Date: 2019-12-26 00:30:32 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 14373 400
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| MAD:NMF | 6 | 1.000 | 0.994 | 0.994 | ** | 2,3,4,5 |
| ATC:hclust | 2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | ** | |
| ATC:skmeans | 2 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | ** | |
| SD:NMF | 6 | 0.993 | 0.975 | 0.975 | ** | 3,4 |
| MAD:hclust | 6 | 0.988 | 0.952 | 0.971 | ** | 5 |
| CV:pam | 6 | 0.982 | 0.941 | 0.972 | ** | |
| MAD:pam | 6 | 0.982 | 0.967 | 0.983 | ** | 5 |
| CV:NMF | 6 | 0.962 | 0.972 | 0.973 | ** | 2,5 |
| ATC:pam | 4 | 0.948 | 0.910 | 0.957 | * | 2,3 |
| SD:mclust | 6 | 0.932 | 0.961 | 0.944 | * | 5 |
| SD:pam | 6 | 0.925 | 0.915 | 0.956 | * | 2 |
| MAD:mclust | 6 | 0.895 | 0.915 | 0.935 | ||
| CV:skmeans | 6 | 0.850 | 0.899 | 0.884 | ||
| SD:hclust | 6 | 0.822 | 0.915 | 0.941 | ||
| CV:mclust | 5 | 0.766 | 0.813 | 0.866 | ||
| CV:hclust | 5 | 0.751 | 0.905 | 0.918 | ||
| MAD:skmeans | 2 | 0.734 | 0.927 | 0.959 | ||
| ATC:mclust | 5 | 0.731 | 0.856 | 0.836 | ||
| SD:skmeans | 3 | 0.720 | 0.850 | 0.913 | ||
| ATC:NMF | 2 | 0.649 | 0.905 | 0.945 | ||
| MAD:kmeans | 6 | 0.627 | 0.766 | 0.740 | ||
| ATC:kmeans | 2 | 0.466 | 0.914 | 0.898 | ||
| SD:kmeans | 5 | 0.436 | 0.717 | 0.671 | ||
| CV:kmeans | 5 | 0.413 | 0.627 | 0.661 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 0.761 0.859 0.941 0.473 0.514 0.514
#> CV:NMF 2 1.000 0.999 1.000 0.501 0.499 0.499
#> MAD:NMF 2 1.000 0.999 1.000 0.486 0.514 0.514
#> ATC:NMF 2 0.649 0.905 0.945 0.483 0.500 0.500
#> SD:skmeans 2 0.457 0.688 0.843 0.494 0.517 0.517
#> CV:skmeans 2 0.421 0.773 0.897 0.483 0.507 0.507
#> MAD:skmeans 2 0.734 0.927 0.959 0.487 0.517 0.517
#> ATC:skmeans 2 1.000 0.999 1.000 0.501 0.500 0.500
#> SD:mclust 2 0.257 0.746 0.848 0.465 0.500 0.500
#> CV:mclust 2 0.341 0.792 0.822 0.372 0.724 0.724
#> MAD:mclust 2 0.243 0.823 0.823 0.437 0.562 0.562
#> ATC:mclust 2 0.623 0.924 0.946 0.187 0.836 0.836
#> SD:kmeans 2 0.156 0.492 0.713 0.395 0.622 0.622
#> CV:kmeans 2 0.136 0.684 0.767 0.384 0.603 0.603
#> MAD:kmeans 2 0.183 0.675 0.807 0.430 0.517 0.517
#> ATC:kmeans 2 0.466 0.914 0.898 0.426 0.500 0.500
#> SD:pam 2 0.939 0.914 0.960 0.465 0.552 0.552
#> CV:pam 2 0.622 0.823 0.897 0.452 0.552 0.552
#> MAD:pam 2 0.623 0.812 0.916 0.479 0.555 0.555
#> ATC:pam 2 1.000 1.000 1.000 0.165 0.836 0.836
#> SD:hclust 2 0.444 0.874 0.927 0.407 0.622 0.622
#> CV:hclust 2 0.567 0.934 0.936 0.270 0.744 0.744
#> MAD:hclust 2 0.731 0.949 0.969 0.485 0.518 0.518
#> ATC:hclust 2 1.000 1.000 1.000 0.165 0.836 0.836
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.945 0.980 0.989 0.297 0.851 0.718
#> CV:NMF 3 0.835 0.950 0.959 0.307 0.787 0.598
#> MAD:NMF 3 1.000 0.999 0.999 0.251 0.851 0.718
#> ATC:NMF 3 0.539 0.774 0.854 0.274 0.888 0.777
#> SD:skmeans 3 0.720 0.850 0.913 0.329 0.640 0.405
#> CV:skmeans 3 0.537 0.766 0.871 0.344 0.649 0.414
#> MAD:skmeans 3 0.706 0.837 0.892 0.329 0.730 0.526
#> ATC:skmeans 3 0.806 0.830 0.880 0.200 0.939 0.879
#> SD:mclust 3 0.336 0.419 0.568 0.152 0.604 0.377
#> CV:mclust 3 0.307 0.713 0.806 0.542 0.651 0.517
#> MAD:mclust 3 0.453 0.861 0.865 0.366 0.789 0.625
#> ATC:mclust 3 0.547 0.842 0.889 1.509 0.765 0.719
#> SD:kmeans 3 0.233 0.496 0.698 0.438 0.653 0.502
#> CV:kmeans 3 0.195 0.532 0.667 0.458 0.818 0.698
#> MAD:kmeans 3 0.340 0.592 0.706 0.365 0.818 0.663
#> ATC:kmeans 3 0.508 0.787 0.837 0.379 0.926 0.852
#> SD:pam 3 0.844 0.886 0.944 0.138 0.955 0.919
#> CV:pam 3 0.827 0.840 0.937 0.317 0.790 0.641
#> MAD:pam 3 0.712 0.629 0.865 0.129 0.823 0.702
#> ATC:pam 3 0.958 0.916 0.971 2.491 0.587 0.506
#> SD:hclust 3 0.542 0.868 0.911 0.298 0.887 0.818
#> CV:hclust 3 0.525 0.779 0.872 0.722 0.779 0.703
#> MAD:hclust 3 0.791 0.957 0.963 0.264 0.860 0.729
#> ATC:hclust 3 0.774 0.973 0.915 2.290 0.626 0.552
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.924 0.976 0.980 0.20005 0.869 0.666
#> CV:NMF 4 0.843 0.850 0.889 0.12067 0.861 0.628
#> MAD:NMF 4 0.962 0.954 0.969 0.20472 0.869 0.666
#> ATC:NMF 4 0.576 0.584 0.735 0.14100 0.803 0.536
#> SD:skmeans 4 0.778 0.746 0.822 0.11137 0.874 0.650
#> CV:skmeans 4 0.751 0.807 0.854 0.13520 0.902 0.720
#> MAD:skmeans 4 0.688 0.685 0.767 0.10843 0.945 0.845
#> ATC:skmeans 4 0.667 0.818 0.833 0.10946 0.845 0.657
#> SD:mclust 4 0.749 0.879 0.894 0.26095 0.701 0.415
#> CV:mclust 4 0.490 0.673 0.769 0.21492 0.876 0.680
#> MAD:mclust 4 0.658 0.809 0.882 0.07556 0.780 0.554
#> ATC:mclust 4 0.608 0.827 0.892 0.33161 0.746 0.580
#> SD:kmeans 4 0.314 0.603 0.692 0.16225 0.807 0.585
#> CV:kmeans 4 0.314 0.474 0.608 0.17767 0.681 0.364
#> MAD:kmeans 4 0.367 0.730 0.718 0.14123 0.890 0.722
#> ATC:kmeans 4 0.549 0.618 0.665 0.15443 0.862 0.680
#> SD:pam 4 0.886 0.919 0.960 0.13784 0.904 0.811
#> CV:pam 4 0.755 0.875 0.873 0.13247 0.938 0.849
#> MAD:pam 4 0.734 0.703 0.817 0.16239 0.750 0.522
#> ATC:pam 4 0.948 0.910 0.957 0.20632 0.820 0.598
#> SD:hclust 4 0.650 0.911 0.948 0.07051 0.971 0.942
#> CV:hclust 4 0.620 0.838 0.897 0.36832 0.791 0.618
#> MAD:hclust 4 0.843 0.862 0.919 0.05296 0.999 0.998
#> ATC:hclust 4 0.775 0.968 0.985 0.00533 0.997 0.994
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.871 0.740 0.846 0.0566 0.918 0.704
#> CV:NMF 5 0.925 0.946 0.951 0.0576 0.873 0.588
#> MAD:NMF 5 0.957 0.966 0.951 0.0490 0.973 0.896
#> ATC:NMF 5 0.560 0.534 0.666 0.0807 0.797 0.442
#> SD:skmeans 5 0.817 0.850 0.835 0.0619 0.891 0.626
#> CV:skmeans 5 0.793 0.858 0.840 0.0581 0.891 0.626
#> MAD:skmeans 5 0.793 0.866 0.851 0.0703 0.885 0.630
#> ATC:skmeans 5 0.647 0.789 0.798 0.0930 0.989 0.964
#> SD:mclust 5 0.921 0.911 0.957 0.1454 0.889 0.680
#> CV:mclust 5 0.766 0.813 0.866 0.1142 0.882 0.610
#> MAD:mclust 5 0.838 0.907 0.947 0.1653 0.858 0.657
#> ATC:mclust 5 0.731 0.856 0.836 0.1463 0.973 0.923
#> SD:kmeans 5 0.436 0.717 0.671 0.1077 0.936 0.801
#> CV:kmeans 5 0.413 0.627 0.661 0.1038 0.893 0.630
#> MAD:kmeans 5 0.493 0.714 0.715 0.0942 0.937 0.790
#> ATC:kmeans 5 0.548 0.449 0.681 0.0769 0.999 0.996
#> SD:pam 5 0.740 0.895 0.933 0.1529 0.910 0.784
#> CV:pam 5 0.872 0.913 0.918 0.0989 0.922 0.780
#> MAD:pam 5 1.000 0.993 0.996 0.1621 0.867 0.642
#> ATC:pam 5 0.899 0.927 0.928 0.0858 0.949 0.826
#> SD:hclust 5 0.732 0.833 0.902 0.3025 0.797 0.576
#> CV:hclust 5 0.751 0.905 0.918 0.0834 0.976 0.933
#> MAD:hclust 5 0.960 0.950 0.968 0.0973 0.922 0.792
#> ATC:hclust 5 0.774 0.966 0.924 0.0030 0.998 0.997
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.993 0.975 0.975 0.04948 0.947 0.762
#> CV:NMF 6 0.962 0.972 0.973 0.05128 0.952 0.791
#> MAD:NMF 6 1.000 0.994 0.994 0.06415 0.948 0.777
#> ATC:NMF 6 0.616 0.588 0.629 0.04001 0.820 0.482
#> SD:skmeans 6 0.809 0.919 0.889 0.03938 0.970 0.859
#> CV:skmeans 6 0.850 0.899 0.884 0.04284 0.973 0.871
#> MAD:skmeans 6 0.819 0.710 0.773 0.04294 0.937 0.730
#> ATC:skmeans 6 0.695 0.670 0.769 0.06343 0.944 0.809
#> SD:mclust 6 0.932 0.961 0.944 0.03349 0.959 0.827
#> CV:mclust 6 0.817 0.779 0.831 0.04142 0.954 0.801
#> MAD:mclust 6 0.895 0.915 0.935 0.06029 0.937 0.770
#> ATC:mclust 6 0.706 0.777 0.817 0.05894 0.934 0.799
#> SD:kmeans 6 0.600 0.781 0.727 0.04972 0.883 0.590
#> CV:kmeans 6 0.486 0.598 0.628 0.05409 0.951 0.789
#> MAD:kmeans 6 0.627 0.766 0.740 0.05251 0.973 0.886
#> ATC:kmeans 6 0.567 0.592 0.567 0.05771 0.835 0.499
#> SD:pam 6 0.925 0.915 0.956 0.13884 0.895 0.678
#> CV:pam 6 0.982 0.941 0.972 0.09480 0.918 0.703
#> MAD:pam 6 0.982 0.967 0.983 0.09222 0.937 0.770
#> ATC:pam 6 0.884 0.896 0.862 0.06009 0.951 0.799
#> SD:hclust 6 0.822 0.915 0.941 0.07666 0.918 0.703
#> CV:hclust 6 0.805 0.950 0.896 0.07780 0.880 0.646
#> MAD:hclust 6 0.988 0.952 0.971 0.03580 0.973 0.909
#> ATC:hclust 6 0.773 0.964 0.985 0.00295 0.998 0.997
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 3000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 4000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 5000)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.444 0.874 0.927 0.4071 0.622 0.622
#> 3 3 0.542 0.868 0.911 0.2976 0.887 0.818
#> 4 4 0.650 0.911 0.948 0.0705 0.971 0.942
#> 5 5 0.732 0.833 0.902 0.3025 0.797 0.576
#> 6 6 0.822 0.915 0.941 0.0767 0.918 0.703
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661857 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661858 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661859 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661860 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661861 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661862 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661863 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661864 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661865 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661866 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661867 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661868 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661869 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661870 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661871 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661872 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661873 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661874 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661875 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661876 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661877 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661878 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661879 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661880 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661881 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661882 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661883 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661884 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661885 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661886 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661887 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661888 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661889 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661890 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661891 1 0.680 0.840 0.820 0.180
#> SRR1661892 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.922 1.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661929 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661930 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661931 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661932 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661933 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661934 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661935 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661936 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661937 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661938 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661939 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661940 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661941 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661942 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661943 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661944 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661945 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661946 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661947 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661948 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661949 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661950 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661951 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661952 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661953 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661954 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661955 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661956 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661957 2 0.260 0.897 0.044 0.956
#> SRR1661958 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661959 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661960 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661961 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661962 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661963 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661964 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661965 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661966 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661967 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661968 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661969 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661970 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661971 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661972 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661973 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661974 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661975 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661976 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661977 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661978 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661979 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661980 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661981 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661982 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661983 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661984 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661985 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661986 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661987 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1661988 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661989 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661990 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661991 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661992 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661993 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661994 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661995 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661996 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661997 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661998 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1661999 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662000 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662001 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662002 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662003 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662004 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662005 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662006 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662007 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662008 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662009 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662010 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662011 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662012 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662013 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662014 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662015 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662016 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662017 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662018 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.912 0.000 1.000
#> SRR1662054 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662055 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662056 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662057 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662058 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662059 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662060 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662061 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662062 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662063 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662064 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662065 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662066 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662067 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662068 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662069 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662070 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662071 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662072 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662073 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662074 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662075 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662076 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662077 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662078 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662079 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662080 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662081 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662082 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662083 2 0.518 0.848 0.116 0.884
#> SRR1662084 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662085 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662086 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662087 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662088 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662089 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662090 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662091 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662092 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662093 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662094 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662095 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662096 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662097 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662098 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662099 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662100 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662101 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662102 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662103 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662104 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662105 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662106 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662107 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662108 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662109 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662110 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662111 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662112 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662113 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662114 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662115 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662116 2 0.767 0.771 0.224 0.776
#> SRR1662117 2 0.767 0.771 0.224 0.776
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661826 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661827 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661828 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661829 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661830 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661831 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661832 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661833 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661834 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661835 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661836 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661837 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661838 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661839 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661840 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661841 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661843 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661844 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661845 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661846 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661847 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661848 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661849 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661850 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661851 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661852 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661853 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661854 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661855 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661856 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661857 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661858 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661859 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661860 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661861 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661862 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661863 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661864 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661865 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661866 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661867 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661868 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661869 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661870 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661871 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661872 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661873 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661874 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661875 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661876 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661877 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661878 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661879 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661880 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661881 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661882 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661883 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661884 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661885 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661886 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661887 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661888 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661889 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661890 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661891 3 0.000 0.792 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661892 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661893 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661894 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661895 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661896 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661897 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661898 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661899 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661900 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661901 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661902 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661903 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661904 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661905 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661906 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661907 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661908 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661909 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661910 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661911 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661912 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661913 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661914 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661915 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661916 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661917 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661918 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661919 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661920 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661921 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661922 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661923 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661924 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661925 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661926 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661927 3 0.484 0.877 0.224 0.000 0.776
#> SRR1661928 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661929 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661930 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661931 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661932 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661933 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661934 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661935 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661936 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661937 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661938 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661939 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661940 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661941 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661942 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661943 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661944 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661945 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661946 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661947 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661948 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661949 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661950 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661951 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661952 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661953 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661954 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661955 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661956 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661957 2 0.465 0.780 0.000 0.792 0.208
#> SRR1661958 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661959 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661960 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661961 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661962 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661963 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661964 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661965 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661966 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661967 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661968 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661969 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661970 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661971 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661972 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661973 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661974 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661975 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661976 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661977 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661978 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661979 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661980 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661981 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661982 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661983 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661984 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661985 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661986 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661987 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1661988 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661989 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661990 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661991 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661992 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661993 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661994 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661995 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661996 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661997 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661998 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1661999 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662000 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662001 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662002 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662003 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662004 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662005 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662006 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662007 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662008 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662009 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662010 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662011 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662012 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662013 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662014 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662015 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662016 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662017 2 0.518 0.689 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662018 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.911 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662054 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662055 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662056 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662057 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662058 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662059 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662060 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662061 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662062 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662063 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662064 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662065 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662066 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662067 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662068 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662069 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662070 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662071 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662072 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662073 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662074 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662075 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662076 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662077 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662078 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662079 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662080 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662081 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662082 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662083 2 0.327 0.860 0.000 0.884 0.116
#> SRR1662084 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661929 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661930 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661931 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661932 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661933 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661934 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661935 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661936 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661937 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661938 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661939 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661940 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661941 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661942 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661943 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661944 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661945 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661946 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661947 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661948 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661949 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661950 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661951 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661952 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661953 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661954 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661955 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661956 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661957 2 0.369 0.772 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1661958 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661959 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661960 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661961 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661962 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661963 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661964 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661965 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661966 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661967 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661968 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661969 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661970 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661971 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661972 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661973 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661974 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661975 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661976 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661977 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661978 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661979 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661980 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661981 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661982 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661983 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661984 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661985 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661986 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661987 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1661988 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661989 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661990 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661991 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661992 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661993 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661994 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661995 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661996 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661997 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661998 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1661999 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662000 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662001 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662002 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662003 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662004 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662005 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662006 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662007 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662008 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662009 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662010 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662011 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662012 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662013 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662014 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662015 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662016 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662017 2 0.468 0.717 0.024 0.744 0.000 0.232
#> SRR1662018 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.916 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662054 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662055 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662056 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662057 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662058 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662059 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662060 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662061 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662062 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662063 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662064 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662065 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662066 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662067 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662068 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662069 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662070 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662071 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662072 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662073 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662074 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662075 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662076 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662077 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662078 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662079 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662080 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662081 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662082 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662083 2 0.259 0.864 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR1662084 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662085 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662086 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662087 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662088 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662089 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662090 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662091 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662092 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662093 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662094 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662095 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662096 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662097 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662098 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662099 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662100 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662101 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662102 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662103 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662104 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662105 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662106 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662107 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662108 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662109 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662110 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662111 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662112 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662113 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662114 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662115 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662116 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662117 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.826 0.00 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.00 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1.00 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661929 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661930 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661931 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661932 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661933 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661934 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661935 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661936 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661937 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661938 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661939 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661940 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661941 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661942 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661943 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661944 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661945 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661946 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661947 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661948 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661949 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661950 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661951 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661952 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661953 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661954 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661955 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661956 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661957 2 0.640 0.461 0.00 0.504 0.208 0.288 0.000
#> SRR1661958 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661959 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661960 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661961 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661962 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661963 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661964 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661965 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661966 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661967 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661968 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661969 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661970 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661971 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661972 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661973 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661974 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661975 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661976 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661977 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661978 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661979 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661980 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661981 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661982 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661983 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661984 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661985 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661986 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661987 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1661988 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661989 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661990 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661991 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661992 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661993 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661994 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661995 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661996 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661997 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661998 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1661999 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662000 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662001 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662002 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662003 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662004 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662005 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662006 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662007 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662008 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662009 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662010 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662011 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662012 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662013 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662014 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662015 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662016 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662017 2 0.651 0.547 0.02 0.568 0.000 0.184 0.228
#> SRR1662018 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662019 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662020 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662021 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662022 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662023 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662024 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662025 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662026 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662027 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662028 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662029 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662030 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662031 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662032 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662033 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662034 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662035 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662036 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662037 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662038 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662039 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662040 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662041 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662042 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662043 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662044 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662045 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662046 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662047 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662048 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662049 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662050 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662051 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662052 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662053 4 0.380 0.736 0.00 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1662054 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662055 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662056 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662057 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662058 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662059 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662060 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662061 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662062 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662063 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662064 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662065 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662066 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662067 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662068 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662069 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662070 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662071 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662072 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662073 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662074 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662075 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662076 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662077 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662078 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662079 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662080 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662081 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662082 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662083 4 0.051 0.856 0.00 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1662084 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662085 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662086 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662087 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662088 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662089 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662090 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662091 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662092 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662093 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662094 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662095 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662096 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662097 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662098 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662099 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662100 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662101 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662102 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662103 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662104 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662105 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662106 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662107 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662108 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662109 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662110 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662111 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662112 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662113 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662114 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662115 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662116 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662117 5 0.000 1.000 0.00 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661717 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661718 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661719 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661720 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661721 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661722 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661723 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661724 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661725 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661726 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661727 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661728 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661729 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661730 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661731 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661732 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661733 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661734 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661735 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661736 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661737 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661738 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661739 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661740 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661741 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661742 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661743 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661744 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661745 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661746 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661747 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661748 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661749 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661750 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661751 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661752 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661753 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661754 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661755 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661756 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661757 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661758 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661759 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661760 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661761 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661762 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661763 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661764 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661766 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661767 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661768 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661769 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661770 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661771 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661772 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661773 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661774 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661775 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661776 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661777 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661778 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661779 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661780 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661781 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661782 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661783 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661784 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661785 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661786 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661787 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661788 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661789 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661790 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661791 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661792 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661793 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661794 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661795 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661796 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661797 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661798 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661799 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661800 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661801 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661802 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661803 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661804 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661805 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661806 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661807 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661808 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661809 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661810 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661811 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661812 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661813 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661814 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661815 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661816 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661817 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661818 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661819 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661820 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661821 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661822 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661823 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661824 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661825 2 0.000 1.000 0 1.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661915 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0 0.00
#> SRR1661928 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661929 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661930 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661931 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661932 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661933 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661934 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661935 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661936 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661937 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661938 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661939 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661940 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661941 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661942 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661943 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661944 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661945 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661946 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661947 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661948 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661949 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661950 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661951 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661952 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661953 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661954 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661955 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661956 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661957 6 0.642 0.722 0 0.104 0.208 0.128 0 0.56
#> SRR1661958 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661959 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661960 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661961 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661962 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661963 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661964 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661965 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661966 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661967 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661968 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661969 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661970 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661971 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661972 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661973 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661974 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661975 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661976 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661977 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661978 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661979 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661980 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661981 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661982 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661983 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661984 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661985 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661986 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661987 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1661988 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661989 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661990 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661991 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661992 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661993 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661994 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661995 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661996 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661997 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661998 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1661999 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662000 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662001 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662002 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662003 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662004 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662005 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662006 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662007 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662008 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662009 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662010 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662011 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662012 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662013 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662014 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662015 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662016 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662017 6 0.000 0.756 0 0.000 0.000 0.000 0 1.00
#> SRR1662018 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662019 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662020 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662021 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662022 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662023 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662024 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662025 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662026 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662027 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662028 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662029 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662030 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662031 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662032 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662033 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662034 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662035 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662036 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662037 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662038 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662039 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662040 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662041 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662042 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662043 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662044 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662045 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662046 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662047 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662048 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662049 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662050 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662051 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662052 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662053 4 0.333 0.739 0 0.284 0.000 0.716 0 0.00
#> SRR1662054 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662055 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662056 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662057 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662058 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662059 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662060 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662061 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662062 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662063 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662064 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662065 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662066 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662067 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662068 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662069 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662070 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662071 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662072 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662073 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662074 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662075 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662076 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662077 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662078 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662079 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662080 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662081 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662082 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662083 4 0.000 0.848 0 0.000 0.000 1.000 0 0.00
#> SRR1662084 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662085 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662086 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662087 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662088 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662089 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662090 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662091 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662092 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662093 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662094 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662095 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662096 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662097 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662098 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662099 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662100 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662101 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662102 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662103 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662104 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662105 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662106 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662107 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662108 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662109 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662110 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662111 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662112 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662113 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662114 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662115 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662116 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
#> SRR1662117 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1 0.00
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.156 0.492 0.713 0.3947 0.622 0.622
#> 3 3 0.233 0.496 0.698 0.4378 0.653 0.502
#> 4 4 0.314 0.603 0.692 0.1622 0.807 0.585
#> 5 5 0.436 0.717 0.671 0.1077 0.936 0.801
#> 6 6 0.600 0.781 0.727 0.0497 0.883 0.590
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661717 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661718 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661719 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661720 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661721 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661722 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661723 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661724 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661725 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661726 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661727 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661728 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661729 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661730 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661731 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661732 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661733 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661734 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661735 2 0.0376 0.6496 0.004 0.996
#> SRR1661736 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661737 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661738 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661739 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661740 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661741 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661742 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661743 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661744 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661745 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661746 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661747 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661748 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661749 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661750 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661751 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661752 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661753 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661754 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661755 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661756 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661757 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661758 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661759 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661760 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661761 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661762 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661763 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661764 2 0.0672 0.6485 0.008 0.992
#> SRR1661766 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.6501 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661797 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661798 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661799 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661800 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661801 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661802 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661803 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661804 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661805 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661806 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661807 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661808 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661809 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661810 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661811 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661812 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661813 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661814 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661815 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661816 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661817 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661818 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661819 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661820 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661821 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661822 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661823 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661824 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661825 2 0.0376 0.6491 0.004 0.996
#> SRR1661826 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661827 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661828 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661829 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661830 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661831 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661832 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661833 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661834 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661835 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661836 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661837 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661838 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661839 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661840 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661841 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661843 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661844 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661845 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661846 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661847 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661848 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661849 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661850 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661851 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661852 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661853 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661854 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661855 1 0.7950 0.7657 0.760 0.240
#> SRR1661856 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661857 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661858 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661859 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661860 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661861 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661862 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661863 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661864 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661865 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661866 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661867 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661868 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661869 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661870 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661871 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661872 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661873 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661874 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661875 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661876 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661877 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661878 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661879 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661880 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661881 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661882 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661883 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661884 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661885 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661886 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661887 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661888 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661889 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661890 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661891 1 0.8909 0.5335 0.692 0.308
#> SRR1661892 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661893 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661894 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661895 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661896 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661897 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661898 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661899 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661900 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661901 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661902 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661903 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661904 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661905 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661906 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661907 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661908 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661909 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661910 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661911 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661912 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661913 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661914 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661915 1 0.7602 0.7473 0.780 0.220
#> SRR1661916 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661917 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661918 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661919 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661920 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661921 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661922 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661923 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661924 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661925 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661926 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661927 1 0.8016 0.7658 0.756 0.244
#> SRR1661928 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661929 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661930 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661931 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661932 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661933 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661934 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661935 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661936 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661937 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661938 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661939 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661940 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661941 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661942 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661943 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661944 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661945 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661946 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661947 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661948 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661949 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661950 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661951 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661952 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661953 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661954 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661955 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661956 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661957 2 0.7674 0.5745 0.224 0.776
#> SRR1661958 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661959 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661960 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661961 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661962 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661963 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661964 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661965 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661966 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661967 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661968 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661969 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661970 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661971 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661972 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661973 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661974 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661975 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661976 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661977 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661978 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661979 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661980 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661981 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661982 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661983 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661984 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661985 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661986 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661987 2 0.9954 0.0494 0.460 0.540
#> SRR1661988 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661989 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661990 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661991 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661992 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661993 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661994 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661995 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661996 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661997 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661998 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1661999 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662000 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662001 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662002 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662003 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662004 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662005 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662006 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662007 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662008 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662009 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662010 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662011 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662012 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662013 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662014 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662015 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662016 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662017 2 0.9922 0.1412 0.448 0.552
#> SRR1662018 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662019 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662020 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662021 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662022 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662023 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662024 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662025 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662026 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662027 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662028 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662029 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662030 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662031 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662032 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662033 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662034 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662035 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662036 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662037 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662038 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662039 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662040 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662041 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662042 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662043 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662044 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662045 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662046 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662047 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662048 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662049 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662050 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662051 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662052 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662053 2 0.8081 0.5644 0.248 0.752
#> SRR1662054 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662055 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662056 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662057 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662058 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662059 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662060 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662061 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662062 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662063 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662064 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662065 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662066 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662067 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662068 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662069 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662070 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662071 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662072 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662073 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662074 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662075 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662076 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662077 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662078 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662079 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662080 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662081 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662082 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662083 2 0.9909 0.1134 0.444 0.556
#> SRR1662084 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662085 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662086 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662087 2 0.9608 0.3046 0.384 0.616
#> SRR1662088 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662089 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662090 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662091 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662092 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662093 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662094 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662095 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662096 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662097 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662098 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662099 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662100 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662101 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662102 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662103 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662104 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662105 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662106 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662107 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662108 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662109 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662110 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662111 2 0.9993 0.0690 0.484 0.516
#> SRR1662112 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662113 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662114 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662115 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662116 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
#> SRR1662117 2 0.9580 0.3091 0.380 0.620
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661717 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661718 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661719 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661720 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661721 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661722 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661723 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661724 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661725 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661726 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661727 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661728 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661729 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661730 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661731 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661732 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661733 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661734 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661735 2 0.0237 0.738 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661736 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.739 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661797 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661798 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661799 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661800 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661801 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661802 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661803 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661804 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661805 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661806 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661807 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661808 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661809 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661810 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661811 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661812 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661813 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661814 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661815 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661816 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661817 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661818 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661819 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661820 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661821 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661822 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661823 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661824 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661825 2 0.0424 0.737 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661826 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661827 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661828 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661829 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661830 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661831 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661832 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661833 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661834 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661835 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661836 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661837 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661838 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661839 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661840 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661841 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661843 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661844 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661845 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661846 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661847 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661848 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661849 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661850 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661851 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661852 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661853 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661854 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661855 1 0.3589 0.413 0.900 0.048 0.052
#> SRR1661856 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661857 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661858 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661859 3 0.8957 0.997 0.376 0.132 0.492
#> SRR1661860 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661861 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661862 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661863 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661864 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661865 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661866 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661867 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661868 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661869 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661870 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661871 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661872 3 0.8957 0.997 0.376 0.132 0.492
#> SRR1661873 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661874 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661875 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661876 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661877 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661878 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661879 3 0.8957 0.997 0.376 0.132 0.492
#> SRR1661880 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661881 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661882 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661883 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661884 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661885 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661886 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661887 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661888 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661889 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661890 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661891 3 0.8947 1.000 0.372 0.132 0.496
#> SRR1661892 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661893 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661894 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661895 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661896 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661897 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661898 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661899 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661900 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661901 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661902 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661903 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661904 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661905 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661906 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661907 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661908 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661909 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661910 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661911 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661912 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661913 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661914 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661915 1 0.1999 0.413 0.952 0.036 0.012
#> SRR1661916 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661917 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661918 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661919 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661920 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661921 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661922 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661923 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661924 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661925 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661926 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661927 1 0.2173 0.431 0.944 0.048 0.008
#> SRR1661928 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661929 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661930 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661931 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661932 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661933 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661934 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661935 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661936 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661937 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661938 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661939 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661940 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661941 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661942 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661943 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661944 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661945 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661946 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661947 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661948 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661949 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661950 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661951 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661952 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661953 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661954 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661955 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661956 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661957 2 0.8505 0.481 0.144 0.600 0.256
#> SRR1661958 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661959 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661960 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661961 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661962 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661963 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661964 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661965 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661966 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661967 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661968 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661969 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661970 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661971 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661972 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661973 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661974 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661975 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661976 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661977 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661978 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661979 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661980 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661981 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661982 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661983 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661984 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661985 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661986 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661987 1 0.9812 -0.141 0.412 0.340 0.248
#> SRR1661988 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661989 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661990 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661991 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661992 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661993 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661994 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661995 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661996 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661997 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661998 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1661999 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662000 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662001 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662002 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662003 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662004 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662005 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662006 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662007 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662008 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662009 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662010 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662011 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662012 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662013 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662014 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662015 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662016 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662017 1 0.9150 0.481 0.544 0.232 0.224
#> SRR1662018 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662019 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662020 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662021 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662022 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662023 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662024 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662025 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662026 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662027 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662028 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662029 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662030 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662031 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662032 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662033 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662034 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662035 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662036 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662037 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662038 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662039 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662040 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662041 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662042 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662043 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662044 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662045 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662046 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662047 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662048 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662049 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662050 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662051 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662052 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662053 2 0.8173 0.529 0.100 0.600 0.300
#> SRR1662054 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662055 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662056 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662057 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662058 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662059 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662060 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662061 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662062 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662063 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662064 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662065 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662066 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662067 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662068 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662069 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662070 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662071 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662072 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662073 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662074 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662075 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662076 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662077 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662078 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662079 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662080 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662081 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662082 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662083 2 0.9911 -0.139 0.304 0.400 0.296
#> SRR1662084 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662085 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662086 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662087 1 0.9882 0.442 0.408 0.280 0.312
#> SRR1662088 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662089 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662090 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662091 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662092 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662093 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662094 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662095 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662096 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662097 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662098 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662099 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662100 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662101 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662102 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662103 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662104 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662105 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662106 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662107 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662108 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662109 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662110 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662111 1 0.9303 0.457 0.500 0.184 0.316
#> SRR1662112 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662113 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662114 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662115 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662116 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
#> SRR1662117 1 0.9919 0.439 0.396 0.292 0.312
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661717 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661718 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661719 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661720 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661721 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661722 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661723 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661724 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661725 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661726 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661727 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661728 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661729 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661730 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661731 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661732 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661733 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661734 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661735 2 0.1406 0.741 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR1661736 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661737 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661738 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661739 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661740 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661741 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661742 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661743 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661744 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661745 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661746 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661747 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661748 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661749 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661750 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661751 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661752 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661753 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661754 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661755 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661756 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661757 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661758 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661759 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661760 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661761 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661762 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661763 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661764 2 0.1042 0.744 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR1661766 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661767 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661768 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661769 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661770 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661771 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661772 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661773 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661774 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661775 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661776 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661777 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661778 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661779 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661780 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661781 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661782 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661783 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661784 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661785 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661786 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661787 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661788 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661789 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661790 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661791 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661792 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661793 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661794 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661795 2 0.0804 0.741 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1661796 2 0.1545 0.738 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661797 2 0.1545 0.738 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661798 2 0.1545 0.738 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661799 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661800 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661801 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661802 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661803 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661804 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661805 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661806 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661807 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661808 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661809 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661810 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661811 2 0.1545 0.738 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661812 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661813 2 0.1545 0.738 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661814 2 0.1545 0.738 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661815 2 0.1545 0.738 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661816 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661817 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661818 2 0.1545 0.738 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661819 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661820 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661821 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661822 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661823 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661824 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661825 2 0.1489 0.738 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661826 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661827 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661828 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661829 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661830 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661831 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661832 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661833 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661834 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661835 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661836 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661837 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661838 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661839 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661840 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661841 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661843 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661844 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661845 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661846 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661847 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661848 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661849 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661850 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661851 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661852 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661853 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661854 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661855 1 0.2602 0.697 0.908 0.008 0.076 0.008
#> SRR1661856 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661857 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661858 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661859 4 0.5109 0.587 0.160 0.040 0.024 0.776
#> SRR1661860 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661861 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661862 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661863 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661864 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661865 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661866 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661867 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661868 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661869 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661870 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661871 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661872 4 0.5109 0.587 0.160 0.040 0.024 0.776
#> SRR1661873 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661874 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661875 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661876 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661877 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661878 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661879 4 0.5207 0.586 0.160 0.040 0.028 0.772
#> SRR1661880 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661881 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661882 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661883 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661884 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661885 4 0.4735 0.589 0.156 0.040 0.012 0.792
#> SRR1661886 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661887 4 0.4466 0.589 0.156 0.040 0.004 0.800
#> SRR1661888 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661889 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661890 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661891 4 0.4608 0.589 0.156 0.040 0.008 0.796
#> SRR1661892 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661893 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661894 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661895 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661896 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661897 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661898 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661899 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661900 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661901 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661902 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661903 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661904 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661905 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661906 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661907 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661908 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661909 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661910 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661911 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661912 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661913 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661914 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661915 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661916 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661917 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661918 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661919 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661920 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661921 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661922 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661923 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661924 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661925 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661926 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661927 1 0.1452 0.713 0.956 0.008 0.000 0.036
#> SRR1661928 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661929 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661930 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661931 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661932 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661933 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661934 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661935 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661936 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661937 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661938 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661939 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661940 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661941 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661942 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661943 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661944 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661945 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661946 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661947 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661948 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661949 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661950 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661951 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661952 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661953 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661954 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661955 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661956 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661957 2 0.8879 0.297 0.120 0.460 0.124 0.296
#> SRR1661958 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661959 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661960 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661961 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661962 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661963 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661964 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661965 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661966 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661967 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661968 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661969 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661970 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661971 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661972 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661973 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661974 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661975 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661976 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661977 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661978 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661979 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661980 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661981 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661982 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661983 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661984 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661985 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661986 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661987 4 0.9709 0.686 0.272 0.216 0.160 0.352
#> SRR1661988 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661989 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661990 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661991 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661992 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661993 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661994 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661995 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661996 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661997 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661998 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1661999 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662000 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662001 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662002 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662003 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662004 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662005 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662006 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662007 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662008 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662009 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662010 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662011 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662012 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662013 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662014 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662015 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662016 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662017 1 0.8313 -0.156 0.512 0.120 0.292 0.076
#> SRR1662018 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662019 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662020 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662021 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662022 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662023 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662024 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662025 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662026 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662027 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662028 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662029 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662030 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662031 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662032 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662033 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662034 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.256 0.256
#> SRR1662035 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662036 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662037 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662038 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662039 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662040 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662041 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.256 0.256
#> SRR1662042 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662043 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662044 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662045 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662046 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662047 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.256 0.256
#> SRR1662048 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662049 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662050 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662051 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662052 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662053 2 0.8556 0.380 0.040 0.448 0.260 0.252
#> SRR1662054 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662055 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662056 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662057 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662058 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662059 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662060 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662061 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662062 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662063 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662064 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662065 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662066 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662067 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662068 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662069 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662070 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662071 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662072 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662073 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662074 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662075 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662076 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662077 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662078 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662079 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662080 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662081 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662082 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662083 4 0.9438 0.712 0.200 0.240 0.144 0.416
#> SRR1662084 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662085 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662086 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662087 3 0.8305 0.980 0.316 0.164 0.476 0.044
#> SRR1662088 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662089 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662090 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662091 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662092 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662093 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662094 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662095 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662096 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662097 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662098 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662099 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662100 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662101 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662102 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662103 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662104 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662105 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662106 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662107 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662108 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662109 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662110 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662111 3 0.7840 0.690 0.396 0.076 0.468 0.060
#> SRR1662112 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662113 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662114 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662115 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662116 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
#> SRR1662117 3 0.8323 0.992 0.312 0.168 0.476 0.044
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661717 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661718 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661719 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661720 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661721 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661722 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661723 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661724 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661725 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661726 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661727 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661728 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661729 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661730 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661731 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661732 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661733 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661734 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661735 2 0.2833 0.687 0.000 0.888 0.068 0.020 0.024
#> SRR1661736 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661737 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661738 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661739 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661740 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661741 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661742 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661743 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661744 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661745 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661746 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661747 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661748 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661749 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661750 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661751 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661752 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661753 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661754 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661755 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661756 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661757 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661758 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661759 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661760 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661761 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661762 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661763 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661764 2 0.2244 0.693 0.000 0.920 0.040 0.024 0.016
#> SRR1661766 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661767 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661768 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661769 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661770 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661771 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661772 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661773 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661774 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661775 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661776 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661777 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661778 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661779 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661780 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661781 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661782 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661783 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661784 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661785 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661786 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661787 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661788 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661789 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661790 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661791 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661792 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661793 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661794 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661795 2 0.0613 0.695 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1661796 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661797 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661798 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661799 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661800 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661801 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661802 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661803 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661804 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661805 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661806 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661807 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661808 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661809 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661810 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661811 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661812 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661813 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661814 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661815 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661816 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661817 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661818 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661819 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661820 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661821 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661822 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661823 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661824 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661825 2 0.2178 0.681 0.000 0.920 0.048 0.008 0.024
#> SRR1661826 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661827 1 0.3925 0.860 0.828 0.000 0.092 0.032 0.048
#> SRR1661828 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661829 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661830 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661831 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661832 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661833 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661834 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661835 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661836 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661837 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661838 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661839 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661840 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661841 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661843 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661844 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661845 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661846 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661847 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661848 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661849 1 0.3925 0.860 0.828 0.000 0.092 0.032 0.048
#> SRR1661850 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661851 1 0.3925 0.860 0.828 0.000 0.092 0.032 0.048
#> SRR1661852 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661853 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661854 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661855 1 0.3907 0.861 0.828 0.000 0.096 0.032 0.044
#> SRR1661856 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661857 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661858 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661859 3 0.6856 0.977 0.104 0.016 0.560 0.284 0.036
#> SRR1661860 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661861 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661862 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661863 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661864 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661865 3 0.6694 0.995 0.104 0.016 0.584 0.264 0.032
#> SRR1661866 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661867 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661868 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661869 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661870 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661871 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661872 3 0.6769 0.984 0.104 0.016 0.568 0.280 0.032
#> SRR1661873 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661874 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661875 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661876 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661877 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661878 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661879 3 0.6987 0.971 0.104 0.016 0.552 0.284 0.044
#> SRR1661880 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661881 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661882 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661883 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661884 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661885 3 0.6694 0.995 0.104 0.016 0.584 0.264 0.032
#> SRR1661886 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661887 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661888 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661889 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661890 3 0.6640 0.996 0.104 0.016 0.584 0.268 0.028
#> SRR1661891 3 0.6620 0.997 0.104 0.016 0.588 0.264 0.028
#> SRR1661892 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661893 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661894 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661895 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661896 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661897 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661898 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661899 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661900 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661901 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661902 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661903 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661904 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661905 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661906 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661907 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661908 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661909 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661910 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661911 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661912 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661913 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661914 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661915 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661916 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661917 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661918 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661919 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661920 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661921 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661922 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661923 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661924 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661925 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661926 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661927 1 0.1412 0.889 0.952 0.000 0.008 0.036 0.004
#> SRR1661928 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661929 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661930 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661931 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661932 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661933 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661934 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661935 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661936 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661937 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661938 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661939 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661940 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661941 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661942 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661943 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661944 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661945 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661946 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661947 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661948 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661949 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661950 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661951 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661952 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661953 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661954 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661955 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661956 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661957 2 0.9398 0.180 0.068 0.328 0.204 0.228 0.172
#> SRR1661958 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661959 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661960 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661961 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661962 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661963 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661964 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661965 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661966 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661967 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661968 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661969 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661970 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661971 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661972 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661973 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661974 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661975 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661976 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661977 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661978 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661979 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661980 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661981 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661982 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661983 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661984 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661985 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661986 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661987 4 0.4986 0.908 0.168 0.100 0.000 0.724 0.008
#> SRR1661988 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661989 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661990 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661991 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661992 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661993 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661994 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661995 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661996 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661997 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661998 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1661999 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662000 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662001 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662002 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662003 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662004 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662005 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662006 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662007 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662008 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662009 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662010 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662011 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662012 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662013 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662014 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662015 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662016 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662017 5 0.8039 0.728 0.336 0.036 0.076 0.116 0.436
#> SRR1662018 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662019 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662020 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662021 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662022 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662023 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662024 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662025 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662026 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662027 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662028 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662029 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662030 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662031 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662032 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662033 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662034 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662035 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662036 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662037 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662038 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662039 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662040 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662041 2 0.8820 0.288 0.012 0.308 0.204 0.208 0.268
#> SRR1662042 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662043 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662044 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662045 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662046 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662047 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662048 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662049 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662050 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662051 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662052 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662053 2 0.8813 0.288 0.012 0.308 0.200 0.208 0.272
#> SRR1662054 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662055 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662056 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662057 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662058 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662059 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662060 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662061 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662062 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662063 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662064 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662065 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662066 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662067 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662068 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662069 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662070 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662071 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662072 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662073 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662074 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662075 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662076 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662077 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662078 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662079 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662080 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662081 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662082 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662083 4 0.5879 0.904 0.116 0.112 0.036 0.712 0.024
#> SRR1662084 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662085 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662086 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662087 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662088 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662089 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662090 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662091 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662092 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662093 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662094 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662095 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662096 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662097 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662098 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662099 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662100 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662101 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662102 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662103 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662104 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662105 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662106 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662107 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662108 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662109 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662110 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662111 5 0.6258 0.764 0.200 0.040 0.016 0.088 0.656
#> SRR1662112 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662113 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662114 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662115 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662116 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
#> SRR1662117 5 0.6081 0.795 0.164 0.092 0.004 0.064 0.676
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661717 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661718 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661719 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661720 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661721 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661722 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661723 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661724 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661725 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661726 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661727 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661728 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661729 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661730 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661731 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661732 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661733 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661734 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661735 2 0.353 0.850 0.004 0.844 0.080 0.024 0.032 0.016
#> SRR1661736 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661737 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661738 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661739 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661740 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661741 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661742 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661743 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661744 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661745 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661746 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661747 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661748 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661749 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661750 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661751 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661752 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661753 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661754 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661755 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661756 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661757 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661758 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661759 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661760 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661761 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661762 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661763 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661764 2 0.290 0.870 0.004 0.880 0.064 0.012 0.020 0.020
#> SRR1661766 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661767 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661768 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661769 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661770 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661771 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661772 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661773 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661774 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661775 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661776 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661777 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661778 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661779 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661780 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661781 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661782 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661783 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661784 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661785 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661786 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661787 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661788 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661789 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661790 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661791 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661792 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661793 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661794 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661795 2 0.115 0.878 0.000 0.960 0.004 0.004 0.004 0.028
#> SRR1661796 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661797 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661798 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661799 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661800 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661801 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661802 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661803 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661804 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661805 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661806 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661807 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661808 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661809 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661810 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661811 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661812 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661813 2 0.300 0.842 0.004 0.880 0.048 0.020 0.028 0.020
#> SRR1661814 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661815 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661816 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661817 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661818 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661819 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661820 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661821 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661822 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661823 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661824 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661825 2 0.294 0.842 0.000 0.880 0.048 0.020 0.028 0.024
#> SRR1661826 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661827 1 0.441 0.813 0.748 0.000 0.176 0.008 0.028 0.040
#> SRR1661828 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661829 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661830 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661831 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661832 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661833 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661834 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661835 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661836 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661837 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661838 1 0.448 0.813 0.748 0.000 0.172 0.012 0.028 0.040
#> SRR1661839 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661840 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661841 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661843 1 0.438 0.814 0.748 0.000 0.180 0.008 0.028 0.036
#> SRR1661844 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661845 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661846 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661847 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661848 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661849 1 0.441 0.813 0.748 0.000 0.176 0.008 0.028 0.040
#> SRR1661850 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661851 1 0.434 0.814 0.748 0.000 0.180 0.004 0.028 0.040
#> SRR1661852 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661853 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661854 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661855 1 0.426 0.814 0.748 0.000 0.188 0.004 0.028 0.032
#> SRR1661856 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661857 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661858 6 0.462 0.595 0.084 0.024 0.000 0.104 0.024 0.764
#> SRR1661859 6 0.562 0.579 0.084 0.024 0.032 0.108 0.036 0.716
#> SRR1661860 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661861 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661862 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661863 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661864 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661865 6 0.479 0.595 0.084 0.024 0.004 0.100 0.028 0.760
#> SRR1661866 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661867 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661868 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661869 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661870 6 0.462 0.595 0.084 0.024 0.000 0.104 0.024 0.764
#> SRR1661871 6 0.470 0.595 0.084 0.024 0.000 0.104 0.028 0.760
#> SRR1661872 6 0.513 0.588 0.084 0.024 0.008 0.108 0.036 0.740
#> SRR1661873 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661874 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661875 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661876 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661877 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661878 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661879 6 0.586 0.574 0.084 0.024 0.040 0.112 0.040 0.700
#> SRR1661880 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661881 6 0.470 0.595 0.084 0.024 0.000 0.104 0.028 0.760
#> SRR1661882 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661883 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661884 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661885 6 0.516 0.590 0.084 0.024 0.012 0.108 0.032 0.740
#> SRR1661886 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661887 6 0.465 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.028 0.764
#> SRR1661888 6 0.484 0.594 0.084 0.024 0.004 0.104 0.028 0.756
#> SRR1661889 6 0.470 0.595 0.084 0.024 0.000 0.104 0.028 0.760
#> SRR1661890 6 0.458 0.595 0.084 0.024 0.000 0.100 0.024 0.768
#> SRR1661891 6 0.470 0.595 0.084 0.024 0.000 0.104 0.028 0.760
#> SRR1661892 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661893 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661894 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661895 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661896 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661897 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661898 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661899 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661900 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661901 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661902 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661903 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661904 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661905 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661906 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661907 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661908 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661909 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661910 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661911 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661912 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661913 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661914 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661915 1 0.169 0.851 0.936 0.000 0.000 0.032 0.020 0.012
#> SRR1661916 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661917 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661918 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661919 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661920 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661921 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661922 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661923 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661924 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661925 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661926 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661927 1 0.162 0.852 0.940 0.000 0.000 0.028 0.020 0.012
#> SRR1661928 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661929 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661930 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661931 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661932 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661933 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661934 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661935 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661936 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661937 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661938 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661939 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661940 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661941 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661942 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661943 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661944 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661945 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661946 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661947 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661948 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661949 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661950 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661951 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661952 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661953 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661954 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661955 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661956 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661957 6 0.940 0.263 0.044 0.252 0.152 0.160 0.136 0.256
#> SRR1661958 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661959 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661960 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661961 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661962 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661963 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661964 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661965 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661966 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661967 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661968 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661969 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661970 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661971 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661972 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661973 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661974 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661975 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661976 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661977 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661978 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661979 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661980 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661981 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661982 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661983 4 0.459 0.896 0.104 0.080 0.016 0.772 0.012 0.016
#> SRR1661984 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661985 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661986 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661987 4 0.458 0.896 0.104 0.080 0.020 0.772 0.008 0.016
#> SRR1661988 5 0.824 0.659 0.280 0.036 0.092 0.108 0.420 0.064
#> SRR1661989 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1661990 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1661991 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1661992 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1661993 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1661994 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1661995 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1661996 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1661997 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1661998 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1661999 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662000 5 0.824 0.659 0.280 0.036 0.092 0.108 0.420 0.064
#> SRR1662001 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662002 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662003 5 0.824 0.659 0.280 0.036 0.092 0.108 0.420 0.064
#> SRR1662004 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662005 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662006 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662007 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1662008 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.092 0.112 0.420 0.060
#> SRR1662009 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1662010 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662011 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662012 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662013 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.088 0.112 0.420 0.064
#> SRR1662014 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.092 0.112 0.420 0.060
#> SRR1662015 5 0.824 0.659 0.280 0.036 0.092 0.108 0.420 0.064
#> SRR1662016 5 0.824 0.659 0.280 0.036 0.092 0.108 0.420 0.064
#> SRR1662017 5 0.823 0.659 0.280 0.036 0.096 0.108 0.420 0.060
#> SRR1662018 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662019 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662020 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662021 3 0.747 0.995 0.004 0.268 0.476 0.120 0.080 0.052
#> SRR1662022 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662023 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662024 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662025 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662026 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662027 3 0.751 0.992 0.004 0.268 0.472 0.124 0.076 0.056
#> SRR1662028 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662029 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662030 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662031 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662032 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662033 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662034 3 0.772 0.974 0.004 0.268 0.448 0.136 0.084 0.060
#> SRR1662035 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662036 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662037 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662038 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662039 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662040 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662041 3 0.776 0.970 0.004 0.268 0.444 0.136 0.084 0.064
#> SRR1662042 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662043 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662044 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662045 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662046 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662047 3 0.762 0.983 0.004 0.268 0.460 0.128 0.084 0.056
#> SRR1662048 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662049 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662050 3 0.746 0.995 0.004 0.268 0.476 0.124 0.076 0.052
#> SRR1662051 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662052 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662053 3 0.743 0.997 0.004 0.268 0.480 0.120 0.076 0.052
#> SRR1662054 4 0.520 0.894 0.052 0.084 0.024 0.752 0.024 0.064
#> SRR1662055 4 0.519 0.894 0.052 0.084 0.020 0.752 0.028 0.064
#> SRR1662056 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662057 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662058 4 0.519 0.894 0.052 0.084 0.020 0.752 0.028 0.064
#> SRR1662059 4 0.519 0.894 0.052 0.084 0.020 0.752 0.028 0.064
#> SRR1662060 4 0.520 0.894 0.052 0.084 0.024 0.752 0.024 0.064
#> SRR1662061 4 0.520 0.894 0.052 0.084 0.024 0.752 0.024 0.064
#> SRR1662062 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662063 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.020 0.756 0.028 0.060
#> SRR1662064 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662065 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662066 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662067 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.020 0.756 0.028 0.060
#> SRR1662068 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662069 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.020 0.756 0.028 0.060
#> SRR1662070 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662071 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662072 4 0.519 0.894 0.052 0.084 0.020 0.752 0.028 0.064
#> SRR1662073 4 0.520 0.894 0.052 0.084 0.024 0.752 0.024 0.064
#> SRR1662074 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662075 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662076 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.020 0.756 0.028 0.060
#> SRR1662077 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.020 0.756 0.028 0.060
#> SRR1662078 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662079 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662080 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.020 0.756 0.028 0.060
#> SRR1662081 4 0.519 0.894 0.052 0.084 0.020 0.752 0.028 0.064
#> SRR1662082 4 0.514 0.894 0.052 0.084 0.024 0.756 0.024 0.060
#> SRR1662083 4 0.520 0.894 0.052 0.084 0.024 0.752 0.024 0.064
#> SRR1662084 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662085 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662086 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662087 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662088 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662089 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662090 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662091 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662092 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662093 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662094 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662095 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662096 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662097 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662098 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662099 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662100 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662101 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662102 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662103 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662104 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662105 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662106 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662107 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662108 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662109 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662110 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662111 5 0.482 0.735 0.104 0.028 0.032 0.040 0.772 0.024
#> SRR1662112 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662113 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662114 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662115 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662116 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
#> SRR1662117 5 0.367 0.753 0.092 0.044 0.000 0.036 0.824 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.457 0.688 0.843 0.4939 0.517 0.517
#> 3 3 0.720 0.850 0.913 0.3286 0.640 0.405
#> 4 4 0.778 0.746 0.822 0.1114 0.874 0.650
#> 5 5 0.817 0.850 0.835 0.0619 0.891 0.626
#> 6 6 0.809 0.919 0.889 0.0394 0.970 0.859
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661717 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661718 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661719 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661720 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661721 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661722 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661723 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661724 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661725 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661726 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661727 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661728 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661729 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661730 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661731 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661732 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661733 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661734 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661735 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661736 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661737 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661738 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661739 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661740 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661741 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661742 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661743 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661744 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661745 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661746 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661747 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661748 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661749 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661750 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661751 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661752 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661753 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661754 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661755 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661756 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661757 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661758 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661759 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661760 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661761 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661762 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661763 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661764 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661766 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661767 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661768 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661769 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661770 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661771 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661772 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661773 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661774 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661775 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661776 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661777 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661778 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661779 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661780 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661781 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661782 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661783 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661784 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661785 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661786 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661787 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661788 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661789 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661790 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661791 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661792 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661793 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661794 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661795 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661796 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661797 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661798 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661799 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661800 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661801 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661802 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661803 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661804 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661805 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661806 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661807 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661808 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661809 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661810 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661811 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661812 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661813 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661814 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661815 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661816 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661817 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661818 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661819 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661820 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661821 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661822 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661823 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661824 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661825 2 0.8763 0.781 0.296 0.704
#> SRR1661826 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661827 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661828 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661829 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661830 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661831 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661832 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661833 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661834 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661835 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661836 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661837 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661838 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661839 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661840 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661841 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661843 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661844 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661845 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661846 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661847 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661848 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661849 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661850 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661851 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661852 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661853 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661854 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661855 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661856 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661857 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661858 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661859 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661860 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661861 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661862 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661863 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661864 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661865 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661866 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661867 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661868 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661869 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661870 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661871 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661872 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661873 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661874 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661875 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661876 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661877 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661878 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661879 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661880 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661881 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661882 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661883 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661884 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661885 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661886 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661887 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661888 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661889 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661890 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661891 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661892 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661893 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661894 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661895 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661896 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661897 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661898 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661899 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661900 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661901 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661902 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661903 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661904 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661905 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661906 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661907 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661908 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661909 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661910 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661911 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661912 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661913 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661914 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661915 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661916 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661917 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661918 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661919 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661920 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661921 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661922 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661923 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661924 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661925 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661926 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661927 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1661928 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661929 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661930 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661931 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661932 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661933 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661934 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661935 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661936 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661937 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661938 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661939 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661940 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661941 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661942 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661943 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661944 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661945 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661946 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661947 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661948 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661949 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661950 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661951 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661952 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661953 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661954 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661955 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661956 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661957 2 0.4298 0.543 0.088 0.912
#> SRR1661958 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661959 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661960 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661961 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661962 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661963 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661964 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661965 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661966 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661967 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661968 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661969 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661970 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661971 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661972 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661973 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661974 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661975 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661976 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661977 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661978 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661979 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661980 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661981 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661982 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661983 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661984 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661985 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661986 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661987 1 0.0376 0.655 0.996 0.004
#> SRR1661988 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661989 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661990 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661991 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661992 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661993 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661994 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661995 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661996 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661997 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661998 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1661999 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662000 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662001 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662002 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662003 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662004 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662005 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662006 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662007 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662008 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662009 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662010 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662011 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662012 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662013 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662014 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662015 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662016 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662017 2 0.8081 0.290 0.248 0.752
#> SRR1662018 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662019 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662020 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662021 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662022 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662023 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662024 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662025 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662026 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662027 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662028 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662029 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662030 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662031 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662032 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662033 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662034 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662035 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662036 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662037 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662038 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662039 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662040 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662041 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662042 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662043 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662044 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662045 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662046 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662047 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662048 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662049 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662050 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662051 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662052 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662053 2 0.8813 0.779 0.300 0.700
#> SRR1662054 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662055 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662056 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662057 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662058 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662059 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662060 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662061 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662062 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662063 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662064 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662065 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662066 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662067 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662068 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662069 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662070 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662071 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662072 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662073 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662074 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662075 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662076 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662077 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662078 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662079 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662080 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662081 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662082 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662083 1 0.3431 0.587 0.936 0.064
#> SRR1662084 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662085 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662086 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662087 2 0.6343 0.463 0.160 0.840
#> SRR1662088 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662089 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662090 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662091 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662092 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662093 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662094 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662095 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662096 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662097 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662098 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662099 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662100 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662101 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662102 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662103 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662104 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662105 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662106 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662107 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662108 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662109 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662110 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662111 1 0.8763 0.825 0.704 0.296
#> SRR1662112 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662113 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662114 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662115 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662116 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
#> SRR1662117 2 0.6247 0.469 0.156 0.844
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.919 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661827 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661828 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661829 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661830 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661831 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661832 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661833 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661834 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661835 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661836 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661837 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661838 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661839 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661840 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661841 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661843 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661844 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661845 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661846 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661847 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661848 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661849 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661850 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661851 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661852 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661853 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661854 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661855 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661856 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661857 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661858 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661859 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661860 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661861 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661862 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661863 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661864 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661865 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661866 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661867 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661868 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661869 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661870 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661871 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661872 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661873 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661874 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661875 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661876 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661877 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661878 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661879 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661880 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661881 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661882 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661883 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661884 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661885 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661886 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661887 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661888 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661889 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661890 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661891 3 0.0424 0.825 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661892 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661893 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661894 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661895 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661896 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661897 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661898 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661899 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661900 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661901 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661902 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661903 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661904 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661905 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661906 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661907 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661908 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661909 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661910 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661911 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661912 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661913 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661914 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661915 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661916 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661917 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661918 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661919 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661920 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661921 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661922 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661923 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661924 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661925 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661926 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661927 1 0.2066 0.966 0.940 0.000 0.060
#> SRR1661928 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661929 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661930 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661931 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661932 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661933 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661934 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661935 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661936 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661937 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661938 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661939 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661940 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661941 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661942 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661943 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661944 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661945 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661946 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661947 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661948 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661949 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661950 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661951 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661952 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661953 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661954 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661955 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661956 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661957 3 0.8665 0.420 0.124 0.324 0.552
#> SRR1661958 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661959 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661960 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661961 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661962 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661963 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661964 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661965 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661966 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661967 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661968 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661969 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661970 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661971 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661972 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661973 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661974 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661975 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661976 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661977 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661978 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661979 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661980 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661981 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661982 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661983 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661984 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661985 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661986 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661987 3 0.4749 0.790 0.116 0.040 0.844
#> SRR1661988 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662019 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662020 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662021 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662022 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662023 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662024 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662025 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662026 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662027 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662028 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662029 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662030 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662031 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662032 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662033 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662034 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662035 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662036 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662037 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662038 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662039 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662040 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662041 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662042 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662043 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662044 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662045 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662046 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662047 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662048 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662049 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662050 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662051 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662052 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662053 2 0.5588 0.686 0.004 0.720 0.276
#> SRR1662054 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662055 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662056 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662057 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662058 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662059 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662060 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662061 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662062 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662063 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662064 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662065 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662066 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662067 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662068 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662069 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662070 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662071 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662072 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662073 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662074 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662075 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662076 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662077 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662078 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662079 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662080 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662081 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662082 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662083 3 0.2774 0.822 0.008 0.072 0.920
#> SRR1662084 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662085 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662086 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662087 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662088 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662089 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662090 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662091 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662092 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662093 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662094 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662095 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662096 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662097 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662098 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662099 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662100 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662101 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662102 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662103 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662104 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662105 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662106 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662107 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662108 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662109 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662110 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662111 1 0.0237 0.965 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662112 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662113 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662114 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662115 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662116 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662117 1 0.0237 0.965 0.996 0.004 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661827 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661828 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661829 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661830 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661831 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661832 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661833 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661834 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661835 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661836 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661837 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661838 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661839 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661840 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661841 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661843 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661844 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661845 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661846 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661847 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661848 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661849 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661850 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661851 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661852 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661853 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661854 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661855 1 0.5100 0.868 0.756 0.000 0.076 0.168
#> SRR1661856 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 0.647 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661893 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661894 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661895 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661896 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661897 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661898 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661899 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661900 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661901 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661902 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661903 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661904 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661905 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661906 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661907 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661908 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661909 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661910 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661911 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661912 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661913 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661914 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661915 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661916 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661917 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661918 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661919 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661920 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661921 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661922 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661923 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661924 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661925 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661926 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661927 1 0.5272 0.866 0.744 0.000 0.084 0.172
#> SRR1661928 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661929 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661930 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661931 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661932 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661933 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661934 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661935 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661936 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661937 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661938 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661939 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661940 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661941 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661942 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661943 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661944 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661945 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661946 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661947 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661948 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661949 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661950 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661951 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661952 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661953 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661954 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661955 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661956 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661957 3 0.7648 0.637 0.096 0.052 0.564 0.288
#> SRR1661958 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661959 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661960 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661961 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661962 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661963 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661964 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661965 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661966 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661967 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661968 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661969 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661970 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661971 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661972 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661973 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661974 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661975 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661976 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661977 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661978 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661979 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661980 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661981 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661982 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661983 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661984 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661985 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661986 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661987 4 0.5143 0.504 0.004 0.000 0.456 0.540
#> SRR1661988 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661989 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661990 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661991 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661992 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661993 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661994 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661995 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661996 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661997 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661998 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661999 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662000 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662001 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662002 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662003 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662004 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662005 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662006 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662007 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662008 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662009 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662010 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662011 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662012 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662013 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662014 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662015 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662016 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662017 1 0.0524 0.862 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662018 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662019 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662020 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662021 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662022 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662023 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662024 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662025 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662026 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662027 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662028 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662029 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662030 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662031 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662032 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662033 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662034 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662035 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662036 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662037 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662038 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662039 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662040 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662041 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662042 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662043 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662044 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662045 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662046 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662047 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662048 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662049 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662050 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662051 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662052 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662053 4 0.7599 0.156 0.000 0.376 0.200 0.424
#> SRR1662054 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662055 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662056 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662057 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662058 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662059 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662060 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662061 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662062 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662063 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662064 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662065 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662066 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662067 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662068 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662069 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662070 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662071 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662072 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662073 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662074 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662075 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662076 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662077 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662078 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662079 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662080 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662081 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662082 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662083 4 0.5151 0.502 0.000 0.004 0.464 0.532
#> SRR1662084 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662085 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662086 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662087 1 0.0672 0.859 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1662088 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662089 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662090 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662091 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662092 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662093 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662094 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662095 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662096 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662097 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662098 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662099 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662100 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662101 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662102 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662103 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662104 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662105 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662106 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662107 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662108 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662109 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662110 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662111 1 0.0188 0.862 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662112 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662113 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662114 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662115 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662116 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1662117 1 0.1256 0.853 0.964 0.028 0.000 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0162 0.996 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0324 0.996 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.996 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661827 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661828 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661829 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661830 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661831 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661832 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661833 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661834 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661835 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661836 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661837 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661838 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661839 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661840 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661841 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661843 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661844 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661845 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661846 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661847 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661848 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661849 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661850 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661851 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661852 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661853 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661854 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661855 1 0.3969 0.977 0.692 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1661856 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661857 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661858 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661859 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661860 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661861 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661862 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661863 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661864 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661865 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661866 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661867 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661868 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661869 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661870 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661871 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661872 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661873 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661874 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661875 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661876 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661877 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661878 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661879 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661880 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661881 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661882 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661883 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661884 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661885 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661886 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661887 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661888 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661889 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661890 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661891 3 0.5600 0.416 0.096 0.000 0.588 0.316 0.000
#> SRR1661892 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661893 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661894 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661895 1 0.3968 0.979 0.716 0.000 0.004 0.004 0.276
#> SRR1661896 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661897 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661898 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661899 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661900 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661901 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661902 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661903 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661904 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661905 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661906 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661907 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661908 1 0.3968 0.979 0.716 0.000 0.004 0.004 0.276
#> SRR1661909 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661910 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661911 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661912 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661913 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661914 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661915 1 0.3968 0.979 0.716 0.000 0.004 0.004 0.276
#> SRR1661916 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661917 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661918 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661919 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661920 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661921 1 0.3968 0.979 0.716 0.000 0.004 0.004 0.276
#> SRR1661922 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661923 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661924 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661925 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661926 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661927 1 0.3992 0.981 0.712 0.000 0.004 0.004 0.280
#> SRR1661928 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661929 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661930 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661931 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661932 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661933 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661934 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661935 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661936 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661937 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661938 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661939 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661940 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661941 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661942 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661943 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661944 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661945 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661946 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661947 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661948 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661949 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661950 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661951 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661952 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661953 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661954 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661955 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661956 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661957 3 0.2029 0.568 0.004 0.008 0.932 0.028 0.028
#> SRR1661958 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661959 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661960 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661961 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661962 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661963 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661964 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661965 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661966 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661967 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661968 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661969 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661970 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661971 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661972 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661973 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661974 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661975 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661976 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661977 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661978 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661979 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661980 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661981 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661982 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661983 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661984 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661985 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661986 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661987 4 0.0566 0.982 0.012 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR1661988 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661989 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661990 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661991 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661992 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661993 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661994 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661995 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661996 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661997 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661998 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1661999 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662000 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662001 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662002 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662003 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662004 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662005 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662006 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662007 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662008 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662009 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662010 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662011 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662012 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662013 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662014 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662015 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662016 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662017 5 0.1357 0.961 0.048 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662018 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662019 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662020 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662021 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662022 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662023 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662024 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662025 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662026 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662027 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662028 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662029 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662030 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662031 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662032 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662033 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662034 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662035 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662036 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662037 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662038 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662039 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662040 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662041 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662042 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662043 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662044 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662045 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662046 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662047 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662048 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662049 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662050 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662051 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662052 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662053 3 0.8640 0.423 0.240 0.268 0.340 0.140 0.012
#> SRR1662054 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662055 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662056 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662057 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662058 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662059 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662060 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662061 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662062 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662063 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662064 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662065 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662066 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662067 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662068 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662069 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662070 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662071 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662072 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662073 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662074 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662075 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662076 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662077 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662078 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662079 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662080 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662081 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662082 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662083 4 0.0693 0.982 0.008 0.000 0.012 0.980 0.000
#> SRR1662084 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662085 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662086 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662087 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662088 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662089 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662090 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662091 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662092 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662093 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662094 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662095 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662096 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662097 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662098 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662099 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662100 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662101 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662102 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662103 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662104 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662105 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662106 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662107 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662108 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662109 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662110 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662111 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662112 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662113 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662114 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662115 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662116 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662117 5 0.0162 0.967 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661717 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661718 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661719 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661720 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661721 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661722 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661723 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661724 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661725 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661726 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661727 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661728 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661729 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661730 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661731 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661732 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661733 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661734 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661735 2 0.0551 0.985 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661736 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661737 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661738 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661739 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661740 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661741 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661742 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661743 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661744 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661745 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661746 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661747 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661748 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661749 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661750 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661751 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661752 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661753 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661754 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661755 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661756 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661757 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661758 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661759 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661760 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661761 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661762 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661763 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661764 2 0.0551 0.986 0.004 0.984 0.008 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661766 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0260 0.988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661797 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661798 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661799 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661800 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661801 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661802 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661803 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661804 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661805 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661806 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661807 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661808 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661809 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661810 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661811 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661812 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661813 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661814 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661815 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661816 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661817 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661818 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661819 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661820 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661821 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661822 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661823 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661824 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661825 2 0.0436 0.988 0.004 0.988 0.004 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661826 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661827 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661828 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661829 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661830 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661831 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661832 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661833 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661834 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661835 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661836 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661837 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661838 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661839 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661840 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661841 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661843 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661844 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661845 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661846 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661847 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661848 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661849 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661850 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661851 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661852 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661853 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661854 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661855 1 0.3164 0.939 0.824 0.000 0.032 0.000 0.140 0.004
