRR772639 4 0.6957 0.274735 0.176 0.012 0.300 0.500 0.012
#> SRR772640 4 0.0404 0.781052 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR772641 4 0.2653 0.784846 0.028 0.052 0.020 0.900 0.000
#> SRR772642 2 0.7100 0.422944 0.112 0.568 0.040 0.028 0.252
#> SRR772643 4 0.6847 0.330542 0.000 0.208 0.248 0.520 0.024
#> SRR772644 3 0.7625 -0.104374 0.128 0.084 0.404 0.004 0.380
#> SRR772645 2 0.7428 0.464770 0.224 0.532 0.164 0.008 0.072
#> SRR772646 4 0.4763 0.668627 0.024 0.220 0.032 0.724 0.000
#> SRR772647 4 0.3707 0.669925 0.000 0.008 0.004 0.768 0.220
#> SRR772648 2 0.7678 0.024114 0.392 0.428 0.060 0.052 0.068
#> SRR772649 2 0.9015 0.294005 0.140 0.388 0.224 0.196 0.052
#> SRR772650 1 0.6606 0.558758 0.636 0.124 0.152 0.004 0.084
#> SRR772651 5 0.6376 0.471728 0.260 0.084 0.056 0.000 0.600
#> SRR772652 1 0.7762 0.509642 0.508 0.188 0.144 0.004 0.156
#> SRR772653 5 0.6883 0.241853 0.276 0.016 0.224 0.000 0.484
#> SRR772654 5 0.5836 0.350838 0.060 0.296 0.004 0.024 0.616
#> SRR772655 5 0.3730 0.578870 0.056 0.008 0.032 0.052 0.852
#> SRR772656 3 0.2927 0.626847 0.060 0.000 0.872 0.000 0.068
#> SRR772657 3 0.1907 0.634234 0.028 0.000 0.928 0.044 0.000
#> SRR772658 4 0.0955 0.781280 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR772659 4 0.8758 -0.075936 0.264 0.200 0.012 0.332 0.192
#> SRR772660 1 0.6463 0.275610 0.444 0.140 0.408 0.000 0.008
#> SRR772661 3 0.3707 0.566025 0.008 0.220 0.768 0.000 0.004
#> SRR772662 1 0.6036 0.535554 0.684 0.152 0.088 0.004 0.072
#> SRR772663 2 0.8196 0.251770 0.320 0.376 0.176 0.004 0.124
#> SRR772664 4 0.7757 0.326497 0.140 0.084 0.244 0.512 0.020
#> SRR772665 2 0.8552 0.275361 0.300 0.412 0.152 0.056 0.080
#> SRR772666 3 0.3402 0.563202 0.184 0.000 0.804 0.004 0.008
#> SRR772667 1 0.6787 0.429103 0.556 0.072 0.304 0.012 0.056
#> SRR772668 3 0.9934 -0.223269 0.192 0.228 0.240 0.168 0.172
#> SRR772669 3 0.9934 -0.223269 0.192 0.228 0.240 0.168 0.172
#> SRR772670 1 0.7145 0.486596 0.548 0.228 0.140 0.000 0.084
#> SRR772671 5 0.6962 0.305706 0.280 0.104 0.076 0.000 0.540
#> SRR772672 3 0.7388 -0.085082 0.380 0.160 0.416 0.012 0.032
#> SRR772673 2 0.5790 0.495109 0.236 0.652 0.032 0.000 0.080
#> SRR772674 3 0.3421 0.550407 0.204 0.008 0.788 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.2681 0.630724 0.004 0.076 0.892 0.024 0.004
#> SRR772676 5 0.8323 0.240855 0.232 0.064 0.028 0.284 0.392
#> SRR772677 1 0.7174 0.476005 0.620 0.088 0.060 0.168 0.064
#> SRR772678 3 0.3647 0.550627 0.004 0.228 0.764 0.000 0.004
#> SRR772679 2 0.8038 0.468491 0.172 0.544 0.064 0.124 0.096
#> SRR772680 5 0.7457 0.143901 0.272 0.060 0.200 0.000 0.468
#> SRR772681 3 0.4260 0.492322 0.256 0.000 0.720 0.020 0.004
#> SRR772682 4 0.7795 -0.070407 0.276 0.040 0.012 0.408 0.264
#> SRR772683 2 0.6746 0.427854 0.036 0.636 0.036 0.168 0.124
#> SRR772685 3 0.8137 0.201218 0.112 0.124 0.428 0.316 0.020
#> SRR772686 3 0.2179 0.619178 0.100 0.000 0.896 0.004 0.000
#> SRR772687 3 0.5335 0.484322 0.132 0.200 0.668 0.000 0.000
#> SRR772688 4 0.0740 0.782866 0.004 0.008 0.008 0.980 0.000
#> SRR772689 4 0.4091 0.759221 0.096 0.048 0.024 0.824 0.008
#> SRR772690 3 0.1740 0.632903 0.056 0.000 0.932 0.012 0.000
#> SRR772691 3 0.4214 0.577829 0.000 0.152 0.780 0.064 0.004
#> SRR772692 1 0.7113 0.487887 0.568 0.088 0.120 0.004 0.220
#> SRR772693 3 0.7032 0.438903 0.064 0.124 0.604 0.188 0.020
#> SRR772694 4 0.6019 0.665461 0.008 0.116 0.068 0.696 0.112
#> SRR772695 5 0.6786 0.320945 0.304 0.196 0.004 0.008 0.488
#> SRR772696 1 0.7093 0.465702 0.560 0.100 0.264 0.060 0.016
#> SRR772697 1 0.7223 0.188408 0.464 0.036 0.020 0.372 0.108
#> SRR772698 3 0.3282 0.589663 0.008 0.188 0.804 0.000 0.000
#> SRR772699 2 0.5656 0.504044 0.096 0.700 0.048 0.000 0.156
#> SRR772700 2 0.5368 0.454459 0.056 0.688 0.032 0.000 0.224
#> SRR772701 5 0.5746 0.479913 0.268 0.076 0.016 0.004 0.636
#> SRR772702 2 0.6948 0.415665 0.180 0.528 0.028 0.004 0.260
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 6 0.6617 0.333875 0.120 0.180 0.012 0.000 0.116 0.572
#> SRR772342 1 0.8127 0.101742 0.404 0.124 0.072 0.000 0.220 0.180
#> SRR772343 1 0.5664 0.351505 0.612 0.012 0.192 0.000 0.176 0.008
#> SRR772344 4 0.1789 0.756009 0.000 0.000 0.000 0.924 0.032 0.044
#> SRR772345 4 0.1621 0.754696 0.004 0.008 0.000 0.936 0.048 0.004
#> SRR772346 6 0.7108 0.397097 0.076 0.128 0.128 0.000 0.100 0.568
#> SRR772347 1 0.8551 0.086785 0.348 0.120 0.188 0.000 0.212 0.132
#> SRR772348 2 0.8751 0.085962 0.160 0.360 0.060 0.084 0.272 0.064
#> SRR772349 4 0.7104 0.142194 0.052 0.304 0.004 0.432 0.196 0.012
#> SRR772350 1 0.5563 0.364341 0.636 0.012 0.208 0.000 0.128 0.016
#> SRR772351 6 0.4930 0.429099 0.016 0.016 0.000 0.104 0.144 0.720
#> SRR772352 2 0.8751 0.175728 0.084 0.388 0.072 0.056 0.180 0.220
#> SRR772353 2 0.8019 0.175956 0.260 0.388 0.044 0.004 0.196 0.108
#> SRR772354 2 0.7177 0.300532 0.128 0.568 0.008 0.116 0.132 0.048
#> SRR772355 1 0.8620 0.206786 0.428 0.108 0.148 0.140 0.148 0.028
#> SRR772356 4 0.4925 0.668075 0.060 0.004 0.016 0.748 0.052 0.120
#> SRR772357 6 0.4665 0.494346 0.048 0.096 0.048 0.000 0.036 0.772
#> SRR772358 2 0.7095 0.319137 0.160 0.560 0.088 0.012 0.152 0.028
#> SRR772359 2 0.7827 0.213167 0.152 0.408 0.268 0.004 0.140 0.028
#> SRR772360 4 0.7438 0.186637 0.112 0.024 0.016 0.448 0.316 0.084
#> SRR772361 3 0.2288 0.672483 0.076 0.004 0.900 0.012 0.004 0.004
#> SRR772362 4 0.0551 0.749920 0.000 0.000 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR772363 4 0.0260 0.747974 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR772364 6 0.8231 -0.043558 0.252 0.112 0.056 0.004 0.216 0.360
#> SRR772365 1 0.5960 0.341013 0.632 0.012 0.168 0.000 0.136 0.052
#> SRR772366 3 0.4664 0.463712 0.044 0.356 0.596 0.000 0.004 0.000
#> SRR772367 3 0.2544 0.664345 0.120 0.000 0.864 0.004 0.012 0.000
#> SRR772368 1 0.7706 0.228681 0.396 0.040 0.168 0.052 0.328 0.016
#> SRR772369 2 0.7614 -0.010912 0.132 0.416 0.024 0.012 0.320 0.096
#> SRR772370 6 0.4833 0.419273 0.012 0.256 0.012 0.008 0.032 0.680
#> SRR772371 1 0.7291 0.122586 0.492 0.176 0.028 0.000 0.208 0.096
#> SRR772372 6 0.6115 0.305922 0.288 0.008 0.028 0.000 0.132 0.544
#> SRR772373 4 0.6436 0.588291 0.044 0.116 0.004 0.628 0.148 0.060
#> SRR772374 4 0.7669 0.362019 0.092 0.132 0.068 0.524 0.168 0.016
#> SRR772375 3 0.1606 0.684250 0.056 0.000 0.932 0.000 0.008 0.004
#> SRR772376 4 0.6239 0.580438 0.108 0.004 0.080 0.612 0.188 0.008
#> SRR772377 3 0.2755 0.672765 0.000 0.140 0.844 0.012 0.004 0.000
#> SRR772378 1 0.7458 0.276455 0.448 0.012 0.172 0.000 0.164 0.204
#> SRR772379 2 0.3093 0.405233 0.048 0.864 0.012 0.000 0.064 0.012
#> SRR772380 2 0.3727 0.405628 0.028 0.824 0.008 0.000 0.056 0.084
#> SRR772381 3 0.2967 0.632987 0.136 0.004 0.840 0.008 0.012 0.000
#> SRR772382 6 0.6062 0.417038 0.136 0.056 0.008 0.000 0.188 0.612
#> SRR772383 2 0.6245 0.269911 0.272 0.544 0.036 0.000 0.140 0.008
#> SRR772384 3 0.3121 0.647694 0.000 0.192 0.796 0.008 0.000 0.004
#> SRR772385 3 0.3606 0.603586 0.000 0.264 0.724 0.008 0.004 0.000
#> SRR772386 1 0.8348 0.142368 0.400 0.076 0.088 0.036 0.292 0.108
#> SRR772387 4 0.6076 0.589873 0.164 0.016 0.100 0.648 0.064 0.008
#> SRR772388 2 0.7040 0.324376 0.244 0.524 0.044 0.000 0.112 0.076
#> SRR772389 1 0.7609 0.207384 0.480 0.188 0.052 0.000 0.172 0.108
#> SRR772390 3 0.2431 0.680869 0.004 0.116 0.872 0.004 0.004 0.000
#> SRR772391 6 0.5438 0.462694 0.172 0.080 0.004 0.000 0.068 0.676
#> SRR772392 1 0.5710 0.309471 0.544 0.020 0.360 0.000 0.048 0.028
#> SRR772393 2 0.7352 0.220719 0.040 0.488 0.056 0.020 0.108 0.288
#> SRR772394 1 0.7978 0.166674 0.468 0.076 0.064 0.036 0.252 0.104
#> SRR772395 1 0.7962 0.051180 0.432 0.008 0.128 0.228 0.164 0.040
#> SRR772396 1 0.8552 -0.035914 0.332 0.160 0.120 0.000 0.252 0.136
#> SRR772397 1 0.7638 0.268720 0.484 0.144 0.108 0.000 0.200 0.064
#> SRR772398 6 0.3704 0.494906 0.068 0.016 0.012 0.000 0.080 0.824
#> SRR772399 2 0.6812 0.112886 0.048 0.460 0.036 0.000 0.100 0.356
#> SRR772400 2 0.6531 0.313176 0.208 0.552 0.040 0.000 0.180 0.020
#> SRR772401 2 0.7193 0.312264 0.148 0.524 0.052 0.000 0.072 0.204
#> SRR772402 5 0.7154 0.059170 0.176 0.032 0.004 0.032 0.404 0.352
#> SRR772403 5 0.8256 0.175510 0.152 0.044 0.008 0.188 0.384 0.224
#> SRR772404 1 0.6041 0.358594 0.652 0.036 0.104 0.008 0.168 0.032
#> SRR772405 3 0.3790 0.599472 0.016 0.264 0.716 0.004 0.000 0.000
#> SRR772406 6 0.6358 0.362482 0.016 0.012 0.076 0.164 0.104 0.628
#> SRR772407 3 0.7067 0.243698 0.256 0.008 0.520 0.104 0.088 0.024
#> SRR772408 4 0.0405 0.748158 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR772409 4 0.1196 0.751634 0.000 0.000 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR772410 2 0.7438 0.331177 0.168 0.564 0.036 0.096 0.072 0.064
#> SRR772411 2 0.6691 0.211878 0.340 0.464 0.008 0.000 0.120 0.068
#> SRR772412 1 0.8144 0.232571 0.432 0.156 0.144 0.000 0.172 0.096
#> SRR772413 1 0.7406 0.310217 0.508 0.220 0.104 0.000 0.096 0.072
#> SRR772414 3 0.4351 0.513204 0.240 0.004 0.704 0.004 0.048 0.000
#> SRR772415 2 0.8674 -0.029655 0.216 0.312 0.016 0.248 0.152 0.056
#> SRR772416 2 0.7816 -0.166927 0.216 0.328 0.008 0.004 0.296 0.148
#> SRR772417 1 0.6492 0.292320 0.576 0.012 0.068 0.008 0.236 0.100
#> SRR772418 3 0.4027 0.578207 0.008 0.292 0.688 0.004 0.004 0.004
#> SRR772419 4 0.4356 0.656856 0.044 0.004 0.184 0.744 0.024 0.000
#> SRR772420 4 0.4999 0.692148 0.048 0.044 0.004 0.728 0.160 0.016
#> SRR772421 4 0.7106 0.518755 0.072 0.040 0.132 0.608 0.076 0.072
#> SRR772422 3 0.6428 0.047324 0.356 0.008 0.492 0.016 0.100 0.028
#> SRR772423 5 0.7827 0.165704 0.296 0.052 0.016 0.032 0.360 0.244
#> SRR772424 1 0.7172 -0.001116 0.384 0.048 0.004 0.008 0.292 0.264
#> SRR772425 1 0.7831 0.268476 0.448 0.008 0.212 0.100 0.192 0.040
#> SRR772426 4 0.1563 0.751794 0.000 0.056 0.012 0.932 0.000 0.000
#> SRR772427 4 0.0551 0.750139 0.004 0.000 0.004 0.984 0.008 0.000
#> SRR772428 2 0.7704 0.294437 0.172 0.468 0.204 0.000 0.080 0.076
#> SRR772429 1 0.7011 0.240722 0.488 0.140 0.052 0.000 0.284 0.036
#> SRR772430 1 0.7745 0.197525 0.340 0.020 0.316 0.000 0.120 0.204
#> SRR772431 5 0.8648 0.208523 0.240 0.236 0.040 0.048 0.340 0.096
#> SRR772432 5 0.8346 0.243550 0.112 0.056 0.052 0.184 0.464 0.132
#> SRR772433 6 0.8658 -0.124850 0.264 0.144 0.088 0.004 0.204 0.296
#> SRR772434 2 0.6420 0.153429 0.348 0.484 0.088 0.000 0.076 0.004
#> SRR772435 2 0.7048 0.243359 0.072 0.496 0.048 0.004 0.076 0.304
#> SRR772436 6 0.6758 0.186609 0.196 0.064 0.000 0.000 0.284 0.456
#> SRR772437 3 0.2069 0.678923 0.068 0.000 0.908 0.020 0.000 0.004
#> SRR772438 1 0.7372 0.310549 0.500 0.232 0.128 0.000 0.072 0.068
#> SRR772439 5 0.7004 0.019802 0.356 0.084 0.008 0.000 0.412 0.140
#> SRR772440 6 0.7554 0.108414 0.056 0.072 0.004 0.300 0.124 0.444
#> SRR772441 2 0.7591 0.204173 0.072 0.520 0.016 0.060 0.176 0.156
#> SRR772442 1 0.7945 0.196954 0.444 0.004 0.092 0.068 0.192 0.200
#> SRR772443 1 0.6797 0.074421 0.448 0.048 0.016 0.000 0.344 0.144
#> SRR772444 2 0.8393 0.217017 0.140 0.400 0.120 0.004 0.120 0.216
#> SRR772445 1 0.7744 0.127468 0.388 0.232 0.052 0.000 0.264 0.064
#> SRR772446 2 0.4532 0.395973 0.120 0.756 0.032 0.000 0.088 0.004
#> SRR772447 2 0.7002 0.112443 0.352 0.416 0.012 0.000 0.152 0.068
#> SRR772448 2 0.7316 0.096853 0.248 0.420 0.008 0.000 0.228 0.096
#> SRR772449 2 0.5742 0.311319 0.160 0.652 0.004 0.000 0.112 0.072
#> SRR772450 4 0.1230 0.751048 0.000 0.000 0.028 0.956 0.008 0.008
#> SRR772451 4 0.1297 0.752597 0.000 0.000 0.000 0.948 0.012 0.040
#> SRR772452 2 0.5492 0.309178 0.152 0.632 0.004 0.000 0.196 0.016
#> SRR772453 1 0.8168 -0.078141 0.320 0.272 0.036 0.000 0.196 0.176
#> SRR772454 1 0.6413 0.334647 0.616 0.084 0.084 0.000 0.176 0.040
#> SRR772455 1 0.6955 0.092323 0.416 0.012 0.096 0.000 0.104 0.372
#> SRR772456 4 0.2019 0.748435 0.012 0.000 0.000 0.900 0.088 0.000
#> SRR772457 4 0.0363 0.750524 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR772458 5 0.7450 0.194722 0.324 0.232 0.004 0.004 0.344 0.092
#> SRR772459 1 0.7618 -0.009334 0.364 0.308 0.024 0.000 0.216 0.088
#> SRR772460 4 0.0363 0.748931 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR772461 4 0.0508 0.749151 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR772462 4 0.8228 0.247090 0.112 0.068 0.204 0.428 0.176 0.012
#> SRR772463 4 0.3241 0.739585 0.016 0.064 0.004 0.856 0.056 0.004
#> SRR772464 3 0.1477 0.683367 0.048 0.000 0.940 0.004 0.008 0.000
#> SRR772465 6 0.6304 0.391469 0.164 0.012 0.004 0.040 0.192 0.588
#> SRR772466 5 0.9130 0.119693 0.216 0.212 0.036 0.220 0.252 0.064
#> SRR772467 4 0.4688 0.695617 0.084 0.032 0.000 0.752 0.120 0.012
#> SRR772468 4 0.3400 0.737568 0.036 0.004 0.008 0.844 0.092 0.016
#> SRR772469 1 0.5885 0.200548 0.528 0.320 0.024 0.000 0.128 0.000
#> SRR772470 2 0.7140 0.027182 0.380 0.388 0.056 0.000 0.148 0.028
#> SRR772471 2 0.3652 0.404211 0.088 0.820 0.004 0.000 0.072 0.016
#> SRR772472 2 0.6864 0.263639 0.152 0.524 0.004 0.000 0.184 0.136
#> SRR772473 5 0.7378 0.147180 0.308 0.160 0.044 0.008 0.440 0.040
#> SRR772474 1 0.6840 0.227734 0.572 0.100 0.016 0.048 0.224 0.040
#> SRR772475 3 0.2976 0.672925 0.000 0.128 0.844 0.016 0.004 0.008
#> SRR772476 4 0.2119 0.753336 0.000 0.000 0.000 0.904 0.060 0.036
#> SRR772477 4 0.0810 0.750632 0.004 0.000 0.004 0.976 0.008 0.008
#> SRR772478 2 0.4898 0.416898 0.080 0.764 0.060 0.004 0.060 0.032
#> SRR772479 2 0.7646 -0.106447 0.280 0.304 0.008 0.000 0.288 0.120
#> SRR772480 5 0.7331 0.110825 0.164 0.336 0.000 0.012 0.388 0.100
#> SRR772481 5 0.8417 0.176902 0.100 0.248 0.004 0.084 0.340 0.224
#> SRR772482 1 0.6759 0.318958 0.520 0.116 0.268 0.000 0.080 0.016
#> SRR772483 2 0.6418 0.259363 0.200 0.584 0.124 0.000 0.080 0.012
#> SRR772484 4 0.2496 0.752078 0.028 0.028 0.000 0.904 0.024 0.016
#> SRR772485 2 0.7321 0.049240 0.084 0.408 0.012 0.344 0.144 0.008
#> SRR772486 1 0.7479 0.235091 0.432 0.024 0.128 0.000 0.132 0.284
#> SRR772487 1 0.7308 -0.023892 0.392 0.132 0.056 0.000 0.372 0.048
#> SRR772488 4 0.4766 0.689954 0.036 0.028 0.004 0.740 0.168 0.024
#> SRR772489 5 0.7611 0.093273 0.324 0.008 0.016 0.244 0.340 0.068
#> SRR772490 6 0.6849 0.091495 0.296 0.032 0.008 0.000 0.264 0.400
#> SRR772491 1 0.8375 0.108528 0.332 0.156 0.144 0.000 0.284 0.084
#> SRR772492 4 0.0291 0.748081 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR772493 4 0.1036 0.753209 0.024 0.000 0.000 0.964 0.008 0.004
#> SRR772494 4 0.0146 0.747467 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772495 4 0.0291 0.748432 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR772496 2 0.7579 0.095751 0.272 0.432 0.008 0.044 0.196 0.048
#> SRR772497 2 0.7899 0.181523 0.140 0.436 0.236 0.036 0.144 0.008
#> SRR772498 3 0.8143 0.235386 0.176 0.100 0.460 0.012 0.092 0.160
#> SRR772499 1 0.7350 0.103709 0.372 0.200 0.344 0.008 0.068 0.008
#> SRR772500 4 0.6621 0.239360 0.108 0.368 0.024 0.464 0.032 0.004
#> SRR772501 4 0.1413 0.753539 0.008 0.004 0.000 0.948 0.036 0.004
#> SRR772502 6 0.9008 0.061368 0.232 0.128 0.020 0.124 0.184 0.312
#> SRR772503 6 0.5150 0.456417 0.080 0.032 0.008 0.004 0.172 0.704
#> SRR772504 4 0.6519 0.440133 0.220 0.000 0.100 0.568 0.100 0.012
#> SRR772505 4 0.5366 0.695528 0.032 0.016 0.040 0.732 0.112 0.068
#> SRR772506 4 0.0260 0.747439 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR772507 4 0.3370 0.740988 0.028 0.004 0.032 0.840 0.096 0.000
#> SRR772508 4 0.6904 0.324255 0.148 0.004 0.064 0.496 0.276 0.012
#> SRR772509 3 0.3183 0.644057 0.000 0.200 0.788 0.008 0.000 0.004
#> SRR772510 3 0.4454 0.468792 0.268 0.012 0.684 0.004 0.032 0.000
#> SRR772511 3 0.6378 0.003184 0.360 0.020 0.484 0.000 0.104 0.032
#> SRR772512 4 0.3054 0.685326 0.004 0.000 0.180 0.808 0.004 0.004
#> SRR772513 2 0.5054 0.409173 0.080 0.748 0.104 0.012 0.020 0.036
#> SRR772514 2 0.5341 -0.038474 0.012 0.476 0.000 0.448 0.060 0.004
#> SRR772515 4 0.5940 0.585323 0.120 0.044 0.004 0.652 0.160 0.020
#> SRR772516 4 0.7842 0.327091 0.132 0.020 0.176 0.508 0.088 0.076
#> SRR772517 2 0.6749 0.343809 0.088 0.624 0.028 0.060 0.152 0.048
#> SRR772518 2 0.9211 0.152254 0.092 0.348 0.168 0.060 0.180 0.152
#> SRR772519 4 0.3224 0.719555 0.000 0.040 0.004 0.824 0.000 0.132
#> SRR772520 4 0.5156 0.649864 0.028 0.016 0.000 0.700 0.080 0.176
#> SRR772521 1 0.6701 0.027799 0.416 0.012 0.012 0.012 0.180 0.368
#> SRR772522 5 0.7610 0.186434 0.316 0.076 0.008 0.024 0.396 0.180
#> SRR772523 1 0.7855 0.117756 0.408 0.048 0.024 0.044 0.180 0.296
#> SRR772524 4 0.7769 -0.018994 0.236 0.028 0.004 0.420 0.108 0.204
#> SRR772525 3 0.4694 0.324346 0.324 0.004 0.624 0.000 0.044 0.004
#> SRR772526 4 0.0260 0.748346 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR772527 4 0.1946 0.750748 0.012 0.000 0.004 0.912 0.072 0.000
#> SRR772528 3 0.5266 0.339708 0.032 0.396 0.536 0.000 0.032 0.004
#> SRR772529 6 0.5978 0.459087 0.036 0.136 0.068 0.004 0.084 0.672
#> SRR772530 5 0.8255 0.112032 0.260 0.260 0.024 0.016 0.316 0.124
#> SRR772531 3 0.3518 0.593464 0.184 0.008 0.784 0.000 0.024 0.000
#> SRR772532 4 0.3579 0.732713 0.020 0.092 0.012 0.832 0.044 0.000
#> SRR772533 4 0.6294 0.473795 0.008 0.252 0.004 0.560 0.140 0.036
#> SRR772534 1 0.7356 0.251503 0.496 0.016 0.080 0.016 0.220 0.172
#> SRR772535 6 0.6094 0.392633 0.044 0.212 0.004 0.012 0.116 0.612
#> SRR772536 4 0.5134 0.697072 0.072 0.048 0.024 0.748 0.096 0.012
#> SRR772537 4 0.3315 0.736938 0.008 0.000 0.000 0.832 0.068 0.092
#> SRR772538 4 0.1732 0.755614 0.004 0.000 0.000 0.920 0.072 0.004
#> SRR772539 6 0.5901 0.382302 0.264 0.028 0.012 0.000 0.108 0.588
#> SRR772540 1 0.5482 0.341434 0.680 0.008 0.068 0.000 0.164 0.080
#> SRR772541 1 0.7221 0.287074 0.456 0.132 0.268 0.004 0.136 0.004
#> SRR772542 1 0.6731 0.091579 0.444 0.020 0.032 0.000 0.156 0.348
#> SRR772543 1 0.6974 0.250753 0.544 0.080 0.048 0.000 0.224 0.104
#> SRR772544 3 0.2636 0.653457 0.120 0.000 0.860 0.016 0.004 0.000
#> SRR772545 2 0.4988 0.337073 0.080 0.640 0.268 0.000 0.012 0.000
#> SRR772546 3 0.7435 0.233726 0.224 0.168 0.484 0.004 0.088 0.032
#> SRR772547 1 0.7119 0.021979 0.380 0.356 0.040 0.000 0.200 0.024
#> SRR772548 1 0.7946 -0.003490 0.404 0.276 0.128 0.000 0.128 0.064
#> SRR772549 2 0.4644 0.402250 0.132 0.744 0.060 0.000 0.064 0.000
#> SRR772550 2 0.7454 0.128872 0.308 0.400 0.020 0.000 0.180 0.092
#> SRR772551 6 0.6031 0.405317 0.248 0.012 0.020 0.004 0.132 0.584
#> SRR772552 6 0.6922 0.236124 0.100 0.284 0.020 0.004 0.084 0.508
#> SRR772553 3 0.2404 0.680393 0.000 0.104 0.880 0.008 0.004 0.004
#> SRR772554 4 0.4784 0.685939 0.032 0.012 0.008 0.756 0.120 0.072
#> SRR772555 4 0.6568 0.606229 0.072 0.044 0.052 0.660 0.084 0.088
#> SRR772556 5 0.7756 0.115629 0.320 0.096 0.052 0.000 0.388 0.144
#> SRR772557 2 0.8510 0.236883 0.128 0.392 0.188 0.008 0.184 0.100
#> SRR772558 2 0.5539 0.361828 0.052 0.644 0.012 0.000 0.056 0.236
#> SRR772559 5 0.7694 0.159167 0.240 0.276 0.000 0.000 0.280 0.204
#> SRR772560 1 0.6413 0.332081 0.628 0.048 0.072 0.000 0.120 0.132
#> SRR772561 3 0.3073 0.608303 0.016 0.000 0.816 0.164 0.000 0.004
#> SRR772562 4 0.8358 -0.247896 0.176 0.196 0.028 0.308 0.280 0.012
#> SRR772563 4 0.7971 0.044095 0.256 0.136 0.008 0.400 0.172 0.028
#> SRR772564 1 0.6161 0.357386 0.624 0.136 0.120 0.000 0.112 0.008
#> SRR772565 1 0.7727 0.256716 0.460 0.216 0.088 0.000 0.168 0.068
#> SRR772566 1 0.7486 0.181576 0.484 0.176 0.032 0.000 0.136 0.172
#> SRR772567 1 0.7588 0.070838 0.412 0.204 0.024 0.000 0.260 0.100
#> SRR772568 4 0.4494 0.722915 0.040 0.052 0.008 0.796 0.036 0.068
#> SRR772569 4 0.1836 0.754000 0.008 0.004 0.000 0.928 0.048 0.012
#> SRR772570 3 0.7191 0.209924 0.096 0.280 0.480 0.004 0.120 0.020
#> SRR772571 1 0.7968 -0.085511 0.340 0.180 0.024 0.008 0.324 0.124
#> SRR772572 1 0.8078 0.037050 0.356 0.324 0.112 0.000 0.092 0.116
#> SRR772573 1 0.6528 0.269444 0.576 0.056 0.032 0.000 0.224 0.112
#> SRR772574 2 0.6862 0.198309 0.268 0.496 0.012 0.000 0.152 0.072
#> SRR772575 2 0.8071 0.055280 0.244 0.300 0.024 0.000 0.168 0.264
#> SRR772576 2 0.9045 -0.089626 0.160 0.276 0.040 0.204 0.260 0.060
#> SRR772577 1 0.8331 0.039125 0.420 0.064 0.048 0.200 0.216 0.052
#> SRR772578 6 0.3323 0.490413 0.044 0.004 0.000 0.048 0.052 0.852
#> SRR772579 3 0.8468 -0.129178 0.160 0.012 0.340 0.204 0.044 0.240
#> SRR772580 3 0.4010 0.498064 0.264 0.000 0.708 0.004 0.020 0.004
#> SRR772581 6 0.5874 0.428273 0.108 0.072 0.000 0.000 0.204 0.616
#> SRR772582 1 0.7137 0.113961 0.476 0.132 0.008 0.000 0.140 0.244
#> SRR772583 3 0.8030 -0.176804 0.244 0.228 0.336 0.004 0.172 0.016
#> SRR772584 1 0.6451 0.267305 0.604 0.040 0.072 0.008 0.220 0.056
#> SRR772585 3 0.7244 -0.050690 0.304 0.036 0.424 0.008 0.204 0.024
#> SRR772586 3 0.5527 0.512912 0.136 0.220 0.620 0.000 0.024 0.000
#> SRR772587 1 0.6205 0.297074 0.608 0.044 0.056 0.004 0.240 0.048
#> SRR772588 4 0.2256 0.752432 0.004 0.048 0.000 0.908 0.032 0.008
#> SRR772589 4 0.6625 0.535174 0.088 0.048 0.008 0.596 0.208 0.052
#> SRR772590 3 0.1452 0.685379 0.032 0.000 0.948 0.008 0.004 0.008
#> SRR772591 1 0.7819 0.211856 0.432 0.252 0.076 0.000 0.160 0.080
#> SRR772592 1 0.6949 0.165854 0.516 0.092 0.012 0.000 0.192 0.188
#> SRR772593 3 0.3190 0.677420 0.020 0.152 0.820 0.004 0.004 0.000
#> SRR772594 1 0.8276 -0.143473 0.292 0.264 0.016 0.220 0.196 0.012
#> SRR772595 1 0.8231 -0.093497 0.312 0.028 0.032 0.280 0.276 0.072
#> SRR772596 3 0.2779 0.679776 0.016 0.120 0.856 0.004 0.000 0.004
#> SRR772597 3 0.2400 0.683323 0.060 0.004 0.900 0.004 0.028 0.004
#> SRR772598 6 0.5859 0.397266 0.068 0.052 0.236 0.000 0.020 0.624
#> SRR772599 2 0.6658 0.215848 0.272 0.500 0.096 0.000 0.132 0.000
#> SRR772600 5 0.7826 0.252531 0.260 0.116 0.008 0.024 0.412 0.180
#> SRR772601 6 0.5109 0.424515 0.060 0.032 0.000 0.004 0.240 0.664
#> SRR772602 3 0.1350 0.689178 0.020 0.008 0.952 0.020 0.000 0.000
#> SRR772603 5 0.8407 0.077799 0.180 0.308 0.076 0.008 0.324 0.104
#> SRR772604 2 0.6845 -0.023432 0.124 0.424 0.000 0.004 0.360 0.088
#> SRR772605 1 0.7132 0.329903 0.508 0.032 0.264 0.004 0.096 0.096
#> SRR772606 1 0.7528 0.281980 0.504 0.096 0.108 0.000 0.088 0.204
#> SRR772607 2 0.8070 0.057724 0.096 0.368 0.080 0.000 0.156 0.300
#> SRR772608 4 0.7344 0.053225 0.220 0.036 0.008 0.452 0.248 0.036
#> SRR772609 1 0.7018 0.118156 0.432 0.116 0.004 0.012 0.356 0.080
#> SRR772610 2 0.6501 0.291223 0.032 0.616 0.072 0.180 0.092 0.008
#> SRR772611 1 0.7811 0.036802 0.332 0.016 0.256 0.296 0.092 0.008
#> SRR772612 6 0.3529 0.475887 0.028 0.008 0.000 0.008 0.148 0.808
#> SRR772613 5 0.8038 -0.027849 0.336 0.004 0.084 0.108 0.364 0.104
#> SRR772614 1 0.6781 0.271904 0.528 0.104 0.072 0.000 0.268 0.028
#> SRR772615 5 0.7980 0.113046 0.264 0.272 0.032 0.000 0.316 0.116
#> SRR772616 1 0.7796 -0.000974 0.332 0.068 0.228 0.000 0.048 0.324
#> SRR772617 4 0.7281 0.280314 0.120 0.072 0.004 0.480 0.284 0.040
#> SRR772618 6 0.5176 0.421772 0.100 0.004 0.000 0.012 0.236 0.648
#> SRR772619 4 0.0748 0.750123 0.000 0.000 0.016 0.976 0.004 0.004
#> SRR772620 4 0.1007 0.751373 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR772621 4 0.8567 0.027910 0.160 0.124 0.024 0.428 0.156 0.108
#> SRR772622 1 0.8754 0.062448 0.400 0.144 0.048 0.124 0.212 0.072
#> SRR772623 1 0.6669 0.296737 0.524 0.020 0.136 0.000 0.268 0.052
#> SRR772624 2 0.4662 -0.193325 0.032 0.496 0.468 0.000 0.004 0.000
#> SRR772625 3 0.4335 0.626326 0.000 0.136 0.752 0.100 0.008 0.004
#> SRR772626 1 0.6684 0.186233 0.504 0.064 0.020 0.000 0.308 0.104
#> SRR772627 1 0.8262 -0.068044 0.316 0.060 0.076 0.224 0.312 0.012
#> SRR772628 1 0.6201 0.208177 0.572 0.108 0.024 0.000 0.264 0.032
#> SRR772629 6 0.4064 0.499237 0.044 0.064 0.012 0.000 0.072 0.808
#> SRR772630 1 0.6478 0.352635 0.620 0.040 0.096 0.000 0.140 0.104
#> SRR772631 3 0.3547 0.568718 0.000 0.300 0.696 0.000 0.004 0.000
#> SRR772632 4 0.2325 0.755430 0.004 0.000 0.008 0.900 0.068 0.020
#> SRR772633 4 0.2162 0.738470 0.000 0.000 0.088 0.896 0.012 0.004
#> SRR772634 2 0.6073 0.391152 0.112 0.668 0.072 0.008 0.112 0.028
#> SRR772635 2 0.5848 0.310113 0.120 0.616 0.016 0.012 0.228 0.008
#> SRR772636 4 0.4105 0.491787 0.000 0.004 0.344 0.640 0.008 0.004
#> SRR772637 1 0.7361 0.246408 0.528 0.108 0.072 0.000 0.184 0.108
#> SRR772638 2 0.6681 0.060833 0.360 0.464 0.044 0.000 0.104 0.028
#> SRR772639 4 0.7107 0.346397 0.152 0.004 0.212 0.512 0.108 0.012
#> SRR772640 4 0.0603 0.751483 0.000 0.000 0.016 0.980 0.004 0.000
#> SRR772641 4 0.2924 0.752485 0.020 0.040 0.016 0.884 0.036 0.004
#> SRR772642 2 0.7788 0.274463 0.088 0.460 0.028 0.020 0.208 0.196
#> SRR772643 4 0.7401 0.156788 0.008 0.168 0.304 0.436 0.052 0.032
#> SRR772644 6 0.8663 0.027637 0.180 0.104 0.244 0.000 0.172 0.300
#> SRR772645 2 0.8180 0.180631 0.180 0.388 0.156 0.000 0.216 0.060
#> SRR772646 4 0.4777 0.678268 0.020 0.160 0.020 0.740 0.056 0.004
#> SRR772647 4 0.4113 0.676375 0.004 0.004 0.036 0.760 0.012 0.184
#> SRR772648 1 0.7713 0.027894 0.416 0.344 0.028 0.060 0.104 0.048
#> SRR772649 2 0.9176 0.045625 0.108 0.288 0.212 0.240 0.112 0.040
#> SRR772650 1 0.5792 0.356703 0.692 0.064 0.076 0.000 0.104 0.064
#> SRR772651 6 0.6822 0.420990 0.220 0.072 0.060 0.000 0.084 0.564
#> SRR772652 1 0.8218 0.261939 0.464 0.144 0.120 0.012 0.140 0.120
#> SRR772653 6 0.6698 0.350266 0.240 0.020 0.156 0.000 0.052 0.532
#> SRR772654 6 0.5869 0.401121 0.032 0.232 0.008 0.028 0.064 0.636
#> SRR772655 6 0.3878 0.485757 0.016 0.012 0.028 0.052 0.060 0.832
#> SRR772656 3 0.4483 0.629104 0.076 0.008 0.776 0.004 0.036 0.100
#> SRR772657 3 0.1405 0.684790 0.024 0.000 0.948 0.024 0.000 0.004
#> SRR772658 4 0.1321 0.753916 0.000 0.004 0.020 0.952 0.024 0.000
#> SRR772659 4 0.8467 -0.227835 0.124 0.120 0.004 0.332 0.300 0.120
#> SRR772660 1 0.7180 0.303872 0.480 0.120 0.264 0.000 0.116 0.020
#> SRR772661 3 0.3810 0.595087 0.008 0.276 0.708 0.004 0.004 0.000
#> SRR772662 1 0.6449 0.304690 0.584 0.088 0.060 0.000 0.232 0.036
#> SRR772663 5 0.8442 0.110176 0.224 0.244 0.092 0.004 0.340 0.096
#> SRR772664 4 0.7351 0.361985 0.152 0.036 0.168 0.544 0.080 0.020
#> SRR772665 2 0.8448 0.123502 0.328 0.352 0.064 0.044 0.136 0.076
#> SRR772666 3 0.2454 0.661695 0.104 0.000 0.876 0.004 0.016 0.000
#> SRR772667 1 0.7056 0.276015 0.472 0.028 0.208 0.000 0.248 0.044
#> SRR772668 6 0.9977 -0.121058 0.168 0.176 0.168 0.168 0.136 0.184
#> SRR772669 6 0.9977 -0.121058 0.168 0.176 0.168 0.168 0.136 0.184
#> SRR772670 1 0.7662 0.208983 0.440 0.216 0.076 0.000 0.216 0.052
#> SRR772671 6 0.6962 0.240124 0.232 0.048 0.024 0.000 0.204 0.492
#> SRR772672 1 0.8097 0.214166 0.348 0.124 0.324 0.016 0.160 0.028
#> SRR772673 2 0.6150 0.365406 0.188 0.616 0.012 0.000 0.108 0.076
#> SRR772674 3 0.3817 0.561918 0.228 0.008 0.744 0.004 0.016 0.000
#> SRR772675 3 0.2660 0.682525 0.008 0.100 0.872 0.016 0.004 0.000
#> SRR772676 6 0.7920 0.119178 0.220 0.048 0.008 0.264 0.068 0.392
#> SRR772677 1 0.6495 0.130352 0.552 0.028 0.004 0.128 0.260 0.028
#> SRR772678 3 0.3841 0.587823 0.004 0.276 0.708 0.004 0.004 0.004
#> SRR772679 2 0.8520 0.183310 0.168 0.408 0.032 0.080 0.224 0.088
#> SRR772680 6 0.7003 0.225710 0.296 0.024 0.128 0.000 0.072 0.480
#> SRR772681 3 0.4313 0.528795 0.240 0.004 0.712 0.016 0.028 0.000
#> SRR772682 4 0.7701 -0.080463 0.200 0.020 0.000 0.376 0.120 0.284
#> SRR772683 2 0.7019 0.317433 0.080 0.580 0.004 0.148 0.064 0.124
#> SRR772685 3 0.8048 -0.015161 0.124 0.036 0.360 0.336 0.128 0.016
#> SRR772686 3 0.1897 0.675784 0.084 0.000 0.908 0.004 0.004 0.000
#> SRR772687 3 0.5766 0.466309 0.144 0.236 0.596 0.000 0.016 0.008
#> SRR772688 4 0.1340 0.754893 0.000 0.000 0.008 0.948 0.040 0.004
#> SRR772689 4 0.3971 0.720650 0.096 0.028 0.012 0.816 0.040 0.008
#> SRR772690 3 0.1152 0.682315 0.044 0.000 0.952 0.004 0.000 0.000
#> SRR772691 3 0.3702 0.650978 0.000 0.164 0.784 0.044 0.008 0.000
#> SRR772692 1 0.7179 0.155525 0.428 0.024 0.076 0.000 0.336 0.136
#> SRR772693 3 0.7873 0.360532 0.088 0.144 0.512 0.148 0.088 0.020
#> SRR772694 4 0.6923 0.481628 0.012 0.124 0.096 0.572 0.020 0.176
#> SRR772695 6 0.7722 0.051961 0.304 0.104 0.008 0.012 0.208 0.364
#> SRR772696 1 0.7218 0.270703 0.516 0.052 0.168 0.040 0.216 0.008
#> SRR772697 4 0.7705 -0.153991 0.348 0.032 0.016 0.380 0.160 0.064
#> SRR772698 3 0.3599 0.632226 0.020 0.220 0.756 0.000 0.000 0.004
#> SRR772699 2 0.4779 0.419715 0.112 0.744 0.016 0.000 0.024 0.104
#> SRR772700 2 0.6875 0.322315 0.092 0.528 0.020 0.000 0.120 0.240
#> SRR772701 6 0.7171 0.166273 0.220 0.060 0.020 0.000 0.248 0.452
#> SRR772702 2 0.7409 0.166696 0.100 0.420 0.004 0.008 0.276 0.192
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.179 0.596 0.758 0.3874 0.591 0.591
#> 3 3 0.243 0.572 0.769 0.3960 0.608 0.482
#> 4 4 0.327 0.678 0.781 0.1889 0.761 0.568
#> 5 5 0.399 0.641 0.763 0.0713 0.961 0.888
#> 6 6 0.416 0.609 0.741 0.0406 0.985 0.955
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.992 0.7698 0.552 0.448
#> SRR772342 1 0.992 0.7686 0.552 0.448
#> SRR772343 2 0.861 0.3135 0.284 0.716
#> SRR772344 2 0.163 0.7042 0.024 0.976
#> SRR772345 2 0.141 0.7068 0.020 0.980
#> SRR772346 2 0.833 0.3784 0.264 0.736
#> SRR772347 2 0.876 0.2724 0.296 0.704
#> SRR772348 2 0.430 0.6859 0.088 0.912
#> SRR772349 2 0.416 0.6877 0.084 0.916
#> SRR772350 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772351 2 0.204 0.7092 0.032 0.968
#> SRR772352 2 0.278 0.7046 0.048 0.952
#> SRR772353 2 0.595 0.6318 0.144 0.856
#> SRR772354 2 0.595 0.6318 0.144 0.856
#> SRR772355 2 0.295 0.7102 0.052 0.948
#> SRR772356 2 0.278 0.7102 0.048 0.952
#> SRR772357 2 0.995 -0.4906 0.460 0.540
#> SRR772358 2 0.991 -0.4275 0.444 0.556
#> SRR772359 2 0.876 0.2723 0.296 0.704
#> SRR772360 2 0.775 0.4792 0.228 0.772
#> SRR772361 1 0.855 0.8499 0.720 0.280
#> SRR772362 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772363 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772364 2 0.943 0.1042 0.360 0.640
#> SRR772365 2 0.861 0.3971 0.284 0.716
#> SRR772366 1 0.850 0.8488 0.724 0.276
#> SRR772367 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772368 2 0.402 0.7088 0.080 0.920
#> SRR772369 2 0.552 0.6513 0.128 0.872
#> SRR772370 2 0.518 0.6620 0.116 0.884
#> SRR772371 2 0.850 0.4101 0.276 0.724
#> SRR772372 2 0.844 0.4220 0.272 0.728
#> SRR772373 2 0.204 0.7085 0.032 0.968
#> SRR772374 2 0.204 0.7072 0.032 0.968
#> SRR772375 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772376 2 0.204 0.7015 0.032 0.968
#> SRR772377 2 0.939 0.0788 0.356 0.644
#> SRR772378 2 0.821 0.4035 0.256 0.744
#> SRR772379 2 0.584 0.6259 0.140 0.860
#> SRR772380 2 0.714 0.5401 0.196 0.804
#> SRR772381 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772382 1 0.993 0.7547 0.548 0.452
#> SRR772383 1 0.996 0.7267 0.536 0.464
#> SRR772384 2 0.978 -0.2522 0.412 0.588
#> SRR772385 2 0.552 0.6972 0.128 0.872
#> SRR772386 2 0.260 0.7065 0.044 0.956
#> SRR772387 2 0.278 0.7053 0.048 0.952
#> SRR772388 1 0.929 0.8668 0.656 0.344
#> SRR772389 1 0.936 0.8652 0.648 0.352
#> SRR772390 1 0.855 0.8502 0.720 0.280
#> SRR772391 1 0.969 0.8385 0.604 0.396
#> SRR772392 1 0.971 0.8349 0.600 0.400
#> SRR772393 2 0.518 0.6942 0.116 0.884
#> SRR772394 2 0.529 0.6890 0.120 0.880
#> SRR772395 2 0.327 0.7061 0.060 0.940
#> SRR772396 1 0.955 0.8557 0.624 0.376
#> SRR772397 1 0.946 0.8627 0.636 0.364
#> SRR772398 2 0.955 -0.1196 0.376 0.624
#> SRR772399 2 0.955 -0.1196 0.376 0.624
#> SRR772400 1 0.936 0.8657 0.648 0.352
#> SRR772401 1 0.943 0.8637 0.640 0.360
#> SRR772402 2 0.808 0.5927 0.248 0.752
#> SRR772403 2 0.808 0.5930 0.248 0.752
#> SRR772404 2 0.430 0.7059 0.088 0.912
#> SRR772405 2 0.966 -0.1841 0.392 0.608
#> SRR772406 2 0.260 0.6998 0.044 0.956
#> SRR772407 2 0.224 0.7017 0.036 0.964
#> SRR772408 2 0.827 0.5854 0.260 0.740
#> SRR772409 2 0.827 0.5854 0.260 0.740
#> SRR772410 2 0.671 0.5697 0.176 0.824
#> SRR772411 2 0.671 0.5697 0.176 0.824
#> SRR772412 1 0.966 0.8424 0.608 0.392
#> SRR772413 1 0.966 0.8424 0.608 0.392
#> SRR772414 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772415 2 0.443 0.6813 0.092 0.908
#> SRR772416 2 0.416 0.6912 0.084 0.916
#> SRR772417 2 0.861 0.3135 0.284 0.716
#> SRR772418 1 0.855 0.8502 0.720 0.280
#> SRR772419 2 0.671 0.6340 0.176 0.824
#> SRR772420 2 0.671 0.6340 0.176 0.824
#> SRR772421 2 0.443 0.6746 0.092 0.908
#> SRR772422 2 0.443 0.6746 0.092 0.908
#> SRR772423 2 0.802 0.5957 0.244 0.756
#> SRR772424 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772425 2 0.163 0.7059 0.024 0.976
#> SRR772426 2 0.163 0.7072 0.024 0.976
#> SRR772427 2 0.163 0.7072 0.024 0.976
#> SRR772428 1 0.913 0.8662 0.672 0.328
#> SRR772429 1 0.929 0.8664 0.656 0.344
#> SRR772430 2 0.574 0.6436 0.136 0.864
#> SRR772431 2 0.788 0.6003 0.236 0.764
#> SRR772432 2 0.788 0.6003 0.236 0.764
#> SRR772433 1 0.909 0.8657 0.676 0.324
#> SRR772434 1 0.904 0.8650 0.680 0.320
#> SRR772435 2 0.839 0.3749 0.268 0.732
#> SRR772436 2 0.844 0.3629 0.272 0.728
#> SRR772437 1 0.839 0.8434 0.732 0.268
#> SRR772438 1 0.961 0.8498 0.616 0.384
#> SRR772439 1 0.946 0.8611 0.636 0.364
#> SRR772440 2 0.388 0.6862 0.076 0.924
#> SRR772441 2 0.311 0.6935 0.056 0.944
#> SRR772442 2 0.767 0.6072 0.224 0.776
#> SRR772443 2 0.788 0.6073 0.236 0.764
#> SRR772444 1 0.969 0.8390 0.604 0.396
#> SRR772445 1 0.961 0.8490 0.616 0.384
#> SRR772446 1 0.993 0.7567 0.548 0.452
#> SRR772447 1 0.994 0.7480 0.544 0.456
#> SRR772448 2 0.416 0.6875 0.084 0.916
#> SRR772449 2 0.311 0.6983 0.056 0.944
#> SRR772450 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772451 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772452 1 0.971 0.8354 0.600 0.400
#> SRR772453 1 0.990 0.7821 0.560 0.440
#> SRR772454 2 0.971 -0.2276 0.400 0.600
#> SRR772455 2 0.850 0.3404 0.276 0.724
#> SRR772456 2 0.821 0.5884 0.256 0.744
#> SRR772457 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772458 1 0.996 0.7253 0.536 0.464
#> SRR772459 1 0.992 0.7614 0.552 0.448
#> SRR772460 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772461 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772462 2 0.242 0.7083 0.040 0.960
#> SRR772463 2 0.242 0.7083 0.040 0.960
#> SRR772464 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772465 2 0.605 0.6172 0.148 0.852
#> SRR772466 2 0.574 0.6329 0.136 0.864
#> SRR772467 2 0.753 0.6130 0.216 0.784
#> SRR772468 2 0.753 0.6130 0.216 0.784
#> SRR772469 2 0.975 -0.2680 0.408 0.592
#> SRR772470 2 0.985 -0.3582 0.428 0.572
#> SRR772471 2 0.952 -0.0991 0.372 0.628
#> SRR772472 2 0.975 -0.2753 0.408 0.592
#> SRR772473 2 0.767 0.6135 0.224 0.776
#> SRR772474 2 0.781 0.6051 0.232 0.768
#> SRR772475 2 0.552 0.6972 0.128 0.872
#> SRR772476 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772477 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772478 1 0.963 0.8453 0.612 0.388
#> SRR772479 1 0.966 0.8418 0.608 0.392
#> SRR772480 2 0.714 0.6700 0.196 0.804
#> SRR772481 2 0.730 0.6699 0.204 0.796
#> SRR772482 1 0.999 0.6779 0.516 0.484
#> SRR772483 1 0.999 0.6779 0.516 0.484
#> SRR772484 2 0.402 0.6884 0.080 0.920
#> SRR772485 2 0.402 0.6884 0.080 0.920
#> SRR772486 1 0.981 0.8095 0.580 0.420
#> SRR772487 1 0.981 0.8095 0.580 0.420
#> SRR772488 2 0.584 0.6310 0.140 0.860
#> SRR772489 2 0.584 0.6310 0.140 0.860
#> SRR772490 1 0.992 0.7646 0.552 0.448
#> SRR772491 1 0.987 0.7929 0.568 0.432
#> SRR772492 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772493 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772494 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772495 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772496 2 0.311 0.6993 0.056 0.944
#> SRR772497 2 0.311 0.6993 0.056 0.944
#> SRR772498 2 0.574 0.6891 0.136 0.864
#> SRR772499 2 0.563 0.6889 0.132 0.868
#> SRR772500 2 0.295 0.6975 0.052 0.948
#> SRR772501 2 0.295 0.6975 0.052 0.948
#> SRR772502 2 0.871 0.2861 0.292 0.708
#> SRR772503 2 0.876 0.2712 0.296 0.704
#> SRR772504 2 0.118 0.7075 0.016 0.984
#> SRR772505 2 0.118 0.7075 0.016 0.984
#> SRR772506 2 0.745 0.6153 0.212 0.788
#> SRR772507 2 0.745 0.6153 0.212 0.788
#> SRR772508 2 0.388 0.7094 0.076 0.924
#> SRR772509 2 0.966 -0.1592 0.392 0.608
#> SRR772510 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772511 2 0.861 0.3135 0.284 0.716
#> SRR772512 1 0.909 0.8485 0.676 0.324
#> SRR772513 2 0.278 0.7087 0.048 0.952
#> SRR772514 2 0.278 0.7087 0.048 0.952
#> SRR772515 2 0.141 0.7073 0.020 0.980
#> SRR772516 2 0.118 0.7072 0.016 0.984
#> SRR772517 2 0.327 0.7009 0.060 0.940
#> SRR772518 2 0.327 0.7009 0.060 0.940
#> SRR772519 2 0.163 0.7076 0.024 0.976
#> SRR772520 2 0.163 0.7076 0.024 0.976
#> SRR772521 2 0.722 0.5317 0.200 0.800
#> SRR772522 2 0.767 0.4864 0.224 0.776
#> SRR772523 2 0.141 0.7084 0.020 0.980
#> SRR772524 2 0.141 0.7084 0.020 0.980
#> SRR772525 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772526 2 0.745 0.6153 0.212 0.788
#> SRR772527 2 0.745 0.6153 0.212 0.788
#> SRR772528 1 0.850 0.8488 0.724 0.276
#> SRR772529 1 0.993 0.7560 0.548 0.452
#> SRR772530 2 0.999 -0.5637 0.480 0.520
#> SRR772531 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772532 2 0.118 0.7069 0.016 0.984
#> SRR772533 2 0.118 0.7069 0.016 0.984
#> SRR772534 2 0.881 0.2529 0.300 0.700
#> SRR772535 2 0.278 0.7082 0.048 0.952
#> SRR772536 2 0.278 0.7005 0.048 0.952
#> SRR772537 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772538 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772539 1 0.990 0.7813 0.560 0.440
#> SRR772540 1 0.991 0.7748 0.556 0.444
#> SRR772541 2 0.416 0.6905 0.084 0.916
#> SRR772542 1 0.988 0.7839 0.564 0.436
#> SRR772543 1 0.975 0.8257 0.592 0.408
#> SRR772544 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772545 1 0.993 0.7548 0.548 0.452
#> SRR772546 1 0.993 0.7548 0.548 0.452
#> SRR772547 2 0.881 0.2547 0.300 0.700
#> SRR772548 2 0.963 -0.1786 0.388 0.612
#> SRR772549 1 0.981 0.8116 0.580 0.420
#> SRR772550 1 0.973 0.8307 0.596 0.404
#> SRR772551 2 0.595 0.6241 0.144 0.856
#> SRR772552 2 0.563 0.6525 0.132 0.868
#> SRR772553 2 0.625 0.6631 0.156 0.844
#> SRR772554 2 0.141 0.7074 0.020 0.980
#> SRR772555 2 0.141 0.7074 0.020 0.980
#> SRR772556 1 0.983 0.8052 0.576 0.424
#> SRR772557 1 0.975 0.8267 0.592 0.408
#> SRR772558 2 0.980 -0.3116 0.416 0.584
#> SRR772559 2 0.992 -0.4463 0.448 0.552
#> SRR772560 2 0.605 0.6260 0.148 0.852
#> SRR772561 1 0.909 0.8485 0.676 0.324
#> SRR772562 2 0.242 0.7085 0.040 0.960
#> SRR772563 2 0.242 0.7085 0.040 0.960
#> SRR772564 1 0.929 0.8672 0.656 0.344
#> SRR772565 1 0.929 0.8672 0.656 0.344
#> SRR772566 1 0.900 0.8644 0.684 0.316
#> SRR772567 1 0.900 0.8644 0.684 0.316
#> SRR772568 2 0.224 0.7091 0.036 0.964
#> SRR772569 2 0.224 0.7091 0.036 0.964
#> SRR772570 2 0.992 -0.4456 0.448 0.552
#> SRR772571 2 0.994 -0.4764 0.456 0.544
#> SRR772572 2 0.767 0.4752 0.224 0.776
#> SRR772573 2 0.745 0.5008 0.212 0.788
#> SRR772574 2 0.987 -0.3797 0.432 0.568
#> SRR772575 2 0.983 -0.3473 0.424 0.576
#> SRR772576 2 0.456 0.6696 0.096 0.904
#> SRR772577 2 0.456 0.6722 0.096 0.904
#> SRR772578 2 0.814 0.5910 0.252 0.748
#> SRR772579 2 0.814 0.5910 0.252 0.748
#> SRR772580 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772581 2 0.625 0.6386 0.156 0.844
#> SRR772582 2 0.634 0.6418 0.160 0.840
#> SRR772583 2 0.605 0.6269 0.148 0.852
#> SRR772584 2 0.584 0.6368 0.140 0.860
#> SRR772585 2 0.373 0.7009 0.072 0.928
#> SRR772586 1 0.855 0.8502 0.720 0.280
#> SRR772587 2 0.904 0.1700 0.320 0.680
#> SRR772588 2 0.204 0.7067 0.032 0.968
#> SRR772589 2 0.204 0.7067 0.032 0.968
#> SRR772590 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772591 1 0.900 0.8644 0.684 0.316
#> SRR772592 1 0.900 0.8644 0.684 0.316
#> SRR772593 1 0.855 0.8502 0.720 0.280
#> SRR772594 2 0.821 0.5886 0.256 0.744
#> SRR772595 2 0.821 0.5886 0.256 0.744
#> SRR772596 1 0.850 0.8488 0.724 0.276
#> SRR772597 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772598 1 0.917 0.8667 0.668 0.332
#> SRR772599 1 0.921 0.8668 0.664 0.336
#> SRR772600 2 0.795 0.6020 0.240 0.760
#> SRR772601 2 0.788 0.6003 0.236 0.764
#> SRR772602 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772603 2 0.781 0.6021 0.232 0.768
#> SRR772604 2 0.788 0.6003 0.236 0.764
#> SRR772605 2 0.494 0.6689 0.108 0.892
#> SRR772606 1 0.943 0.8634 0.640 0.360
#> SRR772607 1 0.946 0.8620 0.636 0.364
#> SRR772608 2 0.388 0.6835 0.076 0.924
#> SRR772609 2 0.388 0.6835 0.076 0.924
#> SRR772610 2 0.224 0.7056 0.036 0.964
#> SRR772611 2 0.242 0.7046 0.040 0.960
#> SRR772612 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772613 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772614 1 0.952 0.8589 0.628 0.372
#> SRR772615 1 0.932 0.8667 0.652 0.348
#> SRR772616 2 0.886 0.2355 0.304 0.696
#> SRR772617 2 0.821 0.5876 0.256 0.744
#> SRR772618 2 0.821 0.5876 0.256 0.744
#> SRR772619 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772620 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772621 2 0.584 0.6279 0.140 0.860
#> SRR772622 2 0.541 0.6453 0.124 0.876
#> SRR772623 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772624 1 0.855 0.8502 0.720 0.280
#> SRR772625 2 0.552 0.6972 0.128 0.872
#> SRR772626 2 0.574 0.6892 0.136 0.864
#> SRR772627 2 0.584 0.6808 0.140 0.860
#> SRR772628 1 1.000 0.6522 0.508 0.492
#> SRR772629 2 0.998 -0.5519 0.476 0.524
#> SRR772630 2 0.881 0.2576 0.300 0.700
#> SRR772631 1 0.850 0.8488 0.724 0.276
#> SRR772632 2 0.529 0.6628 0.120 0.880
#> SRR772633 2 0.529 0.6628 0.120 0.880
#> SRR772634 2 0.730 0.5277 0.204 0.796
#> SRR772635 2 0.738 0.5206 0.208 0.792
#> SRR772636 2 0.552 0.6972 0.128 0.872
#> SRR772637 1 0.952 0.8573 0.628 0.372
#> SRR772638 1 0.952 0.8573 0.628 0.372
#> SRR772639 2 0.163 0.7059 0.024 0.976
#> SRR772640 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772641 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772642 2 0.456 0.6792 0.096 0.904
#> SRR772643 2 0.373 0.6924 0.072 0.928
#> SRR772644 2 0.983 -0.3461 0.424 0.576
#> SRR772645 2 0.990 -0.4121 0.440 0.560
#> SRR772646 2 0.118 0.7070 0.016 0.984
#> SRR772647 2 0.118 0.7070 0.016 0.984
#> SRR772648 2 0.373 0.6877 0.072 0.928
#> SRR772649 2 0.327 0.6941 0.060 0.940
#> SRR772650 2 0.775 0.4753 0.228 0.772
#> SRR772651 2 0.775 0.4753 0.228 0.772
#> SRR772652 1 0.990 0.7759 0.560 0.440
#> SRR772653 1 0.990 0.7759 0.560 0.440
#> SRR772654 2 0.605 0.6173 0.148 0.852
#> SRR772655 2 0.625 0.6094 0.156 0.844
#> SRR772656 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772657 1 0.855 0.8499 0.720 0.280
#> SRR772658 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772659 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772660 2 0.260 0.7007 0.044 0.956
#> SRR772661 2 1.000 -0.5579 0.492 0.508
#> SRR772662 2 0.814 0.4140 0.252 0.748
#> SRR772663 2 0.821 0.4024 0.256 0.744
#> SRR772664 2 0.311 0.7037 0.056 0.944
#> SRR772665 2 0.327 0.7050 0.060 0.940
#> SRR772666 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772667 2 0.625 0.6546 0.156 0.844
#> SRR772668 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772669 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772670 2 0.738 0.5165 0.208 0.792
#> SRR772671 2 0.795 0.4443 0.240 0.760
#> SRR772672 2 0.295 0.7092 0.052 0.948
#> SRR772673 2 0.295 0.7092 0.052 0.948
#> SRR772674 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772675 2 0.966 -0.1841 0.392 0.608
#> SRR772676 2 0.662 0.5784 0.172 0.828
#> SRR772677 2 0.671 0.5725 0.176 0.824
#> SRR772678 2 0.978 -0.2522 0.412 0.588
#> SRR772679 2 0.753 0.5034 0.216 0.784
#> SRR772680 2 0.767 0.4874 0.224 0.776
#> SRR772681 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772682 2 0.242 0.7069 0.040 0.960
#> SRR772683 2 0.260 0.7091 0.044 0.956
#> SRR772685 2 0.141 0.7074 0.020 0.980
#> SRR772686 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772687 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772688 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772689 2 0.833 0.5824 0.264 0.736
#> SRR772690 1 0.833 0.8417 0.736 0.264
#> SRR772691 2 0.552 0.6972 0.128 0.872
#> SRR772692 2 0.814 0.4158 0.252 0.748
#> SRR772693 2 0.689 0.5781 0.184 0.816
#> SRR772694 2 0.295 0.7049 0.052 0.948
#> SRR772695 2 0.482 0.6717 0.104 0.896
#> SRR772696 2 0.373 0.6860 0.072 0.928
#> SRR772697 2 0.373 0.6860 0.072 0.928
#> SRR772698 1 0.850 0.8488 0.724 0.276
#> SRR772699 1 0.998 0.6967 0.524 0.476
#> SRR772700 1 0.998 0.7075 0.528 0.472
#> SRR772701 2 0.995 -0.4940 0.460 0.540
#> SRR772702 2 0.999 -0.5766 0.484 0.516
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.6104 0.2901 0.648 0.004 0.348
#> SRR772342 1 0.5859 0.2920 0.656 0.000 0.344
#> SRR772343 1 0.4289 0.6577 0.868 0.040 0.092
#> SRR772344 1 0.5835 0.5228 0.660 0.340 0.000
#> SRR772345 1 0.5733 0.5449 0.676 0.324 0.000
#> SRR772346 1 0.5093 0.6739 0.836 0.076 0.088
#> SRR772347 1 0.5212 0.6549 0.828 0.064 0.108
#> SRR772348 1 0.6126 0.4042 0.600 0.400 0.000
#> SRR772349 1 0.6126 0.4077 0.600 0.400 0.000
#> SRR772350 3 0.0237 0.7896 0.000 0.004 0.996
#> SRR772351 1 0.5678 0.5545 0.684 0.316 0.000
#> SRR772352 1 0.5216 0.6073 0.740 0.260 0.000
#> SRR772353 1 0.3845 0.6838 0.872 0.116 0.012
#> SRR772354 1 0.3845 0.6838 0.872 0.116 0.012
#> SRR772355 1 0.5560 0.5814 0.700 0.300 0.000
#> SRR772356 1 0.5560 0.5803 0.700 0.300 0.000
#> SRR772357 1 0.4974 0.4791 0.764 0.000 0.236
#> SRR772358 1 0.5070 0.5030 0.772 0.004 0.224
#> SRR772359 1 0.4526 0.6561 0.856 0.040 0.104
#> SRR772360 1 0.5423 0.6952 0.820 0.096 0.084
#> SRR772361 3 0.3425 0.7818 0.112 0.004 0.884
#> SRR772362 2 0.1643 0.8757 0.044 0.956 0.000
#> SRR772363 2 0.1643 0.8757 0.044 0.956 0.000
#> SRR772364 1 0.7865 0.5682 0.660 0.124 0.216
#> SRR772365 1 0.6659 0.6649 0.752 0.132 0.116
#> SRR772366 3 0.3752 0.7778 0.144 0.000 0.856
#> SRR772367 3 0.0000 0.7925 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 1 0.5363 0.5995 0.724 0.276 0.000
#> SRR772369 1 0.4979 0.6740 0.812 0.168 0.020
#> SRR772370 1 0.5008 0.6692 0.804 0.180 0.016
#> SRR772371 1 0.5260 0.6756 0.828 0.092 0.080
#> SRR772372 1 0.5339 0.6777 0.824 0.096 0.080
#> SRR772373 1 0.5623 0.5917 0.716 0.280 0.004
#> SRR772374 1 0.5553 0.5984 0.724 0.272 0.004
#> SRR772375 3 0.0000 0.7925 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 1 0.5926 0.5008 0.644 0.356 0.000
#> SRR772377 1 0.7014 0.5341 0.712 0.080 0.208
#> SRR772378 1 0.4458 0.6758 0.864 0.056 0.080
#> SRR772379 1 0.4540 0.6867 0.848 0.124 0.028
#> SRR772380 1 0.4146 0.6927 0.876 0.080 0.044
#> SRR772381 3 0.0661 0.7947 0.008 0.004 0.988
#> SRR772382 1 0.5948 0.2767 0.640 0.000 0.360
#> SRR772383 1 0.6148 0.2934 0.640 0.004 0.356
#> SRR772384 1 0.6684 0.4417 0.676 0.032 0.292
#> SRR772385 1 0.5835 0.4992 0.660 0.340 0.000
#> SRR772386 1 0.5404 0.6109 0.740 0.256 0.004
#> SRR772387 1 0.5365 0.6148 0.744 0.252 0.004
#> SRR772388 1 0.6302 -0.1262 0.520 0.000 0.480
#> SRR772389 1 0.6295 -0.1089 0.528 0.000 0.472
#> SRR772390 3 0.3816 0.7752 0.148 0.000 0.852
#> SRR772391 1 0.6204 0.0741 0.576 0.000 0.424
#> SRR772392 1 0.6192 0.0872 0.580 0.000 0.420
#> SRR772393 1 0.5502 0.6213 0.744 0.248 0.008
#> SRR772394 1 0.5378 0.6332 0.756 0.236 0.008
#> SRR772395 1 0.5785 0.5365 0.668 0.332 0.000
#> SRR772396 1 0.6244 0.0132 0.560 0.000 0.440
#> SRR772397 1 0.6286 -0.0530 0.536 0.000 0.464
#> SRR772398 1 0.4228 0.5880 0.844 0.008 0.148
#> SRR772399 1 0.4228 0.5880 0.844 0.008 0.148
#> SRR772400 1 0.6308 -0.1580 0.508 0.000 0.492
#> SRR772401 1 0.6295 -0.0979 0.528 0.000 0.472
#> SRR772402 2 0.3879 0.8248 0.152 0.848 0.000
#> SRR772403 2 0.4121 0.8115 0.168 0.832 0.000
#> SRR772404 1 0.5706 0.5477 0.680 0.320 0.000
#> SRR772405 1 0.6264 0.5025 0.716 0.028 0.256
#> SRR772406 1 0.5016 0.6273 0.760 0.240 0.000
#> SRR772407 1 0.5016 0.6226 0.760 0.240 0.000
#> SRR772408 2 0.2066 0.8754 0.060 0.940 0.000
#> SRR772409 2 0.2066 0.8754 0.060 0.940 0.000
#> SRR772410 1 0.5507 0.6892 0.808 0.136 0.056
#> SRR772411 1 0.5507 0.6892 0.808 0.136 0.056
#> SRR772412 1 0.6252 0.0123 0.556 0.000 0.444
#> SRR772413 1 0.6252 0.0123 0.556 0.000 0.444
#> SRR772414 3 0.0237 0.7947 0.004 0.000 0.996
#> SRR772415 1 0.5167 0.6644 0.792 0.192 0.016
#> SRR772416 1 0.5171 0.6562 0.784 0.204 0.012
#> SRR772417 1 0.4479 0.6586 0.860 0.044 0.096
#> SRR772418 3 0.4002 0.7653 0.160 0.000 0.840
#> SRR772419 2 0.5291 0.6336 0.268 0.732 0.000
#> SRR772420 2 0.5291 0.6336 0.268 0.732 0.000
#> SRR772421 1 0.4531 0.6655 0.824 0.168 0.008
#> SRR772422 1 0.4531 0.6655 0.824 0.168 0.008
#> SRR772423 2 0.2878 0.8563 0.096 0.904 0.000
#> SRR772424 2 0.1163 0.8649 0.028 0.972 0.000
#> SRR772425 1 0.5650 0.5533 0.688 0.312 0.000
#> SRR772426 1 0.5810 0.5324 0.664 0.336 0.000
#> SRR772427 1 0.5810 0.5324 0.664 0.336 0.000
#> SRR772428 3 0.6308 0.2021 0.492 0.000 0.508
#> SRR772429 1 0.6308 -0.1691 0.508 0.000 0.492
#> SRR772430 1 0.4615 0.6824 0.836 0.144 0.020
#> SRR772431 2 0.4291 0.8020 0.180 0.820 0.000
#> SRR772432 2 0.4291 0.8020 0.180 0.820 0.000
#> SRR772433 3 0.6295 0.2578 0.472 0.000 0.528
#> SRR772434 3 0.6291 0.2661 0.468 0.000 0.532
#> SRR772435 1 0.5998 0.6667 0.788 0.084 0.128
#> SRR772436 1 0.5915 0.6645 0.792 0.080 0.128
#> SRR772437 3 0.1765 0.7938 0.040 0.004 0.956
#> SRR772438 1 0.6204 0.0692 0.576 0.000 0.424
#> SRR772439 1 0.6286 -0.0846 0.536 0.000 0.464
#> SRR772440 1 0.5020 0.6561 0.796 0.192 0.012
#> SRR772441 1 0.4978 0.6410 0.780 0.216 0.004
#> SRR772442 2 0.4452 0.7886 0.192 0.808 0.000
#> SRR772443 2 0.4504 0.7891 0.196 0.804 0.000
#> SRR772444 1 0.6204 0.0928 0.576 0.000 0.424
#> SRR772445 1 0.6235 0.0501 0.564 0.000 0.436
#> SRR772446 1 0.6057 0.3027 0.656 0.004 0.340
#> SRR772447 1 0.6033 0.3122 0.660 0.004 0.336
#> SRR772448 1 0.5366 0.6530 0.776 0.208 0.016
#> SRR772449 1 0.4887 0.6314 0.772 0.228 0.000
#> SRR772450 2 0.1753 0.8766 0.048 0.952 0.000
#> SRR772451 2 0.1753 0.8766 0.048 0.952 0.000
#> SRR772452 1 0.6126 0.1449 0.600 0.000 0.400
#> SRR772453 1 0.6104 0.2793 0.648 0.004 0.348
#> SRR772454 1 0.6761 0.5228 0.700 0.048 0.252
#> SRR772455 1 0.4121 0.6624 0.876 0.040 0.084
#> SRR772456 2 0.2165 0.8739 0.064 0.936 0.000
#> SRR772457 2 0.1964 0.8759 0.056 0.944 0.000
#> SRR772458 1 0.5926 0.2777 0.644 0.000 0.356
#> SRR772459 1 0.6026 0.2295 0.624 0.000 0.376
#> SRR772460 2 0.0424 0.8541 0.008 0.992 0.000
#> SRR772461 2 0.0424 0.8541 0.008 0.992 0.000
#> SRR772462 1 0.5529 0.5685 0.704 0.296 0.000
#> SRR772463 1 0.5529 0.5685 0.704 0.296 0.000
#> SRR772464 3 0.0237 0.7947 0.004 0.000 0.996
#> SRR772465 1 0.5119 0.6847 0.816 0.152 0.032
#> SRR772466 1 0.5119 0.6821 0.812 0.160 0.028
#> SRR772467 2 0.4002 0.7958 0.160 0.840 0.000
#> SRR772468 2 0.4002 0.7958 0.160 0.840 0.000
#> SRR772469 1 0.4968 0.5576 0.800 0.012 0.188
#> SRR772470 1 0.5461 0.5284 0.768 0.016 0.216
#> SRR772471 1 0.5053 0.5912 0.812 0.024 0.164
#> SRR772472 1 0.5356 0.5570 0.784 0.020 0.196
#> SRR772473 2 0.5138 0.7026 0.252 0.748 0.000
#> SRR772474 2 0.4796 0.7537 0.220 0.780 0.000
#> SRR772475 1 0.5835 0.4992 0.660 0.340 0.000
#> SRR772476 2 0.1753 0.8766 0.048 0.952 0.000
#> SRR772477 2 0.1643 0.8757 0.044 0.956 0.000
#> SRR772478 1 0.6225 0.0502 0.568 0.000 0.432
#> SRR772479 1 0.6215 0.0602 0.572 0.000 0.428
#> SRR772480 1 0.6879 0.2347 0.556 0.428 0.016
#> SRR772481 1 0.6713 0.2521 0.572 0.416 0.012
#> SRR772482 1 0.6307 0.3599 0.660 0.012 0.328
#> SRR772483 1 0.6307 0.3599 0.660 0.012 0.328
#> SRR772484 1 0.4682 0.6556 0.804 0.192 0.004
#> SRR772485 1 0.4682 0.6556 0.804 0.192 0.004
#> SRR772486 1 0.6209 0.2368 0.628 0.004 0.368
#> SRR772487 1 0.6209 0.2368 0.628 0.004 0.368
#> SRR772488 1 0.4551 0.6839 0.844 0.132 0.024
#> SRR772489 1 0.4551 0.6839 0.844 0.132 0.024
#> SRR772490 1 0.5859 0.3006 0.656 0.000 0.344
#> SRR772491 1 0.6062 0.2094 0.616 0.000 0.384
#> SRR772492 2 0.0237 0.8511 0.004 0.996 0.000
#> SRR772493 2 0.0237 0.8511 0.004 0.996 0.000
#> SRR772494 2 0.1643 0.8757 0.044 0.956 0.000
#> SRR772495 2 0.1753 0.8766 0.048 0.952 0.000
#> SRR772496 1 0.5201 0.6293 0.760 0.236 0.004
#> SRR772497 1 0.5201 0.6293 0.760 0.236 0.004
#> SRR772498 1 0.6341 0.5528 0.672 0.312 0.016
#> SRR772499 1 0.6341 0.5550 0.672 0.312 0.016
#> SRR772500 1 0.6079 0.4334 0.612 0.388 0.000
#> SRR772501 1 0.6045 0.4484 0.620 0.380 0.000
#> SRR772502 1 0.4092 0.6598 0.876 0.036 0.088
#> SRR772503 1 0.4369 0.6579 0.864 0.040 0.096
#> SRR772504 1 0.5529 0.5718 0.704 0.296 0.000
#> SRR772505 1 0.5560 0.5697 0.700 0.300 0.000
#> SRR772506 2 0.4178 0.7814 0.172 0.828 0.000
#> SRR772507 2 0.4178 0.7814 0.172 0.828 0.000
#> SRR772508 1 0.5621 0.5667 0.692 0.308 0.000
#> SRR772509 1 0.6303 0.5112 0.720 0.032 0.248
#> SRR772510 3 0.0237 0.7947 0.004 0.000 0.996
#> SRR772511 1 0.4399 0.6603 0.864 0.044 0.092
#> SRR772512 3 0.5156 0.7021 0.216 0.008 0.776
#> SRR772513 1 0.5216 0.6091 0.740 0.260 0.000
#> SRR772514 1 0.5216 0.6091 0.740 0.260 0.000
#> SRR772515 1 0.5465 0.5802 0.712 0.288 0.000
#> SRR772516 1 0.5497 0.5749 0.708 0.292 0.000
#> SRR772517 1 0.4750 0.6377 0.784 0.216 0.000
#> SRR772518 1 0.4750 0.6377 0.784 0.216 0.000
#> SRR772519 1 0.5397 0.5868 0.720 0.280 0.000
#> SRR772520 1 0.5431 0.5834 0.716 0.284 0.000
#> SRR772521 1 0.4423 0.6931 0.864 0.088 0.048
#> SRR772522 1 0.4469 0.6940 0.864 0.076 0.060
#> SRR772523 1 0.5733 0.5453 0.676 0.324 0.000
#> SRR772524 1 0.5678 0.5549 0.684 0.316 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.7925 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 2 0.4062 0.7903 0.164 0.836 0.000
#> SRR772527 2 0.4062 0.7903 0.164 0.836 0.000
#> SRR772528 3 0.3752 0.7778 0.144 0.000 0.856
#> SRR772529 1 0.5810 0.3166 0.664 0.000 0.336
#> SRR772530 1 0.5443 0.4571 0.736 0.004 0.260
#> SRR772531 3 0.0000 0.7925 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 1 0.5733 0.5485 0.676 0.324 0.000
#> SRR772533 1 0.5733 0.5485 0.676 0.324 0.000
#> SRR772534 1 0.4526 0.6498 0.856 0.040 0.104
#> SRR772535 1 0.5621 0.5705 0.692 0.308 0.000
#> SRR772536 1 0.5058 0.6191 0.756 0.244 0.000
#> SRR772537 2 0.1643 0.8761 0.044 0.956 0.000
#> SRR772538 2 0.1643 0.8761 0.044 0.956 0.000
#> SRR772539 1 0.5882 0.2749 0.652 0.000 0.348
#> SRR772540 1 0.5835 0.2898 0.660 0.000 0.340
#> SRR772541 1 0.4399 0.6560 0.812 0.188 0.000
#> SRR772542 1 0.6126 0.2831 0.644 0.004 0.352
#> SRR772543 1 0.6026 0.2059 0.624 0.000 0.376
#> SRR772544 3 0.0237 0.7947 0.004 0.000 0.996
#> SRR772545 1 0.5905 0.2762 0.648 0.000 0.352
#> SRR772546 1 0.5905 0.2762 0.648 0.000 0.352
#> SRR772547 1 0.4742 0.6524 0.848 0.048 0.104
#> SRR772548 1 0.5008 0.5687 0.804 0.016 0.180
#> SRR772549 1 0.6079 0.1897 0.612 0.000 0.388
#> SRR772550 1 0.6111 0.1509 0.604 0.000 0.396
#> SRR772551 1 0.4999 0.6836 0.820 0.152 0.028
#> SRR772552 1 0.4897 0.6756 0.812 0.172 0.016
#> SRR772553 1 0.6723 0.6047 0.704 0.248 0.048
#> SRR772554 1 0.5465 0.5804 0.712 0.288 0.000
#> SRR772555 1 0.5465 0.5804 0.712 0.288 0.000
#> SRR772556 1 0.6140 0.1536 0.596 0.000 0.404
#> SRR772557 1 0.6192 0.1031 0.580 0.000 0.420
#> SRR772558 1 0.4912 0.5414 0.796 0.008 0.196
#> SRR772559 1 0.5335 0.5038 0.760 0.008 0.232
#> SRR772560 1 0.4931 0.6866 0.828 0.140 0.032
#> SRR772561 3 0.5156 0.7021 0.216 0.008 0.776
#> SRR772562 1 0.5529 0.5703 0.704 0.296 0.000
#> SRR772563 1 0.5497 0.5726 0.708 0.292 0.000
#> SRR772564 3 0.6309 0.1748 0.500 0.000 0.500
#> SRR772565 3 0.6309 0.1748 0.500 0.000 0.500
#> SRR772566 3 0.6286 0.2787 0.464 0.000 0.536
#> SRR772567 3 0.6286 0.2787 0.464 0.000 0.536
#> SRR772568 1 0.5623 0.5904 0.716 0.280 0.004
#> SRR772569 1 0.5623 0.5904 0.716 0.280 0.004
#> SRR772570 1 0.5244 0.4929 0.756 0.004 0.240
#> SRR772571 1 0.5502 0.4758 0.744 0.008 0.248
#> SRR772572 1 0.4370 0.6895 0.868 0.076 0.056
#> SRR772573 1 0.4253 0.6919 0.872 0.080 0.048
#> SRR772574 1 0.4883 0.5238 0.788 0.004 0.208
#> SRR772575 1 0.5220 0.5342 0.780 0.012 0.208
#> SRR772576 1 0.4293 0.6666 0.832 0.164 0.004
#> SRR772577 1 0.5147 0.6671 0.800 0.180 0.020
#> SRR772578 2 0.2959 0.8628 0.100 0.900 0.000
#> SRR772579 2 0.2878 0.8647 0.096 0.904 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.7925 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.5253 0.6630 0.792 0.188 0.020
#> SRR772582 1 0.5253 0.6629 0.792 0.188 0.020
#> SRR772583 1 0.4609 0.6876 0.844 0.128 0.028
#> SRR772584 1 0.4139 0.6850 0.860 0.124 0.016
#> SRR772585 1 0.4842 0.6427 0.776 0.224 0.000
#> SRR772586 3 0.4002 0.7653 0.160 0.000 0.840
#> SRR772587 1 0.4397 0.6310 0.856 0.028 0.116
#> SRR772588 1 0.5706 0.5434 0.680 0.320 0.000
#> SRR772589 1 0.5706 0.5434 0.680 0.320 0.000
#> SRR772590 3 0.1647 0.7946 0.036 0.004 0.960
#> SRR772591 3 0.6291 0.2686 0.468 0.000 0.532
#> SRR772592 3 0.6295 0.2583 0.472 0.000 0.528
#> SRR772593 3 0.4002 0.7653 0.160 0.000 0.840
#> SRR772594 2 0.2711 0.8700 0.088 0.912 0.000
#> SRR772595 2 0.2711 0.8700 0.088 0.912 0.000
#> SRR772596 3 0.3752 0.7778 0.144 0.000 0.856
#> SRR772597 3 0.0000 0.7925 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 3 0.6291 0.2505 0.468 0.000 0.532
#> SRR772599 3 0.6286 0.2555 0.464 0.000 0.536
#> SRR772600 2 0.4452 0.7935 0.192 0.808 0.000
#> SRR772601 2 0.4178 0.8084 0.172 0.828 0.000
#> SRR772602 3 0.0475 0.7928 0.004 0.004 0.992
#> SRR772603 2 0.5016 0.7318 0.240 0.760 0.000
#> SRR772604 2 0.4504 0.7854 0.196 0.804 0.000
#> SRR772605 1 0.4840 0.6724 0.816 0.168 0.016
#> SRR772606 1 0.6280 -0.0642 0.540 0.000 0.460
#> SRR772607 1 0.6274 -0.0471 0.544 0.000 0.456
#> SRR772608 1 0.4521 0.6567 0.816 0.180 0.004
#> SRR772609 1 0.4521 0.6567 0.816 0.180 0.004
#> SRR772610 1 0.5254 0.6018 0.736 0.264 0.000
#> SRR772611 1 0.5216 0.6049 0.740 0.260 0.000
#> SRR772612 2 0.0892 0.8615 0.020 0.980 0.000
#> SRR772613 2 0.0592 0.8570 0.012 0.988 0.000
#> SRR772614 1 0.6244 0.0149 0.560 0.000 0.440
#> SRR772615 1 0.6307 -0.1470 0.512 0.000 0.488
#> SRR772616 1 0.4413 0.6450 0.860 0.036 0.104
#> SRR772617 2 0.2711 0.8588 0.088 0.912 0.000
#> SRR772618 2 0.2711 0.8588 0.088 0.912 0.000
#> SRR772619 2 0.0237 0.8511 0.004 0.996 0.000
#> SRR772620 2 0.0237 0.8511 0.004 0.996 0.000
#> SRR772621 1 0.5119 0.6834 0.816 0.152 0.032
#> SRR772622 1 0.4994 0.6782 0.816 0.160 0.024
#> SRR772623 3 0.0237 0.7896 0.000 0.004 0.996
#> SRR772624 3 0.3879 0.7722 0.152 0.000 0.848
#> SRR772625 1 0.5835 0.4992 0.660 0.340 0.000
#> SRR772626 1 0.6313 0.5561 0.676 0.308 0.016
#> SRR772627 1 0.6262 0.5818 0.696 0.284 0.020
#> SRR772628 1 0.6129 0.3597 0.668 0.008 0.324
#> SRR772629 1 0.5291 0.4439 0.732 0.000 0.268
#> SRR772630 1 0.4217 0.6486 0.868 0.032 0.100
#> SRR772631 3 0.3816 0.7760 0.148 0.000 0.852
#> SRR772632 2 0.6225 0.1448 0.432 0.568 0.000
#> SRR772633 2 0.6225 0.1448 0.432 0.568 0.000
#> SRR772634 1 0.4527 0.6945 0.860 0.088 0.052
#> SRR772635 1 0.5075 0.6948 0.836 0.096 0.068
#> SRR772636 1 0.5835 0.4992 0.660 0.340 0.000
#> SRR772637 1 0.6192 0.0671 0.580 0.000 0.420
#> SRR772638 1 0.6204 0.0581 0.576 0.000 0.424
#> SRR772639 1 0.5650 0.5533 0.688 0.312 0.000
#> SRR772640 2 0.1753 0.8766 0.048 0.952 0.000
#> SRR772641 2 0.1753 0.8766 0.048 0.952 0.000
#> SRR772642 1 0.5356 0.6616 0.784 0.196 0.020
#> SRR772643 1 0.5109 0.6465 0.780 0.212 0.008
#> SRR772644 1 0.5012 0.5337 0.788 0.008 0.204
#> SRR772645 1 0.5070 0.5101 0.772 0.004 0.224
#> SRR772646 1 0.5591 0.5603 0.696 0.304 0.000
#> SRR772647 1 0.5591 0.5603 0.696 0.304 0.000
#> SRR772648 1 0.4605 0.6471 0.796 0.204 0.000
#> SRR772649 1 0.4796 0.6386 0.780 0.220 0.000
#> SRR772650 1 0.4194 0.6879 0.876 0.064 0.060
#> SRR772651 1 0.4194 0.6879 0.876 0.064 0.060
#> SRR772652 1 0.6062 0.2155 0.616 0.000 0.384
#> SRR772653 1 0.6062 0.2155 0.616 0.000 0.384
#> SRR772654 1 0.4483 0.6851 0.848 0.128 0.024
#> SRR772655 1 0.4799 0.6863 0.836 0.132 0.032
#> SRR772656 3 0.0661 0.7947 0.008 0.004 0.988
#> SRR772657 3 0.3425 0.7818 0.112 0.004 0.884
#> SRR772658 2 0.1163 0.8631 0.028 0.972 0.000
#> SRR772659 2 0.1163 0.8631 0.028 0.972 0.000
#> SRR772660 1 0.5115 0.6396 0.768 0.228 0.004
#> SRR772661 1 0.6950 0.1663 0.572 0.020 0.408
#> SRR772662 1 0.4914 0.6812 0.844 0.068 0.088
#> SRR772663 1 0.3875 0.6764 0.888 0.044 0.068
#> SRR772664 1 0.5365 0.6243 0.744 0.252 0.004
#> SRR772665 1 0.5178 0.6204 0.744 0.256 0.000
#> SRR772666 3 0.0237 0.7947 0.004 0.000 0.996
#> SRR772667 2 0.6215 0.1983 0.428 0.572 0.000
#> SRR772668 2 0.0237 0.8511 0.004 0.996 0.000
#> SRR772669 2 0.0237 0.8511 0.004 0.996 0.000
#> SRR772670 1 0.4458 0.6932 0.864 0.080 0.056
#> SRR772671 1 0.4925 0.6845 0.844 0.076 0.080
#> SRR772672 1 0.5621 0.5668 0.692 0.308 0.000
#> SRR772673 1 0.5621 0.5668 0.692 0.308 0.000
#> SRR772674 3 0.0661 0.7947 0.008 0.004 0.988
#> SRR772675 1 0.6264 0.5025 0.716 0.028 0.256
#> SRR772676 1 0.4045 0.6898 0.872 0.104 0.024
#> SRR772677 1 0.3886 0.6902 0.880 0.096 0.024
#> SRR772678 1 0.6684 0.4417 0.676 0.032 0.292
#> SRR772679 1 0.3983 0.6934 0.884 0.068 0.048
#> SRR772680 1 0.3993 0.6906 0.884 0.064 0.052
#> SRR772681 3 0.0661 0.7947 0.008 0.004 0.988
#> SRR772682 1 0.5650 0.5548 0.688 0.312 0.000
#> SRR772683 1 0.5497 0.5815 0.708 0.292 0.000
#> SRR772685 1 0.5431 0.5825 0.716 0.284 0.000
#> SRR772686 3 0.0237 0.7947 0.004 0.000 0.996
#> SRR772687 3 0.0747 0.7962 0.016 0.000 0.984
#> SRR772688 2 0.1529 0.8754 0.040 0.960 0.000
#> SRR772689 2 0.1529 0.8754 0.040 0.960 0.000
#> SRR772690 3 0.0237 0.7947 0.004 0.000 0.996
#> SRR772691 1 0.5835 0.4992 0.660 0.340 0.000
#> SRR772692 1 0.4745 0.6848 0.852 0.068 0.080
#> SRR772693 1 0.5067 0.6928 0.832 0.116 0.052
#> SRR772694 1 0.5115 0.6377 0.768 0.228 0.004
#> SRR772695 1 0.4749 0.6718 0.816 0.172 0.012
#> SRR772696 1 0.4733 0.6512 0.800 0.196 0.004
#> SRR772697 1 0.4733 0.6512 0.800 0.196 0.004
#> SRR772698 3 0.3752 0.7778 0.144 0.000 0.856
#> SRR772699 1 0.5733 0.3482 0.676 0.000 0.324
#> SRR772700 1 0.5760 0.3394 0.672 0.000 0.328
#> SRR772701 1 0.5016 0.4793 0.760 0.000 0.240
#> SRR772702 1 0.5465 0.4156 0.712 0.000 0.288
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.436 0.8238 0.780 0.200 0.016 0.004
#> SRR772342 1 0.401 0.8199 0.784 0.208 0.008 0.000
#> SRR772343 2 0.536 0.1570 0.408 0.580 0.004 0.008
#> SRR772344 2 0.292 0.6872 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR772345 2 0.270 0.7024 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772346 2 0.576 0.1399 0.404 0.568 0.004 0.024
#> SRR772347 2 0.572 0.0418 0.428 0.548 0.004 0.020
#> SRR772348 2 0.387 0.5972 0.004 0.788 0.000 0.208
#> SRR772349 2 0.387 0.6021 0.004 0.788 0.000 0.208
#> SRR772350 3 0.316 0.8343 0.108 0.000 0.872 0.020
#> SRR772351 2 0.277 0.7073 0.004 0.880 0.000 0.116
#> SRR772352 2 0.246 0.7426 0.008 0.912 0.004 0.076
#> SRR772353 2 0.363 0.6965 0.160 0.828 0.000 0.012
#> SRR772354 2 0.363 0.6965 0.160 0.828 0.000 0.012
#> SRR772355 2 0.280 0.7292 0.008 0.884 0.000 0.108
#> SRR772356 2 0.259 0.7286 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR772357 1 0.484 0.6934 0.672 0.320 0.008 0.000
#> SRR772358 1 0.492 0.6663 0.656 0.336 0.008 0.000
#> SRR772359 2 0.554 0.0725 0.432 0.552 0.008 0.008
#> SRR772360 2 0.491 0.5576 0.280 0.704 0.008 0.008
#> SRR772361 3 0.472 0.8016 0.128 0.024 0.808 0.040
#> SRR772362 4 0.327 0.8637 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR772363 4 0.327 0.8637 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR772364 1 0.680 0.2299 0.496 0.432 0.020 0.052
#> SRR772365 2 0.637 0.1374 0.400 0.540 0.004 0.056
#> SRR772366 3 0.594 0.6524 0.412 0.012 0.556 0.020
#> SRR772367 3 0.353 0.8491 0.152 0.000 0.836 0.012
#> SRR772368 2 0.369 0.7244 0.028 0.856 0.008 0.108
#> SRR772369 2 0.346 0.7393 0.116 0.860 0.004 0.020
#> SRR772370 2 0.320 0.7519 0.092 0.880 0.004 0.024
#> SRR772371 2 0.705 0.1675 0.380 0.532 0.040 0.048
#> SRR772372 2 0.704 0.1845 0.376 0.536 0.040 0.048
#> SRR772373 2 0.213 0.7324 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR772374 2 0.198 0.7347 0.004 0.928 0.000 0.068
#> SRR772375 3 0.353 0.8491 0.152 0.000 0.836 0.012
#> SRR772376 2 0.335 0.6779 0.004 0.836 0.000 0.160
#> SRR772377 2 0.826 0.3632 0.228 0.552 0.136 0.084
#> SRR772378 2 0.501 0.3770 0.348 0.644 0.004 0.004
#> SRR772379 2 0.399 0.6844 0.176 0.808 0.004 0.012
#> SRR772380 2 0.461 0.5414 0.276 0.716 0.004 0.004
#> SRR772381 3 0.346 0.8377 0.108 0.000 0.860 0.032
#> SRR772382 1 0.394 0.8224 0.800 0.188 0.012 0.000
#> SRR772383 1 0.385 0.8203 0.800 0.192 0.008 0.000
#> SRR772384 2 0.828 0.2278 0.252 0.508 0.196 0.044
#> SRR772385 2 0.558 0.5578 0.044 0.720 0.016 0.220
#> SRR772386 2 0.275 0.7450 0.020 0.904 0.004 0.072
#> SRR772387 2 0.267 0.7460 0.020 0.908 0.004 0.068
#> SRR772388 1 0.241 0.7605 0.916 0.064 0.020 0.000
#> SRR772389 1 0.256 0.7654 0.908 0.072 0.020 0.000
#> SRR772390 3 0.603 0.6511 0.408 0.016 0.556 0.020
#> SRR772391 1 0.305 0.8081 0.872 0.116 0.012 0.000
#> SRR772392 1 0.310 0.8100 0.868 0.120 0.012 0.000
#> SRR772393 2 0.573 0.6928 0.108 0.748 0.020 0.124
#> SRR772394 2 0.583 0.6958 0.108 0.748 0.028 0.116
#> SRR772395 2 0.300 0.6964 0.004 0.864 0.000 0.132
#> SRR772396 1 0.346 0.8011 0.860 0.108 0.032 0.000
#> SRR772397 1 0.305 0.7850 0.884 0.088 0.028 0.000
#> SRR772398 1 0.525 0.4225 0.552 0.440 0.008 0.000
#> SRR772399 1 0.525 0.4225 0.552 0.440 0.008 0.000
#> SRR772400 1 0.314 0.7589 0.884 0.072 0.044 0.000
#> SRR772401 1 0.292 0.7727 0.892 0.080 0.028 0.000
#> SRR772402 4 0.477 0.7870 0.004 0.280 0.008 0.708
#> SRR772403 4 0.488 0.7649 0.004 0.296 0.008 0.692
#> SRR772404 2 0.404 0.6859 0.024 0.828 0.008 0.140
#> SRR772405 2 0.797 0.2949 0.248 0.544 0.168 0.040
#> SRR772406 2 0.281 0.7536 0.028 0.904 0.004 0.064
#> SRR772407 2 0.244 0.7485 0.024 0.916 0.000 0.060
#> SRR772408 4 0.344 0.8637 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR772409 4 0.344 0.8637 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR772410 2 0.514 0.5891 0.256 0.712 0.004 0.028
#> SRR772411 2 0.514 0.5891 0.256 0.712 0.004 0.028
#> SRR772412 1 0.333 0.7987 0.864 0.112 0.024 0.000
#> SRR772413 1 0.333 0.7987 0.864 0.112 0.024 0.000
#> SRR772414 3 0.340 0.8495 0.152 0.000 0.840 0.008
#> SRR772415 2 0.264 0.7614 0.060 0.908 0.000 0.032
#> SRR772416 2 0.230 0.7612 0.048 0.924 0.000 0.028
#> SRR772417 2 0.549 0.1583 0.408 0.576 0.008 0.008
#> SRR772418 3 0.623 0.6326 0.412 0.024 0.544 0.020
#> SRR772419 4 0.493 0.5490 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR772420 4 0.493 0.5490 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR772421 2 0.273 0.7465 0.092 0.896 0.004 0.008
#> SRR772422 2 0.273 0.7465 0.092 0.896 0.004 0.008
#> SRR772423 4 0.413 0.8358 0.004 0.216 0.004 0.776
#> SRR772424 4 0.324 0.8396 0.004 0.136 0.004 0.856
#> SRR772425 2 0.271 0.7131 0.004 0.884 0.000 0.112
#> SRR772426 2 0.297 0.6854 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772427 2 0.297 0.6854 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772428 1 0.249 0.7321 0.916 0.048 0.036 0.000
#> SRR772429 1 0.289 0.7558 0.896 0.068 0.036 0.000
#> SRR772430 2 0.381 0.7347 0.116 0.848 0.008 0.028
#> SRR772431 4 0.497 0.7487 0.004 0.312 0.008 0.676
#> SRR772432 4 0.497 0.7487 0.004 0.312 0.008 0.676
#> SRR772433 1 0.241 0.7076 0.920 0.036 0.044 0.000
#> SRR772434 1 0.231 0.7027 0.924 0.032 0.044 0.000
#> SRR772435 2 0.523 0.4348 0.336 0.648 0.008 0.008
#> SRR772436 2 0.523 0.4343 0.336 0.648 0.008 0.008
#> SRR772437 3 0.415 0.8338 0.120 0.008 0.832 0.040
#> SRR772438 1 0.409 0.7984 0.824 0.140 0.032 0.004
#> SRR772439 1 0.356 0.7682 0.864 0.096 0.036 0.004
#> SRR772440 2 0.255 0.7610 0.060 0.916 0.008 0.016
#> SRR772441 2 0.222 0.7531 0.032 0.932 0.004 0.032
#> SRR772442 4 0.501 0.7416 0.008 0.320 0.004 0.668
#> SRR772443 4 0.520 0.7500 0.016 0.312 0.004 0.668
#> SRR772444 1 0.339 0.8127 0.856 0.124 0.020 0.000
#> SRR772445 1 0.369 0.8089 0.844 0.124 0.032 0.000
#> SRR772446 1 0.401 0.8165 0.784 0.208 0.008 0.000
#> SRR772447 1 0.405 0.8140 0.780 0.212 0.008 0.000
#> SRR772448 2 0.275 0.7607 0.056 0.908 0.004 0.032
#> SRR772449 2 0.202 0.7525 0.024 0.936 0.000 0.040
#> SRR772450 4 0.331 0.8647 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772451 4 0.331 0.8647 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772452 1 0.338 0.8183 0.848 0.140 0.012 0.000
#> SRR772453 1 0.403 0.8204 0.796 0.192 0.008 0.004
#> SRR772454 1 0.556 0.2822 0.536 0.448 0.008 0.008
#> SRR772455 2 0.536 0.1784 0.408 0.580 0.008 0.004
#> SRR772456 4 0.357 0.8620 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR772457 4 0.340 0.8640 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR772458 1 0.401 0.8252 0.800 0.184 0.016 0.000
#> SRR772459 1 0.379 0.8261 0.820 0.164 0.016 0.000
#> SRR772460 4 0.247 0.8277 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772461 4 0.247 0.8277 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772462 2 0.222 0.7226 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772463 2 0.222 0.7226 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772464 3 0.348 0.8499 0.148 0.000 0.840 0.012
#> SRR772465 2 0.441 0.6818 0.192 0.780 0.000 0.028
#> SRR772466 2 0.438 0.6954 0.180 0.788 0.000 0.032
#> SRR772467 4 0.445 0.7583 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR772468 4 0.445 0.7583 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR772469 1 0.519 0.5816 0.616 0.372 0.012 0.000
#> SRR772470 1 0.508 0.6450 0.644 0.344 0.012 0.000
#> SRR772471 1 0.537 0.4764 0.572 0.416 0.008 0.004
#> SRR772472 1 0.510 0.5732 0.612 0.380 0.008 0.000
#> SRR772473 4 0.565 0.6444 0.020 0.356 0.008 0.616
#> SRR772474 4 0.528 0.6850 0.008 0.348 0.008 0.636
#> SRR772475 2 0.558 0.5578 0.044 0.720 0.016 0.220
#> SRR772476 4 0.331 0.8647 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772477 4 0.327 0.8637 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR772478 1 0.293 0.8038 0.880 0.108 0.012 0.000
#> SRR772479 1 0.299 0.8055 0.876 0.112 0.012 0.000
#> SRR772480 2 0.662 0.4232 0.104 0.608 0.004 0.284
#> SRR772481 2 0.672 0.4194 0.112 0.600 0.004 0.284
#> SRR772482 1 0.471 0.7856 0.740 0.240 0.016 0.004
#> SRR772483 1 0.468 0.7877 0.744 0.236 0.016 0.004
#> SRR772484 2 0.255 0.7591 0.060 0.912 0.000 0.028
#> SRR772485 2 0.255 0.7591 0.060 0.912 0.000 0.028
#> SRR772486 1 0.502 0.7829 0.760 0.184 0.052 0.004
#> SRR772487 1 0.502 0.7829 0.760 0.184 0.052 0.004
#> SRR772488 2 0.303 0.7327 0.124 0.868 0.000 0.008
#> SRR772489 2 0.303 0.7327 0.124 0.868 0.000 0.008
#> SRR772490 1 0.421 0.8178 0.780 0.204 0.016 0.000
#> SRR772491 1 0.367 0.8277 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR772492 4 0.259 0.8234 0.004 0.104 0.000 0.892
#> SRR772493 4 0.259 0.8234 0.004 0.104 0.000 0.892
#> SRR772494 4 0.327 0.8637 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR772495 4 0.331 0.8647 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772496 2 0.248 0.7517 0.032 0.916 0.000 0.052
#> SRR772497 2 0.248 0.7517 0.032 0.916 0.000 0.052
#> SRR772498 2 0.692 0.5781 0.124 0.656 0.032 0.188
#> SRR772499 2 0.697 0.5744 0.128 0.652 0.032 0.188
#> SRR772500 2 0.357 0.6212 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772501 2 0.349 0.6346 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR772502 2 0.531 0.1515 0.412 0.576 0.012 0.000
#> SRR772503 2 0.533 0.1214 0.420 0.568 0.012 0.000
#> SRR772504 2 0.247 0.7224 0.004 0.900 0.000 0.096
#> SRR772505 2 0.253 0.7210 0.004 0.896 0.000 0.100
#> SRR772506 4 0.454 0.7368 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR772507 4 0.454 0.7368 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR772508 2 0.352 0.7103 0.020 0.856 0.004 0.120
#> SRR772509 2 0.795 0.3065 0.244 0.548 0.168 0.040
#> SRR772510 3 0.321 0.8490 0.148 0.000 0.848 0.004
#> SRR772511 2 0.548 0.1711 0.404 0.580 0.008 0.008
#> SRR772512 3 0.672 0.7103 0.168 0.088 0.688 0.056
#> SRR772513 2 0.220 0.7386 0.008 0.920 0.000 0.072
#> SRR772514 2 0.220 0.7386 0.008 0.920 0.000 0.072
#> SRR772515 2 0.215 0.7225 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR772516 2 0.222 0.7197 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772517 2 0.203 0.7542 0.028 0.936 0.000 0.036
#> SRR772518 2 0.203 0.7542 0.028 0.936 0.000 0.036
#> SRR772519 2 0.201 0.7277 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR772520 2 0.208 0.7251 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772521 2 0.488 0.4791 0.296 0.692 0.004 0.008
#> SRR772522 2 0.501 0.4395 0.320 0.668 0.008 0.004
#> SRR772523 2 0.270 0.7009 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772524 2 0.253 0.7112 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR772525 3 0.365 0.8491 0.152 0.000 0.832 0.016
#> SRR772526 4 0.448 0.7536 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR772527 4 0.448 0.7536 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR772528 3 0.594 0.6524 0.412 0.012 0.556 0.020
#> SRR772529 1 0.412 0.8108 0.772 0.220 0.008 0.000
#> SRR772530 1 0.511 0.7157 0.672 0.308 0.020 0.000
#> SRR772531 3 0.365 0.8491 0.152 0.000 0.832 0.016
#> SRR772532 2 0.270 0.7027 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772533 2 0.270 0.7027 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772534 2 0.557 -0.0518 0.456 0.528 0.008 0.008
#> SRR772535 2 0.292 0.7157 0.008 0.876 0.000 0.116
#> SRR772536 2 0.221 0.7431 0.012 0.928 0.004 0.056
#> SRR772537 4 0.335 0.8623 0.000 0.160 0.004 0.836
#> SRR772538 4 0.358 0.8628 0.004 0.164 0.004 0.828
#> SRR772539 1 0.385 0.8252 0.800 0.192 0.008 0.000
#> SRR772540 1 0.393 0.8223 0.792 0.200 0.008 0.000
#> SRR772541 2 0.292 0.7535 0.048 0.904 0.008 0.040
#> SRR772542 1 0.532 0.7808 0.740 0.192 0.064 0.004
#> SRR772543 1 0.473 0.7921 0.784 0.164 0.048 0.004
#> SRR772544 3 0.345 0.8467 0.128 0.000 0.852 0.020
#> SRR772545 1 0.417 0.8072 0.776 0.212 0.012 0.000
#> SRR772546 1 0.417 0.8072 0.776 0.212 0.012 0.000
#> SRR772547 2 0.556 -0.0152 0.444 0.540 0.008 0.008
#> SRR772548 1 0.535 0.5223 0.584 0.404 0.008 0.004
#> SRR772549 1 0.340 0.8238 0.840 0.152 0.008 0.000
#> SRR772550 1 0.325 0.8184 0.852 0.140 0.008 0.000
#> SRR772551 2 0.452 0.6967 0.168 0.792 0.004 0.036
#> SRR772552 2 0.454 0.7138 0.148 0.800 0.004 0.048
#> SRR772553 2 0.607 0.6291 0.080 0.740 0.052 0.128
#> SRR772554 2 0.233 0.7247 0.004 0.908 0.000 0.088
#> SRR772555 2 0.233 0.7247 0.004 0.908 0.000 0.088
#> SRR772556 1 0.360 0.8148 0.836 0.148 0.016 0.000
#> SRR772557 1 0.350 0.8127 0.848 0.132 0.020 0.000
#> SRR772558 1 0.502 0.6211 0.632 0.360 0.008 0.000
#> SRR772559 1 0.501 0.6788 0.668 0.320 0.008 0.004
#> SRR772560 2 0.446 0.6641 0.196 0.780 0.008 0.016
#> SRR772561 3 0.672 0.7103 0.168 0.088 0.688 0.056
#> SRR772562 2 0.247 0.7228 0.004 0.900 0.000 0.096
#> SRR772563 2 0.240 0.7244 0.004 0.904 0.000 0.092
#> SRR772564 1 0.266 0.7366 0.908 0.056 0.036 0.000
#> SRR772565 1 0.266 0.7366 0.908 0.056 0.036 0.000
#> SRR772566 1 0.202 0.6890 0.936 0.024 0.040 0.000
#> SRR772567 1 0.202 0.6890 0.936 0.024 0.040 0.000
#> SRR772568 2 0.260 0.7325 0.008 0.904 0.004 0.084
#> SRR772569 2 0.260 0.7325 0.008 0.904 0.004 0.084
#> SRR772570 1 0.498 0.6883 0.664 0.324 0.012 0.000
#> SRR772571 1 0.474 0.6894 0.668 0.328 0.004 0.000
#> SRR772572 2 0.540 0.3473 0.352 0.628 0.004 0.016
#> SRR772573 2 0.545 0.3868 0.340 0.636 0.004 0.020
#> SRR772574 1 0.484 0.6399 0.648 0.348 0.004 0.000
#> SRR772575 1 0.492 0.6038 0.628 0.368 0.004 0.000
#> SRR772576 2 0.220 0.7521 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR772577 2 0.233 0.7553 0.072 0.916 0.000 0.012
#> SRR772578 4 0.402 0.8482 0.000 0.224 0.004 0.772
#> SRR772579 4 0.398 0.8511 0.000 0.220 0.004 0.776
#> SRR772580 3 0.365 0.8491 0.152 0.000 0.832 0.016
#> SRR772581 2 0.577 0.6547 0.184 0.724 0.012 0.080
#> SRR772582 2 0.554 0.6778 0.168 0.744 0.012 0.076
#> SRR772583 2 0.395 0.6925 0.168 0.812 0.000 0.020
#> SRR772584 2 0.395 0.6956 0.168 0.812 0.000 0.020
#> SRR772585 2 0.341 0.7521 0.048 0.880 0.008 0.064
#> SRR772586 3 0.623 0.6365 0.408 0.024 0.548 0.020
#> SRR772587 2 0.546 -0.2042 0.488 0.500 0.004 0.008
#> SRR772588 2 0.265 0.7030 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772589 2 0.265 0.7030 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772590 3 0.400 0.8349 0.120 0.004 0.836 0.040
#> SRR772591 1 0.212 0.6969 0.932 0.028 0.040 0.000
#> SRR772592 1 0.194 0.6995 0.940 0.028 0.032 0.000
#> SRR772593 3 0.623 0.6326 0.412 0.024 0.544 0.020
#> SRR772594 4 0.387 0.8596 0.000 0.208 0.004 0.788
#> SRR772595 4 0.387 0.8596 0.000 0.208 0.004 0.788
#> SRR772596 3 0.593 0.6566 0.408 0.012 0.560 0.020
#> SRR772597 3 0.365 0.8491 0.152 0.000 0.832 0.016
#> SRR772598 1 0.284 0.7109 0.900 0.044 0.056 0.000
#> SRR772599 1 0.308 0.7092 0.888 0.048 0.064 0.000
#> SRR772600 4 0.501 0.7425 0.004 0.320 0.008 0.668
#> SRR772601 4 0.490 0.7617 0.004 0.300 0.008 0.688
#> SRR772602 3 0.331 0.8365 0.104 0.000 0.868 0.028
#> SRR772603 4 0.527 0.6473 0.004 0.380 0.008 0.608
#> SRR772604 4 0.509 0.7179 0.004 0.336 0.008 0.652
#> SRR772605 2 0.350 0.7522 0.084 0.872 0.008 0.036
#> SRR772606 1 0.295 0.7821 0.888 0.088 0.024 0.000
#> SRR772607 1 0.302 0.7865 0.884 0.092 0.024 0.000
#> SRR772608 2 0.172 0.7572 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR772609 2 0.172 0.7572 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR772610 2 0.182 0.7355 0.004 0.936 0.000 0.060
#> SRR772611 2 0.174 0.7370 0.004 0.940 0.000 0.056
#> SRR772612 4 0.300 0.8399 0.004 0.132 0.000 0.864
#> SRR772613 4 0.283 0.8315 0.004 0.120 0.000 0.876
#> SRR772614 1 0.299 0.7999 0.880 0.104 0.016 0.000
#> SRR772615 1 0.280 0.7574 0.900 0.068 0.032 0.000
#> SRR772616 2 0.545 -0.1230 0.468 0.520 0.004 0.008
#> SRR772617 4 0.411 0.8335 0.004 0.200 0.008 0.788
#> SRR772618 4 0.411 0.8335 0.004 0.200 0.008 0.788
#> SRR772619 4 0.259 0.8234 0.004 0.104 0.000 0.892
#> SRR772620 4 0.259 0.8234 0.004 0.104 0.000 0.892
#> SRR772621 2 0.384 0.7207 0.144 0.832 0.004 0.020
#> SRR772622 2 0.322 0.7331 0.120 0.864 0.000 0.016
#> SRR772623 3 0.316 0.8343 0.108 0.000 0.872 0.020
#> SRR772624 3 0.604 0.6446 0.412 0.016 0.552 0.020
#> SRR772625 2 0.558 0.5578 0.044 0.720 0.016 0.220
#> SRR772626 2 0.692 0.5832 0.120 0.660 0.036 0.184
#> SRR772627 2 0.698 0.5993 0.124 0.664 0.044 0.168
#> SRR772628 1 0.430 0.8013 0.768 0.220 0.008 0.004
#> SRR772629 1 0.451 0.7566 0.724 0.268 0.008 0.000
#> SRR772630 2 0.555 0.0419 0.436 0.548 0.008 0.008
#> SRR772631 3 0.612 0.6457 0.412 0.012 0.548 0.028
#> SRR772632 2 0.482 0.1120 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR772633 2 0.482 0.1120 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR772634 2 0.455 0.5581 0.268 0.724 0.004 0.004
#> SRR772635 2 0.458 0.5654 0.272 0.720 0.004 0.004
#> SRR772636 2 0.558 0.5578 0.044 0.720 0.016 0.220
#> SRR772637 1 0.310 0.8047 0.868 0.120 0.012 0.000
#> SRR772638 1 0.305 0.8034 0.872 0.116 0.012 0.000
#> SRR772639 2 0.271 0.7131 0.004 0.884 0.000 0.112
#> SRR772640 4 0.331 0.8647 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772641 4 0.331 0.8647 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR772642 2 0.263 0.7614 0.060 0.912 0.004 0.024
#> SRR772643 2 0.192 0.7525 0.024 0.944 0.004 0.028
#> SRR772644 1 0.504 0.6116 0.628 0.364 0.008 0.000
#> SRR772645 1 0.476 0.6719 0.664 0.332 0.004 0.000
#> SRR772646 2 0.241 0.7120 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772647 2 0.241 0.7120 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772648 2 0.309 0.7601 0.064 0.892 0.004 0.040
#> SRR772649 2 0.295 0.7574 0.048 0.900 0.004 0.048
#> SRR772650 2 0.503 0.4538 0.324 0.664 0.004 0.008
#> SRR772651 2 0.503 0.4538 0.324 0.664 0.004 0.008
#> SRR772652 1 0.384 0.8194 0.816 0.168 0.016 0.000
#> SRR772653 1 0.384 0.8194 0.816 0.168 0.016 0.000
#> SRR772654 2 0.382 0.6919 0.172 0.816 0.004 0.008
#> SRR772655 2 0.373 0.7045 0.164 0.824 0.004 0.008
#> SRR772656 3 0.356 0.8377 0.108 0.000 0.856 0.036
#> SRR772657 3 0.472 0.8016 0.128 0.024 0.808 0.040
#> SRR772658 4 0.313 0.8345 0.004 0.128 0.004 0.864
#> SRR772659 4 0.313 0.8345 0.004 0.128 0.004 0.864
#> SRR772660 2 0.283 0.7537 0.036 0.908 0.008 0.048
#> SRR772661 2 0.878 -0.0270 0.296 0.392 0.268 0.044
#> SRR772662 2 0.490 0.4419 0.332 0.660 0.000 0.008
#> SRR772663 2 0.501 0.3931 0.348 0.644 0.004 0.004
#> SRR772664 2 0.323 0.7510 0.048 0.880 0.000 0.072
#> SRR772665 2 0.337 0.7506 0.048 0.872 0.000 0.080
#> SRR772666 3 0.360 0.8502 0.148 0.000 0.836 0.016
#> SRR772667 2 0.558 0.0096 0.008 0.580 0.012 0.400
#> SRR772668 4 0.266 0.7885 0.004 0.080 0.012 0.904
#> SRR772669 4 0.266 0.7885 0.004 0.080 0.012 0.904
#> SRR772670 2 0.477 0.5273 0.280 0.708 0.004 0.008
#> SRR772671 2 0.524 0.4478 0.320 0.660 0.004 0.016
#> SRR772672 2 0.280 0.7198 0.008 0.884 0.000 0.108
#> SRR772673 2 0.280 0.7198 0.008 0.884 0.000 0.108
#> SRR772674 3 0.346 0.8377 0.108 0.000 0.860 0.032
#> SRR772675 2 0.797 0.2949 0.248 0.544 0.168 0.040
#> SRR772676 2 0.478 0.5767 0.248 0.732 0.004 0.016
#> SRR772677 2 0.473 0.5616 0.256 0.728 0.004 0.012
#> SRR772678 2 0.828 0.2278 0.252 0.508 0.196 0.044
#> SRR772679 2 0.475 0.5096 0.304 0.688 0.000 0.008
#> SRR772680 2 0.481 0.4843 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR772681 3 0.346 0.8377 0.108 0.000 0.860 0.032
#> SRR772682 2 0.271 0.7168 0.004 0.884 0.000 0.112
#> SRR772683 2 0.261 0.7330 0.008 0.896 0.000 0.096
#> SRR772685 2 0.241 0.7314 0.008 0.908 0.000 0.084
#> SRR772686 3 0.355 0.8500 0.144 0.000 0.840 0.016
#> SRR772687 3 0.519 0.7542 0.344 0.000 0.640 0.016
#> SRR772688 4 0.317 0.8619 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR772689 4 0.317 0.8619 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR772690 3 0.361 0.8500 0.140 0.000 0.840 0.020
#> SRR772691 2 0.558 0.5578 0.044 0.720 0.016 0.220
#> SRR772692 2 0.497 0.4767 0.312 0.676 0.008 0.004
#> SRR772693 2 0.475 0.6203 0.228 0.748 0.016 0.008
#> SRR772694 2 0.292 0.7568 0.036 0.900 0.004 0.060
#> SRR772695 2 0.388 0.7461 0.108 0.848 0.008 0.036
#> SRR772696 2 0.252 0.7584 0.064 0.912 0.000 0.024
#> SRR772697 2 0.252 0.7584 0.064 0.912 0.000 0.024
#> SRR772698 3 0.594 0.6524 0.412 0.012 0.556 0.020
#> SRR772699 1 0.454 0.7993 0.752 0.228 0.020 0.000
#> SRR772700 1 0.454 0.8006 0.752 0.228 0.020 0.000
#> SRR772701 1 0.477 0.7090 0.684 0.308 0.008 0.000
#> SRR772702 1 0.452 0.7702 0.736 0.252 0.012 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.363 0.7720 0.836 0.116 0.012 0.004 0.032
#> SRR772342 1 0.322 0.7703 0.852 0.116 0.012 0.000 0.020
#> SRR772343 2 0.569 -0.0406 0.452 0.488 0.004 0.008 0.048
#> SRR772344 2 0.263 0.6811 0.000 0.860 0.000 0.136 0.004
#> SRR772345 2 0.233 0.6919 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR772346 2 0.608 -0.0945 0.456 0.468 0.008 0.024 0.044
#> SRR772347 1 0.606 0.1696 0.480 0.444 0.008 0.020 0.048
#> SRR772348 2 0.372 0.5903 0.000 0.776 0.000 0.204 0.020
#> SRR772349 2 0.363 0.5922 0.000 0.780 0.000 0.204 0.016
#> SRR772350 3 0.472 0.6935 0.036 0.000 0.680 0.004 0.280
#> SRR772351 2 0.250 0.6996 0.004 0.880 0.000 0.112 0.004
#> SRR772352 2 0.251 0.7325 0.012 0.900 0.004 0.076 0.008
#> SRR772353 2 0.428 0.6743 0.180 0.772 0.004 0.008 0.036
#> SRR772354 2 0.428 0.6743 0.180 0.772 0.004 0.008 0.036
#> SRR772355 2 0.236 0.7185 0.008 0.888 0.000 0.104 0.000
#> SRR772356 2 0.236 0.7190 0.008 0.888 0.000 0.104 0.000
#> SRR772357 1 0.423 0.7240 0.764 0.192 0.008 0.000 0.036
#> SRR772358 1 0.432 0.7120 0.748 0.212 0.008 0.000 0.032
#> SRR772359 1 0.584 0.1709 0.492 0.436 0.004 0.008 0.060
#> SRR772360 2 0.557 0.4613 0.320 0.608 0.004 0.008 0.060
#> SRR772361 3 0.423 0.5242 0.024 0.012 0.756 0.000 0.208
#> SRR772362 4 0.272 0.8389 0.000 0.144 0.000 0.852 0.004
#> SRR772363 4 0.267 0.8378 0.000 0.140 0.000 0.856 0.004
#> SRR772364 1 0.712 0.3750 0.528 0.316 0.024 0.052 0.080
#> SRR772365 1 0.701 0.1269 0.448 0.408 0.008 0.056 0.080
#> SRR772366 5 0.608 0.8359 0.248 0.004 0.164 0.000 0.584
#> SRR772367 3 0.504 0.6850 0.056 0.000 0.636 0.000 0.308
#> SRR772368 2 0.514 0.6842 0.048 0.768 0.016 0.100 0.068
#> SRR772369 2 0.355 0.7251 0.136 0.828 0.000 0.016 0.020
#> SRR772370 2 0.331 0.7394 0.108 0.852 0.000 0.016 0.024
#> SRR772371 2 0.738 -0.0509 0.372 0.404 0.004 0.036 0.184
#> SRR772372 2 0.737 -0.0322 0.368 0.408 0.004 0.036 0.184
#> SRR772373 2 0.217 0.7225 0.004 0.912 0.000 0.072 0.012
#> SRR772374 2 0.183 0.7231 0.008 0.924 0.000 0.068 0.000
#> SRR772375 3 0.504 0.6850 0.056 0.000 0.636 0.000 0.308
#> SRR772376 2 0.301 0.6753 0.004 0.836 0.000 0.156 0.004
#> SRR772377 2 0.800 0.2418 0.144 0.488 0.044 0.060 0.264
#> SRR772378 2 0.545 0.2479 0.396 0.552 0.004 0.004 0.044
#> SRR772379 2 0.490 0.6391 0.208 0.724 0.004 0.012 0.052
#> SRR772380 2 0.530 0.4569 0.312 0.628 0.004 0.004 0.052
#> SRR772381 3 0.183 0.7062 0.040 0.000 0.932 0.000 0.028
#> SRR772382 1 0.367 0.7653 0.832 0.116 0.020 0.000 0.032
#> SRR772383 1 0.334 0.7678 0.852 0.104 0.016 0.000 0.028
#> SRR772384 2 0.788 0.0438 0.160 0.440 0.068 0.016 0.316
#> SRR772385 2 0.547 0.5139 0.012 0.676 0.000 0.208 0.104
#> SRR772386 2 0.280 0.7328 0.020 0.888 0.000 0.072 0.020
#> SRR772387 2 0.260 0.7318 0.020 0.896 0.000 0.072 0.012
#> SRR772388 1 0.230 0.7020 0.916 0.016 0.020 0.000 0.048
#> SRR772389 1 0.228 0.7050 0.916 0.016 0.016 0.000 0.052
#> SRR772390 5 0.606 0.8347 0.244 0.004 0.164 0.000 0.588
#> SRR772391 1 0.234 0.7406 0.916 0.040 0.020 0.000 0.024
#> SRR772392 1 0.242 0.7433 0.912 0.044 0.020 0.000 0.024
#> SRR772393 2 0.638 0.6185 0.108 0.652 0.000 0.112 0.128
#> SRR772394 2 0.638 0.6250 0.112 0.652 0.000 0.108 0.128
#> SRR772395 2 0.347 0.6815 0.004 0.832 0.000 0.128 0.036
#> SRR772396 1 0.259 0.7286 0.904 0.032 0.020 0.000 0.044
#> SRR772397 1 0.286 0.7193 0.892 0.032 0.032 0.000 0.044
#> SRR772398 1 0.544 0.5160 0.596 0.340 0.008 0.000 0.056
#> SRR772399 1 0.544 0.5160 0.596 0.340 0.008 0.000 0.056
#> SRR772400 1 0.307 0.6990 0.880 0.024 0.048 0.000 0.048
#> SRR772401 1 0.297 0.7081 0.884 0.028 0.028 0.000 0.060
#> SRR772402 4 0.465 0.7688 0.000 0.212 0.012 0.732 0.044
#> SRR772403 4 0.459 0.7555 0.000 0.228 0.008 0.724 0.040
#> SRR772404 2 0.543 0.6539 0.044 0.740 0.016 0.136 0.064
#> SRR772405 2 0.770 0.1577 0.160 0.476 0.060 0.016 0.288
#> SRR772406 2 0.279 0.7390 0.028 0.892 0.000 0.060 0.020
#> SRR772407 2 0.263 0.7357 0.024 0.900 0.000 0.056 0.020
#> SRR772408 4 0.285 0.8362 0.000 0.156 0.000 0.840 0.004
#> SRR772409 4 0.285 0.8362 0.000 0.156 0.000 0.840 0.004
#> SRR772410 2 0.507 0.5229 0.296 0.656 0.000 0.020 0.028
#> SRR772411 2 0.507 0.5229 0.296 0.656 0.000 0.020 0.028
#> SRR772412 1 0.352 0.7401 0.856 0.060 0.048 0.000 0.036
#> SRR772413 1 0.352 0.7401 0.856 0.060 0.048 0.000 0.036
#> SRR772414 3 0.497 0.6925 0.056 0.000 0.652 0.000 0.292
#> SRR772415 2 0.302 0.7441 0.064 0.880 0.000 0.020 0.036
#> SRR772416 2 0.287 0.7457 0.056 0.892 0.004 0.016 0.032
#> SRR772417 2 0.575 -0.0783 0.464 0.472 0.004 0.008 0.052
#> SRR772418 5 0.604 0.8336 0.252 0.004 0.156 0.000 0.588
#> SRR772419 4 0.438 0.4673 0.000 0.424 0.000 0.572 0.004
#> SRR772420 4 0.438 0.4673 0.000 0.424 0.000 0.572 0.004
#> SRR772421 2 0.301 0.7404 0.104 0.868 0.004 0.008 0.016
#> SRR772422 2 0.301 0.7404 0.104 0.868 0.004 0.008 0.016
#> SRR772423 4 0.377 0.7941 0.000 0.152 0.008 0.808 0.032
#> SRR772424 4 0.242 0.7936 0.000 0.080 0.000 0.896 0.024
#> SRR772425 2 0.257 0.7045 0.008 0.880 0.000 0.108 0.004
#> SRR772426 2 0.256 0.6779 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR772427 2 0.256 0.6779 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR772428 1 0.254 0.6700 0.900 0.004 0.044 0.000 0.052
#> SRR772429 1 0.299 0.6988 0.884 0.024 0.044 0.000 0.048
#> SRR772430 2 0.522 0.6973 0.136 0.748 0.016 0.024 0.076
#> SRR772431 4 0.503 0.7464 0.012 0.232 0.012 0.708 0.036
#> SRR772432 4 0.503 0.7464 0.012 0.232 0.012 0.708 0.036
#> SRR772433 1 0.259 0.6566 0.892 0.000 0.052 0.000 0.056
#> SRR772434 1 0.266 0.6527 0.888 0.000 0.052 0.000 0.060
#> SRR772435 2 0.577 0.3267 0.384 0.552 0.016 0.008 0.040
#> SRR772436 2 0.577 0.3265 0.384 0.552 0.016 0.008 0.040
#> SRR772437 3 0.266 0.6808 0.040 0.004 0.892 0.000 0.064
#> SRR772438 1 0.449 0.7129 0.800 0.068 0.036 0.004 0.092
#> SRR772439 1 0.396 0.6896 0.832 0.032 0.044 0.004 0.088
#> SRR772440 2 0.280 0.7461 0.068 0.892 0.004 0.016 0.020
#> SRR772441 2 0.207 0.7380 0.032 0.928 0.000 0.028 0.012
#> SRR772442 4 0.435 0.7356 0.000 0.268 0.000 0.704 0.028
#> SRR772443 4 0.469 0.7431 0.004 0.260 0.004 0.700 0.032
#> SRR772444 1 0.281 0.7496 0.892 0.056 0.032 0.000 0.020
#> SRR772445 1 0.283 0.7446 0.892 0.052 0.032 0.000 0.024
#> SRR772446 1 0.331 0.7673 0.844 0.124 0.012 0.000 0.020
#> SRR772447 1 0.336 0.7667 0.840 0.128 0.012 0.000 0.020
#> SRR772448 2 0.274 0.7448 0.052 0.896 0.000 0.028 0.024
#> SRR772449 2 0.195 0.7379 0.024 0.932 0.000 0.036 0.008
#> SRR772450 4 0.272 0.8385 0.000 0.144 0.000 0.852 0.004
#> SRR772451 4 0.272 0.8385 0.000 0.144 0.000 0.852 0.004
#> SRR772452 1 0.266 0.7559 0.896 0.064 0.012 0.000 0.028
#> SRR772453 1 0.337 0.7647 0.840 0.120 0.000 0.004 0.036
#> SRR772454 1 0.587 0.3221 0.548 0.384 0.024 0.008 0.036
#> SRR772455 2 0.546 -0.0171 0.464 0.488 0.004 0.004 0.040
#> SRR772456 4 0.297 0.8335 0.000 0.168 0.000 0.828 0.004
#> SRR772457 4 0.281 0.8370 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004
#> SRR772458 1 0.374 0.7682 0.836 0.096 0.024 0.000 0.044
#> SRR772459 1 0.354 0.7653 0.852 0.076 0.028 0.000 0.044
#> SRR772460 4 0.141 0.7949 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR772461 4 0.141 0.7949 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR772462 2 0.245 0.7122 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR772463 2 0.245 0.7122 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR772464 3 0.495 0.6960 0.056 0.000 0.656 0.000 0.288
#> SRR772465 2 0.442 0.6553 0.212 0.748 0.004 0.024 0.012
#> SRR772466 2 0.452 0.6700 0.204 0.748 0.004 0.032 0.012
#> SRR772467 4 0.391 0.7037 0.000 0.292 0.000 0.704 0.004
#> SRR772468 4 0.391 0.7037 0.000 0.292 0.000 0.704 0.004
#> SRR772469 1 0.492 0.6455 0.680 0.268 0.008 0.000 0.044
#> SRR772470 1 0.458 0.6915 0.712 0.244 0.004 0.000 0.040
#> SRR772471 1 0.517 0.5699 0.636 0.312 0.004 0.004 0.044
#> SRR772472 1 0.477 0.6407 0.680 0.276 0.004 0.000 0.040
#> SRR772473 4 0.539 0.6502 0.012 0.300 0.008 0.640 0.040
#> SRR772474 4 0.500 0.6929 0.008 0.280 0.004 0.672 0.036
#> SRR772475 2 0.547 0.5139 0.012 0.676 0.000 0.208 0.104
#> SRR772476 4 0.272 0.8385 0.000 0.144 0.000 0.852 0.004
#> SRR772477 4 0.267 0.8378 0.000 0.140 0.000 0.856 0.004
#> SRR772478 1 0.235 0.7357 0.916 0.036 0.020 0.000 0.028
#> SRR772479 1 0.226 0.7370 0.920 0.036 0.020 0.000 0.024
#> SRR772480 2 0.711 0.3443 0.140 0.516 0.008 0.296 0.040
#> SRR772481 2 0.716 0.3410 0.140 0.516 0.008 0.292 0.044
#> SRR772482 1 0.389 0.7538 0.812 0.144 0.016 0.004 0.024
#> SRR772483 1 0.397 0.7524 0.808 0.144 0.016 0.004 0.028
#> SRR772484 2 0.363 0.7376 0.076 0.852 0.004 0.032 0.036
#> SRR772485 2 0.363 0.7376 0.076 0.852 0.004 0.032 0.036
#> SRR772486 1 0.542 0.6604 0.712 0.108 0.020 0.004 0.156
#> SRR772487 1 0.542 0.6604 0.712 0.108 0.020 0.004 0.156
#> SRR772488 2 0.408 0.7147 0.148 0.800 0.004 0.012 0.036
#> SRR772489 2 0.408 0.7147 0.148 0.800 0.004 0.012 0.036
#> SRR772490 1 0.323 0.7698 0.852 0.112 0.008 0.000 0.028
#> SRR772491 1 0.278 0.7647 0.888 0.072 0.012 0.000 0.028
#> SRR772492 4 0.163 0.7884 0.000 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR772493 4 0.163 0.7884 0.000 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR772494 4 0.267 0.8378 0.000 0.140 0.000 0.856 0.004
#> SRR772495 4 0.272 0.8385 0.000 0.144 0.000 0.852 0.004
#> SRR772496 2 0.243 0.7392 0.036 0.908 0.000 0.048 0.008
#> SRR772497 2 0.243 0.7392 0.036 0.908 0.000 0.048 0.008
#> SRR772498 2 0.715 0.4990 0.112 0.568 0.000 0.176 0.144
#> SRR772499 2 0.715 0.4967 0.112 0.568 0.000 0.176 0.144
#> SRR772500 2 0.332 0.6328 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR772501 2 0.325 0.6426 0.000 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR772502 2 0.544 -0.0368 0.456 0.492 0.004 0.000 0.048
#> SRR772503 2 0.560 -0.0865 0.464 0.476 0.008 0.000 0.052
#> SRR772504 2 0.212 0.7096 0.004 0.900 0.000 0.096 0.000
#> SRR772505 2 0.218 0.7085 0.004 0.896 0.000 0.100 0.000
#> SRR772506 4 0.401 0.6746 0.000 0.312 0.000 0.684 0.004
#> SRR772507 4 0.401 0.6746 0.000 0.312 0.000 0.684 0.004
#> SRR772508 2 0.481 0.6706 0.032 0.784 0.016 0.112 0.056
#> SRR772509 2 0.768 0.1745 0.156 0.480 0.060 0.016 0.288
#> SRR772510 3 0.493 0.6965 0.056 0.000 0.660 0.000 0.284
#> SRR772511 2 0.575 -0.0575 0.460 0.476 0.004 0.008 0.052
#> SRR772512 3 0.582 0.3422 0.040 0.040 0.620 0.004 0.296
#> SRR772513 2 0.266 0.7240 0.004 0.896 0.004 0.064 0.032
#> SRR772514 2 0.250 0.7234 0.004 0.900 0.000 0.064 0.032
#> SRR772515 2 0.185 0.7096 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR772516 2 0.191 0.7072 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR772517 2 0.262 0.7398 0.036 0.904 0.000 0.032 0.028
#> SRR772518 2 0.262 0.7398 0.036 0.904 0.000 0.032 0.028
#> SRR772519 2 0.183 0.7156 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR772520 2 0.189 0.7129 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR772521 2 0.498 0.3781 0.344 0.620 0.000 0.008 0.028
#> SRR772522 2 0.529 0.3231 0.360 0.592 0.004 0.004 0.040
#> SRR772523 2 0.233 0.6940 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR772524 2 0.218 0.7014 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR772525 3 0.506 0.6818 0.056 0.000 0.632 0.000 0.312
#> SRR772526 4 0.395 0.6934 0.000 0.300 0.000 0.696 0.004
#> SRR772527 4 0.395 0.6934 0.000 0.300 0.000 0.696 0.004
#> SRR772528 5 0.608 0.8359 0.248 0.004 0.164 0.000 0.584
#> SRR772529 1 0.325 0.7686 0.840 0.136 0.008 0.000 0.016
#> SRR772530 1 0.445 0.7299 0.752 0.196 0.012 0.000 0.040
#> SRR772531 3 0.506 0.6818 0.056 0.000 0.632 0.000 0.312
#> SRR772532 2 0.233 0.6920 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR772533 2 0.233 0.6920 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR772534 1 0.597 0.2836 0.516 0.404 0.008 0.008 0.064
#> SRR772535 2 0.251 0.7070 0.008 0.876 0.000 0.116 0.000
#> SRR772536 2 0.212 0.7310 0.012 0.924 0.004 0.052 0.008
#> SRR772537 4 0.249 0.8346 0.000 0.124 0.000 0.872 0.004
#> SRR772538 4 0.277 0.8360 0.000 0.128 0.000 0.860 0.012
#> SRR772539 1 0.296 0.7697 0.872 0.096 0.012 0.000 0.020
#> SRR772540 1 0.306 0.7700 0.864 0.104 0.012 0.000 0.020
#> SRR772541 2 0.449 0.7188 0.068 0.808 0.016 0.028 0.080
#> SRR772542 1 0.544 0.6559 0.704 0.108 0.016 0.004 0.168
#> SRR772543 1 0.490 0.6845 0.756 0.080 0.020 0.004 0.140
#> SRR772544 3 0.358 0.7268 0.048 0.000 0.820 0.000 0.132
#> SRR772545 1 0.404 0.7551 0.804 0.140 0.024 0.000 0.032
#> SRR772546 1 0.404 0.7551 0.804 0.140 0.024 0.000 0.032
#> SRR772547 1 0.599 0.2575 0.504 0.416 0.008 0.008 0.064
#> SRR772548 1 0.543 0.6090 0.640 0.288 0.008 0.004 0.060
#> SRR772549 1 0.276 0.7620 0.888 0.076 0.012 0.000 0.024
#> SRR772550 1 0.272 0.7577 0.892 0.068 0.012 0.000 0.028
#> SRR772551 2 0.536 0.6516 0.200 0.708 0.004 0.036 0.052
#> SRR772552 2 0.479 0.6889 0.168 0.752 0.000 0.044 0.036
#> SRR772553 2 0.569 0.5725 0.032 0.688 0.000 0.124 0.156
#> SRR772554 2 0.201 0.7117 0.004 0.908 0.000 0.088 0.000
#> SRR772555 2 0.201 0.7117 0.004 0.908 0.000 0.088 0.000
#> SRR772556 1 0.369 0.7569 0.844 0.080 0.040 0.000 0.036
#> SRR772557 1 0.338 0.7517 0.864 0.060 0.040 0.000 0.036
#> SRR772558 1 0.438 0.6872 0.720 0.248 0.004 0.000 0.028
#> SRR772559 1 0.445 0.7187 0.752 0.200 0.008 0.004 0.036
#> SRR772560 2 0.572 0.5837 0.244 0.660 0.016 0.012 0.068
#> SRR772561 3 0.582 0.3422 0.040 0.040 0.620 0.004 0.296
#> SRR772562 2 0.260 0.7131 0.000 0.884 0.000 0.092 0.024
#> SRR772563 2 0.254 0.7144 0.000 0.888 0.000 0.088 0.024
#> SRR772564 1 0.315 0.6813 0.872 0.016 0.048 0.000 0.064
#> SRR772565 1 0.315 0.6813 0.872 0.016 0.048 0.000 0.064
#> SRR772566 1 0.272 0.6457 0.884 0.000 0.048 0.000 0.068
#> SRR772567 1 0.272 0.6457 0.884 0.000 0.048 0.000 0.068
#> SRR772568 2 0.259 0.7212 0.012 0.892 0.000 0.084 0.012
#> SRR772569 2 0.259 0.7212 0.012 0.892 0.000 0.084 0.012
#> SRR772570 1 0.456 0.7068 0.728 0.228 0.016 0.000 0.028
#> SRR772571 1 0.431 0.7084 0.732 0.228 0.000 0.000 0.040
#> SRR772572 2 0.542 0.2003 0.404 0.548 0.000 0.016 0.032
#> SRR772573 2 0.548 0.2484 0.392 0.556 0.000 0.020 0.032
#> SRR772574 1 0.457 0.7036 0.732 0.216 0.008 0.000 0.044
#> SRR772575 1 0.471 0.6886 0.712 0.236 0.008 0.000 0.044
#> SRR772576 2 0.280 0.7414 0.100 0.876 0.000 0.008 0.016
#> SRR772577 2 0.360 0.7423 0.096 0.848 0.008 0.016 0.032
#> SRR772578 4 0.332 0.8270 0.000 0.192 0.000 0.800 0.008
#> SRR772579 4 0.328 0.8289 0.000 0.188 0.000 0.804 0.008
#> SRR772580 3 0.506 0.6818 0.056 0.000 0.632 0.000 0.312
#> SRR772581 2 0.593 0.6097 0.212 0.664 0.004 0.080 0.040
#> SRR772582 2 0.571 0.6316 0.196 0.680 0.000 0.084 0.040
#> SRR772583 2 0.474 0.6649 0.184 0.748 0.004 0.016 0.048
#> SRR772584 2 0.477 0.6707 0.180 0.748 0.004 0.016 0.052
#> SRR772585 2 0.458 0.7179 0.056 0.808 0.016 0.052 0.068
#> SRR772586 5 0.605 0.8281 0.248 0.004 0.160 0.000 0.588
#> SRR772587 1 0.582 0.3936 0.548 0.380 0.008 0.008 0.056
#> SRR772588 2 0.273 0.6951 0.000 0.868 0.000 0.116 0.016
#> SRR772589 2 0.273 0.6951 0.000 0.868 0.000 0.116 0.016
#> SRR772590 3 0.266 0.6819 0.040 0.004 0.892 0.000 0.064
#> SRR772591 1 0.258 0.6504 0.892 0.000 0.044 0.000 0.064
#> SRR772592 1 0.280 0.6533 0.884 0.004 0.044 0.000 0.068
#> SRR772593 5 0.600 0.8313 0.252 0.004 0.152 0.000 0.592
#> SRR772594 4 0.317 0.8343 0.000 0.176 0.000 0.816 0.008
#> SRR772595 4 0.317 0.8343 0.000 0.176 0.000 0.816 0.008
#> SRR772596 5 0.609 0.8287 0.244 0.004 0.168 0.000 0.584
#> SRR772597 3 0.506 0.6818 0.056 0.000 0.632 0.000 0.312
#> SRR772598 1 0.295 0.6517 0.876 0.004 0.068 0.000 0.052
#> SRR772599 1 0.301 0.6494 0.872 0.004 0.072 0.000 0.052
#> SRR772600 4 0.491 0.7393 0.004 0.248 0.012 0.700 0.036
#> SRR772601 4 0.465 0.7508 0.000 0.232 0.012 0.720 0.036
#> SRR772602 3 0.223 0.7122 0.040 0.000 0.912 0.000 0.048
#> SRR772603 4 0.568 0.6541 0.012 0.312 0.012 0.616 0.048
#> SRR772604 4 0.511 0.7070 0.000 0.284 0.012 0.660 0.044
#> SRR772605 2 0.497 0.7176 0.112 0.772 0.016 0.028 0.072
#> SRR772606 1 0.274 0.7144 0.896 0.028 0.024 0.000 0.052
#> SRR772607 1 0.276 0.7218 0.896 0.032 0.024 0.000 0.048
#> SRR772608 2 0.257 0.7424 0.060 0.904 0.004 0.012 0.020
#> SRR772609 2 0.257 0.7424 0.060 0.904 0.004 0.012 0.020
#> SRR772610 2 0.201 0.7250 0.004 0.924 0.000 0.056 0.016
#> SRR772611 2 0.183 0.7256 0.004 0.932 0.000 0.052 0.012
#> SRR772612 4 0.217 0.7957 0.000 0.076 0.000 0.908 0.016
#> SRR772613 4 0.198 0.7886 0.000 0.064 0.000 0.920 0.016
#> SRR772614 1 0.267 0.7325 0.900 0.036 0.020 0.000 0.044
#> SRR772615 1 0.323 0.7077 0.872 0.032 0.040 0.000 0.056
#> SRR772616 1 0.586 0.3262 0.524 0.404 0.008 0.008 0.056
#> SRR772617 4 0.365 0.7909 0.000 0.140 0.008 0.820 0.032
#> SRR772618 4 0.365 0.7909 0.000 0.140 0.008 0.820 0.032
#> SRR772619 4 0.163 0.7884 0.000 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR772620 4 0.163 0.7884 0.000 0.056 0.000 0.936 0.008
#> SRR772621 2 0.439 0.7005 0.152 0.784 0.004 0.020 0.040
#> SRR772622 2 0.363 0.7145 0.136 0.824 0.000 0.012 0.028
#> SRR772623 3 0.472 0.6935 0.036 0.000 0.680 0.004 0.280
#> SRR772624 5 0.608 0.8358 0.248 0.004 0.164 0.000 0.584
#> SRR772625 2 0.547 0.5139 0.012 0.676 0.000 0.208 0.104
#> SRR772626 2 0.712 0.5020 0.108 0.572 0.000 0.172 0.148
#> SRR772627 2 0.715 0.5086 0.108 0.568 0.000 0.160 0.164
#> SRR772628 1 0.414 0.7524 0.800 0.140 0.012 0.004 0.044
#> SRR772629 1 0.397 0.7418 0.788 0.172 0.008 0.000 0.032
#> SRR772630 1 0.574 0.1598 0.488 0.448 0.004 0.008 0.052
#> SRR772631 5 0.619 0.8282 0.252 0.004 0.176 0.000 0.568
#> SRR772632 2 0.431 0.1767 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR772633 2 0.431 0.1767 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR772634 2 0.512 0.5015 0.300 0.648 0.004 0.004 0.044
#> SRR772635 2 0.514 0.5116 0.304 0.644 0.004 0.004 0.044
#> SRR772636 2 0.547 0.5139 0.012 0.676 0.000 0.208 0.104
#> SRR772637 1 0.284 0.7451 0.888 0.056 0.012 0.000 0.044
#> SRR772638 1 0.270 0.7408 0.896 0.048 0.012 0.000 0.044
#> SRR772639 2 0.257 0.7045 0.008 0.880 0.000 0.108 0.004
#> SRR772640 4 0.272 0.8385 0.000 0.144 0.000 0.852 0.004
#> SRR772641 4 0.272 0.8385 0.000 0.144 0.000 0.852 0.004
#> SRR772642 2 0.349 0.7449 0.076 0.860 0.008 0.020 0.036
#> SRR772643 2 0.226 0.7387 0.020 0.920 0.000 0.024 0.036
#> SRR772644 1 0.450 0.6838 0.716 0.248 0.008 0.000 0.028
#> SRR772645 1 0.435 0.7121 0.744 0.216 0.008 0.000 0.032
#> SRR772646 2 0.230 0.7032 0.000 0.892 0.000 0.100 0.008
#> SRR772647 2 0.230 0.7032 0.000 0.892 0.000 0.100 0.008
#> SRR772648 2 0.295 0.7429 0.072 0.880 0.000 0.036 0.012
#> SRR772649 2 0.277 0.7417 0.052 0.892 0.000 0.044 0.012
#> SRR772650 2 0.578 0.3288 0.364 0.564 0.008 0.008 0.056
#> SRR772651 2 0.578 0.3288 0.364 0.564 0.008 0.008 0.056
#> SRR772652 1 0.378 0.7608 0.832 0.104 0.036 0.000 0.028
#> SRR772653 1 0.378 0.7608 0.832 0.104 0.036 0.000 0.028
#> SRR772654 2 0.407 0.6644 0.192 0.772 0.000 0.008 0.028
#> SRR772655 2 0.388 0.6836 0.180 0.788 0.000 0.008 0.024
#> SRR772656 3 0.192 0.7049 0.040 0.000 0.928 0.000 0.032
#> SRR772657 3 0.423 0.5242 0.024 0.012 0.756 0.000 0.208
#> SRR772658 4 0.246 0.7891 0.000 0.072 0.004 0.900 0.024
#> SRR772659 4 0.246 0.7891 0.000 0.072 0.004 0.900 0.024
#> SRR772660 2 0.437 0.7273 0.060 0.820 0.016 0.044 0.060
#> SRR772661 5 0.821 0.2227 0.188 0.336 0.092 0.012 0.372
#> SRR772662 2 0.565 0.2888 0.388 0.552 0.008 0.008 0.044
#> SRR772663 2 0.570 0.2133 0.408 0.528 0.008 0.004 0.052
#> SRR772664 2 0.301 0.7361 0.052 0.876 0.000 0.064 0.008
#> SRR772665 2 0.314 0.7363 0.052 0.868 0.000 0.072 0.008
#> SRR772666 3 0.464 0.7128 0.056 0.000 0.708 0.000 0.236
#> SRR772667 2 0.607 0.0395 0.004 0.524 0.012 0.384 0.076
#> SRR772668 4 0.241 0.7135 0.000 0.020 0.012 0.908 0.060
#> SRR772669 4 0.241 0.7135 0.000 0.020 0.012 0.908 0.060
#> SRR772670 2 0.522 0.4521 0.316 0.628 0.000 0.008 0.048
#> SRR772671 2 0.582 0.3508 0.352 0.572 0.004 0.016 0.056
#> SRR772672 2 0.324 0.7096 0.008 0.856 0.000 0.100 0.036
#> SRR772673 2 0.324 0.7096 0.008 0.856 0.000 0.100 0.036
#> SRR772674 3 0.183 0.7062 0.040 0.000 0.932 0.000 0.028
#> SRR772675 2 0.770 0.1577 0.160 0.476 0.060 0.016 0.288
#> SRR772676 2 0.449 0.5314 0.272 0.700 0.000 0.012 0.016
#> SRR772677 2 0.456 0.5148 0.284 0.688 0.000 0.012 0.016
#> SRR772678 2 0.788 0.0438 0.160 0.440 0.068 0.016 0.316
#> SRR772679 2 0.569 0.4115 0.336 0.592 0.008 0.008 0.056
#> SRR772680 2 0.574 0.3713 0.352 0.576 0.008 0.008 0.056
#> SRR772681 3 0.183 0.7062 0.040 0.000 0.932 0.000 0.028
#> SRR772682 2 0.245 0.7092 0.004 0.884 0.000 0.108 0.004
#> SRR772683 2 0.235 0.7217 0.008 0.896 0.000 0.092 0.004
#> SRR772685 2 0.224 0.7196 0.008 0.904 0.000 0.084 0.004
#> SRR772686 3 0.479 0.7056 0.056 0.000 0.684 0.000 0.260
#> SRR772687 5 0.654 0.2545 0.220 0.000 0.312 0.000 0.468
#> SRR772688 4 0.249 0.8341 0.000 0.124 0.000 0.872 0.004
#> SRR772689 4 0.249 0.8341 0.000 0.124 0.000 0.872 0.004
#> SRR772690 3 0.420 0.7224 0.056 0.000 0.764 0.000 0.180
#> SRR772691 2 0.547 0.5139 0.012 0.676 0.000 0.208 0.104
#> SRR772692 2 0.532 0.4196 0.336 0.612 0.008 0.004 0.040
#> SRR772693 2 0.519 0.5749 0.256 0.676 0.004 0.008 0.056
#> SRR772694 2 0.279 0.7430 0.036 0.892 0.000 0.056 0.016
#> SRR772695 2 0.444 0.7274 0.128 0.788 0.000 0.032 0.052
#> SRR772696 2 0.248 0.7419 0.064 0.904 0.000 0.020 0.012
#> SRR772697 2 0.248 0.7419 0.064 0.904 0.000 0.020 0.012
#> SRR772698 5 0.608 0.8359 0.248 0.004 0.164 0.000 0.584
#> SRR772699 1 0.355 0.7630 0.832 0.128 0.016 0.000 0.024
#> SRR772700 1 0.355 0.7631 0.832 0.128 0.016 0.000 0.024
#> SRR772701 1 0.434 0.7272 0.756 0.196 0.008 0.000 0.040
#> SRR772702 1 0.412 0.7527 0.796 0.148 0.020 0.000 0.036
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.3412 0.7743 0.840 0.088 0.004 0.004 NA 0.012
#> SRR772342 1 0.3054 0.7732 0.852 0.104 0.004 0.000 NA 0.012
#> SRR772343 2 0.5741 -0.0739 0.424 0.452 0.000 0.004 NA 0.008
#> SRR772344 2 0.2442 0.6678 0.000 0.852 0.000 0.144 NA 0.000
#> SRR772345 2 0.2178 0.6779 0.000 0.868 0.000 0.132 NA 0.000
#> SRR772346 1 0.6683 0.2254 0.408 0.360 0.000 0.016 NA 0.020
#> SRR772347 1 0.6626 0.2988 0.428 0.332 0.000 0.012 NA 0.020
#> SRR772348 2 0.3698 0.5789 0.000 0.756 0.000 0.212 NA 0.004
#> SRR772349 2 0.3483 0.5808 0.000 0.764 0.000 0.212 NA 0.000
#> SRR772350 3 0.5010 0.5585 0.008 0.000 0.648 0.000 NA 0.104
#> SRR772351 2 0.2312 0.6883 0.000 0.876 0.000 0.112 NA 0.000
#> SRR772352 2 0.2729 0.7183 0.008 0.876 0.000 0.080 NA 0.004
#> SRR772353 2 0.4563 0.6339 0.176 0.708 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR772354 2 0.4563 0.6339 0.176 0.708 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR772355 2 0.2504 0.7066 0.004 0.876 0.000 0.104 NA 0.004
#> SRR772356 2 0.2504 0.7059 0.004 0.876 0.000 0.104 NA 0.004
#> SRR772357 1 0.4370 0.7310 0.740 0.160 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772358 1 0.4516 0.7178 0.720 0.184 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772359 1 0.5858 0.1946 0.452 0.408 0.000 0.000 NA 0.016
#> SRR772360 2 0.5768 0.4312 0.280 0.576 0.000 0.008 NA 0.016
#> SRR772361 6 0.4636 -0.3324 0.012 0.000 0.396 0.000 NA 0.568
#> SRR772362 4 0.2234 0.8126 0.000 0.124 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR772363 4 0.2191 0.8123 0.000 0.120 0.000 0.876 NA 0.000
#> SRR772364 1 0.6873 0.3858 0.472 0.204 0.012 0.016 NA 0.020
#> SRR772365 1 0.6903 0.2676 0.396 0.292 0.000 0.020 NA 0.020
#> SRR772366 6 0.5868 0.6527 0.204 0.000 0.348 0.000 NA 0.448
#> SRR772367 3 0.0692 0.7255 0.020 0.000 0.976 0.000 NA 0.004
#> SRR772368 2 0.5138 0.6286 0.016 0.692 0.004 0.100 NA 0.008
#> SRR772369 2 0.3590 0.7062 0.112 0.812 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR772370 2 0.3257 0.7232 0.084 0.840 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR772371 1 0.7816 0.1435 0.304 0.296 0.000 0.016 NA 0.128
#> SRR772372 1 0.7816 0.1286 0.300 0.300 0.000 0.016 NA 0.128
#> SRR772373 2 0.1946 0.7084 0.004 0.912 0.000 0.072 NA 0.000
#> SRR772374 2 0.1643 0.7088 0.008 0.924 0.000 0.068 NA 0.000
#> SRR772375 3 0.0692 0.7255 0.020 0.000 0.976 0.000 NA 0.004
#> SRR772376 2 0.2743 0.6604 0.000 0.828 0.000 0.164 NA 0.000
#> SRR772377 2 0.7905 0.1197 0.108 0.424 0.020 0.044 NA 0.300
#> SRR772378 2 0.5572 0.1845 0.364 0.504 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR772379 2 0.4848 0.6171 0.176 0.696 0.000 0.008 NA 0.004
#> SRR772380 2 0.5251 0.4153 0.288 0.592 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR772381 3 0.4167 0.6471 0.008 0.000 0.636 0.000 NA 0.344
#> SRR772382 1 0.3651 0.7681 0.824 0.088 0.016 0.000 NA 0.008
#> SRR772383 1 0.3600 0.7693 0.824 0.096 0.012 0.000 NA 0.008
#> SRR772384 2 0.7679 -0.0669 0.120 0.380 0.056 0.000 NA 0.348
#> SRR772385 2 0.6431 0.4277 0.016 0.584 0.000 0.200 NA 0.068
#> SRR772386 2 0.2357 0.7176 0.008 0.900 0.000 0.068 NA 0.012
#> SRR772387 2 0.2156 0.7164 0.008 0.908 0.000 0.068 NA 0.008
#> SRR772388 1 0.2477 0.7149 0.904 0.016 0.032 0.000 NA 0.032
#> SRR772389 1 0.2489 0.7174 0.904 0.016 0.028 0.000 NA 0.032
#> SRR772390 6 0.5850 0.6525 0.200 0.000 0.348 0.000 NA 0.452
#> SRR772391 1 0.1975 0.7461 0.928 0.028 0.012 0.000 NA 0.012
#> SRR772392 1 0.2058 0.7472 0.924 0.028 0.012 0.000 NA 0.012
#> SRR772393 2 0.6947 0.5069 0.072 0.572 0.000 0.096 NA 0.080
#> SRR772394 2 0.6861 0.5217 0.072 0.580 0.000 0.092 NA 0.076
#> SRR772395 2 0.3879 0.6580 0.000 0.784 0.000 0.140 NA 0.012
#> SRR772396 1 0.3143 0.7383 0.868 0.032 0.016 0.000 NA 0.052
#> SRR772397 1 0.3012 0.7311 0.876 0.032 0.024 0.000 NA 0.048
#> SRR772398 1 0.5726 0.5481 0.568 0.292 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR772399 1 0.5726 0.5481 0.568 0.292 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR772400 1 0.2665 0.7115 0.892 0.016 0.024 0.000 NA 0.052
#> SRR772401 1 0.2918 0.7183 0.880 0.020 0.020 0.000 NA 0.052
#> SRR772402 4 0.5068 0.7093 0.004 0.156 0.000 0.696 NA 0.024
#> SRR772403 4 0.5051 0.6981 0.000 0.176 0.000 0.680 NA 0.020
#> SRR772404 2 0.5339 0.6063 0.016 0.676 0.004 0.140 NA 0.008
#> SRR772405 2 0.7279 0.0640 0.124 0.420 0.024 0.000 NA 0.336
#> SRR772406 2 0.2915 0.7247 0.020 0.872 0.000 0.068 NA 0.004
#> SRR772407 2 0.2809 0.7217 0.016 0.880 0.000 0.064 NA 0.008
#> SRR772408 4 0.2531 0.8088 0.000 0.132 0.000 0.856 NA 0.000
#> SRR772409 4 0.2531 0.8088 0.000 0.132 0.000 0.856 NA 0.000
#> SRR772410 2 0.5200 0.4693 0.276 0.620 0.000 0.016 NA 0.000
#> SRR772411 2 0.5200 0.4693 0.276 0.620 0.000 0.016 NA 0.000
#> SRR772412 1 0.3190 0.7442 0.868 0.040 0.028 0.000 NA 0.028
#> SRR772413 1 0.3190 0.7442 0.868 0.040 0.028 0.000 NA 0.028
#> SRR772414 3 0.0909 0.7299 0.020 0.000 0.968 0.000 NA 0.012
#> SRR772415 2 0.3195 0.7273 0.048 0.852 0.000 0.016 NA 0.004
#> SRR772416 2 0.2945 0.7293 0.048 0.864 0.000 0.016 NA 0.000
#> SRR772417 2 0.5942 -0.1447 0.428 0.428 0.000 0.004 NA 0.012
#> SRR772418 6 0.5849 0.6536 0.204 0.000 0.336 0.000 NA 0.460
#> SRR772419 4 0.4101 0.4291 0.000 0.408 0.000 0.580 NA 0.000
#> SRR772420 4 0.4101 0.4291 0.000 0.408 0.000 0.580 NA 0.000
#> SRR772421 2 0.3219 0.7248 0.084 0.848 0.000 0.012 NA 0.004
#> SRR772422 2 0.3219 0.7248 0.084 0.848 0.000 0.012 NA 0.004
#> SRR772423 4 0.3719 0.7469 0.000 0.104 0.000 0.800 NA 0.008
#> SRR772424 4 0.2553 0.7559 0.000 0.044 0.000 0.888 NA 0.012
#> SRR772425 2 0.2357 0.6892 0.000 0.872 0.000 0.116 NA 0.000
#> SRR772426 2 0.2340 0.6691 0.000 0.852 0.000 0.148 NA 0.000
#> SRR772427 2 0.2340 0.6691 0.000 0.852 0.000 0.148 NA 0.000
#> SRR772428 1 0.2408 0.6884 0.900 0.004 0.028 0.000 NA 0.056
#> SRR772429 1 0.2831 0.7106 0.884 0.020 0.028 0.000 NA 0.052
#> SRR772430 2 0.4878 0.6592 0.092 0.696 0.004 0.004 NA 0.008
#> SRR772431 4 0.5289 0.6852 0.000 0.184 0.000 0.652 NA 0.020
#> SRR772432 4 0.5289 0.6852 0.000 0.184 0.000 0.652 NA 0.020
#> SRR772433 1 0.2414 0.6799 0.896 0.000 0.036 0.000 NA 0.056
#> SRR772434 1 0.2485 0.6768 0.892 0.000 0.040 0.000 NA 0.056
#> SRR772435 2 0.5607 0.2836 0.364 0.512 0.004 0.000 NA 0.004
#> SRR772436 2 0.5607 0.2840 0.364 0.512 0.004 0.000 NA 0.004
#> SRR772437 3 0.4610 0.5979 0.012 0.000 0.580 0.000 NA 0.384
#> SRR772438 1 0.4546 0.7043 0.776 0.052 0.016 0.000 NA 0.076
#> SRR772439 1 0.3803 0.6936 0.824 0.020 0.020 0.000 NA 0.064
#> SRR772440 2 0.3178 0.7311 0.056 0.860 0.000 0.020 NA 0.008
#> SRR772441 2 0.2102 0.7224 0.020 0.920 0.000 0.032 NA 0.004
#> SRR772442 4 0.4930 0.6947 0.004 0.232 0.000 0.672 NA 0.012
#> SRR772443 4 0.5145 0.6938 0.008 0.228 0.000 0.664 NA 0.016
#> SRR772444 1 0.2767 0.7567 0.888 0.048 0.020 0.000 NA 0.016
#> SRR772445 1 0.3090 0.7537 0.872 0.048 0.020 0.000 NA 0.028
#> SRR772446 1 0.2969 0.7687 0.852 0.112 0.004 0.000 NA 0.008
#> SRR772447 1 0.3057 0.7675 0.844 0.120 0.004 0.000 NA 0.008
#> SRR772448 2 0.2855 0.7295 0.036 0.884 0.000 0.032 NA 0.012
#> SRR772449 2 0.1838 0.7217 0.012 0.928 0.000 0.040 NA 0.000
#> SRR772450 4 0.2302 0.8119 0.000 0.120 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR772451 4 0.2402 0.8112 0.000 0.120 0.000 0.868 NA 0.000
#> SRR772452 1 0.2339 0.7614 0.904 0.056 0.020 0.000 NA 0.004
#> SRR772453 1 0.3379 0.7681 0.836 0.112 0.016 0.004 NA 0.004
#> SRR772454 1 0.5421 0.3644 0.560 0.336 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR772455 2 0.5700 -0.0775 0.432 0.444 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772456 4 0.2653 0.8057 0.000 0.144 0.000 0.844 NA 0.000
#> SRR772457 4 0.2489 0.8096 0.000 0.128 0.000 0.860 NA 0.000
#> SRR772458 1 0.4204 0.7697 0.792 0.092 0.012 0.000 NA 0.028
#> SRR772459 1 0.3896 0.7684 0.816 0.072 0.012 0.000 NA 0.028
#> SRR772460 4 0.0935 0.7741 0.000 0.032 0.000 0.964 NA 0.000
#> SRR772461 4 0.0935 0.7741 0.000 0.032 0.000 0.964 NA 0.000
#> SRR772462 2 0.2747 0.6997 0.000 0.860 0.000 0.096 NA 0.000
#> SRR772463 2 0.2795 0.6985 0.000 0.856 0.000 0.100 NA 0.000
#> SRR772464 3 0.1003 0.7322 0.020 0.000 0.964 0.000 NA 0.016
#> SRR772465 2 0.4626 0.6211 0.196 0.712 0.000 0.020 NA 0.000
#> SRR772466 2 0.4615 0.6357 0.184 0.720 0.000 0.024 NA 0.000
#> SRR772467 4 0.3629 0.6696 0.000 0.276 0.000 0.712 NA 0.000
#> SRR772468 4 0.3629 0.6696 0.000 0.276 0.000 0.712 NA 0.000
#> SRR772469 1 0.5131 0.6439 0.652 0.244 0.004 0.000 NA 0.016
#> SRR772470 1 0.4595 0.6821 0.696 0.224 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772471 1 0.5278 0.5660 0.608 0.284 0.000 0.004 NA 0.008
#> SRR772472 1 0.4843 0.6313 0.652 0.252 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR772473 4 0.5826 0.6205 0.012 0.256 0.000 0.600 NA 0.028
#> SRR772474 4 0.5504 0.6592 0.000 0.228 0.000 0.620 NA 0.024
#> SRR772475 2 0.6431 0.4277 0.016 0.584 0.000 0.200 NA 0.068
#> SRR772476 4 0.2302 0.8119 0.000 0.120 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR772477 4 0.2191 0.8123 0.000 0.120 0.000 0.876 NA 0.000
#> SRR772478 1 0.1989 0.7419 0.928 0.024 0.016 0.000 NA 0.012
#> SRR772479 1 0.1895 0.7429 0.932 0.024 0.012 0.000 NA 0.012
#> SRR772480 2 0.7538 0.1675 0.092 0.404 0.000 0.244 NA 0.020
#> SRR772481 2 0.7575 0.1792 0.096 0.416 0.000 0.236 NA 0.024
#> SRR772482 1 0.4056 0.7587 0.788 0.128 0.004 0.000 NA 0.028
#> SRR772483 1 0.4129 0.7575 0.784 0.128 0.004 0.000 NA 0.032
#> SRR772484 2 0.3756 0.7170 0.060 0.812 0.000 0.032 NA 0.000
#> SRR772485 2 0.3756 0.7170 0.060 0.812 0.000 0.032 NA 0.000
#> SRR772486 1 0.5544 0.6529 0.684 0.092 0.008 0.000 NA 0.132
#> SRR772487 1 0.5544 0.6529 0.684 0.092 0.008 0.000 NA 0.132
#> SRR772488 2 0.4326 0.6862 0.136 0.744 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR772489 2 0.4326 0.6862 0.136 0.744 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR772490 1 0.3538 0.7729 0.828 0.104 0.008 0.000 NA 0.016
#> SRR772491 1 0.3164 0.7711 0.860 0.072 0.008 0.000 NA 0.024
#> SRR772492 4 0.1036 0.7651 0.000 0.024 0.000 0.964 NA 0.004
#> SRR772493 4 0.1036 0.7651 0.000 0.024 0.000 0.964 NA 0.004
#> SRR772494 4 0.2191 0.8123 0.000 0.120 0.000 0.876 NA 0.000
#> SRR772495 4 0.2302 0.8119 0.000 0.120 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR772496 2 0.2480 0.7254 0.028 0.896 0.000 0.048 NA 0.000
#> SRR772497 2 0.2480 0.7254 0.028 0.896 0.000 0.048 NA 0.000
#> SRR772498 2 0.7656 0.3605 0.072 0.488 0.000 0.160 NA 0.100
#> SRR772499 2 0.7656 0.3598 0.072 0.488 0.000 0.160 NA 0.100
#> SRR772500 2 0.3110 0.6260 0.000 0.792 0.000 0.196 NA 0.000
#> SRR772501 2 0.3046 0.6354 0.000 0.800 0.000 0.188 NA 0.000
#> SRR772502 2 0.5846 -0.0984 0.420 0.448 0.000 0.000 NA 0.020
#> SRR772503 2 0.5945 -0.1452 0.428 0.432 0.000 0.000 NA 0.024
#> SRR772504 2 0.2006 0.6934 0.000 0.892 0.000 0.104 NA 0.000
#> SRR772505 2 0.2053 0.6922 0.000 0.888 0.000 0.108 NA 0.000
#> SRR772506 4 0.3729 0.6387 0.000 0.296 0.000 0.692 NA 0.000
#> SRR772507 4 0.3729 0.6387 0.000 0.296 0.000 0.692 NA 0.000
#> SRR772508 2 0.5053 0.6214 0.016 0.708 0.004 0.124 NA 0.008
#> SRR772509 2 0.7283 0.0682 0.120 0.420 0.024 0.000 NA 0.336
#> SRR772510 3 0.1092 0.7320 0.020 0.000 0.960 0.000 NA 0.020
#> SRR772511 2 0.5968 -0.1263 0.420 0.432 0.000 0.004 NA 0.012
#> SRR772512 6 0.5311 -0.1044 0.020 0.016 0.260 0.004 NA 0.648
#> SRR772513 2 0.2944 0.7087 0.000 0.856 0.000 0.068 NA 0.004
#> SRR772514 2 0.2888 0.7081 0.000 0.860 0.000 0.068 NA 0.004
#> SRR772515 2 0.1858 0.6974 0.000 0.904 0.000 0.092 NA 0.000
#> SRR772516 2 0.1858 0.6972 0.000 0.904 0.000 0.092 NA 0.000
#> SRR772517 2 0.2724 0.7232 0.024 0.880 0.000 0.032 NA 0.000
#> SRR772518 2 0.2724 0.7232 0.024 0.880 0.000 0.032 NA 0.000
#> SRR772519 2 0.1967 0.7023 0.000 0.904 0.000 0.084 NA 0.000
#> SRR772520 2 0.2019 0.6998 0.000 0.900 0.000 0.088 NA 0.000
#> SRR772521 2 0.5527 0.3198 0.304 0.576 0.000 0.004 NA 0.012
#> SRR772522 2 0.5716 0.2615 0.320 0.548 0.000 0.000 NA 0.024
#> SRR772523 2 0.2178 0.6816 0.000 0.868 0.000 0.132 NA 0.000
#> SRR772524 2 0.2003 0.6899 0.000 0.884 0.000 0.116 NA 0.000
#> SRR772525 3 0.0806 0.7229 0.020 0.000 0.972 0.000 NA 0.008
#> SRR772526 4 0.3670 0.6588 0.000 0.284 0.000 0.704 NA 0.000
#> SRR772527 4 0.3670 0.6588 0.000 0.284 0.000 0.704 NA 0.000
#> SRR772528 6 0.5868 0.6527 0.204 0.000 0.348 0.000 NA 0.448
#> SRR772529 1 0.3633 0.7697 0.812 0.124 0.008 0.000 NA 0.008
#> SRR772530 1 0.4742 0.7320 0.712 0.184 0.004 0.000 NA 0.016
#> SRR772531 3 0.0806 0.7229 0.020 0.000 0.972 0.000 NA 0.008
#> SRR772532 2 0.2320 0.6773 0.000 0.864 0.000 0.132 NA 0.004
#> SRR772533 2 0.2320 0.6773 0.000 0.864 0.000 0.132 NA 0.004
#> SRR772534 1 0.6101 0.3237 0.472 0.360 0.000 0.004 NA 0.016
#> SRR772535 2 0.2257 0.6919 0.000 0.876 0.000 0.116 NA 0.000
#> SRR772536 2 0.2165 0.7193 0.008 0.912 0.000 0.052 NA 0.004
#> SRR772537 4 0.2225 0.8067 0.000 0.092 0.000 0.892 NA 0.008
#> SRR772538 4 0.2376 0.8084 0.000 0.096 0.000 0.884 NA 0.008
#> SRR772539 1 0.2618 0.7726 0.876 0.092 0.004 0.000 NA 0.004
#> SRR772540 1 0.2717 0.7728 0.868 0.100 0.004 0.000 NA 0.004
#> SRR772541 2 0.4392 0.6751 0.032 0.736 0.004 0.016 NA 0.008
#> SRR772542 1 0.5440 0.6396 0.684 0.084 0.004 0.000 NA 0.148
#> SRR772543 1 0.4974 0.6757 0.732 0.064 0.008 0.000 NA 0.124
#> SRR772544 3 0.3510 0.7070 0.016 0.000 0.772 0.000 NA 0.204
#> SRR772545 1 0.3540 0.7606 0.828 0.096 0.008 0.000 NA 0.012
#> SRR772546 1 0.3540 0.7606 0.828 0.096 0.008 0.000 NA 0.012
#> SRR772547 1 0.6265 0.3091 0.464 0.364 0.000 0.012 NA 0.016
#> SRR772548 1 0.5598 0.6145 0.612 0.248 0.000 0.004 NA 0.024
#> SRR772549 1 0.2562 0.7663 0.892 0.064 0.012 0.000 NA 0.008
#> SRR772550 1 0.2425 0.7626 0.900 0.060 0.016 0.000 NA 0.008
#> SRR772551 2 0.5681 0.6139 0.164 0.660 0.000 0.032 NA 0.020
#> SRR772552 2 0.5127 0.6558 0.144 0.712 0.000 0.036 NA 0.012
#> SRR772553 2 0.6631 0.4805 0.024 0.592 0.000 0.116 NA 0.140
#> SRR772554 2 0.1858 0.6964 0.000 0.904 0.000 0.092 NA 0.000
#> SRR772555 2 0.1858 0.6964 0.000 0.904 0.000 0.092 NA 0.000
#> SRR772556 1 0.3203 0.7591 0.864 0.052 0.020 0.000 NA 0.020
#> SRR772557 1 0.3006 0.7555 0.876 0.044 0.020 0.000 NA 0.020
#> SRR772558 1 0.4715 0.6860 0.692 0.212 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772559 1 0.4956 0.7217 0.708 0.180 0.008 0.004 NA 0.016
#> SRR772560 2 0.5914 0.5146 0.220 0.576 0.004 0.012 NA 0.004
#> SRR772561 6 0.5311 -0.1044 0.020 0.016 0.260 0.004 NA 0.648
#> SRR772562 2 0.2701 0.6977 0.000 0.864 0.000 0.104 NA 0.004
#> SRR772563 2 0.2653 0.6992 0.000 0.868 0.000 0.100 NA 0.004
#> SRR772564 1 0.2783 0.6949 0.884 0.008 0.028 0.000 NA 0.056
#> SRR772565 1 0.2783 0.6949 0.884 0.008 0.028 0.000 NA 0.056
#> SRR772566 1 0.2765 0.6650 0.876 0.000 0.044 0.000 NA 0.064
#> SRR772567 1 0.2765 0.6650 0.876 0.000 0.044 0.000 NA 0.064
#> SRR772568 2 0.2002 0.7064 0.000 0.908 0.000 0.076 NA 0.004
#> SRR772569 2 0.2002 0.7064 0.000 0.908 0.000 0.076 NA 0.004
#> SRR772570 1 0.4677 0.7145 0.708 0.196 0.000 0.000 NA 0.020
#> SRR772571 1 0.4628 0.7131 0.708 0.200 0.004 0.000 NA 0.008
#> SRR772572 2 0.5834 0.1175 0.368 0.504 0.000 0.012 NA 0.008
#> SRR772573 2 0.5891 0.1690 0.356 0.512 0.000 0.016 NA 0.008
#> SRR772574 1 0.4742 0.7089 0.700 0.184 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772575 1 0.4883 0.6887 0.680 0.204 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772576 2 0.3105 0.7245 0.080 0.848 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR772577 2 0.3714 0.7255 0.080 0.820 0.000 0.016 NA 0.008
#> SRR772578 4 0.3030 0.7990 0.000 0.168 0.000 0.816 NA 0.008
#> SRR772579 4 0.2994 0.8011 0.000 0.164 0.000 0.820 NA 0.008
#> SRR772580 3 0.0806 0.7229 0.020 0.000 0.972 0.000 NA 0.008
#> SRR772581 2 0.6641 0.5592 0.164 0.588 0.000 0.076 NA 0.032
#> SRR772582 2 0.6498 0.5876 0.152 0.608 0.000 0.080 NA 0.032
#> SRR772583 2 0.4825 0.6298 0.168 0.700 0.000 0.008 NA 0.004
#> SRR772584 2 0.4679 0.6422 0.160 0.716 0.000 0.008 NA 0.004
#> SRR772585 2 0.4779 0.6738 0.036 0.736 0.004 0.052 NA 0.008
#> SRR772586 6 0.5841 0.6509 0.204 0.000 0.332 0.000 NA 0.464
#> SRR772587 1 0.5968 0.4182 0.504 0.332 0.000 0.004 NA 0.012
#> SRR772588 2 0.2740 0.6839 0.000 0.852 0.000 0.120 NA 0.000
#> SRR772589 2 0.2740 0.6839 0.000 0.852 0.000 0.120 NA 0.000
#> SRR772590 3 0.4610 0.5986 0.012 0.000 0.580 0.000 NA 0.384
#> SRR772591 1 0.2605 0.6692 0.884 0.000 0.040 0.000 NA 0.064
#> SRR772592 1 0.2781 0.6740 0.880 0.004 0.040 0.000 NA 0.060
#> SRR772593 6 0.5841 0.6526 0.204 0.000 0.332 0.000 NA 0.464
#> SRR772594 4 0.2833 0.8071 0.000 0.148 0.000 0.836 NA 0.012
#> SRR772595 4 0.2833 0.8071 0.000 0.148 0.000 0.836 NA 0.012
#> SRR772596 6 0.5855 0.6473 0.200 0.000 0.352 0.000 NA 0.448
#> SRR772597 3 0.0806 0.7229 0.020 0.000 0.972 0.000 NA 0.008
#> SRR772598 1 0.2713 0.6755 0.880 0.000 0.052 0.000 NA 0.052
#> SRR772599 1 0.2775 0.6741 0.876 0.000 0.056 0.000 NA 0.052
#> SRR772600 4 0.5337 0.6801 0.000 0.196 0.000 0.644 NA 0.020
#> SRR772601 4 0.5086 0.6892 0.000 0.192 0.000 0.668 NA 0.016
#> SRR772602 3 0.3984 0.6619 0.008 0.000 0.664 0.000 NA 0.320
#> SRR772603 4 0.6146 0.6142 0.008 0.252 0.000 0.544 NA 0.020
#> SRR772604 4 0.5771 0.6577 0.004 0.228 0.000 0.588 NA 0.016
#> SRR772605 2 0.4871 0.6741 0.076 0.704 0.004 0.016 NA 0.004
#> SRR772606 1 0.2622 0.7274 0.896 0.024 0.016 0.000 NA 0.044
#> SRR772607 1 0.2483 0.7315 0.904 0.024 0.016 0.000 NA 0.036
#> SRR772608 2 0.2985 0.7254 0.044 0.864 0.000 0.012 NA 0.004
#> SRR772609 2 0.2985 0.7254 0.044 0.864 0.000 0.012 NA 0.004
#> SRR772610 2 0.2263 0.7134 0.004 0.900 0.000 0.060 NA 0.000
#> SRR772611 2 0.2052 0.7128 0.004 0.912 0.000 0.056 NA 0.000
#> SRR772612 4 0.2278 0.7581 0.000 0.032 0.000 0.904 NA 0.012
#> SRR772613 4 0.1970 0.7557 0.000 0.028 0.000 0.920 NA 0.008
#> SRR772614 1 0.2725 0.7413 0.892 0.036 0.020 0.000 NA 0.032
#> SRR772615 1 0.3236 0.7184 0.864 0.024 0.032 0.000 NA 0.052
#> SRR772616 1 0.6035 0.3630 0.480 0.352 0.000 0.004 NA 0.012
#> SRR772617 4 0.3576 0.7445 0.000 0.096 0.000 0.812 NA 0.008
#> SRR772618 4 0.3576 0.7445 0.000 0.096 0.000 0.812 NA 0.008
#> SRR772619 4 0.1036 0.7651 0.000 0.024 0.000 0.964 NA 0.004
#> SRR772620 4 0.1036 0.7651 0.000 0.024 0.000 0.964 NA 0.004
#> SRR772621 2 0.4352 0.6794 0.132 0.764 0.000 0.016 NA 0.008
#> SRR772622 2 0.3592 0.6958 0.116 0.808 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR772623 3 0.5010 0.5585 0.008 0.000 0.648 0.000 NA 0.104
#> SRR772624 6 0.5862 0.6535 0.204 0.000 0.344 0.000 NA 0.452
#> SRR772625 2 0.6431 0.4277 0.016 0.584 0.000 0.200 NA 0.068
#> SRR772626 2 0.7622 0.3639 0.068 0.492 0.000 0.156 NA 0.104
#> SRR772627 2 0.7670 0.3711 0.068 0.488 0.000 0.148 NA 0.116
#> SRR772628 1 0.4377 0.7550 0.780 0.116 0.012 0.004 NA 0.024
#> SRR772629 1 0.4218 0.7481 0.764 0.144 0.004 0.000 NA 0.012
#> SRR772630 1 0.5854 0.2033 0.452 0.416 0.000 0.004 NA 0.012
#> SRR772631 6 0.5859 0.6496 0.208 0.000 0.332 0.000 NA 0.460
#> SRR772632 2 0.3984 0.2037 0.000 0.596 0.000 0.396 NA 0.000
#> SRR772633 2 0.3984 0.2037 0.000 0.596 0.000 0.396 NA 0.000
#> SRR772634 2 0.5393 0.4839 0.260 0.620 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR772635 2 0.5317 0.4970 0.268 0.620 0.000 0.000 NA 0.024
#> SRR772636 2 0.6431 0.4277 0.016 0.584 0.000 0.200 NA 0.068
#> SRR772637 1 0.2976 0.7544 0.876 0.056 0.028 0.000 NA 0.016
#> SRR772638 1 0.2783 0.7498 0.888 0.044 0.028 0.000 NA 0.016
#> SRR772639 2 0.2357 0.6892 0.000 0.872 0.000 0.116 NA 0.000
#> SRR772640 4 0.2302 0.8119 0.000 0.120 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR772641 4 0.2302 0.8119 0.000 0.120 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR772642 2 0.3409 0.7295 0.056 0.844 0.000 0.020 NA 0.008
#> SRR772643 2 0.2379 0.7249 0.012 0.904 0.000 0.024 NA 0.008
#> SRR772644 1 0.4693 0.6853 0.692 0.216 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772645 1 0.4628 0.7182 0.716 0.192 0.008 0.000 NA 0.008
#> SRR772646 2 0.2118 0.6914 0.000 0.888 0.000 0.104 NA 0.000
#> SRR772647 2 0.2118 0.6914 0.000 0.888 0.000 0.104 NA 0.000
#> SRR772648 2 0.2964 0.7271 0.060 0.868 0.000 0.036 NA 0.000
#> SRR772649 2 0.2781 0.7265 0.040 0.880 0.000 0.044 NA 0.000
#> SRR772650 2 0.5540 0.2664 0.348 0.520 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR772651 2 0.5540 0.2664 0.348 0.520 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR772652 1 0.3514 0.7628 0.840 0.072 0.016 0.000 NA 0.016
#> SRR772653 1 0.3514 0.7628 0.840 0.072 0.016 0.000 NA 0.016
#> SRR772654 2 0.4290 0.6378 0.168 0.744 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR772655 2 0.4160 0.6546 0.160 0.760 0.000 0.008 NA 0.004
#> SRR772656 3 0.4180 0.6444 0.008 0.000 0.632 0.000 NA 0.348
#> SRR772657 6 0.4636 -0.3324 0.012 0.000 0.396 0.000 NA 0.568
#> SRR772658 4 0.2302 0.7519 0.000 0.032 0.000 0.900 NA 0.008
#> SRR772659 4 0.2302 0.7519 0.000 0.032 0.000 0.900 NA 0.008
#> SRR772660 2 0.4296 0.6974 0.044 0.760 0.000 0.044 NA 0.000
#> SRR772661 6 0.8115 0.2535 0.148 0.276 0.108 0.000 NA 0.384
#> SRR772662 2 0.5443 0.2467 0.364 0.520 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR772663 2 0.5609 0.1631 0.384 0.492 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR772664 2 0.2924 0.7219 0.040 0.868 0.000 0.068 NA 0.000
#> SRR772665 2 0.3044 0.7219 0.036 0.860 0.000 0.076 NA 0.000
#> SRR772666 3 0.2443 0.7276 0.020 0.000 0.880 0.000 NA 0.096
#> SRR772667 2 0.6241 0.0478 0.000 0.476 0.008 0.340 NA 0.016
#> SRR772668 4 0.3377 0.6292 0.000 0.004 0.004 0.816 NA 0.036
#> SRR772669 4 0.3377 0.6292 0.000 0.004 0.004 0.816 NA 0.036
#> SRR772670 2 0.5466 0.3948 0.300 0.572 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR772671 2 0.5700 0.2990 0.332 0.532 0.000 0.008 NA 0.004
#> SRR772672 2 0.3503 0.6937 0.008 0.824 0.000 0.112 NA 0.008
#> SRR772673 2 0.3503 0.6937 0.008 0.824 0.000 0.112 NA 0.008
#> SRR772674 3 0.4167 0.6471 0.008 0.000 0.636 0.000 NA 0.344
#> SRR772675 2 0.7279 0.0640 0.124 0.420 0.024 0.000 NA 0.336
#> SRR772676 2 0.4802 0.4944 0.260 0.660 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR772677 2 0.4892 0.4789 0.268 0.648 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR772678 2 0.7679 -0.0669 0.120 0.380 0.056 0.000 NA 0.348
#> SRR772679 2 0.5536 0.3579 0.312 0.544 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR772680 2 0.5611 0.3139 0.328 0.524 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR772681 3 0.4167 0.6471 0.008 0.000 0.636 0.000 NA 0.344
#> SRR772682 2 0.2581 0.6935 0.000 0.860 0.000 0.120 NA 0.000
#> SRR772683 2 0.2586 0.7063 0.000 0.868 0.000 0.100 NA 0.000
#> SRR772685 2 0.2255 0.7069 0.004 0.892 0.000 0.088 NA 0.000
#> SRR772686 3 0.1549 0.7346 0.020 0.000 0.936 0.000 NA 0.044
#> SRR772687 3 0.5848 -0.2186 0.200 0.000 0.560 0.000 NA 0.224
#> SRR772688 4 0.2170 0.8091 0.000 0.100 0.000 0.888 NA 0.000
#> SRR772689 4 0.2170 0.8091 0.000 0.100 0.000 0.888 NA 0.000
#> SRR772690 3 0.3158 0.7184 0.020 0.000 0.812 0.000 NA 0.164
#> SRR772691 2 0.6431 0.4277 0.016 0.584 0.000 0.200 NA 0.068
#> SRR772692 2 0.5522 0.3845 0.308 0.576 0.000 0.000 NA 0.024
#> SRR772693 2 0.5550 0.5501 0.220 0.644 0.000 0.004 NA 0.052
#> SRR772694 2 0.3041 0.7285 0.020 0.872 0.000 0.056 NA 0.016
#> SRR772695 2 0.4537 0.7057 0.104 0.760 0.000 0.028 NA 0.008
#> SRR772696 2 0.2602 0.7258 0.052 0.888 0.000 0.020 NA 0.000
#> SRR772697 2 0.2602 0.7258 0.052 0.888 0.000 0.020 NA 0.000
#> SRR772698 6 0.5868 0.6527 0.204 0.000 0.348 0.000 NA 0.448
#> SRR772699 1 0.3640 0.7664 0.816 0.108 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR772700 1 0.3640 0.7665 0.816 0.108 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR772701 1 0.4355 0.7355 0.736 0.164 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR772702 1 0.4506 0.7524 0.752 0.132 0.012 0.000 NA 0.012
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.907 0.930 0.970 0.4970 0.502 0.502
#> 3 3 0.536 0.711 0.824 0.2198 0.763 0.584
#> 4 4 0.678 0.805 0.893 0.1335 0.768 0.503
#> 5 5 0.684 0.672 0.828 0.0791 0.944 0.824
#> 6 6 0.646 0.582 0.765 0.0578 0.902 0.664
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.2043 0.94268 0.968 0.032
#> SRR772344 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.2043 0.94331 0.968 0.032
#> SRR772347 1 0.0672 0.95836 0.992 0.008
#> SRR772348 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772353 1 0.9248 0.49511 0.660 0.340
#> SRR772354 2 0.9460 0.44128 0.364 0.636
#> SRR772355 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772357 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772359 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772360 1 0.0376 0.96028 0.996 0.004
#> SRR772361 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.2603 0.93239 0.956 0.044
#> SRR772365 1 0.2948 0.92588 0.948 0.052
#> SRR772366 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.1184 0.96123 0.016 0.984
#> SRR772370 2 0.0938 0.96387 0.012 0.988
#> SRR772371 1 0.8081 0.69169 0.752 0.248
#> SRR772372 1 0.9393 0.48378 0.644 0.356
#> SRR772373 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.7299 0.75744 0.796 0.204
#> SRR772378 2 0.7602 0.72446 0.220 0.780
#> SRR772379 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772380 2 0.8081 0.66734 0.248 0.752
#> SRR772381 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772384 1 0.2603 0.93327 0.956 0.044
#> SRR772385 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772386 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772393 2 0.0376 0.97009 0.004 0.996
#> SRR772394 2 0.1184 0.96076 0.016 0.984
#> SRR772395 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772402 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.1414 0.95082 0.980 0.020
#> SRR772406 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.0938 0.96396 0.012 0.988
#> SRR772411 2 0.2236 0.94292 0.036 0.964
#> SRR772412 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772417 1 0.9460 0.46226 0.636 0.364
#> SRR772418 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.6623 0.79025 0.172 0.828
#> SRR772422 2 0.1414 0.95769 0.020 0.980
#> SRR772423 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772430 1 0.8763 0.58973 0.704 0.296
#> SRR772431 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.3584 0.91116 0.932 0.068
#> SRR772436 1 0.2043 0.94181 0.968 0.032
#> SRR772437 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772440 2 0.0672 0.96718 0.008 0.992
#> SRR772441 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772448 2 0.0672 0.96719 0.008 0.992
#> SRR772449 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772455 1 0.4431 0.89068 0.908 0.092
#> SRR772456 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772466 2 0.0376 0.97009 0.004 0.996
#> SRR772467 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.6343 0.81393 0.840 0.160
#> SRR772470 1 0.2778 0.92983 0.952 0.048
#> SRR772471 1 0.5946 0.83332 0.856 0.144
#> SRR772472 1 0.0938 0.95591 0.988 0.012
#> SRR772473 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772480 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772481 2 0.1184 0.96082 0.016 0.984
#> SRR772482 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772484 2 0.0376 0.97010 0.004 0.996
#> SRR772485 2 0.0376 0.97012 0.004 0.996
#> SRR772486 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.6887 0.77402 0.184 0.816
#> SRR772489 2 0.3274 0.92102 0.060 0.940
#> SRR772490 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772498 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772499 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.7602 0.73442 0.780 0.220
#> SRR772503 1 0.2236 0.93956 0.964 0.036
#> SRR772504 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.9209 0.52694 0.664 0.336
#> SRR772510 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772512 1 0.9686 0.36663 0.604 0.396
#> SRR772513 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.9170 0.49587 0.332 0.668
#> SRR772522 2 0.9552 0.38402 0.376 0.624
#> SRR772523 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.3274 0.91997 0.940 0.060
#> SRR772535 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772541 2 0.0672 0.96714 0.008 0.992
#> SRR772542 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772547 1 0.7376 0.75179 0.792 0.208
#> SRR772548 1 0.2236 0.93971 0.964 0.036
#> SRR772549 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772551 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772552 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772553 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772554 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.1414 0.95078 0.980 0.020
#> SRR772559 1 0.1184 0.95343 0.984 0.016
#> SRR772560 2 0.9996 0.00251 0.488 0.512
#> SRR772561 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772572 1 0.8661 0.62184 0.712 0.288
#> SRR772573 1 0.9977 0.14246 0.528 0.472
#> SRR772574 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772576 2 0.2423 0.93979 0.040 0.960
#> SRR772577 2 0.2778 0.93265 0.048 0.952
#> SRR772578 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.3733 0.90801 0.072 0.928
#> SRR772582 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772583 2 0.2778 0.93342 0.048 0.952
#> SRR772584 2 0.3879 0.90475 0.076 0.924
#> SRR772585 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.1414 0.95092 0.980 0.020
#> SRR772588 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772600 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772606 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0376 0.97012 0.004 0.996
#> SRR772609 2 0.1184 0.96076 0.016 0.984
#> SRR772610 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.6887 0.78414 0.816 0.184
#> SRR772617 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.4161 0.89595 0.084 0.916
#> SRR772622 2 0.1184 0.96085 0.016 0.984
#> SRR772623 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772627 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772628 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772630 1 0.9775 0.33630 0.588 0.412
#> SRR772631 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772635 1 0.3733 0.90695 0.928 0.072
#> SRR772636 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.4431 0.88812 0.092 0.908
#> SRR772643 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772644 1 0.0672 0.95821 0.992 0.008
#> SRR772645 1 0.0376 0.96032 0.996 0.004
#> SRR772646 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772650 1 0.2236 0.93985 0.964 0.036
#> SRR772651 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772654 2 0.8763 0.58523 0.296 0.704
#> SRR772655 2 0.7883 0.69980 0.236 0.764
#> SRR772656 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.3879 0.90521 0.924 0.076
#> SRR772662 1 0.1184 0.95299 0.984 0.016
#> SRR772663 1 0.2423 0.93585 0.960 0.040
#> SRR772664 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.9129 0.50455 0.328 0.672
#> SRR772671 2 0.8016 0.67271 0.244 0.756
#> SRR772672 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.1184 0.95338 0.984 0.016
#> SRR772676 2 0.9460 0.41661 0.364 0.636
#> SRR772677 2 0.7745 0.70028 0.228 0.772
#> SRR772678 1 0.5737 0.84289 0.864 0.136
#> SRR772679 1 0.6048 0.82329 0.852 0.148
#> SRR772680 1 0.0672 0.95819 0.992 0.008
#> SRR772681 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772692 1 0.4690 0.88293 0.900 0.100
#> SRR772693 2 0.7674 0.70851 0.224 0.776
#> SRR772694 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772696 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772697 2 0.0000 0.97293 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.96248 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772342 1 0.5363 0.6601 0.724 0.000 0.276
#> SRR772343 1 0.0661 0.7041 0.988 0.004 0.008
#> SRR772344 2 0.2066 0.8184 0.060 0.940 0.000
#> SRR772345 2 0.0592 0.8032 0.012 0.988 0.000
#> SRR772346 1 0.0000 0.7023 1.000 0.000 0.000
#> SRR772347 1 0.0237 0.7037 0.996 0.000 0.004
#> SRR772348 2 0.5178 0.8163 0.256 0.744 0.000
#> SRR772349 2 0.3619 0.8320 0.136 0.864 0.000
#> SRR772350 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772351 2 0.5254 0.8160 0.264 0.736 0.000
#> SRR772352 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772353 1 0.0424 0.6997 0.992 0.008 0.000
#> SRR772354 1 0.0747 0.6969 0.984 0.016 0.000
#> SRR772355 2 0.5529 0.8044 0.296 0.704 0.000
#> SRR772356 2 0.2878 0.8262 0.096 0.904 0.000
#> SRR772357 1 0.4062 0.6993 0.836 0.000 0.164
#> SRR772358 1 0.2796 0.7119 0.908 0.000 0.092
#> SRR772359 1 0.0892 0.7071 0.980 0.000 0.020
#> SRR772360 1 0.0000 0.7023 1.000 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0424 0.9395 0.008 0.000 0.992
#> SRR772362 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.3619 0.6988 0.864 0.000 0.136
#> SRR772365 1 0.1031 0.7064 0.976 0.000 0.024
#> SRR772366 3 0.1529 0.9248 0.040 0.000 0.960
#> SRR772367 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772368 2 0.5560 0.8033 0.300 0.700 0.000
#> SRR772369 1 0.2165 0.6652 0.936 0.064 0.000
#> SRR772370 1 0.1289 0.6878 0.968 0.032 0.000
#> SRR772371 1 0.3192 0.6252 0.888 0.112 0.000
#> SRR772372 1 0.2955 0.6500 0.912 0.080 0.008
#> SRR772373 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772374 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772375 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772376 2 0.2711 0.8224 0.088 0.912 0.000
#> SRR772377 3 0.7633 0.6014 0.184 0.132 0.684
#> SRR772378 1 0.0592 0.6980 0.988 0.012 0.000
#> SRR772379 1 0.5621 0.1651 0.692 0.308 0.000
#> SRR772380 1 0.0747 0.6961 0.984 0.016 0.000
#> SRR772381 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772382 1 0.4887 0.6806 0.772 0.000 0.228
#> SRR772383 1 0.5327 0.6625 0.728 0.000 0.272
#> SRR772384 3 0.4840 0.7870 0.168 0.016 0.816
#> SRR772385 2 0.2749 0.8138 0.064 0.924 0.012
#> SRR772386 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772387 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772388 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772389 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772390 3 0.1163 0.9336 0.028 0.000 0.972
#> SRR772391 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772392 1 0.5560 0.6454 0.700 0.000 0.300
#> SRR772393 2 0.6298 0.7190 0.388 0.608 0.004
#> SRR772394 2 0.6518 0.5499 0.484 0.512 0.004
#> SRR772395 2 0.4452 0.8286 0.192 0.808 0.000
#> SRR772396 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772397 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772398 1 0.5591 0.6423 0.696 0.000 0.304
#> SRR772399 1 0.5016 0.6708 0.760 0.000 0.240
#> SRR772400 1 0.5650 0.6351 0.688 0.000 0.312
#> SRR772401 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772402 2 0.2590 0.8201 0.072 0.924 0.004
#> SRR772403 2 0.2772 0.8213 0.080 0.916 0.004
#> SRR772404 2 0.5291 0.8137 0.268 0.732 0.000
#> SRR772405 3 0.3619 0.8381 0.136 0.000 0.864
#> SRR772406 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772407 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 1 0.4346 0.5184 0.816 0.184 0.000
#> SRR772411 1 0.4178 0.5419 0.828 0.172 0.000
#> SRR772412 1 0.5733 0.6213 0.676 0.000 0.324
#> SRR772413 1 0.5733 0.6213 0.676 0.000 0.324
#> SRR772414 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772415 1 0.6168 -0.2683 0.588 0.412 0.000
#> SRR772416 2 0.6154 0.6914 0.408 0.592 0.000
#> SRR772417 1 0.0892 0.6953 0.980 0.020 0.000
#> SRR772418 3 0.1163 0.9336 0.028 0.000 0.972
#> SRR772419 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 1 0.4555 0.4543 0.800 0.200 0.000
#> SRR772422 2 0.6204 0.6675 0.424 0.576 0.000
#> SRR772423 2 0.0829 0.8021 0.012 0.984 0.004
#> SRR772424 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772425 2 0.5591 0.8012 0.304 0.696 0.000
#> SRR772426 2 0.2356 0.8201 0.072 0.928 0.000
#> SRR772427 2 0.2356 0.8201 0.072 0.928 0.000
#> SRR772428 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772429 1 0.5650 0.6350 0.688 0.000 0.312
#> SRR772430 1 0.0829 0.7051 0.984 0.004 0.012
#> SRR772431 2 0.2772 0.8200 0.080 0.916 0.004
#> SRR772432 2 0.3030 0.8186 0.092 0.904 0.004
#> SRR772433 1 0.5785 0.6106 0.668 0.000 0.332
#> SRR772434 1 0.5733 0.6213 0.676 0.000 0.324
#> SRR772435 1 0.2448 0.7069 0.924 0.000 0.076
#> SRR772436 1 0.2356 0.7073 0.928 0.000 0.072
#> SRR772437 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772438 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772439 1 0.5706 0.6262 0.680 0.000 0.320
#> SRR772440 1 0.6307 -0.4918 0.512 0.488 0.000
#> SRR772441 2 0.6168 0.6862 0.412 0.588 0.000
#> SRR772442 2 0.2945 0.8229 0.088 0.908 0.004
#> SRR772443 2 0.4172 0.8302 0.156 0.840 0.004
#> SRR772444 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772445 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772446 1 0.4842 0.6822 0.776 0.000 0.224
#> SRR772447 1 0.3267 0.7079 0.884 0.000 0.116
#> SRR772448 2 0.6252 0.6332 0.444 0.556 0.000
#> SRR772449 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.5591 0.6424 0.696 0.000 0.304
#> SRR772453 1 0.4931 0.6729 0.768 0.000 0.232
#> SRR772454 1 0.2537 0.7071 0.920 0.000 0.080
#> SRR772455 1 0.0237 0.7012 0.996 0.004 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772459 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772460 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772461 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772462 2 0.4796 0.8251 0.220 0.780 0.000
#> SRR772463 2 0.5327 0.8137 0.272 0.728 0.000
#> SRR772464 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772465 1 0.5882 0.0257 0.652 0.348 0.000
#> SRR772466 1 0.3686 0.5855 0.860 0.140 0.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.3129 0.7116 0.904 0.008 0.088
#> SRR772470 1 0.3112 0.7108 0.900 0.004 0.096
#> SRR772471 1 0.3295 0.7108 0.896 0.008 0.096
#> SRR772472 1 0.2945 0.7113 0.908 0.004 0.088
#> SRR772473 2 0.4682 0.8285 0.192 0.804 0.004
#> SRR772474 2 0.3784 0.8293 0.132 0.864 0.004
#> SRR772475 2 0.5360 0.8147 0.220 0.768 0.012
#> SRR772476 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772479 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772480 2 0.6513 0.5697 0.476 0.520 0.004
#> SRR772481 1 0.6521 -0.5103 0.504 0.492 0.004
#> SRR772482 1 0.5016 0.6753 0.760 0.000 0.240
#> SRR772483 1 0.4346 0.6934 0.816 0.000 0.184
#> SRR772484 2 0.6154 0.6920 0.408 0.592 0.000
#> SRR772485 2 0.6154 0.6920 0.408 0.592 0.000
#> SRR772486 1 0.5621 0.6419 0.692 0.000 0.308
#> SRR772487 1 0.5650 0.6386 0.688 0.000 0.312
#> SRR772488 1 0.6062 -0.1733 0.616 0.384 0.000
#> SRR772489 1 0.6302 -0.4711 0.520 0.480 0.000
#> SRR772490 1 0.5591 0.6424 0.696 0.000 0.304
#> SRR772491 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772492 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772493 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772494 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772497 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772498 2 0.5728 0.8108 0.272 0.720 0.008
#> SRR772499 2 0.5202 0.8206 0.220 0.772 0.008
#> SRR772500 2 0.2261 0.8205 0.068 0.932 0.000
#> SRR772501 2 0.1964 0.8168 0.056 0.944 0.000
#> SRR772502 1 0.0829 0.7002 0.984 0.012 0.004
#> SRR772503 1 0.0475 0.7029 0.992 0.004 0.004
#> SRR772504 2 0.4121 0.8301 0.168 0.832 0.000
#> SRR772505 2 0.3038 0.8275 0.104 0.896 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.2066 0.8189 0.060 0.940 0.000
#> SRR772509 1 0.9173 -0.1575 0.520 0.304 0.176
#> SRR772510 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772511 1 0.4452 0.4939 0.808 0.192 0.000
#> SRR772512 3 0.6226 0.5613 0.252 0.028 0.720
#> SRR772513 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772514 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772515 2 0.5650 0.7966 0.312 0.688 0.000
#> SRR772516 2 0.5591 0.8016 0.304 0.696 0.000
#> SRR772517 2 0.5948 0.7504 0.360 0.640 0.000
#> SRR772518 2 0.6154 0.6920 0.408 0.592 0.000
#> SRR772519 2 0.5591 0.8015 0.304 0.696 0.000
#> SRR772520 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772521 1 0.2066 0.6707 0.940 0.060 0.000
#> SRR772522 1 0.1964 0.6731 0.944 0.056 0.000
#> SRR772523 2 0.2959 0.8256 0.100 0.900 0.000
#> SRR772524 2 0.4702 0.8265 0.212 0.788 0.000
#> SRR772525 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772526 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.1031 0.9360 0.024 0.000 0.976
#> SRR772529 1 0.5098 0.6722 0.752 0.000 0.248
#> SRR772530 1 0.5178 0.6697 0.744 0.000 0.256
#> SRR772531 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772532 2 0.4750 0.8257 0.216 0.784 0.000
#> SRR772533 2 0.4750 0.8257 0.216 0.784 0.000
#> SRR772534 1 0.0424 0.6999 0.992 0.008 0.000
#> SRR772535 2 0.5397 0.8117 0.280 0.720 0.000
#> SRR772536 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772537 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772538 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772539 1 0.5397 0.6574 0.720 0.000 0.280
#> SRR772540 1 0.4750 0.6843 0.784 0.000 0.216
#> SRR772541 2 0.6140 0.6992 0.404 0.596 0.000
#> SRR772542 1 0.5560 0.6470 0.700 0.000 0.300
#> SRR772543 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772544 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772545 1 0.5363 0.6603 0.724 0.000 0.276
#> SRR772546 1 0.5327 0.6624 0.728 0.000 0.272
#> SRR772547 1 0.0747 0.6971 0.984 0.016 0.000
#> SRR772548 1 0.3784 0.7052 0.864 0.004 0.132
#> SRR772549 1 0.5591 0.6424 0.696 0.000 0.304
#> SRR772550 1 0.5560 0.6456 0.700 0.000 0.300
#> SRR772551 1 0.5291 0.2766 0.732 0.268 0.000
#> SRR772552 2 0.6295 0.5650 0.472 0.528 0.000
#> SRR772553 2 0.5578 0.8123 0.240 0.748 0.012
#> SRR772554 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772555 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772556 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772557 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772558 1 0.1129 0.7070 0.976 0.004 0.020
#> SRR772559 1 0.2590 0.7117 0.924 0.004 0.072
#> SRR772560 1 0.2625 0.6512 0.916 0.084 0.000
#> SRR772561 3 0.0892 0.9318 0.020 0.000 0.980
#> SRR772562 2 0.5591 0.8015 0.304 0.696 0.000
#> SRR772563 2 0.5560 0.8035 0.300 0.700 0.000
#> SRR772564 1 0.5706 0.6261 0.680 0.000 0.320
#> SRR772565 1 0.5706 0.6261 0.680 0.000 0.320
#> SRR772566 1 0.5810 0.6057 0.664 0.000 0.336
#> SRR772567 1 0.5733 0.6219 0.676 0.000 0.324
#> SRR772568 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772569 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772570 1 0.3573 0.7075 0.876 0.004 0.120
#> SRR772571 1 0.1411 0.7097 0.964 0.000 0.036
#> SRR772572 1 0.1031 0.6932 0.976 0.024 0.000
#> SRR772573 1 0.3752 0.5878 0.856 0.144 0.000
#> SRR772574 1 0.2796 0.7124 0.908 0.000 0.092
#> SRR772575 1 0.0892 0.7073 0.980 0.000 0.020
#> SRR772576 2 0.6225 0.6562 0.432 0.568 0.000
#> SRR772577 2 0.6302 0.5633 0.480 0.520 0.000
#> SRR772578 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772579 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772580 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772581 1 0.1964 0.6712 0.944 0.056 0.000
#> SRR772582 2 0.6215 0.6568 0.428 0.572 0.000
#> SRR772583 1 0.1529 0.6825 0.960 0.040 0.000
#> SRR772584 1 0.5178 0.3081 0.744 0.256 0.000
#> SRR772585 2 0.6045 0.7288 0.380 0.620 0.000
#> SRR772586 3 0.2711 0.8784 0.088 0.000 0.912
#> SRR772587 1 0.3349 0.7092 0.888 0.004 0.108
#> SRR772588 2 0.2356 0.8206 0.072 0.928 0.000
#> SRR772589 2 0.1753 0.8148 0.048 0.952 0.000
#> SRR772590 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772591 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772592 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772593 3 0.1529 0.9250 0.040 0.000 0.960
#> SRR772594 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772595 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772596 3 0.0424 0.9390 0.008 0.000 0.992
#> SRR772597 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772598 1 0.5785 0.6108 0.668 0.000 0.332
#> SRR772599 1 0.5733 0.6213 0.676 0.000 0.324
#> SRR772600 2 0.4047 0.8293 0.148 0.848 0.004
#> SRR772601 2 0.2590 0.8194 0.072 0.924 0.004
#> SRR772602 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772603 2 0.6264 0.7134 0.380 0.616 0.004
#> SRR772604 2 0.3349 0.8239 0.108 0.888 0.004
#> SRR772605 1 0.5859 0.0386 0.656 0.344 0.000
#> SRR772606 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772607 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772608 2 0.6215 0.6614 0.428 0.572 0.000
#> SRR772609 2 0.6308 0.5344 0.492 0.508 0.000
#> SRR772610 2 0.5591 0.8015 0.304 0.696 0.000
#> SRR772611 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772612 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772613 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772614 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772615 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772616 1 0.0829 0.7003 0.984 0.012 0.004
#> SRR772617 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772618 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772619 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772620 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772621 1 0.6168 -0.2724 0.588 0.412 0.000
#> SRR772622 1 0.5948 -0.0785 0.640 0.360 0.000
#> SRR772623 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772624 3 0.1964 0.9086 0.056 0.000 0.944
#> SRR772625 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772626 2 0.6018 0.7964 0.308 0.684 0.008
#> SRR772627 2 0.4755 0.8257 0.184 0.808 0.008
#> SRR772628 1 0.4974 0.6771 0.764 0.000 0.236
#> SRR772629 1 0.5497 0.6509 0.708 0.000 0.292
#> SRR772630 1 0.0892 0.6951 0.980 0.020 0.000
#> SRR772631 3 0.1529 0.9248 0.040 0.000 0.960
#> SRR772632 2 0.0237 0.8001 0.004 0.996 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 1 0.1753 0.7095 0.952 0.000 0.048
#> SRR772635 1 0.0475 0.7026 0.992 0.004 0.004
#> SRR772636 2 0.2339 0.8095 0.048 0.940 0.012
#> SRR772637 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772638 1 0.5591 0.6424 0.696 0.000 0.304
#> SRR772639 2 0.5327 0.8138 0.272 0.728 0.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.5706 0.0873 0.680 0.320 0.000
#> SRR772643 2 0.5785 0.7814 0.332 0.668 0.000
#> SRR772644 1 0.2682 0.7118 0.920 0.004 0.076
#> SRR772645 1 0.2772 0.7117 0.916 0.004 0.080
#> SRR772646 2 0.5138 0.8191 0.252 0.748 0.000
#> SRR772647 2 0.5431 0.8100 0.284 0.716 0.000
#> SRR772648 2 0.5835 0.7732 0.340 0.660 0.000
#> SRR772649 2 0.5650 0.7968 0.312 0.688 0.000
#> SRR772650 1 0.0237 0.7012 0.996 0.004 0.000
#> SRR772651 1 0.0592 0.7058 0.988 0.000 0.012
#> SRR772652 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772653 1 0.5529 0.6480 0.704 0.000 0.296
#> SRR772654 1 0.0892 0.6944 0.980 0.020 0.000
#> SRR772655 1 0.0747 0.6969 0.984 0.016 0.000
#> SRR772656 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772657 3 0.0424 0.9395 0.008 0.000 0.992
#> SRR772658 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772659 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772660 2 0.5678 0.7946 0.316 0.684 0.000
#> SRR772661 3 0.4615 0.8123 0.144 0.020 0.836
#> SRR772662 1 0.0237 0.7012 0.996 0.004 0.000
#> SRR772663 1 0.0237 0.7012 0.996 0.004 0.000
#> SRR772664 2 0.5363 0.8099 0.276 0.724 0.000
#> SRR772665 2 0.5363 0.8099 0.276 0.724 0.000
#> SRR772666 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772667 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772668 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772669 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772670 1 0.1163 0.6906 0.972 0.028 0.000
#> SRR772671 1 0.0892 0.6945 0.980 0.020 0.000
#> SRR772672 2 0.5591 0.8015 0.304 0.696 0.000
#> SRR772673 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772674 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772675 3 0.4452 0.7674 0.192 0.000 0.808
#> SRR772676 1 0.4842 0.4287 0.776 0.224 0.000
#> SRR772677 1 0.4002 0.5515 0.840 0.160 0.000
#> SRR772678 3 0.6446 0.6746 0.212 0.052 0.736
#> SRR772679 1 0.0237 0.7012 0.996 0.004 0.000
#> SRR772680 1 0.0475 0.7028 0.992 0.004 0.004
#> SRR772681 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772682 2 0.5560 0.8034 0.300 0.700 0.000
#> SRR772683 2 0.5621 0.7992 0.308 0.692 0.000
#> SRR772685 2 0.6168 0.6864 0.412 0.588 0.000
#> SRR772686 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772687 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772688 2 0.0000 0.7984 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0237 0.7968 0.000 0.996 0.004
#> SRR772690 3 0.0747 0.9447 0.016 0.000 0.984
#> SRR772691 2 0.2749 0.8138 0.064 0.924 0.012
#> SRR772692 1 0.0237 0.7012 0.996 0.004 0.000
#> SRR772693 1 0.5760 0.0562 0.672 0.328 0.000
#> SRR772694 2 0.5706 0.7906 0.320 0.680 0.000
#> SRR772695 1 0.6252 -0.3678 0.556 0.444 0.000
#> SRR772696 2 0.5733 0.7876 0.324 0.676 0.000
#> SRR772697 2 0.5650 0.7966 0.312 0.688 0.000
#> SRR772698 3 0.1411 0.9281 0.036 0.000 0.964
#> SRR772699 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
#> SRR772700 1 0.5291 0.6636 0.732 0.000 0.268
#> SRR772701 1 0.5497 0.6509 0.708 0.000 0.292
#> SRR772702 1 0.5621 0.6391 0.692 0.000 0.308
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772342 1 0.0188 0.90745 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.3052 0.81470 0.860 0.136 0.004 0.000
#> SRR772344 2 0.3942 0.56767 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR772345 2 0.3801 0.61051 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR772346 1 0.1978 0.87829 0.928 0.068 0.000 0.004
#> SRR772347 1 0.2334 0.86244 0.908 0.088 0.000 0.004
#> SRR772348 2 0.1211 0.85019 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772349 2 0.2081 0.80711 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772350 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772351 2 0.0376 0.86566 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR772352 2 0.0000 0.86478 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772353 2 0.4699 0.54575 0.320 0.676 0.004 0.000
#> SRR772354 2 0.4283 0.66093 0.256 0.740 0.004 0.000
#> SRR772355 2 0.0336 0.86219 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772356 2 0.2081 0.80622 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772357 1 0.0592 0.90466 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.1022 0.89802 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772359 1 0.3942 0.70236 0.764 0.236 0.000 0.000
#> SRR772360 1 0.4830 0.38076 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0921 0.91458 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR772362 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772363 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772364 1 0.1362 0.90023 0.964 0.020 0.012 0.004
#> SRR772365 1 0.3071 0.84656 0.884 0.096 0.012 0.008
#> SRR772366 3 0.4673 0.84044 0.132 0.000 0.792 0.076
#> SRR772367 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772368 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772369 2 0.2011 0.83018 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR772370 2 0.2345 0.81329 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR772371 1 0.5037 0.58389 0.684 0.300 0.008 0.008
#> SRR772372 1 0.5381 0.53609 0.656 0.320 0.008 0.016
#> SRR772373 2 0.0376 0.86521 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR772374 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772376 2 0.3649 0.63383 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR772377 3 0.6162 0.65096 0.008 0.228 0.676 0.088
#> SRR772378 2 0.4991 0.37462 0.388 0.608 0.004 0.000
#> SRR772379 2 0.1978 0.83953 0.068 0.928 0.004 0.000
#> SRR772380 2 0.4720 0.52207 0.324 0.672 0.004 0.000
#> SRR772381 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772382 1 0.0376 0.90769 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR772383 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772384 3 0.6352 0.73820 0.044 0.160 0.712 0.084
#> SRR772385 2 0.5070 0.36680 0.000 0.620 0.008 0.372
#> SRR772386 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772388 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772389 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772390 3 0.3764 0.88148 0.072 0.000 0.852 0.076
#> SRR772391 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772392 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772393 2 0.2613 0.84066 0.024 0.916 0.008 0.052
#> SRR772394 2 0.2613 0.84048 0.024 0.916 0.008 0.052
#> SRR772395 2 0.0779 0.85871 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR772396 1 0.0188 0.90745 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772398 1 0.0188 0.90766 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772399 1 0.1389 0.88890 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772401 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772402 4 0.5167 0.61990 0.000 0.340 0.016 0.644
#> SRR772403 4 0.5253 0.57963 0.000 0.360 0.016 0.624
#> SRR772404 2 0.1004 0.85447 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR772405 3 0.6160 0.78130 0.056 0.124 0.736 0.084
#> SRR772406 2 0.0000 0.86478 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.86478 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772408 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772409 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772410 2 0.2469 0.80765 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR772411 2 0.2868 0.78242 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR772412 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772413 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772414 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772415 2 0.1109 0.86121 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR772416 2 0.1004 0.86303 0.024 0.972 0.004 0.000
#> SRR772417 1 0.5151 0.15167 0.532 0.464 0.000 0.004
#> SRR772418 3 0.3875 0.88207 0.068 0.004 0.852 0.076
#> SRR772419 4 0.4543 0.71793 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR772420 4 0.4193 0.79923 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR772421 2 0.1637 0.84479 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR772422 2 0.0469 0.86531 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772423 4 0.4095 0.81406 0.000 0.192 0.016 0.792
#> SRR772424 4 0.2730 0.86101 0.000 0.088 0.016 0.896
#> SRR772425 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772426 4 0.5161 0.39955 0.000 0.476 0.004 0.520
#> SRR772427 4 0.5070 0.55317 0.000 0.416 0.004 0.580
#> SRR772428 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772429 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772430 1 0.5168 -0.00718 0.504 0.492 0.004 0.000
#> SRR772431 4 0.5038 0.69074 0.000 0.296 0.020 0.684
#> SRR772432 4 0.5062 0.68456 0.000 0.300 0.020 0.680
#> SRR772433 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772434 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772435 1 0.4535 0.60229 0.704 0.292 0.004 0.000
#> SRR772436 1 0.4088 0.70028 0.764 0.232 0.004 0.000
#> SRR772437 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772438 1 0.0376 0.90565 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR772439 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772440 2 0.0921 0.86110 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR772441 2 0.0469 0.86531 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772442 4 0.5444 0.42726 0.000 0.424 0.016 0.560
