Date: 2019-12-25 23:52:48 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 7000 383
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| SD:pam | 2 | 1.000 | 0.969 | 0.987 | ** | |
| SD:mclust | 2 | 1.000 | 0.979 | 0.990 | ** | |
| MAD:kmeans | 2 | 1.000 | 0.981 | 0.992 | ** | |
| ATC:kmeans | 2 | 1.000 | 0.995 | 0.998 | ** | |
| ATC:pam | 2 | 1.000 | 0.990 | 0.995 | ** | |
| ATC:mclust | 2 | 1.000 | 0.977 | 0.989 | ** | |
| MAD:mclust | 3 | 1.000 | 0.957 | 0.975 | ** | 2 |
| MAD:pam | 2 | 0.994 | 0.963 | 0.985 | ** | |
| ATC:skmeans | 3 | 0.976 | 0.945 | 0.961 | ** | 2 |
| SD:skmeans | 4 | 0.973 | 0.948 | 0.974 | ** | 2,3 |
| SD:hclust | 3 | 0.971 | 0.937 | 0.974 | ** | 2 |
| ATC:hclust | 3 | 0.967 | 0.957 | 0.980 | ** | 2 |
| MAD:skmeans | 4 | 0.966 | 0.947 | 0.976 | ** | 3 |
| MAD:hclust | 2 | 0.951 | 0.933 | 0.974 | ** | |
| CV:kmeans | 5 | 0.938 | 0.927 | 0.946 | * | |
| CV:skmeans | 5 | 0.923 | 0.887 | 0.940 | * | 3,4 |
| CV:NMF | 3 | 0.917 | 0.913 | 0.963 | * | 2 |
| CV:mclust | 4 | 0.914 | 0.934 | 0.970 | * | 3 |
| SD:kmeans | 5 | 0.905 | 0.898 | 0.934 | * | 2,3 |
| ATC:NMF | 2 | 0.892 | 0.939 | 0.972 | ||
| SD:NMF | 2 | 0.812 | 0.881 | 0.952 | ||
| CV:pam | 4 | 0.680 | 0.784 | 0.911 | ||
| CV:hclust | 5 | 0.499 | 0.708 | 0.776 | ||
| MAD:NMF | 3 | 0.485 | 0.698 | 0.820 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 0.812 0.881 0.952 0.485 0.513 0.513
#> CV:NMF 2 0.999 0.959 0.983 0.498 0.502 0.502
#> MAD:NMF 2 0.681 0.824 0.928 0.424 0.575 0.575
#> ATC:NMF 2 0.892 0.939 0.972 0.360 0.637 0.637
#> SD:skmeans 2 0.967 0.960 0.983 0.401 0.603 0.603
#> CV:skmeans 2 0.826 0.894 0.956 0.495 0.504 0.504
#> MAD:skmeans 2 0.854 0.916 0.965 0.426 0.581 0.581
#> ATC:skmeans 2 1.000 0.963 0.985 0.347 0.657 0.657
#> SD:mclust 2 1.000 0.979 0.990 0.317 0.684 0.684
#> CV:mclust 2 0.850 0.941 0.956 0.488 0.499 0.499
#> MAD:mclust 2 1.000 0.993 0.997 0.255 0.750 0.750
#> ATC:mclust 2 1.000 0.977 0.989 0.335 0.657 0.657
#> SD:kmeans 2 1.000 0.988 0.995 0.278 0.724 0.724
#> CV:kmeans 2 0.676 0.892 0.944 0.351 0.678 0.678
#> MAD:kmeans 2 1.000 0.981 0.992 0.287 0.717 0.717
#> ATC:kmeans 2 1.000 0.995 0.998 0.265 0.735 0.735
#> SD:pam 2 1.000 0.969 0.987 0.306 0.687 0.687
#> CV:pam 2 0.524 0.769 0.898 0.469 0.510 0.510
#> MAD:pam 2 0.994 0.963 0.985 0.307 0.700 0.700
#> ATC:pam 2 1.000 0.990 0.995 0.273 0.728 0.728
#> SD:hclust 2 0.989 0.960 0.983 0.281 0.714 0.714
#> CV:hclust 2 0.587 0.868 0.923 0.184 0.920 0.920
#> MAD:hclust 2 0.951 0.933 0.974 0.308 0.691 0.691
#> ATC:hclust 2 0.989 0.943 0.979 0.264 0.750 0.750
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.597 0.762 0.866 0.3463 0.787 0.601
#> CV:NMF 3 0.917 0.913 0.963 0.3147 0.799 0.617
#> MAD:NMF 3 0.485 0.698 0.820 0.5266 0.657 0.450
#> ATC:NMF 3 0.627 0.766 0.887 0.2439 0.888 0.832
#> SD:skmeans 3 0.959 0.955 0.980 0.5388 0.732 0.574
#> CV:skmeans 3 0.949 0.925 0.966 0.3086 0.791 0.608
#> MAD:skmeans 3 1.000 0.966 0.987 0.4504 0.755 0.594
#> ATC:skmeans 3 0.976 0.945 0.961 0.6990 0.739 0.605
#> SD:mclust 3 0.702 0.866 0.928 0.8844 0.701 0.572
#> CV:mclust 3 1.000 0.975 0.991 0.1135 0.587 0.396
#> MAD:mclust 3 1.000 0.957 0.975 1.2780 0.667 0.555
#> ATC:mclust 3 0.445 0.330 0.735 0.5933 0.792 0.684
#> SD:kmeans 3 0.924 0.923 0.965 1.1565 0.673 0.549
#> CV:kmeans 3 0.475 0.665 0.805 0.6211 0.676 0.543
#> MAD:kmeans 3 0.886 0.923 0.968 1.0976 0.674 0.549
#> ATC:kmeans 3 0.624 0.844 0.870 0.9309 0.654 0.533
#> SD:pam 3 0.718 0.838 0.924 0.9942 0.681 0.542
#> CV:pam 3 0.536 0.760 0.896 0.0715 0.966 0.933
#> MAD:pam 3 0.491 0.710 0.869 0.5949 0.851 0.787
#> ATC:pam 3 0.601 0.853 0.837 0.8809 0.645 0.514
#> SD:hclust 3 0.971 0.937 0.974 0.1596 0.957 0.941
#> CV:hclust 3 0.218 0.392 0.652 1.6396 0.760 0.739
#> MAD:hclust 3 0.745 0.899 0.932 0.2277 0.965 0.949
#> ATC:hclust 3 0.967 0.957 0.980 0.0985 0.947 0.930
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.624 0.673 0.829 0.0971 0.903 0.736
#> CV:NMF 4 0.749 0.798 0.879 0.0996 0.914 0.763
#> MAD:NMF 4 0.501 0.644 0.771 0.1087 0.808 0.515
#> ATC:NMF 4 0.414 0.673 0.787 0.3006 0.745 0.581
#> SD:skmeans 4 0.973 0.948 0.974 0.2119 0.842 0.603
#> CV:skmeans 4 0.964 0.937 0.972 0.1597 0.834 0.568
#> MAD:skmeans 4 0.966 0.947 0.976 0.2136 0.851 0.618
#> ATC:skmeans 4 0.687 0.757 0.845 0.1974 0.850 0.639
#> SD:mclust 4 0.891 0.897 0.948 0.2163 0.847 0.635
#> CV:mclust 4 0.914 0.934 0.970 0.3109 0.817 0.605
#> MAD:mclust 4 0.827 0.875 0.936 0.2229 0.858 0.669
#> ATC:mclust 4 0.481 0.827 0.867 -0.1319 0.773 0.656
#> SD:kmeans 4 0.700 0.644 0.799 0.1722 0.851 0.639
#> CV:kmeans 4 0.586 0.757 0.806 0.1914 0.752 0.465
#> MAD:kmeans 4 0.748 0.843 0.890 0.1989 0.826 0.585
#> ATC:kmeans 4 0.563 0.814 0.853 0.1657 0.855 0.677
#> SD:pam 4 0.765 0.778 0.894 0.1348 0.899 0.744
#> CV:pam 4 0.680 0.784 0.911 0.2655 0.783 0.587
#> MAD:pam 4 0.716 0.770 0.906 0.3585 0.735 0.544
#> ATC:pam 4 0.845 0.881 0.953 0.2639 0.962 0.901
#> SD:hclust 4 0.980 0.929 0.972 0.0497 0.987 0.980
#> CV:hclust 4 0.282 0.569 0.674 0.3314 0.644 0.486
#> MAD:hclust 4 0.616 0.841 0.894 0.1344 0.991 0.986
#> ATC:hclust 4 1.000 0.964 0.989 0.0611 0.995 0.992
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.623 0.708 0.821 0.05346 0.895 0.678
#> CV:NMF 5 0.683 0.684 0.821 0.07709 0.899 0.675
#> MAD:NMF 5 0.536 0.604 0.756 0.04650 0.982 0.934
#> ATC:NMF 5 0.333 0.476 0.636 0.14364 0.833 0.582
#> SD:skmeans 5 0.887 0.858 0.924 0.05498 0.940 0.769
#> CV:skmeans 5 0.923 0.887 0.940 0.05716 0.941 0.769
#> MAD:skmeans 5 0.830 0.791 0.890 0.05840 0.915 0.683
#> ATC:skmeans 5 0.717 0.656 0.829 0.06559 0.913 0.719
#> SD:mclust 5 0.749 0.702 0.824 0.07446 0.893 0.639
#> CV:mclust 5 0.880 0.836 0.924 0.06245 0.951 0.834
#> MAD:mclust 5 0.746 0.785 0.863 0.09915 0.900 0.669
#> ATC:mclust 5 0.395 0.351 0.700 0.30137 0.953 0.927
#> SD:kmeans 5 0.905 0.898 0.934 0.08581 0.868 0.588
#> CV:kmeans 5 0.938 0.927 0.946 0.11062 0.953 0.832
#> MAD:kmeans 5 0.865 0.877 0.919 0.07071 0.944 0.796
#> ATC:kmeans 5 0.614 0.693 0.811 0.13131 0.961 0.895
#> SD:pam 5 0.728 0.692 0.842 0.03982 0.974 0.918
#> CV:pam 5 0.677 0.770 0.903 0.06833 0.948 0.856
#> MAD:pam 5 0.732 0.751 0.900 0.03568 0.964 0.898
#> ATC:pam 5 0.804 0.836 0.923 0.01521 0.989 0.970
#> SD:hclust 5 0.707 0.888 0.922 0.19690 0.991 0.986
#> CV:hclust 5 0.499 0.708 0.776 0.14304 0.851 0.593
#> MAD:hclust 5 0.470 0.612 0.794 0.32521 0.736 0.594
#> ATC:hclust 5 1.000 0.959 0.986 0.00328 1.000 1.000
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.620 0.544 0.729 0.04698 0.934 0.765
#> CV:NMF 6 0.666 0.582 0.756 0.03863 0.945 0.781
#> MAD:NMF 6 0.543 0.421 0.671 0.03729 0.920 0.731
#> ATC:NMF 6 0.346 0.486 0.619 0.07179 0.921 0.731
#> SD:skmeans 6 0.860 0.807 0.882 0.03395 0.967 0.849
#> CV:skmeans 6 0.848 0.787 0.876 0.03255 0.963 0.828
#> MAD:skmeans 6 0.806 0.740 0.834 0.03286 0.966 0.840
#> ATC:skmeans 6 0.750 0.695 0.830 0.04551 0.898 0.647
#> SD:mclust 6 0.760 0.684 0.804 0.04352 0.925 0.677
#> CV:mclust 6 0.852 0.760 0.880 0.05779 0.911 0.670
#> MAD:mclust 6 0.764 0.703 0.837 0.04472 0.970 0.858
#> ATC:mclust 6 0.397 0.507 0.643 0.16381 0.711 0.529
#> SD:kmeans 6 0.832 0.812 0.877 0.03535 0.997 0.988
#> CV:kmeans 6 0.803 0.704 0.838 0.05586 0.962 0.852
#> MAD:kmeans 6 0.852 0.816 0.874 0.03151 0.983 0.929
#> ATC:kmeans 6 0.610 0.609 0.775 0.08301 0.827 0.553
#> SD:pam 6 0.719 0.601 0.802 0.02278 0.880 0.625
#> CV:pam 6 0.723 0.768 0.912 0.02051 0.991 0.970
#> MAD:pam 6 0.734 0.737 0.897 0.00874 0.994 0.982
#> ATC:pam 6 0.816 0.843 0.936 0.00872 0.992 0.977
#> SD:hclust 6 0.643 0.867 0.906 0.04646 1.000 1.000
#> CV:hclust 6 0.597 0.606 0.759 0.05770 0.971 0.880
#> MAD:hclust 6 0.486 0.678 0.771 0.14956 0.809 0.582
#> ATC:hclust 6 0.989 0.941 0.980 0.01552 0.999 0.999
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 700, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1400, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2100, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2800, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3500, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 700, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1400, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2100, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2800, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3500, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 700)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1400)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2100)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2800)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 3500)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.989 0.960 0.983 0.2811 0.714 0.714
#> 3 3 0.971 0.937 0.974 0.1596 0.957 0.941
#> 4 4 0.980 0.929 0.972 0.0497 0.987 0.980
#> 5 5 0.707 0.888 0.922 0.1969 0.991 0.986
#> 6 6 0.643 0.867 0.906 0.0465 1.000 1.000
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.9580 0.456 0.380 0.620
#> SRR1032933 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.7219 0.736 0.800 0.200
#> SRR1032943 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.5737 0.833 0.864 0.136
#> SRR1032963 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.7219 0.736 0.800 0.200
#> SRR1032968 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.9552 0.465 0.376 0.624
#> SRR1032978 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.2236 0.910 0.036 0.964
#> SRR1032988 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.9552 0.465 0.376 0.624
#> SRR1033001 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.2236 0.910 0.036 0.964
#> SRR1033005 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033031 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033039 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.9552 0.465 0.376 0.624
#> SRR1033062 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033063 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.6531 0.787 0.832 0.168
#> SRR1033070 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.7056 0.750 0.808 0.192
#> SRR1033073 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.9552 0.465 0.376 0.624
#> SRR1033087 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033089 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.9552 0.465 0.376 0.624
#> SRR1033098 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033116 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.9552 0.465 0.376 0.624
#> SRR1033122 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033124 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.1414 0.971 0.980 0.020
#> SRR1033126 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.8207 0.634 0.744 0.256
#> SRR1033129 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033133 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.6623 0.781 0.828 0.172
#> SRR1033138 1 0.0672 0.983 0.992 0.008
#> SRR1033140 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033145 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.4562 0.885 0.904 0.096
#> SRR1033147 1 0.6531 0.787 0.832 0.168
#> SRR1033148 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0376 0.987 0.996 0.004
#> SRR1033164 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033171 1 0.6712 0.775 0.824 0.176
#> SRR1033170 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.8713 0.560 0.708 0.292
#> SRR1033190 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.7056 0.750 0.808 0.192
#> SRR1033193 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.9552 0.465 0.376 0.624
#> SRR1033197 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.8267 0.626 0.740 0.260
#> SRR1033217 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.9552 0.465 0.376 0.624
#> SRR1033224 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.9998 0.117 0.492 0.508
#> SRR1033249 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.937 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.991 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0747 0.976 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032918 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.3619 0.870 0.000 0.864 0.136
#> SRR1032921 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.3502 0.439 0.020 0.084 0.896
#> SRR1032933 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032937 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.5810 0.288 0.664 0.000 0.336
#> SRR1032943 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032945 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.6235 -0.147 0.564 0.000 0.436
#> SRR1032963 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.5810 0.288 0.664 0.000 0.336
#> SRR1032968 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.2796 0.430 0.000 0.092 0.908
#> SRR1032978 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032979 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.6280 0.436 0.000 0.540 0.460
#> SRR1032988 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032989 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032995 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.3551 0.874 0.000 0.868 0.132
#> SRR1033000 3 0.2796 0.430 0.000 0.092 0.908
#> SRR1033001 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.6280 0.436 0.000 0.540 0.460
#> SRR1033005 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033007 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033011 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0747 0.976 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033014 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033015 1 0.0747 0.976 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033016 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033019 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033020 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033024 1 0.1031 0.968 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033025 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0747 0.976 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033027 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.3619 0.870 0.000 0.864 0.136
#> SRR1033030 1 0.0747 0.976 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033031 1 0.0892 0.970 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033032 1 0.3686 0.794 0.860 0.000 0.140
#> SRR1033033 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033037 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.1289 0.956 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033039 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033040 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033043 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033046 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033050 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0892 0.973 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033056 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033058 1 0.1289 0.959 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033059 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 3 0.2796 0.430 0.000 0.092 0.908
#> SRR1033062 1 0.0892 0.972 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033063 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033065 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033066 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033067 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033069 3 0.6308 0.361 0.492 0.000 0.508
#> SRR1033070 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033071 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.6286 0.430 0.464 0.000 0.536
#> SRR1033073 1 0.1031 0.969 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033074 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033077 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.1031 0.968 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033080 1 0.0592 0.978 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033081 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033083 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033084 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0592 0.978 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033086 3 0.2796 0.430 0.000 0.092 0.908
#> SRR1033087 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.1163 0.964 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033089 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033090 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033092 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.0747 0.976 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033095 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033097 3 0.2796 0.430 0.000 0.092 0.908
#> SRR1033098 1 0.0592 0.978 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033099 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033102 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033104 1 0.1163 0.964 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033105 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.1031 0.968 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033108 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033111 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033112 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.1163 0.963 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033114 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033115 1 0.1163 0.961 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033116 1 0.1031 0.968 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033117 1 0.1289 0.959 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033118 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033119 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033120 3 0.2796 0.430 0.000 0.092 0.908
#> SRR1033122 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033123 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033124 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.2796 0.875 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033126 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.6235 0.474 0.436 0.000 0.564
#> SRR1033129 1 0.1031 0.968 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033128 1 0.1031 0.965 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033130 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.1163 0.963 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033133 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033136 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033137 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033139 1 0.6309 -0.364 0.504 0.000 0.496
#> SRR1033138 1 0.2165 0.914 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033140 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033141 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0892 0.970 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033145 1 0.0424 0.982 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033146 1 0.5431 0.460 0.716 0.000 0.284
#> SRR1033147 3 0.6309 0.338 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033148 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.1411 0.955 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033150 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.1031 0.967 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033152 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033154 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033156 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033157 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033158 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.0592 0.978 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033160 1 0.0747 0.976 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033161 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033162 1 0.0747 0.973 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033164 1 0.1643 0.944 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033165 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.1529 0.947 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033167 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033169 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.6309 0.351 0.496 0.000 0.504
#> SRR1033170 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033173 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033175 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.3619 0.870 0.000 0.864 0.136
#> SRR1033180 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033181 1 0.0592 0.977 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033183 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033182 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033184 1 0.0747 0.976 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033185 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033187 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.1163 0.961 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033188 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.6062 0.532 0.384 0.000 0.616
#> SRR1033190 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033191 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033192 3 0.6280 0.438 0.460 0.000 0.540
#> SRR1033193 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.3412 0.879 0.000 0.876 0.124
#> SRR1033194 3 0.2796 0.430 0.000 0.092 0.908
#> SRR1033197 1 0.1411 0.952 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033196 1 0.0747 0.975 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033199 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033202 1 0.1031 0.968 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033203 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033204 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033206 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0892 0.972 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033209 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033210 1 0.1289 0.959 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033211 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.1163 0.964 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033213 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.6204 0.495 0.424 0.000 0.576
#> SRR1033217 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033218 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033225 3 0.2796 0.430 0.000 0.092 0.908
#> SRR1033224 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0892 0.972 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033227 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033229 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0237 0.983 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033233 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033236 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033237 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033240 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033239 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033241 1 0.0424 0.982 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033244 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033246 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.2711 0.482 0.088 0.000 0.912
#> SRR1033249 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0424 0.980 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033252 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033258 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033262 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033263 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0424 0.981 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033268 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0747 0.975 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033270 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033271 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.3482 0.876 0.000 0.872 0.128
#> SRR1033275 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.972 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033280 1 0.0592 0.979 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033281 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0817 0.973 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032918 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.3161 0.864 0.000 0.864 0.012 0.124
#> SRR1032921 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.3211 0.329 0.008 0.084 0.884 0.024
#> SRR1032933 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032937 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 4 0.5836 0.313 0.304 0.000 0.056 0.640
#> SRR1032943 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.6213 -0.318 0.484 0.000 0.464 0.052
#> SRR1032963 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 4 0.5836 0.313 0.304 0.000 0.056 0.640
#> SRR1032968 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.2401 0.354 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1032978 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.4977 0.357 0.000 0.540 0.460 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0895 0.972 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1032989 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.3032 0.867 0.000 0.868 0.008 0.124
#> SRR1033000 3 0.2401 0.354 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1033001 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.4977 0.357 0.000 0.540 0.460 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033007 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033011 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0707 0.976 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033014 1 0.0469 0.980 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033015 1 0.0895 0.973 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033016 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033019 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033020 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0524 0.979 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033024 1 0.1022 0.966 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033025 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0707 0.976 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033027 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.3161 0.864 0.000 0.864 0.012 0.124
#> SRR1033030 1 0.1022 0.966 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033031 1 0.1520 0.950 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1033032 1 0.3991 0.769 0.832 0.000 0.120 0.048
#> SRR1033033 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0524 0.979 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033037 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.2124 0.922 0.932 0.000 0.040 0.028
#> SRR1033039 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033040 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0524 0.980 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033043 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0469 0.980 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033046 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033048 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.0779 0.975 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033050 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.1004 0.970 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033056 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033058 1 0.1474 0.945 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033059 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 3 0.2401 0.354 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1033062 1 0.0921 0.970 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033063 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.0469 0.980 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033065 1 0.0376 0.982 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033066 1 0.0672 0.977 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033067 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0779 0.975 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033069 3 0.6332 0.118 0.404 0.000 0.532 0.064
#> SRR1033070 1 0.0779 0.975 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033071 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.6264 0.111 0.376 0.000 0.560 0.064
#> SRR1033073 1 0.1388 0.959 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1033074 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0895 0.973 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033077 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033078 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.1118 0.962 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033080 1 0.0817 0.972 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033081 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0804 0.974 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1033083 1 0.0469 0.980 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033084 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0707 0.975 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033086 3 0.2401 0.354 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1033087 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.1305 0.959 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033089 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033090 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0469 0.981 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033092 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.0895 0.972 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033095 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.0376 0.983 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033097 3 0.2401 0.354 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1033098 1 0.0707 0.975 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033099 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033102 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0524 0.980 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033104 1 0.1302 0.954 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033105 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.1211 0.958 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033108 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0376 0.983 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033111 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033112 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.1489 0.949 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1033114 1 0.0376 0.982 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033115 1 0.1388 0.955 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1033116 1 0.1211 0.958 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033117 1 0.1302 0.954 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033118 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033119 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0336 0.983 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033120 3 0.2401 0.354 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1033122 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033123 1 0.0672 0.977 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033124 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.3367 0.828 0.864 0.000 0.108 0.028
#> SRR1033126 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033127 4 0.3778 0.490 0.052 0.000 0.100 0.848
#> SRR1033129 1 0.1211 0.958 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033128 1 0.1182 0.963 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1033130 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.1576 0.944 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033133 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033136 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033137 1 0.0779 0.975 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033139 3 0.6242 0.112 0.424 0.000 0.520 0.056
#> SRR1033138 1 0.2742 0.878 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1033140 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033141 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0895 0.971 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033145 1 0.0376 0.983 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033146 1 0.5814 0.315 0.644 0.000 0.300 0.056
#> SRR1033147 3 0.6235 0.117 0.420 0.000 0.524 0.056
#> SRR1033148 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.1557 0.941 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033150 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.1706 0.944 0.948 0.000 0.036 0.016
#> SRR1033152 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.1174 0.966 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR1033154 1 0.0376 0.982 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033156 1 0.0707 0.975 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033157 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.0592 0.978 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033160 1 0.1004 0.969 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1033161 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.1004 0.969 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1033162 1 0.1059 0.967 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033164 1 0.1743 0.935 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1033165 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.1833 0.936 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1033167 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033169 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.6163 0.117 0.416 0.000 0.532 0.052
#> SRR1033170 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0592 0.978 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033173 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.0524 0.981 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033175 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.3161 0.864 0.000 0.864 0.012 0.124
#> SRR1033180 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033181 1 0.0672 0.977 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033183 1 0.0469 0.980 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033182 1 0.0376 0.982 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033184 1 0.0895 0.972 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033185 1 0.0524 0.980 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033187 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.1520 0.950 0.956 0.000 0.024 0.020
#> SRR1033188 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 4 0.2469 0.401 0.000 0.000 0.108 0.892
#> SRR1033190 1 0.0524 0.980 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033191 1 0.0524 0.979 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033192 3 0.6201 0.113 0.376 0.000 0.564 0.060
#> SRR1033193 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.3215 0.874 0.000 0.876 0.032 0.092
#> SRR1033194 3 0.2401 0.354 0.000 0.092 0.904 0.004
#> SRR1033197 1 0.1624 0.946 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1033196 1 0.1109 0.965 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1033199 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0592 0.979 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033202 1 0.1211 0.958 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033203 1 0.0524 0.981 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033204 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0592 0.978 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033206 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.1022 0.966 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033209 1 0.0524 0.981 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033210 1 0.1302 0.954 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033211 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.1211 0.958 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033213 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 4 0.3525 0.484 0.040 0.000 0.100 0.860
#> SRR1033217 1 0.0779 0.975 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033218 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0779 0.975 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033225 3 0.2546 0.351 0.000 0.092 0.900 0.008
#> SRR1033224 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.1305 0.957 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033227 1 0.0592 0.978 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033229 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0188 0.984 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033233 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.0895 0.972 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033236 1 0.0657 0.978 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1033237 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0592 0.978 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033240 1 0.0707 0.975 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033239 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0592 0.978 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033241 1 0.0376 0.983 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033244 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.0779 0.975 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033246 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.2654 0.219 0.004 0.000 0.888 0.108
#> SRR1033249 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0336 0.982 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.0779 0.975 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033258 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.0707 0.975 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033262 1 0.0817 0.973 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033263 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0592 0.978 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033268 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.1004 0.969 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1033270 1 0.0707 0.975 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033271 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.3279 0.871 0.000 0.872 0.032 0.096
#> SRR1033275 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.970 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0895 0.972 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033280 1 0.0895 0.972 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033281 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.1270 0.9224 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0404 0.9279 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.1485 0.9161 0.948 0.000 0.032 0.000 0.020
#> SRR1032918 1 0.1270 0.9224 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.4282 0.7781 0.000 0.800 0.064 0.024 0.112
#> SRR1032921 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0609 0.9259 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.1341 0.9214 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0290 0.9278 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 4 0.2301 0.9303 0.004 0.064 0.004 0.912 0.016
#> SRR1032933 1 0.1270 0.9224 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0703 0.9240 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0290 0.9535 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 5 0.5903 0.4929 0.092 0.000 0.312 0.012 0.584
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.2020 0.9051 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0703 0.9271 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0162 0.9275 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.6481 0.5994 0.156 0.000 0.496 0.340 0.008
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0162 0.9277 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1032967 5 0.5903 0.4929 0.092 0.000 0.312 0.012 0.584
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0703 0.9271 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0404 0.9271 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1032977 4 0.1544 0.9549 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1032978 1 0.1608 0.9181 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.4291 0.0648 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1032988 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.2660 0.8504 0.864 0.000 0.128 0.008 0.000
#> SRR1032989 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0404 0.9275 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.4218 0.7827 0.000 0.804 0.060 0.024 0.112
#> SRR1033000 4 0.1544 0.9549 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.4291 0.0648 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9272 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0865 0.9215 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1033007 1 0.0609 0.9259 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0609 0.9232 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.2471 0.8797 0.864 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.1300 0.9186 0.956 0.000 0.028 0.000 0.016
#> SRR1033014 1 0.1082 0.9203 0.964 0.000 0.028 0.000 0.008
#> SRR1033015 1 0.2233 0.8796 0.892 0.000 0.104 0.004 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.0880 0.9222 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.1041 0.9218 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1033020 1 0.1410 0.9251 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0510 0.9242 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.1851 0.9095 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.2690 0.8601 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.1582 0.9142 0.944 0.000 0.028 0.000 0.028
#> SRR1033025 1 0.2074 0.9022 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.1300 0.9186 0.956 0.000 0.028 0.000 0.016
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0510 0.9242 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.4282 0.7781 0.000 0.800 0.064 0.024 0.112
#> SRR1033030 1 0.1668 0.9130 0.940 0.000 0.032 0.000 0.028
#> SRR1033031 1 0.3906 0.6734 0.704 0.000 0.292 0.000 0.004
#> SRR1033032 1 0.5271 0.1443 0.568 0.000 0.384 0.044 0.004
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1908 0.9085 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.2813 0.8492 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.4302 0.5626 0.648 0.000 0.344 0.004 0.004
#> SRR1033039 1 0.1121 0.9180 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0703 0.9293 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.1608 0.9168 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.2732 0.8579 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.1478 0.9195 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0992 0.9209 0.968 0.000 0.024 0.000 0.008
#> SRR1033046 1 0.0794 0.9242 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.1041 0.9223 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1033048 1 0.0703 0.9247 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.1792 0.9115 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.1544 0.9182 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.2674 0.8404 0.856 0.000 0.140 0.004 0.000
#> SRR1033050 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.1943 0.9053 0.924 0.000 0.056 0.000 0.020
#> SRR1033056 1 0.0609 0.9259 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.2377 0.8849 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.2067 0.9029 0.920 0.000 0.032 0.000 0.048
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0880 0.9298 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033061 4 0.1544 0.9549 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1033062 1 0.1310 0.9200 0.956 0.000 0.020 0.000 0.024
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.1082 0.9208 0.964 0.000 0.028 0.000 0.008
#> SRR1033065 1 0.2732 0.8580 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.2773 0.8536 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.2179 0.8814 0.896 0.000 0.100 0.004 0.000
#> SRR1033069 3 0.5757 0.6527 0.068 0.000 0.524 0.400 0.008
#> SRR1033070 1 0.2536 0.8536 0.868 0.000 0.128 0.004 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.5464 0.5417 0.044 0.000 0.520 0.428 0.008
#> SRR1033073 1 0.2264 0.8973 0.912 0.000 0.060 0.004 0.024
#> SRR1033074 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0609 0.9271 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.2763 0.8327 0.848 0.000 0.148 0.004 0.000
#> SRR1033077 1 0.1544 0.9185 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.1608 0.9169 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.1753 0.9108 0.936 0.000 0.032 0.000 0.032
#> SRR1033080 1 0.1485 0.9158 0.948 0.000 0.032 0.000 0.020
#> SRR1033081 1 0.0963 0.9290 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.3741 0.7225 0.732 0.000 0.264 0.000 0.004
#> SRR1033083 1 0.1484 0.9142 0.944 0.000 0.048 0.000 0.008
#> SRR1033084 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.1211 0.9193 0.960 0.000 0.024 0.000 0.016
#> SRR1033086 4 0.1544 0.9549 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1033087 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.1914 0.9095 0.932 0.000 0.032 0.004 0.032
#> SRR1033089 1 0.1124 0.9209 0.960 0.000 0.036 0.000 0.004
#> SRR1033090 1 0.0162 0.9269 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.1082 0.9209 0.964 0.000 0.028 0.000 0.008
#> SRR1033092 1 0.2020 0.9055 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.2338 0.8717 0.884 0.000 0.112 0.004 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.1965 0.8853 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1033097 4 0.1544 0.9549 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1033098 1 0.1386 0.9172 0.952 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.1124 0.9209 0.960 0.000 0.036 0.000 0.004
#> SRR1033102 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.2605 0.8680 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.1830 0.9097 0.932 0.000 0.028 0.000 0.040
#> SRR1033105 1 0.2179 0.8954 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.1197 0.9271 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.1750 0.9101 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036
#> SRR1033108 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.1544 0.9179 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.1732 0.8985 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.2605 0.8681 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.1544 0.9179 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.3419 0.7740 0.804 0.000 0.180 0.016 0.000
#> SRR1033114 1 0.2813 0.8477 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.4070 0.7131 0.728 0.000 0.256 0.012 0.004
#> SRR1033116 1 0.1750 0.9101 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036
#> SRR1033117 1 0.1915 0.9063 0.928 0.000 0.032 0.000 0.040
#> SRR1033118 1 0.1041 0.9209 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1033119 1 0.1792 0.9112 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.1571 0.9108 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR1033120 4 0.1544 0.9549 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1033122 1 0.1124 0.9197 0.960 0.000 0.036 0.000 0.004
#> SRR1033123 1 0.2930 0.8484 0.832 0.000 0.164 0.004 0.000
#> SRR1033124 1 0.1851 0.9091 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.4881 0.5965 0.696 0.000 0.240 0.060 0.004
#> SRR1033126 1 0.2179 0.8969 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1033127 5 0.3423 0.6359 0.040 0.000 0.016 0.092 0.852
#> SRR1033129 1 0.1750 0.9101 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036
#> SRR1033128 1 0.3491 0.7707 0.768 0.000 0.228 0.000 0.004
#> SRR1033130 1 0.1270 0.9230 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.1908 0.9115 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.3381 0.7829 0.808 0.000 0.176 0.016 0.000
#> SRR1033133 1 0.1410 0.9209 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.2439 0.8627 0.876 0.000 0.120 0.000 0.004
#> SRR1033136 1 0.2020 0.9024 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.2674 0.8404 0.856 0.000 0.140 0.004 0.000
#> SRR1033139 3 0.6028 0.7052 0.104 0.000 0.504 0.388 0.004
#> SRR1033138 1 0.4143 0.7565 0.764 0.000 0.196 0.036 0.004
#> SRR1033140 1 0.0955 0.9215 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR1033141 1 0.1410 0.9224 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1544 0.9177 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.2763 0.8635 0.848 0.000 0.148 0.004 0.000
#> SRR1033145 1 0.1671 0.9019 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.6594 0.2464 0.276 0.000 0.524 0.188 0.012
#> SRR1033147 3 0.5912 0.7023 0.092 0.000 0.512 0.392 0.004
#> SRR1033148 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.2139 0.9010 0.916 0.000 0.032 0.000 0.052
#> SRR1033150 1 0.1270 0.9257 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.3353 0.7655 0.796 0.000 0.196 0.008 0.000
#> SRR1033152 1 0.0794 0.9260 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.2970 0.8121 0.828 0.000 0.168 0.004 0.000
#> SRR1033154 1 0.2179 0.8941 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.1469 0.9160 0.948 0.000 0.036 0.000 0.016
#> SRR1033157 1 0.1792 0.9118 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.1670 0.9113 0.936 0.000 0.052 0.000 0.012
#> SRR1033160 1 0.2513 0.8660 0.876 0.000 0.116 0.008 0.000
#> SRR1033161 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.2890 0.8170 0.836 0.000 0.160 0.004 0.000
#> SRR1033162 1 0.2970 0.8443 0.828 0.000 0.168 0.004 0.000
#> SRR1033164 1 0.3841 0.7406 0.780 0.000 0.188 0.032 0.000
#> SRR1033165 1 0.0609 0.9259 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.4178 0.6548 0.696 0.000 0.292 0.004 0.008
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.1851 0.8930 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.6011 0.7029 0.100 0.000 0.492 0.404 0.004
#> SRR1033170 1 0.1792 0.9109 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.1281 0.9185 0.956 0.000 0.032 0.000 0.012
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.1041 0.9212 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1033175 1 0.1544 0.9179 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.2127 0.8968 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.4282 0.7781 0.000 0.800 0.064 0.024 0.112
#> SRR1033180 1 0.2648 0.8655 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.2280 0.8894 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0898 0.9225 0.972 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1033182 1 0.1043 0.9281 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.2583 0.8519 0.864 0.000 0.132 0.004 0.000
#> SRR1033185 1 0.2605 0.8681 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0880 0.9272 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.4088 0.6872 0.712 0.000 0.276 0.004 0.008
#> SRR1033188 1 0.0609 0.9259 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033189 5 0.2020 0.5374 0.000 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1033190 1 0.2890 0.8550 0.836 0.000 0.160 0.000 0.004
#> SRR1033191 1 0.2852 0.8452 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.5357 0.5406 0.044 0.000 0.520 0.432 0.004
#> SRR1033193 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.4240 0.7896 0.000 0.812 0.052 0.048 0.088
#> SRR1033194 4 0.1544 0.9549 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1033197 1 0.3910 0.6988 0.720 0.000 0.272 0.000 0.008
#> SRR1033196 1 0.3013 0.8122 0.832 0.000 0.160 0.008 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.1106 0.9210 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR1033202 1 0.1750 0.9101 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036
#> SRR1033203 1 0.2179 0.8717 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.1444 0.9164 0.948 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR1033206 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.1582 0.9160 0.944 0.000 0.028 0.000 0.028
#> SRR1033209 1 0.1341 0.9137 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.1915 0.9083 0.928 0.000 0.032 0.000 0.040
#> SRR1033211 1 0.0703 0.9280 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.1836 0.9106 0.932 0.000 0.032 0.000 0.036
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033215 5 0.3163 0.6360 0.032 0.000 0.012 0.092 0.864
#> SRR1033217 1 0.2674 0.8389 0.856 0.000 0.140 0.004 0.000
#> SRR1033218 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.1608 0.9167 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.2605 0.8339 0.852 0.000 0.148 0.000 0.000
#> SRR1033225 4 0.1704 0.9524 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004
#> SRR1033224 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.3203 0.7967 0.820 0.000 0.168 0.012 0.000
#> SRR1033227 1 0.1444 0.9164 0.948 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0794 0.9235 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.1608 0.9163 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.2583 0.8511 0.864 0.000 0.132 0.004 0.000
#> SRR1033236 1 0.2377 0.8555 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0162 0.9276 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.1364 0.9168 0.952 0.000 0.036 0.000 0.012
#> SRR1033240 1 0.1386 0.9174 0.952 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR1033239 1 0.0794 0.9281 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.1364 0.9180 0.952 0.000 0.036 0.000 0.012
#> SRR1033241 1 0.2280 0.8650 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.2516 0.8425 0.860 0.000 0.140 0.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.1792 0.9111 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.1341 0.9225 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033247 4 0.4878 0.5535 0.000 0.000 0.264 0.676 0.060
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.2074 0.9002 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.1732 0.9140 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.2629 0.8433 0.860 0.000 0.136 0.004 0.000
#> SRR1033258 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.1386 0.9174 0.952 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR1033262 1 0.1485 0.9157 0.948 0.000 0.032 0.000 0.020
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.1243 0.9275 0.000 0.960 0.028 0.004 0.008
#> SRR1033266 1 0.0404 0.9275 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.1444 0.9164 0.948 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR1033268 1 0.1792 0.9109 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.3123 0.8088 0.828 0.000 0.160 0.012 0.000
#> SRR1033270 1 0.1386 0.9174 0.952 0.000 0.032 0.000 0.016
#> SRR1033271 1 0.1478 0.9189 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.1792 0.9109 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.4295 0.7852 0.000 0.808 0.052 0.048 0.092
#> SRR1033275 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9593 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.1410 0.9202 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0290 0.9267 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.2886 0.8270 0.844 0.000 0.148 0.008 0.000
#> SRR1033280 1 0.2886 0.8270 0.844 0.000 0.148 0.008 0.000
#> SRR1033281 1 0.1792 0.9111 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0510 0.9278 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 1 0.0146 0.9142 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032911 1 0.1387 0.9073 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0458 0.9145 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.1649 0.8996 0.932 0.000 0.032 0.000 0.036 0.000
#> SRR1032918 1 0.1387 0.9073 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.5656 0.6241 0.000 0.692 0.096 0.124 0.044 0.044
#> SRR1032921 1 0.1663 0.9025 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0632 0.9121 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1032925 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032924 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032929 1 0.1444 0.9063 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1032928 1 0.0260 0.9144 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032932 6 0.1680 0.9472 0.004 0.040 0.016 0.004 0.000 0.936
#> SRR1032933 1 0.1387 0.9073 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032936 1 0.0692 0.9123 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020 0.000
#> SRR1032937 2 0.0748 0.9259 0.000 0.976 0.000 0.016 0.004 0.004
#> SRR1032938 1 0.1610 0.9034 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 3 0.5498 0.4789 0.028 0.000 0.596 0.064 0.304 0.008
#> SRR1032943 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032944 1 0.2278 0.8843 0.868 0.000 0.004 0.000 0.128 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0713 0.9136 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1032949 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032952 1 0.0146 0.9141 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032953 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032954 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1032955 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.1663 0.9025 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.1663 0.9025 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1032962 5 0.5970 0.5722 0.104 0.000 0.004 0.044 0.572 0.276
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032966 1 0.0146 0.9142 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032967 3 0.5498 0.4789 0.028 0.000 0.596 0.064 0.304 0.008
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0146 0.9137 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0146 0.9137 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032974 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032975 1 0.0713 0.9136 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1032976 1 0.0458 0.9133 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1032977 6 0.1007 0.9927 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1032978 1 0.1814 0.8993 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1032979 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0146 0.9137 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.3862 0.0613 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1032988 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032990 1 0.3047 0.8266 0.832 0.000 0.004 0.012 0.144 0.008
#> SRR1032989 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032991 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0363 0.9144 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1032995 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.5531 0.6354 0.000 0.700 0.096 0.124 0.040 0.040
#> SRR1033000 6 0.1007 0.9927 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033004 2 0.3862 0.0613 0.000 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9137 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.1151 0.9054 0.956 0.000 0.012 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033007 1 0.0632 0.9121 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033008 1 0.1714 0.9004 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033009 1 0.1663 0.9016 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033010 1 0.0858 0.9077 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.2848 0.8573 0.828 0.000 0.008 0.004 0.160 0.000
#> SRR1033013 1 0.1498 0.9020 0.940 0.000 0.028 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033014 1 0.1334 0.9039 0.948 0.000 0.020 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033015 1 0.2689 0.8627 0.864 0.000 0.004 0.016 0.112 0.004
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.1082 0.9065 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033019 1 0.1297 0.9054 0.948 0.000 0.012 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033020 1 0.1610 0.9091 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033021 1 0.0547 0.9104 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033023 1 0.2048 0.8891 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1033022 1 0.2871 0.8344 0.804 0.000 0.004 0.000 0.192 0.000
#> SRR1033024 1 0.1644 0.8995 0.932 0.000 0.040 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033025 1 0.2219 0.8812 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1033026 1 0.1498 0.9020 0.940 0.000 0.028 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0713 0.9086 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033029 2 0.5656 0.6241 0.000 0.692 0.096 0.124 0.044 0.044
#> SRR1033030 1 0.1794 0.8962 0.924 0.000 0.040 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033031 1 0.4758 0.5959 0.632 0.000 0.032 0.016 0.316 0.004
#> SRR1033032 1 0.4609 0.0696 0.520 0.000 0.004 0.008 0.452 0.016
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2092 0.8880 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1033036 1 0.3152 0.8226 0.792 0.000 0.008 0.004 0.196 0.000
#> SRR1033037 1 0.1663 0.9027 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033038 1 0.5084 0.4559 0.568 0.000 0.032 0.024 0.372 0.004
#> SRR1033039 1 0.1429 0.9024 0.940 0.000 0.004 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033040 1 0.1225 0.9160 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036 0.000
#> SRR1033041 1 0.1765 0.8995 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033042 1 0.3011 0.8313 0.800 0.000 0.004 0.004 0.192 0.000
#> SRR1033043 1 0.1663 0.9024 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033044 1 0.1714 0.9004 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033045 1 0.1245 0.9046 0.952 0.000 0.016 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033046 1 0.0865 0.9096 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033047 1 0.1265 0.9054 0.948 0.000 0.008 0.000 0.044 0.000
#> SRR1033048 1 0.1010 0.9112 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036 0.000
#> SRR1033049 1 0.1910 0.8943 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1033051 1 0.1714 0.9004 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033052 1 0.1814 0.8990 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.3051 0.8179 0.824 0.000 0.004 0.012 0.156 0.004
#> SRR1033050 1 0.1714 0.9004 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033055 1 0.2128 0.8910 0.908 0.000 0.032 0.004 0.056 0.000
#> SRR1033056 1 0.0632 0.9121 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033057 1 0.2454 0.8647 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1033058 1 0.2119 0.8870 0.904 0.000 0.060 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.1124 0.9165 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036 0.000
#> SRR1033061 6 0.1007 0.9927 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033062 1 0.1498 0.9035 0.940 0.000 0.032 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.1320 0.9042 0.948 0.000 0.016 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033065 1 0.3089 0.8334 0.800 0.000 0.008 0.004 0.188 0.000
#> SRR1033066 1 0.3043 0.8271 0.796 0.000 0.004 0.004 0.196 0.000
#> SRR1033067 1 0.1663 0.9016 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033068 1 0.2642 0.8585 0.864 0.000 0.004 0.012 0.116 0.004
#> SRR1033069 5 0.5082 0.6551 0.024 0.000 0.004 0.040 0.604 0.328
#> SRR1033070 1 0.2936 0.8309 0.836 0.000 0.004 0.012 0.144 0.004
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 5 0.4605 0.5486 0.000 0.000 0.004 0.040 0.600 0.356
#> SRR1033073 1 0.2518 0.8832 0.892 0.000 0.036 0.008 0.060 0.004
#> SRR1033074 1 0.1714 0.9004 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033075 1 0.0790 0.9148 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033076 1 0.3178 0.8131 0.816 0.000 0.004 0.016 0.160 0.004
#> SRR1033077 1 0.1714 0.9027 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033078 1 0.1765 0.8996 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033079 1 0.1789 0.8963 0.924 0.000 0.044 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033080 1 0.1649 0.8991 0.932 0.000 0.032 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033081 1 0.1141 0.9155 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1033082 1 0.4253 0.6526 0.664 0.000 0.024 0.008 0.304 0.000
#> SRR1033083 1 0.1738 0.8990 0.928 0.000 0.016 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033084 1 0.1714 0.9004 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033085 1 0.1418 0.9028 0.944 0.000 0.024 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033086 6 0.1007 0.9927 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033087 1 0.1765 0.9001 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033088 1 0.2007 0.8929 0.916 0.000 0.044 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033089 1 0.1442 0.9067 0.944 0.000 0.012 0.004 0.040 0.000
#> SRR1033090 1 0.0260 0.9130 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033091 1 0.1320 0.9046 0.948 0.000 0.016 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033092 1 0.2420 0.8822 0.864 0.000 0.004 0.004 0.128 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.2689 0.8613 0.864 0.000 0.004 0.016 0.112 0.004
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.2196 0.8690 0.884 0.000 0.004 0.004 0.108 0.000
#> SRR1033097 6 0.1007 0.9927 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033098 1 0.1572 0.9004 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.1442 0.9067 0.944 0.000 0.012 0.004 0.040 0.000
#> SRR1033102 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033103 1 0.2631 0.8492 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1033104 1 0.1845 0.8959 0.920 0.000 0.052 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033105 1 0.2300 0.8747 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1033106 1 0.1471 0.9141 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064 0.000
#> SRR1033107 1 0.1780 0.8960 0.924 0.000 0.048 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033108 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033109 1 0.1663 0.9018 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033110 1 0.2001 0.8813 0.900 0.000 0.004 0.004 0.092 0.000
#> SRR1033111 1 0.2631 0.8493 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1033112 1 0.1663 0.9018 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033113 1 0.3829 0.7487 0.768 0.000 0.004 0.020 0.192 0.016
#> SRR1033114 1 0.2902 0.8303 0.800 0.000 0.004 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033115 1 0.4259 0.6699 0.676 0.000 0.020 0.008 0.292 0.004
#> SRR1033116 1 0.1780 0.8960 0.924 0.000 0.048 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033117 1 0.1921 0.8924 0.916 0.000 0.052 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033118 1 0.1268 0.9070 0.952 0.000 0.008 0.004 0.036 0.000
#> SRR1033119 1 0.2003 0.8901 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1033121 1 0.1888 0.8931 0.916 0.000 0.012 0.004 0.068 0.000
#> SRR1033120 6 0.1007 0.9927 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033122 1 0.1340 0.9061 0.948 0.000 0.008 0.004 0.040 0.000
#> SRR1033123 1 0.2793 0.8310 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033124 1 0.2048 0.8878 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1033125 1 0.5178 0.5682 0.652 0.000 0.008 0.028 0.256 0.056
#> SRR1033126 1 0.2402 0.8746 0.856 0.000 0.000 0.004 0.140 0.000
#> SRR1033127 3 0.2841 0.5374 0.032 0.000 0.864 0.000 0.012 0.092
#> SRR1033129 1 0.1780 0.8960 0.924 0.000 0.048 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033128 1 0.3716 0.7513 0.732 0.000 0.012 0.008 0.248 0.000
#> SRR1033130 1 0.1444 0.9089 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1033131 1 0.2053 0.8977 0.888 0.000 0.000 0.004 0.108 0.000
#> SRR1033132 1 0.3776 0.7540 0.768 0.000 0.004 0.016 0.196 0.016
#> SRR1033133 1 0.1701 0.9053 0.920 0.000 0.000 0.008 0.072 0.000
#> SRR1033134 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033135 1 0.2784 0.8419 0.848 0.000 0.012 0.008 0.132 0.000
#> SRR1033136 1 0.2178 0.8809 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1033137 1 0.3051 0.8179 0.824 0.000 0.004 0.012 0.156 0.004
#> SRR1033139 5 0.5535 0.6891 0.048 0.000 0.004 0.048 0.584 0.316
#> SRR1033138 1 0.4460 0.7286 0.728 0.000 0.012 0.020 0.208 0.032
#> SRR1033140 1 0.1225 0.9052 0.952 0.000 0.012 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033141 1 0.1556 0.9086 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1663 0.9016 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033144 1 0.2838 0.8369 0.808 0.000 0.000 0.004 0.188 0.000
#> SRR1033145 1 0.2113 0.8812 0.896 0.000 0.004 0.008 0.092 0.000
#> SRR1033146 5 0.6316 0.2429 0.168 0.000 0.040 0.044 0.616 0.132
#> SRR1033147 5 0.5427 0.6905 0.036 0.000 0.004 0.052 0.588 0.320
#> SRR1033148 1 0.1663 0.9018 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033149 1 0.2179 0.8854 0.900 0.000 0.064 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033150 1 0.1471 0.9109 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064 0.000
#> SRR1033151 1 0.3763 0.7290 0.752 0.000 0.004 0.016 0.220 0.008
#> SRR1033152 1 0.0865 0.9122 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033153 1 0.3327 0.7843 0.792 0.000 0.004 0.012 0.188 0.004
#> SRR1033154 1 0.2340 0.8709 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1033156 1 0.1644 0.8996 0.932 0.000 0.028 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033157 1 0.1910 0.8949 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.1867 0.8929 0.916 0.000 0.020 0.000 0.064 0.000
#> SRR1033160 1 0.2798 0.8556 0.856 0.000 0.004 0.012 0.120 0.008
#> SRR1033161 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033163 1 0.3352 0.7867 0.796 0.000 0.004 0.016 0.180 0.004
#> SRR1033162 1 0.3074 0.8222 0.792 0.000 0.004 0.004 0.200 0.000
#> SRR1033164 1 0.4324 0.6818 0.720 0.000 0.004 0.024 0.228 0.024
#> SRR1033165 1 0.0632 0.9121 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033166 1 0.4608 0.5852 0.632 0.000 0.020 0.012 0.328 0.008
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.2261 0.8716 0.884 0.000 0.008 0.004 0.104 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 5 0.5585 0.6887 0.044 0.000 0.004 0.052 0.568 0.332
#> SRR1033170 1 0.1957 0.8928 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033172 1 0.1624 0.9020 0.936 0.000 0.020 0.004 0.040 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.1297 0.9049 0.948 0.000 0.012 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033175 1 0.1663 0.9018 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033176 1 0.2260 0.8762 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.5656 0.6241 0.000 0.692 0.096 0.124 0.044 0.044
#> SRR1033180 1 0.2845 0.8496 0.820 0.000 0.004 0.004 0.172 0.000
#> SRR1033181 1 0.2416 0.8669 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033183 1 0.1168 0.9063 0.956 0.000 0.016 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033182 1 0.1333 0.9145 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1033184 1 0.3073 0.8341 0.832 0.000 0.004 0.020 0.140 0.004
#> SRR1033185 1 0.2664 0.8460 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1033187 1 0.0937 0.9132 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033186 1 0.4546 0.6141 0.644 0.000 0.020 0.024 0.312 0.000
#> SRR1033188 1 0.0632 0.9121 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033189 3 0.2350 0.4600 0.000 0.000 0.880 0.020 0.000 0.100
#> SRR1033190 1 0.3309 0.8209 0.788 0.000 0.016 0.004 0.192 0.000
#> SRR1033191 1 0.2933 0.8280 0.796 0.000 0.004 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033192 5 0.4616 0.5485 0.000 0.000 0.004 0.040 0.596 0.360
#> SRR1033193 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033195 2 0.5610 0.6345 0.000 0.700 0.068 0.120 0.040 0.072
#> SRR1033194 6 0.1007 0.9927 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033197 1 0.4573 0.6266 0.652 0.000 0.020 0.020 0.304 0.004
#> SRR1033196 1 0.3462 0.7815 0.792 0.000 0.004 0.016 0.180 0.008
#> SRR1033199 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033198 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033200 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033201 1 0.1334 0.9045 0.948 0.000 0.020 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033202 1 0.1780 0.8960 0.924 0.000 0.048 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033203 1 0.2445 0.8584 0.868 0.000 0.004 0.008 0.120 0.000
#> SRR1033204 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033205 1 0.1480 0.9037 0.940 0.000 0.020 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033206 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033207 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033208 1 0.1720 0.8996 0.928 0.000 0.040 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033209 1 0.1531 0.8973 0.928 0.000 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033210 1 0.1995 0.8919 0.912 0.000 0.052 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033211 1 0.0713 0.9141 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033212 1 0.1930 0.8943 0.916 0.000 0.048 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033216 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033215 3 0.2588 0.5470 0.024 0.000 0.876 0.000 0.008 0.092
#> SRR1033217 1 0.3051 0.8154 0.824 0.000 0.004 0.012 0.156 0.004
#> SRR1033218 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033219 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033221 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033220 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033222 1 0.1714 0.9008 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033223 1 0.2982 0.8104 0.820 0.000 0.004 0.012 0.164 0.000
#> SRR1033225 6 0.1152 0.9881 0.000 0.044 0.004 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033224 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033226 1 0.3592 0.7715 0.784 0.000 0.004 0.016 0.184 0.012
#> SRR1033227 1 0.1480 0.9037 0.940 0.000 0.020 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033232 1 0.1003 0.9108 0.964 0.000 0.004 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033233 1 0.1714 0.9005 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.3138 0.8258 0.828 0.000 0.008 0.016 0.144 0.004
#> SRR1033236 1 0.2695 0.8339 0.844 0.000 0.004 0.008 0.144 0.000
#> SRR1033237 1 0.0260 0.9138 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033238 1 0.1564 0.9005 0.936 0.000 0.024 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033240 1 0.1572 0.9008 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033239 1 0.0865 0.9142 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033242 1 0.1536 0.9049 0.940 0.000 0.016 0.004 0.040 0.000
#> SRR1033241 1 0.2784 0.8410 0.848 0.000 0.012 0.008 0.132 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.2810 0.8212 0.832 0.000 0.004 0.008 0.156 0.000
#> SRR1033246 1 0.1957 0.8930 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033248 1 0.1501 0.9087 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1033247 4 0.4326 0.0000 0.000 0.000 0.000 0.656 0.044 0.300
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.2135 0.8836 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1610 0.9034 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033254 1 0.1957 0.8939 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.3013 0.8197 0.828 0.000 0.004 0.012 0.152 0.004
#> SRR1033258 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033257 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1033259 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.1572 0.9008 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033262 1 0.1649 0.8992 0.932 0.000 0.032 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033265 2 0.4855 0.6487 0.000 0.732 0.036 0.140 0.084 0.008
#> SRR1033266 1 0.0363 0.9144 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033267 1 0.1480 0.9037 0.940 0.000 0.020 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033268 1 0.1957 0.8928 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033269 1 0.3559 0.7781 0.788 0.000 0.004 0.016 0.180 0.012
#> SRR1033270 1 0.1572 0.9008 0.936 0.000 0.028 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033271 1 0.1610 0.9027 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9411 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.1957 0.8928 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033274 2 0.5610 0.6343 0.000 0.700 0.068 0.120 0.040 0.072
#> SRR1033275 1 0.1501 0.9051 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1033276 2 0.0146 0.9394 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033277 1 0.1556 0.9039 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033278 1 0.0363 0.9128 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033279 1 0.3304 0.7953 0.804 0.000 0.004 0.012 0.172 0.008
#> SRR1033280 1 0.3304 0.7953 0.804 0.000 0.004 0.012 0.172 0.008
#> SRR1033281 1 0.1957 0.8930 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033282 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033283 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033284 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033285 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033286 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033287 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033288 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033289 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033290 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033291 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033292 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033293 1 0.0547 0.9140 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.988 0.995 0.2777 0.724 0.724
#> 3 3 0.924 0.923 0.965 1.1565 0.673 0.549
#> 4 4 0.700 0.644 0.799 0.1722 0.851 0.639
#> 5 5 0.905 0.898 0.934 0.0858 0.868 0.588
#> 6 6 0.832 0.812 0.877 0.0353 0.997 0.988
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032932 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.7219 0.747 0.200 0.800
#> SRR1032943 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.9954 0.146 0.460 0.540
#> SRR1032978 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033000 1 0.9686 0.338 0.604 0.396
#> SRR1033001 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0672 0.982 0.008 0.992
#> SRR1033062 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.2948 0.942 0.948 0.052
#> SRR1033073 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033120 1 0.7602 0.715 0.780 0.220
#> SRR1033122 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033129 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033171 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.9580 0.380 0.620 0.380
#> SRR1033190 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033217 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033247 1 0.1184 0.981 0.984 0.016
#> SRR1033249 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032911 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032912 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032913 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032914 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032915 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032916 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032917 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1032918 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032919 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032920 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032921 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.2165 0.926 0.936 0.000 0.064
#> SRR1032923 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032925 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032924 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032926 1 0.2356 0.919 0.928 0.000 0.072
#> SRR1032927 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032929 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032928 1 0.0747 0.963 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032930 1 0.0424 0.966 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032931 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032932 3 0.0892 0.931 0.020 0.000 0.980
#> SRR1032933 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032934 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032935 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032936 1 0.4654 0.756 0.792 0.000 0.208
#> SRR1032937 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032938 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.1753 0.942 0.952 0.000 0.048
#> SRR1032940 1 0.1411 0.950 0.964 0.000 0.036
#> SRR1032941 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032942 2 0.9162 0.395 0.196 0.536 0.268
#> SRR1032943 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032944 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032946 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032947 1 0.1289 0.953 0.968 0.000 0.032
#> SRR1032948 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032949 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032950 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032952 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032953 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032954 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032957 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032956 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032959 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032960 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032961 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032963 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032964 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032965 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032966 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032967 3 0.5785 0.533 0.332 0.000 0.668
#> SRR1032968 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032969 1 0.0892 0.962 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032970 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032971 1 0.0424 0.966 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032972 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032973 1 0.0747 0.963 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032974 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032976 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032977 3 0.6275 0.435 0.008 0.348 0.644
#> SRR1032978 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032980 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032981 1 0.0892 0.960 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032982 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032983 1 0.1031 0.958 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032984 1 0.0747 0.963 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032985 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032986 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032987 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032990 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1032989 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032991 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032992 1 0.0747 0.963 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032993 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032994 1 0.3038 0.892 0.896 0.000 0.104
#> SRR1032995 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032996 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032997 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032998 1 0.1643 0.948 0.956 0.000 0.044
#> SRR1032999 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033000 3 0.5728 0.591 0.008 0.272 0.720
#> SRR1033001 1 0.0424 0.966 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033002 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033004 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033006 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033007 1 0.2537 0.912 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033008 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033011 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033014 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033015 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033016 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033019 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033020 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.5560 0.617 0.700 0.000 0.300
#> SRR1033023 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.1163 0.952 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033024 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033025 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033026 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033027 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033029 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033030 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033031 3 0.6260 0.239 0.448 0.000 0.552
#> SRR1033032 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033033 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1753 0.938 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033036 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033037 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.6095 0.400 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033039 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033040 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033041 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033043 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033046 3 0.6235 0.206 0.436 0.000 0.564
#> SRR1033047 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033048 3 0.2878 0.848 0.096 0.000 0.904
#> SRR1033049 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033051 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033050 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033056 1 0.1289 0.953 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033057 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033058 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033059 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.2066 0.931 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033061 2 0.6235 0.232 0.000 0.564 0.436
#> SRR1033062 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033063 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033065 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033066 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033067 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033069 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033070 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033071 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033073 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033074 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.1163 0.955 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033076 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033077 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033080 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033081 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.4750 0.729 0.784 0.000 0.216
#> SRR1033083 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033084 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033086 2 0.6225 0.244 0.000 0.568 0.432
#> SRR1033087 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033089 3 0.0892 0.929 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033090 1 0.2625 0.908 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033091 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033092 1 0.0592 0.962 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033093 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033095 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033097 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033099 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033102 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033105 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033106 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033108 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033109 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033111 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033114 1 0.1753 0.938 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033115 1 0.5058 0.680 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033116 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033117 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033118 3 0.6140 0.324 0.404 0.000 0.596
#> SRR1033119 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033120 3 0.4033 0.798 0.008 0.136 0.856
#> SRR1033122 3 0.2261 0.877 0.068 0.000 0.932
#> SRR1033123 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033124 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033126 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033127 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033129 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033128 1 0.4931 0.702 0.768 0.000 0.232
#> SRR1033130 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033133 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033134 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033136 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033139 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033138 3 0.4291 0.741 0.180 0.000 0.820
#> SRR1033140 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033141 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.2711 0.901 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033145 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033146 3 0.5678 0.561 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033147 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033148 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033150 1 0.0424 0.966 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033151 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033152 1 0.0892 0.960 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033153 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033154 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033156 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033157 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033160 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033161 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033162 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033164 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033165 1 0.2625 0.908 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033166 3 0.6204 0.313 0.424 0.000 0.576
#> SRR1033167 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033169 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033170 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033173 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033175 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0592 0.962 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033177 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033179 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033180 1 0.1411 0.947 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033181 1 0.1753 0.938 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033183 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033182 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033185 1 0.0892 0.957 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033187 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033186 3 0.5835 0.522 0.340 0.000 0.660
#> SRR1033188 1 0.2711 0.904 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033189 3 0.0000 0.939 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033191 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033192 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033193 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033194 2 0.5497 0.580 0.000 0.708 0.292
#> SRR1033197 1 0.1860 0.935 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033196 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033199 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033201 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033202 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033203 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033204 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.3941 0.769 0.156 0.000 0.844
#> SRR1033206 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033209 1 0.5327 0.649 0.728 0.000 0.272
#> SRR1033210 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033211 1 0.0592 0.965 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033212 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033213 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033216 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033217 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033218 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033220 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.5529 0.573 0.296 0.000 0.704
#> SRR1033225 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033226 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033227 3 0.2537 0.863 0.080 0.000 0.920
#> SRR1033229 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033231 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033233 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033236 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033237 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033238 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033240 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033239 1 0.1289 0.953 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033242 1 0.5016 0.705 0.760 0.000 0.240
#> SRR1033241 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033244 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033246 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033247 3 0.4575 0.732 0.184 0.004 0.812
#> SRR1033249 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033258 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033259 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033260 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033262 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033263 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033266 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033267 3 0.1964 0.890 0.056 0.000 0.944
#> SRR1033268 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033270 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033271 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033275 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033276 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033277 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033278 1 0.1643 0.944 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033279 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033280 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033281 1 0.0000 0.967 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033283 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033284 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033285 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033286 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033287 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033288 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033289 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033290 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033291 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033292 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033293 1 0.4452 0.779 0.808 0.000 0.192
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032920 2 0.3486 0.859 0.188 0.812 0.000 0.000
#> SRR1032921 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1032922 4 0.5576 -0.281 0.444 0.000 0.020 0.536
#> SRR1032923 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032925 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032926 4 0.1661 0.665 0.004 0.000 0.052 0.944
#> SRR1032927 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032929 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.4977 0.556 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1032933 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032934 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032935 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032936 4 0.3539 0.546 0.004 0.000 0.176 0.820
#> SRR1032937 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032938 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1032939 4 0.5586 -0.308 0.452 0.000 0.020 0.528
#> SRR1032940 4 0.0707 0.700 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1032941 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 1 0.5231 -0.125 0.676 0.296 0.028 0.000
#> SRR1032943 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.4990 0.723 0.640 0.000 0.008 0.352
#> SRR1032945 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032947 4 0.0469 0.703 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032948 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.4908 0.258 0.292 0.000 0.016 0.692
#> SRR1032951 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032952 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032954 4 0.3726 0.480 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1032955 2 0.0817 0.975 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1032958 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032960 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032961 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1032962 3 0.4967 0.565 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1032963 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032966 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 1 0.1792 0.441 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1032968 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 4 0.0188 0.709 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032970 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 4 0.4477 0.241 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1032975 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032977 1 0.7688 -0.258 0.456 0.260 0.284 0.000
#> SRR1032978 1 0.4998 0.396 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1032979 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032981 4 0.0188 0.709 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032982 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 4 0.0188 0.709 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032984 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032986 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 2 0.0188 0.978 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032990 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1032989 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032991 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.1452 0.688 0.036 0.000 0.008 0.956
#> SRR1032993 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 4 0.7270 -0.125 0.332 0.000 0.164 0.504
#> SRR1032995 4 0.1302 0.688 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1032996 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 4 0.3900 0.526 0.164 0.000 0.020 0.816
#> SRR1032999 2 0.0592 0.976 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033000 1 0.7544 -0.326 0.460 0.200 0.340 0.000
#> SRR1033001 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033002 4 0.5257 -0.243 0.444 0.000 0.008 0.548
#> SRR1033003 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0188 0.978 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0336 0.707 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033006 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033007 4 0.1824 0.656 0.004 0.000 0.060 0.936
#> SRR1033008 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033009 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033010 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033011 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.4973 0.726 0.644 0.000 0.008 0.348
#> SRR1033013 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033014 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033015 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033016 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033019 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033020 1 0.5296 0.363 0.496 0.000 0.008 0.496
#> SRR1033021 3 0.7669 -0.133 0.236 0.000 0.452 0.312
#> SRR1033023 1 0.5110 0.723 0.636 0.000 0.012 0.352
#> SRR1033022 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033024 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033025 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033026 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033027 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0895 0.917 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1033029 2 0.0592 0.976 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033031 1 0.3745 0.525 0.852 0.000 0.060 0.088
#> SRR1033032 3 0.4250 0.736 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1033033 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033036 1 0.5003 0.705 0.676 0.000 0.016 0.308
#> SRR1033037 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033038 1 0.2759 0.496 0.904 0.000 0.044 0.052
#> SRR1033039 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.2589 0.855 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1033041 1 0.5220 0.586 0.568 0.000 0.008 0.424
#> SRR1033042 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033043 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033044 1 0.4898 0.608 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1033045 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033046 3 0.1820 0.889 0.036 0.000 0.944 0.020
#> SRR1033047 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033048 3 0.4100 0.747 0.148 0.000 0.816 0.036
#> SRR1033049 1 0.4973 0.726 0.644 0.000 0.008 0.348
#> SRR1033051 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033052 1 0.5007 0.718 0.636 0.000 0.008 0.356
#> SRR1033053 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033050 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033055 3 0.0336 0.926 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033056 4 0.3229 0.648 0.072 0.000 0.048 0.880
#> SRR1033057 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033058 3 0.0336 0.926 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033059 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.5186 0.728 0.640 0.000 0.016 0.344
#> SRR1033061 1 0.7499 -0.429 0.420 0.400 0.180 0.000
#> SRR1033062 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033063 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033065 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033066 1 0.5110 0.722 0.656 0.000 0.016 0.328
#> SRR1033067 1 0.4998 0.396 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1033068 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033069 3 0.4977 0.556 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1033070 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033071 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.4961 0.570 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1033073 3 0.0336 0.926 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033074 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033075 4 0.2521 0.664 0.064 0.000 0.024 0.912
#> SRR1033076 3 0.0707 0.921 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033077 1 0.4961 0.527 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1033078 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033079 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033081 4 0.5277 -0.285 0.460 0.000 0.008 0.532
#> SRR1033082 1 0.4289 0.587 0.796 0.000 0.032 0.172
#> SRR1033083 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033084 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033085 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033086 1 0.7499 -0.429 0.420 0.400 0.180 0.000
#> SRR1033087 1 0.4877 0.625 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1033088 3 0.0336 0.926 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033089 3 0.0524 0.923 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1033090 4 0.1302 0.675 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1033091 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033092 1 0.5093 0.726 0.640 0.000 0.012 0.348
#> SRR1033093 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.2281 0.923 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033099 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033102 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033103 1 0.4973 0.726 0.644 0.000 0.008 0.348
#> SRR1033104 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033105 1 0.5075 0.728 0.644 0.000 0.012 0.344
#> SRR1033106 1 0.5435 0.592 0.564 0.000 0.016 0.420
#> SRR1033107 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033108 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033109 1 0.5236 0.566 0.560 0.000 0.008 0.432
#> SRR1033110 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033111 1 0.4973 0.726 0.644 0.000 0.008 0.348
#> SRR1033112 1 0.5055 0.700 0.624 0.000 0.008 0.368
#> SRR1033113 3 0.0707 0.922 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033114 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033115 1 0.4149 0.585 0.804 0.000 0.028 0.168
#> SRR1033116 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.4800 0.513 0.004 0.000 0.656 0.340
#> SRR1033119 1 0.4990 0.723 0.640 0.000 0.008 0.352
#> SRR1033121 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 3 0.6506 0.442 0.460 0.072 0.468 0.000
#> SRR1033122 3 0.3257 0.785 0.004 0.000 0.844 0.152
#> SRR1033123 1 0.5130 0.725 0.652 0.000 0.016 0.332
#> SRR1033124 1 0.5007 0.718 0.636 0.000 0.008 0.356
#> SRR1033125 3 0.3688 0.787 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1033126 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033127 3 0.3311 0.819 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1033129 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033128 1 0.3856 0.560 0.832 0.000 0.032 0.136
#> SRR1033130 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033131 1 0.5007 0.718 0.636 0.000 0.008 0.356
#> SRR1033132 3 0.1792 0.890 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1033133 3 0.1637 0.896 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1033134 4 0.4477 0.253 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1033135 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.5093 0.726 0.640 0.000 0.012 0.348
#> SRR1033137 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033139 3 0.4977 0.556 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1033138 1 0.2915 0.479 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR1033140 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033141 1 0.5295 0.393 0.504 0.000 0.008 0.488
#> SRR1033142 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033144 1 0.5193 0.718 0.656 0.000 0.020 0.324
#> SRR1033145 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033146 1 0.1302 0.460 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1033147 3 0.4981 0.551 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1033148 4 0.4898 -0.111 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1033149 3 0.0336 0.926 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033150 1 0.5372 0.532 0.544 0.000 0.012 0.444
#> SRR1033151 3 0.1637 0.897 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1033152 4 0.4661 0.357 0.256 0.000 0.016 0.728
#> SRR1033153 3 0.3266 0.811 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1033154 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033156 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033157 1 0.4990 0.723 0.640 0.000 0.008 0.352
#> SRR1033158 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033161 4 0.4933 -0.174 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1033163 3 0.1389 0.904 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033162 1 0.5130 0.725 0.652 0.000 0.016 0.332
#> SRR1033164 3 0.4898 0.603 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1033165 4 0.1824 0.656 0.004 0.000 0.060 0.936
#> SRR1033166 1 0.1824 0.468 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR1033167 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.4925 0.591 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1033170 1 0.5024 0.713 0.632 0.000 0.008 0.360
#> SRR1033172 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033175 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033176 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033177 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0336 0.977 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.2345 0.926 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033181 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033183 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033182 1 0.5186 0.728 0.640 0.000 0.016 0.344
#> SRR1033184 3 0.0469 0.925 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1033185 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033187 4 0.1637 0.674 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1033186 1 0.2660 0.489 0.908 0.000 0.056 0.036
#> SRR1033188 4 0.1824 0.656 0.004 0.000 0.060 0.936
#> SRR1033189 3 0.4477 0.695 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1033190 1 0.5130 0.725 0.652 0.000 0.016 0.332
#> SRR1033191 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033192 3 0.4977 0.556 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1033193 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033195 2 0.0592 0.976 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.6733 0.512 0.416 0.492 0.092 0.000
#> SRR1033197 1 0.5167 0.729 0.644 0.000 0.016 0.340
#> SRR1033196 3 0.2589 0.854 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1033199 2 0.0592 0.976 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033198 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033200 4 0.1637 0.676 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1033201 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033202 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.927 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033204 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033205 3 0.2831 0.819 0.004 0.000 0.876 0.120
#> SRR1033206 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033207 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033208 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033209 4 0.4991 0.285 0.004 0.000 0.388 0.608
#> SRR1033210 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033211 4 0.4697 0.285 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1033212 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033216 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033215 3 0.4406 0.707 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1033217 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033218 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033219 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033221 2 0.0921 0.974 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0817 0.975 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1033222 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033223 3 0.1297 0.905 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR1033225 2 0.4382 0.761 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1033224 4 0.1867 0.665 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1033226 3 0.1022 0.915 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1033227 3 0.0779 0.917 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1033229 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033231 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033232 4 0.3157 0.588 0.004 0.000 0.144 0.852
#> SRR1033233 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033235 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033236 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033237 4 0.0000 0.711 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033238 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033240 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033239 4 0.6233 -0.128 0.388 0.000 0.060 0.552
#> SRR1033242 4 0.4655 0.370 0.004 0.000 0.312 0.684
#> SRR1033241 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033244 2 0.0592 0.976 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0592 0.976 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033246 1 0.4977 0.489 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1033248 4 0.5165 -0.331 0.484 0.000 0.004 0.512
#> SRR1033247 1 0.4188 0.142 0.752 0.004 0.244 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0592 0.976 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.5186 0.728 0.640 0.000 0.016 0.344
#> SRR1033252 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033254 1 0.4730 0.706 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1033256 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033258 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033257 4 0.0469 0.708 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033259 4 0.1022 0.696 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1033260 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033262 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4999 0.381 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1033265 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.4284 0.429 0.224 0.000 0.012 0.764
#> SRR1033267 3 0.0376 0.925 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033268 1 0.5007 0.718 0.636 0.000 0.008 0.356
#> SRR1033269 3 0.0592 0.923 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033270 3 0.0188 0.927 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033271 4 0.5000 -0.349 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033272 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4866 0.634 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1033274 2 0.0592 0.976 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033276 2 0.1022 0.973 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0592 0.706 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033278 4 0.0921 0.690 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1033279 3 0.0707 0.921 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033280 3 0.0336 0.926 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033281 1 0.4889 0.713 0.636 0.000 0.004 0.360
#> SRR1033282 4 0.0188 0.709 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033283 4 0.0188 0.709 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033284 4 0.0188 0.709 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033285 4 0.3257 0.579 0.004 0.000 0.152 0.844
#> SRR1033286 4 0.3257 0.579 0.004 0.000 0.152 0.844
#> SRR1033287 4 0.3257 0.579 0.004 0.000 0.152 0.844
#> SRR1033288 4 0.3257 0.579 0.004 0.000 0.152 0.844
#> SRR1033289 4 0.3257 0.579 0.004 0.000 0.152 0.844
#> SRR1033290 4 0.3257 0.579 0.004 0.000 0.152 0.844
#> SRR1033291 4 0.3157 0.587 0.004 0.000 0.144 0.852
#> SRR1033292 4 0.3157 0.587 0.004 0.000 0.144 0.852
#> SRR1033293 4 0.3157 0.587 0.004 0.000 0.144 0.852
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032911 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032912 4 0.1124 0.9152 0.036 0.000 0.000 0.960 0.004
#> SRR1032913 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032914 4 0.1041 0.9141 0.032 0.000 0.004 0.964 0.000
#> SRR1032915 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032916 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032917 3 0.0290 0.9506 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032918 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032919 4 0.1124 0.9155 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000
#> SRR1032920 5 0.5021 0.3623 0.008 0.380 0.000 0.024 0.588
#> SRR1032921 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032922 1 0.4847 0.6960 0.732 0.000 0.036 0.200 0.032
#> SRR1032923 4 0.0963 0.9154 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1032925 2 0.1173 0.9678 0.004 0.964 0.000 0.020 0.012
#> SRR1032924 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032926 4 0.1820 0.8973 0.020 0.000 0.020 0.940 0.020
#> SRR1032927 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032929 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032928 4 0.1525 0.9132 0.036 0.000 0.004 0.948 0.012
#> SRR1032930 4 0.1124 0.9155 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000
#> SRR1032931 2 0.1173 0.9678 0.004 0.964 0.000 0.020 0.012
#> SRR1032932 5 0.1872 0.9009 0.020 0.000 0.052 0.000 0.928
#> SRR1032933 4 0.1704 0.9057 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1032934 4 0.1043 0.9162 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1032935 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032936 4 0.3640 0.8057 0.020 0.000 0.120 0.832 0.028
#> SRR1032937 2 0.1173 0.9678 0.004 0.964 0.000 0.020 0.012
#> SRR1032938 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032939 1 0.4707 0.7214 0.748 0.000 0.028 0.184 0.040
#> SRR1032940 4 0.1525 0.9123 0.036 0.000 0.012 0.948 0.004
#> SRR1032941 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032942 5 0.2411 0.8782 0.052 0.024 0.008 0.004 0.912
#> SRR1032943 2 0.0740 0.9744 0.004 0.980 0.000 0.008 0.008
#> SRR1032944 1 0.0451 0.9403 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1032945 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032946 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032947 4 0.1329 0.9132 0.032 0.000 0.008 0.956 0.004
#> SRR1032948 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032949 2 0.1173 0.9678 0.004 0.964 0.000 0.020 0.012
#> SRR1032950 1 0.4635 0.6091 0.688 0.000 0.016 0.280 0.016
#> SRR1032951 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032952 4 0.1285 0.9150 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1032953 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032954 4 0.4321 0.4431 0.396 0.000 0.000 0.600 0.004
#> SRR1032955 2 0.0854 0.9733 0.004 0.976 0.000 0.012 0.008
#> SRR1032957 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032956 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032958 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032959 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032960 4 0.1285 0.9150 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1032961 1 0.1124 0.9361 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1032962 5 0.1943 0.9010 0.020 0.000 0.056 0.000 0.924
#> SRR1032963 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032964 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032965 4 0.1831 0.9016 0.076 0.000 0.000 0.920 0.004
#> SRR1032966 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032967 5 0.2911 0.8108 0.136 0.000 0.008 0.004 0.852
#> SRR1032968 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032969 4 0.1124 0.9155 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000
#> SRR1032970 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032971 4 0.1124 0.9155 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000
#> SRR1032972 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032973 4 0.1285 0.9150 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1032974 1 0.4211 0.4467 0.636 0.000 0.000 0.360 0.004
#> SRR1032975 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032976 4 0.1605 0.9126 0.040 0.000 0.004 0.944 0.012
#> SRR1032977 5 0.2351 0.8904 0.020 0.036 0.028 0.000 0.916
#> SRR1032978 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032979 2 0.1173 0.9678 0.004 0.964 0.000 0.020 0.012
#> SRR1032980 4 0.1043 0.9162 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1032981 4 0.1285 0.9150 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1032982 4 0.1043 0.9162 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1032983 4 0.1787 0.9088 0.032 0.000 0.012 0.940 0.016
#> SRR1032984 4 0.1285 0.9150 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1032985 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032986 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032987 2 0.0693 0.9753 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1032988 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032990 3 0.1082 0.9466 0.000 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR1032989 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1032991 2 0.1173 0.9678 0.004 0.964 0.000 0.020 0.012
#> SRR1032992 4 0.4319 0.7557 0.176 0.000 0.028 0.772 0.024
#> SRR1032993 4 0.1285 0.9150 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1032994 1 0.6861 0.3041 0.516 0.000 0.292 0.160 0.032
#> SRR1032995 4 0.2719 0.8413 0.144 0.000 0.000 0.852 0.004
#> SRR1032996 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032997 4 0.1205 0.9163 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032998 4 0.6232 0.2546 0.388 0.000 0.080 0.508 0.024
#> SRR1032999 2 0.1393 0.9622 0.008 0.956 0.000 0.024 0.012
#> SRR1033000 5 0.2180 0.8948 0.020 0.024 0.032 0.000 0.924
#> SRR1033001 4 0.1285 0.9150 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1033002 1 0.2771 0.8475 0.860 0.000 0.012 0.128 0.000
#> SRR1033003 2 0.1173 0.9678 0.004 0.964 0.000 0.020 0.012
#> SRR1033004 2 0.0451 0.9776 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033005 4 0.1756 0.9076 0.036 0.000 0.016 0.940 0.008
#> SRR1033006 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033007 4 0.2902 0.8674 0.028 0.000 0.056 0.888 0.028
#> SRR1033008 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033009 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033010 3 0.0404 0.9522 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033011 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033012 1 0.0451 0.9403 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1033013 3 0.0290 0.9506 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033014 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033015 3 0.1124 0.9468 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1033016 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033017 2 0.0162 0.9781 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033018 3 0.0865 0.9508 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1033019 3 0.0404 0.9522 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033020 1 0.0992 0.9407 0.968 0.000 0.008 0.024 0.000
#> SRR1033021 3 0.5222 0.5118 0.256 0.000 0.676 0.044 0.024
#> SRR1033023 1 0.0404 0.9389 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033024 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0693 0.9370 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033028 3 0.1522 0.9201 0.000 0.000 0.944 0.044 0.012
#> SRR1033029 2 0.1393 0.9622 0.008 0.956 0.000 0.024 0.012
#> SRR1033030 3 0.0510 0.9510 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033031 1 0.1364 0.9165 0.952 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1033032 3 0.2678 0.8804 0.016 0.000 0.880 0.004 0.100
#> SRR1033033 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033035 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033034 1 0.0693 0.9370 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1033036 1 0.1012 0.9318 0.968 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR1033037 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033038 1 0.2674 0.8175 0.856 0.000 0.004 0.000 0.140
#> SRR1033039 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033040 3 0.1756 0.9372 0.016 0.000 0.940 0.008 0.036
#> SRR1033041 1 0.0693 0.9415 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1033042 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033043 1 0.1124 0.9361 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033044 1 0.0771 0.9415 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1033045 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033046 3 0.1356 0.9388 0.004 0.000 0.956 0.012 0.028
#> SRR1033047 3 0.0404 0.9536 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033048 3 0.4441 0.5707 0.252 0.000 0.716 0.008 0.024
#> SRR1033049 1 0.0566 0.9382 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033051 1 0.0955 0.9404 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033052 1 0.0579 0.9410 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033053 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033054 3 0.1168 0.9474 0.000 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1033050 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033055 3 0.0609 0.9488 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033056 4 0.5981 0.4993 0.308 0.000 0.072 0.592 0.028
#> SRR1033057 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033058 3 0.0510 0.9510 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033059 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033060 1 0.1623 0.9218 0.948 0.000 0.016 0.016 0.020
#> SRR1033061 5 0.2677 0.8764 0.020 0.064 0.020 0.000 0.896
#> SRR1033062 3 0.0510 0.9512 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033063 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033064 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033065 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033066 1 0.1012 0.9318 0.968 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR1033067 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033068 3 0.1251 0.9456 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1033069 5 0.1943 0.9010 0.020 0.000 0.056 0.000 0.924
#> SRR1033070 3 0.1168 0.9474 0.000 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1033071 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033072 5 0.1943 0.9010 0.020 0.000 0.056 0.000 0.924
#> SRR1033073 3 0.0880 0.9424 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033074 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033075 4 0.6007 0.3679 0.364 0.000 0.072 0.544 0.020
#> SRR1033076 3 0.1251 0.9456 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1033077 1 0.0865 0.9412 0.972 0.000 0.004 0.024 0.000
#> SRR1033078 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033079 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033080 3 0.0404 0.9522 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033081 1 0.2173 0.9129 0.920 0.000 0.012 0.052 0.016
#> SRR1033082 1 0.1195 0.9213 0.960 0.000 0.012 0.000 0.028
#> SRR1033083 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033084 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033085 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033086 5 0.2677 0.8764 0.020 0.064 0.020 0.000 0.896
#> SRR1033087 1 0.0609 0.9411 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033088 3 0.0609 0.9488 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033089 3 0.0693 0.9448 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1033090 4 0.1356 0.9106 0.028 0.000 0.012 0.956 0.004
#> SRR1033091 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033092 1 0.0404 0.9389 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0451 0.9760 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033094 3 0.1205 0.9450 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0798 0.9499 0.000 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1033097 5 0.4480 0.3615 0.004 0.400 0.000 0.004 0.592
#> SRR1033098 3 0.0404 0.9522 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033099 2 0.0451 0.9760 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033100 2 0.0566 0.9745 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033101 3 0.0290 0.9506 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033102 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033103 1 0.0613 0.9397 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0566 0.9382 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033106 1 0.1518 0.9309 0.952 0.000 0.016 0.012 0.020
#> SRR1033107 3 0.0162 0.9520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033108 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1033109 1 0.0898 0.9414 0.972 0.000 0.008 0.020 0.000
#> SRR1033110 3 0.1168 0.9474 0.000 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1033111 1 0.0613 0.9397 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1033112 1 0.0579 0.9410 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033113 3 0.1571 0.9331 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1033114 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033115 1 0.1364 0.9165 0.952 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1033116 3 0.0162 0.9520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033117 3 0.0404 0.9522 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033118 3 0.4585 0.4038 0.000 0.000 0.628 0.352 0.020
#> SRR1033119 1 0.0404 0.9389 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 5 0.1960 0.9008 0.020 0.004 0.048 0.000 0.928
#> SRR1033122 3 0.1117 0.9351 0.000 0.000 0.964 0.016 0.020
#> SRR1033123 1 0.1012 0.9318 0.968 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR1033124 1 0.0579 0.9410 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033125 3 0.2835 0.8646 0.016 0.000 0.868 0.004 0.112
#> SRR1033126 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033127 3 0.4516 0.2150 0.004 0.000 0.576 0.004 0.416
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.1364 0.9165 0.952 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1033130 1 0.1329 0.9370 0.956 0.000 0.004 0.032 0.008
#> SRR1033131 1 0.0579 0.9410 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033132 3 0.1717 0.9329 0.008 0.000 0.936 0.004 0.052
#> SRR1033133 3 0.1731 0.9360 0.012 0.000 0.940 0.008 0.040
#> SRR1033134 1 0.3274 0.7162 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1033135 3 0.0566 0.9532 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033136 1 0.0404 0.9389 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.1251 0.9459 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1033139 5 0.1943 0.9010 0.020 0.000 0.056 0.000 0.924
#> SRR1033138 1 0.2681 0.8507 0.876 0.000 0.012 0.004 0.108
#> SRR1033140 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033141 1 0.0992 0.9407 0.968 0.000 0.008 0.024 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033144 1 0.0912 0.9337 0.972 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1033145 3 0.0671 0.9528 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1033146 5 0.1908 0.8492 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1033147 5 0.1943 0.9010 0.020 0.000 0.056 0.000 0.924
#> SRR1033148 1 0.2848 0.8065 0.840 0.000 0.000 0.156 0.004
#> SRR1033149 3 0.0703 0.9466 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033150 1 0.2002 0.9179 0.932 0.000 0.020 0.020 0.028
#> SRR1033151 3 0.1788 0.9300 0.008 0.000 0.932 0.004 0.056
#> SRR1033152 1 0.4872 0.7110 0.736 0.000 0.060 0.184 0.020
#> SRR1033153 3 0.4305 0.6901 0.176 0.000 0.768 0.008 0.048
#> SRR1033154 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033156 3 0.0162 0.9520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033157 1 0.0451 0.9403 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1033158 2 0.0404 0.9759 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033159 3 0.0162 0.9534 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033160 3 0.0771 0.9519 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1033161 1 0.2719 0.8314 0.852 0.000 0.000 0.144 0.004
#> SRR1033163 3 0.1569 0.9377 0.008 0.000 0.944 0.004 0.044
#> SRR1033162 1 0.0912 0.9337 0.972 0.000 0.012 0.000 0.016
#> SRR1033164 5 0.4017 0.6728 0.012 0.000 0.248 0.004 0.736
#> SRR1033165 4 0.2902 0.8674 0.028 0.000 0.056 0.888 0.028
#> SRR1033166 1 0.2624 0.8435 0.872 0.000 0.012 0.000 0.116
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0992 0.9500 0.000 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1033169 2 0.0162 0.9780 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033171 5 0.1845 0.8990 0.016 0.000 0.056 0.000 0.928
#> SRR1033170 1 0.0566 0.9414 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033172 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033175 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033176 1 0.0693 0.9366 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0613 0.9758 0.004 0.984 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033179 2 0.5136 0.0988 0.008 0.528 0.000 0.024 0.440
#> SRR1033180 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033181 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033183 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0981 0.9375 0.972 0.000 0.012 0.008 0.008
#> SRR1033184 3 0.1331 0.9439 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1033185 1 0.0693 0.9366 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1033187 4 0.6089 0.2340 0.408 0.000 0.060 0.504 0.028
#> SRR1033186 1 0.2077 0.8754 0.908 0.000 0.008 0.000 0.084
#> SRR1033188 4 0.2902 0.8674 0.028 0.000 0.056 0.888 0.028
#> SRR1033189 5 0.2497 0.8656 0.004 0.000 0.112 0.004 0.880
#> SRR1033190 1 0.1012 0.9318 0.968 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR1033191 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033192 5 0.1943 0.9010 0.020 0.000 0.056 0.000 0.924
#> SRR1033193 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033195 2 0.1087 0.9692 0.008 0.968 0.000 0.016 0.008
#> SRR1033194 5 0.2569 0.8664 0.012 0.076 0.016 0.000 0.896
#> SRR1033197 1 0.0807 0.9352 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033196 3 0.1830 0.9286 0.012 0.000 0.932 0.004 0.052
#> SRR1033199 2 0.0162 0.9782 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033198 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033200 4 0.3728 0.7298 0.244 0.000 0.000 0.748 0.008
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0290 0.9506 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033203 3 0.0566 0.9532 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033204 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033205 3 0.1106 0.9358 0.000 0.000 0.964 0.012 0.024
#> SRR1033206 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033207 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 3 0.5218 0.4447 0.016 0.000 0.632 0.316 0.036
#> SRR1033210 3 0.0162 0.9533 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033211 1 0.4676 0.7431 0.760 0.000 0.044 0.164 0.032
#> SRR1033212 3 0.0290 0.9531 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033213 2 0.0162 0.9780 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033214 4 0.2068 0.8902 0.092 0.000 0.000 0.904 0.004
#> SRR1033216 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033215 5 0.3231 0.7916 0.004 0.000 0.196 0.000 0.800
#> SRR1033217 3 0.0898 0.9491 0.000 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1033218 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033219 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033221 2 0.0854 0.9733 0.004 0.976 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033220 2 0.0613 0.9758 0.004 0.984 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033222 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033223 3 0.1525 0.9348 0.004 0.000 0.948 0.012 0.036
#> SRR1033225 5 0.2329 0.8169 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1033224 4 0.3366 0.7683 0.212 0.000 0.000 0.784 0.004
#> SRR1033226 3 0.1913 0.9282 0.016 0.000 0.932 0.008 0.044
#> SRR1033227 3 0.0992 0.9389 0.000 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.2011 0.8964 0.088 0.000 0.000 0.908 0.004
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033232 4 0.3898 0.8055 0.028 0.000 0.120 0.820 0.032
#> SRR1033233 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0898 0.9490 0.000 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1033236 3 0.0898 0.9477 0.000 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1033237 4 0.1522 0.9119 0.044 0.000 0.000 0.944 0.012
#> SRR1033238 3 0.0290 0.9506 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.4322 0.7925 0.804 0.000 0.084 0.080 0.032
#> SRR1033242 4 0.4141 0.6524 0.000 0.000 0.236 0.736 0.028
#> SRR1033241 3 0.0579 0.9518 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1033244 2 0.0162 0.9782 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033243 2 0.0162 0.9782 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033245 3 0.1168 0.9432 0.000 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1033246 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033248 1 0.1329 0.9370 0.956 0.000 0.004 0.032 0.008
#> SRR1033247 5 0.2104 0.8816 0.060 0.000 0.024 0.000 0.916
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0162 0.9782 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033251 1 0.0404 0.9389 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033254 1 0.0566 0.9414 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0898 0.9490 0.000 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1033258 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033257 4 0.1831 0.9033 0.076 0.000 0.000 0.920 0.004
#> SRR1033259 4 0.3333 0.7704 0.208 0.000 0.000 0.788 0.004
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0162 0.9520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9530 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033265 2 0.0854 0.9731 0.004 0.976 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033266 1 0.5133 0.3473 0.584 0.000 0.016 0.380 0.020
#> SRR1033267 3 0.0898 0.9449 0.000 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1033268 1 0.0579 0.9410 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033269 3 0.1331 0.9439 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1033270 3 0.0162 0.9520 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033271 1 0.0880 0.9398 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9785 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0566 0.9414 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033274 2 0.0960 0.9712 0.008 0.972 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033275 4 0.1892 0.8992 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004
#> SRR1033276 2 0.0613 0.9758 0.004 0.984 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033277 4 0.1952 0.8979 0.084 0.000 0.000 0.912 0.004
#> SRR1033278 4 0.1285 0.9150 0.036 0.000 0.004 0.956 0.004
#> SRR1033279 3 0.1331 0.9439 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1033280 3 0.1331 0.9439 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1033281 1 0.0566 0.9414 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033282 4 0.2395 0.8932 0.036 0.000 0.012 0.912 0.040
#> SRR1033283 4 0.2395 0.8932 0.036 0.000 0.012 0.912 0.040
#> SRR1033284 4 0.2395 0.8932 0.036 0.000 0.012 0.912 0.040
#> SRR1033285 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
#> SRR1033286 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
#> SRR1033287 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
#> SRR1033288 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
#> SRR1033289 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
#> SRR1033290 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
#> SRR1033291 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
#> SRR1033292 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
#> SRR1033293 4 0.4198 0.7960 0.028 0.000 0.120 0.804 0.048
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.0717 0.859 0.008 0.000 0.000 0.976 NA 0.000
#> SRR1032911 4 0.2020 0.836 0.008 0.000 0.000 0.896 NA 0.000
#> SRR1032912 4 0.0520 0.860 0.008 0.000 0.000 0.984 NA 0.000
#> SRR1032913 4 0.0717 0.859 0.008 0.000 0.000 0.976 NA 0.000
#> SRR1032914 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032915 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032916 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032917 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1032918 4 0.2020 0.836 0.008 0.000 0.000 0.896 NA 0.000
#> SRR1032919 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032920 6 0.5908 0.393 0.000 0.248 0.000 0.000 NA 0.468
#> SRR1032921 1 0.1701 0.873 0.920 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1032922 1 0.6553 0.354 0.480 0.000 0.040 0.184 NA 0.004
#> SRR1032923 4 0.0717 0.860 0.008 0.000 0.000 0.976 NA 0.000
#> SRR1032925 2 0.2476 0.895 0.004 0.868 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1032924 4 0.2537 0.825 0.032 0.000 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1032926 4 0.2070 0.821 0.008 0.000 0.000 0.892 NA 0.000
#> SRR1032927 4 0.2537 0.825 0.032 0.000 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1032929 4 0.2020 0.836 0.008 0.000 0.000 0.896 NA 0.000
#> SRR1032928 4 0.0806 0.856 0.008 0.000 0.000 0.972 NA 0.000
#> SRR1032930 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032931 2 0.2476 0.895 0.004 0.868 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1032932 6 0.0291 0.869 0.004 0.000 0.000 0.000 NA 0.992
#> SRR1032933 4 0.2462 0.828 0.028 0.000 0.000 0.876 NA 0.000
#> SRR1032934 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032935 4 0.2537 0.825 0.032 0.000 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1032936 4 0.4105 0.721 0.008 0.000 0.080 0.760 NA 0.000
#> SRR1032937 2 0.2476 0.895 0.004 0.868 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1032938 1 0.1967 0.864 0.904 0.000 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR1032939 1 0.6150 0.423 0.536 0.000 0.016 0.160 NA 0.012
#> SRR1032940 4 0.0862 0.856 0.008 0.000 0.004 0.972 NA 0.000
#> SRR1032941 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032942 6 0.2882 0.821 0.008 0.000 0.000 0.000 NA 0.812
#> SRR1032943 2 0.2243 0.902 0.004 0.880 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1032944 1 0.1398 0.882 0.940 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1032945 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032946 4 0.1918 0.839 0.008 0.000 0.000 0.904 NA 0.000
#> SRR1032947 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032948 4 0.1701 0.845 0.008 0.000 0.000 0.920 NA 0.000
#> SRR1032949 2 0.2476 0.895 0.004 0.868 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1032950 1 0.5834 0.412 0.536 0.000 0.008 0.248 NA 0.000
#> SRR1032951 4 0.2609 0.823 0.036 0.000 0.000 0.868 NA 0.000
#> SRR1032952 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032953 4 0.2609 0.823 0.036 0.000 0.000 0.868 NA 0.000
#> SRR1032954 4 0.5190 0.359 0.376 0.000 0.000 0.528 NA 0.000
#> SRR1032955 2 0.2386 0.899 0.004 0.876 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1032957 4 0.0260 0.860 0.008 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032956 1 0.1913 0.866 0.908 0.000 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR1032958 4 0.0806 0.858 0.008 0.000 0.000 0.972 NA 0.000
#> SRR1032959 4 0.2679 0.820 0.040 0.000 0.000 0.864 NA 0.000
#> SRR1032960 4 0.0520 0.859 0.008 0.000 0.000 0.984 NA 0.000
#> SRR1032961 1 0.1967 0.864 0.904 0.000 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR1032962 6 0.1926 0.850 0.000 0.000 0.020 0.000 NA 0.912
#> SRR1032963 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032964 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032965 4 0.2537 0.825 0.032 0.000 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1032966 4 0.1049 0.856 0.008 0.000 0.000 0.960 NA 0.000
#> SRR1032967 6 0.4494 0.754 0.092 0.000 0.000 0.000 NA 0.692
#> SRR1032968 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032969 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032970 4 0.0260 0.860 0.008 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032971 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032972 4 0.0260 0.860 0.008 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032973 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032974 1 0.5136 0.129 0.496 0.000 0.000 0.420 NA 0.000
#> SRR1032975 4 0.0806 0.858 0.008 0.000 0.000 0.972 NA 0.000
#> SRR1032976 4 0.1074 0.853 0.012 0.000 0.000 0.960 NA 0.000
#> SRR1032977 6 0.1643 0.867 0.000 0.008 0.000 0.000 NA 0.924
#> SRR1032978 1 0.0891 0.887 0.968 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1032979 2 0.2476 0.895 0.004 0.868 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1032980 4 0.0260 0.860 0.008 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032981 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032982 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032983 4 0.1643 0.837 0.008 0.000 0.000 0.924 NA 0.000
#> SRR1032984 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032985 4 0.2537 0.825 0.032 0.000 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1032986 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032987 2 0.1493 0.927 0.004 0.936 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1032988 4 0.2537 0.825 0.032 0.000 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1032990 3 0.3518 0.795 0.000 0.000 0.732 0.000 NA 0.012
#> SRR1032989 4 0.2609 0.823 0.036 0.000 0.000 0.868 NA 0.000
#> SRR1032991 2 0.2476 0.895 0.004 0.868 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1032992 4 0.5940 0.494 0.180 0.000 0.036 0.584 NA 0.000
#> SRR1032993 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032994 1 0.7626 0.080 0.368 0.000 0.200 0.148 NA 0.008
#> SRR1032995 4 0.3822 0.747 0.128 0.000 0.000 0.776 NA 0.000
#> SRR1032996 4 0.0717 0.859 0.008 0.000 0.000 0.976 NA 0.000
#> SRR1032997 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1032998 4 0.7062 0.206 0.264 0.000 0.072 0.428 NA 0.004
#> SRR1032999 2 0.3575 0.746 0.000 0.708 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR1033000 6 0.1643 0.867 0.000 0.008 0.000 0.000 NA 0.924
#> SRR1033001 4 0.0520 0.859 0.008 0.000 0.000 0.984 NA 0.000
#> SRR1033002 1 0.2308 0.835 0.880 0.000 0.008 0.108 NA 0.000
#> SRR1033003 2 0.2476 0.895 0.004 0.868 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1033004 2 0.1429 0.928 0.004 0.940 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033005 4 0.1065 0.853 0.008 0.000 0.008 0.964 NA 0.000
#> SRR1033006 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033007 4 0.3502 0.767 0.016 0.000 0.024 0.800 NA 0.000
#> SRR1033008 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033009 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033010 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033011 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033012 1 0.1462 0.881 0.936 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033013 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033014 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033015 3 0.3699 0.805 0.000 0.000 0.752 0.000 NA 0.036
#> SRR1033016 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033017 2 0.0508 0.936 0.004 0.984 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033018 3 0.3454 0.813 0.000 0.000 0.768 0.000 NA 0.024
#> SRR1033019 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033020 1 0.0260 0.887 0.992 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033021 3 0.6888 0.406 0.208 0.000 0.468 0.068 NA 0.004
#> SRR1033023 1 0.0972 0.886 0.964 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033022 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033024 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033025 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033026 3 0.0363 0.857 0.000 0.000 0.988 0.000 NA 0.000
#> SRR1033027 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033028 3 0.2020 0.795 0.000 0.000 0.896 0.096 NA 0.000
#> SRR1033029 2 0.3670 0.741 0.000 0.704 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR1033030 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033031 1 0.2151 0.869 0.904 0.000 0.008 0.000 NA 0.016
#> SRR1033032 3 0.4148 0.773 0.000 0.000 0.744 0.000 NA 0.108
#> SRR1033033 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033035 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033034 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033036 1 0.1957 0.873 0.912 0.000 0.008 0.000 NA 0.008
#> SRR1033037 1 0.1049 0.885 0.960 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033038 1 0.3966 0.745 0.772 0.000 0.008 0.000 NA 0.148
#> SRR1033039 3 0.0260 0.861 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.000
#> SRR1033040 3 0.4586 0.763 0.024 0.000 0.684 0.004 NA 0.028
#> SRR1033041 1 0.0291 0.888 0.992 0.000 0.004 0.004 NA 0.000
#> SRR1033042 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033043 1 0.1967 0.864 0.904 0.000 0.000 0.012 NA 0.000
#> SRR1033044 1 0.1196 0.884 0.952 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033045 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033046 3 0.3761 0.791 0.004 0.000 0.740 0.016 NA 0.004
#> SRR1033047 3 0.0291 0.859 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.004
#> SRR1033048 3 0.6222 0.452 0.248 0.000 0.524 0.012 NA 0.012
#> SRR1033049 1 0.1728 0.878 0.924 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033051 1 0.1398 0.881 0.940 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033052 1 0.0260 0.887 0.992 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033053 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033054 3 0.3745 0.796 0.000 0.000 0.732 0.000 NA 0.028
#> SRR1033050 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033055 3 0.0520 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.008
#> SRR1033056 4 0.6789 0.237 0.316 0.000 0.056 0.420 NA 0.000
#> SRR1033057 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033058 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033059 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033060 1 0.3906 0.686 0.744 0.000 0.008 0.012 NA 0.012
#> SRR1033061 6 0.1895 0.864 0.000 0.016 0.000 0.000 NA 0.912
#> SRR1033062 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033063 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033064 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033065 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033066 1 0.1957 0.873 0.912 0.000 0.008 0.000 NA 0.008
#> SRR1033067 1 0.1333 0.882 0.944 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033068 3 0.3860 0.794 0.000 0.000 0.728 0.000 NA 0.036
#> SRR1033069 6 0.1225 0.867 0.000 0.000 0.012 0.000 NA 0.952
#> SRR1033070 3 0.3816 0.794 0.000 0.000 0.728 0.000 NA 0.032
#> SRR1033071 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033072 6 0.0146 0.870 0.000 0.000 0.004 0.000 NA 0.996
#> SRR1033073 3 0.1333 0.841 0.000 0.000 0.944 0.000 NA 0.048
#> SRR1033074 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033075 4 0.6231 0.148 0.392 0.000 0.020 0.432 NA 0.004
#> SRR1033076 3 0.3909 0.789 0.000 0.000 0.720 0.000 NA 0.036
#> SRR1033077 1 0.0260 0.888 0.992 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033078 1 0.0891 0.887 0.968 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033079 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033080 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033081 1 0.3400 0.792 0.832 0.000 0.008 0.064 NA 0.004
#> SRR1033082 1 0.2058 0.871 0.908 0.000 0.008 0.000 NA 0.012
#> SRR1033083 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033084 1 0.0972 0.886 0.964 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033085 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033086 6 0.1895 0.864 0.000 0.016 0.000 0.000 NA 0.912
#> SRR1033087 1 0.0260 0.888 0.992 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033088 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033089 3 0.0891 0.855 0.000 0.000 0.968 0.008 NA 0.000
#> SRR1033090 4 0.0405 0.860 0.008 0.000 0.000 0.988 NA 0.000
#> SRR1033091 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033092 1 0.1333 0.883 0.944 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033093 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033094 3 0.3582 0.810 0.000 0.000 0.768 0.000 NA 0.036
#> SRR1033095 2 0.0000 0.937 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033096 3 0.3215 0.810 0.000 0.000 0.756 0.000 NA 0.004
#> SRR1033097 6 0.5021 0.507 0.004 0.300 0.000 0.000 NA 0.608
#> SRR1033098 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033099 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033100 2 0.0603 0.935 0.004 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033101 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033102 1 0.1524 0.879 0.932 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033103 1 0.1643 0.878 0.924 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033104 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033105 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033106 1 0.2797 0.791 0.844 0.000 0.008 0.004 NA 0.004
#> SRR1033107 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033108 4 0.2537 0.825 0.032 0.000 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1033109 1 0.0260 0.887 0.992 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033110 3 0.3394 0.804 0.000 0.000 0.752 0.000 NA 0.012
#> SRR1033111 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033112 1 0.0260 0.887 0.992 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033113 3 0.3835 0.802 0.000 0.000 0.756 0.000 NA 0.056
#> SRR1033114 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033115 1 0.2058 0.871 0.908 0.000 0.008 0.000 NA 0.012
#> SRR1033116 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033117 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033118 3 0.4798 0.437 0.000 0.000 0.612 0.312 NA 0.000
#> SRR1033119 1 0.0806 0.887 0.972 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.858 0.000 0.000 1.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033120 6 0.1471 0.867 0.000 0.004 0.000 0.000 NA 0.932
#> SRR1033122 3 0.2527 0.834 0.000 0.000 0.868 0.024 NA 0.000
#> SRR1033123 1 0.1845 0.876 0.916 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033124 1 0.0436 0.888 0.988 0.000 0.004 0.004 NA 0.000
#> SRR1033125 3 0.4904 0.718 0.000 0.000 0.644 0.000 NA 0.120
#> SRR1033126 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033127 3 0.4887 0.275 0.000 0.000 0.612 0.000 NA 0.300
#> SRR1033129 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033128 1 0.2151 0.869 0.904 0.000 0.008 0.000 NA 0.016
#> SRR1033130 1 0.1728 0.879 0.924 0.000 0.004 0.008 NA 0.000
#> SRR1033131 1 0.0260 0.887 0.992 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033132 3 0.3830 0.800 0.000 0.000 0.744 0.000 NA 0.044
#> SRR1033133 3 0.4024 0.776 0.000 0.000 0.700 0.000 NA 0.036
#> SRR1033134 1 0.4046 0.689 0.748 0.000 0.000 0.168 NA 0.000
#> SRR1033135 3 0.2402 0.839 0.000 0.000 0.856 0.000 NA 0.004
#> SRR1033136 1 0.0260 0.887 0.992 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033137 3 0.3816 0.794 0.000 0.000 0.728 0.000 NA 0.032
#> SRR1033139 6 0.1594 0.860 0.000 0.000 0.016 0.000 NA 0.932
#> SRR1033138 1 0.5246 0.586 0.640 0.000 0.020 0.000 NA 0.104
#> SRR1033140 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033141 1 0.0405 0.888 0.988 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033142 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033143 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033144 1 0.1845 0.876 0.916 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033145 3 0.2402 0.839 0.000 0.000 0.856 0.000 NA 0.004
#> SRR1033146 6 0.3017 0.801 0.072 0.000 0.000 0.000 NA 0.844
#> SRR1033147 6 0.1644 0.862 0.004 0.000 0.012 0.000 NA 0.932
#> SRR1033148 1 0.3693 0.748 0.788 0.000 0.000 0.120 NA 0.000
#> SRR1033149 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033150 1 0.3492 0.710 0.772 0.000 0.008 0.004 NA 0.008
#> SRR1033151 3 0.4099 0.782 0.000 0.000 0.708 0.000 NA 0.048
#> SRR1033152 1 0.5842 0.483 0.584 0.000 0.024 0.140 NA 0.004
#> SRR1033153 3 0.6215 0.531 0.156 0.000 0.524 0.000 NA 0.040
#> SRR1033154 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033156 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033157 1 0.1462 0.881 0.936 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033158 2 0.0508 0.937 0.000 0.984 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033159 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.000
#> SRR1033160 3 0.2896 0.829 0.000 0.000 0.824 0.000 NA 0.016
#> SRR1033161 1 0.3423 0.785 0.812 0.000 0.000 0.100 NA 0.000
#> SRR1033163 3 0.3998 0.784 0.000 0.000 0.712 0.000 NA 0.040
#> SRR1033162 1 0.1845 0.876 0.916 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033164 6 0.5041 0.478 0.000 0.000 0.248 0.000 NA 0.624
#> SRR1033165 4 0.3736 0.759 0.020 0.000 0.032 0.788 NA 0.000
#> SRR1033166 1 0.3218 0.826 0.840 0.000 0.008 0.000 NA 0.080
#> SRR1033167 2 0.0405 0.937 0.000 0.988 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033168 3 0.3394 0.805 0.000 0.000 0.752 0.000 NA 0.012
#> SRR1033169 2 0.0508 0.937 0.000 0.984 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033171 6 0.1391 0.864 0.000 0.000 0.016 0.000 NA 0.944
#> SRR1033170 1 0.0260 0.887 0.992 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033172 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033173 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033174 3 0.0260 0.858 0.000 0.000 0.992 0.000 NA 0.008
#> SRR1033175 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033176 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033177 2 0.0000 0.937 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033178 2 0.1010 0.933 0.000 0.960 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033179 2 0.6100 -0.101 0.000 0.364 0.000 0.000 NA 0.352
#> SRR1033180 1 0.1728 0.878 0.924 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033181 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033183 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033182 1 0.1307 0.881 0.952 0.000 0.008 0.000 NA 0.008
#> SRR1033184 3 0.3884 0.792 0.000 0.000 0.724 0.000 NA 0.036
#> SRR1033185 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033187 1 0.6447 0.112 0.452 0.000 0.024 0.324 NA 0.004
#> SRR1033186 1 0.3566 0.794 0.812 0.000 0.008 0.000 NA 0.104
#> SRR1033188 4 0.3578 0.764 0.016 0.000 0.028 0.796 NA 0.000
#> SRR1033189 6 0.3585 0.810 0.000 0.000 0.048 0.000 NA 0.780
#> SRR1033190 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033191 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033192 6 0.1155 0.867 0.004 0.000 0.004 0.000 NA 0.956
#> SRR1033193 1 0.1398 0.881 0.940 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033195 2 0.3858 0.751 0.000 0.724 0.000 0.004 NA 0.024
#> SRR1033194 6 0.2094 0.860 0.000 0.024 0.000 0.004 NA 0.908
#> SRR1033197 1 0.1787 0.877 0.920 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033196 3 0.3998 0.784 0.000 0.000 0.712 0.000 NA 0.040
#> SRR1033199 2 0.0692 0.934 0.004 0.976 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033198 1 0.1524 0.879 0.932 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033200 4 0.5250 0.434 0.352 0.000 0.000 0.540 NA 0.000
#> SRR1033201 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033202 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033203 3 0.2632 0.834 0.000 0.000 0.832 0.000 NA 0.004
#> SRR1033204 1 0.1524 0.879 0.932 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033205 3 0.1663 0.839 0.000 0.000 0.912 0.000 NA 0.000
#> SRR1033206 1 0.1398 0.881 0.940 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033207 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033208 3 0.0363 0.857 0.000 0.000 0.988 0.000 NA 0.000
#> SRR1033209 3 0.6326 0.400 0.012 0.000 0.460 0.248 NA 0.004
#> SRR1033210 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.000
#> SRR1033211 1 0.5607 0.523 0.612 0.000 0.016 0.148 NA 0.004
#> SRR1033212 3 0.0146 0.858 0.000 0.000 0.996 0.000 NA 0.004
#> SRR1033213 2 0.0405 0.937 0.000 0.988 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033214 4 0.3112 0.801 0.068 0.000 0.000 0.836 NA 0.000
#> SRR1033216 1 0.1524 0.879 0.932 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033215 6 0.4072 0.295 0.000 0.000 0.448 0.000 NA 0.544
#> SRR1033217 3 0.3394 0.804 0.000 0.000 0.752 0.000 NA 0.012
#> SRR1033218 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033219 1 0.1398 0.881 0.940 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033221 2 0.2149 0.905 0.004 0.888 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033220 2 0.1788 0.917 0.004 0.916 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033222 1 0.1333 0.882 0.944 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033223 3 0.4139 0.769 0.012 0.000 0.692 0.008 NA 0.008
#> SRR1033225 6 0.2474 0.851 0.000 0.032 0.000 0.004 NA 0.884
#> SRR1033224 4 0.4486 0.664 0.208 0.000 0.000 0.696 NA 0.000
#> SRR1033226 3 0.3979 0.782 0.008 0.000 0.708 0.000 NA 0.020
#> SRR1033227 3 0.1610 0.842 0.000 0.000 0.916 0.000 NA 0.000
#> SRR1033229 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033228 4 0.3221 0.800 0.076 0.000 0.000 0.828 NA 0.000
#> SRR1033231 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033230 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033232 4 0.5627 0.610 0.040 0.000 0.156 0.648 NA 0.004
#> SRR1033233 1 0.0972 0.886 0.964 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033235 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033234 3 0.3163 0.814 0.000 0.000 0.764 0.000 NA 0.004
#> SRR1033236 3 0.3081 0.817 0.000 0.000 0.776 0.000 NA 0.004
#> SRR1033237 4 0.1625 0.847 0.012 0.000 0.000 0.928 NA 0.000
#> SRR1033238 3 0.1075 0.857 0.000 0.000 0.952 0.000 NA 0.000
#> SRR1033240 3 0.0363 0.857 0.000 0.000 0.988 0.000 NA 0.000
#> SRR1033239 1 0.5513 0.537 0.624 0.000 0.032 0.088 NA 0.004
#> SRR1033242 4 0.5363 0.520 0.004 0.000 0.240 0.600 NA 0.000
#> SRR1033241 3 0.2340 0.842 0.000 0.000 0.852 0.000 NA 0.000
#> SRR1033244 2 0.0692 0.934 0.004 0.976 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033243 2 0.0692 0.934 0.004 0.976 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033245 3 0.3290 0.805 0.000 0.000 0.744 0.000 NA 0.004
#> SRR1033246 1 0.0520 0.888 0.984 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033248 1 0.1829 0.874 0.920 0.000 0.000 0.024 NA 0.000
#> SRR1033247 6 0.0405 0.868 0.008 0.000 0.000 0.000 NA 0.988
#> SRR1033249 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033250 2 0.0692 0.934 0.004 0.976 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033251 1 0.1124 0.886 0.956 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033252 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033253 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033254 1 0.0260 0.888 0.992 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033256 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033255 3 0.3215 0.808 0.000 0.000 0.756 0.000 NA 0.004
#> SRR1033258 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033257 4 0.2462 0.828 0.028 0.000 0.000 0.876 NA 0.000
#> SRR1033259 4 0.4707 0.616 0.244 0.000 0.000 0.660 NA 0.000
#> SRR1033260 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033261 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033262 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033263 2 0.0146 0.937 0.000 0.996 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033264 1 0.1643 0.875 0.924 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033265 2 0.2308 0.905 0.004 0.880 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033266 1 0.5966 0.276 0.500 0.000 0.008 0.324 NA 0.004
#> SRR1033267 3 0.2454 0.837 0.000 0.000 0.840 0.000 NA 0.000
#> SRR1033268 1 0.0520 0.888 0.984 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033269 3 0.3816 0.793 0.000 0.000 0.728 0.000 NA 0.032
#> SRR1033270 3 0.0458 0.857 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.000
#> SRR1033271 1 0.1462 0.880 0.936 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033272 2 0.0291 0.937 0.000 0.992 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033273 1 0.0260 0.888 0.992 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1033274 2 0.3731 0.761 0.000 0.736 0.000 0.004 NA 0.020
#> SRR1033275 4 0.2537 0.825 0.032 0.000 0.000 0.872 NA 0.000
#> SRR1033276 2 0.1555 0.923 0.004 0.932 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033277 4 0.3221 0.795 0.076 0.000 0.000 0.828 NA 0.000
#> SRR1033278 4 0.0436 0.858 0.004 0.000 0.004 0.988 NA 0.000
#> SRR1033279 3 0.3884 0.792 0.000 0.000 0.724 0.000 NA 0.036
#> SRR1033280 3 0.3816 0.793 0.000 0.000 0.728 0.000 NA 0.032
#> SRR1033281 1 0.0291 0.888 0.992 0.000 0.004 0.004 NA 0.000
#> SRR1033282 4 0.3230 0.762 0.012 0.000 0.000 0.776 NA 0.000
#> SRR1033283 4 0.3230 0.762 0.012 0.000 0.000 0.776 NA 0.000
#> SRR1033284 4 0.3230 0.762 0.012 0.000 0.000 0.776 NA 0.000
#> SRR1033285 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
#> SRR1033286 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
#> SRR1033287 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
#> SRR1033288 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
#> SRR1033289 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
#> SRR1033290 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
#> SRR1033291 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
#> SRR1033292 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
#> SRR1033293 4 0.5190 0.624 0.016 0.000 0.068 0.616 NA 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.967 0.960 0.983 0.401 0.603 0.603
#> 3 3 0.959 0.955 0.980 0.539 0.732 0.574
#> 4 4 0.973 0.948 0.974 0.212 0.842 0.603
#> 5 5 0.887 0.858 0.924 0.055 0.940 0.769
#> 6 6 0.860 0.807 0.882 0.034 0.967 0.849
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.8386 0.6372 0.732 0.268
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.6343 0.8117 0.840 0.160
#> SRR1033015 1 0.5629 0.8479 0.868 0.132
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.9998 0.0135 0.508 0.492
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033030 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033031 2 0.5059 0.8697 0.112 0.888
#> SRR1033032 2 0.0672 0.9714 0.008 0.992
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.4939 0.8760 0.892 0.108
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.0376 0.9746 0.004 0.996
#> SRR1033039 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.2043 0.9562 0.968 0.032
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033055 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033058 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033062 2 0.5178 0.8635 0.116 0.884
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.2948 0.9366 0.948 0.052
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.6048 0.8269 0.852 0.148
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.7453 0.7371 0.788 0.212
#> SRR1033080 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033082 2 0.9732 0.3463 0.404 0.596
#> SRR1033083 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.2423 0.9485 0.960 0.040
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033088 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.3431 0.9245 0.936 0.064
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.5842 0.8364 0.140 0.860
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 1.0000 0.0186 0.504 0.496
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.1633 0.9635 0.976 0.024
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033113 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033115 2 0.8267 0.6615 0.260 0.740
#> SRR1033116 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033117 2 0.0376 0.9746 0.004 0.996
#> SRR1033118 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.2236 0.9521 0.964 0.036
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033125 2 0.5842 0.8343 0.140 0.860
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033129 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033128 2 0.9170 0.5225 0.332 0.668
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033132 2 0.6887 0.7746 0.184 0.816
#> SRR1033133 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.6887 0.7783 0.816 0.184
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.7299 0.7491 0.796 0.204
#> SRR1033139 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033138 2 0.0672 0.9714 0.008 0.992
#> SRR1033140 1 0.1184 0.9709 0.984 0.016
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0672 0.9778 0.992 0.008
#> SRR1033145 1 0.0376 0.9812 0.996 0.004
#> SRR1033146 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033149 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033151 2 0.4022 0.9032 0.080 0.920
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033160 2 0.9881 0.2219 0.436 0.564
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.8555 0.6145 0.720 0.280
#> SRR1033162 1 0.0672 0.9779 0.992 0.008
#> SRR1033164 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033166 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.7139 0.7610 0.804 0.196
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.1184 0.9708 0.984 0.016
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033186 2 0.1414 0.9611 0.020 0.980
#> SRR1033188 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0376 0.9812 0.996 0.004
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.8813 0.5800 0.700 0.300
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0672 0.9778 0.992 0.008
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.7745 0.7117 0.772 0.228
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.7950 0.6919 0.760 0.240
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033217 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0376 0.9812 0.996 0.004
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0376 0.9812 0.996 0.004
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.5519 0.8524 0.872 0.128
#> SRR1033270 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9777 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.4815 0.8807 0.896 0.104
#> SRR1033280 1 0.0376 0.9812 0.996 0.004
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.9845 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032915 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032920 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.4504 0.774 0.804 0.000 0.196
#> SRR1032927 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032930 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.5706 0.572 0.680 0.000 0.320
#> SRR1032937 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.1529 0.941 0.960 0.000 0.040
#> SRR1032941 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.1289 0.947 0.968 0.000 0.032
#> SRR1032948 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032961 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0747 0.960 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032974 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032977 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0592 0.963 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032982 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.1529 0.941 0.960 0.000 0.040
#> SRR1032984 1 0.0424 0.966 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032985 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0424 0.965 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032993 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032994 1 0.2261 0.917 0.932 0.000 0.068
#> SRR1032995 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0424 0.966 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032999 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033006 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033007 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033008 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.5560 0.612 0.700 0.000 0.300
#> SRR1033023 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033031 2 0.6280 0.156 0.460 0.540 0.000
#> SRR1033032 3 0.4931 0.692 0.000 0.232 0.768
#> SRR1033033 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0237 0.968 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.2711 0.885 0.088 0.912 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033046 3 0.0237 0.984 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033047 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033048 3 0.3879 0.791 0.152 0.000 0.848
#> SRR1033049 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.4121 0.810 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033057 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0237 0.968 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033061 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0424 0.965 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.2625 0.901 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033076 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.4796 0.712 0.780 0.220 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033089 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033090 1 0.4235 0.800 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033091 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0592 0.977 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033114 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.4291 0.773 0.820 0.180 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033122 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0892 0.968 0.000 0.020 0.980
#> SRR1033126 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.5882 0.452 0.000 0.652 0.348
#> SRR1033129 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.4504 0.750 0.804 0.196 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033133 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033138 2 0.1950 0.937 0.040 0.952 0.008
#> SRR1033140 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033146 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.1031 0.954 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033151 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033152 1 0.1031 0.954 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033153 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033166 2 0.0592 0.972 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033186 2 0.3340 0.844 0.120 0.880 0.000
#> SRR1033188 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033189 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 3 0.6154 0.262 0.408 0.000 0.592
#> SRR1033210 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 1 0.1411 0.944 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033212 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033233 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033239 1 0.3551 0.851 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033242 3 0.3038 0.857 0.104 0.000 0.896
#> SRR1033241 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.3192 0.872 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033279 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.971 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033286 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033287 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033288 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033289 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033290 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033291 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033292 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033293 1 0.5058 0.707 0.756 0.000 0.244
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.0469 0.936 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1032919 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032923 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032926 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032927 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032929 4 0.0469 0.936 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1032928 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032934 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032935 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032936 4 0.2216 0.891 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1032937 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 4 0.1022 0.928 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1032940 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032947 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.0469 0.936 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1032951 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032952 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032954 1 0.3400 0.766 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1032955 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032960 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032961 1 0.0817 0.957 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032962 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032966 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 4 0.4543 0.567 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1032975 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032984 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032986 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032990 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032989 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032991 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032993 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032995 4 0.3907 0.731 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1032996 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033001 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033002 4 0.1557 0.918 0.056 0.000 0.000 0.944
#> SRR1033003 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033006 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033007 4 0.2011 0.899 0.000 0.000 0.080 0.920
#> SRR1033008 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.0469 0.977 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033011 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 4 0.4375 0.779 0.032 0.000 0.180 0.788
#> SRR1033023 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.4585 0.520 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1033029 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.3311 0.788 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.4543 0.525 0.676 0.324 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.0817 0.965 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033046 3 0.1118 0.954 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033047 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.4428 0.616 0.276 0.000 0.720 0.004
#> SRR1033049 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 4 0.1389 0.919 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR1033057 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.1557 0.925 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033061 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 4 0.0469 0.936 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033076 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.4222 0.621 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1033082 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033089 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033090 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0336 0.971 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033107 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1033109 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0188 0.984 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.4877 0.250 0.000 0.000 0.592 0.408
#> SRR1033119 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 3 0.0592 0.973 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033123 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0469 0.977 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.4843 0.334 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0336 0.972 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033131 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033133 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.1211 0.941 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033135 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0921 0.954 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.3726 0.715 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1033149 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.1767 0.929 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1033151 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033152 4 0.2737 0.873 0.104 0.000 0.008 0.888
#> SRR1033153 3 0.2408 0.880 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.4933 0.173 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1033163 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.0469 0.983 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033165 4 0.2081 0.896 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1033166 1 0.3123 0.807 0.844 0.156 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 4 0.1576 0.919 0.004 0.000 0.048 0.948
#> SRR1033186 1 0.2469 0.870 0.892 0.108 0.000 0.000
#> SRR1033188 4 0.2011 0.899 0.000 0.000 0.080 0.920
#> SRR1033189 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 4 0.4643 0.544 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1033201 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033209 4 0.3266 0.814 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1033210 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033211 4 0.4356 0.807 0.148 0.000 0.048 0.804
#> SRR1033212 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.3172 0.825 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1033216 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0921 0.966 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 4 0.4040 0.717 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1033226 3 0.0336 0.981 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033227 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.2345 0.887 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1033231 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033233 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033237 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033239 4 0.5646 0.699 0.204 0.000 0.088 0.708
#> SRR1033242 4 0.3074 0.836 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033241 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.3486 0.760 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033247 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.2081 0.899 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1033259 4 0.4989 0.193 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1033260 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0188 0.975 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033265 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033267 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.2149 0.897 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1033276 2 0.0000 0.994 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.2469 0.880 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR1033278 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033279 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.988 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 4 0.0000 0.940 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033286 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033287 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033288 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033289 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033290 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033291 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033292 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033293 4 0.2281 0.888 0.000 0.000 0.096 0.904
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.0290 0.9447 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032911 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032912 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032913 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032915 4 0.0162 0.9471 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032916 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032918 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032919 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.2209 0.8926 0.912 0.000 0.000 0.056 0.032
#> SRR1032922 4 0.3662 0.6332 0.004 0.000 0.000 0.744 0.252
#> SRR1032923 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032926 5 0.4060 0.5486 0.000 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1032927 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032929 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032928 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032930 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032934 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032935 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032936 5 0.3132 0.8055 0.000 0.000 0.008 0.172 0.820
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.2595 0.8718 0.888 0.000 0.000 0.080 0.032
#> SRR1032939 5 0.4980 0.0539 0.028 0.000 0.000 0.484 0.488
#> SRR1032940 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032941 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0510 0.9271 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1032945 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032947 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032948 4 0.0404 0.9445 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.1117 0.9296 0.016 0.000 0.000 0.964 0.020
#> SRR1032951 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032952 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032953 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032954 1 0.4697 0.5679 0.660 0.000 0.000 0.304 0.036
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.2540 0.8664 0.888 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1032958 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.0771 0.9382 0.004 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1032960 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032961 1 0.3612 0.7706 0.800 0.000 0.000 0.172 0.028
#> SRR1032962 2 0.0162 0.9928 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032963 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032966 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0162 0.9922 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032973 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032974 4 0.1965 0.8807 0.052 0.000 0.000 0.924 0.024
#> SRR1032975 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032976 4 0.1478 0.8938 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0609 0.9253 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032981 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032982 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032983 4 0.2561 0.7922 0.000 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1032984 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032985 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032986 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032990 5 0.4304 -0.2293 0.000 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1032989 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.4307 -0.1987 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1032993 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032994 5 0.4060 0.5200 0.000 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1032995 4 0.2900 0.7999 0.108 0.000 0.000 0.864 0.028
#> SRR1032996 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032997 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032998 4 0.0404 0.9425 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033001 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033002 4 0.2153 0.8834 0.044 0.000 0.000 0.916 0.040
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033006 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033007 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033008 1 0.1270 0.9173 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033009 1 0.0794 0.9239 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033010 3 0.0162 0.8890 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0290 0.9264 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033013 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033014 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.2424 0.8443 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.1341 0.8775 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033019 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.1478 0.9126 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033021 5 0.4153 0.7975 0.032 0.000 0.036 0.128 0.804
#> SRR1033023 1 0.0290 0.9271 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033022 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033024 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033025 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033026 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.4047 0.4619 0.000 0.000 0.320 0.676 0.004
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033032 3 0.2017 0.8190 0.000 0.080 0.912 0.000 0.008
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0404 0.9260 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033036 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033037 1 0.0880 0.9230 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033038 1 0.3988 0.6288 0.732 0.252 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033039 3 0.0162 0.8899 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033040 3 0.4830 0.6638 0.060 0.000 0.684 0.000 0.256
#> SRR1033041 1 0.0290 0.9270 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033042 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033043 1 0.1399 0.9182 0.952 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR1033044 1 0.0703 0.9244 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033045 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033046 5 0.3863 0.6654 0.000 0.000 0.200 0.028 0.772
#> SRR1033047 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.5967 0.4052 0.268 0.000 0.604 0.012 0.116
#> SRR1033049 1 0.0510 0.9267 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033051 1 0.0794 0.9238 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9269 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.3074 0.8075 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033050 1 0.0794 0.9238 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033055 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 5 0.2964 0.8157 0.004 0.000 0.004 0.152 0.840
#> SRR1033057 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033058 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.4235 0.3394 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033065 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033066 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033067 1 0.0703 0.9244 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033068 3 0.2561 0.8393 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1033069 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.2966 0.8162 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.0162 0.8895 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033074 1 0.1168 0.9215 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1033075 5 0.3741 0.6956 0.004 0.000 0.000 0.264 0.732
#> SRR1033076 3 0.3210 0.7946 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1033077 1 0.1300 0.9207 0.956 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR1033078 1 0.0703 0.9249 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033079 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033080 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.5215 0.4025 0.576 0.000 0.000 0.052 0.372
#> SRR1033082 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033083 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0703 0.9252 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033085 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9269 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033090 4 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033091 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033092 1 0.0290 0.9264 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.2377 0.8458 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.3109 0.8051 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033102 1 0.1851 0.8994 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033103 1 0.0404 0.9260 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033104 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033105 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033106 5 0.4262 0.0762 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1033107 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033108 4 0.0771 0.9382 0.004 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1033109 1 0.0794 0.9236 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033110 3 0.2732 0.8308 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1033111 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9269 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.2280 0.8492 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033114 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033115 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033116 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033117 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033118 3 0.5406 -0.0676 0.000 0.000 0.480 0.056 0.464
#> SRR1033119 1 0.0404 0.9272 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033121 3 0.0404 0.8898 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 3 0.4821 0.0792 0.000 0.000 0.516 0.020 0.464
#> SRR1033123 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033124 1 0.0290 0.9272 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033125 3 0.3074 0.8076 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033126 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033127 3 0.4278 0.1933 0.000 0.452 0.548 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033128 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033130 1 0.4047 0.6058 0.676 0.000 0.000 0.004 0.320
#> SRR1033131 1 0.0404 0.9266 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033132 3 0.2329 0.8475 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033133 5 0.4249 -0.0498 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1033134 1 0.3506 0.8270 0.832 0.000 0.000 0.104 0.064
#> SRR1033135 3 0.2127 0.8587 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033136 1 0.0609 0.9258 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033137 3 0.3274 0.7865 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1033139 2 0.0290 0.9894 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033138 1 0.2505 0.8601 0.888 0.020 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033140 3 0.0162 0.8900 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033141 1 0.1792 0.9024 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1732 0.9042 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033144 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033145 3 0.1544 0.8710 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033146 2 0.0912 0.9685 0.016 0.972 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033147 2 0.0162 0.9928 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033148 1 0.4800 0.6042 0.676 0.000 0.000 0.272 0.052
#> SRR1033149 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 5 0.2707 0.7089 0.132 0.000 0.000 0.008 0.860
#> SRR1033151 3 0.2891 0.8218 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033152 5 0.2873 0.8071 0.020 0.000 0.000 0.120 0.860
#> SRR1033153 5 0.5240 0.1532 0.056 0.000 0.360 0.000 0.584
#> SRR1033154 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033156 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033157 1 0.0404 0.9260 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033160 3 0.1908 0.8618 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033161 4 0.4794 0.3947 0.344 0.000 0.000 0.624 0.032
#> SRR1033163 3 0.3074 0.8073 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033162 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033164 2 0.1668 0.9341 0.000 0.940 0.032 0.000 0.028
#> SRR1033165 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033166 1 0.2573 0.8328 0.880 0.104 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.2813 0.8268 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0162 0.9928 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9269 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0290 0.8904 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.8902 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.1270 0.9173 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033176 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033181 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033183 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033182 1 0.1121 0.9206 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033184 3 0.3395 0.7713 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1033185 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033187 5 0.3016 0.8084 0.020 0.000 0.000 0.132 0.848
#> SRR1033186 1 0.1981 0.8766 0.920 0.064 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033188 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033191 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033192 2 0.0162 0.9928 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033193 1 0.1671 0.9065 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0510 0.9254 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033196 3 0.3143 0.8012 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1908 0.8966 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033200 1 0.5496 0.5730 0.652 0.000 0.000 0.196 0.152
#> SRR1033201 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033202 3 0.0510 0.8851 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033203 3 0.2020 0.8598 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033204 1 0.1908 0.8966 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033205 3 0.4305 0.0265 0.000 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1033206 1 0.1544 0.9104 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033207 1 0.1851 0.8993 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033208 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033209 5 0.2522 0.8041 0.000 0.000 0.012 0.108 0.880
#> SRR1033210 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033211 5 0.2951 0.8033 0.028 0.000 0.000 0.112 0.860
#> SRR1033212 3 0.0290 0.8904 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0898 0.9353 0.008 0.000 0.000 0.972 0.020
#> SRR1033216 1 0.1908 0.8966 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033215 2 0.2813 0.7801 0.000 0.832 0.168 0.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.3895 0.6550 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1033218 1 0.1792 0.9018 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033219 1 0.1732 0.9044 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.1121 0.9202 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033223 5 0.2249 0.6805 0.000 0.000 0.096 0.008 0.896
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.5808 0.2681 0.512 0.000 0.000 0.392 0.096
#> SRR1033226 5 0.2690 0.6065 0.000 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1033227 3 0.4297 0.0895 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.1872 0.9002 0.020 0.000 0.000 0.928 0.052
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1732 0.9042 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033232 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033233 1 0.1270 0.9167 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.4291 0.3491 0.000 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1033236 5 0.4287 -0.0790 0.000 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1033237 4 0.3913 0.4344 0.000 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1033238 3 0.2561 0.7987 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1033240 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033239 5 0.2793 0.7933 0.036 0.000 0.000 0.088 0.876
#> SRR1033242 5 0.2929 0.8162 0.000 0.000 0.008 0.152 0.840
#> SRR1033241 3 0.2377 0.8502 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 5 0.4138 0.1268 0.000 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1033246 1 0.0404 0.9266 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033248 1 0.5733 0.1254 0.476 0.000 0.000 0.084 0.440
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9269 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1043 0.9215 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033254 1 0.0290 0.9266 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.3966 0.6281 0.000 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1033258 1 0.1732 0.9044 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033257 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033259 1 0.5505 0.4571 0.588 0.000 0.000 0.328 0.084
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033262 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3454 0.7899 0.816 0.000 0.000 0.156 0.028
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.3053 0.7551 0.008 0.000 0.000 0.828 0.164
#> SRR1033267 5 0.4306 -0.0906 0.000 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9269 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.3242 0.7908 0.000 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1033270 3 0.0162 0.8905 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033271 1 0.1608 0.9085 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0162 0.9270 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0609 0.9413 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.1310 0.9202 0.020 0.000 0.000 0.956 0.024
#> SRR1033278 4 0.0000 0.9480 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.3752 0.7056 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1033280 3 0.3336 0.7792 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9269 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 5 0.2852 0.8045 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033283 5 0.2852 0.8045 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033284 5 0.2852 0.8045 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033285 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033286 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033287 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033288 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033289 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033290 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033291 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033292 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
#> SRR1033293 5 0.2971 0.8167 0.000 0.000 0.008 0.156 0.836
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.0547 0.90319 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032911 4 0.1765 0.88668 0.052 0.000 0.000 0.924 0.000 0.024
#> SRR1032912 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0260 0.88914 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1032918 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032919 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.2295 0.80848 0.904 0.000 0.000 0.052 0.016 0.028
#> SRR1032922 4 0.4951 0.56907 0.012 0.000 0.000 0.676 0.116 0.196
#> SRR1032923 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032926 5 0.3659 0.45380 0.000 0.000 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1032927 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032929 4 0.1765 0.88662 0.052 0.000 0.000 0.924 0.000 0.024
#> SRR1032928 4 0.0458 0.90490 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032930 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032934 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032935 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032936 5 0.2402 0.74761 0.000 0.000 0.004 0.140 0.856 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.2594 0.79356 0.884 0.000 0.000 0.072 0.016 0.028
#> SRR1032939 6 0.6589 0.07660 0.040 0.000 0.000 0.380 0.192 0.388
#> SRR1032940 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.2491 0.84001 0.868 0.000 0.000 0.000 0.020 0.112
#> SRR1032945 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.1168 0.89863 0.028 0.000 0.000 0.956 0.000 0.016
#> SRR1032947 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032948 4 0.0260 0.90932 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032949 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.2216 0.86529 0.052 0.000 0.000 0.908 0.024 0.016
#> SRR1032951 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032952 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032953 4 0.1908 0.88277 0.056 0.000 0.000 0.916 0.000 0.028
#> SRR1032954 1 0.4339 0.61714 0.728 0.000 0.000 0.208 0.036 0.028
#> SRR1032955 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032956 1 0.2537 0.79652 0.888 0.000 0.000 0.068 0.016 0.028
#> SRR1032958 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.1970 0.88006 0.060 0.000 0.000 0.912 0.000 0.028
#> SRR1032960 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032961 1 0.3219 0.73627 0.828 0.000 0.000 0.132 0.012 0.028
#> SRR1032962 2 0.2692 0.82543 0.000 0.840 0.000 0.000 0.012 0.148
#> SRR1032963 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032966 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0891 0.95482 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1032968 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032970 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032973 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032974 4 0.2605 0.83791 0.108 0.000 0.000 0.864 0.000 0.028
#> SRR1032975 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 4 0.1556 0.85644 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0603 0.84169 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1032979 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032981 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032982 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032983 4 0.2416 0.77155 0.000 0.000 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1032984 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032985 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032986 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032990 6 0.4736 0.75840 0.000 0.000 0.156 0.000 0.164 0.680
#> SRR1032989 4 0.1829 0.88478 0.056 0.000 0.000 0.920 0.000 0.024
#> SRR1032991 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.4237 0.25128 0.000 0.000 0.000 0.584 0.396 0.020
#> SRR1032993 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032994 4 0.6118 -0.21693 0.004 0.000 0.000 0.384 0.380 0.232
#> SRR1032995 4 0.4009 0.60762 0.288 0.000 0.000 0.684 0.000 0.028
#> SRR1032996 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.91092 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 4 0.0993 0.89541 0.000 0.000 0.000 0.964 0.012 0.024
#> SRR1032999 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033001 4 0.0260 0.90918 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033002 4 0.2704 0.79078 0.140 0.000 0.000 0.844 0.016 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033006 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033007 5 0.1471 0.80937 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033008 1 0.1219 0.83141 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033009 1 0.0993 0.83610 0.964 0.000 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR1033010 3 0.0260 0.88619 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.2942 0.82762 0.836 0.000 0.000 0.000 0.032 0.132
#> SRR1033013 3 0.0260 0.88914 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 6 0.3528 0.79265 0.000 0.000 0.296 0.000 0.004 0.700
#> SRR1033016 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.3230 0.60111 0.000 0.000 0.776 0.000 0.012 0.212
#> SRR1033019 3 0.0146 0.89048 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033020 1 0.2070 0.81942 0.896 0.000 0.000 0.000 0.092 0.012
#> SRR1033021 5 0.2938 0.78334 0.032 0.000 0.016 0.044 0.880 0.028
#> SRR1033023 1 0.1951 0.84243 0.908 0.000 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR1033022 1 0.4099 0.77317 0.708 0.000 0.000 0.000 0.048 0.244
#> SRR1033024 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.3351 0.81639 0.800 0.000 0.000 0.000 0.040 0.160
#> SRR1033026 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.3737 0.35117 0.000 0.000 0.392 0.608 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.4190 0.76324 0.692 0.000 0.000 0.000 0.048 0.260
#> SRR1033032 3 0.4731 0.45540 0.000 0.068 0.684 0.000 0.016 0.232
#> SRR1033033 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.3947 0.79276 0.732 0.000 0.000 0.000 0.048 0.220
#> SRR1033036 1 0.4249 0.76082 0.688 0.000 0.000 0.000 0.052 0.260
#> SRR1033037 1 0.0622 0.83848 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033038 1 0.6419 0.55607 0.508 0.180 0.000 0.000 0.048 0.264
#> SRR1033039 3 0.1219 0.85931 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1033040 6 0.5115 0.75658 0.028 0.000 0.260 0.000 0.068 0.644
#> SRR1033041 1 0.1151 0.84345 0.956 0.000 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1033042 1 0.4190 0.76324 0.692 0.000 0.000 0.000 0.048 0.260
#> SRR1033043 1 0.1599 0.82821 0.940 0.000 0.000 0.024 0.008 0.028
#> SRR1033044 1 0.0603 0.83934 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033045 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 5 0.3436 0.65356 0.000 0.000 0.172 0.012 0.796 0.020
#> SRR1033047 3 0.0632 0.88118 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033048 3 0.7460 0.03153 0.256 0.000 0.460 0.032 0.112 0.140
#> SRR1033049 1 0.2872 0.82810 0.836 0.000 0.000 0.000 0.024 0.140
#> SRR1033051 1 0.0622 0.83914 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1033052 1 0.1391 0.84448 0.944 0.000 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR1033053 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 6 0.4002 0.82515 0.000 0.000 0.260 0.000 0.036 0.704
#> SRR1033050 1 0.0909 0.83688 0.968 0.000 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1033055 3 0.0458 0.88592 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033056 5 0.1836 0.80085 0.008 0.000 0.004 0.048 0.928 0.012
#> SRR1033057 1 0.4007 0.78514 0.728 0.000 0.000 0.000 0.052 0.220
#> SRR1033058 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.6157 0.07474 0.420 0.000 0.000 0.004 0.280 0.296
#> SRR1033061 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0260 0.89007 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033065 1 0.4190 0.76324 0.692 0.000 0.000 0.000 0.048 0.260
#> SRR1033066 1 0.4190 0.76324 0.692 0.000 0.000 0.000 0.048 0.260
#> SRR1033067 1 0.0891 0.83723 0.968 0.000 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1033068 6 0.3840 0.80785 0.000 0.000 0.284 0.000 0.020 0.696
#> SRR1033069 2 0.0622 0.96812 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1033070 6 0.3956 0.82274 0.000 0.000 0.264 0.000 0.032 0.704
#> SRR1033071 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.0405 0.88787 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033074 1 0.1426 0.83193 0.948 0.000 0.000 0.008 0.016 0.028
#> SRR1033075 5 0.4402 0.63407 0.084 0.000 0.000 0.196 0.716 0.004
#> SRR1033076 6 0.3998 0.82963 0.000 0.000 0.248 0.000 0.040 0.712
#> SRR1033077 1 0.1536 0.84033 0.944 0.000 0.000 0.020 0.012 0.024
#> SRR1033078 1 0.0725 0.84072 0.976 0.000 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1033079 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.4347 0.51809 0.660 0.000 0.000 0.024 0.304 0.012
#> SRR1033082 1 0.4212 0.76345 0.688 0.000 0.000 0.000 0.048 0.264
#> SRR1033083 3 0.1007 0.86633 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033084 1 0.0622 0.84086 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033085 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.1333 0.84411 0.944 0.000 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR1033088 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 3 0.0717 0.88543 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1033090 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033091 3 0.0146 0.89134 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033092 1 0.2489 0.83469 0.860 0.000 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1033093 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 6 0.3707 0.77540 0.000 0.000 0.312 0.000 0.008 0.680
#> SRR1033095 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.5327 -0.41811 0.000 0.000 0.460 0.000 0.104 0.436
#> SRR1033097 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0717 0.88543 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1033102 1 0.1444 0.82166 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1033103 1 0.3588 0.80496 0.776 0.000 0.000 0.000 0.044 0.180
#> SRR1033104 3 0.0260 0.88914 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033105 1 0.3835 0.79337 0.748 0.000 0.000 0.000 0.048 0.204
#> SRR1033106 5 0.4663 -0.04867 0.472 0.000 0.000 0.004 0.492 0.032
#> SRR1033107 3 0.0260 0.88914 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033108 4 0.1950 0.87944 0.064 0.000 0.000 0.912 0.000 0.024
#> SRR1033109 1 0.1480 0.84091 0.940 0.000 0.000 0.000 0.040 0.020
#> SRR1033110 6 0.4186 0.77828 0.000 0.000 0.312 0.000 0.032 0.656
#> SRR1033111 1 0.4025 0.77983 0.720 0.000 0.000 0.000 0.048 0.232
#> SRR1033112 1 0.1297 0.84282 0.948 0.000 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1033113 6 0.3778 0.79595 0.000 0.000 0.288 0.000 0.016 0.696
#> SRR1033114 1 0.4075 0.77540 0.712 0.000 0.000 0.000 0.048 0.240
#> SRR1033115 1 0.4190 0.76324 0.692 0.000 0.000 0.000 0.048 0.260
#> SRR1033116 3 0.0260 0.88914 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 5 0.5248 0.33079 0.000 0.000 0.392 0.076 0.524 0.008
#> SRR1033119 1 0.1951 0.84192 0.908 0.000 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR1033121 3 0.1588 0.83472 0.000 0.000 0.924 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033120 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 5 0.4909 0.21349 0.000 0.000 0.436 0.016 0.516 0.032
#> SRR1033123 1 0.4168 0.76567 0.696 0.000 0.000 0.000 0.048 0.256
#> SRR1033124 1 0.1461 0.84584 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1033125 6 0.3481 0.80017 0.000 0.000 0.192 0.000 0.032 0.776
#> SRR1033126 1 0.4025 0.78127 0.720 0.000 0.000 0.000 0.048 0.232
#> SRR1033127 3 0.3620 0.33154 0.000 0.352 0.648 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0260 0.88914 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033128 1 0.4305 0.75849 0.684 0.000 0.000 0.000 0.056 0.260
#> SRR1033130 1 0.3101 0.65316 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1033131 1 0.2221 0.84429 0.896 0.000 0.000 0.000 0.032 0.072
#> SRR1033132 6 0.3426 0.80650 0.000 0.000 0.276 0.000 0.004 0.720
#> SRR1033133 6 0.4464 0.77374 0.000 0.000 0.148 0.000 0.140 0.712
#> SRR1033134 1 0.2747 0.79762 0.880 0.000 0.000 0.040 0.056 0.024
#> SRR1033135 3 0.3833 0.25822 0.000 0.000 0.648 0.000 0.008 0.344
#> SRR1033136 1 0.1092 0.84526 0.960 0.000 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033137 6 0.4099 0.83091 0.000 0.000 0.244 0.000 0.048 0.708
#> SRR1033139 2 0.2218 0.87724 0.000 0.884 0.000 0.000 0.012 0.104
#> SRR1033138 6 0.4385 0.14157 0.240 0.004 0.000 0.000 0.060 0.696
#> SRR1033140 3 0.1007 0.86590 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033141 1 0.1700 0.82095 0.916 0.000 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1033142 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1471 0.82438 0.932 0.000 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1033144 1 0.4204 0.76625 0.696 0.000 0.000 0.000 0.052 0.252
#> SRR1033145 3 0.3445 0.50671 0.000 0.000 0.732 0.000 0.008 0.260
#> SRR1033146 2 0.4528 0.59898 0.012 0.680 0.000 0.000 0.048 0.260
#> SRR1033147 2 0.2121 0.88609 0.000 0.892 0.000 0.000 0.012 0.096
#> SRR1033148 1 0.4121 0.68015 0.768 0.000 0.000 0.156 0.048 0.028
#> SRR1033149 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 5 0.4199 0.59117 0.164 0.000 0.000 0.000 0.736 0.100
#> SRR1033151 6 0.3674 0.81475 0.000 0.000 0.268 0.000 0.016 0.716
#> SRR1033152 5 0.2277 0.78019 0.032 0.000 0.000 0.032 0.908 0.028
#> SRR1033153 6 0.4050 0.73121 0.012 0.000 0.104 0.000 0.108 0.776
#> SRR1033154 1 0.4075 0.77559 0.712 0.000 0.000 0.000 0.048 0.240
#> SRR1033156 3 0.0508 0.88824 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1033157 1 0.2983 0.82554 0.832 0.000 0.000 0.000 0.032 0.136
#> SRR1033158 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.1082 0.86523 0.000 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033160 3 0.4080 -0.23646 0.000 0.000 0.536 0.000 0.008 0.456
#> SRR1033161 4 0.4473 0.10057 0.484 0.000 0.000 0.488 0.000 0.028
#> SRR1033163 6 0.3860 0.82962 0.000 0.000 0.236 0.000 0.036 0.728
#> SRR1033162 1 0.4190 0.76324 0.692 0.000 0.000 0.000 0.048 0.260
#> SRR1033164 2 0.3213 0.73367 0.000 0.784 0.008 0.000 0.004 0.204
#> SRR1033165 5 0.1471 0.80937 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033166 1 0.6018 0.64375 0.568 0.104 0.000 0.000 0.060 0.268
#> SRR1033167 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 6 0.4167 0.73045 0.000 0.000 0.344 0.000 0.024 0.632
#> SRR1033169 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0260 0.97668 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033170 1 0.1528 0.84491 0.936 0.000 0.000 0.000 0.016 0.048
#> SRR1033172 3 0.1753 0.82238 0.000 0.000 0.912 0.000 0.004 0.084
#> SRR1033173 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0260 0.88991 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033175 1 0.1010 0.83417 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033176 1 0.3715 0.80031 0.764 0.000 0.000 0.000 0.048 0.188
#> SRR1033177 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.3821 0.79061 0.740 0.000 0.000 0.000 0.040 0.220
#> SRR1033181 1 0.3964 0.78318 0.724 0.000 0.000 0.000 0.044 0.232
#> SRR1033183 3 0.0260 0.88914 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033182 1 0.2511 0.84227 0.880 0.000 0.000 0.000 0.056 0.064
#> SRR1033184 6 0.4142 0.83108 0.000 0.000 0.232 0.000 0.056 0.712
#> SRR1033185 1 0.4000 0.78229 0.724 0.000 0.000 0.000 0.048 0.228
#> SRR1033187 5 0.1780 0.77972 0.048 0.000 0.000 0.028 0.924 0.000
#> SRR1033186 1 0.5731 0.67250 0.588 0.072 0.000 0.000 0.060 0.280
#> SRR1033188 5 0.1471 0.80937 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033189 2 0.0260 0.97560 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.4190 0.76607 0.692 0.000 0.000 0.000 0.048 0.260
#> SRR1033191 1 0.4122 0.77090 0.704 0.000 0.000 0.000 0.048 0.248
#> SRR1033192 2 0.0993 0.95507 0.000 0.964 0.000 0.000 0.012 0.024
#> SRR1033193 1 0.1387 0.82358 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.4075 0.77625 0.712 0.000 0.000 0.000 0.048 0.240
#> SRR1033196 6 0.3642 0.81811 0.000 0.000 0.204 0.000 0.036 0.760
#> SRR1033199 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1663 0.81322 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033200 1 0.3965 0.72035 0.792 0.000 0.000 0.076 0.108 0.024
#> SRR1033201 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0363 0.88618 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033203 3 0.4097 -0.36210 0.000 0.000 0.500 0.000 0.008 0.492
#> SRR1033204 1 0.1501 0.81963 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1033205 5 0.3979 0.21289 0.000 0.000 0.456 0.000 0.540 0.004
#> SRR1033206 1 0.1141 0.83030 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1033207 1 0.1471 0.82485 0.932 0.000 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1033208 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 5 0.1708 0.79315 0.000 0.000 0.004 0.040 0.932 0.024
#> SRR1033210 3 0.0000 0.89202 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 5 0.1777 0.77930 0.044 0.000 0.000 0.024 0.928 0.004
#> SRR1033212 3 0.0547 0.88377 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033213 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.2480 0.84458 0.104 0.000 0.000 0.872 0.000 0.024
#> SRR1033216 1 0.1387 0.82358 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033215 2 0.3464 0.54217 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 6 0.4573 0.82131 0.000 0.000 0.236 0.000 0.088 0.676
#> SRR1033218 1 0.1444 0.82166 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1033219 1 0.1267 0.82722 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.1007 0.83323 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1033223 5 0.4338 -0.11841 0.000 0.000 0.020 0.000 0.492 0.488
#> SRR1033225 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.4901 0.58749 0.696 0.000 0.000 0.184 0.096 0.024
#> SRR1033226 6 0.4619 0.45578 0.000 0.000 0.052 0.000 0.348 0.600
#> SRR1033227 5 0.3975 0.22364 0.000 0.000 0.452 0.000 0.544 0.004
#> SRR1033229 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.4522 0.61282 0.260 0.000 0.000 0.684 0.028 0.028
#> SRR1033231 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1387 0.82358 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033232 5 0.1531 0.80877 0.000 0.000 0.004 0.068 0.928 0.000
#> SRR1033233 1 0.1219 0.83316 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033235 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 6 0.5879 0.56822 0.000 0.000 0.240 0.000 0.284 0.476
#> SRR1033236 5 0.5859 0.00284 0.000 0.000 0.332 0.000 0.460 0.208
#> SRR1033237 4 0.3774 0.28229 0.000 0.000 0.000 0.592 0.408 0.000
#> SRR1033238 3 0.3819 0.62098 0.000 0.000 0.764 0.000 0.172 0.064
#> SRR1033240 3 0.0146 0.89159 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033239 5 0.1949 0.77709 0.036 0.000 0.000 0.020 0.924 0.020
#> SRR1033242 5 0.1411 0.80815 0.000 0.000 0.004 0.060 0.936 0.000
#> SRR1033241 3 0.4033 0.51573 0.000 0.000 0.724 0.000 0.052 0.224
#> SRR1033244 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 6 0.5449 0.43869 0.000 0.000 0.128 0.000 0.368 0.504
#> SRR1033246 1 0.1003 0.84085 0.964 0.000 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR1033248 1 0.4479 0.38079 0.608 0.000 0.000 0.032 0.356 0.004
#> SRR1033247 2 0.0146 0.97986 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.2383 0.83715 0.880 0.000 0.000 0.000 0.024 0.096
#> SRR1033252 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1464 0.83171 0.944 0.000 0.000 0.004 0.036 0.016
#> SRR1033254 1 0.1168 0.84338 0.956 0.000 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR1033256 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 6 0.5267 0.76256 0.000 0.000 0.236 0.000 0.164 0.600
#> SRR1033258 1 0.1387 0.82358 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033257 4 0.1890 0.88231 0.060 0.000 0.000 0.916 0.000 0.024
#> SRR1033259 1 0.4529 0.62923 0.728 0.000 0.000 0.184 0.060 0.028
#> SRR1033260 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0363 0.88846 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033262 3 0.0405 0.88908 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033263 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.2882 0.75594 0.848 0.000 0.000 0.120 0.004 0.028
#> SRR1033265 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.3411 0.73853 0.012 0.000 0.000 0.804 0.160 0.024
#> SRR1033267 5 0.4911 0.26452 0.000 0.000 0.384 0.000 0.548 0.068
#> SRR1033268 1 0.2147 0.83975 0.896 0.000 0.000 0.000 0.020 0.084
#> SRR1033269 6 0.4215 0.83107 0.000 0.000 0.244 0.000 0.056 0.700
#> SRR1033270 3 0.0363 0.88846 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033271 1 0.1327 0.82539 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.1297 0.84323 0.948 0.000 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1033274 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.1908 0.88277 0.056 0.000 0.000 0.916 0.000 0.028
#> SRR1033276 2 0.0000 0.98261 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.3385 0.76019 0.172 0.000 0.000 0.796 0.004 0.028
#> SRR1033278 4 0.0146 0.91082 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033279 6 0.4354 0.82411 0.000 0.000 0.216 0.000 0.080 0.704
#> SRR1033280 6 0.4181 0.82996 0.000 0.000 0.248 0.000 0.052 0.700
#> SRR1033281 1 0.1682 0.84359 0.928 0.000 0.000 0.000 0.020 0.052
#> SRR1033282 5 0.1444 0.80637 0.000 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1033283 5 0.1444 0.80637 0.000 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1033284 5 0.1444 0.80637 0.000 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1033285 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033286 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033287 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033288 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033289 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033290 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033291 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033292 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
#> SRR1033293 5 0.1471 0.81020 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.969 0.987 0.3065 0.687 0.687
#> 3 3 0.718 0.838 0.924 0.9942 0.681 0.542
#> 4 4 0.765 0.778 0.894 0.1348 0.899 0.744
#> 5 5 0.728 0.692 0.842 0.0398 0.974 0.918
#> 6 6 0.719 0.601 0.802 0.0228 0.880 0.625
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.904 0.5727 0.320 0.680
#> SRR1032933 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.625 0.8114 0.156 0.844
#> SRR1032943 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.971 0.3988 0.400 0.600
#> SRR1032968 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.506 0.8577 0.112 0.888
#> SRR1033001 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033062 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.988 0.1579 0.564 0.436
#> SRR1033070 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.402 0.8879 0.080 0.920
#> SRR1033073 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.802 0.6995 0.244 0.756
#> SRR1033122 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.981 0.3453 0.420 0.580
#> SRR1033129 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.563 0.8361 0.868 0.132
#> SRR1033138 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.971 0.2739 0.600 0.400
#> SRR1033147 1 0.995 0.0657 0.540 0.460
#> SRR1033148 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.952 0.4658 0.372 0.628
#> SRR1033170 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.788 0.7109 0.236 0.764
#> SRR1033190 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.981 0.3429 0.420 0.580
#> SRR1033193 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.966 0.4188 0.392 0.608
#> SRR1033217 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.827 0.6752 0.260 0.740
#> SRR1033249 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.000 0.9527 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.000 0.9951 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.2537 0.8451 0.920 0.000 0.080
#> SRR1032923 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.8421 0.4314 0.140 0.608 0.252
#> SRR1032933 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.4346 0.7831 0.816 0.000 0.184
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.1289 0.8794 0.968 0.000 0.032
#> SRR1032941 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.4749 0.7964 0.116 0.844 0.040
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0592 0.8871 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032945 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0747 0.9210 0.016 0.000 0.984
#> SRR1032963 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.9047 0.1774 0.148 0.508 0.344
#> SRR1032968 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.1170 0.9510 0.008 0.976 0.016
#> SRR1032978 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.1163 0.9144 0.028 0.000 0.972
#> SRR1032989 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.4842 0.7428 0.776 0.000 0.224
#> SRR1032995 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.4209 0.8170 0.016 0.856 0.128
#> SRR1033001 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0237 0.8893 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.1031 0.9166 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033007 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.3340 0.8439 0.120 0.000 0.880
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.5882 0.5665 0.652 0.000 0.348
#> SRR1033013 3 0.0424 0.9204 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033014 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033015 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0747 0.9210 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033019 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033020 1 0.4121 0.7961 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033021 1 0.4002 0.7663 0.840 0.000 0.160
#> SRR1033023 1 0.4291 0.7844 0.820 0.000 0.180
#> SRR1033022 1 0.5327 0.6858 0.728 0.000 0.272
#> SRR1033024 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033025 1 0.4062 0.7989 0.836 0.000 0.164
#> SRR1033026 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.4291 0.7884 0.820 0.000 0.180
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033031 3 0.5591 0.5296 0.304 0.000 0.696
#> SRR1033032 3 0.2796 0.8598 0.092 0.000 0.908
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2165 0.8551 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033036 1 0.6260 0.3217 0.552 0.000 0.448
#> SRR1033037 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.4291 0.7553 0.180 0.000 0.820
#> SRR1033039 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033040 3 0.1860 0.8959 0.052 0.000 0.948
#> SRR1033041 1 0.1411 0.8782 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033042 1 0.5706 0.6157 0.680 0.000 0.320
#> SRR1033043 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.2066 0.8890 0.060 0.000 0.940
#> SRR1033046 1 0.5810 0.5465 0.664 0.000 0.336
#> SRR1033047 3 0.3686 0.8049 0.140 0.000 0.860
#> SRR1033048 1 0.5810 0.5147 0.664 0.000 0.336
#> SRR1033049 1 0.1411 0.8776 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033051 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.1753 0.8724 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033050 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033056 1 0.3116 0.8092 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033057 1 0.3686 0.8185 0.860 0.000 0.140
#> SRR1033058 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.5835 0.5816 0.660 0.000 0.340
#> SRR1033061 2 0.0424 0.9634 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033062 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033065 1 0.6244 0.3449 0.560 0.000 0.440
#> SRR1033066 3 0.6308 -0.1054 0.492 0.000 0.508
#> SRR1033067 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033069 3 0.3031 0.8596 0.012 0.076 0.912
#> SRR1033070 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.5988 0.3865 0.000 0.368 0.632
#> SRR1033073 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033074 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.1289 0.8771 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033076 3 0.1753 0.8992 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033077 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033080 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033081 1 0.0592 0.8868 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033082 3 0.6295 -0.0247 0.472 0.000 0.528
#> SRR1033083 3 0.0747 0.9209 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033084 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0237 0.8893 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033088 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033089 1 0.5363 0.6076 0.724 0.000 0.276
#> SRR1033090 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.1289 0.9112 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033092 1 0.5098 0.7143 0.752 0.000 0.248
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.1964 0.8924 0.056 0.000 0.944
#> SRR1033102 1 0.5497 0.6598 0.708 0.000 0.292
#> SRR1033103 1 0.5397 0.6767 0.720 0.000 0.280
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.4796 0.7470 0.780 0.000 0.220
#> SRR1033106 1 0.6045 0.5011 0.620 0.000 0.380
#> SRR1033107 3 0.0237 0.9179 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033108 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.4796 0.7486 0.780 0.000 0.220
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.5465 0.6652 0.712 0.000 0.288
#> SRR1033112 1 0.4178 0.7911 0.828 0.000 0.172
#> SRR1033113 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033114 1 0.5178 0.7051 0.744 0.000 0.256
#> SRR1033115 3 0.5098 0.6463 0.248 0.000 0.752
#> SRR1033116 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 1 0.6154 0.3268 0.592 0.000 0.408
#> SRR1033119 1 0.5497 0.6598 0.708 0.000 0.292
#> SRR1033121 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033120 2 0.7189 0.4939 0.052 0.656 0.292
#> SRR1033122 3 0.2356 0.8814 0.072 0.000 0.928
#> SRR1033123 3 0.5785 0.4619 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033124 1 0.1964 0.8693 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033125 3 0.0424 0.9204 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033126 3 0.5706 0.4924 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033127 3 0.0592 0.9131 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033128 3 0.4062 0.7770 0.164 0.000 0.836
#> SRR1033130 1 0.2448 0.8587 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033131 1 0.5058 0.7210 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033132 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033133 3 0.0747 0.9210 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033134 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.5397 0.6766 0.720 0.000 0.280
#> SRR1033137 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033139 3 0.1015 0.9193 0.012 0.008 0.980
#> SRR1033138 3 0.3340 0.8315 0.120 0.000 0.880
#> SRR1033140 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033141 1 0.5560 0.6542 0.700 0.000 0.300
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.6307 0.1680 0.512 0.000 0.488
#> SRR1033145 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033146 3 0.4233 0.7805 0.160 0.004 0.836
#> SRR1033147 3 0.1129 0.9105 0.020 0.004 0.976
#> SRR1033148 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.6225 0.3634 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033151 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033152 1 0.1860 0.8701 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033153 3 0.1031 0.9167 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033154 1 0.4555 0.7718 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033156 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033157 1 0.2356 0.8601 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033160 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033161 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033162 1 0.5968 0.5292 0.636 0.000 0.364
#> SRR1033164 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033165 1 0.0592 0.8845 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033166 3 0.6126 0.2663 0.400 0.000 0.600
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.0661 0.9164 0.008 0.004 0.988
#> SRR1033170 1 0.1643 0.8739 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0747 0.9209 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033175 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.1289 0.8796 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.4887 0.7054 0.772 0.000 0.228
#> SRR1033181 1 0.6302 0.2126 0.520 0.000 0.480
#> SRR1033183 3 0.2711 0.8629 0.088 0.000 0.912
#> SRR1033182 1 0.5465 0.6652 0.712 0.000 0.288
#> SRR1033184 3 0.1289 0.9129 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033185 1 0.5397 0.6757 0.720 0.000 0.280
#> SRR1033187 1 0.4346 0.7813 0.816 0.000 0.184
#> SRR1033186 3 0.4002 0.7820 0.160 0.000 0.840
#> SRR1033188 1 0.0237 0.8885 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033189 3 0.5621 0.5233 0.000 0.308 0.692
#> SRR1033190 1 0.6168 0.4235 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033191 3 0.6192 0.1960 0.420 0.000 0.580
#> SRR1033192 3 0.3120 0.8573 0.012 0.080 0.908
#> SRR1033193 1 0.0237 0.8893 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.5497 0.6609 0.708 0.000 0.292
#> SRR1033196 3 0.0237 0.9179 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.5178 0.7147 0.744 0.000 0.256
#> SRR1033200 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033202 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0424 0.8883 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033205 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033206 1 0.5465 0.6657 0.712 0.000 0.288
#> SRR1033207 1 0.2796 0.8481 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 3 0.6045 0.3170 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 1 0.5529 0.6581 0.704 0.000 0.296
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.0424 0.9141 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033217 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033218 1 0.4750 0.7505 0.784 0.000 0.216
#> SRR1033219 1 0.4346 0.7822 0.816 0.000 0.184
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0237 0.8893 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033223 3 0.1031 0.9168 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.0892 0.9189 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033227 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0237 0.8893 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033232 3 0.5706 0.5026 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033233 1 0.0592 0.8867 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033236 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033237 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0424 0.9204 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033240 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033239 1 0.5327 0.6905 0.728 0.000 0.272
#> SRR1033242 3 0.5591 0.5609 0.304 0.000 0.696
#> SRR1033241 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033246 1 0.3340 0.8292 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033248 1 0.5016 0.7277 0.760 0.000 0.240
#> SRR1033247 2 0.8007 0.4888 0.116 0.640 0.244
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.6168 0.4226 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.1643 0.8750 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033258 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033262 3 0.1643 0.9029 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.2625 0.8533 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033267 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033268 1 0.5216 0.7013 0.740 0.000 0.260
#> SRR1033269 3 0.0000 0.9150 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033270 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033271 1 0.1529 0.8770 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.2625 0.8537 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.8904 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033280 3 0.0592 0.9225 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033281 1 0.4796 0.7453 0.780 0.000 0.220
#> SRR1033282 1 0.5591 0.6543 0.696 0.000 0.304
#> SRR1033283 1 0.5591 0.6543 0.696 0.000 0.304
#> SRR1033284 1 0.5591 0.6543 0.696 0.000 0.304
#> SRR1033285 1 0.6252 0.3564 0.556 0.000 0.444
#> SRR1033286 1 0.6244 0.3679 0.560 0.000 0.440
#> SRR1033287 1 0.5905 0.5749 0.648 0.000 0.352
#> SRR1033288 3 0.5560 0.5250 0.300 0.000 0.700
#> SRR1033289 3 0.5327 0.5871 0.272 0.000 0.728
#> SRR1033290 3 0.4702 0.6967 0.212 0.000 0.788
#> SRR1033291 1 0.5988 0.5432 0.632 0.000 0.368
#> SRR1033292 1 0.5733 0.6237 0.676 0.000 0.324
#> SRR1033293 1 0.5968 0.5513 0.636 0.000 0.364
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.0817 0.842972 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032911 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.1118 0.841200 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1032916 1 0.1389 0.838177 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1032917 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.2345 0.811223 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1032920 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.3074 0.788822 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1032922 1 0.3754 0.748139 0.852 0.000 0.084 0.064
#> SRR1032923 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.2081 0.821964 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1032926 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.7206 0.334258 0.044 0.580 0.068 0.308
#> SRR1032933 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0592 0.841854 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1032936 1 0.5432 0.570391 0.716 0.000 0.068 0.216
#> SRR1032937 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.2216 0.830675 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1032939 1 0.2345 0.811223 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1032940 1 0.3205 0.794843 0.872 0.000 0.024 0.104
#> SRR1032941 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.3932 0.772303 0.020 0.832 0.008 0.140
#> SRR1032943 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.3528 0.757856 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1032945 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0336 0.843076 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1032948 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.2281 0.813901 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1032951 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.1302 0.835346 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1032955 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.2216 0.824720 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1032958 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0336 0.842557 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1032960 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0707 0.842442 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1032962 3 0.0336 0.934285 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032963 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.7641 0.118023 0.040 0.492 0.088 0.380
#> SRR1032968 1 0.2011 0.823851 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1032969 1 0.1389 0.838284 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1032970 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.1474 0.836628 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1032972 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0469 0.843409 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1032975 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0992 0.946303 0.008 0.976 0.012 0.004
#> SRR1032978 1 0.3123 0.791743 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1032979 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.1022 0.842214 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032981 1 0.0469 0.843504 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1032982 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0469 0.843516 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1032984 1 0.0921 0.842695 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032985 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.2281 0.814211 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1032993 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.5697 0.407900 0.656 0.000 0.052 0.292