#> SRR1661856 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661857 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661858 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661859 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661860 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661861 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661862 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661863 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661864 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661865 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661866 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661867 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661868 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661869 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661870 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661871 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661872 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661873 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661874 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661875 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661876 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661877 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661878 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661879 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661880 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661881 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661882 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661883 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661884 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661885 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661886 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661887 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661888 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661889 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661890 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661891 6 0.5461 0.799 0.076 0.000 0.080 0.180 0.000 0.664
#> SRR1661892 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661893 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661894 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661895 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661896 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661897 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661898 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661899 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661900 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661901 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661902 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661903 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661904 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661905 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661906 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661907 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661908 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661909 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661910 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661911 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661912 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661913 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661914 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661915 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661916 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661917 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661918 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661919 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661920 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661921 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661922 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661923 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661924 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661925 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661926 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661927 1 0.1501 0.952 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1661928 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661929 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661930 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661931 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661932 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661933 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661934 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661935 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661936 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661937 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661938 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661939 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661940 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661941 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661942 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661943 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661944 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661945 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661946 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661947 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661948 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661949 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661950 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661951 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661952 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661953 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661954 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661955 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661956 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661957 6 0.2220 0.758 0.004 0.000 0.060 0.012 0.016 0.908
#> SRR1661958 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661959 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661960 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661961 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661962 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661963 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661964 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661965 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661966 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661967 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661968 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661969 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661970 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661971 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661972 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661973 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661974 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661975 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661976 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661977 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661978 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661979 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661980 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661981 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661982 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661983 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661984 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661985 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661986 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661987 4 0.0146 0.934 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1661988 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661989 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661990 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661991 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661992 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661993 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661994 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661995 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661996 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661997 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661998 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1661999 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662000 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662001 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662002 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662003 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662004 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662005 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662006 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662007 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662008 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662009 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662010 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662011 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662012 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662013 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662014 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662015 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662016 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662017 5 0.4727 0.841 0.148 0.000 0.100 0.000 0.724 0.028
#> SRR1662018 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662019 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662020 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662021 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662022 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662023 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662024 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662025 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662026 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662027 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662028 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662029 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662030 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662031 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662032 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662033 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662034 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662035 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662036 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662037 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662038 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662039 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662040 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662041 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662042 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662043 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662044 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662045 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662046 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662047 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662048 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662049 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662050 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662051 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662052 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662053 3 0.4400 1.000 0.000 0.148 0.760 0.044 0.004 0.044
#> SRR1662054 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662055 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662056 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662057 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662058 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662059 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662060 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662061 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662062 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662063 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662064 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662065 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662066 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662067 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662068 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662069 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662070 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662071 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662072 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662073 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662074 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662075 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662076 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662077 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662078 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662079 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662080 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662081 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662082 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662083 4 0.2737 0.934 0.024 0.000 0.096 0.868 0.000 0.012
#> SRR1662084 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662085 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662086 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662087 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662088 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662089 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662090 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662091 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662092 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662093 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662094 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662095 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662096 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662097 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662098 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662099 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662100 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662101 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662102 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662103 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662104 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662105 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662106 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662107 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662108 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662109 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662110 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662111 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662112 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662113 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662114 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662115 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662116 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662117 5 0.0260 0.871 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.939 0.914 0.960 0.465 0.552 0.552
#> 3 3 0.844 0.886 0.944 0.138 0.955 0.919
#> 4 4 0.886 0.919 0.960 0.138 0.904 0.811
#> 5 5 0.740 0.895 0.933 0.153 0.910 0.784
#> 6 6 0.925 0.915 0.956 0.139 0.895 0.678
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661929 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661930 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661931 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661932 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661933 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661934 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661935 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661936 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661937 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661938 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661939 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661940 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661941 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661942 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661943 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661944 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661945 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661946 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661947 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661948 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661949 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661950 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661951 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661952 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661953 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661954 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661955 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661956 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661957 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1661958 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661959 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661960 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661961 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661962 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661963 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661964 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661965 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661966 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661967 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661968 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661969 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661970 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661971 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661972 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661973 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661974 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661975 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661976 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661977 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661978 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661979 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661980 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661981 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661982 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661983 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661984 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661985 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661986 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661987 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1661988 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.938 0.000 1.000
#> SRR1662054 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662055 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662056 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662057 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662058 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662059 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662060 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662061 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662062 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662063 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662064 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662065 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662066 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662067 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662068 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662069 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662070 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662071 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662072 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662073 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662074 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662075 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662076 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662077 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662078 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662079 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662080 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662081 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662082 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662083 2 0.402 0.900 0.080 0.920
#> SRR1662084 2 0.909 0.559 0.324 0.676
#> SRR1662085 2 0.955 0.452 0.376 0.624
#> SRR1662086 2 0.955 0.452 0.376 0.624
#> SRR1662087 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662088 2 0.904 0.566 0.320 0.680
#> SRR1662089 2 0.946 0.479 0.364 0.636
#> SRR1662090 2 0.936 0.504 0.352 0.648
#> SRR1662091 2 0.961 0.433 0.384 0.616
#> SRR1662092 2 0.949 0.470 0.368 0.632
#> SRR1662093 1 0.987 0.162 0.568 0.432
#> SRR1662094 2 0.921 0.536 0.336 0.664
#> SRR1662095 2 0.952 0.461 0.372 0.628
#> SRR1662096 2 0.955 0.452 0.376 0.624
#> SRR1662097 2 0.939 0.496 0.356 0.644
#> SRR1662098 2 0.943 0.487 0.360 0.640
#> SRR1662099 2 0.958 0.443 0.380 0.620
#> SRR1662100 2 0.925 0.529 0.340 0.660
#> SRR1662101 2 0.861 0.627 0.284 0.716
#> SRR1662102 2 0.891 0.587 0.308 0.692
#> SRR1662103 2 0.876 0.607 0.296 0.704
#> SRR1662104 2 0.886 0.594 0.304 0.696
#> SRR1662105 2 0.936 0.505 0.352 0.648
#> SRR1662106 2 0.966 0.413 0.392 0.608
#> SRR1662107 2 0.963 0.423 0.388 0.612
#> SRR1662108 2 0.958 0.443 0.380 0.620
#> SRR1662109 2 0.969 0.403 0.396 0.604
#> SRR1662110 2 0.949 0.470 0.368 0.632
#> SRR1662111 1 0.000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1662112 2 0.925 0.529 0.340 0.660
#> SRR1662113 2 0.936 0.504 0.352 0.648
#> SRR1662114 1 0.981 0.178 0.580 0.420
#> SRR1662115 2 0.921 0.536 0.336 0.664
#> SRR1662116 2 0.913 0.551 0.328 0.672
#> SRR1662117 2 0.921 0.537 0.336 0.664
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661717 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661718 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661719 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661720 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661721 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661722 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661723 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661724 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661725 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661726 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661727 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661728 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661729 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661730 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661731 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661732 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661733 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661734 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661735 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661736 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661737 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661738 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661739 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661740 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661741 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661742 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661743 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661744 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661745 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661746 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661747 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661748 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661749 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661750 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661751 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661752 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661753 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661754 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661755 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661756 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661757 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661758 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661759 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661760 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661761 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661762 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661763 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661764 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661766 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661767 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661768 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661769 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661770 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661771 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661772 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661773 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661774 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661775 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661776 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661777 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661778 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661779 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661780 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661781 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661782 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661783 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661784 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661785 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661786 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661787 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661788 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661789 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661790 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661791 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661792 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661793 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661794 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661795 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661796 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661797 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661798 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661799 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661800 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661801 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661802 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661803 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661804 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661805 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661806 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661807 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661808 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661809 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661810 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661811 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661812 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661813 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661814 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661815 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661816 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661817 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661818 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661819 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661820 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661821 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661822 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661823 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661824 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661825 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1661826 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661827 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661828 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661829 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661830 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661831 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661832 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661833 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661834 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661835 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661836 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661837 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661838 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661839 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661840 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661841 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661843 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661844 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661845 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661846 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661847 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661848 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661849 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661850 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661851 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661852 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661853 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661854 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661855 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661856 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661857 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661858 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661859 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661860 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661861 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661862 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661863 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661864 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661865 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661866 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661867 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661868 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661869 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661870 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661871 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661872 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661873 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661874 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661875 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661876 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661877 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661878 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661879 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661880 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661881 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661882 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661883 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661884 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661885 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661886 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661887 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661888 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661889 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661890 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661891 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1.0
#> SRR1661892 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661893 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661894 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661895 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661896 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661897 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661898 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661899 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661900 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661901 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661902 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661903 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661904 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661905 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661906 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661907 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661908 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661909 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661910 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661911 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661912 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661913 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661914 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661915 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661916 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661917 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661918 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661919 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661920 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661921 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661922 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661923 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661924 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661925 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661926 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661927 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661928 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661929 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661930 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661931 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661932 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661933 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661934 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661935 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661936 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661937 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661938 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661939 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661940 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661941 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661942 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661943 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661944 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661945 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661946 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661947 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661948 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661949 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661950 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661951 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661952 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661953 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661954 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661955 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661956 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661957 2 0.455 0.7641 0.000 0.800 0.2
#> SRR1661958 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661959 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661960 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661961 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661962 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661963 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661964 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661965 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661966 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661967 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661968 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661969 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661970 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661971 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661972 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661973 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661974 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661975 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661976 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661977 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661978 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661979 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661980 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661981 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661982 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661983 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661984 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661985 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661986 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661987 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1661988 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661989 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661990 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661991 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661992 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661993 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661994 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661995 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661996 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661997 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661998 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661999 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662000 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662001 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662002 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662003 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662004 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662005 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662006 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662007 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662008 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662009 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662010 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662011 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662012 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662013 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662014 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662015 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662016 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662017 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662018 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662019 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662020 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662021 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662022 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662023 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662024 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662025 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662026 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662027 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662028 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662029 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662030 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662031 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662032 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662033 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662034 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662035 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662036 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662037 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662038 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662039 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662040 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662041 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662042 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662043 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662044 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662045 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662046 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662047 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662048 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662049 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662050 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662051 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662052 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662053 2 0.000 0.9086 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662054 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662055 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662056 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662057 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662058 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662059 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662060 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662061 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662062 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662063 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662064 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662065 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662066 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662067 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662068 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662069 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662070 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662071 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662072 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662073 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662074 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662075 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662076 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662077 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662078 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662079 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662080 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662081 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662082 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662083 2 0.254 0.8770 0.080 0.920 0.0
#> SRR1662084 2 0.576 0.5733 0.328 0.672 0.0
#> SRR1662085 2 0.603 0.4788 0.376 0.624 0.0
#> SRR1662086 2 0.603 0.4784 0.376 0.624 0.0
#> SRR1662087 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662088 2 0.586 0.5442 0.344 0.656 0.0
#> SRR1662089 2 0.595 0.5127 0.360 0.640 0.0
#> SRR1662090 2 0.593 0.5210 0.356 0.644 0.0
#> SRR1662091 2 0.604 0.4696 0.380 0.620 0.0
#> SRR1662092 2 0.601 0.4874 0.372 0.628 0.0
#> SRR1662093 1 0.627 0.0396 0.548 0.452 0.0
#> SRR1662094 2 0.583 0.5515 0.340 0.660 0.0
#> SRR1662095 2 0.603 0.4784 0.376 0.624 0.0
#> SRR1662096 2 0.608 0.4513 0.388 0.612 0.0
#> SRR1662097 2 0.595 0.5127 0.360 0.640 0.0
#> SRR1662098 2 0.597 0.5042 0.364 0.636 0.0
#> SRR1662099 2 0.606 0.4606 0.384 0.616 0.0
#> SRR1662100 2 0.593 0.5214 0.356 0.644 0.0
#> SRR1662101 2 0.543 0.6454 0.284 0.716 0.0
#> SRR1662102 2 0.568 0.5938 0.316 0.684 0.0
#> SRR1662103 2 0.553 0.6266 0.296 0.704 0.0
#> SRR1662104 2 0.565 0.6007 0.312 0.688 0.0
#> SRR1662105 2 0.588 0.5366 0.348 0.652 0.0
#> SRR1662106 2 0.613 0.4222 0.400 0.600 0.0
#> SRR1662107 2 0.608 0.4512 0.388 0.612 0.0
#> SRR1662108 2 0.604 0.4696 0.380 0.620 0.0
#> SRR1662109 2 0.613 0.4221 0.400 0.600 0.0
#> SRR1662110 2 0.597 0.5048 0.364 0.636 0.0
#> SRR1662111 1 0.000 0.9860 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662112 2 0.583 0.5515 0.340 0.660 0.0
#> SRR1662113 2 0.599 0.4960 0.368 0.632 0.0
#> SRR1662114 1 0.620 0.1220 0.576 0.424 0.0
#> SRR1662115 2 0.590 0.5288 0.352 0.648 0.0
#> SRR1662116 2 0.588 0.5364 0.348 0.652 0.0
#> SRR1662117 2 0.588 0.5368 0.348 0.652 0.0
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.000 0.0 1.0 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.887 1.000 0.0 0.0 0.000
#> SRR1661928 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661929 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661930 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661931 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661932 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661933 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661934 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661935 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661936 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661937 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661938 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661939 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661940 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661941 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661942 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661943 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661944 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661945 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661946 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661947 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661948 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661949 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661950 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661951 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661952 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661953 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661954 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661955 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661956 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661957 2 0.361 0.781 0.000 0.8 0.2 0.000
#> SRR1661958 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661959 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661960 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661961 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661962 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661963 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661964 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661965 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661966 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661967 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661968 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661969 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661970 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661971 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661972 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661973 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661974 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661975 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661976 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661977 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661978 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661979 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661980 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661981 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661982 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661983 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661984 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661985 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661986 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661987 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1661988 1 0.485 0.514 0.600 0.0 0.0 0.400
#> SRR1661989 1 0.448 0.655 0.688 0.0 0.0 0.312
#> SRR1661990 1 0.464 0.610 0.656 0.0 0.0 0.344
#> SRR1661991 1 0.475 0.573 0.632 0.0 0.0 0.368
#> SRR1661992 1 0.454 0.639 0.676 0.0 0.0 0.324
#> SRR1661993 1 0.438 0.672 0.704 0.0 0.0 0.296
#> SRR1661994 1 0.433 0.682 0.712 0.0 0.0 0.288
#> SRR1661995 1 0.485 0.514 0.600 0.0 0.0 0.400
#> SRR1661996 1 0.475 0.573 0.632 0.0 0.0 0.368
#> SRR1661997 1 0.484 0.522 0.604 0.0 0.0 0.396
#> SRR1661998 1 0.489 0.489 0.588 0.0 0.0 0.412
#> SRR1661999 1 0.438 0.672 0.704 0.0 0.0 0.296
#> SRR1662000 1 0.445 0.659 0.692 0.0 0.0 0.308
#> SRR1662001 1 0.450 0.649 0.684 0.0 0.0 0.316
#> SRR1662002 1 0.462 0.616 0.660 0.0 0.0 0.340
#> SRR1662003 1 0.448 0.653 0.688 0.0 0.0 0.312
#> SRR1662004 1 0.488 0.498 0.592 0.0 0.0 0.408
#> SRR1662005 1 0.413 0.708 0.740 0.0 0.0 0.260
#> SRR1662006 1 0.485 0.514 0.600 0.0 0.0 0.400
#> SRR1662007 4 0.499 -0.174 0.468 0.0 0.0 0.532
#> SRR1662008 1 0.476 0.566 0.628 0.0 0.0 0.372
#> SRR1662009 1 0.495 0.413 0.556 0.0 0.0 0.444
#> SRR1662010 1 0.466 0.605 0.652 0.0 0.0 0.348
#> SRR1662011 1 0.407 0.715 0.748 0.0 0.0 0.252
#> SRR1662012 1 0.413 0.708 0.740 0.0 0.0 0.260
#> SRR1662013 1 0.456 0.633 0.672 0.0 0.0 0.328
#> SRR1662014 1 0.478 0.559 0.624 0.0 0.0 0.376
#> SRR1662015 1 0.436 0.676 0.708 0.0 0.0 0.292
#> SRR1662016 1 0.344 0.769 0.816 0.0 0.0 0.184
#> SRR1662017 1 0.422 0.696 0.728 0.0 0.0 0.272
#> SRR1662018 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662054 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662055 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662056 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662057 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662058 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662059 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662060 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662061 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662062 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662063 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662064 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662065 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662066 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662067 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662068 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662069 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662070 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662071 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662072 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662073 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662074 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662075 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662076 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662077 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662078 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662079 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662080 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662081 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662082 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662083 2 0.000 0.973 0.000 1.0 0.0 0.000
#> SRR1662084 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662085 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662086 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662087 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662088 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662089 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662090 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662091 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662092 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662093 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662094 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662095 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662096 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662097 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662098 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662099 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662100 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662101 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662102 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662103 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662104 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662105 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662106 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662107 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662108 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662109 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662110 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662111 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662112 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662113 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662114 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662115 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662116 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
#> SRR1662117 4 0.000 0.982 0.000 0.0 0.0 1.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.927 0.000 1.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661929 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661930 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661931 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661932 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661933 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661934 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661935 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661936 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661937 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661938 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661939 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661940 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661941 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661942 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661943 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661944 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661945 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661946 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661947 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661948 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661949 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661950 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661951 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661952 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661953 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661954 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661955 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661956 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661957 2 0.311 0.772 0.000 0.800 0.2 0.000 0.000
#> SRR1661958 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661959 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661960 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661961 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661962 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661963 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661964 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661965 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661966 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661967 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661968 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661969 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661970 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661971 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661972 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661973 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661974 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661975 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661976 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661977 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661978 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661979 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661980 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661981 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661982 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661983 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661984 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661985 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661986 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661987 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1661988 1 0.418 0.514 0.600 0.000 0.0 0.000 0.400
#> SRR1661989 1 0.386 0.655 0.688 0.000 0.0 0.000 0.312
#> SRR1661990 1 0.400 0.610 0.656 0.000 0.0 0.000 0.344
#> SRR1661991 1 0.409 0.573 0.632 0.000 0.0 0.000 0.368
#> SRR1661992 1 0.391 0.639 0.676 0.000 0.0 0.000 0.324
#> SRR1661993 1 0.377 0.672 0.704 0.000 0.0 0.000 0.296
#> SRR1661994 1 0.373 0.682 0.712 0.000 0.0 0.000 0.288
#> SRR1661995 1 0.418 0.514 0.600 0.000 0.0 0.000 0.400
#> SRR1661996 1 0.409 0.573 0.632 0.000 0.0 0.000 0.368
#> SRR1661997 1 0.417 0.522 0.604 0.000 0.0 0.000 0.396
#> SRR1661998 1 0.421 0.489 0.588 0.000 0.0 0.000 0.412
#> SRR1661999 1 0.377 0.672 0.704 0.000 0.0 0.000 0.296
#> SRR1662000 1 0.384 0.659 0.692 0.000 0.0 0.000 0.308
#> SRR1662001 1 0.388 0.649 0.684 0.000 0.0 0.000 0.316
#> SRR1662002 1 0.398 0.616 0.660 0.000 0.0 0.000 0.340
#> SRR1662003 1 0.386 0.653 0.688 0.000 0.0 0.000 0.312
#> SRR1662004 1 0.420 0.498 0.592 0.000 0.0 0.000 0.408
#> SRR1662005 1 0.356 0.708 0.740 0.000 0.0 0.000 0.260
#> SRR1662006 1 0.418 0.514 0.600 0.000 0.0 0.000 0.400
#> SRR1662007 5 0.429 -0.174 0.468 0.000 0.0 0.000 0.532
#> SRR1662008 1 0.410 0.566 0.628 0.000 0.0 0.000 0.372
#> SRR1662009 1 0.427 0.413 0.556 0.000 0.0 0.000 0.444
#> SRR1662010 1 0.402 0.605 0.652 0.000 0.0 0.000 0.348
#> SRR1662011 1 0.351 0.715 0.748 0.000 0.0 0.000 0.252
#> SRR1662012 1 0.356 0.708 0.740 0.000 0.0 0.000 0.260
#> SRR1662013 1 0.393 0.633 0.672 0.000 0.0 0.000 0.328
#> SRR1662014 1 0.411 0.559 0.624 0.000 0.0 0.000 0.376
#> SRR1662015 1 0.375 0.676 0.708 0.000 0.0 0.000 0.292
#> SRR1662016 1 0.297 0.769 0.816 0.000 0.0 0.000 0.184
#> SRR1662017 1 0.364 0.696 0.728 0.000 0.0 0.000 0.272
#> SRR1662018 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662019 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662020 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662021 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662022 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662023 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662024 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662025 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662026 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662027 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662028 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662029 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662030 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662031 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662032 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662033 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662034 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662035 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662036 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662037 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662038 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662039 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662040 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662041 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662042 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662043 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662044 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662045 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662046 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662047 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662048 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662049 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662050 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662051 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662052 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662053 4 0.207 1.000 0.000 0.104 0.0 0.896 0.000
#> SRR1662054 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662055 2 0.228 0.888 0.000 0.880 0.0 0.120 0.000
#> SRR1662056 2 0.228 0.888 0.000 0.880 0.0 0.120 0.000
#> SRR1662057 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662058 2 0.228 0.888 0.000 0.880 0.0 0.120 0.000
#> SRR1662059 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662060 2 0.228 0.888 0.000 0.880 0.0 0.120 0.000
#> SRR1662061 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662062 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662063 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662064 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662065 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662066 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662067 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662068 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662069 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662070 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662071 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662072 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662073 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662074 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662075 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662076 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662077 2 0.228 0.888 0.000 0.880 0.0 0.120 0.000
#> SRR1662078 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662079 2 0.228 0.888 0.000 0.880 0.0 0.120 0.000
#> SRR1662080 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662081 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662082 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662083 2 0.223 0.890 0.000 0.884 0.0 0.116 0.000
#> SRR1662084 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662085 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662086 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662087 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662088 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662089 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662090 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662091 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662092 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662093 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662094 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662095 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662096 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662097 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662098 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662099 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662100 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662101 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662102 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662103 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662104 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662105 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662106 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662107 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662108 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662109 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662110 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662111 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662112 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662113 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662114 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662115 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662116 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
#> SRR1662117 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.946 0.000 1.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.887 1.000 0.000 0.0 0 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.448 0.691 0.000 0.700 0.2 0 0.000 0.100
#> SRR1661929 2 0.429 0.711 0.000 0.716 0.2 0 0.000 0.084
#> SRR1661930 2 0.347 0.769 0.000 0.772 0.2 0 0.000 0.028
#> SRR1661931 2 0.323 0.778 0.000 0.784 0.2 0 0.000 0.016
#> SRR1661932 2 0.387 0.747 0.000 0.748 0.2 0 0.000 0.052
#> SRR1661933 2 0.314 0.780 0.000 0.788 0.2 0 0.000 0.012
#> SRR1661934 2 0.456 0.681 0.000 0.692 0.2 0 0.000 0.108
#> SRR1661935 2 0.339 0.771 0.000 0.776 0.2 0 0.000 0.024
#> SRR1661936 2 0.323 0.778 0.000 0.784 0.2 0 0.000 0.016
#> SRR1661937 2 0.398 0.738 0.000 0.740 0.2 0 0.000 0.060
#> SRR1661938 2 0.331 0.775 0.000 0.780 0.2 0 0.000 0.020
#> SRR1661939 2 0.314 0.780 0.000 0.788 0.2 0 0.000 0.012
#> SRR1661940 2 0.520 0.566 0.000 0.616 0.2 0 0.000 0.184
#> SRR1661941 2 0.347 0.768 0.000 0.772 0.2 0 0.000 0.028
#> SRR1661942 2 0.354 0.765 0.000 0.768 0.2 0 0.000 0.032
#> SRR1661943 2 0.398 0.738 0.000 0.740 0.2 0 0.000 0.060
#> SRR1661944 2 0.354 0.765 0.000 0.768 0.2 0 0.000 0.032
#> SRR1661945 2 0.304 0.783 0.000 0.792 0.2 0 0.000 0.008
#> SRR1661946 2 0.368 0.758 0.000 0.760 0.2 0 0.000 0.040
#> SRR1661947 2 0.339 0.772 0.000 0.776 0.2 0 0.000 0.024
#> SRR1661948 2 0.331 0.775 0.000 0.780 0.2 0 0.000 0.020
#> SRR1661949 2 0.381 0.750 0.000 0.752 0.2 0 0.000 0.048
#> SRR1661950 2 0.339 0.772 0.000 0.776 0.2 0 0.000 0.024
#> SRR1661951 2 0.414 0.725 0.000 0.728 0.2 0 0.000 0.072
#> SRR1661952 2 0.439 0.702 0.000 0.708 0.2 0 0.000 0.092
#> SRR1661953 2 0.393 0.743 0.000 0.744 0.2 0 0.000 0.056
#> SRR1661954 2 0.381 0.751 0.000 0.752 0.2 0 0.000 0.048
#> SRR1661955 2 0.387 0.747 0.000 0.748 0.2 0 0.000 0.052
#> SRR1661956 2 0.323 0.778 0.000 0.784 0.2 0 0.000 0.016
#> SRR1661957 2 0.347 0.768 0.000 0.772 0.2 0 0.000 0.028
#> SRR1661958 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661959 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661960 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661963 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661965 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661967 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661968 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661973 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661976 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661978 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661979 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661980 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661981 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661984 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661986 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661987 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1661988 1 0.376 0.514 0.600 0.000 0.0 0 0.400 0.000
#> SRR1661989 1 0.346 0.655 0.688 0.000 0.0 0 0.312 0.000
#> SRR1661990 1 0.359 0.610 0.656 0.000 0.0 0 0.344 0.000
#> SRR1661991 1 0.367 0.573 0.632 0.000 0.0 0 0.368 0.000
#> SRR1661992 1 0.352 0.639 0.676 0.000 0.0 0 0.324 0.000
#> SRR1661993 1 0.339 0.672 0.704 0.000 0.0 0 0.296 0.000
#> SRR1661994 1 0.335 0.682 0.712 0.000 0.0 0 0.288 0.000
#> SRR1661995 1 0.376 0.514 0.600 0.000 0.0 0 0.400 0.000
#> SRR1661996 1 0.367 0.573 0.632 0.000 0.0 0 0.368 0.000
#> SRR1661997 1 0.375 0.522 0.604 0.000 0.0 0 0.396 0.000
#> SRR1661998 1 0.378 0.489 0.588 0.000 0.0 0 0.412 0.000
#> SRR1661999 1 0.339 0.672 0.704 0.000 0.0 0 0.296 0.000
#> SRR1662000 1 0.345 0.659 0.692 0.000 0.0 0 0.308 0.000
#> SRR1662001 1 0.348 0.649 0.684 0.000 0.0 0 0.316 0.000
#> SRR1662002 1 0.358 0.616 0.660 0.000 0.0 0 0.340 0.000
#> SRR1662003 1 0.346 0.653 0.688 0.000 0.0 0 0.312 0.000
#> SRR1662004 1 0.377 0.498 0.592 0.000 0.0 0 0.408 0.000
#> SRR1662005 1 0.320 0.708 0.740 0.000 0.0 0 0.260 0.000
#> SRR1662006 1 0.376 0.514 0.600 0.000 0.0 0 0.400 0.000
#> SRR1662007 5 0.386 -0.174 0.468 0.000 0.0 0 0.532 0.000
#> SRR1662008 1 0.368 0.566 0.628 0.000 0.0 0 0.372 0.000
#> SRR1662009 1 0.383 0.413 0.556 0.000 0.0 0 0.444 0.000
#> SRR1662010 1 0.361 0.605 0.652 0.000 0.0 0 0.348 0.000
#> SRR1662011 1 0.315 0.715 0.748 0.000 0.0 0 0.252 0.000
#> SRR1662012 1 0.320 0.708 0.740 0.000 0.0 0 0.260 0.000
#> SRR1662013 1 0.353 0.633 0.672 0.000 0.0 0 0.328 0.000
#> SRR1662014 1 0.370 0.559 0.624 0.000 0.0 0 0.376 0.000
#> SRR1662015 1 0.337 0.676 0.708 0.000 0.0 0 0.292 0.000
#> SRR1662016 1 0.266 0.769 0.816 0.000 0.0 0 0.184 0.000
#> SRR1662017 1 0.327 0.696 0.728 0.000 0.0 0 0.272 0.000
#> SRR1662018 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662019 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662020 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662021 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662022 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662023 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662024 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662025 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662026 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662027 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662028 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662029 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662030 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662031 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662032 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662033 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662034 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662035 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662036 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662037 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662038 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662039 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662040 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662041 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662042 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662043 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662044 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662045 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662046 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662047 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662048 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662049 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662050 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662051 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662052 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662053 6 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 0 0.000 1.000
#> SRR1662054 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.000 1.000 0.000 0.000 0.0 1 0.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662085 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662086 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662087 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662088 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662089 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662090 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662091 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662092 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662093 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662094 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662095 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662096 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662097 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662098 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662099 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662100 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662101 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662102 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662103 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662104 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662105 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662106 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662107 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662108 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662109 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662110 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662111 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662112 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662113 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662114 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662115 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662116 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
#> SRR1662117 5 0.000 0.982 0.000 0.000 0.0 0 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.257 0.746 0.848 0.4652 0.500 0.500
#> 3 3 0.336 0.419 0.568 0.1521 0.604 0.377
#> 4 4 0.749 0.879 0.894 0.2610 0.701 0.415
#> 5 5 0.921 0.911 0.957 0.1454 0.889 0.680
#> 6 6 0.932 0.961 0.944 0.0335 0.959 0.827
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 5
There is also optional best \(k\) = 5 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.9209 0.396 0.336 0.664
#> SRR1661717 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661718 2 0.9209 0.396 0.336 0.664
#> SRR1661719 2 0.9248 0.385 0.340 0.660
#> SRR1661720 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661721 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661722 2 0.9248 0.385 0.340 0.660
#> SRR1661723 2 0.9248 0.385 0.340 0.660
#> SRR1661724 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661725 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661726 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661727 2 0.9248 0.385 0.340 0.660
#> SRR1661728 2 0.9248 0.385 0.340 0.660
#> SRR1661729 2 0.9209 0.396 0.336 0.664
#> SRR1661730 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661731 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661732 2 0.9209 0.396 0.336 0.664
#> SRR1661733 2 0.9248 0.385 0.340 0.660
#> SRR1661734 2 0.9209 0.396 0.336 0.664
#> SRR1661735 2 0.9170 0.407 0.332 0.668
#> SRR1661736 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661737 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661738 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661739 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661740 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661741 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661742 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661743 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661744 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661745 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661746 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661747 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661748 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661749 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661750 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661751 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661752 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661753 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661754 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661755 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661756 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661757 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661758 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661759 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661760 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661761 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661762 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661763 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661764 2 0.1414 0.788 0.020 0.980
#> SRR1661766 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661767 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661768 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661769 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661770 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661771 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661772 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661773 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661774 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661775 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661776 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661777 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661778 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661779 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661780 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661781 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661782 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661783 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661784 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661785 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661786 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661787 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661788 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661789 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661790 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661791 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661792 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661793 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661794 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661795 2 0.0376 0.784 0.004 0.996
#> SRR1661796 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661797 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661798 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661799 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661800 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661801 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661802 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661803 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661804 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661805 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661806 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661807 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661808 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661809 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661810 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661811 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661812 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661813 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661814 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661815 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661816 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661817 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661818 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661819 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661820 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661821 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661822 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661823 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661824 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661825 2 0.1633 0.788 0.024 0.976
#> SRR1661826 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661827 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661828 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661829 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661830 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661831 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661832 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661833 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661834 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661835 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661836 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661837 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661838 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661839 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661840 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661841 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661843 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661844 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661845 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661846 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661847 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661848 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661849 1 0.0672 0.829 0.992 0.008
#> SRR1661850 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661851 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661852 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661853 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661854 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661855 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661856 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661857 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661858 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661859 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661860 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661861 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661862 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661863 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661864 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661865 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661866 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661867 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661868 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661869 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661870 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661871 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661872 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661873 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661874 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661875 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661876 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661877 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661878 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661879 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661880 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661881 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661882 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661883 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661884 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661885 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661886 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661887 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661888 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661889 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661890 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661891 2 0.7950 0.720 0.240 0.760
#> SRR1661892 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661893 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661894 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661895 1 0.4431 0.846 0.908 0.092
#> SRR1661896 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661897 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661898 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661899 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661900 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661901 1 0.1633 0.833 0.976 0.024
#> SRR1661902 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661903 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661904 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661905 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661906 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661907 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661908 1 0.4431 0.846 0.908 0.092
#> SRR1661909 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661910 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661911 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661912 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661913 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661914 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661915 1 0.4431 0.846 0.908 0.092
#> SRR1661916 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661917 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661918 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661919 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661920 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661921 1 0.4431 0.846 0.908 0.092
#> SRR1661922 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661923 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661924 1 0.1414 0.832 0.980 0.020
#> SRR1661925 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661926 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661927 1 0.0376 0.827 0.996 0.004
#> SRR1661928 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661929 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661930 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661931 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661932 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661933 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661934 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661935 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661936 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661937 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661938 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661939 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661940 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661941 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661942 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661943 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661944 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661945 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661946 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661947 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661948 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661949 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661950 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661951 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661952 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661953 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661954 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661955 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661956 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661957 2 0.8016 0.717 0.244 0.756
#> SRR1661958 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661959 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661960 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661961 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661962 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661963 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661964 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661965 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661966 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661967 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661968 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661969 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661970 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661971 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661972 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661973 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661974 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661975 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661976 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661977 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661978 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661979 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661980 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661981 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661982 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661983 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661984 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661985 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661986 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661987 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1661988 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661989 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661990 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661991 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661992 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661993 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661994 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661995 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661996 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661997 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661998 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1661999 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662000 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662001 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662002 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662003 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662004 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662005 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662006 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662007 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662008 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662009 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662010 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662011 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662012 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662013 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662014 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662015 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662016 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662017 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662018 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662019 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662020 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662021 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662022 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662023 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662024 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662025 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662026 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662027 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662028 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662029 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662030 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662031 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662032 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662033 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662034 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662035 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662036 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662037 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662038 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662039 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662040 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662041 2 0.8861 0.539 0.304 0.696
#> SRR1662042 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662043 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662044 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662045 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662046 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662047 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662048 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662049 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662050 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662051 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662052 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662053 2 0.8909 0.538 0.308 0.692
#> SRR1662054 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662055 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662056 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662057 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662058 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662059 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662060 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662061 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662062 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662063 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662064 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662065 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662066 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662067 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662068 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662069 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662070 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662071 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662072 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662073 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662074 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662075 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662076 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662077 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662078 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662079 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662080 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662081 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662082 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662083 1 0.8661 0.748 0.712 0.288
#> SRR1662084 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662085 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662086 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662087 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662088 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662089 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662090 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662091 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662092 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662093 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662094 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662095 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662096 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662097 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662098 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662099 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662100 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662101 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662102 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662103 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662104 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662105 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662106 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662107 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662108 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662109 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662110 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662111 1 0.4939 0.854 0.892 0.108
#> SRR1662112 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662113 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662114 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662115 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662116 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
#> SRR1662117 1 0.5059 0.856 0.888 0.112
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661717 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661718 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661719 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661720 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661721 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661722 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661723 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661724 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661725 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661726 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661727 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661728 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661729 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661730 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661731 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661732 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661733 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661734 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661735 2 0.7476 0.8260 0.452 0.512 0.036
#> SRR1661736 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661737 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661738 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661739 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661740 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661741 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661742 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661743 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661744 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661745 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661746 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661747 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661748 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661749 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661750 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661751 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661752 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661753 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661754 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661755 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661756 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661757 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661758 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661759 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661760 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661761 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661762 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661763 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661764 2 0.7353 0.9471 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661766 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661767 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661768 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661769 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661770 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661771 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661772 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661773 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661774 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661775 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661776 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661777 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661778 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661779 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661780 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661781 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661782 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661783 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661784 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661785 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661786 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661787 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661788 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661789 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661790 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661791 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661792 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661793 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661794 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661795 2 0.7526 0.9344 0.424 0.536 0.040
#> SRR1661796 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661797 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661798 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661799 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661800 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661801 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661802 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661803 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661804 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661805 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661806 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661807 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661808 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661809 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661810 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661811 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661812 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661813 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661814 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661815 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661816 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661817 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661818 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661819 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661820 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661821 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661822 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661823 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661824 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661825 2 0.7353 0.9470 0.436 0.532 0.032
#> SRR1661826 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661827 1 0.6307 -0.5984 0.512 0.000 0.488
#> SRR1661828 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661829 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661830 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661831 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661832 3 0.6309 0.6095 0.500 0.000 0.500
#> SRR1661833 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661834 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661835 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661836 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661837 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661838 1 0.6309 -0.6158 0.500 0.000 0.500
#> SRR1661839 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661840 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661841 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661843 1 0.6309 -0.6158 0.500 0.000 0.500
#> SRR1661844 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661845 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661846 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661847 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661848 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661849 1 0.6295 -0.5742 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661850 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661851 1 0.6309 -0.6158 0.500 0.000 0.500
#> SRR1661852 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661853 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661854 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661855 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661856 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661857 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661858 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661859 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661860 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661861 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661862 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661863 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661864 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661865 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661866 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661867 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661868 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661869 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661870 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661871 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661872 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661873 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661874 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661875 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661876 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661877 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661878 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661879 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661880 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661881 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661882 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661883 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661884 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661885 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661886 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661887 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661888 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661889 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661890 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661891 3 0.8932 0.4066 0.124 0.420 0.456
#> SRR1661892 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661893 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661894 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661895 1 0.2711 0.4029 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661896 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661897 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661898 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661899 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661900 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661901 1 0.5785 -0.2844 0.668 0.000 0.332
#> SRR1661902 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661903 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661904 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661905 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661906 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661907 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661908 1 0.2625 0.4060 0.916 0.000 0.084
#> SRR1661909 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661910 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661911 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661912 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661913 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661914 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661915 1 0.2625 0.4060 0.916 0.000 0.084
#> SRR1661916 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661917 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661918 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661919 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661920 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661921 1 0.2711 0.4029 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661922 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661923 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661924 1 0.5138 -0.0667 0.748 0.000 0.252
#> SRR1661925 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661926 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661927 3 0.6308 0.6209 0.492 0.000 0.508
#> SRR1661928 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661929 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661930 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661931 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661932 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661933 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661934 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661935 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661936 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661937 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661938 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661939 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661940 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661941 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661942 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661943 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661944 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661945 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661946 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661947 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661948 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661949 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661950 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661951 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661952 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661953 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661954 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661955 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661956 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661957 1 0.8466 0.1446 0.508 0.092 0.400
#> SRR1661958 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661959 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661960 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661961 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661962 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661963 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661964 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661965 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661966 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661967 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661968 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661969 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661970 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661971 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661972 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661973 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661974 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661975 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661976 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661977 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661978 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661979 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661980 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661981 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661982 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661983 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661984 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661985 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661986 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661987 1 0.8779 0.1976 0.580 0.248 0.172
#> SRR1661988 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661989 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661990 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661991 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661992 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661993 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661994 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661995 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661996 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661997 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661998 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1661999 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662000 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662001 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662002 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662003 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662004 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662005 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662006 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662007 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662008 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662009 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662010 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662011 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662012 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662013 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662014 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662015 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662016 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662017 1 0.0475 0.4450 0.992 0.004 0.004
#> SRR1662018 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662019 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662020 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662021 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662022 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662023 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662024 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662025 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662026 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662027 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662028 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662029 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662030 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662031 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662032 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662033 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662034 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662035 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662036 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662037 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662038 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662039 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662040 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662041 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662042 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662043 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662044 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662045 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662046 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662047 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662048 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662049 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662050 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662051 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662052 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662053 1 0.8255 -0.3022 0.496 0.428 0.076
#> SRR1662054 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662055 1 0.8427 -0.2363 0.500 0.412 0.088
#> SRR1662056 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662057 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662058 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662059 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662060 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662061 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662062 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662063 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662064 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662065 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662066 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662067 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662068 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662069 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662070 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662071 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662072 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662073 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662074 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662075 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662076 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662077 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662078 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662079 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662080 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662081 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662082 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662083 1 0.8489 -0.2353 0.496 0.412 0.092
#> SRR1662084 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662085 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662086 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662087 1 0.1163 0.4316 0.972 0.000 0.028
#> SRR1662088 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662089 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662090 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662091 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662092 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662093 1 0.0424 0.4455 0.992 0.000 0.008
#> SRR1662094 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662095 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662096 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662097 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662098 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662099 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662100 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662101 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662102 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662103 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662104 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662105 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662106 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662107 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662108 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662109 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662110 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662111 1 0.1031 0.4313 0.976 0.000 0.024
#> SRR1662112 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662113 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662114 1 0.0237 0.4452 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662115 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662116 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
#> SRR1662117 1 0.0592 0.4457 0.988 0.000 0.012
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661717 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661718 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661719 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661720 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661721 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661722 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661723 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661724 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661725 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661726 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661727 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661728 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661729 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661730 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661731 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661732 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661733 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661734 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661735 2 0.1174 0.841 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1661736 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661737 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661738 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661739 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661740 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661741 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661742 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661743 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661744 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661745 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661746 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661747 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661748 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661749 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661750 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661751 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661752 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661753 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661754 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661755 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661756 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661757 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661758 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661759 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661760 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661761 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661762 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661763 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661764 2 0.0707 0.841 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1661766 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661767 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661768 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661769 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661770 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661771 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661772 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661773 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661774 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661775 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661776 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661777 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661778 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661779 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661780 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661781 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661782 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661783 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661784 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661785 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661786 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661787 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661788 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661789 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661790 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661791 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661792 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661793 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661794 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661795 2 0.0592 0.841 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661796 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661797 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661798 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661799 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661800 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661801 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661802 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661803 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661804 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661805 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661806 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661807 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661808 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661809 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661810 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661811 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661812 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661813 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661814 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661815 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661816 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661817 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661818 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661819 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661820 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661821 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661822 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661823 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661824 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661825 2 0.0592 0.842 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661826 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661857 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661858 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661859 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661860 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661861 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661862 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661863 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661864 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661865 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661866 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661867 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661868 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661869 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661870 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661871 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661872 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661873 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661874 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661875 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661876 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661877 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661878 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661879 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661880 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661881 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661882 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661883 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661884 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661885 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661886 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661887 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661888 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661889 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661890 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661891 3 0.1940 1.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1661892 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.1733 0.923 0.948 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0336 0.977 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.3813 0.723 0.828 0.148 0.024 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.3813 0.723 0.828 0.148 0.024 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.1833 0.917 0.944 0.032 0.024 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.1151 0.950 0.968 0.008 0.024 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.989 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661929 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661930 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661931 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661932 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661933 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661934 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661935 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661936 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661937 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661938 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661939 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661940 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661941 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661942 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661943 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661944 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661945 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661946 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661947 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661948 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661949 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661950 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661951 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661952 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661953 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661954 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661955 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661956 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661957 2 0.5971 0.704 0.008 0.696 0.212 0.084
#> SRR1661958 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661959 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661960 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661961 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661962 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661963 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661964 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661965 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661966 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661967 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661968 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661969 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661970 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661971 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661972 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661973 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661974 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661975 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661976 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661977 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661978 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661979 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661980 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661981 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661982 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661983 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661984 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661985 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661986 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661987 4 0.1824 0.940 0.060 0.004 0.000 0.936
#> SRR1661988 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661989 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661990 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661991 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661992 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661993 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661994 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661995 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661996 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661997 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661998 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1661999 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662000 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662001 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662002 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662003 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662004 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662005 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662006 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662007 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662008 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662009 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662010 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662011 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662012 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662013 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662014 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662015 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662016 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662017 2 0.7044 0.763 0.144 0.672 0.120 0.064
#> SRR1662018 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662019 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662020 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662021 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662022 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662023 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662024 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662025 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662026 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662027 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662028 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662029 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662030 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662031 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662032 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662033 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662034 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662035 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662036 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662037 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662038 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662039 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662040 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662041 4 0.2376 0.908 0.000 0.068 0.016 0.916
#> SRR1662042 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662043 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662044 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662045 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662046 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662047 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662048 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662049 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662050 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662051 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662052 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662053 4 0.1888 0.938 0.000 0.044 0.016 0.940
#> SRR1662054 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662055 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662056 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662057 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662058 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662059 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662060 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662061 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662062 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662063 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662064 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662065 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662066 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662067 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662068 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662069 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662070 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662071 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662072 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662073 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662074 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662075 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662076 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662077 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662078 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662079 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662080 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662081 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662082 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662083 4 0.2218 0.950 0.028 0.036 0.004 0.932
#> SRR1662084 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662085 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662086 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662087 2 0.7028 0.764 0.140 0.672 0.128 0.060
#> SRR1662088 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662089 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662090 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662091 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662092 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662093 2 0.7049 0.764 0.140 0.672 0.124 0.064
#> SRR1662094 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662095 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662096 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662097 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662098 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662099 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662100 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662101 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662102 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662103 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662104 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662105 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662106 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662107 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662108 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662109 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662110 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662111 2 0.7054 0.764 0.148 0.672 0.112 0.068
#> SRR1662112 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662113 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662114 2 0.7049 0.764 0.140 0.672 0.124 0.064
#> SRR1662115 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662116 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
#> SRR1662117 2 0.7049 0.765 0.124 0.672 0.140 0.064
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.875 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.1478 0.924 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1661909 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.1478 0.924 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1661916 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661929 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661930 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661931 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661932 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661933 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661934 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661935 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661936 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661937 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661938 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661939 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661940 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661941 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661942 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661943 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661944 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661945 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661946 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661947 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661948 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661949 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661950 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661951 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661952 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661953 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661954 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661955 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661956 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661957 2 0.6477 0.320 0.000 0.464 0.196 0.000 0.340
#> SRR1661958 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661959 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661960 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661963 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661965 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661967 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661968 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661973 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661976 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661978 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661979 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661980 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661981 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661984 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661986 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661987 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661988 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661989 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661990 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661991 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661992 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661993 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661994 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661995 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661996 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661997 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661998 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661999 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662000 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662001 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662002 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662003 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662004 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662005 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662006 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662007 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662008 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662009 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662010 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662011 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662012 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662013 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662014 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662015 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662016 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662017 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662018 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662019 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662020 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662021 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662022 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662023 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662024 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662025 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662026 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662027 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662028 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662029 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662030 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662031 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662032 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662033 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662034 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662035 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662036 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662037 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662038 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662039 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662040 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662041 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662042 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662043 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662044 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662045 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662046 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662047 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662048 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662049 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662050 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662051 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662052 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662053 4 0.0703 0.980 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662054 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.0000 0.988 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662085 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662086 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662087 5 0.0290 0.990 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662088 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662089 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662090 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662091 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662092 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662093 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662094 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662095 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662096 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662097 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662098 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662099 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662100 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662101 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662102 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662103 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662104 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662105 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662106 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662107 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662108 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662109 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662110 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662111 5 0.0290 0.990 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662112 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662113 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662114 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662115 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662116 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662117 5 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.139 0.921 0.932 0.000 0 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.139 0.921 0.932 0.000 0 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661929 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661930 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661931 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661932 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661933 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661934 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661935 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661936 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661937 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661938 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661939 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661940 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661941 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661942 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661943 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661944 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661945 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661946 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661947 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661948 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661949 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661950 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661951 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661952 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661953 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661954 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661955 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661956 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661957 6 0.389 1.000 0.000 0.312 0 0.000 0.016 0.672
#> SRR1661958 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661959 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661960 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661963 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661965 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661967 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661968 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661973 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661976 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661978 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661979 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661980 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661981 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661984 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661986 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661987 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661988 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661989 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661990 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661991 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661992 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661993 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661994 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661995 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661996 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661997 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661998 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661999 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662000 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662001 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662002 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662003 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662004 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662005 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662006 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662007 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662008 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662009 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662010 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662011 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662012 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662013 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662014 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662015 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662016 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662017 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662018 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662019 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662020 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662021 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662022 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662023 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662024 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662025 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662026 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662027 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662028 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662029 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662030 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662031 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662032 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662033 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662034 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662035 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662036 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662037 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662038 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662039 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662040 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662041 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662042 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662043 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662044 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662045 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662046 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662047 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662048 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662049 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662050 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662051 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662052 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662053 4 0.403 0.782 0.000 0.020 0 0.652 0.000 0.328
#> SRR1662054 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.000 0.877 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662085 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662086 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662087 5 0.026 0.991 0.008 0.000 0 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662088 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662089 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662090 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662091 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662092 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662093 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662094 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662095 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662096 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662097 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662098 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662099 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662100 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662101 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662102 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662103 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662104 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662105 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662106 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662107 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662108 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662109 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662110 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662111 5 0.026 0.991 0.008 0.000 0 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662112 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662113 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662114 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662115 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662116 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662117 5 0.000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.761 0.859 0.941 0.4732 0.514 0.514
#> 3 3 0.945 0.980 0.989 0.2973 0.851 0.718
#> 4 4 0.924 0.976 0.980 0.2001 0.869 0.666
#> 5 5 0.871 0.740 0.846 0.0566 0.918 0.704
#> 6 6 0.993 0.975 0.975 0.0495 0.947 0.762
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 3 4
There is also optional best \(k\) = 3 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.961 0.454 0.616 0.384
#> SRR1661857 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661858 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661859 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661860 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661861 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661862 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661863 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661864 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661865 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661866 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661867 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661868 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661869 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661870 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661871 1 0.961 0.454 0.616 0.384
#> SRR1661872 1 0.961 0.454 0.616 0.384
#> SRR1661873 1 0.961 0.454 0.616 0.384
#> SRR1661874 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661875 1 0.961 0.454 0.616 0.384
#> SRR1661876 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661877 1 0.961 0.454 0.616 0.384
#> SRR1661878 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661879 1 0.966 0.434 0.608 0.392
#> SRR1661880 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661881 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661882 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661883 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661884 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661885 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661886 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661887 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661888 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661889 1 0.961 0.454 0.616 0.384
#> SRR1661890 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661891 1 0.958 0.464 0.620 0.380
#> SRR1661892 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.929 0.451 0.344 0.656
#> SRR1661929 2 0.925 0.461 0.340 0.660
#> SRR1661930 2 0.861 0.578 0.284 0.716
#> SRR1661931 2 0.871 0.563 0.292 0.708
#> SRR1661932 2 0.909 0.499 0.324 0.676
#> SRR1661933 2 0.866 0.571 0.288 0.712
#> SRR1661934 2 0.909 0.499 0.324 0.676
#> SRR1661935 2 0.891 0.532 0.308 0.692
#> SRR1661936 2 0.891 0.532 0.308 0.692
#> SRR1661937 2 0.917 0.481 0.332 0.668
#> SRR1661938 2 0.913 0.490 0.328 0.672
#> SRR1661939 2 0.900 0.516 0.316 0.684
#> SRR1661940 2 0.929 0.451 0.344 0.656
#> SRR1661941 2 0.925 0.461 0.340 0.660
#> SRR1661942 2 0.939 0.420 0.356 0.644
#> SRR1661943 2 0.909 0.499 0.324 0.676
#> SRR1661944 2 0.921 0.471 0.336 0.664
#> SRR1661945 2 0.866 0.571 0.288 0.712
#> SRR1661946 2 0.913 0.490 0.328 0.672
#> SRR1661947 2 0.921 0.471 0.336 0.664
#> SRR1661948 2 0.900 0.516 0.316 0.684
#> SRR1661949 2 0.932 0.441 0.348 0.652
#> SRR1661950 2 0.909 0.499 0.324 0.676
#> SRR1661951 2 0.876 0.556 0.296 0.704
#> SRR1661952 2 0.921 0.471 0.336 0.664
#> SRR1661953 2 0.913 0.490 0.328 0.672
#> SRR1661954 2 0.900 0.516 0.316 0.684
#> SRR1661955 2 0.932 0.441 0.348 0.652
#> SRR1661956 2 0.913 0.490 0.328 0.672
#> SRR1661957 2 0.891 0.532 0.308 0.692
#> SRR1661958 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661959 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661960 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661961 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661962 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661963 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661964 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661965 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661966 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661967 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661968 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661969 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661970 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661971 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661972 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661973 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661974 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661975 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661976 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661977 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661978 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661979 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661980 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661981 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661982 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661983 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661984 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661985 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661986 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661987 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661988 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662054 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662055 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662056 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662057 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662058 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662059 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662060 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662061 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662062 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662063 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662064 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662065 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662066 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662067 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662068 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662069 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662070 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662071 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662072 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662073 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662074 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662075 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662076 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662077 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662078 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662079 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662080 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662081 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662082 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662083 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662084 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.000 0.906 1.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.000 0.906 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661929 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661930 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661931 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661932 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661933 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661934 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661935 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661936 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661937 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661938 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661939 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661940 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661941 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661942 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661943 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661944 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661945 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661946 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661947 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661948 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661949 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661950 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661951 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661952 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661953 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661954 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661955 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661956 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661957 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661958 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661959 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661960 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661961 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661962 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661963 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661964 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661965 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661966 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661967 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661968 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661969 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661970 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661971 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661972 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661973 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661974 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661975 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661976 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661977 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661978 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661979 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661980 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661981 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661982 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661983 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661984 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661985 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661986 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661987 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1661988 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662019 2 0.319 0.893 0 0.888 0.112
#> SRR1662020 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662021 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662022 2 0.334 0.886 0 0.880 0.120
#> SRR1662023 2 0.355 0.874 0 0.868 0.132
#> SRR1662024 2 0.319 0.893 0 0.888 0.112
#> SRR1662025 2 0.355 0.874 0 0.868 0.132
#> SRR1662026 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662027 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662028 2 0.355 0.874 0 0.868 0.132
#> SRR1662029 2 0.348 0.878 0 0.872 0.128
#> SRR1662030 2 0.334 0.886 0 0.880 0.120
#> SRR1662031 2 0.388 0.852 0 0.848 0.152
#> SRR1662032 2 0.348 0.878 0 0.872 0.128
#> SRR1662033 2 0.341 0.882 0 0.876 0.124
#> SRR1662034 2 0.348 0.878 0 0.872 0.128
#> SRR1662035 2 0.341 0.882 0 0.876 0.124
#> SRR1662036 2 0.382 0.856 0 0.852 0.148
#> SRR1662037 2 0.334 0.886 0 0.880 0.120
#> SRR1662038 2 0.341 0.882 0 0.876 0.124
#> SRR1662039 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662040 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662041 2 0.375 0.861 0 0.856 0.144
#> SRR1662042 2 0.355 0.874 0 0.868 0.132
#> SRR1662043 2 0.348 0.878 0 0.872 0.128
#> SRR1662044 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662045 2 0.334 0.886 0 0.880 0.120
#> SRR1662046 2 0.327 0.889 0 0.884 0.116
#> SRR1662047 2 0.280 0.909 0 0.908 0.092
#> SRR1662048 2 0.334 0.886 0 0.880 0.120
#> SRR1662049 2 0.369 0.865 0 0.860 0.140
#> SRR1662050 2 0.341 0.882 0 0.876 0.124
#> SRR1662051 2 0.334 0.886 0 0.880 0.120
#> SRR1662052 2 0.382 0.856 0 0.852 0.148
#> SRR1662053 2 0.369 0.865 0 0.860 0.140
#> SRR1662054 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662055 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662056 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662057 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662058 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662059 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662060 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662061 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662062 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662063 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662064 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662065 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662066 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662067 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662068 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662069 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662070 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662071 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662072 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662073 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662074 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662075 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662076 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662077 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662078 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662079 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662080 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662081 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662082 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662083 2 0.000 0.978 0 1.000 0.000
#> SRR1662084 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661928 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661929 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661930 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661931 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661932 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661933 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661934 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661935 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661936 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661937 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661938 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661939 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661940 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661941 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661942 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661943 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661944 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661945 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661946 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661947 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661948 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661949 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661950 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661951 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661952 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661953 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661954 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661955 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661956 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661957 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661958 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661959 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661960 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661961 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661962 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661963 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661964 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661965 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661966 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661967 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661968 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661969 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661970 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661971 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661972 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661973 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661974 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661975 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661976 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661977 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661978 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661979 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661980 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661981 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661982 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661983 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661984 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661985 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661986 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661987 4 0.0188 0.943 0.000 0.004 0 0.996
#> SRR1661988 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661989 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661990 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661991 1 0.0817 0.978 0.976 0.000 0 0.024
#> SRR1661992 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661993 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661994 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661995 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661996 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661997 1 0.0921 0.976 0.972 0.000 0 0.028
#> SRR1661998 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1661999 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662000 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662001 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662002 1 0.0817 0.978 0.976 0.000 0 0.024
#> SRR1662003 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662004 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662005 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662006 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662007 1 0.0921 0.976 0.972 0.000 0 0.028
#> SRR1662008 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662009 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662010 1 0.0817 0.978 0.976 0.000 0 0.024
#> SRR1662011 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662012 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662013 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662014 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662015 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662016 1 0.0817 0.978 0.976 0.000 0 0.024
#> SRR1662017 1 0.0707 0.979 0.980 0.000 0 0.020
#> SRR1662018 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662019 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662020 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662021 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662022 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662023 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662024 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662025 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662026 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662027 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662028 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662029 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662030 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662031 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662032 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662033 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662034 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662035 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662036 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662037 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662038 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662039 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662040 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662041 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662042 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662043 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662044 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662045 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662046 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662047 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662048 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662049 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662050 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662051 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662052 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662053 4 0.2647 0.920 0.000 0.120 0 0.880
#> SRR1662054 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662055 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662056 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662057 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662058 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662059 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662060 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662061 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662062 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662063 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662064 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662065 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662066 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662067 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662068 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662069 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662070 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662071 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662072 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662073 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662074 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662075 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662076 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662077 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662078 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662079 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662080 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662081 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662082 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662083 4 0.0707 0.949 0.000 0.020 0 0.980
#> SRR1662084 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662085 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662086 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662087 1 0.1302 0.970 0.956 0.000 0 0.044
#> SRR1662088 1 0.1867 0.955 0.928 0.000 0 0.072
#> SRR1662089 1 0.1716 0.960 0.936 0.000 0 0.064
#> SRR1662090 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662091 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662092 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662093 1 0.1867 0.955 0.928 0.000 0 0.072
#> SRR1662094 1 0.1867 0.955 0.928 0.000 0 0.072
#> SRR1662095 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662096 1 0.1716 0.960 0.936 0.000 0 0.064
#> SRR1662097 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662098 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662099 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662100 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662101 1 0.1867 0.955 0.928 0.000 0 0.072
#> SRR1662102 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662103 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662104 1 0.1867 0.955 0.928 0.000 0 0.072
#> SRR1662105 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662106 1 0.1716 0.960 0.936 0.000 0 0.064
#> SRR1662107 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662108 1 0.1716 0.960 0.936 0.000 0 0.064
#> SRR1662109 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662110 1 0.1716 0.960 0.936 0.000 0 0.064
#> SRR1662111 1 0.0817 0.978 0.976 0.000 0 0.024
#> SRR1662112 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662113 1 0.1867 0.955 0.928 0.000 0 0.072
#> SRR1662114 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662115 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662116 1 0.1792 0.958 0.932 0.000 0 0.068
#> SRR1662117 1 0.1867 0.955 0.928 0.000 0 0.072
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 1.0000 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.7785 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661929 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661930 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661931 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661932 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661933 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661934 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661935 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661936 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661937 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661938 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661939 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661940 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661941 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661942 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661943 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661944 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661945 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661946 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661947 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661948 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661949 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661950 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661951 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661952 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661953 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661954 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661955 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661956 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661957 3 0.000 1.0000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661958 4 0.311 0.8126 0.000 0.000 0 0.800 0.200
#> SRR1661959 4 0.337 0.7832 0.000 0.000 0 0.768 0.232
#> SRR1661960 4 0.337 0.7831 0.000 0.000 0 0.768 0.232
#> SRR1661961 4 0.307 0.8136 0.000 0.000 0 0.804 0.196
#> SRR1661962 4 0.311 0.8126 0.000 0.000 0 0.800 0.200
#> SRR1661963 4 0.307 0.8136 0.000 0.000 0 0.804 0.196
#> SRR1661964 4 0.337 0.7832 0.000 0.000 0 0.768 0.232
#> SRR1661965 4 0.311 0.8126 0.000 0.000 0 0.800 0.200
#> SRR1661966 4 0.321 0.8043 0.000 0.000 0 0.788 0.212
#> SRR1661967 4 0.304 0.8140 0.000 0.000 0 0.808 0.192
#> SRR1661968 4 0.324 0.8013 0.000 0.000 0 0.784 0.216
#> SRR1661969 4 0.348 0.7584 0.000 0.000 0 0.752 0.248
#> SRR1661970 4 0.327 0.7972 0.000 0.000 0 0.780 0.220
#> SRR1661971 4 0.307 0.8136 0.000 0.000 0 0.804 0.196
#> SRR1661972 4 0.318 0.8071 0.000 0.000 0 0.792 0.208
#> SRR1661973 4 0.334 0.7882 0.000 0.000 0 0.772 0.228
#> SRR1661974 4 0.321 0.8050 0.000 0.000 0 0.788 0.212
#> SRR1661975 4 0.337 0.7831 0.000 0.000 0 0.768 0.232
#> SRR1661976 4 0.327 0.7972 0.000 0.000 0 0.780 0.220
#> SRR1661977 4 0.311 0.8121 0.000 0.000 0 0.800 0.200
#> SRR1661978 4 0.318 0.8076 0.000 0.000 0 0.792 0.208
#> SRR1661979 4 0.337 0.7831 0.000 0.000 0 0.768 0.232
#> SRR1661980 4 0.307 0.8136 0.000 0.000 0 0.804 0.196
#> SRR1661981 4 0.314 0.8102 0.000 0.000 0 0.796 0.204
#> SRR1661982 4 0.311 0.8121 0.000 0.000 0 0.800 0.200
#> SRR1661983 4 0.337 0.7829 0.000 0.000 0 0.768 0.232
#> SRR1661984 4 0.318 0.8070 0.000 0.000 0 0.792 0.208
#> SRR1661985 4 0.307 0.8136 0.000 0.000 0 0.804 0.196
#> SRR1661986 4 0.324 0.8014 0.000 0.000 0 0.784 0.216
#> SRR1661987 4 0.311 0.8123 0.000 0.000 0 0.800 0.200
#> SRR1661988 1 0.643 0.2798 0.464 0.000 0 0.184 0.352
#> SRR1661989 1 0.629 0.3191 0.484 0.000 0 0.160 0.356
#> SRR1661990 1 0.642 0.2826 0.464 0.000 0 0.180 0.356
#> SRR1661991 1 0.647 0.2474 0.448 0.000 0 0.188 0.364
#> SRR1661992 1 0.629 0.3271 0.492 0.000 0 0.164 0.344
#> SRR1661993 1 0.646 0.2708 0.460 0.000 0 0.188 0.352
#> SRR1661994 1 0.637 0.2987 0.472 0.000 0 0.172 0.356
#> SRR1661995 1 0.630 0.3134 0.480 0.000 0 0.160 0.360
#> SRR1661996 1 0.637 0.2987 0.472 0.000 0 0.172 0.356
#> SRR1661997 1 0.639 0.2909 0.468 0.000 0 0.176 0.356
#> SRR1661998 1 0.642 0.2826 0.464 0.000 0 0.180 0.356
#> SRR1661999 1 0.648 0.2391 0.444 0.000 0 0.188 0.368
#> SRR1662000 1 0.632 0.3129 0.480 0.000 0 0.164 0.356
#> SRR1662001 1 0.637 0.2987 0.472 0.000 0 0.172 0.356
#> SRR1662002 1 0.633 0.3163 0.484 0.000 0 0.168 0.348
#> SRR1662003 1 0.634 0.3153 0.484 0.000 0 0.172 0.344
#> SRR1662004 1 0.646 0.2715 0.460 0.000 0 0.188 0.352
#> SRR1662005 1 0.634 0.3061 0.476 0.000 0 0.168 0.356
#> SRR1662006 1 0.629 0.3191 0.484 0.000 0 0.160 0.356
#> SRR1662007 1 0.649 0.2372 0.444 0.000 0 0.192 0.364
#> SRR1662008 1 0.633 0.3121 0.480 0.000 0 0.168 0.352
#> SRR1662009 1 0.633 0.3000 0.472 0.000 0 0.164 0.364
#> SRR1662010 1 0.646 0.2644 0.456 0.000 0 0.188 0.356
#> SRR1662011 1 0.623 0.3411 0.504 0.000 0 0.156 0.340
#> SRR1662012 1 0.627 0.3282 0.492 0.000 0 0.160 0.348
#> SRR1662013 1 0.642 0.2826 0.464 0.000 0 0.180 0.356
#> SRR1662014 1 0.620 0.3460 0.508 0.000 0 0.152 0.340
#> SRR1662015 1 0.632 0.3129 0.480 0.000 0 0.164 0.356
#> SRR1662016 1 0.625 0.3294 0.492 0.000 0 0.156 0.352
#> SRR1662017 1 0.631 0.3176 0.484 0.000 0 0.164 0.352
#> SRR1662018 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662019 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662020 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662021 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662022 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662023 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662024 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662025 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662026 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662027 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662028 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662029 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662030 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662031 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662032 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662033 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662034 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662035 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662036 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662037 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662038 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662039 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662040 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662041 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662042 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662043 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662044 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662045 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662046 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662047 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662048 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662049 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662050 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662051 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662052 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662053 5 0.440 0.3071 0.000 0.008 0 0.384 0.608
#> SRR1662054 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.000 0.8151 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.677 0.0646 0.324 0.000 0 0.284 0.392
#> SRR1662085 5 0.676 0.0471 0.336 0.000 0 0.272 0.392
#> SRR1662086 5 0.676 0.0471 0.336 0.000 0 0.272 0.392
#> SRR1662087 5 0.674 0.0162 0.348 0.000 0 0.260 0.392
#> SRR1662088 5 0.677 0.0646 0.324 0.000 0 0.284 0.392
#> SRR1662089 5 0.675 0.0382 0.340 0.000 0 0.268 0.392
#> SRR1662090 5 0.676 0.0471 0.336 0.000 0 0.272 0.392
#> SRR1662091 5 0.675 0.0376 0.340 0.000 0 0.268 0.392
#> SRR1662092 5 0.675 0.0280 0.344 0.000 0 0.264 0.392
#> SRR1662093 5 0.678 0.0746 0.308 0.000 0 0.300 0.392
#> SRR1662094 5 0.676 0.0547 0.332 0.000 0 0.276 0.392
#> SRR1662095 5 0.676 0.0544 0.332 0.000 0 0.276 0.392
#> SRR1662096 5 0.674 0.0164 0.348 0.000 0 0.260 0.392
#> SRR1662097 5 0.677 0.0603 0.328 0.000 0 0.280 0.392
#> SRR1662098 5 0.675 0.0280 0.344 0.000 0 0.264 0.392
#> SRR1662099 5 0.675 0.0382 0.340 0.000 0 0.268 0.392
#> SRR1662100 5 0.676 0.0538 0.332 0.000 0 0.276 0.392
#> SRR1662101 5 0.677 0.0599 0.328 0.000 0 0.280 0.392
#> SRR1662102 5 0.676 0.0547 0.332 0.000 0 0.276 0.392
#> SRR1662103 5 0.677 0.0646 0.324 0.000 0 0.284 0.392
#> SRR1662104 5 0.677 0.0599 0.328 0.000 0 0.280 0.392
#> SRR1662105 5 0.675 0.0382 0.340 0.000 0 0.268 0.392
#> SRR1662106 5 0.675 0.0376 0.340 0.000 0 0.268 0.392
#> SRR1662107 5 0.676 0.0547 0.332 0.000 0 0.276 0.392
#> SRR1662108 5 0.675 0.0280 0.344 0.000 0 0.264 0.392
#> SRR1662109 5 0.676 0.0547 0.332 0.000 0 0.276 0.392
#> SRR1662110 5 0.675 0.0379 0.340 0.000 0 0.268 0.392
#> SRR1662111 1 0.626 0.2672 0.460 0.000 0 0.148 0.392
#> SRR1662112 5 0.676 0.0547 0.332 0.000 0 0.276 0.392
#> SRR1662113 5 0.677 0.0603 0.328 0.000 0 0.280 0.392
#> SRR1662114 5 0.678 0.0858 0.292 0.000 0 0.316 0.392
#> SRR1662115 5 0.674 0.0164 0.348 0.000 0 0.260 0.392
#> SRR1662116 5 0.677 0.0646 0.324 0.000 0 0.284 0.392
#> SRR1662117 5 0.677 0.0599 0.328 0.000 0 0.280 0.392
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661826 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661827 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661828 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661829 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661830 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661831 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661832 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661833 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661834 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661835 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661836 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661837 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661838 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661839 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661840 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661841 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661843 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661844 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661845 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661846 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661847 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661848 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661849 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661850 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661851 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661852 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661853 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661854 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661855 1 0.0632 0.980 0.976 0 0.000 0.000 0.024 0
#> SRR1661856 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661857 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661858 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661859 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661860 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661861 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661862 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661863 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661864 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661865 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661866 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661867 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661868 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661869 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661870 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661871 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661872 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661873 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661874 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661875 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661876 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661877 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661878 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661879 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661880 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661881 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661882 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661883 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661884 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661885 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661886 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661887 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661888 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661889 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661890 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661891 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661892 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661893 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661894 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661895 1 0.0363 0.982 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661896 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661897 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661898 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661899 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661900 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661901 1 0.0363 0.981 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661902 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661903 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661904 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661905 1 0.0363 0.982 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661906 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661907 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661908 1 0.0458 0.979 0.984 0 0.000 0.000 0.016 0
#> SRR1661909 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661910 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661911 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661912 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661913 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661914 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661915 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661916 1 0.0363 0.982 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661917 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661918 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661919 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661920 1 0.0458 0.979 0.984 0 0.000 0.000 0.016 0
#> SRR1661921 1 0.0363 0.982 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661922 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661923 1 0.0363 0.982 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661924 1 0.0363 0.982 0.988 0 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661925 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661926 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661927 1 0.0260 0.984 0.992 0 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661928 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661929 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661930 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661931 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661932 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661933 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661934 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661935 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661936 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661937 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661938 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661939 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661940 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661941 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661942 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661943 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661944 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661945 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661946 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661947 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661948 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661949 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661950 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661951 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661952 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661953 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661954 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661955 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661956 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661957 6 0.0000 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661958 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661959 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661960 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661961 4 0.0363 0.954 0.000 0 0.012 0.988 0.000 0
#> SRR1661962 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661963 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661964 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661965 4 0.0260 0.954 0.000 0 0.008 0.992 0.000 0
#> SRR1661966 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661967 4 0.0363 0.954 0.000 0 0.012 0.988 0.000 0
#> SRR1661968 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661969 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661970 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661971 4 0.0260 0.954 0.000 0 0.008 0.992 0.000 0
#> SRR1661972 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661973 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661974 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661975 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661976 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661977 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661978 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661979 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661980 4 0.0363 0.954 0.000 0 0.012 0.988 0.000 0
#> SRR1661981 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661982 4 0.0146 0.953 0.000 0 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1661983 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661984 4 0.0146 0.953 0.000 0 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1661985 4 0.0260 0.954 0.000 0 0.008 0.992 0.000 0
#> SRR1661986 4 0.0000 0.952 0.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661987 4 0.0260 0.954 0.000 0 0.008 0.992 0.000 0
#> SRR1661988 5 0.1858 0.896 0.092 0 0.004 0.000 0.904 0
#> SRR1661989 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1661990 5 0.1700 0.900 0.080 0 0.004 0.000 0.916 0
#> SRR1661991 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1661992 5 0.1908 0.893 0.096 0 0.004 0.000 0.900 0
#> SRR1661993 5 0.1908 0.893 0.096 0 0.004 0.000 0.900 0
#> SRR1661994 5 0.1806 0.898 0.088 0 0.004 0.000 0.908 0
#> SRR1661995 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1661996 5 0.1806 0.898 0.088 0 0.004 0.000 0.908 0
#> SRR1661997 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1661998 5 0.1806 0.898 0.088 0 0.004 0.000 0.908 0
#> SRR1661999 5 0.1588 0.901 0.072 0 0.004 0.000 0.924 0
#> SRR1662000 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1662001 5 0.1806 0.898 0.088 0 0.004 0.000 0.908 0
#> SRR1662002 5 0.1858 0.896 0.092 0 0.004 0.000 0.904 0
#> SRR1662003 5 0.1858 0.896 0.092 0 0.004 0.000 0.904 0
#> SRR1662004 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1662005 5 0.1806 0.898 0.088 0 0.004 0.000 0.908 0
#> SRR1662006 5 0.1858 0.896 0.092 0 0.004 0.000 0.904 0
#> SRR1662007 5 0.1411 0.900 0.060 0 0.004 0.000 0.936 0
#> SRR1662008 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1662009 5 0.1588 0.901 0.072 0 0.004 0.000 0.924 0
#> SRR1662010 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1662011 5 0.1908 0.893 0.096 0 0.004 0.000 0.900 0
#> SRR1662012 5 0.1858 0.896 0.092 0 0.004 0.000 0.904 0
#> SRR1662013 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1662014 5 0.1908 0.893 0.096 0 0.004 0.000 0.900 0
#> SRR1662015 5 0.1753 0.900 0.084 0 0.004 0.000 0.912 0
#> SRR1662016 5 0.1858 0.896 0.092 0 0.004 0.000 0.904 0
#> SRR1662017 5 0.1806 0.898 0.088 0 0.004 0.000 0.908 0
#> SRR1662018 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662019 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662020 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662021 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662022 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662023 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662024 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662025 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662026 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662027 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662028 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662029 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662030 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662031 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662032 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662033 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662034 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662035 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662036 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662037 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662038 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662039 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662040 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662041 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662042 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662043 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662044 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662045 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662046 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662047 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662048 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662049 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662050 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662051 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662052 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662053 3 0.0146 1.000 0.000 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1662054 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662055 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662056 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662057 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662058 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662059 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662060 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662061 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662062 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662063 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662064 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662065 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662066 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662067 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662068 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662069 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662070 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662071 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662072 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662073 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662074 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662075 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662076 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662077 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662078 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662079 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662080 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662081 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662082 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662083 4 0.1501 0.953 0.000 0 0.076 0.924 0.000 0
#> SRR1662084 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662085 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662086 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662087 5 0.2070 0.913 0.012 0 0.000 0.092 0.896 0
#> SRR1662088 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662089 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662090 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662091 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662092 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662093 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662094 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662095 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662096 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662097 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662098 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662099 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662100 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662101 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662102 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662103 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662104 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662105 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662106 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662107 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662108 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662109 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662110 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662111 5 0.2147 0.911 0.020 0 0.000 0.084 0.896 0
#> SRR1662112 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662113 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662114 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662115 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662116 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
#> SRR1662117 5 0.2020 0.914 0.008 0 0.000 0.096 0.896 0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.567 0.934 0.936 0.2696 0.744 0.744
#> 3 3 0.525 0.779 0.872 0.7220 0.779 0.703
#> 4 4 0.620 0.838 0.897 0.3683 0.791 0.618
#> 5 5 0.751 0.905 0.918 0.0834 0.976 0.933
#> 6 6 0.805 0.950 0.896 0.0778 0.880 0.646
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661737 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661738 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661739 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661740 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661741 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661742 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661743 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661744 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661745 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661746 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661747 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661748 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661749 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661750 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661751 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661752 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661753 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661754 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661755 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661756 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661757 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661758 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661759 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661760 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661761 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661762 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661763 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661764 2 0.204 0.926 0.032 0.968
#> SRR1661766 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661767 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661768 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661769 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661770 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661771 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661772 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661773 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661774 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661775 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661776 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661777 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661778 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661779 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661780 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661781 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661782 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661783 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661784 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661785 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661786 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661787 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661788 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661789 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661790 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661791 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661792 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661793 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661794 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661795 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661796 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661797 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661798 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661799 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661800 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661801 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661802 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661803 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661804 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661805 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661806 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661807 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661808 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661809 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661810 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661811 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661812 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661813 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661814 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661815 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661816 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661817 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661818 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661819 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661820 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661821 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661822 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661823 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661824 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661825 1 0.671 1.000 0.824 0.176
#> SRR1661826 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661827 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661828 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661829 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661830 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661831 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661832 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661833 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661834 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661835 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661836 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661837 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661838 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661839 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661840 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661841 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661843 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661844 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661845 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661846 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661847 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661848 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661849 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661850 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661851 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661852 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661853 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661854 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661855 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661856 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661857 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661858 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661859 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661860 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661861 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661862 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661863 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661864 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661865 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661866 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661867 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661868 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661869 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661870 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661871 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661872 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661873 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661874 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661875 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661876 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661877 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661878 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661879 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661880 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661881 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661882 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661883 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661884 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661885 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661886 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661887 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661888 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661889 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661890 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661891 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661892 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661893 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661894 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661895 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661896 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661897 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661898 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661899 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661900 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661901 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661902 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661903 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661904 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661905 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661906 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661907 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661908 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661909 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661910 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661911 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661912 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661913 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661914 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661915 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661916 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661917 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661918 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661919 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661920 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661921 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661922 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661923 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661924 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661925 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661926 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661927 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1661928 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661929 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661930 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661931 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661932 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661933 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661934 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661935 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661936 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661937 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661938 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661939 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661940 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661941 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661942 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661943 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661944 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661945 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661946 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661947 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661948 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661949 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661950 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661951 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661952 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661953 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661954 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661955 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661956 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661957 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661958 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661959 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661960 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661961 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661962 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661963 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661964 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661965 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661966 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661967 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661968 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661969 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661970 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661971 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661972 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661973 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661974 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661975 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661976 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661977 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661978 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661979 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661980 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661981 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661982 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661983 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661984 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661985 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661986 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661987 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1661988 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661989 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661990 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661991 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661992 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661993 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661994 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661995 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661996 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661997 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661998 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1661999 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662000 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662001 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662002 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662003 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662004 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662005 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662006 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662007 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662008 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662009 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662010 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662011 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662012 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662013 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662014 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662015 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662016 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662017 2 0.278 0.933 0.048 0.952
#> SRR1662018 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662054 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662055 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662056 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662057 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662058 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662059 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662060 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662061 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662062 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662063 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662064 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662065 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662066 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662067 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662068 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662069 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662070 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662071 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662072 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662073 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662074 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662075 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662076 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662077 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662078 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662079 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662080 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662081 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662082 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662083 2 0.000 0.948 0.000 1.000
#> SRR1662084 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662085 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662086 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662087 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662088 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662089 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662090 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662091 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662092 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662093 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662094 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662095 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662096 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662097 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662098 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662099 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662100 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662101 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662102 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662103 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662104 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662105 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662106 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662107 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662108 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662109 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662110 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662111 2 0.671 0.834 0.176 0.824
#> SRR1662112 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662113 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662114 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662115 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662116 2 0.224 0.936 0.036 0.964
#> SRR1662117 2 0.224 0.936 0.036 0.964
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661717 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661718 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661719 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661720 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661721 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661722 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661723 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661724 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661725 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661726 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661727 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661728 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661729 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661730 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661731 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661732 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661733 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661734 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661735 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661736 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661737 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661738 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661739 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661740 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661741 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661742 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661743 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661744 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661745 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661746 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661747 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661748 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661749 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661750 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661751 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661752 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661753 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661754 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661755 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661756 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661757 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661758 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661759 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661760 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661761 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661762 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661763 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661764 2 0.153 0.861 0.004 0.964 0.032
#> SRR1661766 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661767 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661768 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661769 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661770 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661771 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661772 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661773 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661774 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661775 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661776 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661777 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661778 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661779 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661780 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661781 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661782 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661783 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661784 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661785 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661786 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661787 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661788 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661789 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661790 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661791 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661792 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661793 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661794 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661795 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661796 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661797 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661798 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661799 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661800 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661801 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661802 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661803 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661804 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661805 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661806 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661807 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661808 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661809 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661810 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661811 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661812 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661813 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661814 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661815 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661816 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661817 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661818 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661819 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661820 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661821 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661822 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661823 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661824 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661825 3 0.424 1.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1661826 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661827 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661828 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661829 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661830 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661831 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661832 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661833 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661834 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661835 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661836 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661837 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661838 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661839 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661840 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661841 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661843 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661844 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661845 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661846 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661847 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661848 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661849 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661850 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661851 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661852 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661853 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661854 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661855 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661856 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661893 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661894 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661895 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661896 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661897 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661898 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661899 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661900 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661901 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661902 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661903 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661904 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661905 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661906 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661907 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661908 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661909 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661910 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661911 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661912 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661913 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661914 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661915 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661916 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661917 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661918 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661919 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661920 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661921 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661922 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661923 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661924 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661925 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661926 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661927 2 0.826 0.492 0.188 0.636 0.176
#> SRR1661928 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661929 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661930 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661931 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661932 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661933 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661934 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661935 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661936 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661937 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661938 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661939 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661940 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661941 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661942 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661943 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661944 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661945 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661946 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661947 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661948 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661949 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661950 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661951 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661952 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661953 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661954 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661955 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661956 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661957 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661958 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661959 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661960 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661961 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661962 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661963 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661964 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661965 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661966 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661967 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661968 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661969 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661970 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661971 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661972 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661973 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661974 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661975 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661976 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661977 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661978 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661979 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661980 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661981 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661982 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661983 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661984 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661985 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661986 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661987 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1661988 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661989 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661990 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661991 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661992 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661993 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661994 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661995 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661996 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661997 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661998 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1661999 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662000 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662001 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662002 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662003 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662004 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662005 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662006 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662007 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662008 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662009 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662010 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662011 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662012 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662013 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662014 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662015 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662016 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662017 1 0.673 0.488 0.564 0.424 0.012
#> SRR1662018 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.870 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662054 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662055 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662056 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662057 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662058 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662059 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662060 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662061 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662062 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662063 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662064 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662065 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662066 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662067 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662068 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662069 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662070 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662071 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662072 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662073 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662074 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662075 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662076 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662077 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662078 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662079 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662080 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662081 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662082 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662083 2 0.129 0.869 0.032 0.968 0.000
#> SRR1662084 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.424 0.545 0.824 0.000 0.176