#> SRR772443 2 0.5152 0.43515 0.000 0.664 0.020 0.316
#> SRR772444 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772445 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772446 1 0.0524 0.90774 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR772447 1 0.0707 0.90308 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.0469 0.86531 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772449 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772450 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772451 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772452 1 0.0188 0.90745 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0376 0.90694 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR772454 1 0.1209 0.90011 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR772455 1 0.4103 0.68513 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR772456 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772457 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772458 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772459 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772460 4 0.2469 0.87713 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772461 4 0.2469 0.87713 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772462 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772463 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772464 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772465 2 0.1557 0.84571 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR772466 2 0.2081 0.82717 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR772467 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772468 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772469 1 0.3486 0.76157 0.812 0.188 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.2281 0.85626 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.3870 0.73383 0.788 0.208 0.004 0.000
#> SRR772472 1 0.1792 0.87849 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR772473 2 0.4434 0.63329 0.000 0.756 0.016 0.228
#> SRR772474 2 0.5435 0.08758 0.000 0.564 0.016 0.420
#> SRR772475 2 0.4539 0.58958 0.000 0.720 0.008 0.272
#> SRR772476 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772477 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772478 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772479 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772480 2 0.3215 0.82020 0.020 0.888 0.016 0.076
#> SRR772481 2 0.3377 0.82051 0.032 0.884 0.016 0.068
#> SRR772482 1 0.0336 0.90705 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0707 0.90397 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772484 2 0.0524 0.86577 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR772485 2 0.0524 0.86577 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR772486 1 0.0712 0.90573 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR772487 1 0.0712 0.90479 0.984 0.004 0.008 0.004
#> SRR772488 2 0.2053 0.84127 0.072 0.924 0.004 0.000
#> SRR772489 2 0.1209 0.86092 0.032 0.964 0.004 0.000
#> SRR772490 1 0.0000 0.90739 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772492 4 0.2469 0.87713 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772493 4 0.2469 0.87713 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772494 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772495 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772496 2 0.0000 0.86478 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.86478 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772498 2 0.2124 0.83580 0.000 0.924 0.008 0.068
#> SRR772499 2 0.2918 0.79474 0.000 0.876 0.008 0.116
#> SRR772500 2 0.2530 0.77184 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR772501 2 0.4008 0.55063 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR772502 2 0.4967 0.16487 0.452 0.548 0.000 0.000
#> SRR772503 1 0.3266 0.78441 0.832 0.168 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.0592 0.85837 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772505 2 0.1022 0.84903 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772506 4 0.3764 0.84983 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR772507 4 0.3688 0.85630 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR772508 2 0.4088 0.58332 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR772509 2 0.3843 0.79249 0.016 0.860 0.040 0.084
#> SRR772510 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772511 2 0.2859 0.80058 0.112 0.880 0.000 0.008
#> SRR772512 3 0.4800 0.60251 0.008 0.264 0.720 0.008
#> SRR772513 2 0.0376 0.86521 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR772514 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772515 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772516 2 0.0376 0.86494 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR772517 2 0.0524 0.86577 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR772518 2 0.0657 0.86528 0.012 0.984 0.004 0.000
#> SRR772519 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772520 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772521 2 0.4008 0.67052 0.244 0.756 0.000 0.000
#> SRR772522 2 0.3486 0.73245 0.188 0.812 0.000 0.000
#> SRR772523 2 0.2760 0.75176 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR772524 2 0.0188 0.86461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772525 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772526 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772527 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772528 3 0.3764 0.88035 0.072 0.000 0.852 0.076
#> SRR772529 1 0.0188 0.90745 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0336 0.90705 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772532 2 0.0336 0.86214 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772533 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772534 1 0.2281 0.85599 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772536 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772537 4 0.2469 0.87713 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772538 4 0.2469 0.87713 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772539 1 0.0376 0.90761 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR772540 1 0.0336 0.90705 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.0895 0.86509 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR772542 1 0.0657 0.90583 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR772543 1 0.0376 0.90714 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772544 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772545 1 0.0376 0.90769 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR772546 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772547 1 0.3982 0.72139 0.776 0.220 0.000 0.004
#> SRR772548 1 0.2760 0.82359 0.872 0.128 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0188 0.90745 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0188 0.90745 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.2401 0.82194 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR772552 2 0.1545 0.85507 0.040 0.952 0.000 0.008
#> SRR772553 2 0.3895 0.72681 0.000 0.804 0.012 0.184
#> SRR772554 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772555 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772556 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772557 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772558 1 0.1576 0.88891 0.948 0.048 0.004 0.000
#> SRR772559 1 0.1576 0.88905 0.948 0.048 0.004 0.000
#> SRR772560 2 0.5060 0.29432 0.412 0.584 0.004 0.000
#> SRR772561 3 0.1109 0.91407 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR772562 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772563 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772564 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772565 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772566 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772567 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772568 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772569 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772570 1 0.1389 0.89124 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR772571 1 0.1305 0.89542 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR772572 1 0.4624 0.51315 0.660 0.340 0.000 0.000
#> SRR772573 2 0.4941 0.21504 0.436 0.564 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.1004 0.90022 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR772575 1 0.1305 0.89537 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR772576 2 0.0524 0.86577 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR772577 2 0.1109 0.86263 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR772578 4 0.2647 0.88090 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR772579 4 0.2647 0.88090 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR772580 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772581 2 0.4407 0.69599 0.216 0.768 0.008 0.008
#> SRR772582 2 0.2002 0.84888 0.044 0.936 0.000 0.020
#> SRR772583 2 0.3791 0.72214 0.200 0.796 0.004 0.000
#> SRR772584 2 0.2586 0.82527 0.092 0.900 0.004 0.004
#> SRR772585 2 0.0524 0.86565 0.008 0.988 0.004 0.000
#> SRR772586 3 0.5100 0.80536 0.168 0.000 0.756 0.076
#> SRR772587 1 0.1867 0.87530 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR772588 2 0.4920 0.17497 0.000 0.628 0.004 0.368
#> SRR772589 2 0.5165 -0.30214 0.000 0.512 0.004 0.484
#> SRR772590 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772591 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772592 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772593 3 0.4344 0.86091 0.108 0.000 0.816 0.076
#> SRR772594 4 0.2859 0.87685 0.000 0.112 0.008 0.880
#> SRR772595 4 0.2973 0.87408 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR772596 3 0.3617 0.88359 0.064 0.000 0.860 0.076
#> SRR772597 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772598 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772599 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772600 2 0.5586 -0.06278 0.000 0.528 0.020 0.452
#> SRR772601 4 0.5013 0.69656 0.000 0.292 0.020 0.688
#> SRR772602 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772603 2 0.3708 0.75197 0.000 0.832 0.020 0.148
#> SRR772604 4 0.5435 0.44344 0.000 0.420 0.016 0.564
#> SRR772605 2 0.2125 0.83544 0.076 0.920 0.004 0.000
#> SRR772606 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772607 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772608 2 0.0779 0.86488 0.016 0.980 0.004 0.000
#> SRR772609 2 0.1004 0.86319 0.024 0.972 0.004 0.000
#> SRR772610 2 0.0376 0.86331 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR772611 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772612 4 0.2730 0.86101 0.000 0.088 0.016 0.896
#> SRR772613 4 0.2730 0.86101 0.000 0.088 0.016 0.896
#> SRR772614 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772615 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772616 1 0.3486 0.76260 0.812 0.188 0.000 0.000
#> SRR772617 4 0.2730 0.86101 0.000 0.088 0.016 0.896
#> SRR772618 4 0.2730 0.86101 0.000 0.088 0.016 0.896
#> SRR772619 4 0.2469 0.87713 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772620 4 0.2469 0.87713 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772621 2 0.1211 0.85692 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR772622 2 0.1302 0.85478 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR772623 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772624 3 0.4919 0.82536 0.152 0.000 0.772 0.076
#> SRR772625 4 0.3873 0.83282 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR772626 2 0.2101 0.83780 0.000 0.928 0.012 0.060
#> SRR772627 2 0.3681 0.73187 0.000 0.816 0.008 0.176
#> SRR772628 1 0.0592 0.90504 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0376 0.90735 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR772630 1 0.5165 0.07233 0.512 0.484 0.000 0.004
#> SRR772631 3 0.4824 0.82996 0.144 0.000 0.780 0.076
#> SRR772632 2 0.4977 -0.14861 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR772633 4 0.4500 0.73073 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR772634 1 0.2921 0.81501 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR772635 2 0.4585 0.51768 0.332 0.668 0.000 0.000
#> SRR772636 2 0.5203 0.21135 0.000 0.576 0.008 0.416
#> SRR772637 1 0.0376 0.90761 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR772638 1 0.0188 0.90745 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772640 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772641 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772642 2 0.1489 0.85543 0.044 0.952 0.004 0.000
#> SRR772643 2 0.0376 0.86521 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR772644 1 0.1576 0.88906 0.948 0.048 0.004 0.000
#> SRR772645 1 0.1305 0.89559 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR772646 2 0.0707 0.85551 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772647 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772648 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772649 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772650 1 0.4655 0.57817 0.684 0.312 0.004 0.000
#> SRR772651 1 0.1902 0.87894 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR772652 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772653 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772654 2 0.2814 0.78650 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR772655 2 0.2704 0.79447 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR772656 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772657 3 0.0921 0.91458 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR772658 4 0.2480 0.86326 0.000 0.088 0.008 0.904
#> SRR772659 4 0.2730 0.86101 0.000 0.088 0.016 0.896
#> SRR772660 2 0.0564 0.86589 0.004 0.988 0.004 0.004
#> SRR772661 3 0.6373 0.77214 0.068 0.124 0.724 0.084
#> SRR772662 1 0.4401 0.64785 0.724 0.272 0.004 0.000
#> SRR772663 1 0.3982 0.71839 0.776 0.220 0.004 0.000
#> SRR772664 2 0.0707 0.85751 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772665 2 0.0592 0.85960 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772666 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772667 4 0.2546 0.86542 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR772668 4 0.2730 0.86101 0.000 0.088 0.016 0.896
#> SRR772669 4 0.2796 0.86331 0.000 0.092 0.016 0.892
#> SRR772670 2 0.3982 0.69658 0.220 0.776 0.004 0.000
#> SRR772671 2 0.4677 0.54026 0.316 0.680 0.004 0.000
#> SRR772672 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772673 2 0.0188 0.86477 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772674 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772675 3 0.6108 0.77397 0.048 0.132 0.736 0.084
#> SRR772676 2 0.3907 0.67952 0.232 0.768 0.000 0.000
#> SRR772677 2 0.3610 0.71871 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR772678 3 0.6476 0.65779 0.024 0.220 0.672 0.084
#> SRR772679 1 0.5060 0.30028 0.584 0.412 0.004 0.000
#> SRR772680 1 0.3751 0.75491 0.800 0.196 0.004 0.000
#> SRR772681 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772682 2 0.0188 0.86363 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772683 2 0.0000 0.86478 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772685 2 0.0336 0.86565 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772686 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772687 3 0.2450 0.89851 0.072 0.000 0.912 0.016
#> SRR772688 4 0.3219 0.88694 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR772689 4 0.2530 0.87859 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR772690 3 0.1022 0.91657 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772691 2 0.5085 0.35571 0.000 0.616 0.008 0.376
#> SRR772692 2 0.4624 0.49371 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR772693 2 0.2654 0.81169 0.108 0.888 0.000 0.004
#> SRR772694 2 0.0524 0.86548 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR772695 2 0.1822 0.85244 0.044 0.944 0.004 0.008
#> SRR772696 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772697 2 0.0188 0.86529 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772698 3 0.4100 0.87107 0.092 0.000 0.832 0.076
#> SRR772699 1 0.0000 0.90739 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0336 0.90700 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0376 0.90769 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR772702 1 0.0188 0.90720 0.996 0.000 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.0290 0.86706 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772342 1 0.0609 0.86705 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772343 1 0.5426 0.60579 0.640 0.108 0.000 0.000 0.252
#> SRR772344 2 0.3635 0.44626 0.000 0.748 0.000 0.248 0.004
#> SRR772345 2 0.3949 0.32797 0.000 0.696 0.000 0.300 0.004
#> SRR772346 1 0.5005 0.65373 0.660 0.064 0.000 0.000 0.276
#> SRR772347 1 0.5245 0.63446 0.640 0.080 0.000 0.000 0.280
#> SRR772348 2 0.2504 0.74142 0.000 0.896 0.000 0.040 0.064
#> SRR772349 2 0.2735 0.71336 0.000 0.880 0.000 0.084 0.036
#> SRR772350 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772351 2 0.1195 0.75920 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR772352 2 0.0898 0.76245 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR772353 2 0.5604 0.45691 0.132 0.628 0.000 0.000 0.240
#> SRR772354 2 0.5365 0.50248 0.116 0.656 0.000 0.000 0.228
#> SRR772355 2 0.0807 0.76203 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR772356 2 0.2193 0.71097 0.000 0.900 0.000 0.092 0.008
#> SRR772357 1 0.1830 0.85265 0.924 0.008 0.000 0.000 0.068
#> SRR772358 1 0.2505 0.83841 0.888 0.020 0.000 0.000 0.092
#> SRR772359 1 0.6388 0.24388 0.496 0.312 0.000 0.000 0.192
#> SRR772360 2 0.6557 0.03260 0.352 0.440 0.000 0.000 0.208
#> SRR772361 3 0.4108 0.85560 0.008 0.000 0.684 0.000 0.308
#> SRR772362 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772363 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772364 1 0.4938 0.60646 0.648 0.040 0.004 0.000 0.308
#> SRR772365 1 0.6040 0.41228 0.516 0.064 0.016 0.004 0.400
#> SRR772366 3 0.1768 0.74734 0.072 0.000 0.924 0.000 0.004
#> SRR772367 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772368 2 0.2124 0.75060 0.000 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR772369 2 0.2233 0.73250 0.004 0.892 0.000 0.000 0.104
#> SRR772370 2 0.2127 0.73054 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR772371 5 0.7156 0.06639 0.352 0.260 0.016 0.000 0.372
#> SRR772372 5 0.7249 0.13201 0.324 0.248 0.024 0.000 0.404
#> SRR772373 2 0.1195 0.75861 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR772374 2 0.0898 0.76133 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR772375 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772376 2 0.3766 0.44335 0.000 0.728 0.000 0.268 0.004
#> SRR772377 3 0.3741 0.62180 0.000 0.108 0.816 0.000 0.076
#> SRR772378 2 0.6269 0.26919 0.188 0.528 0.000 0.000 0.284
#> SRR772379 2 0.3957 0.60368 0.008 0.712 0.000 0.000 0.280
#> SRR772380 2 0.5921 0.36163 0.136 0.568 0.000 0.000 0.296
#> SRR772381 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772382 1 0.0703 0.86601 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772383 1 0.0880 0.86433 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772384 3 0.3802 0.63781 0.004 0.080 0.820 0.000 0.096
#> SRR772385 4 0.6862 0.16125 0.000 0.312 0.184 0.484 0.020
#> SRR772386 2 0.0693 0.76230 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR772387 2 0.0671 0.76099 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR772388 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.1365 0.76274 0.040 0.004 0.952 0.000 0.004
#> SRR772391 1 0.0290 0.86595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772392 1 0.0404 0.86625 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772393 2 0.4759 0.33535 0.000 0.644 0.008 0.020 0.328
#> SRR772394 2 0.4822 0.33476 0.000 0.628 0.008 0.020 0.344
#> SRR772395 2 0.2438 0.74413 0.000 0.900 0.000 0.040 0.060
#> SRR772396 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.2909 0.82473 0.848 0.012 0.000 0.000 0.140
#> SRR772399 1 0.3861 0.78949 0.804 0.068 0.000 0.000 0.128
#> SRR772400 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772401 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772402 5 0.6561 0.47863 0.000 0.204 0.000 0.372 0.424
#> SRR772403 5 0.6714 0.53917 0.000 0.252 0.000 0.344 0.404
#> SRR772404 2 0.2359 0.74658 0.000 0.904 0.000 0.036 0.060
#> SRR772405 3 0.3572 0.66527 0.008 0.064 0.840 0.000 0.088
#> SRR772406 2 0.0290 0.76420 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772407 2 0.0404 0.76423 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772408 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772409 4 0.0794 0.76448 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR772410 2 0.3687 0.64363 0.028 0.792 0.000 0.000 0.180
#> SRR772411 2 0.3769 0.63690 0.032 0.788 0.000 0.000 0.180
#> SRR772412 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0162 0.86473 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772414 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772415 2 0.2020 0.75144 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR772416 2 0.2471 0.73612 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR772417 2 0.6615 -0.01517 0.324 0.444 0.000 0.000 0.232
#> SRR772418 3 0.1087 0.76214 0.016 0.008 0.968 0.000 0.008
#> SRR772419 4 0.3177 0.56300 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR772420 4 0.3109 0.57616 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR772421 2 0.1792 0.74894 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR772422 2 0.0703 0.76236 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772423 4 0.5744 0.06525 0.000 0.092 0.000 0.528 0.380
#> SRR772424 4 0.4283 0.42178 0.000 0.008 0.000 0.644 0.348
#> SRR772425 2 0.0992 0.75896 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR772426 4 0.4632 -0.01481 0.000 0.448 0.000 0.540 0.012
#> SRR772427 4 0.4473 0.05124 0.000 0.412 0.000 0.580 0.008
#> SRR772428 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772429 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772430 2 0.6554 0.14785 0.272 0.476 0.000 0.000 0.252
#> SRR772431 5 0.6271 0.35643 0.000 0.148 0.000 0.412 0.440
#> SRR772432 5 0.6344 0.39475 0.000 0.160 0.000 0.400 0.440
#> SRR772433 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772434 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772435 1 0.6351 0.21552 0.500 0.316 0.000 0.000 0.184
#> SRR772436 1 0.6176 0.34683 0.548 0.268 0.000 0.000 0.184
#> SRR772437 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772438 1 0.0703 0.86030 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772439 1 0.0703 0.86030 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772440 2 0.1043 0.76356 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772441 2 0.0963 0.76190 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772442 5 0.6776 0.56264 0.000 0.292 0.000 0.316 0.392
#> SRR772443 5 0.6300 0.52520 0.000 0.424 0.000 0.152 0.424
#> SRR772444 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0510 0.86646 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772447 1 0.1331 0.86128 0.952 0.008 0.000 0.000 0.040
#> SRR772448 2 0.1197 0.75926 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR772449 2 0.0794 0.76133 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772450 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772451 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772452 1 0.0290 0.86595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772453 1 0.0955 0.86439 0.968 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR772454 1 0.3573 0.78037 0.812 0.036 0.000 0.000 0.152
#> SRR772455 1 0.6365 0.36045 0.520 0.228 0.000 0.000 0.252
#> SRR772456 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772457 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772458 1 0.0162 0.86620 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772459 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772460 4 0.0566 0.75521 0.000 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR772461 4 0.0566 0.75521 0.000 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR772462 2 0.2359 0.74693 0.000 0.904 0.000 0.036 0.060
#> SRR772463 2 0.2193 0.74943 0.000 0.912 0.000 0.028 0.060
#> SRR772464 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772465 2 0.2629 0.70368 0.004 0.860 0.000 0.000 0.136
#> SRR772466 2 0.2439 0.71690 0.004 0.876 0.000 0.000 0.120
#> SRR772467 4 0.0880 0.76235 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772468 4 0.1043 0.75735 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR772469 1 0.4929 0.67431 0.716 0.136 0.000 0.000 0.148
#> SRR772470 1 0.3810 0.77612 0.812 0.088 0.000 0.000 0.100
#> SRR772471 1 0.5006 0.65943 0.708 0.136 0.000 0.000 0.156
#> SRR772472 1 0.3413 0.80306 0.832 0.044 0.000 0.000 0.124
#> SRR772473 2 0.5976 -0.44931 0.000 0.488 0.000 0.112 0.400
#> SRR772474 5 0.6625 0.60731 0.000 0.368 0.000 0.220 0.412
#> SRR772475 2 0.6695 0.12183 0.000 0.548 0.196 0.232 0.024
#> SRR772476 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772477 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772478 1 0.0290 0.86595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772479 1 0.0290 0.86595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772480 5 0.4878 0.34707 0.000 0.440 0.000 0.024 0.536
#> SRR772481 5 0.5300 0.34283 0.012 0.432 0.000 0.028 0.528
#> SRR772482 1 0.2074 0.84714 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR772483 1 0.2416 0.84732 0.888 0.012 0.000 0.000 0.100
#> SRR772484 2 0.2325 0.74762 0.000 0.904 0.000 0.028 0.068
#> SRR772485 2 0.2325 0.74762 0.000 0.904 0.000 0.028 0.068
#> SRR772486 1 0.2576 0.83685 0.900 0.008 0.036 0.000 0.056
#> SRR772487 1 0.2927 0.82025 0.872 0.000 0.060 0.000 0.068
#> SRR772488 2 0.2676 0.73791 0.036 0.884 0.000 0.000 0.080
#> SRR772489 2 0.1768 0.75507 0.004 0.924 0.000 0.000 0.072
#> SRR772490 1 0.0162 0.86643 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772491 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772492 4 0.0955 0.74792 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR772493 4 0.0955 0.74792 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR772494 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772495 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772496 2 0.1117 0.76329 0.000 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR772497 2 0.1117 0.76502 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR772498 2 0.5439 0.36202 0.000 0.656 0.048 0.028 0.268
#> SRR772499 2 0.5811 0.29497 0.000 0.632 0.044 0.052 0.272
#> SRR772500 2 0.3421 0.53154 0.000 0.788 0.000 0.204 0.008
#> SRR772501 2 0.3980 0.35213 0.000 0.708 0.000 0.284 0.008
#> SRR772502 2 0.6268 0.16917 0.260 0.536 0.000 0.000 0.204
#> SRR772503 1 0.5925 0.50751 0.596 0.188 0.000 0.000 0.216
#> SRR772504 2 0.1082 0.75638 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR772505 2 0.1430 0.74489 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR772506 4 0.2852 0.61885 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR772507 4 0.2732 0.63490 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR772508 2 0.4972 0.37354 0.000 0.672 0.000 0.260 0.068
#> SRR772509 2 0.5902 0.23382 0.000 0.556 0.320 0.000 0.124
#> SRR772510 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772511 2 0.3628 0.62362 0.012 0.772 0.000 0.000 0.216
#> SRR772512 3 0.6635 0.41653 0.004 0.284 0.484 0.000 0.228
#> SRR772513 2 0.2144 0.75068 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR772514 2 0.2171 0.75019 0.000 0.912 0.000 0.024 0.064
#> SRR772515 2 0.0955 0.75675 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR772516 2 0.0771 0.75991 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR772517 2 0.2260 0.75193 0.000 0.908 0.000 0.028 0.064
#> SRR772518 2 0.1831 0.75348 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR772519 2 0.0955 0.75816 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR772520 2 0.0794 0.75762 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR772521 2 0.4734 0.55150 0.088 0.724 0.000 0.000 0.188
#> SRR772522 2 0.3863 0.62201 0.028 0.772 0.000 0.000 0.200
#> SRR772523 2 0.1764 0.73628 0.000 0.928 0.000 0.064 0.008
#> SRR772524 2 0.1082 0.75638 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR772525 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772526 4 0.1121 0.75449 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772527 4 0.1121 0.75449 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772528 3 0.1502 0.75709 0.056 0.000 0.940 0.000 0.004
#> SRR772529 1 0.1043 0.86373 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772530 1 0.1205 0.86282 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR772531 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772532 2 0.1205 0.75210 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR772533 2 0.1041 0.75522 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR772534 1 0.5185 0.64749 0.672 0.100 0.000 0.000 0.228
#> SRR772535 2 0.0451 0.76297 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR772536 2 0.0579 0.76210 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772537 4 0.2674 0.68286 0.000 0.004 0.000 0.856 0.140
#> SRR772538 4 0.3010 0.65810 0.000 0.004 0.000 0.824 0.172
#> SRR772539 1 0.0404 0.86647 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772540 1 0.1043 0.86380 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772541 2 0.2806 0.72225 0.004 0.844 0.000 0.000 0.152
#> SRR772542 1 0.2424 0.84344 0.908 0.008 0.032 0.000 0.052
#> SRR772543 1 0.1041 0.86040 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR772544 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772545 1 0.1121 0.86234 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772546 1 0.1121 0.86234 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772547 1 0.6000 0.47591 0.572 0.160 0.000 0.000 0.268
#> SRR772548 1 0.4049 0.75454 0.792 0.084 0.000 0.000 0.124
#> SRR772549 1 0.0290 0.86595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772550 1 0.0290 0.86595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772551 2 0.4086 0.56079 0.012 0.704 0.000 0.000 0.284
#> SRR772552 2 0.3333 0.65175 0.004 0.788 0.000 0.000 0.208
#> SRR772553 2 0.5744 0.34469 0.000 0.636 0.272 0.052 0.040
#> SRR772554 2 0.1082 0.75734 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR772555 2 0.0992 0.75911 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR772556 1 0.0162 0.86620 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772557 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.3771 0.78071 0.796 0.040 0.000 0.000 0.164
#> SRR772559 1 0.3182 0.81062 0.844 0.032 0.000 0.000 0.124
#> SRR772560 2 0.6376 0.21592 0.220 0.516 0.000 0.000 0.264
#> SRR772561 3 0.4009 0.85291 0.004 0.000 0.684 0.000 0.312
#> SRR772562 2 0.2193 0.74943 0.000 0.912 0.000 0.028 0.060
#> SRR772563 2 0.2124 0.75062 0.000 0.916 0.000 0.028 0.056
#> SRR772564 1 0.0703 0.86030 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772565 1 0.0703 0.86030 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772566 1 0.0290 0.86396 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772567 1 0.0162 0.86473 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772568 2 0.0992 0.75896 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR772569 2 0.1082 0.75734 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR772570 1 0.3262 0.81003 0.840 0.036 0.000 0.000 0.124
#> SRR772571 1 0.3327 0.80415 0.828 0.028 0.000 0.000 0.144
#> SRR772572 1 0.6430 0.16617 0.480 0.328 0.000 0.000 0.192
#> SRR772573 2 0.6092 0.21534 0.256 0.564 0.000 0.000 0.180
#> SRR772574 1 0.2777 0.82479 0.864 0.016 0.000 0.000 0.120
#> SRR772575 1 0.3919 0.75885 0.776 0.036 0.000 0.000 0.188
#> SRR772576 2 0.2074 0.75130 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR772577 2 0.2280 0.74309 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR772578 4 0.0955 0.75253 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR772579 4 0.0771 0.75508 0.000 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR772580 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772581 2 0.5452 0.19008 0.056 0.556 0.000 0.004 0.384
#> SRR772582 2 0.4181 0.45879 0.004 0.676 0.000 0.004 0.316
#> SRR772583 2 0.4885 0.53653 0.056 0.668 0.000 0.000 0.276
#> SRR772584 2 0.4029 0.63787 0.024 0.744 0.000 0.000 0.232
#> SRR772585 2 0.2280 0.74373 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR772586 3 0.2504 0.72977 0.064 0.004 0.900 0.000 0.032
#> SRR772587 1 0.4537 0.72514 0.740 0.076 0.000 0.000 0.184
#> SRR772588 2 0.4668 0.16193 0.000 0.624 0.000 0.352 0.024
#> SRR772589 4 0.4897 -0.03417 0.000 0.460 0.000 0.516 0.024
#> SRR772590 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772591 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0162 0.86473 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772593 3 0.1644 0.75429 0.048 0.004 0.940 0.000 0.008
#> SRR772594 4 0.3487 0.61366 0.000 0.008 0.000 0.780 0.212
#> SRR772595 4 0.4263 0.58672 0.000 0.060 0.000 0.760 0.180
#> SRR772596 3 0.1043 0.76500 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR772597 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772598 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772599 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772600 5 0.6691 0.61033 0.000 0.312 0.000 0.260 0.428
#> SRR772601 5 0.6349 0.35223 0.000 0.160 0.000 0.416 0.424
#> SRR772602 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772603 5 0.5524 0.42087 0.000 0.416 0.000 0.068 0.516
#> SRR772604 5 0.6686 0.57284 0.000 0.256 0.000 0.316 0.428
#> SRR772605 2 0.3642 0.65179 0.008 0.760 0.000 0.000 0.232
#> SRR772606 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772607 1 0.0609 0.86130 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772608 2 0.1410 0.76168 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR772609 2 0.2127 0.74931 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR772610 2 0.2054 0.75243 0.000 0.920 0.000 0.028 0.052
#> SRR772611 2 0.2260 0.74818 0.000 0.908 0.000 0.028 0.064
#> SRR772612 4 0.3983 0.44840 0.000 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR772613 4 0.3999 0.44253 0.000 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR772614 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.86535 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.5644 0.57281 0.628 0.144 0.000 0.000 0.228
#> SRR772617 4 0.3983 0.45008 0.000 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR772618 4 0.3999 0.44389 0.000 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR772619 4 0.0955 0.74792 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR772620 4 0.0955 0.74792 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR772621 2 0.1043 0.76112 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772622 2 0.2011 0.74159 0.004 0.908 0.000 0.000 0.088
#> SRR772623 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772624 3 0.1831 0.74444 0.076 0.000 0.920 0.000 0.004
#> SRR772625 4 0.2798 0.65469 0.000 0.140 0.000 0.852 0.008
#> SRR772626 2 0.5360 0.35263 0.000 0.648 0.048 0.020 0.284
#> SRR772627 2 0.6319 -0.09571 0.000 0.544 0.024 0.100 0.332
#> SRR772628 1 0.1628 0.85515 0.936 0.008 0.000 0.000 0.056
#> SRR772629 1 0.0609 0.86712 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772630 2 0.6491 0.05627 0.296 0.484 0.000 0.000 0.220
#> SRR772631 3 0.1831 0.74444 0.076 0.000 0.920 0.000 0.004
#> SRR772632 4 0.4015 0.29538 0.000 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR772633 4 0.3424 0.51470 0.000 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR772634 1 0.5930 0.49833 0.596 0.196 0.000 0.000 0.208
#> SRR772635 2 0.5444 0.45125 0.140 0.656 0.000 0.000 0.204
#> SRR772636 4 0.6581 0.22641 0.000 0.300 0.160 0.524 0.016
#> SRR772637 1 0.0290 0.86595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772638 1 0.0290 0.86595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772639 2 0.0898 0.76112 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR772640 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772641 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772642 2 0.2017 0.75871 0.008 0.912 0.000 0.000 0.080
#> SRR772643 2 0.1197 0.76596 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR772644 1 0.3734 0.77997 0.796 0.036 0.000 0.000 0.168
#> SRR772645 1 0.3616 0.78642 0.804 0.032 0.000 0.000 0.164
#> SRR772646 2 0.1082 0.75770 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR772647 2 0.0955 0.75834 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR772648 2 0.0771 0.76202 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772649 2 0.0794 0.76130 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772650 1 0.6680 0.13472 0.436 0.296 0.000 0.000 0.268
#> SRR772651 1 0.4763 0.69712 0.712 0.076 0.000 0.000 0.212
#> SRR772652 1 0.1270 0.86329 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772653 1 0.1341 0.86251 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR772654 2 0.3123 0.67998 0.012 0.828 0.000 0.000 0.160
#> SRR772655 2 0.3039 0.68894 0.012 0.836 0.000 0.000 0.152
#> SRR772656 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772657 3 0.4108 0.85560 0.008 0.000 0.684 0.000 0.308
#> SRR772658 4 0.2773 0.66279 0.000 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR772659 4 0.3366 0.59535 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR772660 2 0.2179 0.75035 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR772661 3 0.3653 0.66979 0.016 0.056 0.840 0.000 0.088
#> SRR772662 1 0.6601 0.19520 0.460 0.292 0.000 0.000 0.248
#> SRR772663 1 0.6350 0.35765 0.524 0.240 0.000 0.000 0.236
#> SRR772664 2 0.1168 0.75797 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR772665 2 0.1168 0.75863 0.000 0.960 0.000 0.032 0.008
#> SRR772666 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772667 4 0.2583 0.69629 0.000 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR772668 4 0.3395 0.58993 0.000 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR772669 4 0.3336 0.59884 0.000 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR772670 2 0.4840 0.55685 0.064 0.688 0.000 0.000 0.248
#> SRR772671 2 0.5353 0.48205 0.092 0.636 0.000 0.000 0.272
#> SRR772672 2 0.2036 0.75258 0.000 0.920 0.000 0.024 0.056
#> SRR772673 2 0.1914 0.75398 0.000 0.924 0.000 0.016 0.060
#> SRR772674 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772675 3 0.3476 0.65448 0.000 0.076 0.836 0.000 0.088
#> SRR772676 2 0.4238 0.61297 0.088 0.776 0.000 0.000 0.136
#> SRR772677 2 0.3932 0.64254 0.064 0.796 0.000 0.000 0.140
#> SRR772678 3 0.4023 0.61232 0.004 0.096 0.804 0.000 0.096
#> SRR772679 2 0.6736 -0.00896 0.344 0.396 0.000 0.000 0.260
#> SRR772680 1 0.6279 0.39403 0.532 0.200 0.000 0.000 0.268
#> SRR772681 3 0.4193 0.85689 0.012 0.000 0.684 0.000 0.304
#> SRR772682 2 0.0609 0.76076 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR772683 2 0.0609 0.76107 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR772685 2 0.0404 0.76312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772686 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772687 3 0.4465 0.82574 0.056 0.000 0.732 0.000 0.212
#> SRR772688 4 0.0703 0.76631 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772689 4 0.0162 0.75898 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772690 3 0.4213 0.85681 0.012 0.000 0.680 0.000 0.308
#> SRR772691 4 0.6874 0.16165 0.000 0.308 0.188 0.484 0.020
#> SRR772692 2 0.5575 0.41779 0.148 0.640 0.000 0.000 0.212
#> SRR772693 2 0.3339 0.69917 0.040 0.836 0.000 0.000 0.124
#> SRR772694 2 0.2074 0.74029 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR772695 2 0.3461 0.66236 0.004 0.772 0.000 0.000 0.224
#> SRR772696 2 0.1410 0.75526 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR772697 2 0.0794 0.76138 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772698 3 0.1502 0.75709 0.056 0.000 0.940 0.000 0.004
#> SRR772699 1 0.0880 0.86380 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772700 1 0.1544 0.86108 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR772701 1 0.0963 0.86380 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772702 1 0.0162 0.86641 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.0713 0.84142 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772342 1 0.1610 0.82577 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR772343 6 0.4412 0.38447 0.320 0.024 0.000 0.000 0.012 0.644
#> SRR772344 2 0.3056 0.60282 0.000 0.804 0.000 0.184 0.008 0.004
#> SRR772345 2 0.3073 0.57758 0.000 0.788 0.000 0.204 0.008 0.000
#> SRR772346 6 0.4809 0.39305 0.296 0.020 0.000 0.000 0.044 0.640
#> SRR772347 6 0.4836 0.26926 0.356 0.020 0.000 0.000 0.032 0.592
#> SRR772348 2 0.3424 0.70918 0.000 0.816 0.000 0.016 0.032 0.136
#> SRR772349 2 0.2981 0.72202 0.000 0.864 0.000 0.052 0.020 0.064
#> SRR772350 3 0.0972 0.83017 0.000 0.000 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR772351 2 0.0881 0.74955 0.000 0.972 0.000 0.012 0.008 0.008
#> SRR772352 2 0.0891 0.74458 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR772353 6 0.5254 0.48448 0.060 0.316 0.000 0.000 0.028 0.596
#> SRR772354 6 0.5309 0.36962 0.052 0.372 0.000 0.000 0.028 0.548
#> SRR772355 2 0.0767 0.74872 0.000 0.976 0.000 0.004 0.008 0.012
#> SRR772356 2 0.1605 0.73847 0.000 0.940 0.000 0.032 0.016 0.012
#> SRR772357 1 0.3076 0.69753 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR772358 1 0.3547 0.57430 0.668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR772359 6 0.6016 0.57359 0.272 0.208 0.000 0.000 0.012 0.508
#> SRR772360 6 0.5749 0.60662 0.152 0.292 0.000 0.000 0.012 0.544
#> SRR772361 3 0.0363 0.83371 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772362 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772364 1 0.6038 0.00664 0.432 0.020 0.000 0.000 0.140 0.408
#> SRR772365 6 0.6132 0.38528 0.236 0.036 0.000 0.000 0.180 0.548
#> SRR772366 3 0.4466 0.42171 0.020 0.000 0.500 0.000 0.476 0.004
#> SRR772367 3 0.0405 0.83443 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR772368 2 0.3885 0.63644 0.000 0.736 0.000 0.000 0.044 0.220
#> SRR772369 2 0.3697 0.51330 0.004 0.732 0.000 0.000 0.016 0.248
#> SRR772370 2 0.3736 0.47901 0.008 0.716 0.000 0.000 0.008 0.268
#> SRR772371 6 0.6552 0.41933 0.108 0.188 0.000 0.000 0.156 0.548
#> SRR772372 6 0.6377 0.40103 0.092 0.180 0.000 0.000 0.160 0.568
#> SRR772373 2 0.1262 0.74790 0.000 0.956 0.000 0.008 0.016 0.020
#> SRR772374 2 0.0405 0.74734 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR772375 3 0.0405 0.83443 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR772376 2 0.3271 0.58091 0.000 0.760 0.000 0.232 0.008 0.000
#> SRR772377 5 0.5993 -0.22278 0.000 0.044 0.372 0.000 0.492 0.092
#> SRR772378 6 0.4767 0.56601 0.056 0.252 0.000 0.000 0.020 0.672
#> SRR772379 6 0.4397 0.34482 0.004 0.376 0.000 0.000 0.024 0.596
#> SRR772380 6 0.4341 0.51961 0.024 0.284 0.000 0.000 0.016 0.676
#> SRR772381 3 0.0547 0.83422 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772382 1 0.1501 0.82616 0.924 0.000 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772383 1 0.1863 0.81123 0.896 0.000 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR772384 5 0.6082 -0.21293 0.008 0.028 0.364 0.000 0.496 0.104
#> SRR772385 4 0.6701 0.10659 0.000 0.268 0.000 0.396 0.300 0.036
#> SRR772386 2 0.0692 0.74646 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR772387 2 0.0603 0.74701 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR772388 1 0.0520 0.83925 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR772389 1 0.0520 0.83925 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR772390 3 0.4312 0.43046 0.012 0.000 0.508 0.000 0.476 0.004
#> SRR772391 1 0.0865 0.83897 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772392 1 0.0865 0.83897 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772393 2 0.5927 0.00177 0.000 0.456 0.000 0.004 0.188 0.352
#> SRR772394 6 0.5821 0.12122 0.000 0.404 0.000 0.000 0.184 0.412
#> SRR772395 2 0.3226 0.70652 0.000 0.836 0.000 0.020 0.028 0.116
#> SRR772396 1 0.0405 0.83895 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR772397 1 0.0000 0.83821 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.4672 0.51865 0.636 0.016 0.000 0.000 0.036 0.312
#> SRR772399 1 0.5107 0.49627 0.628 0.064 0.000 0.000 0.024 0.284
#> SRR772400 1 0.0717 0.83503 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR772401 1 0.0717 0.83503 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR772402 5 0.7421 0.35440 0.000 0.152 0.000 0.232 0.388 0.228
#> SRR772403 5 0.7480 0.37475 0.000 0.224 0.000 0.212 0.384 0.180
#> SRR772404 2 0.3398 0.70041 0.000 0.824 0.000 0.016 0.040 0.120
#> SRR772405 5 0.6030 -0.22766 0.008 0.024 0.372 0.000 0.492 0.104
#> SRR772406 2 0.1333 0.73980 0.000 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR772407 2 0.1124 0.74283 0.000 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR772408 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772410 2 0.4393 -0.12620 0.008 0.532 0.000 0.000 0.012 0.448
#> SRR772411 2 0.4280 -0.06736 0.008 0.556 0.000 0.000 0.008 0.428
#> SRR772412 1 0.0146 0.83785 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772413 1 0.0146 0.83785 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772414 3 0.0547 0.83414 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772415 2 0.4235 0.54326 0.004 0.672 0.000 0.000 0.032 0.292
#> SRR772416 2 0.4306 0.51805 0.004 0.656 0.000 0.000 0.032 0.308
#> SRR772417 6 0.5621 0.58712 0.108 0.292 0.000 0.000 0.024 0.576
#> SRR772418 3 0.4411 0.42487 0.012 0.000 0.504 0.000 0.476 0.008
#> SRR772419 4 0.3163 0.57145 0.000 0.232 0.000 0.764 0.004 0.000
#> SRR772420 4 0.3023 0.60007 0.000 0.212 0.000 0.784 0.004 0.000
#> SRR772421 2 0.3212 0.61932 0.004 0.800 0.000 0.000 0.016 0.180
#> SRR772422 2 0.1588 0.73226 0.000 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR772423 5 0.7096 0.12608 0.000 0.108 0.000 0.344 0.384 0.164
#> SRR772424 4 0.5864 0.23003 0.000 0.020 0.000 0.488 0.372 0.120
#> SRR772425 2 0.0436 0.74776 0.000 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR772426 2 0.4051 0.14324 0.000 0.560 0.000 0.432 0.008 0.000
#> SRR772427 2 0.4083 0.04659 0.000 0.532 0.000 0.460 0.008 0.000
#> SRR772428 1 0.0622 0.83601 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR772429 1 0.0622 0.83601 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR772430 6 0.6009 0.52900 0.148 0.272 0.000 0.000 0.032 0.548
#> SRR772431 5 0.7286 0.31636 0.000 0.124 0.000 0.252 0.404 0.220
#> SRR772432 5 0.7341 0.34324 0.000 0.140 0.000 0.236 0.404 0.220
#> SRR772433 1 0.0717 0.83503 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR772434 1 0.0717 0.83503 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR772435 6 0.5961 0.51582 0.328 0.184 0.000 0.000 0.008 0.480
#> SRR772436 6 0.5895 0.49280 0.340 0.168 0.000 0.000 0.008 0.484
#> SRR772437 3 0.0547 0.83422 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772438 1 0.1549 0.81613 0.936 0.000 0.000 0.000 0.020 0.044
#> SRR772439 1 0.1245 0.82515 0.952 0.000 0.000 0.000 0.016 0.032
#> SRR772440 2 0.2001 0.73271 0.004 0.900 0.000 0.000 0.004 0.092
#> SRR772441 2 0.1701 0.73131 0.000 0.920 0.000 0.000 0.008 0.072
#> SRR772442 5 0.7426 0.40382 0.000 0.264 0.000 0.176 0.384 0.176
#> SRR772443 5 0.7114 0.41877 0.000 0.296 0.000 0.084 0.388 0.232
#> SRR772444 1 0.0000 0.83821 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.83821 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.1444 0.83024 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR772447 1 0.2883 0.72624 0.788 0.000 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR772448 2 0.2494 0.69720 0.000 0.864 0.000 0.000 0.016 0.120
#> SRR772449 2 0.1524 0.73320 0.000 0.932 0.000 0.000 0.008 0.060
#> SRR772450 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0632 0.83964 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772453 1 0.1501 0.82656 0.924 0.000 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772454 1 0.4178 0.26182 0.560 0.004 0.000 0.000 0.008 0.428
#> SRR772455 6 0.5051 0.59396 0.220 0.120 0.000 0.000 0.008 0.652
#> SRR772456 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0458 0.84007 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772459 1 0.0260 0.83974 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772460 4 0.0717 0.78746 0.000 0.016 0.000 0.976 0.008 0.000
#> SRR772461 4 0.0622 0.78575 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008 0.000
#> SRR772462 2 0.3181 0.70819 0.000 0.840 0.000 0.020 0.028 0.112
#> SRR772463 2 0.2949 0.70930 0.000 0.848 0.000 0.008 0.028 0.116
#> SRR772464 3 0.0405 0.83443 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR772465 2 0.3713 0.42000 0.004 0.704 0.000 0.000 0.008 0.284
#> SRR772466 2 0.3736 0.44730 0.008 0.716 0.000 0.000 0.008 0.268
#> SRR772467 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772468 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.4996 0.29561 0.548 0.064 0.000 0.000 0.004 0.384
#> SRR772470 1 0.4482 0.49407 0.628 0.048 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR772471 1 0.4873 0.17408 0.508 0.048 0.000 0.000 0.004 0.440
#> SRR772472 1 0.3911 0.49257 0.624 0.008 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR772473 5 0.6864 0.35371 0.000 0.368 0.000 0.068 0.380 0.184
#> SRR772474 5 0.7239 0.42147 0.000 0.308 0.000 0.116 0.384 0.192
#> SRR772475 2 0.6559 0.05988 0.000 0.460 0.000 0.168 0.320 0.052
#> SRR772476 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0937 0.83853 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772479 1 0.0547 0.83971 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772480 6 0.6355 -0.22531 0.000 0.228 0.000 0.016 0.376 0.380
#> SRR772481 6 0.6593 -0.13663 0.008 0.220 0.000 0.020 0.336 0.416
#> SRR772482 1 0.3871 0.59429 0.676 0.000 0.000 0.000 0.016 0.308
#> SRR772483 1 0.3840 0.64282 0.696 0.000 0.000 0.000 0.020 0.284
#> SRR772484 2 0.3168 0.69019 0.000 0.820 0.000 0.004 0.028 0.148
#> SRR772485 2 0.3027 0.69036 0.000 0.824 0.000 0.000 0.028 0.148
#> SRR772486 1 0.3852 0.72106 0.784 0.008 0.000 0.000 0.072 0.136
#> SRR772487 1 0.4326 0.66704 0.732 0.004 0.000 0.000 0.096 0.168
#> SRR772488 2 0.3829 0.65536 0.016 0.760 0.000 0.000 0.024 0.200
#> SRR772489 2 0.3441 0.67406 0.004 0.784 0.000 0.000 0.024 0.188
#> SRR772490 1 0.1007 0.84038 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772491 1 0.0146 0.83877 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772492 4 0.0748 0.77767 0.000 0.004 0.000 0.976 0.016 0.004
#> SRR772493 4 0.0748 0.77767 0.000 0.004 0.000 0.976 0.016 0.004
#> SRR772494 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.0790 0.75051 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772497 2 0.1082 0.75062 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR772498 2 0.6265 0.07177 0.000 0.456 0.000 0.016 0.228 0.300
#> SRR772499 2 0.6461 0.04965 0.000 0.444 0.000 0.028 0.224 0.304
#> SRR772500 2 0.2482 0.65536 0.000 0.848 0.000 0.148 0.004 0.000
#> SRR772501 2 0.2915 0.61230 0.000 0.808 0.000 0.184 0.008 0.000
#> SRR772502 6 0.5834 0.54569 0.124 0.340 0.000 0.000 0.020 0.516
#> SRR772503 6 0.5815 0.48450 0.300 0.136 0.000 0.000 0.020 0.544
#> SRR772504 2 0.0551 0.74723 0.000 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR772505 2 0.0891 0.74327 0.000 0.968 0.000 0.024 0.008 0.000
#> SRR772506 4 0.2520 0.67427 0.000 0.152 0.000 0.844 0.004 0.000
#> SRR772507 4 0.2482 0.67985 0.000 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR772508 2 0.5068 0.59313 0.000 0.700 0.000 0.140 0.040 0.120
#> SRR772509 5 0.5655 0.12890 0.000 0.324 0.000 0.000 0.504 0.172
#> SRR772510 3 0.0458 0.83457 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772511 6 0.4527 0.28927 0.004 0.456 0.000 0.000 0.024 0.516
#> SRR772512 3 0.5405 0.16396 0.000 0.336 0.572 0.000 0.052 0.040
#> SRR772513 2 0.3101 0.69361 0.000 0.820 0.000 0.000 0.032 0.148
#> SRR772514 2 0.3010 0.70220 0.000 0.836 0.000 0.004 0.028 0.132
#> SRR772515 2 0.0551 0.74723 0.000 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR772516 2 0.0551 0.74723 0.000 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR772517 2 0.2809 0.70779 0.000 0.848 0.000 0.004 0.020 0.128
#> SRR772518 2 0.3269 0.67771 0.000 0.792 0.000 0.000 0.024 0.184
#> SRR772519 2 0.1065 0.74809 0.000 0.964 0.000 0.008 0.008 0.020
#> SRR772520 2 0.0665 0.74831 0.000 0.980 0.000 0.008 0.004 0.008
#> SRR772521 2 0.4846 -0.12853 0.016 0.520 0.000 0.000 0.028 0.436
#> SRR772522 2 0.4699 -0.20277 0.008 0.496 0.000 0.000 0.028 0.468
#> SRR772523 2 0.0725 0.74726 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR772524 2 0.0520 0.74788 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR772525 3 0.0405 0.83443 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR772526 4 0.0935 0.78932 0.000 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR772527 4 0.0935 0.78932 0.000 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR772528 3 0.4392 0.42664 0.016 0.000 0.504 0.000 0.476 0.004
#> SRR772529 1 0.2300 0.78819 0.856 0.000 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR772530 1 0.2300 0.78551 0.856 0.000 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR772531 3 0.0692 0.83364 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772532 2 0.0717 0.74567 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR772533 2 0.0622 0.74637 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR772534 6 0.5102 0.38535 0.316 0.044 0.000 0.000 0.032 0.608
#> SRR772535 2 0.0603 0.74735 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR772536 2 0.0748 0.74757 0.000 0.976 0.000 0.004 0.004 0.016
#> SRR772537 4 0.3164 0.68825 0.000 0.004 0.000 0.824 0.140 0.032
#> SRR772538 4 0.3494 0.66253 0.000 0.004 0.000 0.792 0.168 0.036
#> SRR772539 1 0.1204 0.83458 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR772540 1 0.2912 0.72635 0.784 0.000 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR772541 2 0.4593 0.41453 0.004 0.604 0.000 0.000 0.040 0.352
#> SRR772542 1 0.3854 0.72616 0.788 0.016 0.000 0.000 0.056 0.140
#> SRR772543 1 0.2633 0.78982 0.864 0.000 0.000 0.000 0.032 0.104
#> SRR772544 3 0.0547 0.83422 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772545 1 0.2092 0.80098 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR772546 1 0.2135 0.79837 0.872 0.000 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR772547 6 0.4809 0.48961 0.256 0.052 0.000 0.000 0.024 0.668
#> SRR772548 1 0.4278 0.49950 0.624 0.016 0.000 0.000 0.008 0.352
#> SRR772549 1 0.0790 0.83858 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772550 1 0.0790 0.83858 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772551 6 0.5096 0.42846 0.000 0.324 0.000 0.000 0.100 0.576
#> SRR772552 2 0.4844 -0.09254 0.000 0.504 0.000 0.000 0.056 0.440
#> SRR772553 2 0.5364 0.13884 0.000 0.504 0.000 0.024 0.416 0.056
#> SRR772554 2 0.0551 0.74771 0.000 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR772555 2 0.0665 0.74708 0.000 0.980 0.000 0.008 0.008 0.004
#> SRR772556 1 0.0790 0.84041 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772557 1 0.0363 0.84003 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772558 1 0.4161 0.28618 0.540 0.012 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR772559 1 0.3934 0.47120 0.616 0.008 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR772560 6 0.5309 0.54689 0.072 0.276 0.000 0.000 0.032 0.620
#> SRR772561 3 0.0508 0.83263 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR772562 2 0.2468 0.72333 0.000 0.880 0.000 0.008 0.016 0.096
#> SRR772563 2 0.2367 0.72701 0.000 0.888 0.000 0.008 0.016 0.088
#> SRR772564 1 0.1003 0.83269 0.964 0.000 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR772565 1 0.1003 0.83269 0.964 0.000 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR772566 1 0.0260 0.83764 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772567 1 0.0260 0.83764 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772568 2 0.0436 0.74830 0.000 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR772569 2 0.0665 0.74781 0.000 0.980 0.000 0.008 0.004 0.008
#> SRR772570 1 0.4589 0.39297 0.580 0.028 0.000 0.000 0.008 0.384
#> SRR772571 1 0.4088 0.32587 0.556 0.004 0.000 0.000 0.004 0.436
#> SRR772572 6 0.5992 0.56326 0.260 0.212 0.000 0.000 0.012 0.516
#> SRR772573 6 0.5786 0.39681 0.104 0.436 0.000 0.000 0.020 0.440
#> SRR772574 1 0.3659 0.50247 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR772575 6 0.4184 -0.05892 0.488 0.012 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR772576 2 0.3301 0.68038 0.000 0.788 0.000 0.000 0.024 0.188
#> SRR772577 2 0.3932 0.61125 0.004 0.720 0.000 0.000 0.028 0.248
#> SRR772578 4 0.1518 0.78706 0.000 0.024 0.000 0.944 0.024 0.008
#> SRR772579 4 0.1065 0.78826 0.000 0.020 0.000 0.964 0.008 0.008
#> SRR772580 3 0.0405 0.83443 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR772581 6 0.5701 0.39966 0.008 0.296 0.000 0.000 0.156 0.540
#> SRR772582 2 0.5825 -0.11687 0.000 0.436 0.000 0.004 0.160 0.400
#> SRR772583 6 0.4533 0.45047 0.020 0.328 0.000 0.000 0.020 0.632
#> SRR772584 6 0.4591 0.06804 0.004 0.452 0.000 0.000 0.028 0.516
#> SRR772585 2 0.3978 0.58974 0.000 0.700 0.000 0.000 0.032 0.268
#> SRR772586 5 0.5133 -0.40565 0.028 0.000 0.460 0.000 0.480 0.032
#> SRR772587 6 0.4861 -0.04471 0.456 0.028 0.000 0.000 0.016 0.500
#> SRR772588 2 0.4361 0.49599 0.000 0.696 0.000 0.252 0.012 0.040
#> SRR772589 2 0.4783 0.34949 0.000 0.612 0.000 0.332 0.012 0.044
#> SRR772590 3 0.0363 0.83371 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772591 1 0.0260 0.83764 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772592 1 0.0260 0.83764 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772593 3 0.4565 0.41542 0.020 0.000 0.496 0.000 0.476 0.008
#> SRR772594 4 0.4754 0.56246 0.000 0.016 0.000 0.692 0.212 0.080
#> SRR772595 4 0.5083 0.57601 0.000 0.076 0.000 0.700 0.164 0.060
#> SRR772596 3 0.4312 0.43046 0.012 0.000 0.508 0.000 0.476 0.004
#> SRR772597 3 0.0508 0.83446 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR772598 1 0.0622 0.83601 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR772599 1 0.0622 0.83601 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR772600 5 0.7434 0.42352 0.000 0.212 0.000 0.160 0.388 0.240
#> SRR772601 5 0.7344 0.31485 0.000 0.128 0.000 0.260 0.388 0.224
#> SRR772602 3 0.0260 0.83421 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772603 5 0.6732 0.34703 0.000 0.248 0.000 0.040 0.392 0.320
#> SRR772604 5 0.7448 0.40720 0.000 0.184 0.000 0.184 0.388 0.244
#> SRR772605 6 0.4624 0.15088 0.000 0.432 0.000 0.000 0.040 0.528
#> SRR772606 1 0.0820 0.83400 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR772607 1 0.0820 0.83400 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR772608 2 0.3296 0.68388 0.004 0.796 0.000 0.000 0.020 0.180
#> SRR772609 2 0.3705 0.63101 0.004 0.740 0.000 0.000 0.020 0.236
#> SRR772610 2 0.2587 0.71758 0.000 0.868 0.000 0.004 0.020 0.108
#> SRR772611 2 0.2838 0.70807 0.000 0.852 0.000 0.004 0.028 0.116
#> SRR772612 4 0.5379 0.28781 0.000 0.000 0.000 0.516 0.364 0.120
#> SRR772613 4 0.5418 0.27386 0.000 0.000 0.000 0.508 0.368 0.124
#> SRR772614 1 0.0405 0.83899 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR772615 1 0.0260 0.83764 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR772616 6 0.4949 0.41024 0.308 0.056 0.000 0.000 0.016 0.620
#> SRR772617 4 0.5466 0.31759 0.000 0.004 0.000 0.532 0.344 0.120
#> SRR772618 4 0.5324 0.33111 0.000 0.000 0.000 0.540 0.340 0.120
#> SRR772619 4 0.0748 0.77767 0.000 0.004 0.000 0.976 0.016 0.004
#> SRR772620 4 0.0748 0.77767 0.000 0.004 0.000 0.976 0.016 0.004
#> SRR772621 2 0.2313 0.70700 0.004 0.884 0.000 0.000 0.012 0.100
#> SRR772622 2 0.3018 0.63631 0.004 0.816 0.000 0.000 0.012 0.168
#> SRR772623 3 0.0972 0.83017 0.000 0.000 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR772624 3 0.4722 0.40367 0.024 0.000 0.488 0.000 0.476 0.012
#> SRR772625 4 0.2866 0.72002 0.000 0.092 0.000 0.864 0.024 0.020
#> SRR772626 2 0.6061 0.01503 0.000 0.440 0.000 0.004 0.228 0.328
#> SRR772627 2 0.6919 -0.06363 0.000 0.388 0.000 0.060 0.232 0.320
#> SRR772628 1 0.2402 0.79585 0.868 0.000 0.000 0.000 0.012 0.120
#> SRR772629 1 0.1643 0.82741 0.924 0.000 0.000 0.000 0.008 0.068
#> SRR772630 6 0.5642 0.58544 0.112 0.288 0.000 0.000 0.024 0.576
#> SRR772631 5 0.4701 -0.43762 0.028 0.000 0.480 0.000 0.484 0.008
#> SRR772632 4 0.3930 0.27040 0.000 0.420 0.000 0.576 0.004 0.000
#> SRR772633 4 0.3337 0.53336 0.000 0.260 0.000 0.736 0.004 0.000
#> SRR772634 6 0.5763 0.44833 0.324 0.112 0.000 0.000 0.024 0.540
#> SRR772635 2 0.5271 -0.29995 0.052 0.472 0.000 0.000 0.020 0.456
#> SRR772636 4 0.6550 0.20338 0.000 0.264 0.000 0.456 0.244 0.036
#> SRR772637 1 0.0777 0.84017 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR772638 1 0.0865 0.83808 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772639 2 0.0291 0.74798 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR772640 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772642 2 0.3866 0.61237 0.008 0.736 0.000 0.000 0.024 0.232
#> SRR772643 2 0.2538 0.72749 0.000 0.860 0.000 0.000 0.016 0.124
#> SRR772644 1 0.3991 0.24055 0.524 0.004 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR772645 1 0.3961 0.33464 0.556 0.004 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR772646 2 0.0748 0.74698 0.000 0.976 0.000 0.016 0.004 0.004
#> SRR772647 2 0.0653 0.74756 0.000 0.980 0.000 0.012 0.004 0.004
#> SRR772648 2 0.1225 0.74236 0.000 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR772649 2 0.1549 0.73646 0.000 0.936 0.000 0.000 0.020 0.044
#> SRR772650 6 0.5275 0.63734 0.184 0.152 0.000 0.000 0.016 0.648
#> SRR772651 6 0.4387 0.23717 0.392 0.016 0.000 0.000 0.008 0.584
#> SRR772652 1 0.2431 0.79399 0.860 0.000 0.000 0.000 0.008 0.132
#> SRR772653 1 0.2768 0.77319 0.832 0.000 0.000 0.000 0.012 0.156
#> SRR772654 2 0.4291 0.20890 0.008 0.620 0.000 0.000 0.016 0.356
#> SRR772655 2 0.4113 0.35594 0.008 0.668 0.000 0.000 0.016 0.308
#> SRR772656 3 0.0547 0.83422 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772657 3 0.0363 0.83371 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772658 4 0.3807 0.62205 0.000 0.000 0.000 0.756 0.192 0.052
#> SRR772659 4 0.4522 0.52651 0.000 0.000 0.000 0.672 0.252 0.076
#> SRR772660 2 0.4201 0.53102 0.000 0.664 0.000 0.000 0.036 0.300
#> SRR772661 5 0.5840 -0.25787 0.012 0.012 0.384 0.000 0.496 0.096
#> SRR772662 6 0.5310 0.63704 0.160 0.180 0.000 0.000 0.016 0.644
#> SRR772663 6 0.5405 0.60895 0.212 0.136 0.000 0.000 0.020 0.632
#> SRR772664 2 0.0551 0.74963 0.000 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR772665 2 0.0653 0.74986 0.000 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR772666 3 0.0260 0.83466 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772667 4 0.3488 0.65114 0.000 0.000 0.000 0.780 0.184 0.036
#> SRR772668 4 0.4478 0.53671 0.000 0.000 0.000 0.680 0.244 0.076
#> SRR772669 4 0.4405 0.54644 0.000 0.000 0.000 0.688 0.240 0.072
#> SRR772670 6 0.4524 0.40636 0.012 0.352 0.000 0.000 0.024 0.612
#> SRR772671 6 0.4546 0.47520 0.020 0.312 0.000 0.000 0.024 0.644
#> SRR772672 2 0.2790 0.71271 0.000 0.856 0.000 0.008 0.020 0.116
#> SRR772673 2 0.2538 0.71275 0.000 0.860 0.000 0.000 0.016 0.124
#> SRR772674 3 0.0547 0.83422 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772675 5 0.6053 -0.21589 0.004 0.032 0.368 0.000 0.492 0.104
#> SRR772676 2 0.4172 0.34127 0.012 0.672 0.000 0.000 0.016 0.300
#> SRR772677 2 0.4154 0.29215 0.004 0.652 0.000 0.000 0.020 0.324
#> SRR772678 5 0.6079 -0.19089 0.000 0.040 0.352 0.000 0.496 0.112
#> SRR772679 6 0.5323 0.60449 0.124 0.216 0.000 0.000 0.020 0.640
#> SRR772680 6 0.5198 0.60468 0.208 0.116 0.000 0.000 0.020 0.656
#> SRR772681 3 0.0547 0.83422 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772682 2 0.0291 0.74945 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772683 2 0.0405 0.74999 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR772685 2 0.1049 0.74479 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR772686 3 0.0260 0.83457 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772687 3 0.4211 0.67339 0.092 0.000 0.764 0.000 0.128 0.016
#> SRR772688 4 0.0713 0.79366 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR772689 4 0.0547 0.79063 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0260 0.83435 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772691 4 0.6694 0.10349 0.000 0.260 0.000 0.396 0.308 0.036
#> SRR772692 6 0.5344 0.47260 0.064 0.384 0.000 0.000 0.020 0.532
#> SRR772693 2 0.3915 0.45556 0.008 0.696 0.000 0.000 0.012 0.284
#> SRR772694 2 0.2743 0.66955 0.000 0.828 0.000 0.000 0.008 0.164
#> SRR772695 2 0.4310 0.07548 0.004 0.512 0.000 0.000 0.012 0.472
#> SRR772696 2 0.2019 0.72024 0.000 0.900 0.000 0.000 0.012 0.088
#> SRR772697 2 0.1434 0.73687 0.000 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR772698 3 0.4491 0.42072 0.016 0.000 0.500 0.000 0.476 0.008
#> SRR772699 1 0.2070 0.82405 0.896 0.000 0.000 0.000 0.012 0.092
#> SRR772700 1 0.3368 0.70988 0.756 0.000 0.000 0.000 0.012 0.232
#> SRR772701 1 0.2378 0.77804 0.848 0.000 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR772702 1 0.1007 0.83832 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.866 0.927 0.968 0.5011 0.499 0.499
#> 3 3 0.771 0.865 0.933 0.2272 0.877 0.758
#> 4 4 0.686 0.730 0.854 0.1657 0.873 0.685
#> 5 5 0.694 0.691 0.826 0.0682 0.936 0.782
#> 6 6 0.709 0.674 0.819 0.0413 0.952 0.807
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772347 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772348 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772353 1 0.4022 0.89727 0.920 0.080
#> SRR772354 1 0.8499 0.62134 0.724 0.276
#> SRR772355 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772357 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772359 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772360 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772361 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772365 1 0.0672 0.96176 0.992 0.008
#> SRR772366 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.5294 0.86166 0.120 0.880
#> SRR772370 2 0.5842 0.83462 0.140 0.860
#> SRR772371 1 0.7139 0.76822 0.804 0.196
#> SRR772372 1 0.7219 0.76335 0.800 0.200
#> SRR772373 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.7299 0.75733 0.796 0.204
#> SRR772378 1 0.8081 0.66918 0.752 0.248
#> SRR772379 2 0.1414 0.95196 0.020 0.980
#> SRR772380 1 0.7219 0.76388 0.800 0.200
#> SRR772381 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772384 1 0.1414 0.95274 0.980 0.020
#> SRR772385 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772386 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772393 2 0.1184 0.95490 0.016 0.984
#> SRR772394 2 0.4161 0.89617 0.084 0.916
#> SRR772395 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772402 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.1414 0.95266 0.980 0.020
#> SRR772406 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.5408 0.84860 0.124 0.876
#> SRR772411 2 0.7453 0.72585 0.212 0.788
#> SRR772412 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0938 0.95776 0.012 0.988
#> SRR772416 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772417 1 0.6887 0.78431 0.816 0.184
#> SRR772418 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.8661 0.62098 0.288 0.712
#> SRR772422 2 0.4815 0.87792 0.104 0.896
#> SRR772423 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772430 1 0.4022 0.89690 0.920 0.080
#> SRR772431 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772436 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772437 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772440 2 0.4690 0.88223 0.100 0.900
#> SRR772441 2 0.1184 0.95509 0.016 0.984
#> SRR772442 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772448 2 0.2948 0.92674 0.052 0.948
#> SRR772449 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772466 2 0.2778 0.92844 0.048 0.952
#> SRR772467 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.1633 0.94951 0.976 0.024
#> SRR772470 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772471 1 0.1843 0.94613 0.972 0.028
#> SRR772472 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772473 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772480 2 0.2778 0.93028 0.048 0.952
#> SRR772481 2 0.4161 0.89782 0.084 0.916
#> SRR772482 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772484 2 0.3114 0.92341 0.056 0.944
#> SRR772485 2 0.1843 0.94616 0.028 0.972
#> SRR772486 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.7376 0.74886 0.208 0.792
#> SRR772489 2 0.5842 0.83745 0.140 0.860
#> SRR772490 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772498 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772499 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.5842 0.83649 0.860 0.140
#> SRR772503 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772504 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.8016 0.69350 0.756 0.244
#> SRR772510 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.2603 0.93283 0.044 0.956
#> SRR772512 2 0.9909 0.22742 0.444 0.556
#> SRR772513 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0672 0.96049 0.008 0.992
#> SRR772519 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.9996 0.00988 0.488 0.512
#> SRR772522 1 0.9775 0.33227 0.588 0.412
#> SRR772523 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772535 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772541 2 0.2236 0.94019 0.036 0.964
#> SRR772542 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772547 1 0.6887 0.78397 0.816 0.184
#> SRR772548 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772551 2 0.4161 0.89852 0.084 0.916
#> SRR772552 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772553 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772554 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772560 1 0.8555 0.63855 0.720 0.280
#> SRR772561 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772572 1 0.7219 0.76305 0.800 0.200
#> SRR772573 1 0.9710 0.37032 0.600 0.400
#> SRR772574 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772576 2 0.4298 0.89396 0.088 0.912
#> SRR772577 2 0.6148 0.82278 0.152 0.848
#> SRR772578 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.9170 0.51966 0.332 0.668
#> SRR772582 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772583 2 0.9850 0.27724 0.428 0.572
#> SRR772584 2 0.7745 0.71984 0.228 0.772
#> SRR772585 2 0.1184 0.95507 0.016 0.984
#> SRR772586 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772588 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772600 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0672 0.96041 0.008 0.992
#> SRR772604 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.2603 0.93209 0.044 0.956
#> SRR772606 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772608 2 0.1843 0.94626 0.028 0.972
#> SRR772609 2 0.5178 0.86494 0.116 0.884
#> SRR772610 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4022 0.89924 0.920 0.080
#> SRR772617 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.7299 0.75440 0.204 0.796
#> SRR772622 2 0.5178 0.86561 0.116 0.884
#> SRR772623 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772627 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772628 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772630 1 0.7950 0.70494 0.760 0.240
#> SRR772631 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772635 1 0.0938 0.95861 0.988 0.012
#> SRR772636 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.7815 0.71469 0.232 0.768
#> SRR772643 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772644 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772650 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772654 1 0.8386 0.64493 0.732 0.268
#> SRR772655 1 0.9358 0.45680 0.648 0.352
#> SRR772656 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.2778 0.92906 0.952 0.048
#> SRR772662 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772663 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772664 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772670 1 0.9460 0.46009 0.636 0.364
#> SRR772671 1 0.7950 0.70230 0.760 0.240
#> SRR772672 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0672 0.96180 0.992 0.008
#> SRR772676 2 0.9866 0.21473 0.432 0.568
#> SRR772677 2 0.9522 0.39778 0.372 0.628
#> SRR772678 1 0.4939 0.87183 0.892 0.108
#> SRR772679 1 0.0672 0.96172 0.992 0.008
#> SRR772680 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772681 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0376 0.96306 0.004 0.996
#> SRR772686 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772692 1 0.0672 0.96176 0.992 0.008
#> SRR772693 2 0.9522 0.43735 0.372 0.628
#> SRR772694 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0376 0.96303 0.004 0.996
#> SRR772696 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772697 2 0.0000 0.96563 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.96767 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.1163 0.90231 0.972 0.000 0.028
#> SRR772342 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0237 0.89859 0.996 0.000 0.004
#> SRR772344 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 1 0.0237 0.90062 0.996 0.000 0.004
#> SRR772347 1 0.1643 0.90192 0.956 0.000 0.044
#> SRR772348 2 0.0237 0.94157 0.000 0.996 0.004
#> SRR772349 2 0.0237 0.94157 0.000 0.996 0.004
#> SRR772350 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772351 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772352 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772353 1 0.1453 0.88515 0.968 0.024 0.008
#> SRR772354 1 0.2280 0.86239 0.940 0.052 0.008
#> SRR772355 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772357 1 0.0237 0.90066 0.996 0.000 0.004
#> SRR772358 1 0.1031 0.90240 0.976 0.000 0.024
#> SRR772359 3 0.5810 0.46368 0.336 0.000 0.664
#> SRR772360 3 0.5678 0.51289 0.316 0.000 0.684
#> SRR772361 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772362 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.2448 0.89176 0.924 0.000 0.076
#> SRR772365 1 0.4291 0.80646 0.820 0.000 0.180
#> SRR772366 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772367 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772368 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772369 2 0.5070 0.73685 0.224 0.772 0.004
#> SRR772370 2 0.6200 0.57571 0.312 0.676 0.012
#> SRR772371 1 0.8230 0.55079 0.632 0.144 0.224
#> SRR772372 1 0.7777 0.61861 0.676 0.160 0.164
#> SRR772373 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772376 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772377 3 0.1964 0.87993 0.000 0.056 0.944
#> SRR772378 1 0.0661 0.89573 0.988 0.004 0.008
#> SRR772379 2 0.5461 0.67969 0.244 0.748 0.008
#> SRR772380 1 0.2063 0.87410 0.948 0.044 0.008
#> SRR772381 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772382 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772383 1 0.1860 0.89990 0.948 0.000 0.052
#> SRR772384 3 0.0237 0.93500 0.004 0.000 0.996
#> SRR772385 2 0.0424 0.94012 0.000 0.992 0.008
#> SRR772386 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772391 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.3116 0.85628 0.000 0.892 0.108
#> SRR772394 2 0.4842 0.71141 0.000 0.776 0.224
#> SRR772395 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772396 1 0.1860 0.90000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772397 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772398 3 0.2711 0.86686 0.088 0.000 0.912
#> SRR772399 3 0.3941 0.78082 0.156 0.000 0.844
#> SRR772400 1 0.4346 0.80086 0.816 0.000 0.184
#> SRR772401 1 0.3267 0.86436 0.884 0.000 0.116
#> SRR772402 2 0.0237 0.94155 0.000 0.996 0.004
#> SRR772403 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772404 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772405 3 0.0237 0.93500 0.004 0.000 0.996
#> SRR772406 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 2 0.5785 0.48788 0.332 0.668 0.000
#> SRR772411 2 0.6302 0.01344 0.480 0.520 0.000
#> SRR772412 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772413 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772414 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772415 2 0.4473 0.81076 0.164 0.828 0.008
#> SRR772416 2 0.1315 0.92979 0.020 0.972 0.008
#> SRR772417 1 0.3425 0.81870 0.884 0.112 0.004
#> SRR772418 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772419 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 3 0.6282 0.34475 0.004 0.384 0.612
#> SRR772422 2 0.4121 0.79345 0.000 0.832 0.168
#> SRR772423 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772428 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772429 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772430 1 0.2116 0.87044 0.948 0.040 0.012
#> SRR772431 2 0.0829 0.93582 0.012 0.984 0.004
#> SRR772432 2 0.1399 0.92614 0.028 0.968 0.004
#> SRR772433 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772434 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772435 1 0.1163 0.90232 0.972 0.000 0.028
#> SRR772436 1 0.1411 0.90195 0.964 0.000 0.036
#> SRR772437 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772438 1 0.2878 0.87925 0.904 0.000 0.096
#> SRR772439 1 0.3879 0.83440 0.848 0.000 0.152
#> SRR772440 2 0.4196 0.84114 0.112 0.864 0.024
#> SRR772441 2 0.1170 0.93179 0.016 0.976 0.008
#> SRR772442 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772444 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772445 1 0.1964 0.89914 0.944 0.000 0.056
#> SRR772446 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.3267 0.85240 0.000 0.884 0.116
#> SRR772449 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772450 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0237 0.89893 0.996 0.000 0.004
#> SRR772456 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772459 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772460 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772463 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772464 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772465 2 0.2682 0.88068 0.076 0.920 0.004
#> SRR772466 2 0.5815 0.55639 0.304 0.692 0.004
#> SRR772467 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.0237 0.89893 0.996 0.000 0.004
#> SRR772470 1 0.0237 0.89893 0.996 0.000 0.004
#> SRR772471 1 0.0237 0.89859 0.996 0.000 0.004
#> SRR772472 1 0.0237 0.89893 0.996 0.000 0.004
#> SRR772473 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772475 2 0.6062 0.37677 0.000 0.616 0.384
#> SRR772476 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.1031 0.90215 0.976 0.000 0.024
#> SRR772480 2 0.4291 0.81924 0.152 0.840 0.008
#> SRR772481 2 0.5109 0.75481 0.212 0.780 0.008
#> SRR772482 1 0.6286 0.24475 0.536 0.000 0.464
#> SRR772483 1 0.5678 0.60757 0.684 0.000 0.316
#> SRR772484 2 0.4228 0.82533 0.148 0.844 0.008
#> SRR772485 2 0.4099 0.83346 0.140 0.852 0.008
#> SRR772486 1 0.5431 0.66835 0.716 0.000 0.284
#> SRR772487 1 0.6154 0.42087 0.592 0.000 0.408
#> SRR772488 2 0.5244 0.72353 0.240 0.756 0.004
#> SRR772489 2 0.4861 0.77824 0.192 0.800 0.008
#> SRR772490 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772491 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772492 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772498 2 0.3038 0.85961 0.000 0.896 0.104
#> SRR772499 2 0.2537 0.88341 0.000 0.920 0.080
#> SRR772500 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 1 0.8865 0.14372 0.476 0.120 0.404
#> SRR772503 1 0.3619 0.85468 0.864 0.000 0.136
#> SRR772504 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772505 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772509 3 0.0892 0.91753 0.000 0.020 0.980
#> SRR772510 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772511 2 0.3573 0.84273 0.120 0.876 0.004
#> SRR772512 3 0.0475 0.93470 0.004 0.004 0.992
#> SRR772513 2 0.0661 0.93849 0.004 0.988 0.008
#> SRR772514 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772515 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772516 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772517 2 0.1267 0.92864 0.024 0.972 0.004
#> SRR772518 2 0.3965 0.84140 0.132 0.860 0.008
#> SRR772519 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772521 1 0.6984 0.30815 0.560 0.420 0.020
#> SRR772522 1 0.9956 0.01905 0.360 0.352 0.288
#> SRR772523 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772525 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772526 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772529 1 0.1964 0.89923 0.944 0.000 0.056
#> SRR772530 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772531 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772532 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772534 1 0.0237 0.89893 0.996 0.000 0.004
#> SRR772535 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.4033 0.83883 0.136 0.856 0.008
#> SRR772542 1 0.5733 0.60105 0.676 0.000 0.324
#> SRR772543 1 0.4121 0.81755 0.832 0.000 0.168
#> SRR772544 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772545 1 0.0892 0.90205 0.980 0.000 0.020
#> SRR772546 1 0.1289 0.90203 0.968 0.000 0.032
#> SRR772547 1 0.3454 0.82324 0.888 0.104 0.008
#> SRR772548 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.5958 0.61507 0.300 0.692 0.008
#> SRR772552 2 0.1399 0.92361 0.028 0.968 0.004
#> SRR772553 3 0.5363 0.60460 0.000 0.276 0.724
#> SRR772554 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772555 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772556 1 0.1860 0.89987 0.948 0.000 0.052
#> SRR772557 1 0.1860 0.89990 0.948 0.000 0.052
#> SRR772558 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0237 0.89859 0.996 0.000 0.004
#> SRR772560 1 0.4099 0.77473 0.852 0.140 0.008
#> SRR772561 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772562 2 0.0237 0.94157 0.000 0.996 0.004
#> SRR772563 2 0.0237 0.94157 0.000 0.996 0.004
#> SRR772564 1 0.6079 0.46767 0.612 0.000 0.388
#> SRR772565 1 0.4121 0.81989 0.832 0.000 0.168
#> SRR772566 1 0.2165 0.89650 0.936 0.000 0.064
#> SRR772567 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772568 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772570 1 0.0592 0.90147 0.988 0.000 0.012
#> SRR772571 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772572 1 0.3851 0.78922 0.860 0.136 0.004
#> SRR772573 1 0.6264 0.43224 0.616 0.380 0.004
#> SRR772574 1 0.1289 0.90212 0.968 0.000 0.032
#> SRR772575 1 0.1964 0.89901 0.944 0.000 0.056
#> SRR772576 2 0.4172 0.81992 0.156 0.840 0.004
#> SRR772577 2 0.4968 0.77814 0.188 0.800 0.012
#> SRR772578 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772580 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772581 1 0.7251 0.46974 0.612 0.348 0.040
#> SRR772582 2 0.0983 0.93217 0.016 0.980 0.004
#> SRR772583 1 0.3695 0.79659 0.880 0.108 0.012
#> SRR772584 2 0.6553 0.37901 0.412 0.580 0.008
#> SRR772585 2 0.3129 0.87987 0.088 0.904 0.008
#> SRR772586 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772587 1 0.0237 0.89893 0.996 0.000 0.004
#> SRR772588 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772591 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772592 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772593 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772594 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772596 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772597 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772598 1 0.3619 0.84825 0.864 0.000 0.136
#> SRR772599 1 0.3482 0.85507 0.872 0.000 0.128
#> SRR772600 2 0.0475 0.94021 0.004 0.992 0.004
#> SRR772601 2 0.0237 0.94155 0.000 0.996 0.004
#> SRR772602 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772603 2 0.4110 0.82445 0.152 0.844 0.004
#> SRR772604 2 0.0475 0.94017 0.004 0.992 0.004
#> SRR772605 2 0.5335 0.71900 0.232 0.760 0.008
#> SRR772606 1 0.2165 0.89669 0.936 0.000 0.064
#> SRR772607 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772608 2 0.4575 0.81176 0.160 0.828 0.012
#> SRR772609 2 0.5122 0.76672 0.200 0.788 0.012
#> SRR772610 2 0.0237 0.94155 0.000 0.996 0.004
#> SRR772611 2 0.0237 0.94157 0.000 0.996 0.004
#> SRR772612 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772614 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772615 1 0.2165 0.89666 0.936 0.000 0.064
#> SRR772616 1 0.0661 0.89675 0.988 0.004 0.008
#> SRR772617 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 2 0.5875 0.76327 0.136 0.792 0.072
#> SRR772622 2 0.5070 0.74121 0.224 0.772 0.004
#> SRR772623 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772624 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772625 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772626 2 0.2796 0.87254 0.000 0.908 0.092
#> SRR772627 2 0.0747 0.93433 0.000 0.984 0.016
#> SRR772628 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772629 1 0.2165 0.89650 0.936 0.000 0.064
#> SRR772630 1 0.3851 0.79187 0.860 0.136 0.004
#> SRR772631 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772632 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 3 0.3619 0.80820 0.136 0.000 0.864
#> SRR772635 3 0.0892 0.93427 0.020 0.000 0.980
#> SRR772636 2 0.0237 0.94157 0.000 0.996 0.004
#> SRR772637 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772640 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 2 0.6703 0.63457 0.052 0.712 0.236
#> SRR772643 2 0.0661 0.93877 0.004 0.988 0.008
#> SRR772644 1 0.0237 0.89859 0.996 0.000 0.004
#> SRR772645 1 0.0237 0.89859 0.996 0.000 0.004
#> SRR772646 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772648 2 0.0475 0.94003 0.004 0.992 0.004
#> SRR772649 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772650 1 0.0237 0.89859 0.996 0.000 0.004
#> SRR772651 1 0.0000 0.89994 1.000 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.4346 0.80409 0.816 0.000 0.184
#> SRR772653 1 0.3941 0.83306 0.844 0.000 0.156
#> SRR772654 1 0.6955 0.68384 0.728 0.172 0.100
#> SRR772655 1 0.9653 0.17456 0.456 0.232 0.312
#> SRR772656 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772657 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772658 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772660 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772661 3 0.0661 0.92908 0.004 0.008 0.988
#> SRR772662 1 0.0237 0.89859 0.996 0.000 0.004
#> SRR772663 1 0.0237 0.89859 0.996 0.000 0.004
#> SRR772664 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772666 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772667 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772668 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772670 1 0.3682 0.80219 0.876 0.116 0.008
#> SRR772671 1 0.1015 0.89254 0.980 0.012 0.008
#> SRR772672 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772673 2 0.0424 0.94020 0.000 0.992 0.008
#> SRR772674 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772675 3 0.0237 0.93500 0.004 0.000 0.996
#> SRR772676 2 0.7453 0.09459 0.436 0.528 0.036
#> SRR772677 2 0.7699 0.23170 0.388 0.560 0.052
#> SRR772678 3 0.1031 0.91338 0.000 0.024 0.976
#> SRR772679 1 0.0848 0.89428 0.984 0.008 0.008
#> SRR772680 1 0.0424 0.89675 0.992 0.000 0.008
#> SRR772681 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772682 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772685 2 0.0892 0.93279 0.020 0.980 0.000
#> SRR772686 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772687 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772688 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.94282 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772691 2 0.2356 0.89186 0.000 0.928 0.072
#> SRR772692 3 0.5728 0.57181 0.272 0.008 0.720
#> SRR772693 3 0.7759 0.00474 0.048 0.476 0.476
#> SRR772694 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772695 2 0.4700 0.78657 0.180 0.812 0.008
#> SRR772696 2 0.1411 0.92191 0.000 0.964 0.036
#> SRR772697 2 0.0237 0.94140 0.000 0.996 0.004
#> SRR772698 3 0.0592 0.94067 0.012 0.000 0.988
#> SRR772699 1 0.2711 0.88437 0.912 0.000 0.088
#> SRR772700 1 0.3116 0.87174 0.892 0.000 0.108
#> SRR772701 1 0.2066 0.89811 0.940 0.000 0.060
#> SRR772702 1 0.2165 0.89650 0.936 0.000 0.064
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772342 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772343 1 0.1792 0.8860 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR772344 2 0.0817 0.7790 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772345 2 0.0817 0.7800 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772346 1 0.2868 0.8333 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR772347 1 0.3450 0.8095 0.836 0.000 0.008 0.156
#> SRR772348 4 0.4277 0.6850 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR772349 2 0.4605 0.4012 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR772350 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772351 2 0.4999 -0.4847 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR772352 2 0.3356 0.6413 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR772353 1 0.4720 0.6880 0.720 0.016 0.000 0.264
#> SRR772354 1 0.6751 0.4881 0.592 0.136 0.000 0.272
#> SRR772355 2 0.1940 0.7260 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772356 2 0.2149 0.7096 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR772357 1 0.0336 0.9050 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772358 1 0.0336 0.9061 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772359 3 0.5329 0.2897 0.420 0.000 0.568 0.012
#> SRR772360 3 0.5268 0.3657 0.396 0.000 0.592 0.012
#> SRR772361 3 0.0469 0.9433 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772362 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772363 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772364 1 0.5708 0.2087 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR772365 4 0.7012 0.3908 0.284 0.000 0.156 0.560
#> SRR772366 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772367 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772368 4 0.3266 0.6575 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR772369 2 0.4036 0.6980 0.076 0.836 0.000 0.088
#> SRR772370 2 0.5122 0.6463 0.080 0.756 0.000 0.164
#> SRR772371 4 0.8120 0.5357 0.252 0.120 0.076 0.552
#> SRR772372 4 0.7436 0.6274 0.188 0.128 0.056 0.628
#> SRR772373 2 0.1302 0.7742 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772374 2 0.1022 0.7789 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772375 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772377 3 0.0672 0.9321 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR772378 1 0.4961 0.4192 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR772379 4 0.4773 0.5957 0.092 0.120 0.000 0.788
#> SRR772380 1 0.4898 0.7051 0.716 0.024 0.000 0.260
#> SRR772381 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772382 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772383 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772384 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772385 2 0.1510 0.7727 0.000 0.956 0.016 0.028
#> SRR772386 2 0.1118 0.7763 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772387 2 0.1302 0.7724 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772388 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772389 1 0.0469 0.9042 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772390 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772391 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772392 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772393 4 0.5839 0.7346 0.000 0.352 0.044 0.604
#> SRR772394 4 0.6805 0.6424 0.000 0.176 0.220 0.604
#> SRR772395 2 0.4134 0.6025 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR772396 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772397 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772398 3 0.2530 0.8626 0.100 0.000 0.896 0.004
#> SRR772399 3 0.3266 0.7835 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR772400 1 0.2149 0.8612 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR772401 1 0.0592 0.9037 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772402 4 0.4331 0.7616 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR772403 4 0.4477 0.7564 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR772404 2 0.4040 0.6168 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR772405 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772406 2 0.3172 0.6161 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR772407 2 0.4679 0.0266 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR772408 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772409 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772410 2 0.6572 0.2903 0.272 0.608 0.000 0.120
#> SRR772411 2 0.6795 0.0223 0.432 0.472 0.000 0.096
#> SRR772412 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772413 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772414 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772415 2 0.5698 0.5010 0.044 0.636 0.000 0.320
#> SRR772416 2 0.4585 0.5294 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR772417 1 0.4071 0.8051 0.832 0.064 0.000 0.104
#> SRR772418 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772419 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772421 2 0.6672 0.3137 0.016 0.548 0.380 0.056
#> SRR772422 2 0.4334 0.6998 0.016 0.836 0.068 0.080
#> SRR772423 4 0.4697 0.7438 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR772424 4 0.4830 0.7186 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR772425 2 0.0707 0.7800 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR772426 2 0.0469 0.7821 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772427 2 0.0469 0.7821 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772428 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772429 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772430 1 0.5252 0.5864 0.644 0.020 0.000 0.336
#> SRR772431 4 0.3266 0.7150 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR772432 4 0.3024 0.7018 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR772433 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772434 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772435 1 0.1807 0.8906 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR772436 1 0.1151 0.9018 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR772437 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772438 1 0.1022 0.8969 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR772439 1 0.1792 0.8762 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR772440 2 0.6077 0.5636 0.076 0.660 0.004 0.260
#> SRR772441 2 0.4868 0.3792 0.012 0.684 0.000 0.304
#> SRR772442 4 0.4431 0.7586 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR772443 4 0.4331 0.7614 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR772444 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772445 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772446 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772447 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772448 4 0.6621 0.5657 0.000 0.408 0.084 0.508
#> SRR772449 2 0.4817 0.0131 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR772450 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772451 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772452 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772453 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772454 1 0.0707 0.9029 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772455 1 0.1118 0.8996 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772456 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772457 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772458 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772459 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772460 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772461 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772462 2 0.4250 0.5886 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR772463 2 0.4164 0.5986 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR772464 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772465 2 0.3308 0.7264 0.036 0.872 0.000 0.092
#> SRR772466 2 0.5160 0.5885 0.136 0.760 0.000 0.104
#> SRR772467 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.1716 0.8891 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR772470 1 0.0707 0.9033 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772471 1 0.2149 0.8746 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR772472 1 0.0921 0.9013 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772473 4 0.4454 0.7559 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR772474 4 0.4304 0.7613 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR772475 2 0.4095 0.5922 0.000 0.792 0.192 0.016
#> SRR772476 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772477 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772478 1 0.0336 0.9050 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772479 1 0.0000 0.9058 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 4 0.4574 0.7494 0.024 0.220 0.000 0.756
#> SRR772481 4 0.3935 0.6955 0.060 0.100 0.000 0.840
#> SRR772482 1 0.4790 0.3967 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR772483 1 0.3764 0.7095 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR772484 2 0.5898 0.4927 0.056 0.628 0.000 0.316
#> SRR772485 2 0.5827 0.4969 0.052 0.632 0.000 0.316
#> SRR772486 1 0.3764 0.7356 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR772487 1 0.4830 0.4195 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR772488 2 0.6612 0.4689 0.132 0.612 0.000 0.256
#> SRR772489 2 0.6404 0.4695 0.096 0.608 0.000 0.296
#> SRR772490 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772491 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772492 2 0.0817 0.7723 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772493 2 0.0817 0.7723 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772494 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772495 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772496 2 0.1792 0.7621 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772497 2 0.1716 0.7642 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772498 4 0.5728 0.7280 0.000 0.364 0.036 0.600
#> SRR772499 4 0.5510 0.7244 0.000 0.376 0.024 0.600
#> SRR772500 2 0.0336 0.7826 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772501 2 0.0469 0.7821 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772502 1 0.7781 0.4547 0.580 0.076 0.252 0.092
#> SRR772503 1 0.2983 0.8608 0.892 0.000 0.040 0.068
#> SRR772504 2 0.1940 0.7551 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772505 2 0.0469 0.7804 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772506 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772508 2 0.4406 0.5620 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR772509 3 0.0524 0.9352 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR772510 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772511 4 0.5404 0.7380 0.052 0.248 0.000 0.700
#> SRR772512 3 0.0188 0.9388 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772513 2 0.4406 0.5607 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR772514 2 0.4356 0.5682 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR772515 2 0.1867 0.7570 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772516 2 0.1792 0.7594 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772517 2 0.4382 0.5717 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR772518 2 0.5708 0.3638 0.028 0.556 0.000 0.416
#> SRR772519 2 0.1474 0.7708 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772520 2 0.0817 0.7823 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772521 1 0.7578 0.0144 0.456 0.384 0.008 0.152
#> SRR772522 1 0.9890 -0.2876 0.304 0.272 0.188 0.236
#> SRR772523 2 0.2281 0.7184 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772524 2 0.0817 0.7793 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772525 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772529 1 0.0188 0.9060 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772530 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772531 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772532 2 0.0469 0.7819 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772533 2 0.0592 0.7801 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772534 1 0.1867 0.8855 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR772535 2 0.4761 -0.0761 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR772536 2 0.1211 0.7736 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772537 4 0.4933 0.6709 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR772538 4 0.4925 0.6771 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR772539 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772540 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772541 4 0.4323 0.5687 0.028 0.184 0.000 0.788
#> SRR772542 1 0.4103 0.6760 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR772543 1 0.2149 0.8604 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR772544 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.9058 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.9058 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772547 1 0.4008 0.8118 0.820 0.032 0.000 0.148
#> SRR772548 1 0.1557 0.8932 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR772549 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772550 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772551 4 0.4869 0.7026 0.088 0.132 0.000 0.780
#> SRR772552 4 0.4837 0.7434 0.000 0.348 0.004 0.648
#> SRR772553 3 0.4897 0.3997 0.000 0.332 0.660 0.008
#> SRR772554 2 0.1716 0.7611 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772555 2 0.1867 0.7570 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772556 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772557 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772558 1 0.0707 0.9030 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772559 1 0.0921 0.9013 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772560 1 0.6089 0.5439 0.608 0.064 0.000 0.328
#> SRR772561 3 0.0336 0.9424 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772562 2 0.3610 0.6599 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772563 2 0.3172 0.6940 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR772564 1 0.4431 0.5802 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR772565 1 0.2216 0.8586 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR772566 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772567 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772568 2 0.0336 0.7829 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772569 2 0.0592 0.7819 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772570 1 0.0336 0.9059 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772571 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772572 1 0.4514 0.7869 0.800 0.064 0.000 0.136
#> SRR772573 1 0.6153 0.3592 0.604 0.328 0.000 0.068
#> SRR772574 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772575 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772576 4 0.6240 0.1904 0.064 0.368 0.000 0.568
#> SRR772577 4 0.5212 0.5210 0.068 0.192 0.000 0.740
#> SRR772578 2 0.4948 -0.3732 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR772579 2 0.4977 -0.4341 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR772580 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772581 4 0.5757 0.6907 0.128 0.144 0.004 0.724
#> SRR772582 4 0.4401 0.7502 0.004 0.272 0.000 0.724
#> SRR772583 4 0.5378 -0.1349 0.448 0.012 0.000 0.540
#> SRR772584 4 0.4636 0.5711 0.140 0.068 0.000 0.792
#> SRR772585 4 0.4501 0.5404 0.024 0.212 0.000 0.764
#> SRR772586 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772587 1 0.1716 0.8894 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR772588 2 0.1118 0.7775 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772589 2 0.0469 0.7817 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772590 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772591 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772592 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772593 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772594 4 0.4866 0.7054 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR772595 4 0.4898 0.6923 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR772596 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772597 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772598 1 0.0707 0.9025 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR772599 1 0.0707 0.9026 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR772600 4 0.4134 0.7600 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR772601 4 0.4008 0.7552 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR772602 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772603 4 0.2882 0.6779 0.024 0.084 0.000 0.892
#> SRR772604 4 0.4008 0.7573 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR772605 4 0.4318 0.6045 0.068 0.116 0.000 0.816
#> SRR772606 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772607 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772608 2 0.5746 0.4905 0.040 0.612 0.000 0.348
#> SRR772609 2 0.6562 0.3342 0.080 0.516 0.000 0.404
#> SRR772610 2 0.3873 0.6351 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR772611 2 0.4277 0.5820 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR772612 4 0.4855 0.7101 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR772613 4 0.4843 0.7147 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR772614 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772615 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772616 1 0.2469 0.8680 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR772617 4 0.4661 0.7461 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR772618 4 0.4585 0.7524 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR772619 2 0.4790 -0.1683 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR772620 2 0.4761 -0.1357 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR772621 2 0.5612 0.6162 0.132 0.752 0.016 0.100
#> SRR772622 2 0.5096 0.6123 0.156 0.760 0.000 0.084
#> SRR772623 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772624 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772625 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772626 4 0.5728 0.7291 0.000 0.364 0.036 0.600
#> SRR772627 4 0.5339 0.7190 0.000 0.384 0.016 0.600
#> SRR772628 1 0.0672 0.9048 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772629 1 0.0672 0.9046 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772630 1 0.4487 0.7677 0.808 0.100 0.000 0.092
#> SRR772631 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772632 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772634 3 0.2814 0.8255 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR772635 3 0.3146 0.8799 0.064 0.008 0.892 0.036
#> SRR772636 2 0.1182 0.7758 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR772637 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772638 1 0.0592 0.9034 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772639 2 0.4843 -0.1127 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR772640 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772641 2 0.0188 0.7819 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772642 2 0.7235 0.4859 0.036 0.632 0.188 0.144
#> SRR772643 2 0.3356 0.6809 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR772644 1 0.1118 0.8998 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772645 1 0.1022 0.9006 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772646 2 0.0188 0.7830 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772647 2 0.0188 0.7830 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772648 2 0.2011 0.7522 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR772649 2 0.1940 0.7547 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772650 1 0.2081 0.8746 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR772651 1 0.1211 0.8970 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772652 1 0.1792 0.8750 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR772653 1 0.1474 0.8857 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR772654 1 0.6871 0.2696 0.548 0.360 0.012 0.080
#> SRR772655 2 0.7664 0.2841 0.312 0.548 0.056 0.084
#> SRR772656 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772657 3 0.0469 0.9433 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772658 4 0.4916 0.6810 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR772659 4 0.4843 0.7143 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR772660 2 0.4431 0.5591 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR772661 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772662 1 0.2011 0.8767 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR772663 1 0.2281 0.8658 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR772664 2 0.0188 0.7831 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772665 2 0.0188 0.7831 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772666 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772667 4 0.4250 0.6808 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR772668 4 0.4761 0.7339 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR772669 4 0.4746 0.7367 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR772670 1 0.6058 0.5647 0.624 0.068 0.000 0.308
#> SRR772671 1 0.4608 0.6619 0.692 0.004 0.000 0.304
#> SRR772672 2 0.3975 0.6223 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR772673 2 0.4103 0.6083 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR772674 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772675 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772676 2 0.6871 0.0671 0.412 0.500 0.008 0.080
#> SRR772677 2 0.7352 0.1393 0.340 0.540 0.028 0.092
#> SRR772678 3 0.0524 0.9352 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR772679 1 0.3791 0.7762 0.796 0.004 0.000 0.200
#> SRR772680 1 0.3764 0.7614 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR772681 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.7826 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772685 2 0.1406 0.7769 0.016 0.960 0.000 0.024
#> SRR772686 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772687 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772688 2 0.0336 0.7808 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772689 2 0.0469 0.7794 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772690 3 0.0592 0.9439 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772691 2 0.1820 0.7646 0.000 0.944 0.036 0.020
#> SRR772692 3 0.5639 0.4861 0.324 0.000 0.636 0.040
#> SRR772693 2 0.7558 0.3058 0.100 0.540 0.324 0.036
#> SRR772694 4 0.3764 0.7492 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR772695 4 0.2843 0.6541 0.020 0.088 0.000 0.892
#> SRR772696 4 0.5497 0.5510 0.000 0.460 0.016 0.524
#> SRR772697 4 0.4985 0.5073 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR772698 3 0.0336 0.9388 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772699 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772700 1 0.0469 0.9050 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772701 1 0.0336 0.9060 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772702 1 0.0469 0.9053 0.988 0.000 0.012 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.0290 0.87214 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772342 1 0.1121 0.86877 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772343 1 0.3922 0.78022 0.780 0.000 0.000 0.040 0.180
#> SRR772344 2 0.0671 0.79267 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR772345 2 0.0807 0.79178 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR772346 1 0.4203 0.73626 0.760 0.000 0.000 0.188 0.052
#> SRR772347 1 0.4134 0.72711 0.760 0.000 0.000 0.196 0.044
#> SRR772348 4 0.6589 0.42262 0.000 0.312 0.000 0.456 0.232
#> SRR772349 2 0.5263 0.45960 0.000 0.680 0.000 0.144 0.176
#> SRR772350 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772351 2 0.5048 -0.26314 0.000 0.492 0.000 0.476 0.032
#> SRR772352 2 0.4193 0.64060 0.000 0.748 0.000 0.212 0.040
#> SRR772353 5 0.3109 0.60643 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR772354 5 0.3687 0.62655 0.180 0.028 0.000 0.000 0.792
#> SRR772355 2 0.1357 0.76707 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR772356 2 0.1282 0.77113 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR772357 1 0.1410 0.86429 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR772358 1 0.1205 0.87083 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR772359 1 0.5231 0.00101 0.496 0.000 0.468 0.008 0.028
#> SRR772360 3 0.5196 0.22603 0.428 0.000 0.536 0.008 0.028
#> SRR772361 3 0.0510 0.91158 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772364 1 0.5078 0.06222 0.508 0.000 0.008 0.464 0.020
#> SRR772365 4 0.5533 0.51447 0.156 0.000 0.124 0.696 0.024
#> SRR772366 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772367 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772368 5 0.6196 0.20839 0.000 0.152 0.000 0.340 0.508
#> SRR772369 2 0.6478 0.48795 0.044 0.612 0.000 0.184 0.160
#> SRR772370 2 0.6529 0.44504 0.040 0.588 0.000 0.132 0.240
#> SRR772371 4 0.4774 0.57862 0.100 0.052 0.024 0.792 0.032
#> SRR772372 4 0.4244 0.66544 0.056 0.076 0.016 0.824 0.028
#> SRR772373 2 0.1877 0.77139 0.000 0.924 0.000 0.012 0.064
#> SRR772374 2 0.2863 0.74805 0.000 0.876 0.000 0.060 0.064
#> SRR772375 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0162 0.79228 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772377 3 0.1965 0.89216 0.000 0.000 0.924 0.024 0.052
#> SRR772378 5 0.4683 0.58597 0.176 0.000 0.000 0.092 0.732
#> SRR772379 5 0.4519 0.57859 0.012 0.048 0.000 0.188 0.752
#> SRR772380 5 0.4843 0.43165 0.292 0.000 0.000 0.048 0.660
#> SRR772381 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0290 0.87139 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772383 1 0.0880 0.86963 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772384 3 0.1965 0.89216 0.000 0.000 0.924 0.024 0.052
#> SRR772385 2 0.2555 0.74983 0.000 0.904 0.016 0.028 0.052
#> SRR772386 2 0.1281 0.78833 0.000 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR772387 2 0.2514 0.75873 0.000 0.896 0.000 0.060 0.044
#> SRR772388 1 0.1043 0.86909 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772389 1 0.0880 0.87032 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772390 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772391 1 0.1732 0.85733 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772392 1 0.1908 0.85345 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR772393 4 0.4258 0.75886 0.004 0.220 0.032 0.744 0.000
#> SRR772394 4 0.4700 0.70425 0.004 0.132 0.116 0.748 0.000
#> SRR772395 2 0.4457 0.19049 0.000 0.620 0.000 0.012 0.368
#> SRR772396 1 0.0162 0.87191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772397 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 3 0.4532 0.66852 0.216 0.000 0.736 0.012 0.036
#> SRR772399 3 0.4425 0.57146 0.296 0.000 0.680 0.000 0.024
#> SRR772400 1 0.1197 0.85871 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0162 0.87122 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR772402 4 0.3655 0.75213 0.000 0.160 0.000 0.804 0.036
#> SRR772403 4 0.3476 0.75986 0.000 0.176 0.000 0.804 0.020
#> SRR772404 2 0.4482 0.25259 0.000 0.636 0.000 0.016 0.348
#> SRR772405 3 0.1965 0.89216 0.000 0.000 0.924 0.024 0.052
#> SRR772406 2 0.3882 0.60603 0.000 0.788 0.000 0.168 0.044
#> SRR772407 2 0.4415 -0.01018 0.000 0.604 0.000 0.388 0.008
#> SRR772408 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772410 2 0.8150 -0.02726 0.156 0.384 0.000 0.160 0.300
#> SRR772411 2 0.8437 -0.17609 0.252 0.300 0.000 0.156 0.292
#> SRR772412 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772415 5 0.3967 0.65720 0.000 0.264 0.000 0.012 0.724
#> SRR772416 5 0.4572 0.65573 0.000 0.280 0.000 0.036 0.684
#> SRR772417 1 0.6426 0.48286 0.540 0.008 0.000 0.272 0.180
#> SRR772418 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772419 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772421 2 0.8137 0.20899 0.016 0.452 0.272 0.128 0.132
#> SRR772422 2 0.5102 0.65062 0.008 0.752 0.032 0.140 0.068
#> SRR772423 4 0.3661 0.76100 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR772424 4 0.3861 0.75678 0.000 0.284 0.000 0.712 0.004
#> SRR772425 2 0.0290 0.79322 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772426 2 0.1106 0.78741 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR772427 2 0.1106 0.78741 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR772428 1 0.0162 0.87122 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772430 5 0.3795 0.61325 0.184 0.004 0.000 0.024 0.788
#> SRR772431 4 0.4528 0.68026 0.000 0.104 0.000 0.752 0.144
#> SRR772432 4 0.4495 0.61156 0.000 0.064 0.000 0.736 0.200
#> SRR772433 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772435 1 0.4047 0.49873 0.676 0.000 0.004 0.000 0.320
#> SRR772436 1 0.3491 0.65582 0.768 0.000 0.004 0.000 0.228
#> SRR772437 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0451 0.87097 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772439 1 0.0992 0.86667 0.968 0.000 0.024 0.000 0.008
#> SRR772440 2 0.6501 0.38184 0.008 0.580 0.012 0.168 0.232
#> SRR772441 2 0.5188 0.44974 0.000 0.612 0.000 0.328 0.060
#> SRR772442 4 0.4204 0.76104 0.000 0.196 0.000 0.756 0.048
#> SRR772443 4 0.4272 0.75624 0.000 0.196 0.000 0.752 0.052
#> SRR772444 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.1671 0.85977 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772447 1 0.1732 0.85808 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772448 4 0.5024 0.43756 0.000 0.368 0.032 0.596 0.004
#> SRR772449 2 0.4940 0.22702 0.000 0.576 0.000 0.392 0.032
#> SRR772450 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.1608 0.86009 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR772453 1 0.1732 0.85733 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772454 1 0.2127 0.84765 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772455 1 0.3577 0.80787 0.808 0.000 0.000 0.032 0.160
#> SRR772456 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0162 0.87136 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772459 1 0.0451 0.87121 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772460 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772462 2 0.4597 -0.00837 0.000 0.564 0.000 0.012 0.424
#> SRR772463 2 0.4649 0.05182 0.000 0.580 0.000 0.016 0.404
#> SRR772464 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772465 2 0.6656 0.41772 0.024 0.556 0.000 0.216 0.204
#> SRR772466 2 0.7502 0.31188 0.080 0.496 0.000 0.216 0.208
#> SRR772467 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.3800 0.80645 0.812 0.000 0.000 0.108 0.080
#> SRR772470 1 0.2351 0.85512 0.896 0.000 0.000 0.016 0.088
#> SRR772471 1 0.4066 0.76639 0.768 0.000 0.000 0.044 0.188
#> SRR772472 1 0.3216 0.83314 0.848 0.000 0.000 0.044 0.108
#> SRR772473 4 0.3804 0.75202 0.000 0.160 0.000 0.796 0.044
#> SRR772474 4 0.3694 0.75768 0.000 0.172 0.000 0.796 0.032
#> SRR772475 2 0.4534 0.61508 0.000 0.776 0.144 0.028 0.052
#> SRR772476 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1544 0.86180 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR772479 1 0.1270 0.86659 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772480 4 0.2060 0.68024 0.016 0.052 0.000 0.924 0.008
#> SRR772481 4 0.3178 0.65496 0.024 0.036 0.000 0.872 0.068
#> SRR772482 1 0.3910 0.59621 0.720 0.000 0.272 0.000 0.008
#> SRR772483 1 0.2522 0.80453 0.880 0.000 0.108 0.000 0.012
#> SRR772484 5 0.4346 0.61969 0.004 0.304 0.000 0.012 0.680
#> SRR772485 5 0.4305 0.62901 0.004 0.296 0.000 0.012 0.688
#> SRR772486 1 0.3879 0.72041 0.784 0.000 0.188 0.012 0.016
#> SRR772487 1 0.4989 0.47052 0.628 0.000 0.336 0.020 0.016
#> SRR772488 5 0.5355 0.59170 0.052 0.288 0.000 0.016 0.644
#> SRR772489 5 0.4441 0.62162 0.012 0.280 0.000 0.012 0.696
#> SRR772490 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0290 0.79070 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772493 2 0.0290 0.79070 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.1502 0.77162 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR772497 2 0.2144 0.75724 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR772498 4 0.4223 0.75813 0.000 0.248 0.028 0.724 0.000
#> SRR772499 4 0.4193 0.75706 0.000 0.256 0.024 0.720 0.000
#> SRR772500 2 0.0404 0.79329 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772501 2 0.0992 0.78869 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR772502 1 0.8072 0.25685 0.440 0.004 0.148 0.260 0.148
#> SRR772503 1 0.5904 0.60569 0.656 0.000 0.040 0.216 0.088
#> SRR772504 2 0.3035 0.72923 0.000 0.856 0.000 0.112 0.032
#> SRR772505 2 0.0162 0.79301 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772506 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772508 5 0.4826 0.31533 0.000 0.472 0.000 0.020 0.508
#> SRR772509 3 0.1965 0.89216 0.000 0.000 0.924 0.024 0.052
#> SRR772510 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772511 4 0.2929 0.60536 0.004 0.044 0.000 0.876 0.076
#> SRR772512 3 0.0162 0.90601 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772513 5 0.4384 0.61600 0.000 0.324 0.000 0.016 0.660
#> SRR772514 5 0.4339 0.59980 0.000 0.336 0.000 0.012 0.652
#> SRR772515 2 0.3355 0.71133 0.000 0.832 0.000 0.132 0.036
#> SRR772516 2 0.3400 0.70873 0.000 0.828 0.000 0.136 0.036
#> SRR772517 5 0.4689 0.38752 0.000 0.424 0.000 0.016 0.560
#> SRR772518 5 0.4572 0.64957 0.000 0.280 0.000 0.036 0.684
#> SRR772519 2 0.1981 0.77218 0.000 0.920 0.000 0.016 0.064
#> SRR772520 2 0.2067 0.76998 0.000 0.920 0.000 0.048 0.032
#> SRR772521 4 0.8616 0.03415 0.308 0.092 0.044 0.388 0.168
#> SRR772522 4 0.8584 0.11654 0.220 0.044 0.124 0.452 0.160
#> SRR772523 2 0.2473 0.75915 0.000 0.896 0.000 0.072 0.032
#> SRR772524 2 0.1469 0.78199 0.000 0.948 0.000 0.016 0.036
#> SRR772525 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772529 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0162 0.87136 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772531 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0671 0.79239 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR772533 2 0.0451 0.79347 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR772534 1 0.4294 0.76378 0.768 0.000 0.000 0.152 0.080
#> SRR772535 2 0.4173 0.34772 0.000 0.688 0.000 0.300 0.012
#> SRR772536 2 0.2172 0.76757 0.000 0.908 0.000 0.076 0.016
#> SRR772537 4 0.4210 0.60508 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR772538 4 0.4242 0.57613 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR772539 1 0.1792 0.85625 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR772540 1 0.1478 0.86479 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772541 5 0.4595 0.61214 0.000 0.088 0.000 0.172 0.740
#> SRR772542 1 0.4065 0.67883 0.752 0.000 0.224 0.016 0.008
#> SRR772543 1 0.1331 0.85970 0.952 0.000 0.040 0.000 0.008
#> SRR772544 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.1121 0.87033 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772546 1 0.0880 0.87199 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772547 1 0.6122 0.62450 0.644 0.020 0.008 0.128 0.200
#> SRR772548 1 0.3464 0.82152 0.836 0.000 0.000 0.068 0.096
#> SRR772549 1 0.1732 0.85733 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772550 1 0.1732 0.85733 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772551 4 0.3427 0.62145 0.020 0.016 0.004 0.848 0.112
#> SRR772552 4 0.4392 0.74985 0.000 0.200 0.004 0.748 0.048
#> SRR772553 3 0.5806 0.35914 0.000 0.336 0.584 0.028 0.052
#> SRR772554 2 0.3622 0.70123 0.000 0.816 0.000 0.136 0.048
#> SRR772555 2 0.3736 0.69514 0.000 0.808 0.000 0.140 0.052
#> SRR772556 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.2813 0.84033 0.868 0.000 0.000 0.024 0.108
#> SRR772559 1 0.2813 0.84451 0.876 0.000 0.000 0.040 0.084
#> SRR772560 5 0.4296 0.59786 0.204 0.016 0.000 0.024 0.756
#> SRR772561 3 0.0510 0.91158 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772562 2 0.3430 0.57770 0.000 0.776 0.000 0.004 0.220
#> SRR772563 2 0.3196 0.61735 0.000 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR772564 1 0.3242 0.69409 0.784 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR772565 1 0.1197 0.85538 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0324 0.79347 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR772569 2 0.0912 0.79128 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR772570 1 0.2102 0.86521 0.916 0.000 0.004 0.012 0.068
#> SRR772571 1 0.1851 0.85838 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772572 1 0.6384 0.53662 0.576 0.016 0.000 0.236 0.172
#> SRR772573 1 0.8089 0.22110 0.436 0.164 0.000 0.208 0.192
#> SRR772574 1 0.1043 0.86936 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772575 1 0.0404 0.87252 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772576 5 0.5776 0.57738 0.004 0.204 0.000 0.160 0.632
#> SRR772577 5 0.6162 0.48162 0.008 0.132 0.000 0.300 0.560
#> SRR772578 2 0.4201 -0.09368 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR772579 2 0.4249 -0.18638 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR772580 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772581 4 0.1587 0.62754 0.012 0.008 0.008 0.952 0.020
#> SRR772582 4 0.1522 0.66681 0.000 0.044 0.000 0.944 0.012
#> SRR772583 5 0.4724 0.60408 0.148 0.004 0.000 0.104 0.744
#> SRR772584 5 0.5028 0.56624 0.040 0.036 0.000 0.204 0.720
#> SRR772585 5 0.4953 0.61476 0.000 0.124 0.000 0.164 0.712
#> SRR772586 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772587 1 0.4255 0.77596 0.776 0.000 0.000 0.128 0.096
#> SRR772588 2 0.0693 0.79170 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR772589 2 0.0290 0.79165 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772590 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772593 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772594 4 0.3895 0.73661 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR772595 4 0.4114 0.66675 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR772596 3 0.1978 0.89646 0.004 0.000 0.928 0.024 0.044
#> SRR772597 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0290 0.87073 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0162 0.87122 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR772600 4 0.3780 0.73572 0.000 0.132 0.000 0.808 0.060
#> SRR772601 4 0.4017 0.74071 0.000 0.148 0.000 0.788 0.064
#> SRR772602 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772603 4 0.3656 0.58055 0.000 0.020 0.000 0.784 0.196
#> SRR772604 4 0.3966 0.73253 0.000 0.132 0.000 0.796 0.072
#> SRR772605 5 0.4361 0.60547 0.016 0.048 0.000 0.160 0.776
#> SRR772606 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772608 5 0.5310 0.61413 0.004 0.284 0.000 0.072 0.640
#> SRR772609 5 0.5723 0.66662 0.044 0.256 0.000 0.052 0.648
#> SRR772610 2 0.4063 0.43737 0.000 0.708 0.000 0.012 0.280
#> SRR772611 5 0.4533 0.38550 0.000 0.448 0.000 0.008 0.544
#> SRR772612 4 0.3774 0.75282 0.000 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR772613 4 0.3884 0.75567 0.000 0.288 0.000 0.708 0.004
#> SRR772614 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.87164 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4805 0.73893 0.728 0.000 0.000 0.144 0.128
#> SRR772617 4 0.4040 0.75814 0.000 0.276 0.000 0.712 0.012
#> SRR772618 4 0.4157 0.75945 0.000 0.264 0.000 0.716 0.020
#> SRR772619 2 0.3774 0.33133 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR772620 2 0.3707 0.36641 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR772621 2 0.5996 0.59028 0.040 0.696 0.020 0.152 0.092
#> SRR772622 2 0.6247 0.52183 0.064 0.640 0.000 0.204 0.092
#> SRR772623 3 0.0703 0.91010 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR772624 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772625 2 0.0579 0.79057 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772626 4 0.4250 0.75732 0.000 0.252 0.028 0.720 0.000
#> SRR772627 4 0.4054 0.76133 0.000 0.248 0.020 0.732 0.000
#> SRR772628 1 0.1117 0.86800 0.964 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR772629 1 0.1597 0.85689 0.940 0.000 0.012 0.000 0.048
#> SRR772630 1 0.6384 0.50120 0.568 0.016 0.000 0.260 0.156
#> SRR772631 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772632 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772634 3 0.3689 0.64787 0.256 0.000 0.740 0.000 0.004
#> SRR772635 3 0.5103 0.73012 0.120 0.004 0.756 0.076 0.044
#> SRR772636 2 0.2555 0.74983 0.000 0.904 0.016 0.028 0.052
#> SRR772637 1 0.1732 0.85804 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772638 1 0.1792 0.85625 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR772639 2 0.4166 0.26509 0.000 0.648 0.000 0.348 0.004
#> SRR772640 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772642 2 0.6882 0.12497 0.048 0.544 0.144 0.000 0.264
#> SRR772643 2 0.2966 0.63922 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR772644 1 0.3141 0.83177 0.852 0.000 0.000 0.040 0.108
#> SRR772645 1 0.3192 0.82891 0.848 0.000 0.000 0.040 0.112
#> SRR772646 2 0.0162 0.79332 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772647 2 0.0162 0.79332 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772648 2 0.5025 0.60509 0.000 0.704 0.000 0.172 0.124
#> SRR772649 2 0.4916 0.61888 0.000 0.716 0.000 0.160 0.124
#> SRR772650 1 0.4150 0.46575 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR772651 1 0.2966 0.78781 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR772652 1 0.2233 0.81410 0.892 0.000 0.104 0.000 0.004
#> SRR772653 1 0.1544 0.84194 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR772654 1 0.8810 -0.06630 0.348 0.264 0.020 0.204 0.164
#> SRR772655 2 0.9034 0.14145 0.192 0.400 0.056 0.196 0.156
#> SRR772656 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0510 0.91158 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.4182 0.62900 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR772659 4 0.3906 0.75403 0.000 0.292 0.000 0.704 0.004
#> SRR772660 5 0.4977 0.53893 0.000 0.356 0.000 0.040 0.604
#> SRR772661 3 0.1965 0.89216 0.000 0.000 0.924 0.024 0.052
#> SRR772662 1 0.4171 0.41649 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR772663 1 0.4262 0.33018 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR772664 2 0.2221 0.76918 0.000 0.912 0.000 0.036 0.052
#> SRR772665 2 0.1800 0.77676 0.000 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR772666 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.6732 0.30741 0.000 0.316 0.000 0.412 0.272
#> SRR772668 4 0.3861 0.75678 0.000 0.284 0.000 0.712 0.004
#> SRR772669 4 0.3861 0.75678 0.000 0.284 0.000 0.712 0.004
#> SRR772670 5 0.2439 0.61864 0.120 0.004 0.000 0.000 0.876
#> SRR772671 5 0.3795 0.59680 0.192 0.000 0.000 0.028 0.780
#> SRR772672 2 0.4451 0.26880 0.000 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR772673 2 0.4697 0.09964 0.000 0.592 0.000 0.020 0.388
#> SRR772674 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.1965 0.89216 0.000 0.000 0.924 0.024 0.052
#> SRR772676 2 0.9177 0.00602 0.264 0.324 0.044 0.188 0.180
#> SRR772677 2 0.9091 0.09043 0.204 0.368 0.044 0.196 0.188
#> SRR772678 3 0.1965 0.89216 0.000 0.000 0.924 0.024 0.052
#> SRR772679 5 0.4066 0.41000 0.324 0.000 0.000 0.004 0.672
#> SRR772680 5 0.4210 0.17365 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR772681 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772683 2 0.0324 0.79365 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR772685 2 0.2086 0.77802 0.008 0.924 0.000 0.020 0.048
#> SRR772686 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.1671 0.87361 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.79328 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0609 0.91251 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772691 2 0.2917 0.73748 0.000 0.888 0.032 0.028 0.052
#> SRR772692 3 0.7132 0.22704 0.372 0.000 0.456 0.088 0.084
#> SRR772693 2 0.7999 0.24136 0.092 0.512 0.240 0.112 0.044
#> SRR772694 4 0.3791 0.69478 0.000 0.112 0.000 0.812 0.076
#> SRR772695 5 0.5128 0.30393 0.004 0.036 0.000 0.380 0.580
#> SRR772696 4 0.4470 0.52106 0.000 0.396 0.004 0.596 0.004
#> SRR772697 4 0.4538 0.30057 0.000 0.452 0.000 0.540 0.008
#> SRR772698 3 0.1818 0.89525 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR772699 1 0.0579 0.87166 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR772700 1 0.0451 0.87202 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772701 1 0.0566 0.87169 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR772702 1 0.0671 0.86905 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.0508 0.87611 0.984 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR772342 1 0.1245 0.87543 0.952 0.000 0.000 0.000 0.016 0.032
#> SRR772343 1 0.5022 0.69204 0.692 0.036 0.000 0.000 0.088 0.184
#> SRR772344 4 0.0777 0.78771 0.000 0.004 0.000 0.972 0.024 0.000
#> SRR772345 4 0.0790 0.78563 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR772346 1 0.5675 0.54703 0.628 0.172 0.000 0.000 0.160 0.040
#> SRR772347 1 0.5525 0.53129 0.628 0.168 0.000 0.000 0.180 0.024
#> SRR772348 2 0.5886 0.32780 0.000 0.412 0.000 0.388 0.000 0.200
#> SRR772349 4 0.4162 0.60858 0.000 0.120 0.000 0.744 0.000 0.136
#> SRR772350 3 0.0458 0.81941 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR772351 4 0.5324 -0.16889 0.000 0.428 0.000 0.468 0.104 0.000
#> SRR772352 4 0.5161 0.29275 0.000 0.100 0.000 0.592 0.304 0.004
#> SRR772353 6 0.1720 0.68220 0.040 0.000 0.000 0.000 0.032 0.928
#> SRR772354 6 0.1700 0.68860 0.028 0.000 0.000 0.012 0.024 0.936
#> SRR772355 4 0.0777 0.78562 0.000 0.024 0.000 0.972 0.004 0.000
#> SRR772356 4 0.0865 0.78077 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR772357 1 0.1572 0.87043 0.936 0.000 0.000 0.000 0.028 0.036
#> SRR772358 1 0.1485 0.87281 0.944 0.000 0.004 0.000 0.024 0.028
#> SRR772359 3 0.5363 0.17699 0.396 0.000 0.492 0.000 0.112 0.000
#> SRR772360 3 0.5137 0.29195 0.352 0.000 0.552 0.000 0.096 0.000
#> SRR772361 3 0.0260 0.82119 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 1 0.4971 0.12336 0.516 0.436 0.008 0.000 0.032 0.008
#> SRR772365 2 0.4597 0.59565 0.108 0.764 0.076 0.000 0.040 0.012
#> SRR772366 3 0.4463 0.75424 0.000 0.104 0.740 0.000 0.140 0.016
#> SRR772367 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772368 6 0.5484 0.30599 0.000 0.288 0.004 0.144 0.000 0.564
#> SRR772369 5 0.5212 0.57712 0.012 0.024 0.004 0.308 0.620 0.032
#> SRR772370 5 0.5314 0.58004 0.020 0.000 0.000 0.284 0.608 0.088
#> SRR772371 2 0.5159 0.49255 0.076 0.692 0.004 0.016 0.196 0.016
#> SRR772372 2 0.3827 0.64332 0.032 0.808 0.000 0.020 0.124 0.016
#> SRR772373 4 0.2070 0.76000 0.000 0.000 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR772374 4 0.3473 0.61841 0.000 0.004 0.000 0.780 0.192 0.024
#> SRR772375 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772376 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772377 3 0.5086 0.73019 0.000 0.108 0.696 0.004 0.164 0.028
#> SRR772378 6 0.3467 0.64839 0.064 0.036 0.000 0.000 0.064 0.836
#> SRR772379 6 0.2493 0.67695 0.000 0.076 0.000 0.004 0.036 0.884
#> SRR772380 6 0.4219 0.55291 0.144 0.016 0.000 0.000 0.080 0.760
#> SRR772381 3 0.0260 0.82119 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0777 0.87480 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024 0.000
#> SRR772383 1 0.1007 0.86960 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR772384 3 0.4948 0.73345 0.000 0.108 0.700 0.000 0.164 0.028
#> SRR772385 4 0.5108 0.50474 0.000 0.100 0.008 0.700 0.164 0.028
#> SRR772386 4 0.2883 0.72379 0.000 0.040 0.000 0.860 0.092 0.008
#> SRR772387 4 0.3262 0.62559 0.000 0.008 0.000 0.788 0.196 0.008
#> SRR772388 1 0.1092 0.87368 0.960 0.000 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR772389 1 0.1176 0.87314 0.956 0.000 0.000 0.000 0.024 0.020
#> SRR772390 3 0.4463 0.75424 0.000 0.104 0.740 0.000 0.140 0.016
#> SRR772391 1 0.1865 0.86490 0.920 0.000 0.000 0.000 0.040 0.040
#> SRR772392 1 0.1934 0.86447 0.916 0.000 0.000 0.000 0.040 0.044
#> SRR772393 2 0.2935 0.75532 0.000 0.852 0.004 0.112 0.028 0.004
#> SRR772394 2 0.3240 0.70601 0.000 0.856 0.056 0.052 0.032 0.004
#> SRR772395 4 0.3945 0.32622 0.000 0.008 0.000 0.612 0.000 0.380
#> SRR772396 1 0.0405 0.87609 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR772397 1 0.0291 0.87432 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772398 3 0.4001 0.62692 0.128 0.000 0.760 0.000 0.112 0.000
#> SRR772399 3 0.4485 0.49874 0.248 0.000 0.684 0.000 0.064 0.004
#> SRR772400 1 0.2066 0.84238 0.904 0.000 0.072 0.000 0.024 0.000
#> SRR772401 1 0.1418 0.86266 0.944 0.000 0.032 0.000 0.024 0.000
#> SRR772402 2 0.2647 0.76718 0.000 0.876 0.000 0.088 0.020 0.016
#> SRR772403 2 0.2604 0.77057 0.000 0.872 0.000 0.100 0.020 0.008
#> SRR772404 4 0.3922 0.44511 0.000 0.016 0.000 0.664 0.000 0.320
#> SRR772405 3 0.4948 0.73345 0.000 0.108 0.700 0.000 0.164 0.028
#> SRR772406 4 0.4662 0.48484 0.000 0.236 0.000 0.668 0.096 0.000
#> SRR772407 4 0.4116 0.08533 0.000 0.416 0.000 0.572 0.012 0.000
#> SRR772408 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772410 5 0.7021 0.52541 0.072 0.092 0.000 0.172 0.568 0.096
#> SRR772411 5 0.7198 0.51065 0.116 0.092 0.000 0.164 0.552 0.076
#> SRR772412 1 0.0692 0.87305 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020 0.000
#> SRR772413 1 0.0692 0.87305 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020 0.000
#> SRR772414 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772415 6 0.2302 0.68062 0.000 0.000 0.000 0.120 0.008 0.872
#> SRR772416 6 0.1956 0.68975 0.000 0.008 0.000 0.080 0.004 0.908
#> SRR772417 5 0.6153 0.41134 0.260 0.108 0.000 0.008 0.572 0.052
#> SRR772418 3 0.4463 0.75424 0.000 0.104 0.740 0.000 0.140 0.016
#> SRR772419 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772420 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772421 5 0.6427 0.52694 0.004 0.008 0.244 0.224 0.504 0.016
#> SRR772422 4 0.4753 0.33044 0.000 0.008 0.024 0.628 0.324 0.016
#> SRR772423 2 0.2527 0.77625 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR772424 2 0.2996 0.75699 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR772425 4 0.0260 0.79322 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR772426 4 0.1075 0.77628 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR772427 4 0.1075 0.77628 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR772428 1 0.0935 0.86959 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032 0.000
#> SRR772429 1 0.0935 0.86959 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032 0.000
#> SRR772430 6 0.1194 0.68722 0.032 0.004 0.000 0.000 0.008 0.956
#> SRR772431 2 0.3123 0.72785 0.000 0.824 0.000 0.040 0.000 0.136
#> SRR772432 2 0.2945 0.70339 0.000 0.824 0.000 0.020 0.000 0.156
#> SRR772433 1 0.0935 0.86959 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032 0.000
#> SRR772434 1 0.0935 0.86959 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032 0.000
#> SRR772435 1 0.4783 0.17967 0.536 0.000 0.008 0.000 0.036 0.420
#> SRR772436 1 0.4554 0.36503 0.600 0.000 0.004 0.000 0.036 0.360
#> SRR772437 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0922 0.86998 0.968 0.000 0.004 0.000 0.024 0.004
#> SRR772439 1 0.2152 0.84424 0.904 0.000 0.068 0.000 0.024 0.004
#> SRR772440 4 0.6736 -0.10565 0.000 0.040 0.004 0.428 0.316 0.212
#> SRR772441 4 0.5842 0.14591 0.000 0.208 0.000 0.512 0.276 0.004
#> SRR772442 2 0.3062 0.77658 0.000 0.816 0.000 0.160 0.024 0.000
#> SRR772443 2 0.3153 0.77737 0.000 0.832 0.000 0.128 0.008 0.032
#> SRR772444 1 0.0146 0.87454 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0146 0.87454 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.1720 0.86490 0.928 0.000 0.000 0.000 0.032 0.040
#> SRR772447 1 0.1794 0.86484 0.924 0.000 0.000 0.000 0.036 0.040
#> SRR772448 2 0.6194 0.26250 0.000 0.484 0.016 0.320 0.176 0.004
#> SRR772449 4 0.5900 0.18989 0.000 0.276 0.000 0.500 0.220 0.004
#> SRR772450 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.1649 0.86625 0.932 0.000 0.000 0.000 0.032 0.036
#> SRR772453 1 0.2066 0.85931 0.908 0.000 0.000 0.000 0.040 0.052
#> SRR772454 1 0.2908 0.82959 0.848 0.000 0.000 0.000 0.048 0.104
#> SRR772455 1 0.4841 0.70344 0.704 0.024 0.000 0.000 0.096 0.176
#> SRR772456 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0146 0.87505 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772459 1 0.0405 0.87640 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR772460 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772462 4 0.4025 0.22495 0.000 0.008 0.000 0.576 0.000 0.416
#> SRR772463 4 0.4002 0.26111 0.000 0.008 0.000 0.588 0.000 0.404
#> SRR772464 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772465 5 0.4636 0.63949 0.012 0.020 0.000 0.224 0.708 0.036
#> SRR772466 5 0.4829 0.65140 0.040 0.012 0.000 0.200 0.712 0.036
#> SRR772467 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772468 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.4742 0.72979 0.740 0.096 0.000 0.000 0.108 0.056
#> SRR772470 1 0.2263 0.85698 0.896 0.000 0.000 0.000 0.056 0.048
#> SRR772471 1 0.4597 0.73904 0.740 0.036 0.000 0.000 0.080 0.144
#> SRR772472 1 0.3682 0.80661 0.816 0.028 0.000 0.000 0.096 0.060
#> SRR772473 2 0.2799 0.75979 0.000 0.860 0.000 0.076 0.064 0.000
#> SRR772474 2 0.2617 0.77220 0.000 0.872 0.000 0.100 0.012 0.016
#> SRR772475 4 0.6346 0.36519 0.000 0.100 0.088 0.620 0.164 0.028
#> SRR772476 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1794 0.86484 0.924 0.000 0.000 0.000 0.036 0.040
#> SRR772479 1 0.1575 0.87040 0.936 0.000 0.000 0.000 0.032 0.032
#> SRR772480 2 0.2679 0.70669 0.004 0.876 0.000 0.008 0.088 0.024
#> SRR772481 2 0.2929 0.71374 0.008 0.868 0.000 0.008 0.040 0.076
#> SRR772482 1 0.3789 0.69593 0.760 0.000 0.196 0.000 0.040 0.004
#> SRR772483 1 0.2827 0.82130 0.868 0.004 0.080 0.000 0.044 0.004
#> SRR772484 6 0.3087 0.64708 0.000 0.004 0.000 0.176 0.012 0.808
#> SRR772485 6 0.3018 0.65334 0.000 0.004 0.000 0.168 0.012 0.816
#> SRR772486 1 0.4611 0.70840 0.752 0.060 0.132 0.000 0.052 0.004
#> SRR772487 1 0.5616 0.51000 0.628 0.076 0.240 0.000 0.052 0.004
#> SRR772488 6 0.5465 0.54021 0.036 0.000 0.004 0.148 0.148 0.664
#> SRR772489 6 0.4033 0.61902 0.004 0.000 0.000 0.156 0.080 0.760
#> SRR772490 1 0.0291 0.87432 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.87509 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772492 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 4 0.2295 0.75914 0.000 0.016 0.000 0.904 0.028 0.052
#> SRR772497 4 0.2444 0.74709 0.000 0.028 0.000 0.892 0.012 0.068
#> SRR772498 2 0.3455 0.73949 0.000 0.812 0.008 0.144 0.032 0.004
#> SRR772499 2 0.3635 0.72978 0.000 0.788 0.008 0.172 0.028 0.004
#> SRR772500 4 0.0603 0.79045 0.000 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR772501 4 0.0937 0.78027 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR772502 5 0.5463 0.54951 0.136 0.060 0.120 0.000 0.680 0.004
#> SRR772503 1 0.6398 0.02695 0.464 0.084 0.056 0.000 0.384 0.012
#> SRR772504 4 0.3190 0.59353 0.000 0.008 0.000 0.772 0.220 0.000
#> SRR772505 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772506 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772507 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772508 6 0.4184 0.08502 0.000 0.012 0.000 0.484 0.000 0.504
#> SRR772509 3 0.4948 0.73345 0.000 0.108 0.700 0.000 0.164 0.028
#> SRR772510 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.4808 0.33719 0.000 0.568 0.000 0.012 0.384 0.036
#> SRR772512 3 0.0146 0.81760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772513 6 0.2848 0.65600 0.000 0.008 0.000 0.176 0.000 0.816
#> SRR772514 6 0.3073 0.63114 0.000 0.008 0.000 0.204 0.000 0.788
#> SRR772515 4 0.3650 0.50907 0.000 0.008 0.000 0.716 0.272 0.004
#> SRR772516 4 0.3668 0.53071 0.000 0.008 0.000 0.728 0.256 0.008
#> SRR772517 6 0.4593 0.27894 0.000 0.020 0.000 0.412 0.012 0.556
#> SRR772518 6 0.3232 0.65950 0.000 0.020 0.000 0.160 0.008 0.812
#> SRR772519 4 0.2173 0.76021 0.000 0.004 0.000 0.904 0.064 0.028
#> SRR772520 4 0.1753 0.75342 0.000 0.004 0.000 0.912 0.084 0.000
#> SRR772521 5 0.5592 0.59332 0.088 0.104 0.064 0.032 0.708 0.004
#> SRR772522 5 0.5582 0.54600 0.044 0.132 0.116 0.016 0.688 0.004
#> SRR772523 4 0.2762 0.73108 0.000 0.092 0.000 0.860 0.048 0.000
#> SRR772524 4 0.2070 0.74299 0.000 0.012 0.000 0.896 0.092 0.000
#> SRR772525 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.4373 0.75733 0.000 0.096 0.748 0.000 0.140 0.016
#> SRR772529 1 0.0291 0.87530 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR772530 1 0.0291 0.87532 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772531 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772532 4 0.0547 0.78932 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR772533 4 0.0632 0.78887 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR772534 1 0.5609 0.56836 0.632 0.108 0.000 0.000 0.212 0.048
#> SRR772535 4 0.3848 0.57114 0.000 0.224 0.000 0.736 0.040 0.000
#> SRR772536 4 0.2624 0.70192 0.000 0.004 0.000 0.844 0.148 0.004
#> SRR772537 2 0.3804 0.51237 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR772538 2 0.3804 0.51210 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR772539 1 0.1908 0.86482 0.916 0.000 0.000 0.000 0.028 0.056
#> SRR772540 1 0.1700 0.87222 0.928 0.000 0.000 0.000 0.024 0.048
#> SRR772541 6 0.1745 0.69026 0.000 0.056 0.000 0.020 0.000 0.924
#> SRR772542 1 0.4538 0.70607 0.752 0.060 0.144 0.000 0.040 0.004
#> SRR772543 1 0.2208 0.85019 0.908 0.004 0.052 0.000 0.032 0.004
#> SRR772544 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.1367 0.87499 0.944 0.000 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR772546 1 0.1265 0.87524 0.948 0.000 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR772547 1 0.6631 0.49769 0.568 0.140 0.000 0.008 0.156 0.128
#> SRR772548 1 0.4482 0.76162 0.764 0.080 0.000 0.000 0.092 0.064
#> SRR772549 1 0.1720 0.86490 0.928 0.000 0.000 0.000 0.032 0.040
#> SRR772550 1 0.1863 0.86386 0.920 0.000 0.000 0.000 0.036 0.044
#> SRR772551 2 0.4050 0.65888 0.012 0.780 0.000 0.004 0.132 0.072
#> SRR772552 2 0.4990 0.73528 0.000 0.696 0.000 0.164 0.112 0.028
#> SRR772553 3 0.7595 0.25186 0.000 0.108 0.412 0.288 0.164 0.028
#> SRR772554 4 0.3628 0.51338 0.000 0.008 0.000 0.720 0.268 0.004
#> SRR772555 4 0.3950 0.42469 0.000 0.008 0.000 0.672 0.312 0.008
#> SRR772556 1 0.0508 0.87551 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012 0.000
#> SRR772557 1 0.0405 0.87483 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR772558 1 0.3210 0.82321 0.836 0.004 0.000 0.000 0.072 0.088
#> SRR772559 1 0.3410 0.82142 0.836 0.024 0.000 0.000 0.076 0.064
#> SRR772560 6 0.3718 0.63364 0.108 0.012 0.000 0.012 0.052 0.816
#> SRR772561 3 0.0260 0.82119 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772562 4 0.3271 0.61101 0.000 0.008 0.000 0.760 0.000 0.232
#> SRR772563 4 0.3161 0.62840 0.000 0.008 0.000 0.776 0.000 0.216
#> SRR772564 1 0.3888 0.62852 0.716 0.000 0.252 0.000 0.032 0.000
#> SRR772565 1 0.2436 0.82513 0.880 0.000 0.088 0.000 0.032 0.000
#> SRR772566 1 0.0146 0.87454 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0291 0.87489 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772568 4 0.0922 0.78731 0.000 0.004 0.000 0.968 0.024 0.004
#> SRR772569 4 0.1219 0.77937 0.000 0.000 0.000 0.948 0.048 0.004
#> SRR772570 1 0.2747 0.85042 0.876 0.004 0.008 0.000 0.076 0.036
#> SRR772571 1 0.2265 0.85998 0.896 0.000 0.000 0.000 0.052 0.052
#> SRR772572 5 0.5667 0.26037 0.352 0.052 0.000 0.000 0.540 0.056
#> SRR772573 5 0.5488 0.55571 0.180 0.032 0.000 0.064 0.684 0.040
#> SRR772574 1 0.1492 0.87051 0.940 0.000 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR772575 1 0.0291 0.87587 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772576 6 0.5491 0.56851 0.000 0.140 0.000 0.140 0.056 0.664
#> SRR772577 6 0.5469 0.54688 0.020 0.224 0.000 0.120 0.004 0.632
#> SRR772578 4 0.3684 0.30617 0.000 0.332 0.000 0.664 0.000 0.004
#> SRR772579 4 0.3714 0.28290 0.000 0.340 0.000 0.656 0.000 0.004
#> SRR772580 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772581 2 0.2932 0.67275 0.000 0.836 0.004 0.000 0.140 0.020
#> SRR772582 2 0.2704 0.71435 0.000 0.868 0.000 0.020 0.100 0.012
#> SRR772583 6 0.2259 0.68643 0.040 0.032 0.000 0.000 0.020 0.908
#> SRR772584 6 0.2485 0.68812 0.016 0.064 0.000 0.008 0.016 0.896
#> SRR772585 6 0.2088 0.68844 0.000 0.068 0.000 0.028 0.000 0.904
#> SRR772586 3 0.4506 0.75239 0.000 0.108 0.736 0.000 0.140 0.016
#> SRR772587 1 0.5643 0.59616 0.644 0.108 0.000 0.000 0.184 0.064
#> SRR772588 4 0.0405 0.79260 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR772589 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0291 0.87489 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772592 1 0.0291 0.87489 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772593 3 0.4506 0.75239 0.000 0.108 0.736 0.000 0.140 0.016
#> SRR772594 2 0.3668 0.67251 0.000 0.668 0.000 0.328 0.000 0.004
#> SRR772595 2 0.3841 0.60076 0.000 0.616 0.000 0.380 0.000 0.004
#> SRR772596 3 0.3874 0.76978 0.000 0.060 0.788 0.000 0.136 0.016
#> SRR772597 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.1780 0.85418 0.924 0.000 0.048 0.000 0.028 0.000
#> SRR772599 1 0.1713 0.85593 0.928 0.000 0.044 0.000 0.028 0.000
#> SRR772600 2 0.2808 0.75565 0.000 0.876 0.000 0.060 0.024 0.040
#> SRR772601 2 0.2675 0.76455 0.000 0.876 0.000 0.076 0.008 0.040
#> SRR772602 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.2643 0.70942 0.000 0.856 0.000 0.008 0.008 0.128
#> SRR772604 2 0.2711 0.75412 0.000 0.880 0.000 0.056 0.016 0.048
#> SRR772605 6 0.1480 0.68454 0.000 0.040 0.000 0.000 0.020 0.940
#> SRR772606 1 0.0777 0.87002 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024 0.000
#> SRR772607 1 0.0777 0.87002 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024 0.000
#> SRR772608 6 0.4661 0.59163 0.004 0.008 0.000 0.144 0.124 0.720
#> SRR772609 6 0.4318 0.66885 0.032 0.024 0.000 0.120 0.040 0.784
#> SRR772610 4 0.3490 0.55917 0.000 0.008 0.000 0.724 0.000 0.268
#> SRR772611 6 0.4062 0.24499 0.000 0.008 0.000 0.440 0.000 0.552
#> SRR772612 2 0.2996 0.75699 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR772613 2 0.2996 0.75699 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR772614 1 0.0291 0.87487 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR772615 1 0.0260 0.87505 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.6027 0.55776 0.612 0.104 0.000 0.000 0.180 0.104
#> SRR772617 2 0.2697 0.77172 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR772618 2 0.2697 0.77172 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR772619 4 0.2969 0.57166 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR772620 4 0.2854 0.60020 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR772621 5 0.5175 0.18494 0.004 0.012 0.020 0.472 0.476 0.016
#> SRR772622 5 0.5439 0.23479 0.024 0.036 0.000 0.452 0.476 0.012
#> SRR772623 3 0.0458 0.81941 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR772624 3 0.4463 0.75424 0.000 0.104 0.740 0.000 0.140 0.016
#> SRR772625 4 0.1138 0.78029 0.000 0.004 0.000 0.960 0.024 0.012
#> SRR772626 2 0.3514 0.73310 0.000 0.812 0.012 0.140 0.032 0.004
#> SRR772627 2 0.2963 0.75900 0.000 0.828 0.000 0.152 0.016 0.004
#> SRR772628 1 0.1390 0.87178 0.948 0.016 0.004 0.000 0.032 0.000
#> SRR772629 1 0.1563 0.86218 0.932 0.000 0.012 0.000 0.056 0.000
#> SRR772630 5 0.5306 0.39026 0.312 0.060 0.000 0.000 0.596 0.032
#> SRR772631 3 0.4536 0.75064 0.000 0.104 0.732 0.000 0.148 0.016
#> SRR772632 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772633 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772634 3 0.4385 0.52303 0.240 0.000 0.696 0.000 0.060 0.004
#> SRR772635 3 0.5052 0.37665 0.080 0.000 0.608 0.008 0.304 0.000
#> SRR772636 4 0.4973 0.52876 0.000 0.100 0.008 0.716 0.148 0.028
#> SRR772637 1 0.1720 0.86490 0.928 0.000 0.000 0.000 0.032 0.040
#> SRR772638 1 0.1995 0.86174 0.912 0.000 0.000 0.000 0.036 0.052
#> SRR772639 4 0.3956 0.43491 0.000 0.292 0.000 0.684 0.024 0.000
#> SRR772640 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 4 0.6518 0.01102 0.024 0.000 0.140 0.460 0.020 0.356
#> SRR772643 4 0.3109 0.62411 0.000 0.000 0.000 0.772 0.004 0.224
#> SRR772644 1 0.3647 0.80536 0.812 0.016 0.000 0.000 0.068 0.104
#> SRR772645 1 0.3591 0.80724 0.816 0.016 0.000 0.000 0.064 0.104
#> SRR772646 4 0.0146 0.79390 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772647 4 0.0260 0.79328 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772648 5 0.4535 0.33333 0.000 0.016 0.000 0.424 0.548 0.012
#> SRR772649 5 0.4419 0.38319 0.000 0.012 0.000 0.404 0.572 0.012
#> SRR772650 6 0.4746 -0.00781 0.444 0.000 0.000 0.000 0.048 0.508
#> SRR772651 1 0.4000 0.69545 0.724 0.000 0.000 0.000 0.048 0.228
#> SRR772652 1 0.3488 0.71955 0.780 0.000 0.184 0.000 0.036 0.000
#> SRR772653 1 0.3172 0.76099 0.816 0.000 0.148 0.000 0.036 0.000
#> SRR772654 5 0.5374 0.64132 0.148 0.008 0.016 0.120 0.692 0.016
#> SRR772655 5 0.5570 0.65090 0.072 0.004 0.068 0.148 0.692 0.016
#> SRR772656 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0260 0.82119 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772658 2 0.3756 0.55559 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR772659 2 0.3101 0.74765 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR772660 6 0.3789 0.53945 0.000 0.024 0.000 0.260 0.000 0.716
#> SRR772661 3 0.4948 0.73345 0.000 0.108 0.700 0.000 0.164 0.028
#> SRR772662 6 0.4704 -0.04911 0.468 0.000 0.000 0.000 0.044 0.488
#> SRR772663 6 0.4563 0.25987 0.368 0.000 0.000 0.000 0.044 0.588
#> SRR772664 4 0.3046 0.63320 0.000 0.000 0.000 0.800 0.188 0.012
#> SRR772665 4 0.2513 0.69748 0.000 0.000 0.000 0.852 0.140 0.008
#> SRR772666 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.6047 -0.20609 0.000 0.340 0.000 0.400 0.000 0.260
#> SRR772668 2 0.3101 0.74753 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR772669 2 0.3221 0.73257 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR772670 6 0.2795 0.64793 0.044 0.000 0.000 0.000 0.100 0.856
#> SRR772671 6 0.3159 0.63754 0.072 0.004 0.000 0.000 0.084 0.840
#> SRR772672 4 0.3819 0.46145 0.000 0.012 0.000 0.672 0.000 0.316
#> SRR772673 4 0.4209 0.28460 0.000 0.020 0.000 0.596 0.000 0.384
#> SRR772674 3 0.0260 0.82119 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.4948 0.73345 0.000 0.108 0.700 0.000 0.164 0.028
#> SRR772676 5 0.5638 0.65832 0.088 0.016 0.056 0.140 0.692 0.008
#> SRR772677 5 0.5832 0.64846 0.056 0.024 0.080 0.144 0.684 0.012
#> SRR772678 3 0.4948 0.73345 0.000 0.108 0.700 0.000 0.164 0.028
#> SRR772679 6 0.3129 0.60405 0.152 0.000 0.000 0.004 0.024 0.820
#> SRR772680 6 0.4291 0.41960 0.292 0.000 0.000 0.000 0.044 0.664
#> SRR772681 3 0.0260 0.82119 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR772682 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772683 4 0.0291 0.79358 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772685 4 0.2654 0.71702 0.004 0.008 0.000 0.864 0.116 0.008
#> SRR772686 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.2762 0.67174 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000
#> SRR772688 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772689 4 0.0000 0.79475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0363 0.82184 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR772691 4 0.5290 0.49307 0.000 0.100 0.016 0.692 0.164 0.028
#> SRR772692 3 0.7223 0.03353 0.240 0.064 0.404 0.000 0.280 0.012
#> SRR772693 4 0.7943 -0.08680 0.076 0.064 0.236 0.456 0.152 0.016
#> SRR772694 2 0.4196 0.73978 0.000 0.784 0.000 0.092 0.076 0.048
#> SRR772695 6 0.4080 0.52655 0.000 0.264 0.000 0.016 0.016 0.704
#> SRR772696 2 0.5882 0.33471 0.000 0.488 0.008 0.360 0.140 0.004
#> SRR772697 4 0.6041 -0.13980 0.000 0.384 0.000 0.404 0.208 0.004
#> SRR772698 3 0.4463 0.75424 0.000 0.104 0.740 0.000 0.140 0.016
#> SRR772699 1 0.1675 0.86425 0.936 0.000 0.032 0.000 0.024 0.008
#> SRR772700 1 0.1485 0.86616 0.944 0.000 0.028 0.000 0.024 0.004
#> SRR772701 1 0.1167 0.87698 0.960 0.000 0.020 0.000 0.012 0.008
#> SRR772702 1 0.0891 0.87431 0.968 0.000 0.024 0.000 0.008 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.245 0.652 0.812 0.3850 0.528 0.528
#> 3 3 0.336 0.597 0.794 0.4283 0.657 0.480
#> 4 4 0.523 0.762 0.871 0.1911 0.839 0.663
#> 5 5 0.596 0.792 0.877 0.0598 0.966 0.903
#> 6 6 0.595 0.504 0.749 0.1233 0.857 0.574
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.8909 0.71589 0.692 0.308
#> SRR772342 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772343 1 0.9954 0.36895 0.540 0.460
#> SRR772344 2 0.3733 0.78514 0.072 0.928
#> SRR772345 2 0.0672 0.76835 0.008 0.992
#> SRR772346 2 0.9963 -0.00131 0.464 0.536
#> SRR772347 1 0.9635 0.59441 0.612 0.388
#> SRR772348 2 0.0376 0.76613 0.004 0.996
#> SRR772349 2 0.0672 0.76822 0.008 0.992
#> SRR772350 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.5737 0.77324 0.136 0.864
#> SRR772352 2 0.4431 0.78539 0.092 0.908
#> SRR772353 2 0.9732 0.29540 0.404 0.596
#> SRR772354 2 0.9580 0.38482 0.380 0.620
#> SRR772355 2 0.4562 0.78410 0.096 0.904
#> SRR772356 2 0.0376 0.76613 0.004 0.996
#> SRR772357 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772358 1 0.9775 0.52928 0.588 0.412
#> SRR772359 2 0.9944 0.05680 0.456 0.544
#> SRR772360 2 0.9909 0.11586 0.444 0.556