#> SRR1032995 1 0.0707 0.841408 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1032996 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.4389 0.789370 0.012 0.828 0.060 0.100
#> SRR1033001 1 0.2281 0.814082 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033002 1 0.2345 0.811223 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1033003 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0817 0.843279 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033006 3 0.0336 0.934362 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033007 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.1716 0.832311 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033009 1 0.2081 0.821757 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033010 3 0.1975 0.883910 0.016 0.000 0.936 0.048
#> SRR1033011 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.6477 0.000505 0.508 0.000 0.072 0.420
#> SRR1033013 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.1867 0.884365 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1033015 3 0.0707 0.927654 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033016 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.3074 0.791649 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1033019 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.5267 0.594140 0.712 0.000 0.048 0.240
#> SRR1033021 1 0.2011 0.793143 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033023 1 0.4605 0.521309 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1033022 1 0.4898 0.292387 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1033024 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.4677 0.561253 0.680 0.000 0.004 0.316
#> SRR1033026 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.4710 0.640924 0.792 0.000 0.120 0.088
#> SRR1033029 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033031 3 0.7421 -0.321335 0.168 0.000 0.432 0.400
#> SRR1033032 3 0.2623 0.855514 0.028 0.000 0.908 0.064
#> SRR1033033 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.4764 0.714177 0.788 0.000 0.088 0.124
#> SRR1033036 4 0.7184 0.446823 0.364 0.000 0.144 0.492
#> SRR1033037 1 0.2081 0.821757 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033038 3 0.5671 0.193002 0.028 0.000 0.572 0.400
#> SRR1033039 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.1940 0.881013 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033041 1 0.2647 0.813025 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1033042 1 0.6278 0.108774 0.532 0.000 0.060 0.408
#> SRR1033043 1 0.1637 0.830984 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033044 1 0.2760 0.809326 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1033045 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.6016 0.293585 0.632 0.000 0.300 0.068
#> SRR1033047 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.4996 -0.136156 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR1033049 1 0.3444 0.768205 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033051 1 0.2081 0.821757 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033052 1 0.3801 0.725108 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033053 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.2081 0.821757 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033055 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0921 0.829913 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033057 1 0.5207 0.569966 0.680 0.000 0.028 0.292
#> SRR1033058 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.6912 0.162545 0.592 0.000 0.192 0.216
#> SRR1033061 2 0.0336 0.959479 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033062 3 0.0336 0.934275 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033063 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 4 0.7363 0.446746 0.356 0.000 0.168 0.476
#> SRR1033066 4 0.7812 0.441024 0.328 0.000 0.264 0.408
#> SRR1033067 1 0.2081 0.821757 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033068 3 0.1118 0.916420 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033069 3 0.0937 0.926188 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1033070 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.4382 0.564299 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.2530 0.815935 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1033075 1 0.0469 0.839213 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033076 3 0.1557 0.900046 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1033077 1 0.1792 0.834334 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033078 1 0.1940 0.825248 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033079 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.1489 0.841086 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033082 4 0.7806 0.435863 0.332 0.000 0.260 0.408
#> SRR1033083 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.2814 0.807882 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033085 3 0.1118 0.916137 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033086 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.3311 0.778772 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033088 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.4888 0.141715 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1033090 1 0.0336 0.843086 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033091 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.5159 0.376703 0.624 0.000 0.012 0.364
#> SRR1033093 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.1716 0.893776 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1033095 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033102 4 0.3356 0.660367 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1033103 4 0.4961 0.249931 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1033104 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.4843 0.360897 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1033106 4 0.6140 0.568685 0.340 0.000 0.064 0.596
#> SRR1033107 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 4 0.4898 0.353299 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1033110 3 0.0921 0.922580 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1033111 4 0.4008 0.623341 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1033112 1 0.4585 0.525873 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1033113 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.4877 0.318826 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1033115 4 0.6652 0.342956 0.088 0.000 0.396 0.516
#> SRR1033116 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.4830 0.107643 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1033119 4 0.4907 0.358458 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1033121 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.6980 0.453881 0.016 0.616 0.124 0.244
#> SRR1033122 3 0.0657 0.926695 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1033123 4 0.5314 0.680219 0.144 0.000 0.108 0.748
#> SRR1033124 1 0.3801 0.730272 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033125 3 0.1716 0.893114 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1033126 4 0.5031 0.682581 0.140 0.000 0.092 0.768
#> SRR1033127 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0336 0.934142 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033128 4 0.5132 0.137309 0.004 0.000 0.448 0.548
#> SRR1033130 1 0.2402 0.814629 0.912 0.000 0.012 0.076
#> SRR1033131 1 0.4985 0.065175 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1033132 3 0.0188 0.936060 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033133 3 0.2469 0.850076 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1033134 1 0.1389 0.834602 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033135 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 4 0.4040 0.622887 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1033137 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033139 3 0.1661 0.902383 0.000 0.004 0.944 0.052
#> SRR1033138 3 0.5543 0.338212 0.028 0.000 0.612 0.360
#> SRR1033140 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.5599 0.319076 0.616 0.000 0.032 0.352
#> SRR1033142 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.3400 0.771049 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1033144 4 0.7665 0.499521 0.304 0.000 0.240 0.456
#> SRR1033145 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.5097 0.205882 0.000 0.004 0.568 0.428
#> SRR1033147 3 0.1716 0.893360 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1033148 1 0.2814 0.808939 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033149 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.7710 -0.412544 0.408 0.000 0.224 0.368
#> SRR1033151 3 0.0707 0.927556 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033152 1 0.2124 0.822242 0.932 0.000 0.040 0.028
#> SRR1033153 3 0.2675 0.851699 0.008 0.000 0.892 0.100
#> SRR1033154 1 0.5658 0.465775 0.632 0.000 0.040 0.328
#> SRR1033156 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.3907 0.715891 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1033158 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0188 0.842379 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033163 3 0.0188 0.936064 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033162 1 0.6887 -0.226988 0.452 0.000 0.104 0.444
#> SRR1033164 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 4 0.7669 0.522795 0.236 0.000 0.312 0.452
#> SRR1033167 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.2760 0.821519 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1033170 1 0.3569 0.757171 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033172 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0707 0.927612 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033175 1 0.2081 0.823754 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033176 1 0.3626 0.767535 0.812 0.000 0.004 0.184
#> SRR1033177 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.7344 0.073178 0.512 0.000 0.300 0.188
#> SRR1033181 4 0.6617 0.603051 0.264 0.000 0.128 0.608
#> SRR1033183 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033182 4 0.6003 0.302986 0.456 0.000 0.040 0.504
#> SRR1033184 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033185 4 0.4977 0.204520 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1033187 1 0.5041 0.588238 0.728 0.000 0.040 0.232
#> SRR1033186 3 0.5980 0.190473 0.044 0.000 0.560 0.396
#> SRR1033188 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.3873 0.667041 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1033190 4 0.6635 0.409424 0.388 0.000 0.088 0.524
#> SRR1033191 4 0.4718 0.685347 0.116 0.000 0.092 0.792
#> SRR1033192 3 0.2319 0.888200 0.000 0.040 0.924 0.036
#> SRR1033193 1 0.3444 0.770061 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033195 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 4 0.5613 0.443276 0.380 0.000 0.028 0.592
#> SRR1033196 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 4 0.0921 0.626660 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1033200 1 0.1792 0.833133 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033201 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.3123 0.795180 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1033203 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.2973 0.800697 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033205 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033206 4 0.3726 0.648464 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1033207 1 0.4746 0.410770 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1033208 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033209 4 0.6523 0.650951 0.236 0.000 0.136 0.628
#> SRR1033210 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033211 4 0.4467 0.674689 0.172 0.000 0.040 0.788
#> SRR1033212 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.1792 0.836950 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033216 1 0.2281 0.820132 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033215 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.0336 0.934308 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033218 4 0.4916 0.327758 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1033219 4 0.4948 0.282290 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1033221 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.3356 0.773877 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1033223 3 0.1022 0.921225 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033225 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.1118 0.839570 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033226 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0469 0.843769 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033231 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.3123 0.791472 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1033232 4 0.6887 0.180662 0.104 0.000 0.444 0.452
#> SRR1033233 1 0.3486 0.764887 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033235 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.5857 0.352158 0.636 0.000 0.056 0.308
#> SRR1033242 3 0.1716 0.864405 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0469 0.932415 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033246 1 0.4543 0.546618 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR1033248 1 0.5810 0.424213 0.660 0.000 0.064 0.276
#> SRR1033247 2 0.5746 0.374707 0.004 0.600 0.028 0.368
#> SRR1033249 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 4 0.4399 0.642388 0.224 0.000 0.016 0.760
#> SRR1033252 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.2814 0.809184 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033254 1 0.3942 0.707695 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1033256 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.3219 0.785480 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1033257 1 0.0188 0.842492 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033259 1 0.0921 0.839612 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033260 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3356 0.774477 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1033265 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.4105 0.734248 0.812 0.000 0.032 0.156
#> SRR1033267 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033268 4 0.4992 0.148627 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1033269 3 0.0707 0.927587 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033270 3 0.0000 0.937743 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.3873 0.726198 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1033272 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4193 0.660112 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1033274 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.967960 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.1022 0.841615 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033278 1 0.0000 0.842152 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.2921 0.810129 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1033280 3 0.0188 0.936014 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033281 1 0.4817 0.380388 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1033282 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033283 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033284 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033285 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033286 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033287 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033288 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033289 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033290 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033291 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033292 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
#> SRR1033293 4 0.2500 0.636059 0.044 0.000 0.040 0.916
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1032921 1 0.3684 0.6240 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1032922 1 0.1952 0.7025 0.912 0.000 0.084 0.004 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.2966 0.6557 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 4 0.0963 0.5589 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.5138 0.5031 0.684 0.000 0.028 0.252 0.036
#> SRR1032937 2 0.4114 0.0567 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1032938 1 0.2516 0.7375 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1032939 1 0.0404 0.7905 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1032940 1 0.1410 0.7681 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 4 0.5155 0.6120 0.000 0.140 0.000 0.692 0.168
#> SRR1032943 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.3983 0.5508 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1032945 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.1608 0.8201 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0290 0.7929 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1032955 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.2648 0.7294 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1032958 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0510 0.7909 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1032962 3 0.1341 0.9041 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 4 0.4883 0.3017 0.000 0.000 0.048 0.652 0.300
#> SRR1032968 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1032978 1 0.3636 0.6352 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1032979 2 0.2179 0.7720 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 4 0.3949 0.8434 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0510 0.9218 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.5530 0.3997 0.632 0.000 0.012 0.284 0.072
#> SRR1032995 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033000 4 0.3988 0.7833 0.000 0.252 0.016 0.732 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0404 0.7907 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033003 2 0.0510 0.8751 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033004 4 0.3932 0.8488 0.000 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.1270 0.9045 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.3480 0.6561 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1033009 1 0.3109 0.6971 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033010 3 0.0880 0.9155 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033011 2 0.0404 0.8783 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033012 1 0.5579 0.1938 0.508 0.000 0.072 0.000 0.420
#> SRR1033013 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.1661 0.8968 0.000 0.000 0.940 0.024 0.036
#> SRR1033015 3 0.3266 0.7770 0.000 0.000 0.796 0.200 0.004
#> SRR1033016 2 0.2929 0.6621 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.4735 0.6338 0.000 0.000 0.680 0.272 0.048
#> SRR1033019 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.5135 0.5536 0.696 0.000 0.004 0.200 0.100
#> SRR1033021 1 0.2208 0.7517 0.908 0.000 0.020 0.072 0.000
#> SRR1033023 1 0.4171 0.4482 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1033022 1 0.4219 0.4043 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1033024 3 0.0404 0.9232 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033025 1 0.4251 0.4903 0.624 0.000 0.004 0.000 0.372
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.4088 0.0886 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1033028 1 0.5010 0.5698 0.748 0.000 0.100 0.124 0.028
#> SRR1033029 4 0.3966 0.8377 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 5 0.6396 0.2897 0.168 0.000 0.412 0.000 0.420
#> SRR1033032 3 0.3003 0.7938 0.000 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1033033 2 0.1608 0.8211 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.5538 0.4130 0.588 0.000 0.088 0.000 0.324
#> SRR1033036 5 0.6188 0.2774 0.364 0.000 0.144 0.000 0.492
#> SRR1033037 1 0.3274 0.6838 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033038 3 0.6178 0.2988 0.024 0.000 0.568 0.092 0.316
#> SRR1033039 3 0.0162 0.9251 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033040 3 0.2409 0.8729 0.000 0.000 0.900 0.068 0.032
#> SRR1033041 1 0.3857 0.5900 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1033042 1 0.5408 0.2716 0.532 0.000 0.060 0.000 0.408
#> SRR1033043 1 0.2230 0.7498 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033044 1 0.3895 0.5786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.5795 0.3882 0.640 0.000 0.124 0.224 0.012
#> SRR1033047 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.5297 -0.0319 0.476 0.000 0.476 0.048 0.000
#> SRR1033049 1 0.3895 0.5786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033051 1 0.3074 0.7001 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033052 1 0.4060 0.5180 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1033053 2 0.4088 0.0886 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1033054 3 0.0162 0.9251 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033050 1 0.3395 0.6693 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.4757 0.4373 0.596 0.000 0.024 0.000 0.380
#> SRR1033058 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.7107 0.1011 0.528 0.000 0.144 0.264 0.064
#> SRR1033061 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033062 3 0.2773 0.8147 0.000 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 5 0.6342 0.2846 0.356 0.000 0.168 0.000 0.476
#> SRR1033066 5 0.6729 0.3027 0.328 0.000 0.264 0.000 0.408
#> SRR1033067 1 0.3274 0.6834 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033068 3 0.1300 0.9095 0.000 0.000 0.956 0.028 0.016
#> SRR1033069 3 0.3093 0.8133 0.000 0.008 0.824 0.168 0.000
#> SRR1033070 3 0.0404 0.9229 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.5043 0.3735 0.000 0.044 0.600 0.356 0.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.3452 0.6628 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1033075 1 0.0609 0.7874 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033076 3 0.2136 0.8789 0.000 0.000 0.904 0.088 0.008
#> SRR1033077 1 0.0404 0.7921 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033078 1 0.2280 0.7479 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.1357 0.7745 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033082 5 0.6723 0.2954 0.332 0.000 0.260 0.000 0.408
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.3730 0.6178 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR1033085 3 0.1018 0.9143 0.000 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1033086 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033087 1 0.3895 0.5786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033088 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.4278 0.1035 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.5441 0.4306 0.596 0.000 0.000 0.080 0.324
#> SRR1033093 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.3940 0.7350 0.000 0.000 0.756 0.220 0.024
#> SRR1033095 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0162 0.9252 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033097 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.4268 -0.2645 0.000 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033102 5 0.2891 0.5437 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1033103 5 0.4268 0.0447 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.4235 0.3864 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1033106 5 0.7301 0.4464 0.304 0.000 0.024 0.280 0.392
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 5 0.4088 0.2844 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1033110 3 0.1831 0.8901 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1033111 5 0.3452 0.4903 0.244 0.000 0.000 0.000 0.756
#> SRR1033112 1 0.4161 0.4569 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1033113 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.4210 0.4131 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1033115 5 0.6077 0.2736 0.088 0.000 0.392 0.012 0.508
#> SRR1033116 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.4161 0.1057 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR1033119 5 0.4658 0.1816 0.408 0.000 0.000 0.016 0.576
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 4 0.1121 0.5671 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1033122 3 0.0566 0.9163 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1033123 5 0.4577 0.5583 0.144 0.000 0.108 0.000 0.748
#> SRR1033124 1 0.4015 0.5388 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1033125 3 0.2270 0.8787 0.000 0.000 0.904 0.076 0.020
#> SRR1033126 5 0.4334 0.5574 0.140 0.000 0.092 0.000 0.768
#> SRR1033127 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0290 0.9239 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033128 5 0.4420 0.0574 0.004 0.000 0.448 0.000 0.548
#> SRR1033130 1 0.3215 0.7203 0.852 0.000 0.000 0.092 0.056
#> SRR1033131 1 0.5713 0.1163 0.500 0.000 0.000 0.084 0.416
#> SRR1033132 3 0.0566 0.9217 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033133 3 0.4054 0.7419 0.000 0.000 0.760 0.204 0.036
#> SRR1033134 1 0.1608 0.7709 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 5 0.3728 0.4938 0.244 0.000 0.000 0.008 0.748
#> SRR1033137 3 0.0290 0.9240 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033139 3 0.1741 0.8976 0.000 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR1033138 3 0.6100 0.3834 0.000 0.000 0.540 0.308 0.152
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.6573 0.2720 0.552 0.000 0.020 0.172 0.256
#> SRR1033142 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.3305 0.6797 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1033144 5 0.6592 0.3660 0.300 0.000 0.240 0.000 0.460
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.4590 0.2543 0.000 0.000 0.568 0.012 0.420
#> SRR1033147 3 0.3264 0.8061 0.000 0.000 0.820 0.164 0.016
#> SRR1033148 1 0.3336 0.6771 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.8163 -0.3270 0.368 0.000 0.172 0.316 0.144
#> SRR1033151 3 0.1106 0.9136 0.000 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1033152 1 0.2605 0.7076 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1033153 3 0.3882 0.7735 0.000 0.000 0.788 0.168 0.044
#> SRR1033154 1 0.5058 0.3972 0.576 0.000 0.040 0.000 0.384
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.3983 0.5513 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1033158 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0404 0.9231 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033162 1 0.5933 -0.0338 0.448 0.000 0.104 0.000 0.448
#> SRR1033164 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 5 0.6605 0.4132 0.236 0.000 0.312 0.000 0.452
#> SRR1033167 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033168 3 0.0290 0.9240 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033169 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033171 3 0.4552 0.6563 0.000 0.000 0.696 0.264 0.040
#> SRR1033170 1 0.3895 0.5786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0162 0.8835 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033174 3 0.1205 0.9112 0.000 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1033175 1 0.3210 0.6895 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1033176 1 0.3932 0.5681 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033177 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033180 1 0.6717 -0.1050 0.416 0.000 0.264 0.000 0.320
#> SRR1033181 5 0.5699 0.4666 0.264 0.000 0.128 0.000 0.608
#> SRR1033183 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.6670 -0.1962 0.436 0.000 0.000 0.308 0.256
#> SRR1033184 3 0.0880 0.9161 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033185 5 0.4287 -0.0229 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1033187 1 0.4878 0.4876 0.676 0.000 0.000 0.264 0.060
#> SRR1033186 3 0.6342 0.3107 0.000 0.000 0.520 0.208 0.272
#> SRR1033188 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.3586 0.6360 0.000 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1033190 5 0.5715 0.2240 0.388 0.000 0.088 0.000 0.524
#> SRR1033191 5 0.4064 0.5394 0.116 0.000 0.092 0.000 0.792
#> SRR1033192 3 0.3214 0.8444 0.000 0.032 0.856 0.104 0.008
#> SRR1033193 1 0.3895 0.5815 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033195 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033194 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033197 5 0.4774 0.3065 0.360 0.000 0.028 0.000 0.612
#> SRR1033196 3 0.0290 0.9240 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 5 0.1478 0.3965 0.000 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1033200 1 0.0880 0.7859 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.3719 0.7825 0.000 0.000 0.816 0.068 0.116
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.3612 0.6397 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1033205 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033206 5 0.5283 0.5443 0.204 0.000 0.000 0.124 0.672
#> SRR1033207 1 0.4747 0.4422 0.620 0.000 0.000 0.028 0.352
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 5 0.7552 0.4755 0.212 0.000 0.056 0.304 0.428
#> SRR1033210 3 0.0162 0.9250 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033211 5 0.5938 0.4235 0.128 0.000 0.000 0.320 0.552
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033214 1 0.2280 0.7481 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1033216 1 0.3895 0.5786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033215 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.2179 0.8644 0.000 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033218 5 0.4150 0.2250 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1033219 5 0.4161 0.2216 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1033221 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.3684 0.6266 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1033223 3 0.2017 0.8837 0.000 0.000 0.912 0.080 0.008
#> SRR1033225 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033224 1 0.0963 0.7846 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033226 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0162 0.8835 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.3586 0.4559 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1033230 1 0.3895 0.5786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033232 3 0.7646 0.0227 0.060 0.000 0.404 0.320 0.216
#> SRR1033233 1 0.3895 0.5786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033235 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0162 0.9251 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.5425 0.3326 0.600 0.000 0.000 0.320 0.080
#> SRR1033242 3 0.1478 0.8599 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.2124 0.8740 0.000 0.000 0.900 0.096 0.004
#> SRR1033246 1 0.4138 0.4733 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033248 1 0.5796 0.3736 0.620 0.000 0.024 0.284 0.072
#> SRR1033247 4 0.3386 0.5747 0.000 0.040 0.000 0.832 0.128
#> SRR1033249 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 5 0.3789 0.5142 0.224 0.000 0.016 0.000 0.760
#> SRR1033252 2 0.3305 0.5768 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1033253 1 0.3837 0.5935 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1033254 1 0.4030 0.5318 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1033256 2 0.4300 -0.3982 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1033255 3 0.0162 0.9252 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033258 1 0.3816 0.5990 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1033257 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0290 0.7928 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033260 2 0.0162 0.8836 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.8857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3895 0.5786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033265 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033266 1 0.3810 0.6583 0.792 0.000 0.000 0.168 0.040
#> SRR1033267 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 5 0.4291 -0.0381 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1033269 3 0.0807 0.9185 0.000 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9259 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.3586 0.6479 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1033272 2 0.0794 0.8652 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033273 1 0.4030 0.5317 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1033274 4 0.3895 0.8588 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 4 0.4262 0.6260 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1033277 1 0.0703 0.7887 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033278 1 0.0000 0.7945 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.3454 0.8157 0.000 0.000 0.836 0.100 0.064
#> SRR1033280 3 0.0609 0.9207 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033281 1 0.4182 0.4395 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1033282 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033283 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033284 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033285 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033286 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033287 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033288 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033289 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033290 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033291 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033292 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1033293 5 0.3895 0.3273 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 6 0.0000 0.87734 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032921 4 0.3607 0.44208 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1032922 4 0.1888 0.76151 0.068 0.000 0.012 0.916 0.004 0.000
#> SRR1032923 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.2664 0.75137 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1032924 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 6 0.3156 0.77636 0.000 0.000 0.180 0.000 0.020 0.800
#> SRR1032933 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 4 0.3990 0.57445 0.000 0.000 0.028 0.688 0.284 0.000
#> SRR1032937 2 0.3857 0.15776 0.000 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1032938 4 0.2340 0.74915 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1032939 4 0.0363 0.85030 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032940 4 0.1267 0.82292 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 6 0.0000 0.87734 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.3869 -0.03274 0.500 0.000 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.3050 0.66911 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1032950 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 4 0.0260 0.85206 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0260 0.90027 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1032957 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 4 0.2378 0.74364 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1032958 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 4 0.0458 0.84820 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.5032 -0.91842 0.472 0.000 0.464 0.000 0.060 0.004
#> SRR1032963 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 6 0.6124 0.35021 0.216 0.000 0.044 0.000 0.176 0.564
#> SRR1032968 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 6 0.3860 0.55556 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1032978 4 0.3547 0.48127 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.3428 0.55972 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1032980 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 6 0.1141 0.85908 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1032988 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.4260 0.96580 0.472 0.000 0.512 0.000 0.016 0.000
#> SRR1032989 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 4 0.3883 0.52046 0.000 0.000 0.012 0.656 0.332 0.000
#> SRR1032995 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033000 6 0.3860 0.55556 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1033001 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 4 0.0363 0.85045 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033003 2 0.0458 0.89574 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033004 6 0.1556 0.83440 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR1033005 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.4808 0.92623 0.472 0.000 0.476 0.000 0.052 0.000
#> SRR1033007 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 4 0.3464 0.51329 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000
#> SRR1033009 4 0.2793 0.69127 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.4534 0.95076 0.472 0.000 0.496 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033011 2 0.0458 0.89611 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033012 1 0.4025 0.17765 0.576 0.000 0.000 0.416 0.008 0.000
#> SRR1033013 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.4705 0.93791 0.472 0.000 0.484 0.000 0.044 0.000
#> SRR1033015 1 0.5826 -0.72461 0.472 0.000 0.324 0.000 0.204 0.000
#> SRR1033016 2 0.2664 0.75074 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033017 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.5862 -0.57415 0.468 0.000 0.216 0.000 0.316 0.000
#> SRR1033019 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 4 0.4237 0.61097 0.048 0.000 0.004 0.704 0.244 0.000
#> SRR1033021 4 0.1895 0.80529 0.000 0.000 0.016 0.912 0.072 0.000
#> SRR1033023 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.4086 0.07906 0.528 0.000 0.000 0.464 0.008 0.000
#> SRR1033024 3 0.4179 0.96920 0.472 0.000 0.516 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033025 1 0.3857 0.07222 0.532 0.000 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.3717 0.41444 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033028 4 0.4352 0.62571 0.020 0.000 0.084 0.752 0.144 0.000
#> SRR1033029 6 0.2823 0.68492 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1033030 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.2706 0.21785 0.832 0.000 0.000 0.160 0.008 0.000
#> SRR1033032 1 0.5779 -0.74658 0.472 0.000 0.340 0.000 0.188 0.000
#> SRR1033033 2 0.1501 0.85448 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033035 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.3923 0.17847 0.580 0.000 0.004 0.416 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.4315 0.29145 0.636 0.000 0.000 0.328 0.036 0.000
#> SRR1033037 4 0.2941 0.66821 0.220 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.3806 -0.07717 0.792 0.000 0.040 0.024 0.144 0.000
#> SRR1033039 3 0.3991 0.97495 0.472 0.000 0.524 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033040 1 0.5290 -0.87172 0.472 0.000 0.428 0.000 0.100 0.000
#> SRR1033041 4 0.3797 0.27043 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.3828 0.13301 0.560 0.000 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1033043 4 0.2003 0.77710 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.3868 -0.00405 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 4 0.5527 0.45613 0.064 0.000 0.072 0.636 0.228 0.000
#> SRR1033047 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 4 0.5814 -0.04003 0.064 0.000 0.424 0.464 0.048 0.000
#> SRR1033049 1 0.3868 -0.00414 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1033051 4 0.2793 0.69157 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.3672 0.44773 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1033054 3 0.3991 0.97495 0.472 0.000 0.524 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033050 4 0.3101 0.63490 0.244 0.000 0.000 0.756 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.3843 0.10833 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 4 0.5999 0.24773 0.052 0.000 0.096 0.540 0.312 0.000
#> SRR1033061 6 0.0260 0.88032 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033062 1 0.5667 -0.78125 0.472 0.000 0.368 0.000 0.160 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.4153 0.27875 0.636 0.000 0.000 0.340 0.024 0.000
#> SRR1033066 1 0.3508 0.32496 0.704 0.000 0.000 0.292 0.004 0.000
#> SRR1033067 4 0.3023 0.65226 0.232 0.000 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.4757 0.93444 0.472 0.000 0.480 0.000 0.048 0.000
#> SRR1033069 1 0.6800 -0.69977 0.472 0.000 0.288 0.000 0.100 0.140
#> SRR1033070 3 0.4260 0.96575 0.472 0.000 0.512 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 6 0.4360 0.41292 0.260 0.000 0.060 0.000 0.000 0.680
#> SRR1033073 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033074 4 0.3175 0.61764 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000 0.000
#> SRR1033075 4 0.0547 0.84630 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033076 1 0.5257 -0.87772 0.472 0.000 0.432 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033077 4 0.0363 0.85037 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033078 4 0.2048 0.77412 0.120 0.000 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 4 0.1219 0.82976 0.004 0.000 0.000 0.948 0.048 0.000
#> SRR1033082 1 0.3448 0.32162 0.716 0.000 0.000 0.280 0.004 0.000
#> SRR1033083 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 4 0.3547 0.48347 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.4471 0.95467 0.472 0.000 0.500 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033086 6 0.0000 0.87734 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033087 4 0.3854 0.13920 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 4 0.5001 0.09810 0.076 0.000 0.384 0.540 0.000 0.000
#> SRR1033090 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 4 0.5172 0.38892 0.284 0.000 0.000 0.592 0.124 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.5886 -0.68463 0.472 0.000 0.292 0.000 0.236 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.3991 0.97496 0.472 0.000 0.524 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033097 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033098 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.3847 0.22494 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1033101 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.5779 -0.08675 0.432 0.000 0.000 0.176 0.392 0.000
#> SRR1033103 1 0.4905 0.16884 0.528 0.000 0.000 0.408 0.064 0.000
#> SRR1033104 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.4172 0.08628 0.528 0.000 0.000 0.460 0.012 0.000
#> SRR1033106 5 0.4874 0.37763 0.084 0.000 0.000 0.308 0.608 0.000
#> SRR1033107 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.5399 0.23346 0.528 0.000 0.000 0.344 0.128 0.000
#> SRR1033110 1 0.5074 -0.90321 0.472 0.000 0.452 0.000 0.076 0.000
#> SRR1033111 1 0.5676 0.13482 0.528 0.000 0.000 0.216 0.256 0.000
#> SRR1033112 1 0.3989 0.07086 0.528 0.000 0.000 0.468 0.004 0.000
#> SRR1033113 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.4086 0.07920 0.528 0.000 0.000 0.464 0.008 0.000
#> SRR1033115 1 0.3210 0.11905 0.836 0.000 0.004 0.088 0.072 0.000
#> SRR1033116 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.5576 0.09386 0.144 0.000 0.480 0.376 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.5228 0.17161 0.504 0.000 0.000 0.400 0.096 0.000
#> SRR1033121 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 6 0.0000 0.87734 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033122 3 0.4303 0.95874 0.460 0.000 0.524 0.012 0.004 0.000
#> SRR1033123 1 0.5046 0.08552 0.632 0.000 0.000 0.144 0.224 0.000
#> SRR1033124 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.5257 -0.87857 0.472 0.000 0.432 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033126 1 0.5123 0.06430 0.616 0.000 0.000 0.140 0.244 0.000
#> SRR1033127 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.4091 0.97185 0.472 0.000 0.520 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033128 1 0.1285 0.08512 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033130 4 0.2831 0.75521 0.024 0.000 0.000 0.840 0.136 0.000
#> SRR1033131 4 0.5748 0.16621 0.308 0.000 0.000 0.496 0.196 0.000
#> SRR1033132 3 0.4335 0.96252 0.472 0.000 0.508 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033133 1 0.5906 -0.68707 0.464 0.000 0.300 0.000 0.236 0.000
#> SRR1033134 4 0.1444 0.81279 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.5751 0.14213 0.512 0.000 0.000 0.232 0.256 0.000
#> SRR1033137 3 0.4091 0.97224 0.472 0.000 0.520 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033139 1 0.5431 -0.89879 0.472 0.000 0.444 0.000 0.060 0.024
#> SRR1033138 1 0.5227 -0.38743 0.456 0.000 0.092 0.000 0.452 0.000
#> SRR1033140 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 4 0.5690 0.36420 0.144 0.000 0.012 0.552 0.292 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 4 0.3050 0.64692 0.236 0.000 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.3911 0.29817 0.712 0.000 0.000 0.256 0.032 0.000
#> SRR1033145 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.2007 0.00532 0.920 0.000 0.012 0.000 0.032 0.036
#> SRR1033147 1 0.6068 -0.76339 0.472 0.000 0.344 0.000 0.168 0.016
#> SRR1033148 4 0.3198 0.61109 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 5 0.6215 0.15203 0.108 0.000 0.048 0.404 0.440 0.000
#> SRR1033151 3 0.4593 0.94751 0.472 0.000 0.492 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033152 4 0.2340 0.75578 0.000 0.000 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1033153 1 0.5862 -0.72196 0.464 0.000 0.324 0.000 0.212 0.000
#> SRR1033154 1 0.3817 0.14450 0.568 0.000 0.000 0.432 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.3991 0.06039 0.524 0.000 0.000 0.472 0.004 0.000
#> SRR1033158 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033159 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.4179 0.96959 0.472 0.000 0.516 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033162 1 0.4150 0.21557 0.592 0.000 0.000 0.392 0.016 0.000
#> SRR1033164 3 0.4091 0.97217 0.472 0.000 0.520 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033165 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.4124 0.26066 0.728 0.000 0.000 0.224 0.036 0.012
#> SRR1033167 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033168 3 0.4091 0.97224 0.472 0.000 0.520 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033169 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033171 1 0.6150 -0.59407 0.472 0.000 0.224 0.000 0.292 0.012
#> SRR1033170 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0146 0.90193 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033174 3 0.4705 0.94041 0.472 0.000 0.484 0.000 0.044 0.000
#> SRR1033175 4 0.2912 0.67288 0.216 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033180 1 0.3647 0.25749 0.640 0.000 0.000 0.360 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.4973 0.28239 0.624 0.000 0.000 0.264 0.112 0.000
#> SRR1033183 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 5 0.5387 0.00809 0.112 0.000 0.000 0.424 0.464 0.000
#> SRR1033184 3 0.4593 0.94774 0.472 0.000 0.492 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033185 1 0.4819 0.15742 0.528 0.000 0.000 0.416 0.056 0.000
#> SRR1033187 4 0.3464 0.57488 0.000 0.000 0.000 0.688 0.312 0.000
#> SRR1033186 1 0.4499 -0.25782 0.652 0.000 0.060 0.000 0.288 0.000
#> SRR1033188 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.5959 0.57160 0.260 0.000 0.452 0.000 0.000 0.288
#> SRR1033190 1 0.4630 0.23668 0.580 0.000 0.000 0.372 0.048 0.000
#> SRR1033191 1 0.5011 0.00535 0.620 0.000 0.000 0.116 0.264 0.000
#> SRR1033192 1 0.6443 -0.66480 0.472 0.000 0.268 0.000 0.032 0.228
#> SRR1033193 4 0.4076 0.15652 0.452 0.000 0.000 0.540 0.008 0.000
#> SRR1033195 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033194 6 0.0260 0.88032 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033197 1 0.5257 0.26408 0.556 0.000 0.000 0.328 0.116 0.000
#> SRR1033196 3 0.4179 0.96918 0.472 0.000 0.516 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 5 0.3468 0.46487 0.284 0.000 0.000 0.004 0.712 0.000
#> SRR1033200 4 0.0790 0.83922 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.5820 -0.75085 0.416 0.000 0.400 0.000 0.184 0.000
#> SRR1033203 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033204 4 0.3309 0.57820 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033206 5 0.5303 0.36969 0.196 0.000 0.000 0.204 0.600 0.000
#> SRR1033207 4 0.5148 0.48345 0.196 0.000 0.000 0.624 0.180 0.000
#> SRR1033208 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 5 0.4299 0.56199 0.032 0.000 0.028 0.212 0.728 0.000
#> SRR1033210 3 0.3991 0.97472 0.472 0.000 0.524 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033211 5 0.2135 0.63571 0.000 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1033212 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033214 4 0.2092 0.77067 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 1 0.5383 -0.85320 0.472 0.000 0.416 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033218 1 0.5702 0.23426 0.496 0.000 0.000 0.324 0.180 0.000
#> SRR1033219 1 0.5249 0.21221 0.528 0.000 0.000 0.368 0.104 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 4 0.3578 0.46726 0.340 0.000 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.5259 -0.87699 0.468 0.000 0.436 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033225 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033224 4 0.0865 0.83694 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0146 0.90193 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033228 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.3868 0.04124 0.000 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR1033230 4 0.3756 0.32743 0.400 0.000 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR1033232 5 0.5847 0.17323 0.344 0.000 0.064 0.060 0.532 0.000
#> SRR1033233 4 0.3869 0.01295 0.500 0.000 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0146 0.90182 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033234 3 0.3991 0.97495 0.472 0.000 0.524 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033236 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033237 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 4 0.3747 0.41778 0.000 0.000 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1033242 3 0.4882 0.87764 0.428 0.000 0.512 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.5257 -0.87413 0.472 0.000 0.432 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033246 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033248 4 0.4289 0.43811 0.000 0.000 0.028 0.612 0.360 0.000
#> SRR1033247 6 0.0146 0.87609 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033249 2 0.0146 0.90182 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033250 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.5682 0.14758 0.528 0.000 0.000 0.224 0.248 0.000
#> SRR1033252 2 0.3151 0.67085 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1033253 4 0.3727 0.35503 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.3862 0.04972 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1033256 6 0.3309 0.56908 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1033255 3 0.3991 0.97488 0.472 0.000 0.524 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033258 4 0.3737 0.34748 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 4 0.0260 0.85200 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0146 0.90199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033261 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.90319 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 4 0.3804 0.26234 0.424 0.000 0.000 0.576 0.000 0.000
#> SRR1033265 6 0.0632 0.87781 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1033266 4 0.3078 0.70752 0.012 0.000 0.000 0.796 0.192 0.000
#> SRR1033267 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.4774 0.15233 0.528 0.000 0.000 0.420 0.052 0.000
#> SRR1033269 3 0.4405 0.95944 0.472 0.000 0.504 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033270 3 0.3860 0.97715 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 4 0.4107 0.57418 0.256 0.000 0.000 0.700 0.044 0.000
#> SRR1033272 2 0.1075 0.87506 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033273 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033274 6 0.0458 0.88185 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033275 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 6 0.3756 0.25212 0.000 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1033277 4 0.0632 0.84404 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1033278 4 0.0000 0.85543 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.5653 -0.79844 0.468 0.000 0.376 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033280 3 0.4260 0.96645 0.472 0.000 0.512 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033281 1 0.3860 0.06211 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033282 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033283 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033284 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033285 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033286 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033287 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033288 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033289 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033290 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033291 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033292 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033293 5 0.0000 0.71856 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.979 0.990 0.3172 0.684 0.684
#> 3 3 0.702 0.866 0.928 0.8844 0.701 0.572
#> 4 4 0.891 0.897 0.948 0.2163 0.847 0.635
#> 5 5 0.749 0.702 0.824 0.0745 0.893 0.639
#> 6 6 0.760 0.684 0.804 0.0435 0.925 0.677
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.8555 0.6177 0.720 0.280
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.2423 0.9451 0.040 0.960
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.1414 0.9812 0.980 0.020
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033014 1 0.1843 0.9748 0.972 0.028
#> SRR1033015 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033019 1 0.1633 0.9780 0.976 0.024
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033031 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033040 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033048 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033062 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.1184 0.9839 0.984 0.016
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0672 0.9887 0.992 0.008
#> SRR1033069 2 0.7602 0.7139 0.220 0.780
#> SRR1033070 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0376 0.9757 0.004 0.996
#> SRR1033073 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.2043 0.9713 0.968 0.032
#> SRR1033080 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.1184 0.9839 0.984 0.016
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033089 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.1843 0.9748 0.972 0.028
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.1184 0.9839 0.984 0.016
#> SRR1033117 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033118 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.9000 0.5403 0.316 0.684
#> SRR1033129 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0672 0.9888 0.992 0.008
#> SRR1033133 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.1843 0.9747 0.972 0.028
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033139 1 0.8081 0.6775 0.752 0.248
#> SRR1033138 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.1633 0.9780 0.976 0.024
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033146 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.3114 0.9461 0.944 0.056
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.1633 0.9780 0.976 0.024
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.1184 0.9839 0.984 0.016
#> SRR1033160 1 0.1843 0.9747 0.972 0.028
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.4939 0.8878 0.892 0.108
#> SRR1033165 1 0.0672 0.9888 0.992 0.008
#> SRR1033166 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.9983 0.0917 0.476 0.524
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.1843 0.9747 0.972 0.028
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.1184 0.9839 0.984 0.016
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.2043 0.9713 0.968 0.032
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.9881 0.2293 0.436 0.564
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033202 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033203 1 0.1184 0.9839 0.984 0.016
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033209 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.2236 0.9677 0.964 0.036
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.1633 0.9574 0.024 0.976
#> SRR1033217 1 0.0672 0.9887 0.992 0.008
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.1843 0.9747 0.972 0.028
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033236 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033240 1 0.1633 0.9780 0.976 0.024
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0672 0.9888 0.992 0.008
#> SRR1033241 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0938 0.9865 0.988 0.012
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.1184 0.9839 0.984 0.016
#> SRR1033262 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.1843 0.9747 0.972 0.028
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.1414 0.9811 0.980 0.020
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9792 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033286 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033287 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033288 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033289 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033290 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033291 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033292 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
#> SRR1033293 1 0.0376 0.9909 0.996 0.004
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 3 0.5503 0.7953 0.020 0.208 0.772
#> SRR1032911 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032912 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032913 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032914 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032915 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032916 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032917 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 3 0.6044 0.7774 0.172 0.056 0.772
#> SRR1032919 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032920 2 0.0424 0.9327 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032921 1 0.1529 0.9276 0.960 0.000 0.040
#> SRR1032922 3 0.4634 0.8265 0.012 0.164 0.824
#> SRR1032923 3 0.5156 0.7945 0.008 0.216 0.776
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032926 3 0.4178 0.8245 0.000 0.172 0.828
#> SRR1032927 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032929 3 0.6119 0.7804 0.164 0.064 0.772
#> SRR1032928 3 0.4912 0.8084 0.008 0.196 0.796
#> SRR1032930 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.5178 0.6202 0.000 0.744 0.256
#> SRR1032933 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032934 3 0.5020 0.8096 0.012 0.192 0.796
#> SRR1032935 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032936 3 0.1860 0.8765 0.000 0.052 0.948
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0747 0.9530 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032939 3 0.3918 0.8487 0.012 0.120 0.868
#> SRR1032940 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032941 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032942 2 0.3879 0.7915 0.000 0.848 0.152
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0424 0.9600 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032945 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032946 3 0.6317 0.7971 0.104 0.124 0.772
#> SRR1032947 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032948 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 3 0.4805 0.8194 0.012 0.176 0.812
#> SRR1032951 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032952 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032953 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032954 1 0.1753 0.9184 0.952 0.000 0.048
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032956 1 0.1411 0.9323 0.964 0.000 0.036
#> SRR1032958 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032959 3 0.5585 0.7630 0.204 0.024 0.772
#> SRR1032960 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032961 1 0.0892 0.9491 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032962 3 0.6180 0.3572 0.000 0.416 0.584
#> SRR1032963 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032964 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032965 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032966 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032967 2 0.6066 0.6313 0.024 0.728 0.248
#> SRR1032968 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032969 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032970 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032971 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032972 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032973 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032974 3 0.5503 0.7609 0.208 0.020 0.772
#> SRR1032975 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032976 3 0.4645 0.8206 0.008 0.176 0.816
#> SRR1032977 2 0.5178 0.6202 0.000 0.744 0.256
#> SRR1032978 1 0.0424 0.9601 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032981 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032982 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032983 3 0.4749 0.8218 0.012 0.172 0.816
#> SRR1032984 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032985 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032986 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032990 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032989 3 0.6001 0.7757 0.176 0.052 0.772
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.4589 0.8229 0.008 0.172 0.820
#> SRR1032993 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032994 3 0.0983 0.8873 0.004 0.016 0.980
#> SRR1032995 3 0.6587 0.3580 0.424 0.008 0.568
#> SRR1032996 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032997 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1032998 3 0.4805 0.8194 0.012 0.176 0.812
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.5216 0.6118 0.000 0.740 0.260
#> SRR1033001 3 0.5171 0.8017 0.012 0.204 0.784
#> SRR1033002 3 0.5497 0.8224 0.048 0.148 0.804
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 3 0.5171 0.8017 0.012 0.204 0.784
#> SRR1033006 3 0.4121 0.8268 0.000 0.168 0.832
#> SRR1033007 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0592 0.9568 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033010 3 0.4978 0.7956 0.004 0.216 0.780
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033020 3 0.0592 0.8878 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033021 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.5156 0.7945 0.008 0.216 0.776
#> SRR1033029 2 0.0424 0.9327 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033030 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.4121 0.8272 0.000 0.168 0.832
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.1031 0.9431 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033039 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0592 0.9567 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.1964 0.8753 0.000 0.056 0.944
#> SRR1033046 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033047 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033048 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033056 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.0237 0.8903 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033061 2 0.4121 0.7705 0.000 0.832 0.168
#> SRR1033062 3 0.4235 0.8223 0.000 0.176 0.824
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0424 0.9600 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033068 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033069 3 0.6274 0.2698 0.000 0.456 0.544
#> SRR1033070 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.6215 0.1873 0.000 0.572 0.428
#> SRR1033073 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0592 0.9567 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033075 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033076 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.4741 0.7550 0.828 0.020 0.152
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033081 3 0.0424 0.8891 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033086 2 0.4121 0.7705 0.000 0.832 0.168
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0424 0.8898 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033089 3 0.0424 0.8897 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033090 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1033091 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.0424 0.9597 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033108 3 0.5503 0.7609 0.208 0.020 0.772
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 3 0.0237 0.8906 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033120 2 0.5098 0.6516 0.000 0.752 0.248
#> SRR1033122 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.2959 0.8254 0.000 0.100 0.900
#> SRR1033129 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 3 0.0592 0.8878 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033131 1 0.4399 0.7397 0.812 0.000 0.188
#> SRR1033132 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033133 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033139 3 0.6235 0.3151 0.000 0.436 0.564
#> SRR1033138 3 0.0424 0.8891 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033140 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033141 3 0.0592 0.8878 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 3 0.5882 0.4538 0.000 0.348 0.652
#> SRR1033148 1 0.0592 0.9567 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033149 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033151 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033152 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033153 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.6973 0.1606 0.564 0.020 0.416
#> SRR1033163 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.5216 0.6999 0.000 0.260 0.740
#> SRR1033165 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033166 1 0.2448 0.8808 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.5988 0.4269 0.000 0.368 0.632
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0424 0.9327 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.3752 0.8399 0.000 0.144 0.856
#> SRR1033182 3 0.0747 0.8864 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033184 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033186 1 0.6282 0.5208 0.664 0.012 0.324
#> SRR1033188 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033189 2 0.6295 -0.0878 0.000 0.528 0.472
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.6252 0.2999 0.000 0.444 0.556
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.4178 0.7647 0.000 0.828 0.172
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1289 0.9356 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033200 1 0.6228 0.3432 0.624 0.004 0.372
#> SRR1033201 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033210 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033212 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 3 0.5585 0.7630 0.204 0.024 0.772
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.4887 0.7498 0.000 0.228 0.772
#> SRR1033217 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033225 2 0.3816 0.7964 0.000 0.852 0.148
#> SRR1033224 1 0.1643 0.9233 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033226 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.3502 0.8536 0.896 0.020 0.084
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033237 3 0.4915 0.8147 0.012 0.184 0.804
#> SRR1033238 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033239 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033242 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 3 0.0592 0.8878 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033247 2 0.4883 0.7115 0.004 0.788 0.208
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0424 0.9601 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 3 0.5792 0.7688 0.192 0.036 0.772
#> SRR1033259 1 0.0592 0.9567 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.6754 0.1106 0.556 0.012 0.432
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.4390 0.8352 0.012 0.148 0.840
#> SRR1033267 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 3 0.5955 0.7740 0.180 0.048 0.772
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9388 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 3 0.5551 0.7567 0.212 0.020 0.768
#> SRR1033278 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1033279 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9656 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1033283 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1033284 3 0.5315 0.7932 0.012 0.216 0.772
#> SRR1033285 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 3 0.0000 0.8914 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.0817 0.9591 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1032911 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032912 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032913 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032914 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032915 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032916 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032917 3 0.0469 0.9348 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032918 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032919 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032920 2 0.1151 0.9243 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1032921 1 0.2868 0.8535 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1032922 3 0.3942 0.7162 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1032923 4 0.0707 0.9618 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032926 4 0.4072 0.6509 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1032927 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032929 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032928 4 0.1022 0.9521 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1032930 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.4332 0.8061 0.000 0.816 0.112 0.072
#> SRR1032933 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032934 4 0.1118 0.9487 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1032935 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032936 3 0.4250 0.6680 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.3024 0.8413 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1032939 3 0.2345 0.8819 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1032940 4 0.0707 0.9617 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1032941 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032942 2 0.3899 0.8226 0.000 0.840 0.108 0.052
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.1792 0.9118 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1032945 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032946 4 0.0937 0.9583 0.012 0.000 0.012 0.976
#> SRR1032947 4 0.0707 0.9618 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1032948 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 3 0.4193 0.6682 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR1032951 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032952 4 0.0817 0.9591 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1032953 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032954 1 0.3718 0.8041 0.820 0.000 0.012 0.168
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032956 1 0.3074 0.8370 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1032958 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032959 4 0.1854 0.9259 0.048 0.000 0.012 0.940
#> SRR1032960 4 0.0817 0.9591 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1032961 1 0.3123 0.8327 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1032962 3 0.2021 0.9063 0.000 0.024 0.936 0.040
#> SRR1032963 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032964 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032965 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032966 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032967 2 0.5383 0.7901 0.056 0.784 0.108 0.052
#> SRR1032968 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032969 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032970 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032971 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032972 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032973 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032974 1 0.5204 0.4200 0.612 0.000 0.012 0.376
#> SRR1032975 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032976 4 0.2345 0.8782 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1032977 2 0.4332 0.8061 0.000 0.816 0.112 0.072
#> SRR1032978 1 0.1940 0.9057 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032981 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032982 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032983 4 0.2704 0.8492 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1032984 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032985 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032986 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032990 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032989 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.4072 0.6929 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1032993 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032994 3 0.1716 0.9123 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1032995 1 0.4485 0.6854 0.740 0.000 0.012 0.248
#> SRR1032996 4 0.0817 0.9591 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1032997 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032998 3 0.4605 0.5442 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.4332 0.8061 0.000 0.816 0.112 0.072
#> SRR1033001 4 0.0817 0.9591 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033002 3 0.5367 0.5624 0.032 0.000 0.664 0.304
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0921 0.9558 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1033006 3 0.1792 0.9048 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1033007 3 0.1940 0.9045 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.1557 0.9205 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033010 4 0.4304 0.5898 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0336 0.9355 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033014 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033015 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033019 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033020 3 0.1118 0.9265 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033021 3 0.1302 0.9232 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0336 0.9355 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033025 1 0.0188 0.9526 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033026 3 0.0336 0.9355 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.2081 0.8940 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1033029 2 0.1151 0.9243 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1033030 3 0.0188 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033031 1 0.0188 0.9518 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033032 3 0.1661 0.9144 0.000 0.004 0.944 0.052
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.1305 0.9224 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033039 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033040 3 0.0469 0.9348 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.2921 0.8497 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033044 1 0.0188 0.9526 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033045 3 0.0707 0.9326 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033046 3 0.1022 0.9284 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033047 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033048 3 0.1022 0.9284 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0469 0.9270 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033056 3 0.1118 0.9265 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0188 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.1022 0.9284 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033061 2 0.5569 0.5791 0.000 0.660 0.296 0.044
#> SRR1033062 3 0.1389 0.9186 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.2011 0.9025 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033068 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033069 3 0.2319 0.8967 0.000 0.036 0.924 0.040
#> SRR1033070 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.4017 0.7919 0.000 0.128 0.828 0.044
#> SRR1033073 3 0.0469 0.9270 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033074 1 0.2216 0.8926 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033075 3 0.1302 0.9225 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1033076 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033077 1 0.3266 0.8191 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033080 3 0.0336 0.9298 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033081 3 0.1389 0.9211 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0707 0.9336 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033086 2 0.5546 0.5867 0.000 0.664 0.292 0.044
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0707 0.9270 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033089 3 0.1792 0.9101 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1033090 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033091 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033092 1 0.0707 0.9388 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0188 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033097 2 0.2060 0.8934 0.000 0.932 0.052 0.016
#> SRR1033098 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0469 0.9348 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0336 0.9355 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 3 0.1022 0.9284 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033107 3 0.0469 0.9348 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033108 4 0.3217 0.8358 0.128 0.000 0.012 0.860
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0336 0.9297 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0469 0.9348 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9342 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.3400 0.7991 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033120 2 0.5936 0.3929 0.000 0.576 0.380 0.044
#> SRR1033122 3 0.1716 0.9111 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.2443 0.8944 0.000 0.024 0.916 0.060
#> SRR1033129 3 0.0469 0.9348 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 3 0.1211 0.9245 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1033131 1 0.5203 0.2396 0.576 0.000 0.416 0.008
#> SRR1033132 3 0.0188 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033133 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033134 1 0.1474 0.9232 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033135 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033139 3 0.2319 0.8967 0.000 0.036 0.924 0.040
#> SRR1033138 3 0.0817 0.9274 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1033140 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033141 3 0.1211 0.9254 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033146 1 0.1767 0.9119 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1033147 3 0.1798 0.9121 0.000 0.016 0.944 0.040
#> SRR1033148 1 0.3024 0.8413 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033149 3 0.0592 0.9273 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033150 3 0.1022 0.9284 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033151 3 0.0188 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033152 3 0.1118 0.9265 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033153 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0336 0.9355 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033160 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033161 1 0.4284 0.7246 0.764 0.000 0.012 0.224
#> SRR1033163 3 0.0188 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.1677 0.9147 0.000 0.012 0.948 0.040
#> SRR1033165 3 0.1389 0.9216 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1033166 1 0.2831 0.8270 0.876 0.000 0.120 0.004
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.2021 0.9063 0.000 0.024 0.936 0.040
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0592 0.9340 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.1004 0.9263 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0188 0.9518 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033183 3 0.4477 0.5854 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1033182 3 0.1022 0.9284 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033184 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 3 0.1118 0.9265 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033186 3 0.5281 0.1457 0.464 0.000 0.528 0.008
#> SRR1033188 3 0.2281 0.8882 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1033189 2 0.6396 0.0876 0.000 0.468 0.468 0.064
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.2411 0.8933 0.000 0.040 0.920 0.040
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.5569 0.5791 0.000 0.660 0.296 0.044
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0336 0.9342 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.4019 0.7670 0.792 0.000 0.012 0.196
#> SRR1033201 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033202 3 0.0469 0.9348 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033203 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0469 0.9348 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033209 3 0.1022 0.9284 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033210 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033211 3 0.1118 0.9265 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033212 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.5300 0.2639 0.408 0.000 0.012 0.580
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.2443 0.8943 0.000 0.024 0.916 0.060
#> SRR1033217 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0921 0.9296 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1033225 2 0.4609 0.7721 0.000 0.788 0.156 0.056
#> SRR1033224 1 0.3047 0.8616 0.872 0.000 0.012 0.116
#> SRR1033226 3 0.0707 0.9328 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033227 3 0.0188 0.9350 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.3895 0.7836 0.804 0.000 0.012 0.184
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 3 0.1940 0.9009 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033236 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033237 4 0.1211 0.9445 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1033238 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033240 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033239 3 0.1118 0.9265 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033242 3 0.2868 0.8416 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1033241 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 3 0.1474 0.9195 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1033247 2 0.6657 0.4376 0.028 0.576 0.352 0.044
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0921 0.9390 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.1938 0.9217 0.052 0.000 0.012 0.936
#> SRR1033259 1 0.2921 0.8500 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0336 0.9355 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033262 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3539 0.8050 0.820 0.000 0.004 0.176
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.4040 0.7020 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1033267 3 0.0000 0.9342 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033270 3 0.0336 0.9355 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9421 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.5174 0.3799 0.368 0.000 0.012 0.620
#> SRR1033278 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033279 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033280 3 0.0188 0.9358 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9547 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033283 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033284 4 0.0469 0.9665 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033285 3 0.4679 0.5077 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1033286 3 0.4661 0.5164 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1033287 3 0.4679 0.5077 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1033288 3 0.4624 0.5333 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1033289 3 0.4643 0.5250 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1033290 3 0.4643 0.5250 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1033291 3 0.4933 0.3028 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1033292 3 0.4955 0.2658 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR1033293 3 0.4948 0.2783 0.000 0.000 0.560 0.440
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.2491 0.7976 0.000 0.000 0.036 0.896 0.068
#> SRR1032911 4 0.2280 0.7835 0.000 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1032912 4 0.0798 0.8137 0.000 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1032913 4 0.0290 0.8138 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1032914 4 0.0290 0.8138 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1032915 4 0.1557 0.8040 0.000 0.000 0.008 0.940 0.052
#> SRR1032916 4 0.1281 0.8122 0.000 0.000 0.012 0.956 0.032
#> SRR1032917 3 0.1502 0.6727 0.000 0.000 0.940 0.056 0.004
#> SRR1032918 4 0.2377 0.7808 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1032919 4 0.0807 0.8113 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1032920 2 0.2124 0.8933 0.000 0.900 0.004 0.000 0.096
#> SRR1032921 1 0.4212 0.8200 0.776 0.000 0.000 0.080 0.144
#> SRR1032922 5 0.5810 0.6054 0.000 0.000 0.212 0.176 0.612
#> SRR1032923 4 0.2450 0.7889 0.000 0.000 0.048 0.900 0.052
#> SRR1032925 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032924 4 0.2648 0.7714 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1032926 4 0.4337 0.6080 0.000 0.000 0.196 0.748 0.056
#> SRR1032927 4 0.2648 0.7714 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1032929 4 0.2471 0.7782 0.000 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1032928 4 0.2423 0.7822 0.000 0.000 0.080 0.896 0.024
#> SRR1032930 4 0.0807 0.8113 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1032931 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032932 2 0.4860 0.7673 0.000 0.764 0.064 0.044 0.128
#> SRR1032933 4 0.2648 0.7714 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1032934 4 0.4164 0.7192 0.000 0.000 0.096 0.784 0.120
#> SRR1032935 4 0.2690 0.7699 0.000 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1032936 4 0.5341 0.3854 0.000 0.000 0.300 0.620 0.080
#> SRR1032937 2 0.0290 0.9484 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1032938 1 0.4437 0.8022 0.760 0.000 0.000 0.100 0.140
#> SRR1032939 5 0.5565 0.6389 0.000 0.000 0.216 0.144 0.640
#> SRR1032940 4 0.1818 0.8059 0.000 0.000 0.044 0.932 0.024
#> SRR1032941 4 0.0579 0.8143 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1032942 2 0.4167 0.7863 0.000 0.792 0.064 0.008 0.136
#> SRR1032943 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032944 1 0.3237 0.8827 0.848 0.000 0.000 0.048 0.104
#> SRR1032945 4 0.0798 0.8129 0.000 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR1032946 4 0.2833 0.7844 0.004 0.000 0.012 0.864 0.120
#> SRR1032947 4 0.1774 0.8024 0.000 0.000 0.052 0.932 0.016
#> SRR1032948 4 0.0451 0.8146 0.000 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1032949 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032950 5 0.6108 0.5541 0.000 0.000 0.208 0.224 0.568
#> SRR1032951 4 0.2690 0.7703 0.000 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1032952 4 0.1741 0.8103 0.000 0.000 0.040 0.936 0.024
#> SRR1032953 4 0.2773 0.7658 0.000 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1032954 1 0.4334 0.8105 0.768 0.000 0.000 0.092 0.140
#> SRR1032955 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032957 4 0.0807 0.8113 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1032956 1 0.4280 0.8155 0.772 0.000 0.000 0.088 0.140
#> SRR1032958 4 0.1205 0.8064 0.000 0.000 0.004 0.956 0.040
#> SRR1032959 4 0.4808 0.6688 0.108 0.000 0.000 0.724 0.168
#> SRR1032960 4 0.0963 0.8101 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1032961 1 0.4376 0.8089 0.764 0.000 0.000 0.092 0.144
#> SRR1032962 5 0.4451 0.6015 0.000 0.040 0.248 0.000 0.712
#> SRR1032963 4 0.1281 0.8122 0.000 0.000 0.012 0.956 0.032
#> SRR1032964 4 0.1106 0.8127 0.000 0.000 0.012 0.964 0.024
#> SRR1032965 4 0.2605 0.7734 0.000 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1032966 4 0.1205 0.8062 0.000 0.000 0.004 0.956 0.040
#> SRR1032967 2 0.5580 0.7332 0.048 0.728 0.064 0.016 0.144
#> SRR1032968 4 0.1195 0.8128 0.000 0.000 0.012 0.960 0.028
#> SRR1032969 4 0.1310 0.8119 0.000 0.000 0.024 0.956 0.020
#> SRR1032970 4 0.0451 0.8141 0.000 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1032971 4 0.0912 0.8120 0.000 0.000 0.012 0.972 0.016
#> SRR1032972 4 0.0566 0.8144 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1032973 4 0.0807 0.8113 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1032974 1 0.6038 0.5333 0.576 0.000 0.000 0.240 0.184
#> SRR1032975 4 0.0771 0.8120 0.000 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1032976 4 0.4307 0.6876 0.000 0.000 0.128 0.772 0.100
#> SRR1032977 2 0.4860 0.7673 0.000 0.764 0.064 0.044 0.128
#> SRR1032978 1 0.3825 0.8415 0.804 0.000 0.000 0.060 0.136
#> SRR1032979 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032980 4 0.1106 0.8128 0.000 0.000 0.012 0.964 0.024
#> SRR1032981 4 0.0912 0.8120 0.000 0.000 0.012 0.972 0.016
#> SRR1032982 4 0.0451 0.8141 0.000 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1032983 4 0.4036 0.6895 0.000 0.000 0.144 0.788 0.068
#> SRR1032984 4 0.0912 0.8120 0.000 0.000 0.012 0.972 0.016
#> SRR1032985 4 0.2605 0.7734 0.000 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1032986 4 0.1124 0.8080 0.000 0.000 0.004 0.960 0.036
#> SRR1032987 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032988 4 0.2648 0.7714 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1032990 3 0.4192 0.1707 0.000 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1032989 4 0.2732 0.7677 0.000 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1032991 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032992 5 0.6474 0.5070 0.000 0.000 0.240 0.264 0.496
#> SRR1032993 4 0.0404 0.8137 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1032994 5 0.5264 0.6779 0.000 0.000 0.256 0.092 0.652
#> SRR1032995 1 0.5631 0.6472 0.636 0.000 0.000 0.164 0.200
#> SRR1032996 4 0.1753 0.8096 0.000 0.000 0.032 0.936 0.032
#> SRR1032997 4 0.1106 0.8127 0.000 0.000 0.012 0.964 0.024
#> SRR1032998 5 0.6598 0.3072 0.000 0.000 0.212 0.376 0.412
#> SRR1032999 2 0.0794 0.9380 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033000 2 0.4860 0.7673 0.000 0.764 0.064 0.044 0.128
#> SRR1033001 4 0.2992 0.7860 0.000 0.000 0.064 0.868 0.068
#> SRR1033002 5 0.7714 0.4423 0.128 0.000 0.172 0.208 0.492
#> SRR1033003 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033004 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033005 4 0.2491 0.7963 0.000 0.000 0.068 0.896 0.036
#> SRR1033006 3 0.6443 -0.0360 0.000 0.000 0.444 0.376 0.180
#> SRR1033007 5 0.6802 0.3018 0.000 0.000 0.352 0.292 0.356
#> SRR1033008 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033009 1 0.3578 0.8529 0.820 0.000 0.000 0.048 0.132
#> SRR1033010 4 0.3705 0.7166 0.000 0.000 0.120 0.816 0.064
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033013 3 0.1740 0.6722 0.000 0.000 0.932 0.056 0.012
#> SRR1033014 3 0.0693 0.6851 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1033015 3 0.4182 0.1890 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.4138 0.2171 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1033019 3 0.0510 0.6835 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033020 5 0.4550 0.6871 0.000 0.000 0.276 0.036 0.688
#> SRR1033021 5 0.5045 0.6721 0.000 0.000 0.308 0.056 0.636
#> SRR1033023 1 0.0794 0.9123 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033022 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033024 3 0.0771 0.6849 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1033025 1 0.1205 0.9117 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033026 3 0.0898 0.6817 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.1914 0.7987 0.000 0.000 0.060 0.924 0.016
#> SRR1033029 2 0.2068 0.8959 0.000 0.904 0.004 0.000 0.092
#> SRR1033030 3 0.0451 0.6803 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033031 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033032 5 0.4919 0.6170 0.000 0.024 0.268 0.024 0.684
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1043 0.9116 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033036 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033037 1 0.1270 0.9078 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033038 1 0.2331 0.8689 0.900 0.000 0.020 0.000 0.080
#> SRR1033039 3 0.1341 0.6727 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033040 5 0.4283 0.6102 0.000 0.000 0.348 0.008 0.644
#> SRR1033041 1 0.1121 0.9097 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033042 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033043 1 0.3966 0.8353 0.796 0.000 0.000 0.072 0.132
#> SRR1033044 1 0.2011 0.8963 0.908 0.000 0.000 0.004 0.088
#> SRR1033045 3 0.3410 0.6113 0.000 0.000 0.840 0.092 0.068
#> SRR1033046 5 0.5014 0.5890 0.000 0.000 0.368 0.040 0.592
#> SRR1033047 3 0.3779 0.4824 0.000 0.000 0.752 0.012 0.236
#> SRR1033048 5 0.4603 0.6752 0.000 0.000 0.300 0.032 0.668
#> SRR1033049 1 0.1197 0.9126 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033051 1 0.1704 0.9034 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1033052 1 0.0609 0.9126 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.4182 0.1908 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1033050 1 0.1544 0.9046 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033055 3 0.0963 0.6796 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033056 5 0.5174 0.6356 0.000 0.000 0.340 0.056 0.604
#> SRR1033057 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033058 3 0.1331 0.6714 0.000 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 5 0.4546 0.6716 0.000 0.000 0.304 0.028 0.668
#> SRR1033061 2 0.5981 0.3925 0.000 0.540 0.108 0.004 0.348
#> SRR1033062 3 0.4519 0.4867 0.000 0.000 0.752 0.148 0.100
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1410 0.6715 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033065 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033066 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033067 1 0.3267 0.8661 0.844 0.000 0.000 0.044 0.112
#> SRR1033068 3 0.4171 0.1919 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033069 5 0.4602 0.5941 0.000 0.052 0.240 0.000 0.708
#> SRR1033070 3 0.4126 0.2397 0.000 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 5 0.5258 0.5355 0.000 0.104 0.232 0.000 0.664
#> SRR1033073 3 0.2583 0.6347 0.000 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR1033074 1 0.4170 0.8227 0.780 0.000 0.000 0.080 0.140
#> SRR1033075 5 0.5197 0.6603 0.000 0.000 0.316 0.064 0.620
#> SRR1033076 3 0.4219 0.1470 0.000 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033077 1 0.3893 0.8464 0.824 0.000 0.016 0.096 0.064
#> SRR1033078 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033079 3 0.1041 0.6830 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1033080 3 0.1626 0.6678 0.000 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR1033081 5 0.5275 0.6790 0.000 0.000 0.276 0.084 0.640
#> SRR1033082 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033083 3 0.0955 0.6805 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1033084 1 0.1043 0.9092 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033085 3 0.2871 0.6268 0.000 0.000 0.872 0.088 0.040
#> SRR1033086 2 0.5917 0.4203 0.000 0.552 0.104 0.004 0.340
#> SRR1033087 1 0.0794 0.9106 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033088 3 0.1997 0.6532 0.000 0.000 0.924 0.036 0.040
#> SRR1033089 4 0.5799 0.1402 0.000 0.000 0.416 0.492 0.092
#> SRR1033090 4 0.0807 0.8113 0.000 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1033091 3 0.1168 0.6862 0.000 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1033092 1 0.1041 0.9105 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.4171 0.1925 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.3730 0.4128 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1033097 2 0.4302 0.7028 0.000 0.720 0.032 0.000 0.248
#> SRR1033098 3 0.0566 0.6818 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.1697 0.6719 0.000 0.000 0.932 0.060 0.008
#> SRR1033102 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033103 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033104 3 0.1168 0.6818 0.000 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1033105 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033106 5 0.4526 0.6745 0.000 0.000 0.300 0.028 0.672
#> SRR1033107 3 0.1942 0.6688 0.000 0.000 0.920 0.068 0.012
#> SRR1033108 4 0.5792 0.5265 0.224 0.000 0.000 0.612 0.164
#> SRR1033109 1 0.0404 0.9123 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033110 3 0.4114 0.2440 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1033111 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033112 1 0.0963 0.9111 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033113 3 0.4219 0.1434 0.000 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033114 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033115 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033116 3 0.2416 0.6359 0.000 0.000 0.888 0.100 0.012
#> SRR1033117 3 0.2513 0.6246 0.000 0.000 0.876 0.116 0.008
#> SRR1033118 4 0.5423 0.2875 0.000 0.000 0.388 0.548 0.064
#> SRR1033119 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033121 3 0.1041 0.6806 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1033120 5 0.6119 0.3436 0.000 0.296 0.160 0.000 0.544
#> SRR1033122 4 0.5504 0.1586 0.000 0.000 0.448 0.488 0.064
#> SRR1033123 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033124 1 0.1043 0.9120 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033125 3 0.4383 0.1038 0.000 0.000 0.572 0.004 0.424
#> SRR1033126 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033127 3 0.6024 0.3568 0.000 0.108 0.684 0.092 0.116
#> SRR1033129 3 0.1408 0.6749 0.000 0.000 0.948 0.044 0.008
#> SRR1033128 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033130 5 0.4844 0.6874 0.000 0.000 0.280 0.052 0.668
#> SRR1033131 1 0.4020 0.7451 0.796 0.000 0.096 0.000 0.108
#> SRR1033132 3 0.4242 0.0917 0.000 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1033133 3 0.4650 -0.0938 0.000 0.000 0.520 0.012 0.468
#> SRR1033134 1 0.3269 0.8671 0.848 0.000 0.000 0.056 0.096
#> SRR1033135 3 0.1851 0.6563 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033136 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033137 3 0.4138 0.2315 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1033139 5 0.4495 0.5999 0.000 0.044 0.244 0.000 0.712
#> SRR1033138 5 0.3934 0.6092 0.008 0.000 0.276 0.000 0.716
#> SRR1033140 3 0.1197 0.6759 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033141 5 0.4691 0.6881 0.000 0.000 0.276 0.044 0.680
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1571 0.9054 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033144 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033145 3 0.3612 0.4510 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1033146 1 0.3003 0.8342 0.864 0.000 0.044 0.000 0.092
#> SRR1033147 5 0.4451 0.6015 0.000 0.040 0.248 0.000 0.712
#> SRR1033148 1 0.4238 0.8170 0.776 0.000 0.000 0.088 0.136
#> SRR1033149 3 0.1943 0.6554 0.000 0.000 0.924 0.056 0.020
#> SRR1033150 5 0.4661 0.6670 0.000 0.000 0.312 0.032 0.656
#> SRR1033151 3 0.4235 0.1198 0.000 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1033152 5 0.4854 0.6736 0.000 0.000 0.308 0.044 0.648
#> SRR1033153 5 0.4305 0.2419 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033154 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033156 3 0.1012 0.6834 0.000 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1033157 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0865 0.6831 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1033160 3 0.2329 0.6336 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033161 1 0.5190 0.7192 0.688 0.000 0.000 0.140 0.172
#> SRR1033163 3 0.4210 0.1501 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033162 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033164 5 0.4455 0.6042 0.000 0.036 0.260 0.000 0.704
#> SRR1033165 5 0.6778 0.3293 0.000 0.000 0.356 0.276 0.368
#> SRR1033166 1 0.3123 0.8078 0.828 0.000 0.012 0.000 0.160
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.4161 0.2028 0.000 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 5 0.4495 0.5999 0.000 0.044 0.244 0.000 0.712
#> SRR1033170 1 0.0703 0.9124 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033172 3 0.1915 0.6827 0.000 0.000 0.928 0.032 0.040
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.4675 0.4832 0.000 0.000 0.736 0.164 0.100
#> SRR1033175 1 0.1478 0.9053 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033176 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.2179 0.8903 0.000 0.896 0.004 0.000 0.100
#> SRR1033180 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033181 1 0.1043 0.9116 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033183 4 0.5504 0.0906 0.000 0.000 0.448 0.488 0.064
#> SRR1033182 5 0.4879 0.6796 0.020 0.000 0.276 0.024 0.680
#> SRR1033184 5 0.4306 0.2361 0.000 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1033185 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033187 5 0.5097 0.6605 0.000 0.000 0.320 0.056 0.624
#> SRR1033186 1 0.5435 0.3667 0.576 0.000 0.072 0.000 0.352
#> SRR1033188 5 0.6816 0.2908 0.000 0.000 0.340 0.308 0.352
#> SRR1033189 3 0.7635 0.0052 0.000 0.348 0.416 0.088 0.148
#> SRR1033190 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033191 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033192 5 0.4602 0.5941 0.000 0.052 0.240 0.000 0.708
#> SRR1033193 1 0.0703 0.9110 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033195 2 0.0963 0.9327 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033194 2 0.5822 0.4072 0.000 0.548 0.108 0.000 0.344
#> SRR1033197 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033196 3 0.4242 0.1047 0.000 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.2069 0.8982 0.912 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR1033200 1 0.4757 0.7706 0.732 0.000 0.000 0.120 0.148
#> SRR1033201 3 0.0579 0.6844 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1033202 3 0.3098 0.5810 0.000 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1033203 3 0.1908 0.6539 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033204 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033205 3 0.3814 0.3571 0.000 0.000 0.720 0.276 0.004
#> SRR1033206 1 0.1043 0.9092 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033207 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033208 3 0.0451 0.6819 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1033209 5 0.6472 0.4046 0.000 0.000 0.384 0.184 0.432
#> SRR1033210 3 0.0693 0.6803 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1033211 5 0.4623 0.6743 0.000 0.000 0.304 0.032 0.664
#> SRR1033212 3 0.1124 0.6804 0.000 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.6410 0.2635 0.476 0.000 0.000 0.340 0.184
#> SRR1033216 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033215 3 0.6316 0.3155 0.000 0.112 0.656 0.092 0.140
#> SRR1033217 3 0.4138 0.2248 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1033218 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033219 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033221 2 0.0162 0.9498 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.1270 0.9077 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033223 3 0.4900 -0.1606 0.000 0.000 0.512 0.024 0.464
#> SRR1033225 2 0.4920 0.7561 0.000 0.756 0.072 0.036 0.136
#> SRR1033224 1 0.4038 0.8290 0.792 0.000 0.000 0.080 0.128
#> SRR1033226 5 0.4457 0.5675 0.000 0.000 0.368 0.012 0.620
#> SRR1033227 3 0.3123 0.5039 0.000 0.000 0.812 0.184 0.004
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.4801 0.7685 0.728 0.000 0.000 0.124 0.148
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033232 4 0.6616 -0.1803 0.000 0.000 0.380 0.404 0.216
#> SRR1033233 1 0.1270 0.9078 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.2377 0.6287 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033236 3 0.3132 0.5839 0.000 0.000 0.820 0.008 0.172
#> SRR1033237 4 0.3971 0.7146 0.000 0.000 0.100 0.800 0.100
#> SRR1033238 3 0.0992 0.6860 0.000 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1033240 3 0.0671 0.6827 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1033239 5 0.4679 0.6627 0.000 0.000 0.316 0.032 0.652
#> SRR1033242 4 0.6184 0.0699 0.000 0.000 0.380 0.480 0.140
#> SRR1033241 3 0.1205 0.6776 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.4138 0.2235 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1033246 1 0.1478 0.9063 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033248 5 0.5171 0.6829 0.000 0.000 0.276 0.076 0.648
#> SRR1033247 5 0.6946 0.0278 0.044 0.380 0.104 0.004 0.468
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.3262 0.8651 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1033254 1 0.0880 0.9124 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.2891 0.5805 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033258 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033257 4 0.5816 0.5905 0.180 0.000 0.012 0.648 0.160
#> SRR1033259 1 0.3992 0.8316 0.796 0.000 0.000 0.080 0.124
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.1282 0.6798 0.000 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1033262 3 0.0807 0.6822 0.000 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4845 0.7625 0.724 0.000 0.000 0.128 0.148
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 5 0.6124 0.5748 0.000 0.000 0.236 0.200 0.564
#> SRR1033267 3 0.2793 0.6283 0.000 0.000 0.876 0.088 0.036
#> SRR1033268 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033269 3 0.4227 0.1210 0.000 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1033270 3 0.1408 0.6792 0.000 0.000 0.948 0.044 0.008
#> SRR1033271 1 0.1121 0.9086 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0162 0.9122 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033274 2 0.0963 0.9327 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033275 4 0.2648 0.7714 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.6386 0.2700 0.480 0.000 0.000 0.340 0.180
#> SRR1033278 4 0.0912 0.8112 0.000 0.000 0.016 0.972 0.012
#> SRR1033279 3 0.4249 0.0739 0.000 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033280 3 0.4192 0.1780 0.000 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1033281 1 0.0963 0.9116 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033282 4 0.0566 0.8144 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1033283 4 0.0566 0.8144 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1033284 4 0.0566 0.8144 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1033285 4 0.6240 0.0904 0.000 0.000 0.360 0.488 0.152
#> SRR1033286 4 0.6240 0.0904 0.000 0.000 0.360 0.488 0.152
#> SRR1033287 4 0.6240 0.0904 0.000 0.000 0.360 0.488 0.152
#> SRR1033288 4 0.6289 0.0724 0.000 0.000 0.356 0.484 0.160
#> SRR1033289 4 0.6240 0.0904 0.000 0.000 0.360 0.488 0.152
#> SRR1033290 4 0.6240 0.0904 0.000 0.000 0.360 0.488 0.152
#> SRR1033291 4 0.6185 0.1439 0.000 0.000 0.348 0.504 0.148
#> SRR1033292 4 0.6166 0.1641 0.000 0.000 0.340 0.512 0.148
#> SRR1033293 4 0.6175 0.1536 0.000 0.000 0.344 0.508 0.148
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.4554 0.64149 0.008 0.000 0.068 0.736 0.172 0.016
#> SRR1032911 4 0.3789 0.31454 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1032912 4 0.0458 0.71373 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032913 4 0.0713 0.71418 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1032914 4 0.0603 0.71447 0.000 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1032915 4 0.1429 0.71148 0.000 0.000 0.004 0.940 0.052 0.004
#> SRR1032916 4 0.0363 0.71299 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032917 3 0.0508 0.82727 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1032918 4 0.3915 0.30987 0.004 0.000 0.000 0.584 0.412 0.000
#> SRR1032919 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032920 2 0.3088 0.83135 0.000 0.832 0.000 0.000 0.048 0.120
#> SRR1032921 5 0.3403 0.75941 0.212 0.000 0.000 0.020 0.768 0.000
#> SRR1032922 6 0.4434 0.69420 0.000 0.000 0.128 0.056 0.056 0.760
#> SRR1032923 4 0.3984 0.66721 0.000 0.000 0.076 0.800 0.080 0.044
#> SRR1032925 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032924 4 0.3986 0.20774 0.004 0.000 0.000 0.532 0.464 0.000
#> SRR1032926 4 0.6083 0.43577 0.000 0.000 0.256 0.572 0.080 0.092
#> SRR1032927 4 0.3989 0.20552 0.004 0.000 0.000 0.528 0.468 0.000
#> SRR1032929 4 0.3961 0.25660 0.004 0.000 0.000 0.556 0.440 0.000
#> SRR1032928 4 0.3900 0.66060 0.000 0.000 0.088 0.796 0.096 0.020
#> SRR1032930 4 0.0547 0.71239 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032931 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032932 2 0.4973 0.74259 0.000 0.716 0.012 0.024 0.092 0.156
#> SRR1032933 4 0.3989 0.20552 0.004 0.000 0.000 0.528 0.468 0.000
#> SRR1032934 4 0.5364 0.59759 0.000 0.000 0.140 0.684 0.100 0.076
#> SRR1032935 4 0.3989 0.20552 0.004 0.000 0.000 0.528 0.468 0.000
#> SRR1032936 4 0.6381 0.32616 0.000 0.000 0.300 0.512 0.072 0.116
#> SRR1032937 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032938 5 0.3171 0.75631 0.204 0.000 0.000 0.012 0.784 0.000
#> SRR1032939 6 0.3886 0.70970 0.000 0.000 0.124 0.032 0.048 0.796
#> SRR1032940 4 0.1340 0.71099 0.000 0.000 0.008 0.948 0.040 0.004
#> SRR1032941 4 0.0547 0.71260 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032942 2 0.4308 0.76054 0.004 0.740 0.000 0.004 0.080 0.172
#> SRR1032943 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032944 1 0.3515 0.46295 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324 0.000
#> SRR1032945 4 0.0260 0.71404 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032946 5 0.4701 -0.04072 0.024 0.000 0.004 0.408 0.556 0.008
#> SRR1032947 4 0.2471 0.69395 0.000 0.000 0.056 0.888 0.052 0.004
#> SRR1032948 4 0.1910 0.67727 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1032949 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032950 6 0.5907 0.57414 0.000 0.000 0.148 0.164 0.068 0.620
#> SRR1032951 4 0.3986 0.20774 0.004 0.000 0.000 0.532 0.464 0.000
#> SRR1032952 4 0.3369 0.67764 0.000 0.000 0.072 0.832 0.084 0.012
#> SRR1032953 4 0.3986 0.20774 0.004 0.000 0.000 0.532 0.464 0.000
#> SRR1032954 5 0.4406 0.75972 0.224 0.000 0.000 0.080 0.696 0.000
#> SRR1032955 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032957 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032956 5 0.3290 0.75822 0.208 0.000 0.000 0.016 0.776 0.000
#> SRR1032958 4 0.0865 0.71223 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1032959 5 0.4634 0.40185 0.072 0.000 0.000 0.284 0.644 0.000
#> SRR1032960 4 0.3208 0.68054 0.000 0.000 0.068 0.844 0.076 0.012
#> SRR1032961 5 0.3345 0.76016 0.204 0.000 0.000 0.020 0.776 0.000
#> SRR1032962 6 0.1536 0.62281 0.000 0.004 0.016 0.000 0.040 0.940
#> SRR1032963 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032964 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032965 4 0.3982 0.21627 0.004 0.000 0.000 0.536 0.460 0.000
#> SRR1032966 4 0.0790 0.71143 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1032967 2 0.5212 0.69102 0.012 0.668 0.004 0.004 0.112 0.200
#> SRR1032968 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032969 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032970 4 0.0363 0.71316 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032971 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032972 4 0.0547 0.71358 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032973 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032974 5 0.4774 0.62911 0.136 0.000 0.000 0.192 0.672 0.000
#> SRR1032975 4 0.0632 0.71338 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032976 4 0.5724 0.53780 0.000 0.000 0.180 0.640 0.104 0.076
#> SRR1032977 2 0.4939 0.74633 0.000 0.720 0.012 0.024 0.092 0.152
#> SRR1032978 5 0.3872 0.49222 0.392 0.000 0.000 0.004 0.604 0.000
#> SRR1032979 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032980 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032981 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032982 4 0.0632 0.71343 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032983 4 0.5327 0.56968 0.000 0.000 0.180 0.672 0.096 0.052
#> SRR1032984 4 0.0547 0.71201 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032985 4 0.3986 0.20774 0.004 0.000 0.000 0.532 0.464 0.000
#> SRR1032986 4 0.0632 0.71359 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032987 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032988 4 0.3989 0.20552 0.004 0.000 0.000 0.528 0.468 0.000
#> SRR1032990 6 0.3937 0.55801 0.000 0.000 0.424 0.000 0.004 0.572
#> SRR1032989 4 0.3986 0.20774 0.004 0.000 0.000 0.532 0.464 0.000
#> SRR1032991 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032992 6 0.6730 0.33446 0.000 0.000 0.184 0.296 0.064 0.456
#> SRR1032993 4 0.0603 0.71447 0.000 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1032994 6 0.3903 0.72391 0.000 0.000 0.156 0.020 0.044 0.780
#> SRR1032995 5 0.4595 0.71566 0.168 0.000 0.000 0.136 0.696 0.000
#> SRR1032996 4 0.3406 0.67914 0.000 0.000 0.064 0.828 0.096 0.012
#> SRR1032997 4 0.0458 0.71264 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032998 6 0.7014 0.16584 0.000 0.000 0.184 0.324 0.088 0.404
#> SRR1032999 2 0.0820 0.91997 0.000 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033000 2 0.4939 0.74633 0.000 0.720 0.012 0.024 0.092 0.152
#> SRR1033001 4 0.3868 0.66145 0.000 0.000 0.096 0.792 0.100 0.012
#> SRR1033002 6 0.7307 0.49058 0.044 0.000 0.128 0.120 0.188 0.520
#> SRR1033003 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033004 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033005 4 0.3702 0.66907 0.000 0.000 0.088 0.812 0.080 0.020
#> SRR1033006 3 0.6426 0.26533 0.000 0.000 0.476 0.316 0.044 0.164
#> SRR1033007 6 0.6688 0.35772 0.000 0.000 0.264 0.272 0.040 0.424
#> SRR1033008 1 0.2823 0.76942 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1033009 5 0.3468 0.68963 0.284 0.000 0.000 0.004 0.712 0.000
#> SRR1033010 4 0.4311 0.60605 0.000 0.000 0.116 0.772 0.056 0.056
#> SRR1033011 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0146 0.85861 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033013 3 0.0508 0.82727 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033014 3 0.0363 0.82442 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033015 6 0.3907 0.58923 0.000 0.000 0.408 0.000 0.004 0.588
#> SRR1033016 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 6 0.3789 0.57255 0.000 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1033019 3 0.1075 0.80855 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033020 6 0.4059 0.72641 0.004 0.000 0.172 0.024 0.032 0.768
#> SRR1033021 6 0.4300 0.72233 0.000 0.000 0.176 0.032 0.044 0.748
#> SRR1033023 1 0.0260 0.85862 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0260 0.82720 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0547 0.85665 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033026 3 0.0405 0.82698 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033027 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.1857 0.70950 0.000 0.000 0.028 0.928 0.032 0.012
#> SRR1033029 2 0.2867 0.84268 0.000 0.848 0.000 0.000 0.040 0.112
#> SRR1033030 3 0.0870 0.82593 0.000 0.000 0.972 0.004 0.012 0.012
#> SRR1033031 1 0.0363 0.84872 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033032 6 0.2619 0.66236 0.000 0.000 0.072 0.008 0.040 0.880
#> SRR1033033 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0260 0.85837 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.3050 0.73093 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1033038 1 0.1701 0.79772 0.920 0.000 0.000 0.000 0.008 0.072
#> SRR1033039 3 0.2213 0.76161 0.000 0.000 0.888 0.008 0.004 0.100
#> SRR1033040 6 0.3250 0.72410 0.000 0.000 0.196 0.004 0.012 0.788
#> SRR1033041 1 0.2178 0.80535 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 5 0.3804 0.62220 0.336 0.000 0.000 0.008 0.656 0.000
#> SRR1033044 1 0.3607 0.49997 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348 0.000
#> SRR1033045 3 0.3807 0.71464 0.000 0.000 0.804 0.112 0.028 0.056
#> SRR1033046 6 0.4268 0.70175 0.000 0.000 0.256 0.016 0.028 0.700
#> SRR1033047 3 0.3993 0.40595 0.000 0.000 0.700 0.024 0.004 0.272
#> SRR1033048 6 0.3833 0.72789 0.000 0.000 0.180 0.020 0.028 0.772
#> SRR1033049 1 0.0363 0.85840 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033051 1 0.3175 0.70404 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1033052 1 0.1267 0.84706 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 6 0.4010 0.58948 0.000 0.000 0.408 0.000 0.008 0.584
#> SRR1033050 1 0.3428 0.60699 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1033055 3 0.1555 0.80520 0.000 0.000 0.932 0.004 0.004 0.060
#> SRR1033056 6 0.4877 0.70043 0.000 0.000 0.212 0.056 0.040 0.692
#> SRR1033057 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0881 0.82404 0.000 0.000 0.972 0.008 0.012 0.008
#> SRR1033059 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 6 0.3716 0.72692 0.000 0.000 0.176 0.016 0.028 0.780
#> SRR1033061 2 0.5076 0.38168 0.000 0.472 0.004 0.000 0.064 0.460
#> SRR1033062 3 0.4661 0.63753 0.000 0.000 0.744 0.116 0.048 0.092
#> SRR1033063 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1714 0.77640 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033065 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 5 0.3851 0.27868 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR1033068 6 0.3890 0.60245 0.000 0.000 0.400 0.000 0.004 0.596
#> SRR1033069 6 0.1555 0.61937 0.000 0.008 0.012 0.000 0.040 0.940
#> SRR1033070 6 0.3961 0.53709 0.000 0.000 0.440 0.000 0.004 0.556
#> SRR1033071 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 6 0.2490 0.58021 0.000 0.052 0.012 0.000 0.044 0.892
#> SRR1033073 3 0.3250 0.65875 0.000 0.000 0.788 0.004 0.012 0.196
#> SRR1033074 5 0.3298 0.73858 0.236 0.000 0.000 0.008 0.756 0.000
#> SRR1033075 6 0.4995 0.69808 0.000 0.000 0.188 0.068 0.048 0.696
#> SRR1033076 6 0.3841 0.62442 0.000 0.000 0.380 0.000 0.004 0.616
#> SRR1033077 1 0.4719 0.35670 0.592 0.000 0.000 0.008 0.360 0.040
#> SRR1033078 1 0.2762 0.77612 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033079 3 0.0146 0.82667 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.1059 0.81857 0.000 0.000 0.964 0.016 0.016 0.004
#> SRR1033081 6 0.4297 0.72366 0.000 0.000 0.168 0.032 0.048 0.752
#> SRR1033082 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.1531 0.78897 0.000 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1033084 1 0.2664 0.78572 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1033085 3 0.2893 0.76509 0.000 0.000 0.868 0.076 0.032 0.024
#> SRR1033086 2 0.5073 0.40759 0.000 0.484 0.004 0.000 0.064 0.448
#> SRR1033087 1 0.2697 0.78446 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1033088 3 0.2133 0.78700 0.000 0.000 0.912 0.016 0.020 0.052
#> SRR1033089 3 0.6217 0.13120 0.000 0.000 0.472 0.372 0.056 0.100
#> SRR1033090 4 0.0632 0.71379 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033091 3 0.1265 0.81783 0.000 0.000 0.948 0.008 0.000 0.044
#> SRR1033092 1 0.0363 0.85860 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 6 0.3944 0.55847 0.000 0.000 0.428 0.000 0.004 0.568
#> SRR1033095 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.4209 -0.07206 0.000 0.000 0.588 0.012 0.004 0.396
#> SRR1033097 2 0.4467 0.63671 0.000 0.632 0.000 0.000 0.048 0.320
#> SRR1033098 3 0.0436 0.82697 0.000 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033099 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0508 0.82784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033102 1 0.2854 0.76547 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0405 0.82714 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 6 0.3716 0.72692 0.000 0.000 0.176 0.016 0.028 0.780
#> SRR1033107 3 0.0692 0.82635 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1033108 5 0.4075 0.57142 0.076 0.000 0.000 0.184 0.740 0.000
#> SRR1033109 1 0.1387 0.84309 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033110 6 0.3979 0.50305 0.000 0.000 0.456 0.000 0.004 0.540
#> SRR1033111 1 0.0260 0.85881 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033112 1 0.1910 0.82049 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1033113 6 0.3684 0.62529 0.000 0.000 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1033114 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0951 0.82511 0.000 0.000 0.968 0.020 0.008 0.004
#> SRR1033117 3 0.1346 0.82069 0.000 0.000 0.952 0.024 0.016 0.008
#> SRR1033118 3 0.5963 0.10644 0.000 0.000 0.488 0.384 0.056 0.072
#> SRR1033119 1 0.0146 0.85846 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033121 3 0.1501 0.78510 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033120 6 0.3924 0.46173 0.000 0.164 0.012 0.000 0.052 0.772
#> SRR1033122 3 0.5179 0.49387 0.000 0.000 0.648 0.252 0.048 0.052
#> SRR1033123 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0790 0.85535 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033125 6 0.4026 0.63220 0.000 0.000 0.376 0.000 0.012 0.612
#> SRR1033126 1 0.0146 0.85491 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033127 3 0.6693 0.44093 0.000 0.116 0.604 0.056 0.084 0.140
#> SRR1033129 3 0.0653 0.82650 0.000 0.000 0.980 0.012 0.004 0.004
#> SRR1033128 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 6 0.4173 0.72486 0.004 0.000 0.168 0.032 0.032 0.764
#> SRR1033131 1 0.3842 0.63340 0.804 0.000 0.072 0.004 0.016 0.104
#> SRR1033132 6 0.3807 0.63716 0.000 0.000 0.368 0.000 0.004 0.628
#> SRR1033133 6 0.4302 0.64018 0.000 0.000 0.368 0.004 0.020 0.608
#> SRR1033134 5 0.4258 0.26748 0.468 0.000 0.000 0.016 0.516 0.000
#> SRR1033135 3 0.2100 0.74736 0.000 0.000 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1033136 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 6 0.3986 0.48390 0.000 0.000 0.464 0.000 0.004 0.532
#> SRR1033139 6 0.1536 0.62281 0.000 0.004 0.016 0.000 0.040 0.940
#> SRR1033138 6 0.1950 0.64040 0.016 0.000 0.032 0.000 0.028 0.924
#> SRR1033140 3 0.1663 0.77723 0.000 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033141 6 0.4162 0.72495 0.000 0.000 0.168 0.028 0.044 0.760
#> SRR1033142 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.3409 0.62044 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.3714 0.21960 0.000 0.000 0.656 0.000 0.004 0.340
#> SRR1033146 1 0.2623 0.73734 0.852 0.000 0.000 0.000 0.016 0.132
#> SRR1033147 6 0.1708 0.62871 0.000 0.004 0.024 0.000 0.040 0.932
#> SRR1033148 5 0.3201 0.75563 0.208 0.000 0.000 0.012 0.780 0.000
#> SRR1033149 3 0.0767 0.82264 0.000 0.000 0.976 0.008 0.012 0.004
#> SRR1033150 6 0.3749 0.72726 0.000 0.000 0.180 0.016 0.028 0.776
#> SRR1033151 6 0.3819 0.63062 0.000 0.000 0.372 0.000 0.004 0.624
#> SRR1033152 6 0.3988 0.72721 0.000 0.000 0.180 0.028 0.028 0.764
#> SRR1033153 6 0.3921 0.68431 0.000 0.000 0.308 0.004 0.012 0.676
#> SRR1033154 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0405 0.82698 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033157 1 0.0363 0.85836 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.1155 0.81426 0.000 0.000 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1033160 3 0.2562 0.67485 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033161 5 0.3490 0.75977 0.176 0.000 0.000 0.040 0.784 0.000
#> SRR1033163 6 0.3830 0.62958 0.000 0.000 0.376 0.000 0.004 0.620
#> SRR1033162 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 6 0.1938 0.63941 0.000 0.004 0.036 0.000 0.040 0.920
#> SRR1033165 6 0.6734 0.35180 0.000 0.000 0.276 0.280 0.040 0.404
#> SRR1033166 1 0.2489 0.71587 0.860 0.000 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1033167 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 6 0.3950 0.55058 0.000 0.000 0.432 0.000 0.004 0.564
#> SRR1033169 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 6 0.1536 0.62281 0.000 0.004 0.016 0.000 0.040 0.940
#> SRR1033170 1 0.1610 0.83984 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033172 3 0.2239 0.79360 0.000 0.000 0.900 0.020 0.008 0.072
#> SRR1033173 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.4556 0.65638 0.000 0.000 0.748 0.120 0.036 0.096
#> SRR1033175 1 0.3101 0.72172 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.3023 0.83411 0.000 0.836 0.000 0.000 0.044 0.120
#> SRR1033180 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.5646 0.25323 0.000 0.000 0.516 0.380 0.036 0.068
#> SRR1033182 6 0.4169 0.72400 0.020 0.000 0.168 0.016 0.028 0.768
#> SRR1033184 6 0.3468 0.69380 0.000 0.000 0.284 0.000 0.004 0.712
#> SRR1033185 1 0.0146 0.85819 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033187 6 0.4429 0.72003 0.000 0.000 0.192 0.040 0.036 0.732
#> SRR1033186 1 0.4114 0.30794 0.628 0.000 0.008 0.000 0.008 0.356
#> SRR1033188 6 0.6674 0.35387 0.000 0.000 0.252 0.280 0.040 0.428
#> SRR1033189 2 0.8026 0.16728 0.000 0.364 0.300 0.064 0.100 0.172
#> SRR1033190 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 6 0.1555 0.61937 0.000 0.008 0.012 0.000 0.040 0.940
#> SRR1033193 1 0.2631 0.78823 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1033195 2 0.1528 0.89933 0.000 0.936 0.000 0.000 0.016 0.048
#> SRR1033194 2 0.5076 0.38183 0.000 0.472 0.004 0.000 0.064 0.460
#> SRR1033197 1 0.0146 0.85819 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033196 6 0.3782 0.64246 0.000 0.000 0.360 0.000 0.004 0.636
#> SRR1033199 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.3937 0.19011 0.572 0.000 0.000 0.004 0.424 0.000
#> SRR1033200 5 0.5113 0.74425 0.260 0.000 0.000 0.080 0.640 0.020
#> SRR1033201 3 0.0363 0.82463 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033202 3 0.1584 0.79911 0.000 0.000 0.928 0.064 0.008 0.000
#> SRR1033203 3 0.2442 0.71170 0.000 0.000 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1033204 1 0.2793 0.77296 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033205 3 0.2849 0.74449 0.000 0.000 0.864 0.084 0.044 0.008
#> SRR1033206 1 0.2730 0.77951 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1033207 1 0.2823 0.76935 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.82544 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 6 0.6418 0.49430 0.000 0.000 0.276 0.192 0.040 0.492
#> SRR1033210 3 0.0260 0.82540 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033211 6 0.3912 0.72761 0.000 0.000 0.180 0.024 0.028 0.768
#> SRR1033212 3 0.0551 0.82693 0.000 0.000 0.984 0.004 0.004 0.008
#> SRR1033213 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 5 0.4003 0.67526 0.116 0.000 0.000 0.124 0.760 0.000
#> SRR1033216 1 0.2793 0.77296 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033215 3 0.6906 0.41177 0.000 0.116 0.576 0.052 0.092 0.164
#> SRR1033217 6 0.4072 0.51863 0.000 0.000 0.448 0.000 0.008 0.544
#> SRR1033218 1 0.2793 0.77296 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033219 1 0.2762 0.77612 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033221 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.2793 0.77301 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033223 6 0.3969 0.65776 0.000 0.000 0.344 0.004 0.008 0.644
#> SRR1033225 2 0.5015 0.74379 0.000 0.716 0.016 0.024 0.088 0.156
#> SRR1033224 5 0.5065 0.66586 0.340 0.000 0.000 0.092 0.568 0.000
#> SRR1033226 6 0.3314 0.71815 0.000 0.000 0.224 0.000 0.012 0.764
#> SRR1033227 3 0.2209 0.77261 0.000 0.000 0.900 0.072 0.024 0.004
#> SRR1033229 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 5 0.4473 0.75159 0.252 0.000 0.000 0.072 0.676 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.2762 0.77612 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033232 4 0.7087 -0.06923 0.000 0.000 0.328 0.348 0.072 0.252
#> SRR1033233 1 0.2912 0.75609 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.3043 0.61950 0.000 0.000 0.796 0.004 0.004 0.196
#> SRR1033236 3 0.3622 0.56719 0.000 0.000 0.760 0.024 0.004 0.212
#> SRR1033237 4 0.5586 0.57195 0.000 0.000 0.144 0.664 0.096 0.096
#> SRR1033238 3 0.0767 0.82756 0.000 0.000 0.976 0.008 0.004 0.012
#> SRR1033240 3 0.0146 0.82667 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033239 6 0.3757 0.72761 0.000 0.000 0.180 0.020 0.024 0.776
#> SRR1033242 4 0.6955 -0.01462 0.000 0.000 0.348 0.364 0.064 0.224
#> SRR1033241 3 0.1531 0.78980 0.000 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1033244 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 6 0.4057 0.54178 0.000 0.000 0.436 0.000 0.008 0.556
#> SRR1033246 1 0.3175 0.70324 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1033248 6 0.4820 0.70403 0.000 0.000 0.172 0.064 0.048 0.716
#> SRR1033247 6 0.5269 0.26631 0.040 0.236 0.004 0.000 0.064 0.656
#> SRR1033249 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0146 0.85846 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 5 0.3804 0.41805 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1033254 1 0.2416 0.80472 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.3586 0.41294 0.000 0.000 0.712 0.004 0.004 0.280
#> SRR1033258 1 0.2793 0.77318 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033257 5 0.4271 0.51786 0.052 0.000 0.008 0.188 0.744 0.008
#> SRR1033259 5 0.4400 0.56570 0.376 0.000 0.000 0.032 0.592 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0363 0.82748 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0405 0.82694 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1033263 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 5 0.4006 0.73430 0.252 0.000 0.000 0.020 0.716 0.012
#> SRR1033265 2 0.0146 0.93199 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033266 6 0.5754 0.59938 0.000 0.000 0.168 0.116 0.076 0.640
#> SRR1033267 3 0.3043 0.77968 0.000 0.000 0.860 0.064 0.020 0.056
#> SRR1033268 1 0.0000 0.85788 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 6 0.3830 0.62888 0.000 0.000 0.376 0.000 0.004 0.620
#> SRR1033270 3 0.0363 0.82748 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.2762 0.77612 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.1863 0.82864 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1033274 2 0.0972 0.91530 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1033275 4 0.4177 0.17589 0.012 0.000 0.000 0.520 0.468 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.93291 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 5 0.3992 0.65575 0.104 0.000 0.000 0.136 0.760 0.000
#> SRR1033278 4 0.0951 0.71414 0.000 0.000 0.008 0.968 0.020 0.004
#> SRR1033279 6 0.3795 0.64379 0.000 0.000 0.364 0.000 0.004 0.632
#> SRR1033280 6 0.3872 0.61242 0.000 0.000 0.392 0.000 0.004 0.604
#> SRR1033281 1 0.0363 0.85872 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033282 4 0.1531 0.70952 0.000 0.000 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR1033283 4 0.1471 0.71030 0.000 0.000 0.000 0.932 0.064 0.004
#> SRR1033284 4 0.1531 0.70952 0.000 0.000 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR1033285 4 0.6954 -0.00516 0.000 0.000 0.344 0.368 0.064 0.224
#> SRR1033286 4 0.6954 -0.00516 0.000 0.000 0.344 0.368 0.064 0.224
#> SRR1033287 4 0.6954 -0.00516 0.000 0.000 0.344 0.368 0.064 0.224
#> SRR1033288 4 0.6963 -0.01061 0.000 0.000 0.340 0.368 0.064 0.228
#> SRR1033289 4 0.6954 -0.00516 0.000 0.000 0.344 0.368 0.064 0.224
#> SRR1033290 4 0.6981 -0.00124 0.000 0.000 0.344 0.368 0.068 0.220
#> SRR1033291 4 0.6967 0.01734 0.000 0.000 0.340 0.376 0.068 0.216
#> SRR1033292 4 0.6967 0.01734 0.000 0.000 0.340 0.376 0.068 0.216
#> SRR1033293 4 0.6967 0.01734 0.000 0.000 0.340 0.376 0.068 0.216
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.812 0.881 0.952 0.4845 0.513 0.513
#> 3 3 0.597 0.762 0.866 0.3463 0.787 0.601
#> 4 4 0.624 0.673 0.829 0.0971 0.903 0.736
#> 5 5 0.623 0.708 0.821 0.0535 0.895 0.678
#> 6 6 0.620 0.544 0.729 0.0470 0.934 0.765
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032917 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032920 1 0.9358 0.4352 0.648 0.352
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.9358 0.4582 0.352 0.648
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.9248 0.4694 0.660 0.340
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0376 0.9530 0.996 0.004
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.9993 0.0773 0.484 0.516
#> SRR1032932 1 0.2043 0.9286 0.968 0.032
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032936 2 0.9661 0.3883 0.392 0.608
#> SRR1032937 1 0.3584 0.8922 0.932 0.068
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.2236 0.9256 0.964 0.036
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032943 1 0.9970 0.0940 0.532 0.468
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.5842 0.8115 0.860 0.140
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032949 1 0.8327 0.6173 0.736 0.264
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.9850 0.2615 0.428 0.572
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0376 0.9331 0.004 0.996
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.1633 0.9363 0.976 0.024
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.5059 0.8500 0.888 0.112
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.9044 0.5291 0.320 0.680
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0376 0.9530 0.996 0.004
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.2948 0.9100 0.948 0.052
#> SRR1032984 1 0.0376 0.9530 0.996 0.004
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0376 0.9329 0.004 0.996
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032990 2 0.9248 0.5093 0.340 0.660
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.7815 0.6822 0.232 0.768
#> SRR1032992 1 0.2043 0.9293 0.968 0.032
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.2236 0.9257 0.964 0.036
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1032999 1 0.0376 0.9529 0.996 0.004
#> SRR1033000 1 0.2423 0.9232 0.960 0.040
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033003 1 0.9775 0.2755 0.588 0.412
#> SRR1033004 2 0.0938 0.9276 0.012 0.988
#> SRR1033005 1 0.0376 0.9530 0.996 0.004
#> SRR1033006 2 0.5629 0.8253 0.132 0.868
#> SRR1033007 1 0.8327 0.6238 0.736 0.264
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033010 2 0.8144 0.6704 0.252 0.748
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033013 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033014 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033015 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033018 2 0.0376 0.9331 0.004 0.996
#> SRR1033019 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.8207 0.6379 0.744 0.256
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033024 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033026 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033028 2 0.9881 0.2649 0.436 0.564
#> SRR1033029 1 0.1184 0.9429 0.984 0.016
#> SRR1033030 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033032 2 0.9710 0.3730 0.400 0.600
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033039 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033040 1 0.7815 0.6810 0.768 0.232
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033045 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033046 2 0.9933 0.2138 0.452 0.548
#> SRR1033047 2 0.1414 0.9229 0.020 0.980
#> SRR1033048 1 0.9044 0.5146 0.680 0.320
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033054 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033055 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.5408 0.8316 0.876 0.124
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033058 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033062 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033064 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033068 2 0.1414 0.9229 0.020 0.980
#> SRR1033069 2 0.5737 0.8209 0.136 0.864
#> SRR1033070 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0938 0.9464 0.988 0.012
#> SRR1033076 2 0.2423 0.9082 0.040 0.960
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033079 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033080 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033083 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033085 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033088 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033089 2 0.7219 0.7456 0.200 0.800
#> SRR1033090 1 0.4562 0.8638 0.904 0.096
#> SRR1033091 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033096 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033098 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033101 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033104 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033107 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033110 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033113 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033116 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033117 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033118 2 0.9286 0.5013 0.344 0.656
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033121 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033122 2 0.7453 0.7293 0.212 0.788
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033125 2 0.0672 0.9308 0.008 0.992
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033129 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033132 2 0.0938 0.9283 0.012 0.988
#> SRR1033133 2 0.7745 0.7065 0.228 0.772
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033135 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033137 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033140 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033145 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.9323 0.4518 0.652 0.348
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033149 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033151 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.7139 0.7367 0.804 0.196
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033156 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033159 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033160 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033163 2 0.0938 0.9283 0.012 0.988
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.5059 0.8452 0.112 0.888
#> SRR1033165 1 0.9732 0.3001 0.596 0.404
#> SRR1033166 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0376 0.9329 0.004 0.996
#> SRR1033168 2 0.6623 0.7803 0.172 0.828
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033172 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033174 2 0.0938 0.9283 0.012 0.988
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.1633 0.9186 0.024 0.976
#> SRR1033179 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033183 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033184 2 0.9635 0.3989 0.388 0.612
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.9323 0.4500 0.652 0.348
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.9996 0.0885 0.488 0.512
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033196 2 0.7674 0.7128 0.224 0.776
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033201 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033202 2 0.0376 0.9331 0.004 0.996
#> SRR1033203 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033205 2 0.1843 0.9172 0.028 0.972
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033208 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033209 2 0.9754 0.3457 0.408 0.592
#> SRR1033210 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033212 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033217 2 0.2948 0.8985 0.052 0.948
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0376 0.9329 0.004 0.996
#> SRR1033220 2 0.0376 0.9329 0.004 0.996
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033223 2 0.9358 0.4838 0.352 0.648
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.9608 0.3568 0.616 0.384
#> SRR1033227 2 0.3431 0.8886 0.064 0.936
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033232 2 0.9977 0.1454 0.472 0.528
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033234 2 0.0376 0.9331 0.004 0.996
#> SRR1033236 2 0.2236 0.9112 0.036 0.964
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033238 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033240 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033242 2 0.9460 0.4566 0.364 0.636
#> SRR1033241 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033245 2 0.7528 0.7238 0.216 0.784
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033247 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033255 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033261 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033262 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033267 2 0.5946 0.8123 0.144 0.856
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033269 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033270 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9352 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0376 0.9530 0.996 0.004
#> SRR1033279 2 0.8499 0.6308 0.276 0.724
#> SRR1033280 2 0.6048 0.8078 0.148 0.852
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.9561 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.9580 0.3680 0.620 0.380
#> SRR1033286 1 0.9775 0.2761 0.588 0.412
#> SRR1033287 1 0.9522 0.3893 0.628 0.372
#> SRR1033288 1 0.9661 0.3347 0.608 0.392
#> SRR1033289 1 0.9795 0.2635 0.584 0.416
#> SRR1033290 1 0.9944 0.1279 0.544 0.456
#> SRR1033291 1 0.9460 0.4100 0.636 0.364
#> SRR1033292 1 0.8861 0.5462 0.696 0.304
#> SRR1033293 1 0.9358 0.4395 0.648 0.352
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 2 0.2878 0.8533 0.096 0.904 0.000
#> SRR1032911 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032912 2 0.2625 0.8564 0.084 0.916 0.000
#> SRR1032913 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032914 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032915 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032916 2 0.2537 0.8555 0.080 0.920 0.000
#> SRR1032917 3 0.2356 0.8580 0.000 0.072 0.928
#> SRR1032918 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032919 2 0.2590 0.8529 0.072 0.924 0.004
#> SRR1032920 1 0.7673 0.5372 0.664 0.236 0.100
#> SRR1032921 1 0.2796 0.8303 0.908 0.092 0.000
#> SRR1032922 1 0.6252 0.3132 0.556 0.444 0.000
#> SRR1032923 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032925 3 0.9998 0.0396 0.324 0.336 0.340
#> SRR1032924 2 0.2878 0.8533 0.096 0.904 0.000
#> SRR1032926 2 0.3356 0.8231 0.036 0.908 0.056
#> SRR1032927 2 0.2711 0.8559 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032929 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032928 2 0.2955 0.8552 0.080 0.912 0.008
#> SRR1032930 2 0.2537 0.8555 0.080 0.920 0.000
#> SRR1032931 2 0.9961 0.0240 0.332 0.372 0.296
#> SRR1032932 2 0.7184 0.5224 0.240 0.688 0.072
#> SRR1032933 2 0.2959 0.8504 0.100 0.900 0.000
#> SRR1032934 2 0.2959 0.8507 0.100 0.900 0.000
#> SRR1032935 2 0.2878 0.8533 0.096 0.904 0.000
#> SRR1032936 2 0.6082 0.5943 0.012 0.692 0.296
#> SRR1032937 1 0.5529 0.5943 0.704 0.296 0.000
#> SRR1032938 1 0.3686 0.8066 0.860 0.140 0.000
#> SRR1032939 1 0.6155 0.5732 0.664 0.328 0.008
#> SRR1032940 2 0.2998 0.8500 0.068 0.916 0.016
#> SRR1032941 2 0.2625 0.8564 0.084 0.916 0.000
#> SRR1032942 1 0.3816 0.7529 0.852 0.148 0.000
#> SRR1032943 1 0.9880 0.0936 0.400 0.332 0.268
#> SRR1032944 1 0.0892 0.8365 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032945 2 0.2625 0.8564 0.084 0.916 0.000
#> SRR1032946 2 0.3038 0.8470 0.104 0.896 0.000
#> SRR1032947 2 0.3141 0.8489 0.068 0.912 0.020
#> SRR1032948 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032949 1 0.9074 0.2569 0.500 0.352 0.148
#> SRR1032950 2 0.6225 0.1501 0.432 0.568 0.000
#> SRR1032951 2 0.2878 0.8457 0.096 0.904 0.000
#> SRR1032952 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032953 2 0.3116 0.8386 0.108 0.892 0.000
#> SRR1032954 1 0.5785 0.5678 0.668 0.332 0.000
#> SRR1032955 1 0.9944 0.0572 0.384 0.296 0.320
#> SRR1032957 2 0.2537 0.8555 0.080 0.920 0.000
#> SRR1032956 1 0.2625 0.8329 0.916 0.084 0.000
#> SRR1032958 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032959 2 0.4504 0.7369 0.196 0.804 0.000
#> SRR1032960 2 0.2860 0.8564 0.084 0.912 0.004
#> SRR1032961 1 0.4346 0.7676 0.816 0.184 0.000
#> SRR1032962 3 0.3532 0.8360 0.108 0.008 0.884
#> SRR1032963 2 0.2625 0.8559 0.084 0.916 0.000
#> SRR1032964 2 0.2448 0.8539 0.076 0.924 0.000
#> SRR1032965 2 0.2711 0.8560 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032966 2 0.2711 0.8560 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032967 1 0.3879 0.7418 0.848 0.152 0.000
#> SRR1032968 2 0.2356 0.8496 0.072 0.928 0.000
#> SRR1032969 2 0.2537 0.8555 0.080 0.920 0.000
#> SRR1032970 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032971 2 0.2356 0.8514 0.072 0.928 0.000
#> SRR1032972 2 0.2625 0.8565 0.084 0.916 0.000
#> SRR1032973 2 0.2749 0.8489 0.064 0.924 0.012
#> SRR1032974 1 0.6252 0.2929 0.556 0.444 0.000
#> SRR1032975 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032976 2 0.2945 0.8566 0.088 0.908 0.004
#> SRR1032977 2 0.8067 0.5018 0.160 0.652 0.188
#> SRR1032978 1 0.1643 0.8417 0.956 0.044 0.000
#> SRR1032979 1 0.9955 0.0577 0.380 0.304 0.316
#> SRR1032980 2 0.2448 0.8539 0.076 0.924 0.000
#> SRR1032981 2 0.2448 0.8539 0.076 0.924 0.000
#> SRR1032982 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1032983 2 0.3091 0.8513 0.072 0.912 0.016
#> SRR1032984 2 0.2590 0.8531 0.072 0.924 0.004
#> SRR1032985 2 0.2625 0.8552 0.084 0.916 0.000
#> SRR1032986 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032987 3 0.7065 0.6143 0.052 0.276 0.672
#> SRR1032988 2 0.2878 0.8533 0.096 0.904 0.000
#> SRR1032990 3 0.6083 0.6992 0.060 0.168 0.772
#> SRR1032989 2 0.2796 0.8543 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032991 3 0.9986 0.0607 0.308 0.340 0.352
#> SRR1032992 2 0.5643 0.6919 0.220 0.760 0.020
#> SRR1032993 2 0.2625 0.8564 0.084 0.916 0.000
#> SRR1032994 1 0.6855 0.5560 0.652 0.316 0.032
#> SRR1032995 2 0.6168 0.2206 0.412 0.588 0.000
#> SRR1032996 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1032997 2 0.2537 0.8555 0.080 0.920 0.000
#> SRR1032998 2 0.2959 0.8508 0.100 0.900 0.000
#> SRR1032999 1 0.5327 0.6274 0.728 0.272 0.000
#> SRR1033000 2 0.6313 0.6493 0.148 0.768 0.084
#> SRR1033001 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1033002 1 0.5905 0.5434 0.648 0.352 0.000
#> SRR1033003 1 0.9278 0.3059 0.516 0.288 0.196
#> SRR1033004 3 0.7860 0.5571 0.088 0.284 0.628
#> SRR1033005 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1033006 3 0.6416 0.3754 0.008 0.376 0.616
#> SRR1033007 2 0.7003 0.6574 0.060 0.692 0.248
#> SRR1033008 1 0.3551 0.8059 0.868 0.132 0.000
#> SRR1033009 1 0.4235 0.7750 0.824 0.176 0.000
#> SRR1033010 2 0.5948 0.3937 0.000 0.640 0.360
#> SRR1033011 3 0.2845 0.8759 0.012 0.068 0.920
#> SRR1033012 1 0.0237 0.8376 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033013 3 0.2537 0.8516 0.000 0.080 0.920
#> SRR1033014 3 0.0237 0.8939 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033015 3 0.1289 0.8869 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033016 3 0.2680 0.8755 0.008 0.068 0.924
#> SRR1033017 3 0.2845 0.8759 0.012 0.068 0.920
#> SRR1033018 3 0.0475 0.8942 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033019 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.4702 0.7338 0.788 0.212 0.000
#> SRR1033021 1 0.9280 0.1897 0.480 0.352 0.168
#> SRR1033023 1 0.0747 0.8411 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033022 1 0.0592 0.8403 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033024 3 0.0237 0.8939 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033025 1 0.0747 0.8407 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033027 3 0.2845 0.8759 0.012 0.068 0.920
#> SRR1033028 2 0.3375 0.7891 0.008 0.892 0.100
#> SRR1033029 1 0.2860 0.7679 0.912 0.084 0.004
#> SRR1033030 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.6054 0.6928 0.052 0.180 0.768
#> SRR1033033 3 0.2845 0.8759 0.012 0.068 0.920
#> SRR1033035 3 0.2845 0.8759 0.012 0.068 0.920
#> SRR1033034 1 0.0424 0.8384 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033036 1 0.0747 0.8411 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033037 1 0.1643 0.8413 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033038 1 0.0237 0.8335 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 1 0.7064 0.6821 0.704 0.220 0.076
#> SRR1033041 1 0.1289 0.8422 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.2878 0.8272 0.904 0.096 0.000
#> SRR1033044 1 0.1289 0.8425 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033045 3 0.0592 0.8926 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033046 2 0.9287 0.4383 0.188 0.508 0.304
#> SRR1033047 3 0.1031 0.8890 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033048 1 0.8650 0.4320 0.572 0.292 0.136
#> SRR1033049 1 0.0592 0.8399 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033051 1 0.1964 0.8398 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033052 1 0.0892 0.8413 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033053 3 0.3406 0.8689 0.028 0.068 0.904
#> SRR1033054 3 0.1163 0.8887 0.028 0.000 0.972
#> SRR1033050 1 0.2537 0.8333 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.8559 0.2374 0.512 0.388 0.100
#> SRR1033057 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033059 3 0.2680 0.8755 0.008 0.068 0.924
#> SRR1033060 1 0.3267 0.8147 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033061 3 0.2496 0.8787 0.004 0.068 0.928
#> SRR1033062 3 0.2066 0.8678 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033063 3 0.2845 0.8759 0.012 0.068 0.920
#> SRR1033064 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0237 0.8378 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033067 1 0.2261 0.8375 0.932 0.068 0.000
#> SRR1033068 3 0.0747 0.8925 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033069 3 0.6944 0.1056 0.468 0.016 0.516
#> SRR1033070 3 0.0892 0.8916 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033071 3 0.2680 0.8755 0.008 0.068 0.924
#> SRR1033072 3 0.1163 0.8885 0.028 0.000 0.972
#> SRR1033073 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.3267 0.8181 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033075 1 0.7276 0.3236 0.564 0.404 0.032
#> SRR1033076 3 0.3425 0.8269 0.112 0.004 0.884
#> SRR1033077 1 0.4399 0.7703 0.812 0.188 0.000
#> SRR1033078 1 0.0747 0.8408 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033080 3 0.0237 0.8939 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033081 1 0.4654 0.7402 0.792 0.208 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0237 0.8941 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033084 1 0.1411 0.8422 0.964 0.036 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033086 3 0.2261 0.8782 0.000 0.068 0.932
#> SRR1033087 1 0.0747 0.8408 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033089 3 0.6057 0.4740 0.004 0.340 0.656
#> SRR1033090 2 0.3134 0.8392 0.052 0.916 0.032
#> SRR1033091 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.0747 0.8408 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033093 3 0.2680 0.8755 0.008 0.068 0.924
#> SRR1033094 3 0.0237 0.8941 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033095 3 0.5085 0.8199 0.092 0.072 0.836
#> SRR1033096 3 0.0848 0.8932 0.008 0.008 0.984
#> SRR1033097 3 0.2496 0.8787 0.004 0.068 0.928
#> SRR1033098 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033099 3 0.2680 0.8755 0.008 0.068 0.924
#> SRR1033100 3 0.2496 0.8770 0.004 0.068 0.928
#> SRR1033101 3 0.2261 0.8613 0.000 0.068 0.932
#> SRR1033102 1 0.4654 0.7407 0.792 0.208 0.000
#> SRR1033103 1 0.0424 0.8391 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033104 3 0.0424 0.8933 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033105 1 0.0592 0.8404 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033106 1 0.4002 0.7833 0.840 0.160 0.000
#> SRR1033107 3 0.4291 0.7455 0.000 0.180 0.820
#> SRR1033108 2 0.5138 0.6492 0.252 0.748 0.000
#> SRR1033109 1 0.1643 0.8414 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033110 3 0.1267 0.8887 0.024 0.004 0.972
#> SRR1033111 1 0.0237 0.8376 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033112 1 0.0424 0.8395 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033113 3 0.1399 0.8871 0.028 0.004 0.968
#> SRR1033114 1 0.0592 0.8397 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.5529 0.5626 0.000 0.296 0.704
#> SRR1033117 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 2 0.6357 0.5106 0.012 0.652 0.336
#> SRR1033119 1 0.0592 0.8404 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033121 3 0.0237 0.8941 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033120 3 0.3921 0.8558 0.080 0.036 0.884
#> SRR1033122 3 0.6247 0.3788 0.004 0.376 0.620
#> SRR1033123 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.1289 0.8421 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033125 3 0.5733 0.5198 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033126 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033129 3 0.1031 0.8886 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033128 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.4654 0.7408 0.792 0.208 0.000
#> SRR1033131 1 0.1964 0.8392 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033132 3 0.3412 0.8188 0.124 0.000 0.876
#> SRR1033133 3 0.6941 0.0899 0.464 0.016 0.520
#> SRR1033134 1 0.4605 0.7462 0.796 0.204 0.000
#> SRR1033135 3 0.0237 0.8941 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033136 1 0.1031 0.8422 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033137 3 0.0592 0.8933 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033139 3 0.6879 0.2505 0.428 0.016 0.556
#> SRR1033138 1 0.0747 0.8317 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033140 3 0.0237 0.8941 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033141 1 0.4346 0.7632 0.816 0.184 0.000
#> SRR1033142 3 0.1529 0.8881 0.000 0.040 0.960
#> SRR1033143 1 0.3752 0.7981 0.856 0.144 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0592 0.8933 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033146 1 0.0237 0.8336 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033147 1 0.3967 0.7816 0.884 0.044 0.072
#> SRR1033148 1 0.3816 0.7988 0.852 0.148 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.4842 0.7193 0.776 0.224 0.000
#> SRR1033151 3 0.2625 0.8536 0.084 0.000 0.916
#> SRR1033152 1 0.5254 0.6667 0.736 0.264 0.000
#> SRR1033153 1 0.6423 0.6993 0.728 0.228 0.044
#> SRR1033154 1 0.0237 0.8377 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033156 3 0.0424 0.8934 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033157 1 0.0592 0.8397 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033158 3 0.0747 0.8931 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033159 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0237 0.8941 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033161 1 0.5835 0.5665 0.660 0.340 0.000
#> SRR1033163 3 0.3112 0.8415 0.096 0.004 0.900
#> SRR1033162 1 0.0237 0.8376 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033164 3 0.4280 0.8085 0.124 0.020 0.856
#> SRR1033165 2 0.6668 0.6349 0.040 0.696 0.264
#> SRR1033166 1 0.0000 0.8358 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033167 1 0.8211 -0.1455 0.464 0.072 0.464
#> SRR1033168 3 0.2680 0.8612 0.068 0.008 0.924
#> SRR1033169 3 0.4768 0.8321 0.100 0.052 0.848
#> SRR1033171 3 0.0829 0.8942 0.004 0.012 0.984
#> SRR1033170 1 0.1031 0.8416 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 3 0.1529 0.8881 0.000 0.040 0.960
#> SRR1033174 3 0.1964 0.8710 0.000 0.056 0.944
#> SRR1033175 1 0.2448 0.8346 0.924 0.076 0.000
#> SRR1033176 1 0.0747 0.8414 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033177 3 0.2165 0.8798 0.000 0.064 0.936
#> SRR1033178 3 0.7381 0.6445 0.244 0.080 0.676
#> SRR1033179 1 0.1765 0.8076 0.956 0.040 0.004
#> SRR1033180 1 0.0424 0.8393 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033181 1 0.1163 0.8423 0.972 0.028 0.000
#> SRR1033183 3 0.5760 0.5023 0.000 0.328 0.672
#> SRR1033182 1 0.3551 0.8051 0.868 0.132 0.000
#> SRR1033184 3 0.8578 0.4462 0.224 0.172 0.604
#> SRR1033185 1 0.0424 0.8384 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033187 1 0.5859 0.5264 0.656 0.344 0.000
#> SRR1033186 1 0.0424 0.8361 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033188 2 0.6226 0.6560 0.028 0.720 0.252
#> SRR1033189 3 0.0237 0.8939 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033190 1 0.0424 0.8384 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033191 1 0.0424 0.8391 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033192 1 0.6447 0.6622 0.744 0.060 0.196
#> SRR1033193 1 0.2448 0.8341 0.924 0.076 0.000
#> SRR1033195 3 0.1031 0.8921 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033194 3 0.5835 0.7681 0.164 0.052 0.784
#> SRR1033197 1 0.0747 0.8417 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033196 1 0.6442 0.2320 0.564 0.004 0.432
#> SRR1033199 3 0.2261 0.8789 0.000 0.068 0.932
#> SRR1033198 1 0.4346 0.7656 0.816 0.184 0.000
#> SRR1033200 1 0.5591 0.6101 0.696 0.304 0.000
#> SRR1033201 3 0.1170 0.8908 0.008 0.016 0.976
#> SRR1033202 3 0.5845 0.5344 0.004 0.308 0.688
#> SRR1033203 3 0.0592 0.8936 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033204 1 0.3941 0.7890 0.844 0.156 0.000
#> SRR1033205 3 0.5623 0.5864 0.004 0.280 0.716
#> SRR1033206 1 0.1964 0.8396 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033207 1 0.2537 0.8333 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033208 3 0.0424 0.8934 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033209 2 0.7140 0.5217 0.040 0.632 0.328
#> SRR1033210 3 0.0237 0.8939 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033211 1 0.5397 0.6433 0.720 0.280 0.000
#> SRR1033212 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 3 0.1411 0.8891 0.000 0.036 0.964
#> SRR1033214 2 0.5810 0.4682 0.336 0.664 0.000
#> SRR1033216 1 0.4062 0.7826 0.836 0.164 0.000
#> SRR1033215 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033217 3 0.1411 0.8847 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033218 1 0.3686 0.8009 0.860 0.140 0.000
#> SRR1033219 1 0.2165 0.8377 0.936 0.064 0.000
#> SRR1033221 3 0.7496 0.6461 0.240 0.088 0.672
#> SRR1033220 3 0.6144 0.7750 0.132 0.088 0.780
#> SRR1033222 1 0.2448 0.8346 0.924 0.076 0.000
#> SRR1033223 3 0.8386 0.4559 0.172 0.204 0.624
#> SRR1033225 3 0.0237 0.8942 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033224 1 0.6062 0.4509 0.616 0.384 0.000
#> SRR1033226 1 0.8181 0.4771 0.584 0.324 0.092
#> SRR1033227 3 0.5420 0.6485 0.008 0.240 0.752
#> SRR1033229 3 0.1163 0.8909 0.000 0.028 0.972
#> SRR1033228 1 0.6274 0.2837 0.544 0.456 0.000
#> SRR1033231 3 0.1163 0.8912 0.000 0.028 0.972
#> SRR1033230 1 0.3551 0.8059 0.868 0.132 0.000
#> SRR1033232 2 0.7013 0.5392 0.036 0.640 0.324
#> SRR1033233 1 0.2356 0.8359 0.928 0.072 0.000
#> SRR1033235 3 0.1411 0.8891 0.000 0.036 0.964
#> SRR1033234 3 0.0892 0.8915 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033236 3 0.1182 0.8919 0.012 0.012 0.976
#> SRR1033237 2 0.3038 0.8485 0.104 0.896 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.8941 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0237 0.8939 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033239 1 0.5291 0.6605 0.732 0.268 0.000
#> SRR1033242 2 0.6357 0.5216 0.012 0.652 0.336
#> SRR1033241 3 0.0237 0.8941 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033244 3 0.5229 0.8126 0.104 0.068 0.828
#> SRR1033243 3 0.6291 0.7573 0.152 0.080 0.768
#> SRR1033245 3 0.2116 0.8776 0.040 0.012 0.948
#> SRR1033246 1 0.1289 0.8420 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033248 1 0.5138 0.6836 0.748 0.252 0.000
#> SRR1033247 1 0.1860 0.7973 0.948 0.052 0.000
#> SRR1033249 3 0.1860 0.8843 0.000 0.052 0.948
#> SRR1033250 3 0.2496 0.8778 0.004 0.068 0.928
#> SRR1033251 1 0.0892 0.8417 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033252 3 0.2066 0.8814 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033253 1 0.4062 0.7839 0.836 0.164 0.000
#> SRR1033254 1 0.1964 0.8398 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033256 3 0.1529 0.8879 0.000 0.040 0.960
#> SRR1033255 3 0.0592 0.8936 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033258 1 0.2537 0.8329 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033257 2 0.5178 0.6499 0.256 0.744 0.000
#> SRR1033259 1 0.5363 0.6541 0.724 0.276 0.000
#> SRR1033260 3 0.1411 0.8892 0.000 0.036 0.964
#> SRR1033261 3 0.1643 0.8780 0.000 0.044 0.956
#> SRR1033262 3 0.0237 0.8939 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033263 3 0.1031 0.8918 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033264 1 0.3482 0.7999 0.872 0.128 0.000
#> SRR1033265 3 0.2261 0.8782 0.000 0.068 0.932
#> SRR1033266 2 0.5431 0.5934 0.284 0.716 0.000
#> SRR1033267 3 0.4063 0.8123 0.020 0.112 0.868
#> SRR1033268 1 0.0747 0.8411 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033269 3 0.4346 0.7578 0.184 0.000 0.816
#> SRR1033270 3 0.0747 0.8912 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033271 1 0.2537 0.8329 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033272 3 0.1643 0.8868 0.000 0.044 0.956
#> SRR1033273 1 0.1163 0.8425 0.972 0.028 0.000
#> SRR1033274 3 0.0592 0.8937 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033275 2 0.2796 0.8556 0.092 0.908 0.000
#> SRR1033276 3 0.5243 0.8130 0.100 0.072 0.828
#> SRR1033277 2 0.6244 0.1335 0.440 0.560 0.000
#> SRR1033278 2 0.2866 0.8544 0.076 0.916 0.008
#> SRR1033279 3 0.7310 0.4465 0.324 0.048 0.628
#> SRR1033280 3 0.4121 0.7752 0.168 0.000 0.832
#> SRR1033281 1 0.0747 0.8411 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033282 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1033283 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1033284 2 0.2711 0.8566 0.088 0.912 0.000
#> SRR1033285 2 0.7208 0.5642 0.048 0.644 0.308
#> SRR1033286 2 0.7208 0.5642 0.048 0.644 0.308
#> SRR1033287 2 0.7208 0.5642 0.048 0.644 0.308
#> SRR1033288 2 0.7274 0.5690 0.052 0.644 0.304
#> SRR1033289 2 0.7065 0.5502 0.040 0.644 0.316
#> SRR1033290 2 0.7065 0.5502 0.040 0.644 0.316
#> SRR1033291 2 0.6490 0.6530 0.036 0.708 0.256
#> SRR1033292 2 0.6546 0.6740 0.044 0.716 0.240
#> SRR1033293 2 0.6490 0.6530 0.036 0.708 0.256
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.1389 0.7838 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1032911 4 0.1211 0.7848 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1032912 4 0.2660 0.7809 0.036 0.056 0.000 0.908
#> SRR1032913 4 0.1118 0.7850 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1032914 4 0.1471 0.7847 0.024 0.004 0.012 0.960
#> SRR1032915 4 0.3176 0.7722 0.036 0.084 0.000 0.880
#> SRR1032916 4 0.4590 0.6912 0.036 0.192 0.000 0.772
#> SRR1032917 3 0.0672 0.7574 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1032918 4 0.2002 0.7864 0.044 0.020 0.000 0.936
#> SRR1032919 4 0.2927 0.7734 0.024 0.068 0.008 0.900
#> SRR1032920 2 0.5027 0.6809 0.160 0.776 0.012 0.052
#> SRR1032921 1 0.6215 0.6421 0.664 0.208 0.000 0.128
#> SRR1032922 1 0.6725 0.5123 0.616 0.052 0.036 0.296
#> SRR1032923 4 0.1584 0.7830 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR1032925 2 0.2392 0.7580 0.016 0.924 0.008 0.052
#> SRR1032924 4 0.3071 0.7784 0.044 0.068 0.000 0.888
#> SRR1032926 4 0.3675 0.7141 0.020 0.016 0.104 0.860
#> SRR1032927 4 0.3286 0.7740 0.044 0.080 0.000 0.876
#> SRR1032929 4 0.1798 0.7869 0.040 0.016 0.000 0.944
#> SRR1032928 4 0.1854 0.7804 0.024 0.008 0.020 0.948
#> SRR1032930 4 0.2731 0.7779 0.028 0.060 0.004 0.908
#> SRR1032931 2 0.2352 0.7608 0.016 0.928 0.012 0.044
#> SRR1032932 2 0.4661 0.3724 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1032933 4 0.2589 0.7851 0.044 0.044 0.000 0.912
#> SRR1032934 4 0.1732 0.7834 0.040 0.008 0.004 0.948
#> SRR1032935 4 0.3421 0.7714 0.044 0.088 0.000 0.868
#> SRR1032936 4 0.5508 0.3088 0.000 0.020 0.408 0.572
#> SRR1032937 2 0.3009 0.7424 0.056 0.892 0.000 0.052
#> SRR1032938 1 0.6623 0.5655 0.620 0.148 0.000 0.232
#> SRR1032939 1 0.5192 0.7126 0.760 0.032 0.024 0.184
#> SRR1032940 4 0.3932 0.7255 0.020 0.140 0.008 0.832
#> SRR1032941 4 0.3176 0.7704 0.036 0.084 0.000 0.880
#> SRR1032942 2 0.5766 0.5991 0.192 0.704 0.000 0.104
#> SRR1032943 2 0.2421 0.7597 0.020 0.924 0.008 0.048
#> SRR1032944 1 0.3591 0.7821 0.824 0.168 0.000 0.008
#> SRR1032945 4 0.3037 0.7746 0.036 0.076 0.000 0.888
#> SRR1032946 4 0.1489 0.7852 0.044 0.004 0.000 0.952
#> SRR1032947 4 0.2364 0.7735 0.008 0.036 0.028 0.928
#> SRR1032948 4 0.2578 0.7838 0.036 0.052 0.000 0.912
#> SRR1032949 2 0.2907 0.7480 0.032 0.900 0.004 0.064
#> SRR1032950 4 0.6153 0.1277 0.432 0.028 0.012 0.528
#> SRR1032951 4 0.4761 0.6899 0.044 0.192 0.000 0.764
#> SRR1032952 4 0.1452 0.7854 0.036 0.008 0.000 0.956
#> SRR1032953 4 0.4467 0.7084 0.040 0.172 0.000 0.788
#> SRR1032954 4 0.5821 0.1650 0.432 0.032 0.000 0.536
#> SRR1032955 2 0.2057 0.7613 0.020 0.940 0.008 0.032
#> SRR1032957 4 0.3404 0.7580 0.032 0.104 0.000 0.864
#> SRR1032956 1 0.6503 0.6008 0.640 0.196 0.000 0.164
#> SRR1032958 4 0.2227 0.7862 0.036 0.036 0.000 0.928
#> SRR1032959 4 0.2926 0.7810 0.048 0.056 0.000 0.896
#> SRR1032960 4 0.2057 0.7875 0.032 0.020 0.008 0.940
#> SRR1032961 1 0.7237 0.4003 0.528 0.176 0.000 0.296
#> SRR1032962 3 0.5161 0.5257 0.272 0.024 0.700 0.004
#> SRR1032963 4 0.4706 0.6445 0.028 0.224 0.000 0.748
#> SRR1032964 4 0.4706 0.6443 0.028 0.224 0.000 0.748
#> SRR1032965 4 0.2670 0.7841 0.040 0.052 0.000 0.908
#> SRR1032966 4 0.4423 0.7067 0.036 0.176 0.000 0.788
#> SRR1032967 2 0.6781 0.4819 0.256 0.596 0.000 0.148
#> SRR1032968 4 0.4993 0.5951 0.028 0.260 0.000 0.712
#> SRR1032969 4 0.3945 0.7243 0.024 0.144 0.004 0.828
#> SRR1032970 4 0.2227 0.7859 0.036 0.036 0.000 0.928
#> SRR1032971 4 0.4568 0.6723 0.024 0.200 0.004 0.772
#> SRR1032972 4 0.3169 0.7662 0.028 0.084 0.004 0.884
#> SRR1032973 4 0.2335 0.7804 0.020 0.044 0.008 0.928
#> SRR1032974 4 0.5986 0.4560 0.060 0.320 0.000 0.620
#> SRR1032975 4 0.2965 0.7771 0.036 0.072 0.000 0.892
#> SRR1032976 4 0.1917 0.7837 0.036 0.008 0.012 0.944
#> SRR1032977 2 0.5767 0.1852 0.008 0.540 0.016 0.436
#> SRR1032978 1 0.3913 0.8013 0.824 0.148 0.000 0.028
#> SRR1032979 2 0.2245 0.7610 0.020 0.932 0.008 0.040
#> SRR1032980 4 0.4149 0.7024 0.028 0.168 0.000 0.804
#> SRR1032981 4 0.3606 0.7445 0.020 0.116 0.008 0.856
#> SRR1032982 4 0.2408 0.7845 0.036 0.044 0.000 0.920
#> SRR1032983 4 0.2422 0.7725 0.028 0.016 0.028 0.928
#> SRR1032984 4 0.4082 0.7173 0.020 0.152 0.008 0.820
#> SRR1032985 4 0.4070 0.7425 0.044 0.132 0.000 0.824
#> SRR1032986 4 0.3176 0.7747 0.036 0.084 0.000 0.880
#> SRR1032987 2 0.4491 0.6930 0.000 0.800 0.140 0.060
#> SRR1032988 4 0.2675 0.7846 0.044 0.048 0.000 0.908
#> SRR1032990 3 0.6254 0.5228 0.224 0.040 0.688 0.048
#> SRR1032989 4 0.2840 0.7833 0.044 0.056 0.000 0.900
#> SRR1032991 2 0.2307 0.7587 0.008 0.928 0.016 0.048
#> SRR1032992 4 0.7847 0.3470 0.320 0.040 0.120 0.520
#> SRR1032993 4 0.1721 0.7868 0.028 0.012 0.008 0.952
#> SRR1032994 1 0.6533 0.6456 0.696 0.040 0.096 0.168
#> SRR1032995 4 0.3099 0.7455 0.104 0.020 0.000 0.876
#> SRR1032996 4 0.1489 0.7836 0.044 0.004 0.000 0.952
#> SRR1032997 4 0.3962 0.7189 0.028 0.152 0.000 0.820
#> SRR1032998 4 0.2165 0.7824 0.032 0.008 0.024 0.936
#> SRR1032999 2 0.4424 0.7049 0.100 0.812 0.000 0.088
#> SRR1033000 2 0.5679 -0.0338 0.016 0.492 0.004 0.488
#> SRR1033001 4 0.2124 0.7884 0.040 0.028 0.000 0.932
#> SRR1033002 1 0.6653 0.3729 0.548 0.096 0.000 0.356
#> SRR1033003 2 0.2632 0.7577 0.028 0.916 0.008 0.048
#> SRR1033004 2 0.4499 0.7036 0.000 0.804 0.124 0.072
#> SRR1033005 4 0.2400 0.7759 0.012 0.028 0.032 0.928
#> SRR1033006 3 0.4991 0.4306 0.004 0.008 0.672 0.316
#> SRR1033007 4 0.8315 0.3026 0.180 0.040 0.304 0.476
#> SRR1033008 1 0.1042 0.8636 0.972 0.008 0.000 0.020
#> SRR1033009 1 0.4764 0.7815 0.788 0.088 0.000 0.124
#> SRR1033010 4 0.5080 0.6390 0.000 0.092 0.144 0.764
#> SRR1033011 3 0.5642 0.5097 0.012 0.292 0.668 0.028
#> SRR1033012 1 0.1576 0.8617 0.948 0.048 0.000 0.004
#> SRR1033013 3 0.0672 0.7574 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1033014 3 0.1042 0.7550 0.020 0.008 0.972 0.000
#> SRR1033015 3 0.3428 0.6748 0.144 0.012 0.844 0.000
#> SRR1033016 3 0.5642 0.5097 0.012 0.292 0.668 0.028
#> SRR1033017 3 0.5858 0.5013 0.020 0.292 0.660 0.028
#> SRR1033018 3 0.0817 0.7574 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1033019 3 0.0921 0.7565 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1033020 1 0.2261 0.8455 0.932 0.036 0.008 0.024
#> SRR1033021 1 0.7626 0.4692 0.588 0.040 0.228 0.144
#> SRR1033023 1 0.0779 0.8634 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1033022 1 0.1211 0.8618 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0895 0.7574 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1033025 1 0.2918 0.8276 0.876 0.116 0.000 0.008
#> SRR1033026 3 0.1004 0.7570 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1033027 3 0.5642 0.5097 0.012 0.292 0.668 0.028
#> SRR1033028 4 0.2334 0.7310 0.000 0.004 0.088 0.908
#> SRR1033029 2 0.4973 0.3875 0.348 0.644 0.000 0.008
#> SRR1033030 3 0.0817 0.7569 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1033031 1 0.2647 0.8234 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.5951 0.5606 0.076 0.024 0.724 0.176
#> SRR1033033 3 0.5711 0.4931 0.012 0.304 0.656 0.028
#> SRR1033035 3 0.5711 0.4931 0.012 0.304 0.656 0.028
#> SRR1033034 1 0.3142 0.8168 0.860 0.132 0.000 0.008
#> SRR1033036 1 0.0376 0.8615 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033037 1 0.1854 0.8623 0.940 0.048 0.000 0.012
#> SRR1033038 1 0.3356 0.7756 0.824 0.176 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0336 0.7583 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033040 1 0.4160 0.7886 0.848 0.040 0.084 0.028
#> SRR1033041 1 0.0376 0.8615 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033042 1 0.1661 0.8613 0.944 0.052 0.004 0.000
#> SRR1033043 1 0.4235 0.8053 0.824 0.084 0.000 0.092
#> SRR1033044 1 0.2928 0.8315 0.880 0.108 0.000 0.012
#> SRR1033045 3 0.1706 0.7499 0.000 0.016 0.948 0.036
#> SRR1033046 3 0.8327 0.0525 0.384 0.040 0.416 0.160
#> SRR1033047 3 0.0188 0.7581 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033048 1 0.5694 0.7193 0.764 0.040 0.092 0.104
#> SRR1033049 1 0.2197 0.8499 0.916 0.080 0.000 0.004
#> SRR1033051 1 0.2635 0.8504 0.904 0.076 0.000 0.020
#> SRR1033052 1 0.1474 0.8597 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033053 3 0.6045 0.4708 0.024 0.308 0.640 0.028
#> SRR1033054 3 0.4079 0.6341 0.180 0.020 0.800 0.000
#> SRR1033050 1 0.2111 0.8622 0.932 0.044 0.000 0.024
#> SRR1033055 3 0.0779 0.7591 0.004 0.016 0.980 0.000
#> SRR1033056 1 0.7408 0.5315 0.620 0.040 0.160 0.180
#> SRR1033057 1 0.1489 0.8619 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1033058 3 0.0921 0.7563 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1033059 3 0.5844 0.4825 0.016 0.308 0.648 0.028
#> SRR1033060 1 0.1082 0.8563 0.972 0.020 0.004 0.004
#> SRR1033061 3 0.5730 0.5113 0.016 0.288 0.668 0.028
#> SRR1033062 3 0.2214 0.7451 0.000 0.028 0.928 0.044
#> SRR1033063 3 0.5865 0.4763 0.016 0.312 0.644 0.028
#> SRR1033064 3 0.0469 0.7586 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033065 1 0.2081 0.8451 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.1489 0.8623 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1033067 1 0.3745 0.8308 0.852 0.088 0.000 0.060
#> SRR1033068 3 0.3048 0.7083 0.108 0.016 0.876 0.000
#> SRR1033069 1 0.4806 0.6529 0.764 0.028 0.200 0.008
#> SRR1033070 3 0.4238 0.6366 0.176 0.028 0.796 0.000
#> SRR1033071 3 0.5886 0.4709 0.016 0.316 0.640 0.028
#> SRR1033072 3 0.2480 0.7244 0.088 0.008 0.904 0.000
#> SRR1033073 3 0.1022 0.7558 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1033074 1 0.5174 0.7536 0.756 0.152 0.000 0.092
#> SRR1033075 1 0.6296 0.6518 0.704 0.040 0.068 0.188
#> SRR1033076 3 0.5442 0.4343 0.336 0.028 0.636 0.000
#> SRR1033077 1 0.4578 0.7678 0.788 0.052 0.000 0.160
#> SRR1033078 1 0.2124 0.8555 0.924 0.068 0.000 0.008
#> SRR1033079 3 0.0592 0.7576 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1033080 3 0.1022 0.7547 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1033081 1 0.2594 0.8394 0.916 0.036 0.004 0.044
#> SRR1033082 1 0.1867 0.8534 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0188 0.7583 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033084 1 0.1284 0.8652 0.964 0.024 0.000 0.012
#> SRR1033085 3 0.1209 0.7550 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1033086 3 0.5618 0.5148 0.012 0.288 0.672 0.028
#> SRR1033087 1 0.2124 0.8550 0.924 0.068 0.000 0.008
#> SRR1033088 3 0.1022 0.7547 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1033089 3 0.5250 0.4302 0.000 0.024 0.660 0.316
#> SRR1033090 4 0.1489 0.7667 0.004 0.000 0.044 0.952
#> SRR1033091 3 0.0469 0.7581 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033092 1 0.2048 0.8590 0.928 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033093 3 0.5711 0.4930 0.012 0.304 0.656 0.028
#> SRR1033094 3 0.1305 0.7555 0.004 0.036 0.960 0.000
#> SRR1033095 2 0.5038 0.3713 0.012 0.652 0.336 0.000
#> SRR1033096 3 0.3508 0.7169 0.064 0.020 0.880 0.036
#> SRR1033097 3 0.5754 0.5059 0.016 0.292 0.664 0.028
#> SRR1033098 3 0.0817 0.7568 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1033099 3 0.5666 0.5044 0.012 0.296 0.664 0.028
#> SRR1033100 3 0.5642 0.5097 0.012 0.292 0.668 0.028
#> SRR1033101 3 0.0804 0.7577 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1033102 1 0.1624 0.8553 0.952 0.020 0.000 0.028
#> SRR1033103 1 0.0921 0.8633 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.1394 0.7551 0.012 0.008 0.964 0.016
#> SRR1033105 1 0.0707 0.8642 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.1388 0.8510 0.960 0.028 0.012 0.000
#> SRR1033107 3 0.2950 0.7256 0.020 0.012 0.900 0.068
#> SRR1033108 4 0.2805 0.7476 0.100 0.012 0.000 0.888
#> SRR1033109 1 0.0859 0.8635 0.980 0.008 0.004 0.008
#> SRR1033110 3 0.4459 0.6217 0.188 0.032 0.780 0.000
#> SRR1033111 1 0.1389 0.8604 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0592 0.8633 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.3806 0.6616 0.156 0.020 0.824 0.000
#> SRR1033114 1 0.1867 0.8522 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.1716 0.8558 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.3551 0.6854 0.016 0.008 0.856 0.120
#> SRR1033117 3 0.0707 0.7572 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033118 4 0.5626 0.3554 0.004 0.020 0.388 0.588
#> SRR1033119 1 0.0817 0.8632 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0336 0.7571 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033120 1 0.8019 -0.0344 0.440 0.148 0.384 0.028
#> SRR1033122 3 0.5508 0.2174 0.000 0.020 0.572 0.408
#> SRR1033123 1 0.2149 0.8453 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.1042 0.8644 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR1033125 1 0.6536 0.3546 0.592 0.040 0.340 0.028
#> SRR1033126 1 0.2081 0.8452 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.1209 0.7557 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1033129 3 0.0992 0.7588 0.004 0.012 0.976 0.008
#> SRR1033128 1 0.2473 0.8421 0.908 0.080 0.000 0.012
#> SRR1033130 1 0.1962 0.8504 0.944 0.024 0.008 0.024
#> SRR1033131 1 0.0524 0.8593 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1033132 3 0.5717 0.3951 0.360 0.028 0.608 0.004
#> SRR1033133 1 0.5915 0.5708 0.696 0.044 0.236 0.024
#> SRR1033134 1 0.3533 0.8313 0.864 0.056 0.000 0.080
#> SRR1033135 3 0.0336 0.7581 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033136 1 0.0188 0.8620 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.3224 0.6952 0.120 0.016 0.864 0.000
#> SRR1033139 1 0.5264 0.6136 0.732 0.028 0.224 0.016
#> SRR1033138 1 0.2383 0.8476 0.924 0.048 0.004 0.024
#> SRR1033140 3 0.0592 0.7582 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1033141 1 0.1598 0.8559 0.956 0.020 0.004 0.020
#> SRR1033142 3 0.4482 0.5770 0.000 0.264 0.728 0.008
#> SRR1033143 1 0.1833 0.8636 0.944 0.032 0.000 0.024
#> SRR1033144 1 0.1398 0.8626 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1033145 3 0.1970 0.7365 0.060 0.008 0.932 0.000
#> SRR1033146 1 0.3143 0.8205 0.876 0.100 0.000 0.024
#> SRR1033147 1 0.2432 0.8331 0.928 0.028 0.020 0.024
#> SRR1033148 1 0.5407 0.7362 0.740 0.108 0.000 0.152
#> SRR1033149 3 0.0469 0.7581 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033150 1 0.1388 0.8511 0.960 0.028 0.012 0.000
#> SRR1033151 3 0.5311 0.4464 0.328 0.024 0.648 0.000
#> SRR1033152 1 0.4254 0.7878 0.840 0.040 0.024 0.096
#> SRR1033153 1 0.4608 0.7814 0.828 0.040 0.048 0.084
#> SRR1033154 1 0.1471 0.8583 0.960 0.024 0.004 0.012
#> SRR1033156 3 0.1114 0.7563 0.016 0.008 0.972 0.004
#> SRR1033157 1 0.2647 0.8214 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1033158 3 0.3160 0.7088 0.000 0.108 0.872 0.020
#> SRR1033159 3 0.0188 0.7583 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033160 3 0.0336 0.7583 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033161 1 0.5853 0.1612 0.508 0.032 0.000 0.460
#> SRR1033163 3 0.5452 0.3971 0.360 0.024 0.616 0.000
#> SRR1033162 1 0.1389 0.8598 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.5906 0.5254 0.244 0.036 0.692 0.028
#> SRR1033165 4 0.8467 0.2568 0.200 0.040 0.312 0.448
#> SRR1033166 1 0.1940 0.8495 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.8289 0.3859 0.268 0.468 0.236 0.028
#> SRR1033168 3 0.4775 0.5700 0.232 0.028 0.740 0.000
#> SRR1033169 3 0.8309 0.0603 0.320 0.208 0.444 0.028
#> SRR1033171 3 0.2317 0.7532 0.036 0.032 0.928 0.004
#> SRR1033170 1 0.1305 0.8633 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1033172 3 0.0188 0.7583 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033173 3 0.4482 0.5799 0.000 0.264 0.728 0.008
#> SRR1033174 3 0.2124 0.7480 0.000 0.028 0.932 0.040
#> SRR1033175 1 0.1820 0.8641 0.944 0.036 0.000 0.020
#> SRR1033176 1 0.0336 0.8627 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033177 3 0.4963 0.5413 0.000 0.284 0.696 0.020
#> SRR1033178 2 0.4606 0.6963 0.060 0.808 0.124 0.008
#> SRR1033179 1 0.5277 0.2109 0.532 0.460 0.000 0.008
#> SRR1033180 1 0.0895 0.8639 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1033181 1 0.0524 0.8607 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1033183 3 0.5392 0.0650 0.000 0.012 0.528 0.460
#> SRR1033182 1 0.1229 0.8544 0.968 0.020 0.008 0.004
#> SRR1033184 3 0.6506 0.1215 0.444 0.040 0.500 0.016
#> SRR1033185 1 0.1743 0.8610 0.940 0.056 0.000 0.004
#> SRR1033187 1 0.5001 0.7590 0.804 0.040 0.052 0.104
#> SRR1033186 1 0.1978 0.8527 0.928 0.068 0.000 0.004
#> SRR1033188 4 0.8253 0.2986 0.168 0.040 0.312 0.480
#> SRR1033189 3 0.1356 0.7554 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR1033190 1 0.2149 0.8454 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.1211 0.8622 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.3038 0.8219 0.904 0.036 0.032 0.028
#> SRR1033193 1 0.0657 0.8619 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1033195 3 0.3539 0.6691 0.000 0.176 0.820 0.004
#> SRR1033194 1 0.7987 0.1399 0.520 0.192 0.260 0.028
#> SRR1033197 1 0.1474 0.8600 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.4735 0.7073 0.792 0.040 0.156 0.012
#> SRR1033199 3 0.5231 0.3922 0.000 0.384 0.604 0.012
#> SRR1033198 1 0.1520 0.8625 0.956 0.020 0.000 0.024
#> SRR1033200 1 0.4540 0.7260 0.772 0.032 0.000 0.196
#> SRR1033201 3 0.1362 0.7536 0.020 0.004 0.964 0.012
#> SRR1033202 3 0.3351 0.6594 0.000 0.008 0.844 0.148
#> SRR1033203 3 0.2610 0.7179 0.088 0.012 0.900 0.000
#> SRR1033204 1 0.1297 0.8587 0.964 0.016 0.000 0.020
#> SRR1033205 3 0.2142 0.7356 0.000 0.016 0.928 0.056
#> SRR1033206 1 0.0672 0.8640 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1033207 1 0.1059 0.8644 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1033208 3 0.0844 0.7575 0.004 0.012 0.980 0.004
#> SRR1033209 3 0.8271 0.2017 0.172 0.040 0.480 0.308
#> SRR1033210 3 0.0376 0.7575 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1033211 1 0.3730 0.8122 0.872 0.040 0.028 0.060
#> SRR1033212 3 0.0188 0.7575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033213 3 0.4328 0.5984 0.000 0.244 0.748 0.008
#> SRR1033214 4 0.3217 0.7210 0.128 0.012 0.000 0.860
#> SRR1033216 1 0.0804 0.8609 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1033215 3 0.1022 0.7553 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1033217 3 0.4323 0.6273 0.184 0.028 0.788 0.000
#> SRR1033218 1 0.0779 0.8618 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033219 1 0.1182 0.8646 0.968 0.016 0.000 0.016
#> SRR1033221 2 0.2324 0.7596 0.028 0.932 0.020 0.020
#> SRR1033220 2 0.4118 0.6760 0.016 0.824 0.144 0.016
#> SRR1033222 1 0.1182 0.8649 0.968 0.016 0.000 0.016
#> SRR1033223 3 0.7103 0.1869 0.404 0.040 0.508 0.048
#> SRR1033225 3 0.2081 0.7321 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1033224 1 0.5649 0.3637 0.580 0.028 0.000 0.392
#> SRR1033226 1 0.5966 0.6858 0.744 0.040 0.124 0.092
#> SRR1033227 3 0.3805 0.7095 0.056 0.024 0.868 0.052
#> SRR1033229 3 0.4539 0.5706 0.000 0.272 0.720 0.008
#> SRR1033228 4 0.5493 0.0600 0.456 0.016 0.000 0.528
#> SRR1033231 3 0.3791 0.6478 0.000 0.200 0.796 0.004
#> SRR1033230 1 0.0804 0.8609 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1033232 3 0.7979 0.1694 0.128 0.040 0.496 0.336
#> SRR1033233 1 0.1182 0.8647 0.968 0.016 0.000 0.016
#> SRR1033235 3 0.4283 0.5906 0.000 0.256 0.740 0.004
#> SRR1033234 3 0.3447 0.6826 0.128 0.020 0.852 0.000
#> SRR1033236 3 0.1174 0.7530 0.020 0.012 0.968 0.000
#> SRR1033237 4 0.2300 0.7716 0.064 0.016 0.000 0.920
#> SRR1033238 3 0.0992 0.7569 0.008 0.012 0.976 0.004
#> SRR1033240 3 0.0376 0.7575 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1033239 1 0.3122 0.8279 0.900 0.040 0.024 0.036
#> SRR1033242 3 0.6534 -0.0207 0.020 0.036 0.492 0.452
#> SRR1033241 3 0.0657 0.7569 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR1033244 2 0.5446 0.3466 0.004 0.636 0.340 0.020
#> SRR1033243 2 0.4030 0.6646 0.012 0.820 0.156 0.012
#> SRR1033245 3 0.4376 0.6358 0.172 0.028 0.796 0.004
#> SRR1033246 1 0.2101 0.8588 0.928 0.060 0.000 0.012
#> SRR1033248 1 0.3052 0.8293 0.896 0.032 0.008 0.064
#> SRR1033247 1 0.3659 0.7905 0.840 0.136 0.000 0.024
#> SRR1033249 3 0.4621 0.5567 0.000 0.284 0.708 0.008
#> SRR1033250 3 0.5180 0.5167 0.004 0.308 0.672 0.016
#> SRR1033251 1 0.0524 0.8608 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1033252 3 0.4826 0.5696 0.000 0.264 0.716 0.020
#> SRR1033253 1 0.2996 0.8494 0.892 0.064 0.000 0.044
#> SRR1033254 1 0.1174 0.8646 0.968 0.020 0.000 0.012
#> SRR1033256 3 0.4252 0.5977 0.000 0.252 0.744 0.004
#> SRR1033255 3 0.2255 0.7303 0.068 0.012 0.920 0.000
#> SRR1033258 1 0.1059 0.8651 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1033257 4 0.3895 0.6572 0.184 0.012 0.000 0.804
#> SRR1033259 1 0.4983 0.6425 0.704 0.024 0.000 0.272
#> SRR1033260 3 0.4452 0.5851 0.000 0.260 0.732 0.008
#> SRR1033261 3 0.1271 0.7560 0.012 0.008 0.968 0.012
#> SRR1033262 3 0.0469 0.7579 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033263 3 0.3870 0.6411 0.000 0.208 0.788 0.004
#> SRR1033264 1 0.7304 0.2755 0.492 0.164 0.000 0.344
#> SRR1033265 3 0.4844 0.5336 0.000 0.300 0.688 0.012
#> SRR1033266 4 0.5889 0.4303 0.336 0.024 0.016 0.624
#> SRR1033267 3 0.3841 0.6912 0.108 0.024 0.852 0.016
#> SRR1033268 1 0.0921 0.8627 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.5929 0.1543 0.448 0.028 0.520 0.004
#> SRR1033270 3 0.1271 0.7589 0.012 0.012 0.968 0.008
#> SRR1033271 1 0.0937 0.8641 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033272 3 0.4482 0.5804 0.000 0.264 0.728 0.008
#> SRR1033273 1 0.0376 0.8627 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033274 3 0.2281 0.7279 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1033275 4 0.1722 0.7815 0.048 0.008 0.000 0.944
#> SRR1033276 2 0.5595 0.1520 0.008 0.576 0.404 0.012
#> SRR1033277 4 0.4599 0.5632 0.248 0.016 0.000 0.736
#> SRR1033278 4 0.1593 0.7839 0.024 0.004 0.016 0.956
#> SRR1033279 1 0.6226 0.2850 0.564 0.036 0.388 0.012
#> SRR1033280 3 0.5756 0.2895 0.400 0.032 0.568 0.000
#> SRR1033281 1 0.1042 0.8656 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR1033282 4 0.1888 0.7797 0.044 0.016 0.000 0.940
#> SRR1033283 4 0.1798 0.7807 0.040 0.016 0.000 0.944
#> SRR1033284 4 0.1888 0.7797 0.044 0.016 0.000 0.940
#> SRR1033285 4 0.8604 0.2064 0.216 0.040 0.340 0.404
#> SRR1033286 4 0.8608 0.1966 0.216 0.040 0.344 0.400
#> SRR1033287 4 0.8604 0.2064 0.216 0.040 0.340 0.404
#> SRR1033288 3 0.8786 -0.1223 0.276 0.040 0.344 0.340
#> SRR1033289 4 0.8658 0.1775 0.228 0.040 0.344 0.388
#> SRR1033290 4 0.8649 0.1578 0.224 0.040 0.352 0.384
#> SRR1033291 4 0.7357 0.4006 0.088 0.036 0.312 0.564
#> SRR1033292 4 0.7539 0.4059 0.108 0.036 0.296 0.560
#> SRR1033293 4 0.7462 0.3949 0.096 0.036 0.312 0.556
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.0613 0.7991 0.008 0.004 0.004 0.984 0.000
#> SRR1032911 4 0.0486 0.7996 0.004 0.000 0.004 0.988 0.004
#> SRR1032912 4 0.1591 0.7998 0.000 0.004 0.004 0.940 0.052
#> SRR1032913 4 0.0162 0.7998 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1032914 4 0.2464 0.7948 0.000 0.004 0.044 0.904 0.048
#> SRR1032915 4 0.2177 0.7935 0.000 0.004 0.008 0.908 0.080
#> SRR1032916 4 0.2964 0.7566 0.000 0.004 0.004 0.840 0.152
#> SRR1032917 3 0.2561 0.7941 0.000 0.096 0.884 0.020 0.000
#> SRR1032918 4 0.0994 0.8005 0.004 0.004 0.004 0.972 0.016
#> SRR1032919 4 0.3047 0.7833 0.000 0.004 0.044 0.868 0.084
#> SRR1032920 5 0.3965 0.7203 0.060 0.040 0.060 0.004 0.836
#> SRR1032921 1 0.5309 0.6451 0.676 0.012 0.000 0.236 0.076
#> SRR1032922 1 0.8088 0.1835 0.408 0.028 0.348 0.144 0.072
#> SRR1032923 4 0.0451 0.7985 0.000 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1032925 5 0.3080 0.7530 0.004 0.124 0.000 0.020 0.852
#> SRR1032924 4 0.1041 0.7999 0.004 0.000 0.000 0.964 0.032
#> SRR1032926 4 0.4667 0.5925 0.012 0.016 0.256 0.708 0.008
#> SRR1032927 4 0.1285 0.8010 0.000 0.004 0.004 0.956 0.036
#> SRR1032929 4 0.0566 0.8008 0.000 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1032928 4 0.3242 0.7581 0.008 0.016 0.112 0.856 0.008
#> SRR1032930 4 0.2419 0.7949 0.000 0.004 0.028 0.904 0.064
#> SRR1032931 5 0.2623 0.7664 0.004 0.096 0.000 0.016 0.884
#> SRR1032932 5 0.5641 0.3102 0.000 0.088 0.000 0.356 0.556
#> SRR1032933 4 0.1124 0.7993 0.004 0.000 0.000 0.960 0.036
#> SRR1032934 4 0.2649 0.7826 0.004 0.004 0.080 0.892 0.020
#> SRR1032935 4 0.1041 0.7998 0.004 0.000 0.000 0.964 0.032
#> SRR1032936 3 0.4984 0.5489 0.012 0.020 0.664 0.296 0.008
#> SRR1032937 5 0.1369 0.7651 0.008 0.028 0.000 0.008 0.956
#> SRR1032938 1 0.6002 0.5129 0.588 0.020 0.004 0.316 0.072
#> SRR1032939 1 0.6634 0.5483 0.584 0.028 0.284 0.076 0.028
#> SRR1032940 4 0.3971 0.7534 0.000 0.004 0.068 0.804 0.124
#> SRR1032941 4 0.1928 0.7964 0.000 0.004 0.004 0.920 0.072
#> SRR1032942 5 0.3755 0.7337 0.072 0.028 0.028 0.020 0.852
#> SRR1032943 5 0.2983 0.7680 0.008 0.100 0.008 0.012 0.872
#> SRR1032944 1 0.4018 0.8212 0.828 0.012 0.020 0.040 0.100
#> SRR1032945 4 0.2392 0.7837 0.000 0.004 0.004 0.888 0.104
#> SRR1032946 4 0.0902 0.8005 0.008 0.008 0.004 0.976 0.004
#> SRR1032947 4 0.4478 0.7039 0.000 0.004 0.144 0.764 0.088
#> SRR1032948 4 0.1026 0.8014 0.000 0.004 0.004 0.968 0.024
#> SRR1032949 5 0.2095 0.7718 0.012 0.060 0.000 0.008 0.920
#> SRR1032950 4 0.7403 -0.0126 0.384 0.012 0.152 0.416 0.036
#> SRR1032951 4 0.1908 0.7876 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1032952 4 0.2251 0.7951 0.000 0.008 0.052 0.916 0.024
#> SRR1032953 4 0.1608 0.7935 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1032954 4 0.5873 0.3931 0.308 0.012 0.028 0.612 0.040
#> SRR1032955 5 0.2589 0.7696 0.012 0.092 0.000 0.008 0.888
#> SRR1032957 4 0.2921 0.7586 0.000 0.004 0.004 0.844 0.148
#> SRR1032956 1 0.5939 0.5681 0.616 0.016 0.004 0.276 0.088
#> SRR1032958 4 0.1365 0.8019 0.000 0.004 0.004 0.952 0.040
#> SRR1032959 4 0.2190 0.7955 0.020 0.016 0.008 0.928 0.028
#> SRR1032960 4 0.2313 0.7954 0.000 0.004 0.044 0.912 0.040
#> SRR1032961 1 0.6336 0.2354 0.480 0.016 0.004 0.412 0.088
#> SRR1032962 3 0.5520 0.6352 0.176 0.100 0.696 0.000 0.028
#> SRR1032963 4 0.3317 0.7267 0.000 0.004 0.004 0.804 0.188
#> SRR1032964 4 0.3196 0.7220 0.000 0.004 0.000 0.804 0.192
#> SRR1032965 4 0.1187 0.8011 0.004 0.004 0.004 0.964 0.024
#> SRR1032966 4 0.2548 0.7782 0.000 0.004 0.004 0.876 0.116
#> SRR1032967 5 0.4257 0.7134 0.072 0.028 0.036 0.036 0.828
#> SRR1032968 4 0.3333 0.7062 0.000 0.004 0.000 0.788 0.208
#> SRR1032969 4 0.3256 0.7583 0.000 0.004 0.016 0.832 0.148
#> SRR1032970 4 0.2237 0.7921 0.000 0.004 0.008 0.904 0.084
#> SRR1032971 4 0.3328 0.7347 0.000 0.004 0.008 0.812 0.176
#> SRR1032972 4 0.2407 0.7891 0.000 0.004 0.012 0.896 0.088
#> SRR1032973 4 0.3520 0.7718 0.000 0.004 0.076 0.840 0.080
#> SRR1032974 4 0.2676 0.7720 0.036 0.000 0.000 0.884 0.080
#> SRR1032975 4 0.1662 0.7996 0.000 0.004 0.004 0.936 0.056
#> SRR1032976 4 0.3142 0.7655 0.012 0.016 0.096 0.868 0.008
#> SRR1032977 2 0.7090 -0.2195 0.000 0.372 0.012 0.348 0.268
#> SRR1032978 1 0.3894 0.8228 0.836 0.012 0.012 0.060 0.080
#> SRR1032979 5 0.2520 0.7673 0.004 0.096 0.000 0.012 0.888
#> SRR1032980 4 0.3067 0.7644 0.000 0.004 0.012 0.844 0.140
#> SRR1032981 4 0.3273 0.7735 0.000 0.004 0.036 0.848 0.112
#> SRR1032982 4 0.2103 0.7985 0.000 0.004 0.020 0.920 0.056
#> SRR1032983 4 0.4716 0.6358 0.012 0.016 0.220 0.732 0.020
#> SRR1032984 4 0.3570 0.7644 0.000 0.004 0.044 0.828 0.124
#> SRR1032985 4 0.1341 0.7981 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1032986 4 0.1928 0.7961 0.000 0.004 0.004 0.920 0.072
#> SRR1032987 5 0.5730 0.4329 0.000 0.392 0.004 0.076 0.528
#> SRR1032988 4 0.1277 0.8009 0.004 0.004 0.004 0.960 0.028
#> SRR1032990 3 0.3342 0.7876 0.064 0.016 0.872 0.032 0.016
#> SRR1032989 4 0.1369 0.7989 0.008 0.008 0.000 0.956 0.028
#> SRR1032991 5 0.2775 0.7644 0.004 0.100 0.000 0.020 0.876
#> SRR1032992 3 0.7302 0.3397 0.224 0.012 0.488 0.252 0.024
#> SRR1032993 4 0.2673 0.7925 0.000 0.004 0.044 0.892 0.060
#> SRR1032994 3 0.6796 0.1569 0.376 0.024 0.504 0.044 0.052
#> SRR1032995 4 0.2973 0.7397 0.084 0.016 0.012 0.880 0.008
#> SRR1032996 4 0.0693 0.7976 0.000 0.012 0.008 0.980 0.000
#> SRR1032997 4 0.3129 0.7550 0.000 0.004 0.008 0.832 0.156
#> SRR1032998 4 0.4994 0.6198 0.016 0.012 0.224 0.716 0.032
#> SRR1032999 5 0.2752 0.7493 0.052 0.024 0.016 0.008 0.900
#> SRR1033000 4 0.7033 -0.0485 0.000 0.320 0.012 0.412 0.256
#> SRR1033001 4 0.2473 0.7992 0.004 0.012 0.040 0.912 0.032
#> SRR1033002 1 0.6483 0.2630 0.496 0.012 0.028 0.400 0.064
#> SRR1033003 5 0.1983 0.7712 0.008 0.060 0.000 0.008 0.924
#> SRR1033004 5 0.5648 0.3321 0.000 0.448 0.004 0.064 0.484
#> SRR1033005 4 0.4111 0.7398 0.000 0.004 0.116 0.796 0.084
#> SRR1033006 3 0.3023 0.7847 0.008 0.028 0.868 0.096 0.000
#> SRR1033007 3 0.5249 0.6728 0.068 0.016 0.704 0.208 0.004
#> SRR1033008 1 0.2769 0.8596 0.892 0.000 0.064 0.020 0.024
#> SRR1033009 1 0.5875 0.7521 0.708 0.016 0.080 0.144 0.052
#> SRR1033010 3 0.6104 0.1536 0.000 0.004 0.496 0.388 0.112
#> SRR1033011 2 0.1990 0.7328 0.008 0.920 0.068 0.000 0.004
#> SRR1033012 1 0.2929 0.8519 0.880 0.008 0.068 0.000 0.044
#> SRR1033013 3 0.2233 0.8045 0.000 0.080 0.904 0.016 0.000
#> SRR1033014 3 0.0865 0.8151 0.004 0.024 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.3448 0.7850 0.064 0.072 0.852 0.000 0.012
#> SRR1033016 2 0.1830 0.7333 0.008 0.924 0.068 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.1924 0.7303 0.008 0.924 0.064 0.000 0.004
#> SRR1033018 3 0.2502 0.8067 0.024 0.060 0.904 0.000 0.012
#> SRR1033019 3 0.1788 0.8137 0.008 0.056 0.932 0.000 0.004
#> SRR1033020 1 0.3435 0.8080 0.828 0.008 0.148 0.012 0.004
#> SRR1033021 3 0.5469 0.6445 0.192 0.024 0.712 0.052 0.020
#> SRR1033023 1 0.1924 0.8553 0.924 0.004 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033022 1 0.1412 0.8574 0.952 0.004 0.036 0.000 0.008
#> SRR1033024 3 0.2179 0.7933 0.000 0.100 0.896 0.004 0.000
#> SRR1033025 1 0.4833 0.8204 0.776 0.012 0.100 0.020 0.092
#> SRR1033026 3 0.1908 0.7992 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.1671 0.7358 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.3538 0.6964 0.000 0.004 0.176 0.804 0.016
#> SRR1033029 5 0.4518 0.6512 0.156 0.044 0.028 0.000 0.772
#> SRR1033030 3 0.1492 0.8149 0.008 0.040 0.948 0.000 0.004
#> SRR1033031 1 0.3870 0.8280 0.828 0.020 0.060 0.000 0.092
#> SRR1033032 3 0.4402 0.7629 0.052 0.036 0.820 0.024 0.068
#> SRR1033033 2 0.1924 0.7293 0.004 0.924 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033035 2 0.1638 0.7314 0.004 0.932 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.4993 0.7995 0.760 0.024 0.084 0.008 0.124
#> SRR1033036 1 0.1525 0.8563 0.948 0.004 0.036 0.000 0.012
#> SRR1033037 1 0.2807 0.8609 0.892 0.000 0.056 0.020 0.032
#> SRR1033038 1 0.3817 0.7736 0.808 0.016 0.024 0.000 0.152
#> SRR1033039 3 0.1731 0.8137 0.004 0.060 0.932 0.004 0.000
#> SRR1033040 1 0.5993 0.2719 0.512 0.024 0.416 0.008 0.040
#> SRR1033041 1 0.1990 0.8551 0.920 0.004 0.068 0.000 0.008
#> SRR1033042 1 0.2282 0.8586 0.920 0.008 0.036 0.004 0.032
#> SRR1033043 1 0.4195 0.8015 0.800 0.008 0.024 0.144 0.024
#> SRR1033044 1 0.3877 0.8485 0.844 0.008 0.052 0.036 0.060
#> SRR1033045 3 0.2304 0.8086 0.004 0.068 0.908 0.020 0.000
#> SRR1033046 3 0.4019 0.7691 0.068 0.024 0.832 0.068 0.008
#> SRR1033047 3 0.1612 0.8143 0.012 0.024 0.948 0.016 0.000
#> SRR1033048 3 0.6549 -0.0770 0.444 0.024 0.456 0.048 0.028
#> SRR1033049 1 0.3685 0.8549 0.852 0.012 0.064 0.016 0.056
#> SRR1033051 1 0.3241 0.8574 0.880 0.012 0.032 0.048 0.028
#> SRR1033052 1 0.1910 0.8588 0.940 0.008 0.016 0.016 0.020
#> SRR1033053 2 0.2074 0.7226 0.016 0.920 0.060 0.000 0.004
#> SRR1033054 3 0.3183 0.7902 0.060 0.048 0.872 0.000 0.020
#> SRR1033050 1 0.3550 0.8557 0.860 0.008 0.068 0.032 0.032
#> SRR1033055 3 0.1331 0.8147 0.008 0.040 0.952 0.000 0.000
#> SRR1033056 3 0.6237 0.3335 0.336 0.020 0.560 0.076 0.008
#> SRR1033057 1 0.2086 0.8528 0.928 0.016 0.028 0.000 0.028
#> SRR1033058 3 0.2439 0.7895 0.004 0.120 0.876 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.1970 0.7246 0.012 0.924 0.060 0.000 0.004
#> SRR1033060 1 0.2900 0.8260 0.864 0.000 0.108 0.000 0.028
#> SRR1033061 2 0.2214 0.7085 0.028 0.916 0.052 0.000 0.004
#> SRR1033062 3 0.2437 0.8101 0.000 0.060 0.904 0.032 0.004
#> SRR1033063 2 0.1638 0.7314 0.004 0.932 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1571 0.8117 0.004 0.060 0.936 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.1843 0.8505 0.940 0.012 0.012 0.004 0.032
#> SRR1033066 1 0.2157 0.8554 0.920 0.004 0.040 0.000 0.036
#> SRR1033067 1 0.5084 0.8124 0.764 0.004 0.068 0.096 0.068
#> SRR1033068 3 0.3237 0.7887 0.064 0.044 0.872 0.004 0.016
#> SRR1033069 3 0.6266 0.3850 0.320 0.052 0.568 0.000 0.060
#> SRR1033070 3 0.2956 0.7921 0.060 0.036 0.884 0.000 0.020
#> SRR1033071 2 0.1970 0.7246 0.012 0.924 0.060 0.000 0.004
#> SRR1033072 3 0.3226 0.7915 0.056 0.060 0.868 0.000 0.016
#> SRR1033073 3 0.1934 0.8150 0.016 0.052 0.928 0.000 0.004
#> SRR1033074 1 0.5235 0.7304 0.728 0.016 0.012 0.172 0.072
#> SRR1033075 1 0.6402 0.5203 0.576 0.012 0.304 0.084 0.024
#> SRR1033076 3 0.4351 0.7042 0.164 0.040 0.776 0.000 0.020
#> SRR1033077 1 0.3952 0.7404 0.764 0.008 0.004 0.216 0.008
#> SRR1033078 1 0.2263 0.8627 0.920 0.000 0.036 0.020 0.024
#> SRR1033079 3 0.2074 0.7942 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.2513 0.7823 0.000 0.116 0.876 0.008 0.000
#> SRR1033081 1 0.3545 0.8203 0.832 0.004 0.128 0.004 0.032
#> SRR1033082 1 0.3508 0.8411 0.848 0.012 0.076 0.000 0.064
#> SRR1033083 3 0.1670 0.8133 0.012 0.052 0.936 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.1918 0.8587 0.940 0.012 0.016 0.020 0.012
#> SRR1033085 3 0.2664 0.8020 0.000 0.092 0.884 0.020 0.004
#> SRR1033086 2 0.1831 0.7358 0.000 0.920 0.076 0.000 0.004
#> SRR1033087 1 0.1966 0.8585 0.936 0.004 0.016 0.016 0.028
#> SRR1033088 3 0.2284 0.7987 0.004 0.096 0.896 0.000 0.004
#> SRR1033089 3 0.3543 0.7615 0.000 0.040 0.828 0.128 0.004
#> SRR1033090 4 0.2787 0.7760 0.000 0.004 0.088 0.880 0.028
#> SRR1033091 3 0.1168 0.8144 0.008 0.032 0.960 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.2506 0.8541 0.904 0.008 0.052 0.000 0.036
#> SRR1033093 2 0.1830 0.7331 0.000 0.924 0.068 0.000 0.008
#> SRR1033094 3 0.3272 0.7927 0.016 0.120 0.848 0.000 0.016
#> SRR1033095 5 0.5488 0.6741 0.040 0.196 0.068 0.000 0.696
#> SRR1033096 3 0.2082 0.8162 0.024 0.032 0.928 0.016 0.000
#> SRR1033097 2 0.1798 0.7309 0.004 0.928 0.064 0.000 0.004
#> SRR1033098 3 0.1892 0.8073 0.004 0.080 0.916 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.2116 0.7360 0.008 0.912 0.076 0.000 0.004
#> SRR1033100 2 0.1732 0.7368 0.000 0.920 0.080 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.2813 0.7949 0.000 0.108 0.868 0.024 0.000
#> SRR1033102 1 0.3639 0.8425 0.856 0.016 0.044 0.068 0.016
#> SRR1033103 1 0.1442 0.8581 0.952 0.004 0.032 0.000 0.012
#> SRR1033104 3 0.2777 0.7816 0.000 0.120 0.864 0.016 0.000
#> SRR1033105 1 0.1278 0.8576 0.960 0.004 0.020 0.000 0.016
#> SRR1033106 1 0.2464 0.8393 0.888 0.000 0.096 0.000 0.016
#> SRR1033107 3 0.2529 0.8097 0.004 0.056 0.900 0.040 0.000
#> SRR1033108 4 0.1281 0.7869 0.032 0.012 0.000 0.956 0.000
#> SRR1033109 1 0.2522 0.8611 0.912 0.012 0.044 0.020 0.012
#> SRR1033110 3 0.2688 0.7963 0.056 0.036 0.896 0.000 0.012
#> SRR1033111 1 0.1790 0.8589 0.940 0.004 0.036 0.004 0.016
#> SRR1033112 1 0.1483 0.8601 0.952 0.008 0.028 0.012 0.000
#> SRR1033113 3 0.2876 0.7969 0.052 0.044 0.888 0.000 0.016
#> SRR1033114 1 0.2434 0.8565 0.908 0.008 0.048 0.000 0.036
#> SRR1033115 1 0.2390 0.8549 0.912 0.012 0.044 0.000 0.032
#> SRR1033116 3 0.2824 0.7980 0.000 0.096 0.872 0.032 0.000
#> SRR1033117 3 0.2516 0.7703 0.000 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.4227 0.5761 0.000 0.016 0.692 0.292 0.000
#> SRR1033119 1 0.1706 0.8574 0.948 0.016 0.016 0.008 0.012
#> SRR1033121 3 0.2416 0.8058 0.012 0.100 0.888 0.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.5819 0.2314 0.336 0.580 0.064 0.000 0.020
#> SRR1033122 3 0.4490 0.6496 0.000 0.052 0.724 0.224 0.000
#> SRR1033123 1 0.2149 0.8514 0.924 0.012 0.028 0.000 0.036
#> SRR1033124 1 0.2199 0.8618 0.928 0.012 0.028 0.020 0.012
#> SRR1033125 1 0.5616 0.2104 0.508 0.036 0.436 0.000 0.020
#> SRR1033126 1 0.1362 0.8528 0.960 0.016 0.004 0.008 0.012
#> SRR1033127 3 0.2609 0.8091 0.000 0.068 0.896 0.008 0.028
#> SRR1033129 3 0.2825 0.7713 0.000 0.124 0.860 0.016 0.000
#> SRR1033128 1 0.1806 0.8481 0.940 0.016 0.016 0.000 0.028
#> SRR1033130 1 0.3942 0.8361 0.828 0.012 0.096 0.056 0.008
#> SRR1033131 1 0.1731 0.8582 0.940 0.008 0.040 0.000 0.012
#> SRR1033132 3 0.4778 0.6632 0.196 0.048 0.736 0.000 0.020
#> SRR1033133 1 0.5434 0.3697 0.560 0.016 0.396 0.008 0.020
#> SRR1033134 1 0.3809 0.7733 0.804 0.020 0.000 0.160 0.016
#> SRR1033135 3 0.2130 0.8115 0.012 0.080 0.908 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.1960 0.8598 0.936 0.012 0.028 0.020 0.004
#> SRR1033137 3 0.3807 0.7826 0.056 0.116 0.820 0.000 0.008
#> SRR1033139 3 0.6210 -0.0633 0.452 0.052 0.456 0.000 0.040
#> SRR1033138 1 0.3570 0.8269 0.844 0.016 0.092 0.000 0.048
#> SRR1033140 3 0.2102 0.8139 0.012 0.068 0.916 0.000 0.004
#> SRR1033141 1 0.3278 0.8477 0.864 0.008 0.088 0.032 0.008
#> SRR1033142 2 0.3863 0.7165 0.000 0.772 0.200 0.000 0.028
#> SRR1033143 1 0.2898 0.8429 0.892 0.012 0.012 0.060 0.024
#> SRR1033144 1 0.1686 0.8548 0.944 0.008 0.028 0.000 0.020
#> SRR1033145 3 0.2386 0.8127 0.032 0.048 0.912 0.004 0.004
#> SRR1033146 1 0.1756 0.8435 0.940 0.016 0.008 0.000 0.036
#> SRR1033147 1 0.5172 0.6985 0.700 0.032 0.224 0.000 0.044
#> SRR1033148 1 0.5055 0.6477 0.680 0.016 0.004 0.268 0.032
#> SRR1033149 3 0.2230 0.7869 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.2976 0.8214 0.852 0.004 0.132 0.000 0.012
#> SRR1033151 3 0.3878 0.7477 0.120 0.040 0.820 0.000 0.020
#> SRR1033152 1 0.4536 0.7735 0.772 0.004 0.152 0.060 0.012
#> SRR1033153 1 0.5108 0.6164 0.660 0.004 0.292 0.016 0.028
#> SRR1033154 1 0.1603 0.8589 0.948 0.012 0.032 0.004 0.004
#> SRR1033156 3 0.2358 0.7976 0.000 0.104 0.888 0.008 0.000
#> SRR1033157 1 0.2072 0.8464 0.928 0.016 0.000 0.020 0.036
#> SRR1033158 2 0.3814 0.6471 0.000 0.720 0.276 0.000 0.004
#> SRR1033159 3 0.2833 0.7768 0.004 0.140 0.852 0.004 0.000
#> SRR1033160 3 0.2392 0.8022 0.004 0.104 0.888 0.000 0.004
#> SRR1033161 4 0.5128 0.1022 0.420 0.020 0.000 0.548 0.012
#> SRR1033163 3 0.4385 0.7052 0.160 0.044 0.776 0.000 0.020
#> SRR1033162 1 0.2140 0.8557 0.924 0.012 0.040 0.000 0.024
#> SRR1033164 3 0.3754 0.7714 0.080 0.036 0.848 0.012 0.024
#> SRR1033165 3 0.4771 0.7094 0.052 0.016 0.748 0.180 0.004
#> SRR1033166 1 0.2618 0.8494 0.900 0.012 0.036 0.000 0.052
#> SRR1033167 2 0.6028 0.2785 0.240 0.628 0.028 0.000 0.104
#> SRR1033168 3 0.2728 0.7896 0.068 0.016 0.896 0.012 0.008
#> SRR1033169 2 0.5764 0.2520 0.336 0.584 0.060 0.000 0.020
#> SRR1033171 3 0.4523 0.7229 0.052 0.160 0.768 0.000 0.020
#> SRR1033170 1 0.1757 0.8557 0.944 0.012 0.012 0.028 0.004
#> SRR1033172 3 0.2536 0.7847 0.004 0.128 0.868 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.3492 0.7264 0.000 0.796 0.188 0.000 0.016
#> SRR1033174 3 0.3667 0.7542 0.000 0.140 0.812 0.048 0.000
#> SRR1033175 1 0.2140 0.8448 0.924 0.012 0.000 0.040 0.024
#> SRR1033176 1 0.1956 0.8556 0.928 0.008 0.052 0.000 0.012
#> SRR1033177 2 0.3527 0.7293 0.000 0.804 0.172 0.000 0.024
#> SRR1033178 5 0.4269 0.7192 0.068 0.072 0.048 0.000 0.812
#> SRR1033179 5 0.5812 0.5551 0.160 0.032 0.132 0.000 0.676
#> SRR1033180 1 0.2741 0.8553 0.892 0.008 0.076 0.008 0.016
#> SRR1033181 1 0.2141 0.8533 0.916 0.004 0.064 0.000 0.016
#> SRR1033183 3 0.4850 0.6155 0.000 0.076 0.700 0.224 0.000
#> SRR1033182 1 0.1996 0.8596 0.932 0.008 0.040 0.004 0.016
#> SRR1033184 3 0.5011 0.6602 0.192 0.036 0.736 0.016 0.020
#> SRR1033185 1 0.3050 0.8617 0.888 0.016 0.044 0.012 0.040
#> SRR1033187 1 0.5507 0.7503 0.712 0.012 0.156 0.104 0.016
#> SRR1033186 1 0.3426 0.8375 0.852 0.012 0.084 0.000 0.052
#> SRR1033188 3 0.4939 0.6925 0.052 0.016 0.728 0.200 0.004
#> SRR1033189 3 0.4075 0.7578 0.000 0.136 0.804 0.024 0.036
#> SRR1033190 1 0.2438 0.8547 0.908 0.008 0.044 0.000 0.040
#> SRR1033191 1 0.1200 0.8553 0.964 0.008 0.016 0.000 0.012
#> SRR1033192 1 0.4818 0.6792 0.700 0.020 0.252 0.000 0.028
#> SRR1033193 1 0.1602 0.8560 0.952 0.012 0.012 0.008 0.016
#> SRR1033195 3 0.6684 -0.0927 0.000 0.288 0.436 0.000 0.276
#> SRR1033194 2 0.5408 0.2045 0.364 0.584 0.032 0.000 0.020
#> SRR1033197 1 0.2120 0.8617 0.924 0.004 0.048 0.004 0.020
#> SRR1033196 1 0.5301 0.4164 0.576 0.020 0.380 0.000 0.024
#> SRR1033199 2 0.5673 0.4322 0.000 0.596 0.112 0.000 0.292
#> SRR1033198 1 0.4113 0.8393 0.836 0.024 0.052 0.060 0.028
#> SRR1033200 1 0.5310 0.6732 0.692 0.024 0.024 0.240 0.020
#> SRR1033201 3 0.1788 0.8137 0.008 0.056 0.932 0.004 0.000
#> SRR1033202 3 0.3307 0.7825 0.000 0.104 0.844 0.052 0.000
#> SRR1033203 3 0.1772 0.8130 0.024 0.016 0.944 0.012 0.004
#> SRR1033204 1 0.2415 0.8516 0.916 0.008 0.016 0.044 0.016
#> SRR1033205 3 0.3485 0.7734 0.000 0.124 0.828 0.048 0.000
#> SRR1033206 1 0.2253 0.8533 0.924 0.008 0.020 0.036 0.012
#> SRR1033207 1 0.2627 0.8523 0.908 0.008 0.020 0.040 0.024
#> SRR1033208 3 0.2011 0.8031 0.000 0.088 0.908 0.004 0.000
#> SRR1033209 3 0.3852 0.7699 0.052 0.016 0.832 0.096 0.004
#> SRR1033210 3 0.1894 0.8088 0.000 0.072 0.920 0.008 0.000
#> SRR1033211 1 0.4264 0.8247 0.808 0.008 0.108 0.060 0.016
#> SRR1033212 3 0.2891 0.7372 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.3353 0.7247 0.000 0.796 0.196 0.000 0.008
#> SRR1033214 4 0.1870 0.7794 0.040 0.016 0.004 0.936 0.004
#> SRR1033216 1 0.2458 0.8486 0.912 0.012 0.008 0.052 0.016
#> SRR1033215 3 0.2488 0.7743 0.000 0.124 0.872 0.000 0.004
#> SRR1033217 3 0.2491 0.7966 0.064 0.024 0.904 0.004 0.004
#> SRR1033218 1 0.2311 0.8507 0.920 0.008 0.012 0.044 0.016
#> SRR1033219 1 0.2029 0.8482 0.932 0.012 0.004 0.036 0.016
#> SRR1033221 5 0.4410 0.6013 0.008 0.276 0.016 0.000 0.700
#> SRR1033220 5 0.5924 0.1771 0.028 0.460 0.036 0.004 0.472
#> SRR1033222 1 0.1812 0.8491 0.940 0.008 0.004 0.036 0.012
#> SRR1033223 3 0.5105 0.6453 0.208 0.028 0.720 0.036 0.008
#> SRR1033225 2 0.4367 0.3931 0.000 0.580 0.416 0.000 0.004
#> SRR1033224 1 0.6002 0.1805 0.476 0.016 0.032 0.456 0.020
#> SRR1033226 1 0.5820 0.4566 0.572 0.004 0.352 0.056 0.016
#> SRR1033227 3 0.3410 0.8085 0.016 0.080 0.860 0.040 0.004
#> SRR1033229 2 0.3318 0.7268 0.000 0.800 0.192 0.000 0.008
#> SRR1033228 4 0.4669 0.3356 0.352 0.012 0.000 0.628 0.008
#> SRR1033231 2 0.5154 0.4946 0.000 0.580 0.372 0.000 0.048
#> SRR1033230 1 0.2122 0.8502 0.928 0.008 0.008 0.040 0.016
#> SRR1033232 3 0.5663 0.6682 0.052 0.056 0.692 0.196 0.004
#> SRR1033233 1 0.2186 0.8467 0.924 0.012 0.004 0.044 0.016
#> SRR1033235 2 0.3282 0.7283 0.000 0.804 0.188 0.000 0.008
#> SRR1033234 3 0.3271 0.8075 0.044 0.080 0.864 0.008 0.004
#> SRR1033236 3 0.2833 0.8168 0.020 0.068 0.888 0.024 0.000
#> SRR1033237 4 0.1947 0.7825 0.032 0.016 0.012 0.936 0.004
#> SRR1033238 3 0.2681 0.8004 0.004 0.108 0.876 0.012 0.000
#> SRR1033240 3 0.2389 0.7874 0.000 0.116 0.880 0.004 0.000
#> SRR1033239 1 0.3623 0.8121 0.828 0.008 0.136 0.020 0.008
#> SRR1033242 3 0.4898 0.6950 0.020 0.052 0.740 0.184 0.004
#> SRR1033241 3 0.2462 0.7975 0.008 0.112 0.880 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.5379 0.2159 0.004 0.596 0.048 0.004 0.348
#> SRR1033243 5 0.5553 0.2421 0.020 0.440 0.032 0.000 0.508
#> SRR1033245 3 0.2728 0.7973 0.064 0.024 0.896 0.012 0.004
#> SRR1033246 1 0.2170 0.8427 0.924 0.020 0.000 0.036 0.020
#> SRR1033248 1 0.4717 0.8068 0.780 0.020 0.132 0.052 0.016
#> SRR1033247 1 0.2609 0.8218 0.896 0.028 0.008 0.000 0.068
#> SRR1033249 2 0.4096 0.7119 0.000 0.760 0.200 0.000 0.040
#> SRR1033250 2 0.4396 0.7153 0.008 0.772 0.152 0.000 0.068
#> SRR1033251 1 0.0992 0.8585 0.968 0.008 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.3724 0.7244 0.000 0.788 0.184 0.000 0.028
#> SRR1033253 1 0.4506 0.8106 0.800 0.012 0.036 0.112 0.040
#> SRR1033254 1 0.1947 0.8491 0.936 0.012 0.004 0.032 0.016
#> SRR1033256 2 0.4430 0.6607 0.000 0.708 0.256 0.000 0.036
#> SRR1033255 3 0.3160 0.7985 0.028 0.116 0.852 0.004 0.000
#> SRR1033258 1 0.2005 0.8487 0.932 0.012 0.004 0.040 0.012
#> SRR1033257 4 0.1809 0.7689 0.060 0.012 0.000 0.928 0.000
#> SRR1033259 1 0.4895 0.5798 0.648 0.024 0.000 0.316 0.012
#> SRR1033260 2 0.4352 0.6754 0.000 0.720 0.244 0.000 0.036
#> SRR1033261 3 0.2233 0.8038 0.000 0.080 0.904 0.016 0.000
#> SRR1033262 3 0.1877 0.8089 0.000 0.064 0.924 0.012 0.000
#> SRR1033263 2 0.4193 0.6683 0.000 0.720 0.256 0.000 0.024
#> SRR1033264 4 0.6121 0.0597 0.404 0.008 0.000 0.488 0.100
#> SRR1033265 2 0.5831 0.5520 0.000 0.608 0.172 0.000 0.220
#> SRR1033266 4 0.6780 0.2443 0.312 0.016 0.184 0.488 0.000
#> SRR1033267 3 0.3076 0.8137 0.024 0.048 0.884 0.040 0.004
#> SRR1033268 1 0.1805 0.8562 0.944 0.012 0.016 0.020 0.008
#> SRR1033269 3 0.4197 0.6763 0.204 0.024 0.760 0.000 0.012
#> SRR1033270 3 0.2677 0.7901 0.000 0.112 0.872 0.016 0.000
#> SRR1033271 1 0.1729 0.8508 0.944 0.008 0.004 0.032 0.012
#> SRR1033272 2 0.4163 0.6929 0.000 0.740 0.228 0.000 0.032
#> SRR1033273 1 0.1383 0.8536 0.960 0.012 0.008 0.008 0.012
#> SRR1033274 3 0.5741 0.4802 0.004 0.204 0.636 0.000 0.156
#> SRR1033275 4 0.0807 0.7936 0.012 0.012 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033276 2 0.5879 -0.0654 0.024 0.492 0.048 0.000 0.436
#> SRR1033277 4 0.2959 0.7148 0.112 0.016 0.000 0.864 0.008
#> SRR1033278 4 0.2504 0.7888 0.000 0.004 0.064 0.900 0.032
#> SRR1033279 3 0.5520 0.3280 0.364 0.024 0.584 0.008 0.020
#> SRR1033280 3 0.3865 0.7233 0.160 0.020 0.804 0.004 0.012
#> SRR1033281 1 0.1883 0.8535 0.940 0.012 0.008 0.028 0.012
#> SRR1033282 4 0.1612 0.7837 0.024 0.016 0.000 0.948 0.012
#> SRR1033283 4 0.1518 0.7855 0.020 0.016 0.000 0.952 0.012
#> SRR1033284 4 0.1612 0.7837 0.024 0.016 0.000 0.948 0.012
#> SRR1033285 4 0.7561 0.2523 0.156 0.056 0.296 0.480 0.012
#> SRR1033286 4 0.7619 0.2201 0.152 0.060 0.308 0.468 0.012
#> SRR1033287 4 0.7496 0.2875 0.160 0.052 0.284 0.492 0.012
#> SRR1033288 4 0.8010 0.1643 0.200 0.072 0.296 0.420 0.012
#> SRR1033289 4 0.7695 0.1683 0.136 0.072 0.328 0.452 0.012
#> SRR1033290 4 0.7855 0.1035 0.132 0.088 0.340 0.428 0.012
#> SRR1033291 4 0.5991 0.4640 0.064 0.028 0.276 0.624 0.008
#> SRR1033292 4 0.5869 0.4999 0.072 0.024 0.248 0.648 0.008
#> SRR1033293 4 0.5971 0.4699 0.064 0.028 0.272 0.628 0.008
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.3012 0.752783 0.036 0.000 0.012 0.864 0.008 0.080
#> SRR1032911 4 0.1933 0.768337 0.032 0.000 0.000 0.920 0.004 0.044
#> SRR1032912 4 0.1257 0.778637 0.000 0.000 0.020 0.952 0.028 0.000
#> SRR1032913 4 0.0862 0.780418 0.000 0.000 0.016 0.972 0.008 0.004
#> SRR1032914 4 0.1908 0.770532 0.000 0.000 0.056 0.916 0.028 0.000
#> SRR1032915 4 0.1616 0.776341 0.000 0.000 0.020 0.932 0.048 0.000
#> SRR1032916 4 0.2121 0.757646 0.000 0.000 0.012 0.892 0.096 0.000
#> SRR1032917 3 0.4433 0.573128 0.000 0.216 0.724 0.016 0.012 0.032
#> SRR1032918 4 0.2263 0.766335 0.036 0.000 0.008 0.908 0.004 0.044
#> SRR1032919 4 0.2506 0.760818 0.000 0.000 0.052 0.880 0.068 0.000
#> SRR1032920 5 0.5261 0.656019 0.044 0.008 0.052 0.008 0.692 0.196
#> SRR1032921 1 0.5003 0.540240 0.708 0.000 0.000 0.104 0.044 0.144
#> SRR1032922 3 0.7173 0.300731 0.108 0.008 0.516 0.060 0.048 0.260
#> SRR1032923 4 0.1963 0.775128 0.012 0.000 0.016 0.924 0.004 0.044
#> SRR1032925 5 0.3058 0.682492 0.000 0.096 0.004 0.024 0.856 0.020
#> SRR1032924 4 0.2434 0.762944 0.040 0.000 0.004 0.900 0.012 0.044
#> SRR1032926 4 0.5698 0.361511 0.012 0.004 0.348 0.548 0.012 0.076
#> SRR1032927 4 0.2403 0.766586 0.044 0.000 0.008 0.904 0.012 0.032
#> SRR1032929 4 0.2351 0.770540 0.028 0.000 0.016 0.908 0.008 0.040
#> SRR1032928 4 0.3949 0.710030 0.012 0.004 0.152 0.788 0.008 0.036
#> SRR1032930 4 0.2030 0.770185 0.000 0.000 0.028 0.908 0.064 0.000
#> SRR1032931 5 0.1837 0.721735 0.000 0.044 0.004 0.020 0.928 0.004
#> SRR1032932 5 0.5168 0.040827 0.000 0.020 0.000 0.456 0.480 0.044
#> SRR1032933 4 0.1729 0.772176 0.036 0.000 0.004 0.936 0.012 0.012
#> SRR1032934 4 0.3072 0.743475 0.004 0.000 0.104 0.852 0.020 0.020
#> SRR1032935 4 0.1982 0.769205 0.040 0.000 0.004 0.924 0.012 0.020
#> SRR1032936 3 0.4987 0.536345 0.004 0.016 0.672 0.248 0.008 0.052
#> SRR1032937 5 0.1901 0.726928 0.016 0.024 0.000 0.012 0.932 0.016
#> SRR1032938 1 0.5505 0.462810 0.636 0.000 0.000 0.180 0.028 0.156
#> SRR1032939 3 0.6961 -0.196039 0.292 0.008 0.396 0.024 0.008 0.272
#> SRR1032940 4 0.4556 0.666736 0.000 0.000 0.120 0.748 0.096 0.036
#> SRR1032941 4 0.1151 0.777343 0.000 0.000 0.012 0.956 0.032 0.000
#> SRR1032942 5 0.4783 0.662986 0.064 0.008 0.012 0.008 0.720 0.188
#> SRR1032943 5 0.2893 0.723034 0.012 0.048 0.000 0.020 0.880 0.040
#> SRR1032944 1 0.4404 0.591015 0.756 0.000 0.004 0.020 0.080 0.140
#> SRR1032945 4 0.2039 0.766559 0.000 0.000 0.020 0.904 0.076 0.000
#> SRR1032946 4 0.2420 0.759013 0.032 0.000 0.000 0.892 0.008 0.068
#> SRR1032947 4 0.4669 0.604967 0.000 0.000 0.220 0.700 0.052 0.028
#> SRR1032948 4 0.0696 0.778829 0.004 0.000 0.004 0.980 0.008 0.004
#> SRR1032949 5 0.2570 0.726837 0.020 0.036 0.000 0.020 0.900 0.024
#> SRR1032950 3 0.8200 -0.160163 0.184 0.004 0.312 0.308 0.036 0.156
#> SRR1032951 4 0.1623 0.775803 0.020 0.000 0.004 0.940 0.032 0.004
#> SRR1032952 4 0.2502 0.759716 0.000 0.000 0.084 0.884 0.020 0.012
#> SRR1032953 4 0.1973 0.771856 0.036 0.000 0.004 0.924 0.028 0.008
#> SRR1032954 1 0.6600 0.231305 0.472 0.008 0.004 0.300 0.024 0.192
#> SRR1032955 5 0.1836 0.721705 0.004 0.048 0.000 0.012 0.928 0.008
#> SRR1032957 4 0.2230 0.762056 0.000 0.000 0.024 0.892 0.084 0.000
#> SRR1032956 1 0.5074 0.536613 0.696 0.000 0.000 0.120 0.036 0.148
#> SRR1032958 4 0.0972 0.778063 0.000 0.000 0.008 0.964 0.028 0.000
#> SRR1032959 4 0.3398 0.728797 0.084 0.000 0.004 0.836 0.012 0.064
#> SRR1032960 4 0.2600 0.753915 0.000 0.000 0.084 0.876 0.036 0.004
#> SRR1032961 1 0.5921 0.403878 0.592 0.000 0.004 0.192 0.028 0.184
#> SRR1032962 3 0.6258 0.249400 0.128 0.024 0.512 0.004 0.008 0.324
#> SRR1032963 4 0.2446 0.738466 0.000 0.000 0.012 0.864 0.124 0.000
#> SRR1032964 4 0.2357 0.744066 0.000 0.000 0.012 0.872 0.116 0.000
#> SRR1032965 4 0.1498 0.778262 0.024 0.000 0.012 0.948 0.012 0.004
#> SRR1032966 4 0.1625 0.772183 0.000 0.000 0.012 0.928 0.060 0.000
#> SRR1032967 5 0.5199 0.653643 0.064 0.008 0.028 0.012 0.700 0.188
#> SRR1032968 4 0.2794 0.722269 0.000 0.000 0.012 0.840 0.144 0.004
#> SRR1032969 4 0.2702 0.753395 0.000 0.000 0.036 0.868 0.092 0.004
#> SRR1032970 4 0.1421 0.778371 0.000 0.000 0.028 0.944 0.028 0.000
#> SRR1032971 4 0.2932 0.735192 0.000 0.000 0.024 0.840 0.132 0.004
#> SRR1032972 4 0.1950 0.768613 0.000 0.000 0.024 0.912 0.064 0.000
#> SRR1032973 4 0.3507 0.716917 0.000 0.000 0.116 0.820 0.044 0.020
#> SRR1032974 4 0.3747 0.707559 0.124 0.000 0.004 0.808 0.024 0.040
#> SRR1032975 4 0.1049 0.777398 0.000 0.000 0.008 0.960 0.032 0.000
#> SRR1032976 4 0.4471 0.684382 0.012 0.004 0.168 0.752 0.016 0.048
#> SRR1032977 4 0.7421 -0.173829 0.000 0.140 0.000 0.376 0.236 0.248
#> SRR1032978 1 0.3784 0.632874 0.812 0.004 0.004 0.032 0.028 0.120
#> SRR1032979 5 0.2428 0.722878 0.000 0.044 0.008 0.020 0.904 0.024
#> SRR1032980 4 0.2633 0.748998 0.000 0.000 0.020 0.864 0.112 0.004
#> SRR1032981 4 0.2767 0.758019 0.000 0.000 0.056 0.868 0.072 0.004
#> SRR1032982 4 0.1575 0.776925 0.000 0.000 0.032 0.936 0.032 0.000
#> SRR1032983 4 0.6185 0.371753 0.012 0.008 0.328 0.528 0.020 0.104
#> SRR1032984 4 0.3582 0.732346 0.000 0.000 0.064 0.820 0.096 0.020
#> SRR1032985 4 0.1743 0.777408 0.024 0.000 0.008 0.936 0.028 0.004
#> SRR1032986 4 0.1226 0.775900 0.000 0.000 0.004 0.952 0.040 0.004
#> SRR1032987 5 0.7166 0.336260 0.000 0.188 0.000 0.200 0.456 0.156
#> SRR1032988 4 0.2051 0.770579 0.044 0.000 0.004 0.920 0.012 0.020
#> SRR1032990 3 0.4361 0.612070 0.064 0.012 0.768 0.020 0.000 0.136
#> SRR1032989 4 0.2662 0.755903 0.048 0.000 0.008 0.884 0.004 0.056
#> SRR1032991 5 0.2630 0.708326 0.000 0.064 0.004 0.024 0.888 0.020
#> SRR1032992 3 0.6344 0.510835 0.040 0.008 0.608 0.148 0.020 0.176
#> SRR1032993 4 0.2209 0.764695 0.000 0.000 0.072 0.900 0.024 0.004
#> SRR1032994 3 0.6140 0.333794 0.120 0.004 0.544 0.012 0.020 0.300
#> SRR1032995 4 0.5688 0.464274 0.256 0.004 0.004 0.588 0.008 0.140
#> SRR1032996 4 0.2699 0.763518 0.028 0.000 0.012 0.884 0.008 0.068
#> SRR1032997 4 0.2454 0.751354 0.000 0.000 0.016 0.876 0.104 0.004
#> SRR1032998 4 0.6153 0.360503 0.000 0.004 0.312 0.536 0.060 0.088
#> SRR1032999 5 0.4566 0.687696 0.044 0.012 0.020 0.008 0.752 0.164
#> SRR1033000 4 0.7726 -0.125660 0.000 0.132 0.020 0.392 0.204 0.252
#> SRR1033001 4 0.3332 0.775943 0.016 0.000 0.060 0.856 0.028 0.040
#> SRR1033002 1 0.7601 -0.013040 0.368 0.000 0.056 0.364 0.072 0.140
#> SRR1033003 5 0.2164 0.726124 0.008 0.044 0.000 0.020 0.916 0.012
#> SRR1033004 5 0.7648 0.187745 0.000 0.236 0.004 0.180 0.364 0.216
#> SRR1033005 4 0.4728 0.608284 0.000 0.000 0.192 0.712 0.060 0.036
#> SRR1033006 3 0.3566 0.661672 0.000 0.000 0.820 0.080 0.016 0.084
#> SRR1033007 3 0.6453 0.496989 0.092 0.016 0.604 0.196 0.008 0.084
#> SRR1033008 1 0.2686 0.659309 0.876 0.000 0.012 0.032 0.000 0.080
#> SRR1033009 1 0.5315 0.561038 0.700 0.000 0.028 0.076 0.032 0.164
#> SRR1033010 4 0.5955 0.246828 0.000 0.008 0.376 0.500 0.088 0.028
#> SRR1033011 2 0.4933 0.518909 0.000 0.612 0.024 0.000 0.040 0.324
#> SRR1033012 1 0.2569 0.653884 0.880 0.000 0.012 0.004 0.012 0.092
#> SRR1033013 3 0.4055 0.625553 0.000 0.160 0.776 0.020 0.008 0.036
#> SRR1033014 3 0.2847 0.679755 0.012 0.068 0.876 0.008 0.000 0.036
#> SRR1033015 3 0.5009 0.520468 0.100 0.020 0.676 0.000 0.000 0.204
#> SRR1033016 2 0.5052 0.522036 0.004 0.620 0.020 0.000 0.048 0.308
#> SRR1033017 2 0.5008 0.524754 0.004 0.624 0.024 0.000 0.040 0.308
#> SRR1033018 3 0.4117 0.623747 0.036 0.020 0.776 0.012 0.000 0.156
#> SRR1033019 3 0.2457 0.680733 0.008 0.056 0.896 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033020 1 0.4067 0.528579 0.752 0.000 0.104 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033021 3 0.5191 0.596151 0.100 0.012 0.696 0.008 0.012 0.172
#> SRR1033023 1 0.2462 0.636198 0.876 0.000 0.028 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033022 1 0.2790 0.612627 0.840 0.000 0.020 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033024 3 0.4248 0.563353 0.000 0.220 0.728 0.008 0.008 0.036
#> SRR1033025 1 0.5438 0.509895 0.692 0.004 0.068 0.008 0.068 0.160
#> SRR1033026 3 0.3411 0.631589 0.000 0.160 0.804 0.012 0.000 0.024
#> SRR1033027 2 0.4947 0.515385 0.000 0.608 0.024 0.000 0.040 0.328
#> SRR1033028 4 0.3788 0.607572 0.000 0.000 0.232 0.740 0.008 0.020
#> SRR1033029 5 0.5445 0.625242 0.076 0.008 0.044 0.004 0.676 0.192
#> SRR1033030 3 0.2473 0.681800 0.008 0.048 0.900 0.004 0.004 0.036
#> SRR1033031 1 0.5263 0.475387 0.680 0.008 0.044 0.004 0.052 0.212
#> SRR1033032 3 0.5531 0.557308 0.056 0.008 0.680 0.012 0.056 0.188
#> SRR1033033 2 0.5107 0.510882 0.000 0.604 0.028 0.000 0.048 0.320
#> SRR1033035 2 0.4889 0.525404 0.000 0.624 0.024 0.000 0.040 0.312
#> SRR1033034 1 0.5421 0.481530 0.680 0.008 0.040 0.004 0.084 0.184
#> SRR1033036 1 0.3932 0.531273 0.760 0.000 0.048 0.000 0.008 0.184
#> SRR1033037 1 0.2114 0.667781 0.904 0.000 0.008 0.012 0.000 0.076
#> SRR1033038 1 0.5883 0.352195 0.612 0.004 0.028 0.004 0.156 0.196
#> SRR1033039 3 0.2638 0.669664 0.016 0.016 0.896 0.016 0.004 0.052
#> SRR1033040 3 0.6127 0.050567 0.256 0.000 0.464 0.000 0.008 0.272
#> SRR1033041 1 0.2752 0.631569 0.856 0.000 0.036 0.000 0.000 0.108
#> SRR1033042 1 0.3172 0.616196 0.816 0.000 0.036 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033043 1 0.4591 0.631905 0.764 0.000 0.024 0.088 0.020 0.104
#> SRR1033044 1 0.3368 0.645435 0.828 0.000 0.004 0.016 0.028 0.124
#> SRR1033045 3 0.3093 0.679360 0.000 0.064 0.864 0.036 0.004 0.032
#> SRR1033046 3 0.4231 0.646426 0.064 0.000 0.776 0.028 0.004 0.128
#> SRR1033047 3 0.2785 0.670305 0.024 0.008 0.888 0.024 0.004 0.052
#> SRR1033048 3 0.6044 0.259901 0.192 0.000 0.528 0.008 0.008 0.264
#> SRR1033049 1 0.4118 0.589146 0.768 0.000 0.052 0.004 0.016 0.160
#> SRR1033051 1 0.2863 0.669581 0.864 0.000 0.012 0.036 0.000 0.088
#> SRR1033052 1 0.1588 0.662600 0.924 0.000 0.000 0.004 0.000 0.072
#> SRR1033053 2 0.5108 0.502252 0.004 0.596 0.024 0.000 0.040 0.336
#> SRR1033054 3 0.4711 0.545367 0.096 0.008 0.716 0.008 0.000 0.172
#> SRR1033050 1 0.2729 0.661863 0.872 0.000 0.016 0.024 0.000 0.088
#> SRR1033055 3 0.1904 0.680505 0.020 0.012 0.932 0.004 0.004 0.028
#> SRR1033056 3 0.5638 0.490321 0.184 0.000 0.640 0.036 0.004 0.136
#> SRR1033057 1 0.3806 0.528427 0.752 0.000 0.028 0.000 0.008 0.212
#> SRR1033058 3 0.3502 0.615482 0.000 0.188 0.784 0.004 0.004 0.020
#> SRR1033059 2 0.4919 0.520748 0.000 0.616 0.024 0.000 0.040 0.320
#> SRR1033060 1 0.5724 -0.002738 0.540 0.000 0.200 0.000 0.004 0.256
#> SRR1033061 2 0.5621 0.460376 0.020 0.564 0.032 0.000 0.040 0.344
#> SRR1033062 3 0.3574 0.677215 0.000 0.048 0.836 0.056 0.004 0.056
#> SRR1033063 2 0.4933 0.517610 0.000 0.612 0.024 0.000 0.040 0.324
#> SRR1033064 3 0.2538 0.682976 0.020 0.076 0.888 0.004 0.000 0.012
#> SRR1033065 1 0.2968 0.613985 0.816 0.000 0.016 0.000 0.000 0.168
#> SRR1033066 1 0.4634 0.454500 0.708 0.000 0.060 0.004 0.016 0.212
#> SRR1033067 1 0.4665 0.617919 0.760 0.000 0.024 0.060 0.032 0.124
#> SRR1033068 3 0.4512 0.560407 0.088 0.008 0.728 0.004 0.000 0.172
#> SRR1033069 3 0.6267 0.172350 0.164 0.004 0.488 0.000 0.024 0.320
#> SRR1033070 3 0.4110 0.601348 0.060 0.008 0.776 0.012 0.000 0.144
#> SRR1033071 2 0.5207 0.501778 0.008 0.596 0.028 0.000 0.036 0.332
#> SRR1033072 3 0.5176 0.491062 0.092 0.016 0.652 0.000 0.004 0.236
#> SRR1033073 3 0.2840 0.675693 0.016 0.032 0.880 0.004 0.004 0.064
#> SRR1033074 1 0.4788 0.561010 0.720 0.000 0.000 0.096 0.032 0.152
#> SRR1033075 3 0.6716 0.147428 0.268 0.004 0.492 0.048 0.004 0.184
#> SRR1033076 3 0.5629 0.424202 0.128 0.020 0.608 0.004 0.000 0.240
#> SRR1033077 1 0.4623 0.544703 0.708 0.000 0.012 0.192 0.000 0.088
#> SRR1033078 1 0.2222 0.663886 0.896 0.000 0.012 0.008 0.000 0.084
#> SRR1033079 3 0.3593 0.615689 0.000 0.180 0.784 0.004 0.004 0.028
#> SRR1033080 3 0.3283 0.641878 0.000 0.140 0.824 0.012 0.004 0.020
#> SRR1033081 1 0.5107 0.386514 0.668 0.000 0.144 0.004 0.008 0.176
#> SRR1033082 1 0.5439 0.452025 0.668 0.004 0.068 0.004 0.052 0.204
#> SRR1033083 3 0.2371 0.674258 0.020 0.032 0.908 0.008 0.000 0.032
#> SRR1033084 1 0.1480 0.667349 0.940 0.000 0.000 0.020 0.000 0.040
#> SRR1033085 3 0.3131 0.679351 0.000 0.072 0.860 0.028 0.004 0.036
#> SRR1033086 2 0.5031 0.506810 0.000 0.600 0.028 0.000 0.040 0.332
#> SRR1033087 1 0.1918 0.658975 0.904 0.000 0.008 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033088 3 0.3184 0.644511 0.000 0.140 0.828 0.008 0.004 0.020
#> SRR1033089 3 0.4060 0.647350 0.012 0.016 0.796 0.124 0.004 0.048
#> SRR1033090 4 0.2630 0.749357 0.000 0.000 0.092 0.872 0.032 0.004
#> SRR1033091 3 0.2455 0.675544 0.016 0.020 0.908 0.016 0.004 0.036
#> SRR1033092 1 0.3343 0.617887 0.816 0.000 0.024 0.004 0.008 0.148
#> SRR1033093 2 0.4972 0.533662 0.000 0.628 0.028 0.000 0.044 0.300
#> SRR1033094 3 0.4781 0.591393 0.028 0.052 0.716 0.004 0.004 0.196
#> SRR1033095 5 0.6159 0.591704 0.020 0.152 0.028 0.004 0.608 0.188
#> SRR1033096 3 0.2792 0.675537 0.024 0.020 0.888 0.024 0.000 0.044
#> SRR1033097 2 0.5044 0.502411 0.000 0.596 0.028 0.000 0.040 0.336
#> SRR1033098 3 0.2809 0.678912 0.008 0.088 0.872 0.012 0.000 0.020
#> SRR1033099 2 0.4942 0.515123 0.000 0.612 0.028 0.000 0.036 0.324
#> SRR1033100 2 0.4897 0.529445 0.000 0.624 0.028 0.000 0.036 0.312
#> SRR1033101 3 0.3192 0.679651 0.004 0.076 0.856 0.048 0.004 0.012
#> SRR1033102 1 0.4353 0.579071 0.756 0.004 0.008 0.064 0.008 0.160
#> SRR1033103 1 0.2199 0.643082 0.892 0.000 0.020 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033104 3 0.4797 0.474379 0.000 0.300 0.644 0.016 0.008 0.032
#> SRR1033105 1 0.2405 0.646463 0.880 0.000 0.016 0.000 0.004 0.100
#> SRR1033106 1 0.4613 0.436956 0.696 0.000 0.100 0.000 0.004 0.200
#> SRR1033107 3 0.5310 0.545423 0.004 0.220 0.672 0.028 0.012 0.064
#> SRR1033108 4 0.3393 0.709538 0.108 0.000 0.000 0.820 0.004 0.068
#> SRR1033109 1 0.2187 0.665702 0.908 0.000 0.012 0.012 0.004 0.064
#> SRR1033110 3 0.3873 0.633448 0.068 0.024 0.812 0.008 0.000 0.088
#> SRR1033111 1 0.2163 0.652632 0.892 0.000 0.016 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033112 1 0.2121 0.645562 0.892 0.000 0.012 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033113 3 0.5036 0.527411 0.092 0.012 0.688 0.012 0.000 0.196
#> SRR1033114 1 0.2876 0.633976 0.844 0.000 0.016 0.000 0.008 0.132
#> SRR1033115 1 0.4058 0.535437 0.748 0.000 0.044 0.000 0.012 0.196
#> SRR1033116 3 0.5066 0.536160 0.000 0.232 0.676 0.024 0.012 0.056
#> SRR1033117 3 0.4278 0.518724 0.000 0.280 0.684 0.004 0.008 0.024
#> SRR1033118 3 0.4777 0.477523 0.000 0.012 0.644 0.300 0.008 0.036
#> SRR1033119 1 0.1863 0.648911 0.896 0.000 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1033121 3 0.3020 0.649445 0.004 0.176 0.812 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033120 6 0.7613 0.855523 0.244 0.188 0.128 0.000 0.020 0.420
#> SRR1033122 3 0.4698 0.530809 0.000 0.028 0.668 0.276 0.008 0.020
#> SRR1033123 1 0.3598 0.592283 0.796 0.004 0.016 0.004 0.012 0.168
#> SRR1033124 1 0.2103 0.669109 0.912 0.000 0.012 0.020 0.000 0.056
#> SRR1033125 3 0.6164 -0.010212 0.248 0.008 0.448 0.000 0.000 0.296
#> SRR1033126 1 0.2302 0.637995 0.872 0.000 0.008 0.000 0.000 0.120
#> SRR1033127 3 0.5644 0.468475 0.000 0.224 0.628 0.008 0.028 0.112
#> SRR1033129 3 0.4796 0.447647 0.000 0.312 0.632 0.008 0.008 0.040
#> SRR1033128 1 0.3836 0.486139 0.728 0.000 0.016 0.004 0.004 0.248
#> SRR1033130 1 0.2954 0.662520 0.872 0.000 0.020 0.032 0.008 0.068
#> SRR1033131 1 0.3453 0.569813 0.788 0.000 0.028 0.000 0.004 0.180
#> SRR1033132 3 0.5732 0.352283 0.160 0.008 0.584 0.008 0.000 0.240
#> SRR1033133 3 0.6262 0.017881 0.248 0.008 0.456 0.004 0.000 0.284
#> SRR1033134 1 0.4044 0.590663 0.768 0.000 0.000 0.084 0.008 0.140
#> SRR1033135 3 0.2780 0.679393 0.016 0.092 0.868 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033136 1 0.2056 0.665229 0.904 0.000 0.004 0.012 0.000 0.080
#> SRR1033137 3 0.5111 0.577700 0.056 0.032 0.700 0.012 0.004 0.196
#> SRR1033139 3 0.6141 0.129519 0.192 0.000 0.476 0.000 0.016 0.316
#> SRR1033138 1 0.5988 0.102034 0.560 0.000 0.152 0.004 0.024 0.260
#> SRR1033140 3 0.2966 0.676103 0.016 0.048 0.876 0.016 0.000 0.044
#> SRR1033141 1 0.2587 0.670260 0.892 0.000 0.016 0.036 0.004 0.052
#> SRR1033142 2 0.3065 0.608414 0.000 0.844 0.100 0.000 0.052 0.004
#> SRR1033143 1 0.3519 0.614770 0.804 0.000 0.000 0.044 0.008 0.144
#> SRR1033144 1 0.3147 0.599025 0.816 0.000 0.016 0.000 0.008 0.160
#> SRR1033145 3 0.3155 0.659715 0.044 0.028 0.860 0.004 0.000 0.064
#> SRR1033146 1 0.4294 0.438628 0.700 0.000 0.032 0.004 0.008 0.256
#> SRR1033147 3 0.6402 -0.236877 0.312 0.000 0.368 0.000 0.012 0.308
#> SRR1033148 1 0.4628 0.546433 0.712 0.000 0.000 0.124 0.008 0.156
#> SRR1033149 3 0.3517 0.614800 0.000 0.180 0.788 0.004 0.004 0.024
#> SRR1033150 1 0.5388 0.213396 0.600 0.000 0.168 0.000 0.004 0.228
#> SRR1033151 3 0.5626 0.383512 0.140 0.012 0.592 0.004 0.000 0.252
#> SRR1033152 1 0.5648 -0.015674 0.536 0.000 0.240 0.000 0.000 0.224
#> SRR1033153 3 0.6031 -0.193135 0.344 0.000 0.404 0.000 0.000 0.252
#> SRR1033154 1 0.3582 0.542169 0.768 0.000 0.036 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033156 3 0.3799 0.611769 0.000 0.180 0.776 0.012 0.004 0.028
#> SRR1033157 1 0.1957 0.656018 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1033158 2 0.3206 0.602334 0.000 0.816 0.152 0.000 0.004 0.028
#> SRR1033159 3 0.2841 0.667393 0.000 0.128 0.848 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033160 3 0.3301 0.663658 0.024 0.044 0.852 0.008 0.000 0.072
#> SRR1033161 1 0.5610 0.108145 0.464 0.000 0.004 0.428 0.008 0.096
#> SRR1033163 3 0.5531 0.445584 0.132 0.016 0.632 0.008 0.000 0.212
#> SRR1033162 1 0.3239 0.607301 0.816 0.000 0.024 0.000 0.008 0.152
#> SRR1033164 3 0.4432 0.598885 0.068 0.004 0.740 0.008 0.004 0.176
#> SRR1033165 3 0.6140 0.549945 0.068 0.020 0.652 0.160 0.012 0.088
#> SRR1033166 1 0.4616 0.515451 0.720 0.004 0.036 0.004 0.028 0.208
#> SRR1033167 2 0.7579 0.020058 0.168 0.420 0.012 0.000 0.224 0.176
#> SRR1033168 3 0.3381 0.641924 0.056 0.004 0.836 0.012 0.000 0.092
#> SRR1033169 6 0.7407 0.875705 0.264 0.164 0.108 0.000 0.020 0.444
#> SRR1033171 3 0.6064 0.391646 0.128 0.036 0.576 0.000 0.008 0.252
#> SRR1033170 1 0.2036 0.667492 0.912 0.000 0.008 0.016 0.000 0.064
#> SRR1033172 3 0.2794 0.664132 0.000 0.144 0.840 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033173 2 0.3128 0.612732 0.000 0.844 0.096 0.000 0.052 0.008
#> SRR1033174 3 0.4214 0.664057 0.000 0.068 0.788 0.096 0.004 0.044
#> SRR1033175 1 0.2844 0.650719 0.864 0.004 0.000 0.036 0.004 0.092
#> SRR1033176 1 0.4006 0.515903 0.744 0.000 0.052 0.000 0.004 0.200
#> SRR1033177 2 0.3039 0.610358 0.000 0.848 0.088 0.000 0.060 0.004
#> SRR1033178 5 0.4549 0.692496 0.036 0.020 0.028 0.004 0.760 0.152
#> SRR1033179 5 0.6299 0.547232 0.068 0.012 0.104 0.004 0.600 0.212
#> SRR1033180 1 0.3164 0.622314 0.832 0.000 0.044 0.000 0.004 0.120
#> SRR1033181 1 0.4064 0.506116 0.740 0.000 0.056 0.000 0.004 0.200
#> SRR1033183 3 0.5712 0.437867 0.000 0.112 0.580 0.284 0.008 0.016
#> SRR1033182 1 0.4751 0.376159 0.672 0.000 0.096 0.000 0.004 0.228
#> SRR1033184 3 0.5255 0.455863 0.124 0.004 0.624 0.004 0.000 0.244
#> SRR1033185 1 0.1788 0.666413 0.916 0.000 0.004 0.000 0.004 0.076
#> SRR1033187 1 0.5264 0.569759 0.712 0.004 0.072 0.064 0.008 0.140
#> SRR1033186 1 0.4966 0.479584 0.696 0.000 0.052 0.004 0.044 0.204
#> SRR1033188 3 0.6554 0.485684 0.068 0.024 0.604 0.196 0.012 0.096
#> SRR1033189 3 0.6044 0.319912 0.000 0.308 0.552 0.012 0.036 0.092
#> SRR1033190 1 0.3062 0.631259 0.824 0.004 0.008 0.000 0.008 0.156
#> SRR1033191 1 0.2357 0.637000 0.872 0.000 0.012 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033192 3 0.6318 -0.249230 0.296 0.008 0.372 0.000 0.000 0.324
#> SRR1033193 1 0.2418 0.660178 0.884 0.000 0.008 0.008 0.004 0.096
#> SRR1033195 2 0.6868 0.273699 0.004 0.480 0.240 0.000 0.204 0.072
#> SRR1033194 6 0.7499 0.795488 0.296 0.260 0.064 0.000 0.024 0.356
#> SRR1033197 1 0.2548 0.659241 0.876 0.004 0.016 0.000 0.004 0.100
#> SRR1033196 3 0.5993 -0.054477 0.272 0.000 0.440 0.000 0.000 0.288
#> SRR1033199 2 0.4434 0.436349 0.000 0.684 0.048 0.000 0.260 0.008
#> SRR1033198 1 0.4449 0.559812 0.728 0.008 0.004 0.056 0.004 0.200
#> SRR1033200 1 0.5271 0.497671 0.676 0.008 0.004 0.128 0.012 0.172
#> SRR1033201 3 0.3794 0.641560 0.004 0.120 0.808 0.008 0.008 0.052
#> SRR1033202 3 0.5422 0.465908 0.000 0.288 0.616 0.028 0.012 0.056
#> SRR1033203 3 0.2069 0.678360 0.016 0.028 0.924 0.012 0.000 0.020
#> SRR1033204 1 0.3114 0.629224 0.832 0.000 0.000 0.036 0.004 0.128
#> SRR1033205 3 0.5188 0.507538 0.000 0.272 0.644 0.032 0.012 0.040
#> SRR1033206 1 0.2766 0.637956 0.852 0.000 0.000 0.020 0.004 0.124
#> SRR1033207 1 0.3313 0.621003 0.812 0.000 0.000 0.036 0.004 0.148
#> SRR1033208 3 0.3479 0.630216 0.000 0.172 0.796 0.008 0.004 0.020
#> SRR1033209 3 0.4894 0.649458 0.052 0.016 0.760 0.076 0.008 0.088
#> SRR1033210 3 0.3842 0.617339 0.000 0.168 0.780 0.012 0.004 0.036
#> SRR1033211 1 0.4398 0.620213 0.776 0.004 0.064 0.028 0.008 0.120
#> SRR1033212 3 0.3599 0.612614 0.000 0.212 0.764 0.004 0.004 0.016
#> SRR1033213 2 0.2913 0.615583 0.000 0.848 0.116 0.000 0.032 0.004
#> SRR1033214 4 0.3830 0.701679 0.112 0.004 0.004 0.804 0.008 0.068
#> SRR1033216 1 0.3196 0.634064 0.836 0.004 0.000 0.040 0.004 0.116
#> SRR1033215 3 0.4731 0.402806 0.000 0.332 0.620 0.004 0.012 0.032
#> SRR1033217 3 0.4187 0.616602 0.076 0.012 0.780 0.012 0.000 0.120
#> SRR1033218 1 0.3000 0.635665 0.840 0.000 0.000 0.032 0.004 0.124
#> SRR1033219 1 0.3055 0.631599 0.844 0.004 0.000 0.032 0.004 0.116
#> SRR1033221 5 0.4445 0.500763 0.008 0.252 0.000 0.008 0.696 0.036
#> SRR1033220 5 0.5217 0.051653 0.012 0.448 0.004 0.004 0.492 0.040
#> SRR1033222 1 0.2579 0.653507 0.876 0.000 0.000 0.032 0.004 0.088
#> SRR1033223 3 0.5405 0.463462 0.164 0.008 0.644 0.004 0.004 0.176
#> SRR1033225 2 0.3480 0.558173 0.000 0.776 0.200 0.000 0.008 0.016
#> SRR1033224 1 0.5991 0.375308 0.576 0.008 0.008 0.228 0.008 0.172
#> SRR1033226 1 0.6375 -0.242852 0.416 0.004 0.344 0.012 0.000 0.224
#> SRR1033227 3 0.4939 0.549359 0.000 0.236 0.680 0.024 0.008 0.052
#> SRR1033229 2 0.2715 0.617900 0.000 0.860 0.112 0.000 0.024 0.004
#> SRR1033228 4 0.5376 0.069167 0.408 0.000 0.000 0.480 0.000 0.112
#> SRR1033231 2 0.4851 0.504864 0.000 0.696 0.196 0.000 0.084 0.024
#> SRR1033230 1 0.2630 0.648996 0.872 0.000 0.000 0.032 0.004 0.092
#> SRR1033232 3 0.8307 0.228235 0.116 0.208 0.432 0.136 0.012 0.096
#> SRR1033233 1 0.2964 0.641702 0.856 0.004 0.000 0.040 0.004 0.096
#> SRR1033235 2 0.2673 0.615575 0.000 0.852 0.132 0.000 0.012 0.004
#> SRR1033234 3 0.3890 0.674650 0.028 0.092 0.820 0.008 0.008 0.044
#> SRR1033236 3 0.3459 0.662638 0.000 0.140 0.816 0.020 0.004 0.020
#> SRR1033237 4 0.4373 0.672491 0.104 0.004 0.012 0.764 0.004 0.112
#> SRR1033238 3 0.3559 0.636212 0.000 0.180 0.788 0.012 0.004 0.016
#> SRR1033240 3 0.3581 0.613349 0.000 0.188 0.780 0.004 0.004 0.024
#> SRR1033239 1 0.5182 0.305069 0.632 0.000 0.156 0.004 0.000 0.208
#> SRR1033242 3 0.6648 0.446185 0.016 0.220 0.568 0.128 0.008 0.060
#> SRR1033241 3 0.2926 0.669848 0.000 0.132 0.844 0.008 0.004 0.012
#> SRR1033244 2 0.5589 0.251410 0.000 0.548 0.024 0.008 0.356 0.064
#> SRR1033243 2 0.5188 0.006566 0.012 0.488 0.008 0.000 0.452 0.040
#> SRR1033245 3 0.3787 0.651595 0.052 0.020 0.828 0.016 0.004 0.080
#> SRR1033246 1 0.2420 0.659588 0.888 0.000 0.000 0.032 0.004 0.076
#> SRR1033248 1 0.3595 0.660392 0.840 0.004 0.032 0.044 0.008 0.072
#> SRR1033247 1 0.4607 0.417505 0.676 0.000 0.024 0.000 0.036 0.264
#> SRR1033249 2 0.3744 0.591055 0.000 0.800 0.116 0.000 0.072 0.012
#> SRR1033250 2 0.4070 0.546339 0.004 0.768 0.064 0.000 0.156 0.008
#> SRR1033251 1 0.2450 0.636945 0.868 0.000 0.016 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033252 2 0.3185 0.608303 0.000 0.832 0.116 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033253 1 0.4217 0.599856 0.768 0.000 0.004 0.072 0.016 0.140
#> SRR1033254 1 0.2541 0.657618 0.884 0.000 0.004 0.028 0.004 0.080
#> SRR1033256 2 0.3809 0.580991 0.000 0.788 0.148 0.000 0.048 0.016
#> SRR1033255 3 0.4040 0.662365 0.028 0.080 0.804 0.004 0.004 0.080
#> SRR1033258 1 0.3184 0.636415 0.832 0.004 0.000 0.032 0.004 0.128
#> SRR1033257 4 0.3557 0.687766 0.140 0.000 0.000 0.800 0.004 0.056
#> SRR1033259 1 0.4770 0.515648 0.696 0.000 0.000 0.164 0.008 0.132
#> SRR1033260 2 0.4014 0.576897 0.000 0.780 0.136 0.000 0.064 0.020
#> SRR1033261 3 0.4629 0.553966 0.000 0.236 0.700 0.016 0.012 0.036
#> SRR1033262 3 0.3884 0.606884 0.000 0.180 0.772 0.008 0.008 0.032
#> SRR1033263 2 0.3095 0.597316 0.000 0.828 0.144 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033264 1 0.6544 0.271649 0.512 0.000 0.004 0.280 0.064 0.140
#> SRR1033265 2 0.4601 0.526166 0.008 0.728 0.076 0.000 0.176 0.012
#> SRR1033266 4 0.7232 0.147597 0.184 0.004 0.240 0.460 0.004 0.108
#> SRR1033267 3 0.3896 0.667281 0.008 0.124 0.808 0.024 0.008 0.028
#> SRR1033268 1 0.1444 0.660800 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033269 3 0.5554 0.450241 0.160 0.016 0.624 0.004 0.000 0.196
#> SRR1033270 3 0.4589 0.549777 0.000 0.244 0.696 0.012 0.012 0.036
#> SRR1033271 1 0.2890 0.635019 0.844 0.000 0.000 0.024 0.004 0.128
#> SRR1033272 2 0.3543 0.597093 0.000 0.812 0.124 0.000 0.052 0.012
#> SRR1033273 1 0.1958 0.654720 0.896 0.000 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR1033274 2 0.7234 0.195060 0.004 0.396 0.344 0.004 0.148 0.104
#> SRR1033275 4 0.2970 0.739652 0.072 0.000 0.004 0.860 0.004 0.060
#> SRR1033276 2 0.5498 0.094720 0.012 0.492 0.016 0.000 0.428 0.052
#> SRR1033277 4 0.5393 0.435516 0.300 0.004 0.004 0.596 0.008 0.088
#> SRR1033278 4 0.2288 0.761563 0.000 0.000 0.072 0.896 0.028 0.004
#> SRR1033279 3 0.6066 0.223615 0.208 0.008 0.528 0.008 0.000 0.248
#> SRR1033280 3 0.5269 0.422012 0.144 0.004 0.612 0.000 0.000 0.240
#> SRR1033281 1 0.2293 0.665374 0.896 0.000 0.004 0.016 0.004 0.080
#> SRR1033282 4 0.5611 0.507372 0.200 0.008 0.004 0.624 0.008 0.156
#> SRR1033283 4 0.5559 0.517594 0.192 0.008 0.004 0.632 0.008 0.156
#> SRR1033284 4 0.5611 0.507372 0.200 0.008 0.004 0.624 0.008 0.156
#> SRR1033285 1 0.8735 0.000731 0.328 0.128 0.100 0.260 0.012 0.172
#> SRR1033286 1 0.8756 -0.004946 0.324 0.132 0.100 0.260 0.012 0.172
#> SRR1033287 1 0.8634 0.016822 0.340 0.124 0.088 0.264 0.012 0.172
#> SRR1033288 1 0.8727 0.019748 0.360 0.160 0.096 0.200 0.012 0.172
#> SRR1033289 1 0.8917 -0.036933 0.316 0.180 0.108 0.212 0.012 0.172
#> SRR1033290 1 0.8961 -0.051341 0.308 0.184 0.116 0.212 0.012 0.168
#> SRR1033291 4 0.8750 0.128918 0.232 0.124 0.116 0.348 0.012 0.168
#> SRR1033292 4 0.8521 0.145383 0.256 0.108 0.088 0.364 0.012 0.172
#> SRR1033293 4 0.8742 0.118817 0.240 0.124 0.112 0.344 0.012 0.168
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.587 0.868 0.923 0.1839 0.920 0.920
#> 3 3 0.218 0.392 0.652 1.6396 0.760 0.739
#> 4 4 0.282 0.569 0.674 0.3314 0.644 0.486
#> 5 5 0.499 0.708 0.776 0.1430 0.851 0.593
#> 6 6 0.597 0.606 0.759 0.0577 0.971 0.880
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.8327 0.72105 0.736 0.264
#> SRR1032911 1 0.8443 0.71112 0.728 0.272
#> SRR1032912 1 0.8386 0.71625 0.732 0.268
#> SRR1032913 1 0.8386 0.71625 0.732 0.268
#> SRR1032914 1 0.8081 0.74056 0.752 0.248
#> SRR1032915 1 0.7056 0.80541 0.808 0.192
#> SRR1032916 1 0.8144 0.73886 0.748 0.252
#> SRR1032917 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1032918 1 0.8443 0.71112 0.728 0.272
#> SRR1032919 1 0.7883 0.75580 0.764 0.236
#> SRR1032920 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1633 0.91870 0.976 0.024
#> SRR1032922 1 0.2778 0.91298 0.952 0.048
#> SRR1032923 1 0.7376 0.80497 0.792 0.208
#> SRR1032925 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.8386 0.71627 0.732 0.268
#> SRR1032926 1 0.4562 0.88973 0.904 0.096
#> SRR1032927 1 0.8443 0.71112 0.728 0.272
#> SRR1032929 1 0.8499 0.70517 0.724 0.276
#> SRR1032928 1 0.5059 0.88047 0.888 0.112
#> SRR1032930 1 0.8207 0.73071 0.744 0.256
#> SRR1032931 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032932 1 0.2778 0.90796 0.952 0.048
#> SRR1032933 1 0.8443 0.71112 0.728 0.272
#> SRR1032934 1 0.5178 0.87260 0.884 0.116
#> SRR1032935 1 0.8386 0.71726 0.732 0.268
#> SRR1032936 1 0.6531 0.82912 0.832 0.168
#> SRR1032937 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.2043 0.91712 0.968 0.032
#> SRR1032939 1 0.2778 0.91298 0.952 0.048
#> SRR1032940 1 0.6801 0.81589 0.820 0.180
#> SRR1032941 1 0.8207 0.73053 0.744 0.256
#> SRR1032942 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032943 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.1184 0.91897 0.984 0.016
#> SRR1032945 1 0.8267 0.72514 0.740 0.260
#> SRR1032946 1 0.7528 0.78547 0.784 0.216
#> SRR1032947 1 0.5629 0.85721 0.868 0.132
#> SRR1032948 1 0.8443 0.71112 0.728 0.272
#> SRR1032949 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.3114 0.90971 0.944 0.056
#> SRR1032951 1 0.8267 0.72756 0.740 0.260
#> SRR1032952 1 0.6048 0.84958 0.852 0.148
#> SRR1032953 1 0.8386 0.71627 0.732 0.268
#> SRR1032954 1 0.2603 0.91443 0.956 0.044
#> SRR1032955 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.8207 0.73053 0.744 0.256
#> SRR1032956 1 0.1184 0.91897 0.984 0.016
#> SRR1032958 1 0.8386 0.71697 0.732 0.268
#> SRR1032959 1 0.7219 0.79874 0.800 0.200
#> SRR1032960 1 0.7950 0.74982 0.760 0.240
#> SRR1032961 1 0.2043 0.91751 0.968 0.032
#> SRR1032962 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1032963 1 0.7674 0.76896 0.776 0.224
#> SRR1032964 1 0.7883 0.75546 0.764 0.236
#> SRR1032965 1 0.8443 0.71112 0.728 0.272
#> SRR1032966 1 0.7950 0.75101 0.760 0.240
#> SRR1032967 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.7883 0.75546 0.764 0.236
#> SRR1032969 1 0.6438 0.82675 0.836 0.164
#> SRR1032970 1 0.8386 0.71697 0.732 0.268
#> SRR1032971 1 0.7950 0.75070 0.760 0.240
#> SRR1032972 1 0.8267 0.72821 0.740 0.260
#> SRR1032973 1 0.8144 0.73534 0.748 0.252
#> SRR1032974 1 0.4161 0.89361 0.916 0.084
#> SRR1032975 1 0.8144 0.73783 0.748 0.252
#> SRR1032976 1 0.6973 0.81095 0.812 0.188
#> SRR1032977 1 0.5946 0.84397 0.856 0.144
#> SRR1032978 1 0.2236 0.91765 0.964 0.036
#> SRR1032979 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.6887 0.81272 0.816 0.184
#> SRR1032981 1 0.7950 0.74954 0.760 0.240
#> SRR1032982 1 0.8267 0.72554 0.740 0.260
#> SRR1032983 1 0.4022 0.89823 0.920 0.080
#> SRR1032984 1 0.6973 0.80502 0.812 0.188
#> SRR1032985 1 0.8327 0.72311 0.736 0.264
#> SRR1032986 1 0.8386 0.71606 0.732 0.268
#> SRR1032987 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.8386 0.71735 0.732 0.268
#> SRR1032990 1 0.1414 0.91990 0.980 0.020
#> SRR1032989 1 0.8386 0.71627 0.732 0.268
#> SRR1032991 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.3431 0.90647 0.936 0.064
#> SRR1032993 1 0.7299 0.79616 0.796 0.204
#> SRR1032994 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1032995 1 0.4161 0.89679 0.916 0.084
#> SRR1032996 1 0.7602 0.77906 0.780 0.220
#> SRR1032997 1 0.7674 0.76933 0.776 0.224
#> SRR1032998 1 0.2778 0.91298 0.952 0.048
#> SRR1032999 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033000 1 0.5946 0.84397 0.856 0.144
#> SRR1033001 1 0.4161 0.89574 0.916 0.084
#> SRR1033002 1 0.2603 0.91573 0.956 0.044
#> SRR1033003 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033004 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.3733 0.90011 0.928 0.072
#> SRR1033006 1 0.1184 0.92029 0.984 0.016
#> SRR1033007 1 0.7453 0.80051 0.788 0.212
#> SRR1033008 1 0.2423 0.91534 0.960 0.040
#> SRR1033009 1 0.1414 0.91868 0.980 0.020
#> SRR1033010 1 0.7219 0.79489 0.800 0.200
#> SRR1033011 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0672 0.91992 0.992 0.008
#> SRR1033013 1 0.1843 0.91843 0.972 0.028
#> SRR1033014 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033015 1 0.1184 0.91982 0.984 0.016
#> SRR1033016 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033017 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033019 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033020 1 0.7674 0.77187 0.776 0.224
#> SRR1033021 1 0.4690 0.88695 0.900 0.100
#> SRR1033023 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033022 1 0.0376 0.91982 0.996 0.004
#> SRR1033024 1 0.1184 0.91911 0.984 0.016
#> SRR1033025 1 0.0672 0.91992 0.992 0.008
#> SRR1033026 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033027 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.7815 0.75897 0.768 0.232
#> SRR1033029 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033030 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033031 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033032 1 0.0376 0.91964 0.996 0.004
#> SRR1033033 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033035 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0672 0.92037 0.992 0.008
#> SRR1033036 1 0.1184 0.91972 0.984 0.016
#> SRR1033037 1 0.1843 0.91786 0.972 0.028
#> SRR1033038 1 0.0376 0.91982 0.996 0.004
#> SRR1033039 1 0.1414 0.92014 0.980 0.020
#> SRR1033040 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033041 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033042 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033043 1 0.2603 0.91408 0.956 0.044
#> SRR1033044 1 0.0672 0.91992 0.992 0.008
#> SRR1033045 1 0.1184 0.91911 0.984 0.016
#> SRR1033046 1 0.3274 0.90969 0.940 0.060
#> SRR1033047 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033048 1 0.1633 0.92052 0.976 0.024
#> SRR1033049 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033051 1 0.0672 0.91970 0.992 0.008
#> SRR1033052 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033053 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033050 1 0.1843 0.91802 0.972 0.028
#> SRR1033055 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033056 1 0.3431 0.90670 0.936 0.064
#> SRR1033057 1 0.0672 0.91992 0.992 0.008