#> SRR1662112 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.000 0.642 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661717 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661718 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661719 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661720 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661721 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661722 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661723 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661724 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661725 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661726 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661727 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661728 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661729 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661730 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661731 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661732 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661733 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661734 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661735 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661736 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661737 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661738 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661739 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661740 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661741 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661742 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661743 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661744 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661745 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661746 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661747 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661748 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661749 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661750 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661751 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661752 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661753 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661754 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661755 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661756 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661757 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661758 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661759 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661760 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661761 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661762 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661763 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661764 3 0.1209 0.889 0.004 0.032 0.964 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661827 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661828 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661829 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661830 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661831 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661832 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661833 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661834 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661835 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661836 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661837 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661838 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661839 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661840 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661841 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661843 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661844 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661845 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661846 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661847 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661848 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661849 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661850 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661851 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661852 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661853 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661854 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661855 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661856 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661857 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661858 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661859 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661860 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661861 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661862 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661863 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661864 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661865 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661866 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661867 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661868 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661869 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661870 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661871 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661872 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661873 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661874 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661875 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661876 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661877 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661878 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661879 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661880 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661881 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661882 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661883 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661884 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661885 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661886 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661887 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661888 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661889 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661890 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661891 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661892 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661893 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661894 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661895 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661896 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661897 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661898 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661899 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661900 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661901 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661902 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661903 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661904 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661905 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661906 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661907 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661908 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661909 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661910 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661911 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661912 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661913 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661914 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661915 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661916 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661917 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661918 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661919 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661920 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661921 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661922 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661923 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661924 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661925 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661926 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661927 1 0.2469 0.800 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1661928 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661929 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661930 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661931 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661932 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661933 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661934 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661935 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661936 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661937 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661938 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661939 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661940 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661941 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661942 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661943 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661944 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661945 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661946 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661947 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661948 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661949 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661950 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661951 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661952 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661953 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661954 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661955 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661956 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661957 3 0.3688 0.780 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1661958 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661959 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661960 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661961 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661962 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661963 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661964 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661965 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661966 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661967 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661968 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661969 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661970 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661971 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661972 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661973 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661974 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661975 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661976 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661977 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661978 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661979 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661980 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661981 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661982 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661983 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661984 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661985 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661986 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661987 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1661988 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661989 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661990 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661991 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661992 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661993 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661994 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661995 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661996 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661997 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661998 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1661999 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662000 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662001 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662002 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662003 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662004 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662005 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662006 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662007 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662008 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662009 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662010 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662011 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662012 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662013 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662014 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662015 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662016 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662017 1 0.7172 0.287 0.484 0.000 0.140 0.376
#> SRR1662018 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662019 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662020 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662021 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662022 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662023 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662024 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662025 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662026 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662027 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662028 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662029 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662030 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662031 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662032 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662033 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662034 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662035 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662036 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662037 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662038 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662039 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662040 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662041 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662042 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662043 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662044 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662045 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662046 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662047 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662048 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662049 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662050 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662051 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662052 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662053 3 0.0804 0.887 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1662054 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662055 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662056 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662057 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662058 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662059 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662060 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662061 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662062 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662063 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662064 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662065 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662066 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662067 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662068 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662069 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662070 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662071 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662072 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662073 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662074 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662075 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662076 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662077 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662078 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662079 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662080 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662081 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662082 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662083 3 0.1022 0.897 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1662084 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662085 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662086 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662087 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662088 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662089 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662090 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662091 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662092 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662093 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662094 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662095 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662096 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662097 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662098 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662099 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662100 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662101 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662102 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662103 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662104 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662105 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662106 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662107 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662108 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662109 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662110 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662111 4 0.3444 0.743 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1662112 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662113 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662114 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662115 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662116 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662117 4 0.0336 0.993 0.008 0.000 0.000 0.992
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661717 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661718 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661719 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661720 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661721 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661722 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661723 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661724 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661725 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661726 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661727 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661728 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661729 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661730 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661731 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661732 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661733 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661734 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661735 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661736 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661737 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661738 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661739 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661740 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661741 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661742 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661743 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661744 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661745 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661746 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661747 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661748 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661749 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661750 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661751 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661752 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661753 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661754 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661755 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661756 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661757 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661758 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661759 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661760 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661761 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661762 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661763 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661764 4 0.1041 0.863 0.004 0.032 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661857 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661858 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661859 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661860 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661861 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661862 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661863 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661864 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661865 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661866 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661867 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661868 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661869 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661870 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661871 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661872 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661873 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661874 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661875 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661876 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661877 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661878 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661879 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661880 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661881 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661882 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661883 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661884 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661885 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661886 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661887 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661888 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661889 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661890 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661891 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661929 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661930 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661931 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661932 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661933 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661934 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661935 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661936 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661937 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661938 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661939 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661940 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661941 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661942 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661943 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661944 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661945 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661946 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661947 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661948 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661949 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661950 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661951 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661952 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661953 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661954 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661955 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661956 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661957 4 0.4197 0.757 0.212 0.000 0.032 0.752 0.004
#> SRR1661958 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661959 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661960 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661961 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661962 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661963 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661964 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661965 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661966 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661967 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661968 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661969 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661970 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661971 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661972 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661973 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661974 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661975 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661976 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661977 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661978 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661979 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661980 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661981 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661982 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661983 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661984 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661985 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661986 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661987 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661988 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661989 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661990 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661991 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661992 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661993 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661994 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661995 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661996 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661997 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661998 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1661999 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662000 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662001 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662002 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662003 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662004 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662005 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662006 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662007 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662008 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662009 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662010 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662011 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662012 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662013 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662014 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662015 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662016 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662017 3 0.3109 1.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1662018 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662019 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662020 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662021 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662022 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662023 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662024 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662025 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662026 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662027 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662028 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662029 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662030 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662031 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662032 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662033 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662034 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662035 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662036 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662037 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662038 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662039 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662040 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662041 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662042 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662043 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662044 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662045 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662046 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662047 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662048 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662049 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662050 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662051 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662052 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662053 4 0.2891 0.796 0.000 0.000 0.176 0.824 0.000
#> SRR1662054 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662055 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662056 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662057 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662058 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662059 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662060 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662061 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662062 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662063 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662064 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662065 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662066 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662067 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662068 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662069 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662070 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662071 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662072 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662073 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662074 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662075 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662076 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662077 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662078 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662079 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662080 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662081 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662082 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662083 4 0.0963 0.871 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1662084 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662085 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662086 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662087 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662088 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662089 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662090 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662091 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662092 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662093 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662094 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662095 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662096 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662097 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662098 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662099 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662100 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662101 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662102 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662103 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662104 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662105 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662106 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662107 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662108 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662109 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662110 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662111 5 0.2929 0.760 0.180 0.000 0.000 0.000 0.820
#> SRR1662112 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662113 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662114 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662115 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662116 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1662117 5 0.0162 0.993 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661717 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661718 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661719 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661720 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661721 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661722 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661723 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661724 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661725 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661726 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661727 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661728 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661729 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661730 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661731 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661732 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661733 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661734 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661735 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661736 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661737 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661738 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661739 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661740 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661741 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661742 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661743 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661744 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661745 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661746 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661747 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661748 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661749 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661750 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661751 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661752 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661753 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661754 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661755 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661756 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661757 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661758 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661759 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661760 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661761 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661762 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661763 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661764 4 0.079 0.896 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.0
#> SRR1661766 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661767 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661768 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661769 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661770 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661771 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661772 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661773 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661774 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661775 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661776 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661777 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661778 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661779 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661780 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661781 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661782 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661783 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661784 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661785 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661786 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661787 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661788 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661789 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661790 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661791 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661792 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661793 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661794 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661795 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661796 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661797 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661798 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661799 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661800 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661801 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661802 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661803 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661804 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661805 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661806 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661807 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661808 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661809 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661810 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661811 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661812 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661813 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661814 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661815 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661816 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661817 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661818 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661819 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661820 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661821 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661822 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661823 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661824 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661825 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661856 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661857 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661858 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661859 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661860 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661861 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661862 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661863 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661864 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661865 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661866 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661867 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661868 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661869 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661870 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661871 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661872 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661873 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661874 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661875 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661876 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661877 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661878 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661879 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661880 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661881 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661882 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661883 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661884 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661885 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661886 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661887 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661888 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661889 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661890 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661891 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661915 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.0
#> SRR1661928 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661929 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661930 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661931 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661932 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661933 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661934 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661935 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661936 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661937 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661938 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661939 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661940 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661941 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661942 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661943 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661944 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661945 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661946 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661947 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661948 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661949 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661950 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661951 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661952 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661953 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661954 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661955 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661956 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661957 3 0.426 1.000 0.024 0.000 0.600 0.376 0.000 0.0
#> SRR1661958 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661959 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661960 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661961 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661962 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661963 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661964 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661965 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661966 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661967 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661968 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661969 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661970 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661971 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661972 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661973 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661974 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661975 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661976 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661977 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661978 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661979 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661980 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661981 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661982 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661983 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661984 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661985 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661986 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661987 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1661988 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661989 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661990 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661991 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661992 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661993 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661994 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661995 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661996 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661997 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661998 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1661999 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662000 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662001 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662002 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662003 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662004 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662005 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662006 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662007 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662008 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662009 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662010 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662011 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662012 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662013 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662014 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662015 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662016 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662017 6 0.328 1.000 0.168 0.000 0.000 0.032 0.000 0.8
#> SRR1662018 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662019 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662020 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662021 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662022 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662023 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662024 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662025 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662026 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662027 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662028 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662029 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662030 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662031 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662032 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662033 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662034 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662035 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662036 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662037 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662038 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662039 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662040 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662041 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662042 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662043 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662044 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662045 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662046 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662047 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662048 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662049 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662050 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662051 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662052 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662053 4 0.339 0.740 0.000 0.000 0.024 0.776 0.000 0.2
#> SRR1662054 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662055 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662056 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662057 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662058 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662059 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662060 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662061 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662062 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662063 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662064 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662065 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662066 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662067 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662068 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662069 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662070 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662071 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662072 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662073 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662074 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662075 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662076 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662077 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662078 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662079 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662080 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662081 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662082 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662083 4 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.0
#> SRR1662084 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662085 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662086 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662087 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662088 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662089 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662090 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662091 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662092 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662093 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662094 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662095 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662096 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662097 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662098 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662099 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662100 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662101 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662102 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662103 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662104 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662105 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662106 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662107 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662108 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662109 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662110 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662111 5 0.370 0.676 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624 0.0
#> SRR1662112 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662113 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662114 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662115 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662116 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
#> SRR1662117 5 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.136 0.684 0.767 0.3839 0.603 0.603
#> 3 3 0.195 0.532 0.667 0.4580 0.818 0.698
#> 4 4 0.314 0.474 0.608 0.1777 0.681 0.364
#> 5 5 0.413 0.627 0.661 0.1038 0.893 0.630
#> 6 6 0.486 0.598 0.628 0.0541 0.951 0.789
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661717 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661718 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661719 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661720 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661721 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661722 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661723 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661724 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661725 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661726 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661727 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661728 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661729 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661730 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661731 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661732 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661733 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661734 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661735 2 0.9608 0.571 0.384 0.616
#> SRR1661736 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661737 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661738 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661739 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661740 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661741 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661742 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661743 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661744 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661745 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661746 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661747 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661748 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661749 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661750 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661751 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661752 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661753 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661754 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661755 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661756 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661757 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661758 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661759 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661760 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661761 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661762 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661763 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661764 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661766 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661767 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661768 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661769 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661770 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661771 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661772 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661773 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661774 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661775 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661776 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661777 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661778 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661779 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661780 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661781 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661782 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661783 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661784 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661785 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661786 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661787 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661788 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661789 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661790 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661791 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661792 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661793 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661794 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661795 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661796 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661797 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661798 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661799 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661800 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661801 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661802 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661803 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661804 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661805 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661806 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661807 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661808 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661809 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661810 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661811 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661812 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661813 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661814 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661815 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661816 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661817 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661818 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661819 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661820 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661821 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661822 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661823 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661824 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661825 2 0.7453 0.931 0.212 0.788
#> SRR1661826 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661827 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661828 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661829 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661830 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661831 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661832 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661833 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661834 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661835 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661836 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661837 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661838 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661839 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661840 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661841 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661843 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661844 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661845 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661846 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661847 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661848 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661849 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661850 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661851 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661852 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661853 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661854 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661855 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661856 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661857 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661858 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661859 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661860 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661861 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661862 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661863 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661864 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661865 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661866 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661867 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661868 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661869 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661870 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661871 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661872 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661873 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661874 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661875 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661876 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661877 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661878 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661879 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661880 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661881 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661882 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661883 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661884 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661885 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661886 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661887 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661888 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661889 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661890 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661891 1 0.7883 0.678 0.764 0.236
#> SRR1661892 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661893 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661894 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661895 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661896 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661897 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661898 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661899 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661900 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661901 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661902 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661903 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661904 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661905 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661906 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661907 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661908 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661909 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661910 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661911 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661912 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661913 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661914 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661915 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661916 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661917 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661918 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661919 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661920 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661921 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661922 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661923 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661924 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661925 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661926 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661927 1 0.0376 0.701 0.996 0.004
#> SRR1661928 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661929 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661930 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661931 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661932 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661933 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661934 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661935 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661936 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661937 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661938 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661939 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661940 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661941 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661942 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661943 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661944 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661945 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661946 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661947 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661948 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661949 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661950 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661951 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661952 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661953 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661954 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661955 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661956 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661957 1 0.8661 0.664 0.712 0.288
#> SRR1661958 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661959 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661960 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661961 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661962 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661963 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661964 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661965 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661966 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661967 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661968 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661969 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661970 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661971 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661972 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661973 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661974 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661975 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661976 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661977 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661978 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661979 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661980 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661981 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661982 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661983 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661984 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661985 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661986 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661987 1 0.8713 0.612 0.708 0.292
#> SRR1661988 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661989 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661990 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661991 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661992 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661993 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661994 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661995 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661996 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661997 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661998 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1661999 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662000 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662001 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662002 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662003 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662004 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662005 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662006 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662007 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662008 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662009 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662010 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662011 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662012 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662013 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662014 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662015 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662016 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662017 1 0.7815 0.646 0.768 0.232
#> SRR1662018 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662019 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662020 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662021 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662022 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662023 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662024 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662025 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662026 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662027 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662028 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662029 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662030 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662031 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662032 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662033 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662034 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662035 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662036 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662037 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662038 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662039 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662040 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662041 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662042 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662043 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662044 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662045 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662046 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662047 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662048 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662049 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662050 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662051 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662052 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662053 1 0.9933 0.391 0.548 0.452
#> SRR1662054 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662055 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662056 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662057 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662058 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662059 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662060 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662061 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662062 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662063 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662064 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662065 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662066 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662067 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662068 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662069 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662070 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662071 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662072 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662073 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662074 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662075 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662076 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662077 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662078 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662079 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662080 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662081 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662082 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662083 1 0.7139 0.690 0.804 0.196
#> SRR1662084 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662085 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662086 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662087 1 0.9000 0.580 0.684 0.316
#> SRR1662088 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662089 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662090 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662091 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662092 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662093 1 0.9491 0.506 0.632 0.368
#> SRR1662094 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662095 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662096 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662097 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662098 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662099 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662100 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662101 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662102 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662103 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662104 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662105 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662106 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662107 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662108 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662109 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662110 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662111 1 0.3584 0.676 0.932 0.068
#> SRR1662112 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662113 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662114 1 0.9286 0.545 0.656 0.344
#> SRR1662115 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662116 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
#> SRR1662117 1 0.9552 0.491 0.624 0.376
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661717 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661718 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661719 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661720 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661721 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661722 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661723 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661724 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661725 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661726 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661727 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661728 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661729 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661730 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661731 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661732 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661733 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661734 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661735 2 0.685 0.653 0.124 0.740 0.136
#> SRR1661736 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661737 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661738 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661739 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661740 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661741 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661742 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661743 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661744 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661745 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661746 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661747 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661748 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661749 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661750 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661751 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661752 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661753 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661754 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661755 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661756 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661757 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661758 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661759 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661760 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661761 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661762 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661763 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661764 2 0.164 0.910 0.044 0.956 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.917 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661797 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661798 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661799 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661800 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661801 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661802 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661803 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661804 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661805 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661806 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661807 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661808 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661809 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661810 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661811 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661812 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661813 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661814 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661815 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661816 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661817 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661818 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661819 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661820 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661821 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661822 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661823 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661824 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661825 2 0.103 0.912 0.024 0.976 0.000
#> SRR1661826 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661827 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661828 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661829 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661830 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661831 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661832 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661833 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661834 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661835 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661836 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661837 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661838 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661839 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661840 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661841 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661843 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661844 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661845 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661846 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661847 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661848 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661849 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661850 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661851 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661852 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661853 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661854 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661855 3 0.789 0.217 0.372 0.064 0.564
#> SRR1661856 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661857 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661858 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661859 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661860 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661861 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661862 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661863 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661864 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661865 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661866 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661867 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661868 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661869 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661870 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661871 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661872 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661873 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661874 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661875 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661876 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661877 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661878 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661879 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661880 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661881 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661882 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661883 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661884 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661885 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661886 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661887 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661888 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661889 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661890 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661891 3 0.447 0.412 0.028 0.120 0.852
#> SRR1661892 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661893 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661894 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661895 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661896 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661897 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661898 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661899 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661900 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661901 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661902 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661903 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661904 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661905 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661906 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661907 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661908 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661909 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661910 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661911 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661912 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661913 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661914 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661915 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661916 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661917 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661918 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661919 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661920 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661921 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661922 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661923 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661924 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661925 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661926 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661927 3 0.782 0.220 0.356 0.064 0.580
#> SRR1661928 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661929 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661930 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661931 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661932 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661933 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661934 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661935 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661936 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661937 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661938 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661939 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661940 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661941 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661942 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661943 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661944 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661945 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661946 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661947 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661948 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661949 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661950 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661951 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661952 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661953 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661954 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661955 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661956 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661957 3 0.569 0.398 0.044 0.168 0.788
#> SRR1661958 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661959 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661960 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661961 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661962 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661963 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661964 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661965 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661966 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661967 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661968 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661969 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661970 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661971 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661972 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661973 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661974 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661975 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661976 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661977 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661978 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661979 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661980 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661981 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661982 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661983 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661984 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661985 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661986 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661987 3 0.976 0.228 0.228 0.380 0.392
#> SRR1661988 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661989 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661990 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661991 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661992 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661993 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661994 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661995 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661996 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661997 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661998 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1661999 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662000 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662001 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662002 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662003 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662004 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662005 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662006 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662007 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662008 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662009 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662010 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662011 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662012 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662013 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662014 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662015 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662016 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662017 1 0.939 0.762 0.484 0.188 0.328
#> SRR1662018 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662019 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662020 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662021 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662022 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662023 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662024 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662025 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662026 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662027 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662028 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662029 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662030 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662031 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662032 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662033 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662034 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662035 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662036 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662037 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662038 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662039 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662040 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662041 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662042 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662043 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662044 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662045 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662046 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662047 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662048 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662049 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662050 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662051 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662052 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662053 3 0.979 0.273 0.236 0.368 0.396
#> SRR1662054 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662055 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662056 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662057 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662058 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662059 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662060 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662061 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662062 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662063 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662064 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662065 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662066 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662067 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662068 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662069 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662070 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662071 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662072 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662073 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662074 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662075 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662076 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662077 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662078 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662079 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662080 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662081 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662082 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662083 3 0.903 0.369 0.164 0.300 0.536
#> SRR1662084 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662085 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662086 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662087 1 0.818 0.790 0.640 0.152 0.208
#> SRR1662088 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662089 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662090 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662091 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662092 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662093 1 0.826 0.806 0.636 0.176 0.188
#> SRR1662094 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662095 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662096 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662097 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662098 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662099 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662100 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662101 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662102 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662103 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662104 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662105 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662106 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662107 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662108 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662109 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662110 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662111 1 0.766 0.208 0.508 0.044 0.448
#> SRR1662112 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662113 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662114 1 0.826 0.803 0.636 0.172 0.192
#> SRR1662115 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662116 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
#> SRR1662117 1 0.835 0.812 0.628 0.188 0.184
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661717 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661718 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661719 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661720 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661721 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661722 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661723 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661724 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661725 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661726 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661727 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661728 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661729 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661730 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661731 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661732 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661733 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661734 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661735 2 0.6787 0.478 0.060 0.688 0.096 0.156
#> SRR1661736 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661737 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661738 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661739 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661740 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661741 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661742 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661743 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661744 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661745 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661746 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661747 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661748 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661749 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661750 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661751 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661752 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661753 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661754 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661755 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661756 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661757 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661758 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661759 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661760 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661761 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661762 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661763 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661764 2 0.1697 0.694 0.004 0.952 0.016 0.028
#> SRR1661766 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661767 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661768 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661769 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661770 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661771 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661772 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661773 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661774 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661775 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661776 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661777 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661778 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661779 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661780 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661781 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661782 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661783 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661784 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661785 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661786 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661787 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661788 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661789 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661790 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661791 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661792 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661793 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661794 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661795 2 0.0376 0.696 0.004 0.992 0.004 0.000
#> SRR1661796 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661797 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661798 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661799 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661800 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661801 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661802 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661803 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661804 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661805 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661806 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661807 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661808 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661809 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661810 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661811 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661812 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661813 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661814 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661815 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661816 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661817 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661818 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661819 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661820 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661821 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661822 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661823 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661824 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661825 2 0.2597 0.679 0.040 0.916 0.004 0.040
#> SRR1661826 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661827 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661828 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661829 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661830 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661831 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661832 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661833 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661834 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661835 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661836 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661837 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661838 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661839 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661840 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661841 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661843 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661844 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661845 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661846 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661847 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661848 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661849 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661850 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661851 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661852 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661853 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661854 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661855 1 0.6079 0.608 0.652 0.008 0.280 0.060
#> SRR1661856 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661857 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661858 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661859 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661860 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661861 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661862 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661863 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661864 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661865 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661866 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661867 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661868 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661869 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661870 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661871 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661872 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661873 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661874 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661875 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661876 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661877 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661878 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661879 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661880 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661881 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661882 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661883 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661884 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661885 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661886 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661887 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661888 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661889 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661890 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661891 3 0.3617 0.634 0.076 0.064 0.860 0.000
#> SRR1661892 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661893 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661894 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661895 1 0.4836 0.617 0.672 0.008 0.320 0.000
#> SRR1661896 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661897 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661898 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661899 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661900 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661901 1 0.4991 0.622 0.672 0.008 0.316 0.004
#> SRR1661902 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661903 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661904 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661905 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661906 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661907 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661908 1 0.4857 0.615 0.668 0.008 0.324 0.000
#> SRR1661909 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661910 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661911 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661912 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661913 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661914 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661915 1 0.4857 0.615 0.668 0.008 0.324 0.000
#> SRR1661916 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661917 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661918 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661919 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661920 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661921 1 0.4857 0.615 0.668 0.008 0.324 0.000
#> SRR1661922 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661923 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661924 1 0.4991 0.622 0.672 0.008 0.316 0.004
#> SRR1661925 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661926 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661927 1 0.4969 0.627 0.676 0.008 0.312 0.004
#> SRR1661928 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661929 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661930 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661931 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661932 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661933 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661934 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661935 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661936 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661937 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661938 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661939 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661940 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661941 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661942 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661943 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661944 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661945 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661946 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661947 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661948 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661949 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661950 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661951 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661952 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661953 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661954 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661955 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661956 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661957 3 0.3977 0.643 0.012 0.084 0.852 0.052
#> SRR1661958 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661959 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661960 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661961 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661962 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661963 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661964 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661965 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661966 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661967 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661968 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661969 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661970 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661971 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661972 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661973 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661974 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661975 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661976 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661977 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661978 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661979 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661980 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661981 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661982 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661983 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661984 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661985 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661986 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661987 2 0.9973 -0.119 0.216 0.272 0.264 0.248
#> SRR1661988 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661989 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661990 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661991 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661992 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661993 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661994 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661995 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661996 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661997 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661998 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1661999 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662000 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662001 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662002 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662003 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662004 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662005 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662006 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662007 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662008 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662009 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662010 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662011 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662012 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662013 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662014 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662015 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662016 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662017 1 0.9298 0.183 0.364 0.096 0.216 0.324
#> SRR1662018 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662019 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662020 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662021 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662022 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662023 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662024 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662025 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662026 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662027 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662028 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662029 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662030 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662031 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662032 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662033 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662034 4 0.9288 0.401 0.084 0.280 0.276 0.360
#> SRR1662035 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662036 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662037 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662038 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662039 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662040 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662041 4 0.9288 0.401 0.084 0.280 0.276 0.360
#> SRR1662042 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662043 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662044 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662045 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662046 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662047 4 0.9097 0.410 0.068 0.280 0.272 0.380
#> SRR1662048 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662049 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662050 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662051 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662052 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662053 4 0.9046 0.412 0.064 0.280 0.272 0.384
#> SRR1662054 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662055 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662056 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662057 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662058 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662059 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662060 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662061 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662062 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662063 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662064 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662065 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662066 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662067 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662068 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662069 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662070 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662071 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662072 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662073 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662074 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662075 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662076 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662077 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662078 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662079 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662080 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662081 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662082 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662083 3 0.9579 0.293 0.240 0.240 0.380 0.140
#> SRR1662084 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662085 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662086 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662087 4 0.7887 0.287 0.320 0.080 0.072 0.528
#> SRR1662088 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662089 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662090 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662091 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662092 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662093 4 0.7967 0.314 0.300 0.092 0.072 0.536
#> SRR1662094 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662095 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662096 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662097 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662098 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662099 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662100 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662101 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662102 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662103 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662104 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662105 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662106 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662107 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662108 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662109 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662110 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662111 1 0.8135 0.318 0.472 0.024 0.200 0.304
#> SRR1662112 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662113 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662114 4 0.7887 0.287 0.320 0.080 0.072 0.528
#> SRR1662115 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662116 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
#> SRR1662117 4 0.7923 0.324 0.292 0.096 0.068 0.544
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661717 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661718 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661719 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661720 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661721 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661722 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661723 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661724 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661725 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661726 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661727 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661728 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661729 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661730 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661731 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661732 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661733 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661734 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661735 2 0.741 0.392 0.076 0.576 0.052 0.224 0.072
#> SRR1661736 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661737 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661738 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661739 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661740 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661741 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661742 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661743 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661744 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661745 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661746 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661747 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661748 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661749 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661750 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661751 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661752 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661753 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661754 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661755 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661756 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661757 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661758 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661759 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661760 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661761 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661762 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661763 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661764 2 0.293 0.795 0.016 0.888 0.008 0.068 0.020
#> SRR1661766 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661767 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661768 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661769 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661770 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661771 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661772 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661773 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661774 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661775 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661776 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661777 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661778 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661779 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661780 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661781 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661782 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661783 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661784 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661785 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661786 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661787 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661788 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661789 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661790 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661791 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661792 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661793 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661794 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661795 2 0.180 0.817 0.000 0.940 0.012 0.028 0.020
#> SRR1661796 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661797 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661798 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661799 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661800 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661801 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661802 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661803 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661804 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661805 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661806 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661807 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661808 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661809 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661810 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661811 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661812 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661813 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661814 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661815 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661816 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661817 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661818 2 0.373 0.792 0.048 0.856 0.016 0.048 0.032
#> SRR1661819 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661820 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661821 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661822 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661823 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661824 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661825 2 0.373 0.792 0.052 0.856 0.016 0.044 0.032
#> SRR1661826 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661827 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661828 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661829 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661830 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661831 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661832 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661833 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661834 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661835 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661836 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661837 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661838 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661839 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661840 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661841 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661843 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661844 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661845 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661846 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661847 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661848 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661849 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661850 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661851 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661852 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661853 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661854 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661855 1 0.571 0.889 0.680 0.008 0.212 0.072 0.028
#> SRR1661856 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661857 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661858 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661859 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661860 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661861 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661862 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661863 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661864 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661865 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661866 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661867 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661868 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661869 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661870 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661871 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661872 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661873 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661874 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661875 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661876 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661877 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661878 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661879 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661880 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661881 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661882 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661883 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661884 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661885 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661886 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661887 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661888 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661889 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661890 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661891 3 0.283 0.591 0.080 0.020 0.884 0.016 0.000
#> SRR1661892 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661893 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661894 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661895 1 0.384 0.908 0.772 0.008 0.208 0.000 0.012
#> SRR1661896 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661897 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661898 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661899 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661900 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661901 1 0.384 0.908 0.772 0.008 0.208 0.000 0.012
#> SRR1661902 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661903 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661904 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661905 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661906 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661907 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661908 1 0.373 0.906 0.776 0.008 0.208 0.000 0.008
#> SRR1661909 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661910 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661911 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661912 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661913 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661914 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661915 1 0.373 0.906 0.776 0.008 0.208 0.000 0.008
#> SRR1661916 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661917 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661918 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661919 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661920 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661921 1 0.373 0.906 0.776 0.008 0.208 0.000 0.008
#> SRR1661922 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661923 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661924 1 0.384 0.908 0.772 0.008 0.208 0.000 0.012
#> SRR1661925 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661926 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661927 1 0.391 0.910 0.772 0.008 0.204 0.000 0.016
#> SRR1661928 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661929 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661930 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661931 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661932 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661933 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661934 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661935 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661936 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661937 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661938 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661939 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661940 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661941 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661942 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661943 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661944 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661945 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661946 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661947 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661948 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661949 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661950 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661951 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661952 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661953 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661954 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661955 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661956 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661957 3 0.381 0.587 0.016 0.024 0.848 0.072 0.040
#> SRR1661958 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661959 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661960 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661961 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661962 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661963 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661964 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661965 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661966 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661967 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661968 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661969 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661970 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661971 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661972 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661973 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661974 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661975 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661976 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661977 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661978 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661979 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661980 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661981 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661982 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661983 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661984 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661985 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661986 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661987 4 0.993 0.496 0.208 0.184 0.172 0.256 0.180
#> SRR1661988 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661989 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661990 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661991 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661992 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661993 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661994 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661995 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661996 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661997 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661998 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1661999 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662000 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662001 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662002 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662003 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662004 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662005 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662006 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662007 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662008 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662009 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662010 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662011 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662012 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662013 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662014 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662015 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662016 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662017 5 0.852 0.660 0.248 0.024 0.160 0.144 0.424
#> SRR1662018 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662019 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662020 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662021 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662022 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662023 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662024 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662025 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662026 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662027 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662028 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662029 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662030 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662031 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662032 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662033 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662034 4 0.799 0.602 0.060 0.144 0.248 0.500 0.048
#> SRR1662035 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662036 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662037 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662038 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662039 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662040 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662041 4 0.799 0.602 0.060 0.144 0.248 0.500 0.048
#> SRR1662042 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662043 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662044 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662045 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662046 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662047 4 0.782 0.607 0.052 0.144 0.248 0.512 0.044
#> SRR1662048 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662049 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662050 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662051 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662052 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662053 4 0.751 0.614 0.036 0.144 0.248 0.532 0.040
#> SRR1662054 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662055 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662056 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662057 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662058 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662059 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662060 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662061 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662062 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662063 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662064 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662065 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662066 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662067 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662068 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662069 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662070 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662071 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662072 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662073 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662074 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662075 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662076 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662077 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662078 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662079 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662080 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662081 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662082 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662083 3 0.975 -0.220 0.236 0.152 0.268 0.224 0.120
#> SRR1662084 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662085 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662086 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662087 5 0.464 0.722 0.088 0.032 0.032 0.044 0.804
#> SRR1662088 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662089 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662090 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662091 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662092 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662093 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662094 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662095 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662096 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662097 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662098 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662099 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662100 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662101 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662102 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662103 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662104 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662105 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662106 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662107 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662108 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662109 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662110 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662111 5 0.735 0.112 0.380 0.012 0.120 0.048 0.440
#> SRR1662112 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662113 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662114 5 0.459 0.722 0.084 0.036 0.032 0.040 0.808
#> SRR1662115 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662116 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
#> SRR1662117 5 0.408 0.728 0.084 0.036 0.032 0.016 0.832
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661717 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661718 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661719 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661720 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661721 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661722 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661723 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661724 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661725 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661726 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661727 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661728 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661729 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661730 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661731 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661732 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661733 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661734 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661735 2 0.7963 0.4047 0.032 0.428 0.156 NA 0.056 0.048
#> SRR1661736 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661737 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661738 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661739 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661740 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661741 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661742 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661743 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661744 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661745 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661746 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661747 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661748 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661749 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661750 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661751 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661752 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661753 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661754 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661755 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661756 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661757 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661758 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661759 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661760 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661761 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661762 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661763 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661764 2 0.4925 0.6981 0.000 0.684 0.060 NA 0.008 0.020
#> SRR1661766 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661767 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661768 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661769 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661770 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661771 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661772 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661773 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661774 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661775 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661776 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661777 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661778 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661779 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661780 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661781 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661782 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661783 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661784 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661785 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661786 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661787 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661788 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661789 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661790 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661791 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661792 2 0.0291 0.7496 0.004 0.992 0.000 NA 0.004 0.000
#> SRR1661793 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661794 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661795 2 0.0260 0.7496 0.000 0.992 0.000 NA 0.008 0.000
#> SRR1661796 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661797 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661798 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661799 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661800 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661801 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661802 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661803 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661804 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661805 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661806 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661807 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661808 2 0.3683 0.7125 0.012 0.816 0.024 NA 0.016 0.004
#> SRR1661809 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661810 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661811 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661812 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661813 2 0.3828 0.7126 0.012 0.816 0.028 NA 0.020 0.008
#> SRR1661814 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661815 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661816 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661817 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661818 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661819 2 0.3794 0.7125 0.012 0.816 0.024 NA 0.020 0.008
#> SRR1661820 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661821 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661822 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661823 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661824 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661825 2 0.3593 0.7123 0.012 0.816 0.020 NA 0.012 0.004
#> SRR1661826 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661827 1 0.5245 0.5845 0.676 0.000 0.012 NA 0.012 0.144
#> SRR1661828 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661829 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661830 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661831 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661832 1 0.5245 0.5845 0.676 0.000 0.012 NA 0.012 0.144
#> SRR1661833 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661834 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661835 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661836 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661837 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661838 1 0.5245 0.5845 0.676 0.000 0.012 NA 0.012 0.144
#> SRR1661839 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661840 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661841 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661843 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661844 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661845 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661846 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661847 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661848 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661849 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661850 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661851 1 0.5245 0.5845 0.676 0.000 0.012 NA 0.012 0.144
#> SRR1661852 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661853 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661854 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661855 1 0.5183 0.5847 0.676 0.000 0.008 NA 0.012 0.144
#> SRR1661856 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661857 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661858 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661859 6 0.2611 0.8239 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.876
#> SRR1661860 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661861 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661862 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661863 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661864 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661865 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661866 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661867 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661868 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661869 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661870 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661871 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661872 6 0.2711 0.8231 0.096 0.016 0.012 NA 0.000 0.872
#> SRR1661873 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661874 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661875 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661876 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661877 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661878 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661879 6 0.2711 0.8231 0.096 0.016 0.012 NA 0.000 0.872
#> SRR1661880 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661881 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661882 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661883 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661884 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661885 6 0.2711 0.8231 0.096 0.016 0.012 NA 0.000 0.872
#> SRR1661886 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661887 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661888 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661889 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661890 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661891 6 0.2468 0.8248 0.096 0.016 0.008 NA 0.000 0.880
#> SRR1661892 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661893 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661894 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661895 1 0.3435 0.6177 0.808 0.000 0.012 NA 0.020 0.156
#> SRR1661896 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661897 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661898 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661899 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661900 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661901 1 0.3435 0.6177 0.808 0.000 0.012 NA 0.020 0.156
#> SRR1661902 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661903 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661904 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661905 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661906 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661907 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661908 1 0.3435 0.6177 0.808 0.000 0.012 NA 0.020 0.156
#> SRR1661909 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661910 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661911 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661912 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661913 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661914 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661915 1 0.3435 0.6177 0.808 0.000 0.012 NA 0.020 0.156
#> SRR1661916 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661917 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661918 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661919 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661920 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661921 1 0.3435 0.6177 0.808 0.000 0.012 NA 0.020 0.156
#> SRR1661922 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661923 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661924 1 0.3435 0.6177 0.808 0.000 0.012 NA 0.020 0.156
#> SRR1661925 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661926 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661927 1 0.3196 0.6194 0.816 0.000 0.008 NA 0.020 0.156
#> SRR1661928 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661929 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661930 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661931 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661932 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661933 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661934 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661935 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661936 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661937 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661938 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661939 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661940 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661941 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661942 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661943 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661944 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661945 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661946 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661947 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661948 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661949 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661950 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661951 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661952 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661953 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661954 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661955 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661956 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661957 6 0.5658 0.8011 0.008 0.028 0.116 NA 0.064 0.704
#> SRR1661958 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661959 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661960 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661961 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661962 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661963 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661964 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661965 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661966 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661967 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661968 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661969 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661970 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661971 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661972 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661973 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661974 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661975 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661976 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661977 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661978 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661979 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661980 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661981 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661982 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661983 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661984 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661985 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661986 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661987 3 0.9722 0.3995 0.204 0.100 0.260 NA 0.172 0.128
#> SRR1661988 5 0.8578 0.6275 0.208 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1661989 5 0.8648 0.6271 0.204 0.024 0.064 NA 0.364 0.124
#> SRR1661990 5 0.8636 0.6273 0.208 0.024 0.064 NA 0.364 0.120
#> SRR1661991 5 0.8589 0.6273 0.204 0.024 0.056 NA 0.364 0.124
#> SRR1661992 5 0.8636 0.6273 0.208 0.024 0.064 NA 0.364 0.120
#> SRR1661993 5 0.8578 0.6275 0.208 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1661994 5 0.8649 0.6269 0.208 0.024 0.064 NA 0.364 0.124
#> SRR1661995 5 0.8649 0.6269 0.208 0.024 0.064 NA 0.364 0.124
#> SRR1661996 5 0.8608 0.6274 0.208 0.024 0.060 NA 0.364 0.120
#> SRR1661997 5 0.8636 0.6273 0.208 0.024 0.064 NA 0.364 0.120
#> SRR1661998 5 0.8575 0.6274 0.204 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1661999 5 0.8575 0.6274 0.204 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1662000 5 0.8634 0.6272 0.208 0.024 0.060 NA 0.364 0.128
#> SRR1662001 5 0.8608 0.6274 0.208 0.024 0.060 NA 0.364 0.120
#> SRR1662002 5 0.8578 0.6275 0.208 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1662003 5 0.8606 0.6275 0.204 0.024 0.060 NA 0.364 0.120
#> SRR1662004 5 0.8608 0.6274 0.208 0.024 0.060 NA 0.364 0.120
#> SRR1662005 5 0.8589 0.6273 0.204 0.024 0.056 NA 0.364 0.124
#> SRR1662006 5 0.8589 0.6273 0.204 0.024 0.056 NA 0.364 0.124
#> SRR1662007 5 0.8575 0.6274 0.204 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1662008 5 0.8606 0.6275 0.204 0.024 0.060 NA 0.364 0.120
#> SRR1662009 5 0.8606 0.6275 0.204 0.024 0.060 NA 0.364 0.120
#> SRR1662010 5 0.8591 0.6274 0.208 0.024 0.056 NA 0.364 0.124
#> SRR1662011 5 0.8578 0.6275 0.208 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1662012 5 0.8635 0.6274 0.204 0.024 0.064 NA 0.364 0.120
#> SRR1662013 5 0.8620 0.6273 0.204 0.024 0.060 NA 0.364 0.124
#> SRR1662014 5 0.8621 0.6272 0.208 0.024 0.060 NA 0.364 0.124
#> SRR1662015 5 0.8575 0.6274 0.204 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1662016 5 0.8575 0.6274 0.204 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1662017 5 0.8578 0.6275 0.208 0.024 0.056 NA 0.364 0.120
#> SRR1662018 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662019 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662020 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662021 3 0.4979 0.6126 0.044 0.112 0.744 NA 0.028 0.072
#> SRR1662022 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662023 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662024 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662025 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662026 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662027 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662028 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662029 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662030 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662031 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662032 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662033 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662034 3 0.6220 0.5908 0.052 0.112 0.680 NA 0.040 0.076
#> SRR1662035 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662036 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662037 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662038 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662039 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662040 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662041 3 0.6220 0.5908 0.052 0.112 0.680 NA 0.040 0.076
#> SRR1662042 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662043 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662044 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662045 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662046 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662047 3 0.5820 0.5993 0.056 0.112 0.704 NA 0.032 0.072
#> SRR1662048 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662049 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662050 3 0.4979 0.6137 0.040 0.112 0.748 NA 0.024 0.072
#> SRR1662051 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662052 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662053 3 0.4840 0.6149 0.040 0.112 0.752 NA 0.024 0.072
#> SRR1662054 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662055 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662056 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662057 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662058 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662059 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662060 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662061 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662062 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662063 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662064 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662065 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662066 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662067 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662068 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662069 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662070 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662071 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662072 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662073 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662074 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662075 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662076 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662077 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662078 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662079 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662080 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662081 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662082 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662083 1 0.9601 -0.0542 0.252 0.088 0.220 NA 0.100 0.204
#> SRR1662084 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662085 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662086 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662087 5 0.3645 0.6684 0.084 0.000 0.040 NA 0.832 0.032
#> SRR1662088 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662089 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662090 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662091 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662092 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662093 5 0.2809 0.6817 0.064 0.008 0.016 NA 0.880 0.032
#> SRR1662094 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662095 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662096 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662097 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662098 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662099 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662100 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662101 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662102 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662103 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662104 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662105 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662106 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662107 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662108 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662109 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662110 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662111 5 0.6930 0.1639 0.356 0.000 0.056 NA 0.452 0.096
#> SRR1662112 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662113 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662114 5 0.3567 0.6704 0.080 0.004 0.036 NA 0.840 0.032
#> SRR1662115 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662116 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
#> SRR1662117 5 0.2138 0.6891 0.060 0.008 0.008 NA 0.912 0.012
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.421 0.773 0.897 0.4829 0.507 0.507
#> 3 3 0.537 0.766 0.871 0.3438 0.649 0.414
#> 4 4 0.751 0.807 0.854 0.1352 0.902 0.720
#> 5 5 0.793 0.858 0.840 0.0581 0.891 0.626
#> 6 6 0.850 0.899 0.884 0.0428 0.973 0.871
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.854 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1661928 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661929 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661930 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661931 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661932 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661933 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661934 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661935 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661936 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661937 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661938 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661939 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661940 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661941 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661942 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661943 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661944 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661945 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661946 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661947 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661948 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661949 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661950 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661951 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661952 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661953 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661954 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661955 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661956 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661957 1 0.0376 0.893 0.996 0.004
#> SRR1661958 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661959 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661960 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661961 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661962 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661963 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661964 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661965 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661966 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661967 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661968 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661969 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661970 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661971 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661972 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661973 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661974 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661975 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661976 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661977 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661978 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661979 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661980 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661981 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661982 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661983 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661984 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661985 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661986 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661987 2 0.9970 0.211 0.468 0.532
#> SRR1661988 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661989 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661990 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661991 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661992 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661993 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661994 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661995 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661996 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661997 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661998 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1661999 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662000 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662001 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662002 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662003 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662004 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662005 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662006 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662007 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662008 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662009 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662010 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662011 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662012 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662013 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662014 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662015 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662016 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662017 1 0.5059 0.841 0.888 0.112
#> SRR1662018 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662019 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662020 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662021 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662022 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662023 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662024 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662025 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662026 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662027 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662028 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662029 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662030 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662031 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662032 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662033 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662034 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662035 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662036 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662037 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662038 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662039 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662040 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662041 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662042 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662043 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662044 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662045 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662046 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662047 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662048 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662049 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662050 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662051 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662052 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662053 2 0.7815 0.726 0.232 0.768
#> SRR1662054 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662055 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662056 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662057 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662058 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662059 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662060 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662061 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662062 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662063 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662064 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662065 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662066 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662067 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662068 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662069 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662070 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662071 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662072 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662073 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662074 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662075 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662076 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662077 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662078 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662079 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662080 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662081 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662082 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662083 1 0.8861 0.494 0.696 0.304
#> SRR1662084 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662085 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662086 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662087 1 0.6801 0.783 0.820 0.180
#> SRR1662088 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662089 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662090 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662091 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662092 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662093 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662094 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662095 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662096 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662097 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662098 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662099 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662100 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662101 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662102 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662103 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662104 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662105 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662106 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662107 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662108 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662109 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662110 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662111 1 0.0000 0.894 1.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662113 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662114 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662115 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662116 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
#> SRR1662117 1 0.6887 0.780 0.816 0.184
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661827 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661828 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661829 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661830 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661831 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661832 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661833 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661834 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661835 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661836 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661837 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661838 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661839 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661840 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661841 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661843 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661844 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661845 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661846 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661847 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661848 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661849 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661850 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661851 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661852 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661853 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661854 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661855 1 0.3340 0.799 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661856 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661857 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661858 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661859 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661860 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661861 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661862 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661863 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661864 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661865 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661866 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661867 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661868 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661869 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661870 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661871 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661872 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661873 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661874 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661875 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661876 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661877 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661878 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661879 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661880 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661881 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661882 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661883 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661884 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661885 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661886 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661887 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661888 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661889 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661890 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661891 3 0.3551 0.771 0.132 0.000 0.868
#> SRR1661892 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661893 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661894 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661895 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661896 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661897 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661898 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661899 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661900 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661901 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661902 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661903 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661904 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661905 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661906 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661907 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661908 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661909 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661910 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661911 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661912 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661913 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661914 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661915 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661916 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661917 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661918 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661919 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661920 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661921 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661922 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661923 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661924 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661925 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661926 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661927 1 0.3482 0.795 0.872 0.000 0.128
#> SRR1661928 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661929 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661930 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661931 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661932 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661933 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661934 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661935 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661936 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661937 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661938 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661939 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661940 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661941 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661942 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661943 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661944 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661945 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661946 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661947 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661948 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661949 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661950 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661951 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661952 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661953 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661954 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661955 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661956 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661957 3 0.3879 0.763 0.152 0.000 0.848
#> SRR1661958 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661959 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661960 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661961 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661962 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661963 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661964 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661965 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661966 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661967 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661968 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661969 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661970 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661971 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661972 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661973 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661974 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661975 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661976 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661977 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661978 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661979 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661980 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661981 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661982 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661983 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661984 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661985 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661986 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661987 1 0.9355 0.271 0.492 0.188 0.320
#> SRR1661988 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661989 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661990 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661991 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661992 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661993 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661994 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661995 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661996 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661997 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661998 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1661999 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662000 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662001 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662002 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662003 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662004 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662005 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662006 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662007 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662008 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662009 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662010 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662011 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662012 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662013 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662014 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662015 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662016 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662017 1 0.0661 0.807 0.988 0.004 0.008
#> SRR1662018 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662019 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662020 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662021 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662022 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662023 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662024 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662025 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662026 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662027 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662028 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662029 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662030 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662031 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662032 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662033 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662034 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662035 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662036 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662037 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662038 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662039 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662040 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662041 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662042 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662043 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662044 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662045 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662046 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662047 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662048 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662049 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662050 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662051 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662052 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662053 3 0.4324 0.724 0.028 0.112 0.860
#> SRR1662054 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662055 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662056 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662057 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662058 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662059 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662060 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662061 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662062 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662063 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662064 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662065 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662066 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662067 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662068 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662069 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662070 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662071 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662072 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662073 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662074 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662075 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662076 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662077 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662078 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662079 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662080 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662081 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662082 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662083 3 0.7925 0.315 0.344 0.072 0.584
#> SRR1662084 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662085 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662086 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662087 1 0.0829 0.806 0.984 0.004 0.012
#> SRR1662088 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662089 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662090 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662091 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662092 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662093 1 0.1315 0.803 0.972 0.020 0.008
#> SRR1662094 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662095 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662096 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662097 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662098 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662099 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662100 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662101 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662102 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662103 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662104 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662105 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662106 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662107 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662108 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662109 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662110 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662111 1 0.1753 0.807 0.952 0.000 0.048
#> SRR1662112 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662113 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662114 1 0.1315 0.803 0.972 0.020 0.008
#> SRR1662115 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662116 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
#> SRR1662117 1 0.1453 0.802 0.968 0.024 0.008
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661717 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661718 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661719 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661720 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661721 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661722 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661723 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661724 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661725 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661726 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661727 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661728 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661729 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661730 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661731 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661732 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661733 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661734 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661735 2 0.194 0.930 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661736 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.985 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661827 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661828 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661829 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661830 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661831 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661832 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661833 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661834 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661835 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661836 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661837 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661838 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661839 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661840 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661841 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661843 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661844 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661845 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661846 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661847 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661848 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661849 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661850 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661851 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661852 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661853 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661854 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661855 1 0.491 0.749 0.764 0.000 0.176 0.060
#> SRR1661856 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661857 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661858 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661859 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661860 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661861 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661862 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661863 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661864 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661865 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661866 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661867 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661868 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661869 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661870 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661871 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661872 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661873 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661874 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661875 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661876 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661877 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661878 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661879 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661880 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661881 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661882 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661883 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661884 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661885 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661886 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661887 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661888 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661889 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661890 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661891 3 0.121 0.779 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1661892 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661893 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661894 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661895 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661896 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661897 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661898 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661899 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661900 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661901 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661902 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661903 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661904 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661905 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661906 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661907 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661908 1 0.521 0.740 0.740 0.000 0.192 0.068
#> SRR1661909 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661910 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661911 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661912 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661913 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661914 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661915 1 0.528 0.736 0.736 0.000 0.192 0.072
#> SRR1661916 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661917 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661918 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661919 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661920 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661921 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661922 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661923 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661924 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661925 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661926 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661927 1 0.514 0.743 0.744 0.000 0.192 0.064
#> SRR1661928 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661929 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661930 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661931 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661932 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661933 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661934 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661935 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661936 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661937 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661938 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661939 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661940 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661941 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661942 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661943 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661944 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661945 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661946 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661947 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661948 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661949 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661950 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661951 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661952 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661953 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661954 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661955 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661956 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661957 3 0.126 0.784 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1661958 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661959 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661960 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661961 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661962 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661963 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661964 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661965 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661966 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661967 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661968 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661969 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661970 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661971 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661972 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661973 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661974 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661975 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661976 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661977 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661978 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661979 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661980 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661981 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661982 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661983 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661984 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661985 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661986 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661987 4 0.207 0.856 0.032 0.016 0.012 0.940
#> SRR1661988 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661989 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661990 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661991 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661992 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661993 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661994 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661995 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661996 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661997 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661998 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661999 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662000 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662001 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662002 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662003 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662004 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662005 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662006 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662007 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662008 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662009 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662010 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662011 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662012 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662013 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662014 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662015 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662016 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662017 1 0.386 0.743 0.824 0.000 0.024 0.152
#> SRR1662018 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662019 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662020 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662021 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662022 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662023 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662024 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662025 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662026 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662027 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662028 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662029 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662030 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662031 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662032 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662033 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662034 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662035 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662036 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662037 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662038 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662039 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662040 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662041 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662042 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662043 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662044 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662045 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662046 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662047 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662048 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662049 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662050 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662051 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662052 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662053 3 0.617 0.507 0.000 0.056 0.556 0.388
#> SRR1662054 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662055 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662056 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662057 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662058 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662059 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662060 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662061 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662062 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662063 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662064 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662065 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662066 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662067 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662068 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662069 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662070 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662071 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662072 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662073 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662074 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662075 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662076 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662077 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662078 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662079 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662080 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662081 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662082 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662083 4 0.544 0.844 0.124 0.008 0.112 0.756
#> SRR1662084 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662085 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662086 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662087 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662088 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662089 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662090 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662091 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662092 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662093 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662094 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662095 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662096 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662097 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662098 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662099 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662100 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662101 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662102 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662103 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662104 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662105 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662106 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662107 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662108 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662109 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662110 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662111 1 0.494 0.735 0.768 0.000 0.072 0.160
#> SRR1662112 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662113 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662114 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662115 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662116 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1662117 1 0.353 0.730 0.808 0.000 0.000 0.192
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661717 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661718 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661719 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661720 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661721 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661722 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661723 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661724 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661725 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661726 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661727 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661728 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661729 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661730 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661731 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661732 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661733 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661734 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661735 2 0.2899 0.894 0.028 0.872 0.004 0.096 0.000
#> SRR1661736 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0566 0.970 0.012 0.984 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0162 0.972 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661827 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661828 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661829 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661830 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661831 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661832 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661833 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661834 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661835 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661836 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661837 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661838 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661839 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661840 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661841 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661843 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661844 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661845 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661846 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661847 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661848 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661849 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661850 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661851 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661852 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661853 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661854 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661855 1 0.4914 0.949 0.672 0.000 0.040 0.008 0.280
#> SRR1661856 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661857 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661858 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661859 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661860 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661861 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661862 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661863 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661864 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661865 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661866 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661867 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661868 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661869 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661870 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661871 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661872 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661873 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661874 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661875 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661876 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661877 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661878 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661879 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661880 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661881 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661882 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661883 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661884 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661885 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661886 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661887 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661888 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661889 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661890 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661891 3 0.1701 0.965 0.048 0.000 0.936 0.016 0.000
#> SRR1661892 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661893 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661894 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661895 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661896 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661897 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661898 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661899 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661900 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661901 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661902 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661903 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661904 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661905 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661906 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661907 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661908 1 0.4838 0.957 0.712 0.000 0.036 0.020 0.232
#> SRR1661909 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661910 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661911 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661912 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661913 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661914 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661915 1 0.4838 0.957 0.712 0.000 0.036 0.020 0.232
#> SRR1661916 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661917 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661918 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661919 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661920 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661921 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661922 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661923 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661924 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661925 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661926 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661927 1 0.4775 0.959 0.712 0.000 0.036 0.016 0.236
#> SRR1661928 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661929 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661930 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661931 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661932 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661933 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661934 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661935 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661936 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661937 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661938 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661939 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661940 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661941 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661942 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661943 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661944 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661945 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661946 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661947 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661948 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661949 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661950 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661951 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661952 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661953 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661954 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661955 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661956 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661957 3 0.0404 0.958 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661958 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661959 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661960 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661961 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661962 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661963 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661964 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661965 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661966 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661967 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661968 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661969 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661970 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661971 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661972 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661973 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661974 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661975 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661976 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661977 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661978 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661979 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661980 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661981 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661982 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661983 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661984 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661985 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661986 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661987 4 0.3715 0.666 0.032 0.024 0.000 0.832 0.112
#> SRR1661988 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661989 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661990 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661991 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661992 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661993 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661994 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661995 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661996 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661997 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661998 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1661999 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662000 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662001 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662002 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662003 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662004 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662005 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662006 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662007 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662008 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662009 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662010 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662011 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662012 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662013 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662014 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662015 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662016 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662017 5 0.2577 0.909 0.084 0.000 0.016 0.008 0.892
#> SRR1662018 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662019 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662020 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662021 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662022 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662023 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662024 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662025 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662026 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662027 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662028 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662029 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662030 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662031 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662032 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662033 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662034 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662035 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662036 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662037 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662038 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662039 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662040 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662041 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662042 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662043 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662044 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662045 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662046 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662047 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662048 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662049 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662050 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662051 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662052 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662053 4 0.7753 0.438 0.220 0.048 0.276 0.444 0.012
#> SRR1662054 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662055 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662056 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662057 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662058 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662059 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662060 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662061 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662062 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662063 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662064 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662065 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662066 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662067 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662068 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662069 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662070 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662071 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662072 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662073 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662074 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662075 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662076 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662077 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662078 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662079 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662080 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662081 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662082 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662083 4 0.4795 0.654 0.156 0.008 0.044 0.764 0.028
#> SRR1662084 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662085 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662086 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662087 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662088 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662089 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662090 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662091 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662092 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662093 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662094 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662095 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662096 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662097 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662098 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662099 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662100 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662101 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662102 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662103 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662104 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662105 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662106 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662107 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662108 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662109 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662110 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662111 5 0.4260 0.223 0.308 0.000 0.008 0.004 0.680
#> SRR1662112 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662113 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662114 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662115 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662116 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
#> SRR1662117 5 0.0898 0.919 0.020 0.000 0.000 0.008 0.972
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661717 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661718 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661719 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661720 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661721 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661722 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661723 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661724 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661725 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661726 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661727 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661728 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661729 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661730 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661731 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661732 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661733 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661734 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661735 2 0.4628 0.817 0.000 0.740 0.132 0.092 0.036 0.000
#> SRR1661736 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661737 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661738 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661739 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661740 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661741 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661742 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661743 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661744 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661745 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661746 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661747 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661748 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661749 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661750 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661751 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661752 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661753 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661754 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661755 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661756 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661757 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661758 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661759 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661760 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661761 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661762 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661763 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661764 2 0.1889 0.925 0.000 0.920 0.056 0.004 0.020 0.000
#> SRR1661766 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0260 0.938 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0146 0.938 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661827 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661828 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661829 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661830 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661831 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661832 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661833 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661834 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661835 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661836 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661837 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661838 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661839 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661840 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661841 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661843 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661844 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661845 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661846 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661847 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661848 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661849 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661850 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661851 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661852 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661853 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661854 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661855 1 0.3483 0.864 0.808 0.000 0.036 0.000 0.144 0.012
#> SRR1661856 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661857 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661858 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661859 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661860 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661861 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661862 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661863 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661864 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661865 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661866 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661867 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661868 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661869 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661870 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661871 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661872 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661873 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661874 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661875 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661876 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661877 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661878 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661879 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661880 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661881 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661882 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661883 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661884 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661885 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661886 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661887 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661888 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661889 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661890 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661891 6 0.1320 0.942 0.036 0.000 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR1661892 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0260 0.894 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1661928 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661929 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661930 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661931 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661932 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661933 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661934 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661935 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661936 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661937 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661938 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661939 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661940 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661941 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661942 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661943 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661944 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661945 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661946 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661947 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661948 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661949 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661950 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661951 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661952 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661953 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661954 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661955 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661956 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661957 6 0.1625 0.929 0.000 0.000 0.060 0.000 0.012 0.928
#> SRR1661958 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661959 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661960 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661961 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661962 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661963 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661964 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661965 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661966 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661967 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661968 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661969 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661970 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661971 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661972 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661973 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661974 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661975 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661976 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661977 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661978 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661979 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661980 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661981 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661982 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661983 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661984 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661985 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661986 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661987 4 0.2705 0.886 0.000 0.004 0.052 0.872 0.072 0.000
#> SRR1661988 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661989 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661990 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661991 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661992 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661993 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661994 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661995 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661996 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661997 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661998 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1661999 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662000 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662001 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662002 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662003 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662004 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662005 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662006 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662007 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662008 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662009 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662010 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662011 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662012 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662013 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662014 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662015 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662016 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662017 5 0.4972 0.800 0.256 0.000 0.064 0.000 0.656 0.024
#> SRR1662018 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662019 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662020 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662021 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662022 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662023 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662024 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662025 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662026 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662027 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662028 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662029 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662030 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662031 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662032 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662033 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662034 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662035 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662036 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662037 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662038 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662039 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662040 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662041 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662042 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662043 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662044 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662045 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662046 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662047 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662048 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662049 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662050 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662051 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662052 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662053 3 0.4377 1.000 0.000 0.008 0.736 0.156 0.000 0.100
#> SRR1662054 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662055 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662056 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662057 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662058 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662059 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662060 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662061 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662062 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662063 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662064 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662065 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662066 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662067 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662068 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662069 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662070 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662071 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662072 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662073 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662074 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662075 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662076 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662077 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662078 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662079 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662080 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662081 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662082 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662083 4 0.1933 0.886 0.044 0.000 0.032 0.920 0.000 0.004
#> SRR1662084 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662085 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662086 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662087 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662088 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662089 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662090 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662091 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662092 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662093 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662094 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662095 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662096 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662097 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662098 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662099 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662100 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662101 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662102 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662103 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662104 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662105 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662106 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662107 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662108 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662109 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662110 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662111 5 0.4211 0.294 0.364 0.000 0.004 0.016 0.616 0.000
#> SRR1662112 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662113 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662114 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662115 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662116 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
#> SRR1662117 5 0.1719 0.833 0.060 0.000 0.000 0.016 0.924 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.622 0.823 0.897 0.4517 0.552 0.552
#> 3 3 0.827 0.840 0.937 0.3168 0.790 0.641
#> 4 4 0.755 0.875 0.873 0.1325 0.938 0.849
#> 5 5 0.872 0.913 0.918 0.0989 0.922 0.780
#> 6 6 0.982 0.941 0.972 0.0948 0.918 0.703
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661827 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661828 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661829 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661830 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661831 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661832 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661833 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661834 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661835 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661836 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661837 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661838 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661839 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661840 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661841 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661843 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661844 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661845 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661846 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661847 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661848 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661849 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661850 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661851 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661852 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661853 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661854 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661855 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661856 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.0000 0.908 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661893 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661894 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661895 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661896 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661897 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661898 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661899 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661900 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661901 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661902 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661903 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661904 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661905 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661906 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661907 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661908 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661909 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661910 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661911 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661912 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661913 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661914 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661915 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661916 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661917 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661918 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661919 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661920 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661921 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661922 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661923 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661924 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661925 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661926 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661927 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661928 2 0.9732 0.546 0.404 0.596
#> SRR1661929 2 0.9833 0.511 0.424 0.576
#> SRR1661930 2 0.9710 0.552 0.400 0.600
#> SRR1661931 2 0.9710 0.552 0.400 0.600
#> SRR1661932 2 0.9754 0.539 0.408 0.592
#> SRR1661933 2 0.9775 0.532 0.412 0.588
#> SRR1661934 2 0.9896 0.478 0.440 0.560
#> SRR1661935 2 0.9710 0.552 0.400 0.600
#> SRR1661936 2 0.9754 0.539 0.408 0.592
#> SRR1661937 2 0.9815 0.518 0.420 0.580
#> SRR1661938 2 0.9710 0.552 0.400 0.600
#> SRR1661939 2 0.9710 0.552 0.400 0.600
#> SRR1661940 2 0.9933 0.452 0.452 0.548
#> SRR1661941 2 0.9815 0.518 0.420 0.580
#> SRR1661942 2 0.9795 0.525 0.416 0.584
#> SRR1661943 2 0.9710 0.552 0.400 0.600
#> SRR1661944 2 0.9909 0.470 0.444 0.556
#> SRR1661945 2 0.9710 0.552 0.400 0.600
#> SRR1661946 2 0.9833 0.510 0.424 0.576
#> SRR1661947 2 0.9881 0.487 0.436 0.564
#> SRR1661948 2 0.9754 0.539 0.408 0.592
#> SRR1661949 2 0.9754 0.539 0.408 0.592
#> SRR1661950 2 0.9754 0.539 0.408 0.592
#> SRR1661951 2 0.9922 0.461 0.448 0.552
#> SRR1661952 2 0.9881 0.487 0.436 0.564
#> SRR1661953 2 0.9795 0.525 0.416 0.584
#> SRR1661954 2 0.9732 0.546 0.404 0.596
#> SRR1661955 2 0.9896 0.478 0.440 0.560
#> SRR1661956 2 0.9850 0.503 0.428 0.572
#> SRR1661957 2 0.9710 0.552 0.400 0.600
#> SRR1661958 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661959 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661960 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661961 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661962 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661963 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661964 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661965 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661966 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661967 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661968 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661969 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661970 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661971 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661972 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661973 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661974 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661975 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661976 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661977 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661978 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661979 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661980 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661981 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661982 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661983 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661984 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661985 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661986 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661987 2 0.0000 0.869 0.000 1.000