#> SRR772361 1 0.6048 0.59550 0.852 0.148
#> SRR772362 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.9970 0.33578 0.532 0.468
#> SRR772365 2 0.9998 -0.15901 0.492 0.508
#> SRR772366 1 0.0376 0.65117 0.996 0.004
#> SRR772367 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.3274 0.78358 0.060 0.940
#> SRR772369 2 0.9087 0.53964 0.324 0.676
#> SRR772370 2 0.9129 0.52983 0.328 0.672
#> SRR772371 2 0.9909 0.10031 0.444 0.556
#> SRR772372 2 0.9608 0.36213 0.384 0.616
#> SRR772373 2 0.5629 0.77413 0.132 0.868
#> SRR772374 2 0.5629 0.77464 0.132 0.868
#> SRR772375 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0376 0.76613 0.004 0.996
#> SRR772377 2 0.9710 0.37553 0.400 0.600
#> SRR772378 2 0.9248 0.50048 0.340 0.660
#> SRR772379 2 0.8267 0.65830 0.260 0.740
#> SRR772380 2 0.9608 0.36598 0.384 0.616
#> SRR772381 1 0.0672 0.65074 0.992 0.008
#> SRR772382 1 0.9044 0.70705 0.680 0.320
#> SRR772383 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772384 1 0.9970 0.17204 0.532 0.468
#> SRR772385 2 0.0376 0.76613 0.004 0.996
#> SRR772386 2 0.7139 0.73288 0.196 0.804
#> SRR772387 2 0.6801 0.74633 0.180 0.820
#> SRR772388 1 0.5629 0.70227 0.868 0.132
#> SRR772389 1 0.5946 0.70668 0.856 0.144
#> SRR772390 1 0.0672 0.65171 0.992 0.008
#> SRR772391 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772392 1 0.9170 0.69476 0.668 0.332
#> SRR772393 2 0.8267 0.65871 0.260 0.740
#> SRR772394 2 0.8955 0.56602 0.312 0.688
#> SRR772395 2 0.3879 0.78514 0.076 0.924
#> SRR772396 1 0.7950 0.73222 0.760 0.240
#> SRR772397 1 0.8499 0.72945 0.724 0.276
#> SRR772398 1 0.9710 0.55830 0.600 0.400
#> SRR772399 1 0.9850 0.48381 0.572 0.428
#> SRR772400 1 0.7528 0.72852 0.784 0.216
#> SRR772401 1 0.6712 0.71713 0.824 0.176
#> SRR772402 2 0.2778 0.78188 0.048 0.952
#> SRR772403 2 0.4562 0.78548 0.096 0.904
#> SRR772404 2 0.0376 0.76613 0.004 0.996
#> SRR772405 1 0.9996 0.05742 0.512 0.488
#> SRR772406 2 0.6148 0.76550 0.152 0.848
#> SRR772407 2 0.7674 0.70416 0.224 0.776
#> SRR772408 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.8386 0.64000 0.268 0.732
#> SRR772411 2 0.8386 0.64138 0.268 0.732
#> SRR772412 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772413 1 0.8763 0.72248 0.704 0.296
#> SRR772414 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.6623 0.75364 0.172 0.828
#> SRR772416 2 0.6887 0.74391 0.184 0.816
#> SRR772417 2 0.9460 0.42977 0.364 0.636
#> SRR772418 1 0.0672 0.65013 0.992 0.008
#> SRR772419 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.9323 0.48603 0.348 0.652
#> SRR772422 2 0.8661 0.61318 0.288 0.712
#> SRR772423 2 0.2043 0.77755 0.032 0.968
#> SRR772424 2 0.0672 0.76832 0.008 0.992
#> SRR772425 2 0.1414 0.77316 0.020 0.980
#> SRR772426 2 0.4562 0.78426 0.096 0.904
#> SRR772427 2 0.4562 0.78426 0.096 0.904
#> SRR772428 1 0.8081 0.73306 0.752 0.248
#> SRR772429 1 0.9358 0.66438 0.648 0.352
#> SRR772430 2 0.9866 0.15476 0.432 0.568
#> SRR772431 2 0.5294 0.77855 0.120 0.880
#> SRR772432 2 0.5294 0.77935 0.120 0.880
#> SRR772433 1 0.7528 0.72911 0.784 0.216
#> SRR772434 1 0.6887 0.72018 0.816 0.184
#> SRR772435 2 0.9977 -0.04340 0.472 0.528
#> SRR772436 2 0.9983 -0.07023 0.476 0.524
#> SRR772437 1 0.7219 0.61646 0.800 0.200
#> SRR772438 1 0.7376 0.72618 0.792 0.208
#> SRR772439 1 0.7950 0.73288 0.760 0.240
#> SRR772440 2 0.8327 0.65310 0.264 0.736
#> SRR772441 2 0.7376 0.72109 0.208 0.792
#> SRR772442 2 0.2423 0.77970 0.040 0.960
#> SRR772443 2 0.4939 0.78193 0.108 0.892
#> SRR772444 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772445 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772446 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772447 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772448 2 0.8267 0.66132 0.260 0.740
#> SRR772449 2 0.6973 0.73942 0.188 0.812
#> SRR772450 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.7528 0.72857 0.784 0.216
#> SRR772453 1 0.8555 0.72843 0.720 0.280
#> SRR772454 1 0.9815 0.50376 0.580 0.420
#> SRR772455 2 0.9909 0.11160 0.444 0.556
#> SRR772456 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772459 1 0.8608 0.72691 0.716 0.284
#> SRR772460 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.2778 0.78151 0.048 0.952
#> SRR772463 2 0.4161 0.78526 0.084 0.916
#> SRR772464 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.7745 0.70259 0.228 0.772
#> SRR772466 2 0.7602 0.71116 0.220 0.780
#> SRR772467 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.9710 0.56354 0.600 0.400
#> SRR772470 1 0.9358 0.66656 0.648 0.352
#> SRR772471 1 0.9710 0.56126 0.600 0.400
#> SRR772472 1 0.9129 0.69904 0.672 0.328
#> SRR772473 2 0.5408 0.77782 0.124 0.876
#> SRR772474 2 0.5408 0.77723 0.124 0.876
#> SRR772475 2 0.1184 0.76889 0.016 0.984
#> SRR772476 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.7376 0.72659 0.792 0.208
#> SRR772479 1 0.8267 0.73195 0.740 0.260
#> SRR772480 2 0.7745 0.70168 0.228 0.772
#> SRR772481 2 0.8555 0.63061 0.280 0.720
#> SRR772482 1 0.9896 0.44101 0.560 0.440
#> SRR772483 1 0.9775 0.53183 0.588 0.412
#> SRR772484 2 0.6343 0.76110 0.160 0.840
#> SRR772485 2 0.5946 0.76975 0.144 0.856
#> SRR772486 1 0.8081 0.73205 0.752 0.248
#> SRR772487 1 0.9491 0.63137 0.632 0.368
#> SRR772488 2 0.8555 0.63324 0.280 0.720
#> SRR772489 2 0.8909 0.57631 0.308 0.692
#> SRR772490 1 0.9087 0.70316 0.676 0.324
#> SRR772491 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772492 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.3733 0.78558 0.072 0.928
#> SRR772497 2 0.4298 0.78531 0.088 0.912
#> SRR772498 2 0.8081 0.66550 0.248 0.752
#> SRR772499 2 0.7602 0.70375 0.220 0.780
#> SRR772500 2 0.1843 0.77598 0.028 0.972
#> SRR772501 2 0.0938 0.77009 0.012 0.988
#> SRR772502 2 0.9881 0.14287 0.436 0.564
#> SRR772503 1 0.9944 0.38292 0.544 0.456
#> SRR772504 2 0.2423 0.77982 0.040 0.960
#> SRR772505 2 0.3431 0.78447 0.064 0.936
#> SRR772506 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.1414 0.77333 0.020 0.980
#> SRR772509 2 0.9170 0.56060 0.332 0.668
#> SRR772510 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.9000 0.55446 0.316 0.684
#> SRR772512 2 0.9000 0.56388 0.316 0.684
#> SRR772513 2 0.5294 0.77868 0.120 0.880
#> SRR772514 2 0.2603 0.78057 0.044 0.956
#> SRR772515 2 0.5946 0.76837 0.144 0.856
#> SRR772516 2 0.5737 0.77242 0.136 0.864
#> SRR772517 2 0.6048 0.76647 0.148 0.852
#> SRR772518 2 0.6343 0.76063 0.160 0.840
#> SRR772519 2 0.4562 0.78452 0.096 0.904
#> SRR772520 2 0.2423 0.77951 0.040 0.960
#> SRR772521 2 0.9393 0.45469 0.356 0.644
#> SRR772522 2 0.9552 0.39071 0.376 0.624
#> SRR772523 2 0.4690 0.78343 0.100 0.900
#> SRR772524 2 0.5059 0.78084 0.112 0.888
#> SRR772525 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.9358 0.66523 0.648 0.352
#> SRR772530 1 0.9209 0.68912 0.664 0.336
#> SRR772531 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.3431 0.78463 0.064 0.936
#> SRR772533 2 0.4815 0.78276 0.104 0.896
#> SRR772534 1 0.9993 0.27041 0.516 0.484
#> SRR772535 2 0.4690 0.78343 0.100 0.900
#> SRR772536 2 0.4939 0.78224 0.108 0.892
#> SRR772537 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.9087 0.70308 0.676 0.324
#> SRR772540 1 0.9491 0.63747 0.632 0.368
#> SRR772541 2 0.5408 0.77892 0.124 0.876
#> SRR772542 1 0.8499 0.72956 0.724 0.276
#> SRR772543 1 0.7883 0.73214 0.764 0.236
#> SRR772544 1 0.0376 0.65105 0.996 0.004
#> SRR772545 1 0.9608 0.60078 0.616 0.384
#> SRR772546 1 0.9248 0.68343 0.660 0.340
#> SRR772547 2 0.9993 -0.11226 0.484 0.516
#> SRR772548 1 0.9209 0.69065 0.664 0.336
#> SRR772549 1 0.8207 0.73222 0.744 0.256
#> SRR772550 1 0.7815 0.73133 0.768 0.232
#> SRR772551 2 0.9286 0.48939 0.344 0.656
#> SRR772552 2 0.6343 0.76189 0.160 0.840
#> SRR772553 2 0.1633 0.77462 0.024 0.976
#> SRR772554 2 0.4161 0.78605 0.084 0.916
#> SRR772555 2 0.3114 0.78321 0.056 0.944
#> SRR772556 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772557 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772558 1 0.9393 0.66028 0.644 0.356
#> SRR772559 1 0.9209 0.69021 0.664 0.336
#> SRR772560 2 0.8861 0.58401 0.304 0.696
#> SRR772561 2 0.9850 0.31700 0.428 0.572
#> SRR772562 2 0.5059 0.78126 0.112 0.888
#> SRR772563 2 0.1184 0.77155 0.016 0.984
#> SRR772564 1 0.8661 0.72590 0.712 0.288
#> SRR772565 1 0.8016 0.73269 0.756 0.244
#> SRR772566 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.5519 0.77727 0.128 0.872
#> SRR772569 2 0.6247 0.75549 0.156 0.844
#> SRR772570 1 0.9286 0.67891 0.656 0.344
#> SRR772571 1 0.9732 0.55117 0.596 0.404
#> SRR772572 2 0.9963 -0.01007 0.464 0.536
#> SRR772573 2 0.9170 0.49636 0.332 0.668
#> SRR772574 1 0.9323 0.67334 0.652 0.348
#> SRR772575 1 0.9427 0.65251 0.640 0.360
#> SRR772576 2 0.7674 0.70812 0.224 0.776
#> SRR772577 2 0.8081 0.67670 0.248 0.752
#> SRR772578 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.9427 0.44975 0.360 0.640
#> SRR772582 2 0.8327 0.65088 0.264 0.736
#> SRR772583 2 0.9427 0.44364 0.360 0.640
#> SRR772584 2 0.8207 0.66738 0.256 0.744
#> SRR772585 2 0.5842 0.77199 0.140 0.860
#> SRR772586 1 0.0938 0.65049 0.988 0.012
#> SRR772587 1 0.9000 0.70936 0.684 0.316
#> SRR772588 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.2603 0.64677 0.956 0.044
#> SRR772591 1 0.1184 0.65787 0.984 0.016
#> SRR772592 1 0.0672 0.65461 0.992 0.008
#> SRR772593 1 0.0672 0.65347 0.992 0.008
#> SRR772594 2 0.0376 0.76624 0.004 0.996
#> SRR772595 2 0.2948 0.78261 0.052 0.948
#> SRR772596 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.8713 0.72446 0.708 0.292
#> SRR772599 1 0.8443 0.73041 0.728 0.272
#> SRR772600 2 0.4939 0.78204 0.108 0.892
#> SRR772601 2 0.3733 0.78520 0.072 0.928
#> SRR772602 1 0.0376 0.65105 0.996 0.004
#> SRR772603 2 0.6247 0.76300 0.156 0.844
#> SRR772604 2 0.4939 0.78264 0.108 0.892
#> SRR772605 2 0.5629 0.77619 0.132 0.868
#> SRR772606 1 0.8081 0.73272 0.752 0.248
#> SRR772607 1 0.8813 0.72027 0.700 0.300
#> SRR772608 2 0.6531 0.75673 0.168 0.832
#> SRR772609 2 0.6801 0.74749 0.180 0.820
#> SRR772610 2 0.2043 0.77725 0.032 0.968
#> SRR772611 2 0.3879 0.78544 0.076 0.924
#> SRR772612 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.8955 0.71349 0.688 0.312
#> SRR772615 1 0.5059 0.69468 0.888 0.112
#> SRR772616 1 0.9922 0.41154 0.552 0.448
#> SRR772617 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.9044 0.54805 0.320 0.680
#> SRR772622 2 0.9044 0.54966 0.320 0.680
#> SRR772623 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0672 0.65347 0.992 0.008
#> SRR772625 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.7602 0.70877 0.220 0.780
#> SRR772627 2 0.6801 0.74293 0.180 0.820
#> SRR772628 1 0.8555 0.72852 0.720 0.280
#> SRR772629 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772630 2 0.9248 0.49972 0.340 0.660
#> SRR772631 1 0.0376 0.65117 0.996 0.004
#> SRR772632 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772634 2 0.9922 0.10140 0.448 0.552
#> SRR772635 2 0.9850 0.19367 0.428 0.572
#> SRR772636 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.7299 0.72577 0.796 0.204
#> SRR772638 1 0.6887 0.71972 0.816 0.184
#> SRR772639 2 0.4562 0.78511 0.096 0.904
#> SRR772640 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.8763 0.60104 0.296 0.704
#> SRR772643 2 0.8144 0.66867 0.252 0.748
#> SRR772644 1 0.9580 0.61434 0.620 0.380
#> SRR772645 1 0.9460 0.64552 0.636 0.364
#> SRR772646 2 0.2603 0.78085 0.044 0.956
#> SRR772647 2 0.3879 0.78527 0.076 0.924
#> SRR772648 2 0.8016 0.68056 0.244 0.756
#> SRR772649 2 0.8144 0.66894 0.252 0.748
#> SRR772650 2 1.0000 -0.18472 0.496 0.504
#> SRR772651 1 0.9754 0.54149 0.592 0.408
#> SRR772652 1 0.9427 0.65087 0.640 0.360
#> SRR772653 1 0.9170 0.69413 0.668 0.332
#> SRR772654 2 0.9661 0.33828 0.392 0.608
#> SRR772655 2 0.9635 0.35830 0.388 0.612
#> SRR772656 1 0.1414 0.65111 0.980 0.020
#> SRR772657 1 0.7453 0.56209 0.788 0.212
#> SRR772658 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.4690 0.78409 0.100 0.900
#> SRR772661 1 0.9710 0.42904 0.600 0.400
#> SRR772662 2 0.9635 0.35554 0.388 0.612
#> SRR772663 1 0.9998 0.23290 0.508 0.492
#> SRR772664 2 0.0376 0.76613 0.004 0.996
#> SRR772665 2 0.0938 0.76941 0.012 0.988
#> SRR772666 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.8144 0.67060 0.252 0.748
#> SRR772671 2 0.8909 0.57635 0.308 0.692
#> SRR772672 2 0.4161 0.78507 0.084 0.916
#> SRR772673 2 0.4815 0.78333 0.104 0.896
#> SRR772674 1 0.0672 0.65004 0.992 0.008
#> SRR772675 2 0.9988 0.11273 0.480 0.520
#> SRR772676 2 0.8813 0.58952 0.300 0.700
#> SRR772677 2 0.8763 0.59667 0.296 0.704
#> SRR772678 2 0.9954 0.19262 0.460 0.540
#> SRR772679 1 0.9970 0.33623 0.532 0.468
#> SRR772680 1 0.9552 0.62485 0.624 0.376
#> SRR772681 1 0.4161 0.63459 0.916 0.084
#> SRR772682 2 0.1184 0.77160 0.016 0.984
#> SRR772683 2 0.2948 0.78272 0.052 0.948
#> SRR772685 2 0.7883 0.69099 0.236 0.764
#> SRR772686 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.65032 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.76400 0.000 1.000
#> SRR772692 2 0.9754 0.27322 0.408 0.592
#> SRR772693 2 0.9170 0.51944 0.332 0.668
#> SRR772694 2 0.7745 0.69933 0.228 0.772
#> SRR772695 2 0.7602 0.71031 0.220 0.780
#> SRR772696 2 0.6973 0.73904 0.188 0.812
#> SRR772697 2 0.7219 0.72892 0.200 0.800
#> SRR772698 1 0.0672 0.65171 0.992 0.008
#> SRR772699 1 0.8861 0.71836 0.696 0.304
#> SRR772700 1 0.9209 0.68971 0.664 0.336
#> SRR772701 1 0.9000 0.71059 0.684 0.316
#> SRR772702 1 0.8861 0.71840 0.696 0.304
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 3 0.6295 0.4772 0.472 0.000 0.528
#> SRR772342 1 0.6307 -0.3929 0.512 0.000 0.488
#> SRR772343 1 0.3340 0.6449 0.880 0.000 0.120
#> SRR772344 1 0.5591 0.6007 0.696 0.304 0.000
#> SRR772345 1 0.6168 0.3738 0.588 0.412 0.000
#> SRR772346 1 0.3267 0.6501 0.884 0.000 0.116
#> SRR772347 1 0.5835 0.1521 0.660 0.000 0.340
#> SRR772348 1 0.5560 0.5988 0.700 0.300 0.000
#> SRR772349 1 0.5621 0.5839 0.692 0.308 0.000
#> SRR772350 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772351 1 0.3192 0.7494 0.888 0.112 0.000
#> SRR772352 1 0.4062 0.7352 0.836 0.164 0.000
#> SRR772353 1 0.1636 0.7355 0.964 0.016 0.020
#> SRR772354 1 0.1751 0.7290 0.960 0.012 0.028
#> SRR772355 1 0.4121 0.7343 0.832 0.168 0.000
#> SRR772356 1 0.5706 0.5798 0.680 0.320 0.000
#> SRR772357 1 0.6308 -0.4039 0.508 0.000 0.492
#> SRR772358 1 0.5785 0.1826 0.668 0.000 0.332
#> SRR772359 1 0.4291 0.5837 0.820 0.000 0.180
#> SRR772360 1 0.2959 0.6735 0.900 0.000 0.100
#> SRR772361 3 0.6935 0.2049 0.372 0.024 0.604
#> SRR772362 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772363 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772364 1 0.4842 0.5086 0.776 0.000 0.224
#> SRR772365 1 0.3500 0.6606 0.880 0.004 0.116
#> SRR772366 3 0.3690 0.6571 0.100 0.016 0.884
#> SRR772367 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772368 1 0.4452 0.7155 0.808 0.192 0.000
#> SRR772369 1 0.0747 0.7381 0.984 0.016 0.000
#> SRR772370 1 0.0475 0.7312 0.992 0.004 0.004
#> SRR772371 1 0.4931 0.4971 0.784 0.004 0.212
#> SRR772372 1 0.3500 0.6519 0.880 0.004 0.116
#> SRR772373 1 0.3340 0.7425 0.880 0.120 0.000
#> SRR772374 1 0.3038 0.7470 0.896 0.104 0.000
#> SRR772375 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772376 1 0.6045 0.4781 0.620 0.380 0.000
#> SRR772377 1 0.5173 0.6157 0.816 0.036 0.148
#> SRR772378 1 0.2176 0.7422 0.948 0.032 0.020
#> SRR772379 1 0.2063 0.7489 0.948 0.044 0.008
#> SRR772380 1 0.2165 0.6964 0.936 0.000 0.064
#> SRR772381 3 0.2187 0.5997 0.028 0.024 0.948
#> SRR772382 3 0.6307 0.4406 0.488 0.000 0.512
#> SRR772383 3 0.6302 0.4584 0.480 0.000 0.520
#> SRR772384 1 0.4233 0.6096 0.836 0.004 0.160
#> SRR772385 2 0.6079 0.3034 0.388 0.612 0.000
#> SRR772386 1 0.2356 0.7510 0.928 0.072 0.000
#> SRR772387 1 0.2448 0.7517 0.924 0.076 0.000
#> SRR772388 3 0.5497 0.6510 0.292 0.000 0.708
#> SRR772389 3 0.5560 0.6486 0.300 0.000 0.700
#> SRR772390 3 0.3461 0.6263 0.076 0.024 0.900
#> SRR772391 3 0.6299 0.4671 0.476 0.000 0.524
#> SRR772392 1 0.6308 -0.3985 0.508 0.000 0.492
#> SRR772393 1 0.2280 0.7509 0.940 0.052 0.008
#> SRR772394 1 0.1453 0.7415 0.968 0.024 0.008
#> SRR772395 1 0.4399 0.7191 0.812 0.188 0.000
#> SRR772396 3 0.6168 0.5791 0.412 0.000 0.588
#> SRR772397 3 0.6260 0.5258 0.448 0.000 0.552
#> SRR772398 1 0.5882 0.1701 0.652 0.000 0.348
#> SRR772399 1 0.4974 0.4659 0.764 0.000 0.236
#> SRR772400 3 0.5988 0.6155 0.368 0.000 0.632
#> SRR772401 3 0.5835 0.6332 0.340 0.000 0.660
#> SRR772402 1 0.4654 0.7031 0.792 0.208 0.000
#> SRR772403 1 0.4605 0.7119 0.796 0.204 0.000
#> SRR772404 1 0.5397 0.6261 0.720 0.280 0.000
#> SRR772405 1 0.3879 0.6186 0.848 0.000 0.152
#> SRR772406 1 0.2796 0.7499 0.908 0.092 0.000
#> SRR772407 1 0.2066 0.7531 0.940 0.060 0.000
#> SRR772408 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772409 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772410 1 0.2806 0.7388 0.928 0.040 0.032
#> SRR772411 1 0.1031 0.7433 0.976 0.024 0.000
#> SRR772412 3 0.6291 0.4805 0.468 0.000 0.532
#> SRR772413 3 0.6260 0.5211 0.448 0.000 0.552
#> SRR772414 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772415 1 0.2796 0.7494 0.908 0.092 0.000
#> SRR772416 1 0.2448 0.7513 0.924 0.076 0.000
#> SRR772417 1 0.1129 0.7249 0.976 0.004 0.020
#> SRR772418 3 0.3502 0.6497 0.084 0.020 0.896
#> SRR772419 2 0.1411 0.9159 0.036 0.964 0.000
#> SRR772420 2 0.1411 0.9162 0.036 0.964 0.000
#> SRR772421 1 0.3272 0.7087 0.904 0.016 0.080
#> SRR772422 1 0.2689 0.7429 0.932 0.036 0.032
#> SRR772423 2 0.6180 0.2240 0.416 0.584 0.000
#> SRR772424 2 0.6204 0.1371 0.424 0.576 0.000
#> SRR772425 1 0.5497 0.6184 0.708 0.292 0.000
#> SRR772426 1 0.5706 0.5577 0.680 0.320 0.000
#> SRR772427 1 0.5835 0.5133 0.660 0.340 0.000
#> SRR772428 3 0.6126 0.5891 0.400 0.000 0.600
#> SRR772429 1 0.6260 -0.2469 0.552 0.000 0.448
#> SRR772430 1 0.3237 0.7325 0.912 0.032 0.056
#> SRR772431 1 0.4002 0.7311 0.840 0.160 0.000
#> SRR772432 1 0.3482 0.7415 0.872 0.128 0.000
#> SRR772433 3 0.5706 0.6367 0.320 0.000 0.680
#> SRR772434 3 0.5497 0.6482 0.292 0.000 0.708
#> SRR772435 1 0.3192 0.6643 0.888 0.000 0.112
#> SRR772436 1 0.3826 0.6631 0.868 0.008 0.124
#> SRR772437 3 0.6952 0.2248 0.376 0.024 0.600
#> SRR772438 3 0.5988 0.6174 0.368 0.000 0.632
#> SRR772439 3 0.6045 0.6036 0.380 0.000 0.620
#> SRR772440 1 0.2492 0.7503 0.936 0.048 0.016
#> SRR772441 1 0.2590 0.7516 0.924 0.072 0.004
#> SRR772442 1 0.5678 0.5913 0.684 0.316 0.000
#> SRR772443 1 0.3551 0.7395 0.868 0.132 0.000
#> SRR772444 3 0.6299 0.4671 0.476 0.000 0.524
#> SRR772445 3 0.6302 0.4584 0.480 0.000 0.520
#> SRR772446 3 0.6305 0.4502 0.484 0.000 0.516
#> SRR772447 1 0.6308 -0.3978 0.508 0.000 0.492
#> SRR772448 1 0.1860 0.7506 0.948 0.052 0.000
#> SRR772449 1 0.2959 0.7530 0.900 0.100 0.000
#> SRR772450 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772451 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772452 3 0.6079 0.6016 0.388 0.000 0.612
#> SRR772453 3 0.6309 0.4343 0.496 0.000 0.504
#> SRR772454 1 0.5058 0.4686 0.756 0.000 0.244
#> SRR772455 1 0.2165 0.6954 0.936 0.000 0.064
#> SRR772456 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772457 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772458 3 0.6299 0.4671 0.476 0.000 0.524
#> SRR772459 3 0.6244 0.5352 0.440 0.000 0.560
#> SRR772460 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772461 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772462 1 0.5058 0.6721 0.756 0.244 0.000
#> SRR772463 1 0.4291 0.7211 0.820 0.180 0.000
#> SRR772464 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772465 1 0.2384 0.7523 0.936 0.056 0.008
#> SRR772466 1 0.2339 0.7506 0.940 0.048 0.012
#> SRR772467 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772468 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772469 1 0.5926 0.0540 0.644 0.000 0.356
#> SRR772470 1 0.6140 -0.1310 0.596 0.000 0.404
#> SRR772471 1 0.5058 0.4179 0.756 0.000 0.244
#> SRR772472 1 0.6008 -0.0102 0.628 0.000 0.372
#> SRR772473 1 0.3482 0.7411 0.872 0.128 0.000
#> SRR772474 1 0.3686 0.7389 0.860 0.140 0.000
#> SRR772475 1 0.5948 0.5094 0.640 0.360 0.000
#> SRR772476 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772477 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772478 3 0.5968 0.6180 0.364 0.000 0.636
#> SRR772479 3 0.6168 0.5753 0.412 0.000 0.588
#> SRR772480 1 0.4544 0.7463 0.860 0.084 0.056
#> SRR772481 1 0.2492 0.7498 0.936 0.048 0.016
#> SRR772482 1 0.5327 0.3970 0.728 0.000 0.272
#> SRR772483 1 0.5291 0.3868 0.732 0.000 0.268
#> SRR772484 1 0.3192 0.7454 0.888 0.112 0.000
#> SRR772485 1 0.3267 0.7442 0.884 0.116 0.000
#> SRR772486 3 0.6295 0.4866 0.472 0.000 0.528
#> SRR772487 1 0.6026 0.0431 0.624 0.000 0.376
#> SRR772488 1 0.4095 0.7460 0.880 0.064 0.056
#> SRR772489 1 0.2486 0.7530 0.932 0.060 0.008
#> SRR772490 1 0.6267 -0.2882 0.548 0.000 0.452
#> SRR772491 1 0.6308 -0.4004 0.508 0.000 0.492
#> SRR772492 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772493 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772494 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772495 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772496 1 0.3879 0.7380 0.848 0.152 0.000
#> SRR772497 1 0.3752 0.7403 0.856 0.144 0.000
#> SRR772498 1 0.3193 0.7473 0.896 0.100 0.004
#> SRR772499 1 0.3030 0.7533 0.904 0.092 0.004
#> SRR772500 1 0.6302 0.1236 0.520 0.480 0.000
#> SRR772501 1 0.6291 0.2080 0.532 0.468 0.000
#> SRR772502 1 0.3644 0.6459 0.872 0.004 0.124
#> SRR772503 1 0.5588 0.3613 0.720 0.004 0.276
#> SRR772504 1 0.5327 0.6453 0.728 0.272 0.000
#> SRR772505 1 0.5058 0.6799 0.756 0.244 0.000
#> SRR772506 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772507 2 0.1411 0.9154 0.036 0.964 0.000
#> SRR772508 1 0.6045 0.4247 0.620 0.380 0.000
#> SRR772509 1 0.3181 0.7211 0.912 0.024 0.064
#> SRR772510 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772511 1 0.0747 0.7384 0.984 0.016 0.000
#> SRR772512 1 0.4937 0.6753 0.824 0.028 0.148
#> SRR772513 1 0.3267 0.7455 0.884 0.116 0.000
#> SRR772514 1 0.4931 0.6860 0.768 0.232 0.000
#> SRR772515 1 0.3192 0.7455 0.888 0.112 0.000
#> SRR772516 1 0.3941 0.7381 0.844 0.156 0.000
#> SRR772517 1 0.3192 0.7455 0.888 0.112 0.000
#> SRR772518 1 0.2796 0.7494 0.908 0.092 0.000
#> SRR772519 1 0.4002 0.7341 0.840 0.160 0.000
#> SRR772520 1 0.5058 0.6735 0.756 0.244 0.000
#> SRR772521 1 0.1525 0.7223 0.964 0.004 0.032
#> SRR772522 1 0.1129 0.7241 0.976 0.004 0.020
#> SRR772523 1 0.4235 0.7269 0.824 0.176 0.000
#> SRR772524 1 0.3267 0.7474 0.884 0.116 0.000
#> SRR772525 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772526 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772527 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772528 3 0.1919 0.6160 0.020 0.024 0.956
#> SRR772529 1 0.6267 -0.2651 0.548 0.000 0.452
#> SRR772530 1 0.6295 -0.3287 0.528 0.000 0.472
#> SRR772531 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772532 1 0.5138 0.6753 0.748 0.252 0.000
#> SRR772533 1 0.4291 0.7253 0.820 0.180 0.000
#> SRR772534 1 0.4399 0.5465 0.812 0.000 0.188
#> SRR772535 1 0.3752 0.7384 0.856 0.144 0.000
#> SRR772536 1 0.3816 0.7416 0.852 0.148 0.000
#> SRR772537 2 0.1289 0.9196 0.032 0.968 0.000
#> SRR772538 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772539 1 0.6308 -0.4038 0.508 0.000 0.492
#> SRR772540 1 0.6111 -0.0754 0.604 0.000 0.396
#> SRR772541 1 0.3482 0.7441 0.872 0.128 0.000
#> SRR772542 3 0.6299 0.4791 0.476 0.000 0.524
#> SRR772543 3 0.6111 0.5931 0.396 0.000 0.604
#> SRR772544 3 0.1267 0.6052 0.004 0.024 0.972
#> SRR772545 1 0.5926 0.1481 0.644 0.000 0.356
#> SRR772546 1 0.6291 -0.3140 0.532 0.000 0.468
#> SRR772547 1 0.5178 0.3900 0.744 0.000 0.256
#> SRR772548 1 0.6008 -0.0195 0.628 0.000 0.372
#> SRR772549 3 0.6168 0.5763 0.412 0.000 0.588
#> SRR772550 3 0.6079 0.6002 0.388 0.000 0.612
#> SRR772551 1 0.4092 0.7075 0.876 0.036 0.088
#> SRR772552 1 0.2878 0.7530 0.904 0.096 0.000
#> SRR772553 1 0.5465 0.6260 0.712 0.288 0.000
#> SRR772554 1 0.4346 0.7255 0.816 0.184 0.000
#> SRR772555 1 0.4931 0.6949 0.768 0.232 0.000
#> SRR772556 3 0.6302 0.4607 0.480 0.000 0.520
#> SRR772557 3 0.6299 0.4671 0.476 0.000 0.524
#> SRR772558 1 0.5810 0.1265 0.664 0.000 0.336
#> SRR772559 1 0.6045 -0.0453 0.620 0.000 0.380
#> SRR772560 1 0.1636 0.7377 0.964 0.020 0.016
#> SRR772561 1 0.6096 0.5067 0.704 0.016 0.280
#> SRR772562 1 0.3551 0.7408 0.868 0.132 0.000
#> SRR772563 1 0.5058 0.6694 0.756 0.244 0.000
#> SRR772564 3 0.6252 0.5157 0.444 0.000 0.556
#> SRR772565 3 0.5988 0.6130 0.368 0.000 0.632
#> SRR772566 3 0.2356 0.6480 0.072 0.000 0.928
#> SRR772567 3 0.2261 0.6498 0.068 0.000 0.932
#> SRR772568 1 0.2959 0.7491 0.900 0.100 0.000
#> SRR772569 1 0.3619 0.7455 0.864 0.136 0.000
#> SRR772570 1 0.6154 -0.1320 0.592 0.000 0.408
#> SRR772571 1 0.5465 0.3412 0.712 0.000 0.288
#> SRR772572 1 0.4575 0.5438 0.812 0.004 0.184
#> SRR772573 1 0.4449 0.6712 0.860 0.040 0.100
#> SRR772574 1 0.6062 -0.0336 0.616 0.000 0.384
#> SRR772575 1 0.5905 0.0939 0.648 0.000 0.352
#> SRR772576 1 0.1878 0.7498 0.952 0.044 0.004
#> SRR772577 1 0.2066 0.7503 0.940 0.060 0.000
#> SRR772578 2 0.2878 0.8649 0.096 0.904 0.000
#> SRR772579 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772580 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772581 1 0.3181 0.7232 0.912 0.024 0.064
#> SRR772582 1 0.1529 0.7470 0.960 0.040 0.000
#> SRR772583 1 0.2229 0.7265 0.944 0.012 0.044
#> SRR772584 1 0.2301 0.7517 0.936 0.060 0.004
#> SRR772585 1 0.3192 0.7455 0.888 0.112 0.000
#> SRR772586 3 0.4861 0.6458 0.192 0.008 0.800
#> SRR772587 1 0.6192 -0.1788 0.580 0.000 0.420
#> SRR772588 2 0.5733 0.5245 0.324 0.676 0.000
#> SRR772589 2 0.5327 0.6202 0.272 0.728 0.000
#> SRR772590 3 0.4270 0.5569 0.116 0.024 0.860
#> SRR772591 3 0.4504 0.6654 0.196 0.000 0.804
#> SRR772592 3 0.4235 0.6665 0.176 0.000 0.824
#> SRR772593 3 0.4700 0.6582 0.180 0.008 0.812
#> SRR772594 2 0.2537 0.8835 0.080 0.920 0.000
#> SRR772595 2 0.4842 0.7028 0.224 0.776 0.000
#> SRR772596 3 0.1453 0.6086 0.008 0.024 0.968
#> SRR772597 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772598 3 0.6126 0.5734 0.400 0.000 0.600
#> SRR772599 3 0.6154 0.5761 0.408 0.000 0.592
#> SRR772600 1 0.3879 0.7360 0.848 0.152 0.000
#> SRR772601 1 0.5138 0.6682 0.748 0.252 0.000
#> SRR772602 3 0.1267 0.6052 0.004 0.024 0.972
#> SRR772603 1 0.3038 0.7479 0.896 0.104 0.000
#> SRR772604 1 0.3816 0.7339 0.852 0.148 0.000
#> SRR772605 1 0.3116 0.7494 0.892 0.108 0.000
#> SRR772606 3 0.6225 0.5546 0.432 0.000 0.568
#> SRR772607 3 0.6280 0.5003 0.460 0.000 0.540
#> SRR772608 1 0.3038 0.7482 0.896 0.104 0.000
#> SRR772609 1 0.2878 0.7490 0.904 0.096 0.000
#> SRR772610 1 0.4931 0.6874 0.768 0.232 0.000
#> SRR772611 1 0.4121 0.7314 0.832 0.168 0.000
#> SRR772612 2 0.1289 0.9196 0.032 0.968 0.000
#> SRR772613 2 0.2959 0.8559 0.100 0.900 0.000
#> SRR772614 3 0.6302 0.4617 0.480 0.000 0.520
#> SRR772615 3 0.5363 0.6549 0.276 0.000 0.724
#> SRR772616 1 0.5678 0.2094 0.684 0.000 0.316
#> SRR772617 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772618 2 0.1529 0.9147 0.040 0.960 0.000
#> SRR772619 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772620 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772621 1 0.2527 0.7302 0.936 0.020 0.044
#> SRR772622 1 0.2229 0.7240 0.944 0.012 0.044
#> SRR772623 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772624 3 0.4047 0.6648 0.148 0.004 0.848
#> SRR772625 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772626 1 0.2356 0.7543 0.928 0.072 0.000
#> SRR772627 1 0.3686 0.7454 0.860 0.140 0.000
#> SRR772628 3 0.6295 0.4848 0.472 0.000 0.528
#> SRR772629 3 0.6302 0.4585 0.480 0.000 0.520
#> SRR772630 1 0.1989 0.7130 0.948 0.004 0.048
#> SRR772631 3 0.4099 0.6623 0.140 0.008 0.852
#> SRR772632 2 0.5905 0.4094 0.352 0.648 0.000
#> SRR772633 2 0.2448 0.8841 0.076 0.924 0.000
#> SRR772634 1 0.4002 0.6132 0.840 0.000 0.160
#> SRR772635 1 0.3644 0.6577 0.872 0.004 0.124
#> SRR772636 2 0.2796 0.8683 0.092 0.908 0.000
#> SRR772637 3 0.5988 0.6170 0.368 0.000 0.632
#> SRR772638 3 0.5968 0.6212 0.364 0.000 0.636
#> SRR772639 1 0.3879 0.7332 0.848 0.152 0.000
#> SRR772640 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772641 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772642 1 0.1989 0.7500 0.948 0.048 0.004
#> SRR772643 1 0.2200 0.7505 0.940 0.056 0.004
#> SRR772644 1 0.5760 0.1654 0.672 0.000 0.328
#> SRR772645 1 0.5859 0.0955 0.656 0.000 0.344
#> SRR772646 1 0.5397 0.6383 0.720 0.280 0.000
#> SRR772647 1 0.3816 0.7381 0.852 0.148 0.000
#> SRR772648 1 0.2486 0.7520 0.932 0.060 0.008
#> SRR772649 1 0.2448 0.7536 0.924 0.076 0.000
#> SRR772650 1 0.0747 0.7214 0.984 0.000 0.016
#> SRR772651 1 0.4555 0.5334 0.800 0.000 0.200
#> SRR772652 1 0.6192 -0.1286 0.580 0.000 0.420
#> SRR772653 1 0.6295 -0.3340 0.528 0.000 0.472
#> SRR772654 1 0.2096 0.7119 0.944 0.004 0.052
#> SRR772655 1 0.2590 0.7043 0.924 0.004 0.072
#> SRR772656 3 0.2434 0.5999 0.036 0.024 0.940
#> SRR772657 3 0.7069 0.1416 0.408 0.024 0.568
#> SRR772658 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772659 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772660 1 0.3752 0.7392 0.856 0.144 0.000
#> SRR772661 1 0.5517 0.4154 0.728 0.004 0.268
#> SRR772662 1 0.0747 0.7237 0.984 0.000 0.016
#> SRR772663 1 0.2448 0.6872 0.924 0.000 0.076
#> SRR772664 1 0.5810 0.5523 0.664 0.336 0.000
#> SRR772665 1 0.5760 0.5689 0.672 0.328 0.000
#> SRR772666 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772667 2 0.1163 0.9216 0.028 0.972 0.000
#> SRR772668 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772669 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772670 1 0.1950 0.7477 0.952 0.040 0.008
#> SRR772671 1 0.1015 0.7351 0.980 0.012 0.008
#> SRR772672 1 0.3941 0.7315 0.844 0.156 0.000
#> SRR772673 1 0.3482 0.7405 0.872 0.128 0.000
#> SRR772674 3 0.3276 0.5740 0.068 0.024 0.908
#> SRR772675 1 0.4002 0.6170 0.840 0.000 0.160
#> SRR772676 1 0.1015 0.7354 0.980 0.012 0.008
#> SRR772677 1 0.1182 0.7348 0.976 0.012 0.012
#> SRR772678 1 0.4164 0.6300 0.848 0.008 0.144
#> SRR772679 1 0.3272 0.6675 0.892 0.004 0.104
#> SRR772680 1 0.5497 0.2826 0.708 0.000 0.292
#> SRR772681 3 0.6252 0.3954 0.268 0.024 0.708
#> SRR772682 1 0.5058 0.6711 0.756 0.244 0.000
#> SRR772683 1 0.4796 0.6986 0.780 0.220 0.000
#> SRR772685 1 0.2200 0.7514 0.940 0.056 0.004
#> SRR772686 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772687 3 0.0892 0.6067 0.000 0.020 0.980
#> SRR772688 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772689 2 0.1031 0.9235 0.024 0.976 0.000
#> SRR772690 3 0.1031 0.6052 0.000 0.024 0.976
#> SRR772691 2 0.6291 -0.0154 0.468 0.532 0.000
#> SRR772692 1 0.2229 0.7238 0.944 0.012 0.044
#> SRR772693 1 0.1919 0.7391 0.956 0.024 0.020
#> SRR772694 1 0.2682 0.7523 0.920 0.076 0.004
#> SRR772695 1 0.2165 0.7511 0.936 0.064 0.000
#> SRR772696 1 0.2448 0.7505 0.924 0.076 0.000
#> SRR772697 1 0.2711 0.7543 0.912 0.088 0.000
#> SRR772698 3 0.4121 0.6462 0.108 0.024 0.868
#> SRR772699 1 0.6309 -0.4141 0.504 0.000 0.496
#> SRR772700 1 0.6244 -0.2439 0.560 0.000 0.440
#> SRR772701 3 0.6307 0.4424 0.488 0.000 0.512
#> SRR772702 3 0.6286 0.4927 0.464 0.000 0.536
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.2216 0.8100 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.1118 0.8179 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR772343 2 0.3975 0.6689 0.240 0.760 0.000 0.000
#> SRR772344 2 0.4193 0.6750 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR772345 2 0.4761 0.4706 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR772346 2 0.4304 0.6059 0.284 0.716 0.000 0.000
#> SRR772347 1 0.4790 0.4964 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR772348 2 0.4453 0.7025 0.012 0.744 0.000 0.244
#> SRR772349 2 0.4008 0.7082 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR772350 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.1557 0.8524 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772352 2 0.2149 0.8438 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR772353 2 0.1978 0.8419 0.068 0.928 0.000 0.004
#> SRR772354 2 0.2542 0.8361 0.084 0.904 0.000 0.012
#> SRR772355 2 0.2081 0.8418 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772356 2 0.4164 0.6794 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR772357 1 0.3400 0.7746 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.4855 0.4414 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR772359 2 0.3873 0.7046 0.228 0.772 0.000 0.000
#> SRR772360 2 0.3266 0.7702 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0336 0.8908 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772362 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772363 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772364 2 0.4916 0.2785 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR772365 2 0.3942 0.6899 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR772366 3 0.6649 0.5854 0.256 0.072 0.644 0.028
#> SRR772367 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.3271 0.8180 0.012 0.856 0.000 0.132
#> SRR772369 2 0.1022 0.8433 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR772370 2 0.1557 0.8382 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR772371 2 0.4661 0.4421 0.348 0.652 0.000 0.000
#> SRR772372 2 0.4008 0.6634 0.244 0.756 0.000 0.000
#> SRR772373 2 0.1118 0.8502 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772374 2 0.0469 0.8510 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772375 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.4661 0.5433 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR772377 2 0.4052 0.8229 0.068 0.856 0.028 0.048
#> SRR772378 2 0.2530 0.8299 0.100 0.896 0.000 0.004
#> SRR772379 2 0.1724 0.8548 0.032 0.948 0.000 0.020
#> SRR772380 2 0.3172 0.7684 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0188 0.8924 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772382 1 0.3172 0.7856 0.840 0.160 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.1557 0.8183 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR772384 2 0.3942 0.8032 0.108 0.848 0.016 0.028
#> SRR772385 4 0.5212 0.1859 0.008 0.420 0.000 0.572
#> SRR772386 2 0.0000 0.8475 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0336 0.8506 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772388 1 0.0927 0.8138 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR772389 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.3744 0.8319 0.052 0.048 0.872 0.028
#> SRR772391 1 0.0592 0.8156 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.3024 0.7876 0.852 0.148 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.1109 0.8512 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR772394 2 0.1302 0.8446 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR772395 2 0.2973 0.8089 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772396 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0592 0.8149 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.4697 0.5069 0.644 0.356 0.000 0.000
#> SRR772399 2 0.4746 0.4203 0.368 0.632 0.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0592 0.8153 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0592 0.8149 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772402 2 0.3105 0.8126 0.004 0.856 0.000 0.140
#> SRR772403 2 0.2868 0.8160 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR772404 2 0.3726 0.7464 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR772405 2 0.4115 0.7933 0.120 0.836 0.016 0.028
#> SRR772406 2 0.0779 0.8524 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR772407 2 0.1411 0.8539 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR772408 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772409 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772410 2 0.2670 0.8424 0.072 0.904 0.000 0.024
#> SRR772411 2 0.1489 0.8470 0.044 0.952 0.000 0.004
#> SRR772412 1 0.1867 0.8122 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0707 0.8168 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.1209 0.8522 0.004 0.964 0.000 0.032
#> SRR772416 2 0.1510 0.8554 0.016 0.956 0.000 0.028
#> SRR772417 2 0.3400 0.7576 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR772418 3 0.6025 0.7089 0.104 0.136 0.732 0.028
#> SRR772419 4 0.1389 0.8879 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR772420 4 0.1302 0.8906 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR772421 2 0.1716 0.8424 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR772422 2 0.1022 0.8471 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR772423 4 0.4985 0.0698 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR772424 4 0.4972 0.1073 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR772425 2 0.3649 0.7515 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR772426 2 0.4382 0.6288 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR772427 2 0.4500 0.5874 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR772428 1 0.1004 0.8173 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR772429 1 0.2973 0.7843 0.856 0.144 0.000 0.000
#> SRR772430 2 0.2918 0.8176 0.116 0.876 0.000 0.008
#> SRR772431 2 0.2530 0.8316 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR772432 2 0.2125 0.8433 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR772433 1 0.1151 0.8010 0.968 0.008 0.024 0.000
#> SRR772434 1 0.0927 0.8052 0.976 0.008 0.016 0.000
#> SRR772435 2 0.3400 0.7555 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR772436 2 0.3569 0.7394 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0657 0.8852 0.004 0.012 0.984 0.000
#> SRR772438 1 0.0804 0.8111 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR772439 1 0.0817 0.8175 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR772440 2 0.0817 0.8514 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR772441 2 0.0469 0.8502 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772442 2 0.4134 0.6914 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR772443 2 0.1716 0.8462 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772444 1 0.0592 0.8151 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.2011 0.8142 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0592 0.8149 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.0469 0.8486 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772449 2 0.1004 0.8554 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR772450 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772451 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772452 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.1211 0.8162 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR772454 2 0.4817 0.3865 0.388 0.612 0.000 0.000
#> SRR772455 2 0.3801 0.7107 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR772456 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772457 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772458 1 0.1022 0.8168 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0592 0.8153 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772460 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772461 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772462 2 0.3528 0.7694 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR772463 2 0.2704 0.8226 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772464 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.2174 0.8517 0.052 0.928 0.000 0.020
#> SRR772466 2 0.1677 0.8519 0.040 0.948 0.000 0.012
#> SRR772467 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772468 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772469 1 0.3528 0.7501 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.3356 0.7752 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.4985 0.2347 0.532 0.468 0.000 0.000
#> SRR772472 1 0.4103 0.7055 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR772473 2 0.1302 0.8529 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772474 2 0.2011 0.8415 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR772475 2 0.4792 0.6190 0.008 0.680 0.000 0.312
#> SRR772476 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772477 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772478 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.2861 0.8315 0.096 0.888 0.000 0.016
#> SRR772481 2 0.1938 0.8523 0.052 0.936 0.000 0.012
#> SRR772482 2 0.4941 0.2092 0.436 0.564 0.000 0.000
#> SRR772483 2 0.4994 0.0243 0.480 0.520 0.000 0.000
#> SRR772484 2 0.1661 0.8490 0.004 0.944 0.000 0.052
#> SRR772485 2 0.1743 0.8483 0.004 0.940 0.000 0.056
#> SRR772486 1 0.2011 0.8073 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR772487 1 0.4304 0.6706 0.716 0.284 0.000 0.000
#> SRR772488 2 0.1833 0.8586 0.032 0.944 0.000 0.024
#> SRR772489 2 0.1545 0.8516 0.040 0.952 0.000 0.008
#> SRR772490 1 0.3311 0.7827 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0592 0.8152 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772492 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772493 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772494 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772495 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772496 2 0.1557 0.8524 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772497 2 0.1557 0.8522 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772498 2 0.2546 0.8516 0.028 0.912 0.000 0.060
#> SRR772499 2 0.2021 0.8552 0.024 0.936 0.000 0.040
#> SRR772500 2 0.4933 0.2958 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR772501 2 0.4941 0.3097 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR772502 2 0.4477 0.5457 0.312 0.688 0.000 0.000
#> SRR772503 1 0.4898 0.3829 0.584 0.416 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.3764 0.7413 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR772505 2 0.3610 0.7584 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772506 4 0.1022 0.8963 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR772507 4 0.1302 0.8906 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR772508 2 0.4605 0.5451 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR772509 2 0.1936 0.8447 0.032 0.940 0.000 0.028
#> SRR772510 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.0707 0.8481 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772512 2 0.5562 0.7365 0.044 0.752 0.168 0.036
#> SRR772513 2 0.1637 0.8478 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772514 2 0.3626 0.7756 0.004 0.812 0.000 0.184
#> SRR772515 2 0.2048 0.8491 0.008 0.928 0.000 0.064
#> SRR772516 2 0.2737 0.8363 0.008 0.888 0.000 0.104
#> SRR772517 2 0.1474 0.8482 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772518 2 0.0657 0.8513 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR772519 2 0.2469 0.8338 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772520 2 0.3356 0.7838 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR772521 2 0.2814 0.7986 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR772522 2 0.1474 0.8392 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR772523 2 0.2921 0.8142 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR772524 2 0.1824 0.8511 0.004 0.936 0.000 0.060
#> SRR772525 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772527 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772528 3 0.3754 0.8248 0.112 0.008 0.852 0.028
#> SRR772529 1 0.3907 0.7307 0.768 0.232 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.3311 0.7744 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.3726 0.7510 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR772533 2 0.2589 0.8288 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR772534 2 0.4843 0.3394 0.396 0.604 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.1716 0.8485 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772536 2 0.1940 0.8489 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772537 4 0.1211 0.8931 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR772538 4 0.1022 0.8963 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR772539 1 0.1389 0.8191 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.3975 0.7224 0.760 0.240 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.3354 0.8421 0.044 0.872 0.000 0.084
#> SRR772542 1 0.2814 0.7959 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0707 0.8167 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772544 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.4830 0.4310 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.4431 0.6311 0.696 0.304 0.000 0.000
#> SRR772547 2 0.4972 0.0520 0.456 0.544 0.000 0.000
#> SRR772548 1 0.4585 0.6192 0.668 0.332 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.3052 0.7944 0.136 0.860 0.000 0.004
#> SRR772552 2 0.1724 0.8552 0.032 0.948 0.000 0.020
#> SRR772553 2 0.4137 0.7577 0.012 0.780 0.000 0.208
#> SRR772554 2 0.2589 0.8309 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR772555 2 0.3311 0.7885 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR772556 1 0.2760 0.7922 0.872 0.128 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0707 0.8168 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.4477 0.6463 0.688 0.312 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.3726 0.7442 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR772560 2 0.2888 0.8071 0.124 0.872 0.000 0.004
#> SRR772561 3 0.5778 -0.0610 0.028 0.472 0.500 0.000
#> SRR772562 2 0.1792 0.8453 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772563 2 0.3356 0.7816 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR772564 1 0.4012 0.7517 0.800 0.184 0.016 0.000
#> SRR772565 1 0.2610 0.8067 0.900 0.088 0.012 0.000
#> SRR772566 1 0.2737 0.7336 0.888 0.008 0.104 0.000
#> SRR772567 1 0.2799 0.7276 0.884 0.008 0.108 0.000
#> SRR772568 2 0.0188 0.8483 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772569 2 0.2402 0.8530 0.012 0.912 0.000 0.076
#> SRR772570 1 0.4522 0.6226 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR772571 2 0.4843 0.3435 0.396 0.604 0.000 0.000
#> SRR772572 2 0.4967 0.0841 0.452 0.548 0.000 0.000
#> SRR772573 2 0.5600 0.3247 0.376 0.596 0.000 0.028
#> SRR772574 1 0.4454 0.6407 0.692 0.308 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.4713 0.5510 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.0817 0.8483 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR772577 2 0.0188 0.8482 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772578 4 0.2973 0.8026 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR772579 4 0.1389 0.8890 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR772580 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.2216 0.8304 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772582 2 0.0707 0.8483 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772583 2 0.2675 0.8295 0.100 0.892 0.000 0.008
#> SRR772584 2 0.1510 0.8558 0.028 0.956 0.000 0.016
#> SRR772585 2 0.1661 0.8493 0.004 0.944 0.000 0.052
#> SRR772586 3 0.7773 0.3205 0.332 0.132 0.508 0.028
#> SRR772587 1 0.4103 0.7019 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR772588 4 0.4697 0.4550 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR772589 4 0.4454 0.5696 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR772590 3 0.0336 0.8908 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772591 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.1284 0.8029 0.964 0.012 0.024 0.000
#> SRR772593 3 0.8056 0.1257 0.392 0.152 0.428 0.028
#> SRR772594 4 0.2281 0.8458 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR772595 4 0.3873 0.6934 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR772596 3 0.2124 0.8686 0.040 0.000 0.932 0.028
#> SRR772597 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0895 0.8171 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR772599 1 0.1109 0.8174 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR772600 2 0.2466 0.8376 0.004 0.900 0.000 0.096
#> SRR772601 2 0.3710 0.7699 0.004 0.804 0.000 0.192
#> SRR772602 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.1635 0.8539 0.008 0.948 0.000 0.044
#> SRR772604 2 0.2480 0.8387 0.008 0.904 0.000 0.088
#> SRR772605 2 0.2036 0.8578 0.032 0.936 0.000 0.032
#> SRR772606 1 0.0592 0.8158 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0707 0.8173 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.1743 0.8489 0.004 0.940 0.000 0.056
#> SRR772609 2 0.1767 0.8539 0.012 0.944 0.000 0.044
#> SRR772610 2 0.3172 0.7967 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR772611 2 0.2281 0.8392 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772612 4 0.1557 0.8833 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR772613 4 0.2589 0.8213 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR772614 1 0.0469 0.8128 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0592 0.8153 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4925 0.3780 0.572 0.428 0.000 0.000
#> SRR772617 4 0.1211 0.8928 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR772618 4 0.1557 0.8825 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR772619 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772620 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772621 2 0.1867 0.8364 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR772622 2 0.2011 0.8318 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR772623 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.7380 0.0668 0.496 0.084 0.392 0.028
#> SRR772625 4 0.1118 0.8916 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR772626 2 0.1042 0.8550 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772627 2 0.2197 0.8442 0.004 0.916 0.000 0.080
#> SRR772628 1 0.1211 0.8177 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR772629 1 0.1022 0.8196 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772630 2 0.3726 0.7188 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR772631 3 0.7400 0.3219 0.376 0.088 0.508 0.028
#> SRR772632 4 0.4804 0.3608 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR772633 4 0.2216 0.8489 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772634 2 0.4164 0.6524 0.264 0.736 0.000 0.000
#> SRR772635 2 0.3837 0.7091 0.224 0.776 0.000 0.000
#> SRR772636 4 0.2334 0.8254 0.004 0.088 0.000 0.908
#> SRR772637 1 0.0921 0.8175 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.1042 0.8141 0.972 0.020 0.008 0.000
#> SRR772639 2 0.2081 0.8410 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772640 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772641 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772642 2 0.0592 0.8505 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR772643 2 0.0524 0.8499 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR772644 1 0.4679 0.5702 0.648 0.352 0.000 0.000
#> SRR772645 1 0.4624 0.6000 0.660 0.340 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.3726 0.7482 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR772647 2 0.1557 0.8515 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772648 2 0.1209 0.8520 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR772649 2 0.2089 0.8537 0.020 0.932 0.000 0.048
#> SRR772650 2 0.1716 0.8371 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR772651 2 0.4193 0.6298 0.268 0.732 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.4888 0.3719 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR772653 1 0.4500 0.6017 0.684 0.316 0.000 0.000
#> SRR772654 2 0.2973 0.7925 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR772655 2 0.3726 0.7307 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR772656 3 0.0188 0.8923 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772657 3 0.0376 0.8906 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR772658 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772659 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772660 2 0.1940 0.8455 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772661 2 0.5846 0.6392 0.216 0.712 0.044 0.028
#> SRR772662 2 0.2408 0.8136 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR772663 2 0.3356 0.7590 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.4304 0.6525 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR772665 2 0.4164 0.6751 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR772666 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772667 4 0.1716 0.8780 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR772668 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772669 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772670 2 0.2662 0.8401 0.084 0.900 0.000 0.016
#> SRR772671 2 0.3219 0.8204 0.112 0.868 0.000 0.020
#> SRR772672 2 0.2408 0.8323 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772673 2 0.1716 0.8446 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772674 3 0.0188 0.8924 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772675 2 0.3352 0.8284 0.072 0.884 0.016 0.028
#> SRR772676 2 0.2125 0.8368 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR772677 2 0.1557 0.8423 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR772678 2 0.3942 0.8037 0.108 0.848 0.016 0.028
#> SRR772679 2 0.3172 0.7705 0.160 0.840 0.000 0.000
#> SRR772680 2 0.4916 0.1812 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0336 0.8908 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772682 2 0.2921 0.8104 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR772683 2 0.2814 0.8190 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772685 2 0.0707 0.8497 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772687 3 0.2859 0.8260 0.112 0.000 0.880 0.008
#> SRR772688 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772689 4 0.0921 0.8979 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772690 3 0.0000 0.8933 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772691 4 0.5295 -0.1063 0.008 0.488 0.000 0.504
#> SRR772692 2 0.2216 0.8318 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772693 2 0.1716 0.8426 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR772694 2 0.1174 0.8555 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR772695 2 0.0779 0.8517 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR772696 2 0.0657 0.8510 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR772697 2 0.1356 0.8560 0.008 0.960 0.000 0.032
#> SRR772698 3 0.5765 0.7303 0.100 0.120 0.752 0.028
#> SRR772699 1 0.3837 0.7429 0.776 0.224 0.000 0.000
#> SRR772700 1 0.4193 0.7055 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR772701 1 0.3356 0.7778 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.1022 0.8184 0.968 0.032 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.1831 0.8167 0.920 0.076 0.000 0.000 0.004
#> SRR772342 1 0.0992 0.8249 0.968 0.024 0.000 0.000 0.008
#> SRR772343 2 0.3757 0.6971 0.208 0.772 0.000 0.000 0.020
#> SRR772344 2 0.4655 0.7022 0.000 0.700 0.000 0.248 0.052
#> SRR772345 2 0.5069 0.5671 0.000 0.620 0.000 0.328 0.052
#> SRR772346 2 0.3861 0.5940 0.284 0.712 0.000 0.000 0.004
#> SRR772347 1 0.4354 0.5049 0.624 0.368 0.000 0.000 0.008
#> SRR772348 2 0.4739 0.7447 0.008 0.724 0.000 0.212 0.056
#> SRR772349 2 0.4150 0.7555 0.000 0.748 0.000 0.216 0.036
#> SRR772350 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772351 2 0.2661 0.8559 0.000 0.888 0.000 0.056 0.056
#> SRR772352 2 0.2782 0.8540 0.000 0.880 0.000 0.072 0.048
#> SRR772353 2 0.1988 0.8474 0.048 0.928 0.000 0.008 0.016
#> SRR772354 2 0.2445 0.8474 0.056 0.908 0.000 0.020 0.016
#> SRR772355 2 0.2522 0.8527 0.000 0.896 0.000 0.052 0.052
#> SRR772356 2 0.4490 0.7337 0.000 0.724 0.000 0.224 0.052
#> SRR772357 1 0.3086 0.7687 0.816 0.180 0.000 0.000 0.004
#> SRR772358 1 0.4610 0.4519 0.596 0.388 0.000 0.000 0.016
#> SRR772359 2 0.3496 0.7348 0.200 0.788 0.000 0.000 0.012
#> SRR772360 2 0.2997 0.7915 0.148 0.840 0.000 0.000 0.012
#> SRR772361 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 2 0.4227 0.3100 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000
#> SRR772365 2 0.3720 0.6971 0.228 0.760 0.000 0.000 0.012
#> SRR772366 5 0.2333 0.9115 0.040 0.016 0.028 0.000 0.916
#> SRR772367 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772368 2 0.3222 0.8369 0.004 0.852 0.000 0.108 0.036
#> SRR772369 2 0.1117 0.8491 0.020 0.964 0.000 0.000 0.016
#> SRR772370 2 0.1469 0.8468 0.036 0.948 0.000 0.000 0.016
#> SRR772371 2 0.5203 0.4583 0.332 0.608 0.000 0.000 0.060
#> SRR772372 2 0.4509 0.6624 0.236 0.716 0.000 0.000 0.048
#> SRR772373 2 0.1469 0.8601 0.000 0.948 0.000 0.036 0.016
#> SRR772374 2 0.1809 0.8544 0.000 0.928 0.000 0.012 0.060
#> SRR772375 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772376 2 0.4843 0.6478 0.000 0.660 0.000 0.292 0.048
#> SRR772377 5 0.1357 0.9233 0.000 0.048 0.004 0.000 0.948
#> SRR772378 2 0.2364 0.8413 0.064 0.908 0.000 0.008 0.020
#> SRR772379 2 0.1891 0.8563 0.016 0.936 0.000 0.032 0.016
#> SRR772380 2 0.2825 0.7956 0.124 0.860 0.000 0.000 0.016
#> SRR772381 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.2471 0.7949 0.864 0.136 0.000 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0963 0.8265 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR772384 5 0.1571 0.9166 0.000 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR772385 5 0.2236 0.8930 0.000 0.024 0.000 0.068 0.908
#> SRR772386 2 0.1043 0.8553 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772387 2 0.1571 0.8528 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR772388 1 0.0451 0.8223 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR772389 1 0.0162 0.8206 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772390 5 0.2204 0.9120 0.016 0.016 0.048 0.000 0.920
#> SRR772391 1 0.0162 0.8231 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.2561 0.7863 0.856 0.144 0.000 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.1970 0.8565 0.012 0.924 0.000 0.004 0.060
#> SRR772394 2 0.1281 0.8522 0.032 0.956 0.000 0.000 0.012
#> SRR772395 2 0.3016 0.8284 0.000 0.848 0.000 0.132 0.020
#> SRR772396 1 0.0000 0.8202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0162 0.8218 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.4101 0.5311 0.664 0.332 0.000 0.000 0.004
#> SRR772399 2 0.4511 0.4371 0.356 0.628 0.000 0.000 0.016
#> SRR772400 1 0.0162 0.8232 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.8202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772402 2 0.3323 0.8394 0.004 0.844 0.000 0.116 0.036
#> SRR772403 2 0.3359 0.8342 0.000 0.840 0.000 0.108 0.052
#> SRR772404 2 0.3280 0.7994 0.000 0.812 0.000 0.176 0.012
#> SRR772405 5 0.1502 0.9183 0.000 0.056 0.004 0.000 0.940
#> SRR772406 2 0.2284 0.8583 0.004 0.912 0.000 0.028 0.056
#> SRR772407 2 0.2173 0.8590 0.012 0.920 0.000 0.016 0.052
#> SRR772408 4 0.0162 0.8915 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772409 4 0.0451 0.8902 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772410 2 0.2141 0.8411 0.064 0.916 0.000 0.004 0.016
#> SRR772411 2 0.1310 0.8558 0.024 0.956 0.000 0.000 0.020
#> SRR772412 1 0.1410 0.8195 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0404 0.8249 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772415 2 0.1630 0.8554 0.004 0.944 0.000 0.036 0.016
#> SRR772416 2 0.2047 0.8565 0.012 0.928 0.000 0.040 0.020
#> SRR772417 2 0.3283 0.7891 0.140 0.832 0.000 0.000 0.028
#> SRR772418 5 0.2072 0.9278 0.020 0.036 0.016 0.000 0.928
#> SRR772419 4 0.1549 0.8659 0.000 0.040 0.000 0.944 0.016
#> SRR772420 4 0.1300 0.8750 0.000 0.028 0.000 0.956 0.016
#> SRR772421 2 0.1915 0.8529 0.040 0.928 0.000 0.000 0.032
#> SRR772422 2 0.1872 0.8530 0.020 0.928 0.000 0.000 0.052
#> SRR772423 4 0.5452 -0.0719 0.000 0.448 0.000 0.492 0.060
#> SRR772424 4 0.5376 0.0281 0.000 0.424 0.000 0.520 0.056
#> SRR772425 2 0.3780 0.8194 0.000 0.808 0.000 0.132 0.060
#> SRR772426 2 0.4928 0.6441 0.000 0.660 0.000 0.284 0.056
#> SRR772427 2 0.5027 0.6039 0.000 0.640 0.000 0.304 0.056
#> SRR772428 1 0.0566 0.8250 0.984 0.012 0.004 0.000 0.000
#> SRR772429 1 0.2516 0.7828 0.860 0.140 0.000 0.000 0.000
#> SRR772430 2 0.3869 0.8014 0.084 0.824 0.000 0.012 0.080
#> SRR772431 2 0.3309 0.8333 0.000 0.836 0.000 0.128 0.036
#> SRR772432 2 0.2464 0.8503 0.004 0.892 0.000 0.092 0.012
#> SRR772433 1 0.0693 0.8136 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR772434 1 0.0290 0.8182 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772435 2 0.3196 0.7527 0.192 0.804 0.000 0.000 0.004
#> SRR772436 2 0.3109 0.7467 0.200 0.800 0.000 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0162 0.9636 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0162 0.8197 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772439 1 0.0510 0.8251 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR772440 2 0.1648 0.8556 0.020 0.940 0.000 0.000 0.040
#> SRR772441 2 0.1571 0.8519 0.004 0.936 0.000 0.000 0.060
#> SRR772442 2 0.4639 0.7199 0.000 0.708 0.000 0.236 0.056
#> SRR772443 2 0.2719 0.8518 0.000 0.884 0.000 0.068 0.048
#> SRR772444 1 0.0290 0.8238 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.1478 0.8214 0.936 0.064 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.8202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0579 0.8235 0.984 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR772448 2 0.0771 0.8510 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020
#> SRR772449 2 0.1697 0.8536 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR772450 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0324 0.8219 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR772453 1 0.1012 0.8231 0.968 0.020 0.000 0.000 0.012
#> SRR772454 2 0.4264 0.4237 0.376 0.620 0.000 0.000 0.004
#> SRR772455 2 0.3456 0.7388 0.184 0.800 0.000 0.000 0.016
#> SRR772456 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0865 0.8250 0.972 0.024 0.000 0.000 0.004
#> SRR772459 1 0.0162 0.8232 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772460 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.3224 0.8100 0.000 0.824 0.000 0.160 0.016
#> SRR772463 2 0.2674 0.8358 0.000 0.868 0.000 0.120 0.012
#> SRR772464 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772465 2 0.2607 0.8636 0.032 0.904 0.000 0.024 0.040
#> SRR772466 2 0.2036 0.8601 0.028 0.928 0.000 0.008 0.036
#> SRR772467 4 0.0290 0.8908 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772468 4 0.0290 0.8908 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772469 1 0.3621 0.7320 0.788 0.192 0.000 0.000 0.020
#> SRR772470 1 0.3194 0.7815 0.832 0.148 0.000 0.000 0.020
#> SRR772471 1 0.4826 0.1974 0.508 0.472 0.000 0.000 0.020
#> SRR772472 1 0.3961 0.6931 0.736 0.248 0.000 0.000 0.016
#> SRR772473 2 0.2438 0.8562 0.000 0.900 0.000 0.040 0.060
#> SRR772474 2 0.3159 0.8420 0.000 0.856 0.000 0.088 0.056
#> SRR772475 5 0.2067 0.8856 0.000 0.032 0.000 0.048 0.920
#> SRR772476 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.8202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.8202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.2900 0.8312 0.092 0.876 0.000 0.020 0.012
#> SRR772481 2 0.1967 0.8569 0.036 0.932 0.000 0.012 0.020
#> SRR772482 2 0.4410 0.1972 0.440 0.556 0.000 0.000 0.004
#> SRR772483 2 0.4968 0.0608 0.456 0.516 0.000 0.000 0.028
#> SRR772484 2 0.2141 0.8559 0.004 0.916 0.000 0.064 0.016
#> SRR772485 2 0.2141 0.8558 0.004 0.916 0.000 0.064 0.016
#> SRR772486 1 0.2139 0.8132 0.916 0.052 0.000 0.000 0.032
#> SRR772487 1 0.4923 0.6587 0.680 0.252 0.000 0.000 0.068
#> SRR772488 2 0.2152 0.8628 0.032 0.924 0.000 0.032 0.012
#> SRR772489 2 0.1731 0.8529 0.040 0.940 0.000 0.008 0.012
#> SRR772490 1 0.2886 0.7894 0.844 0.148 0.000 0.000 0.008
#> SRR772491 1 0.0451 0.8239 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR772492 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.1300 0.8606 0.000 0.956 0.000 0.028 0.016
#> SRR772497 2 0.1364 0.8582 0.000 0.952 0.000 0.036 0.012
#> SRR772498 2 0.3364 0.8421 0.020 0.848 0.000 0.020 0.112
#> SRR772499 2 0.3070 0.8430 0.012 0.860 0.000 0.016 0.112
#> SRR772500 2 0.5338 0.3809 0.000 0.544 0.000 0.400 0.056
#> SRR772501 2 0.5181 0.5039 0.000 0.588 0.000 0.360 0.052
#> SRR772502 2 0.4907 0.5703 0.292 0.656 0.000 0.000 0.052
#> SRR772503 1 0.4640 0.4033 0.584 0.400 0.000 0.000 0.016
#> SRR772504 2 0.4226 0.7847 0.000 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR772505 2 0.4049 0.7937 0.000 0.780 0.000 0.164 0.056
#> SRR772506 4 0.0609 0.8857 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772507 4 0.0794 0.8807 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR772508 2 0.4309 0.6118 0.000 0.676 0.000 0.308 0.016
#> SRR772509 5 0.1671 0.9059 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR772510 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.1018 0.8542 0.016 0.968 0.000 0.000 0.016
#> SRR772512 2 0.5563 0.6766 0.016 0.672 0.208 0.000 0.104
#> SRR772513 2 0.2046 0.8536 0.000 0.916 0.000 0.068 0.016
#> SRR772514 2 0.3256 0.8183 0.004 0.832 0.000 0.148 0.016
#> SRR772515 2 0.3272 0.8491 0.008 0.860 0.000 0.072 0.060
#> SRR772516 2 0.3209 0.8491 0.004 0.860 0.000 0.076 0.060
#> SRR772517 2 0.1809 0.8562 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR772518 2 0.1074 0.8541 0.004 0.968 0.000 0.016 0.012
#> SRR772519 2 0.3255 0.8425 0.000 0.848 0.000 0.100 0.052
#> SRR772520 2 0.3953 0.8079 0.000 0.792 0.000 0.148 0.060
#> SRR772521 2 0.2959 0.8257 0.100 0.864 0.000 0.000 0.036
#> SRR772522 2 0.1668 0.8526 0.032 0.940 0.000 0.000 0.028
#> SRR772523 2 0.3734 0.8228 0.000 0.812 0.000 0.128 0.060
#> SRR772524 2 0.3018 0.8520 0.004 0.872 0.000 0.068 0.056
#> SRR772525 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0162 0.8915 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772527 4 0.0290 0.8908 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772528 5 0.2158 0.9055 0.020 0.008 0.052 0.000 0.920
#> SRR772529 1 0.3210 0.7373 0.788 0.212 0.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.2806 0.7816 0.844 0.152 0.000 0.000 0.004
#> SRR772531 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772532 2 0.4096 0.7869 0.000 0.772 0.000 0.176 0.052
#> SRR772533 2 0.3269 0.8391 0.000 0.848 0.000 0.096 0.056
#> SRR772534 2 0.4497 0.4218 0.352 0.632 0.000 0.000 0.016
#> SRR772535 2 0.2863 0.8520 0.000 0.876 0.000 0.064 0.060
#> SRR772536 2 0.2992 0.8523 0.000 0.868 0.000 0.068 0.064
#> SRR772537 4 0.1701 0.8602 0.000 0.016 0.000 0.936 0.048
#> SRR772538 4 0.1725 0.8628 0.000 0.020 0.000 0.936 0.044
#> SRR772539 1 0.1041 0.8264 0.964 0.032 0.000 0.000 0.004
#> SRR772540 1 0.3690 0.7251 0.764 0.224 0.000 0.000 0.012
#> SRR772541 2 0.3531 0.8454 0.032 0.852 0.000 0.080 0.036
#> SRR772542 1 0.2932 0.7988 0.864 0.104 0.000 0.000 0.032
#> SRR772543 1 0.0451 0.8245 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR772544 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.4114 0.4506 0.624 0.376 0.000 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.3730 0.6468 0.712 0.288 0.000 0.000 0.000
#> SRR772547 2 0.4996 0.0973 0.420 0.548 0.000 0.000 0.032
#> SRR772548 1 0.4465 0.6444 0.672 0.304 0.000 0.000 0.024
#> SRR772549 1 0.0000 0.8202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0162 0.8206 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772551 2 0.3169 0.7808 0.140 0.840 0.000 0.004 0.016
#> SRR772552 2 0.1471 0.8513 0.024 0.952 0.000 0.004 0.020
#> SRR772553 5 0.1907 0.8980 0.000 0.044 0.000 0.028 0.928
#> SRR772554 2 0.3269 0.8435 0.000 0.848 0.000 0.096 0.056
#> SRR772555 2 0.3714 0.8231 0.000 0.812 0.000 0.132 0.056
#> SRR772556 1 0.2127 0.8021 0.892 0.108 0.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0162 0.8231 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.4437 0.6301 0.664 0.316 0.000 0.000 0.020
#> SRR772559 1 0.3630 0.7387 0.780 0.204 0.000 0.000 0.016
#> SRR772560 2 0.3059 0.8101 0.108 0.860 0.000 0.004 0.028
#> SRR772561 3 0.3792 0.5930 0.008 0.180 0.792 0.000 0.020
#> SRR772562 2 0.2233 0.8520 0.000 0.904 0.000 0.080 0.016
#> SRR772563 2 0.3284 0.8184 0.000 0.828 0.000 0.148 0.024
#> SRR772564 1 0.3474 0.7426 0.796 0.192 0.004 0.000 0.008
#> SRR772565 1 0.2289 0.8108 0.904 0.080 0.004 0.000 0.012
#> SRR772566 1 0.1168 0.8041 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR772567 1 0.1357 0.7942 0.948 0.000 0.048 0.000 0.004
#> SRR772568 2 0.1341 0.8538 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR772569 2 0.2679 0.8587 0.004 0.892 0.000 0.048 0.056
#> SRR772570 1 0.4437 0.6155 0.664 0.316 0.000 0.000 0.020
#> SRR772571 2 0.4576 0.3769 0.376 0.608 0.000 0.000 0.016
#> SRR772572 2 0.4723 0.0548 0.448 0.536 0.000 0.000 0.016
#> SRR772573 2 0.4726 0.3134 0.376 0.604 0.000 0.004 0.016
#> SRR772574 1 0.4127 0.6156 0.680 0.312 0.000 0.000 0.008
#> SRR772575 1 0.4339 0.5766 0.652 0.336 0.000 0.000 0.012
#> SRR772576 2 0.0912 0.8512 0.016 0.972 0.000 0.000 0.012
#> SRR772577 2 0.0566 0.8491 0.004 0.984 0.000 0.000 0.012
#> SRR772578 4 0.3152 0.7560 0.000 0.136 0.000 0.840 0.024
#> SRR772579 4 0.0992 0.8806 0.000 0.024 0.000 0.968 0.008
#> SRR772580 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772581 2 0.2171 0.8440 0.064 0.912 0.000 0.000 0.024
#> SRR772582 2 0.1914 0.8519 0.016 0.924 0.000 0.000 0.060
#> SRR772583 2 0.2206 0.8404 0.068 0.912 0.000 0.004 0.016
#> SRR772584 2 0.1721 0.8570 0.020 0.944 0.000 0.020 0.016
#> SRR772585 2 0.2005 0.8571 0.004 0.924 0.000 0.056 0.016
#> SRR772586 5 0.1901 0.9252 0.024 0.040 0.004 0.000 0.932
#> SRR772587 1 0.3961 0.6889 0.736 0.248 0.000 0.000 0.016
#> SRR772588 4 0.5226 0.2621 0.000 0.376 0.000 0.572 0.052
#> SRR772589 4 0.4989 0.4801 0.000 0.296 0.000 0.648 0.056
#> SRR772590 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.8202 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0162 0.8197 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772593 5 0.1869 0.9277 0.016 0.036 0.012 0.000 0.936
#> SRR772594 4 0.2974 0.7941 0.000 0.080 0.000 0.868 0.052
#> SRR772595 4 0.4370 0.6239 0.000 0.200 0.000 0.744 0.056
#> SRR772596 5 0.2110 0.8890 0.016 0.000 0.072 0.000 0.912
#> SRR772597 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0404 0.8259 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0671 0.8250 0.980 0.016 0.004 0.000 0.000
#> SRR772600 2 0.2731 0.8432 0.004 0.876 0.000 0.104 0.016
#> SRR772601 2 0.3985 0.7756 0.004 0.772 0.000 0.196 0.028
#> SRR772602 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.2069 0.8614 0.012 0.924 0.000 0.052 0.012
#> SRR772604 2 0.3494 0.8407 0.004 0.840 0.000 0.096 0.060
#> SRR772605 2 0.2436 0.8581 0.020 0.912 0.000 0.036 0.032
#> SRR772606 1 0.0324 0.8235 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR772607 1 0.0404 0.8255 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.1857 0.8564 0.004 0.928 0.000 0.060 0.008
#> SRR772609 2 0.1988 0.8562 0.008 0.928 0.000 0.048 0.016
#> SRR772610 2 0.2727 0.8389 0.000 0.868 0.000 0.116 0.016
#> SRR772611 2 0.2110 0.8542 0.000 0.912 0.000 0.072 0.016
#> SRR772612 4 0.1403 0.8735 0.000 0.024 0.000 0.952 0.024
#> SRR772613 4 0.2793 0.7920 0.000 0.088 0.000 0.876 0.036
#> SRR772614 1 0.0290 0.8216 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772615 1 0.0162 0.8232 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4774 0.3721 0.556 0.424 0.000 0.000 0.020
#> SRR772617 4 0.1648 0.8658 0.000 0.020 0.000 0.940 0.040
#> SRR772618 4 0.1918 0.8557 0.000 0.036 0.000 0.928 0.036
#> SRR772619 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 2 0.2726 0.8429 0.064 0.884 0.000 0.000 0.052
#> SRR772622 2 0.2654 0.8435 0.064 0.888 0.000 0.000 0.048
#> SRR772623 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772624 5 0.1970 0.8958 0.060 0.012 0.004 0.000 0.924
#> SRR772625 4 0.0451 0.8834 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772626 2 0.2249 0.8510 0.000 0.896 0.000 0.008 0.096
#> SRR772627 2 0.3197 0.8457 0.008 0.864 0.000 0.052 0.076
#> SRR772628 1 0.1082 0.8242 0.964 0.028 0.000 0.000 0.008
#> SRR772629 1 0.0771 0.8272 0.976 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR772630 2 0.4059 0.7558 0.172 0.776 0.000 0.000 0.052
#> SRR772631 5 0.2124 0.9082 0.044 0.012 0.020 0.000 0.924
#> SRR772632 4 0.4494 0.2935 0.000 0.380 0.000 0.608 0.012
#> SRR772633 4 0.2110 0.8296 0.000 0.072 0.000 0.912 0.016
#> SRR772634 2 0.3579 0.6921 0.240 0.756 0.000 0.000 0.004
#> SRR772635 2 0.3562 0.7436 0.196 0.788 0.000 0.000 0.016
#> SRR772636 5 0.4090 0.6612 0.000 0.016 0.000 0.268 0.716
#> SRR772637 1 0.0671 0.8241 0.980 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR772638 1 0.0451 0.8226 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR772639 2 0.3075 0.8475 0.000 0.860 0.000 0.092 0.048
#> SRR772640 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 2 0.1117 0.8516 0.016 0.964 0.000 0.000 0.020
#> SRR772643 2 0.0579 0.8540 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772644 1 0.4709 0.5304 0.612 0.364 0.000 0.000 0.024
#> SRR772645 1 0.4747 0.5913 0.636 0.332 0.000 0.000 0.032
#> SRR772646 2 0.3888 0.8086 0.000 0.796 0.000 0.148 0.056
#> SRR772647 2 0.1992 0.8625 0.000 0.924 0.000 0.044 0.032
#> SRR772648 2 0.2103 0.8539 0.020 0.920 0.000 0.004 0.056
#> SRR772649 2 0.2095 0.8537 0.008 0.920 0.000 0.012 0.060
#> SRR772650 2 0.1872 0.8425 0.052 0.928 0.000 0.000 0.020
#> SRR772651 2 0.4054 0.6472 0.248 0.732 0.000 0.000 0.020
#> SRR772652 1 0.4182 0.3861 0.600 0.400 0.000 0.000 0.000
#> SRR772653 1 0.3774 0.6242 0.704 0.296 0.000 0.000 0.000
#> SRR772654 2 0.2969 0.8082 0.128 0.852 0.000 0.000 0.020
#> SRR772655 2 0.3013 0.7847 0.160 0.832 0.000 0.000 0.008
#> SRR772656 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0162 0.9636 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 4 0.0162 0.8911 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772660 2 0.2079 0.8560 0.000 0.916 0.000 0.064 0.020
#> SRR772661 5 0.1502 0.9229 0.000 0.056 0.004 0.000 0.940
#> SRR772662 2 0.2270 0.8295 0.076 0.904 0.000 0.000 0.020
#> SRR772663 2 0.3141 0.7734 0.152 0.832 0.000 0.000 0.016
#> SRR772664 2 0.4333 0.7512 0.000 0.740 0.000 0.212 0.048
#> SRR772665 2 0.4136 0.7726 0.000 0.764 0.000 0.188 0.048
#> SRR772666 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.2645 0.8216 0.000 0.068 0.000 0.888 0.044
#> SRR772668 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772669 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772670 2 0.2677 0.8463 0.064 0.896 0.000 0.020 0.020
#> SRR772671 2 0.3191 0.8279 0.092 0.864 0.000 0.024 0.020
#> SRR772672 2 0.3216 0.8394 0.000 0.848 0.000 0.108 0.044
#> SRR772673 2 0.2293 0.8500 0.000 0.900 0.000 0.084 0.016
#> SRR772674 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772675 5 0.1571 0.9166 0.000 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR772676 2 0.2797 0.8456 0.060 0.880 0.000 0.000 0.060
#> SRR772677 2 0.2438 0.8506 0.040 0.900 0.000 0.000 0.060
#> SRR772678 5 0.1571 0.9166 0.000 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR772679 2 0.3011 0.7805 0.140 0.844 0.000 0.000 0.016
#> SRR772680 2 0.4620 0.2401 0.392 0.592 0.000 0.000 0.016
#> SRR772681 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772682 2 0.3255 0.8423 0.000 0.848 0.000 0.100 0.052
#> SRR772683 2 0.3409 0.8394 0.000 0.836 0.000 0.112 0.052
#> SRR772685 2 0.1310 0.8548 0.020 0.956 0.000 0.000 0.024
#> SRR772686 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.5440 0.5198 0.184 0.000 0.660 0.000 0.156
#> SRR772688 4 0.0290 0.8908 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772689 4 0.0000 0.8918 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.9694 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772691 5 0.2423 0.8848 0.000 0.024 0.000 0.080 0.896
#> SRR772692 2 0.2006 0.8453 0.072 0.916 0.000 0.000 0.012
#> SRR772693 2 0.1893 0.8509 0.048 0.928 0.000 0.000 0.024
#> SRR772694 2 0.1377 0.8566 0.004 0.956 0.000 0.020 0.020
#> SRR772695 2 0.1106 0.8536 0.012 0.964 0.000 0.000 0.024
#> SRR772696 2 0.1970 0.8534 0.012 0.924 0.000 0.004 0.060
#> SRR772697 2 0.2095 0.8543 0.008 0.920 0.000 0.012 0.060
#> SRR772698 5 0.2170 0.9262 0.020 0.036 0.020 0.000 0.924
#> SRR772699 1 0.3487 0.7441 0.780 0.212 0.000 0.000 0.008
#> SRR772700 1 0.3783 0.7087 0.740 0.252 0.000 0.000 0.008
#> SRR772701 1 0.2852 0.7763 0.828 0.172 0.000 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0609 0.8260 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.2402 0.80297 0.868 0.012 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR772342 1 0.2581 0.79971 0.856 0.016 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR772343 6 0.2412 0.41783 0.092 0.028 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR772344 2 0.1391 0.38527 0.000 0.944 0.000 0.040 0.000 0.016
#> SRR772345 2 0.2445 0.35890 0.000 0.872 0.000 0.108 0.000 0.020
#> SRR772346 6 0.5319 0.27033 0.220 0.184 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR772347 1 0.5002 0.36553 0.516 0.072 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR772348 2 0.4403 -0.02508 0.000 0.564 0.000 0.028 0.000 0.408
#> SRR772349 2 0.4237 -0.02991 0.000 0.584 0.000 0.020 0.000 0.396
#> SRR772350 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772351 2 0.3337 0.31762 0.000 0.736 0.000 0.004 0.000 0.260
#> SRR772352 2 0.3629 0.37961 0.000 0.712 0.000 0.012 0.000 0.276
#> SRR772353 6 0.3547 0.22125 0.004 0.300 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR772354 6 0.3859 0.34856 0.020 0.288 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR772355 2 0.4099 0.37173 0.000 0.612 0.000 0.016 0.000 0.372
#> SRR772356 2 0.2801 0.38285 0.000 0.860 0.000 0.072 0.000 0.068
#> SRR772357 1 0.3592 0.71323 0.740 0.020 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR772358 6 0.5189 -0.18611 0.444 0.088 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR772359 6 0.5479 0.02113 0.132 0.368 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR772360 2 0.5498 0.13998 0.128 0.464 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR772361 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772362 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 1 0.6087 -0.19689 0.372 0.276 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR772365 6 0.5795 0.00485 0.184 0.364 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR772366 5 0.0146 0.97701 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772368 6 0.3942 0.22636 0.000 0.368 0.000 0.004 0.004 0.624
#> SRR772369 6 0.3866 -0.18666 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR772370 6 0.4181 -0.14428 0.012 0.476 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR772371 2 0.6059 -0.02912 0.280 0.408 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR772372 2 0.5839 0.01959 0.188 0.408 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR772373 2 0.3647 0.28230 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR772374 2 0.3499 0.38893 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR772375 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772376 2 0.3876 0.32376 0.000 0.772 0.000 0.120 0.000 0.108
#> SRR772377 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772378 6 0.2309 0.41162 0.028 0.084 0.000 0.000 0.000 0.888
#> SRR772379 6 0.3390 0.31644 0.000 0.296 0.000 0.000 0.000 0.704
#> SRR772380 6 0.2647 0.41309 0.044 0.088 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR772381 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772382 1 0.2950 0.77129 0.828 0.024 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR772383 1 0.1411 0.82643 0.936 0.004 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR772384 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772385 5 0.0922 0.95718 0.000 0.004 0.000 0.004 0.968 0.024
#> SRR772386 2 0.3868 0.23551 0.000 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR772387 2 0.3684 0.36312 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR772388 1 0.0806 0.82701 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR772389 1 0.0713 0.82538 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772390 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0260 0.82464 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772392 1 0.3134 0.74774 0.808 0.024 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR772393 6 0.3446 0.12559 0.000 0.308 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR772394 6 0.3852 0.01613 0.004 0.384 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR772395 2 0.3999 -0.13870 0.000 0.500 0.000 0.004 0.000 0.496
#> SRR772396 1 0.0260 0.82335 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772397 1 0.0603 0.82631 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772398 1 0.5229 0.40673 0.604 0.240 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR772399 2 0.6126 -0.07151 0.312 0.344 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR772400 1 0.0790 0.82719 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772401 1 0.0603 0.82641 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772402 2 0.3699 0.26770 0.000 0.660 0.000 0.004 0.000 0.336
#> SRR772403 2 0.3460 0.41748 0.000 0.760 0.000 0.020 0.000 0.220
#> SRR772404 6 0.4179 0.13961 0.000 0.472 0.000 0.012 0.000 0.516
#> SRR772405 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.3547 0.38554 0.000 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR772407 2 0.3830 0.36659 0.000 0.620 0.000 0.004 0.000 0.376
#> SRR772408 4 0.1556 0.84792 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.1267 0.85758 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR772410 6 0.3445 0.27829 0.012 0.244 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR772411 6 0.4032 -0.06816 0.008 0.420 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR772412 1 0.1387 0.81438 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR772413 1 0.0363 0.82470 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772414 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772415 6 0.3854 0.17898 0.000 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR772416 6 0.3782 0.23960 0.004 0.360 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR772417 6 0.4728 0.28113 0.092 0.256 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR772418 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772419 4 0.4696 0.56680 0.000 0.356 0.000 0.588 0.000 0.056
#> SRR772420 4 0.3607 0.63739 0.000 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR772421 2 0.4377 0.28231 0.024 0.540 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR772422 2 0.3789 0.32703 0.000 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR772423 2 0.5534 0.08458 0.000 0.556 0.000 0.196 0.000 0.248
#> SRR772424 4 0.6017 0.15281 0.000 0.316 0.000 0.424 0.000 0.260
#> SRR772425 2 0.4453 0.24702 0.000 0.528 0.000 0.028 0.000 0.444
#> SRR772426 2 0.2799 0.38490 0.000 0.860 0.000 0.064 0.000 0.076
#> SRR772427 2 0.2179 0.37515 0.000 0.900 0.000 0.064 0.000 0.036
#> SRR772428 1 0.0405 0.82540 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR772429 1 0.2740 0.76909 0.852 0.028 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR772430 6 0.3593 0.38990 0.028 0.136 0.000 0.000 0.028 0.808
#> SRR772431 2 0.3398 0.18581 0.000 0.740 0.000 0.008 0.000 0.252
#> SRR772432 2 0.3023 0.28372 0.000 0.784 0.000 0.004 0.000 0.212
#> SRR772433 1 0.0551 0.82277 0.984 0.000 0.008 0.000 0.004 0.004
#> SRR772434 1 0.0291 0.82239 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR772435 2 0.5635 0.14305 0.148 0.432 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR772436 2 0.5724 0.12824 0.164 0.424 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR772437 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772438 1 0.0603 0.82574 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR772439 1 0.0363 0.82569 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772440 2 0.4032 0.31745 0.008 0.572 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR772441 2 0.3684 0.36236 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR772442 2 0.4408 0.09195 0.000 0.636 0.000 0.044 0.000 0.320
#> SRR772443 2 0.3634 0.26282 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR772444 1 0.0547 0.82697 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772445 1 0.1812 0.81860 0.912 0.008 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772446 1 0.0458 0.82514 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772447 1 0.1524 0.82412 0.932 0.008 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR772448 2 0.3864 0.22700 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR772449 2 0.3706 0.36309 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR772450 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.1075 0.82407 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR772453 1 0.2234 0.80318 0.872 0.004 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR772454 1 0.6094 -0.26032 0.364 0.280 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR772455 6 0.3017 0.41039 0.108 0.052 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR772456 4 0.1075 0.86033 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0865 0.86428 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.1285 0.82702 0.944 0.004 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772459 1 0.0363 0.82562 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772460 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772462 2 0.4184 -0.13472 0.000 0.500 0.000 0.012 0.000 0.488
#> SRR772463 2 0.3955 -0.07092 0.000 0.560 0.000 0.004 0.000 0.436
#> SRR772464 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772465 6 0.3915 0.19977 0.004 0.412 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR772466 2 0.3774 0.26145 0.008 0.664 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR772467 4 0.2340 0.80414 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR772468 4 0.2092 0.82015 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.4229 0.60573 0.668 0.040 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR772470 1 0.4085 0.71691 0.736 0.072 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR772471 6 0.5288 0.05058 0.404 0.088 0.000 0.000 0.004 0.504
#> SRR772472 1 0.4468 0.39777 0.560 0.032 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR772473 2 0.3765 0.31968 0.000 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR772474 2 0.3215 0.39244 0.000 0.756 0.000 0.004 0.000 0.240
#> SRR772475 5 0.1346 0.94370 0.000 0.016 0.000 0.008 0.952 0.024
#> SRR772476 4 0.0146 0.86711 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0146 0.82307 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772479 1 0.0000 0.82166 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 6 0.4750 0.18472 0.052 0.404 0.000 0.000 0.000 0.544
#> SRR772481 6 0.3512 0.33240 0.008 0.272 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR772482 6 0.6034 0.10521 0.368 0.248 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR772483 6 0.6096 0.19320 0.320 0.216 0.000 0.000 0.008 0.456
#> SRR772484 2 0.3198 0.22768 0.000 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR772485 2 0.2996 0.25255 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR772486 1 0.2973 0.80410 0.860 0.040 0.000 0.000 0.016 0.084
#> SRR772487 1 0.5816 0.56480 0.596 0.080 0.000 0.000 0.068 0.256
#> SRR772488 2 0.4312 0.07522 0.028 0.604 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR772489 2 0.4116 0.17673 0.012 0.572 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR772490 1 0.3172 0.76969 0.816 0.036 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR772491 1 0.1082 0.82695 0.956 0.004 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772492 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 6 0.2883 0.30380 0.000 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR772497 6 0.3737 0.20857 0.000 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR772498 2 0.4749 0.35718 0.004 0.588 0.000 0.008 0.032 0.368
#> SRR772499 2 0.4560 0.35482 0.000 0.592 0.000 0.008 0.028 0.372
#> SRR772500 2 0.3352 0.29456 0.000 0.816 0.000 0.112 0.000 0.072
#> SRR772501 2 0.2491 0.33188 0.000 0.868 0.000 0.112 0.000 0.020
#> SRR772502 2 0.5946 0.04139 0.228 0.436 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR772503 1 0.5547 0.31974 0.528 0.160 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR772504 2 0.2282 0.34180 0.000 0.888 0.000 0.024 0.000 0.088
#> SRR772505 2 0.1584 0.40481 0.000 0.928 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR772506 4 0.3563 0.64012 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR772507 4 0.3446 0.67024 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000
#> SRR772508 6 0.4593 0.12245 0.000 0.472 0.000 0.036 0.000 0.492
#> SRR772509 5 0.0260 0.97208 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772510 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772511 6 0.3706 -0.00859 0.000 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR772512 2 0.5791 0.26624 0.004 0.508 0.180 0.000 0.000 0.308
#> SRR772513 6 0.3857 0.15790 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR772514 6 0.4096 0.13785 0.000 0.484 0.000 0.008 0.000 0.508
#> SRR772515 2 0.0547 0.39412 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772516 2 0.2378 0.40982 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR772517 2 0.3266 0.19620 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR772518 6 0.3737 0.22499 0.000 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR772519 2 0.3390 0.13802 0.000 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR772520 2 0.3575 0.13097 0.000 0.708 0.000 0.008 0.000 0.284
#> SRR772521 2 0.4972 0.23394 0.072 0.536 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR772522 2 0.4229 0.28482 0.016 0.548 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR772523 2 0.2165 0.32926 0.000 0.884 0.000 0.008 0.000 0.108
#> SRR772524 2 0.1349 0.39607 0.000 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR772525 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.1075 0.85960 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR772527 4 0.1663 0.84287 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR772528 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.4328 0.66112 0.716 0.092 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR772530 1 0.3660 0.74014 0.780 0.060 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR772531 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772532 2 0.1176 0.38701 0.000 0.956 0.000 0.020 0.000 0.024
#> SRR772533 2 0.3023 0.41664 0.000 0.784 0.000 0.004 0.000 0.212
#> SRR772534 6 0.5438 0.28134 0.260 0.172 0.000 0.000 0.000 0.568
#> SRR772535 2 0.3993 0.22883 0.000 0.520 0.000 0.004 0.000 0.476
#> SRR772536 2 0.2703 0.40987 0.000 0.824 0.000 0.004 0.000 0.172
#> SRR772537 4 0.2178 0.80708 0.000 0.132 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR772538 4 0.2854 0.77603 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR772539 1 0.2520 0.79519 0.844 0.004 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR772540 1 0.4110 0.57649 0.608 0.016 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR772541 6 0.3737 0.19907 0.000 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR772542 1 0.4171 0.74266 0.740 0.028 0.000 0.000 0.028 0.204
#> SRR772543 1 0.1204 0.82647 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR772544 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772545 1 0.5209 0.40336 0.612 0.168 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR772546 1 0.4330 0.58894 0.696 0.068 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR772547 6 0.3130 0.40407 0.144 0.028 0.000 0.000 0.004 0.824
#> SRR772548 1 0.4532 0.32959 0.508 0.024 0.000 0.000 0.004 0.464
#> SRR772549 1 0.0937 0.82556 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772550 1 0.1267 0.82276 0.940 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR772551 6 0.5133 0.20525 0.116 0.292 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR772552 6 0.3734 0.27758 0.020 0.264 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR772553 5 0.0914 0.94837 0.000 0.016 0.000 0.000 0.968 0.016
#> SRR772554 2 0.1398 0.38673 0.000 0.940 0.000 0.008 0.000 0.052
#> SRR772555 2 0.1657 0.38962 0.000 0.928 0.000 0.016 0.000 0.056
#> SRR772556 1 0.2121 0.79594 0.892 0.012 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR772557 1 0.0458 0.82622 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772558 6 0.5069 -0.16607 0.440 0.076 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR772559 1 0.4116 0.46783 0.572 0.012 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR772560 6 0.2389 0.41531 0.052 0.060 0.000 0.000 0.000 0.888
#> SRR772561 3 0.3558 0.65608 0.000 0.184 0.780 0.000 0.004 0.032
#> SRR772562 2 0.3244 0.18229 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR772563 2 0.4062 -0.09496 0.000 0.552 0.000 0.008 0.000 0.440
#> SRR772564 1 0.3806 0.70544 0.780 0.032 0.004 0.000 0.012 0.172
#> SRR772565 1 0.2200 0.80492 0.900 0.004 0.004 0.000 0.012 0.080
#> SRR772566 1 0.0806 0.81748 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008 0.000
#> SRR772567 1 0.1010 0.80872 0.960 0.000 0.036 0.000 0.004 0.000
#> SRR772568 2 0.3804 0.33395 0.000 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR772569 2 0.3337 0.39675 0.000 0.736 0.000 0.004 0.000 0.260
#> SRR772570 1 0.5059 0.32969 0.528 0.080 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR772571 6 0.5764 0.25897 0.280 0.216 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR772572 6 0.5390 0.30750 0.340 0.128 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR772573 6 0.5296 0.36965 0.260 0.152 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR772574 1 0.4641 0.58723 0.664 0.088 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR772575 1 0.5025 0.49640 0.608 0.108 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR772576 2 0.3999 0.18680 0.004 0.500 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR772577 6 0.3823 -0.08930 0.000 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR772578 4 0.2509 0.79538 0.000 0.088 0.000 0.876 0.000 0.036
#> SRR772579 4 0.0547 0.86291 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772581 6 0.3586 0.25258 0.012 0.268 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR772582 2 0.3747 0.34706 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR772583 6 0.3855 0.24365 0.024 0.272 0.000 0.000 0.000 0.704
#> SRR772584 6 0.3804 0.29414 0.008 0.336 0.000 0.000 0.000 0.656
#> SRR772585 6 0.3151 0.31540 0.000 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748
#> SRR772586 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.4675 0.45202 0.580 0.052 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR772588 2 0.5047 0.12112 0.000 0.628 0.000 0.136 0.000 0.236
#> SRR772589 2 0.5419 0.09185 0.000 0.580 0.000 0.200 0.000 0.220
#> SRR772590 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772591 1 0.0000 0.82166 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0146 0.82147 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR772593 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772594 4 0.3756 0.67210 0.000 0.268 0.000 0.712 0.000 0.020
#> SRR772595 4 0.4433 0.55628 0.000 0.344 0.000 0.616 0.000 0.040
#> SRR772596 5 0.0363 0.97141 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0713 0.82773 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772599 1 0.0603 0.82529 0.980 0.000 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR772600 2 0.3944 -0.05407 0.000 0.568 0.000 0.004 0.000 0.428
#> SRR772601 6 0.4751 0.12495 0.000 0.452 0.000 0.048 0.000 0.500
#> SRR772602 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772603 6 0.3782 0.10099 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR772604 2 0.3636 0.14775 0.000 0.676 0.000 0.004 0.000 0.320
#> SRR772605 6 0.1858 0.39794 0.004 0.092 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR772606 1 0.1387 0.82438 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR772607 1 0.0458 0.82662 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772608 2 0.3607 0.05819 0.000 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR772609 2 0.3867 -0.15380 0.000 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR772610 6 0.3986 0.15298 0.000 0.464 0.000 0.004 0.000 0.532
#> SRR772611 6 0.3864 0.14357 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR772612 4 0.1812 0.83579 0.000 0.080 0.000 0.912 0.000 0.008
#> SRR772613 4 0.3198 0.72475 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR772614 1 0.1010 0.82658 0.960 0.004 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772615 1 0.0260 0.82513 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772616 6 0.3674 0.34272 0.268 0.016 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR772617 4 0.2932 0.78964 0.000 0.164 0.000 0.820 0.000 0.016
#> SRR772618 4 0.5081 0.59078 0.000 0.256 0.000 0.616 0.000 0.128
#> SRR772619 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772620 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772621 2 0.4219 0.33275 0.020 0.592 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR772622 2 0.4333 0.32955 0.028 0.596 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR772623 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772624 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772625 4 0.0291 0.86610 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772626 2 0.4699 0.35176 0.000 0.580 0.000 0.008 0.036 0.376
#> SRR772627 2 0.4311 0.37183 0.000 0.616 0.000 0.012 0.012 0.360
#> SRR772628 1 0.2489 0.80177 0.860 0.012 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR772629 1 0.2019 0.81747 0.900 0.012 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772630 6 0.4108 0.37266 0.092 0.164 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR772631 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.5656 0.14563 0.000 0.440 0.000 0.408 0.000 0.152
#> SRR772633 4 0.3351 0.69789 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000 0.000
#> SRR772634 2 0.5865 0.09898 0.196 0.424 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR772635 2 0.5728 0.16148 0.168 0.452 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR772636 5 0.3853 0.75087 0.000 0.052 0.000 0.156 0.780 0.012
#> SRR772637 1 0.1663 0.81320 0.912 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772638 1 0.0858 0.82613 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR772639 2 0.3620 0.34418 0.000 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR772640 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 6 0.3993 -0.15305 0.004 0.476 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR772643 6 0.3857 -0.11707 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR772644 6 0.4193 0.14907 0.352 0.024 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR772645 6 0.4370 -0.06985 0.428 0.012 0.000 0.000 0.008 0.552
#> SRR772646 2 0.3582 0.41099 0.000 0.732 0.000 0.016 0.000 0.252
#> SRR772647 2 0.3841 0.30180 0.000 0.616 0.000 0.004 0.000 0.380
#> SRR772648 2 0.3830 0.35594 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR772649 2 0.3819 0.36142 0.000 0.624 0.000 0.004 0.000 0.372
#> SRR772650 6 0.3725 0.14614 0.008 0.316 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR772651 6 0.5480 0.19031 0.184 0.252 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR772652 1 0.5366 0.32703 0.564 0.144 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR772653 1 0.4134 0.59505 0.708 0.052 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR772654 2 0.5254 0.19993 0.100 0.508 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR772655 2 0.5474 0.19592 0.128 0.488 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR772656 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772657 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772658 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772659 4 0.0260 0.86638 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772660 6 0.3482 0.27873 0.000 0.316 0.000 0.000 0.000 0.684
#> SRR772661 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772662 6 0.4482 0.07922 0.040 0.360 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR772663 6 0.4414 0.28079 0.064 0.260 0.000 0.000 0.000 0.676
#> SRR772664 2 0.3920 0.22697 0.000 0.736 0.000 0.048 0.000 0.216
#> SRR772665 2 0.3835 0.39703 0.000 0.756 0.000 0.056 0.000 0.188
#> SRR772666 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772667 2 0.5943 -0.06985 0.000 0.456 0.000 0.292 0.000 0.252
#> SRR772668 4 0.0000 0.86698 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772669 4 0.0291 0.86660 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR772670 6 0.4731 0.17593 0.048 0.428 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR772671 6 0.3982 0.37749 0.060 0.200 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR772672 2 0.3782 -0.03138 0.000 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR772673 6 0.3868 0.12961 0.000 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR772674 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772675 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772676 2 0.4319 0.35187 0.032 0.620 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR772677 2 0.4064 0.35753 0.016 0.624 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR772678 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772679 6 0.3516 0.34394 0.048 0.164 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR772680 6 0.3421 0.37828 0.256 0.008 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR772681 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772682 2 0.3907 0.31667 0.000 0.588 0.000 0.004 0.000 0.408
#> SRR772683 2 0.3795 0.18617 0.000 0.632 0.000 0.004 0.000 0.364
#> SRR772685 2 0.3833 0.28263 0.000 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444
#> SRR772686 3 0.0000 0.97138 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.4996 0.53452 0.200 0.000 0.644 0.000 0.156 0.000
#> SRR772688 4 0.2048 0.82678 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR772689 4 0.0260 0.86730 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0146 0.97114 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772691 5 0.0777 0.95716 0.000 0.004 0.000 0.000 0.972 0.024
#> SRR772692 2 0.4757 0.19864 0.048 0.480 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR772693 6 0.4319 -0.03159 0.024 0.400 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR772694 6 0.3288 0.29568 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR772695 6 0.3076 0.27065 0.000 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR772696 2 0.3647 0.36605 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR772697 2 0.3634 0.37319 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR772698 5 0.0000 0.97935 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.4105 0.61518 0.632 0.020 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR772700 1 0.4594 0.57242 0.608 0.052 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR772701 1 0.3352 0.73928 0.792 0.032 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR772702 1 0.0937 0.82816 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.768 0.785 0.921 0.3295 0.651 0.651
#> 3 3 0.503 0.807 0.872 0.4269 0.904 0.854
#> 4 4 0.333 0.685 0.738 0.3352 0.724 0.524
#> 5 5 0.333 0.639 0.711 0.0748 0.898 0.711
#> 6 6 0.412 0.495 0.597 0.1014 0.837 0.512
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772342 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772343 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772346 2 1.0000 -0.29341 0.496 0.504
#> SRR772347 2 1.0000 -0.29385 0.496 0.504
#> SRR772348 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0938 0.92905 0.012 0.988
#> SRR772350 1 0.0376 0.77808 0.996 0.004
#> SRR772351 2 0.3431 0.86913 0.064 0.936
#> SRR772352 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772353 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772354 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772355 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772357 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772358 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772359 2 0.3274 0.87433 0.060 0.940
#> SRR772360 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772361 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772364 2 1.0000 -0.30671 0.500 0.500
#> SRR772365 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772366 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772370 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772371 1 0.9988 0.33650 0.520 0.480
#> SRR772372 1 0.9993 0.32602 0.516 0.484
#> SRR772373 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772378 2 0.0376 0.93635 0.004 0.996
#> SRR772379 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772380 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772381 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772382 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772383 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772384 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772385 1 0.0672 0.77535 0.992 0.008
#> SRR772386 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772388 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772389 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772391 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772392 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772393 2 0.9977 -0.20747 0.472 0.528
#> SRR772394 2 0.9866 -0.04834 0.432 0.568
#> SRR772395 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772396 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772397 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772398 1 1.0000 0.29523 0.500 0.500
#> SRR772399 2 0.9732 0.07382 0.404 0.596
#> SRR772400 2 0.0938 0.92918 0.012 0.988
#> SRR772401 2 0.0376 0.93633 0.004 0.996
#> SRR772402 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772403 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772404 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772411 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772412 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772413 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772417 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772418 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.1184 0.92473 0.016 0.984
#> SRR772422 2 0.0938 0.92892 0.012 0.988
#> SRR772423 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772424 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772425 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772428 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772429 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772430 2 0.0376 0.93600 0.004 0.996
#> SRR772431 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772432 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772433 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772434 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772435 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772436 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772437 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772438 2 0.9732 0.07337 0.404 0.596
#> SRR772439 2 0.9686 0.10479 0.396 0.604
#> SRR772440 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772442 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772443 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772444 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772445 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772446 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772447 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772448 2 0.0672 0.93275 0.008 0.992
#> SRR772449 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772452 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772453 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772454 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772455 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772458 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772459 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.3733 0.85796 0.072 0.928
#> SRR772462 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772466 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772469 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772470 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772471 2 0.0938 0.92881 0.012 0.988
#> SRR772472 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772473 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772474 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772475 1 0.1184 0.77318 0.984 0.016
#> SRR772476 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772478 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772479 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772480 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772481 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772482 2 0.0938 0.92927 0.012 0.988
#> SRR772483 2 0.0938 0.92927 0.012 0.988
#> SRR772484 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772485 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772486 2 0.9896 -0.07439 0.440 0.560
#> SRR772487 2 0.9944 -0.13820 0.456 0.544
#> SRR772488 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772489 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772490 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772491 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772492 2 0.9815 0.00329 0.420 0.580
#> SRR772493 2 0.9866 -0.04936 0.432 0.568
#> SRR772494 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772498 2 0.9988 -0.21327 0.480 0.520
#> SRR772499 2 0.9993 -0.22906 0.484 0.516
#> SRR772500 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772502 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772503 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772504 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772510 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772512 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772513 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.1184 0.92475 0.016 0.984
#> SRR772522 2 0.1414 0.92096 0.020 0.980
#> SRR772523 2 0.6048 0.74751 0.148 0.852
#> SRR772524 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0672 0.93281 0.008 0.992
#> SRR772527 2 0.0376 0.93624 0.004 0.996
#> SRR772528 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772529 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772530 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772534 2 0.0672 0.93284 0.008 0.992
#> SRR772535 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772537 1 1.0000 0.29553 0.500 0.500
#> SRR772538 1 1.0000 0.29553 0.500 0.500
#> SRR772539 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772540 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772541 2 0.0376 0.93624 0.004 0.996
#> SRR772542 2 0.9000 0.38542 0.316 0.684
#> SRR772543 2 0.6438 0.72110 0.164 0.836
#> SRR772544 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772545 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772546 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772547 2 0.0376 0.93634 0.004 0.996
#> SRR772548 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772549 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772550 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772551 2 0.7376 0.63687 0.208 0.792
#> SRR772552 2 0.3584 0.86306 0.068 0.932
#> SRR772553 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772554 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772556 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772557 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772558 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772559 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772560 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772561 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772564 2 0.9286 0.29353 0.344 0.656
#> SRR772565 2 0.8443 0.49427 0.272 0.728
#> SRR772566 2 0.0376 0.93636 0.004 0.996
#> SRR772567 2 0.0672 0.93284 0.008 0.992
#> SRR772568 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772570 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772571 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772572 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772573 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772574 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772575 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772576 2 0.0376 0.93622 0.004 0.996
#> SRR772577 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772578 2 0.9522 0.19463 0.372 0.628
#> SRR772579 2 0.9661 0.12845 0.392 0.608
#> SRR772580 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772581 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772582 2 0.9998 -0.27992 0.492 0.508
#> SRR772583 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772584 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772585 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0938 0.77483 0.988 0.012
#> SRR772587 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772588 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772591 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772592 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.9977 -0.20877 0.472 0.528
#> SRR772595 2 0.9815 0.00348 0.420 0.580
#> SRR772596 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772598 2 0.0672 0.93276 0.008 0.992
#> SRR772599 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772600 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772601 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772602 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772603 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772604 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772605 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772606 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772607 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772608 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772612 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772613 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772614 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772615 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772616 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772617 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772618 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772619 2 0.9993 -0.25187 0.484 0.516
#> SRR772620 2 0.9970 -0.19366 0.468 0.532
#> SRR772621 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772622 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772623 1 0.0672 0.77655 0.992 0.008
#> SRR772624 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772625 1 0.4690 0.72862 0.900 0.100
#> SRR772626 2 1.0000 -0.27787 0.496 0.504
#> SRR772627 2 0.9998 -0.26708 0.492 0.508
#> SRR772628 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772629 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772630 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772631 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0672 0.93280 0.008 0.992
#> SRR772633 2 0.0376 0.93635 0.004 0.996
#> SRR772634 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772635 2 0.1633 0.91637 0.024 0.976
#> SRR772636 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772637 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772638 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772643 2 0.0938 0.92886 0.012 0.988
#> SRR772644 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772645 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772646 2 0.1184 0.92483 0.016 0.984
#> SRR772647 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772650 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772651 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772652 2 0.0672 0.93274 0.008 0.992
#> SRR772653 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772654 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772655 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772656 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772658 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772659 1 1.0000 0.30826 0.504 0.496
#> SRR772660 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772662 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772663 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772664 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.9866 -0.04945 0.432 0.568
#> SRR772668 1 0.9977 0.35050 0.528 0.472
#> SRR772669 1 0.9977 0.35050 0.528 0.472
#> SRR772670 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772671 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772672 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772676 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772677 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772678 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772679 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772680 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772681 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0938 0.92898 0.012 0.988
#> SRR772690 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772691 1 0.0376 0.77749 0.996 0.004
#> SRR772692 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772693 2 0.0376 0.93630 0.004 0.996
#> SRR772694 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772696 2 0.3431 0.86843 0.064 0.936
#> SRR772697 2 0.2778 0.88809 0.048 0.952
#> SRR772698 1 0.0000 0.77942 1.000 0.000
#> SRR772699 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772700 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772701 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
#> SRR772702 2 0.0000 0.93964 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.0424 0.8620 0.992 0.008 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.8628 1.000 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0747 0.8625 0.984 0.016 0.000
#> SRR772344 1 0.5291 0.7203 0.732 0.268 0.000
#> SRR772345 1 0.4702 0.7788 0.788 0.212 0.000
#> SRR772346 2 0.6473 0.7345 0.332 0.652 0.016
#> SRR772347 2 0.6608 0.7174 0.356 0.628 0.016
#> SRR772348 1 0.1163 0.8650 0.972 0.028 0.000
#> SRR772349 1 0.1129 0.8659 0.976 0.020 0.004
#> SRR772350 3 0.1289 0.9500 0.000 0.032 0.968
#> SRR772351 1 0.4931 0.7697 0.768 0.232 0.000
#> SRR772352 1 0.4605 0.7907 0.796 0.204 0.000
#> SRR772353 1 0.0892 0.8645 0.980 0.020 0.000
#> SRR772354 1 0.1163 0.8648 0.972 0.028 0.000
#> SRR772355 1 0.4452 0.7966 0.808 0.192 0.000
#> SRR772356 1 0.5178 0.7467 0.744 0.256 0.000
#> SRR772357 1 0.0237 0.8624 0.996 0.004 0.000
#> SRR772358 1 0.0424 0.8641 0.992 0.008 0.000
#> SRR772359 1 0.3826 0.8367 0.868 0.124 0.008
#> SRR772360 1 0.3425 0.8424 0.884 0.112 0.004
#> SRR772361 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 1 0.5859 0.6089 0.656 0.344 0.000
#> SRR772363 1 0.5988 0.5614 0.632 0.368 0.000
#> SRR772364 2 0.6704 0.6919 0.376 0.608 0.016
#> SRR772365 2 0.6553 0.7302 0.324 0.656 0.020
#> SRR772366 3 0.1964 0.9607 0.000 0.056 0.944
#> SRR772367 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 1 0.1411 0.8639 0.964 0.036 0.000
#> SRR772369 1 0.3267 0.8401 0.884 0.116 0.000
#> SRR772370 1 0.3412 0.8360 0.876 0.124 0.000
#> SRR772371 2 0.6416 0.6798 0.304 0.676 0.020
#> SRR772372 2 0.6796 0.6511 0.344 0.632 0.024
#> SRR772373 1 0.3551 0.8357 0.868 0.132 0.000
#> SRR772374 1 0.4399 0.8007 0.812 0.188 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 1 0.4555 0.7983 0.800 0.200 0.000
#> SRR772377 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772378 1 0.0592 0.8626 0.988 0.012 0.000
#> SRR772379 1 0.0747 0.8624 0.984 0.016 0.000
#> SRR772380 1 0.0424 0.8624 0.992 0.008 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 1 0.1529 0.8663 0.960 0.040 0.000
#> SRR772383 1 0.0747 0.8654 0.984 0.016 0.000
#> SRR772384 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772385 3 0.3637 0.9182 0.024 0.084 0.892
#> SRR772386 1 0.4796 0.7873 0.780 0.220 0.000
#> SRR772387 1 0.4931 0.7745 0.768 0.232 0.000
#> SRR772388 1 0.0747 0.8629 0.984 0.016 0.000
#> SRR772389 1 0.1289 0.8597 0.968 0.032 0.000
#> SRR772390 3 0.1964 0.9607 0.000 0.056 0.944
#> SRR772391 1 0.0892 0.8631 0.980 0.020 0.000
#> SRR772392 1 0.0747 0.8632 0.984 0.016 0.000
#> SRR772393 2 0.6814 0.5679 0.372 0.608 0.020
#> SRR772394 2 0.7043 0.4045 0.448 0.532 0.020
#> SRR772395 1 0.1163 0.8638 0.972 0.028 0.000
#> SRR772396 1 0.0892 0.8607 0.980 0.020 0.000
#> SRR772397 1 0.1163 0.8560 0.972 0.028 0.000
#> SRR772398 1 0.5366 0.7852 0.776 0.208 0.016
#> SRR772399 1 0.4963 0.7976 0.792 0.200 0.008
#> SRR772400 1 0.2878 0.8253 0.904 0.096 0.000
#> SRR772401 1 0.2537 0.8265 0.920 0.080 0.000
#> SRR772402 2 0.4723 0.7607 0.160 0.824 0.016
#> SRR772403 2 0.4539 0.7633 0.148 0.836 0.016
#> SRR772404 1 0.1529 0.8637 0.960 0.040 0.000
#> SRR772405 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772406 1 0.4931 0.7645 0.768 0.232 0.000
#> SRR772407 1 0.4465 0.8062 0.820 0.176 0.004
#> SRR772408 1 0.5785 0.6315 0.668 0.332 0.000
#> SRR772409 1 0.5810 0.6240 0.664 0.336 0.000
#> SRR772410 1 0.1031 0.8652 0.976 0.024 0.000
#> SRR772411 1 0.1643 0.8680 0.956 0.044 0.000
#> SRR772412 1 0.1031 0.8592 0.976 0.024 0.000
#> SRR772413 1 0.1289 0.8561 0.968 0.032 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.1031 0.8637 0.976 0.024 0.000
#> SRR772416 1 0.1031 0.8640 0.976 0.024 0.000
#> SRR772417 1 0.0892 0.8654 0.980 0.020 0.000
#> SRR772418 3 0.1860 0.9612 0.000 0.052 0.948
#> SRR772419 1 0.4796 0.7811 0.780 0.220 0.000
#> SRR772420 1 0.4555 0.7951 0.800 0.200 0.000
#> SRR772421 1 0.4887 0.7825 0.772 0.228 0.000
#> SRR772422 1 0.5201 0.7728 0.760 0.236 0.004
#> SRR772423 2 0.4209 0.7557 0.128 0.856 0.016
#> SRR772424 2 0.3183 0.7179 0.076 0.908 0.016
#> SRR772425 1 0.4235 0.8077 0.824 0.176 0.000
#> SRR772426 1 0.4842 0.7761 0.776 0.224 0.000
#> SRR772427 1 0.5016 0.7610 0.760 0.240 0.000
#> SRR772428 1 0.1753 0.8468 0.952 0.048 0.000
#> SRR772429 1 0.1643 0.8492 0.956 0.044 0.000
#> SRR772430 1 0.1525 0.8639 0.964 0.032 0.004
#> SRR772431 2 0.5269 0.7643 0.200 0.784 0.016
#> SRR772432 2 0.5269 0.7643 0.200 0.784 0.016
#> SRR772433 1 0.2261 0.8356 0.932 0.068 0.000
#> SRR772434 1 0.1529 0.8524 0.960 0.040 0.000
#> SRR772435 1 0.0747 0.8610 0.984 0.016 0.000
#> SRR772436 1 0.0592 0.8624 0.988 0.012 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772438 1 0.6416 0.3127 0.676 0.304 0.020
#> SRR772439 1 0.6126 0.4445 0.712 0.268 0.020
#> SRR772440 1 0.3116 0.8475 0.892 0.108 0.000
#> SRR772441 1 0.4235 0.8099 0.824 0.176 0.000
#> SRR772442 2 0.5008 0.7703 0.180 0.804 0.016
#> SRR772443 2 0.5219 0.7627 0.196 0.788 0.016
#> SRR772444 1 0.0892 0.8599 0.980 0.020 0.000
#> SRR772445 1 0.0237 0.8626 0.996 0.004 0.000
#> SRR772446 1 0.1163 0.8612 0.972 0.028 0.000
#> SRR772447 1 0.1163 0.8612 0.972 0.028 0.000
#> SRR772448 1 0.4702 0.7966 0.788 0.212 0.000
#> SRR772449 1 0.4605 0.7948 0.796 0.204 0.000
#> SRR772450 1 0.6062 0.5219 0.616 0.384 0.000
#> SRR772451 1 0.6008 0.5524 0.628 0.372 0.000
#> SRR772452 1 0.1163 0.8607 0.972 0.028 0.000
#> SRR772453 1 0.1031 0.8619 0.976 0.024 0.000
#> SRR772454 1 0.0747 0.8634 0.984 0.016 0.000
#> SRR772455 1 0.0424 0.8624 0.992 0.008 0.000
#> SRR772456 1 0.5968 0.5680 0.636 0.364 0.000
#> SRR772457 1 0.5733 0.6423 0.676 0.324 0.000
#> SRR772458 1 0.0592 0.8618 0.988 0.012 0.000
#> SRR772459 1 0.0892 0.8612 0.980 0.020 0.000
#> SRR772460 1 0.6126 0.4845 0.600 0.400 0.000
#> SRR772461 1 0.6154 0.4647 0.592 0.408 0.000
#> SRR772462 1 0.1411 0.8643 0.964 0.036 0.000
#> SRR772463 1 0.1289 0.8640 0.968 0.032 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.2959 0.8498 0.900 0.100 0.000
#> SRR772466 1 0.2165 0.8645 0.936 0.064 0.000
#> SRR772467 1 0.5098 0.7575 0.752 0.248 0.000
#> SRR772468 1 0.5138 0.7527 0.748 0.252 0.000
#> SRR772469 1 0.0747 0.8617 0.984 0.016 0.000
#> SRR772470 1 0.0892 0.8620 0.980 0.020 0.000
#> SRR772471 1 0.0892 0.8641 0.980 0.020 0.000
#> SRR772472 1 0.0592 0.8634 0.988 0.012 0.000
#> SRR772473 2 0.3846 0.7455 0.108 0.876 0.016
#> SRR772474 2 0.4953 0.7640 0.176 0.808 0.016
#> SRR772475 3 0.3295 0.9289 0.008 0.096 0.896
#> SRR772476 1 0.6008 0.5493 0.628 0.372 0.000
#> SRR772477 1 0.5835 0.6167 0.660 0.340 0.000
#> SRR772478 1 0.0892 0.8632 0.980 0.020 0.000
#> SRR772479 1 0.0424 0.8633 0.992 0.008 0.000
#> SRR772480 2 0.5269 0.7695 0.200 0.784 0.016
#> SRR772481 2 0.5167 0.7668 0.192 0.792 0.016
#> SRR772482 1 0.2711 0.8259 0.912 0.088 0.000
#> SRR772483 1 0.2261 0.8354 0.932 0.068 0.000
#> SRR772484 1 0.1753 0.8639 0.952 0.048 0.000
#> SRR772485 1 0.1643 0.8646 0.956 0.044 0.000
#> SRR772486 1 0.6937 0.0417 0.576 0.404 0.020
#> SRR772487 1 0.7080 -0.0774 0.564 0.412 0.024
#> SRR772488 1 0.1964 0.8626 0.944 0.056 0.000
#> SRR772489 1 0.1643 0.8657 0.956 0.044 0.000
#> SRR772490 1 0.1163 0.8602 0.972 0.028 0.000
#> SRR772491 1 0.0592 0.8612 0.988 0.012 0.000
#> SRR772492 2 0.6783 0.3231 0.396 0.588 0.016
#> SRR772493 2 0.6721 0.3764 0.380 0.604 0.016
#> SRR772494 1 0.6095 0.5023 0.608 0.392 0.000
#> SRR772495 1 0.6095 0.5050 0.608 0.392 0.000
#> SRR772496 1 0.2796 0.8536 0.908 0.092 0.000
#> SRR772497 1 0.2356 0.8606 0.928 0.072 0.000
#> SRR772498 2 0.7987 0.2257 0.448 0.492 0.060
#> SRR772499 1 0.7915 -0.0541 0.488 0.456 0.056
#> SRR772500 1 0.4750 0.7818 0.784 0.216 0.000
#> SRR772501 1 0.5178 0.7448 0.744 0.256 0.000
#> SRR772502 1 0.4291 0.8096 0.820 0.180 0.000
#> SRR772503 1 0.3482 0.8366 0.872 0.128 0.000
#> SRR772504 1 0.4842 0.7733 0.776 0.224 0.000
#> SRR772505 1 0.4842 0.7695 0.776 0.224 0.000
#> SRR772506 1 0.4605 0.7939 0.796 0.204 0.000
#> SRR772507 1 0.4887 0.7759 0.772 0.228 0.000
#> SRR772508 1 0.1529 0.8637 0.960 0.040 0.000
#> SRR772509 3 0.2261 0.9557 0.000 0.068 0.932
#> SRR772510 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 1 0.1529 0.8673 0.960 0.040 0.000
#> SRR772512 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772513 1 0.1163 0.8638 0.972 0.028 0.000
#> SRR772514 1 0.1163 0.8654 0.972 0.028 0.000
#> SRR772515 1 0.5291 0.7314 0.732 0.268 0.000
#> SRR772516 1 0.4750 0.7822 0.784 0.216 0.000
#> SRR772517 1 0.2448 0.8601 0.924 0.076 0.000
#> SRR772518 1 0.1643 0.8647 0.956 0.044 0.000
#> SRR772519 1 0.3551 0.8349 0.868 0.132 0.000
#> SRR772520 1 0.4062 0.8204 0.836 0.164 0.000
#> SRR772521 1 0.4887 0.7681 0.772 0.228 0.000
#> SRR772522 1 0.4575 0.8024 0.812 0.184 0.004
#> SRR772523 1 0.6565 0.3274 0.576 0.416 0.008
#> SRR772524 1 0.5560 0.6797 0.700 0.300 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 1 0.5216 0.7450 0.740 0.260 0.000
#> SRR772527 1 0.5216 0.7438 0.740 0.260 0.000
#> SRR772528 3 0.1964 0.9607 0.000 0.056 0.944
#> SRR772529 1 0.0747 0.8622 0.984 0.016 0.000
#> SRR772530 1 0.1031 0.8608 0.976 0.024 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 1 0.4931 0.7644 0.768 0.232 0.000
#> SRR772533 1 0.4887 0.7697 0.772 0.228 0.000
#> SRR772534 1 0.2261 0.8452 0.932 0.068 0.000
#> SRR772535 1 0.5138 0.7417 0.748 0.252 0.000
#> SRR772536 1 0.4346 0.7992 0.816 0.184 0.000
#> SRR772537 2 0.2902 0.7060 0.064 0.920 0.016
#> SRR772538 2 0.3183 0.7164 0.076 0.908 0.016
#> SRR772539 1 0.0747 0.8624 0.984 0.016 0.000
#> SRR772540 1 0.0424 0.8627 0.992 0.008 0.000
#> SRR772541 1 0.1163 0.8626 0.972 0.028 0.000
#> SRR772542 1 0.5406 0.6994 0.764 0.224 0.012
#> SRR772543 1 0.3851 0.7692 0.860 0.136 0.004
#> SRR772544 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.0892 0.8657 0.980 0.020 0.000
#> SRR772546 1 0.0747 0.8655 0.984 0.016 0.000
#> SRR772547 1 0.1031 0.8607 0.976 0.024 0.000
#> SRR772548 1 0.0592 0.8622 0.988 0.012 0.000
#> SRR772549 1 0.0747 0.8624 0.984 0.016 0.000
#> SRR772550 1 0.0747 0.8624 0.984 0.016 0.000
#> SRR772551 1 0.3377 0.8005 0.896 0.092 0.012
#> SRR772552 1 0.1753 0.8663 0.952 0.048 0.000
#> SRR772553 3 0.2860 0.9420 0.004 0.084 0.912
#> SRR772554 1 0.4605 0.7876 0.796 0.204 0.000
#> SRR772555 1 0.4796 0.7760 0.780 0.220 0.000
#> SRR772556 1 0.1031 0.8592 0.976 0.024 0.000
#> SRR772557 1 0.0592 0.8626 0.988 0.012 0.000
#> SRR772558 1 0.0747 0.8629 0.984 0.016 0.000
#> SRR772559 1 0.1289 0.8592 0.968 0.032 0.000
#> SRR772560 1 0.1031 0.8618 0.976 0.024 0.000
#> SRR772561 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772562 1 0.2066 0.8621 0.940 0.060 0.000
#> SRR772563 1 0.2261 0.8598 0.932 0.068 0.000
#> SRR772564 1 0.3043 0.8264 0.908 0.084 0.008
#> SRR772565 1 0.2860 0.8277 0.912 0.084 0.004
#> SRR772566 1 0.2066 0.8415 0.940 0.060 0.000
#> SRR772567 1 0.1964 0.8462 0.944 0.056 0.000
#> SRR772568 1 0.4399 0.8038 0.812 0.188 0.000
#> SRR772569 1 0.5016 0.7657 0.760 0.240 0.000
#> SRR772570 1 0.0237 0.8638 0.996 0.004 0.000
#> SRR772571 1 0.0424 0.8633 0.992 0.008 0.000
#> SRR772572 1 0.0592 0.8634 0.988 0.012 0.000
#> SRR772573 1 0.2448 0.8568 0.924 0.076 0.000
#> SRR772574 1 0.0424 0.8622 0.992 0.008 0.000
#> SRR772575 1 0.0592 0.8632 0.988 0.012 0.000
#> SRR772576 1 0.3551 0.8401 0.868 0.132 0.000
#> SRR772577 1 0.1860 0.8629 0.948 0.052 0.000
#> SRR772578 1 0.6587 0.5284 0.632 0.352 0.016
#> SRR772579 1 0.6950 0.3431 0.572 0.408 0.020
#> SRR772580 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 2 0.6096 0.7655 0.280 0.704 0.016
#> SRR772582 2 0.6369 0.7228 0.316 0.668 0.016
#> SRR772583 1 0.0424 0.8624 0.992 0.008 0.000
#> SRR772584 1 0.0592 0.8626 0.988 0.012 0.000
#> SRR772585 1 0.1289 0.8635 0.968 0.032 0.000
#> SRR772586 3 0.2682 0.9479 0.004 0.076 0.920
#> SRR772587 1 0.0892 0.8627 0.980 0.020 0.000
#> SRR772588 1 0.2878 0.8557 0.904 0.096 0.000
#> SRR772589 1 0.2165 0.8617 0.936 0.064 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 1 0.1411 0.8552 0.964 0.036 0.000
#> SRR772592 1 0.0592 0.8617 0.988 0.012 0.000
#> SRR772593 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772594 2 0.5843 0.7373 0.252 0.732 0.016
#> SRR772595 2 0.6704 0.5230 0.376 0.608 0.016
#> SRR772596 3 0.1964 0.9607 0.000 0.056 0.944
#> SRR772597 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 1 0.2448 0.8299 0.924 0.076 0.000
#> SRR772599 1 0.2356 0.8332 0.928 0.072 0.000
#> SRR772600 2 0.5219 0.7626 0.196 0.788 0.016
#> SRR772601 2 0.5219 0.7625 0.196 0.788 0.016
#> SRR772602 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772603 2 0.5167 0.7579 0.192 0.792 0.016
#> SRR772604 2 0.5008 0.7598 0.180 0.804 0.016
#> SRR772605 1 0.1289 0.8634 0.968 0.032 0.000
#> SRR772606 1 0.1031 0.8605 0.976 0.024 0.000
#> SRR772607 1 0.1031 0.8605 0.976 0.024 0.000
#> SRR772608 1 0.1289 0.8630 0.968 0.032 0.000
#> SRR772609 1 0.0892 0.8628 0.980 0.020 0.000
#> SRR772610 1 0.1163 0.8638 0.972 0.028 0.000
#> SRR772611 1 0.1289 0.8651 0.968 0.032 0.000
#> SRR772612 2 0.3183 0.7174 0.076 0.908 0.016
#> SRR772613 2 0.3272 0.7218 0.080 0.904 0.016
#> SRR772614 1 0.0592 0.8630 0.988 0.012 0.000
#> SRR772615 1 0.1753 0.8493 0.952 0.048 0.000
#> SRR772616 1 0.1411 0.8601 0.964 0.036 0.000
#> SRR772617 2 0.4068 0.7519 0.120 0.864 0.016
#> SRR772618 2 0.4782 0.7672 0.164 0.820 0.016
#> SRR772619 2 0.3846 0.7183 0.108 0.876 0.016
#> SRR772620 2 0.4345 0.7216 0.136 0.848 0.016
#> SRR772621 1 0.4346 0.8099 0.816 0.184 0.000
#> SRR772622 1 0.3192 0.8451 0.888 0.112 0.000
#> SRR772623 3 0.1529 0.9447 0.000 0.040 0.960
#> SRR772624 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772625 3 0.7059 0.6264 0.112 0.164 0.724
#> SRR772626 2 0.6859 0.5645 0.356 0.620 0.024
#> SRR772627 2 0.6688 0.6393 0.308 0.664 0.028
#> SRR772628 1 0.0747 0.8642 0.984 0.016 0.000
#> SRR772629 1 0.1529 0.8672 0.960 0.040 0.000
#> SRR772630 1 0.1529 0.8662 0.960 0.040 0.000
#> SRR772631 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772632 1 0.5397 0.7140 0.720 0.280 0.000
#> SRR772633 1 0.5560 0.6838 0.700 0.300 0.000
#> SRR772634 1 0.4399 0.8038 0.812 0.188 0.000
#> SRR772635 1 0.5061 0.7871 0.784 0.208 0.008
#> SRR772636 3 0.2945 0.9394 0.004 0.088 0.908
#> SRR772637 1 0.0747 0.8624 0.984 0.016 0.000
#> SRR772638 1 0.0747 0.8624 0.984 0.016 0.000
#> SRR772639 1 0.2261 0.8643 0.932 0.068 0.000
#> SRR772640 1 0.6062 0.5243 0.616 0.384 0.000
#> SRR772641 1 0.5926 0.5870 0.644 0.356 0.000
#> SRR772642 1 0.2878 0.8541 0.904 0.096 0.000
#> SRR772643 1 0.3038 0.8547 0.896 0.104 0.000
#> SRR772644 1 0.0592 0.8624 0.988 0.012 0.000
#> SRR772645 1 0.0592 0.8624 0.988 0.012 0.000
#> SRR772646 1 0.4887 0.7765 0.772 0.228 0.000
#> SRR772647 1 0.4555 0.8006 0.800 0.200 0.000
#> SRR772648 1 0.4750 0.7805 0.784 0.216 0.000
#> SRR772649 1 0.4654 0.7889 0.792 0.208 0.000
#> SRR772650 1 0.0424 0.8624 0.992 0.008 0.000
#> SRR772651 1 0.0424 0.8638 0.992 0.008 0.000
#> SRR772652 1 0.2590 0.8398 0.924 0.072 0.004
#> SRR772653 1 0.2448 0.8380 0.924 0.076 0.000
#> SRR772654 1 0.4178 0.8151 0.828 0.172 0.000
#> SRR772655 1 0.4399 0.8079 0.812 0.188 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772658 2 0.2998 0.7160 0.068 0.916 0.016
#> SRR772659 2 0.3091 0.7193 0.072 0.912 0.016
#> SRR772660 1 0.1411 0.8646 0.964 0.036 0.000
#> SRR772661 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772662 1 0.0592 0.8615 0.988 0.012 0.000
#> SRR772663 1 0.0592 0.8630 0.988 0.012 0.000
#> SRR772664 1 0.3879 0.8240 0.848 0.152 0.000
#> SRR772665 1 0.3686 0.8307 0.860 0.140 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 1 0.2804 0.8399 0.924 0.060 0.016
#> SRR772668 2 0.5506 0.7749 0.220 0.764 0.016
#> SRR772669 2 0.6062 0.7602 0.276 0.708 0.016
#> SRR772670 1 0.0892 0.8636 0.980 0.020 0.000
#> SRR772671 1 0.0592 0.8626 0.988 0.012 0.000
#> SRR772672 1 0.1163 0.8638 0.972 0.028 0.000
#> SRR772673 1 0.1163 0.8638 0.972 0.028 0.000
#> SRR772674 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772675 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772676 1 0.4452 0.7976 0.808 0.192 0.000
#> SRR772677 1 0.4291 0.8079 0.820 0.180 0.000
#> SRR772678 3 0.2066 0.9597 0.000 0.060 0.940
#> SRR772679 1 0.0747 0.8624 0.984 0.016 0.000
#> SRR772680 1 0.0592 0.8630 0.988 0.012 0.000
#> SRR772681 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772682 1 0.3267 0.8459 0.884 0.116 0.000
#> SRR772683 1 0.3816 0.8277 0.852 0.148 0.000
#> SRR772685 1 0.4346 0.8135 0.816 0.184 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.2261 0.9559 0.000 0.068 0.932
#> SRR772688 1 0.4750 0.7833 0.784 0.216 0.000
#> SRR772689 1 0.5016 0.7653 0.760 0.240 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.9648 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 3 0.3293 0.9316 0.012 0.088 0.900
#> SRR772692 1 0.3619 0.8363 0.864 0.136 0.000
#> SRR772693 1 0.4452 0.8071 0.808 0.192 0.000
#> SRR772694 1 0.1411 0.8682 0.964 0.036 0.000
#> SRR772695 1 0.1031 0.8632 0.976 0.024 0.000
#> SRR772696 1 0.5122 0.7959 0.788 0.200 0.012
#> SRR772697 1 0.5012 0.7956 0.788 0.204 0.008
#> SRR772698 3 0.1964 0.9607 0.000 0.056 0.944
#> SRR772699 1 0.2356 0.8331 0.928 0.072 0.000
#> SRR772700 1 0.2261 0.8363 0.932 0.068 0.000
#> SRR772701 1 0.1411 0.8662 0.964 0.036 0.000
#> SRR772702 1 0.1529 0.8636 0.960 0.040 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.1798 0.7759 0.944 0.040 0.000 0.016
#> SRR772342 1 0.1576 0.7790 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR772343 1 0.2593 0.7677 0.892 0.104 0.000 0.004
#> SRR772344 2 0.5156 0.7862 0.236 0.720 0.000 0.044
#> SRR772345 2 0.4767 0.7905 0.256 0.724 0.000 0.020
#> SRR772346 4 0.5953 0.7229 0.268 0.076 0.000 0.656
#> SRR772347 4 0.6148 0.7008 0.280 0.084 0.000 0.636
#> SRR772348 1 0.4872 0.5991 0.728 0.244 0.000 0.028
#> SRR772349 1 0.5403 0.2408 0.628 0.348 0.000 0.024
#> SRR772350 3 0.1635 0.8888 0.000 0.008 0.948 0.044
#> SRR772351 2 0.6575 0.5668 0.412 0.508 0.000 0.080
#> SRR772352 2 0.5253 0.7308 0.360 0.624 0.000 0.016
#> SRR772353 1 0.4331 0.5093 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR772354 1 0.4304 0.5190 0.716 0.284 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.5110 0.7733 0.328 0.656 0.000 0.016
#> SRR772356 2 0.5404 0.7684 0.328 0.644 0.000 0.028
#> SRR772357 1 0.2053 0.7778 0.924 0.072 0.000 0.004
#> SRR772358 1 0.3142 0.7443 0.860 0.132 0.000 0.008
#> SRR772359 2 0.5600 0.5395 0.468 0.512 0.000 0.020
#> SRR772360 2 0.5678 0.5904 0.452 0.524 0.000 0.024
#> SRR772361 3 0.0376 0.9192 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR772362 2 0.6360 0.6600 0.164 0.656 0.000 0.180
#> SRR772363 2 0.6362 0.6653 0.168 0.656 0.000 0.176
#> SRR772364 4 0.6041 0.6459 0.332 0.060 0.000 0.608
#> SRR772365 4 0.6158 0.7238 0.292 0.080 0.000 0.628
#> SRR772366 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772367 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772368 1 0.5143 0.2177 0.628 0.360 0.000 0.012
#> SRR772369 2 0.5040 0.7401 0.364 0.628 0.000 0.008
#> SRR772370 2 0.4905 0.7344 0.364 0.632 0.000 0.004
#> SRR772371 4 0.7482 0.6818 0.204 0.224 0.012 0.560
#> SRR772372 4 0.7422 0.6811 0.244 0.180 0.012 0.564
#> SRR772373 2 0.4193 0.7858 0.268 0.732 0.000 0.000
#> SRR772374 2 0.4250 0.7897 0.276 0.724 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.5471 0.7911 0.268 0.684 0.000 0.048
#> SRR772377 3 0.4534 0.9092 0.000 0.132 0.800 0.068
#> SRR772378 1 0.2489 0.7750 0.912 0.068 0.000 0.020
#> SRR772379 1 0.2654 0.7617 0.888 0.108 0.000 0.004
#> SRR772380 1 0.2473 0.7714 0.908 0.080 0.000 0.012
#> SRR772381 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.2775 0.7689 0.896 0.084 0.000 0.020
#> SRR772383 1 0.2741 0.7768 0.892 0.096 0.000 0.012
#> SRR772384 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772385 3 0.5230 0.8878 0.004 0.152 0.760 0.084
#> SRR772386 2 0.4795 0.7854 0.292 0.696 0.000 0.012
#> SRR772387 2 0.4770 0.7852 0.288 0.700 0.000 0.012
#> SRR772388 1 0.1767 0.7781 0.944 0.044 0.000 0.012
#> SRR772389 1 0.2089 0.7778 0.932 0.048 0.000 0.020
#> SRR772390 3 0.4410 0.9113 0.000 0.128 0.808 0.064
#> SRR772391 1 0.2089 0.7776 0.932 0.048 0.000 0.020
#> SRR772392 1 0.1854 0.7797 0.940 0.048 0.000 0.012
#> SRR772393 4 0.7348 0.6150 0.232 0.240 0.000 0.528
#> SRR772394 4 0.7607 0.5877 0.244 0.244 0.004 0.508
#> SRR772395 2 0.5310 0.6103 0.412 0.576 0.000 0.012
#> SRR772396 1 0.2197 0.7744 0.928 0.048 0.000 0.024
#> SRR772397 1 0.2111 0.7554 0.932 0.044 0.000 0.024
#> SRR772398 1 0.6360 -0.3233 0.516 0.420 0.000 0.064
#> SRR772399 1 0.6090 -0.1025 0.564 0.384 0.000 0.052
#> SRR772400 1 0.3567 0.7341 0.868 0.076 0.004 0.052
#> SRR772401 1 0.3093 0.7491 0.892 0.064 0.004 0.040
#> SRR772402 4 0.4992 0.7935 0.132 0.096 0.000 0.772
#> SRR772403 4 0.5018 0.7924 0.088 0.144 0.000 0.768
#> SRR772404 2 0.5273 0.5079 0.456 0.536 0.000 0.008
#> SRR772405 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772406 2 0.5929 0.7203 0.356 0.596 0.000 0.048
#> SRR772407 2 0.5510 0.7202 0.376 0.600 0.000 0.024
#> SRR772408 2 0.6104 0.7153 0.180 0.680 0.000 0.140
#> SRR772409 2 0.6119 0.6885 0.168 0.680 0.000 0.152
#> SRR772410 1 0.4677 0.4482 0.680 0.316 0.000 0.004
#> SRR772411 1 0.4295 0.6176 0.752 0.240 0.000 0.008
#> SRR772412 1 0.1929 0.7565 0.940 0.036 0.000 0.024
#> SRR772413 1 0.1724 0.7607 0.948 0.032 0.000 0.020
#> SRR772414 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772415 1 0.4277 0.5139 0.720 0.280 0.000 0.000
#> SRR772416 1 0.4103 0.5826 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR772417 1 0.2831 0.7551 0.876 0.120 0.000 0.004
#> SRR772418 3 0.4259 0.9129 0.000 0.128 0.816 0.056
#> SRR772419 2 0.5694 0.7711 0.224 0.696 0.000 0.080
#> SRR772420 2 0.5041 0.7793 0.232 0.728 0.000 0.040
#> SRR772421 2 0.5659 0.7324 0.368 0.600 0.000 0.032
#> SRR772422 2 0.5423 0.7722 0.332 0.640 0.000 0.028
#> SRR772423 4 0.5011 0.7912 0.076 0.160 0.000 0.764
#> SRR772424 4 0.4375 0.7709 0.032 0.180 0.000 0.788
#> SRR772425 2 0.4673 0.7821 0.292 0.700 0.000 0.008
#> SRR772426 2 0.4776 0.7917 0.244 0.732 0.000 0.024
#> SRR772427 2 0.4744 0.7897 0.240 0.736 0.000 0.024
#> SRR772428 1 0.2586 0.7487 0.912 0.048 0.000 0.040
#> SRR772429 1 0.2224 0.7501 0.928 0.032 0.000 0.040
#> SRR772430 1 0.4212 0.6346 0.772 0.216 0.000 0.012
#> SRR772431 4 0.5122 0.7860 0.164 0.080 0.000 0.756
#> SRR772432 4 0.5100 0.7835 0.168 0.076 0.000 0.756
#> SRR772433 1 0.2218 0.7577 0.932 0.028 0.004 0.036
#> SRR772434 1 0.1629 0.7634 0.952 0.024 0.000 0.024
#> SRR772435 1 0.1576 0.7802 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR772436 1 0.1970 0.7805 0.932 0.060 0.000 0.008
#> SRR772437 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.6147 0.2253 0.608 0.056 0.004 0.332
#> SRR772439 1 0.6135 0.2246 0.608 0.068 0.000 0.324
#> SRR772440 2 0.5581 0.5885 0.448 0.532 0.000 0.020
#> SRR772441 2 0.5313 0.7263 0.376 0.608 0.000 0.016
#> SRR772442 4 0.5159 0.7932 0.088 0.156 0.000 0.756
#> SRR772443 4 0.5151 0.7994 0.140 0.100 0.000 0.760
#> SRR772444 1 0.2565 0.7652 0.912 0.056 0.000 0.032
#> SRR772445 1 0.2623 0.7655 0.908 0.064 0.000 0.028
#> SRR772446 1 0.2335 0.7757 0.920 0.060 0.000 0.020
#> SRR772447 1 0.2282 0.7758 0.924 0.052 0.000 0.024
#> SRR772448 2 0.5731 0.6471 0.428 0.544 0.000 0.028
#> SRR772449 2 0.5256 0.7056 0.392 0.596 0.000 0.012
#> SRR772450 2 0.6397 0.6529 0.164 0.652 0.000 0.184
#> SRR772451 2 0.6362 0.6644 0.168 0.656 0.000 0.176
#> SRR772452 1 0.2101 0.7763 0.928 0.060 0.000 0.012
#> SRR772453 1 0.1890 0.7767 0.936 0.056 0.000 0.008
#> SRR772454 1 0.1398 0.7799 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR772455 1 0.2271 0.7717 0.916 0.076 0.000 0.008
#> SRR772456 2 0.6401 0.6820 0.176 0.652 0.000 0.172
#> SRR772457 2 0.6063 0.7303 0.196 0.680 0.000 0.124
#> SRR772458 1 0.2565 0.7686 0.912 0.056 0.000 0.032
#> SRR772459 1 0.2174 0.7613 0.928 0.052 0.000 0.020
#> SRR772460 2 0.6565 0.5866 0.148 0.628 0.000 0.224
#> SRR772461 2 0.6956 0.4794 0.148 0.564 0.000 0.288
#> SRR772462 2 0.5478 0.5267 0.444 0.540 0.000 0.016
#> SRR772463 2 0.5409 0.3890 0.492 0.496 0.000 0.012
#> SRR772464 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772465 1 0.4624 0.3598 0.660 0.340 0.000 0.000
#> SRR772466 1 0.4950 0.2497 0.620 0.376 0.000 0.004
#> SRR772467 2 0.6286 0.7154 0.200 0.660 0.000 0.140
#> SRR772468 2 0.6286 0.7154 0.200 0.660 0.000 0.140
#> SRR772469 1 0.1978 0.7760 0.928 0.068 0.000 0.004
#> SRR772470 1 0.1824 0.7770 0.936 0.060 0.000 0.004
#> SRR772471 1 0.3870 0.6551 0.788 0.208 0.000 0.004
#> SRR772472 1 0.3494 0.6976 0.824 0.172 0.000 0.004
#> SRR772473 4 0.4979 0.7855 0.064 0.176 0.000 0.760
#> SRR772474 4 0.5209 0.7974 0.104 0.140 0.000 0.756
#> SRR772475 3 0.5018 0.8951 0.000 0.144 0.768 0.088
#> SRR772476 2 0.6346 0.6352 0.152 0.656 0.000 0.192
#> SRR772477 2 0.6400 0.6628 0.168 0.652 0.000 0.180
#> SRR772478 1 0.3400 0.6790 0.820 0.180 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.2255 0.7800 0.920 0.068 0.000 0.012
#> SRR772480 4 0.5209 0.8003 0.140 0.104 0.000 0.756
#> SRR772481 4 0.5167 0.8006 0.132 0.108 0.000 0.760
#> SRR772482 1 0.4630 0.5978 0.768 0.196 0.000 0.036
#> SRR772483 1 0.3913 0.7117 0.824 0.148 0.000 0.028
#> SRR772484 1 0.5406 -0.3260 0.508 0.480 0.000 0.012
#> SRR772485 1 0.5281 -0.2447 0.528 0.464 0.000 0.008
#> SRR772486 1 0.7142 -0.1545 0.484 0.116 0.004 0.396
#> SRR772487 4 0.7520 0.3290 0.432 0.108 0.020 0.440
#> SRR772488 1 0.4967 -0.1626 0.548 0.452 0.000 0.000
#> SRR772489 1 0.5112 -0.1132 0.560 0.436 0.000 0.004
#> SRR772490 1 0.2483 0.7723 0.916 0.052 0.000 0.032
#> SRR772491 1 0.2363 0.7754 0.920 0.056 0.000 0.024
#> SRR772492 4 0.6773 0.4559 0.108 0.348 0.000 0.544
#> SRR772493 4 0.6640 0.4723 0.096 0.352 0.000 0.552
#> SRR772494 2 0.6416 0.6293 0.152 0.648 0.000 0.200
#> SRR772495 2 0.6339 0.6276 0.148 0.656 0.000 0.196
#> SRR772496 2 0.4877 0.6431 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR772497 2 0.5088 0.5966 0.424 0.572 0.000 0.004
#> SRR772498 4 0.8183 0.5860 0.160 0.260 0.052 0.528
#> SRR772499 4 0.8332 0.5708 0.160 0.264 0.060 0.516
#> SRR772500 2 0.4711 0.7891 0.236 0.740 0.000 0.024
#> SRR772501 2 0.4678 0.7894 0.232 0.744 0.000 0.024
#> SRR772502 2 0.5452 0.6364 0.428 0.556 0.000 0.016
#> SRR772503 1 0.4610 0.5426 0.744 0.236 0.000 0.020
#> SRR772504 2 0.5025 0.7894 0.252 0.716 0.000 0.032
#> SRR772505 2 0.4767 0.7902 0.256 0.724 0.000 0.020
#> SRR772506 2 0.6167 0.7454 0.220 0.664 0.000 0.116
#> SRR772507 2 0.6031 0.7486 0.216 0.676 0.000 0.108
#> SRR772508 2 0.5388 0.5026 0.456 0.532 0.000 0.012
#> SRR772509 3 0.4491 0.9089 0.000 0.140 0.800 0.060
#> SRR772510 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772511 1 0.4535 0.4387 0.704 0.292 0.000 0.004
#> SRR772512 3 0.0564 0.9176 0.004 0.004 0.988 0.004
#> SRR772513 1 0.5093 0.2923 0.640 0.348 0.000 0.012
#> SRR772514 1 0.5110 0.2997 0.636 0.352 0.000 0.012
#> SRR772515 2 0.5677 0.7781 0.256 0.680 0.000 0.064
#> SRR772516 2 0.4868 0.7907 0.256 0.720 0.000 0.024
#> SRR772517 2 0.5833 0.5856 0.440 0.528 0.000 0.032
#> SRR772518 1 0.5263 -0.2279 0.544 0.448 0.000 0.008
#> SRR772519 2 0.4781 0.7492 0.336 0.660 0.000 0.004
#> SRR772520 2 0.4483 0.7817 0.284 0.712 0.000 0.004
#> SRR772521 1 0.6646 -0.3013 0.488 0.428 0.000 0.084
#> SRR772522 1 0.5696 -0.4539 0.492 0.484 0.000 0.024
#> SRR772523 2 0.7706 0.3843 0.300 0.448 0.000 0.252
#> SRR772524 2 0.5883 0.7547 0.288 0.648 0.000 0.064
#> SRR772525 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.6418 0.7283 0.216 0.644 0.000 0.140
#> SRR772527 2 0.6386 0.7277 0.212 0.648 0.000 0.140
#> SRR772528 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772529 1 0.2002 0.7739 0.936 0.044 0.000 0.020
#> SRR772530 1 0.2300 0.7719 0.924 0.048 0.000 0.028
#> SRR772531 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.4776 0.7893 0.272 0.712 0.000 0.016
#> SRR772533 2 0.5113 0.7920 0.252 0.712 0.000 0.036
#> SRR772534 1 0.3312 0.7588 0.876 0.052 0.000 0.072
#> SRR772535 2 0.5807 0.6950 0.364 0.596 0.000 0.040
#> SRR772536 2 0.4814 0.7731 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR772537 4 0.4839 0.7641 0.044 0.200 0.000 0.756
#> SRR772538 4 0.4595 0.7640 0.040 0.184 0.000 0.776
#> SRR772539 1 0.1576 0.7757 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR772540 1 0.1398 0.7795 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR772541 1 0.3881 0.7034 0.812 0.172 0.000 0.016
#> SRR772542 1 0.6546 0.4966 0.668 0.144 0.012 0.176
#> SRR772543 1 0.5323 0.6089 0.748 0.076 0.004 0.172
#> SRR772544 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.3157 0.7289 0.852 0.144 0.000 0.004
#> SRR772546 1 0.3257 0.7213 0.844 0.152 0.000 0.004
#> SRR772547 1 0.2699 0.7767 0.904 0.068 0.000 0.028
#> SRR772548 1 0.1661 0.7768 0.944 0.052 0.000 0.004
#> SRR772549 1 0.2255 0.7757 0.920 0.068 0.000 0.012
#> SRR772550 1 0.2179 0.7762 0.924 0.064 0.000 0.012
#> SRR772551 1 0.6075 0.5605 0.684 0.168 0.000 0.148
#> SRR772552 1 0.5657 0.5453 0.688 0.244 0.000 0.068
#> SRR772553 3 0.4841 0.9013 0.000 0.140 0.780 0.080
#> SRR772554 2 0.4690 0.7882 0.260 0.724 0.000 0.016
#> SRR772555 2 0.4675 0.7883 0.244 0.736 0.000 0.020
#> SRR772556 1 0.2565 0.7609 0.912 0.056 0.000 0.032
#> SRR772557 1 0.2399 0.7589 0.920 0.048 0.000 0.032
#> SRR772558 1 0.2060 0.7759 0.932 0.052 0.000 0.016
#> SRR772559 1 0.1854 0.7761 0.940 0.048 0.000 0.012
#> SRR772560 1 0.2859 0.7600 0.880 0.112 0.000 0.008
#> SRR772561 3 0.0376 0.9192 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR772562 2 0.4897 0.7397 0.332 0.660 0.000 0.008
#> SRR772563 2 0.4814 0.7548 0.316 0.676 0.000 0.008
#> SRR772564 1 0.4407 0.6983 0.820 0.100 0.004 0.076
#> SRR772565 1 0.3875 0.7210 0.852 0.076 0.004 0.068
#> SRR772566 1 0.2670 0.7476 0.908 0.052 0.000 0.040
#> SRR772567 1 0.2739 0.7479 0.904 0.060 0.000 0.036
#> SRR772568 2 0.4857 0.7863 0.284 0.700 0.000 0.016
#> SRR772569 2 0.4955 0.7862 0.268 0.708 0.000 0.024
#> SRR772570 1 0.2944 0.7531 0.868 0.128 0.000 0.004
#> SRR772571 1 0.2888 0.7572 0.872 0.124 0.000 0.004
#> SRR772572 1 0.3157 0.7474 0.852 0.144 0.000 0.004
#> SRR772573 1 0.4103 0.5948 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.1677 0.7796 0.948 0.040 0.000 0.012
#> SRR772575 1 0.1975 0.7765 0.936 0.048 0.000 0.016
#> SRR772576 2 0.6102 0.6372 0.420 0.532 0.000 0.048
#> SRR772577 1 0.5404 0.1898 0.644 0.328 0.000 0.028
#> SRR772578 4 0.7615 0.2625 0.188 0.332 0.004 0.476
#> SRR772579 4 0.7832 0.4416 0.180 0.284 0.020 0.516
#> SRR772580 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772581 4 0.6323 0.7698 0.176 0.164 0.000 0.660
#> SRR772582 4 0.6362 0.7610 0.168 0.176 0.000 0.656
#> SRR772583 1 0.2796 0.7688 0.892 0.092 0.000 0.016
#> SRR772584 1 0.3157 0.7307 0.852 0.144 0.000 0.004
#> SRR772585 1 0.4284 0.6259 0.764 0.224 0.000 0.012
#> SRR772586 3 0.4514 0.9077 0.000 0.136 0.800 0.064
#> SRR772587 1 0.1545 0.7789 0.952 0.040 0.000 0.008
#> SRR772588 2 0.5619 0.7580 0.320 0.640 0.000 0.040
#> SRR772589 2 0.5130 0.7374 0.332 0.652 0.000 0.016
#> SRR772590 3 0.0188 0.9198 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR772591 1 0.2224 0.7588 0.928 0.040 0.000 0.032
#> SRR772592 1 0.2466 0.7686 0.916 0.056 0.000 0.028
#> SRR772593 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772594 4 0.7070 0.6819 0.168 0.244 0.004 0.584
#> SRR772595 4 0.7498 0.5461 0.180 0.312 0.004 0.504
#> SRR772596 3 0.4259 0.9129 0.000 0.128 0.816 0.056
#> SRR772597 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.3245 0.7382 0.880 0.064 0.000 0.056
#> SRR772599 1 0.2500 0.7440 0.916 0.040 0.000 0.044
#> SRR772600 4 0.4985 0.7907 0.152 0.080 0.000 0.768
#> SRR772601 4 0.4920 0.7818 0.164 0.068 0.000 0.768
#> SRR772602 3 0.0188 0.9198 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR772603 4 0.4937 0.7847 0.172 0.064 0.000 0.764
#> SRR772604 4 0.4919 0.7904 0.152 0.076 0.000 0.772
#> SRR772605 1 0.3925 0.6995 0.808 0.176 0.000 0.016
#> SRR772606 1 0.2399 0.7658 0.920 0.048 0.000 0.032
#> SRR772607 1 0.2313 0.7621 0.924 0.044 0.000 0.032
#> SRR772608 1 0.3547 0.7369 0.840 0.144 0.000 0.016
#> SRR772609 1 0.2402 0.7743 0.912 0.076 0.000 0.012
#> SRR772610 1 0.5236 -0.1095 0.560 0.432 0.000 0.008
#> SRR772611 2 0.5167 0.3782 0.488 0.508 0.000 0.004
#> SRR772612 4 0.4057 0.7640 0.032 0.152 0.000 0.816
#> SRR772613 4 0.4541 0.7825 0.060 0.144 0.000 0.796
#> SRR772614 1 0.2699 0.7666 0.904 0.068 0.000 0.028
#> SRR772615 1 0.2494 0.7543 0.916 0.048 0.000 0.036
#> SRR772616 1 0.2443 0.7764 0.916 0.060 0.000 0.024
#> SRR772617 4 0.4879 0.7949 0.092 0.128 0.000 0.780
#> SRR772618 4 0.4948 0.7976 0.124 0.100 0.000 0.776
#> SRR772619 4 0.5417 0.6947 0.056 0.240 0.000 0.704
#> SRR772620 4 0.5550 0.6849 0.060 0.248 0.000 0.692
#> SRR772621 2 0.4980 0.7848 0.304 0.680 0.000 0.016
#> SRR772622 2 0.5912 0.6034 0.440 0.524 0.000 0.036
#> SRR772623 3 0.1635 0.8888 0.000 0.008 0.948 0.044
#> SRR772624 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772625 3 0.6399 0.8099 0.020 0.168 0.692 0.120
#> SRR772626 4 0.7818 0.6870 0.160 0.212 0.048 0.580
#> SRR772627 4 0.7561 0.6865 0.160 0.232 0.028 0.580
#> SRR772628 1 0.2521 0.7728 0.912 0.064 0.000 0.024
#> SRR772629 1 0.2813 0.7714 0.896 0.080 0.000 0.024
#> SRR772630 1 0.3545 0.7150 0.828 0.164 0.000 0.008
#> SRR772631 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772632 2 0.5988 0.7718 0.224 0.676 0.000 0.100
#> SRR772633 2 0.6064 0.7631 0.220 0.672 0.000 0.108
#> SRR772634 1 0.6187 -0.3314 0.516 0.432 0.000 0.052
#> SRR772635 2 0.5746 0.6784 0.396 0.572 0.000 0.032
#> SRR772636 3 0.4906 0.8994 0.000 0.140 0.776 0.084
#> SRR772637 1 0.1557 0.7754 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.1824 0.7761 0.936 0.060 0.000 0.004
#> SRR772639 2 0.5483 0.5820 0.448 0.536 0.000 0.016
#> SRR772640 2 0.6352 0.6424 0.156 0.656 0.000 0.188
#> SRR772641 2 0.6360 0.6577 0.164 0.656 0.000 0.180
#> SRR772642 2 0.5808 0.6435 0.424 0.544 0.000 0.032
#> SRR772643 2 0.5587 0.7396 0.372 0.600 0.000 0.028
#> SRR772644 1 0.2530 0.7645 0.896 0.100 0.000 0.004
#> SRR772645 1 0.2334 0.7705 0.908 0.088 0.000 0.004
#> SRR772646 2 0.4661 0.7934 0.256 0.728 0.000 0.016
#> SRR772647 2 0.4343 0.7909 0.264 0.732 0.000 0.004
#> SRR772648 2 0.5322 0.7734 0.312 0.660 0.000 0.028
#> SRR772649 2 0.4957 0.7731 0.320 0.668 0.000 0.012
#> SRR772650 1 0.2611 0.7699 0.896 0.096 0.000 0.008
#> SRR772651 1 0.2704 0.7464 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.5008 0.5328 0.732 0.228 0.000 0.040
#> SRR772653 1 0.4904 0.5543 0.744 0.216 0.000 0.040
#> SRR772654 2 0.5465 0.6971 0.392 0.588 0.000 0.020
#> SRR772655 2 0.5193 0.7776 0.324 0.656 0.000 0.020
#> SRR772656 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0376 0.9192 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR772658 4 0.4050 0.7638 0.036 0.144 0.000 0.820
#> SRR772659 4 0.4015 0.7657 0.052 0.116 0.000 0.832
#> SRR772660 1 0.5212 -0.0452 0.572 0.420 0.000 0.008
#> SRR772661 3 0.4410 0.9112 0.000 0.128 0.808 0.064
#> SRR772662 1 0.1824 0.7789 0.936 0.060 0.000 0.004
#> SRR772663 1 0.1792 0.7758 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.4978 0.6759 0.384 0.612 0.000 0.004
#> SRR772665 2 0.5028 0.6451 0.400 0.596 0.000 0.004
#> SRR772666 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772667 1 0.6597 0.2489 0.588 0.304 0.000 0.108
#> SRR772668 4 0.5932 0.7798 0.140 0.116 0.016 0.728
#> SRR772669 4 0.6031 0.7577 0.212 0.088 0.008 0.692
#> SRR772670 1 0.3837 0.6402 0.776 0.224 0.000 0.000
#> SRR772671 1 0.2402 0.7738 0.912 0.076 0.000 0.012
#> SRR772672 1 0.5295 -0.3473 0.504 0.488 0.000 0.008
#> SRR772673 1 0.5229 -0.0972 0.564 0.428 0.000 0.008
#> SRR772674 3 0.0469 0.9214 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772675 3 0.4388 0.9113 0.000 0.132 0.808 0.060
#> SRR772676 2 0.5497 0.5403 0.460 0.524 0.000 0.016
#> SRR772677 2 0.5581 0.5915 0.448 0.532 0.000 0.020
#> SRR772678 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772679 1 0.3052 0.7384 0.860 0.136 0.000 0.004
#> SRR772680 1 0.2011 0.7747 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.4722 0.7761 0.300 0.692 0.000 0.008
#> SRR772683 2 0.4535 0.7805 0.292 0.704 0.000 0.004
#> SRR772685 2 0.5026 0.7781 0.312 0.672 0.000 0.016
#> SRR772686 3 0.0000 0.9209 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772687 3 0.4584 0.9099 0.008 0.128 0.808 0.056
#> SRR772688 2 0.6198 0.7439 0.224 0.660 0.000 0.116
#> SRR772689 2 0.6080 0.7641 0.236 0.664 0.000 0.100
#> SRR772690 3 0.0188 0.9198 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR772691 3 0.4955 0.8971 0.000 0.144 0.772 0.084
#> SRR772692 1 0.6261 -0.3793 0.504 0.440 0.000 0.056
#> SRR772693 2 0.5573 0.7249 0.368 0.604 0.000 0.028
#> SRR772694 1 0.4509 0.4881 0.708 0.288 0.000 0.004
#> SRR772695 1 0.2611 0.7672 0.896 0.096 0.000 0.008
#> SRR772696 2 0.5691 0.6844 0.408 0.564 0.000 0.028
#> SRR772697 2 0.5827 0.6916 0.396 0.568 0.000 0.036
#> SRR772698 3 0.4336 0.9122 0.000 0.128 0.812 0.060
#> SRR772699 1 0.2227 0.7647 0.928 0.036 0.000 0.036
#> SRR772700 1 0.2313 0.7691 0.924 0.044 0.000 0.032
#> SRR772701 1 0.2563 0.7735 0.908 0.072 0.000 0.020
#> SRR772702 1 0.2197 0.7691 0.928 0.048 0.000 0.024
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.4694 0.6969 0.676 0.292 0.000 0.012 0.020
#> SRR772342 1 0.4305 0.7077 0.688 0.296 0.000 0.004 0.012
#> SRR772343 1 0.4070 0.6903 0.728 0.256 0.000 0.012 0.004
#> SRR772344 2 0.2152 0.7029 0.044 0.920 0.000 0.032 0.004
#> SRR772345 2 0.1372 0.6970 0.016 0.956 0.000 0.024 0.004
#> SRR772346 4 0.6493 0.6764 0.280 0.108 0.000 0.572 0.040
#> SRR772347 4 0.7004 0.6448 0.240 0.184 0.000 0.532 0.044
#> SRR772348 1 0.6188 0.4444 0.548 0.352 0.000 0.056 0.044
#> SRR772349 1 0.6094 0.1899 0.476 0.440 0.000 0.044 0.040
#> SRR772350 3 0.1186 0.9479 0.008 0.000 0.964 0.020 0.008
#> SRR772351 2 0.5143 0.5484 0.204 0.712 0.000 0.028 0.056
#> SRR772352 2 0.4027 0.6207 0.144 0.800 0.000 0.012 0.044
#> SRR772353 1 0.5051 0.5409 0.576 0.392 0.000 0.008 0.024
#> SRR772354 1 0.4954 0.5667 0.628 0.336 0.000 0.008 0.028
#> SRR772355 2 0.3770 0.6955 0.104 0.832 0.000 0.024 0.040
#> SRR772356 2 0.4061 0.6939 0.128 0.808 0.000 0.024 0.040
#> SRR772357 1 0.4017 0.7192 0.736 0.248 0.000 0.004 0.012
#> SRR772358 1 0.4528 0.6914 0.680 0.296 0.000 0.012 0.012
#> SRR772359 2 0.3888 0.6143 0.176 0.788 0.000 0.032 0.004
#> SRR772360 2 0.3733 0.6290 0.160 0.804 0.000 0.032 0.004
#> SRR772361 3 0.0162 0.9865 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772362 2 0.5814 0.5806 0.048 0.688 0.000 0.148 0.116
#> SRR772363 2 0.5916 0.5685 0.052 0.680 0.000 0.152 0.116
#> SRR772364 4 0.6890 0.6330 0.240 0.152 0.000 0.556 0.052
#> SRR772365 4 0.6866 0.6828 0.192 0.196 0.000 0.564 0.048
#> SRR772366 5 0.4196 0.9815 0.000 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR772367 3 0.0162 0.9888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772368 1 0.6909 0.2203 0.472 0.376 0.000 0.064 0.088
#> SRR772369 2 0.2907 0.6753 0.116 0.864 0.000 0.008 0.012
#> SRR772370 2 0.2517 0.6825 0.104 0.884 0.000 0.004 0.008
#> SRR772371 4 0.7400 0.5516 0.140 0.340 0.004 0.456 0.060
#> SRR772372 4 0.7642 0.5883 0.196 0.276 0.004 0.460 0.064
#> SRR772373 2 0.2362 0.6981 0.076 0.900 0.000 0.000 0.024
#> SRR772374 2 0.1341 0.6990 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9893 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772376 2 0.4020 0.6871 0.104 0.812 0.000 0.072 0.012
#> SRR772377 5 0.4182 0.9796 0.000 0.000 0.352 0.004 0.644
#> SRR772378 1 0.3552 0.7075 0.812 0.164 0.000 0.012 0.012
#> SRR772379 1 0.4375 0.6706 0.728 0.236 0.000 0.004 0.032
#> SRR772380 1 0.3488 0.7042 0.804 0.180 0.000 0.008 0.008
#> SRR772381 3 0.0510 0.9762 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772382 1 0.5559 0.5777 0.552 0.392 0.000 0.024 0.032
#> SRR772383 1 0.5530 0.5861 0.552 0.392 0.000 0.016 0.040
#> SRR772384 5 0.4196 0.9815 0.000 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR772385 5 0.4574 0.9442 0.000 0.012 0.328 0.008 0.652
#> SRR772386 2 0.2102 0.6889 0.068 0.916 0.000 0.012 0.004
#> SRR772387 2 0.2331 0.6847 0.064 0.908 0.000 0.024 0.004
#> SRR772388 1 0.2971 0.7104 0.836 0.156 0.000 0.000 0.008
#> SRR772389 1 0.3080 0.7089 0.844 0.140 0.000 0.008 0.008
#> SRR772390 5 0.4088 0.9717 0.000 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR772391 1 0.2856 0.6852 0.872 0.104 0.000 0.016 0.008
#> SRR772392 1 0.3596 0.7182 0.792 0.192 0.000 0.008 0.008
#> SRR772393 4 0.7382 0.5065 0.148 0.352 0.000 0.436 0.064
#> SRR772394 4 0.7187 0.4308 0.136 0.396 0.000 0.416 0.052
#> SRR772395 2 0.6049 0.5155 0.240 0.636 0.000 0.052 0.072
#> SRR772396 1 0.4410 0.6995 0.752 0.196 0.000 0.008 0.044
#> SRR772397 1 0.5192 0.6706 0.668 0.264 0.000 0.012 0.056