#> SRR1033058 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033059 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.8016 0.72977 0.756 0.244
#> SRR1033061 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033062 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033063 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033065 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033066 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033067 1 0.1414 0.91898 0.980 0.020
#> SRR1033068 1 0.0938 0.92004 0.988 0.012
#> SRR1033069 1 0.0376 0.91964 0.996 0.004
#> SRR1033070 1 0.1184 0.91983 0.984 0.016
#> SRR1033071 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033072 1 0.0376 0.91964 0.996 0.004
#> SRR1033073 1 0.0672 0.92012 0.992 0.008
#> SRR1033074 1 0.2778 0.91265 0.952 0.048
#> SRR1033075 1 0.7674 0.75663 0.776 0.224
#> SRR1033076 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033077 1 0.2778 0.91242 0.952 0.048
#> SRR1033078 1 0.2043 0.91713 0.968 0.032
#> SRR1033079 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033080 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033081 1 0.5408 0.87057 0.876 0.124
#> SRR1033082 1 0.0672 0.91992 0.992 0.008
#> SRR1033083 1 0.1184 0.91982 0.984 0.016
#> SRR1033084 1 0.2043 0.91708 0.968 0.032
#> SRR1033085 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033086 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.1184 0.91897 0.984 0.016
#> SRR1033088 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033089 1 0.1184 0.92003 0.984 0.016
#> SRR1033090 1 0.8207 0.73016 0.744 0.256
#> SRR1033091 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033092 1 0.0672 0.91970 0.992 0.008
#> SRR1033093 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.0376 0.91964 0.996 0.004
#> SRR1033095 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.1414 0.91997 0.980 0.020
#> SRR1033097 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033098 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033099 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033100 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.1184 0.92003 0.984 0.016
#> SRR1033102 1 0.2603 0.91322 0.956 0.044
#> SRR1033103 1 0.1184 0.91897 0.984 0.016
#> SRR1033104 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033105 1 0.1414 0.91901 0.980 0.020
#> SRR1033106 1 0.9129 0.56327 0.672 0.328
#> SRR1033107 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033108 1 0.8499 0.70517 0.724 0.276
#> SRR1033109 1 0.1414 0.91876 0.980 0.020
#> SRR1033110 1 0.1633 0.91986 0.976 0.024
#> SRR1033111 1 0.1184 0.91940 0.984 0.016
#> SRR1033112 1 0.1184 0.91897 0.984 0.016
#> SRR1033113 1 0.0938 0.91997 0.988 0.012
#> SRR1033114 1 0.0376 0.91982 0.996 0.004
#> SRR1033115 1 0.0376 0.91994 0.996 0.004
#> SRR1033116 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033117 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033118 1 0.9661 0.46577 0.608 0.392
#> SRR1033119 1 0.0672 0.91992 0.992 0.008
#> SRR1033121 1 0.1184 0.91911 0.984 0.016
#> SRR1033120 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.9608 0.48691 0.616 0.384
#> SRR1033123 1 0.0376 0.91982 0.996 0.004
#> SRR1033124 1 0.1633 0.91856 0.976 0.024
#> SRR1033125 1 0.1633 0.91967 0.976 0.024
#> SRR1033126 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033127 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033129 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033128 1 0.0376 0.91982 0.996 0.004
#> SRR1033130 1 0.4939 0.88193 0.892 0.108
#> SRR1033131 1 0.5842 0.85032 0.860 0.140
#> SRR1033132 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033133 1 0.7139 0.77399 0.804 0.196
#> SRR1033134 1 0.7299 0.79886 0.796 0.204
#> SRR1033135 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033136 1 0.2043 0.91704 0.968 0.032
#> SRR1033137 1 0.1414 0.91997 0.980 0.020
#> SRR1033139 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033138 1 0.0672 0.92041 0.992 0.008
#> SRR1033140 1 0.1414 0.91979 0.980 0.020
#> SRR1033141 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033142 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2043 0.91677 0.968 0.032
#> SRR1033144 1 0.0672 0.91992 0.992 0.008
#> SRR1033145 1 0.1184 0.91982 0.984 0.016
#> SRR1033146 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0672 0.91904 0.992 0.008
#> SRR1033148 1 0.2948 0.91171 0.948 0.052
#> SRR1033149 1 0.1184 0.91911 0.984 0.016
#> SRR1033150 1 0.9963 0.18257 0.536 0.464
#> SRR1033151 1 0.0938 0.91941 0.988 0.012
#> SRR1033152 1 0.8661 0.65892 0.712 0.288
#> SRR1033153 1 0.1414 0.92010 0.980 0.020
#> SRR1033154 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033156 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033157 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033158 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.1414 0.92004 0.980 0.020
#> SRR1033160 1 0.1184 0.91982 0.984 0.016
#> SRR1033161 1 0.7453 0.78535 0.788 0.212
#> SRR1033163 1 0.0938 0.91997 0.988 0.012
#> SRR1033162 1 0.0376 0.91982 0.996 0.004
#> SRR1033164 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.7453 0.80051 0.788 0.212
#> SRR1033166 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033167 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.1633 0.92010 0.976 0.024
#> SRR1033169 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033171 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0938 0.91947 0.988 0.012
#> SRR1033172 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033173 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.3274 0.90733 0.940 0.060
#> SRR1033175 1 0.1633 0.91889 0.976 0.024
#> SRR1033176 1 0.1184 0.92040 0.984 0.016
#> SRR1033177 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033178 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033179 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0376 0.91994 0.996 0.004
#> SRR1033181 1 0.2948 0.91168 0.948 0.052
#> SRR1033183 1 0.7883 0.75691 0.764 0.236
#> SRR1033182 1 0.8713 0.63468 0.708 0.292
#> SRR1033184 1 0.2236 0.91741 0.964 0.036
#> SRR1033185 1 0.1184 0.91897 0.984 0.016
#> SRR1033187 2 0.8661 0.57736 0.288 0.712
#> SRR1033186 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.7453 0.80051 0.788 0.212
#> SRR1033189 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0672 0.91992 0.992 0.008
#> SRR1033191 1 0.0376 0.91982 0.996 0.004
#> SRR1033192 1 0.0376 0.91964 0.996 0.004
#> SRR1033193 1 0.4562 0.88783 0.904 0.096
#> SRR1033195 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033194 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0376 0.91982 0.996 0.004
#> SRR1033196 1 0.1184 0.91983 0.984 0.016
#> SRR1033199 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.4298 0.89500 0.912 0.088
#> SRR1033200 1 0.7376 0.80126 0.792 0.208
#> SRR1033201 1 0.1184 0.91911 0.984 0.016
#> SRR1033202 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033203 1 0.1414 0.91925 0.980 0.020
#> SRR1033204 1 0.8763 0.66059 0.704 0.296
#> SRR1033205 1 0.4298 0.88375 0.912 0.088
#> SRR1033206 1 0.2603 0.91414 0.956 0.044
#> SRR1033207 1 0.3114 0.90879 0.944 0.056
#> SRR1033208 1 0.2043 0.91445 0.968 0.032
#> SRR1033209 2 0.5519 0.82920 0.128 0.872
#> SRR1033210 1 0.1843 0.91586 0.972 0.028
#> SRR1033211 2 0.5842 0.82106 0.140 0.860
#> SRR1033212 1 0.1843 0.91586 0.972 0.028
#> SRR1033213 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.8144 0.73873 0.748 0.252
#> SRR1033216 1 0.8955 0.62979 0.688 0.312
#> SRR1033215 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033217 1 0.1633 0.91910 0.976 0.024
#> SRR1033218 1 0.3431 0.90723 0.936 0.064
#> SRR1033219 1 0.2778 0.91211 0.952 0.048
#> SRR1033221 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033220 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.3274 0.90890 0.940 0.060
#> SRR1033223 1 0.6531 0.80786 0.832 0.168
#> SRR1033225 1 0.0938 0.91946 0.988 0.012
#> SRR1033224 1 0.7376 0.80042 0.792 0.208
#> SRR1033226 1 0.6623 0.80351 0.828 0.172
#> SRR1033227 1 0.4298 0.88375 0.912 0.088
#> SRR1033229 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.8207 0.73459 0.744 0.256
#> SRR1033231 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.3431 0.90566 0.936 0.064
#> SRR1033232 1 0.8267 0.67910 0.740 0.260
#> SRR1033233 1 0.3274 0.90754 0.940 0.060
#> SRR1033235 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.6343 0.82029 0.840 0.160
#> SRR1033236 1 0.6343 0.82088 0.840 0.160
#> SRR1033237 2 0.9944 -0.00286 0.456 0.544
#> SRR1033238 1 0.3733 0.89893 0.928 0.072
#> SRR1033240 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033239 1 0.9954 0.23961 0.540 0.460
#> SRR1033242 1 0.7139 0.78931 0.804 0.196
#> SRR1033241 1 0.1633 0.91904 0.976 0.024
#> SRR1033244 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033243 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.3114 0.90788 0.944 0.056
#> SRR1033246 1 0.2948 0.91114 0.948 0.052
#> SRR1033248 1 0.2423 0.91636 0.960 0.040
#> SRR1033247 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033249 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033250 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.2603 0.91558 0.956 0.044
#> SRR1033252 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.2043 0.91739 0.968 0.032
#> SRR1033254 1 0.2948 0.91190 0.948 0.052
#> SRR1033256 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.2043 0.91717 0.968 0.032
#> SRR1033258 1 0.3274 0.90737 0.940 0.060
#> SRR1033257 1 0.8499 0.70517 0.724 0.276
#> SRR1033259 1 0.7528 0.78476 0.784 0.216
#> SRR1033260 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.1414 0.91834 0.980 0.020
#> SRR1033262 1 0.1414 0.91925 0.980 0.020
#> SRR1033263 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4431 0.88640 0.908 0.092
#> SRR1033265 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.4815 0.88145 0.896 0.104
#> SRR1033267 1 0.4298 0.88375 0.912 0.088
#> SRR1033268 1 0.2236 0.91589 0.964 0.036
#> SRR1033269 1 0.1414 0.92069 0.980 0.020
#> SRR1033270 1 0.1633 0.91828 0.976 0.024
#> SRR1033271 1 0.2778 0.91239 0.952 0.048
#> SRR1033272 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.2236 0.91572 0.964 0.036
#> SRR1033274 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.8555 0.69980 0.720 0.280
#> SRR1033276 1 0.0000 0.91994 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.7950 0.75298 0.760 0.240
#> SRR1033278 1 0.8267 0.72782 0.740 0.260
#> SRR1033279 1 0.1414 0.92038 0.980 0.020
#> SRR1033280 1 0.0938 0.91922 0.988 0.012
#> SRR1033281 1 0.2236 0.91653 0.964 0.036
#> SRR1033282 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033283 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033284 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033285 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033286 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033287 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033288 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033289 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033290 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033291 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033292 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
#> SRR1033293 2 0.0000 0.92549 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.890 0.9220 0.500 0.128 0.372
#> SRR1032911 1 0.898 0.9222 0.496 0.136 0.368
#> SRR1032912 1 0.892 0.9204 0.504 0.132 0.364
#> SRR1032913 1 0.892 0.9204 0.504 0.132 0.364
#> SRR1032914 1 0.864 0.9184 0.516 0.108 0.376
#> SRR1032915 3 0.846 -0.7663 0.448 0.088 0.464
#> SRR1032916 1 0.882 0.9081 0.500 0.120 0.380
#> SRR1032917 3 0.243 0.4900 0.024 0.036 0.940
#> SRR1032918 1 0.898 0.9222 0.496 0.136 0.368
#> SRR1032919 1 0.869 0.8618 0.456 0.104 0.440
#> SRR1032920 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032921 3 0.683 0.1607 0.376 0.020 0.604
#> SRR1032922 3 0.529 0.4117 0.172 0.028 0.800
#> SRR1032923 3 0.776 0.0911 0.144 0.180 0.676
#> SRR1032925 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032924 1 0.898 0.9221 0.496 0.136 0.368
#> SRR1032926 3 0.697 0.0590 0.288 0.044 0.668
#> SRR1032927 1 0.903 0.9213 0.492 0.140 0.368
#> SRR1032929 1 0.908 0.9193 0.488 0.144 0.368
#> SRR1032928 3 0.731 -0.0116 0.296 0.056 0.648
#> SRR1032930 1 0.882 0.9214 0.500 0.120 0.380
#> SRR1032931 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032932 3 0.749 0.3453 0.468 0.036 0.496
#> SRR1032933 1 0.903 0.9213 0.492 0.140 0.368
#> SRR1032934 3 0.722 0.0263 0.284 0.056 0.660
#> SRR1032935 1 0.898 0.9195 0.496 0.136 0.368
#> SRR1032936 3 0.801 0.1301 0.244 0.116 0.640
#> SRR1032937 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032938 3 0.695 0.1131 0.376 0.024 0.600
#> SRR1032939 3 0.556 0.3954 0.192 0.028 0.780
#> SRR1032940 3 0.789 -0.6631 0.432 0.056 0.512
#> SRR1032941 1 0.884 0.9145 0.488 0.120 0.392
#> SRR1032942 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032943 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032944 3 0.657 0.2020 0.376 0.012 0.612
#> SRR1032945 1 0.881 0.9212 0.504 0.120 0.376
#> SRR1032946 3 0.919 -0.6689 0.420 0.148 0.432
#> SRR1032947 3 0.751 -0.3457 0.344 0.052 0.604
#> SRR1032948 1 0.898 0.9222 0.496 0.136 0.368
#> SRR1032949 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032950 3 0.564 0.3972 0.180 0.036 0.784
#> SRR1032951 1 0.891 0.9210 0.496 0.128 0.376
#> SRR1032952 3 0.780 -0.2090 0.308 0.076 0.616
#> SRR1032953 1 0.898 0.9221 0.496 0.136 0.368
#> SRR1032954 3 0.719 0.1081 0.356 0.036 0.608
#> SRR1032955 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032957 1 0.879 0.9134 0.492 0.116 0.392
#> SRR1032956 3 0.657 0.1583 0.376 0.012 0.612
#> SRR1032958 1 0.899 0.9228 0.492 0.136 0.372
#> SRR1032959 3 0.889 -0.7501 0.432 0.120 0.448
#> SRR1032960 1 0.867 0.8874 0.480 0.104 0.416
#> SRR1032961 3 0.697 0.1118 0.380 0.024 0.596
#> SRR1032962 3 0.576 0.4906 0.328 0.000 0.672
#> SRR1032963 1 0.845 0.8677 0.488 0.088 0.424
#> SRR1032964 1 0.861 0.8951 0.484 0.100 0.416
#> SRR1032965 1 0.903 0.9213 0.492 0.140 0.368
#> SRR1032966 1 0.879 0.9081 0.492 0.116 0.392
#> SRR1032967 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032968 1 0.861 0.8880 0.484 0.100 0.416
#> SRR1032969 3 0.796 -0.6314 0.428 0.060 0.512
#> SRR1032970 1 0.899 0.9228 0.492 0.136 0.372
#> SRR1032971 1 0.868 0.8914 0.476 0.104 0.420
#> SRR1032972 1 0.882 0.9216 0.500 0.120 0.380
#> SRR1032973 1 0.875 0.9072 0.492 0.112 0.396
#> SRR1032974 3 0.740 -0.2124 0.412 0.036 0.552
#> SRR1032975 1 0.893 0.9171 0.488 0.128 0.384
#> SRR1032976 3 0.855 -0.0291 0.284 0.132 0.584
#> SRR1032977 1 0.795 0.2676 0.548 0.064 0.388
#> SRR1032978 3 0.693 0.1614 0.348 0.028 0.624
#> SRR1032979 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032980 3 0.805 -0.6587 0.432 0.064 0.504
#> SRR1032981 1 0.867 0.8903 0.484 0.104 0.412
#> SRR1032982 1 0.880 0.9211 0.508 0.120 0.372
#> SRR1032983 3 0.645 0.2105 0.252 0.036 0.712
#> SRR1032984 3 0.807 -0.7698 0.464 0.064 0.472
#> SRR1032985 1 0.894 0.9202 0.500 0.132 0.368
#> SRR1032986 1 0.898 0.9221 0.496 0.136 0.368
#> SRR1032987 3 0.650 0.3909 0.464 0.004 0.532
#> SRR1032988 1 0.904 0.9225 0.488 0.140 0.372
#> SRR1032990 3 0.323 0.4964 0.072 0.020 0.908
#> SRR1032989 1 0.899 0.9226 0.492 0.136 0.372
#> SRR1032991 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1032992 3 0.595 0.3341 0.196 0.040 0.764
#> SRR1032993 3 0.834 -0.7718 0.448 0.080 0.472
#> SRR1032994 3 0.357 0.5183 0.120 0.004 0.876
#> SRR1032995 3 0.774 -0.1328 0.376 0.056 0.568
#> SRR1032996 1 0.893 0.7554 0.452 0.124 0.424
#> SRR1032997 1 0.852 0.8462 0.472 0.092 0.436
#> SRR1032998 3 0.512 0.4111 0.160 0.028 0.812
#> SRR1032999 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033000 1 0.795 0.2676 0.548 0.064 0.388
#> SRR1033001 3 0.687 0.1322 0.276 0.044 0.680
#> SRR1033002 3 0.617 0.3972 0.224 0.036 0.740
#> SRR1033003 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033004 3 0.650 0.3909 0.464 0.004 0.532
#> SRR1033005 3 0.606 0.3115 0.224 0.032 0.744
#> SRR1033006 3 0.259 0.5225 0.072 0.004 0.924
#> SRR1033007 3 0.775 0.0952 0.140 0.184 0.676
#> SRR1033008 3 0.723 0.1105 0.364 0.036 0.600
#> SRR1033009 3 0.672 0.1464 0.380 0.016 0.604
#> SRR1033010 3 0.858 -0.7826 0.448 0.096 0.456
#> SRR1033011 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033012 3 0.615 0.2581 0.356 0.004 0.640
#> SRR1033013 3 0.279 0.4879 0.028 0.044 0.928
#> SRR1033014 3 0.328 0.5131 0.068 0.024 0.908
#> SRR1033015 3 0.270 0.5145 0.056 0.016 0.928
#> SRR1033016 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033017 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033018 3 0.303 0.5229 0.076 0.012 0.912
#> SRR1033019 3 0.327 0.5165 0.080 0.016 0.904
#> SRR1033020 3 0.933 -0.1002 0.284 0.204 0.512
#> SRR1033021 3 0.665 0.3315 0.172 0.084 0.744
#> SRR1033023 3 0.625 0.2854 0.344 0.008 0.648
#> SRR1033022 3 0.606 0.2826 0.340 0.004 0.656
#> SRR1033024 3 0.281 0.5007 0.040 0.032 0.928
#> SRR1033025 3 0.613 0.2734 0.352 0.004 0.644
#> SRR1033026 3 0.268 0.5002 0.040 0.028 0.932
#> SRR1033027 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033028 1 0.847 0.8995 0.504 0.092 0.404
#> SRR1033029 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033030 3 0.397 0.5071 0.100 0.024 0.876
#> SRR1033031 3 0.632 0.3282 0.356 0.008 0.636
#> SRR1033032 3 0.569 0.4944 0.288 0.004 0.708
#> SRR1033033 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033035 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033034 3 0.617 0.2387 0.360 0.004 0.636
#> SRR1033036 3 0.638 0.2704 0.340 0.012 0.648
#> SRR1033037 3 0.690 0.1560 0.364 0.024 0.612
#> SRR1033038 3 0.617 0.4160 0.360 0.004 0.636
#> SRR1033039 3 0.334 0.5103 0.060 0.032 0.908
#> SRR1033040 3 0.355 0.5102 0.132 0.000 0.868
#> SRR1033041 3 0.643 0.1742 0.380 0.008 0.612
#> SRR1033042 3 0.627 0.2782 0.348 0.008 0.644
#> SRR1033043 3 0.706 0.1395 0.352 0.032 0.616
#> SRR1033044 3 0.636 0.2103 0.364 0.008 0.628
#> SRR1033045 3 0.253 0.5098 0.044 0.020 0.936
#> SRR1033046 3 0.663 0.3198 0.220 0.056 0.724
#> SRR1033047 3 0.265 0.5174 0.060 0.012 0.928
#> SRR1033048 3 0.537 0.3995 0.208 0.016 0.776
#> SRR1033049 3 0.620 0.2806 0.336 0.008 0.656
#> SRR1033051 3 0.621 0.2085 0.368 0.004 0.628
#> SRR1033052 3 0.634 0.2332 0.360 0.008 0.632
#> SRR1033053 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033054 3 0.228 0.5110 0.052 0.008 0.940
#> SRR1033050 3 0.692 0.1651 0.368 0.024 0.608
#> SRR1033055 3 0.290 0.5157 0.064 0.016 0.920
#> SRR1033056 3 0.558 0.3848 0.168 0.040 0.792
#> SRR1033057 3 0.625 0.2936 0.344 0.008 0.648
#> SRR1033058 3 0.266 0.5052 0.044 0.024 0.932
#> SRR1033059 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033060 3 0.930 -0.0595 0.248 0.228 0.524
#> SRR1033061 3 0.606 0.4553 0.384 0.000 0.616
#> SRR1033062 3 0.425 0.5068 0.108 0.028 0.864
#> SRR1033063 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033064 3 0.270 0.5136 0.056 0.016 0.928
#> SRR1033065 3 0.632 0.2773 0.356 0.008 0.636
#> SRR1033066 3 0.623 0.3085 0.340 0.008 0.652
#> SRR1033067 3 0.672 0.1650 0.380 0.016 0.604
#> SRR1033068 3 0.249 0.5132 0.060 0.008 0.932
#> SRR1033069 3 0.587 0.4876 0.312 0.004 0.684
#> SRR1033070 3 0.268 0.5174 0.068 0.008 0.924
#> SRR1033071 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033072 3 0.566 0.4946 0.284 0.004 0.712
#> SRR1033073 3 0.427 0.5088 0.116 0.024 0.860
#> SRR1033074 3 0.728 0.0933 0.376 0.036 0.588
#> SRR1033075 3 0.908 -0.0508 0.240 0.208 0.552
#> SRR1033076 3 0.287 0.5203 0.076 0.008 0.916
#> SRR1033077 3 0.739 -0.0409 0.380 0.040 0.580
#> SRR1033078 3 0.701 0.1476 0.364 0.028 0.608
#> SRR1033079 3 0.279 0.4998 0.044 0.028 0.928
#> SRR1033080 3 0.346 0.5074 0.076 0.024 0.900
#> SRR1033081 3 0.828 0.1059 0.296 0.108 0.596
#> SRR1033082 3 0.638 0.3029 0.368 0.008 0.624
#> SRR1033083 3 0.341 0.5104 0.068 0.028 0.904
#> SRR1033084 3 0.705 0.1365 0.372 0.028 0.600
#> SRR1033085 3 0.318 0.5095 0.064 0.024 0.912
#> SRR1033086 3 0.606 0.4553 0.384 0.000 0.616
#> SRR1033087 3 0.655 0.2011 0.372 0.012 0.616
#> SRR1033088 3 0.372 0.5085 0.088 0.024 0.888
#> SRR1033089 3 0.260 0.5124 0.052 0.016 0.932
#> SRR1033090 1 0.877 0.9196 0.500 0.116 0.384
#> SRR1033091 3 0.275 0.5180 0.064 0.012 0.924
#> SRR1033092 3 0.606 0.2746 0.340 0.004 0.656
#> SRR1033093 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033094 3 0.541 0.5154 0.224 0.012 0.764
#> SRR1033095 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033096 3 0.300 0.5118 0.068 0.016 0.916
#> SRR1033097 3 0.606 0.4553 0.384 0.000 0.616
#> SRR1033098 3 0.323 0.5114 0.072 0.020 0.908
#> SRR1033099 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033100 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033101 3 0.260 0.5124 0.052 0.016 0.932
#> SRR1033102 3 0.731 0.1056 0.360 0.040 0.600
#> SRR1033103 3 0.649 0.2319 0.360 0.012 0.628
#> SRR1033104 3 0.256 0.4914 0.028 0.036 0.936
#> SRR1033105 3 0.670 0.2369 0.376 0.016 0.608
#> SRR1033106 3 0.946 -0.1724 0.204 0.312 0.484
#> SRR1033107 3 0.269 0.4929 0.032 0.036 0.932
#> SRR1033108 1 0.908 0.9193 0.488 0.144 0.368
#> SRR1033109 3 0.667 0.1794 0.368 0.016 0.616
#> SRR1033110 3 0.292 0.4913 0.044 0.032 0.924
#> SRR1033111 3 0.640 0.3201 0.344 0.012 0.644
#> SRR1033112 3 0.653 0.2324 0.368 0.012 0.620
#> SRR1033113 3 0.295 0.5226 0.088 0.004 0.908
#> SRR1033114 3 0.617 0.3273 0.360 0.004 0.636
#> SRR1033115 3 0.593 0.3696 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033116 3 0.256 0.4914 0.028 0.036 0.936
#> SRR1033117 3 0.279 0.4998 0.044 0.028 0.928
#> SRR1033118 1 0.969 0.6170 0.460 0.264 0.276
#> SRR1033119 3 0.625 0.2124 0.376 0.004 0.620
#> SRR1033121 3 0.205 0.4939 0.020 0.028 0.952
#> SRR1033120 3 0.595 0.4866 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033122 1 0.968 0.6404 0.460 0.256 0.284
#> SRR1033123 3 0.617 0.2937 0.360 0.004 0.636
#> SRR1033124 3 0.678 0.2096 0.364 0.020 0.616
#> SRR1033125 3 0.375 0.5081 0.096 0.020 0.884
#> SRR1033126 3 0.640 0.2466 0.372 0.008 0.620
#> SRR1033127 3 0.585 0.4851 0.268 0.012 0.720
#> SRR1033129 3 0.256 0.4914 0.028 0.036 0.936
#> SRR1033128 3 0.621 0.3239 0.368 0.004 0.628
#> SRR1033130 3 0.818 -0.0254 0.324 0.092 0.584
#> SRR1033131 3 0.868 0.0488 0.316 0.128 0.556
#> SRR1033132 3 0.411 0.5270 0.152 0.004 0.844
#> SRR1033133 3 0.716 0.3327 0.100 0.188 0.712
#> SRR1033134 3 0.922 -0.5094 0.408 0.152 0.440
#> SRR1033135 3 0.280 0.5095 0.060 0.016 0.924
#> SRR1033136 3 0.690 0.1708 0.364 0.024 0.612
#> SRR1033137 3 0.264 0.4756 0.048 0.020 0.932
#> SRR1033139 3 0.552 0.5045 0.268 0.004 0.728
#> SRR1033138 3 0.608 0.4885 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033140 3 0.365 0.5104 0.068 0.036 0.896
#> SRR1033141 3 0.638 0.1996 0.368 0.008 0.624
#> SRR1033142 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033143 3 0.699 0.1338 0.360 0.028 0.612
#> SRR1033144 3 0.623 0.3006 0.340 0.008 0.652
#> SRR1033145 3 0.249 0.5101 0.048 0.016 0.936
#> SRR1033146 3 0.573 0.4218 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033147 3 0.546 0.4974 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033148 3 0.755 0.0755 0.372 0.048 0.580
#> SRR1033149 3 0.281 0.5008 0.040 0.032 0.928
#> SRR1033150 2 0.933 -0.2091 0.164 0.428 0.408
#> SRR1033151 3 0.313 0.5249 0.088 0.008 0.904
#> SRR1033152 3 0.936 -0.1221 0.220 0.268 0.512
#> SRR1033153 3 0.359 0.5149 0.088 0.020 0.892
#> SRR1033154 3 0.636 0.2437 0.364 0.008 0.628
#> SRR1033156 3 0.256 0.4846 0.028 0.036 0.936
#> SRR1033157 3 0.632 0.2617 0.356 0.008 0.636
#> SRR1033158 3 0.595 0.4866 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033159 3 0.219 0.5005 0.028 0.024 0.948
#> SRR1033160 3 0.212 0.5089 0.040 0.012 0.948
#> SRR1033161 1 0.894 0.8025 0.440 0.124 0.436
#> SRR1033163 3 0.303 0.5213 0.092 0.004 0.904
#> SRR1033162 3 0.610 0.2885 0.348 0.004 0.648
#> SRR1033164 3 0.613 0.4514 0.400 0.000 0.600
#> SRR1033165 3 0.775 0.0952 0.140 0.184 0.676
#> SRR1033166 3 0.579 0.4053 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033167 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033168 3 0.341 0.5029 0.080 0.020 0.900
#> SRR1033169 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033171 3 0.611 0.4440 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033170 3 0.638 0.2122 0.368 0.008 0.624
#> SRR1033172 3 0.232 0.4983 0.028 0.028 0.944
#> SRR1033173 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033174 3 0.530 0.4301 0.164 0.032 0.804
#> SRR1033175 3 0.680 0.1719 0.368 0.020 0.612
#> SRR1033176 3 0.638 0.2716 0.340 0.012 0.648
#> SRR1033177 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033178 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033179 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033180 3 0.573 0.3689 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033181 3 0.719 0.2298 0.320 0.044 0.636
#> SRR1033183 1 0.878 0.8808 0.472 0.112 0.416
#> SRR1033182 3 0.952 -0.1098 0.236 0.276 0.488
#> SRR1033184 3 0.404 0.4906 0.104 0.024 0.872
#> SRR1033185 3 0.631 0.3080 0.328 0.012 0.660
#> SRR1033187 2 0.754 0.5205 0.120 0.688 0.192
#> SRR1033186 3 0.611 0.4804 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033188 3 0.775 0.0952 0.140 0.184 0.676
#> SRR1033189 3 0.585 0.4851 0.268 0.012 0.720
#> SRR1033190 3 0.630 0.2857 0.352 0.008 0.640
#> SRR1033191 3 0.613 0.3163 0.352 0.004 0.644
#> SRR1033192 3 0.593 0.4907 0.320 0.004 0.676
#> SRR1033193 3 0.817 -0.0533 0.368 0.080 0.552
#> SRR1033195 3 0.617 0.4413 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033194 3 0.595 0.4866 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033197 3 0.590 0.3814 0.316 0.004 0.680
#> SRR1033196 3 0.313 0.5229 0.088 0.008 0.904
#> SRR1033199 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033198 3 0.798 -0.0195 0.356 0.072 0.572
#> SRR1033200 3 0.927 -0.3173 0.316 0.180 0.504
#> SRR1033201 3 0.257 0.4893 0.032 0.032 0.936
#> SRR1033202 3 0.256 0.4914 0.028 0.036 0.936
#> SRR1033203 3 0.219 0.5002 0.028 0.024 0.948
#> SRR1033204 3 0.979 -0.3648 0.296 0.268 0.436
#> SRR1033205 3 0.477 0.4477 0.052 0.100 0.848
#> SRR1033206 3 0.725 0.0823 0.368 0.036 0.596
#> SRR1033207 3 0.739 0.0650 0.356 0.044 0.600
#> SRR1033208 3 0.277 0.4875 0.024 0.048 0.928
#> SRR1033209 2 0.468 0.7500 0.040 0.848 0.112
#> SRR1033210 3 0.266 0.4895 0.024 0.044 0.932
#> SRR1033211 2 0.525 0.7426 0.076 0.828 0.096
#> SRR1033212 3 0.266 0.4895 0.024 0.044 0.932
#> SRR1033213 3 0.617 0.4413 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033214 1 0.908 0.9059 0.468 0.140 0.392
#> SRR1033216 3 0.985 -0.3811 0.296 0.284 0.420
#> SRR1033215 3 0.585 0.4851 0.268 0.012 0.720
#> SRR1033217 3 0.303 0.4902 0.048 0.032 0.920
#> SRR1033218 3 0.752 0.0301 0.364 0.048 0.588
#> SRR1033219 3 0.733 0.0797 0.364 0.040 0.596
#> SRR1033221 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033220 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033222 3 0.746 0.0689 0.352 0.048 0.600
#> SRR1033223 3 0.664 0.3745 0.092 0.160 0.748
#> SRR1033225 3 0.629 0.4720 0.288 0.020 0.692
#> SRR1033224 3 0.925 -0.3171 0.320 0.176 0.504
#> SRR1033226 3 0.672 0.3853 0.096 0.160 0.744
#> SRR1033227 3 0.477 0.4477 0.052 0.100 0.848
#> SRR1033229 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033228 3 0.949 -0.7169 0.396 0.184 0.420
#> SRR1033231 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033230 3 0.768 0.0307 0.360 0.056 0.584
#> SRR1033232 3 0.767 0.2773 0.088 0.260 0.652
#> SRR1033233 3 0.757 0.0488 0.356 0.052 0.592
#> SRR1033235 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033234 3 0.651 0.3887 0.088 0.156 0.756
#> SRR1033236 3 0.666 0.3757 0.096 0.156 0.748
#> SRR1033237 2 0.946 -0.2438 0.240 0.500 0.260
#> SRR1033238 3 0.404 0.4618 0.040 0.080 0.880
#> SRR1033240 3 0.243 0.4867 0.024 0.036 0.940
#> SRR1033239 2 0.964 -0.2329 0.216 0.440 0.344
#> SRR1033242 3 0.686 0.3157 0.092 0.176 0.732
#> SRR1033241 3 0.244 0.4835 0.028 0.032 0.940
#> SRR1033244 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033243 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033245 3 0.425 0.4736 0.080 0.048 0.872
#> SRR1033246 3 0.741 0.1044 0.360 0.044 0.596
#> SRR1033248 3 0.685 0.2425 0.316 0.032 0.652
#> SRR1033247 3 0.630 0.4245 0.480 0.000 0.520
#> SRR1033249 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033250 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033251 3 0.713 0.1861 0.344 0.036 0.620
#> SRR1033252 3 0.617 0.4413 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033253 3 0.703 0.1025 0.368 0.028 0.604
#> SRR1033254 3 0.737 0.1218 0.352 0.044 0.604
#> SRR1033256 3 0.617 0.4413 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033255 3 0.315 0.4751 0.048 0.036 0.916
#> SRR1033258 3 0.757 0.0246 0.376 0.048 0.576
#> SRR1033257 1 0.908 0.9193 0.488 0.144 0.368
#> SRR1033259 3 0.935 -0.5475 0.384 0.168 0.448
#> SRR1033260 3 0.617 0.4413 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033261 3 0.256 0.4886 0.028 0.036 0.936
#> SRR1033262 3 0.232 0.4944 0.028 0.028 0.944
#> SRR1033263 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033264 3 0.774 -0.2705 0.400 0.052 0.548
#> SRR1033265 3 0.615 0.4406 0.408 0.000 0.592
#> SRR1033266 3 0.750 0.2874 0.212 0.104 0.684
#> SRR1033267 3 0.477 0.4477 0.052 0.100 0.848
#> SRR1033268 3 0.716 0.1362 0.372 0.032 0.596
#> SRR1033269 3 0.346 0.5085 0.096 0.012 0.892
#> SRR1033270 3 0.256 0.4888 0.028 0.036 0.936
#> SRR1033271 3 0.735 0.0628 0.368 0.040 0.592
#> SRR1033272 3 0.617 0.4413 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033273 3 0.704 0.1623 0.348 0.032 0.620
#> SRR1033274 3 0.617 0.4413 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033275 1 0.912 0.9186 0.484 0.148 0.368
#> SRR1033276 3 0.618 0.4426 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033277 1 0.901 0.8844 0.464 0.132 0.404
#> SRR1033278 1 0.889 0.9132 0.488 0.124 0.388
#> SRR1033279 3 0.359 0.4852 0.088 0.020 0.892
#> SRR1033280 3 0.238 0.4884 0.044 0.016 0.940
#> SRR1033281 3 0.708 0.1706 0.356 0.032 0.612
#> SRR1033282 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033283 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033284 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033285 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033286 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033287 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033288 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033289 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033290 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033291 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033292 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
#> SRR1033293 2 0.158 0.8394 0.028 0.964 0.008
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.6307 0.7659 0.412 0.016 0.032 0.540
#> SRR1032911 4 0.6053 0.7682 0.424 0.024 0.012 0.540
#> SRR1032912 4 0.6226 0.7695 0.408 0.020 0.024 0.548
#> SRR1032913 4 0.6226 0.7695 0.408 0.020 0.024 0.548
#> SRR1032914 4 0.5807 0.7688 0.424 0.004 0.024 0.548
#> SRR1032915 1 0.7707 -0.5362 0.428 0.020 0.128 0.424
#> SRR1032916 4 0.6528 0.7519 0.432 0.032 0.024 0.512
#> SRR1032917 3 0.2922 0.5809 0.104 0.004 0.884 0.008
#> SRR1032918 4 0.6053 0.7682 0.424 0.024 0.012 0.540
#> SRR1032919 4 0.6828 0.7183 0.400 0.004 0.088 0.508
#> SRR1032920 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032921 1 0.1139 0.7398 0.972 0.012 0.008 0.008
#> SRR1032922 3 0.7377 0.1272 0.416 0.024 0.472 0.088
#> SRR1032923 3 0.8191 0.1500 0.324 0.200 0.452 0.024
#> SRR1032925 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032924 4 0.5951 0.7634 0.432 0.024 0.008 0.536
#> SRR1032926 1 0.8116 0.2044 0.492 0.040 0.320 0.148
#> SRR1032927 4 0.6032 0.7639 0.428 0.028 0.008 0.536
#> SRR1032929 4 0.6109 0.7641 0.424 0.032 0.008 0.536
#> SRR1032928 1 0.8417 0.1714 0.460 0.052 0.332 0.156
#> SRR1032930 4 0.5648 0.7672 0.428 0.008 0.012 0.552
#> SRR1032931 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032932 4 0.7055 -0.5287 0.124 0.000 0.396 0.480
#> SRR1032933 4 0.6032 0.7639 0.428 0.028 0.008 0.536
#> SRR1032934 1 0.8235 0.1376 0.416 0.024 0.364 0.196
#> SRR1032935 4 0.6121 0.7595 0.432 0.032 0.008 0.528
#> SRR1032936 3 0.9040 -0.1001 0.376 0.120 0.376 0.128
#> SRR1032937 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032938 1 0.1114 0.7253 0.972 0.016 0.004 0.008
#> SRR1032939 3 0.7342 0.0482 0.444 0.024 0.448 0.084
#> SRR1032940 4 0.7396 0.5468 0.404 0.000 0.164 0.432
#> SRR1032941 4 0.6030 0.7682 0.412 0.012 0.024 0.552
#> SRR1032942 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032943 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032944 1 0.1229 0.7409 0.968 0.004 0.008 0.020
#> SRR1032945 4 0.5640 0.7671 0.424 0.008 0.012 0.556
#> SRR1032946 1 0.6787 -0.0678 0.624 0.100 0.016 0.260
#> SRR1032947 1 0.8078 -0.0888 0.448 0.012 0.268 0.272
#> SRR1032948 4 0.6053 0.7682 0.424 0.024 0.012 0.540
#> SRR1032949 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032950 3 0.7539 0.1040 0.416 0.032 0.464 0.088
#> SRR1032951 4 0.6090 0.7432 0.452 0.024 0.012 0.512
#> SRR1032952 1 0.8564 0.0336 0.424 0.036 0.300 0.240
#> SRR1032953 4 0.5951 0.7634 0.432 0.024 0.008 0.536
#> SRR1032954 1 0.2418 0.7168 0.928 0.024 0.016 0.032
#> SRR1032955 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032957 4 0.5914 0.7671 0.412 0.008 0.024 0.556
#> SRR1032956 1 0.0712 0.7358 0.984 0.004 0.008 0.004
#> SRR1032958 4 0.5951 0.7640 0.432 0.024 0.008 0.536
#> SRR1032959 1 0.5803 -0.3703 0.596 0.024 0.008 0.372
#> SRR1032960 4 0.6477 0.7469 0.392 0.004 0.064 0.540
#> SRR1032961 1 0.1394 0.7286 0.964 0.016 0.008 0.012
#> SRR1032962 3 0.7494 0.5982 0.192 0.004 0.516 0.288
#> SRR1032963 4 0.6698 0.7313 0.408 0.008 0.068 0.516
#> SRR1032964 4 0.6391 0.7461 0.412 0.004 0.056 0.528
#> SRR1032965 4 0.6032 0.7639 0.428 0.028 0.008 0.536
#> SRR1032966 4 0.5788 0.7481 0.452 0.008 0.016 0.524
#> SRR1032967 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032968 4 0.6376 0.7437 0.404 0.004 0.056 0.536
#> SRR1032969 4 0.7446 0.5158 0.396 0.000 0.172 0.432
#> SRR1032970 4 0.5951 0.7640 0.432 0.024 0.008 0.536
#> SRR1032971 4 0.6376 0.7471 0.404 0.004 0.056 0.536
#> SRR1032972 4 0.6164 0.7692 0.424 0.020 0.020 0.536
#> SRR1032973 4 0.6076 0.7611 0.396 0.004 0.040 0.560
#> SRR1032974 1 0.5025 0.4096 0.756 0.012 0.032 0.200
#> SRR1032975 4 0.5888 0.7601 0.440 0.016 0.012 0.532
#> SRR1032976 1 0.9142 0.1570 0.416 0.128 0.316 0.140
#> SRR1032977 4 0.6855 0.3162 0.276 0.000 0.144 0.580
#> SRR1032978 1 0.1593 0.7405 0.956 0.024 0.016 0.004
#> SRR1032979 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032980 4 0.7682 0.5223 0.392 0.004 0.184 0.420
#> SRR1032981 4 0.6151 0.7590 0.396 0.004 0.044 0.556
#> SRR1032982 4 0.5829 0.7701 0.416 0.008 0.020 0.556
#> SRR1032983 1 0.7746 0.2208 0.476 0.024 0.372 0.128
#> SRR1032984 4 0.7040 0.6387 0.420 0.000 0.120 0.460
#> SRR1032985 4 0.6044 0.7581 0.436 0.028 0.008 0.528
#> SRR1032986 4 0.6053 0.7682 0.424 0.024 0.012 0.540
#> SRR1032987 4 0.7370 -0.5686 0.160 0.000 0.412 0.428
#> SRR1032988 4 0.6038 0.7619 0.432 0.028 0.008 0.532
#> SRR1032990 3 0.5309 0.5726 0.232 0.012 0.724 0.032
#> SRR1032989 4 0.5957 0.7605 0.436 0.024 0.008 0.532
#> SRR1032991 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1032992 1 0.7738 0.0263 0.436 0.040 0.432 0.092
#> SRR1032993 4 0.7294 0.6492 0.424 0.016 0.096 0.464
#> SRR1032994 3 0.6113 0.5352 0.284 0.000 0.636 0.080
#> SRR1032995 1 0.4020 0.6187 0.852 0.040 0.020 0.088
#> SRR1032996 1 0.7628 -0.4753 0.504 0.068 0.056 0.372
#> SRR1032997 4 0.6805 0.7165 0.404 0.008 0.076 0.512
#> SRR1032998 3 0.7239 0.0766 0.436 0.024 0.464 0.076
#> SRR1032999 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033000 4 0.6855 0.3162 0.276 0.000 0.144 0.580
#> SRR1033001 1 0.7946 0.2353 0.504 0.036 0.324 0.136
#> SRR1033002 1 0.7117 0.2417 0.552 0.024 0.344 0.080
#> SRR1033003 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033004 4 0.7370 -0.5686 0.160 0.000 0.412 0.428
#> SRR1033005 3 0.7884 0.0543 0.392 0.016 0.428 0.164
#> SRR1033006 3 0.5290 0.6231 0.204 0.004 0.736 0.056
#> SRR1033007 3 0.8103 0.1562 0.324 0.200 0.456 0.020
#> SRR1033008 1 0.1575 0.7356 0.956 0.028 0.012 0.004
#> SRR1033009 1 0.0524 0.7297 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033010 4 0.7432 0.5335 0.348 0.000 0.180 0.472
#> SRR1033011 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033012 1 0.1833 0.7405 0.944 0.000 0.024 0.032
#> SRR1033013 3 0.2926 0.5828 0.096 0.012 0.888 0.004
#> SRR1033014 3 0.3764 0.6211 0.116 0.000 0.844 0.040
#> SRR1033015 3 0.3932 0.6215 0.128 0.004 0.836 0.032
#> SRR1033016 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033017 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033018 3 0.5267 0.6316 0.184 0.000 0.740 0.076
#> SRR1033019 3 0.4282 0.6287 0.124 0.000 0.816 0.060
#> SRR1033020 1 0.6466 0.5063 0.664 0.216 0.108 0.012
#> SRR1033021 3 0.7463 0.2460 0.368 0.088 0.512 0.032
#> SRR1033023 1 0.2313 0.7381 0.924 0.000 0.032 0.044
#> SRR1033022 1 0.2214 0.7362 0.928 0.000 0.044 0.028
#> SRR1033024 3 0.3485 0.6003 0.116 0.000 0.856 0.028
#> SRR1033025 1 0.2131 0.7380 0.932 0.000 0.032 0.036
#> SRR1033026 3 0.2924 0.5944 0.100 0.000 0.884 0.016
#> SRR1033027 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033028 4 0.6537 0.7442 0.392 0.004 0.068 0.536
#> SRR1033029 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033030 3 0.4144 0.6214 0.104 0.000 0.828 0.068
#> SRR1033031 1 0.3312 0.6996 0.876 0.000 0.052 0.072
#> SRR1033032 3 0.7128 0.6137 0.184 0.000 0.556 0.260
#> SRR1033033 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033035 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033034 1 0.1892 0.7450 0.944 0.004 0.036 0.016
#> SRR1033036 1 0.2222 0.7429 0.932 0.004 0.032 0.032
#> SRR1033037 1 0.1247 0.7351 0.968 0.012 0.004 0.016
#> SRR1033038 1 0.5116 0.5703 0.764 0.000 0.108 0.128
#> SRR1033039 3 0.4256 0.6161 0.128 0.008 0.824 0.040
#> SRR1033040 3 0.6291 0.4779 0.352 0.008 0.588 0.052
#> SRR1033041 1 0.1059 0.7428 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1033042 1 0.2214 0.7366 0.928 0.000 0.028 0.044
#> SRR1033043 1 0.2392 0.7397 0.928 0.024 0.036 0.012
#> SRR1033044 1 0.0937 0.7434 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1033045 3 0.4010 0.6203 0.156 0.000 0.816 0.028
#> SRR1033046 1 0.6700 0.4205 0.600 0.060 0.316 0.024
#> SRR1033047 3 0.4436 0.6291 0.148 0.000 0.800 0.052
#> SRR1033048 1 0.6260 0.2513 0.584 0.016 0.364 0.036
#> SRR1033049 1 0.2032 0.7409 0.936 0.000 0.028 0.036
#> SRR1033051 1 0.1297 0.7453 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1033052 1 0.1406 0.7441 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1033053 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033054 3 0.4194 0.6142 0.172 0.000 0.800 0.028
#> SRR1033050 1 0.1059 0.7357 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1033055 3 0.3876 0.6242 0.124 0.000 0.836 0.040
#> SRR1033056 3 0.7296 0.1888 0.404 0.040 0.496 0.060
#> SRR1033057 1 0.2759 0.7300 0.904 0.000 0.044 0.052
#> SRR1033058 3 0.3485 0.6131 0.116 0.000 0.856 0.028
#> SRR1033059 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033060 1 0.7038 0.4388 0.600 0.236 0.156 0.008
#> SRR1033061 3 0.7421 0.5769 0.176 0.000 0.468 0.356
#> SRR1033062 3 0.4662 0.6250 0.112 0.000 0.796 0.092
#> SRR1033063 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033064 3 0.3447 0.6176 0.128 0.000 0.852 0.020
#> SRR1033065 1 0.2197 0.7391 0.928 0.000 0.024 0.048
#> SRR1033066 1 0.2844 0.7291 0.900 0.000 0.048 0.052
#> SRR1033067 1 0.0859 0.7387 0.980 0.008 0.004 0.008
#> SRR1033068 3 0.4604 0.6177 0.168 0.004 0.788 0.040
#> SRR1033069 3 0.7185 0.6078 0.176 0.000 0.540 0.284
#> SRR1033070 3 0.4608 0.6267 0.156 0.008 0.796 0.040
#> SRR1033071 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033072 3 0.7190 0.6114 0.192 0.000 0.548 0.260
#> SRR1033073 3 0.4411 0.6245 0.108 0.000 0.812 0.080
#> SRR1033074 1 0.1520 0.7233 0.956 0.024 0.000 0.020
#> SRR1033075 1 0.6891 0.4677 0.628 0.216 0.144 0.012
#> SRR1033076 3 0.5313 0.6077 0.208 0.008 0.736 0.048
#> SRR1033077 1 0.3487 0.6587 0.872 0.016 0.020 0.092
#> SRR1033078 1 0.1762 0.7400 0.952 0.020 0.016 0.012
#> SRR1033079 3 0.2796 0.5958 0.092 0.000 0.892 0.016
#> SRR1033080 3 0.3612 0.6137 0.100 0.000 0.856 0.044
#> SRR1033081 1 0.5397 0.6289 0.772 0.112 0.096 0.020
#> SRR1033082 1 0.2797 0.7184 0.900 0.000 0.032 0.068
#> SRR1033083 3 0.3647 0.6166 0.108 0.000 0.852 0.040
#> SRR1033084 1 0.1509 0.7402 0.960 0.020 0.012 0.008
#> SRR1033085 3 0.3934 0.6190 0.116 0.000 0.836 0.048
#> SRR1033086 3 0.7421 0.5769 0.176 0.000 0.468 0.356
#> SRR1033087 1 0.1362 0.7440 0.964 0.004 0.020 0.012
#> SRR1033088 3 0.3978 0.6192 0.108 0.000 0.836 0.056
#> SRR1033089 3 0.4128 0.6159 0.168 0.004 0.808 0.020
#> SRR1033090 4 0.6086 0.7620 0.400 0.004 0.040 0.556
#> SRR1033091 3 0.3907 0.6258 0.120 0.000 0.836 0.044
#> SRR1033092 1 0.2623 0.7347 0.908 0.000 0.064 0.028
#> SRR1033093 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033094 3 0.6672 0.6158 0.212 0.000 0.620 0.168
#> SRR1033095 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033096 3 0.4473 0.6191 0.168 0.008 0.796 0.028
#> SRR1033097 3 0.7421 0.5769 0.176 0.000 0.468 0.356
#> SRR1033098 3 0.3934 0.6222 0.116 0.000 0.836 0.048
#> SRR1033099 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033100 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033101 3 0.4128 0.6159 0.168 0.004 0.808 0.020
#> SRR1033102 1 0.1543 0.7317 0.956 0.032 0.008 0.004
#> SRR1033103 1 0.1920 0.7443 0.944 0.004 0.028 0.024
#> SRR1033104 3 0.2796 0.5804 0.096 0.004 0.892 0.008
#> SRR1033105 1 0.2039 0.7439 0.940 0.008 0.016 0.036
#> SRR1033106 1 0.7241 0.3439 0.544 0.324 0.120 0.012
#> SRR1033107 3 0.2926 0.5826 0.096 0.004 0.888 0.012
#> SRR1033108 4 0.6109 0.7641 0.424 0.032 0.008 0.536
#> SRR1033109 1 0.1271 0.7415 0.968 0.008 0.012 0.012
#> SRR1033110 3 0.4473 0.5999 0.168 0.008 0.796 0.028
#> SRR1033111 1 0.3256 0.7159 0.884 0.004 0.044 0.068
#> SRR1033112 1 0.2023 0.7456 0.940 0.004 0.028 0.028
#> SRR1033113 3 0.5493 0.6295 0.176 0.004 0.736 0.084
#> SRR1033114 1 0.3216 0.7036 0.880 0.000 0.044 0.076
#> SRR1033115 1 0.4010 0.6669 0.836 0.000 0.064 0.100
#> SRR1033116 3 0.2796 0.5804 0.096 0.004 0.892 0.008
#> SRR1033117 3 0.2796 0.5958 0.092 0.000 0.892 0.016
#> SRR1033118 4 0.9008 0.4786 0.240 0.156 0.128 0.476
#> SRR1033119 1 0.1182 0.7432 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1033121 3 0.3088 0.5930 0.128 0.000 0.864 0.008
#> SRR1033120 3 0.7563 0.5676 0.220 0.000 0.476 0.304
#> SRR1033122 4 0.9060 0.4510 0.228 0.148 0.148 0.476
#> SRR1033123 1 0.2670 0.7296 0.908 0.000 0.040 0.052
#> SRR1033124 1 0.1877 0.7474 0.948 0.012 0.020 0.020
#> SRR1033125 3 0.6142 0.5747 0.236 0.024 0.684 0.056
#> SRR1033126 1 0.1584 0.7406 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1033127 3 0.5968 0.6006 0.092 0.000 0.672 0.236
#> SRR1033129 3 0.2796 0.5804 0.096 0.004 0.892 0.008
#> SRR1033128 1 0.3687 0.6832 0.856 0.000 0.064 0.080
#> SRR1033130 1 0.3953 0.6791 0.848 0.104 0.036 0.012
#> SRR1033131 1 0.5133 0.6433 0.784 0.124 0.076 0.016
#> SRR1033132 3 0.6450 0.5909 0.244 0.008 0.648 0.100
#> SRR1033133 3 0.7960 0.2440 0.324 0.192 0.468 0.016
#> SRR1033134 1 0.6011 0.2936 0.700 0.124 0.004 0.172
#> SRR1033135 3 0.4008 0.6184 0.148 0.000 0.820 0.032
#> SRR1033136 1 0.1877 0.7449 0.948 0.020 0.020 0.012
#> SRR1033137 3 0.4834 0.5646 0.200 0.012 0.764 0.024
#> SRR1033139 3 0.7090 0.6139 0.200 0.004 0.588 0.208
#> SRR1033138 1 0.7752 -0.3515 0.404 0.000 0.360 0.236
#> SRR1033140 3 0.4260 0.6192 0.116 0.008 0.828 0.048
#> SRR1033141 1 0.1042 0.7438 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1033142 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033143 1 0.1745 0.7336 0.952 0.020 0.008 0.020
#> SRR1033144 1 0.3168 0.7190 0.884 0.000 0.060 0.056
#> SRR1033145 3 0.3695 0.6179 0.156 0.000 0.828 0.016
#> SRR1033146 1 0.5006 0.6028 0.772 0.000 0.104 0.124
#> SRR1033147 3 0.7231 0.6153 0.184 0.004 0.564 0.248
#> SRR1033148 1 0.1929 0.7235 0.940 0.024 0.000 0.036
#> SRR1033149 3 0.3307 0.5972 0.104 0.000 0.868 0.028
#> SRR1033150 2 0.7689 0.1372 0.384 0.452 0.152 0.012
#> SRR1033151 3 0.5590 0.6164 0.200 0.012 0.728 0.060
#> SRR1033152 1 0.6995 0.4091 0.592 0.280 0.116 0.012
#> SRR1033153 3 0.5980 0.5821 0.228 0.020 0.696 0.056
#> SRR1033154 1 0.1936 0.7448 0.940 0.000 0.032 0.028
#> SRR1033156 3 0.3102 0.5788 0.116 0.004 0.872 0.008
#> SRR1033157 1 0.2032 0.7389 0.936 0.000 0.028 0.036
#> SRR1033158 3 0.7563 0.5676 0.220 0.000 0.476 0.304
#> SRR1033159 3 0.3272 0.6031 0.128 0.008 0.860 0.004
#> SRR1033160 3 0.4050 0.6201 0.144 0.000 0.820 0.036
#> SRR1033161 1 0.6049 -0.6065 0.524 0.028 0.008 0.440
#> SRR1033163 3 0.5664 0.6145 0.192 0.008 0.724 0.076
#> SRR1033162 1 0.2408 0.7341 0.920 0.000 0.036 0.044
#> SRR1033164 3 0.7558 0.5753 0.196 0.000 0.444 0.360
#> SRR1033165 3 0.8103 0.1562 0.324 0.200 0.456 0.020
#> SRR1033166 1 0.4953 0.6004 0.776 0.000 0.104 0.120
#> SRR1033167 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033168 3 0.5684 0.5861 0.220 0.020 0.716 0.044
#> SRR1033169 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033171 3 0.7590 0.5791 0.180 0.004 0.472 0.344
#> SRR1033170 1 0.1182 0.7449 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1033172 3 0.3519 0.6013 0.128 0.004 0.852 0.016
#> SRR1033173 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033174 3 0.5816 0.5460 0.148 0.000 0.708 0.144
#> SRR1033175 1 0.1124 0.7413 0.972 0.012 0.004 0.012
#> SRR1033176 1 0.2463 0.7434 0.924 0.008 0.032 0.036
#> SRR1033177 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033178 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033179 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033180 1 0.3754 0.6850 0.852 0.000 0.064 0.084
#> SRR1033181 1 0.4313 0.6973 0.840 0.044 0.088 0.028
#> SRR1033183 4 0.7215 0.6432 0.348 0.000 0.152 0.500
#> SRR1033182 1 0.7050 0.4272 0.588 0.288 0.108 0.016
#> SRR1033184 3 0.6223 0.4970 0.292 0.028 0.644 0.036
#> SRR1033185 1 0.2946 0.7298 0.900 0.004 0.048 0.048
#> SRR1033187 2 0.5950 0.6266 0.212 0.704 0.068 0.016
#> SRR1033186 1 0.7607 -0.0505 0.508 0.004 0.244 0.244
#> SRR1033188 3 0.8103 0.1562 0.324 0.200 0.456 0.020
#> SRR1033189 3 0.5910 0.5998 0.088 0.000 0.676 0.236
#> SRR1033190 1 0.2313 0.7372 0.924 0.000 0.032 0.044
#> SRR1033191 1 0.2919 0.7160 0.896 0.000 0.044 0.060
#> SRR1033192 3 0.7318 0.6025 0.196 0.000 0.524 0.280
#> SRR1033193 1 0.2872 0.6859 0.896 0.084 0.012 0.008
#> SRR1033195 3 0.7569 0.5713 0.196 0.000 0.436 0.368
#> SRR1033194 3 0.7563 0.5676 0.220 0.000 0.476 0.304
#> SRR1033197 1 0.3697 0.6822 0.852 0.000 0.048 0.100
#> SRR1033196 3 0.5242 0.6240 0.184 0.004 0.748 0.064
#> SRR1033199 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033198 1 0.2587 0.6983 0.908 0.076 0.004 0.012
#> SRR1033200 1 0.4529 0.5464 0.776 0.196 0.004 0.024
#> SRR1033201 3 0.2918 0.5874 0.116 0.000 0.876 0.008
#> SRR1033202 3 0.2651 0.5826 0.096 0.004 0.896 0.004
#> SRR1033203 3 0.3708 0.6059 0.148 0.000 0.832 0.020
#> SRR1033204 1 0.5485 0.4272 0.680 0.280 0.004 0.036
#> SRR1033205 3 0.5260 0.5324 0.136 0.068 0.776 0.020
#> SRR1033206 1 0.1796 0.7207 0.948 0.032 0.004 0.016
#> SRR1033207 1 0.1968 0.7164 0.940 0.044 0.008 0.008
#> SRR1033208 3 0.3190 0.5761 0.096 0.016 0.880 0.008
#> SRR1033209 2 0.3551 0.7742 0.028 0.860 0.108 0.004
#> SRR1033210 3 0.3071 0.5781 0.096 0.012 0.884 0.008
#> SRR1033211 2 0.4161 0.7743 0.076 0.840 0.076 0.008
#> SRR1033212 3 0.3071 0.5781 0.096 0.012 0.884 0.008
#> SRR1033213 3 0.7569 0.5713 0.196 0.000 0.436 0.368
#> SRR1033214 4 0.6144 0.7387 0.452 0.032 0.008 0.508
#> SRR1033216 1 0.5719 0.3987 0.660 0.296 0.008 0.036
#> SRR1033215 3 0.5910 0.5998 0.088 0.000 0.676 0.236
#> SRR1033217 3 0.4732 0.5873 0.200 0.012 0.768 0.020
#> SRR1033218 1 0.2161 0.7058 0.932 0.048 0.004 0.016
#> SRR1033219 1 0.1674 0.7213 0.952 0.032 0.004 0.012
#> SRR1033221 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033220 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033222 1 0.2573 0.7186 0.920 0.044 0.012 0.024
#> SRR1033223 3 0.7548 0.3739 0.260 0.160 0.560 0.020
#> SRR1033225 3 0.5434 0.5888 0.052 0.000 0.696 0.252
#> SRR1033224 1 0.4529 0.5460 0.776 0.196 0.004 0.024
#> SRR1033226 3 0.7641 0.3808 0.260 0.160 0.556 0.024
#> SRR1033227 3 0.5260 0.5324 0.136 0.068 0.776 0.020
#> SRR1033229 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033228 1 0.6557 -0.1601 0.608 0.096 0.004 0.292
#> SRR1033231 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033230 1 0.2271 0.7089 0.928 0.052 0.008 0.012
#> SRR1033232 3 0.8241 0.1852 0.240 0.236 0.492 0.032
#> SRR1033233 1 0.2317 0.7125 0.928 0.048 0.012 0.012
#> SRR1033235 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033234 3 0.7172 0.3974 0.240 0.144 0.600 0.016
#> SRR1033236 3 0.7246 0.3872 0.236 0.144 0.600 0.020
#> SRR1033237 2 0.6723 0.1150 0.400 0.516 0.004 0.080
#> SRR1033238 3 0.4498 0.5577 0.124 0.048 0.816 0.012
#> SRR1033240 3 0.2983 0.5797 0.108 0.004 0.880 0.008
#> SRR1033239 2 0.7200 -0.0108 0.440 0.452 0.096 0.012
#> SRR1033242 3 0.7326 0.3849 0.152 0.156 0.640 0.052
#> SRR1033241 3 0.3380 0.5875 0.136 0.004 0.852 0.008
#> SRR1033244 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033243 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033245 3 0.5702 0.5468 0.232 0.040 0.708 0.020
#> SRR1033246 1 0.1917 0.7302 0.944 0.036 0.008 0.012
#> SRR1033248 1 0.3882 0.6949 0.852 0.028 0.104 0.016
#> SRR1033247 4 0.7868 -0.4186 0.336 0.004 0.232 0.428
#> SRR1033249 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033250 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033251 1 0.2734 0.7469 0.916 0.024 0.036 0.024
#> SRR1033252 3 0.7569 0.5713 0.196 0.000 0.436 0.368
#> SRR1033253 1 0.1377 0.7255 0.964 0.020 0.008 0.008
#> SRR1033254 1 0.1786 0.7347 0.948 0.036 0.008 0.008
#> SRR1033256 3 0.7569 0.5713 0.196 0.000 0.436 0.368
#> SRR1033255 3 0.4923 0.5747 0.208 0.016 0.756 0.020
#> SRR1033258 1 0.2186 0.7062 0.932 0.048 0.008 0.012
#> SRR1033257 4 0.6109 0.7641 0.424 0.032 0.008 0.536
#> SRR1033259 1 0.6204 0.2286 0.680 0.124 0.004 0.192
#> SRR1033260 3 0.7569 0.5713 0.196 0.000 0.436 0.368
#> SRR1033261 3 0.2983 0.5796 0.108 0.004 0.880 0.008
#> SRR1033262 3 0.3217 0.5936 0.128 0.000 0.860 0.012
#> SRR1033263 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033264 1 0.3923 0.5109 0.828 0.016 0.008 0.148
#> SRR1033265 3 0.7521 0.5743 0.188 0.000 0.444 0.368
#> SRR1033266 1 0.7814 0.2997 0.528 0.092 0.324 0.056
#> SRR1033267 3 0.5260 0.5324 0.136 0.068 0.776 0.020
#> SRR1033268 1 0.1297 0.7371 0.964 0.020 0.000 0.016
#> SRR1033269 3 0.5596 0.5675 0.236 0.012 0.708 0.044
#> SRR1033270 3 0.3043 0.5826 0.112 0.004 0.876 0.008
#> SRR1033271 1 0.1917 0.7153 0.944 0.036 0.008 0.012
#> SRR1033272 3 0.7569 0.5713 0.196 0.000 0.436 0.368
#> SRR1033273 1 0.1640 0.7414 0.956 0.020 0.012 0.012
#> SRR1033274 3 0.7569 0.5713 0.196 0.000 0.436 0.368
#> SRR1033275 4 0.6188 0.7632 0.424 0.036 0.008 0.532
#> SRR1033276 3 0.7591 0.5697 0.200 0.000 0.432 0.368
#> SRR1033277 1 0.6156 -0.6982 0.480 0.032 0.008 0.480
#> SRR1033278 4 0.6721 0.7365 0.368 0.012 0.068 0.552
#> SRR1033279 3 0.5601 0.5351 0.268 0.016 0.688 0.028
#> SRR1033280 3 0.4644 0.5799 0.208 0.004 0.764 0.024
#> SRR1033281 1 0.1985 0.7443 0.944 0.024 0.012 0.020
#> SRR1033282 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033283 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033284 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033285 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033286 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033287 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033288 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033289 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033290 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033291 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033292 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033293 2 0.0336 0.8573 0.000 0.992 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.2859 0.8248 0.096 0.000 0.016 0.876 0.012
#> SRR1032911 4 0.2864 0.8218 0.136 0.000 0.000 0.852 0.012
#> SRR1032912 4 0.2414 0.8200 0.080 0.000 0.008 0.900 0.012
#> SRR1032913 4 0.2414 0.8200 0.080 0.000 0.008 0.900 0.012
#> SRR1032914 4 0.1942 0.8163 0.068 0.000 0.012 0.920 0.000
#> SRR1032915 4 0.6057 0.6746 0.148 0.040 0.100 0.692 0.020
#> SRR1032916 4 0.3189 0.8157 0.080 0.008 0.012 0.872 0.028
#> SRR1032917 3 0.2930 0.7326 0.000 0.164 0.832 0.004 0.000
#> SRR1032918 4 0.2864 0.8218 0.136 0.000 0.000 0.852 0.012
#> SRR1032919 4 0.3790 0.7995 0.084 0.016 0.068 0.832 0.000
#> SRR1032920 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1812 0.8360 0.940 0.036 0.004 0.012 0.008
#> SRR1032922 3 0.8863 0.3730 0.268 0.244 0.332 0.128 0.028
#> SRR1032923 3 0.8278 0.3028 0.260 0.064 0.444 0.040 0.192
#> SRR1032925 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.2997 0.8181 0.148 0.000 0.000 0.840 0.012
#> SRR1032926 4 0.9090 0.0784 0.244 0.144 0.248 0.324 0.040
#> SRR1032927 4 0.3098 0.8168 0.148 0.000 0.000 0.836 0.016
#> SRR1032929 4 0.3106 0.8187 0.140 0.000 0.000 0.840 0.020
#> SRR1032928 4 0.9004 0.0213 0.232 0.108 0.292 0.320 0.048
#> SRR1032930 4 0.1928 0.8155 0.072 0.000 0.004 0.920 0.004
#> SRR1032931 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.3409 0.7521 0.024 0.844 0.016 0.116 0.000
#> SRR1032933 4 0.3055 0.8184 0.144 0.000 0.000 0.840 0.016
#> SRR1032934 3 0.8784 0.1468 0.236 0.124 0.324 0.292 0.024
#> SRR1032935 4 0.3351 0.8169 0.148 0.000 0.004 0.828 0.020
#> SRR1032936 3 0.9550 0.1930 0.196 0.128 0.328 0.232 0.116
#> SRR1032937 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.1725 0.8329 0.944 0.024 0.004 0.024 0.004
#> SRR1032939 3 0.8788 0.3491 0.288 0.228 0.332 0.128 0.024
#> SRR1032940 4 0.5525 0.7069 0.080 0.084 0.112 0.724 0.000
#> SRR1032941 4 0.2777 0.8171 0.072 0.008 0.020 0.892 0.008
#> SRR1032942 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.1557 0.8358 0.940 0.052 0.008 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.1928 0.8148 0.072 0.000 0.004 0.920 0.004
#> SRR1032946 1 0.6750 0.0262 0.484 0.012 0.024 0.384 0.096
#> SRR1032947 4 0.7728 0.4392 0.152 0.092 0.236 0.508 0.012
#> SRR1032948 4 0.2864 0.8218 0.136 0.000 0.000 0.852 0.012
#> SRR1032949 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 3 0.8930 0.3671 0.268 0.236 0.332 0.132 0.032
#> SRR1032951 4 0.3774 0.7806 0.200 0.000 0.008 0.780 0.012
#> SRR1032952 4 0.8635 0.1873 0.208 0.096 0.264 0.396 0.036
#> SRR1032953 4 0.3039 0.8170 0.152 0.000 0.000 0.836 0.012
#> SRR1032954 1 0.2943 0.8141 0.888 0.016 0.016 0.068 0.012
#> SRR1032955 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.2652 0.8163 0.072 0.008 0.020 0.896 0.004
#> SRR1032956 1 0.1547 0.8344 0.948 0.032 0.004 0.016 0.000
#> SRR1032958 4 0.3111 0.8212 0.144 0.000 0.004 0.840 0.012
#> SRR1032959 4 0.4705 0.4487 0.404 0.004 0.000 0.580 0.012
#> SRR1032960 4 0.3237 0.8134 0.076 0.012 0.048 0.864 0.000
#> SRR1032961 1 0.1851 0.8342 0.940 0.024 0.004 0.024 0.008
#> SRR1032962 2 0.4608 0.5748 0.048 0.732 0.212 0.000 0.008
#> SRR1032963 4 0.3885 0.8091 0.096 0.012 0.060 0.828 0.004
#> SRR1032964 4 0.3209 0.8164 0.088 0.016 0.032 0.864 0.000
#> SRR1032965 4 0.3098 0.8168 0.148 0.000 0.000 0.836 0.016
#> SRR1032966 4 0.3327 0.8143 0.160 0.004 0.008 0.824 0.004
#> SRR1032967 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.3463 0.8100 0.088 0.020 0.040 0.852 0.000
#> SRR1032969 4 0.5801 0.6887 0.096 0.076 0.128 0.700 0.000
#> SRR1032970 4 0.3111 0.8212 0.144 0.000 0.004 0.840 0.012
#> SRR1032971 4 0.3232 0.8131 0.084 0.016 0.036 0.864 0.000
#> SRR1032972 4 0.2574 0.8202 0.080 0.004 0.008 0.896 0.012
#> SRR1032973 4 0.2590 0.8091 0.060 0.012 0.028 0.900 0.000
#> SRR1032974 1 0.6018 0.3587 0.584 0.048 0.024 0.332 0.012
#> SRR1032975 4 0.3001 0.8217 0.144 0.000 0.004 0.844 0.008
#> SRR1032976 3 0.9608 0.0590 0.228 0.112 0.280 0.256 0.124
#> SRR1032977 4 0.6226 0.4293 0.044 0.328 0.064 0.564 0.000
#> SRR1032978 1 0.2092 0.8360 0.932 0.028 0.008 0.016 0.016
#> SRR1032979 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.5954 0.6849 0.092 0.068 0.144 0.692 0.004
#> SRR1032981 4 0.2956 0.8091 0.060 0.020 0.036 0.884 0.000
#> SRR1032982 4 0.1928 0.8173 0.072 0.000 0.004 0.920 0.004
#> SRR1032983 3 0.9043 0.1398 0.252 0.164 0.288 0.268 0.028
#> SRR1032984 4 0.4831 0.7661 0.080 0.068 0.076 0.776 0.000
#> SRR1032985 4 0.3421 0.8142 0.152 0.000 0.008 0.824 0.016
#> SRR1032986 4 0.2575 0.8206 0.100 0.000 0.004 0.884 0.012
#> SRR1032987 2 0.2710 0.8237 0.036 0.892 0.008 0.064 0.000
#> SRR1032988 4 0.3141 0.8165 0.152 0.000 0.000 0.832 0.016
#> SRR1032990 3 0.6446 0.6913 0.120 0.264 0.588 0.012 0.016
#> SRR1032989 4 0.3039 0.8168 0.152 0.000 0.000 0.836 0.012
#> SRR1032991 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.9189 0.3020 0.232 0.196 0.324 0.208 0.040
#> SRR1032993 4 0.4733 0.7663 0.068 0.056 0.068 0.796 0.012
#> SRR1032994 3 0.7240 0.4856 0.132 0.384 0.432 0.048 0.004
#> SRR1032995 1 0.3919 0.7580 0.820 0.016 0.008 0.128 0.028
#> SRR1032996 4 0.6850 0.5495 0.292 0.028 0.048 0.568 0.064
#> SRR1032997 4 0.4036 0.7996 0.088 0.020 0.064 0.824 0.004
#> SRR1032998 3 0.8927 0.3683 0.276 0.228 0.324 0.144 0.028
#> SRR1032999 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 4 0.6226 0.4293 0.044 0.328 0.064 0.564 0.000
#> SRR1033001 1 0.9032 -0.1163 0.308 0.136 0.248 0.272 0.036
#> SRR1033002 1 0.8432 -0.0148 0.412 0.184 0.276 0.104 0.024
#> SRR1033003 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.2710 0.8237 0.036 0.892 0.008 0.064 0.000
#> SRR1033005 3 0.8932 0.3140 0.236 0.200 0.328 0.216 0.020
#> SRR1033006 3 0.6379 0.6119 0.072 0.380 0.516 0.024 0.008
#> SRR1033007 3 0.8264 0.3057 0.260 0.068 0.444 0.036 0.192
#> SRR1033008 1 0.1820 0.8269 0.944 0.012 0.016 0.016 0.012
#> SRR1033009 1 0.1646 0.8344 0.944 0.032 0.004 0.020 0.000
#> SRR1033010 4 0.5382 0.6609 0.052 0.068 0.160 0.720 0.000
#> SRR1033011 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.2387 0.8345 0.896 0.092 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033013 3 0.3209 0.7342 0.000 0.180 0.812 0.000 0.008
#> SRR1033014 3 0.4735 0.6955 0.024 0.304 0.664 0.008 0.000
#> SRR1033015 3 0.4947 0.7218 0.028 0.300 0.660 0.004 0.008
#> SRR1033016 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.5950 0.6410 0.056 0.368 0.552 0.020 0.004
#> SRR1033019 3 0.4966 0.6340 0.016 0.368 0.604 0.008 0.004
#> SRR1033020 1 0.6664 0.4989 0.628 0.040 0.096 0.028 0.208
#> SRR1033021 3 0.8023 0.4457 0.292 0.152 0.448 0.016 0.092
#> SRR1033023 1 0.2568 0.8305 0.888 0.096 0.004 0.008 0.004
#> SRR1033022 1 0.2623 0.8322 0.888 0.092 0.012 0.004 0.004
#> SRR1033024 3 0.3675 0.7271 0.008 0.216 0.772 0.004 0.000
#> SRR1033025 1 0.2912 0.8312 0.872 0.104 0.012 0.008 0.004
#> SRR1033026 3 0.3246 0.7357 0.008 0.184 0.808 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.3046 0.7982 0.052 0.020 0.048 0.880 0.000
#> SRR1033029 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.4759 0.6465 0.020 0.328 0.644 0.008 0.000
#> SRR1033031 1 0.3327 0.7857 0.824 0.160 0.008 0.004 0.004
#> SRR1033032 2 0.4774 0.4006 0.040 0.680 0.276 0.004 0.000
#> SRR1033033 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2349 0.8385 0.900 0.084 0.012 0.004 0.000
#> SRR1033036 1 0.2649 0.8356 0.892 0.080 0.020 0.004 0.004
#> SRR1033037 1 0.2361 0.8360 0.916 0.040 0.004 0.032 0.008
#> SRR1033038 1 0.4168 0.6374 0.704 0.284 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033039 3 0.5053 0.7162 0.032 0.264 0.684 0.008 0.012
#> SRR1033040 3 0.7028 0.4747 0.240 0.320 0.428 0.004 0.008
#> SRR1033041 1 0.2270 0.8420 0.916 0.052 0.012 0.020 0.000
#> SRR1033042 1 0.2656 0.8242 0.876 0.112 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033043 1 0.2929 0.8332 0.896 0.036 0.028 0.028 0.012
#> SRR1033044 1 0.2095 0.8403 0.920 0.060 0.008 0.012 0.000
#> SRR1033045 3 0.4854 0.7409 0.044 0.252 0.696 0.004 0.004
#> SRR1033046 1 0.7610 0.2642 0.528 0.108 0.264 0.036 0.064
#> SRR1033047 3 0.5051 0.6942 0.032 0.316 0.640 0.012 0.000
#> SRR1033048 1 0.7403 0.1122 0.480 0.216 0.264 0.020 0.020
#> SRR1033049 1 0.2858 0.8313 0.876 0.100 0.008 0.012 0.004
#> SRR1033051 1 0.2378 0.8419 0.908 0.064 0.012 0.016 0.000
#> SRR1033052 1 0.2414 0.8379 0.900 0.080 0.012 0.008 0.000
#> SRR1033053 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.5640 0.7243 0.072 0.276 0.636 0.012 0.004
#> SRR1033050 1 0.2529 0.8381 0.912 0.040 0.016 0.024 0.008
#> SRR1033055 3 0.4919 0.7134 0.020 0.304 0.660 0.008 0.008
#> SRR1033056 3 0.8804 0.4315 0.256 0.208 0.384 0.112 0.040
#> SRR1033057 1 0.2771 0.8154 0.860 0.128 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.3963 0.7091 0.004 0.256 0.732 0.008 0.000
#> SRR1033059 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.7025 0.4134 0.580 0.048 0.116 0.020 0.236
#> SRR1033061 2 0.2835 0.8276 0.036 0.880 0.080 0.004 0.000
#> SRR1033062 3 0.4851 0.6124 0.020 0.352 0.620 0.008 0.000
#> SRR1033063 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.4595 0.7277 0.028 0.284 0.684 0.004 0.000
#> SRR1033065 1 0.2249 0.8307 0.896 0.096 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.3281 0.8112 0.840 0.136 0.016 0.004 0.004
#> SRR1033067 1 0.1731 0.8374 0.940 0.040 0.008 0.012 0.000
#> SRR1033068 3 0.5619 0.7192 0.060 0.304 0.620 0.008 0.008
#> SRR1033069 2 0.4743 0.4992 0.048 0.700 0.248 0.000 0.004
#> SRR1033070 3 0.5890 0.7145 0.064 0.308 0.604 0.008 0.016
#> SRR1033071 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.4605 0.4825 0.040 0.708 0.248 0.004 0.000
#> SRR1033073 3 0.4865 0.6174 0.020 0.356 0.616 0.008 0.000
#> SRR1033074 1 0.2377 0.8313 0.920 0.024 0.012 0.032 0.012
#> SRR1033075 1 0.6852 0.4736 0.608 0.040 0.108 0.028 0.216
#> SRR1033076 3 0.5904 0.6916 0.088 0.312 0.588 0.004 0.008
#> SRR1033077 1 0.3648 0.7636 0.832 0.028 0.012 0.124 0.004
#> SRR1033078 1 0.1997 0.8292 0.936 0.012 0.020 0.024 0.008
#> SRR1033079 3 0.3300 0.7277 0.000 0.204 0.792 0.004 0.000
#> SRR1033080 3 0.4433 0.6926 0.016 0.280 0.696 0.008 0.000
#> SRR1033081 1 0.6150 0.6778 0.708 0.072 0.076 0.036 0.108
#> SRR1033082 1 0.2991 0.8117 0.860 0.120 0.012 0.004 0.004
#> SRR1033083 3 0.4546 0.7167 0.020 0.284 0.688 0.008 0.000
#> SRR1033084 1 0.1910 0.8343 0.940 0.020 0.016 0.016 0.008
#> SRR1033085 3 0.4608 0.6988 0.016 0.284 0.688 0.008 0.004
#> SRR1033086 2 0.2835 0.8276 0.036 0.880 0.080 0.004 0.000
#> SRR1033087 1 0.1766 0.8364 0.940 0.040 0.012 0.004 0.004
#> SRR1033088 3 0.4483 0.6683 0.012 0.308 0.672 0.008 0.000
#> SRR1033089 3 0.4933 0.7394 0.060 0.248 0.688 0.000 0.004
#> SRR1033090 4 0.2339 0.8033 0.052 0.008 0.028 0.912 0.000
#> SRR1033091 3 0.4731 0.6956 0.016 0.308 0.664 0.008 0.004
#> SRR1033092 1 0.3490 0.8246 0.856 0.084 0.040 0.012 0.008
#> SRR1033093 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 2 0.5656 -0.1158 0.064 0.552 0.376 0.008 0.000
#> SRR1033095 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.5635 0.7263 0.080 0.284 0.624 0.000 0.012
#> SRR1033097 2 0.2835 0.8276 0.036 0.880 0.080 0.004 0.000
#> SRR1033098 3 0.4598 0.6745 0.016 0.312 0.664 0.008 0.000
#> SRR1033099 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.4933 0.7394 0.060 0.248 0.688 0.000 0.004
#> SRR1033102 1 0.1679 0.8314 0.948 0.016 0.004 0.012 0.020
#> SRR1033103 1 0.2006 0.8359 0.916 0.072 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.2813 0.7307 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.1991 0.8369 0.916 0.076 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033106 1 0.7275 0.2134 0.508 0.052 0.100 0.020 0.320
#> SRR1033107 3 0.2852 0.7305 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.3278 0.8121 0.156 0.000 0.000 0.824 0.020
#> SRR1033109 1 0.1618 0.8362 0.944 0.040 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033110 3 0.5491 0.7436 0.056 0.236 0.680 0.012 0.016
#> SRR1033111 1 0.3392 0.8014 0.832 0.144 0.012 0.004 0.008
#> SRR1033112 1 0.2130 0.8358 0.908 0.080 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.5497 0.6383 0.052 0.380 0.560 0.000 0.008
#> SRR1033114 1 0.3396 0.7911 0.824 0.156 0.012 0.004 0.004
#> SRR1033115 1 0.3963 0.7448 0.772 0.204 0.012 0.004 0.008
#> SRR1033116 3 0.2813 0.7307 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.3266 0.7276 0.000 0.200 0.796 0.004 0.000
#> SRR1033118 4 0.5810 0.5824 0.024 0.004 0.136 0.680 0.156
#> SRR1033119 1 0.1768 0.8363 0.924 0.072 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.3897 0.7457 0.028 0.204 0.768 0.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.3634 0.7730 0.088 0.832 0.076 0.004 0.000
#> SRR1033122 4 0.5926 0.5686 0.024 0.004 0.156 0.668 0.148
#> SRR1033123 1 0.2771 0.8158 0.860 0.128 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.1877 0.8391 0.932 0.052 0.008 0.004 0.004
#> SRR1033125 3 0.6544 0.6778 0.108 0.280 0.576 0.008 0.028
#> SRR1033126 1 0.2193 0.8322 0.900 0.092 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.4763 0.2646 0.016 0.624 0.352 0.008 0.000
#> SRR1033129 3 0.2813 0.7307 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.3774 0.7535 0.780 0.200 0.012 0.000 0.008
#> SRR1033130 1 0.4376 0.7755 0.812 0.024 0.032 0.028 0.104
#> SRR1033131 1 0.5460 0.7047 0.748 0.044 0.072 0.024 0.112
#> SRR1033132 3 0.6576 0.5507 0.116 0.372 0.492 0.008 0.012
#> SRR1033133 3 0.8898 0.2848 0.260 0.176 0.344 0.024 0.196
#> SRR1033134 1 0.5980 0.4769 0.624 0.008 0.008 0.248 0.112
#> SRR1033135 3 0.5006 0.7364 0.048 0.272 0.672 0.000 0.008
#> SRR1033136 1 0.2199 0.8397 0.924 0.044 0.008 0.008 0.016
#> SRR1033137 3 0.6230 0.7192 0.112 0.224 0.632 0.016 0.016
#> SRR1033139 2 0.5289 0.2277 0.060 0.620 0.316 0.000 0.004
#> SRR1033138 2 0.6262 0.3048 0.280 0.548 0.168 0.000 0.004
#> SRR1033140 3 0.5019 0.7028 0.016 0.300 0.660 0.012 0.012
#> SRR1033141 1 0.2104 0.8413 0.924 0.044 0.008 0.024 0.000
#> SRR1033142 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2472 0.8358 0.908 0.044 0.000 0.036 0.012
#> SRR1033144 1 0.2753 0.8095 0.856 0.136 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.4927 0.7374 0.040 0.276 0.676 0.004 0.004
#> SRR1033146 1 0.4632 0.6601 0.700 0.264 0.028 0.004 0.004
#> SRR1033147 2 0.5415 0.2476 0.056 0.624 0.308 0.000 0.012
#> SRR1033148 1 0.3317 0.8314 0.876 0.036 0.016 0.052 0.020
#> SRR1033149 3 0.3675 0.7252 0.004 0.216 0.772 0.008 0.000
#> SRR1033150 5 0.7310 0.2413 0.372 0.036 0.128 0.016 0.448
#> SRR1033151 3 0.6109 0.6578 0.084 0.328 0.568 0.004 0.016
#> SRR1033152 1 0.7007 0.3631 0.564 0.032 0.100 0.032 0.272
#> SRR1033153 3 0.6549 0.6679 0.116 0.280 0.572 0.008 0.024
#> SRR1033154 1 0.2351 0.8347 0.896 0.088 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.3381 0.7369 0.016 0.160 0.820 0.004 0.000
#> SRR1033157 1 0.2443 0.8302 0.892 0.096 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033158 2 0.3634 0.7730 0.088 0.832 0.076 0.004 0.000
#> SRR1033159 3 0.4188 0.7447 0.020 0.228 0.744 0.000 0.008
#> SRR1033160 3 0.4829 0.7230 0.036 0.300 0.660 0.000 0.004
#> SRR1033161 4 0.4703 0.6363 0.312 0.000 0.012 0.660 0.016
#> SRR1033163 3 0.6031 0.6591 0.084 0.332 0.568 0.004 0.012
#> SRR1033162 1 0.2470 0.8279 0.884 0.104 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.1965 0.8646 0.052 0.924 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033165 3 0.8264 0.3057 0.260 0.068 0.444 0.036 0.192
#> SRR1033166 1 0.4559 0.6637 0.708 0.260 0.020 0.008 0.004
#> SRR1033167 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.6552 0.6894 0.124 0.264 0.580 0.008 0.024
#> SRR1033169 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.3319 0.7894 0.040 0.852 0.100 0.000 0.008
#> SRR1033170 1 0.2095 0.8385 0.920 0.060 0.012 0.008 0.000
#> SRR1033172 3 0.4007 0.7449 0.020 0.220 0.756 0.004 0.000
#> SRR1033173 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.6482 0.6509 0.024 0.244 0.588 0.140 0.004
#> SRR1033175 1 0.2300 0.8404 0.920 0.040 0.012 0.024 0.004
#> SRR1033176 1 0.2756 0.8333 0.880 0.096 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033177 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.4046 0.7736 0.792 0.168 0.024 0.008 0.008
#> SRR1033181 1 0.4865 0.7651 0.788 0.076 0.076 0.016 0.044
#> SRR1033183 4 0.4181 0.7338 0.048 0.012 0.152 0.788 0.000
#> SRR1033182 1 0.6928 0.3592 0.568 0.048 0.080 0.024 0.280
#> SRR1033184 3 0.7239 0.6278 0.176 0.264 0.516 0.016 0.028
#> SRR1033185 1 0.3044 0.8189 0.860 0.116 0.016 0.004 0.004
#> SRR1033187 5 0.5536 0.6712 0.204 0.024 0.056 0.016 0.700
#> SRR1033186 2 0.5338 0.2282 0.392 0.560 0.040 0.000 0.008
#> SRR1033188 3 0.8264 0.3057 0.260 0.068 0.444 0.036 0.192
#> SRR1033189 2 0.4697 0.2412 0.012 0.620 0.360 0.008 0.000
#> SRR1033190 1 0.2623 0.8320 0.888 0.092 0.012 0.004 0.004
#> SRR1033191 1 0.2976 0.8086 0.852 0.132 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033192 2 0.4607 0.5161 0.048 0.720 0.228 0.000 0.004
#> SRR1033193 1 0.3027 0.7961 0.880 0.004 0.012 0.032 0.072
#> SRR1033195 2 0.1430 0.8912 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.3634 0.7730 0.088 0.832 0.076 0.004 0.000
#> SRR1033197 1 0.3873 0.7663 0.796 0.172 0.020 0.008 0.004
#> SRR1033196 3 0.5785 0.6564 0.072 0.348 0.568 0.000 0.012
#> SRR1033199 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.3105 0.8009 0.880 0.012 0.008 0.036 0.064
#> SRR1033200 1 0.4672 0.6765 0.752 0.004 0.012 0.052 0.180
#> SRR1033201 3 0.3565 0.7424 0.024 0.176 0.800 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.2852 0.7308 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.4608 0.7424 0.028 0.260 0.704 0.004 0.004
#> SRR1033204 1 0.5520 0.5288 0.652 0.004 0.012 0.068 0.264
#> SRR1033205 3 0.5464 0.6992 0.032 0.120 0.748 0.040 0.060
#> SRR1033206 1 0.2876 0.8341 0.896 0.044 0.008 0.032 0.020
#> SRR1033207 1 0.2542 0.8214 0.912 0.016 0.008 0.032 0.032
#> SRR1033208 3 0.3320 0.7357 0.000 0.164 0.820 0.004 0.012
#> SRR1033209 5 0.3792 0.7875 0.028 0.028 0.088 0.012 0.844
#> SRR1033210 3 0.3211 0.7321 0.000 0.164 0.824 0.004 0.008
#> SRR1033211 5 0.4205 0.7934 0.068 0.032 0.056 0.016 0.828
#> SRR1033212 3 0.3211 0.7321 0.000 0.164 0.824 0.004 0.008
#> SRR1033213 2 0.1430 0.8912 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.3670 0.7963 0.180 0.000 0.004 0.796 0.020
#> SRR1033216 1 0.5606 0.4922 0.636 0.004 0.012 0.068 0.280
#> SRR1033215 2 0.4697 0.2412 0.012 0.620 0.360 0.008 0.000
#> SRR1033217 3 0.6193 0.7228 0.100 0.256 0.616 0.012 0.016
#> SRR1033218 1 0.2680 0.8128 0.904 0.012 0.008 0.040 0.036
#> SRR1033219 1 0.2548 0.8271 0.912 0.024 0.008 0.036 0.020
#> SRR1033221 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.2515 0.8218 0.908 0.020 0.000 0.040 0.032
#> SRR1033223 3 0.8161 0.4632 0.196 0.144 0.480 0.016 0.164
#> SRR1033225 2 0.4414 0.2185 0.004 0.616 0.376 0.004 0.000
#> SRR1033224 1 0.4737 0.6727 0.748 0.004 0.012 0.056 0.180
#> SRR1033226 3 0.8300 0.4546 0.196 0.164 0.460 0.016 0.164
#> SRR1033227 3 0.5464 0.6992 0.032 0.120 0.748 0.040 0.060
#> SRR1033229 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.6019 0.1007 0.520 0.000 0.012 0.384 0.084
#> SRR1033231 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.2680 0.8127 0.904 0.008 0.012 0.036 0.040
#> SRR1033232 3 0.8573 0.2914 0.176 0.088 0.448 0.056 0.232
#> SRR1033233 1 0.2520 0.8155 0.912 0.008 0.012 0.032 0.036
#> SRR1033235 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.7949 0.5106 0.180 0.148 0.512 0.016 0.144
#> SRR1033236 3 0.8030 0.4956 0.188 0.152 0.500 0.016 0.144
#> SRR1033237 5 0.6369 0.2835 0.344 0.000 0.008 0.140 0.508
#> SRR1033238 3 0.4673 0.7323 0.028 0.144 0.776 0.008 0.044
#> SRR1033240 3 0.3093 0.7361 0.008 0.168 0.824 0.000 0.000
#> SRR1033239 5 0.7255 0.1661 0.404 0.032 0.080 0.040 0.444
#> SRR1033242 3 0.6762 0.5678 0.044 0.072 0.656 0.080 0.148
#> SRR1033241 3 0.4365 0.7464 0.024 0.204 0.756 0.008 0.008
#> SRR1033244 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.6737 0.6948 0.120 0.228 0.596 0.008 0.048
#> SRR1033246 1 0.2904 0.8313 0.896 0.032 0.008 0.032 0.032
#> SRR1033248 1 0.4938 0.7757 0.780 0.088 0.084 0.024 0.024
#> SRR1033247 2 0.6237 0.5444 0.192 0.660 0.088 0.048 0.012
#> SRR1033249 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.2457 0.8397 0.908 0.060 0.008 0.004 0.020
#> SRR1033252 2 0.1430 0.8912 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.2264 0.8305 0.924 0.024 0.012 0.032 0.008
#> SRR1033254 1 0.1898 0.8303 0.940 0.016 0.012 0.008 0.024
#> SRR1033256 2 0.1430 0.8912 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.5868 0.7323 0.084 0.220 0.664 0.012 0.020
#> SRR1033258 1 0.2705 0.8148 0.904 0.016 0.008 0.036 0.036
#> SRR1033257 4 0.3319 0.8097 0.160 0.000 0.000 0.820 0.020
#> SRR1033259 1 0.6152 0.3711 0.588 0.004 0.012 0.284 0.112
#> SRR1033260 2 0.1430 0.8912 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.3006 0.7328 0.004 0.156 0.836 0.004 0.000
#> SRR1033262 3 0.3656 0.7436 0.020 0.196 0.784 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4264 0.6608 0.760 0.020 0.012 0.204 0.004
#> SRR1033265 2 0.1597 0.8842 0.048 0.940 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.8525 0.0879 0.436 0.124 0.284 0.060 0.096
#> SRR1033267 3 0.5464 0.6992 0.032 0.120 0.748 0.040 0.060
#> SRR1033268 1 0.2465 0.8396 0.912 0.044 0.004 0.028 0.012
#> SRR1033269 3 0.6632 0.6747 0.140 0.264 0.568 0.012 0.016
#> SRR1033270 3 0.3167 0.7365 0.004 0.172 0.820 0.004 0.000
#> SRR1033271 1 0.2548 0.8199 0.912 0.020 0.008 0.036 0.024
#> SRR1033272 2 0.1430 0.8912 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.2220 0.8384 0.924 0.040 0.008 0.020 0.008
#> SRR1033274 2 0.1430 0.8912 0.052 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.3326 0.8145 0.152 0.000 0.000 0.824 0.024
#> SRR1033276 2 0.1270 0.8941 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.4301 0.7253 0.244 0.000 0.008 0.728 0.020
#> SRR1033278 4 0.3361 0.8006 0.056 0.008 0.064 0.864 0.008
#> SRR1033279 3 0.6632 0.6697 0.140 0.264 0.568 0.012 0.016
#> SRR1033280 3 0.6099 0.7145 0.104 0.248 0.624 0.012 0.012
#> SRR1033281 1 0.2822 0.8424 0.896 0.056 0.008 0.024 0.016
#> SRR1033282 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033283 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033284 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033285 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033286 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033287 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033288 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033289 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033290 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033291 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033292 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
#> SRR1033293 5 0.0727 0.8636 0.004 0.000 0.004 0.012 0.980
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.2143 0.7628 0.048 0.000 0.016 0.916 0.008 0.012
#> SRR1032911 4 0.2537 0.7569 0.088 0.000 0.000 0.880 0.008 0.024
#> SRR1032912 4 0.1425 0.7589 0.020 0.000 0.008 0.952 0.008 0.012
#> SRR1032913 4 0.1425 0.7589 0.020 0.000 0.008 0.952 0.008 0.012
#> SRR1032914 4 0.0984 0.7549 0.008 0.000 0.012 0.968 0.000 0.012
#> SRR1032915 4 0.5673 0.5913 0.084 0.024 0.060 0.704 0.012 0.116
#> SRR1032916 4 0.2135 0.7550 0.012 0.000 0.012 0.920 0.024 0.032
#> SRR1032917 3 0.2163 0.5769 0.000 0.092 0.892 0.000 0.000 0.016
#> SRR1032918 4 0.2537 0.7569 0.088 0.000 0.000 0.880 0.008 0.024
#> SRR1032919 4 0.3092 0.7296 0.012 0.012 0.032 0.860 0.000 0.084
#> SRR1032920 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1976 0.8134 0.924 0.032 0.000 0.008 0.004 0.032
#> SRR1032922 6 0.9013 0.5470 0.176 0.196 0.200 0.120 0.012 0.296
#> SRR1032923 3 0.8108 -0.2667 0.180 0.012 0.408 0.028 0.196 0.176
#> SRR1032925 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.2716 0.7526 0.096 0.000 0.000 0.868 0.008 0.028
#> SRR1032926 4 0.8999 -0.3130 0.172 0.092 0.152 0.344 0.032 0.208
#> SRR1032927 4 0.2815 0.7513 0.096 0.000 0.000 0.864 0.012 0.028
#> SRR1032929 4 0.2807 0.7536 0.088 0.000 0.000 0.868 0.016 0.028
#> SRR1032928 4 0.8940 -0.3345 0.156 0.064 0.180 0.324 0.036 0.240
#> SRR1032930 4 0.0912 0.7532 0.008 0.000 0.004 0.972 0.004 0.012
#> SRR1032931 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.2800 0.7417 0.004 0.860 0.008 0.112 0.000 0.016
#> SRR1032933 4 0.2815 0.7527 0.096 0.000 0.000 0.864 0.012 0.028
#> SRR1032934 4 0.8959 -0.4654 0.172 0.084 0.224 0.272 0.016 0.232
#> SRR1032935 4 0.2956 0.7507 0.100 0.000 0.000 0.856 0.016 0.028
#> SRR1032936 4 0.9581 -0.5075 0.136 0.076 0.228 0.232 0.108 0.220
#> SRR1032937 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.1675 0.8091 0.936 0.024 0.000 0.008 0.000 0.032
#> SRR1032939 6 0.9022 0.5547 0.208 0.164 0.224 0.116 0.012 0.276
#> SRR1032940 4 0.4707 0.6380 0.016 0.064 0.036 0.752 0.000 0.132
#> SRR1032941 4 0.1730 0.7555 0.012 0.004 0.004 0.936 0.004 0.040
#> SRR1032942 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.1700 0.8139 0.928 0.048 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032945 4 0.1007 0.7531 0.008 0.000 0.004 0.968 0.004 0.016
#> SRR1032946 1 0.6488 0.0238 0.456 0.000 0.016 0.388 0.080 0.060
#> SRR1032947 4 0.7357 0.2510 0.084 0.056 0.140 0.528 0.004 0.188
#> SRR1032948 4 0.2537 0.7569 0.088 0.000 0.000 0.880 0.008 0.024
#> SRR1032949 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 6 0.9102 0.5601 0.192 0.180 0.200 0.124 0.016 0.288
#> SRR1032951 4 0.3423 0.7126 0.148 0.000 0.000 0.808 0.008 0.036
#> SRR1032952 4 0.8545 -0.1514 0.148 0.060 0.164 0.396 0.024 0.208
#> SRR1032953 4 0.2764 0.7515 0.100 0.000 0.000 0.864 0.008 0.028
#> SRR1032954 1 0.3568 0.7760 0.840 0.016 0.004 0.068 0.012 0.060
#> SRR1032955 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.1912 0.7539 0.012 0.004 0.008 0.928 0.004 0.044
#> SRR1032956 1 0.1679 0.8113 0.936 0.028 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1032958 4 0.2666 0.7560 0.092 0.000 0.000 0.872 0.008 0.028
#> SRR1032959 4 0.4567 0.4225 0.352 0.004 0.000 0.612 0.008 0.024
#> SRR1032960 4 0.2441 0.7482 0.012 0.008 0.024 0.900 0.000 0.056
#> SRR1032961 1 0.1931 0.8100 0.928 0.020 0.000 0.016 0.004 0.032
#> SRR1032962 2 0.4669 0.5857 0.012 0.712 0.112 0.000 0.000 0.164
#> SRR1032963 4 0.3096 0.7363 0.020 0.008 0.028 0.860 0.000 0.084
#> SRR1032964 4 0.2485 0.7450 0.016 0.008 0.016 0.896 0.000 0.064
#> SRR1032965 4 0.2815 0.7513 0.096 0.000 0.000 0.864 0.012 0.028
#> SRR1032966 4 0.2838 0.7477 0.116 0.000 0.004 0.852 0.000 0.028
#> SRR1032967 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.2756 0.7384 0.016 0.012 0.016 0.880 0.000 0.076
#> SRR1032969 4 0.5137 0.6161 0.028 0.052 0.052 0.724 0.000 0.144
#> SRR1032970 4 0.2666 0.7560 0.092 0.000 0.000 0.872 0.008 0.028
#> SRR1032971 4 0.2630 0.7424 0.016 0.008 0.020 0.888 0.000 0.068
#> SRR1032972 4 0.1692 0.7615 0.024 0.000 0.008 0.940 0.008 0.020
#> SRR1032973 4 0.2058 0.7452 0.004 0.008 0.016 0.916 0.000 0.056
#> SRR1032974 1 0.5842 0.3222 0.548 0.044 0.004 0.340 0.004 0.060
#> SRR1032975 4 0.2476 0.7576 0.092 0.000 0.000 0.880 0.004 0.024
#> SRR1032976 4 0.9501 -0.4426 0.168 0.060 0.176 0.256 0.108 0.232
#> SRR1032977 4 0.5543 0.3182 0.000 0.312 0.020 0.568 0.000 0.100
#> SRR1032978 1 0.2469 0.8111 0.904 0.028 0.000 0.012 0.020 0.036
#> SRR1032979 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.5192 0.6143 0.028 0.048 0.060 0.720 0.000 0.144
#> SRR1032981 4 0.2179 0.7446 0.004 0.008 0.016 0.908 0.000 0.064
#> SRR1032982 4 0.1121 0.7575 0.016 0.000 0.008 0.964 0.004 0.008
#> SRR1032983 4 0.9086 -0.5032 0.164 0.108 0.184 0.272 0.020 0.252
#> SRR1032984 4 0.3978 0.6951 0.012 0.044 0.036 0.808 0.000 0.100
#> SRR1032985 4 0.2939 0.7491 0.100 0.000 0.000 0.856 0.012 0.032
#> SRR1032986 4 0.1515 0.7597 0.028 0.000 0.000 0.944 0.008 0.020
#> SRR1032987 2 0.2086 0.8151 0.012 0.912 0.004 0.064 0.000 0.008
#> SRR1032988 4 0.2864 0.7510 0.100 0.000 0.000 0.860 0.012 0.028
#> SRR1032990 3 0.6713 0.1525 0.040 0.168 0.432 0.004 0.004 0.352
#> SRR1032989 4 0.2686 0.7516 0.100 0.000 0.000 0.868 0.008 0.024
#> SRR1032991 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 6 0.9317 0.5235 0.156 0.148 0.196 0.204 0.028 0.268
#> SRR1032993 4 0.3855 0.6993 0.016 0.032 0.028 0.812 0.000 0.112
#> SRR1032994 2 0.7820 -0.4391 0.084 0.332 0.324 0.040 0.000 0.220
#> SRR1032995 1 0.4271 0.7158 0.788 0.012 0.008 0.124 0.024 0.044
#> SRR1032996 4 0.6466 0.4658 0.236 0.012 0.036 0.596 0.052 0.068
#> SRR1032997 4 0.3311 0.7269 0.020 0.016 0.024 0.848 0.000 0.092
#> SRR1032998 6 0.9114 0.5523 0.196 0.192 0.196 0.136 0.012 0.268
#> SRR1032999 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 4 0.5543 0.3182 0.000 0.312 0.020 0.568 0.000 0.100
#> SRR1033001 4 0.8991 -0.4490 0.220 0.092 0.144 0.276 0.020 0.248
#> SRR1033002 1 0.8750 -0.5108 0.344 0.152 0.180 0.092 0.012 0.220
#> SRR1033003 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.2086 0.8151 0.012 0.912 0.004 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033005 6 0.8959 0.5181 0.156 0.160 0.204 0.196 0.004 0.280
#> SRR1033006 3 0.6988 0.3197 0.020 0.332 0.364 0.016 0.004 0.264
#> SRR1033007 3 0.8065 -0.2656 0.180 0.012 0.408 0.024 0.196 0.180
#> SRR1033008 1 0.2014 0.8067 0.924 0.012 0.004 0.004 0.012 0.044
#> SRR1033009 1 0.1821 0.8133 0.928 0.040 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033010 4 0.4816 0.5926 0.008 0.060 0.136 0.740 0.000 0.056
#> SRR1033011 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.2772 0.8088 0.864 0.092 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1033013 3 0.2686 0.5835 0.000 0.100 0.868 0.000 0.008 0.024
#> SRR1033014 3 0.5420 0.5521 0.000 0.272 0.580 0.004 0.000 0.144
#> SRR1033015 3 0.5625 0.5351 0.000 0.244 0.540 0.000 0.000 0.216
#> SRR1033016 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.6561 0.4342 0.020 0.324 0.448 0.012 0.000 0.196
#> SRR1033019 3 0.5593 0.4942 0.000 0.332 0.524 0.004 0.000 0.140
#> SRR1033020 1 0.6663 0.3286 0.556 0.024 0.040 0.004 0.204 0.172
#> SRR1033021 3 0.8459 -0.2588 0.228 0.100 0.380 0.012 0.084 0.196
#> SRR1033023 1 0.2821 0.8076 0.860 0.096 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1033022 1 0.3128 0.8036 0.844 0.096 0.008 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033024 3 0.4067 0.5853 0.000 0.172 0.752 0.004 0.000 0.072
#> SRR1033025 1 0.3126 0.8044 0.844 0.104 0.004 0.004 0.000 0.044
#> SRR1033026 3 0.3041 0.5926 0.000 0.128 0.832 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033027 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.2287 0.7383 0.000 0.012 0.036 0.904 0.000 0.048
#> SRR1033029 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.5175 0.5077 0.000 0.308 0.588 0.004 0.000 0.100
#> SRR1033031 1 0.3626 0.7581 0.788 0.144 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033032 2 0.5117 0.4377 0.016 0.660 0.208 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033033 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2772 0.8140 0.864 0.092 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033036 1 0.3221 0.8104 0.828 0.076 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033037 1 0.2546 0.8141 0.896 0.040 0.000 0.020 0.004 0.040
#> SRR1033038 1 0.4443 0.5517 0.664 0.276 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033039 3 0.5387 0.5586 0.000 0.236 0.620 0.004 0.008 0.132
#> SRR1033040 3 0.7656 -0.0418 0.168 0.272 0.344 0.000 0.004 0.212
#> SRR1033041 1 0.2321 0.8205 0.900 0.052 0.000 0.008 0.000 0.040
#> SRR1033042 1 0.3078 0.7974 0.836 0.108 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033043 1 0.3354 0.8097 0.860 0.044 0.012 0.016 0.012 0.056
#> SRR1033044 1 0.2067 0.8183 0.912 0.064 0.004 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033045 3 0.4772 0.5822 0.004 0.180 0.696 0.004 0.000 0.116
#> SRR1033046 1 0.8047 -0.1477 0.448 0.096 0.164 0.016 0.056 0.220
#> SRR1033047 3 0.5715 0.5401 0.012 0.272 0.572 0.004 0.000 0.140
#> SRR1033048 1 0.7660 -0.2311 0.420 0.200 0.180 0.000 0.016 0.184
#> SRR1033049 1 0.2984 0.8043 0.848 0.104 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1033051 1 0.2653 0.8194 0.876 0.064 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1033052 1 0.2737 0.8135 0.868 0.084 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1033053 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.6162 0.3705 0.016 0.188 0.508 0.004 0.000 0.284
#> SRR1033050 1 0.2775 0.8190 0.880 0.052 0.000 0.008 0.008 0.052
#> SRR1033055 3 0.5425 0.5717 0.004 0.244 0.604 0.004 0.000 0.144
#> SRR1033056 3 0.9174 -0.4999 0.180 0.156 0.284 0.112 0.028 0.240
#> SRR1033057 1 0.3290 0.7834 0.820 0.132 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033058 3 0.4338 0.5781 0.000 0.208 0.716 0.004 0.000 0.072
#> SRR1033059 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.7101 0.1833 0.484 0.036 0.044 0.000 0.224 0.212
#> SRR1033061 2 0.2697 0.8085 0.008 0.876 0.048 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033062 3 0.5190 0.4880 0.000 0.324 0.576 0.004 0.000 0.096
#> SRR1033063 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.4983 0.5851 0.004 0.220 0.652 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033065 1 0.2595 0.8058 0.872 0.084 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033066 1 0.3413 0.7840 0.812 0.108 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033067 1 0.2065 0.8165 0.912 0.052 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1033068 3 0.6139 0.4366 0.016 0.212 0.524 0.004 0.000 0.244
#> SRR1033069 2 0.4923 0.5412 0.016 0.692 0.156 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033070 3 0.6201 0.4508 0.012 0.236 0.496 0.000 0.004 0.252
#> SRR1033071 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.4845 0.5070 0.016 0.692 0.192 0.000 0.000 0.100
#> SRR1033073 3 0.5341 0.4813 0.000 0.336 0.552 0.004 0.000 0.108
#> SRR1033074 1 0.2422 0.8100 0.900 0.024 0.000 0.016 0.004 0.056
#> SRR1033075 1 0.7053 0.2802 0.520 0.024 0.044 0.012 0.204 0.196
#> SRR1033076 3 0.6336 0.3361 0.016 0.236 0.476 0.004 0.000 0.268
#> SRR1033077 1 0.4157 0.7274 0.784 0.024 0.000 0.108 0.004 0.080
#> SRR1033078 1 0.2092 0.8098 0.920 0.012 0.004 0.008 0.008 0.048
#> SRR1033079 3 0.3054 0.5881 0.000 0.136 0.828 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033080 3 0.5050 0.5438 0.000 0.260 0.628 0.004 0.000 0.108
#> SRR1033081 1 0.6383 0.5734 0.644 0.056 0.036 0.016 0.100 0.148
#> SRR1033082 1 0.3337 0.7883 0.824 0.108 0.004 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033083 3 0.5269 0.5777 0.004 0.240 0.624 0.004 0.000 0.128
#> SRR1033084 1 0.2131 0.8129 0.916 0.024 0.004 0.004 0.004 0.048
#> SRR1033085 3 0.5087 0.5526 0.000 0.252 0.628 0.004 0.000 0.116
#> SRR1033086 2 0.2697 0.8085 0.008 0.876 0.048 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033087 1 0.2088 0.8151 0.904 0.028 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033088 3 0.5176 0.5227 0.000 0.288 0.600 0.004 0.000 0.108
#> SRR1033089 3 0.5455 0.5619 0.032 0.188 0.656 0.000 0.004 0.120
#> SRR1033090 4 0.1605 0.7452 0.000 0.004 0.016 0.936 0.000 0.044
#> SRR1033091 3 0.5339 0.5552 0.000 0.268 0.592 0.004 0.000 0.136
#> SRR1033092 1 0.3443 0.7992 0.836 0.072 0.016 0.004 0.000 0.072
#> SRR1033093 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 2 0.5701 0.0280 0.008 0.544 0.288 0.000 0.000 0.160
#> SRR1033095 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.6215 0.4634 0.024 0.216 0.532 0.000 0.004 0.224
#> SRR1033097 2 0.2697 0.8085 0.008 0.876 0.048 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033098 3 0.5235 0.5307 0.000 0.284 0.596 0.004 0.000 0.116
#> SRR1033099 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.5455 0.5619 0.032 0.188 0.656 0.000 0.004 0.120
#> SRR1033102 1 0.2173 0.8110 0.920 0.024 0.004 0.004 0.024 0.024
#> SRR1033103 1 0.2420 0.8115 0.888 0.076 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033104 3 0.2383 0.5751 0.000 0.096 0.880 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033105 1 0.2420 0.8133 0.888 0.076 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1033106 1 0.7161 0.0161 0.424 0.028 0.032 0.004 0.308 0.204
#> SRR1033107 3 0.2350 0.5768 0.000 0.100 0.880 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033108 4 0.3050 0.7444 0.108 0.000 0.000 0.848 0.016 0.028
#> SRR1033109 1 0.2082 0.8149 0.916 0.040 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1033110 3 0.5717 0.4869 0.000 0.176 0.592 0.008 0.008 0.216
#> SRR1033111 1 0.3808 0.7638 0.784 0.132 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR1033112 1 0.2563 0.8127 0.876 0.072 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033113 3 0.6269 0.2746 0.008 0.292 0.408 0.000 0.000 0.292
#> SRR1033114 1 0.3691 0.7535 0.788 0.148 0.004 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033115 1 0.4186 0.6945 0.728 0.192 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033116 3 0.2301 0.5756 0.000 0.096 0.884 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033117 3 0.2942 0.5857 0.000 0.132 0.836 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033118 4 0.5621 0.5646 0.004 0.004 0.116 0.668 0.156 0.052
#> SRR1033119 1 0.2221 0.8144 0.896 0.072 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033121 3 0.3907 0.5928 0.004 0.132 0.776 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033120 2 0.3278 0.7669 0.056 0.848 0.064 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033122 4 0.5761 0.5476 0.004 0.004 0.132 0.656 0.148 0.056
#> SRR1033123 1 0.3318 0.7845 0.824 0.124 0.008 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033124 1 0.2251 0.8176 0.904 0.052 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR1033125 3 0.6900 0.1266 0.032 0.196 0.416 0.004 0.012 0.340
#> SRR1033126 1 0.2762 0.8072 0.860 0.092 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033127 2 0.4480 0.2475 0.000 0.616 0.340 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033129 3 0.2383 0.5773 0.000 0.096 0.880 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033128 1 0.4201 0.7077 0.732 0.196 0.004 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033130 1 0.4731 0.7401 0.764 0.016 0.012 0.020 0.092 0.096
#> SRR1033131 1 0.5891 0.5727 0.644 0.032 0.016 0.008 0.108 0.192
#> SRR1033132 3 0.6721 0.0552 0.032 0.304 0.336 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033133 6 0.8662 0.4133 0.160 0.100 0.216 0.004 0.180 0.340
#> SRR1033134 1 0.6080 0.4585 0.596 0.008 0.004 0.240 0.108 0.044
#> SRR1033135 3 0.5479 0.5383 0.012 0.180 0.612 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033136 1 0.2535 0.8192 0.892 0.048 0.000 0.004 0.008 0.048
#> SRR1033137 3 0.6137 0.2661 0.024 0.124 0.516 0.004 0.004 0.328
#> SRR1033139 2 0.5641 0.2866 0.016 0.596 0.188 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033138 2 0.6553 0.1204 0.264 0.516 0.088 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033140 3 0.5519 0.5510 0.000 0.264 0.584 0.004 0.004 0.144
#> SRR1033141 1 0.2441 0.8195 0.900 0.056 0.008 0.012 0.000 0.024
#> SRR1033142 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2669 0.8144 0.892 0.044 0.000 0.028 0.008 0.028
#> SRR1033144 1 0.3264 0.7795 0.820 0.136 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033145 3 0.5371 0.5638 0.008 0.212 0.616 0.000 0.000 0.164
#> SRR1033146 1 0.4880 0.5963 0.656 0.256 0.012 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033147 2 0.5864 0.2917 0.024 0.576 0.192 0.000 0.000 0.208
#> SRR1033148 1 0.3456 0.8130 0.848 0.040 0.000 0.040 0.012 0.060
#> SRR1033149 3 0.3765 0.5819 0.000 0.156 0.780 0.004 0.000 0.060
#> SRR1033150 5 0.7198 0.2009 0.244 0.008 0.068 0.004 0.440 0.236
#> SRR1033151 3 0.6696 0.2584 0.020 0.264 0.412 0.004 0.004 0.296
#> SRR1033152 1 0.7256 0.1884 0.468 0.028 0.040 0.012 0.272 0.180
#> SRR1033153 3 0.6705 0.0844 0.036 0.204 0.384 0.000 0.004 0.372
#> SRR1033154 1 0.2968 0.8075 0.852 0.092 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033156 3 0.2776 0.5710 0.000 0.088 0.860 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033157 1 0.2629 0.8039 0.868 0.092 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033158 2 0.3278 0.7669 0.056 0.848 0.064 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033159 3 0.4251 0.5914 0.000 0.152 0.748 0.000 0.008 0.092
#> SRR1033160 3 0.5599 0.4843 0.004 0.216 0.568 0.000 0.000 0.212
#> SRR1033161 4 0.4531 0.5464 0.272 0.000 0.000 0.672 0.012 0.044
#> SRR1033163 3 0.6433 0.2019 0.020 0.236 0.400 0.000 0.000 0.344
#> SRR1033162 1 0.3075 0.7966 0.844 0.108 0.008 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033164 2 0.1546 0.8534 0.020 0.944 0.020 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033165 3 0.8065 -0.2656 0.180 0.012 0.408 0.024 0.196 0.180
#> SRR1033166 1 0.4775 0.5898 0.656 0.256 0.004 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033167 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.6787 0.1469 0.044 0.188 0.440 0.000 0.008 0.320
#> SRR1033169 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.3074 0.7842 0.016 0.856 0.060 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033170 1 0.2294 0.8149 0.892 0.072 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033172 3 0.4132 0.5955 0.004 0.136 0.756 0.000 0.000 0.104
#> SRR1033173 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.6820 0.4417 0.008 0.220 0.528 0.128 0.000 0.116
#> SRR1033175 1 0.2547 0.8189 0.896 0.044 0.000 0.012 0.008 0.040
#> SRR1033176 1 0.3426 0.8036 0.828 0.104 0.004 0.000 0.008 0.056
#> SRR1033177 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.4074 0.7385 0.748 0.160 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033181 1 0.5266 0.6410 0.684 0.060 0.016 0.004 0.028 0.208
#> SRR1033183 4 0.3539 0.6721 0.000 0.012 0.136 0.808 0.000 0.044
#> SRR1033182 1 0.7100 0.1208 0.464 0.032 0.032 0.004 0.272 0.196
#> SRR1033184 3 0.7706 -0.0633 0.100 0.208 0.352 0.008 0.012 0.320
#> SRR1033185 1 0.3150 0.7953 0.832 0.104 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033187 5 0.5082 0.5634 0.176 0.004 0.032 0.008 0.708 0.072
#> SRR1033186 2 0.5347 0.1617 0.340 0.564 0.016 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033188 3 0.8065 -0.2656 0.180 0.012 0.408 0.024 0.196 0.180
#> SRR1033189 2 0.4506 0.2233 0.000 0.608 0.348 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033190 1 0.2813 0.8093 0.864 0.092 0.008 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033191 1 0.3395 0.7800 0.816 0.124 0.004 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033192 2 0.4926 0.5589 0.020 0.696 0.124 0.000 0.000 0.160
#> SRR1033193 1 0.3416 0.7770 0.848 0.012 0.000 0.024 0.064 0.052
#> SRR1033195 2 0.0603 0.8818 0.016 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.3278 0.7669 0.056 0.848 0.064 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033197 1 0.4017 0.7325 0.760 0.160 0.004 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033196 3 0.6455 0.2970 0.016 0.268 0.440 0.000 0.004 0.272
#> SRR1033199 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.3464 0.7795 0.848 0.016 0.000 0.028 0.060 0.048
#> SRR1033200 1 0.4651 0.6720 0.728 0.004 0.000 0.032 0.180 0.056
#> SRR1033201 3 0.2875 0.5845 0.000 0.096 0.852 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033202 3 0.2263 0.5784 0.000 0.100 0.884 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033203 3 0.4990 0.5740 0.004 0.184 0.672 0.004 0.000 0.136
#> SRR1033204 1 0.5432 0.5363 0.628 0.004 0.000 0.052 0.264 0.052
#> SRR1033205 3 0.5153 0.4900 0.008 0.068 0.752 0.040 0.064 0.068
#> SRR1033206 1 0.2975 0.8113 0.876 0.048 0.000 0.024 0.012 0.040
#> SRR1033207 1 0.2817 0.7997 0.888 0.024 0.000 0.024 0.032 0.032
#> SRR1033208 3 0.3050 0.5780 0.000 0.092 0.852 0.000 0.012 0.044
#> SRR1033209 5 0.3082 0.7347 0.012 0.008 0.040 0.000 0.860 0.080
#> SRR1033210 3 0.2883 0.5723 0.000 0.092 0.860 0.000 0.008 0.040
#> SRR1033211 5 0.3432 0.7435 0.032 0.008 0.028 0.000 0.840 0.092
#> SRR1033212 3 0.2863 0.5757 0.000 0.096 0.860 0.000 0.008 0.036
#> SRR1033213 2 0.0603 0.8818 0.016 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.3390 0.7219 0.140 0.000 0.000 0.816 0.016 0.028
#> SRR1033216 1 0.5554 0.5047 0.612 0.008 0.000 0.052 0.280 0.048
#> SRR1033215 2 0.4506 0.2233 0.000 0.608 0.348 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033217 3 0.6458 0.3303 0.028 0.156 0.504 0.004 0.008 0.300
#> SRR1033218 1 0.2900 0.7917 0.880 0.012 0.000 0.028 0.028 0.052
#> SRR1033219 1 0.2815 0.8040 0.888 0.028 0.000 0.024 0.024 0.036
#> SRR1033221 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.3257 0.7993 0.868 0.024 0.004 0.032 0.032 0.040
#> SRR1033223 6 0.7840 0.3740 0.076 0.064 0.304 0.004 0.148 0.404
#> SRR1033225 2 0.4453 0.1826 0.000 0.592 0.372 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033224 1 0.4720 0.6678 0.724 0.004 0.000 0.036 0.180 0.056
#> SRR1033226 6 0.8003 0.3868 0.080 0.080 0.288 0.004 0.148 0.400
#> SRR1033227 3 0.5153 0.4900 0.008 0.068 0.752 0.040 0.064 0.068
#> SRR1033229 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.5926 0.2100 0.508 0.000 0.004 0.368 0.084 0.036
#> SRR1033231 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.2745 0.7926 0.888 0.008 0.000 0.028 0.044 0.032
#> SRR1033232 3 0.8359 -0.1303 0.124 0.056 0.444 0.064 0.232 0.080
#> SRR1033233 1 0.2677 0.7994 0.892 0.008 0.000 0.028 0.040 0.032
#> SRR1033235 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 6 0.7788 0.3103 0.064 0.076 0.340 0.004 0.132 0.384
#> SRR1033236 6 0.7788 0.3268 0.068 0.072 0.336 0.004 0.132 0.388
#> SRR1033237 5 0.6038 0.2574 0.328 0.000 0.004 0.128 0.516 0.024
#> SRR1033238 3 0.4108 0.5278 0.004 0.068 0.808 0.008 0.044 0.068
#> SRR1033240 3 0.2647 0.5755 0.000 0.088 0.868 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033239 5 0.6964 0.1751 0.328 0.012 0.044 0.008 0.448 0.160
#> SRR1033242 3 0.6166 0.3148 0.004 0.040 0.652 0.072 0.156 0.076
#> SRR1033241 3 0.3753 0.5713 0.000 0.104 0.792 0.000 0.004 0.100
#> SRR1033244 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.7173 0.1240 0.052 0.152 0.472 0.004 0.032 0.288
#> SRR1033246 1 0.3066 0.8089 0.872 0.036 0.000 0.020 0.020 0.052
#> SRR1033248 1 0.5187 0.7251 0.744 0.084 0.044 0.016 0.020 0.092
#> SRR1033247 2 0.5441 0.3558 0.124 0.608 0.016 0.000 0.000 0.252
#> SRR1033249 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.2978 0.8171 0.860 0.056 0.000 0.000 0.012 0.072
#> SRR1033252 2 0.0603 0.8818 0.016 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.2836 0.8052 0.884 0.028 0.000 0.028 0.012 0.048
#> SRR1033254 1 0.2345 0.8118 0.900 0.020 0.000 0.000 0.020 0.060
#> SRR1033256 2 0.0603 0.8818 0.016 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.6141 0.3739 0.024 0.132 0.572 0.004 0.012 0.256
#> SRR1033258 1 0.2794 0.7927 0.888 0.016 0.000 0.028 0.028 0.040
#> SRR1033257 4 0.3062 0.7395 0.116 0.000 0.000 0.844 0.016 0.024
#> SRR1033259 1 0.6164 0.4011 0.568 0.004 0.004 0.268 0.108 0.048
#> SRR1033260 2 0.0603 0.8818 0.016 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.2457 0.5698 0.000 0.084 0.880 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033262 3 0.3138 0.5872 0.000 0.108 0.832 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033263 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4489 0.6481 0.732 0.020 0.000 0.188 0.004 0.056
#> SRR1033265 2 0.0820 0.8762 0.016 0.972 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 6 0.8589 0.3983 0.308 0.080 0.144 0.036 0.084 0.348
#> SRR1033267 3 0.5153 0.4900 0.008 0.068 0.752 0.040 0.064 0.068
#> SRR1033268 1 0.2665 0.8205 0.892 0.052 0.000 0.016 0.016 0.024
#> SRR1033269 3 0.6852 0.0439 0.044 0.184 0.396 0.004 0.004 0.368
#> SRR1033270 3 0.2487 0.5781 0.000 0.092 0.876 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033271 1 0.2802 0.7992 0.888 0.024 0.000 0.028 0.020 0.040
#> SRR1033272 2 0.0603 0.8818 0.016 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.2446 0.8172 0.900 0.044 0.000 0.008 0.008 0.040
#> SRR1033274 2 0.0603 0.8818 0.016 0.980 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.3103 0.7481 0.100 0.000 0.000 0.848 0.016 0.036
#> SRR1033276 2 0.0458 0.8846 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.4006 0.6491 0.204 0.000 0.000 0.748 0.016 0.032
#> SRR1033278 4 0.3062 0.7465 0.020 0.004 0.056 0.872 0.008 0.040
#> SRR1033279 3 0.6905 0.0357 0.048 0.168 0.424 0.004 0.008 0.348
#> SRR1033280 3 0.6496 0.2702 0.036 0.160 0.500 0.004 0.004 0.296
#> SRR1033281 1 0.3310 0.8221 0.852 0.064 0.000 0.016 0.012 0.056
#> SRR1033282 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033283 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033284 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033285 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033286 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033287 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033288 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033289 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033290 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033291 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033292 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033293 5 0.0000 0.8440 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.676 0.892 0.944 0.3514 0.678 0.678
#> 3 3 0.475 0.665 0.805 0.6211 0.676 0.543
#> 4 4 0.586 0.757 0.806 0.1914 0.752 0.465
#> 5 5 0.938 0.927 0.946 0.1106 0.953 0.832
#> 6 6 0.803 0.704 0.838 0.0559 0.962 0.852
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.6247 0.8470 0.844 0.156
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.1633 0.9247 0.976 0.024
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032932 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0376 0.9334 0.996 0.004
#> SRR1032940 1 0.4431 0.8893 0.908 0.092
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032943 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.9909 0.3270 0.556 0.444
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.7299 0.8022 0.796 0.204
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032980 1 0.1633 0.9248 0.976 0.024
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0376 0.9334 0.996 0.004
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.1184 0.9284 0.984 0.016
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.6148 0.8500 0.848 0.152
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033000 1 0.7299 0.8022 0.796 0.204
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033004 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033005 1 0.6623 0.8347 0.828 0.172
#> SRR1033006 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033007 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033011 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.4161 0.8936 0.916 0.084
#> SRR1033014 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033015 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033016 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033017 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033018 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033019 1 0.9170 0.6033 0.668 0.332
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033027 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033028 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033030 1 0.9996 0.1804 0.512 0.488
#> SRR1033031 1 0.8081 0.7452 0.752 0.248
#> SRR1033032 1 0.8713 0.6767 0.708 0.292
#> SRR1033033 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033035 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033034 1 0.0376 0.9334 0.996 0.004
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033039 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033040 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0938 0.9302 0.988 0.012
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033048 1 0.0376 0.9334 0.996 0.004
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033054 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.7139 0.8110 0.804 0.196
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.9954 0.2768 0.540 0.460
#> SRR1033059 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033062 1 0.7376 0.7974 0.792 0.208
#> SRR1033063 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033064 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.1414 0.9267 0.980 0.020
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.6887 0.8236 0.816 0.184
#> SRR1033069 2 0.9881 0.1090 0.436 0.564
#> SRR1033070 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033071 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033072 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033073 2 0.9998 -0.1184 0.492 0.508
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033080 1 0.8861 0.6557 0.696 0.304
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0938 0.9303 0.988 0.012
#> SRR1033083 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033086 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033088 2 0.9993 -0.0868 0.484 0.516
#> SRR1033089 1 0.5408 0.8694 0.876 0.124
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033094 1 0.9909 0.3271 0.556 0.444
#> SRR1033095 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033096 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033097 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033098 1 0.7453 0.7926 0.788 0.212
#> SRR1033099 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033100 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033101 1 0.6247 0.8470 0.844 0.156
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.6973 0.8197 0.812 0.188
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.4431 0.8894 0.908 0.092
#> SRR1033116 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033117 1 0.6887 0.8236 0.816 0.184
#> SRR1033118 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033120 1 0.9686 0.4596 0.604 0.396
#> SRR1033122 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.5178 0.8752 0.884 0.116
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.6623 0.8347 0.828 0.172
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033129 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033128 1 0.7453 0.7811 0.788 0.212
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033133 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.5294 0.8718 0.880 0.120
#> SRR1033139 2 0.9988 -0.0708 0.480 0.520
#> SRR1033138 1 0.5629 0.8642 0.868 0.132
#> SRR1033140 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033146 1 0.9129 0.6112 0.672 0.328
#> SRR1033147 1 0.9209 0.5951 0.664 0.336
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.8081 0.7454 0.752 0.248
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.6801 0.8276 0.820 0.180
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.4815 0.8820 0.896 0.104
#> SRR1033154 1 0.1184 0.9284 0.984 0.016
#> SRR1033156 1 0.6623 0.8347 0.828 0.172
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033159 1 0.6623 0.8347 0.828 0.172
#> SRR1033160 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033162 1 0.4431 0.8898 0.908 0.092
#> SRR1033164 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.8207 0.7343 0.744 0.256
#> SRR1033167 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033168 1 0.6048 0.8529 0.852 0.148
#> SRR1033169 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033171 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033173 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033174 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033178 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033179 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033180 1 0.1633 0.9248 0.976 0.024
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.5737 0.8612 0.864 0.136
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033186 2 0.9795 0.1817 0.416 0.584
#> SRR1033188 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0376 0.9334 0.996 0.004
#> SRR1033192 1 0.8267 0.7278 0.740 0.260
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033194 2 0.8661 0.5360 0.288 0.712
#> SRR1033197 1 0.2236 0.9189 0.964 0.036
#> SRR1033196 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033199 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033202 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033203 1 0.6623 0.8347 0.828 0.172
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.6623 0.8347 0.828 0.172
#> SRR1033209 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033213 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033217 1 0.4815 0.8818 0.896 0.104
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033220 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033234 1 0.4161 0.8936 0.916 0.084
#> SRR1033236 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.5178 0.8744 0.884 0.116
#> SRR1033240 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033244 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033243 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033245 1 0.3879 0.8981 0.924 0.076
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0938 0.9302 0.988 0.012
#> SRR1033247 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033249 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033250 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033255 1 0.6247 0.8469 0.844 0.156
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033261 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033262 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033263 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033270 1 0.6712 0.8314 0.824 0.176
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0376 0.9612 0.004 0.996
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0672 0.9319 0.992 0.008
#> SRR1033280 1 0.6148 0.8498 0.848 0.152
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9349 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033283 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033284 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033285 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033286 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033287 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033288 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033289 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033290 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033291 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033292 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
#> SRR1033293 1 0.0376 0.9323 0.996 0.004
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032911 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032912 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032913 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032914 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032915 1 0.3879 0.7794 0.848 0.000 0.152
#> SRR1032916 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032917 3 0.2280 0.6977 0.008 0.052 0.940
#> SRR1032918 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032919 1 0.3619 0.7899 0.864 0.000 0.136
#> SRR1032920 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032921 3 0.6252 0.2549 0.444 0.000 0.556
#> SRR1032922 3 0.5012 0.6456 0.204 0.008 0.788
#> SRR1032923 1 0.3272 0.7871 0.892 0.004 0.104
#> SRR1032925 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032924 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032926 1 0.6079 0.5458 0.612 0.000 0.388
#> SRR1032927 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032929 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032928 1 0.5497 0.5927 0.708 0.000 0.292
#> SRR1032930 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032931 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032932 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032933 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032934 3 0.5968 0.5150 0.364 0.000 0.636
#> SRR1032935 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032936 3 0.1643 0.6880 0.044 0.000 0.956
#> SRR1032937 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032938 3 0.6267 0.2248 0.452 0.000 0.548
#> SRR1032939 3 0.4062 0.6617 0.164 0.000 0.836
#> SRR1032940 3 0.5826 0.6501 0.204 0.032 0.764
#> SRR1032941 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032942 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032943 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032944 3 0.5733 0.5569 0.324 0.000 0.676
#> SRR1032945 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032946 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032947 3 0.5178 0.6243 0.256 0.000 0.744
#> SRR1032948 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032949 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032950 3 0.5497 0.5874 0.292 0.000 0.708
#> SRR1032951 1 0.3412 0.7969 0.876 0.000 0.124
#> SRR1032952 1 0.3879 0.7780 0.848 0.000 0.152
#> SRR1032953 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032954 1 0.6008 0.4501 0.628 0.000 0.372
#> SRR1032955 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032957 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032956 3 0.6267 0.2248 0.452 0.000 0.548
#> SRR1032958 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032959 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032960 1 0.3752 0.7875 0.856 0.000 0.144
#> SRR1032961 1 0.6309 0.0010 0.504 0.000 0.496
#> SRR1032962 3 0.3412 0.6755 0.000 0.124 0.876
#> SRR1032963 1 0.6111 0.3114 0.604 0.000 0.396
#> SRR1032964 1 0.5810 0.4896 0.664 0.000 0.336
#> SRR1032965 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032966 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032967 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032968 1 0.6302 -0.0464 0.520 0.000 0.480
#> SRR1032969 3 0.5728 0.6136 0.272 0.008 0.720
#> SRR1032970 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032971 3 0.6308 0.1183 0.492 0.000 0.508
#> SRR1032972 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032973 1 0.5968 0.4276 0.636 0.000 0.364
#> SRR1032974 3 0.6126 0.3953 0.400 0.000 0.600
#> SRR1032975 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032976 1 0.5810 0.5140 0.664 0.000 0.336
#> SRR1032977 3 0.7545 0.6287 0.172 0.136 0.692
#> SRR1032978 3 0.6095 0.4172 0.392 0.000 0.608
#> SRR1032979 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032980 3 0.6180 0.6203 0.260 0.024 0.716
#> SRR1032981 1 0.3482 0.7950 0.872 0.000 0.128
#> SRR1032982 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032983 3 0.3340 0.6787 0.120 0.000 0.880
#> SRR1032984 3 0.6168 0.3994 0.412 0.000 0.588
#> SRR1032985 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032986 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032987 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032988 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032990 3 0.0829 0.6968 0.012 0.004 0.984
#> SRR1032989 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032991 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032992 3 0.4291 0.6557 0.180 0.000 0.820
#> SRR1032993 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032994 3 0.1482 0.7019 0.020 0.012 0.968
#> SRR1032995 1 0.4178 0.7687 0.828 0.000 0.172
#> SRR1032996 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032997 1 0.4974 0.6788 0.764 0.000 0.236
#> SRR1032998 3 0.4605 0.6433 0.204 0.000 0.796
#> SRR1032999 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033000 3 0.7535 0.6293 0.176 0.132 0.692
#> SRR1033001 3 0.6008 0.4884 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033002 3 0.5678 0.5671 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033003 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033004 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033005 3 0.5852 0.6630 0.180 0.044 0.776
#> SRR1033006 3 0.1753 0.7010 0.000 0.048 0.952
#> SRR1033007 1 0.5956 0.5945 0.672 0.004 0.324
#> SRR1033008 1 0.6267 0.2065 0.548 0.000 0.452
#> SRR1033009 3 0.6215 0.3109 0.428 0.000 0.572
#> SRR1033010 3 0.4609 0.6927 0.092 0.052 0.856
#> SRR1033011 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033012 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033013 3 0.1999 0.6986 0.012 0.036 0.952
#> SRR1033014 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033015 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033016 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033017 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033018 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033019 3 0.2165 0.6962 0.000 0.064 0.936
#> SRR1033020 3 0.6154 0.3731 0.408 0.000 0.592
#> SRR1033021 3 0.0892 0.6967 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033023 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033022 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033024 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033025 3 0.5650 0.5709 0.312 0.000 0.688
#> SRR1033026 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033027 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033028 3 0.5905 0.3783 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033029 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033030 3 0.2261 0.6933 0.000 0.068 0.932
#> SRR1033031 3 0.5860 0.6281 0.228 0.024 0.748
#> SRR1033032 3 0.3192 0.6808 0.000 0.112 0.888
#> SRR1033033 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033035 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033034 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033036 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033037 3 0.5859 0.5233 0.344 0.000 0.656
#> SRR1033038 3 0.7476 0.3718 0.040 0.404 0.556
#> SRR1033039 3 0.2096 0.6990 0.004 0.052 0.944
#> SRR1033040 3 0.1031 0.7011 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033041 3 0.5988 0.4750 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033042 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033043 3 0.6215 0.3106 0.428 0.000 0.572
#> SRR1033044 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033045 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033046 3 0.0592 0.6963 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033047 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033048 3 0.2537 0.6885 0.080 0.000 0.920
#> SRR1033049 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033051 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033052 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033053 2 0.0661 0.9861 0.004 0.988 0.008
#> SRR1033054 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033050 3 0.5968 0.4834 0.364 0.000 0.636
#> SRR1033055 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033056 3 0.2796 0.6746 0.092 0.000 0.908
#> SRR1033057 3 0.5678 0.5671 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033058 3 0.2261 0.6932 0.000 0.068 0.932
#> SRR1033059 2 0.0661 0.9861 0.004 0.988 0.008
#> SRR1033060 3 0.4346 0.6501 0.184 0.000 0.816
#> SRR1033061 2 0.5404 0.6318 0.004 0.740 0.256
#> SRR1033062 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033063 2 0.0661 0.9861 0.004 0.988 0.008
#> SRR1033064 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033065 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033066 3 0.5678 0.5673 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033067 3 0.5882 0.5158 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033068 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033069 3 0.4654 0.6226 0.000 0.208 0.792
#> SRR1033070 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033071 2 0.0661 0.9861 0.004 0.988 0.008
#> SRR1033072 3 0.6286 0.1691 0.000 0.464 0.536
#> SRR1033073 3 0.3038 0.6804 0.000 0.104 0.896
#> SRR1033074 3 0.5988 0.4747 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033075 3 0.5882 0.4558 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033076 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033077 3 0.6274 0.2185 0.456 0.000 0.544
#> SRR1033078 3 0.5948 0.4919 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033079 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033080 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033081 3 0.5760 0.5510 0.328 0.000 0.672
#> SRR1033082 3 0.5497 0.5872 0.292 0.000 0.708
#> SRR1033083 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033084 3 0.6235 0.2836 0.436 0.000 0.564
#> SRR1033085 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033086 2 0.1399 0.9675 0.004 0.968 0.028
#> SRR1033087 3 0.5882 0.5161 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033088 3 0.2356 0.6899 0.000 0.072 0.928
#> SRR1033089 3 0.1529 0.7012 0.000 0.040 0.960
#> SRR1033090 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033091 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033092 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033093 2 0.0661 0.9861 0.004 0.988 0.008
#> SRR1033094 3 0.3412 0.6736 0.000 0.124 0.876
#> SRR1033095 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033096 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033097 2 0.0661 0.9861 0.004 0.988 0.008
#> SRR1033098 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033099 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033100 2 0.0661 0.9861 0.004 0.988 0.008
#> SRR1033101 3 0.2096 0.6992 0.004 0.052 0.944
#> SRR1033102 1 0.6252 0.2367 0.556 0.000 0.444
#> SRR1033103 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033104 3 0.2384 0.6964 0.008 0.056 0.936
#> SRR1033105 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033106 3 0.5327 0.5842 0.272 0.000 0.728
#> SRR1033107 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033108 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033109 3 0.5948 0.4922 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033110 3 0.2096 0.6987 0.004 0.052 0.944
#> SRR1033111 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033112 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033113 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033114 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033115 3 0.5591 0.5778 0.304 0.000 0.696
#> SRR1033116 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033117 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033118 1 0.6081 0.5458 0.652 0.004 0.344
#> SRR1033119 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033121 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033120 3 0.3340 0.6771 0.000 0.120 0.880
#> SRR1033122 1 0.6410 0.4249 0.576 0.004 0.420
#> SRR1033123 3 0.5678 0.5666 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033124 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033125 3 0.0592 0.7000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033126 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033127 2 0.1289 0.9658 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033129 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033128 3 0.4887 0.6292 0.228 0.000 0.772
#> SRR1033130 3 0.5733 0.5572 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033131 3 0.5733 0.5572 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033132 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033133 3 0.0661 0.6954 0.008 0.004 0.988
#> SRR1033134 1 0.3941 0.7792 0.844 0.000 0.156
#> SRR1033135 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033136 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033137 3 0.1129 0.7000 0.004 0.020 0.976
#> SRR1033139 3 0.3412 0.6737 0.000 0.124 0.876
#> SRR1033138 3 0.4796 0.6337 0.220 0.000 0.780
#> SRR1033140 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033141 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033142 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033143 3 0.6299 0.1229 0.476 0.000 0.524
#> SRR1033144 3 0.5529 0.5841 0.296 0.000 0.704
#> SRR1033145 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033146 3 0.6693 0.6424 0.148 0.104 0.748
#> SRR1033147 3 0.2537 0.6927 0.000 0.080 0.920
#> SRR1033148 1 0.6307 0.0412 0.512 0.000 0.488
#> SRR1033149 3 0.2400 0.6937 0.004 0.064 0.932
#> SRR1033150 3 0.4399 0.6021 0.188 0.000 0.812
#> SRR1033151 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033152 3 0.6079 0.4195 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033153 3 0.0000 0.6983 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033154 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033156 3 0.2173 0.6984 0.008 0.048 0.944
#> SRR1033157 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033158 2 0.2711 0.9057 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033159 3 0.1765 0.7002 0.004 0.040 0.956
#> SRR1033160 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033161 1 0.4121 0.7626 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033163 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033162 3 0.5678 0.5671 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033164 3 0.5835 0.4723 0.000 0.340 0.660
#> SRR1033165 3 0.3112 0.6683 0.096 0.004 0.900
#> SRR1033166 3 0.6726 0.6414 0.132 0.120 0.748
#> SRR1033167 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033168 3 0.1129 0.7000 0.004 0.020 0.976
#> SRR1033169 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033171 3 0.5733 0.4944 0.000 0.324 0.676
#> SRR1033170 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033172 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033173 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033174 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033175 1 0.6280 0.1733 0.540 0.000 0.460
#> SRR1033176 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033177 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033178 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033179 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033180 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033181 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033183 3 0.4291 0.5248 0.180 0.000 0.820
#> SRR1033182 3 0.5785 0.5435 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033184 3 0.0000 0.6983 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033185 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033187 1 0.6126 0.4846 0.600 0.000 0.400
#> SRR1033186 3 0.6767 0.6046 0.064 0.216 0.720
#> SRR1033188 1 0.5929 0.5971 0.676 0.004 0.320
#> SRR1033189 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033190 3 0.5650 0.5708 0.312 0.000 0.688
#> SRR1033191 3 0.5678 0.5671 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033192 3 0.3031 0.6982 0.012 0.076 0.912
#> SRR1033193 1 0.6252 0.2367 0.556 0.000 0.444
#> SRR1033195 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033194 3 0.4452 0.6255 0.000 0.192 0.808
#> SRR1033197 3 0.5678 0.5672 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033196 3 0.1753 0.7007 0.000 0.048 0.952
#> SRR1033199 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033198 1 0.6215 0.2915 0.572 0.000 0.428
#> SRR1033200 1 0.4178 0.7687 0.828 0.000 0.172
#> SRR1033201 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033202 3 0.2384 0.6964 0.008 0.056 0.936
#> SRR1033203 3 0.1989 0.6994 0.004 0.048 0.948
#> SRR1033204 1 0.4399 0.7546 0.812 0.000 0.188
#> SRR1033205 3 0.6432 -0.1531 0.428 0.004 0.568
#> SRR1033206 3 0.6111 0.4067 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033207 1 0.6260 0.2218 0.552 0.000 0.448
#> SRR1033208 3 0.2173 0.6984 0.008 0.048 0.944
#> SRR1033209 1 0.6509 0.3837 0.524 0.004 0.472
#> SRR1033210 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033211 1 0.6298 0.5710 0.608 0.004 0.388
#> SRR1033212 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033213 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033214 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033216 1 0.4291 0.7620 0.820 0.000 0.180
#> SRR1033215 2 0.5327 0.6486 0.000 0.728 0.272
#> SRR1033217 3 0.1525 0.7003 0.004 0.032 0.964
#> SRR1033218 1 0.6274 0.1900 0.544 0.000 0.456
#> SRR1033219 1 0.6267 0.2065 0.548 0.000 0.452
#> SRR1033221 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033220 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033222 3 0.6267 0.2250 0.452 0.000 0.548
#> SRR1033223 3 0.0592 0.6959 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033225 3 0.4931 0.5410 0.000 0.232 0.768
#> SRR1033224 1 0.3551 0.7936 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033226 3 0.0592 0.6959 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033227 3 0.6468 -0.1955 0.444 0.004 0.552
#> SRR1033229 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033228 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033231 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033230 1 0.6140 0.3643 0.596 0.000 0.404
#> SRR1033232 3 0.5785 0.2899 0.300 0.004 0.696
#> SRR1033233 1 0.6280 0.1736 0.540 0.000 0.460
#> SRR1033235 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033234 3 0.0661 0.6987 0.004 0.008 0.988
#> SRR1033236 3 0.0983 0.6945 0.016 0.004 0.980
#> SRR1033237 1 0.3500 0.7927 0.880 0.004 0.116
#> SRR1033238 3 0.1950 0.6986 0.008 0.040 0.952
#> SRR1033240 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033239 3 0.6079 0.0486 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033242 1 0.6282 0.5109 0.612 0.004 0.384
#> SRR1033241 3 0.2200 0.6978 0.004 0.056 0.940
#> SRR1033244 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033243 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033245 3 0.0829 0.6994 0.004 0.012 0.984
#> SRR1033246 3 0.6225 0.2974 0.432 0.000 0.568
#> SRR1033248 3 0.5058 0.6170 0.244 0.000 0.756
#> SRR1033247 2 0.1289 0.9658 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033249 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033250 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033251 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033252 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033253 1 0.6267 0.2066 0.548 0.000 0.452
#> SRR1033254 3 0.5835 0.5307 0.340 0.000 0.660
#> SRR1033256 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033255 3 0.1989 0.6994 0.004 0.048 0.948
#> SRR1033258 1 0.6225 0.2783 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033257 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033259 1 0.3816 0.7845 0.852 0.000 0.148
#> SRR1033260 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033261 3 0.2384 0.6964 0.008 0.056 0.936
#> SRR1033262 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033263 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033264 3 0.5810 0.5374 0.336 0.000 0.664
#> SRR1033265 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033266 3 0.5650 0.5700 0.312 0.000 0.688
#> SRR1033267 3 0.6432 -0.1527 0.428 0.004 0.568
#> SRR1033268 3 0.5706 0.5630 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033269 3 0.2066 0.6985 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033270 3 0.2301 0.6965 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033271 1 0.6235 0.2647 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033272 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033273 3 0.6045 0.4471 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033274 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033275 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033276 2 0.0424 0.9879 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033277 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033278 1 0.3340 0.7987 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033279 3 0.0424 0.6964 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033280 3 0.0237 0.6989 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033281 3 0.5882 0.5160 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033282 1 0.2774 0.6675 0.920 0.008 0.072
#> SRR1033283 1 0.2774 0.6675 0.920 0.008 0.072
#> SRR1033284 1 0.2774 0.6675 0.920 0.008 0.072
#> SRR1033285 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033286 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033287 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033288 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033289 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033290 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033291 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033292 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033293 1 0.4861 0.5712 0.800 0.008 0.192
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.1637 0.7446 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1032916 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032919 4 0.0524 0.7807 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1032920 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032921 1 0.7121 0.8155 0.540 0.000 0.160 0.300
#> SRR1032922 3 0.6102 0.3561 0.116 0.000 0.672 0.212
#> SRR1032923 4 0.0188 0.7820 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032925 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032924 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032926 4 0.4910 0.4575 0.020 0.000 0.276 0.704
#> SRR1032927 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032928 4 0.3308 0.6872 0.036 0.000 0.092 0.872
#> SRR1032930 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032932 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032933 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032934 4 0.6453 -0.1741 0.360 0.000 0.080 0.560
#> SRR1032935 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032936 3 0.0376 0.9263 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1032937 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032938 1 0.6819 0.7320 0.540 0.000 0.112 0.348
#> SRR1032939 3 0.6756 0.1700 0.188 0.000 0.612 0.200
#> SRR1032940 3 0.6055 0.2242 0.052 0.000 0.576 0.372
#> SRR1032941 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032943 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032944 1 0.7220 0.8244 0.532 0.000 0.176 0.292
#> SRR1032945 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.0336 0.7799 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1032947 3 0.5493 0.0622 0.016 0.000 0.528 0.456
#> SRR1032948 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032950 1 0.7632 0.7504 0.468 0.000 0.244 0.288
#> SRR1032951 4 0.2868 0.6557 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1032952 4 0.0927 0.7751 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR1032953 4 0.0336 0.7812 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1032954 1 0.6510 0.6589 0.540 0.000 0.080 0.380
#> SRR1032955 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032957 4 0.0336 0.7812 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1032956 1 0.7061 0.7984 0.540 0.000 0.148 0.312
#> SRR1032958 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 4 0.2345 0.7033 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1032960 4 0.0672 0.7791 0.008 0.000 0.008 0.984
#> SRR1032961 1 0.6785 0.7232 0.540 0.000 0.108 0.352
#> SRR1032962 3 0.1356 0.9074 0.008 0.032 0.960 0.000
#> SRR1032963 4 0.2928 0.6888 0.108 0.000 0.012 0.880
#> SRR1032964 4 0.2402 0.7257 0.076 0.000 0.012 0.912
#> SRR1032965 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032966 4 0.0336 0.7812 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1032967 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032968 4 0.3390 0.6523 0.132 0.000 0.016 0.852
#> SRR1032969 4 0.6187 0.2026 0.052 0.000 0.432 0.516
#> SRR1032970 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.4227 0.6455 0.060 0.000 0.120 0.820
#> SRR1032972 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.2489 0.7311 0.020 0.000 0.068 0.912
#> SRR1032974 1 0.5408 0.3871 0.500 0.000 0.012 0.488
#> SRR1032975 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 4 0.5440 0.4721 0.104 0.000 0.160 0.736
#> SRR1032977 4 0.9027 0.1102 0.136 0.112 0.360 0.392
#> SRR1032978 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1032979 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032980 4 0.6324 0.2884 0.072 0.000 0.356 0.572
#> SRR1032981 4 0.0524 0.7807 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1032982 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 3 0.3658 0.7217 0.020 0.000 0.836 0.144
#> SRR1032984 4 0.5102 0.5560 0.064 0.000 0.188 0.748
#> SRR1032985 4 0.0336 0.7812 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1032986 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032988 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032990 3 0.0336 0.9254 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032989 4 0.1792 0.7373 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1032991 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032992 3 0.6474 0.1849 0.120 0.000 0.624 0.256
#> SRR1032993 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 3 0.0707 0.9185 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032995 4 0.5158 -0.2864 0.472 0.000 0.004 0.524
#> SRR1032996 4 0.0188 0.7820 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032997 4 0.2048 0.7387 0.064 0.000 0.008 0.928
#> SRR1032998 3 0.6259 0.2891 0.116 0.000 0.652 0.232
#> SRR1032999 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033000 4 0.8952 0.1128 0.136 0.104 0.360 0.400
#> SRR1033001 4 0.7608 -0.5394 0.364 0.000 0.204 0.432
#> SRR1033002 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033003 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033004 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033005 3 0.6102 0.3582 0.116 0.000 0.672 0.212
#> SRR1033006 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033007 4 0.5929 0.3187 0.048 0.004 0.316 0.632
#> SRR1033008 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033009 1 0.7061 0.7984 0.540 0.000 0.148 0.312
#> SRR1033010 3 0.2704 0.8135 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1033011 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033012 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033013 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033017 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.7155 0.8223 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033021 3 0.0921 0.9118 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1033023 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033022 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033024 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033028 4 0.5000 -0.0606 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1033029 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.7442 0.7935 0.504 0.000 0.212 0.284
#> SRR1033032 3 0.1118 0.9080 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1033033 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033035 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033034 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033036 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033037 1 0.7155 0.8228 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033038 1 0.8552 0.3938 0.492 0.272 0.168 0.068
#> SRR1033039 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.0188 0.9288 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033041 1 0.7155 0.8228 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033042 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033043 1 0.7039 0.7926 0.540 0.000 0.144 0.316
#> SRR1033044 1 0.7220 0.8244 0.532 0.000 0.176 0.292
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033046 3 0.2300 0.8631 0.048 0.000 0.924 0.028
#> SRR1033047 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.4281 0.6786 0.180 0.000 0.792 0.028
#> SRR1033049 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033051 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033052 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033053 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.7188 0.8241 0.536 0.000 0.172 0.292
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 3 0.7196 -0.0978 0.212 0.000 0.552 0.236
#> SRR1033057 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033058 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033060 1 0.7407 0.7786 0.516 0.000 0.224 0.260
#> SRR1033061 2 0.4164 0.6562 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.7265 0.8233 0.528 0.000 0.184 0.288
#> SRR1033066 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033067 1 0.7188 0.8241 0.536 0.000 0.172 0.292
#> SRR1033068 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033069 3 0.2345 0.8528 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033072 3 0.3837 0.6903 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1033073 3 0.0707 0.9191 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033074 1 0.7121 0.8153 0.540 0.000 0.160 0.300
#> SRR1033075 1 0.7681 0.7171 0.456 0.000 0.252 0.292
#> SRR1033076 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.6108 0.5588 0.528 0.000 0.048 0.424
#> SRR1033078 1 0.7155 0.8228 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.7170 0.8241 0.540 0.000 0.172 0.288
#> SRR1033082 1 0.7407 0.8034 0.508 0.000 0.204 0.288
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033085 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.2973 0.8367 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1033087 1 0.7155 0.8228 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033088 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033089 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033090 4 0.0524 0.7807 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033093 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033094 3 0.1211 0.9050 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1033095 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033100 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033103 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033106 1 0.7382 0.7932 0.516 0.000 0.208 0.276
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033109 1 0.7170 0.8241 0.540 0.000 0.172 0.288
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033112 1 0.7170 0.8241 0.540 0.000 0.172 0.288
#> SRR1033113 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033115 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033116 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 4 0.4500 0.3683 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1033119 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 3 0.1302 0.9023 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1033122 4 0.4605 0.3375 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1033123 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033124 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033125 3 0.0188 0.9283 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033126 1 0.7265 0.8232 0.528 0.000 0.184 0.288
#> SRR1033127 2 0.2081 0.9052 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.7336 0.8134 0.520 0.000 0.196 0.284
#> SRR1033130 1 0.7170 0.8241 0.540 0.000 0.172 0.288
#> SRR1033131 1 0.7170 0.8241 0.540 0.000 0.172 0.288
#> SRR1033132 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033133 3 0.1022 0.9082 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1033134 4 0.4992 -0.2918 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033137 3 0.0188 0.9283 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033139 3 0.1211 0.9050 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1033138 1 0.7052 0.5391 0.500 0.000 0.372 0.128
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.7203 0.8248 0.536 0.000 0.176 0.288
#> SRR1033142 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033143 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033144 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.7654 0.7712 0.496 0.004 0.228 0.272
#> SRR1033147 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.6966 0.7707 0.540 0.000 0.132 0.328
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.7445 0.7712 0.508 0.000 0.224 0.268
#> SRR1033151 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.7155 0.8223 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033153 3 0.0592 0.9212 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033154 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033158 2 0.4277 0.6233 0.000 0.720 0.280 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 4 0.4477 0.2774 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1033163 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033164 3 0.1867 0.8789 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1033165 3 0.3873 0.7555 0.060 0.000 0.844 0.096
#> SRR1033166 1 0.8065 0.7621 0.500 0.024 0.220 0.256
#> SRR1033167 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033171 3 0.1716 0.8842 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1033170 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.7102 0.8101 0.540 0.000 0.156 0.304
#> SRR1033176 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033177 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033178 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033179 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033180 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033181 1 0.7235 0.8248 0.532 0.000 0.180 0.288
#> SRR1033183 3 0.3837 0.6521 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1033182 1 0.7170 0.8241 0.540 0.000 0.172 0.288
#> SRR1033184 3 0.1118 0.9057 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1033185 1 0.7265 0.8233 0.528 0.000 0.184 0.288
#> SRR1033187 1 0.7567 0.6271 0.412 0.000 0.192 0.396
#> SRR1033186 1 0.8263 0.4995 0.476 0.072 0.348 0.104
#> SRR1033188 4 0.6064 0.3249 0.044 0.008 0.332 0.616
#> SRR1033189 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033190 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033191 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033192 3 0.1209 0.9065 0.032 0.004 0.964 0.000
#> SRR1033193 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033195 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033194 3 0.2011 0.8715 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1033197 1 0.7295 0.8213 0.524 0.000 0.188 0.288
#> SRR1033196 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033198 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033200 4 0.6795 -0.4983 0.432 0.000 0.096 0.472
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033204 4 0.6857 -0.4526 0.404 0.000 0.104 0.492
#> SRR1033205 3 0.3060 0.8383 0.016 0.008 0.888 0.088
#> SRR1033206 1 0.7155 0.8223 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033207 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033209 3 0.5793 0.4067 0.048 0.000 0.628 0.324
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033211 4 0.7146 -0.1357 0.228 0.000 0.212 0.560
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033214 4 0.0188 0.7826 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033216 4 0.6817 -0.4513 0.408 0.000 0.100 0.492
#> SRR1033215 3 0.4103 0.5911 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033219 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033221 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033220 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033222 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033223 3 0.1022 0.9082 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1033225 3 0.1302 0.8883 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1033224 4 0.4855 0.3437 0.268 0.000 0.020 0.712
#> SRR1033226 3 0.1022 0.9090 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1033227 3 0.3126 0.8338 0.016 0.008 0.884 0.092
#> SRR1033229 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033228 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033231 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033230 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033232 3 0.5491 0.5234 0.052 0.000 0.688 0.260
#> SRR1033233 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033235 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033234 3 0.0188 0.9283 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033236 3 0.0336 0.9254 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033237 4 0.1302 0.7531 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.7785 0.6110 0.404 0.000 0.248 0.348
#> SRR1033242 3 0.5143 0.5779 0.036 0.000 0.708 0.256
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033243 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033245 3 0.0188 0.9283 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033246 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033248 1 0.7426 0.7774 0.512 0.000 0.224 0.264
#> SRR1033247 2 0.2775 0.8741 0.084 0.896 0.020 0.000
#> SRR1033249 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033250 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033251 1 0.7203 0.8248 0.536 0.000 0.176 0.288
#> SRR1033252 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033253 1 0.6750 0.7147 0.540 0.000 0.104 0.356
#> SRR1033254 1 0.7155 0.8228 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033256 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033257 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033259 4 0.4790 0.0443 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1033260 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033264 1 0.7134 0.8032 0.532 0.000 0.156 0.312
#> SRR1033265 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033266 1 0.7651 0.7434 0.464 0.000 0.248 0.288
#> SRR1033267 3 0.3510 0.8188 0.028 0.008 0.868 0.096
#> SRR1033268 1 0.7170 0.8241 0.540 0.000 0.172 0.288
#> SRR1033269 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9308 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.7138 0.8199 0.540 0.000 0.164 0.296
#> SRR1033272 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033273 1 0.7155 0.8228 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033274 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033276 2 0.0336 0.9851 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033277 4 0.1867 0.7341 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1033278 4 0.0000 0.7837 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033279 3 0.1474 0.8909 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1033280 3 0.0336 0.9254 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033281 1 0.7155 0.8228 0.540 0.000 0.168 0.292
#> SRR1033282 1 0.5296 -0.4079 0.496 0.008 0.000 0.496
#> SRR1033283 1 0.5296 -0.4079 0.496 0.008 0.000 0.496
#> SRR1033284 4 0.5296 0.3791 0.496 0.008 0.000 0.496
#> SRR1033285 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
#> SRR1033286 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
#> SRR1033287 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
#> SRR1033288 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
#> SRR1033289 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
#> SRR1033290 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
#> SRR1033291 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
#> SRR1033292 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
#> SRR1033293 1 0.6434 -0.3789 0.496 0.008 0.048 0.448
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032911 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032912 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032913 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032914 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032915 4 0.1815 0.907 0.024 0.000 0.016 0.940 0.020
#> SRR1032916 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032917 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1032918 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032919 4 0.1419 0.913 0.012 0.000 0.016 0.956 0.016
#> SRR1032920 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0579 0.970 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1032922 3 0.2359 0.895 0.036 0.000 0.904 0.000 0.060
#> SRR1032923 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032926 4 0.5431 0.265 0.020 0.000 0.404 0.548 0.028
#> SRR1032927 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032929 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032928 4 0.3282 0.835 0.024 0.000 0.092 0.860 0.024
#> SRR1032930 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.1525 0.926 0.000 0.948 0.012 0.004 0.036
#> SRR1032933 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032934 4 0.3742 0.824 0.044 0.000 0.064 0.844 0.048
#> SRR1032935 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032936 3 0.1043 0.935 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1032937 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1032939 3 0.3970 0.723 0.156 0.000 0.788 0.000 0.056
#> SRR1032940 4 0.4820 0.588 0.008 0.000 0.232 0.708 0.052
#> SRR1032941 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0798 0.969 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1032945 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032946 4 0.0609 0.918 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032947 4 0.5070 0.505 0.008 0.000 0.272 0.668 0.052
#> SRR1032948 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.3578 0.804 0.820 0.000 0.132 0.000 0.048
#> SRR1032951 4 0.1410 0.887 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1032952 4 0.2095 0.900 0.020 0.000 0.028 0.928 0.024
#> SRR1032953 4 0.0510 0.919 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1032954 1 0.0486 0.966 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1032955 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.1179 0.916 0.016 0.000 0.016 0.964 0.004
#> SRR1032956 1 0.0613 0.969 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR1032958 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032959 4 0.1430 0.892 0.052 0.000 0.000 0.944 0.004
#> SRR1032960 4 0.1908 0.905 0.016 0.000 0.024 0.936 0.024
#> SRR1032961 1 0.0324 0.967 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1032962 3 0.1430 0.923 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR1032963 4 0.1978 0.901 0.012 0.000 0.024 0.932 0.032
#> SRR1032964 4 0.1893 0.903 0.012 0.000 0.024 0.936 0.028
#> SRR1032965 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032966 4 0.0510 0.919 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.2228 0.892 0.012 0.000 0.028 0.920 0.040
#> SRR1032969 4 0.3527 0.780 0.000 0.000 0.116 0.828 0.056
#> SRR1032970 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032971 4 0.2313 0.889 0.012 0.000 0.032 0.916 0.040
#> SRR1032972 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032973 4 0.1978 0.901 0.012 0.000 0.024 0.932 0.032
#> SRR1032974 1 0.2208 0.902 0.908 0.000 0.000 0.072 0.020
#> SRR1032975 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032976 4 0.3693 0.809 0.036 0.000 0.104 0.836 0.024
#> SRR1032977 4 0.4675 0.723 0.004 0.036 0.128 0.780 0.052
#> SRR1032978 1 0.0693 0.969 0.980 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1032979 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.3551 0.818 0.012 0.000 0.088 0.844 0.056
#> SRR1032981 4 0.1612 0.910 0.012 0.000 0.024 0.948 0.016
#> SRR1032982 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032983 3 0.1525 0.927 0.004 0.000 0.948 0.012 0.036
#> SRR1032984 4 0.3089 0.846 0.012 0.000 0.076 0.872 0.040
#> SRR1032985 4 0.0609 0.918 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032986 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032990 3 0.0703 0.933 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032989 4 0.0880 0.911 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.2592 0.880 0.052 0.000 0.892 0.000 0.056
#> SRR1032993 4 0.0867 0.918 0.008 0.000 0.008 0.976 0.008
#> SRR1032994 3 0.1571 0.922 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1032995 1 0.4310 0.307 0.604 0.000 0.000 0.392 0.004
#> SRR1032996 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032997 4 0.1820 0.907 0.020 0.000 0.020 0.940 0.020
#> SRR1032998 3 0.2688 0.887 0.036 0.000 0.896 0.012 0.056
#> SRR1032999 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 4 0.4516 0.732 0.004 0.028 0.128 0.788 0.052
#> SRR1033001 4 0.5474 0.603 0.168 0.000 0.084 0.708 0.040
#> SRR1033002 1 0.1485 0.956 0.948 0.000 0.020 0.000 0.032
#> SRR1033003 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 3 0.1809 0.915 0.012 0.000 0.928 0.000 0.060
#> SRR1033006 3 0.0963 0.933 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033007 3 0.4701 0.700 0.028 0.000 0.744 0.192 0.036
#> SRR1033008 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.4337 0.699 0.000 0.000 0.748 0.196 0.056
#> SRR1033011 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033013 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033014 3 0.1892 0.933 0.000 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR1033015 3 0.1205 0.936 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1033016 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.1041 0.933 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1033019 3 0.1768 0.934 0.000 0.000 0.924 0.004 0.072
#> SRR1033020 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033021 3 0.1282 0.930 0.000 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR1033023 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033022 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033024 3 0.1792 0.930 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033025 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033026 3 0.1792 0.930 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033027 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.2308 0.880 0.004 0.000 0.048 0.912 0.036
#> SRR1033029 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.2068 0.930 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR1033031 1 0.1492 0.957 0.948 0.000 0.008 0.004 0.040
#> SRR1033032 3 0.1443 0.927 0.000 0.004 0.948 0.004 0.044
#> SRR1033033 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033036 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033037 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.2784 0.912 0.896 0.040 0.012 0.004 0.048
#> SRR1033039 3 0.1043 0.938 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033040 3 0.1443 0.926 0.004 0.000 0.948 0.004 0.044
#> SRR1033041 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033043 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0798 0.969 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033045 3 0.1478 0.937 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033046 3 0.1750 0.919 0.036 0.000 0.936 0.000 0.028
#> SRR1033047 3 0.0794 0.936 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033048 3 0.4701 0.567 0.252 0.000 0.700 0.004 0.044
#> SRR1033049 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033051 1 0.0898 0.968 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1033052 1 0.0898 0.968 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1033053 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0609 0.934 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033050 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.1704 0.934 0.000 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR1033056 3 0.3769 0.704 0.180 0.000 0.788 0.000 0.032
#> SRR1033057 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033058 3 0.2124 0.930 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1033059 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.2793 0.885 0.876 0.000 0.088 0.000 0.036
#> SRR1033061 2 0.4419 0.623 0.004 0.756 0.196 0.008 0.036
#> SRR1033062 3 0.2068 0.930 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR1033063 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1043 0.937 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033065 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033066 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033067 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0963 0.931 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033069 3 0.2387 0.899 0.000 0.040 0.908 0.004 0.048
#> SRR1033070 3 0.0794 0.935 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033071 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.4078 0.736 0.000 0.180 0.776 0.004 0.040
#> SRR1033073 3 0.1704 0.934 0.000 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR1033074 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.2677 0.850 0.872 0.000 0.112 0.000 0.016
#> SRR1033076 3 0.0880 0.930 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033077 1 0.0613 0.967 0.984 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1033078 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.1792 0.930 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033080 3 0.2068 0.930 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR1033081 1 0.0566 0.967 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033082 1 0.1412 0.960 0.952 0.000 0.008 0.004 0.036
#> SRR1033083 3 0.1671 0.932 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033084 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.1704 0.936 0.000 0.000 0.928 0.004 0.068
#> SRR1033086 2 0.2654 0.867 0.004 0.900 0.056 0.008 0.032
#> SRR1033087 1 0.0451 0.969 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033088 3 0.2124 0.929 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1033089 3 0.1341 0.937 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033090 4 0.1314 0.915 0.012 0.000 0.016 0.960 0.012
#> SRR1033091 3 0.1478 0.937 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033092 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033093 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.1205 0.928 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1033095 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0703 0.933 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033097 2 0.0740 0.964 0.004 0.980 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033098 3 0.1768 0.934 0.000 0.000 0.924 0.004 0.072
#> SRR1033099 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0162 0.977 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.1544 0.936 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033102 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033103 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033104 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033105 1 0.0798 0.969 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033106 1 0.2260 0.914 0.908 0.000 0.064 0.000 0.028
#> SRR1033107 3 0.1792 0.930 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033108 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033109 1 0.0451 0.969 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033110 3 0.0510 0.937 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033111 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033112 1 0.0579 0.969 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1033113 3 0.1041 0.931 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1033114 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033115 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033116 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033117 3 0.1792 0.930 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033118 4 0.1041 0.902 0.000 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1033119 1 0.0898 0.968 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1033121 3 0.1732 0.930 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033120 3 0.1492 0.926 0.000 0.008 0.948 0.004 0.040
#> SRR1033122 4 0.3241 0.727 0.000 0.000 0.144 0.832 0.024
#> SRR1033123 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033124 1 0.0898 0.968 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1033125 3 0.0963 0.929 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033126 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033127 2 0.3268 0.799 0.000 0.856 0.080 0.004 0.060
#> SRR1033129 3 0.1792 0.930 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033128 1 0.1329 0.962 0.956 0.000 0.008 0.004 0.032
#> SRR1033130 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033131 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033132 3 0.0963 0.929 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033133 3 0.0794 0.933 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033134 1 0.0451 0.963 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033135 3 0.1671 0.932 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033136 1 0.0451 0.969 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033137 3 0.0609 0.934 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033139 3 0.1357 0.924 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1033138 1 0.2751 0.904 0.888 0.000 0.056 0.004 0.052
#> SRR1033140 3 0.1121 0.939 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033141 1 0.0579 0.970 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1033142 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033144 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033145 3 0.1892 0.934 0.000 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR1033146 1 0.1960 0.941 0.928 0.000 0.020 0.004 0.048
#> SRR1033147 3 0.1282 0.927 0.000 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR1033148 1 0.0486 0.966 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033149 3 0.2011 0.929 0.000 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR1033150 1 0.2270 0.898 0.904 0.000 0.076 0.000 0.020
#> SRR1033151 3 0.0880 0.930 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033152 1 0.1626 0.934 0.940 0.000 0.044 0.000 0.016
#> SRR1033153 3 0.1408 0.924 0.008 0.000 0.948 0.000 0.044
#> SRR1033154 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033156 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033157 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033158 2 0.4132 0.620 0.000 0.760 0.204 0.004 0.032
#> SRR1033159 3 0.1043 0.938 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033160 3 0.1410 0.935 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033161 4 0.1952 0.855 0.084 0.000 0.000 0.912 0.004
#> SRR1033163 3 0.0880 0.930 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033162 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033164 3 0.1990 0.916 0.000 0.028 0.928 0.004 0.040
#> SRR1033165 3 0.1768 0.934 0.004 0.000 0.924 0.000 0.072
#> SRR1033166 1 0.1918 0.946 0.932 0.004 0.012 0.004 0.048
#> SRR1033167 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0609 0.934 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033169 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.1205 0.927 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1033170 1 0.0898 0.968 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1033172 3 0.1608 0.931 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033173 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.1205 0.935 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1033175 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033176 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033177 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033181 1 0.0992 0.968 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033183 3 0.5187 0.581 0.000 0.000 0.656 0.260 0.084
#> SRR1033182 1 0.0693 0.968 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1033184 3 0.1357 0.924 0.004 0.000 0.948 0.000 0.048
#> SRR1033185 1 0.0798 0.969 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033187 1 0.1195 0.952 0.960 0.000 0.028 0.000 0.012
#> SRR1033186 1 0.2299 0.927 0.912 0.000 0.032 0.004 0.052
#> SRR1033188 3 0.4636 0.729 0.028 0.000 0.756 0.176 0.040
#> SRR1033189 2 0.0290 0.972 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033190 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033191 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033192 3 0.1357 0.924 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1033193 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033195 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.1901 0.918 0.000 0.024 0.932 0.004 0.040
#> SRR1033197 1 0.1082 0.966 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1033196 3 0.0880 0.930 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033199 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033200 1 0.0451 0.963 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033201 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033202 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033203 3 0.1410 0.936 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033204 1 0.0727 0.963 0.980 0.000 0.004 0.012 0.004
#> SRR1033205 3 0.1851 0.930 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033206 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033207 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033208 3 0.1732 0.930 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033209 3 0.1369 0.931 0.008 0.000 0.956 0.008 0.028
#> SRR1033210 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033211 1 0.2751 0.899 0.896 0.000 0.040 0.044 0.020
#> SRR1033212 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033213 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0510 0.919 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033216 1 0.0613 0.965 0.984 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1033215 3 0.3750 0.859 0.000 0.084 0.824 0.004 0.088
#> SRR1033217 3 0.0703 0.933 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033218 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033219 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033221 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033223 3 0.0880 0.933 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033225 3 0.2124 0.930 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1033224 1 0.1638 0.916 0.932 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR1033226 3 0.1195 0.930 0.012 0.000 0.960 0.000 0.028
#> SRR1033227 3 0.1851 0.930 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033229 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033232 3 0.2448 0.921 0.020 0.000 0.892 0.000 0.088
#> SRR1033233 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033235 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0963 0.936 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033236 3 0.1121 0.935 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033237 4 0.1043 0.898 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1033238 3 0.1792 0.931 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033240 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033239 1 0.2573 0.863 0.880 0.000 0.104 0.000 0.016
#> SRR1033242 3 0.1908 0.930 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033241 3 0.1671 0.933 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033244 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0703 0.933 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033246 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.1877 0.918 0.924 0.000 0.064 0.000 0.012
#> SRR1033247 2 0.3936 0.712 0.136 0.808 0.004 0.004 0.048
#> SRR1033249 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0451 0.969 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033252 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0324 0.967 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033254 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0609 0.934 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033258 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033257 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033259 1 0.1205 0.939 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1033260 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033262 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033263 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0451 0.969 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033265 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.3769 0.742 0.788 0.000 0.180 0.000 0.032
#> SRR1033267 3 0.1908 0.930 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033268 1 0.0798 0.969 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033269 3 0.0794 0.931 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033270 3 0.1671 0.930 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033271 1 0.0451 0.968 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033272 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0290 0.969 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0290 0.921 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.1282 0.900 0.044 0.000 0.000 0.952 0.004
#> SRR1033278 4 0.0451 0.921 0.008 0.000 0.004 0.988 0.000
#> SRR1033279 3 0.1364 0.924 0.012 0.000 0.952 0.000 0.036
#> SRR1033280 3 0.0703 0.932 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033281 1 0.0451 0.969 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033282 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033283 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033284 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033285 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033286 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033287 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033288 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033289 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033290 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033291 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033292 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR1033293 5 0.2648 1.000 0.000 0.000 0.000 0.152 0.848
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.0146 0.86152 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032911 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 4 0.0146 0.86095 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032913 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.1141 0.85116 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1032915 4 0.3337 0.75725 0.000 0.000 0.000 0.736 0.004 0.260
#> SRR1032916 4 0.1075 0.85216 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1032917 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032918 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 4 0.3337 0.75725 0.000 0.000 0.000 0.736 0.004 0.260
#> SRR1032920 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1219 0.89272 0.948 0.000 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR1032922 6 0.3121 0.41053 0.044 0.000 0.116 0.000 0.004 0.836
#> SRR1032923 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 6 0.5104 0.36498 0.008 0.000 0.164 0.172 0.000 0.656
#> SRR1032927 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 4 0.4571 0.46718 0.004 0.000 0.028 0.536 0.000 0.432
#> SRR1032930 4 0.1765 0.83673 0.000 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1032931 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.3276 0.68072 0.000 0.764 0.004 0.000 0.004 0.228
#> SRR1032933 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 4 0.4275 0.58637 0.016 0.000 0.000 0.592 0.004 0.388
#> SRR1032935 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 3 0.3857 0.18635 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1032937 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.1542 0.88739 0.936 0.000 0.000 0.004 0.008 0.052
#> SRR1032939 6 0.3973 0.39399 0.084 0.000 0.144 0.000 0.004 0.768
#> SRR1032940 6 0.4454 0.08884 0.000 0.000 0.032 0.348 0.004 0.616
#> SRR1032941 4 0.0260 0.86098 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032942 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0777 0.88846 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1032945 4 0.0363 0.86058 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032946 4 0.0972 0.83554 0.008 0.000 0.000 0.964 0.000 0.028
#> SRR1032947 4 0.5120 0.27178 0.000 0.000 0.068 0.472 0.004 0.456
#> SRR1032948 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 6 0.3104 0.37961 0.204 0.000 0.004 0.000 0.004 0.788
#> SRR1032951 4 0.0260 0.85829 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1032952 4 0.3371 0.73281 0.000 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1032953 4 0.0146 0.86034 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.2122 0.87756 0.900 0.000 0.000 0.008 0.008 0.084
#> SRR1032955 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.2994 0.78636 0.000 0.000 0.000 0.788 0.004 0.208
#> SRR1032956 1 0.1219 0.89214 0.948 0.000 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR1032958 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.0363 0.85670 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1032960 4 0.3244 0.75483 0.000 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1032961 1 0.1477 0.88833 0.940 0.000 0.000 0.004 0.008 0.048
#> SRR1032962 3 0.4225 0.32425 0.008 0.000 0.508 0.000 0.004 0.480
#> SRR1032963 4 0.3360 0.75464 0.000 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1032964 4 0.3337 0.75776 0.000 0.000 0.000 0.736 0.004 0.260
#> SRR1032965 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 4 0.0291 0.86109 0.004 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1032967 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.3360 0.75464 0.000 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1032969 4 0.4381 0.42147 0.000 0.000 0.016 0.524 0.004 0.456
#> SRR1032970 4 0.0146 0.86095 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032971 4 0.3360 0.75464 0.000 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1032972 4 0.0363 0.86058 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032973 4 0.3360 0.75464 0.000 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1032974 1 0.2519 0.85105 0.884 0.000 0.000 0.068 0.004 0.044
#> SRR1032975 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 6 0.5216 -0.05916 0.044 0.000 0.032 0.352 0.000 0.572
#> SRR1032977 6 0.5032 -0.22857 0.004 0.020 0.020 0.424 0.004 0.528
#> SRR1032978 1 0.1349 0.89140 0.940 0.000 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1032979 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.3795 0.63357 0.000 0.000 0.000 0.632 0.004 0.364
#> SRR1032981 4 0.3290 0.76383 0.000 0.000 0.000 0.744 0.004 0.252
#> SRR1032982 4 0.0260 0.86098 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032983 6 0.3969 0.21439 0.000 0.000 0.312 0.020 0.000 0.668
#> SRR1032984 4 0.3405 0.74701 0.000 0.000 0.000 0.724 0.004 0.272
#> SRR1032985 4 0.0146 0.86034 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1032986 4 0.0146 0.86095 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032987 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.3774 0.43121 0.000 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1032989 4 0.0146 0.86034 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 6 0.2826 0.40289 0.028 0.000 0.128 0.000 0.000 0.844
#> SRR1032993 4 0.3151 0.76576 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1032994 6 0.3744 0.22817 0.016 0.000 0.256 0.000 0.004 0.724
#> SRR1032995 4 0.5300 -0.09233 0.452 0.000 0.000 0.464 0.008 0.076
#> SRR1032996 4 0.0146 0.85958 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032997 4 0.3360 0.75464 0.000 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1032998 6 0.2886 0.39554 0.016 0.000 0.144 0.000 0.004 0.836
#> SRR1032999 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 6 0.4885 -0.24321 0.004 0.012 0.020 0.432 0.004 0.528
#> SRR1033001 6 0.5654 -0.15476 0.108 0.000 0.008 0.372 0.004 0.508
#> SRR1033002 1 0.3337 0.69594 0.736 0.000 0.000 0.000 0.004 0.260
#> SRR1033003 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 6 0.3206 0.38609 0.028 0.000 0.152 0.000 0.004 0.816
#> SRR1033006 3 0.3672 0.50688 0.000 0.000 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1033007 3 0.5999 0.08599 0.072 0.000 0.484 0.040 0.008 0.396
#> SRR1033008 1 0.2062 0.87657 0.900 0.000 0.000 0.004 0.008 0.088
#> SRR1033009 1 0.1082 0.89123 0.956 0.000 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1033010 6 0.5907 0.14023 0.000 0.000 0.396 0.176 0.004 0.424
#> SRR1033011 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033012 1 0.1082 0.88610 0.956 0.000 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033013 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033014 3 0.2527 0.61079 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1033015 3 0.3647 0.50989 0.000 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1033016 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033017 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.3727 0.49194 0.000 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1033019 3 0.2912 0.59556 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1033020 1 0.2389 0.85795 0.864 0.000 0.000 0.000 0.008 0.128
#> SRR1033021 3 0.4524 0.37904 0.024 0.000 0.520 0.000 0.004 0.452
#> SRR1033023 1 0.1349 0.88287 0.940 0.000 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033022 1 0.1531 0.87911 0.928 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1033024 3 0.0363 0.63176 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033025 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033026 3 0.0363 0.63176 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033027 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033028 4 0.3360 0.75464 0.000 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1033029 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.2260 0.60699 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033031 1 0.2513 0.82346 0.852 0.000 0.000 0.000 0.008 0.140
#> SRR1033032 3 0.4015 0.44852 0.000 0.004 0.596 0.000 0.004 0.396
#> SRR1033033 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033035 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033034 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033036 1 0.1471 0.88057 0.932 0.000 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1033037 1 0.0935 0.89174 0.964 0.000 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1033038 1 0.3678 0.69467 0.748 0.016 0.000 0.000 0.008 0.228
#> SRR1033039 3 0.2092 0.64774 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033040 6 0.4456 -0.27269 0.028 0.000 0.448 0.000 0.000 0.524
#> SRR1033041 1 0.1349 0.88882 0.940 0.000 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033042 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033043 1 0.1333 0.88968 0.944 0.000 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR1033044 1 0.1082 0.88610 0.956 0.000 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033045 3 0.1075 0.64575 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033046 3 0.4968 0.30423 0.076 0.000 0.556 0.000 0.000 0.368
#> SRR1033047 3 0.3309 0.57530 0.000 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1033048 6 0.6032 0.18920 0.248 0.000 0.252 0.000 0.008 0.492
#> SRR1033049 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033051 1 0.1082 0.88610 0.956 0.000 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033052 1 0.1082 0.88610 0.956 0.000 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033053 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033054 3 0.3727 0.46616 0.000 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1033050 1 0.1398 0.88838 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1033055 3 0.3126 0.58780 0.000 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1033056 6 0.5778 0.15336 0.204 0.000 0.304 0.000 0.000 0.492
#> SRR1033057 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033058 3 0.2135 0.61076 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1033059 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033060 1 0.4183 0.28116 0.508 0.000 0.012 0.000 0.000 0.480
#> SRR1033061 2 0.5734 0.34686 0.004 0.568 0.164 0.000 0.008 0.256
#> SRR1033062 3 0.2260 0.60699 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033063 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033064 3 0.3221 0.58732 0.000 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1033065 1 0.1531 0.87911 0.928 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1033066 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033067 1 0.0713 0.89254 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033068 3 0.3860 0.40534 0.000 0.000 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1033069 3 0.4849 0.30915 0.004 0.036 0.496 0.000 0.004 0.460
#> SRR1033070 3 0.3804 0.45652 0.000 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1033071 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033072 3 0.5739 0.27185 0.000 0.160 0.500 0.000 0.004 0.336
#> SRR1033073 3 0.3076 0.57879 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1033074 1 0.1462 0.88733 0.936 0.000 0.000 0.000 0.008 0.056
#> SRR1033075 1 0.4718 0.51619 0.616 0.000 0.036 0.004 0.008 0.336
#> SRR1033076 3 0.3867 0.37296 0.000 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1033077 1 0.1116 0.89237 0.960 0.000 0.000 0.004 0.008 0.028
#> SRR1033078 1 0.0972 0.89189 0.964 0.000 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1033079 3 0.0363 0.63176 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033080 3 0.2260 0.60699 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033081 1 0.2302 0.86341 0.872 0.000 0.000 0.000 0.008 0.120
#> SRR1033082 1 0.1958 0.86134 0.896 0.000 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR1033083 3 0.1610 0.63228 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033084 1 0.1584 0.88524 0.928 0.000 0.000 0.000 0.008 0.064
#> SRR1033085 3 0.2631 0.61052 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1033086 2 0.5025 0.52014 0.000 0.660 0.128 0.000 0.008 0.204
#> SRR1033087 1 0.0909 0.89175 0.968 0.000 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1033088 3 0.2300 0.60468 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033089 3 0.2416 0.61777 0.000 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1033090 4 0.3240 0.76722 0.000 0.000 0.000 0.752 0.004 0.244
#> SRR1033091 3 0.2762 0.60788 0.000 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033092 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033093 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033094 3 0.3937 0.43360 0.000 0.000 0.572 0.000 0.004 0.424
#> SRR1033095 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.3774 0.46107 0.000 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1033097 2 0.1010 0.92913 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033098 3 0.2597 0.61165 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1033099 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033100 2 0.0260 0.95366 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033101 3 0.2219 0.62041 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033102 1 0.2163 0.87328 0.892 0.000 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR1033103 1 0.1411 0.88173 0.936 0.000 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033104 3 0.0000 0.63214 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.1285 0.88386 0.944 0.000 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1033106 1 0.4150 0.46314 0.592 0.000 0.016 0.000 0.000 0.392
#> SRR1033107 3 0.0260 0.63093 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033108 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.1644 0.88830 0.920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.076
#> SRR1033110 3 0.3607 0.51083 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1033111 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033112 1 0.0806 0.89067 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1033113 3 0.3982 0.40073 0.000 0.000 0.536 0.000 0.004 0.460
#> SRR1033114 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033115 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033116 3 0.0260 0.63093 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033117 3 0.0363 0.63176 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033118 4 0.5569 0.43371 0.000 0.000 0.180 0.540 0.000 0.280
#> SRR1033119 1 0.1219 0.88484 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1033121 3 0.0790 0.63661 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033120 3 0.4327 0.39237 0.004 0.008 0.544 0.000 0.004 0.440
#> SRR1033122 3 0.6058 -0.19390 0.000 0.000 0.404 0.324 0.000 0.272
#> SRR1033123 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033124 1 0.1152 0.88580 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033125 6 0.3866 -0.34630 0.000 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1033126 1 0.1349 0.88287 0.940 0.000 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033127 2 0.3909 0.59765 0.000 0.720 0.244 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033129 3 0.0363 0.63176 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033128 1 0.2020 0.86112 0.896 0.000 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR1033130 1 0.2020 0.87484 0.896 0.000 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR1033131 1 0.2118 0.87145 0.888 0.000 0.000 0.000 0.008 0.104
#> SRR1033132 6 0.3860 -0.32394 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1033133 3 0.3810 0.39601 0.000 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1033134 1 0.2473 0.86638 0.876 0.000 0.000 0.012 0.008 0.104
#> SRR1033135 3 0.2454 0.63197 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1033136 1 0.0891 0.89096 0.968 0.000 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1033137 3 0.3706 0.45187 0.000 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033139 3 0.3979 0.38406 0.000 0.000 0.540 0.000 0.004 0.456
#> SRR1033138 1 0.3911 0.45948 0.624 0.000 0.000 0.000 0.008 0.368
#> SRR1033140 3 0.3076 0.60501 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1033141 1 0.1563 0.89263 0.932 0.000 0.000 0.000 0.012 0.056
#> SRR1033142 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2062 0.87657 0.900 0.000 0.000 0.004 0.008 0.088
#> SRR1033144 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033145 3 0.3309 0.57524 0.000 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1033146 1 0.2980 0.76493 0.800 0.000 0.000 0.000 0.008 0.192
#> SRR1033147 3 0.4117 0.37026 0.004 0.000 0.528 0.000 0.004 0.464
#> SRR1033148 1 0.1901 0.88136 0.912 0.000 0.000 0.004 0.008 0.076
#> SRR1033149 3 0.0713 0.63003 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033150 1 0.4403 0.37898 0.564 0.000 0.028 0.000 0.000 0.408
#> SRR1033151 3 0.3862 0.39028 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1033152 1 0.4031 0.58345 0.652 0.000 0.008 0.000 0.008 0.332
#> SRR1033153 6 0.4051 -0.25553 0.008 0.000 0.432 0.000 0.000 0.560
#> SRR1033154 1 0.1531 0.87912 0.928 0.000 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1033156 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033157 1 0.1285 0.88386 0.944 0.000 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1033158 2 0.5683 0.13449 0.000 0.508 0.308 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033159 3 0.2092 0.64218 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033160 3 0.2416 0.64162 0.000 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1033161 4 0.0363 0.85670 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.3866 0.37844 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1033162 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033164 3 0.4576 0.37888 0.000 0.028 0.532 0.000 0.004 0.436
#> SRR1033165 3 0.4289 0.35995 0.024 0.000 0.632 0.000 0.004 0.340
#> SRR1033166 1 0.2773 0.80935 0.836 0.004 0.000 0.000 0.008 0.152
#> SRR1033167 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.3659 0.47425 0.000 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1033169 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.3971 0.39705 0.000 0.000 0.548 0.000 0.004 0.448
#> SRR1033170 1 0.1010 0.88676 0.960 0.000 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033172 3 0.0363 0.63350 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033173 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.3828 0.33286 0.000 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1033175 1 0.1901 0.88135 0.912 0.000 0.000 0.004 0.008 0.076
#> SRR1033176 1 0.1152 0.88543 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033177 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033181 1 0.1152 0.88543 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033183 3 0.4772 0.16853 0.000 0.000 0.668 0.124 0.000 0.208
#> SRR1033182 1 0.2743 0.82969 0.828 0.000 0.000 0.000 0.008 0.164
#> SRR1033184 6 0.3843 -0.28931 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1033185 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033187 1 0.4146 0.62477 0.672 0.000 0.012 0.004 0.008 0.304
#> SRR1033186 1 0.3809 0.58231 0.684 0.004 0.000 0.000 0.008 0.304
#> SRR1033188 3 0.5774 0.18304 0.064 0.000 0.540 0.036 0.008 0.352
#> SRR1033189 2 0.0937 0.91700 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033191 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033192 3 0.4222 0.33978 0.008 0.000 0.516 0.000 0.004 0.472
#> SRR1033193 1 0.2163 0.87328 0.892 0.000 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR1033195 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.4635 0.38193 0.004 0.024 0.536 0.000 0.004 0.432
#> SRR1033197 1 0.1588 0.87751 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1033196 3 0.3862 0.39200 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1033199 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.2163 0.87328 0.892 0.000 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR1033200 1 0.2373 0.86801 0.880 0.000 0.000 0.008 0.008 0.104
#> SRR1033201 3 0.0547 0.63363 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033202 3 0.0000 0.63214 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.2300 0.63715 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033204 1 0.2373 0.86801 0.880 0.000 0.000 0.008 0.008 0.104
#> SRR1033205 3 0.2491 0.55576 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1033206 1 0.1812 0.88138 0.912 0.000 0.000 0.000 0.008 0.080
#> SRR1033207 1 0.2163 0.87328 0.892 0.000 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR1033208 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033209 3 0.4450 0.27152 0.020 0.000 0.528 0.000 0.004 0.448
#> SRR1033210 3 0.0000 0.63214 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.4724 0.52471 0.616 0.000 0.024 0.012 0.008 0.340
#> SRR1033212 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033213 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0146 0.86034 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.2373 0.86801 0.880 0.000 0.000 0.008 0.008 0.104
#> SRR1033215 3 0.3344 0.57037 0.000 0.044 0.804 0.000 0.000 0.152
#> SRR1033217 3 0.3706 0.45592 0.000 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033218 1 0.2163 0.87328 0.892 0.000 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR1033219 1 0.2113 0.87501 0.896 0.000 0.000 0.004 0.008 0.092
#> SRR1033221 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.1918 0.87794 0.904 0.000 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1033223 3 0.3765 0.41848 0.000 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1033225 3 0.2340 0.60093 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033224 1 0.3952 0.78511 0.780 0.000 0.000 0.108 0.008 0.104
#> SRR1033226 3 0.3810 0.39601 0.000 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1033227 3 0.2491 0.55576 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1033229 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.2163 0.87328 0.892 0.000 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR1033232 3 0.3770 0.44562 0.032 0.000 0.752 0.004 0.000 0.212
#> SRR1033233 1 0.1956 0.87994 0.908 0.000 0.000 0.004 0.008 0.080
#> SRR1033235 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.3563 0.48910 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1033236 3 0.3607 0.46549 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1033237 4 0.3997 0.61260 0.080 0.000 0.000 0.764 0.004 0.152
#> SRR1033238 3 0.2300 0.58277 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033240 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033239 1 0.4813 0.44481 0.584 0.000 0.036 0.004 0.008 0.368
#> SRR1033242 3 0.2883 0.52956 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1033241 3 0.2491 0.60187 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1033244 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.3737 0.44178 0.000 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1033246 1 0.1812 0.88096 0.912 0.000 0.000 0.000 0.008 0.080
#> SRR1033248 1 0.2547 0.86559 0.868 0.000 0.016 0.000 0.004 0.112
#> SRR1033247 2 0.5175 0.46268 0.184 0.636 0.000 0.000 0.004 0.176
#> SRR1033249 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0909 0.89197 0.968 0.000 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1033252 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1843 0.88144 0.912 0.000 0.000 0.004 0.004 0.080
#> SRR1033254 1 0.1398 0.88832 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1033256 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.3659 0.46802 0.000 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1033258 1 0.2163 0.87328 0.892 0.000 0.000 0.004 0.008 0.096
#> SRR1033257 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.4297 0.73886 0.744 0.000 0.000 0.152 0.008 0.096
#> SRR1033260 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033262 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033263 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0777 0.89266 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033265 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 6 0.4326 -0.00678 0.404 0.000 0.024 0.000 0.000 0.572
#> SRR1033267 3 0.2823 0.54360 0.000 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1033268 1 0.0777 0.88969 0.972 0.000 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033269 3 0.3860 0.39606 0.000 0.000 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1033270 3 0.0632 0.63368 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033271 1 0.2062 0.87657 0.900 0.000 0.000 0.004 0.008 0.088
#> SRR1033272 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.1265 0.88977 0.948 0.000 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1033274 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.86119 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.95731 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0260 0.85829 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033278 4 0.2378 0.81470 0.000 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1033279 6 0.4407 -0.31301 0.024 0.000 0.484 0.000 0.000 0.492
#> SRR1033280 3 0.3860 0.39606 0.000 0.000 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1033281 1 0.0622 0.89139 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1033282 5 0.0692 0.99836 0.000 0.000 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1033283 5 0.0692 0.99836 0.000 0.000 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1033284 5 0.0692 0.99836 0.000 0.000 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1033285 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033286 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033287 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033288 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033289 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033290 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033291 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033292 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033293 5 0.0547 0.99945 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.826 0.894 0.956 0.4951 0.504 0.504
#> 3 3 0.949 0.925 0.966 0.3086 0.791 0.608
#> 4 4 0.964 0.937 0.972 0.1597 0.834 0.568
#> 5 5 0.923 0.887 0.940 0.0572 0.941 0.769
#> 6 6 0.848 0.787 0.876 0.0326 0.963 0.828
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 3 4
There is also optional best \(k\) = 3 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.7815 0.6966 0.768 0.232
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032922 2 0.9815 0.2907 0.420 0.580
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0376 0.9558 0.996 0.004
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.2423 0.9255 0.960 0.040
#> SRR1032940 1 0.9977 0.1166 0.528 0.472
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032969 2 0.8144 0.6755 0.252 0.748
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032980 2 0.4562 0.8714 0.096 0.904
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.2236 0.9293 0.964 0.036
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.3733 0.8955 0.928 0.072
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032994 2 0.7815 0.6964 0.232 0.768
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0376 0.9558 0.996 0.004
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033005 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033006 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033010 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.1184 0.9467 0.984 0.016
#> SRR1033013 1 0.5629 0.8305 0.868 0.132
#> SRR1033014 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033015 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033018 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033019 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033021 2 0.9608 0.4165 0.384 0.616
#> SRR1033023 1 0.3584 0.8980 0.932 0.068
#> SRR1033022 1 0.9754 0.3015 0.592 0.408
#> SRR1033024 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033025 2 0.4815 0.8607 0.104 0.896
#> SRR1033026 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033030 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033031 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033034 2 0.4690 0.8659 0.100 0.900
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033039 2 0.7528 0.7197 0.216 0.784
#> SRR1033040 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033042 2 0.8713 0.6125 0.292 0.708
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0376 0.9558 0.996 0.004
#> SRR1033045 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033047 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033048 1 0.7528 0.7189 0.784 0.216
#> SRR1033049 2 0.8443 0.6426 0.272 0.728
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033054 2 0.3879 0.8866 0.076 0.924
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033055 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.0376 0.9558 0.996 0.004
#> SRR1033057 2 0.6148 0.8084 0.152 0.848
#> SRR1033058 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033062 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033064 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0938 0.9497 0.988 0.012
#> SRR1033066 2 0.9710 0.3648 0.400 0.600
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033068 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033070 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033076 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033079 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033080 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033082 2 0.3114 0.9044 0.056 0.944
#> SRR1033083 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033085 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033088 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033089 1 0.7376 0.7325 0.792 0.208
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033091 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033092 2 0.9963 0.1643 0.464 0.536
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033096 2 0.3879 0.8859 0.076 0.924
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033098 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.9522 0.4206 0.628 0.372
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.1414 0.9433 0.980 0.020
#> SRR1033104 2 0.8813 0.5747 0.300 0.700
#> SRR1033105 1 0.3584 0.8985 0.932 0.068
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033107 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033110 2 0.8555 0.6135 0.280 0.720
#> SRR1033111 2 0.9427 0.4724 0.360 0.640
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033113 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033114 2 0.7219 0.7509 0.200 0.800
#> SRR1033115 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033116 2 0.8955 0.5501 0.312 0.688
#> SRR1033117 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0938 0.9499 0.988 0.012
#> SRR1033121 1 1.0000 0.0236 0.504 0.496
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033123 2 0.2948 0.9084 0.052 0.948
#> SRR1033124 1 0.0376 0.9557 0.996 0.004
#> SRR1033125 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033126 1 0.5629 0.8287 0.868 0.132
#> SRR1033127 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033129 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033128 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033132 2 0.1184 0.9352 0.016 0.984
#> SRR1033133 1 0.0376 0.9558 0.996 0.004
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033135 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.7056 0.7545 0.808 0.192
#> SRR1033139 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033138 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033140 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033144 2 0.6801 0.7748 0.180 0.820
#> SRR1033145 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033146 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033149 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033151 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.9686 0.3580 0.604 0.396
#> SRR1033154 1 0.9996 0.0372 0.512 0.488
#> SRR1033156 1 0.8499 0.6233 0.724 0.276
#> SRR1033157 1 0.0672 0.9527 0.992 0.008
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033159 2 0.7883 0.6886 0.236 0.764
#> SRR1033160 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033163 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033162 2 0.0376 0.9436 0.004 0.996
#> SRR1033164 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033166 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.9996 0.0563 0.512 0.488
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033172 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033174 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0376 0.9558 0.996 0.004
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033180 2 0.3733 0.8936 0.072 0.928
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.1184 0.9464 0.984 0.016
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.9635 0.3808 0.612 0.388
#> SRR1033185 2 0.9323 0.5010 0.348 0.652
#> SRR1033187 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033186 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033190 2 0.7674 0.7163 0.224 0.776
#> SRR1033191 2 0.4298 0.8762 0.088 0.912
#> SRR1033192 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033197 2 0.3879 0.8887 0.076 0.924
#> SRR1033196 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033201 2 0.7299 0.7376 0.204 0.796
#> SRR1033202 1 0.9686 0.3581 0.604 0.396
#> SRR1033203 2 0.6048 0.8095 0.148 0.852
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.8608 0.6089 0.716 0.284
#> SRR1033209 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033210 2 0.9087 0.5246 0.324 0.676
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033212 2 0.9998 0.0163 0.492 0.508
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033217 1 0.7453 0.7272 0.788 0.212
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.1184 0.9465 0.984 0.016
#> SRR1033227 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.6148 0.8070 0.848 0.152
#> SRR1033236 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.6247 0.8014 0.844 0.156
#> SRR1033240 2 0.9977 0.0960 0.472 0.528
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.9775 0.3137 0.588 0.412
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.7815 0.6978 0.768 0.232
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.2423 0.9257 0.960 0.040
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.8327 0.6446 0.736 0.264
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.9866 0.2534 0.568 0.432
#> SRR1033262 2 0.5842 0.8186 0.140 0.860
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033269 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033270 2 0.9988 0.0654 0.480 0.520
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9464 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.7950 0.6834 0.760 0.240
#> SRR1033280 2 0.1184 0.9358 0.016 0.984
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.9587 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032911 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032912 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032913 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032914 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032915 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032916 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032917 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032919 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032920 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 2 0.9941 0.114 0.324 0.384 0.292
#> SRR1032923 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032925 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032926 1 0.2711 0.899 0.912 0.000 0.088
#> SRR1032927 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032929 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032928 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032930 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032931 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032934 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032935 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032936 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.7138 0.223 0.540 0.024 0.436
#> SRR1032940 1 0.8107 0.151 0.508 0.424 0.068
#> SRR1032941 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032942 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032946 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032947 1 0.2711 0.894 0.912 0.000 0.088
#> SRR1032948 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032949 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032952 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032953 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032954 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032956 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032959 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032961 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032964 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032965 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032966 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032967 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032969 2 0.6200 0.553 0.312 0.676 0.012
#> SRR1032970 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032971 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032972 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032973 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032974 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032976 1 0.0747 0.954 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032977 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 2 0.1878 0.921 0.044 0.952 0.004
#> SRR1032981 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032982 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032983 1 0.6045 0.428 0.620 0.000 0.380
#> SRR1032984 1 0.1399 0.943 0.968 0.028 0.004
#> SRR1032985 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032986 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032987 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032990 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032989 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032991 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.2878 0.891 0.904 0.000 0.096
#> SRR1032993 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032994 3 0.3896 0.844 0.008 0.128 0.864
#> SRR1032995 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032997 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032998 1 0.5016 0.706 0.760 0.000 0.240
#> SRR1032999 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033002 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.0892 0.969 0.000 0.020 0.980
#> SRR1033007 1 0.2261 0.917 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033008 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 2 0.0237 0.957 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033011 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.4002 0.803 0.840 0.160 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033014 3 0.0892 0.969 0.000 0.020 0.980
#> SRR1033015 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033016 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033019 3 0.1643 0.948 0.000 0.044 0.956
#> SRR1033020 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 3 0.0983 0.969 0.004 0.016 0.980
#> SRR1033023 1 0.3267 0.856 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033022 1 0.6291 0.126 0.532 0.468 0.000
#> SRR1033024 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033025 2 0.1163 0.939 0.028 0.972 0.000
#> SRR1033026 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033027 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.6140 0.320 0.404 0.000 0.596
#> SRR1033029 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.1289 0.959 0.000 0.032 0.968
#> SRR1033031 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 2 0.1643 0.926 0.044 0.956 0.000
#> SRR1033036 1 0.0237 0.959 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 3 0.1399 0.960 0.004 0.028 0.968
#> SRR1033041 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 2 0.4654 0.738 0.208 0.792 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0892 0.949 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033045 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033046 3 0.3551 0.838 0.132 0.000 0.868
#> SRR1033047 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033048 3 0.3856 0.886 0.072 0.040 0.888
#> SRR1033049 2 0.4796 0.731 0.220 0.780 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0592 0.954 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0747 0.971 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033056 1 0.5835 0.525 0.660 0.000 0.340
#> SRR1033057 2 0.1860 0.918 0.052 0.948 0.000
#> SRR1033058 3 0.1163 0.962 0.000 0.028 0.972
#> SRR1033059 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.4842 0.729 0.776 0.000 0.224
#> SRR1033061 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.1753 0.945 0.000 0.048 0.952
#> SRR1033063 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033065 1 0.2448 0.900 0.924 0.076 0.000
#> SRR1033066 2 0.6126 0.338 0.400 0.600 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.1031 0.966 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033069 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033071 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033073 2 0.2796 0.873 0.000 0.908 0.092
#> SRR1033074 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.1860 0.931 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033076 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033080 3 0.1163 0.962 0.000 0.028 0.972
#> SRR1033081 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 2 0.0424 0.954 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033083 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033084 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0747 0.971 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033086 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.2066 0.933 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033089 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033090 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033091 3 0.0424 0.976 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033092 2 0.6079 0.382 0.388 0.612 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 2 0.2959 0.865 0.000 0.900 0.100
#> SRR1033095 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.1289 0.959 0.000 0.032 0.968
#> SRR1033099 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.4002 0.803 0.840 0.160 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.3686 0.824 0.860 0.140 0.000
#> SRR1033106 1 0.2448 0.908 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033107 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033109 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 2 0.5621 0.579 0.308 0.692 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.1289 0.960 0.000 0.032 0.968
#> SRR1033114 2 0.1529 0.929 0.040 0.960 0.000
#> SRR1033115 2 0.0237 0.957 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033117 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033118 3 0.5621 0.539 0.308 0.000 0.692
#> SRR1033119 1 0.1964 0.919 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033122 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033123 2 0.2261 0.902 0.068 0.932 0.000
#> SRR1033124 1 0.0424 0.956 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033125 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033126 1 0.5529 0.578 0.704 0.296 0.000
#> SRR1033127 2 0.0892 0.944 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033129 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033128 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0237 0.959 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033131 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0592 0.974 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033133 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033136 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033138 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033141 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 2 0.2448 0.895 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033145 3 0.0747 0.972 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033146 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0424 0.954 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033148 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033150 1 0.2448 0.911 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033151 3 0.0424 0.977 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033152 1 0.0747 0.954 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033153 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033154 1 0.6280 0.151 0.540 0.460 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.2878 0.878 0.904 0.096 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033161 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0424 0.977 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033162 2 0.0424 0.954 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033165 3 0.3412 0.846 0.124 0.000 0.876
#> SRR1033166 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0424 0.956 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033175 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0892 0.949 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 2 0.2356 0.898 0.072 0.928 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033182 1 0.1031 0.948 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033184 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033185 2 0.6235 0.260 0.436 0.564 0.000
#> SRR1033187 1 0.1753 0.933 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033186 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.2066 0.924 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033189 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033190 2 0.3551 0.837 0.132 0.868 0.000
#> SRR1033191 2 0.0892 0.946 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 2 0.0592 0.952 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033196 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033199 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 1 0.5650 0.581 0.688 0.000 0.312
#> SRR1033210 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033212 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033216 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0747 0.947 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033217 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033225 2 0.6095 0.342 0.000 0.608 0.392
#> SRR1033224 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.0237 0.977 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033227 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033231 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.6295 0.168 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033233 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033237 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033238 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033239 1 0.2448 0.910 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033242 3 0.0592 0.970 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033241 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.4654 0.748 0.792 0.000 0.208
#> SRR1033247 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033259 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0237 0.959 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.1529 0.939 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033267 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0424 0.977 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033270 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033276 2 0.0000 0.959 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033278 1 0.0237 0.960 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033279 3 0.0000 0.979 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033280 3 0.0237 0.978 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033281 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0424 0.959 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033283 1 0.0424 0.959 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033284 1 0.0424 0.959 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033285 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033286 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033287 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033288 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033289 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033290 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033291 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033292 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033293 1 0.1860 0.930 0.948 0.000 0.052
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 4 0.6554 0.6306 0.012 0.168 0.152 0.668
#> SRR1032923 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032926 4 0.0188 0.9533 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032927 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032934 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032935 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032936 3 0.4730 0.4087 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 4 0.7948 0.2301 0.236 0.008 0.308 0.448
#> SRR1032940 4 0.1302 0.9245 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1032941 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032947 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.2704 0.8454 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1032951 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032952 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032954 1 0.0469 0.9683 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032960 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 4 0.2149 0.8802 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1032970 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 1 0.2081 0.9040 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1032975 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.3942 0.6892 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1032981 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 4 0.0188 0.9532 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032984 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032989 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.0336 0.9512 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1032993 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 3 0.5602 0.7156 0.004 0.144 0.736 0.116
#> SRR1032995 4 0.4134 0.6550 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1032996 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 4 0.2473 0.8861 0.012 0.000 0.080 0.908
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0336 0.9783 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033001 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033002 1 0.3074 0.8216 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 2 0.1022 0.9560 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033006 3 0.0592 0.9593 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1033007 4 0.1388 0.9359 0.012 0.000 0.028 0.960
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 2 0.1557 0.9323 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0336 0.9653 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0707 0.9561 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 3 0.1398 0.9348 0.040 0.004 0.956 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.1118 0.9480 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0469 0.9622 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033031 2 0.2868 0.8378 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0188 0.9741 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.0336 0.9781 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.0336 0.9649 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0592 0.9654 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033046 3 0.4635 0.6067 0.012 0.000 0.720 0.268
#> SRR1033047 3 0.0188 0.9681 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033048 3 0.5290 0.0712 0.476 0.000 0.516 0.008
#> SRR1033049 1 0.0188 0.9742 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 4 0.4908 0.5913 0.016 0.000 0.292 0.692
#> SRR1033057 1 0.0469 0.9680 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0469 0.9622 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.1661 0.9300 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.2081 0.8931 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0336 0.9653 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 2 0.1474 0.9353 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 4 0.2739 0.8951 0.036 0.000 0.060 0.904
#> SRR1033076 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.2408 0.8806 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0469 0.9622 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033081 1 0.0188 0.9742 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033082 1 0.4855 0.3300 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.2814 0.8367 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR1033089 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033090 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 2 0.2345 0.8816 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0592 0.9593 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.3243 0.8696 0.876 0.000 0.036 0.088
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0592 0.9597 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1033114 1 0.0336 0.9712 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0469 0.9685 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 4 0.0592 0.9472 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 4 0.0817 0.9427 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033123 1 0.0592 0.9655 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0336 0.9781 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033128 2 0.4790 0.3878 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0188 0.9681 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033133 3 0.0188 0.9677 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033134 1 0.2589 0.8645 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 2 0.2973 0.8281 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0336 0.9713 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 2 0.0469 0.9746 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0336 0.9781 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.4467 0.7533 0.788 0.000 0.040 0.172
#> SRR1033151 3 0.0188 0.9681 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033152 4 0.4284 0.7129 0.224 0.000 0.012 0.764
#> SRR1033153 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 4 0.0188 0.9531 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033163 3 0.0188 0.9681 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033162 1 0.0336 0.9713 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 3 0.4964 0.3574 0.004 0.000 0.616 0.380
#> SRR1033166 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0188 0.9741 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.4761 0.4022 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 4 0.3969 0.7752 0.180 0.000 0.016 0.804
#> SRR1033186 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 4 0.1284 0.9386 0.012 0.000 0.024 0.964
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0188 0.9741 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0707 0.9620 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.1940 0.9088 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0188 0.9742 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033205 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033209 4 0.3428 0.8200 0.012 0.000 0.144 0.844
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033211 4 0.3647 0.8107 0.152 0.000 0.016 0.832
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033216 1 0.0336 0.9714 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033215 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0657 0.9592 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1033225 2 0.4804 0.3676 0.000 0.616 0.384 0.000
#> SRR1033224 1 0.4972 0.1328 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1033226 3 0.0779 0.9559 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1033227 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.0469 0.9496 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 4 0.5345 0.2648 0.012 0.000 0.428 0.560
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033237 4 0.0469 0.9496 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033239 4 0.5986 0.4882 0.320 0.000 0.060 0.620
#> SRR1033242 4 0.4866 0.3456 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.1489 0.9372 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033259 1 0.3873 0.7068 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0817 0.9590 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.1388 0.9362 0.028 0.000 0.012 0.960
#> SRR1033267 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0188 0.9683 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033278 4 0.0000 0.9550 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033279 3 0.0592 0.9582 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.9705 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9767 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 4 0.0469 0.9496 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033283 4 0.0469 0.9496 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033284 4 0.0469 0.9496 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033285 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1033286 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1033287 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1033288 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1033289 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1033290 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1033291 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1033292 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1033293 4 0.1059 0.9435 0.012 0.000 0.016 0.972
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032911 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032912 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032913 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032914 4 0.0404 0.9655 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032915 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032916 4 0.0162 0.9645 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032917 3 0.0404 0.9324 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032918 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032919 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032922 4 0.4949 0.7463 0.012 0.060 0.044 0.776 0.108
#> SRR1032923 4 0.3305 0.7063 0.000 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032926 5 0.2230 0.8654 0.000 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1032927 4 0.0510 0.9656 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1032929 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032928 4 0.2690 0.8081 0.000 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1032930 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032934 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032935 4 0.0510 0.9656 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1032936 5 0.3841 0.7556 0.000 0.000 0.188 0.032 0.780
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0566 0.9433 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1032939 5 0.4615 0.7886 0.052 0.004 0.076 0.072 0.796
#> SRR1032940 4 0.0162 0.9618 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.0794 0.9598 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1032947 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032948 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.2005 0.9070 0.016 0.000 0.004 0.924 0.056
#> SRR1032951 4 0.0404 0.9656 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032952 4 0.0162 0.9643 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032953 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032954 1 0.1216 0.9320 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032958 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032959 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032960 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0898 0.9363 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1032962 2 0.0162 0.9492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1032963 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032966 4 0.0510 0.9656 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.0404 0.9536 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1032970 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032971 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0290 0.9652 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032973 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032974 4 0.3857 0.5412 0.312 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1032975 4 0.0510 0.9656 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1032976 5 0.3966 0.5616 0.000 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1032977 2 0.3837 0.5619 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1032978 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0794 0.9373 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032982 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032983 5 0.4390 0.3538 0.000 0.000 0.004 0.428 0.568
#> SRR1032984 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032985 4 0.0404 0.9656 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032986 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032990 5 0.4262 0.0967 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1032989 4 0.0510 0.9656 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 5 0.3496 0.7609 0.000 0.000 0.012 0.200 0.788
#> SRR1032993 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032994 3 0.6842 0.5007 0.012 0.056 0.588 0.100 0.244
#> SRR1032995 4 0.4276 0.6044 0.256 0.000 0.000 0.716 0.028
#> SRR1032996 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032997 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032998 4 0.4058 0.7430 0.000 0.000 0.064 0.784 0.152
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.4278 0.1998 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1033001 4 0.0880 0.9531 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033002 1 0.5004 0.5747 0.672 0.000 0.000 0.256 0.072
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 2 0.4531 0.2658 0.000 0.568 0.004 0.424 0.004
#> SRR1033006 3 0.1059 0.9285 0.000 0.004 0.968 0.008 0.020
#> SRR1033007 5 0.1638 0.8897 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932
#> SRR1033008 1 0.0703 0.9405 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033009 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033010 2 0.4677 0.5422 0.000 0.664 0.036 0.300 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0510 0.9325 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033014 3 0.0162 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033015 3 0.0880 0.9278 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0290 0.9325 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033019 3 0.0451 0.9301 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1033020 1 0.4291 0.1902 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1033021 3 0.4812 0.6539 0.044 0.008 0.716 0.004 0.228
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033025 1 0.0162 0.9451 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0324 0.9316 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1033031 2 0.2773 0.7695 0.164 0.836 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 2 0.0671 0.9371 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0162 0.9451 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033038 2 0.0162 0.9487 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0510 0.9334 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033040 3 0.2238 0.9042 0.020 0.004 0.912 0.000 0.064
#> SRR1033041 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0771 0.9367 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0162 0.9330 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033046 5 0.2511 0.8602 0.004 0.000 0.088 0.016 0.892
#> SRR1033047 3 0.0162 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033048 5 0.6884 0.2485 0.228 0.000 0.348 0.008 0.416
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.1732 0.9062 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033050 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033055 3 0.0162 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033056 5 0.2408 0.8355 0.000 0.000 0.092 0.016 0.892
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 5 0.1952 0.8369 0.084 0.000 0.004 0.000 0.912
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0693 0.9299 0.000 0.008 0.980 0.000 0.012
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0162 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033068 3 0.1478 0.9136 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033069 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.1478 0.9142 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 2 0.4403 0.2374 0.000 0.560 0.436 0.000 0.004
#> SRR1033074 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033075 5 0.1831 0.8876 0.004 0.000 0.000 0.076 0.920
#> SRR1033076 3 0.1732 0.9062 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033077 1 0.3596 0.7184 0.776 0.000 0.000 0.212 0.012
#> SRR1033078 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033079 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033080 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033081 1 0.4283 0.2157 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1033082 1 0.3949 0.4900 0.668 0.332 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0162 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033084 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033085 3 0.0162 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0955 0.9156 0.000 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR1033089 3 0.0404 0.9331 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033090 4 0.0000 0.9637 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0162 0.9322 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 2 0.4269 0.5411 0.000 0.684 0.300 0.000 0.016
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.1197 0.9214 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0324 0.9316 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0404 0.9331 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033102 1 0.1544 0.9136 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0404 0.9324 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 5 0.1591 0.8640 0.052 0.000 0.004 0.004 0.940
#> SRR1033107 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033108 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033109 1 0.1197 0.9270 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033110 3 0.1410 0.9164 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033113 3 0.2017 0.9031 0.000 0.008 0.912 0.000 0.080
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0162 0.9457 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033117 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033118 5 0.2280 0.8620 0.000 0.000 0.000 0.120 0.880
#> SRR1033119 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033121 3 0.0404 0.9331 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 5 0.2179 0.8687 0.000 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1033123 1 0.0162 0.9457 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033125 3 0.1908 0.9004 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0963 0.9213 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033128 2 0.4291 0.1465 0.464 0.536 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.1965 0.8914 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033131 1 0.2329 0.8614 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033132 3 0.1952 0.9056 0.004 0.000 0.912 0.000 0.084
#> SRR1033133 5 0.1197 0.8540 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033134 1 0.3389 0.8308 0.836 0.000 0.000 0.048 0.116
#> SRR1033135 3 0.1121 0.9227 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033136 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033137 3 0.4045 0.5453 0.000 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1033139 2 0.0693 0.9378 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1033138 2 0.3628 0.6941 0.216 0.772 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033140 3 0.0290 0.9323 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033141 1 0.0880 0.9369 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0609 0.9424 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0290 0.9320 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033146 2 0.0963 0.9214 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.1830 0.8964 0.000 0.932 0.040 0.000 0.028
#> SRR1033148 1 0.1282 0.9281 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033149 3 0.0510 0.9319 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033150 5 0.1026 0.8717 0.024 0.000 0.004 0.004 0.968
#> SRR1033151 3 0.1732 0.9062 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033152 5 0.1701 0.8878 0.016 0.000 0.000 0.048 0.936
#> SRR1033153 5 0.4182 0.3731 0.004 0.000 0.352 0.000 0.644
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0510 0.9325 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0609 0.9326 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033160 3 0.0794 0.9275 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033161 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033163 3 0.1732 0.9062 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033162 1 0.0290 0.9429 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 5 0.1818 0.8812 0.000 0.000 0.044 0.024 0.932
#> SRR1033166 2 0.0404 0.9421 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.2424 0.8709 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0290 0.9464 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033172 3 0.0510 0.9334 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0807 0.9288 0.000 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1033175 1 0.0963 0.9344 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0162 0.9451 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.4489 0.2690 0.000 0.000 0.572 0.420 0.008
#> SRR1033182 5 0.4126 0.3405 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1033184 3 0.3047 0.8397 0.004 0.004 0.832 0.000 0.160
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 5 0.1571 0.8895 0.004 0.000 0.000 0.060 0.936
#> SRR1033186 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 5 0.1638 0.8897 0.000 0.000 0.004 0.064 0.932
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.1202 0.9222 0.004 0.960 0.032 0.000 0.004
#> SRR1033193 1 0.1544 0.9133 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0162 0.9457 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.1732 0.9062 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1792 0.9005 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033200 1 0.3750 0.7192 0.756 0.000 0.000 0.012 0.232