#> SRR1661988 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661989 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661990 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661991 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661992 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661993 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661994 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661995 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661996 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661997 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661998 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1661999 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662000 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662001 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662002 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662003 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662004 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662005 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662006 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662007 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662008 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662009 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662010 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662011 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662012 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662013 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662014 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662015 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662016 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662017 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662018 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662019 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662020 2 0.1184 0.865 0.016 0.984
#> SRR1662021 2 0.2603 0.853 0.044 0.956
#> SRR1662022 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662023 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662024 2 0.1633 0.863 0.024 0.976
#> SRR1662025 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662026 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662027 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662028 2 0.1633 0.863 0.024 0.976
#> SRR1662029 2 0.1633 0.863 0.024 0.976
#> SRR1662030 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662031 2 0.3114 0.847 0.056 0.944
#> SRR1662032 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662033 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662034 2 0.0938 0.866 0.012 0.988
#> SRR1662035 2 0.1184 0.865 0.016 0.984
#> SRR1662036 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662037 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662038 2 0.1633 0.863 0.024 0.976
#> SRR1662039 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662040 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662041 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662042 2 0.2043 0.859 0.032 0.968
#> SRR1662043 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662044 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662045 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662046 2 0.1633 0.863 0.024 0.976
#> SRR1662047 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662048 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662049 2 0.1633 0.863 0.024 0.976
#> SRR1662050 2 0.3879 0.835 0.076 0.924
#> SRR1662051 2 0.1414 0.864 0.020 0.980
#> SRR1662052 2 0.1633 0.863 0.024 0.976
#> SRR1662053 2 0.1843 0.861 0.028 0.972
#> SRR1662054 2 0.6531 0.774 0.168 0.832
#> SRR1662055 2 0.7883 0.707 0.236 0.764
#> SRR1662056 2 0.7056 0.752 0.192 0.808
#> SRR1662057 2 0.6712 0.767 0.176 0.824
#> SRR1662058 2 0.7219 0.745 0.200 0.800
#> SRR1662059 2 0.7219 0.745 0.200 0.800
#> SRR1662060 2 0.6623 0.770 0.172 0.828
#> SRR1662061 2 0.6438 0.776 0.164 0.836
#> SRR1662062 2 0.6438 0.776 0.164 0.836
#> SRR1662063 2 0.6343 0.780 0.160 0.840
#> SRR1662064 2 0.6623 0.770 0.172 0.828
#> SRR1662065 2 0.6801 0.763 0.180 0.820
#> SRR1662066 2 0.7376 0.737 0.208 0.792
#> SRR1662067 2 0.6048 0.788 0.148 0.852
#> SRR1662068 2 0.6438 0.777 0.164 0.836
#> SRR1662069 2 0.6247 0.782 0.156 0.844
#> SRR1662070 2 0.6531 0.773 0.168 0.832
#> SRR1662071 2 0.8267 0.680 0.260 0.740
#> SRR1662072 2 0.6438 0.777 0.164 0.836
#> SRR1662073 2 0.6048 0.788 0.148 0.852
#> SRR1662074 2 0.7453 0.733 0.212 0.788
#> SRR1662075 2 0.6887 0.760 0.184 0.816
#> SRR1662076 2 0.7056 0.752 0.192 0.808
#> SRR1662077 2 0.7815 0.712 0.232 0.768
#> SRR1662078 2 0.6712 0.767 0.176 0.824
#> SRR1662079 2 0.7674 0.720 0.224 0.776
#> SRR1662080 2 0.6712 0.767 0.176 0.824
#> SRR1662081 2 0.7056 0.752 0.192 0.808
#> SRR1662082 2 0.7299 0.741 0.204 0.796
#> SRR1662083 2 0.6973 0.756 0.188 0.812
#> SRR1662084 2 0.9580 0.492 0.380 0.620
#> SRR1662085 2 0.9896 0.350 0.440 0.560
#> SRR1662086 2 0.9896 0.350 0.440 0.560
#> SRR1662087 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662088 2 0.9710 0.451 0.400 0.600
#> SRR1662089 2 0.9850 0.383 0.428 0.572
#> SRR1662090 2 0.9710 0.451 0.400 0.600
#> SRR1662091 2 0.9983 0.236 0.476 0.524
#> SRR1662092 2 0.9954 0.289 0.460 0.540
#> SRR1662093 1 0.9427 0.412 0.640 0.360
#> SRR1662094 2 0.9896 0.350 0.440 0.560
#> SRR1662095 2 0.9815 0.403 0.420 0.580
#> SRR1662096 2 0.9944 0.302 0.456 0.544
#> SRR1662097 2 0.9754 0.433 0.408 0.592
#> SRR1662098 2 0.9710 0.451 0.400 0.600
#> SRR1662099 2 0.9881 0.361 0.436 0.564
#> SRR1662100 2 0.9954 0.290 0.460 0.540
#> SRR1662101 2 0.9732 0.442 0.404 0.596
#> SRR1662102 2 0.9977 0.250 0.472 0.528
#> SRR1662103 2 0.9661 0.468 0.392 0.608
#> SRR1662104 2 0.9933 0.315 0.452 0.548
#> SRR1662105 2 0.9775 0.423 0.412 0.588
#> SRR1662106 2 0.9635 0.476 0.388 0.612
#> SRR1662107 2 0.9933 0.315 0.452 0.548
#> SRR1662108 2 0.9795 0.413 0.416 0.584
#> SRR1662109 2 0.9686 0.460 0.396 0.604
#> SRR1662110 2 0.9686 0.460 0.396 0.604
#> SRR1662111 1 0.4431 0.963 0.908 0.092
#> SRR1662112 2 0.9833 0.393 0.424 0.576
#> SRR1662113 2 0.9881 0.361 0.436 0.564
#> SRR1662114 1 0.5519 0.917 0.872 0.128
#> SRR1662115 2 0.9710 0.451 0.400 0.600
#> SRR1662116 2 0.9850 0.383 0.428 0.572
#> SRR1662117 2 0.9732 0.442 0.404 0.596
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661929 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661930 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661931 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661932 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661933 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661934 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661935 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661936 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661937 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661938 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661939 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661940 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661941 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661942 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661943 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661944 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661945 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661946 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661947 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661948 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661949 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661950 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661951 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661952 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661953 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661954 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661955 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661956 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661957 3 0.0000 1.00000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661958 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661959 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661960 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661961 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661962 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661963 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661964 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661965 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661966 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661967 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661968 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661969 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661970 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661971 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661972 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661973 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661974 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661975 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661976 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661977 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661978 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661979 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661980 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661981 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661982 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661983 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661984 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661985 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661986 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661987 2 0.0000 0.91235 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661988 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.2269 0.88956 0.016 0.944 0.040
#> SRR1662019 2 0.2339 0.88723 0.012 0.940 0.048
#> SRR1662020 2 0.2031 0.89327 0.016 0.952 0.032
#> SRR1662021 2 0.3590 0.86276 0.028 0.896 0.076
#> SRR1662022 2 0.2339 0.88713 0.012 0.940 0.048
#> SRR1662023 2 0.2550 0.88613 0.024 0.936 0.040
#> SRR1662024 2 0.2446 0.88486 0.012 0.936 0.052
#> SRR1662025 2 0.2486 0.88192 0.008 0.932 0.060
#> SRR1662026 2 0.2584 0.87971 0.008 0.928 0.064
#> SRR1662027 2 0.2564 0.88615 0.028 0.936 0.036
#> SRR1662028 2 0.2845 0.87584 0.012 0.920 0.068
#> SRR1662029 2 0.2703 0.88136 0.016 0.928 0.056
#> SRR1662030 2 0.2680 0.87739 0.008 0.924 0.068
#> SRR1662031 2 0.4335 0.83961 0.036 0.864 0.100
#> SRR1662032 2 0.3415 0.86431 0.020 0.900 0.080
#> SRR1662033 2 0.2955 0.86983 0.008 0.912 0.080
#> SRR1662034 2 0.1832 0.89414 0.008 0.956 0.036
#> SRR1662035 2 0.2590 0.87630 0.004 0.924 0.072
#> SRR1662036 2 0.2384 0.88402 0.008 0.936 0.056
#> SRR1662037 2 0.2681 0.88412 0.028 0.932 0.040
#> SRR1662038 2 0.2680 0.87726 0.008 0.924 0.068
#> SRR1662039 2 0.2269 0.88956 0.016 0.944 0.040
#> SRR1662040 2 0.2414 0.88812 0.020 0.940 0.040
#> SRR1662041 2 0.3445 0.86077 0.016 0.896 0.088
#> SRR1662042 2 0.3134 0.87555 0.032 0.916 0.052
#> SRR1662043 2 0.3445 0.86061 0.016 0.896 0.088
#> SRR1662044 2 0.2229 0.88925 0.012 0.944 0.044
#> SRR1662045 2 0.2681 0.88412 0.028 0.932 0.040
#> SRR1662046 2 0.2434 0.88801 0.024 0.940 0.036
#> SRR1662047 2 0.2793 0.88233 0.028 0.928 0.044
#> SRR1662048 2 0.2663 0.88415 0.024 0.932 0.044
#> SRR1662049 2 0.3213 0.87321 0.028 0.912 0.060
#> SRR1662050 2 0.4269 0.84619 0.052 0.872 0.076
#> SRR1662051 2 0.2492 0.88555 0.016 0.936 0.048
#> SRR1662052 2 0.2703 0.88132 0.016 0.928 0.056
#> SRR1662053 2 0.2804 0.87917 0.016 0.924 0.060
#> SRR1662054 2 0.5178 0.67463 0.256 0.744 0.000
#> SRR1662055 2 0.5621 0.58892 0.308 0.692 0.000
#> SRR1662056 2 0.5291 0.65680 0.268 0.732 0.000
#> SRR1662057 2 0.5138 0.68047 0.252 0.748 0.000
#> SRR1662058 2 0.5431 0.63129 0.284 0.716 0.000
#> SRR1662059 2 0.5465 0.62437 0.288 0.712 0.000
#> SRR1662060 2 0.5138 0.68013 0.252 0.748 0.000
#> SRR1662061 2 0.5058 0.69107 0.244 0.756 0.000
#> SRR1662062 2 0.4974 0.70125 0.236 0.764 0.000
#> SRR1662063 2 0.5016 0.69621 0.240 0.760 0.000
#> SRR1662064 2 0.5138 0.68013 0.252 0.748 0.000
#> SRR1662065 2 0.5327 0.65061 0.272 0.728 0.000
#> SRR1662066 2 0.5497 0.61785 0.292 0.708 0.000
#> SRR1662067 2 0.4887 0.71149 0.228 0.772 0.000
#> SRR1662068 2 0.5098 0.68556 0.248 0.752 0.000
#> SRR1662069 2 0.5016 0.69622 0.240 0.760 0.000
#> SRR1662070 2 0.5138 0.68007 0.252 0.748 0.000
#> SRR1662071 2 0.5859 0.51776 0.344 0.656 0.000
#> SRR1662072 2 0.5098 0.68594 0.248 0.752 0.000
#> SRR1662073 2 0.4750 0.72559 0.216 0.784 0.000
#> SRR1662074 2 0.5465 0.62445 0.288 0.712 0.000
#> SRR1662075 2 0.5291 0.65680 0.268 0.732 0.000
#> SRR1662076 2 0.5431 0.63113 0.284 0.716 0.000
#> SRR1662077 2 0.5650 0.58186 0.312 0.688 0.000
#> SRR1662078 2 0.5216 0.66880 0.260 0.740 0.000
#> SRR1662079 2 0.5591 0.59630 0.304 0.696 0.000
#> SRR1662080 2 0.5216 0.66892 0.260 0.740 0.000
#> SRR1662081 2 0.5363 0.64410 0.276 0.724 0.000
#> SRR1662082 2 0.5497 0.61757 0.292 0.708 0.000
#> SRR1662083 2 0.5363 0.64416 0.276 0.724 0.000
#> SRR1662084 2 0.6286 0.19482 0.464 0.536 0.000
#> SRR1662085 1 0.6280 0.08480 0.540 0.460 0.000
#> SRR1662086 1 0.6291 0.05498 0.532 0.468 0.000
#> SRR1662087 1 0.0237 0.90126 0.996 0.004 0.000
#> SRR1662088 2 0.6305 0.12536 0.484 0.516 0.000
#> SRR1662089 1 0.6302 0.00710 0.520 0.480 0.000
#> SRR1662090 2 0.6308 0.09526 0.492 0.508 0.000
#> SRR1662091 1 0.6274 0.09908 0.544 0.456 0.000
#> SRR1662092 1 0.6286 0.07015 0.536 0.464 0.000
#> SRR1662093 1 0.5363 0.55534 0.724 0.276 0.000
#> SRR1662094 1 0.6302 0.00719 0.520 0.480 0.000
#> SRR1662095 2 0.6309 0.07938 0.496 0.504 0.000
#> SRR1662096 1 0.6267 0.11271 0.548 0.452 0.000
#> SRR1662097 2 0.6302 0.13997 0.480 0.520 0.000
#> SRR1662098 2 0.6307 0.11042 0.488 0.512 0.000
#> SRR1662099 1 0.6302 0.00710 0.520 0.480 0.000
#> SRR1662100 1 0.6274 0.09906 0.544 0.456 0.000
#> SRR1662101 2 0.6308 0.09520 0.492 0.508 0.000
#> SRR1662102 1 0.6252 0.13912 0.556 0.444 0.000
#> SRR1662103 2 0.6299 0.15449 0.476 0.524 0.000
#> SRR1662104 1 0.6280 0.08485 0.540 0.460 0.000
#> SRR1662105 2 0.6307 0.11072 0.488 0.512 0.000
#> SRR1662106 2 0.6291 0.18154 0.468 0.532 0.000
#> SRR1662107 1 0.6267 0.11279 0.548 0.452 0.000
#> SRR1662108 1 0.6309 -0.05949 0.504 0.496 0.000
#> SRR1662109 2 0.6305 0.12545 0.484 0.516 0.000
#> SRR1662110 2 0.6299 0.15425 0.476 0.524 0.000
#> SRR1662111 1 0.0000 0.90517 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.6307 -0.02678 0.512 0.488 0.000
#> SRR1662113 1 0.6299 0.02349 0.524 0.476 0.000
#> SRR1662114 1 0.2625 0.81940 0.916 0.084 0.000
#> SRR1662115 2 0.6308 0.09530 0.492 0.508 0.000
#> SRR1662116 1 0.6299 0.02354 0.524 0.476 0.000
#> SRR1662117 2 0.6302 0.13988 0.480 0.520 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661717 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661718 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661719 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661720 2 0.3208 0.848 0.004 0.848 0.148 0.000
#> SRR1661721 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661722 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661723 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661724 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661725 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661726 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661727 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661728 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661729 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661730 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661731 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661732 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661733 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661734 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661735 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.850 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661857 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661858 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661859 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661860 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661861 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661862 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661863 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661864 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661865 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661866 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661867 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661868 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661869 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661870 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661871 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661872 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661873 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661874 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661875 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661876 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661877 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661878 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661879 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661880 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661881 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661882 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661883 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661884 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661885 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661886 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661887 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661888 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661889 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661890 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661891 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661892 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.945 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661929 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661930 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661931 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661932 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661933 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661934 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661935 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661936 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661937 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661938 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661939 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661940 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661941 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661942 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661943 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661944 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661945 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661946 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661947 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661948 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661949 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661950 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661951 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661952 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661953 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661954 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661955 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661956 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661957 3 0.4933 1.000 0.000 0.000 0.568 0.432
#> SRR1661958 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661959 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661960 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661961 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661962 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661963 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661964 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661965 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661966 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661967 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661968 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661969 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661970 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661971 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661972 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661973 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661974 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661975 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661976 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661977 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661978 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661979 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661980 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661981 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661982 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661983 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661984 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661985 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661986 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661987 2 0.3257 0.848 0.004 0.844 0.152 0.000
#> SRR1661988 1 0.2011 0.866 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1661989 1 0.1792 0.882 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1661990 1 0.2469 0.822 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1661991 1 0.3801 0.505 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1661992 1 0.1557 0.895 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1661993 1 0.1637 0.891 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1661994 1 0.1940 0.873 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1661995 1 0.2469 0.823 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1661996 1 0.2647 0.799 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1661997 1 0.2589 0.807 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1661998 1 0.2149 0.855 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1661999 1 0.1867 0.878 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1662000 1 0.1940 0.873 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1662001 1 0.1557 0.896 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1662002 1 0.2647 0.798 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1662003 1 0.1792 0.882 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1662004 1 0.3024 0.734 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1662005 1 0.1940 0.874 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1662006 1 0.2149 0.855 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1662007 1 0.3311 0.669 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1662008 1 0.2281 0.843 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1662009 1 0.1211 0.911 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1662010 1 0.2345 0.836 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1662011 1 0.0921 0.922 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1662012 1 0.0921 0.922 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1662013 1 0.2281 0.842 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1662014 1 0.2921 0.754 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1662015 1 0.2011 0.867 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1662016 1 0.0469 0.936 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1662017 1 0.2814 0.773 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1662018 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662019 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662020 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662021 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662022 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662023 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662024 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662025 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662026 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662027 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662028 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662029 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662030 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662031 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662032 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662033 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662034 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662035 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662036 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662037 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662038 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662039 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662040 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662041 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662042 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662043 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662044 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662045 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662046 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662047 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662048 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662049 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662050 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662051 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662052 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662053 2 0.4933 0.709 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662054 2 0.6274 0.720 0.184 0.664 0.152 0.000
#> SRR1662055 2 0.6514 0.686 0.212 0.636 0.152 0.000
#> SRR1662056 2 0.6416 0.701 0.200 0.648 0.152 0.000
#> SRR1662057 2 0.6310 0.716 0.188 0.660 0.152 0.000
#> SRR1662058 2 0.6381 0.706 0.196 0.652 0.152 0.000
#> SRR1662059 2 0.6416 0.701 0.200 0.648 0.152 0.000
#> SRR1662060 2 0.6346 0.711 0.192 0.656 0.152 0.000
#> SRR1662061 2 0.6236 0.724 0.180 0.668 0.152 0.000
#> SRR1662062 2 0.6274 0.720 0.184 0.664 0.152 0.000
#> SRR1662063 2 0.6236 0.724 0.180 0.668 0.152 0.000
#> SRR1662064 2 0.6274 0.720 0.184 0.664 0.152 0.000
#> SRR1662065 2 0.6381 0.706 0.196 0.652 0.152 0.000
#> SRR1662066 2 0.6381 0.707 0.196 0.652 0.152 0.000
#> SRR1662067 2 0.6119 0.737 0.168 0.680 0.152 0.000
#> SRR1662068 2 0.6274 0.720 0.184 0.664 0.152 0.000
#> SRR1662069 2 0.6236 0.725 0.180 0.668 0.152 0.000
#> SRR1662070 2 0.6310 0.715 0.188 0.660 0.152 0.000
#> SRR1662071 2 0.6745 0.639 0.244 0.604 0.152 0.000
#> SRR1662072 2 0.6198 0.729 0.176 0.672 0.152 0.000
#> SRR1662073 2 0.6037 0.745 0.160 0.688 0.152 0.000
#> SRR1662074 2 0.6449 0.696 0.204 0.644 0.152 0.000
#> SRR1662075 2 0.6381 0.706 0.196 0.652 0.152 0.000
#> SRR1662076 2 0.6416 0.701 0.200 0.648 0.152 0.000
#> SRR1662077 2 0.6606 0.668 0.224 0.624 0.152 0.000
#> SRR1662078 2 0.6310 0.716 0.188 0.660 0.152 0.000
#> SRR1662079 2 0.6514 0.685 0.212 0.636 0.152 0.000
#> SRR1662080 2 0.6346 0.711 0.192 0.656 0.152 0.000
#> SRR1662081 2 0.6346 0.711 0.192 0.656 0.152 0.000
#> SRR1662082 2 0.6416 0.701 0.200 0.648 0.152 0.000
#> SRR1662083 2 0.6381 0.706 0.196 0.652 0.152 0.000
#> SRR1662084 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662085 4 0.5097 0.978 0.428 0.004 0.000 0.568
#> SRR1662086 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662087 4 0.6079 0.886 0.380 0.000 0.052 0.568
#> SRR1662088 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662089 4 0.5220 0.986 0.424 0.008 0.000 0.568
#> SRR1662090 4 0.5329 0.983 0.420 0.012 0.000 0.568
#> SRR1662091 4 0.5220 0.986 0.424 0.008 0.000 0.568
#> SRR1662092 4 0.5220 0.986 0.424 0.008 0.000 0.568
#> SRR1662093 4 0.5329 0.973 0.420 0.000 0.012 0.568
#> SRR1662094 4 0.5220 0.986 0.424 0.008 0.000 0.568
#> SRR1662095 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662096 4 0.5097 0.978 0.428 0.004 0.000 0.568
#> SRR1662097 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662098 4 0.5492 0.980 0.416 0.012 0.004 0.568
#> SRR1662099 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662100 4 0.5260 0.983 0.424 0.004 0.004 0.568
#> SRR1662101 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662102 4 0.5220 0.986 0.424 0.008 0.000 0.568
#> SRR1662103 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662104 4 0.5220 0.986 0.424 0.008 0.000 0.568
#> SRR1662105 4 0.5220 0.986 0.424 0.008 0.000 0.568
#> SRR1662106 4 0.5329 0.983 0.420 0.012 0.000 0.568
#> SRR1662107 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662108 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662109 4 0.5492 0.980 0.416 0.012 0.004 0.568
#> SRR1662110 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
#> SRR1662111 1 0.5771 0.281 0.712 0.000 0.144 0.144
#> SRR1662112 4 0.5097 0.978 0.428 0.004 0.000 0.568
#> SRR1662113 4 0.5220 0.986 0.424 0.008 0.000 0.568
#> SRR1662114 4 0.5602 0.952 0.408 0.000 0.024 0.568
#> SRR1662115 4 0.5329 0.983 0.420 0.012 0.000 0.568
#> SRR1662116 4 0.5260 0.983 0.424 0.004 0.004 0.568
#> SRR1662117 4 0.5384 0.987 0.420 0.008 0.004 0.568
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661717 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661718 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661719 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661720 2 0.4395 0.833 0.000 0.748 0 0.064 0.188
#> SRR1661721 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661722 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661723 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661724 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661725 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661726 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661727 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661728 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661729 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661730 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661731 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661732 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661733 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661734 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661735 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661736 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.864 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.965 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661929 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661930 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661931 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661932 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661933 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661934 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661935 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661936 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661937 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661938 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661939 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661940 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661941 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661942 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661943 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661944 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661945 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661946 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661947 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661948 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661949 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661950 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661951 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661952 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661953 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661954 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661955 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661956 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661957 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661958 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661959 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661960 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661961 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661962 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661963 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661964 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661965 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661966 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661967 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661968 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661969 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661970 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661971 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661972 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661973 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661974 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661975 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661976 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661977 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661978 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661979 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661980 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661981 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661982 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661983 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661984 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661985 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661986 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661987 2 0.4455 0.832 0.000 0.744 0 0.068 0.188
#> SRR1661988 1 0.1732 0.912 0.920 0.000 0 0.000 0.080
#> SRR1661989 1 0.1544 0.923 0.932 0.000 0 0.000 0.068
#> SRR1661990 1 0.2127 0.885 0.892 0.000 0 0.000 0.108
#> SRR1661991 1 0.3274 0.702 0.780 0.000 0 0.000 0.220
#> SRR1661992 1 0.1341 0.931 0.944 0.000 0 0.000 0.056
#> SRR1661993 1 0.1410 0.928 0.940 0.000 0 0.000 0.060
#> SRR1661994 1 0.1671 0.917 0.924 0.000 0 0.000 0.076
#> SRR1661995 1 0.2127 0.885 0.892 0.000 0 0.000 0.108
#> SRR1661996 1 0.2280 0.870 0.880 0.000 0 0.000 0.120
#> SRR1661997 1 0.2230 0.875 0.884 0.000 0 0.000 0.116
#> SRR1661998 1 0.1851 0.905 0.912 0.000 0 0.000 0.088
#> SRR1661999 1 0.1608 0.920 0.928 0.000 0 0.000 0.072
#> SRR1662000 1 0.1671 0.917 0.924 0.000 0 0.000 0.076
#> SRR1662001 1 0.1341 0.932 0.944 0.000 0 0.000 0.056
#> SRR1662002 1 0.2280 0.870 0.880 0.000 0 0.000 0.120
#> SRR1662003 1 0.1544 0.923 0.932 0.000 0 0.000 0.068
#> SRR1662004 1 0.2605 0.831 0.852 0.000 0 0.000 0.148
#> SRR1662005 1 0.1671 0.918 0.924 0.000 0 0.000 0.076
#> SRR1662006 1 0.1851 0.906 0.912 0.000 0 0.000 0.088
#> SRR1662007 1 0.2852 0.792 0.828 0.000 0 0.000 0.172
#> SRR1662008 1 0.1965 0.897 0.904 0.000 0 0.000 0.096
#> SRR1662009 1 0.1043 0.942 0.960 0.000 0 0.000 0.040
#> SRR1662010 1 0.2020 0.893 0.900 0.000 0 0.000 0.100
#> SRR1662011 1 0.0794 0.949 0.972 0.000 0 0.000 0.028
#> SRR1662012 1 0.0794 0.949 0.972 0.000 0 0.000 0.028
#> SRR1662013 1 0.1965 0.897 0.904 0.000 0 0.000 0.096
#> SRR1662014 1 0.2516 0.843 0.860 0.000 0 0.000 0.140
#> SRR1662015 1 0.1732 0.913 0.920 0.000 0 0.000 0.080
#> SRR1662016 1 0.0404 0.959 0.988 0.000 0 0.000 0.012
#> SRR1662017 1 0.2424 0.854 0.868 0.000 0 0.000 0.132
#> SRR1662018 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662019 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662020 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662021 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662022 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662023 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662024 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662025 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662026 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662027 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662028 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662029 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662030 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662031 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662032 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662033 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662034 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662035 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662036 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662037 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662038 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662039 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662040 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662041 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662042 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662043 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662044 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662045 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662046 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662047 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662048 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662049 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662050 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662051 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662052 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662053 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000
#> SRR1662054 2 0.5980 0.785 0.076 0.668 0 0.068 0.188
#> SRR1662055 2 0.6325 0.759 0.104 0.640 0 0.068 0.188
#> SRR1662056 2 0.6233 0.767 0.096 0.648 0 0.068 0.188
#> SRR1662057 2 0.6033 0.782 0.080 0.664 0 0.068 0.188
#> SRR1662058 2 0.6185 0.771 0.092 0.652 0 0.068 0.188
#> SRR1662059 2 0.6185 0.771 0.092 0.652 0 0.068 0.188
#> SRR1662060 2 0.6085 0.778 0.084 0.660 0 0.068 0.188
#> SRR1662061 2 0.5980 0.785 0.076 0.668 0 0.068 0.188
#> SRR1662062 2 0.6033 0.782 0.080 0.664 0 0.068 0.188
#> SRR1662063 2 0.5980 0.785 0.076 0.668 0 0.068 0.188
#> SRR1662064 2 0.6033 0.782 0.080 0.664 0 0.068 0.188
#> SRR1662065 2 0.6135 0.775 0.088 0.656 0 0.068 0.188
#> SRR1662066 2 0.6135 0.775 0.088 0.656 0 0.068 0.188
#> SRR1662067 2 0.5751 0.797 0.060 0.684 0 0.068 0.188
#> SRR1662068 2 0.6033 0.782 0.080 0.664 0 0.068 0.188
#> SRR1662069 2 0.5980 0.785 0.076 0.668 0 0.068 0.188
#> SRR1662070 2 0.6085 0.778 0.084 0.660 0 0.068 0.188
#> SRR1662071 2 0.6577 0.731 0.128 0.616 0 0.068 0.188
#> SRR1662072 2 0.5925 0.788 0.072 0.672 0 0.068 0.188
#> SRR1662073 2 0.5690 0.799 0.056 0.688 0 0.068 0.188
#> SRR1662074 2 0.6233 0.767 0.096 0.648 0 0.068 0.188
#> SRR1662075 2 0.6135 0.775 0.088 0.656 0 0.068 0.188
#> SRR1662076 2 0.6233 0.767 0.096 0.648 0 0.068 0.188
#> SRR1662077 2 0.6497 0.741 0.120 0.624 0 0.068 0.188
#> SRR1662078 2 0.6033 0.782 0.080 0.664 0 0.068 0.188
#> SRR1662079 2 0.6280 0.763 0.100 0.644 0 0.068 0.188
#> SRR1662080 2 0.6085 0.779 0.084 0.660 0 0.068 0.188
#> SRR1662081 2 0.6135 0.775 0.088 0.656 0 0.068 0.188
#> SRR1662082 2 0.6135 0.775 0.088 0.656 0 0.068 0.188
#> SRR1662083 2 0.6135 0.775 0.088 0.656 0 0.068 0.188
#> SRR1662084 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662085 5 0.3003 0.970 0.188 0.000 0 0.000 0.812
#> SRR1662086 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662087 5 0.1965 0.837 0.096 0.000 0 0.000 0.904
#> SRR1662088 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662089 5 0.3003 0.970 0.188 0.000 0 0.000 0.812
#> SRR1662090 5 0.3003 0.970 0.188 0.000 0 0.000 0.812
#> SRR1662091 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662092 5 0.3003 0.970 0.188 0.000 0 0.000 0.812
#> SRR1662093 5 0.2852 0.962 0.172 0.000 0 0.000 0.828
#> SRR1662094 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662095 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662096 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662097 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662098 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662099 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662100 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662101 5 0.2891 0.967 0.176 0.000 0 0.000 0.824
#> SRR1662102 5 0.3003 0.970 0.188 0.000 0 0.000 0.812
#> SRR1662103 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662104 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662105 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662106 5 0.3003 0.970 0.188 0.000 0 0.000 0.812
#> SRR1662107 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662108 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662109 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662110 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662111 5 0.4256 0.226 0.436 0.000 0 0.000 0.564
#> SRR1662112 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
#> SRR1662113 5 0.3003 0.970 0.188 0.000 0 0.000 0.812
#> SRR1662114 5 0.2516 0.913 0.140 0.000 0 0.000 0.860
#> SRR1662115 5 0.3003 0.970 0.188 0.000 0 0.000 0.812
#> SRR1662116 5 0.2929 0.972 0.180 0.000 0 0.000 0.820
#> SRR1662117 5 0.2966 0.973 0.184 0.000 0 0.000 0.816
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.3737 0.467 0.000 0.608 0 0.392 0.000 0
#> SRR1661717 2 0.3756 0.451 0.000 0.600 0 0.400 0.000 0
#> SRR1661718 2 0.3756 0.451 0.000 0.600 0 0.400 0.000 0
#> SRR1661719 2 0.3737 0.467 0.000 0.608 0 0.392 0.000 0
#> SRR1661720 2 0.3717 0.482 0.000 0.616 0 0.384 0.000 0
#> SRR1661721 2 0.3737 0.467 0.000 0.608 0 0.392 0.000 0
#> SRR1661722 2 0.3727 0.475 0.000 0.612 0 0.388 0.000 0
#> SRR1661723 2 0.3747 0.460 0.000 0.604 0 0.396 0.000 0
#> SRR1661724 2 0.3747 0.460 0.000 0.604 0 0.396 0.000 0
#> SRR1661725 2 0.3727 0.475 0.000 0.612 0 0.388 0.000 0
#> SRR1661726 2 0.3737 0.467 0.000 0.608 0 0.392 0.000 0
#> SRR1661727 2 0.3747 0.460 0.000 0.604 0 0.396 0.000 0
#> SRR1661728 2 0.3747 0.460 0.000 0.604 0 0.396 0.000 0
#> SRR1661729 2 0.3737 0.467 0.000 0.608 0 0.392 0.000 0
#> SRR1661730 2 0.3747 0.460 0.000 0.604 0 0.396 0.000 0
#> SRR1661731 2 0.3727 0.475 0.000 0.612 0 0.388 0.000 0
#> SRR1661732 2 0.3747 0.460 0.000 0.604 0 0.396 0.000 0
#> SRR1661733 2 0.3747 0.460 0.000 0.604 0 0.396 0.000 0
#> SRR1661734 2 0.3747 0.460 0.000 0.604 0 0.396 0.000 0
#> SRR1661735 2 0.3727 0.475 0.000 0.612 0 0.388 0.000 0
#> SRR1661736 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661737 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661738 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661739 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661740 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661741 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661742 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661743 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661744 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661745 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661746 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661747 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661748 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661749 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661750 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661751 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661752 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661753 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661754 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661755 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661756 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661757 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661758 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661759 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661760 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661761 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661762 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661763 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661764 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661766 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661767 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661768 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661769 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661770 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661771 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661772 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661773 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661774 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661775 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661776 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661777 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661778 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661779 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661780 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661781 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661782 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661783 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661784 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661785 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661786 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661787 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661788 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661789 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661790 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661791 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661792 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661793 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661794 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661795 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661796 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661797 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661798 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661799 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661800 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661801 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661802 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661803 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661804 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661805 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661806 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661807 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661808 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661809 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661810 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661811 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661812 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661813 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661814 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661815 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661816 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661817 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661818 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661819 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661820 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661821 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661822 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661823 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661824 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661825 2 0.0000 0.917 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661826 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661827 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661828 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661829 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661830 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661831 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661832 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661833 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661834 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661835 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661836 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661837 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661838 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661839 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661840 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661841 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661843 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661844 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661845 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661846 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661847 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661848 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661849 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661850 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661851 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661852 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661853 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661854 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661855 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661856 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661857 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661858 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661859 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661860 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661861 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661862 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661863 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661864 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661865 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661866 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661867 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661868 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661869 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661870 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661871 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661872 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661873 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661874 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661875 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661876 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661877 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661878 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661879 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661880 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661881 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661882 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661883 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661884 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661885 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661886 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661887 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661888 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661889 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661890 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661891 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661892 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661893 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661894 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661895 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661896 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661897 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661898 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661899 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661900 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661901 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661902 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661903 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661904 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661905 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661906 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661907 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661908 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661909 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661910 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661911 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661912 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661913 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661914 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661915 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661916 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661917 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661918 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661919 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661920 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661921 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661922 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661923 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661924 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661925 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661926 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661927 1 0.0000 0.972 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661928 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661929 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661930 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661931 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661932 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661933 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661934 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661935 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661936 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661937 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661938 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661939 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661940 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661941 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661942 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661943 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661944 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661945 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661946 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661947 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661948 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661949 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661950 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661951 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661952 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661953 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661954 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661955 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661956 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661957 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1661958 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661959 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661960 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661961 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661962 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661963 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661964 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661965 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661966 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661967 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661968 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661969 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661970 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661971 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661972 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661973 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661974 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661975 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661976 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661977 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661978 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661979 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661980 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661981 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661982 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661983 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661984 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661985 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661986 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661987 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1661988 1 0.1556 0.930 0.920 0.000 0 0.000 0.080 0
#> SRR1661989 1 0.1387 0.938 0.932 0.000 0 0.000 0.068 0
#> SRR1661990 1 0.1910 0.908 0.892 0.000 0 0.000 0.108 0
#> SRR1661991 1 0.2941 0.771 0.780 0.000 0 0.000 0.220 0
#> SRR1661992 1 0.1204 0.945 0.944 0.000 0 0.000 0.056 0
#> SRR1661993 1 0.1267 0.942 0.940 0.000 0 0.000 0.060 0
#> SRR1661994 1 0.1501 0.933 0.924 0.000 0 0.000 0.076 0
#> SRR1661995 1 0.1910 0.908 0.892 0.000 0 0.000 0.108 0
#> SRR1661996 1 0.2048 0.897 0.880 0.000 0 0.000 0.120 0
#> SRR1661997 1 0.2003 0.901 0.884 0.000 0 0.000 0.116 0
#> SRR1661998 1 0.1663 0.924 0.912 0.000 0 0.000 0.088 0
#> SRR1661999 1 0.1444 0.936 0.928 0.000 0 0.000 0.072 0
#> SRR1662000 1 0.1501 0.933 0.924 0.000 0 0.000 0.076 0
#> SRR1662001 1 0.1204 0.945 0.944 0.000 0 0.000 0.056 0
#> SRR1662002 1 0.2048 0.896 0.880 0.000 0 0.000 0.120 0
#> SRR1662003 1 0.1387 0.938 0.932 0.000 0 0.000 0.068 0
#> SRR1662004 1 0.2340 0.866 0.852 0.000 0 0.000 0.148 0
#> SRR1662005 1 0.1501 0.934 0.924 0.000 0 0.000 0.076 0
#> SRR1662006 1 0.1663 0.924 0.912 0.000 0 0.000 0.088 0
#> SRR1662007 1 0.2562 0.837 0.828 0.000 0 0.000 0.172 0
#> SRR1662008 1 0.1765 0.918 0.904 0.000 0 0.000 0.096 0
#> SRR1662009 1 0.0937 0.953 0.960 0.000 0 0.000 0.040 0
#> SRR1662010 1 0.1814 0.915 0.900 0.000 0 0.000 0.100 0
#> SRR1662011 1 0.0713 0.959 0.972 0.000 0 0.000 0.028 0
#> SRR1662012 1 0.0713 0.959 0.972 0.000 0 0.000 0.028 0
#> SRR1662013 1 0.1765 0.918 0.904 0.000 0 0.000 0.096 0
#> SRR1662014 1 0.2260 0.876 0.860 0.000 0 0.000 0.140 0
#> SRR1662015 1 0.1556 0.930 0.920 0.000 0 0.000 0.080 0
#> SRR1662016 1 0.0363 0.966 0.988 0.000 0 0.000 0.012 0
#> SRR1662017 1 0.2178 0.884 0.868 0.000 0 0.000 0.132 0
#> SRR1662018 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662019 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662020 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662021 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662022 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662023 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662024 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662025 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662026 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662027 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662028 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662029 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662030 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662031 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662032 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662033 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662034 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662035 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662036 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662037 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662038 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662039 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662040 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662041 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662042 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662043 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662044 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662045 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662046 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662047 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662048 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662049 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662050 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662051 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662052 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662053 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1662054 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662055 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662056 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662057 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662058 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662059 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662060 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662061 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662062 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662063 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662064 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662065 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662066 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662067 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662068 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662069 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662070 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662071 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662072 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662073 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662074 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662075 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662076 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662077 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662078 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662079 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662080 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662081 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662082 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662083 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000 0.000 0
#> SRR1662084 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662085 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662086 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662087 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662088 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662089 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662090 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662091 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662092 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662093 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662094 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662095 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662096 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662097 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662098 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662099 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662100 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662101 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662102 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662103 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662104 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662105 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662106 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662107 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662108 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662109 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662110 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662111 5 0.4410 0.311 0.412 0.000 0 0.028 0.560 0
#> SRR1662112 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662113 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662114 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662115 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662116 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
#> SRR1662117 5 0.0000 0.984 0.000 0.000 0 0.000 1.000 0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 5)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.341 0.792 0.822 0.3724 0.724 0.724
#> 3 3 0.307 0.713 0.806 0.5419 0.651 0.517
#> 4 4 0.490 0.673 0.769 0.2149 0.876 0.680
#> 5 5 0.766 0.813 0.866 0.1142 0.882 0.610
#> 6 6 0.817 0.779 0.831 0.0414 0.954 0.801
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661717 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661718 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661719 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661720 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661721 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661722 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661723 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661724 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661725 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661726 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661727 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661728 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661729 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661730 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661731 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661732 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661733 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661734 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661735 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661736 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661737 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661738 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661739 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661740 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661741 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661742 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661743 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661744 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661745 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661746 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661747 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661748 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661749 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661750 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661751 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661752 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661753 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661754 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661755 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661756 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661757 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661758 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661759 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661760 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661761 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661762 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661763 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661764 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661766 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661767 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661768 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661769 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661770 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661771 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661772 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661773 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661774 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661775 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661776 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661777 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661778 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661779 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661780 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661781 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661782 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661783 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661784 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661785 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661786 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661787 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661788 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661789 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661790 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661791 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661792 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661793 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661794 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661795 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661796 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661797 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661798 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661799 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661800 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661801 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661802 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661803 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661804 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661805 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661806 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661807 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661808 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661809 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661810 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661811 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661812 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661813 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661814 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661815 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661816 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661817 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661818 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661819 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661820 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661821 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661822 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661823 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661824 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661825 2 0.730 0.736 0.204 0.796
#> SRR1661826 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661827 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661828 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661829 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661830 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661831 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661832 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661833 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661834 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661835 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661836 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661837 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661838 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661839 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661840 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661841 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661843 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661844 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661845 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661846 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661847 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661848 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661849 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661850 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661851 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661852 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661853 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661854 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661855 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661856 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661893 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661894 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661895 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661896 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661897 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661898 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661899 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661900 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661901 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661902 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661903 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661904 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661905 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661906 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661907 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661908 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661909 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661910 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661911 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661912 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661913 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661914 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661915 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661916 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661917 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661918 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661919 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661920 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661921 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661922 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661923 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661924 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661925 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661926 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661927 2 0.788 0.736 0.236 0.764
#> SRR1661928 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661929 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661930 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661931 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661932 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661933 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661934 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661935 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661936 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661937 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661938 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661939 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661940 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661941 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661942 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661943 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661944 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661945 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661946 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661947 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661948 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661949 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661950 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661951 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661952 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661953 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661954 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661955 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661956 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661957 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661958 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661959 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661960 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661961 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661962 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661963 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661964 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661965 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661966 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661967 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661968 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661969 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661970 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661971 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661972 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661973 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661974 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661975 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661976 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661977 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661978 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661979 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661980 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661981 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661982 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661983 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661984 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661985 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661986 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661987 2 0.295 0.789 0.052 0.948
#> SRR1661988 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661989 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661990 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661991 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661992 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661993 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661994 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661995 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661996 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661997 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661998 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1661999 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662000 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662001 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662002 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662003 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662004 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662005 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662006 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662007 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662008 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662009 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662010 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662011 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662012 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662013 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662014 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662015 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662016 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662017 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662018 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662054 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662055 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662056 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662057 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662058 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662059 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662060 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662061 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662062 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662063 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662064 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662065 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662066 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662067 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662068 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662069 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662070 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662071 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662072 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662073 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662074 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662075 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662076 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662077 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662078 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662079 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662080 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662081 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662082 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662083 2 0.000 0.792 0.000 1.000
#> SRR1662084 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662085 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662086 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662087 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662088 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662089 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662090 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662091 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662092 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662093 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662094 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662095 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662096 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662097 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662098 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662099 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662100 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662101 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662102 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662103 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662104 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662105 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662106 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662107 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662108 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662109 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662110 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662111 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662112 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662113 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662114 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662115 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662116 2 0.795 0.734 0.240 0.760
#> SRR1662117 2 0.795 0.734 0.240 0.760
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661717 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661718 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661719 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661720 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661721 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661722 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661723 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661724 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661725 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661726 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661727 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661728 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661729 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661730 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661731 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661732 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661733 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661734 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661735 2 0.8181 0.645 0.324 0.584 0.092
#> SRR1661736 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661737 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661738 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661739 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661740 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661741 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661742 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661743 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661744 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661745 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661746 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661747 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661748 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661749 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661750 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661751 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661752 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661753 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661754 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661755 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661756 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661757 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661758 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661759 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661760 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661761 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661762 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661763 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661764 2 0.7673 0.701 0.236 0.664 0.100
#> SRR1661766 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661767 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661768 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661769 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661770 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661771 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661772 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661773 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661774 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661775 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661776 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661777 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661778 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661779 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661780 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661781 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661782 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661783 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661784 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661785 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661786 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661787 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661788 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661789 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661790 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661791 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661792 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661793 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661794 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661795 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661796 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661797 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661798 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661799 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661800 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661801 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661802 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661803 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661804 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661805 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661806 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661807 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661808 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661809 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661810 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661811 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661812 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661813 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661814 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661815 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661816 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661817 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661818 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661819 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661820 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661821 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661822 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661823 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661824 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661825 2 0.4446 0.685 0.032 0.856 0.112
#> SRR1661826 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0592 0.800 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661828 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0237 0.798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661833 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0237 0.798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661839 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0237 0.798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661844 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0237 0.798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661850 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0237 0.798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661852 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.796 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661857 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661858 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661859 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661860 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661861 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661862 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661863 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661864 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661865 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661866 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661867 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661868 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661869 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661870 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661871 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661872 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661873 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661874 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661875 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661876 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661877 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661878 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661879 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661880 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661881 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661882 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661883 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661884 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661885 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661886 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661887 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661888 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661889 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661890 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661891 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661892 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661893 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661894 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661895 1 0.3637 0.798 0.892 0.024 0.084
#> SRR1661896 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661897 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661898 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661899 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661900 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661901 1 0.3765 0.795 0.888 0.028 0.084
#> SRR1661902 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661903 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661904 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661905 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661906 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661907 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661908 1 0.3637 0.798 0.892 0.024 0.084
#> SRR1661909 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661910 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661911 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661912 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661913 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661914 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661915 1 0.3637 0.798 0.892 0.024 0.084
#> SRR1661916 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661917 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661918 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661919 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661920 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661921 1 0.3765 0.795 0.888 0.028 0.084
#> SRR1661922 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661923 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661924 1 0.3765 0.795 0.888 0.028 0.084
#> SRR1661925 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661926 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661927 1 0.1031 0.795 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661928 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661929 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661930 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661931 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661932 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661933 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661934 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661935 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661936 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661937 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661938 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661939 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661940 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661941 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661942 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661943 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661944 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661945 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661946 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661947 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661948 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661949 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661950 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661951 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661952 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661953 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661954 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661955 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661956 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661957 3 0.0424 1.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1661958 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661959 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661960 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661961 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661962 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661963 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661964 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661965 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661966 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661967 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661968 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661969 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661970 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661971 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661972 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661973 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661974 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661975 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661976 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661977 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661978 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661979 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661980 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661981 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661982 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661983 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661984 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661985 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661986 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661987 2 0.8553 0.573 0.336 0.552 0.112
#> SRR1661988 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661989 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661990 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661991 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661992 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661993 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661994 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661995 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661996 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661997 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661998 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1661999 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662000 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662001 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662002 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662003 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662004 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662005 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662006 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662007 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662008 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662009 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662010 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662011 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662012 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662013 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662014 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662015 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662016 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662017 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662018 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662019 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662020 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662021 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662022 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662023 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662024 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662025 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662026 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662027 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662028 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662029 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662030 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662031 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662032 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662033 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662034 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662035 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662036 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662037 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662038 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662039 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662040 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662041 1 0.6745 0.227 0.560 0.428 0.012
#> SRR1662042 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662043 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662044 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662045 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662046 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662047 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662048 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662049 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662050 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662051 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662052 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662053 1 0.6608 0.231 0.560 0.432 0.008
#> SRR1662054 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662055 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662056 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662057 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662058 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662059 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662060 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662061 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662062 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662063 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662064 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662065 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662066 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662067 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662068 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662069 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662070 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662071 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662072 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662073 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662074 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662075 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662076 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662077 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662078 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662079 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662080 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662081 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662082 2 0.7505 0.535 0.384 0.572 0.044
#> SRR1662083 2 0.7597 0.533 0.384 0.568 0.048
#> SRR1662084 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662085 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662086 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662087 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662088 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662089 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662090 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662091 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662092 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662093 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662094 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662095 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662096 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662097 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662098 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662099 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662100 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662101 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662102 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662103 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662104 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662105 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662106 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662107 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662108 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662109 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662110 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662111 1 0.3112 0.806 0.900 0.004 0.096
#> SRR1662112 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662113 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662114 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662115 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662116 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
#> SRR1662117 1 0.3272 0.806 0.892 0.004 0.104
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661717 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661718 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661719 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661720 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661721 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661722 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661723 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661724 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661725 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661726 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661727 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661728 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661729 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661730 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661731 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661732 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661733 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661734 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661735 2 0.5995 0.607 0.096 0.672 0.000 0.232
#> SRR1661736 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661737 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661738 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661739 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661740 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661741 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661742 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661743 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661744 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661745 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661746 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661747 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661748 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661749 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661750 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661751 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661752 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661753 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661754 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661755 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661756 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661757 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661758 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661759 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661760 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661761 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661762 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661763 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661764 2 0.3172 0.730 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1661766 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.751 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661797 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661798 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661799 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661800 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661801 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661802 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661803 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661804 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661805 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661806 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661807 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661808 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661809 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661810 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661811 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661812 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661813 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661814 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661815 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661816 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661817 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661818 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661819 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661820 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661821 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661822 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661823 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661824 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661825 2 0.0188 0.751 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661826 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661827 1 0.0672 0.600 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1661828 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661829 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661830 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661831 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661832 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661833 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661834 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661835 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661836 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661837 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661838 1 0.1792 0.574 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1661839 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661840 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661841 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661843 1 0.1557 0.580 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1661844 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661845 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661846 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661847 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661848 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661849 1 0.1940 0.570 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1661850 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661851 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661852 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661853 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661854 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661855 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661856 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661857 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661858 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661859 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661860 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661861 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661862 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661863 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661864 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661865 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661866 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661867 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661868 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661869 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661870 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661871 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661872 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661873 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661874 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661875 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661876 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661877 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661878 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661879 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661880 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661881 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661882 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661883 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661884 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661885 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661886 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661887 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661888 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661889 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661890 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661891 3 0.1211 0.957 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.5248 0.522 0.748 0.088 0.000 0.164
#> SRR1661896 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661899 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.4203 0.552 0.824 0.068 0.000 0.108
#> SRR1661902 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.5376 0.512 0.736 0.088 0.000 0.176
#> SRR1661909 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.5517 0.500 0.724 0.092 0.000 0.184
#> SRR1661916 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.5248 0.522 0.748 0.088 0.000 0.164
#> SRR1661922 1 0.0188 0.601 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661923 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.4010 0.557 0.836 0.064 0.000 0.100
#> SRR1661925 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.603 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661929 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661930 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661931 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661932 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661933 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661934 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661935 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661936 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661937 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661938 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661939 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661940 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661941 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661942 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661943 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661944 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661945 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661946 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661947 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661948 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661949 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661950 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661951 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661952 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661953 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661954 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661955 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661956 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661957 3 0.2408 0.948 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1661958 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661959 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661960 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661961 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661962 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661963 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661964 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661965 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661966 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661967 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661968 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661969 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661970 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661971 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661972 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661973 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661974 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661975 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661976 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661977 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661978 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661979 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661980 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661981 4 0.6137 0.630 0.152 0.044 0.076 0.728
#> SRR1661982 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661983 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661984 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661985 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661986 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661987 4 0.5788 0.661 0.152 0.028 0.076 0.744
#> SRR1661988 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661989 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661990 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661991 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661992 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661993 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661994 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661995 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661996 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661997 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661998 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1661999 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662000 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662001 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662002 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662003 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662004 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662005 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662006 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662007 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662008 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662009 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662010 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662011 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662012 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662013 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662014 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662015 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662016 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662017 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662018 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662019 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662020 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662021 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662022 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662023 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662024 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662025 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662026 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662027 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662028 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662029 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662030 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662031 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662032 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662033 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662034 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662035 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662036 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662037 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662038 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662039 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662040 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662041 4 0.4204 0.754 0.192 0.020 0.000 0.788
#> SRR1662042 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662043 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662044 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662045 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662046 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662047 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662048 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662049 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662050 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662051 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662052 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662053 4 0.3978 0.759 0.192 0.012 0.000 0.796
#> SRR1662054 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662055 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662056 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662057 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662058 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662059 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662060 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662061 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662062 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662063 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662064 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662065 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662066 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662067 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662068 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662069 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662070 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662071 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662072 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662073 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662074 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662075 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662076 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662077 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662078 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662079 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662080 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662081 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662082 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662083 2 0.7474 0.194 0.176 0.424 0.000 0.400
#> SRR1662084 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662085 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662086 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662087 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662088 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662089 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662090 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662091 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662092 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662093 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662094 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662095 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662096 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662097 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662098 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662099 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662100 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662101 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662102 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662103 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662104 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662105 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662106 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662107 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662108 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662109 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662110 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662111 1 0.6669 0.543 0.572 0.108 0.000 0.320
#> SRR1662112 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662113 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662114 1 0.7840 0.571 0.468 0.104 0.040 0.388
#> SRR1662115 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662116 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
#> SRR1662117 1 0.7845 0.568 0.464 0.104 0.040 0.392
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661717 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661718 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661719 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661720 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661721 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661722 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661723 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661724 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661725 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661726 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661727 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661728 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661729 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661730 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661731 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661732 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661733 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661734 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661735 2 0.7174 0.265 0.052 0.468 0.000 0.336 0.144
#> SRR1661736 2 0.3601 0.763 0.000 0.820 0.000 0.128 0.052
#> SRR1661737 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661738 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661739 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661740 2 0.3601 0.763 0.000 0.820 0.000 0.128 0.052
#> SRR1661741 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661742 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661743 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661744 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661745 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661746 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661747 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661748 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661749 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661750 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661751 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661752 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661753 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661754 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661755 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661756 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661757 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661758 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661759 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661760 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661761 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661762 2 0.3601 0.763 0.000 0.820 0.000 0.128 0.052
#> SRR1661763 2 0.3507 0.767 0.000 0.828 0.000 0.120 0.052
#> SRR1661764 2 0.3555 0.766 0.000 0.824 0.000 0.124 0.052
#> SRR1661766 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0162 0.829 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.831 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.3525 0.773 0.816 0.004 0.000 0.024 0.156
#> SRR1661896 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.1270 0.934 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1661902 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.3484 0.779 0.820 0.004 0.000 0.024 0.152
#> SRR1661909 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.4033 0.689 0.760 0.004 0.000 0.024 0.212
#> SRR1661916 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.3310 0.800 0.836 0.004 0.000 0.024 0.136
#> SRR1661922 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.1410 0.927 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1661925 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661929 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661930 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661931 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661932 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661933 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661934 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661935 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661936 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661937 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661938 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661939 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661940 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661941 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661942 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661943 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661944 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661945 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661946 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661947 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661948 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661949 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661950 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661951 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661952 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661953 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661954 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661955 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661956 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661957 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661958 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661959 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661960 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661961 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661962 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661963 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661964 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661965 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661966 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661967 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661968 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661969 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661970 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661971 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661972 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661973 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661974 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661975 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661976 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661977 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661978 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661979 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661980 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661981 4 0.6366 0.682 0.076 0.056 0.052 0.692 0.124
#> SRR1661982 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661983 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661984 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661985 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661986 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661987 4 0.5130 0.716 0.076 0.000 0.052 0.748 0.124
#> SRR1661988 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661989 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661990 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661991 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661992 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661993 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661994 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661995 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661996 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661997 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661998 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1661999 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662000 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662001 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662002 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662003 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662004 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662005 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662006 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662007 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662008 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662009 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662010 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662011 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662012 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662013 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662014 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662015 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662016 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662017 5 0.3039 0.876 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1662018 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662019 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662020 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662021 4 0.1478 0.727 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1662022 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662023 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662024 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662025 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662026 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662027 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662028 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662029 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662030 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662031 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662032 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662033 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662034 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662035 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662036 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662037 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662038 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662039 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662040 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662041 4 0.2409 0.720 0.068 0.000 0.000 0.900 0.032
#> SRR1662042 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662043 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662044 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662045 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662046 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662047 4 0.1704 0.726 0.068 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1662048 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662049 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662050 4 0.1478 0.727 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1662051 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662052 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662053 4 0.1410 0.729 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1662054 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662055 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662056 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662057 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662058 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662059 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662060 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662061 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662062 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662063 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662064 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662065 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662066 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662067 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662068 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662069 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662070 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662071 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662072 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662073 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662074 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662075 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662076 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662077 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662078 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662079 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662080 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662081 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662082 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662083 4 0.7727 0.494 0.188 0.292 0.000 0.436 0.084
#> SRR1662084 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662085 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662086 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662087 5 0.1364 0.877 0.036 0.000 0.000 0.012 0.952
#> SRR1662088 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662089 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662090 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662091 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662092 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662093 5 0.1251 0.879 0.036 0.000 0.000 0.008 0.956
#> SRR1662094 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662095 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662096 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662097 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662098 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662099 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662100 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662101 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662102 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662103 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662104 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662105 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662106 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662107 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662108 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662109 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662110 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662111 5 0.4556 0.611 0.292 0.004 0.000 0.024 0.680
#> SRR1662112 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662113 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662114 5 0.1364 0.877 0.036 0.000 0.000 0.012 0.952
#> SRR1662115 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662116 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662117 5 0.0290 0.893 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661717 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661718 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661719 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661720 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661721 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661722 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661723 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661724 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661725 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661726 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661727 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661728 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661729 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661730 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661731 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661732 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661733 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661734 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661735 4 0.6359 0.308 0.000 0.236 0.028 0.484 0.000 0.252
#> SRR1661736 2 0.5275 0.569 0.000 0.600 0.000 0.232 0.000 0.168
#> SRR1661737 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661738 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661739 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661740 2 0.5275 0.569 0.000 0.600 0.000 0.232 0.000 0.168
#> SRR1661741 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661742 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661743 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661744 2 0.5275 0.569 0.000 0.600 0.000 0.232 0.000 0.168
#> SRR1661745 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661746 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661747 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661748 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661749 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661750 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661751 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661752 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661753 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661754 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661755 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661756 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661757 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661758 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661759 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661760 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661761 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661762 2 0.5275 0.569 0.000 0.600 0.000 0.232 0.000 0.168
#> SRR1661763 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661764 2 0.5253 0.574 0.000 0.604 0.000 0.228 0.000 0.168
#> SRR1661766 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0363 0.842 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661857 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661858 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661859 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661860 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661861 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661862 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661863 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661864 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661865 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661866 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661867 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661868 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661869 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661870 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661871 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661872 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661873 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661874 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661875 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661876 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661877 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661878 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661879 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661880 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661881 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661882 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661883 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661884 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661885 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661886 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661887 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661888 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661889 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661890 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661891 3 0.2454 0.938 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1661892 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.4718 0.656 0.740 0.004 0.000 0.116 0.108 0.032
#> SRR1661896 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.2318 0.888 0.904 0.000 0.000 0.020 0.048 0.028
#> SRR1661902 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.4951 0.630 0.720 0.004 0.000 0.120 0.120 0.036
#> SRR1661909 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.5030 0.619 0.712 0.004 0.000 0.128 0.120 0.036
#> SRR1661916 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.4951 0.630 0.720 0.004 0.000 0.120 0.120 0.036
#> SRR1661922 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.1922 0.907 0.924 0.000 0.000 0.012 0.040 0.024
#> SRR1661925 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.978 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661929 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661930 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661931 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661932 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661933 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661934 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661935 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661936 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661937 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661938 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661939 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661940 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661941 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661942 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661943 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661944 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661945 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661946 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661947 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661948 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661949 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661950 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661951 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661952 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661953 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661954 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661955 3 0.0260 0.922 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1661956 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661957 3 0.0146 0.925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661958 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661959 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661960 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661961 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661962 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661963 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661964 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661965 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661966 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661967 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661968 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661969 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661970 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661971 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661972 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661973 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661974 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661975 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661976 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661977 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661978 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661979 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661980 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661981 4 0.3432 0.678 0.000 0.052 0.000 0.800 0.000 0.148
#> SRR1661982 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661983 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661984 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661985 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661986 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661987 4 0.2340 0.715 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1661988 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661989 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661990 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661991 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661992 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661993 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661994 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661995 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661996 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661997 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661998 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1661999 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662000 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662001 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662002 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662003 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662004 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662005 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662006 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662007 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662008 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662009 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662010 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662011 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662012 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662013 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662014 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662015 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662016 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662017 5 0.5590 0.735 0.220 0.000 0.000 0.000 0.548 0.232
#> SRR1662018 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662019 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662020 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662021 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662022 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662023 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662024 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662025 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662026 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662027 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662028 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662029 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662030 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662031 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662032 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662033 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662034 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662035 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662036 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662037 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662038 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662039 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662040 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662041 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662042 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662043 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662044 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662045 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662046 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662047 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662048 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662049 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662050 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662051 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662052 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662053 4 0.4384 0.629 0.036 0.000 0.000 0.616 0.000 0.348
#> SRR1662054 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.2070 0.723 0.044 0.048 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662085 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662086 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662087 5 0.3347 0.709 0.004 0.000 0.000 0.104 0.824 0.068
#> SRR1662088 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662089 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662090 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662091 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662092 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662093 5 0.2651 0.696 0.000 0.000 0.000 0.112 0.860 0.028
#> SRR1662094 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662095 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662096 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662097 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662098 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662099 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662100 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662101 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662102 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662103 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662104 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662105 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662106 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662107 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662108 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662109 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662110 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662111 5 0.6365 0.489 0.232 0.004 0.000 0.120 0.564 0.080
#> SRR1662112 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662113 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662114 5 0.2940 0.696 0.004 0.000 0.000 0.112 0.848 0.036
#> SRR1662115 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662116 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662117 5 0.0000 0.793 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.5014 0.499 0.499
#> 3 3 0.835 0.950 0.959 0.3065 0.787 0.598
#> 4 4 0.843 0.850 0.889 0.1207 0.861 0.628
#> 5 5 0.925 0.946 0.951 0.0576 0.873 0.588
#> 6 6 0.962 0.972 0.973 0.0513 0.952 0.791
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 5
There is also optional best \(k\) = 2 5 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661928 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661929 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661930 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661931 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661932 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661933 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661934 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661935 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661936 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661937 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661938 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661939 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661940 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661941 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661942 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661943 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661944 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661945 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661946 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661947 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661948 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661949 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661950 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661951 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661952 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661953 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661954 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661955 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661956 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661957 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661958 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661959 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661960 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661961 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661962 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661963 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661964 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661965 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661966 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661967 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661968 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661969 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661970 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661971 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661972 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661973 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661974 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661975 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661976 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661977 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661978 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661979 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661980 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661981 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661982 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661983 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661984 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661985 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661986 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661987 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661988 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662019 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662020 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662021 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662022 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662023 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662024 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662025 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662026 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662027 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662028 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662029 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662030 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662031 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662032 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662033 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662034 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662036 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662037 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662038 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662039 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662040 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662041 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662042 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662043 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662044 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662045 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662046 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662047 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662048 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662049 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662050 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662051 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662052 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662053 2 0.0376 0.997 0.004 0.996
#> SRR1662054 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662055 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662056 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662057 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662058 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662059 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662060 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662061 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662062 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662063 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662064 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662065 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662066 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662067 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662068 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662069 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662070 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662071 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662072 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662073 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662074 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662075 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662076 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662077 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662078 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662079 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662080 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662081 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662082 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662083 2 0.0000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662084 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.963 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661827 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661828 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661829 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661830 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661831 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661832 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661833 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661834 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661835 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661836 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661837 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661838 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661839 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661840 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661841 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661843 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661844 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661845 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661846 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661847 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661848 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661849 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661850 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661851 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661852 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661853 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661854 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661855 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661856 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661857 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661858 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661859 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661860 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661861 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661862 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661863 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661864 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661865 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661866 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661867 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661868 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661869 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661870 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661871 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661872 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661873 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661874 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661875 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661876 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661877 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661878 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661879 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661880 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661881 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661882 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661883 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661884 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661885 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661886 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661887 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661888 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661889 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661890 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661891 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661892 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661893 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661894 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661895 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661896 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661897 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661898 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661899 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661900 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661901 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661902 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661903 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661904 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661905 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661906 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661907 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661908 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661909 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661910 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661911 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661912 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661913 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661914 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661915 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661916 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661917 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661918 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661919 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661920 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661921 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661922 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661923 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661924 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661925 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661926 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661927 1 0.2711 0.948 0.912 0.000 0.088
#> SRR1661928 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661929 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661930 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661931 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661932 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661933 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661934 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661935 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661936 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661937 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661938 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661939 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661940 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661941 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661942 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661943 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661944 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661945 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661946 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661947 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661948 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661949 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661950 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661951 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661952 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661953 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661954 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661955 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661956 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661957 3 0.0747 0.961 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661958 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661959 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661960 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661961 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661962 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661963 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661964 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661965 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661966 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661967 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661968 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661969 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661970 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661971 2 0.3610 0.929 0.096 0.888 0.016
#> SRR1661972 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661973 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661974 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661975 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661976 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661977 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661978 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661979 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661980 2 0.3610 0.929 0.096 0.888 0.016
#> SRR1661981 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661982 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661983 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661984 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661985 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661986 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661987 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1661988 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662018 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662019 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662020 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662021 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662022 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662023 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662024 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662025 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662026 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662027 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662028 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662029 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662030 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662031 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662032 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662033 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662034 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662035 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662036 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662037 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662038 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662039 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662040 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662041 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662042 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662043 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662044 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662045 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662046 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662047 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662048 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662049 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662050 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662051 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662052 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662053 3 0.3237 0.929 0.032 0.056 0.912
#> SRR1662054 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662055 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662056 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662057 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662058 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662059 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662060 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662061 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662062 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662063 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662064 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662065 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662066 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662067 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662068 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662069 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662070 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662071 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662072 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662073 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662074 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662075 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662076 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662077 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662078 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662079 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662080 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662081 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662082 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662083 2 0.3528 0.932 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662084 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.0237 0.949 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662112 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.0000 0.949 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661857 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661858 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661859 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661860 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661861 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661862 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661863 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661864 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661865 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661866 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661867 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661868 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661869 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661870 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661871 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661872 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661873 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661874 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661875 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661876 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661877 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661878 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661879 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661880 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661881 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661882 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661883 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661884 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661885 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661886 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661887 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661888 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661889 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661890 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661891 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.790 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661929 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661930 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661931 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661932 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661933 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661934 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661935 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661936 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661937 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661938 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661939 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661940 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661941 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661942 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661943 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661944 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661945 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661946 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661947 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661948 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661949 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661950 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661951 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661952 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661953 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661954 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661955 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661956 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661957 3 0.112 1.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1661958 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661959 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661960 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661961 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661962 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661963 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661964 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661965 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661966 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661967 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661968 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661969 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661970 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661971 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661972 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661973 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661974 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661975 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661976 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661977 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661978 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661979 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661980 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661981 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661982 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661983 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661984 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661985 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661986 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661987 4 0.227 0.782 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1661988 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661989 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661990 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661991 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661992 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661993 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661994 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661995 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661996 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661997 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661998 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1661999 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662000 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662001 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662002 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662003 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662004 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662005 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662006 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662007 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662008 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662009 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662010 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662011 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662012 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662013 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662014 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662015 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662016 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662017 1 0.473 0.749 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1662018 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662019 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662020 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662021 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662022 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662023 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662024 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662025 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662026 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662027 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662028 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662029 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662030 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662031 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662032 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662033 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662034 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662035 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662036 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662037 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662038 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662039 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662040 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662041 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662042 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662043 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662044 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662045 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662046 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662047 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662048 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662049 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662050 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662051 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662052 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662053 4 0.490 0.525 0.004 0.000 0.364 0.632
#> SRR1662054 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662055 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662056 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662057 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662058 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662059 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662060 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662061 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662062 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662063 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662064 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662065 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662066 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662067 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662068 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662069 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662070 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662071 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662072 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662073 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662074 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662075 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662076 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662077 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662078 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662079 4 0.215 0.782 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1662080 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662081 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662082 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662083 4 0.208 0.783 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1662084 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662085 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662086 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662087 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662088 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662089 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662090 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662091 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662092 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662093 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662094 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662095 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662096 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662097 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662098 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662099 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662100 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662101 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662102 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662103 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662104 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662105 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662106 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662107 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662108 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662109 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662110 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662111 1 0.471 0.749 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1662112 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662113 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662114 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662115 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662116 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1662117 1 0.475 0.746 0.632 0.000 0.000 0.368
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661929 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661930 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661931 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661932 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661933 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661934 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661935 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661936 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661937 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661938 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661939 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661940 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661941 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661942 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661943 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661944 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661945 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661946 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661947 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661948 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661949 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661950 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661951 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661952 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661953 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661954 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661955 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661956 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661957 3 0.0000 1.000 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661958 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661959 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661960 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661961 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661962 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661963 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661964 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661965 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661966 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661967 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661968 5 0.3534 0.816 0.000 0 0.000 0.256 0.744
#> SRR1661969 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661970 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661971 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661972 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661973 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661974 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661975 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661976 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661977 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661978 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661979 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661980 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661981 5 0.3534 0.816 0.000 0 0.000 0.256 0.744
#> SRR1661982 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661983 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661984 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661985 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661986 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661987 5 0.3508 0.819 0.000 0 0.000 0.252 0.748
#> SRR1661988 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661989 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661990 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661991 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661992 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661993 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661994 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661995 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661996 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661997 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661998 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1661999 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662000 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662001 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662002 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662003 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662004 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662005 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662006 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662007 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662008 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662009 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662010 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662011 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662012 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662013 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662014 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662015 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662016 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662017 5 0.0404 0.845 0.000 0 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662018 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662019 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662020 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662021 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662022 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662023 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662024 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662025 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662026 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662027 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662028 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662029 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662030 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662031 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662032 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662033 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662034 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662035 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662036 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662037 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662038 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662039 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662040 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662041 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662042 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662043 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662044 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662045 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662046 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662047 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662048 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662049 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662050 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662051 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662052 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662053 4 0.1608 1.000 0.000 0 0.072 0.928 0.000
#> SRR1662054 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662055 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662056 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662057 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662058 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662059 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662060 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662061 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662062 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662063 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662064 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662065 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662066 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662067 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662068 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662069 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662070 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662071 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662072 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662073 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662074 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662075 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662076 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662077 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662078 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662079 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662080 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662081 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662082 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662083 5 0.3816 0.786 0.000 0 0.000 0.304 0.696
#> SRR1662084 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662085 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662086 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662087 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662088 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662089 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662090 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662091 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662092 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662093 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662094 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662095 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662096 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662097 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662098 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662099 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662100 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662101 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662102 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662103 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662104 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662105 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662106 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662107 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662108 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662109 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662110 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662111 5 0.1478 0.797 0.064 0 0.000 0.000 0.936
#> SRR1662112 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662113 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662114 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662115 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662116 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662117 5 0.0000 0.848 0.000 0 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661827 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661828 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661829 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661830 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661831 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661832 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661833 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661834 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661835 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661836 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661837 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661838 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661839 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661840 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661841 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661843 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661844 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661845 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661846 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661847 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661848 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661849 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661850 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661851 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661852 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661853 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661854 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661855 1 0.0146 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661856 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661857 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661858 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661859 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661860 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661861 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661862 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661863 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661864 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661865 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661866 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661867 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661868 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661869 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661870 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661871 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661872 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661873 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661874 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661875 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661876 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661877 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661878 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661879 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661880 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661881 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661882 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661883 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661884 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661885 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661886 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661887 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661888 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661889 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661890 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661891 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661929 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661930 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661931 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661932 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661933 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661934 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661935 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661936 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661937 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661938 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661939 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661940 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661941 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661942 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661943 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661944 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661945 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661946 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661947 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661948 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661949 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661950 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661951 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661952 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661953 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661954 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661955 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661956 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661957 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661958 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661959 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661960 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661963 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661965 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661967 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661968 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661973 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661976 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661978 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661979 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661980 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661981 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661984 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661986 4 0.0000 0.947 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661987 4 0.0146 0.948 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1661988 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661989 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661990 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661991 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661992 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661993 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661994 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661995 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661996 5 0.0405 0.871 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1661997 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661998 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1661999 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662000 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662001 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662002 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662003 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662004 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662005 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662006 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662007 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662008 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662009 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662010 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662011 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662012 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662013 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662014 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662015 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662016 5 0.0405 0.871 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR1662017 5 0.0291 0.873 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662018 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662019 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662020 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662021 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662022 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662023 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662024 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662025 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662026 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662027 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662028 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662029 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662030 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662031 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662032 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662033 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662034 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662035 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662036 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662037 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662038 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662039 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662040 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662041 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662042 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662043 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662044 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662045 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662046 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662047 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662048 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662049 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662050 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662051 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662052 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662053 3 0.0405 1.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1662054 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.1753 0.943 0.000 0.004 0.084 0.912 0.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.1753 0.943 0.000 0.004 0.084 0.912 0.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.1753 0.943 0.000 0.004 0.084 0.912 0.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.1753 0.943 0.000 0.004 0.084 0.912 0.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.1753 0.943 0.000 0.004 0.084 0.912 0.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.1610 0.946 0.000 0.000 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.1753 0.943 0.000 0.004 0.084 0.912 0.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662085 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662086 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662087 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662088 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662089 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662090 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662091 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662092 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662093 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662094 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662095 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662096 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662097 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662098 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662099 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662100 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662101 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662102 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662103 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662104 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662105 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662106 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662107 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662108 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662109 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662110 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662111 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662112 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662113 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662114 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662115 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662116 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR1662117 5 0.3171 0.884 0.000 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.731 0.949 0.969 0.4848 0.518 0.518
#> 3 3 0.791 0.957 0.963 0.2642 0.860 0.729
#> 4 4 0.843 0.862 0.919 0.0530 0.999 0.998
#> 5 5 0.960 0.950 0.968 0.0973 0.922 0.792
#> 6 6 0.988 0.952 0.971 0.0358 0.973 0.909
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 5
There is also optional best \(k\) = 5 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661929 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661930 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661931 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661932 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661933 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661934 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661935 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661936 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661937 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661938 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661939 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661940 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661941 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661942 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661943 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661944 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661945 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661946 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661947 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661948 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661949 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661950 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661951 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661952 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661953 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661954 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661955 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661956 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661957 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1661958 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661959 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661960 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661961 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661962 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661963 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661964 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661965 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661966 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661967 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661968 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661969 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661970 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661971 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661972 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661973 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661974 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661975 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661976 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661977 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661978 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661979 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661980 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661981 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661982 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661983 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661984 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661985 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661986 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661987 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1661988 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661989 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661990 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661991 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661992 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661993 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661994 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661995 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661996 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661997 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661998 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1661999 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662000 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662001 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662002 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662003 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662004 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662005 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662006 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662007 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662008 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662009 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662010 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662011 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662012 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662013 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662014 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662015 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662016 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662017 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662018 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.0000 0.947 0.000 1.000
#> SRR1662054 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662055 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662056 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662057 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662058 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662059 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662060 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662061 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662062 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662063 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662064 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662065 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662066 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662067 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662068 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662069 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662070 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662071 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662072 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662073 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662074 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662075 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662076 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662077 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662078 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662079 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662080 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662081 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662082 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662083 1 0.0376 0.997 0.996 0.004
#> SRR1662084 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662085 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662086 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662087 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662088 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662089 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662090 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662091 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662092 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662093 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662094 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662095 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662096 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662097 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662098 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662099 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662100 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662101 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662102 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662103 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662104 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662105 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662106 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662107 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662108 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662109 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662110 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662111 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662112 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662113 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662114 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662115 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662116 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
#> SRR1662117 2 0.6973 0.831 0.188 0.812
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661826 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661827 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661828 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661829 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661830 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661831 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661832 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661833 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661834 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661835 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661836 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661837 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661838 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661839 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661840 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661841 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661843 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661844 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661845 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661846 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661847 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661848 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661849 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661850 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661851 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661852 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661853 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661854 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661855 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661856 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661857 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661858 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661859 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661860 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661861 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661862 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661863 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661864 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661865 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661866 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661867 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661868 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661869 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661870 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661871 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661872 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661873 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661874 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661875 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661876 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661877 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661878 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661879 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661880 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661881 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661882 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661883 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661884 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661885 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661886 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661887 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661888 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661889 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661890 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661891 3 0.0000 0.947 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661892 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661893 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661894 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661895 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661896 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661897 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661898 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661899 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661900 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661901 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661902 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661903 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661904 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661905 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661906 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661907 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661908 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661909 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661910 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661911 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661912 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661913 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661914 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661915 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661916 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661917 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661918 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661919 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661920 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661921 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661922 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661923 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661924 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661925 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661926 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661927 3 0.3267 0.919 0.116 0.000 0.884
#> SRR1661928 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661929 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661930 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661931 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661932 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661933 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661935 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661936 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661937 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661938 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661939 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661940 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661941 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661942 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661943 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661945 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661946 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661947 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661948 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661950 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661951 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661952 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661953 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661954 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661955 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661957 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661958 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661959 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661960 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661961 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661962 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661963 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661964 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661965 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661966 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661967 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661968 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661969 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661970 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661971 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661972 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661973 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661974 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661975 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661976 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661977 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661978 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661979 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661980 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661981 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661982 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661983 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661984 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661985 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661986 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661987 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661988 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661989 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661990 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661991 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661992 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661993 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661994 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661995 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661996 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661997 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661998 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661999 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662000 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662001 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662002 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662003 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662004 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662005 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662006 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662007 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662008 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662009 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662010 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662011 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662012 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662013 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662014 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662015 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662016 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662017 1 0.4555 0.884 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662018 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662019 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662021 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662022 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662023 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662024 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662026 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662027 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662028 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662029 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662030 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662031 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662032 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662035 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662036 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662037 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662038 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662039 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662040 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662041 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662042 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662043 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662044 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662045 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662046 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662047 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662048 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662050 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662051 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662052 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662053 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662054 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662055 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662056 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662057 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662058 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662059 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662060 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662061 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662062 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662063 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662064 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662065 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662066 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662067 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662068 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662069 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662070 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662071 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662072 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662073 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662074 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662075 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662076 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662077 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662078 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662079 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662080 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662081 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662082 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662083 3 0.0237 0.947 0.000 0.004 0.996
#> SRR1662084 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662085 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662086 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662087 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662088 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662089 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662090 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662091 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662092 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662093 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662094 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662095 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662096 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662097 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662098 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662099 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662100 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662101 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662102 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662103 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662104 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662105 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662106 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662107 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662108 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662109 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662110 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662111 1 0.0000 0.876 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662113 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662114 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662115 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662116 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
#> SRR1662117 1 0.1163 0.905 0.972 0.028 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661827 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661828 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661829 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661830 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661831 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661832 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661833 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661834 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661835 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661836 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661837 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661838 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661839 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661840 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661841 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661843 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661844 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661845 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661846 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661847 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661848 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661849 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661850 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661851 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661852 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661853 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661854 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661855 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661856 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661857 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661858 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661859 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661860 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661861 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661862 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661863 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661864 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661865 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661866 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661867 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661868 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661869 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661870 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661871 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661872 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661873 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661874 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661875 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661876 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661877 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661878 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661879 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661880 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661881 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661882 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661883 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661884 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661885 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661886 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661887 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661888 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661889 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661890 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661891 4 0.0188 0.817 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1661892 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661893 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661894 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661895 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661896 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661897 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661898 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661899 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661900 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661901 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661902 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661903 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661904 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661905 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661906 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661907 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661908 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661909 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661910 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661911 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661912 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661913 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661914 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661915 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661916 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661917 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661918 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661919 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661920 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661921 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661922 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661923 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661924 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661925 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661926 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661927 4 0.4855 0.708 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1661928 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661929 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661930 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661931 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661932 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661933 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661934 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661935 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661936 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661937 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661938 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661939 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661940 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661941 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661942 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661943 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661944 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661945 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661946 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661947 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661948 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661949 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661950 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661951 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661952 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661953 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661954 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661955 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661956 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661957 2 0.0000 0.999 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661958 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661959 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661960 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661961 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661962 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661963 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661964 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661965 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661966 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661967 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661968 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661969 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661970 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661971 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661972 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661973 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661974 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661975 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661976 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661977 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661978 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661979 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661980 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661981 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661982 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661983 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661984 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661985 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661986 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661987 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661988 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661989 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661990 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661991 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661992 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661993 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661994 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661995 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661996 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661997 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661998 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1661999 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662000 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662001 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662002 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662003 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662004 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662005 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662006 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662007 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662008 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662009 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662010 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662011 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662012 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662013 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662014 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662015 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662016 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662017 1 0.3991 0.733 0.808 0.172 0.020 0.000