#> SRR772398 2 0.5595 0.4104 0.312 0.612 0.004 0.064 0.008
#> SRR772399 2 0.5489 0.2838 0.356 0.576 0.000 0.064 0.004
#> SRR772400 1 0.6178 0.5394 0.564 0.340 0.004 0.040 0.052
#> SRR772401 1 0.5430 0.5910 0.616 0.324 0.000 0.032 0.028
#> SRR772402 4 0.3821 0.7471 0.148 0.052 0.000 0.800 0.000
#> SRR772403 4 0.3888 0.7516 0.136 0.064 0.000 0.800 0.000
#> SRR772404 2 0.6357 0.3676 0.300 0.576 0.000 0.056 0.068
#> SRR772405 5 0.4060 0.9800 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR772406 2 0.3910 0.6729 0.128 0.816 0.000 0.028 0.028
#> SRR772407 2 0.3409 0.6762 0.116 0.844 0.000 0.016 0.024
#> SRR772408 2 0.5314 0.6188 0.048 0.732 0.000 0.132 0.088
#> SRR772409 2 0.5280 0.6242 0.048 0.736 0.000 0.124 0.092
#> SRR772410 1 0.5258 0.4257 0.548 0.408 0.000 0.004 0.040
#> SRR772411 1 0.5353 0.5117 0.568 0.384 0.000 0.012 0.036
#> SRR772412 1 0.5201 0.6489 0.636 0.312 0.000 0.016 0.036
#> SRR772413 1 0.4633 0.6842 0.700 0.264 0.000 0.016 0.020
#> SRR772414 3 0.0162 0.9888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772415 1 0.5256 0.4969 0.592 0.356 0.000 0.004 0.048
#> SRR772416 1 0.5433 0.5038 0.596 0.344 0.000 0.012 0.048
#> SRR772417 1 0.4363 0.6992 0.708 0.268 0.000 0.008 0.016
#> SRR772418 5 0.4074 0.9764 0.000 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR772419 2 0.3890 0.6780 0.072 0.828 0.000 0.080 0.020
#> SRR772420 2 0.4322 0.6747 0.084 0.800 0.000 0.092 0.024
#> SRR772421 2 0.3323 0.6647 0.116 0.844 0.000 0.036 0.004
#> SRR772422 2 0.2729 0.6784 0.084 0.884 0.000 0.028 0.004
#> SRR772423 4 0.4020 0.7584 0.108 0.096 0.000 0.796 0.000
#> SRR772424 4 0.4321 0.7433 0.040 0.152 0.000 0.784 0.024
#> SRR772425 2 0.3173 0.6939 0.112 0.856 0.000 0.016 0.016
#> SRR772426 2 0.1498 0.7032 0.024 0.952 0.000 0.016 0.008
#> SRR772427 2 0.1701 0.7049 0.028 0.944 0.000 0.012 0.016
#> SRR772428 1 0.5271 0.6133 0.632 0.312 0.000 0.016 0.040
#> SRR772429 1 0.5265 0.6649 0.668 0.260 0.000 0.016 0.056
#> SRR772430 1 0.5909 0.6033 0.632 0.268 0.004 0.064 0.032
#> SRR772431 4 0.3978 0.7443 0.148 0.052 0.000 0.796 0.004
#> SRR772432 4 0.3835 0.7417 0.156 0.048 0.000 0.796 0.000
#> SRR772433 1 0.4982 0.6774 0.692 0.252 0.000 0.024 0.032
#> SRR772434 1 0.4684 0.6863 0.712 0.244 0.000 0.024 0.020
#> SRR772435 1 0.4742 0.6781 0.632 0.344 0.000 0.012 0.012
#> SRR772436 1 0.4812 0.6538 0.612 0.364 0.000 0.012 0.012
#> SRR772437 3 0.0162 0.9888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772438 1 0.7240 0.2088 0.524 0.200 0.000 0.212 0.064
#> SRR772439 1 0.7217 0.2231 0.500 0.252 0.000 0.200 0.048
#> SRR772440 2 0.4376 0.5269 0.216 0.744 0.000 0.012 0.028
#> SRR772441 2 0.3862 0.6404 0.132 0.816 0.000 0.020 0.032
#> SRR772442 4 0.4020 0.7520 0.096 0.108 0.000 0.796 0.000
#> SRR772443 4 0.3888 0.7468 0.148 0.056 0.000 0.796 0.000
#> SRR772444 1 0.5265 0.6727 0.644 0.296 0.000 0.016 0.044
#> SRR772445 1 0.5175 0.6871 0.664 0.272 0.000 0.012 0.052
#> SRR772446 1 0.2463 0.6869 0.888 0.100 0.000 0.004 0.008
#> SRR772447 1 0.2588 0.6841 0.884 0.100 0.000 0.008 0.008
#> SRR772448 2 0.5176 0.5461 0.196 0.716 0.000 0.048 0.040
#> SRR772449 2 0.3265 0.6639 0.120 0.848 0.000 0.020 0.012
#> SRR772450 2 0.5960 0.5652 0.052 0.676 0.000 0.152 0.120
#> SRR772451 2 0.5960 0.5652 0.052 0.676 0.000 0.152 0.120
#> SRR772452 1 0.2533 0.6823 0.888 0.096 0.000 0.008 0.008
#> SRR772453 1 0.2304 0.6889 0.892 0.100 0.000 0.000 0.008
#> SRR772454 1 0.3905 0.7226 0.752 0.232 0.000 0.004 0.012
#> SRR772455 1 0.3282 0.7065 0.804 0.188 0.000 0.000 0.008
#> SRR772456 2 0.5768 0.6130 0.064 0.700 0.000 0.132 0.104
#> SRR772457 2 0.5332 0.6329 0.060 0.736 0.000 0.116 0.088
#> SRR772458 1 0.5438 0.6693 0.632 0.300 0.000 0.020 0.048
#> SRR772459 1 0.5290 0.6578 0.632 0.312 0.000 0.020 0.036
#> SRR772460 2 0.6071 0.5452 0.052 0.660 0.000 0.180 0.108
#> SRR772461 2 0.6235 0.5193 0.052 0.636 0.000 0.208 0.104
#> SRR772462 2 0.5955 0.3572 0.316 0.584 0.000 0.020 0.080
#> SRR772463 2 0.6347 0.2514 0.352 0.532 0.000 0.032 0.084
#> SRR772464 3 0.0000 0.9893 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772465 2 0.5101 -0.0286 0.416 0.552 0.000 0.008 0.024
#> SRR772466 2 0.5485 0.0421 0.384 0.560 0.000 0.012 0.044
#> SRR772467 2 0.5642 0.6113 0.060 0.708 0.000 0.140 0.092
#> SRR772468 2 0.5487 0.6190 0.056 0.720 0.000 0.136 0.088
#> SRR772469 1 0.3333 0.7119 0.820 0.164 0.000 0.008 0.008
#> SRR772470 1 0.3488 0.7125 0.804 0.180 0.000 0.008 0.008
#> SRR772471 1 0.3554 0.6821 0.776 0.216 0.000 0.004 0.004
#> SRR772472 1 0.3300 0.7078 0.792 0.204 0.000 0.000 0.004
#> SRR772473 4 0.4151 0.7463 0.060 0.152 0.000 0.784 0.004
#> SRR772474 4 0.4480 0.7572 0.128 0.084 0.000 0.776 0.012
#> SRR772475 5 0.4252 0.9674 0.000 0.000 0.340 0.008 0.652
#> SRR772476 2 0.5819 0.5796 0.048 0.688 0.000 0.144 0.120
#> SRR772477 2 0.5789 0.5841 0.052 0.692 0.000 0.148 0.108
#> SRR772478 1 0.3170 0.6806 0.828 0.160 0.000 0.008 0.004
#> SRR772479 1 0.3001 0.7055 0.844 0.144 0.000 0.004 0.008
#> SRR772480 4 0.4075 0.7506 0.160 0.060 0.000 0.780 0.000
#> SRR772481 4 0.4058 0.7538 0.152 0.064 0.000 0.784 0.000
#> SRR772482 2 0.5603 -0.0464 0.424 0.520 0.000 0.036 0.020
#> SRR772483 1 0.5361 0.4468 0.544 0.412 0.000 0.028 0.016
#> SRR772484 2 0.5979 0.3498 0.328 0.576 0.000 0.024 0.072
#> SRR772485 2 0.6054 0.2299 0.372 0.536 0.000 0.024 0.068
#> SRR772486 1 0.7577 0.0393 0.476 0.220 0.000 0.228 0.076
#> SRR772487 1 0.7922 -0.1058 0.428 0.236 0.000 0.236 0.100
#> SRR772488 2 0.5514 0.3952 0.304 0.620 0.000 0.012 0.064
#> SRR772489 2 0.5540 0.1408 0.400 0.540 0.000 0.008 0.052
#> SRR772490 1 0.5476 0.6496 0.612 0.324 0.000 0.020 0.044
#> SRR772491 1 0.5094 0.6927 0.676 0.264 0.000 0.016 0.044
#> SRR772492 2 0.7180 0.1639 0.068 0.480 0.000 0.332 0.120
#> SRR772493 2 0.7098 0.1582 0.060 0.480 0.000 0.340 0.120
#> SRR772494 2 0.5953 0.5668 0.052 0.676 0.000 0.156 0.116
#> SRR772495 2 0.5997 0.5612 0.052 0.672 0.000 0.156 0.120
#> SRR772496 2 0.4765 0.5637 0.232 0.708 0.000 0.004 0.056
#> SRR772497 2 0.5155 0.4699 0.288 0.652 0.000 0.008 0.052
#> SRR772498 4 0.8331 0.5009 0.104 0.332 0.040 0.412 0.112
#> SRR772499 4 0.8376 0.4705 0.120 0.340 0.036 0.396 0.108
#> SRR772500 2 0.2284 0.7039 0.056 0.912 0.000 0.028 0.004
#> SRR772501 2 0.1996 0.7031 0.036 0.928 0.000 0.032 0.004
#> SRR772502 2 0.3229 0.6535 0.128 0.840 0.000 0.032 0.000
#> SRR772503 2 0.5163 -0.1439 0.408 0.556 0.000 0.028 0.008
#> SRR772504 2 0.2249 0.6949 0.040 0.920 0.000 0.020 0.020
#> SRR772505 2 0.1883 0.7047 0.048 0.932 0.000 0.012 0.008
#> SRR772506 2 0.5028 0.6561 0.080 0.756 0.000 0.116 0.048
#> SRR772507 2 0.4826 0.6621 0.068 0.772 0.000 0.108 0.052
#> SRR772508 2 0.6711 0.3321 0.312 0.540 0.000 0.064 0.084
#> SRR772509 5 0.4196 0.9815 0.000 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR772510 3 0.0162 0.9888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772511 2 0.5300 -0.1327 0.432 0.528 0.000 0.012 0.028
#> SRR772512 3 0.0324 0.9850 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR772513 1 0.6535 0.3498 0.516 0.356 0.000 0.040 0.088
#> SRR772514 1 0.6588 0.2965 0.488 0.384 0.000 0.040 0.088
#> SRR772515 2 0.3531 0.6940 0.080 0.852 0.000 0.032 0.036
#> SRR772516 2 0.2341 0.7015 0.056 0.912 0.000 0.020 0.012
#> SRR772517 2 0.4661 0.5796 0.208 0.736 0.000 0.020 0.036
#> SRR772518 2 0.5419 0.2977 0.340 0.600 0.000 0.012 0.048
#> SRR772519 2 0.4439 0.6310 0.176 0.760 0.000 0.008 0.056
#> SRR772520 2 0.3689 0.6746 0.128 0.820 0.000 0.004 0.048
#> SRR772521 2 0.5343 0.3701 0.248 0.672 0.000 0.060 0.020
#> SRR772522 2 0.4042 0.5530 0.196 0.772 0.000 0.020 0.012
#> SRR772523 2 0.6548 0.4802 0.172 0.608 0.000 0.172 0.048
#> SRR772524 2 0.3151 0.6917 0.056 0.876 0.000 0.036 0.032
#> SRR772525 3 0.0000 0.9893 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772526 2 0.5591 0.6150 0.060 0.712 0.000 0.140 0.088
#> SRR772527 2 0.5464 0.6214 0.052 0.720 0.000 0.140 0.088
#> SRR772528 5 0.4060 0.9800 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR772529 1 0.4996 0.6796 0.656 0.300 0.000 0.016 0.028
#> SRR772530 1 0.5121 0.6815 0.648 0.300 0.000 0.012 0.040
#> SRR772531 3 0.0162 0.9888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772532 2 0.3160 0.7057 0.072 0.872 0.000 0.032 0.024
#> SRR772533 2 0.3164 0.7057 0.084 0.868 0.000 0.028 0.020
#> SRR772534 1 0.4818 0.7116 0.732 0.196 0.000 0.056 0.016
#> SRR772535 2 0.4605 0.6206 0.176 0.756 0.000 0.020 0.048
#> SRR772536 2 0.2854 0.6974 0.084 0.880 0.000 0.008 0.028
#> SRR772537 4 0.5247 0.7361 0.044 0.196 0.000 0.712 0.048
#> SRR772538 4 0.5233 0.7230 0.036 0.204 0.000 0.708 0.052
#> SRR772539 1 0.2911 0.7070 0.852 0.136 0.000 0.004 0.008
#> SRR772540 1 0.3807 0.7228 0.748 0.240 0.000 0.000 0.012
#> SRR772541 1 0.6082 0.5863 0.632 0.244 0.000 0.064 0.060
#> SRR772542 1 0.6679 0.3589 0.544 0.300 0.000 0.112 0.044
#> SRR772543 1 0.6084 0.5416 0.648 0.196 0.000 0.116 0.040
#> SRR772544 3 0.0162 0.9888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772545 1 0.4989 0.5962 0.572 0.400 0.000 0.008 0.020
#> SRR772546 1 0.4950 0.6246 0.588 0.384 0.000 0.008 0.020
#> SRR772547 1 0.4160 0.7074 0.772 0.184 0.000 0.036 0.008
#> SRR772548 1 0.3606 0.7149 0.816 0.152 0.000 0.008 0.024
#> SRR772549 1 0.2411 0.6892 0.884 0.108 0.000 0.000 0.008
#> SRR772550 1 0.2699 0.6831 0.880 0.100 0.000 0.012 0.008
#> SRR772551 1 0.6782 0.5126 0.552 0.276 0.000 0.120 0.052
#> SRR772552 1 0.6135 0.4460 0.516 0.392 0.000 0.060 0.032
#> SRR772553 5 0.4268 0.9716 0.000 0.000 0.344 0.008 0.648
#> SRR772554 2 0.1549 0.6983 0.040 0.944 0.000 0.016 0.000
#> SRR772555 2 0.1648 0.6969 0.040 0.940 0.000 0.020 0.000
#> SRR772556 1 0.5483 0.6503 0.616 0.316 0.000 0.016 0.052
#> SRR772557 1 0.5341 0.6700 0.640 0.292 0.000 0.012 0.056
#> SRR772558 1 0.2563 0.7002 0.872 0.120 0.000 0.000 0.008
#> SRR772559 1 0.2907 0.6952 0.864 0.116 0.000 0.012 0.008
#> SRR772560 1 0.5000 0.6711 0.712 0.220 0.000 0.036 0.032
#> SRR772561 3 0.0324 0.9850 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR772562 2 0.4361 0.6482 0.156 0.780 0.000 0.024 0.040
#> SRR772563 2 0.3952 0.6671 0.120 0.816 0.000 0.020 0.044
#> SRR772564 1 0.5781 0.4125 0.564 0.360 0.000 0.056 0.020
#> SRR772565 1 0.5318 0.5755 0.656 0.276 0.000 0.048 0.020
#> SRR772566 1 0.5283 0.5869 0.604 0.348 0.000 0.028 0.020
#> SRR772567 1 0.5149 0.5871 0.604 0.356 0.000 0.020 0.020
#> SRR772568 2 0.1662 0.6971 0.056 0.936 0.000 0.004 0.004
#> SRR772569 2 0.1788 0.6947 0.056 0.932 0.000 0.008 0.004
#> SRR772570 1 0.4594 0.6379 0.620 0.364 0.000 0.004 0.012
#> SRR772571 1 0.4481 0.6958 0.668 0.312 0.000 0.004 0.016
#> SRR772572 1 0.4422 0.6520 0.664 0.320 0.000 0.004 0.012
#> SRR772573 1 0.4787 0.4259 0.528 0.456 0.000 0.004 0.012
#> SRR772574 1 0.4230 0.7097 0.704 0.280 0.000 0.008 0.008
#> SRR772575 1 0.4721 0.6840 0.656 0.316 0.000 0.016 0.012
#> SRR772576 2 0.5009 0.5760 0.176 0.736 0.000 0.044 0.044
#> SRR772577 2 0.5613 0.1885 0.344 0.588 0.000 0.020 0.048
#> SRR772578 2 0.7082 -0.2453 0.088 0.432 0.004 0.412 0.064
#> SRR772579 4 0.7490 0.3177 0.084 0.392 0.020 0.432 0.072
#> SRR772580 3 0.0000 0.9893 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772581 4 0.6373 0.7154 0.124 0.216 0.000 0.616 0.044
#> SRR772582 4 0.6682 0.6847 0.152 0.236 0.000 0.572 0.040
#> SRR772583 1 0.3652 0.6981 0.784 0.200 0.000 0.004 0.012
#> SRR772584 1 0.4558 0.6576 0.708 0.252 0.000 0.004 0.036
#> SRR772585 1 0.6428 0.4842 0.576 0.292 0.000 0.056 0.076
#> SRR772586 5 0.4536 0.9636 0.000 0.008 0.344 0.008 0.640
#> SRR772587 1 0.4326 0.7236 0.764 0.188 0.000 0.016 0.032
#> SRR772588 2 0.4676 0.6111 0.220 0.728 0.000 0.020 0.032
#> SRR772589 2 0.5262 0.5786 0.216 0.700 0.000 0.040 0.044
#> SRR772590 3 0.0000 0.9893 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.4838 0.6770 0.676 0.284 0.000 0.020 0.020
#> SRR772592 1 0.4726 0.6832 0.684 0.280 0.000 0.020 0.016
#> SRR772593 5 0.4060 0.9800 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR772594 4 0.6803 0.5621 0.076 0.308 0.000 0.536 0.080
#> SRR772595 4 0.6934 0.3880 0.088 0.400 0.000 0.448 0.064
#> SRR772596 5 0.4060 0.9800 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR772597 3 0.0162 0.9888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772598 1 0.5504 0.5774 0.624 0.308 0.000 0.040 0.028
#> SRR772599 1 0.5457 0.6284 0.660 0.260 0.000 0.028 0.052
#> SRR772600 4 0.3863 0.7433 0.152 0.052 0.000 0.796 0.000
#> SRR772601 4 0.3764 0.7407 0.156 0.044 0.000 0.800 0.000
#> SRR772602 3 0.0162 0.9879 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772603 4 0.3804 0.7393 0.160 0.044 0.000 0.796 0.000
#> SRR772604 4 0.3835 0.7435 0.156 0.048 0.000 0.796 0.000
#> SRR772605 1 0.6295 0.5616 0.612 0.252 0.000 0.064 0.072
#> SRR772606 1 0.5021 0.6699 0.704 0.228 0.000 0.020 0.048
#> SRR772607 1 0.5049 0.6615 0.700 0.232 0.000 0.020 0.048
#> SRR772608 1 0.4847 0.6391 0.684 0.268 0.000 0.008 0.040
#> SRR772609 1 0.4285 0.6930 0.752 0.208 0.000 0.008 0.032
#> SRR772610 1 0.5813 0.1706 0.472 0.460 0.000 0.020 0.048
#> SRR772611 2 0.5845 0.3095 0.336 0.580 0.000 0.024 0.060
#> SRR772612 4 0.3590 0.7376 0.036 0.128 0.000 0.828 0.008
#> SRR772613 4 0.4123 0.7518 0.060 0.128 0.000 0.800 0.012
#> SRR772614 1 0.5519 0.6564 0.624 0.304 0.000 0.020 0.052
#> SRR772615 1 0.5254 0.6127 0.612 0.340 0.000 0.020 0.028
#> SRR772616 1 0.3837 0.7120 0.800 0.164 0.000 0.024 0.012
#> SRR772617 4 0.4069 0.7547 0.108 0.088 0.000 0.800 0.004
#> SRR772618 4 0.3898 0.7537 0.108 0.076 0.000 0.812 0.004
#> SRR772619 4 0.6707 0.5376 0.056 0.264 0.000 0.568 0.112
#> SRR772620 4 0.6766 0.5279 0.056 0.268 0.000 0.560 0.116
#> SRR772621 2 0.2490 0.6829 0.080 0.896 0.000 0.020 0.004
#> SRR772622 2 0.4244 0.6119 0.168 0.780 0.000 0.028 0.024
#> SRR772623 3 0.1186 0.9479 0.008 0.000 0.964 0.020 0.008
#> SRR772624 5 0.4196 0.9815 0.000 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR772625 5 0.5394 0.8738 0.008 0.036 0.296 0.016 0.644
#> SRR772626 4 0.7962 0.6014 0.100 0.288 0.032 0.480 0.100
#> SRR772627 4 0.7453 0.5819 0.092 0.316 0.012 0.492 0.088
#> SRR772628 1 0.5574 0.6411 0.592 0.340 0.000 0.016 0.052
#> SRR772629 1 0.5518 0.5492 0.540 0.408 0.000 0.024 0.028
#> SRR772630 1 0.4365 0.6766 0.676 0.308 0.000 0.004 0.012
#> SRR772631 5 0.4196 0.9815 0.000 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR772632 2 0.4005 0.6847 0.044 0.828 0.000 0.072 0.056
#> SRR772633 2 0.3973 0.6801 0.036 0.828 0.000 0.080 0.056
#> SRR772634 2 0.4651 0.5689 0.208 0.728 0.000 0.060 0.004
#> SRR772635 2 0.4060 0.6320 0.156 0.788 0.000 0.052 0.004
#> SRR772636 5 0.4268 0.9716 0.000 0.000 0.344 0.008 0.648
#> SRR772637 1 0.2753 0.7059 0.856 0.136 0.000 0.000 0.008
#> SRR772638 1 0.2907 0.6946 0.864 0.116 0.000 0.012 0.008
#> SRR772639 2 0.5071 0.5601 0.260 0.680 0.000 0.016 0.044
#> SRR772640 2 0.5895 0.5636 0.048 0.680 0.000 0.152 0.120
#> SRR772641 2 0.6002 0.5610 0.052 0.672 0.000 0.152 0.124
#> SRR772642 2 0.3937 0.6340 0.184 0.784 0.000 0.020 0.012
#> SRR772643 2 0.3351 0.6793 0.132 0.836 0.000 0.028 0.004
#> SRR772644 1 0.3585 0.6988 0.772 0.220 0.000 0.004 0.004
#> SRR772645 1 0.3246 0.7046 0.808 0.184 0.000 0.000 0.008
#> SRR772646 2 0.2026 0.7052 0.044 0.928 0.000 0.016 0.012
#> SRR772647 2 0.2054 0.7016 0.072 0.916 0.000 0.004 0.008
#> SRR772648 2 0.2708 0.6909 0.072 0.892 0.000 0.016 0.020
#> SRR772649 2 0.2554 0.6868 0.076 0.896 0.000 0.020 0.008
#> SRR772650 1 0.4669 0.6583 0.628 0.352 0.000 0.012 0.008
#> SRR772651 1 0.4688 0.6508 0.616 0.364 0.000 0.004 0.016
#> SRR772652 2 0.5488 0.0558 0.404 0.544 0.000 0.036 0.016
#> SRR772653 2 0.5604 -0.1415 0.444 0.500 0.000 0.040 0.016
#> SRR772654 2 0.3016 0.6579 0.132 0.848 0.000 0.020 0.000
#> SRR772655 2 0.2828 0.6791 0.104 0.872 0.000 0.020 0.004
#> SRR772656 3 0.0404 0.9811 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772657 3 0.0162 0.9865 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772658 4 0.4100 0.7420 0.060 0.096 0.000 0.816 0.028
#> SRR772659 4 0.3617 0.7390 0.060 0.096 0.000 0.836 0.008
#> SRR772660 2 0.6561 0.0173 0.412 0.468 0.000 0.048 0.072
#> SRR772661 5 0.4196 0.9815 0.000 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR772662 1 0.4919 0.6582 0.604 0.368 0.000 0.016 0.012
#> SRR772663 1 0.3455 0.7099 0.784 0.208 0.000 0.000 0.008
#> SRR772664 2 0.5029 0.6075 0.200 0.720 0.000 0.024 0.056
#> SRR772665 2 0.5178 0.5661 0.232 0.692 0.000 0.020 0.056
#> SRR772666 3 0.0000 0.9893 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772667 1 0.7635 0.2302 0.440 0.308 0.000 0.172 0.080
#> SRR772668 4 0.5057 0.6994 0.076 0.112 0.000 0.756 0.056
#> SRR772669 4 0.4963 0.6913 0.140 0.072 0.000 0.752 0.036
#> SRR772670 1 0.4812 0.6075 0.652 0.312 0.000 0.004 0.032
#> SRR772671 1 0.3559 0.7051 0.804 0.176 0.000 0.008 0.012
#> SRR772672 2 0.5939 0.2270 0.368 0.548 0.000 0.024 0.060
#> SRR772673 2 0.5922 -0.1358 0.460 0.464 0.000 0.020 0.056
#> SRR772674 3 0.0794 0.9589 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772675 5 0.4060 0.9800 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR772676 2 0.3846 0.5629 0.200 0.776 0.000 0.020 0.004
#> SRR772677 2 0.3516 0.6138 0.164 0.812 0.000 0.020 0.004
#> SRR772678 5 0.4196 0.9815 0.000 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR772679 1 0.5038 0.6585 0.692 0.248 0.000 0.032 0.028
#> SRR772680 1 0.4654 0.7085 0.732 0.216 0.000 0.024 0.028
#> SRR772681 3 0.0162 0.9888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772682 2 0.3827 0.6729 0.144 0.812 0.000 0.024 0.020
#> SRR772683 2 0.3609 0.6825 0.112 0.836 0.000 0.016 0.036
#> SRR772685 2 0.2490 0.6825 0.080 0.896 0.000 0.020 0.004
#> SRR772686 3 0.0000 0.9893 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772687 5 0.4211 0.9781 0.000 0.000 0.360 0.004 0.636
#> SRR772688 2 0.5407 0.6372 0.076 0.728 0.000 0.132 0.064
#> SRR772689 2 0.5374 0.6539 0.096 0.728 0.000 0.128 0.048
#> SRR772690 3 0.0000 0.9893 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772691 5 0.4252 0.9674 0.000 0.000 0.340 0.008 0.652
#> SRR772692 2 0.4639 0.5115 0.236 0.708 0.000 0.056 0.000
#> SRR772693 2 0.3887 0.6386 0.160 0.796 0.000 0.040 0.004
#> SRR772694 1 0.5229 0.3711 0.528 0.432 0.000 0.004 0.036
#> SRR772695 1 0.4712 0.6723 0.716 0.236 0.000 0.020 0.028
#> SRR772696 2 0.4110 0.6373 0.152 0.792 0.000 0.044 0.012
#> SRR772697 2 0.3982 0.6552 0.116 0.812 0.000 0.060 0.012
#> SRR772698 5 0.4060 0.9800 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR772699 1 0.5468 0.6371 0.632 0.300 0.000 0.028 0.040
#> SRR772700 1 0.5186 0.6682 0.656 0.288 0.000 0.024 0.032
#> SRR772701 1 0.5751 0.4306 0.488 0.448 0.000 0.020 0.044
#> SRR772702 1 0.5724 0.5078 0.528 0.408 0.000 0.024 0.040
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.3516 0.4242 0.792 0.000 0.012 0.024 0.000 0.172
#> SRR772342 1 0.3098 0.4217 0.812 0.000 0.000 0.024 0.000 0.164
#> SRR772343 6 0.5142 0.5628 0.428 0.000 0.000 0.084 0.000 0.488
#> SRR772344 4 0.4558 0.5712 0.256 0.000 0.004 0.680 0.004 0.056
#> SRR772345 4 0.4667 0.5599 0.280 0.000 0.016 0.664 0.004 0.036
#> SRR772346 2 0.6213 0.5271 0.308 0.524 0.008 0.032 0.000 0.128
#> SRR772347 2 0.5735 0.4271 0.420 0.484 0.008 0.036 0.000 0.052
#> SRR772348 6 0.5559 0.6232 0.244 0.016 0.004 0.112 0.004 0.620
#> SRR772349 6 0.5599 0.6117 0.240 0.012 0.004 0.144 0.000 0.600
#> SRR772350 3 0.3056 0.9696 0.000 0.012 0.820 0.000 0.160 0.008
#> SRR772351 4 0.6277 0.2041 0.416 0.008 0.024 0.420 0.000 0.132
#> SRR772352 4 0.5720 0.2466 0.440 0.000 0.020 0.444 0.000 0.096
#> SRR772353 6 0.5541 0.5442 0.364 0.000 0.004 0.124 0.000 0.508
#> SRR772354 6 0.5526 0.6033 0.348 0.000 0.012 0.104 0.000 0.536
#> SRR772355 4 0.5681 0.4701 0.340 0.000 0.020 0.544 0.004 0.092
#> SRR772356 4 0.5693 0.5272 0.204 0.004 0.020 0.624 0.004 0.144
#> SRR772357 1 0.4610 -0.3454 0.568 0.000 0.000 0.044 0.000 0.388
#> SRR772358 1 0.5152 -0.3345 0.512 0.000 0.000 0.088 0.000 0.400
#> SRR772359 4 0.5478 0.3522 0.432 0.012 0.008 0.484 0.000 0.064
#> SRR772360 4 0.5307 0.3223 0.452 0.008 0.008 0.476 0.000 0.056
#> SRR772361 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772362 4 0.5270 0.4591 0.044 0.112 0.084 0.724 0.000 0.036
#> SRR772363 4 0.5372 0.4536 0.048 0.116 0.084 0.716 0.000 0.036
#> SRR772364 2 0.5627 0.4706 0.376 0.528 0.004 0.036 0.000 0.056
#> SRR772365 2 0.6430 0.4554 0.352 0.480 0.004 0.084 0.000 0.080
#> SRR772366 5 0.0260 0.9887 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772367 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772368 6 0.5900 0.5488 0.184 0.044 0.008 0.140 0.000 0.624
#> SRR772369 4 0.5285 0.4469 0.368 0.000 0.000 0.524 0.000 0.108
#> SRR772370 4 0.5223 0.4623 0.356 0.000 0.000 0.540 0.000 0.104
#> SRR772371 2 0.7471 0.3456 0.352 0.392 0.008 0.144 0.020 0.084
#> SRR772372 2 0.7487 0.3571 0.352 0.396 0.008 0.108 0.020 0.116
#> SRR772373 4 0.5186 0.5530 0.232 0.000 0.000 0.612 0.000 0.156
#> SRR772374 4 0.4757 0.5470 0.280 0.000 0.000 0.636 0.000 0.084
#> SRR772375 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772376 4 0.4341 0.5797 0.120 0.028 0.004 0.780 0.008 0.060
#> SRR772377 5 0.0146 0.9869 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772378 6 0.5309 0.5899 0.436 0.028 0.012 0.024 0.000 0.500
#> SRR772379 6 0.4587 0.6396 0.356 0.000 0.000 0.048 0.000 0.596
#> SRR772380 6 0.4588 0.6120 0.420 0.008 0.000 0.024 0.000 0.548
#> SRR772381 3 0.2697 0.9817 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR772382 1 0.3253 0.5878 0.848 0.004 0.020 0.088 0.000 0.040
#> SRR772383 1 0.3160 0.5772 0.840 0.000 0.008 0.104 0.000 0.048
#> SRR772384 5 0.0260 0.9887 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772385 5 0.0508 0.9719 0.000 0.000 0.004 0.012 0.984 0.000
#> SRR772386 4 0.4929 0.5138 0.328 0.004 0.004 0.604 0.000 0.060
#> SRR772387 4 0.4840 0.5056 0.336 0.008 0.004 0.608 0.000 0.044
#> SRR772388 1 0.4808 -0.5510 0.484 0.016 0.012 0.008 0.000 0.480
#> SRR772389 1 0.4946 -0.5341 0.496 0.024 0.012 0.008 0.000 0.460
#> SRR772390 5 0.0458 0.9852 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772391 6 0.5006 0.5586 0.448 0.028 0.012 0.008 0.000 0.504
#> SRR772392 1 0.4805 -0.5461 0.496 0.016 0.008 0.012 0.000 0.468
#> SRR772393 2 0.7213 0.3534 0.324 0.416 0.004 0.148 0.004 0.104
#> SRR772394 2 0.7427 0.3047 0.304 0.388 0.004 0.192 0.004 0.108
#> SRR772395 6 0.5911 -0.0402 0.076 0.036 0.004 0.432 0.000 0.452
#> SRR772396 1 0.3567 0.4748 0.828 0.016 0.016 0.032 0.000 0.108
#> SRR772397 1 0.1857 0.5785 0.928 0.000 0.012 0.032 0.000 0.028
#> SRR772398 1 0.6338 0.0308 0.504 0.044 0.008 0.344 0.004 0.096
#> SRR772399 1 0.5950 0.1523 0.544 0.040 0.004 0.320 0.000 0.092
#> SRR772400 1 0.5290 0.5068 0.700 0.044 0.012 0.172 0.004 0.068
#> SRR772401 1 0.4684 0.5698 0.748 0.044 0.004 0.120 0.000 0.084
#> SRR772402 2 0.4169 0.6902 0.072 0.784 0.000 0.020 0.008 0.116
#> SRR772403 2 0.4188 0.6998 0.080 0.784 0.000 0.028 0.004 0.104
#> SRR772404 6 0.5751 0.3289 0.096 0.028 0.004 0.304 0.000 0.568
#> SRR772405 5 0.0363 0.9875 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772406 4 0.5798 0.3491 0.396 0.000 0.020 0.476 0.000 0.108
#> SRR772407 4 0.5775 0.3642 0.384 0.000 0.016 0.484 0.000 0.116
#> SRR772408 4 0.4982 0.5274 0.060 0.068 0.052 0.756 0.000 0.064
#> SRR772409 4 0.5139 0.5252 0.064 0.080 0.056 0.744 0.000 0.056
#> SRR772410 6 0.5683 0.5290 0.336 0.000 0.000 0.172 0.000 0.492
#> SRR772411 6 0.5509 0.5621 0.368 0.000 0.000 0.136 0.000 0.496
#> SRR772412 1 0.3103 0.5933 0.856 0.004 0.012 0.080 0.000 0.048
#> SRR772413 1 0.2046 0.5689 0.916 0.000 0.008 0.032 0.000 0.044
#> SRR772414 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772415 6 0.5169 0.6290 0.292 0.000 0.000 0.120 0.000 0.588
#> SRR772416 6 0.5117 0.6307 0.288 0.000 0.000 0.116 0.000 0.596
#> SRR772417 1 0.4617 0.0503 0.652 0.004 0.000 0.060 0.000 0.284
#> SRR772418 5 0.0458 0.9852 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772419 4 0.4819 0.5563 0.068 0.040 0.028 0.756 0.000 0.108
#> SRR772420 4 0.4853 0.5397 0.068 0.044 0.016 0.744 0.000 0.128
#> SRR772421 4 0.6159 0.4164 0.364 0.044 0.020 0.508 0.000 0.064
#> SRR772422 4 0.5484 0.4404 0.380 0.012 0.016 0.536 0.000 0.056
#> SRR772423 2 0.4629 0.7080 0.068 0.764 0.000 0.068 0.008 0.092
#> SRR772424 2 0.4419 0.6864 0.040 0.756 0.000 0.160 0.008 0.036
#> SRR772425 4 0.4785 0.5793 0.168 0.008 0.004 0.704 0.000 0.116
#> SRR772426 4 0.3966 0.5968 0.152 0.008 0.016 0.784 0.000 0.040
#> SRR772427 4 0.4179 0.5973 0.152 0.008 0.020 0.772 0.000 0.048
#> SRR772428 1 0.3658 0.5895 0.820 0.024 0.004 0.104 0.000 0.048
#> SRR772429 1 0.3169 0.5868 0.864 0.024 0.012 0.056 0.000 0.044
#> SRR772430 6 0.5563 0.6358 0.252 0.052 0.004 0.056 0.004 0.632
#> SRR772431 2 0.4024 0.6940 0.080 0.784 0.000 0.020 0.000 0.116
#> SRR772432 2 0.4069 0.6925 0.076 0.788 0.004 0.020 0.000 0.112
#> SRR772433 1 0.3673 0.5720 0.836 0.040 0.016 0.064 0.000 0.044
#> SRR772434 1 0.3854 0.5560 0.820 0.032 0.012 0.060 0.000 0.076
#> SRR772435 1 0.3664 0.5839 0.808 0.012 0.000 0.104 0.000 0.076
#> SRR772436 1 0.3196 0.5708 0.844 0.004 0.004 0.072 0.000 0.076
#> SRR772437 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772438 1 0.6133 0.1886 0.604 0.204 0.004 0.036 0.012 0.140
#> SRR772439 1 0.6374 0.1703 0.580 0.208 0.008 0.080 0.000 0.124
#> SRR772440 1 0.5547 -0.1383 0.488 0.000 0.004 0.388 0.000 0.120
#> SRR772441 4 0.5423 0.2939 0.440 0.000 0.012 0.468 0.000 0.080
#> SRR772442 2 0.4416 0.7048 0.072 0.768 0.000 0.060 0.000 0.100
#> SRR772443 2 0.4160 0.6914 0.088 0.776 0.000 0.024 0.000 0.112
#> SRR772444 1 0.2419 0.5855 0.896 0.000 0.016 0.060 0.000 0.028
#> SRR772445 1 0.3113 0.5636 0.864 0.008 0.020 0.048 0.000 0.060
#> SRR772446 6 0.4892 0.5544 0.408 0.024 0.012 0.008 0.000 0.548
#> SRR772447 6 0.4878 0.5791 0.400 0.024 0.012 0.008 0.000 0.556
#> SRR772448 1 0.6541 -0.2200 0.444 0.036 0.020 0.400 0.004 0.096
#> SRR772449 4 0.5983 0.3431 0.408 0.012 0.020 0.468 0.000 0.092
#> SRR772450 4 0.5485 0.4519 0.040 0.116 0.088 0.708 0.000 0.048
#> SRR772451 4 0.5351 0.4426 0.032 0.116 0.088 0.716 0.000 0.048
#> SRR772452 6 0.4871 0.5589 0.396 0.024 0.012 0.008 0.000 0.560
#> SRR772453 6 0.4905 0.5724 0.416 0.024 0.012 0.008 0.000 0.540
#> SRR772454 1 0.4204 0.2057 0.732 0.012 0.008 0.028 0.000 0.220
#> SRR772455 6 0.4471 0.5563 0.472 0.000 0.000 0.028 0.000 0.500
#> SRR772456 4 0.5442 0.4996 0.052 0.080 0.060 0.720 0.000 0.088
#> SRR772457 4 0.5396 0.5198 0.060 0.060 0.064 0.724 0.000 0.092
#> SRR772458 1 0.2589 0.5642 0.888 0.000 0.024 0.028 0.000 0.060
#> SRR772459 1 0.2434 0.5816 0.900 0.004 0.012 0.044 0.000 0.040
#> SRR772460 4 0.5331 0.3981 0.032 0.160 0.064 0.704 0.000 0.040
#> SRR772461 4 0.5334 0.3891 0.028 0.168 0.060 0.700 0.000 0.044
#> SRR772462 6 0.5413 0.5038 0.160 0.000 0.004 0.244 0.000 0.592
#> SRR772463 6 0.5495 0.5484 0.140 0.016 0.004 0.212 0.000 0.628
#> SRR772464 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772465 1 0.5826 0.2361 0.492 0.000 0.000 0.272 0.000 0.236
#> SRR772466 1 0.5927 0.0501 0.448 0.000 0.000 0.228 0.000 0.324
#> SRR772467 4 0.5276 0.4529 0.020 0.112 0.072 0.720 0.000 0.076
#> SRR772468 4 0.5322 0.4523 0.028 0.112 0.076 0.720 0.000 0.064
#> SRR772469 6 0.4808 0.5891 0.436 0.008 0.004 0.028 0.000 0.524
#> SRR772470 6 0.4624 0.5896 0.452 0.008 0.000 0.024 0.000 0.516
#> SRR772471 6 0.4941 0.6065 0.376 0.000 0.000 0.072 0.000 0.552
#> SRR772472 6 0.4994 0.6127 0.412 0.004 0.000 0.060 0.000 0.524
#> SRR772473 2 0.4560 0.7043 0.100 0.756 0.000 0.088 0.000 0.056
#> SRR772474 2 0.4220 0.6978 0.088 0.776 0.000 0.032 0.000 0.104
#> SRR772475 5 0.0146 0.9839 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR772476 4 0.5268 0.4431 0.032 0.108 0.088 0.724 0.000 0.048
#> SRR772477 4 0.5206 0.4455 0.036 0.112 0.084 0.728 0.000 0.040
#> SRR772478 6 0.5327 0.6013 0.372 0.016 0.008 0.052 0.000 0.552
#> SRR772479 6 0.4794 0.5725 0.448 0.012 0.008 0.016 0.000 0.516
#> SRR772480 2 0.4212 0.6947 0.108 0.772 0.000 0.024 0.000 0.096
#> SRR772481 2 0.4187 0.6985 0.124 0.772 0.000 0.024 0.000 0.080
#> SRR772482 1 0.5743 0.2545 0.584 0.044 0.004 0.292 0.000 0.076
#> SRR772483 1 0.5879 0.3543 0.584 0.028 0.004 0.248 0.000 0.136
#> SRR772484 6 0.5977 0.4522 0.188 0.012 0.004 0.256 0.000 0.540
#> SRR772485 6 0.5966 0.4670 0.192 0.012 0.004 0.248 0.000 0.544
#> SRR772486 1 0.7227 0.0709 0.500 0.220 0.008 0.100 0.012 0.160
#> SRR772487 1 0.7265 0.0951 0.508 0.204 0.008 0.104 0.016 0.160
#> SRR772488 6 0.6044 0.3136 0.268 0.000 0.004 0.264 0.000 0.464
#> SRR772489 6 0.6288 0.3824 0.268 0.004 0.012 0.244 0.000 0.472
#> SRR772490 1 0.2207 0.5920 0.900 0.000 0.016 0.076 0.000 0.008
#> SRR772491 1 0.2487 0.5461 0.892 0.000 0.020 0.024 0.000 0.064
#> SRR772492 4 0.5624 0.2345 0.032 0.248 0.032 0.636 0.000 0.052
#> SRR772493 4 0.5611 0.2463 0.032 0.244 0.036 0.640 0.000 0.048
#> SRR772494 4 0.5544 0.4458 0.040 0.116 0.088 0.704 0.000 0.052
#> SRR772495 4 0.5419 0.4428 0.036 0.116 0.088 0.712 0.000 0.048
#> SRR772496 6 0.5697 0.2614 0.168 0.000 0.000 0.356 0.000 0.476
#> SRR772497 6 0.5650 0.3202 0.168 0.000 0.000 0.332 0.000 0.500
#> SRR772498 2 0.8493 0.3146 0.236 0.352 0.004 0.200 0.092 0.116
#> SRR772499 2 0.8519 0.3276 0.228 0.352 0.004 0.204 0.100 0.112
#> SRR772500 4 0.4205 0.5923 0.136 0.008 0.008 0.768 0.000 0.080
#> SRR772501 4 0.4401 0.5946 0.180 0.004 0.016 0.740 0.000 0.060
#> SRR772502 4 0.5257 0.3310 0.448 0.008 0.008 0.484 0.000 0.052
#> SRR772503 1 0.4065 0.3808 0.708 0.004 0.004 0.260 0.000 0.024
#> SRR772504 4 0.5183 0.4905 0.328 0.000 0.012 0.584 0.000 0.076
#> SRR772505 4 0.4788 0.5523 0.276 0.000 0.008 0.648 0.000 0.068
#> SRR772506 4 0.5648 0.4947 0.052 0.096 0.036 0.692 0.000 0.124
#> SRR772507 4 0.5372 0.5176 0.052 0.084 0.040 0.720 0.000 0.104
#> SRR772508 6 0.5925 0.4543 0.096 0.044 0.008 0.260 0.000 0.592
#> SRR772509 5 0.0260 0.9887 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772510 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772511 1 0.5762 0.3219 0.556 0.000 0.012 0.260 0.000 0.172
#> SRR772512 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772513 6 0.5211 0.6118 0.188 0.032 0.004 0.096 0.000 0.680
#> SRR772514 6 0.5486 0.5965 0.188 0.020 0.004 0.148 0.000 0.640
#> SRR772515 4 0.5359 0.4641 0.364 0.000 0.008 0.536 0.000 0.092
#> SRR772516 4 0.5280 0.5087 0.316 0.000 0.004 0.572 0.000 0.108
#> SRR772517 4 0.6042 0.1870 0.360 0.000 0.004 0.424 0.000 0.212
#> SRR772518 1 0.6247 -0.0543 0.352 0.000 0.004 0.320 0.000 0.324
#> SRR772519 4 0.5605 0.0300 0.124 0.000 0.004 0.452 0.000 0.420
#> SRR772520 4 0.5026 0.4813 0.124 0.000 0.000 0.624 0.000 0.252
#> SRR772521 1 0.5376 -0.0149 0.532 0.008 0.008 0.384 0.000 0.068
#> SRR772522 1 0.5543 -0.2708 0.452 0.004 0.008 0.448 0.000 0.088
#> SRR772523 4 0.6710 0.2171 0.364 0.036 0.020 0.440 0.000 0.140
#> SRR772524 4 0.5678 0.4548 0.348 0.008 0.020 0.544 0.000 0.080
#> SRR772525 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772526 4 0.5414 0.4499 0.036 0.108 0.080 0.716 0.000 0.060
#> SRR772527 4 0.5573 0.4487 0.036 0.108 0.080 0.704 0.000 0.072
#> SRR772528 5 0.0363 0.9875 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772529 1 0.2614 0.5820 0.884 0.000 0.012 0.060 0.000 0.044
#> SRR772530 1 0.2475 0.5848 0.892 0.000 0.012 0.060 0.000 0.036
#> SRR772531 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772532 4 0.5017 0.5651 0.248 0.000 0.016 0.652 0.000 0.084
#> SRR772533 4 0.4824 0.5786 0.208 0.000 0.012 0.684 0.000 0.096
#> SRR772534 1 0.4948 0.1069 0.668 0.044 0.004 0.032 0.000 0.252
#> SRR772535 4 0.5866 0.3148 0.404 0.004 0.020 0.472 0.000 0.100
#> SRR772536 4 0.5386 0.5198 0.312 0.000 0.016 0.580 0.000 0.092
#> SRR772537 2 0.5221 0.6066 0.060 0.640 0.004 0.272 0.008 0.016
#> SRR772538 2 0.5400 0.5587 0.056 0.604 0.004 0.308 0.008 0.020
#> SRR772539 6 0.4710 0.5691 0.444 0.012 0.012 0.008 0.000 0.524
#> SRR772540 1 0.3803 0.1589 0.724 0.004 0.000 0.020 0.000 0.252
#> SRR772541 6 0.5129 0.6244 0.240 0.052 0.004 0.040 0.000 0.664
#> SRR772542 1 0.6891 0.3082 0.556 0.136 0.004 0.148 0.012 0.144
#> SRR772543 1 0.6161 0.3899 0.616 0.132 0.004 0.060 0.008 0.180
#> SRR772544 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772545 1 0.4672 0.4980 0.700 0.000 0.004 0.144 0.000 0.152
#> SRR772546 1 0.4790 0.4385 0.680 0.000 0.004 0.120 0.000 0.196
#> SRR772547 1 0.5061 -0.5234 0.472 0.008 0.004 0.044 0.000 0.472
#> SRR772548 1 0.4691 -0.4831 0.524 0.004 0.012 0.016 0.000 0.444
#> SRR772549 6 0.4871 0.5754 0.396 0.024 0.012 0.008 0.000 0.560
#> SRR772550 6 0.4863 0.5616 0.392 0.024 0.012 0.008 0.000 0.564
#> SRR772551 1 0.6379 0.0514 0.520 0.104 0.000 0.084 0.000 0.292
#> SRR772552 1 0.6636 -0.0106 0.448 0.052 0.000 0.184 0.000 0.316
#> SRR772553 5 0.0146 0.9839 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR772554 4 0.4772 0.5349 0.308 0.000 0.004 0.624 0.000 0.064
#> SRR772555 4 0.4916 0.5365 0.296 0.000 0.004 0.620 0.000 0.080
#> SRR772556 1 0.2978 0.5799 0.860 0.000 0.012 0.072 0.000 0.056
#> SRR772557 1 0.2119 0.5666 0.912 0.000 0.008 0.036 0.000 0.044
#> SRR772558 6 0.4834 0.5911 0.408 0.012 0.016 0.012 0.000 0.552
#> SRR772559 6 0.4806 0.5934 0.400 0.020 0.008 0.012 0.000 0.560
#> SRR772560 6 0.5111 0.6440 0.336 0.032 0.000 0.040 0.000 0.592
#> SRR772561 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772562 4 0.4933 0.4822 0.104 0.000 0.000 0.624 0.000 0.272
#> SRR772563 4 0.5381 0.3683 0.144 0.000 0.000 0.560 0.000 0.296
#> SRR772564 1 0.5537 0.4715 0.672 0.060 0.004 0.140 0.000 0.124
#> SRR772565 1 0.4752 0.5071 0.740 0.060 0.000 0.092 0.000 0.108
#> SRR772566 1 0.4053 0.5646 0.780 0.036 0.000 0.140 0.000 0.044
#> SRR772567 1 0.3742 0.5476 0.788 0.000 0.008 0.148 0.000 0.056
#> SRR772568 4 0.4806 0.5417 0.296 0.004 0.004 0.636 0.000 0.060
#> SRR772569 4 0.4940 0.5429 0.284 0.008 0.004 0.644 0.004 0.056
#> SRR772570 1 0.4871 0.3750 0.656 0.000 0.000 0.132 0.000 0.212
#> SRR772571 1 0.4766 -0.0556 0.612 0.000 0.000 0.072 0.000 0.316
#> SRR772572 1 0.4986 -0.4855 0.488 0.000 0.000 0.068 0.000 0.444
#> SRR772573 1 0.5669 -0.0387 0.504 0.000 0.000 0.176 0.000 0.320
#> SRR772574 1 0.3441 0.4404 0.812 0.004 0.012 0.024 0.000 0.148
#> SRR772575 1 0.2753 0.5544 0.872 0.000 0.008 0.048 0.000 0.072
#> SRR772576 1 0.5808 -0.2400 0.452 0.004 0.016 0.428 0.000 0.100
#> SRR772577 1 0.5717 0.3045 0.572 0.000 0.016 0.256 0.000 0.156
#> SRR772578 4 0.7668 -0.1525 0.160 0.340 0.012 0.360 0.008 0.120
#> SRR772579 2 0.8012 0.2374 0.140 0.352 0.012 0.336 0.032 0.128
#> SRR772580 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772581 2 0.6277 0.4796 0.336 0.512 0.008 0.084 0.000 0.060
#> SRR772582 2 0.6701 0.4086 0.344 0.452 0.004 0.128 0.000 0.072
#> SRR772583 6 0.4799 0.6120 0.428 0.008 0.004 0.028 0.000 0.532
#> SRR772584 6 0.4961 0.6042 0.404 0.004 0.004 0.048 0.000 0.540
#> SRR772585 6 0.5422 0.6200 0.248 0.036 0.000 0.088 0.000 0.628
#> SRR772586 5 0.0291 0.9829 0.000 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR772587 1 0.4919 -0.0551 0.628 0.012 0.012 0.036 0.000 0.312
#> SRR772588 4 0.6001 -0.0640 0.140 0.012 0.004 0.460 0.000 0.384
#> SRR772589 6 0.5984 0.2161 0.148 0.008 0.004 0.416 0.000 0.424
#> SRR772590 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772591 1 0.2706 0.5869 0.880 0.004 0.008 0.068 0.000 0.040
#> SRR772592 1 0.2533 0.5747 0.892 0.004 0.008 0.052 0.000 0.044
#> SRR772593 5 0.0363 0.9875 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772594 2 0.6232 0.4718 0.056 0.508 0.008 0.356 0.004 0.068
#> SRR772595 4 0.6850 -0.3519 0.068 0.404 0.008 0.408 0.008 0.104
#> SRR772596 5 0.0458 0.9851 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772597 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772598 1 0.4517 0.5559 0.764 0.044 0.004 0.100 0.000 0.088
#> SRR772599 1 0.3836 0.5679 0.824 0.044 0.012 0.064 0.000 0.056
#> SRR772600 2 0.4052 0.6898 0.076 0.784 0.000 0.024 0.000 0.116
#> SRR772601 2 0.4127 0.6882 0.072 0.784 0.000 0.016 0.008 0.120
#> SRR772602 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772603 2 0.4206 0.6885 0.072 0.784 0.008 0.024 0.000 0.112
#> SRR772604 2 0.4112 0.6897 0.076 0.784 0.000 0.020 0.004 0.116
#> SRR772605 6 0.4996 0.6278 0.240 0.044 0.000 0.048 0.000 0.668
#> SRR772606 1 0.3299 0.5511 0.844 0.004 0.016 0.048 0.000 0.088
#> SRR772607 1 0.3052 0.5683 0.864 0.004 0.020 0.044 0.000 0.068
#> SRR772608 6 0.5187 0.6507 0.332 0.012 0.004 0.064 0.000 0.588
#> SRR772609 6 0.5007 0.6230 0.404 0.008 0.004 0.044 0.000 0.540
#> SRR772610 6 0.5307 0.6094 0.224 0.000 0.004 0.160 0.000 0.612
#> SRR772611 6 0.5529 0.4740 0.152 0.000 0.004 0.284 0.000 0.560
#> SRR772612 2 0.4136 0.6836 0.036 0.776 0.000 0.148 0.004 0.036
#> SRR772613 2 0.4533 0.6709 0.032 0.732 0.000 0.188 0.004 0.044
#> SRR772614 1 0.2550 0.5834 0.892 0.000 0.024 0.048 0.000 0.036
#> SRR772615 1 0.3695 0.5767 0.808 0.008 0.008 0.124 0.000 0.052
#> SRR772616 6 0.5096 0.5746 0.452 0.020 0.008 0.024 0.000 0.496
#> SRR772617 2 0.4640 0.7017 0.044 0.756 0.000 0.072 0.008 0.120
#> SRR772618 2 0.4669 0.7031 0.052 0.756 0.000 0.068 0.008 0.116
#> SRR772619 2 0.5664 0.3529 0.012 0.492 0.024 0.424 0.004 0.044
#> SRR772620 2 0.5816 0.3251 0.016 0.472 0.028 0.436 0.004 0.044
#> SRR772621 4 0.5280 0.4822 0.352 0.004 0.004 0.556 0.000 0.084
#> SRR772622 1 0.5317 -0.1719 0.500 0.000 0.008 0.412 0.000 0.080
#> SRR772623 3 0.3056 0.9696 0.000 0.012 0.820 0.000 0.160 0.008
#> SRR772624 5 0.0260 0.9887 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772625 5 0.1924 0.9162 0.008 0.008 0.008 0.032 0.932 0.012
#> SRR772626 2 0.8066 0.4244 0.256 0.416 0.008 0.152 0.056 0.112
#> SRR772627 2 0.7882 0.4188 0.252 0.424 0.004 0.164 0.044 0.112
#> SRR772628 1 0.2698 0.5946 0.872 0.000 0.016 0.092 0.000 0.020
#> SRR772629 1 0.3471 0.5948 0.824 0.004 0.016 0.120 0.000 0.036
#> SRR772630 1 0.4696 0.2001 0.672 0.004 0.004 0.068 0.000 0.252
#> SRR772631 5 0.0260 0.9887 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772632 4 0.5320 0.5757 0.148 0.052 0.044 0.712 0.000 0.044
#> SRR772633 4 0.5445 0.5474 0.116 0.064 0.052 0.720 0.004 0.044
#> SRR772634 1 0.6291 -0.2482 0.440 0.052 0.016 0.432 0.004 0.056
#> SRR772635 4 0.5775 0.3874 0.404 0.032 0.016 0.500 0.000 0.048
#> SRR772636 5 0.0146 0.9839 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR772637 6 0.4957 0.5707 0.448 0.020 0.012 0.012 0.000 0.508
#> SRR772638 6 0.4839 0.5690 0.420 0.020 0.012 0.008 0.000 0.540
#> SRR772639 4 0.6462 0.2432 0.264 0.008 0.020 0.480 0.000 0.228
#> SRR772640 4 0.5466 0.4432 0.036 0.116 0.092 0.708 0.000 0.048
#> SRR772641 4 0.5425 0.4471 0.036 0.112 0.092 0.712 0.000 0.048
#> SRR772642 4 0.5945 0.4504 0.348 0.036 0.000 0.512 0.000 0.104
#> SRR772643 4 0.5573 0.4926 0.336 0.024 0.004 0.560 0.000 0.076
#> SRR772644 6 0.5296 0.6202 0.404 0.020 0.008 0.040 0.000 0.528
#> SRR772645 6 0.4693 0.6093 0.424 0.004 0.004 0.028 0.000 0.540
#> SRR772646 4 0.4512 0.5820 0.224 0.012 0.004 0.708 0.000 0.052
#> SRR772647 4 0.4341 0.5826 0.216 0.000 0.004 0.712 0.000 0.068
#> SRR772648 4 0.5459 0.4068 0.392 0.000 0.012 0.508 0.000 0.088
#> SRR772649 4 0.5300 0.4719 0.356 0.000 0.016 0.556 0.000 0.072
#> SRR772650 1 0.4814 0.1605 0.660 0.008 0.004 0.064 0.000 0.264
#> SRR772651 1 0.4655 0.3823 0.680 0.000 0.000 0.112 0.000 0.208
#> SRR772652 1 0.5235 0.2076 0.608 0.036 0.000 0.304 0.000 0.052
#> SRR772653 1 0.4957 0.2736 0.644 0.036 0.000 0.280 0.000 0.040
#> SRR772654 4 0.5177 0.4054 0.404 0.000 0.008 0.520 0.000 0.068
#> SRR772655 4 0.5035 0.4478 0.380 0.000 0.004 0.548 0.000 0.068
#> SRR772656 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772657 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772658 2 0.4575 0.6783 0.024 0.756 0.004 0.140 0.008 0.068
#> SRR772659 2 0.4360 0.6902 0.024 0.772 0.000 0.112 0.008 0.084
#> SRR772660 6 0.5543 0.5444 0.152 0.016 0.004 0.204 0.000 0.624
#> SRR772661 5 0.0260 0.9887 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772662 1 0.3607 0.5599 0.796 0.000 0.000 0.112 0.000 0.092
#> SRR772663 1 0.4654 -0.4486 0.544 0.000 0.000 0.044 0.000 0.412
#> SRR772664 4 0.5782 0.1031 0.140 0.008 0.000 0.472 0.000 0.380
#> SRR772665 4 0.5771 0.0415 0.136 0.008 0.000 0.460 0.000 0.396
#> SRR772666 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772667 6 0.6499 0.5307 0.188 0.132 0.008 0.084 0.004 0.584
#> SRR772668 2 0.5488 0.6152 0.016 0.664 0.004 0.172 0.012 0.132
#> SRR772669 2 0.4774 0.6347 0.028 0.696 0.000 0.048 0.004 0.224
#> SRR772670 6 0.5313 0.5790 0.384 0.000 0.000 0.108 0.000 0.508
#> SRR772671 6 0.4475 0.6148 0.412 0.000 0.000 0.032 0.000 0.556
#> SRR772672 6 0.5508 0.5279 0.168 0.004 0.000 0.252 0.000 0.576
#> SRR772673 6 0.5488 0.6031 0.212 0.004 0.004 0.176 0.000 0.604
#> SRR772674 3 0.3050 0.9215 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR772675 5 0.0363 0.9875 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772676 1 0.4834 -0.2760 0.484 0.000 0.004 0.468 0.000 0.044
#> SRR772677 4 0.4932 0.3260 0.452 0.000 0.004 0.492 0.000 0.052
#> SRR772678 5 0.0260 0.9887 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772679 6 0.5685 0.6135 0.364 0.032 0.004 0.068 0.000 0.532
#> SRR772680 1 0.5187 -0.4607 0.500 0.012 0.004 0.048 0.000 0.436
#> SRR772681 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772682 4 0.5360 0.5214 0.140 0.012 0.004 0.640 0.000 0.204
#> SRR772683 4 0.5248 0.5363 0.144 0.008 0.004 0.648 0.000 0.196
#> SRR772685 4 0.5476 0.4552 0.376 0.004 0.016 0.532 0.000 0.072
#> SRR772686 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772687 5 0.0603 0.9823 0.004 0.000 0.016 0.000 0.980 0.000
#> SRR772688 4 0.5276 0.4999 0.056 0.088 0.048 0.732 0.000 0.076
#> SRR772689 4 0.5470 0.5004 0.072 0.084 0.032 0.720 0.004 0.088
#> SRR772690 3 0.2597 0.9941 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772691 5 0.0146 0.9839 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR772692 1 0.5535 -0.2089 0.504 0.016 0.008 0.408 0.000 0.064
#> SRR772693 4 0.5926 0.3907 0.396 0.032 0.012 0.492 0.000 0.068
#> SRR772694 1 0.6027 -0.2622 0.404 0.000 0.004 0.204 0.000 0.388
#> SRR772695 6 0.5308 0.5723 0.424 0.016 0.004 0.052 0.000 0.504
#> SRR772696 4 0.6561 0.3254 0.392 0.044 0.012 0.444 0.004 0.104
#> SRR772697 4 0.6477 0.3316 0.400 0.044 0.008 0.448 0.008 0.092
#> SRR772698 5 0.0363 0.9875 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772699 1 0.4114 0.5843 0.792 0.020 0.012 0.112 0.000 0.064
#> SRR772700 1 0.3262 0.5890 0.852 0.016 0.008 0.072 0.000 0.052
#> SRR772701 1 0.3604 0.5523 0.796 0.004 0.008 0.160 0.000 0.032
#> SRR772702 1 0.3360 0.5807 0.824 0.004 0.012 0.132 0.000 0.028
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.763 0.891 0.951 0.3916 0.608 0.608
#> 3 3 0.668 0.807 0.915 0.4743 0.724 0.580
#> 4 4 0.627 0.732 0.859 0.2385 0.795 0.556
#> 5 5 0.572 0.556 0.770 0.0691 0.887 0.655
#> 6 6 0.556 0.505 0.688 0.0396 0.947 0.805
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772347 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772348 1 0.3733 0.900 0.928 0.072
#> SRR772349 2 0.7883 0.734 0.236 0.764
#> SRR772350 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772351 1 0.8144 0.655 0.748 0.252
#> SRR772352 2 0.9983 0.163 0.476 0.524
#> SRR772353 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772354 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772355 1 0.8661 0.586 0.712 0.288
#> SRR772356 2 0.2423 0.896 0.040 0.960
#> SRR772357 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772359 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772360 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772361 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772365 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772366 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772368 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772369 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772370 1 0.0672 0.957 0.992 0.008
#> SRR772371 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772372 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772373 2 0.4431 0.870 0.092 0.908
#> SRR772374 2 0.4562 0.866 0.096 0.904
#> SRR772375 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.5408 0.838 0.876 0.124
#> SRR772378 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772379 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772380 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772381 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772384 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772385 1 0.9996 -0.093 0.512 0.488
#> SRR772386 1 0.9881 0.120 0.564 0.436
#> SRR772387 2 0.5408 0.847 0.124 0.876
#> SRR772388 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772393 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772394 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772395 2 0.9044 0.611 0.320 0.680
#> SRR772396 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772402 1 0.1414 0.948 0.980 0.020
#> SRR772403 1 0.5946 0.817 0.856 0.144
#> SRR772404 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772405 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772406 1 0.5842 0.823 0.860 0.140
#> SRR772407 1 0.0672 0.958 0.992 0.008
#> SRR772408 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772410 1 0.1184 0.951 0.984 0.016
#> SRR772411 1 0.2236 0.935 0.964 0.036
#> SRR772412 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772415 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772416 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772417 1 0.0938 0.955 0.988 0.012
#> SRR772418 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772421 1 0.0938 0.954 0.988 0.012
#> SRR772422 1 0.8144 0.633 0.748 0.252
#> SRR772423 1 0.3274 0.914 0.940 0.060
#> SRR772424 1 0.9686 0.310 0.604 0.396
#> SRR772425 2 0.4815 0.862 0.104 0.896
#> SRR772426 2 0.5519 0.843 0.128 0.872
#> SRR772427 2 0.3431 0.884 0.064 0.936
#> SRR772428 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772430 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772431 1 0.0672 0.958 0.992 0.008
#> SRR772432 1 0.0672 0.957 0.992 0.008
#> SRR772433 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772436 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772437 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772440 1 0.0672 0.958 0.992 0.008
#> SRR772441 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772442 1 0.8608 0.585 0.716 0.284
#> SRR772443 1 0.1184 0.951 0.984 0.016
#> SRR772444 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772448 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772449 1 0.5629 0.830 0.868 0.132
#> SRR772450 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.8861 0.638 0.304 0.696
#> SRR772463 2 0.9635 0.471 0.388 0.612
#> SRR772464 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772465 1 0.5629 0.832 0.868 0.132
#> SRR772466 1 0.5059 0.857 0.888 0.112
#> SRR772467 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772470 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772471 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772472 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772473 1 0.6973 0.754 0.812 0.188
#> SRR772474 1 0.7056 0.750 0.808 0.192
#> SRR772475 2 0.9209 0.574 0.336 0.664
#> SRR772476 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772480 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772481 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772482 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772484 2 0.9358 0.551 0.352 0.648
#> SRR772485 2 0.9754 0.424 0.408 0.592
#> SRR772486 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.9896 0.334 0.440 0.560
#> SRR772489 1 0.9580 0.318 0.620 0.380
#> SRR772490 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772496 1 0.8443 0.608 0.728 0.272
#> SRR772497 1 0.1633 0.946 0.976 0.024
#> SRR772498 1 0.0672 0.957 0.992 0.008
#> SRR772499 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772500 2 0.0376 0.905 0.004 0.996
#> SRR772501 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.0672 0.957 0.992 0.008
#> SRR772503 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772504 2 0.0672 0.905 0.008 0.992
#> SRR772505 2 0.0672 0.905 0.008 0.992
#> SRR772506 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772508 1 0.9833 0.165 0.576 0.424
#> SRR772509 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772510 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772511 1 0.0938 0.955 0.988 0.012
#> SRR772512 2 0.9323 0.559 0.348 0.652
#> SRR772513 1 0.1633 0.944 0.976 0.024
#> SRR772514 2 0.9710 0.437 0.400 0.600
#> SRR772515 2 0.5294 0.849 0.120 0.880
#> SRR772516 2 0.2236 0.897 0.036 0.964
#> SRR772517 1 0.6048 0.806 0.852 0.148
#> SRR772518 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772519 2 0.1843 0.900 0.028 0.972
#> SRR772520 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772521 1 0.4022 0.892 0.920 0.080
#> SRR772522 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772523 2 0.3879 0.877 0.076 0.924
#> SRR772524 2 0.1843 0.901 0.028 0.972
#> SRR772525 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0672 0.905 0.008 0.992
#> SRR772534 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772535 1 0.7745 0.690 0.772 0.228
#> SRR772536 2 0.9983 0.200 0.476 0.524
#> SRR772537 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772541 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772547 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772548 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772551 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772552 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772553 1 0.8016 0.655 0.756 0.244
#> SRR772554 2 0.0376 0.905 0.004 0.996
#> SRR772555 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772560 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772561 1 0.7602 0.692 0.780 0.220
#> SRR772562 2 0.8499 0.680 0.276 0.724
#> SRR772563 2 0.2043 0.899 0.032 0.968
#> SRR772564 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.8861 0.634 0.304 0.696
#> SRR772569 2 0.2236 0.898 0.036 0.964
#> SRR772570 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772572 1 0.0672 0.957 0.992 0.008
#> SRR772573 1 0.2423 0.931 0.960 0.040
#> SRR772574 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772576 1 0.0938 0.954 0.988 0.012
#> SRR772577 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772578 2 0.0376 0.905 0.004 0.996
#> SRR772579 2 0.0938 0.904 0.012 0.988
#> SRR772580 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772581 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772582 1 0.0938 0.955 0.988 0.012
#> SRR772583 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772584 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772585 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772588 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.1184 0.903 0.016 0.984
#> SRR772590 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.5059 0.852 0.112 0.888
#> SRR772595 2 0.2778 0.893 0.048 0.952
#> SRR772596 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772600 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772601 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772602 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772603 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772604 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772605 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772606 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772608 1 0.2603 0.928 0.956 0.044
#> SRR772609 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772610 1 0.9754 0.223 0.592 0.408
#> SRR772611 1 0.8713 0.549 0.708 0.292
#> SRR772612 2 0.7815 0.727 0.232 0.768
#> SRR772613 1 0.9248 0.455 0.660 0.340
#> SRR772614 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.0672 0.957 0.992 0.008
#> SRR772617 2 0.2043 0.898 0.032 0.968
#> SRR772618 2 0.6712 0.802 0.176 0.824
#> SRR772619 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772621 1 0.6531 0.779 0.832 0.168
#> SRR772622 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772623 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.1184 0.903 0.016 0.984
#> SRR772626 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772627 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772628 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772630 1 0.1843 0.942 0.972 0.028
#> SRR772631 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772635 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772636 2 0.5059 0.856 0.112 0.888
#> SRR772637 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.9000 0.615 0.316 0.684
#> SRR772640 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772642 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772643 1 0.5629 0.826 0.868 0.132
#> SRR772644 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772646 2 0.2603 0.895 0.044 0.956
#> SRR772647 2 0.5059 0.856 0.112 0.888
#> SRR772648 2 0.8813 0.624 0.300 0.700
#> SRR772649 1 0.9896 0.163 0.560 0.440
#> SRR772650 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772654 1 0.1184 0.951 0.984 0.016
#> SRR772655 1 0.5629 0.830 0.868 0.132
#> SRR772656 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772660 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772661 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772662 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772663 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772664 2 0.1843 0.900 0.028 0.972
#> SRR772665 2 0.6531 0.801 0.168 0.832
#> SRR772666 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772667 1 0.5629 0.827 0.868 0.132
#> SRR772668 1 0.2423 0.930 0.960 0.040
#> SRR772669 1 0.0672 0.957 0.992 0.008
#> SRR772670 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772671 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772672 1 0.2423 0.931 0.960 0.040
#> SRR772673 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772674 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772676 1 0.9393 0.417 0.644 0.356
#> SRR772677 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772678 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772679 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772680 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772681 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.7453 0.761 0.212 0.788
#> SRR772683 2 0.6623 0.799 0.172 0.828
#> SRR772685 1 0.8555 0.575 0.720 0.280
#> SRR772686 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.906 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.9608 0.479 0.384 0.616
#> SRR772692 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772693 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772694 1 0.0938 0.955 0.988 0.012
#> SRR772695 1 0.0376 0.960 0.996 0.004
#> SRR772696 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772697 1 0.1633 0.945 0.976 0.024
#> SRR772698 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.962 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.1163 0.9021 0.972 0.000 0.028
#> SRR772344 2 0.0592 0.8430 0.012 0.988 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 1 0.0237 0.9106 0.996 0.000 0.004
#> SRR772347 1 0.0592 0.9091 0.988 0.000 0.012
#> SRR772348 1 0.1999 0.8922 0.952 0.036 0.012
#> SRR772349 1 0.5988 0.3528 0.632 0.368 0.000
#> SRR772350 3 0.1031 0.8984 0.024 0.000 0.976
#> SRR772351 1 0.4452 0.7496 0.808 0.192 0.000
#> SRR772352 1 0.6299 0.0680 0.524 0.476 0.000
#> SRR772353 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772354 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772355 1 0.6513 0.0317 0.520 0.476 0.004
#> SRR772356 2 0.4291 0.7546 0.180 0.820 0.000
#> SRR772357 1 0.0592 0.9089 0.988 0.000 0.012
#> SRR772358 1 0.2066 0.8838 0.940 0.000 0.060
#> SRR772359 1 0.1529 0.8978 0.960 0.000 0.040
#> SRR772360 1 0.0424 0.9102 0.992 0.000 0.008
#> SRR772361 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.3116 0.8511 0.892 0.000 0.108
#> SRR772365 1 0.2448 0.8736 0.924 0.000 0.076
#> SRR772366 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 3 0.6126 0.3311 0.400 0.000 0.600
#> SRR772369 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772370 1 0.0237 0.9105 0.996 0.004 0.000
#> SRR772371 1 0.5650 0.5649 0.688 0.000 0.312
#> SRR772372 1 0.5363 0.6313 0.724 0.000 0.276
#> SRR772373 2 0.4887 0.7193 0.228 0.772 0.000
#> SRR772374 2 0.4346 0.7572 0.184 0.816 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772377 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772378 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772379 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772380 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772384 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772385 3 0.0237 0.9140 0.000 0.004 0.996
#> SRR772386 2 0.6565 0.3977 0.416 0.576 0.008
#> SRR772387 2 0.2261 0.8246 0.068 0.932 0.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772393 3 0.4750 0.6873 0.216 0.000 0.784
#> SRR772394 3 0.4974 0.6575 0.236 0.000 0.764
#> SRR772395 2 0.6033 0.5759 0.336 0.660 0.004
#> SRR772396 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.5363 0.6336 0.724 0.000 0.276
#> SRR772399 1 0.2796 0.8625 0.908 0.000 0.092
#> SRR772400 1 0.5216 0.6641 0.740 0.000 0.260
#> SRR772401 1 0.3686 0.8253 0.860 0.000 0.140
#> SRR772402 1 0.0661 0.9092 0.988 0.008 0.004
#> SRR772403 1 0.1399 0.9003 0.968 0.028 0.004
#> SRR772404 3 0.6140 0.3190 0.404 0.000 0.596
#> SRR772405 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772406 1 0.3112 0.8511 0.900 0.096 0.004
#> SRR772407 1 0.3445 0.8503 0.896 0.088 0.016
#> SRR772408 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772411 1 0.0237 0.9106 0.996 0.004 0.000
#> SRR772412 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772416 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772417 1 0.0424 0.9096 0.992 0.008 0.000
#> SRR772418 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0237 0.8440 0.004 0.996 0.000
#> SRR772421 1 0.5764 0.7692 0.800 0.124 0.076
#> SRR772422 2 0.6497 0.5646 0.336 0.648 0.016
#> SRR772423 1 0.0829 0.9080 0.984 0.012 0.004
#> SRR772424 1 0.4575 0.7568 0.812 0.184 0.004
#> SRR772425 2 0.4346 0.7559 0.184 0.816 0.000
#> SRR772426 2 0.2625 0.8151 0.084 0.916 0.000
#> SRR772427 2 0.1411 0.8359 0.036 0.964 0.000
#> SRR772428 1 0.1163 0.9044 0.972 0.000 0.028
#> SRR772429 1 0.0424 0.9101 0.992 0.000 0.008
#> SRR772430 1 0.5431 0.6197 0.716 0.000 0.284
#> SRR772431 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772432 1 0.0237 0.9106 0.996 0.000 0.004
#> SRR772433 1 0.2165 0.8833 0.936 0.000 0.064
#> SRR772434 1 0.0237 0.9108 0.996 0.000 0.004
#> SRR772435 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772436 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772438 1 0.3482 0.8305 0.872 0.000 0.128
#> SRR772439 1 0.3192 0.8458 0.888 0.000 0.112
#> SRR772440 1 0.1031 0.9015 0.976 0.024 0.000
#> SRR772441 1 0.0592 0.9085 0.988 0.012 0.000
#> SRR772442 1 0.2200 0.8836 0.940 0.056 0.004
#> SRR772443 1 0.0237 0.9106 0.996 0.000 0.004
#> SRR772444 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772448 1 0.4002 0.7988 0.840 0.000 0.160
#> SRR772449 1 0.6319 0.6490 0.732 0.228 0.040
#> SRR772450 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0424 0.9100 0.992 0.000 0.008
#> SRR772460 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.6225 0.3626 0.432 0.568 0.000
#> SRR772463 2 0.6260 0.3191 0.448 0.552 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.0747 0.9071 0.984 0.016 0.000
#> SRR772466 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.0592 0.9087 0.988 0.000 0.012
#> SRR772472 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772473 1 0.2096 0.8849 0.944 0.052 0.004
#> SRR772474 1 0.0592 0.9088 0.988 0.012 0.000
#> SRR772475 3 0.0424 0.9117 0.000 0.008 0.992
#> SRR772476 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.0592 0.9088 0.988 0.000 0.012
#> SRR772479 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772480 1 0.0475 0.9101 0.992 0.004 0.004
#> SRR772481 1 0.0237 0.9106 0.996 0.000 0.004
#> SRR772482 3 0.5497 0.5669 0.292 0.000 0.708
#> SRR772483 1 0.6154 0.3462 0.592 0.000 0.408
#> SRR772484 1 0.6204 0.1568 0.576 0.424 0.000
#> SRR772485 1 0.6045 0.3093 0.620 0.380 0.000
#> SRR772486 1 0.6079 0.3894 0.612 0.000 0.388
#> SRR772487 3 0.5948 0.4320 0.360 0.000 0.640
#> SRR772488 1 0.5650 0.4953 0.688 0.312 0.000
#> SRR772489 1 0.3038 0.8359 0.896 0.104 0.000
#> SRR772490 1 0.0237 0.9109 0.996 0.000 0.004
#> SRR772491 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 1 0.4750 0.6944 0.784 0.216 0.000
#> SRR772497 1 0.3045 0.8651 0.916 0.064 0.020
#> SRR772498 3 0.0592 0.9088 0.012 0.000 0.988
#> SRR772499 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.0747 0.8422 0.016 0.984 0.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 1 0.1337 0.9046 0.972 0.012 0.016
#> SRR772503 1 0.1289 0.9013 0.968 0.000 0.032
#> SRR772504 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.7883 0.3255 0.428 0.516 0.056
#> SRR772509 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772510 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 1 0.0848 0.9087 0.984 0.008 0.008
#> SRR772512 3 0.1964 0.8684 0.000 0.056 0.944
#> SRR772513 1 0.2200 0.8788 0.940 0.056 0.004
#> SRR772514 1 0.4555 0.7204 0.800 0.200 0.000
#> SRR772515 2 0.5621 0.6236 0.308 0.692 0.000
#> SRR772516 2 0.2878 0.8111 0.096 0.904 0.000
#> SRR772517 1 0.1860 0.8832 0.948 0.052 0.000
#> SRR772518 1 0.0424 0.9093 0.992 0.008 0.000
#> SRR772519 2 0.5678 0.6080 0.316 0.684 0.000
#> SRR772520 2 0.4121 0.7686 0.168 0.832 0.000
#> SRR772521 1 0.2400 0.8765 0.932 0.064 0.004
#> SRR772522 1 0.0829 0.9080 0.984 0.012 0.004
#> SRR772523 1 0.6079 0.3429 0.612 0.388 0.000
#> SRR772524 2 0.5098 0.6898 0.248 0.752 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0237 0.9109 0.996 0.000 0.004
#> SRR772531 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 2 0.2959 0.8074 0.100 0.900 0.000
#> SRR772533 2 0.3412 0.7965 0.124 0.876 0.000
#> SRR772534 1 0.0475 0.9101 0.992 0.004 0.004
#> SRR772535 1 0.4346 0.7549 0.816 0.184 0.000
#> SRR772536 2 0.6308 0.1122 0.492 0.508 0.000
#> SRR772537 2 0.0237 0.8441 0.004 0.996 0.000
#> SRR772538 2 0.0237 0.8436 0.004 0.996 0.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772541 1 0.4452 0.7607 0.808 0.000 0.192
#> SRR772542 1 0.6045 0.4131 0.620 0.000 0.380
#> SRR772543 1 0.2959 0.8587 0.900 0.000 0.100
#> SRR772544 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772547 1 0.1643 0.8952 0.956 0.000 0.044
#> SRR772548 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0592 0.9087 0.988 0.000 0.012
#> SRR772550 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772551 1 0.0237 0.9106 0.996 0.000 0.004
#> SRR772552 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772553 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772554 2 0.0424 0.8437 0.008 0.992 0.000
#> SRR772555 2 0.0237 0.8441 0.004 0.996 0.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772560 1 0.1529 0.8966 0.960 0.000 0.040
#> SRR772561 3 0.0237 0.9147 0.000 0.004 0.996
#> SRR772562 2 0.6305 0.1954 0.484 0.516 0.000
#> SRR772563 2 0.4887 0.7201 0.228 0.772 0.000
#> SRR772564 1 0.5397 0.6239 0.720 0.000 0.280
#> SRR772565 1 0.4452 0.7626 0.808 0.000 0.192
#> SRR772566 1 0.1163 0.9037 0.972 0.000 0.028
#> SRR772567 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772568 2 0.4399 0.7534 0.188 0.812 0.000
#> SRR772569 2 0.1163 0.8386 0.028 0.972 0.000
#> SRR772570 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772572 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772573 1 0.0747 0.9071 0.984 0.016 0.000
#> SRR772574 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772576 1 0.0892 0.9054 0.980 0.020 0.000
#> SRR772577 1 0.1163 0.9035 0.972 0.000 0.028
#> SRR772578 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772579 2 0.5291 0.5559 0.000 0.732 0.268
#> SRR772580 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.0475 0.9101 0.992 0.004 0.004
#> SRR772582 1 0.0661 0.9092 0.988 0.008 0.004
#> SRR772583 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772584 1 0.0237 0.9108 0.996 0.000 0.004
#> SRR772585 1 0.1643 0.8951 0.956 0.000 0.044
#> SRR772586 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772587 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772588 2 0.3038 0.8046 0.104 0.896 0.000
#> SRR772589 2 0.4178 0.7601 0.172 0.828 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0237 0.9108 0.996 0.000 0.004
#> SRR772593 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772594 2 0.3009 0.8148 0.052 0.920 0.028
#> SRR772595 2 0.2590 0.7978 0.004 0.924 0.072
#> SRR772596 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 1 0.5988 0.4492 0.632 0.000 0.368
#> SRR772599 1 0.4235 0.7841 0.824 0.000 0.176
#> SRR772600 1 0.0237 0.9106 0.996 0.000 0.004
#> SRR772601 1 0.0237 0.9106 0.996 0.000 0.004
#> SRR772602 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772603 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772604 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772605 1 0.5397 0.6286 0.720 0.000 0.280
#> SRR772606 1 0.1411 0.9009 0.964 0.000 0.036
#> SRR772607 1 0.1163 0.9046 0.972 0.000 0.028
#> SRR772608 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772609 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772610 1 0.5529 0.5327 0.704 0.296 0.000
#> SRR772611 1 0.6095 0.2825 0.608 0.392 0.000
#> SRR772612 1 0.6577 0.2546 0.572 0.420 0.008
#> SRR772613 1 0.6601 0.5366 0.676 0.296 0.028
#> SRR772614 1 0.0424 0.9099 0.992 0.000 0.008
#> SRR772615 1 0.0892 0.9063 0.980 0.000 0.020
#> SRR772616 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772617 2 0.6062 0.4143 0.384 0.616 0.000
#> SRR772618 1 0.5810 0.4655 0.664 0.336 0.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 1 0.5138 0.6290 0.748 0.252 0.000
#> SRR772622 1 0.0237 0.9105 0.996 0.004 0.000
#> SRR772623 3 0.1529 0.8830 0.040 0.000 0.960
#> SRR772624 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772625 3 0.5529 0.5432 0.000 0.296 0.704
#> SRR772626 3 0.4291 0.7286 0.180 0.000 0.820
#> SRR772627 3 0.0592 0.9086 0.012 0.000 0.988
#> SRR772628 1 0.0424 0.9099 0.992 0.000 0.008
#> SRR772629 1 0.0237 0.9108 0.996 0.000 0.004
#> SRR772630 1 0.0592 0.9085 0.988 0.012 0.000
#> SRR772631 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 1 0.5363 0.6455 0.724 0.000 0.276
#> SRR772635 1 0.5180 0.7823 0.812 0.032 0.156
#> SRR772636 3 0.1643 0.8801 0.000 0.044 0.956
#> SRR772637 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772639 1 0.6274 0.0487 0.544 0.456 0.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.6205 0.5173 0.656 0.008 0.336
#> SRR772643 2 0.9880 0.2679 0.324 0.404 0.272
#> SRR772644 1 0.2261 0.8782 0.932 0.000 0.068
#> SRR772645 1 0.0747 0.9073 0.984 0.000 0.016
#> SRR772646 2 0.1031 0.8401 0.024 0.976 0.000
#> SRR772647 2 0.4062 0.7705 0.164 0.836 0.000
#> SRR772648 1 0.6045 0.3790 0.620 0.380 0.000
#> SRR772649 2 0.5480 0.6625 0.264 0.732 0.004
#> SRR772650 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0747 0.9082 0.984 0.000 0.016
#> SRR772653 1 0.1753 0.8930 0.952 0.000 0.048
#> SRR772654 1 0.0424 0.9096 0.992 0.008 0.000
#> SRR772655 1 0.2796 0.8550 0.908 0.092 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 2 0.0592 0.8429 0.012 0.988 0.000
#> SRR772660 1 0.6095 0.3840 0.608 0.000 0.392
#> SRR772661 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772662 1 0.0237 0.9106 0.996 0.000 0.004
#> SRR772663 1 0.1031 0.9047 0.976 0.000 0.024
#> SRR772664 2 0.6079 0.4288 0.388 0.612 0.000
#> SRR772665 1 0.6244 0.1345 0.560 0.440 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 1 0.3832 0.8441 0.888 0.076 0.036
#> SRR772668 3 0.1337 0.9006 0.012 0.016 0.972
#> SRR772669 1 0.4700 0.7690 0.812 0.008 0.180
#> SRR772670 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772671 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772672 1 0.5521 0.7133 0.788 0.180 0.032
#> SRR772673 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772674 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772675 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772676 1 0.4629 0.7467 0.808 0.188 0.004
#> SRR772677 1 0.0475 0.9104 0.992 0.004 0.004
#> SRR772678 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772679 1 0.0892 0.9063 0.980 0.000 0.020
#> SRR772680 1 0.0237 0.9109 0.996 0.000 0.004
#> SRR772681 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772682 2 0.6062 0.4688 0.384 0.616 0.000
#> SRR772683 2 0.4178 0.7626 0.172 0.828 0.000
#> SRR772685 2 0.6359 0.5231 0.364 0.628 0.008
#> SRR772686 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.0237 0.9146 0.004 0.000 0.996
#> SRR772688 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.8443 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 3 0.0237 0.9140 0.000 0.004 0.996
#> SRR772692 1 0.3752 0.8186 0.856 0.000 0.144
#> SRR772693 3 0.5722 0.5642 0.292 0.004 0.704
#> SRR772694 1 0.0892 0.9059 0.980 0.020 0.000
#> SRR772695 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772696 3 0.6954 0.0156 0.484 0.016 0.500
#> SRR772697 3 0.9766 0.1777 0.348 0.236 0.416
#> SRR772698 3 0.0000 0.9174 0.000 0.000 1.000
#> SRR772699 1 0.3340 0.8411 0.880 0.000 0.120
#> SRR772700 1 0.2537 0.8738 0.920 0.000 0.080
#> SRR772701 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.9111 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.1867 0.83796 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR772342 1 0.1118 0.84265 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772343 1 0.1118 0.84371 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772344 2 0.2222 0.83888 0.016 0.924 0.000 0.060
#> SRR772345 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772346 4 0.1940 0.78073 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR772347 4 0.1867 0.78160 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR772348 1 0.1585 0.83963 0.952 0.040 0.004 0.004
#> SRR772349 1 0.3858 0.78865 0.844 0.100 0.000 0.056
#> SRR772350 3 0.3024 0.78704 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR772351 4 0.7395 0.37230 0.176 0.344 0.000 0.480
#> SRR772352 2 0.7082 0.36245 0.252 0.564 0.000 0.184
#> SRR772353 1 0.1118 0.83638 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772354 1 0.0707 0.84330 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772355 2 0.6825 0.45505 0.236 0.612 0.004 0.148
#> SRR772356 2 0.3081 0.81875 0.048 0.888 0.000 0.064
#> SRR772357 1 0.0188 0.84353 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772358 1 0.0336 0.84518 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772359 1 0.1824 0.84112 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR772360 1 0.5835 0.59066 0.688 0.008 0.060 0.244
#> SRR772361 3 0.0336 0.91125 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772362 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 4 0.4542 0.74989 0.108 0.000 0.088 0.804
#> SRR772365 4 0.3320 0.76809 0.056 0.000 0.068 0.876
#> SRR772366 3 0.0376 0.91218 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772367 3 0.0336 0.91125 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772368 1 0.3863 0.74214 0.828 0.000 0.144 0.028
#> SRR772369 1 0.3731 0.80111 0.844 0.036 0.000 0.120
#> SRR772370 1 0.2021 0.83634 0.932 0.056 0.000 0.012
#> SRR772371 4 0.2888 0.71194 0.004 0.000 0.124 0.872
#> SRR772372 4 0.2198 0.73923 0.008 0.000 0.072 0.920
#> SRR772373 2 0.2530 0.81112 0.100 0.896 0.000 0.004
#> SRR772374 2 0.2197 0.82782 0.080 0.916 0.000 0.004
#> SRR772375 3 0.0188 0.91169 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772376 2 0.0336 0.86953 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772377 3 0.0188 0.91193 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772378 1 0.1716 0.83497 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR772379 1 0.0469 0.84482 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772380 1 0.0000 0.84317 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.1151 0.90633 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR772382 1 0.4948 0.26025 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR772383 1 0.3942 0.69124 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR772384 3 0.1022 0.90664 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR772385 3 0.0937 0.90837 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR772386 2 0.5606 0.67805 0.068 0.724 0.008 0.200
#> SRR772387 2 0.0469 0.86834 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772388 1 0.0592 0.84526 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772389 1 0.1211 0.84324 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772390 3 0.0188 0.91193 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772391 1 0.0188 0.84353 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772392 1 0.0592 0.84415 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772393 3 0.5183 0.26206 0.008 0.000 0.584 0.408
#> SRR772394 3 0.5007 0.39835 0.008 0.000 0.636 0.356
#> SRR772395 2 0.5974 0.44839 0.348 0.608 0.008 0.036
#> SRR772396 1 0.3873 0.72184 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR772397 1 0.3266 0.77252 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR772398 4 0.4364 0.63533 0.016 0.000 0.220 0.764
#> SRR772399 4 0.3164 0.77449 0.064 0.000 0.052 0.884
#> SRR772400 1 0.6897 0.43431 0.588 0.000 0.244 0.168
#> SRR772401 1 0.6550 0.51480 0.636 0.000 0.184 0.180
#> SRR772402 4 0.1824 0.77917 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR772403 4 0.1635 0.77421 0.044 0.008 0.000 0.948
#> SRR772404 1 0.2466 0.82256 0.916 0.000 0.056 0.028
#> SRR772405 3 0.0592 0.91147 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772406 4 0.4724 0.76095 0.112 0.096 0.000 0.792
#> SRR772407 4 0.3007 0.78218 0.060 0.028 0.012 0.900
#> SRR772408 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772410 1 0.1004 0.84546 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR772411 1 0.2480 0.82281 0.904 0.008 0.000 0.088
#> SRR772412 1 0.3172 0.78635 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR772413 1 0.2760 0.80581 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR772414 3 0.0657 0.91204 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR772415 1 0.0000 0.84317 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772416 1 0.0469 0.84314 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772417 1 0.4228 0.71703 0.760 0.008 0.000 0.232
#> SRR772418 3 0.0707 0.91058 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772419 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772421 4 0.7742 0.49956 0.068 0.276 0.088 0.568
#> SRR772422 2 0.5962 0.55958 0.028 0.676 0.032 0.264
#> SRR772423 4 0.1545 0.77138 0.040 0.008 0.000 0.952
#> SRR772424 4 0.3198 0.76451 0.040 0.080 0.000 0.880
#> SRR772425 2 0.2174 0.84363 0.052 0.928 0.000 0.020
#> SRR772426 2 0.1209 0.85941 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR772427 2 0.0779 0.86718 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR772428 1 0.3521 0.81137 0.864 0.000 0.052 0.084
#> SRR772429 1 0.3392 0.79915 0.856 0.000 0.020 0.124
#> SRR772430 1 0.1798 0.83144 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR772431 4 0.3400 0.74608 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR772432 4 0.3444 0.74127 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR772433 1 0.6310 0.31957 0.576 0.000 0.072 0.352
#> SRR772434 1 0.1661 0.84161 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR772435 1 0.4605 0.49572 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR772436 1 0.4877 0.30893 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR772437 3 0.0921 0.91007 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR772438 4 0.3966 0.76370 0.072 0.000 0.088 0.840
#> SRR772439 4 0.3308 0.74976 0.036 0.000 0.092 0.872
#> SRR772440 1 0.6115 0.61532 0.680 0.148 0.000 0.172
#> SRR772441 4 0.6319 0.54580 0.312 0.084 0.000 0.604
#> SRR772442 4 0.3301 0.77012 0.048 0.076 0.000 0.876
#> SRR772443 4 0.3266 0.75358 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR772444 1 0.3942 0.69960 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR772445 1 0.4356 0.60012 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR772446 1 0.0000 0.84317 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0707 0.84457 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772448 4 0.3266 0.75185 0.032 0.004 0.084 0.880
#> SRR772449 4 0.6756 0.44842 0.064 0.336 0.020 0.580
#> SRR772450 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0592 0.84422 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772453 1 0.0469 0.84473 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772454 1 0.2921 0.79460 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR772455 1 0.1792 0.83795 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR772456 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.4855 0.41883 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR772459 1 0.2281 0.83108 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR772460 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772462 1 0.4466 0.70389 0.784 0.180 0.000 0.036
#> SRR772463 1 0.3763 0.74956 0.832 0.144 0.000 0.024
#> SRR772464 3 0.0188 0.91169 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772465 1 0.4419 0.77734 0.812 0.084 0.000 0.104
#> SRR772466 1 0.2759 0.83330 0.904 0.044 0.000 0.052
#> SRR772467 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772469 1 0.2704 0.80644 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR772470 1 0.0817 0.84433 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772471 1 0.0336 0.84424 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772472 1 0.1557 0.83890 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR772473 4 0.3245 0.77883 0.064 0.056 0.000 0.880
#> SRR772474 4 0.2924 0.78081 0.100 0.016 0.000 0.884
#> SRR772475 3 0.0657 0.90903 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR772476 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1118 0.83638 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772479 1 0.1211 0.83738 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772480 4 0.1716 0.77929 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR772481 4 0.2530 0.78027 0.100 0.004 0.000 0.896
#> SRR772482 3 0.5057 0.39245 0.340 0.000 0.648 0.012
#> SRR772483 1 0.6253 0.33535 0.564 0.000 0.372 0.064
#> SRR772484 1 0.2319 0.83260 0.924 0.036 0.000 0.040
#> SRR772485 1 0.1677 0.83808 0.948 0.012 0.000 0.040
#> SRR772486 4 0.5085 0.52408 0.020 0.000 0.304 0.676
#> SRR772487 4 0.5296 0.05286 0.008 0.000 0.492 0.500
#> SRR772488 1 0.2300 0.83128 0.924 0.048 0.000 0.028
#> SRR772489 1 0.2530 0.80421 0.896 0.100 0.000 0.004
#> SRR772490 1 0.5345 0.27406 0.560 0.000 0.012 0.428
#> SRR772491 1 0.3688 0.74822 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR772492 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 1 0.2635 0.82196 0.904 0.076 0.000 0.020
#> SRR772497 1 0.2412 0.82521 0.908 0.008 0.000 0.084
#> SRR772498 3 0.1389 0.88561 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR772499 3 0.1022 0.90111 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR772500 2 0.0188 0.87061 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772501 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772502 4 0.5846 0.19598 0.416 0.012 0.016 0.556
#> SRR772503 4 0.3672 0.72995 0.164 0.000 0.012 0.824
#> SRR772504 2 0.1302 0.85558 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772505 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772508 1 0.3661 0.78664 0.864 0.088 0.008 0.040
#> SRR772509 3 0.1305 0.90217 0.004 0.000 0.960 0.036
#> SRR772510 3 0.0657 0.91203 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR772511 4 0.6101 0.58642 0.284 0.004 0.068 0.644
#> SRR772512 3 0.1174 0.90121 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR772513 1 0.1022 0.83770 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772514 1 0.1820 0.83538 0.944 0.020 0.000 0.036
#> SRR772515 2 0.3691 0.78812 0.076 0.856 0.000 0.068
#> SRR772516 2 0.0657 0.86846 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR772517 1 0.3245 0.79953 0.872 0.100 0.000 0.028
#> SRR772518 1 0.1209 0.84644 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR772519 1 0.4992 0.09733 0.524 0.476 0.000 0.000
#> SRR772520 2 0.1716 0.84062 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR772521 4 0.2578 0.77812 0.052 0.036 0.000 0.912
#> SRR772522 4 0.1807 0.77694 0.052 0.008 0.000 0.940
#> SRR772523 2 0.4989 0.67602 0.072 0.764 0.000 0.164
#> SRR772524 2 0.0927 0.86560 0.008 0.976 0.000 0.016
#> SRR772525 3 0.0188 0.91169 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772526 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0921 0.90815 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR772529 1 0.4134 0.65208 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR772530 1 0.4830 0.45540 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR772531 3 0.0657 0.91203 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR772532 2 0.0469 0.86904 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772533 2 0.1798 0.85161 0.040 0.944 0.000 0.016
#> SRR772534 4 0.4761 0.49194 0.332 0.004 0.000 0.664
#> SRR772535 1 0.7756 0.00717 0.424 0.248 0.000 0.328
#> SRR772536 2 0.5528 0.66316 0.124 0.732 0.000 0.144
#> SRR772537 2 0.5284 0.41913 0.016 0.616 0.000 0.368
#> SRR772538 2 0.1940 0.83025 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772539 1 0.1022 0.84427 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772540 1 0.1637 0.83860 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR772541 1 0.1545 0.83318 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR772542 4 0.5928 0.18440 0.036 0.000 0.456 0.508
#> SRR772543 4 0.6961 0.47472 0.316 0.000 0.136 0.548
#> SRR772544 3 0.1004 0.90851 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR772545 1 0.0707 0.84282 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772546 1 0.0336 0.84357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772547 1 0.3300 0.80147 0.848 0.000 0.008 0.144
#> SRR772548 1 0.1661 0.84088 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR772549 1 0.0000 0.84317 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.84317 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772551 1 0.4605 0.53498 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR772552 1 0.2773 0.82894 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR772553 3 0.0592 0.91121 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772554 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772556 1 0.3942 0.68910 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR772557 1 0.4857 0.53487 0.668 0.000 0.008 0.324
#> SRR772558 1 0.0188 0.84372 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772559 1 0.0592 0.84422 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772560 1 0.0817 0.83952 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772561 3 0.0592 0.90918 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772562 2 0.5510 0.08730 0.480 0.504 0.000 0.016
#> SRR772563 2 0.4692 0.65841 0.212 0.756 0.000 0.032
#> SRR772564 3 0.6745 -0.12327 0.092 0.000 0.480 0.428
#> SRR772565 4 0.5687 0.61718 0.068 0.000 0.248 0.684
#> SRR772566 1 0.4335 0.75717 0.796 0.000 0.036 0.168
#> SRR772567 1 0.3400 0.76956 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR772568 2 0.2494 0.83908 0.048 0.916 0.000 0.036
#> SRR772569 2 0.0336 0.86996 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772570 1 0.1389 0.83900 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR772571 1 0.0469 0.84473 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772572 1 0.1637 0.84142 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR772573 1 0.2996 0.82242 0.892 0.064 0.000 0.044
#> SRR772574 1 0.1743 0.84049 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR772575 1 0.3123 0.79648 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR772576 1 0.6404 0.28793 0.548 0.060 0.004 0.388
#> SRR772577 4 0.5928 0.46938 0.372 0.004 0.036 0.588
#> SRR772578 2 0.1767 0.84859 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR772579 3 0.5742 0.37147 0.000 0.368 0.596 0.036
#> SRR772580 3 0.0336 0.91125 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772581 4 0.1557 0.77717 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR772582 4 0.2546 0.78170 0.092 0.008 0.000 0.900
#> SRR772583 1 0.0895 0.84562 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772584 1 0.0000 0.84317 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772585 1 0.1975 0.83106 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR772586 3 0.0336 0.91190 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772587 1 0.3873 0.72748 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR772588 2 0.1474 0.84881 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR772589 2 0.2814 0.78199 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0469 0.91021 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772591 1 0.0817 0.84600 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772592 1 0.4103 0.68421 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR772593 3 0.0188 0.91193 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772594 2 0.6004 0.49501 0.000 0.648 0.076 0.276
#> SRR772595 2 0.6310 0.54243 0.000 0.660 0.152 0.188
#> SRR772596 3 0.0921 0.90812 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR772597 3 0.0336 0.91125 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772598 4 0.7663 0.22798 0.212 0.000 0.380 0.408
#> SRR772599 1 0.4610 0.76711 0.800 0.000 0.100 0.100
#> SRR772600 4 0.1716 0.78030 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR772601 4 0.1557 0.77814 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR772602 3 0.0707 0.90777 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772603 4 0.4431 0.60070 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR772604 4 0.1637 0.77959 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR772605 1 0.1798 0.83096 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR772606 1 0.6727 0.23583 0.520 0.000 0.096 0.384
#> SRR772607 4 0.5173 0.50428 0.320 0.000 0.020 0.660
#> SRR772608 1 0.0707 0.84150 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772609 1 0.0817 0.84527 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772610 1 0.1398 0.83631 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR772611 1 0.2297 0.82973 0.928 0.024 0.004 0.044
#> SRR772612 4 0.2271 0.74788 0.000 0.076 0.008 0.916
#> SRR772613 4 0.2586 0.76201 0.016 0.044 0.020 0.920
#> SRR772614 4 0.5167 -0.06109 0.488 0.000 0.004 0.508
#> SRR772615 1 0.3647 0.78695 0.832 0.000 0.016 0.152
#> SRR772616 1 0.2149 0.82703 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR772617 4 0.4248 0.64158 0.012 0.220 0.000 0.768
#> SRR772618 4 0.4565 0.71932 0.064 0.140 0.000 0.796
#> SRR772619 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772621 2 0.6375 0.41099 0.312 0.600 0.000 0.088
#> SRR772622 1 0.6347 0.49476 0.624 0.100 0.000 0.276
#> SRR772623 3 0.4605 0.46983 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR772624 3 0.0469 0.91199 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772625 3 0.3668 0.72021 0.000 0.188 0.808 0.004
#> SRR772626 3 0.4564 0.47287 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR772627 3 0.3486 0.74501 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR772628 1 0.5313 0.23670 0.536 0.004 0.004 0.456
#> SRR772629 4 0.3837 0.67738 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR772630 1 0.4844 0.60533 0.688 0.012 0.000 0.300
#> SRR772631 3 0.1452 0.89998 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR772632 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772634 1 0.7260 0.12129 0.464 0.000 0.388 0.148
#> SRR772635 4 0.9602 0.45150 0.212 0.184 0.204 0.400
#> SRR772636 3 0.1584 0.88921 0.000 0.036 0.952 0.012
#> SRR772637 1 0.0188 0.84350 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772638 1 0.0469 0.84308 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772639 2 0.4890 0.70387 0.144 0.776 0.000 0.080
#> SRR772640 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 1 0.4991 0.65052 0.744 0.008 0.220 0.028
#> SRR772643 2 0.7436 0.11251 0.432 0.448 0.100 0.020
#> SRR772644 1 0.0336 0.84370 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772645 1 0.0000 0.84317 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0469 0.86845 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772647 2 0.2635 0.82455 0.076 0.904 0.000 0.020
#> SRR772648 2 0.5933 0.24792 0.040 0.552 0.000 0.408
#> SRR772649 2 0.4155 0.64596 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR772650 1 0.0592 0.84488 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772651 1 0.1022 0.84524 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772652 4 0.5080 0.31906 0.420 0.000 0.004 0.576
#> SRR772653 4 0.5148 0.71042 0.208 0.000 0.056 0.736
#> SRR772654 1 0.5776 0.13836 0.504 0.028 0.000 0.468
#> SRR772655 2 0.6831 0.03041 0.100 0.480 0.000 0.420
#> SRR772656 3 0.1004 0.90851 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR772657 3 0.0188 0.91169 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772658 2 0.2149 0.83416 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR772659 4 0.4994 0.02152 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR772660 1 0.2224 0.82619 0.928 0.000 0.040 0.032
#> SRR772661 3 0.0188 0.91193 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772662 1 0.2345 0.81881 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR772663 1 0.0336 0.84357 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772664 1 0.5040 0.44442 0.628 0.364 0.000 0.008
#> SRR772665 1 0.5284 0.58466 0.696 0.264 0.000 0.040
#> SRR772666 3 0.0188 0.91169 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772667 1 0.1211 0.83668 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772668 4 0.5158 0.01516 0.000 0.004 0.472 0.524
#> SRR772669 4 0.4283 0.75986 0.092 0.004 0.076 0.828
#> SRR772670 1 0.0188 0.84373 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772671 1 0.0336 0.84420 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772672 1 0.0469 0.84288 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772673 1 0.0592 0.84396 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772674 3 0.1545 0.89788 0.008 0.000 0.952 0.040
#> SRR772675 3 0.1209 0.90428 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR772676 4 0.6855 0.53014 0.136 0.292 0.000 0.572
#> SRR772677 4 0.5499 0.70289 0.216 0.072 0.000 0.712
#> SRR772678 3 0.0895 0.90990 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR772679 1 0.1211 0.83738 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772680 1 0.1389 0.83767 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR772681 3 0.0592 0.91221 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772682 2 0.5189 0.40889 0.372 0.616 0.000 0.012
#> SRR772683 2 0.4843 0.35365 0.396 0.604 0.000 0.000
#> SRR772685 2 0.6536 0.55558 0.188 0.660 0.008 0.144
#> SRR772686 3 0.0336 0.91125 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772687 3 0.2882 0.82524 0.084 0.000 0.892 0.024
#> SRR772688 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.87178 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0336 0.91125 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772691 3 0.0336 0.91167 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772692 4 0.5100 0.70172 0.076 0.000 0.168 0.756
#> SRR772693 3 0.6365 0.41723 0.268 0.004 0.636 0.092
#> SRR772694 1 0.3706 0.80624 0.848 0.040 0.000 0.112
#> SRR772695 1 0.2469 0.82228 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR772696 4 0.5039 0.30510 0.004 0.000 0.404 0.592
#> SRR772697 4 0.6215 0.42383 0.000 0.072 0.328 0.600
#> SRR772698 3 0.0707 0.91058 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772699 1 0.3828 0.80077 0.848 0.000 0.068 0.084
#> SRR772700 1 0.7201 0.30034 0.552 0.000 0.224 0.224
#> SRR772701 1 0.2760 0.80118 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR772702 1 0.5112 0.19977 0.560 0.000 0.004 0.436
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.1493 0.69677 0.948 0.024 0.000 0.000 0.028
#> SRR772342 1 0.1701 0.69734 0.936 0.016 0.000 0.000 0.048
#> SRR772343 1 0.3686 0.56419 0.780 0.012 0.004 0.000 0.204
#> SRR772344 4 0.2624 0.79700 0.000 0.116 0.000 0.872 0.012
#> SRR772345 4 0.0324 0.85124 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR772346 2 0.4082 0.62563 0.056 0.796 0.008 0.000 0.140
#> SRR772347 2 0.2369 0.62874 0.032 0.908 0.004 0.000 0.056
#> SRR772348 5 0.5413 0.43438 0.460 0.016 0.000 0.028 0.496
#> SRR772349 1 0.7464 -0.13779 0.472 0.064 0.000 0.272 0.192
#> SRR772350 3 0.3977 0.62618 0.000 0.204 0.764 0.000 0.032
#> SRR772351 2 0.7327 0.35737 0.104 0.512 0.008 0.296 0.080
#> SRR772352 4 0.7307 0.27043 0.060 0.196 0.000 0.504 0.240
#> SRR772353 1 0.1270 0.68990 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772354 1 0.1121 0.69013 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772355 4 0.6908 0.52802 0.096 0.188 0.016 0.616 0.084
#> SRR772356 4 0.3271 0.79906 0.016 0.100 0.004 0.860 0.020
#> SRR772357 1 0.1717 0.69468 0.936 0.008 0.004 0.000 0.052
#> SRR772358 1 0.3320 0.61611 0.820 0.012 0.004 0.000 0.164
#> SRR772359 1 0.2709 0.69924 0.900 0.016 0.012 0.012 0.060
#> SRR772360 1 0.5965 0.48274 0.680 0.060 0.144 0.000 0.116
#> SRR772361 3 0.0898 0.80197 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772362 4 0.0162 0.85098 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772363 4 0.0000 0.85100 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 2 0.5488 0.59257 0.084 0.728 0.100 0.000 0.088
#> SRR772365 2 0.4350 0.61263 0.020 0.792 0.120 0.000 0.068
#> SRR772366 3 0.4306 0.62590 0.012 0.000 0.660 0.000 0.328
#> SRR772367 3 0.0865 0.80629 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR772368 1 0.4847 0.40590 0.704 0.000 0.216 0.000 0.080
#> SRR772369 1 0.5868 0.47255 0.696 0.088 0.000 0.092 0.124
#> SRR772370 1 0.4031 0.58057 0.788 0.004 0.000 0.160 0.048
#> SRR772371 2 0.4774 0.54061 0.004 0.728 0.060 0.004 0.204
#> SRR772372 2 0.4177 0.58055 0.004 0.776 0.052 0.000 0.168
#> SRR772373 4 0.3710 0.68435 0.192 0.000 0.000 0.784 0.024
#> SRR772374 4 0.2338 0.78630 0.112 0.000 0.000 0.884 0.004
#> SRR772375 3 0.0703 0.80638 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772376 4 0.1444 0.83971 0.000 0.012 0.000 0.948 0.040
#> SRR772377 3 0.2719 0.79246 0.004 0.000 0.852 0.000 0.144
#> SRR772378 1 0.1557 0.69062 0.940 0.008 0.000 0.000 0.052
#> SRR772379 1 0.3282 0.58521 0.804 0.008 0.000 0.000 0.188
#> SRR772380 1 0.3521 0.55086 0.764 0.004 0.000 0.000 0.232
#> SRR772381 3 0.0794 0.80362 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772382 2 0.5243 0.04062 0.412 0.540 0.000 0.000 0.048
#> SRR772383 1 0.4957 0.26782 0.624 0.332 0.000 0.000 0.044
#> SRR772384 3 0.2806 0.79059 0.004 0.000 0.844 0.000 0.152
#> SRR772385 3 0.2773 0.78871 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR772386 4 0.5885 0.67819 0.092 0.068 0.012 0.712 0.116
#> SRR772387 4 0.1490 0.84281 0.004 0.008 0.004 0.952 0.032
#> SRR772388 1 0.3081 0.60911 0.832 0.012 0.000 0.000 0.156
#> SRR772389 1 0.3055 0.64424 0.840 0.016 0.000 0.000 0.144
#> SRR772390 3 0.2471 0.79414 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR772391 1 0.0794 0.68917 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772392 1 0.1831 0.68491 0.920 0.004 0.000 0.000 0.076
#> SRR772393 2 0.5856 0.36527 0.008 0.592 0.312 0.004 0.084
#> SRR772394 2 0.5599 0.00491 0.000 0.484 0.444 0.000 0.072
#> SRR772395 1 0.5440 0.04773 0.476 0.000 0.004 0.472 0.048
#> SRR772396 1 0.5641 0.36347 0.640 0.228 0.004 0.000 0.128
#> SRR772397 1 0.4550 0.61163 0.772 0.120 0.012 0.000 0.096
#> SRR772398 2 0.5111 0.51599 0.008 0.680 0.248 0.000 0.064
#> SRR772399 2 0.4341 0.61206 0.032 0.804 0.112 0.004 0.048
#> SRR772400 5 0.8096 0.53941 0.252 0.124 0.216 0.000 0.408
#> SRR772401 5 0.7714 0.56575 0.228 0.140 0.144 0.000 0.488
#> SRR772402 2 0.2616 0.63023 0.020 0.880 0.000 0.000 0.100
#> SRR772403 2 0.2407 0.63034 0.012 0.896 0.000 0.004 0.088
#> SRR772404 1 0.3410 0.64357 0.840 0.000 0.092 0.000 0.068
#> SRR772405 3 0.2848 0.78955 0.004 0.000 0.840 0.000 0.156
#> SRR772406 2 0.5276 0.58326 0.084 0.732 0.000 0.140 0.044
#> SRR772407 2 0.6533 0.59010 0.048 0.672 0.052 0.080 0.148
#> SRR772408 4 0.0162 0.85120 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772409 4 0.0162 0.85120 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772410 1 0.5646 -0.35500 0.488 0.064 0.000 0.004 0.444
#> SRR772411 1 0.5779 -0.29322 0.508 0.092 0.000 0.000 0.400
#> SRR772412 1 0.3257 0.65198 0.844 0.028 0.004 0.000 0.124
#> SRR772413 1 0.2448 0.68087 0.892 0.020 0.000 0.000 0.088
#> SRR772414 3 0.0865 0.80377 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR772415 1 0.0771 0.69190 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR772416 1 0.0865 0.69080 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR772417 2 0.6514 -0.17334 0.220 0.476 0.000 0.000 0.304
#> SRR772418 3 0.2813 0.78696 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR772419 4 0.0000 0.85100 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 4 0.0000 0.85100 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 4 0.9225 -0.12041 0.108 0.276 0.136 0.364 0.116
#> SRR772422 4 0.8097 0.37834 0.048 0.140 0.164 0.532 0.116
#> SRR772423 2 0.1121 0.62332 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR772424 2 0.3727 0.62357 0.016 0.836 0.000 0.084 0.064
#> SRR772425 4 0.2511 0.82552 0.024 0.024 0.000 0.908 0.044
#> SRR772426 4 0.1251 0.83986 0.036 0.000 0.000 0.956 0.008
#> SRR772427 4 0.0992 0.84559 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008
#> SRR772428 1 0.6144 0.39227 0.668 0.084 0.096 0.000 0.152
#> SRR772429 1 0.3991 0.65098 0.828 0.056 0.040 0.000 0.076
#> SRR772430 1 0.2260 0.68817 0.908 0.000 0.028 0.000 0.064
#> SRR772431 2 0.6155 0.24220 0.336 0.516 0.000 0.000 0.148
#> SRR772432 2 0.6844 0.31183 0.276 0.492 0.016 0.000 0.216
#> SRR772433 1 0.7422 0.07086 0.508 0.256 0.100 0.000 0.136
#> SRR772434 1 0.4059 0.65250 0.808 0.068 0.012 0.000 0.112
#> SRR772435 1 0.4999 0.56222 0.748 0.064 0.040 0.000 0.148
#> SRR772436 1 0.5282 0.50317 0.700 0.144 0.008 0.000 0.148
#> SRR772437 3 0.1408 0.79623 0.000 0.008 0.948 0.000 0.044
#> SRR772438 2 0.5964 0.34458 0.028 0.576 0.064 0.000 0.332
#> SRR772439 2 0.4181 0.59222 0.016 0.796 0.136 0.000 0.052
#> SRR772440 1 0.5989 0.50781 0.696 0.088 0.004 0.104 0.108
#> SRR772441 1 0.7823 0.09474 0.488 0.264 0.012 0.116 0.120
#> SRR772442 2 0.5047 0.60570 0.028 0.724 0.000 0.056 0.192
#> SRR772443 2 0.4417 0.55474 0.148 0.760 0.000 0.000 0.092
#> SRR772444 1 0.4395 0.54483 0.748 0.188 0.000 0.000 0.064
#> SRR772445 1 0.4351 0.60903 0.784 0.104 0.008 0.000 0.104
#> SRR772446 1 0.1430 0.68286 0.944 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR772447 1 0.0865 0.68630 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR772448 2 0.5142 0.59128 0.020 0.728 0.148 0.000 0.104
#> SRR772449 2 0.6650 0.32711 0.008 0.496 0.016 0.364 0.116
#> SRR772450 4 0.0162 0.85120 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772451 4 0.0162 0.85120 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772452 1 0.3521 0.52792 0.764 0.004 0.000 0.000 0.232
#> SRR772453 1 0.3863 0.48997 0.740 0.012 0.000 0.000 0.248
#> SRR772454 1 0.2712 0.67432 0.880 0.032 0.000 0.000 0.088
#> SRR772455 1 0.4998 0.44397 0.700 0.104 0.000 0.000 0.196
#> SRR772456 4 0.0162 0.85120 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772457 4 0.0290 0.85112 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772458 2 0.5834 0.15971 0.276 0.588 0.000 0.000 0.136
#> SRR772459 1 0.6250 -0.35278 0.488 0.116 0.008 0.000 0.388
#> SRR772460 4 0.0162 0.85129 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772461 4 0.0162 0.85129 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772462 1 0.3649 0.58844 0.808 0.000 0.000 0.152 0.040
#> SRR772463 1 0.2848 0.65791 0.868 0.000 0.000 0.104 0.028
#> SRR772464 3 0.0771 0.80300 0.000 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR772465 1 0.7808 -0.17546 0.464 0.252 0.000 0.156 0.128
#> SRR772466 1 0.6414 0.30963 0.636 0.064 0.000 0.140 0.160
#> SRR772467 4 0.0290 0.85112 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772468 4 0.0162 0.85129 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772469 5 0.6392 0.52159 0.400 0.168 0.000 0.000 0.432
#> SRR772470 1 0.4686 0.05799 0.596 0.020 0.000 0.000 0.384
#> SRR772471 1 0.3109 0.57626 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR772472 1 0.4585 0.20082 0.628 0.020 0.000 0.000 0.352
#> SRR772473 2 0.3840 0.63161 0.040 0.836 0.000 0.044 0.080
#> SRR772474 2 0.5632 0.53617 0.172 0.680 0.000 0.020 0.128
#> SRR772475 3 0.3628 0.75427 0.000 0.000 0.772 0.012 0.216
#> SRR772476 4 0.0000 0.85100 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0162 0.85120 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772478 1 0.1121 0.68431 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772479 1 0.1121 0.69280 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772480 2 0.2172 0.62849 0.016 0.908 0.000 0.000 0.076
#> SRR772481 2 0.2992 0.62258 0.068 0.868 0.000 0.000 0.064
#> SRR772482 3 0.6309 0.02747 0.312 0.008 0.536 0.000 0.144
#> SRR772483 5 0.7241 0.58983 0.292 0.040 0.200 0.000 0.468
#> SRR772484 1 0.2514 0.68282 0.896 0.000 0.000 0.044 0.060
#> SRR772485 1 0.1965 0.69005 0.924 0.000 0.000 0.024 0.052
#> SRR772486 2 0.6909 0.12252 0.008 0.400 0.232 0.000 0.360
#> SRR772487 2 0.6801 0.26901 0.016 0.480 0.320 0.000 0.184
#> SRR772488 1 0.2569 0.68065 0.892 0.000 0.000 0.068 0.040
#> SRR772489 1 0.2795 0.67629 0.880 0.000 0.000 0.056 0.064
#> SRR772490 1 0.6092 0.03597 0.524 0.380 0.020 0.000 0.076
#> SRR772491 1 0.6398 -0.01060 0.540 0.300 0.012 0.000 0.148
#> SRR772492 4 0.0162 0.85129 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772493 4 0.0162 0.85129 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772494 4 0.0404 0.85160 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772495 4 0.0162 0.85120 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772496 1 0.5977 0.31900 0.636 0.016 0.000 0.184 0.164
#> SRR772497 1 0.4912 0.49819 0.728 0.044 0.000 0.028 0.200
#> SRR772498 3 0.6540 0.36592 0.000 0.228 0.472 0.000 0.300
#> SRR772499 3 0.6269 0.44680 0.000 0.168 0.508 0.000 0.324
#> SRR772500 4 0.0833 0.84889 0.004 0.000 0.004 0.976 0.016
#> SRR772501 4 0.0000 0.85100 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 2 0.6348 0.23703 0.272 0.592 0.020 0.008 0.108
#> SRR772503 2 0.4507 0.57886 0.112 0.776 0.012 0.000 0.100
#> SRR772504 4 0.2387 0.82361 0.000 0.040 0.004 0.908 0.048
#> SRR772505 4 0.1377 0.84517 0.000 0.020 0.004 0.956 0.020
#> SRR772506 4 0.0451 0.85152 0.004 0.000 0.000 0.988 0.008
#> SRR772507 4 0.0162 0.85146 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772508 1 0.3372 0.65256 0.852 0.000 0.008 0.088 0.052
#> SRR772509 3 0.2629 0.79531 0.004 0.000 0.860 0.000 0.136
#> SRR772510 3 0.0880 0.80191 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772511 2 0.5072 0.57196 0.096 0.748 0.036 0.000 0.120
#> SRR772512 3 0.1731 0.79340 0.000 0.012 0.940 0.008 0.040
#> SRR772513 1 0.0963 0.69083 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772514 1 0.2125 0.69034 0.920 0.000 0.004 0.024 0.052
#> SRR772515 4 0.3670 0.77454 0.060 0.100 0.000 0.832 0.008
#> SRR772516 4 0.2188 0.83569 0.024 0.028 0.000 0.924 0.024
#> SRR772517 1 0.3010 0.66415 0.860 0.008 0.000 0.016 0.116
#> SRR772518 1 0.2339 0.68125 0.892 0.004 0.000 0.004 0.100
#> SRR772519 4 0.4288 0.31291 0.384 0.000 0.000 0.612 0.004
#> SRR772520 4 0.1626 0.83692 0.044 0.000 0.000 0.940 0.016
#> SRR772521 2 0.2266 0.61887 0.008 0.912 0.000 0.016 0.064
#> SRR772522 2 0.2136 0.62681 0.008 0.904 0.000 0.000 0.088
#> SRR772523 4 0.3566 0.78839 0.056 0.064 0.000 0.852 0.028
#> SRR772524 4 0.0727 0.85018 0.004 0.004 0.000 0.980 0.012
#> SRR772525 3 0.1124 0.80653 0.000 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR772526 4 0.0162 0.85129 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772527 4 0.0290 0.85112 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR772528 3 0.2891 0.78246 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR772529 1 0.4946 0.37354 0.664 0.276 0.000 0.000 0.060
#> SRR772530 2 0.6726 -0.12745 0.328 0.464 0.008 0.000 0.200
#> SRR772531 3 0.0566 0.80508 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR772532 4 0.1200 0.84781 0.008 0.012 0.000 0.964 0.016
#> SRR772533 4 0.1788 0.83471 0.008 0.056 0.000 0.932 0.004
#> SRR772534 2 0.3421 0.58611 0.080 0.840 0.000 0.000 0.080
#> SRR772535 2 0.7595 0.30971 0.128 0.496 0.000 0.244 0.132
#> SRR772536 4 0.6776 0.41194 0.036 0.204 0.000 0.560 0.200
#> SRR772537 4 0.5166 0.22213 0.004 0.436 0.000 0.528 0.032
#> SRR772538 4 0.3630 0.68381 0.000 0.204 0.000 0.780 0.016
#> SRR772539 1 0.0963 0.69251 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772540 1 0.2393 0.68646 0.900 0.016 0.004 0.000 0.080
#> SRR772541 1 0.1205 0.69136 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR772542 2 0.7140 0.21462 0.024 0.436 0.220 0.000 0.320
#> SRR772543 5 0.7375 0.09819 0.076 0.352 0.128 0.000 0.444
#> SRR772544 3 0.1408 0.79632 0.000 0.008 0.948 0.000 0.044
#> SRR772545 1 0.1270 0.69632 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772546 1 0.1205 0.69455 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR772547 5 0.6068 0.56665 0.368 0.112 0.004 0.000 0.516
#> SRR772548 5 0.5539 0.48993 0.444 0.048 0.008 0.000 0.500
#> SRR772549 1 0.2763 0.63833 0.848 0.004 0.000 0.000 0.148
#> SRR772550 1 0.2516 0.64129 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR772551 5 0.6782 0.33846 0.228 0.352 0.004 0.000 0.416
#> SRR772552 1 0.6940 -0.47696 0.428 0.180 0.008 0.008 0.376
#> SRR772553 3 0.2719 0.79303 0.004 0.000 0.852 0.000 0.144
#> SRR772554 4 0.0404 0.85130 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772555 4 0.0693 0.85010 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR772556 1 0.3446 0.65240 0.840 0.048 0.004 0.000 0.108
#> SRR772557 1 0.4454 0.62216 0.784 0.092 0.016 0.000 0.108
#> SRR772558 1 0.2723 0.65973 0.864 0.012 0.000 0.000 0.124
#> SRR772559 1 0.4558 0.28702 0.652 0.024 0.000 0.000 0.324
#> SRR772560 1 0.2179 0.67101 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR772561 3 0.1522 0.79409 0.000 0.012 0.944 0.000 0.044
#> SRR772562 1 0.4755 0.34958 0.664 0.004 0.000 0.300 0.032
#> SRR772563 4 0.5216 0.36622 0.344 0.000 0.004 0.604 0.048
#> SRR772564 3 0.7100 0.16133 0.076 0.336 0.488 0.000 0.100
#> SRR772565 2 0.6949 0.35567 0.060 0.508 0.324 0.000 0.108
#> SRR772566 1 0.6294 0.22409 0.616 0.180 0.028 0.000 0.176
#> SRR772567 1 0.4990 0.48551 0.712 0.188 0.004 0.000 0.096
#> SRR772568 4 0.3331 0.80471 0.032 0.072 0.000 0.864 0.032
#> SRR772569 4 0.0727 0.85122 0.004 0.004 0.000 0.980 0.012
#> SRR772570 1 0.3918 0.53432 0.752 0.008 0.008 0.000 0.232
#> SRR772571 1 0.0794 0.69260 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772572 5 0.5735 0.48504 0.432 0.072 0.004 0.000 0.492
#> SRR772573 5 0.7023 0.55643 0.376 0.136 0.004 0.032 0.452
#> SRR772574 1 0.3563 0.65383 0.840 0.092 0.008 0.000 0.060
#> SRR772575 1 0.4375 0.59434 0.772 0.156 0.008 0.000 0.064
#> SRR772576 1 0.5783 0.54216 0.712 0.060 0.024 0.044 0.160
#> SRR772577 1 0.6542 0.35390 0.612 0.064 0.116 0.000 0.208
#> SRR772578 4 0.3666 0.75111 0.000 0.132 0.012 0.824 0.032
#> SRR772579 4 0.7138 0.43653 0.000 0.120 0.188 0.568 0.124
#> SRR772580 3 0.1041 0.80645 0.000 0.004 0.964 0.000 0.032
#> SRR772581 2 0.1831 0.62333 0.004 0.920 0.000 0.000 0.076
#> SRR772582 2 0.2989 0.63105 0.044 0.872 0.000 0.004 0.080
#> SRR772583 1 0.3047 0.64107 0.832 0.004 0.004 0.000 0.160
#> SRR772584 1 0.1121 0.69127 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772585 1 0.2511 0.68370 0.892 0.004 0.016 0.000 0.088
#> SRR772586 3 0.4178 0.67318 0.008 0.004 0.696 0.000 0.292
#> SRR772587 5 0.6775 0.52828 0.328 0.284 0.000 0.000 0.388
#> SRR772588 4 0.1942 0.81975 0.068 0.000 0.000 0.920 0.012
#> SRR772589 4 0.3551 0.65061 0.220 0.000 0.000 0.772 0.008
#> SRR772590 3 0.0992 0.80117 0.000 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR772591 1 0.3142 0.65640 0.856 0.032 0.004 0.000 0.108
#> SRR772592 2 0.6955 -0.47466 0.340 0.344 0.004 0.000 0.312
#> SRR772593 3 0.3086 0.77652 0.004 0.000 0.816 0.000 0.180
#> SRR772594 2 0.7541 0.23044 0.000 0.380 0.040 0.276 0.304
#> SRR772595 4 0.7395 0.31538 0.004 0.240 0.104 0.532 0.120
#> SRR772596 3 0.2179 0.80092 0.004 0.000 0.896 0.000 0.100
#> SRR772597 3 0.0671 0.80405 0.000 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR772598 3 0.8068 -0.04591 0.228 0.248 0.408 0.000 0.116
#> SRR772599 1 0.7002 0.05356 0.564 0.084 0.124 0.000 0.228
#> SRR772600 2 0.4337 0.60252 0.052 0.744 0.000 0.000 0.204
#> SRR772601 2 0.3670 0.61140 0.020 0.796 0.004 0.000 0.180
#> SRR772602 3 0.2362 0.77648 0.000 0.024 0.900 0.000 0.076
#> SRR772603 2 0.5730 0.22397 0.356 0.548 0.000 0.000 0.096
#> SRR772604 2 0.3731 0.61597 0.040 0.800 0.000 0.000 0.160
#> SRR772605 1 0.2574 0.67518 0.876 0.000 0.012 0.000 0.112
#> SRR772606 2 0.8020 -0.18218 0.264 0.408 0.108 0.000 0.220
#> SRR772607 2 0.6309 0.29803 0.144 0.588 0.020 0.000 0.248
#> SRR772608 1 0.1443 0.69514 0.948 0.004 0.000 0.004 0.044
#> SRR772609 1 0.1124 0.69424 0.960 0.004 0.000 0.000 0.036
#> SRR772610 1 0.1981 0.69253 0.924 0.000 0.000 0.048 0.028
#> SRR772611 1 0.3018 0.66756 0.872 0.000 0.004 0.068 0.056
#> SRR772612 2 0.2366 0.61950 0.004 0.908 0.004 0.016 0.068
#> SRR772613 2 0.2213 0.62813 0.004 0.924 0.016 0.016 0.040
#> SRR772614 1 0.5996 -0.07420 0.464 0.448 0.012 0.000 0.076
#> SRR772615 1 0.6969 -0.39180 0.452 0.220 0.016 0.000 0.312
#> SRR772616 5 0.6416 0.60920 0.356 0.180 0.000 0.000 0.464
#> SRR772617 2 0.6204 0.44827 0.016 0.568 0.000 0.300 0.116
#> SRR772618 2 0.6824 0.47726 0.068 0.576 0.000 0.232 0.124
#> SRR772619 4 0.0404 0.85050 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772620 4 0.0510 0.85044 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772621 1 0.7381 0.00970 0.420 0.056 0.016 0.408 0.100
#> SRR772622 1 0.6244 0.44727 0.664 0.156 0.004 0.112 0.064
#> SRR772623 3 0.5577 0.43938 0.000 0.256 0.624 0.000 0.120
#> SRR772624 3 0.3086 0.77683 0.004 0.000 0.816 0.000 0.180
#> SRR772625 4 0.6495 -0.08667 0.000 0.000 0.388 0.424 0.188
#> SRR772626 3 0.6331 0.03850 0.004 0.420 0.440 0.000 0.136
#> SRR772627 3 0.5857 0.09165 0.000 0.444 0.460 0.000 0.096
#> SRR772628 2 0.6211 0.16008 0.176 0.564 0.004 0.000 0.256
#> SRR772629 2 0.3741 0.59371 0.108 0.816 0.000 0.000 0.076
#> SRR772630 2 0.6394 -0.04031 0.136 0.484 0.000 0.008 0.372
#> SRR772631 3 0.2674 0.79317 0.004 0.000 0.856 0.000 0.140
#> SRR772632 4 0.0162 0.85129 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772633 4 0.0000 0.85100 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 5 0.7783 0.18449 0.112 0.144 0.320 0.000 0.424
#> SRR772635 3 0.9732 -0.17431 0.188 0.204 0.276 0.228 0.104
#> SRR772636 3 0.4179 0.74780 0.000 0.000 0.776 0.072 0.152
#> SRR772637 1 0.3534 0.47261 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR772638 1 0.3074 0.57736 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR772639 4 0.4833 0.68997 0.128 0.096 0.000 0.756 0.020
#> SRR772640 4 0.0000 0.85100 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.85100 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.5710 0.38842 0.680 0.008 0.208 0.024 0.080
#> SRR772643 1 0.7379 0.10629 0.504 0.004 0.184 0.252 0.056
#> SRR772644 1 0.2877 0.64784 0.848 0.004 0.004 0.000 0.144
#> SRR772645 1 0.2338 0.66313 0.884 0.004 0.000 0.000 0.112
#> SRR772646 4 0.0404 0.85032 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR772647 4 0.2484 0.81407 0.068 0.000 0.004 0.900 0.028
#> SRR772648 4 0.4313 0.59056 0.008 0.276 0.000 0.704 0.012
#> SRR772649 4 0.3751 0.68781 0.000 0.212 0.004 0.772 0.012
#> SRR772650 1 0.1956 0.68817 0.916 0.008 0.000 0.000 0.076
#> SRR772651 1 0.2011 0.68633 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088
#> SRR772652 1 0.6329 -0.00288 0.472 0.396 0.008 0.000 0.124
#> SRR772653 2 0.7191 0.32332 0.264 0.524 0.076 0.000 0.136
#> SRR772654 2 0.7230 0.17642 0.228 0.548 0.004 0.076 0.144
#> SRR772655 4 0.5907 0.34883 0.060 0.356 0.000 0.560 0.024
#> SRR772656 3 0.2017 0.78237 0.000 0.008 0.912 0.000 0.080
#> SRR772657 3 0.0992 0.80117 0.000 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR772658 4 0.3354 0.79263 0.000 0.068 0.000 0.844 0.088
#> SRR772659 2 0.5043 0.37606 0.000 0.600 0.000 0.356 0.044
#> SRR772660 1 0.4550 0.41586 0.688 0.000 0.036 0.000 0.276
#> SRR772661 3 0.2890 0.78703 0.004 0.000 0.836 0.000 0.160
#> SRR772662 1 0.2907 0.67779 0.876 0.016 0.016 0.000 0.092
#> SRR772663 1 0.1082 0.69487 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR772664 4 0.6654 0.09272 0.196 0.008 0.000 0.488 0.308
#> SRR772665 4 0.7633 -0.21779 0.292 0.052 0.000 0.400 0.256
#> SRR772666 3 0.0865 0.80168 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR772667 1 0.2929 0.65936 0.840 0.000 0.000 0.008 0.152
#> SRR772668 3 0.6278 0.27198 0.004 0.308 0.532 0.000 0.156
#> SRR772669 2 0.5245 0.58970 0.088 0.736 0.044 0.000 0.132
#> SRR772670 1 0.1121 0.68458 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772671 1 0.2674 0.63845 0.856 0.004 0.000 0.000 0.140
#> SRR772672 1 0.1116 0.69269 0.964 0.004 0.000 0.004 0.028
#> SRR772673 1 0.0771 0.69132 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR772674 3 0.1571 0.79543 0.004 0.000 0.936 0.000 0.060
#> SRR772675 3 0.2230 0.79929 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR772676 2 0.6577 0.41993 0.060 0.536 0.000 0.332 0.072
#> SRR772677 2 0.6941 0.45382 0.196 0.592 0.004 0.128 0.080
#> SRR772678 3 0.2806 0.79018 0.004 0.000 0.844 0.000 0.152
#> SRR772679 1 0.1732 0.69141 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR772680 1 0.1544 0.69218 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR772681 3 0.0771 0.80332 0.000 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR772682 4 0.4169 0.57154 0.256 0.016 0.000 0.724 0.004
#> SRR772683 4 0.3944 0.66002 0.200 0.000 0.000 0.768 0.032
#> SRR772685 4 0.8219 0.34657 0.208 0.072 0.096 0.516 0.108
#> SRR772686 3 0.0898 0.80246 0.000 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR772687 3 0.5114 0.45556 0.032 0.004 0.560 0.000 0.404
#> SRR772688 4 0.0324 0.85164 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR772689 4 0.0404 0.85050 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772690 3 0.1012 0.80138 0.000 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR772691 3 0.2732 0.78937 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR772692 2 0.5023 0.54292 0.028 0.708 0.224 0.000 0.040
#> SRR772693 3 0.7534 0.38081 0.148 0.076 0.576 0.036 0.164
#> SRR772694 1 0.5893 0.46480 0.684 0.160 0.000 0.064 0.092
#> SRR772695 1 0.4216 0.59421 0.780 0.120 0.000 0.000 0.100
#> SRR772696 3 0.5991 0.02318 0.000 0.436 0.476 0.012 0.076
#> SRR772697 2 0.6773 0.41425 0.000 0.560 0.272 0.104 0.064
#> SRR772698 3 0.2561 0.79376 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772699 1 0.6853 0.09411 0.580 0.096 0.096 0.000 0.228
#> SRR772700 1 0.7284 0.01026 0.528 0.152 0.236 0.000 0.084
#> SRR772701 1 0.2654 0.69224 0.888 0.048 0.000 0.000 0.064
#> SRR772702 2 0.5139 0.16645 0.360 0.596 0.004 0.000 0.040
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.3097 0.67506 0.856 0.036 0.000 0.000 NA 0.080
#> SRR772342 1 0.3722 0.67487 0.816 0.032 0.000 0.000 NA 0.084
#> SRR772343 1 0.5722 0.51662 0.636 0.012 0.032 0.000 NA 0.204
#> SRR772344 4 0.3327 0.76901 0.004 0.076 0.000 0.844 NA 0.060
#> SRR772345 4 0.0717 0.81447 0.000 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR772346 2 0.6374 0.34924 0.044 0.556 0.012 0.000 NA 0.240
#> SRR772347 2 0.4455 0.56808 0.040 0.764 0.004 0.000 NA 0.124
#> SRR772348 6 0.6462 0.23852 0.344 0.004 0.000 0.032 NA 0.452
#> SRR772349 1 0.7984 -0.14722 0.336 0.040 0.000 0.272 NA 0.248
#> SRR772350 3 0.4144 0.63169 0.004 0.108 0.776 0.000 NA 0.012
#> SRR772351 6 0.8811 0.05732 0.132 0.212 0.004 0.244 NA 0.284
#> SRR772352 6 0.7756 0.10388 0.048 0.124 0.000 0.348 NA 0.364
#> SRR772353 1 0.1498 0.66943 0.940 0.000 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR772354 1 0.1003 0.67024 0.964 0.000 0.000 0.000 NA 0.016
#> SRR772355 4 0.8375 0.01031 0.076 0.132 0.016 0.388 NA 0.272
#> SRR772356 4 0.5173 0.69453 0.024 0.096 0.000 0.732 NA 0.084
#> SRR772357 1 0.2795 0.66622 0.864 0.004 0.004 0.000 NA 0.100
#> SRR772358 1 0.5054 0.56992 0.668 0.020 0.016 0.000 NA 0.248
#> SRR772359 1 0.5639 0.63158 0.676 0.024 0.012 0.016 NA 0.164
#> SRR772360 1 0.6348 0.54359 0.648 0.056 0.136 0.028 NA 0.020
#> SRR772361 3 0.0935 0.72696 0.000 0.000 0.964 0.000 NA 0.004
#> SRR772362 4 0.0146 0.81465 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR772363 4 0.0260 0.81393 0.000 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR772364 2 0.6518 0.50903 0.104 0.624 0.060 0.000 NA 0.080
#> SRR772365 2 0.6684 0.46044 0.004 0.548 0.136 0.000 NA 0.128
#> SRR772366 3 0.5698 0.60564 0.020 0.000 0.584 0.000 NA 0.148
#> SRR772367 3 0.1152 0.73540 0.004 0.000 0.952 0.000 NA 0.000
#> SRR772368 1 0.6033 0.39532 0.596 0.000 0.208 0.000 NA 0.068
#> SRR772369 1 0.7902 0.23658 0.460 0.108 0.000 0.136 NA 0.200
#> SRR772370 1 0.5821 0.46793 0.612 0.008 0.000 0.232 NA 0.112
#> SRR772371 2 0.6468 0.26241 0.000 0.432 0.056 0.000 NA 0.380
#> SRR772372 2 0.5961 0.36452 0.000 0.492 0.044 0.000 NA 0.376
#> SRR772373 4 0.3126 0.60523 0.248 0.000 0.000 0.752 NA 0.000
#> SRR772374 4 0.2884 0.71012 0.164 0.000 0.000 0.824 NA 0.004
#> SRR772375 3 0.0865 0.73524 0.000 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR772376 4 0.3009 0.78489 0.000 0.020 0.012 0.872 NA 0.036
#> SRR772377 3 0.3670 0.70769 0.000 0.000 0.736 0.000 NA 0.024
#> SRR772378 1 0.2152 0.67847 0.912 0.012 0.000 0.000 NA 0.036
#> SRR772379 1 0.4575 0.55799 0.668 0.016 0.000 0.000 NA 0.276
#> SRR772380 1 0.4724 0.49922 0.616 0.012 0.000 0.000 NA 0.332
#> SRR772381 3 0.1080 0.73352 0.004 0.000 0.960 0.000 NA 0.004
#> SRR772382 1 0.7193 -0.15847 0.384 0.260 0.000 0.000 NA 0.264
#> SRR772383 1 0.6076 0.40558 0.572 0.152 0.000 0.000 NA 0.228
#> SRR772384 3 0.4361 0.69984 0.016 0.000 0.700 0.000 NA 0.036
#> SRR772385 3 0.4516 0.68532 0.008 0.000 0.668 0.000 NA 0.048
#> SRR772386 4 0.5865 0.64309 0.088 0.136 0.016 0.684 NA 0.020
#> SRR772387 4 0.1426 0.81177 0.000 0.016 0.000 0.948 NA 0.008
#> SRR772388 1 0.4354 0.58783 0.704 0.008 0.000 0.000 NA 0.236
#> SRR772389 1 0.5177 0.51458 0.628 0.032 0.000 0.000 NA 0.280
#> SRR772390 3 0.3430 0.71516 0.004 0.000 0.772 0.000 NA 0.016
#> SRR772391 1 0.1901 0.66729 0.912 0.004 0.000 0.000 NA 0.076
#> SRR772392 1 0.2612 0.67263 0.868 0.016 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR772393 2 0.7578 0.20661 0.004 0.340 0.312 0.000 NA 0.172
#> SRR772394 2 0.6829 0.04360 0.004 0.420 0.364 0.000 NA 0.080
#> SRR772395 1 0.5591 0.19915 0.504 0.000 0.000 0.396 NA 0.028
#> SRR772396 1 0.7121 0.26297 0.488 0.180 0.016 0.000 NA 0.228
#> SRR772397 1 0.6628 0.54170 0.612 0.096 0.052 0.000 NA 0.112
#> SRR772398 2 0.7706 0.18154 0.004 0.332 0.240 0.000 NA 0.252
#> SRR772399 2 0.6768 0.41889 0.004 0.532 0.180 0.000 NA 0.176
#> SRR772400 6 0.7784 0.38264 0.116 0.076 0.176 0.000 NA 0.476
#> SRR772401 6 0.6904 0.44880 0.116 0.056 0.136 0.000 NA 0.584
#> SRR772402 2 0.3167 0.57796 0.012 0.852 0.000 0.004 NA 0.052
#> SRR772403 2 0.3391 0.58110 0.012 0.836 0.004 0.000 NA 0.060
#> SRR772404 1 0.3978 0.64511 0.808 0.000 0.076 0.004 NA 0.052
#> SRR772405 3 0.4448 0.69719 0.016 0.000 0.692 0.000 NA 0.040
#> SRR772406 2 0.7812 0.28752 0.080 0.472 0.004 0.220 NA 0.128
#> SRR772407 2 0.6420 0.52164 0.024 0.664 0.080 0.084 NA 0.052
#> SRR772408 4 0.0146 0.81418 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR772409 4 0.0146 0.81418 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR772410 6 0.5701 0.23680 0.340 0.032 0.000 0.016 NA 0.560
#> SRR772411 6 0.5992 0.24413 0.352 0.088 0.000 0.004 NA 0.516
#> SRR772412 1 0.3443 0.65875 0.828 0.028 0.012 0.000 NA 0.012
#> SRR772413 1 0.3080 0.66423 0.848 0.040 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772414 3 0.0935 0.72744 0.004 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR772415 1 0.1564 0.67358 0.936 0.000 0.000 0.000 NA 0.024
#> SRR772416 1 0.1713 0.67264 0.928 0.000 0.000 0.000 NA 0.044
#> SRR772417 6 0.6173 0.32352 0.116 0.248 0.000 0.004 NA 0.572
#> SRR772418 3 0.4401 0.69809 0.012 0.000 0.696 0.000 NA 0.044
#> SRR772419 4 0.0291 0.81462 0.000 0.000 0.000 0.992 NA 0.004
#> SRR772420 4 0.0436 0.81523 0.004 0.000 0.000 0.988 NA 0.004
#> SRR772421 4 0.8815 0.02198 0.168 0.200 0.104 0.388 NA 0.036
#> SRR772422 4 0.8118 0.28019 0.096 0.180 0.116 0.484 NA 0.024
#> SRR772423 2 0.2722 0.57684 0.004 0.872 0.000 0.004 NA 0.088
#> SRR772424 2 0.5255 0.57835 0.024 0.732 0.008 0.048 NA 0.072
#> SRR772425 4 0.3576 0.75894 0.008 0.076 0.000 0.824 NA 0.084
#> SRR772426 4 0.1760 0.79960 0.048 0.000 0.000 0.928 NA 0.004
#> SRR772427 4 0.1390 0.80703 0.032 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR772428 1 0.6921 0.44393 0.580 0.072 0.072 0.000 NA 0.152
#> SRR772429 1 0.5277 0.62580 0.728 0.104 0.044 0.000 NA 0.048
#> SRR772430 1 0.3320 0.66413 0.844 0.000 0.048 0.000 NA 0.032
#> SRR772431 2 0.5702 0.41669 0.180 0.624 0.004 0.000 NA 0.028
#> SRR772432 2 0.5826 0.39684 0.184 0.612 0.004 0.000 NA 0.032
#> SRR772433 1 0.7374 0.34964 0.520 0.160 0.072 0.000 NA 0.076
#> SRR772434 1 0.5595 0.60599 0.688 0.080 0.016 0.000 NA 0.128
#> SRR772435 1 0.5138 0.61358 0.712 0.060 0.032 0.000 NA 0.028
#> SRR772436 1 0.5161 0.59087 0.700 0.112 0.004 0.000 NA 0.040
#> SRR772437 3 0.1932 0.71234 0.004 0.004 0.912 0.000 NA 0.004
#> SRR772438 6 0.6820 0.12033 0.028 0.264 0.084 0.000 NA 0.528
#> SRR772439 2 0.7336 0.34910 0.020 0.464 0.148 0.000 NA 0.252
#> SRR772440 1 0.6808 0.50534 0.612 0.100 0.012 0.104 NA 0.044
#> SRR772441 1 0.8571 0.01225 0.408 0.252 0.052 0.096 NA 0.072
#> SRR772442 2 0.4281 0.56929 0.024 0.792 0.000 0.072 NA 0.024
#> SRR772443 2 0.4424 0.52293 0.120 0.768 0.000 0.004 NA 0.044
#> SRR772444 1 0.5140 0.58878 0.708 0.112 0.000 0.000 NA 0.104
#> SRR772445 1 0.4647 0.65516 0.768 0.068 0.016 0.000 NA 0.056
#> SRR772446 1 0.3277 0.65057 0.812 0.008 0.000 0.000 NA 0.156
#> SRR772447 1 0.3286 0.66837 0.836 0.016 0.000 0.000 NA 0.104
#> SRR772448 2 0.8039 0.26228 0.036 0.400 0.152 0.004 NA 0.228
#> SRR772449 4 0.9054 -0.35793 0.044 0.216 0.052 0.260 NA 0.260
#> SRR772450 4 0.0260 0.81441 0.000 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR772451 4 0.0260 0.81447 0.000 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR772452 1 0.5028 0.45364 0.588 0.012 0.000 0.000 NA 0.340
#> SRR772453 1 0.4696 0.43967 0.592 0.012 0.000 0.000 NA 0.364
#> SRR772454 1 0.4430 0.61809 0.752 0.120 0.000 0.000 NA 0.024
#> SRR772455 1 0.5475 0.37442 0.564 0.052 0.000 0.000 NA 0.340
#> SRR772456 4 0.0260 0.81405 0.000 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR772457 4 0.0291 0.81476 0.000 0.000 0.000 0.992 NA 0.004
#> SRR772458 2 0.6387 0.02049 0.260 0.476 0.000 0.000 NA 0.236
#> SRR772459 6 0.5739 0.33340 0.308 0.068 0.000 0.000 NA 0.568
#> SRR772460 4 0.0405 0.81454 0.000 0.000 0.000 0.988 NA 0.004
#> SRR772461 4 0.0146 0.81430 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.004
#> SRR772462 1 0.3616 0.58556 0.780 0.000 0.000 0.184 NA 0.012
#> SRR772463 1 0.3367 0.61151 0.804 0.000 0.000 0.164 NA 0.012
#> SRR772464 3 0.0837 0.73494 0.004 0.000 0.972 0.000 NA 0.004
#> SRR772465 1 0.7832 -0.22747 0.352 0.164 0.000 0.104 NA 0.336
#> SRR772466 1 0.7901 -0.00545 0.404 0.112 0.000 0.144 NA 0.280
#> SRR772467 4 0.0260 0.81393 0.000 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR772468 4 0.0146 0.81391 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR772469 6 0.5848 0.40122 0.284 0.096 0.000 0.000 NA 0.572
#> SRR772470 6 0.5069 -0.13869 0.464 0.024 0.000 0.000 NA 0.480
#> SRR772471 1 0.4225 0.56827 0.696 0.012 0.000 0.000 NA 0.264
#> SRR772472 1 0.5007 0.16187 0.484 0.024 0.000 0.000 NA 0.464
#> SRR772473 2 0.4139 0.58737 0.040 0.812 0.000 0.044 NA 0.044
#> SRR772474 2 0.5934 0.52671 0.092 0.660 0.004 0.024 NA 0.056
#> SRR772475 3 0.4749 0.66883 0.000 0.000 0.648 0.000 NA 0.092
#> SRR772476 4 0.0000 0.81390 0.000 0.000 0.000 1.000 NA 0.000
#> SRR772477 4 0.0260 0.81405 0.000 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR772478 1 0.2436 0.67238 0.880 0.000 0.000 0.000 NA 0.088
#> SRR772479 1 0.2419 0.67913 0.896 0.016 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR772480 2 0.3770 0.57837 0.008 0.796 0.000 0.000 NA 0.096
#> SRR772481 2 0.4747 0.56623 0.052 0.736 0.000 0.000 NA 0.128
#> SRR772482 3 0.7012 0.16145 0.204 0.012 0.504 0.000 NA 0.092
#> SRR772483 6 0.8048 0.38939 0.196 0.032 0.220 0.000 NA 0.368
#> SRR772484 1 0.2680 0.66401 0.880 0.000 0.000 0.048 NA 0.012
#> SRR772485 1 0.2507 0.66579 0.892 0.000 0.000 0.028 NA 0.020
#> SRR772486 6 0.6847 0.17520 0.000 0.152 0.224 0.000 NA 0.500
#> SRR772487 6 0.7640 -0.05866 0.000 0.228 0.272 0.000 NA 0.312
#> SRR772488 1 0.3105 0.66399 0.852 0.004 0.000 0.096 NA 0.012
#> SRR772489 1 0.3147 0.66855 0.864 0.028 0.000 0.056 NA 0.008
#> SRR772490 1 0.7622 0.09299 0.440 0.240 0.028 0.000 NA 0.144
#> SRR772491 1 0.6948 0.15475 0.456 0.176 0.016 0.000 NA 0.300
#> SRR772492 4 0.0405 0.81431 0.000 0.000 0.000 0.988 NA 0.004
#> SRR772493 4 0.0405 0.81431 0.000 0.000 0.000 0.988 NA 0.004
#> SRR772494 4 0.0000 0.81390 0.000 0.000 0.000 1.000 NA 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.81390 0.000 0.000 0.000 1.000 NA 0.000
#> SRR772496 1 0.7399 0.22636 0.468 0.044 0.000 0.200 NA 0.224
#> SRR772497 1 0.6727 0.37578 0.540 0.060 0.000 0.052 NA 0.272
#> SRR772498 3 0.7506 0.12653 0.000 0.156 0.356 0.000 NA 0.260
#> SRR772499 3 0.6946 0.41639 0.000 0.100 0.472 0.000 NA 0.212
#> SRR772500 4 0.0717 0.81514 0.000 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR772501 4 0.0146 0.81458 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR772502 6 0.8503 0.05891 0.152 0.300 0.036 0.024 NA 0.316
#> SRR772503 2 0.7019 0.20042 0.120 0.484 0.008 0.000 NA 0.260
#> SRR772504 4 0.2452 0.78250 0.000 0.084 0.000 0.884 NA 0.004
#> SRR772505 4 0.3844 0.76644 0.012 0.068 0.004 0.828 NA 0.040
#> SRR772506 4 0.0000 0.81390 0.000 0.000 0.000 1.000 NA 0.000
#> SRR772507 4 0.0146 0.81458 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR772508 1 0.4109 0.63799 0.808 0.008 0.012 0.088 NA 0.024
#> SRR772509 3 0.3911 0.70739 0.008 0.000 0.720 0.000 NA 0.020
#> SRR772510 3 0.1493 0.72435 0.004 0.004 0.936 0.000 NA 0.000
#> SRR772511 2 0.6725 0.40778 0.084 0.552 0.024 0.000 NA 0.232
#> SRR772512 3 0.2580 0.69619 0.000 0.008 0.880 0.008 NA 0.012
#> SRR772513 1 0.1933 0.67546 0.920 0.004 0.000 0.000 NA 0.044
#> SRR772514 1 0.2045 0.67475 0.920 0.000 0.000 0.024 NA 0.028
#> SRR772515 4 0.5302 0.67604 0.072 0.100 0.000 0.716 NA 0.096
#> SRR772516 4 0.3781 0.76737 0.064 0.036 0.000 0.832 NA 0.040
#> SRR772517 1 0.4121 0.65821 0.804 0.060 0.004 0.036 NA 0.008
#> SRR772518 1 0.3095 0.68017 0.864 0.028 0.000 0.008 NA 0.028
#> SRR772519 4 0.4990 0.38316 0.320 0.004 0.000 0.612 NA 0.052
#> SRR772520 4 0.2357 0.78731 0.068 0.012 0.000 0.900 NA 0.012
#> SRR772521 2 0.5752 0.46338 0.012 0.556 0.000 0.008 NA 0.308
#> SRR772522 2 0.4422 0.56812 0.012 0.772 0.024 0.000 NA 0.096
#> SRR772523 4 0.4945 0.65905 0.068 0.152 0.000 0.728 NA 0.016
#> SRR772524 4 0.1794 0.80764 0.012 0.024 0.000 0.936 NA 0.008
#> SRR772525 3 0.1219 0.73520 0.004 0.000 0.948 0.000 NA 0.000
#> SRR772526 4 0.0146 0.81430 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.004
#> SRR772527 4 0.0146 0.81430 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.004
#> SRR772528 3 0.4592 0.69134 0.020 0.000 0.684 0.000 NA 0.044
#> SRR772529 1 0.7002 0.11352 0.456 0.168 0.000 0.000 NA 0.264
#> SRR772530 2 0.7226 -0.10827 0.284 0.432 0.008 0.000 NA 0.176
#> SRR772531 3 0.1124 0.73324 0.008 0.000 0.956 0.000 NA 0.000
#> SRR772532 4 0.1802 0.80566 0.000 0.024 0.000 0.932 NA 0.024
#> SRR772533 4 0.3808 0.75626 0.008 0.060 0.000 0.816 NA 0.092
#> SRR772534 2 0.5682 0.44881 0.088 0.620 0.000 0.000 NA 0.232
#> SRR772535 6 0.8390 0.04013 0.096 0.268 0.000 0.180 NA 0.340
#> SRR772536 4 0.6863 0.23906 0.024 0.128 0.000 0.480 NA 0.312
#> SRR772537 2 0.6669 0.14214 0.000 0.428 0.000 0.368 NA 0.116
#> SRR772538 4 0.5208 0.44699 0.000 0.288 0.000 0.612 NA 0.084
#> SRR772539 1 0.1586 0.67064 0.940 0.004 0.004 0.000 NA 0.012
#> SRR772540 1 0.2896 0.67699 0.880 0.032 0.012 0.000 NA 0.024
#> SRR772541 1 0.2334 0.67205 0.904 0.004 0.008 0.000 NA 0.040
#> SRR772542 6 0.7313 0.10270 0.004 0.200 0.192 0.000 NA 0.448
#> SRR772543 6 0.6968 0.33051 0.036 0.108 0.164 0.000 NA 0.560
#> SRR772544 3 0.1285 0.72280 0.004 0.000 0.944 0.000 NA 0.000
#> SRR772545 1 0.3725 0.67908 0.804 0.016 0.000 0.000 NA 0.064
#> SRR772546 1 0.3041 0.68190 0.856 0.020 0.000 0.000 NA 0.036
#> SRR772547 6 0.7935 0.36138 0.208 0.176 0.028 0.000 NA 0.388
#> SRR772548 6 0.6753 0.33346 0.292 0.032 0.024 0.000 NA 0.484
#> SRR772549 1 0.3892 0.61284 0.740 0.000 0.000 0.000 NA 0.212
#> SRR772550 1 0.3990 0.56129 0.688 0.000 0.000 0.000 NA 0.284
#> SRR772551 6 0.6973 0.32481 0.156 0.220 0.000 0.000 NA 0.484
#> SRR772552 6 0.6937 0.44537 0.236 0.148 0.000 0.008 NA 0.504
#> SRR772553 3 0.3645 0.71006 0.000 0.000 0.740 0.000 NA 0.024
#> SRR772554 4 0.1396 0.81242 0.004 0.024 0.000 0.952 NA 0.012
#> SRR772555 4 0.1167 0.81313 0.000 0.012 0.000 0.960 NA 0.020
#> SRR772556 1 0.3856 0.65525 0.808 0.044 0.012 0.000 NA 0.020
#> SRR772557 1 0.5269 0.61033 0.712 0.108 0.016 0.000 NA 0.048
#> SRR772558 1 0.3755 0.60322 0.732 0.004 0.000 0.000 NA 0.244
#> SRR772559 1 0.4987 0.16620 0.480 0.016 0.000 0.000 NA 0.468
#> SRR772560 1 0.2709 0.66838 0.848 0.000 0.000 0.000 NA 0.132
#> SRR772561 3 0.2121 0.70061 0.000 0.000 0.892 0.000 NA 0.012
#> SRR772562 1 0.5757 0.26872 0.532 0.012 0.000 0.368 NA 0.044
#> SRR772563 4 0.5107 0.40652 0.332 0.016 0.000 0.604 NA 0.020
#> SRR772564 3 0.7339 0.37006 0.044 0.164 0.504 0.000 NA 0.088
#> SRR772565 3 0.8046 -0.11426 0.068 0.296 0.356 0.000 NA 0.088
#> SRR772566 1 0.6884 0.00274 0.428 0.108 0.016 0.000 NA 0.372
#> SRR772567 1 0.6409 0.51011 0.608 0.152 0.020 0.000 NA 0.132
#> SRR772568 4 0.4127 0.75432 0.044 0.056 0.000 0.812 NA 0.056
#> SRR772569 4 0.1121 0.81224 0.016 0.008 0.000 0.964 NA 0.008
#> SRR772570 1 0.5365 0.48162 0.596 0.024 0.000 0.000 NA 0.300
#> SRR772571 1 0.3222 0.67836 0.844 0.024 0.000 0.000 NA 0.096
#> SRR772572 6 0.6477 0.46615 0.224 0.088 0.000 0.004 NA 0.556
#> SRR772573 6 0.6069 0.43793 0.248 0.044 0.000 0.032 NA 0.604
#> SRR772574 1 0.4632 0.64177 0.752 0.092 0.004 0.000 NA 0.112
#> SRR772575 1 0.5633 0.55183 0.676 0.108 0.012 0.000 NA 0.140
#> SRR772576 1 0.5973 0.55569 0.672 0.128 0.016 0.048 NA 0.020
#> SRR772577 1 0.5926 0.51400 0.652 0.120 0.084 0.000 NA 0.012
#> SRR772578 4 0.5285 0.63069 0.000 0.064 0.004 0.696 NA 0.148
#> SRR772579 4 0.7925 0.21642 0.000 0.068 0.120 0.444 NA 0.196
#> SRR772580 3 0.1152 0.73579 0.004 0.000 0.952 0.000 NA 0.000
#> SRR772581 2 0.2982 0.57558 0.016 0.856 0.000 0.000 NA 0.096
#> SRR772582 2 0.4715 0.56765 0.048 0.760 0.008 0.004 NA 0.108
#> SRR772583 1 0.5498 0.56055 0.636 0.040 0.000 0.000 NA 0.220
#> SRR772584 1 0.3317 0.67336 0.836 0.024 0.000 0.000 NA 0.036
#> SRR772585 1 0.2983 0.66435 0.856 0.012 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR772586 3 0.5268 0.65017 0.016 0.000 0.632 0.000 NA 0.112
#> SRR772587 2 0.7233 -0.20229 0.224 0.368 0.000 0.000 NA 0.308
#> SRR772588 4 0.1531 0.79288 0.068 0.000 0.000 0.928 NA 0.000
#> SRR772589 4 0.3411 0.62123 0.232 0.000 0.000 0.756 NA 0.004
#> SRR772590 3 0.0935 0.72767 0.000 0.000 0.964 0.000 NA 0.004
#> SRR772591 1 0.5289 0.53192 0.636 0.032 0.004 0.000 NA 0.264
#> SRR772592 6 0.6631 0.41545 0.240 0.200 0.000 0.000 NA 0.496
#> SRR772593 3 0.4862 0.67674 0.012 0.000 0.664 0.000 NA 0.080
#> SRR772594 6 0.8023 -0.17844 0.000 0.288 0.028 0.192 NA 0.328
#> SRR772595 4 0.8343 -0.16616 0.004 0.284 0.072 0.348 NA 0.124
#> SRR772596 3 0.2913 0.72346 0.004 0.000 0.812 0.000 NA 0.004
#> SRR772597 3 0.1155 0.73499 0.004 0.000 0.956 0.000 NA 0.004
#> SRR772598 3 0.8239 -0.19169 0.280 0.128 0.352 0.000 NA 0.072
#> SRR772599 1 0.8123 0.06997 0.432 0.088 0.168 0.000 NA 0.148
#> SRR772600 2 0.3592 0.56034 0.020 0.812 0.000 0.000 NA 0.044
#> SRR772601 2 0.3007 0.57204 0.020 0.860 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR772602 3 0.2923 0.68477 0.004 0.024 0.856 0.000 NA 0.008
#> SRR772603 2 0.5701 0.27509 0.272 0.588 0.000 0.000 NA 0.036
#> SRR772604 2 0.3774 0.56452 0.024 0.804 0.000 0.000 NA 0.056
#> SRR772605 1 0.4293 0.63597 0.772 0.000 0.036 0.000 NA 0.092
#> SRR772606 6 0.8340 0.29116 0.168 0.164 0.092 0.000 NA 0.392
#> SRR772607 6 0.7516 0.28234 0.144 0.232 0.028 0.000 NA 0.460
#> SRR772608 1 0.2468 0.67620 0.888 0.004 0.000 0.000 NA 0.060
#> SRR772609 1 0.2563 0.67163 0.884 0.008 0.000 0.000 NA 0.068
#> SRR772610 1 0.3868 0.66281 0.816 0.020 0.000 0.088 NA 0.060
#> SRR772611 1 0.3604 0.65279 0.820 0.000 0.000 0.104 NA 0.044
#> SRR772612 2 0.4723 0.55904 0.000 0.708 0.000 0.012 NA 0.156
#> SRR772613 2 0.4047 0.57076 0.000 0.780 0.008 0.004 NA 0.100
#> SRR772614 1 0.7637 0.02572 0.416 0.264 0.028 0.000 NA 0.108
#> SRR772615 6 0.6758 0.28357 0.332 0.104 0.012 0.000 NA 0.472
#> SRR772616 6 0.6416 0.47610 0.224 0.116 0.000 0.004 NA 0.564
#> SRR772617 2 0.4700 0.53410 0.016 0.748 0.000 0.104 NA 0.020
#> SRR772618 2 0.4883 0.52103 0.028 0.744 0.000 0.096 NA 0.024
#> SRR772619 4 0.1088 0.81305 0.000 0.000 0.000 0.960 NA 0.016
#> SRR772620 4 0.1168 0.81121 0.000 0.000 0.000 0.956 NA 0.016
#> SRR772621 4 0.7717 0.08313 0.308 0.048 0.020 0.428 NA 0.052
#> SRR772622 1 0.7777 0.28308 0.492 0.152 0.000 0.124 NA 0.124
#> SRR772623 3 0.5241 0.48432 0.004 0.164 0.660 0.000 NA 0.012
#> SRR772624 3 0.4594 0.69085 0.016 0.000 0.692 0.000 NA 0.056
#> SRR772625 3 0.7031 0.29940 0.000 0.000 0.360 0.304 NA 0.064
#> SRR772626 3 0.7476 0.07891 0.000 0.168 0.380 0.000 NA 0.224
#> SRR772627 3 0.7258 0.15743 0.000 0.232 0.432 0.000 NA 0.160
#> SRR772628 6 0.6705 0.19650 0.084 0.280 0.004 0.004 NA 0.512
#> SRR772629 2 0.6174 0.27100 0.104 0.524 0.000 0.000 NA 0.312
#> SRR772630 6 0.6044 0.24353 0.080 0.256 0.000 0.004 NA 0.584
#> SRR772631 3 0.4310 0.70391 0.024 0.000 0.712 0.000 NA 0.028
#> SRR772632 4 0.0146 0.81438 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR772633 4 0.0146 0.81391 0.000 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR772634 6 0.7618 0.15792 0.052 0.060 0.292 0.000 NA 0.404
#> SRR772635 3 0.9342 -0.19086 0.132 0.164 0.244 0.244 NA 0.032
#> SRR772636 3 0.5219 0.65549 0.004 0.000 0.648 0.096 NA 0.016
#> SRR772637 1 0.5429 0.39029 0.564 0.028 0.000 0.000 NA 0.340
#> SRR772638 1 0.4784 0.47402 0.624 0.012 0.000 0.000 NA 0.316
#> SRR772639 4 0.6054 0.55134 0.072 0.204 0.000 0.632 NA 0.056
#> SRR772640 4 0.0363 0.81394 0.000 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR772641 4 0.0508 0.81434 0.000 0.000 0.000 0.984 NA 0.004
#> SRR772642 1 0.6822 0.35273 0.580 0.012 0.212 0.048 NA 0.052
#> SRR772643 1 0.6804 0.26725 0.508 0.008 0.116 0.280 NA 0.004
#> SRR772644 1 0.3961 0.64511 0.772 0.004 0.004 0.000 NA 0.156
#> SRR772645 1 0.3968 0.63821 0.756 0.004 0.000 0.000 NA 0.180
#> SRR772646 4 0.0862 0.81442 0.004 0.000 0.000 0.972 NA 0.008
#> SRR772647 4 0.2458 0.78237 0.068 0.000 0.000 0.892 NA 0.016
#> SRR772648 4 0.6044 0.55093 0.012 0.156 0.004 0.644 NA 0.112
#> SRR772649 4 0.5542 0.60128 0.000 0.168 0.016 0.676 NA 0.096
#> SRR772650 1 0.2136 0.67387 0.908 0.016 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR772651 1 0.2401 0.67503 0.892 0.008 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR772652 1 0.6808 0.17854 0.472 0.336 0.020 0.000 NA 0.076
#> SRR772653 1 0.8442 -0.16427 0.312 0.268 0.108 0.000 NA 0.096
#> SRR772654 6 0.7829 0.11115 0.108 0.304 0.004 0.040 NA 0.396
#> SRR772655 4 0.6769 0.36509 0.040 0.240 0.000 0.540 NA 0.136
#> SRR772656 3 0.1787 0.72098 0.008 0.004 0.920 0.000 NA 0.000
#> SRR772657 3 0.0777 0.72846 0.000 0.000 0.972 0.000 NA 0.004
#> SRR772658 4 0.4657 0.61775 0.000 0.224 0.000 0.696 NA 0.020
#> SRR772659 2 0.4476 0.45999 0.000 0.712 0.000 0.220 NA 0.024
#> SRR772660 1 0.5875 0.37984 0.572 0.000 0.044 0.000 NA 0.276
#> SRR772661 3 0.4361 0.69622 0.004 0.000 0.700 0.000 NA 0.060
#> SRR772662 1 0.3587 0.68169 0.828 0.020 0.012 0.000 NA 0.036
#> SRR772663 1 0.2329 0.68038 0.904 0.004 0.008 0.000 NA 0.048
#> SRR772664 4 0.5897 0.17132 0.072 0.012 0.000 0.500 NA 0.388
#> SRR772665 4 0.7015 -0.08910 0.148 0.056 0.000 0.396 NA 0.380
#> SRR772666 3 0.1049 0.72667 0.000 0.000 0.960 0.000 NA 0.008
#> SRR772667 1 0.4878 0.63319 0.744 0.020 0.004 0.020 NA 0.112
#> SRR772668 3 0.6438 0.17872 0.000 0.264 0.484 0.000 NA 0.036
#> SRR772669 2 0.7811 0.23891 0.060 0.364 0.064 0.000 NA 0.308
#> SRR772670 1 0.2393 0.67857 0.892 0.004 0.000 0.000 NA 0.064
#> SRR772671 1 0.3704 0.61248 0.744 0.008 0.000 0.000 NA 0.232
#> SRR772672 1 0.2486 0.67727 0.900 0.008 0.000 0.016 NA 0.048
#> SRR772673 1 0.2202 0.67719 0.908 0.012 0.000 0.000 NA 0.052
#> SRR772674 3 0.1929 0.72961 0.016 0.008 0.924 0.000 NA 0.004
#> SRR772675 3 0.3535 0.71632 0.008 0.000 0.760 0.000 NA 0.012
#> SRR772676 4 0.8193 -0.36132 0.044 0.284 0.000 0.308 NA 0.224
#> SRR772677 2 0.8743 0.19519 0.180 0.376 0.016 0.148 NA 0.104
#> SRR772678 3 0.4506 0.69065 0.012 0.000 0.684 0.000 NA 0.048
#> SRR772679 1 0.2791 0.67213 0.872 0.024 0.008 0.000 NA 0.008
#> SRR772680 1 0.3278 0.66735 0.852 0.032 0.008 0.000 NA 0.028
#> SRR772681 3 0.1155 0.72824 0.004 0.004 0.956 0.000 NA 0.000
#> SRR772682 4 0.5760 0.41818 0.256 0.016 0.000 0.608 NA 0.096
#> SRR772683 4 0.4382 0.69364 0.116 0.004 0.000 0.772 NA 0.044
#> SRR772685 4 0.8008 0.27359 0.184 0.076 0.120 0.468 NA 0.008
#> SRR772686 3 0.0935 0.73075 0.004 0.000 0.964 0.000 NA 0.000
#> SRR772687 3 0.6348 0.51665 0.044 0.000 0.524 0.000 NA 0.204
#> SRR772688 4 0.0914 0.81381 0.000 0.000 0.000 0.968 NA 0.016
#> SRR772689 4 0.1232 0.81316 0.000 0.004 0.000 0.956 NA 0.016
#> SRR772690 3 0.1152 0.72404 0.000 0.000 0.952 0.000 NA 0.004
#> SRR772691 3 0.4255 0.69893 0.004 0.000 0.700 0.004 NA 0.036
#> SRR772692 2 0.7847 0.21544 0.024 0.368 0.280 0.000 NA 0.176
#> SRR772693 3 0.8798 0.14604 0.092 0.060 0.412 0.092 NA 0.152
#> SRR772694 1 0.7601 0.20287 0.488 0.152 0.000 0.052 NA 0.180
#> SRR772695 1 0.6187 0.42889 0.580 0.108 0.000 0.004 NA 0.236
#> SRR772696 3 0.7066 0.25869 0.000 0.164 0.504 0.024 NA 0.076
#> SRR772697 3 0.8765 -0.26818 0.000 0.264 0.264 0.140 NA 0.140
#> SRR772698 3 0.4012 0.70594 0.012 0.000 0.724 0.000 NA 0.024
#> SRR772699 1 0.7758 -0.13551 0.380 0.068 0.088 0.000 NA 0.340
#> SRR772700 1 0.8201 -0.06250 0.400 0.076 0.216 0.000 NA 0.148
#> SRR772701 1 0.3674 0.67907 0.824 0.056 0.000 0.000 NA 0.056
#> SRR772702 2 0.6182 -0.02145 0.356 0.460 0.000 0.000 NA 0.160
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.215 0.729 0.837 0.4142 0.513 0.513
#> 3 3 0.266 0.357 0.667 0.3074 0.577 0.400
#> 4 4 0.321 0.643 0.759 0.1446 0.653 0.406
#> 5 5 0.345 0.635 0.764 0.0653 0.968 0.910
#> 6 6 0.428 0.474 0.734 0.0741 0.930 0.803
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.7056 0.7969 0.808 0.192
#> SRR772342 1 0.6887 0.8019 0.816 0.184
#> SRR772343 1 0.9866 0.3382 0.568 0.432
#> SRR772344 2 0.5178 0.8374 0.116 0.884
#> SRR772345 2 0.5178 0.8374 0.116 0.884
#> SRR772346 2 0.9954 0.1520 0.460 0.540
#> SRR772347 2 0.9944 0.1705 0.456 0.544
#> SRR772348 2 0.5294 0.8389 0.120 0.880
#> SRR772349 2 0.5294 0.8389 0.120 0.880
#> SRR772350 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.4562 0.8337 0.096 0.904
#> SRR772352 2 0.5946 0.8392 0.144 0.856
#> SRR772353 2 0.9850 0.3083 0.428 0.572
#> SRR772354 2 0.9881 0.2782 0.436 0.564
#> SRR772355 2 0.5946 0.8375 0.144 0.856
#> SRR772356 2 0.5519 0.8384 0.128 0.872
#> SRR772357 1 0.8443 0.7157 0.728 0.272
#> SRR772358 1 0.8955 0.6495 0.688 0.312
#> SRR772359 1 0.9710 0.4485 0.600 0.400
#> SRR772360 2 0.9775 0.3675 0.412 0.588
#> SRR772361 1 0.3733 0.8059 0.928 0.072
#> SRR772362 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772364 2 0.9775 0.3595 0.412 0.588
#> SRR772365 2 0.9732 0.3791 0.404 0.596
#> SRR772366 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772367 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.6623 0.8287 0.172 0.828
#> SRR772369 2 0.8861 0.6608 0.304 0.696
#> SRR772370 2 0.8327 0.7317 0.264 0.736
#> SRR772371 2 0.9922 0.2172 0.448 0.552
#> SRR772372 2 0.9922 0.2172 0.448 0.552
#> SRR772373 2 0.6343 0.8341 0.160 0.840
#> SRR772374 2 0.6148 0.8357 0.152 0.848
#> SRR772375 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.5737 0.8397 0.136 0.864
#> SRR772377 1 0.7745 0.7649 0.772 0.228
#> SRR772378 2 0.9661 0.4362 0.392 0.608
#> SRR772379 2 0.8909 0.6545 0.308 0.692
#> SRR772380 2 0.9129 0.6102 0.328 0.672
#> SRR772381 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.6973 0.8001 0.812 0.188
#> SRR772383 1 0.7056 0.7977 0.808 0.192
#> SRR772384 1 0.7674 0.7675 0.776 0.224
#> SRR772385 2 0.6247 0.8357 0.156 0.844
#> SRR772386 2 0.6148 0.8357 0.152 0.848
#> SRR772387 2 0.6048 0.8362 0.148 0.852
#> SRR772388 1 0.2603 0.7935 0.956 0.044
#> SRR772389 1 0.2603 0.7935 0.956 0.044
#> SRR772390 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772391 1 0.7139 0.7940 0.804 0.196
#> SRR772392 1 0.7139 0.7940 0.804 0.196
#> SRR772393 2 0.6531 0.8314 0.168 0.832
#> SRR772394 2 0.6623 0.8293 0.172 0.828
#> SRR772395 2 0.5294 0.8392 0.120 0.880
#> SRR772396 1 0.5294 0.8175 0.880 0.120
#> SRR772397 1 0.5178 0.8161 0.884 0.116
#> SRR772398 1 0.6623 0.8081 0.828 0.172
#> SRR772399 1 0.6623 0.8081 0.828 0.172
#> SRR772400 1 0.4690 0.8143 0.900 0.100
#> SRR772401 1 0.4562 0.8133 0.904 0.096
#> SRR772402 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.6148 0.8370 0.152 0.848
#> SRR772405 1 0.7674 0.7675 0.776 0.224
#> SRR772406 2 0.6048 0.8382 0.148 0.852
#> SRR772407 2 0.5946 0.8392 0.144 0.856
#> SRR772408 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.8763 0.6725 0.296 0.704
#> SRR772411 2 0.9000 0.6341 0.316 0.684
#> SRR772412 1 0.5294 0.8165 0.880 0.120
#> SRR772413 1 0.5294 0.8165 0.880 0.120
#> SRR772414 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.7056 0.8153 0.192 0.808
#> SRR772416 2 0.7056 0.8154 0.192 0.808
#> SRR772417 2 0.9922 0.2227 0.448 0.552
#> SRR772418 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772419 2 0.2423 0.8116 0.040 0.960
#> SRR772420 2 0.2423 0.8116 0.040 0.960
#> SRR772421 2 0.8763 0.6788 0.296 0.704
#> SRR772422 2 0.8499 0.7133 0.276 0.724
#> SRR772423 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.6148 0.8366 0.152 0.848
#> SRR772426 2 0.3733 0.8253 0.072 0.928
#> SRR772427 2 0.3733 0.8253 0.072 0.928
#> SRR772428 1 0.4298 0.8113 0.912 0.088
#> SRR772429 1 0.4562 0.8132 0.904 0.096
#> SRR772430 2 0.9209 0.5926 0.336 0.664
#> SRR772431 2 0.0376 0.7932 0.004 0.996
#> SRR772432 2 0.0376 0.7932 0.004 0.996
#> SRR772433 1 0.3274 0.8006 0.940 0.060
#> SRR772434 1 0.3733 0.8053 0.928 0.072
#> SRR772435 1 0.9522 0.5245 0.628 0.372
#> SRR772436 1 0.9850 0.3578 0.572 0.428
#> SRR772437 1 0.4161 0.8098 0.916 0.084
#> SRR772438 1 0.4939 0.8144 0.892 0.108
#> SRR772439 1 0.3733 0.8050 0.928 0.072
#> SRR772440 2 0.7139 0.8115 0.196 0.804
#> SRR772441 2 0.6973 0.8174 0.188 0.812
#> SRR772442 2 0.1184 0.8000 0.016 0.984
#> SRR772443 2 0.1633 0.8042 0.024 0.976
#> SRR772444 1 0.5842 0.8148 0.860 0.140
#> SRR772445 1 0.6343 0.8106 0.840 0.160
#> SRR772446 1 0.7815 0.7653 0.768 0.232
#> SRR772447 1 0.7950 0.7569 0.760 0.240
#> SRR772448 2 0.6712 0.8253 0.176 0.824
#> SRR772449 2 0.7056 0.8153 0.192 0.808
#> SRR772450 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.6247 0.8125 0.844 0.156
#> SRR772453 1 0.6973 0.8003 0.812 0.188
#> SRR772454 1 0.8763 0.6804 0.704 0.296
#> SRR772455 1 0.9983 0.1616 0.524 0.476
#> SRR772456 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.6623 0.8068 0.828 0.172
#> SRR772459 1 0.6712 0.8054 0.824 0.176
#> SRR772460 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.4939 0.8365 0.108 0.892
#> SRR772463 2 0.5408 0.8393 0.124 0.876
#> SRR772464 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.9129 0.6072 0.328 0.672
#> SRR772466 2 0.9044 0.6255 0.320 0.680
#> SRR772467 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.8763 0.6756 0.704 0.296
#> SRR772470 1 0.8713 0.6807 0.708 0.292
#> SRR772471 1 0.8861 0.6651 0.696 0.304
#> SRR772472 1 0.8661 0.6922 0.712 0.288
#> SRR772473 2 0.0376 0.7932 0.004 0.996
#> SRR772474 2 0.0672 0.7955 0.008 0.992
#> SRR772475 2 0.6343 0.8347 0.160 0.840
#> SRR772476 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.7219 0.7910 0.800 0.200
#> SRR772479 1 0.7056 0.7963 0.808 0.192
#> SRR772480 2 0.2423 0.8113 0.040 0.960
#> SRR772481 2 0.2423 0.8113 0.040 0.960
#> SRR772482 1 0.7883 0.7605 0.764 0.236
#> SRR772483 1 0.7950 0.7565 0.760 0.240
#> SRR772484 2 0.7528 0.7931 0.216 0.784
#> SRR772485 2 0.7528 0.7931 0.216 0.784
#> SRR772486 1 0.5737 0.8153 0.864 0.136
#> SRR772487 1 0.5629 0.8157 0.868 0.132
#> SRR772488 2 0.7815 0.7757 0.232 0.768
#> SRR772489 2 0.7883 0.7707 0.236 0.764
#> SRR772490 1 0.7376 0.7873 0.792 0.208
#> SRR772491 1 0.6148 0.8128 0.848 0.152
#> SRR772492 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.5842 0.8384 0.140 0.860
#> SRR772497 2 0.5842 0.8384 0.140 0.860
#> SRR772498 2 0.6247 0.8350 0.156 0.844
#> SRR772499 2 0.6343 0.8338 0.160 0.840
#> SRR772500 2 0.4690 0.8343 0.100 0.900
#> SRR772501 2 0.4690 0.8343 0.100 0.900
#> SRR772502 1 0.9993 0.1181 0.516 0.484
#> SRR772503 1 0.9988 0.1378 0.520 0.480
#> SRR772504 2 0.5408 0.8375 0.124 0.876
#> SRR772505 2 0.5408 0.8375 0.124 0.876
#> SRR772506 2 0.1633 0.8041 0.024 0.976
#> SRR772507 2 0.1633 0.8041 0.024 0.976
#> SRR772508 2 0.4690 0.8344 0.100 0.900
#> SRR772509 1 0.7745 0.7649 0.772 0.228
#> SRR772510 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.9460 0.5089 0.364 0.636
#> SRR772512 1 0.5059 0.8159 0.888 0.112
#> SRR772513 2 0.6712 0.8247 0.176 0.824
#> SRR772514 2 0.6531 0.8287 0.168 0.832
#> SRR772515 2 0.5737 0.8397 0.136 0.864
#> SRR772516 2 0.5842 0.8390 0.140 0.860
#> SRR772517 2 0.6438 0.8311 0.164 0.836
#> SRR772518 2 0.6247 0.8342 0.156 0.844
#> SRR772519 2 0.5737 0.8374 0.136 0.864
#> SRR772520 2 0.5737 0.8374 0.136 0.864
#> SRR772521 2 0.9954 0.1653 0.460 0.540
#> SRR772522 2 0.9954 0.1653 0.460 0.540
#> SRR772523 2 0.4939 0.8356 0.108 0.892
#> SRR772524 2 0.5059 0.8365 0.112 0.888
#> SRR772525 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772529 1 0.8443 0.7162 0.728 0.272
#> SRR772530 1 0.8608 0.6984 0.716 0.284
#> SRR772531 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.5629 0.8382 0.132 0.868
#> SRR772533 2 0.5629 0.8382 0.132 0.868
#> SRR772534 1 0.9963 0.2136 0.536 0.464
#> SRR772535 2 0.5408 0.8387 0.124 0.876
#> SRR772536 2 0.5946 0.8375 0.144 0.856
#> SRR772537 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.8144 0.7426 0.748 0.252
#> SRR772540 1 0.9000 0.6442 0.684 0.316
#> SRR772541 2 0.7528 0.7935 0.216 0.784
#> SRR772542 1 0.5178 0.8163 0.884 0.116
#> SRR772543 1 0.4815 0.8145 0.896 0.104
#> SRR772544 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.7376 0.7853 0.792 0.208
#> SRR772546 1 0.7376 0.7853 0.792 0.208
#> SRR772547 1 0.9954 0.2306 0.540 0.460
#> SRR772548 1 0.9833 0.3649 0.576 0.424
#> SRR772549 1 0.5842 0.8154 0.860 0.140
#> SRR772550 1 0.5519 0.8165 0.872 0.128
#> SRR772551 2 0.7674 0.7829 0.224 0.776
#> SRR772552 2 0.8081 0.7546 0.248 0.752
#> SRR772553 2 0.6623 0.8296 0.172 0.828
#> SRR772554 2 0.5842 0.8382 0.140 0.860
#> SRR772555 2 0.5842 0.8386 0.140 0.860
#> SRR772556 1 0.6048 0.8142 0.852 0.148
#> SRR772557 1 0.6973 0.7996 0.812 0.188
#> SRR772558 1 0.9635 0.4827 0.612 0.388
#> SRR772559 1 0.9393 0.5596 0.644 0.356
#> SRR772560 2 0.9522 0.4978 0.372 0.628
#> SRR772561 1 0.5059 0.8159 0.888 0.112
#> SRR772562 2 0.6343 0.8338 0.160 0.840
#> SRR772563 2 0.6438 0.8318 0.164 0.836
#> SRR772564 1 0.3879 0.8073 0.924 0.076
#> SRR772565 1 0.3879 0.8073 0.924 0.076
#> SRR772566 1 0.2043 0.7875 0.968 0.032
#> SRR772567 1 0.2043 0.7875 0.968 0.032
#> SRR772568 2 0.6438 0.8331 0.164 0.836
#> SRR772569 2 0.6438 0.8331 0.164 0.836
#> SRR772570 1 0.8443 0.7169 0.728 0.272
#> SRR772571 1 0.9286 0.5865 0.656 0.344
#> SRR772572 1 0.9944 0.2393 0.544 0.456
#> SRR772573 1 0.9970 0.1931 0.532 0.468
#> SRR772574 1 0.9635 0.4824 0.612 0.388
#> SRR772575 1 0.9795 0.4001 0.584 0.416
#> SRR772576 2 0.7299 0.8044 0.204 0.796
#> SRR772577 2 0.6973 0.8168 0.188 0.812
#> SRR772578 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.7139 0.8137 0.196 0.804
#> SRR772582 2 0.7056 0.8169 0.192 0.808
#> SRR772583 2 0.8608 0.6992 0.284 0.716
#> SRR772584 2 0.8499 0.7136 0.276 0.724
#> SRR772585 2 0.7602 0.7893 0.220 0.780
#> SRR772586 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772587 1 0.9775 0.4082 0.588 0.412
#> SRR772588 2 0.4298 0.8307 0.088 0.912
#> SRR772589 2 0.4298 0.8307 0.088 0.912
#> SRR772590 1 0.3431 0.8026 0.936 0.064
#> SRR772591 1 0.2043 0.7875 0.968 0.032
#> SRR772592 1 0.2043 0.7875 0.968 0.032
#> SRR772593 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772594 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772597 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.4022 0.8083 0.920 0.080
#> SRR772599 1 0.4815 0.8143 0.896 0.104
#> SRR772600 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0672 0.7736 0.992 0.008
#> SRR772603 2 0.1184 0.7999 0.016 0.984
#> SRR772604 2 0.0376 0.7932 0.004 0.996
#> SRR772605 2 0.7883 0.7710 0.236 0.764
#> SRR772606 1 0.5178 0.8166 0.884 0.116
#> SRR772607 1 0.5294 0.8171 0.880 0.120
#> SRR772608 2 0.7056 0.8152 0.192 0.808
#> SRR772609 2 0.6623 0.8287 0.172 0.828
#> SRR772610 2 0.5178 0.8373 0.116 0.884
#> SRR772611 2 0.5737 0.8385 0.136 0.864
#> SRR772612 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.5519 0.8172 0.872 0.128
#> SRR772615 1 0.6048 0.8145 0.852 0.148
#> SRR772616 1 0.9896 0.3185 0.560 0.440
#> SRR772617 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.8081 0.7531 0.248 0.752
#> SRR772622 2 0.7602 0.7879 0.220 0.780
#> SRR772623 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772625 2 0.5737 0.8400 0.136 0.864
#> SRR772626 2 0.6343 0.8340 0.160 0.840
#> SRR772627 2 0.6438 0.8324 0.164 0.836
#> SRR772628 1 0.7602 0.7727 0.780 0.220
#> SRR772629 1 0.6247 0.8124 0.844 0.156
#> SRR772630 2 0.9983 0.0891 0.476 0.524
#> SRR772631 1 0.1184 0.7787 0.984 0.016
#> SRR772632 2 0.3114 0.8186 0.056 0.944
#> SRR772633 2 0.3114 0.8186 0.056 0.944
#> SRR772634 2 0.8713 0.6881 0.292 0.708
#> SRR772635 2 0.8713 0.6881 0.292 0.708
#> SRR772636 2 0.6247 0.8357 0.156 0.844
#> SRR772637 1 0.5059 0.8158 0.888 0.112
#> SRR772638 1 0.5294 0.8166 0.880 0.120
#> SRR772639 2 0.5946 0.8388 0.144 0.856
#> SRR772640 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.8207 0.7454 0.256 0.744
#> SRR772643 2 0.8207 0.7437 0.256 0.744
#> SRR772644 1 0.9087 0.6278 0.676 0.324
#> SRR772645 1 0.9393 0.5601 0.644 0.356
#> SRR772646 2 0.5519 0.8380 0.128 0.872
#> SRR772647 2 0.5519 0.8380 0.128 0.872
#> SRR772648 2 0.7453 0.7971 0.212 0.788
#> SRR772649 2 0.7528 0.7930 0.216 0.784
#> SRR772650 1 0.9795 0.4021 0.584 0.416
#> SRR772651 1 0.9795 0.4015 0.584 0.416
#> SRR772652 1 0.7299 0.7893 0.796 0.204
#> SRR772653 1 0.7299 0.7893 0.796 0.204
#> SRR772654 2 0.8813 0.6695 0.300 0.700
#> SRR772655 2 0.8608 0.6988 0.284 0.716
#> SRR772656 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.3733 0.8059 0.928 0.072
#> SRR772658 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.7056 0.8159 0.192 0.808
#> SRR772661 1 0.6623 0.8034 0.828 0.172
#> SRR772662 2 0.9996 0.0271 0.488 0.512
#> SRR772663 2 0.9988 0.0623 0.480 0.520
#> SRR772664 2 0.7674 0.7844 0.224 0.776
#> SRR772665 2 0.7674 0.7844 0.224 0.776
#> SRR772666 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.9881 0.2743 0.436 0.564
#> SRR772671 2 0.9815 0.3374 0.420 0.580
#> SRR772672 2 0.5629 0.8386 0.132 0.868
#> SRR772673 2 0.5408 0.8382 0.124 0.876
#> SRR772674 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.7745 0.7649 0.772 0.228
#> SRR772676 1 1.0000 0.0388 0.500 0.500
#> SRR772677 2 1.0000 -0.0237 0.496 0.504
#> SRR772678 1 0.7674 0.7675 0.776 0.224
#> SRR772679 1 0.9795 0.4004 0.584 0.416
#> SRR772680 1 0.9710 0.4483 0.600 0.400
#> SRR772681 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.6048 0.8369 0.148 0.852
#> SRR772683 2 0.5737 0.8377 0.136 0.864
#> SRR772685 2 0.6973 0.8180 0.188 0.812
#> SRR772686 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.7675 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.7908 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0376 0.7705 0.996 0.004
#> SRR772691 2 0.6247 0.8357 0.156 0.844
#> SRR772692 2 0.8555 0.7093 0.280 0.720
#> SRR772693 2 0.7883 0.7707 0.236 0.764
#> SRR772694 2 0.6801 0.8230 0.180 0.820
#> SRR772695 2 0.7056 0.8155 0.192 0.808
#> SRR772696 2 0.7139 0.8122 0.196 0.804
#> SRR772697 2 0.7139 0.8117 0.196 0.804
#> SRR772698 1 0.0938 0.7763 0.988 0.012
#> SRR772699 1 0.7883 0.7610 0.764 0.236
#> SRR772700 1 0.8081 0.7479 0.752 0.248
#> SRR772701 1 0.6973 0.7995 0.812 0.188
#> SRR772702 1 0.6887 0.8017 0.816 0.184
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.5244 0.348007 0.756 0.004 0.240
#> SRR772342 1 0.5285 0.331958 0.752 0.004 0.244
#> SRR772343 1 0.4189 0.546904 0.876 0.068 0.056
#> SRR772344 2 0.6225 0.408217 0.432 0.568 0.000
#> SRR772345 2 0.6225 0.408217 0.432 0.568 0.000
#> SRR772346 1 0.4411 0.495981 0.844 0.140 0.016
#> SRR772347 1 0.4475 0.492508 0.840 0.144 0.016
#> SRR772348 2 0.6295 0.341370 0.472 0.528 0.000
#> SRR772349 2 0.6291 0.349815 0.468 0.532 0.000
#> SRR772350 3 0.1031 0.835526 0.024 0.000 0.976
#> SRR772351 2 0.6008 0.492276 0.372 0.628 0.000
#> SRR772352 2 0.6286 0.349389 0.464 0.536 0.000
#> SRR772353 1 0.4897 0.465395 0.812 0.172 0.016
#> SRR772354 1 0.4782 0.473422 0.820 0.164 0.016
#> SRR772355 1 0.6309 -0.273314 0.500 0.500 0.000
#> SRR772356 2 0.6299 0.326860 0.476 0.524 0.000
#> SRR772357 1 0.4413 0.436806 0.832 0.008 0.160
#> SRR772358 1 0.3989 0.476124 0.864 0.012 0.124
#> SRR772359 1 0.3683 0.533134 0.896 0.044 0.060
#> SRR772360 1 0.6012 0.419922 0.748 0.220 0.032
#> SRR772361 1 0.6307 -0.301163 0.512 0.000 0.488
#> SRR772362 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772363 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772364 1 0.5940 0.443081 0.760 0.204 0.036
#> SRR772365 1 0.6034 0.434350 0.752 0.212 0.036
#> SRR772366 3 0.5650 0.705633 0.312 0.000 0.688
#> SRR772367 3 0.1529 0.844786 0.040 0.000 0.960
#> SRR772368 1 0.6280 -0.153311 0.540 0.460 0.000
#> SRR772369 1 0.5560 0.274139 0.700 0.300 0.000
#> SRR772370 1 0.5835 0.189472 0.660 0.340 0.000
#> SRR772371 1 0.4326 0.488168 0.844 0.144 0.012
#> SRR772372 1 0.4326 0.488168 0.844 0.144 0.012
#> SRR772373 1 0.6286 -0.174305 0.536 0.464 0.000
#> SRR772374 1 0.6299 -0.206136 0.524 0.476 0.000
#> SRR772375 3 0.1289 0.841484 0.032 0.000 0.968
#> SRR772376 2 0.6305 0.308444 0.484 0.516 0.000
#> SRR772377 1 0.5115 0.353708 0.768 0.004 0.228
#> SRR772378 1 0.4963 0.427657 0.792 0.200 0.008
#> SRR772379 1 0.5722 0.288802 0.704 0.292 0.004
#> SRR772380 1 0.5986 0.313514 0.704 0.284 0.012
#> SRR772381 3 0.2625 0.851924 0.084 0.000 0.916
#> SRR772382 1 0.5541 0.331343 0.740 0.008 0.252
#> SRR772383 1 0.5502 0.338187 0.744 0.008 0.248
#> SRR772384 1 0.5158 0.346345 0.764 0.004 0.232
#> SRR772385 1 0.6483 -0.150803 0.544 0.452 0.004
#> SRR772386 1 0.6302 -0.222923 0.520 0.480 0.000
#> SRR772387 1 0.6307 -0.244548 0.512 0.488 0.000
#> SRR772388 1 0.6140 -0.047052 0.596 0.000 0.404
#> SRR772389 1 0.6140 -0.047052 0.596 0.000 0.404
#> SRR772390 3 0.5497 0.727789 0.292 0.000 0.708
#> SRR772391 1 0.4931 0.356244 0.768 0.000 0.232
#> SRR772392 1 0.4931 0.356244 0.768 0.000 0.232
#> SRR772393 1 0.6235 -0.097607 0.564 0.436 0.000
#> SRR772394 1 0.6225 -0.084383 0.568 0.432 0.000
#> SRR772395 2 0.6274 0.364642 0.456 0.544 0.000
#> SRR772396 1 0.5706 0.198274 0.680 0.000 0.320
#> SRR772397 1 0.5706 0.190657 0.680 0.000 0.320
#> SRR772398 1 0.5480 0.299413 0.732 0.004 0.264
#> SRR772399 1 0.5480 0.299413 0.732 0.004 0.264
#> SRR772400 1 0.5859 0.124290 0.656 0.000 0.344
#> SRR772401 1 0.5882 0.101462 0.652 0.000 0.348
#> SRR772402 2 0.1964 0.702264 0.056 0.944 0.000
#> SRR772403 2 0.2066 0.702514 0.060 0.940 0.000
#> SRR772404 1 0.6302 -0.216181 0.520 0.480 0.000
#> SRR772405 1 0.5158 0.346345 0.764 0.004 0.232
#> SRR772406 1 0.6309 -0.264291 0.504 0.496 0.000
#> SRR772407 1 0.6309 -0.269278 0.504 0.496 0.000
#> SRR772408 2 0.1182 0.685988 0.012 0.976 0.012
#> SRR772409 2 0.1182 0.685988 0.012 0.976 0.012
#> SRR772410 1 0.5650 0.257307 0.688 0.312 0.000
#> SRR772411 1 0.5497 0.295594 0.708 0.292 0.000
#> SRR772412 1 0.5706 0.185827 0.680 0.000 0.320
#> SRR772413 1 0.5706 0.185827 0.680 0.000 0.320
#> SRR772414 3 0.1289 0.841484 0.032 0.000 0.968
#> SRR772415 1 0.6215 -0.049023 0.572 0.428 0.000
#> SRR772416 1 0.6225 -0.059357 0.568 0.432 0.000
#> SRR772417 1 0.4291 0.479462 0.840 0.152 0.008
#> SRR772418 3 0.5760 0.684880 0.328 0.000 0.672
#> SRR772419 2 0.4605 0.641331 0.204 0.796 0.000
#> SRR772420 2 0.4605 0.641331 0.204 0.796 0.000
#> SRR772421 1 0.6396 0.250554 0.664 0.320 0.016
#> SRR772422 1 0.6180 0.217826 0.660 0.332 0.008
#> SRR772423 2 0.1411 0.699109 0.036 0.964 0.000
#> SRR772424 2 0.1267 0.694591 0.024 0.972 0.004
#> SRR772425 2 0.6309 0.258490 0.500 0.500 0.000
#> SRR772426 2 0.5650 0.556272 0.312 0.688 0.000
#> SRR772427 2 0.5650 0.556272 0.312 0.688 0.000
#> SRR772428 1 0.5926 0.082984 0.644 0.000 0.356
#> SRR772429 1 0.5882 0.110108 0.652 0.000 0.348
#> SRR772430 1 0.5365 0.351305 0.744 0.252 0.004
#> SRR772431 2 0.2066 0.702576 0.060 0.940 0.000
#> SRR772432 2 0.2165 0.702589 0.064 0.936 0.000
#> SRR772433 1 0.6079 -0.000441 0.612 0.000 0.388
#> SRR772434 1 0.6026 0.030632 0.624 0.000 0.376
#> SRR772435 1 0.5538 0.516604 0.812 0.072 0.116
#> SRR772436 1 0.6111 0.540862 0.784 0.112 0.104
#> SRR772437 3 0.6299 0.385851 0.476 0.000 0.524
#> SRR772438 1 0.5859 0.107030 0.656 0.000 0.344
#> SRR772439 1 0.6045 -0.006561 0.620 0.000 0.380
#> SRR772440 1 0.6154 0.006346 0.592 0.408 0.000
#> SRR772441 1 0.6192 -0.028291 0.580 0.420 0.000