#> SRR1033201 3 0.0404 0.9324 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033202 3 0.0404 0.9324 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033203 3 0.0880 0.9315 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033204 1 0.3242 0.7558 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1033205 5 0.2471 0.8229 0.000 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1033206 1 0.0510 0.9437 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033207 1 0.0963 0.9347 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033208 3 0.0510 0.9325 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033209 5 0.0865 0.8846 0.000 0.000 0.004 0.024 0.972
#> SRR1033210 3 0.0404 0.9324 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033211 5 0.1124 0.8872 0.004 0.000 0.000 0.036 0.960
#> SRR1033212 3 0.0510 0.9325 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033216 1 0.3913 0.5705 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1033215 2 0.1121 0.9147 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.3336 0.7545 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1033218 1 0.1544 0.9135 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033219 1 0.1270 0.9246 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0794 0.9387 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033223 5 0.0963 0.8592 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033225 2 0.4533 0.1687 0.000 0.544 0.448 0.000 0.008
#> SRR1033224 1 0.4425 0.6591 0.716 0.000 0.000 0.040 0.244
#> SRR1033226 5 0.0963 0.8608 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033227 5 0.2280 0.8354 0.000 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.1043 0.9493 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1608 0.9101 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033232 5 0.2234 0.8832 0.004 0.000 0.044 0.036 0.916
#> SRR1033233 1 0.0609 0.9423 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.4015 0.5620 0.000 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1033236 5 0.1608 0.8355 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1033237 5 0.2068 0.8807 0.004 0.000 0.000 0.092 0.904
#> SRR1033238 3 0.3612 0.6623 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1033240 3 0.0404 0.9324 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033239 5 0.1082 0.8858 0.008 0.000 0.000 0.028 0.964
#> SRR1033242 5 0.1907 0.8887 0.000 0.000 0.028 0.044 0.928
#> SRR1033241 3 0.1341 0.9225 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.4114 0.4998 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1033246 1 0.0290 0.9462 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033248 1 0.3961 0.7283 0.760 0.000 0.028 0.000 0.212
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0404 0.9451 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033254 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.2891 0.8282 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033258 1 0.1478 0.9161 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033257 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033259 1 0.3692 0.8037 0.812 0.000 0.000 0.052 0.136
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0404 0.9324 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033262 3 0.0510 0.9325 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.2719 0.8074 0.852 0.000 0.000 0.144 0.004
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 5 0.2026 0.8862 0.012 0.000 0.008 0.056 0.924
#> SRR1033267 5 0.1270 0.8586 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1033268 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033269 3 0.1792 0.9046 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033270 3 0.0404 0.9324 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033271 1 0.0609 0.9423 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0162 0.9472 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9520 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0609 0.9654 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033278 4 0.0290 0.9652 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033279 3 0.4367 0.3909 0.004 0.000 0.580 0.000 0.416
#> SRR1033280 3 0.1851 0.9028 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9471 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 5 0.2068 0.8807 0.004 0.000 0.000 0.092 0.904
#> SRR1033283 5 0.2068 0.8807 0.004 0.000 0.000 0.092 0.904
#> SRR1033284 5 0.2068 0.8807 0.004 0.000 0.000 0.092 0.904
#> SRR1033285 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
#> SRR1033286 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
#> SRR1033287 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
#> SRR1033288 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
#> SRR1033289 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
#> SRR1033290 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
#> SRR1033291 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
#> SRR1033292 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
#> SRR1033293 5 0.1892 0.8867 0.004 0.000 0.000 0.080 0.916
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.0951 0.9310 0.004 0.000 0.000 0.968 0.020 0.008
#> SRR1032911 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032912 4 0.0603 0.9345 0.000 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1032913 4 0.0291 0.9347 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1032914 4 0.0935 0.9333 0.000 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1032915 4 0.1219 0.9317 0.000 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1032916 4 0.1010 0.9330 0.000 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1032917 3 0.0547 0.8589 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1032918 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032919 4 0.1462 0.9268 0.000 0.000 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.2002 0.8505 0.920 0.000 0.000 0.040 0.012 0.028
#> SRR1032922 6 0.4696 0.4040 0.008 0.012 0.004 0.244 0.040 0.692
#> SRR1032923 4 0.3915 0.2832 0.004 0.000 0.000 0.584 0.412 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032926 5 0.2030 0.7860 0.000 0.000 0.000 0.064 0.908 0.028
#> SRR1032927 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032929 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032928 4 0.4191 0.6466 0.000 0.000 0.000 0.704 0.240 0.056
#> SRR1032930 4 0.1082 0.9323 0.000 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032934 4 0.1913 0.9169 0.000 0.000 0.000 0.908 0.012 0.080
#> SRR1032935 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032936 5 0.4230 0.5501 0.000 0.000 0.224 0.004 0.716 0.056
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.2903 0.8241 0.864 0.000 0.000 0.084 0.016 0.036
#> SRR1032939 6 0.4661 0.4897 0.028 0.000 0.016 0.044 0.176 0.736
#> SRR1032940 4 0.2218 0.9012 0.000 0.000 0.000 0.884 0.012 0.104
#> SRR1032941 4 0.0858 0.9342 0.000 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.1152 0.8660 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1032945 4 0.0858 0.9340 0.000 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1032946 4 0.1511 0.9053 0.004 0.000 0.000 0.940 0.044 0.012
#> SRR1032947 4 0.2019 0.9122 0.000 0.000 0.000 0.900 0.012 0.088
#> SRR1032948 4 0.0291 0.9343 0.004 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.4991 0.3048 0.044 0.000 0.000 0.520 0.012 0.424
#> SRR1032951 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032952 4 0.1367 0.9309 0.000 0.000 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR1032953 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032954 1 0.4175 0.7706 0.780 0.000 0.000 0.088 0.100 0.032
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.1219 0.9305 0.000 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1032956 1 0.2614 0.8407 0.884 0.000 0.000 0.060 0.012 0.044
#> SRR1032958 4 0.0291 0.9343 0.004 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1032959 4 0.0508 0.9323 0.004 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1032960 4 0.1411 0.9269 0.000 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1032961 1 0.3422 0.8045 0.832 0.000 0.000 0.100 0.032 0.036
#> SRR1032962 2 0.1714 0.8721 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1032963 4 0.1588 0.9223 0.000 0.000 0.000 0.924 0.004 0.072
#> SRR1032964 4 0.1471 0.9255 0.000 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064
#> SRR1032965 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032966 4 0.0291 0.9350 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.1411 0.9268 0.000 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1032969 4 0.1858 0.9125 0.000 0.000 0.000 0.904 0.004 0.092
#> SRR1032970 4 0.0146 0.9347 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032971 4 0.1757 0.9192 0.000 0.000 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR1032972 4 0.1010 0.9328 0.000 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1032973 4 0.1584 0.9242 0.000 0.000 0.000 0.928 0.008 0.064
#> SRR1032974 4 0.3745 0.6177 0.240 0.000 0.000 0.732 0.000 0.028
#> SRR1032975 4 0.0146 0.9347 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1032976 5 0.3799 0.5487 0.000 0.000 0.000 0.276 0.704 0.020
#> SRR1032977 2 0.5114 0.4371 0.000 0.604 0.000 0.292 0.004 0.100
#> SRR1032978 1 0.1218 0.8550 0.956 0.000 0.000 0.012 0.004 0.028
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.2009 0.9131 0.000 0.008 0.000 0.904 0.004 0.084
#> SRR1032981 4 0.1757 0.9192 0.000 0.000 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR1032982 4 0.0935 0.9333 0.000 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1032983 5 0.5479 0.0810 0.000 0.000 0.004 0.416 0.472 0.108
#> SRR1032984 4 0.1918 0.9136 0.000 0.000 0.000 0.904 0.008 0.088
#> SRR1032985 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032986 4 0.0000 0.9348 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032990 6 0.4893 0.6747 0.000 0.000 0.168 0.000 0.172 0.660
#> SRR1032989 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 6 0.5743 -0.0715 0.000 0.000 0.000 0.168 0.404 0.428
#> SRR1032993 4 0.1913 0.9159 0.000 0.000 0.000 0.908 0.012 0.080
#> SRR1032994 6 0.6185 0.5540 0.000 0.028 0.200 0.064 0.088 0.620
#> SRR1032995 4 0.5123 0.4555 0.280 0.000 0.000 0.632 0.056 0.032
#> SRR1032996 4 0.1410 0.9134 0.004 0.000 0.000 0.944 0.044 0.008
#> SRR1032997 4 0.1219 0.9303 0.000 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1032998 6 0.4384 -0.1578 0.000 0.000 0.004 0.460 0.016 0.520
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.5414 0.0548 0.000 0.476 0.000 0.420 0.004 0.100
#> SRR1033001 4 0.3107 0.8639 0.004 0.000 0.000 0.844 0.072 0.080
#> SRR1033002 1 0.6608 0.4585 0.528 0.000 0.000 0.180 0.088 0.204
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 2 0.6490 -0.0174 0.000 0.384 0.008 0.336 0.008 0.264
#> SRR1033006 3 0.2805 0.6877 0.000 0.000 0.812 0.000 0.004 0.184
#> SRR1033007 5 0.0551 0.8356 0.004 0.000 0.000 0.008 0.984 0.004
#> SRR1033008 1 0.2302 0.8422 0.900 0.000 0.000 0.008 0.060 0.032
#> SRR1033009 1 0.1442 0.8596 0.944 0.000 0.000 0.012 0.004 0.040
#> SRR1033010 2 0.6001 0.3459 0.000 0.532 0.132 0.304 0.000 0.032
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.1501 0.8626 0.924 0.000 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033013 3 0.0458 0.8595 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033014 3 0.0363 0.8566 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033015 3 0.3023 0.6144 0.000 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.2378 0.7563 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1033019 3 0.0632 0.8576 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033020 5 0.4141 0.2647 0.388 0.000 0.000 0.000 0.596 0.016
#> SRR1033021 3 0.5683 0.3244 0.036 0.000 0.620 0.000 0.196 0.148
#> SRR1033023 1 0.1957 0.8607 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1033022 1 0.2135 0.8498 0.872 0.000 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1033024 3 0.0146 0.8574 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033025 1 0.2581 0.8469 0.860 0.020 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1033026 3 0.0000 0.8585 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.1584 0.9242 0.000 0.000 0.000 0.928 0.008 0.064
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0458 0.8555 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033031 2 0.4910 0.5033 0.244 0.640 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033032 2 0.2030 0.8670 0.000 0.908 0.064 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2234 0.8516 0.872 0.004 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033036 1 0.2048 0.8530 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1033037 1 0.0858 0.8618 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1033038 2 0.1088 0.9067 0.016 0.960 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033039 3 0.0363 0.8605 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033040 6 0.4837 0.4423 0.056 0.000 0.432 0.000 0.000 0.512
#> SRR1033041 1 0.0692 0.8636 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1033042 1 0.2219 0.8472 0.864 0.000 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033043 1 0.2471 0.8495 0.888 0.000 0.000 0.056 0.004 0.052
#> SRR1033044 1 0.1267 0.8661 0.940 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033045 3 0.1267 0.8491 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033046 5 0.2579 0.7709 0.004 0.000 0.088 0.000 0.876 0.032
#> SRR1033047 3 0.1007 0.8533 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033048 3 0.7678 -0.0919 0.220 0.004 0.364 0.004 0.264 0.144
#> SRR1033049 1 0.2219 0.8472 0.864 0.000 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033051 1 0.1349 0.8668 0.940 0.000 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033052 1 0.1387 0.8638 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 6 0.3563 0.6897 0.000 0.000 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1033050 1 0.1155 0.8590 0.956 0.000 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1033055 3 0.1267 0.8499 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033056 5 0.4153 0.5325 0.004 0.000 0.020 0.004 0.680 0.292
#> SRR1033057 1 0.2402 0.8434 0.856 0.004 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033058 3 0.0458 0.8555 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 5 0.4604 0.5011 0.064 0.000 0.000 0.000 0.636 0.300
#> SRR1033061 2 0.0146 0.9339 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033062 3 0.0260 0.8568 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.2003 0.8016 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033065 1 0.2003 0.8551 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033066 1 0.2300 0.8449 0.856 0.000 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033067 1 0.1075 0.8632 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033068 6 0.3684 0.6369 0.000 0.000 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1033069 2 0.0458 0.9277 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033070 6 0.3747 0.6129 0.000 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0363 0.9300 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033073 3 0.4199 0.1857 0.000 0.416 0.568 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033074 1 0.1624 0.8537 0.936 0.000 0.000 0.020 0.004 0.040
#> SRR1033075 5 0.1167 0.8240 0.020 0.000 0.000 0.012 0.960 0.008
#> SRR1033076 6 0.3515 0.7005 0.000 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1033077 1 0.4882 0.5325 0.628 0.000 0.000 0.308 0.036 0.028
#> SRR1033078 1 0.0935 0.8602 0.964 0.000 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1033079 3 0.0000 0.8585 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0363 0.8566 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033081 5 0.4589 -0.0352 0.460 0.000 0.000 0.000 0.504 0.036
#> SRR1033082 1 0.4941 0.6161 0.648 0.212 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033083 3 0.0865 0.8582 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033084 1 0.1124 0.8619 0.956 0.000 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR1033085 3 0.0363 0.8566 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033086 2 0.0146 0.9339 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033087 1 0.0790 0.8652 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033088 3 0.0458 0.8555 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033089 3 0.1444 0.8398 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033090 4 0.1411 0.9269 0.000 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1033091 3 0.0865 0.8568 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033092 1 0.2135 0.8550 0.872 0.000 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 2 0.5032 0.4759 0.000 0.640 0.164 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.3684 0.1745 0.000 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1033097 2 0.0146 0.9339 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033098 3 0.0458 0.8562 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.1267 0.8456 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033102 1 0.3578 0.7742 0.800 0.000 0.000 0.016 0.152 0.032
#> SRR1033103 1 0.1957 0.8561 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1033104 3 0.0146 0.8591 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033105 1 0.1863 0.8587 0.896 0.000 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1033106 5 0.1584 0.8079 0.008 0.000 0.000 0.000 0.928 0.064
#> SRR1033107 3 0.0146 0.8591 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033108 4 0.0508 0.9323 0.004 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1033109 1 0.2474 0.8369 0.884 0.000 0.000 0.004 0.080 0.032
#> SRR1033110 6 0.3857 0.4486 0.000 0.000 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1033111 1 0.2219 0.8494 0.864 0.000 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033112 1 0.1387 0.8662 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033113 6 0.3699 0.6857 0.000 0.004 0.336 0.000 0.000 0.660
#> SRR1033114 1 0.2320 0.8468 0.864 0.004 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033115 1 0.2593 0.8395 0.844 0.008 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033116 3 0.0146 0.8591 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033117 3 0.0146 0.8591 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033118 5 0.2060 0.7753 0.000 0.000 0.000 0.084 0.900 0.016
#> SRR1033119 1 0.1556 0.8650 0.920 0.000 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033121 3 0.1957 0.7997 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1033120 2 0.0713 0.9201 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033122 5 0.3124 0.7329 0.000 0.000 0.016 0.108 0.844 0.032
#> SRR1033123 1 0.2667 0.8428 0.852 0.020 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1033124 1 0.1444 0.8651 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033125 6 0.3707 0.7067 0.000 0.000 0.312 0.000 0.008 0.680
#> SRR1033126 1 0.1908 0.8619 0.900 0.000 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1033127 2 0.2402 0.7979 0.000 0.856 0.140 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033129 3 0.0146 0.8591 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033128 1 0.5613 0.2422 0.468 0.384 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033130 1 0.3618 0.7444 0.768 0.000 0.000 0.000 0.192 0.040
#> SRR1033131 1 0.3588 0.7621 0.776 0.000 0.000 0.000 0.180 0.044
#> SRR1033132 6 0.3446 0.7052 0.000 0.000 0.308 0.000 0.000 0.692
#> SRR1033133 6 0.3966 0.1193 0.000 0.000 0.004 0.000 0.444 0.552
#> SRR1033134 1 0.5236 0.6246 0.660 0.000 0.000 0.096 0.212 0.032
#> SRR1033135 3 0.3563 0.3139 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1033136 1 0.1007 0.8663 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033137 6 0.4953 0.6962 0.000 0.000 0.268 0.000 0.108 0.624
#> SRR1033139 2 0.2378 0.8059 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1033138 2 0.5684 0.3624 0.228 0.528 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1033140 3 0.1444 0.8397 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033141 1 0.2282 0.8345 0.888 0.000 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2277 0.8341 0.892 0.000 0.000 0.000 0.076 0.032
#> SRR1033144 1 0.2362 0.8459 0.860 0.004 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033145 3 0.2300 0.7696 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033146 2 0.4237 0.6702 0.120 0.736 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033147 2 0.3766 0.5624 0.000 0.684 0.012 0.000 0.000 0.304
#> SRR1033148 1 0.3583 0.7988 0.820 0.000 0.000 0.040 0.108 0.032
#> SRR1033149 3 0.0146 0.8582 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033150 5 0.1970 0.7886 0.008 0.000 0.000 0.000 0.900 0.092
#> SRR1033151 6 0.3547 0.6968 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1033152 5 0.0520 0.8355 0.008 0.000 0.000 0.008 0.984 0.000
#> SRR1033153 6 0.4574 0.6483 0.008 0.000 0.112 0.000 0.164 0.716
#> SRR1033154 1 0.2092 0.8517 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033156 3 0.0713 0.8570 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033157 1 0.1958 0.8602 0.896 0.000 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR1033158 2 0.0146 0.9337 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033159 3 0.1714 0.8205 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033160 3 0.3330 0.4886 0.000 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1033161 4 0.0717 0.9280 0.008 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016
#> SRR1033163 6 0.3499 0.7019 0.000 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR1033162 1 0.2538 0.8470 0.860 0.016 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033164 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 5 0.0767 0.8301 0.000 0.000 0.012 0.004 0.976 0.008
#> SRR1033166 2 0.2294 0.8509 0.036 0.892 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 6 0.4384 0.6801 0.000 0.000 0.348 0.000 0.036 0.616
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0547 0.9241 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033170 1 0.1444 0.8659 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033172 3 0.1501 0.8354 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.1843 0.8163 0.000 0.000 0.912 0.004 0.004 0.080
#> SRR1033175 1 0.3369 0.8036 0.832 0.000 0.000 0.028 0.108 0.032
#> SRR1033176 1 0.1663 0.8613 0.912 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.2178 0.8507 0.868 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033181 1 0.1970 0.8637 0.900 0.000 0.000 0.000 0.008 0.092
#> SRR1033183 3 0.4247 0.3361 0.000 0.000 0.664 0.296 0.000 0.040
#> SRR1033182 5 0.4506 0.3599 0.348 0.000 0.000 0.000 0.608 0.044
#> SRR1033184 6 0.4002 0.7130 0.000 0.000 0.260 0.000 0.036 0.704
#> SRR1033185 1 0.2178 0.8483 0.868 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033187 5 0.0551 0.8358 0.004 0.000 0.000 0.008 0.984 0.004
#> SRR1033186 2 0.0632 0.9213 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033188 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033189 2 0.0146 0.9332 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.2135 0.8530 0.872 0.000 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1033191 1 0.2219 0.8465 0.864 0.000 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033192 2 0.2669 0.8023 0.000 0.836 0.008 0.000 0.000 0.156
#> SRR1033193 1 0.3280 0.7781 0.812 0.000 0.000 0.004 0.152 0.032
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0363 0.9300 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033197 1 0.2473 0.8464 0.856 0.008 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033196 6 0.3515 0.6995 0.000 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.4118 0.6947 0.732 0.000 0.000 0.016 0.220 0.032
#> SRR1033200 1 0.5187 0.1836 0.496 0.000 0.000 0.032 0.440 0.032
#> SRR1033201 3 0.0713 0.8585 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033202 3 0.0000 0.8585 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.2854 0.6559 0.000 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1033204 1 0.4717 0.4109 0.584 0.000 0.000 0.012 0.372 0.032
#> SRR1033205 5 0.3156 0.6682 0.000 0.000 0.180 0.000 0.800 0.020
#> SRR1033206 1 0.1845 0.8476 0.920 0.000 0.000 0.000 0.052 0.028
#> SRR1033207 1 0.3275 0.7881 0.820 0.000 0.000 0.008 0.140 0.032
#> SRR1033208 3 0.1075 0.8508 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033209 5 0.0603 0.8312 0.000 0.000 0.000 0.004 0.980 0.016
#> SRR1033210 3 0.0260 0.8594 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033211 5 0.0436 0.8355 0.004 0.000 0.000 0.004 0.988 0.004
#> SRR1033212 3 0.1075 0.8514 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0603 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1033216 1 0.4763 0.0991 0.484 0.000 0.000 0.008 0.476 0.032
#> SRR1033215 2 0.3445 0.6533 0.000 0.744 0.244 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033217 6 0.5127 0.6360 0.000 0.000 0.348 0.000 0.096 0.556
#> SRR1033218 1 0.3499 0.7662 0.796 0.000 0.000 0.008 0.164 0.032
#> SRR1033219 1 0.3167 0.8009 0.836 0.000 0.000 0.012 0.120 0.032
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.2822 0.8156 0.856 0.000 0.000 0.004 0.108 0.032
#> SRR1033223 5 0.3601 0.4949 0.000 0.000 0.004 0.000 0.684 0.312
#> SRR1033225 2 0.3996 0.0768 0.000 0.512 0.484 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033224 5 0.5511 -0.0507 0.444 0.000 0.000 0.056 0.468 0.032
#> SRR1033226 6 0.3979 0.0835 0.000 0.000 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1033227 5 0.2901 0.7215 0.000 0.000 0.128 0.000 0.840 0.032
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.1806 0.8925 0.008 0.000 0.000 0.928 0.044 0.020
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.3525 0.7714 0.800 0.000 0.000 0.012 0.156 0.032
#> SRR1033232 5 0.2062 0.7842 0.004 0.000 0.088 0.008 0.900 0.000
#> SRR1033233 1 0.3219 0.8125 0.840 0.000 0.000 0.016 0.104 0.040
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 6 0.5238 0.6792 0.000 0.000 0.236 0.000 0.160 0.604
#> SRR1033236 5 0.4057 0.2945 0.000 0.000 0.012 0.000 0.600 0.388
#> SRR1033237 5 0.0653 0.8342 0.004 0.000 0.000 0.012 0.980 0.004
#> SRR1033238 3 0.4672 0.4505 0.000 0.000 0.684 0.000 0.188 0.128
#> SRR1033240 3 0.0865 0.8553 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033239 5 0.0436 0.8355 0.004 0.000 0.000 0.004 0.988 0.004
#> SRR1033242 5 0.1116 0.8233 0.000 0.000 0.004 0.008 0.960 0.028
#> SRR1033241 3 0.3563 0.3174 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 6 0.4847 0.7008 0.000 0.000 0.220 0.000 0.124 0.656
#> SRR1033246 1 0.1649 0.8489 0.932 0.000 0.000 0.000 0.036 0.032
#> SRR1033248 1 0.5719 0.4284 0.564 0.000 0.052 0.012 0.332 0.040
#> SRR1033247 2 0.0146 0.9334 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.1141 0.8666 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.3360 0.8140 0.840 0.000 0.000 0.044 0.084 0.032
#> SRR1033254 1 0.0891 0.8591 0.968 0.000 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 6 0.4603 0.5645 0.000 0.000 0.416 0.000 0.040 0.544
#> SRR1033258 1 0.3412 0.7822 0.812 0.000 0.000 0.012 0.144 0.032
#> SRR1033257 4 0.0405 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1033259 1 0.5421 0.5646 0.624 0.000 0.000 0.092 0.252 0.032
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0632 0.8580 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033262 3 0.1501 0.8340 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4543 0.6331 0.684 0.000 0.000 0.252 0.012 0.052
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 5 0.3796 0.6915 0.012 0.000 0.000 0.032 0.768 0.188
#> SRR1033267 5 0.1471 0.7998 0.000 0.000 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR1033268 1 0.1219 0.8669 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1033269 6 0.3499 0.7017 0.000 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR1033270 3 0.0937 0.8539 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033271 1 0.2639 0.8264 0.876 0.000 0.000 0.008 0.084 0.032
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0363 0.8615 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0508 0.9323 0.004 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9357 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0622 0.9303 0.008 0.000 0.000 0.980 0.000 0.012
#> SRR1033278 4 0.1082 0.9323 0.000 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1033279 6 0.4691 0.7068 0.000 0.000 0.220 0.000 0.108 0.672
#> SRR1033280 6 0.3547 0.6940 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1033281 1 0.0865 0.8659 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033282 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033283 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033284 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033285 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033286 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033287 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033288 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033289 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033290 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033291 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033292 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1033293 5 0.0405 0.8368 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.524 0.769 0.898 0.4690 0.510 0.510
#> 3 3 0.536 0.760 0.896 0.0715 0.966 0.933
#> 4 4 0.680 0.784 0.911 0.2655 0.783 0.587
#> 5 5 0.677 0.770 0.903 0.0683 0.948 0.856
#> 6 6 0.723 0.768 0.912 0.0205 0.991 0.970
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.5946 0.8045 0.856 0.144
#> SRR1032918 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.1843 0.8604 0.972 0.028
#> SRR1032922 1 1.0000 0.1020 0.500 0.500
#> SRR1032923 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.8081 0.7090 0.752 0.248
#> SRR1032940 1 0.9754 0.4161 0.592 0.408
#> SRR1032941 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.9661 0.4584 0.608 0.392
#> SRR1032945 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.4939 0.8277 0.892 0.108
#> SRR1032948 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.7745 0.7329 0.772 0.228
#> SRR1032951 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.7056 0.7671 0.808 0.192
#> SRR1032958 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0376 0.8651 0.996 0.004
#> SRR1032962 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032963 1 0.4562 0.8346 0.904 0.096
#> SRR1032964 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032968 1 0.3584 0.8476 0.932 0.068
#> SRR1032969 2 0.9944 0.0873 0.456 0.544
#> SRR1032970 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.2236 0.8585 0.964 0.036
#> SRR1032972 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.7299 0.7564 0.796 0.204
#> SRR1032975 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0376 0.8869 0.004 0.996
#> SRR1032978 1 0.7950 0.7188 0.760 0.240
#> SRR1032979 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032980 2 0.9580 0.3539 0.380 0.620
#> SRR1032981 1 0.4690 0.8323 0.900 0.100
#> SRR1032982 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.1414 0.8623 0.980 0.020
#> SRR1032984 1 0.8267 0.6946 0.740 0.260
#> SRR1032985 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.7139 0.7633 0.804 0.196
#> SRR1032989 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.3879 0.8444 0.924 0.076
#> SRR1032993 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.9998 0.1356 0.508 0.492
#> SRR1032995 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.7453 0.7490 0.788 0.212
#> SRR1032999 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.7528 0.6868 0.216 0.784
#> SRR1033001 1 0.0376 0.8651 0.996 0.004
#> SRR1033002 1 0.8081 0.7098 0.752 0.248
#> SRR1033003 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033005 2 0.7139 0.7136 0.196 0.804
#> SRR1033006 2 0.8861 0.5372 0.304 0.696
#> SRR1033007 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.1414 0.8622 0.980 0.020
#> SRR1033010 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033012 2 0.9988 -0.0225 0.480 0.520
#> SRR1033013 1 0.5737 0.8100 0.864 0.136
#> SRR1033014 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033015 2 0.7528 0.6868 0.216 0.784
#> SRR1033016 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.9944 0.2712 0.544 0.456
#> SRR1033019 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.2603 0.8534 0.956 0.044
#> SRR1033023 2 0.9710 0.2930 0.400 0.600
#> SRR1033022 2 0.9710 0.2930 0.400 0.600
#> SRR1033024 2 0.7139 0.7135 0.196 0.804
#> SRR1033025 2 0.1184 0.8797 0.016 0.984
#> SRR1033026 2 0.8713 0.5602 0.292 0.708
#> SRR1033027 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0672 0.8645 0.992 0.008
#> SRR1033029 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033030 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033031 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033034 2 0.5294 0.7985 0.120 0.880
#> SRR1033036 1 0.9775 0.4057 0.588 0.412
#> SRR1033037 1 0.7299 0.7561 0.796 0.204
#> SRR1033038 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033039 1 0.8763 0.6430 0.704 0.296
#> SRR1033040 2 0.9491 0.3870 0.368 0.632
#> SRR1033041 1 0.1633 0.8613 0.976 0.024
#> SRR1033042 2 0.8861 0.5363 0.304 0.696
#> SRR1033043 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.9909 0.3112 0.556 0.444
#> SRR1033045 2 0.9393 0.4189 0.356 0.644
#> SRR1033046 1 0.3114 0.8524 0.944 0.056
#> SRR1033047 2 0.9933 0.1027 0.452 0.548
#> SRR1033048 1 0.9775 0.4051 0.588 0.412
#> SRR1033049 2 0.5629 0.7867 0.132 0.868
#> SRR1033051 1 0.9170 0.5839 0.668 0.332
#> SRR1033052 1 0.9044 0.6049 0.680 0.320
#> SRR1033053 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.9491 0.5134 0.632 0.368
#> SRR1033050 1 0.3274 0.8510 0.940 0.060
#> SRR1033055 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.5519 0.8154 0.872 0.128
#> SRR1033057 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033058 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.3733 0.8461 0.928 0.072
#> SRR1033061 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033062 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033064 2 0.3584 0.8428 0.068 0.932
#> SRR1033065 2 0.9909 0.1341 0.444 0.556
#> SRR1033066 2 0.9358 0.4284 0.352 0.648
#> SRR1033067 1 0.3431 0.8495 0.936 0.064
#> SRR1033068 2 0.6801 0.7336 0.180 0.820
#> SRR1033069 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033070 2 0.8327 0.6116 0.264 0.736
#> SRR1033071 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.2948 0.8536 0.948 0.052
#> SRR1033075 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.9944 0.2714 0.544 0.456
#> SRR1033077 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.4022 0.8427 0.920 0.080
#> SRR1033079 2 0.6247 0.7620 0.156 0.844
#> SRR1033080 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033082 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033083 2 0.8909 0.5281 0.308 0.692
#> SRR1033084 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033085 2 0.0672 0.8846 0.008 0.992
#> SRR1033086 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.2948 0.8537 0.948 0.052
#> SRR1033088 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033089 1 0.6973 0.7705 0.812 0.188
#> SRR1033090 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033091 2 0.1633 0.8745 0.024 0.976
#> SRR1033092 2 0.4562 0.8202 0.096 0.904
#> SRR1033093 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.9977 0.2144 0.528 0.472
#> SRR1033097 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033098 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.8081 0.7101 0.752 0.248
#> SRR1033102 1 0.4431 0.8363 0.908 0.092
#> SRR1033103 2 0.9754 0.2671 0.408 0.592
#> SRR1033104 1 0.9170 0.5826 0.668 0.332
#> SRR1033105 2 0.9710 0.2931 0.400 0.600
#> SRR1033106 1 0.5946 0.8045 0.856 0.144
#> SRR1033107 2 0.9393 0.4186 0.356 0.644
#> SRR1033108 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.6531 0.7869 0.832 0.168
#> SRR1033110 1 0.9795 0.3943 0.584 0.416
#> SRR1033111 2 0.4939 0.8096 0.108 0.892
#> SRR1033112 1 0.8555 0.6669 0.720 0.280
#> SRR1033113 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033114 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033115 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033116 1 0.9710 0.4363 0.600 0.400
#> SRR1033117 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.9775 0.4055 0.588 0.412
#> SRR1033121 1 0.9000 0.6114 0.684 0.316
#> SRR1033120 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033123 2 0.0672 0.8847 0.008 0.992
#> SRR1033124 2 0.9795 0.2397 0.416 0.584
#> SRR1033125 2 0.8144 0.6318 0.252 0.748
#> SRR1033126 2 0.9710 0.2933 0.400 0.600
#> SRR1033127 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033129 2 0.6343 0.7570 0.160 0.840
#> SRR1033128 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033130 1 0.3879 0.8443 0.924 0.076
#> SRR1033131 1 0.3274 0.8509 0.940 0.060
#> SRR1033132 2 0.9491 0.3868 0.368 0.632
#> SRR1033133 1 0.5737 0.8098 0.864 0.136
#> SRR1033134 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033135 2 0.9988 -0.0221 0.480 0.520
#> SRR1033136 1 0.9922 0.2982 0.552 0.448
#> SRR1033137 1 0.6973 0.7703 0.812 0.188
#> SRR1033139 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033138 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033140 2 0.8144 0.6321 0.252 0.748
#> SRR1033141 1 0.8016 0.7139 0.756 0.244
#> SRR1033142 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.2236 0.8585 0.964 0.036
#> SRR1033144 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033145 2 0.0938 0.8822 0.012 0.988
#> SRR1033146 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.2236 0.8583 0.964 0.036
#> SRR1033149 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033151 2 0.4562 0.8202 0.096 0.904
#> SRR1033152 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.9944 0.2714 0.544 0.456
#> SRR1033154 2 0.9815 0.2259 0.420 0.580
#> SRR1033156 1 0.6148 0.7986 0.848 0.152
#> SRR1033157 2 0.9996 -0.0589 0.488 0.512
#> SRR1033158 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.9209 0.5753 0.664 0.336
#> SRR1033160 2 0.7376 0.6977 0.208 0.792
#> SRR1033161 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033163 2 0.9427 0.4081 0.360 0.640
#> SRR1033162 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033166 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.9522 0.5035 0.628 0.372
#> SRR1033169 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.9635 0.4668 0.612 0.388
#> SRR1033172 2 1.0000 -0.0944 0.496 0.504
#> SRR1033173 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033174 2 0.9661 0.3178 0.392 0.608
#> SRR1033175 1 0.4022 0.8424 0.920 0.080
#> SRR1033176 1 0.9323 0.5533 0.652 0.348
#> SRR1033177 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033180 2 0.2423 0.8636 0.040 0.960
#> SRR1033181 1 0.8713 0.6495 0.708 0.292
#> SRR1033183 1 0.0376 0.8651 0.996 0.004
#> SRR1033182 1 0.2778 0.8548 0.952 0.048
#> SRR1033184 1 0.9491 0.5123 0.632 0.368
#> SRR1033185 2 0.7056 0.7191 0.192 0.808
#> SRR1033187 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033186 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033190 2 0.5059 0.8059 0.112 0.888
#> SRR1033191 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033197 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033196 2 0.7745 0.6694 0.228 0.772
#> SRR1033199 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.9754 0.4159 0.592 0.408
#> SRR1033202 1 0.9491 0.5123 0.632 0.368
#> SRR1033203 1 0.9983 0.1984 0.524 0.476
#> SRR1033204 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.7299 0.7562 0.796 0.204
#> SRR1033207 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.7745 0.7319 0.772 0.228
#> SRR1033209 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.9427 0.5292 0.640 0.360
#> SRR1033211 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.9552 0.4945 0.624 0.376
#> SRR1033213 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033217 1 0.7815 0.7277 0.768 0.232
#> SRR1033218 1 0.4939 0.8273 0.892 0.108
#> SRR1033219 1 0.4161 0.8405 0.916 0.084
#> SRR1033221 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0376 0.8651 0.996 0.004
#> SRR1033223 1 0.0938 0.8638 0.988 0.012
#> SRR1033225 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.7815 0.7275 0.768 0.232
#> SRR1033227 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.4431 0.8366 0.908 0.092
#> SRR1033235 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.7602 0.7404 0.780 0.220
#> SRR1033236 1 0.3431 0.8492 0.936 0.064
#> SRR1033237 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.6048 0.8014 0.852 0.148
#> SRR1033240 1 0.9286 0.5612 0.656 0.344
#> SRR1033239 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.8443 0.6779 0.728 0.272
#> SRR1033244 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.8016 0.7145 0.756 0.244
#> SRR1033246 1 0.6531 0.7871 0.832 0.168
#> SRR1033248 1 0.9209 0.5761 0.664 0.336
#> SRR1033247 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.9635 0.4663 0.612 0.388
#> SRR1033252 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0672 0.8645 0.992 0.008
#> SRR1033254 1 0.7674 0.7372 0.776 0.224
#> SRR1033256 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.7950 0.7187 0.760 0.240
#> SRR1033258 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.8016 0.7144 0.756 0.244
#> SRR1033262 1 0.9608 0.4766 0.616 0.384
#> SRR1033263 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.8909 0.6250 0.692 0.308
#> SRR1033265 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.4690 0.8323 0.900 0.100
#> SRR1033267 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.9522 0.5042 0.628 0.372
#> SRR1033269 2 0.6438 0.7524 0.164 0.836
#> SRR1033270 1 0.8016 0.7147 0.756 0.244
#> SRR1033271 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.6343 0.7933 0.840 0.160
#> SRR1033274 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.8892 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.9580 0.4852 0.620 0.380
#> SRR1033280 2 0.9393 0.4184 0.356 0.644
#> SRR1033281 1 0.7674 0.7362 0.776 0.224
#> SRR1033282 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.8657 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.5662 0.7903 0.808 0.100 0.092
#> SRR1032918 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1163 0.8407 0.972 0.028 0.000
#> SRR1032922 1 0.6309 0.1214 0.500 0.500 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.5098 0.7155 0.752 0.248 0.000
#> SRR1032940 1 0.6154 0.4308 0.592 0.408 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.6095 0.4725 0.608 0.392 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.3116 0.8231 0.892 0.108 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.4887 0.7384 0.772 0.228 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.4452 0.7703 0.808 0.192 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0237 0.8408 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.2878 0.8275 0.904 0.096 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.2261 0.8350 0.932 0.068 0.000
#> SRR1032969 2 0.6274 0.0686 0.456 0.544 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.1411 0.8403 0.964 0.036 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.4605 0.7604 0.796 0.204 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0237 0.8673 0.004 0.996 0.000
#> SRR1032978 1 0.5016 0.7249 0.760 0.240 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 2 0.6045 0.3421 0.380 0.620 0.000
#> SRR1032981 1 0.2959 0.8261 0.900 0.100 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0892 0.8411 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032984 1 0.5216 0.7018 0.740 0.260 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.4504 0.7668 0.804 0.196 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.2448 0.8336 0.924 0.076 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.6308 0.1546 0.508 0.492 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.4702 0.7535 0.788 0.212 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.4750 0.6821 0.216 0.784 0.000
#> SRR1033001 1 0.0237 0.8409 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033002 1 0.5098 0.7164 0.752 0.248 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 2 0.4504 0.7093 0.196 0.804 0.000
#> SRR1033006 2 0.5591 0.5295 0.304 0.696 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0892 0.8410 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033010 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 2 0.6302 -0.0430 0.480 0.520 0.000
#> SRR1033013 1 0.3619 0.8099 0.864 0.136 0.000
#> SRR1033014 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033015 2 0.4750 0.6821 0.216 0.784 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.6274 0.2883 0.544 0.456 0.000
#> SRR1033019 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.1643 0.8357 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033023 2 0.6126 0.2799 0.400 0.600 0.000
#> SRR1033022 2 0.6126 0.2799 0.400 0.600 0.000
#> SRR1033024 2 0.4504 0.7093 0.196 0.804 0.000
#> SRR1033025 2 0.0747 0.8601 0.016 0.984 0.000
#> SRR1033026 2 0.5497 0.5530 0.292 0.708 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0424 0.8411 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033031 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 2 0.3340 0.7869 0.120 0.880 0.000
#> SRR1033036 1 0.6168 0.4207 0.588 0.412 0.000
#> SRR1033037 1 0.4605 0.7601 0.796 0.204 0.000
#> SRR1033038 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.5529 0.6519 0.704 0.296 0.000
#> SRR1033040 2 0.5988 0.3760 0.368 0.632 0.000
#> SRR1033041 1 0.1031 0.8409 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033042 2 0.5591 0.5286 0.304 0.696 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.6252 0.3277 0.556 0.444 0.000
#> SRR1033045 2 0.5926 0.4086 0.356 0.644 0.000
#> SRR1033046 1 0.1964 0.8379 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033047 2 0.6267 0.0845 0.452 0.548 0.000
#> SRR1033048 1 0.6168 0.4201 0.588 0.412 0.000
#> SRR1033049 2 0.3551 0.7773 0.132 0.868 0.000
#> SRR1033051 1 0.5785 0.5949 0.668 0.332 0.000
#> SRR1033052 1 0.5706 0.6153 0.680 0.320 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.5988 0.5263 0.632 0.368 0.000
#> SRR1033050 1 0.2066 0.8372 0.940 0.060 0.000
#> SRR1033055 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.3482 0.8149 0.872 0.128 0.000
#> SRR1033057 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033058 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.2356 0.8344 0.928 0.072 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033062 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 2 0.2261 0.8249 0.068 0.932 0.000
#> SRR1033065 2 0.6252 0.1166 0.444 0.556 0.000
#> SRR1033066 2 0.5905 0.4184 0.352 0.648 0.000
#> SRR1033067 1 0.2165 0.8365 0.936 0.064 0.000
#> SRR1033068 2 0.4291 0.7297 0.180 0.820 0.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033070 2 0.5254 0.6054 0.264 0.736 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033073 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.1860 0.8383 0.948 0.052 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.6274 0.2886 0.544 0.456 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.2537 0.8326 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033079 2 0.3941 0.7582 0.156 0.844 0.000
#> SRR1033080 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033083 2 0.5621 0.5203 0.308 0.692 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 2 0.0424 0.8650 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.1860 0.8385 0.948 0.052 0.000
#> SRR1033088 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.4399 0.7736 0.812 0.188 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 2 0.1031 0.8548 0.024 0.976 0.000
#> SRR1033092 2 0.2878 0.8050 0.096 0.904 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.6295 0.2324 0.528 0.472 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.5098 0.7166 0.752 0.248 0.000
#> SRR1033102 1 0.2796 0.8287 0.908 0.092 0.000
#> SRR1033103 2 0.6154 0.2533 0.408 0.592 0.000
#> SRR1033104 1 0.5785 0.5935 0.668 0.332 0.000
#> SRR1033105 2 0.6126 0.2800 0.400 0.600 0.000
#> SRR1033106 1 0.3752 0.8048 0.856 0.144 0.000
#> SRR1033107 2 0.5926 0.4084 0.356 0.644 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.4121 0.7886 0.832 0.168 0.000
#> SRR1033110 1 0.6180 0.4095 0.584 0.416 0.000
#> SRR1033111 2 0.3116 0.7960 0.108 0.892 0.000
#> SRR1033112 1 0.5397 0.6751 0.720 0.280 0.000
#> SRR1033113 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033114 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033115 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.6126 0.4507 0.600 0.400 0.000
#> SRR1033117 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.6168 0.4205 0.588 0.412 0.000
#> SRR1033121 1 0.5678 0.6215 0.684 0.316 0.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033123 2 0.0424 0.8650 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033124 2 0.6180 0.2252 0.416 0.584 0.000
#> SRR1033125 2 0.5138 0.6260 0.252 0.748 0.000
#> SRR1033126 2 0.6126 0.2801 0.400 0.600 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033129 2 0.4002 0.7535 0.160 0.840 0.000
#> SRR1033128 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.2448 0.8336 0.924 0.076 0.000
#> SRR1033131 1 0.2066 0.8372 0.940 0.060 0.000
#> SRR1033132 2 0.5988 0.3758 0.368 0.632 0.000
#> SRR1033133 1 0.4591 0.8094 0.848 0.120 0.032
#> SRR1033134 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 2 0.6302 -0.0426 0.480 0.520 0.000
#> SRR1033136 1 0.6260 0.3149 0.552 0.448 0.000
#> SRR1033137 1 0.4399 0.7734 0.812 0.188 0.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033138 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033140 2 0.5138 0.6264 0.252 0.748 0.000
#> SRR1033141 1 0.5058 0.7202 0.756 0.244 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1411 0.8403 0.964 0.036 0.000
#> SRR1033144 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033145 2 0.0592 0.8625 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033146 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.1411 0.8401 0.964 0.036 0.000
#> SRR1033149 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 2 0.2878 0.8050 0.096 0.904 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.6274 0.2886 0.544 0.456 0.000
#> SRR1033154 2 0.6192 0.2110 0.420 0.580 0.000
#> SRR1033156 1 0.3879 0.7994 0.848 0.152 0.000
#> SRR1033157 2 0.6307 -0.0789 0.488 0.512 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.5810 0.5863 0.664 0.336 0.000
#> SRR1033160 2 0.4654 0.6932 0.208 0.792 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 2 0.5948 0.3976 0.360 0.640 0.000
#> SRR1033162 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.6008 0.5165 0.628 0.372 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.6079 0.4806 0.612 0.388 0.000
#> SRR1033172 2 0.6309 -0.1140 0.496 0.504 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 2 0.6095 0.3052 0.392 0.608 0.000
#> SRR1033175 1 0.2537 0.8325 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033176 1 0.5882 0.5651 0.652 0.348 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 2 0.1529 0.8443 0.040 0.960 0.000
#> SRR1033181 1 0.5497 0.6584 0.708 0.292 0.000
#> SRR1033183 1 0.0237 0.8409 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033182 1 0.1753 0.8388 0.952 0.048 0.000
#> SRR1033184 1 0.5988 0.5251 0.632 0.368 0.000
#> SRR1033185 2 0.4452 0.7149 0.192 0.808 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033190 2 0.3192 0.7930 0.112 0.888 0.000
#> SRR1033191 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033196 2 0.4887 0.6644 0.228 0.772 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.6154 0.4307 0.592 0.408 0.000
#> SRR1033202 1 0.6189 0.5294 0.632 0.364 0.004
#> SRR1033203 1 0.6299 0.2166 0.524 0.476 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.3412 0.7886 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033206 1 0.4605 0.7602 0.796 0.204 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.4887 0.7373 0.772 0.228 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.5948 0.5416 0.640 0.360 0.000
#> SRR1033211 1 0.0237 0.8396 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033212 1 0.6026 0.5077 0.624 0.376 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033217 1 0.4931 0.7333 0.768 0.232 0.000
#> SRR1033218 1 0.3116 0.8228 0.892 0.108 0.000
#> SRR1033219 1 0.2625 0.8313 0.916 0.084 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0237 0.8409 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033223 1 0.0592 0.8411 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.4931 0.7331 0.768 0.232 0.000
#> SRR1033227 1 0.4399 0.7460 0.812 0.000 0.188
#> SRR1033229 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.1031 0.8336 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033233 1 0.2796 0.8288 0.908 0.092 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.4796 0.7453 0.780 0.220 0.000
#> SRR1033236 1 0.2165 0.8363 0.936 0.064 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.5710 0.7905 0.804 0.116 0.080
#> SRR1033240 1 0.5859 0.5728 0.656 0.344 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.5327 0.6857 0.728 0.272 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.5058 0.7209 0.756 0.244 0.000
#> SRR1033246 1 0.4121 0.7889 0.832 0.168 0.000
#> SRR1033248 1 0.5810 0.5873 0.664 0.336 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.6079 0.4801 0.612 0.388 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0424 0.8411 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033254 1 0.4842 0.7424 0.776 0.224 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.5016 0.7248 0.760 0.240 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.5058 0.7207 0.756 0.244 0.000
#> SRR1033262 1 0.6062 0.4902 0.616 0.384 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.5621 0.6347 0.692 0.308 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.2959 0.8261 0.900 0.100 0.000
#> SRR1033267 1 0.3116 0.7977 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033268 1 0.6008 0.5172 0.628 0.372 0.000
#> SRR1033269 2 0.4062 0.7488 0.164 0.836 0.000
#> SRR1033270 1 0.5058 0.7209 0.756 0.244 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4002 0.7946 0.840 0.160 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.8695 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.8406 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.6045 0.4986 0.620 0.380 0.000
#> SRR1033280 2 0.5926 0.4081 0.356 0.644 0.000
#> SRR1033281 1 0.4842 0.7413 0.776 0.224 0.000
#> SRR1033282 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.4686 0.77178 0.788 0.000 0.144 0.068
#> SRR1032918 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1059 0.87201 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1032922 3 0.3907 0.67186 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.4790 0.25225 0.000 0.380 0.620 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.4843 0.40431 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1032940 3 0.4907 0.25908 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 3 0.4855 0.32111 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.3074 0.80023 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.4679 0.50489 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.3569 0.75432 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0188 0.87825 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032962 3 0.0921 0.81042 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1032963 1 0.2530 0.83436 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.1940 0.85336 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032969 3 0.1022 0.81839 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.1557 0.86206 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.4072 0.68272 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.4790 0.44386 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 3 0.0707 0.82302 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032981 1 0.2589 0.83121 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0707 0.87454 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1032984 1 0.5272 0.59408 0.680 0.032 0.288 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.4222 0.65236 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.2281 0.84373 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 3 0.3907 0.67102 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.4522 0.56944 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0188 0.87824 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033002 1 0.4843 0.40513 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 3 0.0188 0.82709 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033006 3 0.2830 0.79314 0.060 0.040 0.900 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0707 0.87451 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033010 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 3 0.4406 0.55863 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1033013 1 0.3569 0.75527 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0336 0.82636 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.3726 0.69922 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1033023 3 0.1474 0.80946 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1033022 3 0.3266 0.73621 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033025 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0188 0.82708 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0336 0.87750 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.3219 0.66445 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1033031 3 0.4907 0.13935 0.000 0.420 0.580 0.000
#> SRR1033032 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 3 0.0188 0.82557 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033036 3 0.3311 0.73346 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1033037 1 0.4040 0.68865 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1033038 3 0.4730 0.30245 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1033039 1 0.4992 0.14660 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1033040 3 0.0469 0.82542 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1033041 1 0.1022 0.87081 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033042 3 0.0188 0.82702 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 3 0.4643 0.46714 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR1033045 3 0.1940 0.79605 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1033046 1 0.1792 0.85731 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033047 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.4543 0.51118 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR1033049 3 0.0336 0.82340 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033051 1 0.6135 0.46601 0.608 0.068 0.324 0.000
#> SRR1033052 1 0.5229 0.29746 0.564 0.008 0.428 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.3400 0.72731 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1033050 1 0.2216 0.84629 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.3074 0.80007 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1033057 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0188 0.82540 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.2149 0.84820 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1033061 3 0.4830 0.23748 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1033062 3 0.4564 0.40674 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 3 0.0188 0.82547 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033066 3 0.0657 0.82526 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR1033067 1 0.2408 0.83919 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033069 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.3726 0.61178 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1033073 3 0.4985 -0.01481 0.000 0.468 0.532 0.000
#> SRR1033074 1 0.1520 0.86688 0.956 0.020 0.024 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.3074 0.74750 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.2469 0.83721 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0188 0.82578 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 3 0.3074 0.66849 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1033083 3 0.0188 0.82707 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.2921 0.77271 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1033087 1 0.1940 0.85384 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1033088 3 0.0921 0.80937 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1033089 1 0.4522 0.57035 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0188 0.82581 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033092 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.3569 0.71424 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0469 0.82267 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.4916 0.32670 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1033102 1 0.2704 0.82494 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1033103 3 0.3577 0.74319 0.156 0.012 0.832 0.000
#> SRR1033104 3 0.4888 0.28615 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1033105 3 0.1557 0.80735 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1033106 1 0.3444 0.76777 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1033107 3 0.2149 0.78852 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.3486 0.76368 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1033110 3 0.3873 0.67622 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1033111 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.4855 0.39374 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033114 3 0.1118 0.80219 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1033115 3 0.0188 0.82546 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033116 3 0.4679 0.44978 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 3 0.3528 0.71770 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033121 3 0.4998 -0.00531 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1033120 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033123 3 0.0336 0.82317 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033124 3 0.1389 0.81127 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033126 3 0.0592 0.82429 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033127 2 0.3764 0.60334 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033128 3 0.2011 0.75788 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1033130 1 0.2345 0.84179 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1033131 1 0.2281 0.84403 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.3910 0.78561 0.820 0.000 0.156 0.024
#> SRR1033134 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.3219 0.73904 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1033136 3 0.4564 0.50227 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1033137 1 0.4543 0.56277 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR1033139 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033138 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.4925 0.31487 0.572 0.000 0.428 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0921 0.87205 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033144 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.0817 0.81192 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1033147 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.1557 0.86220 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 3 0.3801 0.68764 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1033154 3 0.1890 0.80705 0.056 0.008 0.936 0.000
#> SRR1033156 1 0.3726 0.73589 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1033157 3 0.4964 0.37591 0.380 0.004 0.616 0.000
#> SRR1033158 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.4730 0.41958 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033162 3 0.0921 0.80858 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1033164 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 3 0.2345 0.73504 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1033167 3 0.4222 0.49020 0.000 0.272 0.728 0.000
#> SRR1033168 3 0.3907 0.67300 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1033169 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.0188 0.82554 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033170 3 0.4790 0.37770 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1033172 3 0.1716 0.80307 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.1022 0.81852 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1033175 1 0.2281 0.84362 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033176 3 0.4843 0.33264 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 3 0.0469 0.82073 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033181 3 0.4697 0.44088 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1033183 1 0.0336 0.87747 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033182 1 0.2081 0.84965 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033184 3 0.4967 0.14561 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1033185 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.1118 0.91422 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1033190 3 0.1118 0.80159 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1033191 3 0.0707 0.81541 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033192 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.3356 0.73049 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1033202 3 0.4998 -0.00354 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1033203 3 0.3837 0.68155 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.2704 0.81383 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033206 1 0.3975 0.69968 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.4855 0.39401 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033210 3 0.4331 0.58034 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1033211 1 0.0188 0.87769 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033212 3 0.4994 0.03184 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.4522 0.47495 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1033217 3 0.4996 0.01440 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR1033218 1 0.2814 0.81820 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1033219 1 0.2530 0.83431 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0336 0.87751 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033223 1 0.0592 0.87568 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033225 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.4790 0.44348 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1033227 1 0.3486 0.76275 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033229 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0817 0.87024 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033233 1 0.2589 0.83129 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.4830 0.41435 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1033236 1 0.2081 0.84988 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.4332 0.77311 0.800 0.000 0.160 0.040
#> SRR1033240 1 0.4972 0.22118 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.4898 0.35034 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.4898 0.35009 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1033246 1 0.3726 0.73627 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1033248 1 0.4855 0.39374 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1033247 2 0.4898 0.31450 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 3 0.4643 0.46821 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0707 0.87451 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033254 1 0.4948 0.27312 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.4998 -0.00249 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.4877 0.37279 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1033262 3 0.3569 0.71397 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.5000 0.04528 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.2973 0.80814 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1033267 1 0.2469 0.82475 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1033268 3 0.4888 0.28486 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.82725 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.4948 0.27637 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.3311 0.78067 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.97164 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.87900 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.3610 0.71033 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1033280 3 0.0336 0.82637 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033281 1 0.4746 0.47091 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1033282 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 4 0.0000 1.00000 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0912 0.8609 0.972 0.012 0.016 0.000 0.000
#> SRR1032922 3 0.3366 0.5771 0.232 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.4126 0.3082 0.000 0.380 0.620 0.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0794 0.8573 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.4171 0.3685 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1032940 3 0.4227 0.2500 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 3 0.4182 0.2893 0.400 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.2648 0.7528 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.4030 0.4481 0.648 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.3074 0.6976 0.804 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0162 0.8710 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0794 0.8030 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.2179 0.7984 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.1671 0.8286 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1032969 3 0.0880 0.8015 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.1341 0.8430 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.3508 0.6175 0.748 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.3039 0.7015 0.000 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1032978 1 0.4126 0.3988 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 3 0.0609 0.8096 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.2230 0.7936 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0609 0.8640 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.4541 0.5181 0.680 0.032 0.288 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.3992 0.5780 0.720 0.000 0.268 0.012 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.1965 0.8128 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 3 0.3366 0.5778 0.232 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.3895 0.5040 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.3039 0.7015 0.000 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1033001 1 0.0162 0.8710 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.4171 0.3675 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 3 0.0162 0.8158 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.2438 0.7718 0.060 0.040 0.900 0.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0609 0.8641 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 3 0.3796 0.4669 0.300 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1033013 4 0.3745 0.8129 0.196 0.000 0.024 0.780 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0290 0.8144 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.3210 0.6313 0.788 0.000 0.212 0.000 0.000
#> SRR1033023 3 0.1270 0.7876 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1033022 3 0.2813 0.6658 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.3480 0.5541 0.000 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1033025 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.2583 0.7139 0.004 0.000 0.864 0.132 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0290 0.8695 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.2773 0.6691 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000
#> SRR1033031 3 0.4227 0.1980 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 3 0.0162 0.8154 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033036 3 0.2852 0.6606 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.3480 0.6240 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.4074 0.3536 0.000 0.364 0.636 0.000 0.000
#> SRR1033039 4 0.5946 0.6756 0.224 0.000 0.184 0.592 0.000
#> SRR1033040 3 0.0404 0.8132 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0880 0.8577 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033042 3 0.0162 0.8157 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 3 0.3999 0.3921 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.1671 0.7658 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.2376 0.8211 0.904 0.000 0.052 0.044 0.000
#> SRR1033047 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.3913 0.4276 0.324 0.000 0.676 0.000 0.000
#> SRR1033049 3 0.0290 0.8139 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.5284 0.3867 0.608 0.068 0.324 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.4504 0.2893 0.564 0.008 0.428 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.3318 0.6434 0.180 0.000 0.808 0.012 0.000
#> SRR1033050 1 0.1908 0.8172 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.2648 0.7535 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1033057 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0162 0.8153 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.1851 0.8203 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1033061 3 0.4161 0.2892 0.000 0.392 0.608 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.3932 0.4357 0.000 0.328 0.672 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 3 0.0162 0.8154 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033066 3 0.0566 0.8133 0.012 0.004 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.2074 0.8058 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033069 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.3210 0.6151 0.000 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.4294 0.0448 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.1310 0.8526 0.956 0.020 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.2648 0.6857 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.2127 0.8028 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.4161 0.2639 0.000 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1033080 3 0.0162 0.8155 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 3 0.2648 0.6752 0.000 0.152 0.848 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.1270 0.7934 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.2516 0.7754 0.000 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.1671 0.8294 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0794 0.8024 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.3895 0.5062 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0162 0.8156 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033092 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.3074 0.6282 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0404 0.8130 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.5606 0.3001 0.568 0.000 0.344 0.088 0.000
#> SRR1033102 1 0.2329 0.7854 0.876 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1033103 3 0.3081 0.6794 0.156 0.012 0.832 0.000 0.000
#> SRR1033104 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033105 3 0.1341 0.7838 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.2966 0.7134 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR1033107 4 0.3955 0.6109 0.084 0.000 0.116 0.800 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.3003 0.7087 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.5197 0.4804 0.204 0.000 0.680 0.116 0.000
#> SRR1033111 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.4182 0.3612 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 3 0.0963 0.7962 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033115 3 0.0162 0.8153 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033116 4 0.3492 0.8177 0.188 0.000 0.016 0.796 0.000
#> SRR1033117 3 0.1732 0.7586 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 3 0.3039 0.6342 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1033121 4 0.5191 0.7383 0.192 0.000 0.124 0.684 0.000
#> SRR1033120 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.0794 0.8555 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033123 3 0.0290 0.8137 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033124 3 0.1197 0.7906 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033126 3 0.0510 0.8113 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.3242 0.6184 0.000 0.784 0.216 0.000 0.000
#> SRR1033129 4 0.3949 0.3198 0.000 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1033128 3 0.1732 0.7564 0.000 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.2020 0.8100 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.1965 0.8133 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.4693 0.6808 0.768 0.000 0.132 0.076 0.024
#> SRR1033134 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.5472 0.4449 0.156 0.000 0.656 0.188 0.000
#> SRR1033136 3 0.3932 0.4188 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000
#> SRR1033137 4 0.5912 0.5697 0.348 0.000 0.116 0.536 0.000
#> SRR1033139 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.4242 0.3039 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0794 0.8598 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033144 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.0703 0.8046 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1033147 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.1341 0.8433 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0609 0.8072 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 3 0.3274 0.5950 0.220 0.000 0.780 0.000 0.000
#> SRR1033154 3 0.1628 0.7842 0.056 0.008 0.936 0.000 0.000
#> SRR1033156 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033157 3 0.4276 0.3233 0.380 0.004 0.616 0.000 0.000
#> SRR1033158 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.6413 0.1090 0.224 0.000 0.508 0.268 0.000
#> SRR1033160 3 0.0162 0.8154 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033162 3 0.0794 0.8018 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 3 0.2020 0.7356 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR1033167 3 0.3636 0.5172 0.000 0.272 0.728 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.4981 0.5255 0.188 0.000 0.704 0.108 0.000
#> SRR1033169 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.0162 0.8154 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033170 3 0.4126 0.3267 0.380 0.000 0.620 0.000 0.000
#> SRR1033172 4 0.5329 0.2653 0.052 0.000 0.432 0.516 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0880 0.8025 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.1965 0.8128 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1033176 3 0.4171 0.2967 0.396 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 3 0.0404 0.8118 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033181 3 0.4045 0.3699 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.2338 0.7781 0.884 0.000 0.004 0.112 0.000
#> SRR1033182 1 0.1792 0.8225 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.4278 0.1369 0.452 0.000 0.548 0.000 0.000
#> SRR1033185 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0963 0.9177 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033190 3 0.0963 0.7955 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033191 3 0.0609 0.8074 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.5958 0.2337 0.144 0.000 0.568 0.288 0.000
#> SRR1033202 4 0.3196 0.8233 0.192 0.000 0.004 0.804 0.000
#> SRR1033203 3 0.6458 -0.2325 0.180 0.000 0.424 0.396 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033206 1 0.3424 0.6360 0.760 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033210 4 0.3246 0.8157 0.184 0.000 0.008 0.808 0.000
#> SRR1033211 1 0.0162 0.8708 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033212 4 0.3196 0.8234 0.192 0.000 0.004 0.804 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.3895 0.4822 0.000 0.680 0.320 0.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.6807 -0.2742 0.336 0.000 0.364 0.300 0.000
#> SRR1033218 1 0.2424 0.7769 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.2179 0.7982 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0290 0.8695 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.2873 0.7458 0.856 0.000 0.016 0.128 0.000
#> SRR1033225 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.4457 0.4031 0.620 0.000 0.368 0.012 0.000
#> SRR1033227 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.4101 0.2944 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1033233 1 0.2230 0.7939 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 4 0.5970 0.6646 0.228 0.000 0.184 0.588 0.000
#> SRR1033236 1 0.4242 0.0887 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033240 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.3932 0.4087 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000
#> SRR1033241 4 0.6161 0.6139 0.196 0.000 0.248 0.556 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.4359 0.3305 0.584 0.000 0.412 0.004 0.000
#> SRR1033246 1 0.3210 0.6764 0.788 0.000 0.212 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.4182 0.3612 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.4219 0.3215 0.000 0.584 0.416 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 3 0.3999 0.3913 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0609 0.8641 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.4262 0.2714 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.5677 0.0987 0.424 0.000 0.496 0.080 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033262 4 0.6080 0.6002 0.168 0.000 0.272 0.560 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4307 0.0508 0.500 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.2561 0.7635 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1033267 4 0.3109 0.8175 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1033268 3 0.4210 0.2665 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.8164 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033270 4 0.3039 0.8238 0.192 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.2852 0.7290 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.8726 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.3109 0.6198 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1033280 3 0.0290 0.8145 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.4088 0.4205 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1033282 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 4 0.0820 0.8835 0.016 0.012 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.3023 0.5820 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1032923 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 1 0.3706 0.1758 0.620 0.380 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 4 0.0713 0.8811 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 4 0.3747 0.3989 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.3797 0.2578 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.3756 0.3194 0.600 0.000 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 4 0.2378 0.7920 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.3620 0.5031 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1032951 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 4 0.2762 0.7444 0.196 0.000 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR1032958 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 4 0.0146 0.8917 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0713 0.7753 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 4 0.1957 0.8302 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.1501 0.8563 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0790 0.7787 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.1204 0.8684 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 4 0.3151 0.6761 0.252 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1032975 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 6 0.2135 1.0000 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000 0.872
#> SRR1032978 4 0.3706 0.4398 0.380 0.000 0.000 0.620 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0547 0.7856 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1032981 4 0.3252 0.7944 0.032 0.000 0.012 0.828 0.000 0.128
#> SRR1032982 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 4 0.0547 0.8860 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1032984 4 0.4079 0.5913 0.288 0.032 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 4 0.3586 0.6434 0.268 0.000 0.012 0.720 0.000 0.000
#> SRR1032989 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.1765 0.8427 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1032993 4 0.2489 0.8096 0.000 0.000 0.012 0.860 0.000 0.128
#> SRR1032994 1 0.3023 0.5815 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1032995 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 4 0.3499 0.5690 0.320 0.000 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 6 0.2135 1.0000 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000 0.872
#> SRR1033001 4 0.0146 0.8916 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033002 4 0.3747 0.3989 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.2631 0.6586 0.856 0.000 0.012 0.004 0.000 0.128
#> SRR1033006 1 0.2190 0.7463 0.900 0.040 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033007 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 4 0.0547 0.8860 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.3409 0.4914 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.1176 0.7248 0.024 0.000 0.956 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.0260 0.7905 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 4 0.2883 0.6890 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.1141 0.7654 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.2527 0.6573 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.3409 0.4157 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.3265 0.5431 0.748 0.000 0.248 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.0692 0.8852 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 1 0.2491 0.6081 0.836 0.164 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.3797 0.0887 0.580 0.420 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0146 0.7908 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.2562 0.6533 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1033037 4 0.3126 0.6816 0.248 0.000 0.000 0.752 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.3659 0.2161 0.636 0.364 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.4650 0.3588 0.180 0.000 0.688 0.132 0.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0363 0.7892 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033041 4 0.0790 0.8807 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0146 0.7915 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033043 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.3592 0.4315 0.656 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.1501 0.7454 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1033046 4 0.2134 0.8517 0.052 0.000 0.044 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.3515 0.4594 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0260 0.7888 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 4 0.4747 0.4621 0.324 0.068 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR1033052 4 0.4045 0.2893 0.428 0.008 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.2980 0.6383 0.808 0.000 0.012 0.180 0.000 0.000
#> SRR1033050 4 0.1714 0.8465 0.092 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 4 0.2378 0.7922 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0146 0.7905 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 4 0.1663 0.8491 0.088 0.000 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1033061 1 0.3872 0.1520 0.604 0.392 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 1 0.3531 0.2906 0.672 0.328 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0146 0.7907 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0508 0.7892 0.984 0.004 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033067 4 0.1863 0.8368 0.104 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 1 0.2883 0.5376 0.788 0.212 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 1 0.3857 -0.0169 0.532 0.468 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033074 4 0.1176 0.8766 0.024 0.020 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1033075 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.2378 0.6740 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1033077 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 4 0.1910 0.8341 0.108 0.000 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.3843 0.0424 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0146 0.7909 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.2378 0.6167 0.848 0.152 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.1814 0.7295 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.2402 0.7505 0.140 0.856 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 4 0.1501 0.8569 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0713 0.7747 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 4 0.3499 0.5709 0.320 0.000 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1033090 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0146 0.7909 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.2762 0.6260 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0146 0.9673 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 1 0.0363 0.7876 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 4 0.5036 0.3944 0.344 0.000 0.088 0.568 0.000 0.000
#> SRR1033102 4 0.2092 0.8192 0.124 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.2768 0.6679 0.832 0.012 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.1204 0.7623 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033106 4 0.2664 0.7580 0.184 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR1033107 3 0.0725 0.7339 0.012 0.000 0.976 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 4 0.2697 0.7540 0.188 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.4709 0.5133 0.680 0.000 0.132 0.188 0.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 4 0.3756 0.3884 0.400 0.000 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0865 0.7672 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0146 0.7907 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0820 0.7368 0.012 0.000 0.972 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.1556 0.7241 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.2730 0.6309 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.2538 0.5892 0.124 0.000 0.860 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033120 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 4 0.0713 0.8796 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0260 0.7886 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.1075 0.7682 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0458 0.7874 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.2912 0.5511 0.216 0.784 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.2454 0.5249 0.160 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.1556 0.7187 0.920 0.080 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 4 0.1814 0.8402 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1033131 4 0.1765 0.8431 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033133 4 0.4216 0.7374 0.132 0.000 0.076 0.768 0.024 0.000
#> SRR1033134 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.4789 0.4278 0.640 0.000 0.268 0.092 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.3531 0.4533 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.5310 0.1230 0.116 0.000 0.536 0.348 0.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 4 0.3810 0.3068 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 4 0.0713 0.8824 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0632 0.7774 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 4 0.1204 0.8687 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0547 0.7810 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033152 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.2941 0.5966 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.1462 0.7623 0.936 0.008 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.3841 0.3736 0.616 0.004 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1033158 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.5770 0.2197 0.500 0.000 0.288 0.212 0.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0146 0.7908 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0713 0.7740 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.1814 0.6928 0.900 0.100 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033167 1 0.3266 0.4069 0.728 0.272 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.4589 0.5291 0.696 0.000 0.172 0.132 0.000 0.000
#> SRR1033169 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 1 0.0146 0.7908 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.3706 0.3752 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.3565 0.2791 0.304 0.000 0.692 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.0790 0.7790 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033175 4 0.1765 0.8426 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.3747 0.3309 0.604 0.000 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0363 0.7863 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.3634 0.4153 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000 0.000
#> SRR1033183 4 0.2100 0.8191 0.004 0.000 0.112 0.884 0.000 0.000
#> SRR1033182 4 0.1610 0.8510 0.084 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.3843 0.1460 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0865 0.9117 0.036 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0865 0.7663 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0547 0.7809 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.4756 0.1659 0.540 0.000 0.408 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0603 0.7414 0.004 0.000 0.980 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.4774 0.0590 0.420 0.000 0.528 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033204 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033206 4 0.3076 0.6920 0.240 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000
#> SRR1033207 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033209 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033210 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033211 4 0.0146 0.8915 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033212 3 0.0603 0.7413 0.004 0.000 0.980 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.3499 0.3803 0.320 0.680 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 1 0.6116 -0.0217 0.364 0.000 0.304 0.332 0.000 0.000
#> SRR1033218 4 0.2178 0.8120 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1033219 4 0.1957 0.8301 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 4 0.0260 0.8904 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033223 4 0.2581 0.7939 0.016 0.000 0.128 0.856 0.000 0.000
#> SRR1033225 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 4 0.4004 0.4528 0.368 0.000 0.012 0.620 0.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 4 0.3684 0.4693 0.000 0.000 0.372 0.628 0.000 0.000
#> SRR1033233 4 0.2003 0.8264 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.5250 0.2224 0.184 0.000 0.608 0.208 0.000 0.000
#> SRR1033236 4 0.3810 0.3336 0.000 0.000 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR1033237 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.1204 0.6935 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033239 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 4 0.3531 0.5481 0.000 0.000 0.328 0.672 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.3933 0.3554 0.248 0.000 0.716 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 4 0.3915 0.3485 0.412 0.000 0.004 0.584 0.000 0.000
#> SRR1033246 4 0.2883 0.7266 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1033248 4 0.3756 0.3884 0.400 0.000 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.3789 0.1612 0.416 0.584 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.3592 0.4321 0.656 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 4 0.0547 0.8860 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033254 4 0.3828 0.2647 0.440 0.000 0.000 0.560 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.5099 0.1323 0.496 0.000 0.080 0.424 0.000 0.000
#> SRR1033258 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.3558 0.3816 0.248 0.000 0.736 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3869 -0.0532 0.500 0.000 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.2300 0.8009 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR1033267 3 0.0790 0.7277 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.3782 0.2834 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.7921 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033270 3 0.0458 0.7423 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033271 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 4 0.2562 0.7713 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9707 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0146 0.8916 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033278 4 0.0000 0.8929 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.2793 0.6209 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0260 0.7905 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033281 4 0.3672 0.4678 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR1033282 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033283 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033284 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033285 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033286 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033287 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033288 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033289 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033290 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033291 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033292 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033293 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.850 0.941 0.956 0.4878 0.499 0.499
#> 3 3 1.000 0.975 0.991 0.1135 0.587 0.396
#> 4 4 0.914 0.934 0.970 0.3109 0.817 0.605
#> 5 5 0.880 0.836 0.924 0.0625 0.951 0.834
#> 6 6 0.852 0.760 0.880 0.0578 0.911 0.670
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 3
There is also optional best \(k\) = 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032911 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032912 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032913 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032914 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032915 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032916 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032917 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032919 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032920 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.1633 0.943 0.976 0.024
#> SRR1032922 1 0.4161 0.940 0.916 0.084
#> SRR1032923 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032925 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032926 1 0.6712 0.832 0.824 0.176
#> SRR1032927 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032929 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032928 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032930 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032931 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032932 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032933 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032934 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032935 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032936 2 0.6887 0.771 0.184 0.816
#> SRR1032937 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.1184 0.940 0.984 0.016
#> SRR1032939 1 0.9775 0.426 0.588 0.412
#> SRR1032940 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032941 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032942 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1032945 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032946 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032947 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032948 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032949 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.3879 0.946 0.924 0.076
#> SRR1032951 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032952 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032953 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032954 1 0.2043 0.945 0.968 0.032
#> SRR1032955 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032956 1 0.1633 0.943 0.976 0.024
#> SRR1032958 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032959 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032960 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032961 1 0.1414 0.942 0.980 0.020
#> SRR1032962 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032963 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032964 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032965 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032966 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032967 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032968 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032969 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032970 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032971 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032972 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032973 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032974 1 0.2948 0.949 0.948 0.052
#> SRR1032975 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032976 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032977 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032978 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032979 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032981 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032982 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032983 1 0.3879 0.939 0.924 0.076
#> SRR1032984 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032985 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032986 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032987 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032990 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032989 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032991 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.5737 0.905 0.864 0.136
#> SRR1032993 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032994 2 0.9815 0.194 0.420 0.580
#> SRR1032995 1 0.2043 0.947 0.968 0.032
#> SRR1032996 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032997 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1032998 1 0.6623 0.872 0.828 0.172
#> SRR1032999 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033000 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033001 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033002 1 0.3733 0.949 0.928 0.072
#> SRR1033003 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.4431 0.935 0.908 0.092
#> SRR1033006 2 0.2043 0.952 0.032 0.968
#> SRR1033007 2 0.6247 0.801 0.156 0.844
#> SRR1033008 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033009 1 0.1184 0.940 0.984 0.016
#> SRR1033010 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033011 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033013 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033014 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033015 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033018 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033019 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.5294 0.926 0.880 0.120
#> SRR1033021 2 0.4939 0.863 0.108 0.892
#> SRR1033023 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033022 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033024 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.3584 0.948 0.932 0.068
#> SRR1033026 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033029 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033030 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.4690 0.924 0.900 0.100
#> SRR1033032 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033036 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033037 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033038 2 0.8555 0.626 0.280 0.720
#> SRR1033039 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033040 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033041 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033042 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033043 1 0.0672 0.937 0.992 0.008
#> SRR1033044 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033045 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033046 2 0.5737 0.828 0.136 0.864
#> SRR1033047 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033048 2 0.8081 0.647 0.248 0.752
#> SRR1033049 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033051 1 0.3274 0.948 0.940 0.060
#> SRR1033052 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033053 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033054 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033055 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033056 2 0.9044 0.487 0.320 0.680
#> SRR1033057 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033058 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033060 2 0.9661 0.283 0.392 0.608
#> SRR1033061 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033062 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033063 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033064 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033066 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033067 1 0.2236 0.946 0.964 0.036
#> SRR1033068 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033070 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.1843 0.944 0.972 0.028
#> SRR1033075 1 0.8661 0.700 0.712 0.288
#> SRR1033076 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.1184 0.941 0.984 0.016
#> SRR1033078 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033079 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033080 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.5059 0.932 0.888 0.112
#> SRR1033082 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033083 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033085 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033088 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033089 2 0.7602 0.709 0.220 0.780
#> SRR1033090 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033091 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.4161 0.944 0.916 0.084
#> SRR1033093 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033096 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033098 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033101 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033103 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033104 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033106 2 0.7815 0.679 0.232 0.768
#> SRR1033107 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033109 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033110 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033112 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033113 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033115 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033116 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033117 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033118 1 0.4562 0.918 0.904 0.096
#> SRR1033119 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033121 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.5059 0.903 0.888 0.112
#> SRR1033123 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033124 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033125 2 0.2948 0.928 0.052 0.948
#> SRR1033126 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033127 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033129 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033130 1 0.5408 0.924 0.876 0.124
#> SRR1033131 1 0.4022 0.945 0.920 0.080
#> SRR1033132 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033133 2 0.1843 0.951 0.028 0.972
#> SRR1033134 1 0.0376 0.935 0.996 0.004
#> SRR1033135 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033137 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033138 1 0.5737 0.913 0.864 0.136
#> SRR1033140 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033141 1 0.4815 0.936 0.896 0.104
#> SRR1033142 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033144 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033145 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033146 1 0.5737 0.890 0.864 0.136
#> SRR1033147 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.1184 0.940 0.984 0.016
#> SRR1033149 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033150 2 0.3274 0.921 0.060 0.940
#> SRR1033151 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033152 2 0.9170 0.462 0.332 0.668
#> SRR1033153 2 0.1843 0.952 0.028 0.972
#> SRR1033154 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033156 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033158 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033159 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033160 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033163 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033162 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033164 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033165 2 0.6801 0.765 0.180 0.820
#> SRR1033166 1 0.6887 0.836 0.816 0.184
#> SRR1033167 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033168 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033172 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.4562 0.918 0.904 0.096
#> SRR1033175 1 0.2043 0.945 0.968 0.032
#> SRR1033176 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033177 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033181 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033183 1 0.2948 0.946 0.948 0.052
#> SRR1033182 1 0.5059 0.931 0.888 0.112
#> SRR1033184 2 0.0376 0.972 0.004 0.996
#> SRR1033185 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033187 2 0.3584 0.911 0.068 0.932
#> SRR1033186 2 0.7674 0.694 0.224 0.776
#> SRR1033188 2 0.6438 0.789 0.164 0.836
#> SRR1033189 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033191 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033192 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033193 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033195 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033196 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033200 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033201 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033202 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033203 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033205 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033207 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033208 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033209 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033210 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033211 2 0.1633 0.955 0.024 0.976
#> SRR1033212 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033216 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033215 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033217 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033219 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033221 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033223 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.1184 0.940 0.984 0.016
#> SRR1033226 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033227 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033231 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033232 2 0.0376 0.972 0.004 0.996
#> SRR1033233 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033235 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033234 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033236 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033237 1 0.6048 0.871 0.852 0.148
#> SRR1033238 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033240 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033239 2 0.2236 0.944 0.036 0.964
#> SRR1033242 2 0.1184 0.962 0.016 0.984
#> SRR1033241 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033245 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033246 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033248 1 0.9427 0.558 0.640 0.360
#> SRR1033247 2 0.6623 0.791 0.172 0.828
#> SRR1033249 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033252 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.2423 0.947 0.960 0.040
#> SRR1033254 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033256 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033255 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033257 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033259 1 0.0672 0.937 0.992 0.008
#> SRR1033260 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033261 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033262 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.1633 0.943 0.976 0.024
#> SRR1033265 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.8016 0.773 0.756 0.244
#> SRR1033267 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033269 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033270 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033272 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033274 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033276 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033278 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1033279 2 0.0672 0.969 0.008 0.992
#> SRR1033280 2 0.0000 0.975 0.000 1.000
#> SRR1033281 1 0.3431 0.948 0.936 0.064
#> SRR1033282 2 0.4161 0.903 0.084 0.916
#> SRR1033283 2 0.4161 0.903 0.084 0.916
#> SRR1033284 2 0.4161 0.903 0.084 0.916
#> SRR1033285 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033286 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033287 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033288 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033289 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033290 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033291 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033292 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
#> SRR1033293 2 0.0938 0.965 0.012 0.988
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032911 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032919 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032923 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032925 2 0.2165 0.908 0.000 0.936 0.064
#> SRR1032924 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032926 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032927 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032929 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032928 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032930 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032933 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032934 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032935 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032936 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032937 2 0.0892 0.971 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032938 1 0.0424 0.952 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032939 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032940 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032941 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032947 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032948 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.0592 0.982 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032950 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032951 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032952 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032960 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032963 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032966 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032968 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032970 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 3 0.3192 0.870 0.112 0.000 0.888
#> SRR1032975 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032977 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032981 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032982 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032984 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032986 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 3 0.1031 0.973 0.000 0.024 0.976
#> SRR1032988 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032989 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032993 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032995 3 0.4887 0.697 0.228 0.000 0.772
#> SRR1032996 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032997 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033001 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033002 3 0.1643 0.951 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033003 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 3 0.4887 0.706 0.000 0.228 0.772
#> SRR1033005 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033006 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033007 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033020 3 0.0592 0.985 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033021 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.2066 0.885 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033026 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.1031 0.933 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033044 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033046 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033047 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033048 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033056 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033061 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033069 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033076 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.5254 0.582 0.736 0.000 0.264
#> SRR1033078 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033081 3 0.0424 0.989 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033082 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033086 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033089 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033090 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.6154 0.338 0.592 0.000 0.408
#> SRR1033093 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033097 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033108 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033120 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033122 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 3 0.0592 0.985 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033131 1 0.6286 0.165 0.536 0.000 0.464
#> SRR1033132 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033133 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033134 1 0.1163 0.928 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033135 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033139 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033138 3 0.2066 0.933 0.060 0.000 0.940
#> SRR1033140 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033141 3 0.1860 0.942 0.052 0.000 0.948
#> SRR1033142 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.0592 0.947 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033149 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033151 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033152 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033153 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033161 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033165 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033166 1 0.2796 0.840 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033167 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033182 3 0.0237 0.993 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033184 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033186 1 0.6252 0.235 0.556 0.000 0.444
#> SRR1033188 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033189 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0424 0.952 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033201 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033210 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033212 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0237 0.992 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033214 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.0237 0.956 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033219 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033225 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0424 0.952 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033226 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033237 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033239 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033242 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033247 1 0.5058 0.611 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033249 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033259 1 0.1163 0.928 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033260 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.6180 0.320 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033265 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033267 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.997 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033278 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033279 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 3 0.0000 0.996 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 3 0.3764 0.7504 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1032923 4 0.1637 0.9007 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1032925 2 0.2868 0.8193 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1032924 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032926 4 0.4746 0.4175 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1032927 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032928 4 0.2589 0.8432 0.000 0.000 0.116 0.884
#> SRR1032930 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 4 0.3123 0.7900 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1032933 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032934 4 0.1302 0.9160 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1032935 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032936 3 0.3266 0.8181 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1032937 2 0.1118 0.9514 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 3 0.0817 0.9451 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1032940 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 3 0.3754 0.8585 0.000 0.064 0.852 0.084
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.0336 0.9465 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1032947 4 0.0921 0.9302 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1032948 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.0336 0.9824 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032950 3 0.5000 0.0243 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1032951 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032952 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032960 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032963 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 3 0.3552 0.8460 0.000 0.024 0.848 0.128
#> SRR1032968 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 4 0.3688 0.7265 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1032975 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 4 0.3764 0.7243 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1032977 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 4 0.4193 0.6442 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR1032984 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 3 0.4071 0.8381 0.000 0.104 0.832 0.064
#> SRR1032988 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032989 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.3074 0.8356 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1032993 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 3 0.1302 0.9325 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1032995 1 0.4994 0.0593 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1032996 4 0.1302 0.9160 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1032997 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 4 0.4605 0.5217 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033001 4 0.2530 0.8478 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1033002 3 0.4608 0.7984 0.104 0.000 0.800 0.096
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 3 0.4244 0.7856 0.000 0.168 0.800 0.032
#> SRR1033005 4 0.3266 0.7860 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1033006 3 0.2081 0.9027 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1033007 3 0.2408 0.8857 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 3 0.0804 0.9484 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1033021 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.1004 0.9552 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0188 0.9818 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033032 3 0.0817 0.9447 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0188 0.9819 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0376 0.9785 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0188 0.9538 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033046 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033047 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033061 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.2530 0.8776 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0592 0.9687 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033069 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 3 0.1940 0.9089 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033076 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.2011 0.9021 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033081 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033086 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0188 0.9818 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033089 3 0.3219 0.8211 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1033090 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033092 3 0.4981 0.1731 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033097 3 0.0188 0.9534 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0188 0.9866 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 4 0.3356 0.7754 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033122 4 0.3726 0.7299 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0188 0.9539 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 3 0.0657 0.9490 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1033131 3 0.4843 0.3731 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033133 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033134 1 0.0188 0.9821 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033139 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033138 3 0.1661 0.9156 0.052 0.000 0.944 0.004
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 3 0.1576 0.9204 0.048 0.000 0.948 0.004
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0188 0.9819 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033147 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033151 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033152 3 0.0592 0.9491 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033153 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 4 0.0707 0.9360 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1033163 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033165 3 0.0921 0.9430 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1033166 1 0.4250 0.5979 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0336 0.9827 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033171 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 4 0.3311 0.7801 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0188 0.9820 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033183 4 0.0336 0.9466 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033182 3 0.0657 0.9501 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1033184 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033186 3 0.3873 0.7115 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1033188 3 0.2469 0.8827 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1033189 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.1867 0.9102 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1033194 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0188 0.9820 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0817 0.9438 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033209 3 0.0592 0.9493 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033211 3 0.1118 0.9371 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.2149 0.8896 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1033214 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0336 0.9780 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0188 0.9539 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033225 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.0188 0.9539 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033227 3 0.0921 0.9415 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.2480 0.8683 0.088 0.000 0.008 0.904
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033237 3 0.4907 0.3087 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033239 3 0.0469 0.9509 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033242 3 0.2530 0.8788 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 3 0.0592 0.9493 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033247 3 0.5105 0.2699 0.432 0.000 0.564 0.004
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0336 0.9780 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.1118 0.9526 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033259 1 0.0524 0.9749 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4879 0.7339 0.780 0.000 0.092 0.128
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.1792 0.9153 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1033267 3 0.0817 0.9438 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9905 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033278 4 0.0000 0.9525 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033279 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.9551 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9856 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 3 0.3569 0.7822 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1033283 3 0.3569 0.7822 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1033284 3 0.3569 0.7822 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1033285 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033286 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033287 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033288 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033289 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033290 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033291 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033292 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033293 3 0.2647 0.8710 0.000 0.000 0.880 0.120
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.2605 0.79665 0.000 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1032911 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032915 4 0.2230 0.82228 0.000 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1032916 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032918 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 3 0.6662 0.05413 0.000 0.000 0.420 0.236 0.344
#> SRR1032923 4 0.2852 0.77777 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1032925 2 0.2338 0.79843 0.000 0.884 0.004 0.000 0.112
#> SRR1032924 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032926 4 0.5775 0.40821 0.000 0.000 0.136 0.600 0.264
#> SRR1032927 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032928 4 0.3355 0.75096 0.000 0.000 0.012 0.804 0.184
#> SRR1032930 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 4 0.4608 0.48225 0.000 0.000 0.024 0.640 0.336
#> SRR1032933 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032934 4 0.2648 0.79402 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1032935 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032936 3 0.6211 0.37743 0.000 0.000 0.544 0.192 0.264
#> SRR1032937 2 0.1484 0.88725 0.008 0.944 0.000 0.000 0.048
#> SRR1032938 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 3 0.4508 0.60130 0.000 0.000 0.648 0.020 0.332
#> SRR1032940 4 0.2488 0.81696 0.000 0.000 0.004 0.872 0.124
#> SRR1032941 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.7994 -0.26688 0.032 0.384 0.200 0.036 0.348
#> SRR1032943 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.2516 0.80345 0.000 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1032947 4 0.2890 0.78505 0.000 0.000 0.004 0.836 0.160
#> SRR1032948 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0963 0.90479 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1032950 4 0.6506 0.09368 0.000 0.000 0.216 0.476 0.308
#> SRR1032951 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032952 4 0.2377 0.81358 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1032953 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.1544 0.85294 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1032960 4 0.0880 0.87036 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1032961 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.1792 0.83672 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1032963 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032966 4 0.0290 0.87794 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032967 2 0.8222 -0.28994 0.044 0.368 0.200 0.040 0.348
#> SRR1032968 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.0609 0.87418 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1032970 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032974 4 0.4150 0.66152 0.180 0.000 0.004 0.772 0.044
#> SRR1032975 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032976 4 0.5852 0.37314 0.000 0.000 0.136 0.584 0.280
#> SRR1032977 4 0.1908 0.84144 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1032978 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.1792 0.84419 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1032981 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032982 4 0.0162 0.87892 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032983 4 0.5595 0.46058 0.000 0.000 0.124 0.624 0.252
#> SRR1032984 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.7057 -0.14611 0.000 0.456 0.184 0.028 0.332
#> SRR1032988 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.1544 0.84290 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1032989 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.6570 0.12818 0.000 0.000 0.440 0.212 0.348
#> SRR1032993 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032994 3 0.5160 0.53916 0.000 0.000 0.608 0.056 0.336
#> SRR1032995 4 0.4744 0.12718 0.476 0.000 0.000 0.508 0.016
#> SRR1032996 4 0.2732 0.78764 0.000 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1032997 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032998 4 0.5711 0.43974 0.000 0.000 0.136 0.612 0.252
#> SRR1032999 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 4 0.1341 0.86014 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1033001 4 0.4054 0.69662 0.000 0.000 0.036 0.760 0.204
#> SRR1033002 3 0.7329 0.32802 0.116 0.000 0.508 0.100 0.276
#> SRR1033003 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.6595 0.00987 0.000 0.520 0.160 0.016 0.304
#> SRR1033005 4 0.4898 0.58106 0.000 0.000 0.068 0.684 0.248
#> SRR1033006 3 0.5660 0.52880 0.000 0.000 0.612 0.124 0.264
#> SRR1033007 3 0.4733 0.56393 0.000 0.000 0.624 0.028 0.348
#> SRR1033008 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 4 0.0404 0.87300 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033014 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033015 3 0.0162 0.86749 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033016 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0794 0.86295 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033019 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033020 3 0.4975 0.60254 0.028 0.000 0.644 0.012 0.316
#> SRR1033021 3 0.4067 0.65606 0.000 0.000 0.692 0.008 0.300
#> SRR1033023 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033025 1 0.1731 0.90625 0.940 0.000 0.040 0.008 0.012
#> SRR1033026 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033027 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033031 1 0.0290 0.96560 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.4224 0.70866 0.000 0.000 0.744 0.040 0.216
#> SRR1033033 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0162 0.97039 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033040 3 0.1671 0.84017 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033041 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0162 0.97021 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033044 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.1830 0.84352 0.000 0.000 0.932 0.028 0.040
#> SRR1033046 3 0.4232 0.63821 0.000 0.000 0.676 0.012 0.312
#> SRR1033047 3 0.2388 0.82945 0.000 0.000 0.900 0.028 0.072
#> SRR1033048 3 0.4270 0.62759 0.000 0.000 0.668 0.012 0.320
#> SRR1033049 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033050 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033056 3 0.4288 0.62256 0.000 0.000 0.664 0.012 0.324
#> SRR1033057 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033059 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.4047 0.63648 0.000 0.000 0.676 0.004 0.320
#> SRR1033061 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033062 3 0.5798 0.44125 0.000 0.000 0.604 0.248 0.148
#> SRR1033063 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033065 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0609 0.95119 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033069 3 0.2377 0.80677 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033070 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033071 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033073 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033074 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 3 0.5246 0.51792 0.000 0.000 0.596 0.060 0.344
#> SRR1033076 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033077 1 0.2351 0.84839 0.896 0.000 0.000 0.088 0.016
#> SRR1033078 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033080 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033081 3 0.4739 0.61149 0.016 0.000 0.652 0.012 0.320
#> SRR1033082 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033084 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0865 0.85749 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1033086 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033087 1 0.0162 0.96996 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033089 3 0.6243 0.34957 0.000 0.000 0.544 0.240 0.216
#> SRR1033090 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033092 1 0.6252 -0.14336 0.444 0.000 0.436 0.008 0.112
#> SRR1033093 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0162 0.86749 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033095 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.86751 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033097 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033098 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033099 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033102 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033105 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 3 0.4047 0.63648 0.000 0.000 0.676 0.004 0.320
#> SRR1033107 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033108 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0290 0.96558 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0609 0.86480 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033111 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033114 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033117 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033118 4 0.5158 0.56511 0.000 0.000 0.100 0.676 0.224
#> SRR1033119 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033120 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033122 4 0.5464 0.50983 0.000 0.000 0.128 0.648 0.224
#> SRR1033123 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.1251 0.85575 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR1033126 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.0162 0.86760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033129 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033128 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 3 0.4912 0.60191 0.024 0.000 0.644 0.012 0.320
#> SRR1033131 3 0.6458 0.18992 0.372 0.000 0.484 0.012 0.132
#> SRR1033132 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033133 3 0.3461 0.73142 0.000 0.000 0.772 0.004 0.224
#> SRR1033134 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.86751 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0162 0.86760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033139 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033138 3 0.5028 0.62950 0.072 0.000 0.668 0.000 0.260
#> SRR1033140 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033141 3 0.5626 0.58413 0.104 0.000 0.640 0.008 0.248
#> SRR1033142 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0703 0.94575 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.86751 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0404 0.96122 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033147 3 0.0404 0.86701 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033148 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033150 3 0.4047 0.63648 0.000 0.000 0.676 0.004 0.320
#> SRR1033151 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033152 3 0.4323 0.61175 0.000 0.000 0.656 0.012 0.332
#> SRR1033153 3 0.2329 0.80786 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033154 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033157 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 3 0.0162 0.86760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033159 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033160 3 0.0000 0.86751 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 4 0.2920 0.80305 0.016 0.000 0.000 0.852 0.132
#> SRR1033163 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033162 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033165 3 0.4522 0.62053 0.000 0.000 0.660 0.024 0.316
#> SRR1033166 1 0.4558 0.54369 0.728 0.000 0.208 0.000 0.064
#> SRR1033167 2 0.0162 0.94025 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033168 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033169 2 0.0162 0.94025 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033171 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033170 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.86751 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 4 0.5153 0.57115 0.000 0.000 0.112 0.684 0.204
#> SRR1033175 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0404 0.96121 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033183 4 0.1300 0.86355 0.000 0.000 0.016 0.956 0.028
#> SRR1033182 3 0.4735 0.62764 0.024 0.000 0.664 0.008 0.304
#> SRR1033184 3 0.2929 0.77308 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1033185 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 3 0.4165 0.63210 0.000 0.000 0.672 0.008 0.320
#> SRR1033186 3 0.6135 0.39073 0.248 0.000 0.560 0.000 0.192
#> SRR1033188 3 0.4654 0.56997 0.000 0.000 0.628 0.024 0.348
#> SRR1033189 3 0.0162 0.86760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033190 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.2732 0.78403 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1033193 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033197 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0703 0.86321 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033199 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033202 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033203 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033204 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0404 0.86773 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033206 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033209 3 0.4084 0.62688 0.000 0.000 0.668 0.004 0.328
#> SRR1033210 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033211 3 0.4047 0.63648 0.000 0.000 0.676 0.004 0.320
#> SRR1033212 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033213 2 0.0404 0.92868 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0880 0.86982 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033216 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.0290 0.86759 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033217 3 0.0162 0.86760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033218 1 0.0290 0.96589 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.2230 0.81506 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033225 3 0.0162 0.86760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033224 1 0.0162 0.97010 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033226 3 0.3333 0.74434 0.000 0.000 0.788 0.004 0.208
#> SRR1033227 3 0.0290 0.86759 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033229 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.4493 0.69754 0.108 0.000 0.000 0.756 0.136
#> SRR1033231 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 3 0.3934 0.67773 0.000 0.000 0.716 0.008 0.276
#> SRR1033233 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0794 0.86165 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033236 3 0.0290 0.86763 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033237 4 0.6420 0.11302 0.000 0.000 0.192 0.484 0.324
#> SRR1033238 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033240 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033239 3 0.4047 0.63648 0.000 0.000 0.676 0.004 0.320
#> SRR1033242 3 0.4435 0.60032 0.000 0.000 0.648 0.016 0.336
#> SRR1033241 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033244 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0404 0.86698 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033246 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 3 0.4213 0.64281 0.000 0.000 0.680 0.012 0.308
#> SRR1033247 1 0.6205 0.05238 0.512 0.000 0.332 0.000 0.156
#> SRR1033249 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0963 0.93044 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.86751 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.1792 0.84426 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1033259 1 0.0324 0.96694 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033260 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033262 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033263 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4665 0.62312 0.752 0.000 0.008 0.084 0.156
#> SRR1033265 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.5052 0.54604 0.000 0.000 0.612 0.048 0.340
#> SRR1033267 3 0.2136 0.82699 0.000 0.000 0.904 0.008 0.088
#> SRR1033268 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0290 0.86735 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033270 3 0.0162 0.86727 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033271 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.94463 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.2020 0.83381 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1033278 4 0.0000 0.88002 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.2424 0.80249 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033280 3 0.1478 0.84488 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033281 1 0.0000 0.97398 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 5 0.2300 0.92324 0.000 0.000 0.040 0.052 0.908
#> SRR1033283 5 0.2300 0.92324 0.000 0.000 0.040 0.052 0.908
#> SRR1033284 5 0.2300 0.92324 0.000 0.000 0.040 0.052 0.908
#> SRR1033285 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033286 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033287 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033288 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033289 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033290 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033291 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033292 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033293 5 0.0290 0.97541 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.3419 0.8017 0.000 0.000 0.000 0.812 0.084 0.104
#> SRR1032911 4 0.0146 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032912 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 4 0.2852 0.8375 0.000 0.000 0.000 0.856 0.080 0.064
#> SRR1032916 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032919 4 0.0146 0.9121 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1032922 6 0.3156 0.6128 0.000 0.000 0.020 0.056 0.072 0.852
#> SRR1032923 4 0.3650 0.7811 0.000 0.000 0.000 0.792 0.092 0.116
#> SRR1032925 2 0.2549 0.8399 0.000 0.884 0.008 0.000 0.036 0.072
#> SRR1032924 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032926 6 0.4909 0.3591 0.000 0.000 0.012 0.244 0.084 0.660
#> SRR1032927 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032929 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032928 4 0.5144 0.3918 0.000 0.000 0.004 0.548 0.080 0.368
#> SRR1032930 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 4 0.5044 0.3519 0.000 0.000 0.000 0.536 0.080 0.384
#> SRR1032933 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032934 4 0.3458 0.7979 0.000 0.000 0.000 0.808 0.080 0.112
#> SRR1032935 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032936 6 0.3679 0.6186 0.000 0.000 0.060 0.036 0.084 0.820
#> SRR1032937 2 0.0951 0.9526 0.004 0.968 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1032938 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1032939 6 0.1649 0.6757 0.000 0.000 0.036 0.000 0.032 0.932
#> SRR1032940 4 0.3172 0.8194 0.000 0.000 0.000 0.832 0.076 0.092
#> SRR1032941 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 6 0.6444 0.1419 0.020 0.344 0.028 0.020 0.072 0.516
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.3325 0.8126 0.000 0.000 0.000 0.820 0.084 0.096
#> SRR1032947 4 0.4062 0.7138 0.000 0.000 0.000 0.744 0.080 0.176
#> SRR1032948 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0862 0.9549 0.000 0.972 0.008 0.000 0.016 0.004
#> SRR1032950 6 0.4203 0.5028 0.004 0.000 0.012 0.148 0.072 0.764
#> SRR1032951 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032952 4 0.3268 0.8115 0.000 0.000 0.000 0.824 0.076 0.100
#> SRR1032953 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032954 1 0.0363 0.9661 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1032958 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.2685 0.8543 0.000 0.000 0.000 0.868 0.060 0.072
#> SRR1032960 4 0.2384 0.8607 0.000 0.000 0.000 0.884 0.032 0.084
#> SRR1032961 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1032962 6 0.3464 0.2924 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1032963 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032966 4 0.0520 0.9095 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1032967 6 0.6656 0.1467 0.024 0.328 0.028 0.028 0.076 0.516
#> SRR1032968 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.1003 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.964 0.016 0.020
#> SRR1032970 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 4 0.4502 0.6097 0.204 0.000 0.000 0.720 0.028 0.048
#> SRR1032975 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 6 0.5062 0.3239 0.000 0.000 0.012 0.284 0.080 0.624
#> SRR1032977 4 0.1863 0.8796 0.000 0.000 0.000 0.920 0.044 0.036
#> SRR1032978 1 0.0260 0.9675 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.2442 0.8572 0.000 0.000 0.000 0.884 0.068 0.048
#> SRR1032981 4 0.0146 0.9121 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032982 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 6 0.4875 0.3304 0.000 0.000 0.008 0.264 0.080 0.648
#> SRR1032984 4 0.0363 0.9104 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032985 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032986 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 6 0.6191 0.0881 0.000 0.396 0.032 0.024 0.072 0.476
#> SRR1032988 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032990 6 0.3854 -0.2973 0.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1032989 4 0.0260 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 6 0.3141 0.6296 0.000 0.000 0.028 0.052 0.064 0.856
#> SRR1032993 4 0.0146 0.9121 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032994 6 0.2620 0.6566 0.000 0.000 0.032 0.028 0.052 0.888
#> SRR1032995 1 0.4587 0.3028 0.588 0.000 0.000 0.372 0.004 0.036
#> SRR1032996 4 0.3225 0.8147 0.000 0.000 0.000 0.828 0.080 0.092
#> SRR1032997 4 0.0146 0.9121 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032998 6 0.4784 0.3630 0.000 0.000 0.016 0.260 0.060 0.664
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 4 0.1498 0.8902 0.000 0.000 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1033001 4 0.5071 0.3371 0.000 0.000 0.000 0.520 0.080 0.400
#> SRR1033002 6 0.3590 0.5829 0.116 0.000 0.020 0.016 0.024 0.824
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.5799 0.1040 0.000 0.496 0.032 0.008 0.064 0.400
#> SRR1033005 6 0.5103 0.0322 0.000 0.000 0.004 0.392 0.072 0.532
#> SRR1033006 6 0.3758 0.6465 0.000 0.000 0.068 0.040 0.076 0.816
#> SRR1033007 6 0.3324 0.6668 0.000 0.000 0.076 0.008 0.084 0.832
#> SRR1033008 1 0.0146 0.9690 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033009 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033010 4 0.1501 0.8659 0.000 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033013 3 0.0291 0.7227 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033014 3 0.0458 0.7264 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033015 3 0.3531 0.6130 0.000 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 6 0.4097 -0.2473 0.000 0.000 0.492 0.000 0.008 0.500
#> SRR1033019 3 0.0458 0.7271 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033020 6 0.1531 0.6679 0.004 0.000 0.068 0.000 0.000 0.928
#> SRR1033021 6 0.2146 0.6332 0.000 0.000 0.116 0.000 0.004 0.880
#> SRR1033023 1 0.0260 0.9703 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033022 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033024 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.1787 0.8930 0.920 0.000 0.008 0.004 0.000 0.068
#> SRR1033026 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.0260 0.9114 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0363 0.7261 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033031 1 0.0363 0.9673 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033032 6 0.3926 0.6045 0.000 0.000 0.176 0.016 0.040 0.768
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0146 0.9700 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033036 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0935 0.9429 0.964 0.000 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033039 3 0.0547 0.7273 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033040 6 0.3547 0.1919 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1033041 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033042 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033043 1 0.0767 0.9593 0.976 0.000 0.000 0.004 0.008 0.012
#> SRR1033044 1 0.0146 0.9689 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033045 6 0.4758 0.0856 0.000 0.000 0.404 0.008 0.036 0.552
#> SRR1033046 6 0.1588 0.6699 0.000 0.000 0.072 0.004 0.000 0.924
#> SRR1033047 6 0.4585 0.3643 0.000 0.000 0.304 0.008 0.044 0.644
#> SRR1033048 6 0.1327 0.6701 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1033049 1 0.0146 0.9700 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033051 1 0.0260 0.9675 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033052 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.3823 0.4966 0.000 0.000 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0363 0.7261 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033056 6 0.1584 0.6719 0.000 0.000 0.064 0.000 0.008 0.928
#> SRR1033057 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033058 3 0.0260 0.7248 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 6 0.1387 0.6686 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1033061 3 0.3860 0.4358 0.000 0.000 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1033062 6 0.5438 0.5743 0.000 0.000 0.124 0.112 0.084 0.680
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.3221 0.6587 0.000 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1033065 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033066 1 0.0806 0.9606 0.972 0.000 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033067 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033068 3 0.3851 0.4589 0.000 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1033069 6 0.3371 0.3598 0.000 0.000 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1033070 3 0.3531 0.6104 0.000 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.3854 0.4527 0.000 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1033073 3 0.3547 0.6011 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1033074 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033075 6 0.2407 0.6759 0.000 0.000 0.048 0.004 0.056 0.892
#> SRR1033076 3 0.3860 0.4400 0.000 0.000 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1033077 1 0.1874 0.9123 0.928 0.000 0.000 0.028 0.016 0.028
#> SRR1033078 1 0.0146 0.9689 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033079 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0547 0.7275 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033081 6 0.1411 0.6718 0.004 0.000 0.060 0.000 0.000 0.936
#> SRR1033082 1 0.0146 0.9700 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033083 3 0.0260 0.7244 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033084 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033085 3 0.3565 0.6170 0.000 0.000 0.716 0.004 0.004 0.276
#> SRR1033086 3 0.3833 0.4797 0.000 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1033087 1 0.0458 0.9685 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033088 3 0.0363 0.7261 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033089 6 0.4391 0.5951 0.000 0.000 0.072 0.072 0.084 0.772
#> SRR1033090 4 0.0000 0.9124 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0713 0.7295 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033092 6 0.4310 0.1864 0.440 0.000 0.020 0.000 0.000 0.540
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.3817 0.4920 0.000 0.000 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.3672 0.5640 0.000 0.000 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1033097 3 0.3847 0.4625 0.000 0.000 0.544 0.000 0.000 0.456
#> SRR1033098 3 0.0865 0.7307 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.2562 0.7010 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033104 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033106 6 0.1387 0.6686 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1033107 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.0603 0.9091 0.000 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1033109 1 0.0547 0.9620 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033110 3 0.3851 0.4655 0.000 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1033111 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033112 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033113 3 0.3867 0.4147 0.000 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1033114 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033115 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033116 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0146 0.7233 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033118 6 0.5497 -0.0805 0.000 0.000 0.012 0.432 0.088 0.468
#> SRR1033119 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033121 3 0.1141 0.7299 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033120 3 0.3866 0.4214 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1033122 6 0.5573 -0.0647 0.000 0.000 0.016 0.428 0.088 0.468
#> SRR1033123 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033124 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033125 6 0.3843 -0.2663 0.000 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1033126 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033127 3 0.1714 0.7239 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033129 3 0.0146 0.7231 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033128 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033130 6 0.1387 0.6686 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1033131 6 0.4186 0.3853 0.312 0.000 0.032 0.000 0.000 0.656
#> SRR1033132 3 0.3868 0.3947 0.000 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1033133 6 0.3823 -0.2119 0.000 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1033134 1 0.0653 0.9618 0.980 0.000 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR1033135 3 0.2697 0.6953 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033136 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033137 3 0.3765 0.5355 0.000 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1033139 3 0.3862 0.4341 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1033138 6 0.2923 0.6377 0.052 0.000 0.100 0.000 0.000 0.848
#> SRR1033140 3 0.1267 0.7301 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033141 6 0.2384 0.6579 0.048 0.000 0.064 0.000 0.000 0.888
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0865 0.9538 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033145 3 0.3563 0.6022 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1033146 1 0.1124 0.9425 0.956 0.000 0.008 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033147 6 0.3864 -0.3500 0.000 0.000 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1033148 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033149 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 6 0.1387 0.6686 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1033151 3 0.3860 0.4451 0.000 0.000 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1033152 6 0.1462 0.6736 0.000 0.000 0.056 0.000 0.008 0.936
#> SRR1033153 6 0.3789 -0.1403 0.000 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1033154 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033156 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033158 3 0.3765 0.5268 0.000 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1033159 3 0.0547 0.7283 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033160 3 0.2562 0.7024 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033161 4 0.3674 0.8076 0.012 0.000 0.000 0.808 0.084 0.096
#> SRR1033163 3 0.3862 0.4391 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1033162 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033164 3 0.3862 0.4354 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1033165 6 0.3410 0.6644 0.000 0.000 0.100 0.004 0.076 0.820
#> SRR1033166 1 0.3990 0.5193 0.688 0.000 0.028 0.000 0.000 0.284
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.3828 0.4935 0.000 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.3862 0.4362 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000 0.476
#> SRR1033170 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033172 3 0.2092 0.7183 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 6 0.5430 0.0346 0.000 0.000 0.012 0.400 0.084 0.504
#> SRR1033175 1 0.0363 0.9661 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033176 1 0.0146 0.9702 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033181 1 0.0790 0.9514 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033183 4 0.4078 0.5038 0.000 0.000 0.000 0.640 0.020 0.340
#> SRR1033182 6 0.1531 0.6681 0.004 0.000 0.068 0.000 0.000 0.928
#> SRR1033184 6 0.2912 0.4895 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1033185 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033187 6 0.1387 0.6686 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1033186 6 0.4668 0.3752 0.316 0.000 0.064 0.000 0.000 0.620
#> SRR1033188 6 0.3428 0.6674 0.000 0.000 0.084 0.008 0.084 0.824
#> SRR1033189 3 0.3052 0.6769 0.000 0.000 0.780 0.004 0.000 0.216
#> SRR1033190 1 0.0146 0.9700 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033191 1 0.0363 0.9699 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033192 6 0.2823 0.5329 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1033193 1 0.0146 0.9702 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033195 2 0.0146 0.9777 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.3864 0.4286 0.000 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1033197 1 0.0146 0.9700 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033196 3 0.3868 0.3975 0.000 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0717 0.9577 0.976 0.000 0.008 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033201 3 0.0790 0.7303 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033202 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.2454 0.7087 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.1802 0.7243 0.000 0.000 0.916 0.000 0.012 0.072
#> SRR1033206 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033207 1 0.0146 0.9702 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033208 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 6 0.3321 0.6635 0.000 0.000 0.100 0.000 0.080 0.820
#> SRR1033210 3 0.0547 0.7287 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033211 6 0.1387 0.6686 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1033212 3 0.0146 0.7233 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033213 2 0.0909 0.9416 0.000 0.968 0.012 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033214 4 0.2250 0.8722 0.000 0.000 0.000 0.896 0.040 0.064
#> SRR1033216 1 0.0260 0.9674 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033215 3 0.1663 0.7256 0.000 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033217 3 0.3531 0.6054 0.000 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033218 1 0.0725 0.9558 0.976 0.000 0.012 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033219 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.4262 0.3933 0.000 0.000 0.508 0.000 0.016 0.476
#> SRR1033225 3 0.3221 0.6528 0.000 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1033224 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033226 6 0.3717 -0.0147 0.000 0.000 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1033227 3 0.1779 0.7236 0.000 0.000 0.920 0.000 0.016 0.064
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.5345 0.6428 0.132 0.000 0.000 0.688 0.084 0.096
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0146 0.9702 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033232 6 0.3470 0.6350 0.000 0.000 0.152 0.000 0.052 0.796
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.3930 0.5148 0.000 0.000 0.576 0.000 0.004 0.420
#> SRR1033236 3 0.3706 0.5566 0.000 0.000 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033237 6 0.4305 0.5197 0.000 0.000 0.016 0.148 0.084 0.752
#> SRR1033238 3 0.1204 0.7301 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033240 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 6 0.1387 0.6686 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1033242 6 0.3724 0.6537 0.000 0.000 0.096 0.012 0.088 0.804
#> SRR1033241 3 0.1714 0.7255 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.4385 0.4327 0.000 0.000 0.532 0.000 0.024 0.444
#> SRR1033246 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033248 6 0.1327 0.6701 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1033247 1 0.4453 0.1004 0.528 0.000 0.028 0.000 0.000 0.444
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.1196 0.9368 0.952 0.000 0.008 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0508 0.9644 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033254 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.3499 0.6130 0.000 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9696 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.2563 0.8595 0.000 0.000 0.000 0.876 0.052 0.072
#> SRR1033259 1 0.0653 0.9618 0.980 0.000 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0632 0.7290 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4510 0.6779 0.764 0.000 0.004 0.048 0.072 0.112
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 6 0.2605 0.6635 0.000 0.000 0.040 0.012 0.064 0.884
#> SRR1033267 3 0.4079 0.6397 0.000 0.000 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1033268 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033269 3 0.3868 0.3969 0.000 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1033270 3 0.0000 0.7211 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0363 0.9109 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9834 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.2897 0.8404 0.000 0.000 0.000 0.852 0.060 0.088
#> SRR1033278 4 0.0363 0.9109 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033279 6 0.3804 -0.1669 0.000 0.000 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1033280 6 0.3868 -0.3901 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1033281 1 0.0260 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033282 5 0.3772 0.7915 0.000 0.000 0.008 0.040 0.772 0.180
#> SRR1033283 5 0.3772 0.7915 0.000 0.000 0.008 0.040 0.772 0.180
#> SRR1033284 5 0.3772 0.7915 0.000 0.000 0.008 0.040 0.772 0.180
#> SRR1033285 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033286 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033287 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033288 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033289 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033290 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033291 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033292 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033293 5 0.0146 0.9405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.999 0.959 0.983 0.4976 0.502 0.502
#> 3 3 0.917 0.913 0.963 0.3147 0.799 0.617
#> 4 4 0.749 0.798 0.879 0.0996 0.914 0.763
#> 5 5 0.683 0.684 0.821 0.0771 0.899 0.675
#> 6 6 0.666 0.582 0.756 0.0386 0.945 0.781
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032917 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.8016 0.6863 0.244 0.756
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0938 0.9776 0.988 0.012
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032925 1 0.0672 0.9812 0.992 0.008
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032926 2 0.9998 0.0429 0.492 0.508
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032931 1 0.9087 0.5196 0.676 0.324
#> SRR1032932 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032936 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1032937 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.5737 0.8395 0.864 0.136
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032943 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032949 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032955 1 0.7056 0.7601 0.808 0.192
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0376 0.9847 0.996 0.004
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032979 1 0.6712 0.7838 0.824 0.176
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032983 2 0.7674 0.7188 0.224 0.776
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.4022 0.9029 0.080 0.920
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032990 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.7528 0.7299 0.216 0.784
#> SRR1032992 1 0.3274 0.9299 0.940 0.060
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032994 2 0.9608 0.3899 0.384 0.616
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.3879 0.9123 0.924 0.076
#> SRR1032999 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033000 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033003 1 0.0376 0.9847 0.996 0.004
#> SRR1033004 2 0.4690 0.8815 0.100 0.900
#> SRR1033005 1 0.0672 0.9813 0.992 0.008
#> SRR1033006 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033007 2 0.3274 0.9230 0.060 0.940
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033010 2 0.8443 0.6367 0.272 0.728
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033013 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033014 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033015 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033018 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033019 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033021 2 0.9922 0.2014 0.448 0.552
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033024 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033026 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033028 2 0.9983 0.1162 0.476 0.524
#> SRR1033029 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033030 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033039 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033040 2 0.1843 0.9533 0.028 0.972
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033045 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033046 2 0.4939 0.8727 0.108 0.892
#> SRR1033047 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033048 1 0.7453 0.7297 0.788 0.212
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033054 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033055 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.8909 0.5528 0.692 0.308
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033058 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.1843 0.9624 0.972 0.028
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033062 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033064 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033068 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033069 2 0.0376 0.9734 0.004 0.996
#> SRR1033070 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0672 0.9813 0.992 0.008
#> SRR1033076 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033079 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033080 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033083 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033085 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033088 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033089 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033091 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033096 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033098 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033101 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033104 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.2423 0.9505 0.960 0.040
#> SRR1033107 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033110 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033113 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033116 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033117 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033118 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033121 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033122 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033125 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033129 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033132 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033133 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033135 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033137 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033140 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033145 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033149 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.8081 0.6688 0.752 0.248
#> SRR1033151 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033153 2 0.0376 0.9734 0.004 0.996
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033156 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033159 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033160 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033163 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033165 2 0.1414 0.9602 0.020 0.980
#> SRR1033166 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0672 0.9702 0.008 0.992
#> SRR1033168 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033172 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033174 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.1184 0.9637 0.016 0.984
#> SRR1033179 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033183 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033184 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0672 0.9813 0.992 0.008
#> SRR1033186 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033188 2 0.4431 0.8899 0.092 0.908
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.3879 0.9068 0.076 0.924
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033196 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033201 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033202 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033203 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033205 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033208 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033209 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033210 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033211 1 0.1184 0.9740 0.984 0.016
#> SRR1033212 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033217 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.9661 0.3731 0.392 0.608
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033223 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033226 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033227 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033232 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033234 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033236 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033238 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033240 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033239 1 0.9933 0.1605 0.548 0.452
#> SRR1033242 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033241 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033245 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.2778 0.9423 0.952 0.048
#> SRR1033247 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033255 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033261 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033262 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033267 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033269 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033270 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.8267 0.6579 0.260 0.740
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033279 2 0.2043 0.9496 0.032 0.968
#> SRR1033280 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.9882 1.000 0.000
#> SRR1033285 2 0.0376 0.9734 0.004 0.996
#> SRR1033286 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033287 2 0.0376 0.9734 0.004 0.996
#> SRR1033288 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033289 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033290 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000
#> SRR1033291 2 0.0376 0.9734 0.004 0.996
#> SRR1033292 2 0.1184 0.9638 0.016 0.984
#> SRR1033293 2 0.0376 0.9734 0.004 0.996
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032911 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032912 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032913 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032914 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032915 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032916 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032919 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.2066 0.9058 0.000 0.940 0.060
#> SRR1032921 1 0.0892 0.9521 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032922 2 0.1411 0.9302 0.036 0.964 0.000
#> SRR1032923 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032926 2 0.4887 0.6869 0.000 0.772 0.228
#> SRR1032927 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032929 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032928 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032930 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032933 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032934 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032935 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032936 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032937 2 0.0747 0.9479 0.016 0.984 0.000
#> SRR1032938 1 0.1289 0.9425 0.968 0.032 0.000
#> SRR1032939 1 0.3112 0.8632 0.900 0.004 0.096
#> SRR1032940 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032941 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032945 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032946 2 0.0237 0.9570 0.004 0.996 0.000
#> SRR1032947 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032948 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 2 0.4235 0.7755 0.176 0.824 0.000
#> SRR1032951 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032952 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032953 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.1529 0.9348 0.960 0.040 0.000
#> SRR1032955 2 0.0424 0.9538 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032957 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.1031 0.9490 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032958 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032959 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032960 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.1163 0.9457 0.972 0.028 0.000
#> SRR1032962 3 0.0424 0.9580 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032963 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032964 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032965 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032966 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0747 0.9478 0.016 0.984 0.000
#> SRR1032968 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032969 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032970 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032971 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032972 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032973 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032974 2 0.4452 0.7527 0.192 0.808 0.000
#> SRR1032975 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032976 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0747 0.9549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032981 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032982 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032983 2 0.0424 0.9538 0.000 0.992 0.008
#> SRR1032984 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032985 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032986 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0747 0.9467 0.000 0.984 0.016
#> SRR1032988 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0424 0.9580 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032989 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 2 0.9972 0.1308 0.300 0.364 0.336
#> SRR1032993 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032994 3 0.3993 0.8744 0.064 0.052 0.884
#> SRR1032995 2 0.5706 0.5331 0.320 0.680 0.000
#> SRR1032996 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032997 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032998 2 0.5207 0.8035 0.124 0.824 0.052
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033001 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.1163 0.9460 0.972 0.028 0.000
#> SRR1033003 2 0.1289 0.9344 0.032 0.968 0.000
#> SRR1033004 2 0.0424 0.9534 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033005 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033007 3 0.0747 0.9526 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033008 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033009 1 0.0892 0.9521 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033010 2 0.0424 0.9534 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033011 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033016 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033017 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033018 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.5760 0.5064 0.672 0.000 0.328
#> SRR1033023 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033027 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033028 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033029 1 0.0747 0.9513 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033033 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033035 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033034 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0592 0.9571 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 1 0.3752 0.8095 0.856 0.000 0.144
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033044 1 0.0747 0.9549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033046 1 0.6225 0.2239 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033047 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033048 1 0.2066 0.9080 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033049 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033051 1 0.0592 0.9571 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 3 0.0592 0.9563 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033054 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.5553 0.6170 0.724 0.004 0.272
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033059 3 0.0592 0.9563 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 3 0.0592 0.9563 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033062 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033063 3 0.0592 0.9563 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0592 0.9571 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033069 3 0.4654 0.7460 0.208 0.000 0.792
#> SRR1033070 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033071 3 0.0592 0.9563 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033072 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0747 0.9549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033075 1 0.0848 0.9555 0.984 0.008 0.008
#> SRR1033076 3 0.0237 0.9599 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033077 1 0.0747 0.9552 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033078 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033086 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033089 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033090 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.0592 0.9571 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033093 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033094 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033095 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033096 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033097 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033099 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033100 3 0.0424 0.9584 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033101 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033108 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 3 0.4842 0.7055 0.000 0.224 0.776
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033120 3 0.0592 0.9563 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033122 3 0.1163 0.9409 0.000 0.028 0.972
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033125 3 0.5621 0.5805 0.308 0.000 0.692
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.6079 0.3868 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033133 3 0.6309 0.0417 0.496 0.000 0.504
#> SRR1033134 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033139 3 0.0237 0.9599 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033138 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033141 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033142 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.6235 0.2010 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033148 1 0.0747 0.9549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 3 0.0237 0.9599 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.3116 0.8519 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033161 2 0.1964 0.9118 0.056 0.944 0.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033165 3 0.0424 0.9577 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033166 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033167 3 0.4346 0.7849 0.184 0.000 0.816
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033169 3 0.0747 0.9537 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033171 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033174 3 0.4504 0.7474 0.000 0.196 0.804
#> SRR1033175 1 0.0592 0.9571 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033178 3 0.3690 0.8610 0.016 0.100 0.884
#> SRR1033179 1 0.6295 0.0801 0.528 0.472 0.000
#> SRR1033180 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 2 0.6308 0.0225 0.000 0.508 0.492
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.4178 0.7950 0.172 0.000 0.828
#> SRR1033185 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033187 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 3 0.2261 0.9104 0.068 0.000 0.932
#> SRR1033189 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.6295 0.0685 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033194 3 0.0592 0.9563 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033197 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033196 3 0.1753 0.9278 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033199 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0747 0.9549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033200 1 0.0747 0.9549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033205 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033207 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 3 0.0592 0.9551 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033214 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 3 0.7301 0.5049 0.308 0.052 0.640
#> SRR1033220 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033223 3 0.1860 0.9233 0.052 0.000 0.948
#> SRR1033225 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.1031 0.9490 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033226 1 0.5216 0.6350 0.740 0.000 0.260
#> SRR1033227 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033229 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.6305 0.0617 0.516 0.484 0.000
#> SRR1033231 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033232 3 0.0424 0.9579 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033233 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033235 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033237 1 0.4291 0.7654 0.820 0.180 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033244 3 0.0592 0.9541 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033243 3 0.0237 0.9599 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033245 3 0.0237 0.9599 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0592 0.9571 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033247 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033250 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0892 0.9521 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033254 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033256 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033257 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0747 0.9549 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033260 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033263 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.3482 0.8407 0.872 0.128 0.000
#> SRR1033265 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0848 0.9555 0.984 0.008 0.008
#> SRR1033267 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9596 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0747 0.9525 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0424 0.9589 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033272 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033274 3 0.0000 0.9617 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033275 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033276 3 0.6161 0.5957 0.020 0.272 0.708
#> SRR1033277 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033278 2 0.0000 0.9599 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.6225 0.2597 0.432 0.000 0.568
#> SRR1033280 3 0.2356 0.9054 0.072 0.000 0.928
#> SRR1033281 1 0.0237 0.9596 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033282 2 0.6299 0.0721 0.476 0.524 0.000
#> SRR1033283 2 0.5706 0.5147 0.320 0.680 0.000
#> SRR1033284 2 0.6215 0.2356 0.428 0.572 0.000
#> SRR1033285 3 0.5058 0.6882 0.244 0.000 0.756
#> SRR1033286 3 0.4750 0.7322 0.216 0.000 0.784
#> SRR1033287 3 0.5098 0.6816 0.248 0.000 0.752
#> SRR1033288 3 0.5621 0.5719 0.308 0.000 0.692
#> SRR1033289 3 0.4399 0.7724 0.188 0.000 0.812
#> SRR1033290 3 0.3879 0.8189 0.152 0.000 0.848
#> SRR1033291 3 0.2448 0.9014 0.076 0.000 0.924
#> SRR1033292 3 0.4121 0.7990 0.168 0.000 0.832
#> SRR1033293 3 0.2711 0.8899 0.088 0.000 0.912
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.1909 0.8768 0.008 0.048 0.004 0.940
#> SRR1032911 4 0.0336 0.9020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032912 4 0.0336 0.9006 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032913 4 0.0336 0.9020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032914 4 0.0188 0.9023 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1032915 4 0.0000 0.9019 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0592 0.9005 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1032917 3 0.2345 0.8126 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1032918 4 0.0524 0.9003 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1032919 4 0.0657 0.9009 0.000 0.012 0.004 0.984
#> SRR1032920 4 0.4312 0.7592 0.000 0.132 0.056 0.812
#> SRR1032921 1 0.0188 0.9431 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032922 4 0.7209 0.5578 0.068 0.108 0.168 0.656
#> SRR1032923 4 0.1398 0.8859 0.004 0.040 0.000 0.956
#> SRR1032925 4 0.4830 0.3483 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1032924 4 0.0524 0.9024 0.004 0.008 0.000 0.988
#> SRR1032926 4 0.6796 0.2237 0.004 0.088 0.384 0.524
#> SRR1032927 4 0.0524 0.9020 0.004 0.008 0.000 0.988
#> SRR1032929 4 0.0672 0.8993 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1032928 4 0.3029 0.8452 0.008 0.068 0.028 0.896
#> SRR1032930 4 0.0336 0.9022 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032931 2 0.4522 0.4603 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1032932 4 0.2408 0.8348 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1032933 4 0.0336 0.9020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032934 4 0.1305 0.8871 0.000 0.036 0.004 0.960
#> SRR1032935 4 0.0336 0.9020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032936 3 0.2179 0.8163 0.000 0.064 0.924 0.012
#> SRR1032937 4 0.5954 0.3832 0.052 0.344 0.000 0.604
#> SRR1032938 1 0.1406 0.9242 0.960 0.024 0.000 0.016
#> SRR1032939 1 0.5913 0.6271 0.696 0.124 0.180 0.000
#> SRR1032940 4 0.0592 0.9006 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1032941 4 0.0336 0.9020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032942 4 0.1042 0.8978 0.008 0.020 0.000 0.972
#> SRR1032943 4 0.4155 0.6568 0.004 0.240 0.000 0.756
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032946 4 0.2739 0.8514 0.036 0.060 0.000 0.904
#> SRR1032947 4 0.1807 0.8747 0.000 0.052 0.008 0.940
#> SRR1032948 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032949 4 0.4511 0.6015 0.008 0.268 0.000 0.724
#> SRR1032950 4 0.8134 0.4473 0.192 0.108 0.120 0.580
#> SRR1032951 4 0.0524 0.9016 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1032952 4 0.1452 0.8848 0.000 0.036 0.008 0.956
#> SRR1032953 4 0.0657 0.9020 0.004 0.012 0.000 0.984
#> SRR1032954 1 0.2197 0.8988 0.928 0.048 0.000 0.024
#> SRR1032955 4 0.4985 0.1289 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1032957 4 0.0592 0.9023 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1032956 1 0.0524 0.9404 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1032958 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032959 4 0.1174 0.8951 0.020 0.012 0.000 0.968
#> SRR1032960 4 0.0672 0.9004 0.000 0.008 0.008 0.984
#> SRR1032961 1 0.1059 0.9320 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1032962 3 0.2976 0.7846 0.008 0.120 0.872 0.000
#> SRR1032963 4 0.0592 0.9005 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1032964 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032965 4 0.0672 0.8993 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1032966 4 0.0000 0.9019 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 4 0.3013 0.8238 0.080 0.032 0.000 0.888
#> SRR1032968 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032969 4 0.0592 0.9006 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1032970 4 0.0188 0.9013 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1032971 4 0.0707 0.8988 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1032972 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032973 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032974 4 0.4914 0.5071 0.312 0.012 0.000 0.676
#> SRR1032975 4 0.0336 0.9020 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032976 4 0.3959 0.8086 0.024 0.052 0.064 0.860
#> SRR1032977 4 0.0817 0.8968 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1032978 1 0.0376 0.9424 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1032979 4 0.4933 0.2370 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1032980 4 0.0336 0.9006 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032981 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032982 4 0.0188 0.9013 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1032983 4 0.5312 0.6407 0.004 0.068 0.184 0.744
#> SRR1032984 4 0.0188 0.9013 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1032985 4 0.0524 0.9003 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1032986 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032987 2 0.4948 0.1549 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1032988 4 0.0376 0.9011 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1032990 3 0.3219 0.7838 0.020 0.112 0.868 0.000
#> SRR1032989 4 0.0376 0.9024 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1032991 2 0.5189 0.3330 0.000 0.616 0.012 0.372
#> SRR1032992 3 0.9620 0.0342 0.184 0.188 0.392 0.236
#> SRR1032993 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032994 3 0.5140 0.7246 0.040 0.132 0.788 0.040
#> SRR1032995 4 0.6299 0.2304 0.420 0.060 0.000 0.520
#> SRR1032996 4 0.1151 0.8936 0.008 0.024 0.000 0.968
#> SRR1032997 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032998 4 0.6870 0.5070 0.012 0.176 0.176 0.636
#> SRR1032999 4 0.0817 0.8972 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033000 4 0.0817 0.8968 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033001 4 0.2586 0.8587 0.012 0.068 0.008 0.912
#> SRR1033002 1 0.1617 0.9270 0.956 0.024 0.008 0.012
#> SRR1033003 2 0.6288 0.2990 0.048 0.572 0.008 0.372
#> SRR1033004 2 0.4941 0.1657 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033005 4 0.2840 0.8339 0.000 0.044 0.056 0.900
#> SRR1033006 3 0.2775 0.8054 0.000 0.084 0.896 0.020
#> SRR1033007 3 0.4725 0.7361 0.072 0.100 0.812 0.016
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0672 0.9385 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1033010 4 0.1677 0.8804 0.000 0.040 0.012 0.948
#> SRR1033011 2 0.2704 0.8402 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1033012 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.2831 0.8145 0.000 0.120 0.876 0.004
#> SRR1033014 3 0.1211 0.8261 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1033015 3 0.1302 0.8176 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1033016 2 0.2704 0.8402 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR1033017 2 0.2831 0.8410 0.004 0.876 0.120 0.000
#> SRR1033018 3 0.1211 0.8286 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1033019 3 0.1716 0.8246 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1033020 1 0.0657 0.9411 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1033021 3 0.6391 0.4356 0.304 0.092 0.604 0.000
#> SRR1033023 1 0.0188 0.9439 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033022 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.2345 0.8105 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1033025 1 0.0895 0.9368 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1033026 3 0.2011 0.8180 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1033027 2 0.2647 0.8413 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1033028 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033029 1 0.3462 0.8339 0.860 0.116 0.004 0.020
#> SRR1033030 3 0.2216 0.8121 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.1209 0.8224 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1033033 2 0.2530 0.8427 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033035 2 0.2589 0.8422 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0779 0.9392 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1033037 1 0.0188 0.9439 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033038 1 0.0188 0.9434 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.1302 0.8247 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1033040 1 0.5466 0.5464 0.668 0.040 0.292 0.000
#> SRR1033041 1 0.0524 0.9423 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0188 0.9440 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0188 0.9436 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.1557 0.8244 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1033046 3 0.6334 0.5216 0.260 0.076 0.652 0.012
#> SRR1033047 3 0.1637 0.8272 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1033048 1 0.3308 0.8394 0.872 0.036 0.092 0.000
#> SRR1033049 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.2654 0.8409 0.004 0.888 0.108 0.000
#> SRR1033054 3 0.1940 0.8093 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0469 0.8265 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033056 1 0.6851 0.4433 0.584 0.148 0.268 0.000
#> SRR1033057 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.2760 0.7910 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1033059 2 0.2530 0.8425 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033060 1 0.3732 0.8305 0.852 0.056 0.092 0.000
#> SRR1033061 2 0.2466 0.8372 0.000 0.900 0.096 0.004
#> SRR1033062 3 0.2654 0.8170 0.000 0.108 0.888 0.004
#> SRR1033063 2 0.2530 0.8425 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033064 3 0.1302 0.8180 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1033065 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.1452 0.9249 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.1867 0.8092 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1033069 3 0.5727 0.5389 0.236 0.076 0.688 0.000
#> SRR1033070 3 0.2216 0.8001 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1033071 2 0.2530 0.8391 0.000 0.896 0.100 0.004
#> SRR1033072 3 0.1716 0.8125 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1033073 3 0.1940 0.8192 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033074 1 0.0657 0.9396 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033075 1 0.4586 0.7681 0.796 0.068 0.136 0.000
#> SRR1033076 3 0.2831 0.7886 0.004 0.120 0.876 0.000
#> SRR1033077 1 0.0657 0.9400 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1033078 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.2469 0.8068 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1033080 3 0.2216 0.8140 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1033081 1 0.1151 0.9330 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0469 0.8262 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033084 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.2704 0.8147 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1033086 2 0.2530 0.8425 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.2760 0.7932 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1033089 3 0.2048 0.8103 0.000 0.064 0.928 0.008
#> SRR1033090 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033091 3 0.1474 0.8267 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1033092 1 0.0921 0.9324 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.2589 0.8422 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033094 3 0.2589 0.7915 0.000 0.116 0.884 0.000
#> SRR1033095 2 0.2530 0.8425 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033096 3 0.1557 0.8227 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1033097 2 0.2530 0.8425 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033098 3 0.2011 0.8164 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1033099 2 0.2589 0.8422 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033100 2 0.2530 0.8425 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033101 3 0.1118 0.8250 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1033102 1 0.0336 0.9423 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.2149 0.8155 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.3634 0.8319 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR1033107 3 0.2814 0.8087 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR1033108 4 0.0779 0.9024 0.004 0.016 0.000 0.980
#> SRR1033109 1 0.0188 0.9439 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033110 3 0.1557 0.8159 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1033111 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.2125 0.8091 0.004 0.076 0.920 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0817 0.9369 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.2921 0.7985 0.000 0.140 0.860 0.000
#> SRR1033117 3 0.2408 0.8059 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1033118 3 0.4957 0.6388 0.000 0.048 0.748 0.204
#> SRR1033119 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0188 0.8248 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033120 3 0.4459 0.7103 0.032 0.188 0.780 0.000
#> SRR1033122 3 0.3853 0.7199 0.000 0.020 0.820 0.160
#> SRR1033123 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.6428 0.4571 0.264 0.112 0.624 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.3219 0.7740 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1033129 3 0.3024 0.7796 0.000 0.148 0.852 0.000
#> SRR1033128 1 0.0469 0.9421 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0376 0.9434 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033131 1 0.1256 0.9306 0.964 0.028 0.008 0.000
#> SRR1033132 3 0.5309 0.6391 0.164 0.092 0.744 0.000
#> SRR1033133 3 0.6779 0.3407 0.324 0.116 0.560 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0817 0.8227 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1033136 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.2081 0.8060 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1033139 3 0.2469 0.7934 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1033138 1 0.1584 0.9218 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1033140 3 0.1474 0.8177 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1033141 1 0.0188 0.9439 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033142 3 0.3942 0.6814 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0921 0.8268 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1033146 1 0.1452 0.9256 0.956 0.036 0.008 0.000
#> SRR1033147 3 0.6568 0.2187 0.408 0.080 0.512 0.000
#> SRR1033148 1 0.0376 0.9423 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033149 3 0.2973 0.7805 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1033150 1 0.4234 0.7853 0.816 0.052 0.132 0.000
#> SRR1033151 3 0.2593 0.7960 0.004 0.104 0.892 0.000
#> SRR1033152 1 0.2131 0.9064 0.932 0.036 0.032 0.000
#> SRR1033153 1 0.5988 0.5864 0.676 0.100 0.224 0.000
#> SRR1033154 1 0.0779 0.9392 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1033156 3 0.2011 0.8160 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1033157 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033158 3 0.3024 0.7841 0.000 0.148 0.852 0.000
#> SRR1033159 3 0.1022 0.8245 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1033160 3 0.0921 0.8221 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1033161 4 0.2773 0.7952 0.116 0.004 0.000 0.880
#> SRR1033163 3 0.3074 0.7643 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1033162 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.1824 0.8175 0.004 0.060 0.936 0.000
#> SRR1033165 3 0.3319 0.8045 0.012 0.096 0.876 0.016
#> SRR1033166 1 0.0336 0.9429 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033167 2 0.6640 0.5829 0.168 0.624 0.208 0.000
#> SRR1033168 3 0.1474 0.8159 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1033169 3 0.3910 0.7543 0.024 0.156 0.820 0.000
#> SRR1033171 3 0.1792 0.8133 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1033170 1 0.0376 0.9435 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033172 3 0.1557 0.8253 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1033173 3 0.4304 0.6058 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR1033174 3 0.4399 0.6459 0.000 0.020 0.768 0.212
#> SRR1033175 1 0.0336 0.9425 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0524 0.9423 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1033177 2 0.4981 0.1950 0.000 0.536 0.464 0.000
#> SRR1033178 2 0.7006 0.2617 0.004 0.464 0.432 0.100
#> SRR1033179 1 0.6531 0.3685 0.592 0.064 0.012 0.332
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.1722 0.9173 0.944 0.048 0.008 0.000
#> SRR1033183 3 0.5535 0.4808 0.000 0.040 0.656 0.304
#> SRR1033182 1 0.1888 0.9136 0.940 0.044 0.016 0.000
#> SRR1033184 3 0.4300 0.7379 0.088 0.092 0.820 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.1042 0.9350 0.972 0.020 0.008 0.000
#> SRR1033186 1 0.0779 0.9392 0.980 0.016 0.004 0.000
#> SRR1033188 3 0.5369 0.7100 0.132 0.084 0.768 0.016
#> SRR1033189 3 0.3123 0.7732 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1033190 1 0.0188 0.9439 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.6280 0.3592 0.344 0.072 0.584 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 3 0.3356 0.7533 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1033194 3 0.4399 0.6959 0.016 0.224 0.760 0.000
#> SRR1033197 1 0.0188 0.9440 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.3525 0.7777 0.040 0.100 0.860 0.000
#> SRR1033199 2 0.3311 0.8090 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1033198 1 0.0657 0.9389 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033200 1 0.0524 0.9407 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033201 3 0.2011 0.8236 0.000 0.080 0.920 0.000
#> SRR1033202 3 0.2647 0.8057 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1033203 3 0.0817 0.8265 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.2345 0.8126 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1033206 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0921 0.8263 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1033209 3 0.3319 0.7842 0.016 0.096 0.876 0.012
#> SRR1033210 3 0.2081 0.8145 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1033211 1 0.1820 0.9164 0.944 0.036 0.020 0.000
#> SRR1033212 3 0.1867 0.8198 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1033213 3 0.4679 0.4596 0.000 0.352 0.648 0.000
#> SRR1033214 4 0.1406 0.8891 0.024 0.016 0.000 0.960
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.2868 0.7855 0.000 0.136 0.864 0.000
#> SRR1033217 3 0.1792 0.8108 0.000 0.068 0.932 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.3699 0.7682 0.056 0.872 0.020 0.052
#> SRR1033220 2 0.2921 0.8302 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.3198 0.7919 0.040 0.080 0.880 0.000
#> SRR1033225 3 0.3074 0.7749 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1033224 1 0.1489 0.9186 0.952 0.044 0.000 0.004
#> SRR1033226 1 0.6652 0.1914 0.516 0.088 0.396 0.000
#> SRR1033227 3 0.1716 0.8224 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1033229 2 0.4972 0.2186 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR1033228 1 0.4898 0.2873 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1033231 3 0.3975 0.6758 0.000 0.240 0.760 0.000
#> SRR1033230 1 0.0188 0.9439 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033232 3 0.4644 0.7691 0.044 0.164 0.788 0.004
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 3 0.4817 0.3624 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1033234 3 0.1474 0.8168 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1033236 3 0.1716 0.8140 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1033237 1 0.4907 0.7004 0.764 0.060 0.000 0.176
#> SRR1033238 3 0.1118 0.8256 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1033240 3 0.1389 0.8244 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1033239 1 0.3266 0.8521 0.876 0.040 0.084 0.000
#> SRR1033242 3 0.2081 0.8246 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1033241 3 0.0469 0.8256 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033244 2 0.4673 0.7928 0.000 0.792 0.132 0.076
#> SRR1033243 2 0.3995 0.8158 0.004 0.824 0.148 0.024
#> SRR1033245 3 0.2053 0.8123 0.004 0.072 0.924 0.000
#> SRR1033246 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.1305 0.9287 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1033247 1 0.0817 0.9363 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033249 3 0.4331 0.5967 0.000 0.288 0.712 0.000
#> SRR1033250 2 0.3311 0.8047 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1033251 1 0.0336 0.9430 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033252 3 0.4888 0.2954 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1033253 1 0.0524 0.9404 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 3 0.3649 0.7231 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1033255 3 0.1867 0.8216 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1033258 1 0.0188 0.9439 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033257 4 0.0804 0.8981 0.008 0.012 0.000 0.980
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 3 0.4972 0.1216 0.000 0.456 0.544 0.000
#> SRR1033261 3 0.2281 0.8095 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1033262 3 0.1716 0.8225 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1033263 3 0.4643 0.4800 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR1033264 1 0.2149 0.8714 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033265 2 0.4103 0.7107 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1033266 1 0.4841 0.7471 0.780 0.080 0.140 0.000
#> SRR1033267 3 0.0707 0.8240 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.2611 0.8018 0.008 0.096 0.896 0.000
#> SRR1033270 3 0.2216 0.8128 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 3 0.3837 0.6990 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 3 0.2281 0.8152 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1033275 4 0.1174 0.8933 0.012 0.020 0.000 0.968
#> SRR1033276 2 0.4907 0.7785 0.036 0.812 0.072 0.080
#> SRR1033277 4 0.0672 0.9011 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1033278 4 0.0469 0.9016 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033279 3 0.5397 0.5865 0.220 0.064 0.716 0.000
#> SRR1033280 3 0.2797 0.8002 0.032 0.068 0.900 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9443 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.6407 0.1554 0.520 0.068 0.000 0.412
#> SRR1033283 4 0.6430 0.1742 0.428 0.068 0.000 0.504
#> SRR1033284 1 0.6445 0.0378 0.488 0.068 0.000 0.444
#> SRR1033285 3 0.6180 0.4868 0.296 0.080 0.624 0.000
#> SRR1033286 3 0.5851 0.5864 0.236 0.084 0.680 0.000
#> SRR1033287 3 0.6162 0.4783 0.304 0.076 0.620 0.000
#> SRR1033288 3 0.6336 0.4633 0.304 0.088 0.608 0.000
#> SRR1033289 3 0.5496 0.6824 0.160 0.108 0.732 0.000
#> SRR1033290 3 0.5326 0.7099 0.136 0.116 0.748 0.000
#> SRR1033291 3 0.4370 0.7792 0.044 0.156 0.800 0.000
#> SRR1033292 3 0.5480 0.7068 0.124 0.140 0.736 0.000
#> SRR1033293 3 0.4663 0.7676 0.064 0.148 0.788 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.4001 0.81439 0.068 0.024 0.012 0.836 0.060
#> SRR1032911 4 0.2122 0.84804 0.032 0.008 0.000 0.924 0.036
#> SRR1032912 4 0.0566 0.85571 0.000 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1032913 4 0.0693 0.85611 0.008 0.000 0.000 0.980 0.012
#> SRR1032914 4 0.0613 0.85297 0.000 0.008 0.004 0.984 0.004
#> SRR1032915 4 0.1393 0.85579 0.012 0.008 0.000 0.956 0.024
#> SRR1032916 4 0.0451 0.85216 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1032917 3 0.0451 0.74078 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1032918 4 0.3905 0.79863 0.100 0.016 0.004 0.828 0.052
#> SRR1032919 4 0.0854 0.85347 0.000 0.008 0.004 0.976 0.012
#> SRR1032920 4 0.8311 0.38982 0.064 0.092 0.248 0.484 0.112
#> SRR1032921 1 0.2363 0.85526 0.912 0.024 0.000 0.012 0.052
#> SRR1032922 5 0.6526 0.45421 0.032 0.012 0.092 0.276 0.588
#> SRR1032923 4 0.2768 0.84618 0.028 0.016 0.008 0.900 0.048
#> SRR1032925 4 0.5088 0.08987 0.000 0.436 0.000 0.528 0.036
#> SRR1032924 4 0.3297 0.81967 0.080 0.012 0.000 0.860 0.048
#> SRR1032926 4 0.8112 -0.01653 0.020 0.052 0.344 0.352 0.232
#> SRR1032927 4 0.3282 0.81916 0.084 0.012 0.000 0.860 0.044
#> SRR1032929 4 0.2696 0.83987 0.052 0.012 0.000 0.896 0.040
#> SRR1032928 4 0.6120 0.71865 0.040 0.052 0.084 0.708 0.116
#> SRR1032930 4 0.0579 0.85257 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1032931 2 0.4288 0.66754 0.000 0.740 0.004 0.224 0.032
#> SRR1032932 4 0.1992 0.82398 0.000 0.044 0.000 0.924 0.032
#> SRR1032933 4 0.2390 0.84618 0.044 0.012 0.000 0.912 0.032
#> SRR1032934 4 0.2638 0.83992 0.012 0.008 0.008 0.896 0.076
#> SRR1032935 4 0.1646 0.85361 0.032 0.004 0.000 0.944 0.020
#> SRR1032936 3 0.4182 0.39421 0.000 0.004 0.644 0.000 0.352
#> SRR1032937 2 0.6376 0.07610 0.076 0.448 0.000 0.444 0.032
#> SRR1032938 1 0.3442 0.82471 0.864 0.032 0.008 0.024 0.072
#> SRR1032939 5 0.3923 0.68311 0.132 0.016 0.040 0.000 0.812
#> SRR1032940 4 0.1569 0.84323 0.000 0.008 0.004 0.944 0.044
#> SRR1032941 4 0.0162 0.85491 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032942 4 0.2263 0.84520 0.036 0.020 0.000 0.920 0.024
#> SRR1032943 4 0.5816 0.27064 0.036 0.376 0.004 0.556 0.028
#> SRR1032944 1 0.0566 0.87714 0.984 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1032945 4 0.0451 0.85335 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1032946 4 0.7028 0.51254 0.280 0.048 0.032 0.564 0.076
#> SRR1032947 4 0.3046 0.83318 0.004 0.028 0.016 0.880 0.072
#> SRR1032948 4 0.1612 0.85332 0.024 0.012 0.000 0.948 0.016
#> SRR1032949 4 0.4570 0.38591 0.000 0.348 0.000 0.632 0.020
#> SRR1032950 5 0.5973 0.20607 0.076 0.004 0.008 0.384 0.528
#> SRR1032951 4 0.3075 0.83616 0.056 0.016 0.008 0.884 0.036
#> SRR1032952 4 0.1766 0.85354 0.004 0.012 0.004 0.940 0.040
#> SRR1032953 4 0.1954 0.84983 0.032 0.008 0.000 0.932 0.028
#> SRR1032954 1 0.4259 0.79468 0.820 0.056 0.012 0.028 0.084
#> SRR1032955 2 0.5594 0.35786 0.004 0.556 0.008 0.384 0.048
#> SRR1032957 4 0.0324 0.85308 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1032956 1 0.2243 0.85504 0.916 0.016 0.000 0.012 0.056
#> SRR1032958 4 0.0867 0.85581 0.008 0.008 0.000 0.976 0.008
#> SRR1032959 4 0.5017 0.64551 0.236 0.012 0.000 0.696 0.056
#> SRR1032960 4 0.1518 0.84476 0.000 0.004 0.004 0.944 0.048
#> SRR1032961 1 0.2833 0.83986 0.888 0.024 0.000 0.020 0.068
#> SRR1032962 5 0.3767 0.70369 0.032 0.016 0.132 0.000 0.820
#> SRR1032963 4 0.0451 0.85216 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1032964 4 0.0579 0.85257 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1032965 4 0.3247 0.82345 0.072 0.012 0.000 0.864 0.052
#> SRR1032966 4 0.1710 0.85309 0.024 0.012 0.000 0.944 0.020
#> SRR1032967 4 0.6857 0.20979 0.412 0.028 0.016 0.456 0.088
#> SRR1032968 4 0.0451 0.85216 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1032969 4 0.0693 0.85192 0.000 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1032970 4 0.0994 0.85634 0.004 0.004 0.004 0.972 0.016
#> SRR1032971 4 0.0451 0.85216 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1032972 4 0.0290 0.85341 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032973 4 0.0798 0.85089 0.000 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1032974 1 0.5338 0.22434 0.556 0.016 0.000 0.400 0.028
#> SRR1032975 4 0.1095 0.85575 0.012 0.012 0.000 0.968 0.008
#> SRR1032976 4 0.5983 0.70269 0.056 0.024 0.096 0.712 0.112
#> SRR1032977 4 0.1597 0.83523 0.000 0.012 0.000 0.940 0.048
#> SRR1032978 1 0.2086 0.85922 0.924 0.020 0.000 0.008 0.048
#> SRR1032979 4 0.4906 -0.04020 0.000 0.480 0.000 0.496 0.024
#> SRR1032980 4 0.0833 0.85595 0.004 0.000 0.004 0.976 0.016
#> SRR1032981 4 0.0693 0.85192 0.000 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1032982 4 0.0740 0.85549 0.000 0.008 0.004 0.980 0.008
#> SRR1032983 4 0.7123 0.37211 0.004 0.048 0.264 0.528 0.156
#> SRR1032984 4 0.0854 0.85442 0.000 0.008 0.004 0.976 0.012
#> SRR1032985 4 0.2665 0.84172 0.048 0.020 0.000 0.900 0.032
#> SRR1032986 4 0.0290 0.85341 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032987 4 0.5143 0.09986 0.000 0.428 0.000 0.532 0.040
#> SRR1032988 4 0.3143 0.82755 0.068 0.016 0.000 0.872 0.044
#> SRR1032990 5 0.3996 0.65993 0.012 0.008 0.228 0.000 0.752
#> SRR1032989 4 0.2234 0.84953 0.036 0.012 0.000 0.920 0.032
#> SRR1032991 2 0.5245 0.55133 0.000 0.640 0.000 0.280 0.080
#> SRR1032992 5 0.5627 0.65008 0.028 0.020 0.148 0.084 0.720
#> SRR1032993 4 0.0693 0.85192 0.000 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1032994 5 0.5169 0.59579 0.012 0.020 0.276 0.020 0.672
#> SRR1032995 1 0.6195 0.66486 0.696 0.064 0.024 0.120 0.096
#> SRR1032996 4 0.4877 0.76022 0.128 0.028 0.012 0.772 0.060
#> SRR1032997 4 0.0324 0.85429 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1032998 5 0.5869 0.22662 0.004 0.016 0.052 0.396 0.532
#> SRR1032999 4 0.1300 0.84321 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1033000 4 0.1522 0.83692 0.000 0.012 0.000 0.944 0.044
#> SRR1033001 4 0.6151 0.71515 0.116 0.052 0.036 0.704 0.092
#> SRR1033002 1 0.4537 0.70250 0.744 0.016 0.000 0.036 0.204
#> SRR1033003 2 0.5636 0.57143 0.040 0.640 0.000 0.276 0.044
#> SRR1033004 4 0.5188 0.13486 0.000 0.416 0.000 0.540 0.044
#> SRR1033005 4 0.4153 0.64071 0.000 0.016 0.008 0.740 0.236
#> SRR1033006 3 0.5005 0.26265 0.000 0.028 0.580 0.004 0.388
#> SRR1033007 3 0.5009 -0.06449 0.012 0.012 0.496 0.000 0.480
#> SRR1033008 1 0.1787 0.86558 0.936 0.016 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033009 1 0.2502 0.85213 0.904 0.024 0.000 0.012 0.060
#> SRR1033010 4 0.2243 0.83357 0.000 0.016 0.056 0.916 0.012
#> SRR1033011 2 0.2017 0.88521 0.000 0.912 0.080 0.000 0.008
#> SRR1033012 1 0.0451 0.87714 0.988 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033013 3 0.1211 0.73956 0.000 0.016 0.960 0.000 0.024
#> SRR1033014 3 0.2017 0.72987 0.000 0.008 0.912 0.000 0.080
#> SRR1033015 5 0.4430 0.23685 0.000 0.004 0.456 0.000 0.540
#> SRR1033016 2 0.2017 0.88521 0.000 0.912 0.080 0.000 0.008
#> SRR1033017 2 0.2017 0.88531 0.000 0.912 0.080 0.000 0.008
#> SRR1033018 3 0.4455 0.23014 0.000 0.008 0.588 0.000 0.404
#> SRR1033019 3 0.2563 0.71076 0.000 0.008 0.872 0.000 0.120
#> SRR1033020 1 0.3462 0.76874 0.792 0.012 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033021 3 0.6692 0.24981 0.272 0.036 0.552 0.000 0.140
#> SRR1033023 1 0.1597 0.87939 0.940 0.012 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033022 1 0.2069 0.85826 0.912 0.012 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033024 3 0.0955 0.74184 0.000 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR1033025 1 0.2765 0.85005 0.892 0.056 0.004 0.004 0.044
#> SRR1033026 3 0.1403 0.74263 0.000 0.024 0.952 0.000 0.024
#> SRR1033027 2 0.1990 0.88622 0.004 0.920 0.068 0.000 0.008
#> SRR1033028 4 0.0693 0.85192 0.000 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1033029 1 0.4181 0.75428 0.780 0.172 0.000 0.016 0.032
#> SRR1033030 3 0.1753 0.74154 0.000 0.032 0.936 0.000 0.032
#> SRR1033031 1 0.0693 0.87904 0.980 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033032 3 0.4525 0.35375 0.000 0.016 0.624 0.000 0.360
#> SRR1033033 2 0.1983 0.88311 0.008 0.924 0.060 0.000 0.008
#> SRR1033035 2 0.1894 0.88621 0.000 0.920 0.072 0.000 0.008
#> SRR1033034 1 0.1522 0.87508 0.944 0.012 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033036 1 0.3612 0.73514 0.764 0.008 0.000 0.000 0.228
#> SRR1033037 1 0.1116 0.87284 0.964 0.004 0.000 0.004 0.028
#> SRR1033038 1 0.1310 0.87922 0.956 0.020 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033039 3 0.3884 0.52200 0.000 0.004 0.708 0.000 0.288
#> SRR1033040 5 0.5183 0.63854 0.200 0.004 0.104 0.000 0.692
#> SRR1033041 1 0.2723 0.83114 0.864 0.012 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033042 1 0.2006 0.86066 0.916 0.012 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033043 1 0.2017 0.86499 0.912 0.008 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033044 1 0.2074 0.85793 0.920 0.016 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033045 3 0.3081 0.68538 0.000 0.012 0.832 0.000 0.156
#> SRR1033046 3 0.7020 0.26326 0.236 0.048 0.552 0.004 0.160
#> SRR1033047 3 0.3343 0.67112 0.000 0.016 0.812 0.000 0.172
#> SRR1033048 1 0.6008 0.36378 0.568 0.016 0.088 0.000 0.328
#> SRR1033049 1 0.1764 0.87192 0.928 0.008 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033051 1 0.1153 0.87829 0.964 0.008 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033052 1 0.1831 0.86160 0.920 0.004 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033053 2 0.1830 0.88610 0.000 0.924 0.068 0.000 0.008
#> SRR1033054 5 0.3920 0.62787 0.004 0.004 0.268 0.000 0.724
#> SRR1033050 1 0.1026 0.87366 0.968 0.004 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033055 3 0.3353 0.64402 0.000 0.008 0.796 0.000 0.196
#> SRR1033056 5 0.5196 0.67944 0.144 0.020 0.112 0.000 0.724
#> SRR1033057 1 0.2624 0.84299 0.872 0.012 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033058 3 0.1549 0.74156 0.000 0.040 0.944 0.000 0.016
#> SRR1033059 2 0.1924 0.88561 0.004 0.924 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033060 5 0.3963 0.54994 0.256 0.008 0.004 0.000 0.732
#> SRR1033061 2 0.2026 0.88016 0.012 0.924 0.056 0.000 0.008
#> SRR1033062 3 0.1830 0.74373 0.000 0.028 0.932 0.000 0.040
#> SRR1033063 2 0.1983 0.88311 0.008 0.924 0.060 0.000 0.008
#> SRR1033064 3 0.4383 0.18235 0.000 0.004 0.572 0.000 0.424
#> SRR1033065 1 0.3141 0.80699 0.832 0.016 0.000 0.000 0.152
#> SRR1033066 1 0.4418 0.56918 0.652 0.016 0.000 0.000 0.332
#> SRR1033067 1 0.1267 0.87621 0.960 0.012 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033068 5 0.4286 0.52638 0.004 0.004 0.340 0.000 0.652
#> SRR1033069 5 0.4381 0.70185 0.088 0.008 0.124 0.000 0.780
#> SRR1033070 5 0.4354 0.46811 0.000 0.008 0.368 0.000 0.624
#> SRR1033071 2 0.1924 0.88561 0.004 0.924 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033072 5 0.4315 0.65541 0.016 0.012 0.244 0.000 0.728
#> SRR1033073 3 0.2595 0.73183 0.000 0.032 0.888 0.000 0.080
#> SRR1033074 1 0.2104 0.86127 0.924 0.024 0.000 0.008 0.044
#> SRR1033075 5 0.5701 0.05050 0.436 0.028 0.032 0.000 0.504
#> SRR1033076 5 0.3476 0.69862 0.020 0.004 0.160 0.000 0.816
#> SRR1033077 1 0.3465 0.82925 0.840 0.004 0.000 0.052 0.104
#> SRR1033078 1 0.1059 0.87906 0.968 0.008 0.000 0.004 0.020
#> SRR1033079 3 0.1018 0.74346 0.000 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR1033080 3 0.1211 0.74308 0.000 0.016 0.960 0.000 0.024
#> SRR1033081 1 0.3318 0.78691 0.808 0.012 0.000 0.000 0.180
#> SRR1033082 1 0.2011 0.86152 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033083 3 0.3563 0.63167 0.000 0.012 0.780 0.000 0.208
#> SRR1033084 1 0.1106 0.87754 0.964 0.012 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033085 3 0.2989 0.73374 0.000 0.060 0.868 0.000 0.072
#> SRR1033086 2 0.1894 0.88621 0.000 0.920 0.072 0.000 0.008
#> SRR1033087 1 0.1877 0.86702 0.924 0.012 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033088 3 0.1701 0.74049 0.000 0.048 0.936 0.000 0.016
#> SRR1033089 3 0.4649 0.25158 0.000 0.016 0.580 0.000 0.404
#> SRR1033090 4 0.0740 0.85281 0.000 0.008 0.004 0.980 0.008
#> SRR1033091 3 0.2753 0.69914 0.000 0.008 0.856 0.000 0.136
#> SRR1033092 1 0.2906 0.84170 0.884 0.048 0.004 0.004 0.060
#> SRR1033093 2 0.2017 0.88521 0.000 0.912 0.080 0.000 0.008
#> SRR1033094 5 0.4824 0.42998 0.000 0.028 0.376 0.000 0.596
#> SRR1033095 2 0.2017 0.88521 0.000 0.912 0.080 0.000 0.008
#> SRR1033096 3 0.4597 0.14835 0.000 0.012 0.564 0.000 0.424
#> SRR1033097 2 0.2050 0.88534 0.008 0.920 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033098 3 0.2036 0.73862 0.000 0.024 0.920 0.000 0.056
#> SRR1033099 2 0.1924 0.88525 0.004 0.924 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033100 2 0.1924 0.88561 0.004 0.924 0.064 0.000 0.008
#> SRR1033101 3 0.3388 0.64582 0.000 0.008 0.792 0.000 0.200
#> SRR1033102 1 0.2284 0.85583 0.912 0.028 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033103 1 0.0992 0.88056 0.968 0.008 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033104 3 0.0798 0.74257 0.000 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1033105 1 0.1557 0.87125 0.940 0.008 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033106 5 0.4443 -0.07557 0.472 0.004 0.000 0.000 0.524
#> SRR1033107 3 0.0579 0.73874 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1033108 4 0.3328 0.82242 0.084 0.020 0.000 0.860 0.036
#> SRR1033109 1 0.1012 0.87846 0.968 0.012 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033110 5 0.4236 0.54995 0.004 0.004 0.328 0.000 0.664
#> SRR1033111 1 0.1082 0.87830 0.964 0.008 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033112 1 0.2390 0.85245 0.896 0.020 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033113 5 0.3544 0.68059 0.008 0.004 0.200 0.000 0.788
#> SRR1033114 1 0.0955 0.87609 0.968 0.004 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033115 1 0.3852 0.73490 0.760 0.020 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033116 3 0.0693 0.73803 0.000 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR1033117 3 0.1082 0.74115 0.000 0.028 0.964 0.000 0.008
#> SRR1033118 3 0.5935 0.30948 0.000 0.008 0.548 0.352 0.092
#> SRR1033119 1 0.1942 0.86452 0.920 0.012 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033121 3 0.3861 0.55483 0.000 0.008 0.728 0.000 0.264
#> SRR1033120 5 0.3656 0.66853 0.052 0.024 0.080 0.000 0.844
#> SRR1033122 3 0.5153 0.53714 0.000 0.000 0.684 0.204 0.112
#> SRR1033123 1 0.2293 0.85975 0.900 0.016 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033124 1 0.0579 0.87715 0.984 0.008 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033125 5 0.3289 0.69225 0.096 0.004 0.048 0.000 0.852
#> SRR1033126 1 0.1638 0.86878 0.932 0.004 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033127 3 0.2046 0.72460 0.000 0.068 0.916 0.000 0.016
#> SRR1033129 3 0.1124 0.73800 0.000 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033128 1 0.3141 0.80678 0.832 0.016 0.000 0.000 0.152
#> SRR1033130 1 0.1195 0.87910 0.960 0.012 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033131 1 0.4654 0.52953 0.628 0.024 0.000 0.000 0.348
#> SRR1033132 5 0.3460 0.70013 0.076 0.004 0.076 0.000 0.844
#> SRR1033133 5 0.3260 0.69550 0.084 0.004 0.056 0.000 0.856
#> SRR1033134 1 0.0854 0.87862 0.976 0.004 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033135 3 0.4150 0.29555 0.000 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1033136 1 0.1117 0.87711 0.964 0.016 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033137 5 0.4037 0.59849 0.004 0.004 0.288 0.000 0.704
#> SRR1033139 5 0.3745 0.70357 0.036 0.012 0.132 0.000 0.820
#> SRR1033138 5 0.4644 -0.05465 0.460 0.012 0.000 0.000 0.528
#> SRR1033140 3 0.4166 0.40308 0.000 0.004 0.648 0.000 0.348
#> SRR1033141 1 0.0992 0.87610 0.968 0.008 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033142 3 0.3954 0.60636 0.000 0.192 0.772 0.000 0.036
#> SRR1033143 1 0.0486 0.87694 0.988 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033144 1 0.2505 0.84951 0.888 0.020 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033145 3 0.3508 0.57985 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1033146 1 0.4558 0.57309 0.652 0.024 0.000 0.000 0.324
#> SRR1033147 5 0.3570 0.67979 0.124 0.004 0.044 0.000 0.828
#> SRR1033148 1 0.1830 0.86237 0.932 0.012 0.000 0.004 0.052
#> SRR1033149 3 0.1121 0.73746 0.000 0.044 0.956 0.000 0.000
#> SRR1033150 5 0.3715 0.53157 0.260 0.000 0.004 0.000 0.736
#> SRR1033151 5 0.3365 0.68930 0.008 0.004 0.180 0.000 0.808
#> SRR1033152 1 0.4804 0.25179 0.524 0.008 0.008 0.000 0.460
#> SRR1033153 5 0.3292 0.68117 0.120 0.004 0.032 0.000 0.844
#> SRR1033154 1 0.3878 0.71496 0.748 0.016 0.000 0.000 0.236
#> SRR1033156 3 0.1493 0.74240 0.000 0.024 0.948 0.000 0.028
#> SRR1033157 1 0.1809 0.86552 0.928 0.012 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033158 3 0.3164 0.71512 0.000 0.044 0.852 0.000 0.104
#> SRR1033159 3 0.3766 0.55053 0.000 0.004 0.728 0.000 0.268
#> SRR1033160 3 0.4450 -0.07327 0.000 0.004 0.508 0.000 0.488
#> SRR1033161 4 0.3670 0.71212 0.188 0.008 0.000 0.792 0.012
#> SRR1033163 5 0.3412 0.69151 0.008 0.008 0.172 0.000 0.812
#> SRR1033162 1 0.2625 0.84114 0.876 0.016 0.000 0.000 0.108
#> SRR1033164 5 0.4538 0.25938 0.000 0.008 0.452 0.000 0.540
#> SRR1033165 3 0.3289 0.70187 0.004 0.048 0.852 0.000 0.096
#> SRR1033166 1 0.3309 0.84144 0.836 0.036 0.000 0.000 0.128
#> SRR1033167 5 0.7707 -0.00427 0.084 0.312 0.176 0.000 0.428
#> SRR1033168 5 0.4440 0.21523 0.004 0.000 0.468 0.000 0.528
#> SRR1033169 5 0.3748 0.66973 0.056 0.020 0.088 0.000 0.836
#> SRR1033171 5 0.3975 0.64622 0.008 0.008 0.240 0.000 0.744
#> SRR1033170 1 0.1205 0.87470 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033172 3 0.3355 0.66465 0.000 0.012 0.804 0.000 0.184
#> SRR1033173 3 0.4644 0.45140 0.000 0.280 0.680 0.000 0.040
#> SRR1033174 3 0.6387 0.23463 0.000 0.008 0.500 0.352 0.140
#> SRR1033175 1 0.1564 0.86988 0.948 0.024 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033176 1 0.3304 0.79520 0.816 0.016 0.000 0.000 0.168
#> SRR1033177 3 0.4760 0.11871 0.000 0.416 0.564 0.000 0.020
#> SRR1033178 3 0.8291 -0.20278 0.008 0.332 0.368 0.144 0.148
#> SRR1033179 1 0.6759 0.63707 0.660 0.068 0.044 0.128 0.100
#> SRR1033180 1 0.0898 0.87933 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033181 1 0.4768 0.44959 0.592 0.024 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033183 3 0.4796 0.46250 0.000 0.008 0.664 0.300 0.028
#> SRR1033182 1 0.4961 0.26937 0.524 0.028 0.000 0.000 0.448
#> SRR1033184 5 0.3651 0.70133 0.032 0.004 0.152 0.000 0.812
#> SRR1033185 1 0.0912 0.87920 0.972 0.016 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033187 1 0.2575 0.87286 0.904 0.036 0.016 0.000 0.044
#> SRR1033186 1 0.3194 0.81093 0.832 0.020 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033188 3 0.4707 0.65139 0.068 0.064 0.784 0.000 0.084
#> SRR1033189 3 0.1943 0.72758 0.000 0.056 0.924 0.000 0.020
#> SRR1033190 1 0.1281 0.87936 0.956 0.012 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033191 1 0.0865 0.87865 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033192 5 0.3612 0.69405 0.100 0.004 0.064 0.000 0.832
#> SRR1033193 1 0.1430 0.87037 0.944 0.004 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033195 3 0.2505 0.70923 0.000 0.092 0.888 0.000 0.020
#> SRR1033194 5 0.4902 0.60748 0.040 0.040 0.180 0.000 0.740
#> SRR1033197 1 0.1018 0.87746 0.968 0.016 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033196 5 0.3888 0.69622 0.032 0.004 0.176 0.000 0.788
#> SRR1033199 2 0.2813 0.86595 0.000 0.868 0.108 0.000 0.024
#> SRR1033198 1 0.2795 0.83977 0.884 0.028 0.000 0.008 0.080
#> SRR1033200 1 0.2619 0.84643 0.896 0.024 0.004 0.004 0.072
#> SRR1033201 3 0.1281 0.74107 0.000 0.012 0.956 0.000 0.032
#> SRR1033202 3 0.1106 0.73846 0.000 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1033203 3 0.3013 0.67610 0.000 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1033204 1 0.0613 0.87688 0.984 0.008 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033205 3 0.0771 0.74181 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1033206 1 0.1485 0.87719 0.948 0.020 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033207 1 0.0932 0.87427 0.972 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR1033208 3 0.2411 0.71528 0.000 0.008 0.884 0.000 0.108
#> SRR1033209 3 0.4440 0.41556 0.004 0.012 0.660 0.000 0.324
#> SRR1033210 3 0.1106 0.74218 0.000 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1033211 1 0.4310 0.46042 0.604 0.004 0.000 0.000 0.392
#> SRR1033212 3 0.1484 0.73967 0.000 0.008 0.944 0.000 0.048
#> SRR1033213 3 0.4977 0.27173 0.000 0.356 0.604 0.000 0.040
#> SRR1033214 4 0.4564 0.74663 0.152 0.036 0.000 0.772 0.040
#> SRR1033216 1 0.0912 0.87701 0.972 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033215 3 0.1740 0.73079 0.000 0.056 0.932 0.000 0.012
#> SRR1033217 5 0.4151 0.51703 0.000 0.004 0.344 0.000 0.652
#> SRR1033218 1 0.0898 0.87503 0.972 0.008 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033219 1 0.1059 0.87394 0.968 0.008 0.000 0.004 0.020
#> SRR1033221 2 0.3373 0.83489 0.060 0.872 0.020 0.016 0.032
#> SRR1033220 2 0.2824 0.87280 0.000 0.872 0.096 0.000 0.032
#> SRR1033222 1 0.1626 0.87487 0.940 0.016 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033223 5 0.4169 0.64659 0.028 0.000 0.240 0.000 0.732
#> SRR1033225 3 0.2325 0.71955 0.000 0.068 0.904 0.000 0.028
#> SRR1033224 1 0.4060 0.80380 0.828 0.064 0.012 0.016 0.080
#> SRR1033226 5 0.3732 0.66059 0.148 0.008 0.032 0.000 0.812
#> SRR1033227 3 0.1205 0.74031 0.000 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR1033229 2 0.4897 0.19941 0.000 0.516 0.460 0.000 0.024
#> SRR1033228 1 0.4814 0.25982 0.568 0.004 0.000 0.412 0.016
#> SRR1033231 3 0.3326 0.66703 0.000 0.152 0.824 0.000 0.024
#> SRR1033230 1 0.1018 0.87518 0.968 0.016 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033232 3 0.2515 0.71596 0.032 0.040 0.908 0.000 0.020
#> SRR1033233 1 0.0693 0.87645 0.980 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033235 3 0.5024 0.03146 0.000 0.440 0.528 0.000 0.032
#> SRR1033234 5 0.4307 0.10602 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1033236 5 0.4670 0.29934 0.004 0.008 0.440 0.000 0.548
#> SRR1033237 1 0.5282 0.73717 0.760 0.052 0.016 0.080 0.092
#> SRR1033238 3 0.1732 0.72796 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033240 3 0.2077 0.72552 0.000 0.008 0.908 0.000 0.084
#> SRR1033239 5 0.5257 -0.03211 0.468 0.004 0.036 0.000 0.492
#> SRR1033242 3 0.1774 0.73703 0.000 0.016 0.932 0.000 0.052
#> SRR1033241 3 0.3809 0.56541 0.000 0.008 0.736 0.000 0.256
#> SRR1033244 2 0.4224 0.83546 0.000 0.796 0.136 0.044 0.024
#> SRR1033243 2 0.3328 0.85430 0.004 0.844 0.124 0.004 0.024
#> SRR1033245 5 0.4313 0.50099 0.008 0.000 0.356 0.000 0.636
#> SRR1033246 1 0.1364 0.87356 0.952 0.012 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033248 1 0.2578 0.86491 0.908 0.044 0.020 0.004 0.024
#> SRR1033247 1 0.3940 0.73121 0.756 0.024 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033249 3 0.4588 0.53880 0.000 0.220 0.720 0.000 0.060
#> SRR1033250 2 0.3051 0.85654 0.000 0.852 0.120 0.000 0.028
#> SRR1033251 1 0.2305 0.85201 0.896 0.012 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033252 3 0.5283 -0.04103 0.000 0.444 0.508 0.000 0.048
#> SRR1033253 1 0.1808 0.86297 0.936 0.012 0.000 0.008 0.044
#> SRR1033254 1 0.1074 0.87497 0.968 0.012 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033256 3 0.3134 0.68646 0.000 0.120 0.848 0.000 0.032
#> SRR1033255 3 0.4648 -0.00349 0.000 0.012 0.524 0.000 0.464
#> SRR1033258 1 0.0912 0.87845 0.972 0.016 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033257 4 0.2989 0.83382 0.068 0.016 0.000 0.880 0.036
#> SRR1033259 1 0.1646 0.86766 0.944 0.020 0.000 0.004 0.032
#> SRR1033260 3 0.4866 0.30388 0.000 0.344 0.620 0.000 0.036
#> SRR1033261 3 0.0992 0.74200 0.000 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR1033262 3 0.1704 0.73337 0.000 0.004 0.928 0.000 0.068
#> SRR1033263 3 0.4671 0.36596 0.000 0.332 0.640 0.000 0.028
#> SRR1033264 1 0.3103 0.83275 0.872 0.012 0.000 0.072 0.044
#> SRR1033265 2 0.4197 0.70748 0.000 0.728 0.244 0.000 0.028
#> SRR1033266 5 0.3618 0.63307 0.196 0.004 0.012 0.000 0.788
#> SRR1033267 3 0.3741 0.55243 0.000 0.004 0.732 0.000 0.264
#> SRR1033268 1 0.1597 0.87489 0.940 0.012 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033269 5 0.3910 0.64034 0.008 0.004 0.248 0.000 0.740
#> SRR1033270 3 0.1399 0.74231 0.000 0.020 0.952 0.000 0.028
#> SRR1033271 1 0.0771 0.87528 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1033272 3 0.4075 0.62339 0.000 0.160 0.780 0.000 0.060
#> SRR1033273 1 0.1106 0.87970 0.964 0.012 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033274 3 0.1907 0.74052 0.000 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1033275 4 0.4653 0.76930 0.116 0.032 0.004 0.784 0.064
#> SRR1033276 2 0.3423 0.86991 0.024 0.868 0.068 0.016 0.024
#> SRR1033277 4 0.3896 0.78398 0.128 0.020 0.000 0.816 0.036
#> SRR1033278 4 0.0579 0.85257 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1033279 5 0.3732 0.70489 0.056 0.004 0.120 0.000 0.820