#> SRR1662018 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662019 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662020 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662021 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662022 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662023 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662024 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662025 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662026 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662027 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662028 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662029 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662030 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662031 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662032 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662033 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662034 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662035 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662036 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662037 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662038 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662039 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662040 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662041 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662042 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662043 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662044 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662045 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662046 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662047 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662048 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662049 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662050 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662051 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662052 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662053 2 0.0188 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1662054 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662055 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662056 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662057 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662058 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662059 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662060 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662061 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662062 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662063 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662064 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662065 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662066 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662067 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662068 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662069 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662070 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662071 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662072 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662073 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662074 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662075 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662076 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662077 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662078 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662079 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662080 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662081 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662082 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662083 4 0.0000 0.816 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662084 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662111 3 0.4855 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1662112 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.0000 0.723 1.000 0.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661857 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661858 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661859 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661860 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661861 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661862 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661863 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661864 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661865 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661866 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661867 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661868 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661869 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661870 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661871 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661872 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661873 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661874 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661875 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661876 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661877 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661878 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661879 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661880 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661881 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661882 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661883 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661884 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661885 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661886 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661887 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661888 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661889 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661890 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661891 4 0.2377 0.915 0.000 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661929 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661930 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661931 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661932 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661933 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661934 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661935 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661936 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661937 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661938 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661939 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661940 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661941 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661942 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661943 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661944 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661945 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661946 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661947 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661948 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661949 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661950 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661951 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661952 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661953 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661954 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661955 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661956 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661957 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1661958 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661959 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661960 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661963 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661965 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661967 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661968 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661973 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661976 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661978 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661979 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661980 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661981 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661984 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661986 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661987 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661988 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661989 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661990 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661991 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661992 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661993 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661994 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661995 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661996 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661997 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661998 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1661999 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662000 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662001 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662002 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662003 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662004 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662005 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662006 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662007 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662008 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662009 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662010 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662011 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662012 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662013 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662014 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662015 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662016 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662017 5 0.3835 0.797 0.012 0.000 0.244 0.000 0.744
#> SRR1662018 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662019 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662020 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662021 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662022 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662023 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662024 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662025 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662026 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662027 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662028 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662029 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662030 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662031 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662032 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662033 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662034 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662035 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662036 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662037 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662038 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662039 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662040 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662041 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662042 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662043 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662044 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662045 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662046 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662047 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662048 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662049 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662050 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662051 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662052 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662053 2 0.0162 0.996 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1662054 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.0000 0.951 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662085 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662086 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662087 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662088 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662089 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662090 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662091 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662092 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662093 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662094 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662095 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662096 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662097 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662098 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662099 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662100 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662101 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662102 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662103 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662104 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662105 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662106 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662107 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662108 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662109 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662110 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662111 3 0.4101 0.000 0.000 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1662112 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662113 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662114 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662115 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662116 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662117 5 0.0000 0.803 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.998 0 1.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0 0.000 1 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1 0.000 0 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661929 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661930 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661931 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661932 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661933 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661934 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661935 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661936 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661937 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661938 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661939 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661940 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661941 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661942 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661943 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661944 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661945 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661946 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661947 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661948 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661949 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661950 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661951 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661952 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661953 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661954 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661955 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661956 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661957 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661958 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661959 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661960 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661963 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661965 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661967 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661968 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661973 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661976 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661978 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661979 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661980 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661981 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661984 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661986 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661987 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661988 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661989 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661990 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661991 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661992 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661993 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661994 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661995 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661996 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661997 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661998 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661999 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662000 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662001 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662002 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662003 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662004 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662005 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662006 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662007 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662008 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662009 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662010 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662011 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662012 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662013 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662014 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662015 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662016 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662017 5 0.0000 0.725 0 0.000 0 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662019 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662020 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662021 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662022 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662023 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662024 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662025 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662026 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662027 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662028 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662029 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662030 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662031 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662032 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662033 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662034 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662035 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662036 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662037 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662038 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662039 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662040 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662041 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662042 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662043 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662044 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662045 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662046 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662047 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662048 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662049 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662050 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662051 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662052 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662053 2 0.0146 0.996 0 0.996 0 0.004 0.000 0.000
#> SRR1662054 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.0000 1.000 0 0.000 0 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662085 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662086 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662087 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662088 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662089 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662090 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662091 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662092 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662093 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662094 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662095 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662096 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662097 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662098 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662099 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662100 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662101 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662102 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662103 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662104 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662105 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662106 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662107 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662108 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662109 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662110 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662111 6 0.0000 0.000 0 0.000 0 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662112 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662113 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662114 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662115 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662116 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
#> SRR1662117 5 0.3684 0.713 0 0.000 0 0.000 0.628 0.372
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 5)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 6)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.183 0.675 0.807 0.4299 0.517 0.517
#> 3 3 0.340 0.592 0.706 0.3650 0.818 0.663
#> 4 4 0.367 0.730 0.718 0.1412 0.890 0.722
#> 5 5 0.493 0.714 0.715 0.0942 0.937 0.790
#> 6 6 0.627 0.766 0.740 0.0525 0.973 0.886
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661717 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661718 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661719 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661720 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661721 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661722 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661723 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661724 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661725 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661726 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661727 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661728 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661729 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661730 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661731 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661732 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661733 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661734 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661735 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661736 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661767 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661768 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661769 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661770 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661771 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661772 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661773 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661774 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661775 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661776 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661777 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661778 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661779 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661780 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661781 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661782 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661783 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661784 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661785 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661786 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661787 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661788 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661789 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661790 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661791 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661792 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661793 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661794 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661795 2 0.0376 0.806 0.004 0.996
#> SRR1661796 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.806 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661827 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661828 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661829 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661830 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661831 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661832 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661833 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661834 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661835 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661836 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661837 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661838 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661839 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661840 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661841 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661843 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661844 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661845 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661846 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661847 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661848 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661849 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661850 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661851 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661852 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661853 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661854 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661855 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661856 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661857 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661858 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661859 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661860 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661861 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661862 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661863 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661864 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661865 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661866 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661867 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661868 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661869 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661870 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661871 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661872 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661873 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661874 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661875 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661876 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661877 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661878 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661879 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661880 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661881 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661882 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661883 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661884 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661885 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661886 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661887 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661888 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661889 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661890 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661891 1 0.8207 0.707 0.744 0.256
#> SRR1661892 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661893 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661894 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661895 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661896 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661897 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661898 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661899 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661900 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661901 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661902 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661903 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661904 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661905 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661906 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661907 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661908 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661909 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661910 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661911 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661912 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661913 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661914 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661915 1 0.4161 0.707 0.916 0.084
#> SRR1661916 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661917 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661918 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661919 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661920 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661921 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661922 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661923 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661924 1 0.4562 0.712 0.904 0.096
#> SRR1661925 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661926 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661927 1 0.4690 0.713 0.900 0.100
#> SRR1661928 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661929 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661930 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661931 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661932 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661933 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661934 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661935 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661936 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661937 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661938 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661939 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661940 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661941 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661942 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661943 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661944 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661945 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661946 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661947 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661948 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661949 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661950 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661951 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661952 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661953 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661954 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661955 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661956 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661957 2 0.5946 0.731 0.144 0.856
#> SRR1661958 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661959 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661960 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661961 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661962 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661963 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661964 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661965 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661966 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661967 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661968 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661969 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661970 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661971 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661972 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661973 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661974 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661975 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661976 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661977 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661978 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661979 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661980 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661981 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661982 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661983 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661984 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661985 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661986 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661987 1 0.9954 0.550 0.540 0.460
#> SRR1661988 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661989 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661990 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661991 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661992 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661993 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661994 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661995 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661996 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661997 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661998 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1661999 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662000 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662001 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662002 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662003 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662004 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662005 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662006 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662007 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662008 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662009 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662010 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662011 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662012 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662013 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662014 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662015 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662016 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662017 2 0.9850 0.377 0.428 0.572
#> SRR1662018 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662019 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662020 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662021 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662022 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662023 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662024 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662025 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662026 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662027 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662028 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662029 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662030 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662031 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662032 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662033 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662034 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662035 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662036 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662037 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662038 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662039 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662040 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662041 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662042 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662043 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662044 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662045 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662046 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662047 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662048 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662049 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662050 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662051 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662052 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662053 2 0.5408 0.754 0.124 0.876
#> SRR1662054 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662055 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662056 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662057 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662058 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662059 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662060 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662061 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662062 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662063 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662064 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662065 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662066 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662067 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662068 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662069 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662070 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662071 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662072 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662073 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662074 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662075 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662076 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662077 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662078 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662079 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662080 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662081 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662082 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662083 1 0.9977 0.522 0.528 0.472
#> SRR1662084 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662085 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662086 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662087 2 0.9522 0.493 0.372 0.628
#> SRR1662088 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662089 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662090 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662091 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662092 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662093 2 0.9393 0.519 0.356 0.644
#> SRR1662094 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662095 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662096 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662097 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662098 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662099 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662100 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662101 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662102 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662103 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662104 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662105 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662106 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662107 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662108 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662109 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662110 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662111 1 0.7883 0.621 0.764 0.236
#> SRR1662112 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662113 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662114 2 0.9427 0.514 0.360 0.640
#> SRR1662115 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662116 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
#> SRR1662117 2 0.9358 0.523 0.352 0.648
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661717 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661718 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661719 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661720 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661721 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661722 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661723 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661724 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661725 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661726 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661727 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661728 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661729 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661730 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661731 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661732 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661733 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661734 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661735 2 0.0424 0.7611 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661736 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661737 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661738 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661739 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661740 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661741 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661742 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661743 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661744 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661745 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661746 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661747 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661748 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661749 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661750 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661751 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661752 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661753 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661754 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661755 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661756 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661757 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661758 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661759 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661760 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661761 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661762 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661763 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661764 2 0.0237 0.7609 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661766 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661767 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661768 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661769 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661770 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661771 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661772 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661773 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661774 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661775 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661776 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661777 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661778 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661779 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661780 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661781 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661782 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661783 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661784 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661785 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661786 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661787 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661788 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661789 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661790 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661791 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661792 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661793 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661794 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661795 2 0.0424 0.7617 0.000 0.992 0.008
#> SRR1661796 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661797 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661798 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661799 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661800 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661801 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661802 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661803 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661804 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661805 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661806 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661807 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661808 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661809 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661810 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661811 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661812 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661813 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661814 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661815 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661816 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661817 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661818 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661819 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661820 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661821 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661822 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661823 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661824 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661825 2 0.0237 0.7619 0.000 0.996 0.004
#> SRR1661826 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661827 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661828 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661829 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661830 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661831 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661832 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661833 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661834 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661835 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661836 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661837 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661838 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661839 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661840 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661841 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661843 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661844 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661845 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661846 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661847 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661848 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661849 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661850 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661851 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661852 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661853 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661854 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661855 1 0.2050 0.6104 0.952 0.020 0.028
#> SRR1661856 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661857 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661858 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661859 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661860 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661861 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661862 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661863 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661864 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661865 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661866 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661867 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661868 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661869 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661870 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661871 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661872 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661873 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661874 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661875 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661876 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661877 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661878 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661879 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661880 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661881 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661882 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661883 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661884 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661885 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661886 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661887 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661888 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661889 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661890 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661891 3 0.8000 0.6335 0.408 0.064 0.528
#> SRR1661892 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661893 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661894 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661895 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661896 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661897 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661898 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661899 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661900 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661901 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661902 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661903 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661904 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661905 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661906 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661907 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661908 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661909 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661910 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661911 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661912 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661913 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661914 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661915 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661916 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661917 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661918 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661919 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661920 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661921 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661922 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661923 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661924 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661925 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661926 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661927 1 0.2176 0.5977 0.948 0.020 0.032
#> SRR1661928 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661929 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661930 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661931 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661932 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661933 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661934 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661935 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661936 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661937 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661938 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661939 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661940 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661941 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661942 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661943 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661944 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661945 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661946 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661947 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661948 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661949 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661950 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661951 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661952 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661953 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661954 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661955 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661956 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661957 2 0.7453 0.6005 0.092 0.680 0.228
#> SRR1661958 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661959 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661960 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661961 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661962 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661963 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661964 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661965 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661966 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661967 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661968 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661969 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661970 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661971 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661972 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661973 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661974 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661975 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661976 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661977 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661978 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661979 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661980 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661981 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661982 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661983 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661984 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661985 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661986 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661987 3 0.9515 0.7293 0.388 0.188 0.424
#> SRR1661988 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661989 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661990 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661991 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661992 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661993 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661994 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661995 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661996 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661997 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661998 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1661999 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662000 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662001 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662002 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662003 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662004 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662005 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662006 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662007 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662008 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662009 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662010 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662011 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662012 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662013 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662014 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662015 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662016 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662017 1 0.9833 0.2725 0.416 0.324 0.260
#> SRR1662018 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662019 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662020 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662021 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662022 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662023 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662024 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662025 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662026 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662027 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662028 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662029 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662030 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662031 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662032 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662033 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662034 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662035 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662036 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662037 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662038 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662039 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662040 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662041 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662042 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662043 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662044 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662045 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662046 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662047 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662048 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662049 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662050 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662051 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662052 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662053 2 0.7665 0.5402 0.060 0.600 0.340
#> SRR1662054 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662055 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662056 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662057 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662058 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662059 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662060 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662061 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662062 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662063 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662064 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662065 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662066 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662067 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662068 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662069 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662070 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662071 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662072 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662073 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662074 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662075 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662076 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662077 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662078 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662079 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662080 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662081 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662082 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662083 3 0.9556 0.7563 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662084 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662085 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662086 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662087 2 0.9896 -0.1037 0.360 0.376 0.264
#> SRR1662088 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662089 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662090 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662091 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662092 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662093 2 0.9865 -0.0130 0.332 0.404 0.264
#> SRR1662094 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662095 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662096 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662097 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662098 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662099 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662100 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662101 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662102 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662103 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662104 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662105 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662106 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662107 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662108 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662109 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662110 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662111 1 0.8109 0.4065 0.620 0.108 0.272
#> SRR1662112 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662113 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662114 2 0.9865 -0.0130 0.332 0.404 0.264
#> SRR1662115 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662116 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
#> SRR1662117 2 0.9830 0.0381 0.316 0.420 0.264
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661717 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661718 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661719 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661720 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661721 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661722 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661723 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661724 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661725 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661726 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661727 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661728 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661729 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661730 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661731 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661732 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661733 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661734 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661735 2 0.2227 0.764 0.000 0.928 0.036 0.036
#> SRR1661736 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661737 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661738 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661739 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661740 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661741 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661742 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661743 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661744 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661745 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661746 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661747 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661748 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661749 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661750 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661751 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661752 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661753 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661754 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661755 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661756 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661757 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661758 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661759 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661760 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661761 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661762 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661763 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661764 2 0.1284 0.765 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661766 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661767 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661768 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661769 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661770 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661771 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661772 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661773 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661774 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661775 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661776 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661777 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661778 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661779 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661780 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661781 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661782 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661783 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661784 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661785 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661786 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661787 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661788 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661789 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661790 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661791 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661792 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661793 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661794 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661795 2 0.1624 0.765 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1661796 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661797 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661798 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661799 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661800 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661801 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661802 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661803 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661804 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661805 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661806 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661807 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661808 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661809 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661810 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661811 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661812 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661813 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661814 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661815 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661816 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661817 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661818 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661819 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661820 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661821 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661822 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661823 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661824 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661825 2 0.0592 0.768 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661826 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661827 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661828 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661829 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661830 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661831 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661832 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661833 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661834 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661835 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661836 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661837 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661838 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661839 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661840 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661841 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661843 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661844 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661845 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661846 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661847 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661848 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661849 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661850 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661851 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661852 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661853 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661854 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661855 1 0.2599 0.926 0.912 0.004 0.064 0.020
#> SRR1661856 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661857 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661858 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661859 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661860 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661861 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661862 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661863 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661864 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661865 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661866 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661867 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661868 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661869 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661870 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661871 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661872 4 0.7734 0.507 0.308 0.020 0.156 0.516
#> SRR1661873 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661874 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661875 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661876 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661877 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661878 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661879 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661880 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661881 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661882 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661883 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661884 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661885 4 0.7734 0.507 0.308 0.020 0.156 0.516
#> SRR1661886 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661887 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661888 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661889 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661890 4 0.7699 0.507 0.308 0.020 0.152 0.520
#> SRR1661891 4 0.7663 0.507 0.308 0.020 0.148 0.524
#> SRR1661892 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661893 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661894 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661895 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661896 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661897 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661898 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661899 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661900 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661901 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661902 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661903 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661904 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661905 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661906 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661907 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661908 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661909 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661910 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661911 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661912 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661913 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661914 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661915 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661916 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661917 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661918 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661919 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661920 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661921 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661922 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661923 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661924 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661925 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661926 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661927 1 0.1471 0.940 0.960 0.004 0.012 0.024
#> SRR1661928 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661929 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661930 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661931 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661932 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661933 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661934 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661935 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661936 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661937 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661938 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661939 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661940 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661941 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661942 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661943 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661944 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661945 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661946 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661947 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661948 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661949 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661950 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661951 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661952 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661953 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661954 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661955 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661956 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661957 2 0.7088 0.548 0.028 0.636 0.196 0.140
#> SRR1661958 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661959 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661960 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661961 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661962 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661963 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661964 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661965 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661966 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661967 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661968 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661969 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661970 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661971 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661972 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661973 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661974 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661975 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661976 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661977 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661978 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661979 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661980 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661981 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661982 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661983 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661984 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661985 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661986 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661987 4 0.8080 0.698 0.260 0.156 0.048 0.536
#> SRR1661988 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661989 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661990 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661991 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661992 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661993 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661994 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661995 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661996 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661997 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661998 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1661999 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662000 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662001 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662002 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662003 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662004 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662005 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662006 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662007 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662008 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662009 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662010 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662011 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662012 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662013 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662014 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662015 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662016 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662017 3 0.9157 0.846 0.260 0.200 0.436 0.104
#> SRR1662018 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662019 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662020 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662021 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662022 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662023 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662024 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662025 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662026 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662027 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662028 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662029 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662030 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662031 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662032 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662033 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662034 2 0.7869 0.451 0.008 0.476 0.264 0.252
#> SRR1662035 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662036 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662037 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662038 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662039 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662040 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662041 2 0.7869 0.451 0.008 0.476 0.264 0.252
#> SRR1662042 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662043 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662044 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662045 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662046 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662047 2 0.7867 0.451 0.008 0.476 0.268 0.248
#> SRR1662048 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662049 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662050 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662051 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662052 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662053 2 0.7861 0.452 0.008 0.476 0.276 0.240
#> SRR1662054 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662055 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662056 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662057 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662058 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662059 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662060 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662061 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662062 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662063 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662064 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662065 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662066 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662067 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662068 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662069 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662070 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662071 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662072 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662073 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662074 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662075 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662076 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662077 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662078 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662079 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662080 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662081 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662082 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662083 4 0.7051 0.717 0.188 0.172 0.016 0.624
#> SRR1662084 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662085 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662086 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662087 3 0.7798 0.860 0.168 0.220 0.572 0.040
#> SRR1662088 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662089 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662090 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662091 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662092 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662093 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662094 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662095 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662096 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662097 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662098 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662099 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662100 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662101 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662102 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662103 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662104 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662105 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662106 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662107 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662108 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662109 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662110 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662111 3 0.7676 0.561 0.368 0.072 0.504 0.056
#> SRR1662112 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662113 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662114 3 0.7881 0.861 0.160 0.244 0.556 0.040
#> SRR1662115 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662116 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
#> SRR1662117 3 0.7839 0.862 0.148 0.256 0.556 0.040
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661717 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661718 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661719 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661720 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661721 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661722 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661723 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661724 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661725 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661726 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661727 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661728 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661729 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661730 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661731 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661732 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661733 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661734 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661735 2 0.323 0.700 0.064 0.852 0.000 0.084 0.000
#> SRR1661736 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661737 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661738 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661739 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661740 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661741 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661742 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661743 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661744 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661745 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661746 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661747 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661748 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661749 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661750 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661751 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661752 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661753 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661754 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661755 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661756 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661757 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661758 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661759 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661760 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661761 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661762 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661763 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661764 2 0.255 0.716 0.044 0.908 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661766 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661767 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661768 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661769 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661770 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661771 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661772 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661773 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661774 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661775 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661776 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661777 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661778 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661779 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661780 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661781 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661782 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661783 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661784 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661785 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661786 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661787 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661788 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661789 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661790 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661791 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661792 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661793 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661794 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661795 2 0.197 0.711 0.024 0.924 0.000 0.052 0.000
#> SRR1661796 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661797 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661798 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661799 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661800 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661801 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661802 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661803 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661804 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661805 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661806 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661807 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661808 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661809 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661810 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661811 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661812 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661813 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661814 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661815 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661816 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661817 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661818 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661819 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661820 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661821 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661822 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661823 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661824 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661825 2 0.117 0.720 0.032 0.960 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661826 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661827 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661828 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661829 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661830 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661831 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661832 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661833 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661834 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661835 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661836 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661837 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661838 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661839 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661840 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661841 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661843 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661844 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661845 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661846 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661847 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661848 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661849 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661850 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661851 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661852 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661853 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661854 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661855 1 0.492 0.883 0.716 0.000 0.124 0.000 0.160
#> SRR1661856 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661857 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661858 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661859 3 0.748 0.583 0.156 0.008 0.464 0.320 0.052
#> SRR1661860 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661861 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661862 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661863 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661864 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661865 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661866 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661867 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661868 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661869 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661870 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661871 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661872 3 0.743 0.584 0.156 0.008 0.464 0.324 0.048
#> SRR1661873 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661874 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661875 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661876 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661877 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661878 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661879 3 0.748 0.583 0.156 0.008 0.464 0.320 0.052
#> SRR1661880 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661881 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661882 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661883 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661884 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661885 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661886 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661887 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661888 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661889 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661890 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661891 3 0.738 0.584 0.156 0.008 0.464 0.328 0.044
#> SRR1661892 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661893 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661894 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661895 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661896 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661897 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661898 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661899 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661900 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661901 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661902 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661903 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661904 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661905 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661906 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661907 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661908 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661909 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661910 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661911 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661912 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661913 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661914 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661915 1 0.737 0.906 0.540 0.000 0.156 0.116 0.188
#> SRR1661916 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661917 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661918 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661919 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661920 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661921 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661922 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661923 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661924 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661925 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661926 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661927 1 0.740 0.907 0.536 0.000 0.156 0.116 0.192
#> SRR1661928 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661929 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661930 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661931 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661932 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661933 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661934 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661935 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661936 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661937 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661938 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661939 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661940 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661941 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661942 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661943 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661944 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661945 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661946 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661947 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661948 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661949 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661950 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661951 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661952 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661953 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661954 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661955 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661956 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661957 2 0.857 -0.144 0.056 0.476 0.140 0.188 0.140
#> SRR1661958 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661959 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661960 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661961 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661962 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661963 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661964 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661965 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661966 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661967 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661968 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661969 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661970 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661971 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661972 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661973 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661974 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661975 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661976 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661977 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661978 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661979 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661980 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661981 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661982 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661983 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661984 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661985 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661986 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661987 3 0.503 0.694 0.084 0.044 0.784 0.036 0.052
#> SRR1661988 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661989 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661990 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661991 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661992 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661993 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661994 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661995 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661996 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661997 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661998 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1661999 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662000 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662001 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662002 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662003 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662004 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662005 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662006 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662007 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662008 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662009 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662010 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662011 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662012 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662013 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662014 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662015 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662016 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662017 5 0.598 0.841 0.100 0.088 0.036 0.056 0.720
#> SRR1662018 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662019 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662020 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662021 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662022 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662023 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662024 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662025 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662026 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662027 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662028 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662029 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662030 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662031 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662032 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662033 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662034 4 0.747 0.989 0.004 0.376 0.104 0.428 0.088
#> SRR1662035 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662036 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662037 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662038 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662039 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662040 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662041 4 0.747 0.989 0.004 0.376 0.104 0.428 0.088
#> SRR1662042 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662043 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662044 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662045 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662046 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662047 4 0.739 0.996 0.004 0.376 0.104 0.436 0.080
#> SRR1662048 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662049 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662050 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662051 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662052 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662053 4 0.725 0.999 0.000 0.376 0.104 0.440 0.080
#> SRR1662054 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662055 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662056 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662057 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662058 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662059 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662060 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662061 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662062 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662063 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662064 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662065 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662066 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662067 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662068 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662069 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662070 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662071 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662072 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662073 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662074 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662075 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662076 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662077 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662078 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662079 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662080 3 0.213 0.720 0.000 0.044 0.924 0.016 0.016
#> SRR1662081 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662082 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662083 3 0.203 0.721 0.000 0.044 0.928 0.016 0.012
#> SRR1662084 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662085 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662086 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662087 5 0.289 0.859 0.016 0.104 0.004 0.004 0.872
#> SRR1662088 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662089 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662090 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662091 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662092 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662093 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662094 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662095 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662096 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662097 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662098 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662099 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662100 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662101 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662102 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662103 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662104 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662105 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662106 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662107 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662108 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662109 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662110 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662111 5 0.360 0.765 0.076 0.020 0.036 0.012 0.856
#> SRR1662112 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662113 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662114 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662115 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662116 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
#> SRR1662117 5 0.280 0.868 0.004 0.124 0.004 0.004 0.864
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661717 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661718 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661719 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661720 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661721 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661722 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661723 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661724 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661725 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661726 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661727 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661728 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661729 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661730 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661731 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661732 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661733 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661734 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661735 2 0.520 0.6622 0.028 0.736 0.036 0.044 0.020 0.136
#> SRR1661736 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661737 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661738 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661739 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661740 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661741 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661742 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661743 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661744 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661745 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661746 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661747 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661748 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661749 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661750 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661751 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661752 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661753 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661754 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661755 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661756 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661757 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661758 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661759 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661760 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661761 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661762 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661763 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661764 2 0.324 0.6923 0.016 0.864 0.016 0.048 0.004 0.052
#> SRR1661766 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661767 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661768 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661769 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661770 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661771 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661772 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661773 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661774 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661775 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661776 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661777 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661778 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661779 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661780 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661781 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661782 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661783 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661784 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661785 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661786 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661787 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661788 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661789 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661790 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661791 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661792 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661793 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661794 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661795 2 0.335 0.6841 0.012 0.860 0.020 0.024 0.016 0.068
#> SRR1661796 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661797 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661798 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661799 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661800 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661801 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661802 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661803 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661804 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661805 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661806 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661807 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661808 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661809 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661810 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661811 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661812 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661813 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661814 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661815 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661816 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661817 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661818 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661819 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661820 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661821 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661822 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661823 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661824 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661825 2 0.150 0.6987 0.004 0.948 0.012 0.012 0.000 0.024
#> SRR1661826 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661827 1 0.543 0.8459 0.692 0.000 0.012 0.052 0.136 0.108
#> SRR1661828 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661829 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661830 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661831 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661832 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661833 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661834 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661835 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661836 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661837 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661838 1 0.543 0.8459 0.692 0.000 0.012 0.052 0.136 0.108
#> SRR1661839 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661840 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661841 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661843 1 0.539 0.8462 0.696 0.000 0.012 0.052 0.136 0.104
#> SRR1661844 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661845 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661846 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661847 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661848 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661849 1 0.541 0.8462 0.692 0.000 0.012 0.048 0.136 0.112
#> SRR1661850 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661851 1 0.543 0.8459 0.692 0.000 0.012 0.052 0.136 0.108
#> SRR1661852 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661853 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661854 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661855 1 0.537 0.8465 0.696 0.000 0.012 0.048 0.136 0.108
#> SRR1661856 3 0.271 0.9924 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661857 3 0.282 0.9919 0.084 0.008 0.872 0.000 0.028 0.008
#> SRR1661858 3 0.262 0.9921 0.088 0.008 0.876 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661859 3 0.389 0.9535 0.084 0.008 0.824 0.012 0.028 0.044
#> SRR1661860 3 0.262 0.9921 0.088 0.008 0.876 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661861 3 0.271 0.9924 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661862 3 0.262 0.9921 0.088 0.008 0.876 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661863 3 0.262 0.9921 0.088 0.008 0.876 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661864 3 0.271 0.9921 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661865 3 0.282 0.9908 0.084 0.008 0.872 0.000 0.028 0.008
#> SRR1661866 3 0.276 0.9923 0.088 0.008 0.872 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661867 3 0.271 0.9924 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661868 3 0.271 0.9924 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661869 3 0.282 0.9919 0.084 0.008 0.872 0.000 0.028 0.008
#> SRR1661870 3 0.271 0.9924 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661871 3 0.276 0.9919 0.088 0.008 0.872 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661872 3 0.353 0.9727 0.084 0.008 0.844 0.012 0.028 0.024
#> SRR1661873 3 0.282 0.9919 0.084 0.008 0.872 0.000 0.028 0.008
#> SRR1661874 3 0.262 0.9921 0.088 0.008 0.876 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661875 3 0.276 0.9923 0.088 0.008 0.872 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661876 3 0.262 0.9921 0.088 0.008 0.876 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661877 3 0.256 0.9926 0.084 0.008 0.880 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661878 3 0.276 0.9923 0.088 0.008 0.872 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661879 3 0.402 0.9491 0.084 0.008 0.816 0.012 0.028 0.052
#> SRR1661880 3 0.262 0.9921 0.088 0.008 0.876 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661881 3 0.271 0.9921 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661882 3 0.282 0.9919 0.084 0.008 0.872 0.000 0.028 0.008
#> SRR1661883 3 0.276 0.9923 0.088 0.008 0.872 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661884 3 0.276 0.9919 0.088 0.008 0.872 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661885 3 0.290 0.9890 0.088 0.008 0.868 0.004 0.028 0.004
#> SRR1661886 3 0.271 0.9924 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661887 3 0.276 0.9919 0.088 0.008 0.872 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661888 3 0.271 0.9921 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661889 3 0.271 0.9921 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661890 3 0.271 0.9924 0.084 0.008 0.876 0.000 0.028 0.004
#> SRR1661891 3 0.256 0.9926 0.084 0.008 0.880 0.000 0.028 0.000
#> SRR1661892 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661893 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661894 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661895 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661896 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661897 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661898 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661899 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661900 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661901 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661902 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661903 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661904 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661905 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661906 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661907 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661908 1 0.354 0.8766 0.820 0.000 0.040 0.016 0.120 0.004
#> SRR1661909 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661910 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661911 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661912 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661913 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661914 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661915 1 0.354 0.8766 0.820 0.000 0.040 0.016 0.120 0.004
#> SRR1661916 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661917 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661918 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661919 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661920 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661921 1 0.354 0.8766 0.820 0.000 0.040 0.016 0.120 0.004
#> SRR1661922 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661923 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661924 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661925 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661926 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661927 1 0.331 0.8780 0.828 0.000 0.040 0.012 0.120 0.000
#> SRR1661928 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661929 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661930 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661931 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661932 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661933 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661934 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661935 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661936 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661937 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661938 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661939 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661940 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661941 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661942 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661943 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661944 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661945 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661946 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661947 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661948 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661949 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661950 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661951 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661952 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661953 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661954 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661955 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661956 2 0.894 0.0376 0.044 0.396 0.112 0.156 0.148 0.144
#> SRR1661957 2 0.891 0.0380 0.040 0.396 0.112 0.156 0.148 0.148
#> SRR1661958 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661959 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661960 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661961 4 0.626 0.8572 0.120 0.040 0.228 0.592 0.012 0.008
#> SRR1661962 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661963 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661964 4 0.626 0.8572 0.120 0.040 0.228 0.592 0.012 0.008
#> SRR1661965 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661966 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661967 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661968 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661969 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661970 4 0.626 0.8572 0.120 0.040 0.228 0.592 0.012 0.008
#> SRR1661971 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661972 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661973 4 0.626 0.8572 0.120 0.040 0.228 0.592 0.012 0.008
#> SRR1661974 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661975 4 0.626 0.8572 0.120 0.040 0.228 0.592 0.012 0.008
#> SRR1661976 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661977 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661978 4 0.626 0.8572 0.120 0.040 0.228 0.592 0.012 0.008
#> SRR1661979 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661980 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661981 4 0.626 0.8572 0.120 0.040 0.228 0.592 0.012 0.008
#> SRR1661982 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661983 4 0.626 0.8572 0.120 0.040 0.228 0.592 0.012 0.008
#> SRR1661984 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661985 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661986 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661987 4 0.616 0.8576 0.120 0.040 0.228 0.596 0.012 0.004
#> SRR1661988 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1661989 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.016 0.008 0.828 0.016
#> SRR1661990 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1661991 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1661992 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1661993 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1661994 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.016 0.008 0.828 0.016
#> SRR1661995 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1661996 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.016 0.008 0.828 0.016
#> SRR1661997 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1661998 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1661999 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.016 0.008 0.828 0.016
#> SRR1662000 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1662001 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.012 0.008 0.828 0.020
#> SRR1662002 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.012 0.008 0.828 0.020
#> SRR1662003 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.012 0.008 0.828 0.020
#> SRR1662004 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1662005 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1662006 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1662007 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1662008 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1662009 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.016 0.008 0.828 0.016
#> SRR1662010 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1662011 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1662012 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.016 0.008 0.828 0.016
#> SRR1662013 5 0.381 0.7864 0.080 0.052 0.012 0.008 0.828 0.020
#> SRR1662014 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1662015 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1662016 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.016 0.012 0.828 0.012
#> SRR1662017 5 0.382 0.7865 0.080 0.052 0.012 0.012 0.828 0.016
#> SRR1662018 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662019 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662020 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662021 6 0.684 0.9929 0.008 0.232 0.048 0.096 0.052 0.564
#> SRR1662022 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662023 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662024 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662025 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662026 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662027 6 0.684 0.9929 0.008 0.232 0.048 0.096 0.052 0.564
#> SRR1662028 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662029 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662030 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662031 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662032 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662033 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662034 6 0.722 0.9757 0.020 0.232 0.052 0.104 0.052 0.540
#> SRR1662035 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662036 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662037 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662038 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662039 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662040 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662041 6 0.722 0.9757 0.020 0.232 0.052 0.104 0.052 0.540
#> SRR1662042 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662043 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662044 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662045 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662046 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662047 6 0.705 0.9844 0.016 0.232 0.048 0.100 0.052 0.552
#> SRR1662048 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662049 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662050 6 0.680 0.9953 0.008 0.232 0.048 0.092 0.052 0.568
#> SRR1662051 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662052 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662053 6 0.674 0.9976 0.008 0.232 0.044 0.092 0.052 0.572
#> SRR1662054 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662055 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662056 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662057 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662058 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662059 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662060 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662061 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662062 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662063 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662064 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662065 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662066 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662067 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662068 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662069 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662070 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662071 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662072 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662073 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662074 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662075 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662076 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662077 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662078 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662079 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662080 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662081 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662082 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662083 4 0.701 0.8508 0.080 0.048 0.300 0.512 0.016 0.044
#> SRR1662084 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662085 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662086 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662087 5 0.496 0.8242 0.000 0.068 0.024 0.116 0.744 0.048
#> SRR1662088 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662089 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662090 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662091 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662092 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662093 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662094 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662095 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662096 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662097 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662098 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662099 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662100 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662101 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662102 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662103 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662104 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662105 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662106 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662107 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662108 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662109 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662110 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662111 5 0.598 0.7649 0.064 0.020 0.028 0.108 0.688 0.092
#> SRR1662112 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662113 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662114 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662115 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662116 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
#> SRR1662117 5 0.501 0.8259 0.000 0.072 0.024 0.116 0.740 0.048
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.734 0.927 0.959 0.4874 0.517 0.517
#> 3 3 0.706 0.837 0.892 0.3294 0.730 0.526
#> 4 4 0.688 0.685 0.767 0.1084 0.945 0.845
#> 5 5 0.793 0.866 0.851 0.0703 0.885 0.630
#> 6 6 0.819 0.710 0.773 0.0429 0.937 0.730
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661929 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661930 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661931 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661932 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661933 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661934 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661935 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661936 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661937 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661938 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661939 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661940 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661941 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661942 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661943 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661944 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661945 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661946 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661947 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661948 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661949 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661950 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661951 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661952 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661953 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661954 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661955 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661956 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661957 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1661958 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661959 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661960 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661961 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661962 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661963 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661964 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661965 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661966 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661967 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661968 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661969 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661970 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661971 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661972 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661973 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661974 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661975 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661976 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661977 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661978 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661979 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661980 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661981 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661982 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661983 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661984 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661985 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661986 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661987 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1661988 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661989 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661990 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661991 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661992 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661993 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661994 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661995 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661996 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661997 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661998 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1661999 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662000 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662001 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662002 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662003 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662004 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662005 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662006 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662007 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662008 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662009 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662010 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662011 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662012 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662013 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662014 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662015 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662016 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662017 2 0.861 0.705 0.284 0.716
#> SRR1662018 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.933 0.000 1.000
#> SRR1662054 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662055 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662056 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662057 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662058 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662059 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662060 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662061 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662062 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662063 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662064 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662065 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662066 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662067 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662068 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662069 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662070 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662071 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662072 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662073 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662074 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662075 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662076 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662077 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662078 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662079 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662080 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662081 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662082 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662083 1 0.224 0.966 0.964 0.036
#> SRR1662084 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662085 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662086 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662087 2 0.745 0.790 0.212 0.788
#> SRR1662088 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662089 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662090 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662091 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662092 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662093 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662094 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662095 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662096 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662097 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662098 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662099 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662100 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662101 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662102 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662103 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662104 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662105 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662106 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662107 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662108 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662109 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662110 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662111 1 0.000 0.992 1.000 0.000
#> SRR1662112 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662113 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662114 2 0.745 0.790 0.212 0.788
#> SRR1662115 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662116 2 0.730 0.798 0.204 0.796
#> SRR1662117 2 0.730 0.798 0.204 0.796
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.920 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.636 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661857 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661858 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661859 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661860 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661861 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661862 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661863 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661864 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661865 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661866 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661867 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661868 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661869 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661870 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661871 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661872 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661873 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661874 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661875 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661876 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661877 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661878 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661879 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661880 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661881 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661882 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661883 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661884 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661885 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661886 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661887 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661888 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661889 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661890 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661891 3 0.6204 0.986 0.424 0.000 0.576
#> SRR1661892 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661893 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661894 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661895 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661896 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661897 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661898 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661899 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661900 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661901 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661902 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661903 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661904 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661905 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661906 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661907 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661908 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661909 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661910 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661911 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661912 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661913 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661914 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661915 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661916 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661917 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661918 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661919 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661920 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661921 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661922 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661923 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661924 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661925 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661926 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661927 1 0.0424 0.628 0.992 0.000 0.008
#> SRR1661928 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661929 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661930 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661931 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661932 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661933 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661934 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661935 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661936 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661937 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661938 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661939 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661940 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661941 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661942 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661943 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661944 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661945 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661946 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661947 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661948 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661949 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661950 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661951 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661952 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661953 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661954 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661955 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661956 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661957 2 0.6796 0.642 0.020 0.612 0.368
#> SRR1661958 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661959 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661960 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661961 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661962 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661963 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661964 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661965 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661966 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661967 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661968 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661969 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661970 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661971 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661972 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661973 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661974 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661975 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661976 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661977 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661978 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661979 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661980 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661981 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661982 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661983 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661984 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661985 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661986 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661987 3 0.6168 0.990 0.412 0.000 0.588
#> SRR1661988 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661989 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661990 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661991 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661992 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661993 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661994 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661995 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661996 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661997 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661998 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1661999 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662000 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662001 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662002 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662003 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662004 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662005 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662006 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662007 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662008 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662009 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662010 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662011 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662012 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662013 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662014 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662015 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662016 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662017 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662018 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662019 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662020 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662021 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662022 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662023 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662024 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662025 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662026 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662027 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662028 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662029 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662030 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662031 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662032 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662033 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662034 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662035 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662036 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662037 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662038 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662039 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662040 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662041 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662042 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662043 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662044 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662045 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662046 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662047 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662048 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662049 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662050 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662051 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662052 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662053 2 0.3038 0.885 0.000 0.896 0.104
#> SRR1662054 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662055 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662056 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662057 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662058 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662059 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662060 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662061 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662062 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662063 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662064 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662065 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662066 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662067 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662068 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662069 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662070 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662071 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662072 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662073 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662074 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662075 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662076 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662077 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662078 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662079 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662080 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662081 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662082 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662083 3 0.6154 0.990 0.408 0.000 0.592
#> SRR1662084 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662085 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662086 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662087 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662088 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662089 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662090 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662091 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662092 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662093 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662094 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662095 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662096 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662097 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662098 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662099 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662100 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662101 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662102 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662103 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662104 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662105 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662106 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662107 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662108 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662109 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662110 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662111 1 0.6045 0.737 0.620 0.000 0.380
#> SRR1662112 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662113 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662114 1 0.6513 0.744 0.592 0.008 0.400
#> SRR1662115 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662116 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
#> SRR1662117 1 0.6661 0.743 0.588 0.012 0.400
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.813 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661827 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661828 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661829 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661830 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661831 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661832 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661833 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661834 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661835 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661836 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661837 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661838 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661839 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661840 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661841 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661843 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661844 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661845 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661846 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661847 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661848 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661849 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661850 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661851 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661852 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661853 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661854 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661855 1 0.3945 0.589 0.780 0.000 0.004 0.216
#> SRR1661856 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661857 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661858 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661859 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661860 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661861 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661862 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661863 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661864 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661865 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661866 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661867 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661868 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661869 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661870 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661871 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661872 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661873 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661874 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661875 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661876 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661877 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661878 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661879 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661880 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661881 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661882 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661883 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661884 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661885 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661886 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661887 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661888 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661889 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661890 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661891 4 0.4955 0.833 0.084 0.000 0.144 0.772
#> SRR1661892 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661893 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661894 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661895 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661896 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661897 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661898 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661899 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661900 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661901 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661902 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661903 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661904 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661905 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661906 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661907 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661908 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661909 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661910 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661911 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661912 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661913 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661914 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661915 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661916 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661917 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661918 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661919 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661920 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661921 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661922 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661923 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661924 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661925 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661926 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661927 1 0.3837 0.583 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1661928 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661929 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661930 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661931 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661932 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661933 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661934 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661935 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661936 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661937 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661938 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661939 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661940 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661941 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661942 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661943 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661944 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661945 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661946 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661947 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661948 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661949 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661950 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661951 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661952 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661953 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661954 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661955 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661956 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661957 3 0.6820 1.000 0.028 0.284 0.616 0.072
#> SRR1661958 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661959 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661960 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661961 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661962 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661963 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661964 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661965 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661966 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661967 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661968 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661969 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661970 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661971 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661972 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661973 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661974 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661975 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661976 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661977 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661978 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661979 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661980 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661981 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661982 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661983 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661984 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661985 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661986 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661987 4 0.0188 0.901 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661988 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661989 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661990 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661991 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661992 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661993 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661994 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661995 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661996 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661997 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661998 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1661999 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662000 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662001 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662002 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662003 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662004 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662005 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662006 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662007 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662008 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662009 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662010 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662011 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662012 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662013 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662014 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662015 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662016 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662017 1 0.4866 0.613 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1662018 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662019 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662020 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662021 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662022 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662023 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662024 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662025 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662026 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662027 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662028 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662029 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662030 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662031 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662032 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662033 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662034 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662035 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662036 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662037 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662038 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662039 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662040 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662041 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662042 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662043 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662044 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662045 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662046 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662047 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662048 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662049 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662050 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662051 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662052 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662053 2 0.6780 -0.152 0.000 0.488 0.416 0.096
#> SRR1662054 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662055 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662056 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662057 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662058 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662059 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662060 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662061 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662062 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662063 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662064 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662065 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662066 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662067 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662068 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662069 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662070 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662071 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662072 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662073 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662074 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662075 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662076 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662077 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662078 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662079 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662080 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662081 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662082 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662083 4 0.0469 0.898 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1662084 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662085 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662086 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662087 1 0.4941 0.601 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1662088 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662089 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662090 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662091 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662092 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662093 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662094 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662095 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662096 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662097 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662098 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662099 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662100 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662101 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662102 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662103 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662104 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662105 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662106 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662107 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662108 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662109 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662110 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662111 1 0.4661 0.614 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1662112 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662113 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662114 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662115 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662116 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
#> SRR1662117 1 0.5466 0.594 0.548 0.016 0.436 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661737 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661738 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661739 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661740 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661741 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661742 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661743 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661744 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661745 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661746 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661747 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661748 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661749 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661750 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661751 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661752 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661753 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661754 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661755 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661756 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661757 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661758 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661759 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661760 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661761 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661762 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661763 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661764 2 0.0162 0.985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661766 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0609 0.984 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.986 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661827 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661828 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661829 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661830 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661831 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661832 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661833 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661834 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661835 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661836 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661837 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661838 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661839 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661840 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661841 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661843 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661844 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661845 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661846 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661847 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661848 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661849 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661850 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661851 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661852 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661853 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661854 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661855 1 0.0162 0.997 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661856 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661857 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661858 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661859 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661860 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661861 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661862 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661863 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661864 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661865 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661866 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661867 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661868 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661869 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661870 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661871 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661872 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661873 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661874 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661875 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661876 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661877 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661878 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661879 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661880 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661881 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661882 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661883 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661884 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661885 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661886 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661887 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661888 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661889 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661890 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661891 4 0.7559 0.652 0.248 0.000 0.184 0.484 0.084
#> SRR1661892 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661929 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661930 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661931 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661932 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661933 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661934 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661935 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661936 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661937 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661938 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661939 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661940 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661941 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661942 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661943 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661944 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661945 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661946 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661947 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661948 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661949 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661950 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661951 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661952 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661953 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661954 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661955 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661956 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661957 3 0.7139 0.604 0.024 0.108 0.608 0.088 0.172
#> SRR1661958 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661959 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661960 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661961 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661962 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661963 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661964 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661965 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661966 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661967 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661968 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661969 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661970 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661971 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661972 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661973 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661974 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661975 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661976 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661977 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661978 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661979 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661980 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661981 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661982 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661983 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661984 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661985 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661986 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661987 4 0.2189 0.812 0.084 0.000 0.012 0.904 0.000
#> SRR1661988 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661989 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661990 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661991 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661992 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661993 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661994 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661995 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661996 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661997 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661998 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1661999 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662000 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662001 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662002 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662003 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662004 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662005 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662006 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662007 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662008 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662009 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662010 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662011 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662012 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662013 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662014 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662015 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662016 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662017 5 0.3525 0.946 0.184 0.000 0.008 0.008 0.800
#> SRR1662018 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662019 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662020 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662021 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662022 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662023 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662024 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662025 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662026 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662027 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662028 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662029 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662030 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662031 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662032 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662033 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662034 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662035 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662036 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662037 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662038 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662039 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662040 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662041 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662042 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662043 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662044 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662045 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662046 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662047 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662048 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662049 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662050 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662051 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662052 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662053 3 0.4929 0.642 0.000 0.312 0.648 0.032 0.008
#> SRR1662054 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662055 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662056 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662057 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662058 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662059 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662060 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662061 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662062 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662063 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662064 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662065 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662066 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662067 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662068 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662069 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662070 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662071 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662072 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662073 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662074 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662075 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662076 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662077 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662078 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662079 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662080 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662081 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662082 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662083 4 0.2006 0.813 0.072 0.000 0.012 0.916 0.000
#> SRR1662084 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662085 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662086 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662087 5 0.2563 0.950 0.120 0.000 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662088 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662089 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662090 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662091 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662092 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662093 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662094 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662095 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662096 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662097 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662098 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662099 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662100 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662101 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662102 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662103 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662104 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662105 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662106 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662107 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662108 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662109 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662110 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662111 5 0.2966 0.927 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR1662112 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662113 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662114 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662115 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662116 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
#> SRR1662117 5 0.2746 0.952 0.112 0.008 0.008 0.000 0.872
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661717 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661718 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661719 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661720 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661721 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661722 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661723 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661724 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661725 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661726 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661727 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661728 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661729 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661730 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661731 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661732 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661733 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661734 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661735 2 0.1835 0.956 0.000 0.932 0.016 0.036 0.008 0.008
#> SRR1661736 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661737 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661738 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661739 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661740 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661741 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661742 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661743 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661744 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661745 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661746 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661747 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661748 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661749 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661750 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661751 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661752 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661753 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661754 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661755 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661756 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661757 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661758 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661759 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661760 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661761 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661762 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661763 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661764 2 0.0748 0.961 0.000 0.976 0.004 0.016 0.000 0.004
#> SRR1661766 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661767 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661768 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661769 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661770 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661771 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661772 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661773 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661774 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661775 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661776 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661777 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661778 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661779 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661780 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661781 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661782 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661783 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661784 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661785 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661786 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661787 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661788 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661789 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661790 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661791 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661792 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661793 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661794 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661795 2 0.1405 0.963 0.000 0.948 0.024 0.024 0.004 0.000
#> SRR1661796 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0260 0.967 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661827 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661828 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661829 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661830 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661831 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661832 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661833 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661834 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661835 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661836 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661837 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661838 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661839 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661840 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661841 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661843 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661844 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661845 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661846 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661847 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661848 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661849 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661850 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661851 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661852 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661853 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661854 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661855 1 0.1700 0.967 0.936 0.000 0.012 0.028 0.024 0.000
#> SRR1661856 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661857 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661858 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661859 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661860 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661861 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661862 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661863 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661864 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661865 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661866 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661867 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661868 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661869 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661870 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661871 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661872 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661873 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661874 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661875 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661876 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661877 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661878 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661879 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661880 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661881 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661882 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661883 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661884 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661885 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661886 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661887 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661888 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661889 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661890 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661891 6 0.2482 0.286 0.148 0.000 0.004 0.000 0.000 0.848
#> SRR1661892 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.974 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661929 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661930 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661931 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661932 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661933 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661934 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661935 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661936 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661937 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661938 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661939 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661940 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661941 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661942 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661943 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661944 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661945 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661946 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661947 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661948 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661949 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661950 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661951 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661952 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661953 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661954 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661955 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661956 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661957 6 0.7812 0.184 0.000 0.056 0.232 0.316 0.060 0.336
#> SRR1661958 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661959 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661960 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661961 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661962 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661963 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661964 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661965 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661966 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661967 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661968 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661969 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661970 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661971 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661972 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661973 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661974 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661975 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661976 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661977 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661978 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661979 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661980 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661981 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661982 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661983 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661984 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661985 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661986 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661987 4 0.4481 1.000 0.020 0.000 0.008 0.572 0.000 0.400
#> SRR1661988 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661989 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661990 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661991 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661992 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661993 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661994 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661995 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661996 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661997 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661998 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1661999 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662000 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662001 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662002 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662003 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662004 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662005 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662006 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662007 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662008 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662009 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662010 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662011 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662012 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662013 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662014 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662015 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662016 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662017 5 0.4876 0.890 0.152 0.000 0.056 0.028 0.736 0.028
#> SRR1662018 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662019 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662020 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662021 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662022 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662023 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662024 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662025 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662026 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662027 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662028 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662029 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662030 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662031 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662032 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662033 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662034 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662035 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662036 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662037 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662038 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662039 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662040 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662041 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662042 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662043 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662044 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662045 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662046 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662047 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662048 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662049 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662050 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662051 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662052 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662053 3 0.2300 1.000 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662054 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662055 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662056 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662057 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662058 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662059 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662060 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662061 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662062 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662063 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662064 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662065 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662066 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662067 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662068 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662069 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662070 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662071 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662072 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662073 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662074 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662075 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662076 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662077 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662078 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662079 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662080 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662081 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662082 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662083 6 0.4862 -0.778 0.008 0.000 0.024 0.472 0.008 0.488
#> SRR1662084 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662085 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662086 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662087 5 0.1204 0.905 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662088 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662089 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662090 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662091 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662092 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662093 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662094 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662095 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662096 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662097 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662098 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662099 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662100 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662101 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662102 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662103 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662104 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662105 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662106 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662107 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662108 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662109 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662110 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662111 5 0.1471 0.901 0.064 0.000 0.000 0.004 0.932 0.000
#> SRR1662112 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662113 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662114 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662115 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662116 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1662117 5 0.1285 0.906 0.052 0.004 0.000 0.000 0.944 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.623 0.812 0.916 0.4788 0.555 0.555
#> 3 3 0.712 0.629 0.865 0.1287 0.823 0.702
#> 4 4 0.734 0.703 0.817 0.1624 0.750 0.522
#> 5 5 1.000 0.993 0.996 0.1621 0.867 0.642
#> 6 6 0.982 0.967 0.983 0.0922 0.937 0.770
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 5
There is also optional best \(k\) = 5 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661929 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661930 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661931 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661932 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661933 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661934 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661935 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661936 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661937 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661938 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661939 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661940 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661941 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661942 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661943 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661944 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661945 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661946 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661947 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661948 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661949 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661950 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661951 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661952 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661953 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661954 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661955 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661956 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661957 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1661958 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661959 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661960 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661961 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661962 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661963 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661964 2 0.9983 0.284 0.476 0.524
#> SRR1661965 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661966 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661967 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661968 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661969 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661970 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661971 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661972 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661973 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661974 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661975 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661976 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661977 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661978 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661979 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661980 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661981 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661982 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661983 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661984 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661985 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661986 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661987 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1661988 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.0376 0.995 0.996 0.004
#> SRR1661993 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.0672 0.990 0.992 0.008
#> SRR1661998 1 0.0376 0.995 0.996 0.004
#> SRR1661999 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.0376 0.995 0.996 0.004
#> SRR1662008 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.0000 0.859 0.000 1.000
#> SRR1662054 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662055 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662056 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662057 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662058 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662059 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662060 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662061 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662062 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662063 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662064 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662065 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662066 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662067 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662068 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662069 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662070 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662071 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662072 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662073 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662074 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662075 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662076 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662077 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662078 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662079 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662080 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662081 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662082 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662083 2 0.9970 0.307 0.468 0.532
#> SRR1662084 2 0.6438 0.740 0.164 0.836
#> SRR1662085 2 0.6973 0.715 0.188 0.812
#> SRR1662086 2 0.6712 0.728 0.176 0.824
#> SRR1662087 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662088 2 0.6531 0.736 0.168 0.832
#> SRR1662089 2 0.6801 0.724 0.180 0.820
#> SRR1662090 2 0.6531 0.736 0.168 0.832
#> SRR1662091 2 0.6973 0.715 0.188 0.812
#> SRR1662092 2 0.6623 0.732 0.172 0.828
#> SRR1662093 2 0.6973 0.716 0.188 0.812
#> SRR1662094 2 0.6623 0.732 0.172 0.828
#> SRR1662095 2 0.6438 0.740 0.164 0.836
#> SRR1662096 2 0.6623 0.732 0.172 0.828
#> SRR1662097 2 0.6438 0.740 0.164 0.836
#> SRR1662098 2 0.6531 0.736 0.168 0.832
#> SRR1662099 2 0.6801 0.724 0.180 0.820
#> SRR1662100 2 0.6712 0.728 0.176 0.824
#> SRR1662101 2 0.5629 0.767 0.132 0.868
#> SRR1662102 2 0.6438 0.740 0.164 0.836
#> SRR1662103 2 0.6531 0.736 0.168 0.832
#> SRR1662104 2 0.6712 0.728 0.176 0.824
#> SRR1662105 2 0.6438 0.740 0.164 0.836
#> SRR1662106 2 0.6712 0.728 0.176 0.824
#> SRR1662107 2 0.6887 0.720 0.184 0.816
#> SRR1662108 2 0.6801 0.724 0.180 0.820
#> SRR1662109 2 0.6973 0.715 0.188 0.812
#> SRR1662110 2 0.6623 0.732 0.172 0.828
#> SRR1662111 1 0.0000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662112 2 0.6712 0.728 0.176 0.824
#> SRR1662113 2 0.6531 0.736 0.168 0.832
#> SRR1662114 2 0.8499 0.622 0.276 0.724
#> SRR1662115 2 0.6531 0.736 0.168 0.832
#> SRR1662116 2 0.6887 0.720 0.184 0.816
#> SRR1662117 2 0.6712 0.728 0.176 0.824
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661717 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661718 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661719 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661720 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661721 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661722 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661723 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661724 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661725 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661726 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661727 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661728 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661729 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661730 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661731 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661732 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661733 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661734 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661735 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661736 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661737 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661738 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661739 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661740 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661741 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661742 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661743 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661744 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661745 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661746 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661747 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661748 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661749 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661750 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661751 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661752 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661753 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661754 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661755 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661756 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661757 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661758 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661759 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661760 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661761 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661762 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661763 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661764 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661766 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661767 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661768 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661769 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661770 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661771 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661772 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661773 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661774 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661775 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661776 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661777 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661778 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661779 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661780 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661781 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661782 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661783 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661784 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661785 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661786 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661787 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661788 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661789 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661790 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661791 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661792 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661793 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661794 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661795 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661796 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661797 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661798 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661799 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661800 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661801 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661802 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661803 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661804 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661805 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661806 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661807 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661808 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661809 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661810 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661811 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661812 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661813 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661814 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661815 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661816 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661817 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661818 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661819 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661820 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661821 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661822 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661823 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661824 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661825 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661826 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661827 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661828 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661829 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661830 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661831 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661832 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661833 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661834 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661835 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661836 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661837 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661838 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661839 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661840 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661841 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661843 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661844 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661845 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661846 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661847 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661848 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661849 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661850 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661851 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661852 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661853 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661854 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661855 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661892 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661893 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661894 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661895 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661896 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661897 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661898 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661899 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661900 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661901 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661902 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661903 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661904 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661905 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661906 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661907 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661908 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661909 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661910 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661911 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661912 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661913 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661914 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661915 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661916 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661917 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661918 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661919 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661920 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661921 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661922 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661923 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661924 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661925 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661926 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661927 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661928 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661929 2 0.634 0.835 0.400 0.596 0.004
#> SRR1661930 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661931 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661932 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661933 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661934 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661935 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661936 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661937 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661938 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661939 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661940 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661941 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661942 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661943 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661944 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661945 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661946 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661947 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661948 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661949 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661950 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661951 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661952 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661953 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661954 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661955 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661956 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661957 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1661958 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661959 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661960 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661961 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661962 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661963 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661964 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661965 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661966 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661967 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661968 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661969 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661970 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661971 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661972 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661973 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661974 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661975 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661976 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661977 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661978 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661979 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661980 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661981 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661982 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661983 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661984 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661985 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661986 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661987 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1661988 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661989 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661990 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661991 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661992 1 0.611 0.694 0.604 0.396 0.000
#> SRR1661993 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661994 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661995 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661996 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1661997 1 0.610 0.690 0.608 0.392 0.000
#> SRR1661998 1 0.611 0.694 0.604 0.396 0.000
#> SRR1661999 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662000 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662001 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662002 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662003 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662004 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662005 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662006 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662007 1 0.611 0.694 0.604 0.396 0.000
#> SRR1662008 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662009 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662010 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662011 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662012 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662013 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662014 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662015 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662016 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662017 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662018 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662019 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662020 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662021 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662022 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662023 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662024 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662025 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662026 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662027 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662028 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662029 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662030 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662031 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662032 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662033 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662034 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662035 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662036 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662037 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662038 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662039 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662040 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662041 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662042 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662043 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662044 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662045 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662046 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662047 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662048 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662049 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662050 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662051 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662052 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662053 2 0.613 0.838 0.400 0.600 0.000
#> SRR1662054 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662055 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662056 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662057 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662058 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662059 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662060 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662061 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662062 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662063 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662064 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662065 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662066 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662067 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662068 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662069 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662070 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662071 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662072 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662073 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662074 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662075 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662076 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662077 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662078 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662079 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662080 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662081 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662082 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662083 2 0.216 0.339 0.000 0.936 0.064
#> SRR1662084 1 0.624 -0.622 0.560 0.440 0.000
#> SRR1662085 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662086 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662087 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662088 1 0.621 -0.602 0.572 0.428 0.000
#> SRR1662089 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662090 1 0.622 -0.608 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662091 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662092 1 0.620 -0.595 0.576 0.424 0.000
#> SRR1662093 1 0.615 -0.573 0.592 0.408 0.000
#> SRR1662094 1 0.622 -0.608 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662095 1 0.624 -0.622 0.560 0.440 0.000
#> SRR1662096 1 0.621 -0.602 0.572 0.428 0.000
#> SRR1662097 1 0.622 -0.608 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662098 1 0.620 -0.595 0.576 0.424 0.000
#> SRR1662099 1 0.620 -0.596 0.576 0.424 0.000
#> SRR1662100 1 0.618 -0.584 0.584 0.416 0.000
#> SRR1662101 1 0.627 -0.642 0.548 0.452 0.000
#> SRR1662102 1 0.622 -0.608 0.568 0.432 0.000
#> SRR1662103 1 0.620 -0.595 0.576 0.424 0.000
#> SRR1662104 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662105 1 0.621 -0.602 0.572 0.428 0.000
#> SRR1662106 1 0.620 -0.595 0.576 0.424 0.000
#> SRR1662107 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662108 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662109 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662110 1 0.620 -0.595 0.576 0.424 0.000
#> SRR1662111 1 0.613 0.698 0.600 0.400 0.000
#> SRR1662112 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662113 1 0.621 -0.602 0.572 0.428 0.000
#> SRR1662114 1 0.581 -0.462 0.664 0.336 0.000
#> SRR1662115 1 0.621 -0.602 0.572 0.428 0.000
#> SRR1662116 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
#> SRR1662117 1 0.619 -0.589 0.580 0.420 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661717 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661718 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661719 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661720 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661721 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661722 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661723 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661724 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661725 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661726 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661727 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661728 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661729 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661730 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661731 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661732 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661733 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661734 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661735 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661736 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661737 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661738 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661739 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661740 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661741 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661742 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661743 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661744 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661745 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661746 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661747 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661748 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661749 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661750 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661751 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661752 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661753 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661754 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661755 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661756 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661757 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661758 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661759 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661760 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661761 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661762 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661763 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661764 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661766 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661767 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661768 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661769 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661770 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661771 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661772 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661773 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661774 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661775 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661776 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661777 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661778 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661779 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661780 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661781 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661782 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661783 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661784 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661785 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661786 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661787 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661788 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661789 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661790 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661791 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661792 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661793 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661794 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661795 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661796 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661797 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661798 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661799 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661800 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661801 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661802 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661803 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661804 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661805 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661806 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661807 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661808 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661809 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661810 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661811 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661812 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661813 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661814 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661815 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661816 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661817 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661818 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661819 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661820 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661821 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661822 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661823 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661824 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661825 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661826 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.8300 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.5402 0.7476 0.000 0.516 0.012 0.472
#> SRR1661929 2 0.5937 0.7078 0.000 0.492 0.036 0.472
#> SRR1661930 2 0.5158 0.7578 0.000 0.524 0.004 0.472
#> SRR1661931 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661932 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661933 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661934 2 0.5602 0.7355 0.000 0.508 0.020 0.472
#> SRR1661935 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661936 2 0.5288 0.7530 0.000 0.520 0.008 0.472
#> SRR1661937 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661938 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661939 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661940 2 0.5288 0.7530 0.000 0.520 0.008 0.472
#> SRR1661941 2 0.5506 0.7418 0.000 0.512 0.016 0.472
#> SRR1661942 2 0.5402 0.7476 0.000 0.516 0.012 0.472
#> SRR1661943 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661944 2 0.5288 0.7531 0.000 0.520 0.008 0.472
#> SRR1661945 2 0.5288 0.7530 0.000 0.520 0.008 0.472
#> SRR1661946 2 0.5288 0.7531 0.000 0.520 0.008 0.472
#> SRR1661947 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661948 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661949 2 0.5288 0.7531 0.000 0.520 0.008 0.472
#> SRR1661950 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661951 2 0.5602 0.7355 0.000 0.508 0.020 0.472
#> SRR1661952 2 0.5402 0.7476 0.000 0.516 0.012 0.472
#> SRR1661953 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661954 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661955 2 0.5602 0.7355 0.000 0.508 0.020 0.472
#> SRR1661956 2 0.5288 0.7530 0.000 0.520 0.008 0.472
#> SRR1661957 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1661958 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661959 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661960 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661961 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661962 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661963 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661964 4 0.0592 0.8473 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1661965 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661966 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661967 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661968 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661969 4 0.0336 0.8609 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1661970 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661971 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661972 4 0.0336 0.8609 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1661973 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661974 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661975 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661976 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661977 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661978 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661979 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661980 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661981 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661982 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661983 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661984 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661985 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661986 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661987 4 0.0188 0.8671 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1661988 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.4994 0.6247 0.520 0.480 0.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.4992 0.6292 0.524 0.476 0.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.4999 0.7314 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662019 2 0.4999 0.7314 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662020 2 0.4999 0.7314 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662021 4 0.4955 -0.5941 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1662022 2 0.5000 0.7160 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1662023 2 0.4999 0.7316 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662024 4 0.4998 -0.6964 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1662025 4 0.5000 -0.7209 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1662026 2 0.4999 0.7314 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662027 4 0.4992 -0.6702 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1662028 2 0.5000 0.7154 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1662029 2 0.4999 0.7314 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662030 2 0.4996 0.7451 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1662031 4 0.4989 -0.6611 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1662032 2 0.4996 0.7451 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1662033 2 0.4998 0.7384 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1662034 4 0.4977 -0.6331 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1662035 2 0.4994 0.7512 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1662036 2 0.4996 0.7451 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1662037 2 0.5000 0.7236 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1662038 4 0.4998 -0.6960 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1662039 2 0.4996 0.7451 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1662040 2 0.4996 0.7451 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1662041 4 0.4961 -0.6042 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1662042 2 0.4996 0.7451 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1662043 2 0.5000 0.7236 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1662044 2 0.4999 0.7314 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662045 4 0.5000 -0.7131 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1662046 2 0.4998 0.7384 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1662047 4 0.4992 -0.6697 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1662048 2 0.4999 0.7314 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662049 2 0.4998 0.7384 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1662050 2 0.4994 0.7512 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1662051 2 0.4989 0.7622 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1662052 2 0.4998 0.7384 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1662053 2 0.4999 0.7314 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1662054 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662055 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662056 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662057 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662058 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662059 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662060 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662061 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662062 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662063 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662064 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662065 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662066 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662067 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662068 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662069 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662070 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662071 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662072 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662073 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662074 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662075 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662076 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662077 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662078 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662079 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662080 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662081 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662082 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662083 4 0.0000 0.8678 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662084 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662085 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662086 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662088 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662089 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662090 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662091 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662092 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662093 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662094 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662095 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662096 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662097 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662098 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662099 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662100 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662101 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662102 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662103 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662104 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662105 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662106 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662107 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662108 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662109 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662110 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.4989 0.6336 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1662112 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662113 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662114 2 0.3123 -0.0104 0.156 0.844 0.000 0.000