#> SRR772442 2 0.3038 0.693541 0.104 0.896 0.000
#> SRR772443 2 0.3482 0.684340 0.128 0.872 0.000
#> SRR772444 1 0.5560 0.237120 0.700 0.000 0.300
#> SRR772445 1 0.5363 0.281024 0.724 0.000 0.276
#> SRR772446 1 0.4963 0.399197 0.792 0.008 0.200
#> SRR772447 1 0.4912 0.405439 0.796 0.008 0.196
#> SRR772448 1 0.6235 -0.081810 0.564 0.436 0.000
#> SRR772449 1 0.6168 -0.005963 0.588 0.412 0.000
#> SRR772450 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772451 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772452 1 0.5327 0.292602 0.728 0.000 0.272
#> SRR772453 1 0.5285 0.336187 0.752 0.004 0.244
#> SRR772454 1 0.4999 0.457757 0.820 0.028 0.152
#> SRR772455 1 0.4558 0.537861 0.856 0.100 0.044
#> SRR772456 2 0.1337 0.688089 0.016 0.972 0.012
#> SRR772457 2 0.1337 0.688089 0.016 0.972 0.012
#> SRR772458 1 0.5216 0.304760 0.740 0.000 0.260
#> SRR772459 1 0.5178 0.312130 0.744 0.000 0.256
#> SRR772460 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772461 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772462 2 0.6260 0.386663 0.448 0.552 0.000
#> SRR772463 2 0.6307 0.305107 0.488 0.512 0.000
#> SRR772464 3 0.1753 0.846928 0.048 0.000 0.952
#> SRR772465 1 0.5327 0.319710 0.728 0.272 0.000
#> SRR772466 1 0.5397 0.306334 0.720 0.280 0.000
#> SRR772467 2 0.2356 0.702351 0.072 0.928 0.000
#> SRR772468 2 0.2356 0.702351 0.072 0.928 0.000
#> SRR772469 1 0.3983 0.455968 0.852 0.004 0.144
#> SRR772470 1 0.4291 0.452887 0.840 0.008 0.152
#> SRR772471 1 0.3965 0.464767 0.860 0.008 0.132
#> SRR772472 1 0.4453 0.451392 0.836 0.012 0.152
#> SRR772473 2 0.2959 0.696221 0.100 0.900 0.000
#> SRR772474 2 0.2711 0.699104 0.088 0.912 0.000
#> SRR772475 1 0.6468 -0.130075 0.552 0.444 0.004
#> SRR772476 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772477 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772478 1 0.4887 0.354245 0.772 0.000 0.228
#> SRR772479 1 0.4974 0.341358 0.764 0.000 0.236
#> SRR772480 2 0.5327 0.603861 0.272 0.728 0.000
#> SRR772481 2 0.5363 0.601398 0.276 0.724 0.000
#> SRR772482 1 0.5268 0.392680 0.776 0.012 0.212
#> SRR772483 1 0.5220 0.397943 0.780 0.012 0.208
#> SRR772484 1 0.6095 0.049227 0.608 0.392 0.000
#> SRR772485 1 0.6095 0.049227 0.608 0.392 0.000
#> SRR772486 1 0.5591 0.202630 0.696 0.000 0.304
#> SRR772487 1 0.5621 0.192292 0.692 0.000 0.308
#> SRR772488 1 0.6026 0.095135 0.624 0.376 0.000
#> SRR772489 1 0.6008 0.106794 0.628 0.372 0.000
#> SRR772490 1 0.5292 0.368077 0.764 0.008 0.228
#> SRR772491 1 0.5431 0.265690 0.716 0.000 0.284
#> SRR772492 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772493 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772494 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772495 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772496 1 0.6309 -0.265121 0.504 0.496 0.000
#> SRR772497 1 0.6309 -0.265121 0.504 0.496 0.000
#> SRR772498 1 0.6274 -0.154143 0.544 0.456 0.000
#> SRR772499 1 0.6260 -0.129253 0.552 0.448 0.000
#> SRR772500 2 0.6154 0.448837 0.408 0.592 0.000
#> SRR772501 2 0.6168 0.444298 0.412 0.588 0.000
#> SRR772502 1 0.3670 0.531033 0.888 0.092 0.020
#> SRR772503 1 0.3587 0.533131 0.892 0.088 0.020
#> SRR772504 2 0.6267 0.373164 0.452 0.548 0.000
#> SRR772505 2 0.6267 0.373164 0.452 0.548 0.000
#> SRR772506 2 0.4121 0.663248 0.168 0.832 0.000
#> SRR772507 2 0.4121 0.663248 0.168 0.832 0.000
#> SRR772508 2 0.6180 0.437489 0.416 0.584 0.000
#> SRR772509 1 0.5115 0.353708 0.768 0.004 0.228
#> SRR772510 3 0.2356 0.852507 0.072 0.000 0.928
#> SRR772511 1 0.5016 0.375440 0.760 0.240 0.000
#> SRR772512 1 0.6095 -0.010569 0.608 0.000 0.392
#> SRR772513 1 0.6252 -0.101261 0.556 0.444 0.000
#> SRR772514 1 0.6267 -0.126397 0.548 0.452 0.000
#> SRR772515 2 0.6305 0.308914 0.484 0.516 0.000
#> SRR772516 1 0.6309 -0.274386 0.500 0.500 0.000
#> SRR772517 1 0.6280 -0.151914 0.540 0.460 0.000
#> SRR772518 1 0.6295 -0.187832 0.528 0.472 0.000
#> SRR772519 2 0.6308 0.280610 0.492 0.508 0.000
#> SRR772520 2 0.6308 0.280610 0.492 0.508 0.000
#> SRR772521 1 0.4551 0.496777 0.840 0.140 0.020
#> SRR772522 1 0.4551 0.496777 0.840 0.140 0.020
#> SRR772523 2 0.6192 0.430611 0.420 0.580 0.000
#> SRR772524 2 0.6225 0.411857 0.432 0.568 0.000
#> SRR772525 3 0.1163 0.838579 0.028 0.000 0.972
#> SRR772526 2 0.2356 0.702351 0.072 0.928 0.000
#> SRR772527 2 0.2356 0.702351 0.072 0.928 0.000
#> SRR772528 3 0.5497 0.727789 0.292 0.000 0.708
#> SRR772529 1 0.4692 0.439980 0.820 0.012 0.168
#> SRR772530 1 0.4663 0.452537 0.828 0.016 0.156
#> SRR772531 3 0.1163 0.838579 0.028 0.000 0.972
#> SRR772532 2 0.6286 0.348570 0.464 0.536 0.000
#> SRR772533 2 0.6280 0.355509 0.460 0.540 0.000
#> SRR772534 1 0.3713 0.541995 0.892 0.076 0.032
#> SRR772535 2 0.6252 0.390222 0.444 0.556 0.000
#> SRR772536 2 0.6309 0.273926 0.496 0.504 0.000
#> SRR772537 2 0.1267 0.694383 0.024 0.972 0.004
#> SRR772538 2 0.1399 0.695835 0.028 0.968 0.004
#> SRR772539 1 0.4700 0.417852 0.812 0.008 0.180
#> SRR772540 1 0.4209 0.476196 0.856 0.016 0.128
#> SRR772541 1 0.6264 0.077660 0.616 0.380 0.004
#> SRR772542 1 0.5760 0.147715 0.672 0.000 0.328
#> SRR772543 1 0.5835 0.118321 0.660 0.000 0.340
#> SRR772544 3 0.2537 0.852415 0.080 0.000 0.920
#> SRR772545 1 0.4750 0.363499 0.784 0.000 0.216
#> SRR772546 1 0.4750 0.363499 0.784 0.000 0.216
#> SRR772547 1 0.2743 0.546458 0.928 0.052 0.020
#> SRR772548 1 0.2926 0.540361 0.924 0.036 0.040
#> SRR772549 1 0.5465 0.254202 0.712 0.000 0.288
#> SRR772550 1 0.5591 0.224454 0.696 0.000 0.304
#> SRR772551 1 0.6045 0.085910 0.620 0.380 0.000
#> SRR772552 1 0.5948 0.138130 0.640 0.360 0.000
#> SRR772553 1 0.6442 -0.095107 0.564 0.432 0.004
#> SRR772554 2 0.6305 0.306625 0.484 0.516 0.000
#> SRR772555 2 0.6305 0.308542 0.484 0.516 0.000
#> SRR772556 1 0.5431 0.260119 0.716 0.000 0.284
#> SRR772557 1 0.5016 0.334105 0.760 0.000 0.240
#> SRR772558 1 0.3310 0.521681 0.908 0.028 0.064
#> SRR772559 1 0.3120 0.500139 0.908 0.012 0.080
#> SRR772560 1 0.5643 0.407025 0.760 0.220 0.020
#> SRR772561 1 0.6095 -0.010569 0.608 0.000 0.392
#> SRR772562 1 0.6295 -0.182048 0.528 0.472 0.000
#> SRR772563 1 0.6286 -0.158961 0.536 0.464 0.000
#> SRR772564 1 0.6008 0.030845 0.628 0.000 0.372
#> SRR772565 1 0.6008 0.030845 0.628 0.000 0.372
#> SRR772566 1 0.6286 -0.203657 0.536 0.000 0.464
#> SRR772567 1 0.6286 -0.203657 0.536 0.000 0.464
#> SRR772568 1 0.6299 -0.213968 0.524 0.476 0.000
#> SRR772569 1 0.6299 -0.213968 0.524 0.476 0.000
#> SRR772570 1 0.4473 0.435684 0.828 0.008 0.164
#> SRR772571 1 0.4249 0.497744 0.864 0.028 0.108
#> SRR772572 1 0.3764 0.546785 0.892 0.068 0.040
#> SRR772573 1 0.3832 0.542502 0.888 0.076 0.036
#> SRR772574 1 0.3764 0.528223 0.892 0.040 0.068
#> SRR772575 1 0.4097 0.544389 0.880 0.060 0.060
#> SRR772576 1 0.6140 0.023087 0.596 0.404 0.000
#> SRR772577 1 0.6215 -0.050130 0.572 0.428 0.000
#> SRR772578 2 0.1860 0.702517 0.052 0.948 0.000
#> SRR772579 2 0.1964 0.702835 0.056 0.944 0.000
#> SRR772580 3 0.1289 0.841484 0.032 0.000 0.968
#> SRR772581 1 0.6215 -0.069572 0.572 0.428 0.000
#> SRR772582 1 0.6225 -0.082416 0.568 0.432 0.000
#> SRR772583 1 0.5706 0.230531 0.680 0.320 0.000
#> SRR772584 1 0.5760 0.212634 0.672 0.328 0.000
#> SRR772585 1 0.6062 0.074209 0.616 0.384 0.000
#> SRR772586 3 0.5785 0.679370 0.332 0.000 0.668
#> SRR772587 1 0.3028 0.532285 0.920 0.032 0.048
#> SRR772588 2 0.6079 0.473208 0.388 0.612 0.000
#> SRR772589 2 0.6079 0.473208 0.388 0.612 0.000
#> SRR772590 3 0.6140 0.533152 0.404 0.000 0.596
#> SRR772591 1 0.6252 -0.154106 0.556 0.000 0.444
#> SRR772592 1 0.6260 -0.164126 0.552 0.000 0.448
#> SRR772593 3 0.5760 0.684880 0.328 0.000 0.672
#> SRR772594 2 0.1643 0.700865 0.044 0.956 0.000
#> SRR772595 2 0.1753 0.701710 0.048 0.952 0.000
#> SRR772596 3 0.5497 0.727789 0.292 0.000 0.708
#> SRR772597 3 0.1289 0.841484 0.032 0.000 0.968
#> SRR772598 1 0.6026 0.039798 0.624 0.000 0.376
#> SRR772599 1 0.5882 0.112019 0.652 0.000 0.348
#> SRR772600 2 0.2165 0.702745 0.064 0.936 0.000
#> SRR772601 2 0.2261 0.702589 0.068 0.932 0.000
#> SRR772602 3 0.2796 0.848424 0.092 0.000 0.908
#> SRR772603 2 0.3412 0.687057 0.124 0.876 0.000
#> SRR772604 2 0.2796 0.698146 0.092 0.908 0.000
#> SRR772605 1 0.6148 0.143771 0.640 0.356 0.004
#> SRR772606 1 0.5733 0.174729 0.676 0.000 0.324
#> SRR772607 1 0.5678 0.187769 0.684 0.000 0.316
#> SRR772608 1 0.6204 -0.038892 0.576 0.424 0.000
#> SRR772609 1 0.6260 -0.122202 0.552 0.448 0.000
#> SRR772610 2 0.6291 0.348018 0.468 0.532 0.000
#> SRR772611 2 0.6309 0.273541 0.496 0.504 0.000
#> SRR772612 2 0.1647 0.698073 0.036 0.960 0.004
#> SRR772613 2 0.1399 0.695635 0.028 0.968 0.004
#> SRR772614 1 0.5650 0.213720 0.688 0.000 0.312
#> SRR772615 1 0.5465 0.252508 0.712 0.000 0.288
#> SRR772616 1 0.2176 0.543335 0.948 0.032 0.020
#> SRR772617 2 0.1337 0.688047 0.016 0.972 0.012
#> SRR772618 2 0.1482 0.689896 0.020 0.968 0.012
#> SRR772619 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772620 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772621 1 0.5905 0.159793 0.648 0.352 0.000
#> SRR772622 1 0.6111 0.043444 0.604 0.396 0.000
#> SRR772623 3 0.1031 0.835526 0.024 0.000 0.976
#> SRR772624 3 0.5733 0.690480 0.324 0.000 0.676
#> SRR772625 2 0.6513 0.316044 0.476 0.520 0.004
#> SRR772626 1 0.6252 -0.119030 0.556 0.444 0.000
#> SRR772627 1 0.6244 -0.104898 0.560 0.440 0.000
#> SRR772628 1 0.4931 0.381202 0.784 0.004 0.212
#> SRR772629 1 0.5327 0.287523 0.728 0.000 0.272
#> SRR772630 1 0.3845 0.506426 0.872 0.116 0.012
#> SRR772631 3 0.5733 0.691509 0.324 0.000 0.676
#> SRR772632 2 0.5216 0.600903 0.260 0.740 0.000
#> SRR772633 2 0.5178 0.603837 0.256 0.744 0.000
#> SRR772634 1 0.5845 0.257458 0.688 0.308 0.004
#> SRR772635 1 0.5873 0.250505 0.684 0.312 0.004
#> SRR772636 1 0.6483 -0.150803 0.544 0.452 0.004
#> SRR772637 1 0.5706 0.197817 0.680 0.000 0.320
#> SRR772638 1 0.5650 0.215508 0.688 0.000 0.312
#> SRR772639 2 0.6308 0.281651 0.492 0.508 0.000
#> SRR772640 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772641 2 0.1015 0.683899 0.008 0.980 0.012
#> SRR772642 1 0.6297 0.173858 0.640 0.352 0.008
#> SRR772643 1 0.5859 0.174474 0.656 0.344 0.000
#> SRR772644 1 0.3771 0.481660 0.876 0.012 0.112
#> SRR772645 1 0.3031 0.506170 0.912 0.012 0.076
#> SRR772646 2 0.6280 0.361453 0.460 0.540 0.000
#> SRR772647 2 0.6280 0.361453 0.460 0.540 0.000
#> SRR772648 1 0.6154 0.007135 0.592 0.408 0.000
#> SRR772649 1 0.6140 0.021414 0.596 0.404 0.000
#> SRR772650 1 0.4749 0.539515 0.852 0.072 0.076
#> SRR772651 1 0.4749 0.539889 0.852 0.072 0.076
#> SRR772652 1 0.4842 0.356800 0.776 0.000 0.224
#> SRR772653 1 0.4842 0.356800 0.776 0.000 0.224
#> SRR772654 1 0.5815 0.271089 0.692 0.304 0.004
#> SRR772655 1 0.5929 0.238191 0.676 0.320 0.004
#> SRR772656 3 0.2261 0.852029 0.068 0.000 0.932
#> SRR772657 1 0.6307 -0.301163 0.512 0.000 0.488
#> SRR772658 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772659 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772660 1 0.6235 -0.073470 0.564 0.436 0.000
#> SRR772661 1 0.5465 0.237054 0.712 0.000 0.288
#> SRR772662 1 0.6351 0.497054 0.760 0.168 0.072
#> SRR772663 1 0.5173 0.499759 0.816 0.148 0.036
#> SRR772664 1 0.6111 0.055977 0.604 0.396 0.000
#> SRR772665 1 0.6111 0.055977 0.604 0.396 0.000
#> SRR772666 3 0.2356 0.852413 0.072 0.000 0.928
#> SRR772667 2 0.2486 0.700740 0.060 0.932 0.008
#> SRR772668 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772669 2 0.0892 0.671580 0.000 0.980 0.020
#> SRR772670 1 0.5036 0.469952 0.808 0.172 0.020
#> SRR772671 1 0.4645 0.456726 0.816 0.176 0.008
#> SRR772672 2 0.6308 0.291926 0.492 0.508 0.000
#> SRR772673 2 0.6305 0.314287 0.484 0.516 0.000
#> SRR772674 3 0.2625 0.851924 0.084 0.000 0.916
#> SRR772675 1 0.5115 0.353708 0.768 0.004 0.228
#> SRR772676 1 0.4446 0.523869 0.856 0.112 0.032
#> SRR772677 1 0.4519 0.521022 0.852 0.116 0.032
#> SRR772678 1 0.5158 0.346345 0.764 0.004 0.232
#> SRR772679 1 0.4477 0.542614 0.864 0.068 0.068
#> SRR772680 1 0.4469 0.535544 0.864 0.060 0.076
#> SRR772681 3 0.2625 0.851924 0.084 0.000 0.916
#> SRR772682 1 0.6308 -0.247955 0.508 0.492 0.000
#> SRR772683 2 0.6309 0.264175 0.500 0.500 0.000
#> SRR772685 1 0.6192 -0.034793 0.580 0.420 0.000
#> SRR772686 3 0.2261 0.852187 0.068 0.000 0.932
#> SRR772687 3 0.1031 0.835526 0.024 0.000 0.976
#> SRR772688 2 0.1411 0.699237 0.036 0.964 0.000
#> SRR772689 2 0.1411 0.699237 0.036 0.964 0.000
#> SRR772690 3 0.2448 0.851564 0.076 0.000 0.924
#> SRR772691 1 0.6483 -0.150803 0.544 0.452 0.004
#> SRR772692 1 0.6129 0.235327 0.668 0.324 0.008
#> SRR772693 1 0.5988 0.118534 0.632 0.368 0.000
#> SRR772694 1 0.6225 -0.074558 0.568 0.432 0.000
#> SRR772695 1 0.6192 -0.035071 0.580 0.420 0.000
#> SRR772696 1 0.6215 -0.047166 0.572 0.428 0.000
#> SRR772697 1 0.6192 -0.026379 0.580 0.420 0.000
#> SRR772698 3 0.5650 0.705633 0.312 0.000 0.688
#> SRR772699 1 0.5461 0.392015 0.768 0.016 0.216
#> SRR772700 1 0.5503 0.405799 0.772 0.020 0.208
#> SRR772701 1 0.5058 0.339940 0.756 0.000 0.244
#> SRR772702 1 0.5098 0.332526 0.752 0.000 0.248
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.477 0.77117 0.772 0.192 0.016 0.020
#> SRR772342 1 0.412 0.77320 0.796 0.184 0.000 0.020
#> SRR772343 2 0.594 -0.19505 0.476 0.488 0.000 0.036
#> SRR772344 2 0.276 0.65697 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR772345 2 0.276 0.65697 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR772346 2 0.563 0.32922 0.340 0.624 0.000 0.036
#> SRR772347 2 0.563 0.32907 0.340 0.624 0.000 0.036
#> SRR772348 2 0.241 0.71085 0.008 0.908 0.000 0.084
#> SRR772349 2 0.240 0.69968 0.004 0.904 0.000 0.092
#> SRR772350 3 0.259 0.91208 0.016 0.000 0.904 0.080
#> SRR772351 2 0.367 0.53613 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR772352 2 0.293 0.69421 0.012 0.880 0.000 0.108
#> SRR772353 2 0.526 0.46993 0.272 0.692 0.000 0.036
#> SRR772354 2 0.533 0.44458 0.284 0.680 0.000 0.036
#> SRR772355 2 0.197 0.73199 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR772356 2 0.194 0.71584 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772357 1 0.515 0.65795 0.664 0.316 0.000 0.020
#> SRR772358 1 0.570 0.57514 0.612 0.356 0.004 0.028
#> SRR772359 1 0.586 0.25270 0.492 0.476 0.000 0.032
#> SRR772360 2 0.523 0.53101 0.256 0.704 0.000 0.040
#> SRR772361 1 0.697 0.48064 0.644 0.068 0.232 0.056
#> SRR772362 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772363 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772364 2 0.553 0.43828 0.304 0.656 0.000 0.040
#> SRR772365 2 0.557 0.45532 0.296 0.660 0.000 0.044
#> SRR772366 1 0.601 -0.07648 0.560 0.004 0.400 0.036
#> SRR772367 3 0.194 0.94549 0.052 0.000 0.936 0.012
#> SRR772368 2 0.230 0.75145 0.028 0.924 0.000 0.048
#> SRR772369 2 0.395 0.70849 0.136 0.828 0.000 0.036
#> SRR772370 2 0.327 0.74519 0.108 0.868 0.000 0.024
#> SRR772371 2 0.571 0.32608 0.340 0.620 0.000 0.040
#> SRR772372 2 0.571 0.32608 0.340 0.620 0.000 0.040
#> SRR772373 2 0.161 0.74835 0.016 0.952 0.000 0.032
#> SRR772374 2 0.180 0.74516 0.016 0.944 0.000 0.040
#> SRR772375 3 0.217 0.94500 0.052 0.000 0.928 0.020
#> SRR772376 2 0.292 0.71516 0.016 0.884 0.000 0.100
#> SRR772377 1 0.625 0.70556 0.668 0.256 0.036 0.040
#> SRR772378 2 0.511 0.51885 0.252 0.712 0.000 0.036
#> SRR772379 2 0.406 0.68623 0.160 0.812 0.000 0.028
#> SRR772380 2 0.431 0.65244 0.192 0.784 0.000 0.024
#> SRR772381 3 0.402 0.91411 0.128 0.000 0.828 0.044
#> SRR772382 1 0.439 0.77450 0.788 0.188 0.012 0.012
#> SRR772383 1 0.426 0.77420 0.792 0.188 0.012 0.008
#> SRR772384 1 0.622 0.70619 0.672 0.252 0.036 0.040
#> SRR772385 2 0.183 0.75305 0.024 0.944 0.000 0.032
#> SRR772386 2 0.185 0.74264 0.012 0.940 0.000 0.048
#> SRR772387 2 0.181 0.73750 0.008 0.940 0.000 0.052
#> SRR772388 1 0.290 0.68040 0.908 0.036 0.040 0.016
#> SRR772389 1 0.290 0.68040 0.908 0.036 0.040 0.016
#> SRR772390 1 0.599 -0.14482 0.536 0.004 0.428 0.032
#> SRR772391 1 0.462 0.76603 0.772 0.200 0.016 0.012
#> SRR772392 1 0.462 0.76603 0.772 0.200 0.016 0.012
#> SRR772393 2 0.171 0.75741 0.036 0.948 0.000 0.016
#> SRR772394 2 0.161 0.75846 0.032 0.952 0.000 0.016
#> SRR772395 2 0.283 0.66827 0.004 0.876 0.000 0.120
#> SRR772396 1 0.389 0.76032 0.852 0.104 0.024 0.020
#> SRR772397 1 0.343 0.76413 0.868 0.104 0.020 0.008
#> SRR772398 1 0.382 0.78402 0.824 0.160 0.008 0.008
#> SRR772399 1 0.382 0.78402 0.824 0.160 0.008 0.008
#> SRR772400 1 0.307 0.74534 0.888 0.084 0.024 0.004
#> SRR772401 1 0.289 0.74231 0.896 0.080 0.020 0.004
#> SRR772402 4 0.478 0.84978 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR772403 4 0.476 0.85385 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR772404 2 0.198 0.74283 0.016 0.936 0.000 0.048
#> SRR772405 1 0.622 0.70619 0.672 0.252 0.036 0.040
#> SRR772406 2 0.238 0.73358 0.016 0.916 0.000 0.068
#> SRR772407 2 0.225 0.73155 0.012 0.920 0.000 0.068
#> SRR772408 4 0.410 0.88757 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR772409 4 0.410 0.88757 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR772410 2 0.424 0.70604 0.152 0.808 0.000 0.040
#> SRR772411 2 0.429 0.68265 0.172 0.796 0.000 0.032
#> SRR772412 1 0.310 0.76123 0.876 0.104 0.020 0.000
#> SRR772413 1 0.310 0.76123 0.876 0.104 0.020 0.000
#> SRR772414 3 0.211 0.94328 0.044 0.000 0.932 0.024
#> SRR772415 2 0.222 0.76002 0.032 0.928 0.000 0.040
#> SRR772416 2 0.249 0.75936 0.036 0.916 0.000 0.048
#> SRR772417 2 0.547 0.36535 0.324 0.644 0.000 0.032
#> SRR772418 1 0.594 0.00184 0.584 0.004 0.376 0.036
#> SRR772419 2 0.492 -0.33505 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR772420 2 0.492 -0.33505 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR772421 2 0.368 0.69773 0.176 0.816 0.000 0.008
#> SRR772422 2 0.330 0.72774 0.144 0.848 0.000 0.008
#> SRR772423 4 0.460 0.87813 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR772424 4 0.448 0.88761 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR772425 2 0.305 0.73125 0.028 0.884 0.000 0.088
#> SRR772426 2 0.433 0.26665 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR772427 2 0.433 0.26665 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR772428 1 0.276 0.72526 0.908 0.064 0.016 0.012
#> SRR772429 1 0.298 0.73671 0.896 0.076 0.016 0.012
#> SRR772430 2 0.438 0.65327 0.164 0.796 0.000 0.040
#> SRR772431 4 0.478 0.85191 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR772432 4 0.480 0.84491 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR772433 1 0.277 0.69787 0.912 0.044 0.032 0.012
#> SRR772434 1 0.263 0.70651 0.916 0.048 0.028 0.008
#> SRR772435 1 0.574 0.36979 0.536 0.436 0.000 0.028
#> SRR772436 2 0.570 -0.19943 0.484 0.492 0.000 0.024
#> SRR772437 1 0.725 0.36326 0.584 0.064 0.300 0.052
#> SRR772438 1 0.445 0.74536 0.828 0.108 0.036 0.028
#> SRR772439 1 0.406 0.70596 0.856 0.068 0.044 0.032
#> SRR772440 2 0.174 0.75961 0.056 0.940 0.000 0.004
#> SRR772441 2 0.172 0.76016 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR772442 4 0.495 0.75030 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR772443 4 0.499 0.68082 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR772444 1 0.361 0.77733 0.840 0.140 0.020 0.000
#> SRR772445 1 0.397 0.78179 0.816 0.164 0.016 0.004
#> SRR772446 1 0.445 0.73222 0.744 0.244 0.000 0.012
#> SRR772447 1 0.442 0.72365 0.736 0.256 0.000 0.008
#> SRR772448 2 0.149 0.75750 0.032 0.956 0.000 0.012
#> SRR772449 2 0.172 0.76107 0.048 0.944 0.000 0.008
#> SRR772450 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772451 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772452 1 0.385 0.78312 0.820 0.164 0.012 0.004
#> SRR772453 1 0.428 0.77374 0.788 0.192 0.004 0.016
#> SRR772454 1 0.523 0.64279 0.664 0.312 0.000 0.024
#> SRR772455 2 0.589 0.00756 0.424 0.540 0.000 0.036
#> SRR772456 4 0.413 0.88906 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR772457 4 0.413 0.88906 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR772458 1 0.381 0.78181 0.824 0.160 0.012 0.004
#> SRR772459 1 0.390 0.78051 0.816 0.168 0.012 0.004
#> SRR772460 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772461 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772462 2 0.265 0.65875 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772463 2 0.187 0.71279 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772464 3 0.226 0.94563 0.056 0.000 0.924 0.020
#> SRR772465 2 0.447 0.65826 0.180 0.784 0.000 0.036
#> SRR772466 2 0.434 0.67337 0.168 0.796 0.000 0.036
#> SRR772467 4 0.485 0.82012 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR772468 4 0.485 0.82012 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR772469 1 0.520 0.65485 0.668 0.312 0.004 0.016
#> SRR772470 1 0.533 0.64956 0.660 0.316 0.004 0.020
#> SRR772471 1 0.537 0.60400 0.636 0.340 0.000 0.024
#> SRR772472 1 0.513 0.64852 0.668 0.312 0.000 0.020
#> SRR772473 4 0.493 0.77348 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR772474 4 0.492 0.78537 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR772475 2 0.184 0.75546 0.028 0.944 0.000 0.028
#> SRR772476 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772477 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772478 1 0.416 0.76524 0.792 0.192 0.004 0.012
#> SRR772479 1 0.408 0.76968 0.800 0.184 0.004 0.012
#> SRR772480 2 0.495 -0.00858 0.008 0.648 0.000 0.344
#> SRR772481 2 0.495 -0.01174 0.008 0.648 0.000 0.344
#> SRR772482 1 0.496 0.72530 0.724 0.252 0.012 0.012
#> SRR772483 1 0.499 0.72131 0.720 0.256 0.012 0.012
#> SRR772484 2 0.209 0.75793 0.048 0.932 0.000 0.020
#> SRR772485 2 0.209 0.75793 0.048 0.932 0.000 0.020
#> SRR772486 1 0.439 0.76474 0.820 0.132 0.024 0.024
#> SRR772487 1 0.434 0.76300 0.824 0.128 0.024 0.024
#> SRR772488 2 0.244 0.75620 0.060 0.916 0.000 0.024
#> SRR772489 2 0.252 0.75548 0.064 0.912 0.000 0.024
#> SRR772490 1 0.457 0.74648 0.748 0.236 0.012 0.004
#> SRR772491 1 0.370 0.78183 0.828 0.156 0.016 0.000
#> SRR772492 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772493 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772494 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772495 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772496 2 0.181 0.73316 0.008 0.940 0.000 0.052
#> SRR772497 2 0.181 0.73316 0.008 0.940 0.000 0.052
#> SRR772498 2 0.130 0.75098 0.020 0.964 0.000 0.016
#> SRR772499 2 0.128 0.75364 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR772500 2 0.335 0.60587 0.004 0.836 0.000 0.160
#> SRR772501 2 0.331 0.61331 0.004 0.840 0.000 0.156
#> SRR772502 2 0.586 0.06670 0.412 0.552 0.000 0.036
#> SRR772503 2 0.587 0.05002 0.416 0.548 0.000 0.036
#> SRR772504 2 0.247 0.68143 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772505 2 0.247 0.68143 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772506 2 0.499 -0.49977 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR772507 2 0.499 -0.49977 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR772508 2 0.335 0.58778 0.004 0.836 0.000 0.160
#> SRR772509 1 0.625 0.70556 0.668 0.256 0.036 0.040
#> SRR772510 3 0.301 0.94220 0.080 0.000 0.888 0.032
#> SRR772511 2 0.528 0.57596 0.232 0.716 0.000 0.052
#> SRR772512 1 0.648 0.65201 0.716 0.104 0.120 0.060
#> SRR772513 2 0.183 0.75572 0.024 0.944 0.000 0.032
#> SRR772514 2 0.161 0.75264 0.016 0.952 0.000 0.032
#> SRR772515 2 0.261 0.71830 0.008 0.896 0.000 0.096
#> SRR772516 2 0.220 0.73276 0.008 0.920 0.000 0.072
#> SRR772517 2 0.161 0.74944 0.016 0.952 0.000 0.032
#> SRR772518 2 0.145 0.74311 0.008 0.956 0.000 0.036
#> SRR772519 2 0.164 0.72406 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772520 2 0.164 0.72406 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772521 2 0.547 0.26865 0.364 0.612 0.000 0.024
#> SRR772522 2 0.554 0.27497 0.360 0.612 0.000 0.028
#> SRR772523 2 0.302 0.62159 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772524 2 0.287 0.64438 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR772525 3 0.180 0.92966 0.016 0.000 0.944 0.040
#> SRR772526 4 0.485 0.82012 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR772527 4 0.485 0.82012 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR772528 1 0.599 -0.14482 0.536 0.004 0.428 0.032
#> SRR772529 1 0.480 0.67791 0.696 0.292 0.000 0.012
#> SRR772530 1 0.521 0.64760 0.668 0.308 0.000 0.024
#> SRR772531 3 0.183 0.93555 0.024 0.000 0.944 0.032
#> SRR772532 2 0.228 0.69558 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772533 2 0.234 0.69118 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772534 2 0.590 -0.03320 0.432 0.532 0.000 0.036
#> SRR772535 2 0.277 0.67124 0.004 0.880 0.000 0.116
#> SRR772536 2 0.205 0.72846 0.008 0.928 0.000 0.064
#> SRR772537 4 0.445 0.88801 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR772538 4 0.450 0.88630 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR772539 1 0.522 0.68700 0.688 0.280 0.000 0.032
#> SRR772540 1 0.560 0.57219 0.616 0.352 0.000 0.032
#> SRR772541 2 0.256 0.75566 0.056 0.912 0.000 0.032
#> SRR772542 1 0.427 0.75840 0.832 0.116 0.028 0.024
#> SRR772543 1 0.423 0.74418 0.840 0.100 0.032 0.028
#> SRR772544 3 0.346 0.93418 0.108 0.000 0.860 0.032
#> SRR772545 1 0.421 0.75792 0.780 0.204 0.000 0.016
#> SRR772546 1 0.421 0.75792 0.780 0.204 0.000 0.016
#> SRR772547 2 0.582 -0.01519 0.432 0.536 0.000 0.032
#> SRR772548 2 0.586 -0.20011 0.480 0.488 0.000 0.032
#> SRR772549 1 0.303 0.77437 0.868 0.124 0.008 0.000
#> SRR772550 1 0.317 0.76726 0.872 0.112 0.012 0.004
#> SRR772551 2 0.266 0.75519 0.084 0.900 0.000 0.016
#> SRR772552 2 0.295 0.75286 0.088 0.888 0.000 0.024
#> SRR772553 2 0.212 0.75847 0.040 0.932 0.000 0.028
#> SRR772554 2 0.227 0.71751 0.004 0.912 0.000 0.084
#> SRR772555 2 0.227 0.71561 0.004 0.912 0.000 0.084
#> SRR772556 1 0.365 0.77772 0.844 0.136 0.012 0.008
#> SRR772557 1 0.405 0.77002 0.796 0.188 0.000 0.016
#> SRR772558 1 0.576 0.34695 0.524 0.448 0.000 0.028
#> SRR772559 1 0.556 0.49657 0.584 0.392 0.000 0.024
#> SRR772560 2 0.480 0.54352 0.260 0.720 0.000 0.020
#> SRR772561 1 0.648 0.65201 0.716 0.104 0.120 0.060
#> SRR772562 2 0.202 0.74741 0.012 0.932 0.000 0.056
#> SRR772563 2 0.185 0.75101 0.012 0.940 0.000 0.048
#> SRR772564 1 0.266 0.70560 0.916 0.048 0.024 0.012
#> SRR772565 1 0.266 0.70560 0.916 0.048 0.024 0.012
#> SRR772566 1 0.404 0.61805 0.844 0.032 0.108 0.016
#> SRR772567 1 0.404 0.61805 0.844 0.032 0.108 0.016
#> SRR772568 2 0.282 0.74516 0.036 0.900 0.000 0.064
#> SRR772569 2 0.282 0.74516 0.036 0.900 0.000 0.064
#> SRR772570 1 0.524 0.69029 0.688 0.284 0.004 0.024
#> SRR772571 1 0.551 0.52343 0.600 0.376 0.000 0.024
#> SRR772572 2 0.582 -0.00913 0.432 0.536 0.000 0.032
#> SRR772573 2 0.588 0.02245 0.420 0.544 0.000 0.036
#> SRR772574 1 0.576 0.34698 0.524 0.448 0.000 0.028
#> SRR772575 1 0.586 0.21239 0.488 0.480 0.000 0.032
#> SRR772576 2 0.174 0.75941 0.056 0.940 0.000 0.004
#> SRR772577 2 0.164 0.75994 0.044 0.948 0.000 0.008
#> SRR772578 4 0.473 0.86165 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR772579 4 0.476 0.85467 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR772580 3 0.221 0.94426 0.044 0.000 0.928 0.028
#> SRR772581 2 0.308 0.74626 0.064 0.888 0.000 0.048
#> SRR772582 2 0.293 0.74710 0.056 0.896 0.000 0.048
#> SRR772583 2 0.334 0.72996 0.120 0.860 0.000 0.020
#> SRR772584 2 0.310 0.73980 0.104 0.876 0.000 0.020
#> SRR772585 2 0.206 0.75681 0.052 0.932 0.000 0.016
#> SRR772586 1 0.593 0.01599 0.588 0.004 0.372 0.036
#> SRR772587 1 0.578 0.24543 0.504 0.468 0.000 0.028
#> SRR772588 2 0.349 0.54629 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR772589 2 0.349 0.54629 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR772590 1 0.743 0.08667 0.496 0.056 0.396 0.052
#> SRR772591 1 0.352 0.64715 0.876 0.032 0.076 0.016
#> SRR772592 1 0.359 0.64286 0.872 0.032 0.080 0.016
#> SRR772593 1 0.594 0.00184 0.584 0.004 0.376 0.036
#> SRR772594 4 0.468 0.86867 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR772595 4 0.470 0.86574 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR772596 1 0.599 -0.14482 0.536 0.004 0.428 0.032
#> SRR772597 3 0.228 0.94479 0.052 0.000 0.924 0.024
#> SRR772598 1 0.366 0.72524 0.872 0.072 0.036 0.020
#> SRR772599 1 0.367 0.74326 0.868 0.084 0.028 0.020
#> SRR772600 4 0.482 0.83969 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR772601 4 0.482 0.83821 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR772602 3 0.350 0.91748 0.132 0.000 0.848 0.020
#> SRR772603 4 0.499 0.67244 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR772604 4 0.495 0.75538 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR772605 2 0.284 0.75115 0.088 0.892 0.000 0.020
#> SRR772606 1 0.299 0.76059 0.884 0.100 0.012 0.004
#> SRR772607 1 0.298 0.76640 0.880 0.108 0.008 0.004
#> SRR772608 2 0.194 0.75923 0.032 0.940 0.000 0.028
#> SRR772609 2 0.173 0.75638 0.024 0.948 0.000 0.028
#> SRR772610 2 0.215 0.70488 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR772611 2 0.190 0.72542 0.004 0.932 0.000 0.064
#> SRR772612 4 0.454 0.88118 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR772613 4 0.448 0.88411 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR772614 1 0.368 0.76600 0.856 0.112 0.020 0.012
#> SRR772615 1 0.378 0.77911 0.840 0.136 0.012 0.012
#> SRR772616 2 0.586 -0.13874 0.464 0.504 0.000 0.032
#> SRR772617 4 0.419 0.88926 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR772618 4 0.430 0.89044 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR772619 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772620 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772621 2 0.318 0.74852 0.084 0.880 0.000 0.036
#> SRR772622 2 0.329 0.75719 0.080 0.876 0.000 0.044
#> SRR772623 3 0.259 0.91208 0.016 0.000 0.904 0.080
#> SRR772624 1 0.598 -0.03288 0.572 0.004 0.388 0.036
#> SRR772625 2 0.305 0.70420 0.016 0.876 0.000 0.108
#> SRR772626 2 0.139 0.75564 0.028 0.960 0.000 0.012
#> SRR772627 2 0.149 0.75681 0.032 0.956 0.000 0.012
#> SRR772628 1 0.479 0.74867 0.744 0.232 0.008 0.016
#> SRR772629 1 0.415 0.78278 0.816 0.156 0.012 0.016
#> SRR772630 2 0.571 0.24918 0.360 0.604 0.000 0.036
#> SRR772631 1 0.605 -0.02478 0.564 0.008 0.396 0.032
#> SRR772632 2 0.466 0.01168 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR772633 2 0.468 -0.01155 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR772634 2 0.366 0.70931 0.144 0.836 0.000 0.020
#> SRR772635 2 0.361 0.71370 0.140 0.840 0.000 0.020
#> SRR772636 2 0.183 0.75305 0.024 0.944 0.000 0.032
#> SRR772637 1 0.334 0.76459 0.868 0.108 0.020 0.004
#> SRR772638 1 0.346 0.76980 0.860 0.116 0.020 0.004
#> SRR772639 2 0.284 0.72573 0.020 0.892 0.000 0.088
#> SRR772640 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772641 4 0.407 0.88624 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR772642 2 0.322 0.74273 0.120 0.864 0.000 0.016
#> SRR772643 2 0.311 0.74531 0.112 0.872 0.000 0.016
#> SRR772644 1 0.545 0.56180 0.616 0.360 0.000 0.024
#> SRR772645 1 0.556 0.48992 0.584 0.392 0.000 0.024
#> SRR772646 2 0.228 0.69477 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772647 2 0.228 0.69477 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772648 2 0.306 0.75841 0.072 0.888 0.000 0.040
#> SRR772649 2 0.314 0.75806 0.072 0.884 0.000 0.044
#> SRR772650 2 0.586 -0.22427 0.480 0.488 0.000 0.032
#> SRR772651 2 0.586 -0.22126 0.480 0.488 0.000 0.032
#> SRR772652 1 0.414 0.76027 0.780 0.208 0.000 0.012
#> SRR772653 1 0.414 0.76027 0.780 0.208 0.000 0.012
#> SRR772654 2 0.391 0.70324 0.148 0.824 0.000 0.028
#> SRR772655 2 0.365 0.72326 0.128 0.844 0.000 0.028
#> SRR772656 3 0.368 0.92771 0.084 0.000 0.856 0.060
#> SRR772657 1 0.697 0.48064 0.644 0.068 0.232 0.056
#> SRR772658 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772659 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772660 2 0.221 0.76053 0.044 0.928 0.000 0.028
#> SRR772661 1 0.556 0.73190 0.752 0.168 0.036 0.044
#> SRR772662 2 0.535 0.23127 0.388 0.596 0.000 0.016
#> SRR772663 2 0.548 0.32090 0.344 0.628 0.000 0.028
#> SRR772664 2 0.294 0.75799 0.076 0.892 0.000 0.032
#> SRR772665 2 0.294 0.75799 0.076 0.892 0.000 0.032
#> SRR772666 3 0.304 0.93715 0.100 0.000 0.880 0.020
#> SRR772667 4 0.487 0.85640 0.004 0.356 0.000 0.640
#> SRR772668 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772669 4 0.361 0.83719 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR772670 2 0.534 0.43163 0.300 0.668 0.000 0.032
#> SRR772671 2 0.520 0.47772 0.276 0.692 0.000 0.032
#> SRR772672 2 0.164 0.72497 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772673 2 0.179 0.71943 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772674 3 0.402 0.91411 0.128 0.000 0.828 0.044
#> SRR772675 1 0.625 0.70556 0.668 0.256 0.036 0.040
#> SRR772676 2 0.570 0.08121 0.412 0.560 0.000 0.028
#> SRR772677 2 0.569 0.10181 0.408 0.564 0.000 0.028
#> SRR772678 1 0.622 0.70619 0.672 0.252 0.036 0.040
#> SRR772679 1 0.570 0.20594 0.488 0.488 0.000 0.024
#> SRR772680 1 0.569 0.27303 0.508 0.468 0.000 0.024
#> SRR772681 3 0.405 0.91382 0.124 0.000 0.828 0.048
#> SRR772682 2 0.194 0.73487 0.012 0.936 0.000 0.052
#> SRR772683 2 0.166 0.72985 0.004 0.944 0.000 0.052
#> SRR772685 2 0.206 0.76124 0.052 0.932 0.000 0.016
#> SRR772686 3 0.284 0.94110 0.088 0.000 0.892 0.020
#> SRR772687 3 0.301 0.91558 0.032 0.000 0.888 0.080
#> SRR772688 4 0.452 0.88540 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR772689 4 0.452 0.88540 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR772690 3 0.328 0.92923 0.116 0.000 0.864 0.020
#> SRR772691 2 0.183 0.75305 0.024 0.944 0.000 0.032
#> SRR772692 2 0.358 0.70754 0.156 0.832 0.000 0.012
#> SRR772693 2 0.261 0.75288 0.088 0.900 0.000 0.012
#> SRR772694 2 0.152 0.75786 0.024 0.956 0.000 0.020
#> SRR772695 2 0.171 0.76166 0.036 0.948 0.000 0.016
#> SRR772696 2 0.244 0.76266 0.060 0.916 0.000 0.024
#> SRR772697 2 0.214 0.76181 0.056 0.928 0.000 0.016
#> SRR772698 1 0.601 -0.07648 0.560 0.004 0.400 0.036
#> SRR772699 1 0.485 0.72905 0.732 0.244 0.004 0.020
#> SRR772700 1 0.498 0.71262 0.716 0.260 0.004 0.020
#> SRR772701 1 0.454 0.76840 0.780 0.192 0.012 0.016
#> SRR772702 1 0.450 0.77083 0.784 0.188 0.012 0.016
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.417 0.7470 0.792 0.144 0.012 0.000 NA
#> SRR772342 1 0.349 0.7483 0.820 0.144 0.000 0.000 NA
#> SRR772343 1 0.589 0.2712 0.468 0.432 0.000 0.000 NA
#> SRR772344 2 0.291 0.6906 0.000 0.848 0.000 0.140 NA
#> SRR772345 2 0.291 0.6906 0.000 0.848 0.000 0.140 NA
#> SRR772346 2 0.606 0.2566 0.324 0.548 0.000 0.004 NA
#> SRR772347 2 0.610 0.2453 0.324 0.544 0.000 0.004 NA
#> SRR772348 2 0.230 0.7431 0.008 0.900 0.000 0.088 NA
#> SRR772349 2 0.228 0.7350 0.004 0.896 0.000 0.096 NA
#> SRR772350 3 0.384 0.8551 0.000 0.000 0.792 0.044 NA
#> SRR772351 2 0.355 0.5967 0.004 0.796 0.000 0.188 NA
#> SRR772352 2 0.291 0.7248 0.008 0.864 0.000 0.116 NA
#> SRR772353 2 0.525 0.4195 0.272 0.644 0.000 0.000 NA
#> SRR772354 2 0.535 0.3955 0.280 0.632 0.000 0.000 NA
#> SRR772355 2 0.216 0.7563 0.008 0.916 0.000 0.064 NA
#> SRR772356 2 0.219 0.7462 0.000 0.904 0.000 0.084 NA
#> SRR772357 1 0.489 0.6574 0.668 0.276 0.000 0.000 NA
#> SRR772358 1 0.544 0.5995 0.620 0.300 0.004 0.000 NA
#> SRR772359 1 0.585 0.3481 0.500 0.412 0.000 0.004 NA
#> SRR772360 2 0.546 0.4878 0.260 0.648 0.000 0.008 NA
#> SRR772361 1 0.736 0.1956 0.436 0.056 0.136 0.004 NA
#> SRR772362 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772363 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772364 2 0.619 0.3733 0.252 0.568 0.000 0.004 NA
#> SRR772365 2 0.623 0.3965 0.244 0.576 0.000 0.008 NA
#> SRR772366 1 0.650 -0.1892 0.452 0.000 0.352 0.000 NA
#> SRR772367 3 0.144 0.9225 0.040 0.000 0.948 0.000 NA
#> SRR772368 2 0.266 0.7737 0.024 0.900 0.000 0.052 NA
#> SRR772369 2 0.434 0.7046 0.136 0.784 0.000 0.012 NA
#> SRR772370 2 0.382 0.7461 0.108 0.824 0.000 0.012 NA
#> SRR772371 2 0.629 0.2525 0.304 0.532 0.000 0.004 NA
#> SRR772372 2 0.629 0.2525 0.304 0.532 0.000 0.004 NA
#> SRR772373 2 0.203 0.7744 0.024 0.928 0.000 0.040 NA
#> SRR772374 2 0.201 0.7710 0.020 0.928 0.000 0.044 NA
#> SRR772375 3 0.155 0.9214 0.040 0.000 0.944 0.000 NA
#> SRR772376 2 0.286 0.7449 0.012 0.876 0.000 0.096 NA
#> SRR772377 1 0.648 0.5855 0.544 0.200 0.004 0.004 NA
#> SRR772378 2 0.524 0.4935 0.244 0.668 0.000 0.004 NA
#> SRR772379 2 0.429 0.6837 0.148 0.776 0.000 0.004 NA
#> SRR772380 2 0.449 0.6448 0.188 0.748 0.000 0.004 NA
#> SRR772381 3 0.503 0.8764 0.052 0.000 0.688 0.012 NA
#> SRR772382 1 0.373 0.7473 0.812 0.148 0.008 0.000 NA
#> SRR772383 1 0.361 0.7468 0.816 0.152 0.008 0.000 NA
#> SRR772384 1 0.646 0.5809 0.548 0.196 0.004 0.004 NA
#> SRR772385 2 0.254 0.7686 0.012 0.904 0.000 0.032 NA
#> SRR772386 2 0.216 0.7678 0.008 0.920 0.000 0.052 NA
#> SRR772387 2 0.210 0.7634 0.004 0.920 0.000 0.056 NA
#> SRR772388 1 0.220 0.6399 0.920 0.008 0.032 0.000 NA
#> SRR772389 1 0.220 0.6399 0.920 0.008 0.032 0.000 NA
#> SRR772390 1 0.645 -0.2333 0.440 0.000 0.380 0.000 NA
#> SRR772391 1 0.430 0.7435 0.784 0.144 0.012 0.000 NA
#> SRR772392 1 0.430 0.7435 0.784 0.144 0.012 0.000 NA
#> SRR772393 2 0.263 0.7744 0.024 0.900 0.000 0.020 NA
#> SRR772394 2 0.256 0.7757 0.024 0.904 0.000 0.020 NA
#> SRR772395 2 0.254 0.7072 0.000 0.868 0.000 0.128 NA
#> SRR772396 1 0.311 0.7215 0.872 0.068 0.012 0.000 NA
#> SRR772397 1 0.276 0.7246 0.888 0.072 0.008 0.000 NA
#> SRR772398 1 0.373 0.7466 0.812 0.128 0.000 0.000 NA
#> SRR772399 1 0.373 0.7466 0.812 0.128 0.000 0.000 NA
#> SRR772400 1 0.270 0.7023 0.896 0.048 0.012 0.000 NA
#> SRR772401 1 0.265 0.7066 0.896 0.056 0.008 0.000 NA
#> SRR772402 4 0.460 0.8105 0.000 0.300 0.000 0.668 NA
#> SRR772403 4 0.446 0.8231 0.000 0.288 0.000 0.684 NA
#> SRR772404 2 0.217 0.7658 0.012 0.920 0.000 0.052 NA
#> SRR772405 1 0.646 0.5809 0.548 0.196 0.004 0.004 NA
#> SRR772406 2 0.247 0.7628 0.012 0.900 0.000 0.076 NA
#> SRR772407 2 0.224 0.7603 0.008 0.908 0.000 0.076 NA
#> SRR772408 4 0.305 0.8414 0.000 0.164 0.000 0.828 NA
#> SRR772409 4 0.305 0.8414 0.000 0.164 0.000 0.828 NA
#> SRR772410 2 0.462 0.6961 0.148 0.768 0.000 0.024 NA
#> SRR772411 2 0.457 0.6722 0.168 0.760 0.000 0.016 NA
#> SRR772412 1 0.243 0.7204 0.904 0.068 0.008 0.000 NA
#> SRR772413 1 0.243 0.7204 0.904 0.068 0.008 0.000 NA
#> SRR772414 3 0.167 0.9206 0.028 0.000 0.940 0.000 NA
#> SRR772415 2 0.200 0.7786 0.028 0.932 0.000 0.024 NA
#> SRR772416 2 0.226 0.7791 0.032 0.920 0.000 0.032 NA
#> SRR772417 2 0.581 0.3092 0.308 0.584 0.000 0.004 NA
#> SRR772418 1 0.649 -0.1408 0.468 0.000 0.328 0.000 NA
#> SRR772419 2 0.455 -0.2723 0.000 0.528 0.000 0.464 NA
#> SRR772420 2 0.455 -0.2723 0.000 0.528 0.000 0.464 NA
#> SRR772421 2 0.397 0.6926 0.168 0.788 0.000 0.004 NA
#> SRR772422 2 0.371 0.7250 0.136 0.816 0.000 0.004 NA
#> SRR772423 4 0.396 0.8481 0.000 0.248 0.000 0.736 NA
#> SRR772424 4 0.355 0.8523 0.000 0.220 0.000 0.772 NA
#> SRR772425 2 0.277 0.7583 0.024 0.884 0.000 0.084 NA
#> SRR772426 2 0.421 0.3485 0.000 0.680 0.000 0.308 NA
#> SRR772427 2 0.421 0.3485 0.000 0.680 0.000 0.308 NA
#> SRR772428 1 0.207 0.6813 0.924 0.028 0.004 0.000 NA
#> SRR772429 1 0.231 0.6932 0.912 0.040 0.004 0.000 NA
#> SRR772430 2 0.446 0.6590 0.132 0.768 0.000 0.004 NA
#> SRR772431 4 0.440 0.8234 0.000 0.292 0.000 0.684 NA
#> SRR772432 4 0.445 0.8175 0.000 0.300 0.000 0.676 NA
#> SRR772433 1 0.203 0.6535 0.928 0.012 0.016 0.000 NA
#> SRR772434 1 0.195 0.6626 0.932 0.016 0.012 0.000 NA
#> SRR772435 1 0.562 0.4090 0.536 0.384 0.000 0.000 NA
#> SRR772436 1 0.559 0.2725 0.492 0.436 0.000 0.000 NA
#> SRR772437 1 0.776 0.0903 0.412 0.052 0.208 0.008 NA
#> SRR772438 1 0.410 0.6921 0.812 0.068 0.020 0.000 NA
#> SRR772439 1 0.370 0.6546 0.836 0.032 0.028 0.000 NA
#> SRR772440 2 0.259 0.7758 0.048 0.900 0.000 0.008 NA
#> SRR772441 2 0.247 0.7778 0.040 0.908 0.000 0.012 NA
#> SRR772442 4 0.476 0.6967 0.000 0.380 0.000 0.596 NA
#> SRR772443 4 0.491 0.6301 0.000 0.412 0.000 0.560 NA
#> SRR772444 1 0.312 0.7376 0.860 0.108 0.016 0.000 NA
#> SRR772445 1 0.327 0.7451 0.844 0.128 0.012 0.000 NA
#> SRR772446 1 0.424 0.7194 0.752 0.200 0.000 0.000 NA
#> SRR772447 1 0.437 0.7122 0.740 0.208 0.000 0.000 NA
#> SRR772448 2 0.235 0.7773 0.028 0.916 0.000 0.020 NA
#> SRR772449 2 0.292 0.7755 0.048 0.884 0.000 0.012 NA
#> SRR772450 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772451 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772452 1 0.329 0.7455 0.844 0.124 0.008 0.000 NA
#> SRR772453 1 0.394 0.7484 0.800 0.144 0.004 0.000 NA
#> SRR772454 1 0.498 0.6585 0.680 0.244 0.000 0.000 NA
#> SRR772455 2 0.584 -0.0896 0.416 0.488 0.000 0.000 NA
#> SRR772456 4 0.293 0.8419 0.000 0.164 0.000 0.832 NA
#> SRR772457 4 0.293 0.8419 0.000 0.164 0.000 0.832 NA
#> SRR772458 1 0.325 0.7438 0.848 0.120 0.008 0.000 NA
#> SRR772459 1 0.334 0.7455 0.840 0.128 0.008 0.000 NA
#> SRR772460 4 0.248 0.7533 0.000 0.084 0.000 0.892 NA
#> SRR772461 4 0.248 0.7533 0.000 0.084 0.000 0.892 NA
#> SRR772462 2 0.254 0.7079 0.000 0.868 0.000 0.128 NA
#> SRR772463 2 0.179 0.7484 0.000 0.916 0.000 0.084 NA
#> SRR772464 3 0.172 0.9230 0.044 0.000 0.936 0.000 NA
#> SRR772465 2 0.472 0.6380 0.180 0.740 0.000 0.008 NA
#> SRR772466 2 0.461 0.6542 0.168 0.752 0.000 0.008 NA
#> SRR772467 4 0.420 0.7892 0.000 0.328 0.000 0.664 NA
#> SRR772468 4 0.420 0.7892 0.000 0.328 0.000 0.664 NA
#> SRR772469 1 0.479 0.6591 0.684 0.260 0.000 0.000 NA
#> SRR772470 1 0.512 0.6612 0.668 0.260 0.004 0.000 NA
#> SRR772471 1 0.512 0.6275 0.652 0.276 0.000 0.000 NA
#> SRR772472 1 0.484 0.6620 0.688 0.248 0.000 0.000 NA
#> SRR772473 4 0.485 0.7411 0.000 0.360 0.000 0.608 NA
#> SRR772474 4 0.472 0.7291 0.000 0.368 0.000 0.608 NA
#> SRR772475 2 0.256 0.7703 0.016 0.904 0.000 0.028 NA
#> SRR772476 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772477 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772478 1 0.378 0.7425 0.808 0.132 0.000 0.000 NA
#> SRR772479 1 0.369 0.7421 0.816 0.124 0.000 0.000 NA
#> SRR772480 2 0.526 0.0774 0.004 0.604 0.000 0.340 NA
#> SRR772481 2 0.528 0.0566 0.004 0.600 0.000 0.344 NA
#> SRR772482 1 0.480 0.7090 0.720 0.204 0.000 0.004 NA
#> SRR772483 1 0.483 0.7056 0.716 0.208 0.000 0.004 NA
#> SRR772484 2 0.213 0.7722 0.024 0.920 0.000 0.004 NA
#> SRR772485 2 0.213 0.7722 0.024 0.920 0.000 0.004 NA
#> SRR772486 1 0.420 0.7166 0.800 0.092 0.012 0.000 NA
#> SRR772487 1 0.420 0.7148 0.800 0.092 0.012 0.000 NA
#> SRR772488 2 0.264 0.7696 0.036 0.896 0.000 0.008 NA
#> SRR772489 2 0.279 0.7682 0.040 0.888 0.000 0.008 NA
#> SRR772490 1 0.403 0.7293 0.772 0.192 0.004 0.000 NA
#> SRR772491 1 0.320 0.7424 0.852 0.116 0.008 0.000 NA
#> SRR772492 4 0.248 0.7533 0.000 0.084 0.000 0.892 NA
#> SRR772493 4 0.248 0.7533 0.000 0.084 0.000 0.892 NA
#> SRR772494 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772495 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772496 2 0.210 0.7627 0.012 0.920 0.000 0.060 NA
#> SRR772497 2 0.210 0.7627 0.012 0.920 0.000 0.060 NA
#> SRR772498 2 0.227 0.7728 0.012 0.916 0.000 0.020 NA
#> SRR772499 2 0.228 0.7736 0.016 0.916 0.000 0.016 NA
#> SRR772500 2 0.317 0.6395 0.000 0.816 0.000 0.176 NA
#> SRR772501 2 0.313 0.6464 0.000 0.820 0.000 0.172 NA
#> SRR772502 2 0.595 -0.0291 0.408 0.484 0.000 0.000 NA
#> SRR772503 2 0.599 -0.0587 0.412 0.476 0.000 0.000 NA
#> SRR772504 2 0.257 0.7169 0.000 0.876 0.000 0.112 NA
#> SRR772505 2 0.257 0.7169 0.000 0.876 0.000 0.112 NA
#> SRR772506 4 0.456 0.4227 0.000 0.484 0.000 0.508 NA
#> SRR772507 4 0.456 0.4227 0.000 0.484 0.000 0.508 NA
#> SRR772508 2 0.325 0.6248 0.000 0.808 0.000 0.184 NA
#> SRR772509 1 0.648 0.5855 0.544 0.200 0.004 0.004 NA
#> SRR772510 3 0.390 0.9141 0.044 0.000 0.812 0.012 NA
#> SRR772511 2 0.550 0.5698 0.216 0.680 0.000 0.024 NA
#> SRR772512 1 0.625 0.4024 0.504 0.068 0.024 0.004 NA
#> SRR772513 2 0.150 0.7738 0.016 0.952 0.000 0.024 NA
#> SRR772514 2 0.128 0.7709 0.008 0.960 0.000 0.024 NA
#> SRR772515 2 0.241 0.7474 0.004 0.896 0.000 0.088 NA
#> SRR772516 2 0.254 0.7619 0.012 0.900 0.000 0.068 NA
#> SRR772517 2 0.163 0.7721 0.016 0.944 0.000 0.036 NA
#> SRR772518 2 0.149 0.7673 0.008 0.948 0.000 0.040 NA
#> SRR772519 2 0.164 0.7519 0.000 0.932 0.000 0.064 NA
#> SRR772520 2 0.164 0.7519 0.000 0.932 0.000 0.064 NA
#> SRR772521 2 0.580 0.2020 0.352 0.544 0.000 0.000 NA
#> SRR772522 2 0.583 0.2090 0.348 0.544 0.000 0.000 NA
#> SRR772523 2 0.297 0.6687 0.000 0.836 0.000 0.156 NA
#> SRR772524 2 0.284 0.6846 0.000 0.848 0.000 0.144 NA
#> SRR772525 3 0.223 0.8984 0.000 0.000 0.904 0.016 NA
#> SRR772526 4 0.420 0.7892 0.000 0.328 0.000 0.664 NA
#> SRR772527 4 0.420 0.7892 0.000 0.328 0.000 0.664 NA
#> SRR772528 1 0.645 -0.2333 0.440 0.000 0.380 0.000 NA
#> SRR772529 1 0.466 0.6604 0.692 0.260 0.000 0.000 NA
#> SRR772530 1 0.497 0.6428 0.676 0.264 0.000 0.004 NA
#> SRR772531 3 0.170 0.9110 0.008 0.000 0.940 0.008 NA
#> SRR772532 2 0.242 0.7285 0.000 0.888 0.000 0.100 NA
#> SRR772533 2 0.236 0.7235 0.000 0.888 0.000 0.104 NA
#> SRR772534 2 0.614 -0.1188 0.416 0.468 0.000 0.004 NA
#> SRR772535 2 0.283 0.7083 0.004 0.864 0.000 0.120 NA
#> SRR772536 2 0.249 0.7567 0.008 0.900 0.000 0.072 NA
#> SRR772537 4 0.346 0.8533 0.000 0.224 0.000 0.772 NA
#> SRR772538 4 0.352 0.8530 0.000 0.232 0.000 0.764 NA
#> SRR772539 1 0.470 0.6797 0.704 0.236 0.000 0.000 NA
#> SRR772540 1 0.533 0.5893 0.628 0.300 0.000 0.004 NA
#> SRR772541 2 0.256 0.7726 0.032 0.900 0.000 0.008 NA
#> SRR772542 1 0.382 0.7143 0.824 0.080 0.008 0.000 NA
#> SRR772543 1 0.374 0.6992 0.832 0.064 0.012 0.000 NA
#> SRR772544 3 0.411 0.9108 0.068 0.000 0.804 0.012 NA
#> SRR772545 1 0.399 0.7399 0.792 0.140 0.000 0.000 NA
#> SRR772546 1 0.399 0.7399 0.792 0.140 0.000 0.000 NA
#> SRR772547 2 0.592 -0.1085 0.424 0.472 0.000 0.000 NA
#> SRR772548 1 0.593 0.2573 0.468 0.428 0.000 0.000 NA
#> SRR772549 1 0.263 0.7281 0.892 0.072 0.004 0.000 NA
#> SRR772550 1 0.259 0.7207 0.896 0.064 0.004 0.000 NA
#> SRR772551 2 0.303 0.7713 0.076 0.876 0.000 0.016 NA
#> SRR772552 2 0.326 0.7645 0.080 0.860 0.000 0.008 NA
#> SRR772553 2 0.281 0.7716 0.024 0.892 0.000 0.028 NA
#> SRR772554 2 0.235 0.7436 0.004 0.900 0.000 0.084 NA
#> SRR772555 2 0.235 0.7430 0.004 0.900 0.000 0.084 NA
#> SRR772556 1 0.294 0.7376 0.872 0.096 0.008 0.000 NA
#> SRR772557 1 0.333 0.7475 0.828 0.144 0.000 0.000 NA
#> SRR772558 1 0.558 0.4063 0.532 0.392 0.000 0.000 NA
#> SRR772559 1 0.546 0.5362 0.592 0.328 0.000 0.000 NA
#> SRR772560 2 0.487 0.5333 0.244 0.688 0.000 0.000 NA
#> SRR772561 1 0.625 0.4024 0.504 0.068 0.024 0.004 NA
#> SRR772562 2 0.168 0.7693 0.004 0.940 0.000 0.044 NA
#> SRR772563 2 0.153 0.7706 0.004 0.948 0.000 0.036 NA
#> SRR772564 1 0.205 0.6699 0.928 0.020 0.012 0.000 NA
#> SRR772565 1 0.205 0.6699 0.928 0.020 0.012 0.000 NA
#> SRR772566 1 0.332 0.5785 0.852 0.004 0.088 0.000 NA
#> SRR772567 1 0.332 0.5785 0.852 0.004 0.088 0.000 NA
#> SRR772568 2 0.326 0.7705 0.036 0.868 0.000 0.068 NA
#> SRR772569 2 0.326 0.7705 0.036 0.868 0.000 0.068 NA
#> SRR772570 1 0.499 0.6857 0.688 0.228 0.000 0.000 NA
#> SRR772571 1 0.536 0.5611 0.608 0.316 0.000 0.000 NA
#> SRR772572 2 0.596 -0.1124 0.424 0.468 0.000 0.000 NA
#> SRR772573 2 0.599 -0.0854 0.412 0.476 0.000 0.000 NA
#> SRR772574 1 0.562 0.4153 0.532 0.388 0.000 0.000 NA
#> SRR772575 1 0.568 0.2837 0.492 0.428 0.000 0.000 NA
#> SRR772576 2 0.214 0.7775 0.048 0.920 0.000 0.004 NA
#> SRR772577 2 0.224 0.7784 0.040 0.920 0.000 0.016 NA
#> SRR772578 4 0.395 0.8196 0.000 0.300 0.000 0.696 NA
#> SRR772579 4 0.411 0.8115 0.000 0.308 0.000 0.684 NA
#> SRR772580 3 0.174 0.9199 0.032 0.000 0.940 0.004 NA
#> SRR772581 2 0.395 0.7536 0.064 0.832 0.000 0.052 NA
#> SRR772582 2 0.382 0.7550 0.056 0.840 0.000 0.052 NA
#> SRR772583 2 0.327 0.7424 0.096 0.848 0.000 0.000 NA
#> SRR772584 2 0.305 0.7517 0.076 0.864 0.000 0.000 NA
#> SRR772585 2 0.205 0.7726 0.028 0.920 0.000 0.000 NA
#> SRR772586 1 0.651 -0.1385 0.468 0.000 0.324 0.000 NA
#> SRR772587 1 0.604 0.3354 0.484 0.396 0.000 0.000 NA
#> SRR772588 2 0.345 0.5921 0.000 0.784 0.000 0.208 NA
#> SRR772589 2 0.345 0.5921 0.000 0.784 0.000 0.208 NA
#> SRR772590 1 0.775 -0.1771 0.356 0.044 0.316 0.004 NA
#> SRR772591 1 0.282 0.6079 0.884 0.004 0.056 0.000 NA
#> SRR772592 1 0.289 0.6036 0.880 0.004 0.060 0.000 NA
#> SRR772593 1 0.649 -0.1408 0.468 0.000 0.328 0.000 NA
#> SRR772594 4 0.393 0.8349 0.000 0.276 0.000 0.716 NA
#> SRR772595 4 0.398 0.8294 0.000 0.284 0.000 0.708 NA
#> SRR772596 1 0.645 -0.2333 0.440 0.000 0.380 0.000 NA
#> SRR772597 3 0.155 0.9214 0.040 0.000 0.944 0.000 NA
#> SRR772598 1 0.294 0.6814 0.884 0.040 0.016 0.000 NA
#> SRR772599 1 0.273 0.7042 0.892 0.052 0.008 0.000 NA
#> SRR772600 4 0.455 0.8105 0.000 0.304 0.000 0.668 NA
#> SRR772601 4 0.445 0.8147 0.000 0.300 0.000 0.676 NA
#> SRR772602 3 0.375 0.9002 0.092 0.000 0.824 0.004 NA
#> SRR772603 4 0.506 0.6366 0.000 0.416 0.000 0.548 NA
#> SRR772604 4 0.490 0.7160 0.000 0.376 0.000 0.592 NA
#> SRR772605 2 0.285 0.7676 0.072 0.876 0.000 0.000 NA
#> SRR772606 1 0.265 0.7204 0.892 0.068 0.004 0.000 NA
#> SRR772607 1 0.255 0.7247 0.892 0.072 0.000 0.000 NA
#> SRR772608 2 0.181 0.7777 0.020 0.940 0.000 0.016 NA
#> SRR772609 2 0.161 0.7767 0.016 0.948 0.000 0.024 NA
#> SRR772610 2 0.231 0.7394 0.000 0.896 0.000 0.092 NA
#> SRR772611 2 0.176 0.7552 0.000 0.928 0.000 0.064 NA
#> SRR772612 4 0.394 0.8472 0.000 0.220 0.000 0.756 NA
#> SRR772613 4 0.370 0.8464 0.000 0.212 0.000 0.772 NA
#> SRR772614 1 0.295 0.7230 0.880 0.072 0.012 0.000 NA
#> SRR772615 1 0.325 0.7412 0.852 0.104 0.004 0.000 NA
#> SRR772616 1 0.607 0.2408 0.448 0.432 0.000 0.000 NA
#> SRR772617 4 0.321 0.8441 0.000 0.180 0.000 0.812 NA
#> SRR772618 4 0.330 0.8517 0.000 0.204 0.000 0.792 NA
#> SRR772619 4 0.248 0.7533 0.000 0.084 0.000 0.892 NA
#> SRR772620 4 0.248 0.7533 0.000 0.084 0.000 0.892 NA
#> SRR772621 2 0.348 0.7574 0.088 0.848 0.000 0.012 NA
#> SRR772622 2 0.394 0.7664 0.088 0.828 0.000 0.032 NA
#> SRR772623 3 0.384 0.8551 0.000 0.000 0.792 0.044 NA
#> SRR772624 1 0.648 -0.1568 0.464 0.000 0.340 0.000 NA
#> SRR772625 2 0.335 0.7293 0.008 0.848 0.000 0.108 NA
#> SRR772626 2 0.237 0.7745 0.020 0.912 0.000 0.016 NA
#> SRR772627 2 0.247 0.7751 0.024 0.908 0.000 0.016 NA
#> SRR772628 1 0.433 0.7307 0.756 0.192 0.004 0.000 NA
#> SRR772629 1 0.357 0.7455 0.828 0.124 0.004 0.000 NA
#> SRR772630 2 0.596 0.1975 0.340 0.548 0.000 0.004 NA
#> SRR772631 1 0.661 -0.1569 0.456 0.004 0.348 0.000 NA
#> SRR772632 2 0.439 0.0887 0.000 0.612 0.000 0.380 NA
#> SRR772633 2 0.440 0.0744 0.000 0.608 0.000 0.384 NA
#> SRR772634 2 0.401 0.7020 0.136 0.792 0.000 0.000 NA
#> SRR772635 2 0.401 0.7024 0.136 0.792 0.000 0.000 NA
#> SRR772636 2 0.254 0.7686 0.012 0.904 0.000 0.032 NA
#> SRR772637 1 0.274 0.7190 0.892 0.064 0.012 0.000 NA
#> SRR772638 1 0.287 0.7238 0.884 0.072 0.012 0.000 NA
#> SRR772639 2 0.258 0.7553 0.016 0.892 0.000 0.084 NA
#> SRR772640 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772641 4 0.301 0.8400 0.000 0.160 0.000 0.832 NA
#> SRR772642 2 0.329 0.7475 0.120 0.844 0.000 0.004 NA
#> SRR772643 2 0.335 0.7507 0.112 0.844 0.000 0.004 NA
#> SRR772644 1 0.527 0.5938 0.628 0.296 0.000 0.000 NA
#> SRR772645 1 0.560 0.5279 0.580 0.328 0.000 0.000 NA
#> SRR772646 2 0.230 0.7265 0.000 0.892 0.000 0.100 NA
#> SRR772647 2 0.230 0.7265 0.000 0.892 0.000 0.100 NA
#> SRR772648 2 0.383 0.7683 0.076 0.836 0.000 0.032 NA
#> SRR772649 2 0.390 0.7675 0.076 0.832 0.000 0.032 NA
#> SRR772650 1 0.573 0.2826 0.480 0.436 0.000 0.000 NA
#> SRR772651 1 0.573 0.2784 0.480 0.436 0.000 0.000 NA
#> SRR772652 1 0.361 0.7423 0.808 0.156 0.000 0.000 NA
#> SRR772653 1 0.361 0.7423 0.808 0.156 0.000 0.000 NA
#> SRR772654 2 0.445 0.6856 0.152 0.764 0.000 0.004 NA
#> SRR772655 2 0.430 0.7099 0.132 0.784 0.000 0.008 NA
#> SRR772656 3 0.476 0.8676 0.008 0.000 0.672 0.028 NA
#> SRR772657 1 0.736 0.1956 0.436 0.056 0.136 0.004 NA
#> SRR772658 4 0.254 0.7568 0.000 0.088 0.000 0.888 NA
#> SRR772659 4 0.254 0.7568 0.000 0.088 0.000 0.888 NA
#> SRR772660 2 0.261 0.7810 0.040 0.904 0.000 0.028 NA
#> SRR772661 1 0.581 0.5795 0.624 0.116 0.004 0.004 NA
#> SRR772662 2 0.540 0.1680 0.388 0.556 0.000 0.004 NA
#> SRR772663 2 0.546 0.2479 0.344 0.580 0.000 0.000 NA
#> SRR772664 2 0.326 0.7720 0.068 0.868 0.000 0.024 NA
#> SRR772665 2 0.326 0.7720 0.068 0.868 0.000 0.024 NA
#> SRR772666 3 0.309 0.9161 0.064 0.000 0.868 0.004 NA
#> SRR772667 4 0.402 0.8297 0.000 0.272 0.000 0.716 NA
#> SRR772668 4 0.275 0.7346 0.000 0.080 0.000 0.880 NA
#> SRR772669 4 0.265 0.7480 0.000 0.084 0.000 0.884 NA
#> SRR772670 2 0.544 0.3957 0.288 0.628 0.000 0.004 NA
#> SRR772671 2 0.531 0.4558 0.264 0.652 0.000 0.004 NA
#> SRR772672 2 0.176 0.7536 0.000 0.928 0.000 0.064 NA
#> SRR772673 2 0.189 0.7494 0.000 0.920 0.000 0.072 NA
#> SRR772674 3 0.503 0.8764 0.052 0.000 0.688 0.012 NA
#> SRR772675 1 0.648 0.5855 0.544 0.200 0.004 0.004 NA
#> SRR772676 2 0.591 -0.0436 0.412 0.484 0.000 0.000 NA
#> SRR772677 2 0.587 -0.0121 0.408 0.492 0.000 0.000 NA
#> SRR772678 1 0.646 0.5809 0.548 0.196 0.004 0.004 NA
#> SRR772679 1 0.555 0.2683 0.492 0.440 0.000 0.000 NA
#> SRR772680 1 0.552 0.3331 0.516 0.416 0.000 0.000 NA
#> SRR772681 3 0.499 0.8754 0.048 0.000 0.688 0.012 NA
#> SRR772682 2 0.214 0.7629 0.012 0.920 0.000 0.056 NA
#> SRR772683 2 0.179 0.7570 0.004 0.932 0.000 0.056 NA
#> SRR772685 2 0.247 0.7803 0.052 0.908 0.000 0.016 NA
#> SRR772686 3 0.289 0.9190 0.056 0.000 0.880 0.004 NA
#> SRR772687 3 0.428 0.8558 0.016 0.000 0.764 0.028 NA
#> SRR772688 4 0.364 0.8532 0.000 0.232 0.000 0.760 NA
#> SRR772689 4 0.364 0.8532 0.000 0.232 0.000 0.760 NA
#> SRR772690 3 0.340 0.9107 0.076 0.000 0.848 0.004 NA
#> SRR772691 2 0.254 0.7686 0.012 0.904 0.000 0.032 NA
#> SRR772692 2 0.408 0.6995 0.148 0.784 0.000 0.000 NA
#> SRR772693 2 0.346 0.7598 0.080 0.844 0.000 0.004 NA
#> SRR772694 2 0.162 0.7773 0.020 0.948 0.000 0.020 NA
#> SRR772695 2 0.197 0.7812 0.036 0.932 0.000 0.016 NA
#> SRR772696 2 0.274 0.7807 0.052 0.896 0.000 0.024 NA
#> SRR772697 2 0.239 0.7797 0.048 0.912 0.000 0.016 NA
#> SRR772698 1 0.650 -0.1892 0.452 0.000 0.352 0.000 NA
#> SRR772699 1 0.456 0.7129 0.740 0.196 0.000 0.004 NA
#> SRR772700 1 0.462 0.6985 0.728 0.212 0.000 0.004 NA
#> SRR772701 1 0.389 0.7467 0.804 0.148 0.008 0.000 NA
#> SRR772702 1 0.377 0.7473 0.812 0.144 0.008 0.000 NA
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.4026 0.6308 0.804 0.072 0.012 0.000 0.024 0.088
#> SRR772342 1 0.3524 0.6332 0.832 0.080 0.004 0.000 0.020 0.064
#> SRR772343 1 0.6144 -0.1650 0.472 0.296 0.000 0.000 0.012 0.220
#> SRR772344 2 0.2581 0.6388 0.000 0.860 0.000 0.120 0.000 0.020
#> SRR772345 2 0.2581 0.6388 0.000 0.860 0.000 0.120 0.000 0.020
#> SRR772346 2 0.6597 -0.6954 0.292 0.416 0.000 0.008 0.016 0.268
#> SRR772347 2 0.6581 -0.6929 0.280 0.424 0.000 0.008 0.016 0.272
#> SRR772348 2 0.2013 0.6799 0.008 0.908 0.000 0.076 0.000 0.008
#> SRR772349 2 0.2203 0.6740 0.004 0.896 0.000 0.084 0.000 0.016
#> SRR772350 3 0.4540 0.6325 0.000 0.000 0.724 0.024 0.064 0.188
#> SRR772351 2 0.3385 0.5613 0.004 0.796 0.000 0.172 0.000 0.028
#> SRR772352 2 0.3113 0.6593 0.008 0.844 0.000 0.100 0.000 0.048
#> SRR772353 2 0.6004 -0.4176 0.300 0.524 0.000 0.000 0.024 0.152
#> SRR772354 2 0.6069 -0.4380 0.304 0.512 0.000 0.000 0.024 0.160
#> SRR772355 2 0.1906 0.6875 0.008 0.924 0.000 0.036 0.000 0.032
#> SRR772356 2 0.2030 0.6854 0.000 0.908 0.000 0.064 0.000 0.028
#> SRR772357 1 0.4982 0.4948 0.688 0.172 0.000 0.000 0.020 0.120
#> SRR772358 1 0.5550 0.4025 0.632 0.188 0.004 0.000 0.020 0.156
#> SRR772359 1 0.5804 0.0219 0.536 0.292 0.000 0.000 0.012 0.160
#> SRR772360 2 0.5838 -0.3153 0.268 0.548 0.000 0.004 0.008 0.172
#> SRR772361 5 0.6930 0.5855 0.320 0.032 0.124 0.000 0.472 0.052
#> SRR772362 4 0.2636 0.8214 0.000 0.120 0.000 0.860 0.004 0.016
#> SRR772363 4 0.2636 0.8214 0.000 0.120 0.000 0.860 0.004 0.016
#> SRR772364 6 0.6798 0.7625 0.196 0.376 0.000 0.012 0.032 0.384
#> SRR772365 2 0.6726 -0.8145 0.192 0.388 0.000 0.012 0.028 0.380
#> SRR772366 5 0.6108 0.5776 0.292 0.000 0.344 0.000 0.364 0.000
#> SRR772367 3 0.0837 0.7381 0.020 0.000 0.972 0.000 0.004 0.004
#> SRR772368 2 0.2823 0.6889 0.020 0.884 0.000 0.036 0.012 0.048
#> SRR772369 2 0.4812 0.3271 0.144 0.704 0.000 0.004 0.008 0.140
#> SRR772370 2 0.4301 0.4866 0.104 0.756 0.000 0.004 0.008 0.128
#> SRR772371 6 0.6768 0.8822 0.248 0.340 0.000 0.004 0.032 0.376
#> SRR772372 6 0.6768 0.8822 0.248 0.340 0.000 0.004 0.032 0.376
#> SRR772373 2 0.2068 0.6876 0.016 0.916 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR772374 2 0.1718 0.6884 0.020 0.936 0.000 0.020 0.000 0.024
#> SRR772375 3 0.1148 0.7363 0.020 0.000 0.960 0.000 0.004 0.016
#> SRR772376 2 0.2903 0.6797 0.016 0.864 0.000 0.084 0.000 0.036
#> SRR772377 1 0.6850 -0.1090 0.412 0.124 0.000 0.000 0.360 0.104
#> SRR772378 2 0.5618 -0.3396 0.260 0.568 0.000 0.000 0.008 0.164
#> SRR772379 2 0.4638 0.3082 0.148 0.704 0.000 0.000 0.004 0.144
#> SRR772380 2 0.4889 0.1666 0.184 0.672 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR772381 3 0.5178 0.6363 0.020 0.000 0.644 0.008 0.264 0.064
#> SRR772382 1 0.3026 0.6276 0.860 0.064 0.004 0.000 0.008 0.064
#> SRR772383 1 0.2965 0.6289 0.864 0.068 0.004 0.000 0.008 0.056
#> SRR772384 1 0.6949 -0.1204 0.412 0.120 0.004 0.000 0.360 0.104
#> SRR772385 2 0.3146 0.6692 0.020 0.864 0.000 0.016 0.032 0.068
#> SRR772386 2 0.2007 0.6899 0.004 0.916 0.000 0.036 0.000 0.044
#> SRR772387 2 0.1723 0.6882 0.000 0.928 0.000 0.036 0.000 0.036
#> SRR772388 1 0.3492 0.3904 0.824 0.004 0.048 0.000 0.112 0.012
#> SRR772389 1 0.3492 0.3904 0.824 0.004 0.048 0.000 0.112 0.012
#> SRR772390 3 0.6097 -0.5793 0.284 0.000 0.372 0.000 0.344 0.000
#> SRR772391 1 0.4097 0.6224 0.800 0.068 0.012 0.000 0.028 0.092
#> SRR772392 1 0.4097 0.6224 0.800 0.068 0.012 0.000 0.028 0.092
#> SRR772393 2 0.3018 0.6495 0.012 0.856 0.000 0.016 0.012 0.104
#> SRR772394 2 0.2827 0.6526 0.012 0.864 0.000 0.012 0.008 0.104
#> SRR772395 2 0.2806 0.6377 0.000 0.844 0.000 0.136 0.004 0.016
#> SRR772396 1 0.3379 0.5396 0.844 0.020 0.008 0.000 0.084 0.044
#> SRR772397 1 0.2522 0.5736 0.900 0.028 0.008 0.000 0.040 0.024
#> SRR772398 1 0.4113 0.6010 0.792 0.056 0.000 0.000 0.068 0.084
#> SRR772399 1 0.4058 0.6034 0.796 0.056 0.000 0.000 0.064 0.084
#> SRR772400 1 0.2969 0.5051 0.864 0.012 0.008 0.000 0.088 0.028
#> SRR772401 1 0.3010 0.5088 0.864 0.016 0.008 0.000 0.084 0.028
#> SRR772402 4 0.5042 0.7759 0.000 0.244 0.000 0.648 0.012 0.096
#> SRR772403 4 0.4862 0.7899 0.000 0.228 0.000 0.672 0.012 0.088
#> SRR772404 2 0.2179 0.6897 0.008 0.916 0.000 0.040 0.012 0.024
#> SRR772405 1 0.6949 -0.1204 0.412 0.120 0.004 0.000 0.360 0.104
#> SRR772406 2 0.2190 0.6886 0.008 0.908 0.000 0.044 0.000 0.040
#> SRR772407 2 0.2113 0.6904 0.008 0.912 0.000 0.048 0.000 0.032
#> SRR772408 4 0.2680 0.8224 0.000 0.124 0.000 0.856 0.004 0.016
#> SRR772409 4 0.2680 0.8224 0.000 0.124 0.000 0.856 0.004 0.016
#> SRR772410 2 0.5098 0.2974 0.144 0.684 0.000 0.016 0.004 0.152
#> SRR772411 2 0.5051 0.2403 0.152 0.676 0.000 0.008 0.004 0.160
#> SRR772412 1 0.2776 0.5695 0.884 0.032 0.008 0.000 0.056 0.020
#> SRR772413 1 0.2776 0.5695 0.884 0.032 0.008 0.000 0.056 0.020
#> SRR772414 3 0.1714 0.7352 0.016 0.000 0.936 0.000 0.024 0.024
#> SRR772415 2 0.2147 0.6767 0.032 0.912 0.000 0.012 0.000 0.044
#> SRR772416 2 0.2467 0.6764 0.036 0.896 0.000 0.020 0.000 0.048
#> SRR772417 2 0.6007 -0.5338 0.308 0.464 0.000 0.000 0.004 0.224
#> SRR772418 5 0.6103 0.6051 0.300 0.000 0.320 0.000 0.380 0.000
#> SRR772419 2 0.4337 -0.2382 0.000 0.500 0.000 0.480 0.000 0.020
#> SRR772420 2 0.4337 -0.2382 0.000 0.500 0.000 0.480 0.000 0.020
#> SRR772421 2 0.4811 0.2732 0.180 0.692 0.000 0.004 0.004 0.120
#> SRR772422 2 0.4560 0.3835 0.156 0.728 0.000 0.004 0.008 0.104
#> SRR772423 4 0.4024 0.8211 0.000 0.196 0.000 0.748 0.008 0.048
#> SRR772424 4 0.3569 0.8291 0.000 0.164 0.000 0.792 0.008 0.036
#> SRR772425 2 0.2624 0.6860 0.028 0.884 0.000 0.068 0.000 0.020
#> SRR772426 2 0.3898 0.4098 0.000 0.684 0.000 0.296 0.000 0.020
#> SRR772427 2 0.3898 0.4098 0.000 0.684 0.000 0.296 0.000 0.020
#> SRR772428 1 0.2760 0.4682 0.868 0.004 0.012 0.000 0.100 0.016
#> SRR772429 1 0.2919 0.4827 0.860 0.012 0.008 0.000 0.104 0.016
#> SRR772430 2 0.5393 0.1310 0.128 0.652 0.000 0.000 0.032 0.188
#> SRR772431 4 0.4765 0.7883 0.000 0.244 0.000 0.672 0.012 0.072
#> SRR772432 4 0.4858 0.7803 0.000 0.252 0.000 0.660 0.012 0.076
#> SRR772433 1 0.2877 0.4126 0.848 0.000 0.020 0.000 0.124 0.008
#> SRR772434 1 0.2656 0.4295 0.860 0.000 0.012 0.000 0.120 0.008
#> SRR772435 1 0.5774 0.0660 0.560 0.280 0.000 0.000 0.020 0.140
#> SRR772436 1 0.5865 -0.1681 0.512 0.340 0.000 0.000 0.020 0.128
#> SRR772437 5 0.7290 0.5396 0.304 0.032 0.196 0.004 0.424 0.040
#> SRR772438 1 0.4603 0.4061 0.744 0.012 0.012 0.000 0.128 0.104
#> SRR772439 1 0.4391 0.3798 0.764 0.004 0.028 0.000 0.128 0.076
#> SRR772440 2 0.3010 0.6437 0.032 0.848 0.000 0.004 0.004 0.112
#> SRR772441 2 0.2765 0.6535 0.024 0.864 0.000 0.004 0.004 0.104
#> SRR772442 4 0.5162 0.6744 0.000 0.336 0.000 0.580 0.012 0.072
#> SRR772443 4 0.5343 0.6005 0.000 0.372 0.000 0.536 0.012 0.080
#> SRR772444 1 0.2595 0.5973 0.896 0.048 0.012 0.000 0.020 0.024
#> SRR772445 1 0.2630 0.6210 0.888 0.064 0.004 0.000 0.024 0.020
#> SRR772446 1 0.4023 0.5913 0.780 0.124 0.000 0.000 0.016 0.080
#> SRR772447 1 0.4121 0.5836 0.768 0.128 0.000 0.000 0.012 0.092
#> SRR772448 2 0.2697 0.6650 0.020 0.876 0.000 0.012 0.004 0.088
#> SRR772449 2 0.3151 0.6237 0.028 0.832 0.000 0.004 0.004 0.132
#> SRR772450 4 0.2592 0.8198 0.000 0.116 0.000 0.864 0.004 0.016
#> SRR772451 4 0.2592 0.8198 0.000 0.116 0.000 0.864 0.004 0.016
#> SRR772452 1 0.3227 0.6146 0.856 0.056 0.004 0.000 0.028 0.056
#> SRR772453 1 0.3920 0.6297 0.808 0.076 0.004 0.000 0.032 0.080
#> SRR772454 1 0.5030 0.4861 0.696 0.156 0.004 0.000 0.020 0.124
#> SRR772455 1 0.6122 -0.3560 0.424 0.360 0.000 0.000 0.008 0.208
#> SRR772456 4 0.2588 0.8232 0.000 0.124 0.000 0.860 0.004 0.012
#> SRR772457 4 0.2588 0.8232 0.000 0.124 0.000 0.860 0.004 0.012
#> SRR772458 1 0.2726 0.6156 0.884 0.052 0.004 0.000 0.016 0.044
#> SRR772459 1 0.2854 0.6201 0.876 0.056 0.004 0.000 0.016 0.048
#> SRR772460 4 0.2639 0.7370 0.000 0.048 0.000 0.880 0.008 0.064
#> SRR772461 4 0.2639 0.7370 0.000 0.048 0.000 0.880 0.008 0.064
#> SRR772462 2 0.2489 0.6420 0.000 0.860 0.000 0.128 0.000 0.012
#> SRR772463 2 0.2452 0.6773 0.000 0.884 0.000 0.084 0.004 0.028
#> SRR772464 3 0.1237 0.7390 0.020 0.000 0.956 0.000 0.020 0.004
#> SRR772465 2 0.5165 0.1120 0.172 0.652 0.000 0.004 0.004 0.168
#> SRR772466 2 0.5073 0.1685 0.160 0.664 0.000 0.004 0.004 0.168
#> SRR772467 4 0.3879 0.7600 0.000 0.292 0.000 0.688 0.000 0.020
#> SRR772468 4 0.3879 0.7600 0.000 0.292 0.000 0.688 0.000 0.020
#> SRR772469 1 0.5355 0.4568 0.656 0.164 0.000 0.000 0.028 0.152
#> SRR772470 1 0.5460 0.4777 0.656 0.152 0.004 0.000 0.028 0.160
#> SRR772471 1 0.4974 0.4622 0.672 0.172 0.000 0.000 0.008 0.148
#> SRR772472 1 0.4666 0.5114 0.708 0.156 0.000 0.000 0.008 0.128
#> SRR772473 4 0.5316 0.6999 0.000 0.316 0.000 0.580 0.012 0.092
#> SRR772474 4 0.5245 0.6966 0.000 0.320 0.000 0.584 0.012 0.084
#> SRR772475 2 0.3329 0.6633 0.020 0.852 0.000 0.016 0.036 0.076
#> SRR772476 4 0.2592 0.8198 0.000 0.116 0.000 0.864 0.004 0.016
#> SRR772477 4 0.2592 0.8198 0.000 0.116 0.000 0.864 0.004 0.016
#> SRR772478 1 0.3706 0.6276 0.824 0.068 0.004 0.000 0.032 0.072
#> SRR772479 1 0.3832 0.6273 0.820 0.068 0.008 0.000 0.036 0.068
#> SRR772480 2 0.5838 0.0260 0.004 0.548 0.000 0.288 0.012 0.148
#> SRR772481 2 0.5739 0.0282 0.004 0.552 0.000 0.304 0.012 0.128
#> SRR772482 1 0.5150 0.5442 0.700 0.136 0.000 0.000 0.056 0.108
#> SRR772483 1 0.5180 0.5365 0.696 0.144 0.000 0.000 0.056 0.104
#> SRR772484 2 0.3067 0.6330 0.024 0.852 0.000 0.004 0.016 0.104
#> SRR772485 2 0.3067 0.6330 0.024 0.852 0.000 0.004 0.016 0.104
#> SRR772486 1 0.4587 0.4915 0.768 0.036 0.016 0.000 0.088 0.092
#> SRR772487 1 0.4682 0.4772 0.760 0.036 0.016 0.000 0.096 0.092
#> SRR772488 2 0.3537 0.6017 0.040 0.824 0.000 0.004 0.020 0.112
#> SRR772489 2 0.3648 0.5910 0.044 0.816 0.000 0.004 0.020 0.116
#> SRR772490 1 0.3556 0.6118 0.816 0.104 0.000 0.000 0.012 0.068
#> SRR772491 1 0.2613 0.6126 0.892 0.056 0.008 0.000 0.016 0.028
#> SRR772492 4 0.2639 0.7370 0.000 0.048 0.000 0.880 0.008 0.064
#> SRR772493 4 0.2639 0.7370 0.000 0.048 0.000 0.880 0.008 0.064
#> SRR772494 4 0.2592 0.8198 0.000 0.116 0.000 0.864 0.004 0.016
#> SRR772495 4 0.2592 0.8198 0.000 0.116 0.000 0.864 0.004 0.016
#> SRR772496 2 0.2190 0.6894 0.008 0.908 0.000 0.040 0.000 0.044
#> SRR772497 2 0.2190 0.6894 0.008 0.908 0.000 0.040 0.000 0.044
#> SRR772498 2 0.2730 0.6636 0.012 0.876 0.000 0.012 0.012 0.088
#> SRR772499 2 0.2680 0.6594 0.012 0.876 0.000 0.008 0.012 0.092
#> SRR772500 2 0.3062 0.5985 0.000 0.816 0.000 0.160 0.000 0.024
#> SRR772501 2 0.3062 0.6018 0.000 0.816 0.000 0.160 0.000 0.024
#> SRR772502 1 0.6156 -0.4677 0.388 0.360 0.000 0.000 0.004 0.248
#> SRR772503 1 0.6162 -0.4493 0.392 0.352 0.000 0.000 0.004 0.252
#> SRR772504 2 0.2250 0.6576 0.000 0.888 0.000 0.092 0.000 0.020
#> SRR772505 2 0.2250 0.6576 0.000 0.888 0.000 0.092 0.000 0.020
#> SRR772506 4 0.4322 0.3983 0.000 0.452 0.000 0.528 0.000 0.020
#> SRR772507 4 0.4322 0.3983 0.000 0.452 0.000 0.528 0.000 0.020
#> SRR772508 2 0.3264 0.5771 0.000 0.796 0.000 0.184 0.008 0.012
#> SRR772509 1 0.6850 -0.1090 0.412 0.124 0.000 0.000 0.360 0.104
#> SRR772510 3 0.3983 0.7142 0.020 0.000 0.784 0.008 0.152 0.036
#> SRR772511 2 0.5726 -0.2047 0.224 0.580 0.000 0.016 0.000 0.180
#> SRR772512 5 0.6265 0.4987 0.368 0.044 0.016 0.000 0.492 0.080
#> SRR772513 2 0.2057 0.6815 0.016 0.920 0.000 0.016 0.004 0.044
#> SRR772514 2 0.1862 0.6817 0.008 0.928 0.000 0.016 0.004 0.044
#> SRR772515 2 0.1982 0.6830 0.004 0.912 0.000 0.068 0.000 0.016
#> SRR772516 2 0.2287 0.6903 0.012 0.904 0.000 0.048 0.000 0.036
#> SRR772517 2 0.2127 0.6852 0.016 0.920 0.000 0.024 0.008 0.032
#> SRR772518 2 0.1823 0.6858 0.008 0.932 0.000 0.028 0.004 0.028
#> SRR772519 2 0.1461 0.6832 0.000 0.940 0.000 0.044 0.000 0.016
#> SRR772520 2 0.1461 0.6832 0.000 0.940 0.000 0.044 0.000 0.016
#> SRR772521 2 0.6365 -0.6575 0.324 0.408 0.000 0.008 0.004 0.256
#> SRR772522 2 0.6375 -0.6601 0.324 0.404 0.000 0.008 0.004 0.260
#> SRR772523 2 0.2704 0.6243 0.000 0.844 0.000 0.140 0.000 0.016
#> SRR772524 2 0.2581 0.6360 0.000 0.856 0.000 0.128 0.000 0.016
#> SRR772525 3 0.2600 0.7073 0.000 0.000 0.876 0.004 0.036 0.084
#> SRR772526 4 0.3879 0.7600 0.000 0.292 0.000 0.688 0.000 0.020
#> SRR772527 4 0.3879 0.7600 0.000 0.292 0.000 0.688 0.000 0.020
#> SRR772528 3 0.6097 -0.5793 0.284 0.000 0.372 0.000 0.344 0.000
#> SRR772529 1 0.4944 0.5288 0.700 0.140 0.000 0.000 0.024 0.136
#> SRR772530 1 0.5041 0.4849 0.672 0.156 0.000 0.000 0.012 0.160
#> SRR772531 3 0.1700 0.7235 0.000 0.000 0.928 0.000 0.024 0.048
#> SRR772532 2 0.2039 0.6682 0.000 0.904 0.000 0.076 0.000 0.020
#> SRR772533 2 0.2006 0.6650 0.000 0.904 0.000 0.080 0.000 0.016
#> SRR772534 1 0.6187 -0.3960 0.412 0.352 0.000 0.000 0.008 0.228
#> SRR772535 2 0.2393 0.6627 0.004 0.884 0.000 0.092 0.000 0.020
#> SRR772536 2 0.2258 0.6847 0.000 0.896 0.000 0.044 0.000 0.060
#> SRR772537 4 0.3037 0.8318 0.000 0.176 0.000 0.808 0.000 0.016
#> SRR772538 4 0.3189 0.8301 0.000 0.184 0.000 0.796 0.000 0.020
#> SRR772539 1 0.4618 0.5365 0.728 0.148 0.000 0.000 0.020 0.104
#> SRR772540 1 0.5489 0.4025 0.632 0.188 0.000 0.000 0.024 0.156
#> SRR772541 2 0.3226 0.6172 0.028 0.836 0.000 0.000 0.020 0.116
#> SRR772542 1 0.3976 0.5012 0.804 0.024 0.008 0.000 0.092 0.072
#> SRR772543 1 0.4169 0.4607 0.784 0.020 0.008 0.000 0.116 0.072
#> SRR772544 3 0.4137 0.7083 0.036 0.000 0.780 0.008 0.144 0.032
#> SRR772545 1 0.4021 0.6165 0.800 0.076 0.004 0.000 0.032 0.088
#> SRR772546 1 0.4021 0.6165 0.800 0.076 0.004 0.000 0.032 0.088
#> SRR772547 1 0.6183 -0.4068 0.396 0.332 0.000 0.000 0.004 0.268
#> SRR772548 1 0.6155 -0.2542 0.448 0.304 0.000 0.000 0.008 0.240
#> SRR772549 1 0.3744 0.5817 0.832 0.040 0.016 0.000 0.056 0.056
#> SRR772550 1 0.3593 0.5639 0.840 0.036 0.016 0.000 0.068 0.040
#> SRR772551 2 0.3595 0.5963 0.064 0.820 0.000 0.012 0.004 0.100
#> SRR772552 2 0.3743 0.5661 0.072 0.804 0.000 0.004 0.008 0.112
#> SRR772553 2 0.3485 0.6565 0.020 0.840 0.000 0.016 0.036 0.088
#> SRR772554 2 0.1889 0.6792 0.004 0.920 0.000 0.056 0.000 0.020
#> SRR772555 2 0.1829 0.6782 0.000 0.920 0.000 0.056 0.000 0.024
#> SRR772556 1 0.3429 0.6061 0.848 0.048 0.008 0.000 0.056 0.040
#> SRR772557 1 0.3161 0.6318 0.852 0.060 0.000 0.000 0.020 0.068
#> SRR772558 1 0.5688 0.0315 0.524 0.264 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR772559 1 0.5438 0.3010 0.596 0.200 0.000 0.000 0.004 0.200
#> SRR772560 2 0.5497 -0.1770 0.224 0.596 0.000 0.000 0.008 0.172
#> SRR772561 5 0.6265 0.4987 0.368 0.044 0.016 0.000 0.492 0.080
#> SRR772562 2 0.2065 0.6860 0.004 0.912 0.000 0.032 0.000 0.052
#> SRR772563 2 0.1909 0.6858 0.004 0.920 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR772564 1 0.2568 0.4631 0.876 0.000 0.016 0.000 0.096 0.012
#> SRR772565 1 0.2568 0.4631 0.876 0.000 0.016 0.000 0.096 0.012
#> SRR772566 1 0.4111 0.2391 0.764 0.000 0.096 0.000 0.132 0.008
#> SRR772567 1 0.4111 0.2391 0.764 0.000 0.096 0.000 0.132 0.008
#> SRR772568 2 0.3067 0.6821 0.024 0.864 0.000 0.040 0.004 0.068
#> SRR772569 2 0.3009 0.6831 0.024 0.868 0.000 0.040 0.004 0.064
#> SRR772570 1 0.4927 0.4997 0.692 0.148 0.000 0.000 0.016 0.144
#> SRR772571 1 0.5494 0.3432 0.616 0.208 0.000 0.000 0.016 0.160
#> SRR772572 1 0.6252 -0.4074 0.412 0.336 0.000 0.004 0.004 0.244
#> SRR772573 1 0.6149 -0.4356 0.400 0.348 0.000 0.004 0.000 0.248
#> SRR772574 1 0.5679 0.1374 0.556 0.268 0.000 0.000 0.008 0.168
#> SRR772575 1 0.5804 -0.1647 0.492 0.332 0.000 0.000 0.004 0.172
#> SRR772576 2 0.2604 0.6523 0.028 0.872 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR772577 2 0.2520 0.6704 0.024 0.888 0.000 0.008 0.004 0.076
#> SRR772578 4 0.3652 0.7953 0.000 0.264 0.000 0.720 0.000 0.016
#> SRR772579 4 0.3855 0.7856 0.000 0.272 0.000 0.704 0.000 0.024
#> SRR772580 3 0.1630 0.7341 0.020 0.000 0.940 0.000 0.016 0.024
#> SRR772581 2 0.4565 0.5256 0.040 0.756 0.000 0.040 0.016 0.148
#> SRR772582 2 0.4461 0.5393 0.036 0.764 0.000 0.040 0.016 0.144
#> SRR772583 2 0.4077 0.5291 0.080 0.788 0.000 0.004 0.020 0.108
#> SRR772584 2 0.3918 0.5431 0.068 0.800 0.000 0.004 0.020 0.108
#> SRR772585 2 0.2880 0.6333 0.024 0.856 0.000 0.000 0.012 0.108
#> SRR772586 5 0.6093 0.6048 0.296 0.000 0.316 0.000 0.388 0.000
#> SRR772587 1 0.6705 -0.2095 0.444 0.260 0.004 0.000 0.036 0.256
#> SRR772588 2 0.3231 0.5524 0.000 0.784 0.000 0.200 0.000 0.016
#> SRR772589 2 0.3231 0.5524 0.000 0.784 0.000 0.200 0.000 0.016
#> SRR772590 5 0.7223 0.4367 0.276 0.024 0.304 0.000 0.360 0.036
#> SRR772591 1 0.3703 0.3114 0.796 0.000 0.064 0.000 0.132 0.008
#> SRR772592 1 0.3758 0.3005 0.792 0.000 0.068 0.000 0.132 0.008
#> SRR772593 5 0.6103 0.6051 0.300 0.000 0.320 0.000 0.380 0.000
#> SRR772594 4 0.3619 0.8112 0.000 0.232 0.000 0.744 0.000 0.024
#> SRR772595 4 0.3670 0.8070 0.000 0.240 0.000 0.736 0.000 0.024
#> SRR772596 3 0.6097 -0.5793 0.284 0.000 0.372 0.000 0.344 0.000
#> SRR772597 3 0.1353 0.7349 0.024 0.000 0.952 0.000 0.012 0.012
#> SRR772598 1 0.3521 0.4284 0.808 0.016 0.012 0.000 0.152 0.012
#> SRR772599 1 0.3078 0.4968 0.848 0.016 0.004 0.000 0.112 0.020
#> SRR772600 4 0.4976 0.7774 0.000 0.248 0.000 0.652 0.012 0.088
#> SRR772601 4 0.4862 0.7837 0.000 0.244 0.000 0.664 0.012 0.080
#> SRR772602 3 0.3529 0.6988 0.048 0.000 0.816 0.000 0.120 0.016
#> SRR772603 4 0.5569 0.6050 0.000 0.368 0.000 0.516 0.012 0.104
#> SRR772604 4 0.5434 0.6779 0.000 0.328 0.000 0.560 0.012 0.100
#> SRR772605 2 0.3645 0.5877 0.056 0.804 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR772606 1 0.3311 0.5255 0.836 0.032 0.004 0.000 0.112 0.016
#> SRR772607 1 0.3304 0.5491 0.848 0.032 0.008 0.000 0.088 0.024
#> SRR772608 2 0.2513 0.6739 0.020 0.896 0.000 0.016 0.008 0.060
#> SRR772609 2 0.2252 0.6823 0.016 0.908 0.000 0.016 0.004 0.056
#> SRR772610 2 0.1838 0.6793 0.000 0.916 0.000 0.068 0.000 0.016
#> SRR772611 2 0.1713 0.6852 0.000 0.928 0.000 0.044 0.000 0.028
#> SRR772612 4 0.4034 0.8178 0.000 0.168 0.000 0.760 0.008 0.064
#> SRR772613 4 0.3816 0.8165 0.000 0.156 0.000 0.780 0.008 0.056
#> SRR772614 1 0.3292 0.5497 0.852 0.020 0.008 0.000 0.068 0.052
#> SRR772615 1 0.2981 0.6055 0.872 0.052 0.004 0.000 0.040 0.032
#> SRR772616 1 0.6547 -0.2819 0.424 0.284 0.000 0.000 0.028 0.264
#> SRR772617 4 0.3376 0.8193 0.000 0.128 0.000 0.816 0.004 0.052
#> SRR772618 4 0.3511 0.8277 0.000 0.148 0.000 0.800 0.004 0.048
#> SRR772619 4 0.2639 0.7370 0.000 0.048 0.000 0.880 0.008 0.064
#> SRR772620 4 0.2639 0.7370 0.000 0.048 0.000 0.880 0.008 0.064
#> SRR772621 2 0.3956 0.5346 0.096 0.788 0.000 0.008 0.004 0.104
#> SRR772622 2 0.4157 0.5805 0.080 0.784 0.000 0.024 0.004 0.108
#> SRR772623 3 0.4540 0.6325 0.000 0.000 0.724 0.024 0.064 0.188
#> SRR772624 5 0.6112 0.5961 0.300 0.000 0.332 0.000 0.368 0.000
#> SRR772625 2 0.3889 0.6405 0.016 0.816 0.000 0.088 0.024 0.056
#> SRR772626 2 0.2730 0.6562 0.012 0.872 0.000 0.008 0.012 0.096
#> SRR772627 2 0.2779 0.6530 0.012 0.868 0.000 0.008 0.012 0.100
#> SRR772628 1 0.4588 0.5867 0.748 0.092 0.004 0.000 0.028 0.128
#> SRR772629 1 0.3333 0.6128 0.848 0.048 0.004 0.000 0.028 0.072
#> SRR772630 2 0.6121 -0.5942 0.332 0.420 0.000 0.000 0.004 0.244
#> SRR772631 5 0.6234 0.5934 0.296 0.004 0.340 0.000 0.360 0.000
#> SRR772632 2 0.4141 0.1289 0.000 0.596 0.000 0.388 0.000 0.016
#> SRR772633 2 0.4237 0.0975 0.000 0.584 0.000 0.396 0.000 0.020
#> SRR772634 2 0.4525 0.3598 0.128 0.716 0.000 0.000 0.004 0.152
#> SRR772635 2 0.4525 0.3609 0.128 0.716 0.000 0.000 0.004 0.152
#> SRR772636 2 0.3146 0.6692 0.020 0.864 0.000 0.016 0.032 0.068
#> SRR772637 1 0.3287 0.5738 0.860 0.036 0.016 0.000 0.052 0.036
#> SRR772638 1 0.3223 0.5728 0.864 0.036 0.016 0.000 0.048 0.036
#> SRR772639 2 0.2375 0.6850 0.020 0.896 0.000 0.068 0.000 0.016
#> SRR772640 4 0.2547 0.8176 0.000 0.112 0.000 0.868 0.004 0.016
#> SRR772641 4 0.2547 0.8176 0.000 0.112 0.000 0.868 0.004 0.016
#> SRR772642 2 0.3785 0.5180 0.120 0.788 0.000 0.000 0.004 0.088
#> SRR772643 2 0.3927 0.5193 0.100 0.776 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR772644 1 0.5427 0.3829 0.620 0.188 0.000 0.000 0.012 0.180
#> SRR772645 1 0.5362 0.2540 0.588 0.228 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR772646 2 0.1951 0.6677 0.000 0.908 0.000 0.076 0.000 0.016
#> SRR772647 2 0.1951 0.6677 0.000 0.908 0.000 0.076 0.000 0.016
#> SRR772648 2 0.3897 0.6066 0.064 0.804 0.000 0.024 0.004 0.104
#> SRR772649 2 0.4042 0.5907 0.068 0.792 0.000 0.024 0.004 0.112
#> SRR772650 1 0.5891 -0.1268 0.500 0.332 0.000 0.000 0.012 0.156
#> SRR772651 1 0.5900 -0.1461 0.496 0.336 0.000 0.000 0.012 0.156
#> SRR772652 1 0.3490 0.6270 0.828 0.068 0.000 0.000 0.020 0.084
#> SRR772653 1 0.3490 0.6270 0.828 0.068 0.000 0.000 0.020 0.084
#> SRR772654 2 0.5046 0.2203 0.168 0.676 0.000 0.004 0.008 0.144
#> SRR772655 2 0.4738 0.3434 0.144 0.712 0.000 0.004 0.008 0.132
#> SRR772656 3 0.5115 0.6080 0.000 0.000 0.584 0.012 0.336 0.068
#> SRR772657 5 0.6930 0.5855 0.320 0.032 0.124 0.000 0.472 0.052
#> SRR772658 4 0.2860 0.7403 0.000 0.052 0.000 0.868 0.012 0.068
#> SRR772659 4 0.2860 0.7403 0.000 0.052 0.000 0.868 0.012 0.068
#> SRR772660 2 0.2964 0.6734 0.024 0.856 0.000 0.020 0.000 0.100
#> SRR772661 1 0.6265 -0.2337 0.464 0.060 0.004 0.000 0.388 0.084
#> SRR772662 2 0.6085 -0.5369 0.372 0.448 0.000 0.000 0.016 0.164
#> SRR772663 2 0.5996 -0.4772 0.344 0.484 0.000 0.000 0.016 0.156
#> SRR772664 2 0.3791 0.5814 0.072 0.800 0.000 0.016 0.000 0.112
#> SRR772665 2 0.3844 0.5750 0.076 0.796 0.000 0.016 0.000 0.112
#> SRR772666 3 0.2841 0.7238 0.032 0.000 0.864 0.000 0.092 0.012
#> SRR772667 4 0.3653 0.8006 0.000 0.228 0.000 0.748 0.004 0.020
#> SRR772668 4 0.3161 0.6948 0.000 0.040 0.000 0.848 0.020 0.092
#> SRR772669 4 0.2774 0.7153 0.000 0.040 0.000 0.872 0.012 0.076
#> SRR772670 2 0.5919 -0.4097 0.296 0.516 0.000 0.000 0.012 0.176
#> SRR772671 2 0.5724 -0.3305 0.260 0.552 0.000 0.000 0.008 0.180
#> SRR772672 2 0.1297 0.6844 0.000 0.948 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR772673 2 0.1434 0.6838 0.000 0.940 0.000 0.048 0.000 0.012
#> SRR772674 3 0.5178 0.6363 0.020 0.000 0.644 0.008 0.264 0.064
#> SRR772675 1 0.6850 -0.1090 0.412 0.124 0.000 0.000 0.360 0.104
#> SRR772676 1 0.6166 -0.4957 0.396 0.344 0.000 0.004 0.000 0.256
#> SRR772677 1 0.6141 -0.4850 0.400 0.352 0.000 0.004 0.000 0.244
#> SRR772678 1 0.6949 -0.1204 0.412 0.120 0.004 0.000 0.360 0.104
#> SRR772679 1 0.5795 -0.1429 0.512 0.352 0.000 0.000 0.020 0.116
#> SRR772680 1 0.5695 -0.0433 0.536 0.328 0.000 0.000 0.016 0.120
#> SRR772681 3 0.5149 0.6343 0.016 0.000 0.644 0.008 0.264 0.068
#> SRR772682 2 0.1851 0.6880 0.012 0.928 0.000 0.036 0.000 0.024
#> SRR772683 2 0.1552 0.6847 0.004 0.940 0.000 0.036 0.000 0.020
#> SRR772685 2 0.2719 0.6554 0.040 0.876 0.000 0.012 0.000 0.072
#> SRR772686 3 0.2611 0.7295 0.028 0.000 0.880 0.000 0.080 0.012
#> SRR772687 3 0.5258 0.6131 0.012 0.000 0.684 0.020 0.120 0.164
#> SRR772688 4 0.3014 0.8317 0.000 0.184 0.000 0.804 0.000 0.012
#> SRR772689 4 0.3014 0.8317 0.000 0.184 0.000 0.804 0.000 0.012
#> SRR772690 3 0.3150 0.7173 0.036 0.000 0.844 0.000 0.104 0.016
#> SRR772691 2 0.3146 0.6692 0.020 0.864 0.000 0.016 0.032 0.068
#> SRR772692 2 0.4490 0.3750 0.128 0.720 0.000 0.000 0.004 0.148
#> SRR772693 2 0.3672 0.5577 0.064 0.792 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR772694 2 0.2170 0.6801 0.016 0.908 0.000 0.016 0.000 0.060
#> SRR772695 2 0.2285 0.6743 0.028 0.900 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR772696 2 0.3103 0.6567 0.036 0.848 0.000 0.016 0.000 0.100
#> SRR772697 2 0.2973 0.6531 0.040 0.860 0.000 0.016 0.000 0.084
#> SRR772698 5 0.6108 0.5776 0.292 0.000 0.344 0.000 0.364 0.000
#> SRR772699 1 0.4854 0.5654 0.724 0.128 0.000 0.000 0.044 0.104
#> SRR772700 1 0.4699 0.5457 0.728 0.140 0.000 0.000 0.028 0.104
#> SRR772701 1 0.3442 0.6267 0.836 0.076 0.004 0.000 0.016 0.068
#> SRR772702 1 0.3275 0.6302 0.848 0.068 0.004 0.000 0.016 0.064
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.936 0.933 0.972 0.4954 0.502 0.502
#> 3 3 0.582 0.765 0.870 0.2162 0.762 0.586
#> 4 4 0.828 0.846 0.917 0.1504 0.758 0.489
#> 5 5 0.694 0.706 0.832 0.0851 0.879 0.626
#> 6 6 0.700 0.672 0.811 0.0567 0.914 0.680
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.6531 0.795 0.832 0.168
#> SRR772347 1 0.8327 0.660 0.736 0.264
#> SRR772348 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772353 1 0.9775 0.350 0.588 0.412
#> SRR772354 2 0.9833 0.213 0.424 0.576
#> SRR772355 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772357 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772359 1 0.1184 0.942 0.984 0.016
#> SRR772360 1 0.0672 0.948 0.992 0.008
#> SRR772361 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.4298 0.881 0.912 0.088
#> SRR772365 1 0.9922 0.244 0.552 0.448
#> SRR772366 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772370 2 0.0672 0.979 0.008 0.992
#> SRR772371 1 0.9850 0.306 0.572 0.428
#> SRR772372 1 0.9661 0.402 0.608 0.392
#> SRR772373 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772378 2 0.5059 0.862 0.112 0.888
#> SRR772379 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772380 2 0.1414 0.968 0.020 0.980
#> SRR772381 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772384 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772385 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772386 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772393 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772394 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772395 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772402 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772411 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772412 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772417 1 0.9896 0.271 0.560 0.440
#> SRR772418 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.1633 0.964 0.024 0.976
#> SRR772422 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772423 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772430 2 0.9944 0.107 0.456 0.544
#> SRR772431 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.1414 0.939 0.980 0.020
#> SRR772436 1 0.5178 0.853 0.884 0.116
#> SRR772437 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772440 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772448 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772449 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772454 1 0.1414 0.939 0.980 0.020
#> SRR772455 1 0.8955 0.576 0.688 0.312
#> SRR772456 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.1843 0.959 0.028 0.972
#> SRR772466 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772470 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772471 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772472 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772473 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772480 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772481 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772482 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772484 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772485 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772486 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.0376 0.983 0.004 0.996
#> SRR772489 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772490 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772498 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772499 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.1184 0.942 0.984 0.016
#> SRR772503 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772504 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.6623 0.786 0.828 0.172
#> SRR772510 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772512 1 0.8555 0.627 0.720 0.280
#> SRR772513 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.9850 0.200 0.428 0.572
#> SRR772522 2 0.9580 0.346 0.380 0.620
#> SRR772523 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.1633 0.936 0.976 0.024
#> SRR772535 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772541 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772547 1 0.3879 0.892 0.924 0.076
#> SRR772548 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772551 2 0.0376 0.983 0.004 0.996
#> SRR772552 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772553 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772554 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772559 1 0.2236 0.926 0.964 0.036
#> SRR772560 2 0.7815 0.682 0.232 0.768
#> SRR772561 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0376 0.951 0.996 0.004
#> SRR772572 1 0.9850 0.304 0.572 0.428
#> SRR772573 1 0.9922 0.245 0.552 0.448
#> SRR772574 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0376 0.951 0.996 0.004
#> SRR772576 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772577 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772578 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772582 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772583 2 0.0672 0.979 0.008 0.992
#> SRR772584 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772585 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772588 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772600 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772606 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.6801 0.776 0.820 0.180
#> SRR772617 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772622 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772623 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772627 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772628 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772630 1 0.9909 0.258 0.556 0.444
#> SRR772631 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.4161 0.884 0.916 0.084
#> SRR772635 1 0.4161 0.886 0.916 0.084
#> SRR772636 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772643 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772644 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772650 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772654 2 0.0376 0.983 0.004 0.996
#> SRR772655 2 0.4815 0.873 0.104 0.896
#> SRR772656 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772662 1 0.8499 0.634 0.724 0.276
#> SRR772663 1 0.9661 0.393 0.608 0.392
#> SRR772664 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772670 1 0.9881 0.282 0.564 0.436
#> SRR772671 2 0.4815 0.873 0.104 0.896
#> SRR772672 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772676 1 0.9552 0.438 0.624 0.376
#> SRR772677 1 0.9754 0.359 0.592 0.408
#> SRR772678 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772679 1 0.7219 0.754 0.800 0.200
#> SRR772680 1 0.0938 0.945 0.988 0.012
#> SRR772681 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772692 2 0.3584 0.916 0.068 0.932
#> SRR772693 2 0.1184 0.972 0.016 0.984
#> SRR772694 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772696 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772697 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.953 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.4931 0.7236 0.768 0.000 0.232
#> SRR772342 1 0.4399 0.7486 0.812 0.000 0.188
#> SRR772343 1 0.0237 0.7901 0.996 0.000 0.004
#> SRR772344 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772347 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772348 2 0.4654 0.8324 0.208 0.792 0.000
#> SRR772349 2 0.3038 0.8534 0.104 0.896 0.000
#> SRR772350 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772351 2 0.3038 0.8531 0.104 0.896 0.000
#> SRR772352 2 0.4796 0.8275 0.220 0.780 0.000
#> SRR772353 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772354 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.4931 0.8225 0.232 0.768 0.000
#> SRR772356 2 0.3038 0.8531 0.104 0.896 0.000
#> SRR772357 1 0.2625 0.7855 0.916 0.000 0.084
#> SRR772358 1 0.1643 0.7913 0.956 0.000 0.044
#> SRR772359 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772360 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.1031 0.7915 0.976 0.000 0.024
#> SRR772365 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772366 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 2 0.5621 0.7556 0.308 0.692 0.000
#> SRR772369 1 0.1860 0.7539 0.948 0.052 0.000
#> SRR772370 1 0.0237 0.7876 0.996 0.004 0.000
#> SRR772371 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772372 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772373 2 0.5254 0.8018 0.264 0.736 0.000
#> SRR772374 2 0.5216 0.8051 0.260 0.740 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 2 0.3116 0.8531 0.108 0.892 0.000
#> SRR772377 1 0.3879 0.7461 0.848 0.000 0.152
#> SRR772378 1 0.0237 0.7879 0.996 0.004 0.000
#> SRR772379 1 0.5882 0.1934 0.652 0.348 0.000
#> SRR772380 1 0.5138 0.4637 0.748 0.252 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 1 0.4796 0.7314 0.780 0.000 0.220
#> SRR772383 1 0.4504 0.7446 0.804 0.000 0.196
#> SRR772384 1 0.5678 0.6388 0.684 0.000 0.316
#> SRR772385 2 0.4062 0.8452 0.164 0.836 0.000
#> SRR772386 2 0.5138 0.8111 0.252 0.748 0.000
#> SRR772387 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772388 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772389 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772390 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772391 1 0.4974 0.7206 0.764 0.000 0.236
#> SRR772392 1 0.4887 0.7264 0.772 0.000 0.228
#> SRR772393 2 0.5465 0.7792 0.288 0.712 0.000
#> SRR772394 1 0.6309 -0.3599 0.504 0.496 0.000
#> SRR772395 2 0.2625 0.8546 0.084 0.916 0.000
#> SRR772396 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772397 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772398 1 0.4974 0.7204 0.764 0.000 0.236
#> SRR772399 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772400 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772401 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772402 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772404 2 0.4931 0.8226 0.232 0.768 0.000
#> SRR772405 1 0.5733 0.6277 0.676 0.000 0.324
#> SRR772406 2 0.5138 0.8112 0.252 0.748 0.000
#> SRR772407 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 1 0.6079 0.0616 0.612 0.388 0.000
#> SRR772411 1 0.1860 0.7560 0.948 0.052 0.000
#> SRR772412 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772413 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772414 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.6235 -0.1570 0.564 0.436 0.000
#> SRR772416 2 0.6045 0.6471 0.380 0.620 0.000
#> SRR772417 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772418 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772421 1 0.1643 0.7602 0.956 0.044 0.000
#> SRR772422 1 0.5968 0.1371 0.636 0.364 0.000
#> SRR772423 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772425 2 0.4974 0.8206 0.236 0.764 0.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772428 1 0.5138 0.7061 0.748 0.000 0.252
#> SRR772429 1 0.5138 0.7061 0.748 0.000 0.252
#> SRR772430 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772431 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772433 1 0.5650 0.6364 0.688 0.000 0.312
#> SRR772434 1 0.5327 0.6875 0.728 0.000 0.272
#> SRR772435 1 0.0237 0.7902 0.996 0.000 0.004
#> SRR772436 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772438 1 0.5397 0.6764 0.720 0.000 0.280
#> SRR772439 1 0.5138 0.7061 0.748 0.000 0.252
#> SRR772440 2 0.6295 0.4436 0.472 0.528 0.000
#> SRR772441 2 0.5621 0.7564 0.308 0.692 0.000
#> SRR772442 2 0.1529 0.8538 0.040 0.960 0.000
#> SRR772443 2 0.1643 0.8541 0.044 0.956 0.000
#> SRR772444 1 0.5138 0.7061 0.748 0.000 0.252
#> SRR772445 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772446 1 0.1964 0.7901 0.944 0.000 0.056
#> SRR772447 1 0.1411 0.7915 0.964 0.000 0.036
#> SRR772448 2 0.6168 0.5849 0.412 0.588 0.000
#> SRR772449 2 0.6204 0.5610 0.424 0.576 0.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.5016 0.7173 0.760 0.000 0.240
#> SRR772453 1 0.4842 0.7287 0.776 0.000 0.224
#> SRR772454 1 0.0592 0.7911 0.988 0.000 0.012
#> SRR772455 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772459 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772460 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.0592 0.8521 0.012 0.988 0.000
#> SRR772463 2 0.2959 0.8533 0.100 0.900 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.3551 0.6778 0.868 0.132 0.000
#> SRR772466 1 0.1031 0.7766 0.976 0.024 0.000
#> SRR772467 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.2165 0.7894 0.936 0.000 0.064
#> SRR772470 1 0.3941 0.7622 0.844 0.000 0.156
#> SRR772471 1 0.2356 0.7877 0.928 0.000 0.072
#> SRR772472 1 0.1163 0.7920 0.972 0.000 0.028
#> SRR772473 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772475 2 0.5431 0.7841 0.284 0.716 0.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.4974 0.7206 0.764 0.000 0.236
#> SRR772479 1 0.5016 0.7173 0.760 0.000 0.240
#> SRR772480 2 0.4974 0.8207 0.236 0.764 0.000
#> SRR772481 2 0.5016 0.8187 0.240 0.760 0.000
#> SRR772482 1 0.3686 0.7682 0.860 0.000 0.140
#> SRR772483 1 0.3038 0.7795 0.896 0.000 0.104
#> SRR772484 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772485 2 0.5706 0.7411 0.320 0.680 0.000
#> SRR772486 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772487 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772488 1 0.6079 0.0437 0.612 0.388 0.000
#> SRR772489 1 0.6204 -0.1084 0.576 0.424 0.000
#> SRR772490 1 0.4750 0.7339 0.784 0.000 0.216
#> SRR772491 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772492 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772497 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772498 2 0.5397 0.7871 0.280 0.720 0.000
#> SRR772499 2 0.5254 0.8023 0.264 0.736 0.000
#> SRR772500 2 0.0237 0.8515 0.004 0.996 0.000
#> SRR772501 2 0.0237 0.8515 0.004 0.996 0.000
#> SRR772502 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772503 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.0424 0.8518 0.008 0.992 0.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772509 1 0.0237 0.7876 0.996 0.004 0.000
#> SRR772510 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 1 0.4842 0.5336 0.776 0.224 0.000
#> SRR772512 1 0.4277 0.6747 0.852 0.132 0.016
#> SRR772513 2 0.5216 0.8054 0.260 0.740 0.000
#> SRR772514 2 0.5058 0.8169 0.244 0.756 0.000
#> SRR772515 2 0.5016 0.8187 0.240 0.760 0.000
#> SRR772516 2 0.5058 0.8164 0.244 0.756 0.000
#> SRR772517 2 0.4062 0.8456 0.164 0.836 0.000
#> SRR772518 2 0.5216 0.8050 0.260 0.740 0.000
#> SRR772519 2 0.4291 0.8418 0.180 0.820 0.000
#> SRR772520 2 0.4121 0.8445 0.168 0.832 0.000
#> SRR772521 1 0.0237 0.7879 0.996 0.004 0.000
#> SRR772522 1 0.0237 0.7879 0.996 0.004 0.000
#> SRR772523 2 0.0237 0.8516 0.004 0.996 0.000
#> SRR772524 2 0.2261 0.8542 0.068 0.932 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772529 1 0.3551 0.7719 0.868 0.000 0.132
#> SRR772530 1 0.1289 0.7921 0.968 0.000 0.032
#> SRR772531 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 2 0.2625 0.8539 0.084 0.916 0.000
#> SRR772533 2 0.2537 0.8539 0.080 0.920 0.000
#> SRR772534 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.2625 0.8546 0.084 0.916 0.000
#> SRR772536 2 0.5016 0.8187 0.240 0.760 0.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772539 1 0.1860 0.7907 0.948 0.000 0.052
#> SRR772540 1 0.2165 0.7889 0.936 0.000 0.064
#> SRR772541 2 0.5397 0.7881 0.280 0.720 0.000
#> SRR772542 1 0.5058 0.7142 0.756 0.000 0.244
#> SRR772543 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772544 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.3038 0.7803 0.896 0.000 0.104
#> SRR772546 1 0.3941 0.7629 0.844 0.000 0.156
#> SRR772547 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772548 1 0.1289 0.7919 0.968 0.000 0.032
#> SRR772549 1 0.4931 0.7234 0.768 0.000 0.232
#> SRR772550 1 0.4702 0.7355 0.788 0.000 0.212
#> SRR772551 1 0.6008 0.1072 0.628 0.372 0.000
#> SRR772552 1 0.6045 0.0754 0.620 0.380 0.000
#> SRR772553 2 0.6111 0.6184 0.396 0.604 0.000
#> SRR772554 2 0.4974 0.8208 0.236 0.764 0.000
#> SRR772555 2 0.4974 0.8207 0.236 0.764 0.000
#> SRR772556 1 0.5016 0.7174 0.760 0.000 0.240
#> SRR772557 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772558 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0892 0.7916 0.980 0.000 0.020
#> SRR772560 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772561 3 0.5327 0.5471 0.272 0.000 0.728
#> SRR772562 2 0.5058 0.8165 0.244 0.756 0.000
#> SRR772563 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772564 1 0.5363 0.6818 0.724 0.000 0.276
#> SRR772565 1 0.5291 0.6901 0.732 0.000 0.268
#> SRR772566 3 0.4121 0.7473 0.168 0.000 0.832
#> SRR772567 3 0.0424 0.9764 0.008 0.000 0.992
#> SRR772568 2 0.5138 0.8111 0.252 0.748 0.000
#> SRR772569 2 0.5497 0.7743 0.292 0.708 0.000
#> SRR772570 1 0.2537 0.7863 0.920 0.000 0.080
#> SRR772571 1 0.0237 0.7901 0.996 0.000 0.004
#> SRR772572 1 0.0237 0.7901 0.996 0.000 0.004
#> SRR772573 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.0592 0.7912 0.988 0.000 0.012
#> SRR772575 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.6291 0.4549 0.468 0.532 0.000
#> SRR772577 2 0.6111 0.6168 0.396 0.604 0.000
#> SRR772578 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.5882 0.2004 0.652 0.348 0.000
#> SRR772582 2 0.6095 0.6296 0.392 0.608 0.000
#> SRR772583 1 0.3752 0.6640 0.856 0.144 0.000
#> SRR772584 1 0.2165 0.7443 0.936 0.064 0.000
#> SRR772585 2 0.6140 0.6015 0.404 0.596 0.000
#> SRR772586 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772587 1 0.4605 0.7394 0.796 0.000 0.204
#> SRR772588 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 1 0.6126 0.5022 0.600 0.000 0.400
#> SRR772592 1 0.6244 0.4170 0.560 0.000 0.440
#> SRR772593 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772596 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 1 0.5968 0.5520 0.636 0.000 0.364
#> SRR772599 1 0.5591 0.6452 0.696 0.000 0.304
#> SRR772600 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772602 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772603 2 0.1529 0.8537 0.040 0.960 0.000
#> SRR772604 2 0.0237 0.8516 0.004 0.996 0.000
#> SRR772605 1 0.4504 0.5813 0.804 0.196 0.000
#> SRR772606 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772607 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772608 2 0.5327 0.7950 0.272 0.728 0.000
#> SRR772609 2 0.5591 0.7609 0.304 0.696 0.000
#> SRR772610 2 0.3551 0.8498 0.132 0.868 0.000
#> SRR772611 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772614 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772615 1 0.5098 0.7099 0.752 0.000 0.248
#> SRR772616 1 0.0892 0.7916 0.980 0.000 0.020
#> SRR772617 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 1 0.6305 -0.3243 0.516 0.484 0.000
#> SRR772622 1 0.5291 0.4258 0.732 0.268 0.000
#> SRR772623 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772624 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772626 2 0.5397 0.7866 0.280 0.720 0.000
#> SRR772627 2 0.5465 0.7782 0.288 0.712 0.000
#> SRR772628 1 0.4654 0.7374 0.792 0.000 0.208
#> SRR772629 1 0.5016 0.7173 0.760 0.000 0.240
#> SRR772630 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772631 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772635 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772636 2 0.3752 0.8483 0.144 0.856 0.000
#> SRR772637 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772638 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
#> SRR772639 2 0.4605 0.8341 0.204 0.796 0.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.6154 -0.0432 0.592 0.408 0.000
#> SRR772643 1 0.6140 -0.0262 0.596 0.404 0.000
#> SRR772644 1 0.1964 0.7899 0.944 0.000 0.056
#> SRR772645 1 0.1289 0.7917 0.968 0.000 0.032
#> SRR772646 2 0.4235 0.8428 0.176 0.824 0.000
#> SRR772647 2 0.3116 0.8528 0.108 0.892 0.000
#> SRR772648 2 0.6260 0.5024 0.448 0.552 0.000
#> SRR772649 1 0.6244 -0.1662 0.560 0.440 0.000
#> SRR772650 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.4931 0.7234 0.768 0.000 0.232
#> SRR772653 1 0.3752 0.7679 0.856 0.000 0.144
#> SRR772654 1 0.0237 0.7876 0.996 0.004 0.000
#> SRR772655 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772660 2 0.6235 0.5327 0.436 0.564 0.000
#> SRR772661 1 0.6291 0.3435 0.532 0.000 0.468
#> SRR772662 1 0.0237 0.7875 0.996 0.004 0.000
#> SRR772663 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772665 2 0.5138 0.8118 0.252 0.748 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772670 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772671 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772672 2 0.5058 0.8165 0.244 0.756 0.000
#> SRR772673 2 0.4399 0.8392 0.188 0.812 0.000
#> SRR772674 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772675 1 0.3941 0.7539 0.844 0.000 0.156
#> SRR772676 1 0.0424 0.7906 0.992 0.000 0.008
#> SRR772677 1 0.0237 0.7901 0.996 0.000 0.004
#> SRR772678 1 0.5254 0.6934 0.736 0.000 0.264
#> SRR772679 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772680 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772682 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772683 2 0.5058 0.8163 0.244 0.756 0.000
#> SRR772685 2 0.5706 0.7404 0.320 0.680 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.8511 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 2 0.4121 0.8443 0.168 0.832 0.000
#> SRR772692 1 0.0000 0.7894 1.000 0.000 0.000
#> SRR772693 1 0.5363 0.4061 0.724 0.276 0.000
#> SRR772694 2 0.5098 0.8138 0.248 0.752 0.000
#> SRR772695 2 0.5859 0.7061 0.344 0.656 0.000
#> SRR772696 2 0.5760 0.7291 0.328 0.672 0.000
#> SRR772697 2 0.5178 0.8082 0.256 0.744 0.000
#> SRR772698 3 0.0000 0.9853 0.000 0.000 1.000
#> SRR772699 1 0.3816 0.7653 0.852 0.000 0.148
#> SRR772700 1 0.2066 0.7894 0.940 0.000 0.060
#> SRR772701 1 0.4931 0.7238 0.768 0.000 0.232
#> SRR772702 1 0.5058 0.7139 0.756 0.000 0.244
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0817 0.8942 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR772344 4 0.4843 0.5426 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR772345 4 0.4761 0.5929 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR772346 1 0.4283 0.6576 0.740 0.256 0.004 0.000
#> SRR772347 1 0.4252 0.6601 0.744 0.252 0.004 0.000
#> SRR772348 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772349 2 0.0921 0.8944 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772350 3 0.0779 0.9608 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772351 2 0.0336 0.9096 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772352 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772353 1 0.4804 0.4019 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR772354 2 0.4941 0.2128 0.436 0.564 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772357 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772359 1 0.2868 0.7980 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR772360 1 0.2011 0.8518 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0927 0.9602 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR772362 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772363 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772364 1 0.2773 0.8152 0.880 0.116 0.004 0.000
#> SRR772365 2 0.5147 0.1386 0.460 0.536 0.004 0.000
#> SRR772366 3 0.2563 0.9407 0.020 0.000 0.908 0.072
#> SRR772367 3 0.0592 0.9612 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772369 2 0.2011 0.8675 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR772370 2 0.2216 0.8562 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772371 1 0.5126 0.2200 0.552 0.444 0.004 0.000
#> SRR772372 1 0.5163 0.0881 0.516 0.480 0.004 0.000
#> SRR772373 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772375 3 0.0592 0.9612 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772377 1 0.8491 0.2916 0.492 0.300 0.124 0.084
#> SRR772378 2 0.2647 0.8329 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR772379 2 0.1211 0.8991 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR772380 2 0.1716 0.8847 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0779 0.9609 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772382 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772384 1 0.5050 0.6620 0.764 0.000 0.152 0.084
#> SRR772385 2 0.0817 0.9076 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772386 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772388 1 0.0188 0.9007 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772389 1 0.0188 0.9007 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772390 3 0.2376 0.9432 0.016 0.000 0.916 0.068
#> SRR772391 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0188 0.9022 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.0376 0.9136 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR772394 2 0.0895 0.9095 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR772395 2 0.0336 0.9091 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772396 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772402 4 0.2546 0.9424 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR772403 4 0.2546 0.9424 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR772404 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772405 1 0.5050 0.6620 0.764 0.000 0.152 0.084
#> SRR772406 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772408 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772409 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772410 2 0.1389 0.8924 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR772411 2 0.2216 0.8573 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772412 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0592 0.9612 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772415 2 0.1118 0.9019 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR772416 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772417 2 0.4994 0.0432 0.480 0.520 0.000 0.000
#> SRR772418 3 0.2670 0.9391 0.024 0.000 0.904 0.072
#> SRR772419 4 0.2469 0.9357 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772420 4 0.2408 0.9386 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR772421 2 0.2281 0.8572 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR772422 2 0.1118 0.9019 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR772423 4 0.2546 0.9424 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR772424 4 0.2546 0.9424 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR772425 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772426 4 0.2469 0.9350 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772427 4 0.2345 0.9410 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR772428 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772430 2 0.4605 0.5023 0.336 0.664 0.000 0.000
#> SRR772431 4 0.2546 0.9424 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR772432 4 0.3142 0.9112 0.000 0.132 0.008 0.860
#> SRR772433 1 0.0188 0.9007 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772434 1 0.0188 0.9007 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772435 1 0.2530 0.8223 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR772436 1 0.3975 0.6800 0.760 0.240 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0927 0.9602 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR772438 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772440 2 0.0817 0.9078 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR772441 2 0.0188 0.9139 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772442 4 0.5268 0.3782 0.000 0.452 0.008 0.540
#> SRR772443 2 0.5138 0.1503 0.000 0.600 0.008 0.392
#> SRR772444 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0336 0.9013 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.0336 0.9132 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772449 2 0.0469 0.9123 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR772450 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772451 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772452 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772454 1 0.1022 0.8895 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772455 2 0.4746 0.4227 0.368 0.632 0.000 0.000
#> SRR772456 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772457 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772458 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772460 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772461 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772462 2 0.3311 0.7158 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR772463 2 0.0336 0.9091 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772464 3 0.0592 0.9612 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772465 2 0.2149 0.8629 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR772466 2 0.2216 0.8562 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772467 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772468 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772469 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772472 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772473 4 0.4897 0.6708 0.000 0.332 0.008 0.660
#> SRR772474 4 0.3636 0.8695 0.000 0.172 0.008 0.820
#> SRR772475 2 0.1211 0.8984 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772476 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772477 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772478 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.0937 0.9007 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR772481 2 0.1174 0.8940 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR772482 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0188 0.9022 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772484 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772485 2 0.0188 0.9138 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772486 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0188 0.9020 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772488 2 0.1211 0.8990 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR772489 2 0.0921 0.9061 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR772490 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772492 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772493 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772494 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772495 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772496 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772498 2 0.0188 0.9126 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772499 2 0.0188 0.9126 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772500 2 0.4843 0.1566 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR772501 4 0.4697 0.6220 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR772502 1 0.3610 0.7273 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR772503 1 0.1716 0.8662 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.2011 0.8418 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR772505 2 0.3975 0.5946 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR772506 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772507 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772508 4 0.4661 0.6345 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR772509 2 0.5314 0.6896 0.176 0.740 0.000 0.084
#> SRR772510 3 0.0592 0.9612 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772511 2 0.1637 0.8842 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR772512 2 0.4315 0.7807 0.144 0.816 0.012 0.028
#> SRR772513 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772517 2 0.0188 0.9117 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772518 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772521 2 0.5070 0.2667 0.416 0.580 0.004 0.000
#> SRR772522 2 0.4584 0.5619 0.300 0.696 0.004 0.000
#> SRR772523 2 0.5220 0.0111 0.000 0.568 0.008 0.424
#> SRR772524 2 0.0188 0.9117 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772525 3 0.0779 0.9608 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772526 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772527 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772528 3 0.2376 0.9432 0.016 0.000 0.916 0.068
#> SRR772529 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0592 0.8979 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0779 0.9608 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772532 2 0.0188 0.9117 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772533 2 0.0336 0.9091 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772534 1 0.2081 0.8482 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.0592 0.9038 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772536 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772537 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772538 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772539 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0336 0.9013 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772544 3 0.0779 0.9609 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772545 1 0.0336 0.9013 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0188 0.9022 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772547 1 0.2704 0.8110 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR772548 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.1305 0.9027 0.036 0.960 0.004 0.000
#> SRR772552 2 0.1118 0.9016 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR772553 2 0.1398 0.8977 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR772554 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0592 0.8979 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0817 0.8945 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR772560 2 0.3219 0.7891 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR772561 3 0.5155 0.6564 0.252 0.008 0.716 0.024
#> SRR772562 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772566 1 0.3710 0.7027 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR772567 3 0.5112 0.2584 0.436 0.000 0.560 0.004
#> SRR772568 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772570 1 0.0336 0.9013 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0707 0.8964 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772572 1 0.4817 0.3905 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR772573 1 0.4817 0.3905 0.612 0.388 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.0921 0.8922 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.1022 0.8896 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.0336 0.9132 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772577 2 0.0336 0.9132 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772578 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772579 4 0.2281 0.9434 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR772580 3 0.0779 0.9608 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772581 2 0.1743 0.8871 0.056 0.940 0.004 0.000
#> SRR772582 2 0.0895 0.9089 0.020 0.976 0.004 0.000
#> SRR772583 2 0.2149 0.8654 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR772584 2 0.2081 0.8638 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR772585 2 0.0336 0.9132 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772586 3 0.3471 0.9110 0.060 0.000 0.868 0.072
#> SRR772587 1 0.0188 0.9022 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772588 4 0.3400 0.8664 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR772589 4 0.2589 0.9285 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR772590 3 0.0779 0.9609 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772591 1 0.0779 0.8904 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR772592 1 0.1661 0.8615 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR772593 3 0.2871 0.9346 0.032 0.000 0.896 0.072
#> SRR772594 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772595 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772596 3 0.2376 0.9432 0.016 0.000 0.916 0.068
#> SRR772597 3 0.0592 0.9612 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772598 1 0.0188 0.9005 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772599 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772600 4 0.5024 0.6131 0.000 0.360 0.008 0.632
#> SRR772601 4 0.2737 0.9364 0.000 0.104 0.008 0.888
#> SRR772602 3 0.0779 0.9609 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772603 2 0.4594 0.4882 0.000 0.712 0.008 0.280
#> SRR772604 4 0.4049 0.8274 0.000 0.212 0.008 0.780
#> SRR772605 2 0.1474 0.8906 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR772606 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772609 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772612 4 0.2546 0.9424 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR772613 4 0.2401 0.9440 0.000 0.092 0.004 0.904
#> SRR772614 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.3610 0.7169 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR772617 4 0.2401 0.9440 0.000 0.092 0.004 0.904
#> SRR772618 4 0.2546 0.9424 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR772619 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772620 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772621 2 0.0707 0.9093 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR772622 2 0.1118 0.9017 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR772623 3 0.0779 0.9608 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772624 3 0.3056 0.9288 0.040 0.000 0.888 0.072
#> SRR772625 4 0.2647 0.9236 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR772626 2 0.0376 0.9136 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR772627 2 0.0188 0.9126 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772628 1 0.0188 0.9022 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772630 1 0.4985 0.1512 0.532 0.468 0.000 0.000
#> SRR772631 3 0.2843 0.9350 0.020 0.000 0.892 0.088
#> SRR772632 4 0.4164 0.7692 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772633 4 0.2469 0.9357 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR772634 1 0.5000 0.0163 0.500 0.500 0.000 0.000
#> SRR772635 1 0.4643 0.4972 0.656 0.344 0.000 0.000
#> SRR772636 2 0.0817 0.9076 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772637 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772640 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772641 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772642 2 0.0921 0.9059 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR772643 2 0.0921 0.9058 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR772644 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0707 0.8966 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772648 2 0.0921 0.9053 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR772649 2 0.1118 0.9020 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR772650 1 0.1118 0.8870 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR772651 1 0.1211 0.8838 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772654 2 0.2216 0.8562 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772655 2 0.2216 0.8562 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772656 3 0.0779 0.9609 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772657 3 0.0927 0.9602 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR772658 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772659 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772660 2 0.0336 0.9132 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR772661 1 0.6049 0.4595 0.652 0.000 0.264 0.084
#> SRR772662 1 0.5000 -0.0156 0.500 0.500 0.000 0.000
#> SRR772663 2 0.4994 0.0820 0.480 0.520 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772665 2 0.0188 0.9139 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772666 3 0.0592 0.9612 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772667 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772668 4 0.2401 0.9438 0.000 0.092 0.004 0.904
#> SRR772669 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772670 2 0.4746 0.4218 0.368 0.632 0.000 0.000
#> SRR772671 2 0.2704 0.8298 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR772672 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772674 3 0.0779 0.9609 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772675 1 0.8118 0.3210 0.508 0.324 0.084 0.084
#> SRR772676 1 0.4661 0.4828 0.652 0.348 0.000 0.000
#> SRR772677 1 0.4790 0.4100 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR772678 1 0.5230 0.6634 0.760 0.004 0.152 0.084
#> SRR772679 2 0.4989 0.1048 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR772680 1 0.1867 0.8580 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.0927 0.9602 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR772682 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772685 2 0.0188 0.9138 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR772686 3 0.0592 0.9612 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772687 3 0.0927 0.9603 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR772688 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772689 4 0.2216 0.9453 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR772690 3 0.0779 0.9609 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772691 2 0.0817 0.9076 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR772692 2 0.2281 0.8561 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR772693 2 0.1211 0.9009 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR772694 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772695 2 0.0000 0.9140 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772696 2 0.0376 0.9136 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR772697 2 0.0188 0.9126 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772698 3 0.2563 0.9407 0.020 0.000 0.908 0.072
#> SRR772699 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0469 0.9000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.9028 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.0609 0.8418 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772342 1 0.0880 0.8392 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772343 5 0.4430 0.3064 0.456 0.004 0.000 0.000 0.540
#> SRR772344 2 0.4269 0.5767 0.000 0.732 0.000 0.232 0.036
#> SRR772345 2 0.4325 0.5610 0.000 0.724 0.000 0.240 0.036
#> SRR772346 5 0.5538 0.6015 0.312 0.092 0.000 0.000 0.596
#> SRR772347 5 0.5606 0.6164 0.296 0.104 0.000 0.000 0.600
#> SRR772348 2 0.0162 0.8340 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772349 2 0.0324 0.8340 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR772350 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772351 2 0.1043 0.8295 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772352 2 0.1197 0.8314 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR772353 5 0.6128 0.6707 0.204 0.232 0.000 0.000 0.564
#> SRR772354 5 0.6144 0.6650 0.172 0.280 0.000 0.000 0.548
#> SRR772355 2 0.1043 0.8319 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772356 2 0.1121 0.8308 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR772357 1 0.4210 0.1753 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR772358 1 0.4262 0.0677 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR772359 5 0.5353 0.5283 0.360 0.064 0.000 0.000 0.576
#> SRR772360 5 0.4902 0.4314 0.408 0.028 0.000 0.000 0.564
#> SRR772361 3 0.1364 0.9260 0.000 0.000 0.952 0.012 0.036
#> SRR772362 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772363 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772364 1 0.5177 -0.2455 0.488 0.040 0.000 0.000 0.472
#> SRR772365 5 0.6010 0.6662 0.204 0.212 0.000 0.000 0.584
#> SRR772366 3 0.4153 0.8493 0.020 0.000 0.736 0.004 0.240
#> SRR772367 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772368 2 0.1341 0.8292 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR772369 2 0.4713 0.1142 0.016 0.544 0.000 0.000 0.440
#> SRR772370 5 0.4723 0.2718 0.016 0.448 0.000 0.000 0.536
#> SRR772371 5 0.5766 0.6630 0.220 0.164 0.000 0.000 0.616
#> SRR772372 5 0.5740 0.6644 0.216 0.164 0.000 0.000 0.620
#> SRR772373 2 0.0609 0.8358 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772374 2 0.0510 0.8352 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772375 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772376 2 0.0162 0.8334 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772377 5 0.4865 0.4598 0.168 0.040 0.044 0.000 0.748
#> SRR772378 5 0.4942 0.3820 0.028 0.432 0.000 0.000 0.540
#> SRR772379 2 0.4331 0.2461 0.004 0.596 0.000 0.000 0.400
#> SRR772380 2 0.4841 0.1151 0.024 0.560 0.000 0.000 0.416
#> SRR772381 3 0.1106 0.9272 0.000 0.000 0.964 0.012 0.024
#> SRR772382 1 0.0510 0.8419 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772383 1 0.0703 0.8403 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772384 5 0.4927 0.2513 0.296 0.000 0.052 0.000 0.652
#> SRR772385 2 0.1430 0.8200 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR772386 2 0.1121 0.8338 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR772387 2 0.1043 0.8338 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR772388 1 0.0290 0.8429 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772389 1 0.0404 0.8425 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772390 3 0.3521 0.8616 0.000 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR772391 1 0.0609 0.8414 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772392 1 0.0703 0.8408 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772393 2 0.2648 0.7982 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR772394 2 0.3452 0.7122 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR772395 2 0.0290 0.8330 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772396 1 0.0290 0.8396 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772397 1 0.0404 0.8429 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772398 1 0.0794 0.8398 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772399 1 0.0510 0.8416 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772400 1 0.0404 0.8381 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772401 1 0.0290 0.8396 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772402 4 0.3526 0.8330 0.000 0.096 0.000 0.832 0.072
#> SRR772403 4 0.3181 0.8518 0.000 0.072 0.000 0.856 0.072
#> SRR772404 2 0.0510 0.8352 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772405 5 0.5097 0.1931 0.320 0.000 0.056 0.000 0.624
#> SRR772406 2 0.1792 0.8292 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR772407 2 0.1608 0.8273 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR772408 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772409 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772410 2 0.4380 0.3082 0.008 0.616 0.000 0.000 0.376
#> SRR772411 5 0.4689 0.3535 0.016 0.424 0.000 0.000 0.560
#> SRR772412 1 0.0290 0.8423 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772413 1 0.0290 0.8423 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772414 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772415 2 0.2424 0.7817 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR772416 2 0.1410 0.8275 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR772417 5 0.5941 0.6769 0.180 0.228 0.000 0.000 0.592
#> SRR772418 3 0.4208 0.8457 0.020 0.000 0.728 0.004 0.248
#> SRR772419 4 0.4166 0.5563 0.000 0.348 0.000 0.648 0.004
#> SRR772420 4 0.3662 0.7084 0.000 0.252 0.000 0.744 0.004
#> SRR772421 2 0.4862 0.3754 0.032 0.604 0.000 0.000 0.364
#> SRR772422 2 0.3196 0.7508 0.004 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR772423 4 0.2409 0.8774 0.000 0.032 0.000 0.900 0.068
#> SRR772424 4 0.1914 0.8852 0.000 0.016 0.000 0.924 0.060
#> SRR772425 2 0.0290 0.8330 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772426 4 0.4921 0.5462 0.000 0.340 0.000 0.620 0.040
#> SRR772427 4 0.3897 0.7545 0.000 0.204 0.000 0.768 0.028
#> SRR772428 1 0.0162 0.8410 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772429 1 0.0290 0.8420 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772430 5 0.5960 0.5568 0.120 0.352 0.000 0.000 0.528
#> SRR772431 4 0.2504 0.8761 0.000 0.040 0.000 0.896 0.064
#> SRR772432 4 0.4736 0.7177 0.000 0.216 0.000 0.712 0.072
#> SRR772433 1 0.0510 0.8381 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772434 1 0.0510 0.8381 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772435 5 0.5350 0.3206 0.460 0.052 0.000 0.000 0.488
#> SRR772436 5 0.5707 0.5401 0.364 0.092 0.000 0.000 0.544
#> SRR772437 3 0.1281 0.9265 0.000 0.000 0.956 0.012 0.032
#> SRR772438 1 0.0609 0.8351 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772439 1 0.0609 0.8351 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772440 2 0.2329 0.8040 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR772441 2 0.1671 0.8304 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR772442 2 0.5562 0.0998 0.000 0.520 0.000 0.408 0.072
#> SRR772443 2 0.4982 0.5581 0.000 0.692 0.000 0.220 0.088
#> SRR772444 1 0.0404 0.8411 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772445 1 0.0510 0.8424 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772446 1 0.2891 0.6942 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR772447 1 0.3661 0.5308 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR772448 2 0.2690 0.7908 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR772449 2 0.3266 0.7513 0.004 0.796 0.000 0.000 0.200
#> SRR772450 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772451 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772452 1 0.0510 0.8419 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772453 1 0.0510 0.8419 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772454 1 0.4213 0.4290 0.680 0.012 0.000 0.000 0.308
#> SRR772455 5 0.5552 0.5693 0.088 0.328 0.000 0.000 0.584
#> SRR772456 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772457 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772458 1 0.0404 0.8427 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772459 1 0.0404 0.8427 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772460 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772461 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772462 2 0.1809 0.7987 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR772463 2 0.0404 0.8342 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772464 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772465 2 0.4907 -0.1946 0.024 0.492 0.000 0.000 0.484
#> SRR772466 5 0.4747 0.1896 0.016 0.488 0.000 0.000 0.496
#> SRR772467 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772468 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772469 1 0.4060 0.3145 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR772470 1 0.2424 0.7450 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR772471 1 0.4182 0.2147 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR772472 1 0.4126 0.2828 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR772473 2 0.5426 0.3391 0.000 0.608 0.000 0.308 0.084
#> SRR772474 4 0.5513 0.3446 0.000 0.408 0.000 0.524 0.068
#> SRR772475 2 0.3366 0.6851 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR772476 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772477 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772478 1 0.1043 0.8346 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772479 1 0.0609 0.8414 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772480 2 0.2843 0.7918 0.000 0.848 0.000 0.008 0.144
#> SRR772481 2 0.2953 0.7889 0.000 0.844 0.000 0.012 0.144
#> SRR772482 1 0.3949 0.4023 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR772483 1 0.4030 0.3624 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR772484 2 0.0609 0.8353 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772485 2 0.0794 0.8349 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772486 1 0.0609 0.8383 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772487 1 0.0794 0.8360 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772488 2 0.2629 0.7731 0.004 0.860 0.000 0.000 0.136
#> SRR772489 2 0.2179 0.7954 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR772490 1 0.1197 0.8293 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR772491 1 0.0290 0.8429 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772492 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772493 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772494 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772495 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772496 2 0.0609 0.8357 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772497 2 0.0609 0.8357 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772498 2 0.2648 0.7996 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR772499 2 0.2648 0.7996 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR772500 2 0.3577 0.6927 0.000 0.808 0.000 0.160 0.032
#> SRR772501 2 0.4527 0.5149 0.000 0.700 0.000 0.260 0.040
#> SRR772502 5 0.5484 0.5760 0.336 0.080 0.000 0.000 0.584
#> SRR772503 5 0.4752 0.4334 0.412 0.020 0.000 0.000 0.568
#> SRR772504 2 0.2300 0.8048 0.000 0.908 0.000 0.040 0.052
#> SRR772505 2 0.3003 0.7696 0.000 0.864 0.000 0.092 0.044
#> SRR772506 4 0.2286 0.8456 0.000 0.108 0.000 0.888 0.004
#> SRR772507 4 0.1197 0.8905 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR772508 2 0.4651 0.2357 0.000 0.608 0.000 0.372 0.020
#> SRR772509 5 0.3370 0.5300 0.028 0.148 0.000 0.000 0.824
#> SRR772510 3 0.0162 0.9286 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772511 2 0.4655 -0.0344 0.012 0.512 0.000 0.000 0.476
#> SRR772512 5 0.5605 0.2629 0.036 0.380 0.008 0.012 0.564
#> SRR772513 2 0.0703 0.8350 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772514 2 0.0510 0.8352 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772515 2 0.0703 0.8334 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772516 2 0.0609 0.8345 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772517 2 0.0609 0.8353 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772518 2 0.0703 0.8350 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772519 2 0.0162 0.8340 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772520 2 0.0290 0.8330 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772521 5 0.5882 0.6374 0.148 0.264 0.000 0.000 0.588
#> SRR772522 5 0.5357 0.4978 0.068 0.344 0.000 0.000 0.588
#> SRR772523 2 0.4466 0.6258 0.000 0.748 0.000 0.176 0.076
#> SRR772524 2 0.1341 0.8256 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR772525 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772526 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772527 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772528 3 0.3521 0.8616 0.000 0.000 0.764 0.004 0.232
#> SRR772529 1 0.3210 0.6331 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR772530 1 0.4138 0.2594 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR772531 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772532 2 0.0963 0.8317 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772533 2 0.0880 0.8325 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772534 5 0.5068 0.4804 0.388 0.040 0.000 0.000 0.572
#> SRR772535 2 0.1357 0.8272 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR772536 2 0.1197 0.8321 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR772537 4 0.0912 0.9027 0.000 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR772538 4 0.0912 0.9027 0.000 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR772539 1 0.3999 0.3755 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR772540 1 0.4074 0.3252 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR772541 2 0.0794 0.8349 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772542 1 0.0963 0.8344 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772543 1 0.0794 0.8358 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772544 3 0.0451 0.9284 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR772545 1 0.1851 0.7979 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR772546 1 0.1043 0.8345 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR772547 5 0.5571 0.5585 0.348 0.084 0.000 0.000 0.568
#> SRR772548 1 0.4415 0.0124 0.552 0.004 0.000 0.000 0.444
#> SRR772549 1 0.0510 0.8423 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772550 1 0.0703 0.8398 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772551 2 0.4387 0.4808 0.012 0.640 0.000 0.000 0.348
#> SRR772552 2 0.3661 0.6259 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR772553 2 0.3366 0.6852 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR772554 2 0.0963 0.8317 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772555 2 0.0963 0.8317 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR772556 1 0.0404 0.8425 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772557 1 0.0510 0.8424 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772558 5 0.4448 0.2345 0.480 0.004 0.000 0.000 0.516
#> SRR772559 1 0.4650 -0.1210 0.520 0.012 0.000 0.000 0.468
#> SRR772560 5 0.5010 0.4566 0.036 0.392 0.000 0.000 0.572
#> SRR772561 3 0.6033 0.3935 0.080 0.004 0.556 0.012 0.348
#> SRR772562 2 0.0510 0.8352 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772563 2 0.0404 0.8350 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772564 1 0.0609 0.8366 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772565 1 0.0609 0.8366 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772566 1 0.1830 0.7903 0.932 0.000 0.052 0.004 0.012
#> SRR772567 1 0.3751 0.5868 0.772 0.000 0.212 0.004 0.012
#> SRR772568 2 0.1792 0.8274 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR772569 2 0.1792 0.8267 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR772570 1 0.2773 0.7136 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR772571 5 0.4294 0.2688 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR772572 5 0.6071 0.6319 0.284 0.160 0.000 0.000 0.556
#> SRR772573 5 0.6014 0.6526 0.252 0.172 0.000 0.000 0.576
#> SRR772574 5 0.4403 0.3577 0.436 0.004 0.000 0.000 0.560
#> SRR772575 5 0.4268 0.3428 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR772576 2 0.2966 0.7670 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR772577 2 0.2020 0.8216 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR772578 4 0.1082 0.9000 0.000 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR772579 4 0.1557 0.8910 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR772580 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772581 2 0.3910 0.6561 0.008 0.720 0.000 0.000 0.272
#> SRR772582 2 0.3177 0.7540 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR772583 2 0.4526 0.4859 0.028 0.672 0.000 0.000 0.300
#> SRR772584 2 0.4537 0.2093 0.012 0.592 0.000 0.000 0.396
#> SRR772585 2 0.1732 0.8170 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR772586 3 0.4578 0.8343 0.040 0.000 0.712 0.004 0.244
#> SRR772587 1 0.2732 0.7063 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR772588 2 0.4697 0.1759 0.000 0.592 0.000 0.388 0.020
#> SRR772589 4 0.4696 0.3770 0.000 0.428 0.000 0.556 0.016
#> SRR772590 3 0.1364 0.9260 0.000 0.000 0.952 0.012 0.036
#> SRR772591 1 0.0854 0.8299 0.976 0.000 0.012 0.004 0.008
#> SRR772592 1 0.1059 0.8231 0.968 0.000 0.020 0.004 0.008
#> SRR772593 3 0.4506 0.8370 0.036 0.000 0.716 0.004 0.244
#> SRR772594 4 0.1725 0.8922 0.000 0.044 0.000 0.936 0.020
#> SRR772595 4 0.1943 0.8857 0.000 0.056 0.000 0.924 0.020
#> SRR772596 3 0.3491 0.8631 0.000 0.000 0.768 0.004 0.228
#> SRR772597 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772598 1 0.0566 0.8368 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR772599 1 0.0404 0.8381 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772600 2 0.5658 0.2831 0.000 0.572 0.000 0.332 0.096
#> SRR772601 4 0.4737 0.7082 0.000 0.224 0.000 0.708 0.068
#> SRR772602 3 0.0579 0.9277 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR772603 2 0.3806 0.7221 0.000 0.812 0.000 0.104 0.084
#> SRR772604 4 0.5632 0.3781 0.000 0.392 0.000 0.528 0.080
#> SRR772605 2 0.4504 0.1032 0.008 0.564 0.000 0.000 0.428
#> SRR772606 1 0.0609 0.8389 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772607 1 0.0510 0.8391 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772608 2 0.0703 0.8350 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772609 2 0.0794 0.8347 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772610 2 0.0162 0.8340 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR772611 2 0.0404 0.8350 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772612 4 0.2036 0.8859 0.000 0.024 0.000 0.920 0.056
#> SRR772613 4 0.1872 0.8881 0.000 0.020 0.000 0.928 0.052
#> SRR772614 1 0.0000 0.8420 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0290 0.8396 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772616 5 0.5663 0.4358 0.412 0.080 0.000 0.000 0.508
#> SRR772617 4 0.1626 0.8921 0.000 0.016 0.000 0.940 0.044
#> SRR772618 4 0.1845 0.8868 0.000 0.016 0.000 0.928 0.056
#> SRR772619 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772620 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772621 2 0.3366 0.7138 0.004 0.784 0.000 0.000 0.212
#> SRR772622 2 0.4109 0.5927 0.012 0.700 0.000 0.000 0.288
#> SRR772623 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772624 3 0.4756 0.8276 0.052 0.000 0.704 0.004 0.240
#> SRR772625 4 0.3720 0.7325 0.000 0.228 0.000 0.760 0.012
#> SRR772626 2 0.2605 0.8031 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR772627 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR772628 1 0.2127 0.7663 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772629 1 0.0510 0.8419 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772630 5 0.5956 0.6734 0.196 0.212 0.000 0.000 0.592
#> SRR772631 3 0.4286 0.8408 0.020 0.000 0.716 0.004 0.260
#> SRR772632 2 0.4734 0.2503 0.000 0.604 0.000 0.372 0.024
#> SRR772633 4 0.4425 0.3042 0.000 0.452 0.000 0.544 0.004
#> SRR772634 5 0.5872 0.6784 0.168 0.232 0.000 0.000 0.600
#> SRR772635 5 0.5877 0.6576 0.244 0.160 0.000 0.000 0.596
#> SRR772636 2 0.1357 0.8215 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR772637 1 0.0404 0.8425 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772638 1 0.0404 0.8425 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772639 2 0.0609 0.8308 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772640 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772641 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772642 2 0.3508 0.6696 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR772643 2 0.3109 0.7372 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR772644 1 0.4287 -0.0153 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR772645 1 0.4557 -0.1248 0.516 0.008 0.000 0.000 0.476
#> SRR772646 2 0.0290 0.8340 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772647 2 0.0290 0.8333 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772648 2 0.2929 0.7871 0.008 0.840 0.000 0.000 0.152
#> SRR772649 2 0.3582 0.7011 0.008 0.768 0.000 0.000 0.224
#> SRR772650 5 0.4885 0.4495 0.400 0.028 0.000 0.000 0.572
#> SRR772651 5 0.4774 0.3952 0.424 0.020 0.000 0.000 0.556
#> SRR772652 1 0.0510 0.8421 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772653 1 0.1608 0.8125 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR772654 5 0.4689 0.3214 0.016 0.424 0.000 0.000 0.560
#> SRR772655 5 0.4707 0.3982 0.020 0.392 0.000 0.000 0.588
#> SRR772656 3 0.1012 0.9273 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR772657 3 0.1364 0.9260 0.000 0.000 0.952 0.012 0.036
#> SRR772658 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772659 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772660 2 0.2561 0.7712 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR772661 5 0.5861 0.2132 0.260 0.000 0.148 0.000 0.592
#> SRR772662 5 0.6177 0.6514 0.232 0.212 0.000 0.000 0.556
#> SRR772663 5 0.6225 0.6522 0.224 0.228 0.000 0.000 0.548
#> SRR772664 2 0.0290 0.8355 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772665 2 0.1270 0.8306 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR772666 3 0.0324 0.9285 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR772667 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772668 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772669 4 0.0671 0.9042 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR772670 5 0.5702 0.5982 0.104 0.320 0.000 0.000 0.576
#> SRR772671 5 0.5036 0.4354 0.036 0.404 0.000 0.000 0.560
#> SRR772672 2 0.0404 0.8350 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772673 2 0.0404 0.8350 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR772674 3 0.1012 0.9273 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR772675 5 0.5172 0.3960 0.224 0.044 0.032 0.000 0.700
#> SRR772676 5 0.6144 0.5706 0.344 0.144 0.000 0.000 0.512
#> SRR772677 5 0.6204 0.6050 0.312 0.164 0.000 0.000 0.524
#> SRR772678 5 0.4782 0.3499 0.244 0.004 0.052 0.000 0.700
#> SRR772679 5 0.6018 0.6606 0.160 0.272 0.000 0.000 0.568
#> SRR772680 5 0.4815 0.3164 0.456 0.020 0.000 0.000 0.524
#> SRR772681 3 0.1106 0.9272 0.000 0.000 0.964 0.012 0.024
#> SRR772682 2 0.0510 0.8352 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772683 2 0.0290 0.8347 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR772685 2 0.1732 0.8288 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR772686 3 0.0162 0.9290 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772687 3 0.1282 0.9218 0.000 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR772688 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772689 4 0.0510 0.9046 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772690 3 0.0324 0.9285 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR772691 2 0.1430 0.8226 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR772692 5 0.4774 0.3142 0.020 0.424 0.000 0.000 0.556
#> SRR772693 2 0.4457 0.4166 0.012 0.620 0.000 0.000 0.368
#> SRR772694 2 0.0880 0.8371 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772695 2 0.1965 0.8140 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR772696 2 0.2424 0.8108 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR772697 2 0.2471 0.8086 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR772698 3 0.4061 0.8515 0.016 0.000 0.740 0.004 0.240
#> SRR772699 1 0.3857 0.4428 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR772700 1 0.4045 0.3317 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR772701 1 0.0404 0.8421 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772702 1 0.0510 0.8428 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.1572 0.8782 0.936 0.000 0.000 0.000 0.028 0.036
#> SRR772342 1 0.1341 0.8875 0.948 0.000 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR772343 6 0.3102 0.4644 0.156 0.000 0.000 0.000 0.028 0.816
#> SRR772344 2 0.2705 0.7677 0.000 0.872 0.000 0.072 0.052 0.004
#> SRR772345 2 0.2879 0.7631 0.000 0.864 0.000 0.072 0.056 0.008
#> SRR772346 6 0.4710 0.5220 0.088 0.016 0.000 0.000 0.192 0.704
#> SRR772347 6 0.4757 0.5038 0.076 0.016 0.000 0.000 0.220 0.688
#> SRR772348 2 0.0806 0.8035 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR772349 2 0.0748 0.8036 0.000 0.976 0.000 0.004 0.004 0.016
#> SRR772350 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772351 2 0.1594 0.7984 0.000 0.932 0.000 0.000 0.052 0.016
#> SRR772352 2 0.2457 0.7923 0.000 0.880 0.000 0.000 0.084 0.036
#> SRR772353 6 0.4090 0.5093 0.048 0.092 0.000 0.000 0.068 0.792
#> SRR772354 6 0.4177 0.4971 0.036 0.128 0.000 0.000 0.060 0.776
#> SRR772355 2 0.2066 0.8009 0.000 0.904 0.000 0.000 0.072 0.024
#> SRR772356 2 0.1594 0.8019 0.000 0.932 0.000 0.000 0.052 0.016
#> SRR772357 6 0.4694 0.1493 0.376 0.000 0.000 0.000 0.052 0.572
#> SRR772358 6 0.4180 0.2040 0.348 0.000 0.000 0.000 0.024 0.628
#> SRR772359 6 0.3005 0.5081 0.108 0.008 0.000 0.000 0.036 0.848
#> SRR772360 6 0.3447 0.4901 0.148 0.004 0.000 0.000 0.044 0.804
#> SRR772361 3 0.1003 0.8543 0.000 0.000 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR772362 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772364 6 0.6007 0.2730 0.264 0.012 0.000 0.000 0.212 0.512
#> SRR772365 6 0.5392 0.4481 0.068 0.044 0.000 0.000 0.264 0.624
#> SRR772366 3 0.4004 0.6076 0.012 0.000 0.620 0.000 0.368 0.000
#> SRR772367 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772368 2 0.2294 0.7886 0.000 0.892 0.000 0.000 0.036 0.072
#> SRR772369 6 0.5188 0.3849 0.000 0.288 0.000 0.000 0.124 0.588
#> SRR772370 6 0.4304 0.5138 0.004 0.160 0.000 0.000 0.100 0.736
#> SRR772371 6 0.4878 0.4640 0.036 0.044 0.000 0.000 0.252 0.668
#> SRR772372 6 0.4871 0.4631 0.032 0.048 0.000 0.000 0.252 0.668
#> SRR772373 2 0.1152 0.8040 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR772374 2 0.1245 0.8015 0.000 0.952 0.000 0.000 0.016 0.032
#> SRR772375 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772376 2 0.0603 0.8046 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR772377 5 0.5713 0.8115 0.060 0.004 0.036 0.000 0.500 0.400
#> SRR772378 6 0.3419 0.4955 0.004 0.152 0.000 0.000 0.040 0.804
#> SRR772379 6 0.4717 0.3291 0.000 0.364 0.000 0.000 0.056 0.580
#> SRR772380 6 0.4568 0.3466 0.004 0.344 0.000 0.000 0.040 0.612
#> SRR772381 3 0.0914 0.8544 0.000 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR772382 1 0.1003 0.8864 0.964 0.000 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR772383 1 0.1549 0.8730 0.936 0.000 0.000 0.000 0.020 0.044
#> SRR772384 5 0.6275 0.8617 0.152 0.000 0.036 0.000 0.480 0.332
#> SRR772385 2 0.3229 0.7391 0.000 0.816 0.000 0.000 0.140 0.044
#> SRR772386 2 0.1970 0.8012 0.000 0.912 0.000 0.000 0.060 0.028
#> SRR772387 2 0.1890 0.8017 0.000 0.916 0.000 0.000 0.060 0.024
#> SRR772388 1 0.0692 0.8898 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR772389 1 0.0692 0.8898 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR772390 3 0.3647 0.6261 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR772391 1 0.2030 0.8541 0.908 0.000 0.000 0.000 0.028 0.064
#> SRR772392 1 0.2046 0.8545 0.908 0.000 0.000 0.000 0.032 0.060
#> SRR772393 2 0.5605 0.5008 0.000 0.544 0.000 0.000 0.244 0.212
#> SRR772394 2 0.6011 0.1892 0.000 0.416 0.000 0.000 0.248 0.336
#> SRR772395 2 0.0717 0.8032 0.000 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR772396 1 0.0972 0.8898 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR772397 1 0.0508 0.8897 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR772398 1 0.1421 0.8793 0.944 0.000 0.000 0.000 0.028 0.028
#> SRR772399 1 0.1176 0.8840 0.956 0.000 0.000 0.000 0.020 0.024
#> SRR772400 1 0.0713 0.8864 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR772401 1 0.0713 0.8864 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR772402 4 0.5647 0.5913 0.000 0.160 0.000 0.608 0.208 0.024
#> SRR772403 4 0.5085 0.6694 0.000 0.100 0.000 0.672 0.204 0.024
#> SRR772404 2 0.1168 0.8031 0.000 0.956 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR772405 5 0.6324 0.8479 0.164 0.000 0.036 0.000 0.480 0.320
#> SRR772406 2 0.3285 0.7695 0.000 0.820 0.000 0.000 0.116 0.064
#> SRR772407 2 0.3608 0.7563 0.000 0.788 0.000 0.000 0.148 0.064
#> SRR772408 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772410 6 0.5252 0.3850 0.004 0.308 0.000 0.000 0.108 0.580
#> SRR772411 6 0.3932 0.5327 0.004 0.108 0.000 0.000 0.112 0.776
#> SRR772412 1 0.0405 0.8894 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR772413 1 0.0405 0.8894 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR772414 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772415 2 0.3766 0.6617 0.000 0.748 0.000 0.000 0.040 0.212
#> SRR772416 2 0.2728 0.7681 0.000 0.860 0.000 0.000 0.040 0.100
#> SRR772417 6 0.4210 0.5491 0.044 0.048 0.000 0.000 0.136 0.772
#> SRR772418 3 0.4026 0.5991 0.012 0.000 0.612 0.000 0.376 0.000
#> SRR772419 2 0.4212 0.2120 0.000 0.560 0.000 0.424 0.016 0.000
#> SRR772420 4 0.4264 0.0126 0.000 0.488 0.000 0.496 0.016 0.000
#> SRR772421 6 0.5702 0.3348 0.000 0.292 0.000 0.000 0.196 0.512
#> SRR772422 2 0.5816 0.2920 0.000 0.484 0.000 0.000 0.212 0.304
#> SRR772423 4 0.3800 0.7734 0.000 0.044 0.000 0.780 0.164 0.012
#> SRR772424 4 0.2755 0.8192 0.000 0.004 0.000 0.844 0.140 0.012
#> SRR772425 2 0.0820 0.8056 0.000 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR772426 2 0.5141 0.1102 0.000 0.504 0.000 0.420 0.072 0.004
#> SRR772427 4 0.4961 0.3793 0.000 0.368 0.000 0.564 0.064 0.004
#> SRR772428 1 0.0458 0.8903 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR772429 1 0.0603 0.8894 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR772430 6 0.4517 0.4788 0.048 0.156 0.000 0.000 0.052 0.744
#> SRR772431 4 0.3935 0.7711 0.000 0.060 0.000 0.776 0.152 0.012
#> SRR772432 4 0.5874 0.5075 0.000 0.244 0.000 0.552 0.188 0.016
#> SRR772433 1 0.0858 0.8857 0.968 0.000 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR772434 1 0.0692 0.8874 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR772435 6 0.4367 0.4052 0.228 0.016 0.000 0.000 0.044 0.712
#> SRR772436 6 0.4825 0.5177 0.140 0.028 0.000 0.000 0.116 0.716
#> SRR772437 3 0.1003 0.8543 0.000 0.000 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR772438 1 0.0935 0.8825 0.964 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR772439 1 0.0935 0.8818 0.964 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR772440 2 0.3967 0.7136 0.000 0.760 0.000 0.000 0.092 0.148
#> SRR772441 2 0.2897 0.7857 0.000 0.852 0.000 0.000 0.088 0.060
#> SRR772442 2 0.6398 0.2131 0.000 0.448 0.000 0.304 0.224 0.024
#> SRR772443 2 0.5609 0.5833 0.000 0.608 0.000 0.104 0.252 0.036
#> SRR772444 1 0.0547 0.8873 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772445 1 0.0806 0.8879 0.972 0.000 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR772446 1 0.4322 0.3247 0.600 0.000 0.000 0.000 0.028 0.372
#> SRR772447 1 0.4797 0.0591 0.504 0.000 0.000 0.000 0.052 0.444
#> SRR772448 2 0.4800 0.6453 0.000 0.672 0.000 0.000 0.164 0.164
#> SRR772449 2 0.5508 0.4954 0.000 0.564 0.000 0.000 0.212 0.224
#> SRR772450 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0717 0.8890 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR772453 1 0.1257 0.8819 0.952 0.000 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR772454 6 0.4763 0.1783 0.412 0.000 0.000 0.000 0.052 0.536
#> SRR772455 6 0.3557 0.5300 0.024 0.092 0.000 0.000 0.060 0.824
#> SRR772456 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0603 0.8892 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR772459 1 0.0405 0.8901 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR772460 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772462 2 0.1364 0.7992 0.000 0.952 0.000 0.016 0.020 0.012
#> SRR772463 2 0.1092 0.8035 0.000 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR772464 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772465 6 0.4750 0.4928 0.004 0.196 0.000 0.000 0.116 0.684
#> SRR772466 6 0.4369 0.5124 0.000 0.164 0.000 0.000 0.116 0.720
#> SRR772467 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772468 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772469 6 0.4742 0.1329 0.440 0.000 0.000 0.000 0.048 0.512
#> SRR772470 1 0.3865 0.5741 0.720 0.000 0.000 0.000 0.032 0.248
#> SRR772471 6 0.4230 0.1935 0.364 0.000 0.000 0.000 0.024 0.612
#> SRR772472 6 0.4144 0.1955 0.360 0.000 0.000 0.000 0.020 0.620
#> SRR772473 2 0.6021 0.4940 0.000 0.568 0.000 0.172 0.224 0.036
#> SRR772474 2 0.6186 0.1651 0.000 0.468 0.000 0.332 0.180 0.020
#> SRR772475 2 0.5067 0.5803 0.000 0.636 0.000 0.000 0.184 0.180
#> SRR772476 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.2179 0.8478 0.900 0.000 0.000 0.000 0.036 0.064
#> SRR772479 1 0.1575 0.8759 0.936 0.000 0.000 0.000 0.032 0.032
#> SRR772480 2 0.5185 0.5603 0.000 0.564 0.000 0.000 0.328 0.108
#> SRR772481 2 0.5185 0.5856 0.000 0.592 0.000 0.004 0.300 0.104
#> SRR772482 1 0.4444 0.1032 0.536 0.000 0.000 0.000 0.028 0.436
#> SRR772483 6 0.4473 0.0175 0.480 0.000 0.000 0.000 0.028 0.492
#> SRR772484 2 0.1633 0.8002 0.000 0.932 0.000 0.000 0.044 0.024
#> SRR772485 2 0.2197 0.7909 0.000 0.900 0.000 0.000 0.044 0.056
#> SRR772486 1 0.1297 0.8794 0.948 0.000 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR772487 1 0.1713 0.8696 0.928 0.000 0.000 0.000 0.044 0.028
#> SRR772488 2 0.3388 0.7107 0.000 0.792 0.000 0.000 0.036 0.172
#> SRR772489 2 0.3172 0.7347 0.000 0.816 0.000 0.000 0.036 0.148
#> SRR772490 1 0.1926 0.8549 0.912 0.000 0.000 0.000 0.020 0.068
#> SRR772491 1 0.0520 0.8900 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR772492 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.1049 0.8047 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR772497 2 0.0972 0.8029 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR772498 2 0.5296 0.5772 0.000 0.596 0.000 0.000 0.236 0.168
#> SRR772499 2 0.5429 0.5412 0.000 0.576 0.000 0.000 0.236 0.188
#> SRR772500 2 0.2209 0.7823 0.000 0.904 0.000 0.040 0.052 0.004
#> SRR772501 2 0.3196 0.7465 0.000 0.836 0.000 0.096 0.064 0.004
#> SRR772502 6 0.3989 0.5418 0.096 0.008 0.000 0.000 0.120 0.776
#> SRR772503 6 0.3806 0.5256 0.136 0.000 0.000 0.000 0.088 0.776
#> SRR772504 2 0.2182 0.7950 0.000 0.904 0.000 0.008 0.068 0.020
#> SRR772505 2 0.1923 0.7973 0.000 0.916 0.000 0.004 0.064 0.016
#> SRR772506 4 0.3404 0.6673 0.000 0.224 0.000 0.760 0.016 0.000
#> SRR772507 4 0.1958 0.8178 0.000 0.100 0.000 0.896 0.004 0.000
#> SRR772508 2 0.3129 0.7075 0.000 0.820 0.000 0.152 0.024 0.004
#> SRR772509 5 0.4951 0.6785 0.012 0.040 0.000 0.000 0.508 0.440
#> SRR772510 3 0.0260 0.8584 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772511 6 0.5362 0.4406 0.004 0.188 0.000 0.000 0.200 0.608
#> SRR772512 6 0.6173 0.1937 0.008 0.188 0.008 0.000 0.312 0.484
#> SRR772513 2 0.1865 0.7970 0.000 0.920 0.000 0.000 0.040 0.040
#> SRR772514 2 0.1575 0.8014 0.000 0.936 0.000 0.000 0.032 0.032
#> SRR772515 2 0.1176 0.8039 0.000 0.956 0.000 0.000 0.024 0.020
#> SRR772516 2 0.1245 0.8048 0.000 0.952 0.000 0.000 0.032 0.016
#> SRR772517 2 0.1700 0.8020 0.000 0.928 0.000 0.000 0.048 0.024
#> SRR772518 2 0.1713 0.8001 0.000 0.928 0.000 0.000 0.044 0.028
#> SRR772519 2 0.0603 0.8032 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR772520 2 0.0622 0.8038 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR772521 6 0.5133 0.4678 0.032 0.064 0.000 0.000 0.260 0.644
#> SRR772522 6 0.4966 0.4668 0.016 0.076 0.000 0.000 0.256 0.652
#> SRR772523 2 0.3815 0.7327 0.000 0.792 0.000 0.036 0.144 0.028
#> SRR772524 2 0.1807 0.7967 0.000 0.920 0.000 0.000 0.060 0.020
#> SRR772525 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772526 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772527 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772528 3 0.3647 0.6261 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR772529 1 0.3855 0.5296 0.704 0.000 0.000 0.000 0.024 0.272
#> SRR772530 6 0.4377 0.1043 0.436 0.000 0.000 0.000 0.024 0.540
#> SRR772531 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772532 2 0.1320 0.8028 0.000 0.948 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR772533 2 0.1549 0.8003 0.000 0.936 0.000 0.000 0.044 0.020
#> SRR772534 6 0.3751 0.5338 0.108 0.004 0.000 0.000 0.096 0.792
#> SRR772535 2 0.1867 0.7992 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR772536 2 0.2542 0.7916 0.000 0.876 0.000 0.000 0.080 0.044
#> SRR772537 4 0.0291 0.8946 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772538 4 0.0508 0.8922 0.000 0.004 0.000 0.984 0.012 0.000
#> SRR772539 6 0.4578 0.0433 0.444 0.000 0.000 0.000 0.036 0.520
#> SRR772540 6 0.4366 0.0789 0.428 0.000 0.000 0.000 0.024 0.548
#> SRR772541 2 0.1789 0.7957 0.000 0.924 0.000 0.000 0.032 0.044
#> SRR772542 1 0.1649 0.8756 0.932 0.000 0.000 0.000 0.032 0.036
#> SRR772543 1 0.1074 0.8832 0.960 0.000 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR772544 3 0.0405 0.8577 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR772545 1 0.3385 0.7070 0.788 0.000 0.000 0.000 0.032 0.180
#> SRR772546 1 0.2942 0.7750 0.836 0.000 0.000 0.000 0.032 0.132