#> SRR1033280 5 0.4244 0.62888 0.016 0.004 0.268 0.000 0.712
#> SRR1033281 1 0.0693 0.87836 0.980 0.008 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033282 1 0.7386 0.52149 0.596 0.052 0.056 0.156 0.140
#> SRR1033283 1 0.7835 0.37616 0.532 0.052 0.056 0.216 0.144
#> SRR1033284 1 0.7517 0.48977 0.580 0.052 0.056 0.168 0.144
#> SRR1033285 3 0.5519 0.52664 0.164 0.036 0.704 0.000 0.096
#> SRR1033286 3 0.5153 0.57234 0.132 0.036 0.740 0.000 0.092
#> SRR1033287 3 0.5710 0.50739 0.172 0.040 0.688 0.000 0.100
#> SRR1033288 3 0.5302 0.55008 0.152 0.028 0.720 0.000 0.100
#> SRR1033289 3 0.4725 0.61167 0.100 0.028 0.772 0.000 0.100
#> SRR1033290 3 0.4293 0.64264 0.076 0.028 0.804 0.000 0.092
#> SRR1033291 3 0.4550 0.63355 0.072 0.036 0.788 0.000 0.104
#> SRR1033292 3 0.5662 0.52619 0.156 0.040 0.696 0.000 0.108
#> SRR1033293 3 0.4830 0.61158 0.092 0.036 0.768 0.000 0.104
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.5901 0.523391 0.076 0.012 0.012 0.580 0.300 0.020
#> SRR1032911 4 0.2815 0.753229 0.032 0.000 0.000 0.848 0.120 0.000
#> SRR1032912 4 0.1152 0.779103 0.000 0.000 0.004 0.952 0.044 0.000
#> SRR1032913 4 0.1007 0.778634 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1032914 4 0.0260 0.774956 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032915 4 0.3545 0.738408 0.004 0.008 0.004 0.788 0.184 0.012
#> SRR1032916 4 0.0508 0.772223 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1032917 3 0.0951 0.697764 0.000 0.004 0.968 0.000 0.008 0.020
#> SRR1032918 4 0.4940 0.606086 0.076 0.008 0.008 0.668 0.240 0.000
#> SRR1032919 4 0.1333 0.777064 0.000 0.000 0.000 0.944 0.048 0.008
#> SRR1032920 5 0.8881 0.095127 0.032 0.096 0.180 0.264 0.328 0.100
#> SRR1032921 1 0.3357 0.666424 0.764 0.004 0.000 0.008 0.224 0.000
#> SRR1032922 6 0.5324 0.564718 0.016 0.012 0.040 0.080 0.132 0.720
#> SRR1032923 4 0.4073 0.706371 0.028 0.000 0.004 0.748 0.204 0.016
#> SRR1032925 2 0.6176 0.320248 0.004 0.452 0.004 0.380 0.148 0.012
#> SRR1032924 4 0.4338 0.651900 0.072 0.004 0.000 0.716 0.208 0.000
#> SRR1032926 5 0.8208 0.059825 0.016 0.016 0.140 0.248 0.304 0.276
#> SRR1032927 4 0.3948 0.683937 0.064 0.000 0.000 0.748 0.188 0.000
#> SRR1032929 4 0.3987 0.705346 0.056 0.000 0.008 0.760 0.176 0.000
#> SRR1032928 4 0.7449 0.114586 0.008 0.016 0.060 0.396 0.300 0.220
#> SRR1032930 4 0.0260 0.774061 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032931 2 0.5101 0.626360 0.000 0.660 0.000 0.196 0.132 0.012
#> SRR1032932 4 0.3396 0.682699 0.000 0.040 0.000 0.828 0.112 0.020
#> SRR1032933 4 0.3193 0.741256 0.052 0.000 0.000 0.824 0.124 0.000
#> SRR1032934 4 0.6472 0.343232 0.016 0.012 0.012 0.532 0.172 0.256
#> SRR1032935 4 0.2119 0.768484 0.036 0.000 0.000 0.904 0.060 0.000
#> SRR1032936 6 0.5435 0.399442 0.000 0.020 0.344 0.000 0.080 0.556
#> SRR1032937 2 0.7153 0.334233 0.064 0.428 0.000 0.320 0.168 0.020
#> SRR1032938 1 0.3693 0.607458 0.708 0.004 0.000 0.008 0.280 0.000
#> SRR1032939 6 0.3591 0.639445 0.048 0.020 0.020 0.004 0.064 0.844
#> SRR1032940 4 0.4044 0.638951 0.000 0.008 0.000 0.768 0.084 0.140
#> SRR1032941 4 0.0858 0.778609 0.000 0.000 0.004 0.968 0.028 0.000
#> SRR1032942 4 0.4654 0.608674 0.092 0.004 0.000 0.720 0.172 0.012
#> SRR1032943 4 0.6699 -0.110056 0.024 0.364 0.000 0.412 0.184 0.016
#> SRR1032944 1 0.1908 0.769590 0.900 0.004 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.775332 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.6621 -0.223289 0.348 0.012 0.008 0.300 0.332 0.000
#> SRR1032947 4 0.6615 0.423840 0.004 0.020 0.036 0.544 0.236 0.160
#> SRR1032948 4 0.1858 0.774943 0.004 0.000 0.000 0.904 0.092 0.000
#> SRR1032949 4 0.5124 0.449938 0.008 0.216 0.000 0.656 0.116 0.004
#> SRR1032950 6 0.5823 0.426194 0.040 0.012 0.004 0.160 0.132 0.652
#> SRR1032951 4 0.3823 0.719635 0.052 0.004 0.004 0.780 0.160 0.000
#> SRR1032952 4 0.6045 0.437980 0.008 0.012 0.008 0.580 0.176 0.216
#> SRR1032953 4 0.3304 0.739046 0.040 0.004 0.000 0.816 0.140 0.000
#> SRR1032954 1 0.4364 0.529697 0.656 0.012 0.000 0.024 0.308 0.000
#> SRR1032955 2 0.6837 0.461457 0.008 0.488 0.012 0.256 0.204 0.032
#> SRR1032957 4 0.0260 0.775080 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032956 1 0.3512 0.645337 0.740 0.004 0.000 0.008 0.248 0.000
#> SRR1032958 4 0.1700 0.777956 0.004 0.000 0.000 0.916 0.080 0.000
#> SRR1032959 4 0.6139 0.140002 0.276 0.008 0.000 0.460 0.256 0.000
#> SRR1032960 4 0.2123 0.753379 0.000 0.008 0.000 0.908 0.020 0.064
#> SRR1032961 1 0.3788 0.598057 0.704 0.004 0.000 0.012 0.280 0.000
#> SRR1032962 6 0.3182 0.660562 0.004 0.016 0.044 0.000 0.084 0.852
#> SRR1032963 4 0.0508 0.773957 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1032964 4 0.0260 0.776216 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032965 4 0.4558 0.663462 0.060 0.008 0.008 0.712 0.212 0.000
#> SRR1032966 4 0.2988 0.751931 0.028 0.000 0.000 0.828 0.144 0.000
#> SRR1032967 1 0.6512 -0.139888 0.404 0.012 0.008 0.240 0.336 0.000
#> SRR1032968 4 0.0146 0.774226 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032969 4 0.1478 0.769922 0.000 0.004 0.000 0.944 0.032 0.020
#> SRR1032970 4 0.1411 0.779336 0.000 0.000 0.004 0.936 0.060 0.000
#> SRR1032971 4 0.0508 0.772223 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1032972 4 0.0363 0.776249 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032973 4 0.0717 0.770225 0.000 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1032974 1 0.5583 0.182654 0.536 0.000 0.000 0.284 0.180 0.000
#> SRR1032975 4 0.0937 0.778848 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1032976 4 0.7622 0.026788 0.024 0.012 0.048 0.368 0.272 0.276
#> SRR1032977 4 0.2870 0.700459 0.000 0.004 0.000 0.856 0.100 0.040
#> SRR1032978 1 0.3384 0.665905 0.760 0.004 0.000 0.008 0.228 0.000
#> SRR1032979 2 0.5931 0.327589 0.000 0.468 0.000 0.368 0.152 0.012
#> SRR1032980 4 0.1951 0.777598 0.000 0.000 0.000 0.908 0.076 0.016
#> SRR1032981 4 0.0520 0.772286 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1032982 4 0.1584 0.777583 0.000 0.000 0.000 0.928 0.064 0.008
#> SRR1032983 6 0.8015 -0.024354 0.004 0.020 0.140 0.260 0.244 0.332
#> SRR1032984 4 0.2146 0.762027 0.000 0.008 0.000 0.908 0.060 0.024
#> SRR1032985 4 0.2957 0.752767 0.032 0.000 0.004 0.844 0.120 0.000
#> SRR1032986 4 0.0405 0.772728 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1032987 4 0.6026 0.189317 0.000 0.284 0.000 0.544 0.136 0.036
#> SRR1032988 4 0.4447 0.674063 0.068 0.008 0.004 0.724 0.196 0.000
#> SRR1032990 6 0.2094 0.673559 0.004 0.000 0.064 0.000 0.024 0.908
#> SRR1032989 4 0.2752 0.754749 0.036 0.000 0.000 0.856 0.108 0.000
#> SRR1032991 2 0.6599 0.496650 0.000 0.540 0.000 0.184 0.172 0.104
#> SRR1032992 6 0.3941 0.637356 0.008 0.024 0.040 0.012 0.100 0.816
#> SRR1032993 4 0.2351 0.751342 0.000 0.012 0.000 0.900 0.052 0.036
#> SRR1032994 6 0.4733 0.636277 0.008 0.016 0.104 0.012 0.108 0.752
#> SRR1032995 1 0.5367 0.336827 0.564 0.012 0.000 0.092 0.332 0.000
#> SRR1032996 4 0.5867 0.374447 0.152 0.008 0.004 0.520 0.316 0.000
#> SRR1032997 4 0.0713 0.777769 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1032998 6 0.5724 0.429734 0.004 0.016 0.020 0.192 0.124 0.644
#> SRR1032999 4 0.2964 0.700365 0.000 0.012 0.000 0.836 0.140 0.012
#> SRR1033000 4 0.2800 0.703666 0.000 0.004 0.000 0.860 0.100 0.036
#> SRR1033001 4 0.6900 0.266832 0.112 0.016 0.016 0.432 0.384 0.040
#> SRR1033002 1 0.6278 0.164908 0.508 0.012 0.004 0.012 0.308 0.156
#> SRR1033003 2 0.6601 0.529582 0.036 0.544 0.004 0.204 0.196 0.016
#> SRR1033004 4 0.6039 0.230292 0.000 0.264 0.000 0.556 0.140 0.040
#> SRR1033005 4 0.6094 0.081714 0.000 0.016 0.004 0.432 0.140 0.408
#> SRR1033006 6 0.5796 0.434632 0.004 0.012 0.312 0.004 0.116 0.552
#> SRR1033007 6 0.6430 0.544316 0.064 0.012 0.224 0.004 0.116 0.580
#> SRR1033008 1 0.2615 0.747114 0.852 0.000 0.000 0.004 0.136 0.008
#> SRR1033009 1 0.3183 0.699090 0.788 0.000 0.000 0.008 0.200 0.004
#> SRR1033010 4 0.3622 0.711170 0.000 0.008 0.076 0.832 0.056 0.028
#> SRR1033011 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.1124 0.782691 0.956 0.008 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033013 3 0.2265 0.691780 0.000 0.004 0.896 0.000 0.024 0.076
#> SRR1033014 3 0.3511 0.565695 0.000 0.000 0.760 0.000 0.024 0.216
#> SRR1033015 6 0.3952 0.611176 0.004 0.008 0.236 0.000 0.020 0.732
#> SRR1033016 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 6 0.5538 0.325092 0.004 0.036 0.384 0.000 0.048 0.528
#> SRR1033019 3 0.3575 0.489107 0.000 0.000 0.708 0.000 0.008 0.284
#> SRR1033020 1 0.3670 0.678415 0.788 0.004 0.000 0.000 0.056 0.152
#> SRR1033021 1 0.7444 -0.304321 0.312 0.004 0.308 0.000 0.100 0.276
#> SRR1033023 1 0.1812 0.781488 0.912 0.000 0.000 0.000 0.080 0.008
#> SRR1033022 1 0.2000 0.770765 0.916 0.004 0.000 0.000 0.032 0.048
#> SRR1033024 3 0.1332 0.700250 0.000 0.008 0.952 0.000 0.012 0.028
#> SRR1033025 1 0.3104 0.703286 0.788 0.004 0.000 0.004 0.204 0.000
#> SRR1033026 3 0.2002 0.692699 0.000 0.004 0.908 0.000 0.012 0.076
#> SRR1033027 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.0717 0.774202 0.000 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1033029 1 0.5547 0.458586 0.624 0.228 0.004 0.008 0.128 0.008
#> SRR1033030 3 0.2455 0.672952 0.000 0.004 0.872 0.000 0.012 0.112
#> SRR1033031 1 0.1536 0.782467 0.940 0.004 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR1033032 6 0.4853 0.341777 0.000 0.004 0.388 0.000 0.052 0.556
#> SRR1033033 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2358 0.773441 0.900 0.012 0.000 0.000 0.048 0.040
#> SRR1033036 1 0.3946 0.662930 0.772 0.004 0.000 0.000 0.088 0.136
#> SRR1033037 1 0.2062 0.774104 0.900 0.000 0.000 0.004 0.088 0.008
#> SRR1033038 1 0.1814 0.767401 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1033039 3 0.4412 -0.070430 0.000 0.012 0.500 0.000 0.008 0.480
#> SRR1033040 6 0.5622 0.378301 0.252 0.004 0.048 0.000 0.076 0.620
#> SRR1033041 1 0.2762 0.736859 0.860 0.000 0.000 0.000 0.048 0.092
#> SRR1033042 1 0.2144 0.768545 0.908 0.004 0.000 0.000 0.040 0.048
#> SRR1033043 1 0.2711 0.759515 0.872 0.004 0.000 0.000 0.056 0.068
#> SRR1033044 1 0.3089 0.704307 0.800 0.008 0.000 0.004 0.188 0.000
#> SRR1033045 3 0.4406 0.334734 0.000 0.008 0.624 0.000 0.024 0.344
#> SRR1033046 6 0.7761 0.112749 0.268 0.004 0.236 0.004 0.152 0.336
#> SRR1033047 3 0.5192 0.032115 0.000 0.012 0.508 0.000 0.060 0.420
#> SRR1033048 1 0.5896 0.179977 0.528 0.004 0.064 0.000 0.052 0.352
#> SRR1033049 1 0.2314 0.780514 0.900 0.008 0.000 0.000 0.056 0.036
#> SRR1033051 1 0.2536 0.770124 0.880 0.004 0.000 0.004 0.092 0.020
#> SRR1033052 1 0.2390 0.762256 0.896 0.008 0.000 0.000 0.052 0.044
#> SRR1033053 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 6 0.2492 0.673636 0.008 0.000 0.068 0.000 0.036 0.888
#> SRR1033050 1 0.2333 0.750447 0.872 0.004 0.000 0.004 0.120 0.000
#> SRR1033055 3 0.4046 0.302726 0.000 0.004 0.620 0.000 0.008 0.368
#> SRR1033056 6 0.5052 0.585703 0.136 0.016 0.052 0.000 0.068 0.728
#> SRR1033057 1 0.2542 0.748938 0.876 0.000 0.000 0.000 0.080 0.044
#> SRR1033058 3 0.1914 0.699527 0.000 0.016 0.920 0.000 0.008 0.056
#> SRR1033059 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 6 0.4624 0.430407 0.208 0.004 0.000 0.000 0.096 0.692
#> SRR1033061 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.3388 0.631690 0.000 0.000 0.804 0.004 0.036 0.156
#> SRR1033063 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 6 0.4609 0.452669 0.000 0.008 0.344 0.000 0.036 0.612
#> SRR1033065 1 0.3375 0.724135 0.828 0.008 0.000 0.000 0.088 0.076
#> SRR1033066 1 0.4751 0.548787 0.680 0.004 0.000 0.000 0.108 0.208
#> SRR1033067 1 0.3120 0.748810 0.832 0.000 0.000 0.008 0.132 0.028
#> SRR1033068 6 0.2837 0.673500 0.000 0.000 0.088 0.000 0.056 0.856
#> SRR1033069 6 0.3769 0.641965 0.068 0.012 0.044 0.000 0.048 0.828
#> SRR1033070 6 0.3601 0.661727 0.004 0.008 0.152 0.000 0.036 0.800
#> SRR1033071 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 6 0.3994 0.667571 0.028 0.016 0.112 0.000 0.040 0.804
#> SRR1033073 3 0.3622 0.542981 0.000 0.004 0.744 0.000 0.016 0.236
#> SRR1033074 1 0.3415 0.664761 0.760 0.004 0.000 0.004 0.228 0.004
#> SRR1033075 6 0.5939 0.161108 0.376 0.004 0.036 0.000 0.084 0.500
#> SRR1033076 6 0.2351 0.664360 0.028 0.000 0.036 0.000 0.032 0.904
#> SRR1033077 1 0.3546 0.732375 0.832 0.000 0.000 0.052 0.068 0.048
#> SRR1033078 1 0.2554 0.772458 0.876 0.004 0.000 0.000 0.092 0.028
#> SRR1033079 3 0.1882 0.698577 0.000 0.008 0.920 0.000 0.012 0.060
#> SRR1033080 3 0.2121 0.683484 0.000 0.000 0.892 0.000 0.012 0.096
#> SRR1033081 1 0.3663 0.699821 0.796 0.004 0.000 0.000 0.072 0.128
#> SRR1033082 1 0.2278 0.773150 0.900 0.004 0.000 0.000 0.044 0.052
#> SRR1033083 3 0.4178 0.135850 0.000 0.004 0.560 0.000 0.008 0.428
#> SRR1033084 1 0.1788 0.779032 0.928 0.004 0.000 0.000 0.040 0.028
#> SRR1033085 3 0.5807 0.322611 0.000 0.096 0.572 0.000 0.044 0.288
#> SRR1033086 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.1334 0.778323 0.948 0.000 0.000 0.000 0.020 0.032
#> SRR1033088 3 0.2123 0.698314 0.000 0.020 0.908 0.000 0.008 0.064
#> SRR1033089 6 0.5660 0.414395 0.004 0.016 0.332 0.000 0.100 0.548
#> SRR1033090 4 0.0547 0.775509 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033091 3 0.4196 0.366399 0.000 0.000 0.640 0.000 0.028 0.332
#> SRR1033092 1 0.3536 0.647793 0.736 0.000 0.000 0.004 0.252 0.008
#> SRR1033093 2 0.0790 0.825887 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 6 0.4544 0.644876 0.004 0.036 0.152 0.000 0.060 0.748
#> SRR1033095 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 6 0.4943 0.530704 0.000 0.028 0.280 0.000 0.048 0.644
#> SRR1033097 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.3502 0.594908 0.000 0.008 0.780 0.000 0.020 0.192
#> SRR1033099 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0713 0.828468 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.5108 0.006415 0.000 0.004 0.496 0.000 0.068 0.432
#> SRR1033102 1 0.3302 0.673804 0.760 0.004 0.000 0.004 0.232 0.000
#> SRR1033103 1 0.1391 0.785063 0.944 0.000 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR1033104 3 0.0520 0.694342 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033105 1 0.1367 0.779472 0.944 0.000 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR1033106 1 0.5481 0.125752 0.468 0.004 0.000 0.000 0.108 0.420
#> SRR1033107 3 0.0870 0.697300 0.000 0.004 0.972 0.000 0.012 0.012
#> SRR1033108 4 0.3455 0.733017 0.076 0.004 0.004 0.824 0.092 0.000
#> SRR1033109 1 0.2218 0.772130 0.884 0.000 0.000 0.000 0.104 0.012
#> SRR1033110 6 0.4006 0.661429 0.008 0.004 0.192 0.000 0.040 0.756
#> SRR1033111 1 0.1141 0.783406 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1033112 1 0.2468 0.755871 0.888 0.004 0.000 0.000 0.060 0.048
#> SRR1033113 6 0.2950 0.657036 0.008 0.004 0.048 0.000 0.076 0.864
#> SRR1033114 1 0.1268 0.781813 0.952 0.004 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1033115 1 0.4087 0.649974 0.760 0.004 0.000 0.000 0.100 0.136
#> SRR1033116 3 0.0820 0.697618 0.000 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033117 3 0.0914 0.697919 0.000 0.016 0.968 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033118 3 0.6473 0.107766 0.000 0.000 0.412 0.332 0.024 0.232
#> SRR1033119 1 0.2249 0.772811 0.900 0.004 0.000 0.000 0.064 0.032
#> SRR1033121 6 0.3999 0.086605 0.000 0.000 0.496 0.000 0.004 0.500
#> SRR1033120 6 0.6411 0.000582 0.096 0.004 0.064 0.000 0.380 0.456
#> SRR1033122 3 0.6022 0.259128 0.000 0.000 0.512 0.232 0.012 0.244
#> SRR1033123 1 0.2437 0.774370 0.888 0.004 0.000 0.000 0.072 0.036
#> SRR1033124 1 0.2092 0.768444 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1033125 6 0.3382 0.573028 0.048 0.000 0.008 0.000 0.124 0.820
#> SRR1033126 1 0.1982 0.776851 0.912 0.004 0.000 0.000 0.068 0.016
#> SRR1033127 3 0.1124 0.684890 0.000 0.036 0.956 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033129 3 0.0951 0.694408 0.000 0.020 0.968 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033128 1 0.3261 0.716762 0.824 0.000 0.000 0.000 0.104 0.072
#> SRR1033130 1 0.1421 0.780882 0.944 0.000 0.000 0.000 0.028 0.028
#> SRR1033131 1 0.5102 0.457126 0.624 0.000 0.000 0.000 0.148 0.228
#> SRR1033132 6 0.2329 0.631914 0.036 0.004 0.008 0.000 0.048 0.904
#> SRR1033133 6 0.2488 0.603612 0.044 0.000 0.000 0.000 0.076 0.880
#> SRR1033134 1 0.1643 0.787298 0.924 0.000 0.000 0.000 0.068 0.008
#> SRR1033135 6 0.4118 0.373446 0.000 0.004 0.396 0.000 0.008 0.592
#> SRR1033136 1 0.1349 0.779837 0.940 0.000 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1033137 6 0.2941 0.662112 0.004 0.000 0.076 0.000 0.064 0.856
#> SRR1033139 6 0.2408 0.643319 0.004 0.004 0.024 0.000 0.076 0.892
#> SRR1033138 6 0.5945 -0.049672 0.396 0.004 0.000 0.000 0.184 0.416
#> SRR1033140 6 0.4709 0.294195 0.000 0.008 0.412 0.000 0.032 0.548
#> SRR1033141 1 0.2260 0.759688 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1033142 3 0.3676 0.595184 0.000 0.092 0.808 0.000 0.088 0.012
#> SRR1033143 1 0.0858 0.779881 0.968 0.004 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033144 1 0.3562 0.713987 0.784 0.004 0.000 0.000 0.176 0.036
#> SRR1033145 3 0.4158 0.177401 0.000 0.004 0.572 0.000 0.008 0.416
#> SRR1033146 1 0.5032 0.468776 0.636 0.000 0.000 0.000 0.148 0.216
#> SRR1033147 6 0.4723 0.404384 0.060 0.004 0.012 0.000 0.240 0.684
#> SRR1033148 1 0.2772 0.724331 0.816 0.000 0.000 0.004 0.180 0.000
#> SRR1033149 3 0.1353 0.692180 0.000 0.024 0.952 0.000 0.012 0.012
#> SRR1033150 6 0.5214 0.256649 0.172 0.000 0.000 0.000 0.216 0.612
#> SRR1033151 6 0.2128 0.652606 0.004 0.000 0.032 0.000 0.056 0.908
#> SRR1033152 1 0.5279 0.279905 0.544 0.004 0.000 0.000 0.096 0.356
#> SRR1033153 6 0.2985 0.587521 0.056 0.000 0.000 0.000 0.100 0.844
#> SRR1033154 1 0.4079 0.648120 0.760 0.004 0.000 0.000 0.096 0.140
#> SRR1033156 3 0.1606 0.700842 0.000 0.008 0.932 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033157 1 0.2101 0.772567 0.912 0.008 0.000 0.000 0.052 0.028
#> SRR1033158 3 0.4985 0.491967 0.000 0.016 0.676 0.000 0.200 0.108
#> SRR1033159 3 0.4536 -0.074327 0.000 0.004 0.496 0.000 0.024 0.476
#> SRR1033160 6 0.3809 0.548452 0.000 0.004 0.304 0.000 0.008 0.684
#> SRR1033161 4 0.3835 0.573588 0.204 0.000 0.000 0.748 0.048 0.000
#> SRR1033163 6 0.2044 0.667847 0.008 0.004 0.040 0.000 0.028 0.920
#> SRR1033162 1 0.2492 0.759799 0.892 0.012 0.000 0.000 0.048 0.048
#> SRR1033164 6 0.3943 0.652064 0.004 0.000 0.184 0.000 0.056 0.756
#> SRR1033165 3 0.6132 0.373891 0.044 0.012 0.584 0.000 0.116 0.244
#> SRR1033166 1 0.2866 0.759977 0.860 0.000 0.004 0.000 0.084 0.052
#> SRR1033167 5 0.8277 0.225753 0.132 0.092 0.148 0.000 0.380 0.248
#> SRR1033168 6 0.3975 0.646507 0.004 0.000 0.204 0.000 0.048 0.744
#> SRR1033169 6 0.6493 0.026893 0.108 0.004 0.064 0.000 0.364 0.460
#> SRR1033171 6 0.4621 0.535987 0.016 0.000 0.088 0.000 0.180 0.716
#> SRR1033170 1 0.1644 0.778096 0.932 0.000 0.000 0.000 0.040 0.028
#> SRR1033172 3 0.3512 0.557241 0.000 0.004 0.740 0.000 0.008 0.248
#> SRR1033173 3 0.4733 0.514280 0.000 0.144 0.708 0.000 0.136 0.012
#> SRR1033174 6 0.7025 0.127484 0.000 0.008 0.368 0.180 0.064 0.380
#> SRR1033175 1 0.2527 0.728598 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1033176 1 0.3473 0.698061 0.808 0.000 0.000 0.000 0.096 0.096
#> SRR1033177 3 0.4201 0.523780 0.000 0.196 0.732 0.000 0.068 0.004
#> SRR1033178 3 0.7312 0.029584 0.008 0.036 0.392 0.048 0.380 0.136
#> SRR1033179 1 0.5785 0.399309 0.576 0.012 0.016 0.060 0.320 0.016
#> SRR1033180 1 0.1074 0.781249 0.960 0.000 0.000 0.000 0.028 0.012
#> SRR1033181 1 0.5402 0.362111 0.576 0.000 0.000 0.000 0.172 0.252
#> SRR1033183 3 0.5434 0.273516 0.000 0.008 0.572 0.336 0.016 0.068
#> SRR1033182 1 0.5854 0.178312 0.488 0.004 0.000 0.000 0.184 0.324
#> SRR1033184 6 0.2980 0.672220 0.024 0.000 0.072 0.000 0.040 0.864
#> SRR1033185 1 0.0914 0.781158 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1033187 1 0.3066 0.760406 0.828 0.004 0.004 0.000 0.148 0.016
#> SRR1033186 1 0.5061 0.499507 0.636 0.004 0.000 0.000 0.240 0.120
#> SRR1033188 3 0.6661 0.352803 0.092 0.008 0.552 0.000 0.160 0.188
#> SRR1033189 3 0.1341 0.679370 0.000 0.024 0.948 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033190 1 0.2631 0.762246 0.856 0.004 0.000 0.000 0.128 0.012
#> SRR1033191 1 0.1082 0.782380 0.956 0.000 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1033192 6 0.3906 0.589441 0.084 0.004 0.016 0.000 0.096 0.800
#> SRR1033193 1 0.1765 0.780969 0.924 0.000 0.000 0.000 0.052 0.024
#> SRR1033195 3 0.1649 0.673063 0.000 0.036 0.932 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033194 5 0.7240 0.047898 0.056 0.020 0.200 0.000 0.364 0.360
#> SRR1033197 1 0.2212 0.773945 0.880 0.000 0.000 0.000 0.112 0.008
#> SRR1033196 6 0.2680 0.660725 0.012 0.000 0.048 0.000 0.060 0.880
#> SRR1033199 2 0.3277 0.776401 0.000 0.824 0.092 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033198 1 0.3565 0.619582 0.716 0.004 0.000 0.004 0.276 0.000
#> SRR1033200 1 0.3240 0.660253 0.752 0.000 0.000 0.004 0.244 0.000
#> SRR1033201 3 0.1970 0.687678 0.000 0.000 0.900 0.000 0.008 0.092
#> SRR1033202 3 0.0870 0.691141 0.000 0.012 0.972 0.000 0.012 0.004
#> SRR1033203 3 0.3595 0.464711 0.000 0.000 0.704 0.000 0.008 0.288
#> SRR1033204 1 0.1327 0.777392 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1033205 3 0.0976 0.697033 0.000 0.008 0.968 0.000 0.008 0.016
#> SRR1033206 1 0.2302 0.775038 0.872 0.000 0.000 0.000 0.120 0.008
#> SRR1033207 1 0.1327 0.777474 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1033208 3 0.2178 0.664046 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033209 6 0.4638 0.405261 0.000 0.004 0.368 0.000 0.040 0.588
#> SRR1033210 3 0.0993 0.697798 0.000 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1033211 1 0.5519 0.247825 0.520 0.000 0.000 0.000 0.148 0.332
#> SRR1033212 3 0.1434 0.701104 0.000 0.000 0.940 0.000 0.012 0.048
#> SRR1033213 3 0.4606 0.515424 0.000 0.172 0.716 0.000 0.100 0.012
#> SRR1033214 4 0.4375 0.624501 0.144 0.004 0.000 0.732 0.120 0.000
#> SRR1033216 1 0.1333 0.781155 0.944 0.000 0.000 0.000 0.048 0.008
#> SRR1033215 3 0.0820 0.689359 0.000 0.012 0.972 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033217 6 0.2288 0.674588 0.000 0.004 0.116 0.000 0.004 0.876
#> SRR1033218 1 0.2006 0.773170 0.892 0.000 0.000 0.000 0.104 0.004
#> SRR1033219 1 0.2048 0.761371 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1033221 2 0.4047 0.760856 0.036 0.804 0.028 0.024 0.108 0.000
#> SRR1033220 2 0.2846 0.786440 0.000 0.856 0.084 0.000 0.060 0.000
#> SRR1033222 1 0.1367 0.780626 0.944 0.000 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR1033223 6 0.3391 0.595968 0.016 0.000 0.024 0.000 0.148 0.812
#> SRR1033225 3 0.2462 0.650150 0.000 0.032 0.892 0.000 0.064 0.012
#> SRR1033224 1 0.3878 0.581426 0.688 0.008 0.000 0.008 0.296 0.000
#> SRR1033226 6 0.4874 0.339699 0.068 0.004 0.004 0.000 0.288 0.636
#> SRR1033227 3 0.1075 0.700336 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033229 3 0.5173 0.328452 0.000 0.300 0.604 0.000 0.084 0.012
#> SRR1033228 1 0.4589 0.017494 0.504 0.000 0.000 0.460 0.036 0.000
#> SRR1033231 3 0.3214 0.619474 0.000 0.068 0.840 0.000 0.084 0.008
#> SRR1033230 1 0.1219 0.781175 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033232 3 0.1649 0.666014 0.040 0.008 0.936 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033233 1 0.1814 0.772446 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1033235 3 0.5101 0.473689 0.000 0.188 0.672 0.000 0.120 0.020
#> SRR1033234 6 0.3755 0.606725 0.004 0.000 0.244 0.000 0.020 0.732
#> SRR1033236 6 0.4613 0.609024 0.004 0.000 0.200 0.000 0.100 0.696
#> SRR1033237 1 0.5428 0.438264 0.612 0.012 0.004 0.092 0.276 0.004
#> SRR1033238 3 0.1765 0.686621 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033240 3 0.2191 0.668850 0.000 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1033239 6 0.5596 0.128127 0.384 0.012 0.008 0.000 0.080 0.516
#> SRR1033242 3 0.1701 0.699010 0.000 0.000 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1033241 3 0.4093 -0.021891 0.000 0.000 0.516 0.000 0.008 0.476
#> SRR1033244 2 0.4584 0.724770 0.004 0.752 0.128 0.036 0.080 0.000
#> SRR1033243 2 0.3685 0.747019 0.004 0.796 0.120 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033245 6 0.2827 0.672510 0.004 0.004 0.080 0.000 0.044 0.868
#> SRR1033246 1 0.1297 0.779726 0.948 0.000 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1033248 1 0.3523 0.743469 0.816 0.004 0.048 0.000 0.124 0.008
#> SRR1033247 1 0.4364 0.634352 0.732 0.004 0.000 0.000 0.152 0.112
#> SRR1033249 3 0.4694 0.535810 0.000 0.088 0.724 0.000 0.160 0.028
#> SRR1033250 2 0.3965 0.699133 0.000 0.764 0.160 0.000 0.072 0.004
#> SRR1033251 1 0.2237 0.762886 0.896 0.000 0.000 0.000 0.068 0.036
#> SRR1033252 3 0.5455 0.427450 0.000 0.208 0.632 0.000 0.136 0.024
#> SRR1033253 1 0.2946 0.711888 0.808 0.004 0.000 0.004 0.184 0.000
#> SRR1033254 1 0.1765 0.769985 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033256 3 0.3212 0.617231 0.000 0.048 0.840 0.000 0.100 0.012
#> SRR1033255 6 0.3766 0.542676 0.000 0.000 0.304 0.000 0.012 0.684
#> SRR1033258 1 0.1908 0.774521 0.900 0.004 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033257 4 0.3544 0.716150 0.080 0.000 0.000 0.800 0.120 0.000
#> SRR1033259 1 0.2100 0.759318 0.884 0.000 0.000 0.004 0.112 0.000
#> SRR1033260 3 0.4593 0.530867 0.000 0.120 0.728 0.000 0.136 0.016
#> SRR1033261 3 0.1116 0.699309 0.000 0.004 0.960 0.000 0.008 0.028
#> SRR1033262 3 0.2389 0.661804 0.000 0.000 0.864 0.000 0.008 0.128
#> SRR1033263 3 0.4141 0.554964 0.000 0.156 0.756 0.000 0.080 0.008
#> SRR1033264 1 0.3989 0.676727 0.776 0.008 0.000 0.096 0.120 0.000
#> SRR1033265 2 0.5222 0.249852 0.000 0.500 0.416 0.000 0.080 0.004
#> SRR1033266 6 0.4830 0.405239 0.176 0.004 0.000 0.000 0.140 0.680
#> SRR1033267 3 0.4080 0.055576 0.000 0.000 0.536 0.000 0.008 0.456
#> SRR1033268 1 0.1643 0.778497 0.924 0.000 0.000 0.000 0.068 0.008
#> SRR1033269 6 0.3047 0.653558 0.004 0.000 0.064 0.000 0.084 0.848
#> SRR1033270 3 0.1524 0.699903 0.000 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033271 1 0.2048 0.755023 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1033272 3 0.4401 0.547720 0.000 0.060 0.744 0.000 0.168 0.028
#> SRR1033273 1 0.1204 0.781598 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1033274 3 0.1511 0.690698 0.000 0.012 0.944 0.000 0.032 0.012
#> SRR1033275 4 0.5110 0.576932 0.112 0.004 0.008 0.656 0.220 0.000
#> SRR1033276 2 0.3755 0.775509 0.020 0.820 0.052 0.012 0.096 0.000
#> SRR1033277 4 0.4053 0.665343 0.128 0.000 0.004 0.764 0.104 0.000
#> SRR1033278 4 0.0405 0.772728 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1033279 6 0.2972 0.620355 0.024 0.000 0.016 0.000 0.108 0.852
#> SRR1033280 6 0.2663 0.677956 0.012 0.000 0.084 0.000 0.028 0.876
#> SRR1033281 1 0.0858 0.782695 0.968 0.000 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1033282 5 0.6541 0.381300 0.336 0.000 0.072 0.080 0.496 0.016
#> SRR1033283 5 0.6800 0.416166 0.308 0.000 0.072 0.116 0.488 0.016
#> SRR1033284 5 0.6541 0.381300 0.336 0.000 0.072 0.080 0.496 0.016
#> SRR1033285 3 0.6151 0.123462 0.124 0.000 0.496 0.000 0.340 0.040
#> SRR1033286 3 0.6088 0.145018 0.116 0.000 0.504 0.000 0.340 0.040
#> SRR1033287 3 0.6151 0.123462 0.124 0.000 0.496 0.000 0.340 0.040
#> SRR1033288 3 0.6167 0.137423 0.120 0.000 0.500 0.000 0.336 0.044
#> SRR1033289 3 0.5995 0.188121 0.100 0.000 0.520 0.000 0.336 0.044
#> SRR1033290 3 0.5919 0.207235 0.092 0.000 0.528 0.000 0.336 0.044
#> SRR1033291 3 0.5546 0.274058 0.064 0.000 0.564 0.000 0.332 0.040
#> SRR1033292 3 0.5975 0.181467 0.104 0.000 0.520 0.000 0.336 0.040
#> SRR1033293 3 0.5685 0.250097 0.076 0.000 0.552 0.000 0.332 0.040
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.951 0.933 0.974 0.308 0.691 0.691
#> 3 3 0.745 0.899 0.932 0.228 0.965 0.949
#> 4 4 0.616 0.841 0.894 0.134 0.991 0.986
#> 5 5 0.470 0.612 0.794 0.325 0.736 0.594
#> 6 6 0.486 0.678 0.771 0.150 0.809 0.582
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.7453 0.7271 0.212 0.788
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0376 0.9232 0.004 0.996
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.9710 0.2670 0.600 0.400
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0376 0.9232 0.004 0.996
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.9909 0.2805 0.444 0.556
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.5946 0.8072 0.144 0.856
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.9909 0.2805 0.444 0.556
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.5946 0.8072 0.144 0.856
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0672 0.9767 0.992 0.008
#> SRR1033007 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0376 0.9800 0.996 0.004
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033013 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.1633 0.9617 0.976 0.024
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0376 0.9800 0.996 0.004
#> SRR1033019 1 0.0376 0.9800 0.996 0.004
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033024 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033026 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033031 1 0.7219 0.7305 0.800 0.200
#> SRR1033032 1 0.8813 0.5365 0.700 0.300
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.1184 0.9695 0.984 0.016
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.8555 0.5800 0.720 0.280
#> SRR1033039 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0938 0.9732 0.988 0.012
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.5178 0.8542 0.884 0.116
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.1184 0.9695 0.984 0.016
#> SRR1033058 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.9909 0.2805 0.444 0.556
#> SRR1033062 1 0.0938 0.9730 0.988 0.012
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.2948 0.9329 0.948 0.052
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0672 0.9766 0.992 0.008
#> SRR1033069 1 0.9963 0.0368 0.536 0.464
#> SRR1033070 1 0.0672 0.9766 0.992 0.008
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.9944 0.0690 0.544 0.456
#> SRR1033073 1 0.5842 0.8218 0.860 0.140
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0672 0.9766 0.992 0.008
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.1633 0.9619 0.976 0.024
#> SRR1033083 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0672 0.9767 0.992 0.008
#> SRR1033086 2 0.9909 0.2805 0.444 0.556
#> SRR1033087 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033088 1 0.2236 0.9492 0.964 0.036
#> SRR1033089 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0376 0.9800 0.996 0.004
#> SRR1033092 1 0.2236 0.9493 0.964 0.036
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.2043 0.9535 0.968 0.032
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.9909 0.2805 0.444 0.556
#> SRR1033098 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.5059 0.8593 0.888 0.112
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.3584 0.9139 0.932 0.068
#> SRR1033116 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.9983 0.1812 0.476 0.524
#> SRR1033122 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.1414 0.9656 0.980 0.020
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.1184 0.9156 0.016 0.984
#> SRR1033129 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.1184 0.9695 0.984 0.016
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033133 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.9323 0.4178 0.652 0.348
#> SRR1033138 1 0.4939 0.8658 0.892 0.108
#> SRR1033140 1 0.0376 0.9800 0.996 0.004
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033145 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.9170 0.4611 0.668 0.332
#> SRR1033147 1 0.9963 0.0369 0.536 0.464
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0938 0.9731 0.988 0.012
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.2778 0.8925 0.048 0.952
#> SRR1033159 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0672 0.9767 0.992 0.008
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0938 0.9731 0.988 0.012
#> SRR1033162 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033164 1 0.9754 0.2428 0.592 0.408
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.2423 0.9453 0.960 0.040
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.9993 0.1547 0.484 0.516
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0376 0.9799 0.996 0.004
#> SRR1033187 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.5294 0.8504 0.880 0.120
#> SRR1033188 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0938 0.9183 0.012 0.988
#> SRR1033190 1 0.0938 0.9731 0.988 0.012
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 1.0000 0.0932 0.500 0.500
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.9983 0.1812 0.476 0.524
#> SRR1033197 1 0.1414 0.9659 0.980 0.020
#> SRR1033196 1 0.0672 0.9766 0.992 0.008
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.3431 0.8807 0.064 0.936
#> SRR1033217 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.6623 0.7781 0.172 0.828
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.6801 0.7671 0.180 0.820
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0938 0.9731 0.988 0.012
#> SRR1033270 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9255 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.9829 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0592 0.9359 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032911 1 0.0892 0.9340 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032912 1 0.0424 0.9360 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032913 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032914 1 0.0424 0.9360 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032915 1 0.0747 0.9357 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032916 1 0.0747 0.9359 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032917 1 0.3038 0.8980 0.896 0.000 0.104
#> SRR1032918 1 0.0892 0.9340 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032919 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032922 1 0.1643 0.9320 0.956 0.000 0.044
#> SRR1032923 1 0.0747 0.9358 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032926 1 0.0747 0.9353 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032927 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032929 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032928 1 0.0747 0.9362 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032930 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.6905 0.0765 0.016 0.440 0.544
#> SRR1032933 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032934 1 0.0592 0.9359 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032935 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032936 1 0.1643 0.9286 0.956 0.000 0.044
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032939 1 0.1860 0.9266 0.948 0.000 0.052
#> SRR1032940 1 0.0892 0.9353 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032941 1 0.0592 0.9355 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032942 2 0.1031 0.9513 0.000 0.976 0.024
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.1289 0.9304 0.968 0.000 0.032
#> SRR1032945 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032946 1 0.0592 0.9351 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032947 1 0.0892 0.9349 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032948 1 0.1031 0.9348 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.1031 0.9352 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032951 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032952 1 0.0892 0.9355 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032953 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032954 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032956 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032958 1 0.0424 0.9360 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032959 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032960 1 0.0747 0.9357 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032961 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032962 3 0.8222 0.6832 0.308 0.100 0.592
#> SRR1032963 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032964 1 0.0892 0.9353 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032965 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032966 1 0.0892 0.9363 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032967 2 0.1031 0.9513 0.000 0.976 0.024
#> SRR1032968 1 0.0892 0.9353 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032969 1 0.1289 0.9330 0.968 0.000 0.032
#> SRR1032970 1 0.0424 0.9360 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032971 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032972 1 0.0424 0.9360 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032973 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032974 1 0.0892 0.9339 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032975 1 0.1031 0.9348 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032976 1 0.0747 0.9366 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032977 3 0.6968 0.7519 0.120 0.148 0.732
#> SRR1032978 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032981 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032982 1 0.0424 0.9360 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032983 1 0.0747 0.9360 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032984 1 0.1031 0.9347 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032985 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032986 1 0.0424 0.9360 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032987 2 0.6280 0.2099 0.000 0.540 0.460
#> SRR1032988 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032990 1 0.2796 0.9062 0.908 0.000 0.092
#> SRR1032989 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0592 0.9362 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032993 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032994 1 0.1289 0.9340 0.968 0.000 0.032
#> SRR1032995 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032996 1 0.0747 0.9353 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032997 1 0.0747 0.9355 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032998 1 0.0747 0.9357 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.6968 0.7519 0.120 0.148 0.732
#> SRR1033001 1 0.0592 0.9362 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033002 1 0.0747 0.9364 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.6280 0.2099 0.000 0.540 0.460
#> SRR1033005 1 0.0892 0.9351 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033006 1 0.3116 0.8975 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033007 1 0.0747 0.9358 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033008 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033009 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033010 1 0.3192 0.8928 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.1289 0.9303 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033013 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033014 1 0.3192 0.8924 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033015 1 0.3784 0.8706 0.864 0.004 0.132
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.3038 0.8997 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033019 1 0.3116 0.8962 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033020 1 0.1163 0.9340 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033021 1 0.3038 0.8994 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033023 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033022 1 0.1289 0.9303 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033024 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033025 1 0.1163 0.9320 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033026 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.1643 0.9296 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 1 0.3425 0.8899 0.884 0.004 0.112
#> SRR1033031 1 0.6673 0.5686 0.720 0.056 0.224
#> SRR1033032 1 0.8496 -0.2336 0.492 0.092 0.416
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1878 0.9233 0.952 0.004 0.044
#> SRR1033036 1 0.1289 0.9333 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033037 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033038 1 0.7588 0.2569 0.624 0.064 0.312
#> SRR1033039 1 0.3038 0.8980 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033040 1 0.2261 0.9255 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033041 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033042 1 0.1529 0.9265 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033043 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033044 1 0.1163 0.9320 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033045 1 0.2959 0.9003 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033046 1 0.2066 0.9282 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033047 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033048 1 0.1529 0.9310 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033049 1 0.1289 0.9307 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033051 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033052 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.3116 0.8956 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033050 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033055 1 0.5938 0.6524 0.732 0.020 0.248
#> SRR1033056 1 0.1411 0.9338 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033057 1 0.1989 0.9199 0.948 0.004 0.048
#> SRR1033058 1 0.3192 0.8926 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.1031 0.9372 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033061 3 0.6968 0.7519 0.120 0.148 0.732
#> SRR1033062 1 0.3755 0.8816 0.872 0.008 0.120
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.3267 0.8888 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033065 1 0.1163 0.9317 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033066 1 0.3112 0.9031 0.916 0.028 0.056
#> SRR1033067 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033068 1 0.3030 0.9068 0.904 0.004 0.092
#> SRR1033069 3 0.7960 0.7559 0.232 0.120 0.648
#> SRR1033070 1 0.3425 0.8925 0.884 0.004 0.112
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.7923 0.7554 0.228 0.120 0.652
#> SRR1033073 1 0.6437 0.6519 0.732 0.048 0.220
#> SRR1033074 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033075 1 0.0747 0.9370 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033076 1 0.3340 0.8864 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033077 1 0.1163 0.9339 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033078 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033079 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033080 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033081 1 0.0747 0.9370 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033082 1 0.2200 0.9187 0.940 0.004 0.056
#> SRR1033083 1 0.3192 0.8920 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033084 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033085 1 0.3267 0.8909 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033086 3 0.6968 0.7519 0.120 0.148 0.732
#> SRR1033087 1 0.1163 0.9322 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033088 1 0.4136 0.8751 0.864 0.020 0.116
#> SRR1033089 1 0.2878 0.9037 0.904 0.000 0.096
#> SRR1033090 1 0.1163 0.9339 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033091 1 0.3116 0.8962 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033092 1 0.2796 0.8911 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.3965 0.8675 0.860 0.008 0.132
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.3038 0.8989 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033097 3 0.6968 0.7519 0.120 0.148 0.732
#> SRR1033098 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.2878 0.9037 0.904 0.000 0.096
#> SRR1033102 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033103 1 0.1289 0.9303 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033104 1 0.3038 0.8975 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033105 1 0.1163 0.9320 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033106 1 0.1163 0.9356 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033107 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033108 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033109 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033110 1 0.3038 0.8988 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033111 1 0.1411 0.9284 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033112 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033113 1 0.5919 0.6205 0.724 0.016 0.260
#> SRR1033114 1 0.1289 0.9305 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033115 1 0.3695 0.8525 0.880 0.012 0.108
#> SRR1033116 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033117 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033118 1 0.2165 0.9206 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033119 1 0.1031 0.9340 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033121 1 0.3116 0.8959 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033120 3 0.7160 0.7715 0.148 0.132 0.720
#> SRR1033122 1 0.2356 0.9169 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033123 1 0.1163 0.9317 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033124 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033125 1 0.3551 0.8747 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033126 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033127 2 0.1529 0.9341 0.000 0.960 0.040
#> SRR1033129 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033128 1 0.2200 0.9183 0.940 0.004 0.056
#> SRR1033130 1 0.0747 0.9358 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033131 1 0.1031 0.9364 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033132 1 0.3192 0.8930 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033133 1 0.1753 0.9335 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033134 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033135 1 0.3116 0.8956 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033136 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033137 1 0.3116 0.8956 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033139 3 0.7905 0.5903 0.376 0.064 0.560
#> SRR1033138 1 0.5285 0.7856 0.812 0.040 0.148
#> SRR1033140 1 0.3116 0.8962 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033141 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033144 1 0.1163 0.9321 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033145 1 0.3192 0.8922 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033146 1 0.8132 -0.3349 0.488 0.068 0.444
#> SRR1033147 3 0.7944 0.7442 0.244 0.112 0.644
#> SRR1033148 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033149 1 0.3192 0.8926 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033150 1 0.1163 0.9371 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033151 1 0.3340 0.8866 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033152 1 0.1411 0.9311 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033153 1 0.3116 0.8964 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033154 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033156 1 0.3038 0.8975 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033157 1 0.1163 0.9320 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033158 2 0.2280 0.9113 0.008 0.940 0.052
#> SRR1033159 1 0.3038 0.8983 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033160 1 0.3272 0.8995 0.892 0.004 0.104
#> SRR1033161 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033163 1 0.3573 0.8852 0.876 0.004 0.120
#> SRR1033162 1 0.1529 0.9262 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033164 3 0.9305 0.5573 0.380 0.164 0.456
#> SRR1033165 1 0.0747 0.9358 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033166 1 0.2866 0.8901 0.916 0.008 0.076
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.3192 0.8922 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.7917 0.7487 0.152 0.184 0.664
#> SRR1033170 1 0.1163 0.9317 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033172 1 0.3116 0.8955 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.3116 0.8958 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033175 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033176 1 0.1163 0.9320 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.1289 0.9305 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033181 1 0.1031 0.9353 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033183 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033182 1 0.1163 0.9364 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033184 1 0.3116 0.8958 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033185 1 0.1411 0.9284 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033187 1 0.1031 0.9346 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033186 1 0.5631 0.7286 0.792 0.044 0.164
#> SRR1033188 1 0.0747 0.9358 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033189 2 0.1163 0.9456 0.000 0.972 0.028
#> SRR1033190 1 0.1643 0.9242 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033191 1 0.1289 0.9303 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033192 3 0.7984 0.7604 0.216 0.132 0.652
#> SRR1033193 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.7160 0.7715 0.148 0.132 0.720
#> SRR1033197 1 0.2096 0.9173 0.944 0.004 0.052
#> SRR1033196 1 0.3500 0.8886 0.880 0.004 0.116
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033200 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033201 1 0.3038 0.8981 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033202 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033203 1 0.3116 0.8961 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033204 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033205 1 0.2356 0.9158 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033206 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033207 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033208 1 0.3192 0.8920 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033209 1 0.2356 0.9162 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033210 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033211 1 0.1163 0.9334 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033212 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033216 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033215 2 0.3310 0.8558 0.028 0.908 0.064
#> SRR1033217 1 0.3038 0.8994 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033218 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033219 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0892 0.9340 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033223 1 0.2537 0.9119 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033225 2 0.6809 0.1623 0.012 0.524 0.464
#> SRR1033224 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033226 1 0.2959 0.9013 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033227 1 0.2356 0.9158 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1031 0.9352 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033232 1 0.1031 0.9348 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033233 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.3116 0.8956 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033236 1 0.3116 0.8956 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033237 1 0.0892 0.9354 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033238 1 0.2711 0.9073 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033240 1 0.3116 0.8956 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033239 1 0.1163 0.9336 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033242 1 0.2261 0.9181 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033241 1 0.3038 0.8980 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.3038 0.8986 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033246 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033248 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033247 3 0.5810 0.1299 0.000 0.336 0.664
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0892 0.9340 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033254 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.3116 0.8956 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033258 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033257 1 0.1163 0.9339 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033259 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.3192 0.8920 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033262 1 0.3116 0.8950 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.1163 0.9320 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033265 2 0.0237 0.9671 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033266 1 0.1031 0.9353 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033267 1 0.2356 0.9158 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033268 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033269 1 0.3340 0.8868 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033270 1 0.3192 0.8920 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033271 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9702 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033278 1 0.1289 0.9331 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033279 1 0.3038 0.8987 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033280 1 0.3116 0.8956 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033281 1 0.1031 0.9330 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033282 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033283 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033284 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033285 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033286 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033287 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033288 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033289 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033290 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033291 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033292 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033293 1 0.0592 0.9364 0.988 0.000 0.012
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.0921 0.8914 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032911 1 0.1389 0.8877 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1032912 1 0.0592 0.8910 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1032913 1 0.0921 0.8923 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032914 1 0.0707 0.8906 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1032915 1 0.0921 0.8907 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032916 1 0.0921 0.8909 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032917 1 0.3893 0.8137 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1032918 1 0.1389 0.8877 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1032919 1 0.0921 0.8904 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032922 1 0.2799 0.8763 0.884 0.000 0.008 0.108
#> SRR1032923 1 0.1489 0.8906 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032926 1 0.1022 0.8902 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032927 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032929 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032928 1 0.1302 0.8902 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1032930 1 0.1022 0.8906 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.5805 -0.0098 0.000 0.388 0.576 0.036
#> SRR1032933 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032934 1 0.0921 0.8911 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032935 1 0.1474 0.8849 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1032936 1 0.2011 0.8794 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.1474 0.8849 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1032939 1 0.2741 0.8731 0.892 0.000 0.012 0.096
#> SRR1032940 1 0.1118 0.8901 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1032941 1 0.0817 0.8902 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032942 2 0.0921 0.9426 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.1970 0.8792 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1032945 1 0.0921 0.8904 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032946 1 0.0817 0.8899 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032947 1 0.1389 0.8906 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1032948 1 0.1389 0.8892 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.2125 0.8848 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR1032951 1 0.1474 0.8849 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1032952 1 0.1118 0.8906 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1032953 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032954 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0817 0.8907 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032956 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032958 1 0.0592 0.8910 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1032959 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032960 1 0.1118 0.8903 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1032961 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032962 3 0.7001 0.4423 0.136 0.044 0.664 0.156
#> SRR1032963 1 0.1022 0.8902 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032964 1 0.1118 0.8901 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1032965 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032966 1 0.1302 0.8926 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1032967 2 0.0921 0.9426 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1032968 1 0.1118 0.8901 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1032969 1 0.1637 0.8864 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1032970 1 0.0592 0.8910 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1032971 1 0.1022 0.8902 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032972 1 0.0817 0.8912 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032973 1 0.1022 0.8902 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032974 1 0.1557 0.8874 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032975 1 0.1389 0.8892 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1032976 1 0.1489 0.8922 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1032977 3 0.3474 0.3906 0.000 0.064 0.868 0.068
#> SRR1032978 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.1022 0.8902 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032981 1 0.1022 0.8902 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032982 1 0.0592 0.8910 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1032983 1 0.1211 0.8909 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1032984 1 0.1211 0.8898 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1032985 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032986 1 0.0817 0.8912 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032987 2 0.5294 0.0731 0.000 0.508 0.484 0.008
#> SRR1032988 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032990 1 0.3813 0.8359 0.828 0.000 0.024 0.148
#> SRR1032989 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.1211 0.8925 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1032993 1 0.1022 0.8902 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032994 1 0.2329 0.8803 0.916 0.000 0.012 0.072
#> SRR1032995 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1032996 1 0.0921 0.8912 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1032997 1 0.1022 0.8902 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032998 1 0.1398 0.8903 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.3474 0.3906 0.000 0.064 0.868 0.068
#> SRR1033001 1 0.1118 0.8924 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033002 1 0.1661 0.8921 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.5294 0.0731 0.000 0.508 0.484 0.008
#> SRR1033005 1 0.1474 0.8876 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033006 1 0.4121 0.8186 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1033007 1 0.1489 0.8906 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033008 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033009 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033010 1 0.3972 0.8078 0.788 0.000 0.008 0.204
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.1970 0.8807 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033013 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033014 1 0.3972 0.8075 0.788 0.000 0.008 0.204
#> SRR1033015 1 0.4978 0.7870 0.764 0.004 0.052 0.180
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.4104 0.8257 0.808 0.000 0.028 0.164
#> SRR1033019 1 0.3893 0.8143 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033020 1 0.1637 0.8876 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033021 1 0.4050 0.8233 0.808 0.000 0.024 0.168
#> SRR1033023 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033022 1 0.1970 0.8807 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033024 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033025 1 0.1824 0.8824 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033026 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.2530 0.8714 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 1 0.4448 0.8075 0.784 0.004 0.024 0.188
#> SRR1033031 1 0.6040 0.5871 0.684 0.016 0.240 0.060
#> SRR1033032 3 0.8213 0.2885 0.360 0.044 0.456 0.140
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2443 0.8742 0.916 0.000 0.024 0.060
#> SRR1033036 1 0.1902 0.8826 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1033037 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033038 1 0.6585 0.2730 0.576 0.016 0.352 0.056
#> SRR1033039 1 0.3893 0.8140 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033040 1 0.3597 0.8604 0.836 0.000 0.016 0.148
#> SRR1033041 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033042 1 0.2142 0.8794 0.928 0.000 0.016 0.056
#> SRR1033043 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033044 1 0.1743 0.8828 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033045 1 0.3895 0.8191 0.804 0.000 0.012 0.184
#> SRR1033046 1 0.2888 0.8700 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1033047 1 0.3791 0.8130 0.796 0.000 0.004 0.200
#> SRR1033048 1 0.2342 0.8779 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR1033049 1 0.1807 0.8834 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1033051 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033052 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.4459 0.7991 0.780 0.000 0.032 0.188
#> SRR1033050 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033055 1 0.7130 0.4803 0.596 0.008 0.200 0.196
#> SRR1033056 1 0.2125 0.8856 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR1033057 1 0.2489 0.8693 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1033058 1 0.4059 0.8075 0.788 0.000 0.012 0.200
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.1398 0.8936 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033061 3 0.3548 0.3914 0.000 0.068 0.864 0.068
#> SRR1033062 1 0.4587 0.8017 0.776 0.004 0.028 0.192
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.4136 0.8068 0.788 0.000 0.016 0.196
#> SRR1033065 1 0.1824 0.8807 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033066 1 0.3351 0.8685 0.884 0.012 0.036 0.068
#> SRR1033067 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033068 1 0.4197 0.8260 0.808 0.000 0.036 0.156
#> SRR1033069 3 0.5802 0.4900 0.064 0.052 0.756 0.128
#> SRR1033070 1 0.4595 0.7989 0.776 0.000 0.040 0.184
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.5853 0.4813 0.052 0.056 0.748 0.144
#> SRR1033073 1 0.7333 0.5215 0.612 0.028 0.196 0.164
#> SRR1033074 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033075 1 0.1398 0.8934 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033076 1 0.4638 0.7986 0.776 0.000 0.044 0.180
#> SRR1033077 1 0.1637 0.8848 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033078 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033079 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033080 1 0.3933 0.8104 0.792 0.000 0.008 0.200
#> SRR1033081 1 0.1489 0.8932 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033082 1 0.2722 0.8740 0.904 0.000 0.032 0.064
#> SRR1033083 1 0.4136 0.8066 0.788 0.000 0.016 0.196
#> SRR1033084 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033085 1 0.4307 0.8067 0.784 0.000 0.024 0.192
#> SRR1033086 3 0.3548 0.3914 0.000 0.068 0.864 0.068
#> SRR1033087 1 0.1661 0.8843 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1033088 1 0.4830 0.8011 0.772 0.008 0.036 0.184
#> SRR1033089 1 0.3969 0.8209 0.804 0.000 0.016 0.180
#> SRR1033090 1 0.1637 0.8860 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033091 1 0.3852 0.8170 0.800 0.000 0.008 0.192
#> SRR1033092 1 0.3247 0.8579 0.880 0.000 0.060 0.060
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.5033 0.7866 0.760 0.000 0.072 0.168
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.4238 0.8150 0.796 0.000 0.028 0.176
#> SRR1033097 3 0.3548 0.3914 0.000 0.068 0.864 0.068
#> SRR1033098 1 0.3933 0.8104 0.792 0.000 0.008 0.200
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.3969 0.8209 0.804 0.000 0.016 0.180
#> SRR1033102 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033103 1 0.1970 0.8801 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033104 1 0.3978 0.8133 0.796 0.000 0.012 0.192
#> SRR1033105 1 0.1824 0.8819 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033106 1 0.1902 0.8898 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1033107 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033108 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033109 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033110 1 0.4204 0.8083 0.788 0.000 0.020 0.192
#> SRR1033111 1 0.2101 0.8783 0.928 0.000 0.012 0.060
#> SRR1033112 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033113 1 0.6784 0.4612 0.600 0.000 0.244 0.156
#> SRR1033114 1 0.1970 0.8793 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033115 1 0.4114 0.8019 0.828 0.000 0.112 0.060
#> SRR1033116 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033117 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033118 1 0.2999 0.8566 0.864 0.000 0.004 0.132
#> SRR1033119 1 0.1661 0.8848 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1033121 1 0.4054 0.8134 0.796 0.000 0.016 0.188
#> SRR1033120 3 0.4581 0.4525 0.028 0.068 0.828 0.076
#> SRR1033122 1 0.3351 0.8455 0.844 0.000 0.008 0.148
#> SRR1033123 1 0.1824 0.8807 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033124 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033125 1 0.4907 0.7830 0.764 0.000 0.060 0.176
#> SRR1033126 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033127 2 0.1610 0.9231 0.000 0.952 0.032 0.016
#> SRR1033129 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033128 1 0.2670 0.8691 0.904 0.000 0.024 0.072
#> SRR1033130 1 0.1557 0.8921 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033131 1 0.1661 0.8914 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1033132 1 0.4549 0.7954 0.776 0.000 0.036 0.188
#> SRR1033133 1 0.2198 0.8888 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1033134 1 0.1637 0.8847 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033135 1 0.4365 0.8029 0.784 0.000 0.028 0.188
#> SRR1033136 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033137 1 0.4459 0.7991 0.780 0.000 0.032 0.188
#> SRR1033139 3 0.7317 0.3895 0.220 0.036 0.616 0.128
#> SRR1033138 1 0.5186 0.7818 0.780 0.016 0.128 0.076
#> SRR1033140 1 0.3893 0.8143 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033141 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033144 1 0.1902 0.8827 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1033145 1 0.4204 0.8063 0.788 0.000 0.020 0.192
#> SRR1033146 3 0.6827 0.2494 0.368 0.016 0.548 0.068
#> SRR1033147 3 0.6145 0.4783 0.104 0.048 0.736 0.112
#> SRR1033148 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033149 1 0.4059 0.8075 0.788 0.000 0.012 0.200
#> SRR1033150 1 0.1824 0.8936 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033151 1 0.4679 0.7944 0.772 0.000 0.044 0.184
#> SRR1033152 1 0.1902 0.8863 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1033153 1 0.4462 0.8120 0.792 0.000 0.044 0.164
#> SRR1033154 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033156 1 0.4136 0.8074 0.788 0.000 0.016 0.196
#> SRR1033157 1 0.1743 0.8828 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033158 2 0.1637 0.9057 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1033159 1 0.3925 0.8217 0.808 0.000 0.016 0.176
#> SRR1033160 1 0.4595 0.8015 0.776 0.000 0.040 0.184
#> SRR1033161 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033163 1 0.4720 0.7930 0.768 0.000 0.044 0.188
#> SRR1033162 1 0.2335 0.8741 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1033164 3 0.8704 0.3174 0.304 0.116 0.472 0.108
#> SRR1033165 1 0.1489 0.8906 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033166 1 0.3353 0.8521 0.880 0.004 0.060 0.056
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.4307 0.8031 0.784 0.000 0.024 0.192
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.6025 0.3982 0.028 0.136 0.732 0.104
#> SRR1033170 1 0.1743 0.8825 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033172 1 0.4204 0.8070 0.788 0.000 0.020 0.192
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.3870 0.8083 0.788 0.000 0.004 0.208
#> SRR1033175 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033176 1 0.1824 0.8819 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.1970 0.8804 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033181 1 0.1557 0.8870 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033183 1 0.3933 0.8102 0.792 0.000 0.008 0.200
#> SRR1033182 1 0.1743 0.8906 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033184 1 0.4267 0.8072 0.788 0.000 0.024 0.188
#> SRR1033185 1 0.2101 0.8783 0.928 0.000 0.012 0.060
#> SRR1033187 1 0.1743 0.8901 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033186 1 0.5309 0.7275 0.756 0.008 0.164 0.072
#> SRR1033188 1 0.1489 0.8906 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033189 2 0.1284 0.9352 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1033190 1 0.2256 0.8792 0.924 0.000 0.020 0.056
#> SRR1033191 1 0.1970 0.8801 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033192 3 0.5176 0.4412 0.072 0.052 0.800 0.076
#> SRR1033193 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.4581 0.4525 0.028 0.068 0.828 0.076
#> SRR1033197 1 0.2483 0.8753 0.916 0.000 0.032 0.052
#> SRR1033196 1 0.4636 0.7941 0.772 0.000 0.040 0.188
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033200 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033201 1 0.3810 0.8188 0.804 0.000 0.008 0.188
#> SRR1033202 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033203 1 0.4136 0.8076 0.788 0.000 0.016 0.196
#> SRR1033204 1 0.1637 0.8847 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033205 1 0.3196 0.8522 0.856 0.000 0.008 0.136
#> SRR1033206 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033207 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033208 1 0.3852 0.8153 0.800 0.000 0.008 0.192
#> SRR1033209 1 0.2859 0.8624 0.880 0.000 0.008 0.112
#> SRR1033210 1 0.3893 0.8130 0.796 0.000 0.008 0.196
#> SRR1033211 1 0.1743 0.8903 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033212 1 0.4059 0.8072 0.788 0.000 0.012 0.200
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033216 1 0.1637 0.8847 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033215 2 0.3094 0.8516 0.020 0.900 0.048 0.032
#> SRR1033217 1 0.4012 0.8181 0.800 0.000 0.016 0.184
#> SRR1033218 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033219 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.1557 0.8844 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033223 1 0.3498 0.8419 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1033225 2 0.5701 0.0657 0.008 0.504 0.476 0.012
#> SRR1033224 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033226 1 0.4149 0.8203 0.804 0.000 0.028 0.168
#> SRR1033227 1 0.3196 0.8522 0.856 0.000 0.008 0.136
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.1637 0.8847 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1716 0.8878 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033232 1 0.1576 0.8882 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1033233 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.4121 0.8139 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1033236 1 0.4012 0.8166 0.800 0.000 0.016 0.184
#> SRR1033237 1 0.1305 0.8925 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033238 1 0.3636 0.8304 0.820 0.000 0.008 0.172
#> SRR1033240 1 0.3969 0.8192 0.804 0.000 0.016 0.180
#> SRR1033239 1 0.1743 0.8881 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033242 1 0.3032 0.8580 0.868 0.000 0.008 0.124
#> SRR1033241 1 0.3969 0.8189 0.804 0.000 0.016 0.180
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.4267 0.8133 0.788 0.000 0.024 0.188
#> SRR1033246 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033248 1 0.1474 0.8871 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033247 4 0.5137 0.0000 0.000 0.040 0.244 0.716
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.1637 0.8856 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033254 1 0.1637 0.8822 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.4012 0.8167 0.800 0.000 0.016 0.184
#> SRR1033258 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033257 1 0.1557 0.8860 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033259 1 0.1637 0.8847 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.4095 0.8096 0.792 0.000 0.016 0.192
#> SRR1033262 1 0.4163 0.8097 0.792 0.000 0.020 0.188
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.1743 0.8828 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1033265 2 0.0188 0.9631 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033266 1 0.1576 0.8894 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1033267 1 0.3196 0.8522 0.856 0.000 0.008 0.136
#> SRR1033268 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033269 1 0.4720 0.7876 0.768 0.000 0.044 0.188
#> SRR1033270 1 0.4095 0.8096 0.792 0.000 0.016 0.192
#> SRR1033271 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9665 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033278 1 0.1792 0.8839 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033279 1 0.4323 0.8068 0.788 0.000 0.028 0.184
#> SRR1033280 1 0.4459 0.7991 0.780 0.000 0.032 0.188
#> SRR1033281 1 0.1557 0.8836 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033282 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033283 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033284 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033285 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033286 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033287 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033288 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033289 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033290 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033291 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033292 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033293 1 0.1022 0.8917 0.968 0.000 0.000 0.032
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.3734 0.53139 0.752 0.000 0.240 0.004 0.004
#> SRR1032911 1 0.4181 0.36545 0.676 0.000 0.316 0.004 0.004
#> SRR1032912 1 0.4801 0.08668 0.584 0.000 0.396 0.012 0.008
#> SRR1032913 1 0.4505 0.15187 0.604 0.000 0.384 0.012 0.000
#> SRR1032914 1 0.4696 0.07973 0.584 0.000 0.400 0.012 0.004
#> SRR1032915 1 0.4787 -0.13384 0.540 0.000 0.444 0.008 0.008
#> SRR1032916 1 0.4876 -0.10480 0.544 0.000 0.436 0.012 0.008
#> SRR1032917 3 0.3949 0.90515 0.300 0.000 0.696 0.000 0.004
#> SRR1032918 1 0.4181 0.36545 0.676 0.000 0.316 0.004 0.004
#> SRR1032919 1 0.4891 -0.16189 0.532 0.000 0.448 0.012 0.008
#> SRR1032920 2 0.0290 0.97684 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0833 0.70360 0.976 0.000 0.016 0.004 0.004
#> SRR1032922 1 0.4794 -0.27076 0.520 0.000 0.464 0.012 0.004
#> SRR1032923 1 0.4453 0.34416 0.660 0.000 0.324 0.008 0.008
#> SRR1032925 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.2411 0.67136 0.884 0.000 0.108 0.008 0.000
#> SRR1032926 1 0.4594 0.21407 0.620 0.000 0.364 0.012 0.004
#> SRR1032927 1 0.2358 0.67353 0.888 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR1032929 1 0.2389 0.66848 0.880 0.000 0.116 0.004 0.000
#> SRR1032928 1 0.4871 -0.09366 0.548 0.000 0.432 0.012 0.008
#> SRR1032930 1 0.4871 -0.08662 0.548 0.000 0.432 0.012 0.008
#> SRR1032931 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 4 0.5172 0.21973 0.000 0.332 0.048 0.616 0.004
#> SRR1032933 1 0.2612 0.66183 0.868 0.000 0.124 0.008 0.000
#> SRR1032934 1 0.4844 -0.00559 0.564 0.000 0.416 0.012 0.008
#> SRR1032935 1 0.2886 0.64284 0.844 0.000 0.148 0.008 0.000
#> SRR1032936 1 0.4546 -0.22364 0.532 0.000 0.460 0.008 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0703 0.70339 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.4989 -0.28137 0.520 0.000 0.456 0.016 0.008
#> SRR1032940 1 0.4899 -0.19863 0.524 0.000 0.456 0.012 0.008
#> SRR1032941 1 0.4801 0.08366 0.584 0.000 0.396 0.012 0.008
#> SRR1032942 2 0.1885 0.92713 0.000 0.936 0.032 0.020 0.012
#> SRR1032943 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0579 0.69560 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1032945 1 0.4882 -0.12214 0.540 0.000 0.440 0.012 0.008
#> SRR1032946 1 0.3167 0.62190 0.820 0.000 0.172 0.004 0.004
#> SRR1032947 1 0.4891 -0.17948 0.532 0.000 0.448 0.012 0.008
#> SRR1032948 1 0.4253 0.31929 0.660 0.000 0.332 0.004 0.004
#> SRR1032949 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.4528 -0.13778 0.548 0.000 0.444 0.008 0.000
#> SRR1032951 1 0.2570 0.67086 0.880 0.000 0.108 0.008 0.004
#> SRR1032952 1 0.4765 -0.05857 0.556 0.000 0.428 0.008 0.008
#> SRR1032953 1 0.2286 0.67263 0.888 0.000 0.108 0.004 0.000
#> SRR1032954 1 0.1792 0.68586 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.4887 -0.14085 0.536 0.000 0.444 0.012 0.008
#> SRR1032956 1 0.0960 0.70330 0.972 0.000 0.016 0.008 0.004
#> SRR1032958 1 0.4791 0.10565 0.588 0.000 0.392 0.012 0.008
#> SRR1032959 1 0.2286 0.67263 0.888 0.000 0.108 0.004 0.000
#> SRR1032960 1 0.4670 -0.10472 0.548 0.000 0.440 0.008 0.004
#> SRR1032961 1 0.1329 0.70115 0.956 0.000 0.032 0.008 0.004
#> SRR1032962 4 0.6126 0.37891 0.092 0.028 0.148 0.692 0.040
#> SRR1032963 1 0.4902 -0.22218 0.520 0.000 0.460 0.012 0.008
#> SRR1032964 1 0.4902 -0.21898 0.520 0.000 0.460 0.012 0.008
#> SRR1032965 1 0.2707 0.65499 0.860 0.000 0.132 0.008 0.000
#> SRR1032966 1 0.4449 0.26179 0.636 0.000 0.352 0.008 0.004
#> SRR1032967 2 0.1885 0.92713 0.000 0.936 0.032 0.020 0.012
#> SRR1032968 1 0.4905 -0.23894 0.516 0.000 0.464 0.012 0.008
#> SRR1032969 1 0.4816 -0.36250 0.492 0.000 0.492 0.008 0.008
#> SRR1032970 1 0.4791 0.10565 0.588 0.000 0.392 0.012 0.008
#> SRR1032971 1 0.4899 -0.20222 0.524 0.000 0.456 0.012 0.008
#> SRR1032972 1 0.4819 0.05024 0.576 0.000 0.404 0.012 0.008
#> SRR1032973 1 0.4895 -0.18201 0.528 0.000 0.452 0.012 0.008
#> SRR1032974 1 0.2672 0.66608 0.872 0.000 0.116 0.008 0.004
#> SRR1032975 1 0.4253 0.31929 0.660 0.000 0.332 0.004 0.004
#> SRR1032976 1 0.4669 0.25280 0.628 0.000 0.352 0.012 0.008
#> SRR1032977 4 0.1996 0.44295 0.000 0.036 0.032 0.928 0.004
#> SRR1032978 1 0.0162 0.70205 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.4899 -0.20222 0.524 0.000 0.456 0.012 0.008
#> SRR1032981 1 0.4902 -0.21962 0.520 0.000 0.460 0.012 0.008
#> SRR1032982 1 0.4801 0.08668 0.584 0.000 0.396 0.012 0.008
#> SRR1032983 1 0.4758 -0.04349 0.560 0.000 0.424 0.008 0.008
#> SRR1032984 1 0.4811 -0.26956 0.512 0.000 0.472 0.008 0.008
#> SRR1032985 1 0.2463 0.67497 0.888 0.000 0.100 0.008 0.004
#> SRR1032986 1 0.4801 0.06987 0.584 0.000 0.396 0.012 0.008
#> SRR1032987 4 0.5122 0.13652 0.000 0.472 0.028 0.496 0.004
#> SRR1032988 1 0.2411 0.67136 0.884 0.000 0.108 0.008 0.000
#> SRR1032990 3 0.4965 0.77447 0.384 0.000 0.588 0.016 0.012
#> SRR1032989 1 0.2517 0.67234 0.884 0.000 0.104 0.008 0.004
#> SRR1032991 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.4630 0.00780 0.572 0.000 0.416 0.008 0.004
#> SRR1032993 1 0.4895 -0.19199 0.528 0.000 0.452 0.012 0.008
#> SRR1032994 1 0.4549 -0.25883 0.528 0.000 0.464 0.008 0.000
#> SRR1032995 1 0.2136 0.68225 0.904 0.000 0.088 0.008 0.000
#> SRR1032996 1 0.4722 0.02790 0.572 0.000 0.412 0.012 0.004
#> SRR1032997 1 0.4891 -0.16735 0.532 0.000 0.448 0.012 0.008
#> SRR1032998 1 0.4777 -0.10017 0.548 0.000 0.436 0.008 0.008
#> SRR1032999 2 0.0162 0.97978 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033000 4 0.1996 0.44295 0.000 0.036 0.032 0.928 0.004
#> SRR1033001 1 0.4765 -0.06381 0.556 0.000 0.428 0.008 0.008
#> SRR1033002 1 0.4727 0.02358 0.576 0.000 0.408 0.008 0.008
#> SRR1033003 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 4 0.5122 0.13652 0.000 0.472 0.028 0.496 0.004
#> SRR1033005 1 0.4804 -0.23303 0.524 0.000 0.460 0.008 0.008
#> SRR1033006 3 0.4449 0.90139 0.288 0.000 0.688 0.004 0.020
#> SRR1033007 1 0.4453 0.34416 0.660 0.000 0.324 0.008 0.008
#> SRR1033008 1 0.0162 0.70258 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0162 0.70185 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.4217 0.89185 0.280 0.000 0.704 0.004 0.012
#> SRR1033011 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0798 0.69211 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1033013 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033014 3 0.4253 0.90108 0.284 0.000 0.700 0.008 0.008
#> SRR1033015 3 0.5599 0.87802 0.316 0.004 0.612 0.056 0.012
#> SRR1033016 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.4826 0.88067 0.324 0.000 0.644 0.024 0.008
#> SRR1033019 3 0.4156 0.90515 0.288 0.000 0.700 0.008 0.004
#> SRR1033020 1 0.1478 0.69619 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033021 3 0.5006 0.75187 0.408 0.000 0.564 0.020 0.008
#> SRR1033023 1 0.0324 0.69809 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033022 1 0.0798 0.69211 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1033024 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033025 1 0.0798 0.69609 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1033026 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033027 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.4621 0.64954 0.412 0.000 0.576 0.008 0.004
#> SRR1033029 2 0.0290 0.97684 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.4608 0.89550 0.284 0.004 0.688 0.016 0.008
#> SRR1033031 1 0.5000 0.44114 0.712 0.012 0.036 0.228 0.012
#> SRR1033032 4 0.7693 0.20464 0.172 0.028 0.276 0.484 0.040
#> SRR1033033 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1281 0.68735 0.956 0.000 0.012 0.032 0.000
#> SRR1033036 1 0.0798 0.69310 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1033037 1 0.0162 0.70185 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.5807 0.24748 0.596 0.012 0.040 0.332 0.020
#> SRR1033039 3 0.3857 0.89983 0.312 0.000 0.688 0.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.4974 -0.37285 0.508 0.000 0.464 0.028 0.000
#> SRR1033041 1 0.0162 0.70185 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.1059 0.69106 0.968 0.000 0.008 0.020 0.004
#> SRR1033043 1 0.0324 0.70297 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033044 1 0.0162 0.70065 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033045 3 0.4081 0.90116 0.296 0.000 0.696 0.004 0.004
#> SRR1033046 1 0.4449 -0.41017 0.512 0.000 0.484 0.000 0.004
#> SRR1033047 3 0.3752 0.90397 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.4730 -0.06056 0.568 0.000 0.416 0.012 0.004
#> SRR1033049 1 0.0613 0.70197 0.984 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1033051 1 0.0000 0.70037 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0290 0.70086 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.4972 0.88587 0.312 0.000 0.648 0.024 0.016
#> SRR1033050 1 0.0162 0.70233 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.6934 0.63043 0.268 0.008 0.516 0.192 0.016
#> SRR1033056 1 0.4504 0.30654 0.648 0.000 0.336 0.008 0.008
#> SRR1033057 1 0.1569 0.68067 0.948 0.000 0.008 0.032 0.012
#> SRR1033058 3 0.4134 0.89920 0.284 0.000 0.704 0.004 0.008
#> SRR1033059 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.3628 0.56359 0.772 0.000 0.216 0.012 0.000
#> SRR1033061 4 0.2075 0.44445 0.000 0.040 0.032 0.924 0.004
#> SRR1033062 3 0.4587 0.88436 0.276 0.000 0.692 0.024 0.008
#> SRR1033063 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.4015 0.90448 0.284 0.000 0.708 0.004 0.004
#> SRR1033065 1 0.0693 0.69356 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1033066 1 0.2178 0.65949 0.920 0.000 0.008 0.048 0.024
#> SRR1033067 1 0.0162 0.70185 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.5087 0.85564 0.344 0.000 0.616 0.028 0.012
#> SRR1033069 4 0.4919 0.45213 0.036 0.028 0.104 0.784 0.048
#> SRR1033070 3 0.5201 0.88117 0.312 0.000 0.636 0.036 0.016
#> SRR1033071 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 4 0.5168 0.44845 0.032 0.036 0.124 0.764 0.044
#> SRR1033073 3 0.7463 0.61701 0.272 0.016 0.484 0.196 0.032
#> SRR1033074 1 0.0290 0.70290 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.3707 0.55436 0.768 0.000 0.220 0.008 0.004
#> SRR1033076 3 0.5088 0.88479 0.308 0.000 0.644 0.036 0.012
#> SRR1033077 1 0.0771 0.70365 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1033078 1 0.0162 0.70185 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033080 3 0.3957 0.89686 0.280 0.000 0.712 0.000 0.008
#> SRR1033081 1 0.3551 0.55591 0.772 0.000 0.220 0.008 0.000
#> SRR1033082 1 0.1695 0.67640 0.940 0.000 0.008 0.044 0.008
#> SRR1033083 3 0.3838 0.90132 0.280 0.000 0.716 0.000 0.004
#> SRR1033084 1 0.0162 0.70185 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.4587 0.89196 0.276 0.000 0.692 0.008 0.024
#> SRR1033086 4 0.2075 0.44445 0.000 0.040 0.032 0.924 0.004
#> SRR1033087 1 0.0486 0.70241 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033088 3 0.5045 0.87383 0.276 0.004 0.672 0.040 0.008
#> SRR1033089 3 0.4302 0.86066 0.344 0.000 0.648 0.004 0.004
#> SRR1033090 3 0.4813 0.42216 0.476 0.000 0.508 0.008 0.008
#> SRR1033091 3 0.3928 0.90332 0.296 0.000 0.700 0.004 0.000
#> SRR1033092 1 0.2110 0.66032 0.912 0.000 0.016 0.072 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.5411 0.86669 0.292 0.000 0.632 0.068 0.008
#> SRR1033095 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.4957 0.88434 0.328 0.000 0.636 0.020 0.016
#> SRR1033097 4 0.2075 0.44445 0.000 0.040 0.032 0.924 0.004
#> SRR1033098 3 0.3980 0.89954 0.284 0.000 0.708 0.000 0.008
#> SRR1033099 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.4302 0.86066 0.344 0.000 0.648 0.004 0.004
#> SRR1033102 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0613 0.69481 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1033104 3 0.4015 0.90144 0.284 0.000 0.708 0.004 0.004
#> SRR1033105 1 0.0486 0.69718 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033106 1 0.2848 0.64064 0.840 0.000 0.156 0.004 0.000
#> SRR1033107 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033108 1 0.2233 0.67803 0.892 0.000 0.104 0.004 0.000
#> SRR1033109 1 0.0404 0.70195 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.4422 0.90167 0.300 0.000 0.680 0.004 0.016
#> SRR1033111 1 0.0854 0.69168 0.976 0.000 0.008 0.012 0.004
#> SRR1033112 1 0.0162 0.69889 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.7186 0.52746 0.304 0.000 0.432 0.240 0.024
#> SRR1033114 1 0.0912 0.69844 0.972 0.000 0.012 0.016 0.000
#> SRR1033115 1 0.2907 0.62190 0.864 0.000 0.012 0.116 0.008
#> SRR1033116 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033117 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033118 3 0.4446 0.47651 0.476 0.000 0.520 0.000 0.004
#> SRR1033119 1 0.0451 0.70178 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033121 3 0.4521 0.89976 0.316 0.000 0.664 0.008 0.012
#> SRR1033120 4 0.2751 0.45968 0.020 0.040 0.044 0.896 0.000
#> SRR1033122 3 0.4645 0.66171 0.424 0.000 0.564 0.004 0.008
#> SRR1033123 1 0.0693 0.69356 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR1033124 1 0.0162 0.70047 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033125 3 0.5294 0.87381 0.304 0.000 0.632 0.056 0.008
#> SRR1033126 1 0.0451 0.69747 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033127 2 0.4361 0.69423 0.000 0.752 0.204 0.032 0.012
#> SRR1033129 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033128 1 0.1731 0.67651 0.940 0.000 0.008 0.040 0.012
#> SRR1033130 1 0.1270 0.69653 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.2179 0.67920 0.896 0.000 0.100 0.004 0.000
#> SRR1033132 3 0.4954 0.88945 0.308 0.000 0.652 0.024 0.016
#> SRR1033133 1 0.3942 0.49453 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033134 1 0.1341 0.69707 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.4895 0.89198 0.316 0.000 0.648 0.024 0.012
#> SRR1033136 1 0.0162 0.69889 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.4972 0.88587 0.312 0.000 0.648 0.024 0.016
#> SRR1033139 4 0.6295 0.32938 0.120 0.016 0.176 0.656 0.032
#> SRR1033138 1 0.4380 0.53927 0.788 0.004 0.052 0.140 0.016
#> SRR1033140 3 0.4178 0.90648 0.292 0.000 0.696 0.008 0.004
#> SRR1033141 1 0.0404 0.70366 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0833 0.69459 0.976 0.000 0.004 0.016 0.004
#> SRR1033145 3 0.4401 0.90516 0.296 0.000 0.684 0.016 0.004
#> SRR1033146 4 0.5895 0.11105 0.384 0.000 0.040 0.540 0.036
#> SRR1033147 4 0.5288 0.43336 0.080 0.028 0.100 0.760 0.032
#> SRR1033148 1 0.0566 0.70323 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1033149 3 0.4134 0.89920 0.284 0.000 0.704 0.004 0.008
#> SRR1033150 1 0.3461 0.56262 0.772 0.000 0.224 0.004 0.000
#> SRR1033151 3 0.5002 0.88409 0.312 0.000 0.644 0.036 0.008
#> SRR1033152 1 0.4288 0.33493 0.664 0.000 0.324 0.012 0.000
#> SRR1033153 3 0.5274 0.82059 0.356 0.000 0.596 0.036 0.012
#> SRR1033154 1 0.0451 0.69747 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033156 3 0.4305 0.90651 0.296 0.000 0.688 0.012 0.004
#> SRR1033157 1 0.0162 0.70065 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033158 2 0.1410 0.92251 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1033159 3 0.4403 0.89934 0.316 0.000 0.668 0.004 0.012
#> SRR1033160 3 0.4873 0.90030 0.300 0.000 0.660 0.032 0.008
#> SRR1033161 1 0.0794 0.70278 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.5055 0.88350 0.308 0.000 0.644 0.040 0.008
#> SRR1033162 1 0.1186 0.68804 0.964 0.000 0.008 0.020 0.008
#> SRR1033164 4 0.8100 0.23237 0.192 0.092 0.208 0.484 0.024
#> SRR1033165 1 0.4453 0.34416 0.660 0.000 0.324 0.008 0.008
#> SRR1033166 1 0.2456 0.65768 0.904 0.000 0.008 0.064 0.024
#> SRR1033167 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.4560 0.90180 0.304 0.000 0.672 0.016 0.008
#> SRR1033169 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 4 0.5228 0.41129 0.020 0.108 0.100 0.752 0.020
#> SRR1033170 1 0.0324 0.69853 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033172 3 0.3992 0.90207 0.280 0.000 0.712 0.004 0.004
#> SRR1033173 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.4253 0.90306 0.284 0.000 0.700 0.008 0.008
#> SRR1033175 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0486 0.69718 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1033177 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0290 0.97684 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0854 0.69290 0.976 0.000 0.004 0.012 0.008
#> SRR1033181 1 0.1012 0.69993 0.968 0.000 0.020 0.012 0.000
#> SRR1033183 3 0.3838 0.89899 0.280 0.000 0.716 0.000 0.004
#> SRR1033182 1 0.2408 0.68270 0.892 0.000 0.092 0.016 0.000
#> SRR1033184 3 0.4774 0.89531 0.308 0.000 0.660 0.020 0.012
#> SRR1033185 1 0.0968 0.69475 0.972 0.000 0.012 0.012 0.004
#> SRR1033187 1 0.4003 0.43698 0.704 0.000 0.288 0.008 0.000
#> SRR1033186 1 0.4447 0.52663 0.788 0.008 0.028 0.144 0.032
#> SRR1033188 1 0.4453 0.34416 0.660 0.000 0.324 0.008 0.008
#> SRR1033189 2 0.4180 0.71861 0.000 0.768 0.192 0.028 0.012
#> SRR1033190 1 0.1116 0.69081 0.964 0.000 0.004 0.028 0.004
#> SRR1033191 1 0.0740 0.69312 0.980 0.000 0.008 0.008 0.004
#> SRR1033192 4 0.4236 0.42530 0.044 0.028 0.052 0.832 0.044
#> SRR1033193 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 4 0.2751 0.45968 0.020 0.040 0.044 0.896 0.000
#> SRR1033197 1 0.1612 0.67841 0.948 0.000 0.012 0.024 0.016
#> SRR1033196 3 0.5088 0.88499 0.308 0.000 0.644 0.036 0.012
#> SRR1033199 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.1270 0.69946 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.3928 0.89998 0.296 0.000 0.700 0.000 0.004
#> SRR1033202 3 0.3861 0.90030 0.284 0.000 0.712 0.000 0.004
#> SRR1033203 3 0.4240 0.90500 0.304 0.000 0.684 0.004 0.008
#> SRR1033204 1 0.1270 0.69825 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.4437 -0.25167 0.532 0.000 0.464 0.004 0.000
#> SRR1033206 1 0.0290 0.70086 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.4059 0.90557 0.292 0.000 0.700 0.004 0.004
#> SRR1033209 3 0.4706 0.41447 0.492 0.000 0.496 0.008 0.004
#> SRR1033210 3 0.4015 0.90044 0.284 0.000 0.708 0.004 0.004
#> SRR1033211 1 0.4067 0.41522 0.692 0.000 0.300 0.008 0.000
#> SRR1033212 3 0.4111 0.90099 0.280 0.000 0.708 0.008 0.004
#> SRR1033213 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.2179 0.68053 0.896 0.000 0.100 0.004 0.000
#> SRR1033216 1 0.1341 0.69707 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.4985 0.60278 0.000 0.700 0.236 0.048 0.016
#> SRR1033217 3 0.4647 0.85306 0.352 0.000 0.628 0.016 0.004
#> SRR1033218 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0404 0.70263 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.4705 0.75850 0.404 0.000 0.580 0.012 0.004
#> SRR1033225 4 0.5491 0.12750 0.000 0.472 0.044 0.476 0.008
#> SRR1033224 1 0.1270 0.69946 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.5190 0.75288 0.404 0.000 0.560 0.020 0.016
#> SRR1033227 1 0.4437 -0.25167 0.532 0.000 0.464 0.004 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.1341 0.69707 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1671 0.69011 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.4380 0.18977 0.616 0.000 0.376 0.008 0.000
#> SRR1033233 1 0.0324 0.70264 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.4483 0.90206 0.308 0.000 0.672 0.012 0.008
#> SRR1033236 3 0.4398 0.90122 0.312 0.000 0.672 0.008 0.008
#> SRR1033237 1 0.3883 0.52353 0.744 0.000 0.244 0.008 0.004
#> SRR1033238 3 0.4225 0.83174 0.364 0.000 0.632 0.004 0.000
#> SRR1033240 3 0.4502 0.90114 0.312 0.000 0.668 0.008 0.012
#> SRR1033239 1 0.3969 0.40555 0.692 0.000 0.304 0.004 0.000
#> SRR1033242 1 0.4684 -0.22912 0.536 0.000 0.452 0.008 0.004
#> SRR1033241 3 0.4617 0.89968 0.316 0.000 0.660 0.016 0.008
#> SRR1033244 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.4904 0.82659 0.368 0.000 0.604 0.020 0.008
#> SRR1033246 1 0.0000 0.70037 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.1410 0.69833 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033247 5 0.2012 0.00000 0.000 0.020 0.000 0.060 0.920
#> SRR1033249 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0579 0.70068 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0404 0.70255 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0162 0.69889 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.4280 0.90143 0.312 0.000 0.676 0.004 0.008
#> SRR1033258 1 0.0510 0.70354 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.3048 0.61633 0.820 0.000 0.176 0.004 0.000
#> SRR1033259 1 0.1341 0.69707 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.4464 0.90484 0.304 0.000 0.676 0.008 0.012
#> SRR1033262 3 0.4380 0.90538 0.288 0.000 0.692 0.012 0.008
#> SRR1033263 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0162 0.70065 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033265 2 0.0162 0.97931 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033266 1 0.4456 0.33640 0.660 0.000 0.320 0.020 0.000
#> SRR1033267 1 0.4437 -0.25167 0.532 0.000 0.464 0.004 0.000
#> SRR1033268 1 0.0451 0.70139 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033269 3 0.4965 0.87774 0.320 0.000 0.640 0.032 0.008
#> SRR1033270 3 0.4464 0.90484 0.304 0.000 0.676 0.008 0.012
#> SRR1033271 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0162 0.70186 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.2124 0.68008 0.900 0.000 0.096 0.004 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.98257 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0880 0.70221 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.4449 0.26169 0.636 0.000 0.352 0.008 0.004
#> SRR1033279 3 0.4929 0.88246 0.324 0.000 0.640 0.024 0.012
#> SRR1033280 3 0.4858 0.88962 0.308 0.000 0.656 0.024 0.012
#> SRR1033281 1 0.0324 0.70199 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033282 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033283 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033284 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033285 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033286 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033287 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033288 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033289 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033290 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033291 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033292 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
#> SRR1033293 1 0.3942 0.49531 0.728 0.000 0.260 0.012 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 1 0.4452 0.3883 0.636 0.000 0.316 0.000 NA 0.000
#> SRR1032911 1 0.4856 -0.2949 0.476 0.000 0.468 0.000 NA 0.000
#> SRR1032912 3 0.5071 0.5136 0.376 0.000 0.540 0.000 NA 0.000
#> SRR1032913 3 0.5045 0.4422 0.412 0.000 0.512 0.000 NA 0.000
#> SRR1032914 3 0.5071 0.5134 0.376 0.000 0.540 0.000 NA 0.000
#> SRR1032915 3 0.4945 0.6080 0.328 0.000 0.588 0.000 NA 0.000
#> SRR1032916 3 0.4947 0.6135 0.316 0.000 0.596 0.000 NA 0.000
#> SRR1032917 3 0.2747 0.7688 0.096 0.000 0.860 0.044 NA 0.000
#> SRR1032918 1 0.4856 -0.2949 0.476 0.000 0.468 0.000 NA 0.000
#> SRR1032919 3 0.4887 0.6318 0.300 0.000 0.612 0.000 NA 0.000
#> SRR1032920 2 0.0260 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032921 1 0.1334 0.7997 0.948 0.000 0.032 0.000 NA 0.000
#> SRR1032922 3 0.5180 0.5968 0.340 0.000 0.588 0.024 NA 0.004
#> SRR1032923 1 0.4978 -0.1394 0.496 0.000 0.448 0.008 NA 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032924 1 0.3522 0.6733 0.784 0.000 0.172 0.000 NA 0.000
#> SRR1032926 3 0.5050 0.4286 0.416 0.000 0.508 0.000 NA 0.000
#> SRR1032927 1 0.3487 0.6774 0.788 0.000 0.168 0.000 NA 0.000
#> SRR1032929 1 0.3588 0.6637 0.776 0.000 0.180 0.000 NA 0.000
#> SRR1032928 3 0.4882 0.5745 0.352 0.000 0.576 0.000 NA 0.000
#> SRR1032930 3 0.4987 0.5986 0.328 0.000 0.584 0.000 NA 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032932 6 0.4853 0.2535 0.000 0.284 0.008 0.008 NA 0.648
#> SRR1032933 1 0.3652 0.6535 0.768 0.000 0.188 0.000 NA 0.000
#> SRR1032934 3 0.4985 0.5247 0.376 0.000 0.548 0.000 NA 0.000
#> SRR1032935 1 0.3830 0.6172 0.744 0.000 0.212 0.000 NA 0.000
#> SRR1032936 3 0.4697 0.5901 0.348 0.000 0.600 0.004 NA 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032938 1 0.1564 0.7987 0.936 0.000 0.040 0.000 NA 0.000
#> SRR1032939 3 0.5171 0.6246 0.320 0.000 0.604 0.024 NA 0.004
#> SRR1032940 3 0.4819 0.6503 0.284 0.000 0.628 0.000 NA 0.000
#> SRR1032941 3 0.5140 0.4822 0.392 0.000 0.520 0.000 NA 0.000
#> SRR1032942 2 0.1845 0.9016 0.000 0.916 0.000 0.004 NA 0.008
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032944 1 0.1226 0.7907 0.952 0.000 0.004 0.000 NA 0.004
#> SRR1032945 3 0.4961 0.6106 0.320 0.000 0.592 0.000 NA 0.000
#> SRR1032946 1 0.4158 0.5504 0.704 0.000 0.244 0.000 NA 0.000
#> SRR1032947 3 0.4887 0.6238 0.324 0.000 0.596 0.000 NA 0.000
#> SRR1032948 3 0.4855 0.3422 0.460 0.000 0.484 0.000 NA 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032950 3 0.4865 0.5477 0.372 0.000 0.572 0.008 NA 0.000
#> SRR1032951 1 0.3445 0.6925 0.796 0.000 0.156 0.000 NA 0.000
#> SRR1032952 3 0.4983 0.5623 0.356 0.000 0.564 0.000 NA 0.000
#> SRR1032953 1 0.3422 0.6745 0.788 0.000 0.176 0.000 NA 0.000
#> SRR1032954 1 0.2901 0.7328 0.840 0.000 0.128 0.000 NA 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032957 3 0.4904 0.6178 0.316 0.000 0.600 0.000 NA 0.000
#> SRR1032956 1 0.1498 0.7997 0.940 0.000 0.032 0.000 NA 0.000
#> SRR1032958 3 0.5086 0.4946 0.384 0.000 0.532 0.000 NA 0.000
#> SRR1032959 1 0.3319 0.6875 0.800 0.000 0.164 0.000 NA 0.000
#> SRR1032960 3 0.4868 0.6031 0.332 0.000 0.592 0.000 NA 0.000
#> SRR1032961 1 0.1908 0.7914 0.916 0.000 0.056 0.000 NA 0.000
#> SRR1032962 6 0.6278 0.2880 0.024 0.004 0.132 0.320 NA 0.512
#> SRR1032963 3 0.4819 0.6512 0.284 0.000 0.628 0.000 NA 0.000
#> SRR1032964 3 0.4819 0.6499 0.284 0.000 0.628 0.000 NA 0.000
#> SRR1032965 1 0.3773 0.6268 0.752 0.000 0.204 0.000 NA 0.000
#> SRR1032966 3 0.5034 0.3091 0.460 0.000 0.468 0.000 NA 0.000
#> SRR1032967 2 0.1845 0.9016 0.000 0.916 0.000 0.004 NA 0.008
#> SRR1032968 3 0.4801 0.6544 0.280 0.000 0.632 0.000 NA 0.000
#> SRR1032969 3 0.4694 0.6777 0.268 0.000 0.656 0.004 NA 0.000
#> SRR1032970 3 0.5086 0.4946 0.384 0.000 0.532 0.000 NA 0.000
#> SRR1032971 3 0.4837 0.6465 0.288 0.000 0.624 0.000 NA 0.000
#> SRR1032972 3 0.5095 0.5262 0.368 0.000 0.544 0.000 NA 0.000
#> SRR1032973 3 0.4854 0.6413 0.292 0.000 0.620 0.000 NA 0.000
#> SRR1032974 1 0.3530 0.6899 0.792 0.000 0.152 0.000 NA 0.000
#> SRR1032975 3 0.4855 0.3422 0.460 0.000 0.484 0.000 NA 0.000
#> SRR1032976 3 0.4992 0.2868 0.460 0.000 0.472 0.000 NA 0.000
#> SRR1032977 6 0.0622 0.4493 0.000 0.012 0.008 0.000 NA 0.980
#> SRR1032978 1 0.0820 0.8010 0.972 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032980 3 0.4837 0.6465 0.288 0.000 0.624 0.000 NA 0.000
#> SRR1032981 3 0.4819 0.6512 0.284 0.000 0.628 0.000 NA 0.000
#> SRR1032982 3 0.5071 0.5136 0.376 0.000 0.540 0.000 NA 0.000
#> SRR1032983 3 0.4903 0.5629 0.360 0.000 0.568 0.000 NA 0.000
#> SRR1032984 3 0.4738 0.6608 0.276 0.000 0.640 0.000 NA 0.000
#> SRR1032985 1 0.3516 0.6800 0.788 0.000 0.164 0.000 NA 0.000
#> SRR1032986 3 0.5112 0.4741 0.400 0.000 0.516 0.000 NA 0.000
#> SRR1032987 6 0.5017 0.1743 0.000 0.432 0.000 0.008 NA 0.508
#> SRR1032988 1 0.3522 0.6728 0.784 0.000 0.172 0.000 NA 0.000
#> SRR1032990 3 0.4481 0.7512 0.168 0.000 0.748 0.052 NA 0.016
#> SRR1032989 1 0.3516 0.6803 0.788 0.000 0.164 0.000 NA 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032992 3 0.4923 0.5479 0.368 0.000 0.560 0.000 NA 0.000
#> SRR1032993 3 0.4871 0.6441 0.296 0.000 0.616 0.000 NA 0.000
#> SRR1032994 3 0.5035 0.6159 0.336 0.000 0.600 0.012 NA 0.008
#> SRR1032995 1 0.2815 0.7408 0.848 0.000 0.120 0.000 NA 0.000
#> SRR1032996 3 0.5020 0.5239 0.372 0.000 0.548 0.000 NA 0.000
#> SRR1032997 3 0.4887 0.6343 0.300 0.000 0.612 0.000 NA 0.000
#> SRR1032998 3 0.4905 0.5840 0.344 0.000 0.580 0.000 NA 0.000
#> SRR1032999 2 0.0146 0.9739 0.000 0.996 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033000 6 0.0622 0.4493 0.000 0.012 0.008 0.000 NA 0.980
#> SRR1033001 3 0.4928 0.5750 0.352 0.000 0.572 0.000 NA 0.000
#> SRR1033002 3 0.5165 0.5384 0.372 0.000 0.548 0.008 NA 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033004 6 0.5017 0.1743 0.000 0.432 0.000 0.008 NA 0.508
#> SRR1033005 3 0.4827 0.6488 0.296 0.000 0.620 0.000 NA 0.000
#> SRR1033006 3 0.3583 0.7712 0.092 0.000 0.828 0.056 NA 0.008
#> SRR1033007 1 0.4978 -0.1394 0.496 0.000 0.448 0.008 NA 0.000
#> SRR1033008 1 0.0622 0.8011 0.980 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033009 1 0.0520 0.8000 0.984 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033010 3 0.3378 0.7613 0.076 0.000 0.844 0.056 NA 0.008
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033012 1 0.1075 0.7890 0.952 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033013 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033014 3 0.2786 0.7656 0.076 0.000 0.876 0.032 NA 0.008
#> SRR1033015 3 0.4508 0.7494 0.100 0.000 0.772 0.076 NA 0.040
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033018 3 0.3538 0.7804 0.116 0.000 0.824 0.036 NA 0.016
#> SRR1033019 3 0.3004 0.7676 0.080 0.000 0.860 0.048 NA 0.008
#> SRR1033020 1 0.2633 0.7640 0.864 0.000 0.112 0.004 NA 0.000
#> SRR1033021 3 0.4327 0.7266 0.224 0.000 0.724 0.028 NA 0.012
#> SRR1033023 1 0.0935 0.7965 0.964 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033022 1 0.1387 0.7803 0.932 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033024 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033025 1 0.1584 0.7842 0.928 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033026 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033028 3 0.4012 0.7457 0.172 0.000 0.760 0.008 NA 0.000
#> SRR1033029 2 0.0260 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033030 3 0.3177 0.7602 0.076 0.000 0.856 0.040 NA 0.024
#> SRR1033031 1 0.5822 0.4723 0.660 0.012 0.012 0.036 NA 0.172
#> SRR1033032 6 0.7344 0.1215 0.052 0.012 0.316 0.280 NA 0.336
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033034 1 0.2001 0.7798 0.912 0.000 0.008 0.000 NA 0.012
#> SRR1033036 1 0.1531 0.7802 0.928 0.000 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033037 1 0.0520 0.8005 0.984 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033038 1 0.6667 0.2306 0.548 0.012 0.012 0.048 NA 0.248
#> SRR1033039 3 0.2658 0.7718 0.100 0.000 0.864 0.036 NA 0.000
#> SRR1033040 3 0.5050 0.5171 0.344 0.000 0.596 0.016 NA 0.012
#> SRR1033041 1 0.0891 0.8017 0.968 0.000 0.024 0.000 NA 0.000
#> SRR1033042 1 0.1788 0.7738 0.916 0.000 0.000 0.004 NA 0.004
#> SRR1033043 1 0.0820 0.8004 0.972 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033044 1 0.0951 0.7994 0.968 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033045 3 0.2808 0.7640 0.076 0.000 0.868 0.048 NA 0.000
#> SRR1033046 3 0.4517 0.6864 0.288 0.000 0.664 0.024 NA 0.000
#> SRR1033047 3 0.2527 0.7677 0.084 0.000 0.876 0.040 NA 0.000
#> SRR1033048 3 0.4941 0.5372 0.368 0.000 0.572 0.004 NA 0.004
#> SRR1033049 1 0.1282 0.8003 0.956 0.000 0.012 0.004 NA 0.004
#> SRR1033051 1 0.0520 0.8011 0.984 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033052 1 0.0725 0.8002 0.976 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033054 3 0.3840 0.7432 0.084 0.000 0.816 0.068 NA 0.020
#> SRR1033050 1 0.0520 0.8006 0.984 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033055 3 0.5942 0.5165 0.068 0.000 0.640 0.172 NA 0.108
#> SRR1033056 1 0.4961 -0.1732 0.492 0.000 0.456 0.012 NA 0.000
#> SRR1033057 1 0.2215 0.7664 0.900 0.000 0.000 0.012 NA 0.012
#> SRR1033058 3 0.2950 0.7581 0.076 0.000 0.864 0.048 NA 0.004
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033060 1 0.4480 0.4606 0.648 0.000 0.304 0.004 NA 0.000
#> SRR1033061 6 0.0717 0.4508 0.000 0.016 0.008 0.000 NA 0.976
#> SRR1033062 3 0.3628 0.7501 0.076 0.000 0.832 0.060 NA 0.016
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033064 3 0.2848 0.7586 0.072 0.000 0.868 0.052 NA 0.004
#> SRR1033065 1 0.1501 0.7766 0.924 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033066 1 0.2818 0.7492 0.872 0.000 0.000 0.024 NA 0.028
#> SRR1033067 1 0.0820 0.8007 0.972 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033068 3 0.4295 0.7623 0.124 0.000 0.780 0.052 NA 0.032
#> SRR1033069 6 0.5062 0.3618 0.000 0.012 0.068 0.320 NA 0.600
#> SRR1033070 3 0.4008 0.7425 0.088 0.000 0.808 0.060 NA 0.032
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033072 6 0.5339 0.3250 0.000 0.012 0.084 0.352 NA 0.552
#> SRR1033073 3 0.6341 0.5352 0.076 0.004 0.612 0.160 NA 0.136
#> SRR1033074 1 0.0603 0.7999 0.980 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033075 1 0.4210 0.4868 0.672 0.000 0.288 0.000 NA 0.000
#> SRR1033076 3 0.3959 0.7470 0.092 0.000 0.808 0.060 NA 0.032
#> SRR1033077 1 0.1562 0.8017 0.940 0.000 0.032 0.000 NA 0.004
#> SRR1033078 1 0.0622 0.7998 0.980 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033079 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033080 3 0.2774 0.7612 0.076 0.000 0.872 0.040 NA 0.000
#> SRR1033081 1 0.4107 0.5102 0.684 0.000 0.280 0.000 NA 0.000
#> SRR1033082 1 0.2826 0.7401 0.856 0.000 0.008 0.000 NA 0.024
#> SRR1033083 3 0.2364 0.7624 0.072 0.000 0.892 0.032 NA 0.004
#> SRR1033084 1 0.0717 0.8014 0.976 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033085 3 0.3536 0.7561 0.076 0.000 0.836 0.060 NA 0.012
#> SRR1033086 6 0.0717 0.4508 0.000 0.016 0.008 0.000 NA 0.976
#> SRR1033087 1 0.0870 0.8021 0.972 0.000 0.012 0.004 NA 0.000
#> SRR1033088 3 0.4065 0.7495 0.076 0.000 0.808 0.056 NA 0.048
#> SRR1033089 3 0.3114 0.7807 0.128 0.000 0.832 0.036 NA 0.000
#> SRR1033090 3 0.4407 0.7031 0.232 0.000 0.692 0.000 NA 0.000
#> SRR1033091 3 0.2670 0.7696 0.084 0.000 0.876 0.032 NA 0.004
#> SRR1033092 1 0.2952 0.7619 0.872 0.000 0.016 0.008 NA 0.040
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033094 3 0.4488 0.7546 0.088 0.000 0.780 0.056 NA 0.060
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033096 3 0.4070 0.7669 0.108 0.000 0.796 0.064 NA 0.012
#> SRR1033097 6 0.0717 0.4508 0.000 0.016 0.008 0.000 NA 0.976
#> SRR1033098 3 0.2808 0.7583 0.076 0.000 0.868 0.048 NA 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033101 3 0.3114 0.7807 0.128 0.000 0.832 0.036 NA 0.000
#> SRR1033102 1 0.0725 0.8003 0.976 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033103 1 0.1327 0.7831 0.936 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033104 3 0.2822 0.7593 0.076 0.000 0.864 0.056 NA 0.000
#> SRR1033105 1 0.1411 0.7897 0.936 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033106 1 0.4064 0.6038 0.720 0.000 0.236 0.004 NA 0.000
#> SRR1033107 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033108 1 0.3139 0.7081 0.812 0.000 0.160 0.000 NA 0.000
#> SRR1033109 1 0.0820 0.8012 0.972 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033110 3 0.3510 0.7585 0.092 0.000 0.828 0.064 NA 0.008
#> SRR1033111 1 0.1444 0.7792 0.928 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033112 1 0.0820 0.8010 0.972 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033113 3 0.6874 0.3586 0.116 0.000 0.548 0.152 NA 0.168
#> SRR1033114 1 0.1644 0.7826 0.920 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033115 1 0.3578 0.7053 0.812 0.000 0.000 0.008 NA 0.092
#> SRR1033116 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033117 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033118 3 0.4554 0.6553 0.296 0.000 0.656 0.024 NA 0.000
#> SRR1033119 1 0.1138 0.8011 0.960 0.000 0.012 0.000 NA 0.004
#> SRR1033121 3 0.3190 0.7736 0.100 0.000 0.844 0.044 NA 0.004
#> SRR1033120 6 0.1994 0.4573 0.016 0.016 0.024 0.016 NA 0.928
#> SRR1033122 3 0.4291 0.7140 0.240 0.000 0.708 0.040 NA 0.000
#> SRR1033123 1 0.1444 0.7786 0.928 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033124 1 0.0858 0.7969 0.968 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033125 3 0.4480 0.7273 0.092 0.000 0.776 0.076 NA 0.044
#> SRR1033126 1 0.1152 0.7919 0.952 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033127 2 0.4581 0.5268 0.000 0.656 0.008 0.020 NA 0.016
#> SRR1033129 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033128 1 0.2687 0.7515 0.872 0.000 0.000 0.012 NA 0.024
#> SRR1033130 1 0.2052 0.7930 0.912 0.000 0.056 0.004 NA 0.000
#> SRR1033131 1 0.3460 0.7162 0.796 0.000 0.164 0.004 NA 0.000
#> SRR1033132 3 0.3932 0.7447 0.096 0.000 0.808 0.064 NA 0.020
#> SRR1033133 1 0.4358 0.3720 0.620 0.000 0.352 0.008 NA 0.000
#> SRR1033134 1 0.2266 0.7582 0.880 0.000 0.108 0.000 NA 0.000
#> SRR1033135 3 0.3698 0.7551 0.096 0.000 0.820 0.060 NA 0.012
#> SRR1033136 1 0.1010 0.7938 0.960 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033137 3 0.3891 0.7432 0.088 0.000 0.812 0.068 NA 0.020
#> SRR1033139 6 0.6937 0.2704 0.076 0.004 0.156 0.180 NA 0.556
#> SRR1033138 1 0.5546 0.6424 0.716 0.004 0.076 0.040 NA 0.096
#> SRR1033140 3 0.2871 0.7694 0.080 0.000 0.868 0.040 NA 0.008
#> SRR1033141 1 0.1225 0.8007 0.952 0.000 0.036 0.000 NA 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033143 1 0.0725 0.8003 0.976 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033144 1 0.1555 0.7859 0.932 0.000 0.004 0.004 NA 0.000
#> SRR1033145 3 0.3352 0.7699 0.096 0.000 0.840 0.044 NA 0.012
#> SRR1033146 6 0.7380 0.0234 0.288 0.000 0.032 0.108 NA 0.452
#> SRR1033147 6 0.6102 0.3578 0.036 0.012 0.052 0.280 NA 0.592
#> SRR1033148 1 0.1092 0.7989 0.960 0.000 0.020 0.000 NA 0.000
#> SRR1033149 3 0.2950 0.7581 0.076 0.000 0.864 0.048 NA 0.004
#> SRR1033150 1 0.4459 0.4339 0.640 0.000 0.320 0.008 NA 0.000
#> SRR1033151 3 0.4260 0.7368 0.092 0.000 0.792 0.068 NA 0.032
#> SRR1033152 1 0.4736 0.0431 0.532 0.000 0.432 0.008 NA 0.004
#> SRR1033153 3 0.4892 0.7362 0.136 0.000 0.740 0.068 NA 0.024
#> SRR1033154 1 0.1265 0.7906 0.948 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033156 3 0.2948 0.7676 0.092 0.000 0.848 0.060 NA 0.000
#> SRR1033157 1 0.1036 0.7986 0.964 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033158 2 0.1398 0.9173 0.000 0.940 0.000 0.008 NA 0.052
#> SRR1033159 3 0.3176 0.7750 0.100 0.000 0.840 0.052 NA 0.000
#> SRR1033160 3 0.4024 0.7643 0.096 0.000 0.800 0.072 NA 0.024
#> SRR1033161 1 0.1333 0.7965 0.944 0.000 0.048 0.000 NA 0.000
#> SRR1033163 3 0.4061 0.7366 0.084 0.000 0.808 0.056 NA 0.036
#> SRR1033162 1 0.1866 0.7708 0.908 0.000 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR1033164 6 0.8197 0.1681 0.076 0.048 0.252 0.096 NA 0.452
#> SRR1033165 1 0.4978 -0.1394 0.496 0.000 0.448 0.008 NA 0.000
#> SRR1033166 1 0.3982 0.6936 0.796 0.000 0.020 0.012 NA 0.044
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033168 3 0.3542 0.7691 0.096 0.000 0.832 0.044 NA 0.012
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033171 6 0.6032 0.3530 0.004 0.060 0.056 0.116 NA 0.676
#> SRR1033170 1 0.0547 0.7973 0.980 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033172 3 0.2563 0.7633 0.076 0.000 0.880 0.040 NA 0.004
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033174 3 0.2886 0.7684 0.076 0.000 0.872 0.032 NA 0.008
#> SRR1033175 1 0.0717 0.8004 0.976 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033176 1 0.1219 0.7942 0.948 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033179 2 0.0260 0.9709 0.000 0.992 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033180 1 0.1700 0.7794 0.916 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033181 1 0.1989 0.7967 0.916 0.000 0.028 0.004 NA 0.000
#> SRR1033183 3 0.2618 0.7584 0.076 0.000 0.872 0.052 NA 0.000
#> SRR1033182 1 0.3551 0.7007 0.784 0.000 0.168 0.000 NA 0.000
#> SRR1033184 3 0.3326 0.7546 0.084 0.000 0.848 0.040 NA 0.016
#> SRR1033185 1 0.1753 0.7769 0.912 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033187 1 0.4670 0.2384 0.580 0.000 0.380 0.012 NA 0.000
#> SRR1033186 1 0.5229 0.5896 0.724 0.004 0.012 0.060 NA 0.112
#> SRR1033188 1 0.4978 -0.1394 0.496 0.000 0.448 0.008 NA 0.000
#> SRR1033189 2 0.4272 0.5645 0.000 0.676 0.004 0.012 NA 0.016
#> SRR1033190 1 0.2157 0.7760 0.904 0.000 0.008 0.004 NA 0.008
#> SRR1033191 1 0.1501 0.7782 0.924 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033192 6 0.5172 0.3247 0.004 0.008 0.052 0.268 NA 0.648
#> SRR1033193 1 0.0717 0.8011 0.976 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033194 6 0.1994 0.4573 0.016 0.016 0.024 0.016 NA 0.928
#> SRR1033197 1 0.2278 0.7455 0.868 0.000 0.004 0.000 NA 0.000
#> SRR1033196 3 0.4232 0.7393 0.092 0.000 0.796 0.060 NA 0.032
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033198 1 0.0363 0.7997 0.988 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033200 1 0.1838 0.7861 0.916 0.000 0.068 0.000 NA 0.000
#> SRR1033201 3 0.2742 0.7634 0.076 0.000 0.872 0.044 NA 0.000
#> SRR1033202 3 0.2760 0.7585 0.076 0.000 0.868 0.052 NA 0.000
#> SRR1033203 3 0.3284 0.7754 0.100 0.000 0.844 0.032 NA 0.016
#> SRR1033204 1 0.2218 0.7598 0.884 0.000 0.104 0.000 NA 0.000
#> SRR1033205 3 0.4552 0.5169 0.364 0.000 0.592 0.044 NA 0.000
#> SRR1033206 1 0.0909 0.8003 0.968 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033207 1 0.0820 0.8013 0.972 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033208 3 0.2617 0.7663 0.080 0.000 0.876 0.040 NA 0.000
#> SRR1033209 3 0.4496 0.6574 0.300 0.000 0.656 0.020 NA 0.000
#> SRR1033210 3 0.2903 0.7601 0.076 0.000 0.864 0.052 NA 0.004
#> SRR1033211 1 0.4663 0.1620 0.552 0.000 0.408 0.004 NA 0.000
#> SRR1033212 3 0.2733 0.7621 0.080 0.000 0.864 0.056 NA 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033214 1 0.3065 0.7171 0.820 0.000 0.152 0.000 NA 0.000
#> SRR1033216 1 0.2266 0.7565 0.880 0.000 0.108 0.000 NA 0.000
#> SRR1033215 2 0.5429 0.3963 0.000 0.596 0.024 0.028 NA 0.032
#> SRR1033217 3 0.4058 0.7624 0.140 0.000 0.788 0.036 NA 0.016
#> SRR1033218 1 0.0622 0.7996 0.980 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033219 1 0.0458 0.8006 0.984 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033222 1 0.1176 0.8026 0.956 0.000 0.024 0.000 NA 0.000
#> SRR1033223 3 0.4286 0.7445 0.196 0.000 0.740 0.044 NA 0.004
#> SRR1033225 6 0.5470 0.1507 0.000 0.444 0.008 0.016 NA 0.476
#> SRR1033224 1 0.1838 0.7861 0.916 0.000 0.068 0.000 NA 0.000
#> SRR1033226 3 0.5057 0.6856 0.220 0.000 0.684 0.060 NA 0.016
#> SRR1033227 3 0.4552 0.5169 0.364 0.000 0.592 0.044 NA 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033228 1 0.2358 0.7549 0.876 0.000 0.108 0.000 NA 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033230 1 0.2346 0.7467 0.868 0.000 0.124 0.000 NA 0.000
#> SRR1033232 3 0.4584 0.3515 0.444 0.000 0.524 0.004 NA 0.000
#> SRR1033233 1 0.0725 0.8002 0.976 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033234 3 0.2954 0.7716 0.096 0.000 0.852 0.048 NA 0.004
#> SRR1033236 3 0.2747 0.7738 0.096 0.000 0.860 0.044 NA 0.000
#> SRR1033237 1 0.4870 0.2087 0.568 0.000 0.372 0.004 NA 0.000
#> SRR1033238 3 0.3422 0.7635 0.168 0.000 0.792 0.040 NA 0.000
#> SRR1033240 3 0.2875 0.7737 0.096 0.000 0.852 0.052 NA 0.000
#> SRR1033239 1 0.4464 0.1544 0.560 0.000 0.416 0.004 NA 0.004
#> SRR1033242 3 0.4799 0.5398 0.356 0.000 0.592 0.040 NA 0.000
#> SRR1033241 3 0.2860 0.7753 0.100 0.000 0.852 0.048 NA 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033245 3 0.4398 0.7472 0.176 0.000 0.748 0.048 NA 0.016
#> SRR1033246 1 0.0508 0.8007 0.984 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033248 1 0.1926 0.7897 0.912 0.000 0.068 0.000 NA 0.000
#> SRR1033247 4 0.5609 0.0000 0.000 0.012 0.020 0.528 NA 0.060
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033251 1 0.1693 0.7993 0.932 0.000 0.020 0.004 NA 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033253 1 0.0725 0.8012 0.976 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033254 1 0.0806 0.8012 0.972 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033255 3 0.3031 0.7726 0.108 0.000 0.844 0.044 NA 0.004
#> SRR1033258 1 0.0972 0.7999 0.964 0.000 0.028 0.000 NA 0.000
#> SRR1033257 1 0.3617 0.5823 0.736 0.000 0.244 0.000 NA 0.000
#> SRR1033259 1 0.2358 0.7549 0.876 0.000 0.108 0.000 NA 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033261 3 0.2826 0.7677 0.092 0.000 0.856 0.052 NA 0.000
#> SRR1033262 3 0.2803 0.7676 0.084 0.000 0.864 0.048 NA 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033264 1 0.0665 0.7999 0.980 0.000 0.008 0.000 NA 0.004
#> SRR1033265 2 0.0146 0.9734 0.000 0.996 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033266 1 0.5018 0.0976 0.536 0.000 0.396 0.004 NA 0.000
#> SRR1033267 3 0.4552 0.5169 0.364 0.000 0.592 0.044 NA 0.000
#> SRR1033268 1 0.0993 0.8007 0.964 0.000 0.012 0.000 NA 0.000
#> SRR1033269 3 0.4321 0.7437 0.124 0.000 0.780 0.052 NA 0.020
#> SRR1033270 3 0.2826 0.7677 0.092 0.000 0.856 0.052 NA 0.000
#> SRR1033271 1 0.0820 0.8013 0.972 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033273 1 0.0717 0.8016 0.976 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033275 1 0.2949 0.7251 0.832 0.000 0.140 0.000 NA 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9767 0.000 1.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033277 1 0.1500 0.7937 0.936 0.000 0.052 0.000 NA 0.000
#> SRR1033278 1 0.5071 0.0796 0.536 0.000 0.396 0.008 NA 0.000
#> SRR1033279 3 0.3723 0.7490 0.088 0.000 0.824 0.056 NA 0.016
#> SRR1033280 3 0.3706 0.7471 0.092 0.000 0.824 0.052 NA 0.020
#> SRR1033281 1 0.0820 0.8018 0.972 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033282 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033283 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033284 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033285 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033286 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033287 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033288 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033289 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033290 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033291 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033292 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
#> SRR1033293 1 0.4897 0.2715 0.588 0.000 0.344 0.004 NA 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.981 0.992 0.2870 0.717 0.717
#> 3 3 0.886 0.923 0.968 1.0976 0.674 0.549
#> 4 4 0.748 0.843 0.890 0.1989 0.826 0.585
#> 5 5 0.865 0.877 0.919 0.0707 0.944 0.796
#> 6 6 0.852 0.816 0.874 0.0315 0.983 0.929
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.9358 0.4585 0.352 0.648
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.7219 0.7465 0.800 0.200
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033000 1 0.5294 0.8593 0.880 0.120
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033061 1 0.9661 0.3492 0.608 0.392
#> SRR1033062 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.1184 0.9777 0.984 0.016
#> SRR1033070 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.7602 0.7145 0.780 0.220
#> SRR1033073 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.9608 0.3785 0.384 0.616
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033120 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033129 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0938 0.9818 0.988 0.012
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033171 1 0.6343 0.8058 0.840 0.160
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.0376 0.9897 0.996 0.004
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033194 1 0.9661 0.3493 0.608 0.392
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.9998 0.0188 0.508 0.492
#> SRR1033217 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.5629 0.8419 0.132 0.868
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9862 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.9935 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.6291 0.17550 0.532 0.000 0.468
#> SRR1032923 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.5497 0.59046 0.000 0.292 0.708
#> SRR1032933 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.5178 0.68552 0.744 0.000 0.256
#> SRR1032940 1 0.0237 0.95352 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032941 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.6008 0.45085 0.628 0.000 0.372
#> SRR1032948 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0237 0.95358 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032951 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 3 0.6204 0.23539 0.424 0.000 0.576
#> SRR1032970 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.3340 0.84441 0.000 0.120 0.880
#> SRR1032978 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0237 0.95351 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032993 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.5497 0.61868 0.708 0.000 0.292
#> SRR1032995 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.4842 0.73035 0.776 0.000 0.224
#> SRR1032999 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.1411 0.92899 0.000 0.036 0.964
#> SRR1033001 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.3551 0.84566 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033006 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.1411 0.92878 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033024 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.4062 0.80647 0.836 0.000 0.164
#> SRR1033026 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033031 3 0.4452 0.72820 0.192 0.000 0.808
#> SRR1033032 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.5810 0.52635 0.664 0.000 0.336
#> SRR1033036 1 0.4702 0.74513 0.788 0.000 0.212
#> SRR1033037 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.2400 0.88791 0.064 0.004 0.932
#> SRR1033039 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.4702 0.74513 0.788 0.000 0.212
#> SRR1033043 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033046 3 0.5835 0.45372 0.340 0.000 0.660
#> SRR1033047 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033048 3 0.4842 0.67588 0.224 0.000 0.776
#> SRR1033049 1 0.2066 0.90875 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033051 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.4702 0.74523 0.788 0.000 0.212
#> SRR1033058 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.3482 0.84587 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033061 3 0.2448 0.89102 0.000 0.076 0.924
#> SRR1033062 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.4291 0.78751 0.820 0.000 0.180
#> SRR1033066 1 0.4750 0.73948 0.784 0.000 0.216
#> SRR1033067 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033069 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 3 0.5926 0.43499 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033083 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033086 3 0.4555 0.74322 0.000 0.200 0.800
#> SRR1033087 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033089 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033090 1 0.1163 0.93463 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033091 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.4504 0.76699 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033093 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033097 2 0.1289 0.95851 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033098 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.4504 0.76689 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033115 1 0.6140 0.35912 0.596 0.000 0.404
#> SRR1033116 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 1 0.5098 0.67609 0.752 0.000 0.248
#> SRR1033119 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033120 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033122 3 0.3816 0.78431 0.148 0.000 0.852
#> SRR1033123 1 0.4654 0.75067 0.792 0.000 0.208
#> SRR1033124 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033126 1 0.4235 0.79202 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033127 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.6291 0.15695 0.532 0.000 0.468
#> SRR1033130 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033133 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033139 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033138 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.5216 0.67172 0.740 0.000 0.260
#> SRR1033145 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033146 3 0.4504 0.72272 0.196 0.000 0.804
#> SRR1033147 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033154 1 0.4002 0.81108 0.840 0.000 0.160
#> SRR1033156 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033162 1 0.4887 0.72199 0.772 0.000 0.228
#> SRR1033164 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 3 0.4605 0.71164 0.204 0.000 0.796
#> SRR1033167 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.2261 0.90198 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033181 1 0.0747 0.94465 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033183 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033185 1 0.0747 0.94456 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033187 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 3 0.3686 0.79677 0.140 0.000 0.860
#> SRR1033188 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0237 0.98707 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033190 1 0.4702 0.74527 0.788 0.000 0.212
#> SRR1033191 1 0.4062 0.80652 0.836 0.000 0.164
#> SRR1033192 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.4346 0.76531 0.000 0.184 0.816
#> SRR1033197 1 0.4178 0.79699 0.828 0.000 0.172
#> SRR1033196 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.5810 0.50723 0.664 0.000 0.336
#> SRR1033206 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 1 0.4452 0.76027 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033210 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033212 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.2959 0.86885 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033225 2 0.6308 0.00239 0.000 0.508 0.492
#> SRR1033224 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.5882 0.43673 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033227 1 0.5988 0.43221 0.632 0.000 0.368
#> SRR1033229 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.1163 0.93456 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033241 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.4605 0.73739 0.000 0.204 0.796
#> SRR1033249 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.5968 0.44414 0.636 0.000 0.364
#> SRR1033268 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.99094 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.95950 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.95647 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032920 2 0.0817 0.9797 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.4713 0.7259 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1032922 1 0.7155 0.3495 0.504 0.000 0.352 0.144
#> SRR1032923 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032925 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032926 4 0.0336 0.9271 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1032927 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032929 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.7922 0.0445 0.320 0.336 0.344 0.000
#> SRR1032933 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032934 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032935 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032936 4 0.0469 0.9235 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032937 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.4761 0.7120 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1032939 1 0.6198 0.7078 0.672 0.000 0.176 0.152
#> SRR1032940 4 0.0188 0.9299 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032941 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 2 0.0921 0.9800 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1032945 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032947 4 0.4283 0.6060 0.004 0.000 0.256 0.740
#> SRR1032948 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.5512 -0.4405 0.488 0.000 0.016 0.496
#> SRR1032951 4 0.0469 0.9241 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1032952 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032954 4 0.2408 0.8089 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1032955 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 1 0.4790 0.7018 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1032958 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032960 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032961 1 0.4790 0.7018 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1032962 3 0.4454 0.7112 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR1032963 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 2 0.0921 0.9799 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 4 0.4500 0.5000 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1032970 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 4 0.3726 0.6033 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1032975 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032977 3 0.6701 0.5704 0.328 0.108 0.564 0.000
#> SRR1032978 1 0.4040 0.8121 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1032979 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 4 0.0188 0.9299 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032984 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032986 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 2 0.0469 0.9781 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032990 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032989 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032991 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.1059 0.9145 0.012 0.000 0.016 0.972
#> SRR1032993 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 1 0.7744 0.4353 0.440 0.000 0.292 0.268
#> SRR1032995 4 0.0592 0.9204 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032996 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 4 0.6784 0.3103 0.156 0.000 0.244 0.600
#> SRR1032999 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.5492 0.6601 0.328 0.032 0.640 0.000
#> SRR1033001 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033002 1 0.5329 0.5933 0.568 0.000 0.012 0.420
#> SRR1033003 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0469 0.9781 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0707 0.9180 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1033006 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033007 4 0.0336 0.9271 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033008 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033009 1 0.4500 0.7662 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1033010 3 0.0817 0.9056 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033011 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.3529 0.8457 0.836 0.000 0.012 0.152
#> SRR1033013 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033014 3 0.0469 0.9099 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1033015 3 0.0592 0.9149 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033016 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0336 0.9806 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0592 0.9149 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033019 3 0.0592 0.9090 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033020 1 0.5127 0.7254 0.632 0.000 0.012 0.356
#> SRR1033021 3 0.2466 0.8658 0.096 0.000 0.900 0.004
#> SRR1033023 1 0.3577 0.8459 0.832 0.000 0.012 0.156
#> SRR1033022 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1033024 3 0.0336 0.9105 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033025 1 0.3547 0.8437 0.840 0.000 0.016 0.144
#> SRR1033026 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033027 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033029 2 0.0817 0.9797 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0817 0.9056 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033031 1 0.1716 0.7083 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1033032 3 0.3907 0.7857 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1033033 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.3441 0.8281 0.856 0.000 0.024 0.120
#> SRR1033036 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033037 1 0.3636 0.8443 0.820 0.000 0.008 0.172
#> SRR1033038 1 0.1637 0.7066 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1033039 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033040 3 0.3610 0.7864 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1033041 1 0.4137 0.8318 0.780 0.000 0.012 0.208
#> SRR1033042 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033043 1 0.4713 0.7258 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1033044 1 0.3494 0.8439 0.824 0.000 0.004 0.172
#> SRR1033045 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033046 3 0.1677 0.8831 0.012 0.000 0.948 0.040
#> SRR1033047 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033048 3 0.5464 0.6365 0.212 0.000 0.716 0.072
#> SRR1033049 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1033051 1 0.4382 0.7811 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1033052 1 0.3577 0.8459 0.832 0.000 0.012 0.156
#> SRR1033053 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033050 1 0.4730 0.7216 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1033055 3 0.0817 0.9056 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033056 4 0.1042 0.9148 0.020 0.000 0.008 0.972
#> SRR1033057 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033058 3 0.0707 0.9068 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033059 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.3658 0.8435 0.836 0.000 0.020 0.144
#> SRR1033061 3 0.6295 0.6008 0.348 0.072 0.580 0.000
#> SRR1033062 3 0.0817 0.9056 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033063 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033065 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033066 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033067 1 0.3569 0.8372 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033068 3 0.0469 0.9157 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1033069 3 0.4522 0.6972 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033070 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033071 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.4406 0.7201 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1033073 3 0.1389 0.8955 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033074 1 0.4790 0.7018 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033075 4 0.0524 0.9252 0.008 0.000 0.004 0.988
#> SRR1033076 3 0.0592 0.9143 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033077 1 0.3718 0.8450 0.820 0.000 0.012 0.168
#> SRR1033078 1 0.4072 0.8098 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1033079 3 0.0188 0.9123 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033080 3 0.0817 0.9056 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033081 1 0.5392 0.5410 0.528 0.000 0.012 0.460
#> SRR1033082 1 0.1975 0.7375 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR1033083 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033084 1 0.4790 0.7018 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033085 3 0.0469 0.9099 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1033086 3 0.7630 0.3633 0.312 0.228 0.460 0.000
#> SRR1033087 1 0.3400 0.8419 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1033088 3 0.0817 0.9056 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033089 3 0.0524 0.9149 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1033090 4 0.0336 0.9271 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033091 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033092 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033093 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0707 0.9116 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033095 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033097 2 0.3324 0.8853 0.136 0.852 0.012 0.000
#> SRR1033098 3 0.0469 0.9099 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033102 1 0.4830 0.6830 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1033103 1 0.3529 0.8457 0.836 0.000 0.012 0.152
#> SRR1033104 3 0.0188 0.9153 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033105 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1033106 1 0.4844 0.7764 0.688 0.000 0.012 0.300
#> SRR1033107 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033108 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033109 1 0.4936 0.7430 0.652 0.000 0.008 0.340
#> SRR1033110 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033111 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1033112 1 0.3808 0.8433 0.812 0.000 0.012 0.176
#> SRR1033113 3 0.0921 0.9122 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1033114 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033115 1 0.2565 0.7751 0.912 0.000 0.032 0.056
#> SRR1033116 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033117 3 0.0336 0.9105 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033118 4 0.4103 0.6155 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1033119 1 0.3577 0.8459 0.832 0.000 0.012 0.156
#> SRR1033121 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033120 3 0.4564 0.6875 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1033122 3 0.4295 0.6566 0.008 0.000 0.752 0.240
#> SRR1033123 1 0.3554 0.8397 0.844 0.000 0.020 0.136
#> SRR1033124 1 0.3625 0.8458 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1033125 3 0.4040 0.7492 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR1033126 1 0.3547 0.8437 0.840 0.000 0.016 0.144
#> SRR1033127 3 0.3032 0.8482 0.124 0.008 0.868 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9139 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.2589 0.7641 0.912 0.000 0.044 0.044
#> SRR1033130 1 0.5127 0.7252 0.632 0.000 0.012 0.356
#> SRR1033131 1 0.3625 0.8458 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1033132 3 0.1211 0.9054 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1033133 3 0.2469 0.8606 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1033134 4 0.3942 0.5575 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1033135 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033136 1 0.3529 0.8457 0.836 0.000 0.012 0.152
#> SRR1033137 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033139 3 0.4543 0.6926 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR1033138 1 0.4855 -0.0448 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1033140 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033141 1 0.4978 0.7570 0.664 0.000 0.012 0.324
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033144 1 0.3501 0.8370 0.848 0.000 0.020 0.132
#> SRR1033145 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033146 1 0.1637 0.7066 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1033147 3 0.4564 0.6875 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1033148 4 0.4250 0.4474 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1033149 3 0.0592 0.9079 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033150 1 0.5174 0.7146 0.620 0.000 0.012 0.368
#> SRR1033151 3 0.1118 0.9083 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1033152 4 0.2300 0.8570 0.064 0.000 0.016 0.920
#> SRR1033153 3 0.4406 0.6665 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1033154 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033156 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033157 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1033158 2 0.1118 0.9687 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033160 3 0.0469 0.9157 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1033161 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033163 3 0.1211 0.9062 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1033162 1 0.3554 0.8397 0.844 0.000 0.020 0.136
#> SRR1033164 3 0.3907 0.7855 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1033165 4 0.0188 0.9299 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033166 1 0.1557 0.7087 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.3873 0.7885 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1033170 1 0.3718 0.8451 0.820 0.000 0.012 0.168
#> SRR1033172 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0336 0.9148 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033175 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033176 1 0.3529 0.8457 0.836 0.000 0.012 0.152
#> SRR1033177 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0817 0.9797 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1033181 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1033183 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033182 1 0.3672 0.8458 0.824 0.000 0.012 0.164
#> SRR1033184 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033185 1 0.3479 0.8450 0.840 0.000 0.012 0.148
#> SRR1033187 4 0.0188 0.9302 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033186 1 0.1557 0.7087 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1033188 4 0.0336 0.9271 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033189 2 0.3088 0.8951 0.128 0.864 0.008 0.000
#> SRR1033190 1 0.3554 0.8397 0.844 0.000 0.020 0.136
#> SRR1033191 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033192 3 0.4564 0.6875 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1033193 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.7321 0.4612 0.328 0.172 0.500 0.000
#> SRR1033197 1 0.3606 0.8420 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033196 3 0.3801 0.7694 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1033199 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.4817 0.6899 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1033200 4 0.0469 0.9252 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033201 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033202 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033203 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033204 4 0.4008 0.5377 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1033205 4 0.4843 0.3184 0.000 0.000 0.396 0.604
#> SRR1033206 1 0.4776 0.7069 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1033207 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033208 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033209 4 0.3047 0.7965 0.012 0.000 0.116 0.872
#> SRR1033210 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033211 4 0.0188 0.9302 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033212 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033213 2 0.0707 0.9761 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.2921 0.7517 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR1033216 4 0.4040 0.5275 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1033215 3 0.2530 0.8592 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1033217 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033218 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033219 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033221 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.4776 0.7069 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1033223 4 0.5536 0.3413 0.024 0.000 0.384 0.592
#> SRR1033225 2 0.6609 0.5297 0.144 0.620 0.236 0.000
#> SRR1033224 4 0.0336 0.9282 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033226 3 0.4800 0.6808 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR1033227 3 0.5281 0.1184 0.008 0.000 0.528 0.464
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.0336 0.9282 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033232 4 0.0524 0.9275 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR1033233 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033236 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033237 4 0.0000 0.9319 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033238 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033240 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033239 4 0.0927 0.9143 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR1033242 4 0.1211 0.8890 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1033241 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033244 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0469 0.9146 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1033246 1 0.3873 0.8231 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1033248 4 0.4898 -0.1472 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1033247 1 0.6907 0.1470 0.588 0.172 0.240 0.000
#> SRR1033249 2 0.0469 0.9806 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.3529 0.8457 0.836 0.000 0.012 0.152
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.4713 0.7259 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1033254 1 0.3610 0.8353 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033258 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033257 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033259 4 0.0336 0.9282 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033262 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033263 2 0.0188 0.9804 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3486 0.8393 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033265 2 0.0592 0.9805 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.4746 0.3137 0.304 0.000 0.008 0.688
#> SRR1033267 3 0.5360 0.1976 0.012 0.000 0.552 0.436
#> SRR1033268 1 0.3625 0.8458 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1033269 3 0.0592 0.9146 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033270 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033271 1 0.4804 0.6963 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9802 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.3583 0.8424 0.816 0.000 0.004 0.180
#> SRR1033274 2 0.0188 0.9804 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0188 0.9304 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033276 2 0.0921 0.9793 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0817 0.9125 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1033278 4 0.0336 0.9271 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033279 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033280 3 0.0336 0.9165 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033281 1 0.3625 0.8458 0.828 0.000 0.012 0.160
#> SRR1033282 4 0.0188 0.9302 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033283 4 0.0188 0.9302 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033284 4 0.0188 0.9302 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033285 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1033286 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1033287 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1033288 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1033289 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1033290 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1033291 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1033292 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1033293 4 0.0657 0.9245 0.004 0.000 0.012 0.984
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.2520 0.8820 0.048 0.000 0.000 0.896 0.056
#> SRR1032911 4 0.0865 0.8992 0.024 0.000 0.000 0.972 0.004
#> SRR1032912 4 0.0609 0.8995 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032913 4 0.0609 0.8995 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032914 4 0.1012 0.8996 0.020 0.000 0.000 0.968 0.012
#> SRR1032915 4 0.1106 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.964 0.012
#> SRR1032916 4 0.1106 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.964 0.012
#> SRR1032917 3 0.0794 0.9375 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032918 4 0.0865 0.8992 0.024 0.000 0.000 0.972 0.004
#> SRR1032919 4 0.1117 0.8991 0.020 0.000 0.000 0.964 0.016
#> SRR1032920 2 0.0671 0.9759 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1032921 1 0.0566 0.9110 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1032922 1 0.4912 0.5488 0.700 0.000 0.236 0.008 0.056
#> SRR1032923 4 0.0609 0.8995 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032925 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1032924 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032926 4 0.2722 0.8762 0.020 0.000 0.000 0.872 0.108
#> SRR1032927 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032929 4 0.0865 0.8992 0.024 0.000 0.000 0.972 0.004
#> SRR1032928 4 0.1117 0.8991 0.020 0.000 0.000 0.964 0.016
#> SRR1032930 4 0.1012 0.8996 0.020 0.000 0.000 0.968 0.012
#> SRR1032931 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1032932 5 0.3640 0.8309 0.008 0.072 0.084 0.000 0.836
#> SRR1032933 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032934 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032935 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032936 4 0.3113 0.8708 0.020 0.000 0.016 0.864 0.100
#> SRR1032937 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1032938 1 0.0566 0.9110 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1032939 1 0.3827 0.7618 0.816 0.000 0.112 0.004 0.068
#> SRR1032940 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032941 4 0.0992 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008
#> SRR1032942 2 0.0865 0.9760 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1032943 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1032944 1 0.1270 0.8975 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1032945 4 0.1106 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.964 0.012
#> SRR1032946 4 0.0865 0.8992 0.024 0.000 0.000 0.972 0.004
#> SRR1032947 4 0.4675 0.5944 0.020 0.000 0.256 0.704 0.020
#> SRR1032948 4 0.0703 0.8995 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1032949 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1032950 1 0.3283 0.7765 0.832 0.000 0.000 0.140 0.028
#> SRR1032951 4 0.1205 0.8953 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1032952 4 0.1117 0.8991 0.020 0.000 0.000 0.964 0.016
#> SRR1032953 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032954 4 0.3093 0.8117 0.168 0.000 0.000 0.824 0.008
#> SRR1032955 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1032957 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032956 1 0.1282 0.8985 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1032958 4 0.0703 0.8995 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1032959 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032960 4 0.1117 0.8991 0.020 0.000 0.000 0.964 0.016
#> SRR1032961 1 0.1205 0.9011 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1032962 5 0.3282 0.8602 0.008 0.000 0.188 0.000 0.804
#> SRR1032963 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032964 4 0.1106 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.964 0.012
#> SRR1032965 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032966 4 0.0703 0.8995 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1032967 2 0.0671 0.9759 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1032968 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032969 4 0.2922 0.8377 0.024 0.000 0.080 0.880 0.016
#> SRR1032970 4 0.1106 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.964 0.012
#> SRR1032971 4 0.1106 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.964 0.012
#> SRR1032972 4 0.0898 0.8999 0.020 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR1032973 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032974 4 0.3491 0.7080 0.228 0.000 0.000 0.768 0.004
#> SRR1032975 4 0.0703 0.8995 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1032976 4 0.2193 0.8909 0.028 0.000 0.000 0.912 0.060
#> SRR1032977 5 0.4048 0.8746 0.036 0.016 0.136 0.004 0.808
#> SRR1032978 1 0.0324 0.9127 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1032979 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1032980 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032981 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032982 4 0.1012 0.8996 0.020 0.000 0.000 0.968 0.012
#> SRR1032983 4 0.2773 0.8749 0.020 0.000 0.000 0.868 0.112
#> SRR1032984 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1032985 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032986 4 0.0992 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008
#> SRR1032987 2 0.0865 0.9678 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1032988 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032990 3 0.1282 0.9342 0.000 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR1032989 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1032991 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1032992 4 0.4494 0.8404 0.056 0.000 0.036 0.788 0.120
#> SRR1032993 4 0.1117 0.8991 0.020 0.000 0.000 0.964 0.016
#> SRR1032994 1 0.6554 0.2720 0.552 0.000 0.312 0.080 0.056
#> SRR1032995 4 0.1768 0.8853 0.072 0.000 0.000 0.924 0.004
#> SRR1032996 4 0.0609 0.8995 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032997 4 0.1106 0.9001 0.024 0.000 0.000 0.964 0.012
#> SRR1032998 4 0.6492 0.3985 0.240 0.000 0.184 0.560 0.016
#> SRR1032999 2 0.0671 0.9759 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033000 5 0.3925 0.8757 0.036 0.008 0.144 0.004 0.808
#> SRR1033001 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1033002 1 0.3282 0.7408 0.804 0.000 0.000 0.188 0.008
#> SRR1033003 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033004 2 0.0865 0.9678 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033005 4 0.1372 0.8990 0.024 0.000 0.004 0.956 0.016
#> SRR1033006 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033007 4 0.3921 0.8530 0.048 0.000 0.012 0.812 0.128
#> SRR1033008 1 0.1981 0.8834 0.920 0.000 0.000 0.016 0.064
#> SRR1033009 1 0.0324 0.9127 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033010 3 0.1197 0.9232 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033011 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033012 1 0.0290 0.9126 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033013 3 0.0703 0.9399 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033014 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0703 0.9413 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033016 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.1851 0.8857 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033019 3 0.0703 0.9401 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033020 1 0.1697 0.8887 0.932 0.000 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033021 3 0.2722 0.8132 0.108 0.000 0.872 0.000 0.020
#> SRR1033023 1 0.0290 0.9126 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033022 1 0.1043 0.9034 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033024 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.1341 0.8957 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033028 3 0.0912 0.9378 0.000 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR1033029 2 0.0671 0.9759 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033030 3 0.0510 0.9418 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033031 1 0.4287 0.1387 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1033032 5 0.3835 0.7807 0.008 0.000 0.260 0.000 0.732
#> SRR1033033 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033035 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033034 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033036 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9130 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 5 0.3109 0.7332 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1033039 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.2149 0.8851 0.048 0.000 0.916 0.000 0.036
#> SRR1033041 1 0.0290 0.9129 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033042 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033043 1 0.0451 0.9118 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033044 1 0.0510 0.9130 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 3 0.1341 0.9170 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033047 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.3919 0.6604 0.188 0.000 0.776 0.000 0.036
#> SRR1033049 1 0.1478 0.8906 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033051 1 0.0324 0.9127 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9130 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033054 3 0.0510 0.9443 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033050 1 0.0579 0.9109 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033055 3 0.0609 0.9412 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033056 4 0.6093 0.6504 0.236 0.000 0.020 0.616 0.128
#> SRR1033057 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033058 3 0.0510 0.9418 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033059 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033060 1 0.0510 0.9112 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033061 5 0.3387 0.8715 0.024 0.008 0.132 0.000 0.836
#> SRR1033062 3 0.0703 0.9377 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033063 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033066 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033067 1 0.0162 0.9129 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033068 3 0.0609 0.9429 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033069 5 0.3527 0.8690 0.024 0.000 0.172 0.000 0.804
#> SRR1033070 3 0.0510 0.9443 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033071 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033072 5 0.3282 0.8602 0.008 0.000 0.188 0.000 0.804
#> SRR1033073 3 0.4268 -0.0153 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1033074 1 0.0693 0.9101 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033075 4 0.5367 0.7518 0.168 0.000 0.012 0.696 0.124
#> SRR1033076 3 0.0703 0.9413 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033077 1 0.0162 0.9130 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033078 1 0.0324 0.9127 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0510 0.9418 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033081 1 0.3184 0.8272 0.852 0.000 0.000 0.048 0.100
#> SRR1033082 1 0.1965 0.8607 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0992 0.9060 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1033085 3 0.0290 0.9460 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033086 5 0.3732 0.8474 0.004 0.056 0.120 0.000 0.820
#> SRR1033087 1 0.0162 0.9130 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033088 3 0.1043 0.9285 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033089 3 0.1121 0.9269 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033090 4 0.1211 0.8998 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.1341 0.8954 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033093 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033094 3 0.1043 0.9316 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033095 2 0.0671 0.9759 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033096 3 0.0880 0.9427 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033097 5 0.3550 0.6213 0.000 0.236 0.000 0.004 0.760
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0324 0.9749 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033100 2 0.1124 0.9621 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033101 3 0.1043 0.9297 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033102 1 0.2270 0.8720 0.904 0.000 0.000 0.020 0.076
#> SRR1033103 1 0.0404 0.9121 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0609 0.9104 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033106 1 0.1638 0.8897 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1033107 3 0.0609 0.9419 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033108 4 0.1331 0.8974 0.040 0.000 0.000 0.952 0.008
#> SRR1033109 1 0.1251 0.9010 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR1033110 3 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033111 1 0.0963 0.9055 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033112 1 0.0290 0.9129 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033113 3 0.1608 0.9051 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033114 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033115 1 0.1908 0.8652 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033116 3 0.0794 0.9380 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 4 0.5759 0.4471 0.000 0.000 0.324 0.568 0.108
#> SRR1033119 1 0.0162 0.9130 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 5 0.3655 0.8729 0.036 0.000 0.160 0.000 0.804
#> SRR1033122 3 0.1877 0.8979 0.000 0.000 0.924 0.012 0.064
#> SRR1033123 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033124 1 0.0162 0.9130 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033125 3 0.2824 0.8240 0.020 0.000 0.864 0.000 0.116
#> SRR1033126 1 0.0963 0.9052 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033127 5 0.3715 0.7781 0.000 0.004 0.260 0.000 0.736
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.1965 0.8607 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033130 1 0.1809 0.8879 0.928 0.000 0.000 0.012 0.060
#> SRR1033131 1 0.0162 0.9130 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033132 3 0.0880 0.9368 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033133 3 0.1549 0.9293 0.016 0.000 0.944 0.000 0.040
#> SRR1033134 4 0.5604 0.1962 0.456 0.000 0.000 0.472 0.072
#> SRR1033135 3 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033136 1 0.0162 0.9130 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033137 3 0.0510 0.9443 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033139 5 0.3513 0.8653 0.020 0.000 0.180 0.000 0.800
#> SRR1033138 5 0.4433 0.7515 0.200 0.000 0.060 0.000 0.740
#> SRR1033140 3 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033141 1 0.1168 0.9036 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2046 0.8805 0.916 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1033144 1 0.1608 0.8850 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033145 3 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033146 5 0.3424 0.6816 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1033147 5 0.3655 0.8729 0.036 0.000 0.160 0.000 0.804
#> SRR1033148 4 0.4953 0.2839 0.440 0.000 0.000 0.532 0.028
#> SRR1033149 3 0.0290 0.9457 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033150 1 0.2813 0.8431 0.868 0.000 0.000 0.024 0.108
#> SRR1033151 3 0.0880 0.9369 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033152 1 0.6508 0.2010 0.520 0.000 0.020 0.332 0.128
#> SRR1033153 3 0.5164 0.4139 0.256 0.000 0.660 0.000 0.084
#> SRR1033154 1 0.1043 0.9035 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033156 3 0.0794 0.9375 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033157 1 0.0703 0.9092 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033158 2 0.3884 0.6082 0.000 0.708 0.000 0.004 0.288
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0798 0.9093 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1033163 3 0.1124 0.9318 0.004 0.000 0.960 0.000 0.036
#> SRR1033162 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033164 5 0.3231 0.8530 0.004 0.000 0.196 0.000 0.800
#> SRR1033165 4 0.3921 0.8530 0.048 0.000 0.012 0.812 0.128
#> SRR1033166 1 0.2966 0.7674 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033167 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033171 5 0.3318 0.8569 0.008 0.000 0.192 0.000 0.800
#> SRR1033170 1 0.0290 0.9128 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033174 3 0.0162 0.9474 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033175 1 0.1331 0.8996 0.952 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1033176 1 0.0290 0.9126 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033177 2 0.0671 0.9759 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033178 2 0.0671 0.9759 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033179 2 0.0671 0.9759 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033180 1 0.1197 0.8999 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033181 1 0.0963 0.9054 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033183 3 0.0290 0.9464 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033182 1 0.0162 0.9130 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033184 3 0.0609 0.9453 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033185 1 0.0963 0.9054 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033187 4 0.5061 0.7908 0.132 0.000 0.012 0.728 0.128
#> SRR1033186 5 0.3424 0.6828 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1033188 4 0.3921 0.8530 0.048 0.000 0.012 0.812 0.128
#> SRR1033189 5 0.3992 0.5804 0.000 0.268 0.012 0.000 0.720
#> SRR1033190 1 0.1671 0.8822 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033191 1 0.1544 0.8879 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033192 5 0.3691 0.8732 0.040 0.000 0.156 0.000 0.804
#> SRR1033193 1 0.2270 0.8720 0.904 0.000 0.000 0.020 0.076
#> SRR1033195 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033194 5 0.3986 0.8740 0.036 0.020 0.136 0.000 0.808
#> SRR1033197 1 0.1608 0.8851 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033196 3 0.2519 0.8505 0.016 0.000 0.884 0.000 0.100
#> SRR1033199 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033198 1 0.2172 0.8748 0.908 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR1033200 4 0.4083 0.8260 0.132 0.000 0.000 0.788 0.080
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.1043 0.9295 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.5509 0.2257 0.564 0.000 0.000 0.360 0.076
#> SRR1033205 3 0.4172 0.7040 0.000 0.000 0.784 0.108 0.108
#> SRR1033206 1 0.1628 0.8921 0.936 0.000 0.000 0.008 0.056
#> SRR1033207 1 0.2208 0.8751 0.908 0.000 0.000 0.020 0.072
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 4 0.5916 0.7109 0.052 0.000 0.152 0.680 0.116
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 4 0.5510 0.6901 0.216 0.000 0.008 0.664 0.112
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0880 0.9659 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033214 4 0.2971 0.8181 0.156 0.000 0.000 0.836 0.008
#> SRR1033216 1 0.5474 0.2664 0.576 0.000 0.000 0.348 0.076
#> SRR1033215 5 0.3752 0.7435 0.000 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1033217 3 0.0510 0.9462 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033218 1 0.2069 0.8774 0.912 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR1033219 1 0.1830 0.8849 0.924 0.000 0.000 0.008 0.068
#> SRR1033221 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033220 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033222 1 0.0798 0.9088 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1033223 3 0.4426 0.7291 0.056 0.000 0.788 0.028 0.128
#> SRR1033225 5 0.4190 0.7308 0.000 0.172 0.060 0.000 0.768
#> SRR1033224 4 0.3586 0.8537 0.096 0.000 0.000 0.828 0.076
#> SRR1033226 3 0.4266 0.7162 0.120 0.000 0.776 0.000 0.104
#> SRR1033227 3 0.3289 0.7975 0.000 0.000 0.844 0.048 0.108
#> SRR1033229 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033228 4 0.3586 0.8537 0.096 0.000 0.000 0.828 0.076
#> SRR1033231 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033230 1 0.2069 0.8775 0.912 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR1033232 4 0.4480 0.8330 0.084 0.000 0.012 0.776 0.128
#> SRR1033233 1 0.1331 0.8996 0.952 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1033235 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033234 3 0.1282 0.9243 0.000 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR1033236 3 0.1502 0.9142 0.000 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1033237 4 0.2511 0.8806 0.028 0.000 0.000 0.892 0.080
#> SRR1033238 3 0.1502 0.9139 0.000 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1033240 3 0.0162 0.9473 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033239 4 0.6045 0.6195 0.260 0.000 0.012 0.600 0.128
#> SRR1033242 4 0.4554 0.8194 0.028 0.000 0.064 0.780 0.128
#> SRR1033241 3 0.0703 0.9399 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033244 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033243 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033245 3 0.0963 0.9416 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033246 1 0.0290 0.9128 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033248 1 0.3477 0.7915 0.832 0.000 0.000 0.112 0.056
#> SRR1033247 5 0.3802 0.7899 0.120 0.036 0.020 0.000 0.824
#> SRR1033249 2 0.0290 0.9766 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033250 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033251 1 0.0609 0.9101 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033252 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033253 1 0.0579 0.9109 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033254 1 0.0290 0.9128 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033256 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033255 3 0.0609 0.9450 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033258 1 0.2069 0.8774 0.912 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR1033257 4 0.1205 0.8976 0.040 0.000 0.000 0.956 0.004
#> SRR1033259 4 0.3639 0.8513 0.100 0.000 0.000 0.824 0.076
#> SRR1033260 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033261 3 0.0510 0.9437 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9480 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9762 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0609 0.9102 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033265 2 0.0807 0.9764 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1033266 1 0.5140 0.5411 0.664 0.000 0.000 0.252 0.084
#> SRR1033267 3 0.3216 0.8028 0.000 0.000 0.848 0.044 0.108
#> SRR1033268 1 0.0290 0.9128 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033269 3 0.0703 0.9414 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033270 3 0.1043 0.9295 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033271 1 0.2144 0.8782 0.912 0.000 0.000 0.020 0.068
#> SRR1033272 2 0.0162 0.9757 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033273 1 0.0162 0.9131 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033274 2 0.0451 0.9766 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033275 4 0.1041 0.8981 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1033276 2 0.0912 0.9744 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033277 4 0.2959 0.8674 0.100 0.000 0.000 0.864 0.036
#> SRR1033278 4 0.1872 0.8928 0.020 0.000 0.000 0.928 0.052
#> SRR1033279 3 0.0609 0.9429 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033280 3 0.0609 0.9429 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9130 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 4 0.3780 0.8468 0.072 0.000 0.000 0.812 0.116
#> SRR1033283 4 0.3780 0.8468 0.072 0.000 0.000 0.812 0.116
#> SRR1033284 4 0.3780 0.8468 0.072 0.000 0.000 0.812 0.116
#> SRR1033285 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
#> SRR1033286 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
#> SRR1033287 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
#> SRR1033288 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
#> SRR1033289 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
#> SRR1033290 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
#> SRR1033291 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
#> SRR1033292 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
#> SRR1033293 4 0.4386 0.8312 0.080 0.000 0.016 0.788 0.116
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.2492 0.8225 0.020 0.000 0.000 0.876 NA 0.004
#> SRR1032911 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032912 4 0.0551 0.8481 0.004 0.000 0.000 0.984 NA 0.004
#> SRR1032913 4 0.0837 0.8474 0.004 0.000 0.000 0.972 NA 0.004
#> SRR1032914 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032915 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032916 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032917 3 0.2941 0.8364 0.000 0.000 0.780 0.000 NA 0.000
#> SRR1032918 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032919 4 0.0665 0.8468 0.004 0.000 0.000 0.980 NA 0.008
#> SRR1032920 2 0.1957 0.9319 0.000 0.888 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032921 1 0.0972 0.8971 0.964 0.000 0.000 0.008 NA 0.000
#> SRR1032922 1 0.6067 0.3636 0.528 0.000 0.348 0.032 NA 0.024
#> SRR1032923 4 0.0748 0.8476 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.004
#> SRR1032925 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032924 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032926 4 0.2994 0.7717 0.004 0.000 0.000 0.788 NA 0.000
#> SRR1032927 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032929 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032928 4 0.0508 0.8482 0.004 0.000 0.000 0.984 NA 0.000
#> SRR1032930 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032931 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032932 6 0.1692 0.8838 0.000 0.008 0.012 0.000 NA 0.932
#> SRR1032933 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032934 4 0.0508 0.8475 0.004 0.000 0.000 0.984 NA 0.000
#> SRR1032935 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032936 4 0.3991 0.7491 0.008 0.000 0.044 0.748 NA 0.000
#> SRR1032937 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032938 1 0.0777 0.8991 0.972 0.000 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1032939 1 0.5526 0.5442 0.636 0.000 0.256 0.032 NA 0.024
#> SRR1032940 4 0.0767 0.8463 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR1032941 4 0.0291 0.8482 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.004
#> SRR1032942 2 0.3046 0.8754 0.000 0.800 0.000 0.000 NA 0.012
#> SRR1032943 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032944 1 0.1713 0.8907 0.928 0.000 0.000 0.000 NA 0.028
#> SRR1032945 4 0.0551 0.8473 0.004 0.000 0.000 0.984 NA 0.004
#> SRR1032946 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032947 4 0.3899 0.6832 0.004 0.000 0.132 0.788 NA 0.008
#> SRR1032948 4 0.1080 0.8458 0.004 0.000 0.000 0.960 NA 0.004
#> SRR1032949 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032950 1 0.5167 0.6301 0.688 0.000 0.156 0.116 NA 0.000
#> SRR1032951 4 0.1605 0.8394 0.016 0.000 0.000 0.936 NA 0.004
#> SRR1032952 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032953 4 0.1511 0.8408 0.012 0.000 0.000 0.940 NA 0.004
#> SRR1032954 4 0.3885 0.7085 0.192 0.000 0.000 0.756 NA 0.004
#> SRR1032955 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032957 4 0.0665 0.8468 0.004 0.000 0.000 0.980 NA 0.008
#> SRR1032956 1 0.1788 0.8766 0.928 0.000 0.000 0.040 NA 0.004
#> SRR1032958 4 0.0837 0.8474 0.004 0.000 0.000 0.972 NA 0.004
#> SRR1032959 4 0.1511 0.8408 0.012 0.000 0.000 0.940 NA 0.004
#> SRR1032960 4 0.0551 0.8475 0.004 0.000 0.000 0.984 NA 0.004
#> SRR1032961 1 0.2452 0.8339 0.884 0.000 0.000 0.084 NA 0.004
#> SRR1032962 6 0.1151 0.8892 0.000 0.000 0.032 0.000 NA 0.956
#> SRR1032963 4 0.0767 0.8463 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR1032964 4 0.0665 0.8468 0.004 0.000 0.000 0.980 NA 0.008
#> SRR1032965 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032966 4 0.0748 0.8477 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.004
#> SRR1032967 2 0.2915 0.8754 0.000 0.808 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR1032968 4 0.0767 0.8463 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR1032969 4 0.1899 0.8237 0.004 0.000 0.028 0.928 NA 0.008
#> SRR1032970 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032971 4 0.0665 0.8468 0.004 0.000 0.000 0.980 NA 0.008
#> SRR1032972 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032973 4 0.0767 0.8463 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR1032974 4 0.3562 0.7009 0.176 0.000 0.000 0.784 NA 0.004
#> SRR1032975 4 0.1003 0.8462 0.004 0.000 0.000 0.964 NA 0.004
#> SRR1032976 4 0.1411 0.8382 0.004 0.000 0.000 0.936 NA 0.000
#> SRR1032977 6 0.1398 0.8835 0.000 0.000 0.008 0.000 NA 0.940
#> SRR1032978 1 0.0458 0.9010 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032979 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032980 4 0.0767 0.8463 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR1032981 4 0.0748 0.8466 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.004
#> SRR1032982 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1032983 4 0.2989 0.7850 0.004 0.000 0.008 0.812 NA 0.000
#> SRR1032984 4 0.0767 0.8463 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR1032985 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032986 4 0.0146 0.8482 0.004 0.000 0.000 0.996 NA 0.000
#> SRR1032987 2 0.1010 0.9413 0.000 0.960 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1032988 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1032990 3 0.1225 0.8184 0.000 0.000 0.952 0.000 NA 0.012
#> SRR1032989 4 0.1511 0.8408 0.012 0.000 0.000 0.940 NA 0.004
#> SRR1032991 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1032992 4 0.6217 0.5021 0.032 0.000 0.248 0.524 NA 0.000
#> SRR1032993 4 0.0653 0.8472 0.004 0.000 0.000 0.980 NA 0.004
#> SRR1032994 3 0.6308 -0.0869 0.412 0.000 0.444 0.088 NA 0.012
#> SRR1032995 4 0.2278 0.8223 0.052 0.000 0.000 0.900 NA 0.004
#> SRR1032996 4 0.0748 0.8476 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.004
#> SRR1032997 4 0.0767 0.8472 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR1032998 4 0.5897 0.4361 0.112 0.000 0.252 0.596 NA 0.016
#> SRR1032999 2 0.1765 0.9378 0.000 0.904 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033000 6 0.1398 0.8835 0.000 0.000 0.008 0.000 NA 0.940
#> SRR1033001 4 0.0291 0.8480 0.004 0.000 0.000 0.992 NA 0.000
#> SRR1033002 1 0.4825 0.6491 0.700 0.000 0.068 0.200 NA 0.000
#> SRR1033003 2 0.1814 0.9368 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033004 2 0.1010 0.9413 0.000 0.960 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033005 4 0.0893 0.8458 0.004 0.000 0.004 0.972 NA 0.004
#> SRR1033006 3 0.3290 0.8355 0.000 0.000 0.776 0.000 NA 0.016
#> SRR1033007 4 0.4211 0.7366 0.024 0.000 0.024 0.720 NA 0.000
#> SRR1033008 1 0.0790 0.8966 0.968 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033009 1 0.0363 0.9021 0.988 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033010 3 0.4200 0.8102 0.000 0.000 0.720 0.000 NA 0.072
#> SRR1033011 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033012 1 0.1082 0.8997 0.956 0.000 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033013 3 0.2854 0.8397 0.000 0.000 0.792 0.000 NA 0.000
#> SRR1033014 3 0.3500 0.8318 0.000 0.000 0.768 0.000 NA 0.028
#> SRR1033015 3 0.1682 0.8115 0.000 0.000 0.928 0.000 NA 0.052
#> SRR1033016 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033017 2 0.0547 0.9461 0.000 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033018 3 0.2709 0.7745 0.000 0.000 0.848 0.000 NA 0.132
#> SRR1033019 3 0.3744 0.8293 0.000 0.000 0.756 0.000 NA 0.044
#> SRR1033020 1 0.0717 0.9002 0.976 0.000 0.008 0.000 NA 0.000
#> SRR1033021 3 0.3707 0.6730 0.156 0.000 0.792 0.000 NA 0.024
#> SRR1033023 1 0.0458 0.9042 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033022 1 0.1633 0.8922 0.932 0.000 0.000 0.000 NA 0.024
#> SRR1033024 3 0.3103 0.8367 0.000 0.000 0.784 0.000 NA 0.008
#> SRR1033025 1 0.1789 0.8888 0.924 0.000 0.000 0.000 NA 0.032
#> SRR1033026 3 0.2994 0.8379 0.000 0.000 0.788 0.000 NA 0.004
#> SRR1033027 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033028 3 0.4267 0.8144 0.000 0.000 0.740 0.056 NA 0.016
#> SRR1033029 2 0.1714 0.9386 0.000 0.908 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033030 3 0.3738 0.8254 0.000 0.000 0.752 0.000 NA 0.040
#> SRR1033031 6 0.4684 0.3649 0.352 0.000 0.000 0.000 NA 0.592
#> SRR1033032 6 0.3045 0.8164 0.000 0.000 0.100 0.000 NA 0.840
#> SRR1033033 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033035 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033034 1 0.2001 0.8827 0.912 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033036 1 0.1863 0.8870 0.920 0.000 0.000 0.000 NA 0.036
#> SRR1033037 1 0.0260 0.9027 0.992 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033038 6 0.2136 0.8602 0.048 0.000 0.000 0.000 NA 0.904
#> SRR1033039 3 0.2100 0.8480 0.000 0.000 0.884 0.000 NA 0.004
#> SRR1033040 3 0.2915 0.7673 0.048 0.000 0.872 0.000 NA 0.036
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9032 1.000 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033042 1 0.2001 0.8827 0.912 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033043 1 0.0458 0.9010 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033044 1 0.0508 0.9045 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033045 3 0.3043 0.8406 0.000 0.000 0.792 0.000 NA 0.008
#> SRR1033046 3 0.0547 0.8255 0.000 0.000 0.980 0.000 NA 0.000
#> SRR1033047 3 0.2948 0.8442 0.000 0.000 0.804 0.000 NA 0.008
#> SRR1033048 3 0.4013 0.6012 0.184 0.000 0.764 0.008 NA 0.012
#> SRR1033049 1 0.1720 0.8906 0.928 0.000 0.000 0.000 NA 0.032
#> SRR1033051 1 0.0363 0.9019 0.988 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9032 1.000 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033053 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033054 3 0.1334 0.8153 0.000 0.000 0.948 0.000 NA 0.032
#> SRR1033050 1 0.0458 0.9010 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033055 3 0.3738 0.8254 0.000 0.000 0.752 0.000 NA 0.040
#> SRR1033056 1 0.7680 -0.1628 0.300 0.000 0.212 0.268 NA 0.000
#> SRR1033057 1 0.2001 0.8827 0.912 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033058 3 0.3671 0.8270 0.000 0.000 0.756 0.000 NA 0.036
#> SRR1033059 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033060 1 0.3247 0.7591 0.808 0.000 0.156 0.000 NA 0.000
#> SRR1033061 6 0.2182 0.8829 0.000 0.004 0.020 0.000 NA 0.900
#> SRR1033062 3 0.3802 0.8234 0.000 0.000 0.748 0.000 NA 0.044
#> SRR1033063 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033064 3 0.2980 0.8426 0.000 0.000 0.800 0.000 NA 0.008
#> SRR1033065 1 0.1789 0.8888 0.924 0.000 0.000 0.000 NA 0.032
#> SRR1033066 1 0.2001 0.8827 0.912 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033067 1 0.0260 0.9038 0.992 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033068 3 0.1549 0.8121 0.000 0.000 0.936 0.000 NA 0.044
#> SRR1033069 6 0.0891 0.8907 0.000 0.000 0.024 0.000 NA 0.968
#> SRR1033070 3 0.1418 0.8148 0.000 0.000 0.944 0.000 NA 0.032
#> SRR1033071 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033072 6 0.1074 0.8900 0.000 0.000 0.028 0.000 NA 0.960
#> SRR1033073 6 0.5403 0.1525 0.000 0.000 0.360 0.000 NA 0.516
#> SRR1033074 1 0.0777 0.8999 0.972 0.000 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033075 4 0.6919 0.3800 0.296 0.000 0.112 0.452 NA 0.000
#> SRR1033076 3 0.1334 0.8153 0.000 0.000 0.948 0.000 NA 0.032
#> SRR1033077 1 0.0603 0.9037 0.980 0.000 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033078 1 0.0146 0.9030 0.996 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033079 3 0.3201 0.8364 0.000 0.000 0.780 0.000 NA 0.012
#> SRR1033080 3 0.3709 0.8255 0.000 0.000 0.756 0.000 NA 0.040
#> SRR1033081 1 0.3366 0.8036 0.844 0.000 0.052 0.044 NA 0.000
#> SRR1033082 1 0.2201 0.8753 0.900 0.000 0.000 0.000 NA 0.052
#> SRR1033083 3 0.2915 0.8443 0.000 0.000 0.808 0.000 NA 0.008
#> SRR1033084 1 0.0363 0.9019 0.988 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033085 3 0.3602 0.8292 0.000 0.000 0.760 0.000 NA 0.032
#> SRR1033086 6 0.2237 0.8820 0.000 0.004 0.020 0.000 NA 0.896
#> SRR1033087 1 0.0291 0.9041 0.992 0.000 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033088 3 0.4148 0.8087 0.000 0.000 0.724 0.000 NA 0.068
#> SRR1033089 3 0.2482 0.8472 0.000 0.000 0.848 0.004 NA 0.000
#> SRR1033090 4 0.0767 0.8463 0.004 0.000 0.000 0.976 NA 0.008
#> SRR1033091 3 0.3043 0.8399 0.000 0.000 0.792 0.000 NA 0.008
#> SRR1033092 1 0.1789 0.8888 0.924 0.000 0.000 0.000 NA 0.032
#> SRR1033093 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033094 3 0.1867 0.8072 0.000 0.000 0.916 0.000 NA 0.064
#> SRR1033095 2 0.1714 0.9388 0.000 0.908 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033096 3 0.0891 0.8210 0.000 0.000 0.968 0.000 NA 0.008
#> SRR1033097 6 0.3520 0.8017 0.000 0.100 0.000 0.000 NA 0.804
#> SRR1033098 3 0.3500 0.8318 0.000 0.000 0.768 0.000 NA 0.028
#> SRR1033099 2 0.0790 0.9379 0.000 0.968 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033100 2 0.1152 0.9322 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033101 3 0.2527 0.8464 0.000 0.000 0.832 0.000 NA 0.000
#> SRR1033102 1 0.1806 0.8626 0.908 0.000 0.000 0.004 NA 0.000
#> SRR1033103 1 0.1265 0.8977 0.948 0.000 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR1033104 3 0.2994 0.8379 0.000 0.000 0.788 0.000 NA 0.004
#> SRR1033105 1 0.1461 0.8954 0.940 0.000 0.000 0.000 NA 0.016
#> SRR1033106 1 0.0914 0.8974 0.968 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033107 3 0.2994 0.8379 0.000 0.000 0.788 0.000 NA 0.004
#> SRR1033108 4 0.1605 0.8412 0.016 0.000 0.000 0.936 NA 0.004
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9032 1.000 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033110 3 0.0603 0.8252 0.000 0.000 0.980 0.000 NA 0.004
#> SRR1033111 1 0.1549 0.8940 0.936 0.000 0.000 0.000 NA 0.020
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9032 1.000 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033113 3 0.2039 0.8007 0.000 0.000 0.904 0.000 NA 0.076
#> SRR1033114 1 0.1863 0.8870 0.920 0.000 0.000 0.000 NA 0.036
#> SRR1033115 1 0.2136 0.8775 0.904 0.000 0.000 0.000 NA 0.048
#> SRR1033116 3 0.2994 0.8379 0.000 0.000 0.788 0.000 NA 0.004
#> SRR1033117 3 0.3374 0.8342 0.000 0.000 0.772 0.000 NA 0.020
#> SRR1033118 4 0.5978 0.1643 0.000 0.000 0.368 0.404 NA 0.000
#> SRR1033119 1 0.0790 0.9019 0.968 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033121 3 0.2743 0.8471 0.000 0.000 0.828 0.000 NA 0.008
#> SRR1033120 6 0.1341 0.8898 0.000 0.000 0.024 0.000 NA 0.948
#> SRR1033122 3 0.1462 0.8215 0.000 0.000 0.936 0.008 NA 0.000
#> SRR1033123 1 0.2001 0.8827 0.912 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033124 1 0.0146 0.9036 0.996 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033125 3 0.2999 0.7357 0.000 0.000 0.836 0.000 NA 0.124
#> SRR1033126 1 0.1789 0.8888 0.924 0.000 0.000 0.000 NA 0.032
#> SRR1033127 6 0.4400 0.7633 0.000 0.000 0.068 0.000 NA 0.684
#> SRR1033129 3 0.2994 0.8379 0.000 0.000 0.788 0.000 NA 0.004
#> SRR1033128 1 0.2136 0.8775 0.904 0.000 0.000 0.000 NA 0.048
#> SRR1033130 1 0.0713 0.8984 0.972 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033131 1 0.0547 0.9034 0.980 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033132 3 0.1765 0.8095 0.000 0.000 0.924 0.000 NA 0.052
#> SRR1033133 3 0.1492 0.8127 0.000 0.000 0.940 0.000 NA 0.024
#> SRR1033134 1 0.4822 0.4059 0.628 0.000 0.000 0.296 NA 0.004
#> SRR1033135 3 0.0806 0.8342 0.000 0.000 0.972 0.000 NA 0.008
#> SRR1033136 1 0.0632 0.9031 0.976 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033137 3 0.1334 0.8153 0.000 0.000 0.948 0.000 NA 0.032
#> SRR1033139 6 0.1168 0.8899 0.000 0.000 0.028 0.000 NA 0.956
#> SRR1033138 6 0.3351 0.8279 0.068 0.000 0.040 0.000 NA 0.844
#> SRR1033140 3 0.2912 0.8473 0.000 0.000 0.816 0.000 NA 0.012
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9032 1.000 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033142 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033143 1 0.1075 0.8902 0.952 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033144 1 0.1934 0.8850 0.916 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033145 3 0.0909 0.8277 0.000 0.000 0.968 0.000 NA 0.020
#> SRR1033146 6 0.2633 0.8170 0.104 0.000 0.000 0.000 NA 0.864
#> SRR1033147 6 0.0891 0.8907 0.000 0.000 0.024 0.000 NA 0.968
#> SRR1033148 4 0.4834 0.1418 0.468 0.000 0.000 0.484 NA 0.004
#> SRR1033149 3 0.3602 0.8299 0.000 0.000 0.760 0.000 NA 0.032
#> SRR1033150 1 0.4633 0.6286 0.704 0.000 0.188 0.008 NA 0.000
#> SRR1033151 3 0.1807 0.8049 0.000 0.000 0.920 0.000 NA 0.060
#> SRR1033152 1 0.7199 0.1915 0.428 0.000 0.224 0.120 NA 0.000
#> SRR1033153 3 0.5044 0.4501 0.228 0.000 0.672 0.000 NA 0.048
#> SRR1033154 1 0.1789 0.8888 0.924 0.000 0.000 0.000 NA 0.032
#> SRR1033156 3 0.2730 0.8435 0.000 0.000 0.808 0.000 NA 0.000
#> SRR1033157 1 0.1265 0.8976 0.948 0.000 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR1033158 2 0.3551 0.7482 0.000 0.784 0.000 0.000 NA 0.168
#> SRR1033159 3 0.2048 0.8467 0.000 0.000 0.880 0.000 NA 0.000
#> SRR1033160 3 0.1765 0.8398 0.000 0.000 0.924 0.000 NA 0.024
#> SRR1033161 1 0.0458 0.9010 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033163 3 0.1867 0.8027 0.000 0.000 0.916 0.000 NA 0.064
#> SRR1033162 1 0.1934 0.8850 0.916 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033164 6 0.1572 0.8895 0.000 0.000 0.028 0.000 NA 0.936
#> SRR1033165 4 0.4211 0.7366 0.024 0.000 0.024 0.720 NA 0.000
#> SRR1033166 1 0.4145 0.6287 0.700 0.000 0.000 0.000 NA 0.252
#> SRR1033167 2 0.0260 0.9452 0.000 0.992 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033168 3 0.0603 0.8305 0.000 0.000 0.980 0.000 NA 0.004
#> SRR1033169 2 0.0260 0.9452 0.000 0.992 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033171 6 0.1341 0.8898 0.000 0.000 0.028 0.000 NA 0.948
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9032 1.000 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033172 3 0.2882 0.8453 0.000 0.000 0.812 0.000 NA 0.008
#> SRR1033173 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033174 3 0.3279 0.8422 0.000 0.000 0.796 0.000 NA 0.028
#> SRR1033175 1 0.0458 0.9010 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033176 1 0.1196 0.8989 0.952 0.000 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR1033177 2 0.1714 0.9388 0.000 0.908 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033178 2 0.1714 0.9388 0.000 0.908 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033179 2 0.1957 0.9319 0.000 0.888 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033180 1 0.1549 0.8938 0.936 0.000 0.000 0.000 NA 0.020
#> SRR1033181 1 0.1124 0.8999 0.956 0.000 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR1033183 3 0.2994 0.8379 0.000 0.000 0.788 0.000 NA 0.004
#> SRR1033182 1 0.0820 0.9022 0.972 0.000 0.016 0.000 NA 0.000
#> SRR1033184 3 0.1257 0.8172 0.000 0.000 0.952 0.000 NA 0.020
#> SRR1033185 1 0.1633 0.8922 0.932 0.000 0.000 0.000 NA 0.024
#> SRR1033187 4 0.6787 0.4508 0.248 0.000 0.060 0.452 NA 0.000
#> SRR1033186 6 0.3530 0.7680 0.152 0.000 0.000 0.000 NA 0.792
#> SRR1033188 4 0.4207 0.7360 0.020 0.000 0.028 0.720 NA 0.000
#> SRR1033189 6 0.5192 0.6887 0.000 0.168 0.008 0.000 NA 0.644
#> SRR1033190 1 0.1934 0.8850 0.916 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033191 1 0.1863 0.8870 0.920 0.000 0.000 0.000 NA 0.036
#> SRR1033192 6 0.0891 0.8907 0.000 0.000 0.024 0.000 NA 0.968
#> SRR1033193 1 0.1387 0.8780 0.932 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033195 2 0.0547 0.9436 0.000 0.980 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033194 6 0.1401 0.8896 0.000 0.004 0.020 0.000 NA 0.948
#> SRR1033197 1 0.1934 0.8850 0.916 0.000 0.000 0.000 NA 0.040
#> SRR1033196 3 0.2641 0.7745 0.004 0.000 0.876 0.000 NA 0.072
#> SRR1033199 2 0.1863 0.9384 0.000 0.896 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033198 1 0.1501 0.8731 0.924 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033200 4 0.5258 0.6566 0.188 0.000 0.000 0.624 NA 0.004
#> SRR1033201 3 0.3073 0.8392 0.000 0.000 0.788 0.000 NA 0.008
#> SRR1033202 3 0.3052 0.8368 0.000 0.000 0.780 0.000 NA 0.004
#> SRR1033203 3 0.0520 0.8325 0.000 0.000 0.984 0.000 NA 0.008
#> SRR1033204 1 0.4887 0.5393 0.660 0.000 0.000 0.184 NA 0.000
#> SRR1033205 3 0.4621 0.6358 0.000 0.000 0.632 0.064 NA 0.000
#> SRR1033206 1 0.0790 0.8970 0.968 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033207 1 0.1204 0.8857 0.944 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033208 3 0.2730 0.8433 0.000 0.000 0.808 0.000 NA 0.000
#> SRR1033209 3 0.6254 -0.2276 0.012 0.000 0.400 0.368 NA 0.000
#> SRR1033210 3 0.2994 0.8379 0.000 0.000 0.788 0.000 NA 0.004
#> SRR1033211 4 0.6893 0.3831 0.288 0.000 0.060 0.412 NA 0.000
#> SRR1033212 3 0.2697 0.8438 0.000 0.000 0.812 0.000 NA 0.000
#> SRR1033213 2 0.0777 0.9410 0.000 0.972 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033214 4 0.3727 0.7135 0.188 0.000 0.000 0.768 NA 0.004
#> SRR1033216 1 0.4950 0.5270 0.652 0.000 0.000 0.184 NA 0.000
#> SRR1033215 6 0.4407 0.7646 0.000 0.000 0.076 0.000 NA 0.692
#> SRR1033217 3 0.0692 0.8243 0.000 0.000 0.976 0.000 NA 0.004
#> SRR1033218 1 0.1204 0.8854 0.944 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033219 1 0.0937 0.8934 0.960 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033221 2 0.1863 0.9368 0.000 0.896 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033220 2 0.1863 0.9378 0.000 0.896 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033222 1 0.0363 0.9021 0.988 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033223 3 0.4660 0.5379 0.036 0.000 0.696 0.028 NA 0.004
#> SRR1033225 6 0.2663 0.8623 0.000 0.040 0.012 0.000 NA 0.880
#> SRR1033224 4 0.4415 0.7512 0.104 0.000 0.000 0.724 NA 0.004
#> SRR1033226 3 0.3032 0.7266 0.096 0.000 0.852 0.000 NA 0.012
#> SRR1033227 3 0.3634 0.7007 0.000 0.000 0.696 0.008 NA 0.000
#> SRR1033229 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033228 4 0.4541 0.6960 0.196 0.000 0.000 0.704 NA 0.004
#> SRR1033231 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033230 1 0.1007 0.8916 0.956 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033232 4 0.4756 0.7172 0.048 0.000 0.032 0.688 NA 0.000
#> SRR1033233 1 0.0458 0.9010 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033235 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033234 3 0.0713 0.8247 0.000 0.000 0.972 0.000 NA 0.000
#> SRR1033236 3 0.1010 0.8206 0.000 0.000 0.960 0.000 NA 0.004
#> SRR1033237 4 0.3315 0.7739 0.020 0.000 0.000 0.780 NA 0.000
#> SRR1033238 3 0.1814 0.8400 0.000 0.000 0.900 0.000 NA 0.000
#> SRR1033240 3 0.2871 0.8427 0.000 0.000 0.804 0.000 NA 0.004
#> SRR1033239 1 0.7674 -0.1061 0.312 0.000 0.208 0.240 NA 0.000
#> SRR1033242 4 0.5890 0.5357 0.012 0.000 0.212 0.540 NA 0.000
#> SRR1033241 3 0.0547 0.8316 0.000 0.000 0.980 0.000 NA 0.000
#> SRR1033244 2 0.1814 0.9388 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033243 2 0.1765 0.9379 0.000 0.904 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033245 3 0.1296 0.8162 0.004 0.000 0.952 0.000 NA 0.012
#> SRR1033246 1 0.0458 0.9010 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033248 1 0.2294 0.8394 0.892 0.000 0.000 0.072 NA 0.000
#> SRR1033247 6 0.1722 0.8805 0.016 0.008 0.004 0.000 NA 0.936
#> SRR1033249 2 0.0458 0.9445 0.000 0.984 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033250 2 0.1814 0.9391 0.000 0.900 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033251 1 0.0790 0.9020 0.968 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033252 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033253 1 0.0260 0.9025 0.992 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033254 1 0.0260 0.9038 0.992 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033256 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033255 3 0.0692 0.8254 0.000 0.000 0.976 0.000 NA 0.004
#> SRR1033258 1 0.1141 0.8877 0.948 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033257 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1033259 4 0.4556 0.6990 0.192 0.000 0.000 0.704 NA 0.004
#> SRR1033260 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033261 3 0.2933 0.8405 0.000 0.000 0.796 0.000 NA 0.004
#> SRR1033262 3 0.2838 0.8435 0.000 0.000 0.808 0.000 NA 0.004
#> SRR1033263 2 0.0458 0.9445 0.000 0.984 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033264 1 0.0806 0.9037 0.972 0.000 0.000 0.000 NA 0.008
#> SRR1033265 2 0.1075 0.9454 0.000 0.952 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033266 1 0.4754 0.6594 0.720 0.000 0.076 0.168 NA 0.000
#> SRR1033267 3 0.3012 0.6694 0.000 0.000 0.796 0.008 NA 0.000
#> SRR1033268 1 0.0508 0.9039 0.984 0.000 0.000 0.000 NA 0.004
#> SRR1033269 3 0.1564 0.8162 0.000 0.000 0.936 0.000 NA 0.040
#> SRR1033270 3 0.2697 0.8450 0.000 0.000 0.812 0.000 NA 0.000
#> SRR1033271 1 0.1007 0.8917 0.956 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033272 2 0.0363 0.9441 0.000 0.988 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9032 1.000 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033274 2 0.0790 0.9459 0.000 0.968 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033275 4 0.1296 0.8434 0.004 0.000 0.000 0.948 NA 0.004
#> SRR1033276 2 0.1863 0.9378 0.000 0.896 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033277 4 0.3615 0.7641 0.140 0.000 0.000 0.796 NA 0.004
#> SRR1033278 4 0.0777 0.8474 0.004 0.000 0.000 0.972 NA 0.000
#> SRR1033279 3 0.1257 0.8153 0.000 0.000 0.952 0.000 NA 0.020
#> SRR1033280 3 0.1341 0.8153 0.000 0.000 0.948 0.000 NA 0.028
#> SRR1033281 1 0.0260 0.9040 0.992 0.000 0.000 0.000 NA 0.000
#> SRR1033282 4 0.4513 0.6427 0.032 0.000 0.004 0.596 NA 0.000
#> SRR1033283 4 0.4513 0.6427 0.032 0.000 0.004 0.596 NA 0.000
#> SRR1033284 4 0.4513 0.6427 0.032 0.000 0.004 0.596 NA 0.000
#> SRR1033285 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
#> SRR1033286 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
#> SRR1033287 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
#> SRR1033288 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
#> SRR1033289 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
#> SRR1033290 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
#> SRR1033291 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
#> SRR1033292 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
#> SRR1033293 4 0.5201 0.6139 0.036 0.000 0.036 0.560 NA 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.854 0.916 0.965 0.4261 0.581 0.581
#> 3 3 1.000 0.966 0.987 0.4504 0.755 0.594
#> 4 4 0.966 0.947 0.976 0.2136 0.851 0.618
#> 5 5 0.830 0.791 0.890 0.0584 0.915 0.683
#> 6 6 0.806 0.740 0.834 0.0329 0.966 0.840
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 3
There is also optional best \(k\) = 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.9393 0.472125 0.644 0.356
#> SRR1033007 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033010 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033014 2 0.2778 0.914609 0.048 0.952
#> SRR1033015 1 0.9833 0.291275 0.576 0.424
#> SRR1033016 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033018 2 0.9998 0.000936 0.492 0.508
#> SRR1033019 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033024 2 0.8909 0.542813 0.308 0.692
#> SRR1033025 1 0.0376 0.961994 0.996 0.004
#> SRR1033026 1 0.6148 0.819882 0.848 0.152
#> SRR1033027 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033030 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033031 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033034 2 0.7453 0.716282 0.212 0.788
#> SRR1033036 1 0.0376 0.961994 0.996 0.004
#> SRR1033037 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033039 1 0.4939 0.868454 0.892 0.108
#> SRR1033040 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.5842 0.832711 0.860 0.140
#> SRR1033043 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.7299 0.752507 0.796 0.204
#> SRR1033046 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.6887 0.780346 0.816 0.184
#> SRR1033048 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.6887 0.780556 0.816 0.184
#> SRR1033050 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033055 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.2043 0.939538 0.968 0.032
#> SRR1033058 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033062 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033064 2 0.9850 0.233086 0.428 0.572
#> SRR1033065 1 0.0376 0.962032 0.996 0.004
#> SRR1033066 1 0.6712 0.792279 0.824 0.176
#> SRR1033067 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.9732 0.350033 0.596 0.404
#> SRR1033069 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033070 1 0.6343 0.810800 0.840 0.160
#> SRR1033071 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.7219 0.758199 0.800 0.200
#> SRR1033077 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033079 2 0.9922 0.167622 0.448 0.552
#> SRR1033080 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033082 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033083 1 0.6343 0.810483 0.840 0.160
#> SRR1033084 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033085 2 0.5842 0.813803 0.140 0.860
#> SRR1033086 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033088 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.8443 0.643950 0.728 0.272
#> SRR1033092 1 0.3879 0.900883 0.924 0.076
#> SRR1033093 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033098 2 0.4690 0.860500 0.100 0.900
#> SRR1033099 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.7453 0.740982 0.788 0.212
#> SRR1033105 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0376 0.962041 0.996 0.004
#> SRR1033108 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0376 0.962032 0.996 0.004
#> SRR1033111 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033113 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033114 1 0.4431 0.881469 0.908 0.092
#> SRR1033115 2 0.8763 0.590878 0.296 0.704
#> SRR1033116 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033117 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.7139 0.763559 0.804 0.196
#> SRR1033120 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.9661 0.367667 0.608 0.392
#> SRR1033124 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.9795 0.315475 0.584 0.416
#> SRR1033126 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033129 1 0.4562 0.881674 0.904 0.096
#> SRR1033128 2 0.8955 0.557851 0.312 0.688
#> SRR1033130 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.8443 0.643836 0.728 0.272
#> SRR1033133 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.7056 0.769296 0.808 0.192
#> SRR1033136 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.6343 0.810545 0.840 0.160
#> SRR1033139 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033138 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033140 2 1.0000 -0.012669 0.496 0.504
#> SRR1033141 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.3274 0.914058 0.940 0.060
#> SRR1033145 1 0.9661 0.380633 0.608 0.392
#> SRR1033146 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033149 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.9775 0.327097 0.588 0.412
#> SRR1033152 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.2236 0.935981 0.964 0.036
#> SRR1033160 2 0.9988 0.049205 0.480 0.520
#> SRR1033161 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033163 2 0.9988 0.048865 0.480 0.520
#> SRR1033162 1 0.4298 0.890211 0.912 0.088
#> SRR1033164 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033166 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0672 0.958996 0.992 0.008
#> SRR1033169 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.9580 0.413350 0.620 0.380
#> SRR1033173 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.9427 0.462994 0.640 0.360
#> SRR1033175 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0376 0.962030 0.996 0.004
#> SRR1033181 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033186 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.6148 0.817636 0.848 0.152
#> SRR1033191 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.5946 0.831317 0.856 0.144
#> SRR1033196 1 0.9427 0.463673 0.640 0.360
#> SRR1033199 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.7376 0.746896 0.792 0.208
#> SRR1033202 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.6438 0.805596 0.836 0.164
#> SRR1033204 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.5294 0.855619 0.880 0.120
#> SRR1033209 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.6801 0.785055 0.820 0.180
#> SRR1033211 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.7139 0.763559 0.804 0.196
#> SRR1033213 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033217 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0938 0.955837 0.988 0.012
#> SRR1033239 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0672 0.958983 0.992 0.008
#> SRR1033262 1 0.6148 0.819941 0.848 0.152
#> SRR1033263 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033269 2 0.6887 0.757807 0.184 0.816
#> SRR1033270 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.958391 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0672 0.959021 0.992 0.008
#> SRR1033280 1 0.6712 0.791022 0.824 0.176
#> SRR1033281 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.964954 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0424 0.9862 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.1753 0.9493 0.952 0.000 0.048
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.1163 0.9691 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032940 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.5098 0.6746 0.752 0.000 0.248
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0747 0.9802 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032993 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032994 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0892 0.9767 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033006 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033007 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.5058 0.6681 0.000 0.244 0.756
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0892 0.9594 0.000 0.020 0.980
#> SRR1033019 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 3 0.3686 0.8069 0.140 0.000 0.860
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0237 0.9738 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033031 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 2 0.5650 0.5454 0.312 0.688 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 3 0.0237 0.9733 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.2066 0.9345 0.940 0.060 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033046 3 0.1289 0.9419 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033047 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033048 3 0.6305 0.0556 0.484 0.000 0.516
#> SRR1033049 1 0.0237 0.9881 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0747 0.9634 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033056 1 0.0424 0.9862 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033057 1 0.0892 0.9747 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033058 3 0.0237 0.9738 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.4235 0.7898 0.824 0.176 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033073 2 0.6095 0.3508 0.000 0.608 0.392
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033076 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 2 0.0237 0.9746 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0424 0.9707 0.000 0.008 0.992
#> SRR1033089 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033090 1 0.2537 0.9144 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.1529 0.9554 0.960 0.040 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0237 0.9738 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0747 0.9630 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033114 1 0.0424 0.9851 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033115 2 0.6154 0.3182 0.408 0.592 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033122 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033123 1 0.5497 0.5877 0.708 0.292 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033128 2 0.6286 0.1380 0.464 0.536 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033133 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033138 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0892 0.9744 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033146 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033152 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033153 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033162 1 0.1643 0.9513 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0424 0.9862 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033166 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0237 0.9881 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033186 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.2537 0.9122 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.3116 0.8799 0.892 0.108 0.000
#> SRR1033196 3 0.0237 0.9741 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 1 0.4654 0.7420 0.792 0.000 0.208
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.4654 0.7178 0.208 0.000 0.792
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.3879 0.7926 0.152 0.000 0.848
#> SRR1033227 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033239 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033242 3 0.6126 0.3369 0.400 0.000 0.600
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9790 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0747 0.9802 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033279 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.9773 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9907 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033283 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033284 1 0.0237 0.9887 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033285 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033286 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033287 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033288 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033289 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033290 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033291 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033292 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033293 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1940 0.911 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1032922 4 0.1004 0.949 0.024 0.000 0.004 0.972
#> SRR1032923 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0592 0.955 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032926 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032927 4 0.0592 0.955 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032929 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0592 0.955 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032934 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032935 4 0.0592 0.955 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032936 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.2408 0.878 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1032939 4 0.1022 0.944 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1032940 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032947 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.0188 0.961 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032951 4 0.1022 0.944 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1032952 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 4 0.0817 0.950 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1032954 4 0.4103 0.680 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1032955 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 1 0.3907 0.692 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1032958 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 4 0.0707 0.953 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1032960 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032961 1 0.4955 0.166 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1032962 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 4 0.0592 0.955 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032966 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 4 0.1302 0.935 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1032975 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032984 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 4 0.0592 0.955 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032986 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0592 0.955 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032990 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032989 4 0.0817 0.950 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1032991 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.0188 0.961 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032993 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032995 4 0.2589 0.867 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1032996 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033001 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033002 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033006 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033007 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.4543 0.517 0.000 0.324 0.676 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.1022 0.944 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0188 0.978 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033021 3 0.4804 0.754 0.064 0.000 0.776 0.160
#> SRR1033023 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.4331 0.604 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1033029 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033031 2 0.2149 0.900 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1033032 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0469 0.971 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.3024 0.819 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033046 3 0.3311 0.787 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1033047 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.6733 0.142 0.092 0.000 0.492 0.416
#> SRR1033049 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0188 0.970 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033056 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033057 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0469 0.972 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033061 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 2 0.4843 0.339 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1033074 1 0.0592 0.970 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033075 4 0.0188 0.961 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033076 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033081 4 0.4382 0.604 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR1033082 1 0.2530 0.865 0.888 0.112 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0188 0.970 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033089 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033090 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0469 0.972 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033103 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033108 4 0.0592 0.955 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033109 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0188 0.970 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 4 0.4981 0.130 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1033119 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0188 0.970 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0188 0.978 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033131 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033133 3 0.0336 0.966 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033134 1 0.2345 0.881 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1033135 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 2 0.3024 0.824 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0469 0.972 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033142 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0469 0.972 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033144 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 4 0.4817 0.405 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1033149 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.2921 0.832 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033151 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033152 4 0.3172 0.816 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1033153 3 0.4522 0.533 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0469 0.972 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033163 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033166 1 0.4697 0.447 0.644 0.356 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 4 0.0817 0.951 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1033186 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0188 0.970 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1867 0.914 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033200 4 0.4008 0.703 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1033201 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0469 0.972 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033205 3 0.0817 0.953 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1033206 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033209 4 0.1398 0.931 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR1033210 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033211 4 0.3528 0.774 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1033212 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.3649 0.760 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1033216 1 0.0469 0.972 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033215 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0336 0.975 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033221 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0188 0.978 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033223 3 0.4608 0.564 0.004 0.000 0.692 0.304
#> SRR1033225 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 4 0.2469 0.878 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR1033226 3 0.3229 0.873 0.072 0.000 0.880 0.048
#> SRR1033227 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.4564 0.553 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1033231 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0188 0.978 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033232 4 0.0188 0.961 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033233 1 0.0336 0.975 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033235 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033237 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033239 4 0.2345 0.883 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1033242 4 0.0469 0.955 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033241 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0188 0.969 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 4 0.3486 0.783 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1033247 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0188 0.978 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033257 4 0.0469 0.957 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033259 4 0.4661 0.506 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1033260 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0188 0.977 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033265 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.0469 0.958 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033267 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0707 0.953 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1033276 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.3123 0.823 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1033278 4 0.0000 0.962 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033279 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.973 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.980 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033283 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033284 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033285 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033286 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033287 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033288 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033289 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033290 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033291 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033292 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1033293 4 0.0336 0.960 0.008 0.000 0.000 0.992
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.3039 0.6886 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1032911 4 0.1205 0.8854 0.004 0.000 0.000 0.956 0.040
#> SRR1032912 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032913 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032914 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032915 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032916 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032917 3 0.0290 0.8471 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032918 4 0.1205 0.8854 0.004 0.000 0.000 0.956 0.040
#> SRR1032919 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.5128 0.4608 0.604 0.000 0.000 0.344 0.052
#> SRR1032922 5 0.3612 0.6875 0.028 0.000 0.000 0.172 0.800
#> SRR1032923 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.1331 0.8835 0.008 0.000 0.000 0.952 0.040
#> SRR1032926 5 0.4256 0.3819 0.000 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR1032927 4 0.1331 0.8835 0.008 0.000 0.000 0.952 0.040
#> SRR1032929 4 0.1205 0.8854 0.004 0.000 0.000 0.956 0.040
#> SRR1032928 4 0.0963 0.8777 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1032930 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.1331 0.8835 0.008 0.000 0.000 0.952 0.040
#> SRR1032934 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032935 4 0.1331 0.8835 0.008 0.000 0.000 0.952 0.040
#> SRR1032936 5 0.3895 0.6126 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.5142 0.4515 0.600 0.000 0.000 0.348 0.052
#> SRR1032939 5 0.2930 0.6724 0.004 0.000 0.000 0.164 0.832
#> SRR1032940 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032941 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0671 0.8993 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1032945 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032946 4 0.1041 0.8887 0.004 0.000 0.000 0.964 0.032
#> SRR1032947 4 0.0579 0.8953 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1032948 4 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.3932 0.3932 0.000 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1032951 4 0.1444 0.8808 0.012 0.000 0.000 0.948 0.040
#> SRR1032952 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032953 4 0.1444 0.8808 0.012 0.000 0.000 0.948 0.040
#> SRR1032954 4 0.3991 0.6875 0.172 0.000 0.000 0.780 0.048
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032956 4 0.5243 0.1770 0.412 0.000 0.000 0.540 0.048
#> SRR1032958 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032959 4 0.1444 0.8808 0.012 0.000 0.000 0.948 0.040
#> SRR1032960 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032961 4 0.4451 0.5822 0.248 0.000 0.000 0.712 0.040
#> SRR1032962 2 0.1956 0.9106 0.000 0.916 0.008 0.000 0.076
#> SRR1032963 4 0.0000 0.9003 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032965 4 0.1331 0.8835 0.008 0.000 0.000 0.952 0.040
#> SRR1032966 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032969 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032970 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032971 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032972 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032973 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032974 4 0.1549 0.8782 0.016 0.000 0.000 0.944 0.040
#> SRR1032975 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032976 4 0.3857 0.4145 0.000 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.1282 0.8948 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032981 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032982 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032983 5 0.4291 0.3101 0.000 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1032984 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032985 4 0.1331 0.8835 0.008 0.000 0.000 0.952 0.040
#> SRR1032986 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.1331 0.8835 0.008 0.000 0.000 0.952 0.040
#> SRR1032990 5 0.3282 0.4915 0.000 0.000 0.188 0.008 0.804
#> SRR1032989 4 0.1444 0.8808 0.012 0.000 0.000 0.948 0.040
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 5 0.3707 0.6488 0.000 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1032993 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032994 5 0.3534 0.6654 0.000 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1032995 4 0.1800 0.8708 0.020 0.000 0.000 0.932 0.048
#> SRR1032996 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032997 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032998 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033001 4 0.0880 0.8819 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033002 4 0.2248 0.8505 0.012 0.000 0.000 0.900 0.088
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033006 3 0.0162 0.8485 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033007 5 0.4114 0.5055 0.000 0.000 0.000 0.376 0.624
#> SRR1033008 1 0.2179 0.8731 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1033009 1 0.1557 0.8929 0.940 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1033010 3 0.1792 0.7693 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0510 0.9005 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033013 3 0.0162 0.8485 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033014 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.3932 0.6181 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.2848 0.7965 0.000 0.028 0.868 0.000 0.104
#> SRR1033019 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.4278 0.3820 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1033021 3 0.6359 0.4362 0.044 0.000 0.616 0.120 0.220
#> SRR1033023 1 0.0290 0.9005 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033022 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033024 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033026 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.4299 0.3126 0.000 0.000 0.608 0.388 0.004
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 2 0.3048 0.7792 0.176 0.820 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033032 2 0.0404 0.9811 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0486 0.8968 0.988 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033036 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033037 1 0.1357 0.8942 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1033038 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.0963 0.8404 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033040 3 0.5980 0.5323 0.164 0.000 0.616 0.008 0.212
#> SRR1033041 1 0.0963 0.8989 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033042 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033043 1 0.1597 0.8923 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1033044 1 0.1205 0.8951 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1033045 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 5 0.4867 0.6281 0.000 0.000 0.180 0.104 0.716
#> SRR1033047 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 5 0.7663 0.3283 0.072 0.000 0.180 0.360 0.388
#> SRR1033049 1 0.0162 0.9000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033051 1 0.2304 0.8765 0.908 0.000 0.000 0.044 0.048
#> SRR1033052 1 0.0510 0.9002 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.4287 0.3945 0.000 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1033050 1 0.1197 0.8950 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033055 3 0.0404 0.8426 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033056 5 0.3992 0.6613 0.012 0.000 0.000 0.268 0.720
#> SRR1033057 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033058 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 5 0.4666 0.1621 0.412 0.000 0.000 0.016 0.572
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033066 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033067 1 0.1408 0.8940 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1033068 3 0.4249 0.4563 0.000 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033069 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.4262 0.4388 0.000 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.4273 0.1372 0.000 0.448 0.552 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.4238 0.7344 0.756 0.000 0.000 0.192 0.052
#> SRR1033075 5 0.4173 0.6265 0.012 0.000 0.000 0.300 0.688
#> SRR1033076 3 0.4302 0.3458 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1033077 1 0.1197 0.8962 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033078 1 0.1043 0.8978 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033079 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 5 0.5733 0.5700 0.160 0.000 0.000 0.220 0.620
#> SRR1033082 1 0.1831 0.8388 0.920 0.076 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033083 3 0.0290 0.8487 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033084 1 0.1043 0.8975 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1033085 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0290 0.9001 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033088 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 3 0.1908 0.7904 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033090 4 0.0162 0.9014 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033091 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.8993 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.3305 0.7251 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 5 0.4262 -0.1296 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0609 0.8407 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033102 1 0.3455 0.8019 0.784 0.000 0.000 0.008 0.208
#> SRR1033103 1 0.0290 0.9002 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033104 3 0.0162 0.8485 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033105 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033106 5 0.4622 -0.0176 0.440 0.000 0.000 0.012 0.548
#> SRR1033107 3 0.0162 0.8485 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033108 4 0.1557 0.8786 0.008 0.000 0.000 0.940 0.052
#> SRR1033109 1 0.2690 0.8413 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1033110 3 0.4235 0.4660 0.000 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1033111 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033112 1 0.0510 0.9003 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033113 3 0.3491 0.7213 0.000 0.004 0.768 0.000 0.228
#> SRR1033114 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033115 1 0.0566 0.8928 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033116 3 0.0404 0.8452 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033117 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 5 0.5555 0.6650 0.000 0.000 0.152 0.204 0.644
#> SRR1033119 1 0.1121 0.8980 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033121 3 0.0963 0.8407 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 5 0.4339 0.3486 0.000 0.000 0.336 0.012 0.652
#> SRR1033123 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033124 1 0.0510 0.9008 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033125 3 0.4829 0.3114 0.020 0.000 0.496 0.000 0.484
#> SRR1033126 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033127 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033130 1 0.3534 0.7601 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1033131 1 0.1197 0.8934 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033132 3 0.4171 0.5224 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033133 5 0.3107 0.5601 0.008 0.000 0.124 0.016 0.852
#> SRR1033134 1 0.4832 0.7256 0.712 0.000 0.000 0.088 0.200
#> SRR1033135 3 0.3508 0.6989 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1033136 1 0.0609 0.8999 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033137 3 0.4300 0.3572 0.000 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1033139 2 0.0290 0.9864 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033138 2 0.4361 0.7398 0.108 0.768 0.000 0.000 0.124
#> SRR1033140 3 0.0162 0.8493 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033141 1 0.3612 0.7442 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.3391 0.8174 0.800 0.000 0.000 0.012 0.188
#> SRR1033144 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033145 3 0.2377 0.7934 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033146 2 0.1043 0.9546 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0162 0.9898 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033148 4 0.5309 0.5188 0.240 0.000 0.000 0.656 0.104
#> SRR1033149 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 5 0.2514 0.6551 0.060 0.000 0.000 0.044 0.896
#> SRR1033151 3 0.4256 0.4470 0.000 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033152 5 0.2625 0.6942 0.016 0.000 0.000 0.108 0.876
#> SRR1033153 5 0.4946 0.4586 0.168 0.000 0.120 0.000 0.712
#> SRR1033154 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033156 3 0.0404 0.8484 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033157 1 0.0000 0.8993 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.1410 0.8309 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033160 3 0.2424 0.7899 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033161 1 0.4057 0.8010 0.792 0.000 0.000 0.120 0.088
#> SRR1033163 3 0.4273 0.4215 0.000 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1033162 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033164 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 5 0.4161 0.4721 0.000 0.000 0.000 0.392 0.608
#> SRR1033166 1 0.3949 0.5438 0.696 0.300 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.4015 0.5728 0.000 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0880 0.8991 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033172 3 0.1121 0.8371 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.2930 0.8421 0.832 0.000 0.000 0.004 0.164
#> SRR1033176 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0290 0.8996 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033181 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033183 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.2773 0.8344 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1033184 5 0.4150 0.0484 0.000 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033185 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033187 5 0.3988 0.6741 0.016 0.000 0.000 0.252 0.732
#> SRR1033186 2 0.0404 0.9823 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 5 0.4101 0.5132 0.000 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033191 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033192 2 0.0162 0.9897 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033193 1 0.3177 0.8078 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0162 0.8988 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033196 5 0.5407 -0.1584 0.048 0.004 0.424 0.000 0.524
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.4617 0.7255 0.716 0.000 0.000 0.060 0.224
#> SRR1033200 1 0.6564 0.2696 0.468 0.000 0.000 0.296 0.236
#> SRR1033201 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.0609 0.8409 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033203 3 0.3586 0.6817 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1033204 1 0.3882 0.7745 0.756 0.000 0.000 0.020 0.224
#> SRR1033205 5 0.5129 0.4655 0.000 0.000 0.328 0.056 0.616
#> SRR1033206 1 0.2127 0.8746 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1033207 1 0.3109 0.8149 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033208 3 0.0510 0.8468 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033209 5 0.3048 0.6963 0.004 0.000 0.000 0.176 0.820
#> SRR1033210 3 0.0000 0.8495 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 5 0.4303 0.6816 0.056 0.000 0.000 0.192 0.752
#> SRR1033212 3 0.0609 0.8458 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.3477 0.7620 0.112 0.000 0.000 0.832 0.056
#> SRR1033216 1 0.3551 0.7905 0.772 0.000 0.000 0.008 0.220
#> SRR1033215 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 5 0.4088 0.1165 0.000 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033218 1 0.3074 0.8163 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033219 1 0.3123 0.8253 0.812 0.000 0.000 0.004 0.184
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.2358 0.8748 0.888 0.000 0.000 0.008 0.104
#> SRR1033223 5 0.1121 0.6507 0.000 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 4 0.6156 0.3582 0.224 0.000 0.000 0.560 0.216
#> SRR1033226 5 0.1764 0.6106 0.000 0.000 0.064 0.008 0.928
#> SRR1033227 5 0.4367 0.3670 0.000 0.000 0.372 0.008 0.620
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.6536 0.2683 0.464 0.000 0.000 0.320 0.216
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.3160 0.8224 0.808 0.000 0.000 0.004 0.188
#> SRR1033232 5 0.3942 0.6692 0.012 0.000 0.000 0.260 0.728
#> SRR1033233 1 0.3093 0.8378 0.824 0.000 0.000 0.008 0.168
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 5 0.3816 0.3020 0.000 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1033236 5 0.3143 0.4733 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1033237 4 0.3774 0.4784 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1033238 5 0.4306 -0.1054 0.000 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1033240 3 0.0162 0.8492 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033239 5 0.2873 0.6985 0.016 0.000 0.000 0.128 0.856
#> SRR1033242 5 0.3890 0.6752 0.000 0.000 0.012 0.252 0.736
#> SRR1033241 3 0.4249 0.3954 0.000 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 5 0.2929 0.5047 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1033246 1 0.1410 0.8935 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033248 4 0.6442 0.1331 0.196 0.000 0.000 0.480 0.324
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0404 0.8995 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1877 0.8900 0.924 0.000 0.000 0.012 0.064
#> SRR1033254 1 0.0880 0.8997 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 5 0.4060 0.1439 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033258 1 0.3333 0.8054 0.788 0.000 0.000 0.004 0.208
#> SRR1033257 4 0.1484 0.8810 0.008 0.000 0.000 0.944 0.048
#> SRR1033259 1 0.6402 0.3609 0.508 0.000 0.000 0.276 0.216
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0162 0.8485 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033262 3 0.0162 0.8492 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4100 0.7344 0.764 0.000 0.000 0.192 0.044
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.5153 -0.0674 0.040 0.000 0.000 0.524 0.436
#> SRR1033267 5 0.3430 0.4905 0.000 0.000 0.220 0.004 0.776
#> SRR1033268 1 0.0404 0.9005 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033269 3 0.4219 0.4880 0.000 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033270 3 0.0703 0.8409 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033271 1 0.2516 0.8573 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0510 0.8999 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.1444 0.8808 0.012 0.000 0.000 0.948 0.040
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9931 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.4351 0.6946 0.132 0.000 0.000 0.768 0.100
#> SRR1033278 4 0.3039 0.6752 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1033279 5 0.4150 0.0491 0.000 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033280 5 0.4287 -0.1977 0.000 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1033281 1 0.0162 0.9000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033282 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033283 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033284 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033285 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033286 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033287 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033288 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033289 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033290 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033291 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033292 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
#> SRR1033293 5 0.4014 0.6722 0.016 0.000 0.000 0.256 0.728