#> SRR1662115 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662116 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1662117 2 0.2973 0.0279 0.144 0.856 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661717 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661718 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661719 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661720 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661721 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661722 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661723 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661724 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661725 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661726 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661727 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661728 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661729 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661730 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661731 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661732 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661733 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661734 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661735 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661736 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661737 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661738 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661739 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661740 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661741 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661742 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661743 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661744 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661745 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661746 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661747 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661748 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661749 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661750 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661751 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661752 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661753 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661754 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661755 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661756 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661757 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661758 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661759 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661760 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661761 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661762 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661763 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661764 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661766 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661767 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661768 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661769 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661770 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661771 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661772 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661773 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661774 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661775 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661776 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661777 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661778 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661779 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661780 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661781 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661782 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661783 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661784 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661785 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661786 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661787 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661788 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661789 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661790 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661791 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661792 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661793 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661794 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661795 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661796 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661797 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661798 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661799 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661800 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661801 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661802 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661803 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661804 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661805 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661806 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661807 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661808 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661809 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661810 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661811 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661812 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661813 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661814 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661815 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661816 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661817 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661818 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661819 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661820 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661821 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661822 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661823 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661824 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661825 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661915 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661928 2 0.0404 0.983 0 0.988 0.012 0.000 0
#> SRR1661929 2 0.1197 0.953 0 0.952 0.048 0.000 0
#> SRR1661930 2 0.0162 0.988 0 0.996 0.004 0.000 0
#> SRR1661931 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661932 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661933 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661934 2 0.0609 0.977 0 0.980 0.020 0.000 0
#> SRR1661935 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661936 2 0.0290 0.986 0 0.992 0.008 0.000 0
#> SRR1661937 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661938 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661939 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661940 2 0.0290 0.986 0 0.992 0.008 0.000 0
#> SRR1661941 2 0.0510 0.981 0 0.984 0.016 0.000 0
#> SRR1661942 2 0.0404 0.983 0 0.988 0.012 0.000 0
#> SRR1661943 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661944 2 0.0290 0.986 0 0.992 0.008 0.000 0
#> SRR1661945 2 0.0290 0.986 0 0.992 0.008 0.000 0
#> SRR1661946 2 0.0290 0.986 0 0.992 0.008 0.000 0
#> SRR1661947 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661948 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661949 2 0.0290 0.986 0 0.992 0.008 0.000 0
#> SRR1661950 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661951 2 0.0609 0.977 0 0.980 0.020 0.000 0
#> SRR1661952 2 0.0404 0.983 0 0.988 0.012 0.000 0
#> SRR1661953 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661954 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661955 2 0.0703 0.974 0 0.976 0.024 0.000 0
#> SRR1661956 2 0.0290 0.986 0 0.992 0.008 0.000 0
#> SRR1661957 2 0.0000 0.990 0 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661958 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661959 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661960 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661961 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661962 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661963 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661964 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661965 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661966 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661967 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661968 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661969 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661970 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661971 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661972 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661973 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661974 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661975 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661976 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661977 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661978 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661979 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661980 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661981 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661982 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661983 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661984 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661985 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661986 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661987 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1661988 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661989 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661990 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661991 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661992 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661993 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661994 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661995 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661996 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661997 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661998 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661999 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662000 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662001 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662002 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662003 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662004 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662005 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662006 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662007 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662008 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662009 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662010 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662011 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662012 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662013 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662014 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662015 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662016 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662017 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662018 2 0.0880 0.969 0 0.968 0.000 0.032 0
#> SRR1662019 2 0.0880 0.969 0 0.968 0.000 0.032 0
#> SRR1662020 2 0.0794 0.972 0 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1662021 2 0.2280 0.878 0 0.880 0.000 0.120 0
#> SRR1662022 2 0.1043 0.963 0 0.960 0.000 0.040 0
#> SRR1662023 2 0.0880 0.969 0 0.968 0.000 0.032 0
#> SRR1662024 2 0.1410 0.944 0 0.940 0.000 0.060 0
#> SRR1662025 2 0.1043 0.962 0 0.960 0.000 0.040 0
#> SRR1662026 2 0.0880 0.969 0 0.968 0.000 0.032 0
#> SRR1662027 2 0.1608 0.932 0 0.928 0.000 0.072 0
#> SRR1662028 2 0.1043 0.962 0 0.960 0.000 0.040 0
#> SRR1662029 2 0.0880 0.969 0 0.968 0.000 0.032 0
#> SRR1662030 2 0.0609 0.978 0 0.980 0.000 0.020 0
#> SRR1662031 2 0.1732 0.923 0 0.920 0.000 0.080 0
#> SRR1662032 2 0.0510 0.981 0 0.984 0.000 0.016 0
#> SRR1662033 2 0.0609 0.978 0 0.980 0.000 0.020 0
#> SRR1662034 2 0.2074 0.897 0 0.896 0.000 0.104 0
#> SRR1662035 2 0.0404 0.984 0 0.988 0.000 0.012 0
#> SRR1662036 2 0.0609 0.978 0 0.980 0.000 0.020 0
#> SRR1662037 2 0.0963 0.966 0 0.964 0.000 0.036 0
#> SRR1662038 2 0.1410 0.944 0 0.940 0.000 0.060 0
#> SRR1662039 2 0.0703 0.976 0 0.976 0.000 0.024 0
#> SRR1662040 2 0.0510 0.981 0 0.984 0.000 0.016 0
#> SRR1662041 2 0.2230 0.883 0 0.884 0.000 0.116 0
#> SRR1662042 2 0.0510 0.981 0 0.984 0.000 0.016 0
#> SRR1662043 2 0.0963 0.966 0 0.964 0.000 0.036 0
#> SRR1662044 2 0.0880 0.969 0 0.968 0.000 0.032 0
#> SRR1662045 2 0.1197 0.955 0 0.952 0.000 0.048 0
#> SRR1662046 2 0.0609 0.978 0 0.980 0.000 0.020 0
#> SRR1662047 2 0.1671 0.928 0 0.924 0.000 0.076 0
#> SRR1662048 2 0.0794 0.972 0 0.972 0.000 0.028 0
#> SRR1662049 2 0.0609 0.978 0 0.980 0.000 0.020 0
#> SRR1662050 2 0.0510 0.981 0 0.984 0.000 0.016 0
#> SRR1662051 2 0.0162 0.988 0 0.996 0.000 0.004 0
#> SRR1662052 2 0.0703 0.975 0 0.976 0.000 0.024 0
#> SRR1662053 2 0.0880 0.969 0 0.968 0.000 0.032 0
#> SRR1662054 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662055 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662056 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662057 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662058 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662059 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662060 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662061 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662062 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662063 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662064 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662065 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662066 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662067 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662068 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662069 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662070 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662071 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662072 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662073 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662074 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662075 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662076 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662077 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662078 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662079 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662080 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662081 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662082 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662083 4 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 1.000 0
#> SRR1662084 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662085 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662086 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662087 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662088 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662089 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662090 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662091 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662092 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662093 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662094 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662095 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662096 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662097 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662098 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662099 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662100 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662101 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662102 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662103 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662104 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662105 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662106 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662107 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662108 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662109 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662110 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662111 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662112 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662113 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662114 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662115 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662116 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1662117 5 0.0000 1.000 0 0.000 0.000 0.000 1
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.949 0 1.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0 0.000 1.000 0 0 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1 0.000 0.000 0 0 0.000
#> SRR1661928 2 0.310 0.741 0 0.756 0.000 0 0 0.244
#> SRR1661929 2 0.365 0.611 0 0.672 0.004 0 0 0.324
#> SRR1661930 2 0.279 0.790 0 0.800 0.000 0 0 0.200
#> SRR1661931 2 0.297 0.764 0 0.776 0.000 0 0 0.224
#> SRR1661932 2 0.294 0.769 0 0.780 0.000 0 0 0.220
#> SRR1661933 2 0.253 0.820 0 0.832 0.000 0 0 0.168
#> SRR1661934 2 0.349 0.673 0 0.708 0.004 0 0 0.288
#> SRR1661935 2 0.305 0.750 0 0.764 0.000 0 0 0.236
#> SRR1661936 2 0.294 0.769 0 0.780 0.000 0 0 0.220
#> SRR1661937 2 0.291 0.773 0 0.784 0.000 0 0 0.216
#> SRR1661938 2 0.242 0.831 0 0.844 0.000 0 0 0.156
#> SRR1661939 2 0.230 0.842 0 0.856 0.000 0 0 0.144
#> SRR1661940 2 0.363 0.555 0 0.644 0.000 0 0 0.356
#> SRR1661941 2 0.317 0.725 0 0.744 0.000 0 0 0.256
#> SRR1661942 2 0.320 0.719 0 0.740 0.000 0 0 0.260
#> SRR1661943 2 0.310 0.740 0 0.756 0.000 0 0 0.244
#> SRR1661944 2 0.297 0.764 0 0.776 0.000 0 0 0.224
#> SRR1661945 2 0.176 0.881 0 0.904 0.000 0 0 0.096
#> SRR1661946 2 0.310 0.740 0 0.756 0.000 0 0 0.244
#> SRR1661947 2 0.282 0.786 0 0.796 0.000 0 0 0.204
#> SRR1661948 2 0.238 0.835 0 0.848 0.000 0 0 0.152
#> SRR1661949 2 0.310 0.741 0 0.756 0.000 0 0 0.244
#> SRR1661950 2 0.285 0.782 0 0.792 0.000 0 0 0.208
#> SRR1661951 2 0.327 0.732 0 0.748 0.004 0 0 0.248
#> SRR1661952 2 0.333 0.684 0 0.716 0.000 0 0 0.284
#> SRR1661953 2 0.322 0.714 0 0.736 0.000 0 0 0.264
#> SRR1661954 2 0.305 0.751 0 0.764 0.000 0 0 0.236
#> SRR1661955 2 0.327 0.702 0 0.728 0.000 0 0 0.272
#> SRR1661956 2 0.288 0.778 0 0.788 0.000 0 0 0.212
#> SRR1661957 2 0.282 0.786 0 0.796 0.000 0 0 0.204
#> SRR1661958 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661959 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661960 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661961 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661962 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661963 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661964 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661965 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661966 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661967 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661968 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661969 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661970 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661971 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661972 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661973 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661974 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661975 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661976 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661977 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661978 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661979 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661980 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661981 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661982 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661983 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661984 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661985 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661986 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661987 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1661988 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661989 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661990 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661991 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661992 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661993 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661994 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661995 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661996 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661997 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661998 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1661999 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662000 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662001 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662002 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662003 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662004 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662005 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662006 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662007 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662008 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662009 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662010 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662011 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662012 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662013 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662014 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662015 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662016 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662017 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662018 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662019 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662020 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662021 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662022 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662023 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662024 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662025 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662026 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662027 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662028 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662029 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662030 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662031 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662032 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662033 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662034 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662035 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662036 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662037 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662038 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662039 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662040 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662041 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662042 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662043 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662044 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662045 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662046 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662047 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662048 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662049 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662050 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662051 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662052 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662053 6 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 0 1.000
#> SRR1662054 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662055 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662056 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662057 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662058 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662059 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662060 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662061 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662062 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662063 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662064 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662065 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662066 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662067 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662068 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662069 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662070 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662071 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662072 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662073 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662074 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662075 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662076 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662077 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662078 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662079 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662080 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662081 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662082 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662083 4 0.000 1.000 0 0.000 0.000 1 0 0.000
#> SRR1662084 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662085 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662086 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662087 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662088 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662089 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662090 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662091 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662092 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662093 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662094 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662095 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662096 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662097 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662098 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662099 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662100 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662101 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662102 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662103 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662104 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662105 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662106 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662107 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662108 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662109 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662110 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662111 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662112 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662113 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662114 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662115 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662116 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
#> SRR1662117 5 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0 1 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.243 0.823 0.823 0.4369 0.562 0.562
#> 3 3 0.453 0.861 0.865 0.3661 0.789 0.625
#> 4 4 0.658 0.809 0.882 0.0756 0.780 0.554
#> 5 5 0.838 0.907 0.947 0.1653 0.858 0.657
#> 6 6 0.895 0.915 0.935 0.0603 0.937 0.770
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.1843 0.840 0.028 0.972
#> SRR1661717 2 0.2236 0.840 0.036 0.964
#> SRR1661718 2 0.1843 0.840 0.028 0.972
#> SRR1661719 2 0.2043 0.840 0.032 0.968
#> SRR1661720 2 0.2043 0.840 0.032 0.968
#> SRR1661721 2 0.2043 0.840 0.032 0.968
#> SRR1661722 2 0.2043 0.841 0.032 0.968
#> SRR1661723 2 0.1843 0.840 0.028 0.972
#> SRR1661724 2 0.2236 0.840 0.036 0.964
#> SRR1661725 2 0.2043 0.840 0.032 0.968
#> SRR1661726 2 0.1843 0.840 0.028 0.972
#> SRR1661727 2 0.2043 0.840 0.032 0.968
#> SRR1661728 2 0.2236 0.840 0.036 0.964
#> SRR1661729 2 0.2043 0.840 0.032 0.968
#> SRR1661730 2 0.1843 0.840 0.028 0.972
#> SRR1661731 2 0.1843 0.840 0.028 0.972
#> SRR1661732 2 0.2043 0.840 0.032 0.968
#> SRR1661733 2 0.2043 0.841 0.032 0.968
#> SRR1661734 2 0.2236 0.840 0.036 0.964
#> SRR1661735 2 0.2043 0.840 0.032 0.968
#> SRR1661736 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661737 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661738 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661739 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661740 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661741 2 0.0672 0.843 0.008 0.992
#> SRR1661742 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661743 2 0.0672 0.843 0.008 0.992
#> SRR1661744 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661745 2 0.0672 0.843 0.008 0.992
#> SRR1661746 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661747 2 0.0672 0.843 0.008 0.992
#> SRR1661748 2 0.0672 0.843 0.008 0.992
#> SRR1661749 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661750 2 0.0672 0.843 0.008 0.992
#> SRR1661751 2 0.0672 0.843 0.008 0.992
#> SRR1661752 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661753 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661754 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661755 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661756 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661757 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661758 2 0.0672 0.843 0.008 0.992
#> SRR1661759 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661760 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661761 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661762 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661763 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661764 2 0.0376 0.842 0.004 0.996
#> SRR1661766 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661767 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661768 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661769 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661770 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661771 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661772 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661773 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661774 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661775 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661776 2 0.0938 0.843 0.012 0.988
#> SRR1661777 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661778 2 0.0938 0.843 0.012 0.988
#> SRR1661779 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661780 2 0.0938 0.843 0.012 0.988
#> SRR1661781 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661782 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661783 2 0.0938 0.843 0.012 0.988
#> SRR1661784 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661785 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661786 2 0.0938 0.843 0.012 0.988
#> SRR1661787 2 0.0938 0.843 0.012 0.988
#> SRR1661788 2 0.0938 0.843 0.012 0.988
#> SRR1661789 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661790 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661791 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661792 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661793 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661794 2 0.0938 0.843 0.012 0.988
#> SRR1661795 2 0.1184 0.843 0.016 0.984
#> SRR1661796 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.841 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661827 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661828 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661829 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661830 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661831 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661832 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661833 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661834 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661835 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661836 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661837 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661838 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661839 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661840 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661841 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661843 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661844 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661845 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661846 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661847 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661848 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661849 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661850 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661851 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661852 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661853 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661854 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661855 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661856 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661857 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661858 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661859 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661860 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661861 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661862 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661863 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661864 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661865 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661866 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661867 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661868 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661869 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661870 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661871 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661872 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661873 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661874 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661875 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661876 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661877 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661878 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661879 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661880 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661881 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661882 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661883 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661884 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661885 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661886 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661887 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661888 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661889 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661890 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661891 2 0.7056 0.758 0.192 0.808
#> SRR1661892 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661893 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661894 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661895 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661896 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661897 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661898 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661899 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661900 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661901 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661902 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661903 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661904 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661905 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661906 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661907 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661908 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661909 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661910 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661911 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661912 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661913 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661914 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661915 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661916 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661917 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661918 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661919 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661920 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661921 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661922 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661923 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661924 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661925 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661926 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661927 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661928 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661929 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661930 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661931 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661932 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661933 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661934 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661935 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661936 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661937 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661938 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661939 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661940 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661941 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661942 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661943 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661944 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661945 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661946 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661947 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661948 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661949 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661950 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661951 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661952 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661953 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661954 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661955 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661956 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661957 2 0.4022 0.818 0.080 0.920
#> SRR1661958 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661959 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661960 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661961 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661962 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661963 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661964 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661965 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661966 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661967 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661968 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661969 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661970 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661971 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661972 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661973 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661974 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661975 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661976 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661977 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661978 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661979 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661980 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661981 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661982 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661983 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661984 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661985 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661986 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661987 2 0.9608 0.375 0.384 0.616
#> SRR1661988 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661989 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661990 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661991 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661992 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661993 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661994 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661995 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661996 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661997 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661998 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1661999 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662000 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662001 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662002 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662003 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662004 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662005 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662006 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662007 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662008 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662009 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662010 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662011 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662012 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662013 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662014 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662015 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662016 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662017 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662018 2 0.5408 0.795 0.124 0.876
#> SRR1662019 2 0.5294 0.799 0.120 0.880
#> SRR1662020 2 0.5178 0.801 0.116 0.884
#> SRR1662021 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662022 2 0.5519 0.793 0.128 0.872
#> SRR1662023 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662024 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662025 2 0.5519 0.793 0.128 0.872
#> SRR1662026 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662027 2 0.5408 0.795 0.124 0.876
#> SRR1662028 2 0.5178 0.801 0.116 0.884
#> SRR1662029 2 0.5519 0.793 0.128 0.872
#> SRR1662030 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662031 2 0.5519 0.793 0.128 0.872
#> SRR1662032 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662033 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662034 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662035 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662036 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662037 2 0.5178 0.801 0.116 0.884
#> SRR1662038 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662039 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662040 2 0.5408 0.795 0.124 0.876
#> SRR1662041 2 0.5294 0.799 0.120 0.880
#> SRR1662042 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662043 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662044 2 0.5408 0.796 0.124 0.876
#> SRR1662045 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662046 2 0.5519 0.793 0.128 0.872
#> SRR1662047 2 0.5059 0.802 0.112 0.888
#> SRR1662048 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662049 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662050 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662051 2 0.5519 0.793 0.128 0.872
#> SRR1662052 2 0.5178 0.801 0.116 0.884
#> SRR1662053 2 0.5294 0.798 0.120 0.880
#> SRR1662054 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662055 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662056 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662057 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662058 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662059 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662060 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662061 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662062 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662063 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662064 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662065 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662066 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662067 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662068 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662069 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662070 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662071 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662072 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662073 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662074 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662075 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662076 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662077 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662078 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662079 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662080 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662081 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662082 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662083 2 0.9129 0.553 0.328 0.672
#> SRR1662084 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662085 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662086 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662087 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662088 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662089 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662090 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662091 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662092 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662093 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662094 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662095 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662096 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662097 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662098 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662099 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662100 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662101 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662102 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662103 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662104 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662105 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662106 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662107 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662108 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662109 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662110 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662111 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662112 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662113 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662114 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662115 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662116 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
#> SRR1662117 1 0.5629 1.000 0.868 0.132
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661717 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661718 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661719 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661720 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661721 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661722 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661723 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661724 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661725 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661726 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661727 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661728 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661729 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661730 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661731 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661732 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661733 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661734 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661735 2 0.2599 0.899 0.052 0.932 0.016
#> SRR1661736 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661737 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661738 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661739 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661740 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661741 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661742 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661743 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661744 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661745 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661746 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661747 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661748 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661749 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661750 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661751 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661752 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661753 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661754 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661755 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661756 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661757 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661758 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661759 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661760 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661761 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661762 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661763 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661764 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661766 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.936 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661797 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661798 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661799 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661800 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661801 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661802 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661803 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661804 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661805 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661806 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661807 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661808 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661809 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661810 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661811 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661812 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661813 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661814 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661815 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661816 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661817 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661818 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661819 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661820 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661821 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661822 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661823 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661824 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661825 2 0.0592 0.938 0.000 0.988 0.012
#> SRR1661826 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661827 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661828 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661829 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661830 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661831 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661832 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661833 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661834 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661835 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661836 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661837 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661838 1 0.1289 0.865 0.968 0.032 0.000
#> SRR1661839 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661840 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661841 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661843 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661844 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661845 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661846 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661847 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661848 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661849 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661850 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661851 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661852 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661853 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661854 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661855 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661856 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661857 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661858 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661859 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661860 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661861 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661862 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661863 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661864 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661865 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661866 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661867 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661868 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661869 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661870 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661871 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661872 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661873 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661874 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661875 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661876 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661877 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661878 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661879 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661880 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661881 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661882 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661883 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661884 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661885 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661886 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661887 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661888 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661889 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661890 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661891 3 0.6559 0.700 0.040 0.252 0.708
#> SRR1661892 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661893 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661894 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661895 1 0.4504 0.877 0.804 0.196 0.000
#> SRR1661896 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661897 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661898 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661899 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661900 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661901 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661902 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661903 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661904 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661905 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661906 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661907 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661908 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661909 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661910 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661911 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661912 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661913 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661914 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661915 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661916 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661917 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661918 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661919 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661920 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661921 1 0.4452 0.877 0.808 0.192 0.000
#> SRR1661922 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661923 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661924 1 0.4178 0.876 0.828 0.172 0.000
#> SRR1661925 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661926 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661927 1 0.1163 0.865 0.972 0.028 0.000
#> SRR1661928 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661929 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661930 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661931 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661932 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661933 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661934 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661935 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661936 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661937 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661938 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661939 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661940 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661941 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661942 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661943 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661944 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661945 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661946 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661947 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661948 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661949 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661950 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661951 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661952 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661953 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661954 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661955 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661956 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661957 2 0.3918 0.834 0.012 0.868 0.120
#> SRR1661958 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661959 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661960 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661961 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661962 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661963 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661964 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661965 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661966 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661967 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661968 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661969 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661970 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661971 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661972 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661973 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661974 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661975 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661976 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661977 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661978 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661979 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661980 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661981 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661982 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661983 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661984 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661985 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661986 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661987 3 0.4676 0.807 0.040 0.112 0.848
#> SRR1661988 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661989 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661990 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661991 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661992 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661993 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661994 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661995 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661996 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661997 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661998 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1661999 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662000 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662001 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662002 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662003 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662004 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662005 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662006 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662007 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662008 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662009 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662010 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662011 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662012 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662013 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662014 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662015 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662016 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662017 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662018 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662019 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662020 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662021 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662022 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662023 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662024 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662025 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662026 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662027 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662028 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662029 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662030 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662031 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662032 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662033 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662034 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662035 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662036 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662037 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662038 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662039 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662040 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662041 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662042 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662043 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662044 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662045 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662046 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662047 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662048 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662049 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662050 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662051 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662052 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662053 2 0.2918 0.913 0.032 0.924 0.044
#> SRR1662054 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662055 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662056 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662057 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662058 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662059 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662060 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662061 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662062 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662063 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662064 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662065 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662066 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662067 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662068 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662069 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662070 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662071 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662072 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662073 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662074 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662075 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662076 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662077 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662078 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662079 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662080 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662081 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662082 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662083 3 0.4887 0.778 0.000 0.228 0.772
#> SRR1662084 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662085 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662086 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662087 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662088 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662089 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662090 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662091 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662092 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662093 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662094 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662095 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662096 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662097 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662098 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662099 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662100 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662101 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662102 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662103 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662104 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662105 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662106 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662107 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662108 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662109 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662110 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662111 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662112 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662113 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662114 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662115 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662116 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
#> SRR1662117 1 0.4555 0.877 0.800 0.200 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661737 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661738 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661739 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661740 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661741 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661742 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661743 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661744 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661745 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661746 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661747 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661748 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661749 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661750 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661751 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661752 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661753 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661754 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661755 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661756 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661757 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661758 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661759 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661760 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661761 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661762 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661763 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661764 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661766 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.8052 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661797 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661798 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661799 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661800 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661801 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661802 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661803 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661804 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661805 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661806 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661807 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661808 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661809 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661810 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661811 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661812 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661813 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661814 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661815 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661816 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661817 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661818 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661819 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661820 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661821 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661822 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661823 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661824 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661825 2 0.0188 0.8055 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1661826 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661857 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661858 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661859 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661860 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661861 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661862 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661863 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661864 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661865 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661866 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661867 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661868 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661869 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661870 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661871 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661872 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661873 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661874 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661875 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661876 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661877 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661878 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661879 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661880 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661881 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661882 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661883 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661884 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661885 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661886 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661887 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661888 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661889 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661890 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661891 3 0.1211 1.0000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1661892 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.3649 0.6512 0.796 0.204 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.4193 0.4978 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.4843 0.0541 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.4222 0.4943 0.728 0.272 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.1792 0.8668 0.932 0.068 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.9684 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661929 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661930 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661931 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661932 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661933 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661934 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661935 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661936 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661937 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661938 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661939 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661940 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661941 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661942 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661943 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661944 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661945 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661946 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661947 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661948 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661949 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661950 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661951 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661952 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661953 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661954 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661955 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661956 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661957 2 0.4511 0.7183 0.000 0.784 0.176 0.040
#> SRR1661958 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661959 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661960 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661961 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661962 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661963 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661964 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661965 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661966 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661967 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661968 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661969 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661970 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661971 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661972 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661973 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661974 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661975 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661976 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661977 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661978 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661979 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661980 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661981 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661982 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661983 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661984 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661985 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661986 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661987 4 0.0000 0.9925 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661988 2 0.5639 0.6114 0.324 0.636 0.040 0.000
#> SRR1661989 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1661990 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1661991 2 0.5639 0.6114 0.324 0.636 0.040 0.000
#> SRR1661992 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1661993 2 0.5639 0.6114 0.324 0.636 0.040 0.000
#> SRR1661994 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1661995 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1661996 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1661997 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1661998 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1661999 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662000 2 0.5639 0.6114 0.324 0.636 0.040 0.000
#> SRR1662001 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662002 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1662003 2 0.5639 0.6114 0.324 0.636 0.040 0.000
#> SRR1662004 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662005 2 0.5639 0.6114 0.324 0.636 0.040 0.000
#> SRR1662006 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662007 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662008 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1662009 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1662010 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662011 2 0.5639 0.6114 0.324 0.636 0.040 0.000
#> SRR1662012 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1662013 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662014 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1662015 2 0.5910 0.6153 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662016 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1662017 2 0.5639 0.6114 0.324 0.636 0.040 0.000
#> SRR1662018 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662019 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662020 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662021 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662022 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662023 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662024 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662025 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662026 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662027 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662028 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662029 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662030 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662031 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662032 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662033 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662034 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662035 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662036 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662037 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662038 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662039 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662040 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662041 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662042 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662043 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662044 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662045 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662046 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662047 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662048 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662049 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662050 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662051 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662052 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662053 2 0.5143 0.5200 0.000 0.628 0.012 0.360
#> SRR1662054 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662055 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662056 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662057 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662058 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662059 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662060 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662061 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662062 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662063 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662064 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662065 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662066 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662067 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662068 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662069 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662070 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662071 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662072 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662073 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662074 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662075 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662076 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662077 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662078 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662079 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662080 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662081 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662082 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662083 4 0.0524 0.9924 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1662084 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662085 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662086 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662087 2 0.5794 0.6134 0.320 0.636 0.040 0.004
#> SRR1662088 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662089 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662090 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662091 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662092 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662093 2 0.6009 0.6170 0.312 0.636 0.040 0.012
#> SRR1662094 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662095 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662096 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662097 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662098 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662099 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662100 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662101 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662102 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662103 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662104 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662105 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662106 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662107 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662108 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662109 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662110 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662111 2 0.5833 0.6168 0.324 0.636 0.016 0.024
#> SRR1662112 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662113 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662114 2 0.5910 0.6155 0.316 0.636 0.040 0.008
#> SRR1662115 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662116 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
#> SRR1662117 2 0.6099 0.6187 0.308 0.636 0.040 0.016
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.872 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0162 0.990 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661896 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0162 0.990 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661902 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0880 0.961 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1661909 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0963 0.957 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1661916 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0290 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1661922 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0162 0.990 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661925 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661929 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661930 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661931 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661932 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661933 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661934 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661935 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661936 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661937 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661938 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661939 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661940 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661941 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661942 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661943 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661944 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661945 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661946 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661947 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661948 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661949 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661950 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661951 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661952 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661953 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661954 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661955 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661956 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661957 2 0.2852 0.789 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1661958 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661959 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661960 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661963 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661965 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661967 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661968 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661973 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661976 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661978 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661979 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661980 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661981 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661984 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661986 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661987 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661988 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661989 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661990 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661991 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661992 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661993 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661994 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661995 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661996 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661997 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661998 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661999 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662000 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662001 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662002 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662003 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662004 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662005 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662006 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662007 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662008 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662009 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662010 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662011 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662012 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662013 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662014 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662015 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662016 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662017 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662018 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662019 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662020 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662021 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662022 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662023 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662024 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662025 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662026 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662027 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662028 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662029 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662030 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662031 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662032 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662033 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662034 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662035 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662036 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662037 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662038 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662039 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662040 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662041 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662042 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662043 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662044 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662045 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662046 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662047 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662048 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662049 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662050 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662051 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662052 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662053 2 0.6067 0.559 0.000 0.560 0.164 0.276 0.000
#> SRR1662054 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662085 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662086 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662087 5 0.0290 0.991 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1662088 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662089 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662090 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662091 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662092 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662093 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662094 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662095 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662096 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662097 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662098 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662099 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662100 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662101 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662102 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662103 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662104 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662105 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662106 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662107 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662108 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662109 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662110 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662111 1 0.3942 0.640 0.728 0.012 0.000 0.000 0.260
#> SRR1662112 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662113 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662114 5 0.0703 0.973 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1662115 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662116 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1662117 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0146 0.990 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0146 0.990 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0790 0.961 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0865 0.956 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0146 0.990 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661929 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661930 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661931 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661932 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661933 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661934 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661935 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661936 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661937 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661938 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661939 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661940 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661941 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661942 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661943 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661944 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661945 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661946 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661947 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661948 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661949 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661950 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661951 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661952 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661953 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661954 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661955 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661956 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661957 2 0.5395 0.426 0.000 0.520 0.124 0.000 0.000 0.356
#> SRR1661958 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661959 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661960 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661963 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661965 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661967 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661968 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661973 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661976 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661978 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661979 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661980 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661981 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661984 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661986 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661987 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661988 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661989 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661990 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661991 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661992 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661993 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661994 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661995 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661996 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661997 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661998 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661999 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662000 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662001 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662002 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662003 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662004 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662005 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662006 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662007 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662008 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662009 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662010 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662011 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662012 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662013 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662014 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662015 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662016 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662017 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662018 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662019 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662020 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662021 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662022 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662023 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662024 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662025 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662026 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662027 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662028 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662029 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662030 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662031 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662032 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662033 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662034 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662035 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662036 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662037 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662038 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662039 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662040 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662041 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662042 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662043 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662044 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662045 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662046 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662047 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662048 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662049 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662050 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662051 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662052 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662053 6 0.3748 1.000 0.000 0.300 0.000 0.012 0.000 0.688
#> SRR1662054 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662055 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662056 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662057 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662058 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662059 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662060 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662061 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662062 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662063 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662064 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662065 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662066 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662067 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662068 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662069 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662070 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662071 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662072 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662073 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662074 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662075 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662076 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662077 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662078 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662079 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662080 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662081 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662082 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662083 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1662084 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662085 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662086 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662087 5 0.0260 0.991 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1662088 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662089 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662090 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662091 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662092 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662093 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662094 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662095 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662096 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662097 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662098 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662099 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662100 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662101 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662102 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662103 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662104 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662105 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662106 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662107 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662108 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662109 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662110 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.3629 0.636 0.724 0.016 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1662112 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662113 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662114 5 0.0632 0.972 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1662115 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662116 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662117 5 0.0000 0.999 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 6.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.4863 0.514 0.514
#> 3 3 1.000 0.999 0.999 0.2507 0.851 0.718
#> 4 4 0.962 0.954 0.969 0.2047 0.869 0.666
#> 5 5 0.957 0.966 0.951 0.0490 0.973 0.896
#> 6 6 1.000 0.994 0.994 0.0642 0.948 0.777
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 6
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3 4 5
There is also optional best \(k\) = 2 3 4 5 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661857 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661859 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661862 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661866 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661867 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661868 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661869 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1661871 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR1661872 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1661873 1 0.1184 0.985 0.984 0.016
#> SRR1661874 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1661875 1 0.0938 0.989 0.988 0.012
#> SRR1661876 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661877 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1661878 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1661879 1 0.1184 0.985 0.984 0.016
#> SRR1661880 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1661882 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1661883 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661884 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661885 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1661890 1 0.0376 0.996 0.996 0.004
#> SRR1661891 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661929 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661930 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661931 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661932 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661933 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661934 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661935 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661936 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661937 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661938 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661939 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661940 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661941 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661942 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661943 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661944 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661945 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661946 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661947 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661948 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661949 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661950 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661951 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661952 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661953 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661954 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661955 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661956 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661957 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661958 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661959 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661960 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661961 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661962 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661963 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661964 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661965 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661966 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661967 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661968 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661969 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661970 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661971 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661972 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661973 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661974 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661975 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661976 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661977 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661978 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661979 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661980 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661981 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661982 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661983 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661984 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661985 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661986 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661987 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661988 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662054 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662055 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662056 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662057 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662058 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662059 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662060 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662061 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662062 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662063 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662064 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662065 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662066 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662067 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662068 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662069 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662070 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662071 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662072 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662073 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662074 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662075 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662076 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662077 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662078 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662079 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662080 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662081 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662082 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662083 2 0.0000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662084 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.0000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661737 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661738 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661739 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661740 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661741 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661742 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661743 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661744 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661745 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661746 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661747 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661748 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661749 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661750 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661751 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661752 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661753 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661754 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661755 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661756 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661757 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661758 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661759 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661760 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661761 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661762 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661763 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661764 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661766 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661767 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661768 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661769 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661770 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661771 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661772 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661773 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661774 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661775 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661776 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661777 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661778 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661779 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661780 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661781 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661782 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661783 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661784 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661785 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661786 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661787 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661788 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661789 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661790 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661791 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661792 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661793 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661794 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661795 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661796 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661797 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661798 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661799 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661800 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661801 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661802 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661803 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661804 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661805 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661806 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661807 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661808 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661809 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661810 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661811 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661812 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661813 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661814 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661815 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661816 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661817 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661818 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661819 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661820 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661821 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661822 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661823 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661824 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661825 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661928 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661929 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661930 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661931 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661932 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661933 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661934 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661935 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661936 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661937 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661938 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661939 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661940 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661941 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661942 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661943 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661944 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661945 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661946 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661947 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661948 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661949 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661950 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661951 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661952 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661953 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661954 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661955 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661956 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661957 3 0.0000 1.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661958 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661959 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661960 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661961 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661962 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661963 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661964 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661965 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661966 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661967 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661968 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661969 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661970 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661971 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661972 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661973 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661974 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661975 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661976 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661977 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661978 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661979 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661980 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661981 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661982 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661983 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661984 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661985 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661986 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661987 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1661988 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661989 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661990 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661991 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661992 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661993 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661994 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661995 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661996 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661997 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661998 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661999 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662000 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662001 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662002 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662003 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662004 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662005 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662006 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662007 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662008 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662009 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662010 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662011 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662012 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662013 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662014 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662015 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662016 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662017 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1662019 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662020 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662021 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662022 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662023 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662024 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662025 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662026 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662027 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662028 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662029 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662030 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662031 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662032 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662033 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662034 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662035 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662036 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662037 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662038 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662039 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662040 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662041 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662042 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662043 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662044 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662045 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662046 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662047 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662048 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662049 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662050 2 0.0237 0.998 0 0.996 0.004
#> SRR1662051 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662052 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662053 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662054 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662055 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662056 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662057 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662058 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662059 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662060 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662061 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662062 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662063 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662064 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662065 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662066 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662067 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662068 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662069 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662070 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662071 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662072 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662073 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662074 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662075 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662076 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662077 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662078 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662079 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662080 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662081 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662082 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662083 2 0.0000 0.998 0 1.000 0.000
#> SRR1662084 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662085 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662086 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662087 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662088 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662089 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662090 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662091 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662092 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662093 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662094 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662095 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662096 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662097 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662098 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662099 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662100 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662101 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662102 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662103 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662104 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662105 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662106 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662107 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662108 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662109 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662110 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662111 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662112 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662113 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662114 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662115 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662116 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
#> SRR1662117 1 0.0000 1.000 1 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661717 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661718 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661719 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661720 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661721 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661722 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661723 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661724 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661725 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661726 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661727 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661728 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661729 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661730 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661731 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661732 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661733 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661734 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661735 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661736 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661737 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661738 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661739 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661740 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661741 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661742 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661743 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661744 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661745 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661746 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661747 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661748 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661749 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661750 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661751 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661752 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661753 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661754 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661755 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661756 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661757 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661758 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661759 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661760 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661761 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661762 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661763 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661764 2 0.0469 0.991 0.000 0.988 0 0.012
#> SRR1661766 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.992 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661796 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661797 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661798 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661799 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661800 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661801 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661802 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661803 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661804 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661805 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661806 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661807 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661808 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661809 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661810 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661811 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661812 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661813 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661814 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661815 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661816 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661817 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661818 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661819 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661820 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661821 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661822 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661823 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661824 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661825 2 0.0188 0.990 0.000 0.996 0 0.004
#> SRR1661826 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.996 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661928 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661929 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661930 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661931 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661932 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661933 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661934 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661935 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661936 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661937 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661938 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661939 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661940 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661941 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661942 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661943 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661944 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661945 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661946 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661947 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661948 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661949 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661950 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661951 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661952 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661953 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661954 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661955 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661956 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661957 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661958 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661959 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661960 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661961 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661962 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661963 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661964 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661965 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661966 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661967 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661968 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661969 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661970 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661971 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661972 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661973 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661974 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661975 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661976 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661977 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661978 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661979 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661980 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661981 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661982 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661983 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661984 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661985 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661986 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661987 4 0.0336 0.871 0.000 0.008 0 0.992
#> SRR1661988 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661989 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661990 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661991 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661992 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661993 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661994 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661995 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661996 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661997 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661998 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1661999 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662000 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662001 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662002 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662003 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662004 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662005 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662006 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662007 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662008 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662009 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662010 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662011 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662012 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662013 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662014 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662015 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662016 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662017 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662018 4 0.4543 0.695 0.000 0.324 0 0.676
#> SRR1662019 4 0.4500 0.708 0.000 0.316 0 0.684
#> SRR1662020 4 0.4193 0.762 0.000 0.268 0 0.732
#> SRR1662021 4 0.4477 0.714 0.000 0.312 0 0.688
#> SRR1662022 4 0.4331 0.745 0.000 0.288 0 0.712
#> SRR1662023 4 0.4406 0.730 0.000 0.300 0 0.700
#> SRR1662024 4 0.4500 0.708 0.000 0.316 0 0.684
#> SRR1662025 4 0.4543 0.695 0.000 0.324 0 0.676
#> SRR1662026 4 0.4356 0.740 0.000 0.292 0 0.708
#> SRR1662027 4 0.4382 0.736 0.000 0.296 0 0.704
#> SRR1662028 4 0.4331 0.745 0.000 0.288 0 0.712
#> SRR1662029 4 0.4222 0.759 0.000 0.272 0 0.728
#> SRR1662030 4 0.4222 0.759 0.000 0.272 0 0.728
#> SRR1662031 4 0.4164 0.765 0.000 0.264 0 0.736
#> SRR1662032 4 0.4331 0.745 0.000 0.288 0 0.712
#> SRR1662033 4 0.4477 0.714 0.000 0.312 0 0.688
#> SRR1662034 4 0.4382 0.736 0.000 0.296 0 0.704
#> SRR1662035 4 0.4222 0.759 0.000 0.272 0 0.728
#> SRR1662036 4 0.4304 0.749 0.000 0.284 0 0.716
#> SRR1662037 4 0.4277 0.753 0.000 0.280 0 0.720
#> SRR1662038 4 0.4382 0.735 0.000 0.296 0 0.704
#> SRR1662039 4 0.4304 0.749 0.000 0.284 0 0.716
#> SRR1662040 4 0.4250 0.756 0.000 0.276 0 0.724
#> SRR1662041 4 0.4103 0.770 0.000 0.256 0 0.744
#> SRR1662042 4 0.4331 0.745 0.000 0.288 0 0.712
#> SRR1662043 4 0.4277 0.752 0.000 0.280 0 0.720
#> SRR1662044 4 0.4222 0.759 0.000 0.272 0 0.728
#> SRR1662045 4 0.4222 0.759 0.000 0.272 0 0.728
#> SRR1662046 4 0.4250 0.756 0.000 0.276 0 0.724
#> SRR1662047 4 0.4164 0.765 0.000 0.264 0 0.736
#> SRR1662048 4 0.4193 0.762 0.000 0.268 0 0.732
#> SRR1662049 4 0.4500 0.708 0.000 0.316 0 0.684
#> SRR1662050 4 0.4331 0.745 0.000 0.288 0 0.712
#> SRR1662051 4 0.4356 0.740 0.000 0.292 0 0.708
#> SRR1662052 4 0.4304 0.749 0.000 0.284 0 0.716
#> SRR1662053 4 0.4477 0.714 0.000 0.312 0 0.688
#> SRR1662054 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662055 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662056 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662057 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662058 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662059 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662060 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662061 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662062 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662063 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662064 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662065 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662066 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662067 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662068 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662069 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662070 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662071 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662072 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662073 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662074 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662075 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662076 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662077 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662078 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662079 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662080 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662081 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662082 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662083 4 0.0592 0.874 0.000 0.016 0 0.984
#> SRR1662084 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662085 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662086 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662087 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662088 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662089 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662090 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662091 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662092 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662093 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662094 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662095 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662096 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662097 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662098 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662099 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662100 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662101 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662102 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662103 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662104 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662105 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662106 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662107 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662108 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662109 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662110 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662111 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662112 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662113 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662114 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662115 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662116 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
#> SRR1662117 1 0.0336 0.996 0.992 0.000 0 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661767 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661770 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661772 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661773 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661774 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661775 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661776 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661778 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661780 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661783 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661784 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661786 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661788 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661789 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661790 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661791 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661794 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661795 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661797 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661798 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661799 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661800 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661802 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661803 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661804 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661805 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661806 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661807 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661808 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661809 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661810 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661813 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661814 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661815 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661816 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661817 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661818 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661819 2 0.0000 0.998 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661820 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661821 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661822 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661823 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661824 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661825 2 0.0162 0.997 0.000 0.996 0 0.000 0.004
#> SRR1661826 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661827 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661828 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661829 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661830 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661831 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661832 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661833 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661834 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661835 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661836 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661837 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661838 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661839 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661840 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661841 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661843 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661844 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661845 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661846 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661847 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661848 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661849 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661850 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661851 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661852 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661853 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661854 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661855 1 0.2890 0.909 0.836 0.000 0 0.004 0.160
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661893 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661894 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661895 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661896 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661897 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661898 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661899 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661900 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661901 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661902 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661903 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661904 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661905 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661906 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661907 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661908 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661909 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661910 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661911 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661912 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661913 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661914 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661915 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661916 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661917 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661918 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661919 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661920 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661921 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661922 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661923 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661924 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661925 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661926 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661927 1 0.2848 0.909 0.840 0.000 0 0.004 0.156
#> SRR1661928 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661929 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661930 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661931 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661932 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661933 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661934 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661935 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661936 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661937 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661938 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661939 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661940 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661941 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661942 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661943 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661944 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661945 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661946 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661947 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661948 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661949 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661950 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661951 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661952 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661953 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661954 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661955 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661956 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661957 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661958 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661959 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661960 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661961 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661962 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661963 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661964 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661965 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661966 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661967 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661968 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661969 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661970 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661971 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661972 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661973 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661974 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661975 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661976 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661977 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661978 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661979 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661980 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661981 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661982 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661983 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661984 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661985 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661986 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661987 4 0.0162 0.985 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1661988 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661989 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661990 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661991 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661992 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661993 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661994 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661995 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661996 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661997 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661998 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1661999 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662000 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662001 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662002 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662003 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662004 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662005 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662006 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662007 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662008 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662009 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662010 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662011 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662012 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662013 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662014 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662015 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662016 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662017 1 0.0703 0.904 0.976 0.000 0 0.024 0.000
#> SRR1662018 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662019 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662020 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662021 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662022 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662023 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662024 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662025 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662026 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662027 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662028 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662029 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662030 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662031 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662032 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662033 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662034 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662035 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662036 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662037 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662038 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662039 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662040 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662041 5 0.3420 0.992 0.000 0.076 0 0.084 0.840
#> SRR1662042 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662043 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662044 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662045 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662046 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662047 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662048 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662049 5 0.3420 0.995 0.000 0.084 0 0.076 0.840
#> SRR1662050 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662051 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662052 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662053 5 0.3421 0.998 0.000 0.080 0 0.080 0.840
#> SRR1662054 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662055 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662056 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662057 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662058 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662059 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662060 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662061 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662062 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662063 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662064 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662065 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662066 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662067 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662068 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662069 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662070 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662071 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662072 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662073 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662074 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662075 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662076 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662077 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662078 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662079 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662080 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662081 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662082 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662083 4 0.0798 0.985 0.000 0.016 0 0.976 0.008
#> SRR1662084 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662085 1 0.1372 0.898 0.956 0.016 0 0.024 0.004
#> SRR1662086 1 0.1267 0.900 0.960 0.012 0 0.024 0.004
#> SRR1662087 1 0.1026 0.902 0.968 0.004 0 0.024 0.004
#> SRR1662088 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662089 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662090 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662091 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662092 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662093 1 0.1978 0.878 0.928 0.044 0 0.024 0.004
#> SRR1662094 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662095 1 0.1372 0.898 0.956 0.016 0 0.024 0.004
#> SRR1662096 1 0.1267 0.900 0.960 0.012 0 0.024 0.004
#> SRR1662097 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662098 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662099 1 0.1372 0.898 0.956 0.016 0 0.024 0.004
#> SRR1662100 1 0.1267 0.900 0.960 0.012 0 0.024 0.004
#> SRR1662101 1 0.1653 0.891 0.944 0.028 0 0.024 0.004
#> SRR1662102 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662103 1 0.1372 0.898 0.956 0.016 0 0.024 0.004
#> SRR1662104 1 0.1653 0.891 0.944 0.028 0 0.024 0.004
#> SRR1662105 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662106 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662107 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662108 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662109 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
#> SRR1662110 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662111 1 0.0771 0.904 0.976 0.000 0 0.020 0.004
#> SRR1662112 1 0.1653 0.892 0.944 0.028 0 0.024 0.004
#> SRR1662113 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662114 1 0.1901 0.882 0.932 0.040 0 0.024 0.004
#> SRR1662115 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662116 1 0.1564 0.894 0.948 0.024 0 0.024 0.004
#> SRR1662117 1 0.1471 0.897 0.952 0.020 0 0.024 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661717 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661718 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661719 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661720 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661721 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661722 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661723 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661724 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661725 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661726 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661727 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661728 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661729 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661730 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661731 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661732 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661733 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661734 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661735 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661736 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661737 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661738 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661739 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661740 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661741 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661742 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661743 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661744 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661745 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661746 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661747 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661748 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661749 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661750 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661751 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661752 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661753 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661754 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661755 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661756 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661757 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661758 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661759 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661760 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661761 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661762 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661763 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661764 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661766 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661767 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661768 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661769 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661770 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661771 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661772 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661773 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661774 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661775 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661776 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661777 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661778 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661779 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661780 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661781 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661782 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661783 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661784 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661785 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661786 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661787 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661788 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661789 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661790 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661791 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661792 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661793 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661794 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661795 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661796 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661797 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661798 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661799 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661800 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661801 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661802 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661803 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661804 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661805 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661806 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661807 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661808 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661809 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661810 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661811 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661812 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661813 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661814 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661815 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661816 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661817 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661818 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661819 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661820 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661821 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661822 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661823 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661824 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661825 2 0.0000 1.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0
#> SRR1661826 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661827 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661828 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661829 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661830 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661831 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661832 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661833 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661834 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661835 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661836 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661837 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661838 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661839 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661840 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661841 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661843 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661844 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661845 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661846 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661847 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661848 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661849 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661850 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661851 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661852 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661853 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661854 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661855 1 0.0547 0.983 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0
#> SRR1661856 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661857 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661858 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661859 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661860 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661861 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661862 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661863 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661864 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661865 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661866 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661867 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661868 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661869 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661870 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661871 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661872 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661873 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661874 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661875 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661876 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661877 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661878 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661879 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661880 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661881 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661882 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661883 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661884 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661885 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661886 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661887 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661888 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661889 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661890 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661891 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661892 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661893 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661894 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661895 1 0.0363 0.984 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661896 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661897 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661898 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661899 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661900 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661901 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661902 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661903 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661904 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661905 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661906 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661907 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661908 1 0.0363 0.984 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661909 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661910 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661911 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661912 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661913 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661914 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661915 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661916 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661917 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661918 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661919 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661920 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661921 1 0.0363 0.984 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661922 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661923 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661924 1 0.0363 0.984 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0
#> SRR1661925 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661926 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661927 1 0.0260 0.986 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0
#> SRR1661928 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661929 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661930 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661931 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661932 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661933 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661934 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661935 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661936 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661937 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661938 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661939 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661940 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661941 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661942 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661943 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661944 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661945 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661946 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661947 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661948 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661949 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661950 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661951 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661952 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661953 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661954 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661955 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661956 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661957 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1
#> SRR1661958 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661959 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661960 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661961 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661962 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661963 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661964 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661965 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661966 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661967 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661968 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661969 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661970 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661971 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661972 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661973 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661974 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661975 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661976 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661977 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661978 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661979 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661980 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661981 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661982 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661983 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661984 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661985 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661986 4 0.0146 0.995 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0
#> SRR1661987 4 0.0000 0.996 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0
#> SRR1661988 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661989 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661990 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661991 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661992 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661993 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661994 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661995 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661996 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661997 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661998 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1661999 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662000 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662001 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662002 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662003 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662004 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662005 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662006 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662007 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662008 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662009 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662010 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662011 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662012 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662013 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662014 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662015 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662016 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662017 5 0.0547 0.981 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0
#> SRR1662018 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662019 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662020 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662021 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662022 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662023 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662024 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662025 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662026 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662027 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662028 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662029 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662030 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662031 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662032 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662033 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662034 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662035 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662036 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662037 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662038 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662039 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662040 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662041 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662042 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662043 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662044 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662045 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662046 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662047 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662048 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662049 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662050 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662051 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662052 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662053 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0
#> SRR1662054 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662055 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662056 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662057 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662058 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662059 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662060 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662061 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662062 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662063 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662064 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662065 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662066 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662067 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662068 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662069 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662070 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662071 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662072 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662073 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662074 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662075 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662076 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662077 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662078 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662079 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662080 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662081 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662082 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662083 4 0.0146 0.997 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0
#> SRR1662084 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662085 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662086 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662087 5 0.0551 0.981 0.008 0.004 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662088 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662089 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662090 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662091 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662092 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662093 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662094 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662095 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662096 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662097 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662098 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662099 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662100 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662101 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662102 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662103 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662104 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662105 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662106 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662107 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662108 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662109 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662110 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662111 5 0.0508 0.978 0.012 0.000 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662112 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662113 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662114 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662115 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662116 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
#> SRR1662117 5 0.0551 0.983 0.004 0.008 0.000 0.004 0.984 0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.16505 0.836 0.836
#> 3 3 0.774 0.973 0.915 2.29043 0.626 0.552
#> 4 4 0.775 0.968 0.985 0.00533 0.997 0.994
#> 5 5 0.774 0.966 0.924 0.00300 0.998 0.997
#> 6 6 0.773 0.964 0.985 0.00295 0.998 0.997
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0 1 0 1
#> SRR1661717 2 0 1 0 1
#> SRR1661718 2 0 1 0 1
#> SRR1661719 2 0 1 0 1
#> SRR1661720 2 0 1 0 1
#> SRR1661721 2 0 1 0 1
#> SRR1661722 2 0 1 0 1
#> SRR1661723 2 0 1 0 1
#> SRR1661724 2 0 1 0 1
#> SRR1661725 2 0 1 0 1
#> SRR1661726 2 0 1 0 1
#> SRR1661727 2 0 1 0 1
#> SRR1661728 2 0 1 0 1
#> SRR1661729 2 0 1 0 1
#> SRR1661730 2 0 1 0 1
#> SRR1661731 2 0 1 0 1
#> SRR1661732 2 0 1 0 1
#> SRR1661733 2 0 1 0 1
#> SRR1661734 2 0 1 0 1
#> SRR1661735 2 0 1 0 1
#> SRR1661736 2 0 1 0 1
#> SRR1661737 2 0 1 0 1
#> SRR1661738 2 0 1 0 1
#> SRR1661739 2 0 1 0 1
#> SRR1661740 2 0 1 0 1
#> SRR1661741 2 0 1 0 1
#> SRR1661742 2 0 1 0 1
#> SRR1661743 2 0 1 0 1
#> SRR1661744 2 0 1 0 1
#> SRR1661745 2 0 1 0 1
#> SRR1661746 2 0 1 0 1
#> SRR1661747 2 0 1 0 1
#> SRR1661748 2 0 1 0 1
#> SRR1661749 2 0 1 0 1
#> SRR1661750 2 0 1 0 1
#> SRR1661751 2 0 1 0 1
#> SRR1661752 2 0 1 0 1
#> SRR1661753 2 0 1 0 1
#> SRR1661754 2 0 1 0 1
#> SRR1661755 2 0 1 0 1
#> SRR1661756 2 0 1 0 1
#> SRR1661757 2 0 1 0 1
#> SRR1661758 2 0 1 0 1
#> SRR1661759 2 0 1 0 1
#> SRR1661760 2 0 1 0 1
#> SRR1661761 2 0 1 0 1
#> SRR1661762 2 0 1 0 1
#> SRR1661763 2 0 1 0 1
#> SRR1661764 2 0 1 0 1
#> SRR1661766 2 0 1 0 1
#> SRR1661767 2 0 1 0 1
#> SRR1661768 2 0 1 0 1
#> SRR1661769 2 0 1 0 1
#> SRR1661770 2 0 1 0 1
#> SRR1661771 2 0 1 0 1
#> SRR1661772 2 0 1 0 1
#> SRR1661773 2 0 1 0 1
#> SRR1661774 2 0 1 0 1
#> SRR1661775 2 0 1 0 1
#> SRR1661776 2 0 1 0 1
#> SRR1661777 2 0 1 0 1
#> SRR1661778 2 0 1 0 1
#> SRR1661779 2 0 1 0 1
#> SRR1661780 2 0 1 0 1
#> SRR1661781 2 0 1 0 1
#> SRR1661782 2 0 1 0 1
#> SRR1661783 2 0 1 0 1
#> SRR1661784 2 0 1 0 1
#> SRR1661785 2 0 1 0 1
#> SRR1661786 2 0 1 0 1
#> SRR1661787 2 0 1 0 1
#> SRR1661788 2 0 1 0 1
#> SRR1661789 2 0 1 0 1
#> SRR1661790 2 0 1 0 1
#> SRR1661791 2 0 1 0 1
#> SRR1661792 2 0 1 0 1
#> SRR1661793 2 0 1 0 1
#> SRR1661794 2 0 1 0 1
#> SRR1661795 2 0 1 0 1
#> SRR1661796 2 0 1 0 1
#> SRR1661797 2 0 1 0 1
#> SRR1661798 2 0 1 0 1
#> SRR1661799 2 0 1 0 1
#> SRR1661800 2 0 1 0 1
#> SRR1661801 2 0 1 0 1
#> SRR1661802 2 0 1 0 1
#> SRR1661803 2 0 1 0 1
#> SRR1661804 2 0 1 0 1
#> SRR1661805 2 0 1 0 1
#> SRR1661806 2 0 1 0 1
#> SRR1661807 2 0 1 0 1
#> SRR1661808 2 0 1 0 1
#> SRR1661809 2 0 1 0 1
#> SRR1661810 2 0 1 0 1
#> SRR1661811 2 0 1 0 1
#> SRR1661812 2 0 1 0 1
#> SRR1661813 2 0 1 0 1
#> SRR1661814 2 0 1 0 1
#> SRR1661815 2 0 1 0 1
#> SRR1661816 2 0 1 0 1
#> SRR1661817 2 0 1 0 1
#> SRR1661818 2 0 1 0 1
#> SRR1661819 2 0 1 0 1
#> SRR1661820 2 0 1 0 1
#> SRR1661821 2 0 1 0 1
#> SRR1661822 2 0 1 0 1
#> SRR1661823 2 0 1 0 1
#> SRR1661824 2 0 1 0 1
#> SRR1661825 2 0 1 0 1
#> SRR1661826 2 0 1 0 1
#> SRR1661827 2 0 1 0 1
#> SRR1661828 2 0 1 0 1
#> SRR1661829 2 0 1 0 1
#> SRR1661830 2 0 1 0 1
#> SRR1661831 2 0 1 0 1
#> SRR1661832 2 0 1 0 1
#> SRR1661833 2 0 1 0 1
#> SRR1661834 2 0 1 0 1
#> SRR1661835 2 0 1 0 1
#> SRR1661836 2 0 1 0 1
#> SRR1661837 2 0 1 0 1
#> SRR1661838 2 0 1 0 1
#> SRR1661839 2 0 1 0 1
#> SRR1661840 2 0 1 0 1
#> SRR1661841 2 0 1 0 1
#> SRR1661843 2 0 1 0 1
#> SRR1661844 2 0 1 0 1
#> SRR1661845 2 0 1 0 1
#> SRR1661846 2 0 1 0 1
#> SRR1661847 2 0 1 0 1
#> SRR1661848 2 0 1 0 1
#> SRR1661849 2 0 1 0 1
#> SRR1661850 2 0 1 0 1
#> SRR1661851 2 0 1 0 1
#> SRR1661852 2 0 1 0 1
#> SRR1661853 2 0 1 0 1
#> SRR1661854 2 0 1 0 1
#> SRR1661855 2 0 1 0 1
#> SRR1661856 1 0 1 1 0
#> SRR1661857 1 0 1 1 0
#> SRR1661858 1 0 1 1 0
#> SRR1661859 1 0 1 1 0
#> SRR1661860 1 0 1 1 0
#> SRR1661861 1 0 1 1 0
#> SRR1661862 1 0 1 1 0
#> SRR1661863 1 0 1 1 0
#> SRR1661864 1 0 1 1 0
#> SRR1661865 1 0 1 1 0
#> SRR1661866 1 0 1 1 0
#> SRR1661867 1 0 1 1 0
#> SRR1661868 1 0 1 1 0
#> SRR1661869 1 0 1 1 0
#> SRR1661870 1 0 1 1 0
#> SRR1661871 1 0 1 1 0
#> SRR1661872 1 0 1 1 0
#> SRR1661873 1 0 1 1 0
#> SRR1661874 1 0 1 1 0
#> SRR1661875 1 0 1 1 0
#> SRR1661876 1 0 1 1 0
#> SRR1661877 1 0 1 1 0
#> SRR1661878 1 0 1 1 0
#> SRR1661879 1 0 1 1 0
#> SRR1661880 1 0 1 1 0
#> SRR1661881 1 0 1 1 0
#> SRR1661882 1 0 1 1 0
#> SRR1661883 1 0 1 1 0
#> SRR1661884 1 0 1 1 0
#> SRR1661885 1 0 1 1 0
#> SRR1661886 1 0 1 1 0
#> SRR1661887 1 0 1 1 0
#> SRR1661888 1 0 1 1 0
#> SRR1661889 1 0 1 1 0
#> SRR1661890 1 0 1 1 0
#> SRR1661891 1 0 1 1 0
#> SRR1661892 2 0 1 0 1
#> SRR1661893 2 0 1 0 1
#> SRR1661894 2 0 1 0 1
#> SRR1661895 2 0 1 0 1
#> SRR1661896 2 0 1 0 1
#> SRR1661897 2 0 1 0 1
#> SRR1661898 2 0 1 0 1
#> SRR1661899 2 0 1 0 1
#> SRR1661900 2 0 1 0 1
#> SRR1661901 2 0 1 0 1
#> SRR1661902 2 0 1 0 1
#> SRR1661903 2 0 1 0 1
#> SRR1661904 2 0 1 0 1
#> SRR1661905 2 0 1 0 1
#> SRR1661906 2 0 1 0 1
#> SRR1661907 2 0 1 0 1
#> SRR1661908 2 0 1 0 1
#> SRR1661909 2 0 1 0 1
#> SRR1661910 2 0 1 0 1
#> SRR1661911 2 0 1 0 1
#> SRR1661912 2 0 1 0 1
#> SRR1661913 2 0 1 0 1
#> SRR1661914 2 0 1 0 1
#> SRR1661915 2 0 1 0 1
#> SRR1661916 2 0 1 0 1
#> SRR1661917 2 0 1 0 1
#> SRR1661918 2 0 1 0 1
#> SRR1661919 2 0 1 0 1
#> SRR1661920 2 0 1 0 1
#> SRR1661921 2 0 1 0 1
#> SRR1661922 2 0 1 0 1
#> SRR1661923 2 0 1 0 1
#> SRR1661924 2 0 1 0 1
#> SRR1661925 2 0 1 0 1
#> SRR1661926 2 0 1 0 1
#> SRR1661927 2 0 1 0 1
#> SRR1661928 2 0 1 0 1
#> SRR1661929 2 0 1 0 1
#> SRR1661930 2 0 1 0 1
#> SRR1661931 2 0 1 0 1
#> SRR1661932 2 0 1 0 1
#> SRR1661933 2 0 1 0 1
#> SRR1661934 2 0 1 0 1
#> SRR1661935 2 0 1 0 1
#> SRR1661936 2 0 1 0 1
#> SRR1661937 2 0 1 0 1
#> SRR1661938 2 0 1 0 1
#> SRR1661939 2 0 1 0 1
#> SRR1661940 2 0 1 0 1
#> SRR1661941 2 0 1 0 1
#> SRR1661942 2 0 1 0 1
#> SRR1661943 2 0 1 0 1
#> SRR1661944 2 0 1 0 1
#> SRR1661945 2 0 1 0 1
#> SRR1661946 2 0 1 0 1
#> SRR1661947 2 0 1 0 1
#> SRR1661948 2 0 1 0 1
#> SRR1661949 2 0 1 0 1
#> SRR1661950 2 0 1 0 1
#> SRR1661951 2 0 1 0 1
#> SRR1661952 2 0 1 0 1
#> SRR1661953 2 0 1 0 1
#> SRR1661954 2 0 1 0 1
#> SRR1661955 2 0 1 0 1
#> SRR1661956 2 0 1 0 1
#> SRR1661957 2 0 1 0 1
#> SRR1661958 2 0 1 0 1
#> SRR1661959 2 0 1 0 1
#> SRR1661960 2 0 1 0 1
#> SRR1661961 2 0 1 0 1
#> SRR1661962 2 0 1 0 1
#> SRR1661963 2 0 1 0 1
#> SRR1661964 2 0 1 0 1
#> SRR1661965 2 0 1 0 1
#> SRR1661966 2 0 1 0 1
#> SRR1661967 2 0 1 0 1
#> SRR1661968 2 0 1 0 1
#> SRR1661969 2 0 1 0 1
#> SRR1661970 2 0 1 0 1
#> SRR1661971 2 0 1 0 1
#> SRR1661972 2 0 1 0 1
#> SRR1661973 2 0 1 0 1
#> SRR1661974 2 0 1 0 1
#> SRR1661975 2 0 1 0 1
#> SRR1661976 2 0 1 0 1
#> SRR1661977 2 0 1 0 1
#> SRR1661978 2 0 1 0 1
#> SRR1661979 2 0 1 0 1
#> SRR1661980 2 0 1 0 1
#> SRR1661981 2 0 1 0 1
#> SRR1661982 2 0 1 0 1
#> SRR1661983 2 0 1 0 1
#> SRR1661984 2 0 1 0 1
#> SRR1661985 2 0 1 0 1
#> SRR1661986 2 0 1 0 1
#> SRR1661987 2 0 1 0 1
#> SRR1661988 2 0 1 0 1
#> SRR1661989 2 0 1 0 1
#> SRR1661990 2 0 1 0 1
#> SRR1661991 2 0 1 0 1
#> SRR1661992 2 0 1 0 1
#> SRR1661993 2 0 1 0 1
#> SRR1661994 2 0 1 0 1
#> SRR1661995 2 0 1 0 1
#> SRR1661996 2 0 1 0 1
#> SRR1661997 2 0 1 0 1
#> SRR1661998 2 0 1 0 1
#> SRR1661999 2 0 1 0 1
#> SRR1662000 2 0 1 0 1
#> SRR1662001 2 0 1 0 1
#> SRR1662002 2 0 1 0 1
#> SRR1662003 2 0 1 0 1
#> SRR1662004 2 0 1 0 1
#> SRR1662005 2 0 1 0 1
#> SRR1662006 2 0 1 0 1
#> SRR1662007 2 0 1 0 1
#> SRR1662008 2 0 1 0 1
#> SRR1662009 2 0 1 0 1
#> SRR1662010 2 0 1 0 1
#> SRR1662011 2 0 1 0 1
#> SRR1662012 2 0 1 0 1
#> SRR1662013 2 0 1 0 1
#> SRR1662014 2 0 1 0 1
#> SRR1662015 2 0 1 0 1
#> SRR1662016 2 0 1 0 1
#> SRR1662017 2 0 1 0 1
#> SRR1662018 2 0 1 0 1
#> SRR1662019 2 0 1 0 1
#> SRR1662020 2 0 1 0 1
#> SRR1662021 2 0 1 0 1
#> SRR1662022 2 0 1 0 1
#> SRR1662023 2 0 1 0 1
#> SRR1662024 2 0 1 0 1
#> SRR1662025 2 0 1 0 1
#> SRR1662026 2 0 1 0 1
#> SRR1662027 2 0 1 0 1
#> SRR1662028 2 0 1 0 1
#> SRR1662029 2 0 1 0 1
#> SRR1662030 2 0 1 0 1
#> SRR1662031 2 0 1 0 1
#> SRR1662032 2 0 1 0 1
#> SRR1662033 2 0 1 0 1
#> SRR1662034 2 0 1 0 1
#> SRR1662035 2 0 1 0 1
#> SRR1662036 2 0 1 0 1
#> SRR1662037 2 0 1 0 1
#> SRR1662038 2 0 1 0 1
#> SRR1662039 2 0 1 0 1
#> SRR1662040 2 0 1 0 1
#> SRR1662041 2 0 1 0 1
#> SRR1662042 2 0 1 0 1
#> SRR1662043 2 0 1 0 1
#> SRR1662044 2 0 1 0 1
#> SRR1662045 2 0 1 0 1
#> SRR1662046 2 0 1 0 1
#> SRR1662047 2 0 1 0 1
#> SRR1662048 2 0 1 0 1
#> SRR1662049 2 0 1 0 1
#> SRR1662050 2 0 1 0 1
#> SRR1662051 2 0 1 0 1
#> SRR1662052 2 0 1 0 1
#> SRR1662053 2 0 1 0 1
#> SRR1662054 2 0 1 0 1
#> SRR1662055 2 0 1 0 1
#> SRR1662056 2 0 1 0 1
#> SRR1662057 2 0 1 0 1
#> SRR1662058 2 0 1 0 1
#> SRR1662059 2 0 1 0 1
#> SRR1662060 2 0 1 0 1
#> SRR1662061 2 0 1 0 1
#> SRR1662062 2 0 1 0 1
#> SRR1662063 2 0 1 0 1
#> SRR1662064 2 0 1 0 1
#> SRR1662065 2 0 1 0 1
#> SRR1662066 2 0 1 0 1
#> SRR1662067 2 0 1 0 1
#> SRR1662068 2 0 1 0 1
#> SRR1662069 2 0 1 0 1
#> SRR1662070 2 0 1 0 1
#> SRR1662071 2 0 1 0 1
#> SRR1662072 2 0 1 0 1
#> SRR1662073 2 0 1 0 1
#> SRR1662074 2 0 1 0 1
#> SRR1662075 2 0 1 0 1
#> SRR1662076 2 0 1 0 1
#> SRR1662077 2 0 1 0 1
#> SRR1662078 2 0 1 0 1
#> SRR1662079 2 0 1 0 1
#> SRR1662080 2 0 1 0 1
#> SRR1662081 2 0 1 0 1
#> SRR1662082 2 0 1 0 1
#> SRR1662083 2 0 1 0 1
#> SRR1662084 2 0 1 0 1
#> SRR1662085 2 0 1 0 1
#> SRR1662086 2 0 1 0 1
#> SRR1662087 2 0 1 0 1
#> SRR1662088 2 0 1 0 1
#> SRR1662089 2 0 1 0 1
#> SRR1662090 2 0 1 0 1
#> SRR1662091 2 0 1 0 1
#> SRR1662092 2 0 1 0 1
#> SRR1662093 2 0 1 0 1
#> SRR1662094 2 0 1 0 1
#> SRR1662095 2 0 1 0 1
#> SRR1662096 2 0 1 0 1
#> SRR1662097 2 0 1 0 1
#> SRR1662098 2 0 1 0 1
#> SRR1662099 2 0 1 0 1
#> SRR1662100 2 0 1 0 1
#> SRR1662101 2 0 1 0 1
#> SRR1662102 2 0 1 0 1
#> SRR1662103 2 0 1 0 1
#> SRR1662104 2 0 1 0 1
#> SRR1662105 2 0 1 0 1
#> SRR1662106 2 0 1 0 1
#> SRR1662107 2 0 1 0 1
#> SRR1662108 2 0 1 0 1
#> SRR1662109 2 0 1 0 1
#> SRR1662110 2 0 1 0 1
#> SRR1662111 2 0 1 0 1
#> SRR1662112 2 0 1 0 1
#> SRR1662113 2 0 1 0 1
#> SRR1662114 2 0 1 0 1
#> SRR1662115 2 0 1 0 1
#> SRR1662116 2 0 1 0 1
#> SRR1662117 2 0 1 0 1
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661717 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661718 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661719 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661720 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661721 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661722 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661723 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661724 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661725 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661726 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661727 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661728 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661729 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661730 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661731 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661732 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661733 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661734 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661735 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661736 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661737 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661738 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661739 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661740 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661741 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661742 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661743 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661744 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661745 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661746 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661747 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661748 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661749 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661750 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661751 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661752 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661753 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661754 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661755 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661756 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661757 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661758 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661759 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661760 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661761 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661762 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661763 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661764 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661766 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661767 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661768 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661769 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661770 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661771 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661772 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661773 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661774 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661775 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661776 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661777 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661778 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661779 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661780 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661781 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661782 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661783 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661784 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661785 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661786 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661787 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661788 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661789 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661790 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661791 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661792 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661793 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661794 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661795 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661796 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661797 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661798 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661799 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661800 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661801 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661802 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661803 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661804 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661805 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661806 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661807 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661808 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661809 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661810 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661811 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661812 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661813 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661814 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661815 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661816 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661817 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661818 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661819 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661820 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661821 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661822 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661823 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661824 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661825 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661915 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661928 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661929 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661930 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661931 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661932 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661933 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661934 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661935 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661936 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661937 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661938 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661939 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661940 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661941 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661942 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661943 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661944 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661945 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661946 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661947 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661948 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661949 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661950 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661951 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661952 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661953 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661954 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661955 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661956 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661957 2 0.296 0.907 0.1 0.9 0
#> SRR1661958 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661959 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661960 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661961 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661962 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661963 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661964 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661965 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661966 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661967 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661968 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661969 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661970 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661971 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661972 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661973 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661974 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661975 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661976 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661977 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661978 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661979 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661980 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661981 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661982 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661983 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661984 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661985 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661986 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661987 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1661988 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661989 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661990 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661991 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661992 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661993 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661994 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661995 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661996 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661997 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661998 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1661999 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662000 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662001 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662002 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662003 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662004 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662005 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662006 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662007 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662008 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662009 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662010 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662011 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662012 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662013 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662014 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662015 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662016 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662017 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662018 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662019 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662020 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662021 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662022 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662023 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662024 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662025 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662026 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662027 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662028 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662029 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662030 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662031 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662032 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662033 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662034 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662035 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662036 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662037 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662038 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662039 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662040 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662041 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662042 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662043 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662044 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662045 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662046 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662047 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662048 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662049 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662050 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662051 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662052 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662053 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662054 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662055 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662056 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662057 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662058 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662059 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662060 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662061 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662062 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662063 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662064 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662065 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662066 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662067 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662068 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662069 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662070 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662071 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662072 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662073 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662074 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662075 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662076 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662077 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662078 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662079 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662080 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662081 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662082 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662083 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0
#> SRR1662084 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662085 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662086 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662087 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662088 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662089 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662090 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662091 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662092 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662093 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662094 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662095 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662096 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662097 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662098 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662099 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662100 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662101 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662102 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662103 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662104 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662105 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662106 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662107 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662108 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662109 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662110 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662111 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662112 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662113 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662114 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662115 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662116 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
#> SRR1662117 2 0.000 0.971 0.0 1.0 0
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661736 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661737 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661738 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661739 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661740 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661741 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661742 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661743 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661744 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661745 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661746 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661747 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661748 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661749 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661750 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661751 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661752 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661753 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661754 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661755 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661756 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661757 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661758 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661759 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661760 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661761 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661762 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661763 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661764 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661915 1 0.0469 0.988 0.988 0.000 0 0.012
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661928 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661929 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661930 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661931 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661932 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661933 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661934 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661935 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661936 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661937 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661938 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661939 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661940 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661941 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661942 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661943 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661944 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661945 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661946 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661947 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661948 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661949 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661950 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661951 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661952 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661953 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661954 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661955 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661956 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661957 2 0.2345 0.899 0.100 0.900 0 0.000
#> SRR1661958 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661959 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661960 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661961 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661962 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661963 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661964 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661965 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661966 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661967 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661968 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661969 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661970 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661971 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661972 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661973 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661974 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661975 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661976 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661977 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661978 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661979 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661980 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661981 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661982 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661983 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661984 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661985 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661986 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661987 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661988 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661989 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661990 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661991 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661992 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661993 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661994 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661995 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661996 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661997 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661998 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661999 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662000 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662001 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662002 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662003 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662004 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662005 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662006 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662007 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662008 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662009 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662010 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662011 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662012 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662013 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662014 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662015 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662016 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662017 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662018 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662019 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662020 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662021 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662022 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662023 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662024 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662025 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662026 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662027 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662028 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662029 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662030 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662031 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662032 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662033 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662034 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662035 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662036 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662037 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662038 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662039 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662040 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662041 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662042 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662043 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662044 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662045 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662046 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662047 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662048 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662049 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662050 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662051 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662052 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662053 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662054 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662055 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662056 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662057 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662058 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662059 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662060 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662061 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662062 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662063 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662064 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662065 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662066 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662067 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662068 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662069 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662070 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662071 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662072 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662073 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662074 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662075 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662076 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662077 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662078 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662079 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662080 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662081 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662082 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662083 1 0.0000 1.000 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1662084 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662085 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662086 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662087 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662088 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662089 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662090 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662091 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662092 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662093 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662094 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662095 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662096 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662097 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662098 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662099 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662100 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662101 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662102 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662103 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662104 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662105 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662106 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662107 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662108 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662109 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662110 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662111 4 0.0469 0.000 0.000 0.012 0 0.988
#> SRR1662112 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662113 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662114 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662115 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662116 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662117 2 0.0000 0.968 0.000 1.000 0 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661717 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661718 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661719 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661720 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661721 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661722 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661723 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661724 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661725 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661726 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661727 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661728 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661729 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661730 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661731 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661732 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661733 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661734 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661735 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661736 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661737 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661738 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661739 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661740 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661741 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661742 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661743 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661744 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661745 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661746 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661747 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661748 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661749 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661750 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661751 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661752 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661753 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661754 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661755 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661756 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661757 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661758 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661759 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661760 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661761 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661762 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661763 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661764 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661766 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661767 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661768 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661769 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661770 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661771 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661772 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661773 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661774 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661775 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661776 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661777 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661778 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661779 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661780 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661781 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661782 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661783 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661784 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661785 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661786 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661787 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661788 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661789 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661790 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661791 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661792 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661793 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661794 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661795 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661796 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661797 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661798 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661799 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661800 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661801 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661802 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661803 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661804 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661805 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661806 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661807 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661808 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661809 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661810 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661811 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661812 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661813 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661814 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661815 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661816 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661817 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661818 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661819 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661820 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661821 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661822 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661823 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661824 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661825 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661856 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661857 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661858 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661859 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661860 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661861 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661862 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661863 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661864 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661865 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661866 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661867 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661868 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661869 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661870 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661871 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661872 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661873 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661874 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661875 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661876 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661877 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661878 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661879 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661880 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661881 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661882 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661883 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661884 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661885 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661886 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661887 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661888 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661889 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661890 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661891 3 0.000 1.000 0.0 0.0 1 0 0
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661915 4 0.000 0.000 0.0 0.0 0 1 0
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661928 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661929 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661930 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661931 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661932 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661933 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661934 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661935 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661936 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661937 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661938 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661939 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661940 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661941 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661942 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661943 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661944 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661945 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661946 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661947 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661948 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661949 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661950 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661951 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661952 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661953 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661954 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661955 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661956 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661957 2 0.202 0.900 0.1 0.9 0 0 0
#> SRR1661958 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661959 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661960 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661961 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661962 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661963 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661964 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661965 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661966 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661967 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661968 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661969 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661970 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661971 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661972 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661973 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661974 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661975 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661976 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661977 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661978 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661979 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661980 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661981 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661982 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661983 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661984 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661985 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661986 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661987 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1661988 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661989 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661990 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661991 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661992 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661993 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661994 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661995 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661996 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661997 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661998 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1661999 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662000 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662001 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662002 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662003 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662004 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662005 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662006 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662007 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662008 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662009 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662010 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662011 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662012 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662013 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662014 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662015 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662016 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662017 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662018 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662019 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662020 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662021 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662022 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662023 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662024 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662025 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662026 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662027 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662028 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662029 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662030 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662031 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662032 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662033 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662034 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662035 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662036 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662037 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662038 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662039 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662040 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662041 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662042 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662043 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662044 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662045 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662046 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662047 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662048 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662049 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662050 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662051 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662052 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662053 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662054 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662055 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662056 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662057 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662058 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662059 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662060 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662061 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662062 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662063 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662064 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662065 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662066 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662067 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662068 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662069 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662070 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662071 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662072 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662073 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662074 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662075 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662076 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662077 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662078 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662079 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662080 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662081 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662082 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662083 1 0.000 1.000 1.0 0.0 0 0 0
#> SRR1662084 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662085 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662086 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662087 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662088 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662089 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662090 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662091 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662092 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662093 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662094 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662095 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662096 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662097 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662098 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662099 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662100 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662101 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662102 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662103 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662104 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662105 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662106 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662107 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662108 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662109 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662110 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662111 5 0.000 0.000 0.0 0.0 0 0 1
#> SRR1662112 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662113 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662114 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662115 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662116 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
#> SRR1662117 2 0.000 0.969 0.0 1.0 0 0 0
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661736 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661737 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661738 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661739 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661740 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661741 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661742 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661743 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661744 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661745 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661746 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661747 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661748 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661749 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661750 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661751 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661752 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661753 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661754 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661755 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661756 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661757 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661758 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661759 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661760 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661761 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661762 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661763 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661764 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.0 1 0 0 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661908 6 0.0865 0.000 0.036 0.0 0 0 0 0.964
#> SRR1661909 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661915 4 0.0000 0.000 0.000 0.0 0 1 0 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661921 1 0.0865 0.961 0.964 0.0 0 0 0 0.036
#> SRR1661922 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661928 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661929 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661930 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661931 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661932 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661933 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661934 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661935 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661936 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661937 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661938 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661939 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661940 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661941 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661942 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661943 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661944 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661945 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661946 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661947 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661948 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661949 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661950 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661951 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661952 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661953 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661954 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661955 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661956 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661957 2 0.1814 0.900 0.100 0.9 0 0 0 0.000