#> SRR772547 6 0.3269 0.5206 0.108 0.008 0.000 0.000 0.052 0.832
#> SRR772548 6 0.4285 0.2996 0.320 0.000 0.000 0.000 0.036 0.644
#> SRR772549 1 0.1320 0.8824 0.948 0.000 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR772550 1 0.1524 0.8675 0.932 0.000 0.000 0.000 0.008 0.060
#> SRR772551 6 0.5774 0.3349 0.000 0.272 0.000 0.000 0.224 0.504
#> SRR772552 6 0.5723 -0.0202 0.000 0.408 0.000 0.000 0.164 0.428
#> SRR772553 2 0.5175 0.5574 0.000 0.620 0.000 0.000 0.184 0.196
#> SRR772554 2 0.1151 0.8033 0.000 0.956 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR772555 2 0.1245 0.8030 0.000 0.952 0.000 0.000 0.032 0.016
#> SRR772556 1 0.0806 0.8870 0.972 0.000 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR772557 1 0.0993 0.8856 0.964 0.000 0.000 0.000 0.024 0.012
#> SRR772558 6 0.3586 0.4099 0.216 0.000 0.000 0.000 0.028 0.756
#> SRR772559 6 0.3990 0.3325 0.284 0.000 0.000 0.000 0.028 0.688
#> SRR772560 6 0.3001 0.5226 0.008 0.128 0.000 0.000 0.024 0.840
#> SRR772561 3 0.5851 0.0833 0.012 0.000 0.536 0.000 0.176 0.276
#> SRR772562 2 0.1168 0.8036 0.000 0.956 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR772563 2 0.0972 0.8030 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR772564 1 0.0972 0.8839 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR772565 1 0.0972 0.8839 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR772566 1 0.0632 0.8855 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR772567 1 0.2373 0.7990 0.888 0.000 0.084 0.004 0.024 0.000
#> SRR772568 2 0.3424 0.7655 0.000 0.812 0.000 0.000 0.092 0.096
#> SRR772569 2 0.3472 0.7596 0.000 0.808 0.000 0.000 0.092 0.100
#> SRR772570 1 0.4134 0.4485 0.656 0.000 0.000 0.000 0.028 0.316
#> SRR772571 6 0.4144 0.4455 0.200 0.000 0.000 0.000 0.072 0.728
#> SRR772572 6 0.4507 0.5396 0.116 0.028 0.000 0.000 0.108 0.748
#> SRR772573 6 0.4118 0.5513 0.072 0.028 0.000 0.000 0.120 0.780
#> SRR772574 6 0.3210 0.4759 0.168 0.000 0.000 0.000 0.028 0.804
#> SRR772575 6 0.3343 0.5021 0.144 0.004 0.000 0.000 0.040 0.812
#> SRR772576 2 0.5548 0.4522 0.000 0.548 0.000 0.000 0.184 0.268
#> SRR772577 2 0.3745 0.7583 0.000 0.784 0.000 0.000 0.116 0.100
#> SRR772578 4 0.1938 0.8636 0.000 0.036 0.000 0.920 0.040 0.004
#> SRR772579 4 0.2474 0.8348 0.000 0.080 0.000 0.884 0.032 0.004
#> SRR772580 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772581 6 0.6090 0.2771 0.004 0.272 0.000 0.000 0.276 0.448
#> SRR772582 2 0.6068 0.0434 0.000 0.376 0.000 0.000 0.264 0.360
#> SRR772583 6 0.4921 0.1845 0.000 0.420 0.000 0.000 0.064 0.516
#> SRR772584 6 0.4908 0.3467 0.004 0.332 0.000 0.000 0.068 0.596
#> SRR772585 2 0.2887 0.7534 0.000 0.844 0.000 0.000 0.036 0.120
#> SRR772586 3 0.4543 0.5572 0.032 0.000 0.584 0.000 0.380 0.004
#> SRR772587 1 0.4212 0.5093 0.688 0.000 0.000 0.000 0.048 0.264
#> SRR772588 2 0.2848 0.7353 0.000 0.848 0.000 0.124 0.024 0.004
#> SRR772589 2 0.3745 0.5855 0.000 0.732 0.000 0.240 0.028 0.000
#> SRR772590 3 0.1003 0.8543 0.000 0.000 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR772591 1 0.0632 0.8855 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR772592 1 0.0632 0.8855 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR772593 3 0.4252 0.5871 0.024 0.000 0.604 0.000 0.372 0.000
#> SRR772594 4 0.1864 0.8654 0.000 0.040 0.000 0.924 0.032 0.004
#> SRR772595 4 0.2968 0.8128 0.000 0.092 0.000 0.852 0.052 0.004
#> SRR772596 3 0.3647 0.6261 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR772597 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772598 1 0.0547 0.8870 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772599 1 0.0692 0.8886 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR772600 2 0.6270 0.4201 0.000 0.524 0.000 0.204 0.236 0.036
#> SRR772601 4 0.6193 0.3830 0.000 0.292 0.000 0.488 0.200 0.020
#> SRR772602 3 0.0405 0.8577 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR772603 2 0.4938 0.6520 0.000 0.676 0.000 0.056 0.232 0.036
#> SRR772604 2 0.6580 0.0516 0.000 0.408 0.000 0.332 0.228 0.032
#> SRR772605 6 0.4576 0.3229 0.004 0.368 0.000 0.000 0.036 0.592
#> SRR772606 1 0.0972 0.8872 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR772607 1 0.0972 0.8872 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR772608 2 0.1930 0.7932 0.000 0.916 0.000 0.000 0.036 0.048
#> SRR772609 2 0.1863 0.7941 0.000 0.920 0.000 0.000 0.036 0.044
#> SRR772610 2 0.0909 0.8033 0.000 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR772611 2 0.0858 0.8026 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR772612 4 0.2326 0.8492 0.000 0.012 0.000 0.888 0.092 0.008
#> SRR772613 4 0.2420 0.8420 0.000 0.008 0.000 0.876 0.108 0.008
#> SRR772614 1 0.0547 0.8894 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772615 1 0.0632 0.8880 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR772616 6 0.4151 0.4660 0.164 0.012 0.000 0.000 0.068 0.756
#> SRR772617 4 0.1411 0.8702 0.000 0.004 0.000 0.936 0.060 0.000
#> SRR772618 4 0.2243 0.8403 0.000 0.004 0.000 0.880 0.112 0.004
#> SRR772619 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772620 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772621 2 0.5440 0.3968 0.000 0.552 0.000 0.000 0.152 0.296
#> SRR772622 2 0.5681 0.0666 0.000 0.428 0.000 0.000 0.156 0.416
#> SRR772623 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772624 3 0.4563 0.5592 0.044 0.000 0.588 0.000 0.368 0.000
#> SRR772625 4 0.5072 0.3121 0.000 0.388 0.000 0.548 0.048 0.016
#> SRR772626 2 0.5187 0.6047 0.000 0.608 0.000 0.000 0.244 0.148
#> SRR772627 2 0.5579 0.5124 0.000 0.548 0.000 0.000 0.248 0.204
#> SRR772628 1 0.2945 0.7259 0.824 0.000 0.000 0.000 0.020 0.156
#> SRR772629 1 0.0806 0.8910 0.972 0.000 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR772630 6 0.4145 0.5498 0.048 0.040 0.000 0.000 0.136 0.776
#> SRR772631 3 0.4129 0.5353 0.012 0.000 0.564 0.000 0.424 0.000
#> SRR772632 2 0.3491 0.7044 0.000 0.804 0.000 0.148 0.040 0.008
#> SRR772633 2 0.3974 0.5071 0.000 0.680 0.000 0.296 0.024 0.000
#> SRR772634 6 0.4244 0.5454 0.060 0.040 0.000 0.000 0.128 0.772
#> SRR772635 6 0.4094 0.5492 0.068 0.032 0.000 0.000 0.116 0.784
#> SRR772636 2 0.3229 0.7391 0.000 0.816 0.000 0.000 0.140 0.044
#> SRR772637 1 0.0508 0.8898 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR772638 1 0.0508 0.8898 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR772639 2 0.0603 0.8033 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR772640 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772642 2 0.4827 0.5416 0.000 0.632 0.000 0.000 0.092 0.276
#> SRR772643 2 0.4834 0.5665 0.000 0.644 0.000 0.000 0.104 0.252
#> SRR772644 6 0.4101 0.2663 0.308 0.000 0.000 0.000 0.028 0.664
#> SRR772645 6 0.3900 0.3759 0.232 0.000 0.000 0.000 0.040 0.728
#> SRR772646 2 0.0363 0.8040 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR772647 2 0.0547 0.8031 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR772648 2 0.5711 0.3586 0.000 0.516 0.000 0.000 0.208 0.276
#> SRR772649 2 0.5890 0.0760 0.000 0.428 0.000 0.000 0.204 0.368
#> SRR772650 6 0.3553 0.4802 0.128 0.004 0.000 0.000 0.064 0.804
#> SRR772651 6 0.3710 0.4660 0.144 0.004 0.000 0.000 0.064 0.788
#> SRR772652 1 0.1418 0.8768 0.944 0.000 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR772653 1 0.2383 0.8209 0.880 0.000 0.000 0.000 0.024 0.096
#> SRR772654 6 0.4481 0.5122 0.004 0.120 0.000 0.000 0.156 0.720
#> SRR772655 6 0.4297 0.5244 0.008 0.096 0.000 0.000 0.152 0.744
#> SRR772656 3 0.0914 0.8544 0.000 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR772657 3 0.1088 0.8528 0.000 0.000 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR772658 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772659 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772660 2 0.3455 0.7096 0.000 0.784 0.000 0.000 0.036 0.180
#> SRR772661 5 0.6503 0.8482 0.144 0.000 0.064 0.000 0.492 0.300
#> SRR772662 6 0.3836 0.5138 0.096 0.056 0.000 0.000 0.040 0.808
#> SRR772663 6 0.3745 0.5096 0.088 0.052 0.000 0.000 0.044 0.816
#> SRR772664 2 0.1124 0.8046 0.000 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR772665 2 0.2875 0.7715 0.000 0.852 0.000 0.000 0.052 0.096
#> SRR772666 3 0.0260 0.8584 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772667 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772668 4 0.0405 0.8924 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR772669 4 0.0291 0.8940 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772670 6 0.3263 0.5203 0.028 0.112 0.000 0.000 0.024 0.836
#> SRR772671 6 0.3084 0.5128 0.008 0.136 0.000 0.000 0.024 0.832
#> SRR772672 2 0.0858 0.8033 0.000 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR772673 2 0.0891 0.8038 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR772674 3 0.0914 0.8544 0.000 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR772675 5 0.6249 0.8644 0.112 0.012 0.028 0.000 0.476 0.372
#> SRR772676 6 0.5315 0.4997 0.156 0.024 0.000 0.000 0.164 0.656
#> SRR772677 6 0.5238 0.5148 0.120 0.036 0.000 0.000 0.168 0.676
#> SRR772678 5 0.5976 0.8650 0.104 0.000 0.036 0.000 0.496 0.364
#> SRR772679 6 0.3717 0.5157 0.052 0.076 0.000 0.000 0.052 0.820
#> SRR772680 6 0.3966 0.4354 0.184 0.012 0.000 0.000 0.044 0.760
#> SRR772681 3 0.0914 0.8544 0.000 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR772682 2 0.0972 0.8029 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR772683 2 0.0777 0.8036 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR772685 2 0.3563 0.7567 0.000 0.796 0.000 0.000 0.132 0.072
#> SRR772686 3 0.0291 0.8591 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR772687 3 0.1296 0.8433 0.000 0.000 0.948 0.004 0.044 0.004
#> SRR772688 4 0.0405 0.8926 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR772689 4 0.0146 0.8958 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0405 0.8577 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR772691 2 0.3268 0.7383 0.000 0.812 0.000 0.000 0.144 0.044
#> SRR772692 6 0.4741 0.4888 0.004 0.152 0.000 0.000 0.152 0.692
#> SRR772693 6 0.5681 -0.0198 0.000 0.416 0.000 0.000 0.156 0.428
#> SRR772694 2 0.1865 0.8061 0.000 0.920 0.000 0.000 0.040 0.040
#> SRR772695 2 0.4309 0.6628 0.000 0.724 0.000 0.000 0.104 0.172
#> SRR772696 2 0.4896 0.6429 0.000 0.652 0.000 0.000 0.216 0.132
#> SRR772697 2 0.4691 0.6528 0.000 0.672 0.000 0.000 0.220 0.108
#> SRR772698 3 0.4004 0.6076 0.012 0.000 0.620 0.000 0.368 0.000
#> SRR772699 1 0.4410 0.1644 0.560 0.000 0.000 0.000 0.028 0.412
#> SRR772700 1 0.4408 -0.0591 0.488 0.000 0.000 0.000 0.024 0.488
#> SRR772701 1 0.1088 0.8851 0.960 0.000 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR772702 1 0.0622 0.8891 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.959 0.961 0.983 0.5004 0.500 0.500
#> 3 3 0.780 0.837 0.916 0.2293 0.871 0.745
#> 4 4 0.605 0.669 0.822 0.1436 0.913 0.779
#> 5 5 0.640 0.627 0.812 0.0643 0.945 0.832
#> 6 6 0.652 0.569 0.773 0.0406 0.940 0.792
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772342 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772343 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772344 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.1184 0.9660 0.984 0.016
#> SRR772347 1 0.1414 0.9628 0.980 0.020
#> SRR772348 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772353 1 0.3114 0.9316 0.944 0.056
#> SRR772354 1 0.5737 0.8482 0.864 0.136
#> SRR772355 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772357 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772358 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772359 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772360 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772361 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772365 1 0.5737 0.8462 0.864 0.136
#> SRR772366 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.2603 0.9464 0.044 0.956
#> SRR772370 2 0.4022 0.9076 0.080 0.920
#> SRR772371 1 0.5059 0.8760 0.888 0.112
#> SRR772372 1 0.5408 0.8630 0.876 0.124
#> SRR772373 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772378 2 0.9993 0.0282 0.484 0.516
#> SRR772379 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772380 2 0.6801 0.7811 0.180 0.820
#> SRR772381 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772383 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772384 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772385 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772386 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772388 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772389 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772390 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772393 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772394 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772395 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772398 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772399 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772400 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772402 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772406 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772411 2 0.4022 0.9072 0.080 0.920
#> SRR772412 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772417 1 0.4939 0.8797 0.892 0.108
#> SRR772418 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.6623 0.7925 0.172 0.828
#> SRR772422 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772423 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772430 1 0.5842 0.8405 0.860 0.140
#> SRR772431 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772434 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772436 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772437 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772439 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772440 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772444 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772446 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772447 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772448 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772449 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772454 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772455 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772456 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772460 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.5842 0.8328 0.140 0.860
#> SRR772466 2 0.1184 0.9719 0.016 0.984
#> SRR772467 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772470 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772471 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772472 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772473 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772480 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772481 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772482 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772483 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772484 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772485 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772486 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772487 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772488 2 0.2603 0.9458 0.044 0.956
#> SRR772489 2 0.0376 0.9824 0.004 0.996
#> SRR772490 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772491 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772492 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772498 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772499 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772503 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772504 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.3114 0.9310 0.944 0.056
#> SRR772510 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.0376 0.9824 0.004 0.996
#> SRR772512 1 0.6973 0.7750 0.812 0.188
#> SRR772513 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772521 1 0.9358 0.4824 0.648 0.352
#> SRR772522 1 0.9248 0.5086 0.660 0.340
#> SRR772523 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772530 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772535 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772540 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772541 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772542 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772544 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772547 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772548 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772551 2 0.2043 0.9574 0.032 0.968
#> SRR772552 2 0.0672 0.9790 0.008 0.992
#> SRR772553 2 0.0376 0.9824 0.004 0.996
#> SRR772554 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772556 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772558 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772559 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772560 1 0.5946 0.8371 0.856 0.144
#> SRR772561 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772564 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772565 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772566 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772570 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772571 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772572 1 0.7376 0.7526 0.792 0.208
#> SRR772573 1 0.8327 0.6619 0.736 0.264
#> SRR772574 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772575 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772576 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772577 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772578 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.0672 0.9790 0.008 0.992
#> SRR772582 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772583 2 0.2948 0.9378 0.052 0.948
#> SRR772584 2 0.4022 0.9090 0.080 0.920
#> SRR772585 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772588 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772593 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772599 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772600 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.1633 0.9650 0.024 0.976
#> SRR772606 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772608 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772610 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4939 0.8802 0.892 0.108
#> SRR772617 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772622 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772623 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772627 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772628 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772629 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772630 1 0.7453 0.7463 0.788 0.212
#> SRR772631 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772635 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772636 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772637 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772639 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.2948 0.9380 0.052 0.948
#> SRR772643 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772644 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772645 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772646 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772650 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772651 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772653 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772654 2 0.4815 0.8801 0.104 0.896
#> SRR772655 1 0.8955 0.5701 0.688 0.312
#> SRR772656 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772662 1 0.3114 0.9311 0.944 0.056
#> SRR772663 1 0.4022 0.9078 0.920 0.080
#> SRR772664 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772670 1 0.1633 0.9595 0.976 0.024
#> SRR772671 2 0.9866 0.2340 0.432 0.568
#> SRR772672 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772676 1 0.6801 0.7920 0.820 0.180
#> SRR772677 1 0.7745 0.7217 0.772 0.228
#> SRR772678 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772679 1 0.0376 0.9755 0.996 0.004
#> SRR772680 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772681 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772692 2 0.9866 0.2391 0.432 0.568
#> SRR772693 2 0.5946 0.8310 0.144 0.856
#> SRR772694 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772696 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772697 2 0.0000 0.9857 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772700 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0000 0.9786 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.1964 0.81490 0.944 0.000 0.056
#> SRR772342 1 0.1529 0.81527 0.960 0.000 0.040
#> SRR772343 1 0.0592 0.80917 0.988 0.000 0.012
#> SRR772344 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772346 1 0.6255 0.66033 0.684 0.016 0.300
#> SRR772347 1 0.4555 0.77246 0.800 0.000 0.200
#> SRR772348 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772349 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772350 3 0.3619 0.78773 0.136 0.000 0.864
#> SRR772351 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772352 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772353 1 0.0237 0.79965 0.996 0.000 0.004
#> SRR772354 1 0.0661 0.80169 0.988 0.004 0.008
#> SRR772355 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772356 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772357 1 0.4002 0.78295 0.840 0.000 0.160
#> SRR772358 1 0.5431 0.63689 0.716 0.000 0.284
#> SRR772359 1 0.4178 0.77353 0.828 0.000 0.172
#> SRR772360 1 0.6274 0.36547 0.544 0.000 0.456
#> SRR772361 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772362 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.5098 0.73740 0.752 0.000 0.248
#> SRR772365 1 0.8044 0.54530 0.600 0.088 0.312
#> SRR772366 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772367 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772368 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772369 2 0.4346 0.80516 0.184 0.816 0.000
#> SRR772370 2 0.6505 0.21045 0.468 0.528 0.004
#> SRR772371 3 0.8260 0.07011 0.432 0.076 0.492
#> SRR772372 3 0.7552 0.37133 0.352 0.052 0.596
#> SRR772373 2 0.0592 0.96428 0.012 0.988 0.000
#> SRR772374 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772375 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772376 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772377 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772378 1 0.2400 0.77011 0.932 0.064 0.004
#> SRR772379 2 0.4409 0.81744 0.172 0.824 0.004
#> SRR772380 2 0.5480 0.69870 0.264 0.732 0.004
#> SRR772381 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772382 1 0.4121 0.78712 0.832 0.000 0.168
#> SRR772383 1 0.4178 0.78584 0.828 0.000 0.172
#> SRR772384 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772385 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772386 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772387 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772388 1 0.0892 0.81229 0.980 0.000 0.020
#> SRR772389 1 0.1163 0.81345 0.972 0.000 0.028
#> SRR772390 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772391 1 0.1289 0.81388 0.968 0.000 0.032
#> SRR772392 1 0.1289 0.81388 0.968 0.000 0.032
#> SRR772393 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772394 2 0.0747 0.95784 0.000 0.984 0.016
#> SRR772395 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772396 1 0.5988 0.56313 0.632 0.000 0.368
#> SRR772397 1 0.4796 0.76015 0.780 0.000 0.220
#> SRR772398 3 0.5560 0.53259 0.300 0.000 0.700
#> SRR772399 3 0.5591 0.52282 0.304 0.000 0.696
#> SRR772400 3 0.5138 0.62570 0.252 0.000 0.748
#> SRR772401 3 0.6154 0.21327 0.408 0.000 0.592
#> SRR772402 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772404 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772405 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772406 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772407 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 2 0.1411 0.94243 0.036 0.964 0.000
#> SRR772411 2 0.6168 0.28839 0.412 0.588 0.000
#> SRR772412 1 0.4555 0.77330 0.800 0.000 0.200
#> SRR772413 1 0.4555 0.77330 0.800 0.000 0.200
#> SRR772414 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772415 2 0.3715 0.86406 0.128 0.868 0.004
#> SRR772416 2 0.1267 0.95491 0.024 0.972 0.004
#> SRR772417 1 0.1585 0.80306 0.964 0.028 0.008
#> SRR772418 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772419 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772420 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772421 2 0.6168 0.75717 0.124 0.780 0.096
#> SRR772422 2 0.0661 0.96361 0.008 0.988 0.004
#> SRR772423 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772425 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772426 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772428 1 0.5905 0.58051 0.648 0.000 0.352
#> SRR772429 1 0.6154 0.40014 0.592 0.000 0.408
#> SRR772430 1 0.3742 0.73797 0.892 0.072 0.036
#> SRR772431 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772433 1 0.4931 0.75199 0.768 0.000 0.232
#> SRR772434 3 0.6305 -0.11198 0.484 0.000 0.516
#> SRR772435 1 0.3619 0.80202 0.864 0.000 0.136
#> SRR772436 1 0.2537 0.81281 0.920 0.000 0.080
#> SRR772437 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772438 1 0.5760 0.63309 0.672 0.000 0.328
#> SRR772439 1 0.5397 0.70041 0.720 0.000 0.280
#> SRR772440 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772441 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772442 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772444 1 0.4931 0.75052 0.768 0.000 0.232
#> SRR772445 1 0.4887 0.75384 0.772 0.000 0.228
#> SRR772446 1 0.0592 0.80917 0.988 0.000 0.012
#> SRR772447 1 0.0592 0.80917 0.988 0.000 0.012
#> SRR772448 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772449 2 0.0237 0.96656 0.000 0.996 0.004
#> SRR772450 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0892 0.81229 0.980 0.000 0.020
#> SRR772453 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772454 1 0.1163 0.81343 0.972 0.000 0.028
#> SRR772455 1 0.0424 0.80222 0.992 0.000 0.008
#> SRR772456 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.4235 0.78393 0.824 0.000 0.176
#> SRR772459 1 0.4504 0.77405 0.804 0.000 0.196
#> SRR772460 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772463 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772464 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772465 1 0.6521 0.00843 0.504 0.492 0.004
#> SRR772466 1 0.6386 0.28343 0.584 0.412 0.004
#> SRR772467 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772468 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772469 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772470 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772471 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772472 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772473 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772475 2 0.5325 0.68159 0.004 0.748 0.248
#> SRR772476 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1529 0.81491 0.960 0.000 0.040
#> SRR772479 1 0.1289 0.81388 0.968 0.000 0.032
#> SRR772480 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772481 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772482 3 0.2356 0.84402 0.072 0.000 0.928
#> SRR772483 3 0.2356 0.84581 0.072 0.000 0.928
#> SRR772484 2 0.1267 0.95462 0.024 0.972 0.004
#> SRR772485 2 0.2400 0.92310 0.064 0.932 0.004
#> SRR772486 3 0.5810 0.44344 0.336 0.000 0.664
#> SRR772487 3 0.5988 0.35194 0.368 0.000 0.632
#> SRR772488 2 0.5763 0.66955 0.276 0.716 0.008
#> SRR772489 2 0.4629 0.79889 0.188 0.808 0.004
#> SRR772490 1 0.5810 0.62233 0.664 0.000 0.336
#> SRR772491 1 0.4974 0.74617 0.764 0.000 0.236
#> SRR772492 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772497 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772498 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772499 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772500 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772502 1 0.6309 0.19041 0.504 0.000 0.496
#> SRR772503 1 0.6274 0.32976 0.544 0.000 0.456
#> SRR772504 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772506 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772507 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772508 2 0.0424 0.96623 0.008 0.992 0.000
#> SRR772509 3 0.0000 0.87600 0.000 0.000 1.000
#> SRR772510 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772511 2 0.0424 0.96434 0.000 0.992 0.008
#> SRR772512 3 0.0424 0.86992 0.000 0.008 0.992
#> SRR772513 2 0.0983 0.95976 0.016 0.980 0.004
#> SRR772514 2 0.0983 0.95976 0.016 0.980 0.004
#> SRR772515 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772516 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772517 2 0.0424 0.96562 0.008 0.992 0.000
#> SRR772518 2 0.0983 0.95976 0.016 0.980 0.004
#> SRR772519 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772520 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772521 1 0.6556 0.54120 0.692 0.276 0.032
#> SRR772522 1 0.8033 0.53353 0.640 0.240 0.120
#> SRR772523 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772524 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772525 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772526 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772527 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772528 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772529 1 0.5529 0.68048 0.704 0.000 0.296
#> SRR772530 1 0.6008 0.55662 0.628 0.000 0.372
#> SRR772531 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772532 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772533 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772534 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772535 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772536 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772539 1 0.2625 0.81230 0.916 0.000 0.084
#> SRR772540 3 0.5178 0.62155 0.256 0.000 0.744
#> SRR772541 2 0.1399 0.95176 0.028 0.968 0.004
#> SRR772542 3 0.4931 0.65958 0.232 0.000 0.768
#> SRR772543 1 0.6309 0.18975 0.504 0.000 0.496
#> SRR772544 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772545 1 0.1289 0.81388 0.968 0.000 0.032
#> SRR772546 1 0.1031 0.81310 0.976 0.000 0.024
#> SRR772547 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772548 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772549 1 0.0892 0.81229 0.980 0.000 0.020
#> SRR772550 1 0.0592 0.80917 0.988 0.000 0.012
#> SRR772551 2 0.4062 0.82698 0.164 0.836 0.000
#> SRR772552 2 0.4452 0.79767 0.192 0.808 0.000
#> SRR772553 2 0.6476 0.23066 0.004 0.548 0.448
#> SRR772554 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772555 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772556 1 0.4555 0.77330 0.800 0.000 0.200
#> SRR772557 1 0.4555 0.77330 0.800 0.000 0.200
#> SRR772558 1 0.0592 0.80917 0.988 0.000 0.012
#> SRR772559 1 0.0592 0.80917 0.988 0.000 0.012
#> SRR772560 1 0.2918 0.77265 0.924 0.032 0.044
#> SRR772561 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772562 2 0.0592 0.96441 0.012 0.988 0.000
#> SRR772563 2 0.0592 0.96441 0.012 0.988 0.000
#> SRR772564 3 0.5178 0.61941 0.256 0.000 0.744
#> SRR772565 1 0.6274 0.33001 0.544 0.000 0.456
#> SRR772566 1 0.5733 0.63729 0.676 0.000 0.324
#> SRR772567 1 0.5905 0.58967 0.648 0.000 0.352
#> SRR772568 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772569 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772570 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772571 1 0.0747 0.81103 0.984 0.000 0.016
#> SRR772572 1 0.0983 0.80429 0.980 0.016 0.004
#> SRR772573 1 0.1765 0.79496 0.956 0.040 0.004
#> SRR772574 1 0.5098 0.73647 0.752 0.000 0.248
#> SRR772575 1 0.5397 0.70084 0.720 0.000 0.280
#> SRR772576 2 0.0237 0.96738 0.004 0.996 0.000
#> SRR772577 2 0.0237 0.96738 0.004 0.996 0.000
#> SRR772578 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772580 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772581 2 0.2066 0.91523 0.060 0.940 0.000
#> SRR772582 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772583 2 0.6209 0.50705 0.368 0.628 0.004
#> SRR772584 2 0.6467 0.43935 0.388 0.604 0.008
#> SRR772585 2 0.4047 0.84345 0.148 0.848 0.004
#> SRR772586 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772587 1 0.4750 0.76358 0.784 0.000 0.216
#> SRR772588 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772589 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772590 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772591 1 0.4605 0.77061 0.796 0.000 0.204
#> SRR772592 1 0.4605 0.77061 0.796 0.000 0.204
#> SRR772593 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772594 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772596 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772597 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772598 3 0.3340 0.80343 0.120 0.000 0.880
#> SRR772599 3 0.2878 0.82556 0.096 0.000 0.904
#> SRR772600 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772601 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772602 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772603 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772605 2 0.5115 0.75073 0.228 0.768 0.004
#> SRR772606 3 0.5497 0.54675 0.292 0.000 0.708
#> SRR772607 3 0.6244 0.06775 0.440 0.000 0.560
#> SRR772608 2 0.1129 0.95735 0.020 0.976 0.004
#> SRR772609 2 0.1267 0.95475 0.024 0.972 0.004
#> SRR772610 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772611 2 0.0592 0.96441 0.012 0.988 0.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772614 1 0.4654 0.76861 0.792 0.000 0.208
#> SRR772615 1 0.5988 0.56018 0.632 0.000 0.368
#> SRR772616 1 0.1411 0.80490 0.964 0.000 0.036
#> SRR772617 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 2 0.0237 0.96741 0.004 0.996 0.000
#> SRR772622 2 0.0747 0.95800 0.016 0.984 0.000
#> SRR772623 3 0.2959 0.82174 0.100 0.000 0.900
#> SRR772624 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772625 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772626 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772627 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772628 1 0.4702 0.76570 0.788 0.000 0.212
#> SRR772629 1 0.4062 0.78873 0.836 0.000 0.164
#> SRR772630 1 0.2955 0.77354 0.912 0.080 0.008
#> SRR772631 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772632 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772634 3 0.2878 0.82636 0.096 0.000 0.904
#> SRR772635 3 0.3879 0.77087 0.152 0.000 0.848
#> SRR772636 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772637 1 0.0892 0.81229 0.980 0.000 0.020
#> SRR772638 1 0.0892 0.81229 0.980 0.000 0.020
#> SRR772639 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 2 0.3030 0.87902 0.004 0.904 0.092
#> SRR772643 2 0.0661 0.96463 0.008 0.988 0.004
#> SRR772644 1 0.5098 0.72745 0.752 0.000 0.248
#> SRR772645 1 0.1860 0.81036 0.948 0.000 0.052
#> SRR772646 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772647 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772648 2 0.0237 0.96667 0.004 0.996 0.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772650 1 0.2165 0.81488 0.936 0.000 0.064
#> SRR772651 1 0.2261 0.81452 0.932 0.000 0.068
#> SRR772652 1 0.4504 0.77512 0.804 0.000 0.196
#> SRR772653 1 0.4931 0.75152 0.768 0.000 0.232
#> SRR772654 2 0.5016 0.69247 0.240 0.760 0.000
#> SRR772655 1 0.4995 0.70294 0.824 0.144 0.032
#> SRR772656 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772657 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772658 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772660 2 0.1964 0.93256 0.056 0.944 0.000
#> SRR772661 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772662 1 0.7310 0.55682 0.600 0.040 0.360
#> SRR772663 1 0.5237 0.71394 0.824 0.056 0.120
#> SRR772664 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772665 2 0.0424 0.96629 0.008 0.992 0.000
#> SRR772666 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772667 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772670 1 0.0237 0.79965 0.996 0.000 0.004
#> SRR772671 1 0.4110 0.64280 0.844 0.152 0.004
#> SRR772672 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772673 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772674 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772675 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772676 1 0.3896 0.73255 0.864 0.128 0.008
#> SRR772677 1 0.4110 0.70884 0.844 0.152 0.004
#> SRR772678 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772679 1 0.1411 0.81168 0.964 0.000 0.036
#> SRR772680 1 0.1643 0.81460 0.956 0.000 0.044
#> SRR772681 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772682 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772683 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772685 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772686 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772687 3 0.3619 0.78766 0.136 0.000 0.864
#> SRR772688 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772691 2 0.0237 0.96770 0.004 0.996 0.000
#> SRR772692 3 0.5497 0.49651 0.000 0.292 0.708
#> SRR772693 2 0.4974 0.68269 0.000 0.764 0.236
#> SRR772694 2 0.0237 0.96741 0.004 0.996 0.000
#> SRR772695 2 0.0829 0.96218 0.012 0.984 0.004
#> SRR772696 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772697 2 0.0000 0.96869 0.000 1.000 0.000
#> SRR772698 3 0.0237 0.87991 0.004 0.000 0.996
#> SRR772699 3 0.2356 0.84364 0.072 0.000 0.928
#> SRR772700 3 0.2448 0.84109 0.076 0.000 0.924
#> SRR772701 1 0.4796 0.75998 0.780 0.000 0.220
#> SRR772702 1 0.4931 0.75042 0.768 0.000 0.232
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.1004 0.827224 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR772342 1 0.0657 0.826362 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR772343 1 0.1151 0.825660 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR772344 2 0.0000 0.778754 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772345 2 0.0336 0.779618 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772346 1 0.6773 0.657666 0.660 0.020 0.160 0.160
#> SRR772347 1 0.5503 0.718624 0.728 0.008 0.060 0.204
#> SRR772348 2 0.4730 0.182638 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR772349 2 0.4643 0.248151 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR772350 3 0.3801 0.693503 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR772351 2 0.1022 0.781587 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772352 2 0.2216 0.769853 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR772353 1 0.4961 0.259353 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR772354 4 0.5285 -0.033537 0.468 0.008 0.000 0.524
#> SRR772355 2 0.1211 0.780304 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772356 2 0.1716 0.776347 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR772357 1 0.2466 0.816195 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR772358 1 0.3852 0.742593 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR772359 1 0.3447 0.793530 0.852 0.000 0.128 0.020
#> SRR772360 1 0.4584 0.600771 0.696 0.000 0.300 0.004
#> SRR772361 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772363 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772364 1 0.7083 0.611498 0.600 0.008 0.176 0.216
#> SRR772365 1 0.9390 0.246225 0.360 0.124 0.180 0.336
#> SRR772366 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772367 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772368 2 0.4730 0.202197 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR772369 2 0.6087 -0.114635 0.048 0.540 0.000 0.412
#> SRR772370 4 0.6133 0.664625 0.124 0.204 0.000 0.672
#> SRR772371 1 0.9164 0.286103 0.416 0.128 0.144 0.312
#> SRR772372 1 0.9216 0.100286 0.356 0.076 0.268 0.300
#> SRR772373 2 0.4746 0.212781 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR772374 2 0.4382 0.411290 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR772375 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772376 2 0.2281 0.723963 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR772377 3 0.0469 0.868138 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772378 4 0.6089 0.365161 0.328 0.064 0.000 0.608
#> SRR772379 4 0.5495 0.668975 0.028 0.348 0.000 0.624
#> SRR772380 4 0.6788 0.673605 0.144 0.264 0.000 0.592
#> SRR772381 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772382 1 0.1211 0.827157 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR772383 1 0.1474 0.825777 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR772384 3 0.0469 0.868138 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772385 2 0.3494 0.649616 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR772386 2 0.0592 0.780449 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772387 2 0.0592 0.780449 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772388 1 0.0469 0.825912 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772389 1 0.0592 0.826154 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR772390 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.1297 0.825607 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR772392 1 0.1406 0.825072 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR772393 2 0.3726 0.685757 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR772394 2 0.3908 0.682675 0.000 0.784 0.004 0.212
#> SRR772395 2 0.4193 0.472219 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR772396 1 0.4313 0.674879 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR772397 1 0.1637 0.824100 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR772398 3 0.4898 0.278802 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR772399 3 0.4888 0.286590 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR772400 3 0.4761 0.400548 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR772401 1 0.4977 0.187942 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR772402 2 0.3172 0.732018 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR772403 2 0.3219 0.729865 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR772404 2 0.4564 0.308796 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR772405 3 0.0469 0.868138 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772406 2 0.3123 0.739367 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR772407 2 0.3123 0.736100 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR772408 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772409 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772410 2 0.5873 -0.037027 0.036 0.548 0.000 0.416
#> SRR772411 4 0.7269 0.500236 0.264 0.200 0.000 0.536
#> SRR772412 1 0.1677 0.826388 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR772413 1 0.1767 0.826161 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR772414 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772415 4 0.5143 0.660130 0.012 0.360 0.000 0.628
#> SRR772416 4 0.4804 0.640308 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR772417 1 0.4053 0.721091 0.768 0.004 0.000 0.228
#> SRR772418 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.2868 0.683907 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR772420 2 0.2868 0.683907 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR772421 4 0.7856 0.116711 0.160 0.392 0.016 0.432
#> SRR772422 2 0.4746 0.452691 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR772423 2 0.3024 0.736410 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772424 2 0.2814 0.746426 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772425 2 0.1792 0.746709 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772426 2 0.1637 0.775371 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR772427 2 0.1557 0.776294 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772428 1 0.3356 0.754284 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR772429 1 0.4647 0.581542 0.704 0.000 0.288 0.008
#> SRR772430 4 0.6090 0.085681 0.448 0.036 0.004 0.512
#> SRR772431 2 0.2814 0.747903 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772432 2 0.3074 0.734906 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR772433 1 0.2197 0.820499 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR772434 1 0.4584 0.580979 0.696 0.000 0.300 0.004
#> SRR772435 1 0.4552 0.733636 0.784 0.000 0.044 0.172
#> SRR772436 1 0.3760 0.773650 0.836 0.000 0.028 0.136
#> SRR772437 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.4250 0.650209 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR772439 1 0.3764 0.727748 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR772440 2 0.4008 0.535273 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR772441 2 0.1557 0.779293 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR772442 2 0.3400 0.716406 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR772443 2 0.3569 0.705835 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772444 1 0.2647 0.801859 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR772445 1 0.2342 0.820421 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR772446 1 0.0657 0.824046 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR772447 1 0.0707 0.822546 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772448 2 0.3610 0.706811 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772449 2 0.3668 0.712103 0.000 0.808 0.004 0.188
#> SRR772450 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772451 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772452 1 0.0524 0.825603 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR772453 1 0.0469 0.826591 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772454 1 0.1557 0.813129 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR772455 1 0.3710 0.704895 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR772456 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772457 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772458 1 0.1716 0.823105 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR772459 1 0.2345 0.810556 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR772460 2 0.0188 0.778428 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772461 2 0.0188 0.778428 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772462 2 0.4356 0.409841 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR772463 2 0.4817 0.074706 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR772464 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772465 4 0.6813 0.392227 0.292 0.132 0.000 0.576
#> SRR772466 4 0.6452 0.450373 0.268 0.112 0.000 0.620
#> SRR772467 2 0.2704 0.696374 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772468 2 0.2704 0.696374 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772469 1 0.2469 0.801196 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR772470 1 0.1557 0.818423 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR772471 1 0.0895 0.823824 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772472 1 0.0895 0.823338 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772473 2 0.3024 0.736410 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772474 2 0.2704 0.751005 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772475 2 0.7001 0.136847 0.000 0.576 0.244 0.180
#> SRR772476 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772477 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772478 1 0.1406 0.825072 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR772479 1 0.1297 0.825607 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR772480 2 0.3801 0.678084 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR772481 2 0.3688 0.697174 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR772482 3 0.3444 0.746286 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR772483 3 0.3400 0.751107 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR772484 4 0.4843 0.623732 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR772485 4 0.5269 0.656617 0.016 0.364 0.000 0.620
#> SRR772486 3 0.4948 0.204620 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR772487 3 0.4916 0.246568 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR772488 4 0.6350 0.679960 0.092 0.296 0.000 0.612
#> SRR772489 4 0.5937 0.671191 0.052 0.340 0.000 0.608
#> SRR772490 1 0.4134 0.673148 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR772491 1 0.2760 0.798110 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR772492 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772493 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772494 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772495 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772496 2 0.4624 0.319457 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR772497 2 0.4624 0.282762 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR772498 2 0.3649 0.696050 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR772499 2 0.3569 0.699716 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772500 2 0.0336 0.777710 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772501 2 0.0188 0.779153 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772502 1 0.6668 0.285718 0.528 0.000 0.380 0.092
#> SRR772503 1 0.6101 0.348960 0.560 0.000 0.388 0.052
#> SRR772504 2 0.1474 0.777128 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772505 2 0.1118 0.779569 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772506 2 0.2704 0.696374 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772507 2 0.2704 0.696374 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772508 2 0.4331 0.421111 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR772509 3 0.0469 0.868138 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772510 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772511 2 0.4560 0.575929 0.004 0.700 0.000 0.296
#> SRR772512 3 0.0188 0.871155 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772513 4 0.4877 0.611149 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR772514 4 0.4855 0.620587 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR772515 2 0.0592 0.780666 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772516 2 0.1022 0.777697 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772517 2 0.4008 0.521545 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR772518 4 0.4972 0.523552 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR772519 2 0.4331 0.417450 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR772520 2 0.2814 0.688537 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772521 1 0.7426 0.317641 0.512 0.224 0.000 0.264
#> SRR772522 1 0.8141 0.245798 0.456 0.212 0.020 0.312
#> SRR772523 2 0.2530 0.757030 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR772524 2 0.1792 0.773651 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR772525 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772526 2 0.2704 0.696374 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772527 2 0.2704 0.696374 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772528 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.2888 0.801830 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR772530 1 0.4049 0.734718 0.780 0.000 0.212 0.008
#> SRR772531 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772532 2 0.0188 0.778478 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772533 2 0.0000 0.778754 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772534 1 0.2944 0.793729 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR772535 2 0.1302 0.779528 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772536 2 0.1940 0.757516 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772537 2 0.2647 0.753169 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772538 2 0.1867 0.772163 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772539 1 0.1520 0.826072 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR772540 3 0.5217 0.389247 0.380 0.000 0.608 0.012
#> SRR772541 4 0.4991 0.636274 0.004 0.388 0.000 0.608
#> SRR772542 3 0.4713 0.445088 0.360 0.000 0.640 0.000
#> SRR772543 1 0.4955 0.261439 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR772544 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772545 1 0.1059 0.825658 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR772546 1 0.0927 0.825125 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR772547 1 0.3224 0.799900 0.864 0.000 0.016 0.120
#> SRR772548 1 0.1356 0.824898 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR772549 1 0.0672 0.825070 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772550 1 0.0672 0.825264 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772551 2 0.6296 0.308320 0.064 0.548 0.000 0.388
#> SRR772552 4 0.5496 0.235479 0.024 0.372 0.000 0.604
#> SRR772553 2 0.7236 -0.107930 0.000 0.460 0.396 0.144
#> SRR772554 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772555 2 0.0592 0.780465 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772556 1 0.1975 0.826438 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR772557 1 0.1767 0.826161 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR772558 1 0.0921 0.821717 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772559 1 0.1022 0.821009 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772560 4 0.5453 0.218010 0.360 0.012 0.008 0.620
#> SRR772561 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772562 4 0.4972 0.514492 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR772563 4 0.4961 0.537107 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR772564 3 0.4769 0.535311 0.308 0.000 0.684 0.008
#> SRR772565 1 0.5112 0.426028 0.608 0.000 0.384 0.008
#> SRR772566 1 0.3311 0.767002 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR772567 1 0.3801 0.720195 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR772568 2 0.1940 0.760226 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772569 2 0.1867 0.756010 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772570 1 0.0524 0.824768 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR772571 1 0.0895 0.823695 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772572 1 0.3751 0.744675 0.800 0.004 0.000 0.196
#> SRR772573 1 0.4053 0.720497 0.768 0.004 0.000 0.228
#> SRR772574 1 0.4225 0.761245 0.792 0.000 0.184 0.024
#> SRR772575 1 0.4225 0.759943 0.792 0.000 0.184 0.024
#> SRR772576 2 0.4866 0.337235 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR772577 2 0.3444 0.697387 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772578 2 0.2345 0.761847 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772579 2 0.2149 0.766548 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR772580 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772581 2 0.5219 0.590391 0.044 0.712 0.000 0.244
#> SRR772582 2 0.4313 0.629696 0.004 0.736 0.000 0.260
#> SRR772583 4 0.5906 0.657592 0.148 0.152 0.000 0.700
#> SRR772584 4 0.5452 0.659284 0.108 0.156 0.000 0.736
#> SRR772585 4 0.5614 0.672717 0.036 0.336 0.000 0.628
#> SRR772586 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.3224 0.802629 0.864 0.000 0.120 0.016
#> SRR772588 2 0.3649 0.587269 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR772589 2 0.3219 0.647790 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR772590 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772591 1 0.1940 0.819764 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR772592 1 0.2149 0.815578 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR772593 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.2469 0.758583 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772595 2 0.2345 0.761771 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772596 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772597 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772598 3 0.3688 0.710484 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR772599 3 0.3400 0.744872 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR772600 2 0.3266 0.728138 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR772601 2 0.3024 0.736410 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772602 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772603 2 0.3123 0.732531 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR772604 2 0.3266 0.727257 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR772605 4 0.4995 0.670629 0.032 0.248 0.000 0.720
#> SRR772606 3 0.4713 0.429426 0.360 0.000 0.640 0.000
#> SRR772607 3 0.4996 0.000495 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR772608 4 0.4866 0.613484 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR772609 4 0.4933 0.561891 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR772610 2 0.4679 0.229746 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR772611 2 0.4998 -0.361643 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR772612 2 0.3024 0.736410 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772613 2 0.3024 0.736410 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772614 1 0.2469 0.807163 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR772615 1 0.4543 0.568092 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR772616 1 0.4459 0.752168 0.780 0.000 0.032 0.188
#> SRR772617 2 0.2469 0.758814 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772618 2 0.1940 0.770601 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772619 2 0.0188 0.778428 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772620 2 0.0188 0.778428 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772621 2 0.2408 0.759704 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR772622 2 0.3444 0.723344 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772623 3 0.3219 0.760953 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR772624 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.2760 0.698430 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR772626 2 0.3791 0.694721 0.000 0.796 0.004 0.200
#> SRR772627 2 0.3945 0.681018 0.000 0.780 0.004 0.216
#> SRR772628 1 0.3486 0.755011 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR772629 1 0.1118 0.827197 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR772630 1 0.4220 0.703474 0.748 0.004 0.000 0.248
#> SRR772631 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0921 0.772998 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772633 2 0.1022 0.768785 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR772634 3 0.3450 0.772540 0.156 0.000 0.836 0.008
#> SRR772635 3 0.4040 0.661054 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR772636 2 0.3448 0.651169 0.000 0.828 0.004 0.168
#> SRR772637 1 0.0524 0.825197 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR772638 1 0.0672 0.825070 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR772639 2 0.2081 0.778448 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR772640 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772641 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772642 2 0.5993 0.205553 0.000 0.628 0.064 0.308
#> SRR772643 2 0.4193 0.479293 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR772644 1 0.4353 0.717090 0.756 0.000 0.232 0.012
#> SRR772645 1 0.2101 0.824868 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR772646 2 0.0592 0.777481 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772647 2 0.1302 0.766230 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR772648 2 0.4053 0.664861 0.004 0.768 0.000 0.228
#> SRR772649 2 0.3801 0.679682 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR772650 1 0.2021 0.827828 0.936 0.000 0.040 0.024
#> SRR772651 1 0.2494 0.826309 0.916 0.000 0.048 0.036
#> SRR772652 1 0.1767 0.826801 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR772653 1 0.2255 0.823419 0.920 0.000 0.068 0.012
#> SRR772654 2 0.6473 0.382717 0.168 0.644 0.000 0.188
#> SRR772655 1 0.5831 0.658489 0.736 0.112 0.016 0.136
#> SRR772656 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0921 0.780100 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR772659 2 0.1867 0.771758 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772660 4 0.5244 0.478613 0.008 0.436 0.000 0.556
#> SRR772661 3 0.0469 0.868138 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772662 1 0.7892 0.336621 0.420 0.004 0.236 0.340
#> SRR772663 1 0.6119 0.336837 0.584 0.016 0.028 0.372
#> SRR772664 2 0.4843 0.135809 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR772665 2 0.5132 -0.078135 0.004 0.548 0.000 0.448
#> SRR772666 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772667 2 0.2345 0.720006 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR772668 2 0.1211 0.779053 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772669 2 0.0336 0.779345 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR772670 1 0.4941 0.277966 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR772671 4 0.5994 0.417493 0.296 0.068 0.000 0.636
#> SRR772672 2 0.3873 0.546364 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR772673 2 0.4040 0.508294 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR772674 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772675 3 0.0469 0.868138 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772676 1 0.4841 0.715832 0.780 0.080 0.000 0.140
#> SRR772677 1 0.5440 0.683694 0.736 0.104 0.000 0.160
#> SRR772678 3 0.0469 0.868138 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772679 1 0.5174 0.418199 0.620 0.000 0.012 0.368
#> SRR772680 1 0.3647 0.745806 0.832 0.000 0.016 0.152
#> SRR772681 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772682 2 0.4454 0.367792 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR772683 2 0.3074 0.664649 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR772685 2 0.2760 0.751020 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR772686 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772687 3 0.3610 0.719140 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR772688 2 0.1474 0.757275 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR772689 2 0.0469 0.776909 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772690 3 0.0188 0.873639 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772691 2 0.3494 0.649616 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR772692 3 0.6531 0.384757 0.008 0.248 0.640 0.104
#> SRR772693 2 0.6278 0.451197 0.004 0.668 0.212 0.116
#> SRR772694 2 0.3837 0.694764 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR772695 4 0.4804 0.467284 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR772696 2 0.4040 0.653809 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR772697 2 0.3444 0.709988 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772698 3 0.0000 0.872592 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772699 3 0.2760 0.796856 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR772700 3 0.3052 0.785771 0.136 0.000 0.860 0.004
#> SRR772701 1 0.2859 0.806416 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR772702 1 0.2647 0.801353 0.880 0.000 0.120 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.0960 0.81651 0.972 0.004 0.016 0.000 0.008
#> SRR772342 1 0.0960 0.81729 0.972 0.008 0.016 0.000 0.004
#> SRR772343 1 0.1965 0.79850 0.924 0.024 0.000 0.000 0.052
#> SRR772344 4 0.0162 0.78679 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772345 4 0.0162 0.78679 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772346 5 0.5781 0.39728 0.296 0.008 0.096 0.000 0.600
#> SRR772347 5 0.4587 0.51968 0.228 0.008 0.040 0.000 0.724
#> SRR772348 4 0.4375 0.23102 0.000 0.420 0.000 0.576 0.004
#> SRR772349 4 0.4287 0.10315 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR772350 3 0.3395 0.66327 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR772351 4 0.1216 0.78462 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020
#> SRR772352 4 0.2464 0.76733 0.000 0.016 0.000 0.888 0.096
#> SRR772353 2 0.4854 0.30178 0.308 0.648 0.000 0.000 0.044
#> SRR772354 2 0.4161 0.45556 0.208 0.752 0.000 0.000 0.040
#> SRR772355 4 0.1626 0.78122 0.000 0.016 0.000 0.940 0.044
#> SRR772356 4 0.1648 0.77612 0.000 0.020 0.000 0.940 0.040
#> SRR772357 1 0.2520 0.80397 0.888 0.004 0.096 0.000 0.012
#> SRR772358 1 0.2642 0.80303 0.888 0.004 0.084 0.000 0.024
#> SRR772359 1 0.3241 0.78482 0.856 0.028 0.104 0.000 0.012
#> SRR772360 1 0.4124 0.68494 0.744 0.008 0.232 0.000 0.016
#> SRR772361 3 0.0000 0.82962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772363 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772364 1 0.7634 0.01368 0.396 0.068 0.184 0.000 0.352
#> SRR772365 5 0.7555 0.41668 0.168 0.092 0.112 0.044 0.584
#> SRR772366 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772367 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772368 4 0.4734 0.33281 0.000 0.372 0.000 0.604 0.024
#> SRR772369 5 0.7263 0.03276 0.024 0.244 0.000 0.352 0.380
#> SRR772370 2 0.6509 0.47855 0.068 0.604 0.000 0.092 0.236
#> SRR772371 5 0.3500 0.51028 0.100 0.004 0.048 0.004 0.844
#> SRR772372 5 0.3732 0.50399 0.084 0.008 0.060 0.008 0.840
#> SRR772373 4 0.4735 0.06953 0.000 0.460 0.000 0.524 0.016
#> SRR772374 4 0.4135 0.43423 0.000 0.340 0.000 0.656 0.004
#> SRR772375 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772376 4 0.1544 0.76975 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR772377 3 0.2344 0.78986 0.000 0.032 0.904 0.000 0.064
#> SRR772378 2 0.3875 0.55521 0.124 0.816 0.000 0.012 0.048
#> SRR772379 2 0.2563 0.71627 0.000 0.872 0.000 0.120 0.008
#> SRR772380 2 0.4697 0.65400 0.088 0.780 0.000 0.092 0.040
#> SRR772381 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.0932 0.81707 0.972 0.004 0.020 0.000 0.004
#> SRR772383 1 0.0609 0.81678 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR772384 3 0.2344 0.78986 0.000 0.032 0.904 0.000 0.064
#> SRR772385 4 0.4660 0.61858 0.000 0.192 0.000 0.728 0.080
#> SRR772386 4 0.0404 0.78856 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772387 4 0.0404 0.78768 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772388 1 0.0451 0.81336 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772389 1 0.0451 0.81336 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR772390 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772391 1 0.1498 0.81218 0.952 0.016 0.008 0.000 0.024
#> SRR772392 1 0.1588 0.81131 0.948 0.016 0.008 0.000 0.028
#> SRR772393 4 0.4890 0.49994 0.000 0.040 0.000 0.628 0.332
#> SRR772394 4 0.5185 0.41648 0.000 0.040 0.004 0.580 0.376
#> SRR772395 4 0.4015 0.42108 0.000 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR772396 1 0.3074 0.72591 0.804 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0865 0.81736 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR772398 3 0.4278 0.18936 0.452 0.000 0.548 0.000 0.000
#> SRR772399 3 0.4440 0.12178 0.468 0.000 0.528 0.000 0.004
#> SRR772400 3 0.4227 0.28690 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR772401 1 0.4211 0.44038 0.636 0.000 0.360 0.000 0.004
#> SRR772402 4 0.3769 0.68898 0.000 0.032 0.000 0.788 0.180
#> SRR772403 4 0.3769 0.68898 0.000 0.032 0.000 0.788 0.180
#> SRR772404 4 0.4288 0.33578 0.000 0.384 0.000 0.612 0.004
#> SRR772405 3 0.2344 0.78986 0.000 0.032 0.904 0.000 0.064
#> SRR772406 4 0.3621 0.70401 0.000 0.020 0.000 0.788 0.192
#> SRR772407 4 0.3577 0.70832 0.000 0.032 0.000 0.808 0.160
#> SRR772408 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772409 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772410 5 0.7066 0.16376 0.024 0.216 0.000 0.296 0.464
#> SRR772411 5 0.6881 0.38097 0.112 0.180 0.000 0.112 0.596
#> SRR772412 1 0.1507 0.81617 0.952 0.012 0.024 0.000 0.012
#> SRR772413 1 0.1507 0.81617 0.952 0.012 0.024 0.000 0.012
#> SRR772414 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772415 2 0.2338 0.71519 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR772416 2 0.2377 0.71978 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR772417 5 0.4963 0.35614 0.352 0.040 0.000 0.000 0.608
#> SRR772418 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772419 4 0.1965 0.74949 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR772420 4 0.2280 0.73138 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR772421 5 0.8179 0.25268 0.156 0.184 0.000 0.256 0.404
#> SRR772422 4 0.6749 0.01413 0.000 0.328 0.000 0.400 0.272
#> SRR772423 4 0.3772 0.69282 0.000 0.036 0.000 0.792 0.172
#> SRR772424 4 0.3309 0.72425 0.000 0.036 0.000 0.836 0.128
#> SRR772425 4 0.0794 0.78395 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR772426 4 0.1493 0.77762 0.000 0.024 0.000 0.948 0.028
#> SRR772427 4 0.1211 0.78053 0.000 0.024 0.000 0.960 0.016
#> SRR772428 1 0.2377 0.77919 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR772429 1 0.3231 0.71320 0.800 0.000 0.196 0.000 0.004
#> SRR772430 2 0.3812 0.49811 0.196 0.780 0.000 0.004 0.020
#> SRR772431 4 0.3262 0.72766 0.000 0.036 0.000 0.840 0.124
#> SRR772432 4 0.3695 0.69994 0.000 0.036 0.000 0.800 0.164
#> SRR772433 1 0.2116 0.80920 0.912 0.004 0.076 0.000 0.008
#> SRR772434 1 0.3266 0.71666 0.796 0.000 0.200 0.000 0.004
#> SRR772435 1 0.4678 0.65392 0.752 0.180 0.036 0.000 0.032
#> SRR772436 1 0.4492 0.67932 0.776 0.144 0.020 0.000 0.060
#> SRR772437 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.3741 0.63640 0.732 0.000 0.264 0.000 0.004
#> SRR772439 1 0.3231 0.71424 0.800 0.000 0.196 0.000 0.004
#> SRR772440 4 0.4505 0.33620 0.000 0.384 0.000 0.604 0.012
#> SRR772441 4 0.2740 0.75895 0.000 0.096 0.000 0.876 0.028
#> SRR772442 4 0.4572 0.57289 0.000 0.036 0.000 0.684 0.280
#> SRR772443 4 0.4527 0.58711 0.000 0.036 0.000 0.692 0.272
#> SRR772444 1 0.1638 0.81224 0.932 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR772445 1 0.1914 0.81700 0.928 0.008 0.056 0.000 0.008
#> SRR772446 1 0.0898 0.80969 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR772447 1 0.1211 0.80927 0.960 0.016 0.000 0.000 0.024
#> SRR772448 4 0.4134 0.66232 0.000 0.032 0.000 0.744 0.224
#> SRR772449 4 0.4680 0.59583 0.000 0.036 0.004 0.688 0.272
#> SRR772450 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772451 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772452 1 0.0609 0.81074 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772453 1 0.0404 0.81146 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772454 1 0.1997 0.79752 0.924 0.040 0.000 0.000 0.036
#> SRR772455 1 0.5359 0.47010 0.644 0.256 0.000 0.000 0.100
#> SRR772456 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772457 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772458 1 0.0794 0.81709 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.1408 0.81528 0.948 0.000 0.044 0.000 0.008
#> SRR772460 4 0.0162 0.78708 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772461 4 0.0162 0.78708 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772462 4 0.4273 0.14635 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR772463 2 0.4306 0.04457 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR772464 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772465 5 0.6326 0.36793 0.112 0.228 0.000 0.044 0.616
#> SRR772466 5 0.6118 0.33131 0.080 0.256 0.000 0.044 0.620
#> SRR772467 4 0.1851 0.75479 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR772468 4 0.1851 0.75479 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR772469 1 0.4288 0.46462 0.664 0.012 0.000 0.000 0.324
#> SRR772470 1 0.2280 0.76253 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR772471 1 0.1484 0.80358 0.944 0.008 0.000 0.000 0.048
#> SRR772472 1 0.1408 0.80306 0.948 0.008 0.000 0.000 0.044
#> SRR772473 4 0.3810 0.68932 0.000 0.036 0.000 0.788 0.176
#> SRR772474 4 0.3262 0.72830 0.000 0.036 0.000 0.840 0.124
#> SRR772475 4 0.7590 0.17181 0.000 0.180 0.232 0.492 0.096
#> SRR772476 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772477 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772478 1 0.1686 0.81032 0.944 0.020 0.008 0.000 0.028
#> SRR772479 1 0.1498 0.81218 0.952 0.016 0.008 0.000 0.024
#> SRR772480 4 0.5091 0.39830 0.000 0.044 0.000 0.584 0.372
#> SRR772481 4 0.5171 0.53950 0.000 0.076 0.000 0.648 0.276
#> SRR772482 3 0.3395 0.67698 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR772483 3 0.3508 0.65499 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR772484 2 0.2813 0.71134 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR772485 2 0.2516 0.72066 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR772486 1 0.4829 -0.03688 0.496 0.000 0.484 0.000 0.020
#> SRR772487 3 0.4740 0.11731 0.468 0.000 0.516 0.000 0.016
#> SRR772488 2 0.2771 0.72149 0.012 0.860 0.000 0.128 0.000
#> SRR772489 2 0.2719 0.72055 0.004 0.852 0.000 0.144 0.000
#> SRR772490 1 0.3741 0.64622 0.732 0.000 0.264 0.000 0.004
#> SRR772491 1 0.1502 0.81340 0.940 0.000 0.056 0.000 0.004
#> SRR772492 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772493 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772494 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772495 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772496 4 0.4946 0.47446 0.000 0.276 0.000 0.664 0.060
#> SRR772497 4 0.4661 0.44503 0.000 0.312 0.000 0.656 0.032
#> SRR772498 4 0.4708 0.55763 0.000 0.040 0.000 0.668 0.292
#> SRR772499 4 0.4768 0.54277 0.000 0.040 0.000 0.656 0.304
#> SRR772500 4 0.0404 0.78656 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR772501 4 0.0451 0.78701 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772502 5 0.6816 0.05399 0.392 0.012 0.184 0.000 0.412
#> SRR772503 1 0.6884 0.16980 0.444 0.008 0.288 0.000 0.260
#> SRR772504 4 0.0865 0.78315 0.000 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR772505 4 0.0451 0.78648 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772506 4 0.1792 0.75754 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR772507 4 0.1608 0.76513 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR772508 4 0.4192 0.27913 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR772509 3 0.2645 0.77845 0.000 0.044 0.888 0.000 0.068
#> SRR772510 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772511 5 0.4309 0.38711 0.000 0.016 0.000 0.308 0.676
#> SRR772512 3 0.1493 0.81136 0.000 0.024 0.948 0.000 0.028
#> SRR772513 2 0.2852 0.70830 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR772514 2 0.2732 0.71517 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR772515 4 0.0451 0.78666 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR772516 4 0.0912 0.78918 0.000 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR772517 4 0.4304 -0.00609 0.000 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR772518 2 0.3636 0.62021 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR772519 4 0.4088 0.38050 0.000 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR772520 4 0.1965 0.74987 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR772521 5 0.4153 0.53419 0.192 0.008 0.000 0.032 0.768
#> SRR772522 5 0.4170 0.52795 0.136 0.008 0.016 0.036 0.804
#> SRR772523 4 0.2735 0.75158 0.000 0.036 0.000 0.880 0.084
#> SRR772524 4 0.1493 0.77843 0.000 0.024 0.000 0.948 0.028
#> SRR772525 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.1792 0.75754 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR772527 4 0.1792 0.75754 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR772528 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772529 1 0.1942 0.81136 0.920 0.000 0.068 0.000 0.012
#> SRR772530 1 0.2771 0.78388 0.860 0.000 0.128 0.000 0.012
#> SRR772531 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772532 4 0.0162 0.78708 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772533 4 0.0451 0.78712 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR772534 5 0.4648 0.09742 0.464 0.012 0.000 0.000 0.524
#> SRR772535 4 0.1106 0.78125 0.000 0.024 0.000 0.964 0.012
#> SRR772536 4 0.2864 0.73232 0.000 0.012 0.000 0.852 0.136
#> SRR772537 4 0.2570 0.75326 0.000 0.028 0.000 0.888 0.084
#> SRR772538 4 0.2260 0.76240 0.000 0.028 0.000 0.908 0.064
#> SRR772539 1 0.1904 0.81327 0.936 0.028 0.016 0.000 0.020
#> SRR772540 3 0.4912 0.05667 0.480 0.012 0.500 0.000 0.008
#> SRR772541 2 0.2660 0.71910 0.000 0.864 0.000 0.128 0.008
#> SRR772542 3 0.4425 0.20808 0.452 0.000 0.544 0.000 0.004
#> SRR772543 1 0.4367 0.27575 0.580 0.000 0.416 0.000 0.004
#> SRR772544 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.1405 0.81298 0.956 0.016 0.008 0.000 0.020
#> SRR772546 1 0.1278 0.81240 0.960 0.016 0.004 0.000 0.020
#> SRR772547 1 0.4769 0.30912 0.588 0.016 0.004 0.000 0.392
#> SRR772548 1 0.3132 0.69485 0.820 0.008 0.000 0.000 0.172
#> SRR772549 1 0.0727 0.81413 0.980 0.004 0.004 0.000 0.012
#> SRR772550 1 0.0671 0.81124 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR772551 5 0.6746 0.29340 0.028 0.156 0.000 0.288 0.528
#> SRR772552 5 0.6224 0.24025 0.004 0.232 0.000 0.196 0.568
#> SRR772553 4 0.7690 -0.06303 0.000 0.148 0.376 0.384 0.092
#> SRR772554 4 0.0162 0.78708 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772555 4 0.0162 0.78708 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772556 1 0.1908 0.81391 0.936 0.016 0.024 0.000 0.024
#> SRR772557 1 0.1908 0.81391 0.936 0.016 0.024 0.000 0.024
#> SRR772558 1 0.2079 0.79130 0.916 0.020 0.000 0.000 0.064
#> SRR772559 1 0.2208 0.78705 0.908 0.020 0.000 0.000 0.072
#> SRR772560 2 0.5964 0.26980 0.136 0.588 0.000 0.004 0.272
#> SRR772561 3 0.0000 0.82962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772562 2 0.3534 0.63362 0.000 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR772563 2 0.3932 0.54765 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR772564 3 0.4553 0.36052 0.384 0.004 0.604 0.000 0.008
#> SRR772565 1 0.4346 0.56846 0.680 0.004 0.304 0.000 0.012
#> SRR772566 1 0.2127 0.79399 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR772567 1 0.1965 0.80064 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR772568 4 0.2446 0.76721 0.000 0.044 0.000 0.900 0.056
#> SRR772569 4 0.2873 0.73558 0.000 0.020 0.000 0.860 0.120
#> SRR772570 1 0.0510 0.81146 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772571 1 0.1300 0.80907 0.956 0.016 0.000 0.000 0.028
#> SRR772572 1 0.5289 0.00995 0.500 0.048 0.000 0.000 0.452
#> SRR772573 5 0.5280 0.14882 0.440 0.048 0.000 0.000 0.512
#> SRR772574 1 0.3732 0.76454 0.812 0.008 0.148 0.000 0.032
#> SRR772575 1 0.3780 0.77101 0.820 0.020 0.132 0.000 0.028
#> SRR772576 4 0.6441 0.17626 0.000 0.344 0.000 0.468 0.188
#> SRR772577 4 0.4581 0.65712 0.000 0.196 0.000 0.732 0.072
#> SRR772578 4 0.2325 0.76244 0.000 0.028 0.000 0.904 0.068
#> SRR772579 4 0.2036 0.76890 0.000 0.024 0.000 0.920 0.056
#> SRR772580 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772581 5 0.5369 -0.04727 0.004 0.044 0.000 0.444 0.508
#> SRR772582 5 0.5092 -0.03211 0.000 0.036 0.000 0.440 0.524
#> SRR772583 2 0.3011 0.65564 0.036 0.884 0.000 0.048 0.032
#> SRR772584 2 0.2675 0.65637 0.020 0.900 0.000 0.040 0.040
#> SRR772585 2 0.2570 0.71382 0.004 0.880 0.000 0.108 0.008
#> SRR772586 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772587 1 0.3812 0.74416 0.812 0.000 0.096 0.000 0.092
#> SRR772588 4 0.3109 0.65376 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR772589 4 0.2813 0.68753 0.000 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR772590 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0880 0.81658 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR772592 1 0.0963 0.81639 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR772593 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772594 4 0.2685 0.74928 0.000 0.028 0.000 0.880 0.092
#> SRR772595 4 0.2511 0.75518 0.000 0.028 0.000 0.892 0.080
#> SRR772596 3 0.0963 0.82056 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR772597 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772598 3 0.3837 0.54859 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000
#> SRR772599 3 0.3424 0.66114 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000
#> SRR772600 4 0.3883 0.68466 0.000 0.036 0.000 0.780 0.184
#> SRR772601 4 0.3772 0.69272 0.000 0.036 0.000 0.792 0.172
#> SRR772602 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772603 4 0.3810 0.69079 0.000 0.036 0.000 0.788 0.176
#> SRR772604 4 0.3919 0.68053 0.000 0.036 0.000 0.776 0.188
#> SRR772605 2 0.3142 0.65900 0.004 0.864 0.000 0.056 0.076
#> SRR772606 3 0.4161 0.35559 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR772607 1 0.4283 0.16069 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.2732 0.71486 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR772609 2 0.3242 0.66972 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR772610 4 0.4264 0.34980 0.000 0.376 0.000 0.620 0.004
#> SRR772611 2 0.3913 0.54490 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR772612 4 0.3577 0.70292 0.000 0.032 0.000 0.808 0.160
#> SRR772613 4 0.3452 0.71207 0.000 0.032 0.000 0.820 0.148
#> SRR772614 1 0.1197 0.81668 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.3662 0.66132 0.744 0.000 0.252 0.000 0.004
#> SRR772616 1 0.5250 0.61044 0.708 0.084 0.020 0.000 0.188
#> SRR772617 4 0.2535 0.75582 0.000 0.032 0.000 0.892 0.076
#> SRR772618 4 0.2473 0.76007 0.000 0.032 0.000 0.896 0.072
#> SRR772619 4 0.0162 0.78708 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772620 4 0.0162 0.78708 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR772621 4 0.4497 0.60703 0.000 0.208 0.000 0.732 0.060
#> SRR772622 4 0.4929 0.52310 0.004 0.044 0.000 0.660 0.292
#> SRR772623 3 0.3109 0.70359 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR772624 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772625 4 0.2951 0.73844 0.000 0.112 0.000 0.860 0.028
#> SRR772626 4 0.4687 0.56364 0.000 0.040 0.000 0.672 0.288
#> SRR772627 4 0.4935 0.47945 0.000 0.040 0.000 0.616 0.344
#> SRR772628 1 0.3171 0.73190 0.816 0.000 0.176 0.000 0.008
#> SRR772629 1 0.0865 0.81660 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR772630 5 0.5278 0.37047 0.344 0.052 0.000 0.004 0.600
#> SRR772631 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772632 4 0.0609 0.78530 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772633 4 0.0880 0.78256 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772634 3 0.3742 0.71183 0.184 0.012 0.792 0.000 0.012
#> SRR772635 3 0.4809 0.54181 0.296 0.004 0.664 0.000 0.036
#> SRR772636 4 0.4581 0.62066 0.000 0.196 0.000 0.732 0.072
#> SRR772637 1 0.0404 0.81146 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772638 1 0.0771 0.80993 0.976 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR772639 4 0.1568 0.78884 0.000 0.036 0.000 0.944 0.020
#> SRR772640 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772641 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772642 4 0.6489 0.02472 0.000 0.384 0.056 0.500 0.060
#> SRR772643 4 0.4965 0.04619 0.000 0.452 0.000 0.520 0.028
#> SRR772644 1 0.3916 0.71444 0.780 0.004 0.188 0.000 0.028
#> SRR772645 1 0.2122 0.81069 0.924 0.008 0.036 0.000 0.032
#> SRR772646 4 0.0609 0.78530 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR772647 4 0.0880 0.78267 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR772648 4 0.4971 0.17903 0.000 0.028 0.000 0.512 0.460
#> SRR772649 4 0.4829 0.11786 0.000 0.020 0.000 0.496 0.484
#> SRR772650 1 0.2919 0.79489 0.888 0.044 0.024 0.000 0.044
#> SRR772651 1 0.3099 0.79841 0.880 0.040 0.040 0.000 0.040
#> SRR772652 1 0.1921 0.81628 0.932 0.012 0.044 0.000 0.012
#> SRR772653 1 0.2162 0.81275 0.916 0.008 0.064 0.000 0.012
#> SRR772654 5 0.7091 0.31495 0.084 0.084 0.000 0.372 0.460
#> SRR772655 1 0.6152 -0.13128 0.480 0.028 0.004 0.052 0.436
#> SRR772656 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.82962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.0451 0.78619 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772659 4 0.1485 0.77720 0.000 0.020 0.000 0.948 0.032
#> SRR772660 2 0.5940 0.47635 0.000 0.568 0.000 0.292 0.140
#> SRR772661 3 0.2344 0.78986 0.000 0.032 0.904 0.000 0.064
#> SRR772662 2 0.7225 -0.03107 0.340 0.416 0.216 0.000 0.028
#> SRR772663 1 0.5655 0.13129 0.508 0.440 0.016 0.008 0.028
#> SRR772664 4 0.6118 0.24348 0.000 0.288 0.000 0.548 0.164
#> SRR772665 4 0.6728 -0.15159 0.000 0.308 0.000 0.416 0.276
#> SRR772666 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.1410 0.77299 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR772668 4 0.0798 0.78588 0.000 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR772669 4 0.0451 0.78702 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772670 2 0.6175 0.15267 0.312 0.528 0.000 0.000 0.160
#> SRR772671 2 0.5189 0.49252 0.108 0.724 0.000 0.020 0.148
#> SRR772672 4 0.3305 0.62615 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR772673 4 0.3816 0.50412 0.000 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR772674 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.2344 0.78986 0.000 0.032 0.904 0.000 0.064
#> SRR772676 1 0.5049 -0.00536 0.500 0.004 0.000 0.024 0.472
#> SRR772677 1 0.5362 0.00522 0.500 0.008 0.000 0.036 0.456
#> SRR772678 3 0.2344 0.78986 0.000 0.032 0.904 0.000 0.064
#> SRR772679 1 0.5319 0.08379 0.492 0.464 0.004 0.000 0.040
#> SRR772680 1 0.4082 0.67820 0.788 0.160 0.008 0.000 0.044
#> SRR772681 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772682 4 0.4275 0.51715 0.000 0.284 0.000 0.696 0.020
#> SRR772683 4 0.2813 0.68847 0.000 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR772685 4 0.2915 0.74215 0.000 0.024 0.000 0.860 0.116
#> SRR772686 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.3480 0.64497 0.248 0.000 0.752 0.000 0.000
#> SRR772688 4 0.0703 0.78452 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR772689 4 0.0290 0.78714 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR772690 3 0.0162 0.83133 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR772691 4 0.4835 0.61418 0.000 0.188 0.004 0.724 0.084
#> SRR772692 3 0.7235 0.27179 0.000 0.096 0.552 0.176 0.176
#> SRR772693 4 0.6804 0.39635 0.000 0.088 0.184 0.600 0.128
#> SRR772694 4 0.5516 0.58211 0.000 0.220 0.000 0.644 0.136
#> SRR772695 2 0.5597 0.47424 0.000 0.640 0.000 0.200 0.160
#> SRR772696 4 0.4874 0.46297 0.000 0.032 0.000 0.600 0.368
#> SRR772697 4 0.4352 0.62382 0.000 0.036 0.000 0.720 0.244
#> SRR772698 3 0.1043 0.81974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR772699 3 0.3143 0.70961 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000
#> SRR772700 3 0.3430 0.68741 0.220 0.000 0.776 0.000 0.004
#> SRR772701 1 0.1682 0.81836 0.940 0.004 0.044 0.000 0.012
#> SRR772702 1 0.1270 0.81515 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.1223 0.81508 0.960 0.004 0.016 0.000 0.012 0.008
#> SRR772342 1 0.1602 0.81312 0.944 0.004 0.016 0.000 0.020 0.016
#> SRR772343 1 0.3958 0.69783 0.784 0.036 0.000 0.000 0.036 0.144
#> SRR772344 4 0.0260 0.72328 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR772345 4 0.0458 0.72152 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR772346 6 0.5754 0.59668 0.212 0.000 0.096 0.000 0.068 0.624
#> SRR772347 6 0.5031 0.57808 0.100 0.000 0.024 0.000 0.196 0.680
#> SRR772348 4 0.4581 0.26581 0.000 0.372 0.000 0.592 0.012 0.024
#> SRR772349 4 0.4157 0.10746 0.000 0.444 0.000 0.544 0.012 0.000
#> SRR772350 3 0.2772 0.69477 0.180 0.000 0.816 0.000 0.000 0.004
#> SRR772351 4 0.1267 0.70703 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR772352 4 0.2773 0.67617 0.000 0.004 0.000 0.868 0.064 0.064
#> SRR772353 2 0.5240 0.38305 0.192 0.676 0.000 0.000 0.076 0.056
#> SRR772354 2 0.4480 0.49126 0.116 0.760 0.000 0.000 0.068 0.056
#> SRR772355 4 0.1387 0.70516 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR772356 4 0.1765 0.69016 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR772357 1 0.2493 0.81160 0.896 0.012 0.064 0.000 0.012 0.016
#> SRR772358 1 0.3388 0.79776 0.848 0.012 0.076 0.000 0.024 0.040
#> SRR772359 1 0.4357 0.74353 0.780 0.016 0.120 0.000 0.044 0.040
#> SRR772360 1 0.4225 0.65927 0.712 0.000 0.240 0.000 0.012 0.036
#> SRR772361 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 1 0.8086 -0.13579 0.356 0.060 0.136 0.000 0.304 0.144
#> SRR772365 5 0.7457 -0.09170 0.132 0.044 0.084 0.012 0.516 0.212
#> SRR772366 3 0.2071 0.75519 0.000 0.012 0.916 0.000 0.044 0.028
#> SRR772367 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772368 4 0.5590 0.24718 0.000 0.324 0.000 0.568 0.052 0.056
#> SRR772369 6 0.6632 -0.03753 0.004 0.180 0.000 0.340 0.040 0.436
#> SRR772370 2 0.6284 0.38299 0.052 0.552 0.000 0.092 0.016 0.288
#> SRR772371 6 0.5369 0.43390 0.056 0.000 0.028 0.000 0.376 0.540
#> SRR772372 6 0.5377 0.43159 0.056 0.000 0.028 0.000 0.380 0.536
#> SRR772373 4 0.4770 0.10449 0.000 0.428 0.000 0.532 0.016 0.024
#> SRR772374 4 0.4048 0.47186 0.000 0.292 0.000 0.684 0.012 0.012
#> SRR772375 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772376 4 0.1478 0.71199 0.000 0.032 0.000 0.944 0.020 0.004
#> SRR772377 3 0.5252 0.57831 0.000 0.044 0.676 0.000 0.180 0.100
#> SRR772378 2 0.3769 0.55384 0.084 0.820 0.000 0.004 0.040 0.052
#> SRR772379 2 0.3292 0.65969 0.000 0.844 0.000 0.076 0.024 0.056
#> SRR772380 2 0.4802 0.56198 0.040 0.744 0.000 0.040 0.028 0.148
#> SRR772381 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.1296 0.81164 0.952 0.000 0.012 0.000 0.004 0.032
#> SRR772383 1 0.1268 0.81109 0.952 0.000 0.008 0.000 0.004 0.036
#> SRR772384 3 0.5222 0.58183 0.000 0.044 0.680 0.000 0.176 0.100
#> SRR772385 4 0.6695 -0.12856 0.000 0.100 0.000 0.456 0.332 0.112
#> SRR772386 4 0.1257 0.72226 0.000 0.020 0.000 0.952 0.028 0.000
#> SRR772387 4 0.1074 0.72258 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028 0.000
#> SRR772388 1 0.1294 0.81215 0.956 0.004 0.008 0.000 0.008 0.024
#> SRR772389 1 0.1262 0.81044 0.956 0.000 0.008 0.000 0.016 0.020
#> SRR772390 3 0.2071 0.75519 0.000 0.012 0.916 0.000 0.044 0.028
#> SRR772391 1 0.1549 0.80739 0.944 0.004 0.004 0.000 0.024 0.024
#> SRR772392 1 0.1675 0.80164 0.936 0.008 0.000 0.000 0.032 0.024
#> SRR772393 5 0.3788 0.65914 0.000 0.004 0.000 0.280 0.704 0.012
#> SRR772394 5 0.3998 0.63817 0.000 0.000 0.000 0.248 0.712 0.040
#> SRR772395 4 0.3923 0.33127 0.000 0.372 0.000 0.620 0.008 0.000
#> SRR772396 1 0.3368 0.67667 0.756 0.000 0.232 0.000 0.000 0.012
#> SRR772397 1 0.1148 0.81470 0.960 0.004 0.020 0.000 0.000 0.016
#> SRR772398 3 0.4131 0.38237 0.384 0.000 0.600 0.000 0.000 0.016
#> SRR772399 3 0.4101 0.33175 0.408 0.000 0.580 0.000 0.000 0.012
#> SRR772400 3 0.3934 0.41295 0.376 0.000 0.616 0.000 0.000 0.008
#> SRR772401 1 0.3975 0.34491 0.600 0.000 0.392 0.000 0.000 0.008
#> SRR772402 4 0.3684 0.34956 0.000 0.000 0.000 0.664 0.332 0.004
#> SRR772403 4 0.3668 0.36286 0.000 0.000 0.000 0.668 0.328 0.004
#> SRR772404 4 0.4614 0.36037 0.000 0.332 0.000 0.624 0.028 0.016
#> SRR772405 3 0.5222 0.58183 0.000 0.044 0.680 0.000 0.176 0.100
#> SRR772406 4 0.3773 0.54505 0.000 0.000 0.000 0.752 0.204 0.044
#> SRR772407 4 0.3672 0.40642 0.000 0.000 0.000 0.688 0.304 0.008
#> SRR772408 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772409 4 0.0146 0.72356 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772410 6 0.5631 0.13900 0.008 0.072 0.000 0.296 0.032 0.592
#> SRR772411 6 0.4180 0.60578 0.084 0.048 0.000 0.036 0.028 0.804
#> SRR772412 1 0.1275 0.80854 0.956 0.000 0.012 0.000 0.016 0.016
#> SRR772413 1 0.1180 0.80943 0.960 0.000 0.012 0.000 0.012 0.016
#> SRR772414 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772415 2 0.1951 0.66233 0.000 0.916 0.000 0.060 0.004 0.020
#> SRR772416 2 0.2538 0.67886 0.000 0.860 0.000 0.124 0.000 0.016
#> SRR772417 6 0.2669 0.63881 0.156 0.008 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR772418 3 0.2231 0.75126 0.000 0.016 0.908 0.000 0.048 0.028
#> SRR772419 4 0.1701 0.69472 0.000 0.072 0.000 0.920 0.008 0.000
#> SRR772420 4 0.1866 0.68723 0.000 0.084 0.000 0.908 0.008 0.000
#> SRR772421 5 0.7428 0.28392 0.148 0.152 0.000 0.108 0.524 0.068
#> SRR772422 5 0.6448 0.43069 0.004 0.292 0.000 0.212 0.468 0.024
#> SRR772423 4 0.3426 0.45758 0.000 0.000 0.000 0.720 0.276 0.004
#> SRR772424 4 0.3076 0.51941 0.000 0.000 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR772425 4 0.1078 0.71987 0.000 0.016 0.000 0.964 0.008 0.012
#> SRR772426 4 0.2003 0.66659 0.000 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR772427 4 0.1957 0.67001 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR772428 1 0.2994 0.69735 0.788 0.000 0.208 0.000 0.000 0.004
#> SRR772429 1 0.3337 0.63554 0.736 0.000 0.260 0.000 0.000 0.004
#> SRR772430 2 0.3706 0.52150 0.140 0.800 0.000 0.000 0.032 0.028
#> SRR772431 4 0.3383 0.47318 0.000 0.004 0.000 0.728 0.268 0.000
#> SRR772432 4 0.3693 0.44238 0.000 0.008 0.000 0.708 0.280 0.004
#> SRR772433 1 0.2313 0.79214 0.884 0.000 0.100 0.000 0.004 0.012
#> SRR772434 1 0.3221 0.68131 0.772 0.000 0.220 0.000 0.004 0.004
#> SRR772435 1 0.5420 0.51295 0.680 0.188 0.016 0.000 0.068 0.048
#> SRR772436 1 0.4985 0.55278 0.712 0.140 0.000 0.000 0.100 0.048
#> SRR772437 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.4230 0.40894 0.612 0.000 0.364 0.000 0.000 0.024
#> SRR772439 1 0.3713 0.66463 0.744 0.000 0.224 0.000 0.000 0.032
#> SRR772440 4 0.4728 0.19166 0.000 0.392 0.000 0.556 0.052 0.000
#> SRR772441 4 0.3842 0.58839 0.000 0.156 0.000 0.768 0.076 0.000
#> SRR772442 4 0.4676 0.26911 0.000 0.008 0.000 0.632 0.312 0.048
#> SRR772443 4 0.4323 0.32251 0.000 0.004 0.000 0.652 0.312 0.032
#> SRR772444 1 0.2214 0.79526 0.888 0.000 0.096 0.000 0.000 0.016
#> SRR772445 1 0.1674 0.80944 0.924 0.000 0.068 0.000 0.004 0.004
#> SRR772446 1 0.1440 0.80692 0.948 0.004 0.004 0.000 0.012 0.032
#> SRR772447 1 0.1440 0.80673 0.948 0.004 0.004 0.000 0.012 0.032
#> SRR772448 5 0.3860 0.33702 0.000 0.000 0.000 0.472 0.528 0.000
#> SRR772449 5 0.3915 0.49507 0.000 0.000 0.000 0.412 0.584 0.004
#> SRR772450 4 0.0146 0.72356 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772451 4 0.0146 0.72356 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772452 1 0.1793 0.80599 0.932 0.004 0.008 0.000 0.016 0.040
#> SRR772453 1 0.1862 0.80648 0.928 0.004 0.008 0.000 0.016 0.044
#> SRR772454 1 0.3427 0.72797 0.840 0.044 0.000 0.000 0.060 0.056
#> SRR772455 1 0.6860 0.04626 0.468 0.236 0.000 0.000 0.080 0.216
#> SRR772456 4 0.0291 0.72316 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR772457 4 0.0146 0.72356 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772458 1 0.1575 0.81040 0.936 0.000 0.032 0.000 0.000 0.032
#> SRR772459 1 0.1921 0.80547 0.916 0.000 0.052 0.000 0.000 0.032
#> SRR772460 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0146 0.72365 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772462 4 0.4072 0.11312 0.000 0.448 0.000 0.544 0.008 0.000
#> SRR772463 4 0.4312 0.07050 0.000 0.456 0.000 0.528 0.008 0.008
#> SRR772464 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772465 6 0.4287 0.58879 0.084 0.096 0.000 0.016 0.020 0.784
#> SRR772466 6 0.4002 0.58340 0.060 0.092 0.000 0.020 0.020 0.808
#> SRR772467 4 0.1398 0.70601 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008 0.000
#> SRR772468 4 0.1524 0.70193 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008 0.000
#> SRR772469 6 0.4313 0.09901 0.480 0.004 0.000 0.000 0.012 0.504
#> SRR772470 1 0.3466 0.67136 0.760 0.000 0.008 0.000 0.008 0.224
#> SRR772471 1 0.3227 0.73210 0.816 0.004 0.004 0.000 0.020 0.156
#> SRR772472 1 0.3184 0.74297 0.828 0.008 0.004 0.000 0.020 0.140
#> SRR772473 4 0.3626 0.43015 0.000 0.004 0.000 0.704 0.288 0.004
#> SRR772474 4 0.3512 0.46143 0.000 0.008 0.000 0.720 0.272 0.000
#> SRR772475 5 0.8204 0.18317 0.000 0.100 0.124 0.288 0.368 0.120
#> SRR772476 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1623 0.80686 0.940 0.004 0.004 0.000 0.020 0.032
#> SRR772479 1 0.1476 0.80854 0.948 0.004 0.008 0.000 0.012 0.028
#> SRR772480 4 0.5188 -0.17567 0.000 0.012 0.000 0.512 0.416 0.060
#> SRR772481 4 0.5207 0.09671 0.000 0.048 0.000 0.572 0.352 0.028
#> SRR772482 3 0.3560 0.62936 0.256 0.000 0.732 0.000 0.004 0.008
#> SRR772483 3 0.3608 0.63871 0.248 0.000 0.736 0.000 0.004 0.012
#> SRR772484 2 0.2402 0.68049 0.000 0.868 0.000 0.120 0.012 0.000
#> SRR772485 2 0.2313 0.67910 0.000 0.884 0.000 0.100 0.012 0.004
#> SRR772486 3 0.4403 0.31462 0.408 0.000 0.564 0.000 0.000 0.028
#> SRR772487 3 0.4453 0.38902 0.372 0.000 0.592 0.000 0.000 0.036
#> SRR772488 2 0.2468 0.67959 0.008 0.880 0.000 0.096 0.016 0.000
#> SRR772489 2 0.2405 0.68025 0.004 0.880 0.000 0.100 0.016 0.000
#> SRR772490 1 0.3707 0.56301 0.680 0.000 0.312 0.000 0.000 0.008
#> SRR772491 1 0.2384 0.79906 0.884 0.000 0.084 0.000 0.000 0.032
#> SRR772492 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 4 0.4592 0.48514 0.000 0.232 0.000 0.692 0.012 0.064
#> SRR772497 4 0.4590 0.45299 0.000 0.272 0.000 0.668 0.012 0.048
#> SRR772498 5 0.3802 0.66124 0.000 0.000 0.000 0.312 0.676 0.012
#> SRR772499 5 0.3819 0.63097 0.000 0.000 0.000 0.340 0.652 0.008
#> SRR772500 4 0.0508 0.72474 0.000 0.012 0.000 0.984 0.004 0.000
#> SRR772501 4 0.0146 0.72365 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772502 6 0.6108 0.47831 0.248 0.000 0.188 0.000 0.028 0.536
#> SRR772503 3 0.6463 -0.12461 0.328 0.008 0.336 0.000 0.004 0.324
#> SRR772504 4 0.1075 0.71269 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR772505 4 0.0790 0.71666 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR772506 4 0.1333 0.70797 0.000 0.048 0.000 0.944 0.008 0.000
#> SRR772507 4 0.1333 0.70797 0.000 0.048 0.000 0.944 0.008 0.000
#> SRR772508 4 0.4018 0.22111 0.000 0.412 0.000 0.580 0.008 0.000
#> SRR772509 3 0.5589 0.53327 0.000 0.044 0.632 0.000 0.212 0.112
#> SRR772510 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772511 6 0.5000 0.27453 0.000 0.008 0.000 0.180 0.144 0.668
#> SRR772512 3 0.2868 0.71373 0.000 0.004 0.852 0.000 0.112 0.032
#> SRR772513 2 0.2920 0.65823 0.000 0.820 0.000 0.168 0.008 0.004
#> SRR772514 2 0.3109 0.65889 0.000 0.812 0.000 0.168 0.004 0.016
#> SRR772515 4 0.0547 0.72348 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR772516 4 0.0909 0.72496 0.000 0.012 0.000 0.968 0.020 0.000
#> SRR772517 2 0.3991 0.13948 0.000 0.524 0.000 0.472 0.004 0.000
#> SRR772518 2 0.3217 0.60971 0.000 0.768 0.000 0.224 0.008 0.000
#> SRR772519 4 0.3758 0.44602 0.000 0.324 0.000 0.668 0.008 0.000
#> SRR772520 4 0.2170 0.67435 0.000 0.100 0.000 0.888 0.012 0.000
#> SRR772521 6 0.4943 0.53335 0.092 0.000 0.000 0.004 0.272 0.632
#> SRR772522 6 0.5164 0.46662 0.052 0.008 0.008 0.004 0.328 0.600
#> SRR772523 4 0.2883 0.56405 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212 0.000
#> SRR772524 4 0.1814 0.68062 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.1524 0.70193 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008 0.000
#> SRR772527 4 0.1524 0.70193 0.000 0.060 0.000 0.932 0.008 0.000
#> SRR772528 3 0.2071 0.75519 0.000 0.012 0.916 0.000 0.044 0.028
#> SRR772529 1 0.2706 0.79343 0.860 0.000 0.104 0.000 0.000 0.036
#> SRR772530 1 0.2972 0.77998 0.836 0.000 0.128 0.000 0.000 0.036
#> SRR772531 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772532 4 0.0260 0.72316 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR772533 4 0.0458 0.72135 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR772534 6 0.3840 0.60318 0.264 0.004 0.004 0.000 0.012 0.716
#> SRR772535 4 0.0865 0.71569 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR772536 4 0.2568 0.67005 0.000 0.000 0.000 0.876 0.068 0.056
#> SRR772537 4 0.2527 0.61277 0.000 0.000 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR772538 4 0.2048 0.66195 0.000 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR772539 1 0.2564 0.78950 0.896 0.028 0.004 0.000 0.040 0.032
#> SRR772540 3 0.5266 -0.00745 0.468 0.020 0.472 0.000 0.016 0.024
#> SRR772541 2 0.2712 0.67721 0.000 0.864 0.000 0.108 0.016 0.012
#> SRR772542 3 0.4200 0.36945 0.392 0.000 0.592 0.000 0.004 0.012
#> SRR772543 3 0.4399 0.12951 0.460 0.000 0.516 0.000 0.000 0.024
#> SRR772544 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.1053 0.80954 0.964 0.000 0.004 0.000 0.012 0.020
#> SRR772546 1 0.0665 0.80983 0.980 0.000 0.004 0.000 0.008 0.008
#> SRR772547 6 0.4583 0.45627 0.344 0.024 0.000 0.000 0.016 0.616
#> SRR772548 1 0.4413 0.34045 0.612 0.004 0.004 0.000 0.020 0.360
#> SRR772549 1 0.1406 0.80991 0.952 0.004 0.008 0.000 0.016 0.020
#> SRR772550 1 0.1520 0.81039 0.948 0.008 0.008 0.000 0.016 0.020
#> SRR772551 5 0.7275 0.39216 0.016 0.104 0.000 0.176 0.468 0.236
#> SRR772552 6 0.6681 0.13056 0.000 0.116 0.000 0.172 0.180 0.532
#> SRR772553 5 0.8390 0.13855 0.000 0.092 0.224 0.208 0.356 0.120
#> SRR772554 4 0.0260 0.72400 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR772555 4 0.0363 0.72373 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR772556 1 0.1899 0.79425 0.928 0.004 0.008 0.000 0.028 0.032
#> SRR772557 1 0.1819 0.79642 0.932 0.004 0.008 0.000 0.024 0.032
#> SRR772558 1 0.4059 0.63923 0.736 0.016 0.004 0.000 0.020 0.224
#> SRR772559 1 0.3761 0.63887 0.744 0.008 0.000 0.000 0.020 0.228
#> SRR772560 6 0.6407 0.08215 0.104 0.400 0.000 0.000 0.068 0.428
#> SRR772561 3 0.0146 0.77998 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772562 2 0.3634 0.52052 0.000 0.696 0.000 0.296 0.008 0.000
#> SRR772563 2 0.4002 0.35230 0.000 0.588 0.000 0.404 0.008 0.000
#> SRR772564 3 0.4244 0.50224 0.320 0.000 0.652 0.000 0.020 0.008
#> SRR772565 1 0.4546 0.41129 0.608 0.000 0.356 0.000 0.016 0.020
#> SRR772566 1 0.2531 0.77421 0.856 0.000 0.132 0.000 0.000 0.012
#> SRR772567 1 0.2692 0.76262 0.840 0.000 0.148 0.000 0.000 0.012
#> SRR772568 4 0.2445 0.69444 0.000 0.028 0.000 0.896 0.056 0.020
#> SRR772569 4 0.2745 0.67116 0.000 0.012 0.000 0.876 0.056 0.056
#> SRR772570 1 0.1410 0.80861 0.944 0.000 0.004 0.000 0.008 0.044
#> SRR772571 1 0.1737 0.80429 0.932 0.008 0.000 0.000 0.020 0.040
#> SRR772572 6 0.3955 0.50387 0.340 0.004 0.000 0.000 0.008 0.648
#> SRR772573 6 0.3915 0.59721 0.284 0.012 0.000 0.000 0.008 0.696
#> SRR772574 1 0.3692 0.76207 0.812 0.008 0.124 0.000 0.016 0.040
#> SRR772575 1 0.4521 0.73700 0.772 0.016 0.112 0.000 0.044 0.056
#> SRR772576 4 0.6339 -0.39700 0.000 0.252 0.000 0.380 0.356 0.012
#> SRR772577 4 0.5345 0.27960 0.000 0.220 0.000 0.592 0.188 0.000
#> SRR772578 4 0.2260 0.65042 0.000 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR772579 4 0.1863 0.68011 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772581 5 0.5397 0.54661 0.008 0.008 0.000 0.208 0.636 0.140
#> SRR772582 5 0.5525 0.53201 0.000 0.008 0.000 0.224 0.592 0.176
#> SRR772583 2 0.2684 0.61842 0.012 0.892 0.000 0.020 0.044 0.032
#> SRR772584 2 0.3187 0.59566 0.028 0.864 0.000 0.012 0.048 0.048
#> SRR772585 2 0.2182 0.66830 0.000 0.900 0.000 0.076 0.020 0.004
#> SRR772586 3 0.2231 0.75126 0.000 0.016 0.908 0.000 0.048 0.028
#> SRR772587 1 0.4800 0.64565 0.712 0.000 0.104 0.000 0.024 0.160
#> SRR772588 4 0.2848 0.61238 0.000 0.176 0.000 0.816 0.008 0.000
#> SRR772589 4 0.2706 0.62685 0.000 0.160 0.000 0.832 0.008 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.1341 0.81040 0.948 0.000 0.028 0.000 0.000 0.024
#> SRR772592 1 0.1418 0.81018 0.944 0.000 0.032 0.000 0.000 0.024
#> SRR772593 3 0.2231 0.75126 0.000 0.016 0.908 0.000 0.048 0.028
#> SRR772594 4 0.2378 0.63366 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR772595 4 0.2454 0.62694 0.000 0.000 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR772596 3 0.1565 0.76391 0.000 0.004 0.940 0.000 0.028 0.028
#> SRR772597 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772598 3 0.3266 0.60650 0.272 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000
#> SRR772599 3 0.3175 0.63215 0.256 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000
#> SRR772600 4 0.4045 0.31882 0.000 0.008 0.000 0.648 0.336 0.008
#> SRR772601 4 0.3468 0.44334 0.000 0.000 0.000 0.712 0.284 0.004
#> SRR772602 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772603 4 0.3848 0.41240 0.000 0.012 0.000 0.692 0.292 0.004
#> SRR772604 4 0.3984 0.35176 0.000 0.008 0.000 0.664 0.320 0.008
#> SRR772605 2 0.4517 0.51297 0.000 0.720 0.000 0.024 0.056 0.200
#> SRR772606 3 0.3652 0.51854 0.324 0.000 0.672 0.000 0.000 0.004
#> SRR772607 3 0.4184 0.02574 0.488 0.000 0.500 0.000 0.000 0.012
#> SRR772608 2 0.2872 0.67351 0.000 0.832 0.000 0.152 0.012 0.004
#> SRR772609 2 0.3357 0.61118 0.000 0.764 0.000 0.224 0.008 0.004
#> SRR772610 4 0.4000 0.42280 0.000 0.324 0.000 0.660 0.008 0.008
#> SRR772611 2 0.4203 0.37639 0.000 0.596 0.000 0.388 0.008 0.008
#> SRR772612 4 0.3198 0.48670 0.000 0.000 0.000 0.740 0.260 0.000
#> SRR772613 4 0.3076 0.52270 0.000 0.000 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR772614 1 0.1867 0.80862 0.916 0.000 0.064 0.000 0.000 0.020
#> SRR772615 1 0.3717 0.62175 0.708 0.000 0.276 0.000 0.000 0.016
#> SRR772616 1 0.6185 0.27394 0.540 0.060 0.016 0.000 0.064 0.320
#> SRR772617 4 0.2697 0.59004 0.000 0.000 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR772618 4 0.3023 0.56009 0.000 0.004 0.000 0.784 0.212 0.000
#> SRR772619 4 0.0146 0.72365 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772620 4 0.0146 0.72365 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR772621 4 0.5409 0.33672 0.000 0.248 0.000 0.632 0.076 0.044
#> SRR772622 4 0.5777 0.14770 0.000 0.024 0.000 0.576 0.144 0.256
#> SRR772623 3 0.2362 0.72314 0.136 0.000 0.860 0.000 0.000 0.004
#> SRR772624 3 0.2231 0.75126 0.000 0.016 0.908 0.000 0.048 0.028
#> SRR772625 4 0.4644 0.48512 0.000 0.048 0.000 0.732 0.164 0.056
#> SRR772626 5 0.3725 0.65633 0.000 0.000 0.000 0.316 0.676 0.008
#> SRR772627 5 0.3729 0.66463 0.000 0.000 0.000 0.296 0.692 0.012
#> SRR772628 1 0.3588 0.69579 0.776 0.000 0.180 0.000 0.000 0.044
#> SRR772629 1 0.1151 0.81001 0.956 0.000 0.012 0.000 0.000 0.032
#> SRR772630 6 0.3093 0.63945 0.164 0.012 0.000 0.000 0.008 0.816
#> SRR772631 3 0.2394 0.74711 0.000 0.020 0.900 0.000 0.048 0.032
#> SRR772632 4 0.0405 0.72255 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR772633 4 0.0806 0.71873 0.000 0.020 0.000 0.972 0.008 0.000
#> SRR772634 3 0.4028 0.70341 0.132 0.016 0.792 0.000 0.044 0.016
#> SRR772635 3 0.4844 0.60331 0.248 0.004 0.676 0.000 0.024 0.048
#> SRR772636 4 0.6630 -0.08176 0.000 0.100 0.000 0.476 0.316 0.108
#> SRR772637 1 0.1340 0.80781 0.948 0.000 0.004 0.000 0.008 0.040
#> SRR772638 1 0.1628 0.80771 0.940 0.004 0.008 0.000 0.012 0.036
#> SRR772639 4 0.1745 0.70866 0.000 0.012 0.000 0.920 0.068 0.000
#> SRR772640 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 4 0.6352 -0.18376 0.000 0.380 0.032 0.424 0.164 0.000
#> SRR772643 2 0.5642 0.21360 0.000 0.456 0.000 0.420 0.116 0.008
#> SRR772644 1 0.4544 0.70860 0.744 0.004 0.160 0.000 0.032 0.060
#> SRR772645 1 0.3260 0.78214 0.852 0.008 0.040 0.000 0.020 0.080
#> SRR772646 4 0.0717 0.72088 0.000 0.016 0.000 0.976 0.008 0.000
#> SRR772647 4 0.1049 0.71659 0.000 0.032 0.000 0.960 0.008 0.000
#> SRR772648 4 0.6103 -0.37398 0.008 0.004 0.000 0.432 0.384 0.172
#> SRR772649 4 0.6053 -0.37630 0.000 0.000 0.000 0.412 0.308 0.280
#> SRR772650 1 0.3748 0.73120 0.828 0.056 0.008 0.000 0.056 0.052
#> SRR772651 1 0.4221 0.71758 0.804 0.060 0.024 0.000 0.060 0.052
#> SRR772652 1 0.1959 0.80344 0.924 0.000 0.032 0.000 0.024 0.020
#> SRR772653 1 0.2386 0.80320 0.896 0.000 0.064 0.000 0.012 0.028
#> SRR772654 6 0.7127 0.01282 0.044 0.060 0.000 0.304 0.120 0.472
#> SRR772655 6 0.6536 0.45670 0.352 0.016 0.004 0.048 0.092 0.488
#> SRR772656 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.0790 0.71626 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR772659 4 0.1765 0.68122 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR772660 2 0.6476 0.37353 0.000 0.440 0.000 0.304 0.028 0.228
#> SRR772661 3 0.5222 0.58183 0.000 0.044 0.680 0.000 0.176 0.100
#> SRR772662 2 0.7380 -0.02964 0.332 0.392 0.188 0.000 0.044 0.044
#> SRR772663 1 0.5788 0.01469 0.456 0.440 0.000 0.004 0.064 0.036
#> SRR772664 4 0.5558 0.34025 0.000 0.196 0.000 0.600 0.012 0.192
#> SRR772665 4 0.6136 -0.02235 0.000 0.176 0.000 0.448 0.016 0.360
#> SRR772666 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.1124 0.71480 0.000 0.036 0.000 0.956 0.008 0.000
#> SRR772668 4 0.0937 0.71294 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR772669 4 0.0458 0.72127 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR772670 2 0.6989 0.04518 0.196 0.444 0.000 0.000 0.092 0.268
#> SRR772671 2 0.5769 0.37901 0.056 0.616 0.000 0.008 0.072 0.248
#> SRR772672 4 0.3190 0.57025 0.000 0.220 0.000 0.772 0.008 0.000
#> SRR772673 4 0.3595 0.49380 0.000 0.288 0.000 0.704 0.008 0.000
#> SRR772674 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772675 3 0.5252 0.57831 0.000 0.044 0.676 0.000 0.180 0.100
#> SRR772676 6 0.4728 0.53477 0.340 0.000 0.000 0.004 0.052 0.604
#> SRR772677 6 0.6092 0.49598 0.352 0.008 0.000 0.040 0.088 0.512
#> SRR772678 3 0.5252 0.57831 0.000 0.044 0.676 0.000 0.180 0.100
#> SRR772679 2 0.5961 0.09008 0.388 0.484 0.000 0.000 0.076 0.052
#> SRR772680 1 0.5222 0.51289 0.676 0.196 0.000 0.000 0.068 0.060
#> SRR772681 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772682 4 0.3866 0.53537 0.000 0.232 0.000 0.736 0.008 0.024
#> SRR772683 4 0.2669 0.63143 0.000 0.156 0.000 0.836 0.008 0.000
#> SRR772685 4 0.3081 0.55595 0.000 0.004 0.000 0.776 0.220 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.2871 0.68782 0.192 0.000 0.804 0.000 0.000 0.004
#> SRR772688 4 0.0972 0.71644 0.000 0.028 0.000 0.964 0.008 0.000
#> SRR772689 4 0.0000 0.72378 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.78163 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772691 4 0.6726 -0.13813 0.000 0.100 0.000 0.452 0.332 0.116
#> SRR772692 5 0.7671 0.07175 0.004 0.056 0.316 0.084 0.420 0.120
#> SRR772693 4 0.7211 -0.38741 0.000 0.088 0.084 0.416 0.368 0.044
#> SRR772694 4 0.5492 0.18109 0.000 0.192 0.000 0.564 0.244 0.000
#> SRR772695 2 0.5537 0.40935 0.000 0.612 0.000 0.192 0.180 0.016
#> SRR772696 5 0.4344 0.59942 0.000 0.000 0.000 0.356 0.612 0.032
#> SRR772697 5 0.3789 0.50318 0.000 0.000 0.000 0.416 0.584 0.000
#> SRR772698 3 0.2164 0.75293 0.000 0.016 0.912 0.000 0.044 0.028
#> SRR772699 3 0.3449 0.68529 0.192 0.004 0.784 0.000 0.004 0.016
#> SRR772700 3 0.3593 0.66348 0.224 0.004 0.756 0.000 0.004 0.012
#> SRR772701 1 0.1642 0.81553 0.936 0.000 0.032 0.000 0.004 0.028
#> SRR772702 1 0.1845 0.81046 0.920 0.000 0.052 0.000 0.000 0.028
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.343 0.703 0.841 0.4200 0.500 0.500
#> 3 3 0.354 0.491 0.777 0.3393 0.590 0.400
#> 4 4 0.543 0.714 0.855 0.2104 0.688 0.425
#> 5 5 0.563 0.669 0.804 0.0523 0.949 0.850
#> 6 6 0.567 0.585 0.724 0.0810 0.836 0.524
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 1 0.9000 0.73838 0.684 0.316
#> SRR772342 1 0.9323 0.71967 0.652 0.348
#> SRR772343 1 0.9427 0.70752 0.640 0.360
#> SRR772344 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772346 1 0.9754 0.63500 0.592 0.408
#> SRR772347 1 0.9909 0.55382 0.556 0.444
#> SRR772348 2 0.0376 0.86246 0.004 0.996
#> SRR772349 2 0.0376 0.86245 0.004 0.996
#> SRR772350 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0376 0.86246 0.004 0.996
#> SRR772353 1 0.9866 0.58222 0.568 0.432
#> SRR772354 1 0.9850 0.59201 0.572 0.428
#> SRR772355 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772356 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772357 1 0.9358 0.71596 0.648 0.352
#> SRR772358 1 0.9491 0.69870 0.632 0.368
#> SRR772359 1 0.9815 0.60955 0.580 0.420
#> SRR772360 1 0.9775 0.62681 0.588 0.412
#> SRR772361 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772364 1 0.9833 0.60136 0.576 0.424
#> SRR772365 2 0.9954 -0.23506 0.460 0.540
#> SRR772366 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772367 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.6531 0.71373 0.168 0.832
#> SRR772369 2 0.9881 -0.11829 0.436 0.564
#> SRR772370 2 0.9775 0.00913 0.412 0.588
#> SRR772371 2 0.9996 -0.35485 0.488 0.512
#> SRR772372 1 0.9977 0.48439 0.528 0.472
#> SRR772373 2 0.6048 0.73980 0.148 0.852
#> SRR772374 2 0.5059 0.78193 0.112 0.888
#> SRR772375 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.8327 0.74544 0.736 0.264
#> SRR772378 1 0.9922 0.54254 0.552 0.448
#> SRR772379 2 0.9944 -0.20799 0.456 0.544
#> SRR772380 2 0.9909 -0.15479 0.444 0.556
#> SRR772381 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.9323 0.71967 0.652 0.348
#> SRR772383 1 0.9286 0.72276 0.656 0.344
#> SRR772384 1 0.6247 0.74330 0.844 0.156
#> SRR772385 2 0.0938 0.85951 0.012 0.988
#> SRR772386 2 0.5178 0.77773 0.116 0.884
#> SRR772387 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772388 1 0.5629 0.73790 0.868 0.132
#> SRR772389 1 0.6343 0.74463 0.840 0.160
#> SRR772390 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772391 1 0.8955 0.73939 0.688 0.312
#> SRR772392 1 0.9044 0.73681 0.680 0.320
#> SRR772393 2 0.4161 0.80958 0.084 0.916
#> SRR772394 2 0.9248 0.31209 0.340 0.660
#> SRR772395 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772396 1 0.7299 0.74838 0.796 0.204
#> SRR772397 1 0.5178 0.73275 0.884 0.116
#> SRR772398 1 0.6973 0.74756 0.812 0.188
#> SRR772399 1 0.9087 0.73488 0.676 0.324
#> SRR772400 1 0.4161 0.72176 0.916 0.084
#> SRR772401 1 0.2603 0.70764 0.956 0.044
#> SRR772402 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.4161 0.80857 0.084 0.916
#> SRR772405 1 0.5737 0.73848 0.864 0.136
#> SRR772406 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772407 2 0.0938 0.86011 0.012 0.988
#> SRR772408 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.6048 0.72859 0.148 0.852
#> SRR772411 1 1.0000 0.40724 0.500 0.500
#> SRR772412 1 0.5842 0.74016 0.860 0.140
#> SRR772413 1 0.5946 0.74115 0.856 0.144
#> SRR772414 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.9044 0.38352 0.320 0.680
#> SRR772416 2 0.8763 0.45155 0.296 0.704
#> SRR772417 1 0.9580 0.68325 0.620 0.380
#> SRR772418 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772419 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.9358 0.27392 0.352 0.648
#> SRR772422 2 0.8661 0.47520 0.288 0.712
#> SRR772423 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772426 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772428 1 0.2236 0.70461 0.964 0.036
#> SRR772429 1 0.4815 0.72887 0.896 0.104
#> SRR772430 1 0.9833 0.60106 0.576 0.424
#> SRR772431 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772433 1 0.0672 0.69352 0.992 0.008
#> SRR772434 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772435 1 0.9608 0.67664 0.616 0.384
#> SRR772436 1 0.9815 0.60997 0.580 0.420
#> SRR772437 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772438 1 0.6712 0.74659 0.824 0.176
#> SRR772439 1 0.3431 0.71496 0.936 0.064
#> SRR772440 2 0.8713 0.46372 0.292 0.708
#> SRR772441 2 0.6887 0.68845 0.184 0.816
#> SRR772442 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772444 1 0.6148 0.74300 0.848 0.152
#> SRR772445 1 0.8386 0.74783 0.732 0.268
#> SRR772446 1 0.9323 0.71967 0.652 0.348
#> SRR772447 1 0.9358 0.71596 0.648 0.352
#> SRR772448 2 0.7219 0.66182 0.200 0.800
#> SRR772449 2 0.6623 0.70724 0.172 0.828
#> SRR772450 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772452 1 0.8861 0.74181 0.696 0.304
#> SRR772453 1 0.8608 0.74657 0.716 0.284
#> SRR772454 1 0.9460 0.70309 0.636 0.364
#> SRR772455 1 0.9850 0.59203 0.572 0.428
#> SRR772456 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772458 1 0.9087 0.73462 0.676 0.324
#> SRR772459 1 0.8861 0.74222 0.696 0.304
#> SRR772460 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.7376 0.64665 0.208 0.792
#> SRR772466 2 0.9580 0.10646 0.380 0.620
#> SRR772467 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772469 1 0.9358 0.71682 0.648 0.352
#> SRR772470 1 0.9286 0.72321 0.656 0.344
#> SRR772471 1 0.9323 0.71986 0.652 0.348
#> SRR772472 1 0.9358 0.71596 0.648 0.352
#> SRR772473 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772475 2 0.7219 0.66203 0.200 0.800
#> SRR772476 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772478 1 0.8555 0.74682 0.720 0.280
#> SRR772479 1 0.8661 0.74587 0.712 0.288
#> SRR772480 2 0.0938 0.86011 0.012 0.988
#> SRR772481 2 0.0938 0.86020 0.012 0.988
#> SRR772482 1 0.9209 0.72828 0.664 0.336
#> SRR772483 1 0.9286 0.72335 0.656 0.344
#> SRR772484 2 0.2603 0.84074 0.044 0.956
#> SRR772485 2 0.6801 0.69518 0.180 0.820
#> SRR772486 1 0.6048 0.74227 0.852 0.148
#> SRR772487 1 0.8813 0.74350 0.700 0.300
#> SRR772488 2 0.9608 0.14479 0.384 0.616
#> SRR772489 2 0.9580 0.16130 0.380 0.620
#> SRR772490 1 0.9087 0.73509 0.676 0.324
#> SRR772491 1 0.9000 0.73823 0.684 0.316
#> SRR772492 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0938 0.86021 0.012 0.988
#> SRR772497 2 0.1184 0.85807 0.016 0.984
#> SRR772498 2 0.2423 0.84347 0.040 0.960
#> SRR772499 2 0.2603 0.84114 0.044 0.956
#> SRR772500 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772502 1 0.9710 0.64871 0.600 0.400
#> SRR772503 1 0.9491 0.69916 0.632 0.368
#> SRR772504 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.9933 0.52551 0.548 0.452
#> SRR772510 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.8267 0.52168 0.260 0.740
#> SRR772512 2 0.9998 -0.19318 0.492 0.508
#> SRR772513 2 0.5946 0.74462 0.144 0.856
#> SRR772514 2 0.3274 0.82816 0.060 0.940
#> SRR772515 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772516 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772517 2 0.7056 0.67379 0.192 0.808
#> SRR772518 2 0.6531 0.71208 0.168 0.832
#> SRR772519 2 0.0376 0.86246 0.004 0.996
#> SRR772520 2 0.0376 0.86246 0.004 0.996
#> SRR772521 1 0.9993 0.45462 0.516 0.484
#> SRR772522 2 0.9608 0.14382 0.384 0.616
#> SRR772523 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0376 0.86246 0.004 0.996
#> SRR772525 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772529 1 0.9358 0.71627 0.648 0.352
#> SRR772530 1 0.9323 0.71967 0.652 0.348
#> SRR772531 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0376 0.86246 0.004 0.996
#> SRR772533 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772534 1 0.9635 0.66848 0.612 0.388
#> SRR772535 2 0.0376 0.86245 0.004 0.996
#> SRR772536 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772537 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772539 1 0.9323 0.71986 0.652 0.348
#> SRR772540 1 0.9358 0.71628 0.648 0.352
#> SRR772541 2 0.7745 0.61156 0.228 0.772
#> SRR772542 1 0.8081 0.74928 0.752 0.248
#> SRR772543 1 0.6343 0.74410 0.840 0.160
#> SRR772544 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.9358 0.71607 0.648 0.352
#> SRR772546 1 0.9286 0.72300 0.656 0.344
#> SRR772547 1 0.9580 0.68139 0.620 0.380
#> SRR772548 1 0.9358 0.71659 0.648 0.352
#> SRR772549 1 0.8386 0.74826 0.732 0.268
#> SRR772550 1 0.8813 0.74323 0.700 0.300
#> SRR772551 2 0.8327 0.53688 0.264 0.736
#> SRR772552 2 0.9552 0.17611 0.376 0.624
#> SRR772553 2 0.9087 0.36876 0.324 0.676
#> SRR772554 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772555 2 0.0376 0.86246 0.004 0.996
#> SRR772556 1 0.9087 0.73497 0.676 0.324
#> SRR772557 1 0.8861 0.74239 0.696 0.304
#> SRR772558 1 0.9427 0.70752 0.640 0.360
#> SRR772559 1 0.9460 0.70318 0.636 0.364
#> SRR772560 1 0.9754 0.63421 0.592 0.408
#> SRR772561 1 0.4939 0.71518 0.892 0.108
#> SRR772562 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772563 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772564 1 0.1414 0.69831 0.980 0.020
#> SRR772565 1 0.2043 0.70310 0.968 0.032
#> SRR772566 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772567 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772568 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772569 2 0.0938 0.86009 0.012 0.988
#> SRR772570 1 0.9323 0.71967 0.652 0.348
#> SRR772571 1 0.9491 0.69804 0.632 0.368
#> SRR772572 1 0.9580 0.68203 0.620 0.380
#> SRR772573 1 0.9608 0.67900 0.616 0.384
#> SRR772574 1 0.9491 0.69789 0.632 0.368
#> SRR772575 1 0.9608 0.67575 0.616 0.384
#> SRR772576 2 0.8144 0.56120 0.252 0.748
#> SRR772577 2 0.7299 0.65506 0.204 0.796
#> SRR772578 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.5408 0.77020 0.124 0.876
#> SRR772582 2 0.2423 0.84435 0.040 0.960
#> SRR772583 2 0.9710 0.06595 0.400 0.600
#> SRR772584 2 0.9754 0.02624 0.408 0.592
#> SRR772585 2 0.7950 0.58856 0.240 0.760
#> SRR772586 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772587 1 0.8661 0.74598 0.712 0.288
#> SRR772588 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.0376 0.69184 0.996 0.004
#> SRR772592 1 0.0376 0.69184 0.996 0.004
#> SRR772593 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772594 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772597 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.0672 0.69352 0.992 0.008
#> SRR772599 1 0.6973 0.74742 0.812 0.188
#> SRR772600 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0376 0.86245 0.004 0.996
#> SRR772602 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.9686 0.08774 0.396 0.604
#> SRR772606 1 0.5842 0.73992 0.860 0.140
#> SRR772607 1 0.5737 0.73911 0.864 0.136
#> SRR772608 2 0.5178 0.77743 0.116 0.884
#> SRR772609 2 0.6801 0.69578 0.180 0.820
#> SRR772610 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772612 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772614 1 0.8555 0.74714 0.720 0.280
#> SRR772615 1 0.6247 0.74355 0.844 0.156
#> SRR772616 1 0.9522 0.69357 0.628 0.372
#> SRR772617 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.8327 0.53514 0.264 0.736
#> SRR772622 2 0.9635 0.12397 0.388 0.612
#> SRR772623 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772625 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772626 2 0.5408 0.76895 0.124 0.876
#> SRR772627 2 0.5059 0.78263 0.112 0.888
#> SRR772628 1 0.9323 0.71986 0.652 0.348
#> SRR772629 1 0.9248 0.72564 0.660 0.340
#> SRR772630 1 0.9754 0.63792 0.592 0.408
#> SRR772631 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772632 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772634 1 0.9909 0.55228 0.556 0.444
#> SRR772635 1 0.9754 0.63441 0.592 0.408
#> SRR772636 2 0.2236 0.84550 0.036 0.964
#> SRR772637 1 0.8327 0.74839 0.736 0.264
#> SRR772638 1 0.6712 0.74651 0.824 0.176
#> SRR772639 2 0.0376 0.86245 0.004 0.996
#> SRR772640 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.8861 0.43106 0.304 0.696
#> SRR772643 2 0.9491 0.20952 0.368 0.632
#> SRR772644 1 0.9248 0.72594 0.660 0.340
#> SRR772645 1 0.9248 0.72629 0.660 0.340
#> SRR772646 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772647 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.1184 0.85823 0.016 0.984
#> SRR772649 2 0.3431 0.82513 0.064 0.936
#> SRR772650 1 0.9552 0.68694 0.624 0.376
#> SRR772651 1 0.9522 0.69247 0.628 0.372
#> SRR772652 1 0.9248 0.72560 0.660 0.340
#> SRR772653 1 0.9248 0.72560 0.660 0.340
#> SRR772654 1 1.0000 0.39211 0.504 0.496
#> SRR772655 2 0.9996 -0.34059 0.488 0.512
#> SRR772656 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.8386 0.52497 0.268 0.732
#> SRR772661 1 0.3584 0.71652 0.932 0.068
#> SRR772662 1 0.9710 0.64883 0.600 0.400
#> SRR772663 1 0.9933 0.52927 0.548 0.452
#> SRR772664 2 0.0938 0.86023 0.012 0.988
#> SRR772665 2 0.0672 0.86154 0.008 0.992
#> SRR772666 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772670 1 0.9896 0.56377 0.560 0.440
#> SRR772671 2 0.9988 -0.30741 0.480 0.520
#> SRR772672 2 0.1414 0.85511 0.020 0.980
#> SRR772673 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.8207 0.74610 0.744 0.256
#> SRR772676 1 0.9909 0.57601 0.556 0.444
#> SRR772677 1 0.9635 0.67359 0.612 0.388
#> SRR772678 1 0.6712 0.74368 0.824 0.176
#> SRR772679 1 0.9881 0.57261 0.564 0.436
#> SRR772680 1 0.9491 0.69857 0.632 0.368
#> SRR772681 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.1633 0.85393 0.024 0.976
#> SRR772683 2 0.0376 0.86245 0.004 0.996
#> SRR772685 2 0.5629 0.76015 0.132 0.868
#> SRR772686 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.86278 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.5178 0.77886 0.116 0.884
#> SRR772692 2 1.0000 -0.36877 0.496 0.504
#> SRR772693 2 0.9710 0.06865 0.400 0.600
#> SRR772694 2 0.2043 0.84922 0.032 0.968
#> SRR772695 2 0.6887 0.68924 0.184 0.816
#> SRR772696 2 0.4431 0.80177 0.092 0.908
#> SRR772697 2 0.5629 0.75958 0.132 0.868
#> SRR772698 1 0.0000 0.69007 1.000 0.000
#> SRR772699 1 0.9129 0.73255 0.672 0.328
#> SRR772700 1 0.9358 0.71671 0.648 0.352
#> SRR772701 1 0.8763 0.74463 0.704 0.296
#> SRR772702 1 0.7139 0.74807 0.804 0.196
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.4796 0.53970 0.780 0.000 0.220
#> SRR772342 1 0.4504 0.56809 0.804 0.000 0.196
#> SRR772343 1 0.2356 0.65379 0.928 0.000 0.072
#> SRR772344 2 0.6008 0.50616 0.372 0.628 0.000
#> SRR772345 2 0.5785 0.55186 0.332 0.668 0.000
#> SRR772346 1 0.3554 0.66666 0.900 0.036 0.064
#> SRR772347 1 0.2689 0.65721 0.932 0.036 0.032
#> SRR772348 2 0.6305 0.32972 0.484 0.516 0.000
#> SRR772349 2 0.6154 0.46301 0.408 0.592 0.000
#> SRR772350 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772351 2 0.6307 0.32214 0.488 0.512 0.000
#> SRR772352 1 0.6299 -0.21843 0.524 0.476 0.000
#> SRR772353 1 0.2527 0.66372 0.936 0.020 0.044
#> SRR772354 1 0.2443 0.65926 0.940 0.028 0.032
#> SRR772355 1 0.6299 -0.22397 0.524 0.476 0.000
#> SRR772356 2 0.6309 0.30193 0.496 0.504 0.000
#> SRR772357 1 0.4178 0.59250 0.828 0.000 0.172
#> SRR772358 1 0.3500 0.63635 0.880 0.004 0.116
#> SRR772359 1 0.2804 0.66477 0.924 0.016 0.060
#> SRR772360 1 0.2339 0.66566 0.940 0.012 0.048
#> SRR772361 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.3987 0.64834 0.872 0.020 0.108
#> SRR772365 1 0.4479 0.63185 0.860 0.096 0.044
#> SRR772366 3 0.0237 0.88278 0.004 0.000 0.996
#> SRR772367 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 1 0.5706 0.29595 0.680 0.320 0.000
#> SRR772369 1 0.4209 0.60619 0.860 0.120 0.020
#> SRR772370 1 0.3116 0.59936 0.892 0.108 0.000
#> SRR772371 1 0.2939 0.63278 0.916 0.072 0.012
#> SRR772372 1 0.2845 0.63521 0.920 0.068 0.012
#> SRR772373 1 0.5760 0.27533 0.672 0.328 0.000
#> SRR772374 1 0.6008 0.15367 0.628 0.372 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 2 0.6291 0.36969 0.468 0.532 0.000
#> SRR772377 1 0.3879 0.59320 0.848 0.000 0.152
#> SRR772378 1 0.2176 0.65353 0.948 0.032 0.020
#> SRR772379 1 0.3610 0.62016 0.888 0.096 0.016
#> SRR772380 1 0.3482 0.58544 0.872 0.128 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 1 0.4555 0.56366 0.800 0.000 0.200
#> SRR772383 1 0.4002 0.60311 0.840 0.000 0.160
#> SRR772384 1 0.5835 0.29384 0.660 0.000 0.340
#> SRR772385 2 0.6168 0.46919 0.412 0.588 0.000
#> SRR772386 1 0.6045 0.12888 0.620 0.380 0.000
#> SRR772387 1 0.6280 -0.17154 0.540 0.460 0.000
#> SRR772388 1 0.6140 0.12233 0.596 0.000 0.404
#> SRR772389 1 0.6008 0.22622 0.628 0.000 0.372
#> SRR772390 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772391 1 0.4555 0.56512 0.800 0.000 0.200
#> SRR772392 1 0.4452 0.57435 0.808 0.000 0.192
#> SRR772393 1 0.6045 0.11962 0.620 0.380 0.000
#> SRR772394 1 0.4733 0.51865 0.800 0.196 0.004
#> SRR772395 2 0.6274 0.38902 0.456 0.544 0.000
#> SRR772396 1 0.5650 0.37930 0.688 0.000 0.312
#> SRR772397 1 0.6126 0.15096 0.600 0.000 0.400
#> SRR772398 1 0.5529 0.40181 0.704 0.000 0.296
#> SRR772399 1 0.4555 0.56432 0.800 0.000 0.200
#> SRR772400 1 0.6235 0.01317 0.564 0.000 0.436
#> SRR772401 1 0.6280 -0.10074 0.540 0.000 0.460
#> SRR772402 2 0.5291 0.60068 0.268 0.732 0.000
#> SRR772403 2 0.5529 0.57574 0.296 0.704 0.000
#> SRR772404 1 0.6192 -0.01794 0.580 0.420 0.000
#> SRR772405 1 0.6045 0.19505 0.620 0.000 0.380
#> SRR772406 1 0.6286 -0.18540 0.536 0.464 0.000
#> SRR772407 1 0.6274 -0.15850 0.544 0.456 0.000
#> SRR772408 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772409 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772410 1 0.5733 0.26078 0.676 0.324 0.000
#> SRR772411 1 0.2860 0.62174 0.912 0.084 0.004
#> SRR772412 1 0.6045 0.20057 0.620 0.000 0.380
#> SRR772413 1 0.5968 0.24774 0.636 0.000 0.364
#> SRR772414 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.4235 0.53690 0.824 0.176 0.000
#> SRR772416 1 0.5098 0.43635 0.752 0.248 0.000
#> SRR772417 1 0.1647 0.66497 0.960 0.004 0.036
#> SRR772418 3 0.1411 0.86682 0.036 0.000 0.964
#> SRR772419 2 0.1411 0.72602 0.036 0.964 0.000
#> SRR772420 2 0.0892 0.72891 0.020 0.980 0.000
#> SRR772421 1 0.3941 0.55766 0.844 0.156 0.000
#> SRR772422 1 0.4842 0.47266 0.776 0.224 0.000
#> SRR772423 2 0.0237 0.73113 0.004 0.996 0.000
#> SRR772424 2 0.1964 0.72125 0.056 0.944 0.000
#> SRR772425 1 0.6307 -0.26330 0.512 0.488 0.000
#> SRR772426 2 0.4974 0.62932 0.236 0.764 0.000
#> SRR772427 2 0.3116 0.70291 0.108 0.892 0.000
#> SRR772428 1 0.6305 -0.15947 0.516 0.000 0.484
#> SRR772429 1 0.6062 0.18613 0.616 0.000 0.384
#> SRR772430 1 0.2982 0.66731 0.920 0.024 0.056
#> SRR772431 2 0.0892 0.72958 0.020 0.980 0.000
#> SRR772432 2 0.4291 0.66405 0.180 0.820 0.000
#> SRR772433 3 0.6204 0.39059 0.424 0.000 0.576
#> SRR772434 3 0.6280 0.31022 0.460 0.000 0.540
#> SRR772435 1 0.3349 0.64044 0.888 0.004 0.108
#> SRR772436 1 0.3009 0.66506 0.920 0.028 0.052
#> SRR772437 3 0.0424 0.88089 0.008 0.000 0.992
#> SRR772438 1 0.5926 0.27353 0.644 0.000 0.356
#> SRR772439 1 0.6267 -0.06026 0.548 0.000 0.452
#> SRR772440 1 0.5254 0.41132 0.736 0.264 0.000
#> SRR772441 1 0.5733 0.28565 0.676 0.324 0.000
#> SRR772442 2 0.6026 0.48577 0.376 0.624 0.000
#> SRR772443 2 0.6295 0.35562 0.472 0.528 0.000
#> SRR772444 1 0.5785 0.33327 0.668 0.000 0.332
#> SRR772445 1 0.5291 0.46451 0.732 0.000 0.268
#> SRR772446 1 0.4178 0.59251 0.828 0.000 0.172
#> SRR772447 1 0.3752 0.61539 0.856 0.000 0.144
#> SRR772448 1 0.5529 0.34567 0.704 0.296 0.000
#> SRR772449 1 0.5810 0.25684 0.664 0.336 0.000
#> SRR772450 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.4842 0.53620 0.776 0.000 0.224
#> SRR772453 1 0.4931 0.52483 0.768 0.000 0.232
#> SRR772454 1 0.3267 0.63370 0.884 0.000 0.116
#> SRR772455 1 0.2297 0.66229 0.944 0.020 0.036
#> SRR772456 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.4555 0.56366 0.800 0.000 0.200
#> SRR772459 1 0.4842 0.53507 0.776 0.000 0.224
#> SRR772460 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.5968 0.51637 0.364 0.636 0.000
#> SRR772463 2 0.6274 0.39656 0.456 0.544 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.5216 0.40540 0.740 0.260 0.000
#> SRR772466 1 0.4233 0.55684 0.836 0.160 0.004
#> SRR772467 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772468 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772469 1 0.2796 0.64543 0.908 0.000 0.092
#> SRR772470 1 0.3340 0.63080 0.880 0.000 0.120
#> SRR772471 1 0.3879 0.60915 0.848 0.000 0.152
#> SRR772472 1 0.3482 0.62567 0.872 0.000 0.128
#> SRR772473 2 0.6252 0.41180 0.444 0.556 0.000
#> SRR772474 2 0.5678 0.55366 0.316 0.684 0.000
#> SRR772475 1 0.5431 0.37166 0.716 0.284 0.000
#> SRR772476 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.4974 0.51968 0.764 0.000 0.236
#> SRR772479 1 0.4750 0.54627 0.784 0.000 0.216
#> SRR772480 1 0.6305 -0.24269 0.516 0.484 0.000
#> SRR772481 1 0.6295 -0.20557 0.528 0.472 0.000
#> SRR772482 1 0.4555 0.56499 0.800 0.000 0.200
#> SRR772483 1 0.4121 0.59719 0.832 0.000 0.168
#> SRR772484 1 0.6274 -0.15284 0.544 0.456 0.000
#> SRR772485 1 0.5982 0.28092 0.668 0.328 0.004
#> SRR772486 1 0.5905 0.27797 0.648 0.000 0.352
#> SRR772487 1 0.5098 0.50319 0.752 0.000 0.248
#> SRR772488 1 0.4164 0.57716 0.848 0.144 0.008
#> SRR772489 1 0.3482 0.58375 0.872 0.128 0.000
#> SRR772490 1 0.4931 0.52507 0.768 0.000 0.232
#> SRR772491 1 0.4750 0.54598 0.784 0.000 0.216
#> SRR772492 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 1 0.6252 -0.12179 0.556 0.444 0.000
#> SRR772497 1 0.6260 -0.12899 0.552 0.448 0.000
#> SRR772498 1 0.6215 -0.05468 0.572 0.428 0.000
#> SRR772499 1 0.6476 -0.12024 0.548 0.448 0.004
#> SRR772500 2 0.6267 0.40001 0.452 0.548 0.000
#> SRR772501 2 0.6168 0.44920 0.412 0.588 0.000
#> SRR772502 1 0.2096 0.66217 0.944 0.004 0.052
#> SRR772503 1 0.1950 0.66613 0.952 0.008 0.040
#> SRR772504 2 0.6286 0.37779 0.464 0.536 0.000
#> SRR772505 2 0.6260 0.40644 0.448 0.552 0.000
#> SRR772506 2 0.2448 0.71356 0.076 0.924 0.000
#> SRR772507 2 0.1529 0.72433 0.040 0.960 0.000
#> SRR772508 2 0.3482 0.69717 0.128 0.872 0.000
#> SRR772509 1 0.3589 0.65910 0.900 0.048 0.052
#> SRR772510 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 1 0.4974 0.45259 0.764 0.236 0.000
#> SRR772512 1 0.6079 0.58001 0.784 0.128 0.088
#> SRR772513 1 0.5968 0.18022 0.636 0.364 0.000
#> SRR772514 1 0.6235 -0.08483 0.564 0.436 0.000
#> SRR772515 1 0.6302 -0.23879 0.520 0.480 0.000
#> SRR772516 1 0.6302 -0.23935 0.520 0.480 0.000
#> SRR772517 1 0.5835 0.25082 0.660 0.340 0.000
#> SRR772518 1 0.5905 0.21356 0.648 0.352 0.000
#> SRR772519 1 0.6309 -0.28964 0.504 0.496 0.000
#> SRR772520 2 0.6308 0.31401 0.492 0.508 0.000
#> SRR772521 1 0.4281 0.65071 0.872 0.072 0.056
#> SRR772522 1 0.3816 0.56555 0.852 0.148 0.000
#> SRR772523 2 0.6267 0.39326 0.452 0.548 0.000
#> SRR772524 2 0.6308 0.31438 0.492 0.508 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772527 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772528 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772529 1 0.4121 0.59602 0.832 0.000 0.168
#> SRR772530 1 0.3752 0.61523 0.856 0.000 0.144
#> SRR772531 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 2 0.6307 0.32585 0.488 0.512 0.000
#> SRR772533 2 0.6295 0.36158 0.472 0.528 0.000
#> SRR772534 1 0.2280 0.66358 0.940 0.008 0.052
#> SRR772535 2 0.6299 0.35403 0.476 0.524 0.000
#> SRR772536 1 0.6295 -0.21074 0.528 0.472 0.000
#> SRR772537 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772538 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772539 1 0.4002 0.60313 0.840 0.000 0.160
#> SRR772540 1 0.2796 0.64593 0.908 0.000 0.092
#> SRR772541 1 0.5397 0.38129 0.720 0.280 0.000
#> SRR772542 1 0.5397 0.44661 0.720 0.000 0.280
#> SRR772543 1 0.5948 0.26158 0.640 0.000 0.360
#> SRR772544 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.4002 0.60274 0.840 0.000 0.160
#> SRR772546 1 0.4002 0.60293 0.840 0.000 0.160
#> SRR772547 1 0.1878 0.66544 0.952 0.004 0.044
#> SRR772548 1 0.2959 0.64159 0.900 0.000 0.100
#> SRR772549 1 0.5254 0.47286 0.736 0.000 0.264
#> SRR772550 1 0.4796 0.54073 0.780 0.000 0.220
#> SRR772551 1 0.4796 0.47701 0.780 0.220 0.000
#> SRR772552 1 0.3941 0.55877 0.844 0.156 0.000
#> SRR772553 1 0.4062 0.55086 0.836 0.164 0.000
#> SRR772554 2 0.6309 0.28981 0.500 0.500 0.000
#> SRR772555 1 0.6309 -0.30281 0.500 0.500 0.000
#> SRR772556 1 0.4796 0.54118 0.780 0.000 0.220
#> SRR772557 1 0.4931 0.52421 0.768 0.000 0.232
#> SRR772558 1 0.3340 0.63040 0.880 0.000 0.120
#> SRR772559 1 0.2496 0.65739 0.928 0.004 0.068
#> SRR772560 1 0.0848 0.65579 0.984 0.008 0.008
#> SRR772561 3 0.6026 0.43947 0.376 0.000 0.624
#> SRR772562 1 0.6308 -0.27821 0.508 0.492 0.000
#> SRR772563 1 0.6302 -0.23886 0.520 0.480 0.000
#> SRR772564 3 0.6307 0.23357 0.488 0.000 0.512
#> SRR772565 3 0.6302 0.24501 0.480 0.000 0.520
#> SRR772566 3 0.4605 0.72769 0.204 0.000 0.796
#> SRR772567 3 0.3551 0.79680 0.132 0.000 0.868
#> SRR772568 1 0.6225 -0.07725 0.568 0.432 0.000
#> SRR772569 1 0.6244 -0.10406 0.560 0.440 0.000
#> SRR772570 1 0.3619 0.62057 0.864 0.000 0.136
#> SRR772571 1 0.2711 0.64760 0.912 0.000 0.088
#> SRR772572 1 0.1643 0.66295 0.956 0.000 0.044
#> SRR772573 1 0.1950 0.66554 0.952 0.008 0.040
#> SRR772574 1 0.1860 0.66071 0.948 0.000 0.052
#> SRR772575 1 0.2261 0.65580 0.932 0.000 0.068
#> SRR772576 1 0.5254 0.40773 0.736 0.264 0.000
#> SRR772577 1 0.5497 0.35363 0.708 0.292 0.000
#> SRR772578 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772579 2 0.0237 0.73089 0.004 0.996 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.6026 0.13799 0.624 0.376 0.000
#> SRR772582 1 0.6398 -0.01504 0.580 0.416 0.004
#> SRR772583 1 0.3918 0.57781 0.856 0.140 0.004
#> SRR772584 1 0.4047 0.57233 0.848 0.148 0.004
#> SRR772585 1 0.5443 0.42025 0.736 0.260 0.004
#> SRR772586 3 0.3752 0.77731 0.144 0.000 0.856
#> SRR772587 1 0.4504 0.56870 0.804 0.000 0.196
#> SRR772588 2 0.5058 0.61923 0.244 0.756 0.000
#> SRR772589 2 0.3619 0.68730 0.136 0.864 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 3 0.6204 0.39016 0.424 0.000 0.576
#> SRR772592 3 0.6225 0.37375 0.432 0.000 0.568
#> SRR772593 3 0.3192 0.81288 0.112 0.000 0.888
#> SRR772594 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772595 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772596 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772597 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 3 0.6215 0.38445 0.428 0.000 0.572
#> SRR772599 1 0.5859 0.30749 0.656 0.000 0.344
#> SRR772600 2 0.6180 0.45319 0.416 0.584 0.000
#> SRR772601 2 0.5497 0.58561 0.292 0.708 0.000
#> SRR772602 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772603 2 0.6302 0.34069 0.480 0.520 0.000
#> SRR772604 2 0.6180 0.45207 0.416 0.584 0.000
#> SRR772605 1 0.3482 0.58524 0.872 0.128 0.000
#> SRR772606 1 0.6026 0.21153 0.624 0.000 0.376
#> SRR772607 1 0.6026 0.21227 0.624 0.000 0.376
#> SRR772608 1 0.5988 0.16590 0.632 0.368 0.000
#> SRR772609 1 0.5678 0.30399 0.684 0.316 0.000
#> SRR772610 2 0.6307 0.32979 0.488 0.512 0.000
#> SRR772611 1 0.6305 -0.25285 0.516 0.484 0.000
#> SRR772612 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772613 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772614 1 0.5016 0.51425 0.760 0.000 0.240
#> SRR772615 1 0.5926 0.27229 0.644 0.000 0.356
#> SRR772616 1 0.2496 0.65866 0.928 0.004 0.068
#> SRR772617 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772618 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772619 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 1 0.5201 0.45952 0.760 0.236 0.004
#> SRR772622 1 0.3941 0.55846 0.844 0.156 0.000
#> SRR772623 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772624 3 0.3340 0.80539 0.120 0.000 0.880
#> SRR772625 2 0.0237 0.73131 0.004 0.996 0.000
#> SRR772626 1 0.5988 0.16788 0.632 0.368 0.000
#> SRR772627 1 0.6126 0.06030 0.600 0.400 0.000
#> SRR772628 1 0.4235 0.58930 0.824 0.000 0.176
#> SRR772629 1 0.4555 0.56366 0.800 0.000 0.200
#> SRR772630 1 0.1950 0.66519 0.952 0.008 0.040
#> SRR772631 3 0.1529 0.86511 0.040 0.000 0.960
#> SRR772632 2 0.5835 0.54634 0.340 0.660 0.000
#> SRR772633 2 0.1753 0.72229 0.048 0.952 0.000
#> SRR772634 1 0.2564 0.65487 0.936 0.036 0.028
#> SRR772635 1 0.2492 0.66574 0.936 0.016 0.048
#> SRR772636 2 0.6291 0.36543 0.468 0.532 0.000
#> SRR772637 1 0.5178 0.48664 0.744 0.000 0.256
#> SRR772638 1 0.5882 0.29300 0.652 0.000 0.348
#> SRR772639 2 0.6305 0.33674 0.484 0.516 0.000
#> SRR772640 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 1 0.4654 0.49483 0.792 0.208 0.000
#> SRR772643 1 0.4645 0.54423 0.816 0.176 0.008
#> SRR772644 1 0.3482 0.62561 0.872 0.000 0.128
#> SRR772645 1 0.2448 0.65294 0.924 0.000 0.076
#> SRR772646 2 0.6309 0.29744 0.496 0.504 0.000
#> SRR772647 2 0.6307 0.32167 0.488 0.512 0.000
#> SRR772648 1 0.6204 -0.05200 0.576 0.424 0.000
#> SRR772649 1 0.6026 0.12222 0.624 0.376 0.000
#> SRR772650 1 0.1964 0.65885 0.944 0.000 0.056
#> SRR772651 1 0.1964 0.65909 0.944 0.000 0.056
#> SRR772652 1 0.4555 0.56366 0.800 0.000 0.200
#> SRR772653 1 0.4121 0.59619 0.832 0.000 0.168
#> SRR772654 1 0.3181 0.64196 0.912 0.064 0.024
#> SRR772655 1 0.3181 0.64190 0.912 0.064 0.024
#> SRR772656 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772657 3 0.0892 0.86626 0.020 0.000 0.980
#> SRR772658 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772660 1 0.4842 0.47474 0.776 0.224 0.000
#> SRR772661 1 0.6244 -0.00737 0.560 0.000 0.440
#> SRR772662 1 0.2297 0.66307 0.944 0.020 0.036
#> SRR772663 1 0.2564 0.65518 0.936 0.036 0.028
#> SRR772664 1 0.6274 -0.15936 0.544 0.456 0.000
#> SRR772665 1 0.6244 -0.10441 0.560 0.440 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772668 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772669 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772670 1 0.2564 0.65609 0.936 0.036 0.028
#> SRR772671 1 0.2165 0.62810 0.936 0.064 0.000
#> SRR772672 1 0.6291 -0.20057 0.532 0.468 0.000
#> SRR772673 2 0.6309 0.30730 0.496 0.504 0.000
#> SRR772674 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772675 1 0.4883 0.54228 0.788 0.004 0.208
#> SRR772676 1 0.3998 0.65017 0.884 0.060 0.056
#> SRR772677 1 0.2955 0.65351 0.912 0.008 0.080
#> SRR772678 1 0.5497 0.37940 0.708 0.000 0.292
#> SRR772679 1 0.2056 0.65728 0.952 0.024 0.024
#> SRR772680 1 0.2590 0.65612 0.924 0.004 0.072
#> SRR772681 3 0.0892 0.87544 0.020 0.000 0.980
#> SRR772682 1 0.6215 -0.06814 0.572 0.428 0.000
#> SRR772683 2 0.6309 0.30570 0.496 0.504 0.000
#> SRR772685 1 0.5882 0.22067 0.652 0.348 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772688 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772689 2 0.0000 0.73072 0.000 1.000 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.88406 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 1 0.6235 -0.06532 0.564 0.436 0.000
#> SRR772692 1 0.2496 0.62946 0.928 0.068 0.004
#> SRR772693 1 0.3607 0.60288 0.880 0.112 0.008
#> SRR772694 1 0.6267 -0.14208 0.548 0.452 0.000
#> SRR772695 1 0.5650 0.31292 0.688 0.312 0.000
#> SRR772696 1 0.6008 0.14831 0.628 0.372 0.000
#> SRR772697 1 0.5926 0.20222 0.644 0.356 0.000
#> SRR772698 3 0.0424 0.88131 0.008 0.000 0.992
#> SRR772699 1 0.4235 0.58853 0.824 0.000 0.176
#> SRR772700 1 0.4351 0.59958 0.828 0.004 0.168
#> SRR772701 1 0.4702 0.55215 0.788 0.000 0.212
#> SRR772702 1 0.5678 0.37148 0.684 0.000 0.316
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.1118 0.83496 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR772342 1 0.2149 0.83226 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR772343 1 0.4406 0.67339 0.700 0.300 0.000 0.000
#> SRR772344 2 0.4134 0.61446 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR772345 2 0.4522 0.50486 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR772346 2 0.4996 -0.17187 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR772347 2 0.4804 0.28719 0.384 0.616 0.000 0.000
#> SRR772348 2 0.2944 0.75419 0.004 0.868 0.000 0.128
#> SRR772349 2 0.3726 0.68185 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR772350 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772351 2 0.3123 0.72901 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR772352 2 0.3401 0.73795 0.008 0.840 0.000 0.152
#> SRR772353 1 0.4866 0.48217 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR772354 1 0.5000 0.20631 0.504 0.496 0.000 0.000
#> SRR772355 2 0.2704 0.74977 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772356 2 0.2973 0.73705 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR772357 1 0.3024 0.81697 0.852 0.148 0.000 0.000
#> SRR772358 1 0.4222 0.70799 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR772359 1 0.4877 0.48430 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR772360 1 0.4907 0.46012 0.580 0.420 0.000 0.000
#> SRR772361 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772362 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772363 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772364 1 0.3266 0.79456 0.832 0.168 0.000 0.000
#> SRR772365 2 0.4981 0.12844 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR772366 3 0.1661 0.91376 0.052 0.000 0.944 0.004
#> SRR772367 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.1724 0.78231 0.032 0.948 0.000 0.020
#> SRR772369 2 0.3528 0.65647 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR772370 2 0.4222 0.53130 0.272 0.728 0.000 0.000
#> SRR772371 2 0.4356 0.48464 0.292 0.708 0.000 0.000
#> SRR772372 2 0.3837 0.62224 0.224 0.776 0.000 0.000
#> SRR772373 2 0.0895 0.77689 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR772374 2 0.1520 0.78022 0.020 0.956 0.000 0.024
#> SRR772375 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.3311 0.71602 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR772377 1 0.5441 0.48644 0.588 0.396 0.012 0.004
#> SRR772378 2 0.4933 0.10037 0.432 0.568 0.000 0.000
#> SRR772379 2 0.4382 0.48537 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR772380 2 0.3801 0.62053 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772382 1 0.1389 0.83599 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR772383 1 0.1940 0.83195 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR772384 1 0.2515 0.83102 0.912 0.072 0.012 0.004
#> SRR772385 2 0.3583 0.71757 0.004 0.816 0.000 0.180
#> SRR772386 2 0.2125 0.77222 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR772387 2 0.2944 0.75008 0.004 0.868 0.000 0.128
#> SRR772388 1 0.0188 0.82463 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR772389 1 0.0336 0.82939 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772390 3 0.0188 0.94460 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772391 1 0.0336 0.82808 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772392 1 0.0592 0.83171 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772393 2 0.2002 0.78157 0.020 0.936 0.000 0.044
#> SRR772394 2 0.2675 0.75510 0.100 0.892 0.000 0.008
#> SRR772395 2 0.3400 0.71101 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR772396 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772397 1 0.0469 0.82188 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR772398 1 0.1305 0.83302 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR772399 1 0.1389 0.83450 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR772400 1 0.1520 0.82663 0.956 0.020 0.024 0.000
#> SRR772401 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772402 2 0.4955 0.19031 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR772403 2 0.4948 0.19470 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR772404 2 0.1677 0.77973 0.012 0.948 0.000 0.040
#> SRR772405 1 0.2515 0.83149 0.912 0.072 0.012 0.004
#> SRR772406 2 0.1767 0.78127 0.012 0.944 0.000 0.044
#> SRR772407 2 0.2805 0.76899 0.012 0.888 0.000 0.100
#> SRR772408 4 0.0469 0.87966 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772409 4 0.0707 0.87817 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR772410 2 0.2216 0.75213 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772411 2 0.3528 0.64779 0.192 0.808 0.000 0.000
#> SRR772412 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772413 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.3024 0.70632 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR772416 2 0.1854 0.77820 0.048 0.940 0.000 0.012
#> SRR772417 2 0.4981 -0.04634 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR772418 3 0.2530 0.87461 0.100 0.000 0.896 0.004
#> SRR772419 4 0.4250 0.66924 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR772420 4 0.3764 0.75337 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR772421 2 0.3610 0.64860 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR772422 2 0.3659 0.74020 0.136 0.840 0.000 0.024
#> SRR772423 4 0.3688 0.76454 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR772424 4 0.4164 0.67018 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR772425 2 0.2921 0.73954 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR772426 2 0.4941 0.19092 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR772427 4 0.4933 0.31133 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR772428 1 0.1867 0.79070 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR772429 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772430 1 0.4608 0.63857 0.692 0.304 0.000 0.004
#> SRR772431 4 0.3907 0.73256 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR772432 4 0.4999 0.09211 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR772433 1 0.3569 0.64563 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR772434 1 0.2281 0.76853 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR772435 1 0.3311 0.79244 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR772436 1 0.4804 0.48250 0.616 0.384 0.000 0.000
#> SRR772437 3 0.0592 0.93603 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR772438 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772439 1 0.1118 0.80922 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR772440 2 0.2965 0.77989 0.072 0.892 0.000 0.036
#> SRR772441 2 0.2408 0.78310 0.044 0.920 0.000 0.036
#> SRR772442 2 0.4477 0.53630 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR772443 2 0.3266 0.71903 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR772444 1 0.0188 0.82818 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772445 1 0.0592 0.83115 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772446 1 0.2469 0.82576 0.892 0.108 0.000 0.000
#> SRR772447 1 0.2704 0.82590 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR772448 2 0.1510 0.78027 0.028 0.956 0.000 0.016
#> SRR772449 2 0.1284 0.77863 0.012 0.964 0.000 0.024
#> SRR772450 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772451 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772452 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772453 1 0.0592 0.83097 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772454 1 0.3444 0.76075 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR772455 1 0.4961 0.36038 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR772456 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772457 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772458 1 0.0188 0.82664 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772459 1 0.0188 0.82804 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772460 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772461 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772462 2 0.4277 0.57630 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR772463 2 0.2814 0.74956 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772464 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.3123 0.69779 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR772466 2 0.2408 0.74375 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR772467 4 0.0336 0.88020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR772468 4 0.0469 0.87989 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772469 1 0.4304 0.70251 0.716 0.284 0.000 0.000
#> SRR772470 1 0.2704 0.82018 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR772471 1 0.3610 0.78082 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR772472 1 0.3356 0.79710 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR772473 2 0.3486 0.70026 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR772474 2 0.4804 0.37301 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR772475 2 0.2255 0.77368 0.068 0.920 0.000 0.012
#> SRR772476 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772477 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772478 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772479 1 0.0188 0.82804 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772480 2 0.3157 0.74129 0.004 0.852 0.000 0.144
#> SRR772481 2 0.3658 0.74849 0.020 0.836 0.000 0.144
#> SRR772482 1 0.1792 0.83394 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR772483 1 0.3074 0.80640 0.848 0.152 0.000 0.000
#> SRR772484 2 0.3706 0.76382 0.040 0.848 0.000 0.112
#> SRR772485 2 0.3107 0.77664 0.080 0.884 0.000 0.036
#> SRR772486 1 0.0895 0.83310 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR772487 1 0.0188 0.82790 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772488 2 0.4304 0.50847 0.284 0.716 0.000 0.000
#> SRR772489 2 0.4072 0.57179 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR772490 1 0.1302 0.83340 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR772491 1 0.1557 0.83376 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR772492 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772493 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772494 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772495 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772496 2 0.1356 0.78013 0.032 0.960 0.000 0.008
#> SRR772497 2 0.0592 0.77654 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR772498 2 0.1978 0.77483 0.004 0.928 0.000 0.068
#> SRR772499 2 0.2987 0.76711 0.016 0.880 0.000 0.104
#> SRR772500 2 0.3400 0.70845 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR772501 2 0.4008 0.63542 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR772502 1 0.4972 0.37196 0.544 0.456 0.000 0.000
#> SRR772503 2 0.4977 -0.05158 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR772504 2 0.3266 0.71800 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR772505 2 0.3444 0.70240 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR772506 4 0.3764 0.74523 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR772507 4 0.2408 0.84222 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR772508 4 0.4999 0.10411 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR772509 1 0.5112 0.34786 0.560 0.436 0.000 0.004
#> SRR772510 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.2647 0.72820 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR772512 2 0.4929 0.60710 0.224 0.744 0.024 0.008
#> SRR772513 2 0.2224 0.78281 0.040 0.928 0.000 0.032
#> SRR772514 2 0.1722 0.77832 0.008 0.944 0.000 0.048
#> SRR772515 2 0.2868 0.74275 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR772516 2 0.1867 0.77172 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR772517 2 0.3587 0.77619 0.052 0.860 0.000 0.088
#> SRR772518 2 0.2319 0.78312 0.036 0.924 0.000 0.040
#> SRR772519 2 0.2868 0.74275 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR772520 2 0.3024 0.73472 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772521 2 0.4998 -0.17959 0.488 0.512 0.000 0.000
#> SRR772522 2 0.3764 0.62387 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR772523 2 0.3400 0.70815 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR772524 2 0.3074 0.73092 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR772525 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772526 4 0.0336 0.88020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR772527 4 0.0336 0.88020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR772528 3 0.0188 0.94460 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772529 1 0.2011 0.82957 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.3219 0.80017 0.836 0.164 0.000 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.3074 0.73092 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR772533 2 0.3219 0.72159 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR772534 1 0.4907 0.47389 0.580 0.420 0.000 0.000
#> SRR772535 2 0.3074 0.73267 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR772536 2 0.2704 0.75004 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR772537 4 0.1940 0.85811 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR772538 4 0.1792 0.86357 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR772539 1 0.2868 0.82063 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR772540 1 0.3356 0.78083 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR772541 2 0.3143 0.76592 0.100 0.876 0.000 0.024
#> SRR772542 1 0.0592 0.83138 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772543 1 0.0376 0.82341 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR772544 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772545 1 0.1118 0.83446 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR772546 1 0.0921 0.83312 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR772547 2 0.4972 0.00615 0.456 0.544 0.000 0.000
#> SRR772548 1 0.3873 0.75466 0.772 0.228 0.000 0.000
#> SRR772549 1 0.0592 0.83151 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772550 1 0.0592 0.83143 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR772551 2 0.2469 0.74360 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR772552 2 0.2408 0.74529 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR772553 2 0.2976 0.73677 0.120 0.872 0.000 0.008
#> SRR772554 2 0.3024 0.73451 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772555 2 0.3024 0.73418 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772556 1 0.0188 0.82664 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772557 1 0.0188 0.82664 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772558 1 0.3764 0.76832 0.784 0.216 0.000 0.000
#> SRR772559 1 0.4661 0.60361 0.652 0.348 0.000 0.000
#> SRR772560 2 0.4643 0.36977 0.344 0.656 0.000 0.000
#> SRR772561 3 0.4467 0.74986 0.172 0.040 0.788 0.000
#> SRR772562 2 0.2197 0.77149 0.004 0.916 0.000 0.080
#> SRR772563 2 0.1978 0.77465 0.004 0.928 0.000 0.068
#> SRR772564 1 0.2281 0.76517 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR772565 1 0.2647 0.74015 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR772566 1 0.4661 0.33342 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR772567 3 0.4679 0.55001 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR772568 2 0.1174 0.78033 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR772569 2 0.1356 0.77895 0.008 0.960 0.000 0.032
#> SRR772570 1 0.3024 0.81331 0.852 0.148 0.000 0.000
#> SRR772571 1 0.4072 0.73947 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR772572 2 0.4992 -0.07785 0.476 0.524 0.000 0.000
#> SRR772573 2 0.4989 -0.03069 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR772574 1 0.4222 0.70504 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR772575 1 0.4661 0.55443 0.652 0.348 0.000 0.000
#> SRR772576 2 0.2363 0.78061 0.056 0.920 0.000 0.024
#> SRR772577 2 0.1913 0.78172 0.040 0.940 0.000 0.020
#> SRR772578 4 0.2704 0.83222 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR772579 4 0.2345 0.84813 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR772580 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.2036 0.78423 0.032 0.936 0.000 0.032
#> SRR772582 2 0.2722 0.78100 0.064 0.904 0.000 0.032
#> SRR772583 2 0.3801 0.62623 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR772584 2 0.3893 0.66745 0.196 0.796 0.000 0.008
#> SRR772585 2 0.3913 0.73355 0.148 0.824 0.000 0.028
#> SRR772586 3 0.3583 0.79654 0.180 0.000 0.816 0.004