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.3927 0.43365 0.000 0.000 0.000 0.644 0.344 0.012
#> SRR1032911 4 0.1755 0.86288 0.008 0.000 0.000 0.932 0.032 0.028
#> SRR1032912 4 0.0547 0.87565 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032913 4 0.0692 0.87724 0.000 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1032914 4 0.0547 0.87565 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032915 4 0.0260 0.87735 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032916 4 0.0363 0.87720 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032917 3 0.0909 0.85513 0.000 0.000 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1032918 4 0.2195 0.85452 0.024 0.000 0.000 0.912 0.036 0.028
#> SRR1032919 4 0.0458 0.87555 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.5985 0.37442 0.524 0.000 0.000 0.332 0.100 0.044
#> SRR1032922 5 0.6184 0.31739 0.036 0.000 0.000 0.144 0.504 0.316
#> SRR1032923 4 0.0547 0.87565 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.2274 0.85273 0.028 0.000 0.000 0.908 0.036 0.028
#> SRR1032926 5 0.3390 0.60507 0.000 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000
#> SRR1032927 4 0.2274 0.85273 0.028 0.000 0.000 0.908 0.036 0.028
#> SRR1032929 4 0.2038 0.85770 0.020 0.000 0.000 0.920 0.032 0.028
#> SRR1032928 4 0.1863 0.81241 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000
#> SRR1032930 4 0.0458 0.87555 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.2274 0.85273 0.028 0.000 0.000 0.908 0.036 0.028
#> SRR1032934 4 0.0458 0.87725 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032935 4 0.2274 0.85273 0.028 0.000 0.000 0.908 0.036 0.028
#> SRR1032936 5 0.2854 0.66745 0.000 0.000 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.5783 0.28227 0.516 0.000 0.000 0.368 0.072 0.044
#> SRR1032939 5 0.5133 0.32071 0.004 0.000 0.000 0.088 0.576 0.332
#> SRR1032940 4 0.0458 0.87432 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032941 4 0.0260 0.87735 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.2631 0.76219 0.856 0.000 0.000 0.004 0.012 0.128
#> SRR1032945 4 0.0260 0.87735 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032946 4 0.2024 0.85829 0.016 0.000 0.000 0.920 0.036 0.028
#> SRR1032947 4 0.0964 0.86719 0.000 0.000 0.016 0.968 0.012 0.004
#> SRR1032948 4 0.0260 0.87763 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.5091 0.00257 0.020 0.000 0.000 0.516 0.424 0.040
#> SRR1032951 4 0.2351 0.85036 0.032 0.000 0.000 0.904 0.036 0.028
#> SRR1032952 4 0.0632 0.87427 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032953 4 0.2427 0.84806 0.032 0.000 0.000 0.900 0.036 0.032
#> SRR1032954 4 0.5528 0.51904 0.244 0.000 0.000 0.620 0.100 0.036
#> SRR1032955 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0260 0.87595 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032956 4 0.5844 0.15217 0.388 0.000 0.000 0.492 0.080 0.040
#> SRR1032958 4 0.0603 0.87731 0.000 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1032959 4 0.2494 0.84515 0.040 0.000 0.000 0.896 0.036 0.028
#> SRR1032960 4 0.0713 0.87263 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1032961 4 0.5151 0.48234 0.296 0.000 0.000 0.620 0.044 0.040
#> SRR1032962 2 0.4234 0.39640 0.000 0.576 0.004 0.000 0.012 0.408
#> SRR1032963 4 0.0146 0.87628 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032964 4 0.0146 0.87628 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032965 4 0.1959 0.85914 0.020 0.000 0.000 0.924 0.032 0.024
#> SRR1032966 4 0.0260 0.87763 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 4 0.0146 0.87628 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032969 4 0.0363 0.87547 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032970 4 0.0458 0.87666 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032971 4 0.0260 0.87595 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032972 4 0.0547 0.87565 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032973 4 0.0458 0.87432 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032974 4 0.2704 0.83646 0.048 0.000 0.000 0.884 0.036 0.032
#> SRR1032975 4 0.0260 0.87763 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032976 4 0.3971 0.06185 0.000 0.000 0.000 0.548 0.448 0.004
#> SRR1032977 2 0.2006 0.90826 0.000 0.904 0.000 0.000 0.016 0.080
#> SRR1032978 1 0.2078 0.76985 0.912 0.000 0.000 0.004 0.040 0.044
#> SRR1032979 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0260 0.87595 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032981 4 0.0363 0.87547 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032982 4 0.0547 0.87565 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032983 5 0.3607 0.53080 0.000 0.000 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1032984 4 0.0260 0.87595 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032985 4 0.2195 0.85452 0.024 0.000 0.000 0.912 0.036 0.028
#> SRR1032986 4 0.0405 0.87747 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1032987 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.2274 0.85273 0.028 0.000 0.000 0.908 0.036 0.028
#> SRR1032990 6 0.4899 0.40687 0.000 0.000 0.064 0.000 0.404 0.532
#> SRR1032989 4 0.2274 0.85273 0.028 0.000 0.000 0.908 0.036 0.028
#> SRR1032991 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 5 0.2357 0.72449 0.000 0.000 0.000 0.116 0.872 0.012
#> SRR1032993 4 0.0363 0.87529 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032994 5 0.4777 0.60255 0.004 0.000 0.000 0.212 0.676 0.108
#> SRR1032995 4 0.4078 0.74074 0.124 0.000 0.000 0.784 0.056 0.036
#> SRR1032996 4 0.0858 0.87568 0.000 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1032997 4 0.0146 0.87686 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032998 4 0.0717 0.87149 0.000 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1032999 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.2112 0.90163 0.000 0.896 0.000 0.000 0.016 0.088
#> SRR1033001 4 0.1610 0.82721 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1033002 4 0.2877 0.78060 0.020 0.000 0.000 0.848 0.124 0.008
#> SRR1033003 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0363 0.87529 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033006 3 0.0405 0.85604 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033007 5 0.3296 0.68831 0.000 0.000 0.008 0.188 0.792 0.012
#> SRR1033008 1 0.3905 0.70613 0.744 0.000 0.000 0.004 0.212 0.040
#> SRR1033009 1 0.3273 0.75974 0.844 0.000 0.000 0.024 0.084 0.048
#> SRR1033010 3 0.1716 0.82321 0.000 0.036 0.932 0.004 0.000 0.028
#> SRR1033011 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.2094 0.76357 0.900 0.000 0.000 0.000 0.020 0.080
#> SRR1033013 3 0.0777 0.85612 0.000 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033014 3 0.0713 0.85608 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033015 6 0.4348 0.74297 0.000 0.000 0.268 0.000 0.056 0.676
#> SRR1033016 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.4274 0.46056 0.000 0.024 0.676 0.000 0.012 0.288
#> SRR1033019 3 0.1075 0.85103 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033020 5 0.4100 0.02436 0.388 0.000 0.000 0.004 0.600 0.008
#> SRR1033021 3 0.7834 0.01516 0.072 0.000 0.464 0.116 0.184 0.164
#> SRR1033023 1 0.2136 0.77436 0.904 0.000 0.000 0.000 0.048 0.048
#> SRR1033022 1 0.3134 0.72974 0.808 0.000 0.000 0.000 0.024 0.168
#> SRR1033024 3 0.0146 0.85757 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033025 1 0.3202 0.73304 0.800 0.000 0.000 0.000 0.024 0.176
#> SRR1033026 3 0.0000 0.85698 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.4370 0.22553 0.000 0.000 0.552 0.428 0.008 0.012
#> SRR1033029 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0865 0.85464 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033031 2 0.5454 0.55557 0.168 0.648 0.000 0.000 0.032 0.152
#> SRR1033032 2 0.1498 0.93038 0.000 0.940 0.028 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033033 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.3628 0.71580 0.776 0.004 0.000 0.000 0.036 0.184
#> SRR1033036 1 0.3345 0.71578 0.788 0.000 0.000 0.000 0.028 0.184
#> SRR1033037 1 0.2889 0.76388 0.856 0.000 0.000 0.004 0.096 0.044
#> SRR1033038 2 0.0603 0.95702 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033039 3 0.2593 0.76878 0.000 0.000 0.844 0.000 0.008 0.148
#> SRR1033040 6 0.6915 0.33897 0.164 0.000 0.356 0.000 0.084 0.396
#> SRR1033041 1 0.2214 0.76632 0.888 0.000 0.000 0.000 0.096 0.016
#> SRR1033042 1 0.3512 0.70931 0.772 0.000 0.000 0.000 0.032 0.196
#> SRR1033043 1 0.3351 0.75767 0.840 0.000 0.000 0.028 0.084 0.048
#> SRR1033044 1 0.2213 0.76939 0.904 0.000 0.000 0.004 0.044 0.048
#> SRR1033045 3 0.0692 0.85884 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1033046 5 0.4317 0.63138 0.000 0.000 0.092 0.056 0.776 0.076
#> SRR1033047 3 0.1152 0.85658 0.000 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033048 4 0.8213 -0.25035 0.060 0.000 0.144 0.332 0.300 0.164
#> SRR1033049 1 0.2536 0.75692 0.864 0.000 0.000 0.000 0.020 0.116
#> SRR1033051 1 0.4262 0.73011 0.780 0.000 0.000 0.084 0.084 0.052
#> SRR1033052 1 0.1334 0.77522 0.948 0.000 0.000 0.000 0.032 0.020
#> SRR1033053 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 6 0.4718 0.80074 0.000 0.000 0.200 0.000 0.124 0.676
#> SRR1033050 1 0.3009 0.75430 0.844 0.000 0.000 0.004 0.112 0.040
#> SRR1033055 3 0.1644 0.83456 0.000 0.004 0.920 0.000 0.000 0.076
#> SRR1033056 5 0.2153 0.73451 0.004 0.000 0.004 0.084 0.900 0.008
#> SRR1033057 1 0.2790 0.74190 0.840 0.000 0.000 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033058 3 0.0713 0.85608 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033059 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.5832 0.05115 0.428 0.000 0.000 0.000 0.384 0.188
#> SRR1033061 2 0.1196 0.94235 0.000 0.952 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1033062 3 0.0713 0.85608 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033063 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1141 0.85589 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1033065 1 0.3333 0.71673 0.784 0.000 0.000 0.000 0.024 0.192
#> SRR1033066 1 0.3481 0.70910 0.776 0.000 0.000 0.000 0.032 0.192
#> SRR1033067 1 0.2583 0.77122 0.888 0.000 0.000 0.016 0.044 0.052
#> SRR1033068 6 0.4707 0.79463 0.000 0.000 0.216 0.000 0.112 0.672
#> SRR1033069 2 0.1411 0.93136 0.000 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033070 6 0.4638 0.78707 0.000 0.000 0.232 0.000 0.096 0.672
#> SRR1033071 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0692 0.95726 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1033073 3 0.4322 0.25929 0.000 0.372 0.600 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033074 1 0.5383 0.59685 0.652 0.000 0.000 0.208 0.100 0.040
#> SRR1033075 5 0.3015 0.72087 0.012 0.000 0.000 0.120 0.844 0.024
#> SRR1033076 6 0.4631 0.80251 0.000 0.000 0.168 0.000 0.140 0.692
#> SRR1033077 1 0.2778 0.76948 0.872 0.000 0.000 0.016 0.080 0.032
#> SRR1033078 1 0.2984 0.76087 0.848 0.000 0.000 0.004 0.104 0.044
#> SRR1033079 3 0.0458 0.85833 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033080 3 0.0713 0.85608 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033081 5 0.4236 0.55403 0.188 0.000 0.000 0.060 0.740 0.012
#> SRR1033082 1 0.4545 0.66247 0.720 0.048 0.000 0.000 0.032 0.200
#> SRR1033083 3 0.2100 0.81435 0.000 0.000 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1033084 1 0.2838 0.75790 0.852 0.000 0.000 0.004 0.116 0.028
#> SRR1033085 3 0.0260 0.85831 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033086 2 0.1049 0.94747 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1033087 1 0.2451 0.77452 0.888 0.000 0.000 0.004 0.040 0.068
#> SRR1033088 3 0.0790 0.85541 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033089 3 0.2213 0.81320 0.000 0.000 0.904 0.004 0.044 0.048
#> SRR1033090 4 0.0363 0.87529 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033091 3 0.0632 0.86049 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033092 1 0.2445 0.75770 0.872 0.000 0.000 0.000 0.020 0.108
#> SRR1033093 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 6 0.3652 0.64558 0.000 0.000 0.324 0.000 0.004 0.672
#> SRR1033095 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 6 0.5703 0.67304 0.000 0.000 0.212 0.000 0.268 0.520
#> SRR1033097 2 0.0891 0.95240 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1033098 3 0.0790 0.85541 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033099 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.1528 0.84199 0.000 0.000 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR1033102 1 0.4428 0.58949 0.624 0.000 0.000 0.004 0.340 0.032
#> SRR1033103 1 0.2445 0.75844 0.872 0.000 0.000 0.000 0.020 0.108
#> SRR1033104 3 0.0363 0.85679 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033105 1 0.2491 0.75629 0.868 0.000 0.000 0.000 0.020 0.112
#> SRR1033106 5 0.4034 0.26722 0.336 0.000 0.000 0.004 0.648 0.012
#> SRR1033107 3 0.0363 0.85679 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033108 4 0.3907 0.75847 0.064 0.000 0.000 0.800 0.104 0.032
#> SRR1033109 1 0.3508 0.65033 0.704 0.000 0.000 0.000 0.292 0.004
#> SRR1033110 6 0.5187 0.76382 0.000 0.000 0.264 0.000 0.136 0.600
#> SRR1033111 1 0.2988 0.73467 0.824 0.000 0.000 0.000 0.024 0.152
#> SRR1033112 1 0.2266 0.76672 0.880 0.000 0.000 0.000 0.108 0.012
#> SRR1033113 6 0.3606 0.71335 0.000 0.000 0.256 0.000 0.016 0.728
#> SRR1033114 1 0.3418 0.71362 0.784 0.000 0.000 0.000 0.032 0.184
#> SRR1033115 1 0.3712 0.69872 0.760 0.004 0.000 0.000 0.032 0.204
#> SRR1033116 3 0.0508 0.85530 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033117 3 0.0458 0.85861 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033118 5 0.4842 0.58934 0.000 0.000 0.128 0.092 0.728 0.052
#> SRR1033119 1 0.2983 0.76829 0.832 0.000 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1033121 3 0.2053 0.80086 0.000 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1033120 2 0.1913 0.91098 0.000 0.908 0.000 0.000 0.012 0.080
#> SRR1033122 5 0.5600 0.23512 0.000 0.000 0.216 0.016 0.600 0.168
#> SRR1033123 1 0.3245 0.72225 0.800 0.000 0.000 0.000 0.028 0.172
#> SRR1033124 1 0.1845 0.77535 0.920 0.000 0.000 0.000 0.052 0.028
#> SRR1033125 6 0.3165 0.73792 0.008 0.000 0.116 0.000 0.040 0.836
#> SRR1033126 1 0.2624 0.74932 0.856 0.000 0.000 0.000 0.020 0.124
#> SRR1033127 2 0.0363 0.96109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0000 0.85698 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.3572 0.70081 0.764 0.000 0.000 0.000 0.032 0.204
#> SRR1033130 1 0.4323 0.54979 0.600 0.000 0.000 0.004 0.376 0.020
#> SRR1033131 1 0.3041 0.76488 0.832 0.000 0.000 0.000 0.128 0.040
#> SRR1033132 6 0.3511 0.75146 0.000 0.000 0.216 0.000 0.024 0.760
#> SRR1033133 6 0.3766 0.58692 0.000 0.000 0.012 0.000 0.304 0.684
#> SRR1033134 1 0.5296 0.55657 0.588 0.000 0.000 0.056 0.324 0.032
#> SRR1033135 6 0.4584 0.51821 0.000 0.000 0.404 0.000 0.040 0.556
#> SRR1033136 1 0.2058 0.77464 0.908 0.000 0.000 0.000 0.056 0.036
#> SRR1033137 6 0.4854 0.80009 0.000 0.000 0.184 0.000 0.152 0.664
#> SRR1033139 2 0.2553 0.85417 0.000 0.848 0.000 0.000 0.008 0.144
#> SRR1033138 2 0.5727 0.27829 0.080 0.500 0.000 0.000 0.032 0.388
#> SRR1033140 3 0.1863 0.82652 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1033141 1 0.4246 0.51181 0.580 0.000 0.000 0.000 0.400 0.020
#> SRR1033142 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.4459 0.60906 0.640 0.000 0.000 0.008 0.320 0.032
#> SRR1033144 1 0.3134 0.72628 0.808 0.000 0.000 0.000 0.024 0.168
#> SRR1033145 3 0.3841 0.22572 0.000 0.000 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1033146 2 0.4162 0.75336 0.044 0.760 0.000 0.000 0.028 0.168
#> SRR1033147 2 0.2744 0.84714 0.000 0.840 0.000 0.000 0.016 0.144
#> SRR1033148 4 0.6450 0.12384 0.328 0.000 0.000 0.444 0.196 0.032
#> SRR1033149 3 0.0713 0.85608 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033150 5 0.2928 0.65146 0.056 0.000 0.000 0.004 0.856 0.084
#> SRR1033151 6 0.4007 0.77057 0.000 0.000 0.220 0.000 0.052 0.728
#> SRR1033152 5 0.2046 0.70600 0.008 0.000 0.000 0.032 0.916 0.044
#> SRR1033153 6 0.3717 0.64565 0.040 0.000 0.016 0.000 0.152 0.792
#> SRR1033154 1 0.2790 0.73989 0.840 0.000 0.000 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033156 3 0.1152 0.84921 0.000 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1033157 1 0.2122 0.76828 0.900 0.000 0.000 0.000 0.024 0.076
#> SRR1033158 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.2431 0.77405 0.000 0.000 0.860 0.000 0.008 0.132
#> SRR1033160 3 0.3993 0.12022 0.000 0.000 0.592 0.000 0.008 0.400
#> SRR1033161 1 0.5522 0.61670 0.644 0.000 0.000 0.160 0.160 0.036
#> SRR1033163 6 0.4066 0.78391 0.000 0.000 0.204 0.000 0.064 0.732
#> SRR1033162 1 0.3450 0.71172 0.780 0.000 0.000 0.000 0.032 0.188
#> SRR1033164 2 0.0260 0.96552 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033165 5 0.3323 0.67804 0.000 0.000 0.008 0.204 0.780 0.008
#> SRR1033166 1 0.6050 0.47416 0.568 0.148 0.000 0.000 0.044 0.240
#> SRR1033167 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 6 0.5449 0.48518 0.000 0.000 0.424 0.000 0.120 0.456
#> SRR1033169 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0547 0.95938 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033170 1 0.2094 0.77439 0.900 0.000 0.000 0.000 0.080 0.020
#> SRR1033172 3 0.2668 0.74781 0.000 0.000 0.828 0.000 0.004 0.168
#> SRR1033173 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.1814 0.81931 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1033175 1 0.4197 0.64811 0.680 0.000 0.000 0.004 0.284 0.032
#> SRR1033176 1 0.2163 0.75767 0.892 0.000 0.000 0.000 0.016 0.092
#> SRR1033177 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.2432 0.75880 0.876 0.000 0.000 0.000 0.024 0.100
#> SRR1033181 1 0.2858 0.75420 0.844 0.000 0.000 0.000 0.032 0.124
#> SRR1033183 3 0.0146 0.85805 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033182 1 0.4229 0.64548 0.668 0.000 0.000 0.000 0.292 0.040
#> SRR1033184 6 0.4871 0.74863 0.000 0.000 0.124 0.000 0.224 0.652
#> SRR1033185 1 0.2750 0.74275 0.844 0.000 0.000 0.000 0.020 0.136
#> SRR1033187 5 0.1686 0.72931 0.012 0.000 0.000 0.064 0.924 0.000
#> SRR1033186 2 0.1707 0.92028 0.004 0.928 0.000 0.000 0.012 0.056
#> SRR1033188 5 0.3394 0.68727 0.000 0.000 0.012 0.188 0.788 0.012
#> SRR1033189 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.3102 0.73337 0.816 0.000 0.000 0.000 0.028 0.156
#> SRR1033191 1 0.3312 0.71931 0.792 0.000 0.000 0.000 0.028 0.180
#> SRR1033192 2 0.2859 0.83473 0.000 0.828 0.000 0.000 0.016 0.156
#> SRR1033193 1 0.4289 0.59475 0.632 0.000 0.000 0.004 0.340 0.024
#> SRR1033195 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.1802 0.91686 0.000 0.916 0.000 0.000 0.012 0.072
#> SRR1033197 1 0.2932 0.73435 0.820 0.000 0.000 0.000 0.016 0.164
#> SRR1033196 6 0.3787 0.77426 0.000 0.000 0.120 0.000 0.100 0.780
#> SRR1033199 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.4607 0.56192 0.604 0.000 0.000 0.012 0.356 0.028
#> SRR1033200 1 0.6016 0.39128 0.488 0.000 0.000 0.116 0.364 0.032
#> SRR1033201 3 0.0508 0.85895 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033202 3 0.0717 0.84744 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1033203 3 0.4897 -0.28367 0.000 0.000 0.492 0.000 0.060 0.448
#> SRR1033204 1 0.4582 0.56237 0.604 0.000 0.000 0.008 0.356 0.032
#> SRR1033205 5 0.4695 0.45580 0.000 0.000 0.224 0.028 0.696 0.052
#> SRR1033206 1 0.3645 0.69736 0.740 0.000 0.000 0.000 0.236 0.024
#> SRR1033207 1 0.4302 0.61111 0.644 0.000 0.000 0.004 0.324 0.028
#> SRR1033208 3 0.1779 0.83493 0.000 0.000 0.920 0.000 0.016 0.064
#> SRR1033209 5 0.2825 0.70344 0.000 0.000 0.008 0.064 0.868 0.060
#> SRR1033210 3 0.0260 0.85893 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033211 5 0.1850 0.72208 0.016 0.000 0.000 0.052 0.924 0.008
#> SRR1033212 3 0.1970 0.81605 0.000 0.000 0.900 0.000 0.008 0.092
#> SRR1033213 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.5375 0.55823 0.208 0.000 0.000 0.648 0.112 0.032
#> SRR1033216 1 0.4594 0.55650 0.600 0.000 0.000 0.008 0.360 0.032
#> SRR1033215 2 0.0547 0.95465 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 6 0.5192 0.64858 0.000 0.000 0.116 0.000 0.308 0.576
#> SRR1033218 1 0.4331 0.60228 0.636 0.000 0.000 0.004 0.332 0.028
#> SRR1033219 1 0.4306 0.62665 0.656 0.000 0.000 0.004 0.308 0.032
#> SRR1033221 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.3761 0.71630 0.764 0.000 0.000 0.008 0.196 0.032
#> SRR1033223 5 0.3089 0.56654 0.000 0.000 0.004 0.008 0.800 0.188
#> SRR1033225 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 5 0.6718 -0.09098 0.328 0.000 0.000 0.300 0.340 0.032
#> SRR1033226 5 0.4261 0.07738 0.000 0.000 0.020 0.000 0.572 0.408
#> SRR1033227 5 0.4650 0.39954 0.000 0.000 0.232 0.008 0.684 0.076
#> SRR1033229 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.6163 0.40898 0.492 0.000 0.000 0.144 0.332 0.032
#> SRR1033231 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.4355 0.61267 0.644 0.000 0.000 0.004 0.320 0.032
#> SRR1033232 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033233 1 0.4659 0.63441 0.656 0.000 0.000 0.024 0.288 0.032
#> SRR1033235 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 5 0.5616 -0.19756 0.000 0.000 0.156 0.000 0.492 0.352
#> SRR1033236 5 0.5160 0.04764 0.000 0.000 0.104 0.000 0.564 0.332
#> SRR1033237 5 0.4045 0.27520 0.000 0.000 0.000 0.428 0.564 0.008
#> SRR1033238 5 0.5636 -0.23341 0.000 0.000 0.424 0.000 0.428 0.148
#> SRR1033240 3 0.1411 0.84139 0.000 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033239 5 0.1794 0.71044 0.000 0.000 0.000 0.036 0.924 0.040
#> SRR1033242 5 0.3320 0.69808 0.000 0.000 0.032 0.076 0.844 0.048
#> SRR1033241 3 0.6050 -0.41911 0.000 0.000 0.412 0.000 0.276 0.312
#> SRR1033244 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 5 0.4695 -0.18421 0.000 0.000 0.044 0.000 0.508 0.448
#> SRR1033246 1 0.2760 0.75835 0.856 0.000 0.000 0.004 0.116 0.024
#> SRR1033248 5 0.6451 0.25664 0.216 0.000 0.000 0.288 0.464 0.032
#> SRR1033247 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.2325 0.77011 0.892 0.000 0.000 0.000 0.048 0.060
#> SRR1033252 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.3419 0.74194 0.804 0.000 0.000 0.004 0.152 0.040
#> SRR1033254 1 0.2750 0.76992 0.868 0.000 0.000 0.004 0.080 0.048
#> SRR1033256 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 6 0.5810 0.46624 0.000 0.000 0.184 0.000 0.380 0.436
#> SRR1033258 1 0.4450 0.59242 0.628 0.000 0.000 0.008 0.336 0.028
#> SRR1033257 4 0.2825 0.83182 0.040 0.000 0.000 0.876 0.056 0.028
#> SRR1033259 1 0.6095 0.41392 0.496 0.000 0.000 0.132 0.340 0.032
#> SRR1033260 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.1219 0.84924 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1033262 3 0.1411 0.84087 0.000 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1033263 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.5339 0.49494 0.612 0.000 0.000 0.288 0.040 0.060
#> SRR1033265 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 5 0.4829 0.42836 0.056 0.000 0.000 0.356 0.584 0.004
#> SRR1033267 5 0.4934 0.34705 0.000 0.000 0.124 0.004 0.660 0.212
#> SRR1033268 1 0.2579 0.77306 0.872 0.000 0.000 0.000 0.088 0.040
#> SRR1033269 6 0.4619 0.77631 0.000 0.000 0.244 0.000 0.088 0.668
#> SRR1033270 3 0.1779 0.83321 0.000 0.000 0.920 0.000 0.016 0.064
#> SRR1033271 1 0.4264 0.65099 0.676 0.000 0.000 0.004 0.284 0.036
#> SRR1033272 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.2277 0.77348 0.892 0.000 0.000 0.000 0.076 0.032
#> SRR1033274 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.2494 0.84562 0.040 0.000 0.000 0.896 0.036 0.028
#> SRR1033276 2 0.0000 0.96953 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.6228 0.32911 0.268 0.000 0.000 0.516 0.184 0.032
#> SRR1033278 4 0.3266 0.56048 0.000 0.000 0.000 0.728 0.272 0.000
#> SRR1033279 6 0.5041 0.72219 0.000 0.000 0.128 0.000 0.248 0.624
#> SRR1033280 6 0.4862 0.79084 0.000 0.000 0.164 0.000 0.172 0.664
#> SRR1033281 1 0.1723 0.77254 0.928 0.000 0.000 0.000 0.036 0.036
#> SRR1033282 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033283 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033284 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033285 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033286 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033287 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033288 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033289 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033290 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033291 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033292 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1033293 5 0.1501 0.73631 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.994 0.963 0.985 0.30672 0.700 0.700
#> 3 3 0.491 0.710 0.869 0.59487 0.851 0.787
#> 4 4 0.716 0.770 0.906 0.35850 0.735 0.544
#> 5 5 0.732 0.751 0.900 0.03568 0.964 0.898
#> 6 6 0.734 0.737 0.897 0.00874 0.994 0.982
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.5294 0.855 0.120 0.880
#> SRR1032933 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.6712 0.783 0.824 0.176
#> SRR1032963 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.8207 0.654 0.744 0.256
#> SRR1032978 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033000 1 0.7219 0.747 0.800 0.200
#> SRR1033001 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.0672 0.979 0.992 0.008
#> SRR1033031 1 0.6712 0.783 0.824 0.176
#> SRR1033032 1 0.4431 0.891 0.908 0.092
#> SRR1033033 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.9358 0.455 0.648 0.352
#> SRR1033039 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.6438 0.800 0.836 0.164
#> SRR1033056 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.9754 0.322 0.408 0.592
#> SRR1033062 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.9608 0.373 0.616 0.384
#> SRR1033070 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.7376 0.740 0.208 0.792
#> SRR1033073 1 0.7299 0.741 0.796 0.204
#> SRR1033074 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0376 0.983 0.996 0.004
#> SRR1033083 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.8763 0.590 0.296 0.704
#> SRR1033087 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.2603 0.944 0.956 0.044
#> SRR1033089 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.2423 0.948 0.960 0.040
#> SRR1033114 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033120 1 0.9323 0.464 0.652 0.348
#> SRR1033122 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033129 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.6438 0.800 0.836 0.164
#> SRR1033138 1 0.1184 0.972 0.984 0.016
#> SRR1033140 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.9710 0.328 0.600 0.400
#> SRR1033147 1 0.9732 0.317 0.596 0.404
#> SRR1033148 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.8555 0.610 0.720 0.280
#> SRR1033165 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.8081 0.677 0.248 0.752
#> SRR1033170 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.2236 0.952 0.964 0.036
#> SRR1033188 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.8443 0.625 0.728 0.272
#> SRR1033193 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.9522 0.420 0.372 0.628
#> SRR1033197 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.6247 0.812 0.156 0.844
#> SRR1033217 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0376 0.970 0.004 0.996
#> SRR1033249 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.973 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.3038 0.7688 0.896 0.000 0.104
#> SRR1032911 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0237 0.8084 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032916 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0237 0.5703 0.004 0.000 0.996
#> SRR1032918 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0424 0.8087 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.4178 0.7204 0.828 0.000 0.172
#> SRR1032923 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.3340 0.7621 0.120 0.880 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.3038 0.7766 0.896 0.000 0.104
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.2959 0.7797 0.900 0.000 0.100
#> SRR1032940 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.1964 0.8045 0.944 0.000 0.056
#> SRR1032948 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0424 0.8088 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032951 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.7160 0.6371 0.720 0.132 0.148
#> SRR1032963 1 0.0237 0.8085 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032964 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0892 0.8083 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032970 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.1289 0.8065 0.968 0.000 0.032
#> SRR1032974 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.5138 0.5771 0.748 0.252 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0892 0.8083 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032981 1 0.0747 0.8086 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032982 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.4291 0.7089 0.820 0.000 0.180
#> SRR1032984 1 0.2878 0.7815 0.904 0.000 0.096
#> SRR1032985 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.3686 0.7685 0.860 0.000 0.140
#> SRR1032989 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.3267 0.7726 0.884 0.000 0.116
#> SRR1032993 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.2959 0.7790 0.900 0.000 0.100
#> SRR1032995 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 1 0.4555 0.6583 0.800 0.200 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.3482 0.7692 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033007 1 0.1163 0.8073 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033008 1 0.1411 0.8071 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033009 1 0.0237 0.8085 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033010 1 0.4605 0.7439 0.796 0.000 0.204
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.5431 0.5248 0.716 0.000 0.284
#> SRR1033013 3 0.6295 0.1172 0.472 0.000 0.528
#> SRR1033014 3 0.6095 0.4018 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033015 3 0.6280 0.1723 0.460 0.000 0.540
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.3412 0.7691 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033019 1 0.6154 0.3922 0.592 0.000 0.408
#> SRR1033020 1 0.2796 0.7918 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033021 1 0.3267 0.7682 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033023 1 0.2625 0.7907 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033022 1 0.2261 0.7977 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033024 3 0.6307 0.0356 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033025 1 0.4504 0.6880 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033026 1 0.6204 0.3411 0.576 0.000 0.424
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.3192 0.7712 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 1 0.6111 0.4267 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033031 1 0.4741 0.7048 0.828 0.152 0.020
#> SRR1033032 1 0.5092 0.7504 0.804 0.020 0.176
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2448 0.7920 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033036 1 0.5291 0.5612 0.732 0.000 0.268
#> SRR1033037 1 0.0237 0.8084 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033038 1 0.6252 0.3908 0.648 0.344 0.008
#> SRR1033039 1 0.5760 0.5845 0.672 0.000 0.328
#> SRR1033040 1 0.4452 0.7530 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033041 1 0.2625 0.7907 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033042 1 0.1163 0.8116 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033043 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.2711 0.7858 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033045 1 0.3267 0.7682 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033046 1 0.3340 0.7690 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033047 1 0.4555 0.7456 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033048 1 0.3267 0.7682 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033049 1 0.2537 0.7901 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033051 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.1860 0.8037 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.4235 0.7593 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033050 1 0.0237 0.8085 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033055 1 0.5450 0.7167 0.760 0.012 0.228
#> SRR1033056 1 0.0747 0.8107 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033057 1 0.3267 0.7715 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033058 3 0.6307 0.0364 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.2959 0.7796 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033061 2 0.6154 0.0320 0.408 0.592 0.000
#> SRR1033062 1 0.4555 0.7456 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.5882 0.5445 0.652 0.000 0.348
#> SRR1033065 1 0.5431 0.5272 0.716 0.000 0.284
#> SRR1033066 1 0.3551 0.7871 0.868 0.000 0.132
#> SRR1033067 1 0.0892 0.8083 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033068 1 0.6045 0.4682 0.620 0.000 0.380
#> SRR1033069 1 0.6416 0.3191 0.616 0.376 0.008
#> SRR1033070 1 0.4504 0.7484 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.4654 0.5774 0.208 0.792 0.000
#> SRR1033073 1 0.5883 0.7200 0.796 0.092 0.112
#> SRR1033074 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.2878 0.7816 0.904 0.000 0.096
#> SRR1033076 1 0.4504 0.7484 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033077 1 0.0424 0.8089 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033078 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.5216 0.6911 0.740 0.000 0.260
#> SRR1033080 1 0.5098 0.7045 0.752 0.000 0.248
#> SRR1033081 1 0.2537 0.7929 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033082 1 0.4235 0.7662 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033083 1 0.5178 0.6961 0.744 0.000 0.256
#> SRR1033084 1 0.2448 0.7945 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033085 1 0.3816 0.7677 0.852 0.000 0.148
#> SRR1033086 2 0.5529 0.3534 0.296 0.704 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.6140 0.3694 0.404 0.000 0.596
#> SRR1033089 1 0.3267 0.7682 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033090 1 0.3192 0.7710 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033091 1 0.4178 0.7618 0.828 0.000 0.172
#> SRR1033092 1 0.2066 0.8007 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.4235 0.7594 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.3267 0.7682 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 1 0.6111 0.4267 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.3412 0.7690 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033102 1 0.6307 -0.2539 0.512 0.000 0.488
#> SRR1033103 1 0.4555 0.6838 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033104 3 0.3482 0.6700 0.128 0.000 0.872
#> SRR1033105 1 0.2878 0.7857 0.904 0.000 0.096
#> SRR1033106 1 0.3686 0.7548 0.860 0.000 0.140
#> SRR1033107 1 0.5785 0.5767 0.668 0.000 0.332
#> SRR1033108 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.6291 -0.1838 0.532 0.000 0.468
#> SRR1033110 3 0.5497 0.5826 0.292 0.000 0.708
#> SRR1033111 1 0.6168 0.0837 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033112 1 0.4555 0.6822 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033113 1 0.4235 0.7592 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033114 1 0.3412 0.7708 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033115 1 0.0424 0.8097 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033116 1 0.4178 0.7607 0.828 0.000 0.172
#> SRR1033117 1 0.6299 0.1281 0.524 0.000 0.476
#> SRR1033118 1 0.4555 0.7456 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033119 1 0.1529 0.8062 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033121 1 0.6111 0.4270 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033120 1 0.9776 -0.2145 0.440 0.276 0.284
#> SRR1033122 1 0.3941 0.7657 0.844 0.000 0.156
#> SRR1033123 1 0.6244 -0.0545 0.560 0.000 0.440
#> SRR1033124 1 0.3816 0.7469 0.852 0.000 0.148
#> SRR1033125 3 0.5291 0.6116 0.268 0.000 0.732
#> SRR1033126 1 0.6204 0.0255 0.576 0.000 0.424
#> SRR1033127 2 0.1411 0.9173 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033129 3 0.5591 0.5676 0.304 0.000 0.696
#> SRR1033128 1 0.5291 0.6722 0.732 0.000 0.268
#> SRR1033130 1 0.5363 0.5368 0.724 0.000 0.276
#> SRR1033131 1 0.2066 0.8008 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033132 1 0.5138 0.7008 0.748 0.000 0.252
#> SRR1033133 1 0.4235 0.7602 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033134 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.6274 0.1893 0.456 0.000 0.544
#> SRR1033136 1 0.6140 0.1210 0.596 0.000 0.404
#> SRR1033137 3 0.6062 0.4163 0.384 0.000 0.616
#> SRR1033139 1 0.6476 0.6987 0.748 0.068 0.184
#> SRR1033138 1 0.5722 0.6172 0.704 0.004 0.292
#> SRR1033140 1 0.5760 0.5849 0.672 0.000 0.328
#> SRR1033141 1 0.5291 0.5745 0.732 0.000 0.268
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2625 0.7912 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033144 1 0.5363 0.5434 0.724 0.000 0.276
#> SRR1033145 1 0.6180 0.3671 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033146 1 0.6737 0.2884 0.600 0.384 0.016
#> SRR1033147 1 0.7558 0.1689 0.556 0.400 0.044
#> SRR1033148 1 0.0892 0.8082 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033149 3 0.5926 0.4753 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033150 1 0.3038 0.7925 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033151 1 0.6215 0.3273 0.572 0.000 0.428
#> SRR1033152 1 0.2537 0.7929 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033153 1 0.6008 0.4894 0.628 0.000 0.372
#> SRR1033154 1 0.4002 0.7753 0.840 0.000 0.160
#> SRR1033156 1 0.6140 0.4037 0.596 0.000 0.404
#> SRR1033157 1 0.0592 0.8088 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.4291 0.7572 0.820 0.000 0.180
#> SRR1033160 1 0.4555 0.7461 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033161 1 0.1411 0.8067 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033163 1 0.4750 0.7343 0.784 0.000 0.216
#> SRR1033162 1 0.5216 0.5835 0.740 0.000 0.260
#> SRR1033164 1 0.7759 0.5551 0.676 0.180 0.144
#> SRR1033165 1 0.1529 0.8048 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033166 1 0.2959 0.7837 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.6235 0.2666 0.436 0.000 0.564
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.5502 0.4663 0.248 0.744 0.008
#> SRR1033170 1 0.5397 0.5342 0.720 0.000 0.280
#> SRR1033172 3 0.5291 0.6077 0.268 0.000 0.732
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.6126 0.4152 0.600 0.000 0.400
#> SRR1033175 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.3879 0.7415 0.848 0.000 0.152
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.3116 0.7988 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033181 1 0.5560 0.4872 0.700 0.000 0.300
#> SRR1033183 1 0.4346 0.7560 0.816 0.000 0.184
#> SRR1033182 1 0.1753 0.8048 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033184 1 0.5621 0.6172 0.692 0.000 0.308
#> SRR1033185 1 0.5291 0.5611 0.732 0.000 0.268
#> SRR1033187 1 0.2261 0.7978 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033186 1 0.5062 0.7481 0.800 0.016 0.184
#> SRR1033188 1 0.3192 0.7710 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.1289 0.8076 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033191 1 0.5650 0.4553 0.688 0.000 0.312
#> SRR1033192 1 0.6361 0.5780 0.728 0.232 0.040
#> SRR1033193 3 0.5926 0.5771 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.7163 0.1965 0.332 0.628 0.040
#> SRR1033197 1 0.5733 0.4305 0.676 0.000 0.324
#> SRR1033196 1 0.6291 0.1665 0.532 0.000 0.468
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 3 0.5431 0.6394 0.284 0.000 0.716
#> SRR1033200 1 0.5363 0.5420 0.724 0.000 0.276
#> SRR1033201 1 0.5254 0.6854 0.736 0.000 0.264
#> SRR1033202 3 0.4974 0.6316 0.236 0.000 0.764
#> SRR1033203 3 0.4062 0.6631 0.164 0.000 0.836
#> SRR1033204 1 0.5650 0.4563 0.688 0.000 0.312
#> SRR1033205 1 0.3619 0.7688 0.864 0.000 0.136
#> SRR1033206 3 0.6309 0.2749 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033207 1 0.6299 -0.2094 0.524 0.000 0.476
#> SRR1033208 3 0.0000 0.5653 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 1 0.4346 0.7617 0.816 0.000 0.184
#> SRR1033210 3 0.0000 0.5653 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 3 0.5465 0.6374 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033212 3 0.0747 0.5836 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0892 0.8089 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033215 2 0.6510 0.5693 0.156 0.756 0.088
#> SRR1033217 3 0.6168 0.3460 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033218 1 0.6308 -0.2681 0.508 0.000 0.492
#> SRR1033219 1 0.5058 0.6119 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.6095 0.4500 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0237 0.8083 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033226 1 0.4654 0.7412 0.792 0.000 0.208
#> SRR1033227 1 0.4399 0.7529 0.812 0.000 0.188
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0237 0.8083 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1529 0.8063 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033232 1 0.5760 0.4088 0.672 0.000 0.328
#> SRR1033233 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.4974 0.7193 0.764 0.000 0.236
#> SRR1033236 1 0.4178 0.7615 0.828 0.000 0.172
#> SRR1033237 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.6192 0.3546 0.580 0.000 0.420
#> SRR1033240 1 0.4555 0.7456 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033239 1 0.2625 0.7963 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033242 1 0.4399 0.7533 0.812 0.000 0.188
#> SRR1033241 1 0.5706 0.5991 0.680 0.000 0.320
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.6295 0.1495 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033246 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0892 0.8083 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033247 2 0.0237 0.9502 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.4702 0.7361 0.788 0.000 0.212
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.2625 0.7924 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033254 1 0.1753 0.8042 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.5016 0.7129 0.760 0.000 0.240
#> SRR1033258 1 0.4002 0.7328 0.840 0.000 0.160
#> SRR1033257 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.4346 0.7553 0.816 0.000 0.184
#> SRR1033262 1 0.5948 0.5180 0.640 0.000 0.360
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0424 0.8087 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.4062 0.7727 0.836 0.000 0.164
#> SRR1033267 1 0.6180 0.3669 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033268 1 0.3267 0.7774 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033269 3 0.5926 0.4826 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033270 1 0.3412 0.7683 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033271 1 0.6244 -0.0545 0.560 0.000 0.440
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4931 0.6311 0.768 0.000 0.232
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.8080 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0747 0.8090 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033279 1 0.5882 0.5446 0.652 0.000 0.348
#> SRR1033280 1 0.5678 0.6072 0.684 0.000 0.316
#> SRR1033281 1 0.2711 0.7903 0.912 0.000 0.088
#> SRR1033282 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033283 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033284 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033285 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033286 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033287 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033288 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033289 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033290 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033291 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033292 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
#> SRR1033293 3 0.3267 0.6173 0.116 0.000 0.884
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.3024 0.7648 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1032911 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.2011 0.8382 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1032918 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0817 0.8501 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.6685 0.4044 0.616 0.000 0.160 0.224
#> SRR1032923 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.4224 0.7427 0.100 0.824 0.076 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0336 0.8565 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0592 0.8506 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.3833 0.7665 0.848 0.000 0.080 0.072
#> SRR1032948 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0817 0.8502 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032951 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.3542 0.7835 0.000 0.120 0.852 0.028
#> SRR1032963 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0188 0.8587 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032975 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.6313 0.4377 0.652 0.220 0.128 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.4103 0.6353 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1032984 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.4585 0.3590 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.3266 0.7476 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1032993 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 1 0.3791 0.6575 0.796 0.200 0.004 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.3172 0.7079 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.1302 0.8400 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033009 1 0.0336 0.8571 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033010 3 0.0188 0.8785 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.5699 0.3016 0.588 0.000 0.032 0.380
#> SRR1033013 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0336 0.8773 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.4830 0.3048 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.3725 0.7248 0.812 0.000 0.008 0.180
#> SRR1033021 1 0.0469 0.8544 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033023 1 0.3486 0.7212 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033022 1 0.3024 0.7628 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033024 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.4677 0.5234 0.680 0.000 0.004 0.316
#> SRR1033026 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0817 0.8473 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.4514 0.6844 0.800 0.136 0.064 0.000
#> SRR1033032 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2704 0.7477 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1033036 1 0.5855 0.3439 0.600 0.000 0.044 0.356
#> SRR1033037 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.7792 -0.1112 0.412 0.256 0.332 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.6850 0.0393 0.376 0.000 0.516 0.108
#> SRR1033041 1 0.3610 0.7073 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033042 1 0.1297 0.8446 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR1033043 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0817 0.8674 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033046 1 0.2546 0.7921 0.900 0.000 0.092 0.008
#> SRR1033047 3 0.2760 0.7561 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1033048 1 0.0336 0.8564 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.2081 0.8144 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0188 0.8586 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033057 1 0.2011 0.8053 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 3 0.4817 0.3713 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1033062 3 0.1867 0.8245 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.7178 0.1087 0.520 0.000 0.156 0.324
#> SRR1033066 1 0.5855 0.5840 0.704 0.000 0.136 0.160
#> SRR1033067 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0707 0.8704 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033069 3 0.3688 0.7078 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.4989 0.1184 0.000 0.472 0.528 0.000
#> SRR1033073 3 0.0188 0.8783 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.4454 0.4084 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.3569 0.7122 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033082 1 0.6655 0.4220 0.624 0.000 0.184 0.192
#> SRR1033083 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.3400 0.7312 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1033085 3 0.1118 0.8586 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1033086 2 0.4843 0.3210 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.4356 0.5182 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0336 0.8770 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033092 1 0.2773 0.7893 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.1867 0.8270 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.4431 0.4776 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.4804 0.2383 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1033102 4 0.4843 0.4147 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1033103 1 0.4564 0.5040 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033104 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.3837 0.6802 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1033106 1 0.4401 0.6047 0.724 0.000 0.004 0.272
#> SRR1033107 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 4 0.4916 0.3522 0.424 0.000 0.000 0.576
#> SRR1033110 3 0.3444 0.7344 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1033111 4 0.4989 0.1742 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1033112 1 0.4605 0.4875 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1033113 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.5384 0.6232 0.728 0.000 0.076 0.196
#> SRR1033115 1 0.2714 0.7584 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1033116 3 0.4222 0.5331 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.4817 0.2721 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1033119 1 0.1557 0.8333 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033121 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 3 0.3123 0.7625 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1033122 3 0.1867 0.8275 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1033123 1 0.7154 -0.2363 0.436 0.000 0.132 0.432
#> SRR1033124 1 0.4454 0.5454 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1033125 3 0.3837 0.6784 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1033126 4 0.7684 0.3456 0.360 0.000 0.220 0.420
#> SRR1033127 2 0.3266 0.7761 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1033129 3 0.0188 0.8786 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033128 3 0.6638 -0.0210 0.420 0.000 0.496 0.084
#> SRR1033130 1 0.4855 0.3201 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1033131 1 0.2589 0.7916 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033132 3 0.2773 0.8009 0.004 0.000 0.880 0.116
#> SRR1033133 1 0.6611 -0.0158 0.464 0.000 0.456 0.080
#> SRR1033134 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 4 0.5500 0.1972 0.464 0.000 0.016 0.520
#> SRR1033137 3 0.2530 0.8072 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1033139 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033138 3 0.4380 0.7196 0.032 0.004 0.800 0.164
#> SRR1033140 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.5189 0.3748 0.616 0.000 0.012 0.372
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.3610 0.7077 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033144 1 0.6091 0.3380 0.596 0.000 0.060 0.344
#> SRR1033145 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.6352 0.5334 0.108 0.260 0.632 0.000
#> SRR1033147 3 0.3764 0.6988 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.6463 0.4646 0.644 0.000 0.160 0.196
#> SRR1033151 3 0.1716 0.8462 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1033152 1 0.3569 0.7123 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033153 3 0.6058 0.4941 0.180 0.000 0.684 0.136
#> SRR1033154 1 0.4079 0.7151 0.800 0.000 0.020 0.180
#> SRR1033156 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0188 0.8786 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.2216 0.8090 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033163 3 0.0188 0.8787 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033162 1 0.6336 0.3791 0.608 0.000 0.088 0.304
#> SRR1033164 3 0.0188 0.8784 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.6262 0.5018 0.660 0.000 0.132 0.208
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.3123 0.7621 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.4454 0.5491 0.000 0.308 0.692 0.000
#> SRR1033170 1 0.4843 0.3344 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1033172 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.2999 0.7854 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1033175 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.5420 0.5438 0.684 0.000 0.044 0.272
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.3525 0.7671 0.860 0.000 0.100 0.040
#> SRR1033181 1 0.5708 0.1850 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR1033183 3 0.1389 0.8483 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033182 1 0.0188 0.8587 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033184 3 0.5151 0.6509 0.100 0.000 0.760 0.140
#> SRR1033185 1 0.4817 0.3575 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1033187 1 0.3356 0.7347 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1033186 3 0.4331 0.4653 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.1305 0.8429 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1033191 1 0.4925 0.2294 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1033192 3 0.2973 0.7752 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR1033193 4 0.3975 0.6344 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.4998 0.0117 0.000 0.512 0.488 0.000
#> SRR1033197 1 0.6314 0.2220 0.560 0.000 0.068 0.372
#> SRR1033196 3 0.1545 0.8590 0.008 0.000 0.952 0.040
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 4 0.3400 0.6840 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR1033200 1 0.4830 0.3449 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1033201 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.4719 0.6905 0.048 0.000 0.772 0.180
#> SRR1033203 3 0.0188 0.8786 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033204 1 0.4925 0.2295 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1033205 3 0.4072 0.5699 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1033206 4 0.4817 0.4317 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1033207 4 0.4877 0.3857 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR1033208 3 0.0336 0.8773 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033209 1 0.4088 0.7206 0.820 0.000 0.140 0.040
#> SRR1033210 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033211 4 0.3266 0.6911 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1033212 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0921 0.8483 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033215 3 0.2760 0.7898 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1033217 3 0.2675 0.8280 0.048 0.000 0.908 0.044
#> SRR1033218 4 0.4817 0.4318 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1033219 1 0.4761 0.4018 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 4 0.6759 0.3112 0.108 0.000 0.344 0.548
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0188 0.8586 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033226 3 0.1867 0.8274 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0188 0.8586 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.2345 0.8041 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1033232 1 0.5250 0.1573 0.552 0.000 0.008 0.440
#> SRR1033233 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0707 0.8704 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0188 0.8787 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033240 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.3311 0.7390 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033242 3 0.3074 0.7230 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.6570 0.3824 0.204 0.000 0.632 0.164
#> SRR1033246 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0376 0.9682 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.5874 0.5737 0.696 0.000 0.112 0.192
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.3649 0.7071 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1033254 1 0.2530 0.7940 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.4454 0.5453 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1033257 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.4215 0.7399 0.824 0.000 0.104 0.072
#> SRR1033267 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.4922 0.6336 0.736 0.000 0.036 0.228
#> SRR1033269 3 0.0817 0.8702 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1033270 3 0.0000 0.8796 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033271 4 0.4955 0.2784 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4790 0.3794 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9768 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.8600 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0469 0.8556 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033279 3 0.0804 0.8738 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1033280 3 0.0188 0.8787 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033281 1 0.3610 0.7103 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033282 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 4 0.0000 0.6938 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.2561 0.77341 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1032911 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.1671 0.83102 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1032918 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0703 0.85648 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032920 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.5921 0.35413 0.596 0.000 0.184 0.000 0.220
#> SRR1032923 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 4 0.0162 0.82822 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0290 0.86300 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0609 0.85453 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 4 0.0609 0.82421 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.3297 0.77062 0.848 0.000 0.084 0.000 0.068
#> SRR1032948 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0703 0.85655 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1032951 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.3143 0.68006 0.000 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 4 0.1121 0.81045 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0162 0.86524 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032975 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 4 0.4227 -0.01357 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.3534 0.63906 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1032984 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 4 0.3424 0.57745 0.000 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.3774 0.43966 0.296 0.000 0.704 0.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.2813 0.75247 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1032993 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 1 0.4192 0.32179 0.596 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 4 0.4249 0.10135 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.2929 0.67110 0.180 0.000 0.820 0.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.1121 0.84617 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033009 1 0.0162 0.86519 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033010 3 0.0162 0.87075 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.5048 0.28000 0.580 0.000 0.040 0.000 0.380
#> SRR1033013 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0290 0.86945 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033016 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.4074 0.36908 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.3209 0.72957 0.812 0.000 0.008 0.000 0.180
#> SRR1033021 1 0.0404 0.86086 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.3003 0.72601 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033022 1 0.2605 0.76797 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033024 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.4029 0.52637 0.680 0.000 0.004 0.000 0.316
#> SRR1033026 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 4 0.3039 0.65128 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1033028 1 0.0703 0.85363 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.4481 0.59291 0.720 0.000 0.048 0.232 0.000
#> SRR1033032 3 0.0510 0.86420 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2424 0.74388 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.5094 0.34697 0.600 0.000 0.048 0.000 0.352
#> SRR1033037 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 4 0.3109 0.49609 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1033039 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.5834 0.11244 0.348 0.000 0.544 0.000 0.108
#> SRR1033041 1 0.3109 0.71204 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033042 1 0.1117 0.85091 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1033043 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0703 0.85950 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.2249 0.79393 0.896 0.000 0.096 0.000 0.008
#> SRR1033047 3 0.2377 0.75014 0.128 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0290 0.86296 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.1792 0.82017 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033053 2 0.3003 0.77956 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.1732 0.81116 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 4 0.1478 0.79629 0.000 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1033062 3 0.1732 0.80651 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.6375 0.02672 0.496 0.000 0.188 0.000 0.316
#> SRR1033066 1 0.5043 0.58733 0.704 0.000 0.136 0.000 0.160
#> SRR1033067 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0510 0.86520 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033069 4 0.4060 0.43489 0.000 0.000 0.360 0.640 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 4 0.0162 0.82769 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033073 3 0.2230 0.78203 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.3707 0.45850 0.284 0.000 0.716 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.3074 0.71703 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033082 1 0.6632 0.41722 0.620 0.000 0.172 0.120 0.088
#> SRR1033083 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.2929 0.73611 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1033085 3 0.1121 0.84364 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1033086 4 0.0000 0.82715 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.3752 0.52316 0.708 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0290 0.86937 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.2389 0.79469 0.880 0.000 0.004 0.000 0.116
#> SRR1033093 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.1671 0.81381 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.3752 0.50696 0.708 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR1033097 4 0.0000 0.82715 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.4300 0.18771 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1033101 3 0.4161 0.22263 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR1033102 5 0.4171 0.41247 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1033103 1 0.3932 0.50708 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033104 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.3305 0.68443 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1033106 1 0.3790 0.60826 0.724 0.000 0.004 0.000 0.272
#> SRR1033107 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 5 0.4235 0.34956 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1033110 3 0.2891 0.73513 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033111 5 0.4297 0.17109 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1033112 1 0.3966 0.49032 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1033113 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.4747 0.61397 0.720 0.000 0.084 0.000 0.196
#> SRR1033115 1 0.2583 0.73697 0.864 0.000 0.132 0.000 0.004
#> SRR1033116 3 0.3913 0.42412 0.324 0.000 0.676 0.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.4242 0.18295 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.1341 0.83926 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033121 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 4 0.0162 0.82769 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033122 3 0.1270 0.83808 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.6349 -0.24232 0.428 0.000 0.160 0.000 0.412
#> SRR1033124 1 0.3837 0.54865 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1033125 3 0.3274 0.67431 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1033126 5 0.6759 0.34208 0.348 0.000 0.268 0.000 0.384
#> SRR1033127 4 0.0162 0.82822 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033129 3 0.0290 0.86923 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033128 3 0.5725 -0.03721 0.428 0.000 0.488 0.000 0.084
#> SRR1033130 1 0.4182 0.32249 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1033131 1 0.2230 0.79705 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033132 3 0.2389 0.79119 0.004 0.000 0.880 0.000 0.116
#> SRR1033133 3 0.5680 -0.00461 0.428 0.000 0.492 0.000 0.080
#> SRR1033134 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 5 0.4738 0.19473 0.464 0.000 0.016 0.000 0.520
#> SRR1033137 3 0.2179 0.79741 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033139 3 0.4030 0.40250 0.000 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1033138 3 0.4485 0.68765 0.028 0.000 0.772 0.160 0.040
#> SRR1033140 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.4470 0.37703 0.616 0.000 0.012 0.000 0.372
#> SRR1033142 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.3109 0.71241 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033144 1 0.5302 0.32858 0.592 0.000 0.064 0.000 0.344
#> SRR1033145 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 4 0.3798 0.69514 0.064 0.000 0.128 0.808 0.000
#> SRR1033147 4 0.3661 0.59812 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.5761 0.40816 0.620 0.000 0.184 0.000 0.196
#> SRR1033151 3 0.1478 0.83697 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033152 1 0.3074 0.71709 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033153 3 0.5150 0.50334 0.172 0.000 0.692 0.000 0.136
#> SRR1033154 1 0.3513 0.71956 0.800 0.000 0.020 0.000 0.180
#> SRR1033156 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 4 0.0162 0.82822 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033159 3 0.0290 0.86917 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.1908 0.81472 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1033163 3 0.0162 0.87092 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.5534 0.37072 0.604 0.000 0.096 0.000 0.300
#> SRR1033164 4 0.3857 0.53680 0.000 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.6427 0.47128 0.644 0.000 0.148 0.120 0.088
#> SRR1033167 4 0.0609 0.82413 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033168 3 0.2690 0.75312 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1033169 4 0.0162 0.82822 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033171 4 0.0290 0.82665 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1033170 1 0.4171 0.33674 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1033172 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.2583 0.77619 0.004 0.000 0.864 0.000 0.132
#> SRR1033175 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.4712 0.54734 0.684 0.000 0.048 0.000 0.268
#> SRR1033177 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0963 0.93353 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033180 1 0.3058 0.77399 0.860 0.000 0.096 0.000 0.044
#> SRR1033181 1 0.5295 0.13449 0.540 0.000 0.052 0.000 0.408
#> SRR1033183 3 0.1270 0.83651 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0162 0.86524 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033184 3 0.4437 0.64281 0.100 0.000 0.760 0.000 0.140
#> SRR1033185 1 0.4150 0.35980 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1033187 1 0.2891 0.73972 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1033186 4 0.6144 0.20145 0.280 0.000 0.172 0.548 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 4 0.1608 0.78848 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1033190 1 0.1124 0.84912 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1033191 1 0.4242 0.23173 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1033192 3 0.4304 0.00338 0.000 0.000 0.516 0.484 0.000
#> SRR1033193 5 0.3424 0.59617 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1033195 2 0.4192 0.39141 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1033194 4 0.0162 0.82769 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1033197 1 0.5717 0.15744 0.540 0.000 0.092 0.000 0.368
#> SRR1033196 3 0.1331 0.85066 0.008 0.000 0.952 0.000 0.040
#> SRR1033199 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 5 0.2929 0.60080 0.180 0.000 0.000 0.000 0.820
#> SRR1033200 1 0.4161 0.34722 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1033201 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.4497 0.63144 0.060 0.000 0.732 0.000 0.208
#> SRR1033203 3 0.0162 0.87071 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033204 1 0.4242 0.23173 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1033205 3 0.3796 0.47199 0.300 0.000 0.700 0.000 0.000
#> SRR1033206 5 0.4150 0.42948 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1033207 5 0.4201 0.38332 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1033208 3 0.0162 0.87078 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033209 1 0.3521 0.72559 0.820 0.000 0.140 0.000 0.040
#> SRR1033210 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 5 0.2813 0.59986 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR1033212 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 4 0.1121 0.81037 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0880 0.85252 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033215 4 0.2732 0.72933 0.000 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1033217 3 0.2077 0.82991 0.040 0.000 0.920 0.000 0.040
#> SRR1033218 5 0.4150 0.42964 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1033219 1 0.4101 0.40418 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1033221 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 5 0.5804 0.29359 0.104 0.000 0.352 0.000 0.544
#> SRR1033225 4 0.0162 0.82822 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033224 1 0.0162 0.86519 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033226 3 0.1478 0.82660 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0162 0.86519 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033231 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.2020 0.80971 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1033232 1 0.4522 0.15963 0.552 0.000 0.008 0.000 0.440
#> SRR1033233 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0609 0.86271 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0162 0.87076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033240 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.2852 0.74401 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033242 3 0.3074 0.64802 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.5507 0.42272 0.188 0.000 0.652 0.000 0.160
#> SRR1033246 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 4 0.0162 0.82822 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.4918 0.59877 0.708 0.000 0.100 0.000 0.192
#> SRR1033252 2 0.3039 0.77462 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1033253 1 0.3143 0.71181 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1033254 1 0.2179 0.79952 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1033256 2 0.1270 0.91972 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.3837 0.54854 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1033257 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.3177 0.75425 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1033266 1 0.3631 0.74463 0.824 0.000 0.104 0.000 0.072
#> SRR1033267 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.4163 0.64233 0.740 0.000 0.032 0.000 0.228
#> SRR1033269 3 0.0703 0.86197 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033270 3 0.0000 0.87172 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 5 0.4268 0.27573 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1033272 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4126 0.38192 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033274 2 0.3395 0.72145 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.96169 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.86667 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0404 0.86203 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033279 3 0.0693 0.86618 0.008 0.000 0.980 0.000 0.012
#> SRR1033280 3 0.0162 0.87089 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.3109 0.71507 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033282 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 5 0.0000 0.57577 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 1 0.2300 0.78175 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.1501 0.82140 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0632 0.85714 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.5319 0.38119 0.596 0.000 0.184 0.000 0.220 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 6 0.0000 0.74982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0260 0.86168 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0547 0.85905 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0547 0.85430 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 6 0.0458 0.74532 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032943 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.2962 0.78101 0.848 0.000 0.084 0.000 0.068 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0632 0.85687 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.3012 0.67508 0.000 0.000 0.796 0.008 0.000 0.196
#> SRR1032963 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 6 0.0937 0.72877 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1032968 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0146 0.86330 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 4 0.2948 1.00000 0.060 0.000 0.000 0.848 0.000 0.092
#> SRR1032978 1 0.0547 0.85885 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.3175 0.65785 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 6 0.3189 0.46241 0.000 0.236 0.000 0.004 0.000 0.760
#> SRR1032988 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.3371 0.43371 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.2527 0.76512 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 4 0.2948 1.00000 0.060 0.000 0.000 0.848 0.000 0.092
#> SRR1033001 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 6 0.3810 0.14711 0.000 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR1033005 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.2631 0.64413 0.180 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.2308 0.82054 0.892 0.000 0.000 0.068 0.040 0.000
#> SRR1033009 1 0.1285 0.84545 0.944 0.000 0.000 0.052 0.004 0.000
#> SRR1033010 3 0.0146 0.86425 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.4971 0.32078 0.580 0.000 0.040 0.020 0.360 0.000
#> SRR1033013 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0260 0.86285 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033016 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.3659 0.39372 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.2882 0.74578 0.812 0.000 0.008 0.000 0.180 0.000
#> SRR1033021 1 0.0363 0.85983 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.3481 0.74861 0.804 0.000 0.000 0.072 0.124 0.000
#> SRR1033022 1 0.3261 0.76842 0.824 0.000 0.000 0.072 0.104 0.000
#> SRR1033024 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.4451 0.57633 0.680 0.000 0.000 0.072 0.248 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 6 0.3053 0.55214 0.000 0.168 0.000 0.020 0.000 0.812
#> SRR1033028 1 0.0632 0.85410 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.4025 0.61508 0.720 0.000 0.048 0.000 0.000 0.232
#> SRR1033032 3 0.0458 0.85779 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033033 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.3563 0.71312 0.796 0.000 0.132 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.5539 0.41248 0.600 0.000 0.048 0.068 0.284 0.000
#> SRR1033037 1 0.0146 0.86334 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033038 6 0.2793 0.26537 0.200 0.000 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1033039 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.5240 0.14107 0.348 0.000 0.544 0.000 0.108 0.000
#> SRR1033041 1 0.2980 0.73253 0.800 0.000 0.000 0.008 0.192 0.000
#> SRR1033042 1 0.2224 0.82817 0.904 0.000 0.020 0.064 0.012 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0790 0.85473 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0632 0.85139 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.2020 0.80093 0.896 0.000 0.096 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033047 3 0.2135 0.72708 0.128 0.000 0.872 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0260 0.86165 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.1267 0.84274 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.2744 0.80138 0.864 0.000 0.000 0.072 0.064 0.000
#> SRR1033053 2 0.3253 0.74221 0.000 0.788 0.000 0.020 0.000 0.192
#> SRR1033054 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0937 0.85159 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.2442 0.80920 0.884 0.000 0.068 0.048 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 6 0.2542 0.68436 0.000 0.000 0.044 0.080 0.000 0.876
#> SRR1033062 3 0.1556 0.79185 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.6305 0.09404 0.496 0.000 0.188 0.032 0.284 0.000
#> SRR1033066 1 0.5173 0.63120 0.704 0.000 0.112 0.072 0.112 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0458 0.85787 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033069 6 0.3647 0.26868 0.000 0.000 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1033070 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033072 6 0.0000 0.74982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033073 3 0.2100 0.77504 0.000 0.000 0.884 0.004 0.000 0.112
#> SRR1033074 1 0.1204 0.84459 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.3309 0.45698 0.280 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.2762 0.73483 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033082 1 0.6420 0.46404 0.620 0.000 0.172 0.056 0.064 0.088
#> SRR1033083 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.3435 0.74813 0.804 0.000 0.000 0.060 0.136 0.000
#> SRR1033085 3 0.1007 0.83352 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 6 0.1556 0.71698 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1033087 1 0.0363 0.86131 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.3371 0.54351 0.708 0.000 0.292 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0260 0.86263 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.3204 0.78013 0.836 0.000 0.004 0.068 0.092 0.000
#> SRR1033093 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.1556 0.79467 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.3371 0.52648 0.708 0.000 0.292 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033097 6 0.1556 0.71698 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1033098 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0547 0.94213 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.4337 0.12032 0.000 0.500 0.000 0.020 0.000 0.480
#> SRR1033101 3 0.3737 0.23476 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033102 5 0.3747 0.39656 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1033103 1 0.4557 0.53795 0.660 0.000 0.000 0.072 0.268 0.000
#> SRR1033104 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.3786 0.70979 0.768 0.000 0.000 0.064 0.168 0.000
#> SRR1033106 1 0.3606 0.63254 0.724 0.000 0.004 0.008 0.264 0.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 5 0.5007 0.29174 0.416 0.000 0.000 0.072 0.512 0.000
#> SRR1033110 3 0.2597 0.71625 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1033111 5 0.3860 0.14637 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528 0.000
#> SRR1033112 1 0.4476 0.54240 0.664 0.000 0.000 0.064 0.272 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.5060 0.64305 0.712 0.000 0.084 0.072 0.132 0.000
#> SRR1033115 1 0.3084 0.73100 0.832 0.000 0.132 0.032 0.004 0.000
#> SRR1033116 3 0.3531 0.37381 0.328 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 3 0.3810 0.19269 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.2325 0.82023 0.892 0.000 0.000 0.060 0.048 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 6 0.0000 0.74982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033122 3 0.1075 0.83096 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.6768 -0.15509 0.428 0.000 0.160 0.072 0.340 0.000
#> SRR1033124 1 0.4381 0.59851 0.692 0.000 0.000 0.072 0.236 0.000
#> SRR1033125 3 0.2941 0.65690 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1033126 1 0.7000 -0.30577 0.348 0.000 0.268 0.060 0.324 0.000
#> SRR1033127 6 0.0000 0.74982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033129 3 0.0260 0.86262 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033128 3 0.6128 -0.10003 0.428 0.000 0.432 0.072 0.068 0.000
#> SRR1033130 1 0.3756 0.34431 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR1033131 1 0.2003 0.80556 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1033132 3 0.2146 0.77926 0.004 0.000 0.880 0.000 0.116 0.000
#> SRR1033133 3 0.5099 0.03316 0.424 0.000 0.496 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 5 0.5149 0.12500 0.464 0.000 0.016 0.048 0.472 0.000
#> SRR1033137 3 0.1957 0.78644 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033139 3 0.3620 0.40103 0.000 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1033138 3 0.4133 0.67356 0.028 0.000 0.772 0.004 0.040 0.156
#> SRR1033140 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.4015 0.39973 0.616 0.000 0.012 0.000 0.372 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2793 0.73048 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033144 1 0.5748 0.39792 0.592 0.000 0.064 0.072 0.272 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 6 0.3412 0.51580 0.064 0.000 0.128 0.000 0.000 0.808
#> SRR1033147 6 0.3288 0.39327 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1033148 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.5175 0.43201 0.620 0.000 0.184 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033151 3 0.1327 0.82870 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1033152 1 0.2762 0.73488 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033153 3 0.4595 0.51176 0.168 0.000 0.696 0.000 0.136 0.000
#> SRR1033154 1 0.3744 0.74872 0.800 0.000 0.012 0.072 0.116 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0458 0.86023 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033158 6 0.0000 0.74982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033159 3 0.0260 0.86245 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.1714 0.82165 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033163 3 0.0146 0.86443 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.5867 0.43387 0.604 0.000 0.096 0.068 0.232 0.000
#> SRR1033164 6 0.3464 0.34193 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1033165 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.6258 0.51975 0.644 0.000 0.148 0.068 0.068 0.072
#> SRR1033167 6 0.0458 0.74533 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1033168 3 0.2416 0.73867 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033169 6 0.0000 0.74982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033171 6 0.0146 0.74859 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1033170 1 0.4121 0.37102 0.604 0.000 0.000 0.016 0.380 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.2320 0.76411 0.004 0.000 0.864 0.000 0.132 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.5107 0.58883 0.680 0.000 0.048 0.068 0.204 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0865 0.92479 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033180 1 0.3879 0.75700 0.808 0.000 0.076 0.072 0.044 0.000
#> SRR1033181 1 0.5133 0.17809 0.540 0.000 0.052 0.016 0.392 0.000
#> SRR1033183 3 0.1204 0.82109 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.1471 0.83948 0.932 0.000 0.000 0.064 0.004 0.000
#> SRR1033184 3 0.3940 0.63708 0.096 0.000 0.764 0.000 0.140 0.000
#> SRR1033185 1 0.4026 0.39006 0.612 0.000 0.000 0.012 0.376 0.000
#> SRR1033187 1 0.2597 0.75562 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1033186 6 0.5519 -0.01689 0.280 0.000 0.172 0.000 0.000 0.548
#> SRR1033188 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 6 0.1926 0.68934 0.000 0.068 0.000 0.020 0.000 0.912
#> SRR1033190 1 0.2209 0.82508 0.900 0.000 0.004 0.072 0.024 0.000
#> SRR1033191 1 0.4893 0.30898 0.572 0.000 0.000 0.072 0.356 0.000
#> SRR1033192 3 0.3866 -0.00566 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1033193 5 0.3076 0.45744 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760 0.000
#> SRR1033195 2 0.3774 0.36751 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1033194 6 0.0000 0.74982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.6084 0.23870 0.540 0.000 0.092 0.064 0.304 0.000
#> SRR1033196 3 0.1196 0.84246 0.008 0.000 0.952 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 5 0.2631 0.45170 0.180 0.000 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1033200 1 0.3737 0.36920 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.4067 0.58061 0.060 0.000 0.728 0.000 0.212 0.000
#> SRR1033203 3 0.0146 0.86426 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033204 1 0.3810 0.25541 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1033205 3 0.3428 0.42142 0.304 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033206 5 0.3727 0.41434 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1033207 5 0.3774 0.36577 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1033208 3 0.0146 0.86434 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033209 1 0.3163 0.73814 0.820 0.000 0.140 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033210 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 5 0.2527 0.44848 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1033212 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 6 0.0937 0.72900 0.000 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1033214 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.2221 0.82235 0.896 0.000 0.000 0.072 0.032 0.000
#> SRR1033215 6 0.2558 0.57796 0.000 0.000 0.156 0.004 0.000 0.840
#> SRR1033217 3 0.1794 0.82154 0.036 0.000 0.924 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033218 5 0.3965 0.41119 0.388 0.000 0.000 0.008 0.604 0.000
#> SRR1033219 1 0.4704 0.46640 0.628 0.000 0.000 0.072 0.300 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 5 0.5186 0.13481 0.100 0.000 0.356 0.000 0.544 0.000
#> SRR1033225 6 0.0458 0.74569 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033224 1 0.0146 0.86326 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033226 3 0.1267 0.81871 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0146 0.86326 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1958 0.81635 0.896 0.000 0.000 0.004 0.100 0.000
#> SRR1033232 1 0.4062 0.18482 0.552 0.000 0.008 0.000 0.440 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0458 0.85786 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0146 0.86431 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.2562 0.75938 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1033242 3 0.2793 0.61001 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.4918 0.44235 0.184 0.000 0.656 0.000 0.160 0.000
#> SRR1033246 1 0.1444 0.83656 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 6 0.0000 0.74982 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.5057 0.64182 0.708 0.000 0.072 0.072 0.148 0.000
#> SRR1033252 2 0.2762 0.74907 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033253 1 0.3110 0.72533 0.792 0.000 0.000 0.012 0.196 0.000
#> SRR1033254 1 0.2965 0.78927 0.848 0.000 0.000 0.072 0.080 0.000
#> SRR1033256 2 0.1204 0.90586 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1033255 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.3917 0.58128 0.692 0.000 0.000 0.024 0.284 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0865 0.85311 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.3230 0.72041 0.000 0.776 0.000 0.012 0.000 0.212
#> SRR1033266 1 0.3261 0.75759 0.824 0.000 0.104 0.000 0.072 0.000
#> SRR1033267 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.4533 0.68274 0.740 0.000 0.032 0.072 0.156 0.000
#> SRR1033269 3 0.0632 0.85503 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.86540 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 5 0.3833 0.25435 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4736 0.44535 0.620 0.000 0.000 0.072 0.308 0.000
#> SRR1033274 2 0.3076 0.69379 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1033275 1 0.0000 0.86419 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.95156 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0146 0.86331 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0363 0.86128 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033279 3 0.0622 0.85928 0.008 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033280 3 0.0146 0.86440 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.3641 0.73353 0.788 0.000 0.000 0.072 0.140 0.000
#> SRR1033282 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033283 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033284 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033285 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033286 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033287 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033288 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033289 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033290 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033291 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033292 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033293 5 0.0000 0.41589 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.993 0.997 0.2548 0.750 0.750
#> 3 3 1.000 0.957 0.975 1.2780 0.667 0.555
#> 4 4 0.827 0.875 0.936 0.2229 0.858 0.669
#> 5 5 0.746 0.785 0.863 0.0991 0.900 0.669
#> 6 6 0.764 0.703 0.837 0.0447 0.970 0.858
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032932 1 0.4690 0.890 0.900 0.100
#> SRR1032933 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.8386 0.639 0.732 0.268
#> SRR1032943 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.8327 0.646 0.736 0.264
#> SRR1032968 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033000 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033061 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033062 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033073 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033086 1 0.0376 0.993 0.996 0.004
#> SRR1033087 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033097 1 0.4939 0.880 0.892 0.108
#> SRR1033098 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033120 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.4690 0.890 0.900 0.100
#> SRR1033129 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.5408 0.857 0.124 0.876
#> SRR1033159 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033171 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.4690 0.890 0.900 0.100
#> SRR1033190 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033194 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.4690 0.890 0.900 0.100
#> SRR1033217 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033225 1 0.4690 0.890 0.900 0.100
#> SRR1033224 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033247 1 0.1184 0.981 0.984 0.016
#> SRR1033249 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 3 0.1031 0.9747 0.024 0.000 0.976
#> SRR1032911 1 0.5529 0.5917 0.704 0.000 0.296
#> SRR1032912 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032913 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032914 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032915 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032916 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032918 1 0.4504 0.7384 0.804 0.000 0.196
#> SRR1032919 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.1529 0.9410 0.960 0.000 0.040
#> SRR1032922 3 0.1289 0.9720 0.032 0.000 0.968
#> SRR1032923 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.1964 0.9174 0.944 0.000 0.056
#> SRR1032926 3 0.0892 0.9766 0.020 0.000 0.980
#> SRR1032927 1 0.1964 0.9174 0.944 0.000 0.056
#> SRR1032929 1 0.4555 0.7332 0.800 0.000 0.200
#> SRR1032928 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032930 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.0892 0.9766 0.020 0.000 0.980
#> SRR1032933 1 0.1964 0.9174 0.944 0.000 0.056
#> SRR1032934 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032935 1 0.1964 0.9174 0.944 0.000 0.056
#> SRR1032936 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0747 0.9557 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032939 3 0.1289 0.9720 0.032 0.000 0.968
#> SRR1032940 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032941 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032942 3 0.6653 0.5764 0.032 0.288 0.680
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032945 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032946 1 0.6280 0.1657 0.540 0.000 0.460
#> SRR1032947 3 0.1289 0.9734 0.032 0.000 0.968
#> SRR1032948 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 3 0.1289 0.9720 0.032 0.000 0.968
#> SRR1032951 1 0.1643 0.9276 0.956 0.000 0.044
#> SRR1032952 3 0.1289 0.9734 0.032 0.000 0.968
#> SRR1032953 1 0.1964 0.9174 0.944 0.000 0.056
#> SRR1032954 1 0.0892 0.9460 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032956 1 0.1529 0.9410 0.960 0.000 0.040
#> SRR1032958 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032959 1 0.1860 0.9211 0.948 0.000 0.052
#> SRR1032960 3 0.1289 0.9734 0.032 0.000 0.968
#> SRR1032961 1 0.1289 0.9466 0.968 0.000 0.032
#> SRR1032962 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032963 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032964 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032965 1 0.2356 0.9006 0.928 0.000 0.072
#> SRR1032966 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032967 3 0.6867 0.5639 0.040 0.288 0.672
#> SRR1032968 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032969 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032970 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032971 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032972 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032973 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032974 1 0.1643 0.9321 0.956 0.000 0.044
#> SRR1032975 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032976 3 0.1031 0.9747 0.024 0.000 0.976
#> SRR1032977 3 0.1163 0.9743 0.028 0.000 0.972
#> SRR1032978 1 0.0892 0.9536 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032981 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032982 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032983 3 0.0747 0.9782 0.016 0.000 0.984
#> SRR1032984 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032985 1 0.3192 0.8528 0.888 0.000 0.112
#> SRR1032986 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.1860 0.9211 0.948 0.000 0.052
#> SRR1032990 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1032989 1 0.1964 0.9174 0.944 0.000 0.056
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032993 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032994 3 0.1163 0.9743 0.028 0.000 0.972
#> SRR1032995 1 0.1411 0.9378 0.964 0.000 0.036
#> SRR1032996 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032997 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032998 3 0.1031 0.9747 0.024 0.000 0.976
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.1163 0.9743 0.028 0.000 0.972
#> SRR1033001 3 0.1031 0.9747 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033002 3 0.1289 0.9720 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 3 0.1289 0.9733 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033006 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033007 3 0.0747 0.9782 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033008 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033009 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033010 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033013 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033014 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033015 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033019 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033020 3 0.1529 0.9667 0.040 0.000 0.960
#> SRR1033021 3 0.0747 0.9782 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033023 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033022 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033024 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.5431 0.6122 0.716 0.000 0.284
#> SRR1033032 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2356 0.9074 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033036 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033037 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033038 3 0.2959 0.9048 0.100 0.000 0.900
#> SRR1033039 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033040 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033041 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033042 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033043 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033044 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033046 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033047 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033048 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033049 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033051 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033052 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033050 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033056 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033057 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033058 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.1411 0.9689 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033061 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033062 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033066 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033067 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033068 3 0.0237 0.9788 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033069 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033070 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033073 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033074 1 0.0747 0.9557 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033075 3 0.0747 0.9783 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033076 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033077 1 0.2356 0.9096 0.928 0.000 0.072
#> SRR1033078 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033081 3 0.1289 0.9720 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033082 1 0.0892 0.9537 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033084 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033085 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033086 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033087 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033088 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033089 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033090 3 0.1411 0.9718 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033092 1 0.6079 0.3920 0.612 0.000 0.388
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033097 3 0.1015 0.9754 0.012 0.008 0.980
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033102 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033103 1 0.0747 0.9557 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033105 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033106 3 0.1411 0.9690 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033108 1 0.1860 0.9333 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033109 1 0.4605 0.7295 0.796 0.000 0.204
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033111 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033112 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033113 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033114 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033115 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033116 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033118 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033119 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033120 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033122 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033123 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033124 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033125 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033126 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033127 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033129 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033128 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033130 3 0.1860 0.9572 0.052 0.000 0.948
#> SRR1033131 3 0.6307 0.0303 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033132 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033133 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033134 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033136 1 0.0747 0.9557 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033137 3 0.0237 0.9788 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033139 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033138 3 0.1163 0.9743 0.028 0.000 0.972
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033141 3 0.1411 0.9698 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033144 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033146 1 0.1643 0.9375 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033147 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033148 1 0.0892 0.9539 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033150 3 0.1031 0.9758 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033151 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033152 3 0.0892 0.9774 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033153 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033154 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033157 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033158 2 0.2772 0.8900 0.004 0.916 0.080
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033163 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033162 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033164 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033165 3 0.0892 0.9768 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033166 3 0.6111 0.3544 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033170 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033175 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033176 1 0.0747 0.9557 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0747 0.9557 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033181 1 0.4931 0.6883 0.768 0.000 0.232
#> SRR1033183 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033182 3 0.1964 0.9523 0.056 0.000 0.944
#> SRR1033184 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033185 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033187 3 0.0892 0.9774 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033186 3 0.2165 0.9444 0.064 0.000 0.936
#> SRR1033188 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033189 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033190 1 0.0892 0.9536 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033191 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033192 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033193 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033197 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033196 3 0.0592 0.9784 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1643 0.9360 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033200 1 0.1753 0.9372 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033202 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033204 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033205 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033206 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033207 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033209 3 0.0424 0.9797 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033211 3 0.0892 0.9774 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.1031 0.9483 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033216 1 0.1643 0.9351 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033215 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033217 3 0.0237 0.9788 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033218 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033219 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033223 3 0.0747 0.9783 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033225 3 0.0237 0.9797 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033224 1 0.1163 0.9496 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033226 3 0.0747 0.9783 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033227 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033232 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033233 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033237 3 0.1031 0.9747 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033239 3 0.0892 0.9774 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033242 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033246 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033248 3 0.1031 0.9747 0.024 0.000 0.976
#> SRR1033247 3 0.1753 0.9592 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0747 0.9557 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033254 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033258 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033257 1 0.3192 0.8587 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033259 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0892 0.9538 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.1289 0.9720 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033267 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033268 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033269 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9791 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033271 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.1964 0.9174 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9981 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.1163 0.9496 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033278 3 0.0747 0.9782 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033279 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033280 3 0.0424 0.9777 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033281 1 0.0592 0.9571 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033282 3 0.0892 0.9766 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033283 3 0.0892 0.9766 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033284 3 0.0892 0.9766 0.020 0.000 0.980
#> SRR1033285 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033286 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033287 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033288 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033289 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033290 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033291 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033292 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033293 3 0.0592 0.9792 0.012 0.000 0.988
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 3 0.6011 -0.0210 0.040 0.000 0.484 0.476
#> SRR1032911 4 0.2149 0.8338 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1032912 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.2011 0.8932 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1032918 4 0.2760 0.8081 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1032919 4 0.0188 0.8795 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.2469 0.8582 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1032922 3 0.2174 0.8939 0.020 0.000 0.928 0.052
#> SRR1032923 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.3873 0.6959 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1032926 4 0.3569 0.6881 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1032927 4 0.3873 0.6959 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1032929 4 0.2760 0.8079 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1032928 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.1985 0.8997 0.016 0.004 0.940 0.040
#> SRR1032933 4 0.4585 0.5114 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1032934 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032935 4 0.3873 0.6959 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1032936 3 0.4948 0.3918 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0336 0.9504 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1032939 3 0.1913 0.8972 0.020 0.000 0.940 0.040
#> SRR1032940 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 3 0.6357 0.4439 0.028 0.336 0.604 0.032
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.2921 0.7975 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR1032947 4 0.2868 0.7684 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1032948 4 0.0817 0.8686 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 3 0.2335 0.8902 0.020 0.000 0.920 0.060
#> SRR1032951 4 0.4193 0.6341 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1032952 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 4 0.4008 0.6724 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1032954 1 0.3610 0.7382 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 1 0.2469 0.8584 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1032958 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 1 0.4994 0.0435 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1032960 4 0.0336 0.8771 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1032961 1 0.2647 0.8445 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1032962 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1032963 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 4 0.2921 0.7990 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR1032966 4 0.0188 0.8799 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032967 3 0.6828 0.4347 0.056 0.320 0.592 0.032
#> SRR1032968 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 4 0.0469 0.8749 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1032970 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 1 0.4331 0.5855 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1032975 4 0.0188 0.8799 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1032976 4 0.3266 0.7336 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1032977 3 0.1706 0.9011 0.016 0.000 0.948 0.036
#> SRR1032978 1 0.0188 0.9531 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 4 0.4431 0.4759 0.000 0.000 0.304 0.696
#> SRR1032984 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 4 0.2814 0.8050 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1032986 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.3873 0.6959 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1032990 3 0.1576 0.9091 0.004 0.000 0.948 0.048
#> SRR1032989 4 0.3873 0.6959 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 3 0.2450 0.8891 0.016 0.000 0.912 0.072
#> SRR1032993 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 3 0.2413 0.8936 0.020 0.000 0.916 0.064
#> SRR1032995 1 0.3726 0.7208 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1032996 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 3 0.4560 0.6769 0.004 0.000 0.700 0.296
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 3 0.1706 0.9011 0.016 0.000 0.948 0.036
#> SRR1033001 4 0.2704 0.7815 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1033002 3 0.4761 0.7713 0.048 0.000 0.768 0.184
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033006 3 0.2647 0.8689 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1033007 4 0.4998 -0.1101 0.000 0.000 0.488 0.512
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.2921 0.8538 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.2408 0.8793 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1033014 3 0.1389 0.9047 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1033015 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033019 3 0.0469 0.9086 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033020 3 0.2032 0.8944 0.036 0.000 0.936 0.028
#> SRR1033021 3 0.2142 0.8943 0.016 0.000 0.928 0.056
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.2011 0.8933 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.2011 0.8933 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.4830 0.4624 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.1302 0.9053 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1033031 1 0.4576 0.5956 0.728 0.000 0.260 0.012
#> SRR1033032 3 0.0524 0.9083 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1022 0.9266 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.5436 0.4493 0.356 0.000 0.620 0.024
#> SRR1033039 3 0.1389 0.9045 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1033040 3 0.1356 0.9036 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.2281 0.8843 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1033046 3 0.1661 0.9021 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1033047 3 0.1474 0.9039 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1033048 3 0.2473 0.8991 0.012 0.000 0.908 0.080
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 3 0.2363 0.8899 0.024 0.000 0.920 0.056
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.1867 0.8968 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.2124 0.8932 0.040 0.000 0.932 0.028
#> SRR1033061 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033062 3 0.1637 0.9015 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1118 0.9068 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0188 0.9076 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033069 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033070 3 0.1004 0.9089 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033073 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0592 0.9446 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033075 3 0.2949 0.8917 0.024 0.000 0.888 0.088
#> SRR1033076 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033077 1 0.0592 0.9428 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.1940 0.8950 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033080 3 0.1792 0.8985 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1033081 3 0.2363 0.8899 0.024 0.000 0.920 0.056
#> SRR1033082 1 0.0336 0.9490 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033083 3 0.1792 0.8983 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.2408 0.8796 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1033086 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0817 0.9084 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1033089 3 0.3801 0.7625 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1033090 4 0.0000 0.8817 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033091 3 0.2081 0.8913 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1033092 1 0.3969 0.7175 0.804 0.000 0.180 0.016
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0469 0.9086 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.2053 0.9009 0.004 0.000 0.924 0.072
#> SRR1033097 3 0.0712 0.9077 0.004 0.008 0.984 0.004
#> SRR1033098 3 0.1940 0.8950 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.2973 0.8468 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0188 0.9524 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033104 3 0.2281 0.8843 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 3 0.2032 0.8953 0.028 0.000 0.936 0.036
#> SRR1033107 3 0.3219 0.8267 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1033108 1 0.3311 0.7790 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033109 1 0.1792 0.8834 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0188 0.9076 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 3 0.3688 0.7738 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1033117 3 0.1940 0.8950 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033118 3 0.3219 0.8418 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1033119 1 0.0188 0.9527 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033121 3 0.1867 0.8967 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1033120 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033122 3 0.2814 0.8591 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.0188 0.9084 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033129 3 0.1940 0.8950 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 3 0.2996 0.8710 0.064 0.000 0.892 0.044
#> SRR1033131 3 0.5407 0.1070 0.484 0.000 0.504 0.012
#> SRR1033132 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033133 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033139 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033138 3 0.1520 0.9019 0.020 0.000 0.956 0.024
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 3 0.2363 0.8899 0.024 0.000 0.920 0.056
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.2921 0.7921 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1033147 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033148 1 0.2081 0.8832 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033149 3 0.1474 0.9038 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1033150 3 0.2021 0.8955 0.024 0.000 0.936 0.040
#> SRR1033151 3 0.0188 0.9076 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033152 3 0.2021 0.8955 0.024 0.000 0.936 0.040
#> SRR1033153 3 0.0657 0.9070 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.1940 0.8950 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.4679 0.4295 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1033159 3 0.2011 0.8932 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1033160 3 0.1557 0.9027 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0188 0.9076 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033165 4 0.5016 0.2327 0.004 0.000 0.396 0.600
#> SRR1033166 1 0.5503 -0.0121 0.516 0.000 0.468 0.016
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0336 0.9811 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033171 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.1716 0.8997 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0188 0.9082 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0188 0.9525 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0469 0.9461 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033181 1 0.3801 0.6611 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1033183 3 0.3356 0.8134 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1033182 3 0.3182 0.8522 0.096 0.000 0.876 0.028
#> SRR1033184 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 3 0.2111 0.8941 0.024 0.000 0.932 0.044
#> SRR1033186 3 0.5036 0.6009 0.280 0.000 0.696 0.024
#> SRR1033188 4 0.4866 0.1923 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1033189 3 0.0188 0.9084 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033190 1 0.0188 0.9527 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0188 0.9859 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033194 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0804 0.9425 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1033200 1 0.0188 0.9525 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033201 3 0.1867 0.8967 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1033202 3 0.3172 0.8310 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1033203 3 0.0707 0.9083 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.3356 0.8154 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.1716 0.9000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1033209 3 0.3052 0.8781 0.004 0.000 0.860 0.136
#> SRR1033210 3 0.1940 0.8950 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033211 3 0.2111 0.8941 0.024 0.000 0.932 0.044
#> SRR1033212 3 0.1940 0.8950 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.1792 0.8994 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.0188 0.9084 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033217 3 0.0188 0.9082 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.1182 0.9053 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1033225 3 0.0000 0.9075 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0707 0.9416 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033226 3 0.1584 0.9014 0.012 0.000 0.952 0.036
#> SRR1033227 3 0.2216 0.8868 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 3 0.3790 0.8096 0.016 0.000 0.820 0.164
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.1302 0.9053 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1033236 3 0.1792 0.8991 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1033237 4 0.3123 0.7498 0.000 0.000 0.156 0.844
#> SRR1033238 3 0.2011 0.8932 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1033240 3 0.2589 0.8706 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1033239 3 0.2021 0.8955 0.024 0.000 0.936 0.040
#> SRR1033242 3 0.3801 0.7955 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR1033241 3 0.1867 0.8967 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 3 0.3308 0.8751 0.036 0.000 0.872 0.092
#> SRR1033247 3 0.4277 0.7575 0.172 0.004 0.800 0.024
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0188 0.9524 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.1637 0.9010 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.4790 0.3712 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.2345 0.8821 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1033262 3 0.2011 0.8932 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0188 0.9531 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.2363 0.8899 0.024 0.000 0.920 0.056
#> SRR1033267 3 0.0188 0.9082 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033270 3 0.3074 0.8396 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.4008 0.6721 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9911 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.1022 0.9313 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033278 4 0.4164 0.5662 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR1033279 3 0.0376 0.9083 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1033280 3 0.0188 0.9076 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 3 0.4711 0.7033 0.024 0.000 0.740 0.236
#> SRR1033283 3 0.4776 0.6901 0.024 0.000 0.732 0.244
#> SRR1033284 3 0.4807 0.6834 0.024 0.000 0.728 0.248
#> SRR1033285 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1033286 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1033287 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1033288 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1033289 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1033290 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1033291 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1033292 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1033293 3 0.3862 0.8153 0.024 0.000 0.824 0.152
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 5 0.6678 0.2513 0.044 0.000 0.088 0.412 0.456
#> SRR1032911 4 0.3246 0.7997 0.096 0.000 0.024 0.860 0.020
#> SRR1032912 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032913 4 0.0865 0.8464 0.000 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1032914 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032915 4 0.2193 0.8193 0.000 0.000 0.028 0.912 0.060
#> SRR1032916 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032917 3 0.0898 0.8411 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1032918 4 0.3530 0.7925 0.104 0.000 0.024 0.844 0.028
#> SRR1032919 4 0.0955 0.8453 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.5599 0.6195 0.656 0.000 0.020 0.244 0.080
#> SRR1032922 5 0.2825 0.7829 0.000 0.000 0.124 0.016 0.860
#> SRR1032923 4 0.2964 0.7706 0.000 0.000 0.024 0.856 0.120
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.3555 0.7573 0.124 0.000 0.000 0.824 0.052
#> SRR1032926 4 0.5393 0.3486 0.000 0.000 0.080 0.608 0.312
#> SRR1032927 4 0.3555 0.7573 0.124 0.000 0.000 0.824 0.052
#> SRR1032929 4 0.3154 0.7907 0.104 0.000 0.012 0.860 0.024
#> SRR1032928 4 0.2104 0.8235 0.000 0.000 0.024 0.916 0.060
#> SRR1032930 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 5 0.4119 0.7692 0.000 0.032 0.132 0.032 0.804
#> SRR1032933 4 0.4602 0.5804 0.240 0.000 0.000 0.708 0.052
#> SRR1032934 4 0.2707 0.7932 0.000 0.000 0.024 0.876 0.100
#> SRR1032935 4 0.3555 0.7573 0.124 0.000 0.000 0.824 0.052
#> SRR1032936 4 0.6002 -0.1867 0.000 0.000 0.112 0.452 0.436
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.3748 0.8568 0.836 0.000 0.020 0.056 0.088
#> SRR1032939 5 0.2920 0.7832 0.000 0.000 0.132 0.016 0.852
#> SRR1032940 4 0.0865 0.8461 0.000 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1032941 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032942 5 0.6865 0.4438 0.064 0.284 0.084 0.008 0.560
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.3022 0.8865 0.880 0.000 0.020 0.036 0.064
#> SRR1032945 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032946 4 0.4461 0.6997 0.192 0.000 0.024 0.756 0.028
#> SRR1032947 4 0.4226 0.6642 0.000 0.000 0.084 0.776 0.140
#> SRR1032948 4 0.1153 0.8438 0.008 0.000 0.024 0.964 0.004
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 5 0.3432 0.7804 0.000 0.000 0.132 0.040 0.828
#> SRR1032951 4 0.4189 0.7237 0.144 0.000 0.008 0.788 0.060
#> SRR1032952 4 0.2450 0.8069 0.000 0.000 0.028 0.896 0.076
#> SRR1032953 4 0.3904 0.7182 0.156 0.000 0.000 0.792 0.052
#> SRR1032954 1 0.6200 0.3841 0.540 0.000 0.020 0.348 0.092
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032956 1 0.5469 0.6444 0.672 0.000 0.020 0.232 0.076
#> SRR1032958 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032959 4 0.5219 0.3829 0.328 0.000 0.004 0.616 0.052
#> SRR1032960 4 0.2813 0.7899 0.000 0.000 0.040 0.876 0.084
#> SRR1032961 1 0.5670 0.5982 0.644 0.000 0.020 0.256 0.080
#> SRR1032962 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1032963 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032964 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032965 4 0.3409 0.7685 0.112 0.000 0.000 0.836 0.052
#> SRR1032966 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032967 5 0.7151 0.4241 0.096 0.272 0.080 0.008 0.544
#> SRR1032968 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032969 4 0.0992 0.8458 0.000 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1032970 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032971 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032972 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032973 4 0.0865 0.8461 0.000 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1032974 1 0.6213 0.4287 0.556 0.000 0.020 0.324 0.100
#> SRR1032975 4 0.0865 0.8458 0.004 0.000 0.024 0.972 0.000
#> SRR1032976 4 0.4920 0.4425 0.000 0.000 0.048 0.644 0.308
#> SRR1032977 5 0.3400 0.7814 0.000 0.000 0.136 0.036 0.828
#> SRR1032978 1 0.3328 0.8745 0.860 0.000 0.020 0.036 0.084
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0865 0.8461 0.000 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1032981 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032982 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032983 4 0.5831 -0.0169 0.000 0.000 0.096 0.496 0.408
#> SRR1032984 4 0.0865 0.8461 0.000 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1032985 4 0.3536 0.7827 0.100 0.000 0.008 0.840 0.052
#> SRR1032986 4 0.1493 0.8380 0.000 0.000 0.024 0.948 0.028
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.3555 0.7573 0.124 0.000 0.000 0.824 0.052
#> SRR1032990 5 0.4290 0.7479 0.000 0.000 0.304 0.016 0.680
#> SRR1032989 4 0.3555 0.7573 0.124 0.000 0.000 0.824 0.052
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 5 0.3060 0.7832 0.000 0.000 0.128 0.024 0.848
#> SRR1032993 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032994 5 0.3400 0.7815 0.000 0.000 0.136 0.036 0.828
#> SRR1032995 1 0.6098 0.4045 0.552 0.000 0.020 0.344 0.084
#> SRR1032996 4 0.2540 0.8006 0.000 0.000 0.024 0.888 0.088
#> SRR1032997 4 0.0703 0.8471 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1032998 5 0.5284 0.5787 0.000 0.000 0.104 0.236 0.660
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 5 0.3400 0.7814 0.000 0.000 0.136 0.036 0.828
#> SRR1033001 4 0.4461 0.6030 0.000 0.000 0.052 0.728 0.220
#> SRR1033002 5 0.6290 0.5047 0.040 0.000 0.100 0.256 0.604
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.1041 0.8435 0.000 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1033006 3 0.5987 0.4782 0.000 0.000 0.584 0.180 0.236
#> SRR1033007 5 0.6051 0.3293 0.000 0.000 0.120 0.404 0.476
#> SRR1033008 1 0.0992 0.9165 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1033009 1 0.3129 0.8818 0.872 0.000 0.020 0.032 0.076
#> SRR1033010 3 0.6697 0.0594 0.000 0.000 0.384 0.240 0.376
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0671 0.9174 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033013 3 0.1386 0.8370 0.000 0.000 0.952 0.032 0.016
#> SRR1033014 3 0.0955 0.8412 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1033015 5 0.4047 0.7300 0.000 0.000 0.320 0.004 0.676
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 5 0.3838 0.7647 0.000 0.000 0.280 0.004 0.716
#> SRR1033019 3 0.1197 0.8286 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033020 5 0.3451 0.7824 0.012 0.000 0.128 0.024 0.836
#> SRR1033021 5 0.3106 0.7826 0.000 0.000 0.132 0.024 0.844
#> SRR1033023 1 0.0771 0.9162 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1033022 1 0.0671 0.9174 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033024 3 0.1399 0.8374 0.000 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1033025 1 0.0865 0.9151 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033026 3 0.0992 0.8404 0.000 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.6147 0.3402 0.000 0.000 0.168 0.544 0.288
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0794 0.8392 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033031 1 0.4234 0.6958 0.724 0.000 0.020 0.004 0.252
#> SRR1033032 5 0.3055 0.7860 0.000 0.000 0.144 0.016 0.840
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1704 0.9002 0.928 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR1033036 1 0.0566 0.9180 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1033037 1 0.2677 0.8947 0.896 0.000 0.020 0.020 0.064
#> SRR1033038 5 0.5537 0.2572 0.380 0.000 0.048 0.012 0.560
#> SRR1033039 3 0.1197 0.8329 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033040 5 0.2966 0.7867 0.000 0.000 0.136 0.016 0.848
#> SRR1033041 1 0.0451 0.9187 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1033042 1 0.0865 0.9151 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033043 1 0.2984 0.8864 0.880 0.000 0.020 0.028 0.072
#> SRR1033044 1 0.3270 0.8771 0.864 0.000 0.020 0.036 0.080
#> SRR1033045 3 0.3134 0.7904 0.000 0.000 0.848 0.032 0.120
#> SRR1033046 5 0.3039 0.7859 0.000 0.000 0.152 0.012 0.836
#> SRR1033047 3 0.1043 0.8368 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033048 5 0.3284 0.7811 0.000 0.000 0.148 0.024 0.828
#> SRR1033049 1 0.1211 0.9194 0.960 0.000 0.016 0.000 0.024
#> SRR1033051 1 0.3068 0.8840 0.876 0.000 0.020 0.032 0.072
#> SRR1033052 1 0.0566 0.9196 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 5 0.4171 0.6086 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033050 1 0.2124 0.9059 0.924 0.000 0.020 0.012 0.044
#> SRR1033055 3 0.1671 0.8140 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033056 5 0.2969 0.7833 0.000 0.000 0.128 0.020 0.852
#> SRR1033057 1 0.0955 0.9159 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1033058 3 0.0955 0.8424 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 5 0.3078 0.7857 0.004 0.000 0.132 0.016 0.848
#> SRR1033061 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033062 3 0.2777 0.7806 0.000 0.000 0.864 0.016 0.120
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1121 0.8317 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033065 1 0.0671 0.9172 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033066 1 0.0865 0.9151 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033067 1 0.2857 0.8904 0.888 0.000 0.020 0.028 0.064
#> SRR1033068 5 0.3913 0.7294 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033069 5 0.3730 0.7591 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033070 3 0.4307 -0.3220 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033073 3 0.2813 0.7127 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033074 1 0.3879 0.8499 0.828 0.000 0.020 0.064 0.088
#> SRR1033075 5 0.3736 0.7712 0.000 0.000 0.140 0.052 0.808
#> SRR1033076 5 0.3752 0.7537 0.000 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1033077 1 0.1549 0.9167 0.944 0.000 0.016 0.000 0.040
#> SRR1033078 1 0.1168 0.9154 0.960 0.000 0.008 0.000 0.032
#> SRR1033079 3 0.1012 0.8421 0.000 0.000 0.968 0.020 0.012
#> SRR1033080 3 0.1117 0.8436 0.000 0.000 0.964 0.016 0.020
#> SRR1033081 5 0.3099 0.7830 0.000 0.000 0.124 0.028 0.848
#> SRR1033082 1 0.1205 0.9116 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1033083 3 0.0880 0.8404 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033084 1 0.0566 0.9188 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1033085 3 0.2905 0.7793 0.000 0.000 0.868 0.036 0.096
#> SRR1033086 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033087 1 0.1356 0.9158 0.956 0.000 0.012 0.004 0.028
#> SRR1033088 3 0.1124 0.8375 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1033089 3 0.5786 0.2439 0.000 0.000 0.524 0.380 0.096
#> SRR1033090 4 0.0865 0.8461 0.000 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1033091 3 0.1117 0.8424 0.000 0.000 0.964 0.020 0.016
#> SRR1033092 1 0.3341 0.8124 0.840 0.000 0.024 0.008 0.128
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.4182 0.0972 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 5 0.4451 0.6970 0.000 0.000 0.340 0.016 0.644
#> SRR1033097 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033098 3 0.1018 0.8429 0.000 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.1597 0.8268 0.000 0.000 0.940 0.048 0.012
#> SRR1033102 1 0.0898 0.9178 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1033103 1 0.0451 0.9183 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1033104 3 0.1041 0.8367 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1033105 1 0.0865 0.9151 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033106 5 0.3310 0.7866 0.004 0.000 0.136 0.024 0.836
#> SRR1033107 3 0.2632 0.7985 0.000 0.000 0.888 0.040 0.072
#> SRR1033108 1 0.5721 0.4347 0.576 0.000 0.012 0.344 0.068
#> SRR1033109 1 0.1651 0.9112 0.944 0.000 0.012 0.008 0.036
#> SRR1033110 3 0.4294 -0.2114 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1033111 1 0.0324 0.9185 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033112 1 0.0451 0.9184 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1033113 5 0.3966 0.7041 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1033114 1 0.1041 0.9162 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1033115 1 0.1041 0.9162 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1033116 3 0.3226 0.7704 0.000 0.000 0.852 0.060 0.088
#> SRR1033117 3 0.1216 0.8434 0.000 0.000 0.960 0.020 0.020
#> SRR1033118 3 0.6282 0.3251 0.000 0.000 0.536 0.216 0.248
#> SRR1033119 1 0.0865 0.9151 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033121 3 0.0912 0.8425 0.000 0.000 0.972 0.012 0.016
#> SRR1033120 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033122 3 0.2632 0.8079 0.000 0.000 0.888 0.072 0.040
#> SRR1033123 1 0.0865 0.9151 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033124 1 0.0451 0.9183 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1033125 5 0.4025 0.7578 0.000 0.000 0.292 0.008 0.700
#> SRR1033126 1 0.0671 0.9172 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033127 3 0.4504 0.3080 0.000 0.000 0.564 0.008 0.428
#> SRR1033129 3 0.1216 0.8427 0.000 0.000 0.960 0.020 0.020
#> SRR1033128 1 0.0771 0.9164 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1033130 5 0.5842 0.5512 0.216 0.000 0.116 0.020 0.648
#> SRR1033131 1 0.5152 0.5594 0.668 0.000 0.052 0.012 0.268
#> SRR1033132 5 0.3928 0.7552 0.000 0.000 0.296 0.004 0.700
#> SRR1033133 5 0.3957 0.7640 0.000 0.000 0.280 0.008 0.712
#> SRR1033134 1 0.1943 0.9055 0.924 0.000 0.020 0.000 0.056
#> SRR1033135 3 0.2329 0.7717 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033136 1 0.0671 0.9172 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033137 3 0.4256 -0.0537 0.000 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033139 5 0.3707 0.7599 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1033138 5 0.3786 0.7876 0.004 0.000 0.204 0.016 0.776
#> SRR1033140 3 0.1671 0.8137 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033141 5 0.3525 0.7786 0.012 0.000 0.120 0.032 0.836
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0898 0.9167 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1033144 1 0.0671 0.9172 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033145 3 0.3586 0.5563 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1033146 1 0.3308 0.8065 0.832 0.000 0.020 0.004 0.144
#> SRR1033147 5 0.3707 0.7599 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1033148 1 0.5197 0.7099 0.712 0.000 0.020 0.188 0.080
#> SRR1033149 3 0.1124 0.8404 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1033150 5 0.3011 0.7869 0.000 0.000 0.140 0.016 0.844
#> SRR1033151 5 0.3928 0.7537 0.000 0.000 0.296 0.004 0.700
#> SRR1033152 5 0.3011 0.7869 0.000 0.000 0.140 0.016 0.844
#> SRR1033153 5 0.4003 0.7612 0.000 0.000 0.288 0.008 0.704
#> SRR1033154 1 0.0671 0.9172 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033156 3 0.0798 0.8418 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1033157 1 0.1281 0.9190 0.956 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR1033158 2 0.4957 0.3185 0.000 0.624 0.044 0.000 0.332
#> SRR1033159 3 0.1310 0.8408 0.000 0.000 0.956 0.020 0.024
#> SRR1033160 3 0.1124 0.8392 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1033161 1 0.1618 0.9120 0.944 0.000 0.008 0.008 0.040
#> SRR1033163 5 0.3774 0.7518 0.000 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1033162 1 0.0671 0.9172 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033164 5 0.3242 0.7865 0.000 0.000 0.172 0.012 0.816
#> SRR1033165 4 0.5876 -0.0717 0.000 0.000 0.100 0.488 0.412
#> SRR1033166 1 0.4779 0.5833 0.672 0.000 0.024 0.012 0.292
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 5 0.4201 0.5727 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1033169 2 0.0290 0.9819 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033171 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033170 1 0.0566 0.9189 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1033172 3 0.1168 0.8428 0.000 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.2629 0.7847 0.000 0.000 0.860 0.004 0.136
#> SRR1033175 1 0.1485 0.9124 0.948 0.000 0.020 0.000 0.032
#> SRR1033176 1 0.0865 0.9161 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.1041 0.9162 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1033181 1 0.2965 0.8519 0.876 0.000 0.028 0.012 0.084
#> SRR1033183 3 0.2522 0.8044 0.000 0.000 0.896 0.052 0.052
#> SRR1033182 5 0.5682 0.6018 0.184 0.000 0.132 0.016 0.668
#> SRR1033184 5 0.3730 0.7558 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033185 1 0.0671 0.9176 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033187 5 0.2920 0.7843 0.000 0.000 0.132 0.016 0.852
#> SRR1033186 5 0.5745 0.3452 0.352 0.000 0.068 0.012 0.568
#> SRR1033188 4 0.6002 -0.1913 0.000 0.000 0.112 0.452 0.436
#> SRR1033189 3 0.4688 0.2047 0.000 0.004 0.532 0.008 0.456
#> SRR1033190 1 0.1041 0.9158 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1033191 1 0.0771 0.9164 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1033192 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033193 1 0.0671 0.9186 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033195 2 0.0162 0.9865 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033194 5 0.3707 0.7599 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1033197 1 0.0865 0.9151 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033196 5 0.3884 0.7597 0.000 0.000 0.288 0.004 0.708
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1908 0.9081 0.936 0.000 0.016 0.024 0.024
#> SRR1033200 1 0.2795 0.8925 0.892 0.000 0.024 0.024 0.060
#> SRR1033201 3 0.1399 0.8435 0.000 0.000 0.952 0.020 0.028
#> SRR1033202 3 0.2632 0.7981 0.000 0.000 0.888 0.040 0.072
#> SRR1033203 3 0.2020 0.7951 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033204 1 0.0798 0.9182 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033205 3 0.1997 0.8276 0.000 0.000 0.924 0.040 0.036
#> SRR1033206 1 0.0162 0.9189 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033207 1 0.0798 0.9172 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033208 3 0.0963 0.8388 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033209 5 0.4595 0.7428 0.000 0.000 0.172 0.088 0.740
#> SRR1033210 3 0.0912 0.8424 0.000 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR1033211 5 0.2966 0.7857 0.000 0.000 0.136 0.016 0.848
#> SRR1033212 3 0.1818 0.8316 0.000 0.000 0.932 0.044 0.024
#> SRR1033213 2 0.0880 0.9543 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033214 1 0.5182 0.7308 0.720 0.000 0.020 0.168 0.092
#> SRR1033216 1 0.1300 0.9171 0.956 0.000 0.016 0.000 0.028
#> SRR1033215 3 0.4127 0.5562 0.000 0.000 0.680 0.008 0.312
#> SRR1033217 5 0.4126 0.6354 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033218 1 0.0510 0.9189 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033219 1 0.0798 0.9172 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.1725 0.9097 0.936 0.000 0.020 0.000 0.044
#> SRR1033223 5 0.3861 0.7607 0.000 0.000 0.284 0.004 0.712
#> SRR1033225 3 0.4114 0.2052 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1033224 1 0.3186 0.8763 0.872 0.000 0.020 0.056 0.052
#> SRR1033226 5 0.3530 0.7860 0.000 0.000 0.204 0.012 0.784
#> SRR1033227 3 0.1310 0.8413 0.000 0.000 0.956 0.020 0.024
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.1934 0.9082 0.932 0.000 0.020 0.008 0.040
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0798 0.9172 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033232 5 0.5201 0.7174 0.000 0.000 0.128 0.188 0.684
#> SRR1033233 1 0.2580 0.8960 0.900 0.000 0.020 0.016 0.064
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.2561 0.7464 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1033236 3 0.4508 0.3068 0.000 0.000 0.648 0.020 0.332
#> SRR1033237 4 0.5022 0.3796 0.000 0.000 0.048 0.620 0.332
#> SRR1033238 3 0.0898 0.8421 0.000 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1033240 3 0.0955 0.8384 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR1033239 5 0.3011 0.7872 0.000 0.000 0.140 0.016 0.844
#> SRR1033242 5 0.5766 0.6616 0.000 0.000 0.164 0.220 0.616
#> SRR1033241 3 0.1018 0.8424 0.000 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 5 0.3730 0.7558 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033246 1 0.1281 0.9144 0.956 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR1033248 5 0.4879 0.6905 0.000 0.000 0.124 0.156 0.720
#> SRR1033247 5 0.5603 0.4052 0.312 0.000 0.068 0.012 0.608
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0671 0.9172 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0854 0.9183 0.976 0.000 0.004 0.008 0.012
#> SRR1033254 1 0.0451 0.9185 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.3333 0.6485 0.000 0.000 0.788 0.004 0.208
#> SRR1033258 1 0.0671 0.9186 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1033257 1 0.5664 0.3300 0.548 0.000 0.012 0.384 0.056
#> SRR1033259 1 0.2086 0.9055 0.924 0.000 0.020 0.008 0.048
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0865 0.8398 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1033262 3 0.0798 0.8418 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3452 0.8704 0.856 0.000 0.020 0.056 0.068
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 5 0.3601 0.7760 0.000 0.000 0.128 0.052 0.820
#> SRR1033267 3 0.3336 0.6283 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1033268 1 0.0771 0.9162 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1033269 5 0.3774 0.7500 0.000 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1033270 3 0.1043 0.8322 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1033271 1 0.0798 0.9182 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0451 0.9188 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.3692 0.7438 0.136 0.000 0.000 0.812 0.052
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.4063 0.8360 0.816 0.000 0.020 0.088 0.076
#> SRR1033278 4 0.5861 0.0692 0.000 0.000 0.104 0.520 0.376
#> SRR1033279 5 0.3730 0.7583 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1033280 5 0.3774 0.7502 0.000 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1033281 1 0.0324 0.9185 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033282 5 0.5382 0.6621 0.000 0.000 0.100 0.260 0.640
#> SRR1033283 5 0.5404 0.6583 0.000 0.000 0.100 0.264 0.636
#> SRR1033284 5 0.5404 0.6578 0.000 0.000 0.100 0.264 0.636
#> SRR1033285 5 0.4953 0.7337 0.000 0.000 0.124 0.164 0.712
#> SRR1033286 5 0.4953 0.7337 0.000 0.000 0.124 0.164 0.712
#> SRR1033287 5 0.4953 0.7337 0.000 0.000 0.124 0.164 0.712
#> SRR1033288 5 0.4953 0.7337 0.000 0.000 0.124 0.164 0.712
#> SRR1033289 5 0.4953 0.7337 0.000 0.000 0.124 0.164 0.712
#> SRR1033290 5 0.4953 0.7337 0.000 0.000 0.124 0.164 0.712
#> SRR1033291 5 0.4909 0.7331 0.000 0.000 0.120 0.164 0.716
#> SRR1033292 5 0.4901 0.7305 0.000 0.000 0.116 0.168 0.716
#> SRR1033293 5 0.4909 0.7331 0.000 0.000 0.120 0.164 0.716
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 6 0.6206 0.23695 0.020 0.000 0.020 0.376 0.104 0.480
#> SRR1032911 4 0.4932 0.29943 0.088 0.000 0.000 0.600 0.312 0.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 4 0.0260 0.74516 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032914 4 0.0260 0.74531 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032915 4 0.1882 0.71773 0.000 0.000 0.008 0.920 0.012 0.060
#> SRR1032916 4 0.0146 0.74611 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032917 3 0.0458 0.86737 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1032918 4 0.5094 0.24107 0.096 0.000 0.000 0.568 0.336 0.000
#> SRR1032919 4 0.0508 0.74374 0.000 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1032920 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 5 0.4750 0.70744 0.340 0.000 0.000 0.064 0.596 0.000
#> SRR1032922 6 0.3282 0.74989 0.000 0.000 0.016 0.012 0.164 0.808
#> SRR1032923 4 0.1049 0.73699 0.000 0.000 0.000 0.960 0.008 0.032
#> SRR1032925 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.5313 0.05845 0.104 0.000 0.000 0.484 0.412 0.000
#> SRR1032926 4 0.3941 0.48052 0.000 0.000 0.008 0.724 0.024 0.244
#> SRR1032927 4 0.5313 0.05845 0.104 0.000 0.000 0.484 0.412 0.000
#> SRR1032929 4 0.5127 0.20016 0.092 0.000 0.000 0.544 0.364 0.000
#> SRR1032928 4 0.1218 0.73553 0.000 0.000 0.004 0.956 0.012 0.028
#> SRR1032930 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 6 0.4696 0.72586 0.000 0.036 0.036 0.008 0.204 0.716
#> SRR1032933 4 0.5612 -0.14775 0.144 0.000 0.000 0.432 0.424 0.000
#> SRR1032934 4 0.1341 0.73213 0.000 0.000 0.000 0.948 0.024 0.028
#> SRR1032935 4 0.5347 0.04158 0.108 0.000 0.000 0.480 0.412 0.000
#> SRR1032936 4 0.4745 0.11523 0.000 0.000 0.012 0.572 0.032 0.384
#> SRR1032937 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 5 0.3766 0.71892 0.304 0.000 0.000 0.012 0.684 0.000
#> SRR1032939 6 0.3875 0.74715 0.000 0.000 0.036 0.020 0.168 0.776
#> SRR1032940 4 0.0146 0.74591 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032941 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 6 0.6386 0.54704 0.024 0.208 0.008 0.004 0.220 0.536
#> SRR1032943 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.4002 0.04626 0.588 0.000 0.000 0.008 0.404 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.5494 0.05745 0.136 0.000 0.000 0.504 0.360 0.000
#> SRR1032947 4 0.2912 0.61780 0.000 0.000 0.012 0.816 0.000 0.172
#> SRR1032948 4 0.3078 0.59238 0.012 0.000 0.000 0.796 0.192 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 6 0.4031 0.74246 0.000 0.000 0.028 0.036 0.168 0.768
#> SRR1032951 4 0.5319 0.03663 0.104 0.000 0.000 0.476 0.420 0.000
#> SRR1032952 4 0.1168 0.73557 0.000 0.000 0.000 0.956 0.016 0.028
#> SRR1032953 4 0.5380 0.02338 0.112 0.000 0.000 0.476 0.412 0.000
#> SRR1032954 5 0.4729 0.73290 0.196 0.000 0.000 0.128 0.676 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 5 0.5046 0.74749 0.280 0.000 0.000 0.112 0.608 0.000
#> SRR1032958 4 0.0547 0.74168 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032959 5 0.5803 0.30506 0.184 0.000 0.000 0.372 0.444 0.000
#> SRR1032960 4 0.2066 0.70402 0.000 0.000 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1032961 5 0.4368 0.75244 0.272 0.000 0.000 0.056 0.672 0.000
#> SRR1032962 6 0.2706 0.73067 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1032963 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.5185 0.14174 0.092 0.000 0.000 0.512 0.396 0.000
#> SRR1032966 4 0.0260 0.74440 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032967 6 0.6651 0.53717 0.044 0.200 0.008 0.004 0.220 0.524
#> SRR1032968 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.0632 0.74239 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032970 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.0260 0.74557 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032972 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 5 0.4964 0.72013 0.200 0.000 0.000 0.152 0.648 0.000
#> SRR1032975 4 0.0363 0.74305 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032976 4 0.4074 0.40700 0.000 0.000 0.004 0.684 0.024 0.288
#> SRR1032977 6 0.3917 0.74018 0.000 0.000 0.032 0.012 0.204 0.752
#> SRR1032978 1 0.3860 -0.19585 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 4 0.4687 0.20182 0.000 0.000 0.020 0.604 0.024 0.352
#> SRR1032984 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 4 0.5179 0.14832 0.092 0.000 0.000 0.516 0.392 0.000
#> SRR1032986 4 0.1268 0.73565 0.000 0.000 0.004 0.952 0.008 0.036
#> SRR1032987 2 0.0146 0.98551 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032988 4 0.5313 0.05845 0.104 0.000 0.000 0.484 0.412 0.000
#> SRR1032990 6 0.3348 0.68723 0.000 0.000 0.216 0.016 0.000 0.768
#> SRR1032989 4 0.5278 0.07425 0.100 0.000 0.000 0.488 0.412 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 6 0.4031 0.74419 0.000 0.000 0.028 0.036 0.168 0.768
#> SRR1032993 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 6 0.4170 0.74248 0.000 0.000 0.032 0.040 0.168 0.760
#> SRR1032995 5 0.5276 0.63123 0.188 0.000 0.000 0.208 0.604 0.000
#> SRR1032996 4 0.0993 0.74031 0.000 0.000 0.000 0.964 0.012 0.024
#> SRR1032997 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 6 0.5650 0.49512 0.000 0.000 0.016 0.276 0.136 0.572
#> SRR1032999 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 6 0.3917 0.74018 0.000 0.000 0.032 0.012 0.204 0.752
#> SRR1033001 4 0.4084 0.47587 0.000 0.000 0.012 0.712 0.024 0.252
#> SRR1033002 6 0.5646 0.58791 0.004 0.000 0.016 0.180 0.188 0.612
#> SRR1033003 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0837 0.74066 0.000 0.000 0.004 0.972 0.004 0.020
#> SRR1033006 3 0.5225 0.57745 0.000 0.000 0.628 0.112 0.012 0.248
#> SRR1033007 4 0.4778 -0.13290 0.000 0.000 0.012 0.508 0.028 0.452
#> SRR1033008 1 0.1765 0.80395 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1033009 5 0.3782 0.56063 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR1033010 3 0.6421 0.10235 0.000 0.000 0.400 0.208 0.024 0.368
#> SRR1033011 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0260 0.83595 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033013 3 0.0547 0.86687 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0458 0.86710 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033015 6 0.3133 0.67656 0.000 0.000 0.212 0.000 0.008 0.780
#> SRR1033016 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 6 0.3078 0.70823 0.000 0.000 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1033019 3 0.0632 0.86547 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033020 6 0.3676 0.74308 0.020 0.000 0.012 0.004 0.184 0.780
#> SRR1033021 6 0.4064 0.74799 0.000 0.000 0.040 0.028 0.164 0.768
#> SRR1033023 1 0.0508 0.83586 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1033022 1 0.0260 0.83345 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033024 3 0.0603 0.86757 0.000 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1033025 1 0.0363 0.83582 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033026 3 0.0363 0.86832 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.5669 0.22413 0.000 0.000 0.148 0.508 0.004 0.340
#> SRR1033029 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0000 0.86792 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.4499 0.46084 0.716 0.000 0.004 0.000 0.168 0.112
#> SRR1033032 6 0.2036 0.75905 0.000 0.000 0.048 0.008 0.028 0.916
#> SRR1033033 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.2190 0.78458 0.900 0.000 0.000 0.000 0.060 0.040
#> SRR1033036 1 0.0547 0.83663 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033037 1 0.3727 0.21828 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1033038 6 0.6191 0.18945 0.340 0.000 0.004 0.004 0.224 0.428
#> SRR1033039 3 0.1411 0.85155 0.000 0.000 0.936 0.004 0.000 0.060
#> SRR1033040 6 0.2537 0.76219 0.000 0.000 0.024 0.008 0.088 0.880
#> SRR1033041 1 0.1010 0.83595 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033042 1 0.0146 0.83593 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033043 1 0.3838 -0.07246 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448 0.000
#> SRR1033044 5 0.3869 0.27351 0.500 0.000 0.000 0.000 0.500 0.000
#> SRR1033045 3 0.2494 0.82950 0.000 0.000 0.864 0.016 0.000 0.120
#> SRR1033046 6 0.3002 0.76133 0.000 0.000 0.048 0.004 0.100 0.848
#> SRR1033047 3 0.1082 0.86188 0.000 0.000 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR1033048 6 0.4263 0.74157 0.000 0.000 0.032 0.048 0.164 0.756
#> SRR1033049 1 0.2003 0.78087 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1033051 5 0.3997 0.32579 0.488 0.000 0.000 0.004 0.508 0.000
#> SRR1033052 1 0.0865 0.83575 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 6 0.4061 0.52937 0.000 0.000 0.316 0.008 0.012 0.664
#> SRR1033050 1 0.3547 0.41445 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1033055 3 0.1285 0.85740 0.000 0.000 0.944 0.004 0.000 0.052
#> SRR1033056 6 0.3922 0.74472 0.000 0.000 0.028 0.028 0.172 0.772
#> SRR1033057 1 0.0363 0.83613 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.86792 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 6 0.3787 0.74933 0.024 0.000 0.016 0.008 0.164 0.788
#> SRR1033061 6 0.2706 0.73067 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1033062 3 0.1970 0.80721 0.000 0.000 0.900 0.000 0.008 0.092
#> SRR1033063 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0713 0.86472 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033065 1 0.0363 0.83485 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033066 1 0.0260 0.83345 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033067 1 0.3868 -0.29030 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1033068 6 0.3514 0.66798 0.000 0.000 0.228 0.000 0.020 0.752
#> SRR1033069 6 0.2538 0.73300 0.000 0.000 0.124 0.000 0.016 0.860
#> SRR1033070 6 0.4411 0.33019 0.000 0.000 0.400 0.012 0.012 0.576
#> SRR1033071 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 6 0.2706 0.73067 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1033073 3 0.2703 0.74851 0.000 0.000 0.824 0.000 0.004 0.172
#> SRR1033074 5 0.3969 0.69455 0.332 0.000 0.000 0.016 0.652 0.000
#> SRR1033075 6 0.4258 0.73697 0.000 0.000 0.028 0.048 0.172 0.752
#> SRR1033076 6 0.2896 0.71640 0.000 0.000 0.160 0.000 0.016 0.824
#> SRR1033077 1 0.2219 0.76195 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1033078 1 0.2762 0.69730 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1033079 3 0.0363 0.86832 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0291 0.86919 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033081 6 0.3800 0.74448 0.000 0.000 0.028 0.020 0.176 0.776
#> SRR1033082 1 0.0972 0.82494 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1033083 3 0.0000 0.86792 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.1267 0.82396 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1033085 3 0.2309 0.80900 0.000 0.000 0.888 0.028 0.000 0.084
#> SRR1033086 6 0.2942 0.72819 0.000 0.000 0.132 0.000 0.032 0.836
#> SRR1033087 1 0.2912 0.66088 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.86792 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 3 0.5500 0.53213 0.000 0.000 0.584 0.188 0.004 0.224
#> SRR1033090 4 0.0000 0.74616 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0806 0.86788 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR1033092 1 0.2762 0.68599 0.860 0.000 0.000 0.000 0.092 0.048
#> SRR1033093 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.4177 0.10341 0.000 0.000 0.520 0.012 0.000 0.468
#> SRR1033095 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 6 0.3950 0.58931 0.000 0.000 0.276 0.028 0.000 0.696
#> SRR1033097 6 0.3976 0.72271 0.000 0.056 0.128 0.000 0.028 0.788
#> SRR1033098 3 0.0146 0.86839 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.0993 0.86559 0.000 0.000 0.964 0.024 0.000 0.012
#> SRR1033102 1 0.2146 0.78323 0.880 0.000 0.000 0.004 0.116 0.000
#> SRR1033103 1 0.0458 0.83818 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033104 3 0.0458 0.86737 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0146 0.83439 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033106 6 0.3462 0.74908 0.008 0.000 0.016 0.004 0.180 0.792
#> SRR1033107 3 0.1418 0.85505 0.000 0.000 0.944 0.024 0.000 0.032
#> SRR1033108 5 0.5008 0.73369 0.212 0.000 0.000 0.148 0.640 0.000
#> SRR1033109 1 0.1391 0.82792 0.944 0.000 0.000 0.000 0.040 0.016
#> SRR1033110 6 0.4066 0.35236 0.000 0.000 0.392 0.000 0.012 0.596
#> SRR1033111 1 0.0547 0.83649 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033112 1 0.0547 0.83689 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033113 6 0.3348 0.66768 0.000 0.000 0.216 0.000 0.016 0.768
#> SRR1033114 1 0.0547 0.83603 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033115 1 0.0790 0.83146 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033116 3 0.1921 0.83765 0.000 0.000 0.916 0.032 0.000 0.052
#> SRR1033117 3 0.0806 0.86967 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000 0.008
#> SRR1033118 3 0.5306 0.43256 0.000 0.000 0.576 0.100 0.008 0.316
#> SRR1033119 1 0.0363 0.83570 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033121 3 0.0632 0.86545 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033120 6 0.2706 0.73067 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1033122 3 0.2507 0.84679 0.000 0.000 0.884 0.040 0.004 0.072
#> SRR1033123 1 0.0260 0.83345 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033124 1 0.0260 0.83686 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033125 6 0.2491 0.72077 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000 0.836
#> SRR1033126 1 0.0363 0.83485 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033127 3 0.4716 0.37906 0.000 0.000 0.576 0.004 0.044 0.376
#> SRR1033129 3 0.0363 0.86832 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0260 0.83345 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033130 6 0.4963 0.68421 0.120 0.000 0.008 0.008 0.172 0.692
#> SRR1033131 1 0.4764 0.32717 0.660 0.000 0.000 0.000 0.108 0.232
#> SRR1033132 6 0.2821 0.72417 0.000 0.000 0.152 0.000 0.016 0.832
#> SRR1033133 6 0.2454 0.72379 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1033134 1 0.3584 0.46901 0.688 0.000 0.000 0.004 0.308 0.000
#> SRR1033135 3 0.2805 0.74885 0.000 0.000 0.812 0.004 0.000 0.184
#> SRR1033136 1 0.0363 0.83485 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033137 6 0.4057 0.23143 0.000 0.000 0.436 0.000 0.008 0.556
#> SRR1033139 6 0.2706 0.73067 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1033138 6 0.2706 0.76191 0.008 0.000 0.060 0.000 0.056 0.876
#> SRR1033140 3 0.1913 0.83816 0.000 0.000 0.908 0.012 0.000 0.080
#> SRR1033141 6 0.3610 0.74466 0.004 0.000 0.012 0.020 0.176 0.788
#> SRR1033142 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2178 0.77113 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1033144 1 0.0363 0.83485 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033145 3 0.4115 0.44468 0.000 0.000 0.624 0.004 0.012 0.360
#> SRR1033146 1 0.2393 0.75005 0.892 0.000 0.004 0.000 0.064 0.040
#> SRR1033147 6 0.2624 0.73188 0.000 0.000 0.124 0.000 0.020 0.856
#> SRR1033148 5 0.4271 0.75608 0.244 0.000 0.000 0.060 0.696 0.000
#> SRR1033149 3 0.0291 0.86907 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033150 6 0.3384 0.75496 0.000 0.000 0.024 0.008 0.168 0.800
#> SRR1033151 6 0.3217 0.65992 0.000 0.000 0.224 0.000 0.008 0.768
#> SRR1033152 6 0.3219 0.75147 0.000 0.000 0.016 0.008 0.168 0.808
#> SRR1033153 6 0.2513 0.73131 0.000 0.000 0.140 0.000 0.008 0.852
#> SRR1033154 1 0.0603 0.83373 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033156 3 0.0458 0.86737 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.2092 0.76955 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1033158 2 0.4378 0.25595 0.000 0.600 0.000 0.000 0.032 0.368
#> SRR1033159 3 0.2112 0.83533 0.000 0.000 0.896 0.016 0.000 0.088
#> SRR1033160 3 0.1663 0.83724 0.000 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1033161 1 0.3330 0.53367 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1033163 6 0.3098 0.71594 0.000 0.000 0.164 0.000 0.024 0.812
#> SRR1033162 1 0.0260 0.83345 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033164 6 0.2252 0.75568 0.000 0.000 0.072 0.012 0.016 0.900
#> SRR1033165 4 0.4817 0.01860 0.000 0.000 0.020 0.548 0.024 0.408
#> SRR1033166 1 0.5093 0.28963 0.632 0.000 0.000 0.000 0.176 0.192
#> SRR1033167 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 6 0.3847 0.45755 0.000 0.000 0.348 0.000 0.008 0.644
#> SRR1033169 2 0.0260 0.98198 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033171 6 0.2706 0.73067 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1033170 1 0.0260 0.83686 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033172 3 0.0405 0.86953 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1033173 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.2572 0.79829 0.000 0.000 0.852 0.012 0.000 0.136
#> SRR1033175 1 0.2562 0.73028 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1033176 1 0.0622 0.83335 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033177 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0632 0.83535 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033181 1 0.2856 0.69190 0.856 0.000 0.000 0.000 0.068 0.076
#> SRR1033183 3 0.1341 0.85655 0.000 0.000 0.948 0.024 0.000 0.028
#> SRR1033182 6 0.5362 0.62709 0.164 0.000 0.012 0.004 0.176 0.644
#> SRR1033184 6 0.2631 0.72545 0.000 0.000 0.152 0.000 0.008 0.840
#> SRR1033185 1 0.0146 0.83638 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033187 6 0.3822 0.74837 0.000 0.000 0.032 0.016 0.180 0.772
#> SRR1033186 6 0.6075 0.28612 0.320 0.000 0.004 0.004 0.204 0.468
#> SRR1033188 4 0.4751 -0.03841 0.000 0.000 0.012 0.536 0.028 0.424
#> SRR1033189 3 0.4929 0.24253 0.000 0.004 0.528 0.004 0.044 0.420
#> SRR1033190 1 0.0632 0.83447 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033191 1 0.0363 0.83485 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033192 6 0.2706 0.73067 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1033193 1 0.1152 0.83367 0.952 0.000 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1033195 2 0.0146 0.98545 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033194 6 0.2624 0.73188 0.000 0.000 0.124 0.000 0.020 0.856
#> SRR1033197 1 0.0260 0.83532 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033196 6 0.2730 0.72572 0.000 0.000 0.152 0.000 0.012 0.836
#> SRR1033199 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.3809 0.37439 0.684 0.000 0.000 0.004 0.304 0.008
#> SRR1033200 1 0.4056 -0.00971 0.576 0.000 0.000 0.004 0.416 0.004
#> SRR1033201 3 0.0725 0.86963 0.000 0.000 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1033202 3 0.1334 0.85551 0.000 0.000 0.948 0.020 0.000 0.032
#> SRR1033203 3 0.2389 0.80175 0.000 0.000 0.864 0.008 0.000 0.128
#> SRR1033204 1 0.1531 0.81869 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068 0.000
#> SRR1033205 3 0.2687 0.83808 0.000 0.000 0.876 0.044 0.008 0.072
#> SRR1033206 1 0.1075 0.82961 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1033207 1 0.1610 0.80896 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.86792 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 6 0.5255 0.73244 0.000 0.000 0.068 0.096 0.144 0.692
#> SRR1033210 3 0.0260 0.86852 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033211 6 0.3338 0.75132 0.000 0.000 0.020 0.008 0.172 0.800
#> SRR1033212 3 0.0458 0.86833 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.1049 0.94593 0.000 0.960 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1033214 5 0.4095 0.75006 0.216 0.000 0.000 0.060 0.724 0.000
#> SRR1033216 1 0.1411 0.82306 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060 0.000
#> SRR1033215 3 0.4377 0.51823 0.000 0.000 0.644 0.000 0.044 0.312
#> SRR1033217 6 0.3629 0.58735 0.000 0.000 0.276 0.000 0.012 0.712
#> SRR1033218 1 0.0865 0.83221 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033219 1 0.1863 0.79556 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.3244 0.56806 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1033223 6 0.2907 0.73072 0.000 0.000 0.152 0.000 0.020 0.828
#> SRR1033225 3 0.5657 0.15911 0.000 0.056 0.524 0.000 0.048 0.372
#> SRR1033224 5 0.4877 0.42260 0.464 0.000 0.000 0.040 0.488 0.008
#> SRR1033226 6 0.2221 0.75835 0.000 0.000 0.072 0.000 0.032 0.896
#> SRR1033227 3 0.2030 0.85069 0.000 0.000 0.908 0.028 0.000 0.064
#> SRR1033229 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.3163 0.63224 0.764 0.000 0.000 0.004 0.232 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.1204 0.82612 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1033232 6 0.5664 0.63446 0.000 0.000 0.028 0.232 0.136 0.604
#> SRR1033233 1 0.3515 0.42828 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.3420 0.66830 0.000 0.000 0.748 0.012 0.000 0.240
#> SRR1033236 3 0.4325 0.12114 0.000 0.000 0.524 0.020 0.000 0.456
#> SRR1033237 4 0.4228 0.34155 0.000 0.000 0.008 0.656 0.020 0.316
#> SRR1033238 3 0.1151 0.86564 0.000 0.000 0.956 0.012 0.000 0.032
#> SRR1033240 3 0.0547 0.86687 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033239 6 0.3424 0.75267 0.000 0.000 0.032 0.004 0.168 0.796
#> SRR1033242 6 0.5883 0.59635 0.000 0.000 0.060 0.264 0.092 0.584
#> SRR1033241 3 0.1075 0.85773 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1033244 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 6 0.2932 0.71361 0.000 0.000 0.164 0.000 0.016 0.820
#> SRR1033246 1 0.2491 0.72858 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1033248 6 0.5153 0.67326 0.004 0.000 0.024 0.140 0.144 0.688
#> SRR1033247 6 0.5894 0.48895 0.192 0.000 0.008 0.004 0.252 0.544
#> SRR1033249 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0363 0.83220 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.2597 0.71462 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1033254 1 0.1141 0.82930 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.3969 0.49734 0.000 0.000 0.652 0.016 0.000 0.332
#> SRR1033258 1 0.1075 0.82904 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1033257 5 0.5888 0.61398 0.200 0.000 0.000 0.232 0.552 0.016
#> SRR1033259 1 0.3405 0.55572 0.724 0.000 0.000 0.004 0.272 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0547 0.86687 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0717 0.86795 0.000 0.000 0.976 0.016 0.000 0.008
#> SRR1033263 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 5 0.4274 0.50716 0.432 0.000 0.000 0.004 0.552 0.012
#> SRR1033265 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 6 0.4191 0.73888 0.000 0.000 0.028 0.048 0.164 0.760
#> SRR1033267 3 0.3448 0.58513 0.000 0.000 0.716 0.004 0.000 0.280
#> SRR1033268 1 0.0146 0.83633 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033269 6 0.2907 0.71985 0.000 0.000 0.152 0.000 0.020 0.828
#> SRR1033270 3 0.0547 0.86687 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.1714 0.80379 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0547 0.83689 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.5350 0.03861 0.108 0.000 0.000 0.476 0.416 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.98992 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 5 0.4299 0.72539 0.308 0.000 0.000 0.040 0.652 0.000
#> SRR1033278 4 0.4347 0.34566 0.000 0.000 0.012 0.660 0.024 0.304
#> SRR1033279 6 0.2932 0.71685 0.000 0.000 0.164 0.000 0.016 0.820
#> SRR1033280 6 0.2912 0.71257 0.000 0.000 0.172 0.000 0.012 0.816
#> SRR1033281 1 0.0547 0.83685 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033282 6 0.4848 0.43144 0.000 0.000 0.028 0.388 0.020 0.564
#> SRR1033283 6 0.4864 0.41360 0.000 0.000 0.028 0.396 0.020 0.556
#> SRR1033284 6 0.4872 0.40541 0.000 0.000 0.028 0.400 0.020 0.552
#> SRR1033285 6 0.5450 0.68092 0.000 0.000 0.036 0.172 0.140 0.652
#> SRR1033286 6 0.5450 0.68092 0.000 0.000 0.036 0.172 0.140 0.652
#> SRR1033287 6 0.5450 0.68092 0.000 0.000 0.036 0.172 0.140 0.652
#> SRR1033288 6 0.5450 0.68092 0.000 0.000 0.036 0.172 0.140 0.652
#> SRR1033289 6 0.5450 0.68092 0.000 0.000 0.036 0.172 0.140 0.652
#> SRR1033290 6 0.5450 0.68092 0.000 0.000 0.036 0.172 0.140 0.652
#> SRR1033291 6 0.5508 0.67484 0.000 0.000 0.036 0.180 0.140 0.644
#> SRR1033292 6 0.5537 0.67164 0.000 0.000 0.036 0.184 0.140 0.640
#> SRR1033293 6 0.5537 0.67164 0.000 0.000 0.036 0.184 0.140 0.640
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.681 0.824 0.928 0.4238 0.575 0.575
#> 3 3 0.485 0.698 0.820 0.5266 0.657 0.450
#> 4 4 0.501 0.644 0.771 0.1087 0.808 0.515
#> 5 5 0.536 0.604 0.756 0.0465 0.982 0.934
#> 6 6 0.543 0.421 0.671 0.0373 0.920 0.731
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032917 2 0.9580 0.4486 0.380 0.620
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0376 0.9299 0.996 0.004
#> SRR1032920 1 0.2423 0.9001 0.960 0.040
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.3733 0.8435 0.072 0.928
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.1843 0.9109 0.972 0.028
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.9248 0.5326 0.340 0.660
#> SRR1032932 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.3879 0.8657 0.924 0.076
#> SRR1032937 1 0.7950 0.6528 0.760 0.240
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0376 0.9298 0.996 0.004
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.8813 0.5767 0.300 0.700
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.4161 0.8576 0.916 0.084
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.9998 0.1150 0.492 0.508
#> SRR1032950 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.3431 0.8485 0.064 0.936
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.7299 0.7434 0.204 0.796
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.8713 0.5246 0.708 0.292
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.1843 0.8737 0.028 0.972
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.6712 0.7479 0.824 0.176
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.6148 0.7754 0.152 0.848
#> SRR1032992 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1032999 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033000 1 0.6887 0.7196 0.816 0.184
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.5178 0.8203 0.116 0.884
#> SRR1033004 2 0.1633 0.8720 0.024 0.976
#> SRR1033005 1 0.2043 0.9074 0.968 0.032
#> SRR1033006 1 0.9491 0.3859 0.632 0.368
#> SRR1033007 1 0.1184 0.9210 0.984 0.016
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.9686 0.3077 0.604 0.396
#> SRR1033011 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.9996 -0.0295 0.512 0.488
#> SRR1033014 2 0.8813 0.6086 0.300 0.700
#> SRR1033015 2 0.8016 0.6939 0.244 0.756
#> SRR1033016 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.9909 0.1498 0.556 0.444
#> SRR1033019 2 0.1633 0.8750 0.024 0.976
#> SRR1033020 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.1414 0.9177 0.980 0.020
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033024 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033026 2 0.5737 0.8073 0.136 0.864
#> SRR1033027 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.8144 0.6311 0.748 0.252
#> SRR1033029 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033030 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.5629 0.8044 0.868 0.132
#> SRR1033033 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033039 2 0.7056 0.7547 0.192 0.808
#> SRR1033040 1 0.0672 0.9270 0.992 0.008
#> SRR1033041 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.9754 0.2712 0.592 0.408
#> SRR1033046 1 0.6623 0.7535 0.828 0.172
#> SRR1033047 2 0.9491 0.4767 0.368 0.632
#> SRR1033048 1 0.2236 0.9037 0.964 0.036
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033054 2 0.9129 0.5588 0.328 0.672
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033055 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033058 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033062 2 0.9833 0.3339 0.424 0.576
#> SRR1033063 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033064 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.9922 0.1349 0.552 0.448
#> SRR1033069 1 0.9358 0.4299 0.648 0.352
#> SRR1033070 1 0.9909 0.1498 0.556 0.444
#> SRR1033071 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0672 0.8800 0.008 0.992
#> SRR1033073 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.8955 0.5172 0.688 0.312
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033079 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033080 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033083 2 0.0672 0.8800 0.008 0.992
#> SRR1033084 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033085 2 0.8608 0.6349 0.284 0.716
#> SRR1033086 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033088 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033089 1 0.9460 0.3960 0.636 0.364
#> SRR1033090 1 0.0938 0.9241 0.988 0.012
#> SRR1033091 2 0.9170 0.5511 0.332 0.668
#> SRR1033092 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.7883 0.7046 0.236 0.764
#> SRR1033095 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.9248 0.4550 0.660 0.340
#> SRR1033097 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033098 2 0.1633 0.8750 0.024 0.976
#> SRR1033099 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033101 2 0.9944 0.2333 0.456 0.544
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033104 2 0.0938 0.8790 0.012 0.988
#> SRR1033105 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033107 2 0.9661 0.4191 0.392 0.608
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.9996 -0.0286 0.512 0.488
#> SRR1033111 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.9996 -0.0277 0.512 0.488
#> SRR1033114 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.9970 0.0567 0.532 0.468
#> SRR1033117 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033118 1 0.8861 0.5335 0.696 0.304
#> SRR1033119 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033121 2 0.2236 0.8700 0.036 0.964
#> SRR1033120 2 0.8955 0.5619 0.312 0.688
#> SRR1033122 1 0.9522 0.3750 0.628 0.372
#> SRR1033123 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033125 2 0.8207 0.6791 0.256 0.744
#> SRR1033126 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.2603 0.8665 0.044 0.956
#> SRR1033129 2 0.7602 0.7234 0.220 0.780
#> SRR1033128 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.9815 0.2343 0.580 0.420
#> SRR1033133 1 0.6623 0.7536 0.828 0.172
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033135 2 0.4562 0.8369 0.096 0.904
#> SRR1033136 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033137 2 0.5178 0.8242 0.116 0.884
#> SRR1033139 2 0.9996 0.1105 0.488 0.512
#> SRR1033138 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033140 2 0.4161 0.8450 0.084 0.916
#> SRR1033141 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033145 2 0.8016 0.6939 0.244 0.756
#> SRR1033146 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0938 0.9240 0.988 0.012
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033149 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.9998 -0.0393 0.508 0.492
#> SRR1033152 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033156 2 0.4815 0.8316 0.104 0.896
#> SRR1033157 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033159 2 0.7139 0.7513 0.196 0.804
#> SRR1033160 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.8955 0.5175 0.688 0.312
#> SRR1033162 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.4939 0.8322 0.892 0.108
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0672 0.8792 0.008 0.992
#> SRR1033168 1 0.9044 0.4998 0.680 0.320
#> SRR1033169 2 0.6148 0.7753 0.152 0.848
#> SRR1033171 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033172 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.9815 0.2328 0.580 0.420
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0376 0.8806 0.004 0.996
#> SRR1033179 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033183 2 0.9833 0.3337 0.424 0.576
#> SRR1033182 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.8443 0.5955 0.728 0.272
#> SRR1033185 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.2043 0.9075 0.968 0.032
#> SRR1033189 2 0.1843 0.8736 0.028 0.972
#> SRR1033190 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.3431 0.8736 0.936 0.064
#> SRR1033193 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.7528 0.7001 0.216 0.784
#> SRR1033197 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.6343 0.7693 0.840 0.160
#> SRR1033199 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033201 2 0.9996 0.1167 0.488 0.512
#> SRR1033202 1 0.9970 0.0560 0.532 0.468
#> SRR1033203 2 0.9881 0.2979 0.436 0.564
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.9754 0.2712 0.592 0.408
#> SRR1033206 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033208 2 0.4939 0.8289 0.108 0.892
#> SRR1033209 1 0.6973 0.7309 0.812 0.188
#> SRR1033210 2 0.2043 0.8717 0.032 0.968
#> SRR1033211 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033212 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033217 1 0.9393 0.4162 0.644 0.356
#> SRR1033218 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.4815 0.8362 0.896 0.104
#> SRR1033225 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.1414 0.9176 0.980 0.020
#> SRR1033227 1 0.9686 0.3074 0.604 0.396
#> SRR1033229 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0938 0.9241 0.988 0.012
#> SRR1033233 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033234 2 0.9732 0.3886 0.404 0.596
#> SRR1033236 1 0.9393 0.4167 0.644 0.356
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033238 2 0.9896 0.2854 0.440 0.560
#> SRR1033240 2 0.0376 0.8810 0.004 0.996
#> SRR1033239 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.7674 0.6772 0.776 0.224
#> SRR1033241 2 0.4298 0.8426 0.088 0.912
#> SRR1033244 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.8443 0.5955 0.728 0.272
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033247 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033255 2 0.9983 0.1624 0.476 0.524
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033261 2 0.5629 0.8109 0.132 0.868
#> SRR1033262 2 0.9522 0.4662 0.372 0.628
#> SRR1033263 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.9393 0.4164 0.644 0.356
#> SRR1033268 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.9393 0.4168 0.644 0.356
#> SRR1033270 2 0.8713 0.6217 0.292 0.708
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.8818 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.7674 0.6773 0.776 0.224
#> SRR1033280 1 0.8861 0.5337 0.696 0.304
#> SRR1033281 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0672 0.9270 0.992 0.008
#> SRR1033286 1 0.0938 0.9240 0.988 0.012
#> SRR1033287 1 0.0672 0.9270 0.992 0.008
#> SRR1033288 1 0.0376 0.9298 0.996 0.004
#> SRR1033289 1 0.0672 0.9270 0.992 0.008
#> SRR1033290 1 0.0938 0.9240 0.988 0.012
#> SRR1033291 1 0.0376 0.9298 0.996 0.004
#> SRR1033292 1 0.0000 0.9326 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0376 0.9298 0.996 0.004
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 2 0.4931 0.71673 0.232 0.768 0.000
#> SRR1032911 2 0.3619 0.79361 0.136 0.864 0.000
#> SRR1032912 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032913 2 0.3551 0.79489 0.132 0.868 0.000
#> SRR1032914 2 0.3755 0.79499 0.120 0.872 0.008
#> SRR1032915 2 0.3551 0.79489 0.132 0.868 0.000
#> SRR1032916 2 0.3619 0.79361 0.136 0.864 0.000
#> SRR1032917 3 0.5070 0.70850 0.004 0.224 0.772
#> SRR1032918 2 0.3686 0.79187 0.140 0.860 0.000
#> SRR1032919 2 0.3966 0.78867 0.100 0.876 0.024
#> SRR1032920 2 0.4206 0.75129 0.040 0.872 0.088
#> SRR1032921 1 0.5835 0.51554 0.660 0.340 0.000
#> SRR1032922 1 0.6267 0.07308 0.548 0.452 0.000
#> SRR1032923 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032925 3 0.9069 0.30359 0.136 0.424 0.440
#> SRR1032924 2 0.4178 0.77115 0.172 0.828 0.000
#> SRR1032926 2 0.3966 0.78858 0.100 0.876 0.024
#> SRR1032927 2 0.3752 0.78978 0.144 0.856 0.000
#> SRR1032929 2 0.3619 0.79361 0.136 0.864 0.000
#> SRR1032928 2 0.3755 0.79499 0.120 0.872 0.008
#> SRR1032930 2 0.3644 0.79551 0.124 0.872 0.004
#> SRR1032931 2 0.6856 0.54637 0.132 0.740 0.128
#> SRR1032932 2 0.5970 0.71887 0.160 0.780 0.060
#> SRR1032933 2 0.5327 0.65632 0.272 0.728 0.000
#> SRR1032934 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032935 2 0.4346 0.76123 0.184 0.816 0.000
#> SRR1032936 2 0.4045 0.73894 0.024 0.872 0.104
#> SRR1032937 2 0.7458 0.46481 0.244 0.672 0.084
#> SRR1032938 1 0.6008 0.45180 0.628 0.372 0.000
#> SRR1032939 1 0.6168 0.34123 0.588 0.412 0.000
#> SRR1032940 2 0.3755 0.79506 0.120 0.872 0.008
#> SRR1032941 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032942 1 0.6154 0.30882 0.592 0.408 0.000
#> SRR1032943 2 0.9876 -0.00885 0.288 0.412 0.300
#> SRR1032944 1 0.4235 0.76446 0.824 0.176 0.000
#> SRR1032945 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032946 2 0.5138 0.68577 0.252 0.748 0.000
#> SRR1032947 2 0.4379 0.76232 0.060 0.868 0.072
#> SRR1032948 2 0.3619 0.79361 0.136 0.864 0.000
#> SRR1032949 2 0.7447 0.48186 0.160 0.700 0.140
#> SRR1032950 2 0.6307 0.12111 0.488 0.512 0.000
#> SRR1032951 2 0.4235 0.76807 0.176 0.824 0.000
#> SRR1032952 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032953 2 0.4654 0.73794 0.208 0.792 0.000
#> SRR1032954 2 0.5016 0.70658 0.240 0.760 0.000
#> SRR1032955 3 0.8953 0.55843 0.180 0.260 0.560
#> SRR1032957 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032956 1 0.6126 0.36388 0.600 0.400 0.000
#> SRR1032958 2 0.3551 0.79489 0.132 0.868 0.000
#> SRR1032959 2 0.4796 0.72513 0.220 0.780 0.000
#> SRR1032960 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032961 1 0.6267 0.19437 0.548 0.452 0.000
#> SRR1032962 3 0.6148 0.67241 0.244 0.028 0.728
#> SRR1032963 2 0.3551 0.79489 0.132 0.868 0.000
#> SRR1032964 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032965 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032966 2 0.3619 0.79361 0.136 0.864 0.000
#> SRR1032967 2 0.5178 0.69543 0.256 0.744 0.000
#> SRR1032968 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032969 2 0.3845 0.79409 0.116 0.872 0.012
#> SRR1032970 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032971 2 0.3644 0.79551 0.124 0.872 0.004
#> SRR1032972 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032973 2 0.4269 0.77512 0.076 0.872 0.052
#> SRR1032974 2 0.5363 0.65455 0.276 0.724 0.000
#> SRR1032975 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032976 2 0.3752 0.79020 0.144 0.856 0.000
#> SRR1032977 2 0.8376 -0.10507 0.420 0.496 0.084
#> SRR1032978 1 0.4605 0.74526 0.796 0.204 0.000
#> SRR1032979 2 0.8257 0.00618 0.084 0.544 0.372
#> SRR1032980 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032981 2 0.3755 0.79499 0.120 0.872 0.008
#> SRR1032982 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032983 2 0.4137 0.78369 0.096 0.872 0.032
#> SRR1032984 2 0.3755 0.79499 0.120 0.872 0.008
#> SRR1032985 2 0.3686 0.79187 0.140 0.860 0.000
#> SRR1032986 2 0.3619 0.79403 0.136 0.864 0.000
#> SRR1032987 3 0.6195 0.71474 0.020 0.276 0.704
#> SRR1032988 2 0.3752 0.78985 0.144 0.856 0.000
#> SRR1032990 2 0.5847 0.68492 0.048 0.780 0.172
#> SRR1032989 2 0.3686 0.79187 0.140 0.860 0.000
#> SRR1032991 2 0.8043 0.14886 0.084 0.592 0.324
#> SRR1032992 2 0.5036 0.76907 0.172 0.808 0.020
#> SRR1032993 2 0.3644 0.79551 0.124 0.872 0.004
#> SRR1032994 2 0.5621 0.60503 0.308 0.692 0.000
#> SRR1032995 2 0.5706 0.57605 0.320 0.680 0.000
#> SRR1032996 2 0.3619 0.79361 0.136 0.864 0.000
#> SRR1032997 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032998 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1032999 2 0.4346 0.76874 0.184 0.816 0.000
#> SRR1033000 2 0.8113 -0.11294 0.428 0.504 0.068
#> SRR1033001 2 0.3482 0.79568 0.128 0.872 0.000
#> SRR1033002 2 0.6305 0.07112 0.484 0.516 0.000
#> SRR1033003 2 0.9464 -0.23115 0.180 0.416 0.404
#> SRR1033004 3 0.6970 0.69160 0.048 0.276 0.676
#> SRR1033005 2 0.3755 0.79499 0.120 0.872 0.008
#> SRR1033006 2 0.5363 0.53069 0.000 0.724 0.276
#> SRR1033007 2 0.4335 0.78307 0.100 0.864 0.036
#> SRR1033008 1 0.3752 0.79714 0.856 0.144 0.000
#> SRR1033009 1 0.6192 0.31376 0.580 0.420 0.000
#> SRR1033010 2 0.5327 0.54740 0.000 0.728 0.272
#> SRR1033011 3 0.4662 0.82536 0.032 0.124 0.844
#> SRR1033012 1 0.1643 0.82568 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033013 3 0.6169 0.48262 0.004 0.360 0.636
#> SRR1033014 3 0.3500 0.81416 0.004 0.116 0.880
#> SRR1033015 3 0.3272 0.82516 0.104 0.004 0.892
#> SRR1033016 3 0.4280 0.82918 0.020 0.124 0.856
#> SRR1033017 3 0.4139 0.83046 0.016 0.124 0.860
#> SRR1033018 3 0.1289 0.85968 0.000 0.032 0.968
#> SRR1033019 3 0.0237 0.86009 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033020 1 0.3038 0.81366 0.896 0.104 0.000
#> SRR1033021 2 0.4609 0.78780 0.128 0.844 0.028
#> SRR1033023 1 0.1529 0.82389 0.960 0.040 0.000
#> SRR1033022 1 0.1031 0.82011 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033024 3 0.3941 0.78212 0.000 0.156 0.844
#> SRR1033025 1 0.2625 0.81923 0.916 0.084 0.000
#> SRR1033026 3 0.2590 0.84194 0.004 0.072 0.924
#> SRR1033027 3 0.4280 0.82918 0.020 0.124 0.856
#> SRR1033028 2 0.4099 0.71362 0.008 0.852 0.140
#> SRR1033029 1 0.5948 0.40105 0.640 0.360 0.000
#> SRR1033030 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033031 1 0.1964 0.81970 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033032 2 0.7226 0.61295 0.080 0.692 0.228
#> SRR1033033 3 0.4540 0.82684 0.028 0.124 0.848
#> SRR1033035 3 0.5000 0.81995 0.044 0.124 0.832
#> SRR1033034 1 0.3412 0.80725 0.876 0.124 0.000
#> SRR1033036 1 0.0237 0.80615 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033037 1 0.5254 0.66891 0.736 0.264 0.000
#> SRR1033038 1 0.2625 0.81180 0.916 0.084 0.000
#> SRR1033039 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033040 1 0.6172 0.53558 0.680 0.308 0.012
#> SRR1033041 1 0.1031 0.82087 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033042 1 0.1643 0.82432 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033043 1 0.5397 0.64444 0.720 0.280 0.000
#> SRR1033044 1 0.5397 0.63988 0.720 0.280 0.000
#> SRR1033045 3 0.6280 0.21734 0.000 0.460 0.540
#> SRR1033046 2 0.6488 0.68410 0.084 0.756 0.160
#> SRR1033047 3 0.2590 0.84263 0.004 0.072 0.924
#> SRR1033048 2 0.6935 0.46175 0.372 0.604 0.024
#> SRR1033049 1 0.2711 0.81725 0.912 0.088 0.000
#> SRR1033051 1 0.6079 0.40927 0.612 0.388 0.000
#> SRR1033052 1 0.2711 0.82036 0.912 0.088 0.000
#> SRR1033053 3 0.5105 0.81865 0.048 0.124 0.828
#> SRR1033054 3 0.3193 0.82353 0.100 0.004 0.896
#> SRR1033050 1 0.5098 0.69546 0.752 0.248 0.000
#> SRR1033055 3 0.1015 0.86039 0.012 0.008 0.980
#> SRR1033056 2 0.5810 0.55194 0.336 0.664 0.000
#> SRR1033057 1 0.0892 0.81338 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033058 3 0.0661 0.86017 0.004 0.008 0.988
#> SRR1033059 3 0.5000 0.81995 0.044 0.124 0.832
#> SRR1033060 1 0.2448 0.82535 0.924 0.076 0.000
#> SRR1033061 3 0.6663 0.76993 0.124 0.124 0.752
#> SRR1033062 3 0.5365 0.67266 0.004 0.252 0.744
#> SRR1033063 3 0.5000 0.81995 0.044 0.124 0.832
#> SRR1033064 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033065 1 0.0424 0.80800 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033066 1 0.0592 0.81518 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033067 1 0.5650 0.58883 0.688 0.312 0.000
#> SRR1033068 3 0.1620 0.85849 0.024 0.012 0.964
#> SRR1033069 1 0.6452 0.54264 0.712 0.036 0.252
#> SRR1033070 3 0.2434 0.85421 0.024 0.036 0.940
#> SRR1033071 3 0.5105 0.81790 0.048 0.124 0.828
#> SRR1033072 3 0.3112 0.83077 0.096 0.004 0.900
#> SRR1033073 3 0.0000 0.86015 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033074 1 0.6280 0.16239 0.540 0.460 0.000
#> SRR1033075 2 0.6309 0.02415 0.496 0.504 0.000
#> SRR1033076 3 0.7640 0.33188 0.372 0.052 0.576
#> SRR1033077 1 0.5254 0.67085 0.736 0.264 0.000
#> SRR1033078 1 0.3619 0.79907 0.864 0.136 0.000
#> SRR1033079 3 0.1643 0.85404 0.000 0.044 0.956
#> SRR1033080 3 0.1411 0.85812 0.000 0.036 0.964
#> SRR1033081 1 0.4399 0.74153 0.812 0.188 0.000
#> SRR1033082 1 0.0892 0.81979 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033083 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033084 1 0.2261 0.82538 0.932 0.068 0.000
#> SRR1033085 3 0.5363 0.64005 0.000 0.276 0.724
#> SRR1033086 3 0.4540 0.82725 0.028 0.124 0.848
#> SRR1033087 1 0.2711 0.81828 0.912 0.088 0.000
#> SRR1033088 3 0.0983 0.86004 0.004 0.016 0.980
#> SRR1033089 2 0.4887 0.60912 0.000 0.772 0.228
#> SRR1033090 2 0.4269 0.75982 0.052 0.872 0.076
#> SRR1033091 3 0.3340 0.81442 0.000 0.120 0.880
#> SRR1033092 1 0.2066 0.82640 0.940 0.060 0.000
#> SRR1033093 3 0.4540 0.82684 0.028 0.124 0.848
#> SRR1033094 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033095 3 0.3755 0.83500 0.008 0.120 0.872
#> SRR1033096 2 0.6075 0.47323 0.008 0.676 0.316
#> SRR1033097 3 0.4891 0.82192 0.040 0.124 0.836
#> SRR1033098 3 0.1399 0.85806 0.004 0.028 0.968
#> SRR1033099 3 0.5105 0.81790 0.048 0.124 0.828
#> SRR1033100 3 0.3644 0.83482 0.004 0.124 0.872
#> SRR1033101 3 0.5591 0.59828 0.000 0.304 0.696
#> SRR1033102 1 0.4887 0.72107 0.772 0.228 0.000
#> SRR1033103 1 0.1031 0.82011 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033104 3 0.2625 0.83880 0.000 0.084 0.916
#> SRR1033105 1 0.1529 0.82413 0.960 0.040 0.000
#> SRR1033106 1 0.2066 0.82311 0.940 0.060 0.000
#> SRR1033107 2 0.6386 0.18803 0.004 0.584 0.412
#> SRR1033108 2 0.6280 0.17983 0.460 0.540 0.000
#> SRR1033109 1 0.2261 0.82575 0.932 0.068 0.000
#> SRR1033110 3 0.2599 0.84985 0.052 0.016 0.932
#> SRR1033111 1 0.1753 0.82487 0.952 0.048 0.000
#> SRR1033112 1 0.0892 0.81881 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033113 3 0.2200 0.84980 0.056 0.004 0.940
#> SRR1033114 1 0.1753 0.82592 0.952 0.048 0.000
#> SRR1033115 1 0.1643 0.81937 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033116 2 0.5291 0.54392 0.000 0.732 0.268
#> SRR1033117 3 0.0747 0.86027 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033118 2 0.5325 0.57940 0.004 0.748 0.248
#> SRR1033119 1 0.2356 0.81905 0.928 0.072 0.000
#> SRR1033121 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033120 1 0.4209 0.69644 0.860 0.120 0.020
#> SRR1033122 2 0.6442 0.16966 0.004 0.564 0.432
#> SRR1033123 1 0.0237 0.81051 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033124 1 0.1643 0.82318 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033125 1 0.5564 0.65853 0.808 0.128 0.064
#> SRR1033126 1 0.0747 0.81730 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033127 3 0.6244 0.28859 0.000 0.440 0.560
#> SRR1033129 3 0.4784 0.73690 0.004 0.200 0.796
#> SRR1033128 1 0.0424 0.80800 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033130 1 0.3038 0.81092 0.896 0.104 0.000
#> SRR1033131 1 0.0892 0.81909 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033132 3 0.6919 0.20626 0.448 0.016 0.536
#> SRR1033133 1 0.5339 0.69418 0.824 0.096 0.080
#> SRR1033134 1 0.5098 0.69425 0.752 0.248 0.000
#> SRR1033135 3 0.1267 0.85887 0.024 0.004 0.972
#> SRR1033136 1 0.0892 0.81613 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033137 3 0.2945 0.83493 0.088 0.004 0.908
#> SRR1033139 1 0.8345 0.23658 0.560 0.096 0.344
#> SRR1033138 1 0.1753 0.77621 0.952 0.048 0.000
#> SRR1033140 3 0.0829 0.86014 0.004 0.012 0.984
#> SRR1033141 1 0.5058 0.68222 0.756 0.244 0.000
#> SRR1033142 3 0.0747 0.86011 0.000 0.016 0.984
#> SRR1033143 1 0.4291 0.77016 0.820 0.180 0.000
#> SRR1033144 1 0.0237 0.81161 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033145 3 0.2599 0.84911 0.052 0.016 0.932
#> SRR1033146 1 0.0892 0.79932 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033147 1 0.2796 0.74235 0.908 0.092 0.000
#> SRR1033148 1 0.6286 0.15307 0.536 0.464 0.000
#> SRR1033149 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033150 1 0.1860 0.82378 0.948 0.052 0.000
#> SRR1033151 3 0.6667 0.41863 0.368 0.016 0.616
#> SRR1033152 1 0.3918 0.78726 0.856 0.140 0.004
#> SRR1033153 1 0.3377 0.80725 0.896 0.092 0.012
#> SRR1033154 1 0.0424 0.80336 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033156 3 0.1525 0.85792 0.004 0.032 0.964
#> SRR1033157 1 0.2356 0.81285 0.928 0.072 0.000
#> SRR1033158 3 0.1753 0.85698 0.000 0.048 0.952
#> SRR1033159 3 0.2590 0.84421 0.004 0.072 0.924
#> SRR1033160 3 0.0237 0.86009 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033161 1 0.4974 0.71352 0.764 0.236 0.000
#> SRR1033163 3 0.7300 0.54601 0.272 0.064 0.664
#> SRR1033162 1 0.0424 0.80970 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033164 2 0.4679 0.70823 0.020 0.832 0.148
#> SRR1033165 2 0.4015 0.78700 0.096 0.876 0.028
#> SRR1033166 1 0.0892 0.81955 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033167 1 0.6792 0.58898 0.744 0.124 0.132
#> SRR1033168 3 0.7276 0.66872 0.104 0.192 0.704
#> SRR1033169 1 0.4068 0.69412 0.864 0.120 0.016
#> SRR1033171 3 0.2301 0.84867 0.060 0.004 0.936
#> SRR1033170 1 0.2356 0.82603 0.928 0.072 0.000
#> SRR1033172 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033173 3 0.2165 0.85403 0.000 0.064 0.936
#> SRR1033174 3 0.5109 0.71882 0.008 0.212 0.780
#> SRR1033175 1 0.4002 0.78204 0.840 0.160 0.000
#> SRR1033176 1 0.1031 0.81777 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033177 3 0.3038 0.84318 0.000 0.104 0.896
#> SRR1033178 3 0.3528 0.84634 0.016 0.092 0.892
#> SRR1033179 2 0.3412 0.79560 0.124 0.876 0.000
#> SRR1033180 1 0.3816 0.79615 0.852 0.148 0.000
#> SRR1033181 1 0.1289 0.82019 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033183 3 0.6298 0.42817 0.004 0.388 0.608
#> SRR1033182 1 0.1163 0.82070 0.972 0.028 0.000
#> SRR1033184 3 0.9355 0.23520 0.320 0.188 0.492
#> SRR1033185 1 0.2066 0.82430 0.940 0.060 0.000
#> SRR1033187 1 0.5810 0.52019 0.664 0.336 0.000
#> SRR1033186 1 0.4399 0.75832 0.812 0.188 0.000
#> SRR1033188 2 0.4289 0.74937 0.040 0.868 0.092
#> SRR1033189 3 0.6215 0.31480 0.000 0.428 0.572
#> SRR1033190 1 0.1643 0.82509 0.956 0.044 0.000
#> SRR1033191 1 0.1163 0.82162 0.972 0.028 0.000
#> SRR1033192 1 0.4139 0.69397 0.860 0.124 0.016
#> SRR1033193 1 0.1964 0.82465 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033195 3 0.0000 0.86015 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033194 1 0.3918 0.69744 0.868 0.120 0.012
#> SRR1033197 1 0.1289 0.82275 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033196 1 0.3276 0.80608 0.908 0.068 0.024
#> SRR1033199 3 0.3267 0.83900 0.000 0.116 0.884
#> SRR1033198 1 0.6180 0.30890 0.584 0.416 0.000
#> SRR1033200 2 0.6286 0.17745 0.464 0.536 0.000
#> SRR1033201 3 0.4931 0.72205 0.004 0.212 0.784
#> SRR1033202 2 0.6521 -0.10441 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033203 3 0.1751 0.85909 0.012 0.028 0.960
#> SRR1033204 1 0.3192 0.81239 0.888 0.112 0.000
#> SRR1033205 2 0.5706 0.44583 0.000 0.680 0.320
#> SRR1033206 1 0.2537 0.82263 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033207 1 0.3267 0.81230 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033208 3 0.0661 0.86017 0.004 0.008 0.988
#> SRR1033209 2 0.4915 0.71902 0.036 0.832 0.132
#> SRR1033210 3 0.1647 0.85658 0.004 0.036 0.960
#> SRR1033211 1 0.3267 0.80196 0.884 0.116 0.000
#> SRR1033212 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033213 3 0.2625 0.84900 0.000 0.084 0.916
#> SRR1033214 2 0.6079 0.42466 0.388 0.612 0.000
#> SRR1033216 1 0.2959 0.81714 0.900 0.100 0.000
#> SRR1033215 3 0.2261 0.84391 0.000 0.068 0.932
#> SRR1033217 3 0.5931 0.75583 0.124 0.084 0.792
#> SRR1033218 1 0.1860 0.82469 0.948 0.052 0.000
#> SRR1033219 1 0.2959 0.81712 0.900 0.100 0.000
#> SRR1033221 3 0.4662 0.82619 0.032 0.124 0.844
#> SRR1033220 3 0.4413 0.82858 0.024 0.124 0.852
#> SRR1033222 1 0.4842 0.72328 0.776 0.224 0.000
#> SRR1033223 1 0.7932 0.57604 0.660 0.200 0.140
#> SRR1033225 3 0.0000 0.86015 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033224 2 0.6154 0.36559 0.408 0.592 0.000
#> SRR1033226 1 0.5831 0.61510 0.708 0.284 0.008
#> SRR1033227 3 0.6468 0.25912 0.004 0.444 0.552
#> SRR1033229 3 0.1289 0.85900 0.000 0.032 0.968
#> SRR1033228 1 0.4796 0.73079 0.780 0.220 0.000
#> SRR1033231 3 0.0000 0.86015 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.3038 0.81580 0.896 0.104 0.000
#> SRR1033232 2 0.6452 0.74527 0.152 0.760 0.088
#> SRR1033233 1 0.5138 0.67917 0.748 0.252 0.000
#> SRR1033235 3 0.1964 0.85546 0.000 0.056 0.944
#> SRR1033234 3 0.0661 0.86031 0.008 0.004 0.988
#> SRR1033236 3 0.4692 0.75890 0.012 0.168 0.820
#> SRR1033237 2 0.3879 0.78635 0.152 0.848 0.000
#> SRR1033238 3 0.2096 0.85250 0.004 0.052 0.944
#> SRR1033240 3 0.2301 0.85080 0.004 0.060 0.936
#> SRR1033239 1 0.3816 0.78502 0.852 0.148 0.000
#> SRR1033242 2 0.4805 0.67927 0.012 0.812 0.176
#> SRR1033241 3 0.0475 0.86013 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033244 3 0.4413 0.82871 0.024 0.124 0.852
#> SRR1033243 3 0.5403 0.81384 0.060 0.124 0.816
#> SRR1033245 1 0.8690 0.06916 0.456 0.104 0.440
#> SRR1033246 1 0.2625 0.81923 0.916 0.084 0.000
#> SRR1033248 2 0.6309 0.02385 0.496 0.504 0.000
#> SRR1033247 1 0.2165 0.79648 0.936 0.064 0.000
#> SRR1033249 3 0.2448 0.85118 0.000 0.076 0.924
#> SRR1033250 3 0.3192 0.84029 0.000 0.112 0.888
#> SRR1033251 1 0.0747 0.81730 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033252 3 0.3192 0.84029 0.000 0.112 0.888
#> SRR1033253 1 0.4002 0.78676 0.840 0.160 0.000
#> SRR1033254 1 0.3038 0.81643 0.896 0.104 0.000
#> SRR1033256 3 0.1163 0.85935 0.000 0.028 0.972
#> SRR1033255 3 0.0829 0.86110 0.004 0.012 0.984
#> SRR1033258 1 0.2448 0.82482 0.924 0.076 0.000
#> SRR1033257 2 0.6140 0.38071 0.404 0.596 0.000
#> SRR1033259 1 0.5431 0.64189 0.716 0.284 0.000
#> SRR1033260 3 0.2356 0.85210 0.000 0.072 0.928
#> SRR1033261 3 0.2945 0.83578 0.004 0.088 0.908
#> SRR1033262 3 0.2772 0.83720 0.004 0.080 0.916
#> SRR1033263 3 0.0592 0.86015 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033264 1 0.6140 0.34922 0.596 0.404 0.000
#> SRR1033265 3 0.3038 0.84314 0.000 0.104 0.896
#> SRR1033266 2 0.6026 0.45746 0.376 0.624 0.000
#> SRR1033267 3 0.6448 0.52764 0.016 0.328 0.656
#> SRR1033268 1 0.1964 0.82352 0.944 0.056 0.000
#> SRR1033269 3 0.7607 0.54760 0.280 0.076 0.644
#> SRR1033270 3 0.4002 0.78395 0.000 0.160 0.840
#> SRR1033271 1 0.2625 0.82002 0.916 0.084 0.000
#> SRR1033272 3 0.3116 0.84166 0.000 0.108 0.892
#> SRR1033273 1 0.0747 0.81759 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033274 3 0.0000 0.86015 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033275 2 0.4291 0.76468 0.180 0.820 0.000
#> SRR1033276 3 0.3267 0.83900 0.000 0.116 0.884
#> SRR1033277 2 0.6309 0.03322 0.496 0.504 0.000
#> SRR1033278 2 0.3921 0.79072 0.112 0.872 0.016
#> SRR1033279 1 0.9229 0.30193 0.488 0.164 0.348
#> SRR1033280 3 0.7248 0.57597 0.256 0.068 0.676
#> SRR1033281 1 0.0892 0.81881 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033282 2 0.4399 0.76122 0.188 0.812 0.000
#> SRR1033283 2 0.4399 0.76122 0.188 0.812 0.000
#> SRR1033284 2 0.4399 0.76122 0.188 0.812 0.000
#> SRR1033285 2 0.7641 0.25934 0.436 0.520 0.044
#> SRR1033286 2 0.8120 0.32066 0.396 0.532 0.072
#> SRR1033287 2 0.7571 0.20547 0.452 0.508 0.040
#> SRR1033288 1 0.7584 -0.07283 0.488 0.472 0.040
#> SRR1033289 2 0.8013 0.39812 0.364 0.564 0.072
#> SRR1033290 2 0.8054 0.43893 0.340 0.580 0.080
#> SRR1033291 2 0.6576 0.70055 0.192 0.740 0.068
#> SRR1033292 2 0.6414 0.68326 0.248 0.716 0.036
#> SRR1033293 2 0.6630 0.68928 0.220 0.724 0.056
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.3409 0.7989 0.096 0.008 0.024 0.872
#> SRR1032911 4 0.0657 0.8316 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR1032912 4 0.1191 0.8275 0.004 0.004 0.024 0.968
#> SRR1032913 4 0.0657 0.8320 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1032914 4 0.1743 0.8082 0.004 0.000 0.056 0.940
#> SRR1032915 4 0.0657 0.8320 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1032916 4 0.0657 0.8290 0.004 0.012 0.000 0.984
#> SRR1032917 3 0.4455 0.6873 0.064 0.008 0.820 0.108
#> SRR1032918 4 0.0804 0.8304 0.008 0.012 0.000 0.980
#> SRR1032919 4 0.2466 0.7724 0.004 0.000 0.096 0.900
#> SRR1032920 4 0.2882 0.7837 0.000 0.024 0.084 0.892
#> SRR1032921 4 0.5848 0.5941 0.228 0.088 0.000 0.684
#> SRR1032922 1 0.5869 0.6513 0.704 0.004 0.196 0.096
#> SRR1032923 4 0.0937 0.8314 0.012 0.000 0.012 0.976
#> SRR1032925 2 0.3232 0.6405 0.028 0.888 0.012 0.072
#> SRR1032924 4 0.1545 0.8219 0.008 0.040 0.000 0.952
#> SRR1032926 4 0.4163 0.6087 0.004 0.004 0.220 0.772
#> SRR1032927 4 0.1356 0.8250 0.008 0.032 0.000 0.960
#> SRR1032929 4 0.0657 0.8316 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR1032928 4 0.2466 0.7777 0.004 0.000 0.096 0.900
#> SRR1032930 4 0.0967 0.8290 0.004 0.004 0.016 0.976
#> SRR1032931 2 0.5386 0.3061 0.008 0.636 0.012 0.344
#> SRR1032932 4 0.5244 0.2651 0.008 0.436 0.000 0.556
#> SRR1032933 4 0.2589 0.8127 0.044 0.044 0.000 0.912
#> SRR1032934 4 0.0937 0.8314 0.012 0.000 0.012 0.976
#> SRR1032935 4 0.1798 0.8233 0.016 0.040 0.000 0.944
#> SRR1032936 4 0.5016 0.1828 0.000 0.004 0.396 0.600
#> SRR1032937 2 0.5535 0.3468 0.036 0.672 0.004 0.288
#> SRR1032938 4 0.5118 0.6829 0.176 0.072 0.000 0.752
#> SRR1032939 1 0.5693 0.5584 0.644 0.004 0.036 0.316
#> SRR1032940 4 0.1510 0.8225 0.000 0.016 0.028 0.956
#> SRR1032941 4 0.0564 0.8302 0.004 0.004 0.004 0.988
#> SRR1032942 4 0.8110 0.4189 0.124 0.276 0.064 0.536
#> SRR1032943 2 0.3828 0.6018 0.068 0.848 0.000 0.084
#> SRR1032944 1 0.7323 0.2481 0.456 0.156 0.000 0.388
#> SRR1032945 4 0.0895 0.8269 0.004 0.020 0.000 0.976
#> SRR1032946 4 0.2644 0.8132 0.060 0.032 0.000 0.908
#> SRR1032947 4 0.4313 0.5219 0.000 0.004 0.260 0.736
#> SRR1032948 4 0.0895 0.8275 0.004 0.020 0.000 0.976
#> SRR1032949 2 0.5062 0.3559 0.020 0.680 0.000 0.300
#> SRR1032950 1 0.7040 0.5736 0.580 0.004 0.152 0.264
#> SRR1032951 4 0.1545 0.8217 0.008 0.040 0.000 0.952
#> SRR1032952 4 0.1635 0.8200 0.008 0.000 0.044 0.948
#> SRR1032953 4 0.2443 0.8080 0.024 0.060 0.000 0.916
#> SRR1032954 4 0.1109 0.8310 0.028 0.004 0.000 0.968
#> SRR1032955 2 0.2631 0.6509 0.016 0.912 0.008 0.064
#> SRR1032957 4 0.0376 0.8300 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1032956 4 0.4872 0.7189 0.148 0.076 0.000 0.776
#> SRR1032958 4 0.0524 0.8308 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1032959 4 0.1936 0.8233 0.028 0.032 0.000 0.940
#> SRR1032960 4 0.1890 0.8117 0.008 0.000 0.056 0.936
#> SRR1032961 4 0.4586 0.7391 0.136 0.068 0.000 0.796
#> SRR1032962 1 0.5337 0.1565 0.564 0.012 0.424 0.000
#> SRR1032963 4 0.1022 0.8201 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1032964 4 0.0469 0.8267 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032965 4 0.1042 0.8289 0.008 0.020 0.000 0.972
#> SRR1032966 4 0.0657 0.8292 0.004 0.012 0.000 0.984
#> SRR1032967 4 0.6035 0.6670 0.104 0.084 0.064 0.748
#> SRR1032968 4 0.1118 0.8184 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1032969 4 0.1388 0.8223 0.000 0.012 0.028 0.960
#> SRR1032970 4 0.0844 0.8300 0.004 0.004 0.012 0.980
#> SRR1032971 4 0.1004 0.8256 0.000 0.004 0.024 0.972
#> SRR1032972 4 0.1191 0.8267 0.004 0.004 0.024 0.968
#> SRR1032973 4 0.2345 0.7646 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1032974 4 0.2840 0.8102 0.056 0.044 0.000 0.900
#> SRR1032975 4 0.0524 0.8298 0.004 0.008 0.000 0.988
#> SRR1032976 4 0.2675 0.8162 0.048 0.000 0.044 0.908
#> SRR1032977 2 0.6860 0.1858 0.100 0.544 0.004 0.352
#> SRR1032978 1 0.7375 0.3655 0.488 0.176 0.000 0.336
#> SRR1032979 2 0.6330 0.6175 0.008 0.672 0.112 0.208
#> SRR1032980 4 0.0524 0.8281 0.000 0.008 0.004 0.988
#> SRR1032981 4 0.1059 0.8261 0.000 0.012 0.016 0.972
#> SRR1032982 4 0.0844 0.8300 0.004 0.004 0.012 0.980
#> SRR1032983 4 0.4761 0.3857 0.000 0.004 0.332 0.664
#> SRR1032984 4 0.0592 0.8257 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1032985 4 0.1661 0.8141 0.004 0.052 0.000 0.944
#> SRR1032986 4 0.0804 0.8318 0.012 0.000 0.008 0.980
#> SRR1032987 2 0.5457 0.6748 0.004 0.748 0.116 0.132
#> SRR1032988 4 0.1284 0.8282 0.012 0.024 0.000 0.964
#> SRR1032990 3 0.6786 0.5882 0.132 0.004 0.608 0.256
#> SRR1032989 4 0.0927 0.8294 0.008 0.016 0.000 0.976
#> SRR1032991 2 0.4939 0.5860 0.016 0.772 0.032 0.180
#> SRR1032992 3 0.7398 0.5161 0.256 0.004 0.540 0.200
#> SRR1032993 4 0.1114 0.8291 0.004 0.008 0.016 0.972
#> SRR1032994 4 0.7434 0.1895 0.360 0.012 0.128 0.500
#> SRR1032995 4 0.2644 0.8134 0.060 0.032 0.000 0.908
#> SRR1032996 4 0.0927 0.8322 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR1032997 4 0.0376 0.8300 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1032998 4 0.1174 0.8305 0.012 0.000 0.020 0.968
#> SRR1032999 4 0.4642 0.6454 0.020 0.240 0.000 0.740
#> SRR1033000 2 0.6750 0.1655 0.104 0.540 0.000 0.356
#> SRR1033001 4 0.2521 0.8085 0.020 0.004 0.060 0.916
#> SRR1033002 4 0.5170 0.4618 0.324 0.008 0.008 0.660
#> SRR1033003 2 0.4043 0.6161 0.052 0.848 0.012 0.088
#> SRR1033004 2 0.5350 0.6790 0.016 0.772 0.104 0.108
#> SRR1033005 4 0.1114 0.8292 0.004 0.008 0.016 0.972
#> SRR1033006 3 0.5353 0.3632 0.000 0.012 0.556 0.432
#> SRR1033007 4 0.5355 0.1211 0.008 0.004 0.408 0.580
#> SRR1033008 1 0.4729 0.8037 0.820 0.032 0.060 0.088
#> SRR1033009 4 0.5065 0.5692 0.268 0.016 0.008 0.708
#> SRR1033010 3 0.5508 0.2456 0.000 0.016 0.508 0.476
#> SRR1033011 2 0.5108 0.7851 0.020 0.672 0.308 0.000
#> SRR1033012 1 0.2418 0.8122 0.928 0.016 0.032 0.024
#> SRR1033013 3 0.4508 0.6607 0.012 0.028 0.800 0.160
#> SRR1033014 3 0.4944 0.6891 0.128 0.008 0.788 0.076
#> SRR1033015 3 0.4920 0.4649 0.368 0.000 0.628 0.004
#> SRR1033016 2 0.5108 0.7852 0.020 0.672 0.308 0.000
#> SRR1033017 2 0.5228 0.7847 0.024 0.664 0.312 0.000
#> SRR1033018 3 0.4545 0.5643 0.004 0.096 0.812 0.088
#> SRR1033019 3 0.2676 0.5598 0.012 0.092 0.896 0.000
#> SRR1033020 1 0.3435 0.7903 0.864 0.000 0.100 0.036
#> SRR1033021 4 0.6669 0.0078 0.076 0.004 0.400 0.520
#> SRR1033023 1 0.2929 0.8131 0.908 0.024 0.040 0.028
#> SRR1033022 1 0.1911 0.8094 0.944 0.004 0.032 0.020
#> SRR1033024 3 0.3959 0.6204 0.000 0.068 0.840 0.092
#> SRR1033025 1 0.3941 0.7903 0.844 0.004 0.104 0.048
#> SRR1033026 3 0.3168 0.6209 0.000 0.056 0.884 0.060
#> SRR1033027 2 0.5152 0.7828 0.020 0.664 0.316 0.000
#> SRR1033028 4 0.4925 0.0576 0.000 0.000 0.428 0.572
#> SRR1033029 4 0.8483 0.1600 0.312 0.216 0.036 0.436
#> SRR1033030 3 0.2053 0.5693 0.004 0.072 0.924 0.000
#> SRR1033031 1 0.4364 0.7594 0.808 0.136 0.000 0.056
#> SRR1033032 3 0.6344 0.6435 0.208 0.004 0.664 0.124
#> SRR1033033 2 0.5085 0.7858 0.020 0.676 0.304 0.000
#> SRR1033035 2 0.5157 0.7867 0.028 0.688 0.284 0.000
#> SRR1033034 1 0.6580 0.6221 0.632 0.172 0.000 0.196
#> SRR1033036 1 0.1661 0.7996 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1033037 1 0.6447 0.1871 0.484 0.068 0.000 0.448
#> SRR1033038 1 0.6039 0.6777 0.684 0.188 0.000 0.128
#> SRR1033039 3 0.2907 0.6519 0.064 0.032 0.900 0.004
#> SRR1033040 1 0.5628 0.4670 0.644 0.004 0.320 0.032
#> SRR1033041 1 0.2089 0.8067 0.932 0.000 0.048 0.020
#> SRR1033042 1 0.3219 0.7786 0.868 0.112 0.000 0.020
#> SRR1033043 1 0.6559 0.1653 0.480 0.064 0.004 0.452
#> SRR1033044 4 0.6153 0.3790 0.328 0.068 0.000 0.604
#> SRR1033045 3 0.5691 0.5812 0.000 0.048 0.648 0.304
#> SRR1033046 3 0.6605 0.6328 0.212 0.004 0.640 0.144
#> SRR1033047 3 0.4172 0.6837 0.092 0.020 0.844 0.044
#> SRR1033048 4 0.7747 -0.0413 0.384 0.000 0.232 0.384
#> SRR1033049 1 0.5574 0.7191 0.728 0.148 0.000 0.124
#> SRR1033051 4 0.5614 0.3995 0.336 0.036 0.000 0.628
#> SRR1033052 1 0.4570 0.7696 0.804 0.132 0.004 0.060
#> SRR1033053 2 0.5420 0.7819 0.044 0.684 0.272 0.000
#> SRR1033054 3 0.5571 0.5583 0.312 0.016 0.656 0.016
#> SRR1033050 1 0.6795 0.5656 0.612 0.056 0.036 0.296
#> SRR1033055 3 0.3677 0.6708 0.148 0.008 0.836 0.008
#> SRR1033056 1 0.7681 0.3024 0.488 0.004 0.284 0.224
#> SRR1033057 1 0.3392 0.7719 0.856 0.124 0.000 0.020
#> SRR1033058 3 0.3266 0.6575 0.084 0.032 0.880 0.004
#> SRR1033059 2 0.5222 0.7862 0.032 0.688 0.280 0.000
#> SRR1033060 1 0.3958 0.7835 0.844 0.116 0.016 0.024
#> SRR1033061 2 0.5889 0.7257 0.100 0.688 0.212 0.000
#> SRR1033062 3 0.3999 0.6516 0.000 0.036 0.824 0.140
#> SRR1033063 2 0.5195 0.7859 0.032 0.692 0.276 0.000
#> SRR1033064 3 0.3037 0.6622 0.100 0.020 0.880 0.000
#> SRR1033065 1 0.2894 0.7996 0.900 0.072 0.020 0.008
#> SRR1033066 1 0.2977 0.8067 0.904 0.052 0.024 0.020
#> SRR1033067 4 0.6240 -0.0381 0.452 0.044 0.004 0.500
#> SRR1033068 3 0.5153 0.6395 0.176 0.056 0.760 0.008
#> SRR1033069 1 0.3710 0.6999 0.804 0.004 0.192 0.000
#> SRR1033070 3 0.5364 0.6456 0.228 0.036 0.724 0.012
#> SRR1033071 2 0.5222 0.7862 0.032 0.688 0.280 0.000
#> SRR1033072 3 0.5513 0.4351 0.384 0.016 0.596 0.004
#> SRR1033073 3 0.3219 0.4336 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1033074 4 0.3907 0.7507 0.140 0.032 0.000 0.828
#> SRR1033075 1 0.7038 0.1981 0.476 0.004 0.104 0.416
#> SRR1033076 1 0.5263 0.1071 0.544 0.000 0.448 0.008
#> SRR1033077 1 0.6287 0.6488 0.660 0.020 0.060 0.260
#> SRR1033078 1 0.5985 0.6875 0.692 0.140 0.000 0.168
#> SRR1033079 3 0.2644 0.6250 0.008 0.044 0.916 0.032
#> SRR1033080 3 0.3821 0.5419 0.000 0.120 0.840 0.040
#> SRR1033081 1 0.3821 0.7775 0.840 0.000 0.120 0.040
#> SRR1033082 1 0.1943 0.8130 0.944 0.016 0.008 0.032
#> SRR1033083 3 0.3216 0.6697 0.124 0.008 0.864 0.004
#> SRR1033084 1 0.2353 0.8123 0.924 0.012 0.008 0.056
#> SRR1033085 3 0.5900 0.5857 0.000 0.096 0.684 0.220
#> SRR1033086 2 0.5359 0.7861 0.036 0.676 0.288 0.000
#> SRR1033087 1 0.4875 0.7426 0.772 0.160 0.000 0.068
#> SRR1033088 3 0.2926 0.6225 0.048 0.056 0.896 0.000
#> SRR1033089 3 0.5155 0.2757 0.000 0.004 0.528 0.468
#> SRR1033090 4 0.2868 0.7302 0.000 0.000 0.136 0.864
#> SRR1033091 3 0.3761 0.6187 0.000 0.068 0.852 0.080
#> SRR1033092 1 0.3659 0.8071 0.868 0.032 0.016 0.084
#> SRR1033093 2 0.5062 0.7862 0.020 0.680 0.300 0.000
#> SRR1033094 3 0.2984 0.5870 0.028 0.084 0.888 0.000
#> SRR1033095 2 0.4477 0.7832 0.000 0.688 0.312 0.000
#> SRR1033096 3 0.6313 0.5708 0.048 0.020 0.632 0.300
#> SRR1033097 2 0.5497 0.7845 0.044 0.672 0.284 0.000
#> SRR1033098 3 0.3218 0.6407 0.028 0.044 0.896 0.032
#> SRR1033099 2 0.5282 0.7850 0.036 0.688 0.276 0.000
#> SRR1033100 2 0.5173 0.7814 0.020 0.660 0.320 0.000
#> SRR1033101 3 0.5537 0.5923 0.000 0.056 0.688 0.256
#> SRR1033102 1 0.6052 0.7072 0.696 0.004 0.124 0.176
#> SRR1033103 1 0.2297 0.8115 0.932 0.024 0.012 0.032
#> SRR1033104 3 0.4542 0.6041 0.000 0.088 0.804 0.108
#> SRR1033105 1 0.2310 0.8103 0.928 0.004 0.040 0.028
#> SRR1033106 1 0.2742 0.7969 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1033107 3 0.5577 0.5452 0.000 0.036 0.636 0.328
#> SRR1033108 4 0.3587 0.7838 0.104 0.040 0.000 0.856
#> SRR1033109 1 0.3027 0.8129 0.904 0.032 0.024 0.040
#> SRR1033110 3 0.4571 0.6261 0.252 0.004 0.736 0.008
#> SRR1033111 1 0.3204 0.8086 0.892 0.016 0.064 0.028
#> SRR1033112 1 0.2107 0.8091 0.940 0.020 0.024 0.016
#> SRR1033113 3 0.5190 0.6457 0.244 0.008 0.720 0.028
#> SRR1033114 1 0.4345 0.8066 0.840 0.080 0.028 0.052
#> SRR1033115 1 0.3638 0.7741 0.848 0.120 0.000 0.032
#> SRR1033116 3 0.5526 0.3842 0.000 0.020 0.564 0.416
#> SRR1033117 3 0.2221 0.6163 0.008 0.044 0.932 0.016
#> SRR1033118 3 0.5889 0.5773 0.040 0.008 0.640 0.312
#> SRR1033119 1 0.4199 0.7700 0.824 0.128 0.004 0.044
#> SRR1033121 3 0.2489 0.5961 0.020 0.068 0.912 0.000
#> SRR1033120 1 0.2363 0.7888 0.920 0.056 0.024 0.000
#> SRR1033122 3 0.5543 0.5789 0.004 0.032 0.660 0.304
#> SRR1033123 1 0.2113 0.8095 0.940 0.020 0.020 0.020
#> SRR1033124 1 0.2797 0.8141 0.912 0.016 0.028 0.044
#> SRR1033125 1 0.2918 0.7663 0.876 0.008 0.116 0.000
#> SRR1033126 1 0.2307 0.8074 0.928 0.008 0.048 0.016
#> SRR1033127 3 0.5180 0.6112 0.000 0.064 0.740 0.196
#> SRR1033129 3 0.4426 0.6634 0.016 0.032 0.816 0.136
#> SRR1033128 1 0.3246 0.7770 0.868 0.116 0.008 0.008
#> SRR1033130 1 0.3734 0.7856 0.848 0.000 0.108 0.044
#> SRR1033131 1 0.1743 0.7994 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1033132 1 0.5033 0.4605 0.664 0.008 0.324 0.004
#> SRR1033133 1 0.2859 0.7708 0.880 0.008 0.112 0.000
#> SRR1033134 1 0.6659 0.3902 0.544 0.080 0.004 0.372
#> SRR1033135 3 0.3768 0.6615 0.184 0.008 0.808 0.000
#> SRR1033136 1 0.2256 0.8049 0.924 0.000 0.056 0.020
#> SRR1033137 3 0.4713 0.5855 0.292 0.004 0.700 0.004
#> SRR1033139 1 0.4319 0.6491 0.760 0.012 0.228 0.000
#> SRR1033138 1 0.2060 0.7993 0.932 0.052 0.016 0.000
#> SRR1033140 3 0.3730 0.6689 0.144 0.016 0.836 0.004
#> SRR1033141 1 0.4882 0.7643 0.788 0.004 0.124 0.084
#> SRR1033142 2 0.4972 0.6559 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR1033143 1 0.5938 0.6670 0.696 0.052 0.020 0.232
#> SRR1033144 1 0.2287 0.8019 0.924 0.004 0.060 0.012
#> SRR1033145 3 0.4458 0.6576 0.208 0.008 0.772 0.012
#> SRR1033146 1 0.2310 0.7952 0.920 0.068 0.004 0.008
#> SRR1033147 1 0.2546 0.7809 0.900 0.008 0.092 0.000
#> SRR1033148 4 0.4289 0.7116 0.172 0.032 0.000 0.796
#> SRR1033149 3 0.3491 0.6625 0.104 0.028 0.864 0.004
#> SRR1033150 1 0.2198 0.7973 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1033151 1 0.5112 0.1333 0.560 0.000 0.436 0.004
#> SRR1033152 1 0.3597 0.7507 0.836 0.000 0.148 0.016
#> SRR1033153 1 0.3074 0.7466 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1033154 1 0.0779 0.8040 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033156 3 0.3213 0.6480 0.040 0.040 0.896 0.024
#> SRR1033157 1 0.5352 0.7251 0.740 0.168 0.000 0.092
#> SRR1033158 3 0.5497 -0.5193 0.016 0.460 0.524 0.000
#> SRR1033159 3 0.4254 0.6129 0.004 0.064 0.828 0.104
#> SRR1033160 3 0.3142 0.4999 0.008 0.132 0.860 0.000
#> SRR1033161 1 0.6752 0.5607 0.608 0.024 0.068 0.300
#> SRR1033163 3 0.5975 0.3018 0.428 0.016 0.540 0.016
#> SRR1033162 1 0.2402 0.7969 0.912 0.000 0.076 0.012
#> SRR1033164 3 0.6468 0.4932 0.072 0.004 0.576 0.348
#> SRR1033165 4 0.5013 0.3180 0.004 0.004 0.348 0.644
#> SRR1033166 1 0.2542 0.7937 0.904 0.000 0.084 0.012
#> SRR1033167 2 0.5755 0.3489 0.332 0.624 0.044 0.000
#> SRR1033168 3 0.5552 0.6283 0.244 0.004 0.700 0.052
#> SRR1033169 1 0.2522 0.7860 0.908 0.076 0.016 0.000
#> SRR1033171 3 0.5452 0.4964 0.360 0.024 0.616 0.000
#> SRR1033170 1 0.2908 0.8065 0.896 0.000 0.064 0.040
#> SRR1033172 3 0.3351 0.6669 0.148 0.008 0.844 0.000
#> SRR1033173 2 0.4804 0.7449 0.000 0.616 0.384 0.000
#> SRR1033174 3 0.5173 0.6883 0.132 0.004 0.768 0.096
#> SRR1033175 1 0.6405 0.6427 0.660 0.132 0.004 0.204
#> SRR1033176 1 0.2676 0.7902 0.896 0.000 0.092 0.012
#> SRR1033177 2 0.4761 0.7536 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR1033178 2 0.5150 0.7283 0.008 0.596 0.396 0.000
#> SRR1033179 4 0.2115 0.8229 0.024 0.004 0.036 0.936
#> SRR1033180 1 0.4265 0.8034 0.840 0.016 0.068 0.076
#> SRR1033181 1 0.2412 0.7920 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR1033183 3 0.5877 0.5908 0.000 0.068 0.656 0.276
#> SRR1033182 1 0.2820 0.8004 0.904 0.068 0.020 0.008
#> SRR1033184 3 0.5971 0.3126 0.420 0.004 0.544 0.032
#> SRR1033185 1 0.3670 0.7959 0.860 0.004 0.092 0.044
#> SRR1033187 1 0.4462 0.7600 0.804 0.000 0.132 0.064
#> SRR1033186 1 0.5824 0.7203 0.724 0.076 0.016 0.184
#> SRR1033188 4 0.5321 -0.0970 0.004 0.004 0.464 0.528
#> SRR1033189 3 0.5710 0.5835 0.000 0.100 0.708 0.192
#> SRR1033190 1 0.3984 0.7683 0.828 0.132 0.000 0.040
#> SRR1033191 1 0.2165 0.8111 0.936 0.008 0.032 0.024
#> SRR1033192 1 0.2101 0.7917 0.928 0.012 0.060 0.000
#> SRR1033193 1 0.3082 0.7965 0.884 0.000 0.084 0.032
#> SRR1033195 3 0.4040 0.2397 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1033194 1 0.3217 0.7593 0.860 0.128 0.012 0.000
#> SRR1033197 1 0.2456 0.8125 0.924 0.008 0.040 0.028
#> SRR1033196 1 0.2647 0.7701 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1033199 2 0.4535 0.7788 0.000 0.704 0.292 0.004
#> SRR1033198 4 0.7144 0.1110 0.388 0.020 0.080 0.512
#> SRR1033200 4 0.5821 0.6334 0.212 0.040 0.032 0.716
#> SRR1033201 3 0.4518 0.6699 0.024 0.036 0.820 0.120
#> SRR1033202 3 0.5634 0.5903 0.008 0.032 0.664 0.296
#> SRR1033203 3 0.4413 0.6805 0.152 0.012 0.808 0.028
#> SRR1033204 1 0.3543 0.8047 0.868 0.008 0.032 0.092
#> SRR1033205 3 0.5699 0.4647 0.000 0.032 0.588 0.380
#> SRR1033206 1 0.3574 0.8075 0.872 0.008 0.064 0.056
#> SRR1033207 1 0.5588 0.7899 0.772 0.064 0.052 0.112
#> SRR1033208 3 0.3626 0.6764 0.136 0.004 0.844 0.016
#> SRR1033209 3 0.6449 0.4716 0.068 0.004 0.568 0.360
#> SRR1033210 3 0.4126 0.6810 0.088 0.024 0.848 0.040
#> SRR1033211 1 0.3659 0.7636 0.840 0.000 0.136 0.024
#> SRR1033212 3 0.2699 0.6518 0.068 0.028 0.904 0.000
#> SRR1033213 2 0.4925 0.6975 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1033214 4 0.2542 0.8075 0.084 0.012 0.000 0.904
#> SRR1033216 1 0.3795 0.7960 0.856 0.080 0.004 0.060
#> SRR1033215 3 0.4259 0.5324 0.000 0.128 0.816 0.056
#> SRR1033217 3 0.5062 0.5843 0.284 0.000 0.692 0.024
#> SRR1033218 1 0.2500 0.8104 0.916 0.000 0.040 0.044
#> SRR1033219 1 0.5724 0.7099 0.716 0.140 0.000 0.144
#> SRR1033221 2 0.3764 0.7503 0.000 0.816 0.172 0.012
#> SRR1033220 2 0.4268 0.7736 0.004 0.760 0.232 0.004
#> SRR1033222 1 0.6999 0.4894 0.564 0.128 0.004 0.304
#> SRR1033223 1 0.5062 0.5198 0.680 0.000 0.300 0.020
#> SRR1033225 3 0.4103 0.2118 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1033224 4 0.3292 0.7857 0.112 0.004 0.016 0.868
#> SRR1033226 1 0.4267 0.7064 0.788 0.000 0.188 0.024
#> SRR1033227 3 0.4944 0.6387 0.004 0.032 0.744 0.220
#> SRR1033229 2 0.4961 0.6690 0.000 0.552 0.448 0.000
#> SRR1033228 1 0.7106 0.4281 0.528 0.148 0.000 0.324
#> SRR1033231 3 0.4356 0.0934 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1033230 1 0.4142 0.7900 0.836 0.092 0.004 0.068
#> SRR1033232 3 0.6990 0.5214 0.124 0.004 0.560 0.312
#> SRR1033233 1 0.6650 0.1812 0.484 0.084 0.000 0.432
#> SRR1033235 2 0.4961 0.6701 0.000 0.552 0.448 0.000
#> SRR1033234 3 0.4212 0.6656 0.104 0.048 0.836 0.012
#> SRR1033236 3 0.5924 0.6695 0.068 0.036 0.736 0.160
#> SRR1033237 4 0.2300 0.8225 0.048 0.000 0.028 0.924
#> SRR1033238 3 0.2731 0.6295 0.008 0.048 0.912 0.032
#> SRR1033240 3 0.4608 0.5879 0.000 0.096 0.800 0.104
#> SRR1033239 1 0.2596 0.8013 0.908 0.000 0.068 0.024
#> SRR1033242 3 0.5614 0.4625 0.020 0.004 0.592 0.384
#> SRR1033241 3 0.2473 0.5757 0.012 0.080 0.908 0.000
#> SRR1033244 2 0.4164 0.7795 0.000 0.736 0.264 0.000
#> SRR1033243 2 0.3774 0.7513 0.008 0.820 0.168 0.004
#> SRR1033245 1 0.5237 0.4070 0.628 0.000 0.356 0.016
#> SRR1033246 1 0.4804 0.7479 0.780 0.148 0.000 0.072
#> SRR1033248 4 0.5345 0.5218 0.292 0.016 0.012 0.680
#> SRR1033247 1 0.4959 0.7122 0.752 0.196 0.000 0.052
#> SRR1033249 2 0.4916 0.7030 0.000 0.576 0.424 0.000
#> SRR1033250 2 0.4713 0.7616 0.000 0.640 0.360 0.000
#> SRR1033251 1 0.1854 0.8089 0.948 0.008 0.024 0.020
#> SRR1033252 2 0.4830 0.7372 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1033253 1 0.5875 0.7212 0.720 0.020 0.068 0.192
#> SRR1033254 1 0.4287 0.7892 0.828 0.088 0.004 0.080
#> SRR1033256 2 0.4989 0.6274 0.000 0.528 0.472 0.000
#> SRR1033255 3 0.4196 0.6461 0.048 0.052 0.852 0.048
#> SRR1033258 1 0.3993 0.7914 0.844 0.092 0.004 0.060
#> SRR1033257 4 0.2882 0.8050 0.084 0.024 0.000 0.892
#> SRR1033259 1 0.6655 0.1848 0.476 0.084 0.000 0.440
#> SRR1033260 2 0.4972 0.6557 0.000 0.544 0.456 0.000
#> SRR1033261 3 0.3885 0.6291 0.000 0.064 0.844 0.092
#> SRR1033262 3 0.3174 0.6314 0.008 0.052 0.892 0.048
#> SRR1033263 3 0.4985 -0.5067 0.000 0.468 0.532 0.000
#> SRR1033264 4 0.4852 0.7189 0.152 0.072 0.000 0.776
#> SRR1033265 2 0.4679 0.7638 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1033266 4 0.6399 0.2835 0.364 0.004 0.064 0.568
#> SRR1033267 3 0.5758 0.6846 0.164 0.024 0.740 0.072
#> SRR1033268 1 0.3734 0.7832 0.848 0.108 0.000 0.044
#> SRR1033269 3 0.5643 0.2636 0.440 0.004 0.540 0.016
#> SRR1033270 3 0.5499 0.5973 0.000 0.072 0.712 0.216
#> SRR1033271 1 0.3767 0.8035 0.860 0.008 0.048 0.084
#> SRR1033272 2 0.4898 0.7128 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1033273 1 0.1706 0.8077 0.948 0.000 0.036 0.016
#> SRR1033274 3 0.3801 0.3119 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1033275 4 0.1297 0.8302 0.020 0.016 0.000 0.964
#> SRR1033276 2 0.4584 0.7790 0.000 0.696 0.300 0.004
#> SRR1033277 4 0.3495 0.7596 0.140 0.016 0.000 0.844
#> SRR1033278 4 0.4560 0.4521 0.004 0.000 0.296 0.700
#> SRR1033279 1 0.5760 0.0224 0.520 0.004 0.456 0.020
#> SRR1033280 3 0.5632 0.3189 0.420 0.008 0.560 0.012
#> SRR1033281 1 0.2165 0.8082 0.936 0.032 0.008 0.024
#> SRR1033282 4 0.3732 0.7876 0.092 0.000 0.056 0.852
#> SRR1033283 4 0.3156 0.8053 0.068 0.000 0.048 0.884
#> SRR1033284 4 0.3453 0.7969 0.080 0.000 0.052 0.868
#> SRR1033285 3 0.6699 0.3666 0.388 0.004 0.528 0.080
#> SRR1033286 3 0.6654 0.4468 0.352 0.004 0.560 0.084
#> SRR1033287 3 0.6620 0.3293 0.404 0.004 0.520 0.072
#> SRR1033288 3 0.6548 0.2409 0.436 0.004 0.496 0.064
#> SRR1033289 3 0.6666 0.4686 0.340 0.004 0.568 0.088
#> SRR1033290 3 0.6688 0.4830 0.332 0.004 0.572 0.092
#> SRR1033291 3 0.6713 0.6062 0.232 0.004 0.624 0.140
#> SRR1033292 3 0.6847 0.5802 0.252 0.004 0.604 0.140
#> SRR1033293 3 0.6725 0.5983 0.240 0.004 0.620 0.136
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.3966 0.74819 0.048 0.000 0.024 0.820 0.108
#> SRR1032911 4 0.1082 0.78491 0.000 0.000 0.008 0.964 0.028
#> SRR1032912 4 0.2278 0.78336 0.000 0.000 0.032 0.908 0.060
#> SRR1032913 4 0.1399 0.78726 0.000 0.000 0.020 0.952 0.028
#> SRR1032914 4 0.3169 0.76474 0.000 0.000 0.060 0.856 0.084
#> SRR1032915 4 0.1386 0.78662 0.000 0.000 0.016 0.952 0.032
#> SRR1032916 4 0.2921 0.74551 0.000 0.004 0.004 0.844 0.148
#> SRR1032917 3 0.3478 0.69360 0.004 0.064 0.860 0.052 0.020
#> SRR1032918 4 0.0992 0.78533 0.000 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1032919 4 0.3479 0.74804 0.000 0.000 0.084 0.836 0.080
#> SRR1032920 4 0.6523 0.41310 0.020 0.004 0.132 0.560 0.284
#> SRR1032921 4 0.5663 0.53847 0.208 0.008 0.000 0.652 0.132
#> SRR1032922 1 0.6950 0.53288 0.536 0.004 0.216 0.028 0.216
#> SRR1032923 4 0.1830 0.78349 0.000 0.000 0.028 0.932 0.040
#> SRR1032925 5 0.5324 0.58621 0.004 0.448 0.004 0.032 0.512
#> SRR1032924 4 0.1764 0.77766 0.008 0.000 0.000 0.928 0.064
#> SRR1032926 4 0.3321 0.70984 0.000 0.000 0.136 0.832 0.032
#> SRR1032927 4 0.1430 0.77850 0.004 0.000 0.000 0.944 0.052
#> SRR1032929 4 0.1153 0.78548 0.004 0.000 0.008 0.964 0.024
#> SRR1032928 4 0.2554 0.76045 0.000 0.000 0.072 0.892 0.036
#> SRR1032930 4 0.2054 0.78252 0.000 0.000 0.028 0.920 0.052
#> SRR1032931 5 0.5745 0.62606 0.004 0.376 0.000 0.080 0.540
#> SRR1032932 4 0.6684 0.12227 0.008 0.224 0.000 0.496 0.272
#> SRR1032933 4 0.1894 0.77392 0.008 0.000 0.000 0.920 0.072
#> SRR1032934 4 0.2426 0.78250 0.000 0.000 0.036 0.900 0.064
#> SRR1032935 4 0.2011 0.76931 0.004 0.000 0.000 0.908 0.088
#> SRR1032936 4 0.5191 0.09128 0.004 0.000 0.408 0.552 0.036
#> SRR1032937 5 0.6039 0.62572 0.012 0.372 0.000 0.088 0.528
#> SRR1032938 4 0.5006 0.59432 0.180 0.000 0.000 0.704 0.116
#> SRR1032939 1 0.5993 0.65118 0.680 0.000 0.080 0.152 0.088
#> SRR1032940 4 0.3412 0.74269 0.000 0.000 0.028 0.820 0.152
#> SRR1032941 4 0.1818 0.78358 0.000 0.000 0.024 0.932 0.044
#> SRR1032942 5 0.7514 0.08132 0.152 0.012 0.048 0.332 0.456
#> SRR1032943 5 0.5577 0.61330 0.012 0.444 0.000 0.044 0.500
#> SRR1032944 1 0.5945 0.47089 0.584 0.004 0.000 0.284 0.128
#> SRR1032945 4 0.2305 0.77822 0.000 0.000 0.012 0.896 0.092
#> SRR1032946 4 0.1492 0.78255 0.008 0.000 0.004 0.948 0.040
#> SRR1032947 4 0.4269 0.65587 0.000 0.000 0.188 0.756 0.056
#> SRR1032948 4 0.1851 0.77370 0.000 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1032949 5 0.6152 0.59591 0.008 0.356 0.000 0.112 0.524
#> SRR1032950 1 0.7819 0.24626 0.436 0.012 0.128 0.336 0.088
#> SRR1032951 4 0.2068 0.76517 0.004 0.000 0.000 0.904 0.092
#> SRR1032952 4 0.2370 0.77747 0.000 0.000 0.040 0.904 0.056
#> SRR1032953 4 0.2193 0.76306 0.008 0.000 0.000 0.900 0.092
#> SRR1032954 4 0.3214 0.74835 0.032 0.000 0.008 0.856 0.104
#> SRR1032955 5 0.5107 0.59802 0.000 0.448 0.004 0.028 0.520
#> SRR1032957 4 0.2677 0.76843 0.000 0.000 0.016 0.872 0.112
#> SRR1032956 4 0.4777 0.65799 0.116 0.008 0.000 0.748 0.128
#> SRR1032958 4 0.1281 0.78547 0.000 0.000 0.012 0.956 0.032
#> SRR1032959 4 0.1808 0.77791 0.012 0.000 0.008 0.936 0.044
#> SRR1032960 4 0.2344 0.77962 0.000 0.000 0.032 0.904 0.064
#> SRR1032961 4 0.4178 0.69250 0.100 0.004 0.000 0.792 0.104
#> SRR1032962 1 0.6921 0.07381 0.436 0.048 0.408 0.000 0.108
#> SRR1032963 4 0.2741 0.75124 0.000 0.004 0.004 0.860 0.132
#> SRR1032964 4 0.2672 0.75751 0.000 0.004 0.008 0.872 0.116
#> SRR1032965 4 0.1059 0.78612 0.004 0.000 0.008 0.968 0.020
#> SRR1032966 4 0.1892 0.77414 0.000 0.004 0.000 0.916 0.080
#> SRR1032967 4 0.7353 0.15492 0.124 0.004 0.064 0.452 0.356
#> SRR1032968 4 0.2921 0.73876 0.000 0.004 0.004 0.844 0.148
#> SRR1032969 4 0.2932 0.76380 0.000 0.000 0.032 0.864 0.104
#> SRR1032970 4 0.1965 0.78332 0.000 0.000 0.024 0.924 0.052
#> SRR1032971 4 0.3304 0.74991 0.000 0.004 0.028 0.840 0.128
#> SRR1032972 4 0.2712 0.77428 0.000 0.000 0.032 0.880 0.088
#> SRR1032973 4 0.3985 0.73258 0.000 0.004 0.072 0.804 0.120
#> SRR1032974 4 0.3587 0.72574 0.024 0.012 0.000 0.824 0.140
#> SRR1032975 4 0.1408 0.78407 0.000 0.000 0.008 0.948 0.044
#> SRR1032976 4 0.2153 0.77708 0.000 0.000 0.040 0.916 0.044
#> SRR1032977 2 0.7716 -0.23722 0.052 0.420 0.004 0.268 0.256
#> SRR1032978 1 0.6156 0.41120 0.556 0.008 0.000 0.308 0.128
#> SRR1032979 5 0.5464 0.60032 0.000 0.428 0.008 0.044 0.520
#> SRR1032980 4 0.1741 0.78434 0.000 0.000 0.024 0.936 0.040
#> SRR1032981 4 0.2864 0.76416 0.000 0.000 0.024 0.864 0.112
#> SRR1032982 4 0.2067 0.78154 0.000 0.000 0.032 0.920 0.048
#> SRR1032983 4 0.4526 0.55444 0.004 0.004 0.260 0.708 0.024
#> SRR1032984 4 0.3044 0.74057 0.000 0.004 0.008 0.840 0.148
#> SRR1032985 4 0.1892 0.77396 0.004 0.000 0.000 0.916 0.080
#> SRR1032986 4 0.2189 0.77876 0.000 0.000 0.012 0.904 0.084
#> SRR1032987 2 0.5449 -0.13953 0.004 0.652 0.012 0.060 0.272
#> SRR1032988 4 0.1864 0.77370 0.004 0.000 0.004 0.924 0.068
#> SRR1032990 3 0.6422 0.60204 0.136 0.000 0.628 0.180 0.056
#> SRR1032989 4 0.1412 0.78213 0.004 0.000 0.008 0.952 0.036
#> SRR1032991 5 0.5170 0.60939 0.004 0.440 0.000 0.032 0.524
#> SRR1032992 3 0.6715 0.56745 0.108 0.004 0.612 0.200 0.076
#> SRR1032993 4 0.2932 0.76812 0.000 0.000 0.032 0.864 0.104
#> SRR1032994 1 0.7616 0.17922 0.428 0.012 0.124 0.368 0.068
#> SRR1032995 4 0.3265 0.74452 0.040 0.000 0.008 0.856 0.096
#> SRR1032996 4 0.1485 0.78481 0.000 0.000 0.020 0.948 0.032
#> SRR1032997 4 0.1774 0.78437 0.000 0.000 0.016 0.932 0.052
#> SRR1032998 4 0.3340 0.76100 0.000 0.004 0.032 0.840 0.124
#> SRR1032999 4 0.6058 0.33282 0.036 0.056 0.000 0.556 0.352
#> SRR1033000 2 0.7747 -0.24395 0.052 0.408 0.004 0.280 0.256
#> SRR1033001 4 0.2300 0.78315 0.000 0.000 0.040 0.908 0.052
#> SRR1033002 4 0.5679 0.55827 0.220 0.000 0.024 0.664 0.092
#> SRR1033003 5 0.5312 0.61719 0.004 0.436 0.004 0.032 0.524
#> SRR1033004 2 0.5311 -0.08446 0.012 0.672 0.008 0.048 0.260
#> SRR1033005 4 0.3064 0.76686 0.000 0.000 0.036 0.856 0.108
#> SRR1033006 3 0.4841 0.47245 0.000 0.008 0.600 0.376 0.016
#> SRR1033007 4 0.5137 0.05861 0.004 0.000 0.416 0.548 0.032
#> SRR1033008 1 0.3829 0.75388 0.828 0.000 0.016 0.096 0.060
#> SRR1033009 4 0.6354 0.45905 0.264 0.004 0.028 0.596 0.108
#> SRR1033010 3 0.5585 0.50779 0.000 0.048 0.596 0.336 0.020
#> SRR1033011 2 0.1430 0.53360 0.004 0.944 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.2130 0.79890 0.928 0.008 0.012 0.012 0.040
#> SRR1033013 3 0.4174 0.69552 0.004 0.072 0.812 0.096 0.016
#> SRR1033014 3 0.2983 0.69633 0.008 0.036 0.892 0.028 0.036
#> SRR1033015 3 0.5768 0.35082 0.328 0.008 0.580 0.000 0.084
#> SRR1033016 2 0.1341 0.53619 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.1270 0.53388 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.5667 0.68096 0.032 0.120 0.724 0.104 0.020
#> SRR1033019 3 0.3031 0.65036 0.004 0.128 0.852 0.000 0.016
#> SRR1033020 1 0.2549 0.78964 0.904 0.004 0.060 0.008 0.024
#> SRR1033021 3 0.7079 0.15880 0.084 0.000 0.420 0.416 0.080
#> SRR1033023 1 0.1269 0.79786 0.964 0.008 0.008 0.008 0.012
#> SRR1033022 1 0.1256 0.79739 0.964 0.008 0.012 0.004 0.012
#> SRR1033024 3 0.3744 0.66390 0.000 0.108 0.832 0.036 0.024
#> SRR1033025 1 0.5402 0.73373 0.732 0.004 0.108 0.040 0.116
#> SRR1033026 3 0.3465 0.66814 0.004 0.116 0.844 0.024 0.012
#> SRR1033027 2 0.1197 0.53131 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.5174 0.33617 0.000 0.000 0.340 0.604 0.056
#> SRR1033029 5 0.8005 0.16328 0.308 0.028 0.040 0.216 0.408
#> SRR1033030 3 0.2984 0.65992 0.000 0.124 0.856 0.004 0.016
#> SRR1033031 1 0.2047 0.79574 0.928 0.012 0.000 0.020 0.040
#> SRR1033032 3 0.6097 0.62608 0.116 0.012 0.696 0.076 0.100
#> SRR1033033 2 0.1270 0.53388 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.1331 0.52233 0.000 0.952 0.040 0.000 0.008
#> SRR1033034 1 0.4487 0.71819 0.776 0.008 0.004 0.140 0.072
#> SRR1033036 1 0.2152 0.79063 0.920 0.004 0.044 0.000 0.032
#> SRR1033037 1 0.5781 0.43206 0.576 0.004 0.004 0.336 0.080
#> SRR1033038 1 0.4039 0.76099 0.824 0.036 0.000 0.080 0.060
#> SRR1033039 3 0.3454 0.68179 0.016 0.112 0.848 0.008 0.016
#> SRR1033040 1 0.6360 0.30467 0.504 0.004 0.376 0.012 0.104
#> SRR1033041 1 0.1616 0.79680 0.948 0.008 0.032 0.004 0.008
#> SRR1033042 1 0.1530 0.79818 0.952 0.008 0.008 0.004 0.028
#> SRR1033043 1 0.5614 0.33902 0.544 0.004 0.000 0.384 0.068
#> SRR1033044 4 0.5875 0.16432 0.396 0.004 0.000 0.512 0.088
#> SRR1033045 3 0.4455 0.65856 0.000 0.036 0.736 0.220 0.008
#> SRR1033046 3 0.6035 0.64090 0.100 0.000 0.668 0.172 0.060
#> SRR1033047 3 0.3253 0.69218 0.004 0.092 0.864 0.024 0.016
#> SRR1033048 4 0.8080 -0.02040 0.224 0.000 0.304 0.368 0.104
#> SRR1033049 1 0.2842 0.79087 0.888 0.012 0.000 0.056 0.044
#> SRR1033051 4 0.5330 0.47898 0.288 0.000 0.004 0.636 0.072
#> SRR1033052 1 0.2536 0.78890 0.904 0.012 0.000 0.032 0.052
#> SRR1033053 2 0.1695 0.52073 0.008 0.940 0.044 0.000 0.008
#> SRR1033054 3 0.6594 0.40887 0.328 0.012 0.552 0.048 0.060
#> SRR1033050 1 0.5866 0.49970 0.604 0.000 0.016 0.292 0.088
#> SRR1033055 3 0.3336 0.68693 0.024 0.068 0.868 0.004 0.036
#> SRR1033056 1 0.7465 0.30419 0.476 0.000 0.260 0.200 0.064
#> SRR1033057 1 0.1869 0.79568 0.936 0.016 0.000 0.012 0.036
#> SRR1033058 3 0.3086 0.66933 0.004 0.092 0.868 0.004 0.032
#> SRR1033059 2 0.1682 0.52416 0.004 0.940 0.044 0.000 0.012
#> SRR1033060 1 0.3034 0.77734 0.880 0.008 0.052 0.004 0.056
#> SRR1033061 2 0.2930 0.39562 0.076 0.880 0.032 0.000 0.012
#> SRR1033062 3 0.4455 0.68761 0.000 0.096 0.768 0.132 0.004
#> SRR1033063 2 0.1695 0.52032 0.008 0.940 0.044 0.000 0.008
#> SRR1033064 3 0.2943 0.66869 0.004 0.108 0.868 0.004 0.016
#> SRR1033065 1 0.1498 0.79629 0.952 0.008 0.016 0.000 0.024
#> SRR1033066 1 0.1560 0.79276 0.948 0.004 0.020 0.000 0.028
#> SRR1033067 4 0.5986 0.04082 0.428 0.000 0.012 0.484 0.076
#> SRR1033068 3 0.5503 0.62653 0.164 0.072 0.720 0.012 0.032
#> SRR1033069 1 0.5572 0.58427 0.652 0.008 0.232 0.000 0.108
#> SRR1033070 3 0.5914 0.61163 0.192 0.020 0.688 0.052 0.048
#> SRR1033071 2 0.1731 0.51397 0.008 0.940 0.040 0.000 0.012
#> SRR1033072 3 0.6235 0.39814 0.316 0.032 0.568 0.000 0.084
#> SRR1033073 3 0.3461 0.64008 0.000 0.168 0.812 0.016 0.004
#> SRR1033074 4 0.4199 0.70946 0.100 0.000 0.012 0.800 0.088
#> SRR1033075 1 0.7472 0.28087 0.456 0.000 0.136 0.324 0.084
#> SRR1033076 1 0.6388 0.13668 0.496 0.020 0.404 0.012 0.068
#> SRR1033077 1 0.4860 0.67687 0.720 0.004 0.012 0.220 0.044
#> SRR1033078 1 0.4228 0.71846 0.788 0.008 0.000 0.136 0.068
#> SRR1033079 3 0.3543 0.64480 0.000 0.136 0.828 0.012 0.024
#> SRR1033080 3 0.4096 0.65075 0.000 0.148 0.796 0.040 0.016
#> SRR1033081 1 0.3782 0.77452 0.836 0.000 0.084 0.024 0.056
#> SRR1033082 1 0.2177 0.80071 0.928 0.008 0.016 0.016 0.032
#> SRR1033083 3 0.2837 0.67793 0.004 0.100 0.876 0.004 0.016
#> SRR1033084 1 0.2361 0.79187 0.916 0.008 0.004 0.032 0.040
#> SRR1033085 3 0.4696 0.67366 0.000 0.068 0.748 0.172 0.012
#> SRR1033086 2 0.1682 0.52402 0.004 0.940 0.044 0.000 0.012
#> SRR1033087 1 0.2993 0.78405 0.884 0.024 0.000 0.044 0.048
#> SRR1033088 3 0.3647 0.67197 0.008 0.116 0.836 0.008 0.032
#> SRR1033089 3 0.5078 0.40080 0.000 0.008 0.564 0.404 0.024
#> SRR1033090 4 0.3479 0.74048 0.000 0.000 0.084 0.836 0.080
#> SRR1033091 3 0.3304 0.69147 0.000 0.092 0.852 0.052 0.004
#> SRR1033092 1 0.2718 0.79866 0.900 0.008 0.008 0.036 0.048
#> SRR1033093 2 0.1484 0.53013 0.000 0.944 0.048 0.000 0.008
#> SRR1033094 3 0.4319 0.70404 0.040 0.068 0.824 0.048 0.020
#> SRR1033095 2 0.2130 0.53883 0.000 0.908 0.080 0.000 0.012
#> SRR1033096 3 0.5269 0.63395 0.032 0.004 0.684 0.248 0.032
#> SRR1033097 2 0.1757 0.52797 0.004 0.936 0.048 0.000 0.012
#> SRR1033098 3 0.3269 0.68349 0.000 0.112 0.852 0.020 0.016
#> SRR1033099 2 0.1644 0.52892 0.004 0.940 0.048 0.000 0.008
#> SRR1033100 2 0.1830 0.53768 0.000 0.924 0.068 0.000 0.008
#> SRR1033101 3 0.4513 0.67092 0.000 0.052 0.748 0.192 0.008
#> SRR1033102 1 0.6395 0.58453 0.624 0.000 0.064 0.212 0.100
#> SRR1033103 1 0.1278 0.79521 0.960 0.004 0.000 0.016 0.020
#> SRR1033104 3 0.4422 0.68184 0.000 0.076 0.788 0.116 0.020
#> SRR1033105 1 0.1488 0.79904 0.956 0.008 0.016 0.008 0.012
#> SRR1033106 1 0.2504 0.78231 0.900 0.004 0.064 0.000 0.032
#> SRR1033107 3 0.4902 0.64891 0.000 0.016 0.712 0.224 0.048
#> SRR1033108 4 0.2792 0.75610 0.040 0.000 0.004 0.884 0.072
#> SRR1033109 1 0.1706 0.79846 0.948 0.008 0.016 0.012 0.016
#> SRR1033110 3 0.4367 0.62241 0.172 0.028 0.772 0.000 0.028
#> SRR1033111 1 0.2981 0.79103 0.884 0.004 0.036 0.012 0.064
#> SRR1033112 1 0.1121 0.79783 0.968 0.004 0.008 0.004 0.016
#> SRR1033113 3 0.6428 0.58457 0.220 0.020 0.640 0.060 0.060
#> SRR1033114 1 0.2197 0.80005 0.924 0.004 0.008 0.028 0.036
#> SRR1033115 1 0.2124 0.79765 0.924 0.012 0.000 0.020 0.044
#> SRR1033116 3 0.4759 0.54421 0.000 0.004 0.636 0.336 0.024
#> SRR1033117 3 0.3366 0.64970 0.000 0.116 0.844 0.008 0.032
#> SRR1033118 3 0.3975 0.65466 0.000 0.008 0.744 0.240 0.008
#> SRR1033119 1 0.1758 0.79865 0.944 0.008 0.004 0.024 0.020
#> SRR1033121 3 0.2674 0.65845 0.000 0.120 0.868 0.000 0.012
#> SRR1033120 1 0.5856 0.66202 0.700 0.064 0.092 0.004 0.140
#> SRR1033122 3 0.4481 0.66682 0.008 0.028 0.748 0.208 0.008
#> SRR1033123 1 0.0798 0.79709 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1033124 1 0.2227 0.79561 0.924 0.004 0.012 0.028 0.032
#> SRR1033125 1 0.5001 0.68116 0.732 0.016 0.164 0.000 0.088
#> SRR1033126 1 0.1243 0.79619 0.960 0.004 0.028 0.000 0.008
#> SRR1033127 3 0.6042 0.60524 0.004 0.060 0.684 0.120 0.132
#> SRR1033129 3 0.4167 0.68281 0.004 0.060 0.824 0.044 0.068
#> SRR1033128 1 0.1153 0.79514 0.964 0.008 0.004 0.000 0.024
#> SRR1033130 1 0.2696 0.80181 0.900 0.000 0.040 0.028 0.032
#> SRR1033131 1 0.2381 0.78373 0.908 0.004 0.052 0.000 0.036
#> SRR1033132 1 0.6029 0.22520 0.504 0.008 0.396 0.000 0.092
#> SRR1033133 1 0.4150 0.71854 0.788 0.004 0.140 0.000 0.068
#> SRR1033134 1 0.5015 0.55231 0.652 0.004 0.000 0.296 0.048
#> SRR1033135 3 0.3765 0.67200 0.080 0.064 0.836 0.000 0.020
#> SRR1033136 1 0.1870 0.79806 0.936 0.004 0.040 0.004 0.016
#> SRR1033137 3 0.5566 0.51516 0.272 0.024 0.644 0.000 0.060
#> SRR1033139 1 0.6018 0.53508 0.636 0.020 0.252 0.012 0.080
#> SRR1033138 1 0.2075 0.78807 0.924 0.004 0.032 0.000 0.040
#> SRR1033140 3 0.3349 0.68277 0.020 0.092 0.860 0.004 0.024
#> SRR1033141 1 0.4332 0.77050 0.808 0.000 0.056 0.080 0.056
#> SRR1033142 2 0.6182 0.48476 0.000 0.520 0.324 0.000 0.156
#> SRR1033143 1 0.5255 0.62897 0.700 0.000 0.016 0.200 0.084
#> SRR1033144 1 0.1682 0.79761 0.940 0.004 0.044 0.000 0.012
#> SRR1033145 3 0.3966 0.65915 0.108 0.048 0.820 0.000 0.024
#> SRR1033146 1 0.1787 0.79001 0.936 0.004 0.016 0.000 0.044
#> SRR1033147 1 0.4389 0.72538 0.780 0.008 0.120 0.000 0.092
#> SRR1033148 4 0.4288 0.69671 0.116 0.000 0.008 0.788 0.088
#> SRR1033149 3 0.3123 0.68438 0.004 0.068 0.876 0.012 0.040
#> SRR1033150 1 0.2888 0.77045 0.880 0.004 0.060 0.000 0.056
#> SRR1033151 1 0.5877 0.16805 0.500 0.008 0.416 0.000 0.076
#> SRR1033152 1 0.3898 0.74321 0.812 0.004 0.108 0.000 0.076
#> SRR1033153 1 0.4599 0.70869 0.760 0.008 0.144 0.000 0.088
#> SRR1033154 1 0.1854 0.79094 0.936 0.008 0.020 0.000 0.036
#> SRR1033156 3 0.3463 0.66015 0.000 0.120 0.840 0.020 0.020
#> SRR1033157 1 0.2597 0.78909 0.904 0.020 0.000 0.036 0.040
#> SRR1033158 2 0.7145 0.39575 0.080 0.484 0.336 0.000 0.100
#> SRR1033159 3 0.4468 0.69220 0.012 0.056 0.784 0.140 0.008
#> SRR1033160 3 0.3787 0.66884 0.016 0.108 0.836 0.012 0.028
#> SRR1033161 1 0.6859 0.32166 0.504 0.000 0.072 0.344 0.080
#> SRR1033163 3 0.6847 0.16083 0.408 0.012 0.464 0.044 0.072
#> SRR1033162 1 0.1412 0.79669 0.952 0.004 0.036 0.000 0.008
#> SRR1033164 3 0.5942 0.58622 0.072 0.000 0.624 0.268 0.036
#> SRR1033165 4 0.5228 0.27863 0.008 0.000 0.352 0.600 0.040
#> SRR1033166 1 0.3977 0.77187 0.824 0.008 0.088 0.008 0.072
#> SRR1033167 2 0.7096 -0.07503 0.260 0.504 0.028 0.004 0.204
#> SRR1033168 3 0.4536 0.63385 0.128 0.008 0.780 0.008 0.076
#> SRR1033169 1 0.5174 0.69439 0.744 0.052 0.076 0.000 0.128
#> SRR1033171 3 0.6181 0.37189 0.348 0.052 0.552 0.000 0.048
#> SRR1033170 1 0.2847 0.79414 0.896 0.004 0.044 0.028 0.028
#> SRR1033172 3 0.3392 0.67640 0.032 0.076 0.860 0.000 0.032
#> SRR1033173 2 0.5513 0.53378 0.000 0.632 0.252 0.000 0.116
#> SRR1033174 3 0.4214 0.69721 0.012 0.052 0.828 0.052 0.056
#> SRR1033175 1 0.4050 0.71582 0.784 0.008 0.000 0.172 0.036
#> SRR1033176 1 0.2228 0.78657 0.912 0.000 0.048 0.000 0.040
#> SRR1033177 2 0.5766 0.51542 0.000 0.616 0.220 0.000 0.164
#> SRR1033178 2 0.6724 0.44842 0.012 0.508 0.240 0.000 0.240
#> SRR1033179 4 0.5993 0.61181 0.096 0.000 0.056 0.668 0.180
#> SRR1033180 1 0.2819 0.78909 0.884 0.000 0.012 0.080 0.024
#> SRR1033181 1 0.2673 0.78069 0.892 0.004 0.060 0.000 0.044
#> SRR1033183 3 0.4737 0.66450 0.000 0.064 0.732 0.196 0.008
#> SRR1033182 1 0.2813 0.77482 0.884 0.004 0.048 0.000 0.064
#> SRR1033184 3 0.5913 0.30419 0.344 0.008 0.556 0.000 0.092
#> SRR1033185 1 0.3928 0.77144 0.832 0.004 0.072 0.020 0.072
#> SRR1033187 1 0.4344 0.75905 0.804 0.000 0.080 0.080 0.036
#> SRR1033186 1 0.2965 0.79435 0.880 0.000 0.012 0.068 0.040
#> SRR1033188 4 0.5088 -0.01660 0.000 0.000 0.436 0.528 0.036
#> SRR1033189 3 0.6084 0.60058 0.000 0.080 0.676 0.132 0.112
#> SRR1033190 1 0.2436 0.79058 0.912 0.020 0.000 0.032 0.036
#> SRR1033191 1 0.1659 0.79887 0.948 0.004 0.024 0.008 0.016
#> SRR1033192 1 0.4357 0.73408 0.796 0.012 0.092 0.004 0.096
#> SRR1033193 1 0.1969 0.79904 0.932 0.004 0.044 0.008 0.012
#> SRR1033195 3 0.5935 0.18183 0.000 0.268 0.580 0.000 0.152
#> SRR1033194 1 0.5669 0.67155 0.720 0.084 0.076 0.004 0.116
#> SRR1033197 1 0.2596 0.79575 0.908 0.004 0.036 0.020 0.032
#> SRR1033196 1 0.3547 0.75178 0.836 0.004 0.100 0.000 0.060
#> SRR1033199 2 0.6047 0.33848 0.000 0.532 0.136 0.000 0.332
#> SRR1033198 4 0.7347 0.00575 0.384 0.000 0.068 0.416 0.132
#> SRR1033200 4 0.6305 0.46266 0.252 0.000 0.028 0.596 0.124
#> SRR1033201 3 0.3078 0.69717 0.000 0.064 0.872 0.056 0.008
#> SRR1033202 3 0.4407 0.66746 0.000 0.020 0.756 0.196 0.028
#> SRR1033203 3 0.3343 0.68719 0.052 0.068 0.864 0.004 0.012
#> SRR1033204 1 0.3357 0.76571 0.852 0.000 0.008 0.092 0.048
#> SRR1033205 3 0.5015 0.61810 0.000 0.032 0.676 0.272 0.020
#> SRR1033206 1 0.3377 0.77950 0.864 0.000 0.036 0.040 0.060
#> SRR1033207 1 0.4945 0.69187 0.748 0.000 0.024 0.140 0.088
#> SRR1033208 3 0.1699 0.69491 0.004 0.036 0.944 0.008 0.008
#> SRR1033209 3 0.5880 0.51718 0.060 0.000 0.588 0.324 0.028
#> SRR1033210 3 0.3218 0.67930 0.000 0.096 0.860 0.032 0.012
#> SRR1033211 1 0.2984 0.77085 0.860 0.000 0.108 0.000 0.032
#> SRR1033212 3 0.2873 0.65182 0.000 0.120 0.860 0.000 0.020
#> SRR1033213 2 0.5606 0.52452 0.000 0.600 0.296 0.000 0.104
#> SRR1033214 4 0.3142 0.74512 0.056 0.000 0.004 0.864 0.076
#> SRR1033216 1 0.1907 0.79412 0.928 0.000 0.000 0.044 0.028
#> SRR1033215 3 0.4627 0.59821 0.000 0.160 0.764 0.028 0.048
#> SRR1033217 3 0.5182 0.55730 0.256 0.008 0.680 0.008 0.048
#> SRR1033218 1 0.2532 0.79358 0.908 0.000 0.028 0.028 0.036
#> SRR1033219 1 0.4295 0.72324 0.796 0.016 0.000 0.104 0.084
#> SRR1033221 2 0.5763 -0.09823 0.008 0.520 0.056 0.004 0.412
#> SRR1033220 2 0.5741 0.16717 0.008 0.552 0.072 0.000 0.368
#> SRR1033222 1 0.5026 0.60596 0.684 0.004 0.000 0.244 0.068
#> SRR1033223 1 0.5667 0.47640 0.604 0.004 0.316 0.008 0.068
#> SRR1033225 3 0.4937 0.40705 0.000 0.264 0.672 0.000 0.064
#> SRR1033224 4 0.4976 0.66541 0.124 0.000 0.024 0.748 0.104