#> SRR1661958 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661959 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661960 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661961 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661962 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661963 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661964 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661965 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661966 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661967 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661968 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661969 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661970 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661971 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661972 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661973 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661974 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661975 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661976 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661977 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661978 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661979 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661980 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661981 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661982 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661983 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661984 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661985 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661986 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661987 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661988 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661989 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661990 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661991 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661992 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661993 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661994 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661995 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661996 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661997 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661998 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1661999 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662000 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662001 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662002 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662003 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662004 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662005 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662006 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662007 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662008 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662009 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662010 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662011 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662012 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662013 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662014 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662015 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662016 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662017 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662018 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662019 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662020 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662021 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662022 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662023 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662024 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662025 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662026 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662027 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662028 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662029 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662030 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662031 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662032 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662033 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662034 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662035 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662036 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662037 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662038 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662039 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662040 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662041 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662042 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662043 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662044 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662045 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662046 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662047 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662048 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662049 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662050 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662051 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662052 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662053 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662054 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662055 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662056 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662057 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662058 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662059 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662060 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662061 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662062 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662063 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662064 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662065 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662066 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662067 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662068 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662069 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662070 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662071 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662072 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662073 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662074 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662075 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662076 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662077 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662078 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662079 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662080 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662081 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662082 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662083 1 0.0000 1.000 1.000 0.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662084 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662085 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662086 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662087 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662088 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662089 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662090 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662091 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662092 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662093 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662094 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662095 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662096 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662097 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662098 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662099 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662100 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662101 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662102 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662103 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662104 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662105 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662106 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662107 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662108 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662109 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662110 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662111 5 0.0000 0.000 0.000 0.0 0 0 1 0.000
#> SRR1662112 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662113 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662114 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662115 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662116 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
#> SRR1662117 2 0.0000 0.969 0.000 1.0 0 0 0 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.466 0.914 0.898 0.4263 0.500 0.500
#> 3 3 0.508 0.787 0.837 0.3794 0.926 0.852
#> 4 4 0.549 0.618 0.665 0.1544 0.862 0.680
#> 5 5 0.548 0.449 0.681 0.0769 0.999 0.996
#> 6 6 0.567 0.592 0.567 0.0577 0.835 0.499
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661827 1 0.850 0.856 0.724 0.276
#> SRR1661828 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661829 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661830 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661831 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661832 1 0.850 0.856 0.724 0.276
#> SRR1661833 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661834 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661835 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661836 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661837 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661838 1 0.850 0.856 0.724 0.276
#> SRR1661839 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661840 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661841 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661843 1 0.850 0.856 0.724 0.276
#> SRR1661844 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661845 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661846 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661847 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661848 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661849 1 0.850 0.856 0.724 0.276
#> SRR1661850 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661851 1 0.850 0.856 0.724 0.276
#> SRR1661852 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661853 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661854 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661855 1 0.855 0.853 0.720 0.280
#> SRR1661856 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.000 0.767 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661893 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661894 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661895 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661896 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661897 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661898 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661899 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661900 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661901 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661902 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661903 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661904 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661905 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661906 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661907 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661908 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661909 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661910 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661911 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661912 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661913 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661914 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661915 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661916 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661917 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661918 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661919 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661920 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661921 1 0.738 0.873 0.792 0.208
#> SRR1661922 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661923 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661924 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661925 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661926 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661927 1 0.827 0.865 0.740 0.260
#> SRR1661928 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661929 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661930 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661931 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661932 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661933 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661934 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661935 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661936 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661937 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661938 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661939 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661940 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661941 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661942 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661943 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661944 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661945 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661946 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661947 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661948 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661949 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661950 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661951 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661952 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661953 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661954 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661955 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661956 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661957 1 0.978 0.692 0.588 0.412
#> SRR1661958 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661959 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661960 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661961 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661962 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661963 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661964 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661965 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661966 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661967 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661968 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661969 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661970 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661971 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661972 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661973 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661974 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661975 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661976 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661977 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661978 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661979 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661980 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661981 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661982 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661983 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661984 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661985 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661986 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661987 1 0.722 0.874 0.800 0.200
#> SRR1661988 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661989 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661990 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661991 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661992 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661993 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661994 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661995 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661996 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661997 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661998 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1661999 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662000 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662001 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662002 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662003 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662004 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662005 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662006 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662007 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662008 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662009 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662010 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662011 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662012 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662013 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662014 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662015 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662016 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662017 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662018 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662054 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662055 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662056 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662057 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662058 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662059 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662060 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662061 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662062 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662063 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662064 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662065 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662066 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662067 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662068 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662069 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662070 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662071 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662072 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662073 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662074 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662075 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662076 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662077 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662078 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662079 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662080 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662081 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662082 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662083 1 0.653 0.866 0.832 0.168
#> SRR1662084 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662085 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662086 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662087 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662088 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662089 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662090 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662091 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662092 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662093 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662094 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662095 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662096 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662097 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662098 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662099 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662100 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662101 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662102 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662103 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662104 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662105 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662106 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662107 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662108 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662109 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662110 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662111 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662112 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662113 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662114 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662115 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662116 2 0.000 1.000 0.000 1.000
#> SRR1662117 2 0.000 1.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661717 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661718 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661719 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661720 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661721 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661722 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661723 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661724 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661725 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661726 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661727 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661728 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661729 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661730 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661731 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661732 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661733 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661734 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661735 2 0.1643 0.868 0.000 0.956 0.044
#> SRR1661736 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661737 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661738 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661739 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661740 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661741 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661742 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661743 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661744 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661745 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661746 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661747 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661748 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661749 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661750 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661751 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661752 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661753 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661754 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661755 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661756 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661757 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661758 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661759 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661760 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661761 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661762 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661763 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661764 2 0.7640 0.678 0.240 0.664 0.096
#> SRR1661766 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661767 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661768 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661769 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661770 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661771 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661772 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661773 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661774 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661775 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661776 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661777 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661778 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661779 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661780 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661781 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661782 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661783 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661784 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661785 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661786 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661787 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661788 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661789 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661790 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661791 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661792 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661793 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661794 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661795 2 0.0747 0.871 0.000 0.984 0.016
#> SRR1661796 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661797 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661798 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661799 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661800 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661801 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661802 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661803 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661804 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661805 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661806 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661807 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661808 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661809 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661810 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661811 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661812 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661813 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661814 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661815 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661816 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661817 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661818 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661819 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661820 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661821 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661822 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661823 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661824 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661825 2 0.2749 0.868 0.012 0.924 0.064
#> SRR1661826 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661827 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661828 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661829 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661830 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661831 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661832 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661833 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661834 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661835 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661836 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661837 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661838 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661839 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661840 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661841 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661843 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661844 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661845 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661846 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661847 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661848 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661849 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661850 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661851 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661852 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661853 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661854 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661855 1 0.1267 0.768 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661856 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661857 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661858 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661859 3 0.5678 0.997 0.316 0.000 0.684
#> SRR1661860 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661861 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661862 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661863 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661864 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661865 3 0.5650 0.996 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661866 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661867 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661868 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661869 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661870 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661871 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661872 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661873 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661874 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661875 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661876 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661877 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661878 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661879 3 0.5678 0.994 0.316 0.000 0.684
#> SRR1661880 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661881 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661882 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661883 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661884 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661885 3 0.5678 0.997 0.316 0.000 0.684
#> SRR1661886 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661887 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661888 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661889 3 0.5650 0.998 0.312 0.000 0.688
#> SRR1661890 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661891 3 0.5621 0.998 0.308 0.000 0.692
#> SRR1661892 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661893 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661894 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661895 1 0.0592 0.764 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661896 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661897 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661898 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661899 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661900 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661901 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661902 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661903 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661904 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661905 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661906 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661907 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661908 1 0.0592 0.764 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661909 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661910 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661911 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661912 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661913 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661914 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661915 1 0.1337 0.756 0.972 0.012 0.016
#> SRR1661916 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661917 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661918 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661919 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661920 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661921 1 0.0592 0.764 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661922 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661923 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661924 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661925 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661926 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661927 1 0.0892 0.769 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661928 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661929 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661930 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661931 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661932 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661933 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661934 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661935 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661936 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661937 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661938 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661939 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661940 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661941 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661942 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661943 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661944 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661945 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661946 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661947 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661948 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661949 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661950 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661951 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661952 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661953 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661954 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661955 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661956 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661957 1 0.7107 0.554 0.712 0.196 0.092
#> SRR1661958 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661959 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661960 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661961 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661962 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661963 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661964 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661965 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661966 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661967 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661968 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661969 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661970 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661971 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661972 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661973 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661974 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661975 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661976 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661977 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661978 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661979 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661980 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661981 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661982 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661983 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661984 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661985 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661986 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661987 1 0.5020 0.668 0.796 0.012 0.192
#> SRR1661988 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661989 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661990 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661991 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661992 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661993 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661994 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661995 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661996 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661997 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661998 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1661999 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662000 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662001 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662002 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662003 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662004 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662005 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662006 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662007 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662008 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662009 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662010 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662011 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662012 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662013 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662014 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662015 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662016 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662017 2 0.5237 0.849 0.056 0.824 0.120
#> SRR1662018 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662019 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662020 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662021 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662022 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662023 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662024 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662025 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662026 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662027 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662028 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662029 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662030 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662031 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662032 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662033 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662034 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662035 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662036 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662037 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662038 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662039 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662040 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662041 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662042 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662043 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662044 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662045 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662046 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662047 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662048 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662049 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662050 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662051 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662052 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662053 2 0.4838 0.851 0.076 0.848 0.076
#> SRR1662054 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662055 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662056 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662057 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662058 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662059 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662060 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662061 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662062 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662063 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662064 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662065 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662066 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662067 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662068 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662069 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662070 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662071 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662072 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662073 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662074 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662075 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662076 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662077 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662078 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662079 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662080 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662081 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662082 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662083 1 0.4749 0.674 0.816 0.012 0.172
#> SRR1662084 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662085 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662086 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662087 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662088 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662089 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662090 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662091 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662092 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662093 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662094 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662095 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662096 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662097 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662098 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662099 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662100 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662101 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662102 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662103 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662104 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662105 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662106 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662107 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662108 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662109 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662110 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662111 1 0.9485 -0.196 0.428 0.388 0.184
#> SRR1662112 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662113 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662114 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662115 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662116 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
#> SRR1662117 2 0.4002 0.818 0.000 0.840 0.160
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661717 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661718 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661719 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661720 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661721 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661722 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661723 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661724 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661725 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661726 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661727 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661728 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661729 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661730 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661731 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661732 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661733 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661734 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661735 1 0.483 0.718 0.716 0.264 0.020 0.000
#> SRR1661736 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661737 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661738 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661739 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661740 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661741 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661742 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661743 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661744 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661745 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661746 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661747 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661748 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661749 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661750 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661751 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661752 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661753 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661754 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661755 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661756 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661757 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661758 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661759 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661760 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661761 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661762 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661763 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661764 2 0.456 0.546 0.040 0.800 0.008 0.152
#> SRR1661766 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661767 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661768 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661769 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661770 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661771 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661772 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661773 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661774 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661775 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661776 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661777 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661778 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661779 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661780 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661781 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661782 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661783 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661784 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661785 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661786 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661787 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661788 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661789 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661790 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661791 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661792 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661793 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661794 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661795 1 0.546 0.648 0.632 0.340 0.028 0.000
#> SRR1661796 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661797 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661798 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661799 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661800 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661801 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661802 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661803 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661804 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661805 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661806 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661807 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661808 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661809 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661810 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661811 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661812 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661813 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661814 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661815 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661816 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661817 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661818 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661819 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661820 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661821 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661822 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661823 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661824 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661825 2 0.490 0.369 0.364 0.632 0.004 0.000
#> SRR1661826 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661827 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661828 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661829 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661830 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661831 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661832 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661833 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661834 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661835 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661836 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661837 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661838 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661839 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661840 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661841 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661843 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661844 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661845 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661846 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661847 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661848 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661849 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661850 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661851 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661852 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661853 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661854 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661855 4 0.327 0.678 0.040 0.084 0.000 0.876
#> SRR1661856 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661857 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661858 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661859 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661860 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661861 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661862 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661863 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661864 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661865 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661866 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661867 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661868 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661869 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661870 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661871 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661872 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661873 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661874 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661875 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661876 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661877 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661878 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661879 3 0.463 0.974 0.024 0.012 0.784 0.180
#> SRR1661880 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661881 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661882 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661883 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661884 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661885 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661886 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661887 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661888 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661889 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661890 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661891 3 0.340 0.999 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1661892 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661893 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661894 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661895 4 0.106 0.685 0.012 0.016 0.000 0.972
#> SRR1661896 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661897 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661898 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661899 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661900 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661901 4 0.168 0.691 0.012 0.040 0.000 0.948
#> SRR1661902 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661903 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661904 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661905 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661906 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661907 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661908 4 0.106 0.685 0.012 0.016 0.000 0.972
#> SRR1661909 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661910 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661911 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661912 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661913 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661914 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661915 4 0.128 0.683 0.024 0.012 0.000 0.964
#> SRR1661916 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661917 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661918 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661919 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661920 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661921 4 0.117 0.686 0.012 0.020 0.000 0.968
#> SRR1661922 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661923 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661924 4 0.158 0.690 0.012 0.036 0.000 0.952
#> SRR1661925 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661926 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661927 4 0.185 0.693 0.012 0.048 0.000 0.940
#> SRR1661928 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661929 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661930 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661931 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661932 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661933 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661934 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661935 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661936 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661937 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661938 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661939 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661940 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661941 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661942 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661943 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661944 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661945 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661946 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661947 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661948 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661949 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661950 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661951 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661952 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661953 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661954 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661955 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661956 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661957 4 0.567 0.375 0.000 0.448 0.024 0.528
#> SRR1661958 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661959 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661960 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661961 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661962 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661963 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661964 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661965 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661966 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661967 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661968 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661969 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661970 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661971 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661972 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661973 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661974 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661975 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661976 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661977 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661978 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661979 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661980 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661981 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661982 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661983 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661984 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661985 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661986 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661987 4 0.564 0.578 0.072 0.008 0.196 0.724
#> SRR1661988 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661989 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661990 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661991 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661992 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661993 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661994 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661995 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661996 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661997 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661998 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1661999 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662000 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662001 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662002 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662003 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662004 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662005 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662006 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662007 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662008 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662009 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662010 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662011 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662012 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662013 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662014 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662015 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662016 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662017 1 0.728 0.489 0.512 0.384 0.072 0.032
#> SRR1662018 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662019 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662020 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662021 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662022 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662023 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662024 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662025 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662026 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662027 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662028 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662029 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662030 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662031 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662032 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662033 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662034 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662035 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662036 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662037 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662038 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662039 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662040 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662041 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662042 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662043 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662044 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662045 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662046 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662047 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662048 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662049 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662050 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662051 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662052 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662053 2 0.546 0.582 0.240 0.712 0.036 0.012
#> SRR1662054 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662055 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662056 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662057 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662058 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662059 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662060 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662061 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662062 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662063 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662064 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662065 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662066 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662067 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662068 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662069 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662070 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662071 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662072 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662073 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662074 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662075 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662076 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662077 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662078 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662079 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662080 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662081 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662082 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662083 4 0.528 0.594 0.056 0.008 0.188 0.748
#> SRR1662084 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662085 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662086 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662087 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662088 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662089 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662090 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662091 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662092 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662093 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662094 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662095 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662096 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662097 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662098 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662099 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662100 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662101 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662102 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662103 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662104 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662105 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662106 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662107 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662108 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662109 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662110 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662111 2 0.735 0.225 0.076 0.552 0.040 0.332
#> SRR1662112 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662113 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662114 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662115 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662116 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
#> SRR1662117 1 0.367 0.721 0.824 0.164 0.012 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661717 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661718 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661719 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661720 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661721 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661722 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661723 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661724 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661725 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661726 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661727 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661728 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661729 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661730 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661731 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661732 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661733 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661734 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661735 5 0.328 0.653 0.000 0.160 0.004 0.012 0.824
#> SRR1661736 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661737 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661738 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661739 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661740 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661741 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661742 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661743 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661744 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661745 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661746 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661747 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661748 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661749 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661750 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661751 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661752 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661753 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661754 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661755 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661756 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661757 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661758 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661759 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661760 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661761 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661762 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661763 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661764 2 0.832 -0.167 0.124 0.448 0.044 0.288 0.096
#> SRR1661766 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661767 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661768 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661769 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661770 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661771 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661772 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661773 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661774 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661775 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661776 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661777 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661778 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661779 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661780 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661781 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661782 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661783 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661784 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661785 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661786 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661787 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661788 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661789 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661790 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661791 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661792 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661793 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661794 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661795 5 0.458 0.531 0.000 0.308 0.008 0.016 0.668
#> SRR1661796 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661797 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661798 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661799 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661800 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661801 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661802 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661803 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661804 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661805 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661806 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661807 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661808 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661809 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661810 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661811 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661812 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661813 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661814 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661815 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661816 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661817 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661818 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661819 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661820 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661821 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661822 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661823 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661824 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661825 2 0.621 0.451 0.000 0.580 0.036 0.080 0.304
#> SRR1661826 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661827 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661828 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661829 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661830 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661831 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661832 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661833 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661834 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661835 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661836 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661837 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661838 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661839 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661840 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661841 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661843 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661844 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661845 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661846 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661847 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661848 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661849 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661850 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661851 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661852 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661853 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661854 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661855 1 0.471 0.401 0.500 0.008 0.004 0.488 0.000
#> SRR1661856 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.456 0.975 0.252 0.020 0.712 0.016 0.000
#> SRR1661860 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.437 0.980 0.252 0.016 0.720 0.012 0.000
#> SRR1661866 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.456 0.975 0.252 0.020 0.712 0.016 0.000
#> SRR1661873 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.557 0.941 0.252 0.040 0.660 0.048 0.000
#> SRR1661880 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.482 0.968 0.252 0.024 0.700 0.024 0.000
#> SRR1661886 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.351 0.995 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661893 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661894 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661895 1 0.478 0.480 0.592 0.008 0.012 0.388 0.000
#> SRR1661896 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661897 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661898 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661899 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661900 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661901 1 0.478 0.480 0.592 0.008 0.012 0.388 0.000
#> SRR1661902 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661903 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661904 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661905 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661906 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661907 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661908 1 0.478 0.480 0.592 0.008 0.012 0.388 0.000
#> SRR1661909 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661910 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661911 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661912 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661913 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661914 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661915 1 0.467 0.484 0.628 0.008 0.012 0.352 0.000
#> SRR1661916 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661917 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661918 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661919 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661920 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661921 1 0.478 0.480 0.592 0.008 0.012 0.388 0.000
#> SRR1661922 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661923 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661924 1 0.478 0.480 0.592 0.008 0.012 0.388 0.000
#> SRR1661925 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661926 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661927 1 0.487 0.482 0.592 0.012 0.012 0.384 0.000
#> SRR1661928 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661929 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661930 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661931 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661932 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661933 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661934 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661935 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661936 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661937 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661938 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661939 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661940 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661941 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661942 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661943 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661944 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661945 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661946 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661947 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661948 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661949 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661950 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661951 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661952 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661953 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661954 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661955 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661956 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661957 1 0.776 -0.368 0.368 0.216 0.040 0.364 0.012
#> SRR1661958 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661959 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661960 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661961 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661962 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661963 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661964 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661965 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661966 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661967 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661968 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661969 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661970 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661971 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661972 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661973 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661974 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661975 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661976 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661977 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661978 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661979 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661980 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661981 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661982 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661983 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661984 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661985 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661986 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661987 1 0.208 0.507 0.924 0.032 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661988 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661989 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661990 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661991 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661992 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661993 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661994 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661995 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661996 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661997 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661998 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1661999 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662000 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662001 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662002 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662003 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662004 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662005 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662006 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662007 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662008 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662009 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662010 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662011 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662012 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662013 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662014 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662015 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662016 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662017 5 0.622 0.543 0.000 0.136 0.056 0.156 0.652
#> SRR1662018 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662019 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662020 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662021 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662022 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662023 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662024 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662025 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662026 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662027 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662028 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662029 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662030 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662031 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662032 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662033 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662034 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662035 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662036 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662037 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662038 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662039 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662040 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662041 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662042 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662043 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662044 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662045 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662046 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662047 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662048 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662049 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662050 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662051 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662052 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662053 2 0.563 0.538 0.000 0.660 0.036 0.060 0.244
#> SRR1662054 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662055 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662056 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662057 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662058 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662059 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662060 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662061 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662062 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662063 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662064 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662065 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662066 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662067 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662068 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662069 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662070 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662071 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662072 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662073 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662074 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662075 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662076 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662077 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662078 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662079 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662080 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662081 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662082 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662083 1 0.051 0.520 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1662084 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662085 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662086 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662087 5 0.256 0.667 0.000 0.008 0.032 0.060 0.900
#> SRR1662088 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662089 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662090 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662091 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662092 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662093 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662094 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662095 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662096 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662097 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662098 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662099 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662100 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662101 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662102 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662103 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662104 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662105 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662106 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662107 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662108 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662109 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662110 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662111 4 0.875 0.000 0.184 0.200 0.072 0.448 0.096
#> SRR1662112 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662113 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662114 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662115 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662116 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
#> SRR1662117 5 0.248 0.667 0.000 0.008 0.028 0.060 0.904
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661717 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661718 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661719 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661720 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661721 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661722 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661723 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661724 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661725 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661726 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661727 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661728 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661729 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661730 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661731 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661732 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661733 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661734 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661735 2 0.6703 0.267 0.064 0.424 0.136 0.000 0.372 0.004
#> SRR1661736 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661737 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661738 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661739 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661740 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661741 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661742 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661743 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661744 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661745 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661746 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661747 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661748 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661749 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661750 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661751 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661752 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661753 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661754 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661755 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661756 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661757 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661758 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661759 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661760 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661761 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661762 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661763 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661764 1 0.8973 0.176 0.292 0.196 0.276 0.060 0.132 0.044
#> SRR1661766 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661767 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661768 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661769 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661770 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661771 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661772 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661773 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661774 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661775 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661776 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661777 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661778 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661779 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661780 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661781 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661782 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661783 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661784 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661785 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661786 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661787 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661788 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661789 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661790 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661791 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661792 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661793 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661794 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661795 2 0.7235 0.425 0.068 0.348 0.236 0.000 0.340 0.008
#> SRR1661796 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661797 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661798 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661799 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661800 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661801 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661802 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661803 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661804 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661805 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661806 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661807 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661808 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661809 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661810 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661811 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661812 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661813 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661814 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661815 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661816 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661817 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661818 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661819 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661820 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661821 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661822 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661823 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661824 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661825 3 0.7684 0.626 0.132 0.168 0.484 0.000 0.156 0.060
#> SRR1661826 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661827 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661828 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661829 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661830 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661831 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661832 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661833 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661834 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661835 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661836 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661837 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661838 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661839 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661840 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661841 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661843 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661844 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661845 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661846 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661847 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661848 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661849 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661850 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661851 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661852 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661853 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661854 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661855 1 0.4466 0.383 0.640 0.004 0.004 0.328 0.008 0.016
#> SRR1661856 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661857 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661858 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661859 6 0.3571 0.983 0.004 0.000 0.000 0.216 0.020 0.760
#> SRR1661860 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661861 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661862 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661863 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661864 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661865 6 0.3398 0.988 0.000 0.000 0.004 0.216 0.012 0.768
#> SRR1661866 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661867 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661868 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661869 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661870 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661871 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661872 6 0.3398 0.988 0.000 0.000 0.004 0.216 0.012 0.768
#> SRR1661873 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661874 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661875 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661876 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661877 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661878 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661879 6 0.4387 0.960 0.012 0.008 0.004 0.216 0.032 0.728
#> SRR1661880 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661881 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661882 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661883 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661884 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661885 6 0.3790 0.978 0.004 0.004 0.000 0.216 0.024 0.752
#> SRR1661886 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661887 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661888 6 0.3052 0.995 0.000 0.000 0.000 0.216 0.004 0.780
#> SRR1661889 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661890 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661891 6 0.2912 0.997 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1661892 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661893 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661894 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661895 1 0.5982 0.270 0.476 0.004 0.020 0.420 0.052 0.028
#> SRR1661896 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661897 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661898 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661899 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661900 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661901 1 0.5855 0.289 0.488 0.004 0.016 0.416 0.048 0.028
#> SRR1661902 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661903 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661904 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661905 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661906 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661907 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661908 1 0.5985 0.261 0.472 0.004 0.020 0.424 0.052 0.028
#> SRR1661909 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661910 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661911 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661912 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661913 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661914 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661915 4 0.5982 -0.151 0.420 0.004 0.020 0.476 0.052 0.028
#> SRR1661916 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661917 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661918 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661919 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661920 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661921 1 0.5976 0.287 0.484 0.004 0.020 0.412 0.052 0.028
#> SRR1661922 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661923 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661924 1 0.5976 0.287 0.484 0.004 0.020 0.412 0.052 0.028
#> SRR1661925 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661926 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661927 1 0.5783 0.297 0.496 0.008 0.008 0.412 0.048 0.028
#> SRR1661928 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661929 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661930 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661931 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661932 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661933 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661934 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661935 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661936 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661937 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661938 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661939 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661940 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661941 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661942 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661943 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661944 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661945 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661946 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661947 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661948 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661949 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661950 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661951 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661952 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661953 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661954 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661955 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661956 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661957 1 0.8775 0.489 0.392 0.116 0.184 0.180 0.096 0.032
#> SRR1661958 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661959 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661960 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661961 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661962 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661963 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661964 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661965 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661966 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661967 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661968 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661969 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661970 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661971 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661972 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661973 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661974 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661975 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661976 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661977 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661978 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661979 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661980 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661981 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661982 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661983 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661984 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661985 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661986 4 0.0748 0.929 0.016 0.000 0.004 0.976 0.004 0.000
#> SRR1661987 4 0.0717 0.929 0.016 0.000 0.008 0.976 0.000 0.000
#> SRR1661988 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661989 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661990 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661991 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661992 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661993 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661994 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661995 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661996 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661997 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661998 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661999 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662000 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662001 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662002 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662003 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662004 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662005 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662006 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662007 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662008 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662009 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662010 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662011 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662012 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662013 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662014 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662015 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662016 2 0.1232 0.279 0.024 0.956 0.016 0.000 0.000 0.004
#> SRR1662017 2 0.1088 0.279 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1662018 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662019 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662020 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662021 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662022 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662023 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662024 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662025 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662026 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662027 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662028 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662029 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662030 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662031 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662032 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662033 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662034 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662035 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662036 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662037 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662038 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662039 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662040 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662041 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662042 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662043 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662044 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662045 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662046 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662047 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662048 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662049 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662050 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662051 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662052 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662053 3 0.3460 0.712 0.008 0.168 0.796 0.000 0.028 0.000
#> SRR1662054 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662055 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662056 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662057 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662058 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662059 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662060 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662061 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662062 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662063 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662064 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662065 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662066 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662067 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662068 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662069 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662070 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662071 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662072 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662073 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662074 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662075 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662076 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662077 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662078 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662079 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662080 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662081 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662082 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662083 4 0.1950 0.930 0.024 0.000 0.000 0.912 0.064 0.000
#> SRR1662084 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662085 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662086 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662087 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662088 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662089 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662090 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662091 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662092 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662093 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662094 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662095 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662096 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662097 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662098 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662099 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662100 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662101 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662102 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662103 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662104 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662105 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662106 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662107 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662108 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662109 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662110 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662111 1 0.8867 0.389 0.404 0.180 0.168 0.072 0.104 0.072
#> SRR1662112 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662113 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662114 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662115 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662116 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
#> SRR1662117 5 0.5005 1.000 0.000 0.404 0.036 0.000 0.540 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.999 1.000 0.5008 0.500 0.500
#> 3 3 0.806 0.830 0.880 0.2000 0.939 0.879
#> 4 4 0.667 0.818 0.833 0.1095 0.845 0.657
#> 5 5 0.647 0.789 0.798 0.0930 0.989 0.964
#> 6 6 0.695 0.670 0.769 0.0634 0.944 0.809
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661856 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661928 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661929 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661930 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661931 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661932 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661933 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661934 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661935 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661936 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661937 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661938 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661939 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661940 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661941 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661942 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661943 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661944 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661945 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661946 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661947 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661948 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661949 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661950 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661951 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661952 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661953 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661954 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661955 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661956 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661957 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661958 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661959 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661960 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661961 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661962 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661963 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661964 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661965 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661966 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661967 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661968 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661969 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661970 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661971 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661972 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661973 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661974 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661975 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661976 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661977 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661978 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661979 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661980 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661981 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661982 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661983 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661984 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661985 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661986 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661987 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1661988 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661989 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661990 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661991 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661992 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661993 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661994 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661995 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661996 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661997 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661998 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1661999 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662000 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662001 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662002 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662003 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662004 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662005 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662006 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662007 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662008 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662009 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662010 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662011 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662012 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662013 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662014 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662015 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662016 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662017 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662018 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662054 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662055 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662056 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662057 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662058 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662059 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662060 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662061 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662062 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662063 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662064 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662065 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662066 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662067 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662068 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662069 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662070 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662071 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662072 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662073 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662074 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662075 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662076 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662077 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662078 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662079 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662080 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662081 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662082 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662083 1 0.000 1.000 1.000 0.000
#> SRR1662084 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662085 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662086 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662087 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662088 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662089 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662090 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662091 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662092 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662093 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662094 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662095 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662096 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662097 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662098 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662099 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662100 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662101 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662102 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662103 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662104 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662105 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662106 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662107 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662108 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662109 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662110 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662111 2 0.506 0.874 0.112 0.888
#> SRR1662112 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662113 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662114 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662115 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662116 2 0.000 0.999 0.000 1.000
#> SRR1662117 2 0.000 0.999 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661736 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661737 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661738 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661739 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661740 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661741 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661742 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661743 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661744 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661745 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661746 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661747 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661748 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661749 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661750 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661751 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661752 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661753 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661754 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661755 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661756 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661757 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661758 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661759 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661760 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661761 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661762 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661763 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661764 2 0.6045 0.526 0.000 0.620 0.380
#> SRR1661766 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661797 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661798 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661799 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661800 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661801 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661802 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661803 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661804 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661805 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661806 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661807 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661808 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661809 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661810 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661811 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661812 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661813 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661814 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661815 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661816 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661817 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661818 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661819 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661820 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661821 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661822 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661823 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661824 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661825 2 0.2066 0.905 0.000 0.940 0.060
#> SRR1661826 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661827 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661828 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661829 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661830 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661831 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661832 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661833 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661834 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661835 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661836 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661837 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661838 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661839 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661840 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661841 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661843 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661844 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661845 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661846 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661847 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661848 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661849 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661850 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661851 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661852 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661853 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661854 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661855 1 0.1643 0.686 0.956 0.000 0.044
#> SRR1661856 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661857 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661858 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661859 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661860 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661861 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661862 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661863 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661864 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661865 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661866 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661867 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661868 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661869 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661870 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661871 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661872 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661873 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661874 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661875 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661876 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661877 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661878 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661879 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661880 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661881 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661882 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661883 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661884 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661885 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661886 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661887 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661888 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661889 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661890 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661891 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661892 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661893 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661894 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661895 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661896 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661897 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661898 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661899 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661900 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661901 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661902 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661903 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661904 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661905 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661906 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661907 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661908 1 0.0000 0.704 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661910 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661911 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661912 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661913 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661914 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661915 1 0.0747 0.708 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661916 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661917 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661918 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661919 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661920 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661921 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661922 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661923 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661924 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661925 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661926 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661927 1 0.0747 0.702 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661928 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661929 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661930 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661931 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661932 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661933 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661934 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661935 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661936 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661937 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661938 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661939 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661940 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661941 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661942 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661943 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661944 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661945 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661946 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661947 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661948 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661949 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661950 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661951 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661952 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661953 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661954 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661955 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661956 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661957 3 0.0747 1.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1661958 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661959 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661960 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661961 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661962 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661963 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661964 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661965 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661966 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661967 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661968 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661969 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661970 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661971 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661972 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661973 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661974 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661975 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661976 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661977 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661978 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661979 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661980 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661981 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661982 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661983 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661984 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661985 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661986 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661987 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1661988 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661989 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661990 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661991 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661992 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661993 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661994 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661995 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661996 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661997 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661998 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661999 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662000 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662001 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662002 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662003 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662004 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662005 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662006 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662007 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662008 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662009 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662010 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662011 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662012 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662013 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662014 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662015 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662016 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662017 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662018 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662019 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662020 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662021 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662022 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662023 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662024 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662025 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662026 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662027 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662028 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662029 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662030 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662031 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662032 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662033 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662034 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662035 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662036 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662037 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662038 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662039 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662040 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662041 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662042 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662043 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662044 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662045 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662046 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662047 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662048 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662049 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662050 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662051 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662052 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662053 2 0.0747 0.928 0.000 0.984 0.016
#> SRR1662054 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662055 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662056 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662057 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662058 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662059 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662060 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662061 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662062 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662063 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662064 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662065 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662066 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662067 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662068 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662069 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662070 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662071 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662072 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662073 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662074 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662075 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662076 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662077 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662078 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662079 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662080 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662081 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662082 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662083 1 0.5835 0.779 0.660 0.000 0.340
#> SRR1662084 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662085 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662086 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662087 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662088 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662089 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662090 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662091 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662092 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662093 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662094 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662095 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662096 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662097 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662098 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662099 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662100 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662101 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662102 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662103 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662104 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662105 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662106 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662107 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662108 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662109 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662110 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662111 2 0.4796 0.692 0.220 0.780 0.000
#> SRR1662112 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662113 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662114 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662115 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662116 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
#> SRR1662117 2 0.0000 0.933 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661717 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661718 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661719 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661720 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661721 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661722 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661723 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661724 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661725 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661726 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661727 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661728 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661729 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661730 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661731 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661732 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661733 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661734 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661735 2 0.0804 0.866 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1661736 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661737 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661738 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661739 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661740 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661741 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661742 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661743 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661744 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661745 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661746 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661747 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661748 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661749 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661750 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661751 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661752 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661753 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661754 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661755 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661756 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661757 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661758 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661759 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661760 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661761 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661762 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661763 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661764 3 0.5000 0.273 0.000 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661766 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661767 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661768 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661769 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661770 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661771 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661772 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661773 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661774 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661775 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661776 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661777 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661778 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661779 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661780 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661781 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661782 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661783 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661784 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661785 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661786 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661787 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661788 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661789 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661790 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661791 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661792 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661793 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661794 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661795 2 0.0657 0.864 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1661796 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661797 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661798 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661799 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661800 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661801 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661802 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661803 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661804 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661805 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661806 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661807 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661808 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661809 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661810 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661811 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661812 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661813 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661814 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661815 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661816 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661817 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661818 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661819 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661820 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661821 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661822 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661823 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661824 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661825 2 0.3597 0.760 0.000 0.836 0.148 0.016
#> SRR1661826 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661827 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661828 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661829 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661830 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661831 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661832 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661833 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661834 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661835 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661836 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661837 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661838 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661839 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661840 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661841 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661843 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661844 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661845 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661846 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661847 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661848 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661849 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661850 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661851 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661852 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661853 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661854 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661855 1 0.0188 0.918 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661856 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661857 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661858 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661859 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661860 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661861 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661862 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661863 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661864 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661865 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661866 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661867 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661868 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661869 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661870 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661871 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661872 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661873 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661874 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661875 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661876 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661877 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661878 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661879 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661880 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661881 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661882 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661883 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661884 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661885 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661886 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661887 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661888 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661889 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661890 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661891 4 0.4608 0.989 0.304 0.000 0.004 0.692
#> SRR1661892 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661893 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661894 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661895 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661896 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661897 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661898 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661899 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661900 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661901 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661902 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661903 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661904 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661905 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661906 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661907 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661908 1 0.2281 0.921 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1661909 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661910 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661911 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661912 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661913 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661914 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661915 1 0.3400 0.767 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1661916 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661917 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661918 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661919 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661920 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661921 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661922 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661923 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661924 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661925 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661926 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661927 1 0.2216 0.927 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1661928 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661929 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661930 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661931 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661932 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661933 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661934 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661935 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661936 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661937 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661938 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661939 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661940 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661941 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661942 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661943 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661944 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661945 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661946 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661947 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661948 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661949 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661950 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661951 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661952 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661953 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661954 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661955 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661956 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661957 3 0.5108 0.549 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1661958 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661959 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661960 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661961 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661962 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661963 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661964 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661965 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661966 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661967 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661968 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661969 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661970 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661971 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661972 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661973 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661974 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661975 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661976 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661977 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661978 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661979 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661980 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661981 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661982 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661983 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661984 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661985 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661986 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661987 4 0.4697 0.983 0.296 0.000 0.008 0.696
#> SRR1661988 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661989 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661990 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661991 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661992 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661993 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661994 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661995 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661996 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661997 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661998 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1661999 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662000 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662001 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662002 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662003 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662004 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662005 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662006 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662007 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662008 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662009 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662010 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662011 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662012 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662013 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662014 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662015 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662016 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662017 2 0.3245 0.840 0.000 0.880 0.056 0.064
#> SRR1662018 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662019 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662020 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662021 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662022 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662023 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662024 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662025 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662026 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662027 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662028 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662029 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662030 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662031 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662032 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662033 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662034 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662035 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662036 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662037 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662038 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662039 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662040 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662041 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662042 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662043 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662044 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662045 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662046 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662047 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662048 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662049 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662050 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662051 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662052 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662053 2 0.4104 0.788 0.000 0.832 0.080 0.088
#> SRR1662054 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662055 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662056 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662057 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662058 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662059 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662060 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662061 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662062 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662063 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662064 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662065 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662066 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662067 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662068 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662069 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662070 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662071 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662072 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662073 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662074 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662075 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662076 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662077 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662078 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662079 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662080 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662081 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662082 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662083 4 0.4406 0.989 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1662084 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662085 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662086 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662087 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662088 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662089 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662090 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662091 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662092 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662093 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662094 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662095 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662096 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662097 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662098 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662099 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662100 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662101 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662102 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662103 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662104 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662105 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662106 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662107 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662108 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662109 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662110 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662111 2 0.7046 0.432 0.252 0.628 0.064 0.056
#> SRR1662112 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662113 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662114 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662115 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662116 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
#> SRR1662117 2 0.2675 0.854 0.000 0.908 0.044 0.048
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661717 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661718 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661719 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661720 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661721 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661722 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661723 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661724 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661725 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661726 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661727 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661728 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661729 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661730 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661731 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661732 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661733 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661734 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661735 5 0.1121 0.691 0.000 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1661736 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661737 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661738 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661739 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661740 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661741 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661742 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661743 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661744 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661745 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661746 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661747 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661748 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661749 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661750 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661751 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661752 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661753 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661754 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661755 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661756 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661757 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661758 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661759 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661760 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661761 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661762 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661763 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661764 2 0.7615 1.000 0.044 0.364 0.284 0.000 0.308
#> SRR1661766 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661767 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661768 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661769 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661770 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661771 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661772 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661773 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661774 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661775 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661776 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661777 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661778 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661779 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661780 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661781 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661782 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661783 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661784 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661785 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661786 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661787 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661788 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661789 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661790 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661791 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661792 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661793 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661794 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661795 5 0.0162 0.688 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1661796 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661797 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661798 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661799 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661800 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661801 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661802 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661803 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661804 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661805 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661806 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661807 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661808 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661809 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661810 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661811 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661812 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661813 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661814 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661815 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661816 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661817 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661818 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661819 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661820 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661821 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661822 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661823 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661824 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661825 5 0.4359 0.472 0.004 0.128 0.092 0.000 0.776
#> SRR1661826 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661827 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661828 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661829 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661830 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661831 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661832 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661833 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661834 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661835 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661836 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661837 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661838 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661839 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661840 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661841 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661843 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661844 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661845 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661846 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661847 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661848 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661849 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661850 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661851 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661852 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661853 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661854 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661855 1 0.3695 0.885 0.836 0.052 0.016 0.096 0.000
#> SRR1661856 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661857 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661858 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661859 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661860 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661861 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661862 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661863 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661864 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661865 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661866 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661867 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661868 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661869 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661870 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661871 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661872 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661873 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661874 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661875 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661876 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661877 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661878 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661879 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661880 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661881 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661882 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661883 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661884 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661885 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661886 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661887 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661888 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661889 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661890 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661891 4 0.0671 0.974 0.016 0.004 0.000 0.980 0.000
#> SRR1661892 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661893 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661894 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661895 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661896 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661897 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661898 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661899 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661900 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661901 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661902 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661903 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661904 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661905 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661906 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661907 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661908 1 0.3210 0.904 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1661909 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661910 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661911 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661912 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661913 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661914 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661915 1 0.3966 0.725 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1661916 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661917 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661918 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661919 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661920 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661921 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661922 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661923 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661924 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661925 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661926 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661927 1 0.3177 0.909 0.792 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661928 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661929 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661930 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661931 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661932 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661933 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661934 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661935 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661936 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661937 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661938 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661939 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661940 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661941 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661942 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661943 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661944 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661945 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661946 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661947 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661948 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661949 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661950 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661951 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661952 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661953 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661954 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661955 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661956 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661957 3 0.2616 1.000 0.020 0.000 0.880 0.100 0.000
#> SRR1661958 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661959 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661960 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661961 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661962 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661963 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661964 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661965 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661966 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661967 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661968 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661969 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661970 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661971 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661972 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661973 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661974 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661975 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661976 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661977 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661978 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661979 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661980 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661981 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661982 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661983 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661984 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661985 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661986 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661987 4 0.1822 0.947 0.004 0.024 0.036 0.936 0.000
#> SRR1661988 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661989 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661990 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661991 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661992 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661993 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661994 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661995 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661996 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661997 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661998 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1661999 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662000 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662001 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662002 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662003 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662004 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662005 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662006 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662007 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662008 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662009 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662010 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662011 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662012 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662013 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662014 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662015 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662016 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662017 5 0.4015 0.569 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1662018 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662019 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662020 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662021 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662022 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662023 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662024 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662025 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662026 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662027 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662028 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662029 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662030 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662031 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662032 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662033 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662034 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662035 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662036 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662037 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662038 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662039 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662040 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662041 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662042 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662043 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662044 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662045 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662046 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662047 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662048 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662049 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662050 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662051 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662052 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662053 5 0.5448 0.492 0.056 0.248 0.028 0.000 0.668
#> SRR1662054 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662055 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662056 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662057 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662058 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662059 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662060 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662061 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662062 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662063 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662064 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662065 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662066 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662067 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662068 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662069 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662070 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662071 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662072 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662073 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662074 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662075 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662076 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662077 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662078 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662079 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662080 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662081 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662082 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662083 4 0.0404 0.973 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1662084 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662085 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662086 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662087 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662088 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662089 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662090 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662091 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662092 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662093 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662094 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662095 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662096 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662097 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662098 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662099 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662100 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662101 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662102 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662103 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662104 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662105 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662106 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662107 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662108 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662109 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662110 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662111 5 0.6080 0.381 0.200 0.228 0.000 0.000 0.572
#> SRR1662112 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662113 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662114 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662115 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662116 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1662117 5 0.3143 0.662 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661717 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661718 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661719 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661720 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661721 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661722 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661723 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661724 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661725 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661726 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661727 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661728 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661729 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661730 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661731 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661732 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661733 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661734 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661735 2 0.1531 0.371 0.000 0.928 0.004 0.000 0.068 0.000
#> SRR1661736 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661737 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661738 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661739 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661740 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661741 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661742 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661743 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661744 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661745 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661746 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661747 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661748 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661749 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661750 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661751 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661752 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661753 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661754 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661755 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661756 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661757 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661758 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661759 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661760 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661761 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661762 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661763 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661764 3 0.7626 1.000 0.016 0.204 0.396 0.000 0.260 0.124
#> SRR1661766 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661767 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661768 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661769 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661770 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661771 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661772 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661773 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661774 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661775 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661776 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661777 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661778 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661779 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661780 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661781 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661782 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661783 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661784 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661785 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661786 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661787 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661788 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661789 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661790 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661791 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661792 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661793 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661794 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661795 2 0.0146 0.451 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661796 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661797 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661798 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661799 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661800 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661801 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661802 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661803 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661804 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661805 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661806 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661807 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661808 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661809 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661810 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661811 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661812 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661813 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661814 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661815 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661816 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661817 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661818 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661819 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661820 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661821 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661822 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661823 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661824 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661825 2 0.5146 0.420 0.004 0.692 0.168 0.000 0.104 0.032
#> SRR1661826 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661827 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661828 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661829 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661830 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661831 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661832 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661833 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661834 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661835 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661836 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661837 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661838 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661839 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661840 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661841 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661843 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661844 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661845 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661846 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661847 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661848 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661849 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661850 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661851 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661852 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661853 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661854 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661855 1 0.0777 0.839 0.972 0.000 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1661856 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661857 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661858 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661859 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661860 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661861 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661862 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661863 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661864 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661865 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661866 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661867 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661868 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661869 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661870 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661871 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661872 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661873 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661874 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661875 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661876 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661877 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661878 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661879 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661880 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661881 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661882 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661883 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661884 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661885 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661886 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661887 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661888 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661889 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661890 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661891 4 0.0964 0.928 0.012 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004
#> SRR1661892 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661893 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661894 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661895 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661896 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661897 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661898 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661899 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661900 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661901 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661902 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661903 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661904 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661905 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661906 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661907 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661908 1 0.5182 0.869 0.712 0.000 0.056 0.148 0.072 0.012
#> SRR1661909 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661910 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661911 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661912 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661913 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661914 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661915 1 0.6007 0.694 0.580 0.000 0.056 0.280 0.072 0.012
#> SRR1661916 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661917 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661918 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661919 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661920 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661921 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661922 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661923 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661924 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661925 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661926 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661927 1 0.5235 0.872 0.712 0.000 0.056 0.144 0.072 0.016
#> SRR1661928 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661929 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661930 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661931 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661932 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661933 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661934 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661935 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661936 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661937 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661938 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661939 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661940 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661941 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661942 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661943 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661944 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661945 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661946 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661947 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661948 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661949 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661950 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661951 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661952 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661953 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661954 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661955 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661956 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661957 6 0.1219 1.000 0.000 0.004 0.000 0.048 0.000 0.948
#> SRR1661958 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661959 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661960 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661961 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661962 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661963 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661964 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661965 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661966 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661967 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661968 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661969 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661970 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661971 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661972 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661973 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661974 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661975 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661976 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661977 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661978 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661979 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661980 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661981 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661982 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661983 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661984 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661985 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661986 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661987 4 0.3591 0.864 0.008 0.000 0.040 0.828 0.100 0.024
#> SRR1661988 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661989 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661990 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661991 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661992 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661993 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661994 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661995 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661996 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661997 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661998 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1661999 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662000 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662001 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662002 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662003 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662004 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662005 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662006 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662007 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662008 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662009 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662010 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662011 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662012 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662013 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662014 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662015 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662016 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662017 5 0.3854 1.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1662018 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662019 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662020 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662021 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662022 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662023 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662024 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662025 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662026 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662027 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662028 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662029 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662030 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662031 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662032 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662033 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662034 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662035 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662036 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662037 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662038 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662039 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662040 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662041 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662042 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662043 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662044 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662045 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662046 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662047 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662048 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662049 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662050 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662051 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662052 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662053 2 0.4492 0.374 0.000 0.496 0.480 0.000 0.008 0.016
#> SRR1662054 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662055 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662056 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662057 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662058 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662059 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662060 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662061 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662062 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662063 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662064 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662065 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662066 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662067 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662068 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662069 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662070 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662071 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662072 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662073 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662074 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662075 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662076 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662077 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662078 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662079 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662080 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662081 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662082 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662083 4 0.1218 0.924 0.012 0.000 0.004 0.956 0.028 0.000
#> SRR1662084 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662085 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662086 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662087 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662088 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662089 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662090 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662091 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662092 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662093 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662094 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662095 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662096 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662097 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662098 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662099 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662100 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662101 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662102 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662103 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662104 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662105 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662106 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662107 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662108 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662109 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662110 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662111 2 0.6341 -0.475 0.160 0.512 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662112 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662113 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662114 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662115 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662116 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
#> SRR1662117 2 0.4283 -0.305 0.000 0.672 0.036 0.000 0.288 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 1.000 1.000 0.1650 0.836 0.836
#> 3 3 0.958 0.916 0.971 2.4908 0.587 0.506
#> 4 4 0.948 0.910 0.957 0.2063 0.820 0.598
#> 5 5 0.899 0.927 0.928 0.0858 0.949 0.826
#> 6 6 0.884 0.896 0.862 0.0601 0.951 0.799
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0 1 0 1
#> SRR1661717 2 0 1 0 1
#> SRR1661718 2 0 1 0 1
#> SRR1661719 2 0 1 0 1
#> SRR1661720 2 0 1 0 1
#> SRR1661721 2 0 1 0 1
#> SRR1661722 2 0 1 0 1
#> SRR1661723 2 0 1 0 1
#> SRR1661724 2 0 1 0 1
#> SRR1661725 2 0 1 0 1
#> SRR1661726 2 0 1 0 1
#> SRR1661727 2 0 1 0 1
#> SRR1661728 2 0 1 0 1
#> SRR1661729 2 0 1 0 1
#> SRR1661730 2 0 1 0 1
#> SRR1661731 2 0 1 0 1
#> SRR1661732 2 0 1 0 1
#> SRR1661733 2 0 1 0 1
#> SRR1661734 2 0 1 0 1
#> SRR1661735 2 0 1 0 1
#> SRR1661736 2 0 1 0 1
#> SRR1661737 2 0 1 0 1
#> SRR1661738 2 0 1 0 1
#> SRR1661739 2 0 1 0 1
#> SRR1661740 2 0 1 0 1
#> SRR1661741 2 0 1 0 1
#> SRR1661742 2 0 1 0 1
#> SRR1661743 2 0 1 0 1
#> SRR1661744 2 0 1 0 1
#> SRR1661745 2 0 1 0 1
#> SRR1661746 2 0 1 0 1
#> SRR1661747 2 0 1 0 1
#> SRR1661748 2 0 1 0 1
#> SRR1661749 2 0 1 0 1
#> SRR1661750 2 0 1 0 1
#> SRR1661751 2 0 1 0 1
#> SRR1661752 2 0 1 0 1
#> SRR1661753 2 0 1 0 1
#> SRR1661754 2 0 1 0 1
#> SRR1661755 2 0 1 0 1
#> SRR1661756 2 0 1 0 1
#> SRR1661757 2 0 1 0 1
#> SRR1661758 2 0 1 0 1
#> SRR1661759 2 0 1 0 1
#> SRR1661760 2 0 1 0 1
#> SRR1661761 2 0 1 0 1
#> SRR1661762 2 0 1 0 1
#> SRR1661763 2 0 1 0 1
#> SRR1661764 2 0 1 0 1
#> SRR1661766 2 0 1 0 1
#> SRR1661767 2 0 1 0 1
#> SRR1661768 2 0 1 0 1
#> SRR1661769 2 0 1 0 1
#> SRR1661770 2 0 1 0 1
#> SRR1661771 2 0 1 0 1
#> SRR1661772 2 0 1 0 1
#> SRR1661773 2 0 1 0 1
#> SRR1661774 2 0 1 0 1
#> SRR1661775 2 0 1 0 1
#> SRR1661776 2 0 1 0 1
#> SRR1661777 2 0 1 0 1
#> SRR1661778 2 0 1 0 1
#> SRR1661779 2 0 1 0 1
#> SRR1661780 2 0 1 0 1
#> SRR1661781 2 0 1 0 1
#> SRR1661782 2 0 1 0 1
#> SRR1661783 2 0 1 0 1
#> SRR1661784 2 0 1 0 1
#> SRR1661785 2 0 1 0 1
#> SRR1661786 2 0 1 0 1
#> SRR1661787 2 0 1 0 1
#> SRR1661788 2 0 1 0 1
#> SRR1661789 2 0 1 0 1
#> SRR1661790 2 0 1 0 1
#> SRR1661791 2 0 1 0 1
#> SRR1661792 2 0 1 0 1
#> SRR1661793 2 0 1 0 1
#> SRR1661794 2 0 1 0 1
#> SRR1661795 2 0 1 0 1
#> SRR1661796 2 0 1 0 1
#> SRR1661797 2 0 1 0 1
#> SRR1661798 2 0 1 0 1
#> SRR1661799 2 0 1 0 1
#> SRR1661800 2 0 1 0 1
#> SRR1661801 2 0 1 0 1
#> SRR1661802 2 0 1 0 1
#> SRR1661803 2 0 1 0 1
#> SRR1661804 2 0 1 0 1
#> SRR1661805 2 0 1 0 1
#> SRR1661806 2 0 1 0 1
#> SRR1661807 2 0 1 0 1
#> SRR1661808 2 0 1 0 1
#> SRR1661809 2 0 1 0 1
#> SRR1661810 2 0 1 0 1
#> SRR1661811 2 0 1 0 1
#> SRR1661812 2 0 1 0 1
#> SRR1661813 2 0 1 0 1
#> SRR1661814 2 0 1 0 1
#> SRR1661815 2 0 1 0 1
#> SRR1661816 2 0 1 0 1
#> SRR1661817 2 0 1 0 1
#> SRR1661818 2 0 1 0 1
#> SRR1661819 2 0 1 0 1
#> SRR1661820 2 0 1 0 1
#> SRR1661821 2 0 1 0 1
#> SRR1661822 2 0 1 0 1
#> SRR1661823 2 0 1 0 1
#> SRR1661824 2 0 1 0 1
#> SRR1661825 2 0 1 0 1
#> SRR1661826 2 0 1 0 1
#> SRR1661827 2 0 1 0 1
#> SRR1661828 2 0 1 0 1
#> SRR1661829 2 0 1 0 1
#> SRR1661830 2 0 1 0 1
#> SRR1661831 2 0 1 0 1
#> SRR1661832 2 0 1 0 1
#> SRR1661833 2 0 1 0 1
#> SRR1661834 2 0 1 0 1
#> SRR1661835 2 0 1 0 1
#> SRR1661836 2 0 1 0 1
#> SRR1661837 2 0 1 0 1
#> SRR1661838 2 0 1 0 1
#> SRR1661839 2 0 1 0 1
#> SRR1661840 2 0 1 0 1
#> SRR1661841 2 0 1 0 1
#> SRR1661843 2 0 1 0 1
#> SRR1661844 2 0 1 0 1
#> SRR1661845 2 0 1 0 1
#> SRR1661846 2 0 1 0 1
#> SRR1661847 2 0 1 0 1
#> SRR1661848 2 0 1 0 1
#> SRR1661849 2 0 1 0 1
#> SRR1661850 2 0 1 0 1
#> SRR1661851 2 0 1 0 1
#> SRR1661852 2 0 1 0 1
#> SRR1661853 2 0 1 0 1
#> SRR1661854 2 0 1 0 1
#> SRR1661855 2 0 1 0 1
#> SRR1661856 1 0 1 1 0
#> SRR1661857 1 0 1 1 0
#> SRR1661858 1 0 1 1 0
#> SRR1661859 1 0 1 1 0
#> SRR1661860 1 0 1 1 0
#> SRR1661861 1 0 1 1 0
#> SRR1661862 1 0 1 1 0
#> SRR1661863 1 0 1 1 0
#> SRR1661864 1 0 1 1 0
#> SRR1661865 1 0 1 1 0
#> SRR1661866 1 0 1 1 0
#> SRR1661867 1 0 1 1 0
#> SRR1661868 1 0 1 1 0
#> SRR1661869 1 0 1 1 0
#> SRR1661870 1 0 1 1 0
#> SRR1661871 1 0 1 1 0
#> SRR1661872 1 0 1 1 0
#> SRR1661873 1 0 1 1 0
#> SRR1661874 1 0 1 1 0
#> SRR1661875 1 0 1 1 0
#> SRR1661876 1 0 1 1 0
#> SRR1661877 1 0 1 1 0
#> SRR1661878 1 0 1 1 0
#> SRR1661879 1 0 1 1 0
#> SRR1661880 1 0 1 1 0
#> SRR1661881 1 0 1 1 0
#> SRR1661882 1 0 1 1 0
#> SRR1661883 1 0 1 1 0
#> SRR1661884 1 0 1 1 0
#> SRR1661885 1 0 1 1 0
#> SRR1661886 1 0 1 1 0
#> SRR1661887 1 0 1 1 0
#> SRR1661888 1 0 1 1 0
#> SRR1661889 1 0 1 1 0
#> SRR1661890 1 0 1 1 0
#> SRR1661891 1 0 1 1 0
#> SRR1661892 2 0 1 0 1
#> SRR1661893 2 0 1 0 1
#> SRR1661894 2 0 1 0 1
#> SRR1661895 2 0 1 0 1
#> SRR1661896 2 0 1 0 1
#> SRR1661897 2 0 1 0 1
#> SRR1661898 2 0 1 0 1
#> SRR1661899 2 0 1 0 1
#> SRR1661900 2 0 1 0 1
#> SRR1661901 2 0 1 0 1
#> SRR1661902 2 0 1 0 1
#> SRR1661903 2 0 1 0 1
#> SRR1661904 2 0 1 0 1
#> SRR1661905 2 0 1 0 1
#> SRR1661906 2 0 1 0 1
#> SRR1661907 2 0 1 0 1
#> SRR1661908 2 0 1 0 1
#> SRR1661909 2 0 1 0 1
#> SRR1661910 2 0 1 0 1
#> SRR1661911 2 0 1 0 1
#> SRR1661912 2 0 1 0 1
#> SRR1661913 2 0 1 0 1
#> SRR1661914 2 0 1 0 1
#> SRR1661915 2 0 1 0 1
#> SRR1661916 2 0 1 0 1
#> SRR1661917 2 0 1 0 1
#> SRR1661918 2 0 1 0 1
#> SRR1661919 2 0 1 0 1
#> SRR1661920 2 0 1 0 1
#> SRR1661921 2 0 1 0 1
#> SRR1661922 2 0 1 0 1
#> SRR1661923 2 0 1 0 1
#> SRR1661924 2 0 1 0 1
#> SRR1661925 2 0 1 0 1
#> SRR1661926 2 0 1 0 1
#> SRR1661927 2 0 1 0 1
#> SRR1661928 2 0 1 0 1
#> SRR1661929 2 0 1 0 1
#> SRR1661930 2 0 1 0 1
#> SRR1661931 2 0 1 0 1
#> SRR1661932 2 0 1 0 1
#> SRR1661933 2 0 1 0 1
#> SRR1661934 2 0 1 0 1
#> SRR1661935 2 0 1 0 1
#> SRR1661936 2 0 1 0 1
#> SRR1661937 2 0 1 0 1
#> SRR1661938 2 0 1 0 1
#> SRR1661939 2 0 1 0 1
#> SRR1661940 2 0 1 0 1
#> SRR1661941 2 0 1 0 1
#> SRR1661942 2 0 1 0 1
#> SRR1661943 2 0 1 0 1
#> SRR1661944 2 0 1 0 1
#> SRR1661945 2 0 1 0 1
#> SRR1661946 2 0 1 0 1
#> SRR1661947 2 0 1 0 1
#> SRR1661948 2 0 1 0 1
#> SRR1661949 2 0 1 0 1
#> SRR1661950 2 0 1 0 1
#> SRR1661951 2 0 1 0 1
#> SRR1661952 2 0 1 0 1
#> SRR1661953 2 0 1 0 1
#> SRR1661954 2 0 1 0 1
#> SRR1661955 2 0 1 0 1
#> SRR1661956 2 0 1 0 1
#> SRR1661957 2 0 1 0 1
#> SRR1661958 2 0 1 0 1
#> SRR1661959 2 0 1 0 1
#> SRR1661960 2 0 1 0 1
#> SRR1661961 2 0 1 0 1
#> SRR1661962 2 0 1 0 1
#> SRR1661963 2 0 1 0 1
#> SRR1661964 2 0 1 0 1
#> SRR1661965 2 0 1 0 1
#> SRR1661966 2 0 1 0 1
#> SRR1661967 2 0 1 0 1
#> SRR1661968 2 0 1 0 1
#> SRR1661969 2 0 1 0 1
#> SRR1661970 2 0 1 0 1
#> SRR1661971 2 0 1 0 1
#> SRR1661972 2 0 1 0 1
#> SRR1661973 2 0 1 0 1
#> SRR1661974 2 0 1 0 1
#> SRR1661975 2 0 1 0 1
#> SRR1661976 2 0 1 0 1
#> SRR1661977 2 0 1 0 1
#> SRR1661978 2 0 1 0 1
#> SRR1661979 2 0 1 0 1
#> SRR1661980 2 0 1 0 1
#> SRR1661981 2 0 1 0 1
#> SRR1661982 2 0 1 0 1
#> SRR1661983 2 0 1 0 1
#> SRR1661984 2 0 1 0 1
#> SRR1661985 2 0 1 0 1
#> SRR1661986 2 0 1 0 1
#> SRR1661987 2 0 1 0 1
#> SRR1661988 2 0 1 0 1
#> SRR1661989 2 0 1 0 1
#> SRR1661990 2 0 1 0 1
#> SRR1661991 2 0 1 0 1
#> SRR1661992 2 0 1 0 1
#> SRR1661993 2 0 1 0 1
#> SRR1661994 2 0 1 0 1
#> SRR1661995 2 0 1 0 1
#> SRR1661996 2 0 1 0 1
#> SRR1661997 2 0 1 0 1
#> SRR1661998 2 0 1 0 1
#> SRR1661999 2 0 1 0 1
#> SRR1662000 2 0 1 0 1
#> SRR1662001 2 0 1 0 1
#> SRR1662002 2 0 1 0 1
#> SRR1662003 2 0 1 0 1
#> SRR1662004 2 0 1 0 1
#> SRR1662005 2 0 1 0 1
#> SRR1662006 2 0 1 0 1
#> SRR1662007 2 0 1 0 1
#> SRR1662008 2 0 1 0 1
#> SRR1662009 2 0 1 0 1
#> SRR1662010 2 0 1 0 1
#> SRR1662011 2 0 1 0 1
#> SRR1662012 2 0 1 0 1
#> SRR1662013 2 0 1 0 1
#> SRR1662014 2 0 1 0 1
#> SRR1662015 2 0 1 0 1
#> SRR1662016 2 0 1 0 1
#> SRR1662017 2 0 1 0 1
#> SRR1662018 2 0 1 0 1
#> SRR1662019 2 0 1 0 1
#> SRR1662020 2 0 1 0 1
#> SRR1662021 2 0 1 0 1
#> SRR1662022 2 0 1 0 1
#> SRR1662023 2 0 1 0 1
#> SRR1662024 2 0 1 0 1
#> SRR1662025 2 0 1 0 1
#> SRR1662026 2 0 1 0 1
#> SRR1662027 2 0 1 0 1
#> SRR1662028 2 0 1 0 1
#> SRR1662029 2 0 1 0 1
#> SRR1662030 2 0 1 0 1
#> SRR1662031 2 0 1 0 1
#> SRR1662032 2 0 1 0 1
#> SRR1662033 2 0 1 0 1
#> SRR1662034 2 0 1 0 1
#> SRR1662035 2 0 1 0 1
#> SRR1662036 2 0 1 0 1
#> SRR1662037 2 0 1 0 1
#> SRR1662038 2 0 1 0 1
#> SRR1662039 2 0 1 0 1
#> SRR1662040 2 0 1 0 1
#> SRR1662041 2 0 1 0 1
#> SRR1662042 2 0 1 0 1
#> SRR1662043 2 0 1 0 1
#> SRR1662044 2 0 1 0 1
#> SRR1662045 2 0 1 0 1
#> SRR1662046 2 0 1 0 1
#> SRR1662047 2 0 1 0 1
#> SRR1662048 2 0 1 0 1
#> SRR1662049 2 0 1 0 1
#> SRR1662050 2 0 1 0 1
#> SRR1662051 2 0 1 0 1
#> SRR1662052 2 0 1 0 1
#> SRR1662053 2 0 1 0 1
#> SRR1662054 2 0 1 0 1
#> SRR1662055 2 0 1 0 1
#> SRR1662056 2 0 1 0 1
#> SRR1662057 2 0 1 0 1
#> SRR1662058 2 0 1 0 1
#> SRR1662059 2 0 1 0 1
#> SRR1662060 2 0 1 0 1
#> SRR1662061 2 0 1 0 1
#> SRR1662062 2 0 1 0 1
#> SRR1662063 2 0 1 0 1
#> SRR1662064 2 0 1 0 1
#> SRR1662065 2 0 1 0 1
#> SRR1662066 2 0 1 0 1
#> SRR1662067 2 0 1 0 1
#> SRR1662068 2 0 1 0 1
#> SRR1662069 2 0 1 0 1
#> SRR1662070 2 0 1 0 1
#> SRR1662071 2 0 1 0 1
#> SRR1662072 2 0 1 0 1
#> SRR1662073 2 0 1 0 1
#> SRR1662074 2 0 1 0 1
#> SRR1662075 2 0 1 0 1
#> SRR1662076 2 0 1 0 1
#> SRR1662077 2 0 1 0 1
#> SRR1662078 2 0 1 0 1
#> SRR1662079 2 0 1 0 1
#> SRR1662080 2 0 1 0 1
#> SRR1662081 2 0 1 0 1
#> SRR1662082 2 0 1 0 1
#> SRR1662083 2 0 1 0 1
#> SRR1662084 2 0 1 0 1
#> SRR1662085 2 0 1 0 1
#> SRR1662086 2 0 1 0 1
#> SRR1662087 2 0 1 0 1
#> SRR1662088 2 0 1 0 1
#> SRR1662089 2 0 1 0 1
#> SRR1662090 2 0 1 0 1
#> SRR1662091 2 0 1 0 1
#> SRR1662092 2 0 1 0 1
#> SRR1662093 2 0 1 0 1
#> SRR1662094 2 0 1 0 1
#> SRR1662095 2 0 1 0 1
#> SRR1662096 2 0 1 0 1
#> SRR1662097 2 0 1 0 1
#> SRR1662098 2 0 1 0 1
#> SRR1662099 2 0 1 0 1
#> SRR1662100 2 0 1 0 1
#> SRR1662101 2 0 1 0 1
#> SRR1662102 2 0 1 0 1
#> SRR1662103 2 0 1 0 1
#> SRR1662104 2 0 1 0 1
#> SRR1662105 2 0 1 0 1
#> SRR1662106 2 0 1 0 1
#> SRR1662107 2 0 1 0 1
#> SRR1662108 2 0 1 0 1
#> SRR1662109 2 0 1 0 1
#> SRR1662110 2 0 1 0 1
#> SRR1662111 2 0 1 0 1
#> SRR1662112 2 0 1 0 1
#> SRR1662113 2 0 1 0 1
#> SRR1662114 2 0 1 0 1
#> SRR1662115 2 0 1 0 1
#> SRR1662116 2 0 1 0 1
#> SRR1662117 2 0 1 0 1
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661717 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661718 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661719 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661720 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661721 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661722 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661723 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661724 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661725 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661726 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661727 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661728 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661729 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661730 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661731 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661732 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661733 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661734 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661735 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661736 2 0.6008 0.4103 0.372 0.628 0
#> SRR1661737 1 0.5733 0.5067 0.676 0.324 0
#> SRR1661738 2 0.6309 0.0240 0.496 0.504 0
#> SRR1661739 2 0.6280 0.1578 0.460 0.540 0
#> SRR1661740 2 0.6140 0.3284 0.404 0.596 0
#> SRR1661741 2 0.6140 0.3285 0.404 0.596 0
#> SRR1661742 1 0.5835 0.4750 0.660 0.340 0
#> SRR1661743 2 0.5621 0.5499 0.308 0.692 0
#> SRR1661744 2 0.5650 0.5418 0.312 0.688 0
#> SRR1661745 2 0.6260 0.1974 0.448 0.552 0
#> SRR1661746 2 0.6309 0.0253 0.496 0.504 0
#> SRR1661747 2 0.6299 0.1006 0.476 0.524 0
#> SRR1661748 1 0.6215 0.2442 0.572 0.428 0
#> SRR1661749 2 0.6126 0.3395 0.400 0.600 0
#> SRR1661750 2 0.3879 0.7748 0.152 0.848 0
#> SRR1661751 1 0.6235 0.2135 0.564 0.436 0
#> SRR1661752 1 0.6062 0.3647 0.616 0.384 0
#> SRR1661753 1 0.5760 0.4984 0.672 0.328 0
#> SRR1661754 1 0.5988 0.4057 0.632 0.368 0
#> SRR1661755 2 0.6180 0.2955 0.416 0.584 0
#> SRR1661756 1 0.6299 0.0772 0.524 0.476 0
#> SRR1661757 1 0.6307 0.0287 0.512 0.488 0
#> SRR1661758 1 0.6286 0.1192 0.536 0.464 0
#> SRR1661759 1 0.6008 0.3956 0.628 0.372 0
#> SRR1661760 2 0.6204 0.2720 0.424 0.576 0
#> SRR1661761 2 0.5948 0.4395 0.360 0.640 0
#> SRR1661762 2 0.6286 0.1439 0.464 0.536 0
#> SRR1661763 2 0.4654 0.6989 0.208 0.792 0
#> SRR1661764 1 0.6286 0.1197 0.536 0.464 0
#> SRR1661766 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661767 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661768 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661769 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661770 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661771 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661772 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661773 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661774 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661775 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661776 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661777 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661778 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661779 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661780 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661781 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661782 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661783 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661784 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661785 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661786 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661787 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661788 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661789 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661790 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661791 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661792 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661793 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661794 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661795 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661796 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661797 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661798 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661799 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661800 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661801 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661802 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661803 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661804 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661805 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661806 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661807 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661808 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661809 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661810 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661811 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661812 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661813 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661814 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661815 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661816 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661817 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661818 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661819 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661820 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661821 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661822 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661823 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661824 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661825 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661826 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661827 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661828 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661829 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661830 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661831 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661832 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661833 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661834 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661835 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661836 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661837 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661838 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661839 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661840 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661841 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661843 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661844 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661845 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661846 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661847 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661848 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661849 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661850 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661851 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661852 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661853 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661854 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661855 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661856 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661857 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661858 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661859 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661860 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661861 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661862 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661863 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661864 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661865 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661866 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661867 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661868 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661869 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661870 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661871 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661872 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661873 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661874 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661875 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661876 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661877 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661878 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661879 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661880 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661881 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661882 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661883 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661884 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661885 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661886 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661887 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661888 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661889 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661890 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661891 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1
#> SRR1661892 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661893 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661894 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661895 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661896 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661897 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661898 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661899 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661900 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661901 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661902 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661903 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661904 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661905 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661906 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661907 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661908 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661909 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661910 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661911 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661912 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661913 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661914 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661915 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661916 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661917 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661918 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661919 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661920 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661921 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661922 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661923 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661924 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661925 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661926 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661927 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661928 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661929 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661930 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661931 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661932 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661933 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661934 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661935 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661936 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661937 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661938 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661939 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661940 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661941 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661942 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661943 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661944 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661945 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661946 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661947 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661948 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661949 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661950 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661951 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661952 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661953 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661954 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661955 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661956 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661957 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661958 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661959 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661960 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661961 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661962 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661963 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661964 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661965 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661966 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661967 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661968 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661969 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661970 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661971 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661972 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661973 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661974 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661975 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661976 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661977 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661978 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661979 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661980 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661981 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661982 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661983 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661984 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661985 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661986 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661987 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1661988 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661989 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661990 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661991 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661992 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661993 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661994 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661995 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661996 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661997 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661998 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1661999 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662000 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662001 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662002 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662003 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662004 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662005 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662006 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662007 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662008 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662009 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662010 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662011 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662012 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662013 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662014 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662015 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662016 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662017 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662018 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662019 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662020 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662021 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662022 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662023 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662024 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662025 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662026 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662027 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662028 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662029 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662030 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662031 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662032 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662033 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662034 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662035 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662036 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662037 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662038 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662039 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662040 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662041 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662042 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662043 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662044 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662045 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662046 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662047 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662048 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662049 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662050 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662051 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662052 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662053 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662054 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662055 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662056 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662057 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662058 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662059 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662060 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662061 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662062 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662063 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662064 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662065 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662066 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662067 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662068 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662069 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662070 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662071 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662072 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662073 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662074 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662075 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662076 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662077 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662078 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662079 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662080 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662081 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662082 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662083 1 0.0000 0.9608 1.000 0.000 0
#> SRR1662084 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662085 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662086 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662087 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662088 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662089 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662090 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662091 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662092 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662093 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662094 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662095 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662096 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662097 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662098 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662099 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662100 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662101 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662102 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662103 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662104 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662105 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662106 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662107 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662108 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662109 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662110 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662111 1 0.0592 0.9466 0.988 0.012 0
#> SRR1662112 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662113 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662114 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662115 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662116 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
#> SRR1662117 2 0.0000 0.9574 0.000 1.000 0
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661717 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661718 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661719 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661720 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661721 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661722 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661723 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661724 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661725 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661726 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661727 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661728 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661729 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661730 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661731 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661732 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661733 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661734 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661735 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661736 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661737 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661738 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661739 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661740 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661741 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661742 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661743 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661744 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661745 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661746 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661747 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661748 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661749 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661750 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661751 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661752 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661753 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661754 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661755 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661756 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661757 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661758 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661759 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661760 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661761 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661762 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661763 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661764 1 0.0000 0.780 1.000 0.000 0 0.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1661826 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661827 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661828 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661829 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661830 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661831 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661832 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661833 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661834 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661835 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661836 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661837 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661838 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661839 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661840 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661841 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661843 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661844 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661845 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661846 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661847 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661848 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661849 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661850 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661851 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661852 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661853 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661854 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661855 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000
#> SRR1661892 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661893 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661894 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661895 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661896 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661897 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661898 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661899 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661900 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661901 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661902 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661903 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661904 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661905 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661906 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661907 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661908 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661909 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661910 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661911 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661912 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661913 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661914 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661915 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661916 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661917 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661918 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661919 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661920 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661921 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661922 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661923 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661924 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661925 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661926 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661927 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661928 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661929 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661930 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661931 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661932 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661933 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661934 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661935 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661936 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661937 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661938 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661939 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661940 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661941 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661942 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661943 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661944 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661945 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661946 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661947 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661948 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661949 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661950 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661951 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661952 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661953 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661954 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661955 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661956 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661957 1 0.1118 0.777 0.964 0.000 0 0.036
#> SRR1661958 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661959 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661960 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661961 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661962 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661963 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661964 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661965 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661966 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661967 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661968 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661969 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661970 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661971 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661972 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661973 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661974 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661975 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661976 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661977 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661978 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661979 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661980 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661981 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661982 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661983 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661984 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661985 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661986 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661987 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1661988 1 0.4948 0.447 0.560 0.440 0 0.000
#> SRR1661989 1 0.4830 0.533 0.608 0.392 0 0.000
#> SRR1661990 1 0.4933 0.467 0.568 0.432 0 0.000
#> SRR1661991 1 0.4925 0.471 0.572 0.428 0 0.000
#> SRR1661992 1 0.4916 0.483 0.576 0.424 0 0.000
#> SRR1661993 1 0.4898 0.498 0.584 0.416 0 0.000
#> SRR1661994 1 0.4843 0.530 0.604 0.396 0 0.000
#> SRR1661995 1 0.4941 0.457 0.564 0.436 0 0.000
#> SRR1661996 1 0.4933 0.467 0.568 0.432 0 0.000
#> SRR1661997 1 0.4907 0.483 0.580 0.420 0 0.000
#> SRR1661998 1 0.4933 0.467 0.568 0.432 0 0.000
#> SRR1661999 1 0.4933 0.467 0.568 0.432 0 0.000
#> SRR1662000 1 0.4713 0.559 0.640 0.360 0 0.000
#> SRR1662001 1 0.4933 0.467 0.568 0.432 0 0.000
#> SRR1662002 1 0.4941 0.457 0.564 0.436 0 0.000
#> SRR1662003 1 0.4843 0.527 0.604 0.396 0 0.000
#> SRR1662004 1 0.4855 0.524 0.600 0.400 0 0.000
#> SRR1662005 1 0.4804 0.536 0.616 0.384 0 0.000
#> SRR1662006 1 0.4877 0.489 0.592 0.408 0 0.000
#> SRR1662007 1 0.4925 0.475 0.572 0.428 0 0.000
#> SRR1662008 1 0.4933 0.467 0.568 0.432 0 0.000
#> SRR1662009 1 0.4925 0.475 0.572 0.428 0 0.000
#> SRR1662010 1 0.4907 0.487 0.580 0.420 0 0.000
#> SRR1662011 1 0.4790 0.551 0.620 0.380 0 0.000
#> SRR1662012 1 0.4877 0.511 0.592 0.408 0 0.000
#> SRR1662013 1 0.4713 0.569 0.640 0.360 0 0.000
#> SRR1662014 1 0.4898 0.498 0.584 0.416 0 0.000
#> SRR1662015 1 0.4907 0.490 0.580 0.420 0 0.000
#> SRR1662016 1 0.4761 0.546 0.628 0.372 0 0.000
#> SRR1662017 1 0.4933 0.467 0.568 0.432 0 0.000
#> SRR1662018 2 0.1557 0.937 0.056 0.944 0 0.000
#> SRR1662019 2 0.1302 0.944 0.044 0.956 0 0.000
#> SRR1662020 2 0.2149 0.906 0.088 0.912 0 0.000
#> SRR1662021 2 0.3873 0.687 0.228 0.772 0 0.000
#> SRR1662022 2 0.2216 0.902 0.092 0.908 0 0.000
#> SRR1662023 2 0.1474 0.940 0.052 0.948 0 0.000
#> SRR1662024 2 0.1389 0.942 0.048 0.952 0 0.000
#> SRR1662025 2 0.1637 0.934 0.060 0.940 0 0.000
#> SRR1662026 2 0.1474 0.940 0.052 0.948 0 0.000
#> SRR1662027 2 0.3569 0.747 0.196 0.804 0 0.000
#> SRR1662028 2 0.2469 0.882 0.108 0.892 0 0.000