#> SRR772587 1 0.2345 0.82533 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR772588 2 0.4866 0.28700 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR772589 4 0.4981 0.20493 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR772590 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772591 1 0.3528 0.64710 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR772592 1 0.3172 0.69390 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR772593 3 0.4428 0.66008 0.276 0.000 0.720 0.004
#> SRR772594 4 0.3528 0.78145 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR772595 4 0.3356 0.79605 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR772596 3 0.0188 0.94460 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR772597 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772598 1 0.2149 0.78411 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR772599 1 0.0188 0.82800 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772600 2 0.3873 0.65357 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR772601 2 0.4804 0.36569 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR772602 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.3172 0.72498 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR772604 2 0.3942 0.65047 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR772605 2 0.3610 0.64953 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR772606 1 0.0188 0.82752 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772607 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772608 2 0.2844 0.78461 0.048 0.900 0.000 0.052
#> SRR772609 2 0.1209 0.77725 0.032 0.964 0.000 0.004
#> SRR772610 2 0.2814 0.74568 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR772611 2 0.1743 0.77636 0.004 0.940 0.000 0.056
#> SRR772612 4 0.1302 0.87201 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR772613 4 0.2149 0.85322 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR772614 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772615 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772616 1 0.4888 0.44389 0.588 0.412 0.000 0.000
#> SRR772617 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772618 4 0.1302 0.87146 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR772619 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772620 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772621 2 0.3160 0.75897 0.108 0.872 0.000 0.020
#> SRR772622 2 0.3105 0.71311 0.140 0.856 0.000 0.004
#> SRR772623 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772624 3 0.4483 0.64616 0.284 0.000 0.712 0.004
#> SRR772625 4 0.2921 0.82101 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR772626 2 0.2450 0.77854 0.016 0.912 0.000 0.072
#> SRR772627 2 0.1854 0.77984 0.012 0.940 0.000 0.048
#> SRR772628 1 0.2868 0.81404 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR772629 1 0.2281 0.82447 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR772630 2 0.4933 0.11131 0.432 0.568 0.000 0.000
#> SRR772631 3 0.2401 0.88173 0.092 0.000 0.904 0.004
#> SRR772632 2 0.4585 0.49022 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR772633 4 0.4406 0.62323 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR772634 2 0.4989 -0.07041 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR772635 1 0.4999 0.25058 0.508 0.492 0.000 0.000
#> SRR772636 2 0.3196 0.75574 0.008 0.856 0.000 0.136
#> SRR772637 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772638 1 0.0000 0.82591 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772639 2 0.3024 0.73500 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR772640 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772641 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772642 2 0.2081 0.75516 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR772643 2 0.3311 0.68201 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR772644 1 0.3444 0.79098 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR772645 1 0.4761 0.54086 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR772646 2 0.3172 0.72802 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR772647 2 0.3074 0.73259 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR772648 2 0.1833 0.78213 0.032 0.944 0.000 0.024
#> SRR772649 2 0.1888 0.78014 0.044 0.940 0.000 0.016
#> SRR772650 1 0.4164 0.71398 0.736 0.264 0.000 0.000
#> SRR772651 1 0.4431 0.66551 0.696 0.304 0.000 0.000
#> SRR772652 1 0.0336 0.82888 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR772653 1 0.1022 0.83413 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR772654 2 0.4697 0.31010 0.356 0.644 0.000 0.000
#> SRR772655 2 0.4855 0.17301 0.400 0.600 0.000 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772658 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772659 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772660 2 0.2402 0.77022 0.076 0.912 0.000 0.012
#> SRR772661 1 0.3648 0.81392 0.864 0.076 0.056 0.004
#> SRR772662 2 0.5000 -0.19534 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR772663 2 0.4992 -0.12011 0.476 0.524 0.000 0.000
#> SRR772664 2 0.1854 0.78138 0.012 0.940 0.000 0.048
#> SRR772665 2 0.0779 0.77779 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR772666 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772667 4 0.0921 0.87698 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR772668 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772669 4 0.0188 0.88017 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR772670 2 0.4916 0.11761 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR772671 2 0.4431 0.46123 0.304 0.696 0.000 0.000
#> SRR772672 2 0.2149 0.76627 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR772673 2 0.2647 0.75247 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772674 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.4841 0.66724 0.712 0.272 0.012 0.004
#> SRR772676 1 0.4855 0.44850 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR772677 1 0.4304 0.68581 0.716 0.284 0.000 0.000
#> SRR772678 1 0.4809 0.70831 0.728 0.252 0.016 0.004
#> SRR772679 1 0.4992 0.16940 0.524 0.476 0.000 0.000
#> SRR772680 1 0.3975 0.71930 0.760 0.240 0.000 0.000
#> SRR772681 3 0.1118 0.92183 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR772682 2 0.1798 0.78117 0.040 0.944 0.000 0.016
#> SRR772683 2 0.2647 0.75220 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR772685 2 0.1584 0.77924 0.012 0.952 0.000 0.036
#> SRR772686 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772687 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772688 4 0.0469 0.87989 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772689 4 0.0469 0.87989 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR772690 3 0.0000 0.94602 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772691 2 0.3047 0.76601 0.012 0.872 0.000 0.116
#> SRR772692 2 0.4431 0.46058 0.304 0.696 0.000 0.000
#> SRR772693 2 0.4277 0.51882 0.280 0.720 0.000 0.000
#> SRR772694 2 0.2469 0.75815 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR772695 2 0.2089 0.78066 0.048 0.932 0.000 0.020
#> SRR772696 2 0.1297 0.77938 0.016 0.964 0.000 0.020
#> SRR772697 2 0.2924 0.76993 0.016 0.884 0.000 0.100
#> SRR772698 3 0.1209 0.92737 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR772699 1 0.2589 0.82047 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR772700 1 0.3873 0.72642 0.772 0.228 0.000 0.000
#> SRR772701 1 0.0707 0.83165 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR772702 1 0.0188 0.82664 0.996 0.004 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.1818 0.78634 0.932 0.024 0.000 0.000 0.044
#> SRR772342 1 0.3281 0.76795 0.848 0.060 0.000 0.000 0.092
#> SRR772343 1 0.5738 0.58823 0.604 0.264 0.000 0.000 0.132
#> SRR772344 2 0.4376 0.66154 0.000 0.764 0.000 0.092 0.144
#> SRR772345 2 0.4929 0.60721 0.000 0.716 0.000 0.136 0.148
#> SRR772346 2 0.5989 -0.06048 0.412 0.476 0.000 0.000 0.112
#> SRR772347 2 0.5613 0.34099 0.332 0.576 0.000 0.000 0.092
#> SRR772348 2 0.2964 0.73797 0.000 0.856 0.000 0.024 0.120
#> SRR772349 2 0.3714 0.71766 0.000 0.812 0.000 0.056 0.132
#> SRR772350 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772351 2 0.2824 0.72821 0.000 0.864 0.000 0.020 0.116
#> SRR772352 2 0.2770 0.73774 0.004 0.864 0.000 0.008 0.124
#> SRR772353 1 0.6140 0.33481 0.492 0.372 0.000 0.000 0.136
#> SRR772354 2 0.6183 -0.05245 0.408 0.456 0.000 0.000 0.136
#> SRR772355 2 0.2124 0.74351 0.000 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR772356 2 0.2563 0.73000 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR772357 1 0.4593 0.72478 0.748 0.128 0.000 0.000 0.124
#> SRR772358 1 0.5541 0.62421 0.636 0.236 0.000 0.000 0.128
#> SRR772359 1 0.6172 0.37832 0.500 0.356 0.000 0.000 0.144
#> SRR772360 1 0.6180 0.37962 0.496 0.360 0.000 0.000 0.144
#> SRR772361 3 0.0162 0.95028 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR772362 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772364 1 0.4351 0.71911 0.768 0.132 0.000 0.000 0.100
#> SRR772365 2 0.5551 0.10175 0.444 0.488 0.000 0.000 0.068
#> SRR772366 5 0.4967 0.57477 0.060 0.000 0.280 0.000 0.660
#> SRR772367 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772368 2 0.1942 0.74898 0.012 0.920 0.000 0.000 0.068
#> SRR772369 2 0.4588 0.64750 0.136 0.748 0.000 0.000 0.116
#> SRR772370 2 0.5462 0.51402 0.212 0.652 0.000 0.000 0.136
#> SRR772371 2 0.5238 0.47975 0.260 0.652 0.000 0.000 0.088
#> SRR772372 2 0.4752 0.61731 0.184 0.724 0.000 0.000 0.092
#> SRR772373 2 0.1732 0.74115 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR772374 2 0.1357 0.75035 0.004 0.948 0.000 0.000 0.048
#> SRR772375 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772376 2 0.3002 0.72420 0.000 0.856 0.000 0.028 0.116
#> SRR772377 5 0.3416 0.63044 0.072 0.088 0.000 0.000 0.840
#> SRR772378 2 0.6022 0.26652 0.324 0.540 0.000 0.000 0.136
#> SRR772379 2 0.5589 0.46159 0.244 0.628 0.000 0.000 0.128
#> SRR772380 2 0.5006 0.60551 0.156 0.708 0.000 0.000 0.136
#> SRR772381 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.1106 0.78514 0.964 0.024 0.000 0.000 0.012
#> SRR772383 1 0.1872 0.78407 0.928 0.052 0.000 0.000 0.020
#> SRR772384 5 0.3086 0.67085 0.180 0.004 0.000 0.000 0.816
#> SRR772385 2 0.4437 0.21860 0.000 0.532 0.000 0.004 0.464
#> SRR772386 2 0.1357 0.75189 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR772387 2 0.2284 0.74332 0.004 0.896 0.000 0.004 0.096
#> SRR772388 1 0.0404 0.77300 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772389 1 0.0865 0.78366 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR772390 5 0.3895 0.50982 0.000 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR772391 1 0.0510 0.77927 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772392 1 0.1410 0.78369 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR772393 2 0.1605 0.75487 0.012 0.944 0.000 0.004 0.040
#> SRR772394 2 0.3291 0.72050 0.064 0.848 0.000 0.000 0.088
#> SRR772395 2 0.3454 0.71404 0.000 0.816 0.000 0.028 0.156
#> SRR772396 1 0.0963 0.76966 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR772397 1 0.0865 0.77428 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR772398 1 0.1564 0.78825 0.948 0.024 0.004 0.000 0.024
#> SRR772399 1 0.2378 0.78688 0.904 0.048 0.000 0.000 0.048
#> SRR772400 1 0.2429 0.77888 0.900 0.004 0.020 0.000 0.076
#> SRR772401 1 0.1270 0.75531 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR772402 2 0.5791 0.40365 0.000 0.600 0.000 0.260 0.140
#> SRR772403 2 0.5654 0.46545 0.000 0.628 0.000 0.224 0.148
#> SRR772404 2 0.1282 0.75324 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR772405 5 0.3242 0.67308 0.172 0.012 0.000 0.000 0.816
#> SRR772406 2 0.1412 0.75649 0.008 0.952 0.000 0.004 0.036
#> SRR772407 2 0.2177 0.75401 0.008 0.908 0.000 0.004 0.080
#> SRR772408 4 0.0451 0.83205 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR772409 4 0.0794 0.82736 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR772410 2 0.3301 0.71234 0.080 0.848 0.000 0.000 0.072
#> SRR772411 2 0.4698 0.61414 0.172 0.732 0.000 0.000 0.096
#> SRR772412 1 0.0794 0.78188 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772413 1 0.0000 0.77253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772415 2 0.4457 0.65857 0.124 0.760 0.000 0.000 0.116
#> SRR772416 2 0.2344 0.74329 0.032 0.904 0.000 0.000 0.064
#> SRR772417 2 0.5703 0.05944 0.408 0.508 0.000 0.000 0.084
#> SRR772418 5 0.4655 0.60372 0.052 0.000 0.248 0.000 0.700
#> SRR772419 4 0.6091 0.44893 0.000 0.336 0.000 0.524 0.140
#> SRR772420 4 0.5554 0.59584 0.000 0.252 0.000 0.628 0.120
#> SRR772421 2 0.4849 0.62564 0.140 0.724 0.000 0.000 0.136
#> SRR772422 2 0.3754 0.70680 0.100 0.816 0.000 0.000 0.084
#> SRR772423 4 0.5770 0.57291 0.000 0.256 0.000 0.604 0.140
#> SRR772424 4 0.4965 0.55767 0.000 0.304 0.000 0.644 0.052
#> SRR772425 2 0.2806 0.73014 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR772426 2 0.5704 0.43435 0.000 0.620 0.000 0.232 0.148
#> SRR772427 2 0.6154 0.09868 0.000 0.508 0.000 0.348 0.144
#> SRR772428 1 0.2139 0.73089 0.916 0.000 0.052 0.000 0.032
#> SRR772429 1 0.0290 0.77503 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772430 1 0.5852 0.53296 0.584 0.280 0.000 0.000 0.136
#> SRR772431 4 0.5956 0.52380 0.000 0.296 0.000 0.564 0.140
#> SRR772432 2 0.6096 0.20316 0.000 0.536 0.000 0.316 0.148
#> SRR772433 1 0.3304 0.60679 0.816 0.000 0.168 0.000 0.016
#> SRR772434 1 0.3535 0.59259 0.808 0.000 0.028 0.000 0.164
#> SRR772435 1 0.4444 0.72383 0.760 0.136 0.000 0.000 0.104
#> SRR772436 1 0.6058 0.39101 0.528 0.336 0.000 0.000 0.136
#> SRR772437 3 0.0451 0.94261 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR772438 1 0.0703 0.76343 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR772439 1 0.0912 0.76136 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR772440 2 0.3268 0.73878 0.060 0.856 0.000 0.004 0.080
#> SRR772441 2 0.2172 0.75268 0.020 0.916 0.000 0.004 0.060
#> SRR772442 2 0.4845 0.63862 0.000 0.724 0.000 0.128 0.148
#> SRR772443 2 0.3531 0.71015 0.000 0.816 0.000 0.036 0.148
#> SRR772444 1 0.0162 0.77442 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR772445 1 0.1082 0.78590 0.964 0.008 0.000 0.000 0.028
#> SRR772446 1 0.3291 0.76742 0.848 0.088 0.000 0.000 0.064
#> SRR772447 1 0.3535 0.76815 0.832 0.088 0.000 0.000 0.080
#> SRR772448 2 0.1731 0.74965 0.004 0.932 0.000 0.004 0.060
#> SRR772449 2 0.1168 0.75242 0.008 0.960 0.000 0.000 0.032
#> SRR772450 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772452 1 0.0290 0.77525 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772453 1 0.0912 0.78395 0.972 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR772454 1 0.4294 0.71091 0.768 0.152 0.000 0.000 0.080
#> SRR772455 1 0.6191 0.15937 0.436 0.428 0.000 0.000 0.136
#> SRR772456 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772458 1 0.0451 0.77678 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR772459 1 0.0324 0.77769 0.992 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR772460 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772462 2 0.4519 0.64737 0.000 0.752 0.000 0.100 0.148
#> SRR772463 2 0.2932 0.74161 0.000 0.864 0.000 0.032 0.104
#> SRR772464 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772465 2 0.4437 0.66015 0.140 0.760 0.000 0.000 0.100
#> SRR772466 2 0.3479 0.70821 0.080 0.836 0.000 0.000 0.084
#> SRR772467 4 0.1908 0.81436 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR772468 4 0.2068 0.81280 0.000 0.004 0.000 0.904 0.092
#> SRR772469 1 0.4898 0.65033 0.684 0.248 0.000 0.000 0.068
#> SRR772470 1 0.2959 0.76725 0.864 0.100 0.000 0.000 0.036
#> SRR772471 1 0.4926 0.69845 0.716 0.152 0.000 0.000 0.132
#> SRR772472 1 0.4351 0.73043 0.768 0.132 0.000 0.000 0.100
#> SRR772473 2 0.3667 0.70161 0.000 0.812 0.000 0.048 0.140
#> SRR772474 2 0.5482 0.52281 0.000 0.652 0.000 0.204 0.144
#> SRR772475 5 0.5092 0.13529 0.036 0.440 0.000 0.000 0.524
#> SRR772476 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772478 1 0.1205 0.78065 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR772479 1 0.1205 0.77763 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR772480 2 0.3154 0.72395 0.004 0.836 0.000 0.012 0.148
#> SRR772481 2 0.3544 0.73388 0.016 0.812 0.000 0.008 0.164
#> SRR772482 1 0.2927 0.77093 0.868 0.040 0.000 0.000 0.092
#> SRR772483 1 0.4197 0.71894 0.776 0.148 0.000 0.000 0.076
#> SRR772484 2 0.3246 0.74461 0.008 0.808 0.000 0.000 0.184
#> SRR772485 2 0.3276 0.74090 0.032 0.836 0.000 0.000 0.132
#> SRR772486 1 0.2141 0.76837 0.916 0.016 0.004 0.000 0.064
#> SRR772487 1 0.1768 0.77852 0.924 0.004 0.000 0.000 0.072
#> SRR772488 2 0.5668 0.47842 0.232 0.624 0.000 0.000 0.144
#> SRR772489 2 0.5414 0.53754 0.200 0.660 0.000 0.000 0.140
#> SRR772490 1 0.1907 0.78723 0.928 0.044 0.000 0.000 0.028
#> SRR772491 1 0.1626 0.78637 0.940 0.044 0.000 0.000 0.016
#> SRR772492 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772496 2 0.2208 0.74651 0.020 0.908 0.000 0.000 0.072
#> SRR772497 2 0.1121 0.75097 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR772498 2 0.1768 0.75686 0.004 0.924 0.000 0.000 0.072
#> SRR772499 2 0.2284 0.74929 0.004 0.896 0.000 0.004 0.096
#> SRR772500 2 0.3608 0.70376 0.000 0.812 0.000 0.040 0.148
#> SRR772501 2 0.3975 0.68875 0.000 0.792 0.000 0.064 0.144
#> SRR772502 1 0.5934 0.34609 0.496 0.396 0.000 0.000 0.108
#> SRR772503 2 0.6021 -0.02890 0.408 0.476 0.000 0.000 0.116
#> SRR772504 2 0.3284 0.71408 0.000 0.828 0.000 0.024 0.148
#> SRR772505 2 0.3565 0.70522 0.000 0.816 0.000 0.040 0.144
#> SRR772506 4 0.5797 0.54624 0.000 0.276 0.000 0.592 0.132
#> SRR772507 4 0.4221 0.73685 0.000 0.112 0.000 0.780 0.108
#> SRR772508 2 0.6121 0.17628 0.000 0.528 0.000 0.324 0.148
#> SRR772509 5 0.4138 0.61395 0.160 0.064 0.000 0.000 0.776
#> SRR772510 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772511 2 0.3535 0.70493 0.088 0.832 0.000 0.000 0.080
#> SRR772512 2 0.5638 0.58705 0.168 0.680 0.020 0.000 0.132
#> SRR772513 2 0.2248 0.75321 0.012 0.900 0.000 0.000 0.088
#> SRR772514 2 0.1430 0.75533 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR772515 2 0.2488 0.73261 0.000 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR772516 2 0.1430 0.75360 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR772517 2 0.3115 0.75038 0.020 0.860 0.000 0.012 0.108
#> SRR772518 2 0.2270 0.75302 0.016 0.908 0.000 0.004 0.072
#> SRR772519 2 0.2536 0.73523 0.000 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR772520 2 0.2753 0.72508 0.000 0.856 0.000 0.008 0.136
#> SRR772521 2 0.5644 -0.10916 0.440 0.484 0.000 0.000 0.076
#> SRR772522 2 0.4786 0.59856 0.188 0.720 0.000 0.000 0.092
#> SRR772523 2 0.3752 0.69857 0.000 0.804 0.000 0.048 0.148
#> SRR772524 2 0.3098 0.71734 0.000 0.836 0.000 0.016 0.148
#> SRR772525 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772526 4 0.1341 0.82600 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR772527 4 0.1270 0.82688 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR772528 5 0.3913 0.50500 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR772529 1 0.2370 0.78575 0.904 0.040 0.000 0.000 0.056
#> SRR772530 1 0.3966 0.74035 0.796 0.132 0.000 0.000 0.072
#> SRR772531 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772532 2 0.3055 0.71788 0.000 0.840 0.000 0.016 0.144
#> SRR772533 2 0.3370 0.71175 0.000 0.824 0.000 0.028 0.148
#> SRR772534 1 0.5834 0.43836 0.532 0.364 0.000 0.000 0.104
#> SRR772535 2 0.2873 0.72760 0.000 0.856 0.000 0.016 0.128
#> SRR772536 2 0.2338 0.73831 0.000 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR772537 4 0.1894 0.80985 0.000 0.072 0.000 0.920 0.008
#> SRR772538 4 0.3970 0.75628 0.000 0.104 0.000 0.800 0.096
#> SRR772539 1 0.3898 0.75458 0.804 0.116 0.000 0.000 0.080
#> SRR772540 1 0.4751 0.69110 0.732 0.152 0.000 0.000 0.116
#> SRR772541 2 0.3289 0.72988 0.048 0.844 0.000 0.000 0.108
#> SRR772542 1 0.1012 0.78341 0.968 0.012 0.000 0.000 0.020
#> SRR772543 1 0.0794 0.77383 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772544 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772545 1 0.1753 0.78830 0.936 0.032 0.000 0.000 0.032
#> SRR772546 1 0.1648 0.78841 0.940 0.020 0.000 0.000 0.040
#> SRR772547 2 0.5773 0.11417 0.396 0.512 0.000 0.000 0.092
#> SRR772548 1 0.5013 0.68331 0.700 0.192 0.000 0.000 0.108
#> SRR772549 1 0.1830 0.78440 0.924 0.008 0.000 0.000 0.068
#> SRR772550 1 0.1106 0.78536 0.964 0.012 0.000 0.000 0.024
#> SRR772551 2 0.3849 0.69555 0.080 0.808 0.000 0.000 0.112
#> SRR772552 2 0.3464 0.70987 0.068 0.836 0.000 0.000 0.096
#> SRR772553 5 0.5161 0.02691 0.040 0.444 0.000 0.000 0.516
#> SRR772554 2 0.2997 0.72147 0.000 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR772555 2 0.2723 0.72824 0.000 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR772556 1 0.1197 0.78319 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR772557 1 0.0609 0.78008 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772558 1 0.5180 0.67303 0.684 0.196 0.000 0.000 0.120
#> SRR772559 1 0.5826 0.47697 0.556 0.332 0.000 0.000 0.112
#> SRR772560 2 0.5655 0.39252 0.288 0.600 0.000 0.000 0.112
#> SRR772561 3 0.4800 0.53896 0.136 0.036 0.764 0.000 0.064
#> SRR772562 2 0.1831 0.75421 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR772563 2 0.1831 0.75494 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR772564 1 0.2351 0.72470 0.896 0.000 0.088 0.000 0.016
#> SRR772565 1 0.2411 0.69488 0.884 0.000 0.108 0.000 0.008
#> SRR772566 1 0.4730 0.37483 0.688 0.000 0.260 0.000 0.052
#> SRR772567 3 0.5364 0.20069 0.364 0.000 0.572 0.000 0.064
#> SRR772568 2 0.1557 0.75379 0.008 0.940 0.000 0.000 0.052
#> SRR772569 2 0.1153 0.75428 0.008 0.964 0.000 0.004 0.024
#> SRR772570 1 0.3506 0.75418 0.824 0.132 0.000 0.000 0.044
#> SRR772571 1 0.5345 0.66525 0.668 0.196 0.000 0.000 0.136
#> SRR772572 1 0.5557 0.14378 0.468 0.464 0.000 0.000 0.068
#> SRR772573 2 0.5329 0.04217 0.432 0.516 0.000 0.000 0.052
#> SRR772574 1 0.5466 0.63279 0.640 0.244 0.000 0.000 0.116
#> SRR772575 1 0.5737 0.54463 0.592 0.288 0.000 0.000 0.120
#> SRR772576 2 0.2504 0.74028 0.040 0.896 0.000 0.000 0.064
#> SRR772577 2 0.2214 0.74951 0.028 0.916 0.000 0.004 0.052
#> SRR772578 4 0.4872 0.69257 0.000 0.160 0.000 0.720 0.120
#> SRR772579 4 0.4591 0.71937 0.000 0.120 0.000 0.748 0.132
#> SRR772580 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772581 2 0.1978 0.75358 0.024 0.928 0.000 0.004 0.044
#> SRR772582 2 0.2196 0.74952 0.056 0.916 0.000 0.004 0.024
#> SRR772583 2 0.4916 0.61799 0.160 0.716 0.000 0.000 0.124
#> SRR772584 2 0.4634 0.65208 0.136 0.744 0.000 0.000 0.120
#> SRR772585 2 0.3479 0.71501 0.080 0.836 0.000 0.000 0.084
#> SRR772586 5 0.4994 0.65067 0.112 0.000 0.184 0.000 0.704
#> SRR772587 1 0.3840 0.75122 0.808 0.076 0.000 0.000 0.116
#> SRR772588 2 0.5519 0.49012 0.000 0.648 0.000 0.204 0.148
#> SRR772589 2 0.6109 0.19044 0.000 0.532 0.000 0.320 0.148
#> SRR772590 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.3242 0.59862 0.816 0.000 0.172 0.000 0.012
#> SRR772592 1 0.3595 0.59891 0.816 0.000 0.140 0.000 0.044
#> SRR772593 5 0.5184 0.64153 0.136 0.000 0.176 0.000 0.688
#> SRR772594 4 0.5673 0.58562 0.000 0.252 0.000 0.616 0.132
#> SRR772595 4 0.5594 0.60397 0.000 0.232 0.000 0.632 0.136
#> SRR772596 5 0.4182 0.37318 0.000 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR772597 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772598 1 0.2491 0.72361 0.896 0.000 0.068 0.000 0.036
#> SRR772599 1 0.0579 0.77837 0.984 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR772600 2 0.4237 0.67880 0.000 0.772 0.000 0.076 0.152
#> SRR772601 2 0.5198 0.58117 0.000 0.688 0.000 0.164 0.148
#> SRR772602 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772603 2 0.3370 0.71523 0.000 0.824 0.000 0.028 0.148
#> SRR772604 2 0.4309 0.66754 0.000 0.768 0.000 0.084 0.148
#> SRR772605 2 0.4704 0.63209 0.152 0.736 0.000 0.000 0.112
#> SRR772606 1 0.0290 0.77683 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR772607 1 0.0880 0.78380 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR772608 2 0.2773 0.75511 0.020 0.868 0.000 0.000 0.112
#> SRR772609 2 0.2077 0.74658 0.008 0.908 0.000 0.000 0.084
#> SRR772610 2 0.2411 0.73956 0.000 0.884 0.000 0.008 0.108
#> SRR772611 2 0.1341 0.75444 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR772612 4 0.3714 0.76469 0.000 0.056 0.000 0.812 0.132
#> SRR772613 4 0.4117 0.74612 0.000 0.116 0.000 0.788 0.096
#> SRR772614 1 0.0609 0.78077 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR772615 1 0.0794 0.78150 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR772616 1 0.6247 0.33580 0.484 0.364 0.000 0.000 0.152
#> SRR772617 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772618 4 0.1502 0.81972 0.000 0.056 0.000 0.940 0.004
#> SRR772619 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772620 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772621 2 0.3401 0.72162 0.064 0.840 0.000 0.000 0.096
#> SRR772622 2 0.4022 0.68302 0.100 0.796 0.000 0.000 0.104
#> SRR772623 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772624 5 0.5144 0.64176 0.176 0.000 0.132 0.000 0.692
#> SRR772625 4 0.5372 0.64962 0.000 0.180 0.000 0.668 0.152
#> SRR772626 2 0.1408 0.75484 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR772627 2 0.1455 0.75484 0.008 0.952 0.000 0.008 0.032
#> SRR772628 1 0.3543 0.75382 0.828 0.112 0.000 0.000 0.060
#> SRR772629 1 0.3043 0.76875 0.864 0.080 0.000 0.000 0.056
#> SRR772630 2 0.5568 0.16400 0.384 0.540 0.000 0.000 0.076
#> SRR772631 5 0.4728 0.60906 0.060 0.000 0.240 0.000 0.700
#> SRR772632 2 0.5046 0.58850 0.000 0.704 0.000 0.156 0.140
#> SRR772633 4 0.6195 0.35923 0.000 0.368 0.000 0.488 0.144
#> SRR772634 2 0.6140 0.15421 0.356 0.504 0.000 0.000 0.140
#> SRR772635 2 0.6192 -0.18689 0.432 0.432 0.000 0.000 0.136
#> SRR772636 2 0.3958 0.68539 0.000 0.780 0.000 0.044 0.176
#> SRR772637 1 0.0510 0.77363 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR772638 1 0.0404 0.77461 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR772639 2 0.2997 0.71937 0.000 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR772640 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772642 2 0.3359 0.71047 0.052 0.840 0.000 0.000 0.108
#> SRR772643 2 0.4591 0.65257 0.120 0.748 0.000 0.000 0.132
#> SRR772644 1 0.4849 0.70897 0.724 0.140 0.000 0.000 0.136
#> SRR772645 1 0.6030 0.47801 0.544 0.316 0.000 0.000 0.140
#> SRR772646 2 0.3098 0.72405 0.000 0.836 0.000 0.016 0.148
#> SRR772647 2 0.2909 0.72180 0.000 0.848 0.000 0.012 0.140
#> SRR772648 2 0.1990 0.75291 0.028 0.928 0.000 0.004 0.040
#> SRR772649 2 0.1965 0.74706 0.024 0.924 0.000 0.000 0.052
#> SRR772650 1 0.5516 0.62716 0.640 0.232 0.000 0.000 0.128
#> SRR772651 1 0.5699 0.59292 0.608 0.264 0.000 0.000 0.128
#> SRR772652 1 0.1894 0.78439 0.920 0.008 0.000 0.000 0.072
#> SRR772653 1 0.1549 0.78680 0.944 0.016 0.000 0.000 0.040
#> SRR772654 2 0.5691 0.35106 0.296 0.592 0.000 0.000 0.112
#> SRR772655 2 0.5912 0.17505 0.348 0.536 0.000 0.000 0.116
#> SRR772656 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0404 0.94280 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR772658 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772659 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772660 2 0.2830 0.73443 0.044 0.876 0.000 0.000 0.080
#> SRR772661 5 0.3437 0.67539 0.176 0.012 0.004 0.000 0.808
#> SRR772662 2 0.6210 -0.04921 0.404 0.456 0.000 0.000 0.140
#> SRR772663 2 0.6229 -0.00290 0.392 0.464 0.000 0.000 0.144
#> SRR772664 2 0.1764 0.75666 0.008 0.928 0.000 0.000 0.064
#> SRR772665 2 0.1774 0.75163 0.016 0.932 0.000 0.000 0.052
#> SRR772666 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772667 4 0.1579 0.82748 0.000 0.032 0.000 0.944 0.024
#> SRR772668 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772669 4 0.0000 0.83293 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR772670 2 0.6056 0.25685 0.324 0.536 0.000 0.000 0.140
#> SRR772671 2 0.5628 0.46502 0.244 0.624 0.000 0.000 0.132
#> SRR772672 2 0.1764 0.74950 0.000 0.928 0.000 0.008 0.064
#> SRR772673 2 0.2136 0.74289 0.000 0.904 0.000 0.008 0.088
#> SRR772674 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772675 5 0.3224 0.67513 0.160 0.016 0.000 0.000 0.824
#> SRR772676 1 0.5107 0.48479 0.596 0.356 0.000 0.000 0.048
#> SRR772677 1 0.4788 0.66264 0.696 0.240 0.000 0.000 0.064
#> SRR772678 5 0.3460 0.67086 0.128 0.044 0.000 0.000 0.828
#> SRR772679 2 0.6161 0.00836 0.424 0.444 0.000 0.000 0.132
#> SRR772680 1 0.5462 0.61592 0.652 0.212 0.000 0.000 0.136
#> SRR772681 3 0.0798 0.92471 0.016 0.000 0.976 0.000 0.008
#> SRR772682 2 0.2193 0.75224 0.028 0.912 0.000 0.000 0.060
#> SRR772683 2 0.2124 0.74088 0.000 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR772685 2 0.1026 0.75257 0.004 0.968 0.000 0.004 0.024
#> SRR772686 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772687 3 0.1671 0.87184 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR772688 4 0.2011 0.81457 0.000 0.004 0.000 0.908 0.088
#> SRR772689 4 0.1831 0.81928 0.000 0.004 0.000 0.920 0.076
#> SRR772690 3 0.0000 0.95341 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772691 2 0.4449 0.18562 0.000 0.512 0.000 0.004 0.484
#> SRR772692 2 0.5594 0.47521 0.232 0.632 0.000 0.000 0.136
#> SRR772693 2 0.5490 0.53572 0.200 0.652 0.000 0.000 0.148
#> SRR772694 2 0.1965 0.74873 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR772695 2 0.2236 0.74755 0.024 0.908 0.000 0.000 0.068
#> SRR772696 2 0.1329 0.75183 0.008 0.956 0.000 0.004 0.032
#> SRR772697 2 0.2177 0.75202 0.008 0.908 0.000 0.004 0.080
#> SRR772698 5 0.4520 0.56429 0.032 0.000 0.284 0.000 0.684
#> SRR772699 1 0.4334 0.72313 0.768 0.092 0.000 0.000 0.140
#> SRR772700 1 0.5227 0.63771 0.676 0.208 0.000 0.000 0.116
#> SRR772701 1 0.0671 0.78268 0.980 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR772702 1 0.0162 0.77380 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.3189 0.75196 0.760 0.000 0.000 0.000 0.004 0.236
#> SRR772342 1 0.3890 0.54491 0.596 0.000 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR772343 6 0.4106 0.27914 0.312 0.020 0.000 0.000 0.004 0.664
#> SRR772344 2 0.2944 0.66150 0.000 0.860 0.000 0.028 0.092 0.020
#> SRR772345 2 0.3597 0.65792 0.000 0.824 0.000 0.048 0.092 0.036
#> SRR772346 6 0.5605 0.52234 0.256 0.180 0.000 0.000 0.004 0.560
#> SRR772347 6 0.5297 0.56801 0.168 0.212 0.000 0.000 0.004 0.616
#> SRR772348 2 0.3885 0.66223 0.000 0.756 0.000 0.000 0.064 0.180
#> SRR772349 2 0.3718 0.66062 0.000 0.808 0.000 0.016 0.088 0.088
#> SRR772350 3 0.0790 0.92798 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772351 2 0.3456 0.67485 0.000 0.788 0.000 0.000 0.040 0.172
#> SRR772352 2 0.3652 0.61475 0.000 0.720 0.000 0.000 0.016 0.264
#> SRR772353 6 0.4220 0.42356 0.244 0.040 0.000 0.000 0.008 0.708
#> SRR772354 6 0.4980 0.52303 0.192 0.132 0.000 0.000 0.008 0.668
#> SRR772355 2 0.3426 0.61058 0.000 0.720 0.000 0.000 0.004 0.276
#> SRR772356 2 0.2852 0.68385 0.000 0.856 0.000 0.000 0.064 0.080
#> SRR772357 6 0.4468 -0.31508 0.484 0.020 0.000 0.000 0.004 0.492
#> SRR772358 6 0.4252 0.15711 0.344 0.016 0.000 0.000 0.008 0.632
#> SRR772359 6 0.4139 0.39309 0.260 0.036 0.000 0.000 0.004 0.700
#> SRR772360 6 0.4222 0.41799 0.252 0.044 0.000 0.000 0.004 0.700
#> SRR772361 3 0.0692 0.92831 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772362 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772363 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772364 1 0.4901 0.31952 0.484 0.060 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR772365 1 0.5900 -0.27214 0.412 0.204 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR772366 5 0.2867 0.78583 0.040 0.000 0.112 0.000 0.848 0.000
#> SRR772367 3 0.0632 0.92957 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772368 2 0.4093 0.42391 0.000 0.584 0.000 0.000 0.012 0.404
#> SRR772369 6 0.4885 0.34698 0.056 0.340 0.000 0.000 0.008 0.596
#> SRR772370 6 0.4402 0.55157 0.080 0.188 0.000 0.000 0.008 0.724
#> SRR772371 6 0.5357 0.49588 0.120 0.280 0.000 0.000 0.008 0.592
#> SRR772372 6 0.5442 0.36287 0.108 0.336 0.000 0.000 0.008 0.548
#> SRR772373 2 0.4080 0.32791 0.000 0.536 0.000 0.000 0.008 0.456
#> SRR772374 2 0.3923 0.49628 0.000 0.620 0.000 0.000 0.008 0.372
#> SRR772375 3 0.0790 0.92798 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772376 2 0.2558 0.66853 0.000 0.840 0.000 0.004 0.000 0.156
#> SRR772377 5 0.2288 0.79737 0.004 0.004 0.000 0.000 0.876 0.116
#> SRR772378 6 0.4707 0.57698 0.136 0.152 0.000 0.000 0.008 0.704
#> SRR772379 6 0.4763 0.54306 0.092 0.220 0.000 0.000 0.008 0.680
#> SRR772380 6 0.4825 0.42762 0.068 0.284 0.000 0.000 0.008 0.640
#> SRR772381 3 0.0547 0.92952 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772382 1 0.2191 0.78967 0.876 0.004 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR772383 1 0.2730 0.75679 0.808 0.000 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR772384 5 0.2100 0.80116 0.004 0.000 0.000 0.000 0.884 0.112
#> SRR772385 2 0.5259 0.25291 0.000 0.536 0.000 0.000 0.356 0.108
#> SRR772386 2 0.3405 0.61187 0.000 0.724 0.000 0.000 0.004 0.272
#> SRR772387 2 0.3421 0.62335 0.000 0.736 0.000 0.000 0.008 0.256
#> SRR772388 1 0.1682 0.77793 0.928 0.000 0.000 0.000 0.020 0.052
#> SRR772389 1 0.2218 0.78811 0.884 0.000 0.000 0.000 0.012 0.104
#> SRR772390 5 0.2362 0.77346 0.004 0.000 0.136 0.000 0.860 0.000
#> SRR772391 1 0.2219 0.79613 0.864 0.000 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR772392 1 0.3052 0.76109 0.780 0.000 0.000 0.000 0.004 0.216
#> SRR772393 2 0.3819 0.55075 0.000 0.652 0.000 0.000 0.008 0.340
#> SRR772394 6 0.4748 -0.04851 0.032 0.444 0.000 0.000 0.008 0.516
#> SRR772395 2 0.2781 0.66053 0.000 0.868 0.000 0.008 0.084 0.040
#> SRR772396 1 0.2412 0.79244 0.880 0.000 0.000 0.000 0.028 0.092
#> SRR772397 1 0.2006 0.79412 0.892 0.000 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR772398 1 0.2340 0.79359 0.852 0.000 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR772399 1 0.3489 0.71517 0.708 0.000 0.000 0.000 0.004 0.288
#> SRR772400 1 0.4025 0.73909 0.732 0.000 0.024 0.000 0.016 0.228
#> SRR772401 1 0.2728 0.78328 0.872 0.000 0.008 0.000 0.040 0.080
#> SRR772402 2 0.5935 0.59894 0.000 0.624 0.000 0.168 0.092 0.116
#> SRR772403 2 0.5447 0.62948 0.000 0.680 0.000 0.124 0.092 0.104
#> SRR772404 2 0.3360 0.57754 0.000 0.732 0.000 0.000 0.004 0.264
#> SRR772405 5 0.2146 0.79956 0.004 0.000 0.000 0.000 0.880 0.116
#> SRR772406 2 0.3894 0.54815 0.008 0.664 0.000 0.000 0.004 0.324
#> SRR772407 2 0.4018 0.57921 0.000 0.656 0.000 0.000 0.020 0.324
#> SRR772408 4 0.0405 0.88133 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR772409 4 0.0632 0.87348 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR772410 6 0.4158 0.03332 0.004 0.416 0.000 0.000 0.008 0.572
#> SRR772411 6 0.4379 0.31258 0.024 0.336 0.000 0.000 0.008 0.632
#> SRR772412 1 0.2100 0.79003 0.884 0.000 0.000 0.000 0.004 0.112
#> SRR772413 1 0.1007 0.77798 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR772414 3 0.0790 0.92798 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772415 6 0.4411 0.27200 0.028 0.356 0.000 0.000 0.004 0.612
#> SRR772416 2 0.4080 0.31923 0.000 0.536 0.000 0.000 0.008 0.456
#> SRR772417 6 0.5911 0.54469 0.252 0.220 0.000 0.000 0.008 0.520
#> SRR772418 5 0.2487 0.79760 0.032 0.000 0.092 0.000 0.876 0.000
#> SRR772419 2 0.4827 0.30103 0.000 0.620 0.000 0.296 0.084 0.000
#> SRR772420 2 0.5052 -0.04921 0.000 0.512 0.000 0.420 0.064 0.004
#> SRR772421 6 0.4544 0.30585 0.044 0.320 0.000 0.000 0.004 0.632
#> SRR772422 6 0.4770 -0.09729 0.040 0.448 0.000 0.000 0.004 0.508
#> SRR772423 2 0.5179 0.03034 0.000 0.516 0.000 0.392 0.092 0.000
#> SRR772424 2 0.4423 0.07689 0.000 0.552 0.000 0.420 0.028 0.000
#> SRR772425 2 0.4728 0.66206 0.000 0.652 0.000 0.000 0.092 0.256
#> SRR772426 2 0.3590 0.62970 0.000 0.820 0.000 0.068 0.092 0.020
#> SRR772427 2 0.4334 0.57202 0.000 0.756 0.000 0.132 0.092 0.020
#> SRR772428 1 0.1777 0.76551 0.932 0.000 0.012 0.000 0.024 0.032
#> SRR772429 1 0.0692 0.77129 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR772430 6 0.5250 0.29819 0.264 0.116 0.000 0.000 0.008 0.612
#> SRR772431 2 0.4885 0.33435 0.000 0.644 0.000 0.260 0.092 0.004
#> SRR772432 2 0.4001 0.60048 0.000 0.784 0.000 0.108 0.092 0.016
#> SRR772433 1 0.2504 0.70285 0.880 0.000 0.088 0.000 0.028 0.004
#> SRR772434 1 0.3184 0.67589 0.836 0.000 0.016 0.000 0.120 0.028
#> SRR772435 1 0.4934 0.25024 0.488 0.052 0.000 0.000 0.004 0.456
#> SRR772436 6 0.4822 0.35693 0.296 0.072 0.000 0.000 0.004 0.628
#> SRR772437 3 0.0806 0.92522 0.008 0.000 0.972 0.000 0.000 0.020
#> SRR772438 1 0.2433 0.77154 0.884 0.000 0.000 0.000 0.044 0.072
#> SRR772439 1 0.2314 0.76735 0.900 0.000 0.008 0.000 0.036 0.056
#> SRR772440 2 0.4384 0.31123 0.016 0.520 0.000 0.000 0.004 0.460
#> SRR772441 2 0.3930 0.52766 0.004 0.628 0.000 0.000 0.004 0.364
#> SRR772442 2 0.3526 0.66493 0.000 0.828 0.000 0.032 0.092 0.048
#> SRR772443 2 0.2772 0.66166 0.000 0.864 0.000 0.004 0.092 0.040
#> SRR772444 1 0.2340 0.79183 0.852 0.000 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR772445 1 0.2697 0.79021 0.812 0.000 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR772446 1 0.3528 0.68061 0.700 0.000 0.000 0.000 0.004 0.296
#> SRR772447 1 0.4127 0.56297 0.588 0.004 0.000 0.000 0.008 0.400
#> SRR772448 2 0.3986 0.48899 0.004 0.608 0.000 0.000 0.004 0.384
#> SRR772449 2 0.3769 0.51350 0.000 0.640 0.000 0.000 0.004 0.356
#> SRR772450 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772451 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.1644 0.78774 0.920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR772453 1 0.2416 0.79290 0.844 0.000 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR772454 1 0.4798 0.48898 0.580 0.052 0.000 0.000 0.004 0.364
#> SRR772455 6 0.4416 0.48681 0.212 0.076 0.000 0.000 0.004 0.708
#> SRR772456 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772457 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772458 1 0.1910 0.78925 0.892 0.000 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR772459 1 0.1501 0.78665 0.924 0.000 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR772460 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772461 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772462 2 0.2663 0.65250 0.000 0.876 0.000 0.028 0.084 0.012
#> SRR772463 2 0.2700 0.65517 0.000 0.836 0.000 0.004 0.004 0.156
#> SRR772464 3 0.0713 0.92889 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR772465 6 0.4837 0.28519 0.044 0.384 0.000 0.000 0.008 0.564
#> SRR772466 6 0.4576 0.08812 0.024 0.412 0.000 0.000 0.008 0.556
#> SRR772467 4 0.2389 0.83502 0.000 0.052 0.000 0.888 0.060 0.000
#> SRR772468 4 0.2448 0.83139 0.000 0.052 0.000 0.884 0.064 0.000
#> SRR772469 6 0.5241 -0.02748 0.444 0.080 0.000 0.000 0.004 0.472
#> SRR772470 1 0.3189 0.70875 0.760 0.004 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR772471 6 0.4229 -0.15920 0.436 0.000 0.000 0.000 0.016 0.548
#> SRR772472 1 0.3999 0.29683 0.500 0.000 0.000 0.000 0.004 0.496
#> SRR772473 2 0.3370 0.67065 0.000 0.828 0.000 0.008 0.092 0.072
#> SRR772474 2 0.3779 0.65188 0.000 0.812 0.000 0.060 0.092 0.036
#> SRR772475 5 0.5899 0.26240 0.008 0.264 0.000 0.000 0.520 0.208
#> SRR772476 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772478 1 0.2581 0.79685 0.856 0.000 0.000 0.000 0.016 0.128
#> SRR772479 1 0.1807 0.78072 0.920 0.000 0.000 0.000 0.020 0.060
#> SRR772480 2 0.3775 0.67602 0.000 0.780 0.000 0.000 0.092 0.128
#> SRR772481 2 0.4618 0.64950 0.000 0.672 0.000 0.000 0.092 0.236
#> SRR772482 1 0.3979 0.62612 0.628 0.000 0.000 0.000 0.012 0.360
#> SRR772483 1 0.4437 0.34445 0.540 0.020 0.000 0.000 0.004 0.436
#> SRR772484 2 0.4341 0.63213 0.008 0.732 0.000 0.000 0.080 0.180
#> SRR772485 2 0.4321 0.49728 0.016 0.668 0.000 0.000 0.020 0.296
#> SRR772486 1 0.1982 0.78577 0.912 0.000 0.004 0.000 0.016 0.068
#> SRR772487 1 0.3248 0.78983 0.804 0.000 0.000 0.000 0.032 0.164
#> SRR772488 6 0.5133 0.44424 0.088 0.332 0.000 0.000 0.004 0.576
#> SRR772489 6 0.4560 0.47274 0.060 0.252 0.000 0.000 0.008 0.680
#> SRR772490 1 0.3309 0.73331 0.720 0.000 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR772491 1 0.2378 0.78306 0.848 0.000 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR772492 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772493 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772494 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772495 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772496 2 0.4364 0.35844 0.012 0.556 0.000 0.000 0.008 0.424
#> SRR772497 2 0.3725 0.54009 0.000 0.676 0.000 0.000 0.008 0.316
#> SRR772498 2 0.3883 0.54673 0.000 0.656 0.000 0.000 0.012 0.332
#> SRR772499 2 0.4014 0.61678 0.004 0.696 0.000 0.000 0.024 0.276
#> SRR772500 2 0.2588 0.66159 0.000 0.876 0.000 0.008 0.092 0.024
#> SRR772501 2 0.2687 0.65575 0.000 0.872 0.000 0.012 0.092 0.024
#> SRR772502 6 0.5389 0.43240 0.288 0.132 0.000 0.000 0.004 0.576
#> SRR772503 6 0.5413 0.54452 0.244 0.160 0.000 0.000 0.004 0.592
#> SRR772504 2 0.3118 0.67610 0.000 0.836 0.000 0.000 0.092 0.072
#> SRR772505 2 0.2968 0.66979 0.000 0.852 0.000 0.004 0.092 0.052
#> SRR772506 2 0.5015 0.14433 0.000 0.564 0.000 0.352 0.084 0.000
#> SRR772507 4 0.4781 0.54517 0.000 0.320 0.000 0.608 0.072 0.000
#> SRR772508 2 0.3903 0.60470 0.000 0.792 0.000 0.108 0.084 0.016
#> SRR772509 5 0.4046 0.68134 0.068 0.004 0.000 0.000 0.752 0.176
#> SRR772510 3 0.0458 0.93024 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772511 6 0.4433 0.08115 0.016 0.416 0.000 0.000 0.008 0.560
#> SRR772512 6 0.5930 0.45175 0.076 0.224 0.036 0.000 0.036 0.628
#> SRR772513 2 0.4178 0.58187 0.008 0.708 0.000 0.000 0.036 0.248
#> SRR772514 2 0.3717 0.57787 0.000 0.708 0.000 0.000 0.016 0.276
#> SRR772515 2 0.3432 0.68455 0.000 0.800 0.000 0.000 0.052 0.148
#> SRR772516 2 0.3409 0.66216 0.000 0.780 0.000 0.000 0.028 0.192
#> SRR772517 2 0.3250 0.61153 0.012 0.788 0.000 0.000 0.004 0.196
#> SRR772518 2 0.4528 0.51059 0.012 0.588 0.000 0.000 0.020 0.380
#> SRR772519 2 0.4121 0.66303 0.000 0.720 0.000 0.000 0.060 0.220
#> SRR772520 2 0.3247 0.68026 0.000 0.808 0.000 0.000 0.036 0.156
#> SRR772521 6 0.5801 0.47107 0.280 0.180 0.000 0.000 0.008 0.532
#> SRR772522 6 0.4800 0.44578 0.076 0.280 0.000 0.000 0.004 0.640
#> SRR772523 2 0.2588 0.65968 0.000 0.876 0.000 0.008 0.092 0.024
#> SRR772524 2 0.2560 0.66542 0.000 0.872 0.000 0.000 0.092 0.036
#> SRR772525 3 0.0790 0.92798 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772526 4 0.1633 0.85991 0.000 0.024 0.000 0.932 0.044 0.000
#> SRR772527 4 0.1572 0.86170 0.000 0.028 0.000 0.936 0.036 0.000
#> SRR772528 5 0.2442 0.76766 0.004 0.000 0.144 0.000 0.852 0.000
#> SRR772529 1 0.3309 0.72939 0.720 0.000 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR772530 1 0.4410 0.44053 0.560 0.028 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR772531 3 0.0790 0.92798 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772532 2 0.2591 0.67963 0.000 0.880 0.000 0.004 0.064 0.052
#> SRR772533 2 0.3516 0.67323 0.000 0.812 0.000 0.004 0.088 0.096
#> SRR772534 6 0.5185 0.33594 0.344 0.080 0.000 0.000 0.008 0.568
#> SRR772535 2 0.2636 0.68080 0.000 0.860 0.000 0.004 0.016 0.120
#> SRR772536 2 0.3314 0.61720 0.000 0.740 0.000 0.000 0.004 0.256
#> SRR772537 4 0.2632 0.77182 0.000 0.164 0.000 0.832 0.004 0.000
#> SRR772538 4 0.4552 0.59936 0.000 0.288 0.000 0.648 0.064 0.000
#> SRR772539 1 0.4279 0.47176 0.548 0.012 0.000 0.000 0.004 0.436
#> SRR772540 6 0.4433 -0.10252 0.416 0.016 0.000 0.000 0.008 0.560
#> SRR772541 2 0.4489 0.32072 0.020 0.568 0.000 0.000 0.008 0.404
#> SRR772542 1 0.2920 0.78497 0.820 0.004 0.000 0.000 0.008 0.168
#> SRR772543 1 0.2579 0.78357 0.872 0.000 0.000 0.000 0.040 0.088
#> SRR772544 3 0.0547 0.92952 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772545 1 0.2362 0.79014 0.860 0.004 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR772546 1 0.2416 0.78908 0.844 0.000 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR772547 6 0.5511 0.58022 0.212 0.184 0.000 0.000 0.008 0.596
#> SRR772548 6 0.4253 -0.00264 0.412 0.008 0.000 0.000 0.008 0.572
#> SRR772549 1 0.3629 0.72622 0.712 0.000 0.000 0.000 0.012 0.276
#> SRR772550 1 0.2805 0.78678 0.812 0.000 0.000 0.000 0.004 0.184
#> SRR772551 6 0.4223 0.19154 0.016 0.368 0.000 0.000 0.004 0.612
#> SRR772552 6 0.4667 0.02738 0.028 0.428 0.000 0.000 0.008 0.536
#> SRR772553 5 0.6151 0.13197 0.008 0.244 0.000 0.000 0.452 0.296
#> SRR772554 2 0.4328 0.67179 0.000 0.716 0.000 0.000 0.092 0.192
#> SRR772555 2 0.3829 0.67161 0.000 0.760 0.000 0.000 0.060 0.180
#> SRR772556 1 0.3151 0.74221 0.748 0.000 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR772557 1 0.2527 0.78553 0.832 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR772558 6 0.4278 0.14525 0.360 0.020 0.000 0.000 0.004 0.616
#> SRR772559 6 0.4424 0.32752 0.324 0.044 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR772560 6 0.5054 0.49685 0.100 0.256 0.000 0.000 0.008 0.636
#> SRR772561 3 0.5001 0.51159 0.056 0.004 0.684 0.000 0.036 0.220
#> SRR772562 2 0.3460 0.63502 0.000 0.760 0.000 0.000 0.020 0.220
#> SRR772563 2 0.4022 0.60750 0.000 0.708 0.000 0.000 0.040 0.252
#> SRR772564 1 0.3860 0.76561 0.784 0.004 0.052 0.000 0.008 0.152
#> SRR772565 1 0.2766 0.76328 0.872 0.000 0.060 0.000 0.008 0.060
#> SRR772566 1 0.4407 0.59600 0.732 0.000 0.188 0.000 0.060 0.020
#> SRR772567 3 0.5789 0.22680 0.408 0.000 0.476 0.000 0.084 0.032
#> SRR772568 2 0.4032 0.40019 0.000 0.572 0.000 0.000 0.008 0.420
#> SRR772569 2 0.3847 0.52030 0.000 0.644 0.000 0.000 0.008 0.348
#> SRR772570 1 0.3990 0.60645 0.688 0.028 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR772571 6 0.4284 -0.03841 0.392 0.016 0.000 0.000 0.004 0.588
#> SRR772572 6 0.5825 0.49307 0.280 0.184 0.000 0.000 0.008 0.528
#> SRR772573 6 0.6131 0.49443 0.288 0.244 0.000 0.000 0.008 0.460
#> SRR772574 6 0.4150 0.04125 0.372 0.012 0.000 0.000 0.004 0.612
#> SRR772575 6 0.4782 0.30823 0.340 0.056 0.000 0.000 0.004 0.600
#> SRR772576 2 0.4161 0.36165 0.000 0.540 0.000 0.000 0.012 0.448
#> SRR772577 2 0.4022 0.47853 0.008 0.628 0.000 0.000 0.004 0.360
#> SRR772578 4 0.4945 0.46099 0.000 0.328 0.000 0.588 0.084 0.000
#> SRR772579 4 0.4414 0.66370 0.000 0.204 0.000 0.704 0.092 0.000
#> SRR772580 3 0.0790 0.92798 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772581 2 0.4151 0.45464 0.004 0.576 0.000 0.000 0.008 0.412
#> SRR772582 2 0.4455 0.40917 0.020 0.584 0.000 0.000 0.008 0.388
#> SRR772583 6 0.4782 0.33350 0.056 0.340 0.000 0.000 0.004 0.600
#> SRR772584 6 0.4695 0.16830 0.032 0.404 0.000 0.000 0.008 0.556
#> SRR772585 2 0.4787 0.30087 0.040 0.564 0.000 0.000 0.008 0.388
#> SRR772586 5 0.2992 0.80582 0.044 0.000 0.068 0.000 0.864 0.024
#> SRR772587 1 0.3511 0.73272 0.760 0.000 0.000 0.000 0.024 0.216
#> SRR772588 2 0.2762 0.64018 0.000 0.860 0.000 0.048 0.092 0.000
#> SRR772589 2 0.3424 0.61140 0.000 0.812 0.000 0.096 0.092 0.000
#> SRR772590 3 0.0547 0.92952 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772591 1 0.2520 0.69573 0.872 0.000 0.108 0.000 0.012 0.008
#> SRR772592 1 0.2685 0.70196 0.884 0.000 0.052 0.000 0.040 0.024
#> SRR772593 5 0.2685 0.78982 0.072 0.000 0.060 0.000 0.868 0.000
#> SRR772594 2 0.5178 -0.07631 0.000 0.488 0.000 0.424 0.088 0.000
#> SRR772595 2 0.5173 0.00139 0.000 0.520 0.000 0.388 0.092 0.000
#> SRR772596 5 0.3081 0.68243 0.004 0.000 0.220 0.000 0.776 0.000
#> SRR772597 3 0.0632 0.92975 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR772598 1 0.3916 0.75659 0.800 0.000 0.068 0.000 0.032 0.100
#> SRR772599 1 0.2805 0.79245 0.828 0.000 0.000 0.000 0.012 0.160
#> SRR772600 2 0.3142 0.66631 0.000 0.848 0.000 0.016 0.092 0.044
#> SRR772601 2 0.3821 0.64764 0.000 0.808 0.000 0.068 0.092 0.032
#> SRR772602 3 0.0547 0.92952 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772603 2 0.4213 0.67318 0.000 0.744 0.000 0.004 0.092 0.160
#> SRR772604 2 0.3005 0.65244 0.000 0.856 0.000 0.036 0.092 0.016
#> SRR772605 6 0.4751 0.22955 0.040 0.372 0.000 0.000 0.008 0.580
#> SRR772606 1 0.2402 0.79867 0.856 0.000 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR772607 1 0.3052 0.77029 0.780 0.000 0.000 0.000 0.004 0.216
#> SRR772608 2 0.4239 0.56663 0.016 0.696 0.000 0.000 0.024 0.264
#> SRR772609 2 0.3861 0.50513 0.004 0.672 0.000 0.000 0.008 0.316
#> SRR772610 2 0.3333 0.64728 0.000 0.784 0.000 0.000 0.024 0.192
#> SRR772611 2 0.3615 0.55828 0.000 0.700 0.000 0.000 0.008 0.292
#> SRR772612 4 0.4206 0.69817 0.000 0.176 0.000 0.732 0.092 0.000
#> SRR772613 4 0.4585 0.56776 0.000 0.308 0.000 0.632 0.060 0.000
#> SRR772614 1 0.2793 0.78123 0.800 0.000 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR772615 1 0.3136 0.76204 0.768 0.000 0.000 0.000 0.004 0.228
#> SRR772616 6 0.5709 0.39027 0.320 0.100 0.000 0.000 0.028 0.552
#> SRR772617 4 0.0363 0.88059 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR772618 4 0.2135 0.80293 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR772619 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772620 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772621 6 0.4442 -0.07061 0.020 0.440 0.000 0.000 0.004 0.536
#> SRR772622 6 0.4255 0.19574 0.016 0.380 0.000 0.000 0.004 0.600
#> SRR772623 3 0.0790 0.92798 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR772624 5 0.2595 0.78545 0.084 0.000 0.044 0.000 0.872 0.000
#> SRR772625 4 0.5678 0.43565 0.000 0.332 0.000 0.540 0.108 0.020
#> SRR772626 2 0.3565 0.59798 0.004 0.716 0.000 0.000 0.004 0.276
#> SRR772627 2 0.3795 0.50895 0.000 0.632 0.000 0.000 0.004 0.364
#> SRR772628 1 0.3636 0.65485 0.676 0.000 0.000 0.000 0.004 0.320
#> SRR772629 1 0.2871 0.75104 0.804 0.000 0.000 0.000 0.004 0.192
#> SRR772630 6 0.5633 0.52414 0.180 0.240 0.000 0.000 0.008 0.572
#> SRR772631 5 0.2412 0.79784 0.028 0.000 0.092 0.000 0.880 0.000
#> SRR772632 2 0.4434 0.65309 0.000 0.768 0.000 0.072 0.092 0.068
#> SRR772633 2 0.4789 0.36151 0.000 0.640 0.000 0.268 0.092 0.000
#> SRR772634 6 0.3946 0.55707 0.152 0.076 0.000 0.000 0.004 0.768
#> SRR772635 6 0.4492 0.49944 0.216 0.080 0.000 0.000 0.004 0.700
#> SRR772636 2 0.4865 0.59860 0.000 0.704 0.000 0.024 0.104 0.168
#> SRR772637 1 0.1285 0.77699 0.944 0.000 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR772638 1 0.1327 0.78203 0.936 0.000 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR772639 2 0.3424 0.67628 0.000 0.812 0.000 0.000 0.092 0.096
#> SRR772640 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772642 6 0.4209 0.09928 0.012 0.396 0.000 0.000 0.004 0.588
#> SRR772643 6 0.4486 0.37578 0.048 0.292 0.000 0.000 0.004 0.656
#> SRR772644 6 0.4328 -0.22264 0.460 0.000 0.000 0.000 0.020 0.520
#> SRR772645 6 0.4556 0.35098 0.312 0.040 0.000 0.000 0.008 0.640
#> SRR772646 2 0.3472 0.68038 0.000 0.808 0.000 0.000 0.092 0.100
#> SRR772647 2 0.3595 0.67877 0.000 0.796 0.000 0.000 0.084 0.120
#> SRR772648 2 0.4057 0.34934 0.000 0.556 0.000 0.000 0.008 0.436
#> SRR772649 2 0.4304 0.29134 0.008 0.536 0.000 0.000 0.008 0.448
#> SRR772650 6 0.3986 0.08233 0.384 0.004 0.000 0.000 0.004 0.608
#> SRR772651 6 0.4260 0.25340 0.332 0.024 0.000 0.000 0.004 0.640
#> SRR772652 1 0.3606 0.70242 0.708 0.004 0.000 0.000 0.004 0.284
#> SRR772653 1 0.2964 0.76962 0.792 0.004 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR772654 6 0.4937 0.59626 0.152 0.196 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR772655 6 0.5268 0.58077 0.164 0.212 0.000 0.000 0.004 0.620
#> SRR772656 3 0.0547 0.92952 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772657 3 0.0692 0.92818 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR772658 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772659 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772660 6 0.4500 -0.16765 0.012 0.480 0.000 0.000 0.012 0.496
#> SRR772661 5 0.2199 0.80487 0.020 0.000 0.000 0.000 0.892 0.088
#> SRR772662 6 0.4579 0.51781 0.208 0.092 0.000 0.000 0.004 0.696
#> SRR772663 6 0.4422 0.55181 0.180 0.096 0.000 0.000 0.004 0.720
#> SRR772664 2 0.3887 0.50344 0.000 0.632 0.000 0.000 0.008 0.360
#> SRR772665 2 0.3965 0.43065 0.000 0.604 0.000 0.000 0.008 0.388
#> SRR772666 3 0.0458 0.92990 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772667 4 0.2709 0.79932 0.000 0.132 0.000 0.848 0.020 0.000
#> SRR772668 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772669 4 0.0000 0.88522 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR772670 6 0.4940 0.60357 0.144 0.172 0.000 0.000 0.008 0.676
#> SRR772671 6 0.4793 0.51865 0.084 0.240 0.000 0.000 0.008 0.668
#> SRR772672 2 0.3103 0.63753 0.000 0.784 0.000 0.000 0.008 0.208
#> SRR772673 2 0.2631 0.66003 0.000 0.840 0.000 0.000 0.008 0.152
#> SRR772674 3 0.0547 0.92952 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772675 5 0.2191 0.79738 0.004 0.000 0.000 0.000 0.876 0.120
#> SRR772676 1 0.5872 -0.04416 0.492 0.148 0.000 0.000 0.012 0.348
#> SRR772677 1 0.5327 0.21437 0.536 0.100 0.000 0.000 0.004 0.360
#> SRR772678 5 0.2191 0.79738 0.004 0.000 0.000 0.000 0.876 0.120
#> SRR772679 6 0.4794 0.49646 0.228 0.100 0.000 0.000 0.004 0.668
#> SRR772680 6 0.4313 0.06150 0.372 0.020 0.000 0.000 0.004 0.604
#> SRR772681 3 0.1010 0.91565 0.000 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR772682 2 0.4280 0.35829 0.008 0.556 0.000 0.000 0.008 0.428
#> SRR772683 2 0.2805 0.67297 0.000 0.828 0.000 0.000 0.012 0.160
#> SRR772685 2 0.3508 0.57947 0.000 0.704 0.000 0.000 0.004 0.292
#> SRR772686 3 0.0458 0.93013 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR772687 3 0.3590 0.71432 0.004 0.000 0.776 0.000 0.188 0.032
#> SRR772688 4 0.2512 0.83106 0.000 0.060 0.000 0.880 0.060 0.000
#> SRR772689 4 0.2066 0.84715 0.000 0.040 0.000 0.908 0.052 0.000
#> SRR772690 3 0.0547 0.92952 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR772691 2 0.5808 0.01284 0.000 0.424 0.000 0.004 0.416 0.156
#> SRR772692 6 0.4062 0.56136 0.080 0.176 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR772693 6 0.4150 0.53077 0.060 0.204 0.000 0.000 0.004 0.732
#> SRR772694 2 0.3969 0.61140 0.000 0.668 0.000 0.000 0.020 0.312
#> SRR772695 2 0.4486 0.46228 0.016 0.576 0.000 0.000 0.012 0.396
#> SRR772696 2 0.3782 0.51390 0.000 0.636 0.000 0.000 0.004 0.360
#> SRR772697 2 0.3619 0.57534 0.000 0.680 0.000 0.000 0.004 0.316
#> SRR772698 5 0.2491 0.78964 0.020 0.000 0.112 0.000 0.868 0.000
#> SRR772699 1 0.4756 0.36253 0.504 0.008 0.000 0.000 0.032 0.456
#> SRR772700 6 0.4939 0.03508 0.408 0.056 0.000 0.000 0.004 0.532
#> SRR772701 1 0.2178 0.78934 0.868 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR772702 1 0.0937 0.77580 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.994 0.997 0.2358 0.761 0.761
#> 3 3 0.485 0.825 0.876 0.8973 0.823 0.767
#> 4 4 0.325 0.605 0.675 0.3882 0.676 0.481
#> 5 5 0.387 0.636 0.752 0.1297 0.933 0.813
#> 6 6 0.562 0.725 0.802 0.0632 0.900 0.695
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772342 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772343 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772344 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772345 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772346 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772347 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772348 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772349 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772350 1 0.0376 0.977 0.996 0.004
#> SRR772351 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772353 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772354 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772355 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772356 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772357 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772358 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772359 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772360 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772361 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772363 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772364 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772365 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772366 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR772367 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772368 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772369 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772370 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772371 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772372 2 0.0376 0.996 0.004 0.996
#> SRR772373 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772375 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772376 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772377 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR772378 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772379 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772380 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772381 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772382 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772383 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772384 1 0.2778 0.957 0.952 0.048
#> SRR772385 1 0.4161 0.926 0.916 0.084
#> SRR772386 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772387 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772388 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772389 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772390 1 0.1184 0.976 0.984 0.016
#> SRR772391 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772392 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772393 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772394 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772395 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772396 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772397 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772398 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772399 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772400 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772401 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772402 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772403 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772404 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772405 1 0.3584 0.941 0.932 0.068
#> SRR772406 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772407 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772408 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772409 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772410 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772411 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772412 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772413 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772414 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772415 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772416 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772417 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772418 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR772419 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772420 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772421 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772422 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772423 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772424 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772425 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772426 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772427 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772428 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772429 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772430 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772431 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772432 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772433 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772434 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772435 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772436 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772437 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772438 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772439 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772440 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772441 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772442 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772443 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772444 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772445 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772446 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772447 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772448 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772449 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772450 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772451 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772452 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772453 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772454 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772455 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772456 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772457 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772458 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772459 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772460 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772461 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772462 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772463 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772464 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772465 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772466 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772467 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772468 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772469 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772470 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772471 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772472 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772473 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772474 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772475 1 0.4939 0.899 0.892 0.108
#> SRR772476 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772477 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772478 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772479 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772480 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772481 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772482 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772483 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772484 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772485 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772486 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772487 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772488 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772489 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772490 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772491 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772492 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772493 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772494 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772495 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772496 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772497 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772498 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772499 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772500 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772502 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772503 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772504 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772505 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772506 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772507 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772508 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772509 1 0.3274 0.947 0.940 0.060
#> SRR772510 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772511 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772512 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772513 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772514 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772515 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772517 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772519 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772520 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772521 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772522 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772523 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772524 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772526 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772527 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772528 1 0.1184 0.976 0.984 0.016
#> SRR772529 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772530 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772531 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772532 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772533 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772534 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772535 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772536 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772537 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772538 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772539 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772540 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772541 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772542 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772543 2 0.0376 0.996 0.004 0.996
#> SRR772544 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772545 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772546 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772547 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772548 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772549 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772550 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772551 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772552 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772553 1 0.4161 0.926 0.916 0.084
#> SRR772554 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772556 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772557 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772558 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772559 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772560 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772561 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772562 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772563 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772564 2 0.2236 0.962 0.036 0.964
#> SRR772565 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772566 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772567 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772568 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772569 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772570 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772571 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772572 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772573 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772574 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772575 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772576 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772577 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772578 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772579 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772580 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772581 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772582 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772583 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772584 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772585 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772586 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR772587 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772588 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772589 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772590 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772591 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772592 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772593 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR772594 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772595 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772596 1 0.1184 0.976 0.984 0.016
#> SRR772597 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772598 2 0.1184 0.984 0.016 0.984
#> SRR772599 2 0.1633 0.975 0.024 0.976
#> SRR772600 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772601 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772602 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772603 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772604 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772605 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772606 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772607 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772608 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772609 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772610 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772611 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772612 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772613 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772614 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772615 2 0.0938 0.988 0.012 0.988
#> SRR772616 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772617 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772618 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772619 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772620 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772621 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772622 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772623 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772624 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR772625 1 0.7745 0.733 0.772 0.228
#> SRR772626 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772627 2 0.0672 0.992 0.008 0.992
#> SRR772628 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772629 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772630 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772631 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR772632 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772633 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772634 2 0.0376 0.996 0.004 0.996
#> SRR772635 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772636 1 0.3879 0.933 0.924 0.076
#> SRR772637 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772638 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772639 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772640 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772641 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772642 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772643 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772644 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772645 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772646 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772647 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772648 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772650 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772651 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772652 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772653 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772654 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772655 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772656 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772657 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772658 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772659 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772660 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772661 1 0.1633 0.973 0.976 0.024
#> SRR772662 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772663 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772664 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772665 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772666 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772668 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772669 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772670 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772671 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772672 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772673 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772674 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772675 1 0.2236 0.965 0.964 0.036
#> SRR772676 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772677 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772678 1 0.1843 0.971 0.972 0.028
#> SRR772679 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772680 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772681 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772682 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772683 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772685 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772686 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772687 1 0.1184 0.976 0.984 0.016
#> SRR772688 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772689 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772690 1 0.0000 0.977 1.000 0.000
#> SRR772691 1 0.3431 0.944 0.936 0.064
#> SRR772692 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772693 2 0.0376 0.996 0.004 0.996
#> SRR772694 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772695 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772696 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772697 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772698 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR772699 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772700 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772701 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR772702 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.2959 0.8621 0.900 0.100 0.000
#> SRR772342 1 0.1860 0.8641 0.948 0.052 0.000
#> SRR772343 1 0.1289 0.8507 0.968 0.032 0.000
#> SRR772344 1 0.4796 0.8052 0.780 0.220 0.000
#> SRR772345 1 0.5178 0.7839 0.744 0.256 0.000
#> SRR772346 1 0.4702 0.8259 0.788 0.212 0.000
#> SRR772347 1 0.4931 0.8183 0.768 0.232 0.000
#> SRR772348 1 0.1643 0.8442 0.956 0.044 0.000
#> SRR772349 1 0.1289 0.8470 0.968 0.032 0.000
#> SRR772350 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772351 1 0.4702 0.8227 0.788 0.212 0.000
#> SRR772352 1 0.3340 0.8588 0.880 0.120 0.000
#> SRR772353 1 0.0424 0.8517 0.992 0.008 0.000
#> SRR772354 1 0.0237 0.8530 0.996 0.004 0.000
#> SRR772355 1 0.3941 0.8574 0.844 0.156 0.000
#> SRR772356 1 0.3686 0.8471 0.860 0.140 0.000
#> SRR772357 1 0.2878 0.8645 0.904 0.096 0.000
#> SRR772358 1 0.1860 0.8660 0.948 0.052 0.000
#> SRR772359 1 0.4002 0.8441 0.840 0.160 0.000
#> SRR772360 1 0.4121 0.8425 0.832 0.168 0.000
#> SRR772361 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 2 0.6126 0.7080 0.400 0.600 0.000
#> SRR772363 2 0.6299 0.5273 0.476 0.524 0.000
#> SRR772364 1 0.5431 0.7527 0.716 0.284 0.000
#> SRR772365 1 0.5138 0.7969 0.748 0.252 0.000
#> SRR772366 3 0.3669 0.9208 0.040 0.064 0.896
#> SRR772367 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 1 0.1860 0.8479 0.948 0.052 0.000
#> SRR772369 1 0.3192 0.8649 0.888 0.112 0.000
#> SRR772370 1 0.2066 0.8656 0.940 0.060 0.000
#> SRR772371 1 0.4605 0.8282 0.796 0.204 0.000
#> SRR772372 1 0.4452 0.8359 0.808 0.192 0.000
#> SRR772373 1 0.1529 0.8437 0.960 0.040 0.000
#> SRR772374 1 0.1529 0.8572 0.960 0.040 0.000
#> SRR772375 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772376 1 0.3192 0.8561 0.888 0.112 0.000
#> SRR772377 3 0.3888 0.9160 0.048 0.064 0.888
#> SRR772378 1 0.0424 0.8517 0.992 0.008 0.000
#> SRR772379 1 0.1643 0.8421 0.956 0.044 0.000
#> SRR772380 1 0.1289 0.8468 0.968 0.032 0.000
#> SRR772381 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 1 0.4399 0.8442 0.812 0.188 0.000
#> SRR772383 1 0.4002 0.8481 0.840 0.160 0.000
#> SRR772384 3 0.4737 0.8784 0.084 0.064 0.852
#> SRR772385 3 0.5010 0.8654 0.084 0.076 0.840
#> SRR772386 1 0.4399 0.8425 0.812 0.188 0.000
#> SRR772387 1 0.4291 0.8423 0.820 0.180 0.000
#> SRR772388 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772389 1 0.0892 0.8573 0.980 0.020 0.000
#> SRR772390 3 0.3310 0.9254 0.028 0.064 0.908
#> SRR772391 1 0.0592 0.8561 0.988 0.012 0.000
#> SRR772392 1 0.1964 0.8659 0.944 0.056 0.000
#> SRR772393 1 0.4399 0.8351 0.812 0.188 0.000
#> SRR772394 1 0.4399 0.8360 0.812 0.188 0.000
#> SRR772395 1 0.1964 0.8353 0.944 0.056 0.000
#> SRR772396 1 0.4002 0.8434 0.840 0.160 0.000
#> SRR772397 1 0.3879 0.8490 0.848 0.152 0.000
#> SRR772398 1 0.4235 0.8377 0.824 0.176 0.000
#> SRR772399 1 0.4235 0.8365 0.824 0.176 0.000
#> SRR772400 1 0.4291 0.8311 0.820 0.180 0.000
#> SRR772401 1 0.4121 0.8389 0.832 0.168 0.000
#> SRR772402 2 0.3752 0.7918 0.144 0.856 0.000
#> SRR772403 2 0.3192 0.7790 0.112 0.888 0.000
#> SRR772404 1 0.1753 0.8435 0.952 0.048 0.000
#> SRR772405 3 0.4902 0.8683 0.092 0.064 0.844
#> SRR772406 1 0.4702 0.8263 0.788 0.212 0.000
#> SRR772407 1 0.4654 0.8284 0.792 0.208 0.000
#> SRR772408 2 0.6274 0.5866 0.456 0.544 0.000
#> SRR772409 1 0.6235 -0.2227 0.564 0.436 0.000
#> SRR772410 1 0.1163 0.8532 0.972 0.028 0.000
#> SRR772411 1 0.0892 0.8507 0.980 0.020 0.000
#> SRR772412 1 0.4002 0.8514 0.840 0.160 0.000
#> SRR772413 1 0.4346 0.8482 0.816 0.184 0.000
#> SRR772414 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772415 1 0.0747 0.8494 0.984 0.016 0.000
#> SRR772416 1 0.0747 0.8494 0.984 0.016 0.000
#> SRR772417 1 0.1031 0.8513 0.976 0.024 0.000
#> SRR772418 3 0.3434 0.9246 0.032 0.064 0.904
#> SRR772419 1 0.2625 0.8195 0.916 0.084 0.000
#> SRR772420 1 0.2711 0.8157 0.912 0.088 0.000
#> SRR772421 1 0.4062 0.8451 0.836 0.164 0.000
#> SRR772422 1 0.4235 0.8429 0.824 0.176 0.000
#> SRR772423 2 0.3116 0.7840 0.108 0.892 0.000
#> SRR772424 2 0.2711 0.7637 0.088 0.912 0.000
#> SRR772425 1 0.2261 0.8344 0.932 0.068 0.000
#> SRR772426 1 0.6215 0.3305 0.572 0.428 0.000
#> SRR772427 1 0.5706 0.6465 0.680 0.320 0.000
#> SRR772428 1 0.4002 0.8408 0.840 0.160 0.000
#> SRR772429 1 0.4062 0.8431 0.836 0.164 0.000
#> SRR772430 1 0.1031 0.8536 0.976 0.024 0.000
#> SRR772431 2 0.3267 0.7811 0.116 0.884 0.000
#> SRR772432 2 0.3412 0.7790 0.124 0.876 0.000
#> SRR772433 1 0.3941 0.8448 0.844 0.156 0.000
#> SRR772434 1 0.4002 0.8441 0.840 0.160 0.000
#> SRR772435 1 0.4062 0.8522 0.836 0.164 0.000
#> SRR772436 1 0.4178 0.8542 0.828 0.172 0.000
#> SRR772437 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772438 1 0.4178 0.8427 0.828 0.172 0.000
#> SRR772439 1 0.4235 0.8407 0.824 0.176 0.000
#> SRR772440 1 0.2261 0.8660 0.932 0.068 0.000
#> SRR772441 1 0.4178 0.8536 0.828 0.172 0.000
#> SRR772442 2 0.3192 0.7800 0.112 0.888 0.000
#> SRR772443 2 0.3192 0.7835 0.112 0.888 0.000
#> SRR772444 1 0.4062 0.8403 0.836 0.164 0.000
#> SRR772445 1 0.4121 0.8418 0.832 0.168 0.000
#> SRR772446 1 0.0237 0.8530 0.996 0.004 0.000
#> SRR772447 1 0.0237 0.8530 0.996 0.004 0.000
#> SRR772448 1 0.4235 0.8416 0.824 0.176 0.000
#> SRR772449 1 0.4291 0.8406 0.820 0.180 0.000
#> SRR772450 2 0.6008 0.7546 0.372 0.628 0.000
#> SRR772451 2 0.5948 0.7686 0.360 0.640 0.000
#> SRR772452 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772453 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772454 1 0.2066 0.8664 0.940 0.060 0.000
#> SRR772455 1 0.1031 0.8530 0.976 0.024 0.000
#> SRR772456 1 0.5988 0.1254 0.632 0.368 0.000
#> SRR772457 1 0.6168 -0.1110 0.588 0.412 0.000
#> SRR772458 1 0.4178 0.8478 0.828 0.172 0.000
#> SRR772459 1 0.4002 0.8497 0.840 0.160 0.000
#> SRR772460 2 0.5785 0.7904 0.332 0.668 0.000
#> SRR772461 2 0.5785 0.7902 0.332 0.668 0.000
#> SRR772462 1 0.1643 0.8427 0.956 0.044 0.000
#> SRR772463 1 0.1529 0.8440 0.960 0.040 0.000
#> SRR772464 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772465 1 0.1289 0.8575 0.968 0.032 0.000
#> SRR772466 1 0.1031 0.8534 0.976 0.024 0.000
#> SRR772467 1 0.4235 0.7154 0.824 0.176 0.000
#> SRR772468 1 0.4504 0.6781 0.804 0.196 0.000
#> SRR772469 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772470 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772471 1 0.1529 0.8444 0.960 0.040 0.000
#> SRR772472 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772473 2 0.3340 0.7862 0.120 0.880 0.000
#> SRR772474 2 0.4121 0.7921 0.168 0.832 0.000
#> SRR772475 3 0.5093 0.8582 0.088 0.076 0.836
#> SRR772476 2 0.5760 0.7873 0.328 0.672 0.000
#> SRR772477 2 0.5988 0.7587 0.368 0.632 0.000
#> SRR772478 1 0.0237 0.8530 0.996 0.004 0.000
#> SRR772479 1 0.0237 0.8530 0.996 0.004 0.000
#> SRR772480 2 0.3619 0.7891 0.136 0.864 0.000
#> SRR772481 2 0.4291 0.7740 0.180 0.820 0.000
#> SRR772482 1 0.4062 0.8407 0.836 0.164 0.000
#> SRR772483 1 0.4062 0.8410 0.836 0.164 0.000
#> SRR772484 1 0.1163 0.8538 0.972 0.028 0.000
#> SRR772485 1 0.1163 0.8506 0.972 0.028 0.000
#> SRR772486 1 0.4235 0.8416 0.824 0.176 0.000
#> SRR772487 1 0.4178 0.8385 0.828 0.172 0.000
#> SRR772488 1 0.0424 0.8526 0.992 0.008 0.000
#> SRR772489 1 0.0424 0.8526 0.992 0.008 0.000
#> SRR772490 1 0.4178 0.8399 0.828 0.172 0.000
#> SRR772491 1 0.4178 0.8394 0.828 0.172 0.000
#> SRR772492 2 0.5706 0.7897 0.320 0.680 0.000
#> SRR772493 2 0.5785 0.7899 0.332 0.668 0.000
#> SRR772494 2 0.5785 0.7877 0.332 0.668 0.000
#> SRR772495 2 0.5785 0.7877 0.332 0.668 0.000
#> SRR772496 1 0.2066 0.8391 0.940 0.060 0.000
#> SRR772497 1 0.2066 0.8413 0.940 0.060 0.000
#> SRR772498 1 0.4452 0.8330 0.808 0.192 0.000
#> SRR772499 1 0.4654 0.8229 0.792 0.208 0.000
#> SRR772500 1 0.4002 0.7526 0.840 0.160 0.000
#> SRR772501 1 0.5810 0.4125 0.664 0.336 0.000
#> SRR772502 1 0.4291 0.8390 0.820 0.180 0.000
#> SRR772503 1 0.4399 0.8352 0.812 0.188 0.000
#> SRR772504 1 0.4452 0.8393 0.808 0.192 0.000
#> SRR772505 1 0.4452 0.8366 0.808 0.192 0.000
#> SRR772506 1 0.2261 0.8328 0.932 0.068 0.000
#> SRR772507 1 0.2878 0.8133 0.904 0.096 0.000
#> SRR772508 1 0.1964 0.8395 0.944 0.056 0.000
#> SRR772509 3 0.4821 0.8729 0.088 0.064 0.848
#> SRR772510 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772511 1 0.3941 0.8517 0.844 0.156 0.000
#> SRR772512 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772513 1 0.0892 0.8512 0.980 0.020 0.000
#> SRR772514 1 0.0592 0.8505 0.988 0.012 0.000
#> SRR772515 1 0.4235 0.8480 0.824 0.176 0.000
#> SRR772516 1 0.3038 0.8448 0.896 0.104 0.000
#> SRR772517 1 0.2878 0.8531 0.904 0.096 0.000
#> SRR772518 1 0.1643 0.8483 0.956 0.044 0.000
#> SRR772519 1 0.1753 0.8399 0.952 0.048 0.000
#> SRR772520 1 0.2448 0.8303 0.924 0.076 0.000
#> SRR772521 1 0.5327 0.7729 0.728 0.272 0.000
#> SRR772522 1 0.4842 0.8200 0.776 0.224 0.000
#> SRR772523 2 0.5678 0.6218 0.316 0.684 0.000
#> SRR772524 1 0.5529 0.7404 0.704 0.296 0.000
#> SRR772525 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772526 1 0.4291 0.7082 0.820 0.180 0.000
#> SRR772527 1 0.4178 0.7146 0.828 0.172 0.000
#> SRR772528 3 0.3310 0.9254 0.028 0.064 0.908
#> SRR772529 1 0.4062 0.8418 0.836 0.164 0.000
#> SRR772530 1 0.4062 0.8418 0.836 0.164 0.000
#> SRR772531 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772532 1 0.3267 0.8572 0.884 0.116 0.000
#> SRR772533 1 0.3267 0.8283 0.884 0.116 0.000
#> SRR772534 1 0.1411 0.8636 0.964 0.036 0.000
#> SRR772535 1 0.4178 0.8373 0.828 0.172 0.000
#> SRR772536 1 0.3879 0.8596 0.848 0.152 0.000
#> SRR772537 2 0.3619 0.8087 0.136 0.864 0.000
#> SRR772538 2 0.4504 0.8147 0.196 0.804 0.000
#> SRR772539 1 0.1411 0.8626 0.964 0.036 0.000
#> SRR772540 1 0.3879 0.8474 0.848 0.152 0.000
#> SRR772541 1 0.1643 0.8462 0.956 0.044 0.000
#> SRR772542 1 0.4062 0.8407 0.836 0.164 0.000
#> SRR772543 1 0.4351 0.8375 0.828 0.168 0.004
#> SRR772544 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772545 1 0.1643 0.8641 0.956 0.044 0.000
#> SRR772546 1 0.1643 0.8641 0.956 0.044 0.000
#> SRR772547 1 0.1411 0.8486 0.964 0.036 0.000
#> SRR772548 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772549 1 0.0424 0.8517 0.992 0.008 0.000
#> SRR772550 1 0.0237 0.8519 0.996 0.004 0.000
#> SRR772551 1 0.1411 0.8601 0.964 0.036 0.000
#> SRR772552 1 0.0747 0.8507 0.984 0.016 0.000
#> SRR772553 3 0.5004 0.8659 0.088 0.072 0.840
#> SRR772554 1 0.3116 0.8437 0.892 0.108 0.000
#> SRR772555 1 0.2796 0.8396 0.908 0.092 0.000
#> SRR772556 1 0.4504 0.8450 0.804 0.196 0.000
#> SRR772557 1 0.4235 0.8484 0.824 0.176 0.000
#> SRR772558 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772559 1 0.0592 0.8510 0.988 0.012 0.000
#> SRR772560 1 0.1753 0.8425 0.952 0.048 0.000
#> SRR772561 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772562 1 0.1753 0.8429 0.952 0.048 0.000
#> SRR772563 1 0.1643 0.8443 0.956 0.044 0.000
#> SRR772564 1 0.4521 0.8294 0.816 0.180 0.004
#> SRR772565 1 0.4121 0.8386 0.832 0.168 0.000
#> SRR772566 1 0.3941 0.8429 0.844 0.156 0.000
#> SRR772567 1 0.3941 0.8429 0.844 0.156 0.000
#> SRR772568 1 0.2537 0.8670 0.920 0.080 0.000
#> SRR772569 1 0.3816 0.8595 0.852 0.148 0.000
#> SRR772570 1 0.0592 0.8523 0.988 0.012 0.000
#> SRR772571 1 0.1031 0.8603 0.976 0.024 0.000
#> SRR772572 1 0.0747 0.8519 0.984 0.016 0.000
#> SRR772573 1 0.1031 0.8562 0.976 0.024 0.000
#> SRR772574 1 0.4002 0.8440 0.840 0.160 0.000
#> SRR772575 1 0.4002 0.8508 0.840 0.160 0.000
#> SRR772576 1 0.4796 0.8293 0.780 0.220 0.000
#> SRR772577 1 0.4796 0.8264 0.780 0.220 0.000
#> SRR772578 1 0.4504 0.8399 0.804 0.196 0.000
#> SRR772579 1 0.4452 0.8425 0.808 0.192 0.000
#> SRR772580 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772581 1 0.5216 0.7815 0.740 0.260 0.000
#> SRR772582 1 0.5327 0.7735 0.728 0.272 0.000
#> SRR772583 1 0.0592 0.8510 0.988 0.012 0.000
#> SRR772584 1 0.0424 0.8517 0.992 0.008 0.000
#> SRR772585 1 0.1411 0.8463 0.964 0.036 0.000
#> SRR772586 3 0.3554 0.9230 0.036 0.064 0.900
#> SRR772587 1 0.2959 0.8641 0.900 0.100 0.000
#> SRR772588 1 0.1753 0.8425 0.952 0.048 0.000
#> SRR772589 1 0.1860 0.8423 0.948 0.052 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 1 0.3340 0.8568 0.880 0.120 0.000
#> SRR772592 1 0.3192 0.8589 0.888 0.112 0.000
#> SRR772593 3 0.3669 0.9208 0.040 0.064 0.896
#> SRR772594 1 0.6008 0.2965 0.628 0.372 0.000
#> SRR772595 1 0.5650 0.3941 0.688 0.312 0.000
#> SRR772596 3 0.3310 0.9254 0.028 0.064 0.908
#> SRR772597 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 1 0.4733 0.8153 0.800 0.196 0.004
#> SRR772599 1 0.4808 0.8186 0.804 0.188 0.008
#> SRR772600 2 0.3340 0.7841 0.120 0.880 0.000
#> SRR772601 2 0.3412 0.8019 0.124 0.876 0.000
#> SRR772602 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772603 2 0.3816 0.7933 0.148 0.852 0.000
#> SRR772604 2 0.3340 0.7783 0.120 0.880 0.000
#> SRR772605 1 0.1411 0.8487 0.964 0.036 0.000
#> SRR772606 1 0.4452 0.8216 0.808 0.192 0.000
#> SRR772607 1 0.4346 0.8286 0.816 0.184 0.000
#> SRR772608 1 0.0424 0.8526 0.992 0.008 0.000
#> SRR772609 1 0.0747 0.8511 0.984 0.016 0.000
#> SRR772610 1 0.1289 0.8490 0.968 0.032 0.000
#> SRR772611 1 0.1529 0.8439 0.960 0.040 0.000
#> SRR772612 2 0.3192 0.7884 0.112 0.888 0.000
#> SRR772613 2 0.2959 0.7863 0.100 0.900 0.000
#> SRR772614 1 0.3879 0.8456 0.848 0.152 0.000
#> SRR772615 1 0.4178 0.8367 0.828 0.172 0.000
#> SRR772616 1 0.1753 0.8485 0.952 0.048 0.000
#> SRR772617 2 0.3551 0.8089 0.132 0.868 0.000
#> SRR772618 2 0.3482 0.8068 0.128 0.872 0.000
#> SRR772619 2 0.5621 0.7926 0.308 0.692 0.000
#> SRR772620 2 0.5678 0.7888 0.316 0.684 0.000
#> SRR772621 1 0.4121 0.8463 0.832 0.168 0.000
#> SRR772622 1 0.4452 0.8455 0.808 0.192 0.000
#> SRR772623 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772624 3 0.4095 0.9085 0.056 0.064 0.880
#> SRR772625 3 0.6062 0.7152 0.148 0.072 0.780
#> SRR772626 1 0.4452 0.8341 0.808 0.192 0.000
#> SRR772627 1 0.4291 0.8400 0.820 0.180 0.000
#> SRR772628 1 0.3116 0.8621 0.892 0.108 0.000
#> SRR772629 1 0.4555 0.8410 0.800 0.200 0.000
#> SRR772630 1 0.1411 0.8597 0.964 0.036 0.000
#> SRR772631 3 0.3434 0.9246 0.032 0.064 0.904
#> SRR772632 1 0.3879 0.7655 0.848 0.152 0.000
#> SRR772633 1 0.3551 0.7820 0.868 0.132 0.000
#> SRR772634 1 0.4346 0.8333 0.816 0.184 0.000
#> SRR772635 1 0.4291 0.8341 0.820 0.180 0.000
#> SRR772636 3 0.5010 0.8654 0.084 0.076 0.840
#> SRR772637 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772638 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772639 1 0.2066 0.8360 0.940 0.060 0.000
#> SRR772640 2 0.6062 0.7361 0.384 0.616 0.000
#> SRR772641 2 0.5988 0.7582 0.368 0.632 0.000
#> SRR772642 1 0.4178 0.8432 0.828 0.172 0.000
#> SRR772643 1 0.4235 0.8458 0.824 0.176 0.000
#> SRR772644 1 0.2165 0.8664 0.936 0.064 0.000
#> SRR772645 1 0.1289 0.8625 0.968 0.032 0.000
#> SRR772646 1 0.2878 0.8633 0.904 0.096 0.000
#> SRR772647 1 0.2711 0.8645 0.912 0.088 0.000
#> SRR772648 1 0.4796 0.8313 0.780 0.220 0.000
#> SRR772649 1 0.4702 0.8346 0.788 0.212 0.000
#> SRR772650 1 0.2625 0.8648 0.916 0.084 0.000
#> SRR772651 1 0.2537 0.8652 0.920 0.080 0.000
#> SRR772652 1 0.4062 0.8423 0.836 0.164 0.000
#> SRR772653 1 0.4002 0.8448 0.840 0.160 0.000
#> SRR772654 1 0.3752 0.8547 0.856 0.144 0.000
#> SRR772655 1 0.4062 0.8461 0.836 0.164 0.000
#> SRR772656 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772658 2 0.4346 0.8087 0.184 0.816 0.000
#> SRR772659 2 0.3619 0.8098 0.136 0.864 0.000
#> SRR772660 1 0.1753 0.8425 0.952 0.048 0.000
#> SRR772661 3 0.4095 0.9091 0.056 0.064 0.880
#> SRR772662 1 0.3551 0.8563 0.868 0.132 0.000
#> SRR772663 1 0.2711 0.8658 0.912 0.088 0.000
#> SRR772664 1 0.1163 0.8496 0.972 0.028 0.000
#> SRR772665 1 0.1163 0.8496 0.972 0.028 0.000
#> SRR772666 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772667 1 0.4235 0.7137 0.824 0.176 0.000
#> SRR772668 1 0.6154 0.0777 0.592 0.408 0.000
#> SRR772669 2 0.5810 0.7769 0.336 0.664 0.000
#> SRR772670 1 0.1031 0.8491 0.976 0.024 0.000
#> SRR772671 1 0.0424 0.8510 0.992 0.008 0.000
#> SRR772672 1 0.1753 0.8429 0.952 0.048 0.000
#> SRR772673 1 0.1753 0.8429 0.952 0.048 0.000
#> SRR772674 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772675 3 0.4565 0.8892 0.076 0.064 0.860
#> SRR772676 1 0.4887 0.8259 0.772 0.228 0.000
#> SRR772677 1 0.5058 0.8068 0.756 0.244 0.000
#> SRR772678 3 0.4652 0.8836 0.080 0.064 0.856
#> SRR772679 1 0.0892 0.8591 0.980 0.020 0.000
#> SRR772680 1 0.1163 0.8619 0.972 0.028 0.000
#> SRR772681 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772682 1 0.1964 0.8376 0.944 0.056 0.000
#> SRR772683 1 0.1964 0.8397 0.944 0.056 0.000
#> SRR772685 1 0.4235 0.8451 0.824 0.176 0.000
#> SRR772686 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772687 3 0.3406 0.9238 0.028 0.068 0.904
#> SRR772688 1 0.3551 0.7821 0.868 0.132 0.000
#> SRR772689 1 0.5431 0.4581 0.716 0.284 0.000
#> SRR772690 3 0.0000 0.9356 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 3 0.4821 0.8729 0.088 0.064 0.848
#> SRR772692 1 0.4178 0.8390 0.828 0.172 0.000
#> SRR772693 1 0.4399 0.8316 0.812 0.188 0.000
#> SRR772694 1 0.1643 0.8446 0.956 0.044 0.000
#> SRR772695 1 0.1529 0.8587 0.960 0.040 0.000
#> SRR772696 1 0.4452 0.8335 0.808 0.192 0.000
#> SRR772697 1 0.4452 0.8349 0.808 0.192 0.000
#> SRR772698 3 0.3554 0.9230 0.036 0.064 0.900
#> SRR772699 1 0.4121 0.8396 0.832 0.168 0.000
#> SRR772700 1 0.4235 0.8341 0.824 0.176 0.000
#> SRR772701 1 0.4002 0.8474 0.840 0.160 0.000
#> SRR772702 1 0.4178 0.8394 0.828 0.172 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.5623 0.4448 0.552 0.428 0.004 0.016
#> SRR772342 2 0.5517 0.0300 0.412 0.568 0.000 0.020
#> SRR772343 2 0.4630 0.6085 0.196 0.768 0.000 0.036
#> SRR772344 2 0.7399 0.1766 0.208 0.512 0.000 0.280
#> SRR772345 2 0.7754 -0.1601 0.244 0.420 0.000 0.336
#> SRR772346 1 0.6908 0.6552 0.592 0.220 0.000 0.188
#> SRR772347 1 0.6745 0.6853 0.604 0.244 0.000 0.152
#> SRR772348 2 0.2048 0.6774 0.064 0.928 0.000 0.008
#> SRR772349 2 0.2413 0.6791 0.064 0.916 0.000 0.020
#> SRR772350 3 0.5798 0.8618 0.112 0.000 0.704 0.184
#> SRR772351 2 0.6811 0.3706 0.180 0.604 0.000 0.216
#> SRR772352 2 0.6423 0.4435 0.196 0.648 0.000 0.156
#> SRR772353 2 0.3710 0.6462 0.192 0.804 0.000 0.004
#> SRR772354 2 0.3831 0.6405 0.204 0.792 0.000 0.004
#> SRR772355 2 0.7158 -0.1019 0.340 0.512 0.000 0.148
#> SRR772356 2 0.5948 0.5128 0.144 0.696 0.000 0.160
#> SRR772357 1 0.5925 0.4184 0.524 0.444 0.004 0.028
#> SRR772358 2 0.5865 0.0623 0.412 0.552 0.000 0.036
#> SRR772359 1 0.5191 0.7615 0.684 0.292 0.004 0.020
#> SRR772360 1 0.5543 0.7755 0.688 0.268 0.008 0.036
#> SRR772361 3 0.5689 0.8648 0.104 0.000 0.712 0.184
#> SRR772362 2 0.5628 0.2311 0.024 0.556 0.000 0.420
#> SRR772363 2 0.5582 0.2763 0.024 0.576 0.000 0.400
#> SRR772364 1 0.7289 0.5102 0.532 0.200 0.000 0.268
#> SRR772365 1 0.7237 0.4308 0.528 0.176 0.000 0.296
#> SRR772366 3 0.1674 0.8384 0.032 0.012 0.952 0.004
#> SRR772367 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772368 2 0.5109 0.5929 0.212 0.736 0.000 0.052
#> SRR772369 2 0.6038 -0.1236 0.424 0.532 0.000 0.044
#> SRR772370 2 0.5548 0.2829 0.340 0.628 0.000 0.032
#> SRR772371 1 0.7249 0.5586 0.540 0.200 0.000 0.260
#> SRR772372 1 0.7640 0.6039 0.536 0.216 0.012 0.236
#> SRR772373 2 0.3048 0.6739 0.108 0.876 0.000 0.016
#> SRR772374 2 0.4046 0.6421 0.124 0.828 0.000 0.048
#> SRR772375 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772376 2 0.6827 0.3384 0.296 0.584 0.004 0.116
#> SRR772377 3 0.1943 0.8360 0.032 0.008 0.944 0.016
#> SRR772378 2 0.3591 0.6568 0.168 0.824 0.000 0.008
#> SRR772379 2 0.3224 0.6633 0.120 0.864 0.000 0.016
#> SRR772380 2 0.3392 0.6616 0.124 0.856 0.000 0.020
#> SRR772381 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772382 1 0.4452 0.7632 0.732 0.260 0.000 0.008
#> SRR772383 1 0.4836 0.7105 0.672 0.320 0.000 0.008
#> SRR772384 3 0.2616 0.8221 0.036 0.028 0.920 0.016
#> SRR772385 3 0.2993 0.8086 0.040 0.040 0.904 0.016
#> SRR772386 1 0.7599 0.5288 0.424 0.376 0.000 0.200
#> SRR772387 1 0.7649 0.5691 0.456 0.312 0.000 0.232
#> SRR772388 2 0.3972 0.6313 0.204 0.788 0.000 0.008
#> SRR772389 2 0.4744 0.5339 0.284 0.704 0.000 0.012
#> SRR772390 3 0.1109 0.8406 0.028 0.004 0.968 0.000
#> SRR772391 2 0.4769 0.4983 0.308 0.684 0.000 0.008
#> SRR772392 2 0.5337 0.1354 0.424 0.564 0.000 0.012
#> SRR772393 1 0.7611 0.5411 0.476 0.256 0.000 0.268
#> SRR772394 1 0.7644 0.5666 0.468 0.272 0.000 0.260
#> SRR772395 2 0.1724 0.6668 0.020 0.948 0.000 0.032
#> SRR772396 1 0.4372 0.7667 0.728 0.268 0.000 0.004
#> SRR772397 1 0.4980 0.7547 0.708 0.272 0.008 0.012
#> SRR772398 1 0.5072 0.7674 0.740 0.208 0.000 0.052
#> SRR772399 1 0.4542 0.7739 0.752 0.228 0.000 0.020
#> SRR772400 1 0.4604 0.7564 0.756 0.224 0.008 0.012
#> SRR772401 1 0.3942 0.7673 0.764 0.236 0.000 0.000
#> SRR772402 4 0.6269 0.8096 0.272 0.096 0.000 0.632
#> SRR772403 4 0.6245 0.8131 0.268 0.096 0.000 0.636
#> SRR772404 2 0.4631 0.6507 0.144 0.800 0.008 0.048
#> SRR772405 3 0.2810 0.8158 0.036 0.036 0.912 0.016
#> SRR772406 1 0.7717 0.4941 0.444 0.304 0.000 0.252
#> SRR772407 1 0.7760 0.3994 0.436 0.276 0.000 0.288
#> SRR772408 2 0.5476 0.2897 0.020 0.584 0.000 0.396
#> SRR772409 2 0.5386 0.3475 0.020 0.612 0.000 0.368
#> SRR772410 2 0.3428 0.6632 0.144 0.844 0.000 0.012
#> SRR772411 2 0.3681 0.6507 0.176 0.816 0.000 0.008
#> SRR772412 1 0.5068 0.7114 0.676 0.308 0.004 0.012
#> SRR772413 1 0.4868 0.7132 0.684 0.304 0.000 0.012
#> SRR772414 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772415 2 0.2401 0.6738 0.092 0.904 0.000 0.004
#> SRR772416 2 0.1890 0.6723 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR772417 2 0.4220 0.5842 0.248 0.748 0.000 0.004
#> SRR772418 3 0.1356 0.8404 0.032 0.008 0.960 0.000
#> SRR772419 2 0.2335 0.6556 0.020 0.920 0.000 0.060
#> SRR772420 2 0.2255 0.6536 0.012 0.920 0.000 0.068
#> SRR772421 1 0.6991 0.7099 0.540 0.324 0.000 0.136
#> SRR772422 1 0.7304 0.6748 0.492 0.344 0.000 0.164
#> SRR772423 4 0.6107 0.8141 0.264 0.088 0.000 0.648
#> SRR772424 4 0.5875 0.7956 0.224 0.092 0.000 0.684
#> SRR772425 2 0.3958 0.6576 0.160 0.816 0.000 0.024
#> SRR772426 4 0.7558 0.3589 0.192 0.380 0.000 0.428
#> SRR772427 2 0.7514 -0.1638 0.184 0.432 0.000 0.384
#> SRR772428 1 0.4018 0.7688 0.772 0.224 0.000 0.004
#> SRR772429 1 0.4283 0.7565 0.740 0.256 0.000 0.004
#> SRR772430 2 0.4426 0.6347 0.204 0.772 0.000 0.024
#> SRR772431 4 0.5995 0.8048 0.256 0.084 0.000 0.660
#> SRR772432 4 0.6182 0.8078 0.276 0.088 0.000 0.636
#> SRR772433 1 0.4328 0.7720 0.748 0.244 0.000 0.008
#> SRR772434 1 0.4155 0.7734 0.756 0.240 0.000 0.004
#> SRR772435 1 0.5592 0.7477 0.656 0.300 0.000 0.044
#> SRR772436 1 0.5548 0.6998 0.628 0.340 0.000 0.032
#> SRR772437 3 0.5650 0.8659 0.104 0.000 0.716 0.180
#> SRR772438 1 0.4974 0.7761 0.736 0.224 0.000 0.040
#> SRR772439 1 0.4808 0.7676 0.736 0.236 0.000 0.028
#> SRR772440 2 0.5102 0.4963 0.188 0.748 0.000 0.064
#> SRR772441 2 0.7628 -0.5274 0.408 0.428 0.008 0.156
#> SRR772442 4 0.6167 0.8169 0.248 0.100 0.000 0.652
#> SRR772443 4 0.6269 0.8106 0.272 0.096 0.000 0.632
#> SRR772444 1 0.4053 0.7686 0.768 0.228 0.000 0.004
#> SRR772445 1 0.4188 0.7690 0.752 0.244 0.000 0.004
#> SRR772446 2 0.4175 0.6288 0.212 0.776 0.000 0.012
#> SRR772447 2 0.4137 0.6344 0.208 0.780 0.000 0.012
#> SRR772448 1 0.7453 0.6443 0.496 0.300 0.000 0.204
#> SRR772449 1 0.7627 0.6150 0.468 0.292 0.000 0.240
#> SRR772450 2 0.5459 0.2193 0.016 0.552 0.000 0.432
#> SRR772451 2 0.5427 0.2495 0.016 0.568 0.000 0.416
#> SRR772452 2 0.4136 0.6269 0.196 0.788 0.000 0.016
#> SRR772453 2 0.4214 0.6250 0.204 0.780 0.000 0.016
#> SRR772454 2 0.5459 0.0878 0.432 0.552 0.000 0.016
#> SRR772455 2 0.4436 0.5861 0.216 0.764 0.000 0.020
#> SRR772456 2 0.5024 0.3679 0.008 0.632 0.000 0.360
#> SRR772457 2 0.5075 0.3865 0.012 0.644 0.000 0.344
#> SRR772458 1 0.4621 0.7443 0.708 0.284 0.000 0.008
#> SRR772459 1 0.4957 0.6924 0.668 0.320 0.000 0.012
#> SRR772460 2 0.5744 0.1882 0.028 0.536 0.000 0.436
#> SRR772461 2 0.5744 0.1882 0.028 0.536 0.000 0.436
#> SRR772462 2 0.2300 0.6603 0.048 0.924 0.000 0.028
#> SRR772463 2 0.0895 0.6726 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR772464 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772465 2 0.4158 0.6216 0.224 0.768 0.000 0.008
#> SRR772466 2 0.4284 0.6203 0.224 0.764 0.000 0.012
#> SRR772467 2 0.4436 0.5253 0.020 0.764 0.000 0.216
#> SRR772468 2 0.4542 0.5150 0.020 0.752 0.000 0.228
#> SRR772469 2 0.4123 0.6193 0.220 0.772 0.000 0.008
#> SRR772470 2 0.4399 0.6195 0.224 0.760 0.000 0.016
#> SRR772471 2 0.4406 0.6179 0.192 0.780 0.000 0.028
#> SRR772472 2 0.4035 0.6337 0.176 0.804 0.000 0.020
#> SRR772473 4 0.6214 0.8114 0.272 0.092 0.000 0.636
#> SRR772474 4 0.6248 0.8105 0.224 0.120 0.000 0.656
#> SRR772475 3 0.3189 0.7946 0.036 0.048 0.896 0.020
#> SRR772476 2 0.5668 0.1800 0.024 0.532 0.000 0.444
#> SRR772477 2 0.5650 0.2123 0.024 0.544 0.000 0.432
#> SRR772478 2 0.4630 0.5865 0.252 0.732 0.000 0.016
#> SRR772479 2 0.4175 0.6322 0.212 0.776 0.000 0.012
#> SRR772480 4 0.6347 0.7916 0.276 0.100 0.000 0.624
#> SRR772481 4 0.6323 0.7927 0.272 0.100 0.000 0.628
#> SRR772482 1 0.4220 0.7726 0.748 0.248 0.000 0.004
#> SRR772483 1 0.4262 0.7743 0.756 0.236 0.000 0.008
#> SRR772484 2 0.2222 0.6672 0.060 0.924 0.000 0.016
#> SRR772485 2 0.2402 0.6642 0.076 0.912 0.000 0.012
#> SRR772486 1 0.4538 0.7675 0.760 0.216 0.000 0.024
#> SRR772487 1 0.4961 0.7675 0.748 0.212 0.004 0.036
#> SRR772488 2 0.2737 0.6705 0.104 0.888 0.000 0.008
#> SRR772489 2 0.2466 0.6726 0.096 0.900 0.000 0.004
#> SRR772490 1 0.4594 0.7704 0.712 0.280 0.000 0.008
#> SRR772491 1 0.4252 0.7703 0.744 0.252 0.000 0.004
#> SRR772492 2 0.5493 0.1605 0.016 0.528 0.000 0.456
#> SRR772493 2 0.5586 0.1600 0.020 0.528 0.000 0.452
#> SRR772494 2 0.5657 0.1912 0.024 0.540 0.000 0.436
#> SRR772495 2 0.5650 0.1969 0.024 0.544 0.000 0.432
#> SRR772496 2 0.3080 0.6762 0.096 0.880 0.000 0.024
#> SRR772497 2 0.4010 0.6572 0.156 0.816 0.000 0.028
#> SRR772498 1 0.7439 0.5496 0.508 0.220 0.000 0.272
#> SRR772499 1 0.7480 0.5856 0.504 0.248 0.000 0.248
#> SRR772500 2 0.4920 0.5703 0.068 0.768 0.000 0.164
#> SRR772501 2 0.6620 0.2781 0.104 0.576 0.000 0.320
#> SRR772502 1 0.5559 0.7727 0.696 0.240 0.000 0.064
#> SRR772503 1 0.5537 0.7745 0.688 0.256 0.000 0.056
#> SRR772504 1 0.7861 0.2971 0.392 0.284 0.000 0.324
#> SRR772505 1 0.7875 0.3561 0.388 0.296 0.000 0.316
#> SRR772506 2 0.2871 0.6499 0.032 0.896 0.000 0.072
#> SRR772507 2 0.2861 0.6322 0.016 0.888 0.000 0.096
#> SRR772508 2 0.2670 0.6652 0.040 0.908 0.000 0.052
#> SRR772509 3 0.2901 0.8139 0.040 0.036 0.908 0.016
#> SRR772510 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772511 1 0.6619 0.7068 0.568 0.332 0.000 0.100
#> SRR772512 3 0.5650 0.8659 0.104 0.000 0.716 0.180
#> SRR772513 2 0.2611 0.6765 0.096 0.896 0.000 0.008
#> SRR772514 2 0.3224 0.6684 0.120 0.864 0.000 0.016
#> SRR772515 2 0.6570 0.3395 0.204 0.632 0.000 0.164
#> SRR772516 2 0.4827 0.6069 0.124 0.784 0.000 0.092
#> SRR772517 2 0.5436 0.5661 0.128 0.756 0.008 0.108
#> SRR772518 2 0.2730 0.6749 0.088 0.896 0.000 0.016
#> SRR772519 2 0.1833 0.6709 0.032 0.944 0.000 0.024
#> SRR772520 2 0.1936 0.6712 0.032 0.940 0.000 0.028
#> SRR772521 1 0.7188 0.3860 0.528 0.164 0.000 0.308
#> SRR772522 1 0.7211 0.5102 0.544 0.192 0.000 0.264
#> SRR772523 4 0.7297 0.6769 0.244 0.220 0.000 0.536
#> SRR772524 2 0.7904 -0.2825 0.308 0.368 0.000 0.324
#> SRR772525 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772526 2 0.4399 0.5386 0.020 0.768 0.000 0.212
#> SRR772527 2 0.4635 0.5381 0.028 0.756 0.000 0.216
#> SRR772528 3 0.1109 0.8406 0.028 0.004 0.968 0.000
#> SRR772529 1 0.4040 0.7760 0.752 0.248 0.000 0.000
#> SRR772530 1 0.4635 0.7722 0.720 0.268 0.000 0.012
#> SRR772531 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772532 2 0.6310 0.4809 0.152 0.660 0.000 0.188
#> SRR772533 2 0.5512 0.5589 0.100 0.728 0.000 0.172
#> SRR772534 2 0.5453 0.1884 0.388 0.592 0.000 0.020
#> SRR772535 2 0.6756 0.3563 0.200 0.612 0.000 0.188
#> SRR772536 2 0.6651 0.3895 0.236 0.616 0.000 0.148
#> SRR772537 4 0.5894 0.7856 0.200 0.108 0.000 0.692
#> SRR772538 4 0.6449 0.6461 0.132 0.232 0.000 0.636
#> SRR772539 2 0.5339 0.1649 0.384 0.600 0.000 0.016
#> SRR772540 1 0.4673 0.7618 0.700 0.292 0.000 0.008
#> SRR772541 2 0.4702 0.6511 0.172 0.784 0.008 0.036
#> SRR772542 1 0.3975 0.7727 0.760 0.240 0.000 0.000
#> SRR772543 1 0.4888 0.7532 0.752 0.216 0.016 0.016
#> SRR772544 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772545 2 0.5383 0.0405 0.452 0.536 0.000 0.012
#> SRR772546 2 0.5257 0.1216 0.444 0.548 0.000 0.008
#> SRR772547 2 0.4507 0.6071 0.224 0.756 0.000 0.020
#> SRR772548 2 0.4387 0.5859 0.236 0.752 0.000 0.012
#> SRR772549 2 0.3937 0.6394 0.188 0.800 0.000 0.012
#> SRR772550 2 0.4019 0.6417 0.196 0.792 0.000 0.012
#> SRR772551 2 0.4426 0.6072 0.204 0.772 0.000 0.024
#> SRR772552 2 0.3280 0.6742 0.124 0.860 0.000 0.016
#> SRR772553 3 0.2993 0.8070 0.040 0.040 0.904 0.016
#> SRR772554 2 0.5222 0.5919 0.112 0.756 0.000 0.132
#> SRR772555 2 0.5332 0.5925 0.124 0.748 0.000 0.128
#> SRR772556 1 0.4647 0.7481 0.704 0.288 0.000 0.008
#> SRR772557 1 0.4535 0.7438 0.704 0.292 0.000 0.004
#> SRR772558 2 0.3808 0.6403 0.176 0.812 0.000 0.012
#> SRR772559 2 0.3681 0.6411 0.176 0.816 0.000 0.008
#> SRR772560 2 0.4446 0.6291 0.196 0.776 0.000 0.028
#> SRR772561 3 0.5650 0.8659 0.104 0.000 0.716 0.180
#> SRR772562 2 0.2222 0.6784 0.060 0.924 0.000 0.016
#> SRR772563 2 0.1004 0.6731 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR772564 1 0.5322 0.7457 0.740 0.208 0.020 0.032
#> SRR772565 1 0.4579 0.7605 0.768 0.200 0.000 0.032
#> SRR772566 1 0.3982 0.7734 0.776 0.220 0.000 0.004
#> SRR772567 1 0.4053 0.7703 0.768 0.228 0.000 0.004
#> SRR772568 2 0.6089 0.3629 0.280 0.640 0.000 0.080
#> SRR772569 2 0.7128 -0.1349 0.372 0.492 0.000 0.136
#> SRR772570 2 0.4792 0.4812 0.312 0.680 0.000 0.008
#> SRR772571 2 0.5093 0.3803 0.348 0.640 0.000 0.012
#> SRR772572 2 0.4295 0.6026 0.240 0.752 0.000 0.008
#> SRR772573 2 0.4516 0.5897 0.252 0.736 0.000 0.012
#> SRR772574 1 0.5088 0.7736 0.688 0.288 0.000 0.024
#> SRR772575 1 0.5713 0.7216 0.620 0.340 0.000 0.040
#> SRR772576 1 0.7747 0.4240 0.432 0.316 0.000 0.252
#> SRR772577 1 0.7770 0.5289 0.396 0.364 0.000 0.240
#> SRR772578 4 0.7907 -0.0976 0.328 0.308 0.000 0.364
#> SRR772579 4 0.7912 -0.1136 0.328 0.312 0.000 0.360
#> SRR772580 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772581 1 0.7363 0.3438 0.492 0.176 0.000 0.332
#> SRR772582 1 0.7531 0.4035 0.476 0.208 0.000 0.316
#> SRR772583 2 0.3351 0.6633 0.148 0.844 0.000 0.008
#> SRR772584 2 0.3768 0.6503 0.184 0.808 0.000 0.008
#> SRR772585 2 0.2335 0.6717 0.060 0.920 0.000 0.020
#> SRR772586 3 0.1821 0.8374 0.032 0.008 0.948 0.012
#> SRR772587 1 0.5496 0.6008 0.604 0.372 0.000 0.024
#> SRR772588 2 0.1545 0.6635 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR772589 2 0.1888 0.6635 0.016 0.940 0.000 0.044
#> SRR772590 3 0.5650 0.8659 0.104 0.000 0.716 0.180
#> SRR772591 1 0.5007 0.6534 0.636 0.356 0.000 0.008
#> SRR772592 1 0.5231 0.5763 0.604 0.384 0.000 0.012
#> SRR772593 3 0.1690 0.8385 0.032 0.008 0.952 0.008
#> SRR772594 2 0.6854 0.1781 0.112 0.528 0.000 0.360
#> SRR772595 2 0.5848 0.3726 0.048 0.616 0.000 0.336
#> SRR772596 3 0.1004 0.8414 0.024 0.004 0.972 0.000
#> SRR772597 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772598 1 0.4852 0.7443 0.756 0.212 0.016 0.016
#> SRR772599 1 0.5085 0.7361 0.752 0.204 0.028 0.016
#> SRR772600 4 0.6269 0.8104 0.272 0.096 0.000 0.632
#> SRR772601 4 0.6515 0.8082 0.248 0.128 0.000 0.624
#> SRR772602 3 0.5759 0.8634 0.112 0.000 0.708 0.180
#> SRR772603 4 0.6245 0.8140 0.268 0.096 0.000 0.636
#> SRR772604 4 0.6182 0.8042 0.276 0.088 0.000 0.636
#> SRR772605 2 0.3913 0.6497 0.148 0.824 0.000 0.028
#> SRR772606 1 0.4604 0.7527 0.756 0.224 0.012 0.008
#> SRR772607 1 0.4374 0.7593 0.760 0.228 0.008 0.004
#> SRR772608 2 0.2216 0.6709 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR772609 2 0.2593 0.6727 0.104 0.892 0.000 0.004
#> SRR772610 2 0.1890 0.6743 0.056 0.936 0.000 0.008
#> SRR772611 2 0.1820 0.6714 0.036 0.944 0.000 0.020
#> SRR772612 4 0.6189 0.8150 0.268 0.092 0.000 0.640
#> SRR772613 4 0.5998 0.8099 0.248 0.088 0.000 0.664
#> SRR772614 1 0.4647 0.7590 0.704 0.288 0.000 0.008
#> SRR772615 1 0.4475 0.7656 0.748 0.240 0.008 0.004
#> SRR772616 2 0.4267 0.6318 0.188 0.788 0.000 0.024
#> SRR772617 4 0.6386 0.7914 0.212 0.140 0.000 0.648
#> SRR772618 4 0.6224 0.7824 0.188 0.144 0.000 0.668
#> SRR772619 2 0.5682 0.1365 0.024 0.520 0.000 0.456
#> SRR772620 2 0.5594 0.1408 0.020 0.520 0.000 0.460
#> SRR772621 1 0.7278 0.6958 0.520 0.344 0.008 0.128
#> SRR772622 1 0.6780 0.5942 0.488 0.416 0.000 0.096
#> SRR772623 3 0.5798 0.8618 0.112 0.000 0.704 0.184
#> SRR772624 3 0.1771 0.8369 0.036 0.012 0.948 0.004
#> SRR772625 3 0.5106 0.6887 0.028 0.100 0.796 0.076
#> SRR772626 1 0.7590 0.5433 0.480 0.248 0.000 0.272
#> SRR772627 1 0.7718 0.5324 0.484 0.240 0.004 0.272
#> SRR772628 1 0.5290 0.5766 0.584 0.404 0.000 0.012
#> SRR772629 1 0.4910 0.7545 0.704 0.276 0.000 0.020
#> SRR772630 2 0.4635 0.5437 0.268 0.720 0.000 0.012
#> SRR772631 3 0.1543 0.8394 0.032 0.008 0.956 0.004
#> SRR772632 2 0.6050 0.5337 0.112 0.676 0.000 0.212
#> SRR772633 2 0.5690 0.5738 0.096 0.708 0.000 0.196
#> SRR772634 1 0.6016 0.7661 0.692 0.228 0.016 0.064
#> SRR772635 1 0.6311 0.7656 0.656 0.248 0.008 0.088
#> SRR772636 3 0.3081 0.8052 0.040 0.044 0.900 0.016
#> SRR772637 2 0.4137 0.6297 0.208 0.780 0.000 0.012
#> SRR772638 2 0.4290 0.6257 0.212 0.772 0.000 0.016
#> SRR772639 2 0.2759 0.6636 0.044 0.904 0.000 0.052
#> SRR772640 2 0.5508 0.2613 0.020 0.572 0.000 0.408
#> SRR772641 2 0.5508 0.2632 0.020 0.572 0.000 0.408
#> SRR772642 1 0.6351 0.7488 0.628 0.268 0.000 0.104
#> SRR772643 1 0.6293 0.7604 0.628 0.276 0.000 0.096
#> SRR772644 2 0.5991 -0.0302 0.432 0.532 0.004 0.032
#> SRR772645 2 0.5778 0.2925 0.356 0.604 0.000 0.040
#> SRR772646 2 0.6595 0.4345 0.212 0.628 0.000 0.160
#> SRR772647 2 0.6019 0.5271 0.176 0.688 0.000 0.136
#> SRR772648 1 0.7327 0.6387 0.504 0.320 0.000 0.176
#> SRR772649 1 0.7341 0.6200 0.516 0.292 0.000 0.192
#> SRR772650 1 0.5648 0.4738 0.536 0.444 0.004 0.016
#> SRR772651 1 0.5892 0.3755 0.512 0.460 0.008 0.020
#> SRR772652 1 0.4222 0.7657 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR772653 1 0.4452 0.7700 0.732 0.260 0.000 0.008
#> SRR772654 1 0.6315 0.6290 0.540 0.396 0.000 0.064
#> SRR772655 1 0.6111 0.6607 0.556 0.392 0.000 0.052
#> SRR772656 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772657 3 0.5689 0.8648 0.104 0.000 0.712 0.184
#> SRR772658 4 0.6448 0.4333 0.092 0.316 0.000 0.592
#> SRR772659 4 0.6463 0.7412 0.196 0.160 0.000 0.644
#> SRR772660 2 0.4267 0.6344 0.188 0.788 0.000 0.024
#> SRR772661 3 0.2291 0.8307 0.036 0.016 0.932 0.016
#> SRR772662 1 0.5598 0.7006 0.628 0.344 0.008 0.020
#> SRR772663 2 0.5716 -0.0387 0.420 0.552 0.000 0.028
#> SRR772664 2 0.2125 0.6737 0.076 0.920 0.000 0.004
#> SRR772665 2 0.2198 0.6741 0.072 0.920 0.000 0.008
#> SRR772666 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772667 2 0.4214 0.5398 0.016 0.780 0.000 0.204
#> SRR772668 2 0.7218 0.2067 0.164 0.520 0.000 0.316
#> SRR772669 4 0.6068 0.0271 0.044 0.448 0.000 0.508
#> SRR772670 2 0.3946 0.6306 0.168 0.812 0.000 0.020
#> SRR772671 2 0.3498 0.6564 0.160 0.832 0.000 0.008
#> SRR772672 2 0.2466 0.6741 0.056 0.916 0.000 0.028
#> SRR772673 2 0.1837 0.6712 0.028 0.944 0.000 0.028
#> SRR772674 3 0.5650 0.8662 0.104 0.000 0.716 0.180
#> SRR772675 3 0.2291 0.8307 0.036 0.016 0.932 0.016
#> SRR772676 1 0.6078 0.6870 0.620 0.312 0.000 0.068
#> SRR772677 1 0.6852 0.6134 0.600 0.208 0.000 0.192
#> SRR772678 3 0.2513 0.8250 0.036 0.024 0.924 0.016
#> SRR772679 2 0.4737 0.5823 0.252 0.728 0.000 0.020
#> SRR772680 2 0.5465 0.1502 0.392 0.588 0.000 0.020
#> SRR772681 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772682 2 0.2596 0.6782 0.068 0.908 0.000 0.024
#> SRR772683 2 0.2623 0.6760 0.064 0.908 0.000 0.028
#> SRR772685 1 0.7743 0.5518 0.436 0.308 0.000 0.256
#> SRR772686 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772687 3 0.2542 0.8186 0.084 0.012 0.904 0.000
#> SRR772688 2 0.4793 0.5674 0.040 0.756 0.000 0.204
#> SRR772689 2 0.5213 0.4131 0.020 0.652 0.000 0.328
#> SRR772690 3 0.5610 0.8672 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR772691 3 0.2715 0.8183 0.036 0.032 0.916 0.016
#> SRR772692 1 0.6022 0.7671 0.656 0.260 0.000 0.084
#> SRR772693 1 0.6486 0.7671 0.644 0.256 0.012 0.088
#> SRR772694 2 0.3342 0.6597 0.100 0.868 0.000 0.032
#> SRR772695 2 0.3910 0.6323 0.156 0.820 0.000 0.024
#> SRR772696 1 0.7636 0.4957 0.468 0.248 0.000 0.284
#> SRR772697 1 0.7556 0.5964 0.488 0.264 0.000 0.248
#> SRR772698 3 0.1543 0.8394 0.032 0.008 0.956 0.004
#> SRR772699 1 0.4647 0.7717 0.740 0.244 0.008 0.008
#> SRR772700 1 0.4821 0.7718 0.740 0.236 0.008 0.016
#> SRR772701 1 0.4608 0.7415 0.692 0.304 0.000 0.004
#> SRR772702 1 0.4295 0.7633 0.752 0.240 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 1 0.6111 0.10945 0.500 0.424 0.040 0.020 0.016
#> SRR772342 2 0.6121 0.32662 0.384 0.532 0.052 0.024 0.008
#> SRR772343 2 0.5368 0.67451 0.192 0.712 0.044 0.048 0.004
#> SRR772344 2 0.7191 -0.06769 0.240 0.428 0.016 0.312 0.004
#> SRR772345 2 0.7389 -0.25054 0.256 0.364 0.016 0.356 0.008
#> SRR772346 1 0.5157 0.72462 0.712 0.128 0.008 0.152 0.000
#> SRR772347 1 0.5862 0.66393 0.644 0.132 0.016 0.208 0.000
#> SRR772348 2 0.1659 0.70897 0.016 0.948 0.024 0.008 0.004
#> SRR772349 2 0.1574 0.70789 0.012 0.952 0.020 0.012 0.004
#> SRR772350 3 0.3948 0.96865 0.016 0.000 0.776 0.012 0.196
#> SRR772351 2 0.6576 0.04734 0.148 0.496 0.008 0.344 0.004
#> SRR772352 2 0.6957 0.15959 0.292 0.488 0.016 0.200 0.004
#> SRR772353 2 0.4275 0.69510 0.128 0.796 0.052 0.000 0.024
#> SRR772354 2 0.4349 0.69757 0.120 0.796 0.052 0.000 0.032
#> SRR772355 1 0.6854 0.24058 0.440 0.388 0.016 0.152 0.004
#> SRR772356 2 0.6737 0.29846 0.188 0.556 0.016 0.232 0.008
#> SRR772357 1 0.5580 0.33144 0.604 0.336 0.020 0.032 0.008
#> SRR772358 2 0.6095 0.40351 0.400 0.516 0.024 0.056 0.004
#> SRR772359 1 0.3096 0.76152 0.860 0.108 0.008 0.024 0.000
#> SRR772360 1 0.2809 0.75758 0.888 0.068 0.004 0.036 0.004
#> SRR772361 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772362 2 0.6792 0.02953 0.052 0.440 0.088 0.420 0.000
#> SRR772363 2 0.6784 0.07731 0.052 0.456 0.088 0.404 0.000
#> SRR772364 1 0.5503 0.62872 0.652 0.076 0.008 0.260 0.004
#> SRR772365 1 0.5353 0.62546 0.636 0.092 0.000 0.272 0.000
#> SRR772366 5 0.1216 0.92489 0.020 0.000 0.020 0.000 0.960
#> SRR772367 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772368 2 0.5639 0.64482 0.192 0.696 0.024 0.076 0.012
#> SRR772369 1 0.5825 0.20250 0.488 0.444 0.024 0.044 0.000
#> SRR772370 2 0.5152 0.56097 0.268 0.672 0.024 0.036 0.000
#> SRR772371 1 0.5541 0.67944 0.684 0.092 0.004 0.204 0.016
#> SRR772372 1 0.5439 0.69341 0.716 0.080 0.012 0.172 0.020
#> SRR772373 2 0.2207 0.70425 0.020 0.924 0.012 0.040 0.004
#> SRR772374 2 0.3546 0.68225 0.056 0.856 0.020 0.064 0.004
#> SRR772375 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772376 2 0.6774 0.38628 0.312 0.524 0.020 0.136 0.008
#> SRR772377 5 0.1106 0.92107 0.012 0.000 0.024 0.000 0.964
#> SRR772378 2 0.4390 0.70498 0.104 0.808 0.048 0.012 0.028
#> SRR772379 2 0.3301 0.71566 0.076 0.864 0.024 0.036 0.000
#> SRR772380 2 0.3487 0.71963 0.084 0.856 0.020 0.036 0.004
#> SRR772381 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772382 1 0.4263 0.73227 0.792 0.124 0.012 0.072 0.000
#> SRR772383 1 0.5135 0.69000 0.724 0.184 0.036 0.056 0.000
#> SRR772384 5 0.0963 0.92288 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR772385 5 0.1952 0.88453 0.084 0.000 0.000 0.004 0.912
#> SRR772386 1 0.6313 0.54378 0.584 0.280 0.020 0.112 0.004
#> SRR772387 1 0.5611 0.65745 0.692 0.172 0.020 0.112 0.004
#> SRR772388 2 0.4667 0.68521 0.164 0.760 0.060 0.008 0.008
#> SRR772389 2 0.5091 0.64848 0.208 0.712 0.056 0.000 0.024
#> SRR772390 5 0.1121 0.89772 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR772391 2 0.5498 0.66099 0.184 0.712 0.064 0.016 0.024
#> SRR772392 2 0.6223 0.56035 0.272 0.620 0.056 0.024 0.028
#> SRR772393 1 0.5329 0.67110 0.716 0.108 0.016 0.156 0.004
#> SRR772394 1 0.5199 0.67065 0.716 0.108 0.008 0.164 0.004
#> SRR772395 2 0.2158 0.69867 0.020 0.920 0.008 0.052 0.000
#> SRR772396 1 0.2333 0.75486 0.916 0.040 0.016 0.028 0.000
#> SRR772397 1 0.4311 0.74928 0.812 0.100 0.032 0.048 0.008
#> SRR772398 1 0.2291 0.74315 0.916 0.008 0.016 0.056 0.004
#> SRR772399 1 0.2243 0.74293 0.924 0.012 0.012 0.040 0.012
#> SRR772400 1 0.2171 0.74327 0.928 0.020 0.008 0.032 0.012
#> SRR772401 1 0.1772 0.74527 0.940 0.020 0.008 0.032 0.000
#> SRR772402 4 0.3883 0.67188 0.152 0.032 0.012 0.804 0.000
#> SRR772403 4 0.3541 0.67070 0.144 0.012 0.020 0.824 0.000
#> SRR772404 2 0.3890 0.70221 0.076 0.836 0.024 0.060 0.004
#> SRR772405 5 0.1544 0.90322 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR772406 1 0.6485 0.53962 0.552 0.236 0.012 0.200 0.000
#> SRR772407 1 0.6637 0.50224 0.536 0.200 0.016 0.248 0.000
#> SRR772408 2 0.6413 0.17699 0.040 0.500 0.072 0.388 0.000
#> SRR772409 2 0.6306 0.29671 0.048 0.540 0.060 0.352 0.000
#> SRR772410 2 0.3067 0.72305 0.068 0.880 0.032 0.016 0.004
#> SRR772411 2 0.3482 0.71728 0.104 0.844 0.040 0.012 0.000
#> SRR772412 1 0.5664 0.68524 0.712 0.176 0.032 0.052 0.028
#> SRR772413 1 0.5571 0.70757 0.732 0.140 0.032 0.068 0.028
#> SRR772414 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772415 2 0.1716 0.71278 0.016 0.944 0.024 0.016 0.000
#> SRR772416 2 0.1117 0.70958 0.016 0.964 0.020 0.000 0.000
#> SRR772417 2 0.4314 0.70377 0.168 0.776 0.036 0.020 0.000
#> SRR772418 5 0.1195 0.92092 0.012 0.000 0.028 0.000 0.960
#> SRR772419 2 0.3202 0.67763 0.020 0.868 0.020 0.088 0.004
#> SRR772420 2 0.3100 0.68137 0.020 0.868 0.020 0.092 0.000
#> SRR772421 1 0.5175 0.72790 0.720 0.156 0.016 0.108 0.000
#> SRR772422 1 0.5921 0.69725 0.660 0.196 0.016 0.120 0.008
#> SRR772423 4 0.3780 0.68479 0.132 0.028 0.020 0.820 0.000
#> SRR772424 4 0.3233 0.69436 0.112 0.028 0.008 0.852 0.000
#> SRR772425 2 0.3893 0.68518 0.076 0.832 0.016 0.072 0.004
#> SRR772426 4 0.7085 0.26949 0.160 0.380 0.020 0.432 0.008
#> SRR772427 2 0.7329 -0.19325 0.192 0.392 0.024 0.384 0.008
#> SRR772428 1 0.3898 0.74591 0.832 0.088 0.012 0.060 0.008
#> SRR772429 1 0.4071 0.70012 0.808 0.128 0.000 0.036 0.028
#> SRR772430 2 0.5597 0.69135 0.144 0.732 0.044 0.048 0.032
#> SRR772431 4 0.4131 0.68571 0.120 0.020 0.016 0.816 0.028
#> SRR772432 4 0.4213 0.68558 0.120 0.032 0.016 0.812 0.020
#> SRR772433 1 0.3578 0.75230 0.856 0.068 0.012 0.052 0.012
#> SRR772434 1 0.3296 0.74592 0.872 0.044 0.008 0.060 0.016
#> SRR772435 1 0.5898 0.70937 0.692 0.164 0.020 0.100 0.024
#> SRR772436 1 0.7149 0.51773 0.540 0.268 0.028 0.140 0.024
#> SRR772437 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772438 1 0.3981 0.74754 0.824 0.084 0.008 0.076 0.008
#> SRR772439 1 0.4145 0.73999 0.816 0.096 0.020 0.064 0.004
#> SRR772440 2 0.5669 0.32261 0.328 0.588 0.008 0.076 0.000
#> SRR772441 1 0.6860 0.46706 0.520 0.304 0.016 0.148 0.012
#> SRR772442 4 0.3892 0.68954 0.116 0.040 0.016 0.824 0.004
#> SRR772443 4 0.3862 0.68116 0.132 0.032 0.020 0.816 0.000
#> SRR772444 1 0.3145 0.75120 0.868 0.064 0.008 0.060 0.000
#> SRR772445 1 0.3964 0.75069 0.832 0.072 0.012 0.072 0.012
#> SRR772446 2 0.4629 0.68492 0.140 0.776 0.056 0.004 0.024
#> SRR772447 2 0.4607 0.68699 0.132 0.780 0.060 0.004 0.024
#> SRR772448 1 0.5089 0.68676 0.728 0.152 0.016 0.104 0.000
#> SRR772449 1 0.5314 0.67675 0.720 0.128 0.016 0.132 0.004
#> SRR772450 2 0.6575 0.19645 0.040 0.496 0.088 0.376 0.000
#> SRR772451 2 0.6575 0.20284 0.040 0.496 0.088 0.376 0.000
#> SRR772452 2 0.4491 0.68909 0.152 0.772 0.064 0.004 0.008
#> SRR772453 2 0.4517 0.69142 0.144 0.776 0.064 0.012 0.004
#> SRR772454 2 0.6284 0.56976 0.264 0.624 0.036 0.048 0.028
#> SRR772455 2 0.4567 0.70363 0.152 0.776 0.036 0.032 0.004
#> SRR772456 2 0.5927 0.45061 0.028 0.612 0.076 0.284 0.000
#> SRR772457 2 0.6196 0.42078 0.040 0.588 0.076 0.296 0.000
#> SRR772458 1 0.4945 0.71615 0.752 0.144 0.036 0.068 0.000
#> SRR772459 1 0.5201 0.69188 0.724 0.176 0.040 0.060 0.000
#> SRR772460 4 0.6833 0.19378 0.068 0.380 0.076 0.476 0.000
#> SRR772461 4 0.6866 0.20695 0.068 0.372 0.080 0.480 0.000
#> SRR772462 2 0.3139 0.70090 0.016 0.884 0.016 0.052 0.032
#> SRR772463 2 0.1498 0.70342 0.008 0.952 0.016 0.024 0.000
#> SRR772464 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772465 2 0.4102 0.70879 0.112 0.812 0.048 0.028 0.000
#> SRR772466 2 0.4514 0.70464 0.140 0.780 0.040 0.040 0.000
#> SRR772467 2 0.5263 0.57405 0.036 0.704 0.052 0.208 0.000
#> SRR772468 2 0.5305 0.58073 0.040 0.704 0.052 0.204 0.000
#> SRR772469 2 0.4460 0.68696 0.160 0.768 0.060 0.012 0.000
#> SRR772470 2 0.4483 0.68978 0.156 0.768 0.064 0.012 0.000
#> SRR772471 2 0.5349 0.67369 0.192 0.708 0.052 0.048 0.000
#> SRR772472 2 0.4598 0.69497 0.152 0.768 0.056 0.024 0.000
#> SRR772473 4 0.3960 0.68805 0.124 0.044 0.012 0.816 0.004
#> SRR772474 4 0.4160 0.69016 0.128 0.052 0.008 0.804 0.008
#> SRR772475 5 0.1892 0.88818 0.080 0.000 0.000 0.004 0.916
#> SRR772476 4 0.6796 0.10018 0.056 0.404 0.084 0.456 0.000
#> SRR772477 4 0.6892 0.06770 0.060 0.412 0.088 0.440 0.000
#> SRR772478 2 0.5640 0.66331 0.212 0.692 0.048 0.020 0.028
#> SRR772479 2 0.4772 0.68662 0.136 0.772 0.060 0.008 0.024
#> SRR772480 4 0.4352 0.62794 0.176 0.036 0.012 0.772 0.004
#> SRR772481 4 0.4383 0.66716 0.148 0.040 0.012 0.788 0.012
#> SRR772482 1 0.2227 0.74761 0.924 0.028 0.012 0.032 0.004
#> SRR772483 1 0.1989 0.74836 0.932 0.028 0.004 0.032 0.004
#> SRR772484 2 0.2947 0.70875 0.024 0.896 0.016 0.032 0.032
#> SRR772485 2 0.3375 0.71019 0.020 0.876 0.040 0.032 0.032
#> SRR772486 1 0.2043 0.74297 0.928 0.012 0.008 0.048 0.004
#> SRR772487 1 0.2339 0.74510 0.920 0.016 0.008 0.040 0.016
#> SRR772488 2 0.3604 0.71792 0.048 0.864 0.036 0.020 0.032
#> SRR772489 2 0.3099 0.71854 0.044 0.888 0.016 0.024 0.028
#> SRR772490 1 0.2869 0.76166 0.888 0.064 0.004 0.036 0.008
#> SRR772491 1 0.3709 0.75303 0.832 0.108 0.016 0.044 0.000
#> SRR772492 4 0.6541 0.10961 0.036 0.396 0.088 0.480 0.000
#> SRR772493 4 0.6608 0.10727 0.040 0.400 0.088 0.472 0.000
#> SRR772494 2 0.6566 -0.00675 0.036 0.440 0.088 0.436 0.000
#> SRR772495 2 0.6626 0.00468 0.040 0.440 0.088 0.432 0.000
#> SRR772496 2 0.3274 0.70548 0.048 0.872 0.020 0.056 0.004
#> SRR772497 2 0.4099 0.70976 0.080 0.824 0.028 0.064 0.004
#> SRR772498 1 0.4981 0.66953 0.740 0.088 0.012 0.156 0.004
#> SRR772499 1 0.5153 0.67002 0.732 0.092 0.012 0.156 0.008
#> SRR772500 2 0.6015 0.32931 0.088 0.600 0.016 0.292 0.004
#> SRR772501 2 0.6467 0.12643 0.112 0.520 0.016 0.348 0.004
#> SRR772502 1 0.2788 0.75233 0.892 0.064 0.004 0.032 0.008
#> SRR772503 1 0.3039 0.75666 0.884 0.060 0.008 0.036 0.012
#> SRR772504 1 0.6144 0.59246 0.624 0.216 0.016 0.140 0.004
#> SRR772505 1 0.6120 0.60417 0.632 0.192 0.016 0.156 0.004
#> SRR772506 2 0.2950 0.68944 0.028 0.888 0.020 0.060 0.004
#> SRR772507 2 0.3313 0.67201 0.020 0.860 0.020 0.096 0.004
#> SRR772508 2 0.3140 0.69647 0.028 0.880 0.020 0.064 0.008
#> SRR772509 5 0.1270 0.91573 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR772510 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772511 1 0.4420 0.72507 0.784 0.148 0.020 0.044 0.004
#> SRR772512 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772513 2 0.2116 0.71003 0.016 0.932 0.016 0.012 0.024
#> SRR772514 2 0.2313 0.71862 0.044 0.912 0.040 0.004 0.000
#> SRR772515 2 0.6303 0.27715 0.116 0.576 0.016 0.288 0.004
#> SRR772516 2 0.5102 0.55604 0.084 0.732 0.016 0.164 0.004
#> SRR772517 2 0.6508 0.45042 0.152 0.628 0.012 0.176 0.032
#> SRR772518 2 0.2675 0.71244 0.028 0.908 0.012 0.028 0.024
#> SRR772519 2 0.1393 0.70375 0.012 0.956 0.008 0.024 0.000
#> SRR772520 2 0.2901 0.68613 0.020 0.888 0.020 0.068 0.004
#> SRR772521 1 0.5971 0.56782 0.588 0.084 0.008 0.312 0.008
#> SRR772522 1 0.5629 0.67376 0.668 0.100 0.004 0.216 0.012
#> SRR772523 4 0.5506 0.63568 0.156 0.156 0.004 0.680 0.004
#> SRR772524 4 0.7050 0.38857 0.228 0.308 0.012 0.448 0.004
#> SRR772525 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772526 2 0.4969 0.61318 0.036 0.736 0.048 0.180 0.000
#> SRR772527 2 0.5042 0.60754 0.040 0.728 0.044 0.188 0.000
#> SRR772528 5 0.1168 0.91405 0.008 0.000 0.032 0.000 0.960
#> SRR772529 1 0.2872 0.75370 0.884 0.048 0.008 0.060 0.000
#> SRR772530 1 0.2321 0.76112 0.912 0.056 0.008 0.024 0.000
#> SRR772531 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772532 2 0.6753 0.24084 0.228 0.540 0.016 0.212 0.004
#> SRR772533 2 0.6267 0.27159 0.120 0.572 0.012 0.292 0.004
#> SRR772534 2 0.5645 0.33430 0.408 0.532 0.040 0.020 0.000
#> SRR772535 2 0.7002 0.08324 0.296 0.464 0.012 0.224 0.004
#> SRR772536 2 0.6702 0.26816 0.244 0.536 0.020 0.200 0.000
#> SRR772537 4 0.4537 0.69301 0.116 0.072 0.028 0.784 0.000
#> SRR772538 4 0.4898 0.65181 0.088 0.144 0.020 0.748 0.000
#> SRR772539 2 0.6242 0.28879 0.396 0.516 0.052 0.024 0.012
#> SRR772540 1 0.2950 0.75258 0.884 0.076 0.012 0.020 0.008
#> SRR772541 2 0.4747 0.70348 0.088 0.796 0.024 0.060 0.032
#> SRR772542 1 0.2026 0.74779 0.932 0.024 0.008 0.032 0.004
#> SRR772543 1 0.2813 0.74874 0.900 0.036 0.008 0.032 0.024
#> SRR772544 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772545 2 0.6355 0.42988 0.332 0.568 0.048 0.024 0.028
#> SRR772546 2 0.6215 0.50734 0.296 0.604 0.048 0.028 0.024
#> SRR772547 2 0.4974 0.68786 0.180 0.736 0.040 0.044 0.000
#> SRR772548 2 0.4572 0.68742 0.168 0.760 0.056 0.016 0.000
#> SRR772549 2 0.5414 0.68237 0.160 0.732 0.056 0.032 0.020
#> SRR772550 2 0.4601 0.68440 0.140 0.772 0.064 0.000 0.024
#> SRR772551 2 0.3563 0.68567 0.092 0.840 0.008 0.060 0.000
#> SRR772552 2 0.2141 0.71910 0.064 0.916 0.016 0.004 0.000
#> SRR772553 5 0.1952 0.88453 0.084 0.000 0.000 0.004 0.912
#> SRR772554 2 0.5903 0.40916 0.104 0.640 0.016 0.236 0.004
#> SRR772555 2 0.5496 0.49820 0.104 0.696 0.016 0.180 0.004
#> SRR772556 1 0.5000 0.72477 0.764 0.128 0.028 0.068 0.012
#> SRR772557 1 0.4971 0.72687 0.768 0.132 0.032 0.052 0.016
#> SRR772558 2 0.3846 0.69429 0.144 0.800 0.056 0.000 0.000
#> SRR772559 2 0.3953 0.69462 0.148 0.792 0.060 0.000 0.000
#> SRR772560 2 0.4624 0.70026 0.144 0.772 0.036 0.048 0.000
#> SRR772561 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772562 2 0.1865 0.70658 0.024 0.936 0.008 0.032 0.000
#> SRR772563 2 0.1507 0.70529 0.012 0.952 0.012 0.024 0.000
#> SRR772564 1 0.3302 0.72761 0.872 0.016 0.008 0.056 0.048
#> SRR772565 1 0.3005 0.74799 0.884 0.028 0.012 0.068 0.008
#> SRR772566 1 0.2814 0.74922 0.892 0.040 0.004 0.056 0.008
#> SRR772567 1 0.2338 0.74507 0.916 0.024 0.004 0.048 0.008
#> SRR772568 2 0.6336 0.32275 0.324 0.548 0.024 0.104 0.000
#> SRR772569 1 0.6344 0.29403 0.484 0.400 0.020 0.096 0.000
#> SRR772570 2 0.4709 0.64969 0.224 0.716 0.056 0.004 0.000
#> SRR772571 2 0.5651 0.64541 0.228 0.680 0.052 0.020 0.020
#> SRR772572 2 0.4400 0.69386 0.164 0.772 0.048 0.016 0.000
#> SRR772573 2 0.4536 0.68347 0.176 0.760 0.044 0.020 0.000
#> SRR772574 1 0.3658 0.75958 0.836 0.104 0.016 0.044 0.000
#> SRR772575 1 0.4251 0.73931 0.784 0.156 0.016 0.044 0.000
#> SRR772576 1 0.7032 0.43762 0.480 0.272 0.016 0.228 0.004
#> SRR772577 1 0.6664 0.54906 0.536 0.264 0.012 0.184 0.004
#> SRR772578 1 0.7129 0.17272 0.464 0.172 0.028 0.332 0.004
#> SRR772579 1 0.6971 0.25832 0.492 0.184 0.020 0.300 0.004
#> SRR772580 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772581 1 0.5620 0.58707 0.608 0.092 0.004 0.296 0.000
#> SRR772582 1 0.6050 0.47146 0.524 0.112 0.000 0.360 0.004
#> SRR772583 2 0.3610 0.70676 0.092 0.848 0.032 0.004 0.024
#> SRR772584 2 0.3542 0.72045 0.076 0.860 0.028 0.016 0.020
#> SRR772585 2 0.2325 0.70907 0.008 0.920 0.008 0.032 0.032
#> SRR772586 5 0.1195 0.92092 0.012 0.000 0.028 0.000 0.960
#> SRR772587 1 0.4797 0.62220 0.720 0.228 0.016 0.032 0.004
#> SRR772588 2 0.1948 0.70005 0.008 0.932 0.024 0.036 0.000
#> SRR772589 2 0.2173 0.69503 0.012 0.920 0.016 0.052 0.000
#> SRR772590 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772591 1 0.5297 0.66398 0.704 0.204 0.036 0.056 0.000
#> SRR772592 1 0.5406 0.61170 0.672 0.248 0.036 0.044 0.000
#> SRR772593 5 0.1195 0.92092 0.012 0.000 0.028 0.000 0.960
#> SRR772594 2 0.6764 0.01269 0.128 0.456 0.028 0.388 0.000
#> SRR772595 2 0.6189 0.16831 0.072 0.524 0.020 0.380 0.004
#> SRR772596 5 0.1197 0.89562 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR772597 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772598 1 0.2964 0.73580 0.892 0.016 0.012 0.048 0.032
#> SRR772599 1 0.3124 0.73033 0.884 0.016 0.012 0.040 0.048
#> SRR772600 4 0.3827 0.67487 0.144 0.024 0.020 0.812 0.000
#> SRR772601 4 0.4343 0.69537 0.128 0.064 0.012 0.792 0.004
#> SRR772602 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772603 4 0.4086 0.69027 0.120 0.048 0.016 0.812 0.004
#> SRR772604 4 0.3825 0.67871 0.136 0.028 0.020 0.816 0.000
#> SRR772605 2 0.4327 0.70658 0.124 0.796 0.032 0.048 0.000
#> SRR772606 1 0.2234 0.74645 0.924 0.024 0.008 0.036 0.008
#> SRR772607 1 0.1659 0.74654 0.948 0.024 0.008 0.016 0.004
#> SRR772608 2 0.2636 0.71249 0.020 0.908 0.036 0.008 0.028
#> SRR772609 2 0.3120 0.71719 0.028 0.888 0.040 0.024 0.020
#> SRR772610 2 0.1278 0.70899 0.016 0.960 0.020 0.004 0.000
#> SRR772611 2 0.1569 0.70354 0.012 0.948 0.008 0.032 0.000
#> SRR772612 4 0.3722 0.68925 0.128 0.032 0.016 0.824 0.000
#> SRR772613 4 0.3499 0.69596 0.128 0.024 0.008 0.836 0.004
#> SRR772614 1 0.4121 0.74461 0.812 0.108 0.028 0.052 0.000
#> SRR772615 1 0.2578 0.74868 0.912 0.032 0.012 0.024 0.020
#> SRR772616 2 0.5281 0.67733 0.192 0.712 0.044 0.052 0.000
#> SRR772617 4 0.4160 0.69438 0.124 0.048 0.024 0.804 0.000
#> SRR772618 4 0.4546 0.69308 0.124 0.072 0.024 0.780 0.000
#> SRR772619 4 0.6414 0.20862 0.036 0.372 0.080 0.512 0.000
#> SRR772620 4 0.6536 0.14258 0.036 0.392 0.088 0.484 0.000
#> SRR772621 1 0.4879 0.68802 0.720 0.212 0.016 0.052 0.000
#> SRR772622 1 0.6065 0.55209 0.564 0.320 0.012 0.104 0.000
#> SRR772623 3 0.3948 0.96865 0.016 0.000 0.776 0.012 0.196
#> SRR772624 5 0.1211 0.92602 0.024 0.000 0.016 0.000 0.960
#> SRR772625 5 0.5150 0.68032 0.132 0.048 0.000 0.076 0.744
#> SRR772626 1 0.5507 0.65094 0.704 0.100 0.012 0.172 0.012
#> SRR772627 1 0.5484 0.65667 0.712 0.096 0.012 0.164 0.016
#> SRR772628 1 0.5313 0.56715 0.668 0.260 0.048 0.024 0.000
#> SRR772629 1 0.4845 0.72072 0.752 0.124 0.016 0.108 0.000
#> SRR772630 2 0.4735 0.67825 0.196 0.740 0.036 0.028 0.000
#> SRR772631 5 0.1195 0.92092 0.012 0.000 0.028 0.000 0.960
#> SRR772632 2 0.6272 0.32305 0.108 0.588 0.020 0.280 0.004
#> SRR772633 2 0.6486 0.30714 0.128 0.564 0.020 0.284 0.004
#> SRR772634 1 0.2881 0.74747 0.888 0.060 0.008 0.040 0.004
#> SRR772635 1 0.2809 0.74925 0.888 0.068 0.004 0.036 0.004
#> SRR772636 5 0.2011 0.87809 0.088 0.000 0.000 0.004 0.908
#> SRR772637 2 0.4576 0.68898 0.156 0.768 0.060 0.012 0.004
#> SRR772638 2 0.4599 0.68921 0.152 0.768 0.064 0.012 0.004
#> SRR772639 2 0.2792 0.69289 0.024 0.892 0.012 0.068 0.004
#> SRR772640 2 0.6559 0.05206 0.036 0.460 0.088 0.416 0.000
#> SRR772641 2 0.6561 0.05425 0.036 0.456 0.088 0.420 0.000
#> SRR772642 1 0.3141 0.73514 0.860 0.096 0.004 0.040 0.000
#> SRR772643 1 0.3746 0.73680 0.832 0.104 0.008 0.052 0.004
#> SRR772644 1 0.5946 0.01505 0.540 0.388 0.024 0.040 0.008
#> SRR772645 2 0.5861 0.47494 0.376 0.548 0.028 0.048 0.000
#> SRR772646 2 0.7051 0.13972 0.296 0.480 0.020 0.200 0.004
#> SRR772647 2 0.6430 0.40894 0.196 0.600 0.020 0.180 0.004
#> SRR772648 1 0.6339 0.52100 0.548 0.204 0.004 0.244 0.000
#> SRR772649 1 0.5978 0.67218 0.648 0.180 0.024 0.148 0.000
#> SRR772650 1 0.5256 0.44987 0.620 0.336 0.020 0.016 0.008
#> SRR772651 1 0.5280 0.46247 0.624 0.328 0.020 0.024 0.004
#> SRR772652 1 0.3942 0.75505 0.832 0.088 0.012 0.056 0.012
#> SRR772653 1 0.3887 0.74951 0.832 0.092 0.008 0.056 0.012
#> SRR772654 1 0.4643 0.68995 0.724 0.228 0.016 0.032 0.000
#> SRR772655 1 0.4715 0.70813 0.728 0.212 0.012 0.048 0.000
#> SRR772656 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772657 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772658 4 0.5687 0.57284 0.088 0.196 0.036 0.680 0.000
#> SRR772659 4 0.4769 0.68907 0.124 0.076 0.032 0.768 0.000
#> SRR772660 2 0.4865 0.67854 0.160 0.756 0.020 0.056 0.008
#> SRR772661 5 0.1106 0.92580 0.024 0.000 0.012 0.000 0.964
#> SRR772662 1 0.3818 0.73986 0.812 0.144 0.016 0.028 0.000
#> SRR772663 1 0.5520 -0.03045 0.488 0.468 0.016 0.020 0.008
#> SRR772664 2 0.2027 0.71480 0.040 0.928 0.024 0.008 0.000
#> SRR772665 2 0.1653 0.71159 0.024 0.944 0.028 0.000 0.004
#> SRR772666 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772667 2 0.4925 0.57123 0.020 0.712 0.044 0.224 0.000
#> SRR772668 4 0.7990 0.31991 0.236 0.284 0.060 0.408 0.012
#> SRR772669 4 0.6078 0.28128 0.036 0.340 0.060 0.564 0.000
#> SRR772670 2 0.4274 0.70693 0.132 0.796 0.040 0.032 0.000
#> SRR772671 2 0.3595 0.70395 0.120 0.828 0.048 0.004 0.000
#> SRR772672 2 0.2965 0.70508 0.052 0.884 0.008 0.052 0.004
#> SRR772673 2 0.2361 0.70337 0.032 0.916 0.008 0.040 0.004
#> SRR772674 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772675 5 0.1041 0.92432 0.032 0.000 0.004 0.000 0.964
#> SRR772676 1 0.6211 0.55851 0.600 0.156 0.016 0.228 0.000
#> SRR772677 1 0.5819 0.61363 0.624 0.108 0.012 0.256 0.000
#> SRR772678 5 0.0963 0.92288 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR772679 2 0.4784 0.69105 0.176 0.756 0.032 0.012 0.024
#> SRR772680 2 0.5274 0.50696 0.344 0.612 0.024 0.008 0.012
#> SRR772681 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772682 2 0.2376 0.70380 0.024 0.916 0.012 0.044 0.004
#> SRR772683 2 0.3381 0.69932 0.052 0.864 0.016 0.064 0.004
#> SRR772685 1 0.5589 0.66077 0.684 0.176 0.012 0.124 0.004
#> SRR772686 3 0.3074 0.99516 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR772687 5 0.4380 0.76171 0.036 0.000 0.116 0.052 0.796
#> SRR772688 2 0.5177 0.60812 0.040 0.720 0.052 0.188 0.000
#> SRR772689 2 0.6358 0.40103 0.048 0.580 0.080 0.292 0.000
#> SRR772690 3 0.3109 0.99469 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR772691 5 0.1638 0.90634 0.064 0.000 0.000 0.004 0.932
#> SRR772692 1 0.3030 0.74131 0.868 0.088 0.004 0.040 0.000
#> SRR772693 1 0.3551 0.73633 0.844 0.100 0.004 0.044 0.008
#> SRR772694 2 0.3631 0.67931 0.080 0.840 0.012 0.068 0.000
#> SRR772695 2 0.2957 0.70255 0.060 0.884 0.008 0.044 0.004
#> SRR772696 1 0.5436 0.66732 0.708 0.128 0.016 0.144 0.004
#> SRR772697 1 0.5434 0.67129 0.720 0.116 0.020 0.136 0.008
#> SRR772698 5 0.1195 0.92092 0.012 0.000 0.028 0.000 0.960
#> SRR772699 1 0.2476 0.74661 0.912 0.036 0.004 0.036 0.012
#> SRR772700 1 0.1996 0.74844 0.928 0.036 0.004 0.032 0.000
#> SRR772701 1 0.4391 0.73132 0.788 0.136 0.032 0.044 0.000
#> SRR772702 1 0.3384 0.74900 0.852 0.084 0.008 0.056 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.5784 0.3869 0.548 0.336 0.000 0.072 0.004 0.040
#> SRR772342 2 0.5894 0.1669 0.392 0.496 0.000 0.068 0.008 0.036
#> SRR772343 2 0.2461 0.8278 0.048 0.900 0.000 0.028 0.004 0.020
#> SRR772344 4 0.5969 0.4867 0.296 0.068 0.000 0.572 0.012 0.052
#> SRR772345 4 0.6221 0.3739 0.372 0.060 0.000 0.492 0.012 0.064
#> SRR772346 1 0.4522 0.7903 0.760 0.036 0.000 0.052 0.012 0.140
#> SRR772347 1 0.5351 0.7013 0.692 0.068 0.000 0.072 0.008 0.160
#> SRR772348 2 0.1542 0.8305 0.016 0.944 0.000 0.024 0.000 0.016
#> SRR772349 2 0.1881 0.8315 0.008 0.928 0.000 0.040 0.004 0.020
#> SRR772350 3 0.0806 0.9791 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR772351 4 0.6570 0.5345 0.232 0.164 0.000 0.536 0.008 0.060
#> SRR772352 4 0.6656 0.2828 0.392 0.108 0.000 0.428 0.012 0.060
#> SRR772353 2 0.2395 0.8165 0.020 0.892 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR772354 2 0.2662 0.8181 0.020 0.884 0.000 0.004 0.020 0.072
#> SRR772355 1 0.5752 0.4454 0.600 0.060 0.000 0.280 0.012 0.048
#> SRR772356 4 0.6499 0.5105 0.296 0.148 0.000 0.504 0.008 0.044
#> SRR772357 1 0.5498 -0.0655 0.460 0.452 0.000 0.060 0.000 0.028
#> SRR772358 2 0.4176 0.7153 0.200 0.740 0.000 0.044 0.000 0.016
#> SRR772359 1 0.2415 0.8159 0.900 0.036 0.000 0.040 0.000 0.024
#> SRR772360 1 0.1821 0.8144 0.928 0.024 0.000 0.040 0.000 0.008
#> SRR772361 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772362 4 0.2504 0.5695 0.028 0.088 0.000 0.880 0.000 0.004
#> SRR772363 4 0.2755 0.5711 0.040 0.068 0.000 0.876 0.000 0.016
#> SRR772364 1 0.4914 0.6131 0.648 0.028 0.000 0.036 0.004 0.284
#> SRR772365 1 0.4861 0.6882 0.700 0.028 0.000 0.052 0.008 0.212
#> SRR772366 5 0.1007 0.9498 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772367 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772368 2 0.3798 0.7776 0.116 0.796 0.000 0.076 0.000 0.012
#> SRR772369 1 0.5260 0.6408 0.684 0.140 0.000 0.140 0.004 0.032
#> SRR772370 1 0.5910 0.1227 0.452 0.412 0.000 0.112 0.000 0.024
#> SRR772371 1 0.4775 0.7327 0.724 0.020 0.000 0.052 0.020 0.184
#> SRR772372 1 0.4470 0.7729 0.764 0.016 0.000 0.052 0.028 0.140
#> SRR772373 2 0.3991 0.7249 0.052 0.776 0.000 0.152 0.000 0.020
#> SRR772374 2 0.5973 0.2175 0.124 0.532 0.000 0.316 0.004 0.024
#> SRR772375 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772376 1 0.6693 -0.2251 0.364 0.340 0.000 0.268 0.004 0.024
#> SRR772377 5 0.1007 0.9498 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772378 2 0.1749 0.8276 0.016 0.936 0.000 0.004 0.012 0.032
#> SRR772379 2 0.1346 0.8291 0.024 0.952 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR772380 2 0.1787 0.8304 0.032 0.932 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR772381 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772382 1 0.3735 0.7976 0.828 0.048 0.000 0.048 0.008 0.068
#> SRR772383 1 0.4078 0.7844 0.804 0.060 0.000 0.080 0.008 0.048
#> SRR772384 5 0.1666 0.9457 0.020 0.000 0.036 0.000 0.936 0.008
#> SRR772385 5 0.2720 0.9140 0.056 0.004 0.032 0.004 0.888 0.016
#> SRR772386 1 0.4078 0.7645 0.792 0.032 0.000 0.128 0.012 0.036
#> SRR772387 1 0.3558 0.7939 0.832 0.016 0.000 0.092 0.012 0.048
#> SRR772388 2 0.2599 0.8175 0.048 0.888 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR772389 2 0.4452 0.7441 0.096 0.776 0.000 0.056 0.008 0.064
#> SRR772390 5 0.1075 0.9472 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR772391 2 0.4231 0.7727 0.080 0.792 0.000 0.032 0.012 0.084
#> SRR772392 2 0.6068 0.4706 0.264 0.588 0.000 0.056 0.016 0.076
#> SRR772393 1 0.3639 0.7937 0.828 0.008 0.000 0.072 0.020 0.072
#> SRR772394 1 0.3678 0.7901 0.824 0.008 0.000 0.060 0.020 0.088
#> SRR772395 2 0.2833 0.7990 0.012 0.860 0.000 0.104 0.000 0.024
#> SRR772396 1 0.1843 0.8152 0.932 0.016 0.000 0.032 0.004 0.016
#> SRR772397 1 0.2777 0.8151 0.880 0.044 0.000 0.044 0.000 0.032
#> SRR772398 1 0.2259 0.8104 0.904 0.000 0.000 0.044 0.008 0.044
#> SRR772399 1 0.2281 0.8063 0.908 0.004 0.000 0.028 0.012 0.048
#> SRR772400 1 0.2086 0.8101 0.920 0.008 0.000 0.028 0.008 0.036
#> SRR772401 1 0.1636 0.8116 0.936 0.004 0.000 0.024 0.000 0.036
#> SRR772402 6 0.4593 0.8281 0.120 0.016 0.000 0.136 0.000 0.728
#> SRR772403 6 0.4013 0.8432 0.076 0.016 0.000 0.128 0.000 0.780
#> SRR772404 2 0.2505 0.8220 0.040 0.888 0.000 0.064 0.000 0.008
#> SRR772405 5 0.2251 0.9236 0.052 0.000 0.036 0.000 0.904 0.008
#> SRR772406 1 0.4777 0.7385 0.748 0.044 0.000 0.124 0.012 0.072
#> SRR772407 1 0.5068 0.7045 0.716 0.044 0.000 0.164 0.016 0.060
#> SRR772408 4 0.2703 0.5687 0.016 0.116 0.000 0.860 0.000 0.008
#> SRR772409 4 0.2834 0.5676 0.016 0.128 0.000 0.848 0.000 0.008
#> SRR772410 2 0.2318 0.8263 0.048 0.904 0.000 0.028 0.000 0.020
#> SRR772411 2 0.1737 0.8312 0.040 0.932 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR772412 1 0.4816 0.7573 0.748 0.104 0.000 0.076 0.008 0.064
#> SRR772413 1 0.4687 0.7695 0.760 0.088 0.000 0.076 0.008 0.068
#> SRR772414 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772415 2 0.1974 0.8201 0.012 0.920 0.000 0.048 0.000 0.020
#> SRR772416 2 0.1346 0.8253 0.016 0.952 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR772417 2 0.3603 0.8109 0.084 0.832 0.000 0.048 0.008 0.028
#> SRR772418 5 0.1007 0.9498 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772419 2 0.3626 0.7264 0.016 0.780 0.000 0.184 0.000 0.020
#> SRR772420 2 0.3757 0.7320 0.020 0.776 0.000 0.180 0.000 0.024
#> SRR772421 1 0.3489 0.8081 0.844 0.040 0.000 0.048 0.008 0.060
#> SRR772422 1 0.3719 0.8091 0.828 0.036 0.000 0.064 0.008 0.064
#> SRR772423 6 0.4115 0.8444 0.072 0.016 0.000 0.144 0.000 0.768
#> SRR772424 6 0.4719 0.8070 0.072 0.012 0.000 0.236 0.000 0.680
#> SRR772425 2 0.5196 0.5675 0.096 0.652 0.000 0.232 0.004 0.016
#> SRR772426 4 0.6392 0.5028 0.228 0.080 0.000 0.576 0.012 0.104
#> SRR772427 4 0.5990 0.4964 0.264 0.060 0.000 0.588 0.008 0.080
#> SRR772428 1 0.2683 0.8130 0.888 0.044 0.000 0.020 0.004 0.044
#> SRR772429 1 0.3427 0.7682 0.832 0.104 0.000 0.016 0.004 0.044
#> SRR772430 2 0.2663 0.8255 0.032 0.892 0.000 0.016 0.012 0.048
#> SRR772431 6 0.3966 0.8398 0.072 0.008 0.000 0.148 0.000 0.772
#> SRR772432 6 0.3972 0.8407 0.076 0.016 0.000 0.124 0.000 0.784
#> SRR772433 1 0.2401 0.8138 0.900 0.036 0.000 0.020 0.000 0.044
#> SRR772434 1 0.2103 0.8128 0.916 0.024 0.000 0.020 0.000 0.040
#> SRR772435 1 0.4790 0.7725 0.752 0.088 0.000 0.080 0.008 0.072
#> SRR772436 1 0.5471 0.7064 0.684 0.136 0.000 0.096 0.004 0.080
#> SRR772437 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772438 1 0.3025 0.8072 0.872 0.016 0.000 0.040 0.016 0.056
#> SRR772439 1 0.3366 0.8074 0.852 0.028 0.000 0.044 0.012 0.064
#> SRR772440 1 0.6698 0.0368 0.456 0.272 0.000 0.228 0.004 0.040
#> SRR772441 1 0.4856 0.7331 0.732 0.068 0.000 0.148 0.008 0.044
#> SRR772442 6 0.3930 0.8414 0.064 0.008 0.000 0.156 0.000 0.772
#> SRR772443 6 0.3896 0.8430 0.068 0.012 0.000 0.136 0.000 0.784
#> SRR772444 1 0.2130 0.8123 0.920 0.016 0.000 0.028 0.008 0.028
#> SRR772445 1 0.2478 0.8118 0.900 0.028 0.000 0.024 0.004 0.044
#> SRR772446 2 0.3143 0.8019 0.028 0.860 0.000 0.020 0.012 0.080
#> SRR772447 2 0.3143 0.8029 0.028 0.860 0.000 0.020 0.012 0.080
#> SRR772448 1 0.2918 0.8016 0.868 0.008 0.000 0.084 0.012 0.028
#> SRR772449 1 0.2831 0.8002 0.876 0.008 0.000 0.072 0.012 0.032
#> SRR772450 4 0.2325 0.5578 0.008 0.100 0.000 0.884 0.000 0.008
#> SRR772451 4 0.2612 0.5630 0.016 0.108 0.000 0.868 0.000 0.008
#> SRR772452 2 0.2747 0.8167 0.048 0.884 0.000 0.008 0.012 0.048
#> SRR772453 2 0.2633 0.8197 0.044 0.888 0.000 0.004 0.012 0.052
#> SRR772454 2 0.5849 0.4752 0.244 0.612 0.000 0.076 0.008 0.060
#> SRR772455 2 0.2466 0.8300 0.052 0.896 0.000 0.028 0.000 0.024
#> SRR772456 4 0.4323 0.3451 0.004 0.376 0.000 0.600 0.000 0.020
#> SRR772457 4 0.4676 0.2007 0.020 0.412 0.000 0.552 0.000 0.016
#> SRR772458 1 0.4315 0.7808 0.788 0.080 0.000 0.064 0.008 0.060
#> SRR772459 1 0.4178 0.7797 0.796 0.084 0.000 0.068 0.008 0.044
#> SRR772460 4 0.3730 0.5790 0.100 0.060 0.000 0.812 0.000 0.028
#> SRR772461 4 0.3648 0.5829 0.084 0.068 0.000 0.820 0.000 0.028
#> SRR772462 2 0.2844 0.8048 0.004 0.864 0.000 0.092 0.004 0.036
#> SRR772463 2 0.2303 0.8197 0.020 0.904 0.000 0.052 0.000 0.024
#> SRR772464 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772465 2 0.3296 0.8178 0.056 0.856 0.000 0.040 0.008 0.040
#> SRR772466 2 0.2857 0.8242 0.052 0.880 0.000 0.020 0.008 0.040
#> SRR772467 4 0.4500 -0.0481 0.012 0.484 0.000 0.492 0.000 0.012
#> SRR772468 2 0.4574 0.1129 0.016 0.508 0.000 0.464 0.000 0.012
#> SRR772469 2 0.3276 0.8137 0.052 0.856 0.000 0.020 0.012 0.060
#> SRR772470 2 0.2937 0.8160 0.052 0.872 0.000 0.008 0.012 0.056
#> SRR772471 2 0.2693 0.8255 0.048 0.888 0.000 0.024 0.004 0.036
#> SRR772472 2 0.2369 0.8216 0.032 0.904 0.000 0.008 0.008 0.048
#> SRR772473 6 0.4264 0.8484 0.088 0.012 0.000 0.148 0.000 0.752
#> SRR772474 6 0.4905 0.7923 0.140 0.008 0.000 0.172 0.000 0.680
#> SRR772475 5 0.2909 0.8960 0.068 0.004 0.028 0.004 0.876 0.020
#> SRR772476 4 0.3048 0.5752 0.044 0.072 0.000 0.860 0.000 0.024
#> SRR772477 4 0.3156 0.5836 0.056 0.072 0.000 0.852 0.000 0.020
#> SRR772478 2 0.3822 0.7882 0.096 0.808 0.000 0.012 0.008 0.076
#> SRR772479 2 0.2901 0.8085 0.036 0.868 0.000 0.004 0.012 0.080
#> SRR772480 6 0.3826 0.7893 0.124 0.004 0.000 0.088 0.000 0.784
#> SRR772481 6 0.4036 0.8030 0.120 0.008 0.000 0.100 0.000 0.772
#> SRR772482 1 0.1623 0.8135 0.940 0.004 0.000 0.020 0.004 0.032
#> SRR772483 1 0.1659 0.8157 0.940 0.004 0.000 0.020 0.008 0.028
#> SRR772484 2 0.2307 0.8236 0.004 0.904 0.000 0.020 0.012 0.060
#> SRR772485 2 0.2618 0.8243 0.004 0.888 0.000 0.036 0.012 0.060
#> SRR772486 1 0.1515 0.8127 0.944 0.000 0.000 0.028 0.008 0.020
#> SRR772487 1 0.2351 0.8129 0.908 0.008 0.000 0.028 0.016 0.040
#> SRR772488 2 0.2770 0.8271 0.012 0.884 0.000 0.036 0.012 0.056
#> SRR772489 2 0.2832 0.8261 0.016 0.880 0.000 0.040 0.008 0.056
#> SRR772490 1 0.2302 0.8178 0.908 0.008 0.000 0.032 0.008 0.044
#> SRR772491 1 0.2567 0.8131 0.896 0.028 0.000 0.036 0.004 0.036
#> SRR772492 4 0.2456 0.5277 0.008 0.076 0.000 0.888 0.000 0.028
#> SRR772493 4 0.2577 0.5293 0.012 0.072 0.000 0.884 0.000 0.032
#> SRR772494 4 0.2418 0.5450 0.008 0.092 0.000 0.884 0.000 0.016
#> SRR772495 4 0.2467 0.5547 0.016 0.088 0.000 0.884 0.000 0.012
#> SRR772496 2 0.3465 0.7801 0.044 0.820 0.000 0.120 0.000 0.016
#> SRR772497 2 0.2973 0.8109 0.040 0.860 0.000 0.084 0.000 0.016
#> SRR772498 1 0.3847 0.7847 0.812 0.008 0.000 0.088 0.020 0.072
#> SRR772499 1 0.4033 0.7791 0.800 0.008 0.000 0.088 0.024 0.080
#> SRR772500 4 0.6005 0.5893 0.168 0.168 0.000 0.612 0.008 0.044
#> SRR772501 4 0.6259 0.5696 0.172 0.132 0.000 0.608 0.012 0.076
#> SRR772502 1 0.2430 0.8160 0.900 0.012 0.000 0.036 0.004 0.048
#> SRR772503 1 0.2295 0.8157 0.908 0.004 0.000 0.040 0.012 0.036
#> SRR772504 1 0.4243 0.7515 0.776 0.024 0.000 0.144 0.016 0.040
#> SRR772505 1 0.3939 0.7499 0.784 0.016 0.000 0.160 0.016 0.024
#> SRR772506 2 0.3093 0.7995 0.024 0.848 0.000 0.104 0.000 0.024
#> SRR772507 2 0.3395 0.7745 0.020 0.820 0.000 0.132 0.000 0.028
#> SRR772508 2 0.2889 0.7922 0.012 0.852 0.000 0.116 0.000 0.020
#> SRR772509 5 0.1749 0.9436 0.024 0.000 0.036 0.000 0.932 0.008
#> SRR772510 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772511 1 0.2971 0.8084 0.868 0.036 0.000 0.072 0.004 0.020
#> SRR772512 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772513 2 0.1924 0.8274 0.012 0.928 0.000 0.028 0.004 0.028
#> SRR772514 2 0.2115 0.8334 0.020 0.916 0.000 0.032 0.000 0.032
#> SRR772515 4 0.6899 0.4927 0.232 0.160 0.000 0.512 0.012 0.084
#> SRR772516 4 0.6459 0.4502 0.148 0.356 0.000 0.456 0.008 0.032
#> SRR772517 4 0.7146 0.4689 0.204 0.288 0.000 0.432 0.016 0.060
#> SRR772518 2 0.4059 0.7410 0.036 0.784 0.000 0.128 0.000 0.052
#> SRR772519 2 0.2400 0.8174 0.016 0.896 0.000 0.064 0.000 0.024
#> SRR772520 2 0.3757 0.7261 0.024 0.776 0.000 0.180 0.000 0.020
#> SRR772521 1 0.5052 0.6440 0.648 0.020 0.000 0.044 0.012 0.276
#> SRR772522 1 0.4493 0.7760 0.756 0.028 0.000 0.044 0.016 0.156
#> SRR772523 6 0.6836 0.2987 0.180 0.040 0.000 0.368 0.012 0.400
#> SRR772524 4 0.6835 0.3452 0.332 0.072 0.000 0.460 0.012 0.124
#> SRR772525 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772526 2 0.4246 0.4781 0.012 0.636 0.000 0.340 0.000 0.012
#> SRR772527 2 0.4546 0.4267 0.020 0.608 0.000 0.356 0.000 0.016
#> SRR772528 5 0.1007 0.9498 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772529 1 0.1570 0.8145 0.944 0.008 0.000 0.016 0.004 0.028
#> SRR772530 1 0.1515 0.8170 0.944 0.008 0.000 0.028 0.000 0.020
#> SRR772531 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772532 4 0.6235 0.4714 0.340 0.100 0.000 0.508 0.008 0.044
#> SRR772533 4 0.6088 0.5863 0.176 0.176 0.000 0.600 0.012 0.036
#> SRR772534 1 0.6225 0.1192 0.444 0.404 0.000 0.116 0.008 0.028
#> SRR772535 4 0.6501 0.4564 0.352 0.112 0.000 0.476 0.012 0.048
#> SRR772536 4 0.6396 0.3338 0.388 0.104 0.000 0.452 0.008 0.048
#> SRR772537 6 0.6208 0.4250 0.172 0.020 0.000 0.384 0.000 0.424
#> SRR772538 4 0.5769 -0.0169 0.112 0.028 0.000 0.556 0.000 0.304
#> SRR772539 2 0.5338 0.3563 0.356 0.568 0.000 0.028 0.008 0.040
#> SRR772540 1 0.2918 0.8125 0.868 0.064 0.000 0.048 0.000 0.020
#> SRR772541 2 0.2545 0.8273 0.020 0.900 0.000 0.032 0.012 0.036
#> SRR772542 1 0.1623 0.8129 0.940 0.004 0.000 0.020 0.004 0.032
#> SRR772543 1 0.2333 0.8160 0.912 0.016 0.000 0.024 0.020 0.028
#> SRR772544 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772545 2 0.6179 0.3015 0.336 0.528 0.000 0.064 0.016 0.056
#> SRR772546 2 0.6335 0.3934 0.280 0.552 0.000 0.084 0.012 0.072
#> SRR772547 2 0.2714 0.8301 0.056 0.888 0.000 0.016 0.012 0.028
#> SRR772548 2 0.2938 0.8220 0.052 0.876 0.000 0.016 0.012 0.044
#> SRR772549 2 0.2595 0.8182 0.044 0.888 0.000 0.004 0.008 0.056
#> SRR772550 2 0.2386 0.8131 0.028 0.896 0.000 0.000 0.012 0.064
#> SRR772551 2 0.6272 0.3641 0.212 0.564 0.000 0.180 0.012 0.032
#> SRR772552 2 0.1995 0.8315 0.036 0.924 0.000 0.012 0.004 0.024
#> SRR772553 5 0.2545 0.9123 0.060 0.004 0.032 0.000 0.892 0.012
#> SRR772554 4 0.6310 0.5567 0.188 0.204 0.000 0.560 0.008 0.040
#> SRR772555 4 0.6156 0.5528 0.184 0.228 0.000 0.556 0.008 0.024
#> SRR772556 1 0.4211 0.7902 0.792 0.072 0.000 0.072 0.004 0.060
#> SRR772557 1 0.3576 0.7995 0.836 0.052 0.000 0.052 0.004 0.056
#> SRR772558 2 0.2565 0.8174 0.040 0.892 0.000 0.004 0.012 0.052
#> SRR772559 2 0.2287 0.8223 0.036 0.904 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR772560 2 0.2258 0.8295 0.040 0.912 0.000 0.028 0.008 0.012
#> SRR772561 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772562 2 0.2752 0.7968 0.012 0.864 0.000 0.104 0.000 0.020
#> SRR772563 2 0.2698 0.7981 0.020 0.872 0.000 0.092 0.000 0.016
#> SRR772564 1 0.3318 0.7953 0.856 0.004 0.004 0.032 0.048 0.056
#> SRR772565 1 0.2420 0.8111 0.900 0.008 0.000 0.028 0.008 0.056
#> SRR772566 1 0.1844 0.8117 0.928 0.000 0.000 0.016 0.016 0.040
#> SRR772567 1 0.1932 0.8122 0.924 0.000 0.000 0.020 0.016 0.040
#> SRR772568 1 0.6187 0.1194 0.512 0.124 0.000 0.324 0.004 0.036
#> SRR772569 1 0.5017 0.5833 0.672 0.060 0.000 0.236 0.004 0.028
#> SRR772570 2 0.4060 0.7609 0.136 0.788 0.000 0.032 0.008 0.036
#> SRR772571 2 0.5667 0.5446 0.228 0.636 0.000 0.064 0.008 0.064
#> SRR772572 2 0.3234 0.8142 0.056 0.860 0.000 0.024 0.012 0.048
#> SRR772573 2 0.3069 0.8156 0.056 0.868 0.000 0.024 0.008 0.044
#> SRR772574 1 0.3165 0.8098 0.860 0.036 0.000 0.064 0.004 0.036
#> SRR772575 1 0.3608 0.8021 0.832 0.068 0.000 0.060 0.004 0.036
#> SRR772576 1 0.5367 0.7061 0.700 0.072 0.000 0.124 0.008 0.096
#> SRR772577 1 0.4690 0.7473 0.756 0.052 0.000 0.128 0.016 0.048
#> SRR772578 1 0.5053 0.2621 0.564 0.008 0.000 0.372 0.004 0.052
#> SRR772579 1 0.5120 0.2780 0.568 0.024 0.000 0.372 0.008 0.028
#> SRR772580 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772581 1 0.5118 0.6162 0.628 0.024 0.000 0.052 0.004 0.292
#> SRR772582 1 0.5729 0.5420 0.576 0.028 0.000 0.084 0.008 0.304
#> SRR772583 2 0.1901 0.8272 0.012 0.924 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR772584 2 0.3553 0.8185 0.032 0.840 0.000 0.072 0.012 0.044
#> SRR772585 2 0.2445 0.8175 0.004 0.896 0.000 0.060 0.008 0.032
#> SRR772586 5 0.1007 0.9498 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772587 1 0.4571 0.6507 0.736 0.184 0.000 0.040 0.012 0.028
#> SRR772588 2 0.3026 0.8025 0.024 0.856 0.000 0.092 0.000 0.028
#> SRR772589 2 0.2976 0.7934 0.020 0.852 0.000 0.108 0.000 0.020
#> SRR772590 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772591 1 0.4599 0.7563 0.760 0.116 0.000 0.072 0.008 0.044
#> SRR772592 1 0.4894 0.7340 0.736 0.124 0.000 0.084 0.008 0.048
#> SRR772593 5 0.1007 0.9498 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772594 4 0.5339 0.5635 0.188 0.076 0.000 0.680 0.008 0.048
#> SRR772595 4 0.4715 0.5844 0.140 0.084 0.000 0.740 0.008 0.028
#> SRR772596 5 0.1075 0.9472 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR772597 3 0.0260 0.9907 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR772598 1 0.2814 0.8007 0.888 0.008 0.004 0.024 0.036 0.040
#> SRR772599 1 0.3246 0.7975 0.864 0.008 0.004 0.036 0.044 0.044
#> SRR772600 6 0.4009 0.8330 0.076 0.024 0.000 0.112 0.000 0.788
#> SRR772601 6 0.4718 0.8127 0.088 0.008 0.000 0.220 0.000 0.684
#> SRR772602 3 0.0146 0.9954 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR772603 6 0.4231 0.8471 0.084 0.016 0.000 0.140 0.000 0.760
#> SRR772604 6 0.3960 0.8417 0.072 0.016 0.000 0.128 0.000 0.784
#> SRR772605 2 0.1642 0.8293 0.028 0.936 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR772606 1 0.2358 0.8071 0.908 0.012 0.000 0.020 0.016 0.044
#> SRR772607 1 0.1844 0.8117 0.932 0.012 0.000 0.028 0.004 0.024
#> SRR772608 2 0.1741 0.8271 0.008 0.936 0.000 0.008 0.012 0.036
#> SRR772609 2 0.1823 0.8307 0.012 0.932 0.000 0.016 0.004 0.036
#> SRR772610 2 0.1755 0.8297 0.028 0.932 0.000 0.008 0.000 0.032
#> SRR772611 2 0.2196 0.8195 0.016 0.908 0.000 0.056 0.000 0.020
#> SRR772612 6 0.4429 0.8400 0.080 0.016 0.000 0.168 0.000 0.736
#> SRR772613 6 0.4598 0.8207 0.080 0.008 0.000 0.216 0.000 0.696
#> SRR772614 1 0.3057 0.8054 0.868 0.036 0.000 0.044 0.004 0.048
#> SRR772615 1 0.2451 0.8142 0.904 0.008 0.000 0.036 0.024 0.028
#> SRR772616 2 0.2307 0.8272 0.044 0.908 0.000 0.016 0.004 0.028
#> SRR772617 6 0.5887 0.6266 0.136 0.020 0.000 0.324 0.000 0.520
#> SRR772618 6 0.6106 0.4489 0.152 0.020 0.000 0.396 0.000 0.432
#> SRR772619 4 0.2772 0.5214 0.020 0.068 0.000 0.876 0.000 0.036
#> SRR772620 4 0.2669 0.5300 0.016 0.072 0.000 0.880 0.000 0.032
#> SRR772621 1 0.3543 0.7968 0.832 0.040 0.000 0.096 0.008 0.024
#> SRR772622 1 0.4962 0.7195 0.732 0.088 0.000 0.120 0.008 0.052
#> SRR772623 3 0.0806 0.9791 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR772624 5 0.0937 0.9492 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR772625 5 0.5104 0.6954 0.152 0.020 0.024 0.052 0.732 0.020
#> SRR772626 1 0.4306 0.7711 0.780 0.008 0.000 0.092 0.028 0.092
#> SRR772627 1 0.4331 0.7703 0.780 0.008 0.000 0.088 0.032 0.092
#> SRR772628 1 0.4662 0.7116 0.732 0.160 0.000 0.080 0.004 0.024
#> SRR772629 1 0.4632 0.7712 0.764 0.076 0.000 0.064 0.008 0.088
#> SRR772630 2 0.4653 0.7322 0.108 0.752 0.000 0.100 0.008 0.032
#> SRR772631 5 0.1007 0.9498 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772632 4 0.5803 0.5915 0.180 0.132 0.000 0.636 0.008 0.044
#> SRR772633 4 0.5460 0.5963 0.152 0.160 0.000 0.656 0.004 0.028
#> SRR772634 1 0.2587 0.8102 0.896 0.016 0.000 0.048 0.012 0.028
#> SRR772635 1 0.2664 0.8115 0.888 0.020 0.000 0.056 0.004 0.032
#> SRR772636 5 0.2688 0.9122 0.060 0.004 0.032 0.004 0.888 0.012
#> SRR772637 2 0.2422 0.8189 0.040 0.896 0.000 0.000 0.012 0.052
#> SRR772638 2 0.2422 0.8182 0.040 0.896 0.000 0.000 0.012 0.052
#> SRR772639 2 0.4995 0.5141 0.052 0.648 0.000 0.276 0.008 0.016
#> SRR772640 4 0.2218 0.5607 0.012 0.104 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR772641 4 0.2263 0.5623 0.016 0.100 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR772642 1 0.2375 0.8117 0.896 0.016 0.000 0.068 0.000 0.020
#> SRR772643 1 0.2507 0.8142 0.892 0.028 0.000 0.060 0.000 0.020
#> SRR772644 2 0.5142 0.4821 0.324 0.600 0.000 0.056 0.004 0.016
#> SRR772645 2 0.4159 0.6881 0.216 0.732 0.000 0.036 0.000 0.016
#> SRR772646 4 0.6104 0.3632 0.404 0.092 0.000 0.460 0.004 0.040
#> SRR772647 4 0.6427 0.5098 0.296 0.152 0.000 0.504 0.004 0.044
#> SRR772648 1 0.5567 0.6830 0.676 0.064 0.000 0.148 0.008 0.104
#> SRR772649 1 0.4334 0.7776 0.784 0.044 0.000 0.088 0.008 0.076
#> SRR772650 1 0.4896 0.6142 0.684 0.228 0.000 0.060 0.004 0.024
#> SRR772651 1 0.5024 0.5511 0.652 0.260 0.000 0.068 0.004 0.016
#> SRR772652 1 0.2384 0.8134 0.904 0.032 0.000 0.016 0.004 0.044
#> SRR772653 1 0.2627 0.8109 0.892 0.036 0.000 0.024 0.004 0.044
#> SRR772654 1 0.3640 0.7895 0.816 0.048 0.000 0.108 0.000 0.028
#> SRR772655 1 0.3327 0.8015 0.844 0.044 0.000 0.076 0.000 0.036
#> SRR772656 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772657 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772658 4 0.5513 0.2953 0.124 0.032 0.000 0.632 0.000 0.212
#> SRR772659 6 0.5880 0.5415 0.112 0.024 0.000 0.380 0.000 0.484
#> SRR772660 2 0.2422 0.8275 0.052 0.896 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR772661 5 0.1010 0.9495 0.004 0.000 0.036 0.000 0.960 0.000
#> SRR772662 1 0.3043 0.8057 0.860 0.056 0.000 0.064 0.000 0.020
#> SRR772663 1 0.5440 0.3294 0.540 0.364 0.000 0.076 0.000 0.020
#> SRR772664 2 0.1518 0.8290 0.024 0.944 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR772665 2 0.1396 0.8275 0.024 0.952 0.000 0.012 0.004 0.008
#> SRR772666 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772667 2 0.4155 0.5495 0.012 0.660 0.000 0.316 0.000 0.012
#> SRR772668 4 0.6646 0.3763 0.308 0.048 0.000 0.488 0.012 0.144
#> SRR772669 4 0.3666 0.5076 0.060 0.048 0.000 0.824 0.000 0.068
#> SRR772670 2 0.1623 0.8302 0.032 0.940 0.000 0.020 0.004 0.004
#> SRR772671 2 0.2121 0.8262 0.032 0.916 0.000 0.004 0.008 0.040
#> SRR772672 2 0.3634 0.7680 0.044 0.808 0.000 0.128 0.000 0.020
#> SRR772673 2 0.2818 0.8124 0.028 0.872 0.000 0.076 0.000 0.024
#> SRR772674 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772675 5 0.1268 0.9491 0.008 0.000 0.036 0.000 0.952 0.004
#> SRR772676 1 0.5484 0.6997 0.684 0.088 0.000 0.092 0.004 0.132
#> SRR772677 1 0.5145 0.7118 0.700 0.040 0.000 0.080 0.008 0.172
#> SRR772678 5 0.1464 0.9479 0.016 0.000 0.036 0.000 0.944 0.004
#> SRR772679 2 0.4534 0.7376 0.144 0.756 0.000 0.044 0.008 0.048
#> SRR772680 2 0.5358 0.4661 0.316 0.596 0.000 0.036 0.004 0.048
#> SRR772681 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772682 2 0.3078 0.7952 0.032 0.848 0.000 0.104 0.000 0.016
#> SRR772683 2 0.3943 0.7331 0.040 0.772 0.000 0.168 0.000 0.020
#> SRR772685 1 0.2954 0.8048 0.872 0.020 0.000 0.068 0.008 0.032
#> SRR772686 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772687 5 0.3251 0.8771 0.028 0.000 0.092 0.000 0.844 0.036
#> SRR772688 2 0.4640 0.1357 0.016 0.524 0.000 0.444 0.000 0.016
#> SRR772689 4 0.3254 0.5406 0.016 0.172 0.000 0.804 0.000 0.008
#> SRR772690 3 0.0000 0.9978 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR772691 5 0.2222 0.9308 0.040 0.004 0.032 0.000 0.912 0.012
#> SRR772692 1 0.2058 0.8119 0.916 0.012 0.000 0.048 0.000 0.024
#> SRR772693 1 0.2658 0.8093 0.888 0.016 0.000 0.052 0.004 0.040
#> SRR772694 2 0.6120 0.2328 0.132 0.532 0.000 0.300 0.004 0.032
#> SRR772695 2 0.5799 0.4944 0.140 0.616 0.000 0.208 0.008 0.028
#> SRR772696 1 0.3712 0.7892 0.820 0.008 0.000 0.072 0.016 0.084
#> SRR772697 1 0.3715 0.7876 0.824 0.008 0.000 0.080 0.024 0.064
#> SRR772698 5 0.1007 0.9498 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR772699 1 0.2168 0.8154 0.916 0.016 0.000 0.028 0.004 0.036
#> SRR772700 1 0.2207 0.8148 0.916 0.016 0.000 0.028 0.008 0.032
#> SRR772701 1 0.3726 0.7918 0.824 0.056 0.000 0.076 0.004 0.040
#> SRR772702 1 0.2884 0.8079 0.880 0.028 0.000 0.048 0.008 0.036
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 523 rows and 361 columns.