#> SRR1033226 1 0.5350 0.68089 0.724 0.000 0.156 0.056 0.064
#> SRR1033227 3 0.4121 0.68895 0.004 0.032 0.792 0.160 0.012
#> SRR1033229 2 0.5811 0.49520 0.000 0.552 0.340 0.000 0.108
#> SRR1033228 1 0.5733 0.45079 0.588 0.004 0.000 0.312 0.096
#> SRR1033231 3 0.5758 0.19886 0.000 0.284 0.592 0.000 0.124
#> SRR1033230 1 0.2387 0.78894 0.908 0.004 0.000 0.048 0.040
#> SRR1033232 3 0.5987 0.47506 0.028 0.020 0.576 0.348 0.028
#> SRR1033233 1 0.5596 0.48715 0.600 0.012 0.000 0.324 0.064
#> SRR1033235 2 0.5569 0.51263 0.000 0.588 0.320 0.000 0.092
#> SRR1033234 3 0.4205 0.70396 0.048 0.036 0.832 0.060 0.024
#> SRR1033236 3 0.4083 0.70562 0.036 0.012 0.824 0.104 0.024
#> SRR1033237 4 0.2116 0.78373 0.008 0.000 0.028 0.924 0.040
#> SRR1033238 3 0.3333 0.69399 0.000 0.076 0.856 0.060 0.008
#> SRR1033240 3 0.4537 0.68134 0.000 0.072 0.784 0.116 0.028
#> SRR1033239 1 0.3551 0.76448 0.848 0.000 0.068 0.016 0.068
#> SRR1033242 3 0.4241 0.63713 0.008 0.000 0.716 0.264 0.012
#> SRR1033241 3 0.3536 0.69262 0.000 0.072 0.852 0.052 0.024
#> SRR1033244 2 0.5683 0.35194 0.000 0.588 0.108 0.000 0.304
#> SRR1033243 2 0.5761 0.03062 0.004 0.540 0.068 0.004 0.384
#> SRR1033245 1 0.6246 0.26759 0.536 0.036 0.368 0.004 0.056
#> SRR1033246 1 0.3146 0.78407 0.876 0.028 0.000 0.056 0.040
#> SRR1033248 4 0.5684 0.50339 0.268 0.000 0.020 0.636 0.076
#> SRR1033247 1 0.3795 0.76599 0.844 0.044 0.008 0.024 0.080
#> SRR1033249 2 0.6191 0.49354 0.000 0.536 0.292 0.000 0.172
#> SRR1033250 2 0.6010 0.48513 0.000 0.584 0.212 0.000 0.204
#> SRR1033251 1 0.1153 0.79744 0.964 0.004 0.024 0.000 0.008
#> SRR1033252 2 0.5778 0.52490 0.000 0.596 0.272 0.000 0.132
#> SRR1033253 1 0.5816 0.57321 0.652 0.000 0.032 0.232 0.084
#> SRR1033254 1 0.3552 0.75680 0.844 0.016 0.000 0.096 0.044
#> SRR1033256 2 0.6247 0.45609 0.000 0.484 0.364 0.000 0.152
#> SRR1033255 3 0.3955 0.70773 0.028 0.036 0.836 0.088 0.012
#> SRR1033258 1 0.2409 0.79014 0.912 0.016 0.000 0.044 0.028
#> SRR1033257 4 0.2663 0.76509 0.048 0.000 0.008 0.896 0.048
#> SRR1033259 1 0.6018 0.12113 0.472 0.004 0.004 0.436 0.084
#> SRR1033260 2 0.6235 0.47062 0.000 0.500 0.344 0.000 0.156
#> SRR1033261 3 0.4036 0.69096 0.000 0.052 0.816 0.108 0.024
#> SRR1033262 3 0.3530 0.66589 0.000 0.104 0.844 0.024 0.028
#> SRR1033263 2 0.5778 0.34842 0.000 0.464 0.448 0.000 0.088
#> SRR1033264 4 0.4509 0.64695 0.152 0.000 0.000 0.752 0.096
#> SRR1033265 2 0.6181 0.44574 0.000 0.552 0.196 0.000 0.252
#> SRR1033266 4 0.6254 0.39568 0.304 0.000 0.048 0.580 0.068
#> SRR1033267 3 0.3013 0.71005 0.028 0.008 0.876 0.084 0.004
#> SRR1033268 1 0.1885 0.79255 0.936 0.012 0.000 0.020 0.032
#> SRR1033269 3 0.5901 0.09472 0.416 0.004 0.492 0.000 0.088
#> SRR1033270 3 0.4638 0.67661 0.000 0.056 0.764 0.156 0.024
#> SRR1033271 1 0.3727 0.75481 0.836 0.000 0.016 0.084 0.064
#> SRR1033272 2 0.6206 0.49410 0.000 0.528 0.304 0.000 0.168
#> SRR1033273 1 0.0902 0.79749 0.976 0.004 0.008 0.004 0.008
#> SRR1033274 3 0.5805 0.29504 0.000 0.216 0.612 0.000 0.172
#> SRR1033275 4 0.1329 0.78184 0.004 0.000 0.008 0.956 0.032
#> SRR1033276 2 0.5987 0.37585 0.000 0.556 0.140 0.000 0.304
#> SRR1033277 4 0.4788 0.64892 0.136 0.000 0.004 0.740 0.120
#> SRR1033278 4 0.5004 0.59543 0.000 0.000 0.216 0.692 0.092
#> SRR1033279 1 0.6523 0.04896 0.472 0.016 0.424 0.024 0.064
#> SRR1033280 3 0.6203 0.14424 0.428 0.020 0.488 0.012 0.052
#> SRR1033281 1 0.1200 0.79549 0.964 0.012 0.000 0.008 0.016
#> SRR1033282 4 0.5265 0.68158 0.104 0.000 0.052 0.740 0.104
#> SRR1033283 4 0.4596 0.71479 0.088 0.000 0.032 0.784 0.096
#> SRR1033284 4 0.4943 0.70388 0.088 0.000 0.048 0.764 0.100
#> SRR1033285 3 0.6865 0.27112 0.336 0.000 0.500 0.044 0.120
#> SRR1033286 3 0.6746 0.35371 0.308 0.000 0.532 0.044 0.116
#> SRR1033287 3 0.6725 0.27766 0.340 0.000 0.512 0.044 0.104
#> SRR1033288 3 0.6640 0.15215 0.392 0.000 0.476 0.040 0.092
#> SRR1033289 3 0.6815 0.34660 0.324 0.000 0.520 0.056 0.100
#> SRR1033290 3 0.6805 0.37914 0.308 0.000 0.532 0.056 0.104
#> SRR1033291 3 0.7247 0.53309 0.176 0.000 0.548 0.184 0.092
#> SRR1033292 3 0.7633 0.46183 0.212 0.000 0.496 0.184 0.108
#> SRR1033293 3 0.7431 0.49266 0.204 0.000 0.524 0.172 0.100
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.532 0.63274 0.152 0.032 0.008 0.684 0.000 0.124
#> SRR1032911 4 0.222 0.71783 0.036 0.012 0.000 0.908 0.000 0.044
#> SRR1032912 4 0.235 0.71483 0.000 0.028 0.040 0.904 0.000 0.028
#> SRR1032913 4 0.205 0.72288 0.020 0.012 0.020 0.928 0.004 0.016
#> SRR1032914 4 0.390 0.68591 0.000 0.072 0.064 0.816 0.008 0.040
#> SRR1032915 4 0.288 0.72424 0.024 0.032 0.020 0.884 0.000 0.040
#> SRR1032916 4 0.408 0.61778 0.000 0.164 0.004 0.764 0.008 0.060
#> SRR1032917 3 0.305 0.59259 0.000 0.012 0.868 0.064 0.016 0.040
#> SRR1032918 4 0.258 0.71531 0.040 0.008 0.008 0.892 0.000 0.052
#> SRR1032919 4 0.401 0.67886 0.000 0.064 0.084 0.804 0.004 0.044
#> SRR1032920 4 0.844 0.25300 0.168 0.172 0.076 0.376 0.004 0.204
#> SRR1032921 4 0.618 0.23815 0.396 0.036 0.000 0.456 0.004 0.108
#> SRR1032922 6 0.796 0.38294 0.336 0.116 0.128 0.020 0.028 0.372
#> SRR1032923 4 0.297 0.71563 0.012 0.020 0.048 0.880 0.004 0.036
#> SRR1032925 2 0.443 0.49094 0.000 0.668 0.000 0.028 0.288 0.016
#> SRR1032924 4 0.347 0.70422 0.052 0.040 0.000 0.836 0.000 0.072
#> SRR1032926 4 0.506 0.54826 0.004 0.016 0.216 0.672 0.000 0.092
#> SRR1032927 4 0.324 0.70554 0.052 0.044 0.000 0.852 0.000 0.052
#> SRR1032929 4 0.231 0.71996 0.032 0.016 0.004 0.908 0.000 0.040
#> SRR1032928 4 0.413 0.67924 0.004 0.020 0.108 0.784 0.000 0.084
#> SRR1032930 4 0.299 0.70817 0.000 0.048 0.044 0.872 0.004 0.032
#> SRR1032931 2 0.525 0.49121 0.004 0.656 0.000 0.080 0.232 0.028
#> SRR1032932 4 0.664 0.19773 0.004 0.332 0.008 0.484 0.056 0.116
#> SRR1032933 4 0.344 0.70770 0.048 0.048 0.000 0.848 0.008 0.048
#> SRR1032934 4 0.487 0.68431 0.024 0.036 0.076 0.748 0.000 0.116
#> SRR1032935 4 0.328 0.70772 0.044 0.060 0.000 0.856 0.008 0.032
#> SRR1032936 4 0.555 0.00461 0.000 0.012 0.408 0.484 0.000 0.096
#> SRR1032937 2 0.538 0.48417 0.016 0.668 0.000 0.088 0.204 0.024
#> SRR1032938 4 0.612 0.29724 0.376 0.040 0.000 0.472 0.000 0.112
#> SRR1032939 1 0.630 -0.12208 0.528 0.012 0.100 0.048 0.000 0.312
#> SRR1032940 4 0.510 0.60220 0.000 0.124 0.044 0.716 0.008 0.108
#> SRR1032941 4 0.275 0.71000 0.004 0.036 0.032 0.892 0.008 0.028
#> SRR1032942 2 0.831 0.14184 0.224 0.340 0.012 0.160 0.028 0.236
#> SRR1032943 2 0.537 0.47693 0.024 0.624 0.000 0.036 0.288 0.028
#> SRR1032944 1 0.474 0.54053 0.740 0.044 0.000 0.136 0.004 0.076
#> SRR1032945 4 0.340 0.69869 0.004 0.052 0.024 0.852 0.008 0.060
#> SRR1032946 4 0.333 0.70397 0.064 0.016 0.004 0.844 0.000 0.072
#> SRR1032947 4 0.514 0.56784 0.000 0.052 0.200 0.680 0.000 0.068
#> SRR1032948 4 0.239 0.70976 0.008 0.048 0.008 0.908 0.008 0.020
#> SRR1032949 2 0.523 0.48811 0.004 0.672 0.000 0.088 0.204 0.032
#> SRR1032950 1 0.850 -0.11203 0.300 0.044 0.100 0.272 0.024 0.260
#> SRR1032951 4 0.363 0.69420 0.036 0.100 0.000 0.824 0.004 0.036
#> SRR1032952 4 0.358 0.69995 0.004 0.020 0.072 0.828 0.000 0.076
#> SRR1032953 4 0.360 0.70278 0.048 0.068 0.000 0.836 0.008 0.040
#> SRR1032954 4 0.629 0.55599 0.220 0.048 0.016 0.584 0.000 0.132
#> SRR1032955 2 0.461 0.48564 0.004 0.652 0.000 0.032 0.300 0.012
#> SRR1032957 4 0.353 0.68873 0.000 0.056 0.032 0.840 0.008 0.064
#> SRR1032956 4 0.594 0.49291 0.280 0.036 0.004 0.568 0.000 0.112
#> SRR1032958 4 0.187 0.72116 0.024 0.032 0.016 0.928 0.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.386 0.69193 0.080 0.016 0.012 0.812 0.000 0.080
#> SRR1032960 4 0.320 0.70548 0.004 0.044 0.048 0.864 0.004 0.036
#> SRR1032961 4 0.633 0.50820 0.264 0.056 0.008 0.552 0.000 0.120
#> SRR1032962 6 0.754 0.63708 0.188 0.052 0.292 0.004 0.044 0.420
#> SRR1032963 4 0.363 0.65622 0.000 0.124 0.008 0.812 0.008 0.048
#> SRR1032964 4 0.367 0.65725 0.000 0.128 0.016 0.812 0.008 0.036
#> SRR1032965 4 0.122 0.72137 0.032 0.004 0.000 0.956 0.004 0.004
#> SRR1032966 4 0.303 0.69373 0.004 0.088 0.012 0.864 0.008 0.024
#> SRR1032967 4 0.856 0.12264 0.228 0.184 0.020 0.276 0.028 0.264
#> SRR1032968 4 0.413 0.61928 0.000 0.164 0.008 0.764 0.008 0.056
#> SRR1032969 4 0.374 0.68560 0.000 0.060 0.044 0.828 0.008 0.060
#> SRR1032970 4 0.286 0.71160 0.004 0.036 0.040 0.884 0.004 0.032
#> SRR1032971 4 0.448 0.63908 0.000 0.132 0.044 0.764 0.008 0.052
#> SRR1032972 4 0.325 0.69448 0.000 0.072 0.032 0.856 0.008 0.032
#> SRR1032973 4 0.517 0.60746 0.000 0.104 0.088 0.720 0.008 0.080
#> SRR1032974 4 0.488 0.66808 0.072 0.112 0.004 0.748 0.008 0.056
#> SRR1032975 4 0.235 0.71579 0.012 0.040 0.020 0.912 0.008 0.008
#> SRR1032976 4 0.456 0.68680 0.044 0.004 0.084 0.760 0.000 0.108
#> SRR1032977 4 0.839 0.01352 0.060 0.232 0.012 0.376 0.116 0.204
#> SRR1032978 1 0.534 0.48976 0.680 0.044 0.000 0.168 0.004 0.104
#> SRR1032979 2 0.515 0.49019 0.000 0.624 0.012 0.056 0.296 0.012
#> SRR1032980 4 0.276 0.71418 0.000 0.024 0.048 0.884 0.004 0.040
#> SRR1032981 4 0.406 0.67004 0.000 0.084 0.040 0.804 0.008 0.064
#> SRR1032982 4 0.304 0.70956 0.004 0.036 0.036 0.876 0.008 0.040
#> SRR1032983 4 0.578 0.45717 0.004 0.028 0.260 0.600 0.004 0.104
#> SRR1032984 4 0.430 0.63332 0.000 0.144 0.024 0.768 0.008 0.056
#> SRR1032985 4 0.293 0.70337 0.028 0.072 0.000 0.872 0.008 0.020
#> SRR1032986 4 0.273 0.70952 0.012 0.052 0.012 0.892 0.008 0.024
#> SRR1032987 2 0.814 0.24351 0.016 0.368 0.020 0.220 0.240 0.136
#> SRR1032988 4 0.292 0.71374 0.040 0.048 0.000 0.872 0.000 0.040
#> SRR1032990 3 0.634 0.07934 0.088 0.004 0.528 0.080 0.000 0.300
#> SRR1032989 4 0.278 0.71257 0.040 0.020 0.000 0.876 0.000 0.064
#> SRR1032991 2 0.497 0.49880 0.004 0.652 0.000 0.048 0.272 0.024
#> SRR1032992 3 0.750 0.31264 0.036 0.052 0.480 0.192 0.016 0.224
#> SRR1032993 4 0.373 0.68323 0.000 0.072 0.048 0.828 0.008 0.044
#> SRR1032994 1 0.774 -0.37073 0.336 0.008 0.172 0.200 0.000 0.284
#> SRR1032995 4 0.567 0.60776 0.164 0.044 0.012 0.660 0.000 0.120
#> SRR1032996 4 0.256 0.71843 0.032 0.004 0.008 0.888 0.000 0.068
#> SRR1032997 4 0.283 0.70922 0.000 0.032 0.036 0.884 0.008 0.040
#> SRR1032998 4 0.478 0.64847 0.004 0.128 0.036 0.748 0.008 0.076
#> SRR1032999 4 0.764 0.20384 0.156 0.324 0.000 0.368 0.020 0.132
#> SRR1033000 4 0.829 0.00897 0.056 0.240 0.008 0.376 0.116 0.204
#> SRR1033001 4 0.394 0.71024 0.024 0.024 0.052 0.816 0.000 0.084
#> SRR1033002 4 0.628 0.36271 0.312 0.016 0.020 0.512 0.000 0.140
#> SRR1033003 2 0.458 0.48843 0.004 0.668 0.000 0.036 0.280 0.012
#> SRR1033004 2 0.830 0.18795 0.016 0.300 0.020 0.220 0.288 0.156
#> SRR1033005 4 0.408 0.67936 0.000 0.084 0.052 0.800 0.004 0.060
#> SRR1033006 3 0.506 0.44423 0.000 0.012 0.600 0.320 0.000 0.068
#> SRR1033007 4 0.575 0.10626 0.004 0.012 0.380 0.496 0.000 0.108
#> SRR1033008 1 0.317 0.59771 0.852 0.012 0.004 0.080 0.000 0.052
#> SRR1033009 1 0.664 -0.11926 0.416 0.036 0.016 0.396 0.000 0.136
#> SRR1033010 3 0.625 0.22227 0.000 0.052 0.460 0.392 0.004 0.092
#> SRR1033011 5 0.120 0.87750 0.008 0.000 0.040 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033012 1 0.146 0.62443 0.944 0.004 0.000 0.016 0.000 0.036
#> SRR1033013 3 0.392 0.58763 0.000 0.008 0.800 0.124 0.024 0.044
#> SRR1033014 3 0.550 0.54240 0.000 0.060 0.692 0.044 0.040 0.164
#> SRR1033015 6 0.688 0.43733 0.140 0.048 0.396 0.000 0.020 0.396
#> SRR1033016 5 0.120 0.87750 0.008 0.000 0.040 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033017 5 0.130 0.87469 0.012 0.000 0.040 0.000 0.948 0.000
#> SRR1033018 3 0.619 0.43146 0.044 0.008 0.644 0.076 0.048 0.180
#> SRR1033019 3 0.328 0.56956 0.000 0.028 0.852 0.004 0.064 0.052
#> SRR1033020 1 0.354 0.49378 0.768 0.000 0.016 0.008 0.000 0.208
#> SRR1033021 3 0.740 0.16402 0.096 0.012 0.372 0.332 0.000 0.188
#> SRR1033023 1 0.211 0.59982 0.896 0.000 0.004 0.008 0.000 0.092
#> SRR1033022 1 0.242 0.57441 0.864 0.000 0.004 0.004 0.000 0.128
#> SRR1033024 3 0.401 0.58020 0.000 0.020 0.816 0.060 0.044 0.060
#> SRR1033025 1 0.541 0.46461 0.688 0.044 0.012 0.032 0.024 0.200
#> SRR1033026 3 0.406 0.59197 0.000 0.016 0.812 0.056 0.060 0.056
#> SRR1033027 5 0.115 0.87205 0.004 0.000 0.044 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033028 4 0.610 0.30685 0.000 0.056 0.304 0.552 0.008 0.080
#> SRR1033029 1 0.819 0.12083 0.404 0.192 0.032 0.144 0.016 0.212
#> SRR1033030 3 0.411 0.57377 0.000 0.024 0.804 0.024 0.060 0.088
#> SRR1033031 1 0.194 0.61875 0.920 0.004 0.004 0.016 0.000 0.056
#> SRR1033032 3 0.739 0.30740 0.032 0.084 0.504 0.064 0.040 0.276
#> SRR1033033 5 0.127 0.87363 0.008 0.004 0.036 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033035 5 0.120 0.87750 0.008 0.000 0.040 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033034 1 0.376 0.59981 0.808 0.012 0.000 0.080 0.004 0.096
#> SRR1033036 1 0.362 0.46011 0.748 0.000 0.012 0.000 0.008 0.232
#> SRR1033037 1 0.488 0.49941 0.692 0.012 0.004 0.196 0.000 0.096
#> SRR1033038 1 0.295 0.62208 0.864 0.008 0.000 0.048 0.004 0.076
#> SRR1033039 3 0.406 0.53484 0.004 0.004 0.788 0.020 0.048 0.136
#> SRR1033040 6 0.777 0.67783 0.284 0.068 0.268 0.012 0.020 0.348
#> SRR1033041 1 0.244 0.56582 0.852 0.000 0.004 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033042 1 0.256 0.58072 0.860 0.004 0.004 0.004 0.000 0.128
#> SRR1033043 1 0.502 0.48983 0.660 0.004 0.004 0.216 0.000 0.116
#> SRR1033044 1 0.554 0.29197 0.572 0.012 0.004 0.308 0.000 0.104
#> SRR1033045 3 0.453 0.52020 0.000 0.008 0.700 0.220 0.000 0.072
#> SRR1033046 3 0.609 0.38649 0.040 0.008 0.604 0.136 0.004 0.208
#> SRR1033047 3 0.428 0.56944 0.000 0.012 0.780 0.064 0.024 0.120
#> SRR1033048 3 0.759 -0.10522 0.104 0.004 0.316 0.284 0.004 0.288
#> SRR1033049 1 0.264 0.62313 0.876 0.004 0.000 0.048 0.000 0.072
#> SRR1033051 1 0.573 -0.01013 0.472 0.008 0.008 0.412 0.000 0.100
#> SRR1033052 1 0.148 0.62591 0.944 0.004 0.000 0.032 0.000 0.020
#> SRR1033053 5 0.156 0.84999 0.024 0.004 0.032 0.000 0.940 0.000
#> SRR1033054 3 0.675 -0.55063 0.204 0.008 0.424 0.020 0.008 0.336
#> SRR1033050 1 0.492 0.51885 0.716 0.016 0.008 0.164 0.004 0.092
#> SRR1033055 3 0.411 0.50690 0.000 0.016 0.764 0.016 0.024 0.180
#> SRR1033056 1 0.757 -0.44000 0.348 0.004 0.276 0.136 0.000 0.236
#> SRR1033057 1 0.312 0.51975 0.800 0.004 0.004 0.004 0.000 0.188
#> SRR1033058 3 0.344 0.57552 0.000 0.032 0.848 0.012 0.044 0.064
#> SRR1033059 5 0.120 0.87750 0.008 0.000 0.040 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033060 1 0.515 0.10676 0.600 0.004 0.060 0.004 0.008 0.324
#> SRR1033061 5 0.161 0.79836 0.044 0.000 0.016 0.000 0.936 0.004
#> SRR1033062 3 0.499 0.55563 0.000 0.012 0.716 0.168 0.036 0.068
#> SRR1033063 5 0.130 0.87469 0.012 0.000 0.040 0.000 0.948 0.000
#> SRR1033064 3 0.261 0.56547 0.000 0.020 0.892 0.004 0.048 0.036
#> SRR1033065 1 0.306 0.55331 0.816 0.008 0.004 0.000 0.004 0.168
#> SRR1033066 1 0.310 0.49344 0.784 0.000 0.008 0.000 0.000 0.208
#> SRR1033067 1 0.554 0.35227 0.584 0.012 0.008 0.300 0.000 0.096
#> SRR1033068 3 0.539 0.05507 0.100 0.000 0.608 0.008 0.008 0.276
#> SRR1033069 6 0.709 0.70335 0.320 0.028 0.232 0.004 0.020 0.396
#> SRR1033070 3 0.588 -0.07107 0.100 0.004 0.556 0.024 0.004 0.312
#> SRR1033071 5 0.120 0.87750 0.008 0.000 0.040 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033072 3 0.700 -0.49154 0.144 0.028 0.396 0.004 0.036 0.392
#> SRR1033073 3 0.422 0.57964 0.000 0.012 0.796 0.044 0.084 0.064
#> SRR1033074 4 0.593 0.44887 0.308 0.020 0.012 0.552 0.000 0.108
#> SRR1033075 1 0.778 -0.39090 0.312 0.004 0.196 0.240 0.000 0.248
#> SRR1033076 6 0.656 0.70408 0.284 0.004 0.344 0.008 0.004 0.356
#> SRR1033077 1 0.469 0.52994 0.704 0.004 0.004 0.180 0.000 0.108
#> SRR1033078 1 0.357 0.59413 0.820 0.016 0.000 0.080 0.000 0.084
#> SRR1033079 3 0.192 0.58962 0.000 0.004 0.920 0.048 0.028 0.000
#> SRR1033080 3 0.366 0.59410 0.000 0.016 0.832 0.080 0.048 0.024
#> SRR1033081 1 0.479 0.33033 0.660 0.000 0.052 0.020 0.000 0.268
#> SRR1033082 1 0.221 0.62724 0.916 0.012 0.004 0.024 0.004 0.040
#> SRR1033083 3 0.281 0.53759 0.000 0.000 0.848 0.004 0.020 0.128
#> SRR1033084 1 0.179 0.62380 0.924 0.000 0.000 0.040 0.000 0.036
#> SRR1033085 3 0.463 0.54414 0.000 0.004 0.716 0.204 0.024 0.052
#> SRR1033086 5 0.134 0.87478 0.008 0.000 0.040 0.000 0.948 0.004
#> SRR1033087 1 0.207 0.62563 0.908 0.000 0.000 0.044 0.000 0.048
#> SRR1033088 3 0.481 0.55868 0.000 0.056 0.756 0.024 0.052 0.112
#> SRR1033089 3 0.533 0.40419 0.000 0.008 0.560 0.336 0.000 0.096
#> SRR1033090 4 0.452 0.63791 0.000 0.036 0.132 0.756 0.004 0.072
#> SRR1033091 3 0.313 0.58809 0.000 0.008 0.864 0.060 0.024 0.044
#> SRR1033092 1 0.275 0.62273 0.868 0.004 0.004 0.028 0.000 0.096
#> SRR1033093 5 0.120 0.87750 0.008 0.000 0.040 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033094 3 0.538 0.39790 0.048 0.004 0.680 0.040 0.020 0.208
#> SRR1033095 5 0.180 0.83276 0.000 0.016 0.056 0.000 0.924 0.004
#> SRR1033096 3 0.585 0.44084 0.036 0.008 0.624 0.164 0.000 0.168
#> SRR1033097 5 0.134 0.87478 0.008 0.000 0.040 0.000 0.948 0.004
#> SRR1033098 3 0.545 0.55807 0.000 0.052 0.716 0.060 0.060 0.112
#> SRR1033099 5 0.130 0.87469 0.012 0.000 0.040 0.000 0.948 0.000
#> SRR1033100 5 0.107 0.86528 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033101 3 0.451 0.54157 0.000 0.004 0.724 0.192 0.012 0.068
#> SRR1033102 1 0.588 0.47361 0.648 0.028 0.016 0.168 0.008 0.132
#> SRR1033103 1 0.154 0.61610 0.936 0.000 0.000 0.008 0.004 0.052
#> SRR1033104 3 0.369 0.58859 0.000 0.016 0.824 0.104 0.028 0.028
#> SRR1033105 1 0.154 0.61489 0.936 0.000 0.000 0.008 0.004 0.052
#> SRR1033106 1 0.385 0.41547 0.716 0.000 0.020 0.000 0.004 0.260
#> SRR1033107 3 0.521 0.54094 0.000 0.032 0.684 0.192 0.008 0.084
#> SRR1033108 4 0.492 0.63316 0.168 0.024 0.004 0.708 0.000 0.096
#> SRR1033109 1 0.170 0.62287 0.936 0.004 0.000 0.020 0.004 0.036
#> SRR1033110 3 0.476 0.25560 0.068 0.000 0.660 0.004 0.004 0.264
#> SRR1033111 1 0.299 0.61087 0.872 0.016 0.004 0.016 0.016 0.076
#> SRR1033112 1 0.184 0.61015 0.916 0.000 0.000 0.008 0.004 0.072
#> SRR1033113 3 0.642 -0.27697 0.128 0.008 0.488 0.032 0.004 0.340
#> SRR1033114 1 0.160 0.62423 0.944 0.004 0.004 0.016 0.004 0.028
#> SRR1033115 1 0.330 0.54260 0.800 0.004 0.004 0.008 0.004 0.180
#> SRR1033116 3 0.492 0.47348 0.000 0.012 0.628 0.296 0.000 0.064
#> SRR1033117 3 0.290 0.56625 0.000 0.028 0.880 0.012 0.052 0.028
#> SRR1033118 3 0.502 0.49167 0.000 0.008 0.652 0.248 0.004 0.088
#> SRR1033119 1 0.287 0.57313 0.844 0.008 0.000 0.008 0.004 0.136
#> SRR1033121 3 0.265 0.57465 0.000 0.012 0.892 0.016 0.028 0.052
#> SRR1033120 6 0.696 0.24797 0.392 0.048 0.076 0.016 0.032 0.436
#> SRR1033122 3 0.427 0.54443 0.000 0.008 0.744 0.180 0.004 0.064
#> SRR1033123 1 0.245 0.58903 0.876 0.008 0.000 0.004 0.004 0.108
#> SRR1033124 1 0.171 0.62579 0.932 0.004 0.000 0.024 0.000 0.040
#> SRR1033125 1 0.609 -0.46690 0.432 0.004 0.152 0.000 0.012 0.400
#> SRR1033126 1 0.319 0.55944 0.828 0.012 0.008 0.004 0.004 0.144
#> SRR1033127 3 0.657 0.48643 0.000 0.088 0.604 0.100 0.040 0.168
#> SRR1033129 3 0.487 0.57029 0.000 0.044 0.756 0.068 0.032 0.100
#> SRR1033128 1 0.299 0.53354 0.816 0.004 0.004 0.000 0.004 0.172
#> SRR1033130 1 0.220 0.62536 0.912 0.004 0.004 0.024 0.004 0.052
#> SRR1033131 1 0.372 0.41701 0.724 0.004 0.008 0.000 0.004 0.260
#> SRR1033132 6 0.629 0.73993 0.292 0.000 0.264 0.000 0.012 0.432
#> SRR1033133 1 0.616 -0.41443 0.460 0.004 0.156 0.000 0.016 0.364
#> SRR1033134 1 0.461 0.51993 0.708 0.008 0.004 0.204 0.000 0.076
#> SRR1033135 3 0.418 0.38602 0.044 0.000 0.720 0.000 0.008 0.228
#> SRR1033136 1 0.179 0.60372 0.916 0.000 0.000 0.004 0.004 0.076
#> SRR1033137 3 0.569 -0.38294 0.144 0.000 0.484 0.000 0.004 0.368
#> SRR1033139 1 0.646 -0.57088 0.408 0.000 0.204 0.004 0.020 0.364
#> SRR1033138 1 0.451 0.32537 0.680 0.012 0.028 0.000 0.008 0.272
#> SRR1033140 3 0.441 0.52316 0.024 0.004 0.776 0.028 0.032 0.136
#> SRR1033141 1 0.377 0.59983 0.820 0.008 0.024 0.064 0.000 0.084
#> SRR1033142 3 0.710 -0.31907 0.000 0.272 0.392 0.000 0.256 0.080
#> SRR1033143 1 0.454 0.53037 0.736 0.012 0.000 0.148 0.004 0.100
#> SRR1033144 1 0.282 0.58257 0.860 0.008 0.008 0.000 0.012 0.112
#> SRR1033145 3 0.523 0.35706 0.048 0.028 0.664 0.004 0.012 0.244
#> SRR1033146 1 0.365 0.39481 0.716 0.004 0.008 0.000 0.000 0.272
#> SRR1033147 1 0.579 -0.27570 0.488 0.028 0.092 0.000 0.000 0.392
#> SRR1033148 4 0.572 0.50655 0.276 0.016 0.008 0.584 0.000 0.116
#> SRR1033149 3 0.388 0.55849 0.000 0.044 0.812 0.008 0.036 0.100
#> SRR1033150 1 0.444 0.26565 0.652 0.004 0.032 0.000 0.004 0.308
#> SRR1033151 6 0.633 0.73305 0.300 0.004 0.300 0.000 0.004 0.392
#> SRR1033152 1 0.535 -0.20819 0.528 0.000 0.120 0.000 0.000 0.352
#> SRR1033153 1 0.540 -0.30602 0.484 0.000 0.116 0.000 0.000 0.400
#> SRR1033154 1 0.339 0.47755 0.764 0.004 0.004 0.000 0.004 0.224
#> SRR1033156 3 0.169 0.58875 0.000 0.004 0.932 0.044 0.020 0.000
#> SRR1033157 1 0.273 0.62350 0.876 0.008 0.000 0.032 0.004 0.080
#> SRR1033158 3 0.792 -0.10616 0.040 0.112 0.360 0.000 0.192 0.296
#> SRR1033159 3 0.455 0.54807 0.004 0.008 0.752 0.132 0.012 0.092
#> SRR1033160 3 0.373 0.51482 0.012 0.004 0.796 0.012 0.016 0.160
#> SRR1033161 1 0.549 0.41843 0.612 0.008 0.008 0.268 0.004 0.100
#> SRR1033163 3 0.689 -0.62656 0.236 0.008 0.388 0.028 0.004 0.336
#> SRR1033162 1 0.326 0.55087 0.820 0.004 0.008 0.000 0.020 0.148
#> SRR1033164 3 0.670 0.34044 0.064 0.016 0.544 0.176 0.000 0.200
#> SRR1033165 4 0.634 0.26803 0.020 0.020 0.316 0.508 0.000 0.136
#> SRR1033166 1 0.529 0.38046 0.656 0.088 0.004 0.000 0.028 0.224
#> SRR1033167 2 0.854 0.15878 0.252 0.256 0.012 0.032 0.216 0.232
#> SRR1033168 3 0.582 0.28142 0.052 0.056 0.600 0.000 0.016 0.276
#> SRR1033169 1 0.682 -0.22079 0.432 0.044 0.060 0.020 0.032 0.412
#> SRR1033171 3 0.653 -0.54926 0.196 0.012 0.424 0.000 0.016 0.352
#> SRR1033170 1 0.231 0.62632 0.912 0.004 0.004 0.036 0.016 0.028
#> SRR1033172 3 0.314 0.53281 0.000 0.012 0.828 0.000 0.020 0.140
#> SRR1033173 5 0.698 -0.11672 0.000 0.236 0.336 0.000 0.364 0.064
#> SRR1033174 3 0.573 0.54559 0.000 0.064 0.684 0.076 0.036 0.140
#> SRR1033175 1 0.294 0.60949 0.848 0.000 0.000 0.096 0.000 0.056
#> SRR1033176 1 0.357 0.46777 0.760 0.004 0.012 0.000 0.004 0.220
#> SRR1033177 5 0.697 -0.19782 0.000 0.300 0.244 0.000 0.392 0.064
#> SRR1033178 2 0.709 0.27301 0.000 0.396 0.276 0.004 0.260 0.064
#> SRR1033179 4 0.777 0.41557 0.224 0.084 0.056 0.432 0.000 0.204
#> SRR1033180 1 0.256 0.62380 0.884 0.000 0.008 0.068 0.000 0.040
#> SRR1033181 1 0.372 0.44675 0.736 0.004 0.012 0.000 0.004 0.244
#> SRR1033183 3 0.421 0.53611 0.000 0.008 0.724 0.232 0.012 0.024
#> SRR1033182 1 0.402 0.32169 0.680 0.004 0.012 0.000 0.004 0.300
#> SRR1033184 3 0.616 -0.53727 0.176 0.004 0.412 0.004 0.004 0.400
#> SRR1033185 1 0.352 0.60190 0.844 0.016 0.004 0.036 0.020 0.080
#> SRR1033187 1 0.523 0.44817 0.672 0.000 0.036 0.080 0.004 0.208
#> SRR1033186 1 0.325 0.61502 0.840 0.008 0.004 0.048 0.000 0.100
#> SRR1033188 4 0.596 -0.07568 0.004 0.016 0.420 0.440 0.000 0.120
#> SRR1033189 3 0.685 0.46316 0.000 0.092 0.584 0.104 0.056 0.164
#> SRR1033190 1 0.138 0.62505 0.952 0.004 0.000 0.024 0.004 0.016
#> SRR1033191 1 0.243 0.60845 0.888 0.000 0.008 0.008 0.008 0.088
#> SRR1033192 1 0.613 -0.35949 0.472 0.008 0.128 0.004 0.012 0.376
#> SRR1033193 1 0.206 0.62193 0.916 0.000 0.004 0.016 0.008 0.056
#> SRR1033195 3 0.615 0.10543 0.000 0.236 0.568 0.000 0.136 0.060
#> SRR1033194 1 0.681 -0.10657 0.456 0.052 0.040 0.016 0.048 0.388
#> SRR1033197 1 0.216 0.62419 0.916 0.004 0.004 0.020 0.008 0.048
#> SRR1033196 1 0.503 0.00892 0.580 0.000 0.092 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033199 2 0.647 0.34824 0.000 0.480 0.200 0.000 0.280 0.040
#> SRR1033198 1 0.694 0.24906 0.500 0.052 0.020 0.268 0.004 0.156
#> SRR1033200 1 0.667 -0.09164 0.416 0.048 0.008 0.384 0.000 0.144
#> SRR1033201 3 0.326 0.59443 0.000 0.012 0.856 0.072 0.024 0.036
#> SRR1033202 3 0.520 0.54623 0.000 0.028 0.692 0.188 0.016 0.076
#> SRR1033203 3 0.398 0.51113 0.024 0.008 0.796 0.008 0.024 0.140
#> SRR1033204 1 0.245 0.61180 0.884 0.000 0.000 0.064 0.000 0.052
#> SRR1033205 3 0.499 0.51974 0.000 0.016 0.668 0.244 0.008 0.064
#> SRR1033206 1 0.312 0.60356 0.852 0.016 0.000 0.056 0.000 0.076
#> SRR1033207 1 0.443 0.55947 0.772 0.028 0.004 0.092 0.004 0.100
#> SRR1033208 3 0.315 0.56919 0.000 0.028 0.860 0.008 0.028 0.076
#> SRR1033209 3 0.619 0.41321 0.036 0.008 0.568 0.232 0.000 0.156
#> SRR1033210 3 0.257 0.58982 0.000 0.008 0.896 0.048 0.028 0.020
#> SRR1033211 1 0.371 0.46651 0.748 0.000 0.024 0.000 0.004 0.224
#> SRR1033212 3 0.221 0.56636 0.000 0.012 0.912 0.004 0.028 0.044
#> SRR1033213 3 0.720 -0.25311 0.004 0.228 0.416 0.000 0.264 0.088
#> SRR1033214 4 0.506 0.63502 0.164 0.028 0.008 0.704 0.000 0.096
#> SRR1033216 1 0.194 0.62598 0.920 0.000 0.000 0.040 0.004 0.036
#> SRR1033215 3 0.463 0.53679 0.000 0.044 0.776 0.032 0.076 0.072
#> SRR1033217 3 0.545 -0.20472 0.116 0.000 0.528 0.000 0.004 0.352
#> SRR1033218 1 0.215 0.62224 0.920 0.008 0.004 0.024 0.008 0.036
#> SRR1033219 1 0.346 0.58800 0.832 0.012 0.000 0.080 0.004 0.072
#> SRR1033221 2 0.581 0.43981 0.008 0.584 0.112 0.000 0.272 0.024
#> SRR1033220 2 0.617 0.39731 0.004 0.524 0.128 0.000 0.308 0.036
#> SRR1033222 1 0.366 0.57348 0.804 0.012 0.000 0.124 0.000 0.060
#> SRR1033223 1 0.635 -0.52525 0.424 0.008 0.212 0.008 0.000 0.348
#> SRR1033225 3 0.565 0.37173 0.000 0.128 0.660 0.000 0.116 0.096
#> SRR1033224 4 0.639 0.49503 0.272 0.048 0.016 0.548 0.000 0.116
#> SRR1033226 1 0.642 -0.31734 0.480 0.016 0.140 0.024 0.000 0.340
#> SRR1033227 3 0.340 0.58104 0.000 0.012 0.816 0.144 0.004 0.024
#> SRR1033229 3 0.697 -0.24947 0.000 0.212 0.420 0.000 0.292 0.076
#> SRR1033228 1 0.481 0.48937 0.680 0.008 0.000 0.228 0.004 0.080
#> SRR1033231 3 0.639 0.07160 0.000 0.220 0.548 0.000 0.160 0.072
#> SRR1033230 1 0.201 0.62361 0.916 0.000 0.000 0.044 0.004 0.036
#> SRR1033232 3 0.646 0.28326 0.040 0.012 0.500 0.360 0.020 0.068
#> SRR1033233 1 0.469 0.52714 0.716 0.008 0.004 0.196 0.008 0.068
#> SRR1033235 3 0.693 -0.23566 0.000 0.172 0.416 0.000 0.328 0.084
#> SRR1033234 3 0.416 0.46333 0.040 0.000 0.756 0.028 0.000 0.176
#> SRR1033236 3 0.403 0.51093 0.028 0.000 0.764 0.032 0.000 0.176
#> SRR1033237 4 0.299 0.71722 0.044 0.000 0.024 0.864 0.000 0.068
#> SRR1033238 3 0.260 0.58899 0.000 0.008 0.892 0.056 0.012 0.032
#> SRR1033240 3 0.319 0.59343 0.000 0.008 0.856 0.076 0.016 0.044
#> SRR1033239 1 0.495 0.11352 0.608 0.004 0.064 0.004 0.000 0.320
#> SRR1033242 3 0.400 0.54153 0.000 0.004 0.740 0.208 0.000 0.048
#> SRR1033241 3 0.292 0.56315 0.004 0.004 0.864 0.024 0.008 0.096
#> SRR1033244 2 0.647 0.28278 0.000 0.416 0.156 0.000 0.384 0.044
#> SRR1033243 2 0.613 0.39349 0.008 0.512 0.108 0.000 0.340 0.032
#> SRR1033245 1 0.661 -0.63666 0.384 0.004 0.272 0.012 0.004 0.324
#> SRR1033246 1 0.288 0.62492 0.868 0.008 0.000 0.044 0.004 0.076
#> SRR1033248 4 0.616 0.12014 0.424 0.012 0.020 0.432 0.000 0.112
#> SRR1033247 1 0.457 0.47844 0.728 0.052 0.004 0.012 0.008 0.196
#> SRR1033249 3 0.702 -0.35011 0.000 0.316 0.384 0.000 0.228 0.072
#> SRR1033250 2 0.708 0.22272 0.004 0.364 0.292 0.000 0.284 0.056
#> SRR1033251 1 0.299 0.54467 0.824 0.004 0.008 0.000 0.004 0.160
#> SRR1033252 3 0.712 -0.34001 0.000 0.280 0.380 0.000 0.260 0.080
#> SRR1033253 1 0.483 0.53099 0.732 0.024 0.004 0.132 0.004 0.104
#> SRR1033254 1 0.296 0.61532 0.864 0.008 0.000 0.072 0.004 0.052
#> SRR1033256 3 0.691 -0.20461 0.000 0.264 0.444 0.000 0.216 0.076
#> SRR1033255 3 0.418 0.51168 0.024 0.000 0.760 0.052 0.000 0.164
#> SRR1033258 1 0.193 0.62273 0.924 0.004 0.000 0.028 0.004 0.040
#> SRR1033257 4 0.440 0.67024 0.124 0.028 0.004 0.764 0.000 0.080
#> SRR1033259 1 0.511 0.37188 0.612 0.012 0.000 0.296 0.000 0.080
#> SRR1033260 3 0.699 -0.24152 0.000 0.268 0.428 0.000 0.224 0.080
#> SRR1033261 3 0.313 0.59268 0.000 0.012 0.856 0.092 0.016 0.024
#> SRR1033262 3 0.234 0.58148 0.000 0.016 0.912 0.024 0.024 0.024
#> SRR1033263 3 0.645 0.07720 0.000 0.168 0.544 0.000 0.212 0.076
#> SRR1033264 4 0.577 0.36969 0.348 0.016 0.004 0.524 0.000 0.108
#> SRR1033265 2 0.703 0.25898 0.004 0.388 0.252 0.000 0.300 0.056
#> SRR1033266 4 0.611 0.20191 0.376 0.008 0.016 0.468 0.000 0.132
#> SRR1033267 3 0.309 0.55783 0.012 0.000 0.856 0.044 0.004 0.084
#> SRR1033268 1 0.143 0.62555 0.948 0.000 0.000 0.024 0.008 0.020
#> SRR1033269 3 0.695 -0.60761 0.292 0.036 0.372 0.000 0.008 0.292
#> SRR1033270 3 0.386 0.58235 0.000 0.012 0.796 0.140 0.012 0.040
#> SRR1033271 1 0.361 0.58631 0.820 0.012 0.000 0.076 0.004 0.088
#> SRR1033272 3 0.710 -0.31666 0.000 0.296 0.392 0.000 0.228 0.084
#> SRR1033273 1 0.261 0.58537 0.868 0.008 0.000 0.008 0.004 0.112
#> SRR1033274 3 0.612 0.11624 0.000 0.268 0.560 0.000 0.100 0.072
#> SRR1033275 4 0.285 0.70895 0.056 0.008 0.004 0.872 0.000 0.060
#> SRR1033276 2 0.664 0.31730 0.004 0.440 0.172 0.000 0.340 0.044
#> SRR1033277 4 0.607 0.51910 0.264 0.052 0.004 0.572 0.000 0.108
#> SRR1033278 4 0.544 0.53162 0.000 0.048 0.196 0.668 0.008 0.080
#> SRR1033279 6 0.661 0.70756 0.292 0.008 0.336 0.012 0.000 0.352
#> SRR1033280 3 0.641 -0.71150 0.264 0.004 0.368 0.008 0.000 0.356
#> SRR1033281 1 0.173 0.61201 0.924 0.000 0.000 0.008 0.004 0.064
#> SRR1033282 4 0.685 0.52271 0.208 0.052 0.024 0.540 0.004 0.172
#> SRR1033283 4 0.650 0.55686 0.188 0.056 0.012 0.576 0.004 0.164
#> SRR1033284 4 0.678 0.53002 0.204 0.056 0.020 0.548 0.004 0.168
#> SRR1033285 1 0.809 -0.18481 0.368 0.056 0.276 0.056 0.016 0.228
#> SRR1033286 1 0.807 -0.23303 0.332 0.056 0.308 0.056 0.012 0.236
#> SRR1033287 1 0.804 -0.17769 0.376 0.056 0.268 0.052 0.016 0.232
#> SRR1033288 1 0.752 -0.07008 0.452 0.044 0.248 0.040 0.012 0.204
#> SRR1033289 1 0.803 -0.21796 0.344 0.052 0.324 0.064 0.012 0.204
#> SRR1033290 3 0.805 -0.15495 0.324 0.052 0.348 0.068 0.012 0.196
#> SRR1033291 3 0.822 0.15801 0.184 0.040 0.408 0.176 0.012 0.180
#> SRR1033292 3 0.850 -0.01658 0.260 0.040 0.312 0.176 0.012 0.200
#> SRR1033293 3 0.832 0.08593 0.216 0.036 0.372 0.168 0.012 0.196
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.989 0.943 0.979 0.26399 0.750 0.750
#> 3 3 0.967 0.957 0.980 0.09849 0.947 0.930
#> 4 4 1.000 0.964 0.989 0.06105 0.995 0.992
#> 5 5 1.000 0.959 0.986 0.00328 1.000 1.000
#> 6 6 0.989 0.941 0.980 0.01552 0.999 0.999
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.946 0.454 0.364 0.636
#> SRR1032921 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032932 1 0.975 0.290 0.592 0.408
#> SRR1032933 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.980 0.266 0.584 0.416
#> SRR1032943 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.980 0.266 0.584 0.416
#> SRR1032968 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.973 0.301 0.596 0.404
#> SRR1032978 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.939 0.474 0.356 0.644
#> SRR1033000 1 0.973 0.301 0.596 0.404
#> SRR1033001 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.936 0.483 0.352 0.648
#> SRR1033030 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033061 1 0.973 0.301 0.596 0.404
#> SRR1033062 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033073 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033086 1 0.973 0.301 0.596 0.404
#> SRR1033087 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033097 1 0.973 0.301 0.596 0.404
#> SRR1033098 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033120 1 0.973 0.301 0.596 0.404
#> SRR1033122 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.952 0.388 0.628 0.372
#> SRR1033129 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033171 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.939 0.474 0.356 0.644
#> SRR1033180 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.958 0.367 0.620 0.380
#> SRR1033190 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.932 0.491 0.348 0.652
#> SRR1033194 1 0.973 0.301 0.596 0.404
#> SRR1033197 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.952 0.388 0.628 0.372
#> SRR1033217 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033225 1 0.980 0.266 0.584 0.416
#> SRR1033224 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.184 0.935 0.028 0.972
#> SRR1033230 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033247 1 0.969 0.324 0.604 0.396
#> SRR1033249 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.932 0.491 0.348 0.652
#> SRR1033275 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.000 0.959 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.000 0.980 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.000 0.980 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 3 0.438 0.3649 0.064 0.068 0.868
#> SRR1032921 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 1 0.659 -0.2785 0.568 0.008 0.424
#> SRR1032933 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 3 0.738 0.6814 0.376 0.040 0.584
#> SRR1032943 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 3 0.738 0.6814 0.376 0.040 0.584
#> SRR1032968 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.604 0.7258 0.380 0.000 0.620
#> SRR1032978 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.613 0.5392 0.000 0.600 0.400
#> SRR1032988 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 3 0.300 0.3082 0.016 0.068 0.916
#> SRR1033000 3 0.604 0.7258 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033001 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.613 0.5392 0.000 0.600 0.400
#> SRR1033005 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033029 3 0.277 0.2918 0.008 0.072 0.920
#> SRR1033030 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 3 0.604 0.7258 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033062 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 3 0.604 0.7258 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033087 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033097 3 0.604 0.7258 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033098 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 3 0.604 0.7258 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033122 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.730 -0.2084 0.584 0.036 0.380
#> SRR1033129 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 3 0.314 0.3138 0.020 0.068 0.912
#> SRR1033180 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.738 -0.2045 0.584 0.040 0.376
#> SRR1033190 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 3 0.236 0.2756 0.000 0.072 0.928
#> SRR1033194 3 0.604 0.7258 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033197 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.713 -0.0427 0.620 0.036 0.344
#> SRR1033217 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033225 3 0.655 0.7201 0.372 0.012 0.616
#> SRR1033224 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.348 0.8799 0.000 0.872 0.128
#> SRR1033230 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.631 0.4779 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033249 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 3 0.236 0.2756 0.000 0.072 0.928
#> SRR1033275 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.000 0.9835 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.000 0.9929 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 4 0.2483 0.447 0.052 0.000 0.032 0.916
#> SRR1032921 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0592 0.970 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032924 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0188 0.975 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032932 3 0.4194 0.212 0.228 0.008 0.764 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.1118 0.954 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1032938 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 4 0.5269 0.220 0.364 0.000 0.016 0.620
#> SRR1032943 2 0.0707 0.967 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1032944 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0336 0.974 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032950 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0188 0.975 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032957 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 4 0.5269 0.220 0.364 0.000 0.016 0.620
#> SRR1032968 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.0000 0.846 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0469 0.972 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032980 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.4855 0.367 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0336 0.974 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032992 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 4 0.2048 0.491 0.008 0.000 0.064 0.928
#> SRR1033000 3 0.0000 0.846 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0336 0.974 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033004 2 0.4855 0.367 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033029 4 0.2238 0.483 0.004 0.004 0.072 0.920
#> SRR1033030 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 3 0.0000 0.846 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033062 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 1 0.0336 0.987 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033073 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 3 0.0000 0.846 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0336 0.974 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033096 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033097 3 0.0000 0.846 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 3 0.0000 0.846 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.4898 0.144 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1033129 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0336 0.974 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033179 4 0.1970 0.491 0.008 0.000 0.060 0.932
#> SRR1033180 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.5060 0.144 0.584 0.000 0.004 0.412
#> SRR1033190 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.0336 0.987 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 4 0.2888 0.449 0.000 0.004 0.124 0.872
#> SRR1033194 3 0.0000 0.846 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0188 0.975 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033198 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.4790 0.271 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR1033217 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0592 0.969 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033220 2 0.0188 0.975 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033222 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033225 3 0.0469 0.833 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.3105 0.840 0.000 0.856 0.004 0.140
#> SRR1033230 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0188 0.975 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033243 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.2760 0.500 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.1022 0.958 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033266 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.977 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 4 0.2944 0.446 0.000 0.004 0.128 0.868
#> SRR1033275 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0707 0.967 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033277 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032920 5 0.1408 0.452 0.044 0.000 NA 0.000 0.948
#> SRR1032921 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.1478 0.933 0.000 0.936 NA 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0794 0.952 0.000 0.972 NA 0.000 0.000
#> SRR1032932 4 0.3612 0.206 0.228 0.000 NA 0.764 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.3242 0.787 0.000 0.784 NA 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032942 5 0.5107 0.205 0.356 0.000 NA 0.000 0.596
#> SRR1032943 2 0.1478 0.929 0.000 0.936 NA 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0963 0.948 0.000 0.964 NA 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0510 0.954 0.000 0.984 NA 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032967 5 0.5107 0.205 0.356 0.000 NA 0.000 0.596
#> SRR1032968 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032977 4 0.0000 0.840 0.000 0.000 NA 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.1197 0.942 0.000 0.952 NA 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.4547 0.354 0.000 0.588 NA 0.400 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0880 0.949 0.000 0.968 NA 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032999 5 0.0000 0.496 0.000 0.000 NA 0.000 1.000
#> SRR1033000 4 0.0000 0.840 0.000 0.000 NA 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.1544 0.930 0.000 0.932 NA 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.4547 0.354 0.000 0.588 NA 0.400 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0290 0.956 0.000 0.992 NA 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033029 5 0.0693 0.494 0.000 0.000 NA 0.008 0.980
#> SRR1033030 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033061 4 0.0000 0.840 0.000 0.000 NA 1.000 0.000
#> SRR1033062 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033072 1 0.0290 0.987 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1033073 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033086 4 0.0000 0.840 0.000 0.000 NA 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.1043 0.948 0.000 0.960 NA 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033097 4 0.0000 0.840 0.000 0.000 NA 1.000 0.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033120 4 0.0000 0.840 0.000 0.000 NA 1.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.5037 0.156 0.584 0.000 NA 0.000 0.376
#> SRR1033129 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0404 0.956 0.000 0.988 NA 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.956 0.000 1.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033171 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0404 0.956 0.000 0.988 NA 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0290 0.956 0.000 0.992 NA 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.1043 0.946 0.000 0.960 NA 0.000 0.000
#> SRR1033179 5 0.0404 0.495 0.000 0.000 NA 0.000 0.988
#> SRR1033180 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.5091 0.156 0.584 0.000 NA 0.000 0.372
#> SRR1033190 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.0290 0.987 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033195 5 0.2236 0.461 0.000 0.000 NA 0.068 0.908
#> SRR1033194 4 0.0000 0.840 0.000 0.000 NA 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0609 0.954 0.000 0.980 NA 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.4921 0.280 0.620 0.000 NA 0.000 0.340
#> SRR1033217 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0963 0.946 0.000 0.964 NA 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0404 0.956 0.000 0.988 NA 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033225 4 0.0451 0.833 0.000 0.004 NA 0.988 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0404 0.956 0.000 0.988 NA 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.3765 0.819 0.000 0.820 NA 0.004 0.112
#> SRR1033230 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0404 0.956 0.000 0.988 NA 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0703 0.953 0.000 0.976 NA 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0404 0.956 0.000 0.988 NA 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033247 4 0.5975 0.358 0.124 0.000 NA 0.532 0.000
#> SRR1033249 2 0.0404 0.956 0.000 0.988 NA 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0290 0.956 0.000 0.992 NA 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0404 0.956 0.000 0.988 NA 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.4114 0.546 0.000 0.624 NA 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0162 0.956 0.000 0.996 NA 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033274 5 0.2300 0.458 0.000 0.000 NA 0.072 0.904
#> SRR1033275 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.1671 0.919 0.000 0.924 NA 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 5 0.2119 0.804 0.036 0.000 0.060 0.000 0.904 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.2318 0.810 0.000 0.892 0.064 0.044 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.1151 0.891 0.000 0.956 0.012 0.032 0.000 0.000
#> SRR1032932 6 0.3245 -0.223 0.228 0.000 0.000 0.008 0.000 0.764
#> SRR1032933 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.4344 -0.255 0.000 0.612 0.356 0.032 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 3 0.5940 1.000 0.248 0.000 0.456 0.000 0.296 0.000
#> SRR1032943 2 0.2609 0.748 0.000 0.868 0.096 0.036 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.1549 0.872 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.1003 0.892 0.000 0.964 0.020 0.016 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0632 0.965 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 3 0.5940 1.000 0.248 0.000 0.456 0.000 0.296 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 6 0.0000 0.790 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.1930 0.849 0.000 0.916 0.036 0.048 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.4127 -0.241 0.000 0.588 0.004 0.008 0.000 0.400
#> SRR1032988 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.1480 0.874 0.000 0.940 0.020 0.040 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 5 0.0937 0.904 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1033000 6 0.0000 0.790 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.2404 0.796 0.000 0.884 0.080 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.4127 -0.241 0.000 0.588 0.004 0.008 0.000 0.400
#> SRR1033005 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0260 0.909 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033029 5 0.0551 0.910 0.000 0.000 0.008 0.004 0.984 0.004
#> SRR1033030 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.0260 0.983 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033061 6 0.0000 0.790 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033062 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0632 0.965 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 1 0.1049 0.943 0.960 0.000 0.032 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033073 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0260 0.983 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 6 0.0000 0.790 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0146 0.909 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.1575 0.876 0.000 0.936 0.032 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033097 6 0.0000 0.790 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0146 0.909 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0363 0.978 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 6 0.0000 0.790 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0363 0.978 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.5385 -0.577 0.468 0.000 0.420 0.000 0.112 0.000
#> SRR1033129 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0363 0.978 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0260 0.983 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0632 0.965 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0458 0.907 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0632 0.965 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0632 0.965 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0363 0.978 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0260 0.983 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0547 0.970 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.909 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 1 0.0632 0.965 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0458 0.907 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0260 0.909 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.1492 0.873 0.000 0.940 0.036 0.024 0.000 0.000
#> SRR1033179 5 0.1461 0.907 0.000 0.000 0.044 0.016 0.940 0.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.5322 -0.567 0.472 0.000 0.424 0.000 0.104 0.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.1049 0.943 0.960 0.000 0.032 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033193 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 5 0.3013 0.884 0.000 0.000 0.044 0.028 0.864 0.064
#> SRR1033194 6 0.0000 0.790 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0858 0.899 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0146 0.988 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0260 0.908 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.5091 -0.472 0.504 0.000 0.416 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033217 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.1398 0.869 0.000 0.940 0.008 0.052 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0858 0.903 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033225 6 0.0405 0.781 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000 0.988
#> SRR1033224 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0458 0.907 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.3921 0.572 0.000 0.800 0.044 0.032 0.120 0.004
#> SRR1033230 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0458 0.907 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0972 0.896 0.000 0.964 0.008 0.028 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0458 0.907 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 6 0.6811 0.174 0.124 0.000 0.104 0.328 0.000 0.444
#> SRR1033249 2 0.0458 0.907 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0363 0.908 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0260 0.908 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0260 0.908 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0146 0.908 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0458 0.907 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 4 0.3789 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0260 0.908 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 5 0.2860 0.883 0.000 0.000 0.032 0.028 0.872 0.068
#> SRR1033275 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.2365 0.777 0.000 0.888 0.040 0.072 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.995 0.998 0.265 0.735 0.735
#> 3 3 0.624 0.844 0.870 0.931 0.654 0.533
#> 4 4 0.563 0.814 0.853 0.166 0.855 0.677
#> 5 5 0.614 0.693 0.811 0.131 0.961 0.895
#> 6 6 0.610 0.609 0.775 0.083 0.827 0.553
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.9248 0.490 0.340 0.660
#> SRR1032921 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032932 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.4161 0.907 0.916 0.084
#> SRR1032943 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033000 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033061 1 0.7883 0.688 0.764 0.236
#> SRR1033062 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033073 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0376 0.987 0.004 0.996
#> SRR1033087 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033120 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033129 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033171 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.7219 0.751 0.200 0.800
#> SRR1033180 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033217 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033247 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.1753 0.888 0.952 0.000 0.048
#> SRR1032918 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 3 0.6307 -0.580 0.000 0.488 0.512
#> SRR1032921 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.4796 0.526 0.780 0.000 0.220
#> SRR1032923 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032924 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032932 3 0.0592 0.489 0.012 0.000 0.988
#> SRR1032933 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032938 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.2448 0.846 0.924 0.000 0.076
#> SRR1032940 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 3 0.0424 0.481 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032943 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032944 1 0.1411 0.903 0.964 0.000 0.036
#> SRR1032945 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032950 1 0.2261 0.859 0.932 0.000 0.068
#> SRR1032951 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032957 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.4121 0.720 0.168 0.000 0.832
#> SRR1032963 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 3 0.3752 0.690 0.144 0.000 0.856
#> SRR1032968 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.3941 0.692 0.844 0.000 0.156
#> SRR1032970 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.0424 0.482 0.008 0.000 0.992
#> SRR1032978 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032980 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032988 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.5948 0.861 0.360 0.000 0.640
#> SRR1032989 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032992 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.3340 0.767 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032995 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.4399 0.616 0.812 0.000 0.188
#> SRR1032999 2 0.5178 0.839 0.000 0.744 0.256
#> SRR1033000 3 0.0424 0.482 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033001 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033004 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033005 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.6308 -0.599 0.508 0.000 0.492
#> SRR1033007 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.5948 0.862 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033011 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033012 1 0.0424 0.937 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033013 1 0.1753 0.887 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033014 3 0.6008 0.852 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033015 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033016 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033017 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.5968 0.859 0.364 0.000 0.636
#> SRR1033019 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033020 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.6244 -0.438 0.560 0.000 0.440
#> SRR1033023 1 0.0237 0.941 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033022 3 0.6252 0.741 0.444 0.000 0.556
#> SRR1033024 3 0.6154 0.808 0.408 0.000 0.592
#> SRR1033025 1 0.5363 0.329 0.724 0.000 0.276
#> SRR1033026 3 0.6168 0.802 0.412 0.000 0.588
#> SRR1033027 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033028 3 0.5968 0.859 0.364 0.000 0.636
#> SRR1033029 2 0.5216 0.837 0.000 0.740 0.260
#> SRR1033030 3 0.5882 0.865 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033031 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033032 3 0.5835 0.860 0.340 0.000 0.660
#> SRR1033033 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033035 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033034 1 0.6305 -0.578 0.516 0.000 0.484
#> SRR1033036 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033037 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.5678 0.841 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033039 3 0.6180 0.796 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033040 3 0.6079 0.835 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033041 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033042 3 0.6140 0.814 0.404 0.000 0.596
#> SRR1033043 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033046 1 0.0592 0.932 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033047 3 0.6026 0.848 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033048 1 0.5058 0.448 0.756 0.000 0.244
#> SRR1033049 1 0.5016 0.461 0.760 0.000 0.240
#> SRR1033051 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033054 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033050 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.5760 0.853 0.328 0.000 0.672
#> SRR1033056 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 3 0.6307 0.650 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033058 3 0.5760 0.853 0.328 0.000 0.672
#> SRR1033059 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033060 1 0.5560 0.232 0.700 0.000 0.300
#> SRR1033061 3 0.0592 0.456 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033062 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033063 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033064 3 0.5926 0.864 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033065 3 0.5948 0.861 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033066 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033067 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.6140 0.814 0.404 0.000 0.596
#> SRR1033069 3 0.3482 0.669 0.128 0.000 0.872
#> SRR1033070 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033071 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033072 3 0.0592 0.489 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033073 3 0.5733 0.850 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033074 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033077 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.5988 0.855 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033080 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033081 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033083 3 0.6079 0.835 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033084 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.5988 0.856 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033086 3 0.0892 0.450 0.000 0.020 0.980
#> SRR1033087 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.5882 0.865 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033089 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.5926 0.864 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033092 1 0.6295 -0.542 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033093 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033094 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033095 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033096 3 0.5948 0.862 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033097 2 0.4750 0.863 0.000 0.784 0.216
#> SRR1033098 3 0.5926 0.864 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033099 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033100 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033101 1 0.4399 0.615 0.812 0.000 0.188
#> SRR1033102 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.1860 0.885 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033104 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033105 1 0.0237 0.941 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033106 1 0.0237 0.941 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033107 1 0.6225 -0.409 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033108 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033111 1 0.2066 0.870 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033112 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.5785 0.856 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033114 3 0.6260 0.740 0.448 0.000 0.552
#> SRR1033115 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033116 3 0.6307 0.649 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033117 3 0.5882 0.865 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033118 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.1163 0.914 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033121 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033120 3 0.0424 0.482 0.008 0.000 0.992
#> SRR1033122 1 0.0237 0.941 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033123 3 0.6026 0.848 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033124 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.5785 0.856 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033126 3 0.5948 0.861 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033127 3 0.3752 0.690 0.144 0.000 0.856
#> SRR1033129 3 0.6079 0.835 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033128 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033130 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.5785 0.856 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033133 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033134 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033136 1 0.2165 0.868 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033137 3 0.5882 0.865 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033139 3 0.4002 0.710 0.160 0.000 0.840
#> SRR1033138 3 0.5859 0.863 0.344 0.000 0.656
#> SRR1033140 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033141 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 3 0.6008 0.852 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033145 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033146 3 0.3192 0.647 0.112 0.000 0.888
#> SRR1033147 3 0.3340 0.658 0.120 0.000 0.880
#> SRR1033148 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.5785 0.856 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033150 1 0.2066 0.873 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033151 3 0.5785 0.856 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033152 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033153 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033154 3 0.6026 0.847 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033156 3 0.6305 0.659 0.484 0.000 0.516
#> SRR1033157 1 0.5098 0.450 0.752 0.000 0.248
#> SRR1033158 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033159 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033160 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033161 1 0.0237 0.941 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033163 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033162 3 0.6252 0.749 0.444 0.000 0.556
#> SRR1033164 3 0.5058 0.782 0.244 0.000 0.756
#> SRR1033165 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033167 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033168 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033169 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033171 3 0.2448 0.593 0.076 0.000 0.924
#> SRR1033170 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033173 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033175 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 3 0.6225 0.769 0.432 0.000 0.568
#> SRR1033177 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033179 3 0.6308 -0.586 0.000 0.492 0.508
#> SRR1033180 3 0.6215 0.777 0.428 0.000 0.572
#> SRR1033181 3 0.5988 0.854 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033183 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033182 1 0.6045 -0.143 0.620 0.000 0.380
#> SRR1033184 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033185 3 0.6267 0.728 0.452 0.000 0.548
#> SRR1033187 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033186 3 0.5882 0.865 0.348 0.000 0.652
#> SRR1033188 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.0592 0.489 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033190 3 0.5926 0.864 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033191 3 0.6095 0.829 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033192 3 0.0592 0.489 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033193 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.5835 0.780 0.000 0.660 0.340
#> SRR1033194 3 0.3752 0.265 0.000 0.144 0.856
#> SRR1033197 3 0.6291 0.698 0.468 0.000 0.532
#> SRR1033196 3 0.5926 0.864 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033199 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033198 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.5926 0.864 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033202 1 0.2448 0.846 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033203 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033204 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033209 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033210 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033211 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033212 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033213 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033214 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.2878 0.623 0.096 0.000 0.904
#> SRR1033217 3 0.6215 0.777 0.428 0.000 0.572
#> SRR1033218 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033220 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033222 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0424 0.937 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033225 2 0.5760 0.789 0.000 0.672 0.328
#> SRR1033224 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.6309 -0.591 0.504 0.000 0.496
#> SRR1033227 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033230 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.6026 0.846 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033236 1 0.0747 0.928 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033237 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.6095 0.830 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033239 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033244 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033243 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033245 1 0.6215 -0.391 0.572 0.000 0.428
#> SRR1033246 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.0592 0.489 0.012 0.000 0.988
#> SRR1033249 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033251 1 0.4750 0.550 0.784 0.000 0.216
#> SRR1033252 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.6095 0.827 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033258 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.6244 0.756 0.440 0.000 0.560
#> SRR1033262 3 0.6126 0.819 0.400 0.000 0.600
#> SRR1033263 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033266 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0424 0.937 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033268 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033270 3 0.6267 0.730 0.452 0.000 0.548
#> SRR1033271 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.979 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.5138 0.842 0.000 0.748 0.252
#> SRR1033275 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0237 0.979 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033277 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033280 3 0.5905 0.866 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033281 1 0.0000 0.944 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0747 0.931 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033283 1 0.0747 0.931 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033284 1 0.0747 0.931 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033285 1 0.2261 0.865 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033286 1 0.2261 0.865 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033287 1 0.2261 0.865 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033288 1 0.2261 0.865 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033289 1 0.2261 0.865 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033290 1 0.2261 0.865 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033291 1 0.0747 0.931 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033292 1 0.0747 0.931 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033293 1 0.0747 0.931 0.984 0.000 0.016
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.3123 0.9154 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1032911 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032912 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032913 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032914 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032915 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032916 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032917 3 0.5147 -0.1066 0.460 0.000 0.536 0.004
#> SRR1032918 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032919 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032920 4 0.4837 0.6680 0.120 0.076 0.008 0.796
#> SRR1032921 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1032922 3 0.4957 0.5171 0.300 0.000 0.684 0.016
#> SRR1032923 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032925 2 0.1284 0.9772 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1032924 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032926 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032927 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032929 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032928 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032930 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032931 2 0.1004 0.9815 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR1032932 4 0.3873 0.7737 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1032933 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032934 1 0.4609 0.9194 0.788 0.000 0.156 0.056
#> SRR1032935 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032936 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032937 2 0.1284 0.9772 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1032938 1 0.3910 0.9162 0.820 0.000 0.156 0.024
#> SRR1032939 3 0.5364 0.2255 0.392 0.000 0.592 0.016
#> SRR1032940 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032941 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032942 4 0.4513 0.7211 0.120 0.000 0.076 0.804
#> SRR1032943 2 0.1284 0.9772 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1032944 1 0.5466 0.3942 0.548 0.000 0.436 0.016
#> SRR1032945 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032946 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032947 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032948 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032949 2 0.1151 0.9796 0.024 0.968 0.000 0.008
#> SRR1032950 3 0.5408 0.1612 0.408 0.000 0.576 0.016
#> SRR1032951 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032952 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032953 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032954 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032955 2 0.0895 0.9834 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1032957 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032956 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1032958 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032959 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032960 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032961 1 0.4532 0.9194 0.792 0.000 0.156 0.052
#> SRR1032962 3 0.2408 0.6805 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1032963 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032964 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032965 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032966 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032967 4 0.6562 0.4692 0.080 0.000 0.404 0.516
#> SRR1032968 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032969 1 0.5755 0.7167 0.624 0.000 0.332 0.044
#> SRR1032970 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032971 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032972 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032973 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032974 1 0.4452 0.9204 0.796 0.000 0.156 0.048
#> SRR1032975 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032976 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032977 4 0.4188 0.7653 0.004 0.000 0.244 0.752
#> SRR1032978 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1032979 2 0.1284 0.9772 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1032980 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032981 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032982 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032983 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032984 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032985 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032986 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032987 2 0.0188 0.9903 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032988 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032990 3 0.1610 0.8530 0.032 0.000 0.952 0.016
#> SRR1032989 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032991 2 0.1284 0.9772 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1032992 1 0.3808 0.9016 0.812 0.000 0.176 0.012
#> SRR1032993 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032994 1 0.5409 0.2154 0.496 0.000 0.492 0.012
#> SRR1032995 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032996 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032997 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1032998 3 0.5237 0.3534 0.356 0.000 0.628 0.016
#> SRR1032999 4 0.6357 0.5235 0.124 0.232 0.000 0.644
#> SRR1033000 4 0.4188 0.7653 0.004 0.000 0.244 0.752
#> SRR1033001 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033002 1 0.5075 0.6661 0.644 0.000 0.344 0.012
#> SRR1033003 2 0.1284 0.9772 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR1033004 2 0.0188 0.9903 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033005 1 0.4638 0.9095 0.776 0.000 0.180 0.044
#> SRR1033006 3 0.2408 0.7942 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1033007 1 0.4532 0.9199 0.792 0.000 0.156 0.052
#> SRR1033008 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033009 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033010 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 3 0.5506 -0.1028 0.472 0.000 0.512 0.016
#> SRR1033013 3 0.5558 -0.1174 0.432 0.000 0.548 0.020
#> SRR1033014 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033015 3 0.1297 0.8555 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033019 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033020 1 0.3625 0.9116 0.828 0.000 0.160 0.012
#> SRR1033021 3 0.4744 0.5286 0.284 0.000 0.704 0.012
#> SRR1033023 1 0.5337 0.4441 0.564 0.000 0.424 0.012
#> SRR1033022 3 0.2699 0.8338 0.068 0.000 0.904 0.028
#> SRR1033024 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033025 3 0.5643 0.1012 0.428 0.000 0.548 0.024
#> SRR1033026 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033029 4 0.6327 0.5292 0.124 0.228 0.000 0.648
#> SRR1033030 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033031 3 0.1297 0.8555 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR1033032 3 0.1297 0.8555 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 3 0.5343 0.4583 0.316 0.000 0.656 0.028
#> SRR1033036 3 0.2546 0.8357 0.060 0.000 0.912 0.028
#> SRR1033037 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033038 3 0.1297 0.8555 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR1033039 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033040 3 0.1629 0.8548 0.024 0.000 0.952 0.024
#> SRR1033041 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033042 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033043 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033044 1 0.4485 0.8231 0.740 0.000 0.248 0.012
#> SRR1033045 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033046 1 0.5406 0.2569 0.508 0.000 0.480 0.012
#> SRR1033047 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033048 3 0.5057 0.4039 0.340 0.000 0.648 0.012
#> SRR1033049 3 0.5693 -0.1102 0.472 0.000 0.504 0.024
#> SRR1033051 1 0.3625 0.9115 0.828 0.000 0.160 0.012
#> SRR1033052 1 0.5300 0.4897 0.580 0.000 0.408 0.012
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.1182 0.8536 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1033050 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033055 3 0.0188 0.8438 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033056 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033057 3 0.2915 0.8268 0.080 0.000 0.892 0.028
#> SRR1033058 3 0.0188 0.8438 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.3307 0.8037 0.104 0.000 0.868 0.028
#> SRR1033061 4 0.4053 0.7737 0.004 0.000 0.228 0.768
#> SRR1033062 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033065 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033066 3 0.2546 0.8357 0.060 0.000 0.912 0.028
#> SRR1033067 1 0.3672 0.9095 0.824 0.000 0.164 0.012
#> SRR1033068 3 0.1174 0.8565 0.020 0.000 0.968 0.012
#> SRR1033069 3 0.3764 0.4923 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1033070 3 0.1174 0.8565 0.020 0.000 0.968 0.012
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 4 0.4328 0.7667 0.008 0.000 0.244 0.748
#> SRR1033073 3 0.0188 0.8438 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033074 1 0.3695 0.9143 0.828 0.000 0.156 0.016
#> SRR1033075 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033076 3 0.1182 0.8536 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1033077 1 0.5372 0.4184 0.544 0.000 0.444 0.012
#> SRR1033078 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033079 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033080 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033081 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033082 3 0.1520 0.8553 0.020 0.000 0.956 0.024
#> SRR1033083 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033084 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033085 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033086 4 0.4053 0.7737 0.004 0.000 0.228 0.768
#> SRR1033087 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033088 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033089 1 0.5836 0.7568 0.640 0.000 0.304 0.056
#> SRR1033090 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033091 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033092 3 0.5157 0.5518 0.284 0.000 0.688 0.028
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.1182 0.8536 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1033095 2 0.0657 0.9868 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1033096 3 0.0817 0.8579 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033097 4 0.4428 0.5189 0.004 0.276 0.000 0.720
#> SRR1033098 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.5691 -0.2418 0.468 0.000 0.508 0.024
#> SRR1033102 1 0.3450 0.9141 0.836 0.000 0.156 0.008
#> SRR1033103 3 0.5329 0.0863 0.420 0.000 0.568 0.012
#> SRR1033104 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033105 3 0.5398 0.1659 0.404 0.000 0.580 0.016
#> SRR1033106 3 0.4957 0.4456 0.320 0.000 0.668 0.012
#> SRR1033107 3 0.4134 0.5689 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1033108 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033109 1 0.4387 0.8450 0.752 0.000 0.236 0.012
#> SRR1033110 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033111 1 0.5774 0.2646 0.508 0.000 0.464 0.028
#> SRR1033112 1 0.4284 0.8542 0.764 0.000 0.224 0.012
#> SRR1033113 3 0.0592 0.8374 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033114 3 0.2773 0.8328 0.072 0.000 0.900 0.028
#> SRR1033115 3 0.1936 0.8489 0.032 0.000 0.940 0.028
#> SRR1033116 3 0.1302 0.8471 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1033117 3 0.0592 0.8555 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033118 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033119 1 0.5506 0.2772 0.512 0.000 0.472 0.016
#> SRR1033121 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033120 4 0.4053 0.7737 0.004 0.000 0.228 0.768
#> SRR1033122 1 0.5619 0.7423 0.640 0.000 0.320 0.040
#> SRR1033123 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033124 1 0.4212 0.8637 0.772 0.000 0.216 0.012
#> SRR1033125 3 0.0592 0.8374 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033126 3 0.2546 0.8357 0.060 0.000 0.912 0.028
#> SRR1033127 4 0.6491 0.4543 0.072 0.000 0.432 0.496
#> SRR1033129 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033128 3 0.1510 0.8536 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1033130 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033131 1 0.5408 0.2571 0.500 0.000 0.488 0.012
#> SRR1033132 3 0.0592 0.8374 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033133 3 0.2124 0.8457 0.040 0.000 0.932 0.028
#> SRR1033134 1 0.3910 0.9194 0.820 0.000 0.156 0.024
#> SRR1033135 3 0.0592 0.8555 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033136 3 0.5233 0.4063 0.332 0.000 0.648 0.020
#> SRR1033137 3 0.0779 0.8423 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1033139 3 0.3172 0.5926 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1033138 3 0.1059 0.8506 0.012 0.000 0.972 0.016
#> SRR1033140 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033141 1 0.3852 0.8987 0.808 0.000 0.180 0.012
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033144 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033145 3 0.0592 0.8555 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033146 3 0.3528 0.5346 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1033147 3 0.2921 0.6185 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1033148 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033149 3 0.0188 0.8438 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033150 1 0.5204 0.6115 0.612 0.000 0.376 0.012
#> SRR1033151 3 0.0592 0.8374 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1033152 1 0.4718 0.7869 0.708 0.000 0.280 0.012
#> SRR1033153 3 0.1297 0.8543 0.016 0.000 0.964 0.020
#> SRR1033154 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033156 3 0.0817 0.8573 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033157 3 0.3913 0.7580 0.148 0.000 0.824 0.028
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033160 3 0.0592 0.8555 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033161 1 0.4606 0.8104 0.724 0.000 0.264 0.012
#> SRR1033163 3 0.1059 0.8506 0.012 0.000 0.972 0.016
#> SRR1033162 3 0.2915 0.8268 0.080 0.000 0.892 0.028
#> SRR1033164 3 0.2345 0.7272 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1033165 1 0.4609 0.9194 0.788 0.000 0.156 0.056
#> SRR1033166 3 0.1182 0.8536 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.4331 0.3028 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1033170 1 0.4936 0.7231 0.672 0.000 0.316 0.012
#> SRR1033172 3 0.0592 0.8555 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033175 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033176 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.1174 0.9795 0.020 0.968 0.000 0.012
#> SRR1033179 4 0.4762 0.6641 0.120 0.080 0.004 0.796
#> SRR1033180 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033181 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033183 3 0.0592 0.8555 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033182 3 0.2623 0.8342 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033184 3 0.1520 0.8558 0.024 0.000 0.956 0.020
#> SRR1033185 3 0.2845 0.8288 0.076 0.000 0.896 0.028
#> SRR1033187 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033186 3 0.1182 0.8536 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1033188 1 0.4532 0.9199 0.792 0.000 0.156 0.052
#> SRR1033189 4 0.5010 0.7236 0.120 0.000 0.108 0.772
#> SRR1033190 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033191 3 0.2623 0.8358 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1033192 4 0.4955 0.4803 0.000 0.000 0.444 0.556
#> SRR1033193 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033195 4 0.4581 0.6627 0.120 0.080 0.000 0.800
#> SRR1033194 4 0.4198 0.7729 0.004 0.004 0.224 0.768
#> SRR1033197 3 0.2984 0.8237 0.084 0.000 0.888 0.028
#> SRR1033196 3 0.1297 0.8555 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR1033199 2 0.0524 0.9881 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1033198 1 0.3306 0.9148 0.840 0.000 0.156 0.004
#> SRR1033200 1 0.3577 0.9177 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033201 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033202 1 0.5685 0.4226 0.516 0.000 0.460 0.024
#> SRR1033203 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033204 1 0.3123 0.9154 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033205 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033206 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033207 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033208 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033209 1 0.3123 0.9154 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033210 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033211 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033212 3 0.0592 0.8555 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033213 2 0.0188 0.9903 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033214 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033216 1 0.3123 0.9154 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033215 3 0.4916 -0.1832 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1033217 3 0.2179 0.8369 0.064 0.000 0.924 0.012
#> SRR1033218 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033219 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033221 2 0.0524 0.9881 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1033220 2 0.0524 0.9881 0.008 0.988 0.000 0.004
#> SRR1033222 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033223 3 0.5392 -0.1095 0.460 0.000 0.528 0.012
#> SRR1033225 4 0.4408 0.5708 0.004 0.232 0.008 0.756
#> SRR1033224 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033226 3 0.2329 0.8334 0.072 0.000 0.916 0.012
#> SRR1033227 1 0.4348 0.8983 0.780 0.000 0.196 0.024
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033231 2 0.1174 0.9795 0.020 0.968 0.000 0.012
#> SRR1033230 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033232 1 0.3123 0.9154 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033233 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0817 0.8572 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033236 3 0.5127 0.3298 0.356 0.000 0.632 0.012
#> SRR1033237 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033238 3 0.5399 -0.1334 0.468 0.000 0.520 0.012
#> SRR1033240 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033239 1 0.4319 0.8543 0.760 0.000 0.228 0.012
#> SRR1033242 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033241 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033244 2 0.0657 0.9868 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.2402 0.8307 0.076 0.000 0.912 0.012
#> SRR1033246 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033248 1 0.3695 0.9143 0.828 0.000 0.156 0.016
#> SRR1033247 4 0.4053 0.7737 0.004 0.000 0.228 0.768
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 3 0.3653 0.7798 0.128 0.000 0.844 0.028
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033254 1 0.3808 0.9028 0.812 0.000 0.176 0.012
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0817 0.8579 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033258 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033257 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033259 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0817 0.8573 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033262 3 0.0707 0.8579 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3695 0.9143 0.828 0.000 0.156 0.016
#> SRR1033265 2 0.0937 0.9835 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR1033266 3 0.5392 -0.0967 0.460 0.000 0.528 0.012
#> SRR1033267 1 0.4382 0.7687 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1033268 1 0.5038 0.6734 0.652 0.000 0.336 0.012
#> SRR1033269 3 0.1182 0.8536 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1033270 3 0.0817 0.8573 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033271 1 0.3577 0.9131 0.832 0.000 0.156 0.012
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9915 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4137 0.8756 0.780 0.000 0.208 0.012
#> SRR1033274 4 0.6357 0.5235 0.124 0.232 0.000 0.644
#> SRR1033275 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033276 2 0.0804 0.9854 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR1033277 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033278 1 0.4370 0.9207 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR1033279 3 0.1059 0.8547 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR1033280 3 0.1174 0.8565 0.020 0.000 0.968 0.012
#> SRR1033281 1 0.3672 0.9099 0.824 0.000 0.164 0.012
#> SRR1033282 1 0.4103 0.8133 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1033283 1 0.4103 0.8133 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1033284 1 0.4103 0.8133 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1033285 1 0.4277 0.7814 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1033286 1 0.4277 0.7814 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1033287 1 0.4277 0.7814 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1033288 1 0.4277 0.7814 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1033289 1 0.4277 0.7814 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1033290 1 0.4277 0.7814 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1033291 1 0.4103 0.8133 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1033292 1 0.4103 0.8133 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1033293 1 0.4103 0.8133 0.744 0.000 0.256 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.1544 0.8096 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1032911 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.4425 0.2532 0.392 0.000 0.600 0.000 0.008
#> SRR1032918 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 5 0.5212 0.0145 0.000 0.036 0.004 0.420 0.540
#> SRR1032921 1 0.2966 0.7775 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1032922 3 0.6763 0.2735 0.280 0.000 0.396 0.000 0.324
#> SRR1032923 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.2653 0.9409 0.000 0.900 0.020 0.028 0.052
#> SRR1032924 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.2418 0.9465 0.000 0.912 0.020 0.024 0.044
#> SRR1032932 4 0.2793 0.7936 0.000 0.000 0.088 0.876 0.036
#> SRR1032933 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.1270 0.8115 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1032935 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.2815 0.9361 0.000 0.892 0.024 0.028 0.056
#> SRR1032938 1 0.2605 0.7910 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1032939 1 0.6820 -0.0942 0.352 0.000 0.316 0.000 0.332
#> SRR1032940 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 5 0.4948 -0.0565 0.000 0.000 0.028 0.436 0.536
#> SRR1032943 2 0.2599 0.9424 0.000 0.904 0.024 0.028 0.044
#> SRR1032944 1 0.6486 0.3119 0.472 0.000 0.204 0.000 0.324
#> SRR1032945 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.2653 0.9409 0.000 0.900 0.020 0.028 0.052
#> SRR1032950 1 0.6812 -0.0593 0.364 0.000 0.324 0.000 0.312
#> SRR1032951 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.1997 0.9543 0.000 0.932 0.016 0.024 0.028
#> SRR1032957 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.2773 0.7852 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1032958 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.1410 0.8100 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1032962 3 0.4375 0.7102 0.016 0.000 0.780 0.056 0.148
#> SRR1032963 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 5 0.7026 -0.2048 0.012 0.000 0.284 0.280 0.424
#> SRR1032968 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.3109 0.6706 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0880 0.8146 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1032975 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 4 0.2740 0.7908 0.000 0.000 0.096 0.876 0.028
#> SRR1032978 1 0.3003 0.7758 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1032979 2 0.2581 0.9420 0.000 0.904 0.020 0.028 0.048
#> SRR1032980 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0693 0.9670 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1032988 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.3734 0.7538 0.036 0.000 0.796 0.000 0.168
#> SRR1032989 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.2507 0.9440 0.000 0.908 0.020 0.028 0.044
#> SRR1032992 1 0.3663 0.7542 0.776 0.000 0.016 0.000 0.208
#> SRR1032993 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.6656 0.2152 0.440 0.000 0.252 0.000 0.308
#> SRR1032995 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 3 0.6764 0.1708 0.364 0.000 0.368 0.000 0.268
#> SRR1032999 5 0.5947 0.0664 0.000 0.132 0.000 0.312 0.556
#> SRR1033000 4 0.2740 0.7908 0.000 0.000 0.096 0.876 0.028
#> SRR1033001 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.6175 0.4288 0.528 0.000 0.160 0.000 0.312
#> SRR1033003 2 0.2581 0.9420 0.000 0.904 0.020 0.028 0.048
#> SRR1033004 2 0.0693 0.9670 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033005 1 0.0290 0.8143 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.2971 0.6394 0.156 0.000 0.836 0.000 0.008
#> SRR1033007 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.2852 0.7828 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033009 1 0.2966 0.7770 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033010 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033012 1 0.6759 0.0638 0.396 0.000 0.276 0.000 0.328
#> SRR1033013 3 0.4066 0.3764 0.324 0.000 0.672 0.000 0.004
#> SRR1033014 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.3772 0.7502 0.036 0.000 0.792 0.000 0.172
#> SRR1033016 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033017 2 0.0162 0.9689 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033018 3 0.3012 0.7554 0.036 0.000 0.860 0.000 0.104
#> SRR1033019 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.3861 0.7006 0.712 0.000 0.004 0.000 0.284
#> SRR1033021 3 0.6576 0.2506 0.340 0.000 0.444 0.000 0.216
#> SRR1033023 1 0.6497 0.3142 0.472 0.000 0.208 0.000 0.320
#> SRR1033022 3 0.5014 0.6396 0.040 0.000 0.592 0.000 0.368
#> SRR1033024 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033025 1 0.6728 0.1109 0.412 0.000 0.268 0.000 0.320
#> SRR1033026 3 0.1205 0.7387 0.040 0.000 0.956 0.000 0.004
#> SRR1033027 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033028 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033029 5 0.5925 0.0665 0.000 0.128 0.000 0.316 0.556
#> SRR1033030 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033031 3 0.4404 0.7238 0.036 0.000 0.712 0.000 0.252
#> SRR1033032 3 0.2491 0.7492 0.036 0.000 0.896 0.000 0.068
#> SRR1033033 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033035 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033034 1 0.6795 -0.1462 0.364 0.000 0.348 0.000 0.288
#> SRR1033036 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033037 1 0.3210 0.7596 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1033038 3 0.4297 0.7313 0.036 0.000 0.728 0.000 0.236
#> SRR1033039 3 0.1364 0.7452 0.036 0.000 0.952 0.000 0.012
#> SRR1033040 3 0.4021 0.7458 0.036 0.000 0.764 0.000 0.200
#> SRR1033041 1 0.3766 0.7133 0.728 0.000 0.004 0.000 0.268
#> SRR1033042 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033043 1 0.2891 0.7805 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1033044 1 0.4755 0.6762 0.696 0.000 0.060 0.000 0.244
#> SRR1033045 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.6557 0.1144 0.440 0.000 0.352 0.000 0.208
#> SRR1033047 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033048 3 0.6705 0.1689 0.364 0.000 0.392 0.000 0.244
#> SRR1033049 1 0.6608 0.2449 0.456 0.000 0.244 0.000 0.300
#> SRR1033051 1 0.3274 0.7546 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033052 1 0.6486 0.3171 0.472 0.000 0.204 0.000 0.324
#> SRR1033053 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033054 3 0.3734 0.7512 0.036 0.000 0.796 0.000 0.168
#> SRR1033050 1 0.2929 0.7787 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1033055 3 0.0880 0.7382 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.2690 0.7883 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1033057 3 0.5530 0.6019 0.076 0.000 0.556 0.000 0.368
#> SRR1033058 3 0.0880 0.7382 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033060 3 0.5131 0.6339 0.048 0.000 0.588 0.000 0.364
#> SRR1033061 4 0.2676 0.7934 0.000 0.000 0.080 0.884 0.036
#> SRR1033062 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033064 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033065 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033066 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033067 1 0.3491 0.7457 0.768 0.000 0.004 0.000 0.228
#> SRR1033068 3 0.3400 0.7559 0.036 0.000 0.828 0.000 0.136
#> SRR1033069 3 0.6011 0.4568 0.012 0.000 0.612 0.240 0.136
#> SRR1033070 3 0.3734 0.7512 0.036 0.000 0.796 0.000 0.168
#> SRR1033071 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033072 4 0.5056 0.3873 0.000 0.000 0.360 0.596 0.044
#> SRR1033073 3 0.1753 0.7431 0.032 0.000 0.936 0.000 0.032
#> SRR1033074 1 0.2773 0.7852 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1033075 1 0.2813 0.7838 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1033076 3 0.3883 0.7469 0.036 0.000 0.780 0.000 0.184
#> SRR1033077 1 0.6753 0.0912 0.392 0.000 0.268 0.000 0.340
#> SRR1033078 1 0.3305 0.7528 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1033079 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033080 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.3143 0.7647 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1033082 3 0.4716 0.6896 0.036 0.000 0.656 0.000 0.308
#> SRR1033083 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.3366 0.7475 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1033085 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033086 4 0.2616 0.7898 0.000 0.000 0.076 0.888 0.036
#> SRR1033087 1 0.3480 0.7350 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1033088 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.3849 0.6199 0.752 0.000 0.232 0.000 0.016
#> SRR1033090 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033092 3 0.6813 0.2143 0.304 0.000 0.356 0.000 0.340
#> SRR1033093 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033094 3 0.3445 0.7531 0.036 0.000 0.824 0.000 0.140
#> SRR1033095 2 0.1498 0.9608 0.000 0.952 0.008 0.024 0.016
#> SRR1033096 3 0.3214 0.7575 0.036 0.000 0.844 0.000 0.120
#> SRR1033097 4 0.2522 0.6228 0.000 0.108 0.000 0.880 0.012
#> SRR1033098 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0404 0.9675 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033100 2 0.0566 0.9668 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1033101 3 0.4210 0.2196 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.2230 0.8016 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1033103 3 0.6746 0.2669 0.260 0.000 0.380 0.000 0.360
#> SRR1033104 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033105 5 0.6818 -0.2311 0.316 0.000 0.328 0.000 0.356
#> SRR1033106 3 0.6353 0.4548 0.172 0.000 0.480 0.000 0.348
#> SRR1033107 3 0.3766 0.4682 0.268 0.000 0.728 0.000 0.004
#> SRR1033108 1 0.0162 0.8162 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033109 1 0.5069 0.5995 0.620 0.000 0.052 0.000 0.328
#> SRR1033110 3 0.3445 0.7549 0.036 0.000 0.824 0.000 0.140
#> SRR1033111 1 0.6684 0.1408 0.408 0.000 0.240 0.000 0.352
#> SRR1033112 1 0.5144 0.6001 0.632 0.000 0.064 0.000 0.304
#> SRR1033113 3 0.3366 0.7463 0.032 0.000 0.828 0.000 0.140
#> SRR1033114 3 0.5616 0.5949 0.084 0.000 0.552 0.000 0.364
#> SRR1033115 3 0.4880 0.6608 0.036 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1033116 3 0.1282 0.7373 0.044 0.000 0.952 0.000 0.004
#> SRR1033117 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033118 1 0.0290 0.8135 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.6613 0.2385 0.440 0.000 0.228 0.000 0.332
#> SRR1033121 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033120 4 0.2628 0.7954 0.000 0.000 0.088 0.884 0.028
#> SRR1033122 1 0.4436 0.3234 0.596 0.000 0.396 0.000 0.008
#> SRR1033123 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033124 1 0.5156 0.5881 0.620 0.000 0.060 0.000 0.320
#> SRR1033125 3 0.3805 0.7442 0.032 0.000 0.784 0.000 0.184
#> SRR1033126 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033127 3 0.7053 -0.3180 0.016 0.000 0.436 0.248 0.300
#> SRR1033129 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033128 3 0.4820 0.6730 0.036 0.000 0.632 0.000 0.332
#> SRR1033130 1 0.3274 0.7562 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033131 5 0.6815 -0.1948 0.336 0.000 0.308 0.000 0.356
#> SRR1033132 3 0.3769 0.7450 0.032 0.000 0.788 0.000 0.180
#> SRR1033133 3 0.4404 0.7257 0.036 0.000 0.712 0.000 0.252
#> SRR1033134 1 0.0794 0.8152 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033135 3 0.1124 0.7430 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033136 3 0.6631 0.3448 0.224 0.000 0.420 0.000 0.356
#> SRR1033137 3 0.3656 0.7487 0.032 0.000 0.800 0.000 0.168
#> SRR1033139 3 0.5909 0.5075 0.012 0.000 0.632 0.212 0.144
#> SRR1033138 3 0.4378 0.7261 0.036 0.000 0.716 0.000 0.248
#> SRR1033140 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.3807 0.7323 0.748 0.000 0.012 0.000 0.240
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2891 0.7813 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1033144 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033145 3 0.1469 0.7462 0.036 0.000 0.948 0.000 0.016
#> SRR1033146 3 0.6282 0.4832 0.012 0.000 0.584 0.224 0.180
#> SRR1033147 3 0.5909 0.5412 0.012 0.000 0.636 0.192 0.160
#> SRR1033148 1 0.0162 0.8166 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033149 3 0.1041 0.7361 0.032 0.000 0.964 0.000 0.004
#> SRR1033150 1 0.6746 0.1052 0.392 0.000 0.264 0.000 0.344
#> SRR1033151 3 0.3805 0.7442 0.032 0.000 0.784 0.000 0.184
#> SRR1033152 1 0.5967 0.4978 0.556 0.000 0.136 0.000 0.308
#> SRR1033153 3 0.4087 0.7428 0.036 0.000 0.756 0.000 0.208
#> SRR1033154 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033156 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033157 3 0.5844 0.5570 0.104 0.000 0.528 0.000 0.368
#> SRR1033158 2 0.0693 0.9670 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033159 3 0.1124 0.7430 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033160 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.5549 0.6087 0.632 0.000 0.124 0.000 0.244
#> SRR1033163 3 0.3841 0.7437 0.032 0.000 0.780 0.000 0.188
#> SRR1033162 3 0.5770 0.5725 0.096 0.000 0.532 0.000 0.372
#> SRR1033164 3 0.4406 0.7177 0.024 0.000 0.788 0.060 0.128
#> SRR1033165 1 0.1478 0.8091 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1033166 3 0.4087 0.7414 0.036 0.000 0.756 0.000 0.208
#> SRR1033167 2 0.0693 0.9670 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033168 3 0.1836 0.7498 0.036 0.000 0.932 0.000 0.032
#> SRR1033169 2 0.0693 0.9670 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033171 3 0.5985 0.4220 0.012 0.000 0.608 0.256 0.124
#> SRR1033170 1 0.5864 0.4953 0.560 0.000 0.120 0.000 0.320
#> SRR1033172 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0963 0.7418 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.3039 0.7737 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1033176 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033177 2 0.0162 0.9689 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033178 2 0.2333 0.9481 0.000 0.916 0.016 0.028 0.040
#> SRR1033179 5 0.5272 0.0204 0.000 0.040 0.004 0.416 0.540
#> SRR1033180 3 0.5080 0.6365 0.044 0.000 0.588 0.000 0.368
#> SRR1033181 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033183 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033182 3 0.4969 0.6374 0.036 0.000 0.588 0.000 0.376
#> SRR1033184 3 0.3883 0.7504 0.036 0.000 0.780 0.000 0.184
#> SRR1033185 3 0.5297 0.6227 0.060 0.000 0.580 0.000 0.360
#> SRR1033187 1 0.2732 0.7888 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1033186 3 0.4404 0.7242 0.036 0.000 0.712 0.000 0.252
#> SRR1033188 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 5 0.5605 -0.0778 0.000 0.000 0.076 0.404 0.520
#> SRR1033190 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033191 3 0.4958 0.6413 0.036 0.000 0.592 0.000 0.372
#> SRR1033192 4 0.5856 0.3008 0.000 0.000 0.396 0.504 0.100
#> SRR1033193 1 0.2966 0.7781 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033195 5 0.5125 0.0203 0.000 0.040 0.000 0.416 0.544
#> SRR1033194 4 0.2775 0.7778 0.000 0.008 0.068 0.888 0.036
#> SRR1033197 3 0.5449 0.6051 0.068 0.000 0.556 0.000 0.376
#> SRR1033196 3 0.4119 0.7408 0.036 0.000 0.752 0.000 0.212
#> SRR1033199 2 0.1498 0.9603 0.000 0.952 0.008 0.024 0.016
#> SRR1033198 1 0.1732 0.8083 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1033200 1 0.0963 0.8144 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033201 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033202 3 0.4446 -0.0256 0.476 0.000 0.520 0.000 0.004
#> SRR1033203 3 0.2554 0.7537 0.036 0.000 0.892 0.000 0.072
#> SRR1033204 1 0.1608 0.8090 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033205 1 0.1205 0.7926 0.956 0.000 0.040 0.000 0.004
#> SRR1033206 1 0.3305 0.7554 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1033207 1 0.2966 0.7781 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033208 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033209 1 0.1792 0.8071 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1033210 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033211 1 0.3074 0.7734 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1033212 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033213 2 0.0693 0.9670 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033214 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.1608 0.8090 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1033215 3 0.5261 0.1302 0.012 0.000 0.628 0.316 0.044
#> SRR1033217 3 0.4062 0.7430 0.040 0.000 0.764 0.000 0.196
#> SRR1033218 1 0.3003 0.7760 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033219 1 0.2773 0.7864 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1033221 2 0.1893 0.9558 0.000 0.936 0.012 0.024 0.028
#> SRR1033220 2 0.1780 0.9568 0.000 0.940 0.008 0.024 0.028
#> SRR1033222 1 0.3177 0.7645 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1033223 3 0.6818 0.1698 0.316 0.000 0.356 0.000 0.328
#> SRR1033225 4 0.2358 0.6284 0.000 0.104 0.000 0.888 0.008
#> SRR1033224 1 0.0290 0.8162 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033226 3 0.4425 0.7221 0.040 0.000 0.716 0.000 0.244
#> SRR1033227 1 0.3236 0.7167 0.828 0.000 0.152 0.000 0.020
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0609 0.8158 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033231 2 0.2693 0.9377 0.000 0.896 0.016 0.028 0.060
#> SRR1033230 1 0.2648 0.7910 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1033232 1 0.1410 0.8111 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1033233 1 0.3003 0.7763 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.2291 0.7522 0.036 0.000 0.908 0.000 0.056
#> SRR1033236 3 0.5877 0.4536 0.244 0.000 0.596 0.000 0.160
#> SRR1033237 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.4894 0.3070 0.352 0.000 0.612 0.000 0.036
#> SRR1033240 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033239 1 0.5051 0.6566 0.664 0.000 0.072 0.000 0.264
#> SRR1033242 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.1251 0.7420 0.036 0.000 0.956 0.000 0.008
#> SRR1033244 2 0.1885 0.9565 0.000 0.936 0.012 0.020 0.032
#> SRR1033243 2 0.1186 0.9634 0.000 0.964 0.008 0.020 0.008
#> SRR1033245 3 0.4325 0.7194 0.036 0.000 0.724 0.000 0.240
#> SRR1033246 1 0.3534 0.7284 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1033248 1 0.2424 0.7964 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033247 4 0.2654 0.7951 0.000 0.000 0.084 0.884 0.032
#> SRR1033249 2 0.0162 0.9689 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033250 2 0.1059 0.9643 0.000 0.968 0.008 0.020 0.004
#> SRR1033251 3 0.5480 0.6001 0.072 0.000 0.560 0.000 0.368
#> SRR1033252 2 0.0162 0.9691 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033253 1 0.2813 0.7843 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1033254 1 0.3661 0.7108 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1033256 2 0.0162 0.9691 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033255 3 0.2676 0.7551 0.036 0.000 0.884 0.000 0.080
#> SRR1033258 1 0.2813 0.7846 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1033257 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0404 0.8162 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033260 2 0.0162 0.9691 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033261 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033262 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033263 2 0.0162 0.9689 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033264 1 0.2966 0.7766 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033265 2 0.2395 0.9469 0.000 0.912 0.016 0.024 0.048
#> SRR1033266 5 0.6826 -0.2153 0.332 0.000 0.332 0.000 0.336
#> SRR1033267 1 0.5218 0.4745 0.624 0.000 0.308 0.000 0.068
#> SRR1033268 1 0.6245 0.4043 0.516 0.000 0.168 0.000 0.316
#> SRR1033269 3 0.3734 0.7512 0.036 0.000 0.796 0.000 0.168
#> SRR1033270 3 0.1124 0.7399 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1033271 1 0.2929 0.7797 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9689 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4946 0.6370 0.648 0.000 0.052 0.000 0.300
#> SRR1033274 5 0.5947 0.0664 0.000 0.132 0.000 0.312 0.556
#> SRR1033275 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.2217 0.9510 0.000 0.920 0.012 0.024 0.044
#> SRR1033277 1 0.0290 0.8162 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033278 1 0.0000 0.8167 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.3772 0.7503 0.036 0.000 0.792 0.000 0.172
#> SRR1033280 3 0.3695 0.7520 0.036 0.000 0.800 0.000 0.164
#> SRR1033281 1 0.4575 0.6293 0.648 0.000 0.024 0.000 0.328
#> SRR1033282 1 0.4779 0.6775 0.748 0.000 0.124 0.008 0.120
#> SRR1033283 1 0.4779 0.6775 0.748 0.000 0.124 0.008 0.120
#> SRR1033284 1 0.4779 0.6775 0.748 0.000 0.124 0.008 0.120
#> SRR1033285 1 0.5274 0.6133 0.700 0.000 0.160 0.008 0.132
#> SRR1033286 1 0.5274 0.6133 0.700 0.000 0.160 0.008 0.132
#> SRR1033287 1 0.5274 0.6133 0.700 0.000 0.160 0.008 0.132
#> SRR1033288 1 0.5274 0.6133 0.700 0.000 0.160 0.008 0.132
#> SRR1033289 1 0.5274 0.6133 0.700 0.000 0.160 0.008 0.132
#> SRR1033290 1 0.5274 0.6133 0.700 0.000 0.160 0.008 0.132
#> SRR1033291 1 0.4823 0.6730 0.744 0.000 0.128 0.008 0.120
#> SRR1033292 1 0.4823 0.6730 0.744 0.000 0.128 0.008 0.120
#> SRR1033293 1 0.4823 0.6730 0.744 0.000 0.128 0.008 0.120
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.2772 0.7286 0.180 0.000 0.000 0.816 0.004 0.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 4 0.0146 0.8113 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.4810 0.6517 0.140 0.000 0.692 0.160 0.008 0.000
#> SRR1032918 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032920 5 0.2673 0.7642 0.000 0.012 0.004 0.000 0.852 0.132
#> SRR1032921 4 0.3915 0.4847 0.412 0.000 0.000 0.584 0.004 0.000
#> SRR1032922 1 0.2633 0.5880 0.864 0.000 0.020 0.112 0.004 0.000
#> SRR1032923 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.3192 0.8965 0.000 0.836 0.120 0.000 0.024 0.020
#> SRR1032924 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.2882 0.9083 0.000 0.860 0.100 0.000 0.020 0.020
#> SRR1032932 6 0.2222 0.7643 0.008 0.000 0.084 0.000 0.012 0.896
#> SRR1032933 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 4 0.1588 0.7836 0.072 0.000 0.000 0.924 0.004 0.000
#> SRR1032935 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032937 2 0.3235 0.8939 0.000 0.832 0.124 0.000 0.024 0.020
#> SRR1032938 4 0.3584 0.6146 0.308 0.000 0.000 0.688 0.004 0.000
#> SRR1032939 1 0.2593 0.5896 0.844 0.000 0.008 0.148 0.000 0.000
#> SRR1032940 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 5 0.2901 0.7334 0.000 0.000 0.032 0.000 0.840 0.128
#> SRR1032943 2 0.3192 0.8965 0.000 0.836 0.120 0.000 0.024 0.020
#> SRR1032944 1 0.3298 0.4764 0.756 0.000 0.008 0.236 0.000 0.000
#> SRR1032945 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 4 0.0291 0.8107 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.3148 0.8989 0.000 0.840 0.116 0.000 0.024 0.020
#> SRR1032950 1 0.2848 0.5622 0.816 0.000 0.008 0.176 0.000 0.000
#> SRR1032951 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 4 0.0146 0.8121 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032955 2 0.2655 0.9127 0.000 0.872 0.096 0.000 0.012 0.020
#> SRR1032957 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032956 4 0.3636 0.6014 0.320 0.000 0.000 0.676 0.004 0.000
#> SRR1032958 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032961 4 0.2278 0.7574 0.128 0.000 0.000 0.868 0.004 0.000
#> SRR1032962 3 0.6023 0.3972 0.400 0.000 0.468 0.000 0.056 0.076
#> SRR1032963 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032964 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 5 0.5486 0.5191 0.084 0.000 0.148 0.000 0.672 0.096
#> SRR1032968 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032969 4 0.2488 0.7146 0.008 0.000 0.124 0.864 0.004 0.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032974 4 0.0865 0.8023 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1032975 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 6 0.1367 0.7937 0.012 0.000 0.044 0.000 0.000 0.944
#> SRR1032978 4 0.3923 0.4701 0.416 0.000 0.000 0.580 0.004 0.000
#> SRR1032979 2 0.3148 0.8982 0.000 0.840 0.116 0.000 0.024 0.020
#> SRR1032980 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032981 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 4 0.0291 0.8122 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1032984 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0893 0.9451 0.004 0.972 0.016 0.000 0.004 0.004
#> SRR1032988 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.4493 -0.3424 0.548 0.000 0.424 0.004 0.024 0.000
#> SRR1032989 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.3192 0.8965 0.000 0.836 0.120 0.000 0.024 0.020
#> SRR1032992 4 0.3907 0.4835 0.408 0.000 0.000 0.588 0.004 0.000
#> SRR1032993 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.3376 0.5191 0.764 0.000 0.016 0.220 0.000 0.000
#> SRR1032995 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032998 1 0.4761 0.5375 0.688 0.000 0.088 0.212 0.012 0.000
#> SRR1032999 5 0.3165 0.7524 0.000 0.076 0.008 0.000 0.844 0.072
#> SRR1033000 6 0.1367 0.7937 0.012 0.000 0.044 0.000 0.000 0.944
#> SRR1033001 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033002 1 0.3490 0.4151 0.724 0.000 0.008 0.268 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.3192 0.8965 0.000 0.836 0.120 0.000 0.024 0.020
#> SRR1033004 2 0.0893 0.9451 0.004 0.972 0.016 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033005 4 0.0551 0.8060 0.008 0.000 0.004 0.984 0.004 0.000
#> SRR1033006 3 0.4650 0.7791 0.232 0.000 0.684 0.076 0.008 0.000
#> SRR1033007 4 0.0891 0.8072 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1033008 4 0.3872 0.5148 0.392 0.000 0.000 0.604 0.004 0.000
#> SRR1033009 4 0.3881 0.4983 0.396 0.000 0.000 0.600 0.004 0.000
#> SRR1033010 3 0.3536 0.8812 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033011 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033012 1 0.2697 0.5389 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.4655 0.7195 0.164 0.000 0.708 0.120 0.008 0.000
#> SRR1033014 3 0.3429 0.8814 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033015 1 0.4486 -0.2325 0.584 0.000 0.384 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033016 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.4593 -0.4230 0.512 0.000 0.456 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033019 3 0.3476 0.8797 0.260 0.000 0.732 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033020 1 0.3782 0.1603 0.636 0.000 0.000 0.360 0.004 0.000
#> SRR1033021 1 0.5599 0.3994 0.540 0.000 0.152 0.304 0.004 0.000
#> SRR1033023 1 0.3076 0.4643 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0881 0.5633 0.972 0.000 0.012 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033024 3 0.3716 0.8778 0.248 0.000 0.732 0.008 0.012 0.000
#> SRR1033025 1 0.3481 0.5014 0.756 0.000 0.012 0.228 0.004 0.000
#> SRR1033026 3 0.3633 0.8804 0.252 0.000 0.732 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033027 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033028 3 0.3476 0.8802 0.260 0.000 0.732 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033029 5 0.3264 0.7522 0.000 0.076 0.012 0.000 0.840 0.072
#> SRR1033030 3 0.3380 0.8772 0.244 0.000 0.748 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033031 1 0.3441 0.3154 0.784 0.000 0.188 0.004 0.024 0.000
#> SRR1033032 3 0.4428 0.7267 0.340 0.000 0.624 0.004 0.032 0.000
#> SRR1033033 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033035 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033034 1 0.4836 0.4407 0.632 0.000 0.076 0.288 0.004 0.000
#> SRR1033036 1 0.1605 0.5430 0.936 0.000 0.016 0.004 0.044 0.000
#> SRR1033037 4 0.3923 0.4550 0.416 0.000 0.000 0.580 0.004 0.000
#> SRR1033038 1 0.4302 0.2562 0.724 0.000 0.220 0.004 0.040 0.012
#> SRR1033039 3 0.3840 0.8557 0.288 0.000 0.696 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033040 1 0.4185 -0.0375 0.644 0.000 0.332 0.004 0.020 0.000
#> SRR1033041 1 0.3881 0.0389 0.600 0.000 0.000 0.396 0.004 0.000
#> SRR1033042 1 0.0767 0.5612 0.976 0.000 0.012 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033043 4 0.3830 0.5273 0.376 0.000 0.000 0.620 0.004 0.000
#> SRR1033044 1 0.3864 -0.2103 0.520 0.000 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.3429 0.8814 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033046 1 0.5631 0.2648 0.516 0.000 0.144 0.336 0.004 0.000
#> SRR1033047 3 0.3337 0.8794 0.260 0.000 0.736 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.4841 0.4965 0.648 0.000 0.088 0.260 0.004 0.000
#> SRR1033049 1 0.4019 0.3117 0.652 0.000 0.012 0.332 0.004 0.000
#> SRR1033051 4 0.3975 0.3866 0.452 0.000 0.000 0.544 0.004 0.000
#> SRR1033052 1 0.3126 0.4503 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033054 1 0.4852 -0.3484 0.528 0.000 0.420 0.004 0.048 0.000
#> SRR1033050 4 0.3807 0.5418 0.368 0.000 0.000 0.628 0.004 0.000
#> SRR1033055 3 0.3850 0.8599 0.260 0.000 0.716 0.004 0.020 0.000
#> SRR1033056 4 0.3714 0.5793 0.340 0.000 0.000 0.656 0.004 0.000
#> SRR1033057 1 0.1251 0.5727 0.956 0.000 0.012 0.024 0.008 0.000
#> SRR1033058 3 0.3404 0.8775 0.248 0.000 0.744 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033059 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033060 1 0.0881 0.5633 0.972 0.000 0.012 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033061 6 0.1151 0.7950 0.012 0.000 0.032 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033062 3 0.3429 0.8814 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033063 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033064 3 0.3337 0.8794 0.260 0.000 0.736 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.1053 0.5567 0.964 0.000 0.012 0.004 0.020 0.000
#> SRR1033066 1 0.1536 0.5454 0.940 0.000 0.016 0.004 0.040 0.000
#> SRR1033067 4 0.3867 0.2920 0.488 0.000 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.4580 -0.3695 0.528 0.000 0.440 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033069 1 0.6915 -0.2231 0.372 0.000 0.328 0.000 0.056 0.244
#> SRR1033070 1 0.4759 -0.2819 0.556 0.000 0.396 0.004 0.044 0.000
#> SRR1033071 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033072 6 0.6534 0.2618 0.200 0.000 0.252 0.000 0.052 0.496
#> SRR1033073 3 0.4247 0.7885 0.268 0.000 0.688 0.004 0.040 0.000
#> SRR1033074 4 0.3699 0.5808 0.336 0.000 0.000 0.660 0.004 0.000
#> SRR1033075 4 0.3782 0.5533 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR1033076 1 0.4822 -0.2991 0.548 0.000 0.400 0.004 0.048 0.000
#> SRR1033077 1 0.2300 0.5859 0.856 0.000 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1033078 4 0.3966 0.4076 0.444 0.000 0.000 0.552 0.004 0.000
#> SRR1033079 3 0.3429 0.8814 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033080 3 0.3429 0.8814 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033081 4 0.3899 0.4790 0.404 0.000 0.000 0.592 0.004 0.000
#> SRR1033082 1 0.3424 0.3632 0.800 0.000 0.160 0.004 0.036 0.000
#> SRR1033083 3 0.3476 0.8781 0.260 0.000 0.732 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033084 1 0.3995 -0.2470 0.516 0.000 0.000 0.480 0.004 0.000
#> SRR1033085 3 0.3429 0.8814 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033086 6 0.1151 0.7950 0.012 0.000 0.032 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033087 1 0.3982 -0.1747 0.536 0.000 0.000 0.460 0.004 0.000
#> SRR1033088 3 0.3380 0.8772 0.244 0.000 0.748 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033089 4 0.3741 0.6030 0.032 0.000 0.208 0.756 0.004 0.000
#> SRR1033090 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033091 3 0.3290 0.8814 0.252 0.000 0.744 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.2865 0.5911 0.840 0.000 0.012 0.140 0.008 0.000
#> SRR1033093 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033094 1 0.4815 -0.2883 0.552 0.000 0.396 0.004 0.048 0.000
#> SRR1033095 2 0.1938 0.9298 0.000 0.920 0.052 0.000 0.008 0.020
#> SRR1033096 3 0.4310 0.5392 0.472 0.000 0.512 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033097 6 0.1151 0.7464 0.000 0.032 0.012 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033098 3 0.3429 0.8814 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033099 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033100 2 0.0146 0.9461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033101 3 0.4982 0.5317 0.108 0.000 0.656 0.228 0.008 0.000
#> SRR1033102 4 0.3383 0.6624 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004 0.000
#> SRR1033103 1 0.1556 0.5886 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1033104 3 0.3633 0.8804 0.252 0.000 0.732 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033105 1 0.1610 0.5904 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.1082 0.5804 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1033107 3 0.4695 0.6932 0.144 0.000 0.712 0.132 0.012 0.000
#> SRR1033108 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.3314 0.4074 0.740 0.000 0.000 0.256 0.004 0.000
#> SRR1033110 1 0.4536 -0.2909 0.560 0.000 0.408 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033111 1 0.2793 0.5197 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.3565 0.3222 0.692 0.000 0.000 0.304 0.004 0.000
#> SRR1033113 3 0.4932 0.4763 0.452 0.000 0.492 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033114 1 0.1528 0.5697 0.944 0.000 0.016 0.028 0.012 0.000
#> SRR1033115 1 0.2340 0.5019 0.896 0.000 0.056 0.004 0.044 0.000
#> SRR1033116 3 0.3633 0.8804 0.252 0.000 0.732 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033117 3 0.3429 0.8814 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033118 4 0.0858 0.7937 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004 0.000
#> SRR1033119 1 0.2941 0.4933 0.780 0.000 0.000 0.220 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.3560 0.8805 0.256 0.000 0.732 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033120 6 0.0993 0.7976 0.012 0.000 0.024 0.000 0.000 0.964
#> SRR1033122 3 0.5834 0.2390 0.144 0.000 0.428 0.420 0.008 0.000
#> SRR1033123 1 0.0870 0.5597 0.972 0.000 0.012 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033124 1 0.3448 0.3650 0.716 0.000 0.000 0.280 0.004 0.000
#> SRR1033125 1 0.4930 -0.3617 0.496 0.000 0.448 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033126 1 0.0767 0.5612 0.976 0.000 0.012 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033127 5 0.6577 0.1885 0.104 0.000 0.368 0.000 0.440 0.088
#> SRR1033129 3 0.3633 0.8804 0.252 0.000 0.732 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033128 1 0.3000 0.4201 0.840 0.000 0.124 0.004 0.032 0.000
#> SRR1033130 4 0.3997 0.3031 0.488 0.000 0.000 0.508 0.004 0.000
#> SRR1033131 1 0.1910 0.5916 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.4925 -0.3715 0.504 0.000 0.440 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033133 1 0.4427 0.0220 0.660 0.000 0.292 0.004 0.044 0.000
#> SRR1033134 4 0.1152 0.8016 0.044 0.000 0.000 0.952 0.004 0.000
#> SRR1033135 3 0.3583 0.8764 0.260 0.000 0.728 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033136 1 0.1501 0.5878 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.4910 -0.3681 0.520 0.000 0.424 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033139 1 0.6852 -0.2558 0.376 0.000 0.352 0.000 0.056 0.216
#> SRR1033138 1 0.4031 0.2497 0.736 0.000 0.212 0.004 0.048 0.000
#> SRR1033140 3 0.3337 0.8794 0.260 0.000 0.736 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.3966 -0.1333 0.552 0.000 0.000 0.444 0.004 0.000
#> SRR1033142 2 0.0146 0.9468 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 4 0.3862 0.5189 0.388 0.000 0.000 0.608 0.004 0.000
#> SRR1033144 1 0.0964 0.5580 0.968 0.000 0.012 0.004 0.016 0.000
#> SRR1033145 3 0.3650 0.8673 0.272 0.000 0.716 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033146 1 0.6779 -0.0654 0.444 0.000 0.260 0.000 0.056 0.240
#> SRR1033147 1 0.6846 -0.2247 0.396 0.000 0.340 0.000 0.060 0.204
#> SRR1033148 4 0.0508 0.8105 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004 0.000
#> SRR1033149 3 0.3329 0.8704 0.236 0.000 0.756 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033150 1 0.2482 0.5695 0.848 0.000 0.000 0.148 0.004 0.000
#> SRR1033151 1 0.4925 -0.3517 0.504 0.000 0.440 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033152 1 0.3265 0.4181 0.748 0.000 0.000 0.248 0.004 0.000
#> SRR1033153 1 0.4763 -0.2252 0.576 0.000 0.372 0.004 0.048 0.000
#> SRR1033154 1 0.0767 0.5612 0.976 0.000 0.012 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033156 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033157 1 0.0806 0.5737 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008 0.000
#> SRR1033158 2 0.0798 0.9453 0.004 0.976 0.012 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033159 3 0.3583 0.8791 0.260 0.000 0.728 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033160 3 0.3767 0.8723 0.260 0.000 0.720 0.004 0.016 0.000
#> SRR1033161 1 0.3619 0.2699 0.680 0.000 0.000 0.316 0.004 0.000
#> SRR1033163 1 0.4900 -0.3471 0.528 0.000 0.416 0.004 0.052 0.000
#> SRR1033162 1 0.1448 0.5716 0.948 0.000 0.012 0.024 0.016 0.000
#> SRR1033164 3 0.5576 0.5345 0.404 0.000 0.504 0.004 0.064 0.024
#> SRR1033165 4 0.1918 0.7752 0.088 0.000 0.000 0.904 0.008 0.000
#> SRR1033166 1 0.4286 -0.0388 0.648 0.000 0.320 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033167 2 0.0798 0.9453 0.004 0.976 0.012 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033168 3 0.3703 0.8367 0.304 0.000 0.688 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033169 2 0.0551 0.9460 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033171 1 0.6967 -0.2248 0.352 0.000 0.316 0.000 0.056 0.276
#> SRR1033170 1 0.3163 0.4621 0.764 0.000 0.000 0.232 0.004 0.000
#> SRR1033172 3 0.3452 0.8802 0.256 0.000 0.736 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033173 2 0.0146 0.9468 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.3337 0.8794 0.260 0.000 0.736 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033175 4 0.3955 0.4399 0.436 0.000 0.000 0.560 0.004 0.000
#> SRR1033176 1 0.0767 0.5612 0.976 0.000 0.012 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.3025 0.9087 0.004 0.856 0.100 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033179 5 0.2581 0.7675 0.000 0.016 0.000 0.000 0.856 0.128
#> SRR1033180 1 0.1173 0.5660 0.960 0.000 0.016 0.016 0.008 0.000
#> SRR1033181 1 0.1053 0.5574 0.964 0.000 0.012 0.004 0.020 0.000
#> SRR1033183 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033182 1 0.0508 0.5651 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033184 1 0.4521 -0.2734 0.568 0.000 0.400 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033185 1 0.1078 0.5663 0.964 0.000 0.016 0.012 0.008 0.000
#> SRR1033187 4 0.3782 0.5638 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR1033186 1 0.3792 0.3147 0.764 0.000 0.188 0.004 0.044 0.000
#> SRR1033188 4 0.0891 0.8072 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1033189 5 0.3822 0.7117 0.000 0.000 0.096 0.000 0.776 0.128
#> SRR1033190 1 0.0767 0.5612 0.976 0.000 0.012 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033191 1 0.0767 0.5612 0.976 0.000 0.012 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033192 6 0.6431 0.3008 0.184 0.000 0.236 0.000 0.056 0.524
#> SRR1033193 4 0.3971 0.4160 0.448 0.000 0.000 0.548 0.004 0.000
#> SRR1033195 5 0.3058 0.7683 0.000 0.024 0.012 0.000 0.840 0.124
#> SRR1033194 6 0.0993 0.7965 0.012 0.000 0.024 0.000 0.000 0.964
#> SRR1033197 1 0.1149 0.5743 0.960 0.000 0.008 0.024 0.008 0.000
#> SRR1033196 1 0.4399 -0.1525 0.616 0.000 0.352 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033199 2 0.2063 0.9267 0.000 0.912 0.060 0.000 0.008 0.020
#> SRR1033198 4 0.3023 0.7056 0.212 0.000 0.000 0.784 0.004 0.000
#> SRR1033200 4 0.1700 0.7848 0.080 0.000 0.000 0.916 0.004 0.000
#> SRR1033201 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033202 3 0.4954 0.5050 0.088 0.000 0.656 0.244 0.012 0.000
#> SRR1033203 3 0.4172 0.6451 0.424 0.000 0.564 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033204 4 0.2933 0.7140 0.200 0.000 0.000 0.796 0.004 0.000
#> SRR1033205 4 0.1686 0.7648 0.000 0.000 0.064 0.924 0.012 0.000
#> SRR1033206 1 0.3995 -0.2518 0.516 0.000 0.000 0.480 0.004 0.000
#> SRR1033207 4 0.3915 0.4849 0.412 0.000 0.000 0.584 0.004 0.000
#> SRR1033208 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033209 4 0.3171 0.7118 0.204 0.000 0.000 0.784 0.012 0.000
#> SRR1033210 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033211 4 0.3989 0.3680 0.468 0.000 0.000 0.528 0.004 0.000
#> SRR1033212 3 0.3429 0.8810 0.252 0.000 0.740 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033213 2 0.0798 0.9453 0.004 0.976 0.012 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033214 4 0.0146 0.8121 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033216 4 0.2964 0.7111 0.204 0.000 0.000 0.792 0.004 0.000
#> SRR1033215 3 0.4900 0.6251 0.148 0.000 0.700 0.000 0.020 0.132
#> SRR1033217 1 0.3965 -0.1762 0.616 0.000 0.376 0.004 0.004 0.000
#> SRR1033218 4 0.3930 0.4707 0.420 0.000 0.000 0.576 0.004 0.000
#> SRR1033219 4 0.3684 0.5947 0.332 0.000 0.000 0.664 0.004 0.000
#> SRR1033221 2 0.2682 0.9146 0.000 0.876 0.084 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033220 2 0.2682 0.9146 0.000 0.876 0.084 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033222 4 0.3989 0.3662 0.468 0.000 0.000 0.528 0.004 0.000
#> SRR1033223 1 0.2877 0.5839 0.848 0.000 0.020 0.124 0.008 0.000
#> SRR1033225 6 0.0972 0.7513 0.000 0.028 0.008 0.000 0.000 0.964
#> SRR1033224 4 0.0508 0.8104 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004 0.000
#> SRR1033226 1 0.4146 0.0661 0.680 0.000 0.288 0.004 0.028 0.000
#> SRR1033227 4 0.5358 0.2385 0.080 0.000 0.380 0.528 0.012 0.000
#> SRR1033229 2 0.0146 0.9468 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.1152 0.8009 0.044 0.000 0.000 0.952 0.004 0.000
#> SRR1033231 2 0.3936 0.8646 0.004 0.796 0.120 0.000 0.060 0.020
#> SRR1033230 4 0.3619 0.6135 0.316 0.000 0.000 0.680 0.004 0.000
#> SRR1033232 4 0.2320 0.7578 0.132 0.000 0.000 0.864 0.004 0.000
#> SRR1033233 4 0.3966 0.4236 0.444 0.000 0.000 0.552 0.004 0.000
#> SRR1033235 2 0.0146 0.9468 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.3955 0.8235 0.316 0.000 0.668 0.004 0.012 0.000
#> SRR1033236 3 0.5984 0.2426 0.368 0.000 0.468 0.148 0.016 0.000
#> SRR1033237 4 0.0146 0.8121 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033238 3 0.5053 0.6578 0.184 0.000 0.668 0.136 0.012 0.000
#> SRR1033240 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033239 1 0.3668 0.2415 0.668 0.000 0.000 0.328 0.004 0.000
#> SRR1033242 4 0.0405 0.8118 0.004 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR1033241 3 0.3560 0.8805 0.256 0.000 0.732 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033244 2 0.2502 0.9190 0.000 0.884 0.084 0.000 0.012 0.020
#> SRR1033243 2 0.1391 0.9364 0.000 0.944 0.040 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033245 1 0.3757 0.1694 0.712 0.000 0.272 0.008 0.008 0.000
#> SRR1033246 1 0.3966 -0.1326 0.552 0.000 0.000 0.444 0.004 0.000
#> SRR1033248 4 0.3383 0.6575 0.268 0.000 0.000 0.728 0.004 0.000
#> SRR1033247 6 0.2151 0.7719 0.008 0.000 0.072 0.000 0.016 0.904
#> SRR1033249 2 0.0146 0.9468 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.1391 0.9364 0.000 0.944 0.040 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033251 1 0.0363 0.5712 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0653 0.9457 0.004 0.980 0.012 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033253 4 0.3819 0.5419 0.372 0.000 0.000 0.624 0.004 0.000
#> SRR1033254 1 0.3742 0.1930 0.648 0.000 0.000 0.348 0.004 0.000
#> SRR1033256 2 0.0653 0.9457 0.004 0.980 0.012 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033255 3 0.3996 0.7699 0.352 0.000 0.636 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033258 4 0.3782 0.5598 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR1033257 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 4 0.0935 0.8052 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR1033260 2 0.0405 0.9466 0.004 0.988 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033262 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9466 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 4 0.3782 0.5497 0.360 0.000 0.000 0.636 0.004 0.000
#> SRR1033265 2 0.3104 0.9012 0.000 0.844 0.112 0.000 0.024 0.020
#> SRR1033266 1 0.2573 0.5907 0.856 0.000 0.008 0.132 0.004 0.000
#> SRR1033267 3 0.6358 0.1047 0.232 0.000 0.400 0.352 0.016 0.000
#> SRR1033268 1 0.3383 0.4036 0.728 0.000 0.000 0.268 0.004 0.000
#> SRR1033269 1 0.4791 -0.2588 0.564 0.000 0.384 0.004 0.048 0.000
#> SRR1033270 3 0.3536 0.8810 0.252 0.000 0.736 0.004 0.008 0.000
#> SRR1033271 4 0.3899 0.4973 0.404 0.000 0.000 0.592 0.004 0.000
#> SRR1033272 2 0.0291 0.9468 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.3547 0.3122 0.696 0.000 0.000 0.300 0.004 0.000
#> SRR1033274 5 0.3264 0.7522 0.000 0.076 0.012 0.000 0.840 0.072
#> SRR1033275 4 0.0000 0.8123 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.2882 0.9098 0.000 0.860 0.100 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033277 4 0.0692 0.8088 0.020 0.000 0.000 0.976 0.004 0.000
#> SRR1033278 4 0.0146 0.8118 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033279 1 0.4780 -0.3155 0.544 0.000 0.408 0.004 0.044 0.000
#> SRR1033280 1 0.4625 -0.2509 0.572 0.000 0.388 0.004 0.036 0.000
#> SRR1033281 1 0.3489 0.3466 0.708 0.000 0.000 0.288 0.004 0.000
#> SRR1033282 4 0.6094 0.4633 0.288 0.000 0.064 0.564 0.076 0.008
#> SRR1033283 4 0.6094 0.4633 0.288 0.000 0.064 0.564 0.076 0.008
#> SRR1033284 4 0.6094 0.4633 0.288 0.000 0.064 0.564 0.076 0.008
#> SRR1033285 4 0.6210 0.4187 0.308 0.000 0.068 0.540 0.076 0.008
#> SRR1033286 4 0.6210 0.4187 0.308 0.000 0.068 0.540 0.076 0.008
#> SRR1033287 4 0.6210 0.4187 0.308 0.000 0.068 0.540 0.076 0.008
#> SRR1033288 4 0.6210 0.4187 0.308 0.000 0.068 0.540 0.076 0.008
#> SRR1033289 4 0.6210 0.4187 0.308 0.000 0.068 0.540 0.076 0.008
#> SRR1033290 4 0.6210 0.4187 0.308 0.000 0.068 0.540 0.076 0.008
#> SRR1033291 4 0.6109 0.4586 0.292 0.000 0.064 0.560 0.076 0.008
#> SRR1033292 4 0.6109 0.4586 0.292 0.000 0.064 0.560 0.076 0.008
#> SRR1033293 4 0.6109 0.4586 0.292 0.000 0.064 0.560 0.076 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.963 0.985 0.3467 0.657 0.657
#> 3 3 0.976 0.945 0.961 0.6990 0.739 0.605
#> 4 4 0.687 0.757 0.845 0.1974 0.850 0.639
#> 5 5 0.717 0.656 0.829 0.0656 0.913 0.719
#> 6 6 0.750 0.695 0.830 0.0455 0.898 0.647
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.3733 0.904 0.072 0.928
#> SRR1032963 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.7219 0.748 0.200 0.800
#> SRR1032968 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.1414 0.969 0.980 0.020
#> SRR1033020 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.8016 0.670 0.756 0.244
#> SRR1033031 1 0.6048 0.819 0.852 0.148
#> SRR1033032 1 0.9491 0.404 0.632 0.368
#> SRR1033033 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.9954 0.123 0.540 0.460
#> SRR1033039 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033055 2 0.9775 0.317 0.412 0.588
#> SRR1033056 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033058 2 0.9393 0.460 0.356 0.644
#> SRR1033059 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033062 1 0.3274 0.927 0.940 0.060
#> SRR1033063 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033069 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.9866 0.258 0.432 0.568
#> SRR1033074 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.6801 0.773 0.820 0.180
#> SRR1033081 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.1633 0.965 0.976 0.024
#> SRR1033083 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.9248 0.473 0.660 0.340
#> SRR1033089 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.9881 0.207 0.564 0.436
#> SRR1033114 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.7674 0.704 0.776 0.224
#> SRR1033118 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.7674 0.703 0.776 0.224
#> SRR1033126 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.5629 0.838 0.132 0.868
#> SRR1033129 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.2236 0.953 0.964 0.036
#> SRR1033133 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033139 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033138 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR1033140 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033146 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033149 2 0.9963 0.154 0.464 0.536
#> SRR1033150 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.4431 0.892 0.908 0.092
#> SRR1033152 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033164 2 0.7139 0.754 0.196 0.804
#> SRR1033165 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.4815 0.876 0.896 0.104
#> SRR1033167 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.9686 0.328 0.604 0.396
#> SRR1033188 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033217 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.972 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.988 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032912 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032913 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032914 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032915 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032916 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032917 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1032918 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032919 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032920 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032925 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032926 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032927 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032929 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032928 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032930 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032931 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032933 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032934 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032935 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032936 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032937 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032939 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032940 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032941 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032942 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032945 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032946 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032947 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032948 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032949 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.1163 0.96761 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032951 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032952 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032953 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032954 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032955 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032956 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032958 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032959 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032960 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032961 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032962 2 0.4945 0.81654 0.056 0.840 0.104
#> SRR1032963 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032964 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032965 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032966 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032967 2 0.5722 0.75630 0.132 0.800 0.068
#> SRR1032968 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032969 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032970 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032971 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032972 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032973 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032974 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032975 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032976 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032977 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0237 0.96485 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032979 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032981 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032982 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032983 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032984 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032985 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032986 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032987 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032990 3 0.2356 0.94275 0.072 0.000 0.928
#> SRR1032989 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032991 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032993 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032994 1 0.0747 0.96720 0.984 0.000 0.016
#> SRR1032995 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032996 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032997 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032998 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032999 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033002 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033006 3 0.5431 0.66706 0.284 0.000 0.716
#> SRR1033007 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033008 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033009 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033010 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033011 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033013 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033014 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033015 3 0.3686 0.89852 0.140 0.000 0.860
#> SRR1033016 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.2625 0.94184 0.084 0.000 0.916
#> SRR1033019 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033020 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033021 1 0.2625 0.91910 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033023 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033022 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033024 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033025 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033026 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033027 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.2625 0.93500 0.084 0.000 0.916
#> SRR1033029 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033031 3 0.7159 0.30948 0.448 0.024 0.528
#> SRR1033032 3 0.1753 0.95691 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033033 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033036 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033037 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033038 1 0.7360 0.14806 0.528 0.440 0.032
#> SRR1033039 3 0.1964 0.95425 0.056 0.000 0.944
#> SRR1033040 3 0.2165 0.95238 0.064 0.000 0.936
#> SRR1033041 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033042 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033043 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033044 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033045 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033046 1 0.5926 0.43712 0.644 0.000 0.356
#> SRR1033047 3 0.1964 0.95425 0.056 0.000 0.944
#> SRR1033048 1 0.1860 0.95493 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033049 1 0.1289 0.96765 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033051 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033052 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033053 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.2537 0.94264 0.080 0.000 0.920
#> SRR1033050 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033055 3 0.1643 0.95775 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033056 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033057 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033058 3 0.1529 0.95773 0.040 0.000 0.960
#> SRR1033059 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033061 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033063 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1529 0.95773 0.040 0.000 0.960
#> SRR1033065 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033066 1 0.0424 0.96140 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033067 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033068 3 0.2261 0.94170 0.068 0.000 0.932
#> SRR1033069 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.2796 0.93858 0.092 0.000 0.908
#> SRR1033071 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.2066 0.95109 0.060 0.000 0.940
#> SRR1033074 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033075 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033076 3 0.2796 0.93857 0.092 0.000 0.908
#> SRR1033077 1 0.1031 0.96722 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033078 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033079 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033080 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033081 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033082 1 0.2590 0.90340 0.924 0.004 0.072
#> SRR1033083 3 0.1753 0.95805 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033084 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033085 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033086 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.0892 0.96775 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033088 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033089 1 0.6140 0.29207 0.596 0.000 0.404
#> SRR1033090 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033091 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033092 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033093 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.4235 0.85647 0.176 0.000 0.824
#> SRR1033095 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.2448 0.94510 0.076 0.000 0.924
#> SRR1033097 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033099 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033102 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033104 3 0.1529 0.95618 0.040 0.000 0.960
#> SRR1033105 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033106 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033107 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033108 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033109 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033110 3 0.3412 0.91262 0.124 0.000 0.876
#> SRR1033111 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033112 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033113 3 0.2537 0.94264 0.080 0.000 0.920
#> SRR1033114 1 0.0892 0.96774 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033115 1 0.0747 0.95585 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033116 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033117 3 0.1411 0.95261 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033118 1 0.2796 0.91081 0.908 0.000 0.092
#> SRR1033119 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033121 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033120 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033122 3 0.2448 0.93882 0.076 0.000 0.924
#> SRR1033123 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033124 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033125 3 0.2774 0.93988 0.072 0.008 0.920
#> SRR1033126 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033127 2 0.4784 0.78356 0.004 0.796 0.200
#> SRR1033129 3 0.1529 0.95618 0.040 0.000 0.960
#> SRR1033128 1 0.4504 0.72710 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033130 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033132 3 0.2356 0.94267 0.072 0.000 0.928
#> SRR1033133 3 0.3941 0.88047 0.156 0.000 0.844
#> SRR1033134 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033135 3 0.1529 0.95773 0.040 0.000 0.960
#> SRR1033136 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033137 3 0.2165 0.93926 0.064 0.000 0.936
#> SRR1033139 2 0.0424 0.98163 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033138 3 0.4062 0.85029 0.164 0.000 0.836
#> SRR1033140 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033141 1 0.0237 0.96486 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033142 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033144 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033145 3 0.1529 0.95773 0.040 0.000 0.960
#> SRR1033146 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033149 3 0.1411 0.95261 0.036 0.000 0.964
#> SRR1033150 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033151 3 0.2537 0.94264 0.080 0.000 0.920
#> SRR1033152 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033153 3 0.2878 0.93677 0.096 0.000 0.904
#> SRR1033154 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033156 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033157 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033158 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033160 3 0.1529 0.95773 0.040 0.000 0.960
#> SRR1033161 1 0.0892 0.96665 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033163 3 0.2537 0.94264 0.080 0.000 0.920
#> SRR1033162 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033164 2 0.7467 0.44213 0.056 0.624 0.320
#> SRR1033165 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033166 1 0.6280 -0.00976 0.540 0.000 0.460
#> SRR1033167 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.1753 0.95805 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033169 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033172 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033173 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033175 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033176 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033177 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.0592 0.96509 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033181 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033183 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033182 1 0.0592 0.95974 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033184 3 0.3116 0.92766 0.108 0.000 0.892
#> SRR1033185 1 0.0424 0.96142 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033187 1 0.1031 0.96812 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033186 1 0.6769 0.31379 0.592 0.392 0.016
#> SRR1033188 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033189 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033191 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033192 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033196 3 0.3686 0.89856 0.140 0.000 0.860
#> SRR1033199 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1031 0.96812 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033200 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033201 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033202 3 0.2066 0.95146 0.060 0.000 0.940
#> SRR1033203 3 0.2448 0.94515 0.076 0.000 0.924
#> SRR1033204 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.6225 0.22200 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033206 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033209 1 0.1031 0.96814 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033210 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033211 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033212 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033213 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033216 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.3412 0.91866 0.124 0.000 0.876
#> SRR1033218 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0237 0.96485 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033221 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.3038 0.86716 0.896 0.000 0.104
#> SRR1033225 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033226 3 0.6274 0.30661 0.456 0.000 0.544
#> SRR1033227 3 0.2165 0.94850 0.064 0.000 0.936
#> SRR1033229 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033231 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033233 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.1753 0.95806 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033236 3 0.3038 0.91181 0.104 0.000 0.896
#> SRR1033237 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033238 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033240 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033239 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033242 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033241 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033244 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.4178 0.84573 0.172 0.000 0.828
#> SRR1033246 1 0.0424 0.96574 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033248 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033247 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033252 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033254 1 0.0592 0.96653 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033256 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.1753 0.95805 0.048 0.000 0.952
#> SRR1033258 1 0.0747 0.96720 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033257 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033259 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033260 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033262 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033263 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033265 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033267 3 0.2165 0.94850 0.064 0.000 0.936
#> SRR1033268 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033269 3 0.3116 0.92837 0.108 0.000 0.892
#> SRR1033270 3 0.1643 0.95908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1033271 1 0.0000 0.96372 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033274 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033275 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033276 2 0.0000 0.98825 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033278 1 0.1163 0.96843 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033279 3 0.2261 0.94170 0.068 0.000 0.932
#> SRR1033280 3 0.3038 0.93151 0.104 0.000 0.896
#> SRR1033281 1 0.0237 0.96265 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033282 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033283 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033284 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033285 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033286 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033287 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033288 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033289 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033290 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033291 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033292 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033293 1 0.1860 0.92850 0.948 0.000 0.052
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 4 0.3074 0.7319 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1032911 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032917 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1032918 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 4 0.2469 0.7746 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR1032922 4 0.4713 0.3906 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1032923 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032926 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032927 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032934 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032935 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032936 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 4 0.1118 0.8165 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1032939 1 0.4830 0.5239 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1032940 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.4761 0.5686 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1032945 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032947 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.3311 0.7140 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1032951 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032952 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032953 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032954 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032956 4 0.0707 0.8243 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1032958 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032959 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032960 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032961 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032962 2 0.4663 0.7625 0.148 0.788 0.064 0.000
#> SRR1032963 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032967 2 0.5081 0.7818 0.036 0.800 0.064 0.100
#> SRR1032968 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032969 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032974 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032975 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032978 4 0.4431 0.5312 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032983 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032984 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032990 3 0.4661 0.5957 0.348 0.000 0.652 0.000
#> SRR1032989 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.1302 0.8159 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1032993 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032994 4 0.3569 0.6845 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1032995 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032996 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1032998 4 0.0592 0.8251 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1032999 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033001 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033002 4 0.2760 0.7423 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033006 3 0.4543 0.5489 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1033007 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033008 4 0.4843 0.3087 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1033009 4 0.3726 0.6545 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1033010 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.3024 0.8229 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033013 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033014 3 0.2401 0.8566 0.004 0.000 0.904 0.092
#> SRR1033015 1 0.6214 -0.2462 0.480 0.000 0.468 0.052
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.5231 0.5302 0.384 0.000 0.604 0.012
#> SRR1033019 3 0.2489 0.8521 0.020 0.000 0.912 0.068
#> SRR1033020 1 0.3528 0.8112 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1033021 4 0.5250 0.3776 0.316 0.000 0.024 0.660
#> SRR1033023 1 0.3801 0.7942 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033022 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033024 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033025 1 0.4907 0.4259 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1033026 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.5105 0.3656 0.004 0.000 0.564 0.432
#> SRR1033029 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.2266 0.8589 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033031 1 0.3842 0.8125 0.836 0.004 0.024 0.136
#> SRR1033032 3 0.5055 0.6889 0.256 0.000 0.712 0.032
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.4996 0.3183 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1033036 1 0.2814 0.8180 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033037 4 0.4431 0.4872 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1033038 1 0.7023 0.4761 0.544 0.312 0.000 0.144
#> SRR1033039 3 0.2813 0.8537 0.024 0.000 0.896 0.080
#> SRR1033040 1 0.5018 0.2282 0.656 0.000 0.332 0.012
#> SRR1033041 1 0.3610 0.8064 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033042 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033043 4 0.3942 0.6118 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1033044 4 0.4250 0.5354 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1033045 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033046 4 0.6921 0.3007 0.160 0.000 0.260 0.580
#> SRR1033047 3 0.2216 0.8570 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1033048 4 0.5161 -0.2206 0.476 0.000 0.004 0.520
#> SRR1033049 1 0.4999 0.2833 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1033051 4 0.4250 0.5470 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1033052 1 0.3801 0.7935 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.4855 0.5278 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1033050 4 0.3569 0.6824 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1033055 3 0.2578 0.8415 0.036 0.000 0.912 0.052
#> SRR1033056 4 0.2216 0.7803 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1033057 1 0.3764 0.7981 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1033058 3 0.2521 0.8497 0.024 0.000 0.912 0.064
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033061 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.2266 0.8589 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.2342 0.8576 0.008 0.000 0.912 0.080
#> SRR1033065 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033066 1 0.2814 0.8180 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033067 4 0.4382 0.4884 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR1033068 3 0.4830 0.5380 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1033069 2 0.0592 0.9717 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.5881 0.4268 0.420 0.000 0.544 0.036
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.2647 0.7878 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1033074 4 0.1940 0.7914 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1033075 4 0.3610 0.6710 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1033076 3 0.5581 0.4055 0.448 0.000 0.532 0.020
#> SRR1033077 1 0.4564 0.6528 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033078 4 0.4977 0.0488 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1033079 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033080 3 0.2266 0.8589 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033081 4 0.4543 0.4608 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1033082 1 0.3142 0.8180 0.860 0.000 0.008 0.132
#> SRR1033083 3 0.2266 0.8589 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033084 1 0.4855 0.4790 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1033085 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033086 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.4855 0.4849 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1033088 3 0.2266 0.8589 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033089 4 0.4164 0.5361 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR1033090 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033091 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033092 1 0.4008 0.7732 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.6324 0.4647 0.356 0.000 0.572 0.072
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.4553 0.7455 0.180 0.000 0.780 0.040
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.2216 0.8566 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1033102 4 0.3837 0.6603 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1033103 1 0.3172 0.8211 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1033104 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033105 1 0.3486 0.8128 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1033106 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033107 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033108 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033109 1 0.3356 0.8186 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1033110 3 0.5548 0.5145 0.388 0.000 0.588 0.024
#> SRR1033111 1 0.4008 0.7718 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1033112 1 0.3610 0.8074 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033113 3 0.4624 0.6086 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1033114 1 0.3907 0.7819 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1033115 1 0.2647 0.8102 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1033116 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033117 3 0.1940 0.8546 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033118 4 0.0817 0.8159 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1033119 1 0.3801 0.7932 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033121 3 0.2266 0.8589 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033120 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 4 0.4916 0.1010 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1033123 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033124 1 0.4277 0.7243 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1033125 1 0.4967 -0.2246 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1033126 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033127 2 0.4883 0.6393 0.000 0.696 0.288 0.016
#> SRR1033129 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033128 1 0.3570 0.7728 0.860 0.000 0.048 0.092
#> SRR1033130 1 0.5000 0.1371 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1033131 1 0.2973 0.8225 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033132 3 0.4877 0.5183 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1033133 1 0.4832 0.5889 0.768 0.000 0.176 0.056
#> SRR1033134 4 0.3024 0.7456 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1033135 3 0.2450 0.8159 0.072 0.000 0.912 0.016
#> SRR1033136 1 0.3801 0.7924 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033137 3 0.4866 0.5270 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1033139 2 0.1867 0.9204 0.072 0.928 0.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.3464 0.7202 0.868 0.000 0.076 0.056
#> SRR1033140 3 0.2266 0.8589 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033141 4 0.4941 0.1670 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 4 0.4543 0.4954 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1033144 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033145 3 0.2546 0.8470 0.028 0.000 0.912 0.060
#> SRR1033146 2 0.0707 0.9690 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1033147 2 0.1716 0.9290 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR1033148 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033149 3 0.2197 0.8575 0.004 0.000 0.916 0.080
#> SRR1033150 1 0.3172 0.8218 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1033151 3 0.4955 0.4576 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1033152 1 0.4776 0.5525 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1033153 1 0.4797 0.3993 0.720 0.000 0.260 0.020
#> SRR1033154 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033156 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033157 1 0.3024 0.8228 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.2402 0.8560 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR1033160 3 0.2546 0.8244 0.060 0.000 0.912 0.028
#> SRR1033161 4 0.2973 0.7467 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1033163 3 0.4925 0.4859 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1033162 1 0.3024 0.8226 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1033164 2 0.6433 0.5511 0.188 0.648 0.164 0.000
#> SRR1033165 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033166 1 0.4663 0.7829 0.788 0.000 0.064 0.148
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.2908 0.8296 0.064 0.000 0.896 0.040
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.3801 0.7932 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1033172 3 0.2489 0.8520 0.020 0.000 0.912 0.068
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.2266 0.8589 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033175 4 0.4761 0.3799 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1033176 1 0.2973 0.8225 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.3528 0.8128 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1033181 1 0.2868 0.8200 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1033183 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033182 1 0.2944 0.8158 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1033184 3 0.5996 0.3442 0.448 0.000 0.512 0.040
#> SRR1033185 1 0.3402 0.8218 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1033187 4 0.3837 0.6625 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR1033186 1 0.6179 0.6535 0.672 0.188 0.000 0.140
#> SRR1033188 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.2973 0.8225 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1033191 1 0.2921 0.8218 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1033192 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 4 0.4746 0.3903 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1033195 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.3444 0.8162 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1033196 1 0.5884 0.1124 0.592 0.000 0.364 0.044
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 4 0.3266 0.7203 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1033200 4 0.2408 0.7731 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1033201 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033202 3 0.2814 0.8243 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1033203 3 0.4417 0.7730 0.160 0.000 0.796 0.044
#> SRR1033204 4 0.4072 0.6218 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1033205 4 0.4643 0.3367 0.000 0.000 0.344 0.656
#> SRR1033206 4 0.4961 0.1178 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1033207 4 0.4500 0.5131 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1033208 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033209 4 0.1637 0.8052 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1033210 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033211 4 0.4961 0.0982 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1033212 3 0.2266 0.8588 0.004 0.000 0.912 0.084
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033216 4 0.4040 0.6275 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1033215 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 3 0.6483 0.5290 0.324 0.000 0.584 0.092
#> SRR1033218 4 0.4605 0.4691 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1033219 4 0.4134 0.6130 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 4 0.4713 0.4120 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1033223 1 0.6451 0.3684 0.524 0.000 0.072 0.404
#> SRR1033225 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 4 0.0469 0.8282 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1033226 1 0.7527 0.3211 0.484 0.000 0.300 0.216
#> SRR1033227 3 0.3764 0.7369 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.1940 0.7942 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 4 0.4406 0.5443 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1033232 4 0.1302 0.8138 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1033233 4 0.4406 0.5430 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.3099 0.8440 0.020 0.000 0.876 0.104
#> SRR1033236 3 0.4936 0.6349 0.020 0.000 0.700 0.280
#> SRR1033237 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033238 3 0.2216 0.8568 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1033240 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033239 1 0.4804 0.5275 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1033242 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033241 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.7728 0.1809 0.416 0.000 0.352 0.232
#> SRR1033246 4 0.4967 0.1005 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1033248 4 0.1022 0.8206 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1033247 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.3266 0.8205 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 4 0.4008 0.6361 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1033254 4 0.4925 0.1974 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.4336 0.8045 0.060 0.000 0.812 0.128
#> SRR1033258 4 0.4103 0.6187 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1033257 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033259 4 0.1867 0.7969 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033262 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 4 0.1118 0.8168 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.3172 0.7317 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1033267 3 0.4134 0.6816 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1033268 1 0.4134 0.7517 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1033269 3 0.5888 0.4192 0.424 0.000 0.540 0.036
#> SRR1033270 3 0.2149 0.8590 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033271 4 0.4697 0.4215 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4564 0.6465 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1033274 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033278 4 0.0000 0.8325 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033279 3 0.4961 0.4528 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1033280 3 0.5724 0.4373 0.424 0.000 0.548 0.028
#> SRR1033281 1 0.4277 0.7248 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1033282 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033283 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033284 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033285 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033286 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033287 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033288 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033289 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033290 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033291 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033292 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
#> SRR1033293 4 0.6252 0.5244 0.288 0.000 0.088 0.624
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.4054 0.53816 0.020 0.000 0.000 0.732 0.248
#> SRR1032911 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0865 0.89437 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1032918 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032921 4 0.3526 0.67840 0.072 0.000 0.000 0.832 0.096
#> SRR1032922 4 0.5798 0.38918 0.148 0.000 0.000 0.604 0.248
#> SRR1032923 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032926 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032927 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032934 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032935 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032936 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 4 0.1648 0.74422 0.020 0.000 0.000 0.940 0.040
#> SRR1032939 4 0.6729 -0.08724 0.328 0.000 0.000 0.408 0.264
#> SRR1032940 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 4 0.6695 -0.00040 0.308 0.000 0.000 0.428 0.264
#> SRR1032945 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032947 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.3639 0.67802 0.076 0.000 0.000 0.824 0.100
#> SRR1032951 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032952 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032953 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032954 4 0.0162 0.76662 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032955 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032956 4 0.1211 0.75497 0.016 0.000 0.000 0.960 0.024
#> SRR1032958 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032960 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032961 4 0.0162 0.76662 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032962 2 0.4949 0.31199 0.444 0.532 0.020 0.000 0.004
#> SRR1032963 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.4188 0.71830 0.004 0.800 0.008 0.124 0.064
#> SRR1032968 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032974 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032975 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032976 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032978 4 0.5618 0.44642 0.136 0.000 0.000 0.628 0.236
#> SRR1032979 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032983 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032984 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.5107 0.25279 0.640 0.000 0.296 0.000 0.064
#> SRR1032989 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.2377 0.69101 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1032993 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032994 4 0.3479 0.68048 0.084 0.000 0.000 0.836 0.080
#> SRR1032995 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032996 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032998 4 0.0290 0.76463 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033001 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033002 4 0.3416 0.67448 0.088 0.000 0.000 0.840 0.072
#> SRR1033003 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.4201 0.36842 0.000 0.000 0.664 0.328 0.008
#> SRR1033007 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033008 4 0.6164 0.19952 0.140 0.000 0.000 0.492 0.368
#> SRR1033009 4 0.4487 0.60196 0.104 0.000 0.000 0.756 0.140
#> SRR1033010 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033011 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.5759 0.43708 0.596 0.000 0.000 0.128 0.276
#> SRR1033013 3 0.0898 0.89562 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1033014 3 0.0727 0.89772 0.004 0.000 0.980 0.012 0.004
#> SRR1033015 1 0.3656 0.43315 0.784 0.000 0.196 0.000 0.020
#> SRR1033016 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.5230 0.07385 0.528 0.000 0.436 0.012 0.024
#> SRR1033019 3 0.0968 0.89620 0.012 0.000 0.972 0.012 0.004
#> SRR1033020 1 0.6164 0.33120 0.492 0.000 0.000 0.140 0.368
#> SRR1033021 4 0.5498 0.52433 0.140 0.000 0.020 0.696 0.144
#> SRR1033023 1 0.6745 0.09626 0.408 0.000 0.000 0.280 0.312
#> SRR1033022 1 0.3534 0.55413 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1033024 3 0.0671 0.89759 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1033025 4 0.6671 0.04256 0.292 0.000 0.000 0.440 0.268
#> SRR1033026 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033027 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.4210 0.15394 0.000 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033030 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033031 1 0.3597 0.56492 0.800 0.000 0.008 0.012 0.180
#> SRR1033032 3 0.4122 0.58762 0.304 0.000 0.688 0.004 0.004
#> SRR1033033 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 4 0.6368 0.13438 0.332 0.000 0.000 0.488 0.180
#> SRR1033036 1 0.3353 0.56106 0.796 0.000 0.008 0.000 0.196
#> SRR1033037 4 0.5761 0.41903 0.184 0.000 0.000 0.620 0.196
#> SRR1033038 1 0.5337 0.43935 0.704 0.180 0.000 0.020 0.096
#> SRR1033039 3 0.2344 0.86784 0.064 0.000 0.904 0.032 0.000
#> SRR1033040 1 0.5533 0.51093 0.672 0.000 0.176 0.008 0.144
#> SRR1033041 1 0.6257 0.33395 0.512 0.000 0.000 0.168 0.320
#> SRR1033042 1 0.3336 0.56205 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1033043 4 0.4676 0.57607 0.120 0.000 0.000 0.740 0.140
#> SRR1033044 4 0.5478 0.46881 0.164 0.000 0.000 0.656 0.180
#> SRR1033045 3 0.0510 0.89817 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033046 4 0.5022 0.57843 0.040 0.000 0.128 0.752 0.080
#> SRR1033047 3 0.1041 0.88904 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1033048 4 0.5237 0.49591 0.156 0.000 0.000 0.684 0.160
#> SRR1033049 4 0.6231 0.24012 0.288 0.000 0.000 0.532 0.180
#> SRR1033051 4 0.5541 0.46122 0.164 0.000 0.000 0.648 0.188
#> SRR1033052 1 0.6596 0.20696 0.456 0.000 0.000 0.236 0.308
#> SRR1033053 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.4254 0.37787 0.740 0.000 0.220 0.000 0.040
#> SRR1033050 4 0.4158 0.63218 0.092 0.000 0.000 0.784 0.124
#> SRR1033055 3 0.0671 0.88924 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1033056 4 0.1568 0.74699 0.020 0.000 0.000 0.944 0.036
#> SRR1033057 1 0.6540 0.22383 0.480 0.000 0.000 0.252 0.268
#> SRR1033058 3 0.0613 0.89610 0.004 0.000 0.984 0.008 0.004
#> SRR1033059 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.3461 0.56358 0.772 0.000 0.000 0.004 0.224
#> SRR1033061 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033063 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1012 0.89465 0.020 0.000 0.968 0.012 0.000
#> SRR1033065 1 0.3177 0.56345 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1033066 1 0.3086 0.56181 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1033067 4 0.5038 0.52751 0.132 0.000 0.000 0.704 0.164
#> SRR1033068 1 0.4859 0.09576 0.608 0.000 0.364 0.004 0.024
#> SRR1033069 2 0.2783 0.84747 0.116 0.868 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033070 1 0.3993 0.39138 0.756 0.000 0.216 0.000 0.028
#> SRR1033071 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.3582 0.66880 0.224 0.000 0.768 0.000 0.008
#> SRR1033074 4 0.1836 0.73973 0.032 0.000 0.000 0.932 0.036
#> SRR1033075 4 0.4172 0.62916 0.108 0.000 0.000 0.784 0.108
#> SRR1033076 1 0.4129 0.40383 0.756 0.000 0.204 0.000 0.040
#> SRR1033077 4 0.6732 -0.02964 0.284 0.000 0.000 0.416 0.300
#> SRR1033078 4 0.6313 0.24086 0.188 0.000 0.000 0.516 0.296
#> SRR1033079 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033080 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033081 4 0.5177 0.52294 0.132 0.000 0.000 0.688 0.180
#> SRR1033082 1 0.3333 0.56378 0.788 0.000 0.000 0.004 0.208
#> SRR1033083 3 0.1522 0.88590 0.044 0.000 0.944 0.012 0.000
#> SRR1033084 4 0.6638 -0.01028 0.224 0.000 0.000 0.412 0.364
#> SRR1033085 3 0.0671 0.89759 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1033086 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 4 0.6612 0.09696 0.272 0.000 0.000 0.460 0.268
#> SRR1033088 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033089 4 0.2648 0.62799 0.000 0.000 0.152 0.848 0.000
#> SRR1033090 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0609 0.89721 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033092 1 0.6625 0.17190 0.456 0.000 0.000 0.276 0.268
#> SRR1033093 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.3980 0.30994 0.708 0.000 0.284 0.000 0.008
#> SRR1033095 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.5121 0.59871 0.300 0.000 0.648 0.012 0.040
#> SRR1033097 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033099 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.1043 0.88342 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1033102 4 0.5714 0.36613 0.116 0.000 0.000 0.592 0.292
#> SRR1033103 1 0.5215 0.46269 0.592 0.000 0.000 0.056 0.352
#> SRR1033104 3 0.0898 0.89562 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1033105 1 0.6244 0.33278 0.504 0.000 0.000 0.160 0.336
#> SRR1033106 1 0.4920 0.46479 0.584 0.000 0.000 0.032 0.384
#> SRR1033107 3 0.0898 0.89562 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1033108 4 0.0671 0.76127 0.004 0.000 0.000 0.980 0.016
#> SRR1033109 1 0.6012 0.33416 0.484 0.000 0.000 0.116 0.400
#> SRR1033110 1 0.5330 0.27415 0.636 0.000 0.288 0.004 0.072
#> SRR1033111 1 0.6678 0.15223 0.436 0.000 0.000 0.264 0.300
#> SRR1033112 1 0.6531 0.23608 0.456 0.000 0.000 0.208 0.336
#> SRR1033113 1 0.3928 0.26852 0.700 0.000 0.296 0.000 0.004
#> SRR1033114 1 0.6362 0.29426 0.520 0.000 0.000 0.224 0.256
#> SRR1033115 1 0.3109 0.56339 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1033116 3 0.0992 0.89346 0.000 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1033117 3 0.0566 0.89784 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033118 4 0.0771 0.74981 0.000 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1033119 1 0.6771 0.06732 0.392 0.000 0.000 0.284 0.324
#> SRR1033121 3 0.1740 0.87965 0.056 0.000 0.932 0.012 0.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033122 4 0.5255 0.04324 0.012 0.000 0.404 0.556 0.028
#> SRR1033123 1 0.3534 0.55446 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1033124 5 0.6786 -0.00770 0.324 0.000 0.000 0.292 0.384
#> SRR1033125 1 0.3489 0.45213 0.820 0.000 0.144 0.000 0.036
#> SRR1033126 1 0.4425 0.52651 0.680 0.000 0.000 0.024 0.296
#> SRR1033127 2 0.4249 0.55233 0.000 0.688 0.296 0.000 0.016
#> SRR1033129 3 0.0898 0.89562 0.000 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1033128 1 0.2970 0.56043 0.828 0.000 0.004 0.000 0.168
#> SRR1033130 4 0.6477 0.02850 0.184 0.000 0.000 0.424 0.392
#> SRR1033131 1 0.5080 0.47427 0.604 0.000 0.000 0.048 0.348
#> SRR1033132 1 0.3912 0.37917 0.752 0.000 0.228 0.000 0.020
#> SRR1033133 1 0.2616 0.47868 0.888 0.000 0.076 0.000 0.036
#> SRR1033134 4 0.4300 0.62454 0.096 0.000 0.000 0.772 0.132
#> SRR1033135 3 0.3242 0.76494 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.6542 0.20172 0.428 0.000 0.000 0.200 0.372
#> SRR1033137 1 0.4384 0.36002 0.728 0.000 0.228 0.000 0.044
#> SRR1033139 2 0.4481 0.58343 0.312 0.668 0.016 0.000 0.004
#> SRR1033138 1 0.1597 0.52637 0.940 0.000 0.012 0.000 0.048
#> SRR1033140 3 0.1012 0.89453 0.020 0.000 0.968 0.012 0.000
#> SRR1033141 4 0.6356 0.10733 0.164 0.000 0.000 0.452 0.384
#> SRR1033142 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 4 0.5974 0.31482 0.132 0.000 0.000 0.548 0.320
#> SRR1033144 1 0.3305 0.56272 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1033145 3 0.3242 0.81070 0.172 0.000 0.816 0.012 0.000
#> SRR1033146 2 0.2497 0.86129 0.112 0.880 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033147 2 0.4594 0.50441 0.364 0.620 0.012 0.000 0.004
#> SRR1033148 4 0.0798 0.76038 0.008 0.000 0.000 0.976 0.016
#> SRR1033149 3 0.0451 0.89643 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1033150 1 0.5510 0.42544 0.548 0.000 0.000 0.072 0.380
#> SRR1033151 1 0.3958 0.42513 0.776 0.000 0.184 0.000 0.040
#> SRR1033152 5 0.6825 0.06641 0.328 0.000 0.000 0.332 0.340
#> SRR1033153 1 0.2426 0.48208 0.900 0.000 0.064 0.000 0.036
#> SRR1033154 1 0.3424 0.55976 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1033156 3 0.0510 0.89817 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033157 1 0.5029 0.49964 0.648 0.000 0.000 0.060 0.292
#> SRR1033158 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.2179 0.84227 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.3366 0.75031 0.232 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1033161 4 0.4152 0.61955 0.060 0.000 0.000 0.772 0.168
#> SRR1033163 1 0.4096 0.40392 0.760 0.000 0.200 0.000 0.040
#> SRR1033162 1 0.5309 0.48968 0.656 0.000 0.000 0.104 0.240
#> SRR1033164 2 0.5492 0.43589 0.340 0.588 0.068 0.000 0.004
#> SRR1033165 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.4758 0.54752 0.764 0.000 0.036 0.056 0.144
#> SRR1033167 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.3779 0.72954 0.236 0.000 0.752 0.000 0.012
#> SRR1033169 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.0833 0.94999 0.016 0.976 0.004 0.000 0.004
#> SRR1033170 1 0.6613 0.19470 0.440 0.000 0.000 0.228 0.332
#> SRR1033172 3 0.2127 0.84483 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0451 0.89661 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1033175 4 0.6152 0.25813 0.152 0.000 0.000 0.524 0.324
#> SRR1033176 1 0.3809 0.55313 0.736 0.000 0.000 0.008 0.256
#> SRR1033177 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033180 1 0.6362 0.29663 0.520 0.000 0.000 0.224 0.256
#> SRR1033181 1 0.3521 0.56133 0.764 0.000 0.004 0.000 0.232
#> SRR1033183 3 0.0566 0.89790 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033182 1 0.4003 0.53586 0.704 0.000 0.008 0.000 0.288
#> SRR1033184 1 0.4909 0.39597 0.716 0.000 0.216 0.016 0.052
#> SRR1033185 1 0.5470 0.47559 0.628 0.000 0.000 0.104 0.268
#> SRR1033187 4 0.5631 0.37674 0.108 0.000 0.000 0.600 0.292
#> SRR1033186 1 0.4025 0.52723 0.792 0.076 0.000 0.000 0.132
#> SRR1033188 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 1 0.4114 0.54112 0.712 0.000 0.000 0.016 0.272
#> SRR1033191 1 0.3508 0.55622 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR1033192 2 0.0290 0.96275 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 4 0.6195 0.18101 0.144 0.000 0.000 0.488 0.368
#> SRR1033195 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.6317 0.31196 0.496 0.000 0.000 0.172 0.332
#> SRR1033196 1 0.3164 0.47461 0.852 0.000 0.104 0.000 0.044
#> SRR1033199 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 4 0.4983 0.46189 0.064 0.000 0.000 0.664 0.272
#> SRR1033200 4 0.3231 0.62101 0.004 0.000 0.000 0.800 0.196
#> SRR1033201 3 0.0671 0.89789 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1033202 3 0.1331 0.88092 0.000 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1033203 3 0.5271 0.59550 0.312 0.000 0.632 0.016 0.040
#> SRR1033204 4 0.5816 0.35737 0.132 0.000 0.000 0.588 0.280
#> SRR1033205 3 0.5112 0.13520 0.000 0.000 0.496 0.468 0.036
#> SRR1033206 4 0.6363 0.08032 0.164 0.000 0.000 0.444 0.392
#> SRR1033207 4 0.5964 0.28027 0.124 0.000 0.000 0.536 0.340
#> SRR1033208 3 0.0912 0.89579 0.016 0.000 0.972 0.012 0.000
#> SRR1033209 4 0.3890 0.54610 0.012 0.000 0.000 0.736 0.252
#> SRR1033210 3 0.0566 0.89790 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033211 4 0.6534 -0.05642 0.196 0.000 0.000 0.416 0.388
#> SRR1033212 3 0.1492 0.88597 0.040 0.000 0.948 0.008 0.004
#> SRR1033213 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0162 0.76634 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033216 4 0.5797 0.36279 0.132 0.000 0.000 0.592 0.276
#> SRR1033215 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033217 1 0.7505 0.21318 0.468 0.000 0.308 0.104 0.120
#> SRR1033218 4 0.6091 0.25693 0.140 0.000 0.000 0.524 0.336
#> SRR1033219 4 0.5811 0.33707 0.116 0.000 0.000 0.568 0.316
#> SRR1033221 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 4 0.6133 0.26036 0.148 0.000 0.000 0.524 0.328
#> SRR1033223 1 0.7545 -0.14607 0.380 0.000 0.040 0.284 0.296
#> SRR1033225 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 4 0.2074 0.70940 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1033226 1 0.6519 0.27291 0.580 0.000 0.080 0.064 0.276
#> SRR1033227 3 0.4916 0.60425 0.004 0.000 0.708 0.212 0.076
#> SRR1033229 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.3055 0.66873 0.016 0.000 0.000 0.840 0.144
#> SRR1033231 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 4 0.5917 0.32918 0.132 0.000 0.000 0.564 0.304
#> SRR1033232 4 0.2471 0.68451 0.000 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1033233 4 0.6080 0.26191 0.140 0.000 0.000 0.528 0.332
#> SRR1033235 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.5104 0.72735 0.180 0.000 0.724 0.024 0.072
#> SRR1033236 3 0.7710 0.35470 0.176 0.000 0.500 0.148 0.176
#> SRR1033237 4 0.0290 0.76542 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1033238 3 0.4229 0.80931 0.124 0.000 0.800 0.024 0.052
#> SRR1033240 3 0.0510 0.89817 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033239 1 0.6724 0.01465 0.392 0.000 0.000 0.252 0.356
#> SRR1033242 4 0.0404 0.76357 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033241 3 0.3774 0.79914 0.152 0.000 0.808 0.008 0.032
#> SRR1033244 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.8352 -0.05389 0.360 0.000 0.156 0.248 0.236
#> SRR1033246 4 0.6420 0.09526 0.176 0.000 0.000 0.448 0.376
#> SRR1033248 4 0.0880 0.75688 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033247 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.5449 0.42692 0.556 0.000 0.000 0.068 0.376
#> SRR1033252 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 4 0.5117 0.51326 0.088 0.000 0.000 0.672 0.240
#> SRR1033254 4 0.6428 0.11515 0.180 0.000 0.000 0.456 0.364
#> SRR1033256 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.6100 0.64579 0.212 0.000 0.648 0.076 0.064
#> SRR1033258 4 0.5558 0.42382 0.112 0.000 0.000 0.620 0.268
#> SRR1033257 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033259 4 0.2909 0.67475 0.012 0.000 0.000 0.848 0.140
#> SRR1033260 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0771 0.89637 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1033262 3 0.0671 0.89774 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1033263 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 4 0.1168 0.75379 0.008 0.000 0.000 0.960 0.032
#> SRR1033265 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.4237 0.61629 0.076 0.000 0.000 0.772 0.152
#> SRR1033267 3 0.6662 0.57462 0.092 0.000 0.620 0.128 0.160
#> SRR1033268 5 0.6788 -0.04945 0.344 0.000 0.000 0.284 0.372
#> SRR1033269 1 0.4224 0.39186 0.744 0.000 0.216 0.000 0.040
#> SRR1033270 3 0.0671 0.89774 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1033271 4 0.6035 0.26684 0.132 0.000 0.000 0.528 0.340
#> SRR1033272 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 5 0.6779 0.04951 0.288 0.000 0.000 0.324 0.388
#> SRR1033274 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.96908 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.1043 0.75060 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1033278 4 0.0000 0.76795 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.4402 0.40332 0.740 0.000 0.204 0.000 0.056
#> SRR1033280 1 0.4284 0.38063 0.736 0.000 0.224 0.000 0.040
#> SRR1033281 5 0.6809 0.00445 0.320 0.000 0.000 0.312 0.368
#> SRR1033282 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033283 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033284 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033285 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033286 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033287 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033288 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033289 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033290 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033291 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033292 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1033293 5 0.2852 0.70368 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.5515 0.34972 0.184 0.000 0.000 0.556 0.260 0.000
#> SRR1032911 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0891 0.83963 0.000 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1032918 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.1536 0.93071 0.004 0.940 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR1032921 4 0.4552 0.47449 0.300 0.000 0.000 0.640 0.060 0.000
#> SRR1032922 4 0.6665 -0.13867 0.364 0.000 0.000 0.412 0.168 0.056
#> SRR1032923 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 4 0.0820 0.82897 0.012 0.000 0.000 0.972 0.016 0.000
#> SRR1032927 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032933 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 4 0.0790 0.82808 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1032935 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 4 0.0146 0.83470 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 4 0.2830 0.74419 0.144 0.000 0.000 0.836 0.020 0.000
#> SRR1032939 1 0.6734 0.47249 0.484 0.000 0.000 0.272 0.160 0.084
#> SRR1032940 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.1536 0.93071 0.004 0.940 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR1032943 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.3440 0.62973 0.776 0.000 0.000 0.196 0.028 0.000
#> SRR1032945 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 4 0.5027 0.49285 0.272 0.000 0.000 0.640 0.068 0.020
#> SRR1032951 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 4 0.1657 0.81135 0.056 0.000 0.000 0.928 0.016 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 4 0.2573 0.77056 0.112 0.000 0.000 0.864 0.024 0.000
#> SRR1032958 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 4 0.1500 0.81506 0.052 0.000 0.000 0.936 0.012 0.000
#> SRR1032962 6 0.5162 0.44278 0.044 0.212 0.012 0.000 0.048 0.684
#> SRR1032963 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.4659 0.70729 0.016 0.764 0.000 0.108 0.060 0.052
#> SRR1032968 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 4 0.1074 0.82504 0.028 0.000 0.000 0.960 0.012 0.000
#> SRR1032977 2 0.0405 0.96492 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1032978 4 0.5075 -0.07290 0.460 0.000 0.000 0.464 0.076 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 4 0.0820 0.82949 0.016 0.000 0.000 0.972 0.012 0.000
#> SRR1032984 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 6 0.5569 0.63776 0.204 0.000 0.136 0.000 0.032 0.628
#> SRR1032989 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 4 0.4200 0.65943 0.120 0.000 0.000 0.740 0.140 0.000
#> SRR1032993 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 4 0.4532 0.54289 0.276 0.000 0.000 0.672 0.024 0.028
#> SRR1032995 4 0.1408 0.81919 0.036 0.000 0.000 0.944 0.020 0.000
#> SRR1032996 4 0.0363 0.83258 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032997 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 4 0.0777 0.82975 0.024 0.000 0.000 0.972 0.004 0.000
#> SRR1032999 2 0.0458 0.96242 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033000 2 0.0405 0.96492 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033001 4 0.0146 0.83452 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033002 4 0.4704 0.44644 0.300 0.000 0.000 0.628 0.072 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.4291 0.29986 0.000 0.000 0.620 0.356 0.008 0.016
#> SRR1033007 4 0.1802 0.80432 0.072 0.000 0.000 0.916 0.012 0.000
#> SRR1033008 1 0.5640 0.49136 0.528 0.000 0.000 0.280 0.192 0.000
#> SRR1033009 4 0.4139 0.46391 0.336 0.000 0.000 0.640 0.024 0.000
#> SRR1033010 3 0.1321 0.82862 0.000 0.000 0.952 0.004 0.020 0.024
#> SRR1033011 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.1426 0.64557 0.948 0.000 0.000 0.028 0.008 0.016
#> SRR1033013 3 0.0806 0.84034 0.000 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1033014 3 0.1938 0.81811 0.004 0.000 0.928 0.016 0.024 0.028
#> SRR1033015 6 0.4439 0.63923 0.276 0.000 0.024 0.004 0.016 0.680
#> SRR1033016 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.6943 -0.33876 0.376 0.000 0.292 0.008 0.036 0.288
#> SRR1033019 3 0.1738 0.82469 0.004 0.000 0.928 0.000 0.016 0.052
#> SRR1033020 1 0.3965 0.63301 0.768 0.000 0.000 0.064 0.160 0.008
#> SRR1033021 4 0.4876 0.40028 0.356 0.000 0.020 0.596 0.016 0.012
#> SRR1033023 1 0.2745 0.66549 0.876 0.000 0.000 0.056 0.056 0.012
#> SRR1033022 1 0.1864 0.59190 0.924 0.000 0.000 0.004 0.032 0.040
#> SRR1033024 3 0.0622 0.83726 0.000 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033025 1 0.3415 0.63734 0.800 0.000 0.004 0.168 0.024 0.004
#> SRR1033026 3 0.0000 0.83986 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 4 0.4172 0.48574 0.000 0.000 0.252 0.708 0.016 0.024
#> SRR1033029 2 0.0622 0.95999 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1033030 3 0.1003 0.83307 0.000 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1033031 1 0.3930 0.42963 0.772 0.000 0.000 0.008 0.064 0.156
#> SRR1033032 3 0.6740 0.10935 0.172 0.000 0.484 0.000 0.080 0.264
#> SRR1033033 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.4224 0.56679 0.700 0.000 0.000 0.256 0.036 0.008
#> SRR1033036 1 0.4236 0.20271 0.656 0.000 0.000 0.000 0.036 0.308
#> SRR1033037 4 0.4407 0.02896 0.480 0.000 0.000 0.496 0.024 0.000
#> SRR1033038 1 0.6211 0.21052 0.624 0.084 0.004 0.016 0.084 0.188
#> SRR1033039 3 0.4220 0.66415 0.012 0.000 0.724 0.032 0.004 0.228
#> SRR1033040 1 0.5659 0.17856 0.628 0.000 0.148 0.004 0.028 0.192
#> SRR1033041 1 0.3109 0.66650 0.848 0.000 0.000 0.076 0.068 0.008
#> SRR1033042 1 0.2798 0.51311 0.852 0.000 0.000 0.000 0.036 0.112
#> SRR1033043 4 0.3911 0.40000 0.368 0.000 0.000 0.624 0.008 0.000
#> SRR1033044 4 0.4337 0.04809 0.480 0.000 0.000 0.500 0.020 0.000
#> SRR1033045 3 0.0777 0.84243 0.000 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033046 4 0.5435 0.59323 0.176 0.000 0.112 0.672 0.024 0.016
#> SRR1033047 3 0.1426 0.83712 0.000 0.000 0.948 0.016 0.008 0.028
#> SRR1033048 4 0.4317 0.27333 0.408 0.000 0.004 0.572 0.000 0.016
#> SRR1033049 1 0.3766 0.52211 0.684 0.000 0.000 0.304 0.012 0.000
#> SRR1033051 4 0.4465 0.07380 0.460 0.000 0.000 0.512 0.028 0.000
#> SRR1033052 1 0.1970 0.66680 0.912 0.000 0.000 0.060 0.028 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 6 0.2588 0.68585 0.092 0.000 0.024 0.000 0.008 0.876
#> SRR1033050 4 0.4408 0.50581 0.292 0.000 0.000 0.656 0.052 0.000
#> SRR1033055 3 0.2163 0.80458 0.000 0.000 0.892 0.000 0.016 0.092
#> SRR1033056 4 0.3102 0.72529 0.156 0.000 0.000 0.816 0.028 0.000
#> SRR1033057 1 0.2582 0.65723 0.888 0.000 0.000 0.060 0.020 0.032
#> SRR1033058 3 0.0820 0.83381 0.000 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033059 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.2404 0.56636 0.872 0.000 0.000 0.000 0.016 0.112
#> SRR1033061 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.0603 0.83693 0.000 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033063 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.1765 0.81656 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1033065 1 0.2784 0.51969 0.848 0.000 0.000 0.000 0.028 0.124
#> SRR1033066 1 0.3770 0.33809 0.728 0.000 0.000 0.000 0.028 0.244
#> SRR1033067 4 0.3950 0.24965 0.432 0.000 0.000 0.564 0.004 0.000
#> SRR1033068 6 0.5264 0.64574 0.192 0.000 0.144 0.000 0.016 0.648
#> SRR1033069 2 0.4696 0.43081 0.008 0.600 0.000 0.000 0.040 0.352
#> SRR1033070 6 0.3582 0.68663 0.192 0.000 0.024 0.000 0.008 0.776
#> SRR1033071 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 2 0.0909 0.95198 0.000 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1033073 3 0.4773 0.37437 0.016 0.000 0.608 0.000 0.036 0.340
#> SRR1033074 4 0.3202 0.70864 0.176 0.000 0.000 0.800 0.024 0.000
#> SRR1033075 4 0.4134 0.48759 0.316 0.000 0.000 0.656 0.028 0.000
#> SRR1033076 6 0.2781 0.69037 0.108 0.000 0.024 0.000 0.008 0.860
#> SRR1033077 1 0.4086 0.61971 0.728 0.000 0.000 0.220 0.048 0.004
#> SRR1033078 1 0.4326 0.52886 0.656 0.000 0.000 0.300 0.044 0.000
#> SRR1033079 3 0.0146 0.83921 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033080 3 0.0993 0.83166 0.000 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1033081 4 0.4620 0.33914 0.368 0.000 0.000 0.584 0.048 0.000
#> SRR1033082 1 0.3292 0.50901 0.824 0.000 0.000 0.004 0.052 0.120
#> SRR1033083 3 0.2595 0.76415 0.000 0.000 0.836 0.000 0.004 0.160
#> SRR1033084 1 0.4410 0.62220 0.716 0.000 0.000 0.164 0.120 0.000
#> SRR1033085 3 0.0717 0.83641 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1033086 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033087 1 0.3925 0.59934 0.724 0.000 0.000 0.236 0.040 0.000
#> SRR1033088 3 0.0993 0.83111 0.000 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1033089 4 0.1806 0.77448 0.000 0.000 0.088 0.908 0.000 0.004
#> SRR1033090 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0547 0.84256 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033092 1 0.2487 0.66016 0.892 0.000 0.000 0.064 0.024 0.020
#> SRR1033093 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 6 0.5030 0.65996 0.236 0.000 0.084 0.000 0.020 0.660
#> SRR1033095 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 6 0.6395 0.15689 0.148 0.000 0.392 0.004 0.032 0.424
#> SRR1033097 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0820 0.83428 0.000 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1033099 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.2046 0.80048 0.000 0.000 0.908 0.060 0.000 0.032
#> SRR1033102 1 0.6029 0.29007 0.396 0.000 0.000 0.356 0.248 0.000
#> SRR1033103 1 0.2926 0.64083 0.852 0.000 0.000 0.012 0.112 0.024
#> SRR1033104 3 0.0622 0.84062 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1033105 1 0.3498 0.65764 0.824 0.000 0.000 0.044 0.108 0.024
#> SRR1033106 1 0.3424 0.61216 0.800 0.000 0.000 0.004 0.160 0.036
#> SRR1033107 3 0.0405 0.84021 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033108 4 0.0713 0.82811 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1033109 1 0.3909 0.57877 0.732 0.000 0.000 0.020 0.236 0.012
#> SRR1033110 6 0.5501 0.63065 0.248 0.000 0.116 0.000 0.024 0.612
#> SRR1033111 1 0.2507 0.66586 0.892 0.000 0.000 0.060 0.028 0.020
#> SRR1033112 1 0.3050 0.65848 0.852 0.000 0.000 0.044 0.092 0.012
#> SRR1033113 6 0.2687 0.67296 0.072 0.000 0.044 0.000 0.008 0.876
#> SRR1033114 1 0.3651 0.62847 0.812 0.000 0.000 0.116 0.024 0.048
#> SRR1033115 1 0.3709 0.39834 0.756 0.000 0.000 0.000 0.040 0.204
#> SRR1033116 3 0.0520 0.84057 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033117 3 0.0000 0.83986 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 4 0.1434 0.80275 0.000 0.000 0.024 0.948 0.008 0.020
#> SRR1033119 1 0.3419 0.66459 0.828 0.000 0.000 0.088 0.072 0.012
#> SRR1033121 3 0.2562 0.75867 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1033120 2 0.0146 0.96996 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033122 4 0.5071 0.33284 0.000 0.000 0.276 0.628 0.012 0.084
#> SRR1033123 1 0.1923 0.58677 0.916 0.000 0.000 0.004 0.016 0.064
#> SRR1033124 1 0.4059 0.63877 0.760 0.000 0.000 0.088 0.148 0.004
#> SRR1033125 6 0.2113 0.67198 0.092 0.000 0.004 0.000 0.008 0.896
#> SRR1033126 1 0.2999 0.60933 0.852 0.000 0.000 0.004 0.072 0.072
#> SRR1033127 2 0.5059 0.42532 0.004 0.612 0.316 0.000 0.016 0.052
#> SRR1033129 3 0.0260 0.83961 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033128 1 0.3727 0.36293 0.748 0.000 0.000 0.000 0.036 0.216
#> SRR1033130 1 0.5490 0.52146 0.560 0.000 0.000 0.260 0.180 0.000
#> SRR1033131 1 0.2630 0.63820 0.872 0.000 0.000 0.004 0.092 0.032
#> SRR1033132 6 0.2485 0.67774 0.084 0.000 0.024 0.000 0.008 0.884
#> SRR1033133 6 0.3087 0.68203 0.176 0.000 0.004 0.000 0.012 0.808
#> SRR1033134 4 0.4895 0.47253 0.264 0.000 0.000 0.632 0.104 0.000
#> SRR1033135 3 0.3857 0.24979 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1033136 1 0.4447 0.64118 0.744 0.000 0.000 0.092 0.144 0.020
#> SRR1033137 6 0.2501 0.67640 0.072 0.000 0.028 0.000 0.012 0.888
#> SRR1033139 6 0.4967 0.13813 0.032 0.420 0.000 0.000 0.020 0.528
#> SRR1033138 6 0.4482 0.45498 0.384 0.000 0.000 0.000 0.036 0.580
#> SRR1033140 3 0.1700 0.82672 0.000 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1033141 1 0.5283 0.53704 0.588 0.000 0.000 0.264 0.148 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.5820 0.21041 0.416 0.000 0.000 0.400 0.184 0.000
#> SRR1033144 1 0.2667 0.53058 0.852 0.000 0.000 0.000 0.020 0.128
#> SRR1033145 3 0.3668 0.57624 0.000 0.000 0.668 0.000 0.004 0.328
#> SRR1033146 2 0.4953 0.51306 0.032 0.644 0.000 0.000 0.044 0.280
#> SRR1033147 6 0.5142 0.38441 0.044 0.280 0.000 0.000 0.044 0.632
#> SRR1033148 4 0.2221 0.79348 0.072 0.000 0.000 0.896 0.032 0.000
#> SRR1033149 3 0.0891 0.83345 0.000 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1033150 1 0.4767 0.58131 0.708 0.000 0.000 0.040 0.196 0.056
#> SRR1033151 6 0.2264 0.67825 0.096 0.000 0.012 0.000 0.004 0.888
#> SRR1033152 1 0.5531 0.54562 0.604 0.000 0.000 0.184 0.200 0.012
#> SRR1033153 6 0.2544 0.68423 0.120 0.000 0.012 0.000 0.004 0.864
#> SRR1033154 1 0.2554 0.57997 0.876 0.000 0.000 0.004 0.028 0.092
#> SRR1033156 3 0.1700 0.82317 0.000 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1033157 1 0.1350 0.62906 0.952 0.000 0.000 0.008 0.020 0.020
#> SRR1033158 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.3383 0.65125 0.000 0.000 0.728 0.000 0.004 0.268
#> SRR1033160 6 0.4086 -0.09111 0.000 0.000 0.464 0.000 0.008 0.528
#> SRR1033161 4 0.4953 0.44453 0.268 0.000 0.000 0.624 0.108 0.000
#> SRR1033163 6 0.2255 0.68380 0.088 0.000 0.016 0.000 0.004 0.892
#> SRR1033162 1 0.2896 0.59451 0.868 0.000 0.000 0.028 0.028 0.076
#> SRR1033164 6 0.5224 0.05302 0.028 0.440 0.008 0.000 0.024 0.500
#> SRR1033165 4 0.1701 0.80625 0.072 0.000 0.000 0.920 0.008 0.000
#> SRR1033166 1 0.4960 0.38427 0.688 0.000 0.012 0.024 0.052 0.224
#> SRR1033167 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.4628 0.37063 0.024 0.000 0.572 0.000 0.012 0.392
#> SRR1033169 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.3627 0.69447 0.004 0.752 0.000 0.000 0.020 0.224
#> SRR1033170 1 0.3055 0.66643 0.852 0.000 0.000 0.072 0.068 0.008
#> SRR1033172 3 0.3409 0.61379 0.000 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1033173 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.1462 0.83136 0.000 0.000 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR1033175 1 0.5654 0.48570 0.524 0.000 0.000 0.284 0.192 0.000
#> SRR1033176 1 0.2520 0.61594 0.888 0.000 0.000 0.012 0.032 0.068
#> SRR1033177 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.1194 0.94282 0.004 0.956 0.000 0.000 0.008 0.032
#> SRR1033180 1 0.2403 0.63717 0.900 0.000 0.000 0.040 0.020 0.040
#> SRR1033181 1 0.3210 0.52321 0.812 0.000 0.000 0.000 0.036 0.152
#> SRR1033183 3 0.0653 0.84098 0.000 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1033182 1 0.4111 0.56445 0.748 0.000 0.000 0.000 0.108 0.144
#> SRR1033184 6 0.5158 0.64151 0.256 0.000 0.072 0.008 0.016 0.648
#> SRR1033185 1 0.2328 0.63083 0.904 0.000 0.000 0.032 0.020 0.044
#> SRR1033187 4 0.6001 -0.12882 0.348 0.000 0.000 0.412 0.240 0.000
#> SRR1033186 1 0.4962 0.26464 0.672 0.028 0.000 0.000 0.068 0.232
#> SRR1033188 4 0.1643 0.80850 0.068 0.000 0.000 0.924 0.008 0.000
#> SRR1033189 2 0.1672 0.92409 0.004 0.932 0.000 0.000 0.016 0.048
#> SRR1033190 1 0.2138 0.58687 0.908 0.000 0.000 0.004 0.036 0.052
#> SRR1033191 1 0.2002 0.59766 0.916 0.000 0.000 0.008 0.020 0.056
#> SRR1033192 2 0.1333 0.92859 0.000 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048
#> SRR1033193 1 0.5787 0.46854 0.504 0.000 0.000 0.252 0.244 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 1 0.3394 0.65601 0.836 0.000 0.000 0.040 0.092 0.032
#> SRR1033196 6 0.4607 0.57610 0.336 0.000 0.012 0.004 0.024 0.624
#> SRR1033199 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 4 0.5875 0.14718 0.256 0.000 0.000 0.480 0.264 0.000
#> SRR1033200 4 0.4827 0.53848 0.112 0.000 0.000 0.652 0.236 0.000
#> SRR1033201 3 0.0806 0.84079 0.000 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1033202 3 0.0520 0.84057 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033203 6 0.5850 0.20313 0.076 0.000 0.372 0.004 0.036 0.512
#> SRR1033204 1 0.5984 0.33499 0.420 0.000 0.000 0.344 0.236 0.000
#> SRR1033205 4 0.5792 -0.07821 0.004 0.000 0.432 0.460 0.076 0.028
#> SRR1033206 1 0.5590 0.51108 0.548 0.000 0.000 0.220 0.232 0.000
#> SRR1033207 1 0.5992 0.34023 0.420 0.000 0.000 0.340 0.240 0.000
#> SRR1033208 3 0.1745 0.82813 0.000 0.000 0.920 0.000 0.012 0.068
#> SRR1033209 4 0.5647 0.45397 0.128 0.000 0.000 0.592 0.256 0.024
#> SRR1033210 3 0.0622 0.84077 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1033211 1 0.5892 0.48892 0.524 0.000 0.000 0.216 0.252 0.008
#> SRR1033212 3 0.2531 0.78913 0.000 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR1033213 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 4 0.0508 0.83218 0.004 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000
#> SRR1033216 1 0.5979 0.34537 0.424 0.000 0.000 0.340 0.236 0.000
#> SRR1033215 2 0.1442 0.93359 0.004 0.944 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1033217 6 0.7265 0.45612 0.268 0.000 0.132 0.056 0.060 0.484
#> SRR1033218 1 0.5992 0.30984 0.412 0.000 0.000 0.352 0.236 0.000
#> SRR1033219 4 0.5988 -0.12081 0.348 0.000 0.000 0.416 0.236 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.5816 0.44762 0.484 0.000 0.000 0.304 0.212 0.000
#> SRR1033223 1 0.7868 0.23770 0.396 0.000 0.032 0.132 0.208 0.232
#> SRR1033225 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 4 0.3920 0.68634 0.088 0.000 0.000 0.764 0.148 0.000
#> SRR1033226 6 0.6732 0.35004 0.232 0.000 0.020 0.044 0.184 0.520
#> SRR1033227 3 0.6154 0.45163 0.004 0.000 0.600 0.204 0.100 0.092
#> SRR1033229 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 4 0.3767 0.69905 0.088 0.000 0.000 0.780 0.132 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.5942 0.31527 0.424 0.000 0.000 0.356 0.220 0.000
#> SRR1033232 4 0.3316 0.72494 0.052 0.000 0.000 0.812 0.136 0.000
#> SRR1033233 1 0.5835 0.45104 0.488 0.000 0.000 0.280 0.232 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.5169 0.39100 0.004 0.000 0.560 0.004 0.072 0.360
#> SRR1033236 3 0.8283 0.00107 0.088 0.000 0.364 0.128 0.152 0.268
#> SRR1033237 4 0.0806 0.82864 0.008 0.000 0.000 0.972 0.020 0.000
#> SRR1033238 3 0.4568 0.61806 0.000 0.000 0.684 0.004 0.076 0.236
#> SRR1033240 3 0.1462 0.83357 0.000 0.000 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR1033239 1 0.5739 0.52716 0.592 0.000 0.000 0.160 0.224 0.024
#> SRR1033242 4 0.1649 0.81461 0.008 0.000 0.000 0.936 0.040 0.016
#> SRR1033241 3 0.4224 0.50836 0.000 0.000 0.632 0.000 0.028 0.340
#> SRR1033244 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 6 0.7834 0.07996 0.308 0.000 0.056 0.132 0.112 0.392
#> SRR1033246 1 0.5450 0.51942 0.560 0.000 0.000 0.276 0.164 0.000
#> SRR1033248 4 0.2537 0.77695 0.096 0.000 0.000 0.872 0.032 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.3121 0.62688 0.824 0.000 0.000 0.008 0.148 0.020
#> SRR1033252 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 4 0.5509 0.29062 0.292 0.000 0.000 0.544 0.164 0.000
#> SRR1033254 1 0.5445 0.52123 0.564 0.000 0.000 0.268 0.168 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 6 0.5964 -0.08392 0.016 0.000 0.436 0.040 0.052 0.456
#> SRR1033258 4 0.5887 0.05739 0.312 0.000 0.000 0.464 0.224 0.000
#> SRR1033257 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 4 0.4253 0.64844 0.108 0.000 0.000 0.732 0.160 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.1049 0.83873 0.000 0.000 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1033262 3 0.1643 0.82870 0.000 0.000 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR1033263 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 4 0.1644 0.80731 0.076 0.000 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 4 0.5443 0.36410 0.276 0.000 0.000 0.584 0.132 0.008
#> SRR1033267 3 0.7159 0.28782 0.016 0.000 0.480 0.088 0.184 0.232
#> SRR1033268 1 0.3567 0.65130 0.804 0.000 0.000 0.068 0.124 0.004
#> SRR1033269 6 0.3384 0.69412 0.132 0.000 0.032 0.000 0.016 0.820
#> SRR1033270 3 0.1524 0.83224 0.000 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1033271 1 0.5896 0.43398 0.468 0.000 0.000 0.296 0.236 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4631 0.60826 0.692 0.000 0.000 0.140 0.168 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033275 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.97248 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 4 0.1398 0.81596 0.008 0.000 0.000 0.940 0.052 0.000
#> SRR1033278 4 0.0000 0.83559 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 6 0.3637 0.68319 0.096 0.000 0.052 0.000 0.032 0.820
#> SRR1033280 6 0.3816 0.68217 0.200 0.000 0.028 0.000 0.012 0.760
#> SRR1033281 1 0.3967 0.63821 0.760 0.000 0.000 0.092 0.148 0.000
#> SRR1033282 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033283 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033284 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033285 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033286 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033287 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033288 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033289 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033290 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033291 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033292 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
#> SRR1033293 5 0.2209 1.00000 0.040 0.000 0.000 0.052 0.904 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.990 0.995 0.27320 0.728 0.728
#> 3 3 0.601 0.853 0.837 0.88089 0.645 0.514
#> 4 4 0.845 0.881 0.953 0.26395 0.962 0.901
#> 5 5 0.804 0.836 0.923 0.01521 0.989 0.970
#> 6 6 0.816 0.843 0.936 0.00872 0.992 0.977
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.8813 0.582 0.300 0.700
#> SRR1032921 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032932 1 0.6973 0.765 0.812 0.188
#> SRR1032933 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032942 1 0.9460 0.418 0.636 0.364
#> SRR1032943 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032967 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032977 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.2043 0.962 0.032 0.968
#> SRR1033000 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.1843 0.966 0.028 0.972
#> SRR1033030 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.3584 0.927 0.068 0.932
#> SRR1033062 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033073 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.3431 0.931 0.064 0.936
#> SRR1033087 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.2236 0.959 0.036 0.964
#> SRR1033122 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033127 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033129 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033147 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033171 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.7299 0.751 0.204 0.796
#> SRR1033180 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033189 1 0.6048 0.823 0.852 0.148
#> SRR1033190 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.2043 0.962 0.032 0.968
#> SRR1033194 2 0.1843 0.966 0.028 0.972
#> SRR1033197 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033215 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033217 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033247 1 0.7815 0.694 0.768 0.232
#> SRR1033249 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0376 0.984 0.004 0.996
#> SRR1033275 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.987 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.1163 0.9005 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.6126 0.3919 0.000 0.600 0.400
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.8309 0.6687 0.180 0.188 0.632
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.5465 0.2600 0.712 0.000 0.288
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 3 0.5988 0.3152 0.008 0.304 0.688
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.1964 0.8638 0.944 0.000 0.056
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 3 0.5968 0.9104 0.364 0.000 0.636
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0592 0.9185 0.988 0.000 0.012
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.4399 0.6019 0.812 0.000 0.188
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.1031 0.9053 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032999 2 0.2537 0.9057 0.000 0.920 0.080
#> SRR1033000 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.6291 -0.5692 0.532 0.000 0.468
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.6154 0.8658 0.408 0.000 0.592
#> SRR1033007 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0424 0.9228 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033010 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 3 0.6111 0.8864 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033013 3 0.6079 0.8979 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033014 3 0.6026 0.9129 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033015 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033019 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033020 1 0.6307 -0.6292 0.512 0.000 0.488
#> SRR1033021 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 3 0.6126 0.8792 0.400 0.000 0.600
#> SRR1033024 3 0.6286 0.7571 0.464 0.000 0.536
#> SRR1033025 1 0.2625 0.8186 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033026 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.6260 -0.5016 0.552 0.000 0.448
#> SRR1033029 2 0.2165 0.9213 0.000 0.936 0.064
#> SRR1033030 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033031 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033032 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.5859 -0.0683 0.656 0.000 0.344
#> SRR1033036 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033039 3 0.6286 0.7572 0.464 0.000 0.536
#> SRR1033040 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033041 1 0.3412 0.7517 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033042 3 0.6111 0.8852 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 3 0.6045 0.9083 0.380 0.000 0.620
#> SRR1033048 1 0.0424 0.9228 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.3340 0.7581 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033058 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.6140 0.8727 0.404 0.000 0.596
#> SRR1033061 3 0.6126 0.1332 0.000 0.400 0.600
#> SRR1033062 3 0.6291 0.7475 0.468 0.000 0.532
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033065 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033066 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033067 1 0.2537 0.8275 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033068 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033069 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033070 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033073 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033080 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033083 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033084 1 0.2625 0.8212 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033085 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033086 2 0.5810 0.5378 0.000 0.664 0.336
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033089 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033092 1 0.1643 0.8801 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.0424 0.9227 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.6215 -0.4303 0.572 0.000 0.428
#> SRR1033104 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033105 3 0.6180 0.8516 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033106 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033107 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.5706 0.0983 0.680 0.000 0.320
#> SRR1033110 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033111 1 0.1289 0.8962 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033114 3 0.6095 0.8919 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033115 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033116 3 0.6079 0.8973 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033117 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033118 1 0.0237 0.9267 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033119 1 0.0237 0.9267 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033121 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033120 2 0.3686 0.8400 0.000 0.860 0.140
#> SRR1033122 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033123 3 0.6026 0.9129 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.5948 0.9062 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033126 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033127 3 0.5948 0.9062 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033129 3 0.6026 0.9130 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033128 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.5678 0.1213 0.684 0.000 0.316
#> SRR1033132 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033133 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033136 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033137 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033139 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033138 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033140 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033141 1 0.0237 0.9267 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033145 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033146 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033147 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033150 3 0.6291 0.7417 0.468 0.000 0.532
#> SRR1033151 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033152 1 0.4555 0.5706 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033153 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033154 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033156 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033157 1 0.6111 -0.3005 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033160 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033161 1 0.0892 0.9096 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033163 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033162 3 0.6079 0.8979 0.388 0.000 0.612
#> SRR1033164 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.5785 0.8732 0.332 0.000 0.668
#> SRR1033170 1 0.4121 0.6539 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033172 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 3 0.6192 0.8464 0.420 0.000 0.580
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.5678 0.5717 0.000 0.684 0.316
#> SRR1033180 3 0.6026 0.9129 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033181 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033183 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033182 3 0.6126 0.8793 0.400 0.000 0.600
#> SRR1033184 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033185 1 0.5178 0.3875 0.744 0.000 0.256
#> SRR1033187 1 0.1753 0.8749 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033186 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033188 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.8246 0.7190 0.220 0.148 0.632
#> SRR1033190 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033191 3 0.6295 0.7337 0.472 0.000 0.528
#> SRR1033192 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033193 1 0.2448 0.8341 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033195 2 0.2959 0.8848 0.000 0.900 0.100
#> SRR1033194 2 0.1964 0.9286 0.000 0.944 0.056
#> SRR1033197 1 0.6309 -0.6595 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033196 3 0.5988 0.9142 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1529 0.8769 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033202 3 0.6235 0.8130 0.436 0.000 0.564
#> SRR1033203 3 0.5926 0.9018 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033206 1 0.3412 0.7507 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.5138 0.7744 0.252 0.000 0.748
#> SRR1033209 1 0.6302 -0.6165 0.520 0.000 0.480
#> SRR1033210 3 0.5810 0.8781 0.336 0.000 0.664
#> SRR1033211 3 0.6026 0.9129 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033212 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.4887 0.7466 0.228 0.000 0.772
#> SRR1033217 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033218 1 0.0424 0.9226 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.6062 0.9029 0.384 0.000 0.616
#> SRR1033225 2 0.0237 0.9711 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033227 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.3267 0.7643 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033236 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033240 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033239 1 0.6252 -0.4910 0.556 0.000 0.444
#> SRR1033242 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.8246 0.6267 0.148 0.220 0.632
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.1289 0.8958 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033262 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.6095 0.8920 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033267 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033268 1 0.1031 0.9045 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033269 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033270 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.3879 0.6909 0.848 0.000 0.152
#> SRR1033274 2 0.1529 0.9427 0.000 0.960 0.040
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9305 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033280 3 0.6008 0.9172 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033281 1 0.4399 0.6034 0.812 0.000 0.188
#> SRR1033282 3 0.0237 0.4473 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033283 3 0.1289 0.4359 0.032 0.000 0.968
#> SRR1033284 3 0.0237 0.4473 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033285 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 3 0.0000 0.4485 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.0921 0.9280 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.6445 0.2965 0.000 0.600 0.304 0.096
#> SRR1032921 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 3 0.2281 0.8445 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.2760 0.8027 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.4356 0.5782 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 3 0.6790 0.3961 0.000 0.192 0.608 0.200
#> SRR1032943 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.1557 0.9012 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 3 0.0469 0.9095 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.3688 0.6948 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0469 0.9414 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.3486 0.7382 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0817 0.9315 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1032999 2 0.3528 0.7663 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1033000 3 0.3569 0.7125 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.4989 0.0820 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.2345 0.8392 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0336 0.9446 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033010 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 3 0.1118 0.8968 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1033013 3 0.0592 0.9080 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033014 3 0.0188 0.9142 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033020 3 0.4817 0.4051 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 3 0.4454 0.5533 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR1033024 3 0.2216 0.8412 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1033025 1 0.3649 0.6956 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.4989 0.0843 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1033029 2 0.3569 0.7611 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1033030 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033031 3 0.1302 0.8904 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1033032 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 3 0.4989 0.1760 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1033036 3 0.0817 0.9038 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.1389 0.8876 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1033039 3 0.2216 0.8400 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1033040 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.2760 0.8203 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1033042 3 0.4040 0.6492 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 3 0.0336 0.9125 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033048 1 0.0336 0.9446 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.2647 0.8295 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.4830 0.3937 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1033061 4 0.6784 0.3637 0.000 0.104 0.368 0.528
#> SRR1033062 3 0.2281 0.8348 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033065 3 0.2216 0.8488 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1033066 3 0.0336 0.9125 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033067 1 0.2011 0.8755 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033069 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.1211 0.8936 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 3 0.3444 0.7415 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.2081 0.8713 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033085 3 0.0188 0.9143 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033086 2 0.6549 0.2975 0.000 0.556 0.088 0.356
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.1637 0.8957 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.2530 0.8289 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.0469 0.9414 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.6701 0.3356 0.564 0.000 0.328 0.108
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033105 3 0.4193 0.6187 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR1033106 3 0.3610 0.7200 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.4564 0.5129 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.1118 0.9214 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033114 3 0.2281 0.8486 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1033115 3 0.1389 0.8835 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1033116 3 0.2345 0.8394 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.1118 0.9197 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033119 1 0.0188 0.9475 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.4840 0.6626 0.000 0.732 0.028 0.240
#> SRR1033122 3 0.1118 0.8961 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1033123 3 0.2647 0.8217 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033126 3 0.2011 0.8601 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1033127 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0188 0.9142 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033128 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.4500 0.5376 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033133 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033136 3 0.3024 0.7870 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033139 3 0.0188 0.9139 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033138 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0188 0.9475 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 3 0.2345 0.8407 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.1792 0.8653 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1033147 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033150 3 0.3942 0.6645 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1033151 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.3610 0.7224 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1033153 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033154 3 0.2921 0.7979 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.4843 0.3382 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0707 0.9345 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033162 3 0.3649 0.7163 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1033164 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 3 0.1716 0.8741 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.2530 0.8213 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1033170 1 0.3266 0.7674 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0188 0.9143 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 3 0.3908 0.7058 0.212 0.000 0.784 0.004
#> SRR1033177 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.6086 0.5402 0.000 0.680 0.132 0.188
#> SRR1033180 3 0.4164 0.6230 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1033181 3 0.1022 0.8986 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1033183 3 0.0336 0.9125 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1033182 3 0.4713 0.4613 0.360 0.000 0.640 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.4522 0.5247 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1033187 1 0.1389 0.9091 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1033186 3 0.0592 0.9084 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033190 3 0.3764 0.6979 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR1033191 3 0.2973 0.7855 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1033192 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.2011 0.8762 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1033195 2 0.3355 0.8021 0.000 0.836 0.004 0.160
#> SRR1033194 2 0.3208 0.8158 0.000 0.848 0.004 0.148
#> SRR1033197 3 0.6770 0.4143 0.268 0.000 0.592 0.140
#> SRR1033196 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1302 0.9159 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.2281 0.8412 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.2011 0.8596 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1033206 1 0.2921 0.8063 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.4996 0.0040 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033211 3 0.3569 0.7259 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.3444 0.7333 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1033217 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0469 0.9409 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.1118 0.8970 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1033225 2 0.2704 0.8448 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0188 0.9473 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1033233 1 0.2589 0.8338 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.4955 0.1837 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1033242 1 0.1022 0.9224 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.7191 0.0493 0.000 0.148 0.500 0.352
#> SRR1033249 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 3 0.2345 0.8393 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.1022 0.9244 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.3942 0.6702 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1033267 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.1389 0.9076 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.3074 0.7887 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1033274 2 0.2741 0.8626 0.000 0.892 0.012 0.096
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.9556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9504 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.9160 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.3486 0.7395 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1033282 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 4 0.0000 0.9517 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.0794 0.927790 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.6096 0.249799 0.000 0.588 0.284 0.016 0.112
#> SRR1032921 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032922 3 0.2020 0.839474 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.3109 0.543694 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.3966 0.428848 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1032932 3 0.2835 0.801682 0.000 0.004 0.868 0.016 0.112
#> SRR1032933 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.3752 0.577847 0.708 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 3 0.6309 0.379297 0.000 0.196 0.592 0.016 0.196
#> SRR1032943 4 0.4030 0.725370 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.2179 0.696608 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1032950 1 0.1341 0.901038 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 4 0.3366 0.928973 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 3 0.1012 0.895761 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020
#> SRR1032968 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 3 0.5956 0.370422 0.000 0.000 0.592 0.212 0.196
#> SRR1032978 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0162 0.734391 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.3561 0.548885 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1032992 1 0.0404 0.941222 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.3003 0.737724 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0703 0.931380 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.2616 0.686987 0.000 0.880 0.000 0.020 0.100
#> SRR1033000 3 0.5814 0.420449 0.000 0.000 0.612 0.208 0.180
#> SRR1033001 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.4297 0.078016 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.1792 0.708174 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.2020 0.837943 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0290 0.944405 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033010 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033011 4 0.3424 0.927053 0.000 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1033012 3 0.1043 0.892528 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1033013 3 0.0510 0.905834 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0162 0.911896 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033015 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033016 4 0.3508 0.915823 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1033017 4 0.3210 0.939433 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 3 0.4161 0.396847 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033022 3 0.3837 0.556448 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000
#> SRR1033024 3 0.1908 0.839615 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.3143 0.695715 0.796 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1033026 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 4 0.3508 0.915823 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1033028 1 0.4297 0.080472 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.3264 0.643037 0.000 0.820 0.000 0.016 0.164
#> SRR1033030 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 3 0.1121 0.888606 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1033032 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 4 0.3452 0.924005 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR1033035 4 0.3210 0.939433 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1033034 3 0.4297 0.177424 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000