#> SRR1662029 2 0.1716 0.930 0.064 0.936 0 0.000
#> SRR1662030 2 0.1557 0.937 0.056 0.944 0 0.000
#> SRR1662031 2 0.2216 0.902 0.092 0.908 0 0.000
#> SRR1662032 2 0.1474 0.940 0.052 0.948 0 0.000
#> SRR1662033 2 0.1637 0.934 0.060 0.940 0 0.000
#> SRR1662034 2 0.3528 0.755 0.192 0.808 0 0.000
#> SRR1662035 2 0.1474 0.940 0.052 0.948 0 0.000
#> SRR1662036 2 0.1474 0.940 0.052 0.948 0 0.000
#> SRR1662037 2 0.1940 0.919 0.076 0.924 0 0.000
#> SRR1662038 2 0.1389 0.942 0.048 0.952 0 0.000
#> SRR1662039 2 0.1637 0.934 0.060 0.940 0 0.000
#> SRR1662040 2 0.1867 0.923 0.072 0.928 0 0.000
#> SRR1662041 2 0.4855 0.208 0.400 0.600 0 0.000
#> SRR1662042 2 0.1474 0.940 0.052 0.948 0 0.000
#> SRR1662043 2 0.2589 0.872 0.116 0.884 0 0.000
#> SRR1662044 2 0.1302 0.944 0.044 0.956 0 0.000
#> SRR1662045 2 0.2281 0.897 0.096 0.904 0 0.000
#> SRR1662046 2 0.2149 0.906 0.088 0.912 0 0.000
#> SRR1662047 2 0.4356 0.543 0.292 0.708 0 0.000
#> SRR1662048 2 0.1474 0.940 0.052 0.948 0 0.000
#> SRR1662049 2 0.1211 0.947 0.040 0.960 0 0.000
#> SRR1662050 2 0.4331 0.553 0.288 0.712 0 0.000
#> SRR1662051 2 0.1474 0.940 0.052 0.948 0 0.000
#> SRR1662052 2 0.1792 0.926 0.068 0.932 0 0.000
#> SRR1662053 2 0.2011 0.914 0.080 0.920 0 0.000
#> SRR1662054 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662055 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662056 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662057 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662058 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662059 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662060 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662061 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662062 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662063 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662064 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662065 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662066 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662067 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662068 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662069 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662070 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662071 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662072 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662073 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662074 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662075 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662076 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662077 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662078 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662079 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662080 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662081 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662082 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662083 4 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 1.000
#> SRR1662084 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662085 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662086 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662087 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662088 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662089 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662090 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662091 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662092 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662093 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662094 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662095 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662096 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662097 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662098 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662099 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662100 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662101 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662102 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662103 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662104 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662105 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662106 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662107 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662108 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662109 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662110 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662111 1 0.0469 0.779 0.988 0.000 0 0.012
#> SRR1662112 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662113 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662114 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662115 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662116 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
#> SRR1662117 2 0.0000 0.973 0.000 1.000 0 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661717 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661718 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661719 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661720 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661721 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661722 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661723 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661724 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661725 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661726 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661727 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661728 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661729 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661730 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661731 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661732 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661733 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661734 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661735 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661736 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661737 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661738 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661739 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661740 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661741 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661742 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661743 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661744 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661745 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661746 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661747 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661748 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661749 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661750 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661751 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661752 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661753 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661754 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661755 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661756 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661757 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661758 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661759 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661760 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661761 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661762 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661763 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661764 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661767 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661768 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661769 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661770 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661771 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661772 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661773 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661774 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661775 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661776 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661777 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661778 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661779 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661780 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661781 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661782 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661783 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661784 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661785 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661786 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661787 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661788 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661789 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661790 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661791 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661792 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661793 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661794 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661795 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661796 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661797 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661798 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661799 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661800 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661801 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661802 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661803 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661804 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661805 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661806 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661807 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661808 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661809 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661810 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661811 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661812 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661813 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661814 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661815 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661816 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661817 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661818 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661819 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661820 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661821 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661822 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661823 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661824 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661825 2 0.2732 0.939 0.000 0.840 0 0.160 0.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.998 1.000 0.000 0 0.000 0.000
#> SRR1661928 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661929 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661930 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661931 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661932 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661933 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661934 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661935 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661936 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661937 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661938 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661939 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661940 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661941 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661942 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661943 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661944 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661945 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661946 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661947 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661948 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661949 5 0.0290 0.841 0.008 0.000 0 0.000 0.992
#> SRR1661950 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661951 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661952 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661953 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661954 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661955 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661956 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661957 5 0.0000 0.849 0.000 0.000 0 0.000 1.000
#> SRR1661958 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661959 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661960 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661961 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661962 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661963 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661964 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661965 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661966 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661967 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661968 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661969 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661970 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661971 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661972 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661973 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661974 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661975 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661976 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661977 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661978 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661979 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661980 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661981 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661982 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661983 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661984 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661985 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661986 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661987 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1661988 5 0.4182 0.640 0.000 0.400 0 0.000 0.600
#> SRR1661989 5 0.4045 0.685 0.000 0.356 0 0.000 0.644
#> SRR1661990 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1661991 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1661992 5 0.4161 0.652 0.000 0.392 0 0.000 0.608
#> SRR1661993 5 0.4126 0.666 0.000 0.380 0 0.000 0.620
#> SRR1661994 5 0.4074 0.681 0.000 0.364 0 0.000 0.636
#> SRR1661995 5 0.4182 0.640 0.000 0.400 0 0.000 0.600
#> SRR1661996 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1661997 5 0.4161 0.652 0.000 0.392 0 0.000 0.608
#> SRR1661998 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1661999 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1662000 5 0.4030 0.687 0.000 0.352 0 0.000 0.648
#> SRR1662001 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1662002 5 0.4182 0.640 0.000 0.400 0 0.000 0.600
#> SRR1662003 5 0.4088 0.678 0.000 0.368 0 0.000 0.632
#> SRR1662004 5 0.4101 0.675 0.000 0.372 0 0.000 0.628
#> SRR1662005 5 0.4088 0.678 0.000 0.368 0 0.000 0.632
#> SRR1662006 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1662007 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1662008 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1662009 5 0.4161 0.652 0.000 0.392 0 0.000 0.608
#> SRR1662010 5 0.4138 0.662 0.000 0.384 0 0.000 0.616
#> SRR1662011 5 0.3983 0.694 0.000 0.340 0 0.000 0.660
#> SRR1662012 5 0.4114 0.670 0.000 0.376 0 0.000 0.624
#> SRR1662013 5 0.3966 0.696 0.000 0.336 0 0.000 0.664
#> SRR1662014 5 0.4138 0.662 0.000 0.384 0 0.000 0.616
#> SRR1662015 5 0.4150 0.657 0.000 0.388 0 0.000 0.612
#> SRR1662016 5 0.4074 0.681 0.000 0.364 0 0.000 0.636
#> SRR1662017 5 0.4171 0.646 0.000 0.396 0 0.000 0.604
#> SRR1662018 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662019 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662020 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662021 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662022 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662023 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662024 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662025 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662026 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662027 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662028 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662029 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662030 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662031 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662032 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662033 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662034 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662035 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662036 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662037 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662038 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662039 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662040 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662041 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662042 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662043 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662044 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662045 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662046 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662047 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662048 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662049 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662050 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662051 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662052 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662053 4 0.0162 1.000 0.000 0.004 0 0.996 0.000
#> SRR1662054 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662055 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662056 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662057 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662058 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662059 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662060 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662061 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662062 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662063 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662064 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662065 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662066 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662067 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662068 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662069 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662070 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662071 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662072 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662073 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662074 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662075 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662076 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662077 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662078 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662079 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662080 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662081 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662082 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662083 1 0.0162 0.998 0.996 0.000 0 0.004 0.000
#> SRR1662084 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662085 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662086 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662087 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662088 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662089 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662090 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662091 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662092 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662093 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662094 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662095 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662096 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662097 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662098 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662099 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662100 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662101 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662102 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662103 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662104 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662105 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662106 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662107 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662108 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662109 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662110 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662111 5 0.0162 0.846 0.004 0.000 0 0.000 0.996
#> SRR1662112 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662113 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662114 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662115 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662116 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
#> SRR1662117 2 0.0000 0.854 0.000 1.000 0 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661717 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661718 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661719 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661720 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661721 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661722 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661723 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661724 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661725 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661726 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661727 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661728 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661729 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661730 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661731 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661732 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661733 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661734 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661735 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661736 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661737 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661738 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661739 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661740 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661741 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661742 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661743 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661744 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661745 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661746 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661747 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661748 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661749 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661750 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661751 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661752 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661753 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661754 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661755 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661756 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661757 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661758 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661759 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661760 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661761 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661762 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661763 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661764 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661766 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661767 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661768 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661769 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661770 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661771 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661772 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661773 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661774 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661775 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661776 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661777 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661778 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661779 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661780 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661781 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661782 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661783 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661784 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661785 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661786 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661787 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661788 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661789 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661790 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661791 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661792 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661793 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661794 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661795 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661796 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661797 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661798 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661799 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661800 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661801 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661802 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661803 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661804 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661805 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661806 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661807 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661808 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661809 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661810 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661811 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661812 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661813 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661814 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661815 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661816 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661817 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661818 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661819 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661820 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661821 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661822 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661823 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661824 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661825 2 0.0000 0.902 0.000 1.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661826 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661827 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661828 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661829 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661830 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661831 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661832 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661833 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661834 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661835 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661836 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661837 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661838 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661839 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661840 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661841 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661843 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661844 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661845 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661846 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661847 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661848 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661849 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661850 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661851 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661852 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661853 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661854 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661855 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1 0.000 0.000 0
#> SRR1661892 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661893 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661894 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661895 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661896 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661897 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661898 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661899 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661900 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661901 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661902 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661903 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661904 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661905 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661906 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661907 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661908 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661909 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661910 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661911 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661912 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661913 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661914 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661915 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661916 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661917 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661918 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661919 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661920 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661921 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661922 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661923 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661924 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661925 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661926 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661927 1 0.0000 0.985 1.000 0.000 0 0.000 0.000 0
#> SRR1661928 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661929 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661930 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661931 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661932 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661933 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661934 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661935 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661936 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661937 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661938 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661939 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661940 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661941 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661942 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661943 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661944 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661945 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661946 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661947 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661948 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661949 5 0.4097 0.821 0.008 0.000 0 0.488 0.504 0
#> SRR1661950 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661951 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661952 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661953 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661954 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661955 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661956 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661957 5 0.3867 0.828 0.000 0.000 0 0.488 0.512 0
#> SRR1661958 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661959 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661960 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661961 4 0.3868 0.993 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1661962 4 0.3868 0.993 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1661963 4 0.3868 0.993 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1661964 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661965 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661966 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661967 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661968 4 0.3868 0.993 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1661969 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661970 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661971 4 0.3868 0.993 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1661972 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661973 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661974 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661975 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661976 4 0.3868 0.993 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1661977 4 0.3868 0.993 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1661978 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661979 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661980 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661981 1 0.3868 -0.978 0.504 0.000 0 0.496 0.000 0
#> SRR1661982 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661983 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661984 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661985 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661986 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1661987 4 0.3868 0.993 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1661988 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661989 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661990 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661991 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661992 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661993 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661994 5 0.0458 0.620 0.000 0.016 0 0.000 0.984 0
#> SRR1661995 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661996 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661997 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661998 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1661999 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662000 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662001 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662002 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662003 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662004 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662005 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662006 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662007 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662008 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662009 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662010 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662011 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662012 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662013 5 0.0363 0.621 0.000 0.012 0 0.000 0.988 0
#> SRR1662014 5 0.0632 0.614 0.000 0.024 0 0.000 0.976 0
#> SRR1662015 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662016 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662017 5 0.0547 0.618 0.000 0.020 0 0.000 0.980 0
#> SRR1662018 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662019 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662020 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662021 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662022 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662023 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662024 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662025 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662026 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662027 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662028 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662029 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662030 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662031 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662032 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662033 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662034 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662035 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662036 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662037 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662038 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662039 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662040 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662041 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662042 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662043 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662044 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662045 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662046 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662047 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662048 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662049 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662050 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662051 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662052 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662053 6 0.0000 1.000 0.000 0.000 0 0.000 0.000 1
#> SRR1662054 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662055 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662056 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662057 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662058 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662059 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662060 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662061 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662062 4 0.3868 0.992 0.496 0.000 0 0.504 0.000 0
#> SRR1662063 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662064 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662065 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662066 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662067 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662068 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662069 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662070 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662071 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662072 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662073 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662074 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662075 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662076 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662077 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662078 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662079 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662080 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662081 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662082 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662083 4 0.3868 0.999 0.492 0.000 0 0.508 0.000 0
#> SRR1662084 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662085 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662086 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662087 2 0.3930 0.621 0.000 0.576 0 0.004 0.420 0
#> SRR1662088 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662089 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662090 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662091 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662092 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662093 2 0.3728 0.710 0.000 0.652 0 0.004 0.344 0
#> SRR1662094 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662095 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662096 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662097 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662098 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662099 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662100 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662101 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662102 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662103 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662104 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662105 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662106 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662107 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662108 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662109 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662110 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662111 5 0.3996 0.825 0.004 0.000 0 0.484 0.512 0
#> SRR1662112 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662113 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662114 2 0.3619 0.738 0.000 0.680 0 0.004 0.316 0
#> SRR1662115 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662116 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
#> SRR1662117 2 0.3601 0.741 0.000 0.684 0 0.004 0.312 0
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.623 0.924 0.946 0.1873 0.836 0.836
#> 3 3 0.547 0.842 0.889 1.5092 0.765 0.719
#> 4 4 0.608 0.827 0.892 0.3316 0.746 0.580
#> 5 5 0.731 0.856 0.836 0.1463 0.973 0.923
#> 6 6 0.706 0.777 0.817 0.0589 0.934 0.799
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661717 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661718 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661719 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661720 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661721 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661722 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661723 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661724 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661725 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661726 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661727 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661728 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661729 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661730 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661731 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661732 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661733 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661734 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661735 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661736 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661826 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661827 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661828 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661829 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661830 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661831 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661832 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661833 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661834 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661835 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661836 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661837 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661838 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661839 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661840 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661841 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661843 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661844 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661845 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661846 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661847 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661848 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661849 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661850 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661851 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661852 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661853 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661854 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661855 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661856 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661857 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661858 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661859 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661860 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661861 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661862 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661863 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661864 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661865 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661866 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661867 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661868 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661869 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661870 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661871 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661872 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661873 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661874 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661875 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661876 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661877 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661878 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661879 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661880 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661881 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661882 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661883 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661884 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661885 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661886 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661887 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661888 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661889 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661890 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661891 1 0.753 1.000 0.784 0.216
#> SRR1661892 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661893 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661894 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661895 2 0.644 0.799 0.164 0.836
#> SRR1661896 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661897 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661898 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661899 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661900 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661901 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661902 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661903 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661904 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661905 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661906 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661907 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661908 2 0.506 0.850 0.112 0.888
#> SRR1661909 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661910 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661911 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661912 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661913 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661914 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661915 2 0.242 0.917 0.040 0.960
#> SRR1661916 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661917 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661918 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661919 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661920 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661921 2 0.730 0.758 0.204 0.796
#> SRR1661922 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661923 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661924 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661925 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661926 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661927 2 0.753 0.745 0.216 0.784
#> SRR1661928 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661929 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661930 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661931 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661932 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661933 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661934 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661935 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661936 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661937 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661938 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661939 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661940 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661941 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661942 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661943 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661944 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661945 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661946 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661947 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661948 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661949 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661950 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661951 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661952 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661953 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661954 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661955 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661956 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661957 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661958 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661959 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661960 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661961 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661962 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661963 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661964 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661965 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661966 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661967 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661968 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661969 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661970 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661971 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661972 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661973 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661974 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661975 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661976 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661977 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661978 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661979 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661980 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661981 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661982 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661983 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661984 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661985 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661986 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661987 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661988 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661989 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661990 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661991 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661992 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661993 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661994 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661995 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661996 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661997 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661998 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1661999 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662000 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662001 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662002 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662003 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662004 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662005 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662006 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662007 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662008 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662009 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662010 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662011 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662012 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662013 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662014 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662015 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662016 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662017 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662018 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662019 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662020 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662021 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662022 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662023 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662024 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662025 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662026 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662027 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662028 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662029 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662030 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662031 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662032 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662033 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662034 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662035 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662036 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662037 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662038 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662039 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662040 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662041 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662042 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662043 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662044 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662045 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662046 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662047 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662048 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662049 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662050 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662051 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662052 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662053 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662054 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662055 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662056 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662057 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662058 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662059 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662060 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662061 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662062 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662063 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662064 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662065 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662066 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662067 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662068 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662069 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662070 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662071 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662072 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662073 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662074 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662075 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662076 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662077 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662078 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662079 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662080 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662081 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662082 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662083 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662084 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662085 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662086 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662087 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662088 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662089 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662090 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662091 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662092 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662093 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662094 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662095 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662096 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662097 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662098 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662099 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662100 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662101 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662102 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662103 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662104 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662105 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662106 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662107 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662108 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662109 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662110 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662111 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662112 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662113 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662114 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662115 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662116 2 0.000 0.952 0.000 1.000
#> SRR1662117 2 0.000 0.952 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661717 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661718 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661719 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661720 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661721 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661722 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661723 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661724 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661725 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661726 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661727 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661728 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661729 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661730 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661731 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661732 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661733 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661734 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661735 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661736 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661766 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661767 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661768 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661769 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661770 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661771 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661772 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661773 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661774 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661775 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661776 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661777 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661778 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661779 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661780 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661781 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661782 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661783 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661784 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661785 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661786 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661787 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661788 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661789 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661790 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661791 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661792 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661793 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661794 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661795 2 0.0237 0.851 0.004 0.996 0.000
#> SRR1661796 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661797 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661798 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661799 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661800 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661801 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661802 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661803 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661804 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661805 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661806 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661807 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661808 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661809 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661810 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661811 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661812 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661813 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661814 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661815 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661816 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661817 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661818 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661819 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661820 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661821 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661822 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661823 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661824 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661825 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661826 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661827 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661828 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661829 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661830 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661831 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661832 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661833 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661834 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661835 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661836 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661837 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661838 1 0.0892 0.978 0.980 0.020 0.000
#> SRR1661839 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661840 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661841 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661843 1 0.0747 0.984 0.984 0.016 0.000
#> SRR1661844 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661845 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661846 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661847 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661848 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661849 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661850 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661851 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661852 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661853 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661854 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661855 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1661892 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661893 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661894 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661895 2 0.6309 0.315 0.496 0.504 0.000
#> SRR1661896 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661897 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661898 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661899 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661900 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661901 1 0.1031 0.971 0.976 0.024 0.000
#> SRR1661902 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661903 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661904 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661905 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661906 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661907 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661908 2 0.6225 0.490 0.432 0.568 0.000
#> SRR1661909 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661910 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661911 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661912 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661913 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661914 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661915 2 0.5948 0.631 0.360 0.640 0.000
#> SRR1661916 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661917 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661918 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661919 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661920 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661921 1 0.5016 0.570 0.760 0.240 0.000
#> SRR1661922 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661923 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661924 1 0.1964 0.913 0.944 0.056 0.000
#> SRR1661925 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661926 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661927 1 0.0592 0.991 0.988 0.012 0.000
#> SRR1661928 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661929 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661930 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661931 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661932 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661933 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661934 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661935 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661936 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661937 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661938 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661939 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661940 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661941 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661942 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661943 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661944 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661945 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661946 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661947 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661948 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661949 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661950 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661951 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661952 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661953 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661954 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661955 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661956 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661957 2 0.0000 0.851 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661958 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661959 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661960 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661961 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661962 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661963 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661964 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661965 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661966 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661967 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661968 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661969 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661970 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661971 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661972 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661973 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661974 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661975 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661976 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661977 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661978 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661979 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661980 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661981 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661982 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661983 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661984 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661985 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661986 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661987 2 0.5785 0.671 0.332 0.668 0.000
#> SRR1661988 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661989 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661990 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661991 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661992 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661993 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661994 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661995 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661996 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661997 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661998 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1661999 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662000 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662001 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662002 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662003 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662004 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662005 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662006 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662007 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662008 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662009 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662010 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662011 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662012 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662013 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662014 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662015 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662016 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662017 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662018 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662019 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662020 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662021 2 0.0424 0.848 0.008 0.992 0.000
#> SRR1662022 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662023 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662024 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662025 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662026 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662027 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662028 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662029 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662030 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662031 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662032 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662033 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662034 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662035 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662036 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662037 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662038 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662039 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662040 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662041 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662042 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662043 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662044 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662045 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662046 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662047 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662048 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662049 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662050 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662051 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662052 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662053 2 0.0592 0.846 0.012 0.988 0.000
#> SRR1662054 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662055 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662056 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662057 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662058 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662059 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662060 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662061 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662062 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662063 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662064 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662065 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662066 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662067 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662068 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662069 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662070 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662071 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662072 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662073 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662074 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662075 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662076 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662077 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662078 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662079 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662080 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662081 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662082 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662083 2 0.7999 0.718 0.196 0.656 0.148
#> SRR1662084 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662085 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662086 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662087 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662088 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662089 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662090 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662091 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662092 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662093 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662094 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662095 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662096 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662097 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662098 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662099 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662100 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662101 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662102 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662103 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662104 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662105 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662106 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662107 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662108 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662109 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662110 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662111 2 0.7500 0.751 0.164 0.696 0.140
#> SRR1662112 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662113 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662114 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662115 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662116 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
#> SRR1662117 2 0.7508 0.751 0.156 0.696 0.148
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661717 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661718 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661719 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661720 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661721 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661722 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661723 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661724 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661725 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661726 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661727 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661728 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661729 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661730 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661731 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661732 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661733 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661734 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661735 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661736 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661737 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661738 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661739 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661740 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661741 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661742 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661743 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661744 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661745 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661746 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661747 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661748 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661749 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661750 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661751 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661752 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661753 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661754 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661755 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661756 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661757 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661758 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661759 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661760 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661761 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661762 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661763 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661764 2 0.0592 0.8705 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1661766 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661767 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661768 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661769 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661770 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661771 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661772 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661773 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661774 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661775 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661776 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661777 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661778 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661779 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661780 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661781 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661782 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661783 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661784 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661785 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661786 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661787 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661788 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661789 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661790 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661791 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661792 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661793 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661794 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661795 2 0.3688 0.7493 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1661796 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661797 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661798 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661799 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661800 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661801 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661802 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661803 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661804 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661805 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661806 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661807 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661808 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661809 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661810 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661811 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661812 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661813 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661814 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661815 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661816 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661817 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661818 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661819 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661820 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661821 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661822 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661823 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661824 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661825 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1661826 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661827 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661828 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661829 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661830 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661831 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661832 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661833 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661834 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661835 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661836 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661837 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661838 1 0.0524 0.9453 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1661839 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661840 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661841 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661843 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661844 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661845 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661846 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661847 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661848 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661849 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661850 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661851 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661852 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661853 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661854 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661855 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661856 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.0000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661893 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661894 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661895 1 0.6894 0.0998 0.552 0.320 0.000 0.128
#> SRR1661896 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661897 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661898 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661899 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661900 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661901 1 0.0927 0.9260 0.976 0.016 0.000 0.008
#> SRR1661902 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661903 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661904 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661905 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661906 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661907 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661908 1 0.6961 0.0343 0.512 0.368 0.000 0.120
#> SRR1661909 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661910 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661911 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661912 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661913 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661914 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661915 1 0.7423 -0.1295 0.428 0.404 0.000 0.168
#> SRR1661916 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661917 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661918 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661919 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661920 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661921 1 0.5705 0.4363 0.704 0.204 0.000 0.092
#> SRR1661922 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661923 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661924 1 0.2882 0.7977 0.892 0.084 0.000 0.024
#> SRR1661925 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661926 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661927 1 0.0188 0.9536 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1661928 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661929 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661930 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661931 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661932 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661933 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661934 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661935 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661936 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661937 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661938 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661939 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661940 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661941 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661942 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661943 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661944 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661945 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661946 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661947 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661948 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661949 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661950 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661951 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661952 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661953 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661954 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661955 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661956 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661957 2 0.0469 0.8708 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1661958 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661959 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661960 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661961 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661962 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661963 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661964 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661965 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661966 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661967 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661968 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661969 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661970 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661971 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661972 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661973 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661974 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661975 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661976 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661977 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661978 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661979 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661980 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661981 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661982 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661983 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661984 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661985 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661986 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661987 4 0.2334 0.6590 0.088 0.004 0.000 0.908
#> SRR1661988 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661989 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661990 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661991 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661992 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661993 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661994 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661995 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661996 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661997 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661998 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1661999 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662000 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662001 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662002 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662003 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662004 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662005 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662006 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662007 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662008 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662009 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662010 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662011 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662012 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662013 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662014 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662015 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662016 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662017 4 0.4188 0.8373 0.004 0.244 0.000 0.752
#> SRR1662018 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662019 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662020 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662021 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1662022 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662023 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662024 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662025 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662026 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662027 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662028 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662029 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662030 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662031 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662032 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662033 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662034 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1662035 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662036 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662037 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662038 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662039 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662040 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662041 2 0.0376 0.8696 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1662042 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662043 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662044 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662045 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662046 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662047 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662048 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662049 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662050 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662051 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662052 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662053 2 0.0188 0.8683 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1662054 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662055 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662056 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662057 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662058 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662059 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662060 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662061 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662062 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662063 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662064 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662065 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662066 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662067 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662068 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662069 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662070 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662071 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662072 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662073 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662074 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662075 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662076 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662077 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662078 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662079 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662080 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662081 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662082 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662083 2 0.6551 0.6071 0.208 0.672 0.024 0.096
#> SRR1662084 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662085 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662086 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662087 4 0.5233 0.4975 0.004 0.412 0.004 0.580
#> SRR1662088 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662089 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662090 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662091 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662092 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662093 4 0.5139 0.5840 0.004 0.380 0.004 0.612
#> SRR1662094 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662095 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662096 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662097 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662098 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662099 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662100 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662101 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662102 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662103 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662104 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662105 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662106 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662107 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662108 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662109 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662110 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662111 2 0.5441 0.4451 0.016 0.644 0.008 0.332
#> SRR1662112 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662113 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662114 4 0.5201 0.5348 0.004 0.400 0.004 0.592
#> SRR1662115 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662116 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
#> SRR1662117 4 0.4368 0.8378 0.004 0.244 0.004 0.748
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661717 2 0.3857 0.796 0.000 0.808 0.000 0.108 0.084
#> SRR1661718 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661719 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661720 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661721 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661722 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661723 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661724 2 0.3857 0.796 0.000 0.808 0.000 0.108 0.084
#> SRR1661725 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661726 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661727 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661728 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661729 2 0.3857 0.796 0.000 0.808 0.000 0.108 0.084
#> SRR1661730 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661731 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661732 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661733 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661734 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661735 2 0.3862 0.796 0.000 0.808 0.000 0.104 0.088
#> SRR1661736 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661737 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661738 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661739 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661740 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661741 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661742 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661743 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661744 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661745 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661746 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661747 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661748 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661749 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661750 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661751 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661752 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661753 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661754 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661755 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661756 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661757 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661758 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661759 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661760 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661761 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661762 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661763 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661764 2 0.1830 0.817 0.000 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR1661766 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661767 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661768 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661769 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661770 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661771 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661772 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661773 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661774 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661775 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661776 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661777 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661778 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661779 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661780 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661781 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661782 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661783 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661784 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661785 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661786 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661787 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661788 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661789 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661790 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661791 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661792 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661793 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661794 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661795 2 0.3731 0.798 0.000 0.816 0.000 0.112 0.072
#> SRR1661796 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661797 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661798 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661799 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661800 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661801 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661802 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661803 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661804 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661805 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661806 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661807 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661808 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661809 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661810 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661811 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661812 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661813 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661814 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661815 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661816 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661817 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661818 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661819 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661820 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661821 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661822 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661823 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661824 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661825 2 0.3318 0.807 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1661826 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0290 0.981 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1661839 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.1386 0.921 0.952 0.016 0.000 0.000 0.032
#> SRR1661896 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0162 0.987 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.1493 0.912 0.948 0.028 0.000 0.000 0.024
#> SRR1661909 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.2529 0.830 0.900 0.040 0.000 0.004 0.056
#> SRR1661916 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0693 0.959 0.980 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1661922 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0162 0.987 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661929 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661930 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661931 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661932 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661933 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661934 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661935 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661936 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661937 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661938 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661939 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661940 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661941 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661942 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661943 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661944 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661945 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661946 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661947 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661948 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661949 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661950 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661951 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661952 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661953 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661954 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661955 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661956 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661957 2 0.1894 0.817 0.000 0.920 0.000 0.072 0.008
#> SRR1661958 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661959 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661960 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661961 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661962 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661963 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661964 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661965 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661966 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661967 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661968 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661969 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661970 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661971 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661972 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661973 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661974 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661975 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661976 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661977 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661978 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661979 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661980 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661981 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661982 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661983 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661984 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661985 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661986 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661987 4 0.6388 1.000 0.244 0.000 0.000 0.516 0.240
#> SRR1661988 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661989 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661990 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661991 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661992 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661993 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661994 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661995 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661996 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661997 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661998 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1661999 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662000 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662001 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662002 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662003 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662004 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662005 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662006 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662007 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662008 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662009 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662010 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662011 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662012 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662013 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662014 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662015 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662016 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662017 5 0.1492 0.942 0.000 0.008 0.004 0.040 0.948
#> SRR1662018 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662019 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662020 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662021 2 0.2358 0.809 0.000 0.888 0.000 0.104 0.008
#> SRR1662022 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662023 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662024 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662025 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662026 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662027 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662028 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662029 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662030 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662031 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662032 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662033 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662034 2 0.2233 0.809 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1662035 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662036 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662037 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662038 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662039 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662040 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662041 2 0.2249 0.811 0.000 0.896 0.000 0.096 0.008
#> SRR1662042 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662043 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662044 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662045 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662046 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662047 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662048 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662049 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662050 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662051 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662052 2 0.2020 0.808 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1662053 2 0.2074 0.808 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1662054 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662055 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662056 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662057 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662058 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662059 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662060 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662061 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662062 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662063 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662064 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662065 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662066 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662067 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662068 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662069 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662070 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662071 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662072 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662073 2 0.8327 0.403 0.200 0.424 0.124 0.240 0.012
#> SRR1662074 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662075 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662076 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662077 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662078 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662079 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662080 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662081 2 0.8381 0.407 0.200 0.424 0.120 0.240 0.016
#> SRR1662082 2 0.8327 0.403 0.200 0.424 0.124 0.240 0.012
#> SRR1662083 2 0.8310 0.405 0.200 0.424 0.120 0.244 0.012
#> SRR1662084 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662085 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662086 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662087 5 0.4899 0.547 0.096 0.164 0.008 0.000 0.732
#> SRR1662088 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662089 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662090 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662091 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662092 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662093 5 0.3477 0.691 0.024 0.140 0.008 0.000 0.828
#> SRR1662094 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662095 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662096 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662097 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662098 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662099 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662100 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662101 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662102 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662103 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662104 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662105 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662106 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662107 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662108 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662109 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662110 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662111 5 0.6302 0.210 0.120 0.316 0.016 0.000 0.548
#> SRR1662112 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662113 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662114 5 0.3190 0.704 0.012 0.140 0.008 0.000 0.840
#> SRR1662115 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662116 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1662117 5 0.0566 0.941 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661717 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661718 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661719 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661720 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661721 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661722 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661723 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661724 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661725 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661726 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661727 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661728 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661729 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661730 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661731 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661732 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661733 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661734 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661735 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661736 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661737 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661738 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661739 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661740 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661741 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661742 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661743 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661744 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661745 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661746 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661747 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661748 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661749 2 0.1464 0.645 0.000 0.944 0.000 0.004 0.016 0.036
#> SRR1661750 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661751 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661752 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661753 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661754 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661755 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661756 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661757 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661758 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661759 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661760 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661761 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661762 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661763 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661764 2 0.1155 0.643 0.000 0.956 0.000 0.004 0.004 0.036
#> SRR1661766 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661767 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661768 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661769 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661770 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661771 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661772 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661773 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661774 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661775 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661776 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661777 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661778 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661779 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661780 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661781 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661782 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661783 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661784 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661785 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661786 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661787 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661788 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661789 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661790 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661791 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661792 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661793 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661794 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661795 2 0.3178 0.617 0.000 0.804 0.000 0.004 0.176 0.016
#> SRR1661796 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661797 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661798 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661799 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661800 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661801 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661802 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661803 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661804 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661805 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661806 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661807 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661808 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661809 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661810 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661811 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661812 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661813 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661814 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661815 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661816 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661817 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661818 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661819 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661820 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661821 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661822 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661823 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661824 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661825 6 0.3409 1.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1661826 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0146 0.989 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661856 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661857 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661858 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661859 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661860 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661861 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661862 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661863 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661864 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661865 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661866 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661867 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661868 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661869 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661870 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661871 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661872 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661873 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661874 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661875 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661876 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661877 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661878 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661879 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661880 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661881 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661882 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661883 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661884 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661885 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661886 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661887 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661888 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661889 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661890 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661891 3 0.0000 1.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.1349 0.912 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.1493 0.907 0.936 0.004 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.2169 0.865 0.900 0.012 0.000 0.008 0.080 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.1082 0.934 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0508 0.975 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.994 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661929 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661930 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661931 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661932 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661933 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661934 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661935 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661936 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661937 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661938 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661939 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661940 2 0.0976 0.652 0.000 0.968 0.000 0.008 0.008 0.016
#> SRR1661941 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661942 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661943 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661944 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661945 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661946 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661947 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661948 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661949 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661950 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661951 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661952 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661953 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661954 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661955 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661956 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661957 2 0.0717 0.650 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1661958 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661959 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661960 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661961 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661962 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661963 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661964 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661965 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661966 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661967 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661968 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661969 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661970 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661971 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661972 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661973 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661974 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661975 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661976 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661977 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661978 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661979 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661980 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661981 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661982 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661983 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661984 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661985 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661986 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661987 4 0.4176 1.000 0.068 0.000 0.000 0.720 0.212 0.000
#> SRR1661988 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661989 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661990 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661991 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661992 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661993 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661994 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661995 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661996 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661997 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661998 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1661999 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662000 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662001 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662002 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662003 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662004 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662005 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662006 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662007 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662008 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662009 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662010 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662011 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662012 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662013 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662014 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662015 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662016 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662017 5 0.2380 0.917 0.000 0.004 0.000 0.036 0.892 0.068
#> SRR1662018 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662019 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662020 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662021 2 0.3394 0.504 0.000 0.788 0.000 0.012 0.012 0.188
#> SRR1662022 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662023 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662024 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662025 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662026 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662027 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662028 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662029 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662030 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662031 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662032 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662033 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662034 2 0.3648 0.499 0.000 0.776 0.000 0.012 0.024 0.188
#> SRR1662035 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662036 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662037 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662038 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662039 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662040 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662041 2 0.3924 0.533 0.000 0.772 0.000 0.012 0.052 0.164
#> SRR1662042 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662043 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662044 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662045 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662046 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662047 2 0.3087 0.511 0.000 0.808 0.000 0.012 0.004 0.176
#> SRR1662048 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662049 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662050 2 0.3121 0.506 0.000 0.804 0.000 0.012 0.004 0.180
#> SRR1662051 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662052 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662053 2 0.3187 0.497 0.000 0.796 0.000 0.012 0.004 0.188
#> SRR1662054 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662055 2 0.8721 0.216 0.172 0.320 0.020 0.232 0.052 0.204
#> SRR1662056 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662057 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662058 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662059 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662060 2 0.8721 0.216 0.172 0.320 0.020 0.232 0.052 0.204
#> SRR1662061 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662062 2 0.8721 0.216 0.172 0.320 0.020 0.232 0.052 0.204
#> SRR1662063 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662064 2 0.8721 0.216 0.172 0.320 0.020 0.232 0.052 0.204
#> SRR1662065 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662066 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662067 2 0.8721 0.216 0.172 0.320 0.020 0.232 0.052 0.204
#> SRR1662068 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662069 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662070 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662071 2 0.8721 0.216 0.172 0.320 0.020 0.232 0.052 0.204
#> SRR1662072 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662073 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662074 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662075 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662076 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662077 2 0.8721 0.216 0.172 0.320 0.020 0.232 0.052 0.204
#> SRR1662078 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662079 2 0.8721 0.216 0.172 0.320 0.020 0.232 0.052 0.204
#> SRR1662080 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662081 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662082 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662083 2 0.8664 0.217 0.172 0.320 0.016 0.236 0.052 0.204
#> SRR1662084 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662085 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662086 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662087 5 0.4201 0.567 0.080 0.176 0.000 0.004 0.740 0.000
#> SRR1662088 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662089 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662090 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662091 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662092 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662093 5 0.2734 0.695 0.008 0.148 0.000 0.004 0.840 0.000
#> SRR1662094 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662095 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662096 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662097 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662098 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662099 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662100 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662101 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662102 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662103 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662104 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662105 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662106 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662107 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662108 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662109 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662110 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662111 5 0.5673 0.199 0.136 0.336 0.000 0.008 0.520 0.000
#> SRR1662112 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662113 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662114 5 0.2482 0.699 0.000 0.148 0.000 0.004 0.848 0.000
#> SRR1662115 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662116 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1662117 5 0.0291 0.918 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 14373 rows and 400 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.649 0.905 0.945 0.4830 0.500 0.500
#> 3 3 0.539 0.774 0.854 0.2739 0.888 0.777
#> 4 4 0.576 0.584 0.735 0.1410 0.803 0.536
#> 5 5 0.560 0.534 0.666 0.0807 0.797 0.442
#> 6 6 0.616 0.588 0.629 0.0400 0.820 0.482
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1661716 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661717 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661718 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661719 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661720 2 0.5842 0.862 0.140 0.860
#> SRR1661721 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661722 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661723 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661724 2 0.5842 0.862 0.140 0.860
#> SRR1661725 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661726 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661727 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661728 2 0.5737 0.866 0.136 0.864
#> SRR1661729 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661730 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661731 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661732 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661733 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661734 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661735 2 0.5946 0.857 0.144 0.856
#> SRR1661736 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661737 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661738 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661739 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661740 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661741 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661742 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661743 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661744 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661745 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661746 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661747 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661748 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661749 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661750 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661751 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661752 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661753 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661754 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661755 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661756 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661757 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661758 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661759 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661760 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661761 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661762 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661763 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661764 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661766 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661767 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661768 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661769 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661770 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661771 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661772 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661773 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661774 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661775 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661776 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661777 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661778 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661779 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661780 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661781 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661782 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661783 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661784 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661785 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661786 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661787 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661788 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661789 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661790 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661791 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661792 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661793 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661794 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661795 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661796 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661797 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661798 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661799 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661800 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661801 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661802 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661803 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661804 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661805 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661806 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661807 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661808 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661809 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661810 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661811 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661812 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661813 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661814 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661815 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661816 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661817 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661818 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661819 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661820 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661821 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661822 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661823 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661824 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661825 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661826 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661827 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661828 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661829 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661830 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661831 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661832 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661833 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661834 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661835 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661836 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661837 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661838 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661839 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661840 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661841 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661843 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661844 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661845 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661846 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661847 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661848 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661849 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661850 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661851 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661852 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661853 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661854 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661855 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661856 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661857 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661858 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661859 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661860 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661861 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661862 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661863 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661864 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661865 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661866 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661867 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661868 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661869 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661870 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661871 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661872 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661873 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661874 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661875 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661876 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661877 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661878 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661879 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661880 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661881 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661882 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661883 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661884 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661885 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661886 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661887 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661888 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661889 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661890 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661891 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661892 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661893 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661894 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661895 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661896 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661897 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661898 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661899 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661900 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661901 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661902 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661903 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661904 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661905 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661906 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661907 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661908 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661909 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661910 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661911 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661912 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661913 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661914 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661915 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661916 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661917 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661918 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661919 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661920 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661921 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661922 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661923 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661924 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661925 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661926 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661927 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661928 2 0.1184 0.956 0.016 0.984
#> SRR1661929 2 0.2603 0.941 0.044 0.956
#> SRR1661930 2 0.1184 0.956 0.016 0.984
#> SRR1661931 2 0.1843 0.950 0.028 0.972
#> SRR1661932 2 0.1184 0.956 0.016 0.984
#> SRR1661933 2 0.1184 0.956 0.016 0.984
#> SRR1661934 2 0.1633 0.952 0.024 0.976
#> SRR1661935 2 0.2043 0.948 0.032 0.968
#> SRR1661936 2 0.1633 0.952 0.024 0.976
#> SRR1661937 2 0.2043 0.948 0.032 0.968
#> SRR1661938 2 0.0376 0.960 0.004 0.996
#> SRR1661939 2 0.1633 0.952 0.024 0.976
#> SRR1661940 2 0.2043 0.948 0.032 0.968
#> SRR1661941 2 0.0672 0.959 0.008 0.992
#> SRR1661942 2 0.0938 0.957 0.012 0.988
#> SRR1661943 2 0.1633 0.952 0.024 0.976
#> SRR1661944 2 0.1184 0.956 0.016 0.984
#> SRR1661945 2 0.1843 0.951 0.028 0.972
#> SRR1661946 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661947 2 0.0938 0.957 0.012 0.988
#> SRR1661948 2 0.1633 0.952 0.024 0.976
#> SRR1661949 2 0.2236 0.946 0.036 0.964
#> SRR1661950 2 0.1633 0.952 0.024 0.976
#> SRR1661951 2 0.1633 0.952 0.024 0.976
#> SRR1661952 2 0.1414 0.954 0.020 0.980
#> SRR1661953 2 0.1633 0.952 0.024 0.976
#> SRR1661954 2 0.1414 0.954 0.020 0.980
#> SRR1661955 2 0.0938 0.957 0.012 0.988
#> SRR1661956 2 0.1414 0.954 0.020 0.980
#> SRR1661957 2 0.0000 0.961 0.000 1.000
#> SRR1661958 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661959 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661960 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661961 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661962 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661963 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661964 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661965 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661966 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661967 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661968 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661969 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661970 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661971 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661972 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661973 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661974 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661975 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661976 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661977 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661978 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661979 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661980 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661981 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661982 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661983 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661984 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661985 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661986 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661987 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1661988 1 0.8443 0.718 0.728 0.272
#> SRR1661989 1 0.8661 0.692 0.712 0.288
#> SRR1661990 1 0.7745 0.777 0.772 0.228
#> SRR1661991 1 0.8081 0.753 0.752 0.248
#> SRR1661992 1 0.8207 0.742 0.744 0.256
#> SRR1661993 1 0.8081 0.753 0.752 0.248
#> SRR1661994 1 0.8016 0.758 0.756 0.244
#> SRR1661995 1 0.7745 0.777 0.772 0.228
#> SRR1661996 1 0.8081 0.753 0.752 0.248
#> SRR1661997 1 0.8555 0.705 0.720 0.280
#> SRR1661998 1 0.7950 0.763 0.760 0.240
#> SRR1661999 1 0.8016 0.758 0.756 0.244
#> SRR1662000 1 0.7745 0.777 0.772 0.228
#> SRR1662001 1 0.8207 0.742 0.744 0.256
#> SRR1662002 1 0.8555 0.705 0.720 0.280
#> SRR1662003 1 0.7883 0.768 0.764 0.236
#> SRR1662004 1 0.8267 0.736 0.740 0.260
#> SRR1662005 1 0.7883 0.768 0.764 0.236
#> SRR1662006 1 0.8555 0.705 0.720 0.280
#> SRR1662007 1 0.8813 0.670 0.700 0.300
#> SRR1662008 1 0.8608 0.699 0.716 0.284
#> SRR1662009 1 0.8499 0.712 0.724 0.276
#> SRR1662010 1 0.7745 0.777 0.772 0.228
#> SRR1662011 1 0.7745 0.777 0.772 0.228
#> SRR1662012 1 0.7883 0.768 0.764 0.236
#> SRR1662013 1 0.8327 0.730 0.736 0.264
#> SRR1662014 1 0.8327 0.730 0.736 0.264
#> SRR1662015 1 0.8555 0.705 0.720 0.280
#> SRR1662016 1 0.8386 0.724 0.732 0.268
#> SRR1662017 1 0.8555 0.705 0.720 0.280
#> SRR1662018 2 0.4022 0.920 0.080 0.920
#> SRR1662019 2 0.5178 0.887 0.116 0.884
#> SRR1662020 2 0.4939 0.894 0.108 0.892
#> SRR1662021 2 0.7815 0.747 0.232 0.768
#> SRR1662022 2 0.5737 0.869 0.136 0.864
#> SRR1662023 2 0.3879 0.920 0.076 0.924
#> SRR1662024 2 0.3879 0.922 0.076 0.924
#> SRR1662025 2 0.4815 0.898 0.104 0.896
#> SRR1662026 2 0.4562 0.905 0.096 0.904
#> SRR1662027 2 0.5737 0.869 0.136 0.864
#> SRR1662028 2 0.5059 0.894 0.112 0.888
#> SRR1662029 2 0.5519 0.875 0.128 0.872
#> SRR1662030 2 0.4562 0.908 0.096 0.904
#> SRR1662031 2 0.4431 0.911 0.092 0.908
#> SRR1662032 2 0.4562 0.906 0.096 0.904
#> SRR1662033 2 0.3733 0.923 0.072 0.928
#> SRR1662034 2 0.6048 0.852 0.148 0.852
#> SRR1662035 2 0.3431 0.930 0.064 0.936
#> SRR1662036 2 0.4298 0.913 0.088 0.912
#> SRR1662037 2 0.4939 0.897 0.108 0.892
#> SRR1662038 2 0.4815 0.898 0.104 0.896
#> SRR1662039 2 0.3114 0.934 0.056 0.944
#> SRR1662040 2 0.4161 0.917 0.084 0.916
#> SRR1662041 2 0.6531 0.825 0.168 0.832
#> SRR1662042 2 0.4690 0.904 0.100 0.900
#> SRR1662043 2 0.4562 0.908 0.096 0.904
#> SRR1662044 2 0.4298 0.913 0.088 0.912
#> SRR1662045 2 0.4298 0.914 0.088 0.912
#> SRR1662046 2 0.5519 0.876 0.128 0.872
#> SRR1662047 2 0.5629 0.870 0.132 0.868
#> SRR1662048 2 0.4022 0.918 0.080 0.920
#> SRR1662049 2 0.5294 0.885 0.120 0.880
#> SRR1662050 2 0.6343 0.841 0.160 0.840
#> SRR1662051 2 0.5408 0.879 0.124 0.876
#> SRR1662052 2 0.5294 0.884 0.120 0.880
#> SRR1662053 2 0.3584 0.928 0.068 0.932
#> SRR1662054 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662055 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662056 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662057 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662058 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662059 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662060 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662061 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662062 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662063 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662064 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662065 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662066 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662067 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662068 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662069 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662070 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662071 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662072 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662073 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662074 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662075 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662076 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662077 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662078 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662079 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662080 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662081 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662082 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662083 1 0.0000 0.915 1.000 0.000
#> SRR1662084 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662085 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662086 1 0.7453 0.795 0.788 0.212
#> SRR1662087 1 0.5946 0.840 0.856 0.144
#> SRR1662088 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662089 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662090 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662091 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662092 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662093 1 0.6887 0.814 0.816 0.184
#> SRR1662094 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662095 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662096 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662097 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662098 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662099 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662100 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662101 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662102 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662103 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662104 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662105 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662106 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662107 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662108 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662109 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662110 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662111 1 0.0938 0.909 0.988 0.012
#> SRR1662112 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662113 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662114 1 0.7219 0.804 0.800 0.200
#> SRR1662115 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662116 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
#> SRR1662117 1 0.7376 0.798 0.792 0.208
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1661716 2 0.7607 0.402 0.052 0.584 0.364
#> SRR1661717 2 0.7492 0.456 0.052 0.608 0.340
#> SRR1661718 2 0.7513 0.448 0.052 0.604 0.344
#> SRR1661719 2 0.7607 0.401 0.052 0.584 0.364
#> SRR1661720 2 0.7492 0.459 0.052 0.608 0.340
#> SRR1661721 2 0.7685 0.350 0.052 0.564 0.384
#> SRR1661722 2 0.7640 0.381 0.052 0.576 0.372
#> SRR1661723 2 0.7712 0.327 0.052 0.556 0.392
#> SRR1661724 2 0.7470 0.466 0.052 0.612 0.336
#> SRR1661725 2 0.7513 0.450 0.052 0.604 0.344
#> SRR1661726 2 0.7640 0.382 0.052 0.576 0.372
#> SRR1661727 2 0.7533 0.439 0.052 0.600 0.348
#> SRR1661728 2 0.7571 0.420 0.052 0.592 0.356
#> SRR1661729 2 0.7552 0.430 0.052 0.596 0.352
#> SRR1661730 2 0.7552 0.430 0.052 0.596 0.352
#> SRR1661731 2 0.7736 0.302 0.052 0.548 0.400
#> SRR1661732 2 0.7624 0.392 0.052 0.580 0.368
#> SRR1661733 2 0.7656 0.372 0.052 0.572 0.376
#> SRR1661734 2 0.7552 0.430 0.052 0.596 0.352
#> SRR1661735 2 0.7571 0.422 0.052 0.592 0.356
#> SRR1661736 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661737 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661738 2 0.0747 0.890 0.016 0.984 0.000
#> SRR1661739 2 0.0747 0.890 0.016 0.984 0.000
#> SRR1661740 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661741 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661742 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661743 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661744 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661745 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661746 2 0.0424 0.888 0.008 0.992 0.000
#> SRR1661747 2 0.0592 0.889 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661748 2 0.0747 0.890 0.016 0.984 0.000
#> SRR1661749 2 0.0747 0.890 0.016 0.984 0.000
#> SRR1661750 2 0.0892 0.890 0.020 0.980 0.000
#> SRR1661751 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661752 2 0.0592 0.889 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661753 2 0.0592 0.889 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661754 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661755 2 0.0424 0.890 0.008 0.992 0.000
#> SRR1661756 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661757 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661758 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661759 2 0.0592 0.889 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661760 2 0.0592 0.889 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661761 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661762 2 0.0747 0.890 0.016 0.984 0.000
#> SRR1661763 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661764 2 0.0592 0.890 0.012 0.988 0.000
#> SRR1661766 2 0.2297 0.885 0.036 0.944 0.020
#> SRR1661767 2 0.2564 0.883 0.036 0.936 0.028
#> SRR1661768 2 0.2434 0.884 0.036 0.940 0.024
#> SRR1661769 2 0.2550 0.882 0.040 0.936 0.024
#> SRR1661770 2 0.2434 0.884 0.036 0.940 0.024
#> SRR1661771 2 0.2152 0.886 0.036 0.948 0.016
#> SRR1661772 2 0.2918 0.878 0.044 0.924 0.032
#> SRR1661773 2 0.2550 0.882 0.040 0.936 0.024
#> SRR1661774 2 0.1999 0.886 0.036 0.952 0.012
#> SRR1661775 2 0.2550 0.882 0.040 0.936 0.024
#> SRR1661776 2 0.2297 0.885 0.036 0.944 0.020
#> SRR1661777 2 0.2434 0.884 0.036 0.940 0.024
#> SRR1661778 2 0.2434 0.884 0.036 0.940 0.024
#> SRR1661779 2 0.2152 0.886 0.036 0.948 0.016
#> SRR1661780 2 0.2434 0.884 0.036 0.940 0.024
#> SRR1661781 2 0.2434 0.884 0.036 0.940 0.024
#> SRR1661782 2 0.2152 0.886 0.036 0.948 0.016
#> SRR1661783 2 0.2689 0.881 0.036 0.932 0.032
#> SRR1661784 2 0.2681 0.881 0.040 0.932 0.028
#> SRR1661785 2 0.2434 0.884 0.036 0.940 0.024
#> SRR1661786 2 0.2152 0.886 0.036 0.948 0.016
#> SRR1661787 2 0.2297 0.885 0.036 0.944 0.020
#> SRR1661788 2 0.2564 0.883 0.036 0.936 0.028
#> SRR1661789 2 0.2681 0.881 0.040 0.932 0.028
#> SRR1661790 2 0.2297 0.885 0.036 0.944 0.020
#> SRR1661791 2 0.2297 0.885 0.036 0.944 0.020
#> SRR1661792 2 0.2152 0.886 0.036 0.948 0.016
#> SRR1661793 2 0.2550 0.882 0.040 0.936 0.024
#> SRR1661794 2 0.2297 0.885 0.036 0.944 0.020
#> SRR1661795 2 0.2152 0.886 0.036 0.948 0.016
#> SRR1661796 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661797 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661798 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661799 2 0.3112 0.867 0.096 0.900 0.004
#> SRR1661800 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661801 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661802 2 0.3112 0.867 0.096 0.900 0.004
#> SRR1661803 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661804 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661805 2 0.3193 0.865 0.100 0.896 0.004
#> SRR1661806 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661807 2 0.3272 0.863 0.104 0.892 0.004
#> SRR1661808 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661809 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661810 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661811 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661812 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661813 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661814 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661815 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661816 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661817 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661818 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661819 2 0.3193 0.866 0.100 0.896 0.004
#> SRR1661820 2 0.3193 0.865 0.100 0.896 0.004
#> SRR1661821 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661822 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661823 2 0.2945 0.871 0.088 0.908 0.004
#> SRR1661824 2 0.3193 0.865 0.100 0.896 0.004
#> SRR1661825 2 0.3030 0.869 0.092 0.904 0.004
#> SRR1661826 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661827 1 0.2590 0.850 0.924 0.004 0.072
#> SRR1661828 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661829 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661830 1 0.2400 0.849 0.932 0.004 0.064
#> SRR1661831 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661832 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661833 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661834 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661835 1 0.2356 0.851 0.928 0.000 0.072
#> SRR1661836 1 0.2486 0.847 0.932 0.008 0.060
#> SRR1661837 1 0.2400 0.849 0.932 0.004 0.064
#> SRR1661838 1 0.2448 0.850 0.924 0.000 0.076
#> SRR1661839 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661840 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661841 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661843 1 0.2590 0.850 0.924 0.004 0.072
#> SRR1661844 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661845 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661846 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661847 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661848 1 0.2356 0.851 0.928 0.000 0.072
#> SRR1661849 1 0.2680 0.849 0.924 0.008 0.068
#> SRR1661850 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661851 1 0.2590 0.850 0.924 0.004 0.072
#> SRR1661852 1 0.2356 0.851 0.928 0.000 0.072
#> SRR1661853 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661854 1 0.2400 0.849 0.932 0.004 0.064
#> SRR1661855 1 0.2496 0.851 0.928 0.004 0.068
#> SRR1661856 2 0.2743 0.879 0.052 0.928 0.020
#> SRR1661857 2 0.2414 0.887 0.040 0.940 0.020
#> SRR1661858 2 0.2846 0.879 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661859 2 0.2527 0.887 0.044 0.936 0.020
#> SRR1661860 2 0.2846 0.877 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661861 2 0.2414 0.885 0.040 0.940 0.020
#> SRR1661862 2 0.2414 0.885 0.040 0.940 0.020
#> SRR1661863 2 0.3112 0.874 0.056 0.916 0.028
#> SRR1661864 2 0.2743 0.879 0.052 0.928 0.020
#> SRR1661865 2 0.2846 0.877 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661866 2 0.3213 0.872 0.060 0.912 0.028
#> SRR1661867 2 0.2636 0.880 0.048 0.932 0.020
#> SRR1661868 2 0.2846 0.877 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661869 2 0.2527 0.884 0.044 0.936 0.020
#> SRR1661870 2 0.1919 0.888 0.024 0.956 0.020
#> SRR1661871 2 0.2414 0.883 0.040 0.940 0.020
#> SRR1661872 2 0.2879 0.877 0.052 0.924 0.024
#> SRR1661873 2 0.2846 0.877 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661874 2 0.2846 0.877 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661875 2 0.2743 0.879 0.052 0.928 0.020
#> SRR1661876 2 0.2846 0.877 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661877 2 0.2846 0.879 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661878 2 0.2846 0.877 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661879 2 0.3472 0.869 0.056 0.904 0.040
#> SRR1661880 2 0.2879 0.877 0.052 0.924 0.024
#> SRR1661881 2 0.3337 0.870 0.060 0.908 0.032
#> SRR1661882 2 0.2846 0.879 0.056 0.924 0.020
#> SRR1661883 2 0.2743 0.879 0.052 0.928 0.020
#> SRR1661884 2 0.2743 0.879 0.052 0.928 0.020
#> SRR1661885 2 0.2982 0.875 0.056 0.920 0.024
#> SRR1661886 2 0.3337 0.870 0.060 0.908 0.032
#> SRR1661887 2 0.3692 0.864 0.056 0.896 0.048
#> SRR1661888 2 0.2743 0.879 0.052 0.928 0.020
#> SRR1661889 2 0.2636 0.880 0.048 0.932 0.020
#> SRR1661890 2 0.3472 0.868 0.056 0.904 0.040
#> SRR1661891 2 0.2636 0.882 0.048 0.932 0.020
#> SRR1661892 1 0.2959 0.846 0.900 0.000 0.100
#> SRR1661893 1 0.3192 0.841 0.888 0.000 0.112
#> SRR1661894 1 0.2959 0.846 0.900 0.000 0.100
#> SRR1661895 1 0.3551 0.826 0.868 0.000 0.132
#> SRR1661896 1 0.3267 0.838 0.884 0.000 0.116
#> SRR1661897 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661898 1 0.2959 0.848 0.900 0.000 0.100
#> SRR1661899 1 0.2878 0.847 0.904 0.000 0.096
#> SRR1661900 1 0.2878 0.847 0.904 0.000 0.096
#> SRR1661901 1 0.3038 0.844 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661902 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661903 1 0.3116 0.845 0.892 0.000 0.108
#> SRR1661904 1 0.2959 0.846 0.900 0.000 0.100
#> SRR1661905 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661906 1 0.2959 0.846 0.900 0.000 0.100
#> SRR1661907 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661908 1 0.3192 0.841 0.888 0.000 0.112
#> SRR1661909 1 0.3116 0.845 0.892 0.000 0.108
#> SRR1661910 1 0.3267 0.838 0.884 0.000 0.116
#> SRR1661911 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661912 1 0.3116 0.845 0.892 0.000 0.108
#> SRR1661913 1 0.3116 0.845 0.892 0.000 0.108
#> SRR1661914 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661915 1 0.3941 0.812 0.844 0.000 0.156
#> SRR1661916 1 0.3116 0.845 0.892 0.000 0.108
#> SRR1661917 1 0.2878 0.847 0.904 0.000 0.096
#> SRR1661918 1 0.3116 0.845 0.892 0.000 0.108
#> SRR1661919 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661920 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661921 1 0.3192 0.841 0.888 0.000 0.112
#> SRR1661922 1 0.3116 0.845 0.892 0.000 0.108
#> SRR1661923 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661924 1 0.3340 0.835 0.880 0.000 0.120
#> SRR1661925 1 0.2959 0.846 0.900 0.000 0.100
#> SRR1661926 1 0.2959 0.846 0.900 0.000 0.100
#> SRR1661927 1 0.3038 0.847 0.896 0.000 0.104
#> SRR1661928 2 0.4233 0.821 0.160 0.836 0.004
#> SRR1661929 2 0.4409 0.808 0.172 0.824 0.004
#> SRR1661930 2 0.4047 0.832 0.148 0.848 0.004
#> SRR1661931 2 0.4047 0.830 0.148 0.848 0.004
#> SRR1661932 2 0.4521 0.801 0.180 0.816 0.004
#> SRR1661933 2 0.3983 0.834 0.144 0.852 0.004
#> SRR1661934 2 0.4047 0.832 0.148 0.848 0.004
#> SRR1661935 2 0.4883 0.770 0.208 0.788 0.004
#> SRR1661936 2 0.5024 0.759 0.220 0.776 0.004
#> SRR1661937 2 0.4110 0.827 0.152 0.844 0.004
#> SRR1661938 2 0.4047 0.833 0.148 0.848 0.004
#> SRR1661939 2 0.4351 0.811 0.168 0.828 0.004
#> SRR1661940 2 0.4784 0.779 0.200 0.796 0.004
#> SRR1661941 2 0.4172 0.823 0.156 0.840 0.004
#> SRR1661942 2 0.3272 0.862 0.104 0.892 0.004
#> SRR1661943 2 0.3918 0.837 0.140 0.856 0.004
#> SRR1661944 2 0.3573 0.854 0.120 0.876 0.004
#> SRR1661945 2 0.4883 0.774 0.208 0.788 0.004
#> SRR1661946 2 0.3193 0.864 0.100 0.896 0.004
#> SRR1661947 2 0.3715 0.845 0.128 0.868 0.004
#> SRR1661948 2 0.4172 0.824 0.156 0.840 0.004
#> SRR1661949 2 0.4575 0.795 0.184 0.812 0.004
#> SRR1661950 2 0.4682 0.791 0.192 0.804 0.004
#> SRR1661951 2 0.3918 0.840 0.140 0.856 0.004
#> SRR1661952 2 0.3573 0.851 0.120 0.876 0.004
#> SRR1661953 2 0.4233 0.820 0.160 0.836 0.004
#> SRR1661954 2 0.4351 0.813 0.168 0.828 0.004
#> SRR1661955 2 0.3500 0.854 0.116 0.880 0.004
#> SRR1661956 2 0.3112 0.867 0.096 0.900 0.004
#> SRR1661957 2 0.4172 0.823 0.156 0.840 0.004
#> SRR1661958 3 0.1031 0.745 0.024 0.000 0.976
#> SRR1661959 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661960 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661961 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661962 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661963 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661964 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661965 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661966 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661967 3 0.1031 0.745 0.024 0.000 0.976
#> SRR1661968 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661969 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661970 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661971 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661972 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661973 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661974 3 0.1163 0.744 0.028 0.000 0.972
#> SRR1661975 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661976 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661977 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661978 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661979 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661980 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661981 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661982 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661983 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661984 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661985 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661986 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661987 3 0.0892 0.745 0.020 0.000 0.980
#> SRR1661988 3 0.9256 0.433 0.344 0.168 0.488
#> SRR1661989 3 0.9633 0.378 0.352 0.212 0.436
#> SRR1661990 3 0.8663 0.429 0.364 0.112 0.524
#> SRR1661991 3 0.9293 0.332 0.400 0.160 0.440
#> SRR1661992 3 0.9599 0.309 0.388 0.200 0.412
#> SRR1661993 3 0.8468 0.503 0.308 0.116 0.576
#> SRR1661994 3 0.9171 0.397 0.372 0.152 0.476
#> SRR1661995 3 0.8756 0.471 0.332 0.128 0.540
#> SRR1661996 3 0.9291 0.416 0.356 0.168 0.476
#> SRR1661997 3 0.9405 0.440 0.324 0.192 0.484
#> SRR1661998 3 0.9311 0.363 0.384 0.164 0.452
#> SRR1661999 3 0.9335 0.381 0.376 0.168 0.456
#> SRR1662000 3 0.8620 0.448 0.352 0.112 0.536
#> SRR1662001 3 0.9213 0.412 0.356 0.160 0.484
#> SRR1662002 3 0.9371 0.441 0.324 0.188 0.488
#> SRR1662003 3 0.9118 0.431 0.352 0.152 0.496
#> SRR1662004 3 0.9475 0.393 0.360 0.188 0.452
#> SRR1662005 3 0.9154 0.380 0.384 0.148 0.468
#> SRR1662006 3 0.9674 0.376 0.336 0.224 0.440
#> SRR1662007 3 0.9596 0.403 0.336 0.212 0.452
#> SRR1662008 3 0.9556 0.407 0.332 0.208 0.460
#> SRR1662009 3 0.9496 0.368 0.372 0.188 0.440
#> SRR1662010 3 0.9259 0.326 0.404 0.156 0.440
#> SRR1662011 3 0.8772 0.425 0.364 0.120 0.516
#> SRR1662012 3 0.9008 0.423 0.360 0.140 0.500
#> SRR1662013 3 0.9594 0.372 0.360 0.204 0.436
#> SRR1662014 3 0.9520 0.398 0.352 0.196 0.452
#> SRR1662015 3 0.9544 0.377 0.364 0.196 0.440
#> SRR1662016 3 0.9489 0.400 0.352 0.192 0.456
#> SRR1662017 3 0.9539 0.414 0.336 0.204 0.460
#> SRR1662018 2 0.2550 0.883 0.024 0.936 0.040
#> SRR1662019 2 0.2414 0.884 0.020 0.940 0.040
#> SRR1662020 2 0.2434 0.885 0.024 0.940 0.036
#> SRR1662021 2 0.5346 0.795 0.040 0.808 0.152
#> SRR1662022 2 0.2681 0.883 0.028 0.932 0.040
#> SRR1662023 2 0.2434 0.885 0.024 0.940 0.036
#> SRR1662024 2 0.2297 0.885 0.020 0.944 0.036
#> SRR1662025 2 0.2297 0.885 0.020 0.944 0.036
#> SRR1662026 2 0.2313 0.886 0.024 0.944 0.032
#> SRR1662027 2 0.2879 0.881 0.024 0.924 0.052
#> SRR1662028 2 0.3155 0.879 0.044 0.916 0.040
#> SRR1662029 2 0.2550 0.884 0.024 0.936 0.040
#> SRR1662030 2 0.3181 0.875 0.024 0.912 0.064
#> SRR1662031 2 0.2879 0.881 0.024 0.924 0.052
#> SRR1662032 2 0.2793 0.882 0.028 0.928 0.044
#> SRR1662033 2 0.2689 0.883 0.032 0.932 0.036
#> SRR1662034 2 0.2947 0.878 0.020 0.920 0.060
#> SRR1662035 2 0.2636 0.883 0.020 0.932 0.048
#> SRR1662036 2 0.2636 0.882 0.020 0.932 0.048
#> SRR1662037 2 0.3042 0.880 0.040 0.920 0.040
#> SRR1662038 2 0.2926 0.881 0.036 0.924 0.040
#> SRR1662039 2 0.2681 0.883 0.028 0.932 0.040
#> SRR1662040 2 0.3042 0.880 0.040 0.920 0.040
#> SRR1662041 2 0.4059 0.828 0.012 0.860 0.128
#> SRR1662042 2 0.2681 0.883 0.028 0.932 0.040
#> SRR1662043 2 0.2926 0.881 0.036 0.924 0.040
#> SRR1662044 2 0.2383 0.884 0.016 0.940 0.044
#> SRR1662045 2 0.2806 0.882 0.032 0.928 0.040
#> SRR1662046 2 0.2926 0.881 0.040 0.924 0.036
#> SRR1662047 2 0.2773 0.883 0.024 0.928 0.048
#> SRR1662048 2 0.2116 0.885 0.012 0.948 0.040
#> SRR1662049 2 0.2663 0.884 0.024 0.932 0.044
#> SRR1662050 2 0.3434 0.873 0.032 0.904 0.064
#> SRR1662051 2 0.2651 0.880 0.012 0.928 0.060
#> SRR1662052 2 0.2793 0.882 0.028 0.928 0.044
#> SRR1662053 2 0.2926 0.881 0.036 0.924 0.040
#> SRR1662054 3 0.4453 0.717 0.152 0.012 0.836
#> SRR1662055 3 0.4514 0.714 0.156 0.012 0.832
#> SRR1662056 3 0.4326 0.719 0.144 0.012 0.844
#> SRR1662057 3 0.4575 0.712 0.160 0.012 0.828
#> SRR1662058 3 0.4453 0.717 0.152 0.012 0.836
#> SRR1662059 3 0.4514 0.714 0.156 0.012 0.832
#> SRR1662060 3 0.4326 0.718 0.144 0.012 0.844
#> SRR1662061 3 0.4453 0.716 0.152 0.012 0.836
#> SRR1662062 3 0.4692 0.707 0.168 0.012 0.820
#> SRR1662063 3 0.4453 0.717 0.152 0.012 0.836
#> SRR1662064 3 0.4390 0.717 0.148 0.012 0.840
#> SRR1662065 3 0.4514 0.714 0.156 0.012 0.832
#> SRR1662066 3 0.4634 0.710 0.164 0.012 0.824
#> SRR1662067 3 0.4390 0.718 0.148 0.012 0.840
#> SRR1662068 3 0.4514 0.714 0.156 0.012 0.832
#> SRR1662069 3 0.4634 0.710 0.164 0.012 0.824
#> SRR1662070 3 0.4575 0.712 0.160 0.012 0.828
#> SRR1662071 3 0.4634 0.709 0.164 0.012 0.824
#> SRR1662072 3 0.4575 0.712 0.160 0.012 0.828
#> SRR1662073 3 0.4575 0.712 0.160 0.012 0.828
#> SRR1662074 3 0.4575 0.712 0.160 0.012 0.828
#> SRR1662075 3 0.4453 0.717 0.152 0.012 0.836
#> SRR1662076 3 0.4195 0.720 0.136 0.012 0.852
#> SRR1662077 3 0.4575 0.712 0.160 0.012 0.828
#> SRR1662078 3 0.4575 0.712 0.160 0.012 0.828
#> SRR1662079 3 0.4261 0.718 0.140 0.012 0.848
#> SRR1662080 3 0.4195 0.721 0.136 0.012 0.852
#> SRR1662081 3 0.4514 0.715 0.156 0.012 0.832
#> SRR1662082 3 0.4390 0.718 0.148 0.012 0.840
#> SRR1662083 3 0.4514 0.715 0.156 0.012 0.832
#> SRR1662084 1 0.5913 0.702 0.788 0.144 0.068
#> SRR1662085 1 0.5851 0.707 0.792 0.140 0.068
#> SRR1662086 1 0.6283 0.652 0.760 0.176 0.064
#> SRR1662087 1 0.5357 0.749 0.820 0.064 0.116
#> SRR1662088 1 0.5897 0.713 0.792 0.132 0.076
#> SRR1662089 1 0.5760 0.716 0.796 0.140 0.064
#> SRR1662090 1 0.5939 0.703 0.788 0.140 0.072
#> SRR1662091 1 0.5791 0.710 0.792 0.148 0.060
#> SRR1662092 1 0.5470 0.703 0.796 0.168 0.036
#> SRR1662093 1 0.5449 0.741 0.816 0.116 0.068
#> SRR1662094 1 0.6109 0.703 0.780 0.140 0.080
#> SRR1662095 1 0.5939 0.703 0.788 0.140 0.072
#> SRR1662096 1 0.5730 0.713 0.796 0.144 0.060
#> SRR1662097 1 0.5852 0.697 0.788 0.152 0.060
#> SRR1662098 1 0.5787 0.710 0.796 0.136 0.068
#> SRR1662099 1 0.5852 0.700 0.788 0.152 0.060
#> SRR1662100 1 0.5667 0.712 0.800 0.140 0.060
#> SRR1662101 1 0.5757 0.708 0.792 0.152 0.056
#> SRR1662102 1 0.5760 0.709 0.796 0.140 0.064
#> SRR1662103 1 0.5696 0.707 0.796 0.148 0.056
#> SRR1662104 1 0.5851 0.713 0.792 0.140 0.068
#> SRR1662105 1 0.5974 0.696 0.784 0.148 0.068
#> SRR1662106 1 0.5851 0.713 0.792 0.140 0.068
#> SRR1662107 1 0.5696 0.713 0.796 0.148 0.056
#> SRR1662108 1 0.5524 0.697 0.796 0.164 0.040
#> SRR1662109 1 0.5571 0.720 0.804 0.140 0.056
#> SRR1662110 1 0.5875 0.706 0.792 0.136 0.072
#> SRR1662111 1 0.4692 0.777 0.820 0.012 0.168
#> SRR1662112 1 0.6208 0.680 0.772 0.152 0.076
#> SRR1662113 1 0.6025 0.707 0.784 0.140 0.076
#> SRR1662114 1 0.5889 0.719 0.796 0.096 0.108
#> SRR1662115 1 0.5631 0.721 0.804 0.132 0.064
#> SRR1662116 1 0.5598 0.710 0.800 0.148 0.052
#> SRR1662117 1 0.5730 0.719 0.796 0.144 0.060
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1661716 2 0.5574 0.469 0.000 0.668 0.048 0.284
#> SRR1661717 2 0.5500 0.549 0.000 0.708 0.068 0.224
#> SRR1661718 2 0.5528 0.546 0.000 0.700 0.064 0.236
#> SRR1661719 2 0.5546 0.499 0.000 0.680 0.052 0.268
#> SRR1661720 2 0.5354 0.546 0.000 0.712 0.056 0.232
#> SRR1661721 2 0.5668 0.443 0.000 0.652 0.048 0.300
#> SRR1661722 2 0.5668 0.443 0.000 0.652 0.048 0.300
#> SRR1661723 2 0.5668 0.448 0.000 0.652 0.048 0.300
#> SRR1661724 2 0.5312 0.542 0.000 0.712 0.052 0.236
#> SRR1661725 2 0.5387 0.504 0.000 0.696 0.048 0.256
#> SRR1661726 2 0.5471 0.498 0.000 0.684 0.048 0.268
#> SRR1661727 2 0.5573 0.487 0.000 0.676 0.052 0.272
#> SRR1661728 2 0.5550 0.533 0.000 0.692 0.060 0.248
#> SRR1661729 2 0.5489 0.540 0.000 0.700 0.060 0.240
#> SRR1661730 2 0.5434 0.521 0.000 0.696 0.052 0.252
#> SRR1661731 2 0.5994 0.455 0.000 0.636 0.068 0.296
#> SRR1661732 2 0.5528 0.542 0.000 0.700 0.064 0.236
#> SRR1661733 2 0.5691 0.438 0.000 0.648 0.048 0.304
#> SRR1661734 2 0.5508 0.522 0.000 0.692 0.056 0.252
#> SRR1661735 2 0.5590 0.537 0.000 0.692 0.064 0.244
#> SRR1661736 2 0.5050 0.430 0.000 0.588 0.408 0.004
#> SRR1661737 2 0.5105 0.373 0.000 0.564 0.432 0.004
#> SRR1661738 2 0.5050 0.397 0.000 0.588 0.408 0.004
#> SRR1661739 2 0.5080 0.419 0.000 0.576 0.420 0.004
#> SRR1661740 2 0.5070 0.421 0.000 0.580 0.416 0.004
#> SRR1661741 2 0.5097 0.397 0.000 0.568 0.428 0.004
#> SRR1661742 2 0.5112 0.376 0.000 0.560 0.436 0.004
#> SRR1661743 2 0.5088 0.406 0.000 0.572 0.424 0.004
#> SRR1661744 2 0.5039 0.442 0.000 0.592 0.404 0.004
#> SRR1661745 2 0.5070 0.422 0.000 0.580 0.416 0.004
#> SRR1661746 2 0.5080 0.392 0.000 0.576 0.420 0.004
#> SRR1661747 2 0.5126 0.351 0.000 0.552 0.444 0.004
#> SRR1661748 2 0.5028 0.446 0.000 0.596 0.400 0.004
#> SRR1661749 2 0.5060 0.429 0.000 0.584 0.412 0.004
#> SRR1661750 2 0.4936 0.487 0.000 0.624 0.372 0.004
#> SRR1661751 2 0.5126 0.347 0.000 0.552 0.444 0.004
#> SRR1661752 2 0.5132 0.331 0.000 0.548 0.448 0.004
#> SRR1661753 2 0.5137 0.325 0.000 0.544 0.452 0.004
#> SRR1661754 2 0.5016 0.454 0.000 0.600 0.396 0.004
#> SRR1661755 2 0.5097 0.390 0.000 0.568 0.428 0.004
#> SRR1661756 2 0.5088 0.402 0.000 0.572 0.424 0.004
#> SRR1661757 2 0.5070 0.415 0.000 0.580 0.416 0.004
#> SRR1661758 2 0.5080 0.405 0.000 0.576 0.420 0.004
#> SRR1661759 2 0.5137 0.322 0.000 0.544 0.452 0.004
#> SRR1661760 2 0.5016 0.455 0.000 0.600 0.396 0.004
#> SRR1661761 2 0.5088 0.410 0.000 0.572 0.424 0.004
#> SRR1661762 2 0.5039 0.438 0.000 0.592 0.404 0.004
#> SRR1661763 2 0.5088 0.398 0.000 0.572 0.424 0.004
#> SRR1661764 2 0.5060 0.429 0.000 0.584 0.412 0.004
#> SRR1661766 2 0.4730 0.519 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1661767 2 0.4830 0.481 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1661768 2 0.4697 0.527 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1661769 2 0.4624 0.540 0.000 0.660 0.340 0.000
#> SRR1661770 2 0.4776 0.503 0.000 0.624 0.376 0.000
#> SRR1661771 2 0.4830 0.483 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1661772 2 0.4730 0.520 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1661773 2 0.4643 0.537 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1661774 2 0.4746 0.516 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR1661775 2 0.4679 0.531 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1661776 2 0.4817 0.489 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1661777 2 0.4776 0.504 0.000 0.624 0.376 0.000
#> SRR1661778 2 0.4877 0.450 0.000 0.592 0.408 0.000
#> SRR1661779 2 0.4761 0.509 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR1661780 2 0.4746 0.514 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR1661781 2 0.4804 0.494 0.000 0.616 0.384 0.000
#> SRR1661782 2 0.4746 0.513 0.000 0.632 0.368 0.000
#> SRR1661783 2 0.4761 0.510 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR1661784 2 0.4761 0.511 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR1661785 2 0.4790 0.499 0.000 0.620 0.380 0.000
#> SRR1661786 2 0.4697 0.528 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1661787 2 0.4697 0.527 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1661788 2 0.4679 0.531 0.000 0.648 0.352 0.000
#> SRR1661789 2 0.4843 0.475 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR1661790 2 0.4817 0.488 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1661791 2 0.4730 0.519 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1661792 2 0.4830 0.478 0.000 0.608 0.392 0.000
#> SRR1661793 2 0.4697 0.528 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1661794 2 0.4697 0.527 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1661795 2 0.4697 0.528 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1661796 3 0.5155 0.138 0.004 0.468 0.528 0.000
#> SRR1661797 3 0.5143 0.175 0.004 0.456 0.540 0.000
#> SRR1661798 3 0.5147 0.169 0.004 0.460 0.536 0.000
#> SRR1661799 3 0.5273 0.171 0.008 0.456 0.536 0.000
#> SRR1661800 3 0.5147 0.161 0.004 0.460 0.536 0.000
#> SRR1661801 3 0.5151 0.146 0.004 0.464 0.532 0.000
#> SRR1661802 3 0.5151 0.146 0.004 0.464 0.532 0.000
#> SRR1661803 3 0.5112 0.239 0.004 0.436 0.560 0.000
#> SRR1661804 3 0.5220 0.270 0.008 0.424 0.568 0.000
#> SRR1661805 3 0.5281 0.149 0.008 0.464 0.528 0.000
#> SRR1661806 3 0.5143 0.178 0.004 0.456 0.540 0.000
#> SRR1661807 3 0.5212 0.279 0.008 0.420 0.572 0.000
#> SRR1661808 3 0.5119 0.227 0.004 0.440 0.556 0.000
#> SRR1661809 3 0.5147 0.161 0.004 0.460 0.536 0.000
#> SRR1661810 3 0.5151 0.146 0.004 0.464 0.532 0.000
#> SRR1661811 3 0.5158 0.128 0.004 0.472 0.524 0.000
#> SRR1661812 3 0.5143 0.175 0.004 0.456 0.540 0.000
#> SRR1661813 3 0.5143 0.175 0.004 0.456 0.540 0.000
#> SRR1661814 3 0.5161 0.117 0.004 0.476 0.520 0.000
#> SRR1661815 3 0.5143 0.177 0.004 0.456 0.540 0.000
#> SRR1661816 3 0.5151 0.146 0.004 0.464 0.532 0.000
#> SRR1661817 3 0.5151 0.146 0.004 0.464 0.532 0.000
#> SRR1661818 3 0.5151 0.146 0.004 0.464 0.532 0.000
#> SRR1661819 3 0.5229 0.259 0.008 0.428 0.564 0.000
#> SRR1661820 3 0.5268 0.187 0.008 0.452 0.540 0.000
#> SRR1661821 3 0.5126 0.215 0.004 0.444 0.552 0.000
#> SRR1661822 3 0.5161 0.117 0.004 0.476 0.520 0.000
#> SRR1661823 3 0.5143 0.176 0.004 0.456 0.540 0.000
#> SRR1661824 3 0.5268 0.183 0.008 0.452 0.540 0.000
#> SRR1661825 3 0.5147 0.163 0.004 0.460 0.536 0.000
#> SRR1661826 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661827 1 0.0657 0.803 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1661828 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661829 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661830 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661831 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661832 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661833 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661834 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661835 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661836 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661837 1 0.0336 0.804 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661838 1 0.0188 0.804 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1661839 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661840 1 0.0592 0.804 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1661841 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661843 1 0.0779 0.804 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1661844 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661845 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661846 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661847 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661848 1 0.0336 0.805 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1661849 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661850 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661851 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661852 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661853 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661854 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661855 1 0.0469 0.805 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1661856 2 0.1635 0.626 0.000 0.948 0.044 0.008
#> SRR1661857 2 0.1677 0.625 0.000 0.948 0.040 0.012
#> SRR1661858 2 0.1151 0.624 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1661859 2 0.1909 0.625 0.004 0.940 0.048 0.008
#> SRR1661860 2 0.1151 0.623 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1661861 2 0.1545 0.626 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661862 2 0.1640 0.613 0.012 0.956 0.020 0.012
#> SRR1661863 2 0.1284 0.625 0.000 0.964 0.024 0.012
#> SRR1661864 2 0.1182 0.618 0.000 0.968 0.016 0.016
#> SRR1661865 2 0.0895 0.623 0.000 0.976 0.020 0.004
#> SRR1661866 2 0.0927 0.618 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1661867 2 0.1356 0.626 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1661868 2 0.1545 0.627 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661869 2 0.1305 0.627 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1661870 2 0.1640 0.613 0.012 0.956 0.020 0.012
#> SRR1661871 2 0.1488 0.623 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR1661872 2 0.1151 0.623 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1661873 2 0.1151 0.622 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1661874 2 0.1042 0.622 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1661875 2 0.1209 0.626 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1661876 2 0.1042 0.621 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1661877 2 0.1004 0.625 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1661878 2 0.1389 0.627 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1661879 2 0.1452 0.626 0.000 0.956 0.036 0.008
#> SRR1661880 2 0.0927 0.616 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1661881 2 0.1042 0.621 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1661882 2 0.1209 0.626 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1661883 2 0.1305 0.627 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1661884 2 0.1151 0.624 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1661885 2 0.1489 0.627 0.000 0.952 0.044 0.004
#> SRR1661886 2 0.1297 0.620 0.000 0.964 0.020 0.016
#> SRR1661887 2 0.1256 0.625 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1661888 2 0.1545 0.628 0.000 0.952 0.040 0.008
#> SRR1661889 2 0.1305 0.627 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1661890 2 0.1042 0.622 0.000 0.972 0.020 0.008
#> SRR1661891 2 0.1394 0.614 0.008 0.964 0.016 0.012
#> SRR1661892 1 0.1256 0.803 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR1661893 1 0.1584 0.802 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1661894 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661895 1 0.2021 0.793 0.932 0.000 0.012 0.056
#> SRR1661896 1 0.1677 0.801 0.948 0.000 0.012 0.040
#> SRR1661897 1 0.1488 0.803 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661898 1 0.1488 0.802 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661899 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661900 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661901 1 0.1406 0.801 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1661902 1 0.1635 0.798 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1661903 1 0.1635 0.800 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1661904 1 0.1388 0.804 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1661905 1 0.1488 0.804 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661906 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661907 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661908 1 0.1488 0.804 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661909 1 0.1388 0.804 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1661910 1 0.1388 0.804 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1661911 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661912 1 0.1488 0.803 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661913 1 0.1388 0.803 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1661914 1 0.1488 0.803 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661915 1 0.3464 0.743 0.860 0.000 0.032 0.108
#> SRR1661916 1 0.1388 0.804 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1661917 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661918 1 0.1584 0.803 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1661919 1 0.1488 0.804 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661920 1 0.1488 0.804 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661921 1 0.1356 0.803 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1661922 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661923 1 0.1488 0.804 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1661924 1 0.1635 0.799 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1661925 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661926 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661927 1 0.1284 0.803 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1661928 3 0.5321 0.583 0.056 0.228 0.716 0.000
#> SRR1661929 3 0.5219 0.596 0.056 0.216 0.728 0.000
#> SRR1661930 3 0.5249 0.566 0.044 0.248 0.708 0.000
#> SRR1661931 3 0.5090 0.589 0.044 0.228 0.728 0.000
#> SRR1661932 3 0.5235 0.580 0.048 0.236 0.716 0.000
#> SRR1661933 3 0.5203 0.585 0.048 0.232 0.720 0.000
#> SRR1661934 3 0.5213 0.591 0.052 0.224 0.724 0.000
#> SRR1661935 3 0.5250 0.610 0.060 0.192 0.744 0.004
#> SRR1661936 3 0.5471 0.597 0.064 0.208 0.724 0.004
#> SRR1661937 3 0.5056 0.593 0.044 0.224 0.732 0.000
#> SRR1661938 3 0.5393 0.538 0.044 0.268 0.688 0.000
#> SRR1661939 3 0.5279 0.584 0.052 0.232 0.716 0.000
#> SRR1661940 3 0.5321 0.607 0.064 0.192 0.740 0.004
#> SRR1661941 3 0.5213 0.592 0.052 0.224 0.724 0.000
#> SRR1661942 3 0.5143 0.560 0.036 0.256 0.708 0.000
#> SRR1661943 3 0.5235 0.580 0.048 0.236 0.716 0.000
#> SRR1661944 3 0.5249 0.565 0.044 0.248 0.708 0.000
#> SRR1661945 3 0.5508 0.559 0.056 0.252 0.692 0.000
#> SRR1661946 3 0.5207 0.506 0.028 0.292 0.680 0.000
#> SRR1661947 3 0.5137 0.574 0.040 0.244 0.716 0.000
#> SRR1661948 3 0.5343 0.572 0.052 0.240 0.708 0.000
#> SRR1661949 3 0.5148 0.602 0.056 0.208 0.736 0.000
#> SRR1661950 3 0.5327 0.600 0.056 0.208 0.732 0.004
#> SRR1661951 3 0.5203 0.584 0.048 0.232 0.720 0.000
#> SRR1661952 3 0.5256 0.555 0.040 0.260 0.700 0.000
#> SRR1661953 3 0.5269 0.589 0.044 0.228 0.724 0.004
#> SRR1661954 3 0.5413 0.578 0.048 0.236 0.712 0.004
#> SRR1661955 3 0.5249 0.568 0.044 0.248 0.708 0.000
#> SRR1661956 3 0.5137 0.575 0.040 0.244 0.716 0.000
#> SRR1661957 3 0.5090 0.589 0.044 0.228 0.728 0.000
#> SRR1661958 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661959 4 0.2732 0.745 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661960 4 0.2732 0.744 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661961 4 0.2660 0.746 0.012 0.008 0.072 0.908
#> SRR1661962 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661963 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661964 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661965 4 0.2732 0.745 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661966 4 0.2732 0.745 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661967 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661968 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661969 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661970 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661971 4 0.2732 0.745 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661972 4 0.2872 0.739 0.012 0.008 0.084 0.896
#> SRR1661973 4 0.2660 0.746 0.012 0.008 0.072 0.908
#> SRR1661974 4 0.2732 0.745 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661975 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661976 4 0.2732 0.744 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661977 4 0.2660 0.746 0.012 0.008 0.072 0.908
#> SRR1661978 4 0.2732 0.744 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661979 4 0.2660 0.746 0.012 0.008 0.072 0.908
#> SRR1661980 4 0.2586 0.747 0.012 0.008 0.068 0.912
#> SRR1661981 4 0.2660 0.746 0.012 0.008 0.072 0.908
#> SRR1661982 4 0.2732 0.745 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661983 4 0.2660 0.746 0.012 0.008 0.072 0.908
#> SRR1661984 4 0.2732 0.744 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661985 4 0.2940 0.735 0.012 0.008 0.088 0.892
#> SRR1661986 4 0.2803 0.742 0.012 0.008 0.080 0.900
#> SRR1661987 4 0.2732 0.745 0.012 0.008 0.076 0.904
#> SRR1661988 4 0.6606 0.663 0.224 0.152 0.000 0.624
#> SRR1661989 4 0.6606 0.661 0.224 0.152 0.000 0.624
#> SRR1661990 4 0.6566 0.652 0.236 0.140 0.000 0.624
#> SRR1661991 4 0.6581 0.654 0.232 0.144 0.000 0.624
#> SRR1661992 4 0.6594 0.642 0.240 0.140 0.000 0.620
#> SRR1661993 4 0.6542 0.673 0.196 0.168 0.000 0.636
#> SRR1661994 4 0.6621 0.637 0.244 0.140 0.000 0.616
#> SRR1661995 4 0.6602 0.668 0.208 0.164 0.000 0.628
#> SRR1661996 4 0.6552 0.658 0.228 0.144 0.000 0.628
#> SRR1661997 4 0.6583 0.670 0.192 0.176 0.000 0.632
#> SRR1661998 4 0.6609 0.649 0.236 0.144 0.000 0.620
#> SRR1661999 4 0.6594 0.646 0.240 0.140 0.000 0.620
#> SRR1662000 4 0.6509 0.660 0.228 0.140 0.000 0.632
#> SRR1662001 4 0.6586 0.666 0.216 0.156 0.000 0.628
#> SRR1662002 4 0.6613 0.669 0.200 0.172 0.000 0.628
#> SRR1662003 4 0.6646 0.659 0.224 0.156 0.000 0.620
#> SRR1662004 4 0.6552 0.658 0.228 0.144 0.000 0.628
#> SRR1662005 4 0.6609 0.653 0.236 0.144 0.000 0.620
#> SRR1662006 4 0.6586 0.665 0.216 0.156 0.000 0.628
#> SRR1662007 4 0.6620 0.668 0.192 0.180 0.000 0.628
#> SRR1662008 4 0.6646 0.667 0.204 0.172 0.000 0.624
#> SRR1662009 4 0.6606 0.661 0.224 0.152 0.000 0.624
#> SRR1662010 4 0.6630 0.624 0.252 0.136 0.000 0.612
#> SRR1662011 4 0.6581 0.656 0.232 0.144 0.000 0.624
#> SRR1662012 4 0.6594 0.660 0.228 0.148 0.000 0.624
#> SRR1662013 4 0.6552 0.658 0.228 0.144 0.000 0.628
#> SRR1662014 4 0.6576 0.665 0.220 0.152 0.000 0.628
#> SRR1662015 4 0.6606 0.659 0.224 0.152 0.000 0.624
#> SRR1662016 4 0.6581 0.656 0.232 0.144 0.000 0.624
#> SRR1662017 4 0.6613 0.669 0.200 0.172 0.000 0.628
#> SRR1662018 3 0.2924 0.672 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1662019 3 0.3099 0.671 0.000 0.104 0.876 0.020
#> SRR1662020 3 0.2867 0.672 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1662021 3 0.3198 0.659 0.000 0.080 0.880 0.040
#> SRR1662022 3 0.2610 0.671 0.000 0.088 0.900 0.012
#> SRR1662023 3 0.2987 0.672 0.000 0.104 0.880 0.016
#> SRR1662024 3 0.2867 0.672 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1662025 3 0.2805 0.673 0.000 0.100 0.888 0.012
#> SRR1662026 3 0.2805 0.673 0.000 0.100 0.888 0.012
#> SRR1662027 3 0.2796 0.672 0.000 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662028 3 0.2741 0.673 0.000 0.096 0.892 0.012
#> SRR1662029 3 0.2796 0.671 0.000 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662030 3 0.2924 0.672 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1662031 3 0.2924 0.672 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1662032 3 0.2805 0.673 0.000 0.100 0.888 0.012
#> SRR1662033 3 0.2924 0.672 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1662034 3 0.2730 0.671 0.000 0.088 0.896 0.016
#> SRR1662035 3 0.2924 0.672 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1662036 3 0.2924 0.672 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1662037 3 0.2741 0.673 0.000 0.096 0.892 0.012
#> SRR1662038 3 0.2861 0.672 0.000 0.096 0.888 0.016
#> SRR1662039 3 0.2867 0.672 0.000 0.104 0.884 0.012
#> SRR1662040 3 0.2861 0.672 0.000 0.096 0.888 0.016
#> SRR1662041 3 0.2742 0.665 0.000 0.076 0.900 0.024
#> SRR1662042 3 0.2987 0.672 0.000 0.104 0.880 0.016
#> SRR1662043 3 0.2861 0.672 0.000 0.096 0.888 0.016
#> SRR1662044 3 0.2796 0.671 0.000 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662045 3 0.2924 0.672 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1662046 3 0.2805 0.673 0.000 0.100 0.888 0.012
#> SRR1662047 3 0.2796 0.672 0.000 0.092 0.892 0.016
#> SRR1662048 3 0.3048 0.670 0.000 0.108 0.876 0.016
#> SRR1662049 3 0.2924 0.672 0.000 0.100 0.884 0.016
#> SRR1662050 3 0.2542 0.670 0.000 0.084 0.904 0.012
#> SRR1662051 3 0.3080 0.670 0.000 0.096 0.880 0.024
#> SRR1662052 3 0.2741 0.673 0.000 0.096 0.892 0.012
#> SRR1662053 3 0.2987 0.672 0.000 0.104 0.880 0.016
#> SRR1662054 3 0.4077 0.587 0.068 0.004 0.840 0.088
#> SRR1662055 3 0.4142 0.584 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662056 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662057 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662058 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662059 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662060 3 0.4266 0.577 0.068 0.004 0.828 0.100
#> SRR1662061 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662062 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662063 3 0.4077 0.587 0.068 0.004 0.840 0.088
#> SRR1662064 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662065 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662066 3 0.4213 0.581 0.072 0.004 0.832 0.092
#> SRR1662067 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662068 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662069 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662070 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662071 3 0.4213 0.581 0.072 0.004 0.832 0.092
#> SRR1662072 3 0.4213 0.581 0.072 0.004 0.832 0.092
#> SRR1662073 3 0.4068 0.586 0.064 0.004 0.840 0.092
#> SRR1662074 3 0.4077 0.587 0.068 0.004 0.840 0.088
#> SRR1662075 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662076 3 0.4205 0.581 0.068 0.004 0.832 0.096
#> SRR1662077 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662078 3 0.4077 0.587 0.068 0.004 0.840 0.088
#> SRR1662079 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662080 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662081 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662082 3 0.4077 0.587 0.068 0.004 0.840 0.088
#> SRR1662083 3 0.4142 0.585 0.068 0.004 0.836 0.092
#> SRR1662084 1 0.6872 0.431 0.564 0.096 0.008 0.332
#> SRR1662085 1 0.6922 0.413 0.560 0.100 0.008 0.332
#> SRR1662086 1 0.7066 0.393 0.548 0.112 0.008 0.332
#> SRR1662087 1 0.5325 0.638 0.744 0.048 0.012 0.196
#> SRR1662088 1 0.6804 0.440 0.572 0.092 0.008 0.328
#> SRR1662089 1 0.6824 0.447 0.576 0.096 0.008 0.320
#> SRR1662090 1 0.7126 0.399 0.548 0.120 0.008 0.324
#> SRR1662091 1 0.6875 0.442 0.572 0.100 0.008 0.320
#> SRR1662092 1 0.6784 0.480 0.592 0.100 0.008 0.300
#> SRR1662093 1 0.6407 0.511 0.624 0.076 0.008 0.292
#> SRR1662094 1 0.6743 0.423 0.568 0.084 0.008 0.340
#> SRR1662095 1 0.6751 0.445 0.576 0.088 0.008 0.328
#> SRR1662096 1 0.6663 0.482 0.596 0.088 0.008 0.308
#> SRR1662097 1 0.6875 0.442 0.572 0.100 0.008 0.320
#> SRR1662098 1 0.6804 0.438 0.572 0.092 0.008 0.328
#> SRR1662099 1 0.6989 0.423 0.560 0.108 0.008 0.324
#> SRR1662100 1 0.6875 0.449 0.572 0.100 0.008 0.320
#> SRR1662101 1 0.6732 0.485 0.596 0.096 0.008 0.300
#> SRR1662102 1 0.6788 0.448 0.576 0.092 0.008 0.324
#> SRR1662103 1 0.6858 0.456 0.576 0.100 0.008 0.316
#> SRR1662104 1 0.6907 0.426 0.564 0.100 0.008 0.328
#> SRR1662105 1 0.6907 0.425 0.564 0.100 0.008 0.328
#> SRR1662106 1 0.6941 0.426 0.564 0.104 0.008 0.324
#> SRR1662107 1 0.6717 0.465 0.584 0.088 0.008 0.320
#> SRR1662108 1 0.6840 0.456 0.580 0.100 0.008 0.312
#> SRR1662109 1 0.6670 0.498 0.608 0.096 0.008 0.288
#> SRR1662110 1 0.6771 0.455 0.580 0.092 0.008 0.320
#> SRR1662111 1 0.3978 0.677 0.796 0.012 0.000 0.192
#> SRR1662112 1 0.6782 0.428 0.568 0.088 0.008 0.336
#> SRR1662113 1 0.6907 0.428 0.564 0.100 0.008 0.328
#> SRR1662114 1 0.6640 0.404 0.564 0.084 0.004 0.348
#> SRR1662115 1 0.6682 0.476 0.592 0.088 0.008 0.312
#> SRR1662116 1 0.6717 0.478 0.592 0.092 0.008 0.308
#> SRR1662117 1 0.6637 0.497 0.608 0.092 0.008 0.292
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1661716 2 0.5455 0.4155 0.000 0.700 0.092 0.028 0.180
#> SRR1661717 2 0.5356 0.4292 0.000 0.728 0.100 0.044 0.128
#> SRR1661718 2 0.5529 0.4169 0.000 0.704 0.116 0.032 0.148
#> SRR1661719 2 0.5331 0.4357 0.000 0.720 0.096 0.032 0.152
#> SRR1661720 2 0.5342 0.4364 0.000 0.720 0.100 0.032 0.148
#> SRR1661721 2 0.5488 0.4145 0.000 0.696 0.092 0.028 0.184
#> SRR1661722 2 0.5583 0.4179 0.000 0.692 0.096 0.032 0.180
#> SRR1661723 2 0.5611 0.4240 0.000 0.692 0.104 0.032 0.172
#> SRR1661724 2 0.5426 0.4341 0.000 0.716 0.104 0.036 0.144
#> SRR1661725 2 0.5450 0.4220 0.000 0.704 0.100 0.028 0.168
#> SRR1661726 2 0.5302 0.4374 0.000 0.724 0.100 0.032 0.144
#> SRR1661727 2 0.5414 0.4255 0.000 0.708 0.100 0.028 0.164
#> SRR1661728 2 0.5378 0.4391 0.000 0.720 0.100 0.036 0.144
#> SRR1661729 2 0.5480 0.4355 0.000 0.712 0.096 0.040 0.152
#> SRR1661730 2 0.5376 0.4227 0.000 0.724 0.104 0.040 0.132
#> SRR1661731 2 0.5651 0.4288 0.000 0.692 0.104 0.036 0.168
#> SRR1661732 2 0.5328 0.4371 0.000 0.724 0.096 0.036 0.144
#> SRR1661733 2 0.5645 0.4204 0.000 0.688 0.104 0.032 0.176
#> SRR1661734 2 0.5296 0.4300 0.000 0.728 0.100 0.036 0.136
#> SRR1661735 2 0.5378 0.4364 0.000 0.720 0.100 0.036 0.144
#> SRR1661736 2 0.5727 0.3355 0.000 0.560 0.100 0.340 0.000
#> SRR1661737 2 0.5606 0.2827 0.000 0.548 0.068 0.380 0.004
#> SRR1661738 2 0.5630 0.3291 0.000 0.560 0.088 0.352 0.000
#> SRR1661739 2 0.5593 0.3473 0.000 0.572 0.088 0.340 0.000
#> SRR1661740 2 0.5618 0.3370 0.000 0.564 0.088 0.348 0.000
#> SRR1661741 2 0.5730 0.3140 0.000 0.548 0.096 0.356 0.000
#> SRR1661742 2 0.5593 0.3443 0.000 0.572 0.088 0.340 0.000
#> SRR1661743 2 0.5684 0.3401 0.000 0.564 0.096 0.340 0.000
#> SRR1661744 2 0.5715 0.3354 0.000 0.564 0.100 0.336 0.000
#> SRR1661745 2 0.5641 0.3256 0.000 0.556 0.088 0.356 0.000
#> SRR1661746 2 0.5739 0.3323 0.000 0.556 0.100 0.344 0.000
#> SRR1661747 2 0.5616 0.3177 0.000 0.552 0.084 0.364 0.000
#> SRR1661748 2 0.5484 0.3496 0.000 0.584 0.080 0.336 0.000
#> SRR1661749 2 0.5652 0.3419 0.000 0.564 0.092 0.344 0.000
#> SRR1661750 2 0.5584 0.3400 0.000 0.592 0.096 0.312 0.000
#> SRR1661751 2 0.5617 0.3073 0.000 0.560 0.072 0.364 0.004
#> SRR1661752 2 0.5770 0.2590 0.000 0.528 0.080 0.388 0.004
#> SRR1661753 2 0.5628 0.3050 0.000 0.556 0.072 0.368 0.004
#> SRR1661754 2 0.5484 0.3500 0.000 0.584 0.080 0.336 0.000
#> SRR1661755 2 0.5618 0.3334 0.000 0.564 0.088 0.348 0.000
#> SRR1661756 2 0.5639 0.3426 0.000 0.568 0.092 0.340 0.000
#> SRR1661757 2 0.5652 0.3403 0.000 0.564 0.092 0.344 0.000
#> SRR1661758 2 0.5558 0.3220 0.000 0.560 0.080 0.360 0.000
#> SRR1661759 2 0.5719 0.3235 0.000 0.552 0.096 0.352 0.000
#> SRR1661760 2 0.5434 0.3514 0.000 0.588 0.076 0.336 0.000
#> SRR1661761 2 0.5675 0.3300 0.000 0.556 0.092 0.352 0.000
#> SRR1661762 2 0.5546 0.3458 0.000 0.576 0.084 0.340 0.000
#> SRR1661763 2 0.5652 0.3369 0.000 0.564 0.092 0.344 0.000
#> SRR1661764 2 0.5639 0.3442 0.000 0.568 0.092 0.340 0.000
#> SRR1661766 3 0.5707 0.4984 0.000 0.364 0.544 0.092 0.000
#> SRR1661767 3 0.5803 0.4940 0.000 0.368 0.532 0.100 0.000
#> SRR1661768 3 0.5568 0.4887 0.000 0.384 0.540 0.076 0.000
#> SRR1661769 3 0.5598 0.4934 0.000 0.376 0.544 0.080 0.000
#> SRR1661770 3 0.5766 0.4765 0.000 0.392 0.516 0.092 0.000
#> SRR1661771 3 0.5834 0.5055 0.000 0.348 0.544 0.108 0.000
#> SRR1661772 3 0.5607 0.4906 0.000 0.380 0.540 0.080 0.000
#> SRR1661773 3 0.5670 0.4808 0.000 0.388 0.528 0.084 0.000
#> SRR1661774 3 0.5783 0.5004 0.000 0.360 0.540 0.100 0.000
#> SRR1661775 3 0.5492 0.4803 0.000 0.396 0.536 0.068 0.000
#> SRR1661776 3 0.5912 0.4991 0.000 0.348 0.536 0.116 0.000
#> SRR1661777 3 0.5741 0.5011 0.000 0.360 0.544 0.096 0.000
#> SRR1661778 3 0.6066 0.4727 0.000 0.368 0.504 0.128 0.000
#> SRR1661779 3 0.5607 0.4903 0.000 0.380 0.540 0.080 0.000
#> SRR1661780 3 0.5616 0.5043 0.000 0.364 0.552 0.084 0.000
#> SRR1661781 3 0.5783 0.5009 0.000 0.360 0.540 0.100 0.000
#> SRR1661782 3 0.5598 0.4765 0.000 0.400 0.524 0.076 0.000
#> SRR1661783 3 0.5759 0.4788 0.000 0.388 0.520 0.092 0.000
#> SRR1661784 3 0.5752 0.4875 0.000 0.384 0.524 0.092 0.000
#> SRR1661785 3 0.5769 0.5127 0.000 0.340 0.556 0.104 0.000
#> SRR1661786 3 0.5636 0.4954 0.000 0.372 0.544 0.084 0.000
#> SRR1661787 3 0.5778 0.4883 0.000 0.376 0.528 0.096 0.000
#> SRR1661788 3 0.5624 0.4885 0.000 0.388 0.532 0.080 0.000
#> SRR1661789 3 0.5884 0.5012 0.000 0.352 0.536 0.112 0.000
#> SRR1661790 3 0.5865 0.4963 0.000 0.360 0.532 0.108 0.000
#> SRR1661791 3 0.5654 0.4899 0.000 0.380 0.536 0.084 0.000
#> SRR1661792 3 0.5862 0.5050 0.000 0.344 0.544 0.112 0.000
#> SRR1661793 3 0.5458 0.4937 0.000 0.380 0.552 0.068 0.000
#> SRR1661794 3 0.5636 0.4969 0.000 0.372 0.544 0.084 0.000
#> SRR1661795 3 0.5632 0.4825 0.000 0.392 0.528 0.080 0.000
#> SRR1661796 3 0.6851 0.4720 0.004 0.304 0.476 0.208 0.008
#> SRR1661797 3 0.6806 0.4820 0.004 0.296 0.488 0.204 0.008
#> SRR1661798 3 0.6802 0.4817 0.004 0.288 0.492 0.208 0.008
#> SRR1661799 3 0.6806 0.4836 0.004 0.296 0.488 0.204 0.008
#> SRR1661800 3 0.6705 0.4840 0.004 0.292 0.492 0.208 0.004
#> SRR1661801 3 0.6871 0.4683 0.004 0.304 0.472 0.212 0.008
#> SRR1661802 3 0.6917 0.4609 0.004 0.300 0.464 0.224 0.008
#> SRR1661803 3 0.6754 0.4760 0.004 0.288 0.484 0.220 0.004
#> SRR1661804 3 0.6741 0.4742 0.004 0.284 0.488 0.220 0.004
#> SRR1661805 3 0.6794 0.4831 0.004 0.292 0.492 0.204 0.008
#> SRR1661806 3 0.6848 0.4757 0.004 0.296 0.480 0.212 0.008
#> SRR1661807 3 0.6664 0.4879 0.004 0.280 0.504 0.208 0.004
#> SRR1661808 3 0.6754 0.4741 0.004 0.288 0.484 0.220 0.004
#> SRR1661809 3 0.6830 0.4759 0.004 0.304 0.480 0.204 0.008
#> SRR1661810 3 0.6726 0.4788 0.004 0.292 0.488 0.212 0.004
#> SRR1661811 3 0.6684 0.4854 0.004 0.292 0.496 0.204 0.004
#> SRR1661812 3 0.6917 0.4617 0.004 0.300 0.464 0.224 0.008
#> SRR1661813 3 0.6730 0.4788 0.004 0.300 0.484 0.208 0.004
#> SRR1661814 3 0.6806 0.4836 0.004 0.296 0.488 0.204 0.008
#> SRR1661815 3 0.6678 0.4846 0.004 0.284 0.500 0.208 0.004
#> SRR1661816 3 0.6819 0.4798 0.004 0.300 0.484 0.204 0.008
#> SRR1661817 3 0.6661 0.4886 0.004 0.292 0.500 0.200 0.004
#> SRR1661818 3 0.6809 0.4788 0.004 0.304 0.484 0.200 0.008
#> SRR1661819 3 0.6911 0.4555 0.004 0.280 0.472 0.236 0.008
#> SRR1661820 3 0.6836 0.4779 0.004 0.292 0.484 0.212 0.008
#> SRR1661821 3 0.6721 0.4806 0.004 0.284 0.492 0.216 0.004
#> SRR1661822 3 0.6840 0.4767 0.004 0.300 0.480 0.208 0.008
#> SRR1661823 3 0.6798 0.4655 0.004 0.296 0.472 0.224 0.004
#> SRR1661824 3 0.6794 0.4831 0.004 0.292 0.492 0.204 0.008
#> SRR1661825 3 0.6815 0.4828 0.004 0.292 0.488 0.208 0.008
#> SRR1661826 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661827 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661828 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661829 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661830 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661831 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661832 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661833 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661834 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661835 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661836 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661837 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661838 1 0.1772 0.9344 0.940 0.008 0.032 0.000 0.020
#> SRR1661839 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661840 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661841 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661843 1 0.1834 0.9327 0.940 0.008 0.032 0.004 0.016
#> SRR1661844 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661845 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661846 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661847 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661848 1 0.1756 0.9318 0.940 0.008 0.036 0.000 0.016
#> SRR1661849 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661850 1 0.1772 0.9332 0.940 0.008 0.032 0.000 0.020
#> SRR1661851 1 0.1772 0.9344 0.940 0.008 0.032 0.000 0.020
#> SRR1661852 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661853 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661854 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661855 1 0.1673 0.9342 0.944 0.008 0.032 0.000 0.016
#> SRR1661856 3 0.4449 0.4584 0.000 0.352 0.636 0.004 0.008
#> SRR1661857 3 0.4769 0.4299 0.000 0.392 0.588 0.004 0.016
#> SRR1661858 3 0.4696 0.4178 0.000 0.400 0.584 0.004 0.012
#> SRR1661859 3 0.4666 0.4260 0.000 0.388 0.596 0.004 0.012
#> SRR1661860 3 0.4814 0.3964 0.000 0.412 0.568 0.004 0.016
#> SRR1661861 3 0.4843 0.4724 0.004 0.320 0.648 0.004 0.024
#> SRR1661862 3 0.4856 0.4169 0.000 0.392 0.584 0.004 0.020
#> SRR1661863 3 0.4764 0.3651 0.000 0.436 0.548 0.004 0.012
#> SRR1661864 3 0.4806 0.4040 0.000 0.408 0.572 0.004 0.016
#> SRR1661865 3 0.4705 0.4048 0.000 0.404 0.580 0.004 0.012
#> SRR1661866 3 0.4875 0.3950 0.000 0.400 0.576 0.004 0.020
#> SRR1661867 3 0.4714 0.4396 0.000 0.372 0.608 0.004 0.016
#> SRR1661868 3 0.4613 0.4008 0.000 0.408 0.580 0.004 0.008
#> SRR1661869 3 0.4676 0.4298 0.000 0.392 0.592 0.004 0.012
#> SRR1661870 3 0.4686 0.4232 0.000 0.396 0.588 0.004 0.012
#> SRR1661871 3 0.4737 0.4642 0.004 0.336 0.640 0.004 0.016
#> SRR1661872 3 0.4585 0.4191 0.000 0.396 0.592 0.004 0.008
#> SRR1661873 3 0.4594 0.4434 0.000 0.364 0.620 0.004 0.012
#> SRR1661874 3 0.4705 0.4009 0.000 0.404 0.580 0.004 0.012
#> SRR1661875 3 0.4637 0.3922 0.000 0.420 0.568 0.004 0.008
#> SRR1661876 3 0.4752 0.3728 0.000 0.428 0.556 0.004 0.012
#> SRR1661877 3 0.4696 0.4100 0.000 0.400 0.584 0.004 0.012
#> SRR1661878 3 0.4541 0.4376 0.000 0.380 0.608 0.004 0.008
#> SRR1661879 3 0.4743 0.4622 0.000 0.332 0.640 0.004 0.024
#> SRR1661880 3 0.4701 0.4316 0.000 0.368 0.612 0.004 0.016
#> SRR1661881 3 0.4696 0.4010 0.000 0.400 0.584 0.004 0.012
#> SRR1661882 3 0.4594 0.4482 0.000 0.364 0.620 0.004 0.012
#> SRR1661883 3 0.4696 0.4106 0.000 0.400 0.584 0.004 0.012
#> SRR1661884 3 0.4825 0.4474 0.004 0.360 0.616 0.004 0.016
#> SRR1661885 3 0.4553 0.4283 0.000 0.384 0.604 0.004 0.008
#> SRR1661886 3 0.4964 0.3180 0.000 0.460 0.516 0.004 0.020
#> SRR1661887 3 0.4897 0.4438 0.000 0.352 0.616 0.004 0.028
#> SRR1661888 3 0.4745 0.3800 0.000 0.424 0.560 0.004 0.012
#> SRR1661889 3 0.4620 0.4459 0.000 0.372 0.612 0.004 0.012
#> SRR1661890 3 0.4937 0.4301 0.000 0.364 0.604 0.004 0.028
#> SRR1661891 3 0.4822 0.3966 0.000 0.416 0.564 0.004 0.016
#> SRR1661892 1 0.1059 0.9384 0.968 0.004 0.000 0.020 0.008
#> SRR1661893 1 0.1314 0.9356 0.960 0.012 0.000 0.016 0.012
#> SRR1661894 1 0.1299 0.9364 0.960 0.012 0.000 0.020 0.008
#> SRR1661895 1 0.2217 0.9170 0.920 0.012 0.000 0.044 0.024
#> SRR1661896 1 0.1612 0.9311 0.948 0.012 0.000 0.024 0.016
#> SRR1661897 1 0.1095 0.9372 0.968 0.012 0.000 0.012 0.008
#> SRR1661898 1 0.0960 0.9388 0.972 0.004 0.000 0.016 0.008
#> SRR1661899 1 0.1186 0.9373 0.964 0.008 0.000 0.020 0.008
#> SRR1661900 1 0.1059 0.9381 0.968 0.004 0.000 0.020 0.008
#> SRR1661901 1 0.1830 0.9222 0.932 0.004 0.000 0.052 0.012
#> SRR1661902 1 0.1299 0.9364 0.960 0.012 0.000 0.020 0.008
#> SRR1661903 1 0.1200 0.9370 0.964 0.012 0.000 0.016 0.008
#> SRR1661904 1 0.0854 0.9385 0.976 0.004 0.000 0.012 0.008
#> SRR1661905 1 0.1200 0.9370 0.964 0.012 0.000 0.016 0.008
#> SRR1661906 1 0.0960 0.9388 0.972 0.004 0.000 0.016 0.008
#> SRR1661907 1 0.1393 0.9349 0.956 0.012 0.000 0.024 0.008
#> SRR1661908 1 0.1893 0.9198 0.928 0.000 0.000 0.048 0.024
#> SRR1661909 1 0.1095 0.9372 0.968 0.012 0.000 0.012 0.008
#> SRR1661910 1 0.1612 0.9317 0.948 0.012 0.000 0.024 0.016
#> SRR1661911 1 0.1393 0.9349 0.956 0.012 0.000 0.024 0.008
#> SRR1661912 1 0.1299 0.9362 0.960 0.012 0.000 0.020 0.008
#> SRR1661913 1 0.1095 0.9372 0.968 0.012 0.000 0.012 0.008
#> SRR1661914 1 0.1095 0.9372 0.968 0.012 0.000 0.012 0.008
#> SRR1661915 1 0.3012 0.8843 0.876 0.000 0.008 0.056 0.060
#> SRR1661916 1 0.1095 0.9372 0.968 0.012 0.000 0.012 0.008
#> SRR1661917 1 0.0798 0.9388 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1661918 1 0.1095 0.9372 0.968 0.012 0.000 0.012 0.008
#> SRR1661919 1 0.1393 0.9349 0.956 0.012 0.000 0.024 0.008
#> SRR1661920 1 0.1314 0.9356 0.960 0.012 0.000 0.016 0.012
#> SRR1661921 1 0.2542 0.9037 0.904 0.020 0.000 0.056 0.020
#> SRR1661922 1 0.1682 0.9301 0.944 0.012 0.000 0.032 0.012
#> SRR1661923 1 0.1209 0.9356 0.964 0.012 0.000 0.012 0.012
#> SRR1661924 1 0.1483 0.9343 0.952 0.008 0.000 0.028 0.012
#> SRR1661925 1 0.1299 0.9364 0.960 0.012 0.000 0.020 0.008
#> SRR1661926 1 0.0960 0.9390 0.972 0.004 0.000 0.016 0.008
#> SRR1661927 1 0.1299 0.9365 0.960 0.012 0.000 0.020 0.008
#> SRR1661928 3 0.4316 0.5993 0.020 0.056 0.800 0.120 0.004
#> SRR1661929 3 0.4729 0.5981 0.020 0.068 0.768 0.140 0.004
#> SRR1661930 3 0.4454 0.6001 0.020 0.056 0.788 0.132 0.004
#> SRR1661931 3 0.4531 0.5991 0.016 0.064 0.780 0.136 0.004
#> SRR1661932 3 0.4000 0.6034 0.020 0.052 0.824 0.100 0.004
#> SRR1661933 3 0.5006 0.5909 0.020 0.068 0.740 0.168 0.004
#> SRR1661934 3 0.4141 0.6057 0.016 0.060 0.812 0.108 0.004
#> SRR1661935 3 0.4789 0.5792 0.028 0.044 0.756 0.168 0.004
#> SRR1661936 3 0.5891 0.5420 0.028 0.084 0.652 0.232 0.004
#> SRR1661937 3 0.4536 0.5931 0.012 0.060 0.772 0.152 0.004
#> SRR1661938 3 0.5246 0.5814 0.016 0.096 0.708 0.180 0.000
#> SRR1661939 3 0.4859 0.5969 0.024 0.068 0.760 0.144 0.004
#> SRR1661940 3 0.5099 0.5782 0.028 0.056 0.732 0.180 0.004
#> SRR1661941 3 0.4658 0.5953 0.016 0.064 0.768 0.148 0.004
#> SRR1661942 3 0.4029 0.6047 0.008 0.060 0.812 0.116 0.004
#> SRR1661943 3 0.4315 0.6070 0.020 0.072 0.796 0.112 0.000
#> SRR1661944 3 0.4443 0.6024 0.016 0.064 0.788 0.128 0.004
#> SRR1661945 3 0.5423 0.5838 0.024 0.096 0.700 0.180 0.000
#> SRR1661946 3 0.4470 0.6003 0.008 0.068 0.776 0.144 0.004
#> SRR1661947 3 0.4696 0.5881 0.012 0.068 0.748 0.172 0.000
#> SRR1661948 3 0.4534 0.6015 0.024 0.064 0.788 0.120 0.004
#> SRR1661949 3 0.4583 0.5972 0.028 0.056 0.784 0.128 0.004
#> SRR1661950 3 0.5170 0.5687 0.028 0.064 0.716 0.192 0.000
#> SRR1661951 3 0.4192 0.5986 0.012 0.052 0.800 0.132 0.004
#> SRR1661952 3 0.4509 0.6040 0.012 0.072 0.780 0.132 0.004
#> SRR1661953 3 0.4339 0.5990 0.024 0.052 0.800 0.120 0.004
#> SRR1661954 3 0.4735 0.5944 0.028 0.060 0.772 0.136 0.004
#> SRR1661955 3 0.4387 0.6010 0.012 0.064 0.788 0.132 0.004
#> SRR1661956 3 0.4560 0.6034 0.008 0.080 0.772 0.136 0.004
#> SRR1661957 3 0.4920 0.5848 0.020 0.060 0.744 0.172 0.004
#> SRR1661958 5 0.3169 0.5642 0.016 0.000 0.004 0.140 0.840
#> SRR1661959 5 0.3055 0.5623 0.016 0.000 0.000 0.144 0.840
#> SRR1661960 5 0.3098 0.5594 0.016 0.000 0.000 0.148 0.836
#> SRR1661961 5 0.3308 0.5563 0.020 0.000 0.004 0.144 0.832
#> SRR1661962 5 0.3213 0.5640 0.016 0.004 0.000 0.144 0.836
#> SRR1661963 5 0.3342 0.5602 0.020 0.000 0.008 0.136 0.836
#> SRR1661964 5 0.3213 0.5636 0.016 0.004 0.000 0.144 0.836
#> SRR1661965 5 0.3055 0.5627 0.016 0.000 0.000 0.144 0.840
#> SRR1661966 5 0.3256 0.5581 0.016 0.000 0.004 0.148 0.832
#> SRR1661967 5 0.3370 0.5632 0.016 0.004 0.004 0.144 0.832
#> SRR1661968 5 0.3169 0.5653 0.016 0.004 0.000 0.140 0.840
#> SRR1661969 5 0.3011 0.5646 0.016 0.000 0.000 0.140 0.844
#> SRR1661970 5 0.3431 0.5560 0.020 0.000 0.008 0.144 0.828
#> SRR1661971 5 0.3379 0.5548 0.016 0.000 0.008 0.148 0.828
#> SRR1661972 5 0.3435 0.5439 0.020 0.000 0.004 0.156 0.820
#> SRR1661973 5 0.3213 0.5636 0.016 0.004 0.000 0.144 0.836
#> SRR1661974 5 0.3474 0.5514 0.020 0.000 0.008 0.148 0.824
#> SRR1661975 5 0.3610 0.5569 0.020 0.004 0.012 0.136 0.828
#> SRR1661976 5 0.3292 0.5594 0.016 0.000 0.008 0.140 0.836
#> SRR1661977 5 0.3308 0.5594 0.020 0.000 0.004 0.144 0.832
#> SRR1661978 5 0.3379 0.5548 0.016 0.000 0.008 0.148 0.828
#> SRR1661979 5 0.3256 0.5581 0.016 0.000 0.004 0.148 0.832
#> SRR1661980 5 0.3326 0.5646 0.016 0.004 0.004 0.140 0.836
#> SRR1661981 5 0.3387 0.5565 0.020 0.000 0.008 0.140 0.832
#> SRR1661982 5 0.3098 0.5594 0.016 0.000 0.000 0.148 0.836
#> SRR1661983 5 0.3169 0.5635 0.016 0.000 0.004 0.140 0.840
#> SRR1661984 5 0.3213 0.5606 0.016 0.000 0.004 0.144 0.836
#> SRR1661985 5 0.3141 0.5550 0.016 0.000 0.000 0.152 0.832
#> SRR1661986 5 0.3213 0.5606 0.016 0.000 0.004 0.144 0.836
#> SRR1661987 5 0.3431 0.5565 0.020 0.000 0.008 0.144 0.828
#> SRR1661988 5 0.6127 0.3841 0.128 0.416 0.000 0.000 0.456
#> SRR1661989 5 0.6129 0.3778 0.128 0.420 0.000 0.000 0.452
#> SRR1661990 5 0.6375 0.3767 0.144 0.396 0.000 0.004 0.456
#> SRR1661991 5 0.6160 0.3728 0.132 0.420 0.000 0.000 0.448
#> SRR1661992 5 0.6328 0.3741 0.136 0.412 0.000 0.004 0.448
#> SRR1661993 5 0.5847 0.3752 0.096 0.424 0.000 0.000 0.480
#> SRR1661994 5 0.6326 0.3791 0.136 0.408 0.000 0.004 0.452
#> SRR1661995 5 0.6102 0.3813 0.108 0.420 0.000 0.004 0.468
#> SRR1661996 5 0.6328 0.3742 0.136 0.412 0.000 0.004 0.448
#> SRR1661997 5 0.5893 0.3659 0.100 0.436 0.000 0.000 0.464
#> SRR1661998 5 0.6303 0.3679 0.132 0.424 0.000 0.004 0.440
#> SRR1661999 5 0.6355 0.3743 0.140 0.408 0.000 0.004 0.448
#> SRR1662000 5 0.6150 0.3870 0.132 0.404 0.000 0.000 0.464
#> SRR1662001 5 0.6160 0.3743 0.132 0.420 0.000 0.000 0.448
#> SRR1662002 5 0.5959 0.3818 0.108 0.420 0.000 0.000 0.472
#> SRR1662003 5 0.5962 0.3800 0.108 0.424 0.000 0.000 0.468
#> SRR1662004 5 0.6300 0.3755 0.132 0.416 0.000 0.004 0.448
#> SRR1662005 5 0.6062 0.3845 0.120 0.416 0.000 0.000 0.464
#> SRR1662006 5 0.6001 0.3647 0.112 0.432 0.000 0.000 0.456
#> SRR1662007 5 0.6178 0.3672 0.116 0.432 0.000 0.004 0.448
#> SRR1662008 5 0.6239 0.3721 0.124 0.420 0.000 0.004 0.452
#> SRR1662009 5 0.6001 0.3699 0.112 0.432 0.000 0.000 0.456
#> SRR1662010 5 0.6355 0.3735 0.140 0.408 0.000 0.004 0.448
#> SRR1662011 5 0.6097 0.3794 0.124 0.420 0.000 0.000 0.456
#> SRR1662012 5 0.6153 0.3833 0.132 0.408 0.000 0.000 0.460
#> SRR1662013 5 0.6330 0.3704 0.136 0.416 0.000 0.004 0.444
#> SRR1662014 5 0.6173 0.3739 0.116 0.420 0.000 0.004 0.460
#> SRR1662015 5 0.6272 0.3728 0.128 0.424 0.000 0.004 0.444
#> SRR1662016 5 0.6062 0.3834 0.120 0.416 0.000 0.000 0.464
#> SRR1662017 5 0.5927 0.3716 0.104 0.428 0.000 0.000 0.468
#> SRR1662018 3 0.4699 0.4724 0.060 0.000 0.784 0.068 0.088
#> SRR1662019 3 0.4762 0.4720 0.064 0.000 0.780 0.068 0.088
#> SRR1662020 3 0.4646 0.4757 0.064 0.000 0.788 0.064 0.084
#> SRR1662021 3 0.5179 0.4402 0.056 0.000 0.748 0.092 0.104
#> SRR1662022 3 0.4769 0.4680 0.068 0.000 0.780 0.068 0.084
#> SRR1662023 3 0.4517 0.4818 0.052 0.000 0.796 0.076 0.076
#> SRR1662024 3 0.4648 0.4779 0.060 0.000 0.788 0.072 0.080
#> SRR1662025 3 0.4651 0.4750 0.064 0.000 0.788 0.068 0.080
#> SRR1662026 3 0.4769 0.4719 0.068 0.000 0.780 0.068 0.084
#> SRR1662027 3 0.4642 0.4770 0.056 0.000 0.788 0.076 0.080
#> SRR1662028 3 0.4644 0.4757 0.060 0.000 0.788 0.068 0.084
#> SRR1662029 3 0.4704 0.4711 0.060 0.000 0.784 0.072 0.084
#> SRR1662030 3 0.4871 0.4638 0.060 0.000 0.772 0.076 0.092
#> SRR1662031 3 0.4763 0.4706 0.060 0.000 0.780 0.076 0.084
#> SRR1662032 3 0.4707 0.4721 0.064 0.000 0.784 0.068 0.084
#> SRR1662033 3 0.4642 0.4770 0.056 0.000 0.788 0.076 0.080
#> SRR1662034 3 0.4810 0.4694 0.056 0.000 0.776 0.080 0.088
#> SRR1662035 3 0.4631 0.4773 0.052 0.000 0.788 0.076 0.084
#> SRR1662036 3 0.4573 0.4802 0.052 0.000 0.792 0.072 0.084
#> SRR1662037 3 0.4642 0.4770 0.056 0.000 0.788 0.076 0.080
#> SRR1662038 3 0.4822 0.4634 0.064 0.000 0.776 0.072 0.088
#> SRR1662039 3 0.4698 0.4740 0.056 0.000 0.784 0.076 0.084
#> SRR1662040 3 0.4822 0.4634 0.064 0.000 0.776 0.072 0.088
#> SRR1662041 3 0.5141 0.4456 0.052 0.000 0.748 0.080 0.120
#> SRR1662042 3 0.4651 0.4751 0.064 0.000 0.788 0.068 0.080
#> SRR1662043 3 0.4583 0.4775 0.056 0.000 0.792 0.072 0.080
#> SRR1662044 3 0.4631 0.4773 0.052 0.000 0.788 0.076 0.084
#> SRR1662045 3 0.4700 0.4726 0.064 0.000 0.784 0.064 0.088
#> SRR1662046 3 0.4712 0.4713 0.068 0.000 0.784 0.068 0.080
#> SRR1662047 3 0.4822 0.4634 0.064 0.000 0.776 0.072 0.088
#> SRR1662048 3 0.4631 0.4771 0.052 0.000 0.788 0.076 0.084
#> SRR1662049 3 0.4639 0.4746 0.056 0.000 0.788 0.072 0.084
#> SRR1662050 3 0.4762 0.4692 0.064 0.000 0.780 0.068 0.088
#> SRR1662051 3 0.4916 0.4598 0.060 0.000 0.768 0.072 0.100
#> SRR1662052 3 0.4648 0.4744 0.060 0.000 0.788 0.072 0.080
#> SRR1662053 3 0.4631 0.4771 0.052 0.000 0.788 0.076 0.084
#> SRR1662054 4 0.1095 0.9907 0.012 0.000 0.012 0.968 0.008
#> SRR1662055 4 0.1209 0.9936 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662056 4 0.1314 0.9930 0.012 0.000 0.012 0.960 0.016
#> SRR1662057 4 0.1413 0.9904 0.012 0.000 0.012 0.956 0.020
#> SRR1662058 4 0.1413 0.9904 0.012 0.000 0.012 0.956 0.020
#> SRR1662059 4 0.1413 0.9904 0.012 0.000 0.012 0.956 0.020
#> SRR1662060 4 0.1314 0.9922 0.012 0.000 0.012 0.960 0.016
#> SRR1662061 4 0.1314 0.9930 0.012 0.000 0.012 0.960 0.016
#> SRR1662062 4 0.1314 0.9910 0.016 0.000 0.012 0.960 0.012
#> SRR1662063 4 0.1370 0.9899 0.012 0.004 0.012 0.960 0.012
#> SRR1662064 4 0.1209 0.9936 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662065 4 0.1314 0.9909 0.012 0.000 0.012 0.960 0.016
#> SRR1662066 4 0.1209 0.9936 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662067 4 0.1209 0.9936 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662068 4 0.1209 0.9936 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662069 4 0.1413 0.9904 0.012 0.000 0.012 0.956 0.020
#> SRR1662070 4 0.1314 0.9930 0.012 0.000 0.012 0.960 0.016
#> SRR1662071 4 0.1370 0.9899 0.012 0.004 0.012 0.960 0.012
#> SRR1662072 4 0.1209 0.9936 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662073 4 0.1095 0.9907 0.012 0.000 0.012 0.968 0.008
#> SRR1662074 4 0.1209 0.9925 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662075 4 0.1314 0.9926 0.012 0.000 0.012 0.960 0.016
#> SRR1662076 4 0.1200 0.9892 0.012 0.000 0.008 0.964 0.016
#> SRR1662077 4 0.1419 0.9914 0.016 0.000 0.012 0.956 0.016
#> SRR1662078 4 0.1209 0.9925 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662079 4 0.1299 0.9876 0.012 0.000 0.008 0.960 0.020
#> SRR1662080 4 0.1413 0.9906 0.012 0.000 0.012 0.956 0.020
#> SRR1662081 4 0.1209 0.9936 0.012 0.000 0.012 0.964 0.012
#> SRR1662082 4 0.1256 0.9859 0.012 0.004 0.012 0.964 0.008
#> SRR1662083 4 0.1314 0.9926 0.012 0.000 0.012 0.960 0.016
#> SRR1662084 2 0.6650 -0.0464 0.188 0.480 0.000 0.008 0.324
#> SRR1662085 2 0.6571 -0.0671 0.172 0.488 0.000 0.008 0.332
#> SRR1662086 2 0.6602 -0.0514 0.160 0.508 0.004 0.008 0.320
#> SRR1662087 1 0.6791 -0.0219 0.472 0.248 0.000 0.008 0.272
#> SRR1662088 2 0.6662 -0.0853 0.184 0.468 0.000 0.008 0.340
#> SRR1662089 2 0.6636 -0.0552 0.184 0.480 0.000 0.008 0.328
#> SRR1662090 2 0.6616 -0.0439 0.184 0.488 0.000 0.008 0.320
#> SRR1662091 2 0.6653 -0.0457 0.192 0.484 0.000 0.008 0.316
#> SRR1662092 2 0.6830 -0.0365 0.204 0.480 0.004 0.008 0.304
#> SRR1662093 2 0.6965 -0.0944 0.236 0.432 0.000 0.012 0.320
#> SRR1662094 2 0.6527 -0.0802 0.164 0.492 0.000 0.008 0.336
#> SRR1662095 2 0.6695 -0.0553 0.196 0.472 0.000 0.008 0.324
#> SRR1662096 2 0.6739 -0.0489 0.212 0.472 0.000 0.008 0.308
#> SRR1662097 2 0.6592 -0.0444 0.180 0.492 0.000 0.008 0.320
#> SRR1662098 2 0.6691 -0.0753 0.192 0.468 0.000 0.008 0.332
#> SRR1662099 2 0.6658 -0.0522 0.168 0.500 0.004 0.008 0.320
#> SRR1662100 2 0.6581 -0.0409 0.180 0.496 0.000 0.008 0.316
#> SRR1662101 2 0.6777 -0.0523 0.220 0.464 0.000 0.008 0.308
#> SRR1662102 2 0.6602 -0.0467 0.180 0.488 0.000 0.008 0.324
#> SRR1662103 2 0.6569 -0.0334 0.180 0.500 0.000 0.008 0.312
#> SRR1662104 2 0.6654 -0.0740 0.184 0.472 0.000 0.008 0.336
#> SRR1662105 2 0.6739 -0.0408 0.184 0.492 0.004 0.008 0.312
#> SRR1662106 2 0.6636 -0.0748 0.184 0.480 0.000 0.008 0.328
#> SRR1662107 2 0.6817 -0.0588 0.192 0.472 0.004 0.008 0.324
#> SRR1662108 2 0.6819 -0.0474 0.196 0.476 0.004 0.008 0.316
#> SRR1662109 2 0.6728 -0.0605 0.204 0.468 0.000 0.008 0.320
#> SRR1662110 2 0.6566 -0.0484 0.176 0.496 0.000 0.008 0.320
#> SRR1662111 1 0.6745 0.2276 0.540 0.232 0.000 0.024 0.204
#> SRR1662112 2 0.6592 -0.0563 0.180 0.492 0.000 0.008 0.320
#> SRR1662113 2 0.6612 -0.0539 0.180 0.484 0.000 0.008 0.328
#> SRR1662114 2 0.7041 -0.1877 0.220 0.404 0.000 0.016 0.360
#> SRR1662115 2 0.6815 -0.0469 0.208 0.472 0.000 0.012 0.308
#> SRR1662116 2 0.6695 -0.0515 0.196 0.472 0.000 0.008 0.324
#> SRR1662117 2 0.6778 -0.0638 0.216 0.460 0.000 0.008 0.316
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1661716 2 0.711 0.0130 0.008 0.400 0.072 0.112 0.392 0.016
#> SRR1661717 2 0.700 0.0531 0.012 0.416 0.084 0.076 0.396 0.016
#> SRR1661718 2 0.692 0.0869 0.012 0.436 0.072 0.080 0.384 0.016
#> SRR1661719 2 0.698 0.0444 0.008 0.416 0.068 0.100 0.392 0.016
#> SRR1661720 2 0.697 0.0367 0.012 0.412 0.080 0.076 0.404 0.016
#> SRR1661721 5 0.716 0.0225 0.012 0.380 0.076 0.104 0.412 0.016
#> SRR1661722 2 0.717 0.0251 0.012 0.404 0.076 0.104 0.388 0.016
#> SRR1661723 2 0.711 0.0275 0.008 0.408 0.076 0.108 0.384 0.016
#> SRR1661724 2 0.697 0.0622 0.012 0.424 0.080 0.076 0.392 0.016
#> SRR1661725 2 0.697 0.0321 0.012 0.412 0.080 0.076 0.404 0.016
#> SRR1661726 2 0.704 0.0324 0.012 0.408 0.080 0.084 0.400 0.016
#> SRR1661727 2 0.707 0.0146 0.012 0.404 0.076 0.092 0.400 0.016
#> SRR1661728 2 0.691 0.0573 0.008 0.424 0.068 0.084 0.396 0.020
#> SRR1661729 2 0.696 0.0345 0.012 0.412 0.072 0.076 0.408 0.020
#> SRR1661730 2 0.697 0.0507 0.012 0.420 0.076 0.080 0.396 0.016
#> SRR1661731 2 0.712 0.0168 0.008 0.400 0.068 0.132 0.380 0.012
#> SRR1661732 2 0.707 0.0248 0.012 0.408 0.072 0.088 0.400 0.020
#> SRR1661733 2 0.720 0.0212 0.008 0.396 0.076 0.120 0.384 0.016
#> SRR1661734 2 0.693 0.0435 0.012 0.420 0.068 0.084 0.400 0.016
#> SRR1661735 2 0.696 0.0479 0.012 0.420 0.072 0.084 0.396 0.016
#> SRR1661736 2 0.781 0.2899 0.048 0.512 0.092 0.040 0.200 0.108
#> SRR1661737 2 0.784 0.2877 0.048 0.504 0.088 0.040 0.208 0.112
#> SRR1661738 2 0.788 0.2817 0.040 0.488 0.088 0.036 0.212 0.136
#> SRR1661739 2 0.783 0.2867 0.048 0.504 0.088 0.040 0.212 0.108
#> SRR1661740 2 0.788 0.2849 0.052 0.500 0.088 0.036 0.204 0.120
#> SRR1661741 2 0.775 0.2914 0.044 0.516 0.092 0.040 0.200 0.108
#> SRR1661742 2 0.774 0.2901 0.044 0.516 0.088 0.040 0.204 0.108
#> SRR1661743 2 0.786 0.2848 0.052 0.504 0.088 0.040 0.208 0.108
#> SRR1661744 2 0.768 0.2866 0.044 0.520 0.084 0.040 0.208 0.104
#> SRR1661745 2 0.784 0.2859 0.048 0.504 0.084 0.040 0.208 0.116
#> SRR1661746 2 0.797 0.2913 0.056 0.496 0.092 0.036 0.192 0.128
#> SRR1661747 2 0.792 0.2880 0.052 0.500 0.088 0.040 0.200 0.120
#> SRR1661748 2 0.763 0.2854 0.040 0.520 0.088 0.036 0.212 0.104
#> SRR1661749 2 0.768 0.2896 0.040 0.520 0.088 0.040 0.204 0.108
#> SRR1661750 2 0.781 0.2818 0.048 0.504 0.088 0.040 0.216 0.104
#> SRR1661751 2 0.787 0.2853 0.048 0.500 0.092 0.040 0.212 0.108
#> SRR1661752 2 0.790 0.2908 0.048 0.496 0.092 0.036 0.204 0.124
#> SRR1661753 2 0.780 0.2893 0.044 0.508 0.084 0.040 0.204 0.120
#> SRR1661754 2 0.787 0.2779 0.052 0.500 0.088 0.040 0.216 0.104
#> SRR1661755 2 0.783 0.2860 0.044 0.500 0.092 0.040 0.216 0.108
#> SRR1661756 2 0.788 0.2809 0.052 0.500 0.088 0.040 0.212 0.108
#> SRR1661757 2 0.776 0.2882 0.044 0.512 0.088 0.040 0.208 0.108
#> SRR1661758 2 0.778 0.2875 0.044 0.508 0.088 0.040 0.212 0.108
#> SRR1661759 2 0.778 0.2914 0.044 0.512 0.092 0.040 0.204 0.108
#> SRR1661760 2 0.787 0.2828 0.048 0.500 0.092 0.040 0.212 0.108
#> SRR1661761 2 0.771 0.2837 0.040 0.508 0.084 0.036 0.216 0.116
#> SRR1661762 2 0.779 0.2845 0.048 0.508 0.084 0.040 0.212 0.108
#> SRR1661763 2 0.780 0.2896 0.048 0.508 0.088 0.036 0.204 0.116
#> SRR1661764 2 0.778 0.2914 0.044 0.512 0.092 0.040 0.204 0.108
#> SRR1661766 2 0.250 0.4213 0.000 0.896 0.056 0.004 0.028 0.016
#> SRR1661767 2 0.274 0.4162 0.004 0.888 0.060 0.008 0.024 0.016
#> SRR1661768 2 0.281 0.4160 0.000 0.876 0.072 0.004 0.032 0.016
#> SRR1661769 2 0.279 0.4164 0.000 0.876 0.072 0.004 0.036 0.012
#> SRR1661770 2 0.274 0.4187 0.000 0.884 0.056 0.008 0.040 0.012
#> SRR1661771 2 0.254 0.4201 0.000 0.888 0.068 0.000 0.028 0.016
#> SRR1661772 2 0.290 0.4156 0.000 0.872 0.072 0.008 0.036 0.012
#> SRR1661773 2 0.260 0.4175 0.000 0.888 0.064 0.004 0.032 0.012
#> SRR1661774 2 0.256 0.4193 0.000 0.892 0.060 0.004 0.028 0.016
#> SRR1661775 2 0.268 0.4164 0.000 0.884 0.064 0.004 0.036 0.012
#> SRR1661776 2 0.264 0.4189 0.000 0.888 0.060 0.004 0.032 0.016
#> SRR1661777 2 0.268 0.4177 0.000 0.884 0.068 0.004 0.028 0.016
#> SRR1661778 2 0.266 0.4232 0.000 0.888 0.056 0.004 0.032 0.020
#> SRR1661779 2 0.259 0.4187 0.000 0.888 0.068 0.004 0.028 0.012
#> SRR1661780 2 0.280 0.4168 0.000 0.876 0.076 0.004 0.024 0.020
#> SRR1661781 2 0.275 0.4180 0.000 0.884 0.060 0.008 0.032 0.016
#> SRR1661782 2 0.274 0.4202 0.000 0.884 0.056 0.004 0.036 0.020
#> SRR1661783 2 0.271 0.4179 0.000 0.884 0.068 0.008 0.024 0.016
#> SRR1661784 2 0.271 0.4176 0.000 0.884 0.060 0.004 0.036 0.016
#> SRR1661785 2 0.282 0.4225 0.000 0.876 0.072 0.004 0.028 0.020
#> SRR1661786 2 0.246 0.4179 0.000 0.892 0.064 0.000 0.032 0.012
#> SRR1661787 2 0.278 0.4189 0.000 0.880 0.064 0.004 0.032 0.020
#> SRR1661788 2 0.262 0.4196 0.000 0.888 0.060 0.004 0.036 0.012
#> SRR1661789 2 0.263 0.4212 0.000 0.892 0.052 0.008 0.032 0.016
#> SRR1661790 2 0.261 0.4171 0.000 0.884 0.068 0.000 0.032 0.016
#> SRR1661791 2 0.275 0.4196 0.000 0.880 0.064 0.004 0.040 0.012
#> SRR1661792 2 0.260 0.4216 0.000 0.888 0.068 0.004 0.024 0.016
#> SRR1661793 2 0.271 0.4198 0.000 0.884 0.060 0.004 0.036 0.016
#> SRR1661794 2 0.253 0.4189 0.000 0.892 0.064 0.004 0.028 0.012
#> SRR1661795 2 0.256 0.4186 0.000 0.892 0.056 0.004 0.036 0.012
#> SRR1661796 2 0.270 0.4501 0.016 0.892 0.004 0.012 0.020 0.056
#> SRR1661797 2 0.226 0.4510 0.012 0.912 0.004 0.008 0.012 0.052
#> SRR1661798 2 0.261 0.4501 0.016 0.896 0.004 0.012 0.016 0.056
#> SRR1661799 2 0.243 0.4483 0.016 0.908 0.012 0.008 0.012 0.044
#> SRR1661800 2 0.241 0.4506 0.016 0.904 0.004 0.008 0.012 0.056
#> SRR1661801 2 0.283 0.4476 0.016 0.888 0.008 0.012 0.024 0.052
#> SRR1661802 2 0.295 0.4474 0.016 0.880 0.004 0.016 0.028 0.056
#> SRR1661803 2 0.259 0.4501 0.016 0.900 0.008 0.016 0.012 0.048
#> SRR1661804 2 0.269 0.4509 0.016 0.892 0.012 0.008 0.012 0.060
#> SRR1661805 2 0.241 0.4479 0.020 0.908 0.012 0.004 0.012 0.044
#> SRR1661806 2 0.259 0.4500 0.016 0.900 0.008 0.012 0.016 0.048
#> SRR1661807 2 0.287 0.4487 0.020 0.888 0.020 0.012 0.012 0.048
#> SRR1661808 2 0.285 0.4507 0.016 0.888 0.012 0.016 0.016 0.052
#> SRR1661809 2 0.258 0.4474 0.016 0.900 0.008 0.008 0.020 0.048
#> SRR1661810 2 0.274 0.4498 0.016 0.892 0.008 0.012 0.020 0.052
#> SRR1661811 2 0.279 0.4492 0.016 0.892 0.012 0.016 0.016 0.048
#> SRR1661812 2 0.286 0.4469 0.016 0.888 0.008 0.016 0.024 0.048
#> SRR1661813 2 0.245 0.4507 0.016 0.904 0.004 0.012 0.012 0.052
#> SRR1661814 2 0.279 0.4467 0.016 0.892 0.008 0.016 0.024 0.044
#> SRR1661815 2 0.238 0.4500 0.016 0.908 0.004 0.008 0.016 0.048
#> SRR1661816 2 0.250 0.4491 0.016 0.904 0.012 0.008 0.012 0.048
#> SRR1661817 2 0.251 0.4484 0.016 0.904 0.008 0.008 0.020 0.044
#> SRR1661818 2 0.256 0.4462 0.016 0.904 0.012 0.012 0.016 0.040
#> SRR1661819 2 0.285 0.4506 0.024 0.884 0.008 0.008 0.016 0.060
#> SRR1661820 2 0.262 0.4500 0.016 0.900 0.008 0.016 0.016 0.044
#> SRR1661821 2 0.275 0.4512 0.016 0.888 0.012 0.008 0.012 0.064
#> SRR1661822 2 0.278 0.4474 0.016 0.892 0.012 0.012 0.020 0.048
#> SRR1661823 2 0.259 0.4494 0.016 0.900 0.008 0.012 0.016 0.048
#> SRR1661824 2 0.255 0.4504 0.016 0.900 0.004 0.012 0.016 0.052
#> SRR1661825 2 0.261 0.4479 0.020 0.900 0.012 0.008 0.016 0.044
#> SRR1661826 1 0.651 0.7371 0.612 0.004 0.164 0.036 0.124 0.060
#> SRR1661827 1 0.645 0.7374 0.616 0.004 0.168 0.032 0.116 0.064
#> SRR1661828 1 0.648 0.7362 0.612 0.004 0.172 0.036 0.120 0.056
#> SRR1661829 1 0.646 0.7391 0.616 0.004 0.164 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661830 1 0.646 0.7357 0.616 0.004 0.164 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661831 1 0.646 0.7391 0.616 0.004 0.164 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661832 1 0.647 0.7352 0.616 0.004 0.164 0.036 0.120 0.060
#> SRR1661833 1 0.646 0.7391 0.616 0.004 0.164 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661834 1 0.649 0.7378 0.612 0.004 0.168 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661835 1 0.646 0.7391 0.616 0.004 0.164 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661836 1 0.655 0.7380 0.608 0.004 0.164 0.036 0.128 0.060
#> SRR1661837 1 0.640 0.7393 0.620 0.004 0.164 0.036 0.124 0.052
#> SRR1661838 1 0.651 0.7397 0.612 0.004 0.164 0.036 0.124 0.060
#> SRR1661839 1 0.646 0.7391 0.616 0.004 0.164 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661840 1 0.647 0.7385 0.616 0.004 0.164 0.036 0.120 0.060
#> SRR1661841 1 0.645 0.7389 0.616 0.004 0.168 0.036 0.120 0.056
#> SRR1661843 1 0.656 0.7317 0.600 0.004 0.176 0.028 0.124 0.068
#> SRR1661844 1 0.644 0.7360 0.620 0.004 0.164 0.036 0.116 0.060
#> SRR1661845 1 0.647 0.7400 0.616 0.004 0.164 0.036 0.120 0.060
#> SRR1661846 1 0.646 0.7391 0.616 0.004 0.164 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661847 1 0.649 0.7371 0.612 0.004 0.164 0.036 0.128 0.056
#> SRR1661848 1 0.640 0.7389 0.620 0.004 0.168 0.040 0.120 0.048
#> SRR1661849 1 0.644 0.7388 0.616 0.004 0.168 0.032 0.120 0.060
#> SRR1661850 1 0.640 0.7393 0.620 0.004 0.164 0.036 0.124 0.052
#> SRR1661851 1 0.655 0.7382 0.608 0.004 0.168 0.036 0.120 0.064
#> SRR1661852 1 0.640 0.7393 0.620 0.004 0.164 0.036 0.124 0.052
#> SRR1661853 1 0.655 0.7380 0.608 0.004 0.164 0.036 0.128 0.060
#> SRR1661854 1 0.652 0.7390 0.612 0.004 0.164 0.036 0.120 0.064
#> SRR1661855 1 0.646 0.7404 0.616 0.004 0.164 0.036 0.124 0.056
#> SRR1661856 3 0.559 0.8957 0.000 0.256 0.544 0.000 0.200 0.000
#> SRR1661857 3 0.562 0.8915 0.000 0.264 0.536 0.000 0.200 0.000
#> SRR1661858 3 0.568 0.8924 0.000 0.248 0.528 0.000 0.224 0.000
#> SRR1661859 3 0.590 0.8827 0.012 0.252 0.536 0.000 0.200 0.000
#> SRR1661860 3 0.574 0.8715 0.000 0.248 0.516 0.000 0.236 0.000
#> SRR1661861 3 0.557 0.8217 0.004 0.256 0.580 0.004 0.156 0.000
#> SRR1661862 3 0.566 0.8964 0.000 0.252 0.532 0.000 0.216 0.000
#> SRR1661863 3 0.571 0.8554 0.000 0.216 0.520 0.000 0.264 0.000
#> SRR1661864 3 0.572 0.8971 0.004 0.244 0.544 0.000 0.208 0.000
#> SRR1661865 3 0.561 0.8961 0.000 0.236 0.544 0.000 0.220 0.000
#> SRR1661866 3 0.580 0.8916 0.000 0.240 0.528 0.004 0.228 0.000
#> SRR1661867 3 0.555 0.8907 0.000 0.256 0.552 0.000 0.192 0.000
#> SRR1661868 3 0.568 0.8922 0.000 0.248 0.528 0.000 0.224 0.000
#> SRR1661869 3 0.575 0.8980 0.004 0.248 0.536 0.000 0.212 0.000
#> SRR1661870 3 0.580 0.8871 0.000 0.244 0.528 0.004 0.224 0.000
#> SRR1661871 3 0.563 0.8255 0.008 0.224 0.592 0.004 0.172 0.000
#> SRR1661872 3 0.567 0.8920 0.000 0.240 0.532 0.000 0.228 0.000
#> SRR1661873 3 0.570 0.8734 0.000 0.244 0.560 0.008 0.188 0.000
#> SRR1661874 3 0.567 0.8951 0.000 0.244 0.532 0.000 0.224 0.000
#> SRR1661875 3 0.567 0.8937 0.000 0.244 0.532 0.000 0.224 0.000
#> SRR1661876 3 0.569 0.8797 0.000 0.232 0.528 0.000 0.240 0.000
#> SRR1661877 3 0.566 0.8955 0.000 0.248 0.532 0.000 0.220 0.000
#> SRR1661878 3 0.561 0.8732 0.000 0.284 0.532 0.000 0.184 0.000
#> SRR1661879 3 0.572 0.8469 0.000 0.256 0.564 0.012 0.168 0.000
#> SRR1661880 3 0.566 0.8898 0.000 0.236 0.556 0.004 0.204 0.000
#> SRR1661881 3 0.571 0.8959 0.004 0.248 0.544 0.000 0.204 0.000
#> SRR1661882 3 0.564 0.8648 0.004 0.276 0.548 0.000 0.172 0.000
#> SRR1661883 3 0.566 0.8896 0.000 0.248 0.532 0.000 0.220 0.000
#> SRR1661884 3 0.571 0.8950 0.004 0.248 0.544 0.000 0.204 0.000
#> SRR1661885 3 0.559 0.8838 0.000 0.272 0.540 0.000 0.188 0.000
#> SRR1661886 3 0.579 0.8301 0.000 0.196 0.520 0.004 0.280 0.000
#> SRR1661887 3 0.592 0.8721 0.004 0.248 0.552 0.012 0.184 0.000
#> SRR1661888 3 0.583 0.8844 0.000 0.236 0.520 0.004 0.240 0.000
#> SRR1661889 3 0.559 0.8864 0.000 0.268 0.540 0.000 0.192 0.000
#> SRR1661890 3 0.584 0.8881 0.004 0.224 0.544 0.004 0.224 0.000
#> SRR1661891 3 0.568 0.8664 0.000 0.216 0.528 0.000 0.256 0.000
#> SRR1661892 1 0.268 0.7884 0.888 0.012 0.000 0.008 0.048 0.044
#> SRR1661893 1 0.251 0.7903 0.896 0.008 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661894 1 0.261 0.7891 0.892 0.012 0.000 0.008 0.044 0.044
#> SRR1661895 1 0.329 0.7763 0.860 0.012 0.012 0.008 0.056 0.052
#> SRR1661896 1 0.275 0.7882 0.884 0.012 0.000 0.008 0.052 0.044
#> SRR1661897 1 0.261 0.7897 0.892 0.012 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661898 1 0.254 0.7897 0.896 0.012 0.000 0.008 0.048 0.036
#> SRR1661899 1 0.261 0.7891 0.892 0.012 0.000 0.008 0.044 0.044
#> SRR1661900 1 0.268 0.7896 0.888 0.012 0.000 0.008 0.052 0.040
#> SRR1661901 1 0.319 0.7794 0.868 0.016 0.008 0.012 0.048 0.048
#> SRR1661902 1 0.282 0.7897 0.884 0.012 0.004 0.008 0.052 0.040
#> SRR1661903 1 0.258 0.7902 0.892 0.008 0.000 0.008 0.052 0.040
#> SRR1661904 1 0.261 0.7891 0.892 0.012 0.000 0.008 0.044 0.044
#> SRR1661905 1 0.261 0.7897 0.892 0.012 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661906 1 0.261 0.7897 0.892 0.012 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661907 1 0.261 0.7897 0.892 0.012 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661908 1 0.351 0.7770 0.852 0.012 0.012 0.020 0.048 0.056
#> SRR1661909 1 0.261 0.7897 0.892 0.012 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661910 1 0.271 0.7876 0.884 0.008 0.000 0.008 0.056 0.044
#> SRR1661911 1 0.258 0.7894 0.892 0.008 0.000 0.008 0.048 0.044
#> SRR1661912 1 0.261 0.7897 0.892 0.012 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661913 1 0.268 0.7896 0.888 0.012 0.000 0.008 0.052 0.040
#> SRR1661914 1 0.258 0.7902 0.892 0.008 0.000 0.008 0.052 0.040
#> SRR1661915 1 0.413 0.7629 0.820 0.008 0.032 0.044 0.044 0.052
#> SRR1661916 1 0.261 0.7893 0.892 0.012 0.000 0.008 0.052 0.036
#> SRR1661917 1 0.251 0.7903 0.896 0.008 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661918 1 0.261 0.7891 0.892 0.012 0.000 0.008 0.044 0.044
#> SRR1661919 1 0.268 0.7896 0.888 0.012 0.000 0.008 0.052 0.040
#> SRR1661920 1 0.251 0.7903 0.896 0.008 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661921 1 0.348 0.7704 0.852 0.016 0.012 0.012 0.060 0.048
#> SRR1661922 1 0.282 0.7885 0.884 0.012 0.004 0.008 0.048 0.044
#> SRR1661923 1 0.271 0.7887 0.888 0.012 0.000 0.012 0.048 0.040
#> SRR1661924 1 0.358 0.7675 0.848 0.016 0.008 0.024 0.056 0.048
#> SRR1661925 1 0.261 0.7892 0.892 0.008 0.000 0.012 0.044 0.044
#> SRR1661926 1 0.261 0.7897 0.892 0.012 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661927 1 0.261 0.7897 0.892 0.012 0.000 0.008 0.048 0.040
#> SRR1661928 2 0.614 0.2100 0.008 0.528 0.236 0.012 0.000 0.216
#> SRR1661929 2 0.655 0.1898 0.016 0.492 0.236 0.012 0.004 0.240
#> SRR1661930 2 0.620 0.2125 0.004 0.536 0.232 0.016 0.004 0.208
#> SRR1661931 2 0.606 0.1964 0.000 0.512 0.224 0.008 0.004 0.252
#> SRR1661932 2 0.610 0.1772 0.004 0.536 0.260 0.012 0.004 0.184
#> SRR1661933 2 0.628 0.2210 0.004 0.512 0.196 0.016 0.004 0.268
#> SRR1661934 2 0.626 0.1868 0.004 0.508 0.256 0.012 0.004 0.216
#> SRR1661935 2 0.616 0.2163 0.008 0.504 0.212 0.008 0.000 0.268
#> SRR1661936 2 0.626 0.2167 0.004 0.500 0.172 0.016 0.004 0.304
#> SRR1661937 2 0.627 0.1968 0.008 0.508 0.220 0.008 0.004 0.252
#> SRR1661938 2 0.612 0.2357 0.004 0.536 0.192 0.012 0.004 0.252
#> SRR1661939 2 0.628 0.2183 0.008 0.524 0.220 0.012 0.004 0.232
#> SRR1661940 2 0.619 0.2163 0.004 0.496 0.224 0.012 0.000 0.264
#> SRR1661941 2 0.618 0.2077 0.000 0.512 0.208 0.016 0.004 0.260
#> SRR1661942 2 0.625 0.2038 0.008 0.540 0.240 0.016 0.004 0.192
#> SRR1661943 2 0.629 0.2023 0.016 0.544 0.240 0.012 0.004 0.184
#> SRR1661944 2 0.614 0.1983 0.004 0.536 0.228 0.012 0.004 0.216
#> SRR1661945 2 0.634 0.2298 0.008 0.544 0.192 0.024 0.004 0.228
#> SRR1661946 2 0.603 0.2144 0.000 0.536 0.220 0.012 0.004 0.228
#> SRR1661947 2 0.605 0.2025 0.000 0.512 0.216 0.008 0.004 0.260
#> SRR1661948 2 0.618 0.2149 0.004 0.528 0.224 0.012 0.004 0.228
#> SRR1661949 2 0.646 0.1836 0.008 0.496 0.248 0.016 0.004 0.228
#> SRR1661950 2 0.657 0.2105 0.012 0.492 0.196 0.020 0.004 0.276
#> SRR1661951 2 0.628 0.2013 0.004 0.520 0.228 0.016 0.004 0.228
#> SRR1661952 2 0.614 0.2056 0.004 0.516 0.204 0.008 0.004 0.264
#> SRR1661953 2 0.610 0.1894 0.000 0.520 0.240 0.012 0.004 0.224
#> SRR1661954 2 0.632 0.2168 0.008 0.528 0.220 0.016 0.004 0.224
#> SRR1661955 2 0.607 0.2079 0.004 0.536 0.232 0.008 0.004 0.216
#> SRR1661956 2 0.597 0.2222 0.000 0.532 0.212 0.008 0.004 0.244
#> SRR1661957 2 0.628 0.2063 0.004 0.496 0.200 0.012 0.004 0.284
#> SRR1661958 4 0.332 0.9921 0.004 0.000 0.000 0.828 0.084 0.084
#> SRR1661959 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661960 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661961 4 0.327 0.9928 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661962 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661963 4 0.321 0.9943 0.004 0.000 0.000 0.836 0.084 0.076
#> SRR1661964 4 0.326 0.9937 0.004 0.000 0.000 0.832 0.088 0.076
#> SRR1661965 4 0.332 0.9931 0.004 0.000 0.000 0.828 0.084 0.084
#> SRR1661966 4 0.321 0.9943 0.004 0.000 0.000 0.836 0.084 0.076
#> SRR1661967 4 0.332 0.9949 0.004 0.000 0.000 0.828 0.088 0.080
#> SRR1661968 4 0.321 0.9943 0.004 0.000 0.000 0.836 0.084 0.076
#> SRR1661969 4 0.326 0.9937 0.004 0.000 0.000 0.832 0.088 0.076
#> SRR1661970 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661971 4 0.336 0.9932 0.004 0.000 0.004 0.832 0.080 0.080
#> SRR1661972 4 0.327 0.9923 0.004 0.000 0.000 0.832 0.080 0.084
#> SRR1661973 4 0.332 0.9949 0.004 0.000 0.000 0.828 0.088 0.080
#> SRR1661974 4 0.332 0.9921 0.004 0.000 0.000 0.828 0.084 0.084
#> SRR1661975 4 0.321 0.9885 0.004 0.000 0.000 0.836 0.088 0.072
#> SRR1661976 4 0.332 0.9921 0.004 0.000 0.000 0.828 0.084 0.084
#> SRR1661977 4 0.316 0.9909 0.004 0.000 0.000 0.840 0.080 0.076
#> SRR1661978 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661979 4 0.321 0.9943 0.004 0.000 0.000 0.836 0.084 0.076
#> SRR1661980 4 0.332 0.9949 0.004 0.000 0.000 0.828 0.088 0.080
#> SRR1661981 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661982 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661983 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661984 4 0.327 0.9955 0.004 0.000 0.000 0.832 0.084 0.080
#> SRR1661985 4 0.332 0.9935 0.004 0.000 0.000 0.828 0.084 0.084
#> SRR1661986 4 0.332 0.9949 0.004 0.000 0.000 0.828 0.088 0.080
#> SRR1661987 4 0.321 0.9943 0.004 0.000 0.000 0.836 0.084 0.076
#> SRR1661988 5 0.584 0.7689 0.092 0.016 0.068 0.120 0.688 0.016
#> SRR1661989 5 0.590 0.7687 0.096 0.016 0.072 0.116 0.684 0.016
#> SRR1661990 5 0.591 0.7585 0.096 0.012 0.068 0.132 0.676 0.016
#> SRR1661991 5 0.589 0.7720 0.092 0.016 0.072 0.120 0.684 0.016
#> SRR1661992 5 0.586 0.7727 0.096 0.016 0.072 0.112 0.688 0.016
#> SRR1661993 5 0.591 0.7615 0.084 0.016 0.072 0.132 0.680 0.016
#> SRR1661994 5 0.590 0.7687 0.096 0.016 0.072 0.116 0.684 0.016
#> SRR1661995 5 0.588 0.7704 0.088 0.016 0.072 0.124 0.684 0.016
#> SRR1661996 5 0.575 0.7621 0.096 0.008 0.072 0.120 0.688 0.016
#> SRR1661997 5 0.594 0.7682 0.088 0.020 0.076 0.116 0.684 0.016
#> SRR1661998 5 0.590 0.7715 0.096 0.016 0.072 0.116 0.684 0.016
#> SRR1661999 5 0.598 0.7673 0.100 0.016 0.072 0.120 0.676 0.016
#> SRR1662000 5 0.595 0.7560 0.100 0.012 0.068 0.132 0.672 0.016
#> SRR1662001 5 0.578 0.7622 0.080 0.012 0.072 0.132 0.688 0.016
#> SRR1662002 5 0.596 0.7688 0.080 0.020 0.076 0.128 0.680 0.016
#> SRR1662003 5 0.584 0.7689 0.092 0.016 0.068 0.120 0.688 0.016
#> SRR1662004 5 0.588 0.7694 0.096 0.016 0.068 0.120 0.684 0.016
#> SRR1662005 5 0.583 0.7616 0.092 0.012 0.068 0.128 0.684 0.016
#> SRR1662006 5 0.574 0.7591 0.084 0.008 0.076 0.128 0.688 0.016
#> SRR1662007 5 0.589 0.7702 0.088 0.020 0.072 0.116 0.688 0.016
#> SRR1662008 5 0.586 0.7669 0.088 0.016 0.076 0.116 0.688 0.016
#> SRR1662009 5 0.580 0.7696 0.092 0.012 0.072 0.120 0.688 0.016
#> SRR1662010 5 0.581 0.7739 0.096 0.016 0.072 0.108 0.692 0.016
#> SRR1662011 5 0.592 0.7652 0.096 0.012 0.072 0.128 0.676 0.016
#> SRR1662012 5 0.586 0.7548 0.104 0.008 0.068 0.128 0.676 0.016
#> SRR1662013 5 0.585 0.7686 0.096 0.012 0.072 0.120 0.684 0.016
#> SRR1662014 5 0.585 0.7698 0.088 0.016 0.072 0.120 0.688 0.016
#> SRR1662015 5 0.590 0.7746 0.096 0.020 0.072 0.108 0.688 0.016
#> SRR1662016 5 0.584 0.7632 0.096 0.012 0.068 0.124 0.684 0.016
#> SRR1662017 5 0.597 0.7705 0.088 0.020 0.072 0.124 0.680 0.016
#> SRR1662018 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662019 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662020 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662021 2 0.750 0.1113 0.064 0.376 0.364 0.156 0.004 0.036
#> SRR1662022 2 0.724 0.1172 0.068 0.384 0.376 0.144 0.000 0.028
#> SRR1662023 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662024 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662025 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662026 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662027 2 0.726 0.1206 0.064 0.388 0.372 0.144 0.000 0.032
#> SRR1662028 2 0.712 0.1201 0.064 0.392 0.380 0.140 0.000 0.024
#> SRR1662029 2 0.720 0.1181 0.064 0.388 0.376 0.144 0.000 0.028
#> SRR1662030 3 0.722 -0.1369 0.068 0.376 0.380 0.152 0.000 0.024
#> SRR1662031 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662032 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662033 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662034 2 0.742 0.1179 0.068 0.384 0.368 0.144 0.004 0.032
#> SRR1662035 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662036 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662037 2 0.726 0.1211 0.064 0.388 0.372 0.144 0.000 0.032
#> SRR1662038 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662039 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662040 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662041 2 0.728 0.1137 0.060 0.380 0.372 0.156 0.000 0.032
#> SRR1662042 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662043 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662044 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662045 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662046 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662047 2 0.726 0.1206 0.064 0.388 0.372 0.144 0.000 0.032
#> SRR1662048 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662049 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662050 2 0.724 0.1172 0.068 0.384 0.376 0.144 0.000 0.028
#> SRR1662051 3 0.720 -0.1360 0.064 0.376 0.380 0.156 0.000 0.024
#> SRR1662052 2 0.720 0.1207 0.064 0.388 0.376 0.144 0.000 0.028
#> SRR1662053 2 0.714 0.1186 0.064 0.388 0.380 0.144 0.000 0.024
#> SRR1662054 6 0.134 0.9929 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662055 6 0.138 0.9926 0.008 0.036 0.000 0.008 0.000 0.948
#> SRR1662056 6 0.134 0.9932 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662057 6 0.127 0.9940 0.008 0.036 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1662058 6 0.144 0.9929 0.012 0.040 0.000 0.004 0.000 0.944
#> SRR1662059 6 0.151 0.9902 0.012 0.044 0.000 0.004 0.000 0.940
#> SRR1662060 6 0.134 0.9925 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662061 6 0.127 0.9940 0.008 0.036 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1662062 6 0.144 0.9922 0.012 0.040 0.000 0.004 0.000 0.944
#> SRR1662063 6 0.148 0.9869 0.008 0.048 0.000 0.004 0.000 0.940
#> SRR1662064 6 0.151 0.9908 0.012 0.036 0.004 0.004 0.000 0.944
#> SRR1662065 6 0.159 0.9908 0.012 0.040 0.004 0.004 0.000 0.940
#> SRR1662066 6 0.145 0.9918 0.008 0.040 0.000 0.008 0.000 0.944
#> SRR1662067 6 0.134 0.9929 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662068 6 0.127 0.9940 0.008 0.036 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1662069 6 0.127 0.9940 0.008 0.036 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1662070 6 0.144 0.9922 0.012 0.040 0.000 0.004 0.000 0.944
#> SRR1662071 6 0.141 0.9927 0.008 0.036 0.004 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662072 6 0.134 0.9932 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662073 6 0.134 0.9929 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662074 6 0.134 0.9929 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662075 6 0.134 0.9929 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662076 6 0.137 0.9925 0.012 0.036 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662077 6 0.127 0.9940 0.008 0.036 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1662078 6 0.127 0.9940 0.008 0.036 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1662079 6 0.151 0.9908 0.012 0.036 0.004 0.004 0.000 0.944
#> SRR1662080 6 0.134 0.9929 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662081 6 0.137 0.9925 0.012 0.036 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662082 6 0.134 0.9929 0.008 0.040 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662083 6 0.137 0.9925 0.012 0.036 0.000 0.004 0.000 0.948
#> SRR1662084 5 0.253 0.7814 0.028 0.056 0.000 0.024 0.892 0.000
#> SRR1662085 5 0.289 0.7805 0.028 0.060 0.004 0.032 0.876 0.000
#> SRR1662086 5 0.267 0.7822 0.028 0.056 0.004 0.024 0.888 0.000
#> SRR1662087 5 0.555 0.5659 0.204 0.020 0.040 0.048 0.676 0.012
#> SRR1662088 5 0.284 0.7893 0.040 0.052 0.000 0.032 0.876 0.000
#> SRR1662089 5 0.304 0.7813 0.028 0.056 0.012 0.032 0.872 0.000
#> SRR1662090 5 0.275 0.7822 0.028 0.056 0.004 0.028 0.884 0.000
#> SRR1662091 5 0.291 0.7887 0.040 0.052 0.004 0.028 0.876 0.000
#> SRR1662092 5 0.263 0.7814 0.032 0.052 0.012 0.012 0.892 0.000
#> SRR1662093 5 0.376 0.7649 0.064 0.048 0.024 0.032 0.832 0.000
#> SRR1662094 5 0.276 0.7856 0.032 0.056 0.000 0.032 0.880 0.000
#> SRR1662095 5 0.283 0.7894 0.036 0.056 0.000 0.032 0.876 0.000
#> SRR1662096 5 0.291 0.7791 0.036 0.048 0.012 0.024 0.880 0.000
#> SRR1662097 5 0.269 0.7893 0.036 0.052 0.000 0.028 0.884 0.000
#> SRR1662098 5 0.276 0.7866 0.028 0.052 0.004 0.032 0.884 0.000
#> SRR1662099 5 0.287 0.7856 0.032 0.052 0.008 0.028 0.880 0.000
#> SRR1662100 5 0.270 0.7814 0.028 0.056 0.008 0.020 0.888 0.000
#> SRR1662101 5 0.291 0.7811 0.036 0.048 0.012 0.024 0.880 0.000
#> SRR1662102 5 0.267 0.7780 0.028 0.056 0.004 0.024 0.888 0.000
#> SRR1662103 5 0.267 0.7796 0.028 0.056 0.004 0.024 0.888 0.000
#> SRR1662104 5 0.308 0.7857 0.032 0.056 0.008 0.036 0.868 0.000
#> SRR1662105 5 0.276 0.7856 0.032 0.056 0.000 0.032 0.880 0.000
#> SRR1662106 5 0.268 0.7832 0.028 0.056 0.000 0.032 0.884 0.000
#> SRR1662107 5 0.279 0.7798 0.036 0.052 0.008 0.020 0.884 0.000
#> SRR1662108 5 0.316 0.7865 0.044 0.052 0.008 0.032 0.864 0.000
#> SRR1662109 5 0.315 0.7844 0.048 0.052 0.008 0.028 0.864 0.000
#> SRR1662110 5 0.274 0.7823 0.028 0.052 0.012 0.020 0.888 0.000
#> SRR1662111 5 0.717 0.3675 0.204 0.016 0.100 0.096 0.552 0.032
#> SRR1662112 5 0.253 0.7794 0.028 0.056 0.000 0.024 0.892 0.000
#> SRR1662113 5 0.261 0.7839 0.028 0.056 0.000 0.028 0.888 0.000
#> SRR1662114 5 0.424 0.7658 0.068 0.056 0.008 0.064 0.800 0.004
#> SRR1662115 5 0.295 0.7845 0.036 0.048 0.008 0.024 0.880 0.004
#> SRR1662116 5 0.280 0.7839 0.032 0.052 0.008 0.024 0.884 0.000
#> SRR1662117 5 0.321 0.7765 0.040 0.052 0.016 0.028 0.864 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0