#> Top rows (52, 104, 157, 210, 262) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.501 0.787 0.899 0.3709 0.663 0.663
#> 3 3 0.221 0.344 0.643 0.5818 0.710 0.585
#> 4 4 0.357 0.598 0.747 0.1871 0.711 0.435
#> 5 5 0.399 0.429 0.637 0.1083 0.865 0.578
#> 6 6 0.460 0.363 0.570 0.0485 0.858 0.466
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR772341 2 0.0938 0.897586 0.012 0.988
#> SRR772342 2 0.1633 0.896009 0.024 0.976
#> SRR772343 2 0.6343 0.799387 0.160 0.840
#> SRR772344 2 0.1414 0.896219 0.020 0.980
#> SRR772345 2 0.1184 0.894563 0.016 0.984
#> SRR772346 2 0.3114 0.882799 0.056 0.944
#> SRR772347 2 0.2948 0.883119 0.052 0.948
#> SRR772348 2 0.3584 0.880570 0.068 0.932
#> SRR772349 2 0.2948 0.887809 0.052 0.948
#> SRR772350 1 0.4690 0.820531 0.900 0.100
#> SRR772351 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772352 2 0.1414 0.898295 0.020 0.980
#> SRR772353 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772354 2 0.0938 0.896297 0.012 0.988
#> SRR772355 2 0.1414 0.896421 0.020 0.980
#> SRR772356 2 0.0376 0.896157 0.004 0.996
#> SRR772357 2 0.8327 0.628248 0.264 0.736
#> SRR772358 2 0.9954 0.052836 0.460 0.540
#> SRR772359 2 0.3431 0.882833 0.064 0.936
#> SRR772360 2 0.1414 0.897304 0.020 0.980
#> SRR772361 1 0.0000 0.834431 1.000 0.000
#> SRR772362 2 0.5946 0.810328 0.144 0.856
#> SRR772363 2 0.6887 0.771470 0.184 0.816
#> SRR772364 2 0.3274 0.872397 0.060 0.940
#> SRR772365 2 0.4562 0.856520 0.096 0.904
#> SRR772366 1 0.7056 0.769152 0.808 0.192
#> SRR772367 1 0.0938 0.839716 0.988 0.012
#> SRR772368 1 0.8081 0.712976 0.752 0.248
#> SRR772369 2 0.3114 0.887870 0.056 0.944
#> SRR772370 2 0.1184 0.897082 0.016 0.984
#> SRR772371 2 0.9580 0.352937 0.380 0.620
#> SRR772372 1 0.9896 0.304876 0.560 0.440
#> SRR772373 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772374 2 0.1184 0.896667 0.016 0.984
#> SRR772375 1 0.0672 0.838487 0.992 0.008
#> SRR772376 2 0.9998 -0.095340 0.492 0.508
#> SRR772377 1 0.1414 0.840336 0.980 0.020
#> SRR772378 2 0.1843 0.895930 0.028 0.972
#> SRR772379 2 0.3274 0.886135 0.060 0.940
#> SRR772380 2 0.5178 0.846272 0.116 0.884
#> SRR772381 1 0.0000 0.834431 1.000 0.000
#> SRR772382 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772383 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772384 1 0.6438 0.791985 0.836 0.164
#> SRR772385 1 0.2043 0.841131 0.968 0.032
#> SRR772386 2 0.2043 0.891697 0.032 0.968
#> SRR772387 2 0.5519 0.814482 0.128 0.872
#> SRR772388 2 0.3431 0.880643 0.064 0.936
#> SRR772389 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772390 1 0.2236 0.842170 0.964 0.036
#> SRR772391 2 0.0672 0.896140 0.008 0.992
#> SRR772392 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772393 2 1.0000 -0.105909 0.500 0.500
#> SRR772394 1 0.9358 0.541014 0.648 0.352
#> SRR772395 2 0.2603 0.891060 0.044 0.956
#> SRR772396 2 0.9580 0.314252 0.380 0.620
#> SRR772397 2 0.2948 0.882324 0.052 0.948
#> SRR772398 2 0.7528 0.695456 0.216 0.784
#> SRR772399 2 0.9710 0.213526 0.400 0.600
#> SRR772400 2 0.9954 0.000337 0.460 0.540
#> SRR772401 2 0.9129 0.460862 0.328 0.672
#> SRR772402 2 0.5294 0.818242 0.120 0.880
#> SRR772403 2 0.4022 0.854831 0.080 0.920
#> SRR772404 2 0.9833 0.210087 0.424 0.576
#> SRR772405 1 0.6801 0.779377 0.820 0.180
#> SRR772406 2 0.0938 0.896790 0.012 0.988
#> SRR772407 2 0.2043 0.893190 0.032 0.968
#> SRR772408 2 0.1414 0.896200 0.020 0.980
#> SRR772409 2 0.2236 0.893792 0.036 0.964
#> SRR772410 2 0.1184 0.896362 0.016 0.984
#> SRR772411 2 0.1184 0.896248 0.016 0.984
#> SRR772412 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772413 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772414 1 0.0938 0.838075 0.988 0.012
#> SRR772415 2 0.1184 0.896436 0.016 0.984
#> SRR772416 2 0.1184 0.896362 0.016 0.984
#> SRR772417 2 0.1843 0.895687 0.028 0.972
#> SRR772418 1 0.3879 0.838181 0.924 0.076
#> SRR772419 2 0.2423 0.891810 0.040 0.960
#> SRR772420 2 0.3114 0.885558 0.056 0.944
#> SRR772421 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772422 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772423 2 0.3274 0.870136 0.060 0.940
#> SRR772424 2 0.6623 0.752957 0.172 0.828
#> SRR772425 2 0.2423 0.893805 0.040 0.960
#> SRR772426 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772427 2 0.0938 0.896633 0.012 0.988
#> SRR772428 2 0.9775 0.161778 0.412 0.588
#> SRR772429 2 0.5178 0.836825 0.116 0.884
#> SRR772430 2 0.5519 0.831559 0.128 0.872
#> SRR772431 2 0.1843 0.890056 0.028 0.972
#> SRR772432 2 0.0672 0.894734 0.008 0.992
#> SRR772433 2 0.8813 0.511002 0.300 0.700
#> SRR772434 1 0.9998 0.228649 0.508 0.492
#> SRR772435 2 0.1633 0.895101 0.024 0.976
#> SRR772436 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772437 1 0.0938 0.834878 0.988 0.012
#> SRR772438 2 0.5842 0.800432 0.140 0.860
#> SRR772439 2 0.2603 0.888385 0.044 0.956
#> SRR772440 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772441 2 0.0672 0.897601 0.008 0.992
#> SRR772442 2 0.2236 0.885612 0.036 0.964
#> SRR772443 2 0.0672 0.894734 0.008 0.992
#> SRR772444 2 0.3584 0.870795 0.068 0.932
#> SRR772445 2 0.0672 0.896391 0.008 0.992
#> SRR772446 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772447 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772448 2 0.8327 0.611900 0.264 0.736
#> SRR772449 2 0.3274 0.882445 0.060 0.940
#> SRR772450 2 0.2423 0.891962 0.040 0.960
#> SRR772451 2 0.3584 0.879320 0.068 0.932
#> SRR772452 2 0.0938 0.897747 0.012 0.988
#> SRR772453 2 0.1633 0.896714 0.024 0.976
#> SRR772454 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772455 2 0.2043 0.894507 0.032 0.968
#> SRR772456 2 0.1843 0.895161 0.028 0.972
#> SRR772457 2 0.2603 0.891026 0.044 0.956
#> SRR772458 2 0.0672 0.896961 0.008 0.992
#> SRR772459 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772460 2 0.9909 0.212430 0.444 0.556
#> SRR772461 2 0.9922 0.198453 0.448 0.552
#> SRR772462 2 0.2778 0.889958 0.048 0.952
#> SRR772463 2 0.2236 0.893312 0.036 0.964
#> SRR772464 1 0.0672 0.837940 0.992 0.008
#> SRR772465 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772466 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772467 2 0.5178 0.842373 0.116 0.884
#> SRR772468 2 0.5408 0.834583 0.124 0.876
#> SRR772469 2 0.0938 0.896497 0.012 0.988
#> SRR772470 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772471 2 0.4815 0.856908 0.104 0.896
#> SRR772472 2 0.1633 0.895561 0.024 0.976
#> SRR772473 2 0.2043 0.887415 0.032 0.968
#> SRR772474 2 0.3879 0.860137 0.076 0.924
#> SRR772475 1 0.3431 0.840392 0.936 0.064
#> SRR772476 2 0.3584 0.877627 0.068 0.932
#> SRR772477 2 0.8909 0.557787 0.308 0.692
#> SRR772478 2 0.4298 0.864963 0.088 0.912
#> SRR772479 2 0.1633 0.897025 0.024 0.976
#> SRR772480 2 0.5178 0.820653 0.116 0.884
#> SRR772481 2 0.2236 0.886946 0.036 0.964
#> SRR772482 1 0.9427 0.558487 0.640 0.360
#> SRR772483 1 0.9686 0.480971 0.604 0.396
#> SRR772484 2 0.0938 0.897172 0.012 0.988
#> SRR772485 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772486 2 1.0000 -0.197428 0.496 0.504
#> SRR772487 2 0.9552 0.317296 0.376 0.624
#> SRR772488 2 0.1414 0.896478 0.020 0.980
#> SRR772489 2 0.1414 0.896102 0.020 0.980
#> SRR772490 2 0.1843 0.894736 0.028 0.972
#> SRR772491 2 0.3274 0.875649 0.060 0.940
#> SRR772492 2 0.5294 0.831557 0.120 0.880
#> SRR772493 2 0.3584 0.875563 0.068 0.932
#> SRR772494 2 0.4298 0.868300 0.088 0.912
#> SRR772495 2 0.5408 0.834512 0.124 0.876
#> SRR772496 2 0.2948 0.887432 0.052 0.948
#> SRR772497 2 0.6801 0.777228 0.180 0.820
#> SRR772498 1 0.2948 0.841839 0.948 0.052
#> SRR772499 1 0.2043 0.840259 0.968 0.032
#> SRR772500 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772501 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772502 2 0.3584 0.881249 0.068 0.932
#> SRR772503 2 0.3274 0.885267 0.060 0.940
#> SRR772504 2 0.7602 0.692356 0.220 0.780
#> SRR772505 2 0.8016 0.675918 0.244 0.756
#> SRR772506 2 0.2603 0.890582 0.044 0.956
#> SRR772507 2 0.2236 0.893007 0.036 0.964
#> SRR772508 2 0.9248 0.465623 0.340 0.660
#> SRR772509 1 0.4690 0.829633 0.900 0.100
#> SRR772510 1 0.0376 0.836793 0.996 0.004
#> SRR772511 2 0.7528 0.716970 0.216 0.784
#> SRR772512 1 0.0376 0.834033 0.996 0.004
#> SRR772513 2 0.4022 0.874013 0.080 0.920
#> SRR772514 2 0.1184 0.896436 0.016 0.984
#> SRR772515 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772516 2 0.1184 0.896813 0.016 0.984
#> SRR772517 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772518 2 0.0938 0.897446 0.012 0.988
#> SRR772519 2 0.2603 0.890515 0.044 0.956
#> SRR772520 2 0.2043 0.894074 0.032 0.968
#> SRR772521 2 0.4690 0.836918 0.100 0.900
#> SRR772522 2 0.4562 0.841366 0.096 0.904
#> SRR772523 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772524 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772525 1 0.1414 0.841229 0.980 0.020
#> SRR772526 2 0.6531 0.784111 0.168 0.832
#> SRR772527 2 0.7453 0.724747 0.212 0.788
#> SRR772528 1 0.4690 0.829958 0.900 0.100
#> SRR772529 2 0.5408 0.818917 0.124 0.876
#> SRR772530 2 0.4690 0.849222 0.100 0.900
#> SRR772531 1 0.0672 0.837940 0.992 0.008
#> SRR772532 2 0.0376 0.896157 0.004 0.996
#> SRR772533 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772534 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772535 2 0.1414 0.893854 0.020 0.980
#> SRR772536 2 0.1633 0.897808 0.024 0.976
#> SRR772537 2 0.7219 0.714097 0.200 0.800
#> SRR772538 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772539 2 0.2043 0.895719 0.032 0.968
#> SRR772540 1 0.9909 0.349152 0.556 0.444
#> SRR772541 2 0.9732 0.272829 0.404 0.596
#> SRR772542 1 0.9795 0.422826 0.584 0.416
#> SRR772543 2 0.9393 0.410714 0.356 0.644
#> SRR772544 1 0.0938 0.838075 0.988 0.012
#> SRR772545 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772546 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772547 2 0.8144 0.650823 0.252 0.748
#> SRR772548 2 0.1414 0.898138 0.020 0.980
#> SRR772549 2 0.5842 0.815634 0.140 0.860
#> SRR772550 2 0.1633 0.896621 0.024 0.976
#> SRR772551 2 0.0376 0.896809 0.004 0.996
#> SRR772552 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772553 1 0.3274 0.840969 0.940 0.060
#> SRR772554 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772555 2 0.0376 0.896157 0.004 0.996
#> SRR772556 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772557 2 0.0672 0.896950 0.008 0.992
#> SRR772558 2 0.1633 0.897068 0.024 0.976
#> SRR772559 2 0.1633 0.895561 0.024 0.976
#> SRR772560 2 0.8016 0.676663 0.244 0.756
#> SRR772561 1 0.0938 0.834878 0.988 0.012
#> SRR772562 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772563 2 0.1184 0.896667 0.016 0.984
#> SRR772564 1 0.9866 0.405370 0.568 0.432
#> SRR772565 2 0.9427 0.353130 0.360 0.640
#> SRR772566 2 0.5737 0.801498 0.136 0.864
#> SRR772567 2 0.5519 0.829011 0.128 0.872
#> SRR772568 2 0.0376 0.896157 0.004 0.996
#> SRR772569 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772570 2 0.0376 0.895919 0.004 0.996
#> SRR772571 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772572 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772573 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772574 2 0.0376 0.896602 0.004 0.996
#> SRR772575 2 0.0376 0.896157 0.004 0.996
#> SRR772576 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772577 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772578 1 1.0000 0.022022 0.504 0.496
#> SRR772579 1 0.6531 0.784862 0.832 0.168
#> SRR772580 1 0.1184 0.840390 0.984 0.016
#> SRR772581 2 0.6343 0.771414 0.160 0.840
#> SRR772582 2 0.4562 0.841468 0.096 0.904
#> SRR772583 2 0.0672 0.896293 0.008 0.992
#> SRR772584 2 0.2043 0.895906 0.032 0.968
#> SRR772585 2 0.2603 0.891143 0.044 0.956
#> SRR772586 1 0.3879 0.838150 0.924 0.076
#> SRR772587 2 0.9775 0.197074 0.412 0.588
#> SRR772588 2 0.1184 0.896248 0.016 0.984
#> SRR772589 2 0.1633 0.895438 0.024 0.976
#> SRR772590 1 0.0672 0.836068 0.992 0.008
#> SRR772591 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772592 2 0.2423 0.889627 0.040 0.960
#> SRR772593 1 0.5842 0.809283 0.860 0.140
#> SRR772594 2 0.4431 0.863717 0.092 0.908
#> SRR772595 2 0.3879 0.870259 0.076 0.924
#> SRR772596 1 0.3733 0.839134 0.928 0.072
#> SRR772597 1 0.0376 0.836793 0.996 0.004
#> SRR772598 1 0.8955 0.643469 0.688 0.312
#> SRR772599 1 0.9044 0.625803 0.680 0.320
#> SRR772600 2 0.1633 0.891287 0.024 0.976
#> SRR772601 2 0.1414 0.892595 0.020 0.980
#> SRR772602 1 0.1414 0.836692 0.980 0.020
#> SRR772603 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772604 2 0.0672 0.894734 0.008 0.992
#> SRR772605 2 0.8713 0.583633 0.292 0.708
#> SRR772606 1 0.9754 0.443731 0.592 0.408
#> SRR772607 2 0.9000 0.503794 0.316 0.684
#> SRR772608 2 0.1633 0.895561 0.024 0.976
#> SRR772609 2 0.1184 0.896783 0.016 0.984
#> SRR772610 2 0.0672 0.897019 0.008 0.992
#> SRR772611 2 0.2778 0.890549 0.048 0.952
#> SRR772612 2 0.2423 0.883693 0.040 0.960
#> SRR772613 2 0.4939 0.829238 0.108 0.892
#> SRR772614 2 0.2423 0.887213 0.040 0.960
#> SRR772615 2 0.7139 0.741993 0.196 0.804
#> SRR772616 2 0.9795 0.227216 0.416 0.584
#> SRR772617 2 0.7453 0.696634 0.212 0.788
#> SRR772618 2 0.7299 0.708176 0.204 0.796
#> SRR772619 2 0.9522 0.421122 0.372 0.628
#> SRR772620 2 0.9044 0.535970 0.320 0.680
#> SRR772621 2 0.1184 0.898698 0.016 0.984
#> SRR772622 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772623 1 0.5408 0.806882 0.876 0.124
#> SRR772624 1 0.7139 0.765590 0.804 0.196
#> SRR772625 1 0.2778 0.842072 0.952 0.048
#> SRR772626 1 0.4562 0.819327 0.904 0.096
#> SRR772627 1 0.2948 0.832778 0.948 0.052
#> SRR772628 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772629 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772630 2 0.1184 0.896825 0.016 0.984
#> SRR772631 1 0.5519 0.816406 0.872 0.128
#> SRR772632 2 0.1633 0.895647 0.024 0.976
#> SRR772633 2 0.3114 0.885468 0.056 0.944
#> SRR772634 2 0.9710 0.288574 0.400 0.600
#> SRR772635 2 0.5408 0.835513 0.124 0.876
#> SRR772636 1 0.2043 0.840669 0.968 0.032
#> SRR772637 2 0.1414 0.897773 0.020 0.980
#> SRR772638 2 0.1184 0.897553 0.016 0.984
#> SRR772639 2 0.0938 0.896876 0.012 0.988
#> SRR772640 2 0.4298 0.861326 0.088 0.912
#> SRR772641 2 0.7299 0.747939 0.204 0.796
#> SRR772642 1 0.9881 0.367368 0.564 0.436
#> SRR772643 1 0.8861 0.647930 0.696 0.304
#> SRR772644 2 0.9988 -0.052180 0.480 0.520
#> SRR772645 2 0.8443 0.612830 0.272 0.728
#> SRR772646 2 0.3584 0.880222 0.068 0.932
#> SRR772647 2 0.2778 0.889558 0.048 0.952
#> SRR772648 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772649 2 0.0000 0.895415 0.000 1.000
#> SRR772650 2 0.0376 0.896905 0.004 0.996
#> SRR772651 2 0.0672 0.897238 0.008 0.992
#> SRR772652 2 0.0376 0.896573 0.004 0.996
#> SRR772653 2 0.1184 0.896176 0.016 0.984
#> SRR772654 2 0.1843 0.896281 0.028 0.972
#> SRR772655 2 0.0672 0.896140 0.008 0.992
#> SRR772656 1 0.0672 0.836068 0.992 0.008
#> SRR772657 1 0.0376 0.834033 0.996 0.004
#> SRR772658 2 0.7056 0.726081 0.192 0.808
#> SRR772659 2 0.7056 0.725158 0.192 0.808
#> SRR772660 1 1.0000 0.130141 0.504 0.496
#> SRR772661 1 0.5519 0.816614 0.872 0.128
#> SRR772662 2 0.2236 0.894729 0.036 0.964
#> SRR772663 2 0.4939 0.844770 0.108 0.892
#> SRR772664 2 0.1633 0.895438 0.024 0.976
#> SRR772665 2 0.2043 0.894778 0.032 0.968
#> SRR772666 1 0.0000 0.834431 1.000 0.000
#> SRR772667 2 0.5946 0.813190 0.144 0.856
#> SRR772668 1 0.0938 0.834878 0.988 0.012
#> SRR772669 2 0.9983 0.058651 0.476 0.524
#> SRR772670 2 0.2423 0.892807 0.040 0.960
#> SRR772671 2 0.1633 0.895438 0.024 0.976
#> SRR772672 2 0.3274 0.885790 0.060 0.940
#> SRR772673 2 0.2236 0.893210 0.036 0.964
#> SRR772674 1 0.0672 0.836068 0.992 0.008
#> SRR772675 1 0.3584 0.839520 0.932 0.068
#> SRR772676 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772677 2 0.0376 0.895254 0.004 0.996
#> SRR772678 1 0.5294 0.820823 0.880 0.120
#> SRR772679 2 0.2423 0.893380 0.040 0.960
#> SRR772680 2 0.5737 0.807601 0.136 0.864
#> SRR772681 1 0.0376 0.835753 0.996 0.004
#> SRR772682 2 0.2778 0.889807 0.048 0.952
#> SRR772683 2 0.2043 0.895684 0.032 0.968
#> SRR772685 2 0.0938 0.895921 0.012 0.988
#> SRR772686 1 0.0938 0.838075 0.988 0.012
#> SRR772687 1 0.7453 0.750428 0.788 0.212
#> SRR772688 2 0.7376 0.734498 0.208 0.792
#> SRR772689 2 0.4161 0.874234 0.084 0.916
#> SRR772690 1 0.0000 0.834431 1.000 0.000
#> SRR772691 1 0.0672 0.836468 0.992 0.008
#> SRR772692 1 0.9686 0.470816 0.604 0.396
#> SRR772693 1 0.8813 0.654458 0.700 0.300
#> SRR772694 2 0.3114 0.886352 0.056 0.944
#> SRR772695 2 0.0938 0.896559 0.012 0.988
#> SRR772696 2 0.9977 -0.048170 0.472 0.528
#> SRR772697 1 0.9552 0.428559 0.624 0.376
#> SRR772698 1 0.4939 0.826565 0.892 0.108
#> SRR772699 1 0.7815 0.732124 0.768 0.232
#> SRR772700 1 0.9491 0.543111 0.632 0.368
#> SRR772701 2 0.0938 0.896404 0.012 0.988
#> SRR772702 2 0.1843 0.893636 0.028 0.972
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR772341 1 0.3941 0.38858 0.844 0.156 0.000
#> SRR772342 1 0.4702 0.29646 0.788 0.212 0.000
#> SRR772343 1 0.2982 0.49370 0.920 0.056 0.024
#> SRR772344 2 0.7169 -0.24225 0.456 0.520 0.024
#> SRR772345 2 0.7263 -0.15905 0.400 0.568 0.032
#> SRR772346 2 0.6298 0.56272 0.388 0.608 0.004
#> SRR772347 2 0.6824 0.54703 0.408 0.576 0.016
#> SRR772348 1 0.4353 0.49256 0.836 0.156 0.008
#> SRR772349 1 0.5982 0.40603 0.668 0.328 0.004
#> SRR772350 3 0.8590 0.25905 0.120 0.320 0.560
#> SRR772351 1 0.6215 0.14597 0.572 0.428 0.000
#> SRR772352 1 0.6783 0.23540 0.588 0.396 0.016
#> SRR772353 1 0.1289 0.50450 0.968 0.032 0.000
#> SRR772354 1 0.0592 0.50197 0.988 0.012 0.000
#> SRR772355 1 0.7138 0.33429 0.644 0.312 0.044
#> SRR772356 1 0.5327 0.21535 0.728 0.272 0.000
#> SRR772357 1 0.4848 0.46366 0.836 0.036 0.128
#> SRR772358 1 0.5667 0.43035 0.800 0.060 0.140
#> SRR772359 1 0.3415 0.49824 0.900 0.080 0.020
#> SRR772360 1 0.3918 0.42936 0.856 0.140 0.004
#> SRR772361 3 0.0000 0.77729 0.000 0.000 1.000
#> SRR772362 1 0.7378 0.34384 0.560 0.404 0.036
#> SRR772363 1 0.8734 0.26500 0.468 0.424 0.108
#> SRR772364 2 0.7438 0.56025 0.392 0.568 0.040
#> SRR772365 2 0.6879 0.56386 0.360 0.616 0.024
#> SRR772366 3 0.5817 0.72116 0.236 0.020 0.744
#> SRR772367 3 0.0000 0.77729 0.000 0.000 1.000
#> SRR772368 3 0.7828 0.32703 0.448 0.052 0.500
#> SRR772369 1 0.4700 0.47525 0.812 0.180 0.008
#> SRR772370 1 0.2878 0.50294 0.904 0.096 0.000
#> SRR772371 2 0.8091 0.54848 0.348 0.572 0.080
#> SRR772372 2 0.9489 0.48637 0.340 0.464 0.196
#> SRR772373 1 0.5706 0.41267 0.680 0.320 0.000
#> SRR772374 1 0.6079 0.37915 0.612 0.388 0.000
#> SRR772375 3 0.0237 0.77775 0.000 0.004 0.996
#> SRR772376 1 0.9458 0.16883 0.448 0.368 0.184
#> SRR772377 3 0.5136 0.77266 0.132 0.044 0.824
#> SRR772378 1 0.2711 0.47323 0.912 0.088 0.000
#> SRR772379 1 0.3276 0.50298 0.908 0.068 0.024
#> SRR772380 1 0.2443 0.50411 0.940 0.028 0.032
#> SRR772381 3 0.0000 0.77729 0.000 0.000 1.000
#> SRR772382 2 0.6509 0.45849 0.472 0.524 0.004
#> SRR772383 1 0.6235 -0.26349 0.564 0.436 0.000
#> SRR772384 3 0.6662 0.69270 0.252 0.044 0.704
#> SRR772385 3 0.5631 0.76346 0.164 0.044 0.792
#> SRR772386 2 0.7476 -0.11348 0.404 0.556 0.040
#> SRR772387 2 0.8430 -0.01128 0.292 0.588 0.120
#> SRR772388 1 0.3644 0.44530 0.872 0.124 0.004
#> SRR772389 1 0.4293 0.37040 0.832 0.164 0.004
#> SRR772390 3 0.3832 0.77986 0.100 0.020 0.880
#> SRR772391 1 0.2959 0.45277 0.900 0.100 0.000
#> SRR772392 1 0.4178 0.37158 0.828 0.172 0.000
#> SRR772393 2 0.9878 0.44602 0.340 0.396 0.264
#> SRR772394 2 0.9820 0.40562 0.264 0.424 0.312
#> SRR772395 1 0.5325 0.44472 0.748 0.248 0.004
#> SRR772396 1 0.8388 0.05362 0.612 0.248 0.140
#> SRR772397 1 0.5835 -0.02677 0.660 0.340 0.000
#> SRR772398 2 0.7937 0.55321 0.364 0.568 0.068
#> SRR772399 2 0.8255 0.49327 0.428 0.496 0.076
#> SRR772400 1 0.8941 -0.14720 0.544 0.300 0.156
#> SRR772401 1 0.7653 0.05102 0.644 0.276 0.080
#> SRR772402 2 0.6416 0.56710 0.376 0.616 0.008
#> SRR772403 2 0.5926 0.56473 0.356 0.644 0.000
#> SRR772404 1 0.5558 0.44093 0.800 0.048 0.152
#> SRR772405 3 0.6632 0.67274 0.272 0.036 0.692
#> SRR772406 2 0.6008 0.08376 0.372 0.628 0.000
#> SRR772407 2 0.6398 0.55910 0.372 0.620 0.008
#> SRR772408 1 0.6204 0.35968 0.576 0.424 0.000
#> SRR772409 1 0.6026 0.37891 0.624 0.376 0.000
#> SRR772410 1 0.2356 0.50714 0.928 0.072 0.000
#> SRR772411 1 0.3116 0.46023 0.892 0.108 0.000
#> SRR772412 1 0.6126 -0.20682 0.600 0.400 0.000
#> SRR772413 1 0.6476 -0.33886 0.548 0.448 0.004
#> SRR772414 3 0.0592 0.77709 0.000 0.012 0.988
#> SRR772415 1 0.1289 0.50637 0.968 0.032 0.000
#> SRR772416 1 0.2356 0.50513 0.928 0.072 0.000
#> SRR772417 1 0.4002 0.40904 0.840 0.160 0.000
#> SRR772418 3 0.4602 0.77256 0.152 0.016 0.832
#> SRR772419 1 0.5948 0.38440 0.640 0.360 0.000
#> SRR772420 1 0.5988 0.37978 0.632 0.368 0.000
#> SRR772421 1 0.6280 -0.33413 0.540 0.460 0.000
#> SRR772422 1 0.6140 -0.22475 0.596 0.404 0.000
#> SRR772423 2 0.6264 0.56436 0.380 0.616 0.004
#> SRR772424 2 0.7757 0.55238 0.408 0.540 0.052
#> SRR772425 1 0.3826 0.49255 0.868 0.124 0.008
#> SRR772426 2 0.6192 0.05106 0.420 0.580 0.000
#> SRR772427 2 0.6205 -0.04674 0.336 0.656 0.008
#> SRR772428 2 0.8398 0.48591 0.440 0.476 0.084
#> SRR772429 1 0.5560 0.09449 0.700 0.300 0.000
#> SRR772430 1 0.2845 0.49604 0.920 0.068 0.012
#> SRR772431 2 0.6235 0.52909 0.436 0.564 0.000
#> SRR772432 2 0.6126 0.55890 0.400 0.600 0.000
#> SRR772433 1 0.7278 -0.38114 0.516 0.456 0.028
#> SRR772434 1 0.9375 -0.18855 0.496 0.308 0.196
#> SRR772435 1 0.6672 -0.39922 0.520 0.472 0.008
#> SRR772436 1 0.6215 -0.27916 0.572 0.428 0.000
#> SRR772437 3 0.1643 0.76601 0.000 0.044 0.956
#> SRR772438 2 0.6667 0.56441 0.368 0.616 0.016
#> SRR772439 2 0.6735 0.53456 0.424 0.564 0.012
#> SRR772440 1 0.4409 0.43956 0.824 0.172 0.004
#> SRR772441 1 0.6018 0.30712 0.684 0.308 0.008
#> SRR772442 2 0.6154 0.55486 0.408 0.592 0.000
#> SRR772443 2 0.6079 0.56114 0.388 0.612 0.000
#> SRR772444 2 0.6925 0.50775 0.452 0.532 0.016
#> SRR772445 2 0.6950 0.46782 0.476 0.508 0.016
#> SRR772446 1 0.3482 0.43265 0.872 0.128 0.000
#> SRR772447 1 0.3551 0.42538 0.868 0.132 0.000
#> SRR772448 2 0.9243 0.38967 0.368 0.472 0.160
#> SRR772449 2 0.8743 0.42509 0.440 0.452 0.108
#> SRR772450 1 0.6062 0.37727 0.616 0.384 0.000
#> SRR772451 1 0.6008 0.38007 0.628 0.372 0.000
#> SRR772452 1 0.2625 0.46365 0.916 0.084 0.000
#> SRR772453 1 0.2796 0.46018 0.908 0.092 0.000
#> SRR772454 1 0.5810 -0.00597 0.664 0.336 0.000
#> SRR772455 1 0.1289 0.49575 0.968 0.032 0.000
#> SRR772456 1 0.6192 0.35783 0.580 0.420 0.000
#> SRR772457 1 0.5968 0.38253 0.636 0.364 0.000
#> SRR772458 2 0.6513 0.45706 0.476 0.520 0.004
#> SRR772459 2 0.6299 0.45031 0.476 0.524 0.000
#> SRR772460 2 0.9651 -0.20460 0.208 0.396 0.396
#> SRR772461 2 0.9522 -0.22110 0.188 0.412 0.400
#> SRR772462 1 0.5690 0.42546 0.708 0.288 0.004
#> SRR772463 1 0.5835 0.39371 0.660 0.340 0.000
#> SRR772464 3 0.0237 0.77775 0.000 0.004 0.996
#> SRR772465 1 0.3816 0.42626 0.852 0.148 0.000
#> SRR772466 1 0.4002 0.42613 0.840 0.160 0.000
#> SRR772467 1 0.6079 0.37358 0.612 0.388 0.000
#> SRR772468 1 0.6298 0.36924 0.608 0.388 0.004
#> SRR772469 1 0.3752 0.42983 0.856 0.144 0.000
#> SRR772470 1 0.3551 0.43853 0.868 0.132 0.000
#> SRR772471 1 0.2703 0.50398 0.928 0.056 0.016
#> SRR772472 1 0.1031 0.50343 0.976 0.024 0.000
#> SRR772473 2 0.6095 0.56181 0.392 0.608 0.000
#> SRR772474 1 0.6952 -0.44302 0.504 0.480 0.016
#> SRR772475 3 0.5905 0.75368 0.184 0.044 0.772
#> SRR772476 1 0.7396 0.27945 0.488 0.480 0.032
#> SRR772477 1 0.9098 0.24291 0.456 0.404 0.140
#> SRR772478 1 0.2063 0.49589 0.948 0.044 0.008
#> SRR772479 1 0.2096 0.48899 0.944 0.052 0.004
#> SRR772480 2 0.7430 0.54195 0.424 0.540 0.036
#> SRR772481 2 0.6822 0.46386 0.480 0.508 0.012
#> SRR772482 1 0.9336 -0.14597 0.420 0.164 0.416
#> SRR772483 3 0.9201 0.35107 0.352 0.160 0.488
#> SRR772484 1 0.5988 0.39172 0.632 0.368 0.000
#> SRR772485 1 0.4452 0.47899 0.808 0.192 0.000
#> SRR772486 2 0.8812 0.49727 0.360 0.516 0.124
#> SRR772487 2 0.8902 0.46606 0.396 0.480 0.124
#> SRR772488 1 0.5760 0.40499 0.672 0.328 0.000
#> SRR772489 1 0.5859 0.39541 0.656 0.344 0.000
#> SRR772490 1 0.7169 -0.40647 0.520 0.456 0.024
#> SRR772491 2 0.6793 0.49733 0.452 0.536 0.012
#> SRR772492 1 0.7121 0.34305 0.548 0.428 0.024
#> SRR772493 1 0.6598 0.35655 0.564 0.428 0.008
#> SRR772494 1 0.7129 0.35371 0.580 0.392 0.028
#> SRR772495 1 0.7619 0.32663 0.532 0.424 0.044
#> SRR772496 1 0.6154 0.36820 0.592 0.408 0.000
#> SRR772497 1 0.7453 0.39412 0.644 0.292 0.064
#> SRR772498 3 0.6142 0.64259 0.040 0.212 0.748
#> SRR772499 3 0.4708 0.71185 0.036 0.120 0.844
#> SRR772500 1 0.6308 0.28573 0.508 0.492 0.000
#> SRR772501 2 0.6111 -0.11612 0.396 0.604 0.000
#> SRR772502 1 0.7451 -0.23545 0.564 0.396 0.040
#> SRR772503 1 0.7534 -0.28650 0.532 0.428 0.040
#> SRR772504 2 0.8799 0.08054 0.196 0.584 0.220
#> SRR772505 2 0.9302 0.00390 0.240 0.524 0.236
#> SRR772506 1 0.6026 0.37867 0.624 0.376 0.000
#> SRR772507 1 0.6026 0.37972 0.624 0.376 0.000
#> SRR772508 1 0.6091 0.45193 0.784 0.092 0.124
#> SRR772509 3 0.6402 0.71301 0.236 0.040 0.724
#> SRR772510 3 0.0592 0.77669 0.000 0.012 0.988
#> SRR772511 1 0.8652 0.04768 0.576 0.284 0.140
#> SRR772512 3 0.0424 0.77665 0.000 0.008 0.992
#> SRR772513 1 0.5268 0.46171 0.776 0.212 0.012
#> SRR772514 1 0.4291 0.47754 0.820 0.180 0.000
#> SRR772515 1 0.5733 0.38570 0.676 0.324 0.000
#> SRR772516 1 0.5591 0.37526 0.696 0.304 0.000
#> SRR772517 1 0.4062 0.38311 0.836 0.164 0.000
#> SRR772518 1 0.2537 0.48603 0.920 0.080 0.000
#> SRR772519 1 0.5810 0.40027 0.664 0.336 0.000
#> SRR772520 1 0.5926 0.38582 0.644 0.356 0.000
#> SRR772521 2 0.6566 0.56723 0.376 0.612 0.012
#> SRR772522 2 0.6832 0.56660 0.376 0.604 0.020
#> SRR772523 1 0.6252 -0.30571 0.556 0.444 0.000
#> SRR772524 1 0.6140 -0.13469 0.596 0.404 0.000
#> SRR772525 3 0.0424 0.77763 0.000 0.008 0.992
#> SRR772526 1 0.6467 0.36681 0.604 0.388 0.008
#> SRR772527 1 0.6783 0.35970 0.588 0.396 0.016
#> SRR772528 3 0.5119 0.76858 0.160 0.028 0.812
#> SRR772529 2 0.7480 0.48759 0.456 0.508 0.036
#> SRR772530 1 0.6819 -0.38661 0.512 0.476 0.012
#> SRR772531 3 0.0829 0.77947 0.012 0.004 0.984
#> SRR772532 1 0.6381 0.37272 0.648 0.340 0.012
#> SRR772533 1 0.5706 0.38751 0.680 0.320 0.000
#> SRR772534 1 0.5431 0.16602 0.716 0.284 0.000
#> SRR772535 1 0.6924 0.10071 0.580 0.400 0.020
#> SRR772536 1 0.5986 0.31463 0.704 0.284 0.012
#> SRR772537 2 0.8216 0.40168 0.188 0.640 0.172
#> SRR772538 2 0.6267 0.43057 0.452 0.548 0.000
#> SRR772539 1 0.2625 0.46690 0.916 0.084 0.000
#> SRR772540 1 0.8332 0.20491 0.580 0.104 0.316
#> SRR772541 1 0.6318 0.42161 0.760 0.068 0.172
#> SRR772542 1 0.9487 -0.20915 0.476 0.320 0.204
#> SRR772543 1 0.8561 -0.23975 0.528 0.368 0.104
#> SRR772544 3 0.1163 0.77370 0.000 0.028 0.972
#> SRR772545 1 0.4702 0.29890 0.788 0.212 0.000
#> SRR772546 1 0.5016 0.25527 0.760 0.240 0.000
#> SRR772547 1 0.6295 0.39772 0.764 0.164 0.072
#> SRR772548 1 0.3267 0.45778 0.884 0.116 0.000
#> SRR772549 1 0.2743 0.48704 0.928 0.052 0.020
#> SRR772550 1 0.1860 0.48092 0.948 0.052 0.000
#> SRR772551 1 0.6008 -0.12425 0.628 0.372 0.000
#> SRR772552 1 0.4750 0.33189 0.784 0.216 0.000
#> SRR772553 3 0.5412 0.76310 0.172 0.032 0.796
#> SRR772554 1 0.6192 0.35444 0.580 0.420 0.000
#> SRR772555 2 0.6215 -0.20860 0.428 0.572 0.000
#> SRR772556 1 0.6008 -0.12927 0.628 0.372 0.000
#> SRR772557 1 0.6330 -0.20435 0.600 0.396 0.004
#> SRR772558 1 0.2261 0.48726 0.932 0.068 0.000
#> SRR772559 1 0.0592 0.50131 0.988 0.012 0.000
#> SRR772560 1 0.4206 0.48895 0.872 0.088 0.040
#> SRR772561 3 0.0892 0.77281 0.000 0.020 0.980
#> SRR772562 1 0.5327 0.44026 0.728 0.272 0.000
#> SRR772563 1 0.4399 0.46844 0.812 0.188 0.000
#> SRR772564 1 0.9806 -0.27344 0.420 0.328 0.252
#> SRR772565 2 0.7464 0.54528 0.400 0.560 0.040
#> SRR772566 1 0.6813 -0.39477 0.520 0.468 0.012
#> SRR772567 1 0.7597 -0.25522 0.568 0.384 0.048
#> SRR772568 1 0.6274 0.30875 0.544 0.456 0.000
#> SRR772569 2 0.6204 -0.19975 0.424 0.576 0.000
#> SRR772570 1 0.3816 0.42606 0.852 0.148 0.000
#> SRR772571 1 0.3752 0.40462 0.856 0.144 0.000
#> SRR772572 1 0.4702 0.33761 0.788 0.212 0.000
#> SRR772573 1 0.4974 0.30662 0.764 0.236 0.000
#> SRR772574 1 0.6026 -0.11435 0.624 0.376 0.000
#> SRR772575 1 0.6264 -0.13411 0.616 0.380 0.004
#> SRR772576 1 0.6476 -0.30388 0.548 0.448 0.004
#> SRR772577 1 0.6280 -0.37384 0.540 0.460 0.000
#> SRR772578 2 0.7913 -0.29833 0.056 0.492 0.452
#> SRR772579 3 0.6452 0.66359 0.036 0.252 0.712
#> SRR772580 3 0.0892 0.77603 0.000 0.020 0.980
#> SRR772581 2 0.8350 0.55193 0.380 0.532 0.088
#> SRR772582 2 0.7490 0.56640 0.380 0.576 0.044
#> SRR772583 1 0.1964 0.49529 0.944 0.056 0.000
#> SRR772584 1 0.3038 0.44305 0.896 0.104 0.000
#> SRR772585 1 0.1031 0.50212 0.976 0.024 0.000
#> SRR772586 3 0.4453 0.77271 0.152 0.012 0.836
#> SRR772587 1 0.8312 -0.07593 0.576 0.324 0.100
#> SRR772588 1 0.5882 0.38836 0.652 0.348 0.000
#> SRR772589 1 0.5431 0.42636 0.716 0.284 0.000
#> SRR772590 3 0.0000 0.77729 0.000 0.000 1.000
#> SRR772591 1 0.6468 -0.28943 0.552 0.444 0.004
#> SRR772592 1 0.6489 -0.31876 0.540 0.456 0.004
#> SRR772593 3 0.5455 0.74870 0.204 0.020 0.776
#> SRR772594 2 0.7801 0.43641 0.308 0.616 0.076
#> SRR772595 1 0.7807 -0.35790 0.516 0.432 0.052
#> SRR772596 3 0.3826 0.77826 0.124 0.008 0.868
#> SRR772597 3 0.0000 0.77729 0.000 0.000 1.000
#> SRR772598 3 0.9738 0.05083 0.304 0.252 0.444
#> SRR772599 1 0.9963 -0.34209 0.360 0.348 0.292
#> SRR772600 2 0.6095 0.55980 0.392 0.608 0.000
#> SRR772601 2 0.6330 0.55429 0.396 0.600 0.004
#> SRR772602 3 0.2537 0.75121 0.000 0.080 0.920
#> SRR772603 1 0.6308 -0.39638 0.508 0.492 0.000
#> SRR772604 2 0.6079 0.56239 0.388 0.612 0.000
#> SRR772605 1 0.3583 0.49399 0.900 0.044 0.056
#> SRR772606 1 0.8854 0.00990 0.576 0.188 0.236
#> SRR772607 1 0.7918 0.08117 0.640 0.256 0.104
#> SRR772608 1 0.2356 0.50656 0.928 0.072 0.000
#> SRR772609 1 0.1031 0.50027 0.976 0.024 0.000
#> SRR772610 1 0.5948 0.39762 0.640 0.360 0.000
#> SRR772611 1 0.3755 0.49767 0.872 0.120 0.008
#> SRR772612 2 0.6275 0.56621 0.348 0.644 0.008
#> SRR772613 2 0.7123 0.56838 0.364 0.604 0.032
#> SRR772614 1 0.6625 -0.31633 0.552 0.440 0.008
#> SRR772615 1 0.6756 0.18720 0.712 0.232 0.056
#> SRR772616 1 0.6208 0.42648 0.768 0.068 0.164
#> SRR772617 2 0.9547 0.47795 0.392 0.416 0.192
#> SRR772618 1 0.9377 -0.45822 0.448 0.380 0.172
#> SRR772619 2 0.9877 -0.07577 0.292 0.412 0.296
#> SRR772620 2 0.9556 -0.16671 0.372 0.432 0.196
#> SRR772621 1 0.5929 0.40035 0.676 0.320 0.004
#> SRR772622 1 0.5591 0.09695 0.696 0.304 0.000
#> SRR772623 3 0.8967 0.15477 0.148 0.324 0.528
#> SRR772624 3 0.6105 0.70242 0.252 0.024 0.724
#> SRR772625 3 0.6007 0.75273 0.184 0.048 0.768
#> SRR772626 3 0.7634 0.47037 0.100 0.232 0.668
#> SRR772627 3 0.7421 0.48960 0.084 0.240 0.676
#> SRR772628 1 0.5058 0.26703 0.756 0.244 0.000
#> SRR772629 1 0.6309 -0.42689 0.504 0.496 0.000
#> SRR772630 1 0.4733 0.36634 0.800 0.196 0.004
#> SRR772631 3 0.6276 0.72450 0.224 0.040 0.736
#> SRR772632 2 0.6267 -0.23773 0.452 0.548 0.000
#> SRR772633 1 0.6314 0.37376 0.604 0.392 0.004
#> SRR772634 1 0.9301 -0.08478 0.524 0.244 0.232
#> SRR772635 1 0.8109 -0.21267 0.568 0.352 0.080
#> SRR772636 3 0.5798 0.75777 0.176 0.044 0.780
#> SRR772637 1 0.3482 0.44284 0.872 0.128 0.000
#> SRR772638 1 0.3816 0.42210 0.852 0.148 0.000
#> SRR772639 1 0.3192 0.48152 0.888 0.112 0.000
#> SRR772640 1 0.7480 0.30048 0.508 0.456 0.036
#> SRR772641 1 0.7915 0.27854 0.488 0.456 0.056
#> SRR772642 1 0.9280 -0.05750 0.452 0.160 0.388
#> SRR772643 3 0.8068 0.28429 0.456 0.064 0.480
#> SRR772644 1 0.5835 0.42525 0.784 0.052 0.164
#> SRR772645 1 0.3764 0.49200 0.892 0.040 0.068
#> SRR772646 1 0.6540 0.36349 0.584 0.408 0.008
#> SRR772647 1 0.6168 0.36921 0.588 0.412 0.000
#> SRR772648 1 0.6225 -0.27494 0.568 0.432 0.000
#> SRR772649 1 0.6521 -0.43410 0.500 0.496 0.004
#> SRR772650 1 0.4235 0.37330 0.824 0.176 0.000
#> SRR772651 1 0.2945 0.47612 0.908 0.088 0.004
#> SRR772652 1 0.6225 -0.28877 0.568 0.432 0.000
#> SRR772653 2 0.6495 0.49863 0.460 0.536 0.004
#> SRR772654 1 0.4293 0.44400 0.832 0.164 0.004
#> SRR772655 1 0.5733 0.13765 0.676 0.324 0.000
#> SRR772656 3 0.0829 0.77797 0.004 0.012 0.984
#> SRR772657 3 0.0000 0.77729 0.000 0.000 1.000
#> SRR772658 2 0.5988 0.16856 0.168 0.776 0.056
#> SRR772659 2 0.5608 0.31880 0.120 0.808 0.072
#> SRR772660 1 0.7022 0.37563 0.700 0.068 0.232
#> SRR772661 3 0.6423 0.71965 0.228 0.044 0.728
#> SRR772662 1 0.3120 0.49997 0.908 0.080 0.012
#> SRR772663 1 0.3690 0.46200 0.884 0.100 0.016
#> SRR772664 1 0.6033 0.40646 0.660 0.336 0.004
#> SRR772665 1 0.3941 0.49022 0.844 0.156 0.000
#> SRR772666 3 0.0747 0.77591 0.000 0.016 0.984
#> SRR772667 1 0.3091 0.50684 0.912 0.072 0.016
#> SRR772668 3 0.3619 0.71540 0.000 0.136 0.864
#> SRR772669 3 0.9974 -0.32895 0.300 0.340 0.360
#> SRR772670 1 0.0747 0.50324 0.984 0.016 0.000
#> SRR772671 1 0.1964 0.49923 0.944 0.056 0.000
#> SRR772672 1 0.1411 0.50541 0.964 0.036 0.000
#> SRR772673 1 0.3425 0.49945 0.884 0.112 0.004
#> SRR772674 3 0.0892 0.77559 0.000 0.020 0.980
#> SRR772675 3 0.6096 0.73903 0.208 0.040 0.752
#> SRR772676 2 0.6505 0.46124 0.468 0.528 0.004
#> SRR772677 2 0.6280 0.48651 0.460 0.540 0.000
#> SRR772678 3 0.6232 0.72998 0.220 0.040 0.740
#> SRR772679 1 0.2066 0.48762 0.940 0.060 0.000
#> SRR772680 1 0.4345 0.43819 0.848 0.136 0.016
#> SRR772681 3 0.0000 0.77729 0.000 0.000 1.000
#> SRR772682 1 0.3682 0.50016 0.876 0.116 0.008
#> SRR772683 1 0.5517 0.43733 0.728 0.268 0.004
#> SRR772685 2 0.6513 0.25082 0.476 0.520 0.004
#> SRR772686 3 0.0237 0.77775 0.000 0.004 0.996
#> SRR772687 3 0.5619 0.71956 0.244 0.012 0.744
#> SRR772688 1 0.7505 0.34555 0.572 0.384 0.044
#> SRR772689 1 0.6416 0.37666 0.616 0.376 0.008
#> SRR772690 3 0.0000 0.77729 0.000 0.000 1.000
#> SRR772691 3 0.5000 0.77429 0.124 0.044 0.832
#> SRR772692 3 0.8665 0.34907 0.384 0.108 0.508
#> SRR772693 3 0.8614 0.48495 0.304 0.128 0.568
#> SRR772694 1 0.3670 0.50724 0.888 0.092 0.020
#> SRR772695 1 0.1643 0.49596 0.956 0.044 0.000
#> SRR772696 2 0.9555 0.43853 0.300 0.476 0.224
#> SRR772697 3 0.9182 0.11697 0.228 0.232 0.540
#> SRR772698 3 0.5092 0.76415 0.176 0.020 0.804
#> SRR772699 3 0.7777 0.49203 0.364 0.060 0.576
#> SRR772700 1 0.8730 0.04672 0.500 0.112 0.388
#> SRR772701 1 0.6513 -0.37984 0.520 0.476 0.004
#> SRR772702 2 0.6345 0.55327 0.400 0.596 0.004
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR772341 1 0.3428 0.73882 0.844 0.012 0.000 0.144
#> SRR772342 1 0.4175 0.68690 0.776 0.012 0.000 0.212
#> SRR772343 1 0.1543 0.75542 0.956 0.032 0.004 0.008
#> SRR772344 2 0.6083 0.70466 0.144 0.716 0.016 0.124
#> SRR772345 2 0.6081 0.68958 0.088 0.744 0.060 0.108
#> SRR772346 4 0.5124 0.71325 0.072 0.160 0.004 0.764
#> SRR772347 4 0.5102 0.70673 0.064 0.188 0.000 0.748
#> SRR772348 1 0.2156 0.75111 0.928 0.060 0.004 0.008
#> SRR772349 1 0.1302 0.75593 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR772350 4 0.5345 0.34314 0.004 0.008 0.404 0.584
#> SRR772351 4 0.7206 0.07157 0.140 0.400 0.000 0.460
#> SRR772352 2 0.6948 0.27506 0.208 0.588 0.000 0.204
#> SRR772353 1 0.1929 0.76257 0.940 0.024 0.000 0.036
#> SRR772354 1 0.2521 0.75983 0.912 0.024 0.000 0.064
#> SRR772355 2 0.8747 0.42382 0.232 0.484 0.076 0.208
#> SRR772356 4 0.7486 0.27814 0.392 0.080 0.036 0.492
#> SRR772357 1 0.1362 0.76002 0.964 0.020 0.004 0.012
#> SRR772358 1 0.2271 0.75000 0.928 0.052 0.012 0.008
#> SRR772359 1 0.3801 0.74637 0.856 0.064 0.004 0.076
#> SRR772360 1 0.5808 0.48740 0.644 0.036 0.008 0.312
#> SRR772361 3 0.0817 0.72765 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR772362 2 0.4675 0.73104 0.244 0.736 0.020 0.000
#> SRR772363 2 0.5700 0.70662 0.160 0.740 0.084 0.016
#> SRR772364 4 0.1745 0.70494 0.020 0.020 0.008 0.952
#> SRR772365 4 0.2918 0.70290 0.008 0.116 0.000 0.876
#> SRR772366 3 0.5993 0.47621 0.408 0.028 0.556 0.008
#> SRR772367 3 0.0469 0.72733 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772368 1 0.3800 0.67905 0.848 0.036 0.112 0.004
#> SRR772369 1 0.6313 0.61908 0.700 0.184 0.028 0.088
#> SRR772370 1 0.3370 0.76028 0.872 0.048 0.000 0.080
#> SRR772371 4 0.4192 0.68303 0.008 0.208 0.004 0.780
#> SRR772372 4 0.5766 0.67577 0.016 0.172 0.080 0.732
#> SRR772373 1 0.5265 0.65033 0.748 0.160 0.000 0.092
#> SRR772374 2 0.5070 0.54872 0.416 0.580 0.000 0.004
#> SRR772375 3 0.0469 0.72733 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772376 2 0.7405 0.36794 0.400 0.452 0.144 0.004
#> SRR772377 3 0.4568 0.68496 0.200 0.024 0.772 0.004
#> SRR772378 1 0.1913 0.76782 0.940 0.020 0.000 0.040
#> SRR772379 1 0.1211 0.75111 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR772380 1 0.0817 0.75627 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR772381 3 0.0707 0.72809 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772382 4 0.5694 0.65931 0.224 0.080 0.000 0.696
#> SRR772383 4 0.6235 0.22229 0.420 0.056 0.000 0.524
#> SRR772384 3 0.5721 0.52458 0.388 0.024 0.584 0.004
#> SRR772385 3 0.4923 0.66668 0.240 0.024 0.732 0.004
#> SRR772386 2 0.6985 0.55599 0.100 0.604 0.020 0.276
#> SRR772387 2 0.7360 0.60805 0.068 0.640 0.108 0.184
#> SRR772388 1 0.3009 0.76405 0.892 0.052 0.000 0.056
#> SRR772389 1 0.4423 0.71159 0.792 0.040 0.000 0.168
#> SRR772390 3 0.3926 0.70241 0.160 0.016 0.820 0.004
#> SRR772391 1 0.3711 0.73472 0.836 0.024 0.000 0.140
#> SRR772392 1 0.5284 0.58473 0.696 0.040 0.000 0.264
#> SRR772393 4 0.4163 0.64324 0.000 0.020 0.188 0.792
#> SRR772394 4 0.4886 0.61224 0.004 0.028 0.224 0.744
#> SRR772395 1 0.1970 0.74530 0.932 0.060 0.000 0.008
#> SRR772396 1 0.5387 0.66228 0.740 0.032 0.024 0.204
#> SRR772397 1 0.5376 0.32422 0.588 0.016 0.000 0.396
#> SRR772398 4 0.4696 0.70145 0.020 0.116 0.052 0.812
#> SRR772399 4 0.4604 0.71666 0.076 0.032 0.064 0.828
#> SRR772400 4 0.6801 0.57843 0.232 0.016 0.116 0.636
#> SRR772401 1 0.7181 0.40063 0.568 0.036 0.072 0.324
#> SRR772402 4 0.3852 0.69348 0.012 0.180 0.000 0.808
#> SRR772403 4 0.3402 0.68943 0.004 0.164 0.000 0.832
#> SRR772404 1 0.1920 0.74589 0.944 0.028 0.024 0.004
#> SRR772405 3 0.5902 0.43842 0.428 0.028 0.540 0.004
#> SRR772406 2 0.5683 0.29927 0.024 0.648 0.012 0.316
#> SRR772407 4 0.3992 0.68186 0.004 0.188 0.008 0.800
#> SRR772408 2 0.4198 0.73123 0.224 0.768 0.004 0.004
#> SRR772409 2 0.4250 0.72944 0.276 0.724 0.000 0.000
#> SRR772410 1 0.1888 0.75994 0.940 0.044 0.000 0.016
#> SRR772411 1 0.4467 0.71568 0.788 0.172 0.000 0.040
#> SRR772412 4 0.5842 0.14237 0.448 0.032 0.000 0.520
#> SRR772413 4 0.5473 0.49226 0.324 0.032 0.000 0.644
#> SRR772414 3 0.0707 0.72877 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772415 1 0.1610 0.75888 0.952 0.032 0.000 0.016
#> SRR772416 1 0.1209 0.75410 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR772417 1 0.5585 0.65805 0.712 0.204 0.000 0.084
#> SRR772418 3 0.4854 0.66744 0.244 0.020 0.732 0.004
#> SRR772419 2 0.4543 0.67824 0.324 0.676 0.000 0.000
#> SRR772420 2 0.4697 0.63834 0.356 0.644 0.000 0.000
#> SRR772421 4 0.4257 0.71291 0.140 0.048 0.000 0.812
#> SRR772422 4 0.4589 0.69083 0.168 0.048 0.000 0.784
#> SRR772423 4 0.3196 0.69980 0.008 0.136 0.000 0.856
#> SRR772424 4 0.2210 0.70551 0.016 0.028 0.020 0.936
#> SRR772425 1 0.4668 0.73817 0.808 0.108 0.008 0.076
#> SRR772426 2 0.5964 0.29391 0.040 0.536 0.000 0.424
#> SRR772427 2 0.5235 0.60423 0.048 0.716 0.000 0.236
#> SRR772428 4 0.7096 0.45676 0.308 0.020 0.096 0.576
#> SRR772429 1 0.5378 0.45886 0.632 0.016 0.004 0.348
#> SRR772430 1 0.2796 0.74590 0.892 0.016 0.000 0.092
#> SRR772431 4 0.2578 0.69961 0.036 0.052 0.000 0.912
#> SRR772432 4 0.1936 0.70831 0.028 0.032 0.000 0.940
#> SRR772433 4 0.4748 0.61962 0.268 0.016 0.000 0.716
#> SRR772434 1 0.6896 0.44211 0.596 0.020 0.084 0.300
#> SRR772435 4 0.5105 0.59189 0.276 0.028 0.000 0.696
#> SRR772436 4 0.5184 0.54352 0.304 0.024 0.000 0.672
#> SRR772437 3 0.2401 0.69794 0.000 0.004 0.904 0.092
#> SRR772438 4 0.4504 0.70743 0.044 0.152 0.004 0.800
#> SRR772439 4 0.6891 0.68213 0.172 0.160 0.020 0.648
#> SRR772440 1 0.6497 0.45701 0.596 0.100 0.000 0.304
#> SRR772441 4 0.7728 0.10142 0.252 0.308 0.000 0.440
#> SRR772442 4 0.2032 0.71245 0.036 0.028 0.000 0.936
#> SRR772443 4 0.3497 0.71138 0.024 0.124 0.000 0.852
#> SRR772444 4 0.3958 0.71538 0.144 0.032 0.000 0.824
#> SRR772445 4 0.4289 0.69007 0.172 0.032 0.000 0.796
#> SRR772446 1 0.2796 0.75832 0.892 0.016 0.000 0.092
#> SRR772447 1 0.3606 0.72847 0.840 0.020 0.000 0.140
#> SRR772448 4 0.6235 0.66419 0.088 0.072 0.104 0.736
#> SRR772449 4 0.5859 0.67503 0.076 0.068 0.096 0.760
#> SRR772450 2 0.4353 0.72839 0.232 0.756 0.012 0.000
#> SRR772451 2 0.4072 0.72875 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR772452 1 0.2124 0.76990 0.932 0.028 0.000 0.040
#> SRR772453 1 0.2761 0.76614 0.904 0.048 0.000 0.048
#> SRR772454 1 0.5291 0.48984 0.652 0.024 0.000 0.324
#> SRR772455 1 0.1798 0.76803 0.944 0.016 0.000 0.040
#> SRR772456 2 0.3810 0.72184 0.188 0.804 0.008 0.000
#> SRR772457 2 0.4164 0.72788 0.264 0.736 0.000 0.000
#> SRR772458 4 0.6158 0.56653 0.272 0.088 0.000 0.640
#> SRR772459 4 0.7568 0.35741 0.340 0.204 0.000 0.456
#> SRR772460 2 0.4785 0.54828 0.012 0.720 0.264 0.004
#> SRR772461 2 0.4785 0.54929 0.012 0.720 0.264 0.004
#> SRR772462 1 0.2319 0.75297 0.924 0.040 0.000 0.036
#> SRR772463 1 0.2973 0.66811 0.856 0.144 0.000 0.000
#> SRR772464 3 0.0817 0.72784 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR772465 1 0.5432 0.68863 0.740 0.124 0.000 0.136
#> SRR772466 1 0.5110 0.70607 0.764 0.132 0.000 0.104
#> SRR772467 2 0.5018 0.66425 0.332 0.656 0.012 0.000
#> SRR772468 2 0.4917 0.66408 0.336 0.656 0.008 0.000
#> SRR772469 1 0.5076 0.69930 0.756 0.172 0.000 0.072
#> SRR772470 1 0.4713 0.70806 0.776 0.172 0.000 0.052
#> SRR772471 1 0.1398 0.75050 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR772472 1 0.1398 0.75656 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR772473 4 0.1610 0.70685 0.016 0.032 0.000 0.952
#> SRR772474 4 0.3383 0.70545 0.076 0.052 0.000 0.872
#> SRR772475 3 0.5047 0.65620 0.256 0.024 0.716 0.004
#> SRR772476 2 0.5698 0.70510 0.124 0.756 0.028 0.092
#> SRR772477 2 0.5946 0.68362 0.124 0.732 0.124 0.020
#> SRR772478 1 0.1854 0.76130 0.940 0.012 0.000 0.048
#> SRR772479 1 0.2473 0.75651 0.908 0.012 0.000 0.080
#> SRR772480 4 0.2197 0.70961 0.048 0.024 0.000 0.928
#> SRR772481 4 0.2908 0.70457 0.064 0.040 0.000 0.896
#> SRR772482 1 0.8485 -0.03809 0.428 0.048 0.356 0.168
#> SRR772483 1 0.8500 -0.01773 0.448 0.148 0.344 0.060
#> SRR772484 1 0.4488 0.70045 0.808 0.096 0.000 0.096
#> SRR772485 1 0.4015 0.71857 0.832 0.052 0.000 0.116
#> SRR772486 4 0.6623 0.66308 0.036 0.220 0.076 0.668
#> SRR772487 4 0.6569 0.68078 0.072 0.120 0.096 0.712
#> SRR772488 1 0.5250 0.59405 0.736 0.196 0.000 0.068
#> SRR772489 1 0.5890 0.41588 0.660 0.268 0.000 0.072
#> SRR772490 4 0.5930 0.26280 0.420 0.008 0.024 0.548
#> SRR772491 4 0.6626 0.30370 0.384 0.088 0.000 0.528
#> SRR772492 2 0.5099 0.71748 0.200 0.748 0.048 0.004
#> SRR772493 2 0.4453 0.72729 0.244 0.744 0.012 0.000
#> SRR772494 2 0.4542 0.72680 0.228 0.752 0.020 0.000
#> SRR772495 2 0.4916 0.71082 0.184 0.760 0.056 0.000
#> SRR772496 1 0.5317 -0.17322 0.532 0.460 0.004 0.004
#> SRR772497 1 0.2365 0.74187 0.920 0.064 0.012 0.004
#> SRR772498 3 0.6248 0.28493 0.004 0.060 0.596 0.340
#> SRR772499 3 0.4610 0.51818 0.000 0.020 0.744 0.236
#> SRR772500 2 0.6112 0.67827 0.196 0.676 0.000 0.128
#> SRR772501 2 0.5842 0.62775 0.092 0.688 0.000 0.220
#> SRR772502 4 0.7975 0.51719 0.292 0.152 0.036 0.520
#> SRR772503 4 0.6759 0.65767 0.156 0.116 0.044 0.684
#> SRR772504 2 0.6280 0.57122 0.016 0.692 0.188 0.104
#> SRR772505 2 0.6123 0.60482 0.052 0.708 0.200 0.040
#> SRR772506 2 0.4800 0.62188 0.340 0.656 0.004 0.000
#> SRR772507 2 0.4720 0.66462 0.324 0.672 0.004 0.000
#> SRR772508 1 0.1296 0.75089 0.964 0.028 0.004 0.004
#> SRR772509 3 0.4976 0.65412 0.260 0.020 0.716 0.004
#> SRR772510 3 0.1022 0.72613 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR772511 1 0.9501 0.04722 0.396 0.164 0.168 0.272
#> SRR772512 3 0.1022 0.72521 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR772513 1 0.0817 0.75557 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR772514 1 0.1118 0.75082 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR772515 2 0.6996 0.60476 0.228 0.580 0.000 0.192
#> SRR772516 2 0.6990 0.43798 0.304 0.552 0.000 0.144
#> SRR772517 1 0.5884 0.44999 0.620 0.052 0.000 0.328
#> SRR772518 1 0.3525 0.74059 0.860 0.040 0.000 0.100
#> SRR772519 1 0.1902 0.73747 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR772520 1 0.4925 -0.10291 0.572 0.428 0.000 0.000
#> SRR772521 4 0.3808 0.69179 0.004 0.160 0.012 0.824
#> SRR772522 4 0.3741 0.69640 0.004 0.108 0.036 0.852
#> SRR772523 4 0.3885 0.69471 0.092 0.064 0.000 0.844
#> SRR772524 4 0.6878 0.41585 0.128 0.316 0.000 0.556
#> SRR772525 3 0.0707 0.72870 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772526 2 0.4673 0.70642 0.292 0.700 0.008 0.000
#> SRR772527 2 0.4855 0.71589 0.268 0.712 0.020 0.000
#> SRR772528 3 0.5191 0.63151 0.292 0.020 0.684 0.004
#> SRR772529 4 0.4111 0.72914 0.076 0.044 0.028 0.852
#> SRR772530 4 0.6231 0.64518 0.240 0.096 0.004 0.660
#> SRR772531 3 0.0707 0.72811 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR772532 2 0.7592 0.51127 0.336 0.500 0.012 0.152
#> SRR772533 2 0.6382 0.47724 0.340 0.580 0.000 0.080
#> SRR772534 1 0.6525 0.49185 0.612 0.116 0.000 0.272
#> SRR772535 2 0.8424 0.12950 0.264 0.436 0.028 0.272
#> SRR772536 2 0.7670 0.14926 0.300 0.484 0.004 0.212
#> SRR772537 4 0.6187 0.52121 0.000 0.184 0.144 0.672
#> SRR772538 4 0.5231 0.60267 0.028 0.296 0.000 0.676
#> SRR772539 1 0.2805 0.75438 0.888 0.012 0.000 0.100
#> SRR772540 1 0.3391 0.74499 0.884 0.020 0.068 0.028
#> SRR772541 1 0.2215 0.75380 0.936 0.024 0.024 0.016
#> SRR772542 4 0.8433 0.49734 0.244 0.124 0.100 0.532
#> SRR772543 4 0.8188 0.45160 0.304 0.120 0.064 0.512
#> SRR772544 3 0.2149 0.70536 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR772545 1 0.5200 0.58242 0.700 0.036 0.000 0.264
#> SRR772546 1 0.5790 0.44221 0.616 0.044 0.000 0.340
#> SRR772547 1 0.4375 0.70030 0.788 0.180 0.000 0.032
#> SRR772548 1 0.3667 0.75814 0.856 0.088 0.000 0.056
#> SRR772549 1 0.1297 0.76642 0.964 0.016 0.000 0.020
#> SRR772550 1 0.2021 0.76802 0.936 0.040 0.000 0.024
#> SRR772551 1 0.6454 0.36576 0.572 0.084 0.000 0.344
#> SRR772552 1 0.5119 0.71264 0.764 0.112 0.000 0.124
#> SRR772553 3 0.4789 0.67348 0.224 0.024 0.748 0.004
#> SRR772554 2 0.5425 0.73922 0.228 0.716 0.004 0.052
#> SRR772555 2 0.3216 0.65935 0.076 0.880 0.000 0.044
#> SRR772556 1 0.5697 -0.02925 0.488 0.024 0.000 0.488
#> SRR772557 1 0.5781 0.00414 0.492 0.028 0.000 0.480
#> SRR772558 1 0.2483 0.76478 0.916 0.052 0.000 0.032
#> SRR772559 1 0.2124 0.76316 0.932 0.040 0.000 0.028
#> SRR772560 1 0.2485 0.75201 0.916 0.064 0.004 0.016
#> SRR772561 3 0.1389 0.72065 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR772562 1 0.3598 0.70750 0.848 0.124 0.000 0.028
#> SRR772563 1 0.3088 0.69593 0.864 0.128 0.000 0.008
#> SRR772564 4 0.7799 0.50886 0.260 0.028 0.168 0.544
#> SRR772565 4 0.1796 0.71495 0.032 0.016 0.004 0.948
#> SRR772566 4 0.6114 0.15177 0.428 0.048 0.000 0.524
#> SRR772567 1 0.6224 0.28331 0.544 0.028 0.016 0.412
#> SRR772568 2 0.6701 0.49962 0.300 0.592 0.004 0.104
#> SRR772569 2 0.6431 0.57419 0.152 0.680 0.012 0.156
#> SRR772570 1 0.3834 0.75440 0.848 0.076 0.000 0.076
#> SRR772571 1 0.4675 0.62331 0.736 0.020 0.000 0.244
#> SRR772572 1 0.5910 0.62642 0.688 0.208 0.000 0.104
#> SRR772573 1 0.6240 0.59653 0.664 0.200 0.000 0.136
#> SRR772574 1 0.6229 0.01477 0.492 0.036 0.008 0.464
#> SRR772575 4 0.5756 0.17985 0.452 0.020 0.004 0.524
#> SRR772576 4 0.5508 0.60744 0.252 0.056 0.000 0.692
#> SRR772577 4 0.4206 0.70015 0.136 0.048 0.000 0.816
#> SRR772578 2 0.7884 0.11618 0.000 0.384 0.312 0.304
#> SRR772579 3 0.7305 0.41889 0.012 0.308 0.548 0.132
#> SRR772580 3 0.1118 0.72574 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR772581 4 0.2522 0.70557 0.012 0.016 0.052 0.920
#> SRR772582 4 0.4393 0.70154 0.016 0.088 0.064 0.832
#> SRR772583 1 0.2222 0.76953 0.924 0.016 0.000 0.060
#> SRR772584 1 0.2635 0.76609 0.904 0.020 0.000 0.076
#> SRR772585 1 0.1356 0.76446 0.960 0.008 0.000 0.032
#> SRR772586 3 0.4955 0.66637 0.244 0.024 0.728 0.004
#> SRR772587 1 0.7209 0.48237 0.596 0.116 0.024 0.264
#> SRR772588 1 0.4477 0.31631 0.688 0.312 0.000 0.000
#> SRR772589 1 0.2859 0.71004 0.880 0.112 0.000 0.008
#> SRR772590 3 0.0921 0.72713 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR772591 1 0.7098 0.05075 0.472 0.128 0.000 0.400
#> SRR772592 1 0.6919 0.27415 0.528 0.120 0.000 0.352
#> SRR772593 3 0.5581 0.58324 0.340 0.020 0.632 0.008
#> SRR772594 2 0.6561 -0.33503 0.004 0.472 0.064 0.460
#> SRR772595 4 0.7517 0.63001 0.160 0.160 0.056 0.624
#> SRR772596 3 0.4034 0.69876 0.180 0.012 0.804 0.004
#> SRR772597 3 0.0469 0.72780 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR772598 4 0.7647 0.26151 0.144 0.016 0.344 0.496
#> SRR772599 4 0.6294 0.65739 0.120 0.016 0.168 0.696
#> SRR772600 4 0.4149 0.70272 0.028 0.168 0.000 0.804
#> SRR772601 4 0.2256 0.70701 0.020 0.056 0.000 0.924
#> SRR772602 3 0.3668 0.61536 0.000 0.004 0.808 0.188
#> SRR772603 4 0.4990 0.67614 0.184 0.060 0.000 0.756
#> SRR772604 4 0.3308 0.72010 0.036 0.092 0.000 0.872
#> SRR772605 1 0.1639 0.75362 0.952 0.036 0.004 0.008
#> SRR772606 1 0.8027 0.25588 0.500 0.044 0.128 0.328
#> SRR772607 1 0.7151 0.43160 0.584 0.048 0.060 0.308
#> SRR772608 1 0.1629 0.76153 0.952 0.024 0.000 0.024
#> SRR772609 1 0.1913 0.76486 0.940 0.020 0.000 0.040
#> SRR772610 1 0.1635 0.75522 0.948 0.044 0.000 0.008
#> SRR772611 1 0.1118 0.75410 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR772612 4 0.3893 0.68991 0.008 0.196 0.000 0.796
#> SRR772613 4 0.3432 0.70678 0.012 0.096 0.020 0.872
#> SRR772614 4 0.5936 0.50507 0.324 0.056 0.000 0.620
#> SRR772615 1 0.5256 0.68838 0.748 0.024 0.028 0.200
#> SRR772616 1 0.2960 0.74976 0.892 0.084 0.004 0.020
#> SRR772617 4 0.6497 0.57083 0.016 0.160 0.144 0.680
#> SRR772618 4 0.7105 0.63934 0.076 0.128 0.124 0.672
#> SRR772619 2 0.4917 0.58249 0.020 0.748 0.220 0.012
#> SRR772620 2 0.4471 0.61905 0.036 0.796 0.164 0.004
#> SRR772621 2 0.7859 0.43857 0.296 0.448 0.004 0.252
#> SRR772622 1 0.6214 -0.04664 0.476 0.052 0.000 0.472
#> SRR772623 4 0.4820 0.51849 0.000 0.012 0.296 0.692
#> SRR772624 3 0.5993 0.46985 0.408 0.028 0.556 0.008
#> SRR772625 3 0.5187 0.66628 0.228 0.040 0.728 0.004
#> SRR772626 4 0.5511 0.14764 0.000 0.016 0.484 0.500
#> SRR772627 3 0.5938 -0.12518 0.000 0.036 0.488 0.476
#> SRR772628 1 0.6112 0.54899 0.660 0.068 0.008 0.264
#> SRR772629 4 0.5179 0.67173 0.220 0.052 0.000 0.728
#> SRR772630 1 0.6255 0.63481 0.680 0.164 0.004 0.152
#> SRR772631 3 0.5427 0.59243 0.336 0.020 0.640 0.004
#> SRR772632 2 0.3464 0.68571 0.108 0.860 0.000 0.032
#> SRR772633 2 0.4428 0.72343 0.276 0.720 0.004 0.000
#> SRR772634 1 0.8109 -0.02136 0.420 0.024 0.172 0.384
#> SRR772635 4 0.6543 0.62026 0.252 0.044 0.048 0.656
#> SRR772636 3 0.4824 0.67285 0.228 0.024 0.744 0.004
#> SRR772637 1 0.3088 0.76545 0.888 0.052 0.000 0.060
#> SRR772638 1 0.2996 0.76714 0.892 0.044 0.000 0.064
#> SRR772639 1 0.5495 0.67502 0.728 0.096 0.000 0.176
#> SRR772640 2 0.5540 0.69720 0.148 0.740 0.004 0.108
#> SRR772641 2 0.5613 0.69401 0.132 0.736 0.004 0.128
#> SRR772642 1 0.7721 0.31402 0.568 0.060 0.276 0.096
#> SRR772643 1 0.6798 -0.05179 0.524 0.028 0.404 0.044
#> SRR772644 1 0.2039 0.75502 0.940 0.036 0.016 0.008
#> SRR772645 1 0.1109 0.75545 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR772646 2 0.5381 0.72670 0.232 0.716 0.004 0.048
#> SRR772647 2 0.4483 0.72222 0.284 0.712 0.000 0.004
#> SRR772648 4 0.4379 0.70008 0.172 0.036 0.000 0.792
#> SRR772649 4 0.3229 0.72241 0.048 0.072 0.000 0.880
#> SRR772650 1 0.3991 0.70629 0.808 0.020 0.000 0.172
#> SRR772651 1 0.3013 0.76039 0.888 0.032 0.000 0.080
#> SRR772652 4 0.4983 0.60180 0.272 0.024 0.000 0.704
#> SRR772653 4 0.4149 0.70216 0.152 0.036 0.000 0.812
#> SRR772654 1 0.7682 0.27204 0.540 0.200 0.016 0.244
#> SRR772655 4 0.6675 0.52717 0.228 0.156 0.000 0.616
#> SRR772656 3 0.2125 0.70799 0.000 0.004 0.920 0.076
#> SRR772657 3 0.0592 0.72772 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772658 2 0.4885 0.57840 0.004 0.728 0.020 0.248
#> SRR772659 2 0.6474 0.18455 0.000 0.536 0.076 0.388
#> SRR772660 1 0.2594 0.73362 0.916 0.044 0.036 0.004
#> SRR772661 3 0.5696 0.53586 0.380 0.024 0.592 0.004
#> SRR772662 1 0.2744 0.76873 0.908 0.020 0.008 0.064
#> SRR772663 1 0.2670 0.76012 0.904 0.024 0.000 0.072
#> SRR772664 1 0.3852 0.71825 0.808 0.180 0.000 0.012
#> SRR772665 1 0.3384 0.75260 0.860 0.116 0.000 0.024
#> SRR772666 3 0.0817 0.72701 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR772667 1 0.1749 0.75859 0.952 0.024 0.012 0.012
#> SRR772668 3 0.5085 0.42903 0.000 0.020 0.676 0.304
#> SRR772669 4 0.7697 0.43289 0.048 0.104 0.292 0.556
#> SRR772670 1 0.0921 0.75358 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR772671 1 0.1724 0.76137 0.948 0.032 0.000 0.020
#> SRR772672 1 0.1296 0.75104 0.964 0.028 0.004 0.004
#> SRR772673 1 0.1302 0.74785 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR772674 3 0.1792 0.71397 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR772675 3 0.4614 0.67879 0.228 0.016 0.752 0.004
#> SRR772676 4 0.7247 0.57385 0.240 0.216 0.000 0.544
#> SRR772677 4 0.4663 0.71050 0.148 0.064 0.000 0.788
#> SRR772678 3 0.5487 0.59172 0.328 0.024 0.644 0.004
#> SRR772679 1 0.2021 0.76260 0.936 0.024 0.000 0.040
#> SRR772680 1 0.2909 0.76157 0.888 0.020 0.000 0.092
#> SRR772681 3 0.1576 0.71949 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR772682 1 0.1743 0.74745 0.940 0.056 0.000 0.004
#> SRR772683 1 0.3584 0.67367 0.836 0.152 0.008 0.004
#> SRR772685 4 0.6076 0.55737 0.056 0.196 0.036 0.712
#> SRR772686 3 0.1118 0.72607 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR772687 3 0.6272 0.35154 0.444 0.028 0.512 0.016
#> SRR772688 2 0.5799 0.68741 0.292 0.656 0.048 0.004
#> SRR772689 2 0.5755 0.69984 0.288 0.664 0.040 0.008
#> SRR772690 3 0.0592 0.72762 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR772691 3 0.3891 0.69997 0.148 0.020 0.828 0.004
#> SRR772692 3 0.8135 0.30090 0.352 0.020 0.432 0.196
#> SRR772693 1 0.8154 -0.08859 0.420 0.024 0.376 0.180
#> SRR772694 1 0.4475 0.72642 0.824 0.096 0.012 0.068
#> SRR772695 1 0.3176 0.76634 0.880 0.036 0.000 0.084
#> SRR772696 4 0.5800 0.62025 0.000 0.128 0.164 0.708
#> SRR772697 4 0.5728 0.29371 0.004 0.020 0.432 0.544
#> SRR772698 3 0.5664 0.56317 0.360 0.020 0.612 0.008
#> SRR772699 1 0.5679 0.55195 0.720 0.036 0.216 0.028
#> SRR772700 1 0.7271 0.49395 0.616 0.028 0.148 0.208
#> SRR772701 1 0.6214 0.00996 0.480 0.052 0.000 0.468
#> SRR772702 4 0.5800 0.69580 0.164 0.128 0.000 0.708
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR772341 2 0.5176 0.492767 0.040 0.636 0.000 0.012 0.312
#> SRR772342 2 0.5835 0.526456 0.072 0.624 0.000 0.028 0.276
#> SRR772343 2 0.2917 0.619802 0.052 0.888 0.000 0.028 0.032
#> SRR772344 4 0.5242 0.736907 0.024 0.052 0.044 0.760 0.120
#> SRR772345 4 0.5152 0.718117 0.056 0.044 0.052 0.780 0.068
#> SRR772346 1 0.6102 0.371285 0.580 0.032 0.004 0.060 0.324
#> SRR772347 1 0.4880 0.432935 0.696 0.016 0.000 0.036 0.252
#> SRR772348 2 0.3841 0.513109 0.188 0.780 0.000 0.032 0.000
#> SRR772349 2 0.3223 0.606299 0.064 0.868 0.000 0.052 0.016
#> SRR772350 3 0.7226 -0.196996 0.292 0.004 0.392 0.012 0.300
#> SRR772351 4 0.7954 0.208149 0.160 0.128 0.000 0.420 0.292
#> SRR772352 1 0.6466 0.323089 0.536 0.176 0.004 0.280 0.004
#> SRR772353 2 0.4812 0.527986 0.004 0.652 0.000 0.032 0.312
#> SRR772354 2 0.4540 0.498011 0.000 0.640 0.000 0.020 0.340
#> SRR772355 4 0.7701 0.512155 0.188 0.120 0.048 0.564 0.080
#> SRR772356 2 0.8735 -0.041830 0.252 0.344 0.016 0.148 0.240
#> SRR772357 2 0.4156 0.610567 0.004 0.784 0.004 0.044 0.164
#> SRR772358 2 0.3305 0.582480 0.088 0.860 0.020 0.032 0.000
#> SRR772359 2 0.6356 0.538160 0.020 0.588 0.004 0.124 0.264
#> SRR772360 2 0.8064 0.214699 0.192 0.420 0.008 0.092 0.288
#> SRR772361 3 0.1461 0.730336 0.004 0.000 0.952 0.016 0.028
#> SRR772362 4 0.3502 0.766053 0.004 0.104 0.016 0.848 0.028
#> SRR772363 4 0.3212 0.754621 0.008 0.068 0.044 0.872 0.008
#> SRR772364 5 0.4726 0.091533 0.328 0.012 0.008 0.004 0.648
#> SRR772365 5 0.5255 -0.219074 0.480 0.008 0.016 0.008 0.488
#> SRR772366 3 0.5681 0.466653 0.040 0.436 0.504 0.020 0.000
#> SRR772367 3 0.0807 0.732631 0.000 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR772368 2 0.4080 0.547446 0.016 0.812 0.128 0.036 0.008
#> SRR772369 2 0.6977 0.329727 0.208 0.512 0.008 0.256 0.016
#> SRR772370 2 0.6056 0.575812 0.088 0.680 0.000 0.128 0.104
#> SRR772371 1 0.2664 0.501582 0.904 0.008 0.012 0.028 0.048
#> SRR772372 1 0.3857 0.505228 0.848 0.032 0.064 0.040 0.016
#> SRR772373 2 0.7239 0.395804 0.040 0.480 0.000 0.224 0.256
#> SRR772374 4 0.4665 0.598568 0.000 0.260 0.000 0.692 0.048
#> SRR772375 3 0.0960 0.732821 0.000 0.004 0.972 0.016 0.008
#> SRR772376 4 0.7950 0.242114 0.136 0.312 0.144 0.408 0.000
#> SRR772377 3 0.4615 0.701424 0.004 0.220 0.724 0.052 0.000
#> SRR772378 2 0.4345 0.584138 0.012 0.748 0.000 0.028 0.212
#> SRR772379 2 0.2564 0.616953 0.024 0.904 0.000 0.052 0.020
#> SRR772380 2 0.3347 0.617456 0.024 0.864 0.000 0.056 0.056
#> SRR772381 3 0.1267 0.730822 0.004 0.000 0.960 0.012 0.024
#> SRR772382 5 0.6837 0.107428 0.384 0.148 0.000 0.024 0.444
#> SRR772383 1 0.7216 0.071489 0.476 0.244 0.000 0.036 0.244
#> SRR772384 3 0.5084 0.621373 0.000 0.332 0.616 0.052 0.000
#> SRR772385 3 0.4658 0.675760 0.004 0.296 0.672 0.028 0.000
#> SRR772386 4 0.6207 0.446276 0.024 0.048 0.016 0.548 0.364
#> SRR772387 4 0.5919 0.631584 0.012 0.016 0.100 0.660 0.212
#> SRR772388 2 0.4584 0.471360 0.256 0.708 0.000 0.020 0.016
#> SRR772389 2 0.6363 0.227688 0.388 0.496 0.000 0.024 0.092
#> SRR772390 3 0.3684 0.716159 0.004 0.192 0.788 0.016 0.000
#> SRR772391 2 0.4865 0.340038 0.004 0.536 0.000 0.016 0.444
#> SRR772392 5 0.4986 -0.148188 0.012 0.444 0.000 0.012 0.532
#> SRR772393 5 0.6951 -0.203673 0.388 0.008 0.164 0.012 0.428
#> SRR772394 1 0.7350 0.337605 0.492 0.024 0.180 0.020 0.284
#> SRR772395 2 0.5073 0.580117 0.008 0.708 0.000 0.088 0.196
#> SRR772396 2 0.6484 0.398117 0.256 0.608 0.020 0.028 0.088
#> SRR772397 2 0.6449 0.226497 0.112 0.500 0.000 0.020 0.368
#> SRR772398 1 0.5500 0.458294 0.696 0.016 0.072 0.012 0.204
#> SRR772399 1 0.6813 0.369293 0.552 0.036 0.076 0.024 0.312
#> SRR772400 5 0.8768 -0.136004 0.308 0.184 0.108 0.040 0.360
#> SRR772401 2 0.7114 0.203053 0.288 0.492 0.040 0.000 0.180
#> SRR772402 1 0.5290 0.370512 0.620 0.004 0.004 0.048 0.324
#> SRR772403 1 0.5803 0.304712 0.532 0.000 0.000 0.100 0.368
#> SRR772404 2 0.3537 0.608041 0.020 0.868 0.036 0.040 0.036
#> SRR772405 3 0.5271 0.546154 0.008 0.392 0.564 0.036 0.000
#> SRR772406 4 0.5167 0.490932 0.240 0.000 0.000 0.668 0.092
#> SRR772407 1 0.6866 0.223942 0.444 0.000 0.032 0.132 0.392
#> SRR772408 4 0.2865 0.758578 0.004 0.132 0.008 0.856 0.000
#> SRR772409 4 0.3646 0.758004 0.004 0.144 0.000 0.816 0.036
#> SRR772410 2 0.5115 0.560415 0.160 0.720 0.000 0.108 0.012
#> SRR772411 2 0.5879 0.302376 0.352 0.556 0.004 0.084 0.004
#> SRR772412 5 0.4726 0.146705 0.024 0.328 0.000 0.004 0.644
#> SRR772413 5 0.4809 0.344969 0.048 0.240 0.000 0.008 0.704
#> SRR772414 3 0.1281 0.730958 0.000 0.000 0.956 0.012 0.032
#> SRR772415 2 0.4936 0.548866 0.008 0.668 0.000 0.040 0.284
#> SRR772416 2 0.3707 0.621839 0.008 0.828 0.000 0.056 0.108
#> SRR772417 1 0.5291 0.276220 0.596 0.348 0.004 0.052 0.000
#> SRR772418 3 0.4454 0.688892 0.004 0.260 0.708 0.028 0.000
#> SRR772419 4 0.3006 0.754298 0.004 0.156 0.000 0.836 0.004
#> SRR772420 4 0.3607 0.688444 0.000 0.244 0.000 0.752 0.004
#> SRR772421 5 0.6317 0.280011 0.224 0.056 0.004 0.084 0.632
#> SRR772422 5 0.3991 0.454379 0.020 0.124 0.012 0.024 0.820
#> SRR772423 1 0.5102 0.329362 0.580 0.000 0.000 0.044 0.376
#> SRR772424 1 0.5645 0.216442 0.496 0.008 0.032 0.012 0.452
#> SRR772425 2 0.6646 0.132055 0.400 0.476 0.004 0.084 0.036
#> SRR772426 4 0.5329 0.305158 0.012 0.028 0.000 0.488 0.472
#> SRR772427 4 0.4209 0.662670 0.008 0.016 0.000 0.732 0.244
#> SRR772428 1 0.7640 0.040061 0.376 0.220 0.056 0.000 0.348
#> SRR772429 5 0.4722 -0.054240 0.012 0.412 0.004 0.000 0.572
#> SRR772430 2 0.4354 0.470613 0.000 0.624 0.000 0.008 0.368
#> SRR772431 5 0.3282 0.294832 0.188 0.008 0.000 0.000 0.804
#> SRR772432 5 0.3183 0.338493 0.156 0.016 0.000 0.000 0.828
#> SRR772433 5 0.5317 0.406615 0.144 0.148 0.004 0.004 0.700
#> SRR772434 5 0.5762 -0.005830 0.012 0.388 0.052 0.004 0.544
#> SRR772435 5 0.4184 0.362662 0.024 0.232 0.000 0.004 0.740
#> SRR772436 5 0.4488 0.388868 0.048 0.212 0.000 0.004 0.736
#> SRR772437 3 0.2722 0.675973 0.004 0.000 0.868 0.008 0.120
#> SRR772438 1 0.4060 0.480116 0.796 0.020 0.004 0.020 0.160
#> SRR772439 1 0.4350 0.505332 0.820 0.044 0.020 0.036 0.080
#> SRR772440 2 0.7486 0.069811 0.084 0.404 0.000 0.128 0.384
#> SRR772441 5 0.7400 0.275355 0.060 0.220 0.000 0.232 0.488
#> SRR772442 5 0.5076 -0.011575 0.408 0.012 0.004 0.012 0.564
#> SRR772443 1 0.5353 0.369711 0.604 0.004 0.000 0.060 0.332
#> SRR772444 5 0.5888 -0.092963 0.448 0.072 0.004 0.004 0.472
#> SRR772445 5 0.4328 0.430372 0.112 0.092 0.004 0.004 0.788
#> SRR772446 2 0.4338 0.536259 0.008 0.684 0.000 0.008 0.300
#> SRR772447 2 0.4309 0.519951 0.016 0.676 0.000 0.000 0.308
#> SRR772448 1 0.8331 0.274397 0.408 0.064 0.136 0.056 0.336
#> SRR772449 5 0.8300 -0.167335 0.340 0.068 0.088 0.084 0.420
#> SRR772450 4 0.2904 0.762401 0.004 0.112 0.008 0.868 0.008
#> SRR772451 4 0.2629 0.758884 0.000 0.136 0.000 0.860 0.004
#> SRR772452 2 0.4697 0.609203 0.092 0.780 0.000 0.040 0.088
#> SRR772453 2 0.4708 0.588397 0.160 0.760 0.000 0.032 0.048
#> SRR772454 5 0.5250 -0.081312 0.040 0.404 0.000 0.004 0.552
#> SRR772455 2 0.4403 0.611328 0.024 0.772 0.000 0.036 0.168
#> SRR772456 4 0.3289 0.754484 0.048 0.108 0.000 0.844 0.000
#> SRR772457 4 0.3129 0.758819 0.004 0.156 0.000 0.832 0.008
#> SRR772458 1 0.4660 0.470791 0.756 0.084 0.004 0.004 0.152
#> SRR772459 1 0.5013 0.477674 0.756 0.124 0.000 0.052 0.068
#> SRR772460 4 0.3387 0.668538 0.004 0.000 0.196 0.796 0.004
#> SRR772461 4 0.3387 0.669071 0.004 0.000 0.196 0.796 0.004
#> SRR772462 2 0.4883 0.525058 0.000 0.652 0.000 0.048 0.300
#> SRR772463 2 0.5514 0.551745 0.000 0.652 0.000 0.176 0.172
#> SRR772464 3 0.1082 0.731162 0.000 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR772465 1 0.6222 0.066989 0.512 0.392 0.000 0.048 0.048
#> SRR772466 2 0.7436 0.416400 0.296 0.484 0.000 0.104 0.116
#> SRR772467 4 0.3352 0.728320 0.000 0.192 0.004 0.800 0.004
#> SRR772468 4 0.3421 0.720114 0.000 0.204 0.008 0.788 0.000
#> SRR772469 2 0.5936 0.131394 0.436 0.488 0.000 0.052 0.024
#> SRR772470 2 0.5978 0.313851 0.364 0.552 0.000 0.040 0.044
#> SRR772471 2 0.2913 0.605705 0.040 0.876 0.004 0.080 0.000
#> SRR772472 2 0.2875 0.609049 0.052 0.884 0.000 0.056 0.008
#> SRR772473 5 0.4551 0.056296 0.348 0.000 0.008 0.008 0.636
#> SRR772474 5 0.4172 0.402112 0.092 0.036 0.012 0.036 0.824
#> SRR772475 3 0.5431 0.608216 0.008 0.356 0.584 0.052 0.000
#> SRR772476 4 0.3259 0.756062 0.012 0.044 0.008 0.872 0.064
#> SRR772477 4 0.3747 0.744715 0.012 0.048 0.084 0.844 0.012
#> SRR772478 2 0.4585 0.494225 0.000 0.628 0.000 0.020 0.352
#> SRR772479 2 0.4232 0.535540 0.000 0.676 0.000 0.012 0.312
#> SRR772480 5 0.5145 0.161657 0.312 0.008 0.012 0.024 0.644
#> SRR772481 5 0.4805 0.321059 0.192 0.036 0.008 0.020 0.744
#> SRR772482 2 0.7898 -0.006800 0.124 0.456 0.320 0.028 0.072
#> SRR772483 2 0.7075 0.079933 0.252 0.500 0.220 0.024 0.004
#> SRR772484 2 0.5505 0.276229 0.000 0.484 0.000 0.064 0.452
#> SRR772485 5 0.4829 -0.246833 0.000 0.484 0.000 0.020 0.496
#> SRR772486 1 0.3917 0.503794 0.848 0.044 0.044 0.044 0.020
#> SRR772487 1 0.4976 0.500649 0.788 0.048 0.076 0.032 0.056
#> SRR772488 2 0.6503 0.351244 0.000 0.480 0.000 0.220 0.300
#> SRR772489 2 0.6557 0.345324 0.000 0.472 0.000 0.240 0.288
#> SRR772490 5 0.7600 0.342448 0.180 0.272 0.032 0.028 0.488
#> SRR772491 1 0.7180 0.122893 0.448 0.276 0.008 0.012 0.256
#> SRR772492 4 0.2789 0.762290 0.000 0.092 0.020 0.880 0.008
#> SRR772493 4 0.2498 0.761613 0.004 0.100 0.004 0.888 0.004
#> SRR772494 4 0.2835 0.761675 0.000 0.112 0.016 0.868 0.004
#> SRR772495 4 0.3059 0.757270 0.004 0.108 0.028 0.860 0.000
#> SRR772496 4 0.4965 0.239934 0.028 0.452 0.000 0.520 0.000
#> SRR772497 2 0.2837 0.608921 0.016 0.876 0.004 0.100 0.004
#> SRR772498 1 0.7369 0.236187 0.448 0.040 0.380 0.024 0.108
#> SRR772499 1 0.7420 0.268325 0.484 0.052 0.352 0.048 0.064
#> SRR772500 4 0.4845 0.714944 0.020 0.084 0.000 0.752 0.144
#> SRR772501 4 0.4986 0.681250 0.064 0.024 0.000 0.732 0.180
#> SRR772502 1 0.7889 0.348551 0.496 0.216 0.028 0.060 0.200
#> SRR772503 1 0.8119 0.326041 0.452 0.140 0.032 0.080 0.296
#> SRR772504 4 0.5043 0.645809 0.028 0.000 0.164 0.736 0.072
#> SRR772505 4 0.4699 0.679254 0.020 0.012 0.168 0.764 0.036
#> SRR772506 4 0.4096 0.718661 0.040 0.200 0.000 0.760 0.000
#> SRR772507 4 0.3246 0.740024 0.008 0.184 0.000 0.808 0.000
#> SRR772508 2 0.4701 0.567403 0.000 0.700 0.004 0.044 0.252
#> SRR772509 3 0.4635 0.693969 0.000 0.232 0.716 0.048 0.004
#> SRR772510 3 0.0992 0.732050 0.000 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR772511 1 0.6554 0.386934 0.588 0.268 0.052 0.088 0.004
#> SRR772512 3 0.1661 0.727850 0.000 0.000 0.940 0.024 0.036
#> SRR772513 2 0.4303 0.601036 0.000 0.752 0.000 0.056 0.192
#> SRR772514 2 0.4767 0.601201 0.000 0.720 0.000 0.088 0.192
#> SRR772515 4 0.5939 0.711488 0.104 0.132 0.000 0.688 0.076
#> SRR772516 4 0.7286 0.443465 0.208 0.252 0.004 0.496 0.040
#> SRR772517 5 0.4726 -0.040890 0.000 0.400 0.000 0.020 0.580
#> SRR772518 2 0.4818 0.297579 0.000 0.520 0.000 0.020 0.460
#> SRR772519 2 0.4569 0.604825 0.000 0.748 0.000 0.148 0.104
#> SRR772520 4 0.4900 0.180138 0.000 0.464 0.000 0.512 0.024
#> SRR772521 1 0.4977 0.406272 0.680 0.000 0.016 0.036 0.268
#> SRR772522 1 0.5565 0.338518 0.592 0.000 0.040 0.024 0.344
#> SRR772523 5 0.5770 0.332296 0.168 0.040 0.000 0.108 0.684
#> SRR772524 4 0.7027 0.115282 0.160 0.032 0.000 0.448 0.360
#> SRR772525 3 0.1156 0.733870 0.008 0.008 0.968 0.008 0.008
#> SRR772526 4 0.2818 0.760677 0.000 0.128 0.004 0.860 0.008
#> SRR772527 4 0.3087 0.759536 0.004 0.128 0.012 0.852 0.004
#> SRR772528 3 0.4558 0.653430 0.000 0.324 0.652 0.024 0.000
#> SRR772529 1 0.6779 0.307910 0.528 0.084 0.024 0.024 0.340
#> SRR772530 5 0.7810 -0.009779 0.344 0.248 0.016 0.032 0.360
#> SRR772531 3 0.1200 0.731592 0.008 0.000 0.964 0.012 0.016
#> SRR772532 4 0.6257 0.639859 0.088 0.184 0.008 0.660 0.060
#> SRR772533 4 0.5377 0.699963 0.108 0.168 0.000 0.704 0.020
#> SRR772534 1 0.5170 0.405511 0.648 0.296 0.000 0.044 0.012
#> SRR772535 4 0.8880 0.228493 0.216 0.152 0.044 0.408 0.180
#> SRR772536 1 0.6952 0.277336 0.484 0.172 0.004 0.320 0.020
#> SRR772537 1 0.8377 0.265245 0.396 0.008 0.128 0.240 0.228
#> SRR772538 1 0.5470 0.439154 0.680 0.008 0.000 0.152 0.160
#> SRR772539 2 0.5075 0.509323 0.004 0.628 0.000 0.044 0.324
#> SRR772540 2 0.5632 0.562598 0.000 0.656 0.052 0.040 0.252
#> SRR772541 2 0.4605 0.554197 0.000 0.692 0.004 0.032 0.272
#> SRR772542 1 0.7313 0.455124 0.584 0.212 0.096 0.036 0.072
#> SRR772543 1 0.5780 0.465675 0.680 0.212 0.064 0.032 0.012
#> SRR772544 3 0.3155 0.664773 0.008 0.000 0.848 0.016 0.128
#> SRR772545 5 0.5637 -0.196175 0.028 0.444 0.000 0.028 0.500
#> SRR772546 5 0.6475 -0.200901 0.092 0.436 0.000 0.028 0.444
#> SRR772547 2 0.5460 0.336873 0.316 0.624 0.008 0.040 0.012
#> SRR772548 2 0.6262 0.143279 0.408 0.500 0.004 0.052 0.036
#> SRR772549 2 0.3331 0.612933 0.068 0.864 0.000 0.024 0.044
#> SRR772550 2 0.3940 0.597487 0.136 0.808 0.000 0.012 0.044
#> SRR772551 1 0.6274 0.397095 0.596 0.284 0.004 0.036 0.080
#> SRR772552 2 0.5380 0.168299 0.396 0.556 0.000 0.036 0.012
#> SRR772553 3 0.4567 0.701010 0.004 0.232 0.720 0.044 0.000
#> SRR772554 4 0.4561 0.718470 0.076 0.128 0.000 0.776 0.020
#> SRR772555 4 0.4584 0.698838 0.160 0.084 0.000 0.752 0.004
#> SRR772556 5 0.5476 0.135140 0.040 0.320 0.000 0.024 0.616
#> SRR772557 5 0.5144 0.064201 0.024 0.356 0.000 0.016 0.604
#> SRR772558 2 0.3569 0.611492 0.072 0.852 0.000 0.036 0.040
#> SRR772559 2 0.4364 0.601605 0.104 0.800 0.000 0.060 0.036
#> SRR772560 2 0.3107 0.594676 0.096 0.864 0.000 0.032 0.008
#> SRR772561 3 0.1913 0.719938 0.008 0.000 0.932 0.016 0.044
#> SRR772562 2 0.6089 0.450535 0.000 0.532 0.000 0.144 0.324
#> SRR772563 2 0.6372 0.506205 0.012 0.572 0.000 0.200 0.216
#> SRR772564 5 0.7347 0.267120 0.080 0.116 0.216 0.020 0.568
#> SRR772565 5 0.5948 -0.064345 0.376 0.012 0.052 0.012 0.548
#> SRR772566 1 0.6223 0.393307 0.604 0.236 0.008 0.008 0.144
#> SRR772567 2 0.7212 0.005568 0.396 0.412 0.008 0.028 0.156
#> SRR772568 4 0.6440 0.588403 0.140 0.236 0.000 0.592 0.032
#> SRR772569 4 0.6409 0.613891 0.172 0.100 0.012 0.656 0.060
#> SRR772570 2 0.5887 0.428506 0.304 0.600 0.000 0.072 0.024
#> SRR772571 2 0.6495 0.358532 0.072 0.480 0.000 0.044 0.404
#> SRR772572 1 0.6904 0.156446 0.500 0.344 0.000 0.084 0.072
#> SRR772573 1 0.5486 0.301807 0.616 0.320 0.000 0.028 0.036
#> SRR772574 5 0.7266 0.073678 0.080 0.328 0.012 0.080 0.500
#> SRR772575 5 0.7845 0.233962 0.288 0.316 0.012 0.036 0.348
#> SRR772576 5 0.5219 0.457140 0.076 0.152 0.004 0.032 0.736
#> SRR772577 5 0.4148 0.463758 0.020 0.140 0.008 0.028 0.804
#> SRR772578 4 0.7984 0.053962 0.312 0.024 0.212 0.408 0.044
#> SRR772579 1 0.7755 0.229382 0.452 0.092 0.300 0.152 0.004
#> SRR772580 3 0.1153 0.730853 0.004 0.000 0.964 0.008 0.024
#> SRR772581 5 0.5880 -0.148447 0.428 0.004 0.044 0.020 0.504
#> SRR772582 1 0.5948 0.259603 0.516 0.020 0.036 0.012 0.416
#> SRR772583 2 0.4684 0.561753 0.024 0.728 0.000 0.028 0.220
#> SRR772584 2 0.5251 0.458450 0.012 0.584 0.000 0.032 0.372
#> SRR772585 2 0.4835 0.462287 0.000 0.592 0.000 0.028 0.380
#> SRR772586 3 0.4852 0.644387 0.016 0.324 0.644 0.016 0.000
#> SRR772587 1 0.6148 0.321909 0.584 0.324 0.012 0.044 0.036
#> SRR772588 2 0.5344 0.096118 0.000 0.500 0.000 0.448 0.052
#> SRR772589 2 0.6084 0.508403 0.008 0.604 0.000 0.200 0.188
#> SRR772590 3 0.1012 0.731879 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR772591 1 0.5495 0.418349 0.672 0.212 0.000 0.012 0.104
#> SRR772592 1 0.5533 0.387360 0.624 0.296 0.000 0.012 0.068
#> SRR772593 3 0.4869 0.633661 0.004 0.344 0.624 0.028 0.000
#> SRR772594 1 0.5583 0.449867 0.684 0.028 0.024 0.232 0.032
#> SRR772595 1 0.7940 0.412198 0.548 0.124 0.044 0.124 0.160
#> SRR772596 3 0.3197 0.726636 0.000 0.140 0.836 0.024 0.000
#> SRR772597 3 0.1087 0.734312 0.000 0.008 0.968 0.008 0.016
#> SRR772598 5 0.8760 -0.055391 0.172 0.168 0.320 0.020 0.320
#> SRR772599 5 0.7318 0.188281 0.156 0.064 0.188 0.020 0.572
#> SRR772600 1 0.5864 0.245492 0.528 0.020 0.000 0.056 0.396
#> SRR772601 5 0.5779 0.025160 0.368 0.028 0.000 0.044 0.560
#> SRR772602 3 0.4130 0.568779 0.024 0.000 0.768 0.012 0.196
#> SRR772603 5 0.5647 0.438206 0.128 0.132 0.000 0.040 0.700
#> SRR772604 5 0.4911 0.000774 0.400 0.012 0.000 0.012 0.576
#> SRR772605 2 0.3457 0.622764 0.040 0.868 0.008 0.044 0.040
#> SRR772606 1 0.8161 0.214293 0.400 0.364 0.124 0.044 0.068
#> SRR772607 2 0.7329 -0.147640 0.420 0.428 0.048 0.044 0.060
#> SRR772608 2 0.4470 0.570786 0.008 0.720 0.000 0.028 0.244
#> SRR772609 2 0.4751 0.570811 0.008 0.692 0.000 0.036 0.264
#> SRR772610 2 0.4746 0.613197 0.016 0.760 0.000 0.100 0.124
#> SRR772611 2 0.4466 0.608519 0.000 0.748 0.000 0.076 0.176
#> SRR772612 1 0.4147 0.468779 0.776 0.000 0.004 0.048 0.172
#> SRR772613 1 0.5096 0.392100 0.636 0.000 0.020 0.024 0.320
#> SRR772614 1 0.6403 0.323342 0.576 0.184 0.000 0.016 0.224
#> SRR772615 2 0.6856 0.491891 0.216 0.600 0.020 0.040 0.124
#> SRR772616 2 0.5119 0.293721 0.324 0.636 0.016 0.016 0.008
#> SRR772617 5 0.7302 0.237044 0.124 0.028 0.136 0.108 0.604
#> SRR772618 5 0.6586 0.346044 0.100 0.052 0.116 0.056 0.676
#> SRR772619 4 0.4046 0.671077 0.032 0.008 0.180 0.780 0.000
#> SRR772620 4 0.4353 0.690036 0.044 0.028 0.140 0.788 0.000
#> SRR772621 4 0.6988 0.316341 0.012 0.212 0.004 0.460 0.312
#> SRR772622 5 0.7843 0.237259 0.200 0.300 0.000 0.088 0.412
#> SRR772623 5 0.7074 -0.087738 0.228 0.000 0.368 0.016 0.388
#> SRR772624 3 0.5407 0.546044 0.020 0.392 0.560 0.028 0.000
#> SRR772625 3 0.5674 0.622751 0.008 0.316 0.596 0.080 0.000
#> SRR772626 1 0.7472 0.261803 0.404 0.016 0.356 0.020 0.204
#> SRR772627 1 0.6919 0.354869 0.524 0.008 0.276 0.020 0.172
#> SRR772628 1 0.6396 0.272450 0.544 0.344 0.004 0.072 0.036
#> SRR772629 1 0.4718 0.462419 0.752 0.080 0.000 0.012 0.156
#> SRR772630 1 0.5157 0.316110 0.628 0.324 0.000 0.036 0.012
#> SRR772631 3 0.4339 0.675654 0.000 0.296 0.684 0.020 0.000
#> SRR772632 4 0.2712 0.725272 0.088 0.032 0.000 0.880 0.000
#> SRR772633 4 0.2470 0.762663 0.000 0.104 0.000 0.884 0.012
#> SRR772634 2 0.8912 -0.181154 0.252 0.336 0.128 0.032 0.252
#> SRR772635 5 0.8986 -0.032257 0.296 0.160 0.104 0.072 0.368
#> SRR772636 3 0.4806 0.682386 0.000 0.252 0.688 0.060 0.000
#> SRR772637 2 0.5488 0.568027 0.196 0.696 0.000 0.040 0.068
#> SRR772638 2 0.4557 0.592994 0.160 0.768 0.000 0.028 0.044
#> SRR772639 1 0.7001 0.019251 0.456 0.400 0.008 0.080 0.056
#> SRR772640 4 0.3693 0.730071 0.000 0.032 0.004 0.808 0.156
#> SRR772641 4 0.4014 0.745319 0.004 0.044 0.016 0.816 0.120
#> SRR772642 2 0.8203 0.190924 0.016 0.396 0.296 0.076 0.216
#> SRR772643 2 0.7858 0.162275 0.008 0.392 0.352 0.068 0.180
#> SRR772644 2 0.3241 0.612481 0.048 0.876 0.012 0.052 0.012
#> SRR772645 2 0.3310 0.621467 0.016 0.860 0.000 0.084 0.040
#> SRR772646 4 0.3854 0.748804 0.000 0.068 0.012 0.824 0.096
#> SRR772647 4 0.3779 0.752144 0.000 0.124 0.004 0.816 0.056
#> SRR772648 1 0.6343 0.087139 0.460 0.056 0.004 0.036 0.444
#> SRR772649 1 0.5846 0.365040 0.600 0.016 0.004 0.068 0.312
#> SRR772650 2 0.4948 0.348873 0.000 0.536 0.000 0.028 0.436
#> SRR772651 2 0.5818 0.426031 0.012 0.540 0.000 0.068 0.380
#> SRR772652 5 0.4409 0.432612 0.052 0.180 0.000 0.008 0.760
#> SRR772653 5 0.4854 0.224946 0.308 0.044 0.000 0.000 0.648
#> SRR772654 2 0.8290 0.162074 0.252 0.420 0.012 0.204 0.112
#> SRR772655 1 0.8571 0.032428 0.324 0.164 0.004 0.264 0.244
#> SRR772656 3 0.3210 0.668942 0.012 0.000 0.844 0.012 0.132
#> SRR772657 3 0.1211 0.731587 0.000 0.000 0.960 0.016 0.024
#> SRR772658 4 0.4847 0.653922 0.120 0.000 0.016 0.752 0.112
#> SRR772659 4 0.7456 -0.111172 0.320 0.000 0.044 0.416 0.220
#> SRR772660 2 0.3216 0.600833 0.048 0.868 0.016 0.068 0.000
#> SRR772661 3 0.4663 0.604890 0.000 0.376 0.604 0.020 0.000
#> SRR772662 2 0.5732 0.482237 0.008 0.592 0.008 0.060 0.332
#> SRR772663 2 0.5137 0.388394 0.000 0.536 0.000 0.040 0.424
#> SRR772664 2 0.5404 0.433354 0.264 0.636 0.000 0.100 0.000
#> SRR772665 2 0.5711 0.375539 0.296 0.600 0.000 0.100 0.004
#> SRR772666 3 0.1251 0.728926 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR772667 2 0.4847 0.610350 0.056 0.776 0.008 0.040 0.120
#> SRR772668 3 0.5537 0.352309 0.052 0.000 0.620 0.020 0.308
#> SRR772669 1 0.8550 0.226572 0.356 0.040 0.240 0.064 0.300
#> SRR772670 2 0.3985 0.625827 0.036 0.828 0.000 0.064 0.072
#> SRR772671 2 0.4014 0.627378 0.024 0.820 0.000 0.060 0.096
#> SRR772672 2 0.3968 0.629797 0.028 0.832 0.004 0.056 0.080
#> SRR772673 2 0.4528 0.612163 0.000 0.752 0.000 0.104 0.144
#> SRR772674 3 0.2907 0.677307 0.012 0.000 0.864 0.008 0.116
#> SRR772675 3 0.3995 0.712733 0.000 0.180 0.776 0.044 0.000
#> SRR772676 1 0.4271 0.483822 0.808 0.036 0.000 0.064 0.092
#> SRR772677 1 0.4822 0.358042 0.628 0.020 0.000 0.008 0.344
#> SRR772678 3 0.5116 0.647266 0.004 0.304 0.640 0.052 0.000
#> SRR772679 2 0.5111 0.411602 0.000 0.552 0.000 0.040 0.408
#> SRR772680 2 0.5203 0.520667 0.004 0.620 0.000 0.052 0.324
#> SRR772681 3 0.2074 0.715941 0.004 0.000 0.920 0.016 0.060
#> SRR772682 2 0.3895 0.618439 0.024 0.824 0.000 0.108 0.044
#> SRR772683 2 0.4503 0.538699 0.000 0.704 0.000 0.256 0.040
#> SRR772685 5 0.6126 0.266439 0.036 0.020 0.068 0.216 0.660
#> SRR772686 3 0.1195 0.731980 0.000 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR772687 3 0.7048 0.364505 0.172 0.348 0.456 0.012 0.012
#> SRR772688 4 0.4762 0.683275 0.004 0.280 0.024 0.684 0.008
#> SRR772689 4 0.4604 0.709629 0.016 0.232 0.016 0.728 0.008
#> SRR772690 3 0.0912 0.732612 0.000 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR772691 3 0.3730 0.722438 0.004 0.152 0.808 0.036 0.000
#> SRR772692 3 0.8252 0.224136 0.112 0.336 0.396 0.020 0.136
#> SRR772693 2 0.8365 0.006703 0.064 0.388 0.328 0.040 0.180
#> SRR772694 2 0.6643 0.562703 0.064 0.664 0.036 0.136 0.100
#> SRR772695 2 0.5476 0.602150 0.056 0.704 0.000 0.056 0.184
#> SRR772696 5 0.7861 -0.164845 0.296 0.004 0.304 0.052 0.344
#> SRR772697 3 0.7212 -0.079252 0.264 0.008 0.476 0.020 0.232
#> SRR772698 3 0.4553 0.651984 0.004 0.328 0.652 0.016 0.000
#> SRR772699 2 0.6370 0.362372 0.044 0.636 0.240 0.040 0.040
#> SRR772700 2 0.8249 0.276807 0.084 0.496 0.140 0.056 0.224
#> SRR772701 5 0.6757 0.136066 0.216 0.388 0.000 0.004 0.392
#> SRR772702 1 0.5739 0.183957 0.504 0.044 0.000 0.020 0.432
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR772341 1 0.599 0.156457 0.464 0.084 0.000 0.020 0.016 0.416
#> SRR772342 1 0.660 0.145265 0.460 0.068 0.000 0.020 0.076 0.376
#> SRR772343 6 0.581 0.336487 0.280 0.000 0.008 0.088 0.036 0.588
#> SRR772344 4 0.437 0.709071 0.084 0.096 0.016 0.780 0.000 0.024
#> SRR772345 4 0.436 0.645389 0.012 0.168 0.020 0.764 0.020 0.016
#> SRR772346 2 0.594 0.310499 0.028 0.640 0.000 0.040 0.188 0.104
#> SRR772347 2 0.556 0.285468 0.012 0.624 0.000 0.020 0.248 0.096
#> SRR772348 6 0.435 0.454877 0.088 0.004 0.004 0.012 0.128 0.764
#> SRR772349 6 0.382 0.473182 0.160 0.000 0.000 0.028 0.028 0.784
#> SRR772350 5 0.729 -0.010188 0.068 0.268 0.324 0.000 0.332 0.008
#> SRR772351 4 0.836 -0.091417 0.172 0.300 0.000 0.320 0.112 0.096
#> SRR772352 5 0.752 0.319997 0.008 0.132 0.000 0.192 0.384 0.284
#> SRR772353 1 0.426 0.484457 0.740 0.000 0.000 0.076 0.008 0.176
#> SRR772354 1 0.422 0.498923 0.764 0.012 0.000 0.060 0.008 0.156
#> SRR772355 4 0.800 0.350168 0.072 0.124 0.040 0.516 0.140 0.108
#> SRR772356 2 0.891 -0.000239 0.124 0.312 0.008 0.192 0.172 0.192
#> SRR772357 6 0.510 0.184104 0.372 0.016 0.004 0.028 0.008 0.572
#> SRR772358 6 0.432 0.487723 0.132 0.000 0.012 0.036 0.044 0.776
#> SRR772359 1 0.837 0.160006 0.372 0.048 0.020 0.212 0.104 0.244
#> SRR772360 1 0.904 0.003803 0.284 0.128 0.016 0.148 0.172 0.252
#> SRR772361 3 0.366 0.689007 0.000 0.140 0.804 0.008 0.040 0.008
#> SRR772362 4 0.213 0.734606 0.016 0.012 0.020 0.924 0.004 0.024
#> SRR772363 4 0.105 0.727087 0.004 0.012 0.020 0.964 0.000 0.000
#> SRR772364 2 0.643 0.329357 0.328 0.480 0.012 0.004 0.160 0.016
#> SRR772365 2 0.751 0.244400 0.220 0.428 0.060 0.004 0.256 0.032
#> SRR772366 3 0.523 0.454470 0.008 0.000 0.528 0.016 0.040 0.408
#> SRR772367 3 0.189 0.719839 0.004 0.068 0.916 0.000 0.000 0.012
#> SRR772368 6 0.598 0.388566 0.160 0.000 0.144 0.060 0.008 0.628
#> SRR772369 6 0.775 0.178485 0.056 0.060 0.008 0.272 0.172 0.432
#> SRR772370 6 0.677 0.285701 0.244 0.060 0.000 0.160 0.016 0.520
#> SRR772371 5 0.568 0.173565 0.000 0.380 0.012 0.004 0.504 0.100
#> SRR772372 5 0.619 0.320029 0.000 0.252 0.044 0.000 0.544 0.160
#> SRR772373 1 0.710 0.266871 0.440 0.036 0.000 0.336 0.052 0.136
#> SRR772374 4 0.423 0.598561 0.152 0.004 0.000 0.744 0.000 0.100
#> SRR772375 3 0.179 0.719124 0.000 0.068 0.920 0.000 0.004 0.008
#> SRR772376 4 0.748 0.103672 0.012 0.000 0.160 0.416 0.140 0.272
#> SRR772377 3 0.373 0.692327 0.008 0.000 0.776 0.016 0.012 0.188
#> SRR772378 1 0.529 0.082237 0.480 0.008 0.004 0.028 0.020 0.460
#> SRR772379 6 0.436 0.454553 0.184 0.000 0.000 0.044 0.032 0.740
#> SRR772380 6 0.446 0.350788 0.280 0.004 0.000 0.024 0.016 0.676
#> SRR772381 3 0.269 0.707126 0.004 0.120 0.860 0.004 0.012 0.000
#> SRR772382 2 0.771 0.170094 0.288 0.364 0.000 0.016 0.200 0.132
#> SRR772383 5 0.844 0.136771 0.184 0.248 0.000 0.080 0.336 0.152
#> SRR772384 3 0.489 0.613258 0.028 0.000 0.644 0.016 0.016 0.296
#> SRR772385 3 0.478 0.638090 0.012 0.004 0.668 0.016 0.024 0.276
#> SRR772386 4 0.688 0.426432 0.248 0.196 0.012 0.500 0.020 0.024
#> SRR772387 4 0.630 0.578192 0.096 0.196 0.048 0.624 0.020 0.016
#> SRR772388 6 0.553 0.425521 0.124 0.004 0.000 0.012 0.260 0.600
#> SRR772389 5 0.647 0.060938 0.144 0.024 0.000 0.016 0.460 0.356
#> SRR772390 3 0.310 0.703457 0.008 0.000 0.828 0.008 0.008 0.148
#> SRR772391 1 0.398 0.486515 0.748 0.016 0.000 0.020 0.004 0.212
#> SRR772392 1 0.354 0.491781 0.836 0.044 0.000 0.008 0.028 0.084
#> SRR772393 2 0.695 0.297161 0.040 0.564 0.184 0.008 0.148 0.056
#> SRR772394 2 0.708 0.203500 0.012 0.512 0.184 0.004 0.196 0.092
#> SRR772395 1 0.680 0.336056 0.564 0.004 0.036 0.176 0.048 0.172
#> SRR772396 6 0.728 0.347666 0.140 0.108 0.020 0.012 0.196 0.524
#> SRR772397 1 0.698 0.107345 0.376 0.188 0.000 0.008 0.056 0.372
#> SRR772398 5 0.684 0.116884 0.016 0.384 0.040 0.016 0.440 0.104
#> SRR772399 2 0.750 0.142126 0.052 0.496 0.068 0.012 0.244 0.128
#> SRR772400 2 0.788 0.290588 0.076 0.508 0.092 0.028 0.104 0.192
#> SRR772401 6 0.789 -0.113044 0.120 0.260 0.032 0.016 0.136 0.436
#> SRR772402 2 0.492 0.331688 0.016 0.652 0.004 0.016 0.288 0.024
#> SRR772403 2 0.506 0.368122 0.052 0.656 0.000 0.040 0.252 0.000
#> SRR772404 6 0.445 0.353992 0.288 0.000 0.016 0.016 0.008 0.672
#> SRR772405 3 0.510 0.605323 0.028 0.004 0.636 0.012 0.024 0.296
#> SRR772406 4 0.590 0.434481 0.008 0.200 0.000 0.592 0.180 0.020
#> SRR772407 2 0.602 0.371363 0.024 0.636 0.024 0.092 0.208 0.016
#> SRR772408 4 0.130 0.735468 0.004 0.004 0.000 0.952 0.004 0.036
#> SRR772409 4 0.199 0.734320 0.036 0.000 0.000 0.912 0.000 0.052
#> SRR772410 6 0.648 0.451062 0.116 0.016 0.000 0.144 0.124 0.600
#> SRR772411 6 0.636 0.365102 0.040 0.032 0.000 0.128 0.208 0.592
#> SRR772412 1 0.333 0.447804 0.836 0.112 0.000 0.004 0.024 0.024
#> SRR772413 1 0.416 0.333513 0.748 0.196 0.000 0.004 0.036 0.016
#> SRR772414 3 0.195 0.718958 0.000 0.088 0.904 0.000 0.004 0.004
#> SRR772415 1 0.513 0.412766 0.636 0.000 0.000 0.116 0.008 0.240
#> SRR772416 6 0.581 -0.016533 0.424 0.000 0.000 0.116 0.016 0.444
#> SRR772417 5 0.564 0.404426 0.000 0.060 0.000 0.040 0.500 0.400
#> SRR772418 3 0.349 0.696537 0.004 0.000 0.788 0.016 0.008 0.184
#> SRR772419 4 0.226 0.721757 0.016 0.000 0.000 0.892 0.004 0.088
#> SRR772420 4 0.300 0.701906 0.048 0.000 0.000 0.840 0.000 0.112
#> SRR772421 1 0.780 -0.372183 0.364 0.360 0.012 0.128 0.104 0.032
#> SRR772422 1 0.552 0.169117 0.672 0.220 0.032 0.024 0.028 0.024
#> SRR772423 2 0.510 0.328355 0.072 0.616 0.000 0.016 0.296 0.000
#> SRR772424 2 0.547 0.383860 0.132 0.660 0.008 0.008 0.180 0.012
#> SRR772425 5 0.720 0.342411 0.036 0.020 0.028 0.148 0.484 0.284
#> SRR772426 4 0.625 0.294083 0.356 0.132 0.000 0.476 0.032 0.004
#> SRR772427 4 0.447 0.617018 0.220 0.048 0.004 0.716 0.008 0.004
#> SRR772428 2 0.809 0.093776 0.272 0.300 0.028 0.000 0.156 0.244
#> SRR772429 1 0.534 0.419647 0.676 0.168 0.004 0.000 0.036 0.116
#> SRR772430 1 0.358 0.465863 0.748 0.000 0.004 0.008 0.004 0.236
#> SRR772431 2 0.502 0.382169 0.372 0.560 0.000 0.008 0.060 0.000
#> SRR772432 2 0.529 0.337953 0.428 0.472 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR772433 1 0.569 0.118841 0.628 0.228 0.004 0.000 0.088 0.052
#> SRR772434 1 0.575 0.396667 0.672 0.080 0.048 0.000 0.036 0.164
#> SRR772435 1 0.391 0.429953 0.800 0.132 0.004 0.004 0.028 0.032
#> SRR772436 1 0.376 0.347137 0.804 0.120 0.000 0.004 0.060 0.012
#> SRR772437 3 0.393 0.662556 0.012 0.192 0.764 0.000 0.024 0.008
#> SRR772438 2 0.607 0.097764 0.020 0.508 0.012 0.000 0.348 0.112
#> SRR772439 5 0.646 0.339930 0.004 0.232 0.064 0.000 0.544 0.156
#> SRR772440 1 0.747 0.140204 0.380 0.216 0.004 0.052 0.028 0.320
#> SRR772441 2 0.757 0.149704 0.272 0.420 0.000 0.172 0.024 0.112
#> SRR772442 2 0.608 0.252796 0.248 0.488 0.000 0.004 0.256 0.004
#> SRR772443 5 0.598 -0.001672 0.124 0.320 0.000 0.024 0.528 0.004
#> SRR772444 2 0.737 0.069122 0.188 0.380 0.012 0.000 0.328 0.092
#> SRR772445 1 0.621 0.057008 0.556 0.312 0.040 0.004 0.056 0.032
#> SRR772446 1 0.582 0.190564 0.492 0.024 0.000 0.040 0.032 0.412
#> SRR772447 1 0.541 0.138824 0.472 0.044 0.000 0.012 0.016 0.456
#> SRR772448 2 0.710 0.264121 0.036 0.540 0.104 0.000 0.140 0.180
#> SRR772449 2 0.653 0.343233 0.024 0.624 0.084 0.012 0.116 0.140
#> SRR772450 4 0.141 0.731732 0.016 0.004 0.000 0.952 0.008 0.020
#> SRR772451 4 0.153 0.734699 0.016 0.004 0.000 0.944 0.004 0.032
#> SRR772452 6 0.606 0.389425 0.252 0.016 0.000 0.044 0.096 0.592
#> SRR772453 6 0.509 0.486494 0.152 0.000 0.000 0.048 0.100 0.700
#> SRR772454 1 0.400 0.335025 0.784 0.104 0.000 0.000 0.096 0.016
#> SRR772455 6 0.606 -0.003712 0.432 0.020 0.000 0.064 0.032 0.452
#> SRR772456 4 0.247 0.730514 0.004 0.000 0.000 0.888 0.060 0.048
#> SRR772457 4 0.170 0.735513 0.024 0.000 0.000 0.928 0.000 0.048
#> SRR772458 5 0.677 0.306047 0.072 0.252 0.000 0.004 0.496 0.176
#> SRR772459 5 0.569 0.376611 0.028 0.192 0.000 0.012 0.640 0.128
#> SRR772460 4 0.405 0.640120 0.000 0.100 0.108 0.780 0.008 0.004
#> SRR772461 4 0.335 0.673971 0.000 0.072 0.088 0.832 0.004 0.004
#> SRR772462 1 0.510 0.416109 0.624 0.000 0.004 0.092 0.004 0.276
#> SRR772463 1 0.613 0.222139 0.452 0.000 0.000 0.232 0.008 0.308
#> SRR772464 3 0.243 0.711444 0.004 0.116 0.872 0.004 0.000 0.004
#> SRR772465 5 0.594 0.464976 0.040 0.060 0.000 0.044 0.628 0.228
#> SRR772466 5 0.731 0.110926 0.160 0.044 0.000 0.060 0.464 0.272
#> SRR772467 4 0.298 0.716772 0.024 0.000 0.012 0.856 0.004 0.104
#> SRR772468 4 0.275 0.714264 0.036 0.000 0.004 0.864 0.000 0.096
#> SRR772469 6 0.630 0.345002 0.084 0.036 0.000 0.040 0.268 0.572
#> SRR772470 6 0.592 0.302891 0.112 0.008 0.000 0.024 0.300 0.556
#> SRR772471 6 0.459 0.431856 0.176 0.000 0.000 0.096 0.012 0.716
#> SRR772472 6 0.405 0.448665 0.172 0.000 0.000 0.056 0.012 0.760
#> SRR772473 2 0.394 0.433347 0.148 0.780 0.000 0.004 0.060 0.008
#> SRR772474 2 0.570 0.389536 0.292 0.600 0.000 0.024 0.044 0.040
#> SRR772475 3 0.480 0.583922 0.004 0.000 0.624 0.028 0.020 0.324
#> SRR772476 4 0.137 0.732902 0.036 0.012 0.004 0.948 0.000 0.000
#> SRR772477 4 0.250 0.716429 0.004 0.052 0.028 0.900 0.008 0.008
#> SRR772478 1 0.492 0.437674 0.664 0.012 0.004 0.040 0.012 0.268
#> SRR772479 1 0.476 0.357826 0.612 0.012 0.000 0.020 0.012 0.344
#> SRR772480 2 0.459 0.423728 0.208 0.712 0.000 0.008 0.064 0.008
#> SRR772481 2 0.544 0.404536 0.316 0.600 0.012 0.016 0.048 0.008
#> SRR772482 6 0.869 0.044848 0.076 0.076 0.248 0.072 0.128 0.400
#> SRR772483 6 0.633 0.096145 0.024 0.040 0.120 0.016 0.172 0.628
#> SRR772484 1 0.376 0.499765 0.784 0.008 0.000 0.052 0.000 0.156
#> SRR772485 1 0.268 0.502808 0.868 0.004 0.000 0.020 0.004 0.104
#> SRR772486 5 0.679 0.322100 0.016 0.180 0.056 0.008 0.552 0.188
#> SRR772487 5 0.755 0.255611 0.016 0.212 0.136 0.004 0.456 0.176
#> SRR772488 1 0.576 0.361660 0.540 0.004 0.000 0.288 0.004 0.164
#> SRR772489 1 0.573 0.380388 0.568 0.012 0.000 0.276 0.004 0.140
#> SRR772490 2 0.767 -0.164134 0.308 0.360 0.004 0.028 0.068 0.232
#> SRR772491 2 0.743 -0.004596 0.132 0.368 0.000 0.016 0.128 0.356
#> SRR772492 4 0.146 0.731638 0.008 0.004 0.012 0.952 0.004 0.020
#> SRR772493 4 0.152 0.731852 0.008 0.004 0.008 0.948 0.004 0.028
#> SRR772494 4 0.135 0.734238 0.016 0.000 0.000 0.952 0.008 0.024
#> SRR772495 4 0.131 0.732349 0.000 0.000 0.016 0.952 0.004 0.028
#> SRR772496 4 0.497 0.392596 0.080 0.000 0.000 0.628 0.008 0.284
#> SRR772497 6 0.520 0.395645 0.172 0.000 0.004 0.172 0.004 0.648
#> SRR772498 3 0.812 -0.216868 0.012 0.228 0.304 0.008 0.260 0.188
#> SRR772499 5 0.772 0.100672 0.000 0.232 0.252 0.000 0.276 0.240
#> SRR772500 4 0.409 0.680944 0.192 0.028 0.000 0.756 0.008 0.016
#> SRR772501 4 0.482 0.619163 0.196 0.068 0.000 0.708 0.020 0.008
#> SRR772502 2 0.701 0.117130 0.032 0.488 0.008 0.040 0.132 0.300
#> SRR772503 2 0.686 0.232763 0.024 0.544 0.004 0.072 0.124 0.232
#> SRR772504 4 0.491 0.605727 0.008 0.180 0.100 0.700 0.012 0.000
#> SRR772505 4 0.477 0.644282 0.000 0.128 0.096 0.740 0.020 0.016
#> SRR772506 4 0.275 0.710466 0.016 0.000 0.000 0.856 0.008 0.120
#> SRR772507 4 0.275 0.718175 0.016 0.000 0.004 0.864 0.008 0.108
#> SRR772508 1 0.549 0.343861 0.576 0.000 0.008 0.096 0.008 0.312
#> SRR772509 3 0.443 0.670467 0.032 0.000 0.724 0.016 0.012 0.216
#> SRR772510 3 0.273 0.706264 0.004 0.124 0.856 0.004 0.012 0.000
#> SRR772511 5 0.710 0.438756 0.004 0.084 0.016 0.128 0.476 0.292
#> SRR772512 3 0.405 0.678277 0.004 0.156 0.780 0.012 0.040 0.008
#> SRR772513 1 0.580 0.208931 0.484 0.000 0.004 0.124 0.008 0.380
#> SRR772514 1 0.580 0.093533 0.428 0.000 0.000 0.180 0.000 0.392
#> SRR772515 4 0.630 0.605376 0.092 0.040 0.000 0.640 0.124 0.104
#> SRR772516 4 0.802 0.174978 0.048 0.100 0.008 0.392 0.164 0.288
#> SRR772517 1 0.357 0.506075 0.824 0.040 0.000 0.024 0.004 0.108
#> SRR772518 1 0.457 0.470705 0.704 0.016 0.000 0.040 0.008 0.232
#> SRR772519 6 0.613 0.167223 0.312 0.028 0.000 0.156 0.000 0.504
#> SRR772520 4 0.554 0.254797 0.156 0.004 0.000 0.560 0.000 0.280
#> SRR772521 2 0.566 0.088521 0.036 0.516 0.000 0.016 0.396 0.036
#> SRR772522 2 0.541 0.311429 0.060 0.636 0.008 0.028 0.264 0.004
#> SRR772523 2 0.672 0.317124 0.392 0.412 0.000 0.100 0.092 0.004
#> SRR772524 4 0.682 0.282396 0.224 0.164 0.000 0.512 0.096 0.004
#> SRR772525 3 0.235 0.714174 0.000 0.112 0.876 0.004 0.000 0.008
#> SRR772526 4 0.224 0.728186 0.020 0.000 0.008 0.900 0.000 0.072
#> SRR772527 4 0.204 0.730138 0.016 0.000 0.008 0.912 0.000 0.064
#> SRR772528 3 0.447 0.633955 0.012 0.000 0.668 0.012 0.016 0.292
#> SRR772529 2 0.685 0.208206 0.052 0.524 0.004 0.016 0.208 0.196
#> SRR772530 2 0.711 0.161020 0.108 0.472 0.016 0.012 0.076 0.316
#> SRR772531 3 0.205 0.716964 0.004 0.096 0.896 0.000 0.004 0.000
#> SRR772532 4 0.710 0.325311 0.080 0.200 0.000 0.472 0.012 0.236
#> SRR772533 4 0.629 0.569108 0.032 0.116 0.000 0.636 0.096 0.120
#> SRR772534 5 0.702 0.393478 0.016 0.164 0.000 0.056 0.408 0.356
#> SRR772535 2 0.875 0.149714 0.100 0.376 0.032 0.192 0.088 0.212
#> SRR772536 5 0.760 0.215111 0.004 0.152 0.004 0.168 0.360 0.312
#> SRR772537 2 0.844 0.129181 0.028 0.380 0.152 0.212 0.196 0.032
#> SRR772538 2 0.707 0.080323 0.040 0.412 0.004 0.160 0.360 0.024
#> SRR772539 1 0.605 0.243434 0.500 0.040 0.000 0.092 0.004 0.364
#> SRR772540 6 0.736 -0.110206 0.384 0.044 0.052 0.108 0.012 0.400
#> SRR772541 1 0.542 0.317588 0.560 0.000 0.004 0.092 0.008 0.336
#> SRR772542 6 0.745 -0.415568 0.016 0.240 0.064 0.004 0.296 0.380
#> SRR772543 5 0.729 0.309590 0.000 0.176 0.116 0.004 0.400 0.304
#> SRR772544 3 0.458 0.636373 0.020 0.200 0.728 0.004 0.040 0.008
#> SRR772545 1 0.456 0.469509 0.768 0.032 0.000 0.016 0.104 0.080
#> SRR772546 1 0.596 0.421702 0.656 0.068 0.000 0.024 0.148 0.104
#> SRR772547 6 0.494 0.327552 0.064 0.020 0.004 0.016 0.176 0.720
#> SRR772548 6 0.709 -0.112393 0.120 0.012 0.004 0.084 0.364 0.416
#> SRR772549 6 0.475 0.377144 0.276 0.004 0.000 0.012 0.048 0.660
#> SRR772550 6 0.592 0.344159 0.284 0.012 0.000 0.012 0.136 0.556
#> SRR772551 6 0.711 -0.375293 0.120 0.160 0.000 0.000 0.304 0.416
#> SRR772552 6 0.585 0.236164 0.060 0.112 0.000 0.004 0.196 0.628
#> SRR772553 3 0.369 0.694207 0.008 0.000 0.788 0.016 0.016 0.172
#> SRR772554 4 0.497 0.638962 0.024 0.040 0.000 0.688 0.020 0.228
#> SRR772555 4 0.520 0.640842 0.004 0.032 0.000 0.680 0.092 0.192
#> SRR772556 1 0.527 0.458950 0.728 0.064 0.000 0.060 0.108 0.040
#> SRR772557 1 0.431 0.473659 0.792 0.064 0.000 0.012 0.064 0.068
#> SRR772558 6 0.457 0.459647 0.184 0.012 0.000 0.028 0.040 0.736
#> SRR772559 6 0.488 0.468963 0.164 0.000 0.000 0.040 0.084 0.712
#> SRR772560 6 0.291 0.475253 0.152 0.000 0.000 0.000 0.020 0.828
#> SRR772561 3 0.414 0.662205 0.004 0.180 0.764 0.012 0.028 0.012
#> SRR772562 1 0.538 0.426678 0.620 0.004 0.000 0.204 0.004 0.168
#> SRR772563 1 0.586 0.292170 0.528 0.000 0.000 0.292 0.012 0.168
#> SRR772564 1 0.819 -0.119506 0.436 0.144 0.184 0.016 0.172 0.048
#> SRR772565 1 0.824 -0.466464 0.316 0.300 0.100 0.008 0.228 0.048
#> SRR772566 5 0.756 0.358052 0.084 0.236 0.000 0.032 0.428 0.220
#> SRR772567 6 0.854 -0.001975 0.220 0.196 0.012 0.036 0.264 0.272
#> SRR772568 4 0.726 0.476194 0.072 0.156 0.000 0.528 0.064 0.180
#> SRR772569 4 0.709 0.526629 0.044 0.160 0.004 0.564 0.112 0.116
#> SRR772570 6 0.766 0.370919 0.144 0.044 0.000 0.108 0.268 0.436
#> SRR772571 1 0.714 0.338749 0.512 0.068 0.000 0.084 0.076 0.260
#> SRR772572 5 0.642 0.419436 0.100 0.036 0.000 0.068 0.608 0.188
#> SRR772573 5 0.571 0.465308 0.036 0.052 0.000 0.032 0.628 0.252
#> SRR772574 1 0.823 0.263478 0.424 0.176 0.000 0.132 0.136 0.132
#> SRR772575 2 0.819 0.010817 0.264 0.376 0.020 0.052 0.068 0.220
#> SRR772576 1 0.565 -0.124566 0.456 0.452 0.000 0.016 0.012 0.064
#> SRR772577 1 0.601 0.061526 0.516 0.380 0.016 0.020 0.020 0.048
#> SRR772578 4 0.814 0.044530 0.000 0.208 0.188 0.396 0.148 0.060
#> SRR772579 5 0.883 0.116143 0.000 0.180 0.228 0.120 0.240 0.232
#> SRR772580 3 0.249 0.709991 0.004 0.124 0.864 0.000 0.000 0.008
#> SRR772581 2 0.369 0.419936 0.072 0.824 0.000 0.004 0.072 0.028
#> SRR772582 2 0.428 0.389404 0.032 0.780 0.008 0.008 0.140 0.032
#> SRR772583 1 0.574 0.147214 0.492 0.044 0.000 0.004 0.052 0.408
#> SRR772584 1 0.522 0.487961 0.708 0.068 0.000 0.044 0.020 0.160
#> SRR772585 1 0.427 0.491743 0.768 0.008 0.000 0.068 0.016 0.140
#> SRR772586 3 0.472 0.632622 0.004 0.004 0.672 0.012 0.040 0.268
#> SRR772587 5 0.738 0.453029 0.052 0.088 0.024 0.068 0.524 0.244
#> SRR772588 4 0.565 0.114142 0.236 0.000 0.000 0.536 0.000 0.228
#> SRR772589 1 0.587 0.285827 0.480 0.000 0.000 0.276 0.000 0.244
#> SRR772590 3 0.328 0.698036 0.000 0.140 0.824 0.004 0.020 0.012
#> SRR772591 5 0.648 0.423375 0.060 0.128 0.000 0.004 0.504 0.304
#> SRR772592 5 0.613 0.431294 0.048 0.116 0.000 0.000 0.524 0.312
#> SRR772593 3 0.440 0.654949 0.012 0.004 0.704 0.016 0.012 0.252
#> SRR772594 5 0.830 0.147969 0.020 0.216 0.060 0.180 0.420 0.104
#> SRR772595 5 0.927 0.114570 0.180 0.180 0.076 0.076 0.336 0.152
#> SRR772596 3 0.247 0.709822 0.008 0.000 0.884 0.012 0.004 0.092
#> SRR772597 3 0.245 0.721756 0.004 0.068 0.892 0.000 0.004 0.032
#> SRR772598 2 0.819 0.102428 0.060 0.368 0.200 0.004 0.104 0.264
#> SRR772599 2 0.729 0.302999 0.120 0.540 0.160 0.000 0.064 0.116
#> SRR772600 2 0.576 0.359998 0.076 0.612 0.008 0.020 0.268 0.016
#> SRR772601 2 0.504 0.420316 0.104 0.736 0.000 0.016 0.088 0.056
#> SRR772602 3 0.465 0.595796 0.012 0.248 0.692 0.004 0.036 0.008
#> SRR772603 2 0.553 0.343589 0.436 0.484 0.000 0.020 0.048 0.012
#> SRR772604 2 0.548 0.410055 0.196 0.648 0.000 0.004 0.124 0.028
#> SRR772605 6 0.545 0.256634 0.320 0.000 0.004 0.100 0.008 0.568
#> SRR772606 6 0.680 -0.169494 0.040 0.124 0.044 0.000 0.272 0.520
#> SRR772607 6 0.677 0.055408 0.044 0.164 0.036 0.008 0.172 0.576
#> SRR772608 1 0.487 0.333902 0.588 0.008 0.000 0.052 0.000 0.352
#> SRR772609 1 0.548 0.271812 0.536 0.024 0.000 0.060 0.004 0.376
#> SRR772610 6 0.562 0.024334 0.400 0.008 0.000 0.100 0.004 0.488
#> SRR772611 1 0.547 0.177469 0.488 0.000 0.000 0.128 0.000 0.384
#> SRR772612 5 0.500 -0.039803 0.012 0.452 0.004 0.008 0.504 0.020
#> SRR772613 2 0.501 0.220892 0.028 0.604 0.004 0.016 0.340 0.008
#> SRR772614 2 0.751 -0.097143 0.104 0.360 0.000 0.008 0.260 0.268
#> SRR772615 6 0.811 0.330640 0.176 0.148 0.024 0.064 0.112 0.476
#> SRR772616 6 0.574 0.109738 0.060 0.012 0.028 0.016 0.256 0.628
#> SRR772617 2 0.618 0.421870 0.152 0.652 0.072 0.092 0.016 0.016
#> SRR772618 2 0.669 0.384804 0.284 0.548 0.064 0.044 0.048 0.012
#> SRR772619 4 0.462 0.640627 0.000 0.072 0.104 0.768 0.032 0.024
#> SRR772620 4 0.430 0.633205 0.000 0.020 0.156 0.768 0.032 0.024
#> SRR772621 4 0.751 0.219205 0.296 0.096 0.012 0.448 0.024 0.124
#> SRR772622 1 0.864 0.140381 0.320 0.236 0.000 0.132 0.128 0.184
#> SRR772623 3 0.692 0.106298 0.048 0.344 0.424 0.004 0.172 0.008
#> SRR772624 3 0.475 0.581465 0.008 0.000 0.624 0.012 0.028 0.328
#> SRR772625 3 0.525 0.603900 0.004 0.004 0.628 0.060 0.020 0.284
#> SRR772626 2 0.776 0.075711 0.008 0.356 0.276 0.008 0.236 0.116
#> SRR772627 2 0.768 0.037591 0.004 0.376 0.220 0.008 0.264 0.128
#> SRR772628 5 0.737 0.287188 0.024 0.128 0.000 0.112 0.436 0.300
#> SRR772629 5 0.602 0.319614 0.028 0.276 0.000 0.000 0.540 0.156
#> SRR772630 5 0.548 0.473924 0.008 0.028 0.000 0.064 0.600 0.300
#> SRR772631 3 0.431 0.656910 0.016 0.000 0.700 0.012 0.012 0.260
#> SRR772632 4 0.210 0.714285 0.004 0.000 0.004 0.904 0.080 0.008
#> SRR772633 4 0.155 0.734316 0.020 0.000 0.004 0.940 0.000 0.036
#> SRR772634 6 0.807 -0.122855 0.064 0.256 0.104 0.008 0.148 0.420
#> SRR772635 2 0.791 0.274382 0.060 0.512 0.040 0.080 0.140 0.168
#> SRR772636 3 0.430 0.677311 0.008 0.000 0.736 0.040 0.012 0.204
#> SRR772637 6 0.715 0.351139 0.228 0.020 0.000 0.068 0.212 0.472
#> SRR772638 6 0.559 0.434533 0.216 0.016 0.000 0.032 0.088 0.648
#> SRR772639 5 0.798 0.365657 0.112 0.088 0.004 0.132 0.460 0.204
#> SRR772640 4 0.295 0.710759 0.120 0.024 0.000 0.848 0.004 0.004
#> SRR772641 4 0.315 0.727005 0.040 0.048 0.016 0.872 0.008 0.016
#> SRR772642 1 0.850 0.085203 0.368 0.068 0.200 0.072 0.032 0.260
#> SRR772643 6 0.832 0.029143 0.308 0.076 0.184 0.064 0.020 0.348
#> SRR772644 6 0.477 0.446312 0.196 0.004 0.012 0.048 0.020 0.720
#> SRR772645 6 0.578 0.344343 0.244 0.004 0.004 0.128 0.020 0.600
#> SRR772646 4 0.328 0.722663 0.120 0.008 0.016 0.836 0.000 0.020
#> SRR772647 4 0.292 0.727068 0.104 0.004 0.004 0.856 0.000 0.032
#> SRR772648 2 0.690 0.116913 0.204 0.384 0.000 0.032 0.364 0.016
#> SRR772649 5 0.744 0.076883 0.060 0.348 0.000 0.120 0.408 0.064
#> SRR772650 1 0.596 0.463143 0.624 0.060 0.000 0.084 0.016 0.216
#> SRR772651 1 0.578 0.460909 0.632 0.024 0.000 0.140 0.016 0.188
#> SRR772652 1 0.409 0.279449 0.768 0.152 0.000 0.008 0.068 0.004
#> SRR772653 2 0.624 0.339099 0.396 0.456 0.000 0.012 0.108 0.028
#> SRR772654 6 0.842 0.224294 0.124 0.212 0.004 0.148 0.116 0.396
#> SRR772655 2 0.760 0.224343 0.108 0.480 0.000 0.200 0.052 0.160
#> SRR772656 3 0.394 0.647026 0.016 0.216 0.748 0.008 0.012 0.000
#> SRR772657 3 0.351 0.693891 0.000 0.136 0.816 0.008 0.028 0.012
#> SRR772658 4 0.505 0.532463 0.024 0.276 0.004 0.652 0.036 0.008
#> SRR772659 2 0.569 0.301143 0.012 0.600 0.012 0.272 0.100 0.004
#> SRR772660 6 0.450 0.467114 0.136 0.000 0.012 0.088 0.012 0.752
#> SRR772661 3 0.476 0.536622 0.016 0.000 0.588 0.012 0.012 0.372
#> SRR772662 1 0.723 0.236495 0.440 0.072 0.016 0.140 0.008 0.324
#> SRR772663 1 0.614 0.394544 0.568 0.068 0.000 0.080 0.008 0.276
#> SRR772664 6 0.661 0.322302 0.084 0.000 0.000 0.128 0.304 0.484
#> SRR772665 6 0.647 0.212779 0.068 0.000 0.000 0.128 0.316 0.488
#> SRR772666 3 0.340 0.694418 0.004 0.148 0.816 0.004 0.020 0.008
#> SRR772667 6 0.530 0.240520 0.364 0.008 0.028 0.004 0.028 0.568
#> SRR772668 3 0.582 0.377019 0.012 0.360 0.544 0.020 0.048 0.016
#> SRR772669 2 0.761 0.268805 0.036 0.516 0.112 0.048 0.224 0.064
#> SRR772670 6 0.630 0.165244 0.352 0.000 0.000 0.120 0.052 0.476
#> SRR772671 6 0.584 0.030832 0.416 0.000 0.000 0.096 0.028 0.460
#> SRR772672 6 0.625 0.187233 0.324 0.004 0.000 0.132 0.036 0.504
#> SRR772673 6 0.596 0.009851 0.384 0.004 0.000 0.164 0.004 0.444
#> SRR772674 3 0.391 0.662541 0.028 0.180 0.772 0.008 0.012 0.000
#> SRR772675 3 0.366 0.697552 0.032 0.000 0.804 0.012 0.008 0.144
#> SRR772676 5 0.521 0.282754 0.092 0.164 0.000 0.020 0.700 0.024
#> SRR772677 5 0.629 0.104205 0.192 0.272 0.000 0.004 0.508 0.024
#> SRR772678 3 0.490 0.625066 0.024 0.000 0.656 0.024 0.016 0.280
#> SRR772679 1 0.419 0.497767 0.756 0.008 0.000 0.096 0.000 0.140
#> SRR772680 1 0.518 0.454405 0.656 0.012 0.004 0.112 0.000 0.216
#> SRR772681 3 0.381 0.672341 0.008 0.168 0.784 0.012 0.028 0.000
#> SRR772682 6 0.534 0.370832 0.188 0.000 0.000 0.196 0.004 0.612
#> SRR772683 4 0.684 -0.239589 0.208 0.024 0.008 0.408 0.008 0.344
#> SRR772685 2 0.825 0.210298 0.300 0.312 0.120 0.224 0.032 0.012
#> SRR772686 3 0.306 0.706144 0.004 0.120 0.844 0.000 0.024 0.008
#> SRR772687 3 0.645 0.260583 0.036 0.004 0.500 0.004 0.308 0.148
#> SRR772688 4 0.455 0.626381 0.028 0.004 0.020 0.680 0.000 0.268
#> SRR772689 4 0.504 0.621325 0.040 0.012 0.024 0.676 0.004 0.244
#> SRR772690 3 0.350 0.691539 0.004 0.148 0.812 0.004 0.020 0.012
#> SRR772691 3 0.368 0.698407 0.008 0.000 0.800 0.020 0.020 0.152
#> SRR772692 6 0.848 0.014083 0.092 0.248 0.212 0.036 0.044 0.368
#> SRR772693 6 0.795 0.033646 0.108 0.160 0.220 0.000 0.076 0.436
#> SRR772694 6 0.799 0.272508 0.196 0.120 0.052 0.072 0.060 0.500
#> SRR772695 1 0.789 0.140917 0.404 0.088 0.012 0.108 0.064 0.324
#> SRR772696 2 0.704 0.276494 0.024 0.504 0.260 0.024 0.164 0.024
#> SRR772697 2 0.694 0.242065 0.012 0.516 0.284 0.028 0.112 0.048
#> SRR772698 3 0.415 0.662856 0.008 0.000 0.716 0.012 0.016 0.248
#> SRR772699 6 0.600 0.413091 0.116 0.044 0.088 0.020 0.044 0.688
#> SRR772700 6 0.727 0.245070 0.152 0.224 0.032 0.012 0.064 0.516
#> SRR772701 6 0.712 -0.040163 0.304 0.316 0.000 0.008 0.048 0.324
#> SRR772702 2 0.654 0.330590 0.136 0.548 0.000 0.004 0.224 0.088
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0