#> SRR1033036 3 0.0703 0.901676 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.1197 0.885893 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1033039 3 0.1908 0.838489 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.2377 0.819972 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1033042 3 0.3508 0.645399 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 3 0.0290 0.910199 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0290 0.944427 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033053 4 0.4227 0.604675 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.2280 0.829214 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1033058 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 4 0.3210 0.939433 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1033060 3 0.4161 0.396096 0.392 0.000 0.608 0.000 0.000
#> SRR1033061 5 0.7426 0.373410 0.000 0.052 0.276 0.212 0.460
#> SRR1033062 3 0.1965 0.833275 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033063 4 0.3210 0.939433 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 3 0.1965 0.843748 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033066 3 0.0290 0.910245 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.1732 0.875235 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033069 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 4 0.3210 0.939433 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1033072 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.1121 0.888789 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 3 0.2966 0.742332 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.1792 0.871071 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1033085 3 0.0162 0.912003 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.6878 0.290727 0.000 0.520 0.068 0.092 0.320
#> SRR1033087 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.1410 0.895571 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1033093 4 0.3210 0.939433 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033095 4 0.3274 0.937678 0.000 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1033096 3 0.2230 0.823899 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.2230 0.665875 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 4 0.3210 0.939433 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1033100 2 0.4278 -0.300753 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1033101 1 0.0404 0.941253 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.5772 0.336158 0.564 0.000 0.328 0.000 0.108
#> SRR1033104 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 3 0.3612 0.621174 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR1033106 3 0.3109 0.721130 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1033107 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.3932 0.511084 0.672 0.000 0.328 0.000 0.000
#> SRR1033110 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0963 0.921230 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033113 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 3 0.2020 0.843444 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1033115 3 0.1121 0.885330 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033116 3 0.1965 0.842262 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0963 0.919595 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0162 0.947347 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033121 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.4451 0.570611 0.000 0.736 0.024 0.016 0.224
#> SRR1033122 3 0.0963 0.894123 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033123 3 0.2230 0.825569 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033125 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033126 3 0.1792 0.855165 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1033127 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0162 0.911821 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033128 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.3876 0.537140 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1033132 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033133 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 3 0.2648 0.782212 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1033137 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033139 3 0.0162 0.911574 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033138 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0162 0.947332 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.4306 -0.194528 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 3 0.2074 0.835767 0.104 0.000 0.896 0.000 0.000
#> SRR1033145 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.1478 0.867618 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1033147 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 3 0.3424 0.660505 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000
#> SRR1033151 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.3109 0.721896 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1033153 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033154 3 0.2516 0.797767 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.4171 0.335551 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0609 0.934386 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1033163 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033162 3 0.3143 0.717345 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000
#> SRR1033164 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 3 0.1544 0.869165 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.2020 0.833478 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033170 1 0.2813 0.767038 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1033172 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.3242 0.615538 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1033174 3 0.0162 0.912022 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 3 0.3210 0.709610 0.212 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.4171 0.275318 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1033178 2 0.4294 -0.319387 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1033179 2 0.5682 0.442951 0.000 0.668 0.132 0.016 0.184
#> SRR1033180 3 0.3586 0.625483 0.264 0.000 0.736 0.000 0.000
#> SRR1033181 3 0.0880 0.896625 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1033183 3 0.0290 0.910233 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1033182 3 0.4060 0.465170 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.3895 0.524550 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.1197 0.908935 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1033186 3 0.0404 0.908381 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.0404 0.908040 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033190 3 0.3242 0.699254 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000
#> SRR1033191 3 0.2561 0.785124 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.1732 0.875970 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.2362 0.699152 0.000 0.900 0.000 0.024 0.076
#> SRR1033194 2 0.0703 0.724734 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033197 3 0.5831 0.419313 0.268 0.000 0.592 0.000 0.140
#> SRR1033196 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033199 4 0.3242 0.938840 0.000 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR1033198 1 0.1121 0.915670 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1033200 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.1965 0.840148 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033205 3 0.1671 0.861902 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.2516 0.805904 0.860 0.000 0.140 0.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033208 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.4304 0.000808 0.516 0.000 0.484 0.000 0.000
#> SRR1033210 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 3 0.3074 0.726964 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR1033212 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033215 3 0.3246 0.723508 0.000 0.000 0.808 0.008 0.184
#> SRR1033217 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0404 0.940779 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.4297 -0.062534 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1033220 2 0.4074 0.365091 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033223 3 0.0963 0.895085 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0703 0.724734 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.2813 0.663652 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0162 0.947187 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.2230 0.833429 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.4138 0.305625 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.4268 0.180406 0.556 0.000 0.444 0.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0963 0.918395 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.3949 0.433819 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1033243 4 0.3586 0.886940 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1033245 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.6655 0.017782 0.000 0.152 0.484 0.016 0.348
#> SRR1033249 2 0.3895 0.460121 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1033250 2 0.3707 0.517147 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1033251 3 0.1965 0.842502 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0880 0.924215 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0404 0.733975 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.2891 0.651298 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 4 0.3508 0.906708 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.734740 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.3395 0.672161 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR1033267 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.1197 0.907536 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1033269 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.2561 0.680023 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1033273 1 0.2648 0.788293 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0510 0.728592 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0290 0.734087 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.950253 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.913576 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.3003 0.739077 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1033282 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033283 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033284 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033285 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033286 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033287 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033288 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033289 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033290 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033291 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033292 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1033293 5 0.0000 0.946504 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 1 0.0858 0.9244 0.968 0.000 0.028 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032911 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032917 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.5485 0.2262 0.000 0.600 0.268 0.000 0.112 0.020
#> SRR1032921 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032922 3 0.1958 0.8404 0.100 0.000 0.896 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032923 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.2996 0.5841 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.3817 0.3919 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.2536 0.8206 0.000 0.004 0.880 0.004 0.092 0.020
#> SRR1032933 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.3371 0.5666 0.708 0.000 0.292 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032942 3 0.5603 0.4370 0.000 0.196 0.616 0.000 0.164 0.024
#> SRR1032943 4 0.2823 0.6736 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032945 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.2491 0.7248 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.1285 0.9010 0.944 0.000 0.052 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032951 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032955 4 0.0865 0.8157 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032962 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032967 3 0.0865 0.8957 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032977 6 0.0146 0.8201 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1032978 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0363 0.7726 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032990 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.3592 0.5302 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.0363 0.9408 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.2838 0.7277 0.808 0.000 0.188 0.000 0.000 0.004
#> SRR1032995 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0632 0.9300 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.2301 0.7173 0.000 0.884 0.000 0.000 0.096 0.020
#> SRR1033000 6 0.0146 0.8201 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1033001 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.3989 0.0851 0.528 0.000 0.468 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033003 2 0.2300 0.7324 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033006 3 0.1958 0.8387 0.100 0.000 0.896 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033007 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033009 1 0.0405 0.9415 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033010 3 0.0146 0.9167 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033011 4 0.1204 0.8071 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1033012 3 0.1082 0.8954 0.040 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033013 3 0.0458 0.9103 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033014 3 0.0291 0.9157 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033015 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033016 4 0.1501 0.7948 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1033017 4 0.0146 0.8183 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033019 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033020 3 0.3872 0.3922 0.392 0.000 0.604 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033021 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033022 3 0.3584 0.5485 0.308 0.000 0.688 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033024 3 0.1714 0.8428 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.2964 0.6855 0.792 0.000 0.204 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033026 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033027 4 0.1501 0.7948 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.3860 0.0817 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.2945 0.6694 0.000 0.824 0.000 0.000 0.156 0.020
#> SRR1033030 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033031 3 0.1152 0.8912 0.044 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033032 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033033 4 0.1204 0.8075 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1033035 4 0.0146 0.8183 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033034 3 0.3860 0.1728 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033036 3 0.0777 0.9049 0.024 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033037 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033038 3 0.1219 0.8884 0.048 0.000 0.948 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033039 3 0.1714 0.8417 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033040 3 0.0146 0.9167 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033041 1 0.2234 0.8178 0.872 0.000 0.124 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033042 3 0.3151 0.6433 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033045 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033047 3 0.0260 0.9149 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0260 0.9438 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033053 4 0.3244 0.5892 0.000 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033055 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.2146 0.8273 0.880 0.000 0.116 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033058 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033059 4 0.0146 0.8183 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.3872 0.3921 0.392 0.000 0.604 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033061 6 0.0436 0.8189 0.000 0.004 0.000 0.004 0.004 0.988
#> SRR1033062 3 0.1765 0.8347 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033063 4 0.0146 0.8183 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033065 3 0.1908 0.8448 0.096 0.000 0.900 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033066 3 0.0405 0.9138 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033067 1 0.1556 0.8733 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033068 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033069 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033070 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033071 4 0.0146 0.8183 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033073 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033076 3 0.1007 0.8929 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033079 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033080 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033082 3 0.2664 0.7430 0.184 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033083 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.1700 0.8703 0.916 0.000 0.080 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033085 3 0.0146 0.9167 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033086 6 0.4315 0.3902 0.000 0.348 0.000 0.004 0.024 0.624
#> SRR1033087 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033088 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033091 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.1411 0.8916 0.936 0.000 0.060 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033093 4 0.0146 0.8183 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033095 4 0.0713 0.8182 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1033096 3 0.2003 0.8265 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.2300 0.6618 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1033098 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033099 4 0.0146 0.8183 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1033100 4 0.3828 0.3118 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.0363 0.9399 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033103 1 0.5168 0.3269 0.564 0.000 0.344 0.000 0.088 0.004
#> SRR1033104 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033105 3 0.3383 0.6153 0.268 0.000 0.728 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033106 3 0.2933 0.7183 0.200 0.000 0.796 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033107 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033109 1 0.3652 0.5063 0.672 0.000 0.324 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033110 3 0.0146 0.9167 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033111 1 0.1010 0.9178 0.960 0.000 0.036 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033112 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033113 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033114 3 0.1958 0.8442 0.100 0.000 0.896 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033115 3 0.0858 0.9010 0.000 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1033116 3 0.1765 0.8449 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033117 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0865 0.9178 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0291 0.9444 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033121 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.3976 0.6093 0.000 0.760 0.024 0.000 0.188 0.028
#> SRR1033122 3 0.0865 0.8984 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033123 3 0.2146 0.8259 0.116 0.000 0.880 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033124 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033125 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033126 3 0.1753 0.8565 0.084 0.000 0.912 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033127 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033129 3 0.0146 0.9165 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033128 3 0.0146 0.9167 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033130 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.3601 0.5271 0.684 0.000 0.312 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033132 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033133 3 0.0146 0.9167 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033134 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033135 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033136 3 0.2520 0.7814 0.152 0.000 0.844 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033137 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033139 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033138 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033140 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0291 0.9444 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033142 4 0.3810 0.0752 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033144 3 0.2006 0.8365 0.104 0.000 0.892 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033145 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033146 3 0.0790 0.8983 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033147 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033150 3 0.3215 0.6556 0.240 0.000 0.756 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033151 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.2902 0.7169 0.800 0.000 0.196 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033153 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033154 3 0.2402 0.7974 0.140 0.000 0.856 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033156 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.3872 0.3410 0.604 0.000 0.392 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033158 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033160 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0692 0.9315 0.976 0.000 0.020 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033163 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033162 3 0.2964 0.7146 0.204 0.000 0.792 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033164 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033165 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033166 3 0.1387 0.8728 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033168 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.1387 0.8704 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1033170 1 0.2632 0.7633 0.832 0.000 0.164 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033172 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.3244 0.6441 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.0146 0.9168 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033176 3 0.2994 0.7115 0.208 0.000 0.788 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033177 2 0.3868 0.2358 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1033178 4 0.3717 0.4182 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.5028 0.4473 0.000 0.684 0.128 0.000 0.168 0.020
#> SRR1033180 3 0.3221 0.6229 0.264 0.000 0.736 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033181 3 0.0935 0.8996 0.032 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033183 3 0.0260 0.9150 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033182 3 0.3647 0.4569 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033184 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.3619 0.5145 0.680 0.000 0.316 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033187 1 0.1152 0.9090 0.952 0.000 0.044 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033186 3 0.0363 0.9131 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033189 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033190 3 0.3052 0.6961 0.216 0.000 0.780 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033191 3 0.2300 0.7860 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033192 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033193 1 0.1644 0.8753 0.920 0.000 0.076 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033195 2 0.2094 0.7286 0.000 0.900 0.000 0.000 0.080 0.020
#> SRR1033194 2 0.0000 0.7697 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033197 3 0.5372 0.4142 0.268 0.000 0.588 0.000 0.140 0.004
#> SRR1033196 3 0.0146 0.9167 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033199 4 0.0363 0.8192 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.1219 0.9094 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033200 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033201 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033202 3 0.1765 0.8425 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033203 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033205 3 0.1501 0.8651 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.2362 0.8034 0.860 0.000 0.136 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033207 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033208 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.3995 0.0102 0.516 0.000 0.480 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033210 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033211 3 0.2902 0.7244 0.196 0.000 0.800 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033212 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033215 3 0.2664 0.7388 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1033217 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0508 0.9383 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033219 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033221 4 0.3810 0.0308 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.3843 0.3458 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033223 3 0.0865 0.8993 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.7697 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033226 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033227 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.2912 0.6951 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033232 1 0.0146 0.9458 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.2146 0.8268 0.880 0.000 0.116 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033235 2 0.3857 0.2974 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033236 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033240 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.3961 0.1868 0.556 0.000 0.440 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033242 1 0.0865 0.9165 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033241 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.3810 0.3946 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1033243 4 0.1957 0.7662 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1033245 3 0.0146 0.9167 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033246 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033248 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033247 3 0.6122 0.0942 0.000 0.148 0.496 0.004 0.332 0.020
#> SRR1033249 2 0.3765 0.4469 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.3684 0.4954 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1033251 3 0.1908 0.8434 0.096 0.000 0.900 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033252 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0935 0.9208 0.964 0.000 0.032 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033256 2 0.0458 0.7730 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1033255 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.3076 0.6647 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1033261 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033262 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033263 4 0.1910 0.7730 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0146 0.7722 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1033266 3 0.3189 0.6678 0.236 0.000 0.760 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033267 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.1219 0.9042 0.948 0.000 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033269 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033270 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033272 2 0.2697 0.7144 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.2482 0.7852 0.848 0.000 0.148 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033274 2 0.0458 0.7655 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033275 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0363 0.7724 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0146 0.9467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033278 1 0.0000 0.9485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033279 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033280 3 0.0000 0.9182 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.2805 0.7347 0.812 0.000 0.184 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033282 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033283 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033284 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033285 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033286 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033287 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033288 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033289 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033290 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033291 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033292 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033293 5 0.0000 1.0000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.977 0.989 0.335 0.657 0.657
#> 3 3 0.445 0.330 0.735 0.593 0.792 0.684
#> 4 4 0.481 0.827 0.867 -0.132 0.773 0.656
#> 5 5 0.395 0.351 0.700 0.301 0.953 0.927
#> 6 6 0.397 0.507 0.643 0.164 0.711 0.529
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032962 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032963 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032968 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032978 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032981 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033001 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033007 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.2948 0.942 0.948 0.052
#> SRR1033011 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033015 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033016 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033019 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033020 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.3733 0.918 0.928 0.072
#> SRR1033023 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033025 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033027 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033030 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033031 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033032 1 0.8327 0.627 0.736 0.264
#> SRR1033033 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033036 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033038 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033039 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033041 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033046 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033048 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033051 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033055 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033056 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033058 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033059 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033062 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033063 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033065 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033069 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033070 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033072 1 0.8081 0.657 0.752 0.248
#> SRR1033073 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033074 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033077 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033080 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033081 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033083 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033084 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033086 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033087 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033088 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033089 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033092 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033093 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033094 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033095 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033099 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033114 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033116 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033118 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033122 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033124 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033126 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033129 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033130 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033133 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033136 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033139 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033138 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033140 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033141 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033145 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033146 1 0.1184 0.981 0.984 0.016
#> SRR1033147 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033148 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033150 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033152 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033158 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033159 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033161 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033162 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033164 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR1033165 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033167 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033171 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR1033170 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033173 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033175 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033177 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0672 0.989 0.992 0.008
#> SRR1033182 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033188 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033191 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033192 2 0.9815 0.323 0.420 0.580
#> SRR1033193 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033197 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033196 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033199 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033217 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033224 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033270 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.958 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0376 0.994 0.996 0.004
#> SRR1033279 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1033282 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033283 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033284 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033285 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033286 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033287 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033288 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033289 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033290 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033291 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
#> SRR1033292 2 0.8207 0.701 0.256 0.744
#> SRR1033293 2 0.8144 0.708 0.252 0.748
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0424 0.42769 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032911 1 0.2878 0.40576 0.904 0.000 0.096
#> SRR1032912 1 0.3941 0.36781 0.844 0.000 0.156
#> SRR1032913 1 0.3192 0.39771 0.888 0.000 0.112
#> SRR1032914 1 0.3551 0.39259 0.868 0.000 0.132
#> SRR1032915 1 0.3551 0.38501 0.868 0.000 0.132
#> SRR1032916 1 0.5919 0.31567 0.724 0.016 0.260
#> SRR1032917 1 0.5678 0.25777 0.684 0.000 0.316
#> SRR1032918 1 0.2261 0.41668 0.932 0.000 0.068
#> SRR1032919 1 0.3941 0.36725 0.844 0.000 0.156
#> SRR1032920 2 0.0237 0.94459 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032921 1 0.0424 0.42769 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032922 1 0.5529 0.10267 0.704 0.000 0.296
#> SRR1032923 3 0.6309 0.53194 0.496 0.000 0.504
#> SRR1032925 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.1163 0.42515 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032926 1 0.3816 0.39817 0.852 0.000 0.148
#> SRR1032927 1 0.3816 0.37469 0.852 0.000 0.148
#> SRR1032929 1 0.2625 0.41095 0.916 0.000 0.084
#> SRR1032928 1 0.2066 0.41846 0.940 0.000 0.060
#> SRR1032930 1 0.3816 0.37352 0.852 0.000 0.148
#> SRR1032931 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032932 2 0.0237 0.94459 0.000 0.996 0.004
#> SRR1032933 1 0.3941 0.36781 0.844 0.000 0.156
#> SRR1032934 1 0.6299 -0.50701 0.524 0.000 0.476
#> SRR1032935 1 0.2625 0.41110 0.916 0.000 0.084
#> SRR1032936 1 0.5968 -0.17965 0.636 0.000 0.364
#> SRR1032937 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032938 1 0.1411 0.42556 0.964 0.000 0.036
#> SRR1032939 1 0.5706 0.02399 0.680 0.000 0.320
#> SRR1032940 1 0.4002 0.37194 0.840 0.000 0.160
#> SRR1032941 1 0.3879 0.37079 0.848 0.000 0.152
#> SRR1032942 2 0.1163 0.93757 0.000 0.972 0.028
#> SRR1032943 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.4555 0.28856 0.800 0.000 0.200
#> SRR1032945 1 0.3816 0.37360 0.852 0.000 0.148
#> SRR1032946 1 0.2165 0.41872 0.936 0.000 0.064
#> SRR1032947 1 0.5785 0.08606 0.668 0.000 0.332
#> SRR1032948 1 0.2261 0.41643 0.932 0.000 0.068
#> SRR1032949 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.5497 0.10858 0.708 0.000 0.292
#> SRR1032951 1 0.4235 0.35021 0.824 0.000 0.176
#> SRR1032952 1 0.3619 0.38515 0.864 0.000 0.136
#> SRR1032953 1 0.1860 0.42087 0.948 0.000 0.052
#> SRR1032954 1 0.4796 0.24782 0.780 0.000 0.220
#> SRR1032955 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.3816 0.37354 0.852 0.000 0.148
#> SRR1032956 1 0.0424 0.42752 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032958 1 0.2165 0.42006 0.936 0.000 0.064
#> SRR1032959 1 0.5431 0.11635 0.716 0.000 0.284
#> SRR1032960 1 0.2711 0.41580 0.912 0.000 0.088
#> SRR1032961 1 0.0237 0.42707 0.996 0.000 0.004
#> SRR1032962 3 0.6308 0.52672 0.492 0.000 0.508
#> SRR1032963 1 0.3816 0.37354 0.852 0.000 0.148
#> SRR1032964 1 0.3752 0.37572 0.856 0.000 0.144
#> SRR1032965 1 0.3619 0.38226 0.864 0.000 0.136
#> SRR1032966 1 0.3412 0.39070 0.876 0.000 0.124
#> SRR1032967 2 0.1525 0.93456 0.004 0.964 0.032
#> SRR1032968 1 0.4346 0.36848 0.816 0.000 0.184
#> SRR1032969 1 0.4974 0.31352 0.764 0.000 0.236
#> SRR1032970 1 0.3941 0.39453 0.844 0.000 0.156
#> SRR1032971 1 0.4178 0.36945 0.828 0.000 0.172
#> SRR1032972 1 0.3619 0.38226 0.864 0.000 0.136
#> SRR1032973 1 0.4346 0.35408 0.816 0.000 0.184
#> SRR1032974 1 0.1411 0.42332 0.964 0.000 0.036
#> SRR1032975 1 0.3038 0.40196 0.896 0.000 0.104
#> SRR1032976 1 0.5650 0.01638 0.688 0.000 0.312
#> SRR1032977 2 0.3116 0.90848 0.000 0.892 0.108
#> SRR1032978 1 0.3340 0.37850 0.880 0.000 0.120
#> SRR1032979 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.4974 0.31591 0.764 0.000 0.236
#> SRR1032981 1 0.4002 0.36468 0.840 0.000 0.160
#> SRR1032982 1 0.3482 0.38794 0.872 0.000 0.128
#> SRR1032983 1 0.2711 0.42153 0.912 0.000 0.088
#> SRR1032984 1 0.4062 0.36533 0.836 0.000 0.164
#> SRR1032985 1 0.3551 0.38655 0.868 0.000 0.132
#> SRR1032986 1 0.2959 0.40261 0.900 0.000 0.100
#> SRR1032987 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.3192 0.39775 0.888 0.000 0.112
#> SRR1032990 1 0.6192 -0.29271 0.580 0.000 0.420
#> SRR1032989 1 0.3686 0.37903 0.860 0.000 0.140
#> SRR1032991 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.3192 0.38608 0.888 0.000 0.112
#> SRR1032993 1 0.2625 0.42608 0.916 0.000 0.084
#> SRR1032994 1 0.6079 -0.19119 0.612 0.000 0.388
#> SRR1032995 1 0.2261 0.41623 0.932 0.000 0.068
#> SRR1032996 1 0.1529 0.42506 0.960 0.000 0.040
#> SRR1032997 1 0.3412 0.39062 0.876 0.000 0.124
#> SRR1032998 1 0.5098 0.20788 0.752 0.000 0.248
#> SRR1032999 2 0.0237 0.94459 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033000 2 0.3116 0.90848 0.000 0.892 0.108
#> SRR1033001 1 0.2537 0.41301 0.920 0.000 0.080
#> SRR1033002 1 0.3267 0.38819 0.884 0.000 0.116
#> SRR1033003 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.5465 0.10080 0.712 0.000 0.288
#> SRR1033006 3 0.5988 0.65063 0.368 0.000 0.632
#> SRR1033007 1 0.6309 -0.53305 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033008 1 0.5859 -0.07742 0.656 0.000 0.344
#> SRR1033009 1 0.5621 0.04597 0.692 0.000 0.308
#> SRR1033010 3 0.6931 0.65510 0.328 0.032 0.640
#> SRR1033011 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.6154 -0.25533 0.592 0.000 0.408
#> SRR1033013 1 0.5905 0.19322 0.648 0.000 0.352
#> SRR1033014 3 0.5733 0.67917 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033015 1 0.6260 -0.38746 0.552 0.000 0.448
#> SRR1033016 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.6309 -0.52708 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033019 3 0.6260 0.61253 0.448 0.000 0.552
#> SRR1033020 1 0.6280 -0.45265 0.540 0.000 0.460
#> SRR1033021 3 0.7054 0.57696 0.456 0.020 0.524
#> SRR1033023 1 0.5988 -0.14829 0.632 0.000 0.368
#> SRR1033022 1 0.6111 -0.21461 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033024 3 0.5591 0.66332 0.304 0.000 0.696
#> SRR1033025 1 0.5988 -0.13319 0.632 0.000 0.368
#> SRR1033026 3 0.5678 0.67674 0.316 0.000 0.684
#> SRR1033027 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033028 1 0.6244 -0.25675 0.560 0.000 0.440
#> SRR1033029 2 0.0237 0.94459 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033030 3 0.5760 0.68458 0.328 0.000 0.672
#> SRR1033031 3 0.6307 0.54261 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033032 3 0.9484 0.37045 0.240 0.264 0.496
#> SRR1033033 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.6308 -0.51775 0.508 0.000 0.492
#> SRR1033036 1 0.6302 -0.47142 0.520 0.000 0.480
#> SRR1033037 1 0.6252 -0.40240 0.556 0.000 0.444
#> SRR1033038 3 0.6302 0.55532 0.480 0.000 0.520
#> SRR1033039 1 0.6302 -0.48018 0.520 0.000 0.480
#> SRR1033040 3 0.6308 0.53575 0.492 0.000 0.508
#> SRR1033041 1 0.6280 -0.45933 0.540 0.000 0.460
#> SRR1033042 1 0.6308 -0.51295 0.508 0.000 0.492
#> SRR1033043 1 0.6267 -0.44860 0.548 0.000 0.452
#> SRR1033044 1 0.5988 -0.13209 0.632 0.000 0.368
#> SRR1033045 3 0.5650 0.67139 0.312 0.000 0.688
#> SRR1033046 1 0.6309 -0.52708 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033047 3 0.6111 0.67910 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033048 1 0.6309 -0.52136 0.504 0.000 0.496
#> SRR1033049 1 0.6280 -0.42657 0.540 0.000 0.460
#> SRR1033051 1 0.5178 0.17151 0.744 0.000 0.256
#> SRR1033052 1 0.6235 -0.36254 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033053 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.6168 -0.26684 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033050 1 0.5397 0.09857 0.720 0.000 0.280
#> SRR1033055 3 0.6026 0.68955 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033056 1 0.6295 -0.49232 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033057 1 0.5988 -0.12979 0.632 0.000 0.368
#> SRR1033058 3 0.5835 0.68965 0.340 0.000 0.660
#> SRR1033059 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.6225 -0.33799 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033061 2 0.3116 0.90848 0.000 0.892 0.108
#> SRR1033062 3 0.5621 0.66808 0.308 0.000 0.692
#> SRR1033063 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.6307 0.55018 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033065 1 0.6154 -0.25023 0.592 0.000 0.408
#> SRR1033066 1 0.6274 -0.40544 0.544 0.000 0.456
#> SRR1033067 1 0.5760 -0.00858 0.672 0.000 0.328
#> SRR1033068 1 0.6309 -0.52480 0.504 0.000 0.496
#> SRR1033069 3 0.7901 0.56842 0.440 0.056 0.504
#> SRR1033070 1 0.6235 -0.34738 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033071 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.9267 0.49551 0.316 0.180 0.504
#> SRR1033073 3 0.6309 0.51763 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033074 1 0.0424 0.42774 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033075 1 0.6280 -0.46933 0.540 0.000 0.460
#> SRR1033076 1 0.6235 -0.33987 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033077 1 0.5835 -0.03632 0.660 0.000 0.340
#> SRR1033078 1 0.5968 -0.17508 0.636 0.000 0.364
#> SRR1033079 3 0.5733 0.64483 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033080 3 0.5621 0.66898 0.308 0.000 0.692
#> SRR1033081 1 0.6260 -0.44698 0.552 0.000 0.448
#> SRR1033082 3 0.6307 0.53705 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033083 3 0.6305 0.55251 0.484 0.000 0.516
#> SRR1033084 1 0.5560 0.06235 0.700 0.000 0.300
#> SRR1033085 3 0.5733 0.67731 0.324 0.000 0.676
#> SRR1033086 2 0.3116 0.90848 0.000 0.892 0.108
#> SRR1033087 1 0.6026 -0.19499 0.624 0.000 0.376
#> SRR1033088 3 0.5706 0.68037 0.320 0.000 0.680
#> SRR1033089 3 0.6192 0.64826 0.420 0.000 0.580
#> SRR1033090 1 0.3619 0.38754 0.864 0.000 0.136
#> SRR1033091 3 0.6008 0.67499 0.372 0.000 0.628
#> SRR1033092 1 0.6295 -0.46744 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033093 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.6309 -0.52708 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033095 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.6168 -0.27357 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033097 2 0.3116 0.90848 0.000 0.892 0.108
#> SRR1033098 3 0.5650 0.67365 0.312 0.000 0.688
#> SRR1033099 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033101 3 0.5948 0.66853 0.360 0.000 0.640
#> SRR1033102 1 0.0000 0.42636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.5529 0.10013 0.704 0.000 0.296
#> SRR1033104 1 0.6235 -0.00601 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033105 1 0.4796 0.25890 0.780 0.000 0.220
#> SRR1033106 1 0.6062 -0.17864 0.616 0.000 0.384
#> SRR1033107 1 0.6189 0.17604 0.632 0.004 0.364
#> SRR1033108 1 0.3752 0.38073 0.856 0.000 0.144
#> SRR1033109 1 0.4974 0.22577 0.764 0.000 0.236
#> SRR1033110 1 0.6235 -0.33844 0.564 0.000 0.436
#> SRR1033111 1 0.4121 0.33287 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033112 1 0.5905 -0.10555 0.648 0.000 0.352
#> SRR1033113 1 0.6309 -0.52259 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033114 1 0.5988 -0.12717 0.632 0.000 0.368
#> SRR1033115 1 0.6307 -0.50076 0.512 0.000 0.488
#> SRR1033116 1 0.5650 0.25989 0.688 0.000 0.312
#> SRR1033117 3 0.5650 0.65478 0.312 0.000 0.688
#> SRR1033118 1 0.6305 -0.32118 0.516 0.000 0.484
#> SRR1033119 1 0.4974 0.22694 0.764 0.000 0.236
#> SRR1033121 3 0.6180 0.62540 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033120 2 0.3116 0.90848 0.000 0.892 0.108
#> SRR1033122 1 0.6295 -0.28709 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033123 1 0.6095 -0.19136 0.608 0.000 0.392
#> SRR1033124 1 0.3941 0.34817 0.844 0.000 0.156
#> SRR1033125 1 0.6307 -0.49252 0.512 0.000 0.488
#> SRR1033126 1 0.6192 -0.29202 0.580 0.000 0.420
#> SRR1033127 2 0.1289 0.93627 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033129 1 0.6299 -0.14287 0.524 0.000 0.476
#> SRR1033128 3 0.6309 0.51307 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033130 1 0.5621 0.05033 0.692 0.000 0.308
#> SRR1033131 1 0.6095 -0.20094 0.608 0.000 0.392
#> SRR1033132 1 0.6302 -0.47417 0.520 0.000 0.480
#> SRR1033133 1 0.6204 -0.29953 0.576 0.000 0.424
#> SRR1033134 1 0.5859 -0.10033 0.656 0.000 0.344
#> SRR1033135 1 0.6295 -0.43747 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033136 1 0.5926 -0.08060 0.644 0.000 0.356
#> SRR1033137 1 0.6309 -0.51463 0.504 0.000 0.496
#> SRR1033139 3 0.6823 0.53969 0.484 0.012 0.504
#> SRR1033138 3 0.6309 0.52086 0.496 0.000 0.504
#> SRR1033140 3 0.5926 0.69204 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033141 1 0.1753 0.42339 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033142 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.4121 0.32764 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033144 1 0.6267 -0.39301 0.548 0.000 0.452
#> SRR1033145 3 0.6095 0.68380 0.392 0.000 0.608
#> SRR1033146 3 0.6682 0.53426 0.488 0.008 0.504
#> SRR1033147 3 0.6682 0.53426 0.488 0.008 0.504
#> SRR1033148 1 0.0000 0.42636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033149 3 0.5591 0.66332 0.304 0.000 0.696
#> SRR1033150 1 0.6168 -0.26124 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033151 1 0.6302 -0.47096 0.520 0.000 0.480
#> SRR1033152 1 0.6079 -0.18791 0.612 0.000 0.388
#> SRR1033153 1 0.6260 -0.37959 0.552 0.000 0.448
#> SRR1033154 1 0.6180 -0.27518 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033156 3 0.5968 0.64579 0.364 0.000 0.636
#> SRR1033157 1 0.5733 0.01313 0.676 0.000 0.324
#> SRR1033158 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033159 3 0.6286 0.56917 0.464 0.000 0.536
#> SRR1033160 3 0.6307 0.55030 0.488 0.000 0.512
#> SRR1033161 1 0.2878 0.40141 0.904 0.000 0.096
#> SRR1033163 1 0.6267 -0.39055 0.548 0.000 0.452
#> SRR1033162 1 0.6095 -0.19790 0.608 0.000 0.392
#> SRR1033164 3 0.8327 0.59864 0.340 0.096 0.564
#> SRR1033165 1 0.6308 -0.52395 0.508 0.000 0.492
#> SRR1033166 3 0.6309 0.52086 0.496 0.000 0.504
#> SRR1033167 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.6305 -0.48389 0.516 0.000 0.484
#> SRR1033169 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033171 3 0.6682 0.53426 0.488 0.008 0.504
#> SRR1033170 1 0.5678 0.01498 0.684 0.000 0.316
#> SRR1033172 3 0.6111 0.65086 0.396 0.000 0.604
#> SRR1033173 2 0.0237 0.94456 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033174 3 0.6215 0.64779 0.428 0.000 0.572
#> SRR1033175 1 0.3412 0.37845 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033176 1 0.6140 -0.23750 0.596 0.000 0.404
#> SRR1033177 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033179 2 0.0237 0.94459 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033180 1 0.6008 -0.14125 0.628 0.000 0.372
#> SRR1033181 1 0.6168 -0.26308 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033183 3 0.6735 0.46263 0.424 0.012 0.564
#> SRR1033182 1 0.6299 -0.46009 0.524 0.000 0.476
#> SRR1033184 1 0.6168 -0.26308 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033185 1 0.6140 -0.24499 0.596 0.000 0.404
#> SRR1033187 1 0.6079 -0.17659 0.612 0.000 0.388
#> SRR1033186 1 0.6521 -0.53244 0.500 0.004 0.496
#> SRR1033188 1 0.6309 -0.53295 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033189 2 0.1163 0.93757 0.000 0.972 0.028
#> SRR1033190 1 0.5785 -0.01086 0.668 0.000 0.332
#> SRR1033191 1 0.6111 -0.21087 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033192 3 0.9528 0.39744 0.272 0.240 0.488
#> SRR1033193 1 0.1964 0.42072 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033195 2 0.0237 0.94459 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033194 2 0.3116 0.90848 0.000 0.892 0.108
#> SRR1033197 1 0.5327 0.15592 0.728 0.000 0.272
#> SRR1033196 1 0.6225 -0.33047 0.568 0.000 0.432
#> SRR1033199 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.2066 0.41798 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033200 1 0.1643 0.42193 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033201 3 0.6180 0.50723 0.416 0.000 0.584
#> SRR1033202 1 0.5291 0.29751 0.732 0.000 0.268
#> SRR1033203 3 0.6280 0.59891 0.460 0.000 0.540
#> SRR1033204 1 0.2878 0.39845 0.904 0.000 0.096
#> SRR1033205 1 0.5098 0.33526 0.752 0.000 0.248
#> SRR1033206 1 0.0424 0.42769 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033207 1 0.1964 0.41754 0.944 0.000 0.056
#> SRR1033208 3 0.6260 0.41342 0.448 0.000 0.552
#> SRR1033209 1 0.4121 0.33046 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033210 3 0.5968 0.62414 0.364 0.000 0.636
#> SRR1033211 1 0.5760 -0.03266 0.672 0.000 0.328
#> SRR1033212 3 0.5905 0.65876 0.352 0.000 0.648
#> SRR1033213 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.3482 0.38931 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033216 1 0.4235 0.31486 0.824 0.000 0.176
#> SRR1033215 2 0.1163 0.93757 0.000 0.972 0.028
#> SRR1033217 1 0.6168 -0.26689 0.588 0.000 0.412
#> SRR1033218 1 0.1163 0.42747 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033219 1 0.0237 0.42707 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033221 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.1163 0.42725 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033223 1 0.6180 -0.27647 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033225 2 0.2711 0.91573 0.000 0.912 0.088
#> SRR1033224 1 0.1031 0.42675 0.976 0.000 0.024
#> SRR1033226 1 0.6305 -0.48153 0.516 0.000 0.484
#> SRR1033227 3 0.6291 0.47412 0.468 0.000 0.532
#> SRR1033229 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.2066 0.41865 0.940 0.000 0.060
#> SRR1033231 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.3482 0.37164 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033232 1 0.3941 0.37905 0.844 0.000 0.156
#> SRR1033233 1 0.1643 0.42440 0.956 0.000 0.044
#> SRR1033235 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.6286 0.56143 0.464 0.000 0.536
#> SRR1033236 1 0.6252 -0.27791 0.556 0.000 0.444
#> SRR1033237 1 0.3482 0.39486 0.872 0.000 0.128
#> SRR1033238 3 0.6260 0.47349 0.448 0.000 0.552
#> SRR1033240 3 0.6225 0.48995 0.432 0.000 0.568
#> SRR1033239 1 0.6192 -0.29875 0.580 0.000 0.420
#> SRR1033242 1 0.6299 -0.46602 0.524 0.000 0.476
#> SRR1033241 3 0.6225 0.60845 0.432 0.000 0.568
#> SRR1033244 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.6095 -0.18753 0.608 0.000 0.392
#> SRR1033246 1 0.2878 0.40243 0.904 0.000 0.096
#> SRR1033248 1 0.6045 0.08497 0.620 0.000 0.380
#> SRR1033247 2 0.0661 0.94100 0.004 0.988 0.008
#> SRR1033249 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.5968 -0.11480 0.636 0.000 0.364
#> SRR1033252 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.0237 0.42707 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033254 1 0.3116 0.39441 0.892 0.000 0.108
#> SRR1033256 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.6309 -0.49581 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033258 1 0.0424 0.42768 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033257 1 0.2625 0.41127 0.916 0.000 0.084
#> SRR1033259 1 0.1860 0.42372 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033260 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.6295 -0.12672 0.528 0.000 0.472
#> SRR1033262 3 0.5926 0.63097 0.356 0.000 0.644
#> SRR1033263 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.1753 0.42644 0.952 0.000 0.048
#> SRR1033265 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033266 1 0.2959 0.39939 0.900 0.000 0.100
#> SRR1033267 1 0.6260 -0.31186 0.552 0.000 0.448
#> SRR1033268 1 0.5497 0.10371 0.708 0.000 0.292
#> SRR1033269 3 0.6309 0.51307 0.500 0.000 0.500
#> SRR1033270 1 0.6095 0.13091 0.608 0.000 0.392
#> SRR1033271 1 0.0424 0.42769 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033272 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4887 0.24496 0.772 0.000 0.228
#> SRR1033274 2 0.0237 0.94459 0.000 0.996 0.004
#> SRR1033275 1 0.4002 0.36461 0.840 0.000 0.160
#> SRR1033276 2 0.0000 0.94542 0.000 1.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.0892 0.42683 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033278 1 0.9591 0.03852 0.472 0.232 0.296
#> SRR1033279 1 0.6309 -0.51784 0.504 0.000 0.496
#> SRR1033280 1 0.6180 -0.27731 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033281 1 0.4842 0.25262 0.776 0.000 0.224
#> SRR1033282 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033283 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033284 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033285 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033286 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033287 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033288 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033289 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033290 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033291 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033292 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
#> SRR1033293 2 0.6521 0.67616 0.004 0.504 0.492
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.2706 0.884 0.900 0.000 0.080 0.020
#> SRR1032911 1 0.4174 0.857 0.816 0.000 0.140 0.044
#> SRR1032912 1 0.4465 0.852 0.800 0.000 0.144 0.056
#> SRR1032913 1 0.4387 0.853 0.804 0.000 0.144 0.052
#> SRR1032914 1 0.4387 0.853 0.804 0.000 0.144 0.052
#> SRR1032915 1 0.4364 0.855 0.808 0.000 0.136 0.056
#> SRR1032916 1 0.4839 0.821 0.756 0.000 0.044 0.200
#> SRR1032917 1 0.4485 0.851 0.796 0.000 0.052 0.152
#> SRR1032918 1 0.3999 0.859 0.824 0.000 0.140 0.036
#> SRR1032919 1 0.5140 0.845 0.760 0.000 0.144 0.096
#> SRR1032920 2 0.5861 -0.798 0.000 0.488 0.480 0.032
#> SRR1032921 1 0.2489 0.880 0.912 0.000 0.068 0.020
#> SRR1032922 1 0.2282 0.887 0.924 0.000 0.052 0.024
#> SRR1032923 1 0.3991 0.874 0.832 0.000 0.120 0.048
#> SRR1032925 2 0.0524 0.840 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1032924 1 0.3856 0.862 0.832 0.000 0.136 0.032
#> SRR1032926 1 0.4337 0.854 0.808 0.000 0.140 0.052
#> SRR1032927 1 0.4465 0.852 0.800 0.000 0.144 0.056
#> SRR1032929 1 0.4174 0.857 0.816 0.000 0.140 0.044
#> SRR1032928 1 0.3749 0.865 0.840 0.000 0.128 0.032
#> SRR1032930 1 0.4465 0.851 0.800 0.000 0.144 0.056
#> SRR1032931 2 0.0336 0.842 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032932 3 0.5921 0.873 0.000 0.448 0.516 0.036
#> SRR1032933 1 0.4465 0.851 0.800 0.000 0.144 0.056
#> SRR1032934 1 0.2973 0.884 0.884 0.000 0.096 0.020
#> SRR1032935 1 0.4088 0.858 0.820 0.000 0.140 0.040
#> SRR1032936 1 0.3653 0.872 0.844 0.000 0.128 0.028
#> SRR1032937 2 0.2053 0.743 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1032938 1 0.2915 0.881 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR1032939 1 0.1520 0.887 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1032940 1 0.4724 0.855 0.788 0.000 0.136 0.076
#> SRR1032941 1 0.4465 0.851 0.800 0.000 0.144 0.056
#> SRR1032942 3 0.5700 0.951 0.000 0.412 0.560 0.028
#> SRR1032943 2 0.0524 0.840 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1032944 1 0.1297 0.889 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1032945 1 0.4465 0.851 0.800 0.000 0.144 0.056
#> SRR1032946 1 0.3581 0.869 0.852 0.000 0.116 0.032
#> SRR1032947 1 0.3013 0.887 0.888 0.000 0.080 0.032
#> SRR1032948 1 0.3999 0.859 0.824 0.000 0.140 0.036
#> SRR1032949 2 0.0524 0.840 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1032950 1 0.0804 0.888 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1032951 1 0.4465 0.851 0.800 0.000 0.144 0.056
#> SRR1032952 1 0.3581 0.869 0.852 0.000 0.116 0.032
#> SRR1032953 1 0.3948 0.861 0.828 0.000 0.136 0.036
#> SRR1032954 1 0.2214 0.892 0.928 0.000 0.044 0.028
#> SRR1032955 2 0.0336 0.842 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032957 1 0.4756 0.849 0.784 0.000 0.144 0.072
#> SRR1032956 1 0.3082 0.876 0.884 0.000 0.084 0.032
#> SRR1032958 1 0.3999 0.859 0.824 0.000 0.140 0.036
#> SRR1032959 1 0.2300 0.894 0.924 0.000 0.048 0.028
#> SRR1032960 1 0.2984 0.876 0.888 0.000 0.084 0.028
#> SRR1032961 1 0.3128 0.877 0.884 0.000 0.076 0.040
#> SRR1032962 1 0.3710 0.817 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR1032963 1 0.4614 0.852 0.792 0.000 0.144 0.064
#> SRR1032964 1 0.4465 0.851 0.800 0.000 0.144 0.056
#> SRR1032965 1 0.4307 0.855 0.808 0.000 0.144 0.048
#> SRR1032966 1 0.4387 0.853 0.804 0.000 0.144 0.052
#> SRR1032967 3 0.5700 0.951 0.000 0.412 0.560 0.028
#> SRR1032968 1 0.4655 0.863 0.796 0.000 0.116 0.088
#> SRR1032969 1 0.4423 0.847 0.792 0.000 0.040 0.168
#> SRR1032970 1 0.3557 0.875 0.856 0.000 0.108 0.036
#> SRR1032971 1 0.4953 0.854 0.776 0.000 0.120 0.104
#> SRR1032972 1 0.4356 0.853 0.804 0.000 0.148 0.048
#> SRR1032973 1 0.5277 0.844 0.752 0.000 0.116 0.132
#> SRR1032974 1 0.2256 0.890 0.924 0.000 0.056 0.020
#> SRR1032975 1 0.4139 0.857 0.816 0.000 0.144 0.040
#> SRR1032976 1 0.2742 0.881 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1032977 2 0.6027 0.151 0.000 0.660 0.252 0.088
#> SRR1032978 1 0.2413 0.881 0.916 0.000 0.064 0.020
#> SRR1032979 2 0.0524 0.840 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1032980 1 0.4335 0.848 0.796 0.000 0.036 0.168
#> SRR1032981 1 0.4969 0.848 0.772 0.000 0.140 0.088
#> SRR1032982 1 0.4387 0.853 0.804 0.000 0.144 0.052
#> SRR1032983 1 0.3485 0.870 0.856 0.000 0.116 0.028
#> SRR1032984 1 0.5280 0.844 0.752 0.000 0.128 0.120
#> SRR1032985 1 0.4337 0.854 0.808 0.000 0.140 0.052
#> SRR1032986 1 0.3463 0.874 0.864 0.000 0.096 0.040
#> SRR1032987 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032988 1 0.4257 0.856 0.812 0.000 0.140 0.048
#> SRR1032990 1 0.2101 0.883 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR1032989 1 0.4387 0.853 0.804 0.000 0.144 0.052
#> SRR1032991 2 0.0524 0.840 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1032992 1 0.2670 0.881 0.904 0.000 0.072 0.024
#> SRR1032993 1 0.3948 0.861 0.828 0.000 0.136 0.036
#> SRR1032994 1 0.1284 0.888 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1032995 1 0.3948 0.861 0.828 0.000 0.136 0.036
#> SRR1032996 1 0.3856 0.862 0.832 0.000 0.136 0.032
#> SRR1032997 1 0.4387 0.853 0.804 0.000 0.144 0.052
#> SRR1032998 1 0.1174 0.887 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1032999 2 0.5204 -0.425 0.000 0.612 0.376 0.012
#> SRR1033000 2 0.6027 0.151 0.000 0.660 0.252 0.088
#> SRR1033001 1 0.4017 0.862 0.828 0.000 0.128 0.044
#> SRR1033002 1 0.1411 0.889 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033003 2 0.0524 0.840 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1033004 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033005 1 0.2300 0.891 0.924 0.000 0.048 0.028
#> SRR1033006 1 0.4017 0.849 0.828 0.000 0.044 0.128
#> SRR1033007 1 0.2335 0.890 0.920 0.000 0.060 0.020
#> SRR1033008 1 0.2174 0.883 0.928 0.000 0.052 0.020
#> SRR1033009 1 0.1929 0.890 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1033010 1 0.4958 0.827 0.788 0.008 0.080 0.124
#> SRR1033011 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.1305 0.883 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033013 1 0.4605 0.855 0.796 0.000 0.072 0.132
#> SRR1033014 1 0.4568 0.835 0.800 0.000 0.076 0.124
#> SRR1033015 1 0.2179 0.875 0.924 0.000 0.064 0.012
#> SRR1033016 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.2542 0.871 0.904 0.000 0.084 0.012
#> SRR1033019 1 0.4297 0.841 0.820 0.000 0.096 0.084
#> SRR1033020 1 0.2222 0.887 0.924 0.000 0.060 0.016
#> SRR1033021 1 0.3217 0.851 0.860 0.000 0.128 0.012
#> SRR1033023 1 0.2021 0.887 0.936 0.000 0.040 0.024
#> SRR1033022 1 0.1545 0.882 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1033024 1 0.4614 0.838 0.792 0.000 0.064 0.144
#> SRR1033025 1 0.1004 0.886 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033026 1 0.4686 0.837 0.788 0.000 0.068 0.144
#> SRR1033027 2 0.0188 0.843 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033028 1 0.3818 0.857 0.844 0.000 0.048 0.108
#> SRR1033029 2 0.5268 -0.493 0.000 0.592 0.396 0.012
#> SRR1033030 1 0.4827 0.825 0.784 0.000 0.092 0.124
#> SRR1033031 1 0.3048 0.857 0.876 0.000 0.108 0.016
#> SRR1033032 1 0.5216 0.801 0.772 0.100 0.120 0.008
#> SRR1033033 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.1284 0.886 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1033036 1 0.2714 0.866 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1033037 1 0.1510 0.891 0.956 0.000 0.016 0.028
#> SRR1033038 1 0.3224 0.854 0.864 0.000 0.120 0.016
#> SRR1033039 1 0.1629 0.885 0.952 0.000 0.024 0.024
#> SRR1033040 1 0.2473 0.872 0.908 0.000 0.080 0.012
#> SRR1033041 1 0.2489 0.885 0.912 0.000 0.068 0.020
#> SRR1033042 1 0.2255 0.876 0.920 0.000 0.068 0.012
#> SRR1033043 1 0.2635 0.884 0.904 0.000 0.076 0.020
#> SRR1033044 1 0.1411 0.889 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033045 1 0.4415 0.841 0.804 0.000 0.056 0.140
#> SRR1033046 1 0.2443 0.883 0.916 0.000 0.060 0.024
#> SRR1033047 1 0.3919 0.851 0.840 0.000 0.056 0.104
#> SRR1033048 1 0.1929 0.885 0.940 0.000 0.036 0.024
#> SRR1033049 1 0.1004 0.887 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1033051 1 0.2256 0.882 0.924 0.000 0.056 0.020
#> SRR1033052 1 0.1256 0.890 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1033053 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.1576 0.882 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033050 1 0.2596 0.882 0.908 0.000 0.068 0.024
#> SRR1033055 1 0.4667 0.827 0.796 0.000 0.108 0.096
#> SRR1033056 1 0.2882 0.889 0.892 0.000 0.084 0.024
#> SRR1033057 1 0.1297 0.887 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR1033058 1 0.4786 0.825 0.788 0.000 0.108 0.104
#> SRR1033059 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.0779 0.887 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033061 2 0.5968 0.164 0.000 0.664 0.252 0.084
#> SRR1033062 1 0.4711 0.833 0.784 0.000 0.064 0.152
#> SRR1033063 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.3716 0.859 0.852 0.000 0.052 0.096
#> SRR1033065 1 0.1398 0.882 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1033066 1 0.2125 0.880 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1033067 1 0.0895 0.887 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1033068 1 0.3048 0.860 0.876 0.000 0.108 0.016
#> SRR1033069 1 0.5314 0.658 0.676 0.024 0.296 0.004
#> SRR1033070 1 0.2342 0.872 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1033071 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 1 0.6452 0.588 0.624 0.116 0.260 0.000
#> SRR1033073 1 0.3479 0.845 0.840 0.000 0.148 0.012
#> SRR1033074 1 0.2983 0.879 0.892 0.000 0.068 0.040
#> SRR1033075 1 0.2813 0.882 0.896 0.000 0.080 0.024
#> SRR1033076 1 0.2401 0.872 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR1033077 1 0.1042 0.886 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1033078 1 0.2443 0.882 0.916 0.000 0.060 0.024
#> SRR1033079 1 0.4199 0.844 0.804 0.000 0.032 0.164
#> SRR1033080 1 0.4586 0.838 0.796 0.000 0.068 0.136
#> SRR1033081 1 0.2813 0.882 0.896 0.000 0.080 0.024
#> SRR1033082 1 0.2999 0.850 0.864 0.000 0.132 0.004
#> SRR1033083 1 0.3570 0.863 0.860 0.000 0.048 0.092
#> SRR1033084 1 0.2335 0.883 0.920 0.000 0.060 0.020
#> SRR1033085 1 0.4274 0.844 0.808 0.000 0.044 0.148
#> SRR1033086 2 0.5907 0.176 0.000 0.668 0.252 0.080
#> SRR1033087 1 0.2174 0.883 0.928 0.000 0.052 0.020
#> SRR1033088 1 0.4840 0.821 0.784 0.000 0.100 0.116
#> SRR1033089 1 0.5375 0.785 0.744 0.000 0.116 0.140
#> SRR1033090 1 0.4259 0.865 0.816 0.000 0.128 0.056
#> SRR1033091 1 0.3962 0.852 0.832 0.000 0.044 0.124
#> SRR1033092 1 0.1297 0.885 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR1033093 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.2867 0.859 0.884 0.000 0.104 0.012
#> SRR1033095 2 0.0336 0.842 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033096 1 0.2300 0.884 0.924 0.000 0.048 0.028
#> SRR1033097 2 0.5466 0.308 0.000 0.712 0.220 0.068
#> SRR1033098 1 0.4590 0.837 0.792 0.000 0.060 0.148
#> SRR1033099 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.4667 0.862 0.796 0.000 0.108 0.096
#> SRR1033102 1 0.3107 0.877 0.884 0.000 0.080 0.036
#> SRR1033103 1 0.1151 0.888 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR1033104 1 0.3881 0.848 0.812 0.000 0.016 0.172
#> SRR1033105 1 0.1488 0.889 0.956 0.000 0.032 0.012
#> SRR1033106 1 0.1059 0.888 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1033107 1 0.4244 0.849 0.804 0.000 0.036 0.160
#> SRR1033108 1 0.4094 0.866 0.828 0.000 0.116 0.056
#> SRR1033109 1 0.1584 0.887 0.952 0.000 0.036 0.012
#> SRR1033110 1 0.2329 0.876 0.916 0.000 0.072 0.012
#> SRR1033111 1 0.1411 0.889 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033112 1 0.2002 0.886 0.936 0.000 0.044 0.020
#> SRR1033113 1 0.3402 0.837 0.832 0.000 0.164 0.004
#> SRR1033114 1 0.1888 0.883 0.940 0.000 0.044 0.016
#> SRR1033115 1 0.2999 0.858 0.864 0.000 0.132 0.004
#> SRR1033116 1 0.4290 0.848 0.800 0.000 0.036 0.164
#> SRR1033117 1 0.4467 0.836 0.788 0.000 0.040 0.172
#> SRR1033118 1 0.3840 0.874 0.844 0.000 0.052 0.104
#> SRR1033119 1 0.1411 0.887 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033121 1 0.4150 0.847 0.824 0.000 0.056 0.120
#> SRR1033120 2 0.6027 0.151 0.000 0.660 0.252 0.088
#> SRR1033122 1 0.3749 0.858 0.840 0.000 0.032 0.128
#> SRR1033123 1 0.1970 0.877 0.932 0.000 0.060 0.008
#> SRR1033124 1 0.1624 0.887 0.952 0.000 0.028 0.020
#> SRR1033125 1 0.3768 0.821 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR1033126 1 0.2197 0.875 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1033127 3 0.5700 0.951 0.000 0.412 0.560 0.028
#> SRR1033129 1 0.4095 0.847 0.804 0.000 0.024 0.172
#> SRR1033128 1 0.2831 0.860 0.876 0.000 0.120 0.004
#> SRR1033130 1 0.2256 0.882 0.924 0.000 0.056 0.020
#> SRR1033131 1 0.0657 0.887 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1033132 1 0.3636 0.832 0.820 0.000 0.172 0.008
#> SRR1033133 1 0.2266 0.878 0.912 0.000 0.084 0.004
#> SRR1033134 1 0.2773 0.882 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR1033135 1 0.4144 0.846 0.828 0.000 0.068 0.104
#> SRR1033136 1 0.0376 0.887 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033137 1 0.4121 0.816 0.796 0.000 0.184 0.020
#> SRR1033139 1 0.4997 0.669 0.688 0.012 0.296 0.004
#> SRR1033138 1 0.3105 0.849 0.856 0.000 0.140 0.004
#> SRR1033140 1 0.4261 0.844 0.820 0.000 0.068 0.112
#> SRR1033141 1 0.2489 0.882 0.912 0.000 0.068 0.020
#> SRR1033142 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2413 0.882 0.916 0.000 0.064 0.020
#> SRR1033144 1 0.1576 0.882 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033145 1 0.4274 0.842 0.820 0.000 0.072 0.108
#> SRR1033146 1 0.5090 0.640 0.672 0.012 0.312 0.004
#> SRR1033147 1 0.5035 0.686 0.696 0.016 0.284 0.004
#> SRR1033148 1 0.2984 0.876 0.888 0.000 0.084 0.028
#> SRR1033149 1 0.4624 0.834 0.784 0.000 0.052 0.164
#> SRR1033150 1 0.1305 0.883 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033151 1 0.3448 0.834 0.828 0.000 0.168 0.004
#> SRR1033152 1 0.0927 0.886 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1033153 1 0.3088 0.857 0.864 0.000 0.128 0.008
#> SRR1033154 1 0.0895 0.884 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033156 1 0.4307 0.853 0.808 0.000 0.048 0.144
#> SRR1033157 1 0.0524 0.887 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1033158 2 0.0524 0.835 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033159 1 0.4037 0.848 0.832 0.000 0.056 0.112
#> SRR1033160 1 0.4168 0.847 0.828 0.000 0.080 0.092
#> SRR1033161 1 0.1174 0.891 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR1033163 1 0.2944 0.860 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR1033162 1 0.0804 0.885 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1033164 1 0.5555 0.759 0.732 0.052 0.200 0.016
#> SRR1033165 1 0.2742 0.891 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1033166 1 0.3266 0.859 0.868 0.000 0.108 0.024
#> SRR1033167 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033168 1 0.3778 0.856 0.848 0.000 0.052 0.100
#> SRR1033169 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033171 1 0.5224 0.629 0.664 0.016 0.316 0.004
#> SRR1033170 1 0.1913 0.885 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1033172 1 0.4374 0.841 0.812 0.000 0.068 0.120
#> SRR1033173 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.3919 0.851 0.840 0.000 0.056 0.104
#> SRR1033175 1 0.2335 0.881 0.920 0.000 0.060 0.020
#> SRR1033176 1 0.1174 0.886 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR1033177 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.0657 0.837 0.000 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033179 2 0.5663 -0.669 0.000 0.536 0.440 0.024
#> SRR1033180 1 0.1297 0.886 0.964 0.000 0.020 0.016
#> SRR1033181 1 0.1209 0.885 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1033183 1 0.3925 0.844 0.808 0.000 0.016 0.176
#> SRR1033182 1 0.3249 0.853 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1033184 1 0.2399 0.881 0.920 0.000 0.048 0.032
#> SRR1033185 1 0.2928 0.861 0.880 0.000 0.108 0.012
#> SRR1033187 1 0.1520 0.886 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1033186 1 0.2737 0.864 0.888 0.000 0.104 0.008
#> SRR1033188 1 0.3082 0.889 0.884 0.000 0.084 0.032
#> SRR1033189 3 0.5700 0.951 0.000 0.412 0.560 0.028
#> SRR1033190 1 0.1489 0.882 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1033191 1 0.0927 0.884 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1033192 1 0.6750 0.497 0.584 0.128 0.288 0.000
#> SRR1033193 1 0.2563 0.881 0.908 0.000 0.072 0.020
#> SRR1033195 2 0.5279 -0.506 0.000 0.588 0.400 0.012
#> SRR1033194 2 0.5781 0.201 0.000 0.676 0.252 0.072
#> SRR1033197 1 0.1798 0.886 0.944 0.000 0.040 0.016
#> SRR1033196 1 0.1209 0.883 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1033199 2 0.0188 0.845 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033198 1 0.4139 0.865 0.816 0.000 0.144 0.040
#> SRR1033200 1 0.4037 0.860 0.824 0.000 0.136 0.040
#> SRR1033201 1 0.3836 0.847 0.816 0.000 0.016 0.168
#> SRR1033202 1 0.4332 0.848 0.800 0.000 0.040 0.160
#> SRR1033203 1 0.4114 0.851 0.828 0.000 0.060 0.112
#> SRR1033204 1 0.2797 0.879 0.900 0.000 0.068 0.032
#> SRR1033205 1 0.5314 0.842 0.748 0.000 0.144 0.108
#> SRR1033206 1 0.2635 0.882 0.904 0.000 0.076 0.020
#> SRR1033207 1 0.2546 0.892 0.900 0.000 0.092 0.008
#> SRR1033208 1 0.4008 0.848 0.820 0.000 0.032 0.148
#> SRR1033209 1 0.2563 0.882 0.908 0.000 0.072 0.020
#> SRR1033210 1 0.3946 0.846 0.812 0.000 0.020 0.168
#> SRR1033211 1 0.2089 0.884 0.932 0.000 0.048 0.020
#> SRR1033212 1 0.4244 0.841 0.800 0.000 0.032 0.168
#> SRR1033213 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033214 1 0.4257 0.855 0.812 0.000 0.140 0.048
#> SRR1033216 1 0.2489 0.881 0.912 0.000 0.068 0.020
#> SRR1033215 3 0.6007 0.943 0.000 0.408 0.548 0.044
#> SRR1033217 1 0.1629 0.890 0.952 0.000 0.024 0.024
#> SRR1033218 1 0.2773 0.881 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR1033219 1 0.3342 0.873 0.868 0.000 0.100 0.032
#> SRR1033221 2 0.0336 0.842 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033220 2 0.0336 0.842 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033222 1 0.2413 0.881 0.916 0.000 0.064 0.020
#> SRR1033223 1 0.1610 0.885 0.952 0.000 0.016 0.032
#> SRR1033225 2 0.5142 0.383 0.000 0.744 0.192 0.064
#> SRR1033224 1 0.3464 0.871 0.860 0.000 0.108 0.032
#> SRR1033226 1 0.3612 0.858 0.856 0.000 0.044 0.100
#> SRR1033227 1 0.5257 0.851 0.752 0.000 0.144 0.104
#> SRR1033229 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.2255 0.885 0.920 0.000 0.068 0.012
#> SRR1033231 2 0.0707 0.832 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033230 1 0.2596 0.880 0.908 0.000 0.068 0.024
#> SRR1033232 1 0.4514 0.851 0.796 0.000 0.148 0.056
#> SRR1033233 1 0.2413 0.881 0.916 0.000 0.064 0.020
#> SRR1033235 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.3818 0.853 0.844 0.000 0.048 0.108
#> SRR1033236 1 0.2174 0.894 0.928 0.000 0.020 0.052
#> SRR1033237 1 0.4387 0.853 0.804 0.000 0.144 0.052
#> SRR1033238 1 0.4525 0.862 0.804 0.000 0.080 0.116
#> SRR1033240 1 0.3900 0.849 0.816 0.000 0.020 0.164
#> SRR1033239 1 0.1520 0.886 0.956 0.000 0.020 0.024
#> SRR1033242 1 0.4100 0.864 0.816 0.000 0.148 0.036
#> SRR1033241 1 0.3907 0.852 0.836 0.000 0.044 0.120
#> SRR1033244 2 0.0188 0.845 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.1929 0.889 0.940 0.000 0.024 0.036
#> SRR1033246 1 0.1724 0.887 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1033248 1 0.4123 0.863 0.820 0.000 0.136 0.044
#> SRR1033247 3 0.6153 0.846 0.008 0.376 0.576 0.040
#> SRR1033249 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.0779 0.886 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033252 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.2742 0.879 0.900 0.000 0.076 0.024
#> SRR1033254 1 0.2256 0.895 0.924 0.000 0.056 0.020
#> SRR1033256 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.3734 0.856 0.848 0.000 0.044 0.108
#> SRR1033258 1 0.2596 0.881 0.908 0.000 0.068 0.024
#> SRR1033257 1 0.3525 0.873 0.860 0.000 0.100 0.040
#> SRR1033259 1 0.2915 0.877 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR1033260 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.4149 0.849 0.804 0.000 0.028 0.168
#> SRR1033262 1 0.4010 0.848 0.816 0.000 0.028 0.156
#> SRR1033263 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.2773 0.886 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR1033265 2 0.1398 0.794 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1033266 1 0.0927 0.888 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1033267 1 0.4144 0.873 0.828 0.000 0.068 0.104
#> SRR1033268 1 0.1406 0.887 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1033269 1 0.2976 0.856 0.872 0.000 0.120 0.008
#> SRR1033270 1 0.4152 0.851 0.808 0.000 0.032 0.160
#> SRR1033271 1 0.2596 0.880 0.908 0.000 0.068 0.024
#> SRR1033272 2 0.0000 0.846 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.1388 0.888 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1033274 2 0.5268 -0.493 0.000 0.592 0.396 0.012
#> SRR1033275 1 0.4436 0.852 0.800 0.000 0.148 0.052
#> SRR1033276 2 0.0336 0.842 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033277 1 0.2773 0.880 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR1033278 1 0.5322 0.644 0.660 0.000 0.028 0.312
#> SRR1033279 1 0.3877 0.850 0.840 0.000 0.112 0.048
#> SRR1033280 1 0.1888 0.880 0.940 0.000 0.044 0.016
#> SRR1033281 1 0.1411 0.887 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1033282 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033283 4 0.1576 0.992 0.048 0.000 0.004 0.948
#> SRR1033284 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033285 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033286 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033287 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033288 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033289 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033290 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033291 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033292 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1033293 4 0.1389 0.999 0.048 0.000 0.000 0.952
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 1 0.5171 0.31124 0.616 0.000 0.008 0.336 0.040
#> SRR1032911 1 0.4304 0.25741 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1032912 1 0.4978 0.22430 0.496 0.000 0.000 0.476 0.028
#> SRR1032913 1 0.4567 0.27897 0.544 0.000 0.004 0.448 0.004
#> SRR1032914 1 0.4771 0.28089 0.552 0.000 0.008 0.432 0.008
#> SRR1032915 1 0.4552 0.27045 0.524 0.000 0.000 0.468 0.008
#> SRR1032916 1 0.6665 -0.00291 0.520 0.000 0.012 0.240 0.228
#> SRR1032917 1 0.5128 0.39477 0.708 0.000 0.020 0.208 0.064
#> SRR1032918 1 0.4304 0.25741 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1032919 1 0.5103 0.25218 0.512 0.000 0.000 0.452 0.036
#> SRR1032920 3 0.5646 0.05416 0.000 0.400 0.520 0.000 0.080
#> SRR1032921 1 0.5131 0.33207 0.648 0.000 0.008 0.296 0.048
#> SRR1032922 1 0.2395 0.45219 0.912 0.000 0.040 0.036 0.012
#> SRR1032923 4 0.5695 0.46105 0.444 0.000 0.068 0.484 0.004
#> SRR1032925 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032924 1 0.4449 0.24989 0.512 0.000 0.004 0.484 0.000
#> SRR1032926 1 0.4655 0.31849 0.600 0.000 0.012 0.384 0.004
#> SRR1032927 1 0.4561 0.23890 0.504 0.000 0.000 0.488 0.008
#> SRR1032929 1 0.4448 0.25687 0.516 0.000 0.004 0.480 0.000
#> SRR1032928 1 0.4470 0.32962 0.616 0.000 0.012 0.372 0.000
#> SRR1032930 1 0.4974 0.25252 0.508 0.000 0.000 0.464 0.028
#> SRR1032931 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032932 3 0.7500 0.08579 0.000 0.368 0.420 0.116 0.096
#> SRR1032933 1 0.4659 0.24070 0.500 0.000 0.000 0.488 0.012
#> SRR1032934 1 0.5880 -0.29945 0.548 0.000 0.076 0.364 0.012
#> SRR1032935 1 0.4448 0.25129 0.516 0.000 0.004 0.480 0.000
#> SRR1032936 1 0.5103 0.12424 0.556 0.000 0.040 0.404 0.000
#> SRR1032937 2 0.2798 0.74834 0.000 0.852 0.140 0.000 0.008
#> SRR1032938 1 0.4747 0.33828 0.604 0.000 0.012 0.376 0.008
#> SRR1032939 1 0.2379 0.43727 0.912 0.000 0.012 0.048 0.028
#> SRR1032940 1 0.5281 0.30408 0.564 0.000 0.004 0.388 0.044
#> SRR1032941 1 0.5044 0.24450 0.504 0.000 0.000 0.464 0.032
#> SRR1032942 3 0.5579 0.12325 0.000 0.368 0.552 0.000 0.080
#> SRR1032943 2 0.0703 0.84872 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1032944 1 0.2390 0.45898 0.912 0.000 0.032 0.044 0.012
#> SRR1032945 1 0.5168 0.25120 0.508 0.000 0.000 0.452 0.040
#> SRR1032946 1 0.4644 0.31957 0.604 0.000 0.012 0.380 0.004
#> SRR1032947 1 0.4692 0.39050 0.688 0.000 0.024 0.276 0.012
#> SRR1032948 1 0.4576 0.27292 0.536 0.000 0.004 0.456 0.004
#> SRR1032949 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032950 1 0.2116 0.44046 0.924 0.000 0.028 0.040 0.008
#> SRR1032951 1 0.4560 0.25040 0.508 0.000 0.000 0.484 0.008
#> SRR1032952 1 0.4457 0.32795 0.620 0.000 0.012 0.368 0.000
#> SRR1032953 1 0.4448 0.25687 0.516 0.000 0.004 0.480 0.000
#> SRR1032954 1 0.4846 0.34448 0.612 0.000 0.024 0.360 0.004
#> SRR1032955 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1032957 1 0.5168 0.25135 0.508 0.000 0.000 0.452 0.040
#> SRR1032956 1 0.4810 0.31554 0.580 0.000 0.008 0.400 0.012
#> SRR1032958 1 0.4630 0.29473 0.572 0.000 0.008 0.416 0.004
#> SRR1032959 1 0.4982 0.35139 0.636 0.000 0.032 0.324 0.008
#> SRR1032960 1 0.4671 0.34461 0.640 0.000 0.028 0.332 0.000
#> SRR1032961 1 0.5030 0.33748 0.624 0.000 0.008 0.336 0.032
#> SRR1032962 3 0.7830 -0.25902 0.300 0.000 0.360 0.276 0.064
#> SRR1032963 1 0.5242 0.25848 0.516 0.000 0.004 0.444 0.036
#> SRR1032964 1 0.5039 0.25458 0.512 0.000 0.000 0.456 0.032
#> SRR1032965 1 0.4449 0.25399 0.512 0.000 0.000 0.484 0.004
#> SRR1032966 1 0.4567 0.26881 0.544 0.000 0.004 0.448 0.004
#> SRR1032967 3 0.5716 0.13237 0.004 0.364 0.552 0.000 0.080
#> SRR1032968 1 0.5294 0.30755 0.596 0.000 0.008 0.352 0.044
#> SRR1032969 1 0.5752 0.32776 0.632 0.000 0.012 0.252 0.104
#> SRR1032970 1 0.4726 0.32557 0.604 0.000 0.016 0.376 0.004
#> SRR1032971 1 0.5133 0.29926 0.568 0.000 0.000 0.388 0.044
#> SRR1032972 1 0.4583 0.26037 0.528 0.000 0.004 0.464 0.004
#> SRR1032973 1 0.5489 0.29195 0.560 0.000 0.004 0.376 0.060
#> SRR1032974 1 0.5209 0.34478 0.604 0.000 0.016 0.352 0.028
#> SRR1032975 1 0.4430 0.27339 0.540 0.000 0.004 0.456 0.000
#> SRR1032976 1 0.5071 0.27426 0.628 0.000 0.036 0.328 0.008
#> SRR1032977 2 0.8168 0.04801 0.000 0.392 0.252 0.228 0.128
#> SRR1032978 1 0.4749 0.36096 0.700 0.000 0.008 0.252 0.040
#> SRR1032979 2 0.0794 0.84612 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1032980 1 0.5658 0.31481 0.612 0.000 0.012 0.300 0.076
#> SRR1032981 1 0.5283 0.25000 0.508 0.000 0.000 0.444 0.048
#> SRR1032982 1 0.4695 0.26089 0.524 0.000 0.004 0.464 0.008
#> SRR1032983 1 0.4283 0.34427 0.644 0.000 0.008 0.348 0.000
#> SRR1032984 1 0.5329 0.25759 0.516 0.000 0.000 0.432 0.052
#> SRR1032985 1 0.4594 0.24565 0.508 0.000 0.004 0.484 0.004
#> SRR1032986 1 0.4397 0.29997 0.564 0.000 0.004 0.432 0.000
#> SRR1032987 2 0.0510 0.85404 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1032988 1 0.4449 0.24989 0.512 0.000 0.004 0.484 0.000
#> SRR1032990 1 0.2332 0.42458 0.904 0.000 0.076 0.016 0.004
#> SRR1032989 1 0.4889 0.24095 0.504 0.000 0.004 0.476 0.016
#> SRR1032991 2 0.0510 0.85345 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1032992 1 0.4500 0.39105 0.760 0.000 0.020 0.180 0.040
#> SRR1032993 1 0.4866 0.30042 0.580 0.000 0.020 0.396 0.004
#> SRR1032994 1 0.3348 0.43254 0.864 0.000 0.032 0.068 0.036
#> SRR1032995 1 0.4446 0.25925 0.520 0.000 0.004 0.476 0.000
#> SRR1032996 1 0.4676 0.31141 0.592 0.000 0.012 0.392 0.004
#> SRR1032997 1 0.4692 0.27271 0.528 0.000 0.004 0.460 0.008
#> SRR1032998 1 0.2855 0.45130 0.892 0.000 0.028 0.040 0.040
#> SRR1032999 2 0.5658 0.18368 0.000 0.512 0.408 0.000 0.080
#> SRR1033000 2 0.8168 0.04801 0.000 0.392 0.252 0.228 0.128
#> SRR1033001 1 0.4751 0.30389 0.564 0.000 0.008 0.420 0.008
#> SRR1033002 1 0.3386 0.44670 0.856 0.000 0.020 0.088 0.036
#> SRR1033003 2 0.1478 0.81934 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033004 2 0.0510 0.85404 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033005 1 0.4773 0.36485 0.656 0.000 0.024 0.312 0.008
#> SRR1033006 1 0.4478 0.40738 0.792 0.000 0.036 0.108 0.064
#> SRR1033007 1 0.7311 -0.70024 0.412 0.000 0.140 0.388 0.060
#> SRR1033008 1 0.4734 0.33041 0.732 0.000 0.020 0.208 0.040
#> SRR1033009 1 0.4642 0.38542 0.736 0.000 0.016 0.208 0.040
#> SRR1033010 1 0.5317 0.36584 0.740 0.000 0.084 0.104 0.072
#> SRR1033011 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.4882 0.34467 0.764 0.000 0.104 0.096 0.036
#> SRR1033013 1 0.5265 0.39470 0.704 0.000 0.028 0.204 0.064
#> SRR1033014 1 0.5620 0.30687 0.708 0.000 0.092 0.144 0.056
#> SRR1033015 1 0.4474 0.34796 0.788 0.000 0.124 0.036 0.052
#> SRR1033016 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033018 1 0.4784 0.22086 0.744 0.000 0.152 0.096 0.008
#> SRR1033019 1 0.5405 0.18449 0.712 0.000 0.148 0.112 0.028
#> SRR1033020 1 0.6764 -0.21255 0.564 0.000 0.128 0.256 0.052
#> SRR1033021 1 0.6711 -0.30101 0.532 0.004 0.252 0.200 0.012
#> SRR1033023 1 0.4267 0.39357 0.804 0.000 0.044 0.112 0.040
#> SRR1033022 1 0.3086 0.41933 0.876 0.000 0.048 0.016 0.060
#> SRR1033024 1 0.6295 0.21906 0.652 0.000 0.112 0.160 0.076
#> SRR1033025 1 0.2931 0.44463 0.888 0.000 0.028 0.040 0.044
#> SRR1033026 1 0.6649 0.03273 0.600 0.000 0.116 0.216 0.068
#> SRR1033027 2 0.0510 0.85404 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033028 1 0.3713 0.43918 0.844 0.000 0.032 0.068 0.056
#> SRR1033029 2 0.5677 0.14353 0.000 0.496 0.424 0.000 0.080
#> SRR1033030 1 0.6767 0.06975 0.596 0.000 0.184 0.152 0.068
#> SRR1033031 1 0.6540 0.03484 0.620 0.000 0.192 0.116 0.072
#> SRR1033032 1 0.6592 -0.26136 0.520 0.012 0.332 0.128 0.008
#> SRR1033033 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033034 1 0.5020 0.31444 0.756 0.000 0.088 0.112 0.044
#> SRR1033036 1 0.7007 -0.17364 0.560 0.000 0.172 0.204 0.064
#> SRR1033037 1 0.5286 0.18640 0.684 0.000 0.040 0.240 0.036
#> SRR1033038 1 0.6878 -0.09913 0.588 0.004 0.216 0.124 0.068
#> SRR1033039 1 0.4605 0.34827 0.780 0.000 0.120 0.068 0.032
#> SRR1033040 1 0.5448 0.06276 0.680 0.000 0.180 0.132 0.008
#> SRR1033041 1 0.7096 -0.34787 0.516 0.000 0.148 0.280 0.056
#> SRR1033042 1 0.5314 0.28063 0.732 0.000 0.140 0.060 0.068
#> SRR1033043 1 0.6358 -0.21676 0.572 0.000 0.088 0.300 0.040
#> SRR1033044 1 0.4135 0.40213 0.800 0.000 0.020 0.136 0.044
#> SRR1033045 1 0.5225 0.34501 0.740 0.000 0.056 0.132 0.072
#> SRR1033046 1 0.7325 -0.42520 0.508 0.000 0.200 0.228 0.064
#> SRR1033047 1 0.5013 0.32197 0.760 0.000 0.096 0.092 0.052
#> SRR1033048 1 0.6593 -0.22860 0.576 0.000 0.132 0.252 0.040
#> SRR1033049 1 0.4897 0.29199 0.756 0.000 0.060 0.144 0.040
#> SRR1033051 1 0.4524 0.37686 0.768 0.000 0.028 0.164 0.040
#> SRR1033052 1 0.5555 0.25563 0.704 0.000 0.096 0.160 0.040
#> SRR1033053 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033054 1 0.4177 0.38218 0.804 0.000 0.116 0.020 0.060
#> SRR1033050 1 0.4542 0.35744 0.724 0.000 0.008 0.232 0.036
#> SRR1033055 1 0.6017 0.15850 0.656 0.000 0.204 0.088 0.052
#> SRR1033056 1 0.6921 -0.61195 0.440 0.000 0.140 0.388 0.032
#> SRR1033057 1 0.2536 0.43227 0.900 0.000 0.052 0.044 0.004
#> SRR1033058 1 0.6508 0.07372 0.612 0.000 0.200 0.136 0.052
#> SRR1033059 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.4817 0.34715 0.772 0.000 0.112 0.056 0.060
#> SRR1033061 2 0.8124 0.05463 0.000 0.396 0.252 0.232 0.120
#> SRR1033062 1 0.6026 0.24474 0.676 0.000 0.092 0.156 0.076
#> SRR1033063 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033064 1 0.4287 0.34498 0.800 0.000 0.116 0.056 0.028
#> SRR1033065 1 0.4637 0.31312 0.788 0.000 0.064 0.088 0.060
#> SRR1033066 1 0.5860 0.17530 0.692 0.000 0.132 0.112 0.064
#> SRR1033067 1 0.3143 0.43557 0.872 0.000 0.016 0.068 0.044
#> SRR1033068 1 0.5453 0.17356 0.692 0.000 0.196 0.088 0.024
#> SRR1033069 3 0.7647 0.12922 0.200 0.000 0.400 0.336 0.064
#> SRR1033070 1 0.4491 0.35204 0.784 0.000 0.128 0.028 0.060
#> SRR1033071 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033072 3 0.6870 0.20090 0.172 0.016 0.488 0.320 0.004
#> SRR1033073 1 0.6075 0.14290 0.648 0.000 0.216 0.068 0.068
#> SRR1033074 1 0.5273 0.33374 0.636 0.000 0.012 0.304 0.048
#> SRR1033075 1 0.7047 -0.43924 0.500 0.000 0.144 0.308 0.048
#> SRR1033076 1 0.4642 0.35272 0.772 0.000 0.136 0.028 0.064
#> SRR1033077 1 0.1911 0.43912 0.932 0.000 0.028 0.036 0.004
#> SRR1033078 1 0.5457 0.19148 0.664 0.000 0.040 0.256 0.040
#> SRR1033079 1 0.5498 0.32683 0.724 0.000 0.068 0.120 0.088
#> SRR1033080 1 0.6124 0.23674 0.668 0.000 0.108 0.152 0.072
#> SRR1033081 1 0.6820 -0.35232 0.528 0.000 0.136 0.296 0.040
#> SRR1033082 1 0.5718 0.13291 0.704 0.000 0.116 0.120 0.060
#> SRR1033083 1 0.4449 0.36336 0.792 0.000 0.112 0.064 0.032
#> SRR1033084 1 0.4364 0.37326 0.784 0.000 0.028 0.148 0.040
#> SRR1033085 1 0.5591 0.29039 0.712 0.000 0.072 0.144 0.072
#> SRR1033086 2 0.8063 0.06839 0.000 0.404 0.252 0.232 0.112
#> SRR1033087 1 0.5470 0.27700 0.704 0.000 0.076 0.180 0.040
#> SRR1033088 1 0.6586 0.09214 0.616 0.000 0.132 0.184 0.068
#> SRR1033089 4 0.7898 0.73054 0.288 0.000 0.148 0.432 0.132
#> SRR1033090 1 0.5064 0.29413 0.552 0.000 0.004 0.416 0.028
#> SRR1033091 1 0.4638 0.39054 0.784 0.000 0.044 0.104 0.068
#> SRR1033092 1 0.4275 0.34088 0.800 0.000 0.104 0.076 0.020
#> SRR1033093 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033094 1 0.5714 0.20444 0.696 0.000 0.164 0.080 0.060
#> SRR1033095 2 0.1965 0.79170 0.000 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR1033096 1 0.2819 0.41837 0.884 0.000 0.080 0.024 0.012
#> SRR1033097 2 0.7619 0.21218 0.000 0.480 0.248 0.180 0.092
#> SRR1033098 1 0.6358 0.20278 0.644 0.000 0.132 0.156 0.068
#> SRR1033099 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033101 1 0.6653 -0.36524 0.496 0.000 0.104 0.364 0.036
#> SRR1033102 1 0.4871 0.31602 0.604 0.000 0.004 0.368 0.024
#> SRR1033103 1 0.3172 0.42310 0.876 0.000 0.036 0.044 0.044
#> SRR1033104 1 0.5815 0.31976 0.680 0.000 0.040 0.168 0.112
#> SRR1033105 1 0.2607 0.44860 0.904 0.000 0.024 0.040 0.032
#> SRR1033106 1 0.3225 0.43905 0.872 0.000 0.052 0.048 0.028
#> SRR1033107 1 0.5473 0.37425 0.704 0.000 0.028 0.160 0.108
#> SRR1033108 1 0.5232 0.21540 0.500 0.000 0.000 0.456 0.044
#> SRR1033109 1 0.3913 0.42880 0.824 0.000 0.032 0.108 0.036
#> SRR1033110 1 0.3164 0.41343 0.868 0.000 0.084 0.028 0.020
#> SRR1033111 1 0.2542 0.45174 0.904 0.000 0.020 0.056 0.020
#> SRR1033112 1 0.5118 0.32026 0.740 0.000 0.072 0.148 0.040
#> SRR1033113 1 0.7004 -0.13509 0.544 0.000 0.256 0.136 0.064
#> SRR1033114 1 0.2214 0.44107 0.916 0.000 0.052 0.028 0.004
#> SRR1033115 1 0.6223 -0.03485 0.648 0.000 0.100 0.188 0.064
#> SRR1033116 1 0.5486 0.37131 0.696 0.000 0.024 0.176 0.104
#> SRR1033117 1 0.7153 -0.14186 0.552 0.000 0.128 0.224 0.096
#> SRR1033118 1 0.4658 0.40031 0.748 0.000 0.024 0.188 0.040
#> SRR1033119 1 0.2998 0.43879 0.884 0.000 0.036 0.052 0.028
#> SRR1033121 1 0.4813 0.38784 0.776 0.000 0.092 0.072 0.060
#> SRR1033120 2 0.8140 0.05496 0.000 0.396 0.252 0.228 0.124
#> SRR1033122 1 0.4103 0.42696 0.812 0.000 0.024 0.108 0.056
#> SRR1033123 1 0.4345 0.35839 0.808 0.000 0.072 0.060 0.060
#> SRR1033124 1 0.3288 0.43976 0.864 0.000 0.020 0.076 0.040
#> SRR1033125 1 0.7664 -0.39681 0.396 0.000 0.336 0.204 0.064
#> SRR1033126 1 0.5142 0.26210 0.748 0.000 0.068 0.124 0.060
#> SRR1033127 3 0.5864 0.13269 0.004 0.364 0.548 0.004 0.080
#> SRR1033129 1 0.5143 0.38807 0.740 0.000 0.032 0.120 0.108
#> SRR1033128 1 0.6762 -0.15676 0.584 0.000 0.128 0.224 0.064
#> SRR1033130 1 0.4863 0.34251 0.740 0.000 0.036 0.184 0.040
#> SRR1033131 1 0.3753 0.42931 0.844 0.000 0.052 0.048 0.056
#> SRR1033132 1 0.7643 -0.36050 0.432 0.000 0.296 0.204 0.068
#> SRR1033133 1 0.5106 0.30517 0.748 0.000 0.132 0.056 0.064
#> SRR1033134 1 0.4560 0.33104 0.700 0.000 0.012 0.268 0.020
#> SRR1033135 1 0.3801 0.39110 0.828 0.000 0.112 0.028 0.032
#> SRR1033136 1 0.2791 0.42180 0.892 0.000 0.036 0.056 0.016
#> SRR1033137 1 0.7742 -0.38600 0.408 0.000 0.296 0.228 0.068
#> SRR1033139 3 0.7605 0.15009 0.200 0.000 0.400 0.340 0.060
#> SRR1033138 1 0.7434 -0.28872 0.484 0.000 0.252 0.200 0.064
#> SRR1033140 1 0.5467 0.28352 0.724 0.000 0.120 0.100 0.056
#> SRR1033141 1 0.4671 0.38780 0.740 0.000 0.020 0.200 0.040
#> SRR1033142 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.4500 0.37493 0.760 0.000 0.020 0.180 0.040
#> SRR1033144 1 0.5142 0.26996 0.752 0.000 0.092 0.096 0.060
#> SRR1033145 1 0.4826 0.34155 0.772 0.000 0.108 0.068 0.052
#> SRR1033146 3 0.7220 0.17486 0.200 0.000 0.428 0.340 0.032
#> SRR1033147 3 0.7027 0.06987 0.228 0.000 0.432 0.324 0.016
#> SRR1033148 1 0.4390 0.29780 0.568 0.000 0.004 0.428 0.000
#> SRR1033149 1 0.7269 -0.14347 0.536 0.000 0.164 0.216 0.084
#> SRR1033150 1 0.3064 0.41632 0.880 0.000 0.024 0.052 0.044
#> SRR1033151 1 0.7457 -0.31342 0.460 0.000 0.300 0.176 0.064
#> SRR1033152 1 0.1893 0.43975 0.928 0.000 0.024 0.048 0.000
#> SRR1033153 1 0.5860 0.19308 0.692 0.000 0.132 0.112 0.064
#> SRR1033154 1 0.4219 0.36488 0.816 0.000 0.068 0.056 0.060
#> SRR1033156 1 0.5640 0.27964 0.704 0.000 0.080 0.156 0.060
#> SRR1033157 1 0.2937 0.42003 0.884 0.000 0.016 0.040 0.060
#> SRR1033158 2 0.1356 0.83530 0.000 0.956 0.012 0.028 0.004
#> SRR1033159 1 0.3741 0.40528 0.844 0.000 0.040 0.060 0.056
#> SRR1033160 1 0.3898 0.38789 0.820 0.000 0.120 0.028 0.032
#> SRR1033161 1 0.3739 0.43911 0.820 0.000 0.024 0.136 0.020
#> SRR1033163 1 0.5930 0.20628 0.676 0.000 0.176 0.084 0.064
#> SRR1033162 1 0.3149 0.41535 0.872 0.000 0.036 0.072 0.020
#> SRR1033164 1 0.7717 -0.36651 0.448 0.008 0.244 0.248 0.052
#> SRR1033165 1 0.6632 -0.55867 0.452 0.000 0.140 0.392 0.016
#> SRR1033166 1 0.5998 -0.13582 0.636 0.000 0.108 0.228 0.028
#> SRR1033167 2 0.0510 0.85404 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033168 1 0.3308 0.40903 0.864 0.000 0.076 0.028 0.032
#> SRR1033169 2 0.0404 0.85593 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033171 3 0.7134 0.18443 0.196 0.000 0.436 0.340 0.028
#> SRR1033170 1 0.3849 0.41378 0.820 0.000 0.020 0.124 0.036
#> SRR1033172 1 0.5834 0.27629 0.688 0.000 0.112 0.148 0.052
#> SRR1033173 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033174 1 0.3614 0.41844 0.852 0.000 0.052 0.048 0.048
#> SRR1033175 1 0.4440 0.38227 0.772 0.000 0.024 0.164 0.040
#> SRR1033176 1 0.2824 0.42487 0.888 0.000 0.068 0.028 0.016
#> SRR1033177 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.2516 0.75063 0.000 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1033179 3 0.5668 0.01085 0.000 0.416 0.504 0.000 0.080
#> SRR1033180 1 0.1569 0.43931 0.944 0.000 0.044 0.008 0.004
#> SRR1033181 1 0.4654 0.33038 0.788 0.000 0.076 0.072 0.064
#> SRR1033183 1 0.5956 0.29996 0.684 0.000 0.072 0.144 0.100
#> SRR1033182 1 0.6617 -0.07514 0.612 0.000 0.148 0.176 0.064
#> SRR1033184 1 0.3004 0.40585 0.864 0.000 0.108 0.020 0.008
#> SRR1033185 1 0.2916 0.41953 0.880 0.000 0.072 0.040 0.008
#> SRR1033187 1 0.2429 0.45765 0.904 0.000 0.020 0.068 0.008
#> SRR1033186 1 0.5877 0.11422 0.692 0.000 0.100 0.136 0.072
#> SRR1033188 4 0.7761 0.75238 0.332 0.000 0.148 0.416 0.104
#> SRR1033189 3 0.5579 0.12325 0.000 0.368 0.552 0.000 0.080
#> SRR1033190 1 0.4350 0.36410 0.808 0.000 0.064 0.064 0.064
#> SRR1033191 1 0.3517 0.39680 0.856 0.000 0.056 0.056 0.032
#> SRR1033192 3 0.7225 0.28189 0.136 0.036 0.480 0.336 0.012
#> SRR1033193 1 0.4694 0.37588 0.720 0.000 0.012 0.228 0.040
#> SRR1033195 2 0.5684 0.12243 0.000 0.488 0.432 0.000 0.080
#> SRR1033194 2 0.7997 0.08297 0.000 0.412 0.252 0.232 0.104
#> SRR1033197 1 0.3272 0.42029 0.860 0.000 0.060 0.072 0.008
#> SRR1033196 1 0.4063 0.37913 0.816 0.000 0.108 0.044 0.032
#> SRR1033199 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033198 1 0.4572 0.28151 0.540 0.000 0.004 0.452 0.004
#> SRR1033200 1 0.4576 0.27897 0.536 0.000 0.004 0.456 0.004
#> SRR1033201 1 0.4769 0.39839 0.776 0.000 0.044 0.088 0.092
#> SRR1033202 1 0.5661 0.36467 0.672 0.000 0.024 0.204 0.100
#> SRR1033203 1 0.3525 0.41436 0.852 0.000 0.028 0.080 0.040
#> SRR1033204 1 0.4777 0.35921 0.708 0.000 0.012 0.240 0.040
#> SRR1033205 1 0.5466 0.33605 0.620 0.000 0.016 0.312 0.052
#> SRR1033206 1 0.4880 0.35948 0.684 0.000 0.012 0.268 0.036
#> SRR1033207 1 0.4651 0.40612 0.708 0.000 0.036 0.248 0.008
#> SRR1033208 1 0.4722 0.40126 0.776 0.000 0.036 0.104 0.084
#> SRR1033209 1 0.4883 0.38197 0.712 0.000 0.020 0.228 0.040
#> SRR1033210 1 0.5560 0.29150 0.704 0.000 0.044 0.164 0.088
#> SRR1033211 1 0.4054 0.39064 0.800 0.000 0.016 0.144 0.040
#> SRR1033212 1 0.6066 0.15732 0.652 0.000 0.060 0.208 0.080
#> SRR1033213 2 0.0510 0.85404 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033214 1 0.4443 0.26629 0.524 0.000 0.000 0.472 0.004
#> SRR1033216 1 0.4544 0.37653 0.740 0.000 0.012 0.208 0.040
#> SRR1033215 3 0.7022 0.12239 0.000 0.360 0.476 0.072 0.092
#> SRR1033217 1 0.3333 0.40206 0.856 0.000 0.096 0.020 0.028
#> SRR1033218 1 0.4873 0.33420 0.644 0.000 0.000 0.312 0.044
#> SRR1033219 1 0.4595 0.31549 0.588 0.000 0.008 0.400 0.004
#> SRR1033221 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033222 1 0.4874 0.36319 0.704 0.000 0.016 0.240 0.040
#> SRR1033223 1 0.2609 0.40779 0.896 0.000 0.028 0.068 0.008
#> SRR1033225 2 0.7312 0.31159 0.000 0.540 0.196 0.168 0.096
#> SRR1033224 1 0.4748 0.32032 0.596 0.000 0.016 0.384 0.004
#> SRR1033226 1 0.4680 0.23599 0.772 0.000 0.064 0.132 0.032
#> SRR1033227 1 0.6147 0.11738 0.572 0.000 0.064 0.324 0.040
#> SRR1033229 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.4726 0.36759 0.684 0.000 0.020 0.280 0.016
#> SRR1033231 2 0.2690 0.73394 0.000 0.844 0.156 0.000 0.000
#> SRR1033230 1 0.4821 0.36486 0.728 0.000 0.024 0.208 0.040
#> SRR1033232 1 0.5203 0.33124 0.600 0.000 0.012 0.356 0.032
#> SRR1033233 1 0.4825 0.37195 0.720 0.000 0.020 0.220 0.040
#> SRR1033235 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033234 1 0.4920 0.29269 0.752 0.000 0.052 0.152 0.044
#> SRR1033236 1 0.3898 0.44550 0.832 0.000 0.044 0.084 0.040
#> SRR1033237 1 0.4490 0.30907 0.588 0.000 0.004 0.404 0.004
#> SRR1033238 1 0.4964 0.39376 0.744 0.000 0.040 0.164 0.052
#> SRR1033240 1 0.4297 0.40503 0.804 0.000 0.028 0.084 0.084
#> SRR1033239 1 0.4399 0.36976 0.800 0.000 0.076 0.088 0.036
#> SRR1033242 1 0.5213 0.05416 0.556 0.000 0.048 0.396 0.000
#> SRR1033241 1 0.5094 0.31495 0.740 0.000 0.048 0.156 0.056
#> SRR1033244 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.2472 0.42715 0.908 0.000 0.020 0.052 0.020
#> SRR1033246 1 0.3558 0.44346 0.840 0.000 0.016 0.108 0.036
#> SRR1033248 1 0.4574 0.34418 0.652 0.000 0.008 0.328 0.012
#> SRR1033247 3 0.7777 0.14166 0.004 0.332 0.428 0.140 0.096
#> SRR1033249 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033251 1 0.3363 0.40090 0.860 0.000 0.044 0.076 0.020
#> SRR1033252 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.5025 0.34287 0.660 0.000 0.008 0.288 0.044
#> SRR1033254 1 0.2819 0.45914 0.884 0.000 0.024 0.080 0.012
#> SRR1033256 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.4262 0.35489 0.804 0.000 0.036 0.112 0.048
#> SRR1033258 1 0.4914 0.35266 0.672 0.000 0.008 0.280 0.040
#> SRR1033257 1 0.4627 0.28640 0.544 0.000 0.000 0.444 0.012
#> SRR1033259 1 0.4402 0.34032 0.636 0.000 0.012 0.352 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033261 1 0.5267 0.38027 0.736 0.000 0.044 0.120 0.100
#> SRR1033262 1 0.5230 0.35058 0.740 0.000 0.052 0.128 0.080
#> SRR1033263 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.4920 0.34502 0.620 0.000 0.008 0.348 0.024
#> SRR1033265 2 0.1522 0.82809 0.000 0.944 0.044 0.000 0.012
#> SRR1033266 1 0.2193 0.45453 0.912 0.000 0.028 0.060 0.000
#> SRR1033267 1 0.4079 0.43103 0.812 0.000 0.028 0.116 0.044
#> SRR1033268 1 0.2853 0.43489 0.884 0.000 0.008 0.068 0.040
#> SRR1033269 1 0.6553 -0.10273 0.608 0.000 0.120 0.212 0.060
#> SRR1033270 1 0.4581 0.41188 0.788 0.000 0.040 0.096 0.076
#> SRR1033271 1 0.4977 0.33416 0.660 0.000 0.008 0.292 0.040
#> SRR1033272 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.2228 0.45103 0.916 0.000 0.020 0.056 0.008
#> SRR1033274 2 0.5684 0.12243 0.000 0.488 0.432 0.000 0.080
#> SRR1033275 1 0.5048 0.21781 0.492 0.000 0.000 0.476 0.032
#> SRR1033276 2 0.0000 0.86093 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033277 1 0.5196 0.30951 0.576 0.000 0.004 0.380 0.040
#> SRR1033278 1 0.6738 -0.18988 0.496 0.000 0.020 0.160 0.324
#> SRR1033279 1 0.6243 -0.09361 0.620 0.000 0.132 0.216 0.032
#> SRR1033280 1 0.3059 0.40347 0.860 0.000 0.108 0.028 0.004
#> SRR1033281 1 0.3388 0.42846 0.860 0.000 0.028 0.076 0.036
#> SRR1033282 5 0.2872 0.98610 0.048 0.008 0.000 0.060 0.884
#> SRR1033283 5 0.2872 0.98610 0.048 0.008 0.000 0.060 0.884
#> SRR1033284 5 0.2872 0.98610 0.048 0.008 0.000 0.060 0.884
#> SRR1033285 5 0.2806 0.98478 0.052 0.008 0.000 0.052 0.888
#> SRR1033286 5 0.2806 0.98478 0.052 0.008 0.000 0.052 0.888
#> SRR1033287 5 0.2806 0.98478 0.052 0.008 0.000 0.052 0.888
#> SRR1033288 5 0.2806 0.98478 0.052 0.008 0.000 0.052 0.888
#> SRR1033289 5 0.2806 0.98478 0.052 0.008 0.000 0.052 0.888
#> SRR1033290 5 0.2804 0.98584 0.048 0.008 0.000 0.056 0.888
#> SRR1033291 5 0.2853 0.97545 0.040 0.008 0.000 0.068 0.884
#> SRR1033292 5 0.2853 0.97545 0.040 0.008 0.000 0.068 0.884
#> SRR1033293 5 0.2853 0.97545 0.040 0.008 0.000 0.068 0.884
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 1 0.4302 0.5416 0.668 0.000 0.036 NA 0.004 0.000
#> SRR1032911 1 0.3758 0.5310 0.668 0.000 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1032912 1 0.4206 0.5154 0.624 0.000 0.000 NA 0.008 0.012
#> SRR1032913 1 0.3384 0.5711 0.760 0.000 0.004 NA 0.000 0.008
#> SRR1032914 1 0.3679 0.5638 0.724 0.000 0.012 NA 0.000 0.004
#> SRR1032915 1 0.3189 0.5690 0.760 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.7579 0.2552 0.436 0.000 0.132 NA 0.196 0.020
#> SRR1032917 1 0.5151 0.4744 0.720 0.000 0.116 NA 0.076 0.008
#> SRR1032918 1 0.3954 0.5166 0.636 0.000 0.000 NA 0.000 0.012
#> SRR1032919 1 0.3955 0.5376 0.668 0.000 0.000 NA 0.012 0.004
#> SRR1032920 6 0.7162 0.7576 0.000 0.288 0.000 NA 0.084 0.372
#> SRR1032921 1 0.4534 0.5415 0.704 0.000 0.036 NA 0.008 0.016
#> SRR1032922 1 0.5003 0.1634 0.616 0.000 0.316 NA 0.016 0.004
#> SRR1032923 1 0.7085 -0.1670 0.384 0.000 0.344 NA 0.004 0.076
#> SRR1032925 2 0.0622 0.9473 0.000 0.980 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1032924 1 0.3861 0.5180 0.640 0.000 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1032926 1 0.3253 0.5771 0.788 0.000 0.020 NA 0.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.3967 0.5158 0.632 0.000 0.000 NA 0.000 0.012
#> SRR1032929 1 0.3819 0.5263 0.652 0.000 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1032928 1 0.3549 0.5724 0.776 0.000 0.028 NA 0.000 0.004
#> SRR1032930 1 0.3892 0.5245 0.640 0.000 0.000 NA 0.004 0.004
#> SRR1032931 2 0.0508 0.9491 0.000 0.984 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1032932 6 0.7436 0.7667 0.000 0.264 0.052 NA 0.088 0.472
#> SRR1032933 1 0.4046 0.5111 0.620 0.000 0.000 NA 0.004 0.008
#> SRR1032934 1 0.6670 -0.2100 0.416 0.000 0.368 NA 0.000 0.064
#> SRR1032935 1 0.3874 0.5182 0.636 0.000 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1032936 1 0.5081 0.4463 0.676 0.000 0.180 NA 0.000 0.020
#> SRR1032937 2 0.3869 0.5898 0.000 0.764 0.000 NA 0.008 0.184
#> SRR1032938 1 0.3353 0.5873 0.804 0.000 0.032 NA 0.000 0.004
#> SRR1032939 1 0.5434 0.2896 0.652 0.000 0.228 NA 0.016 0.024
#> SRR1032940 1 0.4306 0.5751 0.736 0.000 0.028 NA 0.012 0.016
#> SRR1032941 1 0.4138 0.5133 0.620 0.000 0.000 NA 0.008 0.008
#> SRR1032942 6 0.7417 0.7653 0.000 0.268 0.012 NA 0.084 0.384
#> SRR1032943 2 0.1434 0.9090 0.000 0.940 0.000 NA 0.000 0.048
#> SRR1032944 1 0.4337 0.3428 0.708 0.000 0.244 NA 0.016 0.004
#> SRR1032945 1 0.3772 0.5483 0.692 0.000 0.000 NA 0.008 0.004
#> SRR1032946 1 0.3730 0.5704 0.768 0.000 0.032 NA 0.000 0.008
#> SRR1032947 1 0.4965 0.5220 0.704 0.000 0.144 NA 0.004 0.020
#> SRR1032948 1 0.3764 0.5631 0.724 0.000 0.012 NA 0.000 0.008
#> SRR1032949 2 0.0622 0.9473 0.000 0.980 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1032950 1 0.5373 0.2559 0.628 0.000 0.268 NA 0.008 0.024
#> SRR1032951 1 0.4316 0.5156 0.628 0.000 0.004 NA 0.008 0.012
#> SRR1032952 1 0.3427 0.5758 0.804 0.000 0.032 NA 0.000 0.008
#> SRR1032953 1 0.3969 0.5208 0.644 0.000 0.004 NA 0.000 0.008
#> SRR1032954 1 0.4223 0.5702 0.752 0.000 0.056 NA 0.004 0.012
#> SRR1032955 2 0.0725 0.9450 0.000 0.976 0.000 NA 0.000 0.012
#> SRR1032957 1 0.3871 0.5526 0.696 0.000 0.004 NA 0.008 0.004
#> SRR1032956 1 0.2810 0.5908 0.832 0.000 0.008 NA 0.000 0.004
#> SRR1032958 1 0.3692 0.5681 0.736 0.000 0.012 NA 0.000 0.008
#> SRR1032959 1 0.4654 0.5599 0.736 0.000 0.076 NA 0.012 0.016
#> SRR1032960 1 0.2979 0.5790 0.848 0.000 0.032 NA 0.000 0.008
#> SRR1032961 1 0.2631 0.5831 0.856 0.000 0.012 NA 0.000 0.004
#> SRR1032962 3 0.6591 0.2568 0.056 0.000 0.532 NA 0.060 0.300
#> SRR1032963 1 0.3713 0.5530 0.704 0.000 0.004 NA 0.008 0.000
#> SRR1032964 1 0.3871 0.5505 0.696 0.000 0.008 NA 0.004 0.004
#> SRR1032965 1 0.3969 0.5190 0.644 0.000 0.004 NA 0.000 0.008
#> SRR1032966 1 0.3468 0.5560 0.712 0.000 0.004 NA 0.000 0.000
#> SRR1032967 6 0.7417 0.7653 0.000 0.268 0.012 NA 0.084 0.384
#> SRR1032968 1 0.5585 0.5161 0.616 0.000 0.068 NA 0.048 0.004
#> SRR1032969 1 0.6576 0.4533 0.564 0.000 0.120 NA 0.108 0.008
#> SRR1032970 1 0.3830 0.5683 0.760 0.000 0.036 NA 0.000 0.008
#> SRR1032971 1 0.4859 0.5458 0.660 0.000 0.044 NA 0.016 0.008
#> SRR1032972 1 0.3508 0.5509 0.704 0.000 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1032973 1 0.4996 0.5485 0.688 0.000 0.040 NA 0.044 0.008
#> SRR1032974 1 0.3902 0.5840 0.748 0.000 0.028 NA 0.000 0.012
#> SRR1032975 1 0.3390 0.5509 0.704 0.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.5084 0.4884 0.684 0.000 0.140 NA 0.000 0.024
#> SRR1032977 6 0.5246 0.7355 0.000 0.296 0.004 NA 0.112 0.588
#> SRR1032978 1 0.3050 0.5414 0.852 0.000 0.044 NA 0.012 0.000
#> SRR1032979 2 0.1225 0.9226 0.000 0.952 0.000 NA 0.000 0.036
#> SRR1032980 1 0.6298 0.4730 0.576 0.000 0.104 NA 0.076 0.008
#> SRR1032981 1 0.4252 0.5404 0.668 0.000 0.008 NA 0.012 0.008
#> SRR1032982 1 0.3390 0.5488 0.704 0.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.3376 0.5713 0.816 0.000 0.052 NA 0.000 0.004
#> SRR1032984 1 0.4549 0.5414 0.684 0.000 0.008 NA 0.048 0.004
#> SRR1032985 1 0.4009 0.5139 0.632 0.000 0.004 NA 0.000 0.008
#> SRR1032986 1 0.3121 0.5870 0.804 0.000 0.012 NA 0.000 0.004
#> SRR1032987 2 0.0547 0.9424 0.000 0.980 0.000 NA 0.000 0.020
#> SRR1032988 1 0.3887 0.5140 0.632 0.000 0.000 NA 0.000 0.008
#> SRR1032990 3 0.4921 0.3121 0.428 0.000 0.528 NA 0.008 0.012
#> SRR1032989 1 0.4115 0.5123 0.624 0.000 0.000 NA 0.004 0.012
#> SRR1032991 2 0.1367 0.9137 0.000 0.944 0.000 NA 0.000 0.044
#> SRR1032992 1 0.3647 0.5349 0.820 0.000 0.060 NA 0.008 0.012
#> SRR1032993 1 0.4020 0.5673 0.744 0.000 0.044 NA 0.000 0.008
#> SRR1032994 1 0.5589 0.2023 0.588 0.000 0.292 NA 0.008 0.016
#> SRR1032995 1 0.3835 0.5288 0.656 0.000 0.004 NA 0.000 0.004
#> SRR1032996 1 0.3454 0.5711 0.760 0.000 0.012 NA 0.000 0.004
#> SRR1032997 1 0.4001 0.5645 0.724 0.000 0.020 NA 0.004 0.008
#> SRR1032998 1 0.4984 0.3747 0.680 0.000 0.216 NA 0.012 0.008
#> SRR1032999 6 0.7125 0.7199 0.000 0.348 0.004 NA 0.084 0.380
#> SRR1033000 6 0.5246 0.7355 0.000 0.296 0.004 NA 0.112 0.588
#> SRR1033001 1 0.2755 0.5879 0.844 0.000 0.012 NA 0.000 0.004
#> SRR1033002 1 0.4032 0.4833 0.780 0.000 0.120 NA 0.016 0.000
#> SRR1033003 2 0.1858 0.8725 0.000 0.912 0.000 NA 0.000 0.076
#> SRR1033004 2 0.0547 0.9424 0.000 0.980 0.000 NA 0.000 0.020
#> SRR1033005 1 0.4419 0.5448 0.748 0.000 0.096 NA 0.000 0.020
#> SRR1033006 1 0.6659 -0.1105 0.452 0.000 0.364 NA 0.088 0.008
#> SRR1033007 3 0.7058 0.3179 0.304 0.000 0.444 NA 0.012 0.072
#> SRR1033008 1 0.5126 0.4006 0.688 0.000 0.160 NA 0.008 0.016
#> SRR1033009 1 0.4647 0.4984 0.728 0.000 0.112 NA 0.008 0.008
#> SRR1033010 3 0.7427 0.3166 0.364 0.000 0.400 NA 0.092 0.060
#> SRR1033011 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033012 3 0.5415 0.3289 0.424 0.000 0.504 NA 0.016 0.016
#> SRR1033013 1 0.5837 0.3827 0.656 0.000 0.176 NA 0.072 0.020
#> SRR1033014 3 0.6395 0.4939 0.292 0.000 0.544 NA 0.084 0.020
#> SRR1033015 3 0.4374 0.5002 0.308 0.000 0.656 NA 0.000 0.016
#> SRR1033016 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033018 3 0.4724 0.5791 0.204 0.000 0.716 NA 0.012 0.036
#> SRR1033019 3 0.5392 0.5775 0.188 0.000 0.688 NA 0.036 0.044
#> SRR1033020 3 0.6470 0.2796 0.400 0.000 0.436 NA 0.012 0.044
#> SRR1033021 3 0.6201 0.5075 0.128 0.000 0.632 NA 0.024 0.144
#> SRR1033023 1 0.5639 0.2607 0.612 0.000 0.264 NA 0.016 0.020
#> SRR1033022 3 0.4791 0.2482 0.444 0.000 0.516 NA 0.000 0.020
#> SRR1033024 3 0.6087 0.5226 0.256 0.000 0.592 NA 0.072 0.016
#> SRR1033025 1 0.5476 0.2685 0.620 0.000 0.264 NA 0.016 0.012
#> SRR1033026 3 0.5373 0.5551 0.144 0.000 0.704 NA 0.072 0.020
#> SRR1033027 2 0.0547 0.9424 0.000 0.980 0.000 NA 0.000 0.020
#> SRR1033028 1 0.5919 0.0821 0.568 0.000 0.312 NA 0.040 0.020
#> SRR1033029 6 0.7154 0.7225 0.000 0.344 0.004 NA 0.084 0.376
#> SRR1033030 3 0.6574 0.5505 0.192 0.000 0.600 NA 0.068 0.064
#> SRR1033031 3 0.4486 0.5772 0.152 0.000 0.752 NA 0.004 0.056
#> SRR1033032 3 0.5932 0.4967 0.116 0.004 0.648 NA 0.020 0.172
#> SRR1033033 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033035 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033034 3 0.5954 0.3451 0.412 0.000 0.468 NA 0.016 0.016
#> SRR1033036 3 0.5729 0.5486 0.184 0.000 0.660 NA 0.044 0.088
#> SRR1033037 1 0.6085 0.1352 0.552 0.000 0.260 NA 0.004 0.028
#> SRR1033038 3 0.5716 0.5740 0.148 0.008 0.664 NA 0.004 0.128
#> SRR1033039 3 0.6092 0.3784 0.368 0.000 0.504 NA 0.016 0.032
#> SRR1033040 3 0.5201 0.5765 0.192 0.000 0.692 NA 0.012 0.056
#> SRR1033041 3 0.6523 0.2908 0.360 0.000 0.464 NA 0.016 0.036
#> SRR1033042 3 0.4954 0.5598 0.260 0.000 0.664 NA 0.008 0.044
#> SRR1033043 1 0.6687 -0.2217 0.420 0.000 0.372 NA 0.012 0.036
#> SRR1033044 1 0.5197 0.3729 0.652 0.000 0.204 NA 0.004 0.008
#> SRR1033045 3 0.6334 0.4569 0.320 0.000 0.524 NA 0.076 0.012
#> SRR1033046 3 0.7078 0.4320 0.220 0.000 0.500 NA 0.016 0.092
#> SRR1033047 3 0.5669 0.5576 0.248 0.000 0.628 NA 0.040 0.016
#> SRR1033048 3 0.6433 0.4489 0.260 0.000 0.552 NA 0.016 0.052
#> SRR1033049 3 0.6036 0.2714 0.436 0.000 0.440 NA 0.016 0.020
#> SRR1033051 1 0.4428 0.5014 0.768 0.000 0.080 NA 0.008 0.028
#> SRR1033052 3 0.5330 0.2113 0.456 0.000 0.476 NA 0.012 0.012
#> SRR1033053 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033054 3 0.5038 0.3780 0.380 0.000 0.560 NA 0.000 0.032
#> SRR1033050 1 0.4599 0.4838 0.736 0.000 0.120 NA 0.000 0.024
#> SRR1033055 3 0.6355 0.5698 0.216 0.000 0.604 NA 0.044 0.068
#> SRR1033056 3 0.6812 0.3154 0.304 0.000 0.444 NA 0.000 0.072
#> SRR1033057 1 0.5550 -0.1538 0.496 0.000 0.424 NA 0.012 0.036
#> SRR1033058 3 0.6416 0.5607 0.172 0.000 0.620 NA 0.052 0.068
#> SRR1033059 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033060 3 0.4735 0.3936 0.376 0.000 0.584 NA 0.004 0.020
#> SRR1033061 6 0.5035 0.7358 0.000 0.296 0.000 NA 0.104 0.600
#> SRR1033062 3 0.6297 0.5250 0.244 0.000 0.588 NA 0.076 0.028
#> SRR1033063 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033064 3 0.5550 0.5610 0.240 0.000 0.644 NA 0.032 0.024
#> SRR1033065 3 0.5459 0.4119 0.356 0.000 0.552 NA 0.000 0.040
#> SRR1033066 3 0.5929 0.5290 0.272 0.000 0.596 NA 0.028 0.072
#> SRR1033067 1 0.5339 0.3444 0.640 0.000 0.232 NA 0.012 0.008
#> SRR1033068 3 0.5575 0.5740 0.228 0.000 0.648 NA 0.016 0.060
#> SRR1033069 3 0.6600 0.1880 0.044 0.000 0.496 NA 0.060 0.344
#> SRR1033070 3 0.4463 0.4761 0.316 0.000 0.648 NA 0.004 0.016
#> SRR1033071 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033072 6 0.6472 -0.1007 0.040 0.000 0.400 NA 0.044 0.456
#> SRR1033073 3 0.5221 0.5759 0.188 0.000 0.692 NA 0.012 0.064
#> SRR1033074 1 0.3134 0.5701 0.824 0.000 0.016 NA 0.000 0.012
#> SRR1033075 3 0.6865 0.3389 0.308 0.000 0.448 NA 0.004 0.068
#> SRR1033076 3 0.5026 0.4807 0.328 0.000 0.608 NA 0.004 0.028
#> SRR1033077 1 0.5560 0.2724 0.628 0.000 0.248 NA 0.016 0.020
#> SRR1033078 1 0.5765 0.2481 0.604 0.000 0.232 NA 0.004 0.028
#> SRR1033079 3 0.6539 0.4440 0.340 0.000 0.496 NA 0.088 0.024
#> SRR1033080 3 0.6213 0.5397 0.224 0.000 0.608 NA 0.072 0.032
#> SRR1033081 3 0.6752 0.3032 0.344 0.000 0.436 NA 0.004 0.060
#> SRR1033082 3 0.5710 0.5347 0.256 0.000 0.600 NA 0.000 0.100
#> SRR1033083 3 0.6192 0.4410 0.336 0.000 0.532 NA 0.048 0.028
#> SRR1033084 1 0.4932 0.4534 0.724 0.000 0.140 NA 0.016 0.020
#> SRR1033085 3 0.6421 0.5042 0.272 0.000 0.556 NA 0.076 0.020
#> SRR1033086 6 0.5155 0.7322 0.000 0.308 0.008 NA 0.088 0.596
#> SRR1033087 1 0.6142 0.1729 0.560 0.000 0.268 NA 0.016 0.024
#> SRR1033088 3 0.6074 0.5561 0.180 0.000 0.644 NA 0.064 0.044
#> SRR1033089 3 0.7217 0.3062 0.280 0.000 0.460 NA 0.028 0.068
#> SRR1033090 1 0.3998 0.5798 0.752 0.000 0.024 NA 0.016 0.004
#> SRR1033091 3 0.6681 0.3604 0.384 0.000 0.444 NA 0.084 0.020
#> SRR1033092 3 0.5417 0.4839 0.340 0.000 0.576 NA 0.016 0.016
#> SRR1033093 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033094 3 0.4181 0.5866 0.172 0.000 0.760 NA 0.004 0.044
#> SRR1033095 2 0.2446 0.7949 0.000 0.864 0.000 NA 0.000 0.124
#> SRR1033096 3 0.5284 0.3158 0.436 0.000 0.500 NA 0.024 0.008
#> SRR1033097 6 0.4941 0.6670 0.000 0.376 0.000 NA 0.072 0.552
#> SRR1033098 3 0.6047 0.5441 0.192 0.000 0.636 NA 0.076 0.028
#> SRR1033099 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033100 2 0.0146 0.9525 0.000 0.996 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1033101 3 0.6771 0.3327 0.344 0.000 0.452 NA 0.016 0.048
#> SRR1033102 1 0.3819 0.5631 0.700 0.000 0.020 NA 0.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.5230 0.1953 0.592 0.000 0.316 NA 0.004 0.008
#> SRR1033104 1 0.7488 0.0675 0.468 0.000 0.260 NA 0.108 0.048
#> SRR1033105 1 0.5136 0.2207 0.612 0.000 0.308 NA 0.016 0.004
#> SRR1033106 1 0.5500 0.1176 0.564 0.000 0.340 NA 0.012 0.012
#> SRR1033107 1 0.6460 0.3840 0.596 0.000 0.172 NA 0.116 0.016
#> SRR1033108 1 0.5375 0.5181 0.612 0.000 0.024 NA 0.048 0.016
#> SRR1033109 1 0.4311 0.4670 0.756 0.000 0.120 NA 0.016 0.000
#> SRR1033110 3 0.4788 0.3466 0.420 0.000 0.540 NA 0.004 0.008
#> SRR1033111 1 0.5159 0.3280 0.664 0.000 0.212 NA 0.016 0.004
#> SRR1033112 1 0.5782 0.2200 0.596 0.000 0.268 NA 0.016 0.020
#> SRR1033113 3 0.6382 0.5381 0.172 0.000 0.604 NA 0.036 0.144
#> SRR1033114 1 0.5834 -0.0899 0.520 0.000 0.372 NA 0.008 0.044
#> SRR1033115 3 0.6041 0.5325 0.240 0.000 0.608 NA 0.024 0.080
#> SRR1033116 1 0.6423 0.3873 0.600 0.000 0.172 NA 0.112 0.016
#> SRR1033117 3 0.6888 0.5547 0.196 0.000 0.564 NA 0.108 0.088
#> SRR1033118 1 0.5875 0.2975 0.620 0.000 0.244 NA 0.052 0.024
#> SRR1033119 1 0.4705 0.4012 0.712 0.000 0.168 NA 0.016 0.000
#> SRR1033121 3 0.6225 0.4292 0.372 0.000 0.488 NA 0.068 0.008
#> SRR1033120 6 0.5170 0.7358 0.000 0.296 0.004 NA 0.104 0.596
#> SRR1033122 1 0.6260 0.2475 0.604 0.000 0.216 NA 0.068 0.024
#> SRR1033123 3 0.5478 0.2739 0.416 0.000 0.496 NA 0.000 0.028
#> SRR1033124 1 0.4417 0.4314 0.736 0.000 0.160 NA 0.012 0.000
#> SRR1033125 3 0.6901 0.4061 0.112 0.000 0.552 NA 0.060 0.220
#> SRR1033126 3 0.5797 0.2982 0.396 0.000 0.488 NA 0.000 0.036
#> SRR1033127 6 0.7417 0.7653 0.000 0.268 0.012 NA 0.084 0.384
#> SRR1033129 1 0.7101 0.0841 0.492 0.000 0.276 NA 0.116 0.032
#> SRR1033128 3 0.4713 0.5600 0.168 0.000 0.720 NA 0.000 0.084
#> SRR1033130 1 0.5208 0.4339 0.696 0.000 0.140 NA 0.012 0.024
#> SRR1033131 1 0.5338 0.0871 0.552 0.000 0.368 NA 0.008 0.012
#> SRR1033132 3 0.6550 0.4828 0.136 0.000 0.592 NA 0.048 0.180
#> SRR1033133 3 0.5704 0.3999 0.356 0.000 0.540 NA 0.008 0.068
#> SRR1033134 1 0.4134 0.5324 0.772 0.000 0.116 NA 0.000 0.016
#> SRR1033135 3 0.5764 0.4469 0.344 0.000 0.552 NA 0.032 0.016
#> SRR1033136 1 0.5302 0.1068 0.580 0.000 0.336 NA 0.012 0.008
#> SRR1033137 3 0.6336 0.4411 0.104 0.000 0.612 NA 0.040 0.192
#> SRR1033139 3 0.6499 0.1944 0.044 0.000 0.504 NA 0.060 0.344
#> SRR1033138 3 0.6006 0.5305 0.128 0.000 0.644 NA 0.052 0.152
#> SRR1033140 3 0.6026 0.5526 0.224 0.000 0.620 NA 0.068 0.024
#> SRR1033141 1 0.3115 0.5438 0.856 0.000 0.040 NA 0.016 0.004
#> SRR1033142 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033143 1 0.2728 0.5400 0.864 0.000 0.032 NA 0.004 0.000
#> SRR1033144 3 0.5090 0.5138 0.292 0.000 0.624 NA 0.000 0.060
#> SRR1033145 3 0.5843 0.5565 0.264 0.000 0.608 NA 0.060 0.020
#> SRR1033146 3 0.6732 0.1692 0.040 0.008 0.492 NA 0.060 0.348
#> SRR1033147 3 0.6639 0.1832 0.048 0.000 0.476 NA 0.060 0.364
#> SRR1033148 1 0.3380 0.5747 0.748 0.000 0.004 NA 0.000 0.004
#> SRR1033149 3 0.6569 0.5650 0.164 0.000 0.608 NA 0.100 0.080
#> SRR1033150 1 0.5346 -0.0548 0.512 0.000 0.404 NA 0.000 0.016
#> SRR1033151 3 0.6859 0.4838 0.148 0.000 0.564 NA 0.060 0.180
#> SRR1033152 1 0.5464 0.2167 0.608 0.000 0.284 NA 0.020 0.008
#> SRR1033153 3 0.5025 0.5531 0.216 0.000 0.688 NA 0.008 0.052
#> SRR1033154 3 0.5274 0.3805 0.376 0.000 0.548 NA 0.000 0.032
#> SRR1033156 3 0.6312 0.4572 0.328 0.000 0.520 NA 0.068 0.012
#> SRR1033157 1 0.5179 0.0800 0.544 0.000 0.380 NA 0.000 0.012
#> SRR1033158 2 0.1958 0.8420 0.000 0.896 0.000 NA 0.000 0.100
#> SRR1033159 3 0.6083 0.3702 0.408 0.000 0.468 NA 0.056 0.008
#> SRR1033160 3 0.6074 0.4765 0.328 0.000 0.548 NA 0.036 0.036
#> SRR1033161 1 0.6076 0.3795 0.572 0.000 0.224 NA 0.012 0.020
#> SRR1033163 3 0.6367 0.5239 0.256 0.000 0.576 NA 0.044 0.084
#> SRR1033162 1 0.5672 -0.1549 0.496 0.000 0.416 NA 0.016 0.028
#> SRR1033164 3 0.6299 0.4547 0.088 0.012 0.612 NA 0.004 0.188
#> SRR1033165 3 0.6737 0.3271 0.324 0.000 0.448 NA 0.000 0.076
#> SRR1033166 3 0.5469 0.5598 0.184 0.000 0.672 NA 0.012 0.092
#> SRR1033167 2 0.0458 0.9453 0.000 0.984 0.000 NA 0.000 0.016
#> SRR1033168 3 0.5379 0.4693 0.348 0.000 0.564 NA 0.036 0.000
#> SRR1033169 2 0.0458 0.9453 0.000 0.984 0.000 NA 0.000 0.016
#> SRR1033171 3 0.6231 0.0982 0.020 0.000 0.496 NA 0.060 0.372
#> SRR1033170 1 0.5209 0.3704 0.680 0.000 0.184 NA 0.016 0.012
#> SRR1033172 3 0.6334 0.5467 0.256 0.000 0.576 NA 0.072 0.024
#> SRR1033173 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033174 3 0.6202 0.3134 0.428 0.000 0.448 NA 0.044 0.024
#> SRR1033175 1 0.3172 0.5321 0.844 0.000 0.040 NA 0.016 0.000
#> SRR1033176 1 0.5335 -0.2137 0.472 0.000 0.464 NA 0.016 0.024
#> SRR1033177 2 0.0146 0.9535 0.000 0.996 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033178 2 0.3393 0.6280 0.000 0.784 0.000 NA 0.004 0.192
#> SRR1033179 6 0.7170 0.7564 0.000 0.288 0.000 NA 0.084 0.368
#> SRR1033180 1 0.5307 -0.1356 0.516 0.000 0.420 NA 0.016 0.024
#> SRR1033181 3 0.5290 0.3632 0.384 0.000 0.544 NA 0.004 0.024
#> SRR1033183 1 0.7886 -0.0164 0.424 0.000 0.268 NA 0.124 0.080
#> SRR1033182 3 0.5962 0.5435 0.220 0.000 0.624 NA 0.024 0.088
#> SRR1033184 3 0.4853 0.3646 0.396 0.000 0.556 NA 0.016 0.000
#> SRR1033185 3 0.5068 0.3008 0.448 0.000 0.500 NA 0.012 0.008
#> SRR1033187 1 0.5214 0.2732 0.644 0.000 0.256 NA 0.012 0.012
#> SRR1033186 3 0.6508 0.4972 0.304 0.004 0.528 NA 0.016 0.096
#> SRR1033188 3 0.7269 0.2929 0.304 0.000 0.436 NA 0.024 0.076
#> SRR1033189 6 0.7417 0.7653 0.000 0.268 0.012 NA 0.084 0.384
#> SRR1033190 1 0.5621 -0.1246 0.472 0.000 0.428 NA 0.000 0.028
#> SRR1033191 3 0.5124 0.2894 0.440 0.000 0.500 NA 0.000 0.032
#> SRR1033192 6 0.6116 0.0069 0.008 0.008 0.408 NA 0.048 0.476
#> SRR1033193 1 0.3525 0.5424 0.816 0.000 0.032 NA 0.016 0.004
#> SRR1033195 6 0.7152 0.7271 0.000 0.340 0.004 NA 0.084 0.380
#> SRR1033194 6 0.4961 0.7244 0.000 0.320 0.000 NA 0.088 0.592
#> SRR1033197 1 0.6225 0.1048 0.532 0.000 0.304 NA 0.012 0.032
#> SRR1033196 3 0.5156 0.4509 0.352 0.000 0.580 NA 0.004 0.024
#> SRR1033199 2 0.0508 0.9491 0.000 0.984 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1033198 1 0.4439 0.5349 0.632 0.000 0.020 NA 0.008 0.004
#> SRR1033200 1 0.3852 0.5423 0.664 0.000 0.012 NA 0.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.6561 -0.0146 0.508 0.000 0.324 NA 0.084 0.024
#> SRR1033202 1 0.6239 0.4290 0.628 0.000 0.148 NA 0.112 0.020
#> SRR1033203 3 0.6342 0.3426 0.412 0.000 0.448 NA 0.036 0.024
#> SRR1033204 1 0.3450 0.5538 0.780 0.000 0.032 NA 0.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.3875 0.5739 0.804 0.000 0.028 NA 0.024 0.016
#> SRR1033206 1 0.4171 0.5397 0.760 0.000 0.068 NA 0.016 0.000
#> SRR1033207 1 0.5113 0.5025 0.676 0.000 0.152 NA 0.004 0.012
#> SRR1033208 1 0.6453 -0.0138 0.516 0.000 0.320 NA 0.084 0.016
#> SRR1033209 1 0.3224 0.5351 0.824 0.000 0.040 NA 0.000 0.004
#> SRR1033210 3 0.7200 0.3323 0.392 0.000 0.396 NA 0.092 0.052
#> SRR1033211 1 0.4451 0.4704 0.756 0.000 0.088 NA 0.016 0.008
#> SRR1033212 3 0.6715 0.4919 0.304 0.000 0.512 NA 0.096 0.036
#> SRR1033213 2 0.0547 0.9424 0.000 0.980 0.000 NA 0.000 0.020
#> SRR1033214 1 0.4044 0.5422 0.668 0.000 0.012 NA 0.000 0.008
#> SRR1033216 1 0.3569 0.5342 0.792 0.000 0.036 NA 0.008 0.000
#> SRR1033215 6 0.7462 0.7672 0.000 0.264 0.048 NA 0.084 0.464
#> SRR1033217 3 0.5922 0.2235 0.440 0.000 0.444 NA 0.020 0.012
#> SRR1033218 1 0.4344 0.5489 0.724 0.000 0.036 NA 0.008 0.012
#> SRR1033219 1 0.3296 0.5824 0.796 0.000 0.020 NA 0.000 0.004
#> SRR1033221 2 0.0508 0.9491 0.000 0.984 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1033220 2 0.0508 0.9491 0.000 0.984 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1033222 1 0.3724 0.5364 0.804 0.000 0.040 NA 0.012 0.008
#> SRR1033223 1 0.5799 0.0152 0.544 0.000 0.332 NA 0.008 0.020
#> SRR1033225 6 0.5779 0.6820 0.000 0.376 0.020 NA 0.084 0.512
#> SRR1033224 1 0.3329 0.5730 0.768 0.000 0.004 NA 0.000 0.008
#> SRR1033226 3 0.6920 0.3863 0.380 0.000 0.432 NA 0.040 0.056
#> SRR1033227 1 0.6769 0.2570 0.560 0.000 0.208 NA 0.040 0.056
#> SRR1033229 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033228 1 0.3460 0.5619 0.796 0.000 0.036 NA 0.000 0.004
#> SRR1033231 2 0.3946 0.5370 0.000 0.748 0.000 NA 0.012 0.208
#> SRR1033230 1 0.2932 0.5421 0.840 0.000 0.024 NA 0.004 0.000
#> SRR1033232 1 0.3527 0.5838 0.784 0.000 0.016 NA 0.008 0.004
#> SRR1033233 1 0.4131 0.5345 0.772 0.000 0.048 NA 0.016 0.008
#> SRR1033235 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033234 3 0.6850 0.3202 0.404 0.000 0.416 NA 0.052 0.040
#> SRR1033236 1 0.5733 0.1720 0.588 0.000 0.288 NA 0.024 0.012
#> SRR1033237 1 0.3213 0.5781 0.784 0.000 0.008 NA 0.000 0.004
#> SRR1033238 1 0.6310 0.2337 0.572 0.000 0.256 NA 0.052 0.020
#> SRR1033240 1 0.6408 -0.1381 0.480 0.000 0.368 NA 0.084 0.016
#> SRR1033239 1 0.6018 0.1816 0.572 0.000 0.284 NA 0.016 0.032
#> SRR1033242 1 0.5324 0.4248 0.652 0.000 0.188 NA 0.000 0.024
#> SRR1033241 3 0.6664 0.3928 0.380 0.000 0.452 NA 0.064 0.024
#> SRR1033244 2 0.0508 0.9491 0.000 0.984 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1033243 2 0.0146 0.9535 0.000 0.996 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033245 1 0.6089 -0.0738 0.512 0.000 0.360 NA 0.028 0.020
#> SRR1033246 1 0.5124 0.4600 0.696 0.000 0.136 NA 0.012 0.016
#> SRR1033248 1 0.4688 0.5262 0.732 0.000 0.076 NA 0.012 0.016
#> SRR1033247 6 0.7441 0.7544 0.000 0.280 0.048 NA 0.120 0.460
#> SRR1033249 2 0.0291 0.9524 0.000 0.992 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1033250 2 0.0291 0.9524 0.000 0.992 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1033251 1 0.5646 -0.0907 0.500 0.000 0.388 NA 0.000 0.020
#> SRR1033252 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033253 1 0.3062 0.5605 0.816 0.000 0.024 NA 0.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.5267 0.3869 0.664 0.000 0.200 NA 0.016 0.008
#> SRR1033256 2 0.0146 0.9535 0.000 0.996 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033255 1 0.6555 -0.2410 0.448 0.000 0.392 NA 0.056 0.020
#> SRR1033258 1 0.3699 0.5507 0.772 0.000 0.032 NA 0.000 0.008
#> SRR1033257 1 0.4012 0.5652 0.716 0.000 0.016 NA 0.000 0.016
#> SRR1033259 1 0.3485 0.5860 0.784 0.000 0.028 NA 0.000 0.004
#> SRR1033260 2 0.0146 0.9534 0.000 0.996 0.000 NA 0.000 0.004
#> SRR1033261 1 0.6524 0.1594 0.544 0.000 0.268 NA 0.112 0.020
#> SRR1033262 3 0.6367 0.3292 0.392 0.000 0.460 NA 0.080 0.012
#> SRR1033263 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033264 1 0.3866 0.5832 0.736 0.000 0.024 NA 0.000 0.008
#> SRR1033265 2 0.2866 0.7993 0.000 0.864 0.000 NA 0.020 0.092
#> SRR1033266 1 0.4955 0.3419 0.676 0.000 0.240 NA 0.016 0.012
#> SRR1033267 1 0.6103 0.2314 0.588 0.000 0.252 NA 0.044 0.016
#> SRR1033268 1 0.5000 0.3764 0.680 0.000 0.180 NA 0.016 0.000
#> SRR1033269 3 0.4677 0.5557 0.196 0.000 0.708 NA 0.000 0.076
#> SRR1033270 1 0.5984 0.2438 0.604 0.000 0.248 NA 0.080 0.016
#> SRR1033271 1 0.3724 0.5525 0.772 0.000 0.028 NA 0.012 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.9540 0.000 1.000 0.000 NA 0.000 0.000
#> SRR1033273 1 0.4901 0.3820 0.700 0.000 0.188 NA 0.020 0.004
#> SRR1033274 6 0.7141 0.7183 0.000 0.348 0.004 NA 0.084 0.376
#> SRR1033275 1 0.4538 0.5237 0.628 0.000 0.004 NA 0.016 0.016
#> SRR1033276 2 0.0725 0.9455 0.000 0.976 0.000 NA 0.000 0.012
#> SRR1033277 1 0.4361 0.5525 0.700 0.000 0.036 NA 0.000 0.016
#> SRR1033278 1 0.8164 0.0711 0.368 0.000 0.168 NA 0.236 0.048
#> SRR1033279 3 0.5399 0.5631 0.208 0.000 0.668 NA 0.012 0.072
#> SRR1033280 3 0.5122 0.4041 0.392 0.000 0.552 NA 0.016 0.020
#> SRR1033281 1 0.5144 0.3940 0.684 0.000 0.172 NA 0.016 0.008
#> SRR1033282 5 0.2034 0.9915 0.024 0.000 0.060 NA 0.912 0.000
#> SRR1033283 5 0.2034 0.9915 0.024 0.000 0.060 NA 0.912 0.000
#> SRR1033284 5 0.2034 0.9915 0.024 0.000 0.060 NA 0.912 0.000
#> SRR1033285 5 0.1890 0.9924 0.024 0.000 0.060 NA 0.916 0.000
#> SRR1033286 5 0.1890 0.9924 0.024 0.000 0.060 NA 0.916 0.000
#> SRR1033287 5 0.1890 0.9924 0.024 0.000 0.060 NA 0.916 0.000
#> SRR1033288 5 0.1890 0.9924 0.024 0.000 0.060 NA 0.916 0.000
#> SRR1033289 5 0.1890 0.9924 0.024 0.000 0.060 NA 0.916 0.000
#> SRR1033290 5 0.1890 0.9924 0.024 0.000 0.060 NA 0.916 0.000
#> SRR1033291 5 0.2164 0.9852 0.020 0.000 0.060 NA 0.908 0.000
#> SRR1033292 5 0.2164 0.9852 0.020 0.000 0.060 NA 0.908 0.000
#> SRR1033293 5 0.2164 0.9852 0.020 0.000 0.060 NA 0.908 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 7000 rows and 383 columns.
#> Top rows (700, 1400, 2100, 2800, 3500) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.892 0.939 0.972 0.3596 0.637 0.637
#> 3 3 0.627 0.766 0.887 0.2439 0.888 0.832
#> 4 4 0.414 0.673 0.787 0.3006 0.745 0.581
#> 5 5 0.333 0.476 0.636 0.1436 0.833 0.582
#> 6 6 0.346 0.486 0.619 0.0718 0.921 0.731
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1032910 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032911 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032912 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032913 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032914 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032915 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032918 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032919 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032920 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032921 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032922 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032923 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032925 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032924 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032926 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032927 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032929 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032928 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032930 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032931 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032932 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032933 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032934 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032935 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032936 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032937 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032938 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032939 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032940 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032941 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032942 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032943 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032944 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032945 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032946 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032947 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032948 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032949 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032950 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032951 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032952 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032953 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032954 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032955 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032957 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032956 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032958 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032959 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032960 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032961 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032962 2 0.7674 0.746 0.224 0.776
#> SRR1032963 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032964 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032965 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032966 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032967 2 0.2603 0.907 0.044 0.956
#> SRR1032968 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032969 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032970 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032971 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032972 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032973 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032974 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032975 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032976 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032977 2 0.7528 0.754 0.216 0.784
#> SRR1032978 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032979 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032980 1 0.0376 0.979 0.996 0.004
#> SRR1032981 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032982 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032983 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032984 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032985 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032986 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032987 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032988 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032990 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032989 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032991 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1032992 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032993 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032994 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032995 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032996 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032997 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032998 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1032999 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033000 2 0.9087 0.580 0.324 0.676
#> SRR1033001 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033002 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033003 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033004 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033005 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033006 1 0.2603 0.943 0.956 0.044
#> SRR1033007 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033008 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033009 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033010 1 0.5842 0.833 0.860 0.140
#> SRR1033011 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033012 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033013 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033014 1 0.1414 0.965 0.980 0.020
#> SRR1033015 1 0.3584 0.919 0.932 0.068
#> SRR1033016 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033017 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033018 1 0.6247 0.809 0.844 0.156
#> SRR1033019 2 0.8955 0.607 0.312 0.688
#> SRR1033020 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033021 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033023 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033022 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033024 1 0.2423 0.946 0.960 0.040
#> SRR1033025 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033026 1 0.0672 0.975 0.992 0.008
#> SRR1033027 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033028 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033029 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033030 2 0.8555 0.662 0.280 0.720
#> SRR1033031 2 0.9635 0.441 0.388 0.612
#> SRR1033032 2 0.7815 0.735 0.232 0.768
#> SRR1033033 2 0.0376 0.931 0.004 0.996
#> SRR1033035 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033034 1 0.2778 0.939 0.952 0.048
#> SRR1033036 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033037 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033038 2 0.3584 0.891 0.068 0.932
#> SRR1033039 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033040 1 0.0938 0.972 0.988 0.012
#> SRR1033041 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033042 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033043 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033044 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033045 1 0.3431 0.923 0.936 0.064
#> SRR1033046 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033047 1 0.4690 0.884 0.900 0.100
#> SRR1033048 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033049 1 0.0376 0.979 0.996 0.004
#> SRR1033051 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033052 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033053 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033054 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033050 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033055 2 0.9661 0.432 0.392 0.608
#> SRR1033056 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033057 1 0.0938 0.972 0.988 0.012
#> SRR1033058 2 0.8763 0.636 0.296 0.704
#> SRR1033059 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033060 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033061 2 0.0376 0.931 0.004 0.996
#> SRR1033062 1 0.7602 0.710 0.780 0.220
#> SRR1033063 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033064 1 0.8081 0.659 0.752 0.248
#> SRR1033065 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033066 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033067 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033068 1 0.3733 0.915 0.928 0.072
#> SRR1033069 2 0.7376 0.764 0.208 0.792
#> SRR1033070 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033071 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033072 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033073 2 0.0672 0.929 0.008 0.992
#> SRR1033074 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033075 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033076 1 0.0376 0.979 0.996 0.004
#> SRR1033077 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033078 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033079 1 0.4161 0.901 0.916 0.084
#> SRR1033080 2 0.9896 0.294 0.440 0.560
#> SRR1033081 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033082 1 0.4939 0.874 0.892 0.108
#> SRR1033083 1 0.0376 0.979 0.996 0.004
#> SRR1033084 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033085 1 0.7745 0.693 0.772 0.228
#> SRR1033086 2 0.0376 0.931 0.004 0.996
#> SRR1033087 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033088 2 0.6531 0.808 0.168 0.832
#> SRR1033089 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033090 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033091 1 0.3114 0.931 0.944 0.056
#> SRR1033092 1 0.1184 0.969 0.984 0.016
#> SRR1033093 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033094 2 0.7745 0.741 0.228 0.772
#> SRR1033095 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033096 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033097 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033098 1 0.7139 0.750 0.804 0.196
#> SRR1033099 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033100 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033101 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033102 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033103 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033104 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033105 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033106 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033107 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033108 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033109 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033110 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033111 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033112 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033113 1 0.8144 0.654 0.748 0.252
#> SRR1033114 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033115 1 0.4939 0.873 0.892 0.108
#> SRR1033116 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033117 1 0.4298 0.896 0.912 0.088
#> SRR1033118 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033119 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033121 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033120 2 0.9522 0.476 0.372 0.628
#> SRR1033122 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033123 1 0.0672 0.975 0.992 0.008
#> SRR1033124 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033125 1 0.3431 0.923 0.936 0.064
#> SRR1033126 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033127 2 0.7602 0.750 0.220 0.780
#> SRR1033129 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033128 1 0.3733 0.916 0.928 0.072
#> SRR1033130 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033131 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033132 1 0.3733 0.914 0.928 0.072
#> SRR1033133 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033134 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033135 1 0.1184 0.969 0.984 0.016
#> SRR1033136 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033137 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033139 2 0.6048 0.828 0.148 0.852
#> SRR1033138 2 0.8386 0.684 0.268 0.732
#> SRR1033140 1 0.8861 0.545 0.696 0.304
#> SRR1033141 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033142 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033143 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033144 1 0.0672 0.976 0.992 0.008
#> SRR1033145 1 0.7528 0.718 0.784 0.216
#> SRR1033146 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033147 2 0.6623 0.805 0.172 0.828
#> SRR1033148 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033149 1 0.7883 0.682 0.764 0.236
#> SRR1033150 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033151 1 0.6531 0.794 0.832 0.168
#> SRR1033152 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033153 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033154 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033156 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033157 1 0.0938 0.972 0.988 0.012
#> SRR1033158 2 0.1184 0.924 0.016 0.984
#> SRR1033159 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033160 1 0.6712 0.780 0.824 0.176
#> SRR1033161 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033163 1 0.3274 0.928 0.940 0.060
#> SRR1033162 1 0.1184 0.969 0.984 0.016
#> SRR1033164 1 0.9850 0.191 0.572 0.428
#> SRR1033165 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033166 1 0.6048 0.822 0.852 0.148
#> SRR1033167 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033168 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033169 2 0.0376 0.931 0.004 0.996
#> SRR1033171 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033170 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033172 1 0.1184 0.969 0.984 0.016
#> SRR1033173 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033174 1 0.1633 0.962 0.976 0.024
#> SRR1033175 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033176 1 0.0672 0.976 0.992 0.008
#> SRR1033177 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033178 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033179 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033180 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033181 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033183 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033182 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033184 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033185 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033187 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033186 1 0.9775 0.250 0.588 0.412
#> SRR1033188 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033189 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033190 1 0.0376 0.979 0.996 0.004
#> SRR1033191 1 0.0376 0.979 0.996 0.004
#> SRR1033192 2 0.4939 0.862 0.108 0.892
#> SRR1033193 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033195 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033194 2 0.7883 0.723 0.236 0.764
#> SRR1033197 1 0.0672 0.975 0.992 0.008
#> SRR1033196 1 0.0376 0.979 0.996 0.004
#> SRR1033199 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033198 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033200 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033201 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033202 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033203 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033204 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033205 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033206 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033207 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033208 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033209 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033210 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033211 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033212 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033213 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033214 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033216 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033215 2 0.9129 0.576 0.328 0.672
#> SRR1033217 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033218 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033219 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033221 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033220 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033222 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033223 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033225 2 0.5737 0.838 0.136 0.864
#> SRR1033224 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033226 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033227 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033229 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033228 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033231 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033230 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033232 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033233 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033235 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033234 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033236 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033237 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033240 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033239 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033242 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033241 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033244 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033243 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033245 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033246 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033248 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033247 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033249 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033250 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033251 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033252 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033253 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033254 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033256 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033255 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033258 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033257 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033259 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033260 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033261 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033262 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033263 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033264 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033265 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033266 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033267 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033268 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033269 1 0.4022 0.905 0.920 0.080
#> SRR1033270 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033271 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033272 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033273 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033274 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033275 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033276 2 0.0000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1033277 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033278 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033279 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033280 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033281 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033282 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033283 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033284 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033285 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033286 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033287 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033288 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033289 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033290 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033291 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033292 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
#> SRR1033293 1 0.0000 0.982 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1032910 1 0.0592 0.91041 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032911 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032912 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032913 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032914 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032915 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032916 1 0.0000 0.91082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1032917 1 0.2569 0.89925 0.936 0.032 0.032
#> SRR1032918 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032919 1 0.0661 0.91108 0.988 0.008 0.004
#> SRR1032920 2 0.0661 0.79093 0.008 0.988 0.004
#> SRR1032921 1 0.1267 0.90812 0.972 0.004 0.024
#> SRR1032922 1 0.1781 0.90913 0.960 0.020 0.020
#> SRR1032923 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032925 2 0.5216 0.74967 0.000 0.740 0.260
#> SRR1032924 1 0.1031 0.90649 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032926 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032927 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032929 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032928 1 0.0424 0.91044 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032930 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032931 2 0.4452 0.79372 0.000 0.808 0.192
#> SRR1032932 3 0.5926 0.02153 0.000 0.356 0.644
#> SRR1032933 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032934 1 0.0747 0.90901 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032935 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032936 1 0.1411 0.90603 0.964 0.000 0.036
#> SRR1032937 2 0.4235 0.79963 0.000 0.824 0.176
#> SRR1032938 1 0.0592 0.90988 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032939 1 0.3193 0.87738 0.896 0.004 0.100
#> SRR1032940 1 0.1031 0.91113 0.976 0.000 0.024
#> SRR1032941 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032942 2 0.0592 0.79778 0.000 0.988 0.012
#> SRR1032943 2 0.3879 0.80359 0.000 0.848 0.152
#> SRR1032944 1 0.1182 0.91049 0.976 0.012 0.012
#> SRR1032945 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032946 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032947 1 0.1832 0.90179 0.956 0.036 0.008
#> SRR1032948 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032949 2 0.5138 0.75578 0.000 0.748 0.252
#> SRR1032950 1 0.2261 0.89785 0.932 0.000 0.068
#> SRR1032951 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032952 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032953 1 0.0424 0.91031 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032954 1 0.1289 0.90374 0.968 0.032 0.000
#> SRR1032955 2 0.4291 0.79829 0.000 0.820 0.180
#> SRR1032957 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032956 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1032958 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032959 1 0.1163 0.90536 0.972 0.028 0.000
#> SRR1032960 1 0.0424 0.91124 0.992 0.000 0.008
#> SRR1032961 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032962 3 0.4953 0.53066 0.176 0.016 0.808
#> SRR1032963 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032964 1 0.0747 0.90899 0.984 0.016 0.000
#> SRR1032965 1 0.0592 0.90987 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032966 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032967 2 0.1267 0.77899 0.024 0.972 0.004
#> SRR1032968 1 0.0592 0.91001 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032969 1 0.1170 0.91005 0.976 0.016 0.008
#> SRR1032970 1 0.0892 0.90786 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032971 1 0.0424 0.91044 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032972 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032973 1 0.0829 0.91075 0.984 0.012 0.004
#> SRR1032974 1 0.1031 0.90649 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032975 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032976 1 0.0475 0.91122 0.992 0.004 0.004
#> SRR1032977 3 0.1170 0.61678 0.016 0.008 0.976
#> SRR1032978 1 0.0829 0.91024 0.984 0.012 0.004
#> SRR1032979 2 0.4291 0.79819 0.000 0.820 0.180
#> SRR1032980 1 0.1031 0.90670 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032981 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032982 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032983 1 0.0848 0.91129 0.984 0.008 0.008
#> SRR1032984 1 0.0424 0.91044 0.992 0.008 0.000
#> SRR1032985 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032986 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032987 3 0.2356 0.60023 0.000 0.072 0.928
#> SRR1032988 1 0.0592 0.90987 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032990 1 0.2860 0.88507 0.912 0.004 0.084
#> SRR1032989 1 0.1031 0.90649 0.976 0.024 0.000
#> SRR1032991 2 0.4235 0.79958 0.000 0.824 0.176
#> SRR1032992 1 0.1163 0.90837 0.972 0.000 0.028
#> SRR1032993 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032994 1 0.2050 0.90612 0.952 0.020 0.028
#> SRR1032995 1 0.0592 0.91036 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032996 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1032997 1 0.0892 0.90811 0.980 0.020 0.000
#> SRR1032998 1 0.0592 0.91001 0.988 0.012 0.000
#> SRR1032999 2 0.0592 0.79731 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033000 3 0.0747 0.61701 0.016 0.000 0.984
#> SRR1033001 1 0.0424 0.91044 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033002 1 0.0237 0.91108 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033003 2 0.2448 0.80574 0.000 0.924 0.076
#> SRR1033004 3 0.2066 0.60605 0.000 0.060 0.940
#> SRR1033005 1 0.1877 0.90362 0.956 0.032 0.012
#> SRR1033006 1 0.4446 0.83862 0.856 0.112 0.032
#> SRR1033007 1 0.1031 0.90649 0.976 0.024 0.000
#> SRR1033008 1 0.0747 0.91012 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033009 1 0.1289 0.90374 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033010 1 0.6475 0.61784 0.692 0.280 0.028
#> SRR1033011 3 0.2625 0.59605 0.000 0.084 0.916
#> SRR1033012 1 0.1636 0.91004 0.964 0.020 0.016
#> SRR1033013 1 0.2313 0.90218 0.944 0.024 0.032
#> SRR1033014 1 0.3983 0.87476 0.884 0.068 0.048
#> SRR1033015 1 0.6228 0.46223 0.624 0.004 0.372
#> SRR1033016 3 0.2625 0.59277 0.000 0.084 0.916
#> SRR1033017 3 0.2796 0.58790 0.000 0.092 0.908
#> SRR1033018 1 0.4558 0.85664 0.856 0.044 0.100
#> SRR1033019 1 0.9125 0.30388 0.540 0.192 0.268
#> SRR1033020 1 0.1399 0.90950 0.968 0.004 0.028
#> SRR1033021 1 0.4280 0.82732 0.856 0.124 0.020
#> SRR1033023 1 0.1647 0.90818 0.960 0.004 0.036
#> SRR1033022 1 0.1711 0.90926 0.960 0.008 0.032
#> SRR1033024 1 0.3337 0.88410 0.908 0.060 0.032
#> SRR1033025 1 0.1525 0.90403 0.964 0.032 0.004
#> SRR1033026 1 0.3134 0.89259 0.916 0.032 0.052
#> SRR1033027 3 0.1860 0.60644 0.000 0.052 0.948
#> SRR1033028 1 0.2229 0.90204 0.944 0.012 0.044
#> SRR1033029 2 0.0592 0.79731 0.000 0.988 0.012
#> SRR1033030 1 0.9329 0.15479 0.488 0.332 0.180
#> SRR1033031 1 0.8179 0.34144 0.564 0.352 0.084
#> SRR1033032 2 0.6056 0.41276 0.224 0.744 0.032
#> SRR1033033 3 0.2537 0.59630 0.000 0.080 0.920
#> SRR1033035 3 0.2261 0.60054 0.000 0.068 0.932
#> SRR1033034 1 0.1753 0.90029 0.952 0.048 0.000
#> SRR1033036 1 0.5588 0.67170 0.720 0.004 0.276
#> SRR1033037 1 0.0592 0.90993 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033038 2 0.5406 0.47708 0.200 0.780 0.020
#> SRR1033039 1 0.5928 0.61676 0.696 0.008 0.296
#> SRR1033040 1 0.3276 0.88705 0.908 0.024 0.068
#> SRR1033041 1 0.1399 0.90907 0.968 0.004 0.028
#> SRR1033042 1 0.2116 0.90651 0.948 0.012 0.040
#> SRR1033043 1 0.0237 0.91108 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033044 1 0.0747 0.90900 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033045 1 0.4744 0.83098 0.836 0.028 0.136
#> SRR1033046 1 0.2564 0.90051 0.936 0.028 0.036
#> SRR1033047 1 0.5450 0.72474 0.760 0.012 0.228
#> SRR1033048 1 0.4121 0.81434 0.832 0.000 0.168
#> SRR1033049 1 0.2096 0.90206 0.944 0.004 0.052
#> SRR1033051 1 0.0237 0.91056 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033052 1 0.1129 0.91002 0.976 0.004 0.020
#> SRR1033053 3 0.3038 0.57267 0.000 0.104 0.896
#> SRR1033054 1 0.6267 0.23707 0.548 0.000 0.452
#> SRR1033050 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033055 3 0.7159 0.14622 0.448 0.024 0.528
#> SRR1033056 1 0.1170 0.91076 0.976 0.008 0.016
#> SRR1033057 1 0.3412 0.85608 0.876 0.000 0.124
#> SRR1033058 3 0.7610 0.32705 0.388 0.048 0.564
#> SRR1033059 3 0.1753 0.60723 0.000 0.048 0.952
#> SRR1033060 1 0.5956 0.57784 0.672 0.004 0.324
#> SRR1033061 3 0.0892 0.61588 0.000 0.020 0.980
#> SRR1033062 1 0.4689 0.85377 0.852 0.052 0.096
#> SRR1033063 3 0.2711 0.58878 0.000 0.088 0.912
#> SRR1033064 1 0.6701 0.34147 0.576 0.012 0.412
#> SRR1033065 1 0.4931 0.76216 0.784 0.004 0.212
#> SRR1033066 1 0.5325 0.71838 0.748 0.004 0.248
#> SRR1033067 1 0.0892 0.90776 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033068 1 0.7376 0.61494 0.672 0.076 0.252
#> SRR1033069 3 0.6420 0.46270 0.288 0.024 0.688
#> SRR1033070 1 0.6102 0.57315 0.672 0.008 0.320
#> SRR1033071 3 0.1643 0.60857 0.000 0.044 0.956
#> SRR1033072 3 0.3425 0.58776 0.004 0.112 0.884
#> SRR1033073 3 0.5582 0.55784 0.100 0.088 0.812
#> SRR1033074 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033075 1 0.0892 0.91100 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033076 1 0.6442 0.29340 0.564 0.004 0.432
#> SRR1033077 1 0.3272 0.87016 0.892 0.004 0.104
#> SRR1033078 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033079 1 0.4897 0.79484 0.812 0.016 0.172
#> SRR1033080 1 0.6597 0.64014 0.696 0.036 0.268
#> SRR1033081 1 0.1289 0.90827 0.968 0.000 0.032
#> SRR1033082 1 0.3253 0.89290 0.912 0.036 0.052
#> SRR1033083 1 0.6398 0.45078 0.620 0.008 0.372
#> SRR1033084 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033085 1 0.5357 0.82199 0.820 0.116 0.064
#> SRR1033086 3 0.1529 0.61217 0.000 0.040 0.960
#> SRR1033087 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033088 1 0.9687 0.04775 0.456 0.296 0.248
#> SRR1033089 1 0.2443 0.90082 0.940 0.028 0.032
#> SRR1033090 1 0.0592 0.91001 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033091 1 0.4045 0.86336 0.872 0.024 0.104
#> SRR1033092 1 0.2810 0.90198 0.928 0.036 0.036
#> SRR1033093 3 0.3551 0.55153 0.000 0.132 0.868
#> SRR1033094 1 0.7801 0.20279 0.520 0.052 0.428
#> SRR1033095 2 0.1289 0.80221 0.000 0.968 0.032
#> SRR1033096 1 0.2804 0.89375 0.924 0.016 0.060
#> SRR1033097 3 0.1753 0.60990 0.000 0.048 0.952
#> SRR1033098 1 0.5728 0.76146 0.772 0.032 0.196
#> SRR1033099 3 0.2878 0.57890 0.000 0.096 0.904
#> SRR1033100 3 0.3267 0.56229 0.000 0.116 0.884
#> SRR1033101 1 0.2434 0.90203 0.940 0.024 0.036
#> SRR1033102 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033103 1 0.2400 0.89672 0.932 0.004 0.064
#> SRR1033104 1 0.2564 0.89994 0.936 0.028 0.036
#> SRR1033105 1 0.1315 0.91017 0.972 0.008 0.020
#> SRR1033106 1 0.2682 0.89221 0.920 0.004 0.076
#> SRR1033107 1 0.2806 0.89613 0.928 0.040 0.032
#> SRR1033108 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033109 1 0.0983 0.91005 0.980 0.004 0.016
#> SRR1033110 1 0.3832 0.86768 0.880 0.020 0.100
#> SRR1033111 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033112 1 0.1525 0.90822 0.964 0.004 0.032
#> SRR1033113 3 0.6209 0.40838 0.368 0.004 0.628
#> SRR1033114 1 0.0829 0.91194 0.984 0.012 0.004
#> SRR1033115 1 0.4883 0.76480 0.788 0.004 0.208
#> SRR1033116 1 0.2443 0.90082 0.940 0.028 0.032
#> SRR1033117 1 0.6369 0.56867 0.668 0.016 0.316
#> SRR1033118 1 0.1411 0.90603 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033119 1 0.2496 0.89408 0.928 0.004 0.068
#> SRR1033121 1 0.4861 0.78021 0.800 0.008 0.192
#> SRR1033120 3 0.1129 0.61580 0.020 0.004 0.976
#> SRR1033122 1 0.1529 0.90535 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033123 1 0.3375 0.87416 0.892 0.008 0.100
#> SRR1033124 1 0.0983 0.90959 0.980 0.004 0.016
#> SRR1033125 3 0.4399 0.52764 0.188 0.000 0.812
#> SRR1033126 1 0.3425 0.86898 0.884 0.004 0.112
#> SRR1033127 2 0.3765 0.68226 0.084 0.888 0.028
#> SRR1033129 1 0.2806 0.89608 0.928 0.040 0.032
#> SRR1033128 3 0.6302 0.01618 0.480 0.000 0.520
#> SRR1033130 1 0.0475 0.91173 0.992 0.004 0.004
#> SRR1033131 1 0.3500 0.86637 0.880 0.004 0.116
#> SRR1033132 3 0.5178 0.49056 0.256 0.000 0.744
#> SRR1033133 3 0.6398 0.25742 0.416 0.004 0.580
#> SRR1033134 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033135 1 0.6498 0.39914 0.596 0.008 0.396
#> SRR1033136 1 0.3272 0.87512 0.892 0.004 0.104
#> SRR1033137 3 0.5810 0.44288 0.336 0.000 0.664
#> SRR1033139 3 0.1832 0.61166 0.036 0.008 0.956
#> SRR1033138 3 0.7169 0.29838 0.404 0.028 0.568
#> SRR1033140 1 0.6357 0.60935 0.684 0.020 0.296
#> SRR1033141 1 0.0424 0.91044 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033142 3 0.5254 0.36266 0.000 0.264 0.736
#> SRR1033143 1 0.0475 0.91038 0.992 0.004 0.004
#> SRR1033144 1 0.5431 0.66356 0.716 0.000 0.284
#> SRR1033145 1 0.6510 0.47081 0.624 0.012 0.364
#> SRR1033146 3 0.1765 0.61607 0.004 0.040 0.956
#> SRR1033147 3 0.5268 0.51235 0.212 0.012 0.776
#> SRR1033148 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033149 3 0.6950 0.29334 0.408 0.020 0.572
#> SRR1033150 1 0.3851 0.85167 0.860 0.004 0.136
#> SRR1033151 3 0.5327 0.48141 0.272 0.000 0.728
#> SRR1033152 1 0.3030 0.88416 0.904 0.004 0.092
#> SRR1033153 1 0.6111 0.42040 0.604 0.000 0.396
#> SRR1033154 1 0.6008 0.56393 0.664 0.004 0.332
#> SRR1033156 1 0.2902 0.89070 0.920 0.016 0.064
#> SRR1033157 1 0.3752 0.83989 0.856 0.000 0.144
#> SRR1033158 3 0.0237 0.61576 0.004 0.000 0.996
#> SRR1033159 1 0.6045 0.45600 0.620 0.000 0.380
#> SRR1033160 3 0.6451 0.37009 0.384 0.008 0.608
#> SRR1033161 1 0.0983 0.90969 0.980 0.004 0.016
#> SRR1033163 3 0.6026 0.38568 0.376 0.000 0.624
#> SRR1033162 1 0.5138 0.70710 0.748 0.000 0.252
#> SRR1033164 1 0.8493 0.49446 0.604 0.248 0.148
#> SRR1033165 1 0.1711 0.90451 0.960 0.032 0.008
#> SRR1033166 3 0.6513 0.31174 0.400 0.008 0.592
#> SRR1033167 3 0.2356 0.60151 0.000 0.072 0.928
#> SRR1033168 1 0.3031 0.88655 0.912 0.012 0.076
#> SRR1033169 3 0.0592 0.61602 0.000 0.012 0.988
#> SRR1033171 3 0.1860 0.60914 0.000 0.052 0.948
#> SRR1033170 1 0.1129 0.90906 0.976 0.004 0.020
#> SRR1033172 3 0.6416 0.37256 0.376 0.008 0.616
#> SRR1033173 3 0.6026 0.04704 0.000 0.376 0.624
#> SRR1033174 1 0.3845 0.85860 0.872 0.012 0.116
#> SRR1033175 1 0.0983 0.90938 0.980 0.004 0.016
#> SRR1033176 1 0.5754 0.63983 0.700 0.004 0.296
#> SRR1033177 3 0.6215 -0.12596 0.000 0.428 0.572
#> SRR1033178 2 0.1031 0.80114 0.000 0.976 0.024
#> SRR1033179 2 0.0848 0.78913 0.008 0.984 0.008
#> SRR1033180 1 0.1860 0.90162 0.948 0.000 0.052
#> SRR1033181 1 0.4733 0.78752 0.800 0.004 0.196
#> SRR1033183 1 0.2866 0.88941 0.916 0.008 0.076
#> SRR1033182 1 0.6516 0.14154 0.516 0.004 0.480
#> SRR1033184 1 0.4931 0.73532 0.768 0.000 0.232
#> SRR1033185 1 0.2774 0.87874 0.920 0.072 0.008
#> SRR1033187 1 0.1765 0.90663 0.956 0.004 0.040
#> SRR1033186 1 0.6247 0.47481 0.620 0.376 0.004
#> SRR1033188 1 0.1585 0.90603 0.964 0.028 0.008
#> SRR1033189 2 0.2187 0.75973 0.024 0.948 0.028
#> SRR1033190 1 0.2448 0.88905 0.924 0.000 0.076
#> SRR1033191 1 0.3784 0.85419 0.864 0.004 0.132
#> SRR1033192 3 0.2773 0.60442 0.048 0.024 0.928
#> SRR1033193 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033195 2 0.1411 0.80273 0.000 0.964 0.036
#> SRR1033194 3 0.0475 0.61537 0.004 0.004 0.992
#> SRR1033197 1 0.1878 0.90467 0.952 0.004 0.044
#> SRR1033196 1 0.5968 0.49378 0.636 0.000 0.364
#> SRR1033199 2 0.4178 0.80071 0.000 0.828 0.172
#> SRR1033198 1 0.1289 0.90560 0.968 0.032 0.000
#> SRR1033200 1 0.0592 0.91036 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033201 1 0.2689 0.89926 0.932 0.032 0.036
#> SRR1033202 1 0.2806 0.89617 0.928 0.040 0.032
#> SRR1033203 1 0.3120 0.88235 0.908 0.012 0.080
#> SRR1033204 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033205 1 0.2031 0.90451 0.952 0.016 0.032
#> SRR1033206 1 0.0592 0.91041 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033207 1 0.1163 0.90649 0.972 0.028 0.000
#> SRR1033208 1 0.3253 0.89089 0.912 0.036 0.052
#> SRR1033209 1 0.0747 0.91079 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033210 1 0.3091 0.88634 0.912 0.016 0.072
#> SRR1033211 1 0.1129 0.91056 0.976 0.004 0.020
#> SRR1033212 1 0.5541 0.69260 0.740 0.008 0.252
#> SRR1033213 3 0.1860 0.61225 0.000 0.052 0.948
#> SRR1033214 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033216 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033215 2 0.6906 0.22575 0.324 0.644 0.032
#> SRR1033217 1 0.4062 0.81882 0.836 0.000 0.164
#> SRR1033218 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033219 1 0.0848 0.90974 0.984 0.008 0.008
#> SRR1033221 2 0.4702 0.78209 0.000 0.788 0.212
#> SRR1033220 2 0.5058 0.76603 0.000 0.756 0.244
#> SRR1033222 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033223 1 0.3192 0.86988 0.888 0.000 0.112
#> SRR1033225 3 0.0829 0.61623 0.004 0.012 0.984
#> SRR1033224 1 0.0592 0.90975 0.988 0.012 0.000
#> SRR1033226 1 0.4047 0.83853 0.848 0.004 0.148
#> SRR1033227 1 0.1647 0.90557 0.960 0.004 0.036
#> SRR1033229 3 0.4291 0.49852 0.000 0.180 0.820
#> SRR1033228 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033231 2 0.1753 0.80473 0.000 0.952 0.048
#> SRR1033230 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033232 1 0.0592 0.91113 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033233 1 0.1129 0.90892 0.976 0.004 0.020
#> SRR1033235 3 0.1643 0.61091 0.000 0.044 0.956
#> SRR1033234 1 0.5016 0.72842 0.760 0.000 0.240
#> SRR1033236 1 0.3340 0.86321 0.880 0.000 0.120
#> SRR1033237 1 0.0000 0.91082 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033238 1 0.2301 0.89658 0.936 0.004 0.060
#> SRR1033240 1 0.4068 0.85137 0.864 0.016 0.120
#> SRR1033239 1 0.2682 0.89221 0.920 0.004 0.076
#> SRR1033242 1 0.1411 0.90603 0.964 0.000 0.036
#> SRR1033241 1 0.6180 0.36051 0.584 0.000 0.416
#> SRR1033244 2 0.5835 0.66713 0.000 0.660 0.340
#> SRR1033243 2 0.4842 0.77462 0.000 0.776 0.224
#> SRR1033245 1 0.4555 0.77778 0.800 0.000 0.200
#> SRR1033246 1 0.1525 0.90650 0.964 0.004 0.032
#> SRR1033248 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033247 3 0.5058 0.35999 0.000 0.244 0.756
#> SRR1033249 2 0.6154 0.52442 0.000 0.592 0.408
#> SRR1033250 3 0.6305 -0.36400 0.000 0.484 0.516
#> SRR1033251 1 0.2400 0.89637 0.932 0.004 0.064
#> SRR1033252 3 0.5058 0.39538 0.000 0.244 0.756
#> SRR1033253 1 0.0747 0.90981 0.984 0.016 0.000
#> SRR1033254 1 0.0983 0.90967 0.980 0.004 0.016
#> SRR1033256 2 0.6299 0.37848 0.000 0.524 0.476
#> SRR1033255 1 0.5988 0.48824 0.632 0.000 0.368
#> SRR1033258 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033257 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033259 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033260 3 0.6154 -0.00467 0.000 0.408 0.592
#> SRR1033261 1 0.2689 0.89838 0.932 0.032 0.036
#> SRR1033262 1 0.3181 0.88903 0.912 0.024 0.064
#> SRR1033263 3 0.5968 0.10144 0.000 0.364 0.636
#> SRR1033264 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033265 2 0.6026 0.60760 0.000 0.624 0.376
#> SRR1033266 1 0.0747 0.91088 0.984 0.000 0.016
#> SRR1033267 1 0.1529 0.90589 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033268 1 0.1989 0.90231 0.948 0.004 0.048
#> SRR1033269 1 0.4164 0.84112 0.848 0.008 0.144
#> SRR1033270 1 0.2434 0.90196 0.940 0.024 0.036
#> SRR1033271 1 0.0661 0.91003 0.988 0.008 0.004
#> SRR1033272 3 0.4452 0.48269 0.000 0.192 0.808
#> SRR1033273 1 0.1525 0.90571 0.964 0.004 0.032
#> SRR1033274 2 0.1267 0.79930 0.004 0.972 0.024
#> SRR1033275 1 0.0237 0.91055 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033276 2 0.5621 0.71402 0.000 0.692 0.308
#> SRR1033277 1 0.0424 0.91028 0.992 0.008 0.000
#> SRR1033278 1 0.0592 0.91197 0.988 0.000 0.012
#> SRR1033279 3 0.6204 0.23788 0.424 0.000 0.576
#> SRR1033280 1 0.5882 0.52620 0.652 0.000 0.348
#> SRR1033281 1 0.1647 0.90458 0.960 0.004 0.036
#> SRR1033282 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033283 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033284 1 0.0661 0.90970 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033285 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033286 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033287 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033288 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033289 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033290 1 0.0829 0.90973 0.984 0.004 0.012
#> SRR1033291 1 0.0475 0.91038 0.992 0.004 0.004
#> SRR1033292 1 0.0475 0.91038 0.992 0.004 0.004
#> SRR1033293 1 0.0475 0.91038 0.992 0.004 0.004
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1032910 1 0.0657 0.8282 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1032911 1 0.1118 0.8234 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1032912 1 0.2011 0.8048 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1032913 1 0.1118 0.8249 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1032914 1 0.3074 0.7392 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1032915 1 0.2281 0.7974 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1032916 1 0.1022 0.8262 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032917 3 0.5110 0.7906 0.352 0.000 0.636 0.012
#> SRR1032918 1 0.1022 0.8238 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032919 1 0.4454 0.3844 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1032920 4 0.4431 0.7355 0.000 0.000 0.304 0.696
#> SRR1032921 1 0.1004 0.8230 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1032922 1 0.5090 0.3145 0.660 0.000 0.324 0.016
#> SRR1032923 1 0.1637 0.8165 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1032925 4 0.3708 0.7771 0.000 0.148 0.020 0.832
#> SRR1032924 1 0.1211 0.8235 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1032926 1 0.3801 0.6159 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1032927 1 0.1211 0.8225 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1032929 1 0.1211 0.8225 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1032928 1 0.3528 0.6881 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1032930 1 0.2814 0.7584 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1032931 4 0.3099 0.7913 0.000 0.104 0.020 0.876
#> SRR1032932 2 0.5579 0.2420 0.004 0.640 0.028 0.328
#> SRR1032933 1 0.1022 0.8241 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032934 1 0.3266 0.7287 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1032935 1 0.1022 0.8241 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032936 1 0.5105 -0.2301 0.564 0.000 0.432 0.004
#> SRR1032937 4 0.2546 0.7937 0.000 0.092 0.008 0.900
#> SRR1032938 1 0.0817 0.8290 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1032939 1 0.4622 0.7030 0.800 0.060 0.136 0.004
#> SRR1032940 1 0.3494 0.7081 0.824 0.004 0.172 0.000
#> SRR1032941 1 0.2647 0.7749 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1032942 4 0.4250 0.7571 0.000 0.000 0.276 0.724
#> SRR1032943 4 0.2255 0.7973 0.000 0.068 0.012 0.920
#> SRR1032944 1 0.1489 0.8256 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1032945 1 0.2216 0.7979 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1032946 1 0.1022 0.8241 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032947 1 0.5488 -0.3412 0.532 0.000 0.452 0.016
#> SRR1032948 1 0.1474 0.8192 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1032949 4 0.4095 0.7653 0.000 0.172 0.024 0.804
#> SRR1032950 1 0.4704 0.6556 0.764 0.028 0.204 0.004
#> SRR1032951 1 0.1302 0.8214 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1032952 1 0.3024 0.7410 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1032953 1 0.1118 0.8244 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1032954 1 0.1792 0.8212 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1032955 4 0.2271 0.7973 0.000 0.076 0.008 0.916
#> SRR1032957 1 0.2921 0.7527 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1032956 1 0.1022 0.8285 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1032958 1 0.1474 0.8197 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1032959 1 0.1637 0.8229 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1032960 1 0.3400 0.6935 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1032961 1 0.0817 0.8294 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1032962 2 0.7490 0.1401 0.172 0.496 0.328 0.004
#> SRR1032963 1 0.3172 0.7328 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1032964 1 0.3688 0.6446 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1032965 1 0.1474 0.8192 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1032966 1 0.1867 0.8113 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1032967 4 0.4744 0.7463 0.012 0.000 0.284 0.704
#> SRR1032968 1 0.3024 0.7423 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1032969 1 0.5093 0.2359 0.652 0.004 0.336 0.008
#> SRR1032970 1 0.3024 0.7593 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1032971 1 0.4632 0.4080 0.688 0.000 0.308 0.004
#> SRR1032972 1 0.3172 0.7294 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1032973 1 0.4509 0.4496 0.708 0.000 0.288 0.004
#> SRR1032974 1 0.1211 0.8275 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1032975 1 0.1474 0.8195 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1032976 1 0.2589 0.7925 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1032977 2 0.2287 0.7090 0.012 0.924 0.060 0.004
#> SRR1032978 1 0.0921 0.8245 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1032979 4 0.2861 0.7962 0.000 0.096 0.016 0.888
#> SRR1032980 1 0.4353 0.5893 0.756 0.000 0.232 0.012
#> SRR1032981 1 0.3355 0.7272 0.836 0.000 0.160 0.004
#> SRR1032982 1 0.2081 0.8024 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1032983 1 0.4632 0.3635 0.688 0.000 0.308 0.004
#> SRR1032984 1 0.2831 0.7728 0.876 0.000 0.120 0.004
#> SRR1032985 1 0.1474 0.8196 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1032986 1 0.1302 0.8238 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1032987 2 0.1610 0.6988 0.000 0.952 0.016 0.032
#> SRR1032988 1 0.1211 0.8225 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1032990 3 0.5486 0.7420 0.376 0.016 0.604 0.004
#> SRR1032989 1 0.1302 0.8223 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1032991 4 0.2401 0.7972 0.000 0.092 0.004 0.904
#> SRR1032992 1 0.5080 -0.1278 0.576 0.000 0.420 0.004
#> SRR1032993 1 0.3074 0.7363 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1032994 1 0.5256 -0.0299 0.596 0.000 0.392 0.012
#> SRR1032995 1 0.0817 0.8246 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1032996 1 0.0817 0.8259 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1032997 1 0.3172 0.7250 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1032998 1 0.4220 0.5520 0.748 0.000 0.248 0.004
#> SRR1032999 4 0.3837 0.7706 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1033000 2 0.2287 0.7093 0.012 0.924 0.060 0.004
#> SRR1033001 1 0.3123 0.7394 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1033002 1 0.2408 0.8076 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1033003 4 0.2675 0.7965 0.000 0.048 0.044 0.908
#> SRR1033004 2 0.1042 0.7050 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1033005 1 0.5372 -0.3123 0.544 0.000 0.444 0.012
#> SRR1033006 3 0.5393 0.7736 0.268 0.000 0.688 0.044
#> SRR1033007 1 0.5070 -0.1258 0.580 0.000 0.416 0.004
#> SRR1033008 1 0.1743 0.8240 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1033009 1 0.1767 0.8274 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1033010 3 0.4656 0.6639 0.160 0.000 0.784 0.056
#> SRR1033011 2 0.0524 0.7098 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1033012 1 0.2402 0.8124 0.912 0.000 0.076 0.012
#> SRR1033013 3 0.5040 0.7808 0.364 0.000 0.628 0.008
#> SRR1033014 3 0.5256 0.7981 0.272 0.000 0.692 0.036
#> SRR1033015 3 0.6725 0.7345 0.348 0.104 0.548 0.000
#> SRR1033016 2 0.0524 0.7100 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1033017 2 0.0524 0.7071 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1033018 3 0.4882 0.8029 0.272 0.000 0.708 0.020
#> SRR1033019 3 0.5015 0.7105 0.176 0.024 0.772 0.028
#> SRR1033020 1 0.3024 0.7650 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1033021 3 0.6037 0.7761 0.304 0.000 0.628 0.068
#> SRR1033023 1 0.1978 0.8174 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR1033022 1 0.2125 0.8188 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1033024 3 0.5022 0.7908 0.264 0.000 0.708 0.028
#> SRR1033025 1 0.3925 0.7111 0.808 0.000 0.176 0.016
#> SRR1033026 3 0.4957 0.8083 0.300 0.000 0.684 0.016
#> SRR1033027 2 0.0707 0.7106 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033028 3 0.5060 0.7193 0.412 0.000 0.584 0.004
#> SRR1033029 4 0.4072 0.7635 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1033030 3 0.4677 0.7052 0.176 0.000 0.776 0.048
#> SRR1033031 1 0.9026 -0.2655 0.360 0.068 0.220 0.352
#> SRR1033032 3 0.5339 0.3886 0.100 0.000 0.744 0.156
#> SRR1033033 2 0.0336 0.7062 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1033035 2 0.0188 0.7086 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033034 1 0.5351 0.6032 0.744 0.000 0.152 0.104
#> SRR1033036 1 0.4954 0.6659 0.784 0.120 0.092 0.004
#> SRR1033037 1 0.0895 0.8290 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033038 4 0.7284 0.5139 0.124 0.012 0.324 0.540
#> SRR1033039 3 0.5355 0.7768 0.360 0.020 0.620 0.000
#> SRR1033040 3 0.5286 0.7988 0.328 0.004 0.652 0.016
#> SRR1033041 1 0.2053 0.8125 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1033042 1 0.2515 0.8092 0.912 0.004 0.072 0.012
#> SRR1033043 1 0.0921 0.8314 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033044 1 0.1970 0.8268 0.932 0.000 0.060 0.008
#> SRR1033045 3 0.4854 0.8106 0.316 0.004 0.676 0.004
#> SRR1033046 3 0.5220 0.7890 0.352 0.000 0.632 0.016
#> SRR1033047 3 0.5453 0.8116 0.320 0.032 0.648 0.000
#> SRR1033048 3 0.6367 0.7220 0.392 0.068 0.540 0.000
#> SRR1033049 1 0.1822 0.8240 0.944 0.008 0.044 0.004
#> SRR1033051 1 0.1004 0.8288 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1033052 1 0.1978 0.8139 0.928 0.000 0.068 0.004
#> SRR1033053 2 0.0707 0.7021 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1033054 3 0.7682 0.6645 0.328 0.200 0.468 0.004
#> SRR1033050 1 0.1109 0.8315 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1033055 3 0.5977 0.7547 0.216 0.104 0.680 0.000
#> SRR1033056 1 0.5070 -0.1508 0.580 0.000 0.416 0.004
#> SRR1033057 1 0.2759 0.8030 0.904 0.044 0.052 0.000
#> SRR1033058 3 0.5692 0.6812 0.164 0.088 0.736 0.012
#> SRR1033059 2 0.0000 0.7082 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1033060 1 0.6640 0.3072 0.604 0.288 0.104 0.004
#> SRR1033061 2 0.0707 0.7105 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1033062 3 0.4869 0.7967 0.260 0.004 0.720 0.016
#> SRR1033063 2 0.0921 0.7014 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1033064 3 0.5926 0.8051 0.308 0.060 0.632 0.000
#> SRR1033065 1 0.4083 0.7403 0.840 0.072 0.084 0.004
#> SRR1033066 1 0.5069 0.6545 0.776 0.124 0.096 0.004
#> SRR1033067 1 0.1211 0.8307 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033068 3 0.5337 0.7774 0.244 0.020 0.716 0.020
#> SRR1033069 2 0.7589 0.1820 0.200 0.524 0.268 0.008
#> SRR1033070 3 0.6636 0.7305 0.364 0.080 0.552 0.004
#> SRR1033071 2 0.0188 0.7081 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1033072 3 0.6741 -0.3914 0.008 0.448 0.476 0.068
#> SRR1033073 3 0.6573 0.4406 0.100 0.204 0.672 0.024
#> SRR1033074 1 0.0707 0.8281 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033075 1 0.2216 0.8082 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1033076 3 0.8035 0.5324 0.352 0.280 0.364 0.004
#> SRR1033077 1 0.2674 0.8033 0.908 0.020 0.068 0.004
#> SRR1033078 1 0.0921 0.8267 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033079 3 0.4632 0.8112 0.308 0.000 0.688 0.004
#> SRR1033080 3 0.5543 0.7636 0.216 0.044 0.724 0.016
#> SRR1033081 1 0.3249 0.7587 0.852 0.008 0.140 0.000
#> SRR1033082 1 0.4936 0.6997 0.784 0.028 0.160 0.028
#> SRR1033083 3 0.5639 0.8074 0.324 0.040 0.636 0.000
#> SRR1033084 1 0.1398 0.8196 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1033085 3 0.5038 0.8055 0.296 0.000 0.684 0.020
#> SRR1033086 2 0.0188 0.7097 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033087 1 0.1118 0.8268 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033088 3 0.4893 0.6964 0.172 0.004 0.772 0.052
#> SRR1033089 3 0.5352 0.7554 0.388 0.000 0.596 0.016
#> SRR1033090 1 0.4277 0.4505 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1033091 3 0.5110 0.7901 0.352 0.000 0.636 0.012
#> SRR1033092 1 0.5235 0.5786 0.728 0.024 0.232 0.016
#> SRR1033093 2 0.1792 0.6834 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1033094 3 0.7244 0.7719 0.280 0.104 0.588 0.028
#> SRR1033095 4 0.4053 0.7711 0.000 0.004 0.228 0.768
#> SRR1033096 3 0.4950 0.7689 0.376 0.000 0.620 0.004
#> SRR1033097 2 0.0188 0.7097 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1033098 3 0.5085 0.7971 0.256 0.020 0.716 0.008
#> SRR1033099 2 0.1109 0.7025 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1033100 2 0.1211 0.6941 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1033101 3 0.5007 0.7874 0.356 0.000 0.636 0.008
#> SRR1033102 1 0.0707 0.8308 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033103 1 0.2234 0.8074 0.924 0.008 0.064 0.004
#> SRR1033104 3 0.4978 0.8029 0.324 0.000 0.664 0.012
#> SRR1033105 1 0.1489 0.8200 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1033106 1 0.3568 0.7603 0.856 0.024 0.116 0.004
#> SRR1033107 3 0.5291 0.7903 0.324 0.000 0.652 0.024
#> SRR1033108 1 0.0921 0.8264 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033109 1 0.1576 0.8186 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033110 3 0.5250 0.7840 0.344 0.012 0.640 0.004
#> SRR1033111 1 0.1305 0.8215 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033112 1 0.1389 0.8214 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1033113 3 0.7626 0.5181 0.212 0.288 0.496 0.004
#> SRR1033114 1 0.3224 0.7865 0.864 0.000 0.120 0.016
#> SRR1033115 1 0.4153 0.7360 0.836 0.084 0.076 0.004
#> SRR1033116 3 0.5306 0.7860 0.348 0.000 0.632 0.020
#> SRR1033117 3 0.5101 0.7691 0.212 0.036 0.744 0.008
#> SRR1033118 3 0.5273 0.6203 0.456 0.008 0.536 0.000
#> SRR1033119 1 0.1585 0.8193 0.952 0.004 0.040 0.004
#> SRR1033121 3 0.5678 0.8118 0.316 0.044 0.640 0.000
#> SRR1033120 2 0.2342 0.7046 0.008 0.912 0.080 0.000
#> SRR1033122 3 0.5244 0.6663 0.436 0.008 0.556 0.000
#> SRR1033123 1 0.2727 0.8014 0.900 0.012 0.084 0.004
#> SRR1033124 1 0.1398 0.8221 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1033125 2 0.6214 0.5101 0.152 0.684 0.160 0.004
#> SRR1033126 1 0.2891 0.7969 0.896 0.020 0.080 0.004
#> SRR1033127 3 0.4323 0.2012 0.028 0.000 0.788 0.184
#> SRR1033129 3 0.5367 0.7972 0.304 0.000 0.664 0.032
#> SRR1033128 1 0.7004 -0.0401 0.468 0.428 0.100 0.004
#> SRR1033130 1 0.1716 0.8243 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1033131 1 0.2782 0.7982 0.904 0.024 0.068 0.004
#> SRR1033132 2 0.7367 0.2018 0.160 0.516 0.320 0.004
#> SRR1033133 2 0.7742 -0.1497 0.324 0.460 0.212 0.004
#> SRR1033134 1 0.0469 0.8285 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033135 3 0.6222 0.7990 0.304 0.080 0.616 0.000
#> SRR1033136 1 0.2795 0.7993 0.896 0.012 0.088 0.004
#> SRR1033137 2 0.7906 -0.2994 0.232 0.392 0.372 0.004
#> SRR1033139 2 0.5558 0.5578 0.080 0.712 0.208 0.000
#> SRR1033138 2 0.7698 0.3109 0.252 0.536 0.196 0.016
#> SRR1033140 3 0.5262 0.8158 0.304 0.020 0.672 0.004
#> SRR1033141 1 0.1474 0.8293 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1033142 2 0.4465 0.6076 0.000 0.800 0.056 0.144
#> SRR1033143 1 0.0592 0.8285 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033144 1 0.5400 0.6172 0.748 0.156 0.092 0.004
#> SRR1033145 3 0.6084 0.7865 0.252 0.092 0.656 0.000
#> SRR1033146 2 0.5329 0.6278 0.072 0.792 0.076 0.060
#> SRR1033147 2 0.6639 0.4305 0.196 0.640 0.160 0.004
#> SRR1033148 1 0.0817 0.8265 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033149 3 0.6116 0.6618 0.164 0.128 0.700 0.008
#> SRR1033150 1 0.4494 0.7143 0.808 0.056 0.132 0.004
#> SRR1033151 2 0.7431 0.1922 0.196 0.532 0.268 0.004
#> SRR1033152 1 0.3877 0.7482 0.840 0.032 0.124 0.004
#> SRR1033153 1 0.7986 -0.4579 0.400 0.268 0.328 0.004
#> SRR1033154 1 0.5936 0.4809 0.684 0.232 0.080 0.004
#> SRR1033156 3 0.4605 0.7991 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1033157 1 0.2652 0.8002 0.912 0.028 0.056 0.004
#> SRR1033158 2 0.2011 0.7067 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1033159 3 0.6627 0.7730 0.348 0.096 0.556 0.000
#> SRR1033160 3 0.7387 0.6175 0.208 0.244 0.544 0.004
#> SRR1033161 1 0.1109 0.8234 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1033163 3 0.7935 0.3311 0.240 0.372 0.384 0.004
#> SRR1033162 1 0.5388 0.5994 0.744 0.172 0.080 0.004
#> SRR1033164 3 0.4814 0.6962 0.172 0.004 0.776 0.048
#> SRR1033165 3 0.5392 0.5801 0.460 0.000 0.528 0.012
#> SRR1033166 2 0.7588 -0.1403 0.312 0.468 0.220 0.000
#> SRR1033167 2 0.1677 0.7068 0.000 0.948 0.040 0.012
#> SRR1033168 3 0.4804 0.7562 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1033169 2 0.1940 0.7079 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1033171 2 0.4355 0.6105 0.012 0.772 0.212 0.004
#> SRR1033170 1 0.1576 0.8170 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1033172 3 0.6926 0.7291 0.228 0.164 0.604 0.004
#> SRR1033173 2 0.5845 0.4048 0.000 0.672 0.076 0.252
#> SRR1033174 3 0.5018 0.8084 0.332 0.012 0.656 0.000
#> SRR1033175 1 0.1305 0.8221 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1033176 1 0.6965 0.2211 0.584 0.272 0.140 0.004
#> SRR1033177 2 0.6340 0.2791 0.000 0.620 0.096 0.284
#> SRR1033178 4 0.4008 0.7673 0.000 0.000 0.244 0.756
#> SRR1033179 4 0.4978 0.6744 0.004 0.000 0.384 0.612
#> SRR1033180 1 0.4365 0.6619 0.784 0.028 0.188 0.000
#> SRR1033181 1 0.5649 0.5702 0.728 0.100 0.168 0.004
#> SRR1033183 3 0.5127 0.7870 0.356 0.012 0.632 0.000
#> SRR1033182 1 0.6370 0.4178 0.644 0.252 0.100 0.004
#> SRR1033184 3 0.6374 0.7398 0.372 0.072 0.556 0.000
#> SRR1033185 1 0.4833 0.6172 0.740 0.000 0.228 0.032
#> SRR1033187 1 0.2593 0.7995 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1033186 1 0.7088 -0.0178 0.480 0.000 0.128 0.392
#> SRR1033188 1 0.5296 -0.4906 0.496 0.000 0.496 0.008
#> SRR1033189 3 0.4049 0.0401 0.008 0.000 0.780 0.212
#> SRR1033190 1 0.2099 0.8189 0.936 0.012 0.044 0.008
#> SRR1033191 1 0.4078 0.7360 0.828 0.036 0.132 0.004
#> SRR1033192 2 0.5192 0.5960 0.076 0.760 0.160 0.004
#> SRR1033193 1 0.1661 0.8218 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1033195 4 0.4746 0.7004 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1033194 2 0.1867 0.7074 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1033197 1 0.1930 0.8191 0.936 0.004 0.056 0.004
#> SRR1033196 1 0.7826 -0.5313 0.400 0.212 0.384 0.004
#> SRR1033199 4 0.3464 0.7966 0.000 0.108 0.032 0.860
#> SRR1033198 1 0.1022 0.8289 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033200 1 0.0817 0.8284 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033201 3 0.4980 0.8097 0.304 0.000 0.680 0.016
#> SRR1033202 3 0.5289 0.7834 0.344 0.000 0.636 0.020
#> SRR1033203 3 0.4730 0.7767 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1033204 1 0.0817 0.8278 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033205 3 0.4888 0.7175 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1033206 1 0.1256 0.8250 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1033207 1 0.1902 0.8242 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1033208 3 0.4769 0.8120 0.308 0.000 0.684 0.008
#> SRR1033209 1 0.4643 0.2162 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1033210 3 0.4661 0.8121 0.284 0.004 0.708 0.004
#> SRR1033211 1 0.2466 0.8046 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR1033212 3 0.5149 0.8023 0.336 0.016 0.648 0.000
#> SRR1033213 2 0.3182 0.6982 0.000 0.876 0.096 0.028
#> SRR1033214 1 0.0817 0.8246 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033216 1 0.0895 0.8249 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033215 3 0.4562 0.6289 0.152 0.000 0.792 0.056
#> SRR1033217 3 0.5686 0.7510 0.376 0.032 0.592 0.000
#> SRR1033218 1 0.1118 0.8240 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033219 1 0.0469 0.8285 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033221 4 0.3694 0.7898 0.000 0.124 0.032 0.844
#> SRR1033220 4 0.4656 0.7587 0.000 0.160 0.056 0.784
#> SRR1033222 1 0.0817 0.8259 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1033223 1 0.6351 -0.3539 0.516 0.052 0.428 0.004
#> SRR1033225 2 0.2814 0.6736 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1033224 1 0.1118 0.8273 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033226 1 0.6755 -0.5339 0.456 0.092 0.452 0.000
#> SRR1033227 3 0.4790 0.7623 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1033229 2 0.4100 0.6637 0.000 0.832 0.076 0.092
#> SRR1033228 1 0.0469 0.8264 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033231 4 0.4431 0.7494 0.000 0.000 0.304 0.696
#> SRR1033230 1 0.0895 0.8249 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033232 1 0.3356 0.7207 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1033233 1 0.1109 0.8238 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1033235 2 0.3376 0.6994 0.008 0.868 0.108 0.016
#> SRR1033234 3 0.5793 0.7446 0.384 0.036 0.580 0.000
#> SRR1033236 3 0.5614 0.7453 0.384 0.020 0.592 0.004
#> SRR1033237 1 0.1389 0.8229 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1033238 3 0.5055 0.7734 0.368 0.008 0.624 0.000
#> SRR1033240 3 0.4897 0.8084 0.324 0.004 0.668 0.004
#> SRR1033239 1 0.3306 0.7441 0.840 0.000 0.156 0.004
#> SRR1033242 3 0.4955 0.6551 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1033241 3 0.6548 0.7903 0.312 0.088 0.596 0.004
#> SRR1033244 4 0.4701 0.7531 0.000 0.164 0.056 0.780
#> SRR1033243 4 0.3931 0.7892 0.000 0.128 0.040 0.832
#> SRR1033245 3 0.6842 0.5980 0.436 0.100 0.464 0.000
#> SRR1033246 1 0.1004 0.8243 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1033248 1 0.2814 0.7736 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1033247 2 0.5808 -0.0686 0.000 0.544 0.032 0.424
#> SRR1033249 4 0.6589 0.4873 0.000 0.352 0.092 0.556
#> SRR1033250 4 0.6097 0.4485 0.000 0.364 0.056 0.580
#> SRR1033251 1 0.2238 0.8053 0.920 0.004 0.072 0.004
#> SRR1033252 2 0.4462 0.6014 0.000 0.804 0.064 0.132
#> SRR1033253 1 0.0592 0.8266 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033254 1 0.0592 0.8292 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1033256 2 0.6758 -0.1008 0.000 0.504 0.096 0.400
#> SRR1033255 3 0.6875 0.7194 0.368 0.112 0.520 0.000
#> SRR1033258 1 0.0779 0.8264 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1033257 1 0.0707 0.8265 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1033259 1 0.0469 0.8267 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1033260 2 0.6703 0.3671 0.000 0.612 0.156 0.232
#> SRR1033261 3 0.4957 0.8043 0.320 0.000 0.668 0.012
#> SRR1033262 3 0.5026 0.8079 0.312 0.000 0.672 0.016
#> SRR1033263 2 0.7128 0.3120 0.000 0.556 0.260 0.184
#> SRR1033264 1 0.1211 0.8254 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033265 4 0.5565 0.6571 0.000 0.260 0.056 0.684
#> SRR1033266 1 0.2944 0.7766 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR1033267 3 0.5016 0.7375 0.396 0.004 0.600 0.000
#> SRR1033268 1 0.1847 0.8161 0.940 0.004 0.052 0.004
#> SRR1033269 3 0.6127 0.7687 0.344 0.052 0.600 0.004
#> SRR1033270 3 0.4955 0.7956 0.344 0.000 0.648 0.008
#> SRR1033271 1 0.0921 0.8252 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033272 2 0.4549 0.6393 0.000 0.804 0.100 0.096
#> SRR1033273 1 0.1398 0.8196 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1033274 4 0.4713 0.7084 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1033275 1 0.1211 0.8225 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033276 4 0.4957 0.7409 0.000 0.204 0.048 0.748
#> SRR1033277 1 0.0895 0.8288 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1033278 1 0.2973 0.7540 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1033279 3 0.7937 0.4098 0.244 0.352 0.400 0.004
#> SRR1033280 3 0.6652 0.7672 0.316 0.108 0.576 0.000
#> SRR1033281 1 0.1489 0.8188 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1033282 1 0.0921 0.8250 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033283 1 0.0921 0.8250 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033284 1 0.0921 0.8250 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1033285 1 0.1302 0.8304 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1033286 1 0.1302 0.8304 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1033287 1 0.1211 0.8304 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033288 1 0.1302 0.8304 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1033289 1 0.1211 0.8300 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033290 1 0.1211 0.8300 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1033291 1 0.1118 0.8305 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1033292 1 0.1022 0.8307 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1033293 1 0.1118 0.8305 0.964 0.000 0.036 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1032910 4 0.4065 0.43501 0.264 0.000 0.016 0.720 0.000
#> SRR1032911 4 0.0807 0.60835 0.012 0.000 0.012 0.976 0.000
#> SRR1032912 4 0.1608 0.59672 0.000 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1032913 4 0.0579 0.60942 0.008 0.000 0.008 0.984 0.000
#> SRR1032914 4 0.2583 0.55279 0.004 0.000 0.132 0.864 0.000
#> SRR1032915 4 0.1893 0.60773 0.024 0.000 0.048 0.928 0.000
#> SRR1032916 4 0.0955 0.60710 0.028 0.000 0.004 0.968 0.000
#> SRR1032917 3 0.4525 0.66236 0.016 0.000 0.624 0.360 0.000
#> SRR1032918 4 0.0912 0.60644 0.016 0.000 0.012 0.972 0.000
#> SRR1032919 4 0.3430 0.41871 0.004 0.000 0.220 0.776 0.000
#> SRR1032920 5 0.6315 0.65107 0.160 0.000 0.372 0.000 0.468
#> SRR1032921 4 0.3876 0.35054 0.316 0.000 0.000 0.684 0.000
#> SRR1032922 1 0.6444 0.55646 0.492 0.000 0.168 0.336 0.004
#> SRR1032923 4 0.1764 0.59812 0.008 0.000 0.064 0.928 0.000
#> SRR1032925 5 0.2526 0.73258 0.012 0.080 0.012 0.000 0.896
#> SRR1032924 4 0.0912 0.60761 0.016 0.000 0.012 0.972 0.000
#> SRR1032926 4 0.2513 0.58116 0.008 0.000 0.116 0.876 0.000
#> SRR1032927 4 0.0771 0.60883 0.020 0.000 0.004 0.976 0.000
#> SRR1032929 4 0.0898 0.60904 0.008 0.000 0.020 0.972 0.000
#> SRR1032928 4 0.2969 0.57295 0.020 0.000 0.128 0.852 0.000
#> SRR1032930 4 0.2338 0.57736 0.004 0.000 0.112 0.884 0.000
#> SRR1032931 5 0.2165 0.74663 0.024 0.036 0.016 0.000 0.924
#> SRR1032932 2 0.5294 0.67452 0.012 0.752 0.044 0.080 0.112
#> SRR1032933 4 0.0566 0.60965 0.004 0.000 0.012 0.984 0.000
#> SRR1032934 4 0.3691 0.51999 0.040 0.000 0.156 0.804 0.000
#> SRR1032935 4 0.0693 0.60923 0.012 0.000 0.008 0.980 0.000
#> SRR1032936 4 0.4473 0.11877 0.020 0.000 0.324 0.656 0.000
#> SRR1032937 5 0.1285 0.74623 0.004 0.036 0.004 0.000 0.956
#> SRR1032938 4 0.3266 0.51566 0.200 0.000 0.004 0.796 0.000
#> SRR1032939 1 0.5809 0.61212 0.560 0.012 0.072 0.356 0.000
#> SRR1032940 4 0.2929 0.51587 0.008 0.000 0.152 0.840 0.000
#> SRR1032941 4 0.2563 0.56264 0.008 0.000 0.120 0.872 0.000
#> SRR1032942 5 0.6339 0.67374 0.156 0.000 0.328 0.004 0.512
#> SRR1032943 5 0.2698 0.75372 0.036 0.028 0.036 0.000 0.900
#> SRR1032944 4 0.4645 -0.03187 0.424 0.000 0.008 0.564 0.004
#> SRR1032945 4 0.2068 0.58708 0.004 0.000 0.092 0.904 0.000
#> SRR1032946 4 0.1082 0.60892 0.028 0.000 0.008 0.964 0.000
#> SRR1032947 4 0.4671 0.05097 0.028 0.000 0.332 0.640 0.000
#> SRR1032948 4 0.0880 0.60830 0.000 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1032949 5 0.3224 0.73209 0.044 0.080 0.012 0.000 0.864
#> SRR1032950 1 0.6164 0.49918 0.472 0.004 0.116 0.408 0.000
#> SRR1032951 4 0.0693 0.60973 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1032952 4 0.2519 0.58326 0.016 0.000 0.100 0.884 0.000
#> SRR1032953 4 0.1124 0.60484 0.036 0.000 0.004 0.960 0.000
#> SRR1032954 4 0.3063 0.58896 0.096 0.000 0.036 0.864 0.004
#> SRR1032955 5 0.2124 0.75063 0.012 0.044 0.020 0.000 0.924
#> SRR1032957 4 0.2997 0.52903 0.012 0.000 0.148 0.840 0.000
#> SRR1032956 4 0.3003 0.52503 0.188 0.000 0.000 0.812 0.000
#> SRR1032958 4 0.1121 0.60526 0.000 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1032959 4 0.2139 0.60790 0.052 0.000 0.032 0.916 0.000
#> SRR1032960 4 0.3085 0.57719 0.032 0.000 0.116 0.852 0.000
#> SRR1032961 4 0.2929 0.52614 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000
#> SRR1032962 3 0.7967 0.14480 0.356 0.184 0.356 0.104 0.000
#> SRR1032963 4 0.2806 0.51783 0.004 0.000 0.152 0.844 0.000
#> SRR1032964 4 0.3246 0.47007 0.008 0.000 0.184 0.808 0.000
#> SRR1032965 4 0.1628 0.60046 0.008 0.000 0.056 0.936 0.000
#> SRR1032966 4 0.1697 0.59794 0.008 0.000 0.060 0.932 0.000
#> SRR1032967 5 0.6572 0.65430 0.168 0.000 0.344 0.008 0.480
#> SRR1032968 4 0.2929 0.51883 0.008 0.000 0.152 0.840 0.000
#> SRR1032969 4 0.3878 0.35651 0.016 0.000 0.236 0.748 0.000
#> SRR1032970 4 0.2771 0.56765 0.012 0.000 0.128 0.860 0.000
#> SRR1032971 4 0.3487 0.42735 0.008 0.000 0.212 0.780 0.000
#> SRR1032972 4 0.2753 0.54648 0.008 0.000 0.136 0.856 0.000
#> SRR1032973 4 0.3398 0.41482 0.004 0.000 0.216 0.780 0.000
#> SRR1032974 4 0.1522 0.60564 0.044 0.000 0.012 0.944 0.000
#> SRR1032975 4 0.1444 0.60572 0.012 0.000 0.040 0.948 0.000
#> SRR1032976 4 0.2450 0.60172 0.052 0.000 0.048 0.900 0.000
#> SRR1032977 2 0.3980 0.78900 0.104 0.828 0.032 0.028 0.008
#> SRR1032978 4 0.4196 0.24361 0.356 0.000 0.004 0.640 0.000
#> SRR1032979 5 0.2277 0.74608 0.016 0.052 0.016 0.000 0.916
#> SRR1032980 4 0.3530 0.42408 0.012 0.000 0.204 0.784 0.000
#> SRR1032981 4 0.3055 0.53538 0.016 0.000 0.144 0.840 0.000
#> SRR1032982 4 0.1892 0.59240 0.004 0.000 0.080 0.916 0.000
#> SRR1032983 4 0.3616 0.53744 0.032 0.000 0.164 0.804 0.000
#> SRR1032984 4 0.2389 0.56990 0.004 0.000 0.116 0.880 0.000
#> SRR1032985 4 0.1168 0.60661 0.008 0.000 0.032 0.960 0.000
#> SRR1032986 4 0.1485 0.60735 0.020 0.000 0.032 0.948 0.000
#> SRR1032987 2 0.2438 0.80887 0.044 0.912 0.004 0.008 0.032
#> SRR1032988 4 0.1106 0.60743 0.024 0.000 0.012 0.964 0.000
#> SRR1032990 3 0.6447 0.51918 0.216 0.004 0.528 0.252 0.000
#> SRR1032989 4 0.0992 0.60598 0.008 0.000 0.024 0.968 0.000
#> SRR1032991 5 0.2460 0.74652 0.024 0.072 0.004 0.000 0.900
#> SRR1032992 4 0.6476 -0.15646 0.244 0.000 0.260 0.496 0.000
#> SRR1032993 4 0.2583 0.55189 0.004 0.000 0.132 0.864 0.000
#> SRR1032994 4 0.6674 -0.18010 0.280 0.000 0.280 0.440 0.000
#> SRR1032995 4 0.2753 0.56574 0.136 0.000 0.008 0.856 0.000
#> SRR1032996 4 0.1952 0.59091 0.084 0.000 0.004 0.912 0.000
#> SRR1032997 4 0.2488 0.56269 0.004 0.000 0.124 0.872 0.000
#> SRR1032998 4 0.4787 0.41169 0.080 0.000 0.208 0.712 0.000
#> SRR1032999 5 0.6114 0.68351 0.152 0.000 0.312 0.000 0.536
#> SRR1033000 2 0.4189 0.78501 0.128 0.808 0.028 0.028 0.008
#> SRR1033001 4 0.1965 0.60737 0.024 0.000 0.052 0.924 0.000
#> SRR1033002 4 0.5215 0.06765 0.372 0.000 0.052 0.576 0.000
#> SRR1033003 5 0.3321 0.75187 0.040 0.012 0.092 0.000 0.856
#> SRR1033004 2 0.1690 0.81144 0.024 0.944 0.000 0.008 0.024
#> SRR1033005 4 0.4292 0.24352 0.024 0.000 0.272 0.704 0.000
#> SRR1033006 3 0.5068 0.65684 0.060 0.000 0.640 0.300 0.000
#> SRR1033007 4 0.5030 -0.02568 0.044 0.000 0.352 0.604 0.000
#> SRR1033008 4 0.4738 -0.23361 0.464 0.000 0.016 0.520 0.000
#> SRR1033009 4 0.4404 0.45901 0.252 0.000 0.036 0.712 0.000
#> SRR1033010 3 0.5306 0.60095 0.060 0.000 0.616 0.320 0.004
#> SRR1033011 2 0.0912 0.81274 0.016 0.972 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033012 1 0.5330 0.57024 0.548 0.000 0.056 0.396 0.000
#> SRR1033013 3 0.4620 0.64248 0.016 0.000 0.592 0.392 0.000
#> SRR1033014 3 0.5485 0.69550 0.104 0.000 0.648 0.244 0.004
#> SRR1033015 1 0.7192 -0.00223 0.412 0.032 0.368 0.188 0.000
#> SRR1033016 2 0.0807 0.81348 0.012 0.976 0.000 0.000 0.012
#> SRR1033017 2 0.0579 0.81247 0.008 0.984 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033018 3 0.6147 0.61573 0.180 0.004 0.612 0.196 0.008
#> SRR1033019 3 0.4893 0.65984 0.076 0.012 0.744 0.164 0.004
#> SRR1033020 1 0.5632 0.57778 0.528 0.000 0.080 0.392 0.000
#> SRR1033021 3 0.6465 0.59568 0.140 0.000 0.596 0.228 0.036
#> SRR1033023 1 0.4867 0.50528 0.544 0.000 0.024 0.432 0.000
#> SRR1033022 1 0.5118 0.54835 0.548 0.000 0.040 0.412 0.000
#> SRR1033024 3 0.4165 0.67347 0.008 0.000 0.672 0.320 0.000
#> SRR1033025 1 0.5703 0.51312 0.508 0.000 0.084 0.408 0.000
#> SRR1033026 3 0.4309 0.69759 0.016 0.000 0.676 0.308 0.000
#> SRR1033027 2 0.0693 0.81336 0.012 0.980 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033028 4 0.5078 -0.34672 0.028 0.004 0.424 0.544 0.000
#> SRR1033029 5 0.6175 0.67557 0.152 0.000 0.332 0.000 0.516
#> SRR1033030 3 0.4738 0.68181 0.064 0.004 0.736 0.192 0.004
#> SRR1033031 1 0.8933 0.19337 0.356 0.028 0.244 0.188 0.184
#> SRR1033032 3 0.5689 0.31049 0.240 0.000 0.660 0.056 0.044
#> SRR1033033 2 0.1018 0.81155 0.016 0.968 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033035 2 0.0992 0.81030 0.008 0.968 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033034 1 0.8096 0.31498 0.348 0.000 0.120 0.344 0.188
#> SRR1033036 1 0.6076 0.62947 0.596 0.036 0.072 0.296 0.000
#> SRR1033037 4 0.4540 0.25990 0.340 0.000 0.020 0.640 0.000
#> SRR1033038 5 0.8199 0.52877 0.168 0.036 0.328 0.060 0.408
#> SRR1033039 3 0.6544 0.58794 0.180 0.016 0.548 0.256 0.000
#> SRR1033040 3 0.6422 0.36012 0.308 0.000 0.492 0.200 0.000
#> SRR1033041 1 0.5213 0.58285 0.556 0.000 0.048 0.396 0.000
#> SRR1033042 1 0.5856 0.61447 0.580 0.008 0.068 0.336 0.008
#> SRR1033043 4 0.4380 0.33784 0.304 0.000 0.020 0.676 0.000
#> SRR1033044 4 0.5188 0.25805 0.328 0.000 0.060 0.612 0.000
#> SRR1033045 3 0.5122 0.70831 0.044 0.008 0.640 0.308 0.000
#> SRR1033046 3 0.5967 0.64998 0.136 0.000 0.556 0.308 0.000
#> SRR1033047 3 0.5453 0.69422 0.048 0.016 0.612 0.324 0.000
#> SRR1033048 3 0.6994 0.60033 0.140 0.040 0.472 0.348 0.000
#> SRR1033049 4 0.5206 -0.21741 0.436 0.000 0.028 0.528 0.008
#> SRR1033051 4 0.4025 0.37371 0.292 0.000 0.008 0.700 0.000
#> SRR1033052 1 0.5010 0.57486 0.572 0.000 0.036 0.392 0.000
#> SRR1033053 2 0.1195 0.80927 0.012 0.960 0.000 0.000 0.028
#> SRR1033054 3 0.7514 0.12767 0.368 0.060 0.396 0.176 0.000
#> SRR1033050 4 0.4348 0.31576 0.316 0.000 0.016 0.668 0.000
#> SRR1033055 3 0.6157 0.67678 0.124 0.028 0.640 0.204 0.004
#> SRR1033056 4 0.6385 0.00116 0.200 0.000 0.296 0.504 0.000
#> SRR1033057 1 0.5322 0.42968 0.504 0.028 0.012 0.456 0.000
#> SRR1033058 3 0.5469 0.65179 0.076 0.048 0.724 0.148 0.004
#> SRR1033059 2 0.1106 0.80996 0.012 0.964 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033060 1 0.6866 0.61175 0.536 0.056 0.116 0.292 0.000
#> SRR1033061 2 0.0992 0.81332 0.024 0.968 0.000 0.000 0.008
#> SRR1033062 3 0.4481 0.67928 0.016 0.004 0.668 0.312 0.000
#> SRR1033063 2 0.1168 0.80773 0.008 0.960 0.000 0.000 0.032
#> SRR1033064 3 0.6530 0.64854 0.136 0.024 0.576 0.260 0.004
#> SRR1033065 1 0.5937 0.62866 0.592 0.036 0.056 0.316 0.000
#> SRR1033066 1 0.6165 0.62735 0.604 0.036 0.088 0.272 0.000
#> SRR1033067 4 0.4527 0.42296 0.260 0.000 0.040 0.700 0.000
#> SRR1033068 3 0.6270 0.45165 0.292 0.004 0.556 0.144 0.004
#> SRR1033069 1 0.8348 -0.03667 0.332 0.208 0.328 0.128 0.004
#> SRR1033070 3 0.7112 0.13359 0.364 0.024 0.412 0.200 0.000
#> SRR1033071 2 0.1012 0.81104 0.012 0.968 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033072 3 0.6767 0.20006 0.240 0.168 0.560 0.004 0.028
#> SRR1033073 3 0.5566 0.54309 0.108 0.092 0.728 0.068 0.004
#> SRR1033074 4 0.3171 0.53550 0.176 0.000 0.008 0.816 0.000
#> SRR1033075 4 0.5263 -0.01354 0.368 0.000 0.056 0.576 0.000
#> SRR1033076 1 0.7604 -0.01894 0.376 0.060 0.368 0.196 0.000
#> SRR1033077 4 0.4562 -0.12598 0.444 0.004 0.004 0.548 0.000
#> SRR1033078 4 0.4350 0.04371 0.408 0.000 0.004 0.588 0.000
#> SRR1033079 3 0.4589 0.70298 0.020 0.008 0.680 0.292 0.000
#> SRR1033080 3 0.5181 0.68976 0.032 0.028 0.668 0.272 0.000
#> SRR1033081 4 0.5604 -0.44853 0.460 0.000 0.072 0.468 0.000
#> SRR1033082 1 0.6700 0.58668 0.548 0.008 0.156 0.272 0.016
#> SRR1033083 3 0.6457 0.66231 0.124 0.024 0.580 0.268 0.004
#> SRR1033084 1 0.4644 0.40174 0.528 0.000 0.012 0.460 0.000
#> SRR1033085 3 0.4691 0.67599 0.020 0.004 0.636 0.340 0.000
#> SRR1033086 2 0.0898 0.81070 0.008 0.972 0.000 0.000 0.020
#> SRR1033087 4 0.4555 -0.25859 0.472 0.000 0.008 0.520 0.000
#> SRR1033088 3 0.4408 0.68261 0.032 0.008 0.752 0.204 0.004
#> SRR1033089 3 0.4890 0.54438 0.024 0.000 0.524 0.452 0.000
#> SRR1033090 4 0.3690 0.44274 0.020 0.000 0.200 0.780 0.000
#> SRR1033091 3 0.5087 0.69598 0.036 0.008 0.624 0.332 0.000
#> SRR1033092 1 0.6919 0.54708 0.512 0.012 0.128 0.324 0.024
#> SRR1033093 2 0.1731 0.80395 0.012 0.940 0.008 0.000 0.040
#> SRR1033094 3 0.6943 0.49374 0.244 0.052 0.548 0.156 0.000
#> SRR1033095 5 0.6117 0.68433 0.156 0.000 0.304 0.000 0.540
#> SRR1033096 3 0.6193 0.58606 0.184 0.000 0.544 0.272 0.000
#> SRR1033097 2 0.0912 0.81155 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016
#> SRR1033098 3 0.5109 0.70467 0.032 0.024 0.692 0.248 0.004
#> SRR1033099 2 0.1310 0.81002 0.020 0.956 0.000 0.000 0.024
#> SRR1033100 2 0.1251 0.80659 0.008 0.956 0.000 0.000 0.036
#> SRR1033101 3 0.4798 0.62451 0.016 0.004 0.576 0.404 0.000
#> SRR1033102 4 0.4088 0.37525 0.304 0.000 0.008 0.688 0.000
#> SRR1033103 1 0.4970 0.54830 0.580 0.008 0.020 0.392 0.000
#> SRR1033104 3 0.4632 0.64319 0.012 0.004 0.608 0.376 0.000
#> SRR1033105 1 0.4878 0.45846 0.536 0.000 0.024 0.440 0.000
#> SRR1033106 1 0.5606 0.61627 0.564 0.004 0.072 0.360 0.000
#> SRR1033107 3 0.4446 0.61304 0.008 0.000 0.592 0.400 0.000
#> SRR1033108 4 0.2280 0.57028 0.120 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1033109 1 0.4555 0.39143 0.520 0.000 0.008 0.472 0.000
#> SRR1033110 3 0.6649 0.33272 0.308 0.004 0.472 0.216 0.000
#> SRR1033111 1 0.4747 0.33451 0.500 0.000 0.016 0.484 0.000
#> SRR1033112 1 0.4760 0.52612 0.564 0.000 0.020 0.416 0.000
#> SRR1033113 3 0.7389 0.44971 0.260 0.076 0.500 0.164 0.000
#> SRR1033114 1 0.5685 0.53414 0.520 0.000 0.084 0.396 0.000
#> SRR1033115 1 0.5647 0.57882 0.596 0.048 0.016 0.336 0.004
#> SRR1033116 3 0.4367 0.59688 0.004 0.000 0.580 0.416 0.000
#> SRR1033117 3 0.5241 0.68906 0.072 0.016 0.692 0.220 0.000
#> SRR1033118 4 0.5100 -0.43148 0.036 0.000 0.448 0.516 0.000
#> SRR1033119 1 0.4443 0.36008 0.524 0.004 0.000 0.472 0.000
#> SRR1033121 3 0.5960 0.69718 0.088 0.024 0.612 0.276 0.000
#> SRR1033120 2 0.4712 0.70768 0.216 0.720 0.060 0.004 0.000
#> SRR1033122 3 0.5296 0.52424 0.048 0.000 0.484 0.468 0.000
#> SRR1033123 1 0.5502 0.57734 0.572 0.008 0.044 0.372 0.004
#> SRR1033124 4 0.4450 -0.26905 0.488 0.000 0.004 0.508 0.000
#> SRR1033125 1 0.7799 0.18922 0.452 0.240 0.212 0.096 0.000
#> SRR1033126 1 0.5410 0.60846 0.596 0.016 0.040 0.348 0.000
#> SRR1033127 3 0.5258 0.22827 0.112 0.004 0.744 0.100 0.040
#> SRR1033129 3 0.4339 0.66518 0.012 0.000 0.652 0.336 0.000
#> SRR1033128 1 0.6738 0.59637 0.592 0.092 0.092 0.224 0.000
#> SRR1033130 4 0.4748 -0.37060 0.492 0.000 0.016 0.492 0.000
#> SRR1033131 1 0.5064 0.59309 0.596 0.008 0.028 0.368 0.000
#> SRR1033132 1 0.7878 -0.02009 0.408 0.172 0.316 0.104 0.000
#> SRR1033133 1 0.7723 0.35996 0.468 0.096 0.236 0.200 0.000
#> SRR1033134 4 0.3661 0.42922 0.276 0.000 0.000 0.724 0.000
#> SRR1033135 3 0.6794 0.59197 0.196 0.024 0.528 0.252 0.000
#> SRR1033136 1 0.5098 0.57688 0.584 0.008 0.028 0.380 0.000
#> SRR1033137 1 0.7925 -0.08680 0.372 0.108 0.352 0.168 0.000
#> SRR1033139 1 0.7783 0.00519 0.400 0.284 0.248 0.068 0.000
#> SRR1033138 1 0.7176 0.44906 0.580 0.116 0.168 0.132 0.004
#> SRR1033140 3 0.5970 0.69313 0.092 0.020 0.628 0.256 0.004
#> SRR1033141 4 0.4613 0.16557 0.360 0.000 0.020 0.620 0.000
#> SRR1033142 2 0.5407 0.74597 0.132 0.728 0.076 0.000 0.064
#> SRR1033143 4 0.4238 0.20616 0.368 0.000 0.004 0.628 0.000
#> SRR1033144 1 0.6168 0.63006 0.580 0.044 0.064 0.312 0.000
#> SRR1033145 3 0.6746 0.58116 0.200 0.044 0.576 0.180 0.000
#> SRR1033146 1 0.6195 0.07339 0.564 0.344 0.052 0.028 0.012
#> SRR1033147 1 0.7767 0.21395 0.472 0.204 0.216 0.108 0.000
#> SRR1033148 4 0.2471 0.55786 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1033149 3 0.6021 0.65010 0.084 0.068 0.668 0.180 0.000
#> SRR1033150 1 0.5596 0.62357 0.580 0.004 0.076 0.340 0.000
#> SRR1033151 1 0.7979 0.00470 0.400 0.152 0.316 0.132 0.000
#> SRR1033152 1 0.5452 0.59250 0.556 0.004 0.056 0.384 0.000
#> SRR1033153 1 0.7334 0.37248 0.476 0.048 0.260 0.216 0.000
#> SRR1033154 1 0.5918 0.62251 0.600 0.048 0.044 0.308 0.000
#> SRR1033156 3 0.5024 0.69885 0.040 0.004 0.628 0.328 0.000
#> SRR1033157 1 0.5249 0.37193 0.520 0.028 0.004 0.444 0.004
#> SRR1033158 2 0.4820 0.74368 0.180 0.728 0.088 0.004 0.000
#> SRR1033159 3 0.6672 0.65396 0.116 0.044 0.552 0.288 0.000
#> SRR1033160 3 0.6660 0.64592 0.156 0.060 0.604 0.180 0.000
#> SRR1033161 4 0.3966 0.30089 0.336 0.000 0.000 0.664 0.000
#> SRR1033163 3 0.7830 0.15919 0.356 0.116 0.388 0.140 0.000
#> SRR1033162 1 0.5798 0.62239 0.592 0.036 0.044 0.328 0.000
#> SRR1033164 3 0.5566 0.56387 0.200 0.000 0.656 0.140 0.004
#> SRR1033165 4 0.4989 -0.26683 0.032 0.000 0.416 0.552 0.000
#> SRR1033166 1 0.7994 0.41840 0.452 0.196 0.152 0.200 0.000
#> SRR1033167 2 0.3272 0.80044 0.120 0.848 0.016 0.000 0.016
#> SRR1033168 3 0.6518 0.48968 0.240 0.000 0.484 0.276 0.000
#> SRR1033169 2 0.4589 0.73476 0.212 0.724 0.064 0.000 0.000
#> SRR1033171 2 0.7028 0.25414 0.320 0.428 0.240 0.008 0.004
#> SRR1033170 1 0.4565 0.52336 0.580 0.000 0.012 0.408 0.000
#> SRR1033172 3 0.6793 0.65687 0.144 0.056 0.576 0.224 0.000
#> SRR1033173 2 0.6714 0.65931 0.164 0.616 0.112 0.000 0.108
#> SRR1033174 3 0.5697 0.70107 0.056 0.024 0.608 0.312 0.000
#> SRR1033175 4 0.4219 0.06234 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1033176 1 0.6538 0.62521 0.572 0.056 0.088 0.284 0.000
#> SRR1033177 2 0.6548 0.64523 0.148 0.632 0.088 0.000 0.132
#> SRR1033178 5 0.6145 0.68301 0.156 0.000 0.312 0.000 0.532
#> SRR1033179 5 0.6298 0.61787 0.152 0.000 0.412 0.000 0.436
#> SRR1033180 1 0.5895 0.53967 0.500 0.000 0.104 0.396 0.000
#> SRR1033181 1 0.6356 0.62276 0.580 0.032 0.108 0.280 0.000
#> SRR1033183 3 0.5049 0.57472 0.012 0.016 0.548 0.424 0.000
#> SRR1033182 1 0.6383 0.61528 0.580 0.064 0.064 0.292 0.000
#> SRR1033184 3 0.7225 0.18945 0.336 0.024 0.404 0.236 0.000
#> SRR1033185 1 0.6505 0.53412 0.524 0.000 0.160 0.304 0.012
#> SRR1033187 4 0.4969 -0.30103 0.468 0.004 0.020 0.508 0.000
#> SRR1033186 1 0.7846 0.43438 0.420 0.004 0.072 0.296 0.208
#> SRR1033188 4 0.4649 -0.19997 0.016 0.000 0.404 0.580 0.000
#> SRR1033189 3 0.5466 0.09339 0.132 0.008 0.732 0.084 0.044
#> SRR1033190 1 0.5409 0.37211 0.496 0.020 0.016 0.464 0.004
#> SRR1033191 1 0.5973 0.63058 0.588 0.020 0.084 0.308 0.000
#> SRR1033192 1 0.7726 -0.10924 0.372 0.364 0.204 0.056 0.004
#> SRR1033193 1 0.4448 0.33247 0.516 0.000 0.004 0.480 0.000
#> SRR1033195 3 0.6833 -0.70549 0.172 0.016 0.428 0.000 0.384
#> SRR1033194 2 0.4480 0.73187 0.196 0.748 0.048 0.008 0.000
#> SRR1033197 1 0.4861 0.48806 0.548 0.000 0.024 0.428 0.000
#> SRR1033196 1 0.7544 0.29421 0.420 0.048 0.276 0.256 0.000
#> SRR1033199 5 0.3795 0.74938 0.044 0.072 0.044 0.000 0.840
#> SRR1033198 4 0.4114 0.43039 0.272 0.000 0.016 0.712 0.000
#> SRR1033200 4 0.3596 0.51113 0.212 0.000 0.012 0.776 0.000
#> SRR1033201 3 0.4817 0.70766 0.044 0.000 0.656 0.300 0.000
#> SRR1033202 3 0.4390 0.57376 0.004 0.000 0.568 0.428 0.000
#> SRR1033203 3 0.6625 0.48245 0.244 0.008 0.512 0.236 0.000
#> SRR1033204 4 0.3999 0.29216 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR1033205 3 0.4443 0.51047 0.004 0.000 0.524 0.472 0.000
#> SRR1033206 4 0.4740 -0.21679 0.468 0.000 0.016 0.516 0.000
#> SRR1033207 4 0.4757 0.16521 0.380 0.000 0.024 0.596 0.000
#> SRR1033208 3 0.5042 0.70968 0.064 0.000 0.676 0.256 0.004
#> SRR1033209 4 0.5816 0.18823 0.132 0.000 0.280 0.588 0.000
#> SRR1033210 3 0.5184 0.71103 0.064 0.008 0.668 0.260 0.000
#> SRR1033211 1 0.5083 0.51994 0.532 0.000 0.036 0.432 0.000
#> SRR1033212 3 0.5684 0.68812 0.096 0.004 0.600 0.300 0.000
#> SRR1033213 2 0.4638 0.76883 0.148 0.760 0.080 0.000 0.012
#> SRR1033214 4 0.1608 0.59392 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1033216 4 0.4171 0.14709 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1033215 3 0.4846 0.63591 0.056 0.004 0.696 0.244 0.000
#> SRR1033217 3 0.6922 0.32552 0.304 0.008 0.428 0.260 0.000
#> SRR1033218 4 0.4256 0.00751 0.436 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1033219 4 0.3932 0.33022 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1033221 5 0.3997 0.73603 0.060 0.072 0.040 0.000 0.828
#> SRR1033220 5 0.4695 0.71519 0.084 0.096 0.040 0.000 0.780
#> SRR1033222 4 0.4074 0.23490 0.364 0.000 0.000 0.636 0.000
#> SRR1033223 1 0.6840 0.36407 0.412 0.004 0.252 0.332 0.000
#> SRR1033225 2 0.4651 0.73928 0.104 0.764 0.120 0.000 0.012
#> SRR1033224 4 0.2920 0.57391 0.132 0.000 0.016 0.852 0.000
#> SRR1033226 1 0.7315 0.04360 0.364 0.024 0.344 0.268 0.000
#> SRR1033227 3 0.5000 0.64465 0.036 0.000 0.576 0.388 0.000
#> SRR1033229 2 0.5662 0.73457 0.156 0.696 0.108 0.000 0.040
#> SRR1033228 4 0.3612 0.43944 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1033231 5 0.6518 0.66730 0.160 0.008 0.344 0.000 0.488
#> SRR1033230 4 0.4126 0.19770 0.380 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1033232 4 0.3464 0.59151 0.068 0.000 0.096 0.836 0.000
#> SRR1033233 4 0.4074 0.24940 0.364 0.000 0.000 0.636 0.000
#> SRR1033235 2 0.5233 0.75922 0.168 0.732 0.068 0.012 0.020
#> SRR1033234 3 0.6250 0.63783 0.136 0.012 0.564 0.288 0.000
#> SRR1033236 3 0.6124 0.63389 0.120 0.008 0.552 0.320 0.000
#> SRR1033237 4 0.1012 0.61082 0.020 0.000 0.012 0.968 0.000
#> SRR1033238 3 0.5434 0.68723 0.068 0.004 0.604 0.324 0.000
#> SRR1033240 3 0.5404 0.69339 0.044 0.016 0.612 0.328 0.000
#> SRR1033239 1 0.5778 0.62058 0.576 0.004 0.096 0.324 0.000
#> SRR1033242 4 0.4980 -0.47927 0.028 0.000 0.484 0.488 0.000
#> SRR1033241 3 0.6532 0.65102 0.136 0.032 0.572 0.260 0.000
#> SRR1033244 5 0.3653 0.72427 0.088 0.056 0.016 0.000 0.840
#> SRR1033243 5 0.3888 0.74823 0.060 0.056 0.048 0.000 0.836
#> SRR1033245 1 0.7190 0.08445 0.372 0.016 0.328 0.284 0.000
#> SRR1033246 4 0.4359 0.07194 0.412 0.004 0.000 0.584 0.000
#> SRR1033248 4 0.3479 0.59662 0.080 0.000 0.084 0.836 0.000
#> SRR1033247 5 0.6001 0.14521 0.092 0.380 0.008 0.000 0.520
#> SRR1033249 2 0.7766 0.11675 0.148 0.412 0.104 0.000 0.336
#> SRR1033250 5 0.6519 0.11204 0.112 0.364 0.024 0.000 0.500
#> SRR1033251 1 0.4779 0.56493 0.588 0.000 0.024 0.388 0.000
#> SRR1033252 2 0.5331 0.74188 0.144 0.728 0.080 0.000 0.048
#> SRR1033253 4 0.4135 0.29507 0.340 0.000 0.004 0.656 0.000
#> SRR1033254 4 0.4045 0.26077 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR1033256 2 0.7377 0.53306 0.160 0.544 0.128 0.000 0.168
#> SRR1033255 3 0.7182 0.59866 0.172 0.052 0.504 0.272 0.000
#> SRR1033258 4 0.4101 0.22600 0.372 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1033257 4 0.1732 0.59090 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1033259 4 0.3366 0.48160 0.232 0.000 0.000 0.768 0.000
#> SRR1033260 2 0.7059 0.58803 0.176 0.564 0.184 0.000 0.076
#> SRR1033261 3 0.4356 0.67656 0.012 0.000 0.648 0.340 0.000
#> SRR1033262 3 0.4184 0.70991 0.016 0.000 0.700 0.284 0.000
#> SRR1033263 2 0.7066 0.57396 0.200 0.548 0.192 0.000 0.060
#> SRR1033264 4 0.2352 0.59163 0.092 0.000 0.008 0.896 0.004
#> SRR1033265 5 0.5981 0.62639 0.112 0.164 0.052 0.000 0.672
#> SRR1033266 4 0.4921 0.16318 0.320 0.004 0.036 0.640 0.000
#> SRR1033267 3 0.6000 0.61618 0.132 0.000 0.540 0.328 0.000
#> SRR1033268 1 0.4794 0.43899 0.520 0.004 0.012 0.464 0.000
#> SRR1033269 1 0.6859 0.10237 0.452 0.016 0.348 0.184 0.000
#> SRR1033270 3 0.4856 0.63566 0.020 0.004 0.584 0.392 0.000
#> SRR1033271 4 0.4276 0.17206 0.380 0.000 0.004 0.616 0.000
#> SRR1033272 2 0.5684 0.73032 0.144 0.700 0.108 0.000 0.048
#> SRR1033273 1 0.4307 0.30698 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000
#> SRR1033274 3 0.6575 -0.70445 0.176 0.004 0.428 0.000 0.392
#> SRR1033275 4 0.1117 0.60759 0.020 0.000 0.016 0.964 0.000
#> SRR1033276 5 0.4558 0.70371 0.076 0.120 0.024 0.000 0.780
#> SRR1033277 4 0.2605 0.55797 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1033278 4 0.2470 0.58313 0.012 0.000 0.104 0.884 0.000
#> SRR1033279 3 0.7993 0.10991 0.356 0.120 0.360 0.164 0.000
#> SRR1033280 3 0.7217 0.37262 0.284 0.040 0.476 0.200 0.000
#> SRR1033281 1 0.4297 0.36134 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1033282 4 0.3550 0.49806 0.236 0.000 0.004 0.760 0.000
#> SRR1033283 4 0.3521 0.50221 0.232 0.000 0.004 0.764 0.000
#> SRR1033284 4 0.3550 0.49806 0.236 0.000 0.004 0.760 0.000
#> SRR1033285 4 0.4182 0.32678 0.352 0.000 0.004 0.644 0.000
#> SRR1033286 4 0.4182 0.32340 0.352 0.000 0.004 0.644 0.000
#> SRR1033287 4 0.4182 0.32678 0.352 0.000 0.004 0.644 0.000
#> SRR1033288 4 0.4283 0.32924 0.348 0.000 0.008 0.644 0.000
#> SRR1033289 4 0.4101 0.36741 0.332 0.000 0.004 0.664 0.000
#> SRR1033290 4 0.4218 0.36631 0.332 0.000 0.008 0.660 0.000
#> SRR1033291 4 0.4157 0.46682 0.264 0.000 0.020 0.716 0.000
#> SRR1033292 4 0.4181 0.46134 0.268 0.000 0.020 0.712 0.000
#> SRR1033293 4 0.4181 0.46134 0.268 0.000 0.020 0.712 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1032910 4 0.4574 0.51587 0.192 0.000 0.008 0.708 0.092 0.000
#> SRR1032911 4 0.1542 0.60894 0.008 0.004 0.052 0.936 0.000 0.000
#> SRR1032912 4 0.3047 0.53534 0.008 0.004 0.144 0.832 0.012 0.000
#> SRR1032913 4 0.2002 0.60474 0.012 0.004 0.076 0.908 0.000 0.000
#> SRR1032914 4 0.3918 0.37185 0.004 0.004 0.248 0.724 0.020 0.000
#> SRR1032915 4 0.2678 0.58020 0.020 0.000 0.116 0.860 0.004 0.000
#> SRR1032916 4 0.2825 0.61490 0.028 0.004 0.056 0.880 0.032 0.000
#> SRR1032917 3 0.4815 0.71052 0.016 0.000 0.664 0.256 0.064 0.000
#> SRR1032918 4 0.1812 0.60284 0.008 0.004 0.060 0.924 0.004 0.000
#> SRR1032919 4 0.4353 0.31467 0.004 0.004 0.288 0.672 0.032 0.000
#> SRR1032920 5 0.5470 0.65331 0.016 0.000 0.108 0.000 0.584 0.292
#> SRR1032921 4 0.4570 0.44006 0.264 0.000 0.008 0.672 0.056 0.000
#> SRR1032922 1 0.5900 0.62553 0.600 0.000 0.108 0.240 0.048 0.004
#> SRR1032923 4 0.3636 0.47639 0.016 0.000 0.196 0.772 0.016 0.000
#> SRR1032925 6 0.2359 0.78158 0.004 0.052 0.016 0.000 0.024 0.904
#> SRR1032924 4 0.1655 0.61404 0.008 0.000 0.052 0.932 0.008 0.000
#> SRR1032926 4 0.3172 0.56613 0.012 0.000 0.152 0.820 0.016 0.000
#> SRR1032927 4 0.1945 0.60981 0.016 0.004 0.056 0.920 0.004 0.000
#> SRR1032929 4 0.2205 0.58804 0.008 0.004 0.088 0.896 0.004 0.000
#> SRR1032928 4 0.3436 0.54423 0.020 0.000 0.172 0.796 0.012 0.000
#> SRR1032930 4 0.3502 0.47797 0.004 0.004 0.188 0.784 0.020 0.000
#> SRR1032931 6 0.2529 0.78468 0.020 0.012 0.024 0.000 0.044 0.900
#> SRR1032932 2 0.7218 0.45923 0.020 0.584 0.076 0.108 0.140 0.072
#> SRR1032933 4 0.1863 0.60705 0.008 0.004 0.056 0.924 0.008 0.000
#> SRR1032934 4 0.5240 0.19116 0.068 0.000 0.304 0.604 0.024 0.000
#> SRR1032935 4 0.1788 0.61121 0.012 0.004 0.052 0.928 0.004 0.000
#> SRR1032936 4 0.4714 -0.22677 0.012 0.000 0.456 0.508 0.024 0.000
#> SRR1032937 6 0.2949 0.75604 0.012 0.016 0.020 0.000 0.084 0.868
#> SRR1032938 4 0.3529 0.57067 0.152 0.000 0.008 0.800 0.040 0.000
#> SRR1032939 1 0.4422 0.65267 0.716 0.004 0.056 0.216 0.008 0.000
#> SRR1032940 4 0.4773 0.27988 0.012 0.008 0.272 0.664 0.044 0.000
#> SRR1032941 4 0.4022 0.38468 0.004 0.004 0.240 0.724 0.028 0.000
#> SRR1032942 5 0.5149 0.63254 0.016 0.000 0.064 0.000 0.584 0.336
#> SRR1032943 6 0.3230 0.75366 0.012 0.024 0.016 0.000 0.100 0.848
#> SRR1032944 4 0.5155 0.01466 0.444 0.000 0.004 0.488 0.060 0.004
#> SRR1032945 4 0.3909 0.42578 0.004 0.004 0.212 0.748 0.032 0.000
#> SRR1032946 4 0.2039 0.60764 0.016 0.000 0.072 0.908 0.004 0.000
#> SRR1032947 4 0.4913 -0.16159 0.016 0.000 0.440 0.512 0.032 0.000
#> SRR1032948 4 0.2548 0.57221 0.004 0.004 0.100 0.876 0.016 0.000
#> SRR1032949 6 0.2849 0.78927 0.016 0.044 0.036 0.000 0.020 0.884
#> SRR1032950 1 0.5824 0.47801 0.516 0.004 0.140 0.332 0.008 0.000
#> SRR1032951 4 0.2086 0.60309 0.012 0.004 0.064 0.912 0.008 0.000
#> SRR1032952 4 0.3919 0.47813 0.016 0.004 0.204 0.756 0.020 0.000
#> SRR1032953 4 0.1937 0.60887 0.012 0.004 0.048 0.924 0.012 0.000
#> SRR1032954 4 0.3064 0.61531 0.072 0.000 0.032 0.860 0.036 0.000
#> SRR1032955 6 0.2401 0.77473 0.004 0.020 0.016 0.000 0.060 0.900
#> SRR1032957 4 0.4491 0.29772 0.008 0.004 0.268 0.680 0.040 0.000
#> SRR1032956 4 0.3370 0.57603 0.140 0.000 0.004 0.812 0.044 0.000
#> SRR1032958 4 0.2244 0.58127 0.004 0.004 0.100 0.888 0.004 0.000
#> SRR1032959 4 0.2022 0.62071 0.024 0.000 0.052 0.916 0.008 0.000
#> SRR1032960 4 0.4193 0.43848 0.024 0.004 0.220 0.732 0.020 0.000
#> SRR1032961 4 0.3496 0.57166 0.140 0.000 0.004 0.804 0.052 0.000
#> SRR1032962 1 0.6579 0.40885 0.580 0.080 0.220 0.084 0.036 0.000
#> SRR1032963 4 0.4758 0.21591 0.016 0.004 0.300 0.644 0.036 0.000
#> SRR1032964 4 0.4552 0.26775 0.012 0.004 0.288 0.664 0.032 0.000
#> SRR1032965 4 0.3019 0.55511 0.008 0.004 0.124 0.844 0.020 0.000
#> SRR1032966 4 0.2876 0.52301 0.004 0.004 0.148 0.836 0.008 0.000
#> SRR1032967 5 0.5422 0.64739 0.012 0.000 0.088 0.004 0.576 0.320
#> SRR1032968 4 0.4404 0.33260 0.008 0.004 0.252 0.696 0.040 0.000
#> SRR1032969 4 0.4672 0.08107 0.008 0.004 0.364 0.596 0.028 0.000
#> SRR1032970 4 0.3786 0.39892 0.004 0.004 0.240 0.736 0.016 0.000
#> SRR1032971 4 0.4676 0.21773 0.008 0.004 0.308 0.640 0.040 0.000
#> SRR1032972 4 0.3869 0.39607 0.004 0.004 0.240 0.732 0.020 0.000
#> SRR1032973 4 0.4483 0.20194 0.000 0.004 0.320 0.636 0.040 0.000
#> SRR1032974 4 0.2444 0.62069 0.036 0.000 0.052 0.896 0.016 0.000
#> SRR1032975 4 0.2734 0.56046 0.004 0.004 0.116 0.860 0.016 0.000
#> SRR1032976 4 0.3395 0.58806 0.056 0.000 0.124 0.816 0.004 0.000
#> SRR1032977 2 0.6714 0.60382 0.112 0.616 0.108 0.056 0.104 0.004
#> SRR1032978 4 0.4646 0.34889 0.324 0.000 0.000 0.616 0.060 0.000
#> SRR1032979 6 0.2641 0.78500 0.020 0.020 0.024 0.000 0.040 0.896
#> SRR1032980 4 0.4455 0.22811 0.008 0.004 0.320 0.644 0.024 0.000
#> SRR1032981 4 0.4543 0.31256 0.012 0.004 0.260 0.684 0.040 0.000
#> SRR1032982 4 0.3010 0.52770 0.000 0.004 0.148 0.828 0.020 0.000
#> SRR1032983 4 0.3761 0.47257 0.020 0.000 0.228 0.744 0.008 0.000
#> SRR1032984 4 0.4033 0.40770 0.004 0.004 0.220 0.736 0.036 0.000
#> SRR1032985 4 0.2468 0.57935 0.008 0.004 0.092 0.884 0.012 0.000
#> SRR1032986 4 0.2940 0.58141 0.020 0.004 0.108 0.856 0.012 0.000
#> SRR1032987 2 0.4817 0.66164 0.048 0.776 0.048 0.012 0.080 0.036
#> SRR1032988 4 0.1728 0.60885 0.008 0.000 0.064 0.924 0.004 0.000
#> SRR1032990 1 0.5935 -0.09157 0.436 0.000 0.420 0.124 0.020 0.000
#> SRR1032989 4 0.1988 0.60260 0.008 0.004 0.072 0.912 0.004 0.000
#> SRR1032991 6 0.2875 0.77713 0.000 0.036 0.028 0.000 0.064 0.872
#> SRR1032992 4 0.6392 -0.23980 0.356 0.000 0.188 0.428 0.028 0.000
#> SRR1032993 4 0.3964 0.41076 0.004 0.004 0.220 0.740 0.032 0.000
#> SRR1032994 1 0.6345 0.34708 0.456 0.000 0.244 0.280 0.020 0.000
#> SRR1032995 4 0.2376 0.60877 0.068 0.000 0.000 0.888 0.044 0.000
#> SRR1032996 4 0.1765 0.61579 0.052 0.000 0.000 0.924 0.024 0.000
#> SRR1032997 4 0.4022 0.39462 0.004 0.004 0.240 0.724 0.028 0.000
#> SRR1032998 4 0.6126 0.07231 0.136 0.000 0.296 0.528 0.040 0.000
#> SRR1032999 5 0.4970 0.60122 0.012 0.000 0.052 0.000 0.580 0.356
#> SRR1033000 2 0.6929 0.59365 0.120 0.596 0.112 0.064 0.104 0.004
#> SRR1033001 4 0.3098 0.59649 0.040 0.000 0.120 0.836 0.004 0.000
#> SRR1033002 4 0.5576 -0.06337 0.432 0.000 0.044 0.476 0.048 0.000
#> SRR1033003 6 0.3611 0.65731 0.020 0.000 0.020 0.000 0.172 0.788
#> SRR1033004 2 0.4100 0.67478 0.044 0.812 0.036 0.004 0.084 0.020
#> SRR1033005 4 0.4688 -0.03670 0.008 0.000 0.400 0.560 0.032 0.000
#> SRR1033006 3 0.5407 0.65619 0.016 0.000 0.620 0.232 0.132 0.000
#> SRR1033007 4 0.5335 -0.23517 0.072 0.000 0.428 0.488 0.012 0.000
#> SRR1033008 4 0.5241 0.16718 0.388 0.000 0.008 0.528 0.076 0.000
#> SRR1033009 4 0.4864 0.50962 0.220 0.000 0.036 0.688 0.056 0.000
#> SRR1033010 3 0.4865 0.64428 0.004 0.000 0.652 0.248 0.096 0.000
#> SRR1033011 2 0.0717 0.69529 0.016 0.976 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033012 1 0.5026 0.54038 0.640 0.000 0.024 0.284 0.048 0.004
#> SRR1033013 3 0.4162 0.69770 0.016 0.000 0.700 0.264 0.020 0.000
#> SRR1033014 3 0.6232 0.66786 0.176 0.004 0.580 0.184 0.056 0.000
#> SRR1033015 1 0.5767 0.49356 0.628 0.024 0.220 0.108 0.020 0.000
#> SRR1033016 2 0.0520 0.69425 0.008 0.984 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033017 2 0.1140 0.69451 0.012 0.964 0.008 0.000 0.008 0.008
#> SRR1033018 3 0.6657 0.41833 0.296 0.000 0.484 0.132 0.088 0.000
#> SRR1033019 3 0.6494 0.61601 0.160 0.008 0.584 0.128 0.120 0.000
#> SRR1033020 1 0.4007 0.63981 0.728 0.000 0.052 0.220 0.000 0.000
#> SRR1033021 3 0.7565 0.40184 0.200 0.000 0.392 0.144 0.256 0.008
#> SRR1033023 1 0.4217 0.50320 0.644 0.000 0.012 0.332 0.012 0.000
#> SRR1033022 1 0.4657 0.59128 0.672 0.000 0.044 0.264 0.020 0.000
#> SRR1033024 3 0.4094 0.70127 0.008 0.000 0.728 0.224 0.040 0.000
#> SRR1033025 1 0.5844 0.33100 0.488 0.000 0.056 0.396 0.060 0.000
#> SRR1033026 3 0.4686 0.74011 0.048 0.000 0.692 0.232 0.028 0.000
#> SRR1033027 2 0.0717 0.69529 0.016 0.976 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033028 3 0.5054 0.46723 0.032 0.000 0.508 0.436 0.024 0.000
#> SRR1033029 5 0.5029 0.61386 0.020 0.000 0.048 0.000 0.592 0.340
#> SRR1033030 3 0.5916 0.68189 0.144 0.004 0.636 0.140 0.076 0.000
#> SRR1033031 1 0.7688 0.51948 0.516 0.020 0.108 0.128 0.180 0.048
#> SRR1033032 5 0.7093 -0.08018 0.248 0.000 0.344 0.044 0.352 0.012
#> SRR1033033 2 0.0508 0.69362 0.012 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1033035 2 0.0810 0.69217 0.008 0.976 0.004 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033034 1 0.8219 0.32438 0.336 0.000 0.148 0.308 0.136 0.072
#> SRR1033036 1 0.3777 0.66144 0.784 0.008 0.040 0.164 0.004 0.000
#> SRR1033037 4 0.5348 0.33953 0.316 0.000 0.008 0.596 0.060 0.020
#> SRR1033038 5 0.8500 0.36273 0.184 0.048 0.104 0.060 0.436 0.168
#> SRR1033039 3 0.6419 0.39704 0.332 0.004 0.468 0.164 0.032 0.000
#> SRR1033040 1 0.6366 0.10294 0.476 0.000 0.344 0.124 0.056 0.000
#> SRR1033041 1 0.4039 0.61155 0.716 0.000 0.028 0.248 0.008 0.000
#> SRR1033042 1 0.4701 0.63337 0.712 0.000 0.036 0.196 0.056 0.000
#> SRR1033043 4 0.4812 0.25686 0.348 0.000 0.032 0.600 0.020 0.000
#> SRR1033044 4 0.5524 0.29309 0.320 0.000 0.076 0.576 0.024 0.004
#> SRR1033045 3 0.5143 0.73827 0.084 0.000 0.672 0.208 0.036 0.000
#> SRR1033046 3 0.6325 0.58097 0.240 0.000 0.536 0.172 0.052 0.000
#> SRR1033047 3 0.5487 0.68858 0.164 0.000 0.608 0.216 0.012 0.000
#> SRR1033048 3 0.6884 0.49644 0.268 0.012 0.436 0.248 0.036 0.000
#> SRR1033049 1 0.6022 0.27656 0.468 0.004 0.056 0.424 0.032 0.016
#> SRR1033051 4 0.4476 0.42589 0.280 0.000 0.020 0.672 0.028 0.000
#> SRR1033052 1 0.4067 0.55274 0.680 0.000 0.012 0.296 0.012 0.000
#> SRR1033053 2 0.1015 0.69057 0.012 0.968 0.004 0.000 0.004 0.012
#> SRR1033054 1 0.5782 0.41347 0.596 0.020 0.268 0.100 0.016 0.000
#> SRR1033050 4 0.4667 0.34165 0.328 0.000 0.032 0.624 0.016 0.000
#> SRR1033055 3 0.6287 0.51952 0.276 0.012 0.544 0.132 0.036 0.000
#> SRR1033056 4 0.6411 -0.22764 0.324 0.000 0.308 0.356 0.012 0.000
#> SRR1033057 1 0.4850 0.34424 0.556 0.016 0.004 0.404 0.016 0.004
#> SRR1033058 3 0.6141 0.64116 0.176 0.016 0.620 0.128 0.060 0.000
#> SRR1033059 2 0.0665 0.69193 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033060 1 0.4950 0.64326 0.720 0.044 0.084 0.148 0.004 0.000
#> SRR1033061 2 0.0363 0.69433 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1033062 3 0.4308 0.72322 0.028 0.000 0.720 0.224 0.028 0.000
#> SRR1033063 2 0.0964 0.68855 0.012 0.968 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1033064 3 0.6338 0.53401 0.272 0.004 0.520 0.168 0.036 0.000
#> SRR1033065 1 0.3593 0.65225 0.788 0.004 0.024 0.176 0.008 0.000
#> SRR1033066 1 0.3773 0.66274 0.788 0.004 0.056 0.148 0.004 0.000
#> SRR1033067 4 0.4833 0.46110 0.256 0.000 0.044 0.668 0.032 0.000
#> SRR1033068 1 0.7203 0.05395 0.428 0.008 0.324 0.100 0.136 0.004
#> SRR1033069 1 0.6623 0.45314 0.600 0.100 0.176 0.068 0.056 0.000
#> SRR1033070 1 0.5468 0.43008 0.616 0.016 0.264 0.096 0.008 0.000
#> SRR1033071 2 0.0665 0.69193 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033072 1 0.6732 0.11748 0.484 0.100 0.284 0.000 0.132 0.000
#> SRR1033073 3 0.6551 0.50640 0.180 0.036 0.600 0.052 0.128 0.004
#> SRR1033074 4 0.3106 0.59518 0.120 0.000 0.016 0.840 0.024 0.000
#> SRR1033075 4 0.5521 -0.12442 0.412 0.000 0.092 0.484 0.012 0.000
#> SRR1033076 1 0.5592 0.47126 0.628 0.028 0.236 0.100 0.008 0.000
#> SRR1033077 1 0.5132 0.18944 0.492 0.004 0.028 0.452 0.024 0.000
#> SRR1033078 4 0.4510 0.23188 0.380 0.000 0.008 0.588 0.024 0.000
#> SRR1033079 3 0.4437 0.73547 0.032 0.004 0.724 0.212 0.028 0.000
#> SRR1033080 3 0.3938 0.72013 0.020 0.008 0.764 0.192 0.016 0.000
#> SRR1033081 1 0.5362 0.34092 0.504 0.004 0.072 0.412 0.008 0.000
#> SRR1033082 1 0.5762 0.63876 0.656 0.000 0.100 0.176 0.052 0.016
#> SRR1033083 3 0.6477 0.53328 0.280 0.008 0.500 0.180 0.032 0.000
#> SRR1033084 4 0.4763 0.04846 0.440 0.000 0.004 0.516 0.040 0.000
#> SRR1033085 3 0.4681 0.73158 0.032 0.000 0.688 0.240 0.040 0.000
#> SRR1033086 2 0.0665 0.69193 0.008 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1033087 4 0.4635 -0.09602 0.480 0.000 0.008 0.488 0.024 0.000
#> SRR1033088 3 0.5455 0.69288 0.072 0.004 0.680 0.156 0.088 0.000
#> SRR1033089 3 0.4767 0.64205 0.024 0.000 0.616 0.332 0.028 0.000
#> SRR1033090 4 0.4638 0.23870 0.020 0.004 0.320 0.636 0.020 0.000
#> SRR1033091 3 0.5074 0.72769 0.092 0.000 0.660 0.228 0.020 0.000
#> SRR1033092 1 0.6507 0.59473 0.572 0.004 0.080 0.232 0.100 0.012
#> SRR1033093 2 0.1230 0.68525 0.008 0.956 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1033094 1 0.6872 -0.00399 0.428 0.028 0.392 0.096 0.052 0.004
#> SRR1033095 5 0.5037 0.59611 0.012 0.004 0.048 0.000 0.584 0.352
#> SRR1033096 3 0.6218 0.39868 0.336 0.000 0.468 0.172 0.024 0.000
#> SRR1033097 2 0.0551 0.69294 0.008 0.984 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033098 3 0.4986 0.73698 0.088 0.004 0.688 0.200 0.020 0.000
#> SRR1033099 2 0.0798 0.69098 0.012 0.976 0.004 0.000 0.004 0.004
#> SRR1033100 2 0.1003 0.68398 0.004 0.964 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1033101 3 0.4403 0.70325 0.032 0.000 0.684 0.268 0.016 0.000
#> SRR1033102 4 0.4702 0.48809 0.220 0.000 0.004 0.680 0.096 0.000
#> SRR1033103 1 0.4821 0.43028 0.600 0.000 0.004 0.336 0.060 0.000
#> SRR1033104 3 0.4515 0.69288 0.008 0.000 0.688 0.244 0.060 0.000
#> SRR1033105 1 0.5083 0.25238 0.520 0.000 0.004 0.408 0.068 0.000
#> SRR1033106 1 0.3869 0.65554 0.768 0.000 0.040 0.180 0.012 0.000
#> SRR1033107 3 0.4089 0.67614 0.000 0.000 0.696 0.264 0.040 0.000
#> SRR1033108 4 0.1807 0.61449 0.060 0.000 0.000 0.920 0.020 0.000
#> SRR1033109 1 0.5301 0.21928 0.492 0.000 0.004 0.416 0.088 0.000
#> SRR1033110 1 0.6848 0.29441 0.504 0.016 0.280 0.112 0.088 0.000
#> SRR1033111 4 0.5077 -0.08063 0.464 0.004 0.000 0.468 0.064 0.000
#> SRR1033112 1 0.4196 0.47114 0.640 0.000 0.000 0.332 0.028 0.000
#> SRR1033113 1 0.6500 0.06055 0.456 0.028 0.388 0.092 0.036 0.000
#> SRR1033114 1 0.5962 0.41448 0.536 0.000 0.068 0.340 0.048 0.008
#> SRR1033115 1 0.4843 0.56127 0.672 0.020 0.008 0.264 0.032 0.004
#> SRR1033116 3 0.4157 0.65997 0.004 0.000 0.688 0.276 0.032 0.000
#> SRR1033117 3 0.4841 0.69460 0.048 0.000 0.716 0.168 0.068 0.000
#> SRR1033118 3 0.4975 0.51160 0.016 0.000 0.548 0.396 0.040 0.000
#> SRR1033119 1 0.4803 0.23332 0.528 0.000 0.004 0.424 0.044 0.000
#> SRR1033121 3 0.6042 0.67652 0.164 0.004 0.604 0.176 0.052 0.000
#> SRR1033120 2 0.6517 0.47169 0.336 0.468 0.068 0.000 0.128 0.000
#> SRR1033122 3 0.5312 0.56629 0.048 0.000 0.552 0.368 0.032 0.000
#> SRR1033123 1 0.5057 0.52550 0.644 0.000 0.012 0.264 0.076 0.004
#> SRR1033124 4 0.5127 0.10885 0.408 0.004 0.000 0.516 0.072 0.000
#> SRR1033125 1 0.5670 0.52754 0.684 0.112 0.116 0.068 0.020 0.000
#> SRR1033126 1 0.4490 0.57513 0.688 0.008 0.008 0.260 0.036 0.000
#> SRR1033127 3 0.5859 0.15735 0.004 0.000 0.540 0.108 0.324 0.024
#> SRR1033129 3 0.3998 0.68905 0.000 0.000 0.712 0.248 0.040 0.000
#> SRR1033128 1 0.3884 0.65897 0.800 0.020 0.044 0.128 0.008 0.000
#> SRR1033130 4 0.5350 0.04929 0.424 0.000 0.020 0.496 0.060 0.000
#> SRR1033131 1 0.3755 0.61970 0.744 0.004 0.012 0.232 0.008 0.000
#> SRR1033132 1 0.6319 0.42018 0.600 0.052 0.224 0.084 0.040 0.000
#> SRR1033133 1 0.5230 0.57944 0.708 0.036 0.136 0.104 0.016 0.000
#> SRR1033134 4 0.3900 0.49472 0.232 0.000 0.000 0.728 0.040 0.000
#> SRR1033135 3 0.6987 0.37636 0.336 0.012 0.428 0.160 0.064 0.000
#> SRR1033136 1 0.4715 0.43932 0.604 0.004 0.004 0.348 0.040 0.000
#> SRR1033137 1 0.6597 0.40467 0.572 0.032 0.228 0.092 0.076 0.000
#> SRR1033139 1 0.6162 0.46196 0.632 0.124 0.156 0.064 0.024 0.000
#> SRR1033138 1 0.4724 0.62219 0.772 0.044 0.048 0.080 0.056 0.000
#> SRR1033140 3 0.5750 0.63799 0.224 0.000 0.584 0.172 0.020 0.000
#> SRR1033141 4 0.4815 0.42044 0.284 0.000 0.012 0.644 0.060 0.000
#> SRR1033142 2 0.7619 0.53942 0.084 0.484 0.124 0.000 0.220 0.088
#> SRR1033143 4 0.4720 0.37516 0.308 0.000 0.004 0.628 0.060 0.000
#> SRR1033144 1 0.3872 0.65571 0.772 0.012 0.032 0.180 0.004 0.000
#> SRR1033145 3 0.6559 0.37451 0.344 0.012 0.464 0.144 0.036 0.000
#> SRR1033146 1 0.4599 0.48300 0.748 0.172 0.012 0.036 0.020 0.012
#> SRR1033147 1 0.5564 0.55031 0.692 0.092 0.120 0.080 0.016 0.000
#> SRR1033148 4 0.2349 0.60825 0.080 0.000 0.008 0.892 0.020 0.000
#> SRR1033149 3 0.5889 0.61463 0.104 0.036 0.680 0.120 0.056 0.004
#> SRR1033150 1 0.4223 0.66350 0.752 0.004 0.056 0.176 0.012 0.000
#> SRR1033151 1 0.6130 0.46574 0.620 0.056 0.208 0.088 0.028 0.000
#> SRR1033152 1 0.4436 0.60021 0.676 0.000 0.044 0.272 0.008 0.000
#> SRR1033153 1 0.5042 0.57337 0.696 0.016 0.164 0.116 0.008 0.000
#> SRR1033154 1 0.3502 0.64715 0.780 0.008 0.020 0.192 0.000 0.000
#> SRR1033156 3 0.4592 0.73649 0.064 0.000 0.692 0.232 0.012 0.000
#> SRR1033157 1 0.4751 0.31153 0.560 0.004 0.000 0.392 0.044 0.000
#> SRR1033158 2 0.7213 0.54229 0.224 0.452 0.120 0.000 0.200 0.004
#> SRR1033159 3 0.6381 0.58983 0.252 0.004 0.520 0.188 0.036 0.000
#> SRR1033160 3 0.6699 0.35539 0.348 0.016 0.456 0.136 0.044 0.000
#> SRR1033161 4 0.4204 0.45062 0.260 0.000 0.004 0.696 0.040 0.000
#> SRR1033163 1 0.6064 0.42151 0.604 0.036 0.244 0.084 0.032 0.000
#> SRR1033162 1 0.3863 0.63571 0.760 0.012 0.012 0.204 0.012 0.000
#> SRR1033164 3 0.6881 0.24873 0.340 0.000 0.416 0.084 0.160 0.000
#> SRR1033165 3 0.4943 0.49770 0.044 0.000 0.552 0.392 0.012 0.000
#> SRR1033166 1 0.5734 0.60483 0.660 0.132 0.064 0.136 0.008 0.000
#> SRR1033167 2 0.6054 0.65045 0.124 0.656 0.088 0.000 0.104 0.028
#> SRR1033168 3 0.6361 0.24396 0.396 0.004 0.420 0.152 0.028 0.000
#> SRR1033169 2 0.6718 0.50045 0.316 0.480 0.064 0.004 0.132 0.004
#> SRR1033171 1 0.6626 0.12632 0.496 0.244 0.196 0.000 0.064 0.000
#> SRR1033170 1 0.4799 0.33693 0.560 0.000 0.004 0.388 0.048 0.000
#> SRR1033172 3 0.6766 0.49803 0.288 0.020 0.500 0.140 0.052 0.000
#> SRR1033173 2 0.8604 0.39941 0.124 0.348 0.160 0.000 0.196 0.172
#> SRR1033174 3 0.5517 0.72597 0.108 0.012 0.632 0.232 0.016 0.000
#> SRR1033175 4 0.4972 0.26874 0.352 0.000 0.008 0.580 0.060 0.000
#> SRR1033176 1 0.4194 0.66504 0.752 0.016 0.044 0.184 0.004 0.000
#> SRR1033177 2 0.8484 0.34017 0.112 0.360 0.136 0.000 0.172 0.220
#> SRR1033178 5 0.5001 0.60159 0.008 0.004 0.052 0.000 0.584 0.352
#> SRR1033179 5 0.6216 0.62230 0.028 0.000 0.168 0.008 0.548 0.248
#> SRR1033180 1 0.4886 0.62858 0.652 0.000 0.100 0.244 0.004 0.000
#> SRR1033181 1 0.3903 0.65859 0.784 0.004 0.060 0.144 0.008 0.000
#> SRR1033183 3 0.4738 0.63652 0.012 0.004 0.632 0.316 0.036 0.000
#> SRR1033182 1 0.4162 0.66185 0.756 0.016 0.044 0.180 0.004 0.000
#> SRR1033184 1 0.5951 0.35635 0.560 0.016 0.292 0.116 0.016 0.000
#> SRR1033185 1 0.6666 0.49301 0.524 0.000 0.076 0.224 0.172 0.004
#> SRR1033187 4 0.5199 -0.11026 0.464 0.000 0.016 0.468 0.052 0.000
#> SRR1033186 1 0.7090 0.47594 0.528 0.000 0.020 0.160 0.140 0.152
#> SRR1033188 3 0.5016 0.42284 0.040 0.000 0.520 0.424 0.016 0.000
#> SRR1033189 3 0.5630 -0.15073 0.008 0.000 0.516 0.056 0.392 0.028
#> SRR1033190 1 0.4847 0.41793 0.592 0.000 0.012 0.352 0.044 0.000
#> SRR1033191 1 0.3558 0.65623 0.780 0.004 0.032 0.184 0.000 0.000
#> SRR1033192 1 0.6296 0.43857 0.628 0.148 0.140 0.048 0.032 0.004
#> SRR1033193 4 0.5327 0.15256 0.372 0.000 0.000 0.516 0.112 0.000
#> SRR1033195 5 0.6475 0.54233 0.028 0.008 0.228 0.000 0.504 0.232
#> SRR1033194 2 0.6396 0.55641 0.264 0.544 0.056 0.008 0.128 0.000
#> SRR1033197 1 0.5362 0.25661 0.516 0.004 0.004 0.392 0.084 0.000
#> SRR1033196 1 0.5673 0.56891 0.648 0.024 0.160 0.152 0.016 0.000
#> SRR1033199 6 0.3522 0.77489 0.020 0.024 0.044 0.000 0.068 0.844
#> SRR1033198 4 0.4699 0.52396 0.184 0.000 0.012 0.704 0.100 0.000
#> SRR1033200 4 0.4341 0.55045 0.152 0.000 0.016 0.748 0.084 0.000
#> SRR1033201 3 0.4883 0.73758 0.084 0.000 0.684 0.212 0.020 0.000
#> SRR1033202 3 0.4235 0.65153 0.004 0.000 0.672 0.292 0.032 0.000
#> SRR1033203 1 0.6676 -0.06356 0.432 0.012 0.372 0.140 0.044 0.000
#> SRR1033204 4 0.4863 0.39337 0.284 0.000 0.000 0.624 0.092 0.000
#> SRR1033205 3 0.4518 0.61299 0.008 0.000 0.624 0.336 0.032 0.000
#> SRR1033206 4 0.5173 0.15163 0.388 0.000 0.000 0.520 0.092 0.000
#> SRR1033207 4 0.5272 0.43176 0.256 0.000 0.016 0.624 0.104 0.000
#> SRR1033208 3 0.6205 0.70700 0.128 0.000 0.588 0.192 0.092 0.000
#> SRR1033209 4 0.6667 0.28139 0.212 0.000 0.224 0.496 0.068 0.000
#> SRR1033210 3 0.5647 0.71960 0.104 0.000 0.648 0.176 0.072 0.000
#> SRR1033211 1 0.5560 0.19385 0.476 0.000 0.012 0.416 0.096 0.000
#> SRR1033212 3 0.6548 0.66654 0.160 0.004 0.552 0.200 0.084 0.000
#> SRR1033213 2 0.7402 0.56327 0.140 0.464 0.168 0.000 0.212 0.016
#> SRR1033214 4 0.1887 0.62225 0.048 0.000 0.012 0.924 0.016 0.000
#> SRR1033216 4 0.4868 0.31488 0.332 0.000 0.000 0.592 0.076 0.000
#> SRR1033215 3 0.5285 0.63402 0.012 0.000 0.656 0.204 0.120 0.008
#> SRR1033217 1 0.6262 0.21567 0.508 0.008 0.316 0.140 0.028 0.000
#> SRR1033218 4 0.4989 0.33257 0.316 0.000 0.000 0.592 0.092 0.000
#> SRR1033219 4 0.4619 0.45668 0.244 0.000 0.000 0.668 0.088 0.000
#> SRR1033221 6 0.3510 0.78161 0.004 0.048 0.048 0.000 0.060 0.840
#> SRR1033220 6 0.4509 0.75146 0.024 0.060 0.064 0.000 0.068 0.784
#> SRR1033222 4 0.4683 0.34907 0.320 0.000 0.000 0.616 0.064 0.000
#> SRR1033223 1 0.6437 0.49825 0.568 0.008 0.152 0.204 0.068 0.000
#> SRR1033225 2 0.7473 0.54893 0.120 0.476 0.160 0.008 0.220 0.016
#> SRR1033224 4 0.3410 0.60863 0.076 0.000 0.024 0.836 0.064 0.000
#> SRR1033226 1 0.6764 0.44127 0.536 0.008 0.192 0.172 0.092 0.000
#> SRR1033227 3 0.4905 0.70562 0.048 0.000 0.652 0.272 0.028 0.000
#> SRR1033229 2 0.8102 0.51349 0.140 0.400 0.160 0.000 0.236 0.064
#> SRR1033228 4 0.3877 0.51846 0.208 0.000 0.004 0.748 0.040 0.000
#> SRR1033231 5 0.5899 0.50600 0.016 0.008 0.132 0.000 0.556 0.288
#> SRR1033230 4 0.4945 0.31380 0.328 0.000 0.000 0.588 0.084 0.000
#> SRR1033232 4 0.4711 0.53330 0.052 0.000 0.172 0.724 0.052 0.000
#> SRR1033233 4 0.4783 0.35962 0.308 0.000 0.000 0.616 0.076 0.000
#> SRR1033235 2 0.7922 0.52612 0.152 0.408 0.168 0.000 0.232 0.040
#> SRR1033234 3 0.6751 0.60198 0.232 0.004 0.508 0.180 0.076 0.000
#> SRR1033236 3 0.6695 0.64806 0.192 0.004 0.512 0.224 0.068 0.000
#> SRR1033237 4 0.1668 0.61230 0.008 0.000 0.060 0.928 0.004 0.000
#> SRR1033238 3 0.5927 0.71064 0.124 0.000 0.592 0.232 0.052 0.000
#> SRR1033240 3 0.4880 0.72453 0.032 0.000 0.688 0.216 0.064 0.000
#> SRR1033239 1 0.4321 0.65971 0.732 0.000 0.064 0.192 0.012 0.000
#> SRR1033242 3 0.4763 0.56450 0.028 0.000 0.572 0.384 0.016 0.000
#> SRR1033241 3 0.6544 0.57769 0.240 0.008 0.540 0.148 0.064 0.000
#> SRR1033244 6 0.3245 0.77763 0.036 0.028 0.048 0.000 0.024 0.864
#> SRR1033243 6 0.3148 0.78236 0.024 0.052 0.020 0.000 0.036 0.868
#> SRR1033245 1 0.6413 0.40230 0.568 0.016 0.220 0.148 0.048 0.000
#> SRR1033246 4 0.4947 0.18352 0.384 0.000 0.004 0.552 0.060 0.000
#> SRR1033248 4 0.4244 0.53737 0.080 0.000 0.168 0.744 0.008 0.000
#> SRR1033247 6 0.6524 0.50295 0.124 0.204 0.060 0.008 0.016 0.588
#> SRR1033249 6 0.8452 -0.06457 0.104 0.260 0.140 0.000 0.152 0.344
#> SRR1033250 6 0.6856 0.50577 0.064 0.136 0.104 0.000 0.104 0.592
#> SRR1033251 1 0.4476 0.53975 0.668 0.000 0.008 0.280 0.044 0.000
#> SRR1033252 2 0.8214 0.49908 0.124 0.416 0.160 0.000 0.196 0.104
#> SRR1033253 4 0.4979 0.42183 0.276 0.000 0.012 0.636 0.076 0.000
#> SRR1033254 4 0.4823 0.40971 0.288 0.004 0.004 0.640 0.064 0.000
#> SRR1033256 2 0.8692 0.30270 0.104 0.300 0.176 0.000 0.220 0.200
#> SRR1033255 3 0.7056 0.45884 0.296 0.008 0.444 0.172 0.080 0.000
#> SRR1033258 4 0.4764 0.38833 0.292 0.000 0.000 0.628 0.080 0.000
#> SRR1033257 4 0.1716 0.62619 0.036 0.000 0.028 0.932 0.004 0.000
#> SRR1033259 4 0.3679 0.54163 0.176 0.000 0.000 0.772 0.052 0.000
#> SRR1033260 2 0.8347 0.44278 0.112 0.368 0.184 0.000 0.236 0.100
#> SRR1033261 3 0.4050 0.71284 0.016 0.000 0.728 0.232 0.024 0.000
#> SRR1033262 3 0.4331 0.74111 0.040 0.000 0.728 0.208 0.024 0.000
#> SRR1033263 2 0.8285 0.43432 0.128 0.336 0.192 0.000 0.276 0.068
#> SRR1033264 4 0.2454 0.61189 0.088 0.000 0.008 0.884 0.020 0.000
#> SRR1033265 6 0.5630 0.68818 0.052 0.120 0.056 0.000 0.072 0.700
#> SRR1033266 4 0.5044 0.09989 0.392 0.000 0.040 0.548 0.020 0.000
#> SRR1033267 3 0.6617 0.62489 0.224 0.004 0.512 0.204 0.056 0.000
#> SRR1033268 1 0.4919 0.30659 0.544 0.000 0.000 0.388 0.068 0.000
#> SRR1033269 1 0.6311 0.46208 0.588 0.008 0.208 0.112 0.084 0.000
#> SRR1033270 3 0.4427 0.70400 0.024 0.000 0.692 0.256 0.028 0.000
#> SRR1033271 4 0.4945 0.35648 0.304 0.000 0.000 0.604 0.092 0.000
#> SRR1033272 2 0.8252 0.48445 0.116 0.396 0.164 0.000 0.224 0.100
#> SRR1033273 4 0.5073 -0.02417 0.448 0.000 0.004 0.484 0.064 0.000
#> SRR1033274 5 0.6423 0.57982 0.024 0.008 0.220 0.000 0.504 0.244
#> SRR1033275 4 0.1674 0.59915 0.004 0.000 0.068 0.924 0.004 0.000
#> SRR1033276 6 0.4249 0.76330 0.052 0.080 0.044 0.000 0.024 0.800
#> SRR1033277 4 0.2677 0.60770 0.084 0.000 0.016 0.876 0.024 0.000
#> SRR1033278 4 0.3594 0.50836 0.008 0.004 0.144 0.804 0.040 0.000
#> SRR1033279 1 0.6209 0.43548 0.600 0.032 0.232 0.092 0.044 0.000
#> SRR1033280 1 0.6064 0.21194 0.516 0.012 0.344 0.104 0.024 0.000
#> SRR1033281 1 0.5111 0.16396 0.492 0.000 0.004 0.436 0.068 0.000
#> SRR1033282 4 0.4765 0.53461 0.132 0.000 0.012 0.704 0.152 0.000
#> SRR1033283 4 0.4889 0.53097 0.136 0.000 0.016 0.696 0.152 0.000
#> SRR1033284 4 0.4889 0.53194 0.136 0.000 0.016 0.696 0.152 0.000
#> SRR1033285 4 0.5391 0.48268 0.180 0.004 0.012 0.640 0.164 0.000
#> SRR1033286 4 0.5446 0.47423 0.188 0.004 0.012 0.632 0.164 0.000
#> SRR1033287 4 0.5446 0.47423 0.188 0.004 0.012 0.632 0.164 0.000
#> SRR1033288 4 0.5421 0.47788 0.180 0.004 0.012 0.636 0.168 0.000
#> SRR1033289 4 0.5389 0.49493 0.164 0.004 0.016 0.648 0.168 0.000
#> SRR1033290 4 0.5389 0.49493 0.164 0.004 0.016 0.648 0.168 0.000
#> SRR1033291 4 0.5419 0.52647 0.128 0.004 0.036 0.668 0.164 0.000
#> SRR1033292 4 0.5357 0.52407 0.132 0.004 0.032 0.672 0.160 0.000
#> SRR1033293 4 0.5455 0.52313 0.132 0.004 0.036 0.664 0.164 